Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_004086 | Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 2, complete genome | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 3 |
1. NC_004086
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
1137 : 34313
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_004086|1137:34313|DBSCAN-SWA ATTGAAAGTCGAGAGATACAAATGTAAAAAGATAGAGAAAACTTTAAATACTAGTTTATGCATATGTTATATTGGTGAAAAAAAGATGCAAAAAGTTGTTCAAGTCGGTCAAACAAGGTATTTCGTAGAGTCTGAGGATGATCTAATTTCTGTAACTCATGAGTTAGCCAGGAAGGGTTTCACAGTTGAAAAGATAGCAAGTTTACTAGGAGTCAGTGTAAGAAAAGTTAGGAGATATTTGGAGAGTTGTTAGAAAAGTTAGCCTTATTTTTTTATTTGTAATTTCTAATTCTTCTTTTTCTAATTTTTATTTTTCTCCTAATTAGCTAAGACTATGGACCATTTTTTTCAAGTTTGTGATACTATTTCTAGAGGTTGAAAATATAGAGACATGAAAAAGTAAAGAGATAAAGATGTAAAAGATTAAAGAAAGATTTAAATAGTAGTTTGCACATATGTAAAAGTGGTGAGAAAAGAATGAGTAAACAAATAGGCGTAAAAAATATTTCGTATTCAATTTCTAGTTTAGTTGAAGATTTTTTTATTGAGACGCAAAAGCAAGTCAAAATATTAAGACCGAAAAGGATATTTAAATTTGATAAAGATCAAATGCAGGACTTAATAAACGAGTTAATATTTGAATTGGACGTAAAACCAGACAATATTTATGCATATGATTCGGCAATTTATCAAATGTTTGAGTTCAAGTTCAAATTATCGGTAATTAGAATATATTTCAGAAAAGCTCTTGAAAACCATAAAATTGTCTTTATTTTAGAAAAAGTTGAAATGATTAAGTATCATTAATCTTTTTTTATTTTTTTCTTTTTAATTTTAATTTATTAATTTTCTTTTTCTATATTTAGCTAATTCTATCAATAATTTTTCTCAATTTCTAAATATTATTTCTAAAAGTTAAAAAATCAGAGAGATAAAAAGATAGAGAAAACTTTAAATACTAATTTATGCATATGTAAAAGTGAGGTGAAAAAGATGAAATTCGAAACGTTAAAAAACATGATAAATCCGGTTTTTGAAAATTCGGAGATATGGGAAGTGGATTTAATTTTTAGTGAAGAGATTGAGTTAACAGAGGATGAATATAAAGATCTAACGAAAAATGCGGATCCACTGCAAGAAATTATAAATGATACAACAGGTGTAAATATATACACAGATACATATGAGTGGTGGGAGTTCAATAATCAATACTTAGAATTAGAGATTGACTATTATAGACAAAATGATAAAATATATTTGCTTGAATTACATTTCTGGAGAAAAGTCAAAAAGTAAATTAATTTTTTATTTTTCCTAATTTCAGTTTAATTTCTGTTTTTTTATTTTCACCTAATTATTTAATTTTATCGATAATTTTTCTCCTTTTCCAAATATTATTTCTAAAAGTTGAAAATATGAATTTGATATACTAAGTGTTATGAAGTCAATTAGAAAAAGATATATTTGTCAAATTTCTTAGTTTTATTTTTGAGAAGTTATGGATGAAGATCTTTTAGTTGAAGAAAGTGATAATATTTCAGTTTTAAAATGTAAAAAATGTGGAAAAGTAATTGGAATTGTTGAAAAAAAGGAAATTTCATATTATGCAAAAGTTTTAAAGAAATGTAAACATTTCAGTTGGGGTTATATAGATAAAAAATTTGTCGATAATAATTCTTTACTGTTTGGAATTATAATATATCATATTCCGTTTTATACAATTGGAAAAAATAAGTATTATTTACTGTATAAAGTGAAAAATTTGAGATGAAAAATTAGAGAGATAAAAAGATAGAGAAAGATTTAAATATGCGTTTTTATATATATGAAAACGGTGAACTATAAATGAATGTAGAAAATCAAGTAGAAAAAATAGTTTCATTAGTTGAAAATTTTTTTGACAAATCAAATAAACCAATTGAAACAATAAAGTTAAATGGTAAAGTAATGTTTAATGAAGAACAGTATGATGATTTAATTGGTGAATTAGCTATGACTTTAGCAAGAGGAAAATTAGAAATTTATGAGAGAGAAATACAGTCATTATATTTCAGTGAATTTATTTGTGTAAAAAATAACGAAATTGTAACAATTAGGATGTTTTTCGAAAAAACTAGAGAAAAATATCAATTGAAATTAATTGAAATGACAAGACTTATATTTAAATGTCAATAATTTTTTTCTAATTTTTTCTTTTTCTTTTTAATTTATTTTTTCTCTTTTTCTCTATTTAGCTAATTCTATCAATTATTTTTTTCATATTTCGAATATTATTTCTACTTCTTAATAGTTTTCTAAAACTAACATTTAAAATTGTCATAAATTTAAAGAAATTTAGTAGTGAGAAATATGGGCTATCAATATATTCCAGATGAAATAATTAAGTTAGCTGAAAAATATGTTAAAAATGCAAGTGATAGAAAAAATATATTGAAAATGATAAGAAGAAAAATGATTGAAAAGAAAATAATAGAAAAGTTTAAAAAATTTTATAACATAATTCCATATTATATACAAAAACGTATAAATATATTTAATGGTGAATTTGAATATGGATTTGAAGACAGTTATAAAAATAAGGATGAGAAAATTGAAGTTATTACTAAAGTTATACTAAAATTTAAATATGAAAATGGCGAATTAAAATTATTAGGAATAAAATTCGAAAAATCTATTAATAAGATTTCCTAATTTTTTTATTAGAAATACTATTTCAAAAAGCTGAAAAAATAGAGACATGAAAAGTTAGAGAGATACAAACGTAAAAGTTTAGAGAAAGCTTTATATAGTAGTTTGACAAATATAATATTGGTGAAAAAAGAATGAGTCAAAAAGTCGAATTTCCTTTAAATGTTGAGTTAGAAAGTCAAGAAGAAAAAGTTGAGTTTCAAGTCAAGAAGTTGTATAAGTTTTTTAACTACGTGGAGAATTATCATAACAGTAAAATTAGTAGCGAAGCTAGTGGTAACCATTTATATTTGTTCATTAAAGACGGTGAGTTAAATGTTGATTATGACGGTGATTTCGTTATAAAAGCTCCTAGTTTGCATGTTTCAATTTCTATTGACCGTAACGAAAATCAAGTCGAAATTAATGGTAATGCTAACGGTTACGAATTTAAGATAAAATTTGTCGGAAAAATTAGTGTGTTGGCGAGACAAAATAGAGTCATGTTGATATTTAAAGTTGAATCGTTACCAGAGATTTCTAGATATTAATCATTTTTTATTTTCTTTTTTTAGTTTTTTCTTTTTCTTTTTAATTTCCTAATTTTCTTTTTCTATATTTAGTTAATTCTATCAATAATTTTTCTCAAACTTCAAATTTTATTCCAAGAGCTTAAAAAAATCGAGACATAAAAAGTTAGAGAGATAGAAAGATAAAAGAATAGAGAAAGCTTTATATATGAGTTTTTCGTATATATCAATTAGTGATAAAAAGATGATAAGTGAAAATGTGAAAAAACTAAAAGAAATGATAAACAGTTTCATTAAATCTGAAGAGAAAGAAAAAGAAATTGAATTTAATCCATACTTGATACTGAATAAAAGTGAAACAATAGAAGCATTTGGTAGAGAGAAAAATTCTATATTAACAACACGATTTGATTTATGGATAAACTTATTGTTTTTTGACAAATATAAAATTTTAGTGATATATGAAAATCCAGATGACAAAAAGTTTATAATACATAAGATCAAATTAATAAAAAACTAATCCATTTTTTTTATTTTTTCATTTCTAATTCTTGTTCTTATTTTTTTCGTTTTTTAGTATTAGCTAATTCTATCGATAATTTTTCTCACTTTCCAAATATTAATTCTAATTTTTAATGATTTCTTGAAATTAGTATTATGGAAAGAAGTTTTGATTATCAATAAACTAAGAAAAGAAGAAAAAAACAAAAAATAATATCTTATTTATTATTATTGTTTATCAAATTCTGAATTTGCGGTAAATAATCTTTATTTATGCATATTACTTTAACTTTTCTGTTTATTTTAGGATCTTTCACTTTTTTCTCATAAAATATTCCTTTTTTTAGTAAATTATTTATTACTTGTCGACCATAACCAAGATTGTATGTTAATGATTCATCTTCAAAAATTACAAGTTTTCCTTGATTTTTGTTAATTATATGTTTTCTCTCACAAATTTCATAAGGAGTATCTGTGAGTATTTGATATTTTTGTAACTTAGCAAAAAATCTTCTTATAGTATCTATTTGTCTTTTTCCTAATTTTCTCCTCATTTCTTTTTCACTGATATAGTTTTCGATTTATGACATTTTTATGTTTTCATATTTCTATCTAAGTTTATCAATAATTTTTTTCAAGTCTGTGATAATATTTCTAAAGATTGAAAATATTGAGAGATGAAAATTTAAAATTGTCATAGTTTTATCGAAAATATAGTGAGGAAAAAATGGAATTTGAAGATTTAGATGTAGTTCTATATGTATTTTTTGAAAATCCAGAAATGAAAAGTTTTGAATTTGAATTTAAAGAGTTATTTGAAACTACTGAAAATGGTTTTAAATATCTAGTTGGAGTTCCAGATTCAAGAAATAAAATCAAGAGTAGTAGCGAAATTATTGAAGAATTTATATACTATCAGAATGATAATATTTTAATTAAGCTAACATTTTATTATACTAAAGGCACGAATAAAATTTATATAAGAAAAATCTATGGATGGAGAGAGAAAAGATTAGAGAATGAGGATGAAGAAAACAATATTTAAGAAAGTTAAGTGATCATATGAAGATTCTAGTAGATAATGATTTTGGTAATCTTATAATTGAATTCAAGAGAAATGTTGAGAAAAGTTTTGAAGGTGAGGCTTTTGTCACTATTGGTGTCGATAAGAATGGTAGGATATCTTATATCTCAATTGAACCGTTAGATAAAGATCTAAAAGAAGGAATAAAGAGGATTAAAGTTCTTTAATATTTGATGATTTTTTAAAATCAATATTTAAAAATGTCATGTTTTCACAAT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MNLKKVKRIIDMFFKEKNLDELTLAFKRPLIITENEYNELVKRPNLSFEDKDPWVTSDEFVYYELSNRVVKLIIHYFKEDDIINILEIDLFREKR >NC_004086|1137:34313|29521_29806_-|NP_666579.1|DBSCAN-SWA MVKKMEFEELKSIIDKFFQDSTIIRINLRFNKEVIVSYNQFEELIRNGDLTHRYADKNITSDIYEYRENINSIIDYYWKDNKICILEIDFWRSS >NC_004086|1137:34313|26424_26901_-|NP_666575.1|DBSCAN-SWA MNYDDYFCKLQCCYWREFDFAYSRLDVKDKTITIIGNDCGSSALYFLLKGAKKIIGFEKEEKLNQIFKETVCKEFKICDKVEIKGKWKGNEYPDTDILVMDCEGCEKNLDFSKLQKYKQYCIAIHDWTENRFDLMRKLYGSILTFVSDDNREFVFCKL >NC_004086|1137:34313|9867_10263_+|NP_666551.1|DBSCAN-SWA MASLKQIIDELTSQAKENNKIASRILKIKGIKRIVVQLNAVPQDGKIRYSMTIHSQNNFRKQIGITPQDAQDLKLIAEFLEKYADFLNEYVKFTPRNNNAIQEEELDMEQQEEKEEKTREKGRKKTVEEEF >NC_004086|1137:34313|2981_3311_+|NP_666539.1|DBSCAN-SWA MNVENQVEKIVSLVENFFDKSNKPIETIKLNGKVMFNEEQYDDLIGELAMTLARGKLEIYEREIQSLYFSEFICVKNNEIVTIRMFFEKTREKYQLKLIEMTRLIFKCQ >NC_004086|1137:34313|1137_1389_+|NP_666535.1|DBSCAN-SWA MKVERYKCKKIEKTLNTSLCICYIGEKKMQKVVQVGQTRYFVESEDDLISVTHELARKGFTVEKIASLLGVSVRKVRRYLESC >NC_004086|1137:34313|27838_28369_+|NP_666577.1|DBSCAN-SWA MKIFTFVGFTKHLDELDFDYIVVDKTFNDMTEEQIEKYQEKIIWIMTNTEIRWLRIAKQLLTIVNFAKNIEDDIIAIIDSDLIIPNLREIIPNERVFTPCYWLYYDWANEIRPFCSGTNYIMRKSLLPYLEYTINTYIENEYYKEIPVDIFIHNFIPHMNILKLGTIHYVKTPMEK >NC_004086|1137:34313|2120_2432_+|NP_666537.1|DBSCAN-SWA MKKMKFETLKNMINPVFENSEIWEVDLIFSEEIELTEDEYKDLTKNADPLQEIINDTTGVNIYTDTYEWWEFNNQYLELEIDYYRQNDKIYLLELHFWRKVKK >NC_004086|1137:34313|32492_32819_-|NP_666585.1|DBSCAN-SWA MGKKMDDIRNLSQIIETIQKLLMSTEIGVKVVNFENSLDLHYEEFEWLIEDFTSDNVKHYWFFSGVQDGRYDIFVFDNPKELKRIVIESYRNLERIFIKSIQLIRYPR >NC_004086|1137:34313|2634_2907_+|NP_666538.1|DBSCAN-SWA MDEDLLVEESDNISVLKCKKCGKVIGIVEKKEISYYAKVLKKCKHFSWGYIDKKFVDNNSLLFGIIIYHIPFYTIGKNKYYLLYKVKNLR >NC_004086|1137:34313|14492_14660_-|NP_666561.1|DBSCAN-SWA MALLGYECPICGKIYIKRKSMTTHLRKHNTNLKLSNCKRISLRTGEYIEIKAEEE |
54 | Sulfolobus_islandicus_rod-shaped_virus(98.15%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_004086.1|NP_666537.1|2120_2432_+|hypothetical-protein |
2120_2432_+
Protein sequences of NC_004086.1|NP_666537.1|2120_2432_+|hypothetical-protein>NC_004086.1|NP_666537.1|2120_2432_+|hypothetical-protein MKKMKFETLKNMINPVFENSEIWEVDLIFSEEIELTEDEYKDLTKNADPLQEIINDTTGVNIYTDTYEWWEFNNQYLELEIDYYRQNDKIYLLELHFWRKVKK |
103 aa aa |
AcrID1
anti_CRISPR0435|NP_666537.1|AcrID1|I-D|Verified|Sulfolobus-islandicus-rod-shaped-virus-2 information
|
NA | NA | 1137-34313 | NA | ||||||||
| NC_004086.1|NP_666571.1|19828_20173_+|hypothetical-protein |
19828_20173_+
Protein sequences of NC_004086.1|NP_666571.1|19828_20173_+|hypothetical-protein>NC_004086.1|NP_666571.1|19828_20173_+|hypothetical-protein MNKVYLANAFSINMLSKFPIKVTIDKIDRLEFCTNIDNEEIINAIGHDATIQLINSLCDTKLEKNRIEIKLDKNDKLYIIQISQRLEEGKILSLEEILKLYESGKVQFFEIIVD |
114 aa aa |
AcrIII1
anti_CRISPR3664|NP_666617.1|AcrIII1|III-1|Verified|Sulfolobus-islandicus-rod-shaped-virus-1 information
|
NA | NA | 1137-34313 | NA | ||||||||
| NC_004086.1|NP_666582.1|30774_31524_-|hypothetical-protein |
30774_31524_-
Protein sequences of NC_004086.1|NP_666582.1|30774_31524_-|hypothetical-protein>NC_004086.1|NP_666582.1|30774_31524_-|hypothetical-protein MEVKQIKKLNNLPWVFLDTYLNKFALDKNFVNCAYYSSRSGMTQEGCVQVMQVGDNFKVDTMREVHGIYFTPHASIISLIYRQKGIRSIDDLKEILGSLNLSKVSPKHYQLLVKYSNYTIEIYDIYFKGHIYEFPLVSQQGHLNVYNVPEPRNVYLIYYENNEEKKELNKDLFNEVSEFMIYNHRVTFEKPVLEFKNLQITPGGGALVYVPESMYVKLESSDHQSVEFRPSRDDWLLFSHPRPRRSGND |
249 aa aa |
AcrIIIB1
anti_CRISPR3665|NP_666582.1|AcrIIIB1|III-B|Verified|Sulfolobus-islandicus-rod-shaped-virus-2 information
|
NA | NA | 1137-34313 | NA |