Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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CP023771 | Lactobacillus plantarum strain WLPL04 chromosome, complete genome | 0 crisprs | csa3,DinG,cas3,DEDDh | 0 | 0 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
366509 : 425603
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP023771|366509:425603|DBSCAN-SWA ATTACTCGTCTATTTTATCTTCAATATTTAGGATACTCAATAACTTCCAATGCTTAGAGGATAGGATAAACGTAGCAATGCCAATGAATAAAATATTTAGAAAGAGCCCCTTTAGAAGAGCTTCCATTGGCCCGTTAATGGGTGATTGAGTTGGGTCAATACCTTGAGAATAGAAACTAGAAAAATCTATCAACCAATGGACACTAATGGCAGCCAGTAAGCTTCCGGTTTTTAAATAGATTGCTGCAAGTAAAATACCTAACCCAATAACATAGAGAACCTGACACAATACTGACCATACGGGCTGTGATAAAAGGTTGACCAAATGCATAGCCGCAAAAATAAGCGAAGCAGTCATCATCGAAGCGATGGTGGCCTGCAATGTGGCAAATTTTTTAAGGTTTAGTGCTAAAAGCGTTCTGAATATCATGCCACGAAAAGCGTATTCTTCAGTTATCGCTACAATCAACGAAAGTAATAATGAGATTAAAAATTGATACATGTGGTTTCGAAAGAAAATAAGTAGAAATATTATTGCTAGGCTCAAAGGCAGACTATTCTTCTTTAATATTGACATGATATTAACGGGTAGCCAGTGGATAGGTTGCTTAACATATCGCCTATTCAGAATGATTATCGCGATTAATATAATAGATTCAGTTAATATGAATTGAAAGGGTCCGTCTTTTATTCCCATAATATCAGTCAAAGGATTCATTAAAAAGAGCACTATTAGGTAGTAAATAGCTGTGATTATTACTTTTATTAATGGCATAGTTAAAATTCCCCCCATATAAACTAAAAAGGCTGAGCACTGCAGGCCCAGTCATAAATCGAGTGCTTTCTTATAGTGCTTAAACTTGATGGCTTGAACTATCCGTGGATGAATCCTCGGACAGCGCTAATGACCCAATCGGCAGGCCCAACAGCACTTTTATAATTATTCCGAACGCCACGCGCGCTATAGGCATGGAAAACGCCACCTGAAATAGCATTTAATTCACGGTCACGCAAAACTAGAAATTTTTTCATAATTGTTGATCTCCCCCAAGAAAATTAACGAATACTTTTCAAAATACCACGAATGCCTGCAACTGAACCAATTGCATCAACAACATGTCGAACACTTTTACCAAAGTTATAACCGCCCCGATTAAAACCACCAGATATTTTGGCAAGCTTTTTTTGCGGCAACCTGGAATATTGTAACTTCTCAAACTGTAGCATAAATAATCCCCCTTGTATGATGTTATTTGGAACAAATTTAGTTTAATTTATTTTTTTACCAGATTGTTGAAAAAATTATAAAAGTAAAAAAACGTTCTCTTAACGTCAAATACCAATGTTAGCTAGTTGATGTTTAACCGTTAAGCCTGATGAGGACATTTATCATAAAATTATGTACGTTAATAGATAGTTGGCATACGATAACATTTGTTAGCCCATAATTAAATAGATACCGATACTTAATAATTGGTGAGGGGAGTACAAGTATGCATTGGAGAAACTATGTTGCGCAAGTTGACGAGATGGACTGTGGGGTCGCAGCTTTAGCAATGATTTTGAAAAATTATGGTTCGACAACATCATTGGCCTATCTAAGAAATATTGCTAAAACGAGTTTAGAAGGGACTACGGCATTAGGATTAGTAAAAACGGCCGAAAAGTTAGGTTTTGAAACCAAAGCAATTCAAGCAGATATGAGTCTTTTCGAGGTACAAGATTTACCATTGCCATTCATTGTGCATGTTACCAAAAATGGGGATCTACAGCATTTTTATGTCGTTGTAAAAACCTCGAAAACGCATGTCGTGATTGCTGATCCGGACCCAACAGTTGCGGTTATCAGTATGTCAAAGGAACGGTTTGAAAGCGAATGGTCCGGAGTTGCCCTTTTCTTTGCACCGAAGTCGGAATATAAGCCAGTTAAGCAAGATAAGGGCTCACTATGGGGATTTATTCCAAGCTTATTAAAGCAGCGCCGACTGGTTATTAATATTGTGCTTGCTGCAGTTTTAATCACGATTATTAGTATCTGTGGGTCTTATTTCTTACAAGCGGTGATTGATACTTATATTCCCAATAATATGCACAGTACATTGGCAGTGGTGGCCATTGGTCTAATCGTTTTTTATACCTTTCAGGCTATCTTTACTTATGCCCAGAATTTTTTATTGGCGGTTTTAGGTCAACGACTTTCGATTGAAATTATTTTAGGCTATATTCGGCACGTCTTTGAATTGCCAATGAGTTTTTTTGCCACTCGGCGGACGGGGGAAATTGTTTCGAGGTTTACGGATGCCAGTAAGATTATTGATGCGTTAGCTAGCACAATTGTTTCGCTGTTTTTAGATGTCAGCATCGTTATTATTATGGGGGCAATCTTGGTAATCCAGAATATGACACTTTTTTGGATTACGTTACTCTCGTTGCCAATCTACGCGGTTGTCATCTTAGCCTTTAATAAATCCTTTGAACGATTGAATCAAAAGGAAATGGAGAGCAATGCTATTTTGAGTTCAGCCATTATTGAGGATCTTCATGGGATTGAAACTGTTAAGGCGCTGAATGGTGAGACGGAACGTTATCAGAAAATTGATTCAGAATTTGTTGATTATCTACGTAAGAGTTTAGCCTATCTTAAAGCGGATACTTTGCAACAGGCATTAAAACTGTTTATACAGTTAGTCTTAGAAGTTGTTGTTCTATGGGTGGGCGCCAATCTCGTCATTCATAATCAGTTATCAGTTGGGGAGCTCATGACATATAATGCTTTATTAGCCTATTTTGTTAATCCACTACAGAATATTATTAATTTGCAGACTAAGCTTCAAAGCGCTAAGGTCGCTAACAACCGGTTAAATGAAGTGTATTTGGTCGCTAGTGAATTTGAGGCGTCACGGCCAATTCATAATGAAAGTCAATTAAATGGTGATATTAAGTTACAAGGGGTCAGCTATCGTTATGGTTACGGTGAAAATGTCTTAGATGATGTTAATTTGACGATTCGACAACATGATAAGGTTGCAATTGTGGGGATGAGTTGCTCTGGCAAGTCCACGTTAGTTAAATTGCTTATTGATTTTTATCAACCAAATAGTGGTGATGTCATATTGAATGGCTTCAACGTTAAGAACATCGATAAGCATACATTGCGGACCCATATTAACTACATCCCGCAGGAACCATACATCTTTTCAGCGACCATTGAAGAAAATTTAAGATTAGGTAATCGCAGCGGTATTACTGAGAAAGATATTGCGAAGGCTTGCCAATTGGCGTTAATTGATACGGATATTAATAAAATGGCCATGCAATACCAAACTAAGCTAGATGAGAATGGTAATACACTATCAGGTGGTCAGCGACAACGATTAACGATTGCGAGAGCGTTATTATCACCCGCTCAAGTCTTGATATTTGATGAGTCGACGAGTGGACTGGATGCAATTACTGAAAAACAATTAATTGATAATTTAGTGGCAATGACTGACAAGACGATTATTTTTATTGCCCACCGGTTGTCGATTGCAAAGCGGACGAATCATATCATCGTTCTGCATGATGGTCGGGTCGCTGAAGAGGGGACCCATGCGGCATTGTTGAATGAACATGGTTACTATTACGACTTGATCAATAGCTGAGGGGGGAACTGAATAATGAGAAAAGACCTGCTCGAAAGTGGCGAGTTTTACGGGATTCGGTTTCAAAATTTTTCAACATTACTAATTATTCCAGTGACGCTATTGTTAATTGGTACGATTCTGTTTTCACTCGTAGCGAAGCGCGAGATTGTTATTAATGGTACCGGAACTGTTCAACCGACCGGAACGGTTCCGGTGATTCAAGCGACTGTCAATAGTGCCATCAAAAAGAATTATTTAGTTGAAGGTGCGCGAGTGAAGAAGGGTCAAAAGCTATTAGTTTATACTAACGTTTTTAATCGCAATAAATTACGCGAAGATAATGTCAGCAAACGGCAATTGCAACGCCAAGTAACAGCCTTGGATCATTTTAAAGATGGCATCAATACTGACAGTGATGTTTTTCCAACGACCGATGAATTTGGGTACCGAGAACTATTGCAAAGTTATTTAAAACAGCGTCAAATCTATTTAACAGAGAATCAAATGTTGGCAGCGAAATCGAGCGCTGCTAGTACTAAGAAAGCCACGCTAACGAAGACCGCGCAACAAGTGGTATCAAATACTAAGACCAATCTGGATGCTTATCAAGCCTTATACAATGCGGTGGCTAATGGTAGCAAGTATGCCAATAGTGCCAAGTATGGGTCTGTTTTTAATGAGTATGTCGCTAAGTCAAAGGAGGCCAACAACGCAAACGATAAAAAAGAAGTTAAATCTGCAACGTTAGCAGACATTCAACAGCAGATAGATACGCTTCAGGATTCGTTGTCCTCAGCTAAAGTGCAGTTAGAAGAATTACAAGACTTTGATGATACGAAGTACAGTGTTGAGACTAACAATACCAAATTAGCCATGTTAAAGAACGATCAGTTAAGCGAAGTCGCTGAGAAACGAATGAAAGCCGAGCAAGATTTACGGACCGTGAAAGCAGATATTGATAGCTTAACGACACAATCAAAATCTTACACGATCAAGGCAACCAAAGCCGGCGTCCTACACGTTGCAGACAATTACCGTGGTGCAAAGTACGTTAGTTCAGGAGCTGAAATCGCTAAAATTTTACCGATAATCAAGCAACAACGGCGAGTGAACGTTAAGCTATATATTTCGACGGCAGATATTTCTTCCGTTAAAGTCAAACAAGCCATTAGATTCAAAGTCACGCGGAACGTACCGAAGCCAATTATTTTGGACGGTGTGGTCACAAAGATTGGGGTCTCACCAGTCGAGGAGAGTAAAGCGACTTTTTATGAAGTGACAGCGGCCGTTCCGATTACAGCCGATCAGGCACAGTTACTACGCTACGGGATGATTGGGCAAACGGCGATTATTACGGGCAAGGTGACTTGGTTT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55 | Tupanvirus(22.22%) | tRNA,protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1126926 : 1195669
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP023771|1126926:1195669|DBSCAN-SWA GTCAATGCAGTAACATGATGGTAATTGCTAGGCTATTGATCACAAAGTGGAGCGCAATGGCCGCGCGAATTTTACGGGTCAGCCGATAAACAATAGCTAGCACGAGTCCCATGGTGACGTATATGAGGAAGCTCGGTAAGGTTGAACTACTATGGAGACTACCGAAAACAATCCCGCTGAGCCCGACCTTGAGCCATTCTTGTTGAAAGAAAAGGTTAGTCAGAACGCCACGAAAAACTAACTCTTCAACAATTGGAGTCAAAAAAACGGCGCTCAACGCCATAAGCCAAAGCGACAGAGGACTGCCGGCCATTAAATTTTTAATGGCGGCGTTATTTTGTGTTTGATTCTGGTGATACAGAAGCTGGTTTATAAATTGAAAGCCGCCCTCAAAAATTAAGATGGTGAGATAGGCCATTCCAATAATTTGCCAGTCATGGTGTTGTAAGTTTTCTGATTGATAGTTGCCGGTATAGTGCCGCATTAGGGCGGTTGCCGCCAGTGCTAGGATCACAAAAATTAACAGATAGACACCTGCCAGGGTGATCTGCCAGGCTGTGAGCTGATGCTGGCGATATAATTGGTTAATTAATTTAAGTAACATTGGTGGGATCACGACCCCAACAATTAGGCCAGCAGTGAGCAACACGCGTCCGAGCCACCCCAAGCCGCGGTCAATAATTTCCATCGGACTTCACCTCCCATGGTTGATTTTACCGCAGTGTTCAGGTTTCGACACGGATTTGCAAATCTGAGAAAGGCATCGATGCCAGGCACAAGCGGATGATATTAATCTGGTTGAATGCTAAAAATATAATAATTGTAGAAATAATGGTTGATGCTCTATAAAAATAAAGAATAAAAAAGCATAATTCGGACAAATCTTCACATTTTCTTCACAATTATGTAATAGTATATACTTGTACCTAATAGTTATACACTTGTTCATTTTACTCCCCCAAAGTGGATGGACGAGCAAGTACAATCCCCCATATTGTACTTAAACCTAACTCTTTGGCCCTACTGCTACTAAGCGGTAGAGTCATTTTTTTGTTGCACGTCCCCAAAGTCACCGAATACAGTACCTGCAAAAAATCGTCCCTTAATACATACTTAAATTATTTTTAGCGGTCTAAACTATCAAATTCAACTGGGTTTTATCATTTGATTTATTTTTTGCGGAATTAATGTGGCTGCAAACACCCATAATTATTTGATTGGTGCTAGCTAACGATTGTTCATATTAGCCTTGAACGGGCTAGTCTCAAAACAAAGTGACGCTAGTGTCAAAAATCAATTGGTTTAATCGCAACAAAAAAGGCCGAGGTTAGAAAAACCTCGACCTAGTTAAGCAGTCAGTTAGAATGCTTCACCAGAATAGTCGACCTTTTTAGGATCGGCATTTTTGATGTGTTCGGAAGCAAAGTTAACCGTTTCGCGAATCTGGTTATAGGTTGCTTCATCTAAACCAAGTAAATCCATGCAAGAATTAACGTGGGCAAAAATCTCTGGTTTAGCATCGATGGCTTTTTGCGACAACGAGATGTTGACTTGGCGTTCATCGTCCGTATCGCGCTTGCGTTCGACCCAGCCTTGGGTTTGCATCCGTTTCAATAACGGGGTCAGAGTCCCGCTATCAAGGTTAACGTGTGAACCAAGTTCCCGGACCGTCATCGGACTCTTTTCCCAGAGTGCCAATAAAGTGATGTACTGCGGATAAGTCAGCTTGAAAGGTGCTAAAGCTTCGGAATAAAAATGATTATATCGTTTGCTGGCGGTGTAGAGCGCAAAACAGAGCTGTTCGTCGAGCAAAATGTTTTTTGTTGGGGTTGCCATCAAACCGCCTCCTTTACTATCTATTTTAGTACATTGTACGCAATTAATTCGCCAAATGCAATTAATATTGCGCAAATACATTGTTTTCGAACGATTTATTTATAAAAGCGGGTTAATTAATTGACCTGTTGGCGTTGTTGGGACTTAATGCATGTCAGGAATAACTGGGCCATGGCCTGCTGATTGATGGCAAGTTGATGGTTGTCCGTGAACGCATAAAGTGGAACTTGTGCTGGCAATGTTTTGGCCGCGTGATCACCAACTGGAATCAGGCAGGCGATTTTTGTTTTGTCATGTACAAATTCATGAGCGTCACGTGGGGCGGCCTTAATCGTCAGTGATGCCAATACGTGATAACCGGTCGGCATCATGTGTTGTGCATGTTTGACATGCACCCCGTGTAGTCGGGAACGTAACTGGAACCCAGACGTGGTGGTCAACTGTAACGCTTGCTTTAATTCCAATAAATAAGTTTGTTGATTATCAATATTTTTCAACCGGATCTTGAAGTGTCCGAATGGAATGGCGCGATCCTGATGTTGGACGGCTAAGGCGTGTTGTTCGACCCGCATTTTATCCTTAACGGGCTCAAAGGTATATTGTTGTAAAAGTTGTGTTGCTGTTTTCAAACTATCACTCCCTACGATTAATTTAGTCCTTTAAAAACTTGTGGTCAAATAATTGGTTACGTTTGCGAGTGACGTCGTTTTCAAGTAAAATTAAAGTGATAGGGGGTTGGAAAAATGTTTATGACAACTGGTGATTTACAGCGCTCCCATATGATTAAGGGCGTCGTCTCCGTCACAAAACACCTGATGTTTGAATCTGATGGTGTTGATCAGTTTGAACGGTTTGACGATTTAATCGAGCAAGTCAAGCCACTACTGCTACAAAAGGCAGAGGATCAAGGTGGCGACGGGTTAATTTATGTGAACTTCAATACTGAAGTCGCTCAGATGAGTGTTGCACCACGGTTTTTGATCGTAACCGGCTATGGGACGGTCGTCAAGCTCGTTGATGAATCAGTCTGATACTTAGGATCTGAATTTTCAGGTCCTTTTTTGATAGCAAACAAGTGATAGAAAGGAAGGTTTGATGACCAGTTATTCATTTCCACATGGCGCCATTGACGTATACGACGCTACCCAAAACAATTTAAAGCACGTTAGTCTTCGCGTTCCTAAATATGCAACCACGGTGTTCGTGGGCTTGTCAGGTTCCGGTAAGTCGTCACTCGTTTTTGATACGATTGCAGCGGCGTCACGGCGCGAACTGAATGAAACGTTTCCCAGTTTTACGCAACAATATTTACCGAAGTATGGTCAACCACACGTCGGGCATATCGAGCACTTGCCCGTTGCGATTGTGATTGCTCAACAACGCCTCGGCAAGAATGCGCGTTCAACCTTGGCAACCTATACTGGGATTTATTCGTTACTGCGGCTCTTGTTTTCACGGGTTGGGGAACCGTTTATCGGGTATTCGGACAGTTTTTCGTTTAACTTACCCCAAGGCATGTGCCCAACCTGCCAAGGTTTAGGTTATGTTGACGATATTGATGAGCAGCAATTGATTGATCCTGAGAAATCATTAAATGAGGGGGCCATCACGTTTGTGAGTTTTGCACCGGATACGTGGCGTTGGCGCCGTTATGCGACGAGTGGTTTGTTTGACAATGATAAACCCATCAAGGATTATAGTGCTGCGGAATACGATTTACTGATGCACGCACCGCAACAGAAATTAGCCCATCCTGGAGAAGGTTTTCCTAGAACGGCCCTGTATGAAGGTGTTGTTCCGCGGATCAAGCGCTCGATTATTGGTAAGAAGGAAGCCGAACACCATCGCGATGCGATTGCGGCGATCGTCACGCGCAAACCGTGCCCAACGTGTGATGGCACACGACTCAAACCGGTCGTGTTGACCAATCATATTAACGGGGTCAACATTGCTCAGGTGACGGCTATGGATTTAAAGCATGTTCTGGCATTTTTACAAGCGATTGATGCGCCGTTAGCCCAAGATATTGTGCGGGAGCTGACGACCAAGATCCAATCGTTGGTCGATATTGGCCTGGGCTATCTGACATTGGATCGTGGGACCAGTTCTTTATCTGGTGGTGAAGCGCAACGGATTAAGATTGCCAAATACTTGACCAGCGCCTTAGTAGATATGGTCTACATTTTGGACGAGCCAAGCGTTGGGCTGCACCCACATGATATTCAGTTAATCAAGCAAGCGTTAACGAAGCTGAAGGATAAGGGTAACACAATTCTGATTGTTGAACACAATCCAGCCATGTTTACGTTAGCCGACTATGTTGTCGAGATGGGGCCTGCAGCTGGTCGCACTGGTGGAAACGTGACCTTTACCGGGACTTATGACGAGTTACTGGCTTCTGATACGTTGACGGGCCGGTGGTTGCGACAATCGCATAAATGGGGTCAAGAACGACCAGTCCAGGCCCACTTGGCATTACACCATATTAATGAAAATAACCTGCACGATGTCAGTGTCGACATGCCCCTCGGTGTGATGACGGTCGTCTCGGGGGTGGCCGGTTCAGGGAAGAGTTCGCTGGTTACCGCGCTAAAACGGCAATTAAAGACGGCTTATATTGATTTAGCCCAGACACCAGTGGGCCTGAATATTCGCTCAACACCGGCGACTTACTTAGGAGTGCTCGACCAAATCCGACAACTATTCGCGAAAGCCAATGGCGTGGCAACTAGTTGGTTCAGCTATAATGGTAAGGGTGCTTGTCCGCGGTGTAAGGGTAAAGGCGTGACCATCACGAATATGGCCTTTATGGATCCCGTTGTGCAGACATGTGAATTGTGTCATGGGCTGCGGTATAATGAAACGGCGCTCAGCTATGCTTACCAGGGTAAGACGATTGCCGACGTGCTCCATATGTCAGTCACAGCGGCGTTAGCTTTTTTTGCCACGATGGACAAAGTGGCTCAGCCATTGAAAAATTTAGACCGGGTCGGTTTGGGTTACCTAACATTGGCGCAACCGCTCACCACTTTGTCGGGTGGTGAACTGCAACGGTTGAAGCTGGCGGTTGAGCTAGGCAAGCAGGGAACGGTGTACTTGTTAGATGAACCGACTGCCGGTCTGCATTTGCAAGACACACAACGCTTATTAAAATTATTCGATGC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70 | Lactobacillus_phage(82.61%) | holin,capsid,portal,head,integrase,tail,protease,terminase,transposase,tRNA | attL 1132636:1132652|attR 1174066:1174082 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1221757 : 1232397
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP023771|1221757:1232397|DBSCAN-SWA TGTGGCACGTGACGGGACCGTCACAGAGACAAATGATTTAAAATTGCACGCATTAGGGGAGATTATCGGGATGAACGAACAAGAAGCATATGTAACGACATTTTATTGGCTCGCGGATTGTTGGTTGGAAACTAGCTATCTGGGACTTGAGGATGAATTTGACGACGATGAAATCGATGACGCCGTCAAGTCACTACTAAATCGGATGCAAGCCGGGGCAATTTATGAGGTAACGGCGGATGATCCAATGTGGCAAGCATGGAAGCGGGCAGTTAGGGCCGTGCTTACGCCCAATGATCATGCTGAACATGAAGTTGATGAGACCGACGGAGAGGATGAATTAGTGCTGCCAGCTGGGGTACGACCAGAACGTCAATTAGAAGAAGTTCAAGCCTATGCAGCGATGAACGCGTTTTTGCAGGCACAAGATCAGGAATATCTGCAAGAAATTGGTAAACGGGCGGCCACTCAGGTCAGTGGTGCCGGGTGGCAAGTGTGGCGTGCACATCGCCAGAGCATGCATCCGGAGTCTGCCGCCCCGCTGACGTTGACTGCTGAGCAATTACCAGCCGTGATGTGGGCCTTTTTCGATAAGTACCAGGATACTGAGGACTCTTTTGAGATTTTTGAATTGGTTAGCCAACTTGAACAATGGCAAAAAAGTGCTGATCGAGATTTGGACGCGCAATGGTCACAGCTTGTGGCGAAAAGTCAGATTGATCCGGCCGCAATTACGCTCATGCAGGGCTTGTCGTTAGCTATTGAGTTCTTTGATCAGCTTGAGTGGGACGGTGATTTGACTGCCAAGGCAACTTTGCAGAATAAATTGATGCAACGCACGCTCGATGACACGCTCAATGATGAGACGACAGCCAACTGGGCGGATGCCTGGCAACACTGGGATTTAGCAGATCCGTTGACAACTGAACAGTGGGCCCGACGGTTTGATCCGGCGGACGACTATGAAGAAGATGAAGACGAGAGTAAAGAAGATGGCTCGGCTCGGCCAGCTTGGCAACTTGGTGCGAGTTATAGTACCGTTTTGATTGCAATGCGCTTAGTCGCTTACGGTGTACTGCGGCCTGAGAGTGTGCCTGGTATGGCAACTGTGAAGATGGCGAACCGTGCACTGGCAGCTACCGTCAGTATTGGTATCGTGTTAGTTGCTTGGCTGGTCACAGCTATTCTGATTACAATTGTAATTTGGGGATGGCGGTGGCTGCGTAAGCTGATTTTTTAGTGCAGCTGAACGGCCAACTGAATCACAATAGTGCCGATTGACTAGGCTGAAGTTTGTGAATCCAGTAGTTGAAGCTGAAAGGACGGGGCGTCAGTGGTAGTGCTTCATGATGGTTTGTAACTCGGACAGAAAGTCGGCATCTAAATGGGGCGATTGTCCTAATTGTAATGGTGCCAATGGCTGATATAACGTTGGTATGTCTGGCTTTAACGGCTGGTTATTGAAGTATTGCTGACCATGGATTTTGACGGTCGCTTTGAGCGTTCCAATCGTCATGACGGCCACGGCGGTATTTAAAAAGACGCCACCATTGAGACTAGTATATCCAGCGGAAGAACGCCCAACTAAAGTAACGTGCGGGTTACGTTTTAGCGCCATGATGGTCACCTCCGCGGCACTCGCTGTCTGGTTACCAATAATGGCATAAATATGACGAAAGTGGGCCGCTGTTGGTTGCGAAAAGTTAAAGTCATCTTGACCGAGTCCACCAGTGATTCGGCCATGGTACATCATACGTGGCCGGTTGCGATGATGGTTCGTGATGCCGGTGTAGAGGGTGCCGTCTGGAATGATGGCGGCCAGGCCAGCAATCATCGGTGCCGAACTACCACCAGTATTTGCTGCGAAGTTTAAGATTAAATCGGTTGTCGGCTTAGTTTGTTTAATCAGGTGCTGGAGTTGTGTCCAATACTGTTTTTGTAATTGGTGCTGACTGCTGTAAAATGCTGGCACATTGATGATGGTGAGGCCGGCACTCATTGTCTTGGTCGGACGGGTGGCATGTTCGACTTGGCGGAGATTGGCGACGGCGAATGAATGTAAATTTGCAGCGCGCAGAATTTGATTGGGTTGGGTCAGTGACGTGATTTTGCGACCATGATCAGTCGCATGTAGCATGGCTTGCCATTGCGTGCGATGGTTGATAATGCCATATTTTGACATGTAGGTGATAGCCGGCATAGCGTTGAAGGACGCACGGAGCCGATTAGAAGCGGAAAGACCAAACGTTAGGACTATCGAAATTAGACCTACCAGTCCGTAACGGCATTTATTCGTTATCATGATAAGCCATCCTTACTTTTCGTGACTAGATTAGCATGTATTGGTTAGCTAAAGTGTAGGCGTGGCGTCAAAATTTCGCAACGAAAAGCATATCTTAACTGGTGCGTCTTTGAAATAATGGTTACTGTTAAAATACCCATCTACATTGGCCGTCTTAACGGCTAAGCAGATGGGTATTTGTTGTATCATGAAATTGTTGACGATTGTGCCAGATCGGCTTCTAACTGGGTTAAGAAGATCGTCACCAAGTCTTTTTCCACCTGGTTCAGTGAATGCTCGGCTGGAAAGGCAATGAAATAATTCAGGGACATTAACGCTTGGGGCAAAGGTAAGATGTTATAGCGTTCTGGATCAGGTTGGGTATGCACACTGTCTGGTAAAAAGGTAATACCCAGTCCAGCAGTGGCTAGTTTGGTGATGGTGGCGGTATTCGTGCTCTCAATTACGATATTCGGTGTCACGTTGTGCTTTTGTAATAAGTAGTCAACTTGGCGTCGAATCGATGACCCGTGGGGAGACAAGACTAGAGGCGCTTGTAGCAGGTCGTTAAGGGGGAGCGCTCCCGGATTAATGAAGGCCTGATGTGGTTGGTACCAGTTGACGGTGTTCGGGATAATCGCGTAATACCCGTCCCGACCGCGGTCATAACTTTCAAGCCCCGGCGCGATGGTTTCCGGATTTTGACCAATTAAGAAGTCCAGTTCACCGTGGAGCACGCGCTGTTCGTTGCGACTAGCGATATCTTCGGTTAATTCGATCTTAGTGGCCGGGTGGGCTTTCAAAAAAGCAGGTAAAAATAGGGGCAATAAGTAATAGCCGAGGCTAGATAAGACGCCCAGCCGAATTACTTGCTGGTTGGCATGTGTGTATTGCCTAATTTGCTTATTAAAGTAATCCTTCTCGTTTTCGAGCGCCGTCAAATATTGATAATAAGTCCGCCCAGCCGTGGTCAGTCGCAGTGGCGTGACTTCACGATTGATGATGGTGACGCCCAATTCTTTTTCAACATTGCGGATGCTTTGGGTGAGGTAAGGTTGTGAAATGTAGAGATCTTTAGCCGCCCGGGTAAAATTGCCGTGCTTGAGCAACACATCTAAAAACCGTCGCATTTCGCTAGAATCTGATTTTGGCATAAAGCGCCTTCCTCTCGCATTGTGATTAGGTGAGTATTCGTTTGATTGCTGATTTGGTCATGTTGAGTTAGTTGCATCGCCATAAGGACGTTCAAAACATGTTCAATAAGTTCTGTCAACATCCTGGCGATAGTGGCTAAATAGCATTATGACCAACCATTTTAACATGATTAATTTTAACGCGAATCGTCGACATAGTAAATTTGTTATCGGGGTATAGATAAATAAATATTTCACAAGCAGAGCGCTTTCACGTACACTAATCAGTATTAAGAGTGGCCAATCATTCAATAGCTACTCGTCGAAAACGACTGTTTAAATCATCCTGAAAGGATCTGAAATTATGAAATTTGTTGGGATTGTTGGGACGAATGCAACCAAATCGACCAACCGGCAGTTACTGCAATATATGCAACGGCATTTTCAGCAACAAGCCACGATTGAAATTTGTGAAATAAAAGATTTACCGGCTTTTAATGAACCGGAAGACCGAACAGCACCAGTAGCAATTCAACAGCTCAGTGATAAGATCACCGCAGCAGATGGCGTGATCTTTGCCACGCCGGAGTATGATCATTCAATTCCGGCCGTACTAAAAAGTGCAATCGAATGGCTGTCATATACCACGCGGCCGTTAATTAATAAACCAGTTATGATTGTTGGGGCCTCGAACGGCTCACTGGGAACCTCACGCGCTCAAGCGCACTTACGCCAGATTTTAGAGGCGCCGGAATTAAAAGCACTGGTGATGCCAAATATTGAATACTTACTAGGCCGTTCACTACAAGCTTTTGATGATCAGGGCGACCTGACTTATCCGGATAAAGTTCAGGAATTAGACAATGCGTTTGGCGAATTCATTGATTTTGTAGATTTAACGAATAAAATCATGCCGTCGAGTCAGTTTTTCGAAAAGAGTAAGCAGTTCTCGTGGCGGCAAGTGACTGGGGAGGAATAAACATGAAATTTGTTGGAATTGTTGGAACGAATGCTCAGCATTCGTACAATCGGATGTTGCTGGAATTTATGCAACGACATTTTGCGACACAAGCCGAAATCGAAATTTTAGAATTGACTGATGTCCCGATGTTTGATGAATCGAATGATCAAACTGACAGTACCATCATTCAAAACTTTGCCACTAAAATTGCGACGGCTGACGGGGTTATCATTGCCTCACCGGAACACAATCATTCCGTGCCTTCCGCGTTGAAAAGCATTATTGAATGGTTATCATTCAAAATTCACCCATTAGATGGTCAAGCAGTAATGATTGTTGGGGCTTCATACAGCGTCCAAGGATCGTCACGCGCGCAACTACACTTGCGCCAGATTTTAGACGCTCCCGGTGTTAACGCCAGTGTCATGCCCGGTTCAGAATTCTTATTAGGTCGTGCCCAAACGGCTTTTGACGATCAAGGTAATTTAAAGGTGCAAGGGACGGTTGATTTTCTGGACAGTTGTTTTGCAAAGTTTCAGAAGTTTGCGACCATCGTCGCCGAGATGCGGGCACCAGAAGCGCTTAGCTTTGCCCCGGGTACTTATCAGGTGACGGCCACTGGACA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP023771|1221757:1232397|1223086_1224058_-|AYF24061.1|DBSCAN-SWA MITNKCRYGLVGLISIVLTFGLSASNRLRASFNAMPAITYMSKYGIINHRTQWQAMLHATDHGRKITSLTQPNQILRAANLHSFAVANLRQVEHATRPTKTMSAGLTIINVPAFYSSQHQLQKQYWTQLQHLIKQTKPTTDLILNFAANTGGSSAPMIAGLAAIIPDGTLYTGITNHHRNRPRMMYHGRITGGLGQDDFNFSQPTAAHFRHIYAIIGNQTASAAEVTIMALKRNPHVTLVGRSSAGYTSLNGGVFLNTAVAVMTIGTLKATVKIHGQQYFNNQPLKPDIPTLYQPLAPLQLGQSPHLDADFLSELQTIMKHYH >CP023771|1221757:1232397|1230702_1232397_-|AYF24069.1|transposase|DBSCAN-SWA MQDYYNMNQTTLSIALDYQPEDHHSARYINQLVESLKLKYDYQFGRPREYNLGAMLKLVLLAYSYGIFSSRKIERFARENKPAGWLIADQIPSYRTICRFRISDELATLTTDSLSQLTQYLRQNGMIDDVSFIDGTKILADANKYSFVWKKNTIRFDKMNREKLVDLLGELHEAKIVGEIPAGSELTPELLDIMISKVEDHLVVLNETVEATKQVSPNPAKQQRRTVKSQKRKLDKRRDKMREHQAQQAIYGQRNSYSKTDHDATFMRVKEDPMQNGQLKPAYNVQIATSNQFITGYRLFQNPTDTRTLQPFIEHLKANNVLGHTIVTDAGYGSESNYRYLEDEFGQHTVLIPYGTMLKENSRKWQSDDRKVMNWDYHEKDDYFINPQNVRFNFNAYRRRTDKYGFTRDFKEYIAEKYDENHQLIAAALTPKGYLKRISVNENWEYFKSKQRELLSAPETGQIYAQRKIDVEPVFGKMKASLHFNRFSVRGFDKVTKEAGIVILALNIMKLVTVGTNFKNQRRKQMGRETKIRFLVPFAYTEASYVTASLWHNRPDCTKLPASL >CP023771|1221757:1232397|1230093_1230561_+|AYF24067.1|DBSCAN-SWA MRNKLFSVLLGLLTVLVTVIVLGRIGQADDVSTAGLTGNEARVTDRYGNVITDTSQLSKWEDFTVEYDWAIRNGQPIAAGDTELPNGTVAPVDLGFPLKDDNGRVAGHFKIKAGETAGLITFNDALSQMGTNRASTLQFYVKGTADSDVYFDWKL >CP023771|1221757:1232397|1221757_1222996_+|AYF24060.1|DBSCAN-SWA MARDGTVTETNDLKLHALGEIIGMNEQEAYVTTFYWLADCWLETSYLGLEDEFDDDEIDDAVKSLLNRMQAGAIYEVTADDPMWQAWKRAVRAVLTPNDHAEHEVDETDGEDELVLPAGVRPERQLEEVQAYAAMNAFLQAQDQEYLQEIGKRAATQVSGAGWQVWRAHRQSMHPESAAPLTLTAEQLPAVMWAFFDKYQDTEDSFEIFELVSQLEQWQKSADRDLDAQWSQLVAKSQIDPAAITLMQGLSLAIEFFDQLEWDGDLTAKATLQNKLMQRTLDDTLNDETTANWADAWQHWDLADPLTTEQWARRFDPADDYEEDEDESKEDGSARPAWQLGASYSTVLIAMRLVAYGVLRPESVPGMATVKMANRALAATVSIGIVLVAWLVTAILITIVIWGWRWLRKLIF >CP023771|1221757:1232397|1224243_1225191_-|AYF24062.1|DBSCAN-SWA MPKSDSSEMRRFLDVLLKHGNFTRAAKDLYISQPYLTQSIRNVEKELGVTIINREVTPLRLTTAGRTYYQYLTALENEKDYFNKQIRQYTHANQQVIRLGVLSSLGYYLLPLFLPAFLKAHPATKIELTEDIASRNEQRVLHGELDFLIGQNPETIAPGLESYDRGRDGYYAIIPNTVNWYQPHQAFINPGALPLNDLLQAPLVLSPHGSSIRRQVDYLLQKHNVTPNIVIESTNTATITKLATAGLGITFLPDSVHTQPDPERYNILPLPQALMSLNYFIAFPAEHSLNQVEKDLVTIFLTQLEADLAQSSTIS >CP023771|1221757:1232397|1225534_1226149_+|AYF24063.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNATKSTNRQLLQYMQRHFQQQATIEICEIKDLPAFNEPEDRTAPVAIQQLSDKITAADGVIFATPEYDHSIPAVLKSAIEWLSYTTRPLINKPVMIVGASNGSLGTSRAQAHLRQILEAPELKALVMPNIEYLLGRSLQAFDDQGDLTYPDKVQELDNAFGEFIDFVDLTNKIMPSSQFFEKSKQFSWRQVTGEE >CP023771|1221757:1232397|1229308_1229749_-|AYF24066.1|DBSCAN-SWA MAQIYIASPFFSPEQVTRVTQLEEALAKNPTVTDFYSPRLHQDAQAEQFTKTWATEIFHRDMAQIAAAQVIVTVLDFEAKNLDSGTAYELGVATMRDLPIIALQEKDEAVNLMITESLHWYTKQVSDFETYDFQQLPKGDFIGEIL >CP023771|1221757:1232397|1226151_1228590_+|AYF24064.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNAQHSYNRMLLEFMQRHFATQAEIEILELTDVPMFDESNDQTDSTIIQNFATKIATADGVIIASPEHNHSVPSALKSIIEWLSFKIHPLDGQAVMIVGASYSVQGSSRAQLHLRQILDAPGVNASVMPGSEFLLGRAQTAFDDQGNLKVQGTVDFLDSCFAKFQKFATIVAEMRAPEALSFAPGTYQVTATGHNGELPMRVTLSADRIENIEIDTSSETQGIADVAFERIPKEIIAGQTLAVDAISGASITSHGVIDGVARAVKEAGANPDDLKKRRATKQVAQPAVKEVTTDVVVVGAGGAGMTAAAKVLQAGHQAVVLEKFPAVGGNTVRAGGPMNAADPDWQRQFAALPGEKQTLKDLSERDESTIAPEYRADFRKLKQQIDAYLTANTNQKGTLFDSTLLHRIQTYLGGQRTDLNGQEIHGQYDLVKELTDNALDSVKWLQSIGVKFDESQVTMPVGAIWRRGHKPMGDLGFAYIKTLRAFVEQQGGTIMTETPVKELLVTDGQVRGVIATNAAHEKVIVHADAVILASGGFAANTKMLQKYNTYWTAIDDDVKTTNSPAMTGDGIRLGTSVGAALVGMGFSQMMPVSDPETGELFSGLQVPPANFVMVNQQGKRFVNEYGSRDELTQAAIDNGSLFYLIADDEIKKTAYNTTQAKIDQQVANGTLFRADTLTDLAHQIGMDPAALTKTIADYNRYVDAGEDPEFHKTAFDLKVAVAPFYATPRKPATHHTMGGLKIDPDAHVLNTDGQIIDGLYAAGEVAGGIHAGNRLGGNSLSDIFTFGRIAAAHAVAEHVDPVTA >CP023771|1221757:1232397|1230535_1230766_+|AYF24068.1|DBSCAN-SWA MYILIGSYDEHGLPATLTWNIAFNPSGKKLGTVVVNDTLGSNQSYLSDSVIAQTGAYNDAGNFVQSGRLCHKEAVT >CP023771|1221757:1232397|1228677_1229238_+|AYF24065.1|DBSCAN-SWA MQKPMPVAVTNIADNITHQPAYMTIVLNDHKYSTARKKTPFILKALNEGAAAHGRLTITPSRLSLADERGTVFQTLAPIPTVITDVELGLYRSIVRQLGNGVRMKARYTLAVTLTSDTATYQMLNTDLSVLKPLLAWITDFHLHLTDSLQLATSDIDWPNLTADQFEALTKGTPYFAWQQTIGAHW |
10 | Lactobacillus_phage(90.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2077242 : 2113474
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP023771|2077242:2113474|DBSCAN-SWA ACTACTTTTCGCCTGCTTGTGAGGCGGATTCTGACGCCATTTCAGCGTCATATGATGCAGAACTATTCACTACAGCAACTGTGGACGTTGGTGTTTGCGCTTCGTCAGCAACTTTATTAGCTGCTGCTTCGACTTGACTTTCCTCTTTACTATCAACTGTTGGTGCCGACACTGTTTGAACGTCAGTAATAACGCCCAGCATACCAAGGATCGTTAGTACAGTGTTAATAACGGCAACAATGGCTGACCAGTCACCAGTAAACTTAATGCCAAACATGGCAAAGACTTGTTGAACCAAAACGATCAGTAAGGAAATAATTCCAGCGATCAATTTACCATTCAAGCTTCCATCAGCATTCTTAAAACTAATTTTTCTCATTTCTTTTGGCTTCCTTTTCATATAGATGTTTAAATTCCATGTCATGACCATCTAGCCGGCCTTCTACCTTAATGACCCGATTTTCAATCGCATTCATTGCTTCAGCATTTTGCTGCCTCACTTTTAAACTTTCATCGGTAAAATGGCTCAGCCGCTTGCCTAAATCGTTAAGCGGGATACGGACCGTCTTATTTAGAATCCAATTAGCTAGTACACAAATACTAGCGACAATGGCAACAATTGATCCCCATTCATCCCAGCCTAACCCTAATAGTGTATGCAATTATCGCACCACCAATCGCTGGCCAGGATAGATAGTGGTGTAAATCGTCTTGCCGTTCTGACTAGCTAATGTAGTCATACTTAGGCCGTTGCGCTGAGCGATTGACCACCAGCTGTCGCCAGACTTGACTGTGTAATACGTATGAGTTGCACCACTCTTTACGTATTCCAGCGTATTGCTTGCCGGGCCGGTTGCTAGATAACCATAACCATTAAATCGTGGCTGACGTACCCAGCGATAACCATTCTGAATGATAGCTTGGTCAGTTTTGACCGTAGTCCCAGCTGGCAAGATAGCAATCACACTTGATGCCGTTGACGTGCCAGTGCGCAGCTTAACCGCCGTCTTGAGCGTATAGTTTTTTGACTCCTTGACCCACTTGACCGAATTAGATGGCTTGGAAGTGTTTTTGTTGGCCTCCTGGTTGTTATCATTAACGGCATTTGGATCGGTTGGCTTGACCGTTGATTTCTGACCAGCTGTGTAGTAATCAGTATAAAGTTGACTGACGTCAAAGCCACCGTAGCTAATCCGGAAACGAGCTGCCCCGGACCATTGCCAGGCATTGTTATTCGTATACCACTTCTGACCAGACATGACATAGGGGTAACCAGCAACCCAACCTGTTTTGCCCTTGATGGTCATCTTGTTGTTAGCCCATGATCCAGACGTATAAATGTCGGCCCGATAACCAAACTTCTGAATCTCTTTCATGAAGGCAGCATTGTTGCGGTCGTTGGCCGCTTGTGACAAGATTCCTTGTTCCTCAGCCGATTCTACGTCCGTTGCCAATACTGCGCCCACTGGTAGTCTGGCCGCTTTGGCTGCCTGACCAGCAAAGTCAGCTTCGGCAATTGCTTGAGCCTTAGTTTTATAATGGGCAAAGTGATAGCCGTTGACGTATAAGCCAGCTGCTTGACCATTAGCGATATTGCTAGCAGCATAGCCATCTTTGAAGGTTGTACCTTCACTAATCTTTACGGTAAGGGCCTTAACACCAAATTCATTACGCATCGAAACATACTCTGTCGTTGACATGTAGCCGTTGTTATTAGACACATCGACCATATCCATACGAGCAGCCTGACTGGTAACGTTGATCATTAAAAAGGCCATAAAAATGGCGCCCATCATTAAGATGAGTGCCTTTAATTTACGTTTATTCAATTGTCTACCTCCTATTTGTCATTCCTGATTGAACGGTCAAAAGCATCCTAAAATACACTGGCCTAGTCGTTTTAACTTATTAATTTTCAATTCACCATCTCTTCAAAGTTCATCTTTCACTTAATACTTATGATGTTGGCAATTCATTCTTAAGAATGGATTGCAGCACACTCTGCGCCTCCGACATCGTAACATCGTCTAACTTCTTATCTGAAAAATCTGATTCAGTGGCAGTAACATTCGCATTCACATATGTGCCAGTTTCAGACTGATTAAATTGAGTGGATACCGATGAAATCTTGCCAGCAGTAAAACTCCACCCACCATTAACTGCAATTAGAGAGTCAATTACTGATGGAATCTTATCCACCGCACGTTTGGATAATTCTTTTTTGGTTAGATCATCGAAAGTTTCATCTTTAGCTAAGTCAGTCGGATAAATAGTGACATTTGCTGTAATAGTTACTCGACCTTCTACTTCACCACGAAGGCCTGCAATTACAGAGCTCGTATTACCAGTTCCATCTATATTATAAGAGATGCTAGTGTTTAATAATTCCATCATTATTCCCCTTTTCCATATGCTTTATCGAACTGATCAAATACTAATGCGTATACTTGAGCTACTTGCCCTTCCATCTCATATGGATAGCCCTCAAGTGCATGAAATAAAGCTTTCATTCGTGCAGAATATGAGCTGATTTCAATGCTTACAGGTTCGTTAACTAATTGATCAAACTCTTTTTGAGCTTCGTCCATGGTGTAGTCATCTTTCAGAATTAGAGTCTTTTTGTCTTTCTGATAAATAAAATCTCCGGCTTCATCTGTTTTAAAAAAGTTCTTTTGTGTTGCTAATTGGTCAGCGTTAAATTGCTTGTTTAGGTCTTCAAGATGATTGATCAACCAGGTGCGCCCAAGAGAAGCTCGACCTTTAAGCTTGAACGCTGCTAAAGTGTTTCCAATGGTCACCAGTTGCCCATTTGTGAATGTTACTTCTTCTTTTCTTGCTGTCATAATTAACTATGCCTCTTTCATTTATTTGACTTTAGTTTCTAATTCAGTTATACGATCCCGATAATTACGAATCAACGGGATAAGAGCTAATGCGACTCGGTCATACTGGATACCCCTGACTGCCCCTTTGTCATCGTATTCAACAAGTTCGTTCAGACCAGCATCATCCAGATCATCGGCGATCATTCCAAAGTAAGTTTCTGGATTTTTAGCACTAGGATTGAGCGTCTTGGATAGTACTTCTTCTTTGTCTTTCCAATGCGCAACTGGAACTTCTAGGAGTTTGTCCCCCATCCCAGTTTCAAATGATCGAACAATGTCTGTTTTGTACTTAGCGGCGGAGTTCGACGGAACTAATGCACCGTCTGGGGCCAAATAGGCGTTTGCGCCATGAGATGTTGAATGGGTACTCTTTAGATAAATGTAACTAGCCTGCATACTGATGTTAGAACCATGTAGACCTGTCCCTGCATGACCAGGATCACCAACTCTTATATACGGTGAGAGACCTATGCCATCAGTGAATTCACGACCACCGGATATAAGCACACCCCGTTCCGCACCGCCGATCTTGGTTACTTGCCATCCGGAGGTCGAATGCCCTCCAGAAATACCTGCGAACTTTTCTTCTCCCATTGGCGAAGTAAAGATATTTCCATCGTTAGCTCCGTTAGTGACCACAAAATAGTCACGTCCCCAGAACGTTGCACCACCCCATGAGGCCCCCGCCTGAGCGTTACTGATGCGAACATACGGCGTAGATTGACTTGAGAATAATGTCGGTTGGATCATTTGAATTTCCCCACCAGATATAAATACACGATTATCCTTGTCAGCAACTGAGATATACTTATTAATGTTAATATCAATTGCATTATCAGACGAATGGATACGTCCCGCCTGGAACTCAACATTACCAGTATTCAGATTAATTGATAGGTTACTGCCTTTAATTGTACCGGTCGTTATATTATTCGCATTCAAATTGATTACGTTTATATGCGCAGCATTGATAGTACCTGCAGTAATTTTACCAGCATCTATGCTTTCAATCATGGAGTTCTTAATGATTGCATTATCAATGTAGGTATCCGCCGTAATATGCAGTTTAGTACCGTATATCTTGGTTCCTTCAGGGGAAATATTAATTGCGTTAATAACCCCATTCTTTTCAACACGAAGATTAATCCGGTCATTAGTTTGAAGTATAGCAGAATATGCGTGCTCAAGTTCTGCATTACTTACATTATCAGGAACATAGGCTGCAGCAGTAGCTCCTTGGTTGAGCATTGGGCATATCATAGCAACATGGCCACCACCATGAACTTGGAATGCAAGGCAAACTGTTTCAGTTCCAGCCGGAGGAACAGCATTTTCAACTTTAATTAGTTCCATTCCACGGCTGGTTTTATACGTTTCCTTAAGCCCAATACGATTACCCTTAGTGTCGTAAAATTCAATAGTAATTACCGCAGCGAGGCCAACGGTATCGATATTCACATAAGCACTAGCCGACCAAGGAGTCGAGATATCTTGTCCAATAACAATTCTTCTAGAGTGCAAAGCATACCAGACACTATTGTCAGTCGTCGTTGGTTGATTGAAGCAAATACCTTGATACCCATTAACCCATGACCAAGCAAAATCTGATTTGTACCACATATCAGTAGTCGCACCAGTTGTAGTCCAAGATGGTCCGCTTAGATAGTCGTATTGGAACTGTGAGTTAGTCACAATATTTCTTGAACCAAAGGTATTGACCTGCCCTACAACAGAAGTTATCTGGTTACTTAATTGATCTACCTTGGACTGATAGGTACTGCCATCAACTTTTCCACTAACAGTCGTTTGGATGCTGTTAATAGTTTGAGAGATACTTGAAACTGCATCAACTGTTGCGTTGTCCAATGGATTGGTGGAATAGTCCGTAGCATTTGAACCTAGCTCTAATTTCATATTGGAGAATGTAATAGTAGCTGTCGAAGGCACATTATCTAAGCGGAGATAAGCACCTTGCTGTGAATAGCCATCTAACTTGATTGTTGCTACATAATGCTTCTTTGTGGTACCAACGGCCGCATTATTAAGGTAGCCCATCCAAGTCCCACCGTCTCCGCTAGCACTATTTTGGATTGTAAAGTTCGCAGAAGCCGTAGA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45 | Oenococcus_phage(38.71%) | holin,capsid,portal,head,tail,protease,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2322530 : 2331044
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP023771|2322530:2331044|DBSCAN-SWA 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TACCGGCGCCTTCACCAGGCCCTTCAAGTACCTGTTCACCCTGCGTCCAAAATTTTTTCAAGACTGGTTTTGAATTCTTGTAGGAGCAATGTTCGCTCCACATGCCGGAAAACAACCCGGTTTCAGTCTCGTTAGGTAAGCGTTGAAGGACCTTATCCGTTAATAATTGATACTCAGCATCGGTTAAGCCCCAATCCCGATAGACCTTAGAATCGCGAACATCTGTAGGTGATAATGGTTGCTTTTTAAGCATGGGTGACCTCCTCTTGACTCGCAATGACCGATTGAAAAATTCCGAGACCGTCCGTGGAACCTAAGATCATCTCCACGGCCCGTTCCGGATGGGGCATCATCCCAAGCACATTTCCCGCTTCATTTGTAATGCCAGCAATATTAGCCGTGCTGCCATTTGGATTCTCGACGTATTCGAAGATGATTTGATGATTAGCACGTAATTGCGCCAAGGTGGCCTCATCACAATAATAATTGCCTTCGCCGTGGGCAATCGGTAAACTAATTTGATCTGTCGATCCGTATGCGGTGGTAAAAATCGTCTCATGATTGGCAATTCGTAATGGGCTGTCCTGACAAATAAACTTCGCTGAGCGATTGGCCTGCAATGCACCAGGTAATAATCCGGCTTCGGTCAAGACTTGAAAGCCATTGCAGATTCCGATGACTGGTTTACCAGCGTTAGCAAATGCAATAACGGCCGGCATGATGGGCGCAAAGCGGGCAATCGCACCACTCCGTAAATAATCACCGTACGAAAAGCCACCAGGTAACACCACCGCGTCATAACCTGCTAATGAGGTCGCTGTCGCCGGAATCAAATCAGCCGTAACGTGTAAAATATCGCGCAAGGCATTCACCATGTCATGATCACAATTAGAACCAGGAAAGACTGGTACGGCAAATTTCATCATTACAAAGCCTCCATCTCAGTAATTTCGTAACGATAAGTTTCCATATTAACGTTGGCTAACAAGCGATCACACATCTCGTCGATTTCAGCGGCAACTGGCCGATCATCCGCGTGAATTTTCACCTCAAAATACTTACCTAATTCAACGGCATCGACATTCGTATATCCAAGTCGGTGTAAGGCATCATGAATCGCCTCACCCTTGGGGTCTAGAATTGATTGCTTATAAGTCACATAGATTTTAACTAAGTACATGTTATGCCTCCTCAACGGTTGCTAGCCGCGTCAATACTTCCTGATAAACACTAGTCAAGTCGCCTAGATCCTTGCGGAAGACATCCTTATCAAGCGATGCACCGGTCTTTAGGTCGACTAACCGACAACTATCTGGTGAGATTTCATCAGCCAGCAAGACTTTACCGGTGGTCGTCAACCCAAATTCGATTTTAAAATCAACGAGCTGTACCCCCATCGCCGCAAAAATTGCCGTCAAACGCTGGTTAACCTGTAAGGCCTGCCGTTTAATTTCCGCCACGATTGCCGGTGTTGCAACATTTAGCGCGTGGATTTGTGAATCATTGATAAATGGATCATCCAGCTGATCACTCTTATAGAAAAATTCCAGTACTGGTTCTGCAAATTTGGTTAAGTGTGGCACGGCAAATTTACGCTCAAAACTACCCGAAGCCGCATTCCGAACAACTGTCTCCAAGGGAATCATGGTCACGCGACGGACAAGTTGCACATAGTCTGAAGGTTGCTCAATAAAATGGTTGGCAATGCCGTGATTGGCTAAGTCTTTGAAAATCAAACTCGCGATGCGATTATTCAATCGGCCTTTCTGGTCAATGGGAACCTTCCGCTTACCATTTAGCGCTGTTGCTTGATCTAAGTATTCGACCCATAGAATTTCAGGATCATTAGTGGCATACATCGCTTTCGCTTTACCCGTGTAAAGCAAAGCTTGTTTCTCAATCGCTGCCGTCATTATTATTGTTCCCCTTTCAAATTTGCCACCGACGCTAATGCTGCGTCAATATCGTGATTTAATACGGTGACATGACCCATCTTGCGCTGGGGCTTAATGGCCGCCTTACCGTAGTCGTGAAAATGCCATTCTGGGTGTTCAACCAACTGTTGACGTGCCACTGTTAAGTCATCACCTAGCAGATTACGCATCACTGCCGGACTGGTCTGCGTAATGGCCGGAATCGGTAAGCCACAGATACTTCGAATATGGGCCTCAAACTGCGAGATGTTGCAGGCCTCAATCGTATAGTGACCAGAATTATGTGGGCGTGGTGCCAGTTCATTGACTAATAAAGTATCATCCGGTAAAACAAAGAATTCGATTCCTAGCACGCCGCGTAGTTCCAGAGATTCAGCAATCGAAACCGCAATTTTGCGGGCCGCACTATGAACACTGGGCTGAACATTAGCTGGGGCAATCGTTGTGTGTAAGATATGATGTTGATGCTGATTTTCAACTAACGGAAAAGTCGTAACAACACCAGCAGCACTACGCGTCACCATCATGGAAACTTCTGTTCGAAATTTCTGCCGCGCCTCTAGAATGCACGGCTGTGTCAATAAGACACTAGCGGCTTTTGTCACCACTGCTGTGTCTAGATCCGTTTGTCCGTGACCATCGTAGCCACCTGCCGCCGTTTTGAGAATTGCCGGCGTACCAACACGGTTGAGGGCGTAATTTAATGACTGTAAATCCGTCACCGGTGCGAAAGATGTGACTGGGATGCCATGATCATGAAGAAATTGCTTCTCATTAAGACGATCTCCAGTAATATGCAGGAGTGCAGTGCCCTGCGGTAACTTTGCATAGGCTTGCGCAGCAATCAAAGCATTCTCATCAACGTTTTCAAACTCGTAGGTCAAGACATCACTACGGCGCGCTAGATCAAGTAAAGCCGCCTGATCATCATAAGCCGCAACAATCTGAAAATCTGCGACCTGGGCTGCCGGTGCTTTGGGTGTCGGGTCAAGGACACCTACCCGATAGCCCATCGCCTTCGCGCTAAGCGTCATCATCTGACCGAGTTGACCGCCACCAACGATTCCGATCGTTGCGGGTGGTAAGAGTGCTTCCTTAAAATTGGCGTTCACTTTGTTCAGCCTCCTGACGTTGACGAGCACGAAATTCTCCAATTGCATGTTGTACTTGTGGTTCCCGTAAACCGATAATTTGGGCGGCCATTAGCGCACCATTCTTAGCCCCCGCATCACCAATCGCCATCGTCGCCACGGGTACGCCAGCTGGCATCTGTACGATTGACAATAACGAATCAACTCCGTTCAACGTATGGGTCTTAATGGGCACCCCAATTACCGGGAGTAGTGTATTGGCAGCTAGCATCCCGGGTAAATGGGCAGCGCCCCCCGCACCCGCAATAATAACTTGAATTCCCCGTGACGCTGCTTCTTCACCATAGGATTGTAATGTCTGGGGCATTCGGTGGGCCGAAATAACGTGACGCTCATAAGAGACTCCCAGTGCCGTTAACTGTTCTGCCGCTAATTGCATGGTTGGCCAATCAGAAATTGACCCCATAATCAAACCAACTTTCGCCATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP023771|2322530:2331044|2330558_2331044_-|AYF25087.1|DBSCAN-SWA MMAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQHAIGEFRARQRQEAEQSERQF >CP023771|2322530:2331044|2328454_2328709_-|AYF25084.1|DBSCAN-SWA MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL >CP023771|2322530:2331044|2322530_2323109_-|AYF25079.1|DBSCAN-SWA MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANIPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIKLVLLAGYMRIIGPTLLNAYSHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFDAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI >CP023771|2322530:2331044|2327774_2328455_-|AYF25083.1|DBSCAN-SWA MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA >CP023771|2322530:2331044|2325562_2327782_-|AYF25082.1|DBSCAN-SWA MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHEHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEANFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK >CP023771|2322530:2331044|2324123_2325578_-|AYF25081.1|DBSCAN-SWA MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIREMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK >CP023771|2322530:2331044|2323101_2324127_-|AYF25080.1|DBSCAN-SWA MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSSDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVTGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPVPPIMTLLAELGGLTATDLRSTFNLGLGMVLVVHPDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTAPVVFEEAEHA >CP023771|2322530:2331044|2328710_2329442_-|AYF25085.1|DBSCAN-SWA MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNQRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA >CP023771|2322530:2331044|2329444_2330575_-|AYF25086.1|DBSCAN-SWA MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASVLLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASVANLKGEQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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