Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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AP017978 | Neochlamydia sp. S13 plasmid pS13 DNA, complete genome | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 0 | 0 |
AP017977 | Neochlamydia sp. S13 DNA, complete genome | 0 crisprs | cas3,RT,DEDDh,DinG | 0 | 0 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
815443 : 884331
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >AP017977|815443:884331|DBSCAN-SWA AATGCTGATTGATATCTTATCGCTATTTCCCAACTATTTTAAAGGGCCGTTTGATGAAAGCATTATCATGCAGGCCAGGAAAAAGGGCCTTTTAGATATCAATCTCATTGATATACGTACTTTTGCAGACAATCGCTATCATAAAGTTGATGACAGACCTTATGGGGGTGGACCTGGAATGGTCATGATGCCCCAACCTGTGCTTAGTGCCATCCATAGTGTTAAAAAGCCTGGCGCTAAAGTGATTTATATGTCGCCCCAAGGGCCCCTCCTCAAGGCAGATAAATGTAGAGAATTAGCTCAACAAGATCACCTTATTCTGTTATGTGGGCATTATGAAGGCATTGATGAGCGTATTTTAGATGAGGTAGATGAAGAGATTAGCATTGGAGACTATGTATTAACGAATGGGTGCTTAAGTGCCATAGTTCTTGTTGATGCACTCGTTAGGTTTGTACCTGGTGTACTGGGGCATGAAAGTGCGGCCGCCGAAGATTCGTTTGAAAATGGATTATTAGAGTGCCCTCATTACACTCGGCCAGAGAGCTATGAAGGTAAAGCAGTCCCCGAAATTCTATTAAGTGGGGACCATAAAAAGATCGCCGAATGGCGTCGTAAAAAATCGTTAGAAAAAACTCAACGTGTACGACCCGATTTATGGCAAAAGTTAAATATAAATCTTGAGGAGTAGAAAAAATGAGAAAACATGCTTTGGTCGAAATGATCCAAAACGAACAGCTTAAAAAAGATATTCCCAATTTTAGAATTGGCGATACTATCCGTGTGCATACTCGTATTATTGAAGGTCAGAAAGAGCGTATTCAGGTGTTTACAGGCACAGTAATTGCCCGTAAAGGTTCAGGGCTTTCCGAAACATTCTCTTTACATCGGGTAGCCTATGGAGAAGGTATGGAGCGTCTATTTCCTTTACATAGCCCGCGCATAGCAAAAATTGAAGTCATAAAAGAAGGTCAAGTGCGTCGTGCTAAATTGTACTATCTTAGAGGAACTTCAGGAAAAGCTTCTAAAGTTAAAGGTCGCGTAGGCTTTAATCGCAAAAGCGCTGCAGTTGAAAAAGAGCCTGTAGCTGCAAATGTTGCTAACGAAAGCTAAAATGACTCAATGTCAGAGTTAAAGAAAATTGGCAAGCGTGAAACTAAGCGCTTGCTTAGCCTCACTACATTTGAAGAAGAAGCCCGGCAACAAGGTTATCAGATTATTGCAGGTATCGATGAAGCAGGGCGAGGCCCTCTAGCAGGACCTGTAGTTGCAGCAGCGTGCATCATTCCTGTAGGCCTTTTAATTCCCGAAGTTAACGACAGCAAGCAATTATCCAGCGATAAACGTACGGAATTGTATAATATACTTACCCGCCATGAAGATATTCATTATGGAATAGGGGTAATTGATTCTCCTACTATTGATAAAATTAATATTTATCAGGCCACTATAGCAGCTATGCTTATGGCAGTTGCGCAGTTAAGCTTAGAGCCTCATTTTTTGCTTGTAGATGGTTTAAAGCTTCCGCATCCTAGCATTCCTACTCAAAAGATCATCAAAGGGGATACTAAATCGCAATCTATTGCAGCTGCCTCTATTATTGCCAAAGTAACTCGCGACCGTCTGATGATTGAGTATCATCAACAATGGCCTCTTTATGGTTTCGATCAACATAAAGGGTATGGAACGGCCAAGCATTTAGAAGCACTTAAGGTGCATGGAGTATGCCCGATCCATCGCCAAAGTTTTGGGCCAGTTAGGCATCAACTTGGCATAAGAAATGCTCAATTCTCTTTAACTTTCTAATTAGTTTTTCCCTAGCTAACTGAGCTTCATTACAATCTTAATATAATATTTATAAATTAGTTGTATTTGAAAGTTAATATATGTATATGATAATTTAAGGTTAAAAATTAAGGTATAGGTATGAAAATAAATTCGCAAGACTTGTTTAACGACATTAATGCCCTTCGTTTATATGAAGTGGCAGTGAGCATATCACGTGAAAATGGAAAAAAAAACTATACGATCAAAAGAGTGAAGCTAAATCAGCACGACAGTATAGAAAGAATAGAAGCTTTAATTACTAAGCTTAATGAGGGTAAGATTTGGCTTAAAGTCGGTAAACGTCGCGAAGGCACAGTAAAATATGTGGGTAAAGGATTGAAACCTAGCGAAATTGCAAGCATTATCTTAAAAAAGCAAGATAAAACCGATAAGACACCGATAGAAATCTCCATCGATATCACTAAAGAAAATTTAGAAGATCAAGTAGAAGAGATGTCGCATCAAGATATTTCCTTATTAGAAAGGATAGCTAAAAGCCTTCAAACAACCTTTAAGCTTGACATTCAGAAAAAAGTGAATAGTCAAGCTCATCTCATTAATCACCATGTAGCTGACTCTTCTGTTAATTCAAAGCATGCATTAGCTGCTAAAGCAACTCTATCTGAAGAGAAAAAACTTACCTATCGATCTCGATCTCAAGAATCTAAGAAAGAGAAAAAAGTGGAAGAAGAAAAAGCCATTGAAAAACAACGCGTTCAAAAGCGTAAAGCGCTAACATTGGCTAAAGAGTTAGATGAAAAATCTGATAAGCGCCGTCTTAGAGCTATTAAATCCACTGAAAAGCAAAAAGAGATTTTGAAAGCTGTGCCTTCGCCAAGAAAGGCTTCATAAAGCTTAATTTTGAAGATCGAGAAGCTCCTCAAATTACTCTCTAAATTTTTAAGCGGCGAGTATTCAGGGAAATTGCATGAAGATTTAAGTTGACAAATAAGGAAATAGTTAAAAAAAGATCTTCACATGGTTTAAAAATGTTTTTCACCAAAAAATTTTAAACATGGAAGGTCAAAATGATTGAAAAAGATATCGATTTATTAATCTCTATTTTTTGTGATGTAGAGGCTTGTTGTAAACAATTTGAGCCTGAATGGCGCAAAATATTGGTTGAAAACCACCCAAAACCTTTAATTGGAAAGAACAATAAACCTTCATCCCAGAGGAATTAAATACTATGTCGGTTGGGAAGCCTATGACTTAGCTTCTTAAGCTCTGGTTCAAGCTTTTTAGCACGCCTGCAAATGCGTGTATAATAAGGAACAGGCAGTCTCAAAACGAGCAAGTAATCAGAGACAAGAGAAATCCTCGCAAAGTGCAAAGGGGCAAATGATAAACAGCCCTAATCATCAATGCGCATAAGAAAGCATTAGCGGAGTAAATTCTTAGGCGACTCTTCTTCCCGGCGCTTTTATTTTCCCTCCATCCTTTAATGGACTCCTCTGAGAACCATAAAGTTATGTTTCCTCTTTGCGCTAAAGCTTTGTTATGCTCGGACCAATTACGTATGCGGTGGTTAATCTTTTTTTCCATAGCTTGCCTATATTTTTGTCTTGGCAAACTAAATTTTATATCTCTTAAGCGTTAAAGAGCAATCTTATCGCATACGTTTCTTATCATTTACGCAAGAACGCCTTTTTCCTTTATCGCTTAATCTGAGTGACTTCATGGTGATCAGGATTTAGATTTAAATGCTAAGATTTATTCTGGACTTTAAAAGGTAAATTTGATAATAGATGTTTAATCTATTATATCTAAATAAAGGGGGGGAACATGCAAATAAGCACCTTGGCTAAACTATACATTTTTATTGATAGGCATGCAGATTACGGTGCGCCACGAACTTTGACAAGCCAACGGCGGGTCAAAGATGCTGTACAAGAGATTAGGGAAGGCCCCTAGTAACCGATGACTTAGGCATAGGTTACAAACCACCTTAAGCTGCATGGGTAAAGAGCCCATGTGGTGAGCGTTAAGGAAAAGGTATAGCAAGACTATATCAGGTGAGAGTTAAGGAGACGAATGCAAATGAATCACTGATGACGTGTCGAAAGCATAGGGATGATGTCAAAACTGGGGGGTCTTAGTTAACCCAGGACAAATCTAAGGGAAACCTAATATTAACTGCTTAGATGGCATCCGGCATAAAGGTGACGTGAACTTAACTACAGGCTCTTATACGGAACGTGGGAACCTGTCGCCTTGATGAAAAGGGAGAAGTTCAAATGGAAGCCCCATAAGAACCAGAGTACCGATGCAAGGAACAGGGGCGGAATAGCCCGTAGTAGTGAGGAGACCTCTGTAATGGAGGTGGAGCGAAGGGGACTATATTGTTTAGCTTAAGATTAATCGAACAACTGGAAACAGGAGGAATCGATGAATACAGCAAAGTCGTATTGTATTTCTAAATCCATTGTATGGGAAGCATACAAGAGAGTAAAAGCTAACAAAGGAGCAGCAGGTGTTGACGAAGAGTCTATAGAAGAATTTGAAAAGAATCTTAAAGACAATCTGTATAAACTTTGGAATCGCCTATCGTCGGGGAGCTACTTTCCGCCTCCCGTAAAGATAGTTGCCATACCAAAAAGTGATGGAAAGCTGAGAAAGCTGGGAATACCCACAGTATCAGACAGAATCGCACAGATGGTCGTTAAGCTGTATCTAGAGCCAGAGATTGACCCACATTTTCATCCTGATTCTTATGGGTACAGACCTGGAAAATCAGCGTTAGAAGCCGTAGGAGTCGCTAGACAGAGATGTTGGCGCAACGACTATGTTATTGACCTTGATATCAAAGGATTTTTCGATAATTTAGACCACGAGCTCGTGATGAGAGCCGTAAGGAAACACACCGAAAGCCAATGGATTCTTCTGTATATAGAACGCTGGCTAAAAGCGCCAGAGCAAGATGCAGACGGGAAACTTATAAAAAGAGATAGAGGGACTCCACAAGGGGGTGTAATCAGCCCTTTACTAGCCAATCTATTTCTTCATTATGCCTTAGACGAATGGATGAGGAAATGCTATCCAGGTAATCCATTCGAGCGTTATGCTGATGATATAGTGGTTCACTGTCAAACGGAAGCGCAAGCCAACGAAATAAAGAAAGCTATTGCAGAACGCTTAGCTCAATGCAAACTGGAGTTGCATCCTGCAAAGAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >AP017977|815443:884331|856005_857148_+|BBI16856.1|DBSCAN-SWA MLENPNHLFVTCGQGLESLLIQELAELGFTQVREGFRGVYVFDKSFPAIFRLNYCSRIAGRVLLPLAQFPCYDQKGLYKGGSSIDWLKYLPSGKNFAIDANVSHRQLKNSLFAAQVLKDAICDQIRAKTGNRPSVNVKNPDVQLNLFIHDNQATISVDTSGTPLHKRGYRQESAEAPLQESLAAALLRLADYQPHEILLDPCCGGGTLLIEAALIASRTAPGYLRQKWGFMLLPHFSFEEWLKVKTEVDALRQAIPKNHLFGIDINKNVARICQGNLRAAGFLKDVLVKQADFREFSPSILPTMILTNPPHGKRLDNVDTLIPLYRALGDFMKHNVSKPARGFIFTANTPLVKEIGLSASRRHVITNSSVDSRLLEFGLY >AP017977|815443:884331|854892_855993_+|BBI16855.1|DBSCAN-SWA MAAGRLSCGIVGLPNVGKSTLFNALTSNQAPASNYPFCTIDPNVGVVEVQDARLHVLSEISHSNKIIYATMEFVDIAGLVAGASQGEGLGNKFLANIRETDAIVHVVRCFDSSDIVHVSGQTDPIRDIEVINLELCLADLQMIENAIPRVEKQLKGKKELALTLAVLNRVQEHLNASKPVRMLEFTPEEREVLQLYPLLTMKKVIYATNVSEDDLPDMENPYVKRVRDYAAAEGNVVISICARIEEEIAQLNLSERQQFLDSLGLQESGLQRLIRASYEMLGLISYITTGEIETRAWTINRGTSAAEAAGKIHSDIQKGFIRAEVVSYEDMVTYKGRVAAREAGKARSEGREYVVKDGDVILFMHN >AP017977|815443:884331|819657_820908_+|BBI16821.1|DBSCAN-SWA 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57 | Pseudomonas_phage(28.57%) | protease,tRNA,integrase,transposase | attL 819209:819226|attR 865170:865187 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1278161 : 1317594
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >AP017977|1278161:1317594|DBSCAN-SWA CATGAAATTTGATAAGATAGAGAAATTAGATGATGAACGCTTTCGCAGATTGACAGGGGTAAAGCGTAATACCTTTGATAAGATGGTGCAAATTTTACAGCAAGCTGATATGGCCAAGAAGAGTAAAGGCGGGCGTAAATATAAACTACGTTTAGAAGATATGCTGTTAATGACCTTGGAATATATACGAGAATATAGAACCTATTTCCATATTAGCCAAAGTTATGGAATCAGTGAAAGCTCAGCTTATAAAGCGGTGAAATGGATTGAAGATACGCTAATCAAGCATCCAGATTTTGCTTTACCGGGACGTAAAGAGCTTTTGAAAAGCGATACAGAATATGAGGTTATTTTGGTTGATGCTACAGAAACGCCTATTGAGCGCCCTAAAAAAAACAAAAGCGCTATTATTCAGGGAAAAAGAAAAAACATACCCTAAAGACCCAAGTTGTAGTCGATAAGAAGAGTAAAAAAGTAATATGTACCTCATATGGCAATGGCAAAAAGCATGATTTTAGGCTATTCAAAGAATCCCAAGTTAAAATCAATCCACAAATAAAAGTATTAACCGATTCAGGTTATCAAGGATTAAAAAAGCTGCATATTCACACCCAGATGCCCAAGAAAAAAAGTAAGAAGAAGCCTTTAACTAAAGAGGATAAAAGAACAAATCAAAGTTTATCCAGAGAAAGAGTTGCCAATGAAAACGTCATTGGCCTCCTTAAGCGATTTAAAATTATAGCAGATCGCTACAGAAATAGACGTAAAAGATTTGCCCTTCGCTTCAACTTAATTGCAGCAATCTATAACTGGGAATTAAATGAGTGAGTTTCGAAAGAGGTCTAATGATCAGACAGCATATTCCCGGTGAATGTGCGGAAGTAGATTTTGGTTATCTAGGTTTATGTTTTGACCCTGACAGTGGTAAAAATCGTCGCGCTTGGGTCTTTTCTTTAAGGCTTCGCCACTCACGCAAAGCCTATCGTGAAGTTGTTTTTGATCAGAGCACTAAAACGTTTTTAGCCTGTCATATCCATGCTTTTGAATGGCTAGGTGGAGTACCTACAAAAATTGTTATCGATAATCTAAAAGCTGGGGTAACAAAAGCTTCTTTGCATGAACCTTTACTCAACAGATCTTATCAGCAATTAGCAGAACACTATGCATTCATCATCAGCCCTTGCCTTCCTTACAAGCCTCAACATAAAGGTGGGGTAGAAAACGACATCAAATACATCAAGAGAAATTTCCTTTCCTTTTTCTTAGAAAGTCAAGCACAAAAAGGCATCGAAGTGCCTTCTAAAGGTGATTTTCAGAAAGCTCTTGACCAATGGAATTGCGAGGTTTCTGAAAAACGCAAAATTGGGGGTGTTGATCGTACCCCTCAAGATCTTTTTGAAGAAGAAAAGGAGCATTTAAAATCCCTTCCAAGTTGCCGTTGGGATGCTTTGGAATGGTATTGTACAATGGTAGGAAAAGACTGGAGAGTGCGCTTTGATAAAGTTTGGTATTCGGTTCCTTATGCTTTTATAGGCAAAGAAGTACAAGTTTGTGCTAGTCAAAGCTCTCTTAAAATTTTCCATGCAGGCCAAGAAATTGCTATGCATTTACGTTCATATAAGCTTAATGATTACGTCAGGGCAAATTTACATGCCCCTTTGCAGCAAGAAGAAGTGCTTAATGCCACCCGAGGCGGATTACTAGCTCAAGCAGAAACCATAGGCCCTTTTACCTTAAAGTTAAGTGAAGAGCTTCTTAATGATCCTTCTCACGATAAATTAAGGCCAGTTAGATTAATTTTAAAGTTTGCCTTACGCTATAGCCCTGATAGATTAGAGAAAGCCTGCCAGCGAGCTCTTATCTACGGTACTATTTCTTATACCAGCATAAAAGCGATCTTAGAAAAAGCTTTAGATCAAAAGCCCTTTGAAGAGCAATCTACCCAATTAGATAAACCGCAAAAGTATTTTAAATTCGCTAGAGACCCACAATATTTTACCCAAGGAGCTATGTATGGATGAAATGATTTTGCTTAAATCAAAACTTAACAAGCTTAAATTGCCTAAATTGTTGGAAACGCTTCAGGAACGTTTAAAACAGGCTATAAAAGAAAAATGGTCTTATTCGCAGTTTTTGGACATATTGCTTACGGATGAAATGGATCGTCGTAATCAAAGTCAGTTTGCAAAAAAGCTCGTGAAAAGCCATCTACAAGTCAATAAGACATTAGAAACTTTTGATTTTTCATTTAACACAAAGATTTATGAGCCTATCCTTAAAGAATTAGCGACATGTCATTTTGTAGAGAATAAAGAATGCGTGCTAATCATCGGCCCCCTGACTTCAACACTTTTTTGCGTAAGTATCTGATTATGAAAATCCCCAAAATTTCTATAGGCACTACATTGGAAAGAAAGTAAAGATAAGGAGCTAATTTAAGGCTTATGAAATTTAGGCTTAGAGGAAATGAGCTTGTAAGGGGTTGTGGAATATTTTAACCCCATGACTTGATAAATCTTTAAGCCATGGTTACTAGCTTTTGAGGGGATCACGTAGCGCTGTCCATTTTTATCTTTCAAAATGCTGGATTGAATTCTAATTAGCTCTTGACGAATAGCTTCAGGTGACATTTTCTCATATTGTAAGGCTACCCGATATTCAAGATGCCTTACGCAACAAAAGGCTATAAAAGATAGGGCAAGATGAGCTTTTACTCTCTCAGGCGTCCAATGAAATATAGGTCTGACTTTAAGATCATGTTTAGTGATTCGGAAAGATTCTTCTACTTGCCAAAGACCGCGGTAGTGTTCTAACAGCTCGTGGGGTGATAAGTGTTTGGCATTGGTAATTATTCCATGCAGCCCATCCCACTGAGCCTCTTCTTGTAGTTTTTTCTCATTTAAAGATATTTGTGACTGCCCTTTAAAATTTAAATATTTCTTGTAACCGTAATTTGAAATAAATGCTTGGCACTTTTTGCTTTTCTTTAGCTTCTCTATTAACTTGTTAAGAGCTTTTTCTCGATCATAAGCATCTTTTTTCGCTCTAGAGGCATTATGGGTAACAATTAGACGATGATCCTCATCTAAGTAAATAGCAGTAAGGCGTGTTTGACCATTTTCAGGATAGGTTGCATAAGCATTTAAATCTAAAATCTTCTTCTTAATCTCTGTTTTTTGATTTTTTAGGCGTGCTCCAATAATATACTCATATTTTGCTTGCTCAAGTGCTAAAAGATTAGCGCTATTTAAAATGCCACTATCGCCTACAAATATCACTTTATCTAGCTGATAGTTGGCTTTAACCTTTTCTAAAATAGGCATAAGAGTATGCCCTTCATAGGTTGATCCTGGAAAAGCCTGGTATCCAATAGGCATGCCTTGTTTAGTTACCATTAAGGAAATTAAGACTTGAGGCTGATTGAATTTAAGGTCTTTGCTATAACCATTTTGCTTAAATTCATCTTCTTGGAAAGACTCAAAATAAAGGGTATTAGCGTCAAAAAAAATCAGATCGATTTTTTGTCCAAATAATTCTTTGGCTGTATTGTAAGCACAATCCTGTATAGCTTGCTGAGCCTGTTGATTTAAACAATCCATCATCCTATAAACACCTTGCAAGTTGATTTGTATCCCAAAGTCTTGCTCTAATTGCCTAACAGAAGCTCTTTTGCTAACAGGATTAGCAATGCGGGCCATGACAATGTGTTTTAATATTTCTGCACTTGAAGTGTTTTTAAGAATATTTCCAAAACCTAGCTCTTCATAGATTTTTCCATAAATCTCATGAATGCCCACGATAGCACGCTGTTCTTCTTCTAGGTTTTTAAGGTTAACGTTTAGCTCCTCATCGTTTAGCTTTGACATGTTTTTTGATTTAATCGCTTGCTGAGCCATTTCTTCAGGACCAAAAAGAGTGGGATCGTGTTGGTGTTCTATCTTGCTCTTGATATGTTCCGCTAGCTCAACCATTTTTTTAAGTTCTTGCTCGTCCATAGCAATCCCGACATAGCGGACGATTCTTTGTTTAACTTTTTCTCCATCGCGCACCGATTCAACAATCTGCACAGATTTTCTGGGGCTATTAGGTGTGGTTTTTACTCTGACAAACATAAAAATAAGCTATAAGTTTTCTTGCAATATAAAAGATTTCTAAAAATAAAGCAAGATAAATGTTTTACTAGGCACTACAAACTAGAAAACAGAAAAATCAGGAGTGTTCTCCTAGGAAAATTTGAAAAGCTTTATCACTTTTTGAGGTTAAAATGTTGAAGTCAGGAAAAATGGTCTTATTCGCAGTTTTTGGACATATTGCTTACGGATGAAATGGATCGTCGTAATCAAAGTCAGTTTGCAAAAAAGCTCGTGAAAAGCCATCTACAAGTCAATAAGACATTAGAAACTTTTGATTTTTCATTTAACACAAAGATTTATGAGCCTATCCTTAAAGAATTAGCGACATGTCATTTTGTAGAGAATAAAGAATGCGTGCTAATCATCGGCCCCAGTGGAGTAGGAAAGAGCCATCTTGCCCAATCGATAGGCCATGAAGCTATTAGAAAAGGCTATGAGGTGCTTTTCTATAGAACATACCAGCTTTTTTATTGGATATCTATCGGCCATGGAGATGGGAGCTATAGAAAAAGACTACAGCAGGTCATTAAAGTGCCTTTATTAATTTTAGATGATTTTGGGTTACAATCGCTTAGTGAAGCCAGTCAAATGGATCTTTATGAAGTGATTTGTGAAAGATATGAGAAGGCTGCCACGATTATTACCAGCAATAGAGAATTTGGAGAGTGGCAGGAAATATTCGCCAATCCATTAATAGGTAGTGCAGCACTAGATCGTTTGATTCACAGAGCCACAAAGCTTGTGATTGAAGGAAAAAGTTATCGTATGGAACAATTCCATAAAAGATCAAAACAAAATAAAGAAACCGAGAAGTAAAGAAAAAATCCAAGCTAGGGTGGGTCACTAAAGGTGACGAGGGGGTGGGTC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37 | Enterobacteria_phage(16.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1631438 : 1695428
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >AP017977|1631438:1695428|DBSCAN-SWA 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MSFSVFLKTSLNEYFKCLSLPDNLTVIHYVLGNESADLDSVISSLMYAYLLYENHSRQELYLPLINIKREEVNTRKDLLYLLQLAKISTNHLLFLEEAPFSYLFSRRQLRLNLVDHHILRMDQQIFSAAVESIIDHHFPEPINYPLLSPASLLIEPVGSTATLIAEKLIAHPTINITPKIATLLLAPILVDTHNLKSIDKTTWRDIKIAKKLLQVAAGALPSNFYDILQVEKNNISLLSPLQLLNKDFKSYLAGNFFYGISSLPQGVDWWQQERQSLLPLLNTYAQEKKLSLLILFMSPINPIGPKRRIIVYTPSPLILESFKFYVEKDVILKKLLMPSSSLRHQCLAYYEIESFIARKHLQPYFHFLKNLANLSW >AP017977|1631438:1695428|1639572_1639995_+|BBI17459.1|DBSCAN-SWA MKRGDLLAPEAKINGERLTPTSEGLKRKALLLDTFINAIPELKLNAWNVITTLNIFLQRTVEEVGGLLLIGNNLADQLNNLAVKKIGLEYELEQSIDFIATFKEVHALFEKHVLEAEKATKGAGNVFPLLLTQALENKED |
52 | Pigeonpox_virus(20.0%) | integrase,transposase | attL 1687396:1687410|attR 1698443:1698457 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1726590 : 1780152
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >AP017977|1726590:1780152|DBSCAN-SWA 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44 | Orpheovirus(33.33%) | protease,tRNA,tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2016849 : 2095255
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >AP017977|2016849:2095255|DBSCAN-SWA 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56 | Enterobacteria_phage(27.27%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2115407 : 2152825
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >AP017977|2115407:2152825|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >AP017977|2115407:2152825|2142138_2143317_+|BBI17863.1|DBSCAN-SWA MINLDSKELLETDFNALARKILTLENQTNNFNEKVDNLAKVILFKNERHEQHLKTLCEQNQLFMETIVKLKSDNIILTTENKVLKQEAQKWKNKASKTQAVMQLALQANEQFGEAVQALTTDKEKLSQENGSLKEDKARLTQASHAFKQDNANLRAENQVLKDKNKGLKSEKQRLTTKVQAAENGFQTLTKENEHLRDLGGRLNQQIALLTQQAQEAPTLPPKILKLMIEEGLKVNPDTPLTEAIRLIFEINENLKKKNKELQATLIRIETTLGLQKGVSCDSILRAINKAIVIPNKLKVLGNKLVIANLLKKDYQPEDVLEILNGVLNDYLDFRRHQPMICKELGIKATSNIETILKKMQEKKDESGVSAYFSRLGRSTLCLLSLGFAKVV >AP017977|2115407:2152825|2132080_2132530_+|BBI17854.1|DBSCAN-SWA MTKEMVEDFKEDFSLFIEAGFIAVKQLDEISASRIFQAAQTLNPESTAPQIGLGYIALNKLEVKQATKIFEEVVQKEPENYLAQTFLGISFLLTKPKRKKGEKLIQEAMDKSNDPTVKNLGFLSLQWAQKDLNDLKSHFFNHEKGEVKK >AP017977|2115407:2152825|2140491_2140803_-|BBI17861.1|DBSCAN-SWA MYSLHEPHVECIAKGEIEKSYEFGCKAALVITPQEGLALDVRAIHGNPYDGHTLEEAIRKAESNSDKNIEVDFVDKDYRGQTVEGKAIFISGQRKGLTHWIQT >AP017977|2115407:2152825|2120416_2120854_+|BBI17844.1|transposase|DBSCAN-SWA 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35 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(20.0%) | integrase,transposase | attL 2108935:2108950|attR 2136232:2136247 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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