Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020412 | Legionella longbeachae strain FDAARGOS_201 chromosome, complete genome | 0 crisprs | PD-DExK,cas3,DEDDh,csa3,DinG,WYL,RT | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
178688 : 185505
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020412|178688:185505|DBSCAN-SWA ATTATATTCCCTCGATAAGTTGATCTAATGCTTTACCTATGTCTTTAGCCCTCATTAAGCTTTCTCCAACAAGAAATGTGTTTATGCCATGAGACTGCATCAAACGAATATCTGCATGGGTATTAATCCCGCTTTCAGTAATGGTTATTCTATCTTTGGGAATGTAGTGTTTTAAATCAATACTCAACTGTATATTGGTATGAAACGTATGAAGACTTCGGTTATTGACTCCTATTAATGGAGTAGGTAAACGTAAAGCACGTTCGAGTTCTTCTTGAGTATGGCTTTCTACAAGGACGGCCATACCAAGCTCCTGAGCCAATTGGCAAAACTCAATTAACTGAGCATCATCAAGTAAAGCGACAATAAGTAAAATACAGTCAGCACCCAAAGCTAAGCTTTCATATATTTGATAGGTATCAAGAATAAAATCTTTACGCAATACTGGCAAGTTACAATGCATTTTCGCTTGAGCTAAATAATCTGGATGACCTTGGAAAAAGTCGATATCAGTAAGTACTGAAAGACACCGTGCTCCATGTAGCGCATATATTTTTGTGATTTCTACTACATTAAAATCTTCTCGAATGATCCCTTTACTGGGGGACGCTCGTTTAATTTCTGCGATAATAGCTGGTGATTCTTGAGCTTGTAAAGCACCACAAAAATTTCTTTGCTCCATTAATGGTTGTTGTTTTAATGAATCTAAAGGCCTTTTTTTCTTGGCCAAACTAATTTCTTCTAATTTTTTGTGAGTAATACGCTGTAGTACACTATTCATGATTTGATTCTTTATTTAAAGTTTGAGTTAATTGGCGGAGTCGTGTAAAGCATTGCTTCGCTTTGCCGCTATCTATGGCGAGTTTAGCGTGTTCTAATGCTTGTTCAAAAGATAATTCATTCCCAGCACAATAAATGGCGGCCGCCGAGTTTAAGAGTACTATATCTCGTGGAGCTCCTAATTTTCCGGAAAATACCGCTTGGATATAGTCTAAACTTTGCTCAGGTGAATCAATAATGATTTCATTTAATGAATGATGATTGATCCCATAATCTGTAGGATTAAGAATCCAGTGATTAAATCTTCCTTCTCGATATTCAACGATATTTGTAGGGGCAGCGATACTAATTTCATCCAAGCCATCCTGGGAACTAACTACTAATGCCCTTTCGCTCCCTAAACGAGCAAGAACAGAAGCTAAGGGCTTTTGCCAAAATCCTGAAAAAACCCCTACTACTTGCTTTTTTACTCGAGCAGGGTTAATTAATGGGCCGAGTAAGTTAAATAAAGTTCTAATTCCTAATTGTTGACGTGCTGCTCGAGCATATTGCATCGCAGGATGGTAATGAGGGGCAAATAAAAATGCTAATCCACATTGGTTCATGCACATTTGCATTTGTTCATCTGTAAGATTGAGTTCAAATCCTGCTTTTTCTAATAAATCGGCGCTTCCACTACGACTGGAGACTGAGCGATTACCATGTTTAGCGACAGGAAATCCCGCACTTGCGACGACAAAACTACAAGCAGTGGATACATTAAACGTGTTTTTTCCGTCTCCACCAGTGCCTACTATGTCAATTAAATTTGTACCTAATTCAATATGGTGCGCTAATTGTTGCATTACTTCTGCTGCAGCAATTAACTCATCAGTAGTTTCAACTTTCATACGCATGAGCGCTAAAAAAGTAGCAATCTGGACATCGCTATATTCACCAGACATACAAGCATGAAGAACATCGTGAACTTGTTCAGTGCTTAAATTCTTTTTTGCGATTAGCTGTTCAAATAGAAGATTATGTTTCATATGTTAAAAAATTTTCTAATAGTTTTAGACCATGCTGGCTTAATATTGCTTCTGGATGGAATTGTAGACCAAAAATGGGATATTGACGATGTGAAATTGCCATAATGGTATTATCTGCCCATGCATCAATGGAGAAACAATCTGGCAGACTGTCCTTATCAACCGCTAGGGAATGATAACGAGTTGCTTTGAATTGATTCGGGATATTTGTAAATATCTTTTGTTGATTATGTATAATGGTCGATGTTTTTCCATGCATTATTTCAGGAGCGGATATAATTTTACCGCCAAAAACCTCTGCAATGCATTGATGCCCAAGGCAAATTCCTAATATTGGGATATCTTGATAAAAATTATAAATTACTTCCATTGAAATACCGGCATCCTTGGGGGCTTTGGGTCCAGGAGAAATCACTAAGTAGCCTGGTTTAAGCTTCCTTATTTGCGACAAAGTAATTTGATCATGGGTGAAAACAATCACCTCTTGGTTTAAGCATTGAAAATATTGTACTAGATTGTAAGTAAATGAGTCGTAATTATCGATGATGAGTAACATATTAAATTAAAATTTGGTATAAGAATCGTATTTTAAAGTAGTCGCTTTATATATCCGAATTGTGTTGCGCTACACCCCGAATTTTCTTTCAGTCCGTGAGATCCAACTATAGTATGGAGCAAGAGCATCTTTTGTTTCAATTTTGTGAACAATTCTCGAAAACCAACTGCTGGCCTTTAATGAGCAAGATTTTCTTAGGGTTATTCACCTACATTTCATTTATAGAGTAAAGTCATCACCTAAATAAACAGCCCTTACTTGTTGGTTAGCCAATATAATATCAGGTGTTCCTTCACACAATATTTTTCCTTGGCTAACAATATAGGCGCGTTCACAGATATCTAATGTTTCTCTAACATTATGATCAGTGATGAGTACCCCAATGCCTTTATTACATAAATGTTGAATAATTTTTTTGATATCAATTACTGAAATGGGATCAACTCCAGCAAAAGGCTCATCAAGTAAAATAAAAGAAGGCTCTATGGCTAAAGCTCTAGCAATTTCAACCCGTCGCCGCTCTCCTCCTGATAAAGACATACCTAGACTTTTGTCTAGATGGGAAATATGAAACTCTTGAAGCAAGAGGTCAAGCTTTTCTTGTCGAGCTTGTTCACTTAAATCAGCTCTTAATTCTAATATAGCCATAATATTTTCAGCAACAGTAAGCTTACGGAATACAGAAGCCTCTTGGGGAAGGTAGCTGATTCCTAATCGGGCTCGTTGATGCATGGCACTTGATGTAATATCCTTTTCAGACAAGAAAATTTTCCCTTCATCACATGCTTGTAGTCCTACTATCATATAAAAGCAAGTCGTTTTTCCTGCACCATTGGGTCCTAGCAAACCAACACATTCGCCTTTGTTTATGTGAAGGGTAACTCCATCAACCACTGTGCGTGATTTAAACGATTTTTTGAGGTTTTGTGCTTCTAGAATACTCATGATGGTTTCTTTTCTGGATGATAAATAATCATTATTCTTTTGCTGCCATCGCCCTGAGATAAAACATGTTGCTTTTCAGTATCATAACTTATTTTGGTTGCAGAGAATGAGTTATTCCCTTGTTCAACTCGAGCATTTCCTATTAATTCAATTAAATGACGTAAGGGATAATAACGTATGGTATCAGCATATGCATGCAGTGGGGGTTTCTTTGGATCCGTCGTTGTCCAATAATGAGCTTGTTGTCCAGGAGCCCCACTTGCGATGGCTACAACAAGTTGATTCTTTTCATTACCTAAAGTGATAGCTTTTGTTGCCCGTAGATTCGTTGTCCCTTGTATGAGTTCAACATTACCCGTATAAATACCTTTATGTTGTTGTTGGCTCAAATCTGCTGAGTCGGCCATTACATGCATGACTTTTTCTTTATCTTCTGACAATGCATATGAAGAACAAGCAAATGTTAAAAAAAACCATAAGCAGAACCACAATTTAAAATACTGATGTGACGCACTGTATCTAACCATTTGCTGGAACATAACTTCCTCGGGCTCGATGAAGTAACTCTACTCGTTTTTCATCCAGATAAGCATTCATTCCAGTAGATTGAACGATGTTACCTGATTGTTCATAAGTTACTAAAACATTGGAAATTGCTTTCTTTTCTTTTGGGAAGTAGGTGACTTCCTCTGTTTTTAAGGTACTTTCCTGGGATTTATTACCTTTATTTTGATGTACAATCACGTTACCAAGGAACGTAACTTGTTTCCCTCCATCAATCGATTTGCCTTTTTCTGAACGAATATCCCAAGGTGCTTGTTCGTCCTCGCTTACAATAATATGAGGATTTTCAAATAAATAAACATTACCTTTTTGAATATGTTGCAAGAGGGGTGCGGTTAATAAATTGGCTAGGGTACCTTTTTGATTAAACTGACGCACTGTTACGTGAGAGATTGTCGTATCTACTGAATTTGCCAAAGTTTCATGATCCAGGCGAATTAATGTTGTAGAATGGCTGTAATACCAGCCTGAACAAGCTAGAAGAATTAATGTAAAAAAAAGCCACATAAATTGTTTTGCTGCGTTCATTGTTTTAAATAACCTGATATGGCTAAATCCATTTTGCCCTGTGCATTAAGAATAAAGTCGCATAATTCACGTACAGCCCCACGACCGCCTGGTAAACTAGTTTGCCACATGGCAATTTCTTTAGCTAAATAAGTTGCATCGGCAACAGCAACACTAAGACCTACTTGTTGCATAATTGGTATGTCTGGAATATCGTCACCTATGTAAGCGAATTGTTCATCTTTAAGGCTTAAGGCTATTTTGAGTTGATTGTAAGCTTCTGTTTTATCTATTTTATCTTTGTAATAATGAAAAATACCTAGTTGTTGCATGCGATGATCAACTAACGGATTATGAGAGCCAGTGATAACAGCGACTTCAATGCCGATTGCCATAAGTAATTTTAAGCCAACGCCATCATGAATATGAAATGTTTTCTGCTCATTACAATGAGTATCAATATATAAAAAACCATCGGTGAGTACACCATCGAGATCACAGATGAGGCATTTTATATTTTTCGCTTTTTCTATTAACTGGATCATTAAAAAATACCTGCTTTTAACAAATCATGAAGATGAATCACGGCAGCAGGCCTTGTTTCTTCATCAATTACAATCAGTGATGTTATACTGTATTTTTGCATCATAGCTAAGGCTTCAGCAGCAAGCATTCCCTTGTAAATAGTGCGTGCATTACGCGTCATTACTTCTTTAATTGGAGTAGTGTTAATATCGTATTGATGTGTTAAAGTCCGTCGAATGTCCCCATCCGTATAGATACCAGTAAGGTATCCTTTATTATCAATAACACAAGTCATACCTAGTTTTTTTTCGGTTACTTCGATAAGCGCTTCACTAACAGTTGCATTTTCATGAACAAGCGGCAACTGTTCCCCTTGGTGACAGAGCTCGTCAATACGTAATAAAAGCCGTTTGCCCAAAGAGCCTCCCGGATGAGATAAAGCAAAATCCTCTTCACTGAACCCTCGAGCCTGCAACAGCGCAATAGCTAGTGCATCCCCCATCACCAGTGCCACTGTGGTGCTTGTTGTGGGGGCCAGCCCAAGCGGACATGCCTCTTGTTTAATACCGACATCTAAATTAACGTCTGATGCTTTTGCTAAAGCAGATTCAGGATTACCAGTTAAGGTGATAAGAGGTATTTCCAAGCGCTTTAATAAAGGAAGTAAGGTAACCAACTCTGCGGTATTGCCTGAGTGGGAGATGGCGATTACTGTGTCTTGCCGAGTAATCATTCCCAGATCACCATGGCTTGCCTCACCTGGGTGCATAAAAAAAGAAGGACTGCCTGTACTTGATAAAGTAGCAGCAATTTTATTGGCTATATGTCCTGATTTCCCCATGCCAGTTACAACGATCCGTCCTTTACAGGCAAGCAGTAATTCACAGGCCTTTTCAAATCGGTTATCAATTCTTTGGGTTAATTCAAAGACGGCTTGTGCTTCAGTCTCAATAACGGCAAGCCCTAATTTACAAAAATTCATAAGCTTATTTATTGTTTTTTTGTCTAATTTTGATTCTATCAAAAAAACATTTGAATAAATAGAATTAAATAGCTCATTTTTTTTTGTGATCCAGTATATACTCCTACTTTTGGCTAAACTGGAAAAATAGAGAATGCCTGAAAATTGGGTTGAAATAAAGAATTTAATTTTTACTCGTGAAAAGCGTCGCATCTTCGATGGCATTAATATGAAAGTTAAACGAGGTAATATTACCGCGATTATGGGGCCGAGTGGTTCTGGAAAGACGACCTTATTGCAGCTCATTGGTGCACAGTTGAAGCCCGATAGTGGTGTTATTCATGTAAATGACCAAAATATGCACCAATTGCCTCGCAAAGCTCTATATGAAGCAAGGCGTAATATGGGGCTTCTTTTTCAAAGCTCTGCTTTATTTACCCATCTATCAGTATTTGATAATGTTGCTTTTCCTTTACGGGAACACACGCAATTAAATGCATCCATGTTACGAAATATTGTATTAATGAAACTTGAGGCTGTTGGCCTACGTGGAGCTGTTGATTTAATGCCGGCCCAGTTGTCTGGCGGAATGGCAAGACGTGTTGCTTTAGCACGCACAATTGCTTTGGACCCAGAGCTTATGATGTACGATGAGCCTTTTACTGGACAAGATCCTATTTCACTGGGTGTTCTGGTTCGGCTCATTAAAAGACTAAATGAATTGCTGCATACGACAACCATCATTGTTTCTCATGATGTAGAAGAAACGTGTTCTATTGCTGATTATATCTACCTTATATTTGGTGGAAAAATTATAGGAGAAGGAACCCCACAGGAGTTATTAAAATCTACCGAACCTCAGGTGAAGCAATTTATGCATGGGGAAGCAGATGGAGTAGTGCGTTTTCATTATCCTGCCAGACCTTATACAGAGGAGCTATTAGATGTTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020412|178688:185505|179460_180495_-|ARB90838.1|DBSCAN-SWA MKHNLLFEQLIAKKNLSTEQVHDVLHACMSGEYSDVQIATFLALMRMKVETTDELIAAAEVMQQLAHHIELGTNLIDIVGTGGDGKNTFNVSTACSFVVASAGFPVAKHGNRSVSSRSGSADLLEKAGFELNLTDEQMQMCMNQCGLAFLFAPHYHPAMQYARAARQQLGIRTLFNLLGPLINPARVKKQVVGVFSGFWQKPLASVLARLGSERALVVSSQDGLDEISIAAPTNIVEYREGRFNHWILNPTDYGINHHSLNEIIIDSPEQSLDYIQAVFSGKLGAPRDIVLLNSAAAIYCAGNELSFEQALEHAKLAIDSGKAKQCFTRLRQLTQTLNKESNHE >CP020412|178688:185505|178688_179468_-|ARB90837.1|DBSCAN-SWA MNSVLQRITHKKLEEISLAKKKRPLDSLKQQPLMEQRNFCGALQAQESPAIIAEIKRASPSKGIIREDFNVVEITKIYALHGARCLSVLTDIDFFQGHPDYLAQAKMHCNLPVLRKDFILDTYQIYESLALGADCILLIVALLDDAQLIEFCQLAQELGMAVLVESHTQEELERALRLPTPLIGVNNRSLHTFHTNIQLSIDLKHYIPKDRITITESGINTHADIRLMQSHGINTFLVGESLMRAKDIGKALDQLIEGI >CP020412|178688:185505|184707_185505_+|ARB90844.1|DBSCAN-SWA MPENWVEIKNLIFTREKRRIFDGINMKVKRGNITAIMGPSGSGKTTLLQLIGAQLKPDSGVIHVNDQNMHQLPRKALYEARRNMGLLFQSSALFTHLSVFDNVAFPLREHTQLNASMLRNIVLMKLEAVGLRGAVDLMPAQLSGGMARRVALARTIALDPELMMYDEPFTGQDPISLGVLVRLIKRLNELLHTTTIIVSHDVEETCSIADYIYLIFGGKIIGEGTPQELLKSTEPQVKQFMHGEADGVVRFHYPARPYTEELLDV >CP020412|178688:185505|183611_184574_-|ARB94005.1|DBSCAN-SWA MNFCKLGLAVIETEAQAVFELTQRIDNRFEKACELLLACKGRIVVTGMGKSGHIANKIAATLSSTGSPSFFMHPGEASHGDLGMITRQDTVIAISHSGNTAELVTLLPLLKRLEIPLITLTGNPESALAKASDVNLDVGIKQEACPLGLAPTTSTTVALVMGDALAIALLQARGFSEEDFALSHPGGSLGKRLLLRIDELCHQGEQLPLVHENATVSEALIEVTEKKLGMTCVIDNKGYLTGIYTDGDIRRTLTHQYDINTTPIKEVMTRNARTIYKGMLAAEALAMMQKYSITSLIVIDEETRPAAVIHLHDLLKAGIF >CP020412|178688:185505|183084_183612_-|ARB90843.1|DBSCAN-SWA MIQLIEKAKNIKCLICDLDGVLTDGFLYIDTHCNEQKTFHIHDGVGLKLLMAIGIEVAVITGSHNPLVDHRMQQLGIFHYYKDKIDKTEAYNQLKIALSLKDEQFAYIGDDIPDIPIMQQVGLSVAVADATYLAKEIAMWQTSLPGGRGAVRELCDFILNAQGKMDLAISGYLKQ >CP020412|178688:185505|181992_182535_-|ARB90841.1|DBSCAN-SWA MFQQMVRYSASHQYFKLWFCLWFFLTFACSSYALSEDKEKVMHVMADSADLSQQQHKGIYTGNVELIQGTTNLRATKAITLGNEKNQLVVAIASGAPGQQAHYWTTTDPKKPPLHAYADTIRYYPLRHLIELIGNARVEQGNNSFSATKISYDTEKQHVLSQGDGSKRIMIIYHPEKKPS >CP020412|178688:185505|182515_183088_-|ARB90842.1|DBSCAN-SWA MNAAKQFMWLFFTLILLACSGWYYSHSTTLIRLDHETLANSVDTTISHVTVRQFNQKGTLANLLTAPLLQHIQKGNVYLFENPHIIVSEDEQAPWDIRSEKGKSIDGGKQVTFLGNVIVHQNKGNKSQESTLKTEEVTYFPKEKKAISNVLVTYEQSGNIVQSTGMNAYLDEKRVELLHRARGSYVPANG >CP020412|178688:185505|180484_181051_-|ARB90839.1|DBSCAN-SWA MLLIIDNYDSFTYNLVQYFQCLNQEVIVFTHDQITLSQIRKLKPGYLVISPGPKAPKDAGISMEVIYNFYQDIPILGICLGHQCIAEVFGGKIISAPEIMHGKTSTIIHNQQKIFTNIPNQFKATRYHSLAVDKDSLPDCFSIDAWADNTIMAISHRQYPIFGLQFHPEAILSQHGLKLLENFLTYET >CP020412|178688:185505|181270_181996_-|ARB90840.1|DBSCAN-SWA MSILEAQNLKKSFKSRTVVDGVTLHINKGECVGLLGPNGAGKTTCFYMIVGLQACDEGKIFLSEKDITSSAMHQRARLGISYLPQEASVFRKLTVAENIMAILELRADLSEQARQEKLDLLLQEFHISHLDKSLGMSLSGGERRRVEIARALAIEPSFILLDEPFAGVDPISVIDIKKIIQHLCNKGIGVLITDHNVRETLDICERAYIVSQGKILCEGTPDIILANQQVRAVYLGDDFTL |
9 | Acinetobacter_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
306050 : 372740
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020412|306050:372740|DBSCAN-SWA ATTATTGGCAATGGGTTTGAAAAAGTTGATCAATGGTACAATTAGTTTTTCTACGAATGGATTTAGCTTGTGCCCACTTATGCTCAATTGGATTAAGATCTGGAGAATAAGGAGGAAGATATTCTAAAGTAAATCCAGCTAGAAATAAGAGTTCTTGCATTACCCTATCTTTATGAAAAGCGGCATTATCCATCACCACAACAGAGGCTGCGGGTAATTTGGGTATTAAATCCTGCTCTAACCAACTATTGAAGGTAGCAGCATTAATAGTGCCTTCAAAGAGACTGACTGTAATCAATTGATTATCAAGCAATGCACCAATAGCATTGATTCGCCCTCGTTCTCCCCAAGCCCGTTGTCCATAACATCGATGTCCCTTAAGGGAATAACCATGGGTACGAGGCATCGAATGAGCAAAACCACTTTCATCTAAATAGACTATGGGACGCTTTGCTTCTTGATAGGCGCTTATTTTTTCTTGAAATAAAGCACGTTGTACTTTATCTGCCTTGGGGTGATTCCATGTTTTTTTTATAGCTTACTTTTAAGCGCAGTAAGGCTAAACGAATGCCAGAAGCACTCACTCCAAGACGTTGTGCTCTTTCGTATTGAAAACTATCCGGATAATTGACTACATCCTCTTGCAGAAGGAGCATATTTATCTTAGTGGCAGGTTTGTTACGGTTTTTTTTCGGTTCCAGCTCTACAAGCCACCGCATAACGCTGGCTTTACCAACTCCAAATCGTAGTGCAACTTGTTCTATACTTAGCCCTTCTTCGGATCTTATTTTTAATACTTTTTGCCGAAAATCTAATGAGTAGGTCATAAATAATTGATTATAATCAATTTATTATACGTTGGCTATACTGAGATTTTTTTATCGAATCCTAAAACATAATTAGTGATTATTAAATGCATTAATTAAATCCAGATATTTAACATTACTACTACTATCAAATTTAATAAAGTGTTTGCATTGCCAATCTTGCGATCGTTTAGCTTGTTTATTTAAATTTTGTATCCAAGGTGGATAAAGCCGGATCCCTCTTTTTCCTTCTTTGGAGTCCGAAGAAATAACGCTTTGTTGAAGCAAAACTGATTTATGAAAAATGAATTGTCCAAAGCCAATATTGTCATGAACACTAATAACAAAAAATTCTGACGAATCTGTGATATGGTGTGGTTTTGTTAAGCCATTTACTCTTTGCCATAATGTCACAAAAAATCCTGGTTTAGTAGGTGTTATTTTTCCTGTTCTAAATGTTATCAGTTTGCCATCTAGTGTAAATGTTAAAGCCCCATATTCAACACTCTCTTCTTCAATTTTAATCAATGAAGGGTAAAGGCCACTAGGTATATATGCGATTTGCGTTGCTAAGCTAAAGTCTGGATGAGGGAGCATATCTTTTTTTTGTATCCTATATTGATGTTTAAGAATGCAAATTTGAGAAATATTTTGACGCAGCAATTAGGCTCAATCGAATTGTTAACCGCCTCGAATCAAAACATACAATCTTATCTATGTCTTTATTTAATAATGTTCGATTTTCATATCAAGACTTTTAACTATAAAAGGGGGCTTATTAGTTGTTTTTTGACTCGTAATAAGTAATGAAAAGGAAACATTAAGATGCAATTCAGGAACATTGTAATTTTGATTGACTCTCCAGCATCGTGCTCCAAAGCAAAGATCTTCTTTAATTAAACTAGGGGAATTCAATGGCTTAGGATGAAGTGTAAGTTTGTACTGCTTAATTATTTGGGATTCATTAAAATAAAAATCATTCATGGGCTCCCATGCAGAATGAGAGAAATTTTTTGCAGCCTGTTTTTCTTCATTGGGCGTAGTCTGATAACTAATTGACATGGTCTGCATTAATACTTTCTGAACCCAATCTGTGACTTCGTTATTAGTAACAGCATATACTAATGGCGATGCAGGAAGTGAAATAAGTAATGTTAATCGAACGAGTAATTTGCGCATAATTTATCCATTTAGTTAAGCAGAAATCGATAGTATATTAAAATTATAATTAATTTTACTATTTTAGATAGTTCAGTATATAACTTTAACTGTCATATAAAATGTAAAAGTACAGATATAGAGAATAAAAGATAAAAGTAGTAAGGCGAGTTGCGTAGGCGGTGGGGATGTGGTCAACACGTCTTAGTGTAAAAGATAATTTTGTTGGATAACGGACTATTCGGAGGAAATGTAGGGTCATGTTTTTCATCTATTTAAGGTTGCTTGTGAGCAATCAACATAATGTCTATTTTATTTTCTGCTCCGGGTAAATGCTCAACTCTTTTAATGATAATTAAAAATTAAGTGCGCTTAAATTGATAAGTTTTCATTTTCATCTTTGAACAGTTTTTATGATCTGGAGTTCTATGAGATCGCCAGAGCTTTTTCATTTTCGGATTCAAACCATTTTTTCGACAAAGTCACCATCCTGATTATTTTAGCTTGGCTGGATAACTATCCCCGGGTTTTACACCAATCATAACTATTGTCGCGCCATGTTTGGAATGACTGCTGAAGCAAGTATAAGCAGGTAGGATAAAATATTCTCCTTTGCTATAGGTTGTTGTTTTACTATTAAGATGAAGGTGAAGTTTTCCCTCCATTATGACAACGAGCAGTTTATGTTTATAAAAATGTGGTGGGTGATTGTGGCCTTTAGGAAGTTTGACAATACCCCCTGTAAATTCATTAAATATGACAGCTTGCCTGGTTGATTTACTGTAACTATTACCTATTAATTTCCATTTTTCATGTTTAGCTGTTCCGGACTCAACGGGTTGGGTATTGCCTGTGCATTGAGTAAAAGCTGAGGTGGAACAACTTAGTAATAATGCAGTACTTGCAAAGAGATGAAATAAAGCCCGTCGAGTAATGCAGCTCATGATCTTCCTTGATTTATAGCGTTATCGGTAGGTATAGTATCTGATTTGATATATGTCTAGTTGGGTTAAATTAGATCTTTTAAGTTTGACAGCATTACAAAAATGATTTTAATGATAAACTTCTTTTCTTATATCGTTGTTTTTCTTCTGCATCAAGATTCTTGTAAAAGCTGTTCATCACAGAAATATTTAGAAGCAGGATTTCAAAATGATTTATGTGACGGTATGGAAGTAGAGGAGAATCAAGACACGCTGCTACACCATCCTTAAGTAGTCTTTTTTTGAACTCAGGATCAACCCAGGTGCGGGTCACGACGCGAACACCTCCCATAGGGCCAATGCTTTCATATCACCCCACTAAACGTCGATGATCATCGGCTGTAAATACACCTTTCTCAATATAAAGTTCGCGAATAGCGGCCTCTAAAATAGTAAACTCAACAGCCTCATGACGCTCCTTAATAGGGTGCAAATTTACATATTCATCGCCATGACTATGCTCATGAAGATGATCATGTTCTTCACAACAAGTTGAGCTTTTAGATCTCTATGTTATGGAGCTCTCCCAATAAATAAAATCTATATATGCTCTATCCATCGTTCAGATAACTCAGTATCCAGCGAATTAATCGCGGGCCCTCCGTAGCCAGCCCATAAATCAGTCATTTTAAAACGAACCATATAAAATGGCTCTCTACGTCCCTCGTATCTGCCCCACGCTTCATCTTCAGTGATTACCCAAGAAGACCTTATCATGACGACTTCCCCTATTTTTCCGCGTGTATATCCCTGCATTAGTGTGTGAAATAGGGAGGGTAAATCGATTACTCTTATTTTATTACCCATTTTAAATTTAGTGCTCATTGACAAGCTTCCTCACGTTTTTTAACTTATTGTGAATAGGAAAACCCTTTTTCTAATCTCATACATAGAGCATGAATGTGTAAAATGAACTATGAATGGTTCAGAGTTTGTTTTTGATAAATGGAAAAAACTGCTCTCCGGTATACATGTTTCTTTGAGCTAAAATGGTACAAAAATGACTGATCATATCCCAATCTAACTGAAATTCTATCTAGATGAGACGATCATCTACGTATCTCGATAATTCATCAAATAACCGTCTTTAGCTATGATTCAACTGCATTTTTTAAGATTGAAAATCTAATCGAATCGCACGCCGAGCTTGATGTATTCAATTGATTCATGTGATTTATAAAAAAAACTAATTGGATAAATAATTGCATATGTGGACATAATGTATTCTTAAAAGGTAGATGTTGTAGGTACACATTATGCAAAGCAAAGTAAATACTGATGATTGGAAGTTTGATATAGAAAAATTTAAAAAAGATAAAGACGTAGTTAAACAAAGAATAGATGCACTCAAAGAAACGCTCAAGGAAAGAAAAGAGGAGTATTTAAAAAATTTAACTCAAGAGTCCAACATAAAAACCTTGGTAGAAACAATAATAGAGAAAAAAAATCAGGAGATACAAAGCTCAAAGGATGATTTAAATAGTAATAATAGTATACGTGCTGATGTGCGAAAATACCTTGAAAAGGGTATAGAGCAAACTGAGAATGAGAAAAAAAAATGGGAAGAATTCTTAGAAAAAAAGAACAAAAATGAAGAAGAATTAAATATAAAAATAGGAAAAATCACTGAAGATATTGAGTCATTGGAAGTGATGAGGAAATATGGAAATGAGTTTTTAGATGGATTTGTTACATTAAAGAATGTAGGCGGTGTGAATATACCTGAGACGGAGAAGGAACGAGAAGAGTTTAACAAGAAAGTTGAGGGTAAAACAGATGAAGAATTACCTGATAGCGATAAAGCATTAAAGAATTTTTTACACGCAACCGATCAATTAAGAAATTTTCTTAAAGAGATAAAAGCCTTTTCAAAAACGTACCAGTTAGACGAAGTGGATGGGGTCGCATTTTGGTCTAAAATTCACCAAAGAGTAGCTATCAAGTTGGCAGAAAAACAAGGACTAACTGTATTAGAGGGCACCATTGTTGGATTGTTTGATGGTTTAAATTTTGGGTACCCATGGATACCAGCCCCCCCAAAAGGACAGGCACC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51 | Escherichia_phage(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
3502188 : 3557959
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020412|3502188:3557959|DBSCAN-SWA 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50 | Alteromonas_phage(11.11%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3741652 : 3750902
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020412|3741652:3750902|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020412|3741652:3750902|3743905_3745045_+|ARB93665.1|DBSCAN-SWA MEKRDYYELLEVSRTASDAEIKKAYRKLAMKYHPDRNPGDSEAEEKFKEIQSAYSVLSDPQKRAAYDQFGHAGVDPSMRGGPGGFGGFGGFGDVFEDIFENIFSGGRASGRQSRGQRGADLQFNVQLTLEEAALGKEVQITVPRHGTCTVCNGSGAKAGTQPKTCETCNGVGQVRIQQGFFSIQQTCPHCHGEGKTISDPCSSCHGQGRIRESKKLTVKIPPGVDNGDRVRLSGEGEAGMHGGGPGDLYVQVSIKKHTIFERHENDLHCEVPISFITAALGGSIEVPTLEGRVTLKIPQETQTSKVFRLRGKGMKSVRGHGQGDLLCKVVVETPVNLSREQKELLTKFHESLENAKGNHSPRSNSWFAGVKKFFEDMKF >CP020412|3741652:3750902|3747560_3748886_+|ARB93668.1|DBSCAN-SWA MELVDKVGVRGNMIHDYKVADMALASWGRKEIAIAETEMPGLMALREEYGATKPLKGARIAGCLHMTIQTAVLIETLVALGAEVRWSSCNIFSTQDHAAAAIAAKGIPVFAWKGETEEEYWWCVEQTLAGPNNWAPNLLLDDGGDLTQIIHQKYPQLLPNIKGVSEETTTGVARLYEMAKHGELSIPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLLDGLKRATDVMVAGKVALILGYGDVGKGCAQALRGQGAVVLVAEIDPICALQAAMEGYRVVTLDDVAEQVDIVVTATGNYHVVTHEHMKRMRNQAILCNIGHFDSEIDVQSLKKYQWENIKPQVDHVIFPDGKRIILLAEGRLVNLGCATGHPSFVMSASFSNQVLAQIELFKNADQYEKQVYVLPKLLDEKVARLHLGRIGVKLTQLTDEQSKYLGVDIKGPYKPDHYRY >CP020412|3741652:3750902|3741652_3743602_+|ARB93664.1|DBSCAN-SWA MAKIIGIDLGTTNSCVAVMEGDKPKVIENSEGHRTTPSIVAFTDDGEVLVGQSAKRQAVTNPDNTLFAIKRLIGRRFDDAVVQKDIKMVPYKIVKADNGDAWVCVKNQDKAPPQISAEVLSKMKKTAEDYLGEEVKEAVITVPAYFNDSQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGMDKKRGDSVIAVYDLGGGTFDVSIIEIAEVDGEHQFEVLATNGDTFLGGEDFDLALIDYLASEFKKDSGIDLHSDPLALQRLKDAAEKAKIELSSSQQTDVNLPYITADASGPKHLNIKLTRAKLESLVEKLVERTIEPCKTALKDAGLTVSQINEVILVGGQTRMPLVQKTVEEFFGKEPRKDVNPDEAVAVGAAIQAAVLSGEVKDILLLDVTPLSLGIETMGGIMTKLIEKNTTIPTKTAQVFSTADDNQTAVTVHVLQGEREQASANKSLGRFDLSDIPAAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAKDKATGKAQSIVIKASSGLSDEEVDAMIKDAKSHAEEDKKFKEMADLRNQADSLIHSCEKSMKDLATELTDDEKKGIETAIAELKEAIQGTDKAKIEDKLKVLSDASAKMAERVYAKKASEGQAGQGQAHQEQAQTQAHESAKTDESVVDAEFEEVKDDKK >CP020412|3741652:3750902|3746401_3747550_+|ARB93667.1|DBSCAN-SWA MNESHVFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDAILMQDPNARVACEVFVKTGMVLVGGEITTKAWVDVEAVTRQVVKDIGYNSSQMGFDWESCAVLSAIGKQSPDIAQGVDNKETKILGAGDQGLMFGYASRETDVYMPAPIAYAHRLMEKQSYLRKSGALPWLRPDAKCQLTLKYEHGIPVEVDTVVFSTQHAAEISHNDLIEAVREEIINTTLPVEWLTRRTRYFINPTGRFVIGGPLGDCGLTGRKIIVDTYGGMARHGGGCFSGKDPSKVDRSAAYAARHVAKNIVAAGLADKCELQISYAIGVAEPTSIFVETFGTGRLKDNEIIELVNTHFDLTPQGIIEYHDLLRPIYRQTATYGHYGRETFPWERLDKVAELRKAL >CP020412|3741652:3750902|3749219_3750902_+|ARB93669.1|protease|DBSCAN-SWA MLKLGILSLGLLSIAHNALATSAHDSVRVIIKYKEQITSVSSLKSQIKQSTQLPVKQLNPMANGAYLLILDATNSAFSKEMDNEDTTSLVLERLRKNPQVLYAVKDRVSYFKPVPDPEILDAGNILSHEIQWDEFSRPAGIMLESKPGSRDGAWFYTTGLSKEPVVVAVLDTGIALNENLINNLVKDDAGNIWGWNFAGNNNNLMDETRSYHGTHVAGTIAGYGHVMSGMGEDLKILPLKIPGSNGMFYESSVINAIYWAVGGDVPGVPKNIHPAKILNMSFGVDKGPNEEIDYCDQALQEAVFFARDNGAVLAVAAGNDNVWEHFNAPAICNGTIKVASTGPEGLRSYFSNYGPSVTLAAPGGDKRYGLWGGILSTVNPGGGYGGSGFDFYQGTSMATPHVAGVAGLILAASNKELGSEQIEQLLYMTTHDFGVSSDSNKSCVGKKPCGHGILDAENAVKAAAAGYDLLFSSPKIESLTMQNCGKNSLTPGKSRVVLKGVTWILDNTACESMDSFQKPHIEQTKNGSIIAHYGSVSYRLDQRAYKECHVIGYDGVGCYL >CP020412|3741652:3750902|3745180_3746293_+|ARB93666.1|DBSCAN-SWA MMNQPAILALADGTIYKGISIGASGDCVGELVFNTSLTGYQEMLTDPSYARQIITLTTAHIGNTGCNHEDMESNKVWASGLVIRNASILHSNYRAEQSLQDWLKKNGVVGIADIDTRDLTLRLREKGALGACISTDVDNPELVLTKAKSFSGLQGVDLALEVSRKTIERWHVGLGEWGKNSQPQQFHVVAYDFGVKHNILRILYDKGCHLTLVPARTSAAEVMAMDPDGIFLSNGPGDPQACDYAIRATQEFLEHNIPLFGICLGFQILALACGGVTKKMKFGHHGANHPVIETEGKKRVFITSQNHGFAVDEESLPDCLAITHRSLFDNTLQGIRHKEKPALGFQGHPEASPGPHDIEIIFNEFIQLMS |
6 | Micromonas_pusilla_virus(16.67%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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