Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG813249 | Listeria monocytogenes 6179 | 4 crisprs | cas2,cas1,cas9,csa3,DinG,cas3,WYL,casR,cas6,cas8b2,cas7,cas5,DEDDh | 8 | 24 | 7 | 7 |
NZ_HG813250 | Listeria monocytogenes 6179 plasmid LM6179, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG813249_1 | 49-414 | TypeII |
II-A,II-B
Consensus repeat of NZ_HG813249_1
|
5 spacers
spacers of NZ_HG813249_1
>1.1|85|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAGCTAATGCGGTTATCTTTCGTAAGGTT >1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTATACAGGTTAGGAAGTAAACTCCTTGTA >1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTAAAGTTGTCAACTTCTATTTTTTATAT >1.4|283|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAAACGTATCAAAAGGCACTGTCGCGAT >1.5|349|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATTGTTTATCTTCTCCCAAATAAAATCA |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_HG813249_1
The CRISPR arrays of NZ_HG813249_1 >merge|NZ_HG813249|1|49-414|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACCAAGCTAATGCGGTTATCTTTCGTAAGGTTGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACGTATACAGGTTAGGAAGTAAACTCCTTGTAGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACCTTAAAGTTGTCAACTTCTATTTTTTATATGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACAAAAAACGTATCAAAAGGCACTGTCGCGATGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACTCATTGTTTATCTTCTCCCAAATAAAATCAGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC >NZ_HG813249|1|1|49-414|PILER-CR GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC CAAGCTAATGCGGTTATCTTTCGTAAGGTT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC GTATACAGGTTAGGAAGTAAACTCCTTGTA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC CTTAAAGTTGTCAACTTCTATTTTTTATAT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC AAAAAACGTATCAAAAGGCACTGTCGCGAT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TCATTGTTTATCTTCTCCCAAATAAAATCA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC >NZ_HG813249|1|1|49-414|CRISPRCasFinder GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC CAAGCTAATGCGGTTATCTTTCGTAAGGTT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC GTATACAGGTTAGGAAGTAAACTCCTTGTA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC CTTAAAGTTGTCAACTTCTATTTTTTATAT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC AAAAAACGTATCAAAAGGCACTGTCGCGAT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TCATTGTTTATCTTCTCCCAAATAAAATCA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC >NZ_HG813249|1|1|49-414|CRT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC CAAGCTAATGCGGTTATCTTTCGTAAGGTT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC GTATACAGGTTAGGAAGTAAACTCCTTGTA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC CTTAAAGTTGTCAACTTCTATTTTTTATAT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC AAAAAACGTATCAAAAGGCACTGTCGCGAT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TCATTGTTTATCTTCTCCCAAATAAAATCA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC
>NZ_HG813249.1|WP_031669208.1|542_1205_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MNFNFKLLDEPITIEDSTIFVIEDVRVFANVAKLFYQYDETEELKVFNTKQHPLKSSELMLVTDILGHDINSAATLKLIYTDLEQQLNEKPKVKSMIDKLTATISELIGYELLEHELDLEEDEITVIELFKALGIKIETKSDTVFEKLIEIVQVYKYLSKKKLLVLINVCSYLTEEELLELRRYISLYQVKVLFIEPRKIKGSPQVTLDSDYFLHVENSV >NZ_HG813249.1|WP_003733027.1|1194_1536_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSYRYMRMLLMFDMPTDTAKERKAYRQFRRFILSEGFIMHQYSVYSKILLNGTASKAMLARLKQQNPKKGLITLLTVTEKQFARMVYLSGEQNKSVGNSDARLIFLGDAIDEF >NZ_HG813249.1|WP_003733028.1|1532_2399_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRTVVVNSHSKLSYKNQHLVFKSAYQHEMIHLSEIDVLILETTDITLTTMLINCLVAENILILFCDDKRLPIGKVLPFYGRHDSSLQLSKQLGWDSELKSEVWTEIISQKILNQSTFLSMLNYDEKADSLIKLHETLEIFDPTNREGHAARIYFNQLFGNDFTREQENDINSGLNYGYTLLLSIFARELVKSGCMTQFGLKHSNQFNDFNFASDIMEPFRPLVDQIVYEKRNEDFQVIKRSLFELFNKQFDYNDQHMFLTNIASDYTKKIVKVLNEEREGVPEFRI >NZ_HG813249.1|WP_031669209.1|2399_6404_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKKPYTIGLDIGTNSVGWAVLTDQYDLVKRKMKISGDSEKKQIKKNFWGVRLFEKGETAAKRRMSRTARRRIERRRNRISYLQEIFAIQMNEVDDNFFNRLKESFYAESDKKYNRHPFFGTVEEEVAYYKDFPTIYHLRKELIDSQKKADLRLVYLALAHIIKYRGHFLIEGALDTKNTSIDEMFKQFLQIYNQVFANDIEEASLKKTEKNQEVAQILAEKFTRKDKLDKILSLYPGEKTTGVFAQFVNIIVGSTGKFKKHFNLHEKKDINCAEDTYDTDLESLLAIIGDEFAEVFVAAKNAYNAVVLSNIITVTDSTTRAKLSASLIERFENHKEDLKKMKRFVRTYLPEKYDEIFDDTEKHGYAGYISGKTKQADFYKYMKATLEKIEGADYFIAKIEEENFLRKQRTFDNGVIPHQLHLEELEAILHQQAKYYPFLREDYEKIKSLVTFRIPYFVGPLAKGQSEFAWLTRKADGEIRPWNIEEKVDFGKSAVDFIEKMTNKDTYLPKENVLPKHSLCYQKYMVYNELTKVRYIDDQGKTNYFSGQEKQQIFNDLFKQKRKVKKKDLELFLRNINQIESPTIEGLEDSFNASYATYHDLLKVGMKQEILDNPLNTEMLEDIVKILTVFEDKRMIKEQLQQFSDVLDGTVLKKLERRHYTGWGRLSAKLLVGIRDKQSHLTILDYLMNDDGLNRNLMQLINDSNLSFKSIIEKEQVSTADKDLQSIVADLAGSPAIKKGILQSLKIVDELVSVMGYPPQTIVVEMARENQTTNKGKNNSKPRYKSLEKAIKEFGSQILKEHPTDNQELKNNRLYLYYLQNGKDMYTGQELDIHNLSNYDIDHIVPQSFITDNSVDNLVLTSSAGNREKGDNVPPLEIVQKRKIFWEKLYQGNLMSKRKFDYLTKAERGGLTEADKARFIHRQLVETRQITKNVANILHQRFNYKTDGNKDTMETVRIVTLKSALVSQFRKQFQFYKVREVNDYHHAHDAYLNGVVANTLLKVYPQLEPEFVYGEYHQFDWFKANKATAKKQFYTNIMLFFAQKDRIIDENGEILWDKRYLETVKKVLGYRQMNIVKKTEIQKGEFSNVTPNPKGKSNKLIPRKKDWDPIKYGGFDGSKMAYAIIIEYEKQKRKVRIEKKLIQINIMEREAFEKDEKTFLEEKGYHQPKVLIKVPKYTLYECENGRRRMLGSANEAHKGNQMLLPNHLMALLYHAEKYEAIDGESLAYIEVHRALFDELLAYISEFARKYTLSNDRLDEINMLYERNKDGDVKSIAESFVSLKKFNAFGVHQDFSFFGTKIERKRDRKLNELLNSTIIYQSITGLYESRKRLDN >NZ_HG813249.1|WP_003733030.1|6928_7417_-|hypothetical-protein MKEDILAVYKKFEINNLNMFFDDLIEYVNKYYTVFSKYISLDYLDAITRLDSTSLILGHSDDNFEIAIPFYTNKVIEGLNEEELSNQVSSLIWDLSAYMTEELCPSCNDSNLRLTTMVSREDTLVKFCDECLYTGIRNERVEIEEDLVPAPKKKVEEYLRGK >NZ_HG813249.1|WP_003733031.1|7426_8812_-|hypothetical-protein MSRIDIAELNEFLHNLKSSNDEARRMLGKMQEVTNAYATDTSLKGKAIETSQAYFDQTYSVICKSLIEALDESEERLERYIREFGEQVDSSYNARIDAEMLQEAIFRLAEIKRKQEDLLQRMSASTGTLHEGEQQRLRTQFTDALEQEKILERYIAFEQSHGRFFDSFSELVYCAGKAVRELAANVTFNSQTGTYDIGKLDTNKFHALQKFLPKKKKYNFNEYEIRWNGAAHILLRGDVVDAEATAAYNDAVAKGELPKVSNQATESAEEINAVVNALKKGQDPITGQEISKAQSFGIAIGLVYMYVGGKYKGRKIKLPKNALENLEKQQAFKDKEVGGADIPNPNVGIVQSRVNLAENPTRFSPSKNAGMKHVRNRHYNPSKNAGQFTIPESDLKNILQSKQVVNTPVKQIESGDFERVIDIGKNMGTVKPSLGGQTTTWIKVITDKAGNIITTYPVPKP >NZ_HG813249.1|WP_003749666.1|9103_9496_-|30S-ribosomal-protein-S9 MAQVQYYGTGRRKSSVARVRLVPGDGKIVINNRDWEDYIPFAALREVIKQPLVATETLGNYDVLVNVRGGGYTGQAGAIRHGVARALLQVAPEYRPALKSAGLLTRDSRMKERKKPGLKGARRAPQFSKR >NZ_HG813249.1|WP_003727703.1|9517_9955_-|50S-ribosomal-protein-L13 MRTTYMAKPGEVERKWYVIDATGVSLGRLSSEVASILRGKNKPQFTPHIDTGDFVIIINAGKIGLTGKKATDKIYYRHSQYPGGLKSRTAGEMRTNNPEKLLELSIKGMLPKNSLGRQLFKKLHVYGGSEHEHAAQQPEVYELRG >NZ_HG813249.1|WP_015455273.1|10149_10896_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MTRYKAIISYDGSGFYGYQVQPNTRTVQAEIEKALTKMHKGKTVRVTASGRTDTGVHAKGQVIHFDSELDITAEKFQKALQVMTPFDISFLTVEEVPDDFHARFGTVGKEYRYVVKRTKIFDPFSRNFALHYPYELDILKMKLASKRLIGEHDFTSFCSARTERDSKVRTLYSIDFYEEDDETLVIAFQGNGFLYNMVRILTGTLLDAGQGRISPDDISEALLARDRQKLISKTAPPQGLYLWRVDYE >NZ_HG813249.1|WP_010959067.1|10901_11699_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MMDKMILGRYIPGNSWLHRIDPRAKITAVMAFIAIVFLANNWLTYALMFAYVLYLVLTSKVPFLFFIKGLQPIFWLILITLLLQVFFTKGGTVLVDLGLLQITTLGLTNGAMMFCRFVLIIFMTTLLTLTTSPIELTDGLEKILAPFRLVHLPVHELALMLSISLRFIPTLMDETEKILKAQKARGVEFTSGKWSDRIKAIIPLLVPLFISAFKRAEDLAIAMEARGYRGGKGRTRFRLLRWRFADTFLLISLAVLSGLLFWLRS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG813249_2 | 774192-774776 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_HG813249_2
|
7 spacers
spacers of NZ_HG813249_2
>2.1|774231|39|NZ_HG813249|CRT TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG >2.2|774309|39|NZ_HG813249|CRT TCTTACATGTTTTATGATAATAGAAACCTTGAGGTGCTG >2.3|774387|39|NZ_HG813249|CRT TATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTG >2.4|774465|39|NZ_HG813249|CRT TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA >2.5|774543|39|NZ_HG813249|CRT GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG >2.6|774621|39|NZ_HG813249|CRT CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA >2.7|774699|39|NZ_HG813249|CRT GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_HG813249_2
The CRISPR arrays of NZ_HG813249_2 >merge|NZ_HG813249|2|774192-774776|CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATGTGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTGGATGTAAGTCATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATGTCTTACATGTTTTATGATAATAGAAACCTTGAGGTGCTGGATGTAAGCAACCTTGATACCGGTTCAGTAACTAATATGTATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTGGATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATGTATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTAGATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATGGTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTGGATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATGCGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTAGATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATGGCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTTGATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG >NZ_HG813249|2|2|774192-774776|CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATG TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG GATGTAAGTCATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATG TCTTACATGTTTTATGATAATAGAAACCTTGAGGTGCTG GATGTAAGCAACCTTGATACCGGTTCAGTAACTAATATG TATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTG GATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATG TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA GATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATG GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG GATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATG CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA GATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATG GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTT GATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG
>NZ_HG813249.1|WP_077418270.1|771362_773399_+|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MFGNVPSSKPSAWNGYLNRINHIEIEEATLTGDFESYFRSNVFLALESVRIERSNLSGVTSFANAFYASRAEKIIIKDNDYPTASSLLTTENMFKYCSSLTELDVSGLDTSAVTNMTEMFYGCNALKELDASNFDTSSVTDMNSMFISCSALEKLDVSNFDTSSVTDMNSMFRGCSALKKLDASNFDTSSVTNMNNMFFACASLEELNASNFDTSSVTDMNSMFRYCNKLKKLDISNFDTSSVTDMNSMFRTCSALERVDVSNFDTSSVTDMNRMFDECKSLEILDVSNFDTNSVTDMGYMFYENEKLKKLDLSNFDTSSVTDMSFMFFQCTGLEELDVSNFDTNSVTNMSYMFYKCAGLEELDLSNFDTSSVTDMSFMFFQSTGLKKLDLSNFDTSSVTNMSYMFATCTALKSLYLDNFTDVSGGTVNMFIETSSLTYLFVSHNFKDFSGLENTNWYDEKNWAQFTNRSELQTYHQKQIEPTGYRKGVFHSLTMDAMGGQFDDAEEQKVQNKVPGDYWEEMIPVKEDYYFDGWYVDQDFTSKFDFSMPATASTTIYAKWIENYTVVIPASISLNETSELKVEGINRGSKTLSVGLNRTATSISESNELTLAHAADTTIQCLAPLSWDGSENNPKNAILTLAPGSEITEGDAVMDIEAPEDIQAGKYTGNLVFSIKYE >NZ_HG813249.1|WP_031669156.1|769225_770764_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MREYLDSKSQKKVALLEKIFYAENHTSTQEELLNDLNITYPTLISTIKTINFDIERFGYKEFSIVHSAPNLSYTLKISDNCSIQLIINAYIRESPKFQILETLLLSSFPNLQALAKKVHVSYSGIKKEIKELNEELSERNLYISTGNQVEITGDEFSLRIFYAFLFLVAYSGDRWPFSFVRYDEITDLLESCPKEIYRADSIDKAMMIHYYVAMHLLRDRMNCHIDTTRQFKVALYKACTEESKKSESAFIKKVAKQLPNRNYKEITYTTQIILSTIVAFGSYSSIEKMPSFFYMDEQLEEMGFMKLVDFASERVNDNLSIPFSEKEMELLRYSFASINYRYFLLDNLINKFNNIVPGYTDLDRNIRKIHKVNHLEPLISQLVNLKEMRLLKPFEERLASDYLIILDKRIDFSIHTLPIKVTILSTISNETAVFDFMRYFSSYYNLEIINQVDTVVDLYISDFSVSPEVLTSLRINQPIVYVNTRWLESDYVKINDNLAKIARKKFIANKKD >NZ_HG813249.1|WP_015455545.1|767047_768598_+|hydantoinase/oxoprolinase-family-protein MYKIGIDVGGTNTDAVILDENQQLIHSVKMPTSEDIETGITESLHRVLSETGIDRSKVTHAMLGTTQCTNAIVERKKLAKVGVLRLGYPATASVLPYTAWPEDMVGFLSGKYKLTGGGYEYDGQVLSEINEAEIRETLASWKGEVESVAVVGVFSSLKNDQELAVQKIIEEELGADIPVSISSSVGSVGLIERENATILNAALFKVIAATSDGFEKALEQEGIEHAEIYLCQNDGTLMSLNYARQFPILTIACGPTNSIRGASYLAGLKDAMVLDVGGTTSDIGVLTDGFPRESSLAVDVGGVRTNFRMPDIISIGLGGGSIVREKDGDIIIGPDSVGYRISEEALVFGGKTMTTTDIAVRLGMAEIGNPELVAHIPTDFAEKAYKKIADMTEDAIDKMKTSSGSVSLVLVGGGSVIIPDEISGVAQIFRDKNGPVANAIGASISQISGQYEQIYIYSQIEREEALQDAEQKAREQATLAGAVTDSIEVVEVEEIPLAYHPGNATRLRVKVVGNLV >NZ_HG813249.1|WP_003728991.1|765954_767055_+|DUF917-domain-containing-protein MRYLDEQAIENIAIGAAFLGTGGGGDPYIGKMMALTAIKKHGPIKLLSPEEIADDDYFIPAAMMGAPSVLIEKFPKGDEFVRVFEKLGRYVGKEVKGTFPMEAGGVNSMIPIVVAAQLGLPMVDCDGMGRAFPELQMVTFHLDGISATPMAITDEKGNIGIMETIDNKWTERLARVTTVEMGASSLVSLYPCNGAQIKQSSIKNIVTLSEEIGKVIRETSMDEAEKLQKLLDVTHGYHLFEGKITDVVRETRAGFNFGRVKIDGLNKDTDSEVIVHFQNENLVAEKNGEPIAITPDLICMVDLETLMPVTTEALKYGKRVRVMALPADDAWRTDKGIETVGPRYFGYDVDFEPLEELVKKEERRHV >NZ_HG813249.1|WP_003721244.1|764670_765954_+|cytosine-permease MTEKKTVEQAQSWQSLAFVWTGAMICVPSLLVGGTLISGMPLWEAILIALLGYGVIVVFMIYQGMQSSDLGIPAVSVASQVFGEQGSKKIISILLAIACLGWFGIQANVCGAAFSQFLGIYGINLPVPVSSLIWGVIMLLSAIYGIRILSILNYIAVPILLFVCIYGLVVSLNNGGLAVVENYKPAGSMSFMTGLAITIGSFALGAVIAGDYSQYTKSRKDVVKAAIVGILPSGVLMIAVGAILALTAGTADISVVFTNLGLPVLGIIGLILAAWTTNAVNAFSGGIAIINVFNISEKYHKVAVAIAGGLGTVLAVIGILNHFVPIMSVLSAMVPPVAGVMIASYWIVQKGDKSKWAPVPGVNWLGVTSWLVGAVIAGIPVILTFFPALPQLPNQPLIGIILSLAVYLVGAKVLSGKTNNVENLEGK >NZ_HG813249.1|WP_009925652.1|762941_764537_+|PucR-family-transcriptional-regulator MSVKLADLMKLPSLKEARVVSGKSGLSKLVSSISVLEYTEVALLEDDLFDNDEFYGSEIVVSAFVNIREDVEAQCRTIERLHKVGEVALILYYVGIFVPKIDQKLIDFANELDFTIIVMPENEMSLRYSEVIYEVVEAIVKQEMTDTNFVTESLEQISSVRPPQRNIDTTLKILSDRTHSSLVLTDNSFQVINSITWPRTRHWDFERVIETSKQIDEHELVQLHLDERDFYTARKPIFQDGMQAMHLFMMKEKGALTADVVMQITEVVQVFMNLWGRNYVEISTAELMKAILNDESVKMRRLGKILNVDVSSIKWMWLVKTEEIRNNEQVLAELKSFVASHFQVSLIDLFEDNIVVLLDNSVAQRDRTHTANEFAMMMKEHGIDLKITVCQGMAQTSDVQSAYSLVNEYKNAANAIYANKSIYSLQEIDFAAKCVEIVDRGELAIAEQMRPLKSLEDNDELIETLSVFLLEGESNYNQAAELLFLHKNTIKYRIQRINELLQYPATKIPESYNLYLAVAIRRLLGGNNNNK >NZ_HG813249.1|WP_015454177.1|761838_762786_-|MoxR-family-ATPase MSIEPSIKIEEIINEVEKVIVGKRHVVKLSLTALLAGGHVLLEDVPGVGKTMMVRTLSKTIGVSFKRIQFTPDLLPADVTGVSIFNPETRDFEFRPGPVMGNIVLADEINRTAPRTQAALLEGMAENSVTVDGITRKLANPFFVMATQNPIEYEGTYALPEAQLDRFLLKINIGYPTVEEEMQLLTLKQYQDPLDQTQQVVTLSELLDLKNKAKQVFIDDVLKNYIIRLVNATRKHPSVALGISPRGSLAFMQAAQAFALIEGRDYVIPDDIQYLAPYIFTHRLILKSEAYYNEETAESIIASILKNTSVPVEKR >NZ_HG813249.1|WP_015454176.1|760685_761834_-|DUF58-domain-containing-protein MLKKRLLLAFRWIIMLIIYAGLWTYTLFQGDTASWFLTYFFSFILLLLFLSSIYPLKAWKVNRSFVKNTYHDGDLIDMQVSFTRKSRYPVGYLLFQQIIPATFGKVRARQQVVYPLFKKQFTVTLAGFVGVRGIHSFPPVDVETSDAFGLLERSRQLSSEKSLTIYPTYFPNVLEKISEASPENERNAAYWTLKKNSNLHSLREFSSGDRISLIDWKSSAKSDQLMTREFENSATSRLSVIFYGASHPNFELSLRAAYSFIRKISEENGEIRVTLLGDQTSKFAPAKGTSRLQDISTAFAEIAPVDSLTLQESLDSNLHSGEKILLFTPCMDTMLMQKVTRLTDNKQLQIITFQSEHSKAMDAPAIFLEQASLLSRWERETK >NZ_HG813249.1|WP_031669155.1|758529_760689_-|transglutaminase MKRYLTLVMLFILSVLLISEWIYPFAELTELSTATWIILFITLSLGSFFLRLKYYWTIPLHVVMIIIVSGIYYAKGGILAGNWLGSFFQITFNGFRDMVQFRSSDISMDFILIVFLIALWLLSYITTYSILCKHRIMSVLVLTVAYLAVINTFTDYNSNWAIVRTVLEGFLLLHLALASRIATPNRISADSLKRNGLFYHGFVILLLAVFVFSSLILPKKAPIFPDPVPTIKNALGINTTRTVGYSEDDTTLGGALKKDNATVFTARAEKGHYWRVESKTVYTGTGWANANSGDVISFSSGDNFPIQLTEQTTGATNTAEISFASSSDYMPYPYGTQAVNGAVDSFSANLTIERVGPVDTIKNYTVQLKTPVYNIEKMQNADFSTLSNAFVSQYTQTPKDLPDRVTKLANKVTKDADSIYDKTKAIESYLSTSGTFTYSTDDAKETPMGADYVDQFLFETQIGYCDNFSTSMVVMLRTLGIPARWAKGYTPGDGEKKENDAKTTYTITNNNAHSWPEVFFPGTGWVPFEPTATFSNPENFQEPTTETANKPETPNDSTSTPETPNTPENTPEQNNGSNSTGETPKKEEPKTETAASNFEIPSWVWWIPAGLVVALLALVIIFRRRIRSYLLLRSLRNSPEFGKTYHRLMKLLASYGYVRESSETLRHFGTRVDAELTATEFSRLTKMYEAQVYSNNFTEKVITAEETQLVQQVIARLTK >NZ_HG813249.1|WP_003721239.1|757657_758413_-|DUF4866-family-protein MTTIFPKEQNVTPLFEQILANPTACRRFKDVFLDNLESYQETRGFEKDDTLFAKIILSAYRQSDVSALLLGVCGRTLFELLRQAFLIPKKLTVDNPFFLTDKEGNFIAKKDDISNREQEKFQEIYQSDLHHSETTIFLVDDDDIVHSYEPDFSISTKRINKKRGILVLYSLPNTLKLEMTESEVYAFIWKTFLHIQEIIPSSRIFYGQETSENADELGVFLPIHHFEKKMLQNIEQVNELVDALREQMVNK >NZ_HG813249.1|WP_015454184.1|775669_776143_+|hypothetical-protein MKKKRVVVISLLLLLVSVIGISSYFLFKDKINLLDVDPSAVEWNGKKQKDTSGEENTIAIPGFEKVTLYANETKQAVNFHNPEINDCYFKISLIHPDGSVLWISDLIEPGKGMYSIELEKTLAVGEYENAVLKYECFSLNDQSPLNGSEINLKLVVV >NZ_HG813249.1|WP_015454185.1|776162_776648_+|hypothetical-protein MNKLVLSTLSVAAMGMVFFSGGTAYAADKEGNTVVEYSVEGDYTLVVPEKVNLSNDNATEMSVKTINRNLEPGKEVEVTLSSGLSADGEIELQRVGATSDVITSSFKSNNSTVTMANPVIGSFSGYAIEETEVSKIQIGSPQGDKKAGAYQTTLTFTAAFK >NZ_HG813249.1|WP_031669159.1|776675_776981_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKRKLVLAMVLISFCGMFFLSPDRVQASQTVVEVLISEDDLDVSEENIQEIPKKELAASSDKDNKQHTLPKAGDTVTNYTLLGLVLILIWLIMQRKRKKKE >NZ_HG813249.1|WP_003733328.1|777056_777323_+|hypothetical-protein MARIEYGEEIQKSLLVLYSRGSTIDSICKEYGIPRYEFHKWMKLHDSDKLETKEVETFLQIRELKQQKNKLEEEILFLNEAINLLESP >NZ_HG813249.1|WP_003721256.1|777862_778147_+|DUF3130-domain-containing-protein MREIKVDERTFQQHATKLASESTGSYLPLKNGNMAYSRANSIDQLRSALIELVDVVEDFQHVTKKDASRLKKMGIAYAKQDQLMGQKINQLEVR >NZ_HG813249.1|WP_038409712.1|778147_778516_+|hypothetical-protein MDSAHSQLEQQLQQIKKAKITAETDVDQTRRKQNEQDWLEEDSNQLTQEKRVLLDFLRSGWQGEEASGFHRYLEEQQHEESHAWRRDLQDKRADLDTELQENKDKLHTLETKQATLQKEWSK >NZ_HG813249.1|WP_003721260.1|779910_780183_+|hypothetical-protein MTKKEQLYFLLNGLDNGEIEINNFTNQFMKIFDLEIDYDELSKEEYTILGNVSDMAARFSDSEEDLKLPNVYYSEKQIREEVTRSLEALA >NZ_HG813249.1|WP_003721261.1|780210_780558_+|hypothetical-protein MQKDTYNGIRLSVIQLIDSKKENLKENNIKLTIIKNEKDGYVVELDNDKCMAEIVVEEPTYAPYRYISFEVVSLMDGKVKIIYSWYDDETSQWSDIEKELNKGIQFLNNFKTMEQ >NZ_HG813249.1|WP_003733213.1|780961_781204_+|hypothetical-protein MKRIILTSTLIVWTIVCIYMSISMVSNNTGIAFPIWLHIILLICFLATSIVNVKKKEYLWSTMLFEGELVVLLSLIIVLV >NZ_HG813249.1|WP_031668867.1|781286_782264_-|HD-domain-containing-protein MKMTDPLYGTFEIEPVLAELIQSPLVSRLAHVHQGGSSYLVNPLWDLSRLDHSIGVMLFIRKFGGSLEEQIAGLLHDVSHTAFSHVVDYALDFEEEDYHEQIFEDFVKTSTIPAILEKYGYSFEGIFEDISKWEILEQEAPELCADRIDYTLQDLYRHGKISLAEVEGFLQALVMVNGRLYLANISSAEWFVKQYYSEVIDYFYDPLNVYSYEILAEAMRIAFQQETITTDDLRLTDAELLAKLNANSDAREKIQLLASPHLEENEVDFTYHHKKKMRLINPSVLVDGRLIPADELSEKVREMNDWASERSKHGIYIKATKKSKQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG813249_3 | 809631-809981 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of NZ_HG813249_3
|
5 spacers
spacers of NZ_HG813249_3
>3.1|809661|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT TGTCATCTGTGGTGTCTTCAACCACTTCTTCTAT >3.2|809725|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT CTGTAAAATCAAAAGTATCATAGAAACAATCTTC >3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT TCGCCATGACGAAATCTAGCGCTTGTCCTACTAA >3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT GCACAGTCTTCACGATTTCGGGGATGGGGAAAACT >3.5|809918|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT AAACAAGTGCTTCTGGCAATACCAACGTTCCATC >3.6|809660|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder TTGTCATCTGTGGTGTCTTCAACCACTTCTTCTAT >3.7|809724|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder TCTGTAAAATCAAAAGTATCATAGAAACAATCTTC >3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder TTCGCCATGACGAAATCTAGCGCTTGTCCTACTAA >3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder GGCACAGTCTTCACGATTTCGGGGATGGGGAAAACT >3.10|809917|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder TAAACAAGTGCTTCTGGCAATACCAACGTTCCATC |
cas6,cas8b2,cas7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_HG813249_3
The CRISPR arrays of NZ_HG813249_3 >merge|NZ_HG813249|3|809631-809981|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGTTACTTATTTTGAAATGTAAATTTGTCATCTGTGGTGTCTTCAACCACTTCTTCTATGTTTTAGTTACTTATTTTGAAATGTAAATTCTGTAAAATCAAAAGTATCATAGAAACAATCTTCGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATTTCGCCATGACGAAATCTAGCGCTTGTCCTACTAAGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATGGCACAGTCTTCACGATTTCGGGGATGGGGAAAACTGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATTAAACAAGTGCTTCTGGCAATACCAACGTTCCATCTTTTTAGTTACTTATTATGAAATGTAAATT >NZ_HG813249|3|2|809631-809981|PILER-CR GTTTTAGTTACTTATTTTGAAATGTAAATT TGTCATCTGTGGTGTCTTCAACCACTTCTTCTAT GTTTTAGTTACTTATTTTGAAATGTAAATT CTGTAAAATCAAAAGTATCATAGAAACAATCTTC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATT TCGCCATGACGAAATCTAGCGCTTGTCCTACTAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATG GCACAGTCTTCACGATTTCGGGGATGGGGAAAACT GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATT AAACAAGTGCTTCTGGCAATACCAACGTTCCATC TTTTTAGTTACTTATTATGAAATGTAAATT >NZ_HG813249|3|2|809631-809980|CRISPRCasFinder GTTTTAGTTACTTATTTTGAAATGTAAAT TTGTCATCTGTGGTGTCTTCAACCACTTCTTCTAT GTTTTAGTTACTTATTTTGAAATGTAAAT TCTGTAAAATCAAAAGTATCATAGAAACAATCTTC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTCGCCATGACGAAATCTAGCGCTTGTCCTACTAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT GGCACAGTCTTCACGATTTCGGGGATGGGGAAAACT GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TAAACAAGTGCTTCTGGCAATACCAACGTTCCATC TTTTTAGTTACTTATTATGAAATGTAAAT >NZ_HG813249|3|3|809631-809981|CRT GTTTTAGTTACTTATTTTGAAATGTAAATT TGTCATCTGTGGTGTCTTCAACCACTTCTTCTAT GTTTTAGTTACTTATTTTGAAATGTAAATT CTGTAAAATCAAAAGTATCATAGAAACAATCTTC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATT TCGCCATGACGAAATCTAGCGCTTGTCCTACTAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATG GCACAGTCTTCACGATTTCGGGGATGGGGAAAACT GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATT AAACAAGTGCTTCTGGCAATACCAACGTTCCATC TTTTTAGTTACTTATTATGAAATGTAAATT
>NZ_HG813249.1|WP_015454211.1|808457_809393_+|ribose-phosphate-pyrophosphokinase MAGKMKLFSVTSERPLATKIADYLDIPLCEVELQKFSDGEVKINIEESIRGTNAYVVQSMNSNVNERLMELLIMVDALKRASVHSINIIMPYYGYARQDRKARSREPITAKLMANLIQRAGANRLITVDLHAAQIQGFFNIPIDHLSAIPLIGDYLIENYGEKDVVVVAPDHSGVVRARRIADRLNAPIAILNRKPRPHEDEIMSVIGDVKGKVAIVVDDIIDTGVRATTSADILLEKGAIEVIACATHSVMAGNATERLQNSNIKEVITSDSIDLPEDKQFDKLTTISIGRILGRAIEGVQENRSLHPLF >NZ_HG813249.1|WP_003721294.1|807046_808318_+|PTS-galactitol-transporter-subunit-IIC MDIILDFFKYIIGLGVTVMMPIIITILGVIFRKKISVAFKAGLTVGVGFVGLGVITSLMLTTITPVTKALVENYNFKLTATDIGWGVGSSLAWGTEVVPFVFVAIIATNILMIAFKWTKTMDVDIWNYWQPLFIASALYLTTGSMIIAVLSSIINMAIIFKIADWTQKDVEDVLGLEGISLPQIQTTGWALVGYPMNWLLGKIPGVRKINWSTEKVQSRLGIFGEPMLMGLIIGGGLAAIAQMPLSQVLQTGVTIAASLVLIPRMVSLLMDGLTVISEAAHEFMEKRFPGRELFIGLDSAVGIGHPFVLSLGLLMIPITLILAFILPGNKVLPLADLTALPFYMIFAIVPSKGNLFRGIFTGIVIVIITLYLSGAAAPLMTELAGQIGYNIPKDAVEVTSLAVGTQWYTWIVYYGLHWFGGIL >NZ_HG813249.1|WP_003721293.1|806738_807032_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKKKRIYVCCGTGIATSTVISKKVRAVLDEKRIPYEISQCTVQEVASKVSTSKPDIIVSSTTVTGDVGDVPVVIGRSFLTGLKKQETIDEILAILQD >NZ_HG813249.1|WP_003721292.1|805676_806723_+|galactitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKALKLYGKRDLRYEEADMPTIEEPDDVILKVKTVGICGSDISRYSKLGPYVPGMVWGHEFSGEVIEVGSEVTDIEIGDRAAGCPALYCGECEYCKKGEFARCRKLTVIGARHPGAYAEYIKLPAENVVKIPDELDYEAAALVEPSAVVVHGFYHTKLQAGDDVVVVGSGNIGLLAIQWAKVFGARRVIAIDVDDKKLALAKEVGADVVINSLKEDPLEVVAAHTDGLNADLVVEAAGSPITSAQVFAYAKKGGGVVFLGIPYADVTIERFYFEKIVRSELTVWGSWNAISAPFPGKEWQTTIHFLANKQINIEPMITHRLSLAEGPEVFERIYERNEFFGKVLFFPE >NZ_HG813249.1|WP_003721291.1|805029_805680_+|ribulose-phosphate-3-epimerase MAKIVPSVFGADIGRINEQLQVLEKNDIDLLHVDMMDGSFVPNIAFGPDQIKMMKKGTKLQFDVHMMVYEPDRYIPRLVEAGAHMITVHQEATTHLHRTIQLIKSYGVRAGVVLNPGTPPSTLEYVLDDIDCILLMTVNPGLGGQKFFQSSLEKIRKTKAYIGNRPIQIEVDGGVNDELAKECTLAGADLIVVGSYLFEGDIEANLEKLAKGVLTE >NZ_HG813249.1|WP_003721290.1|804620_805019_+|hypothetical-protein MGSFFASFVDWLIGSPGRFVVNLIEDNMLIFMVVVMIYATTILYAKWTLAYYLPKKMSQLAEMKTWELDELYAAWQTEKKALPWYILVPSRNEFWVKSARNAPESTKLLHFSQQKLKLSDKEKLQKIIEIQS >NZ_HG813249.1|WP_003721289.1|804136_804604_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MDVLEYFKEEMVRFSNEQDKEKLLTEMAEQLCEVGAVKPSYKDAVIKREKVFPTGLLTAHAGVAIPHTDSEHVIRPVVAVRILKKPVSFIEMASDNEAIDVRIVFMMALRSADEQLDMLQTLIQLIQDEEVMTTLLKAQETGDVLSAIEHFSKNN >NZ_HG813249.1|WP_015454208.1|803506_804109_+|SIS-domain-containing-protein MDKKAILDNIHQTWQEEANAISRLPEVTSEEALVKTVEKIAECTGKIVVAGCGTSGVAAKKLVHSFNCIERPAVFLTPSDAVHGTLGVLQKEDILILISKGGNTGELLNLIPACKTKGSTLIGVTENPDSVIAKEADIFFPVSVSKEPDPFNMLATASTMAVIASFDAVIVCLMTYMNYTKEQFSVIHPGGAVGNKLLNK >NZ_HG813249.1|WP_010989498.1|801442_803503_+|BglG-family-transcription-antiterminator MYLDNRSKTLFQEVIKNPNITNKQLEVKYKLSRYQISYSFQKVNEWLKWKNYPEVKRSKNGRFILEPELTALFSEKETRDPSVEYLPSENERANLILLMLLTSKEELSLAHFTTKIQVSKNTILRDLKVAQKLLPKETTVTYSRASGYQLAGSEWELRKVLTQVVSSVKEMFRGEHYFLSYSGIEKVQLMEIRRTLEEAEAMMQIKFTYEQIELLPYLLSVMFLRIRDRRLIDTAFHIDEKSLSDTREYHITDILLEKTGPVPEQERLFITLQLLTTNIFSGEILTEKLTEDLEKVVLTCLDLFEKKALVSLKNKHILIEKLLLHLKPAYYRIKYQMNLEDTLYEKFNQEFEALNFIVKEAFDPLAKFIGREIPAGEIFFISLFIGSDMIPQNDIYHKQKRAIVLCPSGVTFSKIMENILVKLFPEIHFYPTISVREYAFFKAEVDIVFSSIPLKDGENVFVVQPFMNDIEKTQLRQHVLQNLFGMGNQLTSIDKIMEVVERNADIKDPNAIRDGIIDILSANIATDENKRVKKVYLHDLITEDNIMICEDVKNYQEAIRLASQPLLLQQAITANYVKTMIDNHKFHDPYIIIGEDIAIPHAMPNAGVNRLAMSLLVVKNGVYFSETEQVHFVIVIAPVDKEQHIEALYQIVHLAENHQILDDLLENVTKEKIMQTINQLVIREDE >NZ_HG813249.1|WP_031668874.1|800683_801334_+|transaldolase MHLDSANLDDVKKIQASSIFKGITTNPTILVKEKCNRQTAINRILELTDKQVFVQTVGFSYEEILADARMLLAMFGKEKIAIKIPAHEAGINVIDTLKKEDKTIQILGTAIYSADQAITAALAGADFVAPYVNRMSAANIDPFKEISQMRHFFDKKALKTQIMAASFKHSGQVMQAYESGADTVTIPYEIYSQMTNKVLAVEAIRVFNEDAVLYEK >NZ_HG813249.1|WP_009930754.1|810370_810949_+|hypothetical-protein MKKILVPILLLATILASCSSPNEKITKDTKISKTITIRADYKVPKDIKELEDDSANIVKVKFLQNKTIGKDGSTISEIEILTSYKGNLEKGSKVDISEPWYLSDGKYVAVENYIALDKEQEYTIFLGEKDKDTYPLSSLGYGKFGGSLKEDQAVLADFNILGEVQKFDFISENTEEVKNYQLIKEQVAGKYK >NZ_HG813249.1|WP_003733188.1|811055_811736_+|type-1-glutamine-amidotransferase MIIDVLQHVPHEGPGLIANWARENQHQLKIHSLFEENAHVPNDSDFLIVLGGPMGINDTAEFPWLKDERKLIKRLSEQHKPVFGVCLGAQQIAATFGSEITVNKEKEVGWFPVKRTSDKLSFFPESLNVFHWHQDTFALPAGATRLFASEGCLNQAFLYGENIIGLQFHFEMEKAGIETILQIDEAFITPGKYVQSVEVMQEKDVPEDNKQMLEAILDYLINPKTI >NZ_HG813249.1|WP_003721298.1|811760_812120_-|Lin0512-family-protein MEQILFIQTGFGVDVHGQNITKAAERAVRNAIFTNSMPGIQGLLPDGDLQNMVVNIKLALPCDADQLDEDTIRAIIPYGTVTIEKMAGGMMTTSGIFLEDKEDKNDLMYIVNASVETGY >NZ_HG813249.1|WP_009932856.1|812126_812585_-|MarR-family-transcriptional-regulator MNNEQNMNQQIALFYFGYKAFTETADLIIAKHSLKRLHHRILFFTARMPGLTINELLTFLEISKQALHQPLAELKERELLTIEQGRRDKRQRCIFLTSAGKELENELGAAQRKQMSEIFTNSADTDGMHFTEVMEGYAKNRPGAAFIKDFKE >NZ_HG813249.1|WP_003721301.1|814902_815334_+|universal-stress-protein MEKYHRILVAVDGSEPAKLAFEKGLELALKLDGVLGIASIVDLRAFSPNVSYDGSLEEKAELELKTSVNEYAEKARTAGVKQVETFVAKGNPKILLSTDIPAEFQADLIICGATGMNRVEKLVLGSVSSYIMAHAICDTLIAR >NZ_HG813249.1|WP_015454215.1|815380_816811_-|CapA-family-protein MKRRTYVIITGLVLVFIAGAFWITNSTNQSDQKATQTEPLKKTSPANVKTISSEAKKTLNSLASSGADKASISDLNQLIKEIKSYPTEKNDSGIYLQNLTACLEAVKSYTTGKTDEKTLGKVYPAFLASEQKLSAIEKTNQYDWFYAAAATNQQGLKEKGVVTLTMVGDNSFGTYPETPEHLKFDNVFQKNNGNNTYVYKNCLPWFKSDDYTVINAESAFTNATKAENKMWRIKSDPAHVAFLPASGVDAANLANNHTMDYFQVGYDDTLKAFKENNIPVFNADAPLETTIKGMKTVLLGYDCRMSQQSPAYLERIVKDVKKYKKEDTLVIVNMHWGVEYRETPTDYQTQFGHAILDAGADIIMGSHPHRLESVEKYKDKYIVYSMGDFAFGADPTLLSRMTSMFQLRFTKEDNKIVLKDISIVPTYENSDGSTTENNYQPLPVFGDDAKKIVDELNRISKPIEGGVTEYTYFDPF >NZ_HG813249.1|WP_015454216.1|816931_817747_-|histidine-phosphatase-family-protein MKKNIFKLLMALCAVLLIAGCGNSTSADKKETKETKEDGTVTFYVVRHGKTMLNTTDRVQGWSDAVLTPAGEEVVKSAGKGLKDVDFSAAYSSDSGRAIQTANLILKESDKSADKEVQTDPRFREFNFGSYEGDLNENMWTDIAKSQGKTLEEWQKAGLSPKDFANSVAALDKTRLKEGENWPAEDYATIQARLKEGLTDVAKKESKNGDSNVLLVSHGLSIGALLDTIEPGYKLPAEGIKNASVTKITYKDGKFTIGDVNDLSYVEKGSK >NZ_HG813249.1|WP_003721304.1|818098_818821_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLKINCDFDSKIISKDFQSKVVSLFKAGIMKSSPERYENLFGGNKHKQYTFSVYLPKPQNKGAEIQLNEANCIINFSTGDAETGIIFYNALMSLRGSKVLFGAGNHITVKNIQIVPEKKIIGKRTILRTLSPVVSRDHNRETFKNWFYSFEDEEFEPTLKRNMLPYLMDAFGEQARYDLEKLKITPISMKKVVVYCHEIHIESSVGIFELEAEAYLQKYLVENGIGTMTGSGFGMIEQF >NZ_HG813249.1|WP_003721305.1|818836_820525_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MRTEIEVRANDWLINAGLTGFLNIVGKENVRIDGQAIYFTADLLEDFETKYFNFFIQEYKETLSWYKIVSYKETMEQFRIDEFASFDEVALGNLNKYMKDVVKFYLKKANYIKVFPLIDPSANVTKWLEKLNTINLTKKQKWDEVKADIIEEVKQTYTQLDLIIDFCASEKGLQYLGAKNLIYSVINKGWSGVSFLLKQTKFIDPYLDYKTSFLDPVIDYLDTDLSKAKYNCFNCNQPIKNLKLDLSFMNDVGFDTARKTAHVWDFNNDVATCPICRLIYSCVPAGFTYVYGEGMFVNDSYGVEELHRVNERMRNSILRFNKDGINSTNTYRALVESITMEHENNRRYELADIQLVRYENEHYRFNLLSKKMLHIVNDSKGILKSLIRCGYKEGNLNVNLYKEVIQHLMNNENLFTLIHKLIYYKQTSVNGLYYNMGHVSGILDINTKFLKEMEVMTNISQNQLWFVQNCGKEFKEGYVKKKSENKISGITYKLLNSLKVNDKDGFMDTLLNSYSYLSMPIPDVFIKMFSNNEAFKSVGYAFMLGVGGEKTKKEDGGNTDEK >NZ_HG813249.1|WP_003721306.1|820514_821384_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKNKGLAMTIIFQAESANYGESLGNISSLKKISRNNGDQYTYISRQAIRYNLMDQIGEKEAPVKAEGGGDKKVIQFLSEATITDFPELDFFGYLKTEKGSGGQKRSAKVRLSNAISLETFKGDLDFLTNKGQADKLNENMNIAQAEIHKSYYRYTITIDLDQIGIDGEIALDNKEKARRVKKLMDTVAFLYRDIRGRREDLKPLFVIGGVYDVKNPVFQNIVDVADNNIVIKNIKDLLTYEDIKENTRVGIIDGQFANSDEVKVELKAESVPAFFNDIKGKIDAYYESN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_HG813249_4 | 825174-827484 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of NZ_HG813249_4
|
35 spacers
spacers of NZ_HG813249_4
>4.1|825203|36|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGACCTTCGATTTCATTCTCACTTTCCAGTTAAT >4.2|825268|36|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTTGTAGCGGAGGTGTACAATGCCGAAAGTGAC >4.3|825333|36|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTGGTAAATTTGGCGGAACTAATCGTACTGAAATA >4.4|825398|37|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATATTAGCCCTTATATAGAAGCCCCGCCCCTACCA >4.5|825464|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAGTCCCCATATCCATCTGCTATTATCCTCCAC >4.6|825528|36|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCTTCACGTTGGTTTTTCGTAGCCCAATTGCTAAA >4.7|825593|37|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGTTGGACAACGAGGTGAGTATGATATGACTCAAAT >4.8|825659|36|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGGAATGCGAAGTTGTTATATATAACTTATCTCGC >4.9|825724|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT TCTTAAATGGTGTTTGCACATGTTAAGGGAGTCATG >4.10|825789|49|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT GTGCATATGTAAATGTGCATATCTCCTATATTCATGGCTGTATATGTGT >4.11|825867|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTCCACATCGACAATAAAAAACACATTGTATCACTT >4.12|825932|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGGTTACTCAACTGGCGACAGTAATACACCTCAAT >4.13|825997|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTGGATAGGTTGTTTCTGATAAATAGGTTCACG >4.14|826060|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTCTACTTGGATTTAGCTCTACACCTGCAACATGA >4.15|826126|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGAAAAAAAACATCTTTCCAATTTGTTGTTTTGC >4.16|826189|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGAAGCGTTAGCGGCATTGTTCGAAAGTAATTTA >4.17|826252|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTTCGACGGCTTAGACAACCATCACGCTTCTTTA >4.18|826317|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATAAAATATTGCCCAATGTGCGGAAGGAGTTTGGA >4.19|826382|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTCATAAGGATTTCGAGGCGGGTTAAACGACATGTA >4.20|826447|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTTTTTTCAACAATTTTATCACCAGATGTCATTA >4.21|826511|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGAGCAGTGTCACCTGTTTCCGTATCTGCTTTTTTC >4.22|826576|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGAAATCCGGGAAGTTTTGTTCTACAGAGCGAACGG >4.23|826642|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTCAATAACTAGACGAGCTAACGTTTGTCGCTGTTT >4.24|826707|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTTATCTCCTGTGATGTAAAATAACCCTTCTATC >4.25|826771|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATACAAAATATTCATAACTCCTACATCATTATATA >4.26|826837|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGCAAACCTAACTTATCTTTGTTTTTTTGCTTTTC >4.27|826902|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGGATTTTATTAAATACAGAGTCACGGATTGTATTT >4.28|826968|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGAACAGGCGCGCGCTGGGATTTAAAAGCAGAAGGC >4.29|827033|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CACGTACTTTAATCGGCATCAAACCACCTCGATTTC >4.30|827098|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAGATATGCTAGAAATGGCGCAAATAGCGCGCG >4.31|827161|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGTTTGCGGTAGTTTTACCGGGCACGGTCAAATAT >4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAAACAGAGAACGCGTGTTCATTATCGGACATCTTA >4.33|827292|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTGAAATATGAGGACTTAGAAAATGAAAAAAAT >4.34|827356|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAACTATGCAATTAGCAAAGTGATTTTATGTAATT >4.35|827422|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT TAACGAGCCAATTAAACCATCTTCTTCTAGTAAT |
cas2,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_HG813249_4
The CRISPR arrays of NZ_HG813249_4 >merge|NZ_HG813249|4|825174-827484|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NZ_HG813249|4|3|825174-825723|PILER-CR GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT AAAGACCTTCGATTTCATTCTCACTTTCCAGTTAAT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTTTTTGTAGCGGAGGTGTACAATGCCGAAAGTGAC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT GCTGGTAAATTTGGCGGAACTAATCGTACTGAAATA GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ACATATTAGCCCTTATATAGAAGCCCCGCCCCTACCA GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TATAGTCCCCATATCCATCTGCTATTATCCTCCAC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT CGCTTCACGTTGGTTTTTCGTAGCCCAATTGCTAAA GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ACGTTGGACAACGAGGTGAGTATGATATGACTCAAAT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT GCGGAATGCGAAGTTGTTATATATAACTTATCTCGC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTCTTAAATGGTGTTTGCACATGTTAAGGGAGTCATGGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGTGCATATGTAAATGTGCATATCTCCTATATTCATGGCTGTATATGTGTGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT GTCCACATCGACAATAAAAAACACATTGTATCACTT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT CTGGTTACTCAACTGGCGACAGTAATACACCTCAAT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTTGGATAGGTTGTTTCTGATAAATAGGTTCACG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT AAGTCTACTTGGATTTAGCTCTACACCTGCAACATGA 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>NZ_HG813249.1|WP_003721310.1|824697_824976_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVILIYDISIENGGAKVWRNVFKICKKYLTHVQKSVFEGEITPALLVKLRMELDKYIRDDQDSVIVFSSRQQRWLEKEFWGLTDEKTSNFF >NZ_HG813249.1|WP_031668875.1|822211_824395_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MHKYLAKSNPEETIQEHTDNLLKNYQRLKKLYPAVEIDWYLLELVCLLHDLGKMNLLFQTKLGNASGKGKEIPHGYLSVAFVPDSKLEEMGYSEDEIKVVYQAIARHHERKYDFSDSEWKKEIIKLEEQWAGFIYSQLGGNAEYSSEVEMLYFYPGSRIFEGNSAADAETFKKYVLLKGLLNRIDFAASGGIDVELENDFLMDSMEVQLAHFKAENPEADWNALQKYMMQHQNENIVVIAETGMGKTEAGLLWLGNNKGFFTLPLRAAINAIYERITKNIVTTNQAERVGLLHSETYSQYLLHEGNAEMDIDEYYTRTRQMSLPITICTLDQLFDFVFRYAGFEHKLATLSYSKVIIDEIQMYSPDLLAYLILGLSYIDKFGGKFCIMTATLPGIVTDLLLENGVDFVQPEEKFVSSRIRHSMEMVHTEIESEFIKPFFNNNRILVICNTISKAKKIYSELKEHFQGEEIHLIHSQFIKRDRSAKEKAIFKDGQKDSTKKCIWVATQVVEASLDIDFDLLFTELSDVNGLFQRMGRCYRNRALDVDTNVYVFDGGAKVCSGIGTFIDKLIFVNSKTILNEHAGVLTEEKKMELVEQVYSTEALSGSEFYNDLIDKLNYVKAFESYLMNKADVRMRFRNINSVSVIPEEVWQDNAEEINSYFVTLRKTSKEISTKEKIIARTNLAEFMVSIPDYLYKKGESVVREINRYESVIEFKCGYSSDVGVFMR >NZ_HG813249.1|WP_003721307.1|821361_822144_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MLIMKAIRVRLWQDLVNFKKPTSFQLKETYPLPPYSTVIGMVHTLCGFTSYHEMKISIQGKYFSKVNDLATRYEFKNGMTYDASRHQIKVDKYGVSRGVSTVELLVDLELLLHIIPEDPSLVPIIEKAFREPIEFPSLGRREDIATIQKVEVVDVEKRQPKKSTEISDGYNAYVPISLTENNSVHFKSHESSVGRDKLLGTRYLLTEKYERVNHGTEKAPKFFRKWRKKDVIYSSRIFVSKKDVFFFDEDDYLVFIEEEE >NZ_HG813249.1|WP_003721306.1|820514_821384_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKNKGLAMTIIFQAESANYGESLGNISSLKKISRNNGDQYTYISRQAIRYNLMDQIGEKEAPVKAEGGGDKKVIQFLSEATITDFPELDFFGYLKTEKGSGGQKRSAKVRLSNAISLETFKGDLDFLTNKGQADKLNENMNIAQAEIHKSYYRYTITIDLDQIGIDGEIALDNKEKARRVKKLMDTVAFLYRDIRGRREDLKPLFVIGGVYDVKNPVFQNIVDVADNNIVIKNIKDLLTYEDIKENTRVGIIDGQFANSDEVKVELKAESVPAFFNDIKGKIDAYYESN >NZ_HG813249.1|WP_003721305.1|818836_820525_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MRTEIEVRANDWLINAGLTGFLNIVGKENVRIDGQAIYFTADLLEDFETKYFNFFIQEYKETLSWYKIVSYKETMEQFRIDEFASFDEVALGNLNKYMKDVVKFYLKKANYIKVFPLIDPSANVTKWLEKLNTINLTKKQKWDEVKADIIEEVKQTYTQLDLIIDFCASEKGLQYLGAKNLIYSVINKGWSGVSFLLKQTKFIDPYLDYKTSFLDPVIDYLDTDLSKAKYNCFNCNQPIKNLKLDLSFMNDVGFDTARKTAHVWDFNNDVATCPICRLIYSCVPAGFTYVYGEGMFVNDSYGVEELHRVNERMRNSILRFNKDGINSTNTYRALVESITMEHENNRRYELADIQLVRYENEHYRFNLLSKKMLHIVNDSKGILKSLIRCGYKEGNLNVNLYKEVIQHLMNNENLFTLIHKLIYYKQTSVNGLYYNMGHVSGILDINTKFLKEMEVMTNISQNQLWFVQNCGKEFKEGYVKKKSENKISGITYKLLNSLKVNDKDGFMDTLLNSYSYLSMPIPDVFIKMFSNNEAFKSVGYAFMLGVGGEKTKKEDGGNTDEK >NZ_HG813249.1|WP_003721304.1|818098_818821_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLKINCDFDSKIISKDFQSKVVSLFKAGIMKSSPERYENLFGGNKHKQYTFSVYLPKPQNKGAEIQLNEANCIINFSTGDAETGIIFYNALMSLRGSKVLFGAGNHITVKNIQIVPEKKIIGKRTILRTLSPVVSRDHNRETFKNWFYSFEDEEFEPTLKRNMLPYLMDAFGEQARYDLEKLKITPISMKKVVVYCHEIHIESSVGIFELEAEAYLQKYLVENGIGTMTGSGFGMIEQF >NZ_HG813249.1|WP_015454216.1|816931_817747_-|histidine-phosphatase-family-protein MKKNIFKLLMALCAVLLIAGCGNSTSADKKETKETKEDGTVTFYVVRHGKTMLNTTDRVQGWSDAVLTPAGEEVVKSAGKGLKDVDFSAAYSSDSGRAIQTANLILKESDKSADKEVQTDPRFREFNFGSYEGDLNENMWTDIAKSQGKTLEEWQKAGLSPKDFANSVAALDKTRLKEGENWPAEDYATIQARLKEGLTDVAKKESKNGDSNVLLVSHGLSIGALLDTIEPGYKLPAEGIKNASVTKITYKDGKFTIGDVNDLSYVEKGSK >NZ_HG813249.1|WP_015454215.1|815380_816811_-|CapA-family-protein MKRRTYVIITGLVLVFIAGAFWITNSTNQSDQKATQTEPLKKTSPANVKTISSEAKKTLNSLASSGADKASISDLNQLIKEIKSYPTEKNDSGIYLQNLTACLEAVKSYTTGKTDEKTLGKVYPAFLASEQKLSAIEKTNQYDWFYAAAATNQQGLKEKGVVTLTMVGDNSFGTYPETPEHLKFDNVFQKNNGNNTYVYKNCLPWFKSDDYTVINAESAFTNATKAENKMWRIKSDPAHVAFLPASGVDAANLANNHTMDYFQVGYDDTLKAFKENNIPVFNADAPLETTIKGMKTVLLGYDCRMSQQSPAYLERIVKDVKKYKKEDTLVIVNMHWGVEYRETPTDYQTQFGHAILDAGADIIMGSHPHRLESVEKYKDKYIVYSMGDFAFGADPTLLSRMTSMFQLRFTKEDNKIVLKDISIVPTYENSDGSTTENNYQPLPVFGDDAKKIVDELNRISKPIEGGVTEYTYFDPF >NZ_HG813249.1|WP_003721301.1|814902_815334_+|universal-stress-protein MEKYHRILVAVDGSEPAKLAFEKGLELALKLDGVLGIASIVDLRAFSPNVSYDGSLEEKAELELKTSVNEYAEKARTAGVKQVETFVAKGNPKILLSTDIPAEFQADLIICGATGMNRVEKLVLGSVSSYIMAHAICDTLIAR >NZ_HG813249.1|WP_009932856.1|812126_812585_-|MarR-family-transcriptional-regulator MNNEQNMNQQIALFYFGYKAFTETADLIIAKHSLKRLHHRILFFTARMPGLTINELLTFLEISKQALHQPLAELKERELLTIEQGRRDKRQRCIFLTSAGKELENELGAAQRKQMSEIFTNSADTDGMHFTEVMEGYAKNRPGAAFIKDFKE >NZ_HG813249.1|WP_003721311.1|827556_827925_-|DUF1304-domain-containing-protein MAILAFILTFIVMIEHIYIMILEMFFANTKLAAKTFGVEKELLANKKVQTLFANQGLYNGFLAAGLVWGLFFAGAGMAETVQIFFLSCVVVAALFGGATSSKGILVKQGLPAVLALVVVLLV >NZ_HG813249.1|WP_003733750.1|828071_829487_+|multidrug-efflux-MFS-transporter MQQEATGGQKIRPIPIIASFLMAGFIGLFSETALNMALSDLIQVFDISSATVQWLTTGYLLTLGILVPISGLLLQWFTTRGLFFTAVSFSIAGTLIAALSPTFAMLMIGRVVQAVGTALLLPLMFNTILLIFPEHKRGSAMGMIGLVIMFAPAVGPTISGLILENLTWNWIFWISLPFLIIALLFGMKFMQNVSVVTKPKIDILSIILSTLGFGGVVFAFSSAGESGWGSATVLVSIIVGGLALGLFVWRQLTMEKPLMDLKVFKYPMFTLGLILVFISFMMILSTMILLPLYLQNSLALAAFSAGLVLLPGGVLNGLMSPFTGRLFDAYGPRALVIPGFIVAVVALFFLTRIEVGTSALTIIVLHSVLMIGISMVMMPAQTNGLNQLPRKLYPDGTAIMNTLQQVSGAIGTAVAITIMSAGQKAYMETAQGVGPEQMVASLTAGIQNAFVFGLIMACIGLLCSLFIRKAK >NZ_HG813249.1|WP_003721314.1|829618_830623_+|ROK-family-transcriptional-regulator MAIPRDLKELNKKNIKSILRQQGAMTKAEIAEVTGLSVVTVNKLIRDLVENEEILEQDNSVATGGRRAVSYEINPNFQQVLVISLQEKWKKITYSFSVYNLLGEPEFVEDMSGEDLDITALKRNTKDIICAFPKISCVVIGVPGIEIGGKLRAMDFPLLLNVQLRETLEAEVNLPVLVETDTNAAILGYKNRPVKEENIVGLYYPERFPPGAGLLMNGEILKGQNGLAGEIKHMPLQVDWDNFDFSVDEIKAHIRKMVLLTMSFYDPETIVLYTNFYFGQKDFMEELKEELKQVYPYAVLPEIVLSRKFTTDYRIGLLAFGIDYLENNMTDWRI >NZ_HG813249.1|WP_003721315.1|830654_831971_-|6-phospho-beta-glucosidase MTKGIKIATIGGGSSYTPELIEGFIKRQDELPVRELWLVDVEAGREKLEIVGNLAKRMVKKAGVNMEIHLTLDREEALKDADFVTTQLRVGLLDARVKDERIPNSYGVVGQETNGPGGMFKGLRTIPVILDICKDMERLCPDAWLINFANPAGMVTEAVLRYSNQKKVVGLCNGPIGIERNIAETLGVDVSEIYVEFVGLNHMVFAKTVYHNGKDVTKDVVFKMTEDEAGSSLKNINATGWDKTFLRTLNMIPIDYLRYYWQTKQQLEDQARAYAEHGTRAEVVKKVEAELFELYKQEELAEKPKQLEQRGGAYYSEAACNLINSIYNDKRDIQIVNTRNNGAILDIDPDSAVETNCVITRQGPIPLASGRLPIAINGIIQEIKTFERLTAEAAVTGDYDKALLAMTINPLTPSESVAREMLDELLEAHKEYLPNFFK >NZ_HG813249.1|WP_003721316.1|832171_832924_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MLFLDKNLELNDTELDIYNYIVANLDKVVYMRIRDLATEAHVSTTTILRFCRKFGCNGFSEFRVKLQLYLEEQKLAQIDMADETTYIDFLKRTAQPEFKAQIQNAVEILRDRELVLFAGVGSSGVIAEYGAIYFSSLFTLALHIEDPLNHPFYHLSSKLSDKICMIAISVEGENEDIIRYIHQLKAQNCKVISITNSAKSTIARLSDANIAYYINKEMYQEANITSQLPALYTIENIAREIRTQLDKEKM >NZ_HG813249.1|WP_003721317.1|833029_833473_+|hypothetical-protein MYSNMKEKVVFTLIMCSLMILCMSSYNIFLENGIGTDSLLIVLKAFVPFLFIGFLLDFFVVGKIVYRLHALLVSEDASKFKKIIMMQLLMVTFMCVLMSTLSLIVNQGEWSHLGILILRNYFVALFLQIFIVSPFVRLISPRIFALL >NZ_HG813249.1|WP_003721318.1|833518_835180_-|SulP-family-inorganic-anion-transporter MFKHILLSLNGYKISYLRNDVISGVGVAALTIPVAMGYAQVAGLPPIYGLYASFLPVIAYVIFASSPQLIFGIDATASAITGSIILGTAGLAAGSKEAIALAPILAFFCAIFLVLFSVLKLGRFAKYISAPVLSGFISGLSVSIIMGQIPKIMGLKESGDSFFSSLGIIFGQFFQSNWISFAMGVVTVIIVITCKKVIPKIPMSLVVLVLGTMAAYFFKLDQYNVDIVGKIPVGFPSLALPDFGASSWALAIGGGLVCAIATFAGSLLPSESFAMRNKYTIDDNRELFAYGVSNFVAAFSGCSPASASVSRTAANEQFRGKTQMVSIVAATIIALIVAFLSGLLYYMPQPVLSGIVFAALVGIIDVDVLKGLFKVSRREATVWIVAALGTLLVGVIFGVLLGIFLSFINVVSRSMKTPIAILGVIEGRHGYFDLKRKSEAKPIPNVVIYRYSASLFFGNFNKFADGLKEAVQDDTKLVIFEASAIINIDTTATESMKDLLKWLDDKGIEYYFADLIDHLKTSFRKHDLGYLIDNGYTKKTVEDALDAYYAEHK >NZ_HG813249.1|WP_015454222.1|835435_836767_+|DUF1254-domain-containing-protein MATQKNLVDLATKAYIYGFPFIFNTQQIERYVTVGIGGTKQVPFNNFTHASRLAEPSDKFVSVNNDTIYSNAPIDVSAGPVVLSVPDTSGRYYVLQFVDAWSNNFAYVGKRATGTSAGKFLLTPPNWNGDVPADMIEIKFPTNIGIIIGRLACDGEADLPTVRELQEQLKITPLNEGKEVDGFPEYDRSLGKELAFFEQLRVYMAQFPPAERDLVKQESFAPIGLMEKGVSPYSNPSEELKNALKEGAKAGLANIKKATTNFKSENGWGLTQHLFDYNADFFEIGTKKSLDWVIEDREEAYIIRAVSAITALWGNHGYEAVYLMTWTDTDGNALNGKNKYTLELNPIPPVDSFWSITMYDLPEYFLCENPINRYSIGDRTPGIQYNDDGGITIVVSKDEPTDPKERANWLPAPDAEFRPMFRLYNPQQPLVDGSYHFPGFEKK >NZ_HG813249.1|WP_003721320.1|836811_837552_-|MerR-family-transcriptional-regulator MQIKELAELTGVSVRTLHHYDKIGLLVPQKDDWNGYRIYSEKDVDKLQQILFFKELDFPLKKIQQILDDPLFDKNVALDMQRHLLIEKKQRIETMLATLDLTIKNEKGEITMTNKEKFTGFDFSSNPYEEEARKLWGDKVVEKANEKVNNMSEKEQLTLKESFDAEFRHLASVRKLTPESEEAQLEIDHFFHYLNDTHGNIYSLEAFASLGEMYVNDERFTKNIDQFGDGLSQFLQEAMTIYAKNK >NZ_HG813249.1|WP_003721321.1|837781_839257_+|membrane-protein MIRKVKSISMWLWHHLTPQIFAVICVFIITIIALFMPPYIGMADNGDFFRIFSSNGLFVNNTNYDALQFGHFVKEFGIYQYFNENQVAIYSSQSIFIQMALLLNKLFWSTTVFDVRFLGGLQLALLLPAIYLLVAGLTAKMKGWPGYVVAALTVFIFADTAYTAYFNSFFSEGLILIMMLYISAGFLLLYQHKYNDYAMLGLIFVASLILITAKQQNAPIAVVIAVCGILVFFIRKNRAFRISAAATFLVIFLSGVVMYAFIPGEFVTINQYQTMTRGVLLDSENPEKSLEEMGMNSEFALLKGTNFYQKYKMIDLDSKLMEKEFYPNYNFVTVLSYYLENPKQFGKMLDLSAQNSFSIRPFEMGNFEKATGYKFKEKTHFFSAYSDVKEKFAPAKFTFLILWALVFLICYGVSAFKHFREKNIRGTLLFDLIVLLIGSGFAVILVTIVGDGEADLTKHNFLFNVCFDLTMLIGAASLLEVYLKKRGERNA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG813249_3 | 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809789-809822 | 34 | NZ_HG813249.1 | 1735051-1735084 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_3 | 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809788-809822 | 35 | NZ_HG813249.1 | 1735051-1735085 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_4 | 4.12|825932|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 825932-825967 | 36 | NZ_HG813249.1 | 1733355-1733390 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_4 | 4.16|826189|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 826189-826222 | 34 | NZ_HG813249.1 | 1733964-1733997 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_4 | 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827226-827262 | 37 | NZ_HG813249.1 | 1850997-1851033 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_3 | 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809853-809887 | 35 | NZ_HG813249.1 | 1735586-1735620 | 1 | 0.971 |
NZ_HG813249_3 | 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809852-809887 | 36 | NZ_HG813249.1 | 1735585-1735620 | 1 | 0.972 |
NZ_HG813249_1 | 1.5|349|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 349-378 | 30 | NZ_HG813249.1 | 1558002-1558031 | 2 | 0.933 |
NZ_HG813249_3 | 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809789-809822 | 34 | NZ_HG813249.1 | 1561029-1561062 | 2 | 0.941 |
NZ_HG813249_3 | 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809788-809822 | 35 | NZ_HG813249.1 | 1561029-1561063 | 2 | 0.943 |
1. spacer 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to position: 1735051-1735084, mismatch: 0, identity: 1.0
tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa Protospacer **********************************
2. spacer 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to position: 1735051-1735085, mismatch: 0, identity: 1.0
ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa Protospacer ***********************************
3. spacer 4.12|825932|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 1733355-1733390, mismatch: 0, identity: 1.0
ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat CRISPR spacer ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat Protospacer ************************************
4. spacer 4.16|826189|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 1733964-1733997, mismatch: 0, identity: 1.0
agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta CRISPR spacer agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta Protospacer **********************************
5. spacer 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 1850997-1851033, mismatch: 0, identity: 1.0
caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta CRISPR spacer caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta Protospacer *************************************
6. spacer 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to position: 1735586-1735620, mismatch: 1, identity: 0.971
gcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer gcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaact Protospacer *******************.***************
7. spacer 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to position: 1735585-1735620, mismatch: 1, identity: 0.972
ggcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer ggcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaact Protospacer ********************.***************
8. spacer 1.5|349|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1558002-1558031, mismatch: 2, identity: 0.933
tcattgtttatcttctcccaaataaaatca CRISPR spacer tcattatttattttctcccaaataaaatca Protospacer *****.*****.******************
9. spacer 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to position: 1561029-1561062, mismatch: 2, identity: 0.941
tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer tcgtcatgacgaaatctagcgcttgtccaactaa Protospacer ***.************************ *****
10. spacer 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to position: 1561029-1561063, mismatch: 2, identity: 0.943
ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer ttcgtcatgacgaaatctagcgcttgtccaactaa Protospacer ****.************************ *****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | NC_042048 | Listeria phage LMTA-34, complete genome | 74603-74632 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | NC_024360 | Listeria phage LMSP-25, complete genome | 74603-74632 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | NZ_CP011399 | Listeria monocytogenes strain CFSAN008100 plasmid pCFSAN008100, complete sequence | 4400-4429 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | FW590615 | JP 2010534058-A/25: ANTIBIOTIC RESISTANCE FREE LISTERIA STRAINS AND METHODS FOR CONSTRUCTING AND USING SAME | 2528-2557 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | HI504184 | Sequence 26 from Patent EP2147092 | 2528-2557 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | AJ417489 | bacteriophage U153 int gene for U153 integrase | 2528-2557 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | KJ094022 | Listeria phage LP-030-3, complete genome | 30296-30325 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | AJ312240 | Bacteriophage PSA complete genome | 18523-18552 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_1 | 1.5|349|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 349-378 | 30 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 225302-225331 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_1 | 1.5|349|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 349-378 | 30 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 15775-15804 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_3 | 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809789-809822 | 34 | MT500540 | Listeria phage LP-HM00113468, complete genome | 26210-26243 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_3 | 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809788-809822 | 35 | MT500540 | Listeria phage LP-HM00113468, complete genome | 26209-26243 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_4 | 4.12|825932|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 825932-825967 | 36 | NC_003216 | Listeria phage A118, complete genome | 18563-18598 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_4 | 4.12|825932|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 825932-825967 | 36 | AJ242593 | Bacteriophage A118 complete genome | 18563-18598 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_4 | 4.16|826189|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 826189-826222 | 34 | NC_003216 | Listeria phage A118, complete genome | 19172-19205 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_4 | 4.16|826189|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 826189-826222 | 34 | AJ242593 | Bacteriophage A118 complete genome | 19172-19205 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_4 | 4.29|827033|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827033-827068 | 36 | KP399678 | Listeria phage vB_LmoS_293, complete genome | 6980-7015 | 0 | 1.0 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | MN172529 | Listeria phage LP-039, complete genome | 59048-59077 | 1 | 0.967 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | MT178766 | Listeria virus P100plus, complete genome | 26020-26049 | 1 | 0.967 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | NC_025440 | Listeria phage WIL-1, complete genome | 106789-106818 | 1 | 0.967 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | NC_047872 | Listeria phage LMTA-94, complete genome | 72338-72367 | 1 | 0.967 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | MT178767 | Listeria virus P200, complete genome | 26020-26049 | 1 | 0.967 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | DQ004855 | Listeria bacteriophage P100, complete genome | 26019-26048 | 1 | 0.967 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | KJ591605 | Listeria phage LMTA-57, complete genome | 83087-83116 | 1 | 0.967 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | KJ094033 | Listeria phage LP-048, complete genome | 61505-61534 | 1 | 0.967 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | KJ668715 | Listeria phage LMTA-34, partial genome | 59201-59230 | 1 | 0.967 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | MN128594 | Listeria phage LP-066, complete genome | 60544-60573 | 1 | 0.967 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | KJ094030 | Listeria phage LP-083-2, complete genome | 65710-65739 | 1 | 0.967 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | KJ094031 | Listeria phage LP-124, complete genome | 27825-27854 | 1 | 0.967 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | NC_021539 | Listeria phage LP-030-2, complete genome | 18331-18360 | 1 | 0.967 |
NZ_HG813249_3 | 3.2|809725|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809725-809758 | 34 | DQ003642 | Listeria phage A006, complete genome | 5993-6026 | 1 | 0.971 |
NZ_HG813249_3 | 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809789-809822 | 34 | NC_003216 | Listeria phage A118, complete genome | 20259-20292 | 1 | 0.971 |
NZ_HG813249_3 | 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809789-809822 | 34 | AJ242593 | Bacteriophage A118 complete genome | 20259-20292 | 1 | 0.971 |
NZ_HG813249_3 | 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809789-809822 | 34 | X85008 | Bacteriophage A118 hol118 and ply118 genes | 507-540 | 1 | 0.971 |
NZ_HG813249_3 | 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809853-809887 | 35 | DQ003642 | Listeria phage A006, complete genome | 19079-19113 | 1 | 0.971 |
NZ_HG813249_3 | 3.7|809724|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809724-809758 | 35 | DQ003642 | Listeria phage A006, complete genome | 5993-6027 | 1 | 0.971 |
NZ_HG813249_3 | 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809788-809822 | 35 | NC_003216 | Listeria phage A118, complete genome | 20259-20293 | 1 | 0.971 |
NZ_HG813249_3 | 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809788-809822 | 35 | AJ242593 | Bacteriophage A118 complete genome | 20259-20293 | 1 | 0.971 |
NZ_HG813249_3 | 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809788-809822 | 35 | X85008 | Bacteriophage A118 hol118 and ply118 genes | 507-541 | 1 | 0.971 |
NZ_HG813249_3 | 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809852-809887 | 36 | DQ003642 | Listeria phage A006, complete genome | 19078-19113 | 1 | 0.972 |
NZ_HG813249_4 | 4.6|825528|36|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 825528-825563 | 36 | NZ_CP011399 | Listeria monocytogenes strain CFSAN008100 plasmid pCFSAN008100, complete sequence | 60125-60160 | 1 | 0.972 |
NZ_HG813249_4 | 4.6|825528|36|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 825528-825563 | 36 | NC_009812 | Listeria phage B025, complete genome | 27503-27538 | 1 | 0.972 |
NZ_HG813249_4 | 4.29|827033|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827033-827068 | 36 | NC_003216 | Listeria phage A118, complete genome | 6982-7017 | 1 | 0.972 |
NZ_HG813249_4 | 4.29|827033|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827033-827068 | 36 | AJ242593 | Bacteriophage A118 complete genome | 6982-7017 | 1 | 0.972 |
NZ_HG813249_4 | 4.29|827033|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827033-827068 | 36 | MH341452 | Listeria phage PSU-VKH-LP040, complete genome | 6993-7028 | 1 | 0.972 |
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NZ_HG813249_4 | 4.31|827161|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827161-827196 | 36 | AJ312240 | Bacteriophage PSA complete genome | 14022-14057 | 1 | 0.972 |
NZ_HG813249_4 | 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827226-827262 | 37 | KY705255 | Streptococcus phage P0095, complete genome | 33666-33702 | 1 | 0.973 |
NZ_HG813249_4 | 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827226-827262 | 37 | KY705251 | Streptococcus phage P0091, complete genome | 32778-32814 | 1 | 0.973 |
NZ_HG813249_4 | 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827226-827262 | 37 | KX879643 | Streptococcus phage CHPC1151, complete genome | 31697-31733 | 1 | 0.973 |
NZ_HG813249_4 | 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827226-827262 | 37 | MK202161 | Streptococcus phage CHPC1282, complete genome | 32484-32520 | 1 | 0.973 |
NZ_HG813249_4 | 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827226-827262 | 37 | KY705252 | Streptococcus phage P0092, complete genome | 31845-31881 | 1 | 0.973 |
NZ_HG813249_4 | 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827226-827262 | 37 | MH937506 | Streptococcus phage CHPC1148, complete genome | 35552-35588 | 1 | 0.973 |
NZ_HG813249_4 | 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827226-827262 | 37 | KY705253 | Streptococcus phage P0093, complete genome | 32631-32667 | 1 | 0.973 |
NZ_HG813249_4 | 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827226-827262 | 37 | KY705254 | Streptococcus phage P0094, complete genome | 31034-31070 | 1 | 0.973 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | MT438761 | Listeria virus P61, complete genome | 70795-70824 | 2 | 0.933 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | MT668624 | Listeria phage LP-Mix_6.2, complete genome | 60394-60423 | 2 | 0.933 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | DQ003638 | Listeria phage A511, complete genome | 59585-59614 | 2 | 0.933 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | KJ591604 | Listeria phage LMTA-148, complete genome | 66986-67015 | 2 | 0.933 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | MK792752 | UNVERIFIED: Listera phage vB-LmoM-SH3-3, complete genome | 80589-80618 | 2 | 0.933 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | NC_041862 | Listeria phage LP-064, complete genome | 69005-69034 | 2 | 0.933 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | JX126918 | Listeria phage LP-125, complete genome | 69007-69036 | 2 | 0.933 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | JQ797329 | Listeria phage vB_LmoM_AG20, complete genome | 58894-58923 | 2 | 0.933 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | KJ535721 | Listeria phage List-36, complete genome | 69453-69482 | 2 | 0.933 |
NZ_HG813249_1 | 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151-180 | 30 | FJ147490 | Listeria phage 20422-1 unknown genes | 607-636 | 2 | 0.933 |
NZ_HG813249_3 | 3.2|809725|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809725-809758 | 34 | MH341451 | Listeria phage PSU-VKH-LP019, complete genome | 5984-6017 | 2 | 0.941 |
NZ_HG813249_3 | 3.2|809725|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809725-809758 | 34 | KP399677 | Listeria phage vB_LmoS_188, complete genome | 5993-6026 | 2 | 0.941 |
NZ_HG813249_3 | 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809853-809887 | 35 | NC_003216 | Listeria phage A118, complete genome | 20794-20828 | 2 | 0.943 |
NZ_HG813249_3 | 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809853-809887 | 35 | AJ242593 | Bacteriophage A118 complete genome | 20794-20828 | 2 | 0.943 |
NZ_HG813249_3 | 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809853-809887 | 35 | X85008 | Bacteriophage A118 hol118 and ply118 genes | 1042-1076 | 2 | 0.943 |
NZ_HG813249_3 | 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809853-809887 | 35 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 19818-19852 | 2 | 0.943 |
NZ_HG813249_3 | 3.7|809724|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809724-809758 | 35 | MH341451 | Listeria phage PSU-VKH-LP019, complete genome | 5984-6018 | 2 | 0.943 |
NZ_HG813249_3 | 3.7|809724|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809724-809758 | 35 | KP399677 | Listeria phage vB_LmoS_188, complete genome | 5993-6027 | 2 | 0.943 |
NZ_HG813249_3 | 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809852-809887 | 36 | NC_003216 | Listeria phage A118, complete genome | 20793-20828 | 2 | 0.944 |
NZ_HG813249_3 | 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809852-809887 | 36 | AJ242593 | Bacteriophage A118 complete genome | 20793-20828 | 2 | 0.944 |
NZ_HG813249_3 | 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809852-809887 | 36 | X85008 | Bacteriophage A118 hol118 and ply118 genes | 1041-1076 | 2 | 0.944 |
NZ_HG813249_3 | 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809852-809887 | 36 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 19817-19852 | 2 | 0.944 |
NZ_HG813249_4 | 4.6|825528|36|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 825528-825563 | 36 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 27001-27036 | 2 | 0.944 |
NZ_HG813249_4 | 4.11|825867|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 825867-825902 | 36 | MH341453 | Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome | 26132-26167 | 2 | 0.944 |
NZ_HG813249_4 | 4.17|826252|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 826252-826287 | 36 | KJ094022 | Listeria phage LP-030-3, complete genome | 38302-38337 | 2 | 0.944 |
NZ_HG813249_4 | 4.19|826382|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 826382-826417 | 36 | KP399678 | Listeria phage vB_LmoS_293, complete genome | 1049-1084 | 2 | 0.944 |
NZ_HG813249_4 | 4.29|827033|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827033-827068 | 36 | DQ003637 | Listeria phage A500, complete genome | 6959-6994 | 2 | 0.944 |
NZ_HG813249_4 | 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827226-827262 | 37 | MN689509 | Lactococcus phage CHPC1175, complete genome | 29544-29580 | 2 | 0.946 |
NZ_HG813249_4 | 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827226-827262 | 37 | MK448735 | Streptococcus phage Javan349, complete genome | 11483-11519 | 2 | 0.946 |
NZ_HG813249_1 | 1.5|349|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 349-378 | 30 | MT500540 | Listeria phage LP-HM00113468, complete genome | 29150-29179 | 3 | 0.9 |
NZ_HG813249_4 | 4.1|825203|36|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 825203-825238 | 36 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 228347-228382 | 3 | 0.917 |
NZ_HG813249_4 | 4.18|826317|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 826317-826352 | 36 | MH341453 | Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome | 41996-42031 | 3 | 0.917 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | NZ_CP026684 | Nostoc sp. 'Peltigera membranacea cyanobiont' N6 plasmid pNPM2, complete sequence | 95843-95872 | 5 | 0.833 |
NZ_HG813249_4 | 4.18|826317|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 826317-826352 | 36 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 32760-32795 | 5 | 0.861 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | KT207918 | Bacillus phage Eyuki, complete genome | 116456-116485 | 6 | 0.8 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | NC_031054 | Bacillus phage DirtyBetty, complete genome | 116445-116474 | 6 | 0.8 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | NZ_CP031070 | Bacillus sp. JAS24-2 plasmid pl278, complete sequence | 44141-44170 | 6 | 0.8 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | MH538193 | Bacillus phage Saddex, complete genome | 117316-117345 | 6 | 0.8 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | MF288919 | Bacillus phage AaronPhadgers, complete genome | 115968-115997 | 6 | 0.8 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | MG763894 | Bacillus phage HonestAbe, complete genome | 116215-116244 | 6 | 0.8 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | NC_031116 | Bacillus phage Zuko, complete genome | 117017-117046 | 6 | 0.8 |
NZ_HG813249_4 | 4.15|826126|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 826126-826159 | 34 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 1764851-1764884 | 6 | 0.824 |
NZ_HG813249_4 | 4.29|827033|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827033-827068 | 36 | KJ094022 | Listeria phage LP-030-3, complete genome | 15373-15408 | 6 | 0.833 |
NZ_HG813249_4 | 4.33|827292|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827292-827326 | 35 | MN694189 | Marine virus AFVG_250M578, complete genome | 47879-47913 | 6 | 0.829 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | KX961629 | Bacillus phage BJ4, complete genome | 115259-115288 | 7 | 0.767 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | NC_031070 | Bacillus phage Nemo, complete genome | 116990-117019 | 7 | 0.767 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | MF288920 | Bacillus phage Zainny, complete genome | 116438-116467 | 7 | 0.767 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | KJ489399 | Bacillus phage Hakuna, complete genome | 114490-114519 | 7 | 0.767 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | NC_031027 | Bacillus phage SageFayge, complete genome | 115953-115982 | 7 | 0.767 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | KX349902 | Bacillus phage Kida, complete genome | 116180-116209 | 7 | 0.767 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | KX156152 | Bacillus phage Smudge, complete genome | 116059-116088 | 7 | 0.767 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | KJ489401 | Bacillus phage Megatron, complete genome | 115838-115867 | 7 | 0.767 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | MN038179 | Bacillus phage ALPS, complete genome | 116242-116271 | 7 | 0.767 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | MH638311 | Bacillus phage OmnioDeoPrimus, complete genome | 115905-115934 | 7 | 0.767 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | MF288918 | Bacillus phage Bubs, complete genome | 117020-117049 | 7 | 0.767 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | KX961632 | Bacillus phage SBP8a, complete genome | 115649-115678 | 7 | 0.767 |
NZ_HG813249_1 | 1.5|349|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 349-378 | 30 | MG592459 | Vibrio phage 1.084.O._10N.261.49.F5, partial genome | 30611-30640 | 7 | 0.767 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | NZ_CP016726 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC08 plasmid pUC08A, complete sequence | 53675-53704 | 8 | 0.733 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | NZ_CP023393 | Lactococcus raffinolactis strain WiKim0068 plasmid pWiKim0068-1, complete sequence | 30092-30121 | 8 | 0.733 |
NZ_HG813249_1 | 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 217-246 | 30 | NZ_CP034167 | Escherichia albertii strain 2014C-4015 plasmid p2014C-4015-3, complete sequence | 117743-117772 | 9 | 0.7 |
NZ_HG813249_3 | 3.7|809724|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder | 809724-809758 | 35 | NZ_CP045351 | Vibrio sp. THAF100 plasmid pTHAF100_a, complete sequence | 1102881-1102915 | 9 | 0.743 |
NZ_HG813249_4 | 4.15|826126|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 826126-826159 | 34 | NZ_CP038863 | Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence | 39302-39335 | 9 | 0.735 |
NZ_HG813249_4 | 4.20|826447|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 826447-826481 | 35 | NC_014533 | Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence | 491525-491559 | 9 | 0.743 |
NZ_HG813249_4 | 4.33|827292|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827292-827326 | 35 | MK448625 | Streptococcus satellite phage Javan738, complete genome | 5960-5994 | 9 | 0.743 |
NZ_HG813249_4 | 4.33|827292|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827292-827326 | 35 | MK448449 | Streptococcus satellite phage Javan356, complete genome | 4490-4524 | 9 | 0.743 |
NZ_HG813249_4 | 4.33|827292|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827292-827326 | 35 | MK448636 | Streptococcus satellite phage Javan749, complete genome | 6112-6146 | 9 | 0.743 |
NZ_HG813249_4 | 4.33|827292|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827292-827326 | 35 | NZ_CP045037 | Lactobacillus mali strain LM596 plasmid unnamed2, complete sequence | 34734-34768 | 9 | 0.743 |
NZ_HG813249_4 | 4.33|827292|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827292-827326 | 35 | NZ_CP018177 | Lactobacillus hordei strain TMW 1.1822 plasmid pL11822-1, complete sequence | 11325-11359 | 9 | 0.743 |
NZ_HG813249_4 | 4.33|827292|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827292-827326 | 35 | NZ_CP018181 | Lactobacillus nagelii strain TMW 1.1827 plasmid pL11827-1, complete sequence | 63608-63642 | 9 | 0.743 |
NZ_HG813249_3 | 3.2|809725|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT | 809725-809758 | 34 | MK044828 | Streptococcus phage 33888, complete genome | 5436-5469 | 10 | 0.706 |
NZ_HG813249_4 | 4.30|827098|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 827098-827131 | 34 | NZ_CP034816 | Paracoccus sp. Arc7-R13 plasmid unnamed6, complete sequence | 26153-26186 | 11 | 0.676 |
1. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_042048 (Listeria phage LMTA-34, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_024360 (Listeria phage LMSP-25, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtatacaggttaggaagtaaactccttgta CRISPR spacer gtatacaggttaggaagtaaactccttgta Protospacer ******************************
3. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011399 (Listeria monocytogenes strain CFSAN008100 plasmid pCFSAN008100, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer cttaaagttgtcaacttctattttttatat Protospacer ******************************
4. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FW590615 (JP 2010534058-A/25: ANTIBIOTIC RESISTANCE FREE LISTERIA STRAINS AND METHODS FOR CONSTRUCTING AND USING SAME) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer cttaaagttgtcaacttctattttttatat Protospacer ******************************
5. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HI504184 (Sequence 26 from Patent EP2147092) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer cttaaagttgtcaacttctattttttatat Protospacer ******************************
6. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AJ417489 (bacteriophage U153 int gene for U153 integrase) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094022 (Listeria phage LP-030-3, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer cttaaagttgtcaacttctattttttatat Protospacer ******************************
8. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AJ312240 (Bacteriophage PSA complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer cttaaagttgtcaacttctattttttatat Protospacer ******************************
9. spacer 1.5|349|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcattgtttatcttctcccaaataaaatca CRISPR spacer tcattgtttatcttctcccaaataaaatca Protospacer ******************************
10. spacer 1.5|349|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcattgtttatcttctcccaaataaaatca CRISPR spacer tcattgtttatcttctcccaaataaaatca Protospacer ******************************
11. spacer 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to MT500540 (Listeria phage LP-HM00113468, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa Protospacer **********************************
12. spacer 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to MT500540 (Listeria phage LP-HM00113468, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa Protospacer ***********************************
13. spacer 4.12|825932|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_003216 (Listeria phage A118, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat CRISPR spacer ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat Protospacer ************************************
14. spacer 4.12|825932|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AJ242593 (Bacteriophage A118 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat CRISPR spacer ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat Protospacer ************************************
15. spacer 4.16|826189|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_003216 (Listeria phage A118, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta CRISPR spacer agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta Protospacer **********************************
16. spacer 4.16|826189|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AJ242593 (Bacteriophage A118 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta CRISPR spacer agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta Protospacer **********************************
17. spacer 4.29|827033|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KP399678 (Listeria phage vB_LmoS_293, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cacgtactttaatcggcatcaaaccacctcgatttc CRISPR spacer cacgtactttaatcggcatcaaaccacctcgatttc Protospacer ************************************
18. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN172529 (Listeria phage LP-039, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
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19. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT178766 (Listeria virus P100plus, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
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20. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_025440 (Listeria phage WIL-1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
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21. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047872 (Listeria phage LMTA-94, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
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22. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT178767 (Listeria virus P200, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
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23. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to DQ004855 (Listeria bacteriophage P100, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
gtatacaggttaggaagtaaactccttgta CRISPR spacer gtatataggttaggaagtaaactccttgta Protospacer *****.************************
24. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ591605 (Listeria phage LMTA-57, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
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25. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094033 (Listeria phage LP-048, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
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26. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ668715 (Listeria phage LMTA-34, partial genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
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27. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN128594 (Listeria phage LP-066, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
gtatacaggttaggaagtaaactccttgta CRISPR spacer gtatataggttaggaagtaaactccttgta Protospacer *****.************************
28. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094030 (Listeria phage LP-083-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
gtatacaggttaggaagtaaactccttgta CRISPR spacer gtatataggttaggaagtaaactccttgta Protospacer *****.************************
29. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094031 (Listeria phage LP-124, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
gtatacaggttaggaagtaaactccttgta CRISPR spacer gtatataggttaggaagtaaactccttgta Protospacer *****.************************
30. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021539 (Listeria phage LP-030-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
cttaaagttgtcaacttctattttttatat- CRISPR spacer cttaaagttgtcaacttcta-tttttatata Protospacer ******************** *********
31. spacer 3.2|809725|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to DQ003642 (Listeria phage A006, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgtaaaatcaaaagtatcatagaaacaatcttc CRISPR spacer ctgtaaaatcaaaagtatcatagaaacgatcttc Protospacer ***************************.******
32. spacer 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to NC_003216 (Listeria phage A118, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctaccaa Protospacer *******************************.**
33. spacer 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to AJ242593 (Bacteriophage A118 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctaccaa Protospacer *******************************.**
34. spacer 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to X85008 (Bacteriophage A118 hol118 and ply118 genes) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctaccaa Protospacer *******************************.**
35. spacer 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to DQ003642 (Listeria phage A006, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer gcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaacg Protospacer **********************************
36. spacer 3.7|809724|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to DQ003642 (Listeria phage A006, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tctgtaaaatcaaaagtatcatagaaacaatcttc CRISPR spacer tctgtaaaatcaaaagtatcatagaaacgatcttc Protospacer ****************************.******
37. spacer 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to NC_003216 (Listeria phage A118, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctaccaa Protospacer ********************************.**
38. spacer 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to AJ242593 (Bacteriophage A118 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctaccaa Protospacer ********************************.**
39. spacer 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to X85008 (Bacteriophage A118 hol118 and ply118 genes) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctaccaa Protospacer ********************************.**
40. spacer 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to DQ003642 (Listeria phage A006, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ggcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer ggcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaacg Protospacer ***********************************
41. spacer 4.6|825528|36|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011399 (Listeria monocytogenes strain CFSAN008100 plasmid pCFSAN008100, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
cgcttcacgttggtttttcgtagcccaattgctaaa CRISPR spacer cgcttcacgttgatttttcgtagcccaattgctaaa Protospacer ************.***********************
42. spacer 4.6|825528|36|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009812 (Listeria phage B025, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
cgcttcacgttggtttttcgtagcccaattgctaaa CRISPR spacer cgcttcacgttgatttttcgtagcccaattgctaaa Protospacer ************.***********************
43. spacer 4.29|827033|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_003216 (Listeria phage A118, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
cacgtactttaatcggcatcaaaccacctcgatttc CRISPR spacer cacgtactttaatcggcatcaaatcacctcgatttc Protospacer ***********************.************
44. spacer 4.29|827033|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AJ242593 (Bacteriophage A118 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
cacgtactttaatcggcatcaaaccacctcgatttc CRISPR spacer cacgtactttaatcggcatcaaatcacctcgatttc Protospacer ***********************.************
45. spacer 4.29|827033|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH341452 (Listeria phage PSU-VKH-LP040, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
cacgtactttaatcggcatcaaaccacctcgatttc CRISPR spacer cacgtactttaatcggcattaaaccacctcgatttc Protospacer *******************.****************
46. spacer 4.31|827161|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_021539 (Listeria phage LP-030-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
acgtttgcggtagttttaccgggcacggtcaaatat CRISPR spacer acgttcgcggtagttttaccgggcacggtcaaatat Protospacer *****.******************************
47. spacer 4.31|827161|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AJ312240 (Bacteriophage PSA complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
acgtttgcggtagttttaccgggcacggtcaaatat CRISPR spacer acgttcgcggtagttttaccgggcacggtcaaatat Protospacer *****.******************************
48. spacer 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY705255 (Streptococcus phage P0095, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta CRISPR spacer caaaacagagaacgagtgttcattatcggacatctta Protospacer ************** **********************
49. spacer 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY705251 (Streptococcus phage P0091, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta CRISPR spacer caaaacagagaacgagtgttcattatcggacatctta Protospacer ************** **********************
50. spacer 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX879643 (Streptococcus phage CHPC1151, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta CRISPR spacer caaaacagagaacgagtgttcattatcggacatctta Protospacer ************** **********************
51. spacer 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK202161 (Streptococcus phage CHPC1282, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta CRISPR spacer caaaacagagaacgagtgttcattatcggacatctta Protospacer ************** **********************
52. spacer 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY705252 (Streptococcus phage P0092, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta CRISPR spacer caaaacagagaacgagtgttcattatcggacatctta Protospacer ************** **********************
53. spacer 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH937506 (Streptococcus phage CHPC1148, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta CRISPR spacer caaaacagagaacgagtgttcattatcggacatctta Protospacer ************** **********************
54. spacer 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY705253 (Streptococcus phage P0093, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta CRISPR spacer caaaacagagaacgagtgttcattatcggacatctta Protospacer ************** **********************
55. spacer 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY705254 (Streptococcus phage P0094, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta CRISPR spacer caaaacagagaacgagtgttcattatcggacatctta Protospacer ************** **********************
56. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT438761 (Listeria virus P61, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gtatacaggttaggaagtaaactccttgta CRISPR spacer gtgtataggttaggaagtaaactccttgta Protospacer **.**.************************
57. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT668624 (Listeria phage LP-Mix_6.2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gtatacaggttaggaagtaaactccttgta CRISPR spacer gtgtataggttaggaagtaaactccttgta Protospacer **.**.************************
58. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to DQ003638 (Listeria phage A511, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gtatacaggttaggaagtaaactccttgta CRISPR spacer gtgtataggttaggaagtaaactccttgta Protospacer **.**.************************
59. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ591604 (Listeria phage LMTA-148, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gtatacaggttaggaagtaaactccttgta CRISPR spacer gtgtataggttaggaagtaaactccttgta Protospacer **.**.************************
60. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK792752 (UNVERIFIED: Listera phage vB-LmoM-SH3-3, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gtatacaggttaggaagtaaactccttgta CRISPR spacer gtgtataggttaggaagtaaactccttgta Protospacer **.**.************************
61. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041862 (Listeria phage LP-064, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gtatacaggttaggaagtaaactccttgta CRISPR spacer gtgtataggttaggaagtaaactccttgta Protospacer **.**.************************
62. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX126918 (Listeria phage LP-125, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gtatacaggttaggaagtaaactccttgta CRISPR spacer gtgtataggttaggaagtaaactccttgta Protospacer **.**.************************
63. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JQ797329 (Listeria phage vB_LmoM_AG20, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gtatacaggttaggaagtaaactccttgta CRISPR spacer gtgtataggttaggaagtaaactccttgta Protospacer **.**.************************
64. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ535721 (Listeria phage List-36, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gtatacaggttaggaagtaaactccttgta CRISPR spacer gtgtataggttaggaagtaaactccttgta Protospacer **.**.************************
65. spacer 1.2|151|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FJ147490 (Listeria phage 20422-1 unknown genes) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gtatacaggttaggaagtaaactccttgta CRISPR spacer gtgtataggttaggaagtaaactccttgta Protospacer **.**.************************
66. spacer 3.2|809725|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to MH341451 (Listeria phage PSU-VKH-LP019, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
ctgtaaaatcaaaagtatcatagaaacaatcttc CRISPR spacer ccgtaaaatcaaaagtatcatagaaacgatcttc Protospacer *.*************************.******
67. spacer 3.2|809725|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to KP399677 (Listeria phage vB_LmoS_188, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
ctgtaaaatcaaaagtatcatagaaacaatcttc CRISPR spacer ccgtaaaatcaaaagtatcatagaaacgatcttc Protospacer *.*************************.******
68. spacer 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to NC_003216 (Listeria phage A118, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
gcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer gcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaacg Protospacer *******************.**************
69. spacer 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to AJ242593 (Bacteriophage A118 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
gcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer gcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaacg Protospacer *******************.**************
70. spacer 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to X85008 (Bacteriophage A118 hol118 and ply118 genes) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
gcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer gcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaacg Protospacer *******************.**************
71. spacer 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
gcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer gcacagtcttcacgattgcggggatggggaaaacg Protospacer ***************** ****************
72. spacer 3.7|809724|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to MH341451 (Listeria phage PSU-VKH-LP019, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
tctgtaaaatcaaaagtatcatagaaacaatcttc CRISPR spacer tccgtaaaatcaaaagtatcatagaaacgatcttc Protospacer **.*************************.******
73. spacer 3.7|809724|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to KP399677 (Listeria phage vB_LmoS_188, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
tctgtaaaatcaaaagtatcatagaaacaatcttc CRISPR spacer tccgtaaaatcaaaagtatcatagaaacgatcttc Protospacer **.*************************.******
74. spacer 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to NC_003216 (Listeria phage A118, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ggcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer ggcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaacg Protospacer ********************.**************
75. spacer 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to AJ242593 (Bacteriophage A118 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ggcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer ggcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaacg Protospacer ********************.**************
76. spacer 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to X85008 (Bacteriophage A118 hol118 and ply118 genes) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ggcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer ggcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaacg Protospacer ********************.**************
77. spacer 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ggcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer ggcacagtcttcacgattgcggggatggggaaaacg Protospacer ****************** ****************
78. spacer 4.6|825528|36|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
cgcttcacgttggtttttcgtagcccaattgctaaa CRISPR spacer cgcttcacgttgattttttgtagcccaattgctaaa Protospacer ************.*****.*****************
79. spacer 4.11|825867|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH341453 (Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
gtccacatcgacaataaaaaacacattgtatcactt CRISPR spacer gtccacattgacaacaaaaaacacattgtatcactt Protospacer ********.*****.*********************
80. spacer 4.17|826252|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ094022 (Listeria phage LP-030-3, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ttgttcgacggcttagacaaccatcacgcttcttta CRISPR spacer cttttcgacggcttagacaaccatcacgcttcttta Protospacer .* *********************************
81. spacer 4.19|826382|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KP399678 (Listeria phage vB_LmoS_293, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ctcataaggatttcgaggcgggttaaacgacatgta CRISPR spacer ctcataaggattgcgaggcgggttaaatgacatgta Protospacer ************ **************.********
82. spacer 4.29|827033|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to DQ003637 (Listeria phage A500, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
cacgtactttaatcggcatcaaaccacctcgatttc CRISPR spacer cacgtactttaatcggcatcaaatcacctctatttc Protospacer ***********************.****** *****
83. spacer 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN689509 (Lactococcus phage CHPC1175, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta CRISPR spacer caaaaccgagaacgtgtgttcattatcggacatctta Protospacer ****** *******.**********************
84. spacer 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448735 (Streptococcus phage Javan349, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta CRISPR spacer caaaacagagaacgggtgttcattgtcggacatctta Protospacer ************** *********.************
85. spacer 1.5|349|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT500540 (Listeria phage LP-HM00113468, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tcattgtttatcttctcccaaataaaatca CRISPR spacer tcattgtttattttctcccagataaaatcg Protospacer ***********.********.********.
86. spacer 4.1|825203|36|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
aaagaccttcgatttcattctcactttccagttaat CRISPR spacer gaaaaccttcgatttcattcttactttccagttaat Protospacer .**.*****************.**************
87. spacer 4.18|826317|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH341453 (Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
tataaaatattgcccaatgtgcggaaggagtttgga CRISPR spacer tataaaatattgtccaatgtgtggaaggagtttggg Protospacer ************.********.*************.
88. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026684 (Nostoc sp. 'Peltigera membranacea cyanobiont' N6 plasmid pNPM2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaaattttcaacttctattttttctct Protospacer *****.** **************** * *
89. spacer 4.18|826317|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.861
tataaaatattgcccaatgtgcggaaggagtttgga CRISPR spacer cattgaattttgcccaatgtgcggaaggagcttgga Protospacer .** .*** *********************.*****
90. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT207918 (Bacillus phage Eyuki, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactattttttaagg Protospacer ***** ********* ********** .
91. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_031054 (Bacillus phage DirtyBetty, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactattttttaagg Protospacer ***** ********* ********** .
92. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031070 (Bacillus sp. JAS24-2 plasmid pl278, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer cctcattatgtcaatttctattttttatat Protospacer *.* * ******.***************
93. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH538193 (Bacillus phage Saddex, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaaggt Protospacer ***** ********* ******** * .*
94. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF288919 (Bacillus phage AaronPhadgers, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaaggt Protospacer ***** ********* ******** * .*
95. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG763894 (Bacillus phage HonestAbe, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaaggt Protospacer ***** ********* ******** * .*
96. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_031116 (Bacillus phage Zuko, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaaggt Protospacer ***** ********* ******** * .*
97. spacer 4.15|826126|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
agaaaaaaaacatctttccaatttgttgttttgc CRISPR spacer agcaaaaaaacatctttcctatttgttttatcac Protospacer ** **************** ******* * *..*
98. spacer 4.29|827033|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ094022 (Listeria phage LP-030-3, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
cacgtactttaatcggcatcaaaccacctcgatttc CRISPR spacer tattaactttaatcggcatcaaaccacctctatctc Protospacer .*. ************************* **.**
99. spacer 4.33|827292|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694189 (Marine virus AFVG_250M578, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer taataaaaaatgagggcttagaaaatgaaaaaatt Protospacer * *.*** ******.***************** *
100. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX961629 (Bacillus phage BJ4, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaagga Protospacer ***** ********* ******** * .
101. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_031070 (Bacillus phage Nemo, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaagga Protospacer ***** ********* ******** * .
102. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF288920 (Bacillus phage Zainny, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaagga Protospacer ***** ********* ******** * .
103. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ489399 (Bacillus phage Hakuna, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaagga Protospacer ***** ********* ******** * .
104. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_031027 (Bacillus phage SageFayge, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaagga Protospacer ***** ********* ******** * .
105. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX349902 (Bacillus phage Kida, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaagga Protospacer ***** ********* ******** * .
106. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX156152 (Bacillus phage Smudge, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaagga Protospacer ***** ********* ******** * .
107. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ489401 (Bacillus phage Megatron, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaagga Protospacer ***** ********* ******** * .
108. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN038179 (Bacillus phage ALPS, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaagga Protospacer ***** ********* ******** * .
109. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH638311 (Bacillus phage OmnioDeoPrimus, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaagga Protospacer ***** ********* ******** * .
110. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF288918 (Bacillus phage Bubs, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaagga Protospacer ***** ********* ******** * .
111. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX961632 (Bacillus phage SBP8a, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer attaaatttgtcaactactatttttaagga Protospacer ***** ********* ******** * .
112. spacer 1.5|349|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG592459 (Vibrio phage 1.084.O._10N.261.49.F5, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcattgtttatcttctcccaaataaaatca CRISPR spacer tattcatttatctcctcctaaataaaatcc Protospacer * *..*******.****.**********
113. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016726 (Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC08 plasmid pUC08A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer tatcttgttctcaccttctattttttataa Protospacer . * *** *** ***************
114. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023393 (Lactococcus raffinolactis strain WiKim0068 plasmid pWiKim0068-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer tatcttgttctcaccttctattttttataa Protospacer . * *** *** ***************
115. spacer 1.3|217|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034167 (Escherichia albertii strain 2014C-4015 plasmid p2014C-4015-3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cttaaagttgtcaacttctattttttatat CRISPR spacer agaggagttgtcaaattctatttttttatt Protospacer ..********* *********** *
116. spacer 3.7|809724|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045351 (Vibrio sp. THAF100 plasmid pTHAF100_a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tctgtaaaatcaaaagtatcatagaaacaatcttc CRISPR spacer tccgtaaaatcaaaagtatcatcgattttatgata Protospacer **.******************* ** . ** *
117. spacer 4.15|826126|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP038863 (Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
agaaaaaaaacatctttccaatttgttgttttgc----- CRISPR spacer aagaaaaaaacatatttccaatt-----ttttccaaaaa Protospacer *..********** ********* **** *
118. spacer 4.20|826447|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014533 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gcttttttcaacaattttatcaccagatgtcatta CRISPR spacer agttttttcaacaattttatgaacagataattttt Protospacer . ****************** * *****. . **
119. spacer 4.33|827292|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448625 (Streptococcus satellite phage Javan738, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer gtatgaactatgaggacttagaaagtgaagacctg Protospacer * **** ****************.****.*
120. spacer 4.33|827292|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448449 (Streptococcus satellite phage Javan356, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer gtatgaactatgaggacttagaaagtgaagacctg Protospacer * **** ****************.****.*
121. spacer 4.33|827292|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448636 (Streptococcus satellite phage Javan749, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer gtctgaactatgaggacttagaaagtgaagacctg Protospacer *.**** ****************.****.*
122. spacer 4.33|827292|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP045037 (Lactobacillus mali strain LM596 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer ttaagaaatataaggacttagtaaatgaagttatg Protospacer ** *******.********* *******. *
123. spacer 4.33|827292|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP018177 (Lactobacillus hordei strain TMW 1.1822 plasmid pL11822-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer ttaagaaatataaggacttagtaaatgaagttatg Protospacer ** *******.********* *******. *
124. spacer 4.33|827292|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP018181 (Lactobacillus nagelii strain TMW 1.1827 plasmid pL11827-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer ttaagaaatataaggacttagtaaatgaagttatg Protospacer ** *******.********* *******. *
125. spacer 3.2|809725|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to MK044828 (Streptococcus phage 33888, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ctgtaaaatcaaaagtatcatagaaacaatcttc CRISPR spacer tgggaaaatcaaaagtatcaaagtaacagatgta Protospacer . * **************** ** ****. . *
126. spacer 4.30|827098|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP034816 (Paracoccus sp. Arc7-R13 plasmid unnamed6, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
caagatatgctagaaatggcgcaaatagcgcgcg CRISPR spacer gtccggctgcttgaaatggcgcagatagcgcgtc Protospacer . **** ***********.********.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
406594 : 413119
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_HG813249|406594:413119|DBSCAN-SWA TTCAAAACTTCTTGTAAACATCAATGGAATTGCCAAAATTAATGAAATATCCACCATAATCATACATTGGACCATATTTTTCCGCGTAATGAGAAACTGTATGGCGCAAAAATTCTTCTGTTACCTCTAAAAACTCCGCTACTTCAAAATATTCTCGTAAGCCTAGATAAAAACAAGCAATGATGTCATCAAGCGGTATTAGTTCCTCATAACCTTTGCGACGAGCGAAAATCTCTTGTTTTTTATCCATGATTGTTTCCTGTTTGGTGATATTACCTACAGTGTATTTGTAATGCATCAATTCTTCTACTAAAACACAGCCTTTTTCAATGGAAGATTGATCCTTACTAATAAAAATCATCCCATTTAAATAAAGTCCCGGAAGTTTGTAAGGCATTTTCTCTTCTCTGATTGTTACCTCATCTTGGTATTTATTTACCAATTTTTCGTACAATAAAATCACATCCCGCGATGGAGTTTTTTCTTCATCTCTATATAAGCTAAAATATCCCGCATTTCTTCCTCGGTTACGTCATCATCAATATGGGCTGCAATTGTTACCAAGCGTTCATCAACAGGGGGTAAATTTCTTTCAGGAAAAAAGTCATCTAATCGTTTGTTGAAGATTTTTGCAAGTTCAAATAAAACATCTTGATTTGCTTTTCGATCACCATTTTCATAACGGCTAATAGTTTGGCGAGTTGTATGAAGCTTTTCTGCTAATGCTTCTTGATTTAAGCCTCGTTCCTCGCGATATTGTTTTATTTTATTTCCTACAAATTTATTTAGCTCCATAATAATTGTCCTCCATATGTTTATGGCTTCAGTATAGCACTTTTAGCACCAAAACGGAACTTTTTCGAACATATTTGTCGGATAAAGTTTACCAGTAACCAAAATGGTGCTATAATATTTGTAGAGCTAGAAAATAAAAGCGGCTGATTTTGCACTGATAGCACCGAATTGGTGACAAGACTACTATATTAATTTATGAGATGGAAGTGGAAATGGATGGATAGAAAACTTTTAAAAGAAAAGCAAATCCAACTAATTTTTCAACTAGAACAAGAAGAAAATCGATTTATTCGAAAGCGTTTGATAGAAGAGTTGGAGTTTTTTGAAGCACTTGGGGATAGGGAAAAAGGACTTCTAACGGCGGAGCAAAAGTTGCTTATTTTAACACCTAGTGAGTACCGAGAATACAAAAGAACCAAATCAGATGTGCAAATTAGTAGGATAATTGGAGTATCGAGATCGTCACTTGCAGAATGGAAACGAAAAAAAGGTTTAAATAGAAAAAAGTCGCAACCGGTTCAGCAGGAAATGATTGATGTATTAGCTTTTCATTTAGATAAAACAAAAGAAGAAATTGGCGCTTTACCTGCTTCGGCGATTGAATGTCAGTATGAGGCTTTTGTGATTAATGAAGCCAATAATTAAGGAGTGATAAAATGCAGGTTTTAGTTTTACCAGAAAATAAGGATATCAATTATATAAAAACGGTCCAAGAAGTAAAACGATTTTTTGCGGATTTCGAGAGATTTCGGATGATTACGGGGTTATCAAAAAAGCCACATTTATTTAGAAATGGTTTTCTGGAAGAGCCGCAGTTTGAGCCGGTAGCATTTTCTGCTAGACATAATAAAGAAGTCATTTTGGAAGCGCGATGGTTGGTAGAGAAATATACTGAAATGTTAAATCAGATGGATGATTTATATCGCACTATTTTGATGGAATGTTACGTGGAACGAAAACAAGATGTGGCGGTAATGATGGATTTACCGTACGAAATTGCCCAGTTTAAACGGATAAAAAAACGAGCAGTATTAGAAATCGCAACGCTAATGGGAATTTTAGTAAGGAAATGATGATACTTTCGTGATATTTTGAAACGTCATTTTACGATTAATATAGAAGTAAGCTAATTGTCCAGTAAGCGGATGACAATAAAAGCTGCATCAGAATGAAGGTGCACCGATTTTCTGATAATACATGATGTTTTACAAGAAATTTGTTTTTATGATTGGATTTAAATCCGTTGAGATAAACAAATATTCTATTTTGGAAAGTAAAGTTCGGAGGAATAAATTATTAAATGTGGTCTTGACCGAACTTTGCTTTCTGTTTTAAAGGAGTGAACGCTTGGTGAAGAGTTTGAGCTTCATGAGAGTTTTGGAAGCAGTGAGAATAATGCTCCAGGAAAAAGGCGGACTAGATGTTTCTATTGTAATGCGTGACCAAGTGGAAATGCCTACAACGATGATCGAGATGATTGATCAAGAGGAAGAAGAAAGCCAAACTGCCTGGAAAGAAAAATACCGTTTTGCAATCCATCATTATACAAATGAAACGGACCTAGCGGGAGTCGAAAAGATAGATACGCTTATCCAAACAGGATTCACTTTGCCTGAAGGATACAAATTAATCGCTGTTCGACATTACGGAAAACAAAATTTAGTCAAAGAAAATACGTTAATTCACGCAAAAACCAGTTTTGAAGTAAGTATTTGTCGTGAATTAAAAGTAAAAATTTAGGGGGAAATATTAATGGCATTTGAAGAGAATTTATATTGTGATTATACACCGGGAGCTGCTAAAGCGGTCGCGGGGAAAGATGTAATTTTAGCAGTTTTTAACGCAGCGGGGGACAAACTATTAGCGGTTGCGGGCCAACAAGGTCTAACTGTAAACCGTTCTAAAGATAGCATTGAAATTACATCTAAAGATACAGTTGGCGGATGGAAATCCAAAATTGGCGGTATGAAAGAATGGTCAATTGAAAATGACGGATTATATGTCGCTGATGCAGAGTCTCACAAAGAATTGGCGAAATATTTCGAAAGTGATAGCCCAGTTTGTGTGAAAATCATTAATCAAGCATCTAAAAAAGGTCTTTTCGGTGGTTTGGCAATTGTAGCTGACTATAGTTTTGAAGCACCTTTTGATGAAGCGATGACTTACTCTGTAAAACTAGACGGAATGGGCGCGCTTGTTGATTTAACGATTACTGAGGGCGGCGACCAAATGCCCGGCGAAACACCTGTAGCACCAGCAGAATAAAATAGAAAGCCACTGAAATAAGTGGCTTTCCCTTAGGAGGAAAATAAATGTTTGAAGTGAATGATACAACTTATATTTTACGATTTAATAAACAAAAAGTTAAAACGGTGGAATTAACATCAGGGATTAGTTTAGTTGCAGCTTTGACTGCGAATAAAGGGATTTTGAGCTATCAAGTGATTGAAACACTATTTGTTTCAGGACTTGTGGAAGAAAAAGGCTTAGTACCTGTAAAACAAAAAGAAGCTTTGGAGATTTTCGATAAATTAGTAGAAGAACAAGGCTTAATTTCGCTTAATGTAGCTGTTATTGAGAAATTGCAAGAGGATATGGGTTTTTTGTTCCGTTAAAACAGATTGAGTTTGAGTATTTTGGTGCTGAGGACGAAGAAGTGGATAGTGAAATGAACCATGATTTCGATTTGGAAAAACAATTTGCTTTTTTTGTAGTTAATTTTCAGATGTCCAAGCATGATTTTGAAGAACTTACTGAAGTGGAGAAAAATTTCATCATGAAAGAATGGGAAAACAAGGTGATTTTTGAATCTACTATGCTTCGAAATGCAGTTTTAAATGCGGAACAAAATCTCAATCGAAAACGAAATTCCCGTTTTATCGACTTGCATAAAAAACGTCAGAAGAAAGCCGATGTTAATTATACAGTAAATGCACTTCAAGCAATTTCCGAGAATGAAGCGAAGGAAGGTAAAGCGTGGATTGATCGGATTTATGGTGCAAATGGGTTGCGAAGACCTAAGAATAAAGAAGAAAGGAGGAACGTGAATGGCGGATTCTAAAAGTTTTACATTTGAACTCAACGAGAGCGTTTTAACAGCGCAAGTTGGCAGGCTAGATGAAATGGCGATGGTTGTAGAGCAACGATTTTCAGAGCTCAAAATGACTATTGAAGATGTTGGAAATGCTGATCCAGGTTCGAAAATTTCCGAGTCTTTAGGTGGGCTGCAGTCTGGGCTTGGCACGATTAGTTCGGCGTTTGGACAGCTGGGTTCTAGTAGTGAGGCGATTACATCTGGATTCGGTACTGCGGTTGGTTCTGTTGGTGGAATCACGGATGCGTTTAAAAATCTAGGTTCAAGTGTGCAAAATGGTACGTTATTTTCAAGCTTGGCGACTGGAATTGGTGGCATGAGTACGATGCTTGGTGGAGTATCTGGCGGCGTTCAAGGAATTACAAATCTAGCTAGTGGTTTTATGGAATTGAAGAATCATTTAGGCGGTTTGATGTCTTCTATTGGCGGCGTTGGTGGAATTATGGGTAAACTGACTTCTCCAATGGGGTTAGTAATTATCGGGATTGTTGCGCTAGTTGCTGCTTTTACGTACTTGATGACGACGAATGAATCGTTCCGAAATACCGTGATGTCAGTCGTAACGCAGGTTGCGCAGTTGTTCGGGCAACTTGTCGCTAGTTTAATGCCGATTATTATGCAAATTGTTACTGCGGTTATGCAAATTGGTGCCGCGTTAATGCCGATAGTTATGCAGTTTATTAGCTTTTTTGCCCAGTTGTTAGCTCAATTAATGCCATTTATTAATATGCTGATTTCTATGCTTATGCCTGTTATTATGCAGATTGTTCAAGTTGTTATGTCGCTTGTTTCAGCGTTATTACCAAGCATTATGACAGTGATCCAAGGCATTATGAGTGTTATTCAATTTTTAATTCCGATAATTATGCAAATCGCGACGGTGGTTGTACAAATTGTTGTAACGATTATTTCTTATATAAGTAAAATTATGCCGATTGTTATGACGATTATTGGCGTTATTGTTTCGATTATCACAACGATTATTAGTTACGTCGTTATTATTGCGACGACGATTGCTAGTGTTATTGGGAAAATTATTAGCTTTATTGCGAGTGTTATTACGGCGGTTATCGGGATTGTGCAACCAATTATTGCCTTTATTACCAATATCTTTACGACTATCGTGACAATTATTGGTGCAGCTTTCCAAATGGTATTTACTGTTGCATCCAAAATTTGGAATTCCATTATGTCGACTATTTCCGGAATTATTGACGGAATCAAAGCAGTCATCACAGGTATTTCTACTACAGTTTCATCAGTGTTTAACGGAGTGAAGCGCATTATTACAGGTGTTTTTGACGGAATCAAAAGTGCTTGGGGTGGTTTAACTGATTTTGTAGGAAATATTTTCGATGGTGTTTCAAGTGCAATTCAAACAGTGGTAGACAATGTCAAAGGTTTTGTAAACGTGGTAATTCGAGGGATTAATGGAGCCATTGGTTTAATTAATAAGATTCCAGGAGTTGAAATCGGCAAAATACCGCAATTAATTTCCGGAACAACAAATTTCCAAGGTGGCTTTGCTCGAATGAATGAAGGCGGCCGAGGCGAAATGGTTGTTTTACCGTCGGGTTCGCAAGTAATTCCGCACGATGCAACGATGAAATACGCAAGAGAAAGTGCGCGCGGAAATAAATCAATGCTTTACACGAGTCAAGGCGCTGATTTGGCTAGAGTTGAAAATCTTCTCGAGCGCTTACTACAAAAAAATCCTGTAATCAAAATGGATGACAAAGTGGTAGCTGAGGTAGTTAGCCGTAATCAAGCTAACTCATTTGATCAGTACAACTATACAATGGGAGGTGCAGCTTATTCATGAGTGACTTGTTTTTAGAATTAAATGGAAAAGTGCATTCGCTTAGTGAGACATTTCCAGGTCTTTCTGTACAAGAAGTTTCGAGACAAAGTCCCCAGTTAAGCATGGAAACTGCTGAAATCGCTGGGACTGATGGGGTTATCCCAGGAATGACCCAATTTAAACCGTTTATCTTTTCAGCAAAATGTAATTTGCAAGCACATGATATTCCGGATTACCATTTGGCAGTTAGGGAAATTTATGAATTTTTATTTCAACGGGATAGTTATTATATTTGGAGCGATCAAATGCCAGGAATTCGGTATGAGGTGCATCCTAAACCAGTTGATTTTAGTCGAGAATCGGATCGTGTTGGTTTACTCACTATAGAATTTGATGTATTTAAAGGCTATGCGGAGTCACGTGGCACGAGCCTTGACCCTATGACTTTTGAAGTGGATTTATGGCAGATGGGAATGAATTTATCGAACCGTGATGATTTATTTTATATTTTTAAAGAAAATACATTTCGGGTCTATAATGCGGGGAGCGACCGTGTTAATCCACTGATGCGGCATGAACTAGATATTGCGATGACGGCGAATGGGACACCAACGATTCATAATCTTACAACGGGAGAATCCTTCGAGTATCAGAAAGAGCTCCGAAAAACAGATGTTTTACTGTTAAACAATATTTATCCACTTGTTAATAACCGCCGTGTTGGAAAAGATACCAATCATGGGATTATCACCCTTGAAAAAGGCTGGAACGATTTTGAAATCAAAGGTGTAACGGATGTAACGATTGCTTTTAATTTTCCGTTCATTTATCGGTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_HG813249|406594:413119|410435_412304_+|WP_031669176.1|DBSCAN-SWA MADSKSFTFELNESVLTAQVGRLDEMAMVVEQRFSELKMTIEDVGNADPGSKISESLGGLQSGLGTISSAFGQLGSSSEAITSGFGTAVGSVGGITDAFKNLGSSVQNGTLFSSLATGIGGMSTMLGGVSGGVQGITNLASGFMELKNHLGGLMSSIGGVGGIMGKLTSPMGLVIIGIVALVAAFTYLMTTNESFRNTVMSVVTQVAQLFGQLVASLMPIIMQIVTAVMQIGAALMPIVMQFISFFAQLLAQLMPFINMLISMLMPVIMQIVQVVMSLVSALLPSIMTVIQGIMSVIQFLIPIIMQIATVVVQIVVTIISYISKIMPIVMTIIGVIVSIITTIISYVVIIATTIASVIGKIISFIASVITAVIGIVQPIIAFITNIFTTIVTIIGAAFQMVFTVASKIWNSIMSTISGIIDGIKAVITGISTTVSSVFNGVKRIITGVFDGIKSAWGGLTDFVGNIFDGVSSAIQTVVDNVKGFVNVVIRGINGAIGLINKIPGVEIGKIPQLISGTTNFQGGFARMNEGGRGEMVVLPSGSQVIPHDATMKYARESARGNKSMLYTSQGADLARVENLLERLLQKNPVIKMDDKVVAEVVSRNQANSFDQYNYTMGGAAYS >NZ_HG813249|406594:413119|412300_413119_+|WP_031669177.1|tail|DBSCAN-SWA MSDLFLELNGKVHSLSETFPGLSVQEVSRQSPQLSMETAEIAGTDGVIPGMTQFKPFIFSAKCNLQAHDIPDYHLAVREIYEFLFQRDSYYIWSDQMPGIRYEVHPKPVDFSRESDRVGLLTIEFDVFKGYAESRGTSLDPMTFEVDLWQMGMNLSNRDDLFYIFKENTFRVYNAGSDRVNPLMRHELDIAMTANGTPTIHNLTTGESFEYQKELRKTDVLLLNNIYPLVNNRRVGKDTNHGIITLEKGWNDFEIKGVTDVTIAFNFPFIYR >NZ_HG813249|406594:413119|408738_409128_+|WP_003733902.1|DBSCAN-SWA MKSLSFMRVLEAVRIMLQEKGGLDVSIVMRDQVEMPTTMIEMIDQEEEESQTAWKEKYRFAIHHYTNETDLAGVEKIDTLIQTGFTLPEGYKLIAVRHYGKQNLVKENTLIHAKTSFEVSICRELKVKI >NZ_HG813249|406594:413119|408044_408461_+|WP_031669175.1|DBSCAN-SWA MQVLVLPENKDINYIKTVQEVKRFFADFERFRMITGLSKKPHLFRNGFLEEPQFEPVAFSARHNKEVILEARWLVEKYTEMLNQMDDLYRTILMECYVERKQDVAVMMDLPYEIAQFKRIKKRAVLEIATLMGILVRK >NZ_HG813249|406594:413119|407604_408033_+|WP_003732219.1|DBSCAN-SWA MDRKLLKEKQIQLIFQLEQEENRFIRKRLIEELEFFEALGDREKGLLTAEQKLLILTPSEYREYKRTKSDVQISRIIGVSRSSLAEWKRKKGLNRKKSQPVQQEMIDVLAFHLDKTKEEIGALPASAIECQYEAFVINEANN >NZ_HG813249|406594:413119|410044_410449_+|WP_072217178.1|DBSCAN-SWA MDSEMNHDFDLEKQFAFFVVNFQMSKHDFEELTEVEKNFIMKEWENKVIFESTMLRNAVLNAEQNLNRKRNSRFIDLHKKRQKKADVNYTVNALQAISENEAKEGKAWIDRIYGANGLRRPKNKEERRNVNGGF >NZ_HG813249|406594:413119|409140_409653_+|WP_003721744.1|tail|DBSCAN-SWA MAFEENLYCDYTPGAAKAVAGKDVILAVFNAAGDKLLAVAGQQGLTVNRSKDSIEITSKDTVGGWKSKIGGMKEWSIENDGLYVADAESHKELAKYFESDSPVCVKIINQASKKGLFGGLAIVADYSFEAPFDEAMTYSVKLDGMGALVDLTITEGGDQMPGETPVAPAE >NZ_HG813249|406594:413119|406594_407047_-|WP_003721739.1|DBSCAN-SWA MYEKLVNKYQDEVTIREEKMPYKLPGLYLNGMIFISKDQSSIEKGCVLVEELMHYKYTVGNITKQETIMDKKQEIFARRKGYEELIPLDDIIACFYLGLREYFEVAEFLEVTEEFLRHTVSHYAEKYGPMYDYGGYFINFGNSIDVYKKF >NZ_HG813249|406594:413119|409700_410003_+|WP_003721745.1|DBSCAN-SWA MFEVNDTTYILRFNKQKVKTVELTSGISLVAALTANKGILSYQVIETLFVSGLVEEKGLVPVKQKEALEIFDKLVEEQGLISLNVAVIEKLQEDMGFLFR >NZ_HG813249|406594:413119|407052_407388_-|WP_003721740.1|DBSCAN-SWA MELNKFVGNKIKQYREERGLNQEALAEKLHTTRQTISRYENGDRKANQDVLFELAKIFNKRLDDFFPERNLPPVDERLVTIAAHIDDDVTEEEMRDILAYIEMKKKLHRGM |
10 | Listeria_phage(33.33%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1400310 : 1407733
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_HG813249|1400310:1407733|DBSCAN-SWA AATGAAAAAGGTTATTACATATGGAACATTTGACTTGCTTCATTGGGGGCATATTCACTTATTAAAGCGCGCTAAGGCTCTTGGTGATTATTTAATAGTAGCAATTTCTTCCGATGAATTTAATCGAATTAAACATAAAGAAGCTTATCATAGTTACGAACACCGTAAATTAATTATTGAAGCAATACGTTATGTGGATGAGGTGATCCCAGAGAATAACTGGGAACAAAAAAGAGATGATATAGAGAAATACGGAATCGATGTTTTTGTAATGGGTGATGACTGGGAAGGCGAATTTGATTTTCTAAAAGATGTGTGTGAAGTTGTTTATCTTCCTCGAACAGAAGGGATTTCTACGTCTCAAATCAAAGATGAACTAAAATAAAAATGTGAGAGGAGCATTCTTTTGGAACCTTTAGTAAGTGTAATTATTCCAGTTTATAATGTAGAAAAGTATGTCAAACGATGCTTGGATTCAGTTCTTGAGCAAACATATCATAACCTCGAAGTTATCGTAGTTAATGATGGAGCGACTGATAATTCAGCTAAAGTCATAAAAAGTATCTCAGATAATCGAATTCGTTATTTTGAAAAAGAAAATGGCGGACAAGCTACTGCCCGAAATTTTGGATTAGATGTGGCTACGGGAGATTACATCGTGATGGTAGATAGTGATGATTACATTAGCAAAAACCTAGTAGAAACTTGTTTGGATACTGTACAAAAAACAAATGCTGATTTAGTCTTGTTTACTTCATATAATGTGAATCAGGAAGGAAAAATGCAGTATATAAAGCGTGATAAAGGCATCAAAGTTTTAGATGCAGGTCCAACTCCATGGAACAAATTTTATCAAGCAGATCTATGGAAGGGTTCGCGTTTTCCAGTAGGTTATTGGTATGAAGATCTAGGAATTATTCCAGTCGTCACGCTAAAAGCAAAAAATCCAGTGAAAATCCAGGACGCACTTTATTACTACATAACTGATAGAGCGGATTCACAATCGAATATTCAACAAGTAGATCACTTTTTAGATGTGGTTATTATGTTGGAAAATGTTGAAACAGAATTAAAAAAACTAGGTATTTACGAAGAATCAAAAGATCAACTTGCGTACCTATATATAGAACATCTAATTTATCGTTTAGTTTTACGAAAAGCGATTTACATTACGGATAAGCAAGAACGTAAAAAACTTATTAAGAAAATTAGTACAATTATTCAAGAGAAGTTCCCTAATTGGGGTAGTTATCCTTATCAAGCGGGTGGAAAACTAACTGCAATATTAAAGAAAAAAGCATTATGGCTTTATATACATCATTTGTACTTGTTGGGTGATTTAGTATGGAAATATCCATTTTCTATCAGAAGTAAGCAAACAGGGTTTTAAAGGAGGTTATCATTTTGCATAAATTAAGTGTGGTCATTGCCGTATACAATGTTTCTGAGTATATAGAAGCATGCTTAACATCAGTCTTAGAACAAAACTACAAGAATGTGGAATTAATTATTGTCAATGATGGTTCAACTGATGATACCTTTCAAAAAGTAGAAAAACTAGTAGACGGACATACGAATGTTATTTTGATTGATCAAGAAAACCAAGGTGTTTCTGCTGTCCGAAATAATGGTGTAAAAGTCGCTACAGGTGATTATCTAGGCTTTGTCGATGGAGACGATATCATTGCTAAAGATATGTTTCAAAAAATGATGGATTCTTTTGAAATGTCGGATGCAGATATGGTAACAATTGGTGTGGCAAGACTTTCAGGAGATAAAGTATACCCTTCTACATTACACGAAAGATATATGGTAGAAAAAAAAGAAGCCACAACAATTGAAGAAACACCGGCACTTTTATATGATACTACTTCGTGGAATAAAGTATTTAAAAAATCTTTTTGGGATAAACACCATTTGGAATTTCCAGAGGGCCAAATGTATGAAGATATCGCATTAATGATTCCAGCCTTTTTGTATGCAAAAAAGGTAAATATTATTCCTGATGTTGGCTATTATTGGCGCAGTCGCGAGGGTGGAGCAAAATCAATCACTCAAAGACGAAATGACATTGCCATGGTGAATGATCGTTTACTTGCTTTGAAAAAAGTAAATCAAGTACTTAATGAGAAAAATATTCAGGGTGATTTAAGATATCAAAATGAACGTAAAAACTTTGAAATTGATTTGTTTTCCATGATTGAATGGGCATTTTTAGCGCCGAAGGATTACTATTTGGCTCTTCAACCACTTATCAAAAATTATGTTGAGCAAGAAATGAAAACAACTGCTTTGAATGATATTCCAAAAGAAAAGAAACGACTTTTCAAAGCTTTGTTAGCAAATAATCGTCCGGCTTTTCTCCTAAATAGTTACATTTATTTTGGTAAGAAAGCTGTGAAAAAAATAACGAAATAAGAGACAAAGGACAAAATACTTCGGATCTTTAGTACACTTGTAAACAATTGATTCAAGTGTGCCATTGCATCATTAGAAGTACTATGTCTTAGGCTCTTTTTTTGTTAGTAACAGTTAATTTAATAGTGAATCTACCTTTTATATGCTATGATAATTGGTATATAATAAGTCAAATTAATGCTTATAAAAAATGATAGGAGCAGAAGAAATGACAAATTTATTTCAAGATGATAGTCTAACGCTGCATACAGACTTATATCAACTAAATATGATGAAAGCGTATTTTGACGATGGACTTCATGAGCGTAGATCGGTGTTTGAAGTGTTTTTCCGAGATATGCCATTTGATTCGGGTTTTGTTGTGTTTGCGGGGCTAGAACGAATTATTCATTATATGCAAAATTTACGTTTTACAGAAACGGATATTGCTTATTTACACGACGAACTTGGTTTTGATGGACCTTTTCTAGAATATTTACGTAACTTTAAATTTAAAGGAAATATTCTTGCTGCGAAAGAAGGGGAGTTTGTTTTTAAAACAGAGCCAATCCTTCAAGTAGAAGCAAGTCTAGCGGAAGCACAATTAATCGAAACAGCTTTGCTTAATATTGTGAATTTCCAAACGCTGATTGCAACAAAAGCGGCGCGAATCCGTTCTGTTATTGACGACGAAACGTTTGCCGAATTTGGTACAAGACGTGCACAAGAAATGGATGCGGCTATTTGGGGCACACGAGCGGCTTACATCGGCGGTTGTGATTCGACAAGTAATGTTCGCGCTGGGAAGATTTTCGGCATTCCTGTGTCTGGTACGATGGCACATGCGATGGTTCAAGCTTACCGCGACGAACTAGAAGCATTTAGAAGTTACGCAAAAACGCATTTTGATTCAATTTTCTTAGTAGATACATACGATACGCTAAAATCTGGCGTACCAAATGCGATTAAAGTGGCGAAAGAAATGGGCGATAAAATTAACTTTATCGGCATTCGTTTAGATAGCGGGGATATGGCTTTCTTATCTAAAAAAGCACGCCAAATGTTAGATGAGGCTGGTTTTACAGAAGCAAAAATCTTTGCTTCTAGTGACTTAGACGAACATACTATTTTATCGTTAAAAGCGCAAAAAGCAAAAATCGATTCTTGGGGCGTTGGCACAAAACTAATCACCGCTTACGACCAACCAGCATTAGGTGCCGTTTACAAAATGGCGGCAATTGCTGATGAAAATGATATTTTACAGGATTCGATTAAACTTTCAAGTAACACCGAAAAAGTGTCGACACCTGGTAAAAAGAAAGTTTACCGGATTATTACGAATGAAGATGGCTTGAAAGCGGAAGGCGATTATATTGCTTTGGCGGACGAATCACTCGAAAATGTCGATAAACTAACGATGTTCCACCCAGTCCATACGTATATTATGAAAACAGTCGAGAATTTCACCGCGCGTGAGCTACTTGTACCCATTTTCCAAAACGGGGAACTTGTGTATGATATGCCTTCACTAGATGAAATTAAAGCTTATAAAGAAGAGAACTTGGCGCTACTTTGGGACGAGTACAAACGAACCGTTCGCCCAGAGCAATACCCAGTTGATTTAAGTGTAAAATGTTGGAAAAATAAGATGCGTAATATCGAAAAGGTACGTAAAAGTGTCCAGCTTCATTCACCAGTTGAACTAGATATGCCGTTTTAGGAGGAATTATAATGGAAATCAGAGAAAGAATTTTAGCAGATATGCAAGTGGCAGAAACGATTGATGCACACGAAGAAATCCGAAAAAGTGTCGAGTTTTTAAAAGCATATTTAAAAAAGAATACGTTCTTAAAAAGCTTTGTTCTTGGGATTTCTGGGGGACAAGATTCGACTTTAACAGGAAAACTAGCACAGATGGCGATAAGCGAAATGCGAGCAGAAACGGGTGACGATGAGTACCAATTCTTCGCTGTGAGCTTGCCATACGGAACGCAACTAGATGAATCGGACCGTCAAGATGCACTGAACTTTATGGAACCAGATAATCGTTTAACCGTAAATATTAAAGCTTCAGTGGATGCGAGTGTTGCGGCGCTTGCGGAAGCGGGAGTCGAACTATCTGATTTTGCTAAAGGTAACGAAAAAGCGCGCGAACGGATGAAAGTACAATATGCAATTGCAGCGATGCATAAAGGCGTAGTGGTTGGAACCGATCACTCCGCAGAAGCTGTTACTGGTTTTTATACGAAATACGGCGATGGTGGAACAGATATTAATCCACTGTTCCGCTTGAATAAAAGACAAGGCAAGGCGCTTCTTAAAGAGCTAGGCTGCCCAGAACATCTATATTTGAAAAAACCGACAGCAGATTTAGAAGATAATAAACCGGCACTTCCTGATGAGGTCGCGCTTGGTGTGACTTATGACCAAATTGACGATTACTTGGAAGGCAAAGAAGTTTCAGCAGATGCTGCGGCAAAAATTGAGAACTGGTTTATTAAAACCGAACATAAACGCCATATGGCAATTACTATATTTGACGATTTCTGGAAATAGGAGGCTGTTTAAATGAAAGTTGGTTATGGTTTATTAACTGCATTTTATACACACCCAGGAGAAAAAGATAATTTAGTGAAAATTTTGCTTGAAGCGGCAGAGGCTTTGGATGATTACAACACGTGTATCCAATATATTGTCAGTGAATCTGAAACCGAGGTAGATACGGTGTTTGTTTCTGAAATTTGGGTCGACAAAGGGCATCATGCAGCATCACTTGATAACCCAGCAGTACAAGAAACAATTAAACGCGCCAAACCGATGATAAAAGAAATAAAACAAATACAAGAATTAGACATACTCGGTGGAAAAGGCGTATAATTTTAACAACAAGAATGATTCTGGGACTCTCCTGGAATCATTTTTTTGGAGGGATGACAAATGCAAACGTTGATGATTGTTTGTGCTGGCGGTGCGACGTCAAGCTTAATGGCACAAAATGTCGTGAAAAGCGCGATGTCAGAAGGAATGGACGCTGTTTTACTATTTCCAGATGACGTAAAATACAAAGATAGTTTTCTCGAGAAATATAGTGAGCGGGATCTGGTTGTCGTGATGGGTCCAGTCGGCGCAATTACAGCCGGGAAATTCCGTGATTATAAAGAGCAAGTTGATGCCGTTTTAGTAGCACCACAAGTGAAATATATGTACAAAACAGTGGAGGAAGTATTAGGCGAACTAAATATTCCTTGCGCTAATATTGATTCACTGGATTTCGGTCGGATGCGCGGGGATAAGATTCTCACGCAAGGTCTAGCCTTAATGGATGCGAAAAATTCCAAATAAGGTGTTGCAACTTTAGAGGGGAAACGTTAAAATGAAAGAAGATGAAAAGGACAAGTGATTTGTCCTTTTCTTATATTATTGTGAAGTAACCGCAATTTTGCGGTTTCATTTTATAGATAAGGGTGGTTTTGTTTAAAATTATGAAAGACTTTACCGAGCAAGAGAAAATTATCGTTCTAGATTTTGGTAGTCAGTACAATCAACTAATTACGCGCCGCATTCGTGAATTCGGTGTGTATAGTGAATTACATCCGCATACTATTACAGTTGAAGAAATGAAAGCACTAAATCCAACGGGGATTATTTTTTCAGGAGGACCTAACAGCGTGTATGACGAAGATGCCTTCCGCGCTGACGAAAGAATCTTTGACATGGGAATTCCAATTTTGGGAATTTGTTACGGCATGCAATTAATGACAACGCACTTCGGTGGCAAAGTAGAACGTGCGAAAGACCGCGAATACGGGAAAGCGGACATTCACGTTGAGAAGCCAAACCGTTTATTTGCTGGACTACCAACCGATCAAGTTGTTTGGATGAGTCACGGCGATTTAGTTGTCGAGGAGCCTGCTGGTTTTGAAGTAACAGTTACTAGTAAATCTTGCCCAATTGCAGGTATTGCGGACGAAGAACGTTCACTTTACGGCGTGCAATTCCACCCAGAAGTACGTCACTCCGTTTATGGCAACGAATTACTGAAGAATTTTGCATTAAATGTTTGTGGCTGTAAAGGCGACTGGACAATGGAAAACTTTAGTGAAGTAGAAATCGCAAAAATCCAAGAAATCGTAGGCGACAAAAAAGTCTTGCTTGCCCTTTCTGGCGGCGTAGATTCCTCTGTTGTTGGTGTGTTAATTCATAAAGCAATTGGCGACCAACTAACATGTATTTTCGTTGATCATGGCCTTCTTCGTAAAGGGGAAGCTGACCAAGTAATGGCGACATTACAAGGCGAGTTCAACATGAACATCATCAAAGTAGATGCGAAAAAACGCTTCATGGACAAACTTGCTGGCGTTTCTGACCCAGAACAAAAACGTAAAATCATCGGTAACGAATTCATTTACGTATTCGACGATGAAGCCAACAAACTAGACGGCGTAGAATTCCTAGCTCAAGGAACACTTTACACAGACATCATCGAAAGTGGTACAGCAACTGCCCAAACAATCAAGTCTCACCACAACGTAGGCGGCTTACCAGAAGATATGCAATTTAAACTAATCGAACCTTTAAATACACTTTTCAAAGATGAAGTTCGCGCACTAGGAACAGAACTTGGCATGCCTGACGCAATCGTTTGGCGCCAACCATTCCCGGGCCCAGGCTTAGGAATCCGCGTACTTGGCGAAATTACGGAAGAGAAATTAGAGATTGTTCGTGATTCTGATTACATCTTGCGTGAAGAAATCAAAAACGCAGGTCTAGAACGCGAAATCTGGCAATACTTTACTGCTCTTCCAAATATCCGTAGCGTTGGTGTTATGGGTGATGGTAGAACGTATGACCATACTGTGGTTGTCCGTGCGGTGACGAGTATTGATGGTATGACAGCGGATTGGGCACGTATTCCTTGGGATGTGCTGGAGAAGATTTCGGTGCGGATTGTGAATGAAGTGGATCATGTGAATCGTGTTGTTTATGATATTACGAGTAAGCCACCAGCTACGGTTGAGTGGGAATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_HG813249|1400310:1407733|1405643_1406048_+|WP_031669483.1|DBSCAN-SWA MQTLMIVCAGGATSSLMAQNVVKSAMSEGMDAVLLFPDDVKYKDSFLEKYSERDLVVVMGPVGAITAGKFRDYKEQVDAVLVAPQVKYMYKTVEEVLGELNIPCANIDSLDFGRMRGDKILTQGLALMDAKNSK >NZ_HG813249|1400310:1407733|1400715_1401699_+|WP_015454559.1|DBSCAN-SWA MEPLVSVIIPVYNVEKYVKRCLDSVLEQTYHNLEVIVVNDGATDNSAKVIKSISDNRIRYFEKENGGQATARNFGLDVATGDYIVMVDSDDYISKNLVETCLDTVQKTNADLVLFTSYNVNQEGKMQYIKRDKGIKVLDAGPTPWNKFYQADLWKGSRFPVGYWYEDLGIIPVVTLKAKNPVKIQDALYYYITDRADSQSNIQQVDHFLDVVIMLENVETELKKLGIYEESKDQLAYLYIEHLIYRLVLRKAIYITDKQERKKLIKKISTIIQEKFPNWGSYPYQAGGKLTAILKKKALWLYIHHLYLLGDLVWKYPFSIRSKQTGF >NZ_HG813249|1400310:1407733|1404437_1405262_+|WP_015454563.1|DBSCAN-SWA MEIRERILADMQVAETIDAHEEIRKSVEFLKAYLKKNTFLKSFVLGISGGQDSTLTGKLAQMAISEMRAETGDDEYQFFAVSLPYGTQLDESDRQDALNFMEPDNRLTVNIKASVDASVAALAEAGVELSDFAKGNEKARERMKVQYAIAAMHKGVVVGTDHSAEAVTGFYTKYGDGGTDINPLFRLNKRQGKALLKELGCPEHLYLKKPTADLEDNKPALPDEVALGVTYDQIDDYLEGKEVSADAAAKIENWFIKTEHKRHMAITIFDDFWK >NZ_HG813249|1400310:1407733|1405274_1405583_+|WP_031669482.1|DBSCAN-SWA MKVGYGLLTAFYTHPGEKDNLVKILLEAAEALDDYNTCIQYIVSESETEVDTVFVSEIWVDKGHHAASLDNPAVQETIKRAKPMIKEIKQIQELDILGGKGV >NZ_HG813249|1400310:1407733|1402935_1404426_+|WP_003721509.1|DBSCAN-SWA MTNLFQDDSLTLHTDLYQLNMMKAYFDDGLHERRSVFEVFFRDMPFDSGFVVFAGLERIIHYMQNLRFTETDIAYLHDELGFDGPFLEYLRNFKFKGNILAAKEGEFVFKTEPILQVEASLAEAQLIETALLNIVNFQTLIATKAARIRSVIDDETFAEFGTRRAQEMDAAIWGTRAAYIGGCDSTSNVRAGKIFGIPVSGTMAHAMVQAYRDELEAFRSYAKTHFDSIFLVDTYDTLKSGVPNAIKVAKEMGDKINFIGIRLDSGDMAFLSKKARQMLDEAGFTEAKIFASSDLDEHTILSLKAQKAKIDSWGVGTKLITAYDQPALGAVYKMAAIADENDILQDSIKLSSNTEKVSTPGKKKVYRIITNEDGLKAEGDYIALADESLENVDKLTMFHPVHTYIMKTVENFTARELLVPIFQNGELVYDMPSLDEIKAYKEENLALLWDEYKRTVRPEQYPVDLSVKCWKNKMRNIEKVRKSVQLHSPVELDMPF >NZ_HG813249|1400310:1407733|1406176_1407733_+|WP_020246560.1|DBSCAN-SWA MFKIMKDFTEQEKIIVLDFGSQYNQLITRRIREFGVYSELHPHTITVEEMKALNPTGIIFSGGPNSVYDEDAFRADERIFDMGIPILGICYGMQLMTTHFGGKVERAKDREYGKADIHVEKPNRLFAGLPTDQVVWMSHGDLVVEEPAGFEVTVTSKSCPIAGIADEERSLYGVQFHPEVRHSVYGNELLKNFALNVCGCKGDWTMENFSEVEIAKIQEIVGDKKVLLALSGGVDSSVVGVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEADQVMATLQGEFNMNIIKVDAKKRFMDKLAGVSDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEANKLDGVEFLAQGTLYTDIIESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRALGTELGMPDAIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRDSDYILREEIKNAGLEREIWQYFTALPNIRSVGVMGDGRTYDHTVVVRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPATVEWE >NZ_HG813249|1400310:1407733|1401713_1402727_+|WP_014930875.1|DBSCAN-SWA MHKLSVVIAVYNVSEYIEACLTSVLEQNYKNVELIIVNDGSTDDTFQKVEKLVDGHTNVILIDQENQGVSAVRNNGVKVATGDYLGFVDGDDIIAKDMFQKMMDSFEMSDADMVTIGVARLSGDKVYPSTLHERYMVEKKEATTIEETPALLYDTTSWNKVFKKSFWDKHHLEFPEGQMYEDIALMIPAFLYAKKVNIIPDVGYYWRSREGGAKSITQRRNDIAMVNDRLLALKKVNQVLNEKNIQGDLRYQNERKNFEIDLFSMIEWAFLAPKDYYLALQPLIKNYVEQEMKTTALNDIPKEKKRLFKALLANNRPAFLLNSYIYFGKKAVKKITK >NZ_HG813249|1400310:1407733|1400310_1400694_+|WP_003721506.1|DBSCAN-SWA MKKVITYGTFDLLHWGHIHLLKRAKALGDYLIVAISSDEFNRIKHKEAYHSYEHRKLIIEAIRYVDEVIPENNWEQKRDDIEKYGIDVFVMGDDWEGEFDFLKDVCEVVYLPRTEGISTSQIKDELK |
8 | Hokovirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1496866 : 1600633
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_HG813249|1496866:1600633|DBSCAN-SWA TATGTTAGAACAGTTACAGACGTTGAAAAATGAAGCAGAAACGCAAATCAACGAAGCATCAGACTTAAAAACATTAAACGACTTACGGGTAAAATACCTTGGTAAAAAAGGCCCGATGACCGAAATTATGAAACAAATGGGGAAACTTTCCGCAGAAGAGCGACCAAAAATGGGTTCACTTGCGAATGAAGTAAGAACAGCCCTAACAGAAGCGATTTCTAGTAAACAACAAATTTTAGAAACAGAAGCAATCAATGAAAAACTAAAATCAGAAACCATTGACGTTACATTACCAGGGACTGCTCCGAGTATTGGAACAAAACACTTGCTAACACAAGTAATTGAAGAAATGGAAGATATGTTCATCGGGATGGGTTACGAAATTGCAGAAGGGCCAGAAGTAGAACTAGATTACTATAACTTCGAAGCGCTAAATTTACCAAAAGATCACCCAGCTCGTGATATGCAAGATAGCTTCTATATCACAGAAAATACTTTACTACGTACCCAAACTTCTCCTGTACAAGCAAGAACAATGGAAAAACATGACTTCTCTAAAGGACCAATCAAAGTTATCTGTCCAGGGAAGGTGTACCGCCGCGATAATGATGATGCAACTCACTCTCACCAATTTACGCAAATTGAAGGGCTAGTTGTTGGCGAAAATATCACGTTTGCTGACTTAAAAGGAACATTAACTGTTCTCGCAAAAACGATGTTTGGTGAAGAACGTGAAATTCGTCTTCGTCCATCCTTCTTCCCATTCACAGAACCATCCGTTGAAATGGATATCTCTTGCTTTAAATGTGGTGGTAAAGGTTGTCGCGTTTGTAAAGGAACCGGTTGGATTGAAATTTTAGGAAGCGGGATGGTACATCCAAACGTCCTTGAAATGTCTGGAATTGATTCTACTCGATACAGCGGTTTTGCTTTCGGCTTAGGACCTGAACGTGTTGCAATGTTGAAATATGCGGTGGATGATATTCGCCACCTTTATACAAATGATTTACGCTTTACGAAGCAATTCCAAAGTACAGAAACGGGGGAAATCTAATGTTAGTTTCATATAATTGGGTCAAAGAATTTTTCCAAGACTTCCCGTTAACGGCGGAAGAGCTAGGGGAAGCAATTACAAGAACCGGGATTGAAATCGAAGGCGTAGAAGAATTAAGCGCTAGTTTGAAAAATGTCGTAGTCGGTGAAGTTTTATCATGCGAACGCCACCCCGATGCAGAAAAATTGAATAAATGTCTCGTTCAAACAGACGAAGCAGAACCAGTTCAAATCATTTGTGGAGCTCCAAACGTTGCAGCTGGTCAAAAAGTAATCGTAGCCAAAGTTGGCGCAAGACTTCCAGGTGGACTTAAAATCAAACGCGCAAAACTACGCGGTGAAGTGTCAGAGGGAATGATTTGCTCCCTCGCAGAACTTGGCTTTGAAAGCAAAGTTGTGCCAAAAGCATACGCAGAAGGCATTTATGTATTACCTGCGCACGTGGAAACGGGTGTAAATGCAATCACGTTACTTGGGCTAGATGATGCGATTTTGGATATGGCAATCACACCAAACCGCGCAGACGCATTGAGCATGAACGGTGTAGCTCACGAGGTTGGTGCGATTATTCATCAAAAACCAGCACAACCTACCGAGCCTGACGTATCTGAAAAAGGAAAAGCAGAAGATTTCATTTCTGTAGAAGTAGAAAATCCAGCCGAAACACCTTACTATGCTATTAAAATGGTAGAAAATATCGAAATCAAAGAATCACCACTATGGCTTCAAACGAAACTAATGAAAGCCGGGATTCGTCCACATAATAACGTTGTCGATGTCACAAACTACATCAATTTATTATACGGACAACCGTTGCATTCTTTTGACTACGATAAAATTGGCAGCAAGAAAATTGTTGTACGTTCTGCAAAAGAGCAAGAAGAAATTACTACGCTTGATGGCGAGAAAAGAACTTTACAAGCTGGGCATACAGTTATCACTAACGGAGTAGAACCAATTGCTATCGCCGGCGTTATGGGGGGAGAATTTTCCGAAGTTACCGCAAATACGACAACCGTTGCGCTAGAAGGTGCTATTTTCAGCAGCTCTTCCATCGGTAAAGCATCTCGCGAATTATACCTACGTACAGAAGCGAGCATTCGTTACGACAAAGGATCGGATGCCTGGAAAGTAGAAAAAGCACTTGCGCACGGCGGAGCACTAATCGCTGAACTGAGCGGCGGTACACTAGTCGGCGGTGTCGTAGAAGTAGATAACCGTGAAAAAGCAGTGAATAAAATCGAAACGAGCCTAACACGCATTAACCGCATTTTAGGAACCGCAATTACGCTTACGGAAATTGAAACTATTTTTGATCGTTTAGGATTTGTATTAGAAGTAAAAAATGATGCTCTAATCATTGAAGTACCAACAAGACGTTGGGATATTAAGATTGAAGCGGATATTTTAGAAGAAGTAGCTCGGATTTACGGTTACGATGAAATTCCGGTAACACTTCCGGCGACAAGCACAACAGGAGGTTTATCAGACAGCCAAAAAGCTCGTCGTGTCATGCGCGCTTATTTAGAAGGAGCAGGGCTTAACCAAGCATTAACTTACTCTTTAACATCTAAAAAAGATGCAACTCGTCTAGCACTTTCTGATGAAAAAACAGTTGCATTATCGATGCCAATGAGCGAAGAACATAGCCATTTAAGAACAAGTATCGTTCCACAATTAATTCGTAGCGCAAGTTATAACATCGCTCGTAAAAATATGGACGTGGCACTTTATGAAATGGGTACCGTATTCTACGCAACAGAAGGCGACAATTTACCAATTGAACAAGAGCATTTGGCAGGTCTAATTACTGGAAACTGGCACATTGCAGATTGGCAAAAAACACCGAAACCAGTAGACTTCTTCGTTTTAAAAGGAATTGTCGAAGGCTTAGTGAACAAATTAGGTATCAAATCCGAACTTCACTGGAAACAAACTGAAAAAGAAGAACTGCATCCGGGAAGAACCGCGAGCCTTGTTTTGGAAGGGCAAGAAATCGGCTATCTTGGGGCGCTTCATCCAGCAGTAGAAGCGAACTATGATTTAAAAGAAACGTATGTATTCGAAATCAATGTGGCGGCTTTACTAGATGCAACCAAAGAAAAAGTTGTGTATCATCCAATTCCACGTTACCCAGAAATGACACGCGACTTAGCATTACTTGTGGATAAAGATACTAACCACGCAGCAATTTCGCAAGTAATCAAAGAGCACGGCGGGAAATTACTTGTCGATATCGAGCTATTTGATATTTTCGAAGGGGAGAGCCTTGGCGAAAATAAAAAATCACTCGCATACACATTGACTTTCCTAGACAGCGAAAGAACACTAGTCGAAGAAGATGTACAAAAAGCAACCAACAAAGTAGTAGAAGCATTACAGGAAAAACTAAATGCAATTATTCGCTAAATAAAGAAGAACTAAGCTACCTGGAAAACATTTTCAGCTAGTTTAGTTCTTTTTTTGTTTTTTATAAAATAGTGGAAATCTTTCCTTTTTTAGTACTTCACTTACTTAAATAACACATGTTATAATGATGGCACATGCCAGAGAAAAAAGGACGAGAAAAATGACCTATGTAGAAATGAAAGATGTATCTAAATACTATCAAATGGGCGAGAACGTTGTCACTGCTAATGATAAAATCACTTTCGGGATAAAAAAGGGTGAATTTGTTGTTATAGTTGGGCCTTCTGGGGCCGGAAAATCCACAGTATTAAACATACTTGGTGGAATGGATAGTGCAAGTGAAGGCAAAATTATGGTAGATGGGCAGGATATTGCTCAATATAATGCAAAACAATTAACCAAATATCGGCGAACCGATGTCGGTTTTGTATTCCAATTTTACAATTTGGTACCTAATTTGACTGCTAAAGAGAACGTAGAATTAGCTGCACAAATTGCGCCAAATGCATTAGACGCAGAAACTGTTTTAACTCAAGTTGGATTAAGTCACAGATTAGACAATTTTCCAGCGCAATTATCTGGTGGGGAACAGCAACGTGTCGCTATAGCACGTGCACTTGCTAAAGCTCCTAAACTGTTACTGTGTGATGAGCCAACCGGTGCACTTGATTATGATACCGGCAAATCAGTCTTAAAATTATTACAAGAAACTTGCCGTAACACGGGGACAACCGTTATTGTTATTACCCATAACACGGCGATTACGCCAATTGCTGATCGAATTATTGAAATTAATAATGCAAAAGTTCGTAGCATCAAAGAAAATTCAGAACCAATGTCCATTGATGATTTAGAATGGTAGGAAGGAGCAACCAGTGAAACGTTCAGCTTTATGGAAAGATATCTACCGCGAAATATGGCGTTCTAAGAGCCGCTTTATTTCCATTTTTATGCTGATTATGTTGGGCGTTGCTTTTTTCTCCGGATTAAAAGCAACTGGACCCGATATGCTTCTAACAGCCGACAACTATTTTAATAAGTATGAATTAGCTAATTTTAATGTGCAATCTACTTATGGACTAGATGAGACAGACAAGGAAGCACTTGAAGATATATCCGGTGTCGCACAAGTGGAACTCGGATATACAGCAGATACTTTAATGAAAGATAAAAATATCGTAACGAAACTATTTTCCACATCTAAAAGCGATAATTTAAATCAATACAAGGTAATTAGTGGCCGTTTACCAGAAAAATCAGGAGAAATTGCGCTTGATAATAATCAACTTGTTCATAAAAATGTCAAAATTGGTGACAAAGTAACTTTTGTGAAAAGCGATGGTAACAAGCTAACTGATACACTTAAAAAATCCACCTATAAAGTAGTCGGTTTTGTTAGCTCACCCGCTTATATCCAGAAATCCGAACGTGGCTCGAGCACGGTAGGTAAAGGAAAGACAGATGCTTTTGGTGTAATTCCAAAGCAAGATTTTAATTTACCAGAATACACTATTGCCAATCTTACTTTTGATAACTTA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112 | Listeria_phage(79.37%) | capsid,transposase,portal,integrase,tRNA,holin,terminase,tail,protease | attL 1504142:1504158|attR 1543291:1543307 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1679052 : 1739750
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_HG813249|1679052:1739750|DBSCAN-SWA 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83 | Listeria_phage(86.96%) | capsid,portal,integrase,holin,plate,terminase,tail | attL 1695594:1695609|attR 1717392:1717407 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1841141 : 1879982
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_HG813249|1841141:1879982|DBSCAN-SWA 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60 | Listeria_phage(94.44%) | holin,terminase,tail,integrase | attL 1828504:1828518|attR 1842647:1842661 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1899109 : 1944379
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_HG813249|1899109:1944379|DBSCAN-SWA 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41 | Bacillus_virus(23.08%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2454180 : 2462466
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_HG813249|2454180:2462466|DBSCAN-SWA 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ATCGCCAATATCAACAATCCCAGCACCTTCACCCGGTCCTTGCAACACTTGTTTTCCTTCTGTAGGAAATTTCCGAAGTACTGGTTTAGAATTTTTATAGCTACAATGTTCGGACCACATAACGGAGAAAAGTCCAGTTTCTGTATAATTAGGCTCGCGTCCAAGAATCGAACAAACAAGCTCATATTCACTATCAGTTAAGCCCATTTCTTGATAAATCTTTTGTTCTTTAATTTCTTTTGTCGTTGGCTCCATGTTAGGCATTTACTTGTTCCTCCTTCCAAGCTTTTACAACGGACTCGAAAAGTCTTAAACCATCAGTACCGCCAATAATTTCTTCTACCGCGCGTTCTGGATGTGGCATCATTCCAAGCACATTACCGCGCTCATTTACGATACCCGCAATATCCGCACGACTACCATTCGGATTAACGCTATCATATGTAAAAACAATTTGGTTATTTTCTTTTAATTTTAAAAGTGTTTCGTCGTCACAGTAATAATTACCTTCTCCGTGAGCAACGGGAACTTGGATAATTTCGCCTTCTTCATAAAGCTCCGTAAACATCGTACTTGCATTTGCCACACGAAGCGGCACTGTTTTACAAATAAAATGCAAATTATTATTTCTAATTAAAGCACCTGGCAACAATCCAATTTCAGTTAAAATTTGGAATCCGTTACACACACCAAGCACTGGTTTTCCCATTTCAGCAAAGCGCAAAACTTCTGGCATAATACTTGAAAATTTTGCAATCGCACCAGTTCGCAAGTAATCTCCGTAAGAAAATCCACCTGGAAGTAATACCGCATCAAAACCTGCAAGACTTGTTTCCGCATGCCATACATATTCCGCCTCCTCGCCAAGAGAATCGCGAATCGCATGTAACATATCAAGATCACAATTAGAACCTGGGAACTGAATGACAGCAAATTTCATCGTTTAAGCCTCCTCAATTTCATATCGGTAATCTTCCATCACCGGATTTGTTAGCAGTTTGTCACACATTTCATTTAACACTTCACGAATATCTCTATCCGACTTCGCTACTTTAAGTTCCATAAATTTACCAATACGAACATCTTCTACTTCCTCGTAACCCATGCTTTTCGCTGCATCTTTTACTGCAACCCCTTGCGGATCTAATACGCTTTTCTTTAAAGTGACATAAACTTTGACATTATACATTTTGTGGCCTCCTAGTTTTGAACTTGCTTTAATCTATTCAATACTTCTGTATACACATCTGTTAAATTGCCAATATTCCGACGAAAGACATCCTTATCGAGCTTTTGATTTGTTTCCTTGTCCCAAAGTCTACATGTATCCGGCGAAATCTCATCTGCTAGCAAAATTTCTCCAGCCACGTCCCGACCAAATTCTAATTTAAAATCGATCAGCGTAATATTCATTTGATTGAATAATTCTTGTAGCACCTTATTAATCGAACGAGCCGCCTGACGAATCGTATCCATCTCACTCGTTGTCGCAACCTCTAAATAAAGCACATGGTCATCATTAATAAACGGGTCATCTAGCGCATCATCTTTATAGTAAAATTCTACTATCGCATTCGGAATTTGCTCGCCTTCTTCTTTTCCAAGCCGTTTCGCAAGACTCCCAGCCATCACATTACGAACAACCACTTCAAGTGGAATAATTGATACCTCTTTCACCAATTGTTCCGTTTCCGAAATCGCCCGAATAAAATGACTCTCTATTCCCGCTTCCGCCAAATGAGAAAAAATAAGCGATGTAATTTGGTTATTAAGCTCACCCTTCCCAGCAAAAGATTCCTTTCGTACTCCATTTAACGCTGTCGCATCGTCCTTATAAGCAACACGCAAGACACCAGCTTCTTCTGTTTTAAAAAGTCGTTTTGCCTTACCTTCATAAACCAGTTCATTAGTCACGATAATTTATCTCCTTATAAAGTACTTAACCTCTTTGAAAAAATAAATATCAAAGAGGTTAGGTTGTATTCTGCCCGTAATTATAATCCTAAACGATCAAAAATTAAGTCGACATTCTTCAGGTGATAGTTGTAATCAAAGCAATCTGCAATTTCTTCCGCAGATAAGTTTTCAGTAATGGTTGCATCTTGTTCTACTAATTCACGGAAAGGTACTTGTTTTTCCCAAGCTTCCATTGCTCTTGGTTGTACGACATCATAAGCCGCCTCACGAGCTAAACCTTTATCAATAAGCGCCAGTAATACACGCTGTGAATAAATAAGTCCAAGTGTTCTGTCCATATTGCGTTTCATATTTTCTGGGAACACCGTCAAGTTTTTCACGATATTTCCAAAACGATTCAAAATATAATCTAATAAAATAGTAGAATCTGGTAAAATAATTCGTTCCGCTGAACTATGAGAAATATCACGTTCATGCCAAAGTGGTACATTTTCATAAGCAGTAACCATATGACCGCGAATAACGCGCGCTAATCCAGTTACATTTTCAGAACCAATTGGATTACGTTTATGTGGCATTGCGGACGAACCTTTTTGTCCTTTTGCAAAGAATTCTTCCACTTCGCGCACTTCGCTTTTTTGTAACGCACGTACTTCTACCGCAAATTTTTCTACAGAAGTTGCAATTAATGCAAGTGTTGCCAAATATTCAGCATGACGATCACGTTGCAATGTTTGCGTAGAAATAGGTGCAGGTGTCGTTCCTAATTTTTCACATACGTAAGTTTCTACAAAAGGATCAATATTCGCATACGTCCCAACCGCCCCAGAGATCTTCCCGAATTCCACACCATCAGCTGCAAAATTAAAACGTTCTAAGTTACGTTTCATTTCCTCGTACCATAGAGCAAGCTTCAAGCCAAAAGTAGTAGGTTCCGCGTGAACACCATGTGTACGTCCCATAGTTACAGTATATTTATGTTCTTTTGCTTTTTCGCCAATAATCGCAATGAAATTTTCCAAATCCTTGCGCAAAATCTCATTCGCTTGTTTAAGTAAATAAGAATTCGCTGTATCCACTACGTCTGTTGATGTTAAGCCATAATGAACCCATTTACGTTCCGCACCAAGCGACTCAGAAACCGAACGAGTAAATGCCACAACATCATGTCTAGTTTCTAGCTCAATCTCATGAATCCGATCCACATCAAACTTCGCATTAGCACGGATCTTCGCAACATCTTCTTTCGGAATATCACCAAGCTCTGCCCAAGCTTCACAAGCCAAAATCTCCACTTCTAGCCAAGCCTGATAACGATTTTGTTCTGTCCAAATGTTGCCCATTTCTTTACGAGTATAACGTTCTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_HG813249|2454180:2462466|2455811_2457239_-|WP_003722245.1|DBSCAN-SWA MLAEVKGLNEECGIFGIWDHPNAAEITYYGLHSLQHRGQEGAGIVSTDGETLKGHRNLGLLADVFKHGELDDLKGKAAIGHVRYATAGQKNLGNVQPFLFHFHSSSLALAHNGNLVNAKSLRRELEEEGAIFQTSSDTEVLAHLIKRSHTGDFVEDLKVALNKVKGGFAYMLLTEDTMYAALDPNGFRPLSIGRIGDSYVVASETCAFETVGAEFVRDVEPGELIIINDDGLRIEKFTENVTHSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHSARKRSGKRLAKEAFIDADVVTGVPDSSISAAIGYAEEAGLPYELGLIKNRYVARTFIQPSQELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVQLLREAGAAEVHVRIASPPLAYPCFYGIDIQTRNELIASNYSVDEICRIIGADSLEYLSEEGLVDSIGRPYPNEPYGGLCMAYFNGDYPTPLYDYEAEYLASLEAEK >NZ_HG813249|2454180:2462466|2454743_2455793_-|WP_003733242.1|DBSCAN-SWA MAENAYSKAGVDVEAGYQVVERIKKHVARTERIGAMGALGSFGGMFDLSSLNLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYIATGKTDPVKMEQIVKGVADGCEQAGAALIGGETAEMPDMYGADDYDLAGFTVGAVEKQKLITEGAVQAGDTLIGIPSSGIHSNGYSLVRKIFFKDNEFTLDAEISELDVPLVEELLKPTRIYVKPVLEVLKEVDVHGITHVTGGGFVENLPRMLTNDLAVKVELGSWPVLPIFDVMKKYGQLNEMEMYEIFNMGIGMVLAVAKADVERTLEVLVQNGEAAYVIGEVTTRESNAVIFAGGKKG >NZ_HG813249|2454180:2462466|2460122_2460368_-|WP_015454911.1|DBSCAN-SWA MYNVKVYVTLKKSVLDPQGVAVKDAAKSMGYEEVEDVRIGKFMELKVAKSDRDIREVLNEMCDKLLTNPVMEDYRYEIEEA >NZ_HG813249|2454180:2462466|2459435_2460119_-|WP_003722247.1|DBSCAN-SWA MKFAVIQFPGSNCDLDMLHAIRDSLGEEAEYVWHAETSLAGFDAVLLPGGFSYGDYLRTGAIAKFSSIMPEVLRFAEMGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALIRNNNLHFICKTVPLRVANASTMFTELYEEGEIIQVPVAHGEGNYYCDDETLLKLKENNQIVFTYDSVNPNGSRADIAGIVNERGNVLGMMPHPERAVEEIIGGTDGLRLFESVVKAWKEEQVNA >NZ_HG813249|2454180:2462466|2457223_2459443_-|WP_031669014.1|DBSCAN-SWA MPNMEPTTKEIKEQKIYQEMGLTDSEYELVCSILGREPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTEGKQVLQGPGEGAGIVDIGDGLGVAFKVESHNHPSYVEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPIAMLNSLRFGELDTPHAKYLVSEVVAGIAGYGNSIGIPTVGGEIQFDPCYTKNPLVNAMCVGLIEAKDIQKGQAKGIGNPVMYVGAKTGRDGIHGATFASVEFSEEGEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLDVIRDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGAGLELIMDDVPQRELNMTPYEMLLSESQERMLLCVKKGHVEEIQALFERYGLEAVVIGQVTDDKMYKIIHHGEVVANVPVDALAEDAPVYHKPSKEPARYQAFQEEEAFVPVIDDVVGVWKELLAQPTIASKRHIYEQYDYQVRTDTAVVPGSDAAIVRVRGTEKAIAMTTDCNSRYLYLDPEVGGAIAVAEAARNIVCSGGKPLAITDGLNFGNPEKPEIFWEIEKAADGISAACLELDTPVISGNVSLYNETDGTGIYPTPVIGMVGLVEDLAHITTQDFKNSGDVIFLIGETKAEYSGSELQKLQQGKISGRAPELDLATEKKYQQLLLTAIQEGLVASSHDLAEGGFGVALAEATFKAGLGADVEVPFALNQLFSESQSRFLVSVKPENEATFAQLMELEKVYRLGVVTEDDTIRVKHKEDLVTVKTTELRSIWEGAIPCLLK >NZ_HG813249|2454180:2462466|2461173_2462466_-|WP_003733238.1|DBSCAN-SWA MLERYTRKEMGNIWTEQNRYQAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVAKIRANAKFDVDRIHEIELETRHDVVAFTRSVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTANSYLLKQANEILRKDLENFIAIIGEKAKEHKYTVTMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLERFNFAADGVEFGKISGAVGTYANIDPFVETYVCEKLGTTPAPISTQTLQRDRHAEYLATLALIATSVEKFAVEVRALQKSEVREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMVTAYENVPLWHERDISHSSAERIILPDSTILLDYILNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTLGLIYSQRVLLALIDKGLAREAAYDVVQPRAMEAWEKQVPFRELVEQDATITENLSAEEIADCFDYNYHLKNVDLIFDRLGL >NZ_HG813249|2454180:2462466|2460379_2461093_-|WP_014931516.1|DBSCAN-SWA MTNELVYEGKAKRLFKTEEAGVLRVAYKDDATALNGVRKESFAGKGELNNQITSLIFSHLAEAGIESHFIRAISETEQLVKEVSIIPLEVVVRNVMAGSLAKRLGKEEGEQIPNAIVEFYYKDDALDDPFINDDHVLYLEVATTSEMDTIRQAARSINKVLQELFNQMNITLIDFKLEFGRDVAGEILLADEISPDTCRLWDKETNQKLDKDVFRRNIGNLTDVYTEVLNRLKQVQN >NZ_HG813249|2454180:2462466|2454180_2454747_-|WP_003722243.1|DBSCAN-SWA MNIAIFASGSGSNFQALVDDEFIKPYVKLLVCDKPNAYVLERANKHDIPVFLFEAKNYPDKEAFETEILLELRRLEIDLLVLAGYMRLIGPTLLAEFPEQIVNLHPSLLPEFKGKDAIGQAIQANVSGTGVTAHFVDAGMDTGPIIDQVKVTIETAETTDTLAEKIHQVEHIFYPKVIRGLIQNGGND |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG813249.1|WP_003731276.1|1563735_1563987_-|hypothetical-protein |
1563735_1563987_-
Protein sequences of NZ_HG813249.1|WP_003731276.1|1563735_1563987_-|hypothetical-protein>NZ_HG813249.1|WP_003731276.1|1563735_1563987_-|hypothetical-protein MSKTMYKNDVIELIKNAKTNNEELLFTSVERNTREAATQYFRCPEKHVSDAGVYYGEDFEFDGFEIFEDDLIYTRSYDKEELN |
83 aa aa |
AcrIIA12
anti_CRISPR3641|WP_003731276.1|AcrIIA12|II-A|Verified|Listeria-monocytogenes information
|
NA | NA | 1496866-1600633 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.5|349|30|NZ_HG813249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_HG813249 position: 1558031-1558002, mismatch: 2 tcattgtttatcttctcccaaataaaatca CRISPR spacer tcattatttattttctcccaaataaaatca Protospacer *****.*****.****************** 2. spacer 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to NZ_HG813249 position: 1561062-1561029, mismatch: 2 tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer tcgtcatgacgaaatctagcgcttgtccaactaa Protospacer ***.************************ ***** 3. spacer 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813249 position: 1561063-1561029, mismatch: 2 ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer ttcgtcatgacgaaatctagcgcttgtccaactaa Protospacer ****.************************ ***** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_HG813249.1|WP_003770002.1|1702662_1702848_+|hypothetical-protein |
1702662_1702848_+
Protein sequences of NZ_HG813249.1|WP_003770002.1|1702662_1702848_+|hypothetical-protein>NZ_HG813249.1|WP_003770002.1|1702662_1702848_+|hypothetical-protein MKNRLEDIVNKEQFITSQIGKKKLDDVMNALEELENEYELVPCQIEDIAKHYRLVKLLPFP |
61 aa aa | NA |
HTH_XRE
HTH_XRE HTH domain information
|
NA | 1679052-1739750 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to NZ_HG813249 position: 1735084-1735051, mismatch: 0 tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa Protospacer ********************************** 2. spacer 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to NZ_HG813249 position: 1735586-1735620, mismatch: 1 gcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer gcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaact Protospacer *******************.*************** 3. spacer 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813249 position: 1735085-1735051, mismatch: 0 ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa Protospacer *********************************** 4. spacer 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813249 position: 1735585-1735620, mismatch: 1 ggcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer ggcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaact Protospacer ********************.*************** 5. spacer 4.12|825932|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_HG813249 position: 1733355-1733390, mismatch: 0 ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat CRISPR spacer ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat Protospacer ************************************ 6. spacer 4.16|826189|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_HG813249 position: 1733964-1733997, mismatch: 0 agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta CRISPR spacer agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta Protospacer ********************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_HG813249.1|WP_046155079.1|1702807_1703119_-|hypothetical-protein |
1702807_1703119_-
Protein sequences of NZ_HG813249.1|WP_046155079.1|1702807_1703119_-|hypothetical-protein>NZ_HG813249.1|WP_046155079.1|1702807_1703119_-|hypothetical-protein MVTLQSAIISLIGGDIMKTTIASLKCIQCENNFPLNLNVKSSHITCPFCQTEVANDLIEQIYVAANTVGEVNYNFRKYAVEYQKPIFELSVKEMEVVLPIDNV |
103 aa aa | NA |
HTH_XRE
HTH_XRE HTH domain information
|
NA | 1679052-1739750 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to NZ_HG813249 position: 1735084-1735051, mismatch: 0 tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa Protospacer ********************************** 2. spacer 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to NZ_HG813249 position: 1735586-1735620, mismatch: 1 gcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer gcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaact Protospacer *******************.*************** 3. spacer 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813249 position: 1735085-1735051, mismatch: 0 ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa Protospacer *********************************** 4. spacer 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813249 position: 1735585-1735620, mismatch: 1 ggcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer ggcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaact Protospacer ********************.*************** 5. spacer 4.12|825932|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_HG813249 position: 1733355-1733390, mismatch: 0 ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat CRISPR spacer ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat Protospacer ************************************ 6. spacer 4.16|826189|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_HG813249 position: 1733964-1733997, mismatch: 0 agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta CRISPR spacer agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta Protospacer ********************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_HG813249.1|WP_003747290.1|1701172_1701391_-|hypothetical-protein |
1701172_1701391_-
Protein sequences of NZ_HG813249.1|WP_003747290.1|1701172_1701391_-|hypothetical-protein>NZ_HG813249.1|WP_003747290.1|1701172_1701391_-|hypothetical-protein MYCPNCGHALDNRETECPGCLAPITYQTSNNEKAQKVGAFMEESGKLMSGCGCLMTLLITIPVIVILIIMFL |
72 aa aa | NA |
HTH_XRE
HTH_XRE HTH domain information
|
NA | 1679052-1739750 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to NZ_HG813249 position: 1735084-1735051, mismatch: 0 tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa Protospacer ********************************** 2. spacer 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to NZ_HG813249 position: 1735586-1735620, mismatch: 1 gcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer gcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaact Protospacer *******************.*************** 3. spacer 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813249 position: 1735085-1735051, mismatch: 0 ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa Protospacer *********************************** 4. spacer 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813249 position: 1735585-1735620, mismatch: 1 ggcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer ggcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaact Protospacer ********************.*************** 5. spacer 4.12|825932|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_HG813249 position: 1733355-1733390, mismatch: 0 ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat CRISPR spacer ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat Protospacer ************************************ 6. spacer 4.16|826189|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_HG813249 position: 1733964-1733997, mismatch: 0 agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta CRISPR spacer agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta Protospacer ********************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_HG813249.1|WP_012582373.1|1701446_1701614_-|hypothetical-protein |
1701446_1701614_-
Protein sequences of NZ_HG813249.1|WP_012582373.1|1701446_1701614_-|hypothetical-protein>NZ_HG813249.1|WP_012582373.1|1701446_1701614_-|hypothetical-protein MKKLDELNMQHDVVILEHEFTSCSFTLKKEVFIVIDSRLSQSEKLEDVARLLNKI |
55 aa aa | NA |
HTH_XRE
HTH_XRE HTH domain information
|
NA | 1679052-1739750 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.3|809789|34|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to NZ_HG813249 position: 1735084-1735051, mismatch: 0 tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer tcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa Protospacer ********************************** 2. spacer 3.4|809853|35|NZ_HG813249|PILER-CR,CRT matches to NZ_HG813249 position: 1735586-1735620, mismatch: 1 gcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer gcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaact Protospacer *******************.*************** 3. spacer 3.8|809788|35|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813249 position: 1735085-1735051, mismatch: 0 ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa CRISPR spacer ttcgccatgacgaaatctagcgcttgtcctactaa Protospacer *********************************** 4. spacer 3.9|809852|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813249 position: 1735585-1735620, mismatch: 1 ggcacagtcttcacgatttcggggatggggaaaact CRISPR spacer ggcacagtcttcacgatttcagggatggggaaaact Protospacer ********************.*************** 5. spacer 4.12|825932|36|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_HG813249 position: 1733355-1733390, mismatch: 0 ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat CRISPR spacer ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat Protospacer ************************************ 6. spacer 4.16|826189|34|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_HG813249 position: 1733964-1733997, mismatch: 0 agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta CRISPR spacer agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta Protospacer ********************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_HG813249.1|WP_003733687.1|1845012_1845207_+|hypothetical-protein |
1845012_1845207_+
Protein sequences of NZ_HG813249.1|WP_003733687.1|1845012_1845207_+|hypothetical-protein>NZ_HG813249.1|WP_003733687.1|1845012_1845207_+|hypothetical-protein MRKIAFTNSFLTKRNRKESVLTIELSITGEDFSDLSILPELYSEINSLVNRLSEKTNGDLGKRK |
64 aa aa | NA |
HTH_XRE
HTH_XRE HTH domain information
|
NA | 1841141-1879982 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_HG813249 position: 1850997-1851033, mismatch: 0 caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta CRISPR spacer caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta Protospacer ************************************* |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_HG813249.1|WP_003733686.1|1845218_1845503_+|hypothetical-protein |
1845218_1845503_+
Protein sequences of NZ_HG813249.1|WP_003733686.1|1845218_1845503_+|hypothetical-protein>NZ_HG813249.1|WP_003733686.1|1845218_1845503_+|hypothetical-protein MNRRYLSNKRSEQKDCVFKTKDIPPENLKSLNIKMQGDRNCCYGVLEINGKQLRKGITAVKLDLKAGSLPVVQVEYHPFTISEEMQRLIWSGKY |
94 aa aa | NA |
HTH_XRE
HTH_XRE HTH domain information
|
NA | 1841141-1879982 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.32|827226|37|NZ_HG813249|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_HG813249 position: 1850997-1851033, mismatch: 0 caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta CRISPR spacer caaaacagagaacgcgtgttcattatcggacatctta Protospacer ************************************* |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
42353 : 51343
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_HG813250|42353:51343|DBSCAN-SWA GCTAAGCTGCCGATATCACAATCTCATCATCCACTAAATCAGCCTTCAAGTTTTTGACATCTAAGTGGTCAAGGTAAAAATCCGTTACCTTATCACGAATTTGTTGTTCAATTACTCGCCGTAACGGCCGCGCACCCATTGCTTCATCATAGCCTTGTTCCATCAGCCAATCTTTGGCCGCTTTAGTTACCTCAAGTTTGATGGATTTTTTGGCTAAAGTTTTTTGTACATCCGACAACATTAAATCGACAATTTGACTTAAGTCTTGCTTAGTCAGATGTGAAAATTCCACGATTCCATTAAAACGGTTCAGAAATTCTGGGCGGAAAAATGGTGCTAACTTATCCATTAATGACTGATCTCGTTGCTCGTCACCACTTAATGATTCATTACCAAAGCCAGCATTAGAAGTAGCAATAATAATCGTATTTTTGAAATTAATGACATTGCCTTGTCCATCCGTTAAGTGCCCATCATCCATCACTTGTAACAGTAACGTTAATACTTGTGGATCAGCCTTTTCAATTTCATCTAATAATACAATGGAATATGGATTACGCCGAACCCGTTCAGTTAGAGTATTAGCATTATCTTCATAGCCTACGTATCCAGCCGAGGTACCAATTAATTTCGACACAGCTGTACGATCAGCATATTCACTCATATCTAGCCGAATAATCGCATTTTCATTTCCAAACATATCTAAGGCTAATTGCTTAGCTAATTCAGTCTTTCCTACGCCAGTTGGGCCCACAAACAGAAAACTTCCAATCGGCTGATCACCCTCTGAAAAGCCCGCACGGTTACGCCGAATTGCTTTTGCTACCATTTCAACCGCTTCATCTTGACCGATTACCTTACTTTTCAGACGCTTATCAAGATTTTTCAAGCGCTCAATATCATTAGCGCCCATATCAGAAACTGGTATACCAGTTAAACGTTCAACCGATTGTGCCACATCATCAATCGTGGCAGTGATTTTTTCTTTTTGATCCGTTTCTTTAATTTTTTGCTTGGTTTCCTCGATCGACTTCTTGATATCAGCGGCTTTTGTAAAGTCCTCCGCTTTAATGGCGGCCTCCTTAGCTGCCTCTAATTTTTTAAGGCGTTGATCCAATGTCTCAACATCAGTTTGCGAATTTTTAGCCGCTAAATGAGCCGCAGTCATGTCGATCAAATCGATAGCTTTATCTGGCAAAGTGCGTTGTGGTATATATTGGATTGAATAATCCACAGCCGCCTTCAAAACATCATCTGGTAATACAACATGATGATGTTTTTCGTACAGCTCTTTAACACCTTGTAATATACGTAAAGTGTCAGCGGCCGTCGGTTCATTAATCACAACATCATTGAATCGCCGTGCCAAAGCCGCATTTTTCAAAATAGTATTGCGATATTCATCTTGAGTCGTAGCCCCGATTACACTCAGCTCGCCACGTGACAAAGCAGGTTTAATGATATCAGCCAATCCTTTGCCACCATCTTCACCACCAGTGGCACCCGTGCCGAGAATCTGATGAATTTCATCGAAGAATAGAATAATATTACCAGCTGCTTTAACTTCCTCTACCAGCTGTTTAATATTTTCTTCAAAAGAACCGCGATATTGAGTTCCCGCTTCCAAAGACGATAAATCAATCGAATAGATTTCTTTATCTTGAATCGTTTCTGGAACTTTACCAGCCACAATTGCTTGTGCCAGACCTTCGACGACTGCAGTTTTACCTACACCGGCATCACCAACTAAGATTGCATTATTTTTCGTTCTACGACTCAAAATTTCTGCAGTTTCTTGAATCTCATTCTCACGTCCAATCACTGGATCTAGTAAGCCATCACGAGCCTGTTCCGTCAAATTAGTCCCTAACTTTTCTAAAATCCCTCCTTTTTTAACAGCCTGTTTACCATCTTTAGATACTTCTATTGTTTTATTATTTTGGGGTAGCTTACCAGTTGCTCGGTATTGAGTAAACTCATCCGGTGTCAACGATTGTCCGTTAACTAAATACCGTGCACGCTCCGAATTTTGATTATCCATGCGCCGAAATAATTGATTGAAAACATCATCCATATCATTGTTGAAAAAAGGATCATTTCCGTAAAAATTTGCCATATTACAACACCTCCATAAAAATTTATATGTGTAACTTAGTGACCATAATATCCTTTAAGTTATAACTTAATTGTATCACAATTTTTATGTATCGCTAAGTAAAGTGACTATAGAATCAATTAGAAATAATTAGGATAATTTTGTTTAAACAAATGAGAAATCACTTTCATAAAATGAATTGATTTCCCTACAAGGTTCCCTATTTAATAGCCCTTGATAAAGAACTTGAATTAACAAGTTACTTTCCAGACCAATTTTAATTTAAGAGACTAATACTCATACGCGTGGTGCTAGTTAAATTTAGACAGTAAAAAATCCTGACGGTTTACACTTAGAGCAATCTATAGTAAAGAAGTGTTAAGCGTATCAGACTAAGACTTTGCTTTTTCGTGGGCTTCGATTGCCAGAACGACCTTTGAAACTTCGTTCAATTCATTACCTCATTTCTTTTATTATTTATGATACGGATTAAAGCGTACTCTTTGCCCAAAAAAATATTGTTAATAGGAACTCGATACAGATTAGACAGCTCATTTAAAAGAGAAAATGGAATATCAGAACTATCTTTTTCATATTTGGACAACGTTTGAAAATGCACATCAGCAGCTTTAGCGGCTTCTTTGCTAGTGAATCCAGCATTAACGCGCGCTGCCTTTAACGACATAGCAGATTATTTTGGCGTATTGAAGTCTACGATTGATCCGCGGTATGGCGAGATATCGAAAAATTTAATACCTGTTGAAAAATATAGACAGATTCCTGTTTTGGGAGAAATTGCTTGTGGAGATCCTATTTTAGCTGAAGAAAATATTGAAGAATATAGAGAAGAGATAGACGAAAACTTGCACAAAAATAACCCGAAAACTAACAACACTCTTTTTTTTGAGTGTTCAGTTTTCGGGTAGGGATTCAGAATAGGCTTAACAGATGAGAGCGTACCTAGTATCTTGCACCTGGATACTCACCAATAATAGCATAATTTAATTAGTAGCTCCATGTCGCTTTAGCTATTTTATTTAACTTTTTACACTTGCTGCTTATGAGTCGCATTTCTAAATTTTCCAAGCAGATACTTGACTTGACTAAATACGGCCGCCGTTAGCAAAACCAAGATGCATCCAAAGATAGTGACCCCTATGTAGTTATCCATCAAAACGTTTAATCGGAATAGCGCTGAAAAGTAAATTTCCATTAACACCGTGATACCTAACATTAAGACCATTCCTACTACATCAAATAAATTATTTTTCATTCTCTTTCTCCATCTCCTTTATTTTTTTATAAAGCGTTGCTCTTGGGACACCAGTATCTTCTACAATTTCAGAAATAGATACATCCAATTGTTTTCTATTCTTCCACATCGCGATTGCTCTCCGAATTTTTTCTTCTGGCTGACCTGTACGACCTAATTTCTTTCCAGCTGCCTTTGCACGTTGTCGACCTTCTCCAGTCCGATTGACGATCATATCTCGCTCAAATTCTGCAAAGGATCCAAGCACATTAAATAACAGACGTTGCATCGCATTATTTTCGGTATCTGCTTCAAACGTCATGTTATTATCTAAAAAAGTGACGCTGACGCCTTTTTCTTTAAATCGGTTCATCACGTTATTTAAATCAATAATCGATCTTGCTAGTCGATCAATCTTTGTCACAAAGACATGATCACCGTTTCTTGCCTGCTTCAGTAAATTTTCAAGCTCATGTCGATTTCTTGTGGTCGTCCCAGATTTTTTTTCAATAAATAGATAATCATCCGTGATCCCAGCATTTTTGAGCTTTTCGATCTGTGTCTGCAGATCTTGACCGACCGTACTCACACGTGCATATCCTAATTTCAACTTTTCCACCTTCTAACAGTCTATAATATGCAATATTCTATACCTTTAATTATAGACTATCTTGTAGACAAAAACAAGCATTTTTAAGTACTTAAAACCCGCATTCGTTCGTCGGCACAAAAAAAGTCTAGAAATTATAATTTCTAGACTTTTTTCAATTCTTAATAGCAATGCAATAAATTTATTTCTCCTTTCAAATTAGAATTGCTCAATTAATGAGCTTCAATTTCTCCATAAGTTATAAATTTCAGTTCTTCTATTAAAAGCTTCATGCCCACCTTCCATAATATCTACAATCTTATTTTGAATGAGTTTACTGTCGATACTACCAGTGTCAGTAGTAATTCCTTCATCATCATAAGATACTGAAATTATTTGTTCTGAGTCACCTAAAACAGGGATGTTAGCATTATGTGTAGCAAATATAAATTGAACATCTGGTTTTCTTGACTTTATTTCTTTGATGATTTCGTTATAAATTACTTGATTATCCAAATCATCTTCCGGCTGATCAATCATAATTAAATTATTATTCTTTTGCGAAAGGATAAATAACACCAGCGCTGAAGCTCTTTGACCAATGGAGTGGTTGGTAATAGGTTTTCCATGATAATTGATTGTAATATTGTTAGGTGTTTTGTGTTTAAGATAAGAACTGTACTCTTCCCTCACTCGTTGTTTAACTTTAGTAAGATGTGTGTCTGGCAATATCTGAGAAATTTTTTCAGAGTCTTTAAGCAGAATGTCTATAACTAAAGAGGTAAAGTCAGGAAATTTTCCAGTTATTTGTTCATAGCTACTAGTAGAAACACTAGTACCTTTAAATGAATCTTTAAGTTGGGTTAAAAATTCTTTCTTATCGCCTTTAAAAGTAATATGTAACTTTAATGAAGTTTGACTTTGATTTATTCTGTTTATTTCATTTTTATAAATTTCCAACTCTTTAAGAAGCGTGTCGTTTCTCTCCTGTACTAACTCATTTAGTTCAACGACTAATTTATTTTTTTCATTTTCTTGCTGATCGATTTTTTCTATAGCCTCTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_HG813250|42353:51343|49311_49800_-|WP_031669356.1|DBSCAN-SWA MWLFFFVILTTYEQHKGCKSDCERQCFINGHCISFPGEPNKKNIGITSFFEKRLATTINLLATFIIPYFSMRKKETGVREVDEIRERIRKRFGDISPAEMAEILKIDVKKNIHMEGGSKLAFIDGSPVILIGYRVSLLQYPKCIAKEIRQYLSDHPSIMESW >NZ_HG813250|42353:51343|49958_50336_-|WP_003769263.1|DBSCAN-SWA MARIHDLKILPIYFAEVVAKRKTFEIRKNDRVFCVGDMVRLKEWEKGDYTGREVTARITYLTDFQQKPGYLVFSFDLQRYQPSMESIKELHQQTDVGLLTCKLALIDANGNLELAIENMRNKGNA >NZ_HG813250|42353:51343|51016_51343_-|WP_031641563.1|DBSCAN-SWA MNAARRKRIDQSIEFIIKQTEEVESIMEEEQEAIDNIPENLQGSARYGEMEEAISHLEAVIRSLDDALDVLQYELSSRATVPSVKSTKKTLGEIIKEQGLLIKIEEEF >NZ_HG813250|42353:51343|50354_51017_-|WP_003731676.1|DBSCAN-SWA MANDDLLRKVKKLLALAADASDEESRSALARAQALMTEHAISEADIFDHRKQNLSEEVIQTAVYDGRPRRWMYRLAWIIAKNFRVEDFYITNESTQLIFMGLQSDVQLAEITFQYATGSIGYSARKYMQRPEIKRKRKRKWQMKQDYIEGYLSALESLFDQQVVTNGYELALQLPDVVKDEIAKIEFVTGKDVSHEVKDFEAYHTGYREGKKFKQRDQIN >NZ_HG813250|42353:51343|45094_45373_+|WP_003731679.1|DBSCAN-SWA MNPALTRAAFNDIADYFGVLKSTIDPRYGEISKNLIPVEKYRQIPVLGEIACGDPILAEENIEEYREEIDENLHKNNPKTNNTLFFECSVFG >NZ_HG813250|42353:51343|46531_48709_-|WP_096832442.1|DBSCAN-SWA MEELNSYDKGYFILMAHIEQRSGFLKECDGGLIESLAQKTYFKNSVLGFQKGRTRDKIKQLEQWMGYKLPYIEGSDCKSIDEIGKGDKKCYVKIGDSNFDSVALAFKDFKNRISLEKSTSSHGFIRSVEFLGGKLDGKKIYLSPELNCLIGIRGSGKSSIIEAIRYALDIPPSNSDNDYKREVVKNLLGSGGQVILELQDNYGNLYRIKRILGEDPHVTDMDDKGVGAKIGSILSAPLYFGQKDLSAMDNGFELTLLDKIVGEVSGNFETQISNIEERISSKMKGFINLENKINNGGELEKDLSDIKHKIKIFEEKGLSDKLSKQVNFQQDKATIDNVNTLVGKYIQALQNIISSEELSMLIKLEKSNSQEVPELFEKLRIEIKKVTSTKNKIEEIIQEVKDSKSKLVEFSNEMNNTITSLEEEFAEIKREIDIPNLNPDDFSALKLRETKIEEAIEKIDQQENEKNKLVVELNELVQERNDTLLKELEIYKNEINRINQSQTSLKLHITFKGDKKEFLTQLKDSFKGTSVSTSSYEQITGKFPDFTSLVIDILLKDSEKISQILPDTHLTKVKQRVREEYSSYLKHKTPNNITINYHGKPITNHSIGQRASALVLFILSQKNNNLIMIDQPEDDLDNQVIYNEIIKEIKSRKPDVQFIFATHNANIPVLGDSEQIISVSYDDEGITTDTGSIDSKLIQNKIVDIMEGGHEAFNRRTEIYNLWRN >NZ_HG813250|42353:51343|45492_45720_-|WP_003728510.1|DBSCAN-SWA MKNNLFDVVGMVLMLGITVLMEIYFSALFRLNVLMDNYIGVTIFGCILVLLTAAVFSQVKYLLGKFRNATHKQQV >NZ_HG813250|42353:51343|42353_44468_-|WP_003728507.1|protease|DBSCAN-SWA MANFYGNDPFFNNDMDDVFNQLFRRMDNQNSERARYLVNGQSLTPDEFTQYRATGKLPQNNKTIEVSKDGKQAVKKGGILEKLGTNLTEQARDGLLDPVIGRENEIQETAEILSRRTKNNAILVGDAGVGKTAVVEGLAQAIVAGKVPETIQDKEIYSIDLSSLEAGTQYRGSFEENIKQLVEEVKAAGNIILFFDEIHQILGTGATGGEDGGKGLADIIKPALSRGELSVIGATTQDEYRNTILKNAALARRFNDVVINEPTAADTLRILQGVKELYEKHHHVVLPDDVLKAAVDYSIQYIPQRTLPDKAIDLIDMTAAHLAAKNSQTDVETLDQRLKKLEAAKEAAIKAEDFTKAADIKKSIEETKQKIKETDQKEKITATIDDVAQSVERLTGIPVSDMGANDIERLKNLDKRLKSKVIGQDEAVEMVAKAIRRNRAGFSEGDQPIGSFLFVGPTGVGKTELAKQLALDMFGNENAIIRLDMSEYADRTAVSKLIGTSAGYVGYEDNANTLTERVRRNPYSIVLLDEIEKADPQVLTLLLQVMDDGHLTDGQGNVINFKNTIIIATSNAGFGNESLSGDEQRDQSLMDKLAPFFRPEFLNRFNGIVEFSHLTKQDLSQIVDLMLSDVQKTLAKKSIKLEVTKAAKDWLMEQGYDEAMGARPLRRVIEQQIRDKVTDFYLDHLDVKNLKADLVDDEIVISAA >NZ_HG813250|42353:51343|45709_46318_-|WP_003728511.1|DBSCAN-SWA MEKLKLGYARVSTVGQDLQTQIEKLKNAGITDDYLFIEKKSGTTTRNRHELENLLKQARNGDHVFVTKIDRLARSIIDLNNVMNRFKEKGVSVTFLDNNMTFEADTENNAMQRLLFNVLGSFAEFERDMIVNRTGEGRQRAKAAGKKLGRTGQPEEKIRRAIAMWKNRKQLDVSISEIVEDTGVPRATLYKKIKEMEKENEK >NZ_HG813250|42353:51343|44895_45132_-|WP_003728509.1|DBSCAN-SWA MSLKAARVNAGFTSKEAAKAADVHFQTLSKYEKDSSDIPFSLLNELSNLYRVPINNIFLGKEYALIRIINNKRNEVMN |
10 | Cronobacter_phage(16.67%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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