Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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CP020403 | Pasteurella multocida strain FDAARGOS_216 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DinG,DEDDh,cas3,cas2,cas1,cas9,csa3,cas8f,cas5f,cas7f,cas6f,cas3-cas2 | 0 | 0 | 2 | 0 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1710846 : 1755737
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020403|1710846:1755737|DBSCAN-SWA 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55 | Pseudomonas_phage(44.74%) | transposase,capsid,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2090311 : 2099670
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020403|2090311:2099670|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020403|2090311:2099670|2095833_2096781_-|ARB74498.1|DBSCAN-SWA MPDIKLFTGNATPELAKRISERLYLSLGDATVGRFSDGEIQVQINENVRGSDVFIIQSTCAPTNDNLMELIVMVDALRRASAGRITAVIPYFGYARQDRRVRSARVPITAKVVADFLSSVGVDRVLTCDLHAEQIQGFFDVPVDNVFGSPVLVHDMLKKIDMQNPIVVSPDIGGVVRARAIAKLLNDTDMAIIDKRRPRANVAQVMHIIGDVAGRDCILVDDMIDTGGTLCKAAEALKERGAKRVFAYATHAVFSGSAAKNLASDALDEVVVTDTIPLSPEIKALNKVRVLTLSGMLAEAIRRISNEESISAMFT >CP020403|2090311:2099670|2093178_2093970_-|ARB74496.1|DBSCAN-SWA MHIHSIKLPLVELKNINVVFEQKKALQNINLTLYPNSIITIVGPNGGGKSTLLKVLLKLLPPTSGQVIYHKNLRIGYVPQKIHLDHSLPITVERFLSLKKGISRQAIQDALSLLSISHLHKNSLQKLSGGEMQRVLLARAILNKPNLLVLDEPTQGVDINGQAELYQLIQQTQHQLNCAILMVSHDLNIVMADTNEVLCINQHICCAGTPETVSNDPTFIHFFGDQFAKNVALYTHKHNHKHDIHGDICCTSDFQSQQCTHKE >CP020403|2090311:2099670|2092384_2093170_-|ARB74495.1|DBSCAN-SWA MFEILFPAWLTGMLLSLITAPLGAFVVWRKMAYFGDTLAHSALLGVALGIFLDINPYLSIVLLTLILAILMVWLEGKTQFSVDTLLGIIAHSCLSLGVVTVGLLQNVRVDLMAYLFGDLLAMNYEDLVVIGIGVVFVLVTLLYFWHPLLSTTVSPELAQVEGVNVQKMRFILMILTALTIALSMKFVGALIITSLLIIPSATARRFAKTPESMVFIAILISMLSISLGLLLSAYYDTAAGPSVVICASLLFLLSLMKKEHN >CP020403|2090311:2099670|2094204_2095758_+|ARB74497.1|DBSCAN-SWA MQIKIAIFFSIILFIVLVVSLGKKEEGQDSSADSQTQTETQIEKQPALSTATVESPSSVQADSTLSPPSSAESVEKQAITEHHTESSAVSMDEKNSDTQVDASSQETTAKPAENTLDATSFYDDLEAKDDEVDEIKPDMLDELAAFPEPVRHALSDLFDVMDQAMRIKNQFSHTVVKGDSLKDVLELSGLDASVSERLIKAYPEFKNLKPGQQFYWILDNQGELEYLNWLVSEREEKIYEKTADGQYQREILKKQSVWKKEVLKGRIDGSFNTALRTLGLDIRQINQLANALQWQINLKRLKKGDKFAVLVTREYIEGKLTGQGNVDGIHIISAGKSYYAIQASNGRYYNRQGETLGKGFARYPLQRQARVSSHFNPYRRHPVTGRIAPHKGVDFAMPVGTPVIAPADGIVEKVAYQANGAGRYIVVRHGREYQTVYMHLSRALVKAGQNVKRGQRIALSGNTGRSTGPHLHYEFHINGRAVNPLTVKLPGTSSGMGTAERKQFLVKAKEIERQLRL >CP020403|2090311:2099670|2097737_2098355_-|ARB74500.1|DBSCAN-SWA MKKQHFLLPIIASFFLFACTLDTERPTDVKYISHTDPTWQQHLSQLKKIRDYTNQGQLGYISQKERFSTRFDWQYQNPTNYRLTLSSTLSPTTLSIEVRHNVMHLSDNKGPLRSAQDAKRLLKEIVGMDLPLDQFALWLKGQPDESREYRVAENHLLAHFSYPIDNQQWTADYLSYHQLPLPLPKDILLKTEGQTLKIRIDNWTY >CP020403|2090311:2099670|2090311_2091310_+|ARB74493.1|DBSCAN-SWA MALLNVENLSVHFGDENAPFKAVDRVSYTVNEGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDYPGRVQAEQLLFNQSDLLALTEKQKQKIVGADVSMIFQDAMTSLNPSYTVGYQIMEALKVHQGGAKAWRKERAIELLTLVGIPDPRSRLDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACNPKLLIADEPTTALDVTIQAQIIDLLLELQRKENMALILITHDLALVAEAAHRIIVMYAGQVVEEGRAEEIFKCPRHPYTQALLRALPEFAEGKSRLQSLPGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATDRCREQEPETRLVNGHRVKCHTPLNAQGMPSCTEFAVS >CP020403|2090311:2099670|2098395_2099670_-|ARB74501.1|DBSCAN-SWA MNNKIKIYLVGGAVRDQLLNLVVKDRDWVVVGATPDDLLSQGYQQVGKDFPVFLHPQTKEEYALARTERKAGSGYTGFICDFSPTISLEQDLSRRDLTINALAQDLDGKIYDFYGGLTDLKQRLLRHVSPAFAEDPLRVLRVARFAARYHTLGFTIASETRELMQQLSQSGELSNLTAERVWLETEKALLEPHPEVYFQTLQEVGALQVLFPELAALQGVPNPAKYHPEIDTFVHTMLVLQQAVLLTENTDSDKSAVRFAAICHDLGKALTPKEILPHHYGHEKAGVMPTRRLCQRFKLPHAIQDFAELCCEYHSHIHKAFELRAETILKLFNRLDVWRKPERFKALLLVCIADTRGRTGFEQVDYPQREFLWQLYQSALQVNVQDIIQQGFQQQAIRDELNRRRIIAIKQTRAEILPRFTNPC >CP020403|2090311:2099670|2096850_2097738_-|ARB74499.1|DBSCAN-SWA MQHYHFSHSLLAQQEKPYRFPCPAKLNLFLYINGKRQDGYHELQTLFQFVDFGDWLDIEVREDNEICLTPELPSLKNEDNLVYRAAKLLQQKTNCALGANLTLDKILPMGSGLGGGSSNAATALVALNYLWNTQLSTKQLAKLGLMLGADVPIFVHGHAAFAEGVGEKITYCEPKEKWYVVLKPNVSISTATVFSDPDLIRNTPKQSLEQLLNQKYANDCEKVVLNHYPEVEEILHRLLQYAPSRLTGTGACVFAEFNDEESAQLAFQTIPKNYFGFVAQGLNKSPLHNMLAKIS >CP020403|2090311:2099670|2091326_2092307_+|ARB74494.1|DBSCAN-SWA MQELERQAPLLDAVNLKKYYPVKKGILSKPKLVKAVDGVSFTLERGKTLAIVGESGCGKSTLGRMLTMIEAPTEGELFYKGQNFLENDTATQKLRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGTILEEPLLINTDLNAKERKQQVLEMMEKVGLKPEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLRPDIVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQEEMGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCVEQGETKAIFNHPRHPYTQALLSATPRLEAEHRRERIKLTGELPSPLSPPKGCAFHARCRFAMEKCALEKPALKQYEDGSKIACFMLD |
9 | Planktothrix_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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