Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014255 | Legionella pneumophila subsp. pascullei strain F-4185, complete genome | 0 crisprs | csa3,DEDDh,DinG,cas3,WYL | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
943173 : 950056
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP014255|943173:950056|DBSCAN-SWA ATTAATTATGCATCAGTTCCTGTAATGCTTTCCCGATGTTATCAGCTCTCATTAAACTTTCTCCAATCAAAAAGGCATTAATTCCATGGGATTGCATTAATTTTATGTCTTCACGGGTGTTAATTCCGCTTTCGGTAATAATAATTTTATCTTTAGGGGCCAGTTGTTTTAATTGGATACTCAACTGAATGTCTGTTTTAAAGGTGTGAAGGCTGCGGTTGTTAATGCCTATAAGAGGGGTAGGTAAGCGTAAGGCTCTTTCTAACTCATCTTGCGTGTGGCTTTCAACCAAAACAGACATTTTAAGTTCTTGAGCCAGTTGGCAAAAATCCATTAATTGCACATCATCCAATAAGGCGACAATCAACAAAATACAATCAGCGCCCAAGACGAGACTTTCGTAGATTTGATAAGAATCAATAATAAAATCTTTACGTAATACGGGTAAAGTACTTTTTGATTTTGCCAAGGCTAAATAATCCGGATGACCCTGAAAAAACTCAATATCCGTTAAAACAGATAAGCATCTTGCACCATGCTGAGTATAAGTTTTGGCAATTTCTGCAACATTAAAATCTTTTCGAATTAAACCCTTGCTTGGAGAAGCTTTTTTTATCTCAGCGATGATTGCCGGGGAAGCATTGGATTTTAAAGCGGTTGTGAAGTCACGTATTTCTCCCGGCCGTTGTTTTGACAGAACATGCAAAGGTTTGTTCTTTTTCGCGACTGCAATTTCCTCTAATTTATGCTGAGCTATGCGTTCTAGGATACTATTCATGATTTGATTCTTTATTTAAAGTTTGAGTCAATAAACGAAGTTTGTTAAAGCAATCATTTGCCTTACCACTATCAATAGCAATTCTTGCTTCCTCTATGGCCGCATCAAACGATATATCATCTTTGGCACAATAAATGGCTGCGGCAGAATTGAGAAGGACTATATCTCGAGCTGGGCCAGAATCACCGGAAAGTACTGATTGAATCAAATGCAGACTTTGTTCCGGTGAGTCCACTATGATTGCATCTAAAGAAGAATGCTTTAGACCATAATCTTCAGGAAAAATGAACCATTGCTTAAAATGTCCATCACGGTATTCAACCACTTCGCTTTTGGCCGCAATACTAATTTCATCCAGTCCATCCTGGGAGCTTATTACTAATGATCTTTCACTACCCAAATTAGCCAGAACAGTGGCTATTGTTTTGAGCCAACTCGTAGAAAATACACCAACAACTTGTCGTTTTACCTGAGCCGGGTTAATCAGCGGGCCAAGTAAATTAAATAAAGTCCTTATTCCTAATTGTTGTCTTGCAGCTCTCGCATGTTGCATGGCAGGATGATAATGGGGAGCAAACAAGAAAGCCAATTGACATTGGTTCATGCAGTCTTGTACATGTAAGTCAGAAAGATTGAGTATAAATCCAGCTTGTTCTAATAGATCAGCGCTGCCACTTCGGCTTGAAACAGAACGGTTACCATGCTTTGCAACCTTTATCCCTGCCGCAGCTGCTACAAAACCACATGCTGTCGATACATTAAAAGTATTTCTTCCATCTCCGCCAGTGCCAACTATATCAATGAGATTATTTCCTAAATCTATTTTGTGGGCTAATTGTCTCATGACTTTAGCAGCTGCAGTAAGCTCATTGACGGTTTCGCCTTTCATGCGCATTAATACCAGAAAGGTTGCAATTTGCACATCACTAAACTCACCTGTCATACAAGCATGGATGATCTCTTGCATCTGTTCTGAGCTCAAATCCTGTCGGGATAGAAGCTGTTCAAATAGAAGTTTGGGTTTCATAACGTAAAAAATTCTCGAGTATTTGTAAGCCAAATTGACTTAATATGGCTTCAGGATGAAATTGTAGACCAAAAAGAGGAAATTGACGATGTGATATTGCCATTATTGTATTGTTTGCCCATGCATCTATCGAAAAGCAATTGGGCAAGCTCATGATATCTACAGCTAAAGAATGATACCTTGTCGCTTGAAAGTGATTCGGTATTCCTTTAAATAAGCCCTGGTAATGATGGGTAATTTCTGAAGTTTTACCATGCATGATTTCTGACGCTGGAATAATTTTACCTCCAAAAGCCTGAGCTATGCACTGATGGCCAAGACAAATACCCAATATCGGGGTATGTCCATGAAATTCCTTAATAACTTCTATAGAAACTCCTGATTCATCAGGAGAGTTGGGGCCTGGTGAAATGACTATGTATTGTGGAGCTGATTTTCGGATAGCATCAATTTGAATTTGGTCATTTTTAAAAACGACCACTTCTTGATTCAGGCTCTGGAAATACTGGACCAGGTTATAAGTAAATGAATCGTAGTTATCAATAATTAGCAACATAATATAATTAAAAATGTATTTTTTAAATTAGGCTACAAAGCAAATTCTTCACCCAAATAGACTTGCCTTACTTGCTGATTGGCGAGTATGGCTTCCGGGGTTCCTTCGCAAAGAATTTTTCCCTGACTGACAATATAAGCGCGTTCACAAATGTCTAAAGTCTCTCTTACGTTATGATCTGTAATTAAAACCCCTATGCCTTTATCGCACAAATGCAAGATAATTTTTTTGATATCGATTACAGAAATTGGATCAACTCCTGCAAAGGGTTCGTCAAGTAAGATAAAGGATGGCTCTATTGCCAGAGCTCTTGCAATCTCAACACGCCTTCTTTCACCGCCAGATAATGCCATGCCCAAGCTGTTTTCTATGTGGGAAATATGAAACTCTTGTAAGAGGAGATCCAGCTTTTCTTCCCGCGTTTGATCATCTAAATCTTTTCTTAGTTCCAGAATTGCCATGATATTTTCGGCAACAGTAAGCTTTCTAAAAACAGAGGCTTCTTGCGGAAGGTAACTAATACCGTGCCTTGCTCTCAGATGCATAGCATCTTGAGTTATGTCTTTTCCGTTAAGAATAATGTGACCTTCATCACAGGATTGCAGACCTACAATCATATAAAAACAAGTGGTTTTACCCGCTCCGTTAGGACCCAACAACCCTACACATTCACCTTGCTTAATGTGAATGCTGACACCATTAACAACCGTTCGGCCCTTAAATGATTTTTTTAATTGTTTGGCTTCTAGTAAACTCATGATTTCTTTTCAGGATAAATAATGATTGTCGTTCTTGTTTTTTCGTCACTATGAGATAAAACATGTTGTTCCTGAGTATCATAACTAATTTTGGCCGCTGAAAGAGAGTTGGGTCCCTGCTCTATGCGAGCGTTCCCTATTAATTCGATTAAATGTTTGAGCGGGTAATATTTTATAGTATCCGCATAGGCATGGAATGGGGGTTTATCCGGGGCTGTTGTAGTCCAATAATGAGCTTGCTTATCTTTAGAGCCTTCAGCGATAGCTAAAGTAAGCTGATTTTTGGCATCCCCTTGAGTAATGGCTTTTGCTGCACGTAAATTGGTTGAGCCTTGAACGAATTCAACATTTCCTATATAGACTCCCTGATGGTTTTTTTGATTTAAATCCGCTGAATCAGAAACCACTTGCACCATTTTTTCCTTATCAAACGGAAGGGCGTTTCCTGAAATAGAGCACAACATCAACAATAACAGTATAATGTATTTAACCTTTAGCTGGGTCATAACTACCTCTGGCTTTATGGAGTAACTCTACTCTTTTCTCATCCAAATAGGCATTCATTCCAGTAGACTGTATAATATTGCCTGGTTGTTCAAAGGTTACAAAAAGACTTGTTGTTGCTTTTTTTTCCTTGGGGTAATAAGTGATTTCTTCAGTTTTTAAAGTACTTTCCCGAGTGCTTTCCCCGGGACTTTGATGAACCACTACTTGCTCGATAAATGTAATTTGTTTACCACCGTCAAATGATTTTGCCCGTAATGAATTGATTTCCCATGCCGGTTGATTGTCTTGCTTAATAATAATATGAGGGTTTTTAAGCAAATGAAGATTATTGTTAGGAATATATTCTACCTGTGGAGTGGTTAATAAGTTAATTAACACACCTTCTGAATTAAATTGCTTTACGGTAAGCTGCGAAATCGTTGTGTCAACTTCATTTGACAACGTTTTCTTATTGATAATAGCCTGATTAAAATGAGCATAATACCAACCCGAGCCTGCTAAAACAAGCAAGGTCAAGAATAGCCAAATTGCTTGCTTGGTAGTATTCATTGTTTTAAATAGCCTGTGATTGCTAATTCTGCTTTATTTTGTGCGTTAAGAATTAAGTCACATAATTCACGAACCGCACCTCGACCACCAGTTCGCTCTGTCCTCCAATCCGCAAATTCGAGAACCTGAGGCACGGCATTACTCACCGCAACACCTAATCCCACTTGTTGTATTAAAGGTAAGTCAGGCAAATCATCACCAATATAGGCGAACTCTTCATCATTGAGGCCTAATGTTTTTTTTAGATGTTGGTAAGCGTTACGTTTATCAACCTGACCTTTATAATAATGAGTTATACCTAATTGCTCCATTCGATGGTCAACCACAGTGTTTTGTGCAGTGGTAATGATTGCGACTTGTATCCCGGCAGCCATTAATAATTTTAATCCCATTCCATCTTGTACATGGAATGATTTCAGTTCATTACCGTGATTATCAATGTGAAGAAGACCATCACTGAGCACACCATCGACATCACAAATAAGACATTTAATTTTTTTCGCTTTTTCCAATAAGTCGTTCATTCTTTTCTCTATATATTAAAAAACACCTGCTTTTAGCAAGTCATGTAAATGGAGTACCGCATAAGGTCTATTATCATTTTCAACTACCACCAGGGATGTGATGCTATATTTTTGCATGATTGCTAAAGCTTCGGCAGCCAACATGCCTTTAGGAATGGTTCTGCAGTTTTTAGTCATGACGTCCTTAATTAAAGTGGTGTTGATATTAAATTGACGTGTCAATGTTCGACGTATATCTCCATCAGTATATACACCCACTAAATAGCCATGCTTGTCTACAACACAAGTCATTCCCAGTTTTTTATTCGTGACTTCAATTAAAGCGTCACTCACTGTGGCGTTTTCATTCGCTAATGGAAGTTGCTCTCCTGTATGACATAAATCATCTATTCTTAGCAAGAGCTTTTTGCCAAGTGTTCCTCCTGGATGGGAAAGGGCGAAATCTTCTGCGCTAAATCCCCGTGCTTGTAAAAGAGATATAGCCAATGCATCTCCCATAACCAGCGATACAGTAGTGCTGGTTGTTGGAGCAAGACCTAGTGGGCAGGCCTCTTGTTTAATACTGACATCTATATTGATATCGGCCGATTTAGCCAGAGTTGATTGTTTATTACCGGTCAATGCAATTAAGGGTACTTCAAGCCTTTTTAATAATGGAAGCAACGTAACTATTTCATGGGTATTACCCGAATTGGAAATGGCAACAACTATATCCTGACGGGTTATCATGCCTAAGTCTCCATGACTTGCCTCCCCAGGATGCATAAAAAAAGCAGGGCTGCCAGTGCTGGAAAAAGTAGACGCCAGTTTATTAGCTATGTGGCCAGATTTCCCCATGCCTGTGACGACAATGCGCCCTTTGCATGATAAGAGTAATTCACAAGCTTTTTCAAAACGTTCATCAATTCGTTGAGTTAGCTCAAATACAGCTTGTGCTTCAGTTTCAATAACTGCTAGTCCAAGTGTGCAAAAGTTCATAGGCCGTTGCGTTGTAATTTTGTTTGGCTTTCATTCTAACATAATGCATTTAAATGATGTACCCTATATTTGAGTAACTGATACAATTGTGTAATATTTGAATAGGTTGTTGGTATCTTAATACGGTTTAATATGTAGTGCTTATAATATTATTTTTGGATTAAATAAAATCCAGTTTTCTCTCTTTTTGCGAAAAATGAATTTTATTTGAATTTTATGAACAATTATTGAAAAAATTGGTTGTGTAAAAAAAATTTTATAAAGTTTTTTTTAGTGGAAACGCAATTATTAAACACATTTTTATTTATCCAGTATATACTTCATTAAAGAGATAAAAAAGCATTACCTGTCTTTGATAGATATCGAACTGACATCATTACCCGTTAAAATAATAATTGGATAATAAAGCATGCCTGATAATTGGGTTGAAATAAAAAATCTATTCTTTAGCCTTGATGATCGCTGCATTTTTGATGGCATTGATATGGTAGTGAAACAAGGCAAGATTACCGCTATTATGGGACCCAGTGGTTCTGGAAAGACTACTTTACTGCGGTTAATTGGTGCGCAATTAACGCCTGATAGTGGCCAAATTTATGTCAATGGCCAGAATATCCATCAATTATCCCGCAAAGCGCTTTATGAAACCAGGCGAAACATGGGATTGCTTTTTCAAAGTAGTGCCTTATTTACTCATCTTTCAGTATTTGAAAATGTTGCTTTTCCACTAAGAGAACATACTGAATTAAATGCATCCATGATAAGAAACATTGTATTAATGAAACTAGAAGCCGTTGGTTTGCGTGGAGCTGCGCATCTAATGCCTGCTCAATTATCCGGGGGGATGTGCAGGCGAGTTGCATTAGCCAGAACCATTGCCCTTGACCCTGTGTTAATGATGTATGATGAGCCTTTTACGGGGCAAGACCCAATTTCTATGGGAGTATTGGTCAGGTTAATACAACGATTGAATCAATTATTGCATACTACTACTATTATCGTATCTCATGATGTTGAAGAAACGTGTTCAATAGCAGATTACATCTACTTAATATCAGGAGGTAAGATTATAGGTCAAGGTACGCCGGAAGAATTAAAGCGATCTATTGAACCTCAGATAAGACAGTTTATGCATGGAGAAGCGGATGGGGTAGTTCCATTCCATTATCCGGCGAAGCCGTATACAGAGGAGTTATTAAATGCTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP014255|943173:950056|946777_947347_-|AMP90454.1|DBSCAN-SWA MNTTKQAIWLFLTLLVLAGSGWYYAHFNQAIINKKTLSNEVDTTISQLTVKQFNSEGVLINLLTTPQVEYIPNNNLHLLKNPHIIIKQDNQPAWEINSLRAKSFDGGKQITFIEQVVVHQSPGESTRESTLKTEEITYYPKEKKATTSLFVTFEQPGNIIQSTGMNAYLDEKRVELLHKARGSYDPAKG >CP014255|943173:950056|946287_946797_-|AMP90455.1|DBSCAN-SWA MTQLKVKYIILLLLMLCSISGNALPFDKEKMVQVVSDSADLNQKNHQGVYIGNVEFVQGSTNLRAAKAITQGDAKNQLTLAIAEGSKDKQAHYWTTTAPDKPPFHAYADTIKYYPLKHLIELIGNARIEQGPNSLSAAKISYDTQEQHVLSHSDEKTRTTIIIYPEKKS >CP014255|943173:950056|945565_946291_-|AMP90456.1|DBSCAN-SWA MSLLEAKQLKKSFKGRTVVNGVSIHIKQGECVGLLGPNGAGKTTCFYMIVGLQSCDEGHIILNGKDITQDAMHLRARHGISYLPQEASVFRKLTVAENIMAILELRKDLDDQTREEKLDLLLQEFHISHIENSLGMALSGGERRRVEIARALAIEPSFILLDEPFAGVDPISVIDIKKIILHLCDKGIGVLITDHNVRETLDICERAYIVSQGKILCEGTPEAILANQQVRQVYLGEEFAL >CP014255|943173:950056|947343_947871_-|AMP90453.1|DBSCAN-SWA MNDLLEKAKKIKCLICDVDGVLSDGLLHIDNHGNELKSFHVQDGMGLKLLMAAGIQVAIITTAQNTVVDHRMEQLGITHYYKGQVDKRNAYQHLKKTLGLNDEEFAYIGDDLPDLPLIQQVGLGVAVSNAVPQVLEFADWRTERTGGRGAVRELCDLILNAQNKAELAITGYLKQ >CP014255|943173:950056|944954_945533_-|AMP90457.1|DBSCAN-SWA MLLIIDNYDSFTYNLVQYFQSLNQEVVVFKNDQIQIDAIRKSAPQYIVISPGPNSPDESGVSIEVIKEFHGHTPILGICLGHQCIAQAFGGKIIPASEIMHGKTSEITHHYQGLFKGIPNHFQATRYHSLAVDIMSLPNCFSIDAWANNTIMAISHRQFPLFGLQFHPEAILSQFGLQILENFLRYETQTSI >CP014255|943173:950056|949258_950056_+|AMP90451.1|DBSCAN-SWA MPDNWVEIKNLFFSLDDRCIFDGIDMVVKQGKITAIMGPSGSGKTTLLRLIGAQLTPDSGQIYVNGQNIHQLSRKALYETRRNMGLLFQSSALFTHLSVFENVAFPLREHTELNASMIRNIVLMKLEAVGLRGAAHLMPAQLSGGMCRRVALARTIALDPVLMMYDEPFTGQDPISMGVLVRLIQRLNQLLHTTTIIVSHDVEETCSIADYIYLISGGKIIGQGTPEELKRSIEPQIRQFMHGEADGVVPFHYPAKPYTEELLNA >CP014255|943173:950056|947886_948849_-|AMP90452.1|DBSCAN-SWA MNFCTLGLAVIETEAQAVFELTQRIDERFEKACELLLSCKGRIVVTGMGKSGHIANKLASTFSSTGSPAFFMHPGEASHGDLGMITRQDIVVAISNSGNTHEIVTLLPLLKRLEVPLIALTGNKQSTLAKSADINIDVSIKQEACPLGLAPTTSTTVSLVMGDALAISLLQARGFSAEDFALSHPGGTLGKKLLLRIDDLCHTGEQLPLANENATVSDALIEVTNKKLGMTCVVDKHGYLVGVYTDGDIRRTLTRQFNINTTLIKDVMTKNCRTIPKGMLAAEALAIMQKYSITSLVVVENDNRPYAVLHLHDLLKAGVF >CP014255|943173:950056|943942_944977_-|AMP90458.1|DBSCAN-SWA MKPKLLFEQLLSRQDLSSEQMQEIIHACMTGEFSDVQIATFLVLMRMKGETVNELTAAAKVMRQLAHKIDLGNNLIDIVGTGGDGRNTFNVSTACGFVAAAAGIKVAKHGNRSVSSRSGSADLLEQAGFILNLSDLHVQDCMNQCQLAFLFAPHYHPAMQHARAARQQLGIRTLFNLLGPLINPAQVKRQVVGVFSTSWLKTIATVLANLGSERSLVISSQDGLDEISIAAKSEVVEYRDGHFKQWFIFPEDYGLKHSSLDAIIVDSPEQSLHLIQSVLSGDSGPARDIVLLNSAAAIYCAKDDISFDAAIEEARIAIDSGKANDCFNKLRLLTQTLNKESNHE >CP014255|943173:950056|943173_943950_-|AMP90459.1|DBSCAN-SWA MNSILERIAQHKLEEIAVAKKNKPLHVLSKQRPGEIRDFTTALKSNASPAIIAEIKKASPSKGLIRKDFNVAEIAKTYTQHGARCLSVLTDIEFFQGHPDYLALAKSKSTLPVLRKDFIIDSYQIYESLVLGADCILLIVALLDDVQLMDFCQLAQELKMSVLVESHTQDELERALRLPTPLIGINNRSLHTFKTDIQLSIQLKQLAPKDKIIITESGINTREDIKLMQSHGINAFLIGESLMRADNIGKALQELMHN |
9 | Acinetobacter_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1332937 : 1342345
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP014255|1332937:1342345|DBSCAN-SWA TATGACTAAAAGCAAAGTGCTCGTTATAGATGACGAACCAGACATAAGAGAGTTATTAACTCTTACTTTATCGCGCATGGGCTTAGCTTGCGATGCGGTGTCTGATTTTAAGCAGGGCTTAGAACATATAAAACAAAATTATTATTCTTTGGTTTTAACCGACATGCGTTTGCCTGATGGAGATGGTATAGAAATTGTTAAATTCATTCAGAAATACAAACCACAGTTGCCAGTTGCTGTCATTACCGCTTATGGAAATGTCGAGGGTGCGGTCAATACTTTAAAGGCTGGGGCATTTGATTATGTATCCAAACCCGTAGACTTAAAGATGCTTAGAGATCTAGTCAAGACCGCATTATCCATGCAAAATCCGTCTACCGAAAATCCTGATGAAGGTTTATTGGTTGGTGAGAGTTTGGTAATGCAACAACTTCGTGAAAGCATCCATAAATTAGCTCGCAGTCAGGCACCGGTTTTTATTCAAGGTGATTCAGGTGTTGGGAAAGAACTTGTTGCTCAGCTGATTCATGCTAATGGTCCCAGAAAAGATAAGCCATTTATTCCTGTAAATTGTGGTGCTATACCTGGTGAGTTGATGGAATCAGAGTTTTTTGGCCATAAAAAAGGGAGCTTTACAGGAGCGATTTCTGATAAAACAGGGTTATTTGTTGCGGCTCATGGTGGCACTTTGTTTCTTGATGAAATCGCCGAGCTTCCTCTCGCCATGCAGGTTAAATTACTACGTGCAATTCAAGAGAAGGCAATTAAACCAATAGGTGAGTTATATGAAATTCCGGTGGATGTACGCATTCTAAGTGCGAGCCATAAAAGTTTGATTGAGGAAATCAATGCAGGGAAGTTTCGTCAAGATTTGTATTATCGAATTAATGTGATTGAATTGCGTGTCCCAACTTTAATGGAAAGACTTTCTGATATTCCTTGCCTGACGGAGGCGATATTAAAAAAATTATCTAAAAATCAAAATAGAAGCCTGGTCAAAATCAATCCAGCCTGTTTTGAAATATTGAGTCATTATCATTTTCCAGGGAATGTCAGAGAATTGGAGAATATCCTCGAGCGTGCCATGGCTATGTGTGAGGAAGAGATCATAGAACCAGGCGATTTACATTTGCCTAGAACGACAATAACCCCAGTTGTTGCTGCATCCCCAGTGTCAACTAACTTAAATGGTTATCTTCAGGATCAGGAAAAGGAATTAATTCTAGATGCTCTTGAGAAAACAAAATGGAACAGGACAGCCGCTGCACAACTATTAGGTGTCAGCTTCCGCACTCTCCGTTATCGATTAAAAAAACTGGGCCTTGATTAGGTCTTAGCTATGAAGATTTTCAAGGGATAAAATAGACCTCTTGCATAAAACGTTTCTGCTTTGTTCACTTACAGCATGTAAACTCCGCTTCTTAAAACGTTTGCGCCTTGCCCTAAAACAAAATAATCAGGTTATGCAAGGTCTAATAGAATTGTTTTTCATCTGTGTTTGAAATCTGTCAATTCATGGTATAAATTTATATAACGCAATGAACTCTTGTTCAAAGCGAAAAAATATAATTGATTAAAATTAAGGAAGAAACAATGAACTCATGGAATAGTGTTGTTTTTTTAAAAACTAAAAATGCATGGTCAGATTCTGCTGCGATAGCAAAGATGAACGGTGTTCAAAGTCTTTGGTCTACCTCTGGGGACTGGGATTGGTGTATAAAACTTGACTCCAAGCATTCAAGCCCTGAGGAAACTGCTTTGTTTGTTAAAAATTTAAGAAATGCCGATTGGGTTGCAGAAACCAAAACCAGTTGGTGGAAAGAAGTTGCTGTAAAGTAATTTAATAAGACAGATCGATTGGGAAATTATAATGATATTTATTGTAATTTCCCATCTGGTCATGAGCTATTTCAAGTTAGATGTCACTAATACTCATTTCCATCTCATTCTCATTCTCATTCTCATTCTGACTAATTTTCAACCATAAATTTTATTTCATCAATTTTTGCTGAAATTCTTGCAGATAAATAAGCATCTTTTCTAGCCAGCTTCTGCGCTACTTTTAATTGGGCAATGGCTCCTCTTTTTTGTCCCTCAAGTAGTAAGCATTGTGCTTGAGTAAAATAGGCATAACTTTTCTGATGAGATTCCGCTTGAGCTCTTGCCAATTCCCGGCAAAGCGGCAAGTCTTCCTTGTATTGTCTACTGCCCTTAAGAAGAACGGCTGTAGCTTTTTCAGGTTTATTTGCGGTTAACAATCCTTGGGCATAAGCCATCAGAGCGGCATAATTGTCAGGAAAATTATTTTGTAATTCAGCAAGACGGGCCAGTGCAGATTGATATTGTGATAAACCTAATTCGGCCTGAGCCATAGCAATTTGAAAATTGAGATTACCATTATCCTGGAGCAGTAAAGAATTTAATTTTTCCGCTGCTTTCTGGAAGTTGTTATTATTTAACAAAGCGAGTACGTACCCATATTGGCAAGCAGTGGCAGGATTTTTTTTATGACAATGATGTTCATAATAATCAAGAATTTGTTTATTGTTCGATGCGACAGAAACCCTGATTAATTCTTTAAATAAGGCATAGTCCAAAGAATCAGTATAATGTTTTTTAGGCAAACGGCTGGTTCTGTTTTCAGCCTCGGCAATCCTGTCAGCATCCAAAGGGTGAGTTCGCAGTATCGCTGGAATATTGGCAGTGTAATAATAACGGGAATTTTCCTGCATTTTATTAAAAAATGCAGCCATGCCTTGAGGATTGAATCCTGCTTTAATAAGCATATCAATACCAATTCTGTCGGCTTCTTTTTCCTTTGAACGTGTAAAATTGATGTTATCCTGGGAAAATCCTGAAACGGATGCCATCATGGCCCCCATTCCAACCGTTGGATTCAAGACACCTAATGCCGCAGACGCCAGAATAGATGCTAATAATGGGACACGCATCTGTTTTTGATGCTCTATAATGCTGTAAAGATGATGTAAGCGAACATGGGCAATTTCGTGAGCCATTACTGCAGCCAGTTCACTTTCATTGCTGGTTGTTAAAATAAGTTGGGTATTAATGCCTATATAACCTCCTGGACCAGCAAAAGCATTGATTTCTTTGGATTTAACAATAAAGAAATAAGGTGTTTTGATACGGCCATAATGTGCCAGTTTTTTACCGATGTAGTTGATGTATTGACTAGCCAAAGGATTGCGCTCTACGCTGTCCGATTGATTAATAAGTTGAATAAATTCTTTTTCTAATTGCTCCAGTTCTTTGGTGGTATAGGGTGAAAGACTGCCGGCATGAGTTGTTGATGCTAAAAAAAAGAATATAACCACCAAGCCCCAGTGAAATAATTTAGGTAAGATGTTTTTCCTGGTTAACTTATAATTTAAATTCAATTTAATCATTAGGCTACTCAATAATTGAATAATTTGTTATCATTCGACCACATTAAGAAGGTGGTTAATCTATGCACGAACAGTTCCTGCTTGCAGCACTTGAACAAGCCAAACTGGGGAGAGGCTTTTGTGCCCCCAATCCCAGCGTTGGGGCGGTTGCTGTGCAAAATGGTAATATTATAGCACAGGCATGGCATAGAGGTGCAGGTACACCGCATGCAGAACAATTATTGTTATCACAAATTCCACCCAAAACACCAGGGGTGAAGCTCTATGTTACGCTGGAACCTTGTAATCACTGGGGTAAAACCCCCCCTTGTGTTGATGCTATTATTAGTCATGGTATAGAAGAAGTTATTTTTTCCTATTTTGATCCTAATCCCATTGTTGCCAAAAGTAATTCTTCTGCAAAATTACGAGAACATGGAATACAAGTCAGACATATCCCTATAACTGTAATCGATGAATTCTATAAAAGCTATGCCTATTGGACAGTGACTCATAAACCAAGAGTCACGGTTAAAATAGCACAAACTTTTGATGGTAAAATTGGAAGATCTAAGGGGGAGCGGCTGGTTTTGTCCAATGGATTATGCGAAAAATTCACTCATCAAATGCGTGCTGCCAGCGATGTAATATTAACAAGCGCCAAAACTGTTCAAATGGATAATCCAAGAATGAACGCCAGACTAGATAGTGGGGTGGTAGCAAAACCAGTTGCCATTATTGATCGCGATTTAAGTTTGTCCGATGACGCAATCATTTTTTCGACAGCAAAACATTGTCATATTTATCATCAAGCACAAGCAAATCAGGCGAAGACTTACCCTAACAGCACTCATTATGCGATGCCTTTGCATAATAGATTGATGGATTTGGACGCAATAATAACTCACCTTGGTCAACTGGGATACCATGACGTATGGGTTGAAGCGGGTGGGGCCATTTTTTCTGCGTTACATAGTAAGGGATTGGTGCATAGAACTTATTTGTATTTAGTTCCCCGCAGTTTAGGAGATCAGGCTATATCAGCTTATCAACAACAGGGGATTTTTGAAAAAGCTCATACGGTGAGTTGGAATGCTATGGGTGACAATATGATAGTATGTTTGGATTGGCAGGAGGATGAGTGTTTACCGGATTGATAGAAAATACAGGCAAAGTATTAGTGAACAGGCAAGGAGAAAATTCTAGTCGTTTAGTCGTTTCTTCAAGTTATCAGGATTTGAAACCCGGTGAGAGCATCGCTGTAAATGGAGTTTGTTTAACCCTGTTACCATCCGACTTGCCTGATTTGTGTTTTGATATTTCACCTGAAACCCTGCAGGTTACCACACTGTCAAAATTATCATCTGGCGACATTGTTAATCTTGAAAGAGCTATGCTGGCATCAACCCGCTTTGGCGGTCATTATGTATCGGGGCACGTAGATACCAAGGTTAAAGTTAAATCCATTCAGGCTGTTAATGAATTTATAGCAATGGATTTGGAGGGTTTTATTCCAGAACACAAGTGTTATCTGATACCCAAAGGTAGCATCACAGTAAATGGCGTAAGTTTGACTATTAATACTGTGTCAGAACAAACCATTGGACTTATGCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP014255|1332937:1342345|1332937_1334266_+|AMP90119.1|DBSCAN-SWA MTKSKVLVIDDEPDIRELLTLTLSRMGLACDAVSDFKQGLEHIKQNYYSLVLTDMRLPDGDGIEIVKFIQKYKPQLPVAVITAYGNVEGAVNTLKAGAFDYVSKPVDLKMLRDLVKTALSMQNPSTENPDEGLLVGESLVMQQLRESIHKLARSQAPVFIQGDSGVGKELVAQLIHANGPRKDKPFIPVNCGAIPGELMESEFFGHKKGSFTGAISDKTGLFVAAHGGTLFLDEIAELPLAMQVKLLRAIQEKAIKPIGELYEIPVDVRILSASHKSLIEEINAGKFRQDLYYRINVIELRVPTLMERLSDIPCLTEAILKKLSKNQNRSLVKINPACFEILSHYHFPGNVRELENILERAMAMCEEEIIEPGDLHLPRTTITPVVAASPVSTNLNGYLQDQEKELILDALEKTKWNRTAAAQLLGVSFRTLRYRLKKLGLD >CP014255|1332937:1342345|1341520_1342345_+|AMP90111.1|DBSCAN-SWA MRLCGFEVGLDKPLFLIAGPCVIESEELALETAGYLKEMCSQLNIPFIYKSSFDKANRSSISSYRGPGFEKGLSILEKVKSQIGVPVLTDVHEDTPLFEVSSVVDVLQTPAFLCRQTNFIQKVAAMNKPVNIKKGQFLAPWEMKHVIAKAKAQGNEQIMACERGVSFGYNNLVSDMRSLVIMRETGCPVVYDATHSVQLPGGNNGVSGGQREFIPALARAAVAVGISGLFMETHPDPDKALSDGPNSWPLGKMKQLLESLKATDEVYKKYRDDF >CP014255|1332937:1342345|1339293_1339761_+|AMP90113.1|DBSCAN-SWA MREIKTIVSDNVTFPIAIVVSTFNELITSALKQGALDRLTELGFKSNDITLVEVPGAVEIPFVAQLLAKKLQVEVIVALGAVIRGETSHYDYVCEQVSQGCQRVMLDYNIPVIFGVLTTENDEQALERVGGTHGHKGREAIDCAVSMRSIKQQLQ >CP014255|1332937:1342345|1334529_1334775_+|AMP90118.1|DBSCAN-SWA MNSWNSVVFLKTKNAWSDSAAIAKMNGVQSLWSTSGDWDWCIKLDSKHSSPEETALFVKNLRNADWVAETKTSWWKEVAVK >CP014255|1332937:1342345|1338074_1339286_+|AMP90114.1|DBSCAN-SWA MKHSLATIEEAIATLKAGKMIILMDDEDRENEGDLVIAAEHATPEAINFMSRFGCGLICLPMAEELIDKLQLPMMARHNKSPYGTAFTVSIEAANGVSTGISARDRARTIQVAIDPQSGPSDIISPGHVFPLRARKKGVLERPGQTEGSVDLVKLAGLTPAAVICEIINEDGTMSRRDELALFSKKHQIPLVTIKDLIHYRIRHENLVHAVATTRIPLEGNGVFTMTVFENQMDSAEHFALVKPPLYGNQVPLVRIHSECITGDVFGSRKCDCGKQLELSLSQIGAEGGILIYLRQEGRGIGLANKLKAYALQEEQGLDTVEANLKLGLPADDRDYAVAYQMLKYLGVEALRMLTNNPLKIASLERYGMKITQRIPLEIEPSRENHSYLKTKKIKLGHLLAID >CP014255|1332937:1342345|1334906_1336355_-|AMP90117.2|protease|DBSCAN-SWA MSSLMIKLNLNYKLTRKNILPKLFHWGLVVIFFFLASTTHAGSLSPYTTKELEQLEKEFIQLINQSDSVERNPLASQYINYIGKKLAHYGRIKTPYFFIVKSKEINAFAGPGGYIGINTQLILTTSNESELAAVMAHEIAHVRLHHLYSIIEHQKQMRVPLLASILASAALGVLNPTVGMGAMMASVSGFSQDNINFTRSKEKEADRIGIDMLIKAGFNPQGMAAFFNKMQENSRYYYTANIPAILRTHPLDADRIAEAENRTSRLPKKHYTDSLDYALFKELIRVSVASNNKQILDYYEHHCHKKNPATACQYGYVLALLNNNNFQKAAEKLNSLLLQDNGNLNFQIAMAQAELGLSQYQSALARLAELQNNFPDNYAALMAYAQGLLTANKPEKATAVLLKGSRQYKEDLPLCRELARAQAESHQKSYAYFTQAQCLLLEGQKRGAIAQLKVAQKLARKDAYLSARISAKIDEIKFMVEN >CP014255|1332937:1342345|1339886_1341524_+|AMP90112.1|DBSCAN-SWA MTKYIFITGGVVSSLGKGIAAASLAAILEARGLRVTLIKLDPYINVDPGTMSPFQHGEVFVTNDGAETDLDLGHYERFVKTTMTKRNNFTSGKIYENVIKKERRGDYLGGTVQVIPHITNEIKRCIKLGADAFDVAMVEIGGTVGDIESLPFLEAIRQMRIELGSQRAIFIHLTLVPYIATSGETKTKPTQHSVKELRSIGIQPDVLICRSEKPLSMADRAKIALFTNVEKEAVISLEDANSIYQIPMILHAQYLDEIVVKKLSLEAKQADLSEWQRVVDMQAVQTMTVKIAMVGKYTELNDAYKSINEALLHAGIHTETKVEIIYFDAELIEKHGALLLESVDAILVPGGFGERGVEGKIKAIQYAREHKVPFLGICLGMQTAVIEFARNVVGLTGANSTEFNKETLYPVLGLISEWMDADGSKQTRDENTDLGGTMRLGGQYCHLAEGTLARKVYGKPQIVERHRHRYEVNNKYVDSLVKHGLIISGRSADNSLVEMIELADHPWFLACQFHPEFTSNPRDSHPLFKKFVLAARIHHQEKDKK >CP014255|1332937:1342345|1337463_1338078_+|AMP90115.1|DBSCAN-SWA MFTGLIENTGKVLVNRQGENSSRLVVSSSYQDLKPGESIAVNGVCLTLLPSDLPDLCFDISPETLQVTTLSKLSSGDIVNLERAMLASTRFGGHYVSGHVDTKVKVKSIQAVNEFIAMDLEGFIPEHKCYLIPKGSITVNGVSLTINTVSEQTIGLMLVPHTLLMTNLGSLTVGQQVNIEFDYLTRIVAHQLQTIGKLNHEVVS >CP014255|1332937:1342345|1336405_1337479_+|AMP90116.1|DBSCAN-SWA MHEQFLLAALEQAKLGRGFCAPNPSVGAVAVQNGNIIAQAWHRGAGTPHAEQLLLSQIPPKTPGVKLYVTLEPCNHWGKTPPCVDAIISHGIEEVIFSYFDPNPIVAKSNSSAKLREHGIQVRHIPITVIDEFYKSYAYWTVTHKPRVTVKIAQTFDGKIGRSKGERLVLSNGLCEKFTHQMRAASDVILTSAKTVQMDNPRMNARLDSGVVAKPVAIIDRDLSLSDDAIIFSTAKHCHIYHQAQANQAKTYPNSTHYAMPLHNRLMDLDAIITHLGQLGYHDVWVEAGGAIFSALHSKGLVHRTYLYLVPRSLGDQAISAYQQQGIFEKAHTVSWNAMGDNMIVCLDWQEDECLPD |
9 | Staphylococcus_phage(42.86%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2262164 : 2272282
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP014255|2262164:2272282|DBSCAN-SWA ATCATAAATAACAACCCACGCCATCATATCCGATGACATGACATTCTTTATAAGCAGACTGATCCAATTCATAGCTTATCGAACCATAATAAGCATAAATCTTACCATCTTTGGTTTTTTCAACATGCGGATTCTGATAACTTATATCGGCTTCACAGCTTGCTTTCGTTTGAATCCAGGTCACTGTATTGTCATTAATGATATTTTTTCCAGGCTTCAACCTGTTCTTGCCGCATTCGTGTGTTGCCAGATCAGCCATTTTAGGGGCTGAGAATAATACATCATAACCATTCAATGCGACCTGCACAGCATTATCCGCATCCAATATCCCATGTCCACAAGGTTTTTTGCCGACGCAAGATTTATTGGCATCGTTGCTCTGCCCAAACTCATGCGTAGTAACATACAGTATCTGTTCTACTTGTTCAGGTTTTAAAGATTTATTACTGACGGCAAAAATTAAACCAGCTACCCCAGCTACATGTGGCGAAGCCATACTCGTCCCTTGATAAAAATCAAAACCGGATGAATTGTACCCACCTCCCGGGTTTACAGTAGATAAAATACCTCCCGCAGTACCATAACGCTTATCACCACCCGGTGCTGCAAGGGTTATACTGGGGCCATAGTTTGAAAAATAGGAACGCAACCCTTCTGGTCCAGTGGAGGCAACCTTGATCGTTCCATTACACACAGCTGGGGCATTATAGTGTTCCCAAACATTATCATTTCCGGCAGCAACAGCGACTACAGCTCCTTTTTTTCGAGCAAAGAACAAAGCCTCTTGTAAAGCCTCGTCACAATAATCGATTTCTTTTCCAGGCTCCAAATCGACACCAAAACTCATATTTAATACCTTGGCTGGATGTATATTTTTAGGAACTCCGGGAACATCGCCTCCAACAGACCAATAGATACTATTCACCACAGCACTTTCATAAAACATACCATTCTCAGCAGGAATTTTAACAGTCAGAATTTTTAAATCCTCACCAACTCCATTCATGATATCACCATACCCTGCAATGGTACCGGCAACGTGAGTGCCATGGTATGACCTGGTTTCATCGGATAAATCATTGTTATTCGCTGCAAAATTCCATCCAAATACATTGCCTTCATTATCTTTTACAAGGTTATTCACCAAACTGTCATTCAATGCAATCCCTGTATCTAAAACCGCAACAACTATCGGCTTCCTGGACTTTCCTGTGGTATATGCCCATGCGCCATCTCTTAAACCAGGTTTGGATTCCAAGCGAATTCCTGCTGGTCTTTCAAACTCATCCCATTGACTCTCATGGGATAGCAATTGACTTAATTCATGGTTTATTGCTGGATCAGGAAGAGGTTTAAAATGCCCTATTCTGTCTTTAACTGCATAAAGTACATTGGGATTTTTGCGCAAACGTTCCAAAACATTGGCTGTAACATCCTCTTCTTTAGCCTTAACAACAGCAGGCGCACTGGATACATCAAAAACAAGCGAATAAGCGCCATTAGCCATAGGCTTCATTTCTTTAACAGGTATTTGAATAGATTTAAAGATTTGTGATTTTAGTGAAGAAATGGCGACGGGTTGCTGTTTGTATTTAATAATAACCCTGATTGTTTCAGTTGCAGCAAAACTGCCACAAGCAAGTGATAAAAGACTTAATCCCAATATTCCTGATTTCAAACCCATACTTCAATCTCCTTTTTAAAGTCAATCAGTAGCCTTGACCAATTTTCAAAAATAAAAAACCAACTCAGTATGCAGGAGAATAAATATCAACTCAAGAATCAACAAGCGATGGGATTAAATTAAAATACAGCAATCATTGGATTTCATGTTTTTCCCTATATTCTGTGGGAGTGATTCCTGTCCATCGTTTGAATGCTTTTGAAAAATTGGATGTGTCTTGAAAACCCAATAAAAAACTGATCTCGGTCATGGAAATATTATTATTGAGCAAAAATGTCTTTGCCTTTTGTTCTCTTACCTCATCAAGCAACTCTTGATAAGTCACATGCAAGCGCTGCAAATGACGTCTTAGAGTACGAGAAGTCATGCATAATTGGCTGGCTATCTCATCCATGCTGACATGATTTAAATTCTGATTGATTAAAATAGATTTAATCTTGCTTGCCATATCCTCATTTAATGACATTTTTTTTTCAATTTCTTGTAATTGCTTTTTTGCCAGTTGATAACTGACATCGTCAGCAAAATGAATGGGATAATTCAGTTCCTCTGCTTTAAACCAAACACGAGTACTCTCTGTATTAAAAACAATTTCACACTGAAAAATTGTTTGATAATATTTTGCATAAGGAGGTTCATCATAATTCAACTCGATCTTGAGCATTGGATTATTACAACTAATCAAAAAATTTCTCATTTTAATAAGATGAGTAATGGCCAATTCGGTTATAAAGCGTGATAAAACCATTTCTTTTGTATGAGATAATAACTTGATGTAAGCATTGTTTTTATTATTAAACTGATGTAACTCCAGGGACAACAAACTGGTTCGTGTATTAAGGTAACTGAGCACAGTCTGTATAGCAGTACCAAATGTGGGACTGCTCATTGCCGCATACCCAAGAAAGCCATGATTGACTATGGATAAATTTTGACCAAAAATTAACCCCAATTCCGGACATTGGCTTAATTTATAAGCTTCTATAATAACATGGTTAAATTCATCCTGAGTTAAGTAGGCATTAGGATCATGTACTCTTATCAGATCAAATCCAATTTTTTCTAAAAAATGCTTAATCCCAAATTGCTCAAGACATTTTTCCAGAGTAGAAAGATAATTCGCTGCTATAACCAGATCCATCAACAGGCTTTTCTTTTTTAATAGAGAAATGAATTAATTCTAATCTATATTAGAGGATAAGATCCAATGATGTGAAGAAAAATTCAAGATTTAGTTGTCTAGGCTAAATCTTGAATCAAATTAGTTTAATAACGATAATGATCCGGCTTATAGGGCCCATTTTTATCTACACCTATATAATCAGCCTGTTCATTACTTAATTGAGTTAATTTTGCCCCAATACGCCCCAAATGCAAACGGGCTACTTTTTCATCCAAAACTTTTGGAAGTACATAGACTTGATTCTGGTATTGGCTGGAATTCTGGAACAGCTCTATCTGCGCCAATACTTGATTGGTAAAGGAAGCAGACATGACAAAGCTGGGATGGCCTGTAGCACAGCCTAAATTCACCAAACGCCCTTCAGCCAGAATAATGATACGCTTTCCATCAGGGAAAATTACATGATCAACCTGAGGTTTGATATTTTCCCATTGATACTGTTTTAAGCTTTGAATATCAATTTCCGAATCAAAATGACCTATATTGCACAATATCGCCTGATTACGCATACGTTTCATATGCTCATGAGTAACAACATGGTAATTACCAGTAGCTGTCACGACGATATCAACTTGCTCGGCAACATCGTCAAGAGTAACAACTCTGTAGCCTTCCATTGCCGCTTGAAGTGCACAAATAGGATCAATTTCTGCGACAAGTACTGTTGCTCCCTGTCCGCGCAAGGCCTGAGCACAGCCTTTCCCCACATCACCATAGCCTAGAATCAAAGCGACCTTGCCAGCTATCATAACATCTGTTGCACGTTTTAATCCATCCAACAGGGATTCCCTGCATCCATATAAATTATCAAATTTGGATTTGGTTACTGCATTATTCACATTAATGGCAGGAATTTTTAAATGACCATGCTTTGCCATTTCGTACAACCTGGCTACACCGGTAGTGGTTTCCTCGGATACCCCTTTAATTGCAGCTAGCAATTGGGGATATTTTTGGTGAACAACTTGTGTTAGATCCCCTCCATCATCTAATAATAAATTAGGTTTCCAACCATTGGGGCCGCTTAATGTTTGCTCAACACACCACCAATATTCATCTTCTGTTTCACCCTTCCAGGCAAATACTGGAATTCCTTTTGCGGCAATAGCTGAAGCCGCATGATCCTGAGTGGAAAAAATATTACAGGAAGACCAGCGCACTTCAGCACCCAATGCAACCAGGGTCTCAATCAATACCGCAGTTTGAATCGTCATATGCAAACAACCTGCAATACGAGCGCCTTGAAGTGGTTTTTTTGCGGAAAATTCCTCACGTAAAGCCATTAAACCCGGCATTTCGGTTTCAGCTATCGCTATCTCTTTTCTCCCCCATTCCGCTAATGAAATATCCGCTACTTTATAATCTTGTAATGTATTGATTTTTTGTACTCCTTCTTCTACCAGTTCCATTAGAGTATCCTTAAAAAATTATAATGCCTTGCTTAATTCAGCTACTTTGTTTAATCGCTCCCATGGAAAGTTCTCCCTACCATAGTGCCCATAAGTTGCTGTCTGTCTATAAATAGGACGAAGCAAATCGTGTTGATCAATAATTCCTTGCGGTGTTAAATCAAAATGGGTATGAATTAAATCAATTATTTCGCTGTTTTTTAGTCGCCCCGTACCAAAAGTCTCAACAAAAATAGAAGTAGGTTCAGCAACACCAATAGCATAGGAAATCTGTAATTCGCATTTATCGGCCAAACCAGCCGCCACAATGTTCTTGGCAACATGTCTTGCAGCATAAGCAGCGGAGCGGTCTACTTTTGAAGGATCTTTACCTGAAAAACAGCCACCACCATGCCTTGCCATACCACCATAAGTATCTACAATGATCTTACGACCAGTTAAGCCGCAATCACCCAAAGGACCACCTATTACGAAGCGTCCTGTCGGATTGATGAAGTATCGGGTCTTATCATTTAGCCATTCAGCGGGAAGAACTGGTTTAATAATCTCTTCACGGATCGCTTCAACCAAATCTTTATGCTCAATATCAGGAGAATGCTGTGTAGAAAAAACAACAGTATCCACTTCAACCGGCATCCCTTGTCCATATTTTAAAGTAAGCTGGCATTTTGCATCGGGTCTTAACCAAGGTAACTGGCCTGATTTACGCATAAAAGCTAATTTT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ACGATAGAAGGAGTTGTTCTGTGACCTTCACTATTTTCAATTACCTTCGGTTTGTCACCTTCCATGACAGCAACACAAGAGTTGGTAGTACCCAAGTCTATACCTATAATTTTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP014255|2262164:2272282|2269019_2270159_-|AMP89342.1|DBSCAN-SWA MEQRDYYELLEVSRNASDAEIKKAYRRLAMKYHPDRNPGDASAEEKFKEIQKAYNILSDKQKRAAYDQFGHAGVDPSMGGGPGGFGGFGGFGDVFEDIFENIFSGGRGHGRQSRGQRGADLQFNVQLTLEEAAIGKEVEITVPRHGTCTVCEGSGAKKGTSPKTCETCQGMGQVRIQQGFFSIQQTCPSCHGEGKIISDPCVSCHGQGRVRESKKINVKIPAGVDNGDRVRLSGEGEAGVHGGGSGDLYVQISLKKHAIFERHENDLHCEVPIGFATAALGGSIEVPTLEGRVTLKIPAETQTGKVFRLRSKGMKSVRGYGQGDLLCKVVVETPVNLSREQKELLNKLQDSLENAKGTHSPKTSSWFAGVKKFFEDMKF >CP014255|2262164:2272282|2262164_2263847_-|AMP89347.1|protease|DBSCAN-SWA MGLKSGILGLSLLSLACGSFAATETIRVIIKYKQQPVAISSLKSQIFKSIQIPVKEMKPMANGAYSLVFDVSSAPAVVKAKEEDVTANVLERLRKNPNVLYAVKDRIGHFKPLPDPAINHELSQLLSHESQWDEFERPAGIRLESKPGLRDGAWAYTTGKSRKPIVVAVLDTGIALNDSLVNNLVKDNEGNVFGWNFAANNNDLSDETRSYHGTHVAGTIAGYGDIMNGVGEDLKILTVKIPAENGMFYESAVVNSIYWSVGGDVPGVPKNIHPAKVLNMSFGVDLEPGKEIDYCDEALQEALFFARKKGAVVAVAAGNDNVWEHYNAPAVCNGTIKVASTGPEGLRSYFSNYGPSITLAAPGGDKRYGTAGGILSTVNPGGGYNSSGFDFYQGTSMASPHVAGVAGLIFAVSNKSLKPEQVEQILYVTTHEFGQSNDANKSCVGKKPCGHGILDADNAVQVALNGYDVLFSAPKMADLATHECGKNRLKPGKNIINDNTVTWIQTKASCEADISYQNPHVEKTKDGKIYAYYGSISYELDQSAYKECHVIGYDGVGCYL >CP014255|2262164:2272282|2265113_2266439_-|AMP89345.1|DBSCAN-SWA MELVEEGVQKINTLQDYKVADISLAEWGRKEIAIAETEMPGLMALREEFSAKKPLQGARIAGCLHMTIQTAVLIETLVALGAEVRWSSCNIFSTQDHAASAIAAKGIPVFAWKGETEDEYWWCVEQTLSGPNGWKPNLLLDDGGDLTQVVHQKYPQLLAAIKGVSEETTTGVARLYEMAKHGHLKIPAINVNNAVTKSKFDNLYGCRESLLDGLKRATDVMIAGKVALILGYGDVGKGCAQALRGQGATVLVAEIDPICALQAAMEGYRVVTLDDVAEQVDIVVTATGNYHVVTHEHMKRMRNQAILCNIGHFDSEIDIQSLKQYQWENIKPQVDHVIFPDGKRIIILAEGRLVNLGCATGHPSFVMSASFTNQVLAQIELFQNSSQYQNQVYVLPKVLDEKVARLHLGRIGAKLTQLSNEQADYIGVDKNGPYKPDHYRY >CP014255|2262164:2272282|2266457_2267606_-|AMP89344.1|DBSCAN-SWA MNEVHVFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDAILAQDPKARVACEVLVKTGMVLVGGEITTKAWVDVEDITRHVIKDIGYNSSQMGFDWESCAVLSAIGKQSPDIAQGVDNQQTKILGAGDQGLMFGYASRETDVFMPAPIAYAHRLMEKLAFMRKSGQLPWLRPDAKCQLTLKYGQGMPVEVDTVVFSTQHSPDIEHKDLVEAIREEIIKPVLPAEWLNDKTRYFINPTGRFVIGGPLGDCGLTGRKIIVDTYGGMARHGGGCFSGKDPSKVDRSAAYAARHVAKNIVAAGLADKCELQISYAIGVAEPTSIFVETFGTGRLKNSEIIDLIHTHFDLTPQGIIDQHDLLRPIYRQTATYGHYGRENFPWERLNKVAELSKAL >CP014255|2262164:2272282|2270347_2272282_-|AMP89341.1|DBSCAN-SWA MAKIIGIDLGTTNSCVAVMEGDKPKVIENSEGHRTTPSIVAFTDDNEILVGQSAKRQSVTNPEKTLFAIKRLIGRRFDDPIVQKDIKMVPYKIIKADNGDAWVRVKDQDKAPPQISAEVLRKMKKTAEDYLGEEVKEAVITVPAYFNDSQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGMDKKRGDSVIAVYDLGGGTFDISIIEIAEVDGEHQFEVLATNGDTFLGGEDFDLALIEYLASEFKKDTGIDLHNDPLALQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADASGPKHLNIKLTRAKLESLVEKLVERTVEPCKIALKDAGLTVSQINEVILVGGQTRMPLVQKTVEEFFGKEPRKDVNPDEAVAVGAAIQAAVLSGEVKDILLLDVTPLSLGIETMGGVMTKLIEKNTTIPTKATQVFSTADDNQTAVTVHVLQGEREQASANKSLGRFDLRDIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAKDKATGKAQSIVIKASSGLSEEEVAAMVKDAQAHAEEDKKFKEMAELRNQADSLIHSCEKSMKDLANDLSEDEKKGIETAISELKEAVQGTDKARIEDKLKVLTDASAKMAERIYAKKSSEGQAAQGQTQSQESTKPEEEGVVDAEFEEVKEEDKK >CP014255|2262164:2272282|2267808_2268936_-|AMP89343.2|DBSCAN-SWA MSIFFMINKSAILALADGTVFEGLSVGATGDSVGELVFNTSMTGYQEMLTDPSYARQIITLTTAHVGNTGCNMEDMESTKVWAAGLVMRSCTAIPSNYRAEQSFPDWLNKNGVVAISGIDTRALTLKLREKGAIGACISTNVEKPEIALAKAKSFAGLQGADLALEVTRQTTERWHEGQGEWSLSKQPQQLHVVAYDFGVKHNILRILHDKGCHITIVPAKTSAEEVLAMNPNGVFLSNGPGDPQACDYAIKATQVFLDNNIPLFGICLGFQILALACGGITKKMKFGHHGSNHPVIETTGKKRVFITSQNHGFAVDEDSLPNCLEVTHRSLFDNSLQGIRHKTKPAFGFQGHPEASPGPHDIDILFNEFVNLMK >CP014255|2262164:2272282|2263980_2264994_-|AMP89346.2|DBSCAN-SWA MLMDLVIAANYLSTLEKCLEQFGIKHFLEKIGFDLIRVHDPNAYLTQDEFNHVIIEAYKLSQCPELGLIFGQNLSIVNHGFLGYAAMSSPTFGTAIQTVLSYLNTRTSLLSLELHQFNNKNNAYIKLLSHTKEMVLSRFITELAITHLIKMRNFLISCNNPMLKIELNYDEPPYAKYYQTIFQCEIVFNTESTRVWFKAEELNYPIHFADDVSYQLAKKQLQEIEKKMSLNEDMASKIKSILINQNLNHVSMDEIASQLCMTSRTLRRHLQRLHVTYQELLDEVREQKAKTFLLNNNISMTEISFLLGFQDTSNFSKAFKRWTGITPTEYREKHEIQ |
7 | Bacillus_phage(16.67%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2624309 : 2635735
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP014255|2624309:2635735|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP014255|2624309:2635735|2624309_2625311_-|AMP89089.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLVLGIESSCDETGVAVYDSESGLLSHALHSQIATHRVHGGVVPELASRDHVNYLIPLVDEVLTKAQIRKNQLDGIAYTAGPGLIGALLVGSCFAKSLAYALNIPALAIHHLEAHLLAAKMETPSLDFPFIALLVSGGHCQLIEVNNIGEYRLLGDTLDDAVGEAFDKTAKLMGIPYPGGAVLANLADQCLSTPYQFPRPMTDRPGLDFSFSGLKTHALNTWNQSAKKENDRSEIAKAFQQAVVETLIIKCKRAIKESQSKRLVVAGGVGANKALRSALQKWIKDIQGEVYFPALEYCTDNGAMVAYAGCLRMLRGESDEGWGVVVKPRWPLA >CP014255|2624309:2635735|2626396_2628142_+|AMP89086.2|DBSCAN-SWA MRSNMSGLIPQPFIDDLLHRTDLVELIDGYVPLKKRGNSHIACCPFHNEKTPSFNVVAKKQFYHCFGCGASGNAISFIMNYLNQGFTDAVETLATRLGLSVPRDGTGEKHKSSLNLYNLMTEVSQYYQKKLKYNGQVAIDYLRSRGLSGEIAKRYHLGYAPEGWHNLEKAFPNNQRELLSTGMLIKSDDGKIYDRYRNRIMFPIHDRNGRVIGFGGRVLDKDQKPKYLNSPETVLFQKSRELYGLHQVLSQQKNPDSIIVVEGYMDVIALAQHGIFNVVATLGTATSTFHIQLLAKHTKHLIFCFDGDAAGRQAAWRALESSLPHLNAGLDAGFIFLPAEHDPDSLVRNEGKNGFLELLRQATPLHRFFFDTLSKDINLLNPAGKTQLINAVKPYLQKMVEGSYKQLLIDDLARLTHIESHRLNNLITEKSESKPEVQAAISRSPLRIAIALLLQNPEIYSVAIQQINPELLNEQEHHILLKLLQQLKDNPNANTATLIEFWRNSSYFELIVKLAAWDHQVPDQELIKEFIDVLLFLQKQNREILIRQYIEKSRKIGLTENERLNLQNLLKERHGQAEIEK >CP014255|2624309:2635735|2628228_2630094_+|AMP89085.1|DBSCAN-SWA MTMNDQDQQSSQITKVISLGKEQGYLTYSQINDLLPNIVDTEHFDVIISMLEGMNIKVFELPPSEDELALLLNTEEVPDIEEAAMVLASVDKETGRTTDPVRMYMREMGTVELLTREGEIRIAKRIEEGIYQVLKSLAHYPETVQLVLEDYDRFLVEEIRLNEIISGFADVDEEIAPATNIGSMLDEEQQEDILLDVDEEDEDGEGGISDVDDGPNPEQAKAYFDELREAFDKAMKALKEHGRTNKKTVELLDSMSESFLKLKLTSRQVDKLTRHFRQLRNHIREFERSIMRLCIEKARIPRKLFIDTFPGQETDLSWLETIISKHAKKLDLERIEEYREEILRLQSKLASFEIEYGLTISEIKDINRKMSIGEAKARRAKKEMVEANLRLVISIAKKYTNRGLQFLDLIQEGNIGLMKAVDKFEYRRGYKFSTYATWWIRQAITRSIADQARTIRIPVHMIETINKLNRISRQILQETGREATPEELAEKMELSEDKIRKVLKIAKEPISMETPVGDDDDSHLGDFIEDNNIESPIDMATAEGLREATLEILETLTPREAKVLRMRFGIEMNTDHTLEEVGKQFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSEKLRSFLEGDEG >CP014255|2624309:2635735|2631192_2631684_-|AMP89081.1|DBSCAN-SWA MKQGGSYANSSGGVLEGLVEFALTKKGFTVVRYKDWKLNPSSYGDELLLKNVPYEGLYKHASATEFVLMSKAYNLNTRIECKWQQVSGSVDEKLPYLFLNCSEKMIEPHIIILLDGGGAKPGAIEWLRESCEKFNLRELDVSKRRIDLMNMTEFVQWVNSVFK >CP014255|2624309:2635735|2631693_2632530_-|AMP89080.1|DBSCAN-SWA MRKNNEQALIVPIRPFLKWAGGKFQIINKIRASLPKGARLIEPFVGSGAVFLNMDYDKFLLADINADLINLFEHLKSERHDFIHFCKQFFSDEFNKKSTFLTLRSEFNSTKDSYLKAALFLYLNRHAFNGLMRYNSSGKFNTAFGDYKKPYFPENEMLTFIQKSEKAEFKCADYSLIMNEATKGDVVYCDPPYVPLSASANFTKYHSTDFGSEDQRRLVELAKELAAKGIPVILSNHDTAFTQNLYQGSSILSFDVQRSISCNGSTRGRAREVLALFN >CP014255|2624309:2635735|2630956_2631178_-|AMP89082.1|DBSCAN-SWA MCQIKKGTNKIYCWLKNKFGGNGIPTDMKILETIYSLYLEDFLNYSPENKTREEKIYLPIEIKKIAEILRTDE >CP014255|2624309:2635735|2625515_2625755_+|AMP89088.1|DBSCAN-SWA MPTVRVKEGENPEYALRRFKRSCEKAGILTELRRREFYEKPTAERKRKQAAAVKRHLKKISRDVSSKRGVGHRRKKSTT >CP014255|2624309:2635735|2625956_2626400_+|AMP89087.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTIKEQINNDIKDAMRAKDKNLLNALRLISAAVKQIEVDERIEVDNERMLVILDKMSKQRKESIAQFEKANRDDLVAQEQFELDVIAKYLPEPLTDDEIDALISDAIKSTGAEKMSDMGKVMAILKPKLQGRADMAQVSAQIKAKLS >CP014255|2624309:2635735|2630347_2630707_+|AMP89084.1|DBSCAN-SWA MRRDWDVIRNILIKIENLETNTYLQLKNFPESEHNKISHHIELLCDDNLIECNIHKTTAGRPYDFHVSRLTWRGHEFLDSVRSDTVWSKTKEVFKNKGVDMGFNLIIATAQKIAGTLLS >CP014255|2624309:2635735|2633083_2635735_-|AMP89079.1|DBSCAN-SWA MAIAFARVSIHSRSKGHSAIAAISYRAGIKLVDERTGLTHDFSHRQDVVFSEVLLPNNSDSAFSDRSILWSAVETAEKRVDAQLCKDVVLALPKELNREQQIDLTRRFAHTHFVENGLPADIAIHDHGDGNPHAHILIPTRRLEGKQFSKYKARDLNPTFAKGFIVENDYWGELWREMQNEYFVEQNLDLEVDANHLISERHRGQQRNSSAHYLQEENQLIQQARMEMTRDNINHVIEHLSSQHSVFTRRDVERLLFKTFSPSNNPQEYLQFVEKVLSDKDVILLGENSKGKVSYTTRSHFLEEAGLLDDIENMMRSNKHRNNQSIDYLAQQYTLSEEQKEAFHYITQSPDIAVVIGRPGTGKSYLLKPVNEFYKQANQLVIGAALSGKVAKALQSETGIKSSTIKSLSYRLANNMMQLSDKHVLIIDEAGMVDFASLAYLIKEAHKAGSKVVLIGDPDQLKPIQKGEIFRGIAARTGYIEIENIKRQQDLGDRQASLDLAKGDIDKAIQHYQDKGAITITDTKLQAIEQVVTGWKQDLEITNMADTIMLSYTRKAVNQLNDLARESLIAENKLGEENIVYQGLERSLKISTGERLLFRENNKVLGVRNGDTATVKEISSQQMSVQLDSGELLTIPREYKALDYAYALTVHKSQGMTAKKVRVLIDSKYWDRNLSFVAMTRHKEQLNIYADQENHPTVQALKQTLSRSSTKDNVIDWPLDFATRAGFDSDSLISRAVNHIVGVGHKIKQAYNFIVNYEAYLLKARKQGKLQDIGEARADARQEALKVDATMPENKAYKISHQSFETLKKDFPQLGELETLINKRQRMTGYFAEKADKQITTMSRQLLTNKAVANQVKSQYPEFYQKIQSIYNKQKEKALLYDR >CP014255|2624309:2635735|2630728_2630956_-|AMP89083.1|DBSCAN-SWA MIFGRIYHYLNKKHSFDKTPLFEIKLGTDIHVIQFPLMVSILAELLNDHRRFKTSIWLSVGALVLSVVSIAVSFH |
11 | Vibrio_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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