Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NC_004087 | Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 1, complete genome | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 3 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1305 : 31003
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_004087|1305:31003|DBSCAN-SWA 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MSYCLEIIMKIFTFVGFTKHLDELDFDYVVVDKTFNDMSDDQIKKYQEKIIWIMTNTEIRWLRIAKQLLTIVNFAKNIEDDIIAIIDSDLIIPNLREIIPNERIFTPCYWLYYDWANEIRPFCSGTNYIFRKSLLPYLEYTINTYIENEYYKEIPVDIFIHNFIPHMNILKLGTIHYVKTPIGEIKMEFRYEDIQQIFKHIPEFVLLIG >NC_004087|1305:31003|16140_16365_+|NP_666616.1|DBSCAN-SWA MNYLKMSEQKKKSNLNTELTAKLYLALDDLTMALATEDKEEVRKSEVFQKALEVVKVVKEMRRLQVKPAEGEEK >NC_004087|1305:31003|11576_11789_-|NP_666608.1|DBSCAN-SWA MDLIAFKNVKSKFLLMALLGYECPICGEIYIKRKSMITHLRKHNTNLKLSNCRRISLRTGEYIEIKTEEE >NC_004087|1305:31003|27608_28334_-|NP_666628.1|DBSCAN-SWA MEIKERKKLDYLPNVFLLPDGNKISVTDKFINCEKYISRSRLTFQGCFEVSILENKIKVDKAKETNGIYYTPNPPIFNITFKQKIFRKINDIKSMLINLDLSKVSLKSSSIIIKYDNYSIQLFDIYYKGEKLEFSPAFYPDGKQGHLSVYEVPPLKIEKINEELFEKTRIIGIYNHIIEFDINVLKYKQLHIMPGEGALVYLPEPPVVKIISPEHDNVGFTEFGGKWLLFSHPVPKKNPKD >NC_004087|1305:31003|13251_13506_-|NP_666611.1|DBSCAN-SWA MNYLRRKMKMSETTLVLTIISTTTTTLFAIIQLYLKIKQALKDAVKEIVNSELSNLKTEIEELKIKQDELSRQVEEIKRKLDQK >NC_004087|1305:31003|28568_29327_-|NP_666629.1|DBSCAN-SWA MNKVEVSVRKKLNNLPKVFLDIYLNKFTLDKNYINCVHYVSRSGLTQEGCVTGYTVGSMLKIDTLKEVKGIYYVPHPSIINITFRQKAIRNLDDLKQFLMSLDVSKISPRQPWLLVKYSNYSIEVFDIYFKGLIYEFPLLAEQGHLRIYSVPEPKDVYLLYYDNDGQKREINKELFTEVSEFMIFNHKVTFDKSILMFKNLYVTPGSGTLLYVPEDVHVKLESSDHKEVEVNVNRDTWLLFSHTRPRRSGQD >NC_004087|1305:31003|10158_10635_-|NP_666605.1|DBSCAN-SWA MILSDRDIKTYINSKKLVINPLSEDTIRENGVDLKIGNEIVRIKENMEKEVGDEFIIYPNEHVLLTTKEYIKLSNDIIAFCNLRSTFARKGLLIPPTIVDAGFEGQLTIELVGSSIPVKLKSGERFLHLIFARTLTPVEKPYNGKYQKQKGVTLAKED >NC_004087|1305:31003|13060_13255_-|NP_666610.1|DBSCAN-SWA MITYYYDEKNKELHIKIYILIDQVPNKPTEEELKKVLPKILKDYANMIENGKMKLIDSKEWGIW >NC_004087|1305:31003|2117_2426_+|NP_666591.1|DBSCAN-SWA MEFEDLDVVLYVFFENPEMKSFEFEFKQLFETTESGLRYLIGVPDSRNKIKNNNEIIEEFIYYQNDDIVTKLIFYYTKGTNRIYIRKIYGWKEKRLESEDEE >NC_004087|1305:31003|25308_26379_+|NP_666624.1|DBSCAN-SWA MQKTIFYVYPQHHDVSFKFVAQEHVKMLREKYIVYEIPTLSFYQFTPFRYPISIIHPLFYSMWKWGKIEFSFFEQYRTRVSALLGVEVADTDKIAKQYIEYANNFTDGMILNSEWSVNAFKNSGLKVPAYKVFHNFKDRLLAKNEELKLDDQILYIEKLKKEKNFKLIFISLWHSDYRKGADIFHVIAKELQKERNDIYFLVKSGLPRTDFQDLKMFNIFGNTSFDNIVKMYRISDLYLLTSRGGSFELNGLEAFISKIPALATKGGAWEDYYPPNLKDLLIDSCENPQIFPDNPIHIGNGVQMCIGKAIDKILEVLDNYDNYKAKIEENYNFWIENFSYNAVKKQLLEVMEKYSN >NC_004087|1305:31003|29937_30165_-|NP_666631.1|DBSCAN-SWA MDLFFEDSIIQELSLKFKISFEINEEEYQQLIELAFSQFIYPSNDNIEIKINTKELADNEKALLYEIQLWRTKKS >NC_004087|1305:31003|3961_5161_-|NP_666595.1|DBSCAN-SWA MELERKSSGIIKSFNVLDIFSINLLYMGILSGISYPLFVSSLMKNVNLLFAIVIGAVFEIPLLLMYYKLTTKFPLNGGDYAYIRTAFSSKFYTIFGISLWLTYVLSQPILGDLVLLNFNIQNQFEQFLIVESLFPLVLLIIASKRIYAKIVDILAIFQIIIAIFIAFKSFNYQYQTFTISNTLLSALLFDLSAFIFINAISYIAGEIKNIKKSSMIGYFVSYGVVAILSILDSYSNLNILFALMPIWFFSYMPIANKIQSRLIQTMSFDKVLPEKFSKINPNVLLLIFSTETIANVLENLLGFNISFGLDGLLFIFWNFIIVAFAYLKLMNDKKLFSIVLTSLAIQIFLFFYLGYQNPIFYKFVIAGNIEYTILRIMILPIIGAIVYLLRKSKINVIPK >NC_004087|1305:31003|23281_23758_-|NP_666621.1|DBSCAN-SWA MNFDDYFCKLQCCYWREFEFAYSKLDVKDKTITIIGNDCGSSALYFLLKGAKKIIGFEKEEKLNQIFKETVCKEFKICDKVESKGEWKSNEYPDTDILVMDCEGCEKNLDFSKLQKYKQYCIAIHDWTENRFDLLRKLYGTILTFVTDDNREFVFCKL >NC_004087|1305:31003|13471_13804_-|NP_666612.1|DBSCAN-SWA MRIEDPFQNIFGVVRIAIDKIKELEQRGQIYGLSRFLPNSIIVMKTIDYPLIVDLYIPGFTFYFQFSIIQDQQTKQIFIDDFRVVYPQPYAKQINSTANFELSEEENEDE >NC_004087|1305:31003|8184_8808_+|NP_666600.1|DBSCAN-SWA MVIMNYEDHIKESFKVKYPADTIFPSEVGICYRKSYLARNIEFERGINEIYLDLGEQYHERIEQYFKEKLNCQTEVEIKDEIEGIKISGRIDIVCNNDLLEIKTISYNYFQVKEYHLYQVALYYHILKKQNYQINNVYIVYLNRNTREVKQFKIDEKVLENYYQKVIEWIKKFKEYLKETDYKKVPGVNNYICKSCEFKQKCIISLF >NC_004087|1305:31003|1305_1473_+|NP_666589.1|DBSCAN-SWA MKKEIQVQGVRYYVESEDDLVSVAHELAKMGYTVQQIANALGVSERKVRRYLESC >NC_004087|1305:31003|26664_26952_-|NP_666626.1|DBSCAN-SWA MNLKKVKRIIDMFFKEKNLNELTLAFKRPLIVSENEYNELVGRPNLSFVDKDPWVLSDEFVYYELSNTLVKLIIYYFKEKGFIHILEIDLFREKR >NC_004087|1305:31003|5397_5568_-|NP_666596.1|DBSCAN-SWA MQTQEQSQKKKQKAVFGIYMDKDLKTRLKVYCAKNNLQLTQAIEEAIKEYLQKRNG >NC_004087|1305:31003|2446_2677_+|NP_666592.1|DBSCAN-SWA MSYIEKLGDNMVKRLKILIDNEFSNLIIEFKRNVKKSFEGEAFVTIGIDENDKISYISIEPLDKDLKEGIKRIKVL >NC_004087|1305:31003|6447_6843_+|NP_666598.1|DBSCAN-SWA MASLKEIIDELGKQAKEQNKIASRILKIKGIKRIVVQLNAVPQDGKIRYSLTIHSQNNFRKQIGITPQDAEDLKLIAEFLEKYSDFLNEYVKFTPRNNNAIQEEEIDMEQQEEKEEKPREKGKKKSVEEEF >NC_004087|1305:31003|26379_26652_-|NP_666625.1|DBSCAN-SWA MEFEELKSIVEKFFQDQTIVRMNLMLNKEIIVSYNQFEEIIKDGDLTYRYAEKNRTVDFYEYRNNIHSIINYFWKDNKVCIIEIDFWRSR >NC_004087|1305:31003|11141_11546_+|NP_666607.1|coat|DBSCAN-SWA MAKGHTKRSYSQRYAKWQAKFNAFSNPTVASTILSNVAPVAQQNFQTNVPTFTAVNENVSAVLSQYGITGPNRAIYQGFGLKIARALNRIGSGPALVNMINGLKSYYISAFNANPQVLDAVVNIITGSPTGYVS >NC_004087|1305:31003|13893_15426_-|NP_666613.1|DBSCAN-SWA MLILLILYFLFLQLHIFDSFIKSIMYDIYIHYAICKFIFLLEIYKLIAMGKRKGQRNIASMKYHLYNKILNRKSFPAFSVMFDAGVESVLPTPLENIQIPLGINTNYGIAYASIISSLLSALNNLAISVFNPNFNSQTFLNLGQSANFGISNGISLLNNYTSLYDNYVQLCNILYQPAVFDETYFDLSVYQPALATEYQNQSCKKIEQYFSSLTTTNVSVNVTTLGTGITNIPNVDNYMYNNIADTGIIDLLNALNINFNQLPDFAKFIIAFIPDLNSIINNGFALDVGWLDRCVLAPETQNGIQLQNGMILQYFADVFGMILDYTPLDFAVLMPEFNPENVTQDDLIAILSADKTVISIFGNLFKMHLYDPSPGGINIAYSSEIENYAVSYQQFLQIQKIVNKKYSNIWYAKMVASATIEIARYPYQQNYSYTSGKRTLSYQDFLNYWKTKWKFYGLTDQDLQYAQQLGEQLQGQAKIENQIKLAQKSAKTKQYKPIFYYKNFQNIAVR >NC_004087|1305:31003|10647_10953_-|NP_666606.1|DBSCAN-SWA MEIDIKNECRKYIIQFRNWLESRYSDNIYFFNVFEDEEIILMQIKINMKKKEYEKAGMSMLKYLVRTFKYPNYIKVNWRYDKNMFKISAICGDINMSESNN |
45 | Sulfolobus_islandicus_rod-shaped_virus(55.56%) | coat,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_004087.1|NP_666617.1|16361_16706_+|DNA-binding-protein |
16361_16706_+
Protein sequences of NC_004087.1|NP_666617.1|16361_16706_+|DNA-binding-protein>NC_004087.1|NP_666617.1|16361_16706_+|DNA-binding-protein MNKVYLANAFSINMLTKFPTKVVIDKIDRLEFCENIDNEDIINSIGHDSTIQLINSLCGTTFQKNRVEIKLEKEDKLYVVQISQRLEEGKILTLEEILKLYESGKVQFFEIIVD |
114 aa aa |
AcrIII1
anti_CRISPR3664|NP_666617.1|AcrIII1|III-1|Verified|Sulfolobus-islandicus-rod-shaped-virus-1 information
|
NA | NA | 1305-31003 | NA | ||||||||
NC_004087.1|NP_666628.1|27608_28334_-|hypothetical-protein |
27608_28334_-
Protein sequences of NC_004087.1|NP_666628.1|27608_28334_-|hypothetical-protein>NC_004087.1|NP_666628.1|27608_28334_-|hypothetical-protein MEIKERKKLDYLPNVFLLPDGNKISVTDKFINCEKYISRSRLTFQGCFEVSILENKIKVDKAKETNGIYYTPNPPIFNITFKQKIFRKINDIKSMLINLDLSKVSLKSSSIIIKYDNYSIQLFDIYYKGEKLEFSPAFYPDGKQGHLSVYEVPPLKIEKINEELFEKTRIIGIYNHIIEFDINVLKYKQLHIMPGEGALVYLPEPPVVKIISPEHDNVGFTEFGGKWLLFSHPVPKKNPKD |
241 aa aa |
AcrIIIB1
anti_CRISPR3665|NP_666582.1|AcrIIIB1|III-B|Verified|Sulfolobus-islandicus-rod-shaped-virus-2 information
|
NA | NA | 1305-31003 | NA | ||||||||
NC_004087.1|NP_666629.1|28568_29327_-|hypothetical-protein |
28568_29327_-
Protein sequences of NC_004087.1|NP_666629.1|28568_29327_-|hypothetical-protein>NC_004087.1|NP_666629.1|28568_29327_-|hypothetical-protein MNKVEVSVRKKLNNLPKVFLDIYLNKFTLDKNYINCVHYVSRSGLTQEGCVTGYTVGSMLKIDTLKEVKGIYYVPHPSIINITFRQKAIRNLDDLKQFLMSLDVSKISPRQPWLLVKYSNYSIEVFDIYFKGLIYEFPLLAEQGHLRIYSVPEPKDVYLLYYDNDGQKREINKELFTEVSEFMIFNHKVTFDKSILMFKNLYVTPGSGTLLYVPEDVHVKLESSDHKEVEVNVNRDTWLLFSHTRPRRSGQD |
252 aa aa |
AcrIIIB1
anti_CRISPR3665|NP_666582.1|AcrIIIB1|III-B|Verified|Sulfolobus-islandicus-rod-shaped-virus-2 information
|
NA | NA | 1305-31003 | NA |