bac_id	spacer_id	hit_phage_id	hit_phage_def	spacer_sequence	hit_phage_region	hit_phage_sequence	mismatch	coverage	hmm_mismatch
NC_015565	1.2|584716|34|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP032091	Pseudoalteromonas donghaensis strain HJ51 plasmid unnamed1, complete sequence	AATCAAGGCTTGAAGCAGGGAAGCCATTATGGGA	84223-84256	TCCCATAATGGCTTACCTGTTTCACGGGCAATAA	2	0.7058823529411765	8
NC_015565	1.13|585450|34|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MF417868	Uncultured Caudovirales phage clone 7AX_1, partial genome	TTTAGTAGCTTTTGGTTTTTTAGCAGTTGTAGTT	134209-134242	TTTAGTAGCTTTTACTTTTTTAGCCATTATTTAA	2	0.7058823529411765	9
NC_015565	1.13|585450|34|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MH542234	Staphylococcus phage Terranova, complete genome	TTTAGTAGCTTTTGGTTTTTTAGCAGTTGTAGTT	48361-48394	TTAAATAATGGCTAAAAAAGTAAAAGCTACTAAA	2	0.7058823529411765	9
NC_015565	1.13|585450|34|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	KP027447	Staphylococcus phage phiIPLA-C1C, complete genome	TTTAGTAGCTTTTGGTTTTTTAGCAGTTGTAGTT	11758-11791	TTAAATAATGGCTAAAAAAGTAAAAGCTACTAAA	2	0.7058823529411765	9
NC_015565	1.13|585450|34|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MH321490	Staphylococcus phage Quidividi, complete genome	TTTAGTAGCTTTTGGTTTTTTAGCAGTTGTAGTT	47703-47736	TTAAATAATGGCTAAAAAAGTAAAAGCTACTAAA	2	0.7058823529411765	9
NC_015565	1.13|585450|34|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MH321491	Staphylococcus phage Twillingate, complete genome	TTTAGTAGCTTTTGGTTTTTTAGCAGTTGTAGTT	48228-48261	TTAAATAATGGCTAAAAAAGTAAAAGCTACTAAA	2	0.7058823529411765	9
NC_015565	1.36|586986|34|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MN582082	Podoviridae sp. ctrTa16, complete genome	ATGAAAAGTATGGTTGGGGAAAACGGATACTTAA	1282-1315	CCTGACATCCGTTTACCCCAACCATACTTATCGG	2	0.7647058823529411	10
NC_015565	1.37|587052|38|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MK113950	Phage 5P_2, complete genome	TGATTCTATTTCTCCACCGATATCAAAAGCGCTAGGAG	4391-4428	TGATTCTATTTCTCCACCGATATCAAAAGCGCTAGGAG	0	1.0	0
NC_015565	2.8|590382|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_011246	Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124, complete sequence	TTCCCGGTTATTTAAAGTAAGTCTTTGAAATAGTG	73117-73151	AAAAATTTCAAAGACTTACTTAAAATAGCCTTTAA	2	0.7428571428571429	8
NC_015565	2.8|590382|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_011247	Borrelia duttonii Ly plasmid pl165, complete sequence	TTCCCGGTTATTTAAAGTAAGTCTTTGAAATAGTG	111445-111479	AAAAATTTCAAAGACTTACTTAAAATAGCCTTTAA	2	0.7428571428571429	8
NC_015565	2.9|590449|34|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP043609	Bacteroides fragilis strain GUT04 plasmid unnamed1, complete sequence	CCAAAAATATCTCCGCTTCTCAATCTCTGTCAGC	62590-62623	AAGGAAATACCTACGCTTCTCAATCTCTCAACCA	2	0.7058823529411765	9
NC_015565	2.9|590449|34|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP036547	Bacteroides fragilis strain DCMSKEJBY0001B plasmid pBFS01_1, complete sequence	CCAAAAATATCTCCGCTTCTCAATCTCTGTCAGC	38651-38684	AAGGAAATACCTACGCTTCTCAATCTCTCAACCA	2	0.7058823529411765	9
NC_015565	2.9|590449|34|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP036540	Bacteroides fragilis strain DCMOUH0017B plasmid pBFO17_1, complete sequence	CCAAAAATATCTCCGCTTCTCAATCTCTGTCAGC	44279-44312	TGGTTGAGAGATTGAGAAGCGTAGGTATTTCCTT	2	0.7058823529411765	9
NC_015565	2.14|590783|34|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP049244	Rhizobium pseudoryzae strain DSM 19479 plasmid unnamed3, complete sequence	CAAAATTCCAGGGAGAACACCGCCTTTCTCATTG	870741-870774	GACCTATACAGGGAGAATACCGCTTTTCTCATAA	2	0.7058823529411765	10
NC_015565	2.17|590982|33|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_AP018204	Leptolyngbya boryana NIES-2135 plasmid plasmid1 DNA, complete genome	ATATCGTAGACTTTGGTTTTGCAGTTTGGGCAC	118049-118081	TGGGTCGCGAGTTAGGTTTTGCAGTTTGGGCAC	2	0.7575757575757576	7
NC_015565	2.17|590982|33|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP007453	Peptoclostridium acidaminophilum DSM 3953 strain al-2 plasmid EAL2_808p, complete sequence	ATATCGTAGACTTTGGTTTTGCAGTTTGGGCAC	350432-350464	ATGCCCAAAATGCAAAACCAGAGTCAAGCATGA	2	0.7272727272727273	8
NC_015565	2.19|591113|34|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP044049	Klebsiella variicola strain FDAARGOS_627 plasmid unnamed1, complete sequence	TCCTTTATATGCTTGTCCAAGTTTTGCATAGCTT	26548-26581	ATTTGAACCAGCTTGTTCAAGTTTTGTATAGCTT	2	0.7058823529411765	10
NC_015565	2.26|591579|34|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	JQ432564	Uncultured bacterium plasmid pKS208, complete sequence	TCAATGCCCACGGTTTTTGCCACGCCGCCAACGG	30238-30271	CTGCTGCCCACGGTTTTTGCCAAGGCGCTGTCCC	2	0.7058823529411765	11
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP015797	Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid cp26, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	17893-17927	TCAATATTATAAAGATTAATTTGTTTTAAAAAAAA	2	0.7428571428571429	6
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP015781	Borrelia mayonii strain MN14-1420 plasmid cp26, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	17919-17953	TCAATATTATAAAGATTAATTTGTTTTAAAAAAAA	2	0.7428571428571429	6
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_009130	Staphylococcus sp. 693-2 plasmid pLEW6932, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	6225-6259	AGTTTTTTTAAACTAATTATTTTTTATTATTCTGT	2	0.7428571428571429	9
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP054442	Staphylococcus saprophyticus strain UTI-058y plasmid pUTI-058y-2, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	22268-22302	ACAGAATAATAAAAAATAATTAGTTTAAAAAACTG	2	0.7142857142857143	10
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP022091	Staphylococcus saprophyticus strain FDAARGOS_355 plasmid unnamed1, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	17614-17648	ACAGAATAATAAAAAATAATTAGTTTAAAAAACTG	2	0.7142857142857143	10
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP014058	Staphylococcus saprophyticus strain FDAARGOS_137 plasmid unnamed, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	14916-14950	ACAGAATAATAAAAAATAATTAGTTTAAAAAACTG	2	0.7142857142857143	10
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP014114	Staphylococcus saprophyticus strain FDAARGOS_168 plasmid unnamed1, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	27671-27705	ACAGAATAATAAAAAATAATTAGTTTAAAAAACTG	2	0.7142857142857143	10
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP035296	Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 = NCTC 7292 strain ATCC 15305 plasmid unnamed2, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	12873-12907	ACAGAATAATAAAAAATAATTAGTTTAAAAAACTG	2	0.7142857142857143	10
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_016643	Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus plasmid pSSAP2, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	22268-22302	ACAGAATAATAAAAAATAATTAGTTTAAAAAACTG	2	0.7142857142857143	10
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_011412	Clostridium perfringens plasmid pCP8533etx, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	22104-22138	ATTTTACAATAAAAATTAATTATTTTCAAAAATGT	2	0.7142857142857143	9
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP054435	Staphylococcus saprophyticus strain UTI-035 plasmid pUTI-035-1, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	22268-22302	ACAGAATAATAAAAAATAATTAGTTTAAAAAACTG	2	0.7142857142857143	10
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_019688	Clostridium perfringens plasmid pNetB-NE10, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	35679-35713	ATTTTACAATAAAAATTAATTATTTTCAAAAATAT	2	0.7142857142857143	8
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP017461	Staphylococcus nepalensis strain JS1 plasmid pSNJS101, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	34816-34850	ACAGAATAATAAAAAATAATTAGTTTAAAAAACTG	2	0.7142857142857143	10
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP025502	Clostridium perfringens strain EHE-NE18 plasmid pJIR3535, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	67812-67846	ATATTTTTGAAAATAATTAATTTTTATTGTAAAAT	2	0.7142857142857143	8
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP019601	Brachyspira hyodysenteriae strain BH718 plasmid pBH718, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	32837-32871	ATACAATTCTAAAAATTAATTATTTTTAAAGAAAG	2	0.7142857142857143	9
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP017467	Staphylococcus nepalensis strain JS11 plasmid pSNJS1101, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	23247-23281	CAGTTTTTTAAACTAATTATTTTTTATTATTCTGT	2	0.7142857142857143	10
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP054577	Staphylococcus saprophyticus strain UTI-050 plasmid pUTI-050-2, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	3566-3600	CAGTTTTTTAAACTAATTATTTTTTATTATTCTGT	2	0.7142857142857143	10
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_012226	Brachyspira hyodysenteriae WA1 plasmid pBHWA1, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	5055-5089	CTTTCTTTAAAAATAATTAATTTTTAGATTTATAT	2	0.7142857142857143	8
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP054446	Staphylococcus saprophyticus strain UTI-056 plasmid pUTI-056-2, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	22267-22301	ACAGAATAATAAAAAATAATTAGTTTAAAAAACTG	2	0.7142857142857143	10
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_007351	Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 = NCTC 7292 plasmid pSSP1, complete sequence	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	11107-11141	CAGTTTTTTAAACTAATTATTTTTTATTATTCTGT	2	0.7142857142857143	10
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	JF734911	Helicobacter phage phiHP33, complete genome	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	11273-11307	GCTCAATAAGAAAAATGAATTAGTTTTAAAAACGA	2	0.7142857142857143	10
NC_015565	2.28|591711|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_019928	Helicobacter phage KHP30 DNA, complete genome	ATTAATAAATAAAAATTAATTAGTTTTAAAAAAAC	11164-11198	GATCAATAAGAAAAATGAATTAGTTTTAAAAACGA	2	0.7142857142857143	7
NC_015565	2.38|592377|33|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MK574078	Pseudomonas phage KP1, complete sequence	ATGAAAAAACAAAACCGCCTTACGGCGGTCTAA	35099-35131	AATGACCGCCGAAAGGCGGTTTTTTTTTCATCC	2	0.7575757575757576	6
NC_015565	3.8|622458|37|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MK448767	Streptococcus phage Javan467, complete genome	CAACATAATCTGCCTGCTTTTGTGTTACTTTTTTAAT	10797-10833	ATGATTGAGTTAACACAAAAACAGGCTGATTATGTTG	2	0.7297297297297297	8
NC_015565	3.8|622458|37|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MK448942	Streptococcus phage Javan448, complete genome	CAACATAATCTGCCTGCTTTTGTGTTACTTTTTTAAT	10796-10832	ATGATTGAGTTAACACAAAAACAGGCTGATTATGTTG	2	0.7297297297297297	8
NC_015565	3.8|622458|37|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_004586	Streptococcus pyogenes phage 315.3, complete genome	CAACATAATCTGCCTGCTTTTGTGTTACTTTTTTAAT	10902-10938	ATGATTGAGTTAACACAAAAACAGGCTGATTATGTTG	2	0.7297297297297297	8
NC_015565	3.8|622458|37|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MK448964	Streptococcus phage Javan502, complete genome	CAACATAATCTGCCTGCTTTTGTGTTACTTTTTTAAT	10776-10812	ATGATTGAGTTAACACAAAAACAGGCTGATTATGTTG	2	0.7297297297297297	8
NC_015565	3.8|622458|37|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MK448943	Streptococcus phage Javan450, complete genome	CAACATAATCTGCCTGCTTTTGTGTTACTTTTTTAAT	10797-10833	ATGATTGAGTTAACACAAAAACAGGCTGATTATGTTG	2	0.7297297297297297	8
NC_015565	3.8|622458|37|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MK448786	Streptococcus phage Javan509, complete genome	CAACATAATCTGCCTGCTTTTGTGTTACTTTTTTAAT	10797-10833	ATGATTGAGTTAACACAAAAACAGGCTGATTATGTTG	2	0.7297297297297297	8
NC_015565	3.8|622458|37|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MK448963	Streptococcus phage Javan498, complete genome	CAACATAATCTGCCTGCTTTTGTGTTACTTTTTTAAT	6419-6455	ATGATTGAGTTAACACAAAAACAGGCTGATTATGTTG	2	0.7297297297297297	8
NC_015565	3.19|623275|36|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_005355	Lactobacillus prophage Lj965, complete genome	ATCCCCAAACCATTACTATCAACTATAACAATTTTT	9187-9222	ACAAATTGTTTTAGGTGATAGTAATGGTAAAAATCA	2	0.7222222222222222	9
NC_015565	3.19|623275|36|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	AY459535	Lactobacillus johnsonii prophage Lj965, complete genome	ATCCCCAAACCATTACTATCAACTATAACAATTTTT	9187-9222	ACAAATTGTTTTAGGTGATAGTAATGGTAAAAATCA	2	0.7222222222222222	9
NC_015565	4.30|806513|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_MG205641	Paeniclostridium sordellii strain 7508-A plasmid pCS1-7, complete sequence	AATACTTTAGCAAAATATTCTTCTTGTTCTTTTGT	104865-104899	AATAATGAACAAAAAGAATATTTTGCTAAAACTTT	2	0.7714285714285715	7
NC_015565	4.30|806513|35|NC_015565|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_MG205642	Paeniclostridium sordellii strain 7543-A plasmid pCS1-6, complete sequence	AATACTTTAGCAAAATATTCTTCTTGTTCTTTTGT	104865-104899	AATAATGAACAAAAAGAATATTTTGCTAAAACTTT	2	0.7714285714285715	7
NC_015565	5.1|1966570|53|NC_015565|CRISPRCasFinder	MT024872	Streptomyces phage Muntaha, complete genome	AGGCCCAATTTGGCTCCCCGAGTAGGATTCGAACCTACAACCTACCGGTTAAC	75122-75174	GTTAACCGATAGGTTGTAGGTTCGAGTCCTACTCGGGGAGCTTGACAAACTGC	2	0.7735849056603774	8
NC_015565	5.1|1966570|53|NC_015565|CRISPRCasFinder	MT024865	Streptomyces phage Wakanda, complete genome	AGGCCCAATTTGGCTCCCCGAGTAGGATTCGAACCTACAACCTACCGGTTAAC	74955-75007	GTTAACCGATAGGTTGTAGGTTCGAGTCCTACTCGGGGAGCAATTGCGTGGTA	2	0.7735849056603774	8
