Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_JPTX01000038 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig45, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000012 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig12, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_JPTX01000050 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig57, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000035 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig41, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000004 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig4, whole genome shotgun sequence | 1 crisprs | cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3,cas2 | 1 | 12 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000002 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig2, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | csa3,DinG,cas3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_JPTX01000031 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig37, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000056 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig63, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000066 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig75, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000063 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig72, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000042 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig49, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000055 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig62, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000023 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig27, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000029 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig34, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000007 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig7, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | DinG | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000044 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig51, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000026 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig31, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000019 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig23, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000059 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig67, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000058 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig66, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000022 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig26, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000018 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig19, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000024 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig29, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000051 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig58, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000049 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig56, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000030 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig35, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000053 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig60, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000001 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig1, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | DEDDh,cas3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
NZ_JPTX01000052 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig59, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000048 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig55, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000036 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig42, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000015 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig15, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_JPTX01000060 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig69, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000057 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig65, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000003 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig3, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000016 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig16, whole genome shotgun sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000065 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig74, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000014 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig14, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 1 |
NZ_JPTX01000045 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig52, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000020 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig24, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000025 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig30, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000064 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig73, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000040 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig47, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000037 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig43, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000006 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig6, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | casR,csa3,RT,WYL | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_JPTX01000043 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig50, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000027 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig32, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000039 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig46, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000013 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig13, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000008 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig8, whole genome shotgun sequence | 1 crisprs | WYL,csa3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_JPTX01000017 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig18, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000009 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig9, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000021 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig25, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000032 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig38, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000005 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig5, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
NZ_JPTX01000054 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig61, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000011 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig11, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000047 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig54, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000010 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig10, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000028 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig33, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000061 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig70, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000041 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig48, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000062 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig71, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000033 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig39, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000034 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig40, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_JPTX01000046 | Listeria monocytogenes strain G4599 contig53, whole genome shotgun sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
51755 : 58192
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_JPTX01000006|51755:58192|DBSCAN-SWA CTTACTTGATTCCGATTACTAAGCTATCTCGTGCGGCTTCAACAACTTCTGTTGTTATCGTCTCAAGCTGGTTAATTTCAAGTATTCTTTCAATTTGGGTGAACAGTCTCTGTATGAGCCTGAAGTTCCCTCCAGTAATCTTTATTATGCTGGTTATTGCTTCATAATCGGAAAAGTCCTCAAGCTTTATAGAAAGTCCTAACTCTTCCCATTTATACTCTAGAATATGATGGGTTTCATCTTTACTTAGTTTATCAAATTCATGGGCAAATCCAATTCTGGAGTAGAGTTGAGGGTATCGAGCTAATCGTTTTTCAATGCCAGGCATTCCAATTAATATCAAAGCAATGTCATTTCGATCGTAAATATCCCTAAGTTGTTCTAAATTTTGCACTTTTAGGCGATCAATTTCATCAACAATAATCAAGTCGATATCTTCATAAGCGTCAGTGGTGTAATTTTCTTCTTCTCCTTTAGTAAGTACTTTATACATAGTTCTTACCATATTCATTCTGGAACCAATAAGATTGATCTGTTCAGTCATTTTAGTCGCTCGTACTGCAGGAGCTGTATAAAAAATTGTTCTAGCCTCAAGTATCTTTTCATCTGCATCTAGGCCAATATTGTTTGCTGTTTTATAAGCTATTTGTTTTTCGATAGAATCCCAATTCGAATAGTACCTTGAGGACAATGTTTTTCCTACACCCGGTAATCCATAACAAATACCTATATATTTGTATCTAATACATGCATCACAGAACTCGGCAAATCTCTTAAATTCTTTTGTTTCAATAAACTTTTGCCCTTTATTCATTGAAATACCTCTTTAGTTTCGACTTTTTAGAATTAGATTCATTTGTTTTATTCCCTAGATCGTGTTGCTTTGATAAGGCAATTTCTTCCGCAACCGTTTTTCCAGAATCAAGTTGTTTTTTTAGATTTTTCCGTACTTTATTTCGTGCTGAAACAATCTCCTTTAAATCTACTGTATAATCGGAAATCTCGGGGGAAATAGCCGTACATAAATATTTATCTTGATAAAACACTCGAATCTCCGCAATGTCTCTCGGATCATAACGAATAATGATTGTTTCACCAACGTATGCAGCTAGATTTGTGTCTATATATCTAAGTCCTTGGAAATGAATCCCGTCAGAATGAACTTTCCTTGGTTTTGCTACATTTAGCAATAATAAATCAAGACTTTCCAGACTTTCTGGCATATTGGGAAGGAATCCAGAATTATTCCACGACTGTATCGGTTCTTTTTTTGTTGTACCATGAAGCCTATGATGATAATTATATATGAGGAAATTAAATAATTTTTCATCCAGTTCCTTAAGGGTAAGAAGTGAGCTAGTAGTCTGATTTCCCAAGTACCCAGGTAAATCTTGCAAAAACAATTGATTGACGGTTAAAAAGAATCTTTCAATTTTCCCACGTCCTCTTGGAACACCAATTGCAGAAAAGACTAGATTAATTTTCAAATCAATTGCTACTTGCTCCAAATGGTTGGACGTAAAATCACTTCCATGGTCTGTATAAAACATTTCAGGGATACCACATATTTGCCAATCGGGATTACTTTTTCTCCATATTGCTTGGTGTAAGACCAAAGATGTATTTATAGCAGAGGGGTTTTCAAAAGTTAAAAAATATCCAGCGACTGCTCGGCTATAATCATCTAAAATTATTGTTAACCAAGGTCTTTCTGGGTTTCCTTTTTCATTTAAAACTAGAATATCTAATGGGGTATGGTCTGCTTGCCAAATTTCATTGGGATAGCTTGCTTCTCTTCGGTAAATTAAATCATATTGATTGTCGTATGCTTTTTGACCATCATGCGCTAACTTCTTCAAACTTGGCGAAAGGGACTGCGATACCTTATACACTTGATAATAACTCGGTTCTTGCCAGCCTTTTTTCCGACATTGCTCACAGATCATTCGATGAAGAGACGTCAATGAATTCTTTTTGTACTTCAAAATTAGTTGTTCGATCAAAGGGACCATTTCCGGTTCTAAATGTATTTTGCCAGCATCACTTCTTGTTTTTCGAATTAAACCTTTTAATCCAAATTGTTTATAGTCCCGAATCCAGTATTGTAGCGTTCTTTTTGCAATGCCGGTTTCTTCTGTAATGACAGTTAATGTTTTCTCGTCGGTAAGATAAGGAGCAATGATTTTATACTTTACCATCGCTGCTTGTCGTTGTTCTTCTGAATAAGCTGTTAATGGAGGATGTTCATTTTGCATAGACATCAACCCTTCCGATTTACTGTTTTTCTAAATAGCGATAAATCGTAGTGCGAGACACATCCCACTTTTCCGCAACATCTTTAATCGATGTGCCACTTTCAATTAAAGCTTTCATCATTTCAATATCTTTTGATCCATACTTCTCCGGGCGTCCACCTAGACGCCCACGTGCTTTTGCGGCTGCTCGTCCAGCAGCAGAGCGCTCCTCAATCAAATTACGTTCAAATTCCGCAAATGCTGCGAACAAGTGAAACATTAATTGCCCTGTCGCATTGCTTTTGTCCATGGTTAAGTTTTCTTGTAGACTATGAAAGCCAATGCCTCGTTCATTTAAGCTGTTCACAATTTGAATCAAATCTTGCATGTTACGTCCTAGTCGGTCCAATCGCCAAACGATAATTGTATCGCCTTTACGTGCATACTGAAGTGCTTCCTCTAAACCGGGACGTTGTTTTATTGTTCCACTCATTTTATCGTGAAAGATTTTCGTACAACCATGTTGCGCTAAAGCATCTGATTGTAAATCCAAATTTTGTAATCCTGTTGACACACGTGCATATCCAATTAACACCAAAATCACTCTTTCCTCGTTTTCCCTTTGATTTCATTGTAACATAAGACATTAAATATATGGTTAATGAACATAGATTAATGAACGGAGTTTTGTTACATTCTAAACGGTAAAAAACGCCCCTTATGAATTAAAAAGGAGCGTGTTCAGAAAAGGACGAGTTTTGGAACAGATATTGGGATTTTAAATTATTTACATTGATAAATAGTGCTTTTTAACTTTGTCCGCAACGAGGTTATATTATTTAGGGGAATAAACAAGCATTTAGATAATGTAATTGAGATTGTGATGGATTACACTTAAACTAACGGGGCAGGTTACTTGAATAAGATTTCTTCTTACCGGAATTGGTTAATCCAATTCTTTTTTTATTTCTCATTCAAATATTAGTTTGACTAAGAAATAAAAAATGGGTATACTATATTCAAATCAATGTTTGAATGACGGATAAATCAATGAACCGAATAGGGAGTTTTTTAAATACTTTTTTTGGAGGTGGGTTTTATATGGAATTAAACAAAATTGAATTATATTTTATGAATAATCCAATGAGACGTTGGTTACAAAAAAACATTGAATTTAAAACGTTTAAAGAATTTTTAGAGAAGCAACATCTTTCTTTAGAAGGAAAAGTCATATTAGATGCTGGTTGCGGTTCAGGATACAGTACAAAGTTAATAGAACAGTTTGCACCTACTGAACTGATAGGATTTGATATTATGCCGTTGCAAATTGAGAAGGCAAAACAAACCTATCCCGAATTGAATTTCTTTGTTGGCAATGTGTTAGAAACACATTTAGATTCTAATAAGTTTGATGCCGTTTTCGTCTTTGGGATTCTACATCATATTCCTCAATGGAAAGATGCGATTAGAGAACTATATCGGGTATTAAAACCTGGTGGTGTACTTTTACTAGAGGATTTCAATAAAGATGCTTCTCGCTTCTTTGCAACTTATATGAAATTTGACCATCCTCCAGAGGCTTATTTTTCTTGGGATGAGTTTACTCAGCATCTTGAAGAAACAGGATTCGGTATTTTAGAACAAAAAAGGATTATTTCAAAAGGAGTCGGGTCTTTCCTTTGCTTTAAAAGTTAATAATCAAAAACATTTCATTGAGAAGGAGTGATATTTATGAGTAAAAAAGATACCTGTGAAATTTATTGTTATGATGAACCAAAAGTCAAACGAATACGAGACGAAATGCAAAAAGAAGATATCTCAAGCGTCGCCCTACTGTTTAAATCTCTGGCAGATGAAAATAGGGCAAAAATTTCCTATGCCTTATGCCAAGAAGATGAACTATGTGTGTGTGATGTTGCTAACATCATTGGTTCCTCTGTGGCGACAGCTTCCCATCATTTACGAACTCTTCATAAGCAAGGGGTTGTGAAGTATCGAAAAGAAGGAAGACTTGCGTTTTATTCATTGGATGATGAACATATCAAACAGTTAATTGTTATAGCGTTATCTCATAATAAAGAGGTGAAGGTAAATGTCTGAACAAGAAATGAAAACATATCGTGTTCAAGGATTTACTTGTACAAACTGTGCAGCTATCTTTGAAAATAACGTTAAAGAGTTACCTGGAGTTCAAGGGGCGAAGGTTAACTTTGGAGCATCAAAAGTATATGTTCAAGGAAATGCTACGATTGAAGAACTAGAAAAAGCAGGAGCATTTGAAAATTTAAAGATTCGGGATGAAAAAGAACAAAAGATTGAACGTGAACCATTTTGGAAACAAAAAGAAAACATTAAGGTCTATATTTCCGCACTATTGCTTGTGATTAGCTGGTTCTTAGGTGAACAATACGGGGAAGAACATATTCTTCCGACGATTGGTTTTGCAGCATCCATTTTAATTGGTGGATATTCACTATTCATTAAAGGGCTTAAAAATCTAAGCCGATTAAAGTTCGATATGAATACGCTCATGACTATTGCCATTTTAGGGGCTGCGGTTATTGGTGAATGGGGCGAAGGAGCAATGGTTGTCATTCTGTTCGCTATCAGTGAAGCGTTAGAGCGATATTCAATGGATAAAGCCCGTCAATCCATTGAATCATTAATGGATATTGCTCCAAAAGAAGCGTTAATTCGTCGTGGAAATGAAGAAATGATGGTTCATGTTGAAGATATTCAGGTTGGAGACATCATGATAGTAAAACCTGGTCAAAAATTAGCGATGGATGGAACAGTTATTAAGGGAACTTCAACGTTAAATCAAGCTGCAATTACCGGAGAAAGTGTTCCGGTAACTAAAACAAAAGATGATGAGGTCTTTGCGGGAACCTTAAATGAAGAAGGATTACTCGAAGTAAAAGTAACAAAACGAGTTGAAGATACGACTCTTTCGAAAATCATTCATCTTGTAGAAGAAGCTCAAGCAGAGCGAGCACCTTCTCAAGCGTTTGTAGATAAATTTGCGAAATACTATACACCTGCAATTGTGATTTTGGCTGCTTTAATTGCTGTTCTTCCACCACTATTTGGTGGAGATTGGAGCGAATGGATTTATCAAGGTTTAGCGGTATTAGTGGTTGGTTGTCCATGTGCTTTAGTTGTTTCGACTCCAGTTGCTGTCGTTACTGCAATAGGAAATGCTGCAAGAAACGGTGTTTTAATTAAAGGTGGCGTTCATTTAGAAGAAACAGGACATTTAAAAGCAATTGCTTTTGATAAAACAGGAACTCTTACCAAAGGTGTTCCTGCTGTAACCGATATCGTGACATATGGCGGAAACGAAAATGAATTATTGATAATCACAGCAGCCATCGAAAATGGTTCCCAACATCCATTAGCTTCAGCGATTATGAGAAAAGCTGAAGAAAACGGATTAAACTTTAATGATGTCGTGGTTGAAGAGTTCCAATCCATTACTGGTAAAGGTGTAAAAGCGAAAGTAAATAATGAATTGTATTATGTTGGAAGTCCGAATTTGTTTGAAGAAACCCTTCTAAATGGTATTGAAGCATCCATTATAGAAAATATTACTCGTATGCAAACACAAGGTAAAACCGTAATGGTTTTGGGAACGGAAAAAGAAATTCTTTCGTTGATTGCCGTTGCAGACGAAATGAGAGAATCGTCAAAAGAAGTCATCAGTAAATTGAATGTTATGGGAATTGAAACGGTAATGCTGACAGGTGATAATCAAAGAACAGCTTCGGCAATTGGAAAATTAGTAGGAGTTTCTGATATTAAAGCTGACTTATTACCAGAAGATAAACTAAATTACATTAAAGAACTTCGAGGAAAGCATCAAAGTGTAGCAATGGTTGGTGATGGTGTTAACGATGCACCAGCACTTGCAGCTTCTTCGGTTGGTGTAGCGATGGGTGGCGCTGGTACTGATACAGCGTTAGAAACAGCGGATATTGCATTAATGTCTGATGATTTATCCAAATTGCCATATACCATCAAATTAAGCCGCAAGGCATTAACCATCATCAAACAAAACATTACCTTCTCTTTAGCAATTAAATTAGTTGCGTTGGTGTTAGTTATGCCTGGTTGGTTGACGCTATGGATAGCGATATTTGCCGATATGGGAGCAACATTACTCGTAACACTAAACAGTTTACGATTACTAAAAGTAAAAGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_JPTX01000006|51755:58192|54028_54583_-|WP_033533546.1|DBSCAN-SWA MLIGYARVSTGLQNLDLQSDALAQHGCTKIFHDKMSGTIKQRPGLEEALQYARKGDTIIVWRLDRLGRNMQDLIQIVNSLNERGIGFHSLQENLTMDKSNATGQLMFHLFAAFAEFERNLIEERSAAGRAAAKARGRLGGRPEKYGSKDIEMMKALIESGTSIKDVAEKWDVSRTTIYRYLEKQ >NZ_JPTX01000006|51755:58192|55719_56088_+|WP_033533403.1|DBSCAN-SWA MSKKDTCEIYCYDEPKVKRIRDEMQKEDISSVALLFKSLADENRAKISYALCQEDELCVCDVANIIGSSVATASHHLRTLHKQGVVKYRKEGRLAFYSLDDEHIKQLIVIALSHNKEVKVNV >NZ_JPTX01000006|51755:58192|51755_52568_-|WP_033533400.1|DBSCAN-SWA MNKGQKFIETKEFKRFAEFCDACIRYKYIGICYGLPGVGKTLSSRYYSNWDSIEKQIAYKTANNIGLDADEKILEARTIFYTAPAVRATKMTEQINLIGSRMNMVRTMYKVLTKGEEENYTTDAYEDIDLIIVDEIDRLKVQNLEQLRDIYDRNDIALILIGMPGIEKRLARYPQLYSRIGFAHEFDKLSKDETHHILEYKWEELGLSIKLEDFSDYEAITSIIKITGGNFRLIQRLFTQIERILEINQLETITTEVVEAARDSLVIGIK >NZ_JPTX01000006|51755:58192|56080_58192_+|WP_033533404.1|DBSCAN-SWA MSEQEMKTYRVQGFTCTNCAAIFENNVKELPGVQGAKVNFGASKVYVQGNATIEELEKAGAFENLKIRDEKEQKIEREPFWKQKENIKVYISALLLVISWFLGEQYGEEHILPTIGFAASILIGGYSLFIKGLKNLSRLKFDMNTLMTIAILGAAVIGEWGEGAMVVILFAISEALERYSMDKARQSIESLMDIAPKEALIRRGNEEMMVHVEDIQVGDIMIVKPGQKLAMDGTVIKGTSTLNQAAITGESVPVTKTKDDEVFAGTLNEEGLLEVKVTKRVEDTTLSKIIHLVEEAQAERAPSQAFVDKFAKYYTPAIVILAALIAVLPPLFGGDWSEWIYQGLAVLVVGCPCALVVSTPVAVVTAIGNAARNGVLIKGGVHLEETGHLKAIAFDKTGTLTKGVPAVTDIVTYGGNENELLIITAAIENGSQHPLASAIMRKAEENGLNFNDVVVEEFQSITGKGVKAKVNNELYYVGSPNLFEETLLNGIEASIIENITRMQTQGKTVMVLGTEKEILSLIAVADEMRESSKEVISKLNVMGIETVMLTGDNQRTASAIGKLVGVSDIKADLLPEDKLNYIKELRGKHQSVAMVGDGVNDAPALAASSVGVAMGGAGTDTALETADIALMSDDLSKLPYTIKLSRKALTIIKQNITFSLAIKLVALVLVMPGWLTLWIAIFADMGATLLVTLNSLRLLKVKE >NZ_JPTX01000006|51755:58192|55089_55683_+|WP_046670254.1|DBSCAN-SWA MELNKIELYFMNNPMRRWLQKNIEFKTFKEFLEKQHLSLEGKVILDAGCGSGYSTKLIEQFAPTELIGFDIMPLQIEKAKQTYPELNFFVGNVLETHLDSNKFDAVFVFGILHHIPQWKDAIRELYRVLKPGGVLLLEDFNKDASRFFATYMKFDHPPEAYFSWDEFTQHLEETGFGILEQKRIISKGVGSFLCFKS >NZ_JPTX01000006|51755:58192|52560_54009_-|WP_033533401.1|integrase,transposase|DBSCAN-SWA MQNEHPPLTAYSEEQRQAAMVKYKIIAPYLTDEKTLTVITEETGIAKRTLQYWIRDYKQFGLKGLIRKTRSDAGKIHLEPEMVPLIEQLILKYKKNSLTSLHRMICEQCRKKGWQEPSYYQVYKVSQSLSPSLKKLAHDGQKAYDNQYDLIYRREASYPNEIWQADHTPLDILVLNEKGNPERPWLTIILDDYSRAVAGYFLTFENPSAINTSLVLHQAIWRKSNPDWQICGIPEMFYTDHGSDFTSNHLEQVAIDLKINLVFSAIGVPRGRGKIERFFLTVNQLFLQDLPGYLGNQTTSSLLTLKELDEKLFNFLIYNYHHRLHGTTKKEPIQSWNNSGFLPNMPESLESLDLLLLNVAKPRKVHSDGIHFQGLRYIDTNLAAYVGETIIIRYDPRDIAEIRVFYQDKYLCTAISPEISDYTVDLKEIVSARNKVRKNLKKQLDSGKTVAEEIALSKQHDLGNKTNESNSKKSKLKRYFNE |
6 | Streptococcus_phage(33.33%) | integrase,transposase | attL 50918:50933|attR 55098:55113 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
95742 : 104028
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_JPTX01000012|95742:104028|DBSCAN-SWA ATTAATCGTTCCCTCCATTTTGAATTAATCCTCGAATCACTTTTGGATAAAAAATATGTTCTACTTGATGAATTTTTCCAGCTAAAGTATCTACAGTTTCCGCATGTTCAATCGGTACTTTCACTTGATCAATAATTGGTCCAGTATCCATTCCCGCATCCACAAAGTGCGCCGTGACACCAGTTTCTGAAACATTCGCTTGAATCGCTTGACCAATTGCATCTTTTCCTTTGAATTCAGGTAACAACGATGGGTGCAGGTTGACAATTTGCTCGGGAAATTCTGCTAATAAAGTCGGCCCAATCAAACGCATATATCCTGCTAGCACTAACAAATCAATTTCCAACCCGCGAAGTTCTAGTAAAATTTCTGTCTCAAAAGCTTCTTTATCCGGATAATTTTTCGCTTCAAAAAGGAACACCGGAATCTGATATGTGTTTGCGCGTTCTAAAACATAAGCATTTGGTTTATCACATACCAGTAGTTTCACATGAGGCTTAATAAACGCATCATCCACTAAAGCTTGAAAATTCGAACCGTTACCCGAAGCAAAAATGGCTATATTCATCCTTTTGTGCCTCCTGTGAAAATAACCGCATCATTTTCACGTGTCGTAACTTCTCCAATAACATAAGCCGCTTCCCCGTTTTGAACGAGTACTTCTAATGTTCTTTCCACATCCGCTTTCGCAACTGCCAACACCATACCAATGCCCATATTGAAAATTTCATACATTTCAAGTTCGCTCAATTGGCCGTATTTCTTCATAACGTCAAAAATCGGCAACACCGGCCATGAACCTAGCTCCACTTTGACAGCTAAATCATTTGTTAACATCCGCGGTAAATTCTCTACAAATCCGCCACCAGTCACATGCGTAATTCCGTGCACATCTACCTCTTTCAATACTTCTAAAACTGGCTTCACATAAATCCGTGTCGGTTTAAGTAGCTCTTCCACAAGCGGTACATCTAGTTCACTGATTTCCGCATCGAGTGTCAATTCGTTATCTTTAAAGAAAATTTTACGCACTAGGGAGTAACCATTACTATGAATTCCGCTTGATGGAATACCAATGAGTGTATCTCCTTCTTTGACTGCGCCTTCTGTAATTAGCTTCTGTTTCTCTACAGCCCCAACAGTAAAACCAGCTAAATCATAATCTTCCGCGCCGTACATATCAGGCATTTCAGCAGTTTCGCCGCCAATTAAAGCCGCACCAGCTTGTTCACAGCCGTCAGCCACGCCTTTAACAATTTGTTCCATTTTCACTGGATCTGTTTTTCCAGTAGCGATATAATCTAAGAAAAATAATGGCTCGGCGCCTTGAGCTAAAATGTCATTCACACACATTGCCACGCAGTCAATCCCGATGGTATCATGCTTATCTGCTTCAATTGCCAAAAGTAATTTTGTCCCAACACCATCCGTACCAGAAACAAGGACAGGTTCTTTTAAATGCAAACTACTTAAGTCAAACATTCCACCAAATGAACCAAGTGCCCCCATCGCGCCTAATCGCTCTGTTCTAGCCACATGTTTTTTGATACGTTCTACAACTTGATAGCCAGCTTCTACGTCCACGCCTGCTTTACTATATGCATTTTCTGCCATTCGATTTGTCACTCCTCATTATTTTTCTGCTTCTAAGCTCGCTAAATATTCCGCTTCATAATCATATAAAGGGGTTGGGTAATCGCCGTTGAAATAAGCCATACAAAGTCCCCCGTAAGGTTCGTTCGGATAAGGTCTGCCAATGGAATCTACTAAACCTTCTTCACTCAAATACTCTAAAGAATCAGCCCCAATAATCCGACAAATTTCATCAACAGAATAATTAGAAGCGATTAATTCATTTCGTGTTTGGATATCAATTCCATAAAAACAAGGATAAGCAAGTGGTGGAGAAGCGATTCTTACATGAACTTCCGCCGCTCCTGCTTCACGTAAAAGCTGGACAATGCGTTTACTTGTCGTCCCGCGAACAATCGAATCATCAATCATGACAACGCGTTTTCCTTCCACAACCCCGCGCACGGCAGAAAGTTTCATTCTAACGCCTTGTTCCCTAAGTTCTTGTGATGGCTGGATAAAAGTTCTTGCCACATATCTATTTTTGATGAGACCAAGTTCGTAAGGAAGACCAGCTTCCTCCGCATAACCAATCGCTGCAGAAATACTGGAATCTGGTACACCTGTAACCACATCTGCATCAATAAAAGCCTCTTTTGCTAATCTTTTCCCAGAACGTTTTCTTGCCGAGTGGACATTAATTCCAGCAATATTAGAGTCAGGTCGCGCAAAATAAATGTATTCCATACTGCAAATCGAATGCGTCACATTTTCCGTGAATTTTTCAATTCGAAGCCCGTCATCATTAATAATAATTAGTTCACCTGGCTCCACATCGCGAACAAACTCAGCGCCAACCGTTTCAAAGGCACATGTTTCCGAAGCAACTACGTAAGAATCACCAATGCGACCTATCGAAAGCGGTCTAAAACCATTCGGGTCAAGCGCCGCATACATCGTGTCTTCCGTCAGAAGCATGTACGCAAAGCCACCCTTAACCTTGTTCAAAGCCACTTTTAAATCTTCCACAAAATCACCTGTATGGCTACGTTTAATTAAATGCGCTAACACTTCTGTATCCGAACTCGTTTGAAAAATAGCGCCTTCTTCTTCTAGTTCACGGCGTAAACTTTTCGCATTAACCAAATTTCCATTATGCGCAAGTGCTAAAGAAGAACTATGAAAGTGAAATAAAAATGGTTGTACGTTCCCTAAGTTTTTTTGACCAGCTGTCGCGTATCGAACATGACCAATGGCTGCTTTACCTTTTAAATCGTCTAGTTCACCATGTTTAAATACGTCTGCTAAAAGGCCGAGATTTCGGTGACCTTTTAGTGTTTCACCGTCTGTCGAAACAATTCCGGCACCTTCTTGACCGCGATGTTGTAAACTATGCAACCCATAATAGGTGATTTCCGCTGCATTAGGATGATCCCAAATACCAAAAATACCACATTCTTCGTTAAGTCCTTTTACTTCAGCAAGCATGGAATAGCCCCTTCCCAAATGGATCGTAATTCCGTTGTTTTCGCTGTAACTTGATCTTCCTTATGTTTCACACGAATCGTATCATCCTCGGTTACTAAACCAAGGCGGTATACTTTTTCCAGTTCCATTAATTGCGCAAAAGCTGCTTCGTTTTCCGGTTTTACCGATACTAAGAAACGTGATTGCGATTCACTGAATAGTTGATTCAACTCAAACGGTACTTCTACATCCGCACCAAGCCCTGCTTTAAAAGTCGCTTCCGCAAGGGCAACACCAAATCCACCTTCTGCCAAATCGTGACTAGAAGCAACTAGACCTTCCTGAATCGCCGTTAGAAGTAATTGTTGGTATTTTTTCTCTGTCGTTAAATCTAATTCCGGCGCACGTCCGCTAATTTTCCCTTGTTGCAATTTTTGCAATTCCGAACCACTATATTCAGCTTTTGTTTCACCAATTAAGAAAATCACATCGCCACTATTTTTAAAATCTTGTGTCGTAATATGTGCCAAATCTTCTACTAAACCAACCATTCCAATGACTGGCGTTGGATAAATTCCGGTACCATCTGTTTCATTATAAAGCGATACATTACCAGAGATAACAGGCGTATCAAGTTCTAAACAAGCCGCACTAATACCATCAGCCGCTTTTTCAATTTCCCAAAAAATTTCTGGTTTTTCAGGATTTCCAAAGTTCAGTCCATCTGTAATCGCTAGTGGTTTCCCGCCAGAACAAACGATATTGCGCGCCGCTTCCGCAACCGCTATCGCTCCGCCTACTTCTGGATCAAGATACAAATAGCGTGAGTTACAATCAGTTGTCATGGCAATTGCCTTCTCGGTCCCACGCACACGAACAATCGCCGCATCTGAACCAGGTACAACAGCTGTATCCGTCCGAACTTGATAATCATATTGCTCATAAATATGGCGCTTACTAGCAATCGTTGGCTGAGCAAGCAGTTCCTTCCAAACACCGACCACATCCTCCATAACTGGCACAAACGATTCCTCTTCTTGGAAAGCTTGATAACGAGCTGGCTCTTTGGAAGGTTTATGATAAACTGGCGCATCTTCTGCAAGCGCATCTACAGGAACGTTCGCAACTACTTCACCATGATGAATAATTTTGTACATTTTATCATCTGTTACTTGACCAATCACAACAGCCTCTAAACCATAACGTTCAAATAACGCTTGGATTTCTTCCACATGCCCTTTTTTCACACATAGAAGCATCCGTTCTTGCGATTCAGAAAGCAACATTTCATAAGGCGTCATATTTAGTTCTCGTTGCGGCACATCATCCATAATTAATTCTAGCCCAGCGCCCGCTTTTGAGGCCATTTCAGAACTTGAACTAACGAGACCTGCAGCCCCCATATCTTGAATTCCCACTAAAATATCCGAATGATCACGAATCACATCTAAACAAGCTTCAAGCAACAATTTCTCCATAAAAGGATCGCCAACCTGTACAGCAGAGCGTTGTTGTTCGCCTTCTTCACTAAACTCTACAGAAGCAAAAGTAGCACCATGAATCCCGTCACGACCAGTTTTAGCGCCAACATACATCACCGGATTACCAATTCCTTTTGCTTGCCCTTTTTGAATATCTTTCGCCTCGATTAAACCAACACACATTGCATTAACTAGCGGATTTTTTGTATAACAAGGATCAAATTGGATTTCGCCACCAACCGTTGGAATCCCAATGGAGTTACCGTATCCTGCGATTCCCGCAACGACTTCACTAACTAAGTATTTCGCATGGGGTGTATCTAACTCACCAAAACGAAGCGAGTTAAGCATTGCAATCGGTCTAGCTCCCATCGAGAACACATCACGGATAATCCCGCCGACCCCAGTCGCAGCCCCTTGATACGGCTCCACGTAGGATGGATGATTATGACTCTCCACTTTAAAAGCAACACCTAAACC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_JPTX01000012|95742:104028|102735_104028_-|WP_003729814.1|DBSCAN-SWA MLERYTRKEMGNIWTEQNRYQAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVAKIRANAKFDVDRIHEIELETRHDVVAFTRSVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTANSYLLKQANEILRKDLENFIAIIGEKAKEHKYTVTMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLERFNFAADGVEFGKISGAVGTYANIDPFVEAYVCEKLGTTPAPISTQTLQRDRHAEYLATLALIATSVEKFAVEVRALQKSEVREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMVTAYENVPLWHERDISHSSAERIILPDSTILLDYILNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTLGLIYSQRVLLALIDKGLAREAAYDVVQPRAMEAWEKQVPFRELVEQDATITENLSAEEIADCFDYNYHLKNVDLIFDRLGL >NZ_JPTX01000012|95742:104028|97373_98801_-|WP_003722245.1|DBSCAN-SWA MLAEVKGLNEECGIFGIWDHPNAAEITYYGLHSLQHRGQEGAGIVSTDGETLKGHRNLGLLADVFKHGELDDLKGKAAIGHVRYATAGQKNLGNVQPFLFHFHSSSLALAHNGNLVNAKSLRRELEEEGAIFQTSSDTEVLAHLIKRSHTGDFVEDLKVALNKVKGGFAYMLLTEDTMYAALDPNGFRPLSIGRIGDSYVVASETCAFETVGAEFVRDVEPGELIIINDDGLRIEKFTENVTHSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHSARKRSGKRLAKEAFIDADVVTGVPDSSISAAIGYAEEAGLPYELGLIKNRYVARTFIQPSQELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVQLLREAGAAEVHVRIASPPLAYPCFYGIDIQTRNELIASNYSVDEICRIIGADSLEYLSEEGLVDSIGRPYPNEPYGGLCMAYFNGDYPTPLYDYEAEYLASLEAEK >NZ_JPTX01000012|95742:104028|101684_101930_-|WP_003722248.1|DBSCAN-SWA MYNVKVYVTLKKSVLDPQGVAVKDAAKSMGYEEVEDVRIGKFMELKVAKSDRDIHEVLNEMCDKLLTNPVMEDYRYEIEEA >NZ_JPTX01000012|95742:104028|95742_96309_-|WP_003731569.1|DBSCAN-SWA MNIAIFASGNGSNFQALVDDAFIKPHVKLLVCDKPNAYVLERANTYQIPVFLFEAKNYPDKEAFETEILLELRGLEIDLLVLAGYMRLIGPTLLAEFPEQIVNLHPSLLPEFKGKDAIGQAIQANVSETGVTAHFVDAGMDTGPIIDQVKVPIEHAETVDTLAGKIHQVEHIFYPKVIRGLIQNGGND >NZ_JPTX01000012|95742:104028|101941_102655_-|WP_003726214.1|DBSCAN-SWA MTNELVYEGKAKRLFKTEEAGVLRVAYKDDATALNGVRKESFAGKGELNNQITSLIFSHLAGAGIESHFIRAISETEQLVKEVSIIPLEVVVRNVMAGSLAKRLGKEEGELIPNAIVEFYYKDDALDDPFINDDHVLYLELATTSEMDIIRQAARSINKVLQELFNQMNITLIDFKLEFGRDATGNILLADEISPDTCRLWDKETNQKLDKDVFRRNIGNLTDVYTEVLNRLKQVQN >NZ_JPTX01000012|95742:104028|96305_97355_-|WP_003726210.1|DBSCAN-SWA MAENAYSKAGVDVEAGYQVVERIKKHVARTERLGAMGALGSFGGMFDLSSLHLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYIATGKTDPVKMEQIVKGVADGCEQAGAALIGGETAEMPDMYGAEDYDLAGFTVGAVEKQKLITEGAVKEGDTLIGIPSSGIHSNGYSLVRKIFFKDNELTLDAEISELDVPLVEELLKPTRIYVKPVLEVLKEVDVHGITHVTGGGFVENLPRMLTNDLAVKVELGSWPVLPIFDVMKKYGQLSELEMYEIFNMGIGMVLAVAKADVERTLEVLVQNGEAAYVIGEVTTRENDAVIFTGGTKG >NZ_JPTX01000012|95742:104028|98785_101005_-|WP_046670802.1|DBSCAN-SWA MPNMEPTTKEIKEQKIYQEMGLTDSEYELVCSILGREPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTEGKQVLQGPGEGAGIVDIGDGLGVAFKVESHNHPSYVEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPIAMLNSLRFGELDTPHAKYLVSEVVAGIAGYGNSIGIPTVGGEIQFDPCYTKNPLVNAMCVGLIEAKDIQKGQAKGIGNPVMYVGAKTGRDGIHGATFASVEFSEEGEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLDVIRDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGAGLELIMDDVPQRELNMTPYEMLLSESQERMLLCVKKGHVEEIQALFERYGLEAVVIGQVTDDKMYKIIHHGEVVANVPVDALAEDAPVYHKPSKEPARYQAFQEEESFVPVMEDVVGVWKELLAQPTIASKRHIYEQYDYQVRTDTAVVPGSDAAIVRVRGTEKAIAMTTDCNSRYLYLDPEVGGAIAVAEAARNIVCSGGKPLAITDGLNFGNPEKPEIFWEIEKAADGISAACLELDTPVISGNVSLYNETDGTGIYPTPVIGMVGLVEDLAHITTQDFKNSGDVIFLIGETKAEYSGSELQKLQQGKISGRAPELDLTTEKKYQQLLLTAIQEGLVASSHDLAEGGFGVALAEATFKAGLGADVEVPFELNQLFSESQSRFLVSVKPENEAAFAQLMELEKVYRLGLVTEDDTIRVKHKEDQVTAKTTELRSIWEGAIPCLLK >NZ_JPTX01000012|95742:104028|100997_101681_-|WP_060587023.1|DBSCAN-SWA MKFAVIQFPGSNCDLDMLHAIRDSLGEEAEYVWHAETSLAGFDAVLLPGGFSYGDYLRTGAIAKFSSIMPEVLRFAEMGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALIRNNNLHFICKTVPLRVANASTIFTGLYKEGEIIQVPVAHGEGNYYCDDETLLKLKDNNQIVFTYDSVNPNGSRADIAGIVNERGNVLGMMPHPERAVEEIIGGTDGLRLFESVVKAWKEEQVNA |
8 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
47 : 10169
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_JPTX01000015|47:10169|DBSCAN-SWA ACTAGAGCCATTCAATAGTAACTTGTTCACCGTCAATATAAATTTTATTAATTAGTGATTTTAAATAAAGTTGTTTTTCTCTAAACTCTAAAGAGTCAAAATCAACTGTTGCTAAATCAGCTAAATTTTCTTGTATCTTTTTGTTTTTCTTCAATTCTTCGTTAGCTTCTATTTGTGCTTCATAATAATTAATTTGAGCATCAATATCAGCCATCATACCATCGAGTTCTGAAACTTCGTAAGAACCACTGATATATAAATCAAACAGCCGCTTCTTTTTTGCGTGTTCTGTTTTAAGTTTTTCGTTTAAACTATCTAATTCGTCTTCTTTATCTACATTCCTAGAAGCGAAACTATAGTTATTCACGCGATCAATAATTAGTTCTTCTAGTTTGTCAGCTCTCCAAATTTTATTCCCGCATTTTTCAAGTTCATGAGTATGCTTGTAAGTCTTGCAACTATAATATCTATAATGATATTTTTTCCCACGGGAAACAGTATCCTTTCTCCGATGAACATAACCCAACCCACATTTTCCACACACTACCAAATTATTTAGAAGTGATGCTGAATCTCTATTCATATTTGGATTTTTACCCATGCGAGAAAAAATTTCTTGAACTCGATAAAATTGTTCCTCTGAAATAATAGGCTCATGAACACCTTTTGTATGCACTTTATCCGCATAAGATACATAGCCACAGTATAAATCATTAGTCAGCCAATTGTTGTAACTGCTATATGATTTCACTTTGAATCCTAATTTTTTTAGCCTCTTCTGTAAAGTGGTAATGCTTTTTTCTTCCTCAAAAATATCATAAATCATTTGTAATTGTTTTGCTTCTTCTTCATTAATATATAATTTAGTATCTATAACATCATAGCCGAACGTTCTACCTTTTGCAGTCGTTAAAGGAAGACCTGCTTCAATACGCTTAATTTTCCCCATCACCATGCGATCACGTATAGTTTCGCGCTCTAATTGAGCGAACACGGATAATATACCAATCATCGCCCGACCGAAAGGAGAGCTGGTATCAAGCGTTTCAGACAGACTAACAAACTCCACATTGTTTTTTAAGAAGTATTCTTCAATAAGCGTTATCGTATCTCTTTGCGAGCGGGATAGTCTGTCTAATCGATATACGACTACAGCATCAATTTCATGTAATTTACTTAGCATTTCATTTAGCGCAGGGCGATTCATGTTTGAACCGCTGTATCCGCCGTCAATGAAAATATCGTATACGTCCCAGTCCTTCGAGCGGCACAAGGCTGTTAGCTTTTCAGTTTGAGCTTGTATAGAGTAATTCTCTATTTGTTCTTGAGTAGATACGCGTATATAAATAGCTGCCTTCATTTCCGTTCTCCTTTCGCACATACGTTCTTTTTTTCGGTAAAAAGAAAAGCCCGGAGGCTCTCTTTTATTTGATTATATTAATTGATTCAGCATTTAAACCAGGAATTCTCATTTCTCCGCCAATAGTCGTTTCATATGTGTAATTACCATATATGGTTCCGTATACTTCGATGATGTCATCCTCAACAGCATCCGTAAAACCATCATATAGAACCGCCATTGTGTCATCATAATAACCACTTCCGTCATCTGTAACGTTAACACGCATTAATGTTGTGCCAGAATCTTCAATAGCTTGCACTACTTTGCCTTTTATATAATAAGGCTCATCTTTATACGTATCAGCATTTTTATTAAGCATTTGATATGAAATTGATTTTGCGTTATCTTTAGCTTCTTGATTATTTTTGTTTTTTAATTCTTTAGCTTCATTAGCTGATTTTTCTTCCTGTTCTTTACGCTCTTTATCAGCGTTTAATTGAGCTGAATCATTTAAAAATAAAATAACTGCTTTTTCTGTTGTTTCTTTTCCTTTTTCAGCAATTAAAGTAGCTTGTTTCTCATCTTGGATAGTAACCTCTAAAGTAAATTTTCCCTTGTCGTCAGCCGTAGTTTCGGCAAAAGTTGTAGTTTGCTCCATAAGATATATTTTTGCATTTGGATTTGTCATTCCTGCGATAGTTACATTACCATTATCATCGGATGTGAAAACTTCTGATGAAATATTTATAAAAGCAGATTCACTTTTTGAAGAAGTATCAATATTACTTTTTTTTGAATCATTACTTGCAGTTTCACAACCTGTTAAAAACATACAAAAAATTATTAAAAACCCCGTTAATAAAACCATCCCTTTTTTCACATTACAAGCTCCCTTTTGTATGTACCAACCCGCGGCCGCAAACTGGTTACATAGTTATATTTTATTCAAAAGCCTTGCGATGTCTTCCAATTTTTCGCTTCGACTTAATCTACTATCAATAACTATGAAAATTTCTTTTTTTAAAGTGAATGAACAAGAAGTGAATTCGTGTTCTAGTATCACTATATCATGTTGTACGTTCAGTTCATCTAAAGTTTTCATGTATTTATACCCCGTTGTATTTTATTGCAACGTTGCACTTACATTATACATAATTTTTATAAGAAATATCACGTTTTCACAGAAAGTTAATATTCAATAGCAATAACGAGTAAATAAATTACAAGTCAAGTAGTTCAAAGGTAAATAAATTATTAATTTATTCTTTTTTTTGTTGCTCATAAAATTCAATGAATGACTTAACTGCTTTGACTGCTTCCGCATCATTCATTACTCGAGCTGCAACAGCTTTAAAATCTTCGTTCTCTTCAACAAATTTATCAACTGCTTCATCTTCTTTTGAAGCTATTTCCGTAATATTTATTTCTCTTTCATTTGTATGTTCTTTTCTTTTTTCTTCTATATAAGCGAGTATCTCTTTTATATCTTCTTCTGTTGCGTTTGAATCAATGTGTGCTGCGATTGTGTCAGCGAGATTATTATCGTCTCTTCCTAATAAATAATCAGTAGATACATTAAAAAATTCAGCTATTTTCAGTAATGTTTGATAGTCAGGCTCTCTTGTTCCTTGTTCATAATTAGCTACTTGACCTCTAGAAAATCCAAGTTCGTCCGCTAATTTGTATTGTGAAAAACCTTTTTTCTTTCGCAACTCAGATAATCTTTTACTAAACATTTCTAACACCTACGCTTTCTATATGTATATTATAAGAAACAATTAGTTTCCAGTCCATTAATTCTTCAATGTAGAAACAAAAAGTTTCCAAAAAGCTTGACAGAAACATATTGTTTCTGATATAGTGTATTTATAGAGAAACAAAACGTTTCTTTTGGGGGTGAAAAAATGAGAAACAGGCTTATTGAGCTAAGGAAATCAAAAACAAGACGGGAGGTATCGAAAGATTTAAATATAACACCTCAAATGTTAGGGGCAATTGAGAGAGGAGACCGGACTCCCTCGTTAAAACTAGCTAACAAAATCGCAAACTATTATGATGTGCCAATTGAAGATATTTTTTTTGATAATAAAGACACGTTATGTGTCTGAATTGGACGGAAAACAAAACAGGAGGCTAGAAAATGAGGAAAATTGCATTTACAAACTCTTTCCTAACCAAGAGAAATAGAAAAGAGTCAGTACTCACCATTGAATTAAGTATAACTGGAGAAGATTTTAGCGATTTAAGTATTTTGCCGGAACTTTATTCAGAAATTAATTCATTAGTTAATAGATTATCGGAAAAAACTAACGGCGATTTGGGCAAAAGAAAATAAAGTTTGGATTGGATTATTTTTAACTTCTTCTTTTGCTTTAGACCATACAGAGTCATCTTTAACAGAATTTATGAATTGGTCTCCAGACACTGTTAGAAAACGGATAATGTAGTCGTAATTACCGTCCATGTTACCAGTTGGATAATCACCAACTGCAAGACCTTCATACAGAATTAATGATACCGCATTAGCAAGTTCATGAAAAGAGTACTTGTCACCAAGTCTTTCAGTGAAAAAGTCGCTATGTAAATCGCCATATTCTTCTTGATCGCGCACTAACAACAAAACATCTCGAATACAATCATAGTTAATTTTCATAATATCACCTCCAATCAAACTAATTATAGCAGATTGGAGAGTAACCAAAATAGGAGGCTAGAAAATGAGTAACGAAGAGTTAACTTTGTCAATCAAAACTAGTCAAAGAGAAGATGGGTCTGCATATAATGCCATTCAACTTGGTGACTGGAAAGTAGGGCGATTTGTAACGGGTATTCATTTAGAAATACTGGGTGGTGAACGACCAAAGTTAATTATTGAATGCTATCCAGAAAGAATAGACGTGGATGGTTTAGAAGTAGAGGCTTTTTTAAAACAAATAGAGGAGGGAGAAAAATGAATAACATCAAACAAGCAATTATTAAACTAGAAACAATTTTAGAAAATGGTAATGCAATAGAGAGCGGCTCATTTGTTAAATACAGCGTTATAAAAAATATTTTAAATTTACTTGAAAAAGATCAAGAGCTAAAAATTATCGAAATGGAAGTAGAGCTGAATGGAGTAGAGGATTCCATAGAAAACGCCGCTTTGTTAGAAAAGAGATTAAGTGAAGCCAAATCTTTGGTGGAAGACTTGGCTAGCACTATAAACTCGTTAGAAATTAAGGTGAATTCTAAGGAAGAAATAAGAGAGGCAGAAAAGAGTATAAAATTAAGACATTTTGCTACTCCAAGTACTGATTTTTAATATCTTCAATTGTTTCATGAGTTTCTTTTAGATATTCATCTAAATCTGCTACTTCAGTTTTAATCTTAATACCTTCTTCATATGACGTTAAATATCCAGCAAAGATATCTGTTTCGTCTTCGTTTATAAGTTCTTTCTTTTTTAGTAAGTCAATCAAGGAATTAAATCTTTTCTCTAAATCGACTAAAACTTTAGAAGTATTGTAATACTCTACTTCGTTTCTTGTTACGGATGAATAAGTATAGGTGTTTTCATCAATTACAAAAGGTTTAGTTGTTAAGAATAATTGAATTTTTCCTTTGGAATCAAATACAAATCTGCCAAATCTACCATAGTATTTTTTATTATCAAACA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TTCGACAAAGAGCAGAAACAAATAAAACAAGAAACTTCAACAACAGAATCAAGCGAAAACTTAGAAAAGAAAGTCGCTGAAATTAAAGCACAGTTAGCGGCTAGGAACGAGGTGCAGGCGTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_JPTX01000015|47:10169|3292_3496_+|WP_003731437.1|DBSCAN-SWA MRNRLIELRKSKTRREVSKDLNITPQMLGAIERGDRTPSLKLANKIANYYDVPIEDIFFDNKDTLCV >NZ_JPTX01000015|47:10169|2322_2490_-|WP_014601103.1|DBSCAN-SWA MKTLDELNVQHDIVILEHEFTSCSFTLKKEIFIVIDSRLSRSEKLEDIARLLNKI >NZ_JPTX01000015|47:10169|7444_8404_+|WP_031646021.1|DBSCAN-SWA MAVAKEKTMNVLASVKDMNRTQWLLTRRLGIGGSDAGIIMGLNQYKTAFELWLDKTDQVLPDESAGEAAYWGNQMEEVVAKEFEKRTGKKVRRSNMMYQHSEHDFMLANVDRFVVGEDAILECKTASAYLAKEWEADEVPATYLVQIQHYLAVTGKSKAYVAVLIGGNKFIWKEIERDDELINQIIAFELDFWETNVKGHVAPALDGSSAAEKYLKDRFAKSEAKQVILSKKYNEFLAERANLERDIKLLETRKKEIDNNIKNDLKEAETGIADEFTITWKPVITSRVDTKRLKEEHPDIYKKLRKETSYRKFAVKENK >NZ_JPTX01000015|47:10169|6699_6915_+|WP_023548459.1|DBSCAN-SWA MSEVLVSASYEGYESKSINFTEINNIVKERFKKIDEVERKKRAEAFNKKYKVTKELVDGHLREIIIPRRAI >NZ_JPTX01000015|47:10169|4338_4692_+|WP_003731222.1|DBSCAN-SWA MNNIKQAIIKLETILENGNAIESGSFVKYSVIKNILNLLEKDQELKIIEMEVELNGVEDSIENAALLEKRLSEAKSLVEDLASTINSLEIKVNSKEEIREAEKSIKLRHFATPSTDF >NZ_JPTX01000015|47:10169|9251_10169_+|WP_060587051.1|DBSCAN-SWA MDGYIALHRKIIDSWIWQDPEFYRLWSYCLIKASFKEREIFLGQQIVKLNPGQFVIGREKLEEAMNVGLKNKRTAVTWWRRLQKLEKAQMLNIKSYNKFSVVTIENWGFYQGSDIENEQQNEQQTNNKRTTDVQQTITNNKDNKEKNDNKDNNKRQNKFDEVHLSLANLLFEMIKSNNPEEKNPDIEKWAHDLRIMIEQDKREPEKVKNAIIWSQENDFWCSVIKSPRSLRRNYDKMATQRNKPVANKPFNKYSKQTKPEVLPDWFDKEQKQIKQETSTTESSENLEKKVAEIKAQLAARNEVQA >NZ_JPTX01000015|47:10169|4669_5212_-|WP_003731223.1|DBSCAN-SWA MTKLIINEFDFSLNASNYHILNDLICVESTLNNSELNSFIELYKSHLTDEESFDFMFDNKKYYGRFGRFVFDSKGKIQLFLTTKPFVIDENTYTYSSVTRNEVEYYNTSKVLVDLEKRFNSLIDLLKKKELINEDETDIFAGYLTSYEEGIKIKTEVADLDEYLKETHETIEDIKNQYLE >NZ_JPTX01000015|47:10169|2647_3124_-|WP_060571499.1|DBSCAN-SWA MFSKRLSELRKKKGFSQYKLADELGFSRGQVANYEQGTREPDYQTLLKIAEFFNVSTDYLLGRDDNNLADTIAAHIDSNATEEDIKEILAYIEEKRKEHTNEREINITEIASKEDEAVDKFVEENEDFKAVAARVMNDAEAVKAVKSFIEFYEQQKKE >NZ_JPTX01000015|47:10169|7023_7212_+|WP_039385072.1|DBSCAN-SWA MTERVFRKQTIFGNSEIFIDDRTKMIANPAFRQKIPLIETGCEKMTDYIEELKLKGYEEVTR >NZ_JPTX01000015|47:10169|3681_4041_-|WP_060587047.1|DBSCAN-SWA MKINYDCIRDVLLLVRDQEEYGDLHSDFFTERLGDKYSFHELANAVSLILYEGLAVGDYPTGNMDGNYDYIIRFLTVSGDQFINSVKDDSVWSKAKEEVKNNPIQTLFSFAQIAVSFFR >NZ_JPTX01000015|47:10169|5275_6049_+|WP_015987419.1|DBSCAN-SWA MSNLQIFNFEGNEVRTVFIENEPHFIGKDVAKVLGYSNSRDALKRHVFLKNKGVVKHDSLGGSQNLTAINEAGLYQLIFKSKLESAERFQDWVTSEVLPSVRKHGAYMTNDTIEKAITDPDFLIRLATNLKEEKTKRIEAEQRLEIQKPKVMFAEAVSDARGTILIRDLAKLIQQNGIDIGEKRLFEWMRQRGYLISRKGTDYNRPTQKSMELGLFKIKETAIIRSSGAQTAITAKVTGKGQLYFVNKFLEQSLKTI >NZ_JPTX01000015|47:10169|3528_3723_+|WP_003733687.1|DBSCAN-SWA MRKIAFTNSFLTKRNRKESVLTIELSITGEDFSDLSILPELYSEINSLVNRLSEKTNGDLGKRK >NZ_JPTX01000015|47:10169|6169_6703_+|WP_060587049.1|DBSCAN-SWA MFQKSTSATAAMQVLAETRTQKELAIDSYVTPALISNQIRGKRTVSLEQAEQLIDSYNEPESTYLFAHEFSNGMIPPLLDGLDNHHASLTNRFELEVEEAINTLKNGLETMTYSLRKGDMLQREAAKQAIAEITDVIASALTLNTSIAKAFNIDLQQVLNKRDLYYQKSGLVRSCGK >NZ_JPTX01000015|47:10169|1470_2268_-|WP_060587045.1|DBSCAN-SWA MKKGMVLLTGFLIIFCMFLTGCETASNDSKKSNIDTSSKSESAFINISSEVFTSDDNGNVTIAGMTNPNAKIYLMEQTTTFAETTADDKGKFTLEVTIQDEKQATLIAEKGKETTEKAVILFLNDSAQLNADKERKEQEEKSANEAKELKNKNNQEAKDNAKSISYQMLNKNADTYKDEPYYIKGKVVQAIEDSGTTLMRVNVTDDGSGYYDDTMAVLYDGFTDAVEDDIIEVYGTIYGNYTYETTIGGEMRIPGLNAESINIIK >NZ_JPTX01000015|47:10169|47_1406_-|WP_026750224.1|DBSCAN-SWA MKAAIYIRVSTQEQIENYSIQAQTEKLTALCRSKDWDVYDIFIDGGYSGSNMNRPALNEMLSKLHEIDAVVVYRLDRLSRSQRDTITLIEEYFLKNNVEFVSLSETLDTSSPFGRAMIGILSVFAQLERETIRDRMVMGKIKRIEAGLPLTTAKGRTFGYDVIDTKLYINEEEAKQLQMIYDIFEEEKSITTLQKRLKKLGFKVKSYSSYNNWLTNDLYCGYVSYADKVHTKGVHEPIISEEQFYRVQEIFSRMGKNPNMNRDSASLLNNLVVCGKCGLGYVHRRKDTVSRGKKYHYRYYSCKTYKHTHELEKCGNKIWRADKLEELIIDRVNNYSFASRNVDKEDELDSLNEKLKTEHAKKKRLFDLYISGSYEVSELDGMMADIDAQINYYEAQIEANEELKKNKKIQENLADLATVDFDSLEFREKQLYLKSLINKIYIDGEQVTIEWL >NZ_JPTX01000015|47:10169|8406_9222_+|WP_003725086.1|DBSCAN-SWA MATNDELKNQLANKQNGGQVASAQSLDLKGLLEAPTMRKKFEKVLDKKAPQFLTSLLNLYNGDDYLQKTDPMTVVTSAMVAATLDLPIDKNLGYAWIVPYKGRAQFQLGYKGYIQLALRTGQYKSINVIEVREGELLKWNRLTEEIELDLDNNTSEKVVGYCGYFQLINGFEKTVYWTRKEIEAHKQKFSKSDFGWKKDYDAMAKKTVLRNMLSKWGILSIDMQTAVTEDEAEPRERKDITEDESIPDIIDVPTTPSDTLEAGSVVQGSMI >NZ_JPTX01000015|47:10169|4105_4342_+|WP_015987418.1|DBSCAN-SWA MSNEELTLSIKTSQREDGSAYNAIQLGDWKVGRFVTGIHLEILGGERPKLIIECYPERIDVDGLEVEAFLKQIEEGEK |
17 | Listeria_phage(93.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_JPTX01000004_1 | 51031-52422 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of NZ_JPTX01000004_1
|
21 spacers
spacers of NZ_JPTX01000004_1
>1.1|51060|37|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATGCTTAAACCGAGAGCATCAAATTGTTCCCATGC >1.2|51126|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTACAGTACAAGCAAGGGTTATTGAGTTAAATATT >1.3|51191|35|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAATGATAAGAGCGGAAAGAAAACTTTCAAGGG >1.4|51255|37|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCCCCTTAAGATACAAACTCGATTTGACAGGTGCAG >1.5|51321|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGTTTATGACCTTATGAAAGAGTTAACACCTCGAC >1.6|51386|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTCCTACTTTTTGACATAAAAAATAAGCCGAGTTG >1.7|51451|37|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTATCGCCTTCGCTAGGCGTTTCGGGCGGCGTTTCC >1.8|51517|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTTAGAGAAAGAAAAACAAGAAAAAGTAAAACTG >1.9|51582|37|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGTAATTTTACGATTATACTTTTTAGTCAAATTAC >1.10|51648|35|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAACAAGTAGTGTTATACCTGCAACAATACCAGC >1.11|51712|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGAAATGGGAAGAAAGAAATGCACTGATTGTAGAG >1.12|51777|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCCACATCGACAATAAAAAACACATTGTATCACTT >1.13|51842|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGGTTACTCAACTGGCGACAGTAATACACCTCAAT >1.14|51907|34|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGGATAGGTTGTTTCTGATAAATAGGTTCACG >1.15|51970|33|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAAAAAAACATCTTTCCAATTTGTTGTTTTGC >1.16|52032|37|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAGTGCTAGAACAGAAGTTATAATTTGAACATTAC >1.17|52098|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTTCGACGGCTTAGACAACCATCACGCTTCTTTA >1.18|52163|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAAAATATTGCCCAATGTGCGGAAGGAGTTTGGA >1.19|52228|37|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAAATCCGGGAAGTTTTGTTCTACAGAGCGAACGG >1.20|52294|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGTAATTCTTAATTCCGTATTGATTCGCTAGTTTT >1.21|52359|35|NZ_JPTX01000004|CRISPRCasFinder,CRT TTTTGAAATATGAGGACTTAGAAAATGAAAAAAAT |
cas2,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_JPTX01000004_1
The CRISPR arrays of NZ_JPTX01000004_1 >merge|NZ_JPTX01000004|1|51031-52422|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATCAATGCTTAAACCGAGAGCATCAAATTGTTCCCATGCGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATATTACAGTACAAGCAAGGGTTATTGAGTTAAATATTGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATATTAATGATAAGAGCGGAAAGAAAACTTTCAAGGGGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTCCCCCTTAAGATACAAACTCGATTTGACAGGTGCAGGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTCGTTTATGACCTTATGAAAGAGTTAACACCTCGACGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATCTTCCTACTTTTTGACATAAAAAATAAGCCGAGTTGGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAGTATCGCCTTCGCTAGGCGTTTCGGGCGGCGTTTCCGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATACTTTAGAGAAAGAAAAACAAGAAAAAGTAAAACTGGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTCGTAATTTTACGATTATACTTTTTAGTCAAATTACGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAAGTAACAAGTAGTGTTATACCTGCAACAATACCAGCGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTGGAAATGGGAAGAAAGAAATGCACTGATTGTAGAGGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGTCCACATCGACAATAAAAAACACATTGTATCACTTGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATCTGGTTACTCAACTGGCGACAGTAATACACCTCAATGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTTGGATAGGTTGTTTCTGATAAATAGGTTCACGGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAGAAAAAAACATCTTTCCAATTTGTTGTTTTGCGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATACAAGTGCTAGAACAGAAGTTATAATTTGAACATTACGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTGTTCGACGGCTTAGACAACCATCACGCTTCTTTAGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTATAAAATATTGCCCAATGTGCGGAAGGAGTTTGGAGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAAGAAATCCGGGAAGTTTTGTTCTACAGAGCGAACGGGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGTGTAATTCTTAATTCCGTATTGATTCGCTAGTTTTGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTTTGAAATATGAGGACTTAGAAAATGAAAAAAATGTTTTAACTACTTATTATGAAATCATAAA >NZ_JPTX01000004|1|1|51031-52358|PILER-CR GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT CAATGCTTAAACCGAGAGCATCAAATTGTTCCCATGC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ATTACAGTACAAGCAAGGGTTATTGAGTTAAATATT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ATTAATGATAAGAGCGGAAAGAAAACTTTCAAGGG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TCCCCCTTAAGATACAAACTCGATTTGACAGGTGCAG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TCGTTTATGACCTTATGAAAGAGTTAACACCTCGAC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT CTTCCTACTTTTTGACATAAAAAATAAGCCGAGTTG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT AGTATCGCCTTCGCTAGGCGTTTCGGGCGGCGTTTCC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ACTTTAGAGAAAGAAAAACAAGAAAAAGTAAAACTG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTCGTAATTTTACGATTATACTTTTTAGTCAAATTAC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAA GTAACAAGTAGTGTTATACCTGCAACAATACCAGC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TGGAAATGGGAAGAAAGAAATGCACTGATTGTAGAG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT GTCCACATCGACAATAAAAAACACATTGTATCACTT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT CTGGTTACTCAACTGGCGACAGTAATACACCTCAAT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTTGGATAGGTTGTTTCTGATAAATAGGTTCACG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT AGAAAAAAACATCTTTCCAATTTGTTGTTTTGC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ACAAGTGCTAGAACAGAAGTTATAATTTGAACATTAC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTGTTCGACGGCTTAGACAACCATCACGCTTCTTTA GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TATAAAATATTGCCCAATGTGCGGAAGGAGTTTGGA GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT AAGAAATCCGGGAAGTTTTGTTCTACAGAGCGAACGG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT GTGTAATTCTTAATTCCGTATTGATTCGCTAGTTTT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT >NZ_JPTX01000004|1|1|51031-52422|CRISPRCasFinder GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT CAATGCTTAAACCGAGAGCATCAAATTGTTCCCATGC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ATTACAGTACAAGCAAGGGTTATTGAGTTAAATATT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ATTAATGATAAGAGCGGAAAGAAAACTTTCAAGGG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TCCCCCTTAAGATACAAACTCGATTTGACAGGTGCAG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TCGTTTATGACCTTATGAAAGAGTTAACACCTCGAC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT CTTCCTACTTTTTGACATAAAAAATAAGCCGAGTTG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT AGTATCGCCTTCGCTAGGCGTTTCGGGCGGCGTTTCC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT 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CAATGCTTAAACCGAGAGCATCAAATTGTTCCCATGC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ATTACAGTACAAGCAAGGGTTATTGAGTTAAATATT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ATTAATGATAAGAGCGGAAAGAAAACTTTCAAGGG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TCCCCCTTAAGATACAAACTCGATTTGACAGGTGCAG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TCGTTTATGACCTTATGAAAGAGTTAACACCTCGAC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT CTTCCTACTTTTTGACATAAAAAATAAGCCGAGTTG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT AGTATCGCCTTCGCTAGGCGTTTCGGGCGGCGTTTCC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ACTTTAGAGAAAGAAAAACAAGAAAAAGTAAAACTG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTCGTAATTTTACGATTATACTTTTTAGTCAAATTAC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAA GTAACAAGTAGTGTTATACCTGCAACAATACCAGC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TGGAAATGGGAAGAAAGAAATGCACTGATTGTAGAG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT GTCCACATCGACAATAAAAAACACATTGTATCACTT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT CTGGTTACTCAACTGGCGACAGTAATACACCTCAAT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTTGGATAGGTTGTTTCTGATAAATAGGTTCACG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT AGAAAAAAACATCTTTCCAATTTGTTGTTTTGC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ACAAGTGCTAGAACAGAAGTTATAATTTGAACATTAC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTGTTCGACGGCTTAGACAACCATCACGCTTCTTTA GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TATAAAATATTGCCCAATGTGCGGAAGGAGTTTGGA GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT AAGAAATCCGGGAAGTTTTGTTCTACAGAGCGAACGG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT GTGTAATTCTTAATTCCGTATTGATTCGCTAGTTTT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTTTGAAATATGAGGACTTAGAAAATGAAAAAAAT GTTTTAACTACTTATTATGAAATCATAAA
>NZ_JPTX01000004.1|WP_003721310.1|50554_50833_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVILIYDISIENGGAKVWRNVFKICKKYLTHVQKSVFEGEITPALLVKLRMELDKYIRDDQDSVIVFSSRQQRWLEKEFWGLTDEKTSNFF >NZ_JPTX01000004.1|WP_046670317.1|48062_50252_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MHKYLAKSNPEETIQEHTDNLLKNYQRLKKLYPAVEIDWYLLELVCLLHDLGKMNLLFQTKLGNASGKGKEIPHGYLSVAFVPDSKLEEMGYSEDEIKVVYQAIARHHERKYDFSDSEWKKEIIKLEEQWAGFIYSQLGENAEYSSEVEMLYFYPGSRIFEGNSAADAETFKKYVLLKGLLNRIDFAASGGIDVELENDFLMDSMEVQLAHFKAENPEADWNALQKYMMQHQNENIVVIAETGMGKTEAGLLWLGNNKGFFTLPLRAAINAIYERITKNIVTTNQAERVGLLHSETYSQYLLHEGNAEMDIDEYYTRTRQMSLPITICTLDQLFDFVFRYAGFEHKLATLSYSKVIIDEIQMYSPDLLAYLILGLSYIDKFGGKFCIMTATLPGIVTDLLLENGVDFVQPEDKFVSSRIRHSMEMVHTEIESEFIKPFFNNNRILVICNTISKAKKIYSELKEHFQGEEIHLIHSQFIKKDRSAKEDAIFKDGQKDSKKKCIWVATQVVEASLDIDFDLLFTELSDVNGLFQRMGRCYRNRRLDVDTNVYVFDGGAKVCSGVGIDNFIDKLIFENSKTILNEHAGVLTEEKKMELVEQVYSTEALSGSKFYKELIRTINYVKAFESYLMNKADVRRRFRNINSVSVIPEEVWQDNAEEINSYFVTLRKTSKEISTKEKIIARTNLAEFMVSIPDYLYKKGESVVREINRYESVIEFKCGYSSDVGVFMR >NZ_JPTX01000004.1|WP_003731262.1|47212_47995_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MLIMKAIRVKLWQDLVNFKKPTSFQLKETYPLPPYSTVIGMVHTLCGFTSYHEMKISIQGKYFSKVNDLATRYEFKNGMTYDASRHQIKVDKYGVSRGVSTVELLVDLELLLHIIPEDPSLVPIIEKAFREPIEFPSLGRREDIATIQKVEVVDVEKRQPKKSTEISDGYNAYVPISLTENNSVHFKSHESSVGRDKLLGTRYLLTEKYERVNHGTEKAPKFFRKWRKKDVIYSSRIFVSKKDVFFFDEDDYLVFIEEEE >NZ_JPTX01000004.1|WP_031643486.1|46365_47235_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKNKGLAMTIIFQAESANYGESLGNISSLKKISRNNGDQYTYISRQAIRYNLMDQIGEKEAPVKAEGGGDKKVIQFLSEATITDFPELDFFGYLKTEKGSGGQKRSAKVRLSNAISLETFKGDLDFLTNKGQADKLNENMNIAQAEIHKSYYRYTMTIDLDQIGIDGEIALENKEKARRVKKLMDTVAFLYRDIRGRREDLKPLFVIGGVYDVKNPVFQNVVDVADNNIVIKNIKDLLTYEDIKENTRVGIIDGQFANSDEVKVELKAESVPAFFNDIKGKIDAYYESN >NZ_JPTX01000004.1|WP_003731260.1|44687_46376_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MRTEIEVRANDWLINAGLIGFLNIVGKENVRIDGQSIYFTADLLEDFETKYFNFFIQEFKETLSWYKIVSYKETMEQFRIDEFASFDEVALGNLNKYMKDVVKFYLKKVNYIKVFPLIDPSANVTKWLENLNTINLTKKQRWDEVKADIIEEVKQTYTQLDLIIDFCASEKGLQYLGAKNLIYSVINKGWSGVSFLFKQTKFIDPYLDYKTTFVDSVLDYLDTDLSKAKYNCFNCNQPIKNLKLDLSFMNDVGFDTARKTSHVWDFNNDVATCPICRLIYSCVPAGFTYVYGEGMFVNDSYGVEELHRVNERMRNSILSFNQDGINSTNTYRALVESITMEHENNRRYELADIQLVRYENEHYRFNLLSKKMLHIVNDSKGILKGLIRCGYKEGNLNVNLYKEVLQHLMNNENLFTLIHKLIYYKQTSVNGLYYNMGHVSGILDINTKFLKEMEVMTNISQNQLWFVQNCGKEFKEGYVKKKSENKISGITYKLLNSLKVNDKDGFMDTLLNSYSYLAMPIPDVFIKMFSDNEAFKSVGYAFMLGVGGEKTKKEDGGNTDEK >NZ_JPTX01000004.1|WP_003731259.1|43949_44672_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLKINCDFDSKIIPKDFQSKVVSLFKAGIMKSSPERYENLFGGNKHKQYTFSVYLPKPQNKGAEIQLNEANCIINFSTGDAETGIIFYNALISLRGSKILFGAGNNITIKNIQIVPEKKIIGNRTILRTLSPVVSRDHNRETFKNWFYSFEDEEFEPTLKRNMLPYLIDAFGEQARYDLEKLKITPISMKKVVVYCHEIHIESSVGIFELEAEAYLQKYLVENGLGTMTGSGFGMIEQL >NZ_JPTX01000004.1|WP_003727297.1|42781_43597_-|histidine-phosphatase-family-protein 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>NZ_JPTX01000004.1|WP_009928927.1|58871_60461_+|type-I-restriction-modification-system-subunit-M MALSTEQKTKMWAMLNQTRGQIGLTAYKDYIFGILFYKYLSEKATHWLNGVLRGENWESVYSQDSVKALNYMKKNLGYAIQPNEFFVDWKKAIDTDRFNIGMMTDTFTHFNQQIAFEAKNDFEGIFDGMRFDSADLGANAQARASVMISMIELLSSPEFDLSGSNDTVSDIYEYLVAQFATVLASDMGQYYTPKEISNVMARILTFGREDMEKFSIFDPTVGSGSLLLTTASYMKNSGRRGVIKYYGQEKDATPYRLSRMNLMMHGIEYNDININHADTLESDWPDGVVDGKDTPRMFDAVMANPPYSAHWNNKDREDDPRWREYGVSPKTKADYAFLLHCLYHLEDNGRMAIILPHGVLFRGASEGRIRKALIDKHQIEAIIGFPEKLFLNTPIPVCVVILRKNRIESDVLFVDASKGFEKIKKQNNLRSEDVEKIVDTVINRKEIEKYSHVATLDEIKENDYNLNIPRYVDTFEEEEAIDLVALGNEMVALNADIKKAETDFLGLLDELAVTADTKEIIEATKAVFR >NZ_JPTX01000004.1|WP_031641459.1|60457_61663_+|restriction-endonuclease-subunit-S 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>NZ_JPTX01000004.1|WP_003726690.1|65480_66233_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MLFLDKNLELNDTELDIYNYIVANLDKVVYMRIRDLATEAHVSTTTILRFCRKFGCNGFSEFRVKLQLYLEEQKLAQIDMADETTYIDFLKRTAQPEFKAQIQNAVEILRDRELVLFAGVGSSGVIAEYGAIYFSSLFTLALHIEDPLNHPFYHLSSKLSDKICMIAISVEGENEDIIRYIHQLKAQNCKVISITNSAKSTIARLSDANIAYYINKEMYQEANITSQLPALYTIENIAREIRTQIDKEKM |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_JPTX01000004_1 | 1.2|51126|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51126-51161 | 36 | NZ_JPTX01000014.1 | 20275-20310 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.2|51126|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 20275-20310, mismatch: 0, identity: 1.0
attacagtacaagcaagggttattgagttaaatatt CRISPR spacer attacagtacaagcaagggttattgagttaaatatt Protospacer ************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_JPTX01000004_1 | 1.2|51126|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51126-51161 | 36 | DQ003642 | Listeria phage A006, complete genome | 16672-16707 | 0 | 1.0 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.3|51191|35|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51191-51225 | 35 | MH341453 | Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome | 31167-31201 | 0 | 1.0 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.13|51842|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51842-51877 | 36 | NC_003216 | Listeria phage A118, complete genome | 18563-18598 | 0 | 1.0 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.13|51842|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51842-51877 | 36 | AJ242593 | Bacteriophage A118 complete genome | 18563-18598 | 0 | 1.0 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.1|51060|37|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51060-51096 | 37 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 9186-9222 | 1 | 0.973 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.6|51386|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51386-51421 | 36 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 17910-17945 | 1 | 0.972 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.1|51060|37|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51060-51096 | 37 | MT500540 | Listeria phage LP-HM00113468, complete genome | 35729-35765 | 2 | 0.946 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.12|51777|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51777-51812 | 36 | MH341453 | Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome | 26132-26167 | 2 | 0.944 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.17|52098|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 52098-52133 | 36 | KJ094022 | Listeria phage LP-030-3, complete genome | 38302-38337 | 2 | 0.944 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.18|52163|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 52163-52198 | 36 | MH341453 | Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome | 41996-42031 | 3 | 0.917 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.6|51386|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51386-51421 | 36 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 227438-227473 | 4 | 0.889 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.20|52294|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 52294-52329 | 36 | FW590615 | JP 2010534058-A/25: ANTIBIOTIC RESISTANCE FREE LISTERIA STRAINS AND METHODS FOR CONSTRUCTING AND USING SAME | 3844-3879 | 4 | 0.889 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.20|52294|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 52294-52329 | 36 | HI504184 | Sequence 26 from Patent EP2147092 | 3844-3879 | 4 | 0.889 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.20|52294|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 52294-52329 | 36 | AJ417489 | bacteriophage U153 int gene for U153 integrase | 3844-3879 | 4 | 0.889 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.18|52163|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 52163-52198 | 36 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 32760-32795 | 5 | 0.861 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.21|52359|35|NZ_JPTX01000004|CRISPRCasFinder,CRT | 52359-52393 | 35 | MN694189 | Marine virus AFVG_250M578, complete genome | 47879-47913 | 6 | 0.829 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.15|51970|33|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51970-52002 | 33 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 1764852-1764884 | 7 | 0.788 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.15|51970|33|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51970-52002 | 33 | NZ_CP038863 | Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence | 39302-39334 | 7 | 0.788 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.8|51517|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51517-51552 | 36 | AP013647 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C72-MedDCM-OCT-S41-C96, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 13305-13340 | 8 | 0.778 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.20|52294|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 52294-52329 | 36 | NC_019743 | Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.08, complete sequence | 4997-5032 | 8 | 0.778 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.3|51191|35|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51191-51225 | 35 | NZ_CP013615 | Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence | 176358-176392 | 9 | 0.743 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.21|52359|35|NZ_JPTX01000004|CRISPRCasFinder,CRT | 52359-52393 | 35 | MK448625 | Streptococcus satellite phage Javan738, complete genome | 5960-5994 | 9 | 0.743 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.21|52359|35|NZ_JPTX01000004|CRISPRCasFinder,CRT | 52359-52393 | 35 | MK448449 | Streptococcus satellite phage Javan356, complete genome | 4490-4524 | 9 | 0.743 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.21|52359|35|NZ_JPTX01000004|CRISPRCasFinder,CRT | 52359-52393 | 35 | MK448636 | Streptococcus satellite phage Javan749, complete genome | 6112-6146 | 9 | 0.743 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.21|52359|35|NZ_JPTX01000004|CRISPRCasFinder,CRT | 52359-52393 | 35 | NZ_CP045037 | Lactobacillus mali strain LM596 plasmid unnamed2, complete sequence | 34734-34768 | 9 | 0.743 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.21|52359|35|NZ_JPTX01000004|CRISPRCasFinder,CRT | 52359-52393 | 35 | NZ_CP018177 | Lactobacillus hordei strain TMW 1.1822 plasmid pL11822-1, complete sequence | 11325-11359 | 9 | 0.743 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.21|52359|35|NZ_JPTX01000004|CRISPRCasFinder,CRT | 52359-52393 | 35 | NZ_CP018181 | Lactobacillus nagelii strain TMW 1.1827 plasmid pL11827-1, complete sequence | 63608-63642 | 9 | 0.743 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.8|51517|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51517-51552 | 36 | NZ_CP018048 | Pseudomonas aeruginosa strain DN1 plasmid unnamed1, complete sequence | 142304-142339 | 11 | 0.694 |
NZ_JPTX01000004_1 | 1.8|51517|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 51517-51552 | 36 | NZ_AP015030 | Pseudomonas putida strain KF715 plasmid pKF715A, complete sequence | 410342-410377 | 11 | 0.694 |
1. spacer 1.2|51126|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to DQ003642 (Listeria phage A006, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attacagtacaagcaagggttattgagttaaatatt CRISPR spacer attacagtacaagcaagggttattgagttaaatatt Protospacer ************************************
2. spacer 1.3|51191|35|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH341453 (Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaatgataagagcggaaagaaaactttcaaggg CRISPR spacer attaatgataagagcggaaagaaaactttcaaggg Protospacer ***********************************
3. spacer 1.13|51842|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_003216 (Listeria phage A118, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat CRISPR spacer ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat Protospacer ************************************
4. spacer 1.13|51842|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AJ242593 (Bacteriophage A118 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat CRISPR spacer ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat Protospacer ************************************
5. spacer 1.1|51060|37|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
caatgcttaaaccgagagcatcaaattgttcccatgc CRISPR spacer caatgcttaaacctagagcatcaaattgttcccatgc Protospacer ************* ***********************
6. spacer 1.6|51386|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
cttcctactttttgacataaaaaataagccgagttg CRISPR spacer cttcctactttttgacataaaaaataagccgaattg Protospacer ********************************.***
7. spacer 1.1|51060|37|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT500540 (Listeria phage LP-HM00113468, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
caatgcttaaaccgagagcatcaaattgttcccatgc CRISPR spacer caatgcttaacccaagagcatcaaattgttcccatgc Protospacer ********** **.***********************
8. spacer 1.12|51777|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH341453 (Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
gtccacatcgacaataaaaaacacattgtatcactt CRISPR spacer gtccacattgacaacaaaaaacacattgtatcactt Protospacer ********.*****.*********************
9. spacer 1.17|52098|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094022 (Listeria phage LP-030-3, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ttgttcgacggcttagacaaccatcacgcttcttta CRISPR spacer cttttcgacggcttagacaaccatcacgcttcttta Protospacer .* *********************************
10. spacer 1.18|52163|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH341453 (Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
tataaaatattgcccaatgtgcggaaggagtttgga CRISPR spacer tataaaatattgtccaatgtgtggaaggagtttggg Protospacer ************.********.*************.
11. spacer 1.6|51386|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
cttcctactttttgacataaaaaataagccgagttg CRISPR spacer cttcctactttttgacataaaaaataagccttgctc Protospacer ****************************** *.*
12. spacer 1.20|52294|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FW590615 (JP 2010534058-A/25: ANTIBIOTIC RESISTANCE FREE LISTERIA STRAINS AND METHODS FOR CONSTRUCTING AND USING SAME) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
gtgtaattcttaattccgtattgattcgctagtttt CRISPR spacer ttataatccttaattccgtattgatttgctagtttt Protospacer *.****.******************.*********
13. spacer 1.20|52294|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HI504184 (Sequence 26 from Patent EP2147092) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
gtgtaattcttaattccgtattgattcgctagtttt CRISPR spacer ttataatccttaattccgtattgatttgctagtttt Protospacer *.****.******************.*********
14. spacer 1.20|52294|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AJ417489 (bacteriophage U153 int gene for U153 integrase) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
gtgtaattcttaattccgtattgattcgctagtttt CRISPR spacer ttataatccttaattccgtattgatttgctagtttt Protospacer *.****.******************.*********
15. spacer 1.18|52163|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.861
tataaaatattgcccaatgtgcggaaggagtttgga CRISPR spacer cattgaattttgcccaatgtgcggaaggagcttgga Protospacer .** .*** *********************.*****
16. spacer 1.21|52359|35|NZ_JPTX01000004|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694189 (Marine virus AFVG_250M578, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer taataaaaaatgagggcttagaaaatgaaaaaatt Protospacer * *.*** ******.***************** *
17. spacer 1.15|51970|33|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
agaaaaaaacatctttccaatttgttgttttgc CRISPR spacer gcaaaaaaacatctttcctatttgttttatcac Protospacer . **************** ******* * *..*
18. spacer 1.15|51970|33|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038863 (Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
agaaaaaaacatctttccaatttgttgttttgc----- CRISPR spacer agaaaaaaacatatttccaatt-----ttttccaaaaa Protospacer ************ ********* **** *
19. spacer 1.8|51517|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP013647 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C72-MedDCM-OCT-S41-C96, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
actttagagaaagaaaaacaagaaaaag----taaaactg CRISPR spacer tctttagaaaaagaaatacaagaaaaaagatttaaa---- Protospacer *******.******* **********. ****
20. spacer 1.20|52294|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019743 (Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.08, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
gtgtaattcttaattccgtattgattcgctagtttt--- CRISPR spacer gtgtaattcttactgccgtattgatt---taactctgaa Protospacer ************ * *********** **..*.*
21. spacer 1.3|51191|35|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013615 (Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
attaatgataagagcggaaagaaaactttcaaggg CRISPR spacer gaaattaaaaagagagcaaagaaaactttcaagga Protospacer . * *.* ***** * *****************.
22. spacer 1.21|52359|35|NZ_JPTX01000004|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448625 (Streptococcus satellite phage Javan738, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer gtatgaactatgaggacttagaaagtgaagacctg Protospacer * **** ****************.****.*
23. spacer 1.21|52359|35|NZ_JPTX01000004|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448449 (Streptococcus satellite phage Javan356, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer gtatgaactatgaggacttagaaagtgaagacctg Protospacer * **** ****************.****.*
24. spacer 1.21|52359|35|NZ_JPTX01000004|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448636 (Streptococcus satellite phage Javan749, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer gtctgaactatgaggacttagaaagtgaagacctg Protospacer *.**** ****************.****.*
25. spacer 1.21|52359|35|NZ_JPTX01000004|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045037 (Lactobacillus mali strain LM596 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer ttaagaaatataaggacttagtaaatgaagttatg Protospacer ** *******.********* *******. *
26. spacer 1.21|52359|35|NZ_JPTX01000004|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018177 (Lactobacillus hordei strain TMW 1.1822 plasmid pL11822-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer ttaagaaatataaggacttagtaaatgaagttatg Protospacer ** *******.********* *******. *
27. spacer 1.21|52359|35|NZ_JPTX01000004|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018181 (Lactobacillus nagelii strain TMW 1.1827 plasmid pL11827-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer ttaagaaatataaggacttagtaaatgaagttatg Protospacer ** *******.********* *******. *
28. spacer 1.8|51517|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018048 (Pseudomonas aeruginosa strain DN1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
actttagagaaagaaaaacaagaaaaagtaaaactg CRISPR spacer gaaaaagagaaagagaaacaagagaaagtaacaagc Protospacer . *********.********.******* *
29. spacer 1.8|51517|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP015030 (Pseudomonas putida strain KF715 plasmid pKF715A, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
actttagagaaagaaaaacaagaaaaagtaaaactg CRISPR spacer gaaaaagagaaagagaaacaagagaaagtaacaagc Protospacer . *********.********.******* *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
398661 : 409390
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_JPTX01000002|398661:409390|DBSCAN-SWA TTCAAAACTTCTTGTAAACATCAATGGAATTGCCAAAATTAATGAAATATCCACCATAATCATACATCGGACCATATTTTTCTGCGTAATGAGTAACTGTATGGCGCAAAAATTCTTCTGTTACCTCTAAAAACTCCGCTACTTCAAAATATTCTCGTAAGCCTAGATAAAAACAAGCAATGATGTCATCAAGCGGTATTAGTTCCTCATAACCTTTACGACGAGCAAAAATTTCTTGTTTTTTATCCATAATTGTTTCCTGTTTAGTGATGTTACCTACAGTGTATTTGTAATGCATCAATTCTTCTACTAAAACACAGCCTTTTTCAATGGAAGATTGATCCTTACTAATAAAAATCGTCCCATTTAAATAAAGACCTGGCAATTTGTAAGGCATTTTTTCTTCTCTGATTGTTACCTCATCTTGGTATTTATTTACCAATTTTTCGTACAATAAAATCACATCCCGCGATGGAGTTTTTTCTTCATCTCTATATAAGCTAAAATATCCCGCATTTCTTCCTCGGTTACGTCATCATCAATATGGGCTGCAATTGTTACCAAGCGTTCATCAACAGGTGGTAAATTTCTTTCAGGAAAAAAGTCATCTAATCGTTTGTTGAAAATTTTTGCAAGTTCAAATAAAACGTCTTGATTTGCTTTTCGATCACCATTTTCATAACGGCTAATAGTTTGGCGAGTTGTATGAAGCTTTTCTGCTAATGCTTCTTGATTTAAGCCTCGTTCCTCGCGATATTGTTTTATTTTATTTCCTACAAATTTATTTAACTCCATAATAATTGCCCTCCACATGTTTATGGCTTCAGTATAGCACTTTTAGCACCAAAACGGAACTTTTTCGAACATATTTGTCGGATAAAGTTTACCAGTAACCAAAATGGTGCTATAATATTTGTAGAGCTAGAAAATAAATGCGGCTGATTTTGCGCCGATAGCACCGAATTGGTGACAATGTTGCTATATTAATTTATGAGATGGAAGTGGGAATGGATGGATAGAAAACTTTTAAAAGAAAAGCAAATCCAACTAATTTTTCAACTAGAACAAGAAGAAAATCGATTTATTCGAAAGCGTTTAATAGAAGAGTTGGAGTTTTTTGAAGCGCTTGGGGACAGAGAAAAAGGACTGTTAACGGCGGAGCAAAAGTTGCTTATTTTAACACCAAGTGAGTACCGAGAATACAAACGAACTAAATCAGATGTGCAAATTAGTAGGTTAATTGGAGTATCGAGATCGTCTCTTGCGGAATGGAAGCGAAAAAAAGGTTTAAATAGAAAAAAGCCGCAACCGGTTCAGCAGGAAATGATTGATGTATTAGCTTTTCATTTAGATAAAACAAAAGACGAAATTGGCGCTTTACCTGCTTCGGCGATTGAATGTCAGTATGAGGCTTTTGTGATTAATGAAGCGCACAATTAAGGAGTGATAACATGCAGGTTTTAGTGTTACCAGAAAATAAGGATATCAATTATATAAAAACGGTCCAAGAAGTAAAGCGATTTTTTGCGGATCTTGAGCGGTTTCGGATGATTACGGGGTTATCAAAAAAGCCACACTTACTTAGAAATGGTTTTCTGGAAGAGCCGCAGTTTGAGCCGGTAGCATTTTCTGCTAGATATAATAAAGAGGTCATTTTGGAAGCGCGATGGTTGGTAGAGAAATATACTGAAATGTTAAATCAGATGGATGATTTATATCGCACTATTTTGATGGAATGTTACGTGGAACGAAAACAAGATGTGGCGGTAATGATGGATTTACCGTACGAAATTGCCCAGTTTAAACGGATAAAAAAACGAGCAGTATTAGAAATCGCAACGCTAATGGGAATTTTAGTAAGGAAATGATGATACTTTCGTGATATTTTGAAACGTCATTTTACGATTAATATAGAAGTAAGCTAATTGTCCAGTAAGCGGATGACAATAAAAGCTGCATCAGAATGAAGGTGCACCGATTTTCTGATAATACAAGAGGTTGTACAAGAAATTTGTTTTTATGATTGGATTTTTCATCCGTTGACATAAACAAATATTCTATTTTGGAAAGTAAAGTTCGGAGGAATAAATTATCAAATGTGGTCTCGACCGAATTTTACTTTCTGTTTTTAAAGGAGTGAACGCTTGGTGAAGAGTTTAAGCTTCATGAGAGTTTTGGAAGCAGTGAGAACAATGCTCCAGGAAAAAGGCGGACTAGATGTTTCTATTGTAATGCGTGACCAAGTGGAAATGCCTACAACGATGATCGAGATGATTGATCAAGAGGAAGAAGAAAGCCAAACTGCCTGGAAAGAAAAATACCGTTTTGCAATCCATCATTATACAAATGAAACGGACTTAGCGGGAGTCGAAATGATAGATACGCTTATCCAAACAGGGTTCACTTTGCCTGAAGGATACAAATTAATCGCTGTTCGACATTACGGAAAACAAAATTTAGTCAAAGAAAATACGTTAATTCACGCAAAAACCAGTTTTGAAGTAAGTATTTGTCGTGAATTAAAAGTAAAAATTTAGGGGGAAATATTAATGGCATTTGAAGAGAATTTATATTGTGATTATACACCGGGAGCTGCTAAAGCGGTCGCGGGGAAAGATGTAATTTTAGCAGTTTTTAACGCAGCGGGGGATAAGCTATTAGCGGTTGCGGGGCAACAAGGTCTAACTGTAAACCGTTCTAAAGATAGCATTGAAATTACATCTAAAGATACAGTTGGCGGATGGAAATCCAAAATTGGCGGTATGAAAGAATGGTCAATTGAAAATGACGGATTATATGTCGCTGATGCAGAGTCTCACAAAGAATTGGCGAAATATTTCGAAAGTGATAGCCCGGTTTGCGTGAAAATCATTAATCAAGCATCTAAAAAAGGTCTTTTCGGTGGTTTGGCAATTGTAGCTGACTATAGTTTTGAAGCACCTTTTGATGAAGCGATGACTTACTCTGTAAAACTAGACGGAATGGGTGCGCTTGTTGATTTAACGATTACTGAGGGCGGAGATCAAATGCCCGGCGAAACACCTGTAGCACCAGCAGAATAAAATAGAGAGCCACTGAAATAAGTGGCTTTCCCTTAGGAGGAAAATAAATGTTTGAAGTGAATGATACAACTTATATTTTACGATTTAATAAACAAAAAGTTAAAACGGTGGAATTAACATCAGGGATTAGTTTAGTTGCAGCTTTGACTGCGAATAAAGGGATTTTGAGCTACCAAGTGATTGAAACGCTATTTGTTTCAGGACTTGTGGAAGAAAAAGGCTTAGTACCTGTAAAACAAAAAGAAGCTTTGGAGATTTTCGACAAATTAGTAGAAGAACAAGGCTTAATTTCGCTTAATGTAGCTGTTATTGAGAAATTGCAAGAGGATATGGGTTTTTTGTTCCGTTAAAACAGATTGAATTTGAGTATTTTGGTGCTGAGGACGAAGAAGTGGATAGTGAAATGAACCATGATTTTGATTTGGAAAAACAATTCGCTTTTTTTGTAGTTAATTTTCAGATGTCCAAGCATGATTTTGAAGAACTTACTGAAGTGGAGAAAAATTTCATCATGAAAGAATGGGAAAACAAGGTGATTTTTGAATCTACTATGCTTCGAAATGCAGTTTTAAATGCGGAACAAAATCTCAATCGAAAACGAAATTCACGTTTTATCGACTTGCATAAAAAACGTCAGAAGAAAGCCGATGTTAATTATACAGTAAATGCACTTCAAGCAATTTCCGATAATGAAGCGAAGGAAGGTAAAGCGTGGATTGATCGGATTTATGGTGCAAATGGGTTACGAAGACCTAAGAATAAAGAAGAAAGGGGGAAAGTGAATGGCGGATTCTAAAAGTTTTACATTTGAACTGAACGAGAGCGTTTTAACAGCGCAAGTTGGCAGGCTAGATGAGATGGCGATGGTTGTAGAGCGGCGGTTTTCAGAGCTCAAAATGACTATTGAAGATGTTGGAAATGCTGATCCAGGTTCGAAAATTTCCGAATCTTTAGGTGGGCTGCAGTCTGGGCTTGGCACGATTAGTTCGGCGTTTGGACAACTGGGTTCTAGTAGTGAGGCGATTACATCCGGATTCGGTACTGCGGTTGGTTCTGTTGGTGGAATCACGGATGCGTTTAAAAATCTAGGTTCAAGTGTGCAAAATGGTACGTTATTTTCAAGCTTGGCAACCGGGATTGGTGGCATGAGTACAATGCTTGGTGGAGTATCTGGCGGCGTTCAAGGAATTACAAATCTAGCTAGTGGATTTATGGAATTGAAGAAGCATCTAGGCGGTTTGATGTCATCTATTGGTGGCGTTGGTGGAATTATGGGTAAACTGACCTCTCCAATGGGGTTAGTAATTATCGGGATTGTAGCGTTAGTAGCTGCATTTGCGTATTTGATGACGACGAATGAATCATTCCGAAATACGGTGATGTCAGTTGTAACACAGGTTGCGCAACTGTTCGGTCAACTTGTCGCCAGTTTAATGCCGATTATCATGCAAATTGTTACTGCGGTTATGCAAATTGGTGCCGCGTTAATGCCGATGGTTATGCAATTTATTAGCTTTTTTGCGCAATTGTTAGCCCAATTAATGCCGTTTATTAATATGCTGATTTCCATGCTTATGCCTGTTATTATGCAGATTGTTCAAGTTGTTATGTCACTTGTTTCGGCACTATTACCGAGCATCATGACAGTGATTCAAGGCATTATGAGCGTTATTCAATTTTTAATTCCGATAATCATGCAAATTGCGACGGTGGTTGTACAAATTGTTGTAACGATTATTTCTTATATAAGTAAAATTATGCCGATTGTTATGACGATTATTGGCGTTATTGTTTCGATTATCACAACGATTATTAGTTACGTCGTTATTATTGCGACGACGATTGCTAGTGTTATTGGGAAAATTATTAGCTTTATTGCGAGTGTTATTACGGCGGTTATCGGGATTGTGCAACCAATTATTGGCTTTATTACTAATATCTTTACGACTATCGTGACGATTATTGGTGCAGCTTTCCAAATGGTATTTACTGTTGCATCCAAAATCTGGAATGCCATTATGACGACGATTTCCGGAATTATTGAAGGAATCAAAGCAGTCATCACAGGTATTTCTACTACGGTTTCATCAGTGTTTAACGGAGTGAAGCGCATTATTACAGGTGTTTTTGACGGAATCAAAAGTGCTTGGGGTGGTTTAACTGATTTTGTAGGAAATATTTTCGATGGTGTTTCAAGTGCAATTCAAACCGTGGTAGATAATGTCAAAGGTTTTGTAAACGTCGTAATTCGAGGGATTAATGGAGCCATTGGTTTAATTAATAAGATTCCAGGCGTTGAAATCGGCAAAATACCACAATTAATTTCCGGTACAACAAATTTCCAAGGTGGCTTTGCTCGAATGAATGAAGGCGGCCGAGGCGAAATGGTGGTTTTACCGTCGGGTTCGCAAGTAATTCCGCACGATGCAACGATGAAATACGCAAGGGAAAGTGCGCGCGGAAATAAATCAATGCTTTACACGAGTCAAGGTGCTGATTTGGCTAGAGTTGAAAATCTTCTCGAGCGCTTACTACAAAAAAATCCTGTAATCAAAATGGATGACAAAGTGGTAGCCGAGGTAGTTAGCCGTAACCAAGCTAACTCATTTGATCAGTACAATTACACAATGGGAGGTGCAGCTTATTCATGAGCGACTTGTTTTTAGAATTAAATGGAAAAGTGCATTCGCTTAGTGAGACATTTCCAGGTCTTTCTGTACAAGAAGTTTCCAGACAAAGTCCCCAGTTAAGCATGGAAACTGCTGAAATCGCTGGGACTGATGGGGTTATCCCGGGAATGACCCAATTTAAACCGTTTATCTTTTCAGCAAAATGTAATTTGCAAGCACTTGATATTCCAGATTATCATTTGGCAGTCAGAGAAATTTATGAATTTTTATTCCAGCGCGATAGTTATTATATTTGGAGCGATCAAATGCCAGGAATTCGGTATGAGGTGCATCCTAAACCAGTTGATTTTAGTCGAGAATCGGATCGTGTTGGTTTACTCACTATAGAATTTGATGTATTTAAAGGCTATGCGGAGTCACGTGGCACGAGCCTTGACCCTATGACTTTTGAAGTGGATTTATGGCAAATGGGAATGAATTTATCGAACCGTGATGATTTATTTTATATTTTTAAAGAAAATACATTTCGGGTCTATAATGCGGGGAGCGACCGTGTTAATCCACTGATGCGACATGAATTAGATATTGCGATGACGGCGAATGGGACACCAACGATTCATAATCATACAACGGGAGAATCCTTCGAGTATCGGAAAGAGCTCCAAAAAACAGATGTTTTACTGTTGAACAATATTTATCCACTTGTTAATAACCGCCGTGTTGGAAAAGATACCAATCATGGGATTATCACCCTTGAAAAAGGCTGGAACGATTTTGAAATCAAAGGTGTAACGGATGTAACGATTGCTTTTAATTTTCCGTTCATTTATCGGTAGGTGATAGATATGGATTATGTGATTATTCAAAGTATGGACAAAGAAGTGGAAGAGATTCTAACAGACATTGATTACGGCTCCTTTTCCTACGATTATGAAAAAAATACAAGTCGTGCTATCTCGTTTACTGTGAACAAAACGAAACAGAATGCAGCAATTTTTGACTTGGTAGGAAATGAAGCAATTTTAACATATCAAGGGCAGCAATTTGTTATTAAAAAATGTACGCCAAAATCTATTGGAGGAACACTTTCAAAGCAGATTACGGCCCAGCATATTTGTTATACAGTGCAAGATCATGTGCAGTATAACGTGAAATCTGGACGAAAAAAATATTCGATTCAAACGGTATTGGAATTTGCGTTACAAGATAATGTACTAGGATTTTCTTATGAAATTCAAGGGAGTTTTCCTTTAGTTGAACTAGAGGACTTAGGAAATAAAAATGGCTTAGAGCTAGTGAATTTATGTTTGGAAGAATTCGGAGCAATTTTATTTGCAGATAATAAAAAGCTTTATTTTTACGATGAAAAAAGTTGGTATGTAAGGACAGAGAAGCAATTTCGTTATTTATATAATACAGAAGAAGTTTCGGTGGATACGAACACAGATAATTTGAAGACGGAGATAAAATGTTACGGCAAGCAAAAAGAGAATGCCGATAAGCTGACTGGAGATAATAAGTACATGGCGGTTGTCACATATACTTCGCCAAATGAGGCTATTTACGGGAAACGAATGGCAAATGCTAAAAGTGATGACAAAATCACGAACAATGATGACTTATTAATTTTTGCAAAGAAACAAATTCTAGATGTTCCGGAGACAGCGCTTACTATTTCTTACAAAGGAAAAGAACCTGTTTTAGAGCGGGATGTTTGGTATTTCATTCATGAACCGATGGGGTTTGAAACAGAAGTAAAAGTAACGAAAATTAAATCGAGTCATCCTTGGAGTAAGAAGTTTCAAGAAATTGGCTTCAGTAATTCGCGACGAGATATGGTCCGAATTCAAACGCAAATTGCTAATCAAGTGAAAAAAGCGAGCGTAGATACAAATAAAATTAATTCGTTTTCGAGCATCGCAATGAATGCTTATGATTCACGAATTTTAACGGAAGTAGTAGGTGTGGTAGATGGCGACTGAAATTAGAGTGTTAAAAAATGTAGATGATACAGTTTTCTATCCGAAGACACATGTAACGGCTGTGGAAGGTTTGGACTCGGCTACAACTACTACATCTGGATTAATGCCCGCCAGCGACAAAACGAAATTAAATGGAATCGAAGCTAATGCAGAAAAAAATAATGTGACTGCAATCGATATTGCCAATTGGAATAAAAAACAGGACGCAATTTTGGTTTCTGAAAATGGCTCTAATTTCAAAATAACTGTCACAAATGCTGGTGAACTAAAGGCAACAAAAGTGGAATAGGAAGGAGGTTGCGTATGAAGTTGGATTTATGGAAATGGGAAATGCTTCTTCAAGGTCGAGAATTTAGAAATAAAACAAATGACAACTGGCAAAAATTAATGGATTGGTCCGATTTTATTTCAACAGGTTTAAGCGCGATTTATGTCTATGTAAATAAAGCAGATGCTACTTTAAATAACAAAATTGATACTGTGGATAAGGCGGTAAATGCAAGGGTAAATGAATTGATTAGCGGGACAGAGCAGTTAAGTGAAGTGGTCGACGCCAGAGTGGATGCATTTGGCGCACGCTTCCCAGTACTAAGAGAACGTTTAAACCAAGAACAGCTAATTTACAATAAAAAAAGCACGGTGCAATTTGACGTGAATACTATTATAAATATGGAAAAACAAGATATTGGGCTGCTAACAAGTAAAACAATCTCGGAAGCGCAAACCGTATGTTTTTTAAATATATCAAGCCTTAATGAAGACGCGGATATTGTTCTTGAAAAAACAGGCGAGACAAGCTTCTCAGAAAATTTAACAAGTCTAGTCTTTGCAAAAATTGGAACGAATGAACGCTACCAAATGGAGCTAGTTGGCGCATAAAGGAGGAGTGAGCAATGACTGAAATAAAGCGAATGCTGCAGACAAAAGAAGATAATTCAAAAGAACAATTTTATCCAGAGACGCATGTTGCGGGGATTGTTGGGTTGACGGAATATGTGTCAGGCCAGCTTCCGACAGGCGTAGTCAGTGTTAATGGCAAATCGGGTAGTGTTTTACTAGAGGCAGATGACATTTACGCTGCAAAAAAAACACACAGTCACGATGTGGCAACATACACTACGAATGGTTTTATGAGTTCATTTGACAAACAAAAAATTGATGAATTAGTTTCTCCAGAAGCCGGTGTTGTAAGTGTGAATGGTAAAACAGGAATTGTTGATTTATTTGCAGCGGATGTTGAGGCAGCTGAAATAAATCATACACATAGAGAAGCCTCAGCGCAGGAAAGCGGTTTTTTATCAATCGATGACAAAGAAAAATTAGATGCGATACAAGTAATCGCGCTGGAAACTATTAAGGAGGTTATAGAATGACTAAAATTGTAAAAATGTCAGAGAAAAACGAACATGGAACTCTAGAACAATTCTATCCAGAAACACATGCAGAGGCTGTTAAAGGACTTGTGTCGGTTTCAGAGGAAGAGAAAACAATTTGGGATCAAAAGGAAAGTACGGCGGGTGCAGAGCAAAAAGCAAACACAGCCTTAAATAGTGCTAAAGATTATGTGGATACGATAGGTGAAGGAACGGTGATTTTTAAAGGCGCTAACCTTATGGGGGCTGGACAATCATTTAAATGGGACGCTTCTAAACTGAAATTTGGGATGACTTTGTTATTTAGTCGCTATGATGCTGCAAATAATACACCGCAAGATTATTATTATCATTCTGTATTCTTATCTAAGGCACAATTAGTTGAGCTTGCAGGAAAAGGTATTTTAGTTCAAATGCCATCAACGACTTATGGAGATCGAAAATATCTGTATGTGTCAACAACTGGGTTATCTGGACATTTTGATAATTTGAATTATGCGGCTTGGGCACTTCGCCAAGTAACAATTATGTAACTAAAAAGGAGGTTTTCCATGGAAGTCATACTAAAAATTGGGATTTTAGGTTTTGGCGCGATATTTGGATACTTGTTTGGGGAAGTGGATTTATTGGTAAAAGTGCTGGTGTGCTTTATTGTAGCTGACTATATTTCTGGGCTACTCGCTTCAGGGTATCTTGGGGAACTTAGCAGCAAAATGGGTTTCAAAGGAATCGCGAAAAAAATCGCTATCTTAATTTTAGTGGCTATTGCGCATCAAATAGATTTGATTCTTGGAACGCATAATACAACGCGGGATGCGGTTATCTTTTTCTATTTGGCGAATGAGCTGATTTCCATATTGGAAAATTTCGTTCGAATGGGGATGAAGGTCCCGGAAGTATTGAAAAATTTAATTTTGATTTTCGATGCAAAGTCAGGAGAGGATGAGGAAAAACATGACAAAGATATGGATTGACGCTGGACACGGTGGTAAGGATTCAGGTGCGAGTGGTAATGGACTTGTTGAAAAAAATTGGGTACTAACTGTAGCAAAACAACTTCAAACGGAGTTAGTTAAAGCTGGTTTTGAAGTGGGAATGACAAGGACAAATGATACATTCTATGAATTAAGTGATCGTGCGAAGAAGGCGAATAGTTTTAAAGCTGATTTATTTATTTCGCTTCATTTTAATGCTGGTGGCGGTAAAGGATATGAAGATTATATTTACACATCCGTCCCGGCTGCAACGGTAGAAATACAGAAAATCATTCATAAAAATATTATTGCTAAAGTTACTAAACACGGAATGAATGATCGTGGGATGAAGAAGGCTAATTTTGCTGTATTAAGAGAAACAGCAATGGACGCTATCTTACTGGAAGCTGGTTTTTGTGATAGCACAGATGCATTAATTCTTGAGAAGAAAGCTTATCAAACTGATTATTGTTTAGGAATTGTAGCAGCAGTACAAGAGATTTTTGGGGCTATGGTAACAAAATATAGGGCAGGTAAATATTTGACAAGTGATGATGCTATATCAGGCACAAATATTAAAGGATATTTAGAAGCAGGAACAAAGGTTTTTGTTTATAAAGAAACAGAAAAAACGCTTAATTTAACTACTACAAAGGGTGTTCCAGGAAGTTGGGTTTTAAAAACAGAAGTTAATACAGGAAAAAGATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_JPTX01000002|398661:409390|407227_407707_+|WP_003728207.1|DBSCAN-SWA MTEIKRMLQTKEDNSKEQFYPETHVAGIVGLTEYVSGQLPTGVVSVNGKSGSVLLEADDIYAAKKTHSHDVATYTTNGFMSSFDKQKIDELVSPEAGVVSVNGKTGIVDLFAADVEAAEINHTHREASAQESGFLSIDDKEKLDAIQVIALETIKEVIE >NZ_JPTX01000002|398661:409390|399119_399455_-|WP_003721740.1|DBSCAN-SWA MELNKFVGNKIKQYREERGLNQEALAEKLHTTRQTISRYENGDRKANQDVLFELAKIFNKRLDDFFPERNLPPVDERLVTIAAHIDDDVTEEEMRDILAYIEMKKKLHRGM >NZ_JPTX01000002|398661:409390|401209_401722_+|WP_003721744.1|tail|DBSCAN-SWA MAFEENLYCDYTPGAAKAVAGKDVILAVFNAAGDKLLAVAGQQGLTVNRSKDSIEITSKDTVGGWKSKIGGMKEWSIENDGLYVADAESHKELAKYFESDSPVCVKIINQASKKGLFGGLAIVADYSFEAPFDEAMTYSVKLDGMGALVDLTITEGGDQMPGETPVAPAE >NZ_JPTX01000002|398661:409390|400807_401197_+|WP_003728212.1|DBSCAN-SWA MKSLSFMRVLEAVRTMLQEKGGLDVSIVMRDQVEMPTTMIEMIDQEEEESQTAWKEKYRFAIHHYTNETDLAGVEMIDTLIQTGFTLPEGYKLIAVRHYGKQNLVKENTLIHAKTSFEVSICRELKVKI >NZ_JPTX01000002|398661:409390|406323_406623_+|WP_003721751.1|DBSCAN-SWA MATEIRVLKNVDDTVFYPKTHVTAVEGLDSATTTTSGLMPASDKTKLNGIEANAEKNNVTAIDIANWNKKQDAILVSENGSNFKITVTNAGELKATKVE >NZ_JPTX01000002|398661:409390|406637_407213_+|WP_003731180.1|DBSCAN-SWA MKLDLWKWEMLLQGREFRNKTNDNWQKLMDWSDFISTGLSAIYVYVNKADATLNNKIDTVDKAVNARVNELISGTEQLSEVVDARVDAFGARFPVLRERLNQEQLIYNKKSTVQFDVNTIINMEKQDIGLLTSKTISEAQTVCFLNISSLNEDADIVLEKTGETSFSENLTSLVFAKIGTNERYQMELVGA >NZ_JPTX01000002|398661:409390|402504_404373_+|WP_003731178.1|DBSCAN-SWA MADSKSFTFELNESVLTAQVGRLDEMAMVVERRFSELKMTIEDVGNADPGSKISESLGGLQSGLGTISSAFGQLGSSSEAITSGFGTAVGSVGGITDAFKNLGSSVQNGTLFSSLATGIGGMSTMLGGVSGGVQGITNLASGFMELKKHLGGLMSSIGGVGGIMGKLTSPMGLVIIGIVALVAAFAYLMTTNESFRNTVMSVVTQVAQLFGQLVASLMPIIMQIVTAVMQIGAALMPMVMQFISFFAQLLAQLMPFINMLISMLMPVIMQIVQVVMSLVSALLPSIMTVIQGIMSVIQFLIPIIMQIATVVVQIVVTIISYISKIMPIVMTIIGVIVSIITTIISYVVIIATTIASVIGKIISFIASVITAVIGIVQPIIGFITNIFTTIVTIIGAAFQMVFTVASKIWNAIMTTISGIIEGIKAVITGISTTVSSVFNGVKRIITGVFDGIKSAWGGLTDFVGNIFDGVSSAIQTVVDNVKGFVNVVIRGINGAIGLINKIPGVEIGKIPQLISGTTNFQGGFARMNEGGRGEMVVLPSGSQVIPHDATMKYARESARGNKSMLYTSQGADLARVENLLERLLQKNPVIKMDDKVVAEVVSRNQANSFDQYNYTMGGAAYS >NZ_JPTX01000002|398661:409390|402113_402518_+|WP_003740367.1|DBSCAN-SWA MDSEMNHDFDLEKQFAFFVVNFQMSKHDFEELTEVEKNFIMKEWENKVIFESTMLRNAVLNAEQNLNRKRNSRFIDLHKKRQKKADVNYTVNALQAISDNEAKEGKAWIDRIYGANGLRRPKNKEERGKVNGGF >NZ_JPTX01000002|398661:409390|405197_406334_+|WP_003728209.1|tail|DBSCAN-SWA MDYVIIQSMDKEVEEILTDIDYGSFSYDYEKNTSRAISFTVNKTKQNAAIFDLVGNEAILTYQGQQFVIKKCTPKSIGGTLSKQITAQHICYTVQDHVQYNVKSGRKKYSIQTVLEFALQDNVLGFSYEIQGSFPLVELEDLGNKNGLELVNLCLEEFGAILFADNKKLYFYDEKSWYVRTEKQFRYLYNTEEVSVDTNTDNLKTEIKCYGKQKENADKLTGDNKYMAVVTYTSPNEAIYGKRMANAKSDDKITNNDDLLIFAKKQILDVPETALTISYKGKEPVLERDVWYFIHEPMGFETEVKVTKIKSSHPWSKKFQEIGFSNSRRDMVRIQTQIANQVKKASVDTNKINSFSSIAMNAYDSRILTEVVGVVDGD >NZ_JPTX01000002|398661:409390|401769_402072_+|WP_003721745.1|DBSCAN-SWA MFEVNDTTYILRFNKQKVKTVELTSGISLVAALTANKGILSYQVIETLFVSGLVEEKGLVPVKQKEALEIFDKLVEEQGLISLNVAVIEKLQEDMGFLFR >NZ_JPTX01000002|398661:409390|407703_408240_+|WP_003728206.1|DBSCAN-SWA MTKIVKMSEKNEHGTLEQFYPETHAEAVKGLVSVSEEEKTIWDQKESTAGAEQKANTALNSAKDYVDTIGEGTVIFKGANLMGAGQSFKWDASKLKFGMTLLFSRYDAANNTPQDYYYHSVFLSKAQLVELAGKGILVQMPSTTYGDRKYLYVSTTGLSGHFDNLNYAAWALRQVTIM >NZ_JPTX01000002|398661:409390|399671_400100_+|WP_003724946.1|DBSCAN-SWA MDRKLLKEKQIQLIFQLEQEENRFIRKRLIEELEFFEALGDREKGLLTAEQKLLILTPSEYREYKRTKSDVQISRLIGVSRSSLAEWKRKKGLNRKKPQPVQQEMIDVLAFHLDKTKDEIGALPASAIECQYEAFVINEAHN >NZ_JPTX01000002|398661:409390|400111_400528_+|WP_003728213.1|DBSCAN-SWA MQVLVLPENKDINYIKTVQEVKRFFADLERFRMITGLSKKPHLLRNGFLEEPQFEPVAFSARYNKEVILEARWLVEKYTEMLNQMDDLYRTILMECYVERKQDVAVMMDLPYEIAQFKRIKKRAVLEIATLMGILVRK >NZ_JPTX01000002|398661:409390|398661_399114_-|WP_003728215.1|DBSCAN-SWA MYEKLVNKYQDEVTIREEKMPYKLPGLYLNGTIFISKDQSSIEKGCVLVEELMHYKYTVGNITKQETIMDKKQEIFARRKGYEELIPLDDIIACFYLGLREYFEVAEFLEVTEEFLRHTVTHYAEKYGPMYDYGGYFINFGNSIDVYKKF >NZ_JPTX01000002|398661:409390|408661_409390_+|WP_003724957.1|DBSCAN-SWA MTKIWIDAGHGGKDSGASGNGLVEKNWVLTVAKQLQTELVKAGFEVGMTRTNDTFYELSDRAKKANSFKADLFISLHFNAGGGKGYEDYIYTSVPAATVEIQKIIHKNIIAKVTKHGMNDRGMKKANFAVLRETAMDAILLEAGFCDSTDALILEKKAYQTDYCLGIVAAVQEIFGAMVTKYRAGKYLTSDDAISGTNIKGYLEAGTKVFVYKETEKTLNLTTTKGVPGSWVLKTEVNTGKR >NZ_JPTX01000002|398661:409390|404369_405188_+|WP_003731179.1|tail|DBSCAN-SWA MSDLFLELNGKVHSLSETFPGLSVQEVSRQSPQLSMETAEIAGTDGVIPGMTQFKPFIFSAKCNLQALDIPDYHLAVREIYEFLFQRDSYYIWSDQMPGIRYEVHPKPVDFSRESDRVGLLTIEFDVFKGYAESRGTSLDPMTFEVDLWQMGMNLSNRDDLFYIFKENTFRVYNAGSDRVNPLMRHELDIAMTANGTPTIHNHTTGESFEYRKELQKTDVLLLNNIYPLVNNRRVGKDTNHGIITLEKGWNDFEIKGVTDVTIAFNFPFIYR >NZ_JPTX01000002|398661:409390|408258_408681_+|WP_003728205.1|holin|DBSCAN-SWA MEVILKIGILGFGAIFGYLFGEVDLLVKVLVCFIVADYISGLLASGYLGELSSKMGFKGIAKKIAILILVAIAHQIDLILGTHNTTRDAVIFFYLANELISILENFVRMGMKVPEVLKNLILIFDAKSGEDEEKHDKDMD |
17 | Listeria_phage(40.0%) | tail,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_JPTX01000008_1 | 85967-86128 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_JPTX01000008_1
|
1 spacers
spacers of NZ_JPTX01000008_1
>1.1|86022|52|NZ_JPTX01000008|CRISPRCasFinder GATTGGCTGTATTTAATAATTTGTGCTCCCCTTTTTGAGTTGTTCGTCCACT |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_JPTX01000008_1
The CRISPR arrays of NZ_JPTX01000008_1 >merge|NZ_JPTX01000008|1|85967-86128|CRISPRCasFinder TTTTTTTATGGAAACAACGCTCCACTTTGTTACGCCTTGTATTGGAGTTCTAGGGGATTGGCTGTATTTAATAATTTGTGCTCCCCTTTTTGAGTTGTTCGTCCACTTTTTTTTATGGAAACAACGCTCCACTTCGTTACGCCTTGTATTGGAGTTCTAGGG >NZ_JPTX01000008|1|1|85967-86128|CRISPRCasFinder TTTTTTTATGGAAACAACGCTCCACTTTGTTACGCCTTGTATTGGAGTTCTAGGG GATTGGCTGTATTTAATAATTTGTGCTCCCCTTTTTGAGTTGTTCGTCCACT TTTTTTTATGGAAACAACGCTCCACTTCGTTACGCCTTGTATTGGAGTTCTAGGG
>NZ_JPTX01000008.1|WP_003726178.1|85091_85838_-|carboxylesterase MKITPPQPFLFEKGKRAVLLLHGFTGSSADVRILGRFLQENNYTCYAPQYRGHGVSPDLLLKTGPNDWWEDVLEAYDHLKSLGYTEIAVAGLSLGGLFSLKLGFSRPLKGIIAMSTPTRMDSSSPIIQGFLDYVRNYKKLEGKTPEQIDAEMVAYKDAPMNTIAKLKDEINGVVAEIDMIYAPIMVVQGEKDDMVDVSGAQLIYDTVESTKKELHWFKESGHVITLDKERKEVNQAILTFLDSLDWQE >NZ_JPTX01000008.1|WP_046671029.1|82676_85058_-|ribonuclease-R MEQKQMEEKIMNLLTSAPDKTFALEDLEIEIALNNADDFKLMVKALVKLEDSGTIVRSRKNRYALPEKMDLVKGTFRAHERGFGFVLPEEKEMDDIFIPPNEVKDAMNGDLVFATITKRKGDNLAEGTIKKIVERKTTQIVGTYMEDLAGTPIVMPDDKRLFGEVEIDLEDGLKPVDGHKVIVELTEYATGHARARGVVKSIIGHRNDPGVDILSIIHKHGISIGFPEEVMEQVSKAPDVVDDSDIGNRRDLRDQMIITIDGADAKDLDDAVTVTQLSNGNWKLGVHIADVTHYVTEGSPLDVEAQERGTSVYLVDRVIPMLPHKLSNGICSLNPQVDRFTMSCEMEIDEEGHVVNHEIFESIIKTTERMTYTDVNDILVEKDEALREKYAPIVPMLEKMQHLAEILHRKREKRGAIDFDFKEARVVVDEDGHPEAVVMRERSAGEHLIEEFMLAANETVAEHFHWMDVPFIYRIHEDPKEDKLARFFEFITNFGLIVKGTANDIHPAALQQVLEEVKGKPEEMVVSTVMLRSMQQAKYDTVSAGHFGLSTDFYTHFTSPIRRYPDLIVHRLIREYLINGDVRPETLEKRAEELPEIAEHSSKMERRAVEAERETDELKKTEFMVDKVGERFIGIISSVTNFGLFIELPTTIEGLVHVSAMKGDYFKFHQNQLAMIGERTGQIYRIGDEVEVEVTKVDVDAREIDFALRSEGKPGPVSDKQKRQREKPIDKTRNFKSNQKKGRNKRSAGKSEDVKPKSERKEDEWHTKPKKKKKKKPFYQGVAKESPKKKKRR >NZ_JPTX01000008.1|WP_003723350.1|82196_82661_-|SsrA-binding-protein-SmpB MPKGDGKLVAQNKKARHDYAIEETFEAGIVLQGTEIKSVRNARVNLKDSYARIDKGEIFLHNMHISPYEQGNRYNHDPLRTRKLLLHKKQISRLIGETKESGYSIVPLKMYIKDGYAKVLIGVARGKKKYDKRQDLKQKEAKRDIERAFKERQQ >NZ_JPTX01000008.1|WP_003726176.1|81231_82140_+|Rgg/GadR/MutR-family-transcriptional-regulator MQNIGDTLKFIRKSKNLTQQETCTNALSRSNYQKIENNKIMPSMDRFIQILLNFNMTLEEFEFVKRDFTPSPKENILYLYSKIITSSETDMILNVISKCDDYLENHTDIFISDIKASLEGILLAEKEHNFELAREKVTYIWDRLSEADELFWNDILILRNIFFIFENETAQHIVNRLISQLKKYRYLYPTLSIEISLHVNRATYLILDEEYELALHYIELSIKIAKHNHYYLQFCMAIAKKGIVLYKLGQKQKGKHFMQRALRVAKVLEEERILNGIKNEIDYFLHDELQNLSLNEFTKIDI >NZ_JPTX01000008.1|WP_003726175.1|77573_80849_-|carbohydrate-binding-protein MKRKGKKSSLIFILTILIFSCLSGFGTNVFAMDGEYHSPYGDDDLYTVQPTERSPRDPKAGEDVTLNITTWPIEDGQNVWVEWTKNGVAQENVTAAYDYNSGNNTYWKADLGKFEKGDEITYTTKGSTDGGTAYESGPFTFYVTDWEYVQDVSSVVDNGDSITLNMTATAGEFTPKLYLSFEDLDTLRMELSPTGKETGHAGKTGYTVDDGADKVTVTTEDLRVEIQKSPYRMEVYQADGTLLTSEYTTANSLGWLTDGKNVINQYQNNFMTPSDEAFYGFGERYDTINQRGKDVETYVYNEYQDQAQTERTYLAVPFFVSANKYGMYVNSDFHSQFQMASKVEDKYSFVLDNDGDMTNMLDYYVISGKDQNDIVNNYTDITGKTTLLPKWAFGLWMSANEWDRESDVSSALSNAKANDIPATGFVLEQWSDEETYYIWNNATYTAKKNGEAFSYDDFTFNGKWTDPKAMVDSVHDAGMNIVLWQVPVLKDDGTVYEQRDNDEAYMISQGYSADDGTGAPYRVPASQWFGNGILLDFTNKDAVDWWTSQREYLLTEVGIDGFKTDGGEMVWGRDTTFSNGEKGQEMRNRYPTDYVSSYFDFAKSINPEAVSFSRSGTSGAQKSGIYWSGDQTSTFDSFQASLKAGLSASTSGVSYWAWDMAGFTGDYPTAELYKRATAMAAFAPIMQFHSEKSDPSPSEERSPWNAVARTGDETILPTFQKYLYTRMNLLPYIYTAAKDTADNGKSMMRQMAMDYPEDINARDLDEQYMFGDDLLVAPIVQEGQTEKEVYLPEGEWVDLWNGGIHPGGETISYYADVDTLPVFAKAGAIIPMNMTDGYQLGQNVGNDLKSYDNLTFRVYPSGDSEYSFYDDVNGGEMRDISVSEDFANEKVSVDLPAMADETTMQVFSTEPTSVTIDGADVAKADTLDAFNEATTGYYYDTVQNLTYVKAAAKDAKQAIVLNGVNHAPYEAEFAHLTNVSTASDHAGYTGTGFVAGFDAEKEAVEFDVDAVDGASDYTMEVRYSAGVEDATRTVYINGKKQQITLPKTADWDTWSTIEVPVTLQAGNNQVVFDFEADDTAGINFDHVVFKK >NZ_JPTX01000008.1|WP_031644129.1|76568_77513_-|lmo2445-family-class-3-internalin MKKIIGLAFIAFCCMLFAPTIKAQADTVPLPAPIIEAFPVEAIAEAIAGELDKDSVNDTITQADLDTMTLIPLPSLGLTGEDLSVLNNEVFTNAIELAIWSNNIGELPDLSDALPALENIEANGANITLFPDANYPNLTNADLSQNNFGFNIPKFVGMEGLVSINMEDAGLSGYVAEDIWMNMPNLDSLLLNENHLISIPEDIFLSEQLSTHSFANQTATYPHTTIKQGENLEVFVPFIYQALDFIAPSRHDLIIIKDNGRTLYEPPYPTYDGSYMYKIETAGLQPGEHLLEISLGYNSGEYTGWYDFPVTITE >NZ_JPTX01000008.1|WP_041176875.1|72621_76554_-|DUF5110-domain-containing-protein MKKGMKQVCVSMAVVPLVWLNLGITQPLQVEVKAEETKEKEVKQEANTGAAKQLSKEEYAKLSAEEGLGNVLEATVTDNVITLKIDNGDEAEDDYLEISPLANNLLKVNLRPRNIENSPSTPMIDPNATFTAIGATIDLESDPMIISTDECTLEIAKEPARMTFKDKNGKTLLSESADGGIFDGGVRFKRGASDHVYGAYGISFSDGDLGMERDNTAADSNKTAQAGQQGNAGGPFMWSTAGYGLLVDSDGGYPYSVSDEEKLEFYYGDTVVEGRRYVKENVEMYLMSGEPEEIMSSYADVTGHTPMMPKWSLGFSNFEWGTNETEFRENINTYRAKGIPIDSFAFDYDWKFYGDPTYGGDYGEFAWNTENFPSAKDTTLKSDMDALGVKMIGITKPRVVTNLEDGTATQQGKDAEANGYWYPGQSAYEDYAFPVTVRSIDPYNEDERNWWWSHSEDALDKGIVGWWNDETDKVSSNGADYWFGNFTTGFTSEAMYEGQRDYTNERVWQTGRTFYPGAQRYSTSTWSGDIGVQWKKGEVIDWANGMQEQPSTMLSTINLGQTKWGMDTGGFNANSGQVLNPDPELYSRWMEFSSLVPVFRTHGNQNQQRQPWFYGGTAEEVAKSSMTWRYSMIPYMYAYERQAYDSGVGLVQPLTFDNPTDENVVNLTDEWMFGDGLLAAPVLEEGAGSRDIYLPAGTWIDYNRGDVYEGNQTISYEVNDDDWTDVPMFVKQGAIMPMQQPQNYVGESAVKTIYLDTFASDKETSFTHYDDDGKSFDYEKDTYLKQKMTTSKTADTSTFTIGAKEGSYKADTENYIVKLHGNAAESVQVNGADSKVYDDLSALETADGSGYAVGSDVYGAVTYVKVPAQADADTVITTSGSASVVQTGTYEMETGSNFADTVADKPVAEKTYVDGYDKDGAGTTIYANVKDSGDYNVDLTYKNASADNQSLSIFVNGDYVKQTTLKPNTDWSVQSEALPLSAGKNSISYKVVTDTGDKADQVSLDKVNIGFTPTVAKVEAEEADLAGTLKVANDHWFYSGEGFVGGFGAAGDEIKFEVDVPADGEYVLNTRTANGTGMPQTLDLYTNGDYNSRVTFPSEGENWNIWSDTEKAVNLKAGTNKITFLRDGETTGNVNIDRILVSAEPINSPVQSEVNLLDNGGFERDAAATTNWVESHPDGQDKAYGVDSGSGVNPPESPAFGKQSAYFYLPGAYKQTLAQQIAVPVNNANYDVEAWVKVSNDDAAKAQMTVNNYDSSDGKTIDLVADDVWHYVTMKDVKVTTGNINTSFQMDSPGGTSIHIDNVRVMPSAE 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>NZ_JPTX01000008.1|WP_003727920.1|94762_95809_-|sugar-binding-transcriptional-regulator MSDLINIQKKLLPDVLMIMQKRYQILRSIYFSEPVGRRTLAGMLGMSERVLRGEVEFLKAQGLVEIASSGMTVTKEGLVVFRDLENVMNQLSGLHSMEEQLAKKLQIKKCLVVQGDSDDTPWVREEMGRVAVEQLDMALTEKRNIVAVMGGSTMATVAEMMTTDFAKGRELLFVPGRGGIGEDLDNQANTICDKMATKTNTKHRVLYVPEQLGEEAYRSLLKEPAIQEGLRLVQSANAIILGIGDALAMAKRRHTGEDVLEKIIRRKAVGEAFGYYFDEQGEVVHKVPTFGLQFEDLAQIPHIIAVAGGTSKAKAIKSYMKSAPKNTILITDEGAAKSLLKGSNTLLK >NZ_JPTX01000008.1|WP_003731281.1|96249_97593_-|RNA-polymerase-factor-sigma-54 MRLESNFVQKQQQKQSQKLNMTQQLSQSIAMLQFATADLVAFLEDKALENPLIEVIPGSDFATDFSYSSRKSAGSSDDTDWLEQIADNKLTLADALKEQLHLMDVTQTQKIIVLYLIESLNDNGYLQIDLKDVSAALLMDDSSVLEGLEILQSMEPAGVGARDARECILLQIERSPDAPYIAYDVIQKFFTEFAEKKWKKIATEMDVSLQDIQEVSDYIQTLNPKPGSEFESERVQYVVPDLILLQHEDEFAVSLAKQFLPQVRFQEAYYETMRATEEKDVAQFLREKAGEFDWIKKGIEQRENTLQRVGEAIVNHQKAYFLDNSAHLQPLTLKEVAEELGVHESTVSRAVNGKYMETTNGVYELKRFFASGLQKKSSENENTGDISSTTIKKLVQEFVAAEDKLKPLSDQKIVDMLAEKEIQVSRRAIAKYRLELNIPSSSKRKRF 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
110169 : 118011
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_JPTX01000008|110169:118011|DBSCAN-SWA ATTAACTATTACTGATTTTCAGTCCTACTTGTGCTGGTGTTTCCCCGCTTCTAAGGCGCTCTGCAATCTGATCTAGTTTCCGGAGACGATGATTAATACCTGATTTACTTACTTGACCTGTTGTCAGCATTTCGCCTAGCTCTTTTAAGGTAACATCTTCATTAGCTATACGAAGCGCTGCAATCTCACGCAGTCGTTCTGGTAAAGCTTCTAGCCCAACGGTTGATTGGATATACTTGATATTATCGATTTGCCTAACAGCCGCATTAATTGTCTTGTTGAGATTCGCCGTTTCACAGTTCACTAGCCTGTTCACCGAATTCCGCATATCACGCATAATCCGAACATCCTCAAAATGAAGAAGCGCGCTAGTTGCTCCGATAATACTCAAGAATTCCGTGATTTTTTCCGCTTCTTTCAAATAGGTAATAAAACCATTTTTCCGTTCAAGCGTTCGCGCATTGAGATCGAATTGATTCATCAAAGCGCAAATCGCCTCATTGTGCTCCTCATAAACAGAGAAAATTTCTAAATGATAAGAAGAAGTTTCCGGATTATTAACTGACCCACTTGCCAAAAAGGCTCCACGTAAATAAGCACGTTTGGCGCTCCTCTTCTTAACAAATCCCCTATCAATCGATTTCGTAAACGTCATCGGTGGCTCTAGTATCCGTAAATCTTCCAAAATCCCCCGTGTACCTGACTTCAAGCGAACTATATAAACATTATTTTTTTTCAACTTCATTTTGCGACGTACAAGAAGTTCTATTGGCACTTCGTATAAGTCTTTCAGTAATTGATACATTCGTCTAGCTATGGCTGCATTCTCGGTTTGGACATCCATTATCACTAATTGATTCGAAAACGAGATGGCACCATTCATTCGAATAAAAGCTGCGAGTTCCACTTTTGCATCGCTATCACTTACGTCCATATGGGTTAATTCTTTCTTGGTTTCCGATGCAAATGACATGGCTTACTCACTCCTTTTCAATAGTTTGGTTAGGTAACATCGCTAAAAGCGCGTCCGCCACCTTTTCAGCAGCATGGCGCACAAGGCCATCCTCTGTAGAAAGAAAATCTTGATAAATGGCTTCTACGCCAAGCTCTTCCATTCCTTTGGCATTATGCTCTACTTGCGCAACATCCTCTGGGAATAAAAGTTCTTTCGGAACAGTCGTCGTATTAATTAACGTTTTATCTATAAAAGATTTTCCCACATGCTCATGGATAACTTTAATATGATCCGCATCTGAGAAAAAGTCGGTTTCGCCAATTTGCGTTAAAATGTTCGTAATGTATACTTTCGGAGCCTTGCTTGCTATAATTTCATCAGCTAATTCCGTAAGTAATAGATTTGGTAAAATACTTGTGTATAAACTCCCTGGACCAATAACAATCAAATCAGCCTCTTTCACTGCTTCGACTGCTGTCGGATATGGTTTTACATTTTCTGGTTCGATATACACACGATTAATATGCTTTCCTTGTAACGGGATAAGCGATTCACCGTGCACAATAGAACCATCTTCCATTTCGGCATTTAAGATGAGTGGTTGATCCGTTGCTGGAATAACTTTGCCGCGGATTTTCAGCACCGTTGCTAGCACATTAATCGCATCAACATAACTATCATTCAATTGCGATAAAGCCGTTAAAATCAAATTTCCAATAACATGCCCCGATAAATCACCATCTACCGCAAAACGATATTGAAATAAATCGACAACCCGTGGATCAACATTGGATAAAGCTAGCATGACATTGCGTATATCACCTGGGGGAAGCACATCCATTTGCTCGCGAATTTTACCAGAACTACCACCATCGTCCGCTACGGTCACAATGGCCGTTAAATGAATATCCTTCTTTTTAAGCCCTTTTAAAATGACTGGAAGACCGGTCCCGCCACCGATTACTACTACTTTAGGTTTCGTTTCCTTTTTCATATTAACGGCCCTTTCTACGTTTCATATCTCGGTGTGAAATCGTTGTTTCATATTTTTGTTGAATTGCCTTACCAACGAACTCTGTCAAAGCTACTGAACGATGCTGTCCTCCAGTACATCCAATGGCAATAACTAATTGTGTTTTTCCTTCTCGTTTGTAAAAAGGAAGTGTAAACATTAATAGATCTACTAACTTATCTAAAAAGGTCTGCGTTTCTGGCCATTTCATCACATATTCATACACATCTTCATCAAGTCCTGTCAGCGGACGCATTTTGTCAATGTAATGCGGATTCGGTAAAAAGCGCACATCAAACACTAAATCAGCATCAATCGGAATGCCGTATTTGAAACCAAATGACATCAATTGCACATTGAATATATCTTTATCTTCGGTTTGGAATTCATTGTTAATTCGCTCGCGTAACTCACGTGGCGCCATATTCGATGTATTAATAACTAACTGCGAACGGCCTTTTAAATCACTAAGCAGTTCGCGCTCTGCATTAATCCCGTCTAGCACAGACCCATTAGGCTCCAGTGGATGGTGGCGGCGCGTTTCTTTATAACGCGAAACAAGTACCTTATCATCAGCCTCTAAAAAGAGGATTTTCGTTGTTATAAAATTGGTATTATCTAGCTCATCTAGCGCTGGTTCAATGGAATCGAAAAACTCACGGCCGCGAAGATCCATTACGAGCGCGATTTTATCCATTTTATCGCTTTCTTTCATTAGCTCCCAGAACTTTGGAAGTAAACTTGGCGGTAAATTATCTACACAAAAATAACCGAGATCTTCTAAAGACTGCATTGCGACTGTTTTTCCTGCTCCAGACATCCCAGTAATGATTACTAATTTTAATTGTTTAGAAGCCATATCTGCCTCATCCTTTCGCACCAATAATATCTATCTTCCATTTTAGCACACTTCTCACTAGAAAATCCCGGAAAAGTCTCTAAAGCGAGTTTCCGGGATTTTTCTTTTTAAGCTTCGATATGTTGCATCAAATCAGCTTTCACTTTTTCTAATTTTGTTGCACTTTCTTCTTTACTTTCACCACGAATACTAAAGTAGAATTTGATTTTCGGTTCTGTGCCGGATGGACGTAAACAGAACCATGAACCATCTTCAAAATAACATTTAATGACATCTGCTGTTGGCAAATGAATCGCTTCGGTTTTTCCAGTAGCAATCCAAGTTGTTTCGCTTCTTAAATAATCTTCCGCACGTTCCACGGGGAATCCACCCATACTTGTTGGTAGTTGCTCGCGAAAATTACTTGTAATTTCTTTGATGCGCCGAGAACCATCCTTACCGCTTAAAGTTAAGGAAACTAGATCTTCTTTGTAATAGCCAAACTCAGCATAAATTTGCTCTAAATCTTCTAGTAAACTTCCACCTTCTACTTTGCTAACGAGCGCCACTTCCGCAATCGCAAGCACCGCTTGAATCGCATCTTTATCACGCGTAAACGGCTTAACCATATAACCATTACTTTCTTCATAACCAAATTCAAACGTATGCTTGCCAGTTTCTTCAAAGTGCTTAATTTGTTCTGCAATAAATTTGAAACCAGTTAATACTTCAATCATTTCCGCACCGTAATGTTTCGCGATTTCTGTTCCAAGATTACTTGTTACAATAGATTTTAATACCGCTGCATTAGCTGGCAATTCATTTTGCGCTTTCTTTTGTTTTAATAAATAATGTAAAATAATCGCGCCAATCTGGTTTCCAGATAACACTTCATATTCGCCGTCAAGATTACGAACTGCCACGCCTAAACGGTCAGCATCCGGATCTGTTCCGACTAAAATGTCGCCACCAAACTTCTTACCATATTCAATCGCAAGTAAAAAGGCTTCGCGGTTTTCCGGGTTAGGCGATTTTACCGTTCCAAAATCGGGATCATTCACAAATTGCTCGTCAACCTTAACAATATTCGTAAAGCCAACACTTTCAAGCGCAGGAACGCCAAGAATTCCGCCAGTACCATGAAGGGGCGTGAAAACAATTTTCAAATCCTCCCCTCGTTCTTGAACAAGCTCTTTATTGACAATAACCTCTTTTAATTTTTCCAAATATGGACGGTCTACTTTTTCACTGATTACCTCAAGTAAACCATTTTCAATTAATAGCTCTTGGTTCGCTACTTCTACAGAAAAAATATCCTCTACCGCGTTTATGTATTCAATTACAGCACTTGCCCCTGTTGGAGGCATTTGTCCGCCATCTTCACCATAAATCTTGTAGCCATTGTATTCTGGTGGGTTATGGCTAGCTGTAATAACAATCCCACCAAACGCATTTAAATGACGTACTGCAAAGGAAAGTTCCGGTGTTGGTCGAAGCGCATCAAAAACATAGCTTTTCACACCATGATGCCCTAATACCGCCGCCGATTCAAAAGCAAATTCGCGTGACATATGACGAGGGTCATACGCAATTACTATTCCGCGCTTCTTAGCCTCGTCACCGTTCTCCGCCACAAATTGCGCCAAACCTAGAGAAGCCTTACGAATAGTATAGATATTCATGCGGTTTGTTCCAGCGCCTAGTACACCACGCATCCCAGCCGTTCCAAATTCCATATTACGATAAAAACTATCCTCAAGTTCTTTTTCATTTGCTTCCATATTCGTTAATTGTTTTCTTAATGTGCTATCTAATTTGTCATTAGCAACCCATTTTTGATATTCTTCTTGCCAATTCATTCTCTACACTCCTTCATTTAGAACTCTTTAATTAAAATTTATCAGCTCTCCACTGTGAAACGAAAAGCTGTTCTAGATGTAAAAGGTTTTTCTGGTCGAAGTACAATATCACCAAATCCGTCATGGTTAATCGCATCTACTAAACCCTGTGTTTCCATTGTTATGCCAGCATATTTTGGCACAGTTCGCTCGCCAATCTCAAAAGAGCCATCCAAACTATTCGCCGTATAAATTAATACCGAGTCAGCTTTGGTTTCCATTTCCAAGCGCCGTCCTGACTTTGGATCAAACAAAACTGCATCTGGACGACTATTTTCATGTTTTAAAATGAATGCATGATCCAGCCCCGCACCAACTAATTTTACTTGCTGGTCCTGACTTTGTGTAATCTCCGCTACTTCACGACCTGCACGCAAATCAAAGATAGTATTTTCCGCTAACCGCTTTTCCCCAATTGGGAGAAACTCTTCATCAATTGGTAGGAAGCTGTCACTATTAACCCAAAGCTGATGTTGTAAAACCGTTGAACCAGCTTCTCCGCTTAGATTAAAATAAATATGATTGCTCGGGTTATATATAGTCGGCTGATCGCTTTTCGCTTCATAATCAAGCAGCCATTCATTTTTATTATTTAACGTATATGTCATTTTTGCATCAATATTTCCTGGATAGCCATTTTCTCCATCCGCCCAGCAGTATTCAAAAGTCATCACAATTTGATCAAGACTTTTTTCTACTGAAACATCCCAAAGCTTCTTACTAAAATTGAATTTCCCACCGTGACGATGGTTAGCTCCTTCATTTTGAATCAGTTGAAATTGTTTACCGTCCAAACTAAATTGCCCATTTGTAATGCGTCCAGCAACAGGGCCAAGTGTCGCGCCGAAGTATGGGGAGTGTGCCAAATAATCATCTAAATTTGTAAAACCAAGACTAATATTCGCAAAATCACCAAATTTATCTTTTGTTTCAAGGGAAGTAACAATCGCTCCGTAATTTAAAACACTCATGCGCATACCATGATCATTTACCATCGTCCACTTCCAAACAGTTTCTCCCTCAAACTCCCCAAATCGCTCCTTCATTACTTCGATAAAAATCACATTCCTTCATAAGTTATTAATAGCCATTTGGATGAGATACGTGCCATTTCCAAGCAGTGGCGATAATATCTTTTACGTCTGTATAAGTTGGCTCCCAACCAAGAATTTCACGCGCTTTATCACTTGAAGCAATTAACGTTCCTGGATCTCCTGCACGGCGTGGTACAACTTCAGCTGGAATTTCTTTACCTGTTACAGTACGAGCTGCTTCAAGCATTTCTTTCACTGAAAAACCGTTACTGCTACCAAGGTTGAAAATATTACTTTCCCCGCCATTTTTCAAGTATTCTAGCGCTTTAATATGCGCGTCAATTAAATCTTCTACTTGTACATAATCACGAATACAAGTACCATCAGGCGTATTGTAGTCGTCACCGTAAATCGCTAATTTTTCTCGTTGACCAAGCGCAACTTGTAAAATAATTGGGACTAAGTGTGATTCTGGTTTGTGATCTTCCCCAATTGAACCATCCGCTTTGGCGCCAGCAACATTAAAATACCGGAGTGCAACATATTTCATATCATACGCTTTATCGCACCATTTCATCATTTTTTCCATGATTAGCTTCGTTTCGCCGTAAGTACTTTCCGGATTTGTTGGCATATCTTCCGTAATCGGTACTCGTTCTGACTCACCATATGTTGCAGCGCTAGAAGAAAAGACAATATGTTTCACACCAAATTGCTCCATCACTTCTAAGACAATTTGCGTACCATAAACATTATTATTTAAATAAACAAGCGGTACTTCCATCGATTCTCCTACAAGTGAACTAGCAGCAAAGTGAATCACACCATCTACCTTTTCTTTTTCAAAAACTGAACTTAAAAATGCCTTATCTCGAATATCTCCTTCATAAAATTTTGCCTTTGTATGAATGGATTCCTTGTGCCCTGTTCTTAAATTATCAATAACTACTACTTCATATCCGCGAGTAATTAACTCATCTACTGCATGTGAACCGATATAGCCAGCGCCACCAAGTACAGCAATACCCATTACTTATCTCCCCTAATACTTGTCTTTGTCTTCCATTTTACACTACTCAAGTCTATATAGTCACGCAAAAATGGGGCTAAGATAAATAATCCTAGACCCATTTGCACTTTTTACTATTATTTAGCTGCTTCAGCTTCTAATGACTCTTTTAATTCTTCTACATATTTTTGAGCGTTTTGTCCAGCAAGTCCGCCATCGCCTGTTGCTGTTACAATTTGGCGTAAGCTTTTCGCACGAACATCACCAGCTGCAAAAATACCAGGAAGGTTTGTACGCATTTCCTCATCTGTTACGATATAGCCCTCATCATCTGTAATACCTAAATTTAAGAATGCTTTCGTAAGTGGAACAAGTCCAACATAGATGAAAACACCATCCACTGGCATAATAGATTCGGAACCATCCACTGTGGAAACAAGTTTTGCTCCAGTTACTTTTTTGCCATCGCCAACAATTTCTTCTACTGTACTATTCCAAATGAAATCAACTTTTTCATCTTTGAAAGCACGATCTTGTAAAATTTGTTGTGCGCGCAATTTATCACGACGGTGTACTATCGTTACTTTATCTGCATAACGAGTCAAATAAGTTCCTTCTTCCACTGCAGAGTCTCCGCCGCCAACCACGATTAATTCGCGATTTTTGAAGAACGCTCCATCACAAACAGCACAATAAGAAACGCCGCGTCCACTAAGCTCTTCTTCGCCAGCTGCACCAAGTTTCCGGTGTTCAGCACCAGTCGCAATAATAATCGCCCGAGCTTTATAGGTTTTCGATCCAGCCGTTACAGTTTTAAATTCTTTGCCATCAACGACTTCTTTAATGTCCCCATAAGCATACTCAGCGCCAAATTGTTTCGCACCGCTAAGCATCTTATCGGATAAATCGGGTCCTAAAATACTATCAAATCCAGGGTAATTTTCAACCTCAGCTGTGTTAACCATTTGTCCACCAGGTACACCGCGTTCAATCATTAACGTATCTAAATCTGCACGGGAAGTATATAAAGCAGCTGTCATTCCAGCTGGTCCCGCTCCAATAATAATCACATCATAAATTTTTTCTTCACTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_JPTX01000008|110169:118011|110169_111141_-|WP_003725407.1|DBSCAN-SWA MSFASETKKELTHMDVSDSDAKVELAAFIRMNGAISFSNQLVIMDVQTENAAIARRMYQLLKDLYEVPIELLVRRKMKLKKNNVYIVRLKSGTRGILEDLRILEPPMTFTKSIDRGFVKKRSAKRAYLRGAFLASGSVNNPETSSYHLEIFSVYEEHNEAICALMNQFDLNARTLERKNGFITYLKEAEKITEFLSIIGATSALLHFEDVRIMRDMRNSVNRLVNCETANLNKTINAAVRQIDNIKYIQSTVGLEALPERLREIAALRIANEDVTLKELGEMLTTGQVSKSGINHRLRKLDQIAERLRSGETPAQVGLKISNS >NZ_JPTX01000008|110169:118011|114873_115935_-|WP_003741152.1|DBSCAN-SWA MIFIEVMKERFGEFEGETVWKWTMVNDHGMRMSVLNYGAIVTSLETKDKFGDFANISLGFTNLDDYLAHSPYFGATLGPVAGRITNGQFSLDGKQFQLIQNEGANHRHGGKFNFSKKLWDVSVEKSLDQIVMTFEYCWADGENGYPGNIDAKMTYTLNNKNEWLLDYEAKSDQPTIYNPSNHIYFNLSGEAGSTVLQHQLWVNSDSFLPIDEEFLPIGEKRLAENTIFDLRAGREVAEITQSQDQQVKLVGAGLDHAFILKHENSRPDAVLFDPKSGRRLEMETKADSVLIYTANSLDGSFEIGERTVPKYAGITMETQGLVDAINHDGFGDIVLRPEKPFTSRTAFRFTVES >NZ_JPTX01000008|110169:118011|117051_118011_-|WP_003722610.1|DBSCAN-SWA MASEEKIYDVIIIGAGPAGMTAALYTSRADLDTLMIERGVPGGQMVNTAEVENYPGFDSILGPDLSDKMLSGAKQFGAEYAYGDIKEVVDGKEFKTVTAGSKTYKARAIIIATGAEHRKLGAAGEEELSGRGVSYCAVCDGAFFKNRELIVVGGGDSAVEEGTYLTRYADKVTIVHRRDKLRAQQILQDRAFKDEKVDFIWNSTVEEIVGDGKKVTGAKLVSTVDGSESIMPVDGVFIYVGLVPLTKAFLNLGITDDEGYIVTDEEMRTNLPGIFAAGDVRAKSLRQIVTATGDGGLAGQNAQKYVEELKESLEAEAAK >NZ_JPTX01000008|110169:118011|113101_114832_-|WP_003725409.1|DBSCAN-SWA MNWQEEYQKWVANDKLDSTLRKQLTNMEANEKELEDSFYRNMEFGTAGMRGVLGAGTNRMNIYTIRKASLGLAQFVAENGDEAKKRGIVIAYDPRHMSREFAFESAAVLGHHGVKSYVFDALRPTPELSFAVRHLNAFGGIVITASHNPPEYNGYKIYGEDGGQMPPTGASAVIEYINAVEDIFSVEVANQELLIENGLLEVISEKVDRPYLEKLKEVIVNKELVQERGEDLKIVFTPLHGTGGILGVPALESVGFTNIVKVDEQFVNDPDFGTVKSPNPENREAFLLAIEYGKKFGGDILVGTDPDADRLGVAVRNLDGEYEVLSGNQIGAIILHYLLKQKKAQNELPANAAVLKSIVTSNLGTEIAKHYGAEMIEVLTGFKFIAEQIKHFEETGKHTFEFGYEESNGYMVKPFTRDKDAIQAVLAIAEVALVSKVEGGSLLEDLEQIYAEFGYYKEDLVSLTLSGKDGSRRIKEITSNFREQLPTSMGGFPVERAEDYLRSETTWIATGKTEAIHLPTADVIKCYFEDGSWFCLRPSGTEPKIKFYFSIRGESKEESATKLEKVKADLMQHIEA >NZ_JPTX01000008|110169:118011|111148_112117_-|WP_003731212.1|DBSCAN-SWA MKKETKPKVVVIGGGTGLPVILKGLKKKDIHLTAIVTVADDGGSSGKIREQMDVLPPGDIRNVMLALSNVDPRVVDLFQYRFAVDGDLSGHVIGNLILTALSQLNDSYVDAINVLATVLKIRGKVIPATDQPLILNAEMEDGSIVHGESLIPLQGKHINRVYIEPENVKPYPTAVEAVKEADLIVIGPGSLYTSILPNLLLTELADEIIASKAPKVYITNILTQIGETDFFSDADHIKVIHEHVGKSFIDKTLINTTTVPKELLFPEDVAQVEHNAKGMEELGVEAIYQDFLSTEDGLVRHAAEKVADALLAMLPNQTIEKE >NZ_JPTX01000008|110169:118011|112118_112994_-|WP_003722606.1|DBSCAN-SWA MASKQLKLVIITGMSGAGKTVAMQSLEDLGYFCVDNLPPSLLPKFWELMKESDKMDKIALVMDLRGREFFDSIEPALDELDNTNFITTKILFLEADDKVLVSRYKETRRHHPLEPNGSVLDGINAERELLSDLKGRSQLVINTSNMAPRELRERINNEFQTEDKDIFNVQLMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPHYIDKMRPLTGLDEDVYEYVMKWPETQTFLDKLVDLLMFTLPFYKREGKTQLVIAIGCTGGQHRSVALTEFVGKAIQQKYETTISHRDMKRRKGR >NZ_JPTX01000008|110169:118011|115951_116935_-|WP_003727909.1|DBSCAN-SWA MGIAVLGGAGYIGSHAVDELITRGYEVVVIDNLRTGHKESIHTKAKFYEGDIRDKAFLSSVFEKEKVDGVIHFAASSLVGESMEVPLVYLNNNVYGTQIVLEVMEQFGVKHIVFSSSAATYGESERVPITEDMPTNPESTYGETKLIMEKMMKWCDKAYDMKYVALRYFNVAGAKADGSIGEDHKPESHLVPIILQVALGQREKLAIYGDDYNTPDGTCIRDYVQVEDLIDAHIKALEYLKNGGESNIFNLGSSNGFSVKEMLEAARTVTGKEIPAEVVPRRAGDPGTLIASSDKAREILGWEPTYTDVKDIIATAWKWHVSHPNGY |
7 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_JPTX01000016_1 | 215-789 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_JPTX01000016_1
|
7 spacers
spacers of NZ_JPTX01000016_1
>1.1|244|49|NZ_JPTX01000016|CRT AAGCTTCTCCAGTTTTTCATTATCAGAAAACATGGCAGCCATATTAGTT >1.2|322|49|NZ_JPTX01000016|CRT TAACGCTTCAAGACTAGTACAACCAGCAAACATGGCACGCATATCAGTT >1.3|400|49|NZ_JPTX01000016|CRT CAACTTCTCAAGGGCGCTACAATTTCTAAACATTTGAACCATTGCAGTA >1.4|478|49|NZ_JPTX01000016|CRT TAGTTTCTTCAGTTTTTCACAGCCATTAAACACTCTATACATATCAGTA >1.5|556|49|NZ_JPTX01000016|CRT CAGCTCTTCAAGACTAGTACAATCTTCAAACATGGCATACATATTAGTT >1.6|634|49|NZ_JPTX01000016|CRT CAGCACCTCAAGGTTTCTATTATCATAAAACATGTAAGACATATTAGTT >1.7|712|49|NZ_JPTX01000016|CRT CAGTTCCTCAAGTGCCCTACAGCTGTTAAACATATCCCACATAGTAGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_JPTX01000016_1
The CRISPR arrays of NZ_JPTX01000016_1 >merge|NZ_JPTX01000016|1|215-789|CRT ACTGAACTGGTATCAAAGGTACTTAAATCAAGCTTCTCCAGTTTTTCATTATCAGAAAACATGGCAGCCATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAAATTACTTACATCTAACGCTTCAAGACTAGTACAACCAGCAAACATGGCACGCATATCAGTTACTAAGCTCGTATTAAAATTACTTACATCCAACTTCTCAAGGGCGCTACAATTTCTAAACATTTGAACCATTGCAGTAGCGGAACTGGTATCGAAATTACTTACATCTAGTTTCTTCAGTTTTTCACAGCCATTAAACACTCTATACATATCAGTAACTGAACTCGTATCAAAATGACTTACATCCAGCTCTTCAAGACTAGTACAATCTTCAAACATGGCATACATATTAGTTACTGAACCGGTATCAAGGTTGCTTACATCCAGCACCTCAAGGTTTCTATTATCATAAAACATGTAAGACATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAAATGACTTACATCCAGTTCCTCAAGTGCCCTACAGCTGTTAAACATATCCCACATAGTAGTTACCGCACTAGTATCAAGACCACTCAAATC >NZ_JPTX01000016|1|1|215-789|CRT ACTGAACTGGTATCAAAGGTACTTAAATC AAGCTTCTCCAGTTTTTCATTATCAGAAAACATGGCAGCCATATTAGTT ACTGAACTCGTATCAAAATTACTTACATC TAACGCTTCAAGACTAGTACAACCAGCAAACATGGCACGCATATCAGTT ACTAAGCTCGTATTAAAATTACTTACATC CAACTTCTCAAGGGCGCTACAATTTCTAAACATTTGAACCATTGCAGTA GCGGAACTGGTATCGAAATTACTTACATC TAGTTTCTTCAGTTTTTCACAGCCATTAAACACTCTATACATATCAGTA ACTGAACTCGTATCAAAATGACTTACATC CAGCTCTTCAAGACTAGTACAATCTTCAAACATGGCATACATATTAGTT ACTGAACCGGTATCAAGGTTGCTTACATC CAGCACCTCAAGGTTTCTATTATCATAAAACATGTAAGACATATTAGTT ACTGAACTCGTATCAAAATGACTTACATC CAGTTCCTCAAGTGCCCTACAGCTGTTAAACATATCCCACATAGTAGTT ACCGCACTAGTATCAAGACCACTCAAATC
>NZ_JPTX01000016.1|WP_060587054.1|1581_3735_-|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKFSMRVVLIISVLFIALGNANVSIAQERDTTNKLPEEELSSLDTSNIIAEEVAQEKPAEVEQLEEIPTTDELMQNPDVREQPVADSDNPDLTVVSSGAYWTIYRNTVNGEYSLHMFGNVPSSIPSAWKSYLSNIKHIEIEEATLTGSFETYFKSKIGGFLALESVRIERSNLSGVTSFREAFFNPILQKVIIRDNDYPTVPSLLTMESMFENSYNLTELDVSGLDTSAVTNMKNMFYKCSVLKELDLSNWDTSAVNNMNSMFGYCESLEKLNVSNFDTSSVNDMHYMFRDCKALEKLDVSDFDTSSVTTMYGMFVNSTSLKELDVSNFNTSSVTTMQGMFSTCRALEKLDVSNFDTSSVTTMLGMFAACNSLEELDVSNFDTSSVTNMYSMFADCELLEKLDVSHFDTSSVTDMRTMFNNCQSLEKLDVSNFDTSLVTNMQGMFQNCTALKSLYLDNFTTAKTMTDMFTGTTSLTYLFVSHNLQSFYGLANTNWYDEKNWVQFSNLSQLQTYHRNQSEPTGYRKGAFLSLTMDAMGGEFEDAEEQKVQNKISGEYWEEVIPVKEGHYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPAAVSTTIYAKWVENYTVVIPASISLNETSELKVEGINRGSKTLSVGLNQLATSISESNKLTLANTADTTVQCLAPLSWDGSENNPENAILTLAPGSEITEGDAVVEIESPENIQAGKYTGNLVFSINYE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 5762
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_JPTX01000005|0:5762|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_JPTX01000005|0:5762|3301_3754_+|WP_025370563.1|DBSCAN-SWA MWLDKYREQYPELTIIEDTKMKNTHKGLYYNKHIFVNPNQSDVEMRCTLAEEVGHHHLTVGNIIKQKTVNDRKQEKLARNWGYESLVPLRKIIDSYYEGYTEYYEVADFLEVTEDFLKHSIEYYKNKYGNTVECNGYVIIFRSSIQIIAC >NZ_JPTX01000005|0:5762|1796_2120_-|WP_025370566.1|DBSCAN-SWA MTLNDKIIFYLMENPKATNSDIANFCEIQENHAKVTISKLKSRGDIEVSGQGDKRTITVLKEPAVKLNKKERYNRQLDFLEEIMFSDVDPKYRLEASAQHIRLLNKL >NZ_JPTX01000005|0:5762|931_1174_-|WP_015987310.1|DBSCAN-SWA MGRPVKNKHRAINFLYGVWTLEEFAQASPRTYGWWLDNIKDFPELAEFSNWATKNQREAWAFDAVKANDWLIKKFVYKEV >NZ_JPTX01000005|0:5762|1175_1379_-|WP_009929536.1|DBSCAN-SWA MSVEHQRFAVAVYAKLKAINMKQSDLAKTLNISNPYLSDIINGKREASKVRKNIIEILELEIHERSE >NZ_JPTX01000005|0:5762|3805_4462_+|WP_012951517.1|DBSCAN-SWA MIGLSVLMLVLGFFGLVTGIVLLCIKRTRKAGLITTISSVILGIIFTIVLAVGGFNAVKEGVSKNTTNDSVSQEDSYSDDSEDNYNDESLNTDETESLSIGDVESFSNEDDGTSVDVKIKEVQKVTPTAEDESTGNYFIKAIVEFKNTGTESYTANAAEFSIYDGNDEKGEVSSKDFIVEEVAPGKTYTGNVFFDVKNDGPYEIHLYDSSWTWTGEHN >NZ_JPTX01000005|0:5762|2185_2503_+|WP_025370565.1|DBSCAN-SWA MDMILKICIADGTSIVIDGFDIISMYTSIPNVEVEHSGYSWRENYYYDLLNYLNEYKYLSIKRHDCNDELKYRNHDYTFQNGDFKHNTPLFLKTSNIITIIDMYD >NZ_JPTX01000005|0:5762|2961_3285_+|WP_025370564.1|DBSCAN-SWA MTTFERVKKLAEKNKISLKELAIKLNMGENAIYSWKVKTPGVDKLKAVADYFNVSTDYLLGRTDNPIIDSDIPPEAATLAAHIDPAATEEDMKKILEYIDFIQQKYK >NZ_JPTX01000005|0:5762|743_929_-|WP_023548967.1|DBSCAN-SWA MIDEVELLLAKIRKYDPNFCPKSTGKYLLTELQSRHLDHEIKHKKRPKYKHRFANSIERHW >NZ_JPTX01000005|0:5762|1445_1649_+|WP_003730994.1|DBSCAN-SWA MTFYDFLITYYLSENSPLGDLAHDVQLDGNFPTESKSEDEIRDYFSNIGTPGFQEALDEALNYFRRL >NZ_JPTX01000005|0:5762|0_220_-|WP_143185452.1|DBSCAN-SWA MTLTTETINNLIGIKESYQASDALMKILFDREKREEIFKQFLQHDTHLEKDWFHVYFEEEHANKKKYAQDFTP >NZ_JPTX01000005|0:5762|356_509_-|WP_009929542.1|DBSCAN-SWA MKLLRFFGLISIDENGNEYIEKSDRYTLVCLALTVLIALVVGIGGLILNG >NZ_JPTX01000005|0:5762|4607_5762_+|WP_025370561.1|integrase|DBSCAN-SWA MKIKKLTNGKYAVRLRIKVDGEWKEKRLTDTSETNLMYKASKLLKQVQHDSSSLKEWNFKDFYTLFMKTFKDGKSSQSTINLYDFAYNQFVDYFDEKIKLNSIDAVQYQQFINHLSVDYAISTVDTRHRKIRAIFNKAVHLGYMKKNPAIGAHISGHDVAKTKAQFMETDKVHLLLEELAKFHSISRAVIFLAVQTGMRFEEIIALTKKDINFAKRSITVNKAWDYKYTNTFIDTKTKKSRVIYIDNSTVQYLQSYLTWHSAYIKEYSIKNPQMLLFITYHNKPVDNASCNKALKKICSTINSEPVTLHKLRHTHTGLCVEAGMDIIYVADRLGHDDINTTLKYYSHLSSNLRQHNQSKVDAFFTLKTDENTTNFATNTTKTTE |
12 | Listeria_phage(100.0%) | integrase | attL 886:899|attR 6497:6510 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_2 |
118371 : 125794
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_JPTX01000005|118371:125794|DBSCAN-SWA ACTATTCCCACTCAACCGTAGCTGGTGGTTTACTCGTAATATCATAAACAACACGATTCACATGATCCACTTCATTCACAATCCGTACCGAAATTTTCTCCAGTACATCCCACGGAATACGTGCCCAATCGGCTGTCATACCATCAATACTCGTCACCGCACGGACAACCACAGTATGGTCATACGTTCTACCATCACCCATAACACCAACGCTACGGATATTTGGAAGAGCTGTGAAATATTGCCAGATTTCGCGTTCTAGACCTGCGTTTTTGATTTCTTCGCGCAAGATATAATCAGAATCACGAACAATCTCTAATTTCTCTTCCGTAATTTCGCCAAGGACACGGATTCCTAGGCCTGGGCCTGGGAATGGTTGGCGCCAAACGATTGCGTCAGGCATGCCAAGTTCTGTTCCTAGTGCGCGAACTTCATCTTTGAAAAGTGTATTTAATGGTTCGATTAGTTTAAATTGCATATCTTCTGGTAGGCCGCCTACGTTGTGGTGAGACTTGATTGTTTGGGCAGTTGCTGTACCACTTTCGATGATGTCTGTGTAAAGTGTTCCTTGTGCAAGGAATTCTACGCCGTCTAGTTTGTTAGCTTCATCGTCGAATACGTAAATGAATTCGTTTCCGATGATTTTACGTTTTTGTTCTGGATCAGAAACGCCAGCAAGTTTGTCCATGAAGCGTTTTTTCGCATCTACTTTGATAATGTTCATGTTGAATTCGCCTTGTAATGTCGCCATTACTTGGTCAGCTTCCCCTTTACGAAGAAGGCCGTGATCAACGAAAATACATGTTAGTTGTTCGCCGATTGCTTTATGAATTAACACACCAACAACAGAGGAATCTACGCCACCAGAAAGTGCAAGCAAGACTTTTTTGTCGCCTACGATTTCTTGGATTTTAGCGATTTCTACTTCACTAAAGTTTTCCATTGTCCAGTCGCCTTTACAACCACAAATGTTTAATGCAAAATTCTTCAGTAATTCGTTGCCGTAAGCTGAGTGACGTACTTCTGGGTGGAATTGCACGCCGTAAAGCAAACGATCTTCGTCCGCAATAGCTGCAATTGGGCAAGACTTACTAGTAGCTGTTACTTCAAATCCAGCTGGTTCCTTGACAACTAAATCACCATGACTCATCCAAACAACTTGATCTGTTGGTAAGCTAGCAAATAAACGGCTTGGGTTTTCAACGTGAATGTCCGCTTTCCCGTATTCGCGGTCTTTTGCACGTTCTACTTTGCCACCGAAGTGCGTTGTCATTAATTGCATGCCATAACAAATCCCTAAAATCGGAATTCCCATGTCAAAGATTCTTTCGTCAGCGCGGAAGGCATCTTCGTCATACACACTGTTAGGTCCTCCTGAAAAAATAATCCCCGTTGGATTTAGTGCTTTCATTTCTTCAACTGTAATAGTATGCGGATGTAATTCACTATACACACCGAATTCACGAATGCGGCGCGTAATTAGTTGATTGTACTGACTACCAAAATCTAGAACGATAATTTTCTCTTGCTCGGTAAAGTCTTTCATAATTTTAAACAAAACCACCCTTATCTATAAAATGAAACCGCAAAATCACGGTTACTTCACAATAATATAAGAAAAGGACAAATCACTTGTCCTTTTCATCTTCTTTCATTTTAACGTTTCCCCTCTAAAGTTGCAACACCTTATTTGGAATTTTTCGCATCCATTAAGGCTAGACCTTGCGTGAGAATCTTATCCCCGCGCATCCGACCGAAATCCAGTGAATCAATATTAGCGCAAGGAATATTTAGTTCGCCTAATACTTCCTCCACTGTTTTGTACATATATTTCACTTGTGGTGCTACTAAAACGGCATCGACTTGCTCTTTATAATCACGGAATTTCCCGGCTGTAATTGCGCCGACCGGTCCCATCACGACAACCAAATCCCGCTCGCTGTATTTTTCGCGAAAACTATCTTTGTATTTCACATCATCTGGAAATAGTAAAACAGCATCCATTCCTTCTGACGTCGCGCTTTTCACGACATTTTGTGCCATTAAACTCGACGTTGCGCCGCCAGCACAAACAATCATCAACGTTTGCATTTTTCATCCCTCCAAAAAAATGATTCCAGGAGAGTCCTAGAATCATTCATGTTTTATCATCTATATGCCTTTTCCACCGAGTATGTCTAATTCTTGTATTCGTTTTATTTCTTTTATCATCGGTTTGGCGCGTTTAATCATTTCTTTTACAGCTGGGTTATCAAGTGATGCTGCATGATGCCCTTTGTCGACCCAAATTTCAGAAACAAACACCGTGTCTGGCTCGGTTTCAGATTCGCTGACAATATACTGAATACACGTGTTGTAATCATCCAATCCTTCAGCCGCTTCAAGCAAAATTTTCACTAAATTATCTTTTTCTCCTGGATGTGTATAAAATGCAGTTAATAAACCATAACCAACTTTCATTTAAACAGCCTCCTATTTCCAGAAATCGTCAAATATAGTAATTGCCATATGGCGTTTATGTTCGGTTTTAATAAACCAGTTCTCAATTTTTGCTGCAGCATCTGCTGGAACTTCCTTACCTTCCAAGTAATCGTCAATTTGGTCATAAGTCACACCAAGCGCGACCTCATCAGGAAGTGCCGGTTTATTATCTTCTAAATCTGCTGTCGGTTTTTTCAAATATAGATGTTCTGGGCAGCCAAGCTCTTTAAGAAGCGCCTTGCCTTGTCTTTTATTCAAGCGGAATAGTGGATTAATATCCGTTCCACCGTCGCCGTACTTCGTATAAAAGCCAGTAACTGCTTCTGCGGAGTGATCGGTTCCAACTACTACGCCTTTATGCATCGCTGCAATTGCGTATTGTACTTTCATCCGTTCGCGCGCTTTTTCGTTACCTTTAGCGAAATCAGATAGTTCCACTCCCGCTTCCGCAAGCGCCGCAACACTCGCATCCACTGAAGCTTTAATATTTACGGTTAAACGATTATCTGGTTCCATAAAGTTCAGTGCATCTTGACGGTCCGATTCATCTAGTTGCGTTCCGTATGGCAAGCTCACAGCGAAGAATTGGTACTCATCGTCACCCGTTTCTGCTCGCATTTCGCTTATCGCCATCTGTGCTAGTTTTCCTGTTAAAGTCGAATCTTGTCCCCCAGAAATCCCAAGAACAAAGCTTTTTAAGAACGTATTCTTTTTTAAATATGCTTTTAAAAACTCGACACTTTTTCGGATTTCTTCGTGTGCATCAATCGTTTCTGCCACTTGCATATCTGCTAAAATTCTTTCTCTGATTTCCATTATAATTCCTCCTAAAACGGCATATCTAGTTCAACTGGTGAATGAAGCTGGACACTTTTACGTACCTTTTCGATATTACGCATCTTATTTTTCCAACATTTTACACTTAAATCAACTGGGTATTGCTCCGGACGAACTGTTCGTTTGTACTCGTCCCAAAGTAGCGCCAAGTTCTCTTCTTTATATGCTTTAATTTCATCTAGTGAAGGCATATCATATACAAGTTCTCCGTTTTGGAAAATCGGTACAAGTAGCTCACGCGCGGTGAAGTTCTCGACTGTTTTCATAATATACGTATGAACTGGGTGGAACATCGTTAGTTTATCCACATTTTCGAGTGATTCGTCCGCTAAAGCAATATAATCGCCTTCCGCTTTCAAGCCATCTTCATTCGTAATAATCCGGTAAACTTTCTTTTTACCAGGAGTCGACACTTTTTCGGTGTTACTCGAAAGTTTAATCGAATCTTGTAAAATATCATTTTCATCAGCAATTGCCGCCATTTTGTAAACGGCACCTAATGCTGGTTGGTCGTAAGCGGTGATTAGTTTTGTGCCAACGCCCCAAGAATCGATTTTTGCTTTTTGCGCTTTTAACGATAAAATAGTATGTTCGTCTAAGTCACTCGAAGCAAAGATTTTTGCTTCTGTAAAACCAGCCTCATCTAACATTTGGCGTGCTTTTTTAGATAAGAAAGCCATATCCCCGCTATCTAAACGAATGCCGATAAAGTTAATTTTATCGCCCATTTCTTTCGCCACTTTAATCGCATTTGGTACGCCAGATTTTAGCGTATCGTATGTATCTACTAAGAAAATCGAATCAAAATGCGTTTTTGCGTAACTTCTAAATGCTTCTAGTTCGTCGCGATAAGCTTGAACCATCGCATGTGCCATCGTACCAGACACAGGAATACCGAAAATTTTTCCAGCGCGAACATTACTCGTCGAATCACAACCGCCGATGTAAGCCGCTCGTGTGCCCCAAATAGCCGCATCCATTTCTTGTGCACGTCTTGTACCGAATTCTGCAAACGTTTCGTCATCAATAACAGAACGGATTCGCGCCGCTTTTGTTGCAATCAGCGTTTGGAAATTCACAATATTAAGCAAAGCTGTTTCAATTAATTGTGCTTCCGCCAAGCTTGCTTCTACTTGAAGGATTGGCTCTGTTTTAAAAACAAATTCCCCTTCTTTCGCAGCAAGAATATTTCCTTTAAATTTAAAATTACGTAAATATTCTAGAAAAGGTCCTTCAAAACCAAGTTCGTCGTGTAAATAAGCAATATCCGTTTCTGTAAAACGTAAATTTTGCATATAATGAATAATTCGTTCTAGCCCCGCAAACACAACAAAACCCGAATCAAATGGCATATCTCGGAAAAACACTTCAAATACCGATCTACGCTCATGAAGTCCATCGTCAAAATACGCTTTCATCATATTTAGTTGATATAAGTCTGTATGCAGCGTTAGACTATCATCTTGAAATAAATTTGTCATTTCTTCTGCTCCTATCATTTTTTATAAGCATTAATTTGACTTATTATATACCAATTATCATAGCATATAAAAGGTAGTTTCACTATTAAATTAACTGTTACTAACAAAAAAAGAGCCTAAGACATAGTACTTCTAATGATGCAATGGCACACTTGAATCAATTGTTTACAAGTGTACTTAAGATCCGAAGTATTTTGTCTTTTGTCTCTTATTTCGTTATTTTTTTCACAGCTTTCTTACCGAAATAAATGTAACTATTTAGGAGAAAAGCCGGACGATTATTTGCTAACAAAGCTTTGAAAAGTTGTTTCTTTTCTTTTGGAATATCATTCAAAGCAGTTGTTTTCATTTCTTGCTCAACATAATTTTTGATAAGTGGTTGAAGAGCCAAATAGTAATCCTTCGGCGCTAAAAATGCCCATTCAATCATGGAAAACAAATCAATTTCAAAGTTTTTACATTCATTTTGATATCTTAAATCACCCTGAATGTTTTTCTCATTAAGTACTTGATTTACTTTTTTCAAAGCAAGTAAACGATCATTCACCATGGCAATGTCATTTCGTCTTTGAGTGATAGATTTTGCTCCACCCTCTCGACTGCGCCAATAATAACCAACATCAGGAATAACATTTACCTTTTCTGCATACAAAAAGGCTGGAATCATTAAAGCGATATCTTCATACATTTGGCCCTCTGGAAATTCCAAATGGTATTTATCCCAAAAAGATTTTTTAAATACTTTATTCCACGAAGTAGTATCATATAAAAGTGCCGGTGTTTCTTCAATTGTTGTGGCTTCTTTTTTTTCTACCATATATCTTTCGTGTAATGTAGAAGGGTATACTTTATCTCCTGAAAGTCTTGCCACACCAATTGTAACCATATCTGCATCCGACATTTCAAAAGAATCCATCATTTTTTGAAACATATCTTTAGCAATGATATCGTCTCCATCGACAAAGCCTAGATAATCACCTGTAGCGACTTTTACACCATTATTTCGGACAGCAGAAACACCCTGATTTTCTTGATCAATCAAAATAACGTTCGAATGTCCGTCTACTAGTTTTTCTACTTTTTGAAAGGTATTATCAGTTGAACCGTCATTGACAATAATTAATTCCACATTCTTGTAGTTTTGTTCTAAGACTGATGTTAAACATGCTTCTATATACTCAGAAACATTATATACGGCAATGACCACACTTAATTTATGCAAAATGATAACCTCCTTTAAAACCCTGTTTGCTTACTTCTGATAGAAAATGGATATTTCCATACTAAATCACCCAACACGTACAAATGATGTAAATAAAGCCATAATGCTTTTTTCTTTAATGTTGCTGTTAGTTTGCCACCCGCTTGATAAGGATAACTACCCCAATTAGGGAACTTCTCTTGAATAATTGTACTAATTTTCTTAATAAGGTTTTTACGTTCTTGCTTATCAGTAATGTAAATCGCTTTTCGTAAAACTAAACGATAAATTAGATGTTCTATATATAGGTACGCAAGTTGATCTTTTGATTCTTCGTAAATACCTAGTTTTTTTAATTCTGTTTCAACATTTTCCAACATAATAACCACATCTAAAAAGTGATCTACTTGTTGAATATTCGATTGTGAATCCGCTCTATCAGTTATGTAGTAATAAAGTGCGTCCTGGATTTTCACTGGATTTTTTGCTTTTAGCGTGACGACTGGAATAATTCCTAGATCTTCATACCAATAACCTACTGGAAAACGCGAACCCTTCCATAGATCTGCTTGATAAAATTTGTTCCATGGAGTTGGACCTGCGTCTAAAACTTTGATGCCTTTATCACGCTTTATATACTGCATTTTTCCTTCCTGATTCACATTATATGAAGTAAACAAGACTAAATCAGCATTCGTTTTTTGTACAGTATCCAAACAAATTTCTACTAGGTTTTTGCTAATATAATCATCACTATCTACCATCACAATGTAATCTCCCGTAGCCACATCTAATCCAAAATTTCGGGCAGTAGCTTGTCCGCCATTTTCTTTTTCAAAATAACGAATTCGGTTATCTGAGATACTTTTTATAACTTTAGCTGAATTATCAGTCGCTCCATCATTAACTACGATAACTTCGAGGTTATGATATGTTTGCTCAAGAACTGAATCCAAGCATCGTTTGACATACTCTTCTACATTATAAACTGGAATAATTACACTTACTAAAGGTTCCAAAAGAATGCTCCTCTCACATTTTTATTTTAGTTCATCTTTAATTTGAGACGTAGAAATCCCTTCTGTTCGAGGAAGATAAACAACTTCACACACTTCTTTTAGAAAATCAAATTCGCCTTCCCAGTCATCCCCCATTACAAAAACATCAATTCCGTATTTCTCTATATCATCTCTTTTTTGTTCCCAGTTATTCTCTGGGATCACCTCATCCACATAACGTATTGCTTCAATAATTAATTTACGGTGTTCGTAACTATGATAAGCTTCTTTATGTTTAATTCGATTAAATTCATCAGAAGAAATTGCTACTATTAAATAATCACCAAGAGCCTTAGCGCGCTTTAATAAGTGAATATGCCCCCAATGAAGCAAGTCAAATGTTCCATATGTAATAACCTTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_JPTX01000005|118371:125794|121678_123169_-|WP_003724632.1|DBSCAN-SWA MTNLFQDDSLTLHTDLYQLNMMKAYFDDGLHERRSVFEVFFRDMPFDSGFVVFAGLERIIHYMQNLRFTETDIAYLHDELGFEGPFLEYLRNFKFKGNILAAKEGEFVFKTEPILQVEASLAEAQLIETALLNIVNFQTLIATKAARIRSVIDDETFAEFGTRRAQEMDAAIWGTRAAYIGGCDSTSNVRAGKIFGIPVSGTMAHAMVQAYRDELEAFRSYAKTHFDSIFLVDTYDTLKSGVPNAIKVAKEMGDKINFIGIRLDSGDMAFLSKKARQMLDEAGFTEAKIFASSDLDEHTILSLKAQKAKIDSWGVGTKLITAYDQPALGAVYKMAAIADENDILQDSIKLSSNTEKVSTPGKKKVYRIITNEDGLKAEGDYIALADESLENVDKLTMFHPVHTYIMKTVENFTARELLVPIFQNGELVYDMPSLDEIKAYKEENLALLWDEYKRTVRPEQYPVDLSVKCWKNKMRNIEKVRKSVQLHSPVELDMPF >NZ_JPTX01000005|118371:125794|125410_125794_-|WP_003730941.1|DBSCAN-SWA MKKVITYGTFDLLHWGHIHLLKRAKALGDYLIVAISSDEFNRIKHKEAYHSYEHRKLIIEAIRYVDEVIPENNWEQKRDDIEKYGIDVFVMGDDWEGEFDFLKEVCEVVYLPRTEGISTSQIKDELK >NZ_JPTX01000005|118371:125794|118371_119928_-|WP_077941359.1|DBSCAN-SWA MFKIMKDFTEQEKIIVLDFGSQYNQLITRRIREFGVYSELHPHTITVEEMKALNPTGIIFSGGPNSVYDEDAFRADERIFDMGIPILGICYGMQLMTTHFGGKVERAKDREYGKADIHVENPSRLFASLPTDQVVWMSHGDLVVKEPAGFEVTATSKSCPIAAIADEDRLLYGVQFHPEVRHSAYGNELLKNFALNICGCKGDWTMENFSEVEIAKIQEIVGDKKVLLALSGGVDSSVVGVLIHKAIGEQLTCIFVDHGLLRKGEADQVMATLQGEFNMNIIKVDAKKRFMDKLAGVSDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEANKLDGVEFLAQGTLYTDIIESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRALGTELGMPDAIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRDSDYILREEIKNAGLEREIWQYFTALPNIRSVGVMGDGRTYDHTVVVRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPATVEWE >NZ_JPTX01000005|118371:125794|120056_120461_-|WP_046670537.1|DBSCAN-SWA MQTLMIVCAGGATSSLMAQNVVKSATSEGMDAVLLFPDDVKYKDSFREKYSERDLVVVMGPVGAITAGKFRDYKEQVDAVLVAPQVKYMYKTVEEVLGELNIPCANIDSLDFGRMRGDKILTQGLALMDAKNSK >NZ_JPTX01000005|118371:125794|124405_125389_-|WP_046670532.1|DBSCAN-SWA MEPLVSVIIPVYNVEEYVKRCLDSVLEQTYHNLEVIVVNDGATDNSAKVIKSISDNRIRYFEKENGGQATARNFGLDVATGDYIVMVDSDDYISKNLVEICLDTVQKTNADLVLFTSYNVNQEGKMQYIKRDKGIKVLDAGPTPWNKFYQADLWKGSRFPVGYWYEDLGIIPVVTLKAKNPVKIQDALYYYITDRADSQSNIQQVDHFLDVVIMLENVETELKKLGIYEESKDQLAYLYIEHLIYRLVLRKAIYITDKQERKNLIKKISTIIQEKFPNWGSYPYQAGGKLTATLKKKALWLYLHHLYVLGDLVWKYPFSIRSKQTGF >NZ_JPTX01000005|118371:125794|120521_120830_-|WP_046670536.1|DBSCAN-SWA MKVGYGLLTAFYTHPGEKDNLVKILLEAAEGLDDYNTCIQYIVSESETEPDTVFVSEIWVDKGHHAASLDNPAVKEMIKRAKPMIKEIKRIQELDILGGKGI >NZ_JPTX01000005|118371:125794|123377_124391_-|WP_046670534.1|DBSCAN-SWA MHKLSVVIAVYNVSEYIEACLTSVLEQNYKNVELIIVNDGSTDNTFQKVEKLVDGHSNVILIDQENQGVSAVRNNGVKVATGDYLGFVDGDDIIAKDMFQKMMDSFEMSDADMVTIGVARLSGDKVYPSTLHERYMVEKKEATTIEETPALLYDTTSWNKVFKKSFWDKYHLEFPEGQMYEDIALMIPAFLYAEKVNVIPDVGYYWRSREGGAKSITQRRNDIAMVNDRLLALKKVNQVLNEKNIQGDLRYQNECKNFEIDLFSMIEWAFLAPKDYYLALQPLIKNYVEQEMKTTALNDIPKEKKQLFKALLANNRPAFLLNSYIYFGKKAVKKITK >NZ_JPTX01000005|118371:125794|120842_121667_-|WP_003727000.1|DBSCAN-SWA MEIRERILADMQVAETIDAHEEIRKSVEFLKAYLKKNTFLKSFVLGISGGQDSTLTGKLAQMAISEMRAETGDDEYQFFAVSLPYGTQLDESDRQDALNFMEPDNRLTVNIKASVDASVAALAEAGVELSDFAKGNEKARERMKVQYAIAAMHKGVVVGTDHSAEAVTGFYTKYGDGGTDINPLFRLNKRQGKALLKELGCPEHLYLKKPTADLEDNKPALPDEVALGVTYDQIDDYLEGKEVPADAAAKIENWFIKTEHKRHMAITIFDDFWK |
8 | Hokovirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
162 : 25573
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_JPTX01000014|162:25573|DBSCAN-SWA AATGACTAGCACAATAAAAATATCTGAAAAAGATAAAGTGTTCCAGATTGCGACGGAAGCTGGGTGGGTTGAACAGACTGGAATGCAAGTGACGATTGACGGAATGGACTTTGCAATTTATCCGTTCCATGCAGAAAACAATATTTTTATACAAGTTAGTGAAGTAGATAGTGGTGGAGTATTAATAAATTTCCCAGCCGATTTTATAGACGTTTTTGTTTTAGACACTCGAGATAAAGCAATCGAATATTATAAAGATAGCGTGATTCCTTTAATCCAGAAAAAAATCGAAGCAAATGGATTAGACAAATTTAGAAAAGAAGTTGAAAAAACAAAAAAATATATGGTTGAAACCTACGGAGAACGACCGAAAATTAAAGATTTTGAGGAGGATGACGAATGAGTATTAATAACTGGTGTATCAATTGCGGTGAATGGTTAGAACCAAATCATAAATGTGAATCCAAAATCAAAGAGGAAGAAAGAGAGGGAAAGCTAATGATACCACCATTCAGAGTCGCAGAGGACGAATTTATAGCTATTTCTACAGCAGAAGAACTTTTAGATTATATCAAACATGCGGAAGAACTTATAAGTATAGTAAGAGAATCAAGAAGCAAAGCCTACAAAGAATTAGCAAATCGAGGCTTACGACCAATAGATAGGAGTACGGAATAATGATGAATCGTGTAGTACTTGTAGGACGATTAACAAAAGACCCAGATTTACGTTACACTCCGGCTGGCGTGGCAGTTGCGACTTTTACATTAGCTGTAAATCGCCCATTTAAAAATGCACAAGGAGAACAAGAAGCCGATTTCATTAATTGTGTTGTTTGGCGTAAACCAGCGGAAAACGTTGCTAATTTCTTGAAGAAGGGAAGCATGGCGGGTGTTGATGGACGTGTTCAAACTCGTAATTATGAGGATAGCGATGGTAAACGTGTTTTCATTACAGAAGTAGTTGCTGAATCAGTTCAATTCTTAGAGCCCAGAAACCACGCAGAAGGCGCTACATCAAATAATTATCAAAACCAAGCTAATTATTCAAATAACAATAAAACAAGCTCATATAGAGCGGATACGAGCCAGAAGAGCGATTCATTTGCGAATGAAGGTAAGCCGATTGATATTAACGAAGACGATTTGCCGTTTTGAGGGAGAGGGTGAATAAAAATGACAGCAGAAACAGCAATAAAAAAGTTGAGAAATAGATCCATGAACATCAGATTTATGGCTAATGCAATTGCAGAAGTCACAAACTACCAAATTAGCGAAATTGAACAAATGGGGGACGAAGAAATTGAGGCGAAGTATACGGCGTACGTCATTAACGAGACGAACGAGTACGCGAAGTAAATATAATGCGAAGAAAGTAGTTATTGACAATATAAAGTTCGATAGCAAAGCAGAAGCAGCTTATTATCAGCAATTGAAATTATTAAAAATGAGCGGGGAAGTAGTGAGCTTCGATTTACAGCCAGAGTTTATTTTGCAGGACTCATTTGTAAAGAATGGGAAAAAGTATCATGCGATTAAATATAGAGCTGACTTTCTCGTTCGATACAAAGATGGTCACGAGGAATTAATCGATGTTAAAGGCATGTTGACAAAAGAGTTTCGAATCAAGCAAAAACTTTTCGAACTGCGTTATATGCAATCAATTAAGTGTTTGAAATTAAAAGGCAGACAATTCGTGGAGGTGTGACAAATGGAAGTATTAGAGATGACAGAGAAAGTATTAGAGATGACAGAGAATAAAGAGAGGCAACGGGAGATAATTAGTTATTTAATAAACGAAAATTTACCTTTTGCTGACAGGAAAGTGTTGCAAAAAGAGTTAAACGATTTAATGAATACTAATACAGAAGAGAAAATGCGTACTTGGATGAAGAAGGAAGCAAGAGCGATAGTCGGAAATAGGAATTGGGAAAATATGAATATTATTGAATTTGTTAAATTGCGACATGCGGGGCTAACACAATCGGAAATAGCTGATTTCTTTAATGTATCTAAATCGAAAATGGATAATTTTGTAGCAATTAGAGAAAATCGCTCATATTACCGAAAGAATTTTGTTTACGATTTACACAGAATCGCTAGGGAAAATTGGACGGATAAATGATTTTTAGGGGGCGATTTTATGAAAAAAGAAGATGGTGTGTATACTCGCGTAAATGGTGAAGAAAAGTTAATAACAAAACCACCTGAAAACGGCTTCGGAAAAACTACCATAACCTGGAGTCACGGCAAACCTACCACTGCCGAAAATGTACAAACAATAAAACTAAATAAATAGTCTGGTCGAAAAAATCGAAGGACGTCATGAACAGTTAAATCTGTCGTGACGTCCTTTTTTTATTAATCATTGGGGAGAGTGACGAGAATGCAAGAATTAATTAATGAGTACAGAGGAGCTTTACAAGATGTGCAAAAAGTAAAAGCTAATCTGCAAAAAAGAATTGATGCTGAAAAACGCCCTCCATTAGAAGCGGGACAGAAAAGAATTTTTCAAGATGTGTCAGAAAAAACCACGATGTCAAAATTAAAAAGTATTATCGACAGTTTAGAGTATTCAATTGAGTGGATGGAATTAGGACATGAACCAGCACCACGCAGAGCTATTCACAGACGCTCCGGTTTGCAAAGAGAGATATGCGTTACAGATATTGAAAAAATGCGTCAGTGGTTCGTATATGAGCATGGGAACGCGTATGAGTTTGAAGATAATGAGCCGAAAATTTCAGAATGGGATAAAATTCGGATGGAAGATGCTATGAGTACGATGTCAGCGCAAGAGAAAAAAGTATTTTTATTAAAACATGAAAAAAATTTATCTTTATCTCAAATTAGTGACGAACTAGAGATAAGCATTCGTTCTGTGCGATCATACTTACATCGAGGAGAAGAAAAAATACAACAAAAAATCGACGGAAGTTTGTTTTGCATGGCAATTTAGTGTTTTTTTGCCGCACACCTGCCACCTAATAGTGAGAAGTGAAGATGATTACAAAAATAAATCATATATTGAGTCTGCGCTCCACTTCTCATATCCTATCCACACTGGATGTAAAACACGCTTGTGGCGCTGACTGGTGCGTTAACCAGTTTGTTTATATTAAAATAGAACCTCTAACACCGCTCAAAGAAGTGTCCCACGGTAGGGCGATAATTTGGCTCCGAATTTCGGGGCTTTTTTGATACATGAAAATAATAAGGGGTTGATTATATGAGAGACATTATAAAAGCTGGAATAACAGAGGTAAAAGGAAAAGAAGCTGAATTCAAAATAAACATAGCTGGCTCTGAACAAGAACAAAGCTTTGCATTAGCGCAGATTCATTACATGAAAATAGAGCGGTTAGCTATGCTAAATGGTAAGACTTTTGAACAAGCTAAGAGTGATTATTTAGAAGCGCTAAGCATCATTGTAGGAACGATTAAAGATAATAATTAATTAGCGAAACAAACACAGAATGCGAGGTGGTGGAAGTGAGTGGCTAGAGCAAGAAACCCAAACAGAGATATAGCAAAGAAAATGTGGCTTGATTCAGATAAGACAATGCCACTTGTGGAAATTGCCAGTAAGTTAAATTGTAAACCATCCCAGATTAGGAAATGGAAATCGGAAGATAACTGGAGTGATAACGCGAATAGTAACGTTACGAATCAAAAGGAGCGTTACTATTCAATGAAAGGGAACGGGAATGCTAAGAACAATAAAGGCGGCGCCGCTCCTAAAGGGAATCAAAACGCACGTACACACGGACTGTATTCTAAATATCTTCCGGATGATACGATAGATATTATTAGTATGATGGACCATCAAGAACCAGCTGATTTAATTTGGGGGCAGATACAAATTCAATACGCCGCTATTATCCGAGCACAGAAAATTATGTGGGTAGAAAATTCCGAAGATGAAACTAAAGTTCAAACACAAGTGGGGTTCGGAGATAGTGGTTCTGATAAATATGAGTATCAATTCGCTTGGGATAAACAGGCGAATTTTTTAAATGCACAAAGTCGTGCGATGTCTACACTGAGTGGGTTAATTAAGCAATTTATTGCCATTGCTGATGAGCAAGATGAACGCAAAGCTAAGCTTAATCAAATTATTGCATCAACAGATAATATACAGGCCCGCACAGCTCTTATTAAAGGCGCTGAAAAAGATACATCATTATTAAACGCATTGATTGATGTTGCGAATGGTGGTGACGGCAGTGGTTCAATTGGCATTCAGTCCGAAACAACAAGAGACGATACGGGAACAAACTAAAAACATAACGTTAGAAGTTAATGAGGGGACTCCACGTTCTGGGAAAACCACAGCTGATATTTTTAAAATGGCAAATTTCTACATTAAATCTAGGGATATGAACCATTTAGTTACAGCCTATAACCAAGAACAGGCCTTTCGATTATTTATGGATGGTGACGGTTTAGGTTTAATTCATATTTATGGAAACCTTGCTGAAATGAAGCACGATGAGCACGGAGACCACTTACTTTTACATGCTCCCAACGGCAAGAAAAAGATTTACTACAAAGGTGGAGGTAAGGTAAACAGTGTTGGTGCTATCACAGGTATGTCGCTTGGCTCTGTAACATTTTTGGAAATCAACTTATTACACATGGATTTTGTAAAAGAGTGTTTCCGGAGAACTTATGCAGCAAAAGATAGATTCCATTTAGCAGAATTAAATCCTCCCGCTCCAAGCCATCCAGTATTAACAGAAGTATTTGATCGTTACGAAAAAACAGGACGTTACAAGTGGCGTCATTGGACACCATTTGATAATCCTATACTTGACGAAGAGAGAAGAAACGAACTATATAACGAATTAAAGTTCTCTTCTTACCTTTTGCAGCGTGACTGGTATGGTAAACGAGTTTTGCCGAAAGGTATTATTTACGAAACATTTGATATGCAGAAAAACCAAATATCCAAATTAGAAGGTCGTCCAATTGAGATGGTCTTTTTTGGTGACGGAGGAC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MIEDLVAHFKKTFPAIKTLGFIKQTGLDSMVVINEAPTFQNKQVQTQSRVRESVGFLIYDKNTIQCKRTYDLLRNYFLLTNPSELNIQNQKVVATDIASGGQVDYDDDGRLIYQLTILFEKEMEANANIRSKRN >NZ_JPTX01000014|162:25573|12175_12607_+|WP_060587041.1|DBSCAN-SWA MKSFNFNENEVKLPLGINGKMYYADISAQAHIKYSALLDEAPKILGQVLAPKLKADESDDEHTIPNDENMHELLMTITDGIVATNDDIFAIFFSKEDREEINSKTLPTKVYEGLIEYIIAKLFETDMSEESGEGKPQENSITE |
35 | Listeria_phage(100.0%) | tail,capsid,holin,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_JPTX01000014.1|WP_003731276.1|25056_25308_-|hypothetical-protein |
25056_25308_-
Protein sequences of NZ_JPTX01000014.1|WP_003731276.1|25056_25308_-|hypothetical-protein>NZ_JPTX01000014.1|WP_003731276.1|25056_25308_-|hypothetical-protein MSKTMYKNDVIELIKNAKTNNEELLFTSVERNTREAATQYFRCPEKHVSDAGVYYGEDFEFDGFEIFEDDLIYTRSYDKEELN |
83 aa aa |
AcrIIA12
anti_CRISPR3641|WP_003731276.1|AcrIIA12|II-A|Verified|Listeria-monocytogenes information
|
NA | NA | 162-25573 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.2|51126|36|NZ_JPTX01000004|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_JPTX01000014 position: 20275-20310, mismatch: 0 attacagtacaagcaagggttattgagttaaatatt CRISPR spacer attacagtacaagcaagggttattgagttaaatatt Protospacer ************************************ |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
576 : 33216
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_JPTX01000001|576:33216|DBSCAN-SWA AATGAAACAAGAAGAGTTAGACATCATATTAGAGAATCATGGGAAATGGCTCCTCAACGAAGGTGGCGAGAGAGCGAATTTAAGTAATATTGACTTAAAAAACACAAATTTAAGATTTGCAAATTTAAGACTTGCATATTTAAGGGGTGCAGATTTAAGTAATGCAAATTTAAGAGGTGCAAATTTAAGATTTGCAGATTTAAGAGGTGCAGATTTAAGATTTGCAGATTTAAGTTATGCAAATTTAAGTATTGCAGATTTAAGTTATGCAAATTTAAGTAATGCAGATTTAAGTAATGTCAATTTAAGTAATGCAAATTTCAGAGGTGTAGATTTAAGTGACGCAAATTTAAATTGGGTAAACTGGCAACATGTAGAAGGCTTAACAGTTATCTGCGTACAAGTAGATACCAGTAGACGAAACAACCAAATAGCATATATTAAAGAATTAGACATATGGACAACAGGCTGTTTTCAAGGAACATTAGATGAGCTTAAAGCGTCTGTTGAACAAACGCATAAGTATAACGAAAAACTTAAAAAAAGATATTACAGAGTGATTGATTTTATTTTGAGGGAGGCAAAGGAATGAAGTACCGAAAACATCAAACTCATTCCTTTCAGCTAAGGCGTTTAAAACGTTCGGTACGCGTGTTAATACTTAAAATTATTAAAAGTTTGAAAGAGGTGGCGGAATAAATGGGAGTGAGTATTGATTTATACAGTTATGATTATGAAGCGCTTGTGGAAGGCATTCAAAGCTATACAAAAGCGGAAAATACGGAAGTTATAAGAAAAATACTTCTAATAGGCGGAAATGTCGTAGGTGATAAATATATCATTTTAAACAATGAACTCTGGGAAGATAACAGTTCATATTACAACGTTCCGAACGCTTTAGAGCGTTTGTATAAAGTTGATGATGTCTTTGGAAAAATCTTCTGTACTTTTGATGATAGGTTCGGTAGAGAGACGCTAATTAATGGTTGTGATACCCCAGAAGAAATATTAGAAGAGGTGATGGAATGACGACATTTAAACCGAGAAACATCCTAAGTTGGCGCAGTGGATTGCCTTACGATAATACGAGATTTTCAATAGGTAAACCACCAGCAGGTGGACAACATGGTGATGAATGGTATAACGGAGAAATGAATGTAAATGTAATCAGCATTGAATATATACTGCCTAATCCAATCACGGAAAGCACAGGAAACTATATTATCAAGTTGGAAGATGATAGGAGAATTGTTATCTCCGAAGAAATTCCGTCTTTTATTGAGGAGATGGCGGAGGAATGAAGTACCGACAACACGAAACCTATTCCTTTCTGCAAAGGCGTTTAAAACGAGTAGTACTAGTGTTGATACTAAAAATAATTAAAAGTTTGAAAGCGGTGGTGGAATGAAAAGAGCTGGATTCTATTTTACAGATAATGACGATGATGCAACTTCTTTTTGTCCAGAGTGCGGAGAACTAAATATAAGTATTAGCGCGCGAAAAGTGCTCGAGTGTATAAAGATTAATCGACCAGTATATGTCCAATGTGCAGCGTGTAAAGCATGGTACAACATCGGCGGAGACGTTGAAGAAGGAGGATGACGAATGACTAGCGCAAATGACTTAGCTAATCATCTTGACCTTGACACTGACTATTTATTATTTAATTTATTAGGAGGAATATAAAATGGCAATTTTAAAAAGCGAATTATACGCAGTGATCAGCAAAAAGGAATCAGAAATCAGAACAGAATATCTTGAAAAAGAACGACAAATCAAAACGGACGCTATTAACGCCTTTTATGAAAACGAGGAGTTAGACGAAACACTAGAATTATTTGTTAAACAATTACAAGAAATCAAGAAAACAGCTTCCTTGTTAGAACCTAAAATACAATCTTATTACACACCTGTCCACACTATTGACAACTTAGACTGGTTCGACGATGTGGACGCGTTAAAACAAAACTTGGGTCGTAACGTTTGGCGGAATGGCAAAATCAAGATATTCACTCCGGAAGTAAAAGAATTAGACTACAATAACGACAAAGAATGGATTTCTAGACTAGCCGAATTTCAACGCCTGACTGCGACAATCAAAGCCAACTCACCTGCAAAAGGTTATAAACTACTTAAAGAATTAGGTTTCGATGTATCTCATATTGACGCATCAAGCAAACCAAAATCAAGTGCACCTATGGTTCTAGATTTTGACACTACTAAATTGGGGGTGCAAAATGACAAAACAAATCATCATAAACGAAGCAAACAGTTTACTTCACAGAAAAAGCAAAGAATTGAGTAAATCAATTATTAAAACACCAAAGGACCTTGAAAGATTCGCAATTGGTCTTGATAAATTATCGCAAGATATGTGGGACTATAAAAACGAACTGGAGGCGATTAAATGAGTATTGTAGCTGGTGATAAAGTAGAGGTACAGGATAGAACGGGTGTAGCTGAATTGTGTGTTGATGGTGAGCAGTTTCATGTTCTGATGAATAATGGTGGTCTGCTAACTGTTGAAGATGAAGACGGATTTTCATCCTTTAACATACCAGCAACTCAAGTCAAGAAAGTGAAAGTGAATAGTGATGTTAAATTAATAAATGAGCTATATGACCAATCAGATGCAGTAAGTTTTAGTATATATAATGCAGATATAGATAAAGCTAAGTTGTTTGTATCTAATGTAAATAAGCCACAATTTGACGAAAGAAACAATGTGAAGTGGTATTCTGCATCAAAAGACAAAATAACAGCAACAGCATTTTTGAAAGGGGATAACTAACATGACAACCTTATATTCGATCCAAGATAAATACCAACAACTCTTGAACTTAGCAGAACAGCTTGATCCAGAATTACTAAAAGATACCCTTGAAAGTATCGATGATGAACTAGAAACGAAAGCTGAAAACGTAGCATTTGTTATTAAAGAGCTAGAAGGTCAATCGCTAATCTTAGAAAAAGAAACAAAGCGTTTAGCTGAACGGAAAAATACTATTAATAATAATGTGAAGCGACTGAAACAATCGTTATTTGATGCAATGATAACTGCCAATAAGCAAAAAATTAAAACAAACTTATTCACATTAGATATCCGGAAGAACCCGCCAAGCCTCATTGTAGAAGACGAAAGCAAACTGCTGAATTACCTGATTGAACAACCAAAAAAATTAGATAAAACAAAATTAGGCGATGATTTGAAGAAAGGTATTGAGGTACCAGGTGCGAAAATTATTCAAACAGAAAGATTGCAAATAAGATGAGGAGGGGTTTTGTTGGAATTTATTCAATCGGAAGAAATGAAGAGGTCAGAGTATTTTAATATTATGATTTATGCCAAACCAGGTGCAGGTAAAACAACTACAATTAAATACTTAAAAGGTAAAACATTAATGTTAGATTGCGATGGCACGTCAAAAGTTTTAAGCGGGTTGCCTGATATCACAATTGCAACATTGAATCCTCGTAATCCCGTGCAAGACATGGCAGATTTTTATGGATATGCAAAAACACACGCGGATGAATACGACAATGTAGTAATTGATAATTTGAGTCATTATCAAAAACTGTGGTTAATGTTCAATGGAAGAAATACTAAATCAGGGCAACCGGAGTTACAACATTATGGGATATTTGATACAAATTTAATTGATATGATTTCCGTATTTAATAACTTAGCAAACACAAATATTGTTTATACCGCATGGGAAAATACACGACAAATTCAATTAGAAAGTGGTCAACTTTATAATCAGTTTTTACCGGATATTAGAGAAAAAGTAGTTAATCATGTGATGGGAATTGTTCCAGTTGTTGCGAGATTAATACGAAATCCTGAAACTGGACAACGAGGCTTTCTACTCACAGAGAATAATGGTAATTTTGCAAAAAACCAGTTAGATAATAGAGAATTCGCCTTACAAGAAGATCTATTCAAAATCGGTGATATTGATGCTAAAGCTTAGAGAATATCAACAAGAAATTATAAATGATGTAAAGGGGGCTTTTTTACAGGGATATAATAGACCGTGCGTCGTTGCTCCCTGTGGGTAGGTGCAGGTAAATCGGTTATTTTATCGGAAATAATTCGTATGACAACACATAATAAAAACCATGTTCTTTTCCTAGTCCACAGAAAAGAGTTGATTGACCAAATCAGAAACACACTCATTATGAATGAAGTGGATATGAGTTACGTCAAATTGGGAATGGTTCAAACGATAGTTAGACGTCTAAACAAAACTTCGGAGCCTTCGTTAATCATAATTGATGAAAGTCATCATGTGTTAGCAAATAGCTATAAAAAAATAATTCATCACTTTTCTAAAGCGAAGGTTGTTGGATTTACTGCAACACCCGTAAGAATAAATGGCGGTGGGCTGGGTGATATAAATGACACATTAATCGAAAAAGTGAATGTGAAGTGGTTAATAGAAAATCAGTTTTTAGCATCTTACAAATACTATGCTCCTGAAATTGTTCAAACAGAGTCATTAAATGTTAAACGAACTGGCGAATTTGACATGACAGGTCTTGATGATCAATTCAATAAGAAAATGATTTGGGGGGATGTGATTAAACATTATCAAAAATTAGCTAACGAAGAGCAGGCAATTCTTTATGCTAGTTCGATATATCAAAGCGAAAAAATGGCAGCTAGTTTTAATGCAGTAGGCATTTCATCCGCACATATTGACGGTAAAACACCTAAACTCATTCGAGATGACATCATAAAACGGTTTCGAGAAGGAGAAATAAAGGTCCTTTGCAATCTTGACCTTATAGGTGAAGGCTTCGATGTACCGGATTGCTCTACAGTGATTATGCTAAGACCTACACAATCGTTATCATTGTACATTCAACAATCCATGAGAGGTATGCGTTATAAACATAATAAAACGGCTATCATCATCGACCATGTAGGTAATGTAAAACGTTTCGGTCTGCCAGATATGGAACGAACATGGTCCTTAGCACCTCGTAAAGGAAGT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40 | Listeria_phage(97.44%) | portal,tail,protease,capsid,terminase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
57378 : 114213
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_JPTX01000001|57378:114213|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_virus(15.0%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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