Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP054042 | Listeria monocytogenes strain PNUSAL000009 chromosome | 4 crisprs | WYL,csa3,csn2,cas2,cas1,cas9,DinG,cas3,casR,DEDDh | 2 | 14 | 9 | 2 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP054042_1 | 259479-259640 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP054042_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP054042_1
>1.1|259534|52|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder GATTGGTTGAATTTAATAATTTGTGCTTCCCTTTTCGGGTTGTTCGTCCACT |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP054042_1
The CRISPR arrays of NZ_CP054042_1 >merge|NZ_CP054042|1|259479-259640|CRISPRCasFinder TTTTTTTATGGAAACAACGCTCCACTTCGTTACGCCTTGTATTGGAGTTCTAGGGGATTGGTTGAATTTAATAATTTGTGCTTCCCTTTTCGGGTTGTTCGTCCACTTTTTTTAATGGAAACAACGCTCCACTTCGTTACGCCTTGTATTGGAGTTCTAGGG >NZ_CP054042|1|1|259479-259640|CRISPRCasFinder TTTTTTTATGGAAACAACGCTCCACTTCGTTACGCCTTGTATTGGAGTTCTAGGG GATTGGTTGAATTTAATAATTTGTGCTTCCCTTTTCGGGTTGTTCGTCCACT TTTTTTAATGGAAACAACGCTCCACTTCGTTACGCCTTGTATTGGAGTTCTAGGG
>NZ_CP054042.1|WP_003723352.1|258605_259352_-|alpha/beta-fold-hydrolase MKITPPQPFLFEKGKRAVLLLHGFTGSSADVRILGRFLQENNYTCYAPQYRGHGVSPDLLLKTGPNDWWEDVLEAYDHLKSLGYTEIAVAGLSLGGLFSLKLGFSRPLKGIIAMSTPTRMDSSSPIIQGFLDYVRNYKKLEGKTTEQIDAEMVAYKDAPMNTIAKLKDEISGVVAEIDMIYAPIMVVQGEKDDMVDVSGAQLIYDTVESTKKELHWFKESGHVITLDKERKEVNQAILTFLDSLDWQE >NZ_CP054042.1|WP_003732481.1|256190_258572_-|ribonuclease-R MEQKQMEEKIMNLLTSAPDKTFALEDLEIEIALNNADDFKLMVKALVKLEDSGTIVRSRKNRYALPEKMDLVKGTFRAHERGFGFVLPEEKEMDDIFIPPNEVKDAMNGDLVFATITKRKGDNLAEGTIKKIVERKTTQIVGTYMEDLAGTPIVMPDDKRLFGEVEIDLEDGLKPVDGHKVIVELTEYATGHARARGVVKSIIGHRNDPGVDILSIIHKHGISIGFPEEVMEQVSKAPDVVDDSDIGNRRDLRDQMIITIDGADAKDLDDAVTVKQLPNGNWKLGVHIADVTHYVTEGSPLDIEAQERGTSVYLVDRVIPMLPHKLSNGICSLNPQVDRFTMSCEMEINQEGHVVNHEIFESIIKTTERMTYTDVNDILVEKDEALREKYAPIVPMLEAMQNLAEILRRKREKRGAIDFDFKEARVVVDEDGHPEAVVMRERSAGEHLIEEFMLAANETVAEHFHWMDVPFIYRIHEDPKEDKLARFFEFITNFGLIVKGTANDIHPAALQQVLEEVKGKPEEMVVSTVMLRSMQQAKYDTVSAGHFGLSTDFYTHFTSPIRRYPDLIVHRLIREYLINGDVRPETLEKRAEELPEIAEHSSKMERRAVEAERETDELKKTEFMVDKVGERFIGIISSVTNFGLFIELPTTIEGLVHVSAMKGDYFKFHQNQLAMIGERTGQIYRIGDEVEVEVTKVDVDAREIDFALRSEGKPGPVSDKQKRQREKPIDKTRNFKSSSKNNRNKRRTGKSEDVKPKTERKDDEWYTKPKKKKKKKPFYQGVAKESPKKKKRR >NZ_CP054042.1|WP_003723350.1|255710_256175_-|SsrA-binding-protein-SmpB MPKGDGKLVAQNKKARHDYAIEETFEAGIVLQGTEIKSVRNARVNLKDSYARIDKGEIFLHNMHISPYEQGNRYNHDPLRTRKLLLHKKQISRLIGETKESGYSIVPLKMYIKDGYAKVLIGVARGKKKYDKRQDLKQKEAKRDIERAFKERQQ >NZ_CP054042.1|WP_003732480.1|254746_255655_+|Rgg/GadR/MutR-family-transcriptional-regulator MQNIGDTLKFIRKSKNLTQQETCTNALSRSNYQKIENNKIMPSMDRFIQILLNFNMTLEEFEFVKRDFTPSPKENILYLYSKIITSSETDILLDVISKCDDYLANQNDIFISDIKASLEGILLAEKEHNFELAREKVAYIWDRLSEADELFWNDILILRNIFFIFENETAQHIVNRLISQLKKYRYLYPTLSIEISLHVNRATYLILDEEYELALHYIELSIKIAKHNHYYLQFCMAVAKKGIVLYKLDQKQQGKHFMQRALRVAKVLEEERILNGIKNEIDYFLHDELQDLSLNEFTKIDI >NZ_CP054042.1|WP_010989995.1|251088_254364_-|carbohydrate-binding-protein MKRRTRKCSLVFILGILIFSCLSGFGTNVFAMDGEYHSPYGDDDLYTVQPTERSPRDPKAGEDVILNITTWPIENGQDVWVEWTKNGVAQENVTAAYDYNSGNNTYWKADLGKFEKGDEITYTTKGSTNGGTAYESGPFTFYVTDWEYVQDVTSVVDNGDSITLNMTATAGDFSPKLYLSFEDLDTLRMELSPTGKETGHAGKSGYTVEDTAEKVTVTTEDLSIEIQKSPYRMEVHQADGTLLTSEYTTANSLGWLTDGKNVINQYQNNFMTPSDEAFYGFGERYDTINQRGKDVETYVYNEYQDQAQTERTYLAVPFFVSANKYGMYVNSDFHSQFQMASKVEDKYSFVLDNDGDMTNMLDYYVISGKDQNDIVNNYTDITGKTTLLPKWAFGLWMSANEWDRESDVSSALSNAKANDIPATGFVLEQWSDEETYYIWNNATYTAKKNGEAFSYDDFTFNGKWTDPKGMVDSVHDAGMNIVLWQVPVLKDDGTVYEQRDNDEEYMISQGYSADDGTGAPYRVPASQWFGNGILLDFTNKDAVDWWTSQREYLLTEVGIDGFKTDGGEMVWGRDTTFSNGEKGQEMRNRYPTDYVSSYFDFAKSINPEAVSFSRSGTSGAQKSGIYWSGDQTSTFDSFQASLKAGLSASTSGVSYWAWDMAGFTGDYPTAELYKRATAMAAFAPIMQFHSEKSDPSPSEERSPWNAVARTGDETILPTFQKYLYTRMNLLPYIYTAAKDTADNGKSMMRQMAMDYPEDVNARDLDEQYMFGDDLLVAPIVQEGQTEKEVYLPEGEWVDIWNGGVHPGGETISYYADVDTLPVFAKAGAIIPMNMTDGYQLGQNVGNDLKSYDNLTFRVYPSGDSEYSFYDDVNGGEMRDISVSEDFANEKVSVDLPAMADETTMQVFSTEPTSVTIDGADVAKADTLDAFNEATTGYYYDTVQNLTYVKAAAKDAKQAIVLNGVNHAPYEAEFGHLTNVTTASDHAGYTGTGFVAGFDAEKEAVEFDIDAVDGASDYTMEVRYSAGVEDATRTVYINGKKQQITLPKTANWDTWNTVEVPVTLQAGNNQVVFDFEADDTAGINFDHVVIKK >NZ_CP054042.1|WP_003732478.1|250084_251029_-|lmo2445-family-class-3-internalin MKKIIGLTFVAICCILFAPTIKAQADTVPLPAPIIEAFPVEAIAEAIAGELDKDSVNDTITQADLDTMTAIPLPSLGLTGEDLSVLNNEVFTNAIELAIWSNNIGELPDLSEALPALENIEANGANITVFPDANYPNLTNVDLSQNNFGFNIPKFVGMEGLVSINMENAGLSGYIAEDIWMNMPNLDSLILNENHLISIPEDIFLSQQLGTHSFANQTATYPPTTIKQGENLKVFVPFIYQALDFIAPSNHDLIIIKDNGRTLYEPPYPTYDGSYMYTIETAGLQPGEHLLEISLGYNSGEYTGWYDFPVTITE >NZ_CP054042.1|WP_025997732.1|246137_250070_-|DUF5110-domain-containing-protein MKKGMKQVCVSLAVVPLVWLNLGITQPLQVEVKAEETKKKETQKKANTETAKQLSKEEYAKLSAEEGLGNVLEATVTDNVITLKIDNGDEAEDDYLEISPLANNLLKVNLRPRNIENSPSTPMIDPNATFTAIGATIDLESDPMIISTDECTLEIDKEPARMTFKDKNGKTLLSESADGGIFDGGVRFKRGASDHVYGAYGISFSDGDLGMERDDTAADSNKTAQAGQQGNAGGPFMWSTAGYGLLVDSDGGYPYSVSDEEKLEFYYGDTIVEGRRYVKENVEMYLMSGEPEEIMSSYADVTGHTPMMPKWSLGFSNFEWGTNEEEFRENINTYRAKGIPIDSFAFDYDWKFYGDPTYGGDYGEFAWNTENFPSAKDTTLKSDMDALGVKMIGITKPRVVTNLEDGTATQQGKDADANGYWYPGQSAYEDYAFPVTVRSIDPYNADERNWWWSHSEDALDKGIVGWWNDETDKVSSNGADYWFGNFTTGFTSEAMYEGQRDYTNERVWQTGRTFYPGAQRYSTSTWSGDIGVQWKKGEVIDWANGMQEQPSTMLSTINLGQTKWGMDTGGFNANSGQVLNPDPELYSRWMEFSSLVPVFRTHGNQNQQRQPWFYGGTAEEVAKSSMTWRYSMIPYMYAYERQAYDSGVGLVQPLTFDNPTDENVVNLTDEWMFGDGLLAAPVLEEGAGSRDIYLPAGTWIDYNRGDVYEGNQTINYEVNDDDWTDVPMFVKQGAIMPMQQPQNYVGETAVKTIYLDTFASDKETSFTHYDDDGKSFDYEKDTYLKQKMTTSKTADTSTFTIGAKEGSYKADTENYIVKLHGNAAESVQVNGADSKVYDDLSALENADGSGYAVGSDVYGAVTYVKVPAQADADTVITTSGSASIVQTGTYEMETGSNFADTVADKPVAEKTYVDGYDKDGAGTTIYANVKDSGDYNVDLTYKNASSDNQALSIFVNGEYVKQTTLKPNTDWSVQSEALPLSAGKNSISYKVVTDTGDKADQVSLDKVNIGFTPTVAKVEAEEADLAGTLKVANDHWFYSGEGFVGGFGTAGDEIKFEVDVPADGEYVLNTRTANGTGMPQTLDLYTNGDYNSRVTFPSKGENWNIWSDTEKAVNLKAGTNKITFLRDGETTGNVNIDRILVSAEPINSPVQSEVNLLDNGGFERDAAATTNWVESHPDGQDKAYGVDSGSGVNPPESPAFGKQSAYFYLPGAYKQTLAQQIAVPVNNANYDVEAWVKVSKDDAAKAQMTVNNYDSSGGKTIDLVADDVWHYVTIKDVKVTKGNINTSFQMDSPGGTSIHIDNVRVMPSAE >NZ_CP054042.1|WP_003732476.1|244768_245188_-|hypothetical-protein MYRLLSIAFFGIAVICLLFPWMSSGIDAATFELVYEPAYKLIWMQPIIIVGYLGFLCTIFIPKFQRGKNRIVPFIGILILVLGLLNLAVRPLFGFDSFNFSIIDAYVSELVEPAFLIAVSASILSLIMYAIYLKKSENL >NZ_CP054042.1|WP_003723344.1|244023_244593_-|YdcF-family-protein MRSLRKIVIILIIIGFMYLLIVAAFMFSGSRTKPSENADTVLILGAKVKGNPAVPSLVLQERLDAAVAYLNEYPKAKVIVSGGQGADESATEASVMEEYLVNEGIARKRIETETKSKRTEENIKYSNAKFNLGKTVIVTSDYHMYRALMLAKRQGIDASGLPATSQTFAKYKGMMREVLSITYAWVFDH >NZ_CP054042.1|WP_003732475.1|243082_243979_-|YafY-family-transcriptional-regulator MKLERILAILVMILERKVLASELAEKFEVSTRTIYRDMDTLLYAGFPVVALPGKNGGFTMLDTYKLATFTFSEAEKQILLEALEARSEFMLNDSQEILREKITLLQTEKPTSKHIFFDSATQHRQQIEAEVKRKIAYIQKAFTTNKQLEITYIAMSGAETTREISPQKLNLMDGSWYLEAYCHKRAAIRHFKLTRITSLKEIDKAIMEVEETEYQPAEMKRIVLEFPKNQLGKLLDYFLQEEMETGDDYVRVSFFYDLERNIIPFLLMFGSAVKILEPASLQKDYKSEVEKLYFNLNC >NZ_CP054042.1|WP_003727926.1|259714_259948_-|preprotein-translocase-subunit-SecG MSTVLTVLLIIVSVLLITVIILQPGKSAGLSGAISGGAEQLFGKQKARGLELILHRTTIVLSVVFFAILIALAYFVQ >NZ_CP054042.1|WP_003732482.1|260047_260791_-|alpha/beta-fold-hydrolase MSADRSFTLKAGNRAVLLLHGFAGTTEDVRELGEILAENGYTVHAPNFRGHGDEPAIFLKTTPEMWYEDAVAGYRQLEKDGYDEIAIVGVAMGGVFALKMAESFSPKAIVPLCANVNRKMRYIPIENYLTKQLKKQGIVEQEADQMLKNYLPEIDVMTEARATFYKNVARDIEKIHVPTMIGQGCQDEEIDADNANYIFKHIHTNDKQLCFYAGSGHDIVNDCEKDILEEDLIYFLDDLVWLEEKVV >NZ_CP054042.1|WP_003727924.1|260973_261693_-|alpha/beta-hydrolase MIAEINGINLFYQIIGKGEPILLIHGNGQNHRSLKRMIDDLSTNHQVIAVDSRAHGKSEAGNTPLDFEVMALDMLSLLDYLKIDKYKVIGYSDGGIVALVMGKMQPNRQIASVVIGTNYHVNQIRFLPDLFCRVAYGAAFLLAPFSRFFERMKRQLALTIYHPHMSEADLQKISAPLLAVVGEYDLISSKDTKKMVHSVQHGEMVIVRNGLHYLPRQKPKQLLQLIHSFFSNLSAEIHK >NZ_CP054042.1|WP_003772391.1|261825_261999_-|hypothetical-protein MLMKVKNSQASKVLETPKIKDAVVHEKSHPLAEKHSVQKKIINADMPQQQFHRRLMK >NZ_CP054042.1|WP_003727923.1|262101_263394_-|phosphopyruvate-hydratase MSIITEVYAREVLDSRGNPTVEVEVYTEAGAFGRALVPSGASTGEYEAVELRDGDKARYLGKGVLKAVENVNDIIADKIIGFDVTDQIGIDKAMIELDGTPNKGKLGANAILGVSLAAARAAADELGVHLYEYLGGVNGKVLPVPMMNILNGGEHADNNVDVQEFMVMPVGAPNFKEALRMGAEILHALKAVLKGKGLNTGVGDEGGFAPNLKSNEEALETIMQAIKDAGYKPGEEVKLAMDAASSEFYNRETGKYELKGEGVTRTSEEMVTWYEEMITKYPIISIEDGLDENDWDGFKLLTERIGDRVQLVGDDLFVTNTTKLKEGIEKGIANSILIKVNQIGTLTETLDAIEMAKRAGYTAVISHRSGETEDSTIADIAVATNAGQIKTGAPTRTDRVAKYNQLLRIEDNLADLAEYHGNDTFYNLKK >NZ_CP054042.1|WP_003732483.1|263529_265062_-|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase MSKSPVAIIILDGFGKRAETVGNAVAQANKPNFDRYWANFPHGELKAAGLDVGLPEGQMGNSEVGHTNIGAGRIVYQSLTRIDKAIEEGEFQENKALNNAFTHTKENNSDLHLFGLLSDGGVHSHINHLVALLETAKDKGVKNVYIHAFLDGRDVAPQSSLEYLETLEKAISDLNYGAIATVSGRFYAMDRDKRWERVEKAYKAIVSAEGEKFEDPIELVKASYANDKNDEFVVPAIITKDGKPVATVKDNDAVIFFNFRPDRAIQLSNAFTDKEWDHFDRGADHPKNIKFVTMTLYNPSVDAEVAFEPIEMKNVIGEVLSNEGLAQLRIAETEKYPHVTFFMNGGRNEEFPGESRILINSPKVETYDLQPEMSAYEVTDALVEDIKNDKHDAIILNFANPDMVGHSGMLEPTIKAIEAVDENLGRVVDLILEKGGSAIIFADHGNSETMSTPEGKPHTAHTTVPVPVIVTKKGVTLREGGRLADVAPTMLDLLGVKKPAEMTGESLIQK >NZ_CP054042.1|WP_003732485.1|267189_268200_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MTVKVGINGFGRIGRLAFRRIQNVEGIEVVAINDLTDAKMLAHLLKYDTTQGRFDGEVEVHDGFFKVNGKEVKVLANRNPEELPWGDLGVDIVLECTGFFTAQDKAELHIKAGAKKVVISAPATGDMKTIVYNVNHETLDGTETVISGASCTTNCLAPMAKVLEDKFGVVEGLMTTIHAYTGDQNTLDAPHPKGDFRRARAAAENIIPNTTGAAKAIGEVLPTLKGKLDGAAQRVPVPTGSLTELVTVLDKKVTVDEVNAAMEAASDPETFGYTSDQVVSSDIKGMTFGSLFDETQTKVLTVGDQQLVKTVAWYDNEMSYTAQLVRTLEYFAKIAK >NZ_CP054042.1|WP_003732486.1|268233_269280_-|sugar-binding-transcriptional-regulator MSDLINIQKKLLPDVLMIMQKRYQILRSIYFSEPVGRRTLAGMLGMSERVLRGEVEFLKAQGLVEIASSGMTVTKEGLVVFRDLESVMNQLSGLHSMEEQLAKKLQIKKCLVVQGDSDDTPWVREEMGRVAVEQLDMALTEKRNIVAVMGGSTMATVAEMMTTDFAKGRELLFVPGRGGIGEDLDNQANTICDKMATKTNTKHRVLYVPEQLGEEAYRSLLKEPAIQEGLRLVQSANAIILGIGDALAMAKRRHTGEDVLEKIIHRKAVGEAFGYYFDEQGEVVHKVPTFGLQFEDLAQIPHIIAVAGGTSKAKAIKSYMKSAPKNTILITDEGAAKSLLKGSNTLLK >NZ_CP054042.1|WP_003732487.1|269722_271066_-|RNA-polymerase-factor-sigma-54 MRLESNFVQKQQQKQSQKLNMTQQLSQSIAMLQFATADLVAFLEDKALENPLIEVIPGSDFATDFSYSSRKSAGSSDDTDWLEQIADNKMTLADALKEQLHLMDVTQTQKIIVLYLIESLNDNGYLQIDLKDVSAALLMDDSSVLEGLEILQSMEPAGVGARDARECILLQIERSPDAPYIAYDVIQKFFTEFAEKKWKKIASEMDVSLQDIQEVSDYIQTLNPKPGSEFESERVQYVVPDLILLQHEDEFAVSLAKQFLPQVRFQEAYYETMRATEEKDVAQFLREKAGEFDWIKKGIEQRESTLQRVGEAIVSHQKAYFLDNSAHLQPLTLKEVAEELGVHESTVSRAVNGKYMETTNGVYELKRFFASGLQKKSSENENIGDISSTTIKKLVQEFVAAEDKLKPLSDQKIVDMLAEKEIQVSRRAIAKYRLELNIPSSSKRKRF >NZ_CP054042.1|WP_003732488.1|271224_272151_-|membrane-dipeptidase MRVIDTHCDALYKLQAGKGKYTFQDAEELDVNFERLIEAKMLLQGFAIFLDEDIPVEHKWKKAVEQVNIFKQHVLHKGGIIHHVKKWCDLENLPEDKIGAMLTLEGIEPIGRDLDKLTQLLDGGVLSVGLTWNNANLAADGIMEERGAGLTRFGKDIIHLLNERKVFTDVSHLSVKAFWETLEQAEFVIASHSSAKAICAHPRNLDDEQIKAMIEHDAMIHVIFHPLFTTNDGVADIEDVIRHIDHICELGGMKNIGFGSDFDGIPDHVKGLEHAGKYQNFLETLGKHYTKEEVEGFASRNFLNHLPK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP054042_2 | 499856-500816 | TypeII |
II-A,II-B
Consensus repeat of NZ_CP054042_2
|
14 spacers
spacers of NZ_CP054042_2
>2.1|499892|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT TTCGTCCAATGTACCTCGCCTTTTTTGTCT >2.2|499958|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCGAAGTAGGTTAGGGTATCGCCGATTTT >2.3|500024|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGACACATCGAGTCGTCCGGTTTTACTTAC >2.4|500090|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGAAAATCCGCAATCAATCCAAGCAGAAAT >2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGAATGTGTAAGCTTCTGAGTAACCTAGCA >2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAACCTTTAAAATTAAATTGAAGGTGCGGA >2.7|500289|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACAATTGACCGGGAATTCATCAATAATTA >2.8|500355|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCATATATTATGAATATCGAGATAGTGTTC >2.9|500421|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTTCTATTTTGGTGACTTTAGTACTTTT >2.10|500487|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGGGAATGCCATAGTTATTACCAATATTG >2.11|500553|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTCGATCTATCGGACGTGTCGACATTAT >2.12|500619|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTGACTCGGAAATGAAAACAAAAGGTCA >2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACATCGCTACCAATCAATCCGCTATTAAG >2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCTATATTATCATACGTCAAGGAAGGGTA |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP054042_2
The CRISPR arrays of NZ_CP054042_2 >merge|NZ_CP054042|2|499856-500816|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTGTGTTGATATTCAGAATAATATAGCTCTAAAACTTCGTCCAATGTACCTCGCCTTTTTTGTCTGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACACCGAAGTAGGTTAGGGTATCGCCGATTTTGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACCGACACATCGAGTCGTCCGGTTTTACTTACGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACAGAAAATCCGCAATCAATCCAAGCAGAAATGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACTCGAATGTGTAAGCTTCTGAGTAACCTAGCAGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACTAACCTTTAAAATTAAATTGAAGGTGCGGAGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACAACAATTGACCGGGAATTCATCAATAATTAGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACTCATATATTATGAATATCGAGATAGTGTTCGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACGTTTTCTATTTTGGTGACTTTAGTACTTTTGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACATGGGAATGCCATAGTTATTACCAATATTGGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACTATTCGATCTATCGGACGTGTCGACATTATGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACTATTGACTCGGAAATGAAAACAAAAGGTCAGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACTACATCGCTACCAATCAATCCGCTATTAAGGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAACATCTATATTATCATACGTCAAGGAAGGGTAGTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC >NZ_CP054042|2|2|499856-500816|CRISPRCasFinder TGTGTGTTGATATTCAGAATAATATAGCTCTAAAAC TTCGTCCAATGTACCTCGCCTTTTTTGTCT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC ACCGAAGTAGGTTAGGGTATCGCCGATTTT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC CGACACATCGAGTCGTCCGGTTTTACTTAC GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC AGAAAATCCGCAATCAATCCAAGCAGAAAT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TCGAATGTGTAAGCTTCTGAGTAACCTAGCA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TAACCTTTAAAATTAAATTGAAGGTGCGGA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC AACAATTGACCGGGAATTCATCAATAATTA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TCATATATTATGAATATCGAGATAGTGTTC GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC GTTTTCTATTTTGGTGACTTTAGTACTTTT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC ATGGGAATGCCATAGTTATTACCAATATTG GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TATTCGATCTATCGGACGTGTCGACATTAT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TATTGACTCGGAAATGAAAACAAAAGGTCA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TACATCGCTACCAATCAATCCGCTATTAAG GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC ATCTATATTATCATACGTCAAGGAAGGGTA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC >NZ_CP054042|2|1|499856-500816|CRT TGTGTGTTGATATTCAGAATAATATAGCTCTAAAAC TTCGTCCAATGTACCTCGCCTTTTTTGTCT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC ACCGAAGTAGGTTAGGGTATCGCCGATTTT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC CGACACATCGAGTCGTCCGGTTTTACTTAC GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC AGAAAATCCGCAATCAATCCAAGCAGAAAT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TCGAATGTGTAAGCTTCTGAGTAACCTAGCA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TAACCTTTAAAATTAAATTGAAGGTGCGGA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC AACAATTGACCGGGAATTCATCAATAATTA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TCATATATTATGAATATCGAGATAGTGTTC GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC GTTTTCTATTTTGGTGACTTTAGTACTTTT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC ATGGGAATGCCATAGTTATTACCAATATTG GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TATTCGATCTATCGGACGTGTCGACATTAT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TATTGACTCGGAAATGAAAACAAAAGGTCA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TACATCGCTACCAATCAATCCGCTATTAAG GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC ATCTATATTATCATACGTCAAGGAAGGGTA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC >NZ_CP054042|2|1|499922-500816|PILER-CR GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC ACCGAAGTAGGTTAGGGTATCGCCGATTTT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC CGACACATCGAGTCGTCCGGTTTTACTTAC GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC AGAAAATCCGCAATCAATCCAAGCAGAAAT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TCGAATGTGTAAGCTTCTGAGTAACCTAGCA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TAACCTTTAAAATTAAATTGAAGGTGCGGA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC AACAATTGACCGGGAATTCATCAATAATTA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TCATATATTATGAATATCGAGATAGTGTTC GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC GTTTTCTATTTTGGTGACTTTAGTACTTTT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC ATGGGAATGCCATAGTTATTACCAATATTG GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TATTCGATCTATCGGACGTGTCGACATTAT GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TATTGACTCGGAAATGAAAACAAAAGGTCA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC TACATCGCTACCAATCAATCCGCTATTAAG GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC ATCTATATTATCATACGTCAAGGAAGGGTA GTTTTGGTAGCATTCAAAATAACATAGCTCTAAAAC
>NZ_CP054042.1|WP_003723646.1|498967_499330_-|hypothetical-protein MKKTSIIFIFCALLLTACSTTTKEIPRQTTEATGTIEQVETESILIKNFKIKNDNNTPELSVRFHISEKYHDETGNKIKRTELNKNDNIKIILTKDFQIQETSPAQIDPKYVQKIILLNK >NZ_CP054042.1|WP_003733025.1|498422_498845_-|MerR-family-transcriptional-regulator MNIKQAADLFGLTVDTLRYYERVGVIPPVHRNESGYRDYKTSDLNWVYLVKNLRNAGLSVESLIEFATLAQLRETQNVEAAQKQVLVDQLKELDEKLAEMKKVRELLVYKIDSYDSHIAQFKAGELNADNVEKLWERDKF >NZ_CP054042.1|WP_031668145.1|497549_498401_-|aldo/keto-reductase MKTVKLNNGVEVPILGFGTYQITDVAEAEQAVKDAIKAGYRHIDTAQSYMNEEAVGRGIAASGVDRKELFITTKIWVENVSYKGVMSSFDRSLKRLGLDYVDLLLIHQPFNDVYGAWIAMEELQASGKIRAIGVSNFSPDRVIDLAAFNEVTPQVNQIEVNPFQQQAANLAVLRKEGVAIEAWAPFAEGKNDVFNNPVLTKIGAKYGKSAAQVILRWLVEQDIIVLAKSVKPERMAQNLAIFDFELTEADKEEIAGLDQGESQFFSHADPEMVKWMASRKLNV >NZ_CP054042.1|WP_003733023.1|495981_497508_+|GW-domain-containing-glycosaminoglycan-binding-protein MDRKFIKPGIILLIVAFLVVSINVGAETGGSRTAQVNLTTSQQAFIDEILPAAQDGYRDGKLLTSVTLAQAILESNWGESGLSQNSNNLFGIKGTYKGKSVSMGTMEASGSTTANFRVYPSWKESIEDHTALITENARYQDAVGETNYRKALQAIKDGGYATDPDYVSKLVAIIERYNLDKYDVIYDKIESNQSLAAIGTVAENKEQEVIWSAPYNTENANKIETLENYSGRNLEISWEAKTEKGLWYFIRENNKDIGWVNSNALKISYHQKEDENVHLTKYVDDLSAHVYRLPSPEKQFDNGTIAKYDRKALQVDKKITRGGYAWFRISEGEKVIGWVRADKLNDRLYDRITEQTSYDGYALVSKSATDNVWTAPFNTKNAEKLAPLADYNNEKLEIVTRAKAGNTLWYQFKVDGKLVGWASEKDLNVFYTPAKEEPVKQVAYVKDPTAKLYNKPVESTSTNPKAVGFYYGKLLAVDKTATILGEDWLHLKDSQNSLGWIKAIDINS >NZ_CP054042.1|WP_003733022.1|494684_495713_-|Mrp/NBP35-family-ATP-binding-protein MLNEQQITRLLYRLQDPVLEASLEETEGVLEVQVLEETANIKIALADPAVETDHFVHNIEELLTQFGVNEINIELEYLPAAVIDRIFQARDNILSEASETKFLAIASGKGGVGKSTVSANLAIALAQQGKKVGLLDADIYGFSIPVLLGTTESPHKENGQIIPVETHGIQMISMDFFVEQGEPVIWRGPMLGKMIKMFLEEVRWGKLDYLLIDLPPGTGDVALDIHTLIPKCNELIVTTPHYAAASVASRAGYMAAKNNHKIIGVIENMSYLTLADGQVLKVFGQGGGEKVAADLETQLLIQLPIEQPEPNGNGYVSALFNSSSTSGKAYKTLAEKIIPYLS >NZ_CP054042.1|WP_060579674.1|487792_488956_+|site-specific-integrase MASYVSLGNNKYELRVSKGYDARGKQIRKTKNVTAKTVKALKLELSNFEAYVYSSDYTEIKDMRFIDFVEKWRINYAKRELKGNTIDKYNLFLDNWIIPYFERKKISKITTMQLLDYFHEVQKKGVSSSALEGHHRVIRSLFKYATLWGITETDVSLSVKKPTYKVPEKNIYNRREIEVLIDRIKILQKYQQVMIKLALYCGLRRGEVIGLTTKDMNYNKNTINVYRAVIKSASEGIKLDETKNKRKRIVPAPAGLMEEIKELAKEKQKNKDKLGLLWKGTKDLDGKTVILIFSHDDGTPFTPASVTRMFNRFLEKEENNDLTKISFHDLRHSAASFLLEQGINVKVIQNILGHSDIKVTLNTYAHITEDGYSEAAKTFDNFYKSSK >NZ_CP054042.1|WP_003731435.1|487080_487731_+|hypothetical-protein MIALFVLAGLFIFIGIIILAASQLPGIALVEFAFAALFIWLALRIKRKKGTYVKFDTKTIPENSPQIKLNFGLAQQDLGFQIKSAAGTNYNMIQLIPSNKIIFLSKNGLVTNDEFYFVDYKWLGATYNTHTKTNSKAGKTIAGGVVGGLVGGGAGTVVGAVAGSSGKTNSTSTQIENKSKAIFYFYNKTKDIDLVTELNITSKDIVKLERFVKYVK >NZ_CP054042.1|WP_031290773.1|486858_487026_+|hypothetical-protein MKTLDELNVQHDIVILEHEFTSCSFALKREIFIVIDSRLSRSEKLEDIARLLNKI >NZ_CP054042.1|WP_060579672.1|486225_486702_+|XRE-family-transcriptional-regulator MFGNRLKQLRKNNNKTQEDISKILGISRGAYSHIENGRNEPDMETIVKLANIFGVSTDYLLGRSSNSFIDTIAAHIDSNATEEDIKEILAYIEEKRKDHVNEEEINITEIASKEDDAVDKFVEENEDFKAVAARVMNDAEAVKAVKSFIEFYEQQKNN >NZ_CP054042.1|WP_060579670.1|485841_486063_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MRLSFKEKRNKAGLTQRELGIAVGLAEISIRKLENGERDPSINTAVKISKALNSNMEEIFPDIFLDISDTKCI >NZ_CP054042.1|WP_003733026.1|500944_501607_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MNFNFKLLDEPITIEDSTIFVIEDVRVFANVAKLFYQYDETEELKVFNTKQHPLKSSELMLVTDILGHDINSAATLKLIYTDLEQQLNEKPEVKSMIDKLTATISELIGYELLEHELDLEEDEITVIELFKALGIKIETKSDTVFEKLIEIVQVYKYLSKKKLLVLINVCSYLTEEELLELRRYISLYQVKVLFIEPRKIKGSPQVTLDPDYFLHVENSV >NZ_CP054042.1|WP_003733027.1|501596_501938_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSYRYMRMLLMFDMPTDTAKERKAYRQFRRFILSEGFIMHQYSVYSKILLNGTASKAMLARLKQQNPKKGLITLLTVTEKQFARMVYLSGEQNKSVGNSDARLIFLGDAIDEF >NZ_CP054042.1|WP_031668146.1|501934_502801_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRTVVVNSHSKLSYKNQHLVFKSAYQHEMIHLSEIDVLILETTDITLTTMLINCLVAENILILFCDDKRLPIGKVLPFYGRHDSSLQLSKQLGWDSELKSEVWTEIISQKILNQNTFLSMLNYDEKADSLIKLHETLEIFDPTNREGHAARIYFNQLFGNDFTREQENDINSGLNYGYTLLLSIFARELVKSGCMTQFGLKHSNQFNDFNFASDIMEPFRPLVDQIVYEKRNEDFQVIKRSLFELFNKQFDYNDQHMFLTNIASDYTKKIVKVLNEEREGVPEFRI >NZ_CP054042.1|WP_003733029.1|502801_506806_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKKPYTIGLDIGTNSVGWAVLTDQYDLVKRKMKISGDSEKKQIKKNFWGVRLFEKGETAAKRRMSRTARRRIERRRNRISYLQEIFAIQMNEVDDNFFNRLKESFYAESDKKYNRHPFFGTVEEEVAYYKDFPTIYHLRKELIDSQKKADLRLVYLALAHIIKYRGHFLIEGALDTKNTSIDEMFKQFLQIYNQVFANDIEEASLKKTEKNQEVAQILAEKFTRKDKLDKILSLYPGEKTTGVFAQFVNIIVGSTGKFKKHFNLHEKKDINCAEDTYDTDLESLLAIIGDEFAEVFVAAKNAYNAVVLSNIITVTDSTTRAKLSASLIERFENHKEDLKKMKRFVRTYLPEKYDEIFDDTEKHGYAGYISGKTKQADFYKYMKATLEKIEGADYFIAKIEEENFLRKQRTFDNGVIPHQLHLEELEAILHQQAKYYPFLREDYEKIKSLVTFRIPYFVGPLAKGQSEFAWLTRKADGEIRPWNIEEKVDFGKSAVDFIEKMTNKDTYLPKENVLPKHSLCYQKYMVYNELTKVRYIDDQGKTNYFSGQEKQQIFNDLFKQKRKVKKKDLELFLRNINQIESPTIEGLEDSFNASYATYHDLLKVGMKQEILDNPLNTEMLEDIVKILTVFEDKRMIKEQLQQFSDVLDGTVLKKLERRHYTGWGRLSAKLLVGIRDKQSHLTILDYLMNDDGLNRNLMQLINDSNLSFKSIIEKEQVSTTDKDLQSIVAELAGSPAIKKGILQSLKIVDELVSVMGYPPQTIVVEMARENQTTNKGKNNSKPRYKSLEKAIKEFGSQILKEHPTDNQELKNNRLYLYYLQNGKDMYTGQELDIHNLSNYDIDHIVPQSFITDNSVDNLVLTSSAGNREKGDNVPPLEIVQKRKIFWEKLYQGNLMSKRKFDYLTKAERGGLTEADKARFIHRQLVETRQITKNVANILHQRFNYKTDGNKDTMETVRIVTLKSALVSQFRKQFQFYKVREVNDYHHAHDAYLNGVVANTLLKVYPQLEPEFVYGEYHQFGWFKANKATAKKQFYTNIMLFFAQKDRIIDENGEILWDKRYLETVKKVLGYRQMNIVKKTEIQKGEFSNVTPNPKGKSNKLIPRKKDWDPIKYGGFDGSKMAYAIIIEYEKQKRKVRIEKKLIQINIMEREAFEKDEKTFLEEKGYHQPKVLIKVPKYTLYECKNGRRRMLGSANEAHKGNQMLLPNHLMALLYHAEKYEAIDGESLAYIEVHRALFDELLAYISEFARKYTLSNDRLDEINMLYERNKDGDVKSIAESFVSLKKFNAFGVHQDFSFFGTKIERKRDRKLNELLNSTIIYQSITGLYESRKRLDN >NZ_CP054042.1|WP_003733030.1|507330_507819_-|hypothetical-protein MKEDILAVYKKFEINNLNMFFDDLIEYVNKYYTVFSKYISLDYLDAITRLDSTSLILGHSDDNFEIAIPFYTNKVIEGLNEEELSNQVSSLIWDLSAYMTEELCPSCNDSNLRLTTMVSREDTLVKFCDECLYTGIRNERVEIEEDLVPAPKKKVEEYLRGK >NZ_CP054042.1|WP_003733031.1|507828_509214_-|hypothetical-protein MSRIDIAELNEFLHNLKSSNDEARRMLGKMQEVTNAYATDTSLKGKAIETSQAYFDQTYSVICKSLIEALDESEERLERYIREFGEQVDSSYNARIDAEMLQEAIFRLAEIKRKQEDLLQRMSASTGTLHEGEQQRLRTQFTDALEQEKILERYIAFEQSHGRFFDSFSELVYCAGKAVRELAANVTFNSQTGTYDIGKLDTNKFHALQKFLPKKKKYNFNEYEIRWNGAAHILLRGDVVDAEATAAYNDAVAKGELPKVSNQATESAEEINAVVNALKKGQDPITGQEISKAQSFGIAIGLVYMYVGGKYKGRKIKLPKNALENLEKQQAFKDKEVGGADIPNPNVGIVQSRVNLAENPTRFSPSKNAGMKHVRNRHYNPSKNAGQFTIPESDLKNILQSKQVVNTPVKQIESGDFERVIDIGKNMGTVKPSLGGQTTTWIKVITDKAGNIITTYPVPKP >NZ_CP054042.1|WP_003723652.1|509505_509898_-|30S-ribosomal-protein-S9 MAQVQYYGTGRRKSSVARVRLVPGDGKIVINNRDWEDYIPFAALREVIKQPLVATETLGNYDVLVNVHGGGYTGQAGAIRHGVARALLQVAPEYRPALKSAGLLTRDSRMKERKKPGLKGARRAPQFSKR >NZ_CP054042.1|WP_003727703.1|509919_510357_-|50S-ribosomal-protein-L13 MRTTYMAKPGEVERKWYVIDATGVSLGRLSSEVASILRGKNKPQFTPHIDTGDFVIIINAGKIGLTGKKATDKIYYRHSQYPGGLKSRTAGEMRTNNPEKLLELSIKGMLPKNSLGRQLFKKLHVYGGSEHEHAAQQPEVYELRG >NZ_CP054042.1|WP_003733032.1|510551_511298_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MTRYKAIISYDGSGFYGYQVQPNTRTVQAEIEKALTKMHKGKTVRVTASGRTDTGVHAKGQVIHFDSELDITAEKFQKALQVMTPFDISFLTVEEVPDDFHARFGTVGKEYRYVVKRTKIFDPFSRNFALHYPYELDISKMKLASKRLIGEHDFTSFCSARTERDSKVRTLYSIDFYEEDDETLVIAFQGNGFLYNMVRILTGTLLDAGQGRISPDDISEALLARDRQKLISKTAPPQGLYLWRVDYE >NZ_CP054042.1|WP_003733033.1|511303_512101_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MMDKMILGRYIPGNSWLHRIDPRAKITAVMAFIAIVFLANNWLTYALMFVYVLYLVLTSKVPFLFFIKGLQPIFWLILITLLLQVFFTKGGTVLVDLGLLQITTLGLANGAMMFCRFVLIIFMTTLLTLTTSPIELTDGLEKILAPFRLVHLPVHELALMLSISLRFIPTLMDETEKILKAQKARGVEFTSGKWSDRIKAIIPLLVPLFISAFKRAEDLAIAMEARGYRGGKGRTRFRLLRWRFADTFLLISLAVLSGLLFWLRS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP054042_3 | 972527-972678 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP054042_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP054042_3
>3.1|972574|58|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder ATTCGAATTTCCACCACCACCTACGGATGAAGAGTTAAGACTTGCTTTGCCAGAGACG |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP054042_3
The CRISPR arrays of NZ_CP054042_3 >merge|NZ_CP054042|3|972527-972678|CRISPRCasFinder CCAATGCTTCTTGGTTTTAATGCTCCTGCTACATCAGAACCGAGCTCATTCGAATTTCCACCACCACCTACGGATGAAGAGTTAAGACTTGCTTTGCCAGAGACGCCAATGCTTCTTGGTTTTAATGCTCCTGCTACATCGGAACCGAGCTC >NZ_CP054042|3|3|972527-972678|CRISPRCasFinder CCAATGCTTCTTGGTTTTAATGCTCCTGCTACATCAGAACCGAGCTC ATTCGAATTTCCACCACCACCTACGGATGAAGAGTTAAGACTTGCTTTGCCAGAGACG CCAATGCTTCTTGGTTTTAATGCTCCTGCTACATCGGAACCGAGCTC
>NZ_CP054042.1|WP_003722732.1|969952_971485_+|zinc-metalloproteinase-Mpl MKSKLICIIMVIAFQAHFTMTVKADSVGEEKLQNNTQAKKTPADLKALPDSCEAKDFYKNFKILDMTKDKLGVTHYTLALSSGGYLTDNDEIKVHVTPDNKITFINGDLQQGQLRITNQIKITEKNAIEKAFEAIGQSEAHVKSYVGNPVKEKEIILNSRTKRLVYNIKLIFAEPEVASWIVQVDAETGAILKKQNMLSEVERADTHKDFQALGKGANRLLQRPLHVMKINDLFYLVDRTHKGLIRTFDLKHNTDTSFGKVVSNKTNMFTDPEFSSAVDAHFYASEVYEYYKNVHQLESLDGKGGEIDSFVHYGLNCNNAFWDGQEILYGDGDKKNFKPFSCAKTIVGHELTHAVIQYSAGLEYEGQSGALNESFADVFGYFIAPNHWLIGEDVCVRGSRDGRIRSIKDPDKYNQAAHMKDYESLPITEEGDWGGVHYNSGIPNKAAYNTITKLGKEKTEQLYFRALKYYLTKKSQFTDAKKALQQAAKDLYGEDASKKVAEAWEAVGVN >NZ_CP054042.1|WP_003722731.1|968032_969622_+|cholesterol-dependent-cytolysin-listeriolysin-O MKKIMLVFITLILVSLPIAQQTEAKDASAFNKENSISSMAPPASPPASPKTPIEKKHADEIDKYIQGLDYNKNNVLVYHGDAVTNVPPRKGYKDGNEYIVVEKKKKSINQNNADIQVVNAISSLTYPGALVKANSELVENQPDVLPVKRDSLTLSIDLPGMTNQDNKIVVKNATKSNVNNAVNTLVERWNEKYAQAYPNVSAKIDYDDEMAYSESQLIAKFGTAFKAVNNSLNVNFGAISEGKMQEEVISFKQIYYNVNVNEPTRPSRFFGKAVTKEQLQALGVNAENPPAYISSVAYGRQVYLKLSTNSHSTKVKAAFDAAVSGKSVSGDVELTNIIKNSSFKAVIYGGSAKDEVQIIDGNLGDLRDILKKGATFNRETPGVPIAYTTNFLKDNELAVIKNNSEYIETTSKAYTDGKINIDHSGGYVAQFNISWDEVNYDPEGNEIVQHKNWSENNKSKLAHFTSSIYLPGNARNINVYAKECTGLAWEWWRTVIDDRNLPLVKNRNISIWGTTLYPKYSNKVDNPIE >NZ_CP054042.1|WP_003733144.1|966837_967791_-|phosphatidylinositol-specific-phospholipase-C MYKNYLQRTLVLLLCFILYFFTFPLGGKAYSLNNWNKPIKNSVTTKQWMSALPDTTNLAALSIPGTHDTMSYNGDITWTLTKPLAQTQTMSLYQQLEAGIRYIDIRAKDNLNIYHGPIFLNASLSGVLETITQFLKKNPKETIIMRLKDEQNSNDSFDYRIQPLINIYKDYFYTTPRTDTSNKIPTLKDVRGKILLLSENHTKKPLVINSRKFGMQFGAPNQVIQDDYNGPSVKTKFKEIVQTAYQASKADNKLFLNHISATSLTFTPRQYAAALNNKVEQFVLNLTSEKVRGLGILIMDFPEKQTIKNIIKNNKFN >NZ_CP054042.1|WP_003722729.1|965853_966567_-|listeriolysin-O-transcriptional-regulator-PrfA MNAQAEEFKKYLETNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISENGTIMNLQYYKGAFVIMSGFIDTETSVGYYNLEVISEQATAYVIKINELKELLSKNLTHFFYVFQTLQKQVSYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTYVYGKETPDGIKITLDNLTMQELGYSSGIAHSSAVSRIISKLKQEKVIVYKNSCFYVQNLDYLKRYAPKLDEWFYLACPATWGKLN >NZ_CP054042.1|WP_003722728.1|964854_965811_+|ribose-phosphate-diphosphokinase MSNEYFDPKLKIFSLNSNRELAEEIAKEVGIELGKSSVTHFSDGEIQINIEESIRGCHVYVIQSTSNPVNQNLMELLIMIDALKRASAATINIVMPYYGYARQDRKARSREPITAKLVANLIETAGATRMITLDMHAPQIQGFFDIPIDHLNAVRLLSDYFSERHLGDDLVVVSPDHGGVTRARKMADRLKAPIAIIDKRRPRPNVAEVMNIVGNVEGKVCIIIDDIIDTAGTITLAAKALREAGATKVYACCSHPVLSGPAMKRIEESPIEKLVVTNSIALPEEKWIDKMEQLSVAALLGEAIVRVHENASVSSLFE >NZ_CP054042.1|WP_003722727.1|963430_964804_+|bifunctional-UDP-N-acetylglucosamine-diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate-N-acetyltransferase-GlmU MSKRYAVVLAAGQGTRMKSKLYKVLHPVCGKPMVEHVVDQISTLNVDKVVTIVGHGAEKVQEHLAGKSEFVKQDEQLGTAHAVLQAKAELAGKDGVTLVVCGDTPLIEASTMEALLKYHHEKRAKATILTTVIEDPTGYGRIIRDDLGIVEKIVEHKDATEKEQRISEINTGTYCFDNKALFEALENVSNDNVQGEYYLPDVIKILKDSDEVVAAYRMESFEESLGVNDRIALAEASKLMQRRINENHMRNGVTLVNPESTYIDIDVKIGQDTVIEPGVMLRGKTVIGDDCVVTSGSEIVNSVIGERVHVRTSSIFESKVGDDVQIGPYAHLRPESDIHDHVKIGNYVETKKAVVGEGTKLPHFIYMGDAEIGKNVNVGCGSIAVNYDGKNKAKTIIGDNVFVGCNSNLIAPVKVGDRAFIAAGSTITKDVPEDALGIARAKQDNKLGYAKHLNHGK >NZ_CP054042.1|WP_003722726.1|962735_963044_+|septation-regulator-SpoVG MQVTDVRLRRVETDGRMRAIASITLDEEFVVHDIRVIDGNNGLFVAMPSKRGVDGEFRDIAHPINSDTRAKIQEVVLAEYERVGEEEATAVTEEESESVSAE >NZ_CP054042.1|WP_003722725.1|962307_962616_+|septation-regulator-SpoVG MEITDVRLRRVETDGRMKAISSITIDGEFVIHDIRVIDGNEGLFVAMPSKRTPDGEFRDIAHPINSGTRAKIQEAVLAAYEVADEPAVNEESSADESIVEEN >NZ_CP054042.1|WP_003722724.1|960414_961623_+|ABC-transporter-permease MNVLQSMKMAWKQLKASKLRSFLTMLGIIIGVASVILLVSLGNGVTQEVDDQMGDLGSNLITVVNSSVNPNDKYTYDEVMKYQNIDGVKSVSPELSGQVNATFDYKSSSNKVIGTNDQYKAARSLEMKEGRFLLPIDTEYGQKVAVIGSTVASDLFGFGDPIGETIRLNGMPYKVVGVLKEKGASMMGSSDDQIFIPISSAQRLLKDTNVRTIYVETKSAEDVDFVVNTLESRLAIKFGDEKEQEKNASSAQMGPSYQVINQQEILNAFNTISTTLTTALGAIAAISLVVGGIGIMNIMLVSVSERTREIGIRKALGAKKRAILLQFLIESIVISVCGGVIGIIIGVSGALIFGSVAGISSGITAGTIIFSFVFSLCIGVIFGIAPANKASKLRPIDALRSE >NZ_CP054042.1|WP_003722723.1|959725_960418_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MPKPLIDMKNLTKTYTLGGETFKALDDVTFTVEQGEFLSIVGPSGSGKSTLMNMIGCLDVPDEGSYHLDDVDVFKLSDNKLSEIRNKKIGFIFQQFNLLPKLSAFENVELPLIYAGLSVSAREKAAIECLEKVGLLEKRRNLPTQLSGGQQQRVAIARALAGKPQILLADEPTGALDSKTGKEVMGILQELNRAGNTIVMITHDPTIASYGTRSIRIQDGKLFHEEATQA >NZ_CP054042.1|WP_003733146.1|973638_974508_+|phosphatidylcholine-phospholipase-C MKFKKVVLGMCLTASVLVFPITIKANACCDEYLQTPAAPHDIDSKLPHKLSWSADNPTNTDVNTHYWLFKQAEKILAKDVNHMRANLMNELKKFDKQIAQGIYDADHKNPYYDTSTFLSHFYNPDRDNTYLPGFANAKITGAKYFNQSVTDYREGKFDTAFYKLGLAIHYYTDISQPMHANNFTAISYPPGYHCAYENYVDTIKHNYQATEDMVAKRFCSDDVKDWLYENAKRAKADYPKIVNAKTKKSYLVGNSEWKKDTVEPTGARLRDSQQTLAGFLEFWSKKTNE >NZ_CP054042.1|WP_003722735.1|974579_974903_+|DUF5502-family-protein MYIKGRLIFFFVMFVIALCSVLILLIIKISVWKDEPFHLSDAKEIECLGSCEIKNTNQKIHFFSIKENLFEEKGDIAGILNEDEQKVADKSIFIVILDDEKGIANEE >NZ_CP054042.1|WP_003722736.1|975037_975499_+|YehR-family-lipoprotein MKMLKKGTAVLFVMIMAVMLVACGDKEETKTYTLSQNGVDSKLTYTYKGDKVTKQTAENTMSYASLGVASKEDAEKMLKATSDKFQGIDGLKEKIEYKDDKAIETLEVDYTKISSEDMNKIPGMSSNGDTSKGISMEESAKMLESQGYKEVSK >NZ_CP054042.1|WP_003725735.1|975549_975882_-|putative-heavy-metal-binding-protein MIVTTSPNIEGKQIIEYKKIVFGEVITGVNFMKDIGAGLRNFFGGRSQGYEDELINAREEAIREMEQRAKDIGANAVIGVDIDYEVLGADNGMLMVTASGTAVVIEAQDY >NZ_CP054042.1|WP_009930499.1|975948_976623_-|DNA-alkylation-repair-protein MITFDQLDTELQALENPNTIKIFRNHGCPDSLDLYGLKIGDLKKIIRREKLTKNHELAVKLIESNNSDLIYLGLLAINPNKITTEQIEKWNIAFRETWSQLTFGLASIVSKRDDALLFAKTWIESDYDLTKSMGWQIYSEHINNLPEAETLLQRAKETLQTETNRTRYSMNGFIITCGIYKDDLHEKAMEAAKSVGKVHVNLGNTACKVPDAISYIEKARNRTK >NZ_CP054042.1|WP_003722739.1|976699_977641_-|L-lactate-dehydrogenase MKDHQKIILVGDGAVGSSYAFACVNLSIGQEFGIIDIDKDRTIGDAMDLSHAVPFSTPKKIYSANYSDCHDADLVVVTAGTAQKPGETRLDLVNRNIKIMKGIVDEVMASGFDGIFLIASNPVDILTYATWKFSGLPKERVIGSGTSLDTARFRMSIADYLKVDARNVHGYILGEHGDTEFPAWSHTTVGGLPITEWISEDEQGAMDTIFVSVRDAAYEIINKKGATFYGVAAALARITKAILNNENAILPLSVYLDGHYGMNDIYIGAPAVVNRQGVRHIVEMNLNDKEKEQMKNSADTLKKVLDDAMKQID >NZ_CP054042.1|WP_003722740.1|977934_978558_+|50S-ribosomal-protein-L25/general-stress-protein-Ctc MATTLEVQKRETTQHSEVTRLRSEGKVPGIIYGYKSENVPVSVDSLELIKAVRDNGRNAVFSVTVDGKKLNVLLHEYQVDPLKDVLVHVDLLAVDMNEEVETDVRVVLVGDAPGVKAGGVLQQIIHDVKVSATPEKLPETIELDISSLEIGDVLTTNDLPENKDYVVQAEEEETVVTVSAPRAEEEPTTTEAPEPEAVHGKDEEPVE >NZ_CP054042.1|WP_003733150.1|978647_979232_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MLDKSVPHISVIMVNHDATNYPEFHLPAGYSFCFYKDGLEEDWCRLQLETGQVLSMDSIRARFETEFGNEKEKLTKRCIFVKAPNGEIIGTAMLWDGNTFGKMESRIHWVAVLDSHGGKGIAKALLSKILGLNKSKFVYLTTQTGSYQAIYLYRKFGFEKYVGKTPENWKTVNFQEEKETAWQIIENKIAEHQA >NZ_CP054042.1|WP_003733151.1|979338_979899_+|aminoacyl-tRNA-hydrolase MKLIAGLGNPGKKYERTRHNVGFMVVDELSFRHQTPWKKSKFNGMTSEIIVGGEKMILVKPLTFMNASGECIRPLMDYYNISIEDVVIVYDDLDLPVGKIRLRQKGSAGGHNGMKSIIQHVKTQEFNRIRVGVSRPLKGEVINYVLGDFPKAEQPDIIAAIQKSADAIEDFAQTPFIEVMNKYNQK >NZ_CP054042.1|WP_003733152.1|980013_983553_+|transcription-repair-coupling-factor MKGLQQLIYEQKDIRAVLNALDEKEKAQLVTGLTGSSRALFASVVEGASKRPVVFVTHNLYHAQKLYDDLLSLMDVDRLFLYPADELISSELSISSPELRGQRVEALDFLLSGKPGIVIVPVAGLRKMLPPVSLWKHFNISIVEGEEIDPDVLRQKLVTMGYTMSGMVNTPGEFSVRGGIIDIYPITEEFPIRIELFDTEVDSLRFFDVETQRSTTRVEEFRLLPATEIILDQSYYPDIVKRLEKKMTHTLNELKENEDKQALVENLEEDLEMLRSGVKPDMFFKYIGLAYPDPASLFDYLPKNTAILLDEFGRILETEESLEREEAEWQTETLSRMETVRDVQVSHSFKKLLEGNHSPKIYLSLFQKQMASMRVSKTTNIVYKQMQQFHGQMNVLKTELESWHKNNYAVVILAPNLERAEKMQQTLTDYDMESTILKKESDVPKYGMVQFVIGTFQNGFELPLAKVAIISETELFNKKIKKVKKRQKLSNAERIQSYSELKVGDYVVHVNHGIARYVGMETLDINGVHKDYLLLVYQGEDKLFIPVDQLDLVQKYVGAEGKSPRLNKLGGAEWKRVKKKVQASVQDIADDLIKLYAEREAEKGYAFSADDEMQREFEEAFPYQETEDQLRSISEIKKDMERPRPMDRLLVGDVGYGKTEVALRAAFKAIMDGKQVAFLVPTTILAQQHFETMKERFQGFPIEIGLLSRFRTKKQQTETLKGMKNGTVDVVVGTHRLLSKDVEYQDLGLLIVDEEQRFGVTHKEKIKQMRSKIDVLTLTATPIPRTLHMSMLGVRDLSVIETPPANRFPVQTYVAEQNNVLVREAIERELARDGQVYYLYNRVESITQKADEISAMVPDARVATAHGQMGESELESVILSFLEGEFDVLVTTTIIETGVDIPNVNTLFVQDADRMGLSQLYQLRGRVGRWNRIAYAYFMYQKDKILREEAEKRLSAIKEFTELGSGFKIAMRDLSIRGAGNILGAQQHGFIDSVGFDLYSQMLKEAIEAKKPKEEQKQIVPVEIDIQADAYIPEYYITDGRQKIEMYKRFRNIETLSELEDLQSDMIDRFGEYPEEVEYLFTMTELKVHALEVGIESVKQEQNKITMLFSESGTAGIRGDIVMQIIGEFGRMVGVGMEGTQLKITINVQNKPLKEWLYQVKSLAEKLRGAMKEKASTEN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP054042_4 | 1303241-1303527 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of NZ_CP054042_4
|
4 spacers
spacers of NZ_CP054042_4
>4.1|1303270|37|NZ_CP054042|PILER-CR,CRT TTTATTTCTCCTACGCTTTTCTTATTTCTGTAAATAA >4.2|1303336|34|NZ_CP054042|PILER-CR,CRT TTTTCTACTCCTGCTTCTAAAATGTCGTTTATAA >4.3|1303399|35|NZ_CP054042|PILER-CR,CRT CTAAAACATCCTTCACTGTATCAACTCCTTTCTAT >4.4|1303463|36|NZ_CP054042|PILER-CR,CRT ACAATAATAGGATATTTTGGATTTGTCTGCGTTCCT >4.5|1303270|38|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder TTTATTTCTCCTACGCTTTTCTTATTTCTGTAAATAAG >4.6|1303336|35|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder TTTTCTACTCCTGCTTCTAAAATGTCGTTTATAAG >4.7|1303399|36|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder CTAAAACATCCTTCACTGTATCAACTCCTTTCTATA >4.8|1303463|37|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder ACAATAATAGGATATTTTGGATTTGTCTGCGTTCCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP054042_4
The CRISPR arrays of NZ_CP054042_4 >merge|NZ_CP054042|4|1303241-1303527|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATTTTATTTCTCCTACGCTTTTCTTATTTCTGTAAATAAGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATTTTTCTACTCCTGCTTCTAAAATGTCGTTTATAAGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATCTAAAACATCCTTCACTGTATCAACTCCTTTCTATATTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATACAATAATAGGATATTTTGGATTTGTCTGCGTTCCTGTTTTAGTTACTTATTATGAAATGTAAAT >NZ_CP054042|4|2|1303241-1303527|PILER-CR GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTTATTTCTCCTACGCTTTTCTTATTTCTGTAAATAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTTTCTACTCCTGCTTCTAAAATGTCGTTTATAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT CTAAAACATCCTTCACTGTATCAACTCCTTTCTAT ATTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT ACAATAATAGGATATTTTGGATTTGTCTGCGTTCCT GTTTTAGTTACTTATTATGAAATGTAAAT >NZ_CP054042|4|2|1303241-1303527|CRT GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTTATTTCTCCTACGCTTTTCTTATTTCTGTAAATAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTTTCTACTCCTGCTTCTAAAATGTCGTTTATAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT CTAAAACATCCTTCACTGTATCAACTCCTTTCTAT ATTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT ACAATAATAGGATATTTTGGATTTGTCTGCGTTCCT GTTTTAGTTACTTATTATGAAATGTAAAT >NZ_CP054042|4|4|1303242-1303527|CRISPRCasFinder TTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTTATTTCTCCTACGCTTTTCTTATTTCTGTAAATAAG TTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTTTCTACTCCTGCTTCTAAAATGTCGTTTATAAG TTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT CTAAAACATCCTTCACTGTATCAACTCCTTTCTATA TTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT ACAATAATAGGATATTTTGGATTTGTCTGCGTTCCTG TTTTAGTTACTTATTATGAAATGTAAAT
>NZ_CP054042.1|WP_003721295.1|1302068_1303004_+|ribose-phosphate-pyrophosphokinase MAGKMKLFSVTSERPLATKIADYLDIPLCEVELQKFSDGEVKINIEESIRGTNAYVVQSMNSNVNERLMELLIMVDALKRASVHSINIIMPYYGYARQDRKARSREPITAKLMANLIQRAGANRLITVDLHAAQIQGFFNIPIDHLSAIPLIGDYLIENYGEKDVVVVAPDHSGVVRARRIADRLNAPIAILNRKPRPHEDEIMSVIGDVKGKVAIVVDDIIDTGVRATTSADILLEKGAVEVIACATHSVMAGNATERLQNSSIKEVITSDSIDLPEDKQFDKLTTISIGRILGRAIEGVQENRSLHPLF >NZ_CP054042.1|WP_003721294.1|1300657_1301929_+|PTS-galactitol-transporter-subunit-IIC MDIILDFFKYIIGLGVTVMMPIIITILGVIFRKKISVAFKAGLTVGVGFVGLGVITSLMLTTITPVTKALVENYNFKLTATDIGWGVGSSLAWGTEVVPFVFVAIIATNILMIAFKWTKTMDVDIWNYWQPLFIASALYLTTGSMIIAVLSSIINMAIIFKIADWTQKDVEDVLGLEGISLPQIQTTGWALVGYPMNWLLGKIPGVRKINWSTEKVQSRLGIFGEPMLMGLIIGGGLAAIAQMPLSQVLQTGVTIAASLVLIPRMVSLLMDGLTVISEAAHEFMEKRFPGRELFIGLDSAVGIGHPFVLSLGLLMIPITLILAFILPGNKVLPLADLTALPFYMIFAIVPSKGNLFRGIFTGIVIVIITLYLSGAAAPLMTELAGQIGYNIPKDAVEVTSLAVGTQWYTWIVYYGLHWFGGIL >NZ_CP054042.1|WP_003721293.1|1300349_1300643_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKKKRIYVCCGTGIATSTVISKKVRAVLDEKRIPYEISQCTVQEVASKVSTSKPDIIVSSTTVTGDVGDVPVVIGRSFLTGLKKQETIDEILAILQD >NZ_CP054042.1|WP_003721292.1|1299287_1300334_+|galactitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKALKLYGKRDLRYEEADMPTIEEPDDVILKVKTVGICGSDISRYSKLGPYVPGMVWGHEFSGEVIEVGSEVTDIEIGDRAAGCPALYCGECEYCKKGEFARCRKLTVIGARHPGAYAEYIKLPAENVVKIPDELDYEAAALVEPSAVVVHGFYHTKLQAGDDVVVVGSGNIGLLAIQWAKVFGARRVIAIDVDDKKLALAKEVGADVVINSLKEDPLEVVAAHTDGLNADLVVEAAGSPITSAQVFAYAKKGGGVVFLGIPYADVTIERFYFEKIVRSELTVWGSWNAISAPFPGKEWQTTIHFLANKQINIEPMITHRLSLAEGPEVFERIYERNEFFGKVLFFPE >NZ_CP054042.1|WP_003721291.1|1298640_1299291_+|ribulose-phosphate-3-epimerase MAKIVPSVFGADIGRINEQLQVLEKNDIDLLHVDMMDGSFVPNIAFGPDQIKMMKKGTKLQFDVHMMVYEPDRYIPRLVEAGAHMITVHQEATTHLHRTIQLIKSYGVRAGVVLNPGTPPSTLEYVLDDIDCILLMTVNPGLGGQKFFQSSLEKIRKTKAYIGNRPIQIEVDGGVNDELAKECTLAGADLIVVGSYLFEGDIEANLEKLAKGVLTE >NZ_CP054042.1|WP_003721290.1|1298231_1298630_+|hypothetical-protein MGSFFASFVDWLIGSPGRFVVNLIEDNMLIFMVVVMIYATTILYAKWTLAYYLPKKMSQLAEMKTWELDELYAAWQTEKKALPWYILVPSRNEFWVKSARNAPESTKLLHFSQQKLKLSDKEKLQKIIEIQS >NZ_CP054042.1|WP_003721289.1|1297747_1298215_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MDVLEYFKEEMVRFSNEQDKEKLLTEMAEQLCEVGAVKPSYKDAVIKREKVFPTGLLTAHAGVAIPHTDSEHVIRPVVAVRILKKPVSFIEMASDNEAIDVRIVFMMALRSADEQLDMLQTLIQLIQDEEVMTTLLKAQETGDVLSAIEHFSKNN >NZ_CP054042.1|WP_003733192.1|1297117_1297720_+|SIS-domain-containing-protein MDKQAILNNIHQTWQEEANAISRLPEVTSEEALVKTVEKIAECTGKIVVAGCGTSGVAAKKLVHSFNCIERPAVFLTPSDAVHGTLGVLQKEDILILISKGGNTGELLNLIPACKTKGSTLIGVTENPDSVIAKEADIFFPVSVSKEPDPFNMLATASTMAVIASFDAVIVCLMTYMNYTKEQFSVIHPGGAVGNKLLNK >NZ_CP054042.1|WP_003733193.1|1295053_1297114_+|BglG-family-transcription-antiterminator MYLDNRSKTLFQEVIKNPNITNKQLEVKYKLSRYQISYSFQKVNEWLKWKNYPEVKRSKNGRFILEPELTALFSEKETRDPSVEYLPSENERANLILLMLLTSKEELSLAHFTTKIQVSKNTILRDLKVAQKLLPKETTVTYSRASGYQLAGSEWELRKVLTQVVSSVKEMFRGEHYFLSYSGIEKVQLMEIRRTLEEAEAMMQIKFTYEQIELLPYLLSVMFLRIRDRRLIDTAFHIDEKSLSDTREYHITDILLEKTGPVPEQERLFITLQLLTTNIFSGEILTEKLTEDLEKVVLTCLDLFEKKALVSLKNKHILIEKLLLHLKPAYYRIKYQMNLEDTLYEKFNQEFEALNFIVKEAFDPLAKFIGREIPAGEIFFISLFIGSDMIPQNDIYHKQKRAIVLCPSGVTFSKIMENILVKLFPEIHFYPTISVREYAFFKAEVDIVFSSIPLKDGENVFVVQPFMNDIEKTQLRQHVLQNLFGMGNQLTSIDKIMEVVERNADIKDPNAIRDGIIDILSANTATDENKRVKKVYLHDLITEDNIMICEDVKNYQEAIRLASQPLLLQQAITANYVKTMIDNHKFHDPYIIIGEDIAIPHAMPNAGVNRLAMSLLVVKNGVYFSETEQVHFVIVIAPVDKEQHIEALYQIVHLAENHQILDDLLENVTKEKIMQTINQLVIREDE >NZ_CP054042.1|WP_003733194.1|1294294_1294945_+|transaldolase MHLDSANLDDVKKIQASSIFKGITTNPTILVKEKCNRQTAINRILELTDKQVFVQTVGFTYEEILADARMLLTMFGKDKIAIKIPAHEAGTNVIDTLKKEDKTIQILGTAIYSADQAITAALVGADFVAPYVNRMSAANIDPFKEISQMRHFFDKKALKTQIMAASFKHSGQVMQAYESGADTVTIPYEIYSQMTNKVLAVEAIRVFNEDAVLYEK >NZ_CP054042.1|WP_009930754.1|1303918_1304497_+|hypothetical-protein MKKILVPILLLATILASCSSPNEKITKDTKISKTITIRADYKVPKDIKELEDDSANIVKVKFLQNKTIGKDGSTISEIEILTSYKGNLEKGSKVDISEPWYLSDGKYVAVENYIALDKEQEYTIFLGEKDKDTYPLSSLGYGKFGGSLKEDQAVLADFNILGEVQKFDFISENTEEVKNYQLIKEQVAGKYK >NZ_CP054042.1|WP_003733188.1|1304603_1305284_+|type-1-glutamine-amidotransferase MIIDVLQHVPHEGPGLIANWARENQHQLKIHSLFEENAHVPNDSDFLIVLGGPMGINDTAEFPWLKDERKLIKRLSEQHKPVFGVCLGAQQIAATFGSEITVNKEKEVGWFPVKRTSDKLSFFPESLNVFHWHQDTFALPAGATRLFASEGCLNQAFLYGENIIGLQFHFEMEKAGIETILQIDEAFITPGKYVQSVEVMQEKDVPEDNKQMLEAILDYLINPKTI >NZ_CP054042.1|WP_003721298.1|1305308_1305668_-|Lin0512-family-protein MEQILFIQTGFGVDVHGQNITKAAERAVRNAIFTNSMPGIQGLLPDGDLQNMVVNIKLALPCDADQLDEDTIRAIIPYGTVTIEKMAGGMMTTSGIFLEDKEDKNDLMYIVNASVETGY >NZ_CP054042.1|WP_003733187.1|1305674_1306133_-|MarR-family-transcriptional-regulator MNNEQNMNQQIALFYFGYKAFTETADLIIAKHSLKRLHHRILFFTARMPGLTINELLTFLEISKQALHQPLAELKERELLTIEQGRRDKRQRCIFLTAAGKELENELGAAQRKQMSEIFTNSADTDGMHFTEVMEGYAKNRPGAAFIKDFKE >NZ_CP054042.1|WP_031668100.1|1306514_1308350_+|lmo0514-family-class-1-internalin MKKALKLFLAMICMFIMIYPSTAAHAEETNIVNIPDANLKTYLNGLLKQASDAPITKTQMNTIQTVTLSGSTYTDLTGLEEAGNLVTLSINNTNIQTLEPIKNQTSLTYLTVGGDNVKDSLFVDLNGLVNLQSLSINGSEVTHNVFKTFNKLPKLTYLYAQNSMKITDISALASLPALTTLFLQFDGIDDFRPLNDFESFKNGNLKALAAFGQNTGRTNPRITLKSGKLDYNETNQTLYLPFSMMPKPLTSFDGTVAPFSKSTSASNTYLGFNDVALPSARLSITEDGITVSGVTKEEFDNLDEIEYNARYDFPTGSYPTPPSMTSYTISSGTYDQYFDISHTLDLTADESFDYNQYDTTSEEQFLKDVHAETDDGTAVKSDFDQVVKLDVPGEYTVTLNAENAAGLKATPVTVKVTVHEKPVITSDSQISYKKETTKSVDEFLKEIHGSVTGNAVLTSDFDKVVDLNTPGEYTVTLNAINDRGQKADPVTVVVTVTTSDSGHVNPVPPTPEVKPTPQEETDQTIIPEPQSETTEDSVKEDQAKDGQAKSEEKADKTSLTTKENKVEKSEKTNQPKTKALPQTGDTNKTALPIAGVMLSLAALLIFRKSKS >NZ_CP054042.1|WP_003721301.1|1308450_1308882_+|universal-stress-protein MEKYHRILVAVDGSEPAKLAFEKGLELALKLDGVLGIASIVDLRAFSPNVSYDGSLEEKAELELKTSVNEYAEKARTAGVKQVETFVAKGNPKILLSTDIPAEFQADLIICGATGMNRVEKLVLGSVSSYIMAHAICDTLIAR >NZ_CP054042.1|WP_003733185.1|1308928_1310359_-|CapA-family-protein MKRRTYVIITGLVLVFIAGAFWITNSTNQSDQKATQTEPIKKISPANVKTISSEAKKTLNSLASSGADKASISDLKQLIKELKSYPTEKNDSGVYLQNLTACLEAVKSYTTGKADEKALGKVYPDFLASEQKLSAIEKTNQYDWFYAAAATNQQGLKEKGVVTLTMVGDNSFGTYPETPEHLKFDNVFQKNNGNNTYVYNNCLPWFKSDDYTVINAESAFTNATKAENKMWRIKSDPAHVAFLPASGVDAANLANNHTMDYFQVGYDDTLKAFKENNIPVFNTDAPLETTIKGMKTVLLGYDCRMSQQSPAYLERIVKDVKKYKKEDTLVIVNMHWGVEYRETPTDYQTQFGHAILDAGADIIMGSHPHRLESVEKYKDKYIVYSMGDFAFGADPTLLSRMTSMFQLRFTKEDNKIVLKDISIVPTYENSDGSTTENNYQPLPVFGDDAKKIVDELNRISKPIEGGVTEYTYFDPF >NZ_CP054042.1|WP_003721303.1|1310479_1311295_-|histidine-phosphatase-family-protein MKKNIFKLLMALCAVLLIAGCGNSTSADKKETKETKEDGTVTFYVVRHGKTMLNTTDRVQGWSDAVLTPAGEEVVKSAGKGLKDVDFSAAYSSDSGRAIQTANLILKESDKSADKEVQTDPRFREFNFGSYEGDLNENMWTDIAKSQGKTLEEWQKAGLSPKDFANSVAALDKTRVKEGENWPAEDYATIQARLKEGLTDVAKKESKNGDSNVLLVSHGLSIGALLDTIEPGYKLPAEGIKNASVTKITYKDGKFTIGDVNDLSYVEKGSK >NZ_CP054042.1|WP_003721311.1|1311575_1311944_-|DUF1304-domain-containing-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP054042_2 | 2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500156-500186 | 31 | NZ_CP054042.1 | 466018-466048 | 2 | 0.935 |
NZ_CP054042_4 | 4.4|1303463|36|NZ_CP054042|PILER-CR,CRT | 1303463-1303498 | 36 | NZ_CP054042.1 | 1454553-1454588 | 2 | 0.944 |
1. spacer 2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 466018-466048, mismatch: 2, identity: 0.935
tcgaatgtgtaagcttctgagtaacctagca CRISPR spacer tcaaacgtgtaagcttctgagtaacctagca Protospacer **.**.*************************
2. spacer 4.4|1303463|36|NZ_CP054042|PILER-CR,CRT matches to position: 1454553-1454588, mismatch: 2, identity: 0.944
acaataataggatattttggatttgtctgcgttcct CRISPR spacer acgataataggatattttggatttgcctgcgttcct Protospacer **.**********************.**********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP054042_2 | 2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500156-500186 | 31 | KJ094022 | Listeria phage LP-030-3, complete genome | 16313-16343 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500223-500252 | 30 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 19426-19455 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NC_003216 | Listeria phage A118, complete genome | 6554-6583 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | AJ242593 | Bacteriophage A118 complete genome | 6554-6583 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | KJ094022 | Listeria phage LP-030-3, complete genome | 14945-14974 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | MN172529 | Listeria phage LP-039, complete genome | 60277-60306 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | MT668624 | Listeria phage LP-Mix_6.2, complete genome | 61623-61652 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | NC_025440 | Listeria phage WIL-1, complete genome | 105560-105589 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | NC_047872 | Listeria phage LMTA-94, complete genome | 71109-71138 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | KJ591604 | Listeria phage LMTA-148, complete genome | 68215-68244 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | KJ591605 | Listeria phage LMTA-57, complete genome | 81858-81887 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | KJ094033 | Listeria phage LP-048, complete genome | 62734-62763 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | KJ668715 | Listeria phage LMTA-34, partial genome | 57972-58001 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | NC_042048 | Listeria phage LMTA-34, complete genome | 75832-75861 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | NC_041862 | Listeria phage LP-064, complete genome | 70234-70263 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | JX126918 | Listeria phage LP-125, complete genome | 70236-70265 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | NC_024360 | Listeria phage LMSP-25, complete genome | 75832-75861 | 0 | 1.0 |
NZ_CP054042_2 | 2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500156-500186 | 31 | KP399678 | Listeria phage vB_LmoS_293, complete genome | 7920-7950 | 1 | 0.968 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | MT438761 | Listeria virus P61, complete genome | 72024-72053 | 1 | 0.967 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | MT178766 | Listeria virus P100plus, complete genome | 27249-27278 | 1 | 0.967 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | DQ003638 | Listeria phage A511, complete genome | 60814-60843 | 1 | 0.967 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | MT178767 | Listeria virus P200, complete genome | 27249-27278 | 1 | 0.967 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | DQ004855 | Listeria bacteriophage P100, complete genome | 27248-27277 | 1 | 0.967 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | MN128594 | Listeria phage LP-066, complete genome | 61773-61802 | 1 | 0.967 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | MK792752 | UNVERIFIED: Listera phage vB-LmoM-SH3-3, complete genome | 79360-79389 | 1 | 0.967 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | KJ094030 | Listeria phage LP-083-2, complete genome | 66939-66968 | 1 | 0.967 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | JQ797329 | Listeria phage vB_LmoM_AG20, complete genome | 60123-60152 | 1 | 0.967 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | KJ535721 | Listeria phage List-36, complete genome | 68224-68253 | 1 | 0.967 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | KJ094031 | Listeria phage LP-124, complete genome | 29054-29083 | 1 | 0.967 |
NZ_CP054042_4 | 4.3|1303399|35|NZ_CP054042|PILER-CR,CRT | 1303399-1303433 | 35 | NC_021539 | Listeria phage LP-030-2, complete genome | 18926-18960 | 1 | 0.971 |
NZ_CP054042_4 | 4.3|1303399|35|NZ_CP054042|PILER-CR,CRT | 1303399-1303433 | 35 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 22882-22916 | 1 | 0.971 |
NZ_CP054042_4 | 4.7|1303399|36|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder | 1303399-1303434 | 36 | NC_021539 | Listeria phage LP-030-2, complete genome | 18926-18961 | 1 | 0.972 |
NZ_CP054042_4 | 4.7|1303399|36|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder | 1303399-1303434 | 36 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 22882-22917 | 1 | 0.972 |
NZ_CP054042_2 | 2.2|499958|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 499958-499987 | 30 | KJ094028 | Listeria phage LP-083-1 contig 2, partial genome | 18565-18594 | 2 | 0.933 |
NZ_CP054042_2 | 2.2|499958|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 499958-499987 | 30 | DQ003641 | Listeria phage P35, complete genome | 34695-34724 | 2 | 0.933 |
NZ_CP054042_2 | 2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500156-500186 | 31 | MH341452 | Listeria phage PSU-VKH-LP040, complete genome | 7933-7963 | 2 | 0.935 |
NZ_CP054042_2 | 2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500156-500186 | 31 | DQ003637 | Listeria phage A500, complete genome | 7899-7929 | 2 | 0.935 |
NZ_CP054042_2 | 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500223-500252 | 30 | NC_003216 | Listeria phage A118, complete genome | 20408-20437 | 2 | 0.933 |
NZ_CP054042_2 | 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500223-500252 | 30 | AJ242593 | Bacteriophage A118 complete genome | 20408-20437 | 2 | 0.933 |
NZ_CP054042_2 | 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500223-500252 | 30 | X85008 | Bacteriophage A118 hol118 and ply118 genes | 656-685 | 2 | 0.933 |
NZ_CP054042_4 | 4.1|1303270|37|NZ_CP054042|PILER-CR,CRT | 1303270-1303306 | 37 | NC_009812 | Listeria phage B025, complete genome | 30705-30741 | 2 | 0.946 |
NZ_CP054042_4 | 4.3|1303399|35|NZ_CP054042|PILER-CR,CRT | 1303399-1303433 | 35 | NC_009812 | Listeria phage B025, complete genome | 23381-23415 | 2 | 0.943 |
NZ_CP054042_4 | 4.7|1303399|36|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder | 1303399-1303434 | 36 | NC_009812 | Listeria phage B025, complete genome | 23381-23416 | 2 | 0.944 |
NZ_CP054042_4 | 4.5|1303270|38|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder | 1303270-1303307 | 38 | NC_009812 | Listeria phage B025, complete genome | 30704-30741 | 3 | 0.921 |
NZ_CP054042_2 | 2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500156-500186 | 31 | NC_003216 | Listeria phage A118, complete genome | 7919-7949 | 4 | 0.871 |
NZ_CP054042_2 | 2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500156-500186 | 31 | AJ242593 | Bacteriophage A118 complete genome | 7919-7949 | 4 | 0.871 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | MN693541 | Marine virus AFVG_25M436, complete genome | 24008-24037 | 5 | 0.833 |
NZ_CP054042_2 | 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500751-500780 | 30 | MK327943 | Escherichia phage vB_EcoM_G53, complete genome | 71695-71724 | 6 | 0.8 |
NZ_CP054042_2 | 2.1|499892|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT | 499892-499921 | 30 | MK813941 | Aeromonas phage 4_L372XY, complete genome | 93420-93449 | 7 | 0.767 |
NZ_CP054042_2 | 2.8|500355|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500355-500384 | 30 | NC_041887 | Rhodococcus phage Weasels2, complete genome | 68085-68114 | 7 | 0.767 |
NZ_CP054042_2 | 2.9|500421|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500421-500450 | 30 | NC_015498 | Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5 plasmid pGLAAG01, complete sequence | 13562-13591 | 7 | 0.767 |
NZ_CP054042_2 | 2.11|500553|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500553-500582 | 30 | NZ_CP053711 | Acetobacteraceae bacterium strain PAMC 26569 plasmid unnamed4, complete sequence | 17299-17328 | 7 | 0.767 |
NZ_CP054042_2 | 2.11|500553|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500553-500582 | 30 | NZ_CP053711 | Acetobacteraceae bacterium strain PAMC 26569 plasmid unnamed4, complete sequence | 69337-69366 | 7 | 0.767 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_CP042479 | Citrobacter freundii strain C50 plasmid pC50_001, complete sequence | 5535-5564 | 7 | 0.767 |
NZ_CP054042_2 | 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500223-500252 | 30 | NZ_CP043436 | Campylobacter fetus subsp. venerealis NCTC 10354 plasmid p3226, complete sequence | 2890-2919 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500223-500252 | 30 | NZ_CP016721 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC11 plasmid pUC11B, complete sequence | 23276-23305 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500223-500252 | 30 | NZ_CP016727 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC08 plasmid pUC08B, complete sequence | 23275-23304 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500223-500252 | 30 | NZ_CP008809 | Campylobacter fetus subsp. fetus 04/554 plasmid pCFF04554, complete sequence | 8547-8576 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500223-500252 | 30 | NZ_CP008812 | Campylobacter fetus subsp. venerealis 97/608 plasmid pCFV97608-2, complete sequence | 17700-17729 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500223-500252 | 30 | NZ_CP018792 | Campylobacter sp. RM8964 plasmid pVIC8964, complete sequence | 21826-21855 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500223-500252 | 30 | NZ_CP016699 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain 275 plasmid p275A, complete sequence | 55457-55486 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500223-500252 | 30 | NZ_CP018794 | Campylobacter sp. RM12175 plasmid pVIC12175-1, complete sequence | 22093-22122 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500223-500252 | 30 | KC699836 | Bacillus phage SIOphi, partial genome | 2244-2273 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.9|500421|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500421-500450 | 30 | NZ_CP015799 | Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid cp32-13, complete sequence | 7241-7270 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.11|500553|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500553-500582 | 30 | NC_014120 | Paraburkholderia sp. CCGE1002 plasmid pBC201, complete sequence | 170278-170307 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.12|500619|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500619-500648 | 30 | NC_015427 | Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p4BKT015925, complete sequence | 20826-20855 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_CP041048 | Citrobacter sp. CF971 plasmid pBM527-2, complete sequence | 49887-49916 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | MN783744 | Klebsiella oxytoca plasmid pFDL-VIM, complete sequence | 53506-53535 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NC_012885 | Aeromonas hydrophila plasmid pRA1, complete sequence | 6505-6534 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_CP022274 | Citrobacter freundii strain 18-1 plasmid pA18-1, complete sequence | 53211-53240 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_CP042536 | Citrobacter freundii strain E51 plasmid pE51_002, complete sequence | 5535-5564 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_CP034714 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Mikawasima strain RSE15 plasmid pRSE15, complete sequence | 5534-5563 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_CP010360 | Enterobacter roggenkampii strain 35734 plasmid p35734-141.404kb, complete sequence | 111873-111902 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_CP012168 | Enterobacter hormaechei subsp. steigerwaltii strain 34998 plasmid p34998-239.973kb, complete sequence | 228661-228690 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | MN783743 | Escherichia coli plasmid pGA_VIM, complete sequence | 64763-64792 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_CP034084 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain R210-2 plasmid pR210-2-VIM, complete sequence | 5538-5567 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_MH220284 | Aeromonas sp. pRIVM0001_VIM-1 plasmid pRIVM0001_VIM-1_171012_B12, complete sequence | 5494-5523 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_MG228427 | Kluyvera cryocrescens strain BO64W plasmid pKC-BO-N1-VIM, complete sequence | 5538-5567 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_MG550958 | Escherichia coli strain G3216 plasmid pG3216.2, complete sequence | 38131-38160 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_MH325469 | Enterobacter hormaechei strain Ec13 plasmid pEc13, complete sequence | 5811-5840 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_MH325468 | Enterobacter hormaechei strain Ec09 plasmid pEc09, complete sequence | 5811-5840 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_MH594478 | Citrobacter freundii strain AA593 plasmid pIBAC_Incx3_A/C, complete sequence | 30452-30481 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_MH594477 | Citrobacter freundii strain AA535 plasmid pIBAC_IncA/C, complete sequence | 31209-31238 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500685-500714 | 30 | NZ_MG053108 | Citrobacter freundii strain 33587 plasmid pCf587, complete sequence | 6505-6534 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054042_2 | 2.9|500421|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 500421-500450 | 30 | JQ680352 | Unidentified phage clone 1013_scaffold1713 genomic sequence | 5412-5441 | 9 | 0.7 |
1. spacer 2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ094022 (Listeria phage LP-030-3, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcgaatgtgtaagcttctgagtaacctagca CRISPR spacer tcgaatgtgtaagcttctgagtaacctagca Protospacer *******************************
2. spacer 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taacctttaaaattaaattgaaggtgcgga CRISPR spacer taacctttaaaattaaattgaaggtgcgga Protospacer ******************************
3. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_003216 (Listeria phage A118, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer tacatcgctaccaatcaatccgctattaag Protospacer ******************************
4. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AJ242593 (Bacteriophage A118 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer tacatcgctaccaatcaatccgctattaag Protospacer ******************************
5. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ094022 (Listeria phage LP-030-3, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer tacatcgctaccaatcaatccgctattaag Protospacer ******************************
6. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN172529 (Listeria phage LP-039, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer atctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer ******************************
7. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT668624 (Listeria phage LP-Mix_6.2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer atctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer ******************************
8. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_025440 (Listeria phage WIL-1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer atctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer ******************************
9. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047872 (Listeria phage LMTA-94, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer atctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer ******************************
10. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ591604 (Listeria phage LMTA-148, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer atctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer ******************************
11. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ591605 (Listeria phage LMTA-57, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer atctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer ******************************
12. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ094033 (Listeria phage LP-048, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer atctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer ******************************
13. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ668715 (Listeria phage LMTA-34, partial genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer atctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer ******************************
14. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_042048 (Listeria phage LMTA-34, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer atctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer ******************************
15. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_041862 (Listeria phage LP-064, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer atctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer ******************************
16. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX126918 (Listeria phage LP-125, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer atctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer ******************************
17. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_024360 (Listeria phage LMSP-25, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer atctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer ******************************
18. spacer 2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KP399678 (Listeria phage vB_LmoS_293, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.968
tcgaatgtgtaagcttctgagtaacctagca CRISPR spacer tcgaatgtgtaagcttctgagtaacctagta Protospacer *****************************.*
19. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT438761 (Listeria virus P61, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer gtctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer .*****************************
20. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT178766 (Listeria virus P100plus, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer gtctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer .*****************************
21. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to DQ003638 (Listeria phage A511, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer gtctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer .*****************************
22. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT178767 (Listeria virus P200, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer gtctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer .*****************************
23. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to DQ004855 (Listeria bacteriophage P100, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer gtctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer .*****************************
24. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN128594 (Listeria phage LP-066, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer gtctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer .*****************************
25. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK792752 (UNVERIFIED: Listera phage vB-LmoM-SH3-3, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer gtctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer .*****************************
26. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ094030 (Listeria phage LP-083-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer gtctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer .*****************************
27. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JQ797329 (Listeria phage vB_LmoM_AG20, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer gtctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer .*****************************
28. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ535721 (Listeria phage List-36, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer gtctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer .*****************************
29. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ094031 (Listeria phage LP-124, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer gtctatattatcatacgtcaaggaagggta Protospacer .*****************************
30. spacer 4.3|1303399|35|NZ_CP054042|PILER-CR,CRT matches to NC_021539 (Listeria phage LP-030-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctaaaacatccttcactgtatcaactcctttctat CRISPR spacer ctaaaacatccttcactgtctcaactcctttctat Protospacer ******************* ***************
31. spacer 4.3|1303399|35|NZ_CP054042|PILER-CR,CRT matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctaaaacatccttcactgtatcaactcctttctat CRISPR spacer ctaaaacatccttcactgtctcaactcctttctat Protospacer ******************* ***************
32. spacer 4.7|1303399|36|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder matches to NC_021539 (Listeria phage LP-030-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ctaaaacatccttcactgtatcaactcctttctata CRISPR spacer ctaaaacatccttcactgtctcaactcctttctata Protospacer ******************* ****************
33. spacer 4.7|1303399|36|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ctaaaacatccttcactgtatcaactcctttctata CRISPR spacer ctaaaacatccttcactgtctcaactcctttctata Protospacer ******************* ****************
34. spacer 2.2|499958|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ094028 (Listeria phage LP-083-1 contig 2, partial genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
accgaagtaggttagggtatcgccgatttt CRISPR spacer tccgaaataggttagggtatcgccgatttt Protospacer *****.***********************
35. spacer 2.2|499958|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to DQ003641 (Listeria phage P35, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
accgaagtaggttagggtatcgccgatttt CRISPR spacer tccgaaataggttagggtatcgccgatttt Protospacer *****.***********************
36. spacer 2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH341452 (Listeria phage PSU-VKH-LP040, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.935
tcgaatgtgtaagcttctgagtaacctagca CRISPR spacer tcaaacgtgtaagcttctgagtaacctagca Protospacer **.**.*************************
37. spacer 2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to DQ003637 (Listeria phage A500, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.935
tcgaatgtgtaagcttctgagtaacctagca CRISPR spacer tcaaacgtgtaagcttctgagtaacctagca Protospacer **.**.*************************
38. spacer 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_003216 (Listeria phage A118, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
taacctttaaaattaaattgaaggtgcgga CRISPR spacer tagcctttataattaaattgaaggtgcgga Protospacer **.****** ********************
39. spacer 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AJ242593 (Bacteriophage A118 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
taacctttaaaattaaattgaaggtgcgga CRISPR spacer tagcctttataattaaattgaaggtgcgga Protospacer **.****** ********************
40. spacer 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to X85008 (Bacteriophage A118 hol118 and ply118 genes) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
taacctttaaaattaaattgaaggtgcgga CRISPR spacer tagcctttataattaaattgaaggtgcgga Protospacer **.****** ********************
41. spacer 4.1|1303270|37|NZ_CP054042|PILER-CR,CRT matches to NC_009812 (Listeria phage B025, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
tttatttctcctacgcttttcttatttctgtaaataa CRISPR spacer tttatttctcctgcgcttttcttatttttgtaaataa Protospacer ************.**************.*********
42. spacer 4.3|1303399|35|NZ_CP054042|PILER-CR,CRT matches to NC_009812 (Listeria phage B025, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctaaaacatccttcactgtatcaactcctttctat CRISPR spacer ctaaaacatccttcactatctcaactcctttctat Protospacer *****************.* ***************
43. spacer 4.7|1303399|36|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder matches to NC_009812 (Listeria phage B025, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ctaaaacatccttcactgtatcaactcctttctata CRISPR spacer ctaaaacatccttcactatctcaactcctttctata Protospacer *****************.* ****************
44. spacer 4.5|1303270|38|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder matches to NC_009812 (Listeria phage B025, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
tttatttctcctacgcttttcttatttctgtaaataag CRISPR spacer tttatttctcctgcgcttttcttatttttgtaaataaa Protospacer ************.**************.*********.
45. spacer 2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_003216 (Listeria phage A118, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
tcgaatgtgtaagcttctgagtaacctagca CRISPR spacer tcgaatgtgtaagcttccgaataacctaaaa Protospacer *****************.**.*******. *
46. spacer 2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AJ242593 (Bacteriophage A118 complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
tcgaatgtgtaagcttctgagtaacctagca CRISPR spacer tcgaatgtgtaagcttccgaataacctaaaa Protospacer *****************.**.*******. *
47. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693541 (Marine virus AFVG_25M436, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
-tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ataca-ggttaccaatcaaaccgctattaac Protospacer **** *.********** **********
48. spacer 2.14|500751|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK327943 (Escherichia phage vB_EcoM_G53, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
atctatattatcatacgtcaaggaagggta CRISPR spacer gtctatagtatcatacctcaaggagaagta Protospacer .****** ******** *******...***
49. spacer 2.1|499892|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK813941 (Aeromonas phage 4_L372XY, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttcgtccaatgtacctcgccttttttgtct CRISPR spacer taatttcaatgtacctcgccaattttgtcg Protospacer * *.************** *******
50. spacer 2.8|500355|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_041887 (Rhodococcus phage Weasels2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcatatattatgaatatcgagatagtgttc CRISPR spacer ttctatattatgaagatcgaaatagttatg Protospacer *. *********** *****.***** *
51. spacer 2.9|500421|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_015498 (Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5 plasmid pGLAAG01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gttttctattttggtgactttagtactttt CRISPR spacer gccttctattttagtgactttagtagtgaa Protospacer *..*********.************ *
52. spacer 2.11|500553|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP053711 (Acetobacteraceae bacterium strain PAMC 26569 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tattcgatctatcggacgtgtcgacattat CRISPR spacer gattcgatctagcggacgtgacgacacctc Protospacer ********** ******** *****.. .
53. spacer 2.11|500553|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP053711 (Acetobacteraceae bacterium strain PAMC 26569 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tattcgatctatcggacgtgtcgacattat CRISPR spacer gattcgatctagcggacgtgacgacacctc Protospacer ********** ******** *****.. .
54. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP042479 (Citrobacter freundii strain C50 plasmid pC50_001, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcaca Protospacer .**.*********** *********.* .
55. spacer 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP043436 (Campylobacter fetus subsp. venerealis NCTC 10354 plasmid p3226, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taacctttaaaattaaattgaaggtgcgga CRISPR spacer caacctttaaaattaaatttaaagaaatta Protospacer .****************** **.* . *
56. spacer 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP016721 (Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC11 plasmid pUC11B, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taacctttaaaattaaattgaaggtgcgga CRISPR spacer aagaatttaaaattaaatagaaggtgataa Protospacer *. ************* ******* .*
57. spacer 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP016727 (Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC08 plasmid pUC08B, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taacctttaaaattaaattgaaggtgcgga CRISPR spacer aagaatttaaaattaaatagaaggtgataa Protospacer *. ************* ******* .*
58. spacer 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP008809 (Campylobacter fetus subsp. fetus 04/554 plasmid pCFF04554, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taacctttaaaattaaattgaaggtgcgga CRISPR spacer caacctttaaaattaaatttaaagaaatta Protospacer .****************** **.* . *
59. spacer 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP008812 (Campylobacter fetus subsp. venerealis 97/608 plasmid pCFV97608-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taacctttaaaattaaattgaaggtgcgga CRISPR spacer caacctttaaaattaaatttaaagaaatta Protospacer .****************** **.* . *
60. spacer 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP018792 (Campylobacter sp. RM8964 plasmid pVIC8964, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taacctttaaaattaaattgaaggtgcgga CRISPR spacer caacctttaaaattaaatttaaagaaatta Protospacer .****************** **.* . *
61. spacer 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP016699 (Lactococcus lactis subsp. lactis strain 275 plasmid p275A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taacctttaaaattaaattgaaggtgcgga CRISPR spacer aagaatttaaaattaaatagaaggtgacaa Protospacer *. ************* ******* .*
62. spacer 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP018794 (Campylobacter sp. RM12175 plasmid pVIC12175-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taacctttaaaattaaattgaaggtgcgga CRISPR spacer caacctttaaaattaaatttaaagaaatta Protospacer .****************** **.* . *
63. spacer 2.6|500223|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KC699836 (Bacillus phage SIOphi, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taacctttaaaattaaattgaaggtgcgga CRISPR spacer tccaacttaaatttaaattgaaagtgcggg Protospacer * .***** **********.******.
64. spacer 2.9|500421|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015799 (Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid cp32-13, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gttttctattttggtgactttagtactttt CRISPR spacer gaaaataatgttggtgactttattactttt Protospacer * . ** ************ *******
65. spacer 2.11|500553|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014120 (Paraburkholderia sp. CCGE1002 plasmid pBC201, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tattcgatctatcggacgtgtcgacattat CRISPR spacer ttttcgatctatcggacgtggcgctgggaa Protospacer * ****************** ** .. *
66. spacer 2.12|500619|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_015427 (Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p4BKT015925, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tattgactcggaaatgaaaacaaaaggtca CRISPR spacer taaatcttcggaaataaaaacaaaaggttg Protospacer ** .********.************..
67. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP041048 (Citrobacter sp. CF971 plasmid pBM527-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
68. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN783744 (Klebsiella oxytoca plasmid pFDL-VIM, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
69. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_012885 (Aeromonas hydrophila plasmid pRA1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
70. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP022274 (Citrobacter freundii strain 18-1 plasmid pA18-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
71. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP042536 (Citrobacter freundii strain E51 plasmid pE51_002, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
72. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP034714 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Mikawasima strain RSE15 plasmid pRSE15, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
73. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP010360 (Enterobacter roggenkampii strain 35734 plasmid p35734-141.404kb, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
74. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP012168 (Enterobacter hormaechei subsp. steigerwaltii strain 34998 plasmid p34998-239.973kb, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
75. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN783743 (Escherichia coli plasmid pGA_VIM, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
76. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP034084 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain R210-2 plasmid pR210-2-VIM, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
77. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MH220284 (Aeromonas sp. pRIVM0001_VIM-1 plasmid pRIVM0001_VIM-1_171012_B12, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
78. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MG228427 (Kluyvera cryocrescens strain BO64W plasmid pKC-BO-N1-VIM, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
79. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MG550958 (Escherichia coli strain G3216 plasmid pG3216.2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
80. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MH325469 (Enterobacter hormaechei strain Ec13 plasmid pEc13, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
81. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MH325468 (Enterobacter hormaechei strain Ec09 plasmid pEc09, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
82. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MH594478 (Citrobacter freundii strain AA593 plasmid pIBAC_Incx3_A/C, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
83. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MH594477 (Citrobacter freundii strain AA535 plasmid pIBAC_IncA/C, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
84. spacer 2.13|500685|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MG053108 (Citrobacter freundii strain 33587 plasmid pCf587, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tacatcgctaccaatcaatccgctattaag CRISPR spacer ggcaccgctaccaatccatccgctatcgca Protospacer .**.*********** *********.. .
85. spacer 2.9|500421|30|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JQ680352 (Unidentified phage clone 1013_scaffold1713 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gttttctattttggtgactttagtactttt CRISPR spacer cctttctattttggtgagtttagtgaccca Protospacer .*************** ******. ...
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
275720 : 318123
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP054042|275720:318123|DBSCAN-SWA 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MVLGSISIAGMSVGELIALISLIAAIVGFVIRWALVAPLRNMIDSLDITLKSLREEMSESKKDRMSLREKQNDHDKEIALLKREDKAIWKYVTEKNEKEVK |
65 | Listeria_phage(95.31%) | tail,integrase,terminase,holin | attL 276257:276276|attR 315664:315683 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
322041 : 329885
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP054042|322041:329885|DBSCAN-SWA ATTAACTATTACTGATTTTCAGCCCTACTTGCGCTGGTGTTTCTCCGCTTCTAAGGCGCTCTGCAATCTGATCTAGTTTCCGGAGACGATGATTAATACCTGATTTACTTACTTGACCCGTTGTCAGCATTTCGCCTAGCTCTTTTAAGGTAACATCCTCATTAGCTATACGAAGCGCTGCAATCTCACGCAGTCGTTCTGGTAAAGCTTCTAGTCCAACGGTTGATTGGATATACTTGATATTATCGATTTGTCTGACAGCCGCATTAATCGTTTTGTTGAGATTCGCCGTTTCACAGTTCACTAGCCTGTTCACCGAATTCCGCATATCACGCATAATTCGAACATCCTCAAAATGAAGAAGCGCGCTAGTTGCTCCGATAATACTCAAGAATTCCGTGATTTTTTCCGCTTCTTTCAAATAGGTAATAAAACCATTTTTCCGTTCAAGCGTTCGCGCGTTAAGATCAAATTGGTTCATCAAAGCGCAAATTGCCTCGTTGTGCTCCTCATAAACAGAAAAAATTTCTAAATGATAGGAAGAAGTTTCCGGATTATTAACTGATCCACTTGCCAAAAAGGCTCCGCGCAAATAAGCACGTTTGGCGCTTCTCTTCTTAACAAATCCCCTATCAATCGATTTCGTAAACGTCATCGGTGGCTCTAGTATCCGCAAATCTTCCAAAATCCCCCGTGTACCAGACTTCAATCGAACTATATAAACATTATTTTTTTTCAGCTTCATTTTGCGACGTACAAGAAGTTCAATTGGCACTTCATATAAGTCTTTCAGTAATTGATACATTCGTCTAGCTATAGCGGCATTCTCTGTTTGGACATCCATGATGACTAATTGACTCGAAAACGAGATGGCGCCATTCATTCGAATAAAAGCTGCGAGTTCCACTTTTGCATCGCTATCACTTACGTCCATATGGGTTAATTCTTTCTTGGTTTCCGATGCAAATGACATGGCTTACTCACTCCTTTTCATTAGTTTGGTTAGGTAACATCGCTAAAAGCGCGTCCGCCACCTTTTCAGCGGCATGGCGCACAAGACCATCCTCTGTAGAAAGAAAATCTTGATAAATTGCTTCTACACCAAGTTCTTCCATTCCTTTAGCATTATGCTCTACTTGCGCAACGTCTTCTGGGAATAGAAGCTCTTTTGGAACAGTCGTCGTATTAATTAACGTTTTATCTATAAATGATTTCCCCACATGCTCATGGATAACTTTAATGTGATCCGCATCTGAGAAAAAGTCGGTTTCGCCAATTTGCGTTAAAATATTCGTAATATAAACTTTCGGAGCCTTACTTGCTGTGATTTCATCGGCCAACTCCGTAAGTAATAGATTTGGTAAGATACTTGTGTATAAACTTCCTGGACCAATAACAATCAAATCAGCCTCTTTCACTGCTTCGACTGCTGTCGGATAAGGTTTTACATTTTCTGGTTCGATATACACACGATTAATATGCTTTCCTTGTAACGGGATAAGCGATTCACCGTGCACAATAGAACCATCTTCCATTTCGGCATTTAAAATAAGTGGTTGATCCGTTGCTGGAATAACTTTGCCGCGGATTTTCAGCACCGTTGCTAGCACATTAATCGCATCAACATAACTATCATTCAATTGCGATAAAGCCGTTAAAATCAAATTCCCAATAACATGTCCCGATAAATCACCATCTACCGCAAAACGATACTGGAATAAATCAACAACACGTGGATCGACATTGGATAAAGCCAGCATAACATTGCGTATATCACCTGGTGGAAGCACATCCATTTGCTCGCGAATTTTACCAGAACTACCACCATCGTCCGCTACTGTCACGATGGCAGTTAGATGAATGTCCTTCTTTTTAAGCCCTTTTAAAATAACTGGAAGACCAGTCCCCCCACCGATTACTACTACTCTAGGTTTCGTTTCCTTTTTCATATTAACGACCCTTTCTACGTTTCATATCTCGGTGCGAAATCGTTGTCTCATATTTTTGTTGAATTGTCTTACCAACAAACTCTGTCAAGGCTACCGAACGATGCTGTCCTCCAGTACATCCAATGGCAATAACTAATTGTGTTTTTCCTTCTCGTTTGTAAAAAGGGAGTGTAAACATTAATAGATCTACTAACTTATCTAAAAAGGTCTGCGTTTCTGGCCATTTCATCACGTATTCATAAACATCTTCATCAAGCCCTGTCAGCGGACGCATTTTGTCAATGTAATGCGGATTCGGTAAAAAGCGTACATCAAACACTAAATCAGCATCAATCGGAATGCCGTATTTGAAACCGAACGACATCAATTGCACATTGAATATATCTTTATCTTCGGTTTGGAATTCATTGTTAATTCGTTCTCTGAGTTCGCGCGGTGCCATATTTGACGTATTAATAACTAACTGCGAACGCCCTTTTAAATCGCTAAGCAGTTCGCGCTCTGCATTAATCCCATCAAGCACAGACCCATTAGGCTCCAGTGGATGGTGGCGGCGCGTTTCTTTATAACGCGAAACAAGTACCTTATCATCAGCCTCTAAAAAGAGGATTTTCGTTGTTATAAAATTGGTATTATCTAGCTCATCTAGCGCTGGTTCAATGGAATCGAAAAACTCACGGCCGCGAAGGTCCATTACGAGCGCGATTTTATCCATTTTATCGCTTTCTTTCATTAACTCCCAGAATTTCGGAAGTAAACTTGGCGGTAAATTATCTACACAAAAATAACCGAGATCTTCTAAAGACTGCATTGCAACTGTTTTTCCTGCCCCAGACATCCCAGTAATGATTACTAATTTTAATTGTTTAGAAGCCATATCTGCCTCATCCTTTCGCACAAATAATATCTACCTTCCATTTTAGCACACTTCCCACTAGAAAATCCCGGAAAAGTCTCTAAAGCGAGTTTCCGGGATTTTTCTTTTTAAGCTTCGATATGTTGCATCAAATCAGCTTTCACTTTTTCTAATTTTGCCGTACTTTCTTCTTTACTTTCACCACGAATACTAAAGTAGAATTTGATTTTCGGTTCTGTGCCCGATGGACGTAAACAGAACCATGAACCATCTTCAAAATAACATTTAATGACATCTGCTGTTGGTAAATGAATTGCTTCGGTTTTCCCTGTTGCAATCCAAGTCGTTTCACTTCTCAAATAATCTTCCGCACGTTCTACTACGAACCCACCCATACTTGTTGGCAGTTGTTCACGGAAGTTACTTGTAATTTCTTTGATGCGCCGAGAACCATCTTTTCCACTTAACGTAAGTGAAACGAGATCCTCATTATAATAACCAAATTCATCATAAATTTGATCTAAATCTTCTAATAAAGTTCTACCTGCTACTTTGCTAACGAGCGCCACTTCAGCAACCGCAAGAACGGCTTGAATCGCATCTTTATCACGCGTAAACGGCTTAACCATATAACCATTGCTTTCTTCATAACCAAATTCAAACGTATGCTTGCCAGTTTCTTCAAAGTGCTTAATTTGTTCTGCAATAAATTTGAAACCAGTTAATACTTCAATCATTTCAGCGCCGTAATGTTTCGCGATTTCTGTTCCAAGATTACTTGTTACGATAGATTTTAATACCGCTGCATTAGCCGGCAACTCATTTTGCGCTTTCTTTTGTTTTAATAAATAATGTAAAATAATCGCACCAATTTGGTTTCCAGATAAAACTTTGTATTCTCCGTCCGCATTACGAACAGCCACGCCTAAACGGTCAGCATCCGGGTCGGTTCCTACTAAAATATCCCCGCCAAACTTCTTACCATATTCAATCGCAAGTAAAAAGGCTTCGCGGTTTTCCGGGTTAGGCGATTTTACCGTTCCAAAATCAGGATCATTCACAAATTGCTCGTCAACCTTAACAATGTTCGTAAAGCCAACACTTTCAAGCGCAGGAACGCCAAGAATTCCGCCAGTACCATGAAGCGGCGTGAAAACAATTTTCAAATCCTCCCCGCGTTCTTGAACAAGCTCTTTATTGACAATAACCTCTTTTAATTTTTCCAAATATGGACGGTCTACTTTTTCACTGATTACCTCAAGTAAACCATTTTCAATTAATAGCTCTTGGTTCGCTACTTCTACAGAAAAAATATCCTCTACCGCGTTTATGTATTCAATTACAGCACTTGCACCTGTTGGAGGCATTTGTCCGCCATCTTCACCATAAATCTTGTAGCCATTGTATTCTGGCGGATTATGGCTAGCTGTGATAACAATTCCACCAAACGCATTTAAATGACGCACTGCAAAAGAAAGTTCCGGTGTTGGTCGAAGCGCATCAAAAACATAACTTTTCACACCATGATGCCCTAATACTGCCGCCGATTCAAAAGCAAATTCGCGTGACATATGACGAGGGTCATACGCAATTACTATTCCGCGCTTCTTAGCCTCTTCACCGTTCTCTGCCACAAATTGCGCCAAACCTAGAGAAGCCTTACGAATAGTATAGATATTCATGCGGTTTGTTCCAGCACCTAGTACGCCACGCATCCCAGCAGTTCCAAATTCCATATTACGATAAAAACTATCTTCAAGTTCTTTTTCATTTGTCTCCATATTCGTTAATTGTTTTCTTAATGTGCTATCTAATTTGTCATTAGCAACCCATTTTTGATATTCTTCTTGCCAATTCATTCTCTACACTCCTTCATTTAGAACTCTTTAATTAAAATTTATCAGCTCTCCACTGTGAAACGAAAAGCTGTTCTAGATGTAAAAGGTTTTTCTGGTCGAAGTACAATATCACCAAATCCGTCATGGTTAATCGCATCCACCAAACCCTGTGTTTCCATTGTTATGCCAGCATATTTTGGTACAGCTCGCTCGTCAATCTCAAAAGAGCCATCCAAACTATTCGCCGTATAAATTAATACCGAGTCAGCTTTGGTTTCCATTTCCAAGCGCCGTCCTGACTTTGGATCAAACAAAACTGCATCTGGACGACCATTTTCATGTTTTAAAATGAACGTATGATCCAGCCCCGCACCAACTAATTTTACTTGCTGGTCCTGACTTTGTGTAATCTCCGCTACTTCACGACCTGCACGCAAATCAAAGATAGTATTTTCCGCTAACCGCTTTTCCCCAATTGGGAGGAACTCTTCATCAATTGGTAGGAAGCTATCACTATTGACCCAAAGCTGATGTTGTAAAACCGTTGAACCAGCTTCTCCGCTCAGATTAAAATAAATATGATTGCTCGGGTTATATATAGTCGGCTGATTGCTTCTCGCTTCATAATCAACCAGCCATTCATTTTTATTATTTAACGTATATGTCATTTTTGCATCAATTTTTCCTGGATAGCCATTTTCTCCATCCGCCCAGCAGTATTCAAAAGTCATCACAATTTGATCAAGACTTTTTTCTACTGAAACATCCCAAAGCTTCTTACTAAAATTGAATTTCCCCCCGTGACGATGGTTAGAGCCTTCATTTTGAATCAGTTGAAATTGTTTGCCATCCAAACTAAATTGCCCATTTGTAATACGTCCAGCAACAGGGCCAAGTGTCGCGCCGAAGTAAGGAGAGTGTGCCAAATAATCATCTAAATTTGTAAAACCAAGACTAATATTCGCAAAATCACCAAATTTATCTTTTGTTTCAAGTGAAGTAACAATCGCTCCGTAATTTAAAACACTCATGCGCATACCATGATCATTTATCATCGTCCACTTCCAAACAGTTTCTCCCTCAAACTCCCCAAATCGCTCCTTCATTACTTCGATAAAAATCACATTCCTTCATAAGTTATTAATAGCCATTTGGATGAGATACGTGCCATTTCCAAGCAGTGGCGATAATATCTTTTACATCTGTATAAGTTGGCTCCCAACCAAGAATTTCGCGCGCTTTATCACTAGAAGCAATTAACGTTCCTGGGTCTCCTGCACGACGTGGTACTACTTCAGCAGGGATTTCTTTTCCTGTTACAGTACGAGCTGCTTCAAGCATTTCTTTCACAGAAAAACCGTTACTGCTACCAAGATTGAAAATATTACTTTCTCCCCCATTTTTCAAGTATTCTAGCGCTCTAATATGTGCGTCTATTAAATCTTCTACTTGTACATAGTCACGAATACAAGTACCATCTGGTGTATTATAGTCATCACCGTAGATCGCTAATTTTTCTCGTTGACCAAGCGCAACTTGTAAAATAATTGGCACTAGATGCGATTCTGGTTTGTGATCTTCCCCAATCGAACCATCTGCTTTTGCACCAGCGACATTAAAATAACGGAGTGCAACAAATTTCATGCCGTATGCTTTATCGCACCATTTCATCATTTTTTCCATGATTAGCTTTGTTTCGCCATAAGTACTTTCCGGATTTGTTGGCATATCTTCCGTAATTGGCACGCGTTCTGGTTCACCGTATGTAGCCGCACTGGAAGAAAAGACGATATGCTTCACATCAAATTCCTCCATCACTTCTAAAACGATTTGCGTACCATAGACATTATTATTTAAATAATCCAGCGGTACTTCCATCGATTCTCCTACAAGTGAACTAGCAGCAAAATGAATCACACCATCTACTTTTTCTTTTTCAAAAACTGAACTTAAAAATGCTTTATCACGAATATCTCCTTCATAAAATTTTGCCTTTTTATGAATGGATTCCCTATGCCCTGTTCTTAAATTATCAATAACTACTACTTCATATCCGCGAGTAATTAACTCATCTACTGCATGTGAACCGATATAGCCAGCGCCACCAAGTACAGCAATACCCATTACTTATCTCTCCTAACGCTTGTCTTTGTATTTCATTTTACACTACTCTGGTCTATATAGTCACGCAAAAATGGGTCTAAGATAAATAATCTCAGACCCATTCGAGTTTTCTTTACTATTATTTAGCCGCCTCAGCTTCTAGCGACTCTTTTAATTCTTCTACATATTTTTGAGCATTTTGTCCAGCAAGTCCGCCGTCGCCTGTAGCTGTTACAATTTGGCGTAAGCTTTTCGCACGAACATCACCTGCTGCAAAAATACCAGGAAGATTTGTACGCATTTCTTCGTCCGTTACGATGTATCCTTCATCATCTGTAATACCTAAATTTAAGAATGCTTTCGTAAGTGGAACAAGTCCAACATAGATGAAAACGCCATCTACTGGCATAATCGATTCGGAGCCATCCACAGTAGAAACAAGTTTTGCTCCTGTTACTTTTTTACCATCGCCAACAATTTCTTCTACTGTACTATTCCAAATGAAATCAACTTTTTCATCTTTAAAAGCACGATCTTGTAAAATTTGTTGTGCTCGCAATTTATCACGACGGTGTACAATGGTTACTTTATCTGCATAACGAGTCAAGTAGGTTCCTTCTTCCACTGCAGAGTCTCCGCCGCCAACCACAATTAATTCGCGATTTTTGAAGAATGCTCCGTCACAGACTGCGCAGTAAGAAACACCACGTCCACTAAGTTCTTCTTCACCAGCCGCGCCAAGTTTACGGTGTTCAGCTCCAGTCGCAATAATAATTGCCCGAGCCTTGTAGGTTTTCGACCCAGCTGTTACTGTTTTAAATTCTTTACCGTCAACAACTTCTTTAATATCACCATAAGCATACTCAGCTCCAAATTGTTTCGCACCACTAAGCATCTTGTCGGACAAATCTGGTCCTAAAATGCTATCAAATCCTGGGTAATTTTCTACCTCAGCTGTGTTAACCATTTGTCCACCGGGTACACCGCGTTCAATCATTAACGTATCTAAATCTGCACGGGAAGTATATAAAGCTGCTGTCATTCCAGCAGGCCCCGCCCCAATAATAATCACATCATAAATTTTTTCTTCACTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP054042|322041:329885|322041_323013_-|WP_003722604.1|DBSCAN-SWA MSFASETKKELTHMDVSDSDAKVELAAFIRMNGAISFSSQLVIMDVQTENAAIARRMYQLLKDLYEVPIELLVRRKMKLKKNNVYIVRLKSGTRGILEDLRILEPPMTFTKSIDRGFVKKRSAKRAYLRGAFLASGSVNNPETSSYHLEIFSVYEEHNEAICALMNQFDLNARTLERKNGFITYLKEAEKITEFLSIIGATSALLHFEDVRIMRDMRNSVNRLVNCETANLNKTINAAVRQIDNIKYIQSTVGLEALPERLREIAALRIANEDVTLKELGEMLTTGQVSKSGINHRLRKLDQIAERLRSGETPAQVGLKISNS >NZ_CP054042|322041:329885|323990_324866_-|WP_010990001.1|DBSCAN-SWA MASKQLKLVIITGMSGAGKTVAMQSLEDLGYFCVDNLPPSLLPKFWELMKESDKMDKIALVMDLRGREFFDSIEPALDELDNTNFITTKILFLEADDKVLVSRYKETRRHHPLEPNGSVLDGINAERELLSDLKGRSQLVINTSNMAPRELRERINNEFQTEDKDIFNVQLMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPHYIDKMRPLTGLDEDVYEYVMKWPETQTFLDKLVDLLMFTLPFYKREGKTQLVIAIGCTGGQHRSVALTEFVGKTIQQKYETTISHRDMKRRKGR >NZ_CP054042|322041:329885|328925_329885_-|WP_003722610.1|DBSCAN-SWA MASEEKIYDVIIIGAGPAGMTAALYTSRADLDTLMIERGVPGGQMVNTAEVENYPGFDSILGPDLSDKMLSGAKQFGAEYAYGDIKEVVDGKEFKTVTAGSKTYKARAIIIATGAEHRKLGAAGEEELSGRGVSYCAVCDGAFFKNRELIVVGGGDSAVEEGTYLTRYADKVTIVHRRDKLRAQQILQDRAFKDEKVDFIWNSTVEEIVGDGKKVTGAKLVSTVDGSESIMPVDGVFIYVGLVPLTKAFLNLGITDDEGYIVTDEEMRTNLPGIFAAGDVRAKSLRQIVTATGDGGLAGQNAQKYVEELKESLEAEAAK >NZ_CP054042|322041:329885|324973_326704_-|WP_020246726.1|DBSCAN-SWA MNWQEEYQKWVANDKLDSTLRKQLTNMETNEKELEDSFYRNMEFGTAGMRGVLGAGTNRMNIYTIRKASLGLAQFVAENGEEAKKRGIVIAYDPRHMSREFAFESAAVLGHHGVKSYVFDALRPTPELSFAVRHLNAFGGIVITASHNPPEYNGYKIYGEDGGQMPPTGASAVIEYINAVEDIFSVEVANQELLIENGLLEVISEKVDRPYLEKLKEVIVNKELVQERGEDLKIVFTPLHGTGGILGVPALESVGFTNIVKVDEQFVNDPDFGTVKSPNPENREAFLLAIEYGKKFGGDILVGTDPDADRLGVAVRNADGEYKVLSGNQIGAIILHYLLKQKKAQNELPANAAVLKSIVTSNLGTEIAKHYGAEMIEVLTGFKFIAEQIKHFEETGKHTFEFGYEESNGYMVKPFTRDKDAIQAVLAVAEVALVSKVAGRTLLEDLDQIYDEFGYYNEDLVSLTLSGKDGSRRIKEITSNFREQLPTSMGGFVVERAEDYLRSETTWIATGKTEAIHLPTADVIKCYFEDGSWFCLRPSGTEPKIKFYFSIRGESKEESTAKLEKVKADLMQHIEA >NZ_CP054042|322041:329885|323020_323989_-|WP_003722605.1|DBSCAN-SWA MKKETKPRVVVIGGGTGLPVILKGLKKKDIHLTAIVTVADDGGSSGKIREQMDVLPPGDIRNVMLALSNVDPRVVDLFQYRFAVDGDLSGHVIGNLILTALSQLNDSYVDAINVLATVLKIRGKVIPATDQPLILNAEMEDGSIVHGESLIPLQGKHINRVYIEPENVKPYPTAVEAVKEADLIVIGPGSLYTSILPNLLLTELADEITASKAPKVYITNILTQIGETDFFSDADHIKVIHEHVGKSFIDKTLINTTTVPKELLFPEDVAQVEHNAKGMEELGVEAIYQDFLSTEDGLVRHAAEKVADALLAMLPNQTNEKE >NZ_CP054042|322041:329885|327823_328807_-|WP_009924988.1|DBSCAN-SWA MGIAVLGGAGYIGSHAVDELITRGYEVVVIDNLRTGHRESIHKKAKFYEGDIRDKAFLSSVFEKEKVDGVIHFAASSLVGESMEVPLDYLNNNVYGTQIVLEVMEEFDVKHIVFSSSAATYGEPERVPITEDMPTNPESTYGETKLIMEKMMKWCDKAYGMKFVALRYFNVAGAKADGSIGEDHKPESHLVPIILQVALGQREKLAIYGDDYNTPDGTCIRDYVQVEDLIDAHIRALEYLKNGGESNIFNLGSSNGFSVKEMLEAARTVTGKEIPAEVVPRRAGDPGTLIASSDKAREILGWEPTYTDVKDIIATAWKWHVSHPNGY >NZ_CP054042|322041:329885|326745_327807_-|WP_020246727.1|DBSCAN-SWA MIFIEVMKERFGEFEGETVWKWTMINDHGMRMSVLNYGAIVTSLETKDKFGDFANISLGFTNLDDYLAHSPYFGATLGPVAGRITNGQFSLDGKQFQLIQNEGSNHRHGGKFNFSKKLWDVSVEKSLDQIVMTFEYCWADGENGYPGKIDAKMTYTLNNKNEWLVDYEARSNQPTIYNPSNHIYFNLSGEAGSTVLQHQLWVNSDSFLPIDEEFLPIGEKRLAENTIFDLRAGREVAEITQSQDQQVKLVGAGLDHTFILKHENGRPDAVLFDPKSGRRLEMETKADSVLIYTANSLDGSFEIDERAVPKYAGITMETQGLVDAINHDGFGDIVLRPEKPFTSRTAFRFTVES |
7 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
416345 : 511298
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP054042|416345:511298|DBSCAN-SWA ATCACATTTTTTCTGGTGCTGATACACCTAAAAGCGTCAAACCATTTCTAAGAGTAATTTGTGCTGTCTTAATAAGTGCTAGTCTTGCTTTTGTTACTTCTAAATTATCCATATCAAGTACTTTATTGCTATTGTAGAAACGGTGGAAGGCGGATGCTAAATCATTTAAGTAACGGACAATACGGTGTGGCGCTCTTTTTGCAGCGGCTTCCGTAACAACGTCCGCGAACTCACCTAACACTTTTAATAAATCATATTCTGCTTCTGTTTGTAGTAAGCTCATGTCAGCGTCTTTTGTTACCTCTAGACCTTGTTCTTTACCAGAACGTAAAATGCTAGAAATTCTGGCGTGTGCATATTGTACATAATAAACTGGATTATCATTAGACGTGGATTTCGCTAAACTCATATCAAAGTTCATATGTGTATCTGAACTACGCATTGCAAAGAAATATCTCGTCGCATCAAGCCCAACTTCTTCAATCAAGTCACGCATCGTAACAGATTTACCAGTACGTTTACTCATTTTAACTTGAACACCGTCTTCGAATAAGTGAACAAGTTGAATAATTTCTACTTCTAATTGATTGGGTGAGTAACCCAGTGCTTCAATCGCCGCACGCATTCGAGGAATGTAACCGTGGTGATCAGCTCCCCATATATCAATTAATACATCAAAGCCACGCTCTAATTTGTTTAGGTGGTAAGCAATATCTGGTAAGAAATACGTATAACTACCGTCCGATTTGATTAAAACACGGTCTTTGTCATCTTCAAAATCAGTTGTTCTTAACCACGTCGCGCCATCTTGTTCATAAATATAGCCATTTTCGCGTAAACGTTCTAATGCTGGTAGCACTTTATTTTCTTCATAAAGAGATGTTTCTGAAAACCACTCATCAAAAGAAACGCGGAATTCTTCTAAGTCAGCGCGTAATTTCCCTGTTTCAAATGCTAAAGCATCCACACGGAAAATGGAACGGCGCTCTTCTTCGCTTGTGTGCACATATTTATCGCCGTATTTAGCAGCTAAATCTTTTCCAAGGGAGATAATATCTGCACCGCGGTAACCATCTTCTGGGAATTCAGATTCTAAGCCTAACGCTTCAAAATAACGTGCTTCTGCTGAAAGAACTAAATTATTGATTTGATTTCCAGCATCATTAATGTAGTATTCTCTTGAAACATCAAATCCGGCCATTTTCATTATATTTGCTAGTGAGTCGCCAATTGCTGCACCACGAGCATGTCCTAAATGCAAGTCACCAGTTGGGTTAGCGGAAACAAATTCAATTTGGAATTTTTCTCCTTTACCAAAATCAGACTCTCCGTATTTTTTATCTTCGGTTAAAATAACTGGAACTAAATCAGTTAAATAAGCATTATCTAAGTAGAAGTTGATAAAACCAGGTCCAGCAATTTCTACTTCTTTAATTAATTTGTTGTCTTTTTTTAGTTCTGGAACGATACTTTCGGCAATTTGACGAGGGGCTTTCTTAGCTACTCTAGCAAGTTGCATCGCTATATTAGTCGAATAATCTCCATGCTTTTTATCTTTTGGTACTTCTAGTAAAATTTCTGGTACTTCTGTTTCTTCTAAACCAACCGCTTGAACAACTGCTTGTTTGATATGTTCAATTAGTTTGATTTGGTTCTCTTGCATGACATTCATTCTGCGTCCTCCTCTATTTTCATTAAAACAGTATATGAGCCAATGTATTCGCCGTGGCTTAGCAAATCATATTGAAAAGCAACTTCGCTCAATACATCAGGCTTATTTTCATATAGTTCTTCCATTGATACTAATTCTGATTCTAATTGTAATTTTCCTGCCCCCGAATCAACAGACGCAGTACTTCTCCGATTATCTCGAAAAAAGTGCATTCTCATATTTACGGCACCACTTCTCATTAAAAGCAGTTCGTTGTCAGCAATTTTAAGAACCGTACGAATTGTTCCAGCTAATTGTTTTTCCTCATAATGCAGATAACGATTGCCTTTATCGCGGTAAAAAACACCCGAAACAGACATATCGGATTTCTCTTCTGCATCCATCTGACGGATGACATTGGTGATATGAATAGTTACTTTTTTTCGTTCCATTTGATTAGCTGTCATATCGCTTATTTACCCCTTTCCGGTCAGAAGAATAGACGCATTATATTATAGTGAAAAATAGCATGAAAAGCAACAGGTTAAAATGATGTCAGACCAAATATTGTTAAAATAACATTTAAAACAAACGGAATAACCGTATTAAAAATTGGCTGAATCGTAAATGCTGAAATAGGCGTTAATGCAACTACTAAGAAAATAAGCATCGCATAGCGTTCAAGTGGTTCCAGCTTAGACCTGGTTGACATTGGTAAAAACTCCACTAATATTTGATAACCATCAAGTGGTGGTAGTGGAATCAAGTTAAACACAAATAGCACTAGATTCAATTGCACAAAAATCATTAAAAAAGTTTCCGCAACGGAGCCATATGTAAAGAAGGAATAATTTAGAAACAAAGCATAGAACCCCACACCAACCATCGCAAGTAGTAAATTACTTACTGGTCCTGCAAGCGAAACAAGTATACTTCCAAGGCGGCGTTTTTTTAATTTAAATCGATTTACCGGGGTCGGCTTAGCCCAACCAAAACCTGCAATTAATATCATTAGCAAACCGAATAAATCAATATGTACCATGGGGTTTAGAGAGAGTCTCCCCTCATTTTTGGCTGTATCATCTCCAAATGCGAGAGCGACCAAGGCGTGTGCCCATTCATGAATAGTAAAAGCAATTAATAATGTAACTAAAACATACGGTATCATTTCGAGTGGATACGCGAGAAAACTAGGCATAGGAGCCTCCTTTATCTTTTATTGAGTAATTTTTATATGCTATAATGAAAAAAACGTTGATTGAGGTGAGAAAATGCCATTTGTTACCATTCAATTTTTAGAAGGTCGTACAGACGACCAAAAGAAAGCTTTAGTTAGTGAAGTAACAGAAGTAGTTTCCAAAAATCTAAAAGCACCAAAAGAAAACATTCATGTGATTTTAGAAGAAATGAAAAAAACTGATTACGGTGTTGGCGGCGTAAGAAAATCTGATATTTAAGTGTGTAAGAAGCAAGGCAAAATGCCTTGCTTTTTTATTTTTCCTTTAACGAATGCGCATGGATGAGGGCAATCATTCTTTCTGTAATTGCTTGGTCTACATCGCCACTTTCGATAAAATCGAGCGGATAATATAATTTAATATCGGTTCGACGCTCTCGACCAATCGCCTCAACAACCGGAGACTCGGTAGATAACTCACGCAATTCACCATTTCCCATCAATAGTTTAATTGGGTCTTTACCGCTTCCCACTCCTGGAAGATAGTAATCATAAGGTAAATCGCTGGAAGAATCAATTACTAAATAATACGACGGATCAATATCAGCTTTTTCAAGAAGTCCTTTTAGTTCTGCGTAAAGTTCTGCATCTTCTTTTGGATCGTAGTTAATGTATCGCAACAATCTTCTGTTCAAAAAGCGACTACATAAATCACTCAAAATCGGATCTTCTTCCTCTTGCCAAATGGAAAAATAGTACATCAACACAATATCATCAAGCACAATATAATCTTTTAAACTCACTTCATTTAAAAAGAATGGTAGCACTTGAACGGGAGTAACTTGAAATTCATATCCAGCGCAATATAACTTTTTGGCACGCTCAAGTATTTTCCATAATAGCACTTCCCCACTCCGACTAACTGGATGGAAATACACTTGTTGATACATTTGATAACGACTCATAATATAGTCTTCCACCGCATGCATGCCAGAATATTTCACAATAACACCATTGCCATCTGGACTAGGGCGTAGAACTCGCAAAATCCGTTCTAAATCAAACTTTCCATAGCTTACTCCAGTATAATAGGCATCTCGCAGCAAATAATCCATTCGGTCAGCATCAATCTGACTCGAAATCAACTTCACCAATGTTTGATTCGGATAATTTTTCTTAATAATAGCAGCAACCTTAAGCGGAAATTCTTCTCCTGCTCTCATCAATACTTCACTAACTTCCGTATCTCCAATAATTATCTCTTGAGTGTATGCTTCATGGTCCGTTCCAAAAACTTTTTCAAAAGCATGAGAAAATGGCCCGTGACCTAAATCATGCAAAAGCGCTGCACACAATGCCACCATGCGCTCTTCTGGATTCAGTTGCGGTTCATTCGCAAATGTTACATCGATTATTTGCCGAACAATTTCGTAAACACCTAATGAATGATTAAAACGGCTATGTTCCGCCCCATGAAAAGTAAGTGAAGTTGTCCCCAATTGATGGATACGCCGCAAACGCTGAAACTCTTTTGTGGCAATCAAATCCCAAACTATCTTATCAGAAACATGTACATATCCATGAACCGGGTCTTTGAATACTTTCTCTTCCCTTAGTTTCTCTGTTAAATAACTCATACAACCTCCTCCTCTCAAGTAAGCACTTTATCATTTCGGGCAATTAAACGTTCGTAATAGGCTGGGAAAAGATCTAACTCTTCAGACGTAAGCGTACCAGATACAAGCTCACCTGCGTAATGTCGCAAACTATTGAAAAGACGTACTAACGTCCCATTTAAACTTATATCATTTTTCATTAAGTCCGAAAGCGAACCCATAACATTCGGATTTACATCTGGAAAAGTATATTTTGTTTGCTTTGCTTTTCCGCTAATCGTATAGAAATCGCGAATCAGTTCTGAGCGAGTAGTTTGATCCCCGTCAATAGCTAAATAAATTTGGACCGCTACCCCTTTTGCCATTCTACGCTGAGAAATACCGGCAAACTTTTTCCCTTGAATACTAAGGTCATAACTACCAGGACAATAAGAGTCTTCTATTTCTTTCGCTTCAATTACCTCATTACAATCTACGAACATGTCTTTGATTAGTGTAAACATAGTTTCATAACCACGTTCAATCGCAATTCCGCGTTCTGCATCTGGAAGAACCA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105 | Listeria_phage(86.67%) | tail,portal,terminase,holin,integrase,plate,capsid,tRNA,protease | attL 449727:449776|attR 489044:489093 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
658471 : 668502
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP054042|658471:668502|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP054042|658471:668502|666711_667020_+|WP_072215787.1|DBSCAN-SWA MGRLHQCNCNTGKNCTDNIQKFSYTSSRIRKKHVISPLFINTYRIRDTAPNVNCSSNHMHETQRFNSETYTIDMKHEPKAPKSIYQLVETVYINKASKTKTD >NZ_CP054042|658471:668502|662581_664048_-|WP_003722118.1|DBSCAN-SWA MWETKFAKEGLTFDDVLLVPAKSDVLPNDVDLSVEMAPSLKLNVPIWSAGMDTITEAKMAIAIARQGGIGVVHKNMSIEQQAEEIEKVKRSESGVIIDPFYLTPDHQVFAAEHLMGKYRISGVPIVNNEKERKLVGILTNRDLRFISDYSTVIKDVMTKENLVTAPVGTTLKQAEQILQKHRIEKLPLVDEAGILKGLITIKDIEKVIEFPNSAKDKHGRLLAAAAVGITNDTFVRVEKLIEAGVDAIVIDTAHGHSAGVINKISEIRQTFKDVVIVAGNVATAEGARALFEVGVDIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATVAREFGKTIIADGGIKYSGDIVKALAAGGNAVMLGSMLAGTDESPGETEIFQGRQFKTYRGMGSLAAMEHGSKDRYFQADAKKLVPEGIEGRVPYKGSVADIIFQLVGGIRSGMGYTGSPDLRHLREEAAFVRMTGAGLRESHPHDIQITKEAPNYSIS >NZ_CP054042|658471:668502|660648_662421_-|WP_003732117.1|DBSCAN-SWA MIEQARAILQQNFGYQDFRNGQVDVISKLCAGEDTLAIMPTGGGKSLCYQIPALLFDGLTIVVSPLISLMKDQVDALVSEGIAATFINSTLTNREIDIRLDAAFSGELKMLYIAPERIETPGFQRLIEQVPISLFAIDEAHCISQWGHDFRPSYLTLCDSLDKMTRRPLVIALTATATQAVSDDICRLLKIRADSVVKTGFSRDNLAFQVVKGQDKDKYLIDYLTKNVTESGIIYASTRKEVERLHSFLQKKGVESGMYHGGMTDLARKDWQEKFLYDDIRVIVATNAFGMGINKSNVRFVIHYNIPRNIEAYYQEAGRAGRDGVPSDCILLFSPQDSRIQQFLIEQSEMDDERKQNEFAKLRQMTGYGYTEICLQKYIVQYFGDDEPNCGKCSNCLDTREATDITILAQQVFSCIKRMGERFGKVLIAKVLTGSADQKVKDWRFDELSTYGLMKDASQKDVLQLIDYLTAEKYLQPTDSQFPSLKLTDRAVSVLRGELKVERKQAKRAEKVKIDVNSDLFEKLREVRRELAAKHKVPPYIIFSDETLREMCAYMPQTEDALLEVKGIGAMKRDKYGAEFLAVLQQEASK >NZ_CP054042|658471:668502|664334_664865_-|WP_003732118.1|DBSCAN-SWA MEITIVKGDITEQEVDVIVNAANSGLLGGGGVDGAIHQAAGPDLLKECQEVINRIGSCPAGEAVITSAGDLKATYIIHAVGPIWKDGEHQEANKLASCYWKALDLAVGKDLTSIAFPNISTGVYGFPKKLAAEVALYTVRKWVEEEYDASIKEIRFVCFDEENLKLYNKLINSEVV >NZ_CP054042|658471:668502|658471_660625_-|WP_003722116.1|DBSCAN-SWA MTKTLVLAEKPSVGKDIGRVLGAKQGKNGYLEGGKYVVTWALGHLVTLADPERYDSKYKSWNMEDLPILPEKMKLEPIKQTRKQYETVKKLMNRTDITTIVIATDAGREGELVARWIIDYAKIKKPLKRLWISSVTDKAIREGFEHLKPGKAYENLYHSAVARSEADWVVGINATRALTTKYNAQLSCGRVQTPTLAMIQHREEEIRNFKSREYYGITALTEQESFTWNNGQTFDKALAEKLVKSLQGENAVITDVSMKEKKTFSPGLYDLTELQRDANNRYDFSAKETLNIMQTLYERHKVLTYPRTDSRFISTDIVPTLKERLVACGVGENAKAARQISVKPIKANKSFVDNSKVSDHHAIIPTEQPVSLGDLSDKERKIYDLVVKRFLAVLSDPYIYEETSVKAKIGQEEFTLKGKVVKSLGWKSIYGESREPDQLTKMKKGDTIPVKRINLETGKTKPPARFNEATLLSAMENPSKYMETTNKALAKTLGETGGLGTVATRADIIEKLFNSFSLEKQGKDIQITSKGRQLLELVPEDLKSPELTARWEQKLSKIAKGELDYRKFTAEMRDYAKKAVTEIKQNDKKFRHDNITSQKCPDCGKPMLKVKGKRGTMLVCQDRECGHRESVSRTTNARCPNCHKRMEMRGEGDKQIFVCVCGHREKLSAFQQRRDKQKNKNVSKTDVAKFMKKQNKQEDEPFNNPMAEALAKLKLDK >NZ_CP054042|658471:668502|667047_668502_+|WP_003725314.1|DBSCAN-SWA MEHNKLKPFPKDFLWGSASAAYQVEGAWDEDGKGPSVWDEFVRIPGTTFKETNGDVAVDNYHRYKEDVALMAEQGLKAYRFSVAWSRVIPHGNGEVNEAGLKFYDNLIDELLSYGIEPVVTLYHWDIPQGLQDEYGGWESRKVVEDFTNYAALLFERFNGRVKYWVTLNEQNVFISHGYKLAYHPPGVSDDKRMFAANHNANLANASAIAKFRELGTSGKIGPSFAYGPSYSIDANPANVLASENSEEFNAHFWMDVYTWGEYPTATWNWLEEHGLAPEILPGDTELLKKGKPDFMGVNYYRSMTHAFNGKDGVGSGKMNTTGEKGTSEETGVPGLYKNTNNPYLEKTNWDWDIDPTGLRIGLRRITNRYKLPIMITENGLGEYDSLTEDHKIHDEYRIEYIRAHALAIQEAITDGVEMLGYCTWSFTDLLSWLNGYQKRYGFVYVDRDENDEKELKRYKKDSFYWYKKTIEANGANLVEEQGK >NZ_CP054042|658471:668502|664922_666533_-|WP_003732119.1|DBSCAN-SWA MTIVAMNEVVKSFTGDIILEKVSLQLEEGERVGLIGRNGEGKSTILKILKGTEGVDSGIVTSKKGAKIGLLEQLSTVDPNIIVEQYLRTSFGELEDLEKELRALEGEMATNSSEKLMNRYGDKMALFGELGGYEMDANLNKVVNGLGIGLLLSQRWGDLSGGEKTKAALAHLLLQKTDLLLLDEPTNHLDLMAVEWLTAFLQHYSGTVLVVSHDRYFLDEVVEKMVELENRELIVYHTNFSGYLKEREERLLREFQDYKDQQKKIKKMQQAIKRLRQWAMQANPPNDAMFRRAKNMERALERMEKVKRPVLTQKQMQLQFDEAGRSGQEVVVMENLSKSFSEKTIVQEVSLQIRQGERVAIIGENGAGKSTLLKIMEGKVVPDDGVIKVGASVKIASLSQQMEELNEEMTVLDAFRDKVAVTEGEARQMLAGFMFYGEMVFRKVRNISGGERMRLRLAQFINMPVNTLILDEPTNHLDIASREVLEEAIRAFSGTIITVSHDRYFIDQLCSKVIWLENKQLTVYEGNYSYATNKRR |
7 | Tupanvirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
884227 : 935456
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP054042|884227:935456|DBSCAN-SWA TTCAAAACTTCTTGTAAACATCAATGGAATTGCCAAAATTAATGAAATATCCACCATAATCATACATTGGACCATATTTTTCCGCGTAATGAGAAACTGTATGGCGCAAAAATTCTTCTGTTACCTCTAAAAACTCCGCTACTTCAAAATATTCTCGTAAGCCTAGATAAAAACAAGCAATGATGTCATCAAGCGGTATTAGTTCCTCATAACCTTTGCGACGAGCGAAAATTTCTTGTTTTTTATCCATGATTGTTTCCTGTTTGGTGATATTACCTACAGTGTATTTGTAATGCATCAATTCTTCTACTAAAACACAGCCTTTTTCAATGGAAGATTGATCCTTACTAATAAAAATCATCCCATTTAAATAAAGTCCCGGAAGTTTGTAAGGCATTTTCTCTTCTCTGATTGTTACCTCGTCTTGGTATTTATTTACCAATTTTTCGTACAATAAAATCACATCCCGCGATGGAGTTTTTTCTTCATCTCTATATAAGCTAAAATATCCCGCATTTCTTCTTCTGTTACATCATCATCAATATGGGCTGCAATTGTCACCAAGCGTTCATCAACAGGCGGTAAATTTCTTTCAGGAAAAAAGTCATCTAATCGTTTGTTGAAGATTTTTGCAAGTTCAAATAAAACATCTTGATTTGCTTTTCGATCGCCATTTTCATAGCGGCTAATAGTTTGGCGAGTCGTATGAAGCTTCTCTGCTAATGCTTCTTGGTTTAAGCCTCGTTCCTCGCGATATTGTTTTATTTTATTTCCTACAAATTTATTTAACTCCATAATAATTGCCCTCCACATGTTTATGGCTTCAGTATAGCACTTTTAGCACCAAAACGGAACTTTTTCGAACATATTTGTCGGATAAAGTTTACCAGTAACCAAAATGGTGCTATAATATTTGTAGAGCTAGAAAATAAATGCGGCTGATTTTGCATCGATAGCACCGAATTGGTGACAAGGCTGCTATATTAATTTATGAGATGGAAGTGGGAATGGATGGATAGAAAACTTTTAAAAGAAAAGCAAATCCAACTAATTTTTCAACTAGAAGAAGAAGAAAATCGATTTATTCGAAAGCGTTTGATAGAAGAGTTGGAGTTTTTTGAAGCACTTGGGGATAGGGAAAAAGGACTTCTAACAGCGGAGCAAAAGTTGCTTATTTTAACACCTAGTGAGTACCGAGAATACAAAAGAACCAAATCAGATGTGCAAATTAGTAGGATAATTGGAGTATCGAGATCGTCACTTGCAGAATGGAAACGAAAAAAAGGTTTAAATAGAAAAAAGTCGCAACCGGTTCAGCAGGAAATGATTGATGTATTAGCTTTTCATTTAGATAAAACAAAAGAAGAAATTGGCGCTTTACCTGCTTCGGCGATTGAATGTCAGTATGTGGCTTTTGTGATTAATGAAGCCAATAATTAAGGAGTGATAAAATGCAGGTTTTAGTTTTACCAGAAAATAAGGATATCAATTATATAAAAACGGTCCAAGAAGTAAAACGATTTTTTGCGGATTTCGAGAGATTTCGGATGATTACGGGGTTATCAAAAAAGCCACATTTACTTAGAAATGGTTTTCTGGAAGAGCCGCAGTTTGAGCCGGTAGCATTTTCTGCTAGACATAATAAAGAAGTCATTTTGGAAGCGCGATGGTTGGTAGAGAAATATACTGAAATGTTGAATCAGATGGATGATTTATATCGAACTATTTTGATGGAATGTTACGTGGAACGAAAACAAGATGTGGCGGTAATGATGGATTTACCGTATGAAATTGCCCAGTTTAAACGGATAAAAAAACGGGCAGTGCTAGAACTTGCAACGCTAATGGGAATTTTAGTAAGGAAATGATGATACTTTCGTGATATTTTGAAACATCATTTTCCTATTAATATAGAAGTAAGCTAATTGTCCAGTAAGCGGATGACAATAAAAGCTGCATCAGAATGAAGGTGCACCGATTTTCTGATAATACATGATGTTTTACAAGAAATTTGTTTTTATGATTGGATTTTTCATCCGTTGACATAAACAAATATTCTATTTTGGAAAGTAAAGTTCGGAGGAATAAATTATTAAATGTGGTCTTGACCGAACTTTGCTTTCTGTTTTAAAGGAGTGAACGCTTGGTGAAGAGTTTGAGCTTCATGAGAGTTTTGGAAGCAGTGAGAACAATGCTCCAGGAAAAAGATGGCCTAGATGTTTCTATTGTAATGCGTGACCAAGTGGAAATGCCTACAACGATGATCGAGATGATTGATCAAGAGGAAGAAGAAAGCCAAACTGCCTGGAAAGAAAAATACCGTTTTGCTATACATCATTATACAAATGAACAGGACTTAGCGGGGGTCGAGAAGATTGATACGCTTATCCAAATGGGTTTCATTTTGCCCGAGGGATACAAATTAGTCGCAGTTCGACATTATGGAAAACAAAATTTAGTCAAAGAAAATACGTTAATTCACGCAAAAACCAGTTTTGAAGTAAGTATTTGTCGTGAATTAAAAGTAAAAATTTAGGGGGAAATATTAATGGCATTTGAAGAGAATTTATATTGTGATTATACACCGGGAGCTGCTAAAGCGGTCGCGGGGAAAGATGTAATTTTAGCAGTTTTTAACGCAGCGGGGGATAAACTATTGGCTGTTGCGGGCCAACAAGGTCTGACTGTAAACCGTTCTAAAGATAGTATTGAAATTACATCCAAAGATACAGTGGGCGGATGGAAATCCAAAATTGGCGGTATGAAAGAATGGTCAATTGAAAATGACGGGTTATATGTCGCTGATGCAGAGTCTCACAAAGAATTGGCGAAATATTTCGAAAGTGACAGCCCTGTTTGCGTGAAAATCATTAATCAAGCATCTAAAAAAGGTCTTTTCGGTGGTTTGGCAATTGTAGCTGACTATAGTTTTGAAGCACCTTTTGATGAAGCGATGACTTACTCTGTAAAACTAGACGGAATGGGCGCGCTTGTTGATTTAACGATTACTGAGGGCGGCGACCAAATGCCCGGCGAAACACCTGTAGCACCAGCAGAATAAAATAGAAAGCCACTGAAATAAGTGGCTTTCCCTTAGGAGGAAAATAAATGTTTGAAGTGAATAATACAACTTATATTTTACGATTTAATAAACAAAAAGTTAAAACGGTGGAATTAACATCAGGGATTAGTTTAGTTGCAGCTTTGACTGCGAATAAAGGGATTTTGAGCTATCAAGTGATTGAAACACTATTTGTTTCAGGACTTGTGGAAGAAAAAGGCTTAGTACCTGTAAAACAAAAAGAAGCTTTGGAGATTTTCGACAAATTAGTAGAAGAACAAGGCTTAATTTCGCTTAATGTAGCTGTTATTGAGAAATTGCAAGAGGATATGGGTTTTTTGTTCCGTTAAAACAGATTGAGTTTGAGTATTTTGGTGCTGAGGACGAAGAAGTGGATAGTGAAATGAACCATGATTTCGATTTGGAAAAACAATTTGCTTTTTTTGTAGTTAATTTTCAGATGTCCAAGCATGATTTTGAAGAACTTACTGAAGTGGAGAAAAATTTCATCATGAAAGAATGGGAAAACAAGGTGATTTTTGAATCTACTATGCTTCGAAATGCAGTTTTAAATGCGGAACAAAATCTCAATCGAAAACGAAATTCACGTTTTATTGACTTGCATAAAAAACGTCAGAAGAAAGCCGATGTTAATTATACAGTAAATGCACTTCAAGCAATTTCCGATAATGAAGCGAAGGAAGGTAAAGCGTGGATTGATCGGATTTATGGTGCAAATGGGTTGCGAAGACCTAAAACTAAAGAAGAAAGGGGGAAAATGAATGGCGGATTCTAAAAGTTTTACATTTGAACTCAACGAGAGCGTTTTAACAGCGCAAGTTGGCAGGCTAGATGAAATGGCGATGGTTGTAGAGCAACGATTTTCAGAGCTCAAAATGACTATTGAAGATGTTGGAAATGCTGATCCAGGTTCGAAAATTTCCGAGTCTTTAGGTGGGCTGCAGTCTGGGCTTGGCACGATTAGTTCGGCGTTTGGACAGCTGGGTTCTAGTAGTGAGGCGATTACATCTGGATTCGGTACTGCGGTTGGTTCTGTTGGTGGAATCACGGATGCGTTTAAAAATCTAGGTTCAAGTGTGCAAAATGGTACGTTATTTTCAAGCTTGGCAACCGGAATTGGTGGCATGAGTACCATGCTTGGTGGAGTATCTGGCGGAGTTCAAGGAATTACAAATCTAGCTAGTGGATTTATGGAATTGAAGAATCATTTAGGCGGTTTGATGTCTTCTATTGGCGGCGTTGGTGGAATTATGGGTAAACTGACTTCTCCAATGGGGTTAGTAATTATCGGGATTGTTGCGCTAGTTGCTGCTTTTACGTACTTGATGACGACGAATGAATCGTTCCGAAATACCGTGATGTCAGTCGTAACGCAGGTTGCGCAGTTGTTCGGGCAACTTGTCGCTAGTTTAATGCCGATTATTATGCAAATTGTTACTGCGGTTATGCAAATTGGTGCCGCGTTAATGCCGATAGTTATGCAGTTTATTAGCTTTTTTGCCCAGTTGTTAGCTCAATTAATGCCATTTATTAATATGCTGATTTCTATGCTTATGCCTGTTATTATGCAGATTGTTCAAGTTGTTATGTCGCTTGTTTCAGCGTTATTACCAAGCATTATGACAGTGATCCAAGGCATTATGAGTGTTATTCAATTTTTAATTCCGATAATTATGCAAATCGCGACGGTGGTTGTACAAATTGTTGTAACGATTATTTCTTATATAAGTAAAATTATGCCGATTGTAATGACGATTATTGGCGTTATTGTTTCGATTATCACGACGATTATTAGCTATGTAGTTATTATTGCAACGACAATTGCAAGCGTTATTGGGAAAATTATTAGCTTTATTGCAAGTGTTATTACTGCGGTTATCGGGATTGTGCAACCAATTATTGCCTTTATTACCAATAT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55 | Listeria_phage(20.0%) | tRNA,transposase,tail,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1436620 : 1471061
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP054042|1436620:1471061|DBSCAN-SWA 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45 | Listeria_phage(48.39%) | head,portal,terminase,integrase,tail,holin,capsid,protease | attL 1446314:1446331|attR 1482008:1482025 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1917948 : 1925371
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP054042|1917948:1925371|DBSCAN-SWA AATGAAAAAGGTTATTACATATGGAACATTTGACTTGCTTCATTGGGGGCATATTCACTTATTAAAGCGCGCTAAGGCTCTTGGTGATTATTTAATAGTAGCAATTTCTTCCGATGAATTTAATCGAATTAAACATAAAGAAGCTTATCATAGTTACGAACACCGTAAATTAATTATTGAAGCAATACGTTATGTGGATGAGGTGATCCCAGAGAATAACTGGGAACAAAAAAGAGATGATATAGAGAAATACGGAATTGATGTTTTTGTAATGGGTGATGACTGGGAAGGCGAATTTGATTTTCTAAAAGATGTGTGTGAAGTTGTTTATCTTCCTCGAACAGAAGGGATTTCTACGTCTCAAATAAAAGATGAACTAAAATAAAAATGTGAGAGGAGCATTCTTTTGGAACCTTTAGTAAGTGTAATTATTCCAGTTTATAATGTAGAAAAGTATGTTAAACGATGCTTGGATTCAGTTCTTGAGCAAACATATCATAACCTCGAAGTTATCGTAGTTAATGATGGAGCGACTGATAATTCAGCTAAAGTCATAAAAAGTATCTCAGATAATCGAATTCGTTATTTTGAAAAAGAAAATGGCGGACAAGCTACTGCCCGAAATTTTGGATTAGATGTGGCTACGGGAGATTACATCGTGATGGTAGATAGTGATGATTACATTAGCAAAAACCTAGTAGAAACTTGTTTGGATACTGTACAAAAAACGAATGCTGATTTAGTCTTGTTTACTTCATATAATGTGAATCAGGAAGGAAAAATGCAGTATATAAAGCGTGATAAAGGCATCAAAGTTTTAGATGCAGGTCCAACTCCATGGAACAAATTTTATCAAGCAGATCTATGGAAGGGTTCGCGTTTTCCAGTAGGTTATTGGTATGAAGATCTAGGAATTATTCCAGTCGTCACGCTAAAAGCAAAAAATCCAGTGAAAATCCAGGACGCACTTTATTACTACATAACTGATAGAGCGGATTCACAATCGAATATTCAACAAGTAGATCACTTTTTAGATGTGGTTATTATGTTGGAAAATGTTGAAACAGAATTAAAAAAACTAGGTATTTACGAAGAATCAAAAGATCAACTTGCGTACCTATATATAGAACATCTAATTTATCGTTTAGTTTTACGAAAAGCGATTTACATTACGGATAAGCAAGAACGTAAAAAACTTATTAAGAAAATTAGTACAATTATTCAAGAGAAGTTCCCTAATTGGGGTAGTTATCCTTATCAAGCGGGTGGAAAACTAACTGCAACATTAAAGAAAAAAGCATTATGGCTTTATTTACATCATTTGTACTTGTTGGGTGATTTAGTATGGAAATATCCATTTTCTATCAGAAGTAAGCAAACAGGGTTTTAAAGGAGGTTATCATTTTGCATAAATTAAGTGTGGTCATTGCCGTATATAATGTTTCTGAGTATATAGAAGCATGTTTAACATCAGTCTTAGAACAAAACTACAAGAATGTGGAATTAATTATTGTCAATGACGGTTCAACTGATGATACCTTTCAAAAAGTAGAAAAACTAGTAGACGGACATACGAATGTTATTTTGATTGATCAAGAAAACCAAGGTGTTTCTGCTGTCCGAAATAATGGTGTAAAAGCCGCTACAGGTGATTATCTAGGCTTTGTCGATGGAGACGATATCATTGCTAAAGATATGTTTCAAAAAATGATGGATTCTTTTGAAATGTCGGATGCAGATATGGTTACAATTGGTGTGGCAAGACTTTCAGGAGATAAAGTATACCCTTCTACATTACACGAAAGATATATGGTAGAAAAAAAAGAAGCCACAACAATTGAAGAAACACCGGCACTTTTATATGATACTACTTCGTGGAATAAAGTATTTAAAAAATCTTTTTGGGATAAACACCATTTGGAATTTCCAGAGGGCCAAATGTATGAAGATATCGCATTAATGATTCCAGCCTTTTTGTATGCAAAAAAGGTAAATATTATTCCTGATGTTGGCTATTATTGGCGCAGTCGCGAGGGTGGAGCAAAATCAATCACTCAAAGACGAAATGACATTGCCATGGTGAATGATCGTTTACTTGCTTTGAAAAAAGTAAATCAAGTACTTAATGAGAAAAATATTCAGGGTGATTTAAGATATCAAAATGAACGTAAAAACTTTGAAATTGATTTGTTTTCCATGATTGAATGGGCATTTTTAGCGCCGAAGGATTACTATTTGGCTCTTCAACCACTTATCAAAAATTATGTTGAGCAAGAAATGAAAACAACTGCTTTGAATGATATTCCAAAAGAAAAGAAACGACTTTTCAAAGCTTTGTTAGCAAATAATCGTCCGGCTTTTCTCCTAAATAGTTACATTTATTTTGGTAAGAAAGCTGTGAAAAAAATAACGAAATAAGAGACAAAGGACAAAATACTTCGGATCTTTAGTACACTTGTAAACAATTGATTCAAGTGTGCCATTGCATCATTAGAAGTACTATGTCTTAGGCTCTTTTTTTGTTAGTAACAGTTAATTTAATAGTGAATCTACCTTTTATATGCTATGATAATTGGTATATAATAAGTCAAATTAATGCTTATAAAAAATGATAGGAGCAGAAGAAATGACAAATTTATTTCAAGATGATAGTCTAACGCTGCATACAGACTTATATCAACTAAATATGATGAAAGCGTATTTTGACGATGGACTTCATGAGCGTAGATCGGTGTTTGAAGTGTTTTTCCGAGATATGCCATTTGATTCGGGTTTTGTTGTGTTTGCGGGGCTAGAACGAATTATTCATTATATGCAAAATTTACGTTTTACAGAAACGGATATTGCTTATTTACACGACGAACTTGGTTTTGATGGACCTTTTCTAGAATATTTACGTAACTTTAAATTTAAAGGAAATATTCTTGCTGCGAAAGAAGGGGAGTTTGTTTTTAAAACAGAGCCAATCCTTCAAGTAGAAGCAAGTCTAGCGGAAGCACAATTAATCGAAACAGCTTTGCTTAATATTGTGAATTTCCAAACGCTGATTGCAACAAAAGCGGCGCGAATCCGTTCTGTTATTGACGACGAAACGTTTGCCGAATTTGGTACAAGACGTGCACAAGAAATGGATGCGGCTATTTGGGGCACACGAGCGGCTTACATCGGCGGTTGTGATTCGACAAGTAATGTTCGCGCTGGGAAGATTTTCGGCATTCCTGTGTCTGGTACGATGGCACATGCGATGGTTCAAGCTTACCGCGACGAACTAGAAGCATTTAGAAGTTACGCAAAAACGCATTTTGATTCAATTTTCTTAGTAGATACATACGATACGCTAAAATCTGGCGTACCAAATGCGATTAAAGTGGCGAAAGAAATGGGCGATAAAATTAACTTTATCGGTATCCGCCTAGATAGTGGCGATATGGCGTTCTTATCTAAAAAAGCACGCCAAATGTTGGATGAGGCTGGTTTTACAGAAGCAAAAATCTTTGCTTCGAGTGACTTAGACGAACATACTATTTTATCGTTAAAAGCGCAAAAAGCAAAAATCGATTCTTGGGGCGTTGGCACAAAACTAATCACCGCTTACGACCAACCAGCATTAGGTGCCGTTTACAAAATGGCGGCAATTGCTGATGAAAATGATATTTTACAGGATTCGATTAAACTTTCAAGTAACACCGAAAAAGTGTCGACACCTGGTAAAAAGAAAGTTTACCGGATTATTACGAATGAAGATGGCTTGAAAGCGGAAGGCGATTATATTGCTTTGGCGGACGAATCACTCGAAAATGTCGATAAACTAACGATGTTCCACCCAGTTCATACGTATATTATGAAAACAGTCGAGAATTTCACCGCGCGTGAGCTACTTGTACCCATTTTTCAAAACGGGGAACTTGTGTATGATATGCCTTCACTCGATGAAATTAAAGCTTATAAAGAAGAGAACTTGGCGCTACTTTGGGACGAATACAAACGAACCGTTCGTCCGGAGCAATACCCAGTTGATTTAAGTGTAAAATGTTGGAAAAATAAGATGCGTAATATCGAAAAAGTACGTAAAAGTGTCCAACTTCATTCACCAGTTGAACTAGATATGCCGTTTTAGGAGGAATTATAATGGAAATCAGAGAAAGAATTTTAGCAGATATGCAAGTGGCAGAAACGATTGATGCACACGAAGAAATCCGAAAAAGTGTCGAGTTTTTAAAAGCATATTTAAAAAAGAATACGTTCTTAAAAAGCTTTGTTCTTGGGATTTCTGGGGGACAAGATTCGACTTTAACAGGAAAACTAGCACAGATGGCGATAAGCGAAATGCGAGCGGAAACGGGCGACGATGAGTACCAATTCTTCGCTGTGAGCTTGCCATACGGAACGCAACTAGATGAATCGGACCGTCAAGATGCACTGAACTTTATGGAACCAGATAATCGTTTAACCGTAAATATTAAAGCCTCAGTGGATGCGAGTGTTGCGGCGCTTGCGGAAGCGGGAGTGGAACTATCTGATTTTGCTAAAGGTAACGAAAAAGCGCGCGAACGGATGAAAGTGCAATATGCGATTGCGGCGATGCATAAAGGCGTAGTGGTTGGAACCGATCACTCCGCGGAAGCAGTTACTGGCTTTTATACGAAATACGGCGACGGTGGAACGGATATTAATCCACTGTTCCGCTTGAATAAAAGACAAGGCAAGGCGCTTCTTAAAGAGCTTGGCTGCCCAGAACATCTATATTTGAAAAAACCAACAGCAGATTTAGAAGATAATAAACCGGCACTTCCTGATGAGGTCGCGCTTGGTGTGACTTATGACCAAATTGACGATTACTTGGAAGGCAAAGAAGTTCCAGCAGATGCTGCGGCAAAAATTGAGAATTGGTTTATTAAAACCGAACATAAACGCCATATGGCAATTACTATATTTGACGATTTCTGGAAATAGGAGGCTGTTTAAATGAAAGTTGGTTATGGTTTATTAACTGCATTTTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP054042|1917948:1925371|1917948_1918332_+|WP_003721506.1|DBSCAN-SWA MKKVITYGTFDLLHWGHIHLLKRAKALGDYLIVAISSDEFNRIKHKEAYHSYEHRKLIIEAIRYVDEVIPENNWEQKRDDIEKYGIDVFVMGDDWEGEFDFLKDVCEVVYLPRTEGISTSQIKDELK >NZ_CP054042|1917948:1925371|1918353_1919337_+|WP_003732709.1|DBSCAN-SWA MEPLVSVIIPVYNVEKYVKRCLDSVLEQTYHNLEVIVVNDGATDNSAKVIKSISDNRIRYFEKENGGQATARNFGLDVATGDYIVMVDSDDYISKNLVETCLDTVQKTNADLVLFTSYNVNQEGKMQYIKRDKGIKVLDAGPTPWNKFYQADLWKGSRFPVGYWYEDLGIIPVVTLKAKNPVKIQDALYYYITDRADSQSNIQQVDHFLDVVIMLENVETELKKLGIYEESKDQLAYLYIEHLIYRLVLRKAIYITDKQERKKLIKKISTIIQEKFPNWGSYPYQAGGKLTATLKKKALWLYLHHLYLLGDLVWKYPFSIRSKQTGF >NZ_CP054042|1917948:1925371|1922912_1923221_+|WP_003732711.1|DBSCAN-SWA MKVGYGLLTAFYTHPGEKDNLVKILLEAAEALDDYNTCIQYIVNESETEPDTVFVSEIWVDKGHHKASLDNPAVQETIARAKPMIKEIKQIQELDILGGKGV >NZ_CP054042|1917948:1925371|1922075_1922900_+|WP_003727000.1|DBSCAN-SWA MEIRERILADMQVAETIDAHEEIRKSVEFLKAYLKKNTFLKSFVLGISGGQDSTLTGKLAQMAISEMRAETGDDEYQFFAVSLPYGTQLDESDRQDALNFMEPDNRLTVNIKASVDASVAALAEAGVELSDFAKGNEKARERMKVQYAIAAMHKGVVVGTDHSAEAVTGFYTKYGDGGTDINPLFRLNKRQGKALLKELGCPEHLYLKKPTADLEDNKPALPDEVALGVTYDQIDDYLEGKEVPADAAAKIENWFIKTEHKRHMAITIFDDFWK >NZ_CP054042|1917948:1925371|1919351_1920365_+|WP_020246559.1|DBSCAN-SWA MHKLSVVIAVYNVSEYIEACLTSVLEQNYKNVELIIVNDGSTDDTFQKVEKLVDGHTNVILIDQENQGVSAVRNNGVKAATGDYLGFVDGDDIIAKDMFQKMMDSFEMSDADMVTIGVARLSGDKVYPSTLHERYMVEKKEATTIEETPALLYDTTSWNKVFKKSFWDKHHLEFPEGQMYEDIALMIPAFLYAKKVNIIPDVGYYWRSREGGAKSITQRRNDIAMVNDRLLALKKVNQVLNEKNIQGDLRYQNERKNFEIDLFSMIEWAFLAPKDYYLALQPLIKNYVEQEMKTTALNDIPKEKKRLFKALLANNRPAFLLNSYIYFGKKAVKKITK >NZ_CP054042|1917948:1925371|1923814_1925371_+|WP_020246560.1|DBSCAN-SWA MFKIMKDFTEQEKIIVLDFGSQYNQLITRRIREFGVYSELHPHTITVEEMKALNPTGIIFSGGPNSVYDEDAFRADERIFDMGIPILGICYGMQLMTTHFGGKVERAKDREYGKADIHVEKPNRLFAGLPTDQVVWMSHGDLVVEEPAGFEVTVTSKSCPIAGIADEERSLYGVQFHPEVRHSVYGNELLKNFALNVCGCKGDWTMENFSEVEIAKIQEIVGDKKVLLALSGGVDSSVVGVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEADQVMATLQGEFNMNIIKVDAKKRFMDKLAGVSDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEANKLDGVEFLAQGTLYTDIIESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRALGTELGMPDAIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRDSDYILREEIKNAGLEREIWQYFTALPNIRSVGVMGDGRTYDHTVVVRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPATVEWE >NZ_CP054042|1917948:1925371|1923281_1923686_+|WP_003732712.1|DBSCAN-SWA MQTLMIVCAGGATSSLMAQNVVKSATSEGMDAVLLFPDDVKYKDSFLEKYSERDLVVVMGPVGAITAGKFRDYKEQVDAVLVAPQVKYMYKTVEEVLGELNIPCANIDSLDFGRMRGDKILTQGLALMNAKNSK >NZ_CP054042|1917948:1925371|1920573_1922064_+|WP_003721509.1|DBSCAN-SWA MTNLFQDDSLTLHTDLYQLNMMKAYFDDGLHERRSVFEVFFRDMPFDSGFVVFAGLERIIHYMQNLRFTETDIAYLHDELGFDGPFLEYLRNFKFKGNILAAKEGEFVFKTEPILQVEASLAEAQLIETALLNIVNFQTLIATKAARIRSVIDDETFAEFGTRRAQEMDAAIWGTRAAYIGGCDSTSNVRAGKIFGIPVSGTMAHAMVQAYRDELEAFRSYAKTHFDSIFLVDTYDTLKSGVPNAIKVAKEMGDKINFIGIRLDSGDMAFLSKKARQMLDEAGFTEAKIFASSDLDEHTILSLKAQKAKIDSWGVGTKLITAYDQPALGAVYKMAAIADENDILQDSIKLSSNTEKVSTPGKKKVYRIITNEDGLKAEGDYIALADESLENVDKLTMFHPVHTYIMKTVENFTARELLVPIFQNGELVYDMPSLDEIKAYKEENLALLWDEYKRTVRPEQYPVDLSVKCWKNKMRNIEKVRKSVQLHSPVELDMPF |
8 | Hokovirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2056169 : 2115678
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP054042|2056169:2115678|DBSCAN-SWA ATTATTTTGTAGCTTTACTCGCAGCTGAGATGACTGAAACTTGTTTTAATCCTTTACTTATTAGACGTAAAATAACGAACCAAACAATTACGATTAGAACAATTTGTTTAAATGCAATAGCTGGTAGTGGGTTGAAAGGACAATCCCAAACGAAATGTAAAGCAATCGGAATAATAAACCATTTCCAGAAAGTGCCTGTGAAAATATGGTGCATTCCCAGTTTTTGATCTCCTTTAGCAATTACGAGAGCAGCACCAGTTATGGCAGCCCATACAACATGGCCACCGATAGACTGCCAACCACGACTAAAGATAACATTCATCATTGTTTCACCAGCAATATGAATATCCTTGAATAAAAATGCTGCATCGACACTATAGTTAAATGCATATCCAAGTGATTCAAAAGCAGCGAAACCAGCCCCAACAGCCGCACCGATTAGTAAGCCGTTTAGAATATACTTCGAATTAAGCGAGCGGATGAATAGGGCAACGATAATCATTTTTCCAGTTTCTTCAATAAAACCAACTAATAAAGCATTAAAGTAGTTTAATTTTCCAACTGGAATAATCGAATAAATGACAAGTGTTGCAACAAGCGCTGCGACACCACCGATGAAAAACATTTTCACAACATCGAAAACGCTGATATTTCGCGGTGCATTTGTTTCGAAAAAGAATAATAAGACCGAAAATGGAACTGCAAAAGAGCCAATAACCATCAGCCCAGGTATGGTATTACTGTTATCAAACAAATATGTACAAGCAAGAAGTAAAAAGTACGTAATGATTAAAACTAAGAATACTCTAGAAAACACCCATGGATGGGGCCAAGTATGTGGAATGTCACTAGTTGCAGGCGTCGTATATTTTGTTCCTGCGATAAATACTTTTTCGCCTTCCTCTTTAGAGTGCTTTTTAAAGACAGCAGAGAAAAGATTTCCAATTTTTAATTCTGAATTCCCGTGATTCAAAGCATGTTGATGTAATTCTGTTTGCTTGAATACAACCCACTCTGGATGAGGGGATTTTTGGACCAATGTAAGATTATTAATCTCTTTCTTTCTATATAGAGCAATCATCTCTACATTTGTAAAAGGTCCAACTTTCTGTTCGTTCTTTTTGAAGTACCATTCTGACAAATGAAACTCCCCCTTTAGCTTTTTATTTTGACTCCATTAATTATTCCCAAAAACGCTAAAAGTTAAACGAGCGAAGGGAATTAATCGTTTATTTTCTTCGCTTGTTCGTAAAGGAAATTAATTGAATCAGCTAAAAAAGCTGCTGCGGACTCATTTAGTGGTTGTCCATCTAAATTTAAATCATCCTCATATTTTAAATCTTCACTAATTTTAGTTATTCTTTTTCCAATATCTTTCTCGTTTTGGAGTTCACTAGGAGCATATGTTGGGATACTTTGTTGTCCAAGTAAATAATCGACACTAACATCATAAAGTGTTGCAATTTGAGTCACCATTTCTAAATCTGGCTCCCGAATACCATATTCCCAATTGCCATAAGTGGAAGGTGCTTTTAAACCAAGTCTTCTAGCTGTTTCTGCTTTTGACCAACCTTGTTTTTCCCGTAATAAAGTAAGTCTGTTACTTAAATTTGGCATAATTTCACTCCTTTTTGTTTGATTATACAATATCTTACTCAGTTTAGCTATATTTTAACACATAACGTATTATTTTGTGATTGACATAGTCGTATTGAGTTGGTAATATTGTATTAACAACTCAAATTGTGTAGATAAGGAGAAGATGACATGAAAACAGTAGACACCAGAAGAATTAATACAACAAAAATTCGAGAATTGCGATTGCAGCGAGGAATCACCCAAGCTTTCATTGCGCGACGGATGGGCTATAGGTACACATCAGGTTACAGTAACATTGAAAAAGGAACTGTTAGACTATCACACAAAAATGCTGTTATTCTAAGTGAAATTTTAATGTGCGATTTGAAATTCTTTTATGAATAACTAGACACGGGATAAAAATGTTAAATAAAAAGATTATCTTTTTAACAAACGTTTTATGGAATTTATTTAAAATGAATACACACAAAATGTGTGGAATAAGAGCGAAGGAGAAAACATCATGAGGAAAAAAACGTTAGCAGTGTTTCTTATTTTTACGGTGTTAGTTGCATTATTAGCGCCAACTAATGCAAGCGCATATACAAAACTTGGGTATGTGATGACAAAGTCTAGTGCAAAAAATTTTAAAATTTATATTAACGGTTCGGCGAAAGGGTTTAAAAATATTATTATTAGTGGCGCAAAAGCCTGGAACCCATCTCCCTACTTGAATACAGTAAGCATAGGGAACGATGTCAAACCTAACTATACGGTTAGTAGTTCAGGGACAAACAAGGGAAGTGTTTTGGCGGTATGCAACACAACTTACTACAAATCAAATAAATTGATCTCCAAAAACGAGATCACTTTGTACAAAGGCTTTCGTTCGCTTTCAACTAACCATAAAATAGAAACTATTGTACATGAATTTGGACATGGCTTTGGCCTAGGGCACGTGAAAACTAAAAATGCAATTATGTTAGACAAAGGGTTTATAAATAAAACAAAACCTCAAACAGACGATTTCAATGGCATCAAAGCTTTATATAAGTAAAATAAGGAGGATTGACAATGAAGAATAGGATTACAATGATTGCAGGTATAGTATGCCTTAGTATTTTAACTGCTTGTTCTAGTAGTGAGAGTGTGAAAGGAACGACATCAGAAGAACAAACAACATCACAAAGCGGAGCAGAAATGATAAAAGCAAATAACGGGGTTGTCTCTTACCACGGAAAATACCTCAAACTTGCTGAAAATATGGATAACCTTGAAAAAGATGCCCCAATTATCATTAAAGCAACCAAAAAATCCGAAAAAACAACTGTAACAAAAGAAACAAAAGAAAATGTATTTCCAACCGATTTTTATACGATGAGCGATGTGCAAATAAATTCTATCGAGAAAGATACAACAGGAAAATTGAGTGAGAATATGACTATTAAAGTGTTGGAGTATAGCGTGGAAAATGTTTTGGTAGAAGGAGAAGAATATGATTTAACTATTGATGGCTATAAAAATATGGAAAAGGGAGAAGAGTATACGCTTTTCTTAGAAAAAAATCCAGATGGTGACAATTATATACTATCAAATGCAGTTATAAGTAAATTCCCAGTGGAAGAATTATCTGAAGAAGAATTGTTCTTAGATGGCGGGCAAGCAACAGAAGAAACAGATAGCATAGAAGAAATTTATCAGGAAGTCTATCAAGAAGTTTTGGAAGAATACAGTGAATAAAAAGTTTTAACGCCCGCAAGACCTCGGTGTAAAAATCGAGGTCTAATTTTTTTGAAATAAAAATTTGATAAAAATTGAAGCTTAATCTAGACAATTTTTCGTAATAAAACACCATAAAAACCTCTTGACAGAAGCAGACGATACAAGTAGAATGAATCAAACCAAATCAACATTTTTTGCTACAAATGGTTAGATTTTTAACAATAAGGGTAAATCCAGTTAGTATAAATAAAGCTTTTTCAAATAAAAGGAGATAAAACGATGAGTGGAAGTGGTGCTTTTTTTCCAATGAGTGTTAAAAAATTTCTGGAAAAAGGGATTACCTCGTTGTCCGAAGAAGAAAAAATGAGTACGCTGCATTATTTGGAGAATGCGTATCATCAAGAGCCTTGCAACGAGGAAATTGTACATAGATTAATTCAATTTTATAATCAGACAGATAAAACGAAGAAAGCGCAAGAAATCGGCCAAAACTTTTTGACGATGAATGGCTATAATAAGGAAATTCTTGGAGAGCTATCTGTAACTTTTATGAAAGAAGATAATATGGATACGTACTTTACATTAGTTAGGCATTATATGGAAGAAGAAAAAAAAGAAGCAACGGAAGAAATAGCTGATAATGTTATTCCTTTTCCCAAACAGTTTGTTCCAAGAAGAGATATTCGTGAATTTGCGTCTTGGCAGACGACGGAACAATTGGAGTTTTTACAAGAAGCTCGTTTCTTAGAAATAGATTCCTTTTTGTCAGCATTTAAAGATTTTCTAGCGGATGACACTTTTTCCCCGTTTGTTCAGTCGATGATTTTCGAATTAATGCAAGAAAAAGAAATAAATGAAGATGTTACAGTCCGAAAAATAGATAAGCATGGTACCTTTAATCCAAGTCTTGTGCCAATGCTTGCTGATAACAAATTTGCAGAAGCCATTTTTGCTGGACTTGCTGAGATGCTCGAACATAGTAATCCAAGCCTTTTAGAGCAAGTGATTGGAATTATACAGCAACATCTATTTATGCTTTATCCTTTTGAATTAGAACCTCGGGAAGTAGATGTTTGGGTAAACGCATACTATAAATGGGCGAATGCAATGTACGGTAATTATTGCGTTATTTCGGACGATGTGAATCACTTAGCAGTAGAAGAAGCTATTTCCATTATTGAAGAGTTAGAAATTAGGCAACAAAATTATTTTATATAATGATATTTCTTGTTTTCAAGTCAGGGATATCTGTGTTATTATTAGTGAGTATGGCTGAAACTTGTCATGAGAGTAATTAAATTGAACTAAATAGATGATGGAGGGAATTATACCATGTCAGTAAAATGGGAAAAACAAGAAGGTAATGTTGGAAAACTTACTTTTGAAATTGAACAAGAAAAAGTAAAAGAAGGTTTAGATAGAGCTTTCGTAAAAGTGCGTAAAACTCTTAATGTGCCTGGCTTCCGTAAAGGGAAAGTTCCACGTCAAATTTTCAATCAACGTTTTGGTGAAGAAGCTCTTTTCCAAGATGCGCTTGATATCTTGCTTCCAGAAGTATATTCTGCAGCAATTGACGAAGCTGGTATTGATCCAGTGGATACTCCTCAAGTAAACATTGAGTCTATGGAAAAAGGCGAAACTTGGGTTTTAACAGCTGAAGTTACAGTGAAACCTGAAGTGAAACTTGGAGACTACAAAGG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58 | Bacillus_virus(16.67%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2631558 : 2639844
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP054042|2631558:2639844|DBSCAN-SWA ATTAATCGTTCCCTCCATTTTGAATTAATCCTCGAATCACTTTTGGATAAAAAATATGTTCTACTTGATGAATTTTTTCAGCTAAAGTATCTGTGGTTTCTGCTGTTTCAATCGTAACTTTCACTTGGTCAATGATTGGCCCTGTATCCATTCCAGCATCTACAAAATGCGCGGTGACCCCAGTTCCTGAAACATTCGCTTGAATCGCTTGACCAATCGCATCTTTTCCTTTGAATTCAGGTAAAAGAGACGGATGCAAGTTGACAATTTGCTCAGGAAATTCTGCTAATAAAGTTGGTCCAATCAAACGCATATATCCCGCTAGCACCAACAAATCAATTTCCAATCTGCGAAGTTCTAGCAAAATTTCTGTTTCAAAAGCTTCTTTATCCGGATAATTTTTCGCTTCAAAAAGAAAAACTGGAATATCATGCTTGTTTGCCCGCTCTAAAACATAAGCATTCGGTTTATCACATACCAGTAATTTCACATGAGGCTTAATAAATTCGTCATCCACTAACGCTTGAAAATTCGAACCGCTACCAGAAGCAAAAATGGCTATATTCATCCTTTTTTGCCTCCTGCGAAAATAACCGCGTTGCTTTCACGTGTCGTAACTTCGCCAATAACGTAAGCCGCTTCTCCGTTTTGAACGAGTACTTCTAATGTTCTTTCCACATCCGCTTTCGCAACTGCCAACACCATACCAATGCCCATATTAAAAATTTCATACATTTCCATTTCGTTTAATTGGCCGTATTTCTTCATAACATCAAAAATCGGCAACACAGGCCATGAACCTAGCTCCACTTTCACAGCTAAATCATTCGTTAACATCCGTGGTAAATTCTCTACAAATCCGCCACCAGTCACATGCGTAATTCCGTGCACATCTACCTCTTTCAATACTTCTAAAACTGGTTTGACATAAATACGTGTTGGTTTAAGTAGCTCTTCCACAAGTGGCACATCTAGTTCACTGATTTCCGCATCGAGCGTAAATTCGTTATCTTTAAAGAAAATTTTCCGAACGAGTGAATAACCATTACTATGAATCCCACTAGATGGAATTCCAATTAACGTATCTCCTGCTTGGACAGCGCCTTCTGTAATTAGTTTTTGTTTCTCTACAGCGCCAACTGTAAAACCAGCTAAATCATAATCATCCGCGCCATACATATCTGGCATTTCCGCTGTTTCGCCACCAATTAACGCTGCTCCCGCTTGTTCACAGCCGTCAGCTACACCTTTAACAATTTGTTCCATTTTAACAGGATCTGTCTTCCCTGTTGCAATATAATCTAAGAAAAATAATGGCTCGGCACCTTGAGCTAAAATGTCATTCACGCACATTGCCACGCAGTCAATCCCGATGGTATCATGTTTATCTGCTTCAATAGCCAAAAGTAATTTTGTCCCAACACCATCTGTACCAGAAACAAGGACAGGCTCTTTTAAATTCAAGCTACTTAAATCAAACATTCCACCAAAAGAACCAAGTGCCCCCATCGCGCCTATTCGTTCTGTTCTAGCCACATGTTTTTTGATGCGTTCCACTACTTGATAGCCAGCTTCTACGTCCACGCCTGCTTTACTATATGCATTTTCTGCCATTCGATTTGTCACTCCTCATTATTTTTCTGCTTCTAAGCTCGCTAAATATTCCGCTTCATAATCGTATAAAGGGGTCGGGTAATCGCCGTTGAAATAAGCCATACAAAGTCCCCCGTATGGTTCGTTCGGATAAGGTCTACCAATGGAATCTACTAAACCCTCTTCACTCAAATACTCTAAAGAATCAGCGCCAATAATTCGGCAAATTTCATCGACAGAATAATTAGAAGCAATTAATTCATTTCGCGTTTGGATATCAATACCGTAAAAACAAGGATAGGCAAGTGGTGGAGATGCGATTCGCACATGAACTTCCGCCGCCCCAGCTTCGCGCAAAAGTTGTACAATTCGTTTACTTGTCGTTCCGCGCACAATCGAATCATCAATCATGACAACCCGCTTGCCTTCCACAACCCCACGCACCGCTGAAAGCTTCATTCTAACCCCTTGCTCACGGAGTTCCTGTGATGGTTGAATAAAAGTTCTTGCCACATATCTATTTTTGATGAGACCAAGCTCATAAGGAAGACCAGCTTCTTCGGCATAACCAATCGCCGCAGAAATACTAGAATCCGGCACACCAGTCACAACGTCTGCATCAATAAATGCTTCTTTTGCTAACCGTTTTCCGGAACGTTTTCTTGCCGAGTGTACATTAATTCCAGCAATATTAGAGTCTGGTCGCGCAAAATAAATATATTCCATGCTACAAATCGAATGTGTCACATTCTCCGTGAACTTTTCAATCCGAAGTCCGTCATCATTAATAATAATTAGTTCGCCTGGCTCCACGTCTCGAACAAATTCAGCGCCAACCGTTTCAAAAGCACATGTTTCTGAAGCAACTACGTAAGAATCACCAATGCGACCAATCGAAAGCGGTCTAAAACCATTCGGATCAAGTGCAGCATACATTGTATCTTCCGTAAGCAGCATATAAGCAAAGCCTCCCTTAACTTTGTTTAAAGCCACTTTTAAATCTTCTACAAAGTCACCCGTATGGCTACGTTTAATTAAATGCGCTAATACTTCTGTGTCTGAGCTCGTTTGGAAAATAGCGCCTTCTTCTTCTAGTTCACGGCGTAAACTTTTGGCATTAACCAAATTCCCGTTATGTGCAAGTGCTAAAGAAGAACTATGAAAGTGAAATAAAAATGGTTGTACATTGCCTAAGTTTTTTTGACCAGCTGTCGCGTATCGAACGTGGCCAATGGCTGCTTTACCTTTTAAATCATCTAATTCGCCATGTTTAAATACGTCTGCTAAAAGTCCGAGATTTCGGTGACCTTTTAGCGTTTCTCCGTCTGTGGAAACAATTCCGGCACCTTCTTGACCGCGGTGTTGTAAACTATGCAACCCATAATAGGTAATTTCCGCTGCATTAGGATGATCCCAAATACCAAAAATACCACATTCTTCGTTAAGTCCTTTTACTTCAGCAAGCATGGAATAGCCCCTTCCCAAATGGATCGTAATTCCGTTGTTTTCACTGTTACTAGGTCTTCCTTATGTTTCACACGAATCGTATCATCCTCGGTTACTACACCAAGGCGGTATACTTTTTCCAGTTCCATTAATTGCGCAAAAGTTGCTTCGTTTTCCGGTTTTACCGATACTAAGAAACGTGATTGCGATTCACTGAATAGTTGATTCAACGCAAACGGTACTTCTACATCCGCACCAAGCCCTGCTTTAAAAGTCGCTTCCGCAAGGGCAACACCAAATCCGCCTTCTGCCAAATCGTGACTAGAAGCAACTAGACCTTCCTGAATCGCCGTTAGAAGTAATTGTTGGTATTTTTTCTCTGTCGCTAAATCTAATTCCGGCGCACGTCCGCTAATTTTCCCTTGTTGTAATTTCTGCAATTCCGAACCACTATATTCAGCTTTTGTTTCACCAATTAAGAAAATCACATCGCCACTATTTTTAAAATCTTGCGTCGTAATATGTGCCAAATCTTCTACTAAACCAACCATTCCAATAACTGGCGTTGGATAAATTCCGGTACCATCTGTTTCATTATAAAGCGATACATTCCCTGAGATAACAGGCGTATCAAGTTCTAAACAAGCTGCACTAATACCGTCAGCCGCTTTTTCAATTTCCCAAAAAATTTCTGGTTTTTCAGGATTACCAAAATTCAGTCCATCTGTAATCGCTAGTGGTTTCCCGCCAGAACAAACGATATTGCGCGCCGCTTCCGCAACCGCTATCGCTCCGCCAACTTCTGGATCAAGATACAAATAGCGTGAGTTACAATCTGTCGTCATCGCAATTGCCTTCTCTGTTCCACGCACACGAACAATCGCCGCATCTGAACCAGGTACAACAGCTGTATCCGTCCGAACTTGATAATCATATTGCTCATAAATATGGCGCTTACTAGCAATCGTTGGCTGAGCAAGCAGTTCTTTCCAAACTCCCACCACATCATCAATAACTGGCACAAACGCTTCCTCTTCTTGGAATGCTTGATAACGAGCTGGTTCTTTTGAAGGCTTATGATAAACTGGCGCGTCTTCCGCAAGTGCATCAACAGGCACATTCGCAACTACTTCACCATGATGAATAATTTTGTACATTTTATCATCCGTTACTTGACCAATCACAACAGCCTCTAAACCATAACGTTCAAATAACGCTTGGATTTCTTCCACATGCCCTTTTTTCACACATAGAAGCATCCGTTCTTGCGATTCAGAAAGCAACATTTCATATGGCGTCATATTTAGTTCCCGTTGCGGCACATCATCCATAATTAATTCTAGCCCAGCGCCCGCTTTTGAAGCCATTTCAGAACTTGAGCTAACGAGTCCAGCAGCTCCCATATCTTGAATTCCCACTAAAATATCCGAATGATCACGAATCACATCTAAACAAGCTTCAAGCAACAATTTCTCCATAAAAGGATCGCCCACTTGTACAGCAGAACGTTGTTGTTCGCCTTCTTCACTAAACTCTACAGAAGCAAAAGTAGCGCCGTGAATACCGTCACGACCAGTTTTAGCACCAACATACATCACCGGGTTGCCAATTCCTTTTGCTTGGCCTTTTTGAATATCTTTCGCTTCGATTAAACCAACGCACATCGCGTTGACTAGCGGATTTTTCGTATAACAAGGATCAAATTGGATTTCGCCACCAACTGTTGGAATCCCAATGGAGTTACCGTATCCTGCGATTCCAGCAACGACTTCACTCACCAAGTATTTCGCATGTGGTGTATCTAATTCGCCGAAGCGAAGCGAGTTAAGCATCGCAATCGGTCTAGCTCCCATCGAGAACACATCGCGAATAATTCCACCAACCCCAGTTGCAGCCCCTTGATACGGCTCCACATAGGATGGATGATTATGACTCTCCACTTTAAATGCAACACCTAGACCATCGCCAATATCGACAATCCCAGCACCTTCACCCGGTCCTTGCAATACTTGTTTTCCTTCTGTCGGAAATTTTCGAAGCACTGGTTTTGAGTTTTTATAGCTACAATGTTCGGACCACATAACGGAGAAAAGTCCAGTTTCTGTATAATTAGGCTCGCGTCCAAGAATCGAACAAACAAGATCATATTCACTATCAGTTAATCCCATTTCTTGATAAATCCTTTGTTCTTTAATTTCTTTTGTCGTTGGCTCCATGTTAGGCATTTACTTGTTCCTCCTTCCAAGCTTTTACAACGGACTCGAAAAGTCTTAAACCATCTGTCCCACCAATAATTTCTTCTACCGCACGTTCTGGGTGCGGCATCATCCCAAGCACATTACCTCGTTCATTTACAATACCTGCAATATCCGCACGGCTGCCATTCGGATTAACGCTATCATATGTAAAAACAATTTGGTTATTTTCTTTTAGTTTTAAAAGTGTTTCGTCGTCACAGTAATAGTTACCTTCTCCGTGAGCAACGGGAACTTGGATAATTTCGCCTTCTTCATAAAGTTCCGTAAACATCGTACTCGCATTTGCCACACGAAGCGGCACTGTTTTACAAATAAAATGCAGATTATTATTTCTAATTAAAGCACCCGGCAGCAAACCAATTTCCGTTAGAATTTGAAATCCGTTACACACACCAAGCACTGGTTTTCCCATTTCAGCAAAGCGCAAAACTTCTGGCATAATACTTGAAAATTTTGCAATCGCACCAGTTCGCAAGTAGTCTCCGTAAGAAAATCCACCTGGAAGTAATACCGCGTCAAAGCCTGCAAGACTTGTTTCCGCATGCCATATATATTCCGCCTCCTCGCCAAGAGAATCGCGAATCGCATGTAGCATATCAAGATCACAATTAGAACCTGGGAACTGAATGACAGCAAATTTCATCGTTTAAGCCTCCTCAATTTCATATCGGTAATCTTCCATCACCGGATTTGTTAGCAGTTTGTCACACATTTCATTTAACACTTCATGAATATCTCTATCCGACTTCGCTACTTTAAGTTCCATAAATTTACCAATACGAACATCTTCTACTTCCTCGTAACCCATGCTTTTCGCTGCATCTTTTACTGCAACCCCTTGCGGATCTAATACGCTTTTCTTTAAAGTGACATAAACTTTGACATTATACATTTTGTGGCCTCCTAGTTTTGAACTTGCTTTAATCTATTCAATACTTCTGTATACACATCTGTTAAATTGCCAATATTCCGACGAAAGACATCCTTATCGAGCTTTTGATTTGTTTCCTTGTCCCAAAGTCTACATGTATCAGGCGAAATCTCATCTGCTAGCAAAATTTCTCCAGCCGCGTCCCGACCAAATTCTAATTTAAAATCGATCAGCGTAATATTCATTTGATTGAATAATTCTTGTAGCACCTTATTAATCGAACGAGCCGCCTGACGAATCGTATCCATCTCACTCGTTGTCGCAACCTCTAAATAAAGCACATGGTCATCATTAATAAACGGGTCATCTAGCGCATCATCTTTATAGTAAAATTCTACTATCGCATTCGGAATTGGCTCGCCTTCTTCTTTTCCAAGCCGTTTCGCAAGACTCCCAGCCATCACATTACGAACAACCACTTCAAGTGGAATAATTGATACCTCTTTCACCAATTGTTCCGTTTCCGAAATCGCCCGAATAAAATGACTCTCTATTCCCGCTTCCGCCAAATGAGAAAAAATAAGCGATGTAATTTGGTTATTAAGCTCACCCTTCCCAGCAAAAGATTCCTTTCGTACTCCATTTAGCGCTGTCGCATCGTCCTTATAAGCAACACGCAAGACACCTGCTTCTTCTGTTTTAAAAAGTCGTTTTGCCTTTCCTTCATAAACCAGTTCATTAGTCACAATAATTTATCTCCTTATAAATTACTTAACCTCTTTGAAAAAATAAATATCAAAGAGGTTAGGTTGTATTCTGCCCGTAATTATAATCCTAAACGATCAAAAATTAAGTCGACATTCTTCAGGTGATAGTTGTAATCAAAGCAATCTGCAATTTCTTCCGCAGATAAGTTTTCAGTAATTATTGCATCTTGTTCTACTAATTCACGGAAAGGTACTTGTTTTTCCCAAGCTTCCATTGCTCTTGGTTGTACGACATCATAAGCCGCCTCACGAGCTAAACCTTTATCAATAAGCGCCAGTAATACACGCTGTGAATAAATAAGTCCAAGTGTTCTGTCCATATTGCGTTTCATATTTTCTGGGAACACCGTCAAGTTTTTCACGATATTTCCAAAACGATTCAAAATATAATCTAATAAAATAGTAGAATCTGGTAAAATAATTCGTTCCGCTGAGCTATGAGAAATATCACGTTCATGCCAAAGCGGCACATTTTCATAAGCAGTAACCATATGACCACGAATAACGCGCGCTAATCCAGTTACATTTTCAGAACCAATTGGATTACGTTTATGCGGCATTGCAGATGAACCTTTTTGTCCTTTTGCAAAGAATTCTTCTACTTCACGCACTTCACTTTTTTGCAGTGCACGTACTTCTACCGCAAATTTTTCTACAGAAGTTGCAATTAATGCAAGTGTTGCCAAATATTCTGCATGGCGATCGCGTTGCAACGTTTGTGTAGAAATCGGCGCAGGAGTTGTTCCTAATTTTTCACATACGTAAGCCTCCACAAAAGGATCAATATTCGCATACGTCCCGACCGCACCAGAGATTTTCCCGAATTCCACACCATCAGCTGCAAAATTAAAACGTTCTAGGTTACGTTTCATTTCCTCGTACCATAGAGCAAGCTTCAAGCCAAAAGTAGTAGGTTCCGCGTGAACACCATGTGTACGTCCCATTGTTACGGTATATTTATGTTCTTTTGCTTTTTCGCCAATAATCGCAATGAAATTTTCCAAATCCTTACGCAAAATCTCATTCGCTTGTTTAAGTAAATAAGAATTCGCTGTATCCACTACGTCTGTTGAAGTTAAGCCATAATGAACCCATTTACGTTCCGCACCAAGCGACTCAGAAACTGAACGAGTAAATGCCACAACATCATGTCTCGTTTCTAGTTCAATCTCATGAATCCGATCCACATCAAACTTCGCATTAGCACGGATCTTCGCAACATCTTCTTTCGGAATATCACCAAGCTCTGCCCAAGCTTCACAAGCCAAAATCTCCACTTCTAGCCAAGCCTGATAACGATTTTGTTCTGTCCAAATGTTGCCCATTTCTTTACGAGTATAACGTTCTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP054042|2631558:2639844|2637757_2638471_-|WP_003733239.1|DBSCAN-SWA MTNELVYEGKAKRLFKTEEAGVLRVAYKDDATALNGVRKESFAGKGELNNQITSLIFSHLAEAGIESHFIRAISETEQLVKEVSIIPLEVVVRNVMAGSLAKRLGKEEGEPIPNAIVEFYYKDDALDDPFINDDHVLYLEVATTSEMDTIRQAARSINKVLQELFNQMNITLIDFKLEFGRDAAGEILLADEISPDTCRLWDKETNQKLDKDVFRRNIGNLTDVYTEVLNRLKQVQN >NZ_CP054042|2631558:2639844|2632121_2633171_-|WP_003733242.1|DBSCAN-SWA MAENAYSKAGVDVEAGYQVVERIKKHVARTERIGAMGALGSFGGMFDLSSLNLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYIATGKTDPVKMEQIVKGVADGCEQAGAALIGGETAEMPDMYGADDYDLAGFTVGAVEKQKLITEGAVQAGDTLIGIPSSGIHSNGYSLVRKIFFKDNEFTLDAEISELDVPLVEELLKPTRIYVKPVLEVLKEVDVHGITHVTGGGFVENLPRMLTNDLAVKVELGSWPVLPIFDVMKKYGQLNEMEMYEIFNMGIGMVLAVAKADVERTLEVLVQNGEAAYVIGEVTTRESNAVIFAGGKKG >NZ_CP054042|2631558:2639844|2634601_2636821_-|WP_003733241.1|DBSCAN-SWA MPNMEPTTKEIKEQRIYQEMGLTDSEYDLVCSILGREPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTEGKQVLQGPGEGAGIVDIGDGLGVAFKVESHNHPSYVEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPIAMLNSLRFGELDTPHAKYLVSEVVAGIAGYGNSIGIPTVGGEIQFDPCYTKNPLVNAMCVGLIEAKDIQKGQAKGIGNPVMYVGAKTGRDGIHGATFASVEFSEEGEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLDVIRDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGAGLELIMDDVPQRELNMTPYEMLLSESQERMLLCVKKGHVEEIQALFERYGLEAVVIGQVTDDKMYKIIHHGEVVANVPVDALAEDAPVYHKPSKEPARYQAFQEEEAFVPVIDDVVGVWKELLAQPTIASKRHIYEQYDYQVRTDTAVVPGSDAAIVRVRGTEKAIAMTTDCNSRYLYLDPEVGGAIAVAEAARNIVCSGGKPLAITDGLNFGNPEKPEIFWEIEKAADGISAACLELDTPVISGNVSLYNETDGTGIYPTPVIGMVGLVEDLAHITTQDFKNSGDVIFLIGETKAEYSGSELQKLQQGKISGRAPELDLATEKKYQQLLLTAIQEGLVASSHDLAEGGFGVALAEATFKAGLGADVEVPFALNQLFSESQSRFLVSVKPENEATFAQLMELEKVYRLGVVTEDDTIRVKHKEDLVTVKTTELRSIWEGAIPCLLK >NZ_CP054042|2631558:2639844|2631558_2632125_-|WP_003733243.1|DBSCAN-SWA MNIAIFASGSGSNFQALVDDEFIKPHVKLLVCDKPNAYVLERANKHDIPVFLFEAKNYPDKEAFETEILLELRRLEIDLLVLAGYMRLIGPTLLAEFPEQIVNLHPSLLPEFKGKDAIGQAIQANVSGTGVTAHFVDAGMDTGPIIDQVKVTIETAETTDTLAEKIHQVEHIFYPKVIRGLIQNGGND >NZ_CP054042|2631558:2639844|2637500_2637746_-|WP_003722248.1|DBSCAN-SWA MYNVKVYVTLKKSVLDPQGVAVKDAAKSMGYEEVEDVRIGKFMELKVAKSDRDIHEVLNEMCDKLLTNPVMEDYRYEIEEA >NZ_CP054042|2631558:2639844|2633189_2634617_-|WP_003722245.1|DBSCAN-SWA MLAEVKGLNEECGIFGIWDHPNAAEITYYGLHSLQHRGQEGAGIVSTDGETLKGHRNLGLLADVFKHGELDDLKGKAAIGHVRYATAGQKNLGNVQPFLFHFHSSSLALAHNGNLVNAKSLRRELEEEGAIFQTSSDTEVLAHLIKRSHTGDFVEDLKVALNKVKGGFAYMLLTEDTMYAALDPNGFRPLSIGRIGDSYVVASETCAFETVGAEFVRDVEPGELIIINDDGLRIEKFTENVTHSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHSARKRSGKRLAKEAFIDADVVTGVPDSSISAAIGYAEEAGLPYELGLIKNRYVARTFIQPSQELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVQLLREAGAAEVHVRIASPPLAYPCFYGIDIQTRNELIASNYSVDEICRIIGADSLEYLSEEGLVDSIGRPYPNEPYGGLCMAYFNGDYPTPLYDYEAEYLASLEAEK >NZ_CP054042|2631558:2639844|2636813_2637497_-|WP_003733240.1|DBSCAN-SWA MKFAVIQFPGSNCDLDMLHAIRDSLGEEAEYIWHAETSLAGFDAVLLPGGFSYGDYLRTGAIAKFSSIMPEVLRFAEMGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALIRNNNLHFICKTVPLRVANASTMFTELYEEGEIIQVPVAHGEGNYYCDDETLLKLKENNQIVFTYDSVNPNGSRADIAGIVNERGNVLGMMPHPERAVEEIIGGTDGLRLFESVVKAWKEEQVNA >NZ_CP054042|2631558:2639844|2638551_2639844_-|WP_020246648.1|DBSCAN-SWA MLERYTRKEMGNIWTEQNRYQAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVAKIRANAKFDVDRIHEIELETRHDVVAFTRSVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTANSYLLKQANEILRKDLENFIAIIGEKAKEHKYTVTMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLERFNFAADGVEFGKISGAVGTYANIDPFVEAYVCEKLGTTPAPISTQTLQRDRHAEYLATLALIATSVEKFAVEVRALQKSEVREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMVTAYENVPLWHERDISHSSAERIILPDSTILLDYILNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTLGLIYSQRVLLALIDKGLAREAAYDVVQPRAMEAWEKQVPFRELVEQDAIITENLSAEEIADCFDYNYHLKNVDLIFDRLGL |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP054042.1|WP_003731276.1|450946_451198_+|hypothetical-protein |
450946_451198_+
Protein sequences of NZ_CP054042.1|WP_003731276.1|450946_451198_+|hypothetical-protein>NZ_CP054042.1|WP_003731276.1|450946_451198_+|hypothetical-protein MSKTMYKNDVIELIKNAKTNNEELLFTSVERNTREAATQYFRCPEKHVSDAGVYYGEDFEFDGFEIFEDDLIYTRSYDKEELN |
83 aa aa |
AcrIIA12
anti_CRISPR3641|WP_003731276.1|AcrIIA12|II-A|Verified|Listeria-monocytogenes information
|
NA | NA | 416345-511298 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.5|500156|31|NZ_CP054042|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP054042 position: 466018-466048, mismatch: 2 tcgaatgtgtaagcttctgagtaacctagca CRISPR spacer tcaaacgtgtaagcttctgagtaacctagca Protospacer **.**.************************* |
||||||||||||||||||||||
NZ_CP054042.1|WP_023552266.1|1444999_1445248_+|DUF3850-domain-containing-protein |
1444999_1445248_+
Protein sequences of NZ_CP054042.1|WP_023552266.1|1444999_1445248_+|DUF3850-domain-containing-protein>NZ_CP054042.1|WP_023552266.1|1444999_1445248_+|DUF3850-domain-containing-protein MTKTHELKIAPEYFEAVTEGRKTFEIRKNDRDFQVGDILILREWDDMDTGLYTVVEVVYMTDYEQKDGFVVLGIVLKEEEEE |
82 aa aa | NA | NA | NA | 1436620-1471061 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.4|1303463|36|NZ_CP054042|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP054042 position: 1454588-1454553, mismatch: 2 acaataataggatattttggatttgtctgcgttcct CRISPR spacer acgataataggatattttggatttgcctgcgttcct Protospacer **.**********************.********** |