Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP020411 | Haemophilus influenzae strain FDAARGOS_199 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas3,DEDDh,DinG | 0 | 0 | 5 | 0 |
1. CP020411
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
477147 : 530339
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020411|477147:530339|DBSCAN-SWA CTTACAAAATATACGCTTCTTGAATATGATGTGGCTTTTGGTCTTCTTCTGGTGGAAGCTTCATATAATCTCCATAATATTGTGTTAAGTGTTCGTGATATCCATTCATTACTTGAAATTGTCGTCCTTCAAATTCTTTATAAATAACATGGTTAAAATATTCCTTCGGCATATAAGATTTTTGCCAACCACCGTAGTCAGATAATACAAGACCAATATAATCGCATTGTTTTATCGGATATTTTATTTGGAATTGTGCTAAATTTTTTTGCATTTTGGAAAATAGAAAGTGGCTTAATTTATTAAGTATAGCTTTTTGCACGGTGTTTTCTTTTGCCCTTAACCATCTTTTTTTGCAAGAGGAAAAGCGAAGTTTAATTCTTCGATGCTTTTTCATCAGTGGATAGATGATCTTTGGTTCATTCGGTACGCCATCATAGATAAATATATCCATAAACATTGGGCTTTTTCTTCCCTTAGCATCTGTTATTTGAGTGCGGCAATCGAAAATTTTTGCCATTTCACCAGTATATTGAGCAAGGATATCTTCCGCCGTTTCCATATTGTAGTGTTCGTGAGTTTCTTGAAACCAAACATCAACGAACCTTTGATATTCATCACGGTGCATATAAACATCAATATCATCATCCCAAGGGATAAAGCCTTTGTGGCGTATAGCACCGATTAATGTTCCACCACCGAGAGAATAGCTAATTTTATATCGTTCACACAGTGCGTGGAAATAATCTAAGATGTTTAGACAAACGAGTTGTTGTTCTCTGAGAGTCAATTTTTTCATTATTTTTCCTTGTTTGGTGTCAATTTTTGTAAAATGTGGTGATAGTCATCAAGGTTATCCATTTCAAATATATCATCACTGTTAAGTTGTTCCGTATAGATATTCAATTTCTCTATATATTCCATCGGAATGGTATCCCAATAAAGTTTTGGATTTTTTAACCGCACTTCACTTGTGTATTCTTTGAGCAAAGTTAGAATGATATTGCAATCCTGTGTAGTCCAGAATGATATTCCTGACAAACTGGGTTGATTCAGTGAACCAATATCAATACGTATTACTTGTCCATTACTATTTAAAATCGGTAGCCATTCATTGTGCGTTTTAGAACGAATAACTGTGAAATATTTGCTGTGTGATGGTTTCGTTAGAAAAATATTACGATTAAGCACTACATCCGCATCAATAACATAACAATCATTAAAGAAGTCTTGCGCCAGAGAAAAGGAATAAATGCTGTTATATTCGCGATATTTTTCGTTGTAAATCAAGGTGCAGTCATATTTTTTCTTTAGATACTCGAATTGTTCGTGTAAATACCCTGTAACAATGACAATATTGTCGATATTTGCTTGACGTAGAAAAGTGAGTGTCCGTTCTAAGTTAGGTGTGCCGTGAATATCTAACAATGATTTATGTGTGCTTTGTGTGATGTCTTTAAATCGGCTGCCTAATCCTGCTGCTAAAATGATTGCATTCATTTTTGTTCCCCTTTGTAATAAAGTGTAACGATCACTCCTGCACTTAATAATAAGGTGAGCAGTAAGGTAATGGGCTTAATTGGCTGTTTATAGAGCAGATAACCAAGTCCAATTGCCCATACAGAATATGTGATATTTAATGCCATTGCTTTGATTGGTTTTAACAGATAAATCGCTTGGTAATAGCAGCAGTAAGATAATGCACCAAAGATTATTACACCAGCAATTTGTACATAATTAAAACTAAGTATATCTAGTGAGAAATTTTTCAAGGAAAGAATAAATAGAATCAATAAATAACCAATAGTTGAACCACATAGTCTTAAAAAATACACCTGAAGTCCAGAGAGAGAACGCATTGTATAGGAGGATATCACTATTTCAGATGACCACCCTAATATACAAATTATTAAAAAAATAAAACCGATAGTATTAAAGGTTATTTCTTGTCCTACTTCAATAGCAAGCAACGAAGAAGAAATAATAGCCAAGGCGAATCCGAATTGGGCTGTTTTGGTAATTTTTTCTTTTAGAATCCAATAAGACATTAACGCAGCGAAAACAGGAAAGAGAGATGAAAGCGGTGCAGCATAATAGATTGTTAAATAATGAATGCTTAATAAATAGGCAGACATTCCTATTGGTCCGCCTAATATGCCAGATAACGCAGGTTGCCAAAAAACACCTTGAAAATCTACCGCACTTTTTCGCCATAATGTGATGCCGATAACTAATAACGAGCAAAAATCAATTAAAAAAAGCAATGAAATCACTTTCCCTAACGCAGTATATTCACTTAATGGCAATTCATTATACAACAGTCCAGATAATGCCCAAAATACAGCGGACAGTATGCCAAAGAGATAGCCACGCATTATGGCAATTCCTCTAACAGTTTAAATGCTGCGTCTAAGCGTTTTAACGCATAATCGCCAAAATTCTCGCCGTGTTCTTCTTTTACTTTTGTCCATAAAAACCACAATACATTTTGGCAAAAACGATGGATTTTTAACCGTTTGTGAGCGATTTGAAATTCTGTCTTGTGATATTTATTTGTCTGATTGCAATAGGTTTCTAATAGAAAATCAGCAGCTTCTTTCGATAAATGAGCTTCCTCAATGATAGTAGCTATATCAAATAGCGGATCATTTAAGCCCGAATATTCCCAATCGATAAAAAATAGCCGATCATCTTGTAATAACATATTTTCAGGGACTAAATCATTGTGGCACGGACGTAAAATTACCTCTTTATTGATTTCTTCAAATTGCCAAAATACAGCTGAAAGTTTATCCATTCTCGAATCAGCTTGATAAAAAGCGGATTTGTTTTCTAGCAATGAAAAATATTGGCGAAACTCATCGAATACGCTAAATACATTACGAAAAACAAATTCACTATTGTGTAAACGATATAAATTATTCACAACTTGAGACAAACAACTTTGTTCGTTTAATTGTATCTGGCTTAACGTATTACTATTTTCTAAATAACGAGTCAGTTTTACGCCACTTTTGGCATCTAATACGGGAGTTTCTACATTCAAGCCAGCACGATATGCCTGTGCATTATTGAATGCCTCATATTCTCGATTTATAAGTGATAAATTTACGGCATTAGGGATCCGTAATACAAACTTAACTCCAGAAATATTAAGTAGAACATTTTGATTGGTCATTCCTCCAATGGAGGAAAAAGGAATGGAATGCTGATGAAGAAAATGAAATACTTCCTCAGGCTTGTAGCAAGTTTTAACAAATCCTACAATTTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGCATAGCATTTTTGTATTCATTTTTATATTTAAATTTTGTTTGATTTTAACACGTTAAAGTTATTTTTGTAAGGCTCTGAATCTTATGAGTTTATTCAACTTTTGAACCTTTCAACCACTTTTTTACCCAAGCTCGGTTAGCTGAAAGATTATGTAATATGCCTTCGCTTATTGGTAATGGCTCGCCATAAATGATTGAAGCTAAGGTTTCGCCTAAGAGTGGAGCAGAGGTAAGCCCACGAGAACCTAAGGCTGCGATTAAGAAAAGATTCTGAAAATTGGCTGCACTTTGAATAGGTTGTTTACGGCGGCGGAGGTTAAATAGATTGTAATAATCCGCTTGTTGCTGTTCAAAATGAGGCACGTTTCCCACCATTGGGGCAAGATCTCTTACAGAGCAACGAATGCCTACACGAGCGAGATTATCTGATGTATCCACATCTTGCGTCCAAGGTTGGGCGATATTTTGCTGGAGTTTTTGTTGATTTTCTTGTTGTTCTTGTTCGCTAAAATCGCGATCAACATTATCACGAACATGGCTTGCGCCGATGCAATGTGAGGTTTTTAATTGATTGGCTGGAGTAAGATAGCCATCATAACAAAGCACAGATTTCAGTTTGAGTAAGTTTTCTGATGTTGGAATTTGGCTGACTTGCCCGCGGATAGGGTAGAGCGGTAGCTTTTCTGTTTGAACAAAATCAGTAATTTTATGTCCGTTCGCAAGAATGACGACTTCATGGCAGTATTTTTGACCTTGCATATTTTTTAGTTCCCAACCTTTTTCTAGCTGAGAAAGTGCGGTAATTTTTTGTGCGGTTTTAATGACGACACCCTGCTTTTCAAGAAATGAAAAGGCATTTTGAACAAATTGTCTTGGTGCAAGCCAAGCCCCTTGTTCAATCCAACCGCCTTCGCAATTAAGCGGTAATCCCACTTTTTCACTGAGTTGTTCAGCACTCAGCATTTGGAAGATTTCGTTCGGTAAACCAAGCTGAGAAATCTTTGTTAATTTAACCGCACTTTTTTCGTTGTAAGCACATAGTGCCACGCCACAAAATTCGTGTTCAAACACTATGTTTTGTTCGATTGCCCAATCAAGTAATTGGCGACCGTAACTGAAAGCGTGCAGGTAAAAATCAACGGTAAGCGCATTATCATCGCTAAGTTGCGGATAAAATGCGCCTTGTTTATTGCCCGAAGCATTAAGTGCGAGCGCGTCATCTTCACAATAAATGGTGACTTTTGCCCCACGTTTTATTAAGGAAATAGCAGCACAAAGAGAGGCAATACCACCGCCGATAATAGCGACATCTTGTTTTTCCATTTTCGCAGGCTGAGCAAGATACCAAGGTGTTGAAAGTGCGGTAGATTTTGATTGTATTTTTAGCCCACTTAAACATTCTCGCTTTTTGCCGAAGCCTTTACGTTTTGTCACGTTAAAGCCTGCGGATTCAAGTCCTTTTCTGACTGCACTTGCTGCGGTGAAAGTGGCAAAAGTTCCATTGGGTTTCGTGAAACGAAACATTAAGTTATAGAGATCATCATTCCACATTTCAGGATTTTTACTCGGCGCAAAGCCATCTAAAAACCAAGCATTAATACGTTCATTCATATAATCGCCAAGTTGTGGCAAGTTTTCTGATACATCACCAAACCATAAAT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62 | Shigella_phage(25.58%) | tRNA,head,holin,plate,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
576040 : 632575
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020411|576040:632575|DBSCAN-SWA 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>CP020411|576040:632575|626481_626811_+|ARB89589.1|DBSCAN-SWA MLNINGIEVETDKDGYLLHSQQWNEDAARAIAQLESIELTDAHWEVIYFVRDFYQEYNTSPAIRMLVKAMAEKLGADKGNSRYLQHLFPEGPAKQATKLAGLPKPAKCL >CP020411|576040:632575|583068_584412_+|ARB89552.1|terminase|DBSCAN-SWA MSQLNIQFPTKFKPLFESIWRFIIFYGGRGSGKSFSIARALVLRAYQSPVRVLCCREIQKSISDSVIQMLADQIEMLSLQAFFDVQKTQIIGQNGSRFTFAGLKTNITSIKSMTGIDVVWVEEGENVSKESWDILIPTIREDGSQIIVSFNPKNILDDTYQRFVIHPPERCKSVLVNWQDNPYFPKELMEDMEQMRERDYELYRHVYEGEPVADSDLAIIKPVWIEYAVDAHLKLGFTAKGMKKVGFDVADEGADSNANAFVHGSVVLDIEVWKNGDVIDSANRTNQSAVKFKADLIIFDSIGVGAGVKAHFKRLPKSLQVEGFNAGGAVAYPEREYIKGKKNQDMFSNIKAQSWWALRDRFYKTYRAVKYGDVYPDDELISLSSKIKELEYLKAELSRPRVDYDNNGRVKVESKKDMKKRGIPSPNMADALVMCYAPTKPKSLLDL >CP020411|576040:632575|607511_608009_-|ARB89575.1|DBSCAN-SWA MLSENVVKLLNDQMNLEFYSSNLYLQMSAWCDQQGFEGTAKFLSVHAAEEMQHMRKLFTYLNETGSLAVISAIEAPAHEYKSLKEVIETTYEHEKLITSKINELVGKTFEEKDYSAFNFLQWYVEEQHEEEKLFSSILDKLNFLGEDGKGLFLIDKDLGNLSTKA >CP020411|576040:632575|595922_596090_+|ARB89565.1|DBSCAN-SWA 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MNILDGIKSLALKLGSKQDQTYYARGLSLTDDLMQIEALWRDNWIANKVCIKRSEDMVRNWRDIFSNDLKSEQLDEFTKLERRLKLRETLTKALQWSSLYGAVGLLVVTDTINITSPLQPTERLKRLIILPKWKISPTGQRDDDVFSPNFGRYSEYTITGGTQSVSVHHSRLLIINANDAPLSDNDIWGVSDLEKIIDVLKRFDSASANVGDLIFESKIDIFKIAGLSDKISAGLENDVAHVISAVQSIKSATNSLLLDAENEYDRKELSFGGLKDLLTEFRNAVAGAADMPVTILFGQSVSGLASGDEDIQNYHESIHRLQETRLRPVLEVLDTLLCNELFGGQPDDWWFEFLPLTVVKQEQQVNMLNTFATAANTLIQNGVVNEYQVANELRESGLFANISADDIEEMKNANELARNFEEPEGESTQVQASEDE >CP020411|576040:632575|601146_601419_-|ARB89569.1|DBSCAN-SWA MFRRSDQIVKIDENSLQLATVDVCGVQREVNISLVCTGNPADLLGKWVLVHVGFTMSVIDEDEAKKIQEALITMSQLEHEVGDFLGLNQK >CP020411|576040:632575|623276_624008_-|ARB89586.1|DBSCAN-SWA MTDIQDVISPKLAVAIANPIFPAVDSLLRSGRHISTEHLDNHAFLMDFQNELDGFYRRYNVELIRAPEGFFYLRPKATTLIARSVLSELEMLVGKVLCYLYLSPERLAQQGIFSTQEVYDELLNLADEGKLLKAVNQRSSGSDLDKQKLAEKVRAAIGRLRRLGMIQTVGEQNSGKFTISESVFRFGAEVRSGDDPLESQARLIRDGEAATPDSLALEKQAQLMENDTKSADEIDEEFDGEQE |
55 | Haemophilus_phage(24.0%) | tRNA,head,terminase,holin,integrase,protease | attL 568434:568450|attR 599624:599640 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
830856 : 839370
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020411|830856:839370|DBSCAN-SWA TATGAATATTTTCAATCCAAACCACGATCGTAAAGCGATTGTCATCTTTTCAGGTGGACAAGACTCCACGACTTGTTTATTCCAAGCTATTGCTGAATACGGCAAAGAAAACATAGAAGCCATTACCTTTCAATATGGGCAGCGTCATGCTATTGAGTTAGAAAAGGCGCGCACTATTGCGCAAGATCTCGGCATTAAACAAACCTTGATTGATACATCTGTTATGAAAGCTATCACGCATAATGCATTAATGGATGAACAAGCGCATATTGAGCAAAAAGAGAATGAATTGCCAAACACTTTTGTTGATGGTCGCAATGCCCTATTTTTACTTTATGCAGCGATTTATGCGAAAGGCCAAGGCATTCAAGATATTATCACTGGCGTATGTGAAACAGATTTCAGCGGTTATCCAGATTGCCGAGATGTGTTTATCAAGTCAATGAATGTCACATTAAATTTAGCTATGGATTATCAATTCAATATCAAAACACCATTAATGTATCTCACTAAAGCCCAAACTTGGCAACTTGCTGATGAATTAGGCGTATTAGATTATGTACAAAAACATACTCACACTTGCTATGAAGGCATCGAAGGTGGATGCAGAAAATGCCCAAGCTGTATTTTACGCAATAAAGGTTTAAAGAAATATTTGACTCAAAAAGGTAGAAAAAATGTTTAAAATTTCCAAAGAATTTAGCTTTGACATGGCACATTTATTAGATGGACATGATGGGAAATGTCAAAATTTACATGGACACACATATAAATTACAAGTTGAAATTTCGGGTGACTTATATAAATCAGGTGCAAAAAAAGCAATGGTCATTGATTTTTCAGATCTAAAGTCTATTGTGAAAAAAGTTATTTTAGATCCGATGGATCACGCCTTTATTTATGATCAAACCAATGAGCGAGAAAGCCAAATTGCCACTCTATTGCAAAAGTTAAACTCAAAAACTTTTGGTGTTCCCTTTAGAACTACGGCAGAAGAAATAGCTCGTTTTATTTTTAATCGTTTAAAACATGATGAACAACTGTCCATATCATCCATTCGTTTATGGGAAACCCCAACTTCATTTTGCGAGTATCAGGAGTAAATGTTGATGGAAAAATATCATGATTTTGAACCGAACTTTAACATAGTCGAAATTTTTGAAAGTCTGCAAGGGGAGGGCTTCAATACGGGAATGCCAAGTGTTTTTGTACGATTTGGTAAATGCAATCTAGACTGTCCTTGGTGTGATACACCTTATAATAATTTTAAACGCTGGTCTGTATCACAAATTCTAGAAAAAGTGCGGTCATTTTCGTCAAAGAATATTATCATCACAGGTGGTGAGCCAACAATTGTACCAAAAATTGAATACTTACTTGAGCAATTTAAATCAGATGGCTATTTTCTTGCAATTGAAACCAATGGTCTAAAAGCAATTCCTGCACAAATAGATTATATTGCGACGAGTCCTAAGAGCCTTTATGCTCATAAGTATGAAAAGCGTTGCATTCCATTTGCAAATGAAGTACGTATTGTAATGGACAGTAATATGCCATCATTTTGTGAATTGATCGAGCAAAAAATAAAAGCAAAGAATTACTATCTTTCACCTTGTGAAATTGATGGGAAAATGAATTTACTTGAGACTATCACTTTACTTGGTCAATTGAATCAACGTTCAAATAAACCTAAATGGCAGCTAAGTTTACAAACACATAAATTGATTGGTATTGAGTAATAGAAGGAAATATTATTTTTTGATCAGTATATAATTTAGTATATGACGTTTTCTACTTTAGAGAATGATCATAATGAAACTTGGATAGCACACTTCTCCCATTCCTTTGTGCTAACCATTTTTTGGAATTTTGTACCATATCTCACCCTTTCTTATTTGTATTAATTATGAATAACATTGAATTTGAGTAACTTTTTAACCTAAAACTTAATTCGGACAAAATCACCGACTATGCGTAAAATGGCGTGCAAGTAGAAAGAAAAGCAAATGTTTATAAAATCATTACAGGAATCCTAGCAAATCAAGTATTGATTAAGTCATTAAACAACATTCCTATGCTATTATTGTTCATCATGGGTATTTTTGGAAAAATGAGAAACCTTGCATTTTAGGAATGAGAGGTAAACGAATTAAAAGTTTGTTTATAAATAGTATAAAAATAGCTTTCAAAGCATATGGTTTTGATGTTGAGTTTAAGGATATAGGAGAATCCCGCTTAATATTATTCTTAAAATGTTCTACCCTACTTTTGATATACTCACAAATCTTATTGTTTCACAAGATAGATGGGACTATAATAACTGTAAATTTAAACAGATTAAAGATAGTTTATGATGGATATTTCTGAATTACTTGACGGACTCAACGATAAACAACGCGAAGCCGTAGCTGCTCCTCTTGGTAATCACTTAGTGCTAGCTGGTGCAGGCTCGGGCAAAACGCGTGTATTGACGCACCGTATTGCTTGGTTAATTGCGGTCGAAAATATTTCTGAAGGCAGCATTATGGCGGTGACGTTTACCAATAAAGCCGCAGCAGAAATGCGTCATCGTATTCAATCTACCCTTGCCAAACACGCACAACATCAATTATTTGGTATGTGGATTGGCACCTTCCATAGCATTGCTCATCGTTTGTTGCGAGCTCATCATTTAGATGTGGGATTGCCACAAGATTTCCAAATTTTAGATTCAGAAGATCAACTTCGTTTAATTAAACGATTATTAAAATTACATAATTTTGATGAAAAAGCTTTTCCGCCTAAACAGGCTTGTTGGTACATCAATAACAAAAAAGATGAAGGCTTGCGACCAAATGATATTGAAGATTTTAATGATCGCCAAGAACGTGAATGGATTAAAATTTATCAGATCTATCAAGACACTTGCGATCGCGCAGGGTTGGTCGATTTTGCTGAATTATTAATTCGGGTCTATGAATTATTTGAGAAAAAACCATTAATTTTGCAACGTTATCAACAACGTTTTCAGCATATTTTGGTGGATGAATTTCAAGACACCAATAAAATCCAATATAAATGGATCAAAATTCTTGCTGGAAAAACAGGCCAAGTCATGATTGTGGGCGATGATGATCAATCTATATACGGTTGGCGTGGTGCACAAATAGAAAATATCCAAAAATTCTTGAAAGATTTCAAAGCCGAAACAATTCGCCTTGAACAAAACTATCGTTCTACCGCCAATATCCTAAACAGCGCAAATGAATTAATTGCAAACAATAGTGATCGTCTTGGTAAAAATTTATGGACAGAGGGTGAGAAAGGCGATCCTGTGGGCATCTATTCTGCCTTTAATGAATTAGATGAAGCAAAATTTGTCGCTTCACAAATTCAGGATTGGGTAGAACATGGCGGAAAACTTGATGATTGCGCTGTACTTTATCGTAGTAATAGCCAATCACGGGTTATTGAAGAAGCTTTAATTCGTTGTCAAATTCCATACCGTATTTATGGCGGTATGCGTTTCTTCGAACGTCAAGAAATTAAAGATGCGTTAGCCTATCTTCGTTTGATTAATAATCGTCAAGATGATGCGGCTTTTGAGCGTGTAATTAATACGCCAACCCGTGGCATTGGCGACCGCACTTTAGATATATTGCGTAACTTAACACGCGAACGCCAAATTACCTTATGGCAAGCAGTACAAGTCGCAACACAAGAAAATATGTTGGCAGGGCGAGCCTCAACAGCCTTATTACGTTTCCAAGAATTAATTAATTCACTACAACTTGATACCGCAGAAATGCCGCTTTTCGCACAAACTGATTTTGTGATTAAACATTCGGGCTTATATGAAATGTATCAACAAGAAAAAGGCGAAAAAGGCGAAGTGCGTATTGAAAACTTGGAAGAATTAGTTACCGCAACCCGTGAATTTATCAAACCTGATAATGCGGAAGAAATGACCGAACTCACTGCCTTTTTAACGCACGCTTCCTTAGAAGCTGGCGAAGAACAAGCCTCGCCGCATCAATCTTGTGTAGAAATGATGACGTTGCACTCTGCGAAAGGCTTAGAATTTCCTCGTGTATTTATGGTGGGCGTAGAAGAAGGATTATTCCCAAGTTTTCGTTCTTTTGAAGAACCCGGACGTTTAGAAGAAGAGCGTCGTTTAGCTTATGTCGGTATTACTCGCGCGAAGAAAAAACTGACCATCTCTTATGCGGAAAGCCGTCGATTATATGCCAAAGAAGAACGCCATTTGCCATCACGGTTTATCGCAGAATTACCGAGAGAATGTATCCAAGAAATTCGTTTACGAGGGACAGTCACTCGTGCGATGAACCTAGCAAAAGTCGGTTCATTGTCGAATACCAGTGCGGTCGAAAATGAATGGAAAATGGGTCAAAAAGTTAAACACGAAAAATTTGGTTTCGGCACAGTGATTAATGTGGAAGGATCTGAAAATAACACACGTTTACAAATAGCATTCCAAGCGCAAGGCATTAAATGGTTGATTGCGCATTTGGCAAAATTGGAAAAAGTGCGGTAGAATTCAAGAGTATTATATTTTTTACCGATTAATTTCTTTGAAGAGTGCGGTGAATTTTTACCGCACTTTTATTATCTACGAGTGATGGAATGTTTAAATTTGTATTCAAACGAATCTTAATGGTGATCCCTACTTTTATTGCCATTACTCTTATTACCTTTGCCCTTGTGCATTTTATTCCCGGTGATCCTGTGGAAATTATGATGGGGGAACGTGGCTTAACGGCAGAAGTACATCAACAAATGATGCACCAATTGGGTTTAGATTTACCTCTTTATCAGCAATATTTCCACTATATTGGCAATGTAATTCAAGGGGATTTCGGTGCATCGTTCCGCACTCAACAACCTGTCCTTACTGAATTTTTTACGCTTTTCCCTGCTACCGCTGAATTAGCTTTTTTTGCGTTATTTTGGTCATTATTAGGTGGAATAATTTTAGGCACGATTGCCGCAGTAAAAAAAGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020411|830856:839370|831532_831958_+|ARB89746.1|DBSCAN-SWA MFKISKEFSFDMAHLLDGHDGKCQNLHGHTYKLQVEISGDLYKSGAKKAMVIDFSDLKSIVKKVILDPMDHAFIYDQTNERESQIATLLQKLNSKTFGVPFRTTAEEIARFIFNRLKHDEQLSISSIRLWETPTSFCEYQE >CP020411|830856:839370|837391_838384_+|ARB89751.1|DBSCAN-SWA MALLDVKELSVHFGDKKTPFKAVDRISYQVAQGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDHPGRVSAESLQFENTDLLTLESKAKRQLIGADVAMIFQDPMTSLNPAYTVGFQIMEALKTHEGGTKKARKDRTLELLKLVGIPDPESRIDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACRPKLLIADEPTTALDVTIQAQIMELLLELQKKECMSLILITHDLALVAEAAERIIVMYAGQIVEEGTAKDIFREPKHPYTQALLRSLPEFAEGKSRLESLQGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATEYCRQVEPQLHHIGSRKVKCHTPLNEQGNPVEYQGA >CP020411|830856:839370|832988_833222_+|ARB89748.1|DBSCAN-SWA MRGKRIKSLFINSIKIAFKAYGFDVEFKDIGESRLILFLKCSTLLLIYSQILLFHKIDGTIITVNLNRLKIVYDGYF >CP020411|830856:839370|836494_837382_+|ARB89750.1|DBSCAN-SWA MSDTPLTFAPKTPLQEFWFYFKQNRGALIGLIFILIVALISILAPYIAPFDPTEQNRTALLLPPAWYEGGNPAYLLGTDDIGRDILSRIIYGTRISVFAGFIIVLLSCAFGTSLGLISGYYGGVLDTIIIRLIDIMLAIPNLLLTIVVVSILEPSLANATLAIAVVSIPSYVRLTRAAMMNEKNRDYVTSSKVAGAGILRLMFIVILPNCLAPLIVQMTMGISNAILELATLGFLGIGAKPPTPELGTMLSEARGFMQAANWLVTIPGLVILSLVLAFNLMGDGLRDALDPKLKQ >CP020411|830856:839370|838386_839370_+|ARB89752.1|DBSCAN-SWA MTNEVKENTPLLNAIGLKKYYPVKKGLFAKPQQVKALDGVSFQLERGKTLAVVGESGCGKSTLGRLLTMIEEPTKGELYYKGHNFLENDSETKALRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGSILEEPLIINTKLSAKERREKVLSMMEKVGLRAEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLDPDVVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQDELGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCIEKGTTEQIFSNPQHPYTKALLSATPRLSPNLRRERIKLTGELPSPINPPKGCAFNPRCWKATEKCRENQPHLEQHTDGKLIACFHID >CP020411|830856:839370|835508_836480_+|ARB89749.1|DBSCAN-SWA MVIPTFIAITLITFALVHFIPGDPVEIMMGERGLTAEVHQQMMHQLGLDLPLYQQYFHYIGNVIQGDFGASFRTQQPVLTEFFTLFPATAELAFFALFWSLLGGIILGTIAAVKKDSWISHTVTAASLTGYSMPIFWWGLILILYVSPQLGLPQGGRLDNEFWIDTPTGFMLIDSWLSGVSGAFENAVKSLILPAIVLGTVPLAIITRMTRSAMLEVLGEDYIRTAKAKGLSYTRIVIVHALRNALIPVVTVVGLIVAQLLSGAVLTETIFSWPGIGKWIIDAIQARDYPVLQGSVLIIATIIIVVNLTVDLLYGVVNPRIRH >CP020411|830856:839370|831958_832594_+|ARB89747.1|DBSCAN-SWA MLMEKYHDFEPNFNIVEIFESLQGEGFNTGMPSVFVRFGKCNLDCPWCDTPYNNFKRWSVSQILEKVRSFSSKNIIITGGEPTIVPKIEYLLEQFKSDGYFLAIETNGLKAIPAQIDYIATSPKSLYAHKYEKRCIPFANEVRIVMDSNMPSFCELIEQKIKAKNYYLSPCEIDGKMNLLETITLLGQLNQRSNKPKWQLSLQTHKLIGIE >CP020411|830856:839370|833205_835389_+|AVH82727.1|DBSCAN-SWA MMDISELLDGLNDKQREAVAAPLGNHLVLAGAGSGKTRVLTHRIAWLIAVENISEGSIMAVTFTNKAAAEMRHRIQSTLAKHAQHQLFGMWIGTFHSIAHRLLRAHHLDVGLPQDFQILDSEDQLRLIKRLLKLHNFDEKAFPPKQACWYINNKKDEGLRPNDIEDFNDRQEREWIKIYQIYQDTCDRAGLVDFAELLIRVYELFEKKPLILQRYQQRFQHILVDEFQDTNKIQYKWIKILAGKTGQVMIVGDDDQSIYGWRGAQIENIQKFLKDFKAETIRLEQNYRSTANILNSANELIANNSDRLGKNLWTEGEKGDPVGIYSAFNELDEAKFVASQIQDWVEHGGKLDDCAVLYRSNSQSRVIEEALIRCQIPYRIYGGMRFFERQEIKDALAYLRLINNRQDDAAFERVINTPTRGIGDRTLDILRNLTRERQITLWQAVQVATQENMLAGRASTALLRFQELINSLQLDTAEMPLFAQTDFVIKHSGLYEMYQQEKGEKGEVRIENLEELVTATREFIKPDNAEEMTELTAFLTHASLEAGEEQASPHQSCVEMMTLHSAKGLEFPRVFMVGVEEGLFPSFRSFEEPGRLEEERRLAYVGITRAKKKLTISYAESRRLYAKEERHLPSRFIAELPRECIQEIRLRGTVTRAMNLAKVGSLSNTSAVENEWKMGQKVKHEKFGFGTVINVEGSENNTRLQIAFQAQGIKWLIAHLAKLEKVR >CP020411|830856:839370|830856_831540_+|ARB89745.1|DBSCAN-SWA MNIFNPNHDRKAIVIFSGGQDSTTCLFQAIAEYGKENIEAITFQYGQRHAIELEKARTIAQDLGIKQTLIDTSVMKAITHNALMDEQAHIEQKENELPNTFVDGRNALFLLYAAIYAKGQGIQDIITGVCETDFSGYPDCRDVFIKSMNVTLNLAMDYQFNIKTPLMYLTKAQTWQLADELGVLDYVQKHTHTCYEGIEGGCRKCPSCILRNKGLKKYLTQKGRKNV |
9 | uncultured_Caudovirales_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
971632 : 983720
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020411|971632:983720|DBSCAN-SWA TATGTTTAACAAAATTTTTTCGTGGTTTGAAAATCGTTTAAATCCCTATCCAGAAAGCAATCCAACAACACCTAAAAAAGGTTTGTTCCGTTTTATTTGGTCTAGTATTACAGGAATGAAAGGCTGGATTTTTTTGCTCGCAATTTTAACCGTAGGTACAGGTGTAATGGAAGCTGTATTATTCCAATTTATGGGAACGCTTGTAGATTGGTTAGGCACATTTACACCTGAAAGATTATGGCAAGAAAAAAGTCATTTATTAATTGGAATGGCTGCTCTATTACTTATTAGTATTGTGTGGGGATTTTTAGCTTCGGCCGTGCATTTACAAACCTTACAAGGCGTATTTCCAATGCGATTACGTTGGAATTTCCATCGTTTAATGCTTGGACAAAGTTTAAGTTTTTATCAAGACGAATTTGCAGGTAGAGTATCCGCAAAAGTAATGCAAACCGCCCTTGCAGTACGTGACACAGTACTTACACTTGCAAATATGTTCGTTTATGTATTGGTATATTTTATTACCTCTGGCGTAGTGCTAGTGGCATTAGATTCTTGGTTCTTATTACCATTTATTACTTGGATTATACTCTTCGGTTTGATCCTACGAACCCTAATTCCTAAACTATCAAAAACCGCACAACGACAAGCTGATGCTCGTTCTTTAATGACAGGACGCATTACAGATGCTTATTCTAATATTGCTACAGTAAAATTATTTTCTCACGGCTCACGCGAAGCTACTTATGCCAAGCGTTCTATGCAAGATTTTATGGTAACAGTACACGCCCAAATGCGCTTAGCAACATCACTAGATACACTCACTTACGCTACAAATATTCTACTTACGTTAAGTACTGCAATACTTGGTATTATTTTATGGAAAAATGGTCAAGTTGGCGTGGGTGCAATAGCAACGGCAACGGCAATGGCATTACGCGTAAATGGGCTTTCTCGCTGGATTATGTGGGAATCTGCCCGTTTGTTTGAGAATATCGGAACCGTAAACGACGGAATGAATACTTTAACCAAACCTCACACTATTGTGGATAAACCACAAGCGTCACCGTTACAAGTGAAACAAGGGGAAATTAAGTTTAACGATATTACCTTTGCTTACGATCCGACAAAACCATTACTCAATCATTTCAATCTCACTATCAAACCAGGGGAAAAGGTTGGGTTAATCGGTCGTTCTGGTGCAGGAAAATCTACGATTGTGAACTTATTGCTTCGCTTTTATGAAGCACAACAAGGCGAAATTACCATTGATGGACAAAATGTACTCAATGTGCAACAAGAAAGCTTACGTCGCCAAATCGGTTTAGTCACTCAAGACACTTCCTTGCTACATCGTTCTGTACGTGACAATATTATTTATGGTCGCCCGAATGCTACTGATGAAGAAATGGTTTTAGCTGCTGAACGAGCGGAAGCCGCTGATTTCATCCCATTTCTCAGTGATTCTCAAGGTAGAAAAGGCTATGATGCCCATGTGGGAGAACGAGGGGTAAAACTTTCTGGTGGTCAGCGTCAGAGAATTGCCATTGCTCGTGTAATGTTAAAAGACGCACCAATTCTATTGTTAGATGAAGCCACAAGTGCATTGGATTCAGAAGTGGAAGTGGCAATACAAGAAAGTCTAGATAAGATGATGGAAAATAAAACTGTGATTGCCATTGCCCATCGTTTATCCACCATCGCAGCGATGGATCGCCTGATTGTGCTTGATAAAGGACAAATTGTCGAACAAGGTACGCACGCCGAATTACTAGAGCTCAATGGTCTGTACGCTAAACTTTGGAATCATCAAAGTGGCGGATTTTTAAGCGAAAGTGCTGAATAATATTGCATTTATCATATTTAATTAATTGTACTGTAATCAAACTAATTAAAAAATTAGTCTAATTTAATAGCTAAAGAAAAGTGCGGTGAATTTTTACCGCACTTTTTTGCTAGATATTTAGCGTTTAATTCACGACTTCAGCAGTATATTTCAGCTTGTGAATTGCATCGAATAATTGTTGGTTTGTGACATTTGGATCTTCCACAACCGTCACTAAACCATCTTTAATAGATGCTTTTGTTGAAATAACGCCATTGATATTACGCAGTTCTTTATTGACTAAGTAAGCACAAAGCTGACAATTCATTTCCTTTACTTTTAGCACAATTTGTTTGGTTTCATTCGCATGAGCGAAAGAGATTGCAAACAGCGAAAGCAAAAGTGCGGTACATAATTTCTTCATTTTTATTCCTAATTAGCTAATTCTAAAATCCAAGGCAAAATTGTTGGATAGGTTAAGAAAAAAATCATCACAATAAATACAATCCAATATAAAACGATGAGTTTTTTACGGGAAATATATTTGCTACAAATGATTTTTTTGGAAAACATCAACAGCCAAAATCCATAGGCAAAGGCGCATAATGAAATAATAAGCATGGGAATACGCAAATAATCATATTCGCCTAAGCCAATCAACCAAGTGGACGACACACCAAATACTAAATAAATTAATGGTGCGATGCAGCACAAGGTTGATGCCACCGCAGCACTTAGTGCGGCGGCTATGGCAACCCAAAAGGATTTATTAGAGTTTTTTAGAGACGTAGTCATATTTAAATTCTTTTGGATCAAAGGAATTTAACGGATCGCCACCTACTTCTGCATATGGATAGCCGAAGTTATTGATTGGAGCCAGTTCTGGTTGTGGATATAAATCAAAGTCACGGGCATGATTAAATCCCACCCAGTTTGCTTCCCAGTTACCAAACAAATATTTTGCTACGGCTTGTGTATCTTTATCTTCAACAGATTTTTTCTCTGCTAAACGCATTTTGGCAACGTCTGCGGAATCAACTGGTACCCATCCAAACCCTGCAAGGTAGAATTCAGCGCGGCAGTGTTGGCCACCACTTACGTTTGCGATGCCTTGTTCATTTGCACTACCGAAGGCACCTTTTGAATATTTGCCCATTTTCTCTGCCGCACCTAAGCGAATACCAAAAATTTCACGAGCAGGGATGCCTGCAGCACGAGCAAGTGCCACAAATACAGAGTTAATATCGGTACATTTACCTTTTAACACGCCAGTGGTAAGAATTTTTTCTACATCGCCGTCACCACAACCTAATACAGAATTATCACGTTCCATATTTTTTACGATCCAGTGGTGAATAAGTTCTGCTTTTTTCAATGGATTAGTTTCTTTACCTAGGATTTTGTCAGCAAATTCTTTCACAATGCCATCAGTTTTAATATGTGGAGTAGCTTTTAAGTATTCTTGTACATCCACGGAATACTGAATATCTTTTGGCGGAGTATAATTCTCTAAAGCACCTTTCACCATCGGTTCACGGTCTTTTGTTTCAATGACCATCATGACTTTTAAATCACGCTTTTGTGCATCTTTATTCCAAGTGGCAAATAAGGTTTTCGCTCCGTATTTATTGTTTTCTGTTACATAGGCATTCATGTAATTACCTTCAAAGTGAATCGATTTCACTTGTTGGTATTCCCCATTAAATGGTAATGGAACCCATAAATTGGTTTGTCCTTGCGAGCCTTTTGGCACAACTAAATCATAGGTTTGCGTGAATTCGTAAAGATGGGCGTCTGTATTGTAGTTTGGAATATTAGTGTTTGCATGAGCTAACGAGCCACATGCAGAAAGCACCGCAACTGCGATAAGTTTCTTCATGAAAAGATCCTCTAGTTAATAATAGTTAAACTTAACATATTAGATAAACTAACACGCCACTATGCTAACGGATTTTTAAATCCATAGTCAATTTGTTATTCCAAAGTTTATTAAAACATCAATCTACTAAAATACCCTATAAATAATATACCTATTAATGATTAATTGATTTGGCTCAAGTAAAACTTCTATACAAAGATTATAATTAACTCGTTTTAGTTATTTTTCAATCTGACTGTGGGGGAACGATATAATGAGTAACTTTAATCAAATAAGTCGCCGAGATTTTGTCAAGGCGTCATCTGCGGGAGCTGCACTGGCAGTTTCAAATCTTACTTTACCTTTCAATGTAATGGCTAAAGAGACACAACGCCTCAATGAAAATAATCAAGAACGTATTGTTTGGAGTGCTTGTACAGTAAACTGTGGTAGCCGTTGTCCATTACGAATGCACGTAAAAGATAACCGAATCACTTATGTGGAAACCGATAATACGGGGACAGAAACATATAATCTTGATCATCAGGTTCGTGCTTGTCTACGTGGACGTTCTATGCGTCGTCGAGTATATAACCCAGACCGTTTAAAATATCCAATGAAACGTATAGGTAAACGCGGAGAAGGCAAATTCAAACGAATCAGTTGGGATGAGGCTTTAACTGAAATTGCAGACGCATTGAAACGCAATATAAAAAAATATGGCAATGAATCAATTTATTTAAACTATGGTACGGGAACACTCGGTGGCACAATGGCTAAATCTTGGCCACCTGCATCCACTATGATCGCTCGTTTTATGAATTGTATTGGTGGATATTTAAACCATTATGGTGATTACAGCACCGCACAAATTGCTGTCGGTTTAGATTATACCTATGGTGGTGGTTGGGCATTGGGAAATGGAATGGCTGACATTGAAAACACCAAATTAATAGTGTTATTCGGTAATAATCCTGCAGAAACTCGTATGAGTGGAGGTGGTTTAACTTATTGTATTGAACAAGCCAAAGCTCGTTCCAATGCCAAAATGATTATTATCGATCCTCGTTATAATGATACTGGTGCAGGGCGTGAAGATGAGTGGATCCCAATTCGTCCAGGTACTGATGCAGCCCTTGTTGCTGCCCTTGCTTATGTAATGATTCAAGAAAATCTCGTGGATCAACCTTTCTTAGATAAATATTGTGTTGGTTATGATGAAAAAACATTACCTACGGATGCCCCTAAAAATGGTCATTATAAAGCCTATATTTTAGGTTATGGTAATGATGGTATCGCTAAAACCCCAGAATGGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020411|971632:983720|973601_973880_-|ARB89875.1|DBSCAN-SWA MKKLCTALLLSLFAISFAHANETKQIVLKVKEMNCQLCAYLVNKELRNINGVISTKASIKDGLVTVVEDPNVTNQQLFDAIHKLKYTAEVVN >CP020411|971632:983720|974225_975335_-|ARB89876.1|DBSCAN-SWA MKKLIAVAVLSACGSLAHANTNIPNYNTDAHLYEFTQTYDLVVPKGSQGQTNLWVPLPFNGEYQQVKSIHFEGNYMNAYVTENNKYGAKTLFATWNKDAQKRDLKVMMVIETKDREPMVKGALENYTPPKDIQYSVDVQEYLKATPHIKTDGIVKEFADKILGKETNPLKKAELIHHWIVKNMERDNSVLGCGDGDVEKILTTGVLKGKCTDINSVFVALARAAGIPAREIFGIRLGAAEKMGKYSKGAFGSANEQGIANVSGGQHCRAEFYLAGFGWVPVDSADVAKMRLAEKKSVEDKDTQAVAKYLFGNWEANWVGFNHARDFDLYPQPELAPINNFGYPYAEVGGDPLNSFDPKEFKYDYVSKKL >CP020411|971632:983720|973888_974182_-|ARB90661.1|DBSCAN-SWA MASTLCCIAPLIYLVFGVSSTWLIGLGEYDYLRIPMLIISLCAFAYGFWLLMFSKKIICSKYISRKKLIVLYWIVFIVMIFFLTYPTILPWILELAN >CP020411|971632:983720|978019_978637_+|ARB89878.1|DBSCAN-SWA MEQYGFYFDSERCTGCKTCELACKDYKDLGTEVNFRRIYEYTGGQWNQQADGCWHQNIFAYYMSISCNHCADPACTKVCPTGAMHKNADGFVIVNEEICIGCRYCHMACPYDAPQYDAQKGHMTKCDGCYSRVKSGQKPICVDACPLRALDFAPIDELRTKYGTQASIAPLPPTDITQPNLVVKPNKYARLSGDTSGFLGNPREV >CP020411|971632:983720|982805_983720_-|ARB89883.1|DBSCAN-SWA MKCVDLFSGCGGLSLGFELAGFEICAAFENWEKAIEIYKNNFSHPIYNIDLRNEKEAVEKIKKYSPDLIMGGPPCQDFSSAGKRDISLGRADLTYSFANIVCNIRPKWFVMENVEQIKKSHILQDIINQFIDFGYGLTSAILDASYCGVPQSRTRFFLIGKLNSEHNFLIPTLSRKLSDKPMTVRDYLGNSLNLEFYYRHPRNYNRRGIFSIDEPSPTIRGVNRPIPKGYNINSCDPKGVELAKVRPLTTIERSYIQTFPKSFLFSGTKTDLEQMIGNAVPVNLAKFVASAIINFEKEPIRSMG >CP020411|971632:983720|981220_982660_+|ARB89882.1|DBSCAN-SWA MVIATVKGDVHDIGKNIVSVVMQCNNFEVIDLGVMVPADKIIQTAINQKTDIIALSGLITPSLDEMEYFLGEMTRLGLNLPVMIGGATTSKEHTAIKLYPKYKQHCVFYTSNASRAVTVCATLMNPEGRAALWEQFKKDYEKIQQSFANSKPLRKQLSIEEARDGFSGEWADYVPPTPKQTGIVEFKNVPIAELRKFIDWSPFFRIWGLMGCYPDAFDYPEGGEEARKVWNDAQVVLDELEQNHKLNPSGILGIFPAERVGDDVVLFSDEERTQTIGTAYGLRQQTERGKNSKSPFNFCLSDFIADRQSGKKNWFGMFAVCVGVEEMELVEGYKAAGDDYNAILLQAVGDRLAEAMAEYLHFELRTRIWGYTQEEFDNQGLINENYVGIRPAPGYPSWPEHTEKALIWDLLEVEQRIGMKLTESYAMWPAASVCGWYFTHPASNYFTLGRIDEDQAQDYAKRKGWDEREMMKWLGVAMK >CP020411|971632:983720|978638_979478_+|ARB89879.1|DBSCAN-SWA MNTGLYELPLVFFTVLAQSAVGAWLVFTFVLLNEKNTKSRTYIHKVMFVILALLGIGFIASIMHLGLPIRAFNSLNRVGSSMMSNEIAAGAIFFTLAGFYWLIAILGKMPVSLGNVWRIVTALIGILFMYVMNQVYHITSIPTWNNALTSWSFYLTVVLGGLTLSYALLIPNKQREYQLQHLPSLFAIGVSLVAIVAIYQGFNLHNIHSAIQNAADLVPNYAIMTVTRLCLLSIVAFLLFRVKNIGLLGISVLLTLVAEGIGRVLFYGLHMTYGMTIGG >CP020411|971632:983720|980200_980701_+|ARB89881.1|DBSCAN-SWA MKNEAYYQAYLSHHHISRRGLLRHVFPATKSTIEKTQSRPPFSAREDLFSAVCNGCGECASACPNGLIQLKQQQATLEIDYAPCDLCGKCAEVCPTNALHPNFPADTLLRPQFSSACLILQNQTCPDCQTACPLQAISSTLEIDNERCNGCGECKITCFVAAITLK >CP020411|971632:983720|971632_973477_+|ARB89874.1|DBSCAN-SWA MFNKIFSWFENRLNPYPESNPTTPKKGLFRFIWSSITGMKGWIFLLAILTVGTGVMEAVLFQFMGTLVDWLGTFTPERLWQEKSHLLIGMAALLLISIVWGFLASAVHLQTLQGVFPMRLRWNFHRLMLGQSLSFYQDEFAGRVSAKVMQTALAVRDTVLTLANMFVYVLVYFITSGVVLVALDSWFLLPFITWIILFGLILRTLIPKLSKTAQRQADARSLMTGRITDAYSNIATVKLFSHGSREATYAKRSMQDFMVTVHAQMRLATSLDTLTYATNILLTLSTAILGIILWKNGQVGVGAIATATAMALRVNGLSRWIMWESARLFENIGTVNDGMNTLTKPHTIVDKPQASPLQVKQGEIKFNDITFAYDPTKPLLNHFNLTIKPGEKVGLIGRSGAGKSTIVNLLLRFYEAQQGEITIDGQNVLNVQQESLRRQIGLVTQDTSLLHRSVRDNIIYGRPNATDEEMVLAAERAEAADFIPFLSDSQGRKGYDAHVGERGVKLSGGQRQRIAIARVMLKDAPILLLDEATSALDSEVEVAIQESLDKMMENKTVIAIAHRLSTIAAMDRLIVLDKGQIVEQGTHAELLELNGLYAKLWNHQSGGFLSESAE >CP020411|971632:983720|979589_980201_+|ARB89880.1|DBSCAN-SWA MQNTLQQISIYGRLLGAVFYYEPNDARLTDILTFFRQPNWMQEWEISFDVKTHKKITALIEKGLQQNITEQYQYLFIGPNELPTPPWGSVYLDPECVIFGNSLLALRDFLQQHQIAFQTQQDEPEDHIGLMLMLAAYLAENRPHLLTKFLREHFLTWAYHFLEQLSKIENSDFYQALALLTIKTLQQWQVDLHINVPTVRFYR >CP020411|971632:983720|975588_978009_+|ARB89877.1|DBSCAN-SWA MSNFNQISRRDFVKASSAGAALAVSNLTLPFNVMAKETQRLNENNQERIVWSACTVNCGSRCPLRMHVKDNRITYVETDNTGTETYNLDHQVRACLRGRSMRRRVYNPDRLKYPMKRIGKRGEGKFKRISWDEALTEIADALKRNIKKYGNESIYLNYGTGTLGGTMAKSWPPASTMIARFMNCIGGYLNHYGDYSTAQIAVGLDYTYGGGWALGNGMADIENTKLIVLFGNNPAETRMSGGGLTYCIEQAKARSNAKMIIIDPRYNDTGAGREDEWIPIRPGTDAALVAALAYVMIQENLVDQPFLDKYCVGYDEKTLPTDAPKNGHYKAYILGYGNDGIAKTPEWAAKITGIPAERIIKLAREIGSTKPAFISQGWGPQRRSNGELISRAIAMLPILTGNVGIHGGNTGARESAYSIPFVRMPTLKNPVKASIPMFLWTDAIIRGTEMTALTDGIRGVDKLSSPIKVIWNYASNCLINQHAQINRTHDILQDDTQCEMIITIDNHMTSTAKYSDILLPDCTTSEQMDFALDAFVSNMAYVIFADQVIKPSFECRPIYDMLSDLAEKMGVKEKFTEGRTQEEWLRHIYEQSREKLPELPTFEEFRQQGIFKKVDPNGFKVAYKDFRDNPEAHPLKTPSGKIEIYSSRLAEIAKTWKLAEDDVIHPLPIHAQSFEHYGDPLMEKYPLQLSGFHYKARTHSTYGNVDVLKAANPQEVWMNPIDAEPRNIKNGDMIRIFNDRGEVHINVKITPRIIPGVVALSEGAWYAPDKDRIDHSGCINVLTTQRPSPLAKGNPQHSNLVQVERL >CP020411|971632:983720|980978_981227_+|ARB90662.1|DBSCAN-SWA MGELLKHALVKGITTCQTLPSPLDVIEGPLMAGMDVVGDLFGDGKMFLPQVVKSARVMKQSVAYLEPFIMQPNKKVQATVKW |
12 | Escherichia_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1761129 : 1764882
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP020411|1761129:1764882|DBSCAN-SWA AATGAAAACTATCACATTAAACATAAAAGGCATACATTGCGGCTGTTGCGTAAAAAGTCTTACTCAAGTTTTAACTGAATTAGATGGTGTACAATCTGCTGATGTGCAATTAGAGGGTAAAGCAAATATTACTTTTGATGAAAATCGAGTCAATGTTGCACAGCTGATTGAGGTCATTGAAGATGCTGGATTTGACGCCACAGAGTAAAAAAATTTCAATTCAGATTGGTGGGATGGCCTGCCAATCGCATTCATCAATAAAACAACTAACAAGGAGTAAAAATGAAAACTATCACATTAAACATAAAAGGCATACATTGCGGCTGTTGCGTAAAAAATCTTACTCAAGTTTTAACTGAATTAGATGGTGTACAATCTGCTGATGTGCAATTAGAGGGTAAAGCAAATATTACTTTTGATGAAAATCGAGTCAATGTTGCACAGTTGATTGAGGTCATTGAAGATGCTGGATTTGACGCCACAGAGTAAAAAATTTCAATTCAGATTGGTGGGATGGCCTGCCAATCGCATTCATCAATAAAACAACTAACAAGGAGTAAAAATGAAAACTATCACATTAAACATAAAAGGCATACATTGCGGCTGTTGCGTAAAAAATCTTACTCAAGTTTTAACTGAATTAGATGGTGTACAATCTGCTGATGTGCAATTAGAGGGTAAAGCAAATATTACTTTTGATGAAAATCGAGTCAATGTTGCACAGTTGATTGAGGTCATTGAAGATGCTGGATTTGACGCCACAGAGTAAAAAAATTTCAATTCAGATTGGTGGGATGGCCTGCCAATCGCATTCATCAATAAAACAACTAACAAGGAGTAAAAATGAAAACTATCACATTAAACATAAAAGGCATACATTGCGGCTGTTGCGTAAAAAATCTTACTCAAGTTTTAACTGAATTAGATGGTGTACAATCTGCTGATGTGCAATTAGAGGGTAAAGCAAATATTACTTTTGATGAAAATCGAGTCAATGTTGCACAGTTGATTGAGGTCATTGAAGATGCTGGATTTGACGCCACAGAGTAAAAAAATTTCAATTCAGATTGGTGGGATGGCCTGCCAATCGCATTCATCAATAAAACAACTAACAAGGAGTAAAAATGAAAACTATCACATTAAACATAAAAGGCATACATTGCGGCTGTTGCGTAAAAAATCTTACTCAAGTTTTAACTGAATTAGATGGTGTACAATCTGCTGATGTGCAATTAGAGGGTAAAGCAAATATTACTTTTGATGAAAATCGAGTCAATGTTGCACAGCTGATTGAGGTCATTGAAGATGCTGGATTTGACGCCACAGAGTAAAAAATTTCAATTCAGATTGGTGGGATGGCCTGCCAATCGCATTCATCAATAAAACAACTAACAAGGAGTAAAAATGAAAACTATCACATTAAACATAAAAGGCATACATTGCGGCTGTTGCGTAAAAAATCTTACTCAAGTTTTAACTGAATTAGATGGTGTACAATCTGCTGATGTGCAATTAGAGGGTAAAGCAAATATTACTTTTGATGAAAATCGAGTCAATGTTGCACAGTTGATTGAGGTCATTGAAGATGCTGGATTTGACGCCACAGAGTAAAAAAATTTCAATTCAGATTGGTGGGATGACCTGCCAATCTTGTGCCAATCGCATTGAAAAAGTTTTAAATAAAAAACCATTTGTGCAACAAGCAGGCGTAAATTTTGCTGCCGAAGAAGCACAAGTTGTATTTGACGCTACGCAAGCAAGCGAAGCTCAAATTATAGAGATTATCCATAAAACAGGTTTCTCTGCCCATATCAAACAAGCCAACGAATTACCAATAGAAGAAAATACATCAATCCCTTGGCGATTAATCGTACTTTGGATAATCAATATTCCATTTCTGATTGGAATGCTTGGTATGATAGGTGGCTCCCATAACTTAATGTTACCGCCGATTTGGCAATTTGCATTAGCGAGCATTGTGCAACTTTGGTTAGCCATTCCATTTTATCGCGGAGCAATCGGTAGTATTCGTGGTGGACTTACCAATATGGATGTACTGGTCAGCACAGGAACGCTCACTATTTATCTTTATTCTGCTTTCATGTTGTTTTACCACGCCAATCATGCAATGGGACATGTGTACTTTGAAGCTTCTGTTATGGTAATTGGTTTTGTCAGTCTTGGAAAATTTCTTGAAGATCGCACTAAAAAGCACAGCCTAAATAGCTTAAGTATGCTCTTGCAACTGACACCGAAAAAAGTCACTGTTTTACGTAATGAAAAATGGATTGAAATTGCTCTTGACCAAGTCAATATCGGCGAAATCATTCGTGCGAATCAAGGCGAGCGTATTGCGGCAGATGGCGTAATTGAAAGTGGAAATGGTTGGTGTGATGAAAGCCATTTAACGGGGGAATCTCGCCCAGAAGAAAAACAGAAAGGTGGAAAAGTATTAGCGGGGGCGATGGTAACAGAAGGTTCTATTATCTATCGAGCAAATCAGCTTGGTAGCCAAACCTTACTTGGCGATATGATGAATGCATTATCAGATGCACAAGGTTCAAAAGCACCCATTGCTCGATTTGCTGACAAAGTTACTTCCGTGTTTGTGCCTGTCGTTTTAGTGATTTCACTTGTTACTTTCGCACTCACTTATATTCTGACGAATGATAGTGTGTCTTCACTAATTCACGCGGTATCCGTGCTTGTGATTGCTTGCCCTTGTGCCTTGGGATTAGCCACACCAGCAGCCATAATGGTTGGTTTAGGTAAAGCAGTCAATGCTGGCGTATGGTTTAAAGATGCGGCTGCAATGGAGGAAACCGCCCACGTGGATACCGTTGTACTTGATAAAACTGGCACATTAACAAAAGGAGAGCTTGAAATCTCTGCTTTATGGCAGCCACAAAGTGCGGTGTATTCTGAAGACGATTTGTATCGTTTTGCAGCAGCAGTTGAACGACAAGCTAACCACCCAATTGCAAAAGCTATTGTGCAAGCAGCAGAACAAAAAATGTTAGAAATTCCCACCGCACTTTTTTCAAAGATGGAAGTGGGTCAAGGCATTCAAGCCGAATTAGAACAAGTGGGAACAATAAAAGTCGGTAAACCTGATTATTGCGGTTTAATCTTGCCTAAAAATTTAGAGGATATTTGGCAAATTGCGAGCATTGTCGCAGTATCCATAAATGATGAACCCATCGGTGCATTTGCACTGACGGATACTTTAAAAAACGATAGCTTGCACGCCATTCAACGCTTACAACAGCAAAATATTGATGTCGTAATTATGAGTGGCGATCAACAATCTGTCGTGGATTACATAGCGAAACAACTCGGCATTAAGAAAGCCTTTGGGAAACTAACTCCAAGAGATAAAGCGGAACAAATCCAAAAGCTGAAAGATCTAGGTCATATTGTCGCAATGGTAGGCGATGGAATAAATGATGCGCCTGCTTTAGCTTCTGCAAACGTCAGTTTTGCGATGAAATCAAGTTCAGATATTGCAGAACAAACAGCCTCTGCAACGCTTATGCAACATTCGGTGAATCAACTTGTGGATGCGCTTTTTATTGCAAGAGCAACCTTGAAAAATATCAAACAAAATCTATTTTTTGCTTTGATTTACAATATTCTCGGCATACCCCTTGCCGCTTTCGGTTTTCTTAGCCCTATAATCGCTGGTGCTGCTATGGCGTTGAGCTCAATTTCCGTATTGATGAACGCCTTAAGATTGAAAAAAGTGCGGTTCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP020411|1761129:1764882|1762713_1764882_+|ARB90588.1|DBSCAN-SWA MLDLTPQSKKISIQIGGMTCQSCANRIEKVLNKKPFVQQAGVNFAAEEAQVVFDATQASEAQIIEIIHKTGFSAHIKQANELPIEENTSIPWRLIVLWIINIPFLIGMLGMIGGSHNLMLPPIWQFALASIVQLWLAIPFYRGAIGSIRGGLTNMDVLVSTGTLTIYLYSAFMLFYHANHAMGHVYFEASVMVIGFVSLGKFLEDRTKKHSLNSLSMLLQLTPKKVTVLRNEKWIEIALDQVNIGEIIRANQGERIAADGVIESGNGWCDESHLTGESRPEEKQKGGKVLAGAMVTEGSIIYRANQLGSQTLLGDMMNALSDAQGSKAPIARFADKVTSVFVPVVLVISLVTFALTYILTNDSVSSLIHAVSVLVIACPCALGLATPAAIMVGLGKAVNAGVWFKDAAAMEETAHVDTVVLDKTGTLTKGELEISALWQPQSAVYSEDDLYRFAAAVERQANHPIAKAIVQAAEQKMLEIPTALFSKMEVGQGIQAELEQVGTIKVGKPDYCGLILPKNLEDIWQIASIVAVSINDEPIGAFALTDTLKNDSLHAIQRLQQQNIDVVIMSGDQQSVVDYIAKQLGIKKAFGKLTPRDKAEQIQKLKDLGHIVAMVGDGINDAPALASANVSFAMKSSSDIAEQTASATLMQHSVNQLVDALFIARATLKNIKQNLFFALIYNILGIPLAAFGFLSPIIAGAAMALSSISVLMNALRLKKVRF >CP020411|1761129:1764882|1762532_1762739_+|ARB90587.1|DBSCAN-SWA MKTITLNIKGIHCGCCVKNLTQVLTELDGVQSADVQLEGKANITFDENRVNVAQLIEVIEDAGFDATE >CP020411|1761129:1764882|1761410_1761617_+|ARB90583.1|DBSCAN-SWA MKTITLNIKGIHCGCCVKNLTQVLTELDGVQSADVQLEGKANITFDENRVNVAQLIEVIEDAGFDATE >CP020411|1761129:1764882|1761971_1762178_+|ARB90585.1|DBSCAN-SWA MKTITLNIKGIHCGCCVKNLTQVLTELDGVQSADVQLEGKANITFDENRVNVAQLIEVIEDAGFDATE >CP020411|1761129:1764882|1761690_1761897_+|ARB90584.1|DBSCAN-SWA MKTITLNIKGIHCGCCVKNLTQVLTELDGVQSADVQLEGKANITFDENRVNVAQLIEVIEDAGFDATE >CP020411|1761129:1764882|1761129_1761336_+|ARB90582.1|DBSCAN-SWA MKTITLNIKGIHCGCCVKSLTQVLTELDGVQSADVQLEGKANITFDENRVNVAQLIEVIEDAGFDATE >CP020411|1761129:1764882|1762252_1762459_+|ARB90586.1|DBSCAN-SWA MKTITLNIKGIHCGCCVKNLTQVLTELDGVQSADVQLEGKANITFDENRVNVAQLIEVIEDAGFDATE |
7 | uncultured_virus(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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