Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP001937 | Acinetobacter baumannii MDR-ZJ06, complete genome | 0 crisprs | csa3,WYL,DEDDh,RT,cas3 | 0 | 0 | 8 | 0 |
1. CP001937
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
38982 : 53788
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP001937|38982:53788|DBSCAN-SWA CATGCTTCTAATGATCGACAATTACGACTCTTTTACCTACAACATCGTTCAATACTTTGGCGAGTTGAATCAGGAAGTAAAAGTAGTTCGCAATGATCAAGTCACATTAGAGGATATTGAACGATGGCAACCAAAATATCTTGTGATTGGTCCTGGCCCTTGCTCTCCAAGCGAGGCAGGTATTTCAATTCCTGCAATTAATCATTTTGCCGGAAAAATTCCTTTGCTTGGGGTGTGTTTAGGCCATCAAAGTATTGGGCAAGCTTTTGGCGGGAAAATTGTAAGAGCCAAAACGGTGATGCATGGACGTTTATCTGATATGTACCATAGCAATAAAGGTATTTTCAGTAATCTTCCTAGCCCATTCTCGGCAACTCGTTATCATTCATTAGTCATTGATCAAGAAACACTACCTGACTGCCTTGAAGTAACATGCTGGACCAATGAAGCAGATGGCTCAATGGAAGAAATTATGGGCGTTAAACATAAGACACTTCCTGTTGAAGGCGTGCAGTTCCATCCTGAATCCATTTTGAGCCAACATGGCCATCAAATCTTTAAAAACTTTTTAGACATCTACGCATAAGTCAGCCGTCAATAGATTGTTTTTAAAGTAATTTGATAAGAACCCTTAATAAAAAAGCCAACTACGATCAGTTGGCTTTTTTATGGCTGAATCAATTACAACTTTAACTGTTGCACAATTGACCCATCTTGTTTTGCTACCAGCGATTCGCAGAGTTGAATACGTTCTTTGGTTTGTTTCAATCCTCTTTCTACCCCAACCAACTCTTTAGTTCGTGGTGCAAAAAAGTCATTTAACTGTGCTGCTTGTTGTTGGGTACAAGCTGCCCCACTGAACATTGCAGGGAAACGCCCAGCTGAAGATTTACCTAAACGATCAAACACAGCGTCATGATTTACTTTAAACCAAGACCATAAGCCACCTTGTTCATCTCCATAACTATTGATTGAGTTGACCACGGTACGAACTTCACCAACTTTAACACGCGGGTTTAAAATCAACTGACGTGCTTGTTGGCGCGTTGCTTCTTGATTTGCTGAACCCAAGGCTGTAAGTATTGCAAGACGTTGTGTCGGTTGAGTCACGCGTTGTAACTCTCCAGACAATCGGTCAAAAGCTGGTTGACCTTTTTCTTGTACACGTACAGCTAAAATGGTTGGCAATAATTCAGGTGTTACTTGCGCAAAATTAAGCTGCTTTTGAGCAAATAGAGCATCTGACTGTTTTAACAGTTGGGTACGAACTTCAGGAACTTGAATATCTAGAGCAAGAAATCTAACCAACTCACTACGCCATAAACTGTCTTCAGCTGATTCGTCTGTTTTGCTGACATAACCCAACTGATTTAATTTAGGTAAATATAAATTAGCTAAGACTTTTCTAAAACGTTCACGTTCAGCTTCTGTTTTCAATACATGACGATGAATGGTACTTAACTGGGAAAACAGCGCTGTACTAATTTGTCGGCTATTCGAATTGGCAAATTTCTTCGCAGCATCTACGACAGCCAATAAATTAATATCACCGTGGTTAAATGCAGCTGAAATTGCATAGGCATAAGCCAACTGTTCAGTGTTAGAAAGCTTTTCTGTAGCAGCAGTCAGACGAGTAAATTCTTTCTGTGGCAAACTAAATTGATAGTATCCTGCCGCATCTGCATTTGGAATATACCAACTGCCAAGGCTGGCACCTTTGAGTTCAATCTTGGCTTCTGCTTGGTCTACCAATTCACATTGCACTTTACTACCTGCATTTGGAACTTCATAACGTACACATAACGGTACACCCCAGAGGCTTCTTGCATCACCTTTTGAGCCCACAGGTAAATAACGGCTTTGCTTCACATTTAAAAAGACTTTATTGCCTTCTTGCTGTAATGCGGTGTTAATTAAAGGCACACCTGGTTGATCAAGAAAACTTTTCATCGCTCTAGTAAAGCGCTCACCTTGTCCAGACTGCTCTGCTAAAGCGCTAATTAAATCATTAGCTGTCGCATTACCATATTGGTGCTTATTAATATAATTACGCACTCCTTGTTTGAATTTTTCTTCGCCTAAATAGCTTTCAAACATATTTAAAACAGCCGCACCTTTTTGATACGTGATGCCATCAAAAGCCGTTTGAATATCGGCATTGCTTAAAATAGGTTGACGAATACGGCGCACACTCACTAAGCTGTCACTTTTCATCGCATCTGCGGTGTCTGTAATACGTTCTAGGTCAGCATTAAATTCGGGATGTAATTTTTGAGTAATTTTACTTTGCATCCATGTGGCAAAAGATTCATTTAGCCACAAATCATCCCACCACGGCATCGTGACGACATCACCGAACCATTGATGCGCCAACTCATGTGCATTGACATTAAATGAATTCTGTACAAAAAAAACTGGCGAGTCCTTATCTAATAACATCAAGTAGTCTCTAAAAGTAATTAACCCCGGGTTCTCCATTGCCCCAGCAGCAAAGTCTGGTGCTGCAAGTAAGTCGAGCTTGTCAAATGGATAACCAAAGGCAAAATAATCTTCTAAAGTTTTTAAAATGGCTGGCGTTTCAGATAAGGCTTGCTGCATTTTTTCAGCTTTAGTATCAGGTGCAATACCACGTAACTGGATCGGCTGCTTACGCCATGAAGTTGCTCCAATATCAGGCCCTTTTTGTAATTGCCACGGTCCGACAGCCAATGCAAGTAAATATGTTGGTAGTGGTTTGGTTTGTGCAAAACTGAGTGTTTTCCACCCTGACTTCTCTATTTGCTCAGATGTTTGTTGGGTATTGGCAAAACCTGAATATTTGCTTGGAATCGTCAAACGAATATTAAACGGCGTTTTAAAACGTGGTTCATCAAATGATGGGAATGACTGGCGTGCACTAATTGCTTCCATTTGCGTCATCACATAAGGTTTACCCTCAAACTCGATTTTATAAATACCATCGAGCTGCTGGTCATACGCTGCATTAAAATCTAGAACGAGTTGATACTGTCCTGCGGGCAAGGTTTTGGCAAATTTAATTTTACTCACCCCATCTATTTCAGAGGCTTGCTCATATTTTGCCTTGGTTTTGACGCCCTCTGCCGATGTAATATTCACATCTTTAACCGTTAAAGATTTACCATGAATCCAGATGTGATCTGTGGCTTGAGCCAGCTTTAAATGAATCGTAGTTTTACCGGTATAGCCTTTTTGTGCGGGATCAATCTTAAAATCTAAATCATAAGATTCGGGTACGACCCACTCGGGTAATTTACCAATCGGGATTTGTTCACTGTTATTCGATGCAAAAATCTGTGTTGCCGATAAAGATAATAATGTTGTAAGTAACAATCTTTTTTTAAATGAAGGCTTGACCAGCATAAGGGGTTTTATCCTCTGTAGTTTTAAATAAAAAGATGCAGCAAATGCTGTACCACTTCACTGCATCCATACATCATTCTTAGAATTTATAGTTAAACTCCAACCAACCTTGACGGCCGAATGGTGAATATGATCCTATCGGATAATACGGCCAACCGCCTGTGTCATCTCGTTTCACTTTGTCAAACAAGTTATTAATAATGATTGAAGCAGAAGCTTTTGGAGAGATTTGATAAGTACCGCTCCAGTTCACCAAATACGTTGGGCTTAAATAGGCAGTTTGGTTACCATTTGGAATTTTGCCATAACGATTAACTAATACTGTTGATGCCCAATCACCAAAGCTCCAGCTGAGACTGGTATTAAAACGGTCACGCCAATCCAGACTACTTAAATCTTTTAAATAGTCATCTTTCTCGTGATCTTTTGATTGTTGATATTCATGTTCTAGTACACGGCTATAATTGATCGTCCAGAGAAAGTTACCAAAGCTGTCTGTTTTCCAGCGCCATCTGCTAGTGAAATCAATCCCGCGGGTATGGTCGGATGCAGCATTAATCGGAACGATATTTATATTCTTAATCACATTTGGGTCGACAACTGCATTTGCAGGGTTACGCTCCACACGTGCTAATGCATCAATACAGGCTGCAGAGTTAATATCTTGGTTGCCTAAACGACAATCTGCTTCCAAACGTAGAATTTTGTCCGCACTTAAGTTGGTCACAAGATTATCAATTTTGATATCCCAGTAATCGACGCTGATATCAAATTTATTGGTTGGCGACCAAACAAACCCTGCACCATAAGATTTACCCTCTTCAGGTTTCAGCTCTTTGTTTCCGGTTAAAGTGTAGTTCGCCCCAGGTGCGTAATCTTTAAAGCTACATTTATCTAAAGGTTGTCCCGTTTGGCTACAACGTAAATAGTCAGTCGTACTTGCGAAATAACCTTTTTGCTTATTTAAGAACAGATAGTTCATATCTGGTGCACGAAAACTAGTTGCGTAGTTACCGCGCACCAATAAAGTCGGATGTGGCCTAAACTCAAGGCCTGAACCGAAAGTTAGCTTATCAATACTGTTATCTGACAAAGCATAACGGTCATAACGTCCGGACAAGGTTAAATTTAATGGCTTTGCTAAAGGTAAGAATAATTCTGCACCAAGTGCTTGGCGTGTACGAGTACCACTATATTCTCCACTAGAACTCGTATTATAAAACTCACCATTTTCGATCGCCTCATCTGGCTTAATCGAAAAACCTTGACGCCCAATTTCGGCCACAGTCGCAAGTTTGGCCGTTCCTGCAGGTAACTTAAATACATCACCATTCGCACTTAAGGTTAAACTTTGTGCCCACGATTTATCTTTTTCTTTTGTTGTGCCCGAAATACTTTCAAATTCACTTGCTGTTAGTGGTCGACTTAAACGATCTAAGTGAGGTGAATAAATAGGAATACCATCTGCATCTGTACCAAGTTGCTGACCTAAGAAATATTCATCAACATTCGAACGTAATAAGCCTTGGCGGTTTAGCTGACTAGTATAAATGGAACCATTATAGACTGCTTCATAACTCCAGCTCGTCTCTCCAATATCGCCTCGAATTCCAAAATTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP001937|38982:53788|49100_51476_-|AEP07213.1|DBSCAN-SWA MNQTIDLNISKKSAKAGDSIPHESAHLHVTGQATYIDDLPELENTMHLAVGFSNCAKGKISKFDLDAVRQADGVHAVFSAKDIEVENNWGPIVKDDPIFAEEQVEFYGQALFVVVAESYQQARQAVRLAKIEYVPETPILTIQDAIKKESWVLPPVEFSHGEVEQAFQNAAHQLSGAIELGGQEHFYLEGQISYAIPQENQSLKVYCSTQHPTEMQLLICHALGMNMHQVSVESRRMGGGFGGKESQSAQWACIASLAAKKTGRPCKLRLDRDDDMSATGKRHGFAYEWSVAFDDTGILQGLKVQLASNCGFSADLSGPVNERAICHIGNAYYLNAVELRNLRCKTNTVSNTAYRGFGGPQGMFVIENIIDDIARYLGCDPVEIRQRNFFAEQPGGGRDRMHYGAEVRDNVAPKLVAELLQSSDYAKRRQTIHAFNQNNDIIKRGIALTPLMFGISFNAVHYNQAGALVYVYMDGTVAITHGGTEMGQGLYTKVRQVAAHELGLPIDSVRLIATDTSRVPNTSATAASSGADLNGKAVQNACIKIRERLAKLAAEISQSEADQVQFEDSMVSTANGHSWTFPDLVQRAYMARVQLWDSGFYKTPEIHYDQVNHLGRPFFYYAYGAAVSEVAIDTLTGEMKVLRADILHDVGQSINPAIDIGQIEGGFVQGMGWLTTEELYWQPQGPHAGRLFTHAPSTYKIPTSVDIPHIFNVKLFNNQNQADTIYRSKAVGEPPFMLALSVFSAIRQAVQAAIPENAPLVLNAPATPEEILRAIAIGRGQALAARPQAKM >CP001937|38982:53788|42441_45174_-|AEP07208.2|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
115039 : 155598
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP001937|115039:155598|DBSCAN-SWA 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49 | Pseudomonas_phage(21.74%) | transposase,tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1489799 : 1562225
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP001937|1489799:1562225|DBSCAN-SWA 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69 | uncultured_Caudovirales_phage(22.22%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_4 |
2471933 : 2484281
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP001937|2471933:2484281|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP001937|2471933:2484281|2479860_2480049_+|AEP05619.1|DBSCAN-SWA MKISDLMTYHGCKNRKELSEKTGYSTVTLWKWENNGIPARTQAVLQVKTKGKLKADLQALTA >CP001937|2471933:2484281|2480785_2481010_+|AEP05622.1|DBSCAN-SWA MILNELHDRNRKNLRAKGYDENNAAITREEFSQTMAQRFRTNQWLAGQIVNSLANADLVQKFGGYVKPKVGVHE >CP001937|2471933:2484281|2482683_2483022_+|AEP05625.1|DBSCAN-SWA MKASKLIRDKGLQYAKEIVDSAPSNATEWNEGFEFQCGQSVEISKADREKYFVDLSELKRLVESVDLVESWGGIDDVKLYDLSHCKNRPESAGYKLLQAIADYESIYGGGYV >CP001937|2471933:2484281|2477714_2478722_-|AEP05615.2|DBSCAN-SWA MSKTVVKDKTVHYKKVDFLKGANLGQLLKAQLLDKDSFYYKAINRQQFVSATKDDFILINHASSHQSMFFGELIIVESGKAQAVLKIDSDDATEFPIKTYLTDDLPDDEDGVDATEVVRKEFIDSVLYFGVIDNHVAIIQSRSLTARTLESYLGWLLGEAAKALPENSALILKDAPNPTVKQKLESTPAKTISISSGIGSTELQPVHTVESSIPAKIDYKIEDNVVDVLKSAFGVDLENLKLEDGLDDANLKLKLTLTYNRKTSKSGQKVIDTVASSMRHNDDYVITLEDGTKVTADNLKMSGKISVETINNKVYNDGLKVQLYNWMTTNINFGD >CP001937|2471933:2484281|2476618_2476861_+|AEP05612.1|DBSCAN-SWA 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>CP001937|2471933:2484281|2481886_2482687_+|AEP05624.1|DBSCAN-SWA MNELAPFESFLKELIAAYRTKYAVQFNKNFPVEGKNAVPMQIVEQQLAKALVGVTPNQLQRGLALFYASTNTYMPNFAEFRAMCMGDDWWSAEKAWVKACEYTQISQHKKVTLPDGREQNQEITTLTKFVLDQVYLLIQDGEMYKAKMEFIKIYDEYKAEAQLKGKTQAWYQEPILLAQKNEQKVHIPVSNEEAQKHLKSLMERLKINGRKPAPVQKLQAKEKEPELAKELGPDPFDNPYEYAEMCRREGMPIPRNILQLIEGANV >CP001937|2471933:2484281|2475981_2476425_-|AEP05611.2|DBSCAN-SWA MNVKATPFNSFAFVSMAALAISGGSLVACQLQPAFQTKDAPTLFTPKTQPSTYSVLTAKITGKHSGVAVIKLDSFRLNVSFDFEAHPDSYGVPGSEFTTVDITQLTVNEITDINGKSYNDFTEFEDIRNINSLLKGFIERNKLVEAA >CP001937|2471933:2484281|2474242_2475364_-|AEP05608.1|DBSCAN-SWA MALPIITADQTLLVQAIIVYLYADPGLGKSSMGFTAEKAISFDFDRGAHRTGELRRGAVVQVQQWSDVANLTPQDLAPYKTVVIDTVGAMLECIKTHLLLTANNRQKDGSLKLKAQGLANQTFKQYINTLISLGKDVVFIAHASEDQNGDQIIYRPDLGGKNRNELYRIADVMGYLTTVTTGEGKNARVINFKPSPTHHAKNSGALGGETGEVWVPDLKAHPTFLADLITQAKDHINTLTPAQLAAAKAQEELENWKQSCEEAEHAGDLNQLTESLDKEHMYYQNMRQAMLMRAKALNCTFDKQRGTWISPPEFNGISDQQRDELQNFIAERGLDVKTVCEHFGIDALIQIEAAKLTAVKQEIETLAKTGMTA >CP001937|2471933:2484281|2483804_2484281_+|AEP05628.1|DBSCAN-SWA MSAVLKTQQMDWSKYTIDGWLEQFGAWCETVRMKGGDLPDGLHINQIYWLMREAGKEVQKSKSYIRCEISDYEADQIQALLRSLLNSDKTDFTTKFALICLIKNKVENKGLLKVAQETNQSKAQVAIMVSCARFYLLGHDKRLRQNGGSNENIHCKTI >CP001937|2471933:2484281|2471933_2472656_-|AEP05604.1|DBSCAN-SWA MSESTLWAVAMRPEGYSPFKQTPAASKEIAERAVERYRKMHEKEGNNFFLEIFDDVIKVQKWHGSRKDHIKNLFYVESWFSEPMYQCFDLKTAERVFKFDEIVICYKKGSAPLVTKSFDEAKLFYGSSETGFKYQIQPIEPPENLFNWFHPDIELFDTIEEGAEAYTREQWAQLQMNLRVEIETQLLDYDEIPNIPEDAVVWPNWKPEPPEQGLFLIAAFDSEDGPVLWWANPKAESKEK >CP001937|2471933:2484281|2483406_2483808_+|AEP05627.1|DBSCAN-SWA MSSVSIAEYRKLFPIKKNKKRRSAKQVARQPSVGEMVLATHLRACKIGFEQEYKFHPKRKWRADFLIIGTKILIEVEGGIWSGGRHTRGKGYIGDMEKYNSAAMMGFTVLRFSTEQVKAGVAIKQIEQLVGEK |
24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
2488239 : 2516913
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP001937|2488239:2516913|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.75%) | terminase,tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
3641534 : 3687737
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP001937|3641534:3687737|DBSCAN-SWA 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68 | Acinetobacter_phage(95.08%) | head,transposase,terminase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
3844992 : 3880319
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP001937|3844992:3880319|DBSCAN-SWA 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>CP001937|3844992:3880319|3870327_3870513_+|AYK13792.1|DBSCAN-SWA MFPNQLTFYFNYRISGDTSGGLQLFGLIGLIYGPIIFALTMVLLRLYTIEFKDFLERQDNS |
33 | Escherichia_phage(20.0%) | integrase,tRNA,transposase | attL 3861310:3861369|attR 3881449:3882268 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
3916048 : 3957740
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP001937|3916048:3957740|DBSCAN-SWA 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64 | Acinetobacter_phage(93.33%) | integrase,terminase,transposase,plate,head | attL 3915948:3915964|attR 3957743:3957759 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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