Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_030884 | Sulfolobus islandicus rudivirus 3 isolate SIRV3, complete genome | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 2 |
1. NC_030884
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
1192 : 31911
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_030884|1192:31911|DBSCAN-SWA AATGAAAAGACAAGTAAGAGTTGGGAACACAATATATTACGTAGAAAGTGAGGATGATCTAGTTAGCGTGACTCACGAGCTAGCCCGACAGGGCATAAAAATTGAGAAAATAGCGTATTTGTTGGGCGTTAGCGTGCGAAAAGTTCGCCAATATTTGGAGAGTTGTTAAGAAGTTAAGTTTTCTTTTTTTCTTCTTAGTTTCTAATGCTATTTTTTTCTATTTTTTATTTTCTCCTAATTAGCTAAGATTATGCTTAGTTTTTTTCAGGATTGTGATACTAATTCTAAAGGTTGAAAAAATTGAGAGGTGAAAAAATAAAGAGATAGAGAAGTAAAAAGATAGAGAAAGATTTAAATAGCAGAAGATACATAGATTATGTTGGGGAAAGAAAAATGAATTACAAAGAATTAGAAAAAATGTTAGATGTAATATTTGAAAATTCCGAAATAAAAGAAATAGATTTATTTTTTGATCCTGAGGTCGAAATTTCAAAGCAAGAGTTTGAAGATCTTGTGAAAAATGCAGACCCTCTTCAAAAAGTTGTTGGAGACAATTATATAACAGAAACTTTTGAATGGTGGGAATTTGAAAATCAATACTTAGAGTTTGAACTTGATTATTATGTCAAAGATGAGAAAATATTTGTTTTAGAAATGCATTTTTGGAGGAAAATTAGAAAGTAATCCTATTTTTTTAATTTTTTAATTTCATTTTAATTTTCTCTTTTTCTTTTTCTTCTTACTAACTAAAACTATGAACTATTTTTTTCAAAATTGTAATATTATTCCAGTTAGTTGAAAAAATGGAGAGATGAAATGATAAATAAAAATTTAAAAATGTCATAATCTAAAAGAAAATATAGAGGTGAGAAAAAGTATGAATAAAGATATGGAAGAAGTAATAGATACAGTTCAAAGATTAATACAAGAAAATATAATCGGTGAGAAAGTTGTCAGTTTTGAAAATTCAATAGACTTACACATTCAAGAATTCGAATGGGTGATAGAAGTTTTAATTTATGCAGATGTTAAACATTACTGGTTTACTATCGGGCGTGAAAAAAAGAGATATGATATATTTATTTTTGATAATACTAGAGAATTAAAACGAATTATTATTGAAAGTCATTTTAATGTTGAAAGAATTTTTATTGATTCAATACAATTAATTAGATATCCAAGATAATTTTGTTTTTTTCTTTTTTTCTAATTAGCTAATTCTATCTTTAATTTTTTTCAAGTTTGGAATGATAATTCTATTTTTTAGCAATTTCCTAGAATGAAAATTTAAAATTGTCATAGTTTTATCGAAATTTATTAGTGAGAAATATGGGCTATCAAGATATTCCAAATGAAATAATTAAACTAAGCGAAAAATATGTGAAAATTGTCGGAGAAAGAAAAAATATATTTAAAACTTTAAGAAGAAAAAGTATCGAAAAAAAGATAATAGAAAAATTTGAAAAATTTTGTGATATAATTCCATTATATATACTTGAAAATATACTTAAACCAAATAATGTTTTTGAATATAGTTTCGAAAAAAGTTATAAAAACAAAAGTGAGAAAATTGAAGTTATTACTAAAGCTAGACTAAAATTTAAATATGAAAATTATGAATTAAAATTATTAAGTGTTAAATTTGAAAAATCAATTAATCTAATTTCATAATTTTTTTATTAGGAATACTATTTCTAAAAGTTAAAAAATCAGAGAGATGAAAAAATAGAGAGATAGAGATGTAAAAAGATAGAGAAAGCTTTATATAGTAGTTTGACAAATATAATATTGAGGTAAGAAAGATGAGTCAAGAAATCGAATTTCCCGTAAATATAAATTTAGAAAGTCAAGAAGAAAAAATTCAACCGCAAGTCAAGAAGTTATACAAATTTTTTAATTACGTGAGTAACTACCATAATGGGAAAATTGATACTATGACGACTCAAAGTTACCTATATTTATTCGTTAGAGACGGTGCCATTAAGGTTGATTATGATGGCGAAATTTCAATAGAGACGACGGGTCTAAATATTTCAATTTGGGTCAATAGAGTAGAAAAAGAAGTAGAAATTAACGGTAATGCTAATGGATACGAGTTTAATATACAATTTACCGGAAAAGTAAAAGTAAGGACAGAAGAAAATAGACTTGTATTGACGTTAAAGCCTGAGACAATTCCTCAAATTACAACTCATTAATCATTTTTTATTTTCTTTTTTTATTTTCTATTATTTTCTTCTTTTTTATGTTTTTTGTTTTTCTATAATTAGCCAATTCTCTCGATTGTTTTTTTCAAGTTTGTGATACTAATTCAAGAGGTTGAAAATATAGAGACATAAAAAGTTAGAGAGATACAAACGTAAAAAGATAGAGAAAACTTTAAATATTAGTTTTTACATATATAAGAATGAGGTAAGAAAAATGAAAACGAAAATGAGTAAGAAAGAAAACAAAAAGAATAAAGTTTATTTTTGCAGAATGTGTAGTTTTGTAGCTACAGATTTAGATGAGTTAGATTTTCACTATAAGATGAGTCATGAATCATTTGATGAAGACTCTTTTTGGTAAGCTTTAAGTTATTTTATTTTTTATTTTCTCTTTCTAATTCTTCTTTTATATGTTTTTTCTTTTTCTATAATTAACTAATTCTATCTTTAATTTTTCTCAAGTTCGGAATAATAATTCTATTTTTTAGCAATTTCCTAGAATGAAAATTTAAAATTGTCATAGTTTTATCGAAAACATAGTGAGAAAAAAATGGAATTTGAAGATTTAGATGTAGTTCTATATGTATTTTTTGAAAATCAAGAAATGAAAAGTTTTGAATTTGAATTTAAAGAATTATTTGAAATTACTGAAAATGGATTAAGATATCTTGTAGGAGTTCCAGATTCAAGAAATAAAATCAAGAGTAATAGCGAAATTATTGAAGAATTTATATATTATCAGAATGATAATATTGTTATTAAGTTGACATTTTATTATACTAAAGACACGAATAAAATTTATATAAGAAAAATTTACGGTTGGAGAGAGAAAAGATCAGAATCTGAGAATGAAGAAGACAATATTTAAGTATGCTATTTGATTAATTTATTATTCTTCTAATTCAATTTCCAAATCATTATTACTTTTCTTTATATTTTGTGGCTTATTTTTCTTTATTTCACTTGCAATTTTATAGTTTTGAATTATCTCATTAACTAGACTATCTAGTCCCATTTTTTTTAATTTCTTAGCATATATCGTATATTTATTTTCAATATTCCAATTATTATATTTTAAAATCCAAGCATTTATAGTTTGTAAAATTTTTACATTTGAAAGATCATATTCAAATGGAAAATTTGTCTTATCTAAAAATTCATATAATAGTTCTTCTTCTTCTTTTGTTAATGTTCTTTTTTTTCTATCGCCTACATATCTTCTAGAACCATCAAACCAAAAGATCTCTCTGAAACCTGAAATTCTTGTATAAGTTGAAGTATCCATAGAATTAGCATTATCAAAAGTTTGGAGAAAATATGGAGCAGACATTCCTAGAACATGAAGTTTTTTTGTGTATTTTCTTAGATAATAATACCAAGGAAATGTATAGATTAAAATTTTTAATTTACTAGATGCAATTATTCCGCCAAATGCTATATAATCAGTGTATTGTTTATAAAAATCTAAGGCTTCATCTACTTCTCTAATTGGATATAAATGTATAACTGGGATAATTCTTTCTATATATTCAATTTTAGTATATAGATATTCGAAATATTCGAAATTCTTTCTATTTAATGGTTCAAAAATAGATGGAATATCAAGAGAAAAAAATGCATAAGCATTATATGTTTTATATTTTTCTAATACATCTTTTACTGAAATTTTCAAATTGTAAAGGCTAATTTGATAACCGCCACTGTCAACCCAAGTTTCATTTTTCCAAGTTATTTTTTTGTTATGTAATTGATTAATCAAAACTGGAAAATTTGTCTTGAGTAATAGTTCTTTTGATGATGTTATTTCAAATACTAATTTCATATAACTTTCTATTTTGGTATGACATTTATTTTATTTCTTCTTAATAAGTATACTATAGATCCTATTATTGGTATTATTATAATTCTTAATATTGTATCTTCTATATTTCCAGAGATTACAAATTTATAAAATATTGGATTTTGATATCCTAAGTAGAAGAATAGAAATATCTGAATTGCTAAAGATGTTAGAACTATAGAAAATAATTTTTTATCATTCATGAGTTTCAAATATGCAAATGCTACAATTATGAAATTCCAGAAGATGAACAATAAACCATCAAGTCCAAAAGATATATTAAATCCAAGTAGATTTTCTAGAACATTTGCTATTGTTTCTGTCGCAAAAATCAATAATAAAATATTTGGATTTATTTTGCTAAATGTTTCAGGTAATACTTTATCGAAACTCATAGTTTGAATTAATCTACTTTGGATTTTATTTGCAATTGGCATGTAACTAAAGAACCAAATTGGCATTAATGCAAACAATATTGACAAATTTGAATAGCTATCTAGAATTGAAAGTATCACGACTACTAAATAGCTTACAAAATATCCGACCATACTAGATTTTTTAATATTTTTTATTTCTCCAGCTATGTAACTGATTGCATTTATGAATATAAACGCTGATAAATCAAATAGTAATGCAGATAATAAAGTATTAGAAATTGTGAAGTTTTGATATTGAAAATTAAATGATTTAAAAACTATAAATAATGCTACTATTATTTGTGCAATTGCTAATATATCAACAATTTTTGCATATATTCTCTTATTAGCGATAATTAGTAAAACAATAGGAAATAAAGATTCAACAATTAGAAATTGTTCAAATTGATTTTGAATATTAAAGTTTAAGAGTACAAGATCACCTAAGATTGGTTGAGATAGTACATATGTTAACCATAATGAAATTCCAAAAATTGTAAAGAATTTTGAAGAAAATGCAGTTCTAATATATGCATA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>NC_030884|1192:31911|27586_27859_-|YP_009272988.1|DBSCAN-SWA MEFEELKSIIDKFFQDSTIIRINLRFNKEVIASYDQFEEIVKDADLLHRYDDRNIRTDICEYRKNINSIINYYVKDSKVYIVEIDFWRSS >NC_030884|1192:31911|27871_28159_-|YP_009272989.1|DBSCAN-SWA MNLKKVKRIIDMFFKEKNLDELTLAFKRSLILTENEYNELVRRPNLSFIDKDPWITSDEFVYYELSNKVVKLIIHYFKEDGFINILEIDLFREKR >NC_030884|1192:31911|13523_13718_+|YP_009272974.1|DBSCAN-SWA MIFYQYDEKDKTLHVKIYLLIEQVPNKPTEEQLRKVLPKILRDYANMIENGKIKIIDSNEWGTW |
45 | Sulfolobus_islandicus_rudivirus(100.0%) | coat,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_030884.1|YP_009272954.1|1584_1875_+|anti-CRISPR-protein-AcrID1 |
1584_1875_+
Protein sequences of NC_030884.1|YP_009272954.1|1584_1875_+|anti-CRISPR-protein-AcrID1>NC_030884.1|YP_009272954.1|1584_1875_+|anti-CRISPR-protein-AcrID1 MNYKELEKMLDVIFENSEIKEIDLFFDPEVEISKQEFEDLVKNADPLQKVVGDNYITETFEWWEFENQYLEFELDYYVKDEKIFVLEMHFWRKIRK |
96 aa aa |
AcrID1
anti_CRISPR0434|YP_009272954.1|AcrID1|I-D|Verified|Sulfolobus-islandicus-rudivirus-3 information
|
NA | NA | 1192-31911 | NA | ||||||||
| NC_030884.1|YP_009272980.1|16836_17181_+|hypothetical-protein |
16836_17181_+
Protein sequences of NC_030884.1|YP_009272980.1|16836_17181_+|hypothetical-protein>NC_030884.1|YP_009272980.1|16836_17181_+|hypothetical-protein MNKNYLANAFSINMLSKFPIKVTIDKIDRLEFCTNIDNEEIINAIGHDSTVQLINSLCDTKFEKNRIEIKLDKRDKLYIVQISQRLEEGKILTLEEILKLYETGKVQFFEIIVD |
114 aa aa |
AcrIII1
anti_CRISPR3664|NP_666617.1|AcrIII1|III-1|Verified|Sulfolobus-islandicus-rod-shaped-virus-1 information
|
NA | NA | 1192-31911 | NA |