Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014063 | Staphylococcus aureus strain FDAARGOS_159 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 3 | 0 |
CP014064 | Staphylococcus aureus strain FDAARGOS_159 chromosome, complete genome | 8 crisprs | DEDDh,DinG,cas3,csa3,RT,WYL | 9 | 2 | 12 | 2 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014064_1 | 31264-31345 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP014064_1
|
1 spacers
spacers of CP014064_1
>1.1|31288|34|CP014064|CRISPRCasFinder ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP014064_1
The CRISPR arrays of CP014064_1 >merge|CP014064|1|31264-31345|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCATCCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >CP014064|1|1|31264-31345|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>CP014064.2|AMG40568.1|30281_31160_+|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLSQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLNDLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQVHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >CP014064.2|AMG40567.1|30166_30280_+|hypothetical-protein MKENLLGTIIWSIATFYYSRMMKIMNLAILKIKIGGS >CP014064.2|AMG40566.1|29722_30103_+|glycine-cleavage-system-protein-H MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQLEALLTAEKYSEMIGE >CP014064.2|AMG40565.1|29208_29565_+|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >CP014064.2|AMG40564.1|28744_29065_-|thioredoxin MQAIKSNESFKSIINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >CP014064.2|AMG40563.1|28054_28594_+|nitroreductase MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVYVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEEDMPKAPRKNRNLITLY >CP014064.2|AMG40562.1|27255_27972_+|3-dehydroquinase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFINDLYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIIKHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGEPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >CP014064.2|AMG40561.1|26685_27108_-|organic-hydroperoxide-reductase-OsmC/OhrA MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >CP014064.2|AMG40560.1|25792_26287_-|N-acetyltransferase MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >CP014064.2|AMG40559.2|24387_24948_+|histidine-phosphatase-family-protein MRHGQTLFNFKGLIQGFGDSPLTELGIAQAQKARSYYETKGINFDLYASSTQERASDTLENVAPNQSYQRFKGLKEWHFGIFEGESVYLFDNLYKPEDLFGDRIVPFKGEARQQVEERIVKTLHDIMSQTKNNALVVSHGTIMGVFLRYCLKLDEALKHNIGNCNILKFEYDNGTFKFVELIDPNL >CP014064.2|AMG40569.1|31633_31747_+|hypothetical-protein MLGPRQLAHYCKLTYHQLLCWGPAIIEKFVIGVFSFG >CP014064.2|AMG40570.1|31956_32343_+|topiosmerase MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >CP014064.2|AMG40571.1|32335_32632_+|thioredoxin MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >CP014064.2|AMG40572.1|32881_33907_+|methionine-import-ATP-binding-protein-MetN-2 MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >CP014064.2|AMG40573.1|33899_34595_+|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWIVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >CP014064.2|AMG40574.1|34612_35434_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYDLDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >CP014064.2|AMG40575.1|35787_35982_+|CsbD-family-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >CP014064.2|AMG40576.1|36215_37067_-|DUF368-domain-containing-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFTGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >CP014064.2|AMG40577.1|37394_38156_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >CP014064.2|AMG40578.1|38253_39561_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKHFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDKNASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014064_2 | 1248229-1248310 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP014064_2
|
1 spacers
spacers of CP014064_2
>2.1|1248253|34|CP014064|CRISPRCasFinder TTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGG |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP014064_2
The CRISPR arrays of CP014064_2 >merge|CP014064|2|1248229-1248310|CRISPRCasFinder GGCCCCCACCCCAACTTACATTGTTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCCACCCCAACTTGCATTGT >CP014064|2|2|1248229-1248310|CRISPRCasFinder GGCCCCCACCCCAACTTACATTGT TTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGG GGCCCCCACCCCAACTTGCATTGT
>CP014064.2|AMG41753.1|1246784_1248008_+|succinyl-diaminopimelate-desuccinylase MTTFSEKEKIQLLADIVELQTENNNEIDVCNYLKDLFDKYDIKSEILKVNEHRANIVAEIGNGSPILALSGHMDVVDAGNQDNWTYPPFQLTEKAGKLYGRGTTDMKGGLMALVITLIELKEQNQLPQGTIRLLATAGEEKEQEGAKLLADKGYLDDVDGLIIAEPTGSGIYYAHKGSMSCKVTATGKAVHSSVPFIGDNAIDTLLEFYNQFKEKYSELKKHDTKHELDVAPMFKSLIGKEISEEDANYASGLTAVCSIINGGKQFNSVPDEASLEFNVRPVPEYDNDFIESFFQNIINDVDSNKLSLDIPSNHRPVTSDKNSKLITTIKDVASSYVEQDEIFVSALVGATDASSFLGDNKDNVDLAIFGPGNPLMAHQIDEYIEKDMYLKYIDIFKEASIQYLKEK >CP014064.2|AMG41752.1|1245293_1246349_-|bi-component-leukocidin-LukGH-subunit-H MKNKKRVLIASSLSCAILLLSAATTQANSAHKDSQDQNKKEHVDKSQQKDKRNVTNKDKNSTVPDDIGKNGKITKRTETVYDEKTNILQNLQFDFIDDPTYDKNVLLVKKQGSIHSNLKFESHKEEKNSNWLKYPSEYHVDFQVKRNRKTEILDQLPKNKISTAKVDSTFSYSSGGKFDSTKGIGRTSSNSYSKTISYNQQNYDTIASGKNNNWHVHWSVIANDLKYGGEVKNRNDELLFYRNTRIATVENPELSFASKYRYPALVRSGFNPEFLTYLSNEKSNEKTQFEVTYTRNQDILKNRPGIHYAPPILEKNKDGQRLIVTYEVDWKNKTVKVVDKYSDDNKPYKEG >CP014064.2|AMG41751.1|1244255_1245272_-|bi-component-leukocidin-LukGH-subunit-G MIKQLYKNITICSLAISTALTVFPATSYAKINSEIKAVSEKNLDGDTKMYTRTATTSDSQKNITQSLQFNFLTEPNYDKETVFIKAKGTIGSGLRILDPNGYWNSTLRWPGSYSVSIQNVDDNNNTNVTDFAPKNQDESREVKYTYGYKTGGDFSINRGGLTGNITKESNYSETISYQQPSYRTLLDQSTSHKGVGWKVEAHLINNMGHDHTRQLTNDSDNRTKSEIFSLTRNGNLWAKDNFTPKDKMPVTVSEGFNPEFLAVMSHDKKDKGKSQFVVHYKRSMDEFKIDWNRHGFWGYWSGENHVDKKEEKLSALYEVDWKTHDVKFVKVLNDNEKK >CP014064.2|AMG41749.1|1242099_1243137_+|site-specific-integrase MKTRCYDGKKWQYEFKHEGKRYRKKGFRTKREANSAGLDKLNELRSGFNIDNYITLEEYFENWIKTYKQPVVKENTYRHYRNALQHIQKHKIGKMELSKINRQVYQKFINDYSKEHAKETIRKTNGAIRSALDDALYDGLIFKNPAYKVNYKAGKPTKSEQEKFISVTEYEILKDHVRKKRTRSSLALFIMICTGCRVSGARNIKIEHINQVKNTIFIDERKTNTSPRYISIAKSDMKHIMDVISTFAISYDGYIFKEGGSIINLHAINNALKSACRVNNIPIITSHALRHTHCSYLLAKGVSIHYISKRLGHKNIAITTSVYSHLLEEKFNEEDKKTTKILESM >CP014064.2|AMG41748.1|1241576_1242041_+|hypothetical-protein MKRLLGLLLVSTLVLSACGNDENQEESKKEVKSKEKKIEKEKENKSKKDKEKEVATQQQPDNQTVEQPQSQEQSVQQPQQQIPQNSVPQQNVQVQQNKKQKVDLNNMPPTDFSTEGMSEQAQKQIEELSMQKDYHGLSQREYNDRVSEIINNDN >CP014064.2|AMG41747.1|1241294_1241477_+|hypothetical-protein MKITNCKIKRETVIYEVLTSGNQPFTYELPKDLSSHNARKYLEFISQKLDGDKLTKEDSL >CP014064.2|AMG41746.1|1240749_1241091_+|hypothetical-protein MIKKIFTKKHVFLVIEDENHNHSDAVFGKSILLSIYVGVNKKTNSKSGKFIYLDRSKRIVRQSDITKIESANENDVDFYNLLKKEKEIVYSKNIVDKYNLANYIIYYEVSTKE >CP014064.2|AMG41745.1|1239811_1240744_+|ATP-dependent-helicase MKKYDIAVLDFETMNEHMNSPCEVAVSLIKDLSIVKVYSSYINPPNNRYNLKNAKIHKIPEDVILKAPKYPDIYQEILYLLKESHLIIAHNALFDISVLKNTNNYYDLPVPNFMYVDSINIFRSFHAISSFKLENLCSLYDIDKEKLHSAKFDVLALSKMLISLAKNNQHYSVLKLIHYMPKQYIRFSKYSNSPTKLFDSGFQKIHMKISEINKIEVESVIPILKDKNVVFTGNFDTEKQDLMILTRKKGAYIRSDVTAKTDILVEGVQDDKYKDVNGLVSKQRKAREYVGNGAKIQFLNEEDLINLIKE >CP014064.2|AMG41744.1|1239082_1239796_+|XRE-family-transcriptional-regulator MNKERNIIIAKNIRKFLNDSNMSQKKLAELINIKPSTLSDYLNLRSNPSHGVIQRIADVFEVGKSDIDTTYKDDNDITSIYNKLTPPRQENVLNYANEQLEEQNSKGDNVVDINSYKQEKTPVNVNGCVSAGVGERLHDETLFTEMVKGPIPTHDLALKVNGDSMEPMFKDGEIIFVEKTHNIKNGQIGIFIIEEEAYVKKVFVEDDRLTLVSLNKDYDDLHFYRNESVRLIGKVIL >CP014064.2|AMG41743.1|1238946_1239120_-|transcriptional-regulator MFLAIIIFLSLFILLTSFFLIIRNFHIIVKFFTKKTYLMLTIRKFRIILGLRKAVTT >CP014064.2|AMG41754.1|1248451_1249759_+|TrkH-family-potassium-uptake-protein MNKVHKPLYFYLMLFFSTTIIGALLLYLPFTGKKPISFLDALFIASSAFTVTGLSPVDIGSQFNILGEIVILLLIQIGGLGIVTVTLLTLVFLNRKISMKNRFLIMVTWNIDEPGGVIKLIKHLAIYSLVTELIGMICLCLSFIPKFGIGKGLFLSLFTSVSAFNNAGFALFKNNLIDYSSDPIVIITISILIIFGGIGHFVVIDFINCKKLSKLSLHSKLVLTTTSILIIIGAITFFLLEQFNTMQHMGLVEKIGNSFFQSVTTRTAGFNSIDIASINKSTALMLMLLMFIGGAPLSAAGGIKITTFAVAFIFVLNYIRKENNVSVFNKEISDKHIKLSIVTINISFLFISIITFILSIINPNISLIKLLFEVVSAFGTVGLSMNLTTEYHGITKIIIIFVMLCGKVGLLTLLRTFIPPKSPKNYRYTKGQIYL >CP014064.2|AMG41755.1|1250298_1251915_-|molecular-chaperone-GroEL MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNVYQKVSEIEAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >CP014064.2|AMG41756.1|1251990_1252275_-|co-chaperone-GroES MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGTGRLLNDGTRVTPEVKEGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE >CP014064.2|AMG41757.1|1252449_1253193_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MTRLWASLLTVIIYILSQFLPLLIVKKLPFVQYSGIELTKAVIYIQLVLFLIAATTIILINLKIKNPTKLELEVKEPKKYIIPWALLGFALVMIYQMVVSIVLTQIYGGQQVSPNTEKLIIIARKIPIFIFFVSIIGPLLEEYVFRKVIFGELFNAIKGNRIVAFIIATTVSSLIFALAHNDFKFIPVYFGMGVIFSLAYVWTKRLAVPIIIHMLQNGFVVIFQLLNPEALKKATEQANFIYHIFIP >CP014064.2|AMG41758.1|1253217_1254477_-|hypothetical-protein MSYHWFKKMLLSTSILILSSSSLGLATHTVEAKDNLNGEKPTTNLNHNITSPSVNSEMNNNETGTPHESNQTGNEGTGSNSRDANPDSNNVKPDSNNQNPSTDSKPDPNNQNPSPNPKPDPDNPKPKPDPKPDPDKPKPNPDPKPDPDKPKPNPNPKPDPDKPKPNPDPKPDPDKPKPNPNPKPDPNKPNPNPSPDPDQPGDSNHSGGSKNGGTWNPNASDGSNQGQWQPNGNQGNSQNPTGNDFVSQRFLALANGAYKYNPYILNQINKLGKDYGEVTDEDIYNIIRKQNFSGNAYLNGLQQQSNYFRFQYFNPLKSERYYRNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPEDKPDSKQRSFEPHEKDDFTVVKKQEDNKKSASTAYSKSWLAIVCSMMVVFSIMLFLFVKRNKKKNKNESQRR >CP014064.2|AMG41759.1|1254673_1255300_+|nitroreductase-family-protein MGLFKKDKKAMTFDNAMEERRSIYNLKDSISISDDELESMIAHAVKHVPSSFNSQSTRIVLLLNDNNNKFWDNTKAILKEVMGENRDFEPTEQKIDNFKHSYGTILFYEDQDVVSGLQEQMPNYYDNFAIWSTQTNAMHQFAIWTALATKGIGASLQHYNPLVDEMTSKEFNIPKSWKLIAQMPFGDIREAAGEKTFNPVEDRFVIKK >CP014064.2|AMG41760.1|1255660_1256446_+|carbon-nitrogen-family-hydrolase MKVQIYQLPIIFGDSSKNETQITQWFEKNMNAEVDVVVLPEMWNNGYDLEHLNEKADNNLGQSFSFIKHLAEKYKVDIVAGSVSNIRNYQIFNTAFSVNKSGQLINEYDKVHLVPMLREHEFLTAGENVAEPFQLSDGTYVTQLICYDLRFPELLRYPARSGAKIAFYVAQWPMSRLQHWHSLLKARAIENNMFVIGTNSTGFDGNTEYAGHSIVINPNGDLVGELNESADILTVDLNLNEVEQQRENIPVFKSIKLDLYK >CP014064.2|AMG41761.1|1257045_1257180_-|delta-lysin-family-phenol-soluble-modulin MSCLILRIFILIKEGVISMAQDIISTIGDLVKWIIDTVNKFTKK >CP014064.2|AMG41762.1|1257415_1257979_+|accessory-gene-regulator-AgrB MNYFDNKIDQFATYLQKRNNLDHIQFLQVRLGMQIIVGNFFKILVTYSISIFLSVFLFTLVTHLSYMLIRYNAHGAHAKSSILCYIQSILTFVFVPYFLINIDINFTYLLALSIIGLISVVIYAPAATKKQPIPIKLVKRKKYLSIIMYLLVLILSLIIHPFYAQFMLLGILVESITLLPIFFPKED >CP014064.2|AMG41763.1|1257981_1258125_+|cyclic-lactone-autoinducer-peptide MNTLVNMFFDFIIKLAKAIGIVGGVNACSSLFDEPKVPAELTNLYDK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014064_3 | 1377485-1377565 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP014064_3
|
1 spacers
spacers of CP014064_3
>3.1|1377509|33|CP014064|CRISPRCasFinder ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP014064_3
The CRISPR arrays of CP014064_3 >merge|CP014064|3|1377485-1377565|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT >CP014064|3|3|1377485-1377565|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTT ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT
>CP014064.2|AMG41880.1|1376376_1377468_+|transcriptional-regulator MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENGKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >CP014064.2|AMG41879.1|1375133_1376111_+|cation-transporter MSHSHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >CP014064.2|AMG41878.1|1374811_1375132_+|ArsR-family-transcriptional-regulator MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >CP014064.2|AMG41877.1|1373994_1374660_-|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGEQDIKDALTQFEIEKD >CP014064.2|AMG41876.1|1372620_1373559_-|mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >CP014064.2|AMG41875.1|1372359_1372590_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >CP014064.2|AMG41874.1|1370314_1371688_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVKKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >CP014064.2|AMG41873.1|1369444_1369858_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >CP014064.2|AMG41872.1|1368801_1369245_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >CP014064.2|AMG41871.1|1367970_1368681_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >CP014064.2|AMG41881.2|1377900_1378005_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >CP014064.2|AVC42050.1|1378437_1378620_-|hypothetical-protein MIIFRFKVNAFFPVKLCLMIRFCLESCCIFRRHLLITFHNIRSKFIMFKYISSKCIICTG >CP014064.2|AVC42051.1|1378684_1378843_+|integrase MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >CP014064.2|AVC42052.1|1379279_1379372_+|erm-Leader-peptide MTYGSIVAILCALFVIFFIPYMEKKDKKKK >CP014064.2|AMG41882.1|1379500_1380358_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >CP014064.2|AMG41883.1|1380425_1381208_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKNISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGGVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHHLLKLVGISAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLNILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >CP014064.2|AMG41884.1|1381439_1383245_-|glutamine--fructose-6-phosphate-aminotransferase MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEDGTPVVALATQENVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >CP014064.2|AMG41885.1|1383925_1385464_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >CP014064.2|AMG41886.1|1385498_1387631_+|PRD-domain-containing-protein MLLSTREKEMIALLIKYHSQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGADSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >CP014064.2|AMG41887.1|1387642_1388077_+|mannitol-specific-phosphotransferase-enzyme-IIA-component MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP014064_4 | 1498845-1498925 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP014064_4
|
1 spacers
spacers of CP014064_4
>4.1|1498870|31|CP014064|CRISPRCasFinder CACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP014064_4
The CRISPR arrays of CP014064_4 >merge|CP014064|4|1498845-1498925|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTG >CP014064|4|4|1498845-1498925|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTG CACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCT TCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTG
>CP014064.2|AMG41996.1|1498617_1498803_+|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNDLECDINVKEPLKINYVVIFGSGTEITFSQNLFR >CP014064.2|AMG41995.1|1498141_1498492_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >CP014064.2|AMG41994.1|1496828_1498040_+|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETDVINKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >CP014064.2|AMG41993.1|1496395_1496836_+|MarR-family-transcriptional-regulator MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >CP014064.2|AMG41992.1|1495469_1496234_-|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >CP014064.2|AMG41991.1|1495226_1495478_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLVIIHMGILAHSTYVYLY >CP014064.2|AMG41990.1|1493572_1494838_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYILNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >CP014064.2|AMG41989.1|1490288_1493456_-|AcrB/AcrD/AcrF-family-protein MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASAPNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHVDGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >CP014064.2|AMG41988.1|1488837_1490157_+|ISL3-like-element-IS1181-family-transposase MCNDTLELLRIKDENIKYINQEIDVIIKGKKATVVNAVLTYKPSACYCCGVKNEGQIHKHGKRVSRITLLKTQGYNTYLNLAKQRFKCLECNGTFTAKTSIVDESCFISRCVTQKVIEEATKVKTEIDTAEDNCISPSTVSRIRTKAANSLRIKPFNCLPEHIAMDEFKSVKNVTGSMSFIFIDNDTHDVIDILENRTTRFLRAYFERFDLKNRQQVKTVTIDMYEPYVRLFRDLFPNAAIIFDRFHIVQHLNRELNKYRVQVMNEYRNKKGPNYTIFKNNWKVLLMDTSKTIFSKYRWNKSFKAYKRSSDIVEFMLSKDDILRRSYELVQGLRKDLRLCNWPKFINRLNSVSKKSVSKGVWKVVKYYRKHQRMLRNTIYYPAFNNGAIEGINNKIKLIKRISFGYRNFNNFKARIMMIFSLYKGEKKKTTKPNNGLAA >CP014064.2|AMG41987.1|1488267_1488585_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >CP014064.2|AMG41998.1|1499068_1500091_-|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >CP014064.2|AMG41999.1|1500110_1500710_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNIYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >CP014064.2|AMG42000.1|1500716_1500950_-|molybdopterin-synthase-sulfur-carrier-subunit MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >CP014064.2|AMG42001.1|1500955_1501402_-|molybdopterin-synthase-catalytic-subunit MKQFEIVIEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >CP014064.2|AMG42002.1|1501415_1501901_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKTHGYTVATIKHHGHAKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRDEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >CP014064.2|AMG42003.1|1501897_1503157_-|molybdopterin-molybdenumtransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAKKLGLEVGIYKTQKDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >CP014064.2|AMG42004.1|1503219_1503714_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSGQ >CP014064.2|AMG42005.1|1503715_1504222_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFVTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >CP014064.2|AMG42006.1|1504252_1505257_-|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDGCIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >CP014064.2|AMG42007.1|1505426_1506032_-|molybdenum-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTTKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSKHIDQLIQTLNINHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP014064_5 | 2115344-2115428 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP014064_5
|
1 spacers
spacers of CP014064_5
>5.1|2115370|33|CP014064|CRISPRCasFinder TGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP014064_5
The CRISPR arrays of CP014064_5 >merge|CP014064|5|2115344-2115428|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG >CP014064|5|5|2115344-2115428|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTG TGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG
>CP014064.2|AMG42567.1|2114235_2115195_+|cation-transporter MNGKKANTINRYKYFHHVNHQKIQQSSKKTLWASLIITLLFTVIEFVGGLVSNSLALLSDSFHMLSDVLALGLSMLAIYFASKKPTARYTFGYLRFEILVAFLNGLALIVISIWILYEAIVRIIYPQPIESGIMFMIASIGLLVNIILTIILVRSLKQEDNINIQSALWHFMGDLLNSIGVIVAVVLIYFTGWRIIDPIISIVISLIILRGGYKITRNAWLILMESVPQHLDTDQIMADIKNIDGILDVHEFHLWSITTEHYSLSAHVVLDKKYEGDDYQAIDQVSSLLKEKYGIAHSTLQIENLQLNPLDEPYFDKLT >CP014064.2|AMG42566.1|2112101_2113589_+|aldehyde-dehydrogenase MAVNVRDYIAENYGLFINGEFVKGSSDETIEVTNPATGETLSHITRAKDKDVDHAVKVAQEAFESWSLTSKSERAQMLRDIGDKLMAQKDKIAMIETLNNGKPIRETTAIDIPFAARHFHYFASVIETEEGTVNDIDKDTMSIVRHEPIGVVGAVVAWNFPMLLAAWKIAPAIAAGNTIVIQPSSSTPLSLLEVAKIFQEVLPKGVVNILTGKGSESGNAIFNHDGVDKLSFTGSTDVGYQVAEAAAKHLVPATLELGGKSANIILDDANLDLAVEGIQLGILFNQGEVCSAGSRLLVHEKIYDQLVPRLQEAFSNIKVGDPQDEATQMGSQTGKDQLDKIQSYIDAAKESDAQILAGGHRLTENGLDKGFFFEPTLIAVPDNHHKLAQEEIFGPVLTVIKVKDDQEAIDIANDSEYGLAGGVFSQNITRALNIAKAVRTGRIWINTYNQVPEGAPFGGYKKSGIGRETYKGALSNYQQVKNIYIDTSNALKGLY >CP014064.2|AMG42565.1|2111291_2111675_-|DUF454-domain-containing-protein MRLILIVIGLIFTALGIAGAVLPLLPTTPFLLVAVFCFARSSDRFYNWLINQKIYKEYVENFYLHRGYTLQQKIKILISLYIVIGFSIYMVDVLAVRVGLIIMVIIQTAVLFTFVKTLPKSNHKIEE >CP014064.2|AMG42564.1|2110958_2111285_-|staphylobilin-forming-heme-oxygenase-IsdI MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQGIETIEGFQQMFVTKTLNTEDTDEVKILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK >CP014064.2|AMG42563.1|2109748_2110894_+|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase-(non-hydrolyzing) MKKIMVIFGTRPEAIKMAPLVKEIDHNGNFEANIVITAQHRDMLDSVLSIFDIQADHDLNIMQDQQTLADLTANALAKLDSIINEEQPDMILVHGDTTTTFVGSLAAFYHQIPVGHVEAGLRTHQKYSPFPEELNRVMVSNIAELNFAPTVIAAKNLLFENKDKERIFITGNTVIDALSTTVQNDFVSTIINKHKGKKVILLTAHRRENIGEPMHQIFKAVRDLADEYKDVVFIYPMHRNPKVRAIAEKYLSGRNRIELIEPLDAIEFHNFTNQSYLVLTDSGGIQEEAPTFGKPVLVLRNHTERPEGVEAGTSRVIGTDYDNIVRNVKQLIEDDEAYQRMSQANNPYGDGQASRRICEAIEYYFGLRSDKPDEFVPLRHK >CP014064.2|AMG42562.1|2108409_2109672_+|nucleotide-sugar-dehydrogenase MKLTVVGLGYIGLPTSIMFAKHGVDVLGVDINQQTIDKLQSGQISIEEPGLQEVYEEVLSSGKLKVSTTPEASDVFIIAVPTPNNDDQYRSCDISLVMRALDSILPFLEKGNTIIVESTIAPKTMDDFVKPVIENLGFTIGEDICLVHCPERVLPGKILEELVHNNRIIGGVTKACIEAGKYVYRTFVQGEMIETDARTAEMSKLMENTYRDVNIALANELTKICNNLNINVLDVIEMANKHPRVNIHQPGPGVGGHCLAVDPYFIIAKDPENAKLIQTGREINNSMPAYVVDTTKQIIKALSGNKVTVFGLTYKGDVDDIRESPAFDIYELLNQEPDIEVCAYDPHVELDFVEHDMSHAVKDASLVLILSDHSEFKNLSDSHFDKMKHKVIFDTKNVVKSSFEDVSYYNYGNIFNFIDK >CP014064.2|AMG42561.1|2107468_2108356_+|UDP-glucose-4-epimerase MRKNILITGVHGYIGNALKDKLIEQGHQVDQINVRNQLWKSTSFKDYDVLIHTAALVHNNSPQARLSDYMQVNMLLTKQLAQKAKAEDVKQFIFMSTMAVYGKEGQVGKSDQIDTQTPMNPTTNYGISKKFAEQALQELISDSFKVAIVRPPMIYGAHCPGNFQRLMQLSKRLPIIPNINNQRSALYIKHLTAFIDQLISLEVTGVYHPQDSFYFDTSSVMYEIRRQSHRKTVLINMPSVLNKYFNKLSVFRKLFGNLTYSNTLYENNNALEVIPGKMSLVIADIMDETTTKDKA >CP014064.2|AMG42560.1|2106911_2107469_+|sugar-transferase MKRLFDVVSSIYGLVVLSPILLITALLIKMESPGPAIFKQKRPTINNELFNIYKFRSMKIDTPNVATDLMDSTSYITKTGKVIRKTSIDELPQLLNVLKGEMSIVGPRPALYNQYELIEKRTKANVHTIRPGVTGLAQVMGRDDITDDQKVAYDHYYLTHQSMMLDMYIIYKTIKNIVTSEGVHH >CP014064.2|AMG42559.1|2105695_2106901_+|glycosyltransferase-WbuB MSEKKILILCQYFYPEYVSSATLPTQLAEDLIANHINVDVMCGWPYEYSNHKQVSKTEMHRGIRIRRLKYSRFNNKSKVGRIINFFSLFSKFVINIPKMLKYDQILVYSNPPILPLIPDVLHRLLKKKYSFVVYDIAPDNAIKTGATRPGSMIDKLMRYINRHVYKNAENVIVLGTEMKNYLLNHQISKNADNIHVIPNWYDMRQLQDNRIYNDTFKAYREQYDKILLYSGNMGQLQDMETLISFLKLNKDQPQTLTILCGHGKKFADVKTAIEDHRIENVKMFEFLTGTDYADVLKIADVCIASLIKEGVGLGVPSKNYGYLAAKKPLVLIMDKQSDIVQHVEQYDAGIQIDNGDAHAIYNFINTHSSKELHEMGERAHQLFKDKYTREINTMKYYNLLK >CP014064.2|AMG42558.1|2104489_2105695_+|capsular-biosynthesis-protein MVKKVFIMDSVKTIIGTLLIALGLQFLAYPIINQRVGNEAFGSILTIYTIITITSVVLGNTLNNIRLINMNLYKSNHYYWKFVSILLISILIESIALIIVFLYFFNLNTIDIIFLILLNILMCLRIYLNVFFRMTLKYNQILYIALIQFLGLLIGLFLYYLIQNWIVCFITSELFATIYTLVKLRGLTIGEYQSEDNNVVKDYVMLLSTNSLNNLNLYLDRLILLPIIGGTAVTISFLSTFIGKMLATFLYPINNVVLSYISVNESDNIKKQYLKTNLFAIAALCLVMIICYPITLIIVSLLYNIDSSLYSKFIILGNIGVLFNAVSIMIQTLNTKHASITLQANYMTLHTITFIFITILMTIAFGLNGFFWTTLFSNIIKYVILNIIGLKSKFINKKDVD >CP014064.2|AMG42569.1|2115489_2115693_-|hypothetical-protein MDKESVVASLARNKKIAVETMAGQRYIIERILHTNDEKHIHILKPKDVVLDVDSIKEIDENHLNDAT >CP014064.2|AMG42570.1|2115871_2116384_+|DUF4242-domain-containing-protein MTLFLLEANNLDFASTKEELEAKAASLSTKTIPTLIEVQATENLTHGYFIVEANDEAEAKQFLTEADISIQLVKEVRLVGKDLDEVKNGDAHVDYLVTWNIPEGITMDQYLARKKKNSVHYEEVPEVEFKRTYVCEDMSKCICLYNAPDEEAVRRARKAVDTPIDGIEKL >CP014064.2|AMG42571.1|2116725_2117466_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKIQQLQHHFGSHKVIHNFNLDISKGEIVTFIGKSGCGKSTLLNVIGGFIHPSSGRVIIDNEIKQQPSPDCLMLFQHHNLLPWKTINDNIRIGFQQKISDEEINAQLKLVDLEDRGKHFPEQLSGGMKQRVALCRAHVHKPNVILMDEPLGALDAFTRYKLQDQLVQLKHKTQSTIILVTHDIDEAIYLSDRIVLLGEGCNIISQYEITASHPRSRNDSHLLKIRNEIMETFALNHHQVEPEYYL >CP014064.2|AMG42572.1|2117479_2118451_+|nitrate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKRLSIIVIIGIFIITGCDWQRTSKEPSKNAQNQQVIKIGYLPITHSANLMMTKKLLSQYNHPKYKLELVKFNNWPDLMDALNSGRIDGASTLIELAMKSKQKGSNIKAVALGHHEGNVIMGQKGMHLNEFNNGDDYHFGIPHRYSTHYLLLEELRKQLKIKPGHFSYHEMSPAEMPAALSEHRITGYSVAEPFGALGEKLGKGKTLKHGDDVIPDAYCCVLVLRGELLDQHKDVAQAFVQDYKKSGFKMNDRKQSVDIMTHHFKQSRDVLTQSAAWTSYGDLTIKPSGYQEITTLVKQHHLFNPPAYDDFVEPSLYKEASRS >CP014064.2|AMG42573.1|2118447_2119209_+|ABC-transporter-permease MTRPTNNKFILPIITFIIFLGIWEMVIIIGHYQPVLLPGPALVGKSIWTFIVTGEIFQHLAISLWRFVAGFVVALLVAIPLGFLLGRNRWLYNAIEPLFQLIRPISPIAWAPFVVLWFGIGSLPAIAIIFIAAFFPIVFNTIKGVRDIEPQYLKIAANLNLTGWSLYRNILFPGAFKQIMAGIHMAVGTSWIFLVSGEMIGAQSGLGFLIVDARNMLNLEDVLAAIFFIGLFGFIIDRFISYIEQFILRRFGE >CP014064.2|AMG42574.2|2119221_2120253_+|acyl-CoA-dehydrogenase MTLETLIKEQLDPHLVEVDEGTYYPRTFIQQLFVDGYFGEAALRKNAEVIEAVSQSCLTTGFCLWCQLAFSTYLENATQPHLNNDLQQQLLSGEILGATGLSNPMKSFNDLEKLNLEHTYVDGQLVVSGRMPAVSNIQEDHYFGAISKHESSDEFVMFILRANQDGITLVEKTNFLGVNGSATYQITLNQVVVPQSQIITHDAKQFAATIRPQFIAYQIPIGLGSIKSSLELIDAFSNAQNGINQYLEYDVEAFKKRYRQLREEYYAILDDGNLTSHLSELISLKKDIGYLLLDVNQASVVNGGSRAYTPYSPQVRKLKEGFFFAALTPTLRHLGKLEAELKG >CP014064.2|AMG42575.1|2120469_2120829_+|DUF2294-domain-containing-protein MNTIDTHTKEQQFSNLVRSYRKEYVGKGPNSIRVSFKDNWAIAHMTGVLSKVESFYLNDKRNESMLHYTRTEKIKQMYKEIDVNEMESLVGAKFVKLFTDIDLNDDEVISIFVFDKSIE >CP014064.2|AMG43235.1|2121002_2122028_+|formate-dehydrogenase MKIVALFPEAVEGQENQLLNTKKAIGLKTFLEERGHEFIILADNGEDLDKHLPDMDVIISAPFYPAYMTRERIEKAPNLKLAITAGVGSDHVDLAAASEHNIGVVEVTGSNTVSVAEHAVMDLLILLRNYEEGHRQSVEGEWNLSQVGNHAHELQHKTIGIFGFGRIGQLVAERLAPFNVTLQHYDPINQQDHKLSKFVSFDELVSSSDAITIHAPLTPETDNLFDKDVLSRMKKHSYLVNTARGKIVNRDALVEALASEHLQGYAGDVWYPQPAPADHPWRTMPRNAMTVHYSGMTLEAQKRIEDGVKDILERFFNHEPFQDKDIIVASGRIASKSYTAK >CP014064.2|AMG42576.1|2122413_2123664_+|MFS-transporter MKRLSTTLKVRLISNFLQLIITTAFIPFIALYLTDMLSQSIVGIYLVGLVVLKFPLSIISGYLIEIFPKKLLVLIYQATMVIMLVFMGVFGSHQLWQIIGFCVAYAIFTIVWGLQFPVMDTLIMDAITEDVEHYIYKISYWMTNLSVAIGALLGGLMYGYSMLLLFLIAACIFLIVLFILYIWLPQDRNQVKQSDDKRHASRYQKLQIMNIFRSYKLVLKDRNYMLLISGFSIIMMGEFSISSYIAIRLKDQFETISIGSYDITGAKMLAILLMINTVVVILLTYSISKVVLKIDFKKALITGLLIYIVGYSGLTYLNQFGLLVVFMIIATVGEIIYSPIVSEQRFKIIPKAKRGTYSAVNALGIHFSETLARLGIVLGVFLTSLQMGLYMFIVLTIGASMLVAGVFGGQKQVNTN >CP014064.2|AMG43236.1|2124110_2131286_+|non-ribosomal-peptide-synthetase MIMGNLRFQQEYFRIYKNNTESTTHRNAYWVKLAKNVEATKMMYALSTIVQQHASIRHFFDVTTDDNLTMILHEFLPFIEIKQVPSSSANYDLEAFFKQELSTYHFNDSPLFKVKLFQFADAAYILLDFHVSIFDDSQIDIFLDDLCNAYRGNTVINNTRQHAHINRNDDKDNQDASHIALDSNYFRLENNSDIHIDSYFPIKHPFEQALYQTYLIDDMTSIDMASLAVSVYLANHIMSQQHDVTLGIHVPSHLPNDLHGNIVPLTLTIDAKDVCQRFTTDFNKCVLQNMSQLQCAKSSLSLETIFHCYHHMMSCCNDVIEDVHQIHDAHTSLADIEIFPHQHGFKIIYNSAAYDLLSIETLSDLVRNIYLQITEENGNKRTTVDELNLMTERDIQLYDDINLSLPEIDDAQTVVTLFEQQVEATPNHVAVQFDGVFITYQTLNARANDLAHRLRNQYGVEPNDRVAVIAEKSIEMIIAMIGVLKAGGAYVPIDPNYPSDRQEYILKDATPKVVITYQALYENGKQNINHIDLNKIAWKNIDNLSKCNTLEDHAYVIYTSGTTGNPKGTLIPHRGIVRLVHRNHYVPLNEETTILLSGTIAFDAATFEIYGALLNGGKLIVAKKEQLLNPIAVEQLINENDVNTMWLTSSLFNQIASERIEVLVPLKYLLIGGEVLNAKWVDLLNQKPKHPQIINGYGPTENTTFTTTYNIPNKVPNRIPIGKPILGTHVYIMQGERRCGVGIPGELCTSGFGLAAGYLNQPELTADKFIKDSNINQLMYRSGDIVRLLPDGNIDYLYRKDKQVKIRGFRIELSEVEHALERIQGINKAVVIVQNHDQDQYIVAYYEAMHTLSHNKIKSQLRMTLPEYMIPVNFMHIEQIPITINGKLDKKALPIMDYVDTDAYVAPSTDTEHLLCQIFADILHVNQVGIHDNFFELGGHSLKATLVVNRIEASTGKRLQIGDLLQKPTVFELAQAIAKVQEQNYEVIPEAIVKDDYVLSSAQKRMYLLWKSNHKDTVYNVPFLWRLSSGLNVAQLQQAVQHLIARHEILRTQYIVVDDEVRQRIVADVVADFEEVNTHFTDEQEIMRQFVAPFNLEKPSQIRVRYIRSPLHAYLFIDTHHIINDGMSNIQLMNDLNALYQHKLLLPLKLQYKDYSEWMSHRDMTKHRQYWLSQFKDEVPILSLPTDYVRPNIKTTNGAMMSFTMNQQMRQLLQKYVEKHQITDFMFFMSVVMTLLSRYARKDDVVVGSVMSARMHKGTEQMLGMFANTLVYRGQPSPDKMWTQFLQEVKEMSLEAYEHQEYPFECLVNDLDQSHDASRNPLFDVMLVLQNNETNHAHFGHSKLTHIQPKSVTAKFDLSFIIEEDRDDYTINIEYNTDLYHSETVRHMGNQCMIMIDYILKHQDTLQICDIPNGTEELLNWVNTHVNDRMLNVPGNKSIISYFNEVVSRQGNHVALVMNDLTMTYETLRNYVDAIAHMLLSNGVGNGQRVALFTERSFEMIAAMLATVKVGASYIPIDIDFPNKRQGAILEDAKVTAVMSYGVEIETTLPVIQLENAKGFVESKENEQYDDLHGNQLENTAMLDNEMYAIYTSGTTGMPKGVAIRQRNLLNLVHAWSTELQLGDNEVFLQHANIVFDASVMEIYCCLLNGHTLVIPDREERVNPEQLQQLINKHRVTVASIPLQMCSIMEDFYIEKLITGGATSTASFVKYIEKHCGTYFNAYGPSESTVITSYWSHHCGDLIPETIPIGKPLSNIQVYIMSDGLLCGIGMPGELCIAGDSLAIGYINRPELMADKWQNNPFGKGKLYHSGDLARYTSDGQIEFLGRIDKQVKVNGYRIELDEIENVILAIRGISDCVVTVSHFDTHDILNAYYVGEQQVEQDLKQYLNDQLPKYMIPKTITHIDCMPLTTNDKVDTTRLPNPSPIQQSNKVYSEPSNEIEQTFVDVFGEVLKQNDVGVDDDFFELGGNSLEAMLVVSHLKRFGHHISMQTLYQYKTVRQIVNYMYQNQQSLVALPDNLSELQKIVMSRYNLGILEDSLSHRPLGNTLLTGATGFLGAYLIEALQGYSHRIYCFIRADNEEIAWYKLMTNLNDYFSEETVEMMLSNIEVIVGDFECMDDVVLPENMDTIIHAGARTDHFGDDDEFEKVNVQGTVDVIRLAQQHHARLIYVSTISVGTYFDIDTEDVTFSEADVYKGQLLTSPYTRSKFYSELKVLEAVNNGLDGRIVRVGNLTSPYNGRWHMRNIKTNRFSMVMNDLLQLDCIGVSMAEMPVDFSFVDTTARQIVALAQVNTPQIIYHVLSPNKMPVKSLLECVKRKEIELVSDESFNEILQKQDMYETIGLTSVDREQQLAMIDTTLTLKIMNHISEKWPTITNNWLYHWAQYIKTIFNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014064_6 | 2353103-2353204 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP014064_6
|
1 spacers
spacers of CP014064_6
>6.1|2353126|56|CP014064|CRISPRCasFinder AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP014064_6
The CRISPR arrays of CP014064_6 >merge|CP014064|6|2353103-2353204|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGTATTAAATTTG >CP014064|6|6|2353103-2353204|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTG AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT ATATGAATTGAGTATTAAATTTG
>CP014064.2|AVC42081.1|2352636_2352894_-|hypothetical-protein MLVNDESHKGTLIFTFTTNAFFLKQKYLFTVAFELPPAHTNPQKMLILIRQNFLQRVCSKRLFKVDHLLSFYSINMRLAIFIKPS >CP014064.2|AMG42786.1|2352327_2352426_+|hypothetical-protein MQLNVNMMKFDRWHKGICKQIVLNLVEKGEKG >CP014064.2|AMG42785.1|2350854_2352243_-|L-cystine-transporter MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLVYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFESNDNAALTSH >CP014064.2|AMG42784.1|2350019_2350775_+|NADPH-dependent-oxidoreductase MSDYVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >CP014064.2|AMG42783.1|2348958_2349528_-|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >CP014064.2|AMG42782.1|2347419_2348943_-|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDEKSKELKELLTEISDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKNLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMSTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLKDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >CP014064.2|AMG42780.1|2346349_2346976_-|NDxxF-motif-lipoprotein MKKRLLLSTFLASALILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >CP014064.2|AMG42779.1|2345696_2346080_-|hypothetical-protein MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIILMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFISAIITLAIGGKSVDKNDSH >CP014064.2|AMG42778.1|2345049_2345631_+|histidine-phosphatase-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSREEAVDLKVENCKPYIIE >CP014064.2|AMG42777.1|2344662_2344872_-|hypothetical-protein MTTQSFIFMNIILLDGATQRHPFFICQILAFLFPKFPHINLLLFYPILSTFSNIIIHIDHFHANKKDDN >CP014064.2|AMG42787.1|2353220_2354177_-|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKVLAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNENAAETSNKEATVDADAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >CP014064.2|AMG42788.1|2354294_2354957_-|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >CP014064.2|AMG42789.1|2355099_2355507_-|hypothetical-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHKEVQEHNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >CP014064.2|AMG42790.1|2356019_2356598_+|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >CP014064.2|AMG42791.1|2356597_2357866_+|purine-permease MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILVLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >CP014064.2|AMG42792.1|2357903_2359370_+|IMP-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >CP014064.2|AMG42793.1|2359394_2360936_+|GMP-synthase-(glutamine-hydrolyzing) MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >CP014064.2|AMG42794.1|2361048_2361585_-|hypothetical-protein MHNKNEFNKKLKDFIGSDKRMALVKGYINEYKLTTVLRALNNSDYTKGTIHTRSIGNLKQIVDNRIIPKNITQNKIFKLSNLTLEVNLYERNTIYHGDFAIYYPVESALIIETDTPRLINHINNNPVQKIFIITTNDWSFNTLELEKIVDETIIYDLKQEDPKQYEILYKNKHGKLPY >CP014064.2|AMG42795.1|2361976_2362681_-|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin MSKNINQANSKLNTSNKKLKQAYSKSDSKNMKVIYMPHWLEFYSIAIHSDVTSNKKRYYKSFSRGTVVYVKLGSNIGSEFSGNHFCVILDNKDNKGKETVTIVPLSSKGNKNYLKLNESVLNLTATDLKKQIIDISSKVQALTQKYRDIDIKLSTEDKKLLSNLNQKANELYRVIGVYSKHKGKDTYVNISAITTISKRRISKINDSDPTGTIIISEDDMNEIEKQLKIKFFSN >CP014064.2|AMG42796.1|2363079_2363352_-|hypothetical-protein MTKERRTFSSEFKLQMVRLYKNGKLKNEIIRKYDLKPSIISNSIKQHQNTGPFNHQDNLKSDEKELIKLRKEVQHLKMEHDVLKQILKLI |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014064_7 | 2767580-2767658 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP014064_7
|
1 spacers
spacers of CP014064_7
>7.1|2767604|31|CP014064|CRISPRCasFinder CTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTATTGCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP014064_7
The CRISPR arrays of CP014064_7 >merge|CP014064|7|2767580-2767658|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT >CP014064|7|7|2767580-2767658|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT CTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTATTGCC TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT
>CP014064.2|AMG43163.1|2764406_2767253_+|excinuclease-ABC-subunit-A MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIDVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGIDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >CP014064.2|AMG43162.1|2762413_2764399_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVDGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >CP014064.2|AMG43161.1|2761908_2762145_+|DUF2198-domain-containing-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >CP014064.2|AMG43160.1|2761261_2761912_+|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >CP014064.2|AMG43159.1|2760248_2761088_+|peptidase-M23 MKKTLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >CP014064.2|AMG43246.2|2759993_2760101_+|hypothetical-protein MCLLKQHMQCAFSNITYGDFQGIELIVENVLNYMV >CP014064.2|AMG43158.2|2758729_2759840_+|peptide-chain-release-factor-2 MELSEIKRNIDKYNQDLTQIRGSLDLENKETNIQEYEEMMAEPNFWDNQTKAQDIIDKNNALKAIVNGYKTLQAEVDDMDATWDLLQEEFDEEMKEDLEQEVINFKAKVDEYELQLLLDGPHDANNAILELHPGAGGTESQDWANMLFRMYQRYCEKKGFKVETVDYLPGDEAGIKSVTLLIKGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFASCDVIPDFNNDEIEIEINPDDITVDTFRASGAGGQHINKTESAIRITHHPSGIVVNNQNERSQIKNREAAMKMLKSKLYQLKLEEQAREMAEIRGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNEETGKVDAVMDGDIGPFIESYLRQTMSHD >CP014064.2|AMG43157.1|2758463_2758568_+|hypothetical-protein MLWEESFYFTSVKYFKKCEEVVKRCYVLSFKKSV >CP014064.2|AMG43156.1|2755890_2758422_+|preprotein-translocase-subunit-SecA MGFLSKILDGNNKEIKQLGKLADKVIALEEKTAILTDEEIRNKTKQFQTELADIDNVKKQNDYLDKILPEAYALVREGSKRVFNMTPYKVQIMGGIAIHKGDIAEMRTGEGKTLTATMPTYLNALAGRGVHVITVNEYLSSVQSEEMAELYNFLGLTVGLNLNSKTTEEKREAYAQDITYSTNNELGFDYLRDNMVNYSEDRVMRPLHFAIIDEVDSILIDEARTPLIISGEAEKSTSLYTQANVFAKMLKQDEDYKYDEKTKAVHLTEQGADKAERMFKVENLYDVQNVDVISHINTALRAHVTLQRDVDYMVVDGEVLIVDQFTGRTMPGRRFSEGLHQAIEAKEGVQIQNESKTMASITFQNYFRMYNKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYNMTVTQIPTNKPVQRNDKSDLIYISQKGKFDAVVEDVVEKHKAGQPVLLGTVAVETSEYISNLLKKRGIRHDVLNAKNHEREAEIVAGAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVEELGGLAVIGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDKGDSRFYLSLQDELMIRFGSERLQKMMSRLGLDDSTPIESKMVSRAVESAQKRVEGNNFDARKRILEYDEVLRKQREIIYNERNSIIDEEDSSQVVDAMLRSTLQRSINYYINTADDEPEYQPFIDYINDIFLQEGDITEDDIKGKDAEDIFEVVWAKIEAAYQSQKDILEEQMNEFERMILLRSIDSHWTDHIDTMDQLRQGIHLRSYAQQNPLRDYQNEGHELFDIMMQNIEEDTCKFILKSVVQVEDNIEREKTTEFGEAKHVSAEDGKEKVKPKPIVKGDQVGRNDDCPCGSGKKFKNCHGK >CP014064.2|AMG43155.1|2754904_2755477_+|ribosomal-subunit-interface-protein MIRFEIHGDNLTITDAIRNYIEEKIGKLERYFNDVPNAVAHVKVKTYSNSATKIEVTIPLKNVTLRAEERNDDLYAGIDLINNKLERQVRKYKTRINRKSRDRGDQEVFVAELQEMQETQVDNDAYDDNEIEIIRSKEFSLKPMDSEEAVLQMNLLGHDFFVFTDRETDGTSIVYRRKDGKYGLIQTSEQ >CP014064.2|AMG43164.1|2767916_2768849_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >CP014064.2|AMG43165.1|2768854_2769694_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >CP014064.2|AMG43166.1|2769701_2770187_+|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >CP014064.2|AMG43167.1|2770194_2771634_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >CP014064.2|AMG43168.1|2771700_2772636_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >CP014064.2|AMG43169.2|2772982_2773171_-|hypothetical-protein MGPNTEKLDFQFLQTMQVGVWAPTKRISKRNSTGNASWGVGPNTEAYDKSAYDNVQVGVVQR >CP014064.2|AMG43170.1|2773521_2774433_+|RNase-adaptor-protein-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >CP014064.2|AMG43171.1|2774429_2775425_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >CP014064.2|AMG43172.1|2775535_2776480_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >CP014064.2|AMG43173.1|2777043_2777631_+|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014064_8 | 2773035-2773304 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP014064_8
|
4 spacers
spacers of CP014064_8
>8.1|2773071|22|CP014064|CRT CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA >8.2|2773129|23|CP014064|CRT TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT >8.3|2773188|22|CP014064|CRT CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA >8.4|2773246|23|CP014064|CRT TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP014064_8
The CRISPR arrays of CP014064_8 >merge|CP014064|8|2773035-2773304|CRT GCTTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGAAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGAAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCCTGACTAGAGTTGAAAAA >CP014064|8|1|2773035-2773304|CRT GCTTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTG CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA TTCTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTG TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT TTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTG CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA TTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTG TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT TTCTCTGTGTTGGGGCCCCTGACTAGAGTTGAAAAA
>CP014064.2|AMG43168.1|2771700_2772636_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >CP014064.2|AMG43167.1|2770194_2771634_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >CP014064.2|AMG43166.1|2769701_2770187_+|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >CP014064.2|AMG43165.1|2768854_2769694_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >CP014064.2|AMG43164.1|2767916_2768849_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >CP014064.2|AMG43163.1|2764406_2767253_+|excinuclease-ABC-subunit-A MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIDVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGIDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >CP014064.2|AMG43162.1|2762413_2764399_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVDGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >CP014064.2|AMG43161.1|2761908_2762145_+|DUF2198-domain-containing-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >CP014064.2|AMG43160.1|2761261_2761912_+|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >CP014064.2|AMG43159.1|2760248_2761088_+|peptidase-M23 MKKTLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >CP014064.2|AMG43170.1|2773521_2774433_+|RNase-adaptor-protein-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >CP014064.2|AMG43171.1|2774429_2775425_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >CP014064.2|AMG43172.1|2775535_2776480_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >CP014064.2|AMG43173.1|2777043_2777631_+|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >CP014064.2|AMG43174.1|2777873_2778776_-|epimerase MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGMILSNEGGALQTMKLPYKYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE >CP014064.2|AMG43175.1|2779478_2780108_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDNASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >CP014064.2|AMG43176.1|2780920_2781934_+|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >CP014064.2|AMG43177.1|2781986_2782997_+|aldehyde-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >CP014064.2|AMG43178.1|2783135_2784326_+|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >CP014064.2|AMG43179.1|2784447_2785209_+|triose-phosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014064_2 | 2.1|1248253|34|CP014064|CRISPRCasFinder | 1248253-1248286 | 34 | CP014064.2 | 2767579-2767612 | 0 | 1.0 |
CP014064_5 | 5.1|2115370|33|CP014064|CRISPRCasFinder | 2115370-2115402 | 33 | CP014064.2 | 550737-550769 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.1|2773071|22|CP014064|CRT | 2773071-2773092 | 22 | CP014064.2 | 31337-31358 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.1|2773071|22|CP014064|CRT | 2773071-2773092 | 22 | CP014064.2 | 550640-550661 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.1|2773071|22|CP014064|CRT | 2773071-2773092 | 22 | CP014064.2 | 639191-639212 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.1|2773071|22|CP014064|CRT | 2773071-2773092 | 22 | CP014064.2 | 820721-820742 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.1|2773071|22|CP014064|CRT | 2773071-2773092 | 22 | CP014064.2 | 835255-835276 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.1|2773071|22|CP014064|CRT | 2773071-2773092 | 22 | CP014064.2 | 1147067-1147088 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.1|2773071|22|CP014064|CRT | 2773071-2773092 | 22 | CP014064.2 | 2115331-2115352 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.1|2773071|22|CP014064|CRT | 2773071-2773092 | 22 | CP014064.2 | 2238467-2238488 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.1|2773071|22|CP014064|CRT | 2773071-2773092 | 22 | CP014064.2 | 2238577-2238598 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.1|2773071|22|CP014064|CRT | 2773071-2773092 | 22 | CP014064.2 | 2601099-2601120 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.1|2773071|22|CP014064|CRT | 2773071-2773092 | 22 | CP014064.2 | 2725625-2725646 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.3|2773188|22|CP014064|CRT | 2773188-2773209 | 22 | CP014064.2 | 31337-31358 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.3|2773188|22|CP014064|CRT | 2773188-2773209 | 22 | CP014064.2 | 550640-550661 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.3|2773188|22|CP014064|CRT | 2773188-2773209 | 22 | CP014064.2 | 639191-639212 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.3|2773188|22|CP014064|CRT | 2773188-2773209 | 22 | CP014064.2 | 820721-820742 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.3|2773188|22|CP014064|CRT | 2773188-2773209 | 22 | CP014064.2 | 835255-835276 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.3|2773188|22|CP014064|CRT | 2773188-2773209 | 22 | CP014064.2 | 1147067-1147088 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.3|2773188|22|CP014064|CRT | 2773188-2773209 | 22 | CP014064.2 | 2115331-2115352 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.3|2773188|22|CP014064|CRT | 2773188-2773209 | 22 | CP014064.2 | 2238467-2238488 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.3|2773188|22|CP014064|CRT | 2773188-2773209 | 22 | CP014064.2 | 2238577-2238598 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.3|2773188|22|CP014064|CRT | 2773188-2773209 | 22 | CP014064.2 | 2601099-2601120 | 0 | 1.0 |
CP014064_8 | 8.3|2773188|22|CP014064|CRT | 2773188-2773209 | 22 | CP014064.2 | 2725625-2725646 | 0 | 1.0 |
CP014064_1 | 1.1|31288|34|CP014064|CRISPRCasFinder | 31288-31321 | 34 | CP014064.2 | 550736-550769 | 1 | 0.971 |
CP014064_2 | 2.1|1248253|34|CP014064|CRISPRCasFinder | 1248253-1248286 | 34 | CP014064.2 | 337307-337340 | 1 | 0.971 |
CP014064_2 | 2.1|1248253|34|CP014064|CRISPRCasFinder | 1248253-1248286 | 34 | CP014064.2 | 940610-940643 | 1 | 0.971 |
CP014064_4 | 4.1|1498870|31|CP014064|CRISPRCasFinder | 1498870-1498900 | 31 | CP014064.2 | 2780323-2780353 | 1 | 0.968 |
CP014064_4 | 4.1|1498870|31|CP014064|CRISPRCasFinder | 1498870-1498900 | 31 | CP014064.2 | 2780379-2780409 | 1 | 0.968 |
CP014064_7 | 7.1|2767604|31|CP014064|CRISPRCasFinder | 2767604-2767634 | 31 | CP014064.2 | 2238542-2238572 | 1 | 0.968 |
CP014064_8 | 8.1|2773071|22|CP014064|CRT | 2773071-2773092 | 22 | CP014064.2 | 144827-144848 | 1 | 0.955 |
CP014064_8 | 8.1|2773071|22|CP014064|CRT | 2773071-2773092 | 22 | CP014064.2 | 854982-855003 | 1 | 0.955 |
CP014064_8 | 8.2|2773129|23|CP014064|CRT | 2773129-2773151 | 23 | CP014064.2 | 550756-550778 | 1 | 0.957 |
CP014064_8 | 8.2|2773129|23|CP014064|CRT | 2773129-2773151 | 23 | CP014064.2 | 1147125-1147147 | 1 | 0.957 |
CP014064_8 | 8.2|2773129|23|CP014064|CRT | 2773129-2773151 | 23 | CP014064.2 | 1486496-1486518 | 1 | 0.957 |
CP014064_8 | 8.2|2773129|23|CP014064|CRT | 2773129-2773151 | 23 | CP014064.2 | 2726575-2726597 | 1 | 0.957 |
CP014064_8 | 8.2|2773129|23|CP014064|CRT | 2773129-2773151 | 23 | CP014064.2 | 2726909-2726931 | 1 | 0.957 |
CP014064_8 | 8.3|2773188|22|CP014064|CRT | 2773188-2773209 | 22 | CP014064.2 | 144827-144848 | 1 | 0.955 |
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57. spacer 4.1|1498870|31|CP014064|CRISPRCasFinder matches to position: 2314365-2314395, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **********************..*******
58. spacer 4.1|1498870|31|CP014064|CRISPRCasFinder matches to position: 2601154-2601184, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **********************..*******
59. spacer 4.1|1498870|31|CP014064|CRISPRCasFinder matches to position: 2780435-2780465, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgactttccgccagct Protospacer ***********************.*.*****
60. spacer 5.1|2115370|33|CP014064|CRISPRCasFinder matches to position: 639083-639115, mismatch: 2, identity: 0.939
tgggccccaacaaagagaaattggattcccaat CRISPR spacer tggaccccaacaaagagaaattgtattcccaat Protospacer ***.******************* *********
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ctgtgttggggccccgccaacttgtattgcc CRISPR spacer ctgtgttggggccccgccaacttgcattacc Protospacer ************************.***.**
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tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgtagaaattgggaatacaat Protospacer **************.*** ****
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tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.********
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tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgtagaaattgggaatacaat Protospacer **************.*** ****
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tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014064_8 | 8.2|2773129|23|CP014064|CRT | 2773129-2773151 | 23 | AP014226 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 28490-28512 | 3 | 0.87 |
CP014064_8 | 8.2|2773129|23|CP014064|CRT | 2773129-2773151 | 23 | AP014225 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 24653-24675 | 3 | 0.87 |
CP014064_8 | 8.4|2773246|23|CP014064|CRT | 2773246-2773268 | 23 | AP014226 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 28490-28512 | 3 | 0.87 |
CP014064_8 | 8.4|2773246|23|CP014064|CRT | 2773246-2773268 | 23 | AP014225 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 24653-24675 | 3 | 0.87 |
1. spacer 8.2|2773129|23|CP014064|CRT matches to AP014226 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
2. spacer 8.2|2773129|23|CP014064|CRT matches to AP014225 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
3. spacer 8.4|2773246|23|CP014064|CRT matches to AP014226 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
4. spacer 8.4|2773246|23|CP014064|CRT matches to AP014225 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
119 : 7864
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP014064|119:7864|DBSCAN-SWA AATGCAAGGTATCGCAGAAAAAGAGACGTATCATTTACCCACCGAACACCTGCAAGTTTTCAATGTGATAAAAAATACGTCCAATAAGTATATTACTAAAACTAAAATCTTAAATCAATTAGGATATGAATATAATTCAAGCAATGAACGATGGTTAAGAAAAGTAATCAATTCATTAGTATATGATTATGGCTATCCTATCGGATGTAGTTATAAACCTAGTGAACGTGGTTACTACATTATTACGACAGAACAAGAAAAGCAACAAGCGATGATAAGTATTAAAAAGCTAGCTGATGGCAGTATGAAACGCTATGAAGCTTTGAAACGAATTGAAGTGTAAAGGGGATAAAAATGAAAACTGAATCGTACTTTAAAGAATACAACCAATTTGTATTAGATCAACGCAAGGCTATACAAGAATTGGAACAAGAGCGTAATGCATTGGAAAGTAAAATAAAGTTAGATAAGTCCACATACAAACAGTTAATCATGGATGGACAAGATGACAAGGCAGATAACCTATATCAAGCAACAGATGCTGATGAAAAGAAACTAAAAGCACTTAATAAACGCTTAGAGACAAAGAAAAGTGTATCGAAAGAAGTTAAATATCAAAAGACAATTGAGTTATTAAAACATCAAAGCGAGTTGTCATCATTATATGAATCAGAAAAACAATCAGCTTTAGGTAAATTAAAAAAGGTAGTCGATGCATATAATGAGATCATTGATGAAATAGAAGATATTAATGATAGATATGAAGATGAGCATCAGCAATATGCGAGTATTTATAGTCAAGAACAATTATATGATGATAAAGAGGCTAGGGAAGCATTGAATGGCTACTTTAGAGAAAATATATTTACATCATATATTAATGGTAATGATTTGCCATACGAACACAATAACAAGTTGTTTTTAAAACGTTAAAAAGAAAGGGTAATTAAATGGAAACAAAATACGAGTTAAATAATACTAAAAAGGTCGCAAATGCATTTGGTTTAAATGAAGAAGATACAAATCTATTAATAAATGCAGTTGATTTGGATATTAAAAACAATATGCAGGAGATTTCAAGTGAGTTACAACAATCAGAACAGTCTAAGCAAAAGCAATATGGTACAACGCTACAAAATTTAGCTAAGCAAAACAGGATTATTAAATAGCAATGATTGCCTATCCAATTCGGGTAGGCTCTGTTTATAGGGGTGAATAAATGAAACTGCTTAAAACGAAGAATTGTTTATATTATCGTAATGGTGACAATAAATTATCTGATTATCAACTATTAACGCAATTTAACCCAGCATTTATTAATAAGAAAATTAAGATGTGTGAATTCCAAATTGAAAGTATGTACCATATGAGTGCATCGACAACAACATGTGATGAAATAATGGGGGTCGTGTCTGTCTCATATCCAATTGAAAAACTAGTTATCAAAATTATTGAAACAAAGGCAAGATTACAAAACTATAAAAATCGATCTATAAGTAATATGGTGTTGTTGAAAACGGTACTAAATCATTATACAGAAAGAGAGCAGAAGCAAGTTGTAAAATATATGCGTTCAAATGGACGATATAAGCCCTACAACGTCATTGAACGCTTACAGGGTGATTTGTATCAAGCAAGTATTAAACAACGTTCAGAACGTCAAAAACAAAGAAATATAGCAATTGAAAATAGCAAGATTGCACGAGTAAATGCTTATCACCAATCTTCACATGTAAAAGTGGTGTAACAATGGATAAACAGCAAATAAAAGGCTTCGTTTGTGATTATCATGAGCGAACTAGAAGTGATGTATTAATAGATGATGATATAAATACTGATGAATTCTTTTCAATAGGTGATGAAAATTCTAATGAATGGATGACAGACGATAACATTGATGATCATATTGTAAAGAATCACTTAGAAATGATTGTTGACCGAGTAGCTAATGATAAAGAGTTTTATATTTTCGATTCTTTGATACAAGGACGTAGTTTTAAAGATATTAGCAATGTCTTAGAGTGTTCAGAACAATCTGTAAGATTATGGTATGAAACTTTATTAGATAAAATTGTGGAGGTGATAGAATGAGTGATTTAACAGCAAAACAAGCGCGTTTTGTGAATGAATACATTAGAACACTTAATGTGACACAAAGTGCCATAAAAGCAGGCTATAGCGCAAATAGCGCACATGTGACAGGGTGTAGATTATTAAAGAAGCCACACATCAAGCAATATATACAAGAACAAAAAGATAAGATTATAGATGAGAATGTATTAACTGCAAAAGAGTTACTACATGTGCTTACAAATGCGGCAGTCGGTGATGAAACAGAAACGAAAGAAGTTGTAGTAAAGCGTGGAGAATATAAAGAGAATCCACAAAGTGGCAAAGTACAGTTAGTCTATAACGAACATGTTGAACTGGTAGAGTTGCCAATTAAGCCAAGTGATCGTTTAAAAGCTCGTGATATGTTGGGTAAGTACCATAAGTTATTTACAGATAAGCATGATATTAACGGCAATGTGCCTATATTCATTAACATTGGTGAATGGGACGGAGACGATGAGGAGTTAGATAAGGCAGTGAAAGATGTATCTAACAATAATCCTAATCATACTGTGATTGTGGATGATATACCGTTAGAGGATTGAGGAGATTGAAACATCGTTTAATTGTGATCATAACATTTAAAAAGCTGTTAAAATTAGTACTAGGTACTAAAATGTAGTATAATGATATTGTGTAGTTGCAACTAATGTCATTCCCCGATATTAGTTGCCTTTTTCATATATAATCTTTTTATTTTGTAAATTTAAATATATAATGTATAAAACTACACATGAAAGAGGTAACGGGGAAATGTCATACAGTAACGAATTTAATAATTTAATTAAAAAAGTAAACGAGTATTCGCTTGATGATGTTGAAAAAAACTCACAATTATATTTTGTTAAGAAAATATTCACTAAGGATAAAGATAATAATAAAAAAAGAAGTTGGTTAGCTATGAATGTAGTTGCAACTAACATTATAAGGAAAATTCATAAAATAGTAGATACTGCAGTTCAAGATAGCGTAATATATAAATCAAATGGAGAAGATGTGAAAAAAAGTGTGAAAAAATACACGCCAACTTCAAATAATAATGAAGAAATTTTAGTTACAGACTATAATTATTTGAATGACCAACCTGAAGAATTTATAAAAAAATTACTTCATAAAGAAAGCGAAAAAATGTTAACTGAAGAAATGCAATTTTTTACTTATTCACTAAATATCGATAATCAAACTGCCTATTTTATAGGTAAAGTAGAGAAACTAAATGCTATAAAAAATGGTTTGATTGCAAAATTTACAGAGGATGGACTTAAATTAGGGAAAAATGATCAATTTGGTATAAAAGACCATGTTGGTGTAATATTGTATGATAAAAAAAATATATCCTTAAAAAATATATTTTTGAAGTACTTTTTGATTTGGAAGAAAAGTTTTTAAAGGAAACAAAAAAACATATTAATAACATTTCTAATTCAAAACACTTTATAGGTTTAGATGTATATTTAGAATCAATAAAAAATAATAGAAATATAACAAGGAAAATAAGTAAAGCAGTTGAAAAATTTAACGAAAATGGTATTGATTATAGTAATATTAATTCAGATAATTTTAAAAGTAAAATTGATATCATAAATCAACATGGTGAAGATTTTAAATTAAACAAGAATAATCAGTTAGAGATAGAAAAAGATACAGATATCGATAGTATTACTAGGTTAATTACTGATGACTATTATTTTACGGTTCTTACAGACAGTTTTGGTTATAATGAATAGGAAGTGATTAAAGCAGTGTTTTATATTAAGCAATTATTTGTGTTTCTTAGTTCTTATCTGCCTCTATTTTTTATTTTATTTGTATCAAATATTAATTATAAGTGTAAAGAGAAATTAGGAACTGGTTTAGAATTTAAATCGATGATTAGCTTACTTATAATAATAATAACGATAATATTAATTAGTTTTTTATATTTAATTTGTAAGAAAAAGAAAGCTATTAAATTTAGTGATGATTCTAAATTTAAAGAAACAGAATATAATTTTTTAAATTATTTCGCTACTTTTTTAATTCCACTATCGACTTTTAAACCTGATGAGTTAGATTCTGTAATTTTAAACATATCAATGCTATTGTTTTTATTTATTTTTTATATGCAAACACAATCCTATTTTTATAATATATTTTCCATGTCATTTAATAGAAGTATATTTAAAGATCAAAGTGGAAATTTTGTAATAACCGACTATGATTTACAAGAATTACAAAGTAAAATAATAGAAAATTATGAGTTTAAATATATTAATATCAATAAAAAGGTACACATTATCTTAAAAAAGCACCAAAAAAATTAAATTATTTTTTGTTTTTTTGATAGAAAAGTTGATATTATAATAAAATATTTTCAATGACTAATTATTATATAGTATAAGCGTTAATACTAAACTGGTTTAACGCTTATTTTTATGTACAAAATTAGTATTAAGTACTAAAATACGCTGAGAAACGGCCTGTGTTGCAGTGACCGATGAGCGTGTATATAGAAATAGATAAAGTATAGATTTAGATTTAGAAATTATAAATTAATATTTGAGATACTGCCTCTTTAAAAAAGACAAGTTACATTAAAAAAGTAACCTGTCTTTAACCATGATTAGTTTATCGTGATTTTATCTATATCCTTTTTAAATAACATCAATTGTTTATGATCATTATAGTCATCACCAACTTTAGCTGAAATTGGGGGATCATTTTTATCTTTACTATGGATAGTTACTGTGTCACCGTTTTTAACGATTTGTTTCTCTTTTAATTTGTCAGTTAATTTTTTCCATGCATCATTTGCGTCAAACCTATTTCCGTTTGGATTTATTCTTGACAAATCAATTCTTTTAACACTATCGGTATTAATCGGTTTGTTATTAAAATTACTAAGTTCATCTAAATCAGCTGTACCCGTAATACTACTTTCGCCACCATTATTTAAACTGTACGTAACACCGACTGTCTCATTTGCTGTTTTATCGATAATATTTGCTTCTTTCAAAGCATCTCTTACATTTTTCCATAAGTCTCTATCAGTTGTTTCAGCAGCTTTTACAACGTTATTAATACCATTATAATTTGAAGAAGAATGAAAACCTGAACCTACTGTTGTTAAAACTAAAGCACTTGCTATCAATGTTTTTGTTAATAGTTTTTTATTCATTTTAATTTCTCCTAAAATTTATTCTGTAATCGATTACAAAACAAATTTACAATTATTATTCATGTAAATCAATTAACTAATTATTAACAAACTATAAAAATTTATTATTAAAATACATTTGTTTTTAATCTAGAAATATTAGTTGTTTATGCTATAATCATTTTAGGCACAGCAATGTGTTCAAATTTTTATCTATTCGTAAGTTAGCCTTCGGGCTAACTTTTTATTTCCATTATTATTCACATGTTAATCTTGTTGTTATTTAGGCAGGTACTTCGGTACTTGCCTATTATTATATCTCTATACGATAGGAATCGACTATATGACTTACTAAGTTTTATAGCAAATTAGACAATTAACACATAAGGCATTTAATATTGAGTTGTTATAGTAGTTGTATAATATATAGCTAGTTCCTTATAACAGCAAAAAAATAATTTTGACTATAAGATTAAATATAAGAATATAAAATTAACAGTAGAAACCAATTTTAGAATTTGAAAAATTGAATGCATTAATTATAAGAGTGTGAATATATAAACAATGTTATTAATTCAAGATGCTTAGAAATCCTCTGTTTCTCCTTGAGAAAGAGTTTTGTATATAAGTTCAGATGAAGTATAGTTAATTAATTTTCAAAGCATAACTTAATTCTTAGAAATAACGTGAAATCATTAAATATAATTAATTTTCTTTTAATATTTTTTTAATTGAATATTTAAGATTATAACATATATTTAAAGTGTATCTAGATACTTTTTGGGAATGTTGGATGAAGGAGATAAAAATGAATAAGAGTCGATTTATTTCATGCGTAATTTTGATATTCGCACTTATACTAGTTCTTTTTACACCCAACGTATTAGCAGAGAGCCAACCAGACCCTACGCCAGATGAGTTGCACAAATCAAGTGAGTTTACTGGTACGATGGGTAATATGAAATATTTATATGATGATCATTATGTATCAGCAACTAAAGTTAAGTCTGTAGATAAATTTTTGGCACATGATTTAATTTATAACATTAGTGATAAAAAACTAAAAAATTATGACAAAGTGAAAACAGAGTTATTAAATGAAGATTTAGCAAAAAAGTACAAAGATGAAGTAGTTGATGTGTATGGATCAAATTACTATGTAAACTGCTATTTTTCATCCAAAGATAATGTAGGTAAAGTTACAGGTGGTAAAACTTGTATGTATGGAGGAATAACAAAACATGAAGGAAACCACTTTGATAATGGGAACTTACAAAATGTACTTATAAGAGTTTATGAAAATAAAAGAAACACAATTTCTTTTGAAGTGCAAACTGATAAGAAAAGTGTAACAGCTCAAGAACTAGACATAAAAGCTAGGAATTTTTTAATTAATAAAAAAAATTTGTATGAGTTTAACAGTTCACCATATGAAACAGGATATATAAAATTTATTGAAAATAACGGCAATACTTTTTGGTATGATATGATGCCTGCACCAGGCGATAAGTTTGACCAATCTAAATATTTAATGATGTACAACGACAATAAAACGGTTGATTCTAAAAGTGTGAAGATAGAAGTCCACCTTACAACAAAGAATGGATAATGTTAATCCGATTTTGATATAAAAAGTGAAAGTATTAGATATATTTGAAAGGTAAGTACTTCGGTGCTTGCCTTTTTAGGATGCATATATATAGATTAAACCGCACTTCTATATTAATAGAAAGTGCGGTTATTTATACAGTGAATCTAAACTATAATAATTGGAATCATCTTTTTGAAATTTCGACATCTAGATGAAATTGTGTTGAATCAACAGTTTTATTATCTTTGTAAATTTTTAAGAAGCTTTCTGGAAGACCGTATCCTGTGTAAAATAAATCATACGAGAAATTAGAACCATCATTTATATGGAATACTACACTCCCCTTATCAAAACCGCTATAAAATTTTGAAGAAGTGCCGTATTCTTTACCTTTACCAGTATCATTGTGTCCATAAATATTAAATTCATCTTGCAAGTATTTTCTTAGTTTGACATCTATTTCTTGTGCGGTAACCATTTTTTTATCTGTAGAAACACTTTTAGTTGTAACTGTTTGATGCTTGCCATTGATAATTAAATTTATAGGTATTATTCTTGGCGAATCTAATTTATTGTTTTCTGCTTTAGTAACACCACCATATATAGTACGAGAGTTAGAACCATATTTATAGCTTATACCAAAAACATCGACATTTTTTCCCTTTAGATCACTAGTTATATATTCATTGTCAAATTCAGCATACAATGTATCATTTTTATACGAGTATTCTAAGCGGTGTGATTCTGGTGAATTTTTGTCTTTAACATTCTTTAAATTCACATATTCATATTTAGTATAAAAATTTCTTAGGTTTCCTGGACCTACATCGCCGTTAGATAAGACTGTATGATTAGAAGAAAAAATAAATAAAGTAATAACAATTACAAATAATAATCTTTTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP014064|119:7864|1337_1865_+|AMG40532.1|coat|DBSCAN-SWA MKLLKTKNCLYYRNGDNKLSDYQLLTQFNPAFINKKIKMCEFQIESMYHMSASTTTCDEIMGVVSVSYPIEKLVIKIIETKARLQNYKNRSISNMVLLKTVLNHYTEREQKQVVKYMRSNGRYKPYNVIERLQGDLYQASIKQRSERQKQRNIAIENSKIARVNAYHQSSHVKVV >CP014064|119:7864|3972_4533_+|AMG40535.1|DBSCAN-SWA MFYIKQLFVFLSSYLPLFFILFVSNINYKCKEKLGTGLEFKSMISLLIIIITIILISFLYLICKKKKAIKFSDDSKFKETEYNFLNYFATFLIPLSTFKPDELDSVILNISMLLFLFIFYMQTQSYFYNIFSMSFNRSIFKDQSGNFVITDYDLQELQSKIIENYEFKYININKKVHIILKKHQKN >CP014064|119:7864|2205_2775_+|AMG40534.1|terminase|DBSCAN-SWA MSDLTAKQARFVNEYIRTLNVTQSAIKAGYSANSAHVTGCRLLKKPHIKQYIQEQKDKIIDENVLTAKELLHVLTNAAVGDETETKEVVVKRGEYKENPQSGKVQLVYNEHVELVELPIKPSDRLKARDMLGKYHKLFTDKHDINGNVPIFINIGEWDGDDEELDKAVKDVSNNNPNHTVIVDDIPLED >CP014064|119:7864|119_461_+|AMG40529.1|DBSCAN-SWA MQGIAEKETYHLPTEHLQVFNVIKNTSNKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRKVINSLVYDYGYPIGCSYKPSERGYYIITTEQEKQQAMISIKKLADGSMKRYEALKRIEV >CP014064|119:7864|4832_5387_-|AMG40536.1|DBSCAN-SWA MNKKLLTKTLIASALVLTTVGSGFHSSSNYNGINNVVKAAETTDRDLWKNVRDALKEANIIDKTANETVGVTYSLNNGGESSITGTADLDELSNFNNKPINTDSVKRIDLSRINPNGNRFDANDAWKKLTDKLKEKQIVKNGDTVTIHSKDKNDPPISAKVGDDYNDHKQLMLFKKDIDKITIN >CP014064|119:7864|1068_1287_+|AMG40531.1|DBSCAN-SWA METKYELNNTKKVANAFGLNEEDTNLLINAVDLDIKNNMQEISSELQQSEQSKQKQYGTTLQNLAKQNRIIK >CP014064|119:7864|7141_7864_-|AMG40538.1|DBSCAN-SWA MKKRLLFVIVITLFIFSSNHTVLSNGDVGPGNLRNFYTKYEYVNLKNVKDKNSPESHRLEYSYKNDTLYAEFDNEYITSDLKGKNVDVFGISYKYGSNSRTIYGGVTKAENNKLDSPRIIPINLIINGKHQTVTTKSVSTDKKMVTAQEIDVKLRKYLQDEFNIYGHNDTGKGKEYGTSSKFYSGFDKGSVVFHINDGSNFSYDLFYTGYGLPESFLKIYKDNKTVDSTQFHLDVEISKR >CP014064|119:7864|6174_6975_+|AMG40537.1|DBSCAN-SWA MNKSRFISCVILIFALILVLFTPNVLAESQPDPTPDELHKSSEFTGTMGNMKYLYDDHYVSATKVKSVDKFLAHDLIYNISDKKLKNYDKVKTELLNEDLAKKYKDEVVDVYGSNYYVNCYFSSKDNVGKVTGGKTCMYGGITKHEGNHFDNGNLQNVLIRVYENKRNTISFEVQTDKKSVTAQELDIKARNFLINKKNLYEFNSSPYETGYIKFIENNGNTFWYDMMPAPGDKFDQSKYLMMYNDNKTVDSKSVKIEVHLTTKNG >CP014064|119:7864|472_1051_+|AMG40530.1|DBSCAN-SWA MKTESYFKEYNQFVLDQRKAIQELEQERNALESKIKLDKSTYKQLIMDGQDDKADNLYQATDADEKKLKALNKRLETKKSVSKEVKYQKTIELLKHQSELSSLYESEKQSALGKLKKVVDAYNEIIDEIEDINDRYEDEHQQYASIYSQEQLYDDKEAREALNGYFRENIFTSYINGNDLPYEHNNKLFLKR >CP014064|119:7864|1996_2209_+|AVC42096.1|DBSCAN-SWA MTDDNIDDHIVKNHLEMIVDRVANDKEFYIFDSLIQGRSFKDISNVLECSEQSVRLWYETLLDKIVEVIE |
10 | Staphylococcus_phage(75.0%) | terminase,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
39675 : 87408
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP014064|39675:87408|DBSCAN-SWA 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72 | Staphylococcus_phage(72.46%) | head,plate,terminase,capsid,holin,integrase,tail,portal | attL 35924:35940|attR 64676:64692 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
170283 : 223407
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP014064|170283:223407|DBSCAN-SWA 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55 | Streptococcus_phage(28.57%) | holin,bacteriocin,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
241828 : 250301
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP014064|241828:250301|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP014064|241828:250301|243425_244130_+|AMG40799.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >CP014064|241828:250301|241828_242311_+|AMG40797.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTMLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >CP014064|241828:250301|248703_249732_+|AMG40804.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >CP014064|241828:250301|247226_248711_+|AMG40803.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAINDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >CP014064|241828:250301|249734_250301_+|AMG40805.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDCGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >CP014064|241828:250301|245058_247248_+|AMG40802.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGNEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >CP014064|241828:250301|244394_245066_+|AMG40801.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLATEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >CP014064|241828:250301|244129_244393_+|AMG40800.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >CP014064|241828:250301|242297_243422_+|AMG40798.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSGRKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
870256 : 879299
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP014064|870256:879299|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCAACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACGTTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCGATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACGTCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCCTTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTATGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGCCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAATGCATCATGATTGACATCTGTGTCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAAGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAATGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCCGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTCGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAATAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGATCCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTAAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCTGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCATCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAACCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACGCCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCTGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCACTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATCCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCACCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTCGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGCTTCAATAGTCGATTTGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTGCCAGCTCGCGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAATACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP014064|870256:879299|877267_878293_-|AMG41384.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >CP014064|870256:879299|878294_879299_-|AVC42040.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERG >CP014064|870256:879299|870256_870775_-|AMG41379.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >CP014064|870256:879299|870796_873070_-|AMG41380.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDVNHDALQLSDMTKAIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >CP014064|870256:879299|873272_875552_-|AMG41381.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >CP014064|870256:879299|876105_877245_-|AMG41383.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >CP014064|870256:879299|875826_876087_-|AMG41382.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
993327 : 1066360
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP014064|993327:1066360|DBSCAN-SWA 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68 | Staphylococcus_phage(95.74%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1072561 : 1076808
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP014064|1072561:1076808|DBSCAN-SWA CTTAATCTTTATATAAAAATACATCAATATGATAATTAGATGAGCTAACTGTTCTATTATCACTATAAAATTGAAAAAACTCTGCTCCCACTGAACCTTTTACGTTATATAAATCATAATAAAATGATTGATCTTGATGATTATGAGAATGAAAGAAAATGCATCCTTTTTGTATGTTACCGGTATCTTTATTGTATATTTTATATAAATTTTCTAATTTAAATCGAACTTTAGTGTCTAATTCTTGTACTGTTACTTTAGCCTTTTTGGTTTTTATAACAAAACCTTCTTGTTGGACACCATCTTTAAATACATTAACGCCTATAACTTTCTCTTCATCTAATTGATTTCCATCATGTATCGTAACTCCTCCGTATAAGCATGATGTTTTTTCTTCAGTTAAGCCTACACATTTATTTCCAAAATACAGTCCATAAATATCTATATTTTTTCCTTTAAATTGATTTGCTAAATCTGATGAGTTAAACTCAACTTTCAAACTAGAAGTTTTAAGTACGGATATATCAATATTTTTTAATATTATAGTATTATTCAGTAGTTGATCTGTACTAATTTTATTTGACTCGTCTAATTGCCACGTTATATCAGTATAATAGCTTGTTAAATTAAATAACTTACTACTATCTAGATCAGATTTTTTCTTTAAATCTTTTTTGTCTACTTCAGCATTAACATAATTATTATTAATAAGACATAATAAAGTTATTATAATTGCAGCTATGTAGAACAATCTCATAAGCTTTTTAATATTTTTTATAATATTCTCTCCCTCAATTATTTTTTGGTTAAATGAACTTCTACATTAATAGATTTACTCTCAACTGTTTTATTATCATTATAAATTAGTAAATATTTAGTCGGATAAAATTTTTTACCAGATTCAGGCATCAAATCATACCAAAAAGAATGACCACTTCCTTCTATAAACTTTATATAGCCAGTCTCATAAGGCGAACTGTTAAATTCATATAAATTTTTATGCTTAAGTAAATAGTTTCTAACTTTATAATCTATTTCTTGTGCTGTTATGTTTTTCTTATTAGTAGGTATATCAAAAGATAATGAATTTCTCTCGTTTTCATAAACTTTAATTAAGATATTATGAGAGTTATCAGTTGAATTATTTTTATCTATTTGATTTCCATCATGCTCGGTCACACCGCCATACATACACGTTTTTTTCAATTAATCTACCATCATTTAATTCCATATTATCCAATGAAAAATAGCATTGATTATAATAGTTTGTCCCAAACAAATCTACGTTTTTATTTTTATATTTATCCGAAAGGCTTTTATTATTAAATTCTGTTTTTAAAATTTTAGAACCATTTATTTTAAATAATAAATCATGTTGTAAAAACTTTTCTTGGGATTTAATGTTTGTTTCTGATACGTGTTTATCATCATACAAATACCTCATATTATCCATTAGACCAGTGAATTCACTCGCTTTATTCAATTGTTCTGGTTTAGGATTGCCATTTAACATAAATAGTAAGCTGCAAGACTTAACACATATGAAGATAAAGGCAAATAACTTCATTACAACAACTCCATATTTTAATTTTTTATAAATTTGATGTATTACAGGGAATATTTAACGTACACATTAGCCCTAGAGACTTTAAAATTTAAATAGTTAATACATATATTAATTTCGTATAAATTCGCATTTTAGTGTTAAAACTAATTATCATTAGTTACTATCTACATATGATATTTCGACATCAAGATGAAATTTTTCAGATTCTATTATTTTATTATCTTCATAAATTTTCAAAAAACTTACAGGCAGTCCATCTCCTGTATAAAACAAATCATATGAAAATGATTTTTCATTATTTAAATGAAATAAAACTTTCCCATTATTAAAACCTGAATAAAATTTAGATTTATATCCATATTCTTTGCCTTTACCAGTGTTATTATGACCATATATATTGTATTCTTCTTGAAGATATCTTCTTAATTTAACATCAATTTCTTGAGCTGTTACTAGTTTTTTATTAGTTGCTATTTTGTCAGTAGAAATTGTTTTATGTTTGCCATTAACCCAAAGATTAATAGGGATTTTTCTAGCAGAATTTAAGTATTGTCCTGATAAAGTGGCCCCTCCATACATGTATTTAGATTTACAAGGACCATTATAATCAATGCCAAAAATATCCAGTTTCTTTCCTTTAAATTTACTTATTTCGTCCCAATTATTAGATTCTGAGATCAAATCATTGGTACCTGTTGAAAATTCGAGTTGATTTGCAATAGGTAGGTTTTTATCTGTGACGCCTTTTAAATCTATATAATCATGTTTTGTATAGAAATTTCTTAAGTTACCTACACCAATATCACCTTGAGCATACGTAAGATCTTTAATGTTAAAAAGTAATATAAAAACTAATATAAAACTATATTTAAATTTTTTCATGGCATTTCCTTTACTAAGTTATGATTGAAATACTTCAACTTTCGTCCTTATAAGATATTTCTACATCTAAATGGAATTTTTCAGTTTCGACAGTTTTGTTGTCATTATATATTTTTAAGAAACTTTCAGCTTGTCCTGTTCCAGTATCAAATAAGTCATAAGAAAATGATGAACCATCATTCAAATGAAATAATATTTTTCCTGCATTAAATCCAGAACTAAATTTTGACTTATTACCATAATTTCTTACTTTATTTGTATCATTAAAGCCATAAATATTATATTCTTCTTGTAGATATCTTCTTAATTTAGTATCAATTTCTTGAGCTGTTACTAACTTTTTATTAGTTGATACTTTGTCAGTAGATATAGTTTGATGTTCTCCATTAACCCAAAGATTAATAGGAATACGTCTAGATTTCTCTAAATAATCACCTGCTAATGTAACTCCACCGTATATATATTTGTTTTTCAAACAATATCCACTATAACTTAGACCATATACATCTACAGCATGATTTTTGAATTTCTTTACATCATCAACGTTCTTAAATTCAGCTGTTACTGTCGAATTATCCATAGAAAAAACTAATTGATGCGAAAGATGATTATTTTCAGGATTAATACTTTGGTGGTCTTCAATTGGATAGCTACCATAATAGTTCCTAAGATTCAAAACTCCGACATCAGCGGTTGCGATATGATTTTGCGAATAGCAAAACAATAAAACAACAATGATAAGTATTCTTTTCATATTTTATTTCTCCTATATTTAAACTTCTCTATCTTTATTATCTTTTATTGTAAAAATAACCAATTCTTCTTAAATCATCATGATTCTATCCCACTTATATATTATTACTCGTTAATCTGGTTTTGTTATCTATACTAAAATAGAAAGCTTTTTATAGTAATAAAGTTAGATTTGAATCACTATTCGTTCTTCATCATTTACTAAGCTACTTTGTAAAAATATGTTAATATCTATAGTTCTTTATAGGATTGTAAGTTGATATCCATCAACTTTCAGATTGTTATGTAAATAAATAAACATCAATATGATAGTCTGATGAATCTATTGTTTTATTATCATTATAAATTTGCAAATATTGATCTGGTAAATTTCCTTTAATATAAAATAAATCATAATAAAATGATTCTTTATGCTCAGAATGAGAATGAAATTTAATATAACCTTTTTGTACATCACTAGTCATTCTGTCATACAATTTATATGCATTATTTAATTTTGTTCTTACTTTAATATCAAGTTCTTGTGCAGTAACTTTCTTTTTATCTGTAGTAACGATAAATGTATTAACATTTACATTATCCTTATACACAGCTACTCCTATATTTTTAGGCTCGCTTAATTTATTATTTTCATGAGGTGTTACCCCACCATATGTACAGGCAGTATCCACTTGATGCTCACCATGACAATGTGCTTTATAGTAAACACCATAAATATCAACAGTCTTTCCTAGAAATTCTTTAGAAATCGCTGATGAGCTAAATTCCACTTTTAAATCTTTAAATTCAGCAGATATTCCATCTAACCAATTAATACTTTTAAATAATAAATCGAAGTCTAAGAATTTTTCTGTAGTTGATACAATTGATTTTACTGTCGTAAATCGATTATTTATATAATCATCATTAATATTATGTAAAGCAATAGGGTCTACACTTGACTTCTTACACAAACTCTCTATTTTAGGATCTTCTTCATTTGCATATGCATTGTTTACACTACATATTGCAATTAAATTTAAAATTAATAATAATACATTTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP014064|1072561:1076808|1073355_1073751_-|AMG41570.1|DBSCAN-SWA MYGGVTEHDGNQIDKNNSTDNSHNILIKVYENERNSLSFDIPTNKKNITAQEIDYKVRNYLLKHKNLYEFNSSPYETGYIKFIEGSGHSFWYDLMPESGKKFYPTKYLLIYNDNKTVESKSINVEVHLTKK >CP014064|1072561:1076808|1072561_1073317_-|AMG41569.1|DBSCAN-SWA MRLFYIAAIIITLLCLINNNYVNAEVDKKDLKKKSDLDSSKLFNLTSYYTDITWQLDESNKISTDQLLNNTIILKNIDISVLKTSSLKVEFNSSDLANQFKGKNIDIYGLYFGNKCVGLTEEKTSCLYGGVTIHDGNQLDEEKVIGVNVFKDGVQQEGFVIKTKKAKVTVQELDTKVRFKLENLYKIYNKDTGNIQKGCIFFHSHNHQDQSFYYDLYNVKGSVGAEFFQFYSDNRTVSSSNYHIDVFLYKD >CP014064|1072561:1076808|1073725_1074127_-|AMG41571.1|DBSCAN-SWA MKLFAFIFICVKSCSLLFMLNGNPKPEQLNKASEFTGLMDNMRYLYDDKHVSETNIKSQEKFLQHDLLFKINGSKILKTEFNNKSLSDKYKNKNVDLFGTNYYNQCYFSLDNMELNDGRLIEKNVYVWRCDRA >CP014064|1072561:1076808|1076043_1076808_-|AMG41574.1|DBSCAN-SWA MLNVLLLILNLIAICSVNNAYANEEDPKIESLCKKSSVDPIALHNINDDYINNRFTTVKSIVSTTEKFLDFDLLFKSINWLDGISAEFKDLKVEFSSSAISKEFLGKTVDIYGVYYKAHCHGEHQVDTACTYGGVTPHENNKLSEPKNIGVAVYKDNVNVNTFIVTTDKKKVTAQELDIKVRTKLNNAYKLYDRMTSDVQKGYIKFHSHSEHKESFYYDLFYIKGNLPDQYLQIYNDNKTIDSSDYHIDVYLFT >CP014064|1072561:1076808|1075043_1075763_-|AMG41573.1|DBSCAN-SWA MKRILIIVVLLFCYSQNHIATADVGVLNLRNYYGSYPIEDHQSINPENNHLSHQLVFSMDNSTVTAEFKNVDDVKKFKNHAVDVYGLSYSGYCLKNKYIYGGVTLAGDYLEKSRRIPINLWVNGEHQTISTDKVSTNKKLVTAQEIDTKLRRYLQEEYNIYGFNDTNKVRNYGNKSKFSSGFNAGKILFHLNDGSSFSYDLFDTGTGQAESFLKIYNDNKTVETEKFHLDVEISYKDES >CP014064|1072561:1076808|1074280_1075009_-|AMG41572.1|DBSCAN-SWA MKKFKYSFILVFILLFNIKDLTYAQGDIGVGNLRNFYTKHDYIDLKGVTDKNLPIANQLEFSTGTNDLISESNNWDEISKFKGKKLDIFGIDYNGPCKSKYMYGGATLSGQYLNSARKIPINLWVNGKHKTISTDKIATNKKLVTAQEIDVKLRRYLQEEYNIYGHNNTGKGKEYGYKSKFYSGFNNGKVLFHLNNEKSFSYDLFYTGDGLPVSFLKIYEDNKIIESEKFHLDVEISYVDSN |
6 | Staphylococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1171098 : 1253193
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP014064|1171098:1253193|DBSCAN-SWA TATGAAAAGAAACTTTCCAAAATTAATAGCTTTAAGTTTAATATTTTCTTTAAGTGTTACCCCTATTGCAAACGCTGAGAGCAATTCAAATATCAAAGCAAAAGATAAGAAGCATGTGCAAGTTAATGTCGAGGACAAGAGTGTTCCTACTGACGTACGTAATTTAGCGCAAAAAGACTATCTTTCTTATGTTACTTCACTTGATAAAATCTATAATAAAGAGAAAGCCTCGTATACACTTGGTGAACCTTTTAAAATTTATAAATTCAACAAAAAGAGTGATGGTAATTATTATTTTCCAGTTTTGAACACTGAAGGTAATATCGATTATATAGTTACAATTTCACCAAAAATCACTAAGTATTCTAGTTCATCTTCTAAATACACAATCAATGTTTCTCCATTTTTATCTAAAGTCTTAAATCAATATAAAGATCAACAAATTACTATTTTGACAAACTCAAAAGGTTACTATGTGGTTACTCAAAATCATAAAGCTAAACTAGTACTAAAAACACCACGTCTAGAAGATAAAAAGTTAAAAAAGACTGAGAGTATACCTACTGGCAATAATGTAACGCAACTAAAGCAAAAAGCTTCTGTCACTATGCCAACTAGTCAATTTAAAAGTAATAATTATACTTACAACGAGCAATATATAAATAAACTTGAGAATTTCAAGATAAGAGAAACTCAAGGTAACAATGGTTGGTGTGCAGGCTATACGATGTCTGCATTACTAAATGCGACTTATAATACTAACAAATATCATGCAGAAGCTGTGATGAGATTTTTACACCCAAACTTACAAGGACAACGATTCCAATTTACTGGTTTAACGCCAAGAGAGATGATTTATTTTGGACAAACTCAGGGAAGAAGTCCACAACTTCTTAATAGAATGACTACATATAATGAAGTTGACAATCTTACTAAAAATAATAAAGGAATTGCTGTTTTAGGTAGTAGAGTAGAATCAAGAAATGGTATGCACGCAGGGCATGCCATGGCAGTTGTTGGGAACGCTAAATTAGATAATGGACAAGAGGTTATAATTATATGGAATCCATGGGATAATGGTTTTATGACTCAAGATGCTAAAAACAATGTTATTCCAGTATCCAATGGCGACCATTATCGATGGTATTCATCTATTTATGGTTATTAAAATTTGTATTTTAGAAAGGTAAATAATATTATGGAACAAATTGAATTATTTAGTATTGATAAATTCAAATGTAATTCAGAGGCTAAGTATTATCTTAATATTATTGAGGGAGAATGGCATCCTCAAGATTTAAATGATAGTCCTTTAAAATTTATTCTCAGTACCTCAGACGATTCTGATTACATTTGCAAATATATAAATACAGAACACAAACAACTCACATTATATAATAAAAATAATAGCTCAATTGTTATTGAAATATTTATACCAAATGATAATAAAATACTACTAACAATTATGAACACAGAAGCTTTGGGAACTTCTCCTAGAATGACTTTCATTAAGCATAAGTCATAAGACTATCTAGATATGATTAAGTAAACTATTAATCTTATTAAAGGTCTCTAGGAAGAAAAAATTTCATGCGATGAGATTGTTTTAGAAAAAGCGACGATATATATAATCTAACAATAATTTTTAAAATATTAAGAACCCCCAGCATATGCTTTATATAGCTTGCTGGGGGTTTCTCATACAATATGGATCGAGCATCTTGCATGTATAAACAAATAGGCTATTCAAAGTAAAATTACTCAAACTTTGAATAGCCTTTCCTCTTCAAATAGTCTTTATTTAAATTGGATTATGTTATTGGATTTTCTTACCTACAAAAACGATTTCTTGATGTGATACTTCAACCGTGCCATCTTTTTGCTCTTGAAACACGGGTTTTTCAATACGTTTTACCGGCATATACCCTTGCATTTTCATTCGTGACAAACAATCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTACCAAACGCAGCATAGTGCGTAACGCCATATCCTAAATTTCGAAGTTCATTCGGTAAATCTAACTCATATTCTGCTGAAGTTACATTTACAACTGTATAACCTAATGCCAGTTTTTCTTCTATTTTCATACCAACAATGATACCTATTGAAAAACCAAATGCGTAGGCAATAATATTTTGAATATGGTCTAAATTAGACATAACCAAACCTAAACCAACGATATAAACTAATACTTCTAAAAAACTAACTGATGCAGCAATATAACGATAACCTTTCAACGTTAAAATTGTTCGCATCGTTAAAAACGTTACATAACAAACGTTAATGATAAATATAGTTAGTACCATTAACCATGGATTTTCTGTTACGAATGACATAAGGCGCCCCACTCTCTTTCAATTACACTTTAAATACCAAACTGCTTCAACCTAACCTTAATGAATGCATATTAATATAATATAGTACGAAAACTCTCATAAATAAATAGCGAATTTGTCATAAATAAAAATTTATTCTCAAATGAACATACTTACTTTAGTTCATACACTTTCAATTTATACACTGAAGTAGTCTAGCTGAATGTGGTTTAATGTTATTAATTCTAACTCATATTTAATTTAAGTCACACGTTAGAAGAAAAAATTAAATTAGGATTTTGGCCACGTGTATCTTGTATATGCAAGTTCACGTTTGTGTGCATTTCGTATATAATGATTTTCAATTACTTTTTGTTCTTCTGGCGTAACTGGCTTACCTTCTAAATAATTATCAATCGCCTCATAAGTTACACCTAATGCATCTTCATCTGGAAGCTGTGGTTTATCATCTTCTAAATCAGCAGTTGGCGTTTTTTCATATAATTCCTTTGGCGCACCAAGATACGCTAATAATTGACGACCTTGTCGTTTATTCAAACCAAATATAGGTGCGATATCTGCAGCACCATCACCGTACTTCGTATAAAACCCAGTTATATTTTCAGCTGAATGATCTGTTCCTACTACAATACCTTGTCGGTTTGAAGCAATTGAAAATTGTACTTTCATACGTTCACGCGCTTTTTCATTTCCTTTTTGGAAATCTGTAAGAACAATACCAGCTTCTTTTAATGATTGCACACTTTGATCAACTGCAGGCTTAATATTGACTGTTACTATTTCATCTGGTTCAATGAATCGCAAAGCTTGGTCAACTTCATCAGCATCTTTTTGAACTCCATAAGGTAATTTAACTGCAATAAACGTACAATCAATGCCTTCTTCACGTAATTCGTTAACAGACATTTGTACTAGTTTTCCAACTAATGTAGAATCTTGTCCTCCTGAAATACCTAACACTAAAGATTTTATAAATGAATGTGATTGTACATAATTTTTTATAAATTGCTTTAATTCCATAATTTCTTCAGCACTATCGATACGCTTTTTCACTTTCATTTCTTGTACAATAACGTCTTGTAATTTACTCATTATCTTCTTCCATCTCCTTAACGTGTTCCGCAACTTCAAAAATACGTTTATGTTTATTATCCCAACATGCCTTGCTTAAATCGACTGGATATTCTTGTGGATTAAGGAAACGCTTATTTTCATCCCAAATAGATTGTAATCCTTGTGCTAAATATTCACGTGATTCATCTTCTGTTGGCATTTGATATACTAATTTACCATTTTCATAAATATTATGATGCAAATCAATGGCTTCGAAAGATTTTATAAATTTCATTTTATAAGTATGCACTGGATGGAATAATTTTAAAGGTTGTTCATCGTATGGATTTTCATTTTCCAAAGTAATATAATCGCCTTCTGCCTTACCTGTTTTCTTGTTTATAATGCGATATACATTTTTCTTACCTGGCGTCGTAACCTTTTCAGCGTTATTTGATAATTTAATACGATCACTATATGAACCCTCTTCATTTTCAATAGCTACAAGTTTATATACTGCACCTAATGCTGGTTGATCGTATCCTGTAATCAGCTTTGTACCAACGCCCCAAGAATCTACTTTTGCACCTTGTGCTTTCAAACTCGTAATCGTTTCTTCATCCAAATCATTAGACGCGATAATTTTAGTTTCAGTAAATCCTGCTTCATCAAGCATACGTCTTGCCTCTTTAGATAAATAAGCGATATCTCCAGAATCCAATCGAATACCTACAAAGTTAATTTTGTCACCTAATTCTTTTGCAACTTTTATTGCATTTGGCACGCCAGATTTTAAAGTATGGAATGTATCTACTAGGAACACACAATTTTTATGTCTTTCAGCATATTTTTTGAAGGCAACATATTCATCTCCATAAGTTTGGACAAATGCGTGTGCATGTGTACCAGACACAGGTATACCAAATAATTTACCTGCCCTAACATTACTTGTAGAATCAAAGCCCCCGATGTAAGCAGCTCTAGCGCCCCACAATGCTGCATCAATTTCTTGCGCACGACGTGTACCAAACTCCATTAATTTATCATTTGATGCAATTTGACGAATTCTACTAGCCTTTGTTGTAATTAGTGTATGGAAATTTACAATGTTTAATAAAATTGTTTCTATTAATTGCGCTTGAATCAATGGTGCTTCTACGCGTAACAATGGTTCGTTACCAAAGCATAATTCGCCTTCTTGCATCGAACGAATGCTTCCTGTGAATTTTAAATCTTTTAAATATGATAAGAAATCATCCTTGTAGCCAATAGACTTTAAATATTCCAAATCAGATTCTGAAAATCCAAAATGTTCTATAAAATCAATGACGCGTTTTAAACCATTAAAAACAGCATAGCCACTATTAAATGGCA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MNIIEQKFYDSKAFFNTQQTKDISFRKDQLKKLSKAIKSYESDILEALYTDLGKNKVEAYATEIGITLKSIKNARKELKNWTKTKNVDTPLYLFPTKSYIKKEPYGTVLIIAPFNYPFQLVFEPLIGAIAAGNTAIIKPSELTPNVARVIKRLINETFDANYIEVIEGGIEETQTLIHLPFDYVFFTGSENVGKIVYQAASENLVPVTLEMGGKSPVIVDETANIKVASERICFGKFTNAGQTCVAPDYILVHESVKDDLITALSKTLREFYGQNIQQSPDYGRIVNLKHYHRLTSLLNSAQMNIVFGGHSDEDERYIEPTLLDHVTSDSAIMQEEIFGPILPILTYQSLDEAIAFIHQRPKPLSLYLFSEDENATQRVINELSFGGGAINDTLMHLANPKLPFGGVGASGMGRYHGKYSFDTFTHEKSYIFKSTRLESGVHLPPYKGKFKYIKAFFKN >CP014064|1171098:1253193|1235706_1235967_-|AMG41733.1|DBSCAN-SWA MYYKTGDVCRKIFNVDGFDFQLRVKKRAYSVEIVVLDHEGNSIDGLLVSDENDLYTALDILKQSIYEWIENNTDEQDRLINLVMKW >CP014064|1171098:1253193|1202744_1202900_+|AVC42046.1|DBSCAN-SWA MRCSDCNISMLLRYMYRVKGKKDINCRISVRLLGHLTGYIVHSYYIHLIIT >CP014064|1171098:1253193|1220835_1221981_-|AMG41712.1|capsid|DBSCAN-SWA 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108 | Staphylococcus_phage(88.16%) | head,protease,terminase,holin,capsid,integrase,tail,portal | attL 1220157:1220174|attR 1244333:1244350 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2404447 : 2410188
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP014064|2404447:2410188|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP014064|2404447:2410188|2406344_2407019_+|AMG42841.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGVNVHHSTIYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDTEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVVTDQAPSTKAAMAKIIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >CP014064|2404447:2410188|2404447_2405368_+|AMG42838.1|DBSCAN-SWA MNNIIEINNLTKQYGSQIAVNNLSITVESGQIYGFLGRNGAGKTTTIRMLLGLIKPTKGNIKIFEKEFESNKTEILKNIGAMVETPGFYSNLTAKENLTINAKILGIQKENAIEEVLEIVGLASEKVKLFKNYSLGMKQRLGIARALLHNPELLILDEPTNGLDPIGIKEIRKLIKDLAQSRNITILISSHILSEIEQLVDKVGIIHNGVLLEEIMYEDLKKKNRQFISISVSDEEKVACLLETNFGIYDYKIKENGEFKIYSHIDRQQEINRLLVLNNIDVFQMRVIEDNLETYFEDLVGGGTIG >CP014064|2404447:2410188|2407791_2408322_+|AMG42842.1|DBSCAN-SWA MITEMKAGHLKDIDKPSEPFEVIGKIIPRYENENWTFTELLYEAPYLKSYQDEEDEEDEEADCLEYIDNTDKIIYLYYQDDKCVGKVKLRKNWNRYAYIEDIAVCKDFRGQGIGSALINISIEWAKHKNLHGLMLETQDNNLIACKFYHNCGFKIGSVDTMLYANFEKAVFWYLRF >CP014064|2404447:2410188|2409513_2410188_-|AMG42844.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDAEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMAKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >CP014064|2404447:2410188|2408414_2409209_+|AMG42843.1|DBSCAN-SWA MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKMTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYEDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF >CP014064|2404447:2410188|2407180_2407747_+|AVC42083.1|DBSCAN-SWA MDLTLLPLEELDNYLKGDKLIKVLIDKDCRIKRDIVPTDIDYHVRKPSAREYDDCCNEFWNVTPYVIKGLCRKEILFAIDHFNQIVRHELLRMISWKVGIETGFKLSVGKNYKFIERYISEDLWEKLLSTYRMDSYENIWEALFLCHQLFRAVSGEVAERLHYAYPEYDRNITKYTRDMYKKYTGKTG >CP014064|2404447:2410188|2406111_2406315_+|AMG42840.1|DBSCAN-SWA MGFIEQIKAFILGVVEGLTEFAPVSSTGHMIIVDDMWLNTADDLGSASATTFKVVIQLGGSVAKLNL >CP014064|2404447:2410188|2405360_2406098_+|AMG42839.1|DBSCAN-SWA MDNLLRTEFIKLKRSYMFLISILGTCVAPFMVVVASFISMRTKVPTPNIVFKQLFEEVSLYHMLIIGPPLYGVIIAYLFGREYIEDTLKNLLIIPISRESFLVSKIILLFLWIQTLSVIAWLLTLMLGMLLHFQGLSQSLIIDSFFTFVIGGVLLWILSPPIIILSIYFKNYVPTIVLTIIITLINLMTANSEHRGLFPWAAVGDISRGTLPNTYPFLLSLIIIIVTSIFSVIILFSYFKKTDIS |
8 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2704703 : 2712524
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP014064|2704703:2712524|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP014064|2704703:2712524|2709776_2710445_-|AMG43113.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >CP014064|2704703:2712524|2704703_2705759_-|AMG43106.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >CP014064|2704703:2712524|2708638_2709352_-|AMG43111.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >CP014064|2704703:2712524|2707955_2708540_-|AMG43110.1|DBSCAN-SWA MILYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >CP014064|2704703:2712524|2705758_2706445_-|AMG43107.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >CP014064|2704703:2712524|2706419_2706893_-|AMG43108.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >CP014064|2704703:2712524|2709355_2709775_-|AMG43112.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >CP014064|2704703:2712524|2710795_2711389_+|AMG43114.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >CP014064|2704703:2712524|2707235_2707676_-|AMG43109.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >CP014064|2704703:2712524|2711372_2712524_+|AMG43115.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQFESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2728556 : 2739192
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP014064|2728556:2739192|DBSCAN-SWA 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TAACTTATCTAAATTGCGTGCACGTGGTGAAGCAATTAAAGGAATTAAAGGCGTAGCGAAAGGCGTTTTACCTATTGCTAAGTCACTTGAAGGTGGCTTTAGCTATGCAGATCAACTTGGTCAACGCCCTGGTGCTGGTGCTGTGTACTTAAATATCTTCCATTATGATGTAGAAGAATTTTTAGATACTAAAAAAGTAAATGCGGATGAAGATTTACGTTTATCTACAATATCAACTGGTTTAATTGTTCCATCTAAATTCTTCGATTTAGCTAAAGAAGGTAAGGACTTTTATATGTTTGCACCTCATACAGTTAAAGAAGAATATGGTGTGACATTAGACGATATCGATTTAGAAAAATATTATGATGACATGGTTGCAAACCCAAATGTTGAGAAAAAGAAAAAGAATGCGCGTGAAATGTTGAATTTAATTGCGCAAACACAATTACAATCAGGTTATCCATATTTAATGTTTAAAGATAATGCTAACAGAGTGCATCCGAATTCAAACATTGGACAAATTAAAATGAGTAACTTATGTACGGAAATTTTCCAACTACAAGAAACTTCAATTATTAATGACTATGGTATTGAAGACGAAATTAAACGTGATATTTCTTGTAACTTGGGCTCATTAAATATTGTTAATGTAATGGAAAGCGGAAAATTCAGAGATTCAGTTCACTCTGGTATGGACGCATTAACTGTTGTGAGTGATGTAGCAAATATTCAAAATGCACCAGGAGTTAGAAAAGCTAACAGTGAATTACATTCAGTTGGTCTTGGTGTGATGAATTTACACGGTTACCTAGCAAAAAATAAAATTGGTTATGAGTCAGAAGAAGCAAAAGATTTTGCAAATATCTTCTTTATGATGATGAATTTCTACTCAATCGAACGTTCAATGGAAATCGCTAAAGAGCGTGGTATCAAATATCAAGACTTTGAAAAGTCTGATTATGCTAATGGCAAATATTTCGAGTTCTATACAACTCAAGAATTTGAACCTCAATTCGAAAAAGTACGTGAATTATTCGATGGTATGGCTATTCCTACTTCTGAGGATTGGAAGAAACTACAACAAGATGTTGAACAATATGGTTTATATCATGCATATAGATTAGCAATTGCTCCAACACAAAGTATTTCTTATGTTCAAAATGCAACAAGTTCTGTAATGCCAATCGTTGACCAAATTGAACGTCGTACTTATGGTAATGCGGAAACATTTTACCCTATGCCATTCTTATCACCACAAACAATGTGGTACTACAAATCAGCATTCAATACTGATCAGATGAAATTAATCGATTTAATTGCGACAATTCAAACGCATATTGACCAAGGTATCTCAACGATCCTTTATGTTAATTCTGAAATTTCTACACGTGAGTTAGCAAGATTATATGTATATGCGCACTATAAAGGATTAAAATCACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAACACACAAGAAGATATGACGAATATGTTTTGGAGACAAAATATATCTCAAATGTGGGTTGAAACAGAATTTAAAGTATCAAAAGACATTGCAAGTTGGAAGACTTTATCTGAAGCTGAACAAGACACATTTAAAAAAGCATTAGCTGGTTTAACAGGCTTAGATACACATCAAGCAGATGATGGCATGCCTTTAGTTATGCTACATACGACTGACTTAAGGAAAAAAGCAGTTTATTCATTTATGGCGATGATGGAGCAAATACACGCGAAAAGCTATTCACATATTTTCACAACACTATTACCATCTAGTGAAACAAACTACCTATTAGATGAATGGGTTTTAGAGGAACCCCATTTAAAATATAAATCTGATAAAATTGTTGCTAATTATCACAAACTTTGGGGTAAAGAAGCTTCGATATACGACCAATATATGGCCAGAGTTACGAGTGTATTTTTAGAAACATTCTTATTCTTCTCAGGTTTCTATTATCCACTATATCTTGCTGGTCAAGGGAAAATGACGACATCAGGTGAAATCATTCGTAAAATTCTTTTAGATGAATCTATTCATGGTGTATTTACCGGTTTAGATGCACAGCATTTACGAAATGAACTATCTGAAAGTGAGAAACAAAAAGCAGATCAAGAAATGTATAAATTGCTAAATGACTTGTATTTAAATGAAGAGTCATACACAAAAATGTTATACGATGATCTTGGAATCACTGAAGATGTGCTAAACTATGTTAAATATAATGGAAACAAAGCACTTTCAAACTTAGGCTTTGAACCTTATTTTGAGGAACGTGAATTTAACCCAATCATTGAGAATGCCTTAGATACAACAACTAAAAACCATGACTTCTTCTCAGTAAAAGGTGATGGTTATGTATTAGCATTAAACGTAGAAGCATTACAAGATGATGACTTTGTATTTGACAACAAATAACAATTAAATTAAAAGACCTTCACATGTAAAGGGAAATAGCGATTCGTTTCGTCTTGTCTCCTACATGTTGAAGGTCTTTTCTCTATGCTTAAAAGCGTATGCATATTTTGAAAAAGTAAAAATTGTATTTAATGATGTCAATGAGGCTAGAAAGTATACAAGATATTGCATTACAAAAGGGTGTTCTATTTTACTTTAAGCAAACAAAATACACATTCCGAAAAATTAAATTTCAGTTTAATTGCAAATATCAATAAAATTGACACTAAATTATTTGAAAGGCTATTGAAATTATGGTCAAAAAACGCTACTATTAATGAGAAATATTATCAATGATAATGATTATCATTAATTTAAAGGGAGAAAAATTTGTAATGAAGTATTTATTAAAGGGAAATATTTTGCTTCTATTACTAATATTGTTGACAATTATTTCGTTGTTCATAGGTGTGAGTGAACTATCAATTAAAGATTTACTACATTTAACTGAATCACAGCGGAATATTTTATTCTCAAGCCGAATACCAAGGACGATGAGTATTTTAATTGCTGGAAGTTCGTTGGCTTTAGCAGGCTTGATAATGCAACAAATGATGCAAAATAAGTTTGTTAGTCCGACTACAGCTGGAACGATGGAATGGGCTAAACTAGGTATTTTAATTGCTTTATTGTTCTTTCCAACCGGTCATATTTTATTAAAACTAGTATTTGCTGTTATTTGCAGTATTTGCGGTACGTTTTTATTTGTTAAAATCATTGATTTTATAAAAGTGAAAGATGTCATTTTTGTACCGCTTTTAGGAATTATGATGGGTGGGATTGTTGCAAGTTTCACAACCTTCATCTCATTGCGCACGAATGCTGTTCAAAGCATTGGTAACTGGCTTAACGGGAACTTTGCCATTATCACAAGTGGACGCTATGAAATTTTATATTTAAGTATTCCTCTTTTAGCATTGACATATCTTTTTGCTAATCATTTCACGATTGTAGGAATGGGTAAAGACTTTACTAATAATTTAGGTTTGAGTTACGAAAAATTAATTAACATCGCATTGTTTATTACTGCAACTATTACAGCATTGGTAGTGGTGACTGTTGGAACATTACCGTTCTTAGGACTAGTAATACCAAATATTATTTCAATTTATCGAGGTGATCATTTGAAAAATGCTATCCCTCATACGATGATGTTAGGTGCCATCTTTGTATTATTTTCTGATATAGTTGGCAGAATTGTTGTTTATCCATATGAAATAAATATTGGTTTAACAATAGGTGTATTTGGAACAATCATTTTCCTTATCTTGCTTATGAAAGGTAGGAAAAATTATGCGCAACAATAATAAAAAAATAATGCTTTTAATTGCAGTAACGTTATTAATTAGTATGCTGTACTTATTTGTAGGTATTGATTTTGAAATATTTGAATATCAATTTTCAAGTCGTTTAAGAAAGTTCATATTAATTATTTTAGTAGGTGCTGCCATTGCAACTTCAGTGGTGATTTTTCAAGCGATTACAAATAACCGTCTATTGACACCATCAATAATGGGGTTAGATGCAGTTTATTTATTTATCAAAGTATTGCCAGTCTTTTTATTTGGAATTCAATCGGTATGGGTTACTAATGTATATTTGAACTTTATATTAACACTTATAACGATGGTGTTATTCGCACTAATCCTATTCCAAGGTATCTTTAAAATTGGACATTTTTCAATTTATTTTATCTTACTTATTGGTGTCCTTTTAGGAACATTTTTTAGAAGCATAACAGGTTTTATTCAACTGATTATGGATCCTGAGTCATTTTTAGCAATACAAAGTAGTATGTTTGCTAATTTTAATGCTTCTAATTCGAATTTAGTTACTTTCTCAGCAGTGCTATTAGTAATCTTATTAGTCATTACAATTTTACTATTGCCTTATTTAGATGTATTGCTTTTAGGTCGTGCTGAAGCAATTAATCTTGGGATATCGTATGAAAAATTAACGCGAATTCTACTTGTAATAGTCTCAGTTTTAGTTTCTGTGTCAACTGCATTAGTAGGACCAATTACATTTTTAGGTTTATTAACTGTAAATCTAGCGCATGAACTAATGAAGACGTATGAACATAAGTATATTTTAATTGCGACAATTTGCTTGAGTTGGATTAGTTTATTTAGTGCGCAATGGGTAGTTGAAAATGTGTTTGAAGCTACGACAGAAATGAGTATACTTATTGATTTGATTGGTGGAAGTTATTTCATTTATCTATTAGTTAGAAGGAGAAATGCGCAATGATTCAAGTTGAAAATTTAACTAAAACTATAAATAATCAAATGATATTGGAAGATATTAGCATAGATATCGAAAAAGGTAAATTGACTTCTTTAATTGGACCTAATGGTGCGGGTAAGAGTAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP014064|2728556:2739192|2732589_2732988_+|AMG43133.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >CP014064|2728556:2739192|2728556_2730062_-|AMG43130.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >CP014064|2728556:2739192|2735173_2736145_+|AMG43135.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >CP014064|2728556:2739192|2736325_2736481_+|AMG43136.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >CP014064|2728556:2739192|2732173_2732440_+|AVC42094.1|DBSCAN-SWA MCLMYNETHNIVLVKRKRHNILCFVCKCFIYEEITFKSNLTQKFNSYYQLIVIFLENVLSKWKISNDVNTTYSDFYTFNLYKLLFSQI >CP014064|2728556:2739192|2732950_2735056_+|AMG43134.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSISFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >CP014064|2728556:2739192|2736519_2737491_+|AMG43245.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >CP014064|2728556:2739192|2737477_2738434_+|AMG43137.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >CP014064|2728556:2739192|2730402_2730903_-|AMG43131.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >CP014064|2728556:2739192|2738430_2739192_+|AMG43138.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >CP014064|2728556:2739192|2730127_2730373_-|AVC42093.1|DBSCAN-SWA MIFLTYWCVFHLAYIIGYIKITFYTKVHQKNISTRIKQHFYRNLLHFNVNKYIFILSLINCARLITEYSQYFYFFVICWNI >CP014064|2728556:2739192|2730922_2731789_-|AMG43132.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFLYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSSREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFVLFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK |
12 | uncultured_Caudovirales_phage(62.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2790149 : 2800969
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP014064|2790149:2800969|DBSCAN-SWA AATGAATTTAAAGCAATCAATAGAAGAGATTATTAATCAACCTGAATATGAACCTATGTCAGTGTCAGATTTTCAAGATGCATTAGGTTTAAGTAGTGCCGACTCATTTAGAGATTTAATTAAGGTGCTCGTAGAATTAGAACAATCAGGATTAATTGAACGTACAAAAACAGACAGATATCAAAAAAAGCATAGTTCAAAAGGTCATTCAAAATTGATAAAGGGAACGTTAAGTCAAAATAAAAAAGGCTTTGCATTCTTAAGACCTGAAGATGAGGATATGGAAGATATATTTATTCCCCCAACAAAAATTAATCGTGCCTTAGATGGAGATACTGTAATTGTAGAAATACATCAATCTAAAGGTGAACATAAAGGTAAAATTGAAGGGGAAGTTAAGTCGATTGAGAAGCATTCAGTAACTCAAGTTGTTGGTACGTATAGTGAAGCTAGACATTTCGGATTTGTTATTCCAGATGATAAACGTATTATGCAAGATATTTTCATTCCTAAAGGACAAAGTTTAGGTGCAGTAGATGGGCATAAGGTACTTGTTCAAATTACTAAATATGCTGATGGTTCAGATAATCCAGAAGGACATATTTCTGCTATTTTAGGACATAAAAATGATCCTGGCGTAGATATTTTATCTATTATCTATCAACATGGCATAGAAATTGAATTTCCTGATGAAGTGTTACAAGAAGCTGAAGCAGTACCTGATCATATTGAAAATACTGAAATTAAAGGCCGTCATGATTTACGTGATGAATTGACAATCACAATTGATGGTGCTGATGCTAAAGACTTAGATGACGCAATTAGTGTTAAAAAGTTAGCGAACGGTAATACGCAGTTGACTGTAAGTATTGCTGATGTCAGTTATTATGTAACTGAAGATTCAGCTTTAGATAAAGAAGCTTATGATAGAGCGACAAGTGTATATCTTGTTGACCGTGTGATTCCGATGATTCCACATCGATTAAGCAATGGTATTTGTTCATTAAATCCTCATGTTGATCGTTTAACGTTAAGCTGTCGCATGGAAATCGATGCTAGTGGTCGCGTTGTTAAACATGAAATTTTTGATAGTGTTATACATTCTGATTATCGAATGACGTATGATGCGGTAAATCAGATTATTACTGAAAAGGATCCTAACATTCGCGAACAATATAAAGAAATTACGCCTATGTTAGATTTAGCACAAGATTTATCTAATCGTTTGATTCAAATGAGAAAACGACGTGGTGAAATCGATTTTGATATTAGTGAAGCAAAAGTATTAGTTAACGAAGTCGGTATACCAACAGATGTTCAATTAAGACAACGTGGCGAGGGTGAACGTCTAATTGAATCATTTATGTTAATTGCAAATGAAACAGTTGCTGAACATTTTAGTAAGTTAAATGTACCTTTTATTTACCGAGTGCATGAGCAACCTAAATCAGATCGCTTAAGACAATTCTTTGATTTTATTACAAACTTTGGCATCATGATTAAGGGCACTGGCGAAGATATTCATCCAACAACACTTCAAAAGGTTCAAGAAGAAGTAGAAGGTCGACCTGAACAAATGGTCATTTCAACAATGATGTTACGTTCAATGCAACAAGCGCATTATGATGATGTGAACTTGGGACATTTTGGCTTATCAGCTGAATATTATACGCATTTTACATCACCAATTAGACGTTATCCTGATTTAACAGTTCATCGTTTAATCCGTAAGTATTTAATTGAGAAATCAATGGATAACAAAGAAGTGAAGCGTTGGGAAGACAAATTGCCTGAGTTAGCTGAACATACTTCTAAACGTGAACGTCGTGCTATTGAGGCAGAACGTGATACTGATGAATTGAAAAAAGCAGAATATATGATTCAACATATTGGTGATGAATTTGAAGGTATTGTCAGCTCAGTAGCTAACTTCGGTATGTTCATTGAATTGCCAAATACGATAGAAGGTATGGTTCATATTGCGAATATGACTGATGATTATTACCGTTTTGAAGAGCGTCAAATGGCATTAATTGGTGAGCGTCAAGCTAAAGTATTTAGAATTGGTGACACAGTTAAGGTTAAAGTGACGCATGTTGATGTAGATGAACGATTAATTGATTTTCAAATTGTTGGAATGCCTTTACCTAAAAATGACCGCTCACAGCGACCAGCAAGAGGTAAAACGCGTGGCAAATCTTTAGATAAATCGAAATCTGATGATAAGGGTCGTAAGAAAAAAGGTAAGCAACGTAAAGGTAAAAACCAACGTAATAATGATAAATCAGGTAATAGTAAGCATAAGCCATTTTATAAAGATAAAAGTGTGAAAAAGAAAGCACGTCGTAAGAAAAAATAAGCAGCAATGAGGTGAGTATGAATGGCTAAGAAGAAATCACCAGGTACATTAGCGGAAAATCGTAAAGCAAGACATGATTATAATATTGAAGATACGATTGAAGCGGGAATCGTATTACAAGGTACAGAAATAAAATCGATTCGCCGAGGTAGTGCTAACCTTAAAGATAGTTACGCGCAAGTTAAAAACGGTGAAATGTATTTGAATAATATGCATATAGCACCATACGAAGAAGGGAATCGTTTTAATCACGATCCTCTTCGTTCTCGAAAATTATTATTGCATAAACGTGAAATCTTTAAATTAGGTGAACAAACTCGAGAAATTGGTTATTCGATTGTGCCGTTAAAGCTTTATTTGAAGCATGGACATTGTAAAGTATTACTTGGTGTTGCACGAGGTAAGAAAAAATATGATAAACGTCAAGCTTTGAAAGAAAAAGCAGTCAAACGAGATGTTACGCGCGATATGAAAGCCCGTTATTAAGCGATTTAGTTGCTTAATCGGGCTATATTTGATATAGTTATATGTGCTTTTGTAAATTACAAAAGTATGATTTGTTTGATTTATTATTTCGGGGACGTTCATGGATTCGACAGGGGTCCCCCGAGCTCATTAAGCGTGTCGGAGGGTTGGCTTCGTCATCAACACACACAGTTTATAATAACTGGCAAATCAAACAATAATTTCGCAGTAGCTGCCTAATCGCACTCTGCATCGCCTAACAGCATTTCCTATGTGCTGTTAACGCGATTCAACCTTAATAGGATATGCTAAACACTGCCGTTTGAAGTCTGTTTAGAAGAAACTTAATCAAGCTAGCATCATGTTGGTTGTTTATCACTTTTCATGATGCGAAACCTTTCGATAAACTACACACGTAGAAAGATGTGTATCAGGACCTCTGGACGCGGGTTCAAATCCCGCCGTCTCCATTATATAGTCTGCGACCTTAGTGGTTGTAGGCTTTTTATTTTTGAGTGCACAAAAAGTGCACAGATAGTGCACAGGATACAAAAAGACACAACCAATTTTAGTTGGCAGTACCTTATAAGTATTTAACTATTTCTTTCTGTGTACTAGGATATAAATGACCATATCGGTTATATACTTCAGTCGTATCGCTGTGACCTAAACGCTGAGCTATAATCATTACACTAGCCCCTAGATTAACTAGCATAGATGCATGGCTATGTCTTAACTCGTGTATAACGATTCTAGGGAAATTTTGTCCGTTTGGTAATTGCTCATCCAACACTTTTAATGCGTTAGTAAACCAACGATCAATAGTAGACTCGCTATAAGCTTTATAGAATGTACCAAATAATACATAATCATCTTTAAATATGTTATTTTCTTTATACCAATTTAAATAATTTTTGATGTCACCCATCATGTGAGTAGGCAAATATATATCACGTATGGCTGATTTCGTTTTAGGGGCTGTCACTTCACCGTGATAGTCCGTTTTGTTTATATGGATAAAGTCATCATCAAAGTTAATATCGCGCCATGTGAGCGCTCTGATTTCGCCTTTACGTGCTCCAGAGTAGAACAATAGTTTAAAGAATAACTTTTGTTGTTGTGTCACTAGCGCACCATAAAATTGATTGAATTGTTCTAACGTCCAATAATTCAATCGTTTCTGTGATTCTATTTCAAAATTCCCTACAAGAGATGCAACATTTTGTTTTAACTCATGAAACTTCATTGCATGATTCAGTAATGATACTAAATATACATGCATCTTCTTTAAGTAGTCTCCAGAATGCCCCTCTTTTAACTTCTTATTCTGAAATTTCATCACATCTTGTGTAGTCATTTTAAATACATCCATAGATTTAAAATAAGGTAGCAAATGGTTATTGGTATGTGTCTTTAATGCTTTTACACTTGATGTCTTTCGACGTGCTGAATACCAGTCTATATATTCTTCAACGAGCTTGTCAAAAGGTAATCTATTAAGGTGTCCGACTCCCTCTAATTCGTCCATCATTTCGTTACATTTCTTTACTGCATCTTTACGTTGTTTAAACCCCTTACGTGTTATGTACTTACGAGTATTGCTTTTGTCATAGTAAGTGATACGGAAATAGTAAGTGCCACGTTTAGCGTCTTTATATATGTTGTGGGATAAGTTTAAGTTATATGACATTGTATTCACTCTTCACTAATTTTCTCTAGATCATGTTTAACTCTATAGTCATCAATGTATTCTAATAGATCAAAGTATTTGTTAGATATTGTCGTAAGGAATTCATCGATGCTCTCATCTTTTAAAAATTCTTTTGCTTTTGAATCTTCATAATAGTCAACTACTAATTCTTGCGCATTTATTGTTCTTTGATAAGCGAAATATGTTAAAGATTCAAGATCTCTATTTCCTAAATCTAATTCTAATTGTAAATAATGTTGTAACAATTTTCTAAATAAATTTTCGTTAAAATTTTCTTTACCTCTTTCATAATAGGAAAATATAAAACGAGAAACTGAAGATGATAATTCATTAGCTAGAAAACTATTGTTAGCACACATATTTGTGTCTAAAATAAACTTTATTTCCTCGTTTGCAATACTTTCTAACAACCCTAGAAAATCACCGTATATTAATTGATGTACACTTATATTCCCTAACTTAGCAATCTCTTTTAATCTTTCATTACTTGGTTTTGTTAGTCCTTTTTCCCATTTTGAAACAATAGATTTATGAGCTTTATGTGTGAATTTTTCACCAAACTCTTCCATCGTAAGACCTAATTCTTTTCTAATTTTTTTTATATTATTAGCTAAAATTGATTGTTGTGAAATACTAAACGCCTCCTTAATGATGAATATTTATGTTAGTATTCTATCATTAATTTAGCTTTAGTGGAATTATAAGTTTCATAAAGTATCATAAAAAGTGTTGACAAGTAAAAGGAGAGGTTATATGCTTGTAGCATAAAGTTTCAAGGAGGTGGTTTTGATGAAAAATAAAGTAAGCAATTACAGAAGGTATATTGGTTTAACACAAAATCAAATGGCTAATAATTTAAAAATTTCAGTTACTGCTTATAGAAATAAAGAAAGAGGAATAACACCATTTAAAGATTCAGAGAAGGTGTTTATAAAAAATAAATTAATAGAAAATGGTATCAAAGACATTACTATTGATGATATTTTTTTTAATTAATAAGTAGCATAAAGTTTCCTTTAGGAGTGATTAGAATGACAAAACTAACTTATCCAATGTTATACATTACTAGAAAAGAAAAAGGTGACACGCAAAAGAAAGTTGCTAGCAAACTTGGTATTAGTCCACAACGCTACCAGTTAAAGGAAAGTGGTAAAGCAATATTTAATTTAAATGAGTGTCAGATTCTTTCAGAAATGTATGACATGCCAATTGATGAGTTATTTTCATCAAAAATTAAAGTAGAGGGGTCAAGGCAATGAAAATGTACTTAACTTATATCTGCTTAGTTTCATTGTTAACAATATTATTACTAGCAATATCTAACATGTATGTCGCTTTTAGTGTGTACGGCATGATGGTAACTTATGGATTTAATTTAACAGGAGAGATTACAACGTGCGAAAACAAGTTATTATTACAAAAACAGTAGTTGGCTGGTACAACATTAAAGATACTCAACATAATTTAATGTTAAATATACCGCCAAAAGTATTTGAACAGTACTTTCCTGATGTTAGTAAAGATGTTCAAGTTGCGTGTTTAGAAATGGATTTATCAAAAATTACAGAAATTAAAAATAAGAAAAAAGTAGGTAGTTAAGATGGAAATCAAACAAAAATATCAATTATCAAAAGTGGTTAAAATATTAGAAGTAGTATTATACGAGGAAGATAAGTTTCAATCCGATAAGGACTATCATTATCAGGATAAAGCATTTTATGAATATGCTTTAAAGTTAGTTCATAATGGATTGTTCAATATTCTTGCTGAATTAGATTTTGAAGATGAAGCATTTTTAATTCTTGATGAAGTAACAATGACGCTAAGTGATGTCATGAAAGAAACACAACACGTTTACCGTTATAGTGTCATAGACGAAAAAGGTGAACATAAACATACAACAGATCGCAAAGGACACGTGTTTGGAATGTTAGAGTGGGCATTAGATTACATTGTGGGAAATATTGAAGTGGAGGAATTATAAATGAATTGGGAGATTAAAGATTTGATGTGTGATATTGAAGTGATAAAAGAAAAAATCAATGATGTAGCTATCAAACATGGTTGGTTTGTTGAAGATAAATTTGTCAAAAATGAATTAGAAACAAAACAAGAACATATCAGTTACTCAGCAGGCTATTTAGAACATCGTATACAAAATGAACATACAGTTGAGTTATTACAGGTTTATTTAAAAGAGTTCGATGAACTTATACAAAAATTTCATGAATTAGAAAAAGCATCATCTGAGAACTTTGACGAGGAATCAGATGACGCGCAGAAATTAAAAATCACAGAGTAATTTAGAAATTACACATGTTTATTATAACATTTTTTACTCTGTGAATCACTAGAGGTGCAAAAAATGAATGAAATTAAATTAGAATATGACACACGTGTTTCAGTGGTACATTATGAAAGTTTAGACTCACGTTCATTTAAGAGCTTTTCAAAACCTAAATGGAATAAGTTGGTTAGTAAACTGTCTGTGCCTATAGAAGCAAATTATAAGTATGCACGTGGTGTTGCTGTTTACGGTGATATTAAAGACGGTACAAATAATCACGGTGAAATTATCGAAAAGCATCGAAATGATAAAAATGTCATATATCGAGATGTGATTGTACTTGATTACGATGAAATAAATGATTTAAAGCAATTACATGACGCAATCAGCTCAGTTTTAAGCAGTGTTGCATGGTTTTGGCACACATCGTTCAGCCATACAACTGAACAAGCTAGAATACGCCTGTATATCCCTCTGAATGAGCGGATCTATGCAGATGATTATCGTAAATATACAAAAGTATTAGCAAATAAAATTGGTCATAAAGTGGATGAAGGTTCATATCAGCCAAGCAGATGTTTTGCGTTACCAGTTATTCAAAAAGGACACATATTTATTAAGCGAGTGAATGACTGTCCAATTATGGATGTTGATATGCTCGAACAGTGGTTAAAGGAGTACGAACAATCAAATGCTAGTCCTAATATCATAGGATACACTCGACGCGATAGTGAGTACTGGCGTGAGTTAAGCTTTGGGGCAACTGAAGGCAGTCGTAACAATGCACTGGCTAGTTTGGTGGGGCATTTATTAAGATGTCACGTTAATGATTATATTGTTTATTCATTTGCTTTATTATGGGGACAATTCGCATGTAAACCACCTATGAAAGAACAAGAAATCAACGCCACTTTTCAATCGATATTAAATAAACACTATAACAATTAGAAAGGGGCTTTGTATGGAAACAGGTAAAAGTGATGTACTTGATAAAATTGAAAAAATTAATAAAAAAGATAGTGCCTTACAAGAAATTATACCGAAAGGCTATGAAATTGAACATCATCAATACGGTATTGCCTTATATCAACTTATATCAAGTAAAAAAGAAGGTGAACCAGATAAAAAGGTTTTTATCACAAGTACAATCCCTCAAATCACTGAACGCTTTGAAGATATTGAAAGTAACGAAGTCAGCTTTAATATGCTTTTCTATGACAATAAAACGCCGGTAAATATAGCTGTGAGTGCCGAAGAAATTTCAGATAGTCGTCAACTCTTGAAATTGGTTAATAAAAAGTTAGATGTAACATCATCGACATCTAATAAACTTGTTGACTATATTAACGTATCTAAAAGGTATAACCCACCATTAAATGTTAAAGTTGCAACGCGCTTGGGACATGTGAAAGGTTATTTTATTTATCCTTATCAAGAAGTAATGAAAGATAGCAATATCAAGTTGTTTAGTAATGATAAAGGATTTCAAAAGTTAATAGACTCTTTTAGAAGTAAAGGAACACTAGAAGGTTACTCTAAAAAGGTGTTTGCTCAAATAAAAGATCTACCAATGGTAATGGTTATGTTATATGCATCTTTAGGCTCAGTTTTATTAAGAGAATTTGGATTACAACCCTTTATTGTAGAAATATCAGGTAGTACATCCACAGGTAAAACATTCACACTCAACTTAGTATCAAGTGTTTGGGGAACCAGTGACCTTATTACGACATGGAGTTCTACTCAAAATAGTATTGAATCAATGGCATCATTTTTGAACTCATTTCCAATGTTTAAAGATGATACACGTAACACGCATCCTAAGTTTGTTACTAGTGCCACATATAATTTTTCTAGTGGCGAAAGTAAATCAAGAAGTAATATTAATTTAACGCTAAATGCTAAAAAAGAATGGCGAAATATTTTAATTTCTACTGGTGAATCATCTATCGCAAATATGGCTGATGAAAAAGCGGGTGTATCAGCACGTGTAGTTACACTACAAGATCAACCGTATCCGGATAACTTTGATTTTACTACATTAGATAAAGCATTTAGAGAAAACTATGGAACGCTAGGACTGGTATTTATTAAACAATATGAGTCAAAAAAAGACGTGTATAAGAACGCTTTTGAGAGCTATCAACGGTATTTTAATCAAAAAGGTAGTAATGAAATCATGCAACGTTTAGGACGTGCCTTTGCTTTACTACAAGTTACCGGTGAGGTTTTGAATGATATTGATGGATTTGAACATGACCATTTTAAAATTATTGAACAAGCCTATGACAGCATGCTTAAAAACAATAAGACGATTGATAAACCTAAGCAACTGTTAGAGGAACTATTACAATATTTAGATGCGAATAGAAATAATATTGTAGGTGACGGTTATGATTCAGTAAATTACGGAGATGTTAAAGCGGTATATAAACATGATTTTCTTTGTATTAAAAATGAGACTGTCAAAAATAAATTAGGTCATGAGATGCAGACGATTACAGGGCAATGGGACAAAAAAGGTTATTTAATAAAAGATAAAAAAAGAATTCAAAAACAAGTAAAACATAAATCTCAAAGGCATCTGGGTTATGCGATTAAAAAAGAAATAATTGAAGAACTAGGATTTGATTTCTCGGTTTCACATAATCCATATACAGAAAGTTATTAGTACACACCAGTACACGCTCAATTTTAAAATATGTGTATTCGATAAATTCAATAATATCAACAGTTACATGCAGATAGTACACGAAGTACACAATGTACACATATAAATATATGGTCATAGTTAAAATTAATAAAAAATTATCGTAGATTTCTAAATAATATACAACTATCACTAAAATTTCTGTGTACTTTGTGTACTAATTATCACGAGACTATATACATCAATGTTTTAGCCAGTACACGAATGTAAAAAAATAGTGTGTATTTAACTGTGTATGGTACACAATCAATATAAATATGGAGGTTACACATGGATAAAGAACAACTTAAAAAGTATATATACGATTATGTAAAAGAATATAAGGAGATACCGATATATCAGTTAGAAGATTTGTTTAAAGAAATGAATCACGACTATATAGGGAGAACTAGTATCACACACGATAAGGATGAGAATATTGTGTTTTGGAGTGGATGGAACAAAATTACAATGTTTGCGCTGATTGAATTAGTTGAAATTGAACAACTTGATTTAGTGTATAGAGGTAGTTTTGTAATGCGTTATTTGTTGGATGGTAGAGTTCCTAACTTACCATTAGCTATTTGTTATCCAGAAGATGGACAACAAACGGACGTGCCCTCATGGGTGCCTATGGTATTAAGAATAAATAAAGAGGAGAAAATCAAATGAACATAGAAACTATCGTAAACCAATTTGAAACACGAGCAGGCACGTTACTAAGGTACTACACAGGATTATTAGAACATAGTAAAGTGCAACCATGTTGCTTTAAGTTATACAATGATCCATTTGATATGGCATACGTGATGATGAATGGGAAGTTATTCGGTCATGTATATATTAAAGATTGTAAAGTAAGGCAATCATTTGAATTAGCGTCACCTAAGCACACTGAGGGGCTTATAAGAAGTATAGAAGGTCATTATGTAGGTTATGAATTACATGACGGTAAACAGCTTTCTATTAGTGATATGATGGCCAGTCAATTATTTGAAGATGAGTATTTTATGTATGGATTACAAACATATGCAGAATCAAATAATAGTGATGTGTTTGAGTACCTAGAAAATGGATTTGATACCGATACACTTGAGGGCATTCAATCGAGTAATACTGATGTGATAGCGAATATTGAAATGTTGTATCAGTTAGCTACAGGAATCAATGAACCAGCACCAGAGTTAGTTGAGGGGTTGAGATTAGTAACTGAGTTTGTACAAGATGAGAATGCGACACAAGAGGATTACAAGGCTTTAGAATGTAAATTGAATAATCTAAAAGCGTCTTACTATAGCTTGAGTAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP014064|2790149:2800969|2795714_2795942_+|AMG43190.1|DBSCAN-SWA MTKLTYPMLYITRKEKGDTQKKVASKLGISPQRYQLKESGKAIFNLNECQILSEMYDMPIDELFSSKIKVEGSRQ >CP014064|2790149:2800969|2797048_2797918_+|AMG43194.1|DBSCAN-SWA MNEIKLEYDTRVSVVHYESLDSRSFKSFSKPKWNKLVSKLSVPIEANYKYARGVAVYGDIKDGTNNHGEIIEKHRNDKNVIYRDVIVLDYDEINDLKQLHDAISSVLSSVAWFWHTSFSHTTEQARIRLYIPLNERIYADDYRKYTKVLANKIGHKVDEGSYQPSRCFALPVIQKGHIFIKRVNDCPIMDVDMLEQWLKEYEQSNASPNIIGYTRRDSEYWRELSFGATEGSRNNALASLVGHLLRCHVNDYIVYSFALLWGQFACKPPMKEQEINATFQSILNKHYNN >CP014064|2790149:2800969|2795938_2796112_+|AVC42095.1|DBSCAN-SWA MKMYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGFNLTGEITTCENKLLLQKQ >CP014064|2790149:2800969|2796667_2796985_+|AMG43193.1|DBSCAN-SWA MNWEIKDLMCDIEVIKEKINDVAIKHGWFVEDKFVKNELETKQEHISYSAGYLEHRIQNEHTVELLQVYLKEFDELIQKFHELEKASSENFDEESDDAQKLKITE >CP014064|2790149:2800969|2793555_2794662_-|AMG43187.1|integrase|DBSCAN-SWA MSYNLNLSHNIYKDAKRGTYYFRITYYDKSNTRKYITRKGFKQRKDAVKKCNEMMDELEGVGHLNRLPFDKLVEEYIDWYSARRKTSSVKALKTHTNNHLLPYFKSMDVFKMTTQDVMKFQNKKLKEGHSGDYLKKMHVYLVSLLNHAMKFHELKQNVASLVGNFEIESQKRLNYWTLEQFNQFYGALVTQQQKLFFKLLFYSGARKGEIRALTWRDINFDDDFIHINKTDYHGEVTAPKTKSAIRDIYLPTHMMGDIKNYLNWYKENNIFKDDYVLFGTFYKAYSESTIDRWFTNALKVLDEQLPNGQNFPRIVIHELRHSHASMLVNLGASVMIIAQRLGHSDTTEVYNRYGHLYPSTQKEIVKYL >CP014064|2790149:2800969|2792528_2792993_+|AMG43186.1|DBSCAN-SWA MAKKKSPGTLAENRKARHDYNIEDTIEAGIVLQGTEIKSIRRGSANLKDSYAQVKNGEMYLNNMHIAPYEEGNRFNHDPLRSRKLLLHKREIFKLGEQTREIGYSIVPLKLYLKHGHCKVLLGVARGKKKYDKRQALKEKAVKRDVTRDMKARY >CP014064|2790149:2800969|2790149_2792507_+|AMG43185.1|DBSCAN-SWA MNLKQSIEEIINQPEYEPMSVSDFQDALGLSSADSFRDLIKVLVELEQSGLIERTKTDRYQKKHSSKGHSKLIKGTLSQNKKGFAFLRPEDEDMEDIFIPPTKINRALDGDTVIVEIHQSKGEHKGKIEGEVKSIEKHSVTQVVGTYSEARHFGFVIPDDKRIMQDIFIPKGQSLGAVDGHKVLVQITKYADGSDNPEGHISAILGHKNDPGVDILSIIYQHGIEIEFPDEVLQEAEAVPDHIENTEIKGRHDLRDELTITIDGADAKDLDDAISVKKLANGNTQLTVSIADVSYYVTEDSALDKEAYDRATSVYLVDRVIPMIPHRLSNGICSLNPHVDRLTLSCRMEIDASGRVVKHEIFDSVIHSDYRMTYDAVNQIITEKDPNIREQYKEITPMLDLAQDLSNRLIQMRKRRGEIDFDISEAKVLVNEVGIPTDVQLRQRGEGERLIESFMLIANETVAEHFSKLNVPFIYRVHEQPKSDRLRQFFDFITNFGIMIKGTGEDIHPTTLQKVQEEVEGRPEQMVISTMMLRSMQQAHYDDVNLGHFGLSAEYYTHFTSPIRRYPDLTVHRLIRKYLIEKSMDNKEVKRWEDKLPELAEHTSKRERRAIEAERDTDELKKAEYMIQHIGDEFEGIVSSVANFGMFIELPNTIEGMVHIANMTDDYYRFEERQMALIGERQAKVFRIGDTVKVKVTHVDVDERLIDFQIVGMPLPKNDRSQRPARGKTRGKSLDKSKSDDKGRKKKGKQRKGKNQRNNDKSGNSKHKPFYKDKSVKKKARRKKK >CP014064|2790149:2800969|2796078_2796282_+|AMG43191.1|DBSCAN-SWA MRKQVIITKTVVGWYNIKDTQHNLMLNIPPKVFEQYFPDVSKDVQVACLEMDLSKITEIKNKKKVGS >CP014064|2790149:2800969|2794667_2795315_-|AMG43188.2|DBSCAN-SWA MSQQSILANNIKKIRKELGLTMEEFGEKFTHKAHKSIVSKWEKGLTKPSNERLKEIAKLGNISVHQLIYGDFLGLLESIANEEIKFILDTNMCANNSFLANELSSSVSRFIFSYYERGKENFNENLFRKLLQHYLQLELDLGNRDLESLTYFAYQRTINAQELVVDYYEDSKAKEFLKDESIDEFLTTISNKYFDLLEYIDDYRVKHDLEKISEE >CP014064|2790149:2800969|2799950_2800331_+|AMG43196.1|DBSCAN-SWA MDKEQLKKYIYDYVKEYKEIPIYQLEDLFKEMNHDYIGRTSITHDKDENIVFWSGWNKITMFALIELVEIEQLDLVYRGSFVMRYLLDGRVPNLPLAICYPEDGQQTDVPSWVPMVLRINKEEKIK >CP014064|2790149:2800969|2800327_2800969_+|AMG43197.1|DBSCAN-SWA MNIETIVNQFETRAGTLLRYYTGLLEHSKVQPCCFKLYNDPFDMAYVMMNGKLFGHVYIKDCKVRQSFELASPKHTEGLIRSIEGHYVGYELHDGKQLSISDMMASQLFEDEYFMYGLQTYAESNNSDVFEYLENGFDTDTLEGIQSSNTDVIANIEMLYQLATGINEPAPELVEGLRLVTEFVQDENATQEDYKALECKLNNLKASYYSLSK >CP014064|2790149:2800969|2797931_2799641_+|AMG43195.1|DBSCAN-SWA METGKSDVLDKIEKINKKDSALQEIIPKGYEIEHHQYGIALYQLISSKKEGEPDKKVFITSTIPQITERFEDIESNEVSFNMLFYDNKTPVNIAVSAEEISDSRQLLKLVNKKLDVTSSTSNKLVDYINVSKRYNPPLNVKVATRLGHVKGYFIYPYQEVMKDSNIKLFSNDKGFQKLIDSFRSKGTLEGYSKKVFAQIKDLPMVMVMLYASLGSVLLREFGLQPFIVEISGSTSTGKTFTLNLVSSVWGTSDLITTWSSTQNSIESMASFLNSFPMFKDDTRNTHPKFVTSATYNFSSGESKSRSNINLTLNAKKEWRNILISTGESSIANMADEKAGVSARVVTLQDQPYPDNFDFTTLDKAFRENYGTLGLVFIKQYESKKDVYKNAFESYQRYFNQKGSNEIMQRLGRAFALLQVTGEVLNDIDGFEHDHFKIIEQAYDSMLKNNKTIDKPKQLLEELLQYLDANRNNIVGDGYDSVNYGDVKAVYKHDFLCIKNETVKNKLGHEMQTITGQWDKKGYLIKDKKRIQKQVKHKSQRHLGYAIKKEIIEELGFDFSVSHNPYTESY >CP014064|2790149:2800969|2795472_2795679_+|AMG43189.1|DBSCAN-SWA MKNKVSNYRRYIGLTQNQMANNLKISVTAYRNKERGITPFKDSEKVFIKNKLIENGIKDITIDDIFFN >CP014064|2790149:2800969|2796283_2796667_+|AMG43192.1|DBSCAN-SWA MEIKQKYQLSKVVKILEVVLYEEDKFQSDKDYHYQDKAFYEYALKLVHNGLFNILAELDFEDEAFLILDEVTMTLSDVMKETQHVYRYSVIDEKGEHKHTTDRKGHVFGMLEWALDYIVGNIEVEEL |
14 | Staphylococcus_phage(80.0%) | integrase | attL 2781218:2781233|attR 2800295:2800310 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014064.2|AMG41685.1|1195723_1195900_-|hypothetical-protein |
1195723_1195900_-
Protein sequences of CP014064.2|AMG41685.1|1195723_1195900_-|hypothetical-protein>CP014064.2|AMG41685.1|1195723_1195900_-|hypothetical-protein MKHLTKIFVVLAIILFIIGYYLQATNHESQGIKLLLAAIMFMICAFISRSNDRRKNSK |
58 aa aa | NA |
WHTH_GntR
WHTH_GntR HTH domain information
|
NA | 1171098-1253193 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 8.2|2773129|23|CP014064|CRT matches to CP014064 position: 1248310-1248332, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** 2. spacer 8.4|2773246|23|CP014064|CRT matches to CP014064 position: 1248310-1248332, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** |
|||||||||||||||||||||||||
CP014064.2|AMG41686.1|1196142_1196241_-|hypothetical-protein |
1196142_1196241_-
Protein sequences of CP014064.2|AMG41686.1|1196142_1196241_-|hypothetical-protein>CP014064.2|AMG41686.1|1196142_1196241_-|hypothetical-protein MMWWQEGMMTLITGGLLIIFRLWLELKWKNKK |
32 aa aa | NA |
WHTH_GntR
WHTH_GntR HTH domain information
|
NA | 1171098-1253193 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 8.2|2773129|23|CP014064|CRT matches to CP014064 position: 1248310-1248332, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** 2. spacer 8.4|2773246|23|CP014064|CRT matches to CP014064 position: 1248310-1248332, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 15431
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP014063|0:15431|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP014063|0:15431|5605_6025_+|AMG40492.1|DBSCAN-SWA MELDNCINYLLSTSQNRVFKQFKSLLSPYNITPAEYGVLNCLINSNLNTPKAIGNTLNLEPSTISGILDKMSKKDLITRQTDNENRRTVLINSTNKAKDLWPTLEKKAYQLNNHYFANLTNEETVVFKKILLKINETTF >CP014063|0:15431|9868_10447_+|AMG40496.1|DBSCAN-SWA MKIGYARVSTGLQNLDLQEDQLNQYGCEKIFNDHMSGSKSKRPGLDKAIEFARSGDTIVVWRLDRLGRNMEDLIILVNELNNRGVSFHSLEENITMDKSSSTGQLLFHLFAAFAEFERNLILERSSAGRIAARARGRYGGRPEKLNKQDLKLLKTLYDNGTPIKTIAEQWKVSRTTIYRYLNKLNNQENKDK >CP014063|0:15431|9224_9605_+|AMG40495.1|DBSCAN-SWA MANKQVEISMAEWDVMNIIWDKKSVSANEIVVEIQKYKEVSDKTIRTLITRLYKKEIIKRYKSENIYFYSSNIKEDDIKMKTAKTFLNKLYGGDMKSLVLNFAKNEELNNKEIEELRDILNDISKK >CP014063|0:15431|10573_11185_+|AMG40497.1|DBSCAN-SWA MIIGYARVSSVDQNLERQLDNLKTFGVEKIFTEKQSGKSVENRPVFQEALNFVRMGDRFVVESIDRLGRNYDEVINTVNYLKDKEVQLMITSLPMMNEVIGNPLLDKFMKDLIIQILAMVSEQERNESKRRQAQGIKVAKEKGVYKGRPLLYSPNAKDPQKRIIYHRVVEMLEEGTAISKIAKEVNITRQTVYRIKHDNDLVS >CP014063|0:15431|4510_5482_-|AMG40491.1|DBSCAN-SWA MFNAVVVRKSASNVSYKVETVDESHLSKGDVLVKVVYSSINYKDMLALQYKGGVIRDYPMIPGIDFAGIVESSSNDKFKEDDNVLVTGYDVGVTHTGGFSEYAQVPGEWIVPIPQEMSIKESMVYGTAGFTAALSIFELEKYGMNIKSQPEILVSGATGGVGSVAIQILRKIGYENITAIVRKEKQIEIAKKLGAKQVIIIEDDNKPLKKGIFDYFLDTVGSNVTLYGLKRLNYQGVATVCGNVAGNSLNANILPFILRGIKLIGIDSVYVDHNIREDIWSKLANEWNIGNSLLYNEIGFEEFYKTIDQLLKGQHLGRTILRV >CP014063|0:15431|7477_9235_+|AMG40494.1|DBSCAN-SWA MAKLLITSVVSFCFIFLLLVFFKYILKRYFNYSLNYKVWYLTVLAGLIPFIPIKFSFIKLNNVNNQAPTVESKSHDLNHNINTTKPVQEFTTDIHKFNWDSIDNICTVVWIVLVIILSFKFLKSLLYLKYLKKQSLYLNENEKNKIDTILFNHQYKKNIVIRKAETIQSPITFWYGKYIILIPSSYFKSVIDKRLKYIILHEYAHAKNRDTLHLIIFNIFSIVMSYNPLIHIVKRKIIHDNEVEADRFVLNNINKNEFKTYAESIMDSVLNIPFFNKNILSHSFNGKKSLLKRRLINIKEANLKKQSKLIPIFICIFTFLLMVIQSQFLMGQSITDYNYKKPLQNDHQILDESKNFGSNSGSFVMYSMKKDKYYIYNEKESRKRYSPDSTYKIYLAMFGLDHHIISDKNSRMSWNHKHYPFESWNKEQDLNTAMQNSVNWYFERISNQIPKNYTAAQLKQLNYGNENLGSYKSYWMEDSLKISNLEQVIVFKNMMEQNNHFSKKAKNQLSSSLLIKKNEKYELYGKTGTGIVNGKYNNGWFVGYVITNHDKYYFATHLSDGKPSGKNAELISEKILKEMGVLNGQ >CP014063|0:15431|11455_13678_-|AMG40498.1|DBSCAN-SWA MIKLKEFQEKMVDKLLRFTAPDYKVNELLIKAPTGSGKTICLLSWINDYIISTHDDVVFVWFTPGAGELEEQSKDKAKGFTNIKSQSVDEALNQGFEKETVTFINYERVTGKKKKAMMTDSEKDNLEDKINEAFRKGYHFILVIDEAHRNDTKKARDIISKFKASKIVRVSATIENPNNPDKIEFYEIDENDVINSGLITKSVIVNEGIDIDINVENEFDLLFNAAEIKRKEILNAYQDKNINNINPLVLVQLPDKTDNEDFLVQKIENYIKKNLKKDYENSTLGIWLSDKKKNHFNISDLNNPVEYLIIKQAVATGWDAPRAKILIKIRENMGEVFTIQTIGRIRRMPQPKLGHYNIDVLDNAYLYTFDKDFLNGAFAVGQAVAPTPILKLKESAKTLSLISERVYNQEIEKDEKVIFKNLFLGLKQAWHTTEDFNENAEIIRNYGMIIGTTIKTTFKQGRFSTLENAERLEDVERLIEVDYRKNRIDLLHVFHELSRVTHLPISKVEVILKKLFLDNKKMEKEKLLKLNSQEWTAFILNNWRYLREEFKKIDIQLSLTLDLSEIQQNDFKFPLEERYTYNPELPSRIIITNAYDGYLSSTIATRPSLVERLFERYVEQNADIIDFIYKNGDKGTQYFSLTYKSNGGLHHFYPDYIVQLKNKEVYIIETKAGKTKDGIDKNIDPYSPVKFESLKDYSLRHNVKWAFVRDFNEELWYLNSGIWSDDMYRWTTIDKLFEEK >CP014063|0:15431|6525_7371_-|AMG40493.1|DBSCAN-SWA MKKLIFLIAIALVLSACNSNSPHAKKLNDLEKKYNAHIGVYALDTKSGKEVKFNSDKRFAYASTSKAINSAILLEQIPYNKLNKKIHINKDDIVAYSPILEKYVGKDITLKELIEASMTYSDNTANNKIIKEIGGIKKVKQRLKELGDKVTNPVRYEIELNYYSPKSKKDTSTPAAFGKTLNKLIANGKLSKENKKFLLDLMLNNKSGDTLIKDGVSKDCKVADKSGQAITYASRNDVAFVYPKGQSEPIVLVIFTNKDNKSDKPNDKLISETAKSVMKEF >CP014063|0:15431|3564_3915_+|AMG40490.1|DBSCAN-SWA MLIEYNNKSFYTSKDLALSVIGGRWKIAIVYHLLHSNRLRLSELQNKLPDINQRMLIRQLRELEQDKILERTVYPVVPPKVDYRLTEIGLKLDKVVFSICDWGDDFLDTVKINNHR >CP014063|0:15431|2219_2738_-|AMG40488.1|DBSCAN-SWA MTKKVAIILADEFEDIELTSPKEALENAGFETEIIGDTAKQELVGKHGEKVTVDISISDAKPENYDALLIPGGFSPDHLRGDEEGRYGTFTKYFTQNNVPTFAICHGPLLLVDTDHLNGRTITGVINVRKDLSNAGAHVVDESVVVDNNIVTSRVPDDLDDFNREIIKQLEA >CP014063|0:15431|13670_15431_-|AMG40499.2|DBSCAN-SWA MSSEFIERPFKNEKDEAIKYISNLLNKAKNKNELYDAQNLEEVLRLLNSKKYGLVWEEHKEKVEEKLKTHIPVFKEDKERKINGMKNINDFNFLLEGDNLHSLYLLEKTHTNKIDLIYIDPPYNMGQKDFKYNDDYVDKDDNYYHSKWLSFMKSRLLMAKKLLTEDGILAVSIDYHEGFQLKLLLDEIFGENNFASDLHVETSAIAGPRRIAAMKGSIVKTTEYVLIYTKNSSKKVIKKPMYDKIEGFDSHYSKFLNSESGILENFTETLRRTKNISDIFEKYNMKINLENLGKLVYLEKEVSDWLYDKSISANLFRIDKIFKDKSINLEKGLNIVNGKYVVFNTNGNPYYAFRYSERIGDTSGFIESFGERAVRGNLWKGFSSDGGNLKKEGSVDFKKGKKPLRLIKQLVMTLLGDKQDTIILDFFAGSGTTAHAVAALNKEDGGNRKYIICTNNENNICEEVTYKRLENIQSDLPHNVKYFKTCFIEKELFPDIELESELLKYITPLVELEFTTDIKNPLYQIILSNEQLESLLESNNIKSNSVLFMHPEVLLGREEKKMIKSLDVRIEEIPDYFFGKELWAND >CP014063|0:15431|2826_3462_-|AMG40489.1|DBSCAN-SWA MKLQLAIDLLDQKEAAKLAQEVEEFIDIVEIGTPIVINEGLSAVEHMSKSVTNTQVLADLKIMDAASYEVSQAIKFGADIVTILGVSEDASIKSAIEEAHNNGKELLVDMIAVQNLEQRAAELDKMGADYIAVHTGYDLQAKGVSPLESLRTVKSVISNSKVAVAGGIKPDTIKSVVVEQPDLIIVGGGIANADDPKAAAKKCRDIIDGNA >CP014063|0:15431|1250_2021_+|AMG40527.1|DBSCAN-SWA MKTIKMVADELNVTKQTIVNNAKSLNISFEKENGINYINDNDCLKIIEKITKKERTMQNKESIKKERFNENTAEFEKHIYNNSNSFESLKTKVNELEKQIEIFETRAKNDEKYIENLTKQLDQQNSNVNTLNKLLENQQILALESNKKIQKLENQLEEERQLNYSFDTATNDRQSINPQEATFTEEYQNINQQQKKIQPIKAELNHKGISEAKKDDSANKDVLKRDDKLSEEKESGPEDREVETPKKGFWSRLFGS |
13 | Salmonella_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
19910 : 22724
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP014063|19910:22724|DBSCAN-SWA TATGAGTTATGAAAATACTTGTGATGTGATCTGTGTACATGAGGATAAAGTTAACAATGCTTTAAGTTTTTTAGAAGATGATAAATCTAAGAAATTACTTAACATTTTAGAAAAAATTTGTGATGAGAAGAAATTGAAAATCATATTATCTTTGATTAAAGAAGATGAGTTGTGTGTTTGTGATATTTCTTTGATATTGAAAATGAGTGTTGCTTCAACTTCACATCATTTAAGGCTTTTATATAAAAATGAGGTACTTGATTTTTATAAAGATGGAAAGATGGCATATTATTTTATTAAAGACGATGAAATAAGAGAGTTTTTCTCTAAAAATCATGAGGGTTTTTGAAACGAGTGAAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATGCTATATAGAAATAACGTTCTTTTCTAAAATCCTTTTGAAGCGTTGATATGACGGCGTTTCATACTGTTTTCCGTGGGGAAAATAAAATTTGACATAAAAAAACTCCAGTAATATGATTAAGGTGTCTAATCTAAATCAATACTGGAGGTCTTTTTATATGCAATACAATACTACTAGATATATAGACGAAAATCAAGATAATAAAACATTAAAAGATATGATGAAAAATGGGAAACAGCGCCCATGGAGAGAAAAGAAGGTTCTGTTGCAAAGTTAGAAATATAGTATAATAGTCAACAAAAATGAGGTGCAGAGGATGAATTATTTCAGATATAAGCAATTTGACAAAGATGTCATTACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTAAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTGAGAGAACGAGGCATCTATGTTCATCATTCAACAATTTATCGATGGGTACAGGAATATGCTCCTATTTTGTATCAAATTTGGAAGAAAAAGAATAAGCAAGCTTATTATAAATGGCATATAGACGAGACGTATATCAAAATTAAAGGGCAATGGCATTATTTATATCGCGCTATTGATGCAGATGGCCATACACTAGATATTTCGTTACGTAAGAAACGAGATAATCACTCAGCATATACGTTTATTAAACGTCTTATTAAACAATTTGGCAAACCTCAAATGATAATTACAGACCAAGCCCCTTCAACGAAGGTGGCAATGTCCAAAGTGATTAAAGATTTTAAACTTACCCCCAACTGTCATTGTACCTCTAAATATTTAAATAATCTCATTGAACAAGATCATCGTCATATCAAAGTAAGGAAAATAAGTTATCAAAGTATCAATACGGCAAAGAATACGATCAAAGGCATTGAATGTATTTATGGACTATATAAAAAGAACCGCAGATCTCTTCAGATCTAAGGGTTTTCGCCATGCCGTGTAATTAGCATCATGCTAGCTAGTTAATACGAAGTATTATTTTAAACATAAGGTTAGACACTTATTTTTTAACTTTGCAACAGAACCTATTAAGGACTATACAATTAAACTCAGAGAACAGAAAACCCGTAAACAAAAACAAATCCCCCTTTATCATCTAAAGAAGGATATTGATCGTTATATTCAGTTCCTGGAGGATGAAGATTATTTGTTTAAAAGCAATAAACTCGATTCTGAGGCCCAAATTAAACCTATCAGTCGTGTACAGGCTTATCGAATTCTTAATCATTCAGCAAAATCAATCGGTTTAAGTGAAATTGGTACACACTCGATGCGTAAAACCTTTGGTTACCATTACTACAAGAAAACAAAGGATGTGGCTTTGTTGATGGATTTATTTAATCATTCTTCTCAGGTTGTTACATTGAGGTATGTTGGAATCAGTCAAGAAGTTATAAATTCTTCAATAAGTGAAACAATGCAAAATGTCTATTATTAATTGTAAAGATATCTCATTATGTCTTTGCTAAAGTTTAAATAAATATAATTTTACATAGTGATACTCTACTCAAGACTATATATTAGGATGTCAGGATATTTTTAATTCCTCTAATCTTTATTGGGTATAATTAAAGGAAATATAGAGACTGGGGGAATAAAAGAGTTACACGCTAAAAGGTTGGTTAGTTTGTTGAAATCTAATAAAAAATATTATCTTTATATAGGATTTCAAGAATGTCCGTATTGCCGAGATTTTTCTGAAACATTAAGAGAATTTAGTAGTAATGCCAATCTCCCTATTTATTATTTTAATTTAAACAGTGGAAACTCTAAACTAAATGAATCAGATAAAAAATTCATAGAAAAGGTATTGAACGAAAGTGTAAATTTAAGAGGAACTCCTACATTTTTAAAGATTGAAAAGAAAAAAATAATTGCTAAATTTGAAGGTTCTCAGACAACAATTAGAGATTTAAATGATATTAATTAAAGTATATAAGGTGTGAAAACTATGTATAAAAATTTTGACTTATTTTTAGGTATTGTATCATTACTATCTGCAATAATCATTTATATTATTGATTCAGATAGTAAAGGGATAGCTCTCGTAGTTTTAATAATGGGGATAGTATTTATTTTGACTAGTATGATACGAAAAAAAGACAAGTTCAAAGTATAATTTACTTTGAACTTGTCTTTTTTGTCATATATATTTGACAAAAAAGGGATGAATATGTACAATATATGCGACATTGAGGTGAAGATAATTGAATAAAATAAAAGAATTTAGGAAAAAAAAGGGGTTATCACAATTAGATTTAGCTAGAAATATTTTAGTCTCTAGACAAACTATAAATTTGATTGAAAATAACAAATATAACCCATCGTTAGATTTATGTTTAAAATTAGCAAGTGTGTTAGAAACAGATTTAAATTCATTGTTTTGGGAGGAAAAAGACCATGAATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP014063|19910:22724|19910_20258_+|AMG40504.1|DBSCAN-SWA MSYENTCDVICVHEDKVNNALSFLEDDKSKKLLNILEKICDEKKLKIILSLIKEDELCVCDISLILKMSVASTSHHLRLLYKNEVLDFYKDGKMAYYFIKDDEIREFFSKNHEGF >CP014063|19910:22724|20607_21237_+|AMG40506.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFDKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGIYVHHSTIYRWVQEYAPILYQIWKKKNKQAYYKWHIDETYIKIKGQWHYLYRAIDADGHTLDISLRKKRDNHSAYTFIKRLIKQFGKPQMIITDQAPSTKVAMSKVIKDFKLTPNCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKISYQSINTAKNTIKGIECIYGLYKKNRRSLQI >CP014063|19910:22724|21943_22246_+|AMG40528.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MLKSNKKYYLYIGFQECPYCRDFSETLREFSSNANLPIYYFNLNSGNSKLNESDKKFIEKVLNESVNLRGTPTFLKIEKKKIIAKFEGSQTTIRDLNDIN >CP014063|19910:22724|20448_20568_+|AMG40505.1|DBSCAN-SWA MQYNTTRYIDENQDNKTLKDMMKNGKQRPWREKKVLLQS >CP014063|19910:22724|21343_21754_+|AVC42024.1|integrase|DBSCAN-SWA MKDYTIKLREQKTRKQKQIPLYHLKKDIDRYIQFLEDEDYLFKSNKLDSEAQIKPISRVQAYRILNHSAKSIGLSEIGTHSMRKTFGYHYYKKTKDVALLMDLFNHSSQVVTLRYVGISQEVINSSISETMQNVYY >CP014063|19910:22724|22523_22724_+|AMG40507.1|DBSCAN-SWA MNKIKEFRKKKGLSQLDLARNILVSRQTINLIENNKYNPSLDLCLKLASVLETDLNSLFWEEKDHE |
6 | Streptococcus_phage(50.0%) | bacteriocin,integrase,transposase | attL 11349:11370|attR 30188:30209 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
26278 : 34940
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP014063|26278:34940|DBSCAN-SWA AATGAAAAAAATACCCTTTATCCAACAAGAAGATGCAAAAGATTGTGGTCCTGTATGTATCGCGATGATATGTAAATTTTATAATAAAAAAGTATCAATAGAAAAGCTTAGAAAAATTTCTGGTACCGACAACAATGGTACTAACCTATTTGGCCTTATAGAACTTGGACAATATTTAGGGCTTGAACTCAGCGGAGTACAGGCGGAAAGTACAAAAAATCTATATGAAATCCATTATCCGTGTATAGCGCACATAATTAATAAAAAAGGGAGCGAACACTTTGTTATAATTGAAAAAGTTTTAAATGATAAAGTTTATATTGTAGATCCTGATATTGGTAGATATTCTACATCTTTAAATCAATTTGATACATACTGGACTAAAATATTACTTCTCATAGAAAAAAAAGACGATTTTACTACATATGATGATAGGCCTTCCATATCCACTTTGTTTCGTAGTTTAATTACTCATAATAGTAAATATATAGGATTAATAATTTTATCTTCTCTATTAATCAATTTATTTGGATTTCTCGGTACTTTTTATTTTAAGTTGCTGATTGATGATATATTACCTAGTAATATAGTATATAACCTTCATATATTGTCTGGATCTATCTTACTAATGTATCTTGTCCAATCGTTGATTACATATTTCAGATCTCATCTAATACTTTTCTTAAGTCTGAAAATTGATATAAAAATTATGCTTGATTATTATAATCATGTATTAAAGTTACCTATGGGTTTCTTCGAAACACGTAAGTCTGGAGAAATTCTTTCAAGATTTATGGATAGTAATAAAATCAGAGAAGCTTTTTCTACTGTTACAGTTACGTTTTTTATTGATACTTTAATGATTTTCTTAGGTAGTATTCTACTGTATTTACAAAGTAGTAGACTATTTTTTATTACTCTAATATTTGTGCCTATCTATATATTATTGGCATTAATGTTTAGAAAACCTTTTGAAAAATATAATCGCCAACAAATGGAACAAAATTCTGAGCTTAATTCTTATTTAATTGAAACCATTAACGGTATATCCACGATAAAAAGTTATACTGCAGAAGAAGAAGTATCAATTAAATCAGAAAAGTTTTTCATTCGTCTAATTAAGAAAGTTTTAAAGTTAGGTATTATAACTAACATACAGATGAGTATAAAAGGATTTTTGTCACTATTAATCAGTACGGTTATTTTATGGATAGGTTCATATTATGTTATTAATAATCAAATGACTTTAGGCGAACTCATCACATTTAATGCCCTTGTTGTTTATTTTTTAGGTCCTATTGAACGCATGATAGATGCCCAACCTGTTATACAATCAGCAATCGTTGCGTCTAGAAGAATTGTTGAAATACTCGATTTAGAAGTAGAGGATAAAGAAAATGCTGTATCAGAATTCTCATTTAATAATCAAATACAGATAAGTAATCTATATTTTAACTATGGTCATCGAGAAGATTTATTAAAAGATATTAATATTACAATACCTAAAGATACTTTTGTTGCTTTAGTAGGAGAAAGTGGTTCCGGTAAGTCAACATTAGCGAAACTTCTAGTTAATTACTATCAAGCAAAACAAGGCGATATTCAGATAGATCAAAAGAATATAGTCTCTATTGAAAATAAGTCTTTAAGAAAAAACATAGGCTATGTATCACAAAAGAATTTTTTCTTTAGTGGGTCAATTATAGAAAACCTATTACTGGGTAATGATAAGCATATCACCATGGATGAAATAATATGGGCCTGTAAAAACGCTGAAATACATGATTTTATTGAAGAGTTGCCTCAAGGATATCAAACTACTTTAGAAGCTGATGGTGATAATTTTTCTGGGGGACAACTACAGAGACTTGCTTTAGCTAGATTATATATTAAAAATCCTGAGGTCTTTATATTAGACGAAGTTACAAGTGCTTTAGATTCTACGACAGAAAACAAAATCATCAATAACTTACACAGTGTTTCTAAAAAAGGTAAAACAGTAATTATCATCTCACATAAGTTAAGTACTATTGAAAAAGTAGATAATATTTATTGTTTAAAAAATGGGAGAATAGTTGAACAAGGAAATCATAAGCAGTTACTATCAAACCGTTCAGAATATTATACACTATGGAAAAATCAAACAACGGAGGGAATATAATATGAAAAAAATATACTCCTTTGAAGATTTTCAAGATAGTACTGTGTATTTGAATAATTCTCCTTCAAAGTTCATAACAAGATCGCTCATAATACTCTTCATAATATTTATGGCCGTTATTATTTCTATATTTTTTATTAAAAAAACTGATTATATTAAATCCACGGCTGTAATAACACCAAAAAATAATCCTATTAATATTACAACAGATAAGGATATTAAAGTTAAAAAGCTGCTAAAAGATAATGGAGAATTAGTACAGCAAAAGGAGAAAGTTATTACTATTCAAGATATAAATAATGATAAGAAACAGATAACTTCTAAAATAAAATATAAAAAGGAGTCGTTAAAGGATTTATCATTACTCTATGATAAAATAGACAACTATCCTTTAGAATCAGATAAAAAACTGCATACTGATTATAGTGAAAAGTACTTTGAAAGCTATAAAAAACAATATAATCAAACAGACTACCTAGATAATTCACAACGTAACAACATTAAATCTCAAAGCCTTCAAATTCTAATTGAAAAAATAAATACTCTAAAAGATGAGTTACACGAGTTATCCGTAATTAAGGGAAATGACAATCAGGATTATGTAACCAAGAATGGTTATATTTTTTACCCTAAAGAAGTACAAGAAGGATTAATAATTCCTAAAGGTAAATTGCTCTATCAAATTTACAAAAATAGAGATAAAGAAGTAGTTACATATATTTCGAGTGAAGATATTTTAAGCTTAAATCCTAATCAAAAAGTCTCAATTACATTTAAAACAAAAAAAGATGAATTCTACCTTCAGGGGAATATTAAATATATTTCGAAATTCCCCGAAGAATCAAAAAATAATGAAACATTTTACAAAGTAAAAATTTCACTGAAAGATAAAATTCCTAAGCAACTTGAAAATGTATATTACCTTAAAGGTACCTCGTATGTTGAACTAGAAAAAGAGACAATAGCTCAATATCTGTATCGTAAAATAAAAGAATAAAAAATAAGTGTCTAACCTTATGTTTAAAATAATACTTCGTATTAACTAGCTAGCATGATGCTAATTACACGGCATGGCGAAAACCCGTAGATCTGAAGAGATCTGCGGTTCTTTTTATATAGTCCATAAATACATTCAATGCCTTTGATCGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATAACTTATTTTCCTTACTTTGATATGACGATGATCTTGTTCAATGAGATTATTTAAATATTTAGAGGTACAATGACAGTTGGGGGTAAGTTTAAAATCTTTAATCACTTTGGACATTGCCACCTTCGTTGAAGGGGCTTGGTCTGTAATTATCATTTGAGGTTTGCCAAATTGTTTAATAAGACGTTTAATAAACGTATATGCTGAGTGATTATCTCGTTTCTTACGTAACGAAATATCTAGTGTATGGCCATCTGCATCAATAGCGCGATATAAATAATTCCATTGCCCTTTAATTTTGATATACGTCTCATCTATATGCCATTTATAATAAGCTTGCTTATTCTTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATAGGAGCATATTCCTGTACCCATCGATAAATTGTTGAATGATGAACATAGATGCCTCGTTCTCTCAATATTTCAGATATATCACGATAACTTAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTAATGACATCTTTGTCAAATTGCTTATATCTGAAATAATTCATCCTCTGCACCTCATTTTTGTTGACTATTATACTATATTTCTAACTTTGCAACAGAACCATATAAGATGACTTATCGGAAGTAGATATGCTTGTATATTCACAGATAGTATAATAATAGAGTCGCCTATCTCTCAGGCGTCAATCTAGACGTAGAGAGGAGGTGTATAAATTGCATATTATCGCTTTTTTATCTAGAGAAATGCTGTTAAATTAAATTTATATTTATTGGCTTTGTATAGATCTGCATAGAAATTCAACTTTACAACAGAACCGTATTATCCATATCTTTTTCCTCGCCTTTTATAATAGCGATATCATTCGAATCATTAGGTATATACTCACAAATATTCATCTTACCAAATGGTGTGCTTAACCCTGAATGAACAGGATACACCGCACCTATACATCCATTTATTTTTCTATTACCAGCACAGTGTTTTGCTGTTAATCCTATTTTGTCTGTAATCATAGTTGCAGAACAATATACTGAATAGTCTGGATCATACCTTGCCGTATATTTACTTTTAGGATCTTTGGTTGTACCTACCAACTTTCTAGTTCCTAAATCTTCTGCATATGATATGTTAAATGACGAAAAAAACAAACCTATAGTAGCAAGAACAATCAATTTTTTAAACTTCATAATATCACTCCTCATTCATATTTTTTGTATACAAAAACAGAATAAATATTTTCTTTTAATAATAAAATATCATATAATGAAATTATATATAAATAACAATCAAGAGGAGATTTTTATGAAAAACAAATTACTTTTTAAAATTTTTTTGAGTTTATCTTTAGCATTAAGCGTTTATTCAATTAATGATAAAATCATAGAAGTATCTAATACTTCTTTAGCAGCTGATGTTAAAAATTTCACTGATTTAGATGAGGCAACTAAATGGGGGAATAAACTTATAAAACAAGCTAAGTATAGTTCGGATGATAAAATAGCTCTATACGAATATACAAAAGATAGTTCTAAGATAAATGGTCCATTAAGACTCGCAGGTGGAGATATTAATAAGCTAGATTCAACAACTCAAGACAAAGTAAGAAGATTAGATTCATCTATTTCTAAATCTACTACTCCTGAATCTGTATACGTTTATAGACTTTTAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP014063|26278:34940|34265_34940_+|AMG40520.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFDKDVITVAVGYHLRYALSYRDISEILKERGVDVHHSTIYRWVQEYAPILYQIWKKKNNKAYYKWHIDETYIKIKGRWCYLYRAIDADGHTLDIWLRKKRDHQSAYAFIKRLIKQFGKPQMIITDQAPSTKVAMTKIAKVFKLNPYCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSLNTVKNTLKGIECIYGLYKKNHRSLQIYGFSPCHEISHMLAS >CP014063|26278:34940|30410_30794_-|AMG40516.2|DBSCAN-SWA MKFKKLIVLATIGLFFSSFNISYAEDLGTRKLVGTTKDPKSKYTARYDPDYSVYCSATMITDKIGLTAKHCAGNRKINGCIGAVYPVHSGLSTPFGKMNICEYIPNDSNDIAIIKGEEKDMDNTVLL >CP014063|26278:34940|31994_32669_-|AMG40518.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFDKDVITVAVGYHLRYALSYRDISEILKERGVDVHHSTIYRWVQEYAPILYQIWKKKNNKAYYKWHIDETYIKIKGRWCYLYRAIDADGHTLDIWLRKKRDHQSAYAFIKRLIKQFGKPQMIITDQAPSTKVAMTKIAKVFKLNPYCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSLNTVKNTLKGIECIYGLYKKNHRSLQIYGFSPCHEISHMLAS >CP014063|26278:34940|32776_33529_-|AMG40519.1|DBSCAN-SWA MKELIVIVLLLSVSQIKDNTFQTSSEDLHHKSELSSLALNNMRHNYFHRWPPVKGENKITNDQFLANTLLFKDFLTNHQYYNDLLVQFNSKETTDKFKAKTVDIYGLAYGFQCNGGEPNKTNCIYGGLTTHEDNKLDKPKNVPINLWIDGAQKRVSLDKVKTDKKTVTIQELDAQARYFLQGEYLLYHNDSFGGKIQKGFIEFHDANGFEVSYDLFDVKGDYPDTQLRIYNDNKTISSKNLHIDIYLFTK >CP014063|26278:34940|29476_30151_-|AMG40515.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFDKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGIYVHHSTIYRWVQEYAPILYQIWKKKNKQAYYKWHIDETYIKIKGQWNYLYRAIDADGHTLDISLRKKRDNHSAYTFIKRLIKQFGKPQMIITDQAPSTKVAMSKVIKDFKLTPNCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKISYQSINTAKNTIKGIECIYGLYKKNRRSLQIYGFSPCRVISIMLAS >CP014063|26278:34940|26278_28438_+|AMG40513.1|DBSCAN-SWA MKKIPFIQQEDAKDCGPVCIAMICKFYNKKVSIEKLRKISGTDNNGTNLFGLIELGQYLGLELSGVQAESTKNLYEIHYPCIAHIINKKGSEHFVIIEKVLNDKVYIVDPDIGRYSTSLNQFDTYWTKILLLIEKKDDFTTYDDRPSISTLFRSLITHNSKYIGLIILSSLLINLFGFLGTFYFKLLIDDILPSNIVYNLHILSGSILLMYLVQSLITYFRSHLILFLSLKIDIKIMLDYYNHVLKLPMGFFETRKSGEILSRFMDSNKIREAFSTVTVTFFIDTLMIFLGSILLYLQSSRLFFITLIFVPIYILLALMFRKPFEKYNRQQMEQNSELNSYLIETINGISTIKSYTAEEEVSIKSEKFFIRLIKKVLKLGIITNIQMSIKGFLSLLISTVILWIGSYYVINNQMTLGELITFNALVVYFLGPIERMIDAQPVIQSAIVASRRIVEILDLEVEDKENAVSEFSFNNQIQISNLYFNYGHREDLLKDINITIPKDTFVALVGESGSGKSTLAKLLVNYYQAKQGDIQIDQKNIVSIENKSLRKNIGYVSQKNFFFSGSIIENLLLGNDKHITMDEIIWACKNAEIHDFIEELPQGYQTTLEADGDNFSGGQLQRLALARLYIKNPEVFILDEVTSALDSTTENKIINNLHSVSKKGKTVIIISHKLSTIEKVDNIYCLKNGRIVEQGNHKQLLSNRSEYYTLWKNQTTEGI >CP014063|26278:34940|30909_31653_+|AMG40517.1|DBSCAN-SWA MKNKLLFKIFLSLSLALSVYSINDKIIEVSNTSLAADVKNFTDLDEATKWGNKLIKQAKYSSDDKIALYEYTKDSSKINGPLRLAGGDINKLDSTTQDKVRRLDSSISKSTTPESVYVYRLLNLDYLTSIVGFTNEDLYKLQQTNNGQYDENLVRKLNNVMNSRIYREDGYSSTQLVSGAAVGGRPIELRLELPKGTKAAYLNSKDLTAYYGQQEVLLPRGTEYAVGSVELSNDKKKIIITAIVFKK >CP014063|26278:34940|28439_29435_+|AMG40514.1|DBSCAN-SWA MKKIYSFEDFQDSTVYLNNSPSKFITRSLIILFIIFMAVIISIFFIKKTDYIKSTAVITPKNNPINITTDKDIKVKKLLKDNGELVQQKEKVITIQDINNDKKQITSKIKYKKESLKDLSLLYDKIDNYPLESDKKLHTDYSEKYFESYKKQYNQTDYLDNSQRNNIKSQSLQILIEKINTLKDELHELSVIKGNDNQDYVTKNGYIFYPKEVQEGLIIPKGKLLYQIYKNRDKEVVTYISSEDILSLNPNQKVSITFKTKKDEFYLQGNIKYISKFPEESKNNETFYKVKISLKDKIPKQLENVYYLKGTSYVELEKETIAQYLYRKIKE |
8 | Staphylococcus_phage(80.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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