| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP020425 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
| CP020424 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 chromosome, complete genome | 9 crisprs | DEDDh,csa3,cas14j,WYL,DinG,cas3,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas1,cas2,cas14k | 1 | 28 | 5 | 0 |
| CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | cas14k,c2c4_V-U1 | 0 | 0 | 2 | 0 |
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
0 : 23832
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020425|0:23832|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020425|0:23832|22926_23832_-|ARC16889.1|DBSCAN-SWA MSKLGIDIGNYAVKTSTDDIFESKVTEVKNFGSDSDSIKIGNKTYYLGEGDEEINIVKYEKENFLPLLLGAICRNTDDEVIDLALGLPVKQFGGLRKDLIEKLQGKEYHVEFEKGNETTKRDITIRSVQVFPEGVTGYLYYAKDIVDQIAGRDVVLVDIGGKTTDIALVQGNKATDPYSVNVGTINIYDAIKKSLEMDERFLGKVEIKREKIQDYIDKGFYLNGEKQDIKKNIDASVGLFKQIYNELKLNYPISTSAVVVMGGGAKLLGEAFKKNIPGIIVMSDVDKHVFANAKGYKKMMK >CP020425|0:23832|4637_4994_+|ARC16868.1|DBSCAN-SWA MGIDNLGVFEALALDLGLNASNFNRKIKKFTKETGQELAENIRDETPVKTEKLKKGWEEKQPEYDTYIVKNEVDYATLVNNGHSTKNGGIVPGSFMVEKGIERTKENMTSAKANLFDW >CP020425|0:23832|902_1664_+|ARC16861.1|head|DBSCAN-SWA MNQKIITKLTEDIYKSAENRTKPFYKYQRENRDKLLLEIAKILLTHDIINEYLNINNKDKKNLRSKLNKIINEYSNSYDEEVKDIETILSDSSKNKYSNLIILLGVILKIKDVSNINNKVINKIVNNKVDGKHWSDRLWKNKKGIEESLKKEIKSFLNGKTSVNKIEKAIRDKYSTGAGQTSRLIENEVARCQSEVNEYFFKVQGIIKVMYCADLDSRTCSDCSMHNGVIFYVNEDRPSLPRHCHCRCQYIPV >CP020425|0:23832|1722_2049_+|ARC16862.1|DBSCAN-SWA 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MKLIDYLPSFANNEIDIQIQEALENELLTLIDEKDDLLEQFFIDTATWGLDDWENLLSIKVNYKLDFDTRRSNIKAKMRGKGTTTIEVIKAISEAYTKTNVDVEVFSNLFSFTLSFITNDCSYNTILELDKKIEEIKPAHLEHKFEMILFNENGLYAGAMSSTGETVTIYPYTPKNIECFGEIILASGNNKSAERVTLYPQEVI >CP020425|0:23832|19494_19986_+|ARC16885.1|DBSCAN-SWA MHLKDLDNSRSFLIQKLGGNMNLTIVFLATNIFIKLVILAIAFDTLLGCLRAIKTHQFNSSFGINGGIRKVAMIACIFFLAVVDILTKFNFLFMLPQDWIDFLRLNHLGISEFFSILFILYESVSILKNMYLCGLPVPKKLKEKIGNLLDTMTDELNIKGGNK |
30 | Clostridioides_phage(57.14%) | plate,head,tail,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_2 |
28919 : 44618
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020425|28919:44618|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020425|28919:44618|33092_33305_-|ARC16903.1|DBSCAN-SWA MNMCKIKTLREKCSLIDDKVEFSGEYKTFPGFAGSKLLECECNKNYICKIQIMTANSNCPLFKKARQLQY >CP020425|28919:44618|37469_37847_+|ARC16910.1|DBSCAN-SWA MNNVVLVGRLARDPELRYIPEYGTPVATFALAVDRGYAKKDGTREVDFIPIEVMGGSAEFCANYLTKGRMVSIQGQIRIEKYEKDGEKKTFTKVRTKIVNALDHKPKDEEKEIGFQVLDDEDIPF >CP020425|28919:44618|34385_35717_+|ARC16907.1|DBSCAN-SWA MNYSLEAEQNILGSFLINDSIGYKIRELKENDFYFESHKIILSCMKKIIDSNKPLDLLLLKNELEKIDRLVDIGGVSYITSLTTIVITTSNIDHYIKIIKEKLLKRQISELANELINNSNSDTSIDELIIDINDLKALVTTSSSVNDNYIDASKIKREKGVHKSIDTGFNKLNNMLDGFRYGTLTILTGKPASGKSTIVNQFIAQAITNGEKAFLYSGELPSFMSMDWFRKTVANDYHIKEYKSVYGGTYTDIPDYAVELISDWIEDKFFLYDEDAISDEVNLLNTIEHLYLKKGVRFFVLDNLMTIKTGNKADKYERQEQIVSNLKNLAKKYNLVIVLVAHPRKNMGDMKPTMYDVSGASEIVNYADYILSTYRVVDEEEETDDTYLLILKNRITGKQNISFKMNFSERRKRLYTTSEELNRDYKYDVNKQYVQVEIPEDVF >CP020425|28919:44618|38598_38928_+|ARC16912.1|DBSCAN-SWA 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MLIEVTENNRELKVGDIVEINGGNKLYMILSLKETIGGYVIINMQNGYGSFGAYKSLSQLELDLKVRGYKLYSSDDYKLQLVPKE >CP020425|28919:44618|31883_32615_+|ARC16900.1|DBSCAN-SWA MDLLKDARKKEWFWLENDLVDREDLGIYEKMIYIVLARYSDNESCCFPSYKTIALKCGCSERQAKSVVKILENKGLIKKENRIKSNSNEKESNIYFVLTAKLGGEYDAQQVVNMMHNPSAPHAQQVVNMMHSKKTNIKKTYIKSNTTPQNEPKTDYLDLSFLDLDIEKVKLTKDEYDKLISKFGKKYIHDKIVSLENYIVNGKGSRYKSHYRALLTWGNADTSKGILQPVTKAKNPLSGFKEL >CP020425|28919:44618|36528_37233_+|AVI59031.1|DBSCAN-SWA MIRNAMEYLVKLGKRETVCVDGFKYTTDALEIIKEPKANELEITTLSGLVDYIKSGIDHEEDELLLIQVLTPRKVLLKSALRKNRDRETYIECVALLPDKRFDRPLDLDTFNIMLQSAFIKNNDRDTLLKIAGNIQESTVKNVGDDGVSQSVTIKTGVASVSEAIVPNRVKLIPYRTFQEVEQPESEFIFRMSTGPAAGLYEADGGAWKNQAMLNIKAYLQEELKDFKNVNIIA >CP020425|28919:44618|41006_41651_+|ARC16916.1|DBSCAN-SWA MEAHSGQKVNPIKDIEDVFRLLNFLEEWNERNYLLALFGMCTGLRIGDILALKVADVTDIKLDKKGKKIRVSKDWIRVIEEKRDYDREVFLSDVIKSAIENYTQDKPGEEFLFKSGKRKKFNRPIQTRQAGRIIKGAAEKVGIKENVATHSLRKTFARHIYDEEENKTYALELIRKILGHKTIEMTRRYIGIDKDEEVKAITKFTNKLKKRKRN >CP020425|28919:44618|33467_33728_+|ARC16904.1|DBSCAN-SWA MKEEKLELTEKELHCIARHLQNEIMEMVFRGNREAPTSCEVCDYLQECEGDFTCMYHSFTKLSKITGVKVTAFKYCFPDENPKATI >CP020425|28919:44618|42878_44618_+|ARC16918.1|DBSCAN-SWA MDNLERNIQLIFSYLAKTFIRNGASIKDAEKEANEIIKANSNNLWGVNGLAYQLGKINLEFFCMYFMQDTYLPKEDNAAAPIAKVHHELWEDIQESIIGDGSQQLGRIYPRGTGKSAFGDLATTVWSHCYKHKTYTLICSDIGSTAEKFVKDIKNALLENEYIKKAFGVLLNDNDRKYICNSTQLELTNKTFIEAISSSSPMRGRKYNNNRPDLIILDDYQSEENVRTEDAREKKFKRFSDDVKYAAQKPVIRNGKTIKRGTTFIALGTLQHKECFYSRLKKLPTWKFKCEKGVLVDNVDELFNSGLWLKFKEILFDFKNTNHLEDAKEFYWENEKEMKFPILWPSFWDCLDMALSYYENPTSFKQEVQNDVNSIGEKWFKTVRTETREEIESHTFKKTMLLCDPASAGGSKHDYSAFLVGSESENGLLYGRLAELAKINARTDFDKYIDHMIYLLKVYSDITHIYIEKNTFNGADANQLEFKIKNDNVLSYRDIEIINEQQKKNKDDKISTLIPVLNKGQMIFAEEDKEFIQQILDFTGQKYSLHDDAPDISSEFINRINNIKVSETVNIFDRKLLGF >CP020425|28919:44618|31639_31855_+|ARC16899.1|DBSCAN-SWA MKISDFNKNQIGTAVQLQDIRFGTKVDCIITKVEKNEILVMYYEKETEEIAYKTLTKEDLILDDYKLKLLS |
25 | Clostridium_phage(52.94%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP020424_1 | 374552-375699 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP020424_1
|
17 spacers
spacers of CP020424_1
>1.1|374581|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT AAATTTCAAAGAGATTGGACAACGAATAAAAATTGCA >1.2|374647|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT ATATTTGTGTCGATATATAGTTCTAACTAAGTATAAG >1.3|374713|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT ACATATTTTACATGTTTGAAGATTTTATCAGAAACCCT >1.4|374780|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT TATTAATAGTGCTATGTTGTTTATTTGCATTAACAAG >1.5|374846|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTAATTTAGATAAATGTTCTGTTGGAGATTTAACCA >1.6|374913|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCAACAGTTCAGCAAGGAGCTACAAATATGTATAA >1.7|374978|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATATACTATATTTATCAACTGATGAAGTGTTGCAAT >1.8|375044|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAACGAAATTAAAATTGAATCTAATAATTAGCTATA >1.9|375110|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGCTTGCAAACCATTCGACAATGCTATTTATTATTTC >1.10|375176|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGTACCTATTTTAACAGGAAATCTATTGCAATCTTT >1.11|375242|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGTCTCAACTTTCAAATAATCTTCTTTTTCTATCAG >1.12|375308|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCCTAGTCTTGATGCTGGAGATAATATTGTAATTC >1.13|375373|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTCTTTCTGGAGTTGCTTACGATTTACCTTATACTCC >1.14|375439|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAATTAATCCCGACGTTCCTATAGTTGGCATTGATTT >1.15|375505|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GACCAAGTACATGTTTTAAAGAAAAAACAAGAAGTT >1.16|375570|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACAATAAAAGTCAGCTCGAAATGTTCATGGAAAACA >1.17|375635|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTATAATAAAAAACAGATGGGGTGGAGCTTCTTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020424_1
The CRISPR arrays of CP020424_1 >merge|CP020424|1|374552-375699|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAATTTCAAAGAGATTGGACAACGAATAAAAATTGCAATTTATATACCATATAGTTAATATAAAGCATATTTGTGTCGATATATAGTTCTAACTAAGTATAAGATTTACATACCTCATAGTTAATATAAAACACATATTTTACATGTTTGAAGATTTTATCAGAAACCCTATTTACATACCGCATAGTTAATATAAAACTATTAATAGTGCTATGTTGTTTATTTGCATTAACAAGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTGTAATTTAGATAAATGTTCTGTTGGAGATTTAACCAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTGCAACAGTTCAGCAAGGAGCTACAAATATGTATAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAATATACTATATTTATCAACTGATGAAGTGTTGCAATATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTAACGAAATTAAAATTGAATCTAATAATTAGCTATAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGGCTTGCAAACCATTCGACAATGCTATTTATTATTTCATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTGTACCTATTTTAACAGGAAATCTATTGCAATCTTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAGTCTCAACTTTCAAATAATCTTCTTTTTCTATCAGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATCCTAGTCTTGATGCTGGAGATAATATTGTAATTCATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTCTTTCTGGAGTTGCTTACGATTTACCTTATACTCCATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCAATTAATCCCGACGTTCCTATAGTTGGCATTGATTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGACCAAGTACATGTTTTAAAGAAAAAACAAGAAGTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACACAATAAAAGTCAGCTCGAAATGTTCATGGAAAACAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGCTATAATAAAAAACAGATGGGGTGGAGCTTCTTTGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP020424|1|1|374552-375699|CRISPRCasFinder ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAATTTCAAAGAGATTGGACAACGAATAAAAATTGCA ATTTATATACCATATAGTTAATATAAAGC ATATTTGTGTCGATATATAGTTCTAACTAAGTATAAG ATTTACATACCTCATAGTTAATATAAAAC ACATATTTTACATGTTTGAAGATTTTATCAGAAACCCT ATTTACATACCGCATAGTTAATATAAAAC TATTAATAGTGCTATGTTGTTTATTTGCATTAACAAG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTGTAATTTAGATAAATGTTCTGTTGGAGATTTAACCA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TGCAACAGTTCAGCAAGGAGCTACAAATATGTATAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AATATACTATATTTATCAACTGATGAAGTGTTGCAAT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTAACGAAATTAAAATTGAATCTAATAATTAGCTATA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GGCTTGCAAACCATTCGACAATGCTATTTATTATTTC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTGTACCTATTTTAACAGGAAATCTATTGCAATCTTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TAGTCTCAACTTTCAAATAATCTTCTTTTTCTATCAG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATCCTAGTCTTGATGCTGGAGATAATATTGTAATTC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTCTTTCTGGAGTTGCTTACGATTTACCTTATACTCC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CAATTAATCCCGACGTTCCTATAGTTGGCATTGATTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GACCAAGTACATGTTTTAAAGAAAAAACAAGAAGTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ACAATAAAAGTCAGCTCGAAATGTTCATGGAAAACA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GCTATAATAAAAAACAGATGGGGTGGAGCTTCTTTG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP020424|1|1|374552-375699|CRT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAATTTCAAAGAGATTGGACAACGAATAAAAATTGCA ATTTATATACCATATAGTTAATATAAAGC ATATTTGTGTCGATATATAGTTCTAACTAAGTATAAG ATTTACATACCTCATAGTTAATATAAAAC ACATATTTTACATGTTTGAAGATTTTATCAGAAACCCT ATTTACATACCGCATAGTTAATATAAAAC TATTAATAGTGCTATGTTGTTTATTTGCATTAACAAG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTGTAATTTAGATAAATGTTCTGTTGGAGATTTAACCA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TGCAACAGTTCAGCAAGGAGCTACAAATATGTATAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AATATACTATATTTATCAACTGATGAAGTGTTGCAAT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTAACGAAATTAAAATTGAATCTAATAATTAGCTATA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GGCTTGCAAACCATTCGACAATGCTATTTATTATTTC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTGTACCTATTTTAACAGGAAATCTATTGCAATCTTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TAGTCTCAACTTTCAAATAATCTTCTTTTTCTATCAG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATCCTAGTCTTGATGCTGGAGATAATATTGTAATTC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTCTTTCTGGAGTTGCTTACGATTTACCTTATACTCC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CAATTAATCCCGACGTTCCTATAGTTGGCATTGATTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GACCAAGTACATGTTTTAAAGAAAAAACAAGAAGTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ACAATAAAAGTCAGCTCGAAATGTTCATGGAAAACA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GCTATAATAAAAAACAGATGGGGTGGAGCTTCTTTG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP020424|1|1|374817-375699|PILER-CR ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTGTAATTTAGATAAATGTTCTGTTGGAGATTTAACCA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TGCAACAGTTCAGCAAGGAGCTACAAATATGTATAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AATATACTATATTTATCAACTGATGAAGTGTTGCAAT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTAACGAAATTAAAATTGAATCTAATAATTAGCTATA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GGCTTGCAAACCATTCGACAATGCTATTTATTATTTC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTGTACCTATTTTAACAGGAAATCTATTGCAATCTTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TAGTCTCAACTTTCAAATAATCTTCTTTTTCTATCAG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATCCTAGTCTTGATGCTGGAGATAATATTGTAATTC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTCTTTCTGGAGTTGCTTACGATTTACCTTATACTCC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CAATTAATCCCGACGTTCCTATAGTTGGCATTGATTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GACCAAGTACATGTTTTAAAGAAAAAACAAGAAGTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ACAATAAAAGTCAGCTCGAAATGTTCATGGAAAACA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GCTATAATAAAAAACAGATGGGGTGGAGCTTCTTTG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
>CP020424.2|ARC13848.1|373855_374143_-|hypothetical-protein MKKILYALYSFIVIIANFRLKEKNYNFILLAIFFILLLIQNGVLKTGYQNRATFYQDNYFNGEDKNDKIKFMTIKIFIFLSLPLCFNILFNYLTS >CP020424.2|ARC13847.1|372765_373317_+|XRE-family-transcriptional-regulator MSINTVIAKNLNRLRNERNLSLGQLAELSGVSKVMLSQIEKGDSNPTVNTIWKIASGLNVPYTAILEQPQNETFIVSKTDIDVQVSENKDYRLYCYYPNTPTRNFELFQMELEEGHSYTSVGHSEKSQEYIMIIEGQLKLEVNDSIYQLRENDSICFSAESIHTYHNQGEKTLKAVIINYYPV >CP020424.2|ARC13846.1|371612_372575_-|cysteine-synthase-family-protein MRVLNNVTEAIGNTHMLHLSKIADEFGVQGNIYAKMEYLNPGFSKKDRVALQMITEAENAGLLVPGQAVVELTSGNTGTGLAIACACKGYKFIACMSKGNSMERARMMKALGAEVVLVDQMPNSVHGQVSGEDLALVEIEAQKIAKERNAFRADQFNLEACNHAHEKYTAEEMWEQLDGNIDVFVDFLGSGSTFAGCSKTLKKHNSSIKCYVVEPETAAIYSGKEITDQGHKIQGGGYSMDLPLVDKKLIDGYIQVTDEEATDVARKLAKLEGVFAGFSSGANVCAAIKLLKSSEKGKNIILTLNDSGLKYLSTDLYEEL >CP020424.2|ARC13845.1|369473_371318_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MQKRILRNFIFTGKNILNKLVFIIKYNFSTLILFELFHKGLALFFIWPSIRYIFDILIKSLHIVYLNMDNFIKVLTNPMSIVLIILSVIILAFYAFFEFTSVIICLNKSIKYEKIGLFELFKISFENSIKLLYPKNILLFIFVILIIPLVNTVLISGFIGKIQIPEYILDYIKSDIILNIIYMIFLLIIYISVIRWIFSIHEITLNTENFKRARKESVNLIKGKIIRTIIYSLILSLVVAIIGYAIYHSGIIFIGIWTKYCTDMEFLKNVFINRCIAFEEYFRLILSIFIFILDIGFISATYYQYKGVSISKNNIKKEKKSISKIVFNLVLILLISYIESVAFSSHINGMFNTSFSFYTTAIAHRAGAEMAPENTLAAIKEASHAKADYAEIDVQEAKDGELIVLHDSNFKRTTGVDKNVWDVNYNEVKTYDAGSFYYYGKGYYDEKFVGEKIPTLKEMIKYSKGKVKLLIEIKLNGHEKGDVVKKVVQLIKENNFENQCIVASMDKTILQKVKKLDENLLTCYFMAIAYGDFSKLNYVDMYGIESTFVNKTVVEKIHKMNKKIFVWTVNSDSLIEKMLDLNVDSIITDNPYLIESAIYWKKNGFISQVSDYLF >CP020424.2|ARC13844.1|368567_369152_-|sugar-O-acetyltransferase MTEREKMLAGELYDCGDIELLTQWHKAKDLVRDYNQTDSSDLEKKEKILNELLGGKGKNLWITAPYYVDYGNNIYFGNNCEVNMNCTFLDDNKIIIGDNALIAPNVQIYTAFHPTNAGDRFGNAKEDGSFEFCKTQTAPVTIGDNVWIGGGAIIMPGVTIGDNVVIGAGSIVTKDIPSNMIAYGNPCRIIRENK >CP020424.2|ARC13843.1|367288_367465_+|hypothetical-protein MFIGEIDKCTHILTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFISEYGETVVETCLHQVLLLVSRYN >CP020424.2|ARC13842.1|365691_366714_-|hypothetical-protein MVNWEIKKLAKSKSMFISLGILVLILMISIFIAPVLETESYYIDKEKGRIEDTRSGIDIGNEKFQNKINVLKQFSNQTDTGEFSKKIELMSKKKLDNLSVNEYKDISFWKVFNYRVTNSLINVGMLIIISIIISNIYVDEVVTSVKDIILSSKEKKKALKSKIFVALLVPLVIYSVYLMGIFIITCMQQGVPVNGDLESFRIVDNVVALKTNLSITKYVILNIGIELLMFEGWAMIAIFGSFISKSSISSISFFIFIISITKIMSVIHILPKKLLSVVSNVNYYDLIFGFNKIIGNYLGDIMIFKVNIDIVNIAIGLLMAILIGTMSLCFLVIKSDYISR >CP020424.2|ARC13841.1|364790_365678_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNKLEIENLSKIYGKKVANDKITVTLENGVYGLLGPNGAGKSTLMKQITTLIKPDEGQILYNGEDIFKMDADYRNILGYLPQEFGVYKNFTAKEFLQYIGALKGLRGKYLNSKIGELLDLVGLYDVRNKSIGKFSGGMKRRVGIAQVLLNDPKIIVLDEPTAGLDPQERARFRNLIAKMSRDKIIILSTHIISDIESVAKETIMIKDGKLLMKGTHKDILSHMENKVYNVQVKNECEVDDIQSKYKVVSIQSDINSIVLRIVSEDILSEDNIQPVQAKFEDVYMFYFDLEDAREV >CP020424.2|ARC13840.1|364011_364785_-|ABC-transporter-permease MMYLVKAEMIKILKSKSVWIIWLFLIFFGFFLIRKFDVLDTYADIFYKIEGSIPLIGLIMFIITSGNYIKEYDSNMTGLINTTKKGKKSVVLSKLVANGLILSIINISFILLVGIRGFSFFDFKNLNEPIHNLWYFGNSNLNLTVIQMYIIVILTTIFASFIFAQIGLTLSSIFKSAVIPFILGGLIMAIPYFSVGFIPDKAIKFMSVTPNWIMMSQQMVKYNVPSILIVFSIVISIILMIVLTKITYENFTSSKRF >CP020424.2|ARC13839.1|363174_363900_-|DNA-binding-response-regulator MENRVLIIDDEVEILKLLETVLKKEGLNNIYTAKTKKEGLELFKSINPDLIVLDIMLPDGEGYDICKEIRKTSNSPIIFLSAKTEELDKLLGLAIGGDDYVTKPFSPKEVAFRVKAHLRRLSYFSDAQNESKNLNNNEEKIISFGPYILNESRAELIKDGKSIGLSAKELKILSLFAHNQNQIISKEKLWDKVWGEDYVGFDNTIMVHIRKIREKLEDNPSKPEYILTIKGLGYKLAVKED >CP020424.2|ARC16760.1|375949_376126_+|integrase MLTILSILIILLLAGTNIKIISERLGHTNIKITMNRYFLVLNDMDKKASENIIKVLFK >CP020424.2|AVI58770.1|376345_377617_+|guanine-deaminase MLKVLKGNIIFTKTSETFTVFENSYIILEKGKVKGIFKEIPKEYKNLKVVDYTDKLIIPGMNDLHAHASQFKNLGMAMDKELLPWLETYTFPEESNYKDIEYATKMYKKFVKELWKSGTTRIAVFATVHKEASMKLMDIFKEVGLGAYVGKVNMNMNCPDTLLENTQDSITDTEEIINKYSDTDSIVKPIITPRFIPSCTSELLKGLGDLCLKYNIPIQSHLSENYDEIEWVRSLEPESKFYGDAYNRYNLFGQTPTLMAHCVHCSQDEIDLMRENNVMAVHCPASNFNVGSGAMPIRKLIDNNIRLALGSDISGGHTLSIFKAMVSAIQLSKLYWVNSGKKYNFLSLSEAFYIATKSGGSFFGKVGSFEEGYDFDALIIDDSNLNHDNYSILERLERFIYVGDDRNIIHRYVCGKLIEEPNI >CP020424.2|ARC13849.1|378200_378518_+|hypothetical-protein MSEFKNVTAVKKANVYFDGKVSSRVIILPNGERKTLGLMLPGEYTFSTREEEIMEMLAGSMDVKLPGSNEFVTYKEGQKFNVPSDSSFDLKVNEVVDYCCSYIAD >CP020424.2|ARC13850.1|378603_380961_-|ATPase-P MDKVNLERYSCDINVGLNKNQLQSRIDDNLINAFDNGKTKTYKQIFKDNIFTLFNLINIVLVCLLVSVGSFKNTLFIFIAVINTIIGVIQEIRAKRLLDNLSVIVSNKVSVIREKEKKEIDVQELVLDDIMILKTGNQICADSKVLNGKLEVNESLVTGESDIIIKNKGDFLYSGSFVVSGEAFVRVENIGKDNYANKIANDAKISKKHNSQLRNSLNAILKIVGIIIIPLGIILFAKQHFGNGDSIATSVVGTVAAVNGMIPEGLTLLTSIALAVGTIKLASHKTLVQELYCVETLARVDTLCLDKTGTITEGKMQVDDIVMLEEVDINEIMGNICNSLKDDNATLNAIRDKYNVLDTYKAKNLIPFSSERKYSGVTFENKGTYLLGAFEFIFKEKNKKLRIEVERYSKKGNRVIVLAHSDSYMEDNNIPEDIKPLAFILILDKIRDEAKETLEFFYNEGVDIKIISGDNPITVSEVARKAGLKTASNFIDATTLKNDSDIYKAVDKYSVFGRVSPQQKKQMILALKKQNHTVAMTGDGVNDVLALKEADCSIAMASGSDVTKNVSNLVLLDSNFASMPKVVMEGRKVINNIQRASSLFLVKTIFSFFLSLLTLFFFSRQYPFVPIQLSLIGAVTVGIPSFFLALEANKSRISGNFLLNILKNALPGALCVTVNVIIVYNIVEYLGYSSSVFSTMCAILTGVCGLLILRQQCLPFNKERLFLIVSMTIAFVIGILFLGGLFSFVALSRELILITMVLAILMPIMIKVMLFVLDEILETIVPDLN >CP020424.2|AVI58771.1|381383_382841_-|glycine-dehydrogenase-subunit-2 MKEYNSLLIDISKKGRKAYSLPKLDIDDIKIEDMIDPDMARQSELNLPEVGELELVRHYTLLSNKNFGVDTGFYPLGSCTMKYNPKINEDMAALPNFTGMHPYQSSDTAQGSLSLMYDLSRRLAEITGMDEVTLQPSAGSHGEFTGLMIIKAYHENRGDHKRTKVIIPDSAHGTNPASAAMANFDVIQIASDKNGAVDINALKEVLNDEVAALMLTNPSTLGLFEKNIKEIATLVHEAGGLLYYDGANMNAIMGITRPGDMGFDVVHLNLHKTFSTPHGGGGPGAGPVGVKKELVPFLPIPVIERKEDKYVLNYDREKSIGKIKNFYGNFGVLVRAYTYILTMGRDGLKEASEMAVLNANYIKESIKDDYILPIDTLCKHEFVLGGLPRGEANIKTIDIAKRLLDYGYHPPTMYFPLIINEALMIEPTESESIETLDSFIEAMKSVAKEAKEEPELLKTAPHNTLVKRVDDARAVKKPILTWSQR >CP020424.2|ARC13851.1|382840_385315_-|glycine-cleavage-system-protein-T MNELKRVSLYNIHKELGAKLVEFAGWEMPLEYEGINKEHEKVRKSAGIFDVSHMGEVQIKGAESEKFIQNLVTNDISTLKINDIIYTPMCYENGGVVDDLLIYKFGEEDYLLVINAGNIDKDVAWIIKQSEGYNVDIKNISSEVSQLAIQGPKAEEILQKITDIDLNSIKFYKSIPSTKVCGCPCLVSRTGYTGEDGFEIYCKNKYVEIIWNEVLKVGGEDICPAGLGCRDTLRFEAALPLYGHEINEHISPIEGGLSIFVKTNKESFIGKSILSKEKESGAKRKLVGFEMQGKGMPRNGYDIRIGDKTVGFVTTGCASPTTGKILGMGIIDSEYAKVGNEIGIAIRKKVVPAVIVKKPFYKKQYKKDNIILNKENKFSYIPATSEDKSKMLKVVGLNSVDELFSDIPEEVKLKRDLNLEIGKSELEVSKIVKRLSEENLSLEDLTCFLGAGAYDHYIPSIIKHITSRSEFYTAYTPYQAEISQGTLQVVFEFQSMIAEITGMEIANASMYDGATAAIEACIMAMNQTRKSKIVVSKTIHPETLSVLRTYLQYKDCEIVEIDFCNEYGTTDIEKLKASVDKDTACVLIQTPNFFGIIEEMEEIEKITHENKAMLIMSVDPISLGVLKTPGEIGADIVVGEAQSLGNPLNFGGPYVGFLASKSKYTRKMPGRIVGQSLDVEGKIAYVLTLQTREQHVRREKATSNICSNQALNALVASIYMATMGKEGFKEVGMQSMKKAHYTYNKLVQTGKYKPIFKGKFFKEFAVQGNLNIETINDKLLEENILGGYNLEYNYPELKNSTLLCVTEKRSKEEIDKLVGIMEGL >CP020424.2|ARC13852.1|386120_386636_-|HXXEE-domain-containing-protein MEKYIWLFPLLFIFHDMEEIIGFGIWLKKNKSMLDKKYPFISKVYKNYSTEGMAFAVFEEFILCIIFCILTVITENQYVYLLWLGSFIAYTLHLVIHIGQSIIIRKYIPSLITSIICLPISIWCISKSIYIVDCEMSTTILYSIIGIIIVALNLKFAQSLIGKFTKWMSNI >CP020424.2|ARC13853.1|387160_388891_-|sodium:proton-antiporter MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKNVIISLLIGILSGSFIIKASGINVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGVINLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFFDDYANSLIVGPMMRPVADKMKISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRFYNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVEELDDLAPKNGVKLSVWNAIIPIGTLIIVALASFYYSGYTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALFQSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITGVILILAWSLSSVIKELGTAKFLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIVSTSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAGLGLPIYIVLPVAIAAIFVGIQIIGKKVDEAEIELVE >CP020424.2|ARC13854.1|389374_390361_+|lipoate--protein-ligase MLLIYNEKTNPYFNLAMEEYLLKNFDEDLFILWRNEPSIIVGKNQNTLSEINLEYIKEYSIPVVRRQSGGGAVFHDLGNINFTFIACNNNNFSDFRRFTQPIIDLLKTLDVNAEFSGRNDLLIDGKKFSGNAQYNYKNKVMHHGTLLFSSEINDLSKALKVKPIKFEGKGIKSVKSRVTNISEHLHSKMDILEFKDAIMDYLSKTNTDNTNYCLSEHDIKQIEKLTKSKYETWDWNFGNSPKYTLSNELKYSGGNVEFNLNVDKGIITSIKFFGDFFGKCDVAFVENKLIGIRHEENALRNTLDSIEINDYFLGADTDILVSGILGVK >CP020424.2|ARC13855.1|390670_391468_+|lipoprotein MKFKKLLCLLLCLVLTLAVVGCSKAKDDKKIVVGATLVPGGELLEELKPLIKEKGYTLEVKNFDDYILPNEALNNGEIDANLFQHEPYLKEAVKAKGYKIMAGKKLYVCPAILYSYKIKSVDEFKKGDTIAISNNPSSCSKNLRYLESIGLLTLPKGDGLVSPKDIIENPKGIQFKELDIAQIPSSLPDVTAAFIDTTYAVPAGLDAKKNGIYTAPINDEYANLLAFRTEDKDSEKIKVLQDVLTSDKARSLIEEKYKGIVIPTF |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP020424_2 | 549274-549765 | TypeV |
I-A
Consensus repeat of CP020424_2
|
7 spacers
spacers of CP020424_2
>2.1|549303|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT ATAAGTAATATAAATTTATGTAAAGCAACAAAAGATAG >2.2|549370|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAGTTTACATTTTTATTTTAGAATATAAGTCGTTGTA >2.3|549437|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTAGAGAAAGCGAAAACGTACCATTAAAATCAAAT >2.4|549502|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTAGTTAATATTATAATTCCAACTCCTATAAGTATA >2.5|549569|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTGCTTAAACTTTTAAGACAAGGTGGAGCTTAAAA >2.6|549635|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATCCAACCAATTCTATATTTATCATTCCAAGAACG >2.7|549700|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTCCTCTAAAGTCCAAACACCCTCTAGCTTTCCCGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020424_2
The CRISPR arrays of CP020424_2 >merge|CP020424|2|549274-549765|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTTACATTCTGTATAGTTAATATAAAACATAAGTAATATAAATTTATGTAAAGCAACAAAAGATAGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGAAGTTTACATTTTTATTTTAGAATATAAGTCGTTGTAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCTTAGAGAAAGCGAAAACGTACCATTAAAATCAAATATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTGTAGTTAATATTATAATTCCAACTCCTATAAGTATAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTATTGCTTAAACTTTTAAGACAAGGTGGAGCTTAAAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTATCCAACCAATTCTATATTTATCATTCCAAGAACGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTTCCTCTAAAGTCCAAACACCCTCTAGCTTTCCCGTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP020424|2|2|549274-549765|CRISPRCasFinder ACTTACATTCTGTATAGTTAATATAAAAC ATAAGTAATATAAATTTATGTAAAGCAACAAAAGATAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GAAGTTTACATTTTTATTTTAGAATATAAGTCGTTGTA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTTAGAGAAAGCGAAAACGTACCATTAAAATCAAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTGTAGTTAATATTATAATTCCAACTCCTATAAGTATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATTGCTTAAACTTTTAAGACAAGGTGGAGCTTAAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATCCAACCAATTCTATATTTATCATTCCAAGAACG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTCCTCTAAAGTCCAAACACCCTCTAGCTTTCCCGT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP020424|2|2|549274-549765|CRT ACTTACATTCTGTATAGTTAATATAAAAC ATAAGTAATATAAATTTATGTAAAGCAACAAAAGATAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GAAGTTTACATTTTTATTTTAGAATATAAGTCGTTGTA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTTAGAGAAAGCGAAAACGTACCATTAAAATCAAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTGTAGTTAATATTATAATTCCAACTCCTATAAGTATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATTGCTTAAACTTTTAAGACAAGGTGGAGCTTAAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATCCAACCAATTCTATATTTATCATTCCAAGAACG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTCCTCTAAAGTCCAAACACCCTCTAGCTTTCCCGT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP020424|2|2|549341-549765|PILER-CR ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GAAGTTTACATTTTTATTTTAGAATATAAGTCGTTGTA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CTTAGAGAAAGCGAAAACGTACCATTAAAATCAAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTGTAGTTAATATTATAATTCCAACTCCTATAAGTATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATTGCTTAAACTTTTAAGACAAGGTGGAGCTTAAAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATCCAACCAATTCTATATTTATCATTCCAAGAACG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTCCTCTAAAGTCCAAACACCCTCTAGCTTTCCCGT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC
>CP020424.2|ARC13973.1|548833_549106_+|hypothetical-protein MKIVIGATIRYLIKHKVNYCNKKSLDKLELKYGNIDREKAVKLEIFYQYLIELEYIEMSLLIRRLDTAITSLALVSIITIASYYLIRKNV >CP020424.2|ARC13972.1|547796_548615_-|MerR-family-transcriptional-regulator MEKQYFTTGEFAKLCGISKQTLIFYDKIGIFSPEYKDKNNYRYYSVYQYDTLDILQSLREIGMSLEEIKEYIQNRTPQLCVKMLKEEEKKIREKIKKLRKISSKMQNRINITVEGISKMNSEEIYISKKFEEYLVLSSDLSNMSNSDFMMELIDFTNYCKSKNLYQGYELGVIVSNENIKNGDYLSISSFYLKIDKKIKDKKLYVKPEGMYACIKHIGKYEDSYKSYEKLKKYIYENEYKIIGNSYEESILDFFCESNEDNYMTEISIQVSR >CP020424.2|ARC13971.1|545543_547664_+|ferrous-iron-transport-protein-B MGLTHNSTKMSSLKDMFDIDNKEDQFVIALAGNPNTGKSTVFNHLTGLRQHTGNWPGKTVATARGNFKYKNTEYALIDLPGTYSLFALSQEEIVARDFICFGNPDAVIVVCDATCLERNLNLVFQVMELTDKVILCINLIDEARKKGITIDKKLLEDSLGIPVILTAARNGSGMDELLDTLNDVSFDKYKLNNKPVRYNENIENVVKSIQPELDNIIPGINSRWLGLRLIDGDESIFESMSNYIDKDSIDAINEVKKKIPDNINKQKIRDEFTKINYDYAKKLSDECCSNVAKKSTDREEKVDKILTSKIFGLPIMLLLLGTILWITIEGANYPSTLLSNLLLGFEPSISGILNSINCPSWLNDMLVLGLYRTLAWVISVMLPPMAIFFPLFTLLEDFGYLPRVAFNLDHLFKKACAHGKQCLTMCMGFGCNAAGVIGCRIIDSPRERLIAILTNNFVPCNGRFPTLIAISTIFFSSVITNSFVSSVATALCITLLIILGVIITLLVSYTLSKTLLKGVPSTFTLELPPYRVPQIGRTLYTSIIDRTIFVLGRAVMVAIPAGVITWIFANIYIGDLSILSHVANFLDPLAKLIGLDGFILLAFILGFPANEIVVPILLMAYLATGSMIELDSFSALGQVLREHGWTYLTALNVMLFSLLHWPCATTLLTIKKETGSLKWTALGFLMPTILAFVVCFLTTTVYNLFI >CP020424.2|ARC13970.1|545290_545518_+|ferrous-iron-transport-protein-A MKNLNDIQVKKTVKVEDILSSGNLRERMLALGLTRGAVIDVVRKGPKNNLTVYKIRGSKIALRQEESSLILVSDI >CP020424.2|ARC13969.1|544524_544965_+|acyltransferase MFKIKHFNDLSLDEFYEIAKSRYEVFACEQKIFSLNDYDDIDKSSYHIFLKENGLICAYARIIPKEYSSYNDVSIGRVLVLSSHRRKGLAKQMMDCAIDFIKVNLHENNITLSAQTYIKNLYLSCGFKEISEVYDEAGIEHIKMRL >CP020424.2|ARC13968.1|543383_544352_-|DUF2232-domain-containing-protein MNTTKKLTEAALLSSLFIVVTIIAVSTGFGYAIYLDFIVPVFFCIICLKCDLKYTILSGITSLLIISLVLGNLGTAIWASQSVLLGIMCGYLINKPTMVMDDLVYGSVFGVIVMVFIDIYASTLIGYSFMKEFQGYSKWIYFNGYTNFIYYLMIALFPFGMVFCIYLLSLILGNKLHILDSNSLKKFLIFKNFRNLNQFLCCSKKAFYICVSYLAIFEVLKLLNVKVDSVYLKTIFISITYISVYFIIRDSCMSLQNFIIAKFRKLLYARILFLIIILLLFFIFDVTVISLIIINAFLNKKINIRLSQSNIVNKQINLLIEK >CP020424.2|ARC13967.1|541698_542907_-|tyrosine--tRNA-ligase MKSIDEQMRIIMKGVDDLIDEKELREKLIKSEKEGKPMIVKLGLDPSAPDIHLGHTVVLRKMKQLQDLGHQIVIIIGDFTGKIGDPTGKSKARKALTTEQVLANAKTYEEQIFKVLDKEKTIVRFNSEWLAKLNFEDVIKLAATITVARMLEREDFKKRYEGQMPISVHEFFYPLMQAYDSIALEADIELGGTDQRFNLLMGRSLQREFGMESQIVIMMPLIEGLDGKEKMSKSLGNYIGIDEEAGIMYQKSMEIPDELIIKYYNLVTDVHPDEVNKIESQLKEGSVNPRDIKMNLAREIVTLYHGEESAKEAEERFKSVFQKGQIPEDIQTIQVKEDGFDLIEVLVSNEIVKSKSEVRRLASQGGVKVNGEKVEDLSTIVKESELVVQIGKKKFVKIELVK >CP020424.2|ARC13966.1|540756_541638_+|polysaccharide-deacetylase MVKKRKKKTVTLTILVVIVIGIFSMAWADMSRKKEMKETQERLKAERLEKERIEKEKNEPIIGAKKEAVKEYGYDAKIVWDKLNKYDYSNNGEKIVFLTFDDGPSTTNTPQVLDILKRHGVRGTFFIKGDSLERKGANEILKRTFDEGNAIAHHSYTHDYKKLYPNRSLNLDTFVNELNKTDEAMKKVLGKNFSSNVVRCPGGYMSWKNMEPLGNYLKEKNMASIDWNALNADAEGKKKNAQELFEHAKKSSEGKEMVVLLMHDTYGKQETVNALDQIITYFKDNGYQFKILI >CP020424.2|ARC16762.1|539426_540341_-|EamA/RhaT-family-transporter MKKYFGEIGLIFIAIIWGSGFVATQFALDGGLTPLQIITLRFFLAAIIMNLLFFKQIRANMGKKLLKAGGILGIFLFLAFTVQTIGLMYTTPSKNAFITAANVVIVPFIGFILYRRKLDKIGIISSLVALIGIGILSLEADFSINFGDFLTLICSFGFAFHIFFTSEFAKDNNPMALTAIQFTVAFLMSVVVQTFAGQLKMEAELSGYMGTMYLAVFSTTIGFLFQTICQKRVDGTRTAIILSTEAVFGTIFSIIILKELITAKLVIGSILIFVAIITAETKLSFLKSKKVKLKDSEESSLESI >CP020424.2|ARC13965.1|538658_539204_-|NADH-peroxidase MKKFVCTVCGYIHEGDAAPAQCPVCKVGADKFEEMKGEMVWADEHRIGVAQGVDAEIIEGLRANFTGECTEVGMYLAMSRQADREGYPEVAEAYKRIAFEEAEHAAKFAELLGEVVVADTKENLRVRVDAEYGATDGKLKLAKRAKELGLDAIHDTVHEMCKDEARHGKAFLGLLNRHFGK >CP020424.2|ARC13974.1|550423_552517_-|GGDEF-domain-containing-protein MNKHNFEVILNQLQINIYVTNIHTNEIIFMNKKMKEEYNILDPEGKVCWQVLYPEKNSTCSFCKVLELLKNDKKGVLIKWYEKCNKLNRVFENYDSLITWQDGTVVHMHQSIDIANSTSLNKPIKINEFHEISNNKEEKGVFNFSRDNFDYNSTLLYDALIRGTDEYIYICNMKTGVFRYSPSQVELFDLPGEIVKNPLVYWKKIVHPEDWNRFYKSNTEIGKNQMDYHTVEFRAKNRSGEYIWLRCRGQLMRDEFGEPSIFAGIMTQLGKQNKIDSLTQLLNYHEFMSVFEDKISNPMIEKLCIVLLDIDDFKNVNEMYDRDFGDNIIKTLAQSVQSILPDNAELYKLDGDEMGILVDNVEENEILTLYNQIQNMIIHLQLWRKYGLNITISAGCVIYPKHGDTVKELYKCASYSLQYAKEHGKNRLVFFSQEILKNKMYSLEMMRDLKASINDDFRGFSLRFQPQVDTESHKIIGVEVLLRWTNDKCKAISPLEFIPILEENDMINIVGAWVLRMALRTFRKWIDYYPFFKVSVNVSAVQILEDTFIEDIVKIIDDENFPYQNLVLELTESHTVQNMSILQFKFKALQDLGIYIAMDDFGTGYSSLEVLKFSPIDIVKIDRVFVKDILKSKFDATFIHFIVAICHDVGIKVCLEGVETQEEYDLVKQIKPDYIQGYLFGKPQTATEIFDLLKLDN >CP020424.2|ARC13975.1|553169_554093_+|DUF2520-domain-containing-protein MGSGKVGTSLANYFLSKGYCVSGFYGRNQLSLLESTNLTKTKIYSNLKDIIYENDILFITTSDDSIEIIDKKLSKFNLKHKYICHTSGSLKSSILFCSKKAGALIYSIHPIFAFSNKNTNIKKMKDICFSIESDNEQDDLVIQNFIDDLGNQFFIRDKDTSATYHLANVLVSNLVLSLLDIGVSYFIKLGLSEEESLKAISPLVKKNIENILDNGFTKALTGPVSRGDITPIRKHLSVLDKKDEDIYKILSLNILKIIALGNDNSLKGIKNITIENAIENLISKSEKYKEIYKLLGGKNDEKYHTDF >CP020424.2|ARC13976.1|554067_554895_+|3-methyl-2-oxobutanoate-hydroxymethyltransferase MKNTIQTFKNAKYEGKKLSMLTAYDYSIAKIMDECDINGILIGDSLGMVIKGEENTLSVTIDEIIYHTKAVKNGVKNALIVSDMPFLSYHVSIEDAVKNAGRLIKEGGAHAVKLEGGSNVIKQIESIVNAQIPVMGHLGLTPQSVNSFGGFKVQGNTSETARQLIEDAKLIEKAGAFSIVLEGVPTKIAEMVTNSISIPTIGIGAGINCDGQILVYQDMLGMFGDFVPKFVKQYANIGDIMKDSIKNYILEVNTGAFPQEKHSFSINESELEKLY >CP020424.2|ARC13977.1|554913_555762_+|pantoate--beta-alanine-ligase MLVKEIKLLRNIIKDWRKHGYSIGLVTTMGFLHEGHQSLIKKAIKENDKVVVSVFVNPTQFGPNEDFNSYPRDIDKDFKYCMDSGATVVFNPSPEEMYLKGNCTTINVSGLTDFLCGAKRPVHFGGVCLVVSKFLNIVTPDKAYFGEKDAQQLAVIKRMVKDLNIDTEIIGCPIIRENDGLAKSSRNTYLSEEERKSALILNKSLSLAKEELVKGNLNPENIKELITAKINSEHLAKIDYVEIVDSETLQPVKQIEHSILVAIAVFIGKTRLIDNFTFELNI >CP020424.2|ARC13978.1|556208_556355_+|hypothetical-protein MTAYIASLKEYYSFIETQIGDFIKKYGEDVVELCLHRVMILLCECGLA >CP020424.2|ARC13979.1|557186_558101_+|DUF2935-domain-containing-protein MIDNQKYVILSLELHLFFSRIMKEHALFLEAGFTNKNYNLAMEADHYKKQFEDLLSYTVSASNGIIRPDILYSEELVTTLTSVAEQKTEEFTGIEINKNITTRELNLQSGVNPQVGQDLVNYVAQLNSDAIRLLDGLINFKERVLDGVLSCTIFTSNYPLLLEHIIHEANLYRSYVVDLENKIDIESKNAKEIELFWDHIMMEHALFMRGLLDPSEGELINTSNDFAIKFNELIEKTNEMTDSNIKNITEETLNETVEFKDFKEAGASGIEQCKIKSIILPLLADHVLREANHYIRILESYKNM >CP020424.2|ARC13980.1|558490_559138_+|lactate-utilization-protein MIRQTPLEKRYDKLGPHIVTALKKRYFDAYYCKTRNEALQQILDLIPQNHVVSWGGSETLKEMGVQTAVREKGFKVIDRDLAKTPEERTEIMRQALLCDTFLMSSNAISEDGQLFNIDGNGNRVAAMIFGPKNVIVVAGMNKIVKNIDDAIQRTRTIASPAVVQRFQDVNTPCYINGSCIDCTSPESICAYMVTTRISRPAKKIKVILVGENLGL >CP020424.2|ARC13981.1|559304_559874_-|lipoprotein MKKFIICIIMFAISVLVLAGCTNDNKIKNEVDSMFNSIKTQDADTVDKYFPKSGLGNLIYEDKEGFKMYSKNMTWEISDIKNNKDKVTVDLKINNTDMVSILKKNPPKLGEMMPNPTMKDIDSAKKKEFNITLELVKSGDNYVCKVNQESAMKLLNVITGGGIDYLADYNKDYYKQLDEEQKNYENKNS >CP020424.2|ARC13982.1|559878_560778_-|4Fe-4S-binding-protein MKLLSKVNNNIRLITQVAFTALTNGYVNGFLEGTIYGGESKKLCVPGLNCYSCPGALGACPIGSLQAVLSSREYKFSFYVVGFLMAFGAFFGRFVCGWLCPFGLVQDLLHKVPFPVKIKKVYGDKYLKYLKYIVLIMFVIILPVAIVNVAGGGNPWFCKWICPSGTLLGGIPLILGNENLRESIGFLFSWKLSILLLILLMSIITYRPFCKYICPLGAIYGFFNPISIYRFKIDKDKCTNCTACQTKCKLDIPIYKDVNSPDCIRCGECIKVCPQNAITTTFSKDKKENNICAKKYRGI >CP020424.2|ARC13983.1|560788_560938_-|hypothetical-protein MSNFIKDNKKGISIIAISIIFIALGTYRGETNTVLTKAIMICLECIGIG |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP020424_3 | 660027-660976 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP020424_3
|
14 spacers
spacers of CP020424_3
>3.1|660056|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT TCCTTGATTGTACTCTCTAACTTTTCAACATTATACT >3.2|660122|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATAAAAGTGTTGCAATTACTGGGTTTTATAAAGTTA >3.3|660188|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTAGCACCTTATTTATCTATAGAGCTACAGAAAGT >3.4|660253|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGCATCAAATACATTTATCATTCTGTCTATAATTTT >3.5|660319|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATACCTCCTTTTATAAAAAAATGTCGTGAAAAAGT >3.6|660385|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGTATTTATTTGTTCTTGTACTATTGTTTTACTCT >3.7|660450|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTCCAAAACTTGATTCTAAATTTAGAAAAGGACTAT >3.8|660516|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTAGAAAGCTCGTTTGTGGATGAAGTTCTAAAATC >3.9|660581|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGAACTTTTAAAAGATTCAAGGAAAAAAGATTGGTTT >3.10|660647|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTAAGGATAAGCCTAGAGAGAATAGCCCTTCTCTCT >3.11|660714|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTATTTTTTTATCGTTTTGAAACCTGTTTCTTCTGC >3.12|660780|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATCTTTTGATTATTCTGATAAAAAGTAATAATACAA >3.13|660846|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTCCCGAAGTTGTTAATGTTGTTGCGACTCTTGCTG >3.14|660912|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCAATACTTTGATGCAGTTTTTAACTAGATTTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020424_3
The CRISPR arrays of CP020424_3 >merge|CP020424|3|660027-660976|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTCTATACATTTTAGTTAATGTAAAATTCCTTGATTGTACTCTCTAACTTTTCAACATTATACTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATAAAAGTGTTGCAATTACTGGGTTTTATAAAGTTAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTAGCACCTTATTTATCTATAGAGCTACAGAAAGTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGCATCAAATACATTTATCATTCTGTCTATAATTTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAATACCTCCTTTTATAAAAAAATGTCGTGAAAAAGTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATGTATTTATTTGTTCTTGTACTATTGTTTTACTCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACACTCCAAAACTTGATTCTAAATTTAGAAAAGGACTATATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTGTAGAAAGCTCGTTTGTGGATGAAGTTCTAAAATCATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGGAACTTTTAAAAGATTCAAGGAAAAAAGATTGGTTTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTGTAAGGATAAGCCTAGAGAGAATAGCCCTTCTCTCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATTATTTTTTTATCGTTTTGAAACCTGTTTCTTCTGCATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATCTTTTGATTATTCTGATAAAAAGTAATAATACAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGCTCCCGAAGTTGTTAATGTTGTTGCGACTCTTGCTGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATCAATACTTTGATGCAGTTTTTAACTAGATTTTCAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP020424|3|3|660027-660976|CRISPRCasFinder TATTCTATACATTTTAGTTAATGTAAAAT TCCTTGATTGTACTCTCTAACTTTTCAACATTATACT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TATAAAAGTGTTGCAATTACTGGGTTTTATAAAGTTA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTAGCACCTTATTTATCTATAGAGCTACAGAAAGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAGCATCAAATACATTTATCATTCTGTCTATAATTTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TAATACCTCCTTTTATAAAAAAATGTCGTGAAAAAGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATGTATTTATTTGTTCTTGTACTATTGTTTTACTCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ACTCCAAAACTTGATTCTAAATTTAGAAAAGGACTAT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TGTAGAAAGCTCGTTTGTGGATGAAGTTCTAAAATC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GGAACTTTTAAAAGATTCAAGGAAAAAAGATTGGTTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTGTAAGGATAAGCCTAGAGAGAATAGCCCTTCTCTCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATTATTTTTTTATCGTTTTGAAACCTGTTTCTTCTGC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TATCTTTTGATTATTCTGATAAAAAGTAATAATACAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GCTCCCGAAGTTGTTAATGTTGTTGCGACTCTTGCTG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATCAATACTTTGATGCAGTTTTTAACTAGATTTTCA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP020424|3|3|660027-660976|CRT TATTCTATACATTTTAGTTAATGTAAAAT TCCTTGATTGTACTCTCTAACTTTTCAACATTATACT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TATAAAAGTGTTGCAATTACTGGGTTTTATAAAGTTA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTAGCACCTTATTTATCTATAGAGCTACAGAAAGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAGCATCAAATACATTTATCATTCTGTCTATAATTTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TAATACCTCCTTTTATAAAAAAATGTCGTGAAAAAGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATGTATTTATTTGTTCTTGTACTATTGTTTTACTCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ACTCCAAAACTTGATTCTAAATTTAGAAAAGGACTAT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TGTAGAAAGCTCGTTTGTGGATGAAGTTCTAAAATC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GGAACTTTTAAAAGATTCAAGGAAAAAAGATTGGTTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTGTAAGGATAAGCCTAGAGAGAATAGCCCTTCTCTCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATTATTTTTTTATCGTTTTGAAACCTGTTTCTTCTGC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TATCTTTTGATTATTCTGATAAAAAGTAATAATACAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GCTCCCGAAGTTGTTAATGTTGTTGCGACTCTTGCTG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATCAATACTTTGATGCAGTTTTTAACTAGATTTTCA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP020424|3|3|660093-660976|PILER-CR ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TATAAAAGTGTTGCAATTACTGGGTTTTATAAAGTTA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTAGCACCTTATTTATCTATAGAGCTACAGAAAGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAGCATCAAATACATTTATCATTCTGTCTATAATTTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TAATACCTCCTTTTATAAAAAAATGTCGTGAAAAAGT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATGTATTTATTTGTTCTTGTACTATTGTTTTACTCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ACTCCAAAACTTGATTCTAAATTTAGAAAAGGACTAT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TGTAGAAAGCTCGTTTGTGGATGAAGTTCTAAAATC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GGAACTTTTAAAAGATTCAAGGAAAAAAGATTGGTTT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTGTAAGGATAAGCCTAGAGAGAATAGCCCTTCTCTCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATTATTTTTTTATCGTTTTGAAACCTGTTTCTTCTGC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TATCTTTTGATTATTCTGATAAAAAGTAATAATACAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GCTCCCGAAGTTGTTAATGTTGTTGCGACTCTTGCTG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATCAATACTTTGATGCAGTTTTTAACTAGATTTTCA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
>CP020424.2|ARC14058.1|657967_659701_+|diguanylate-cyclase MSILLKKAPKLAKHIITSFYINRDIDEVLKYLCENVTWIGPGEQEFLTSFNEIKNYFYAGQDEIPSCDINNDIFETVSEDENRCMVLGRYTVRTKENAQMILEVNQRCTFEIIEDRGKLLIKHMHISNPYGEMQLDEYFPTKIGTQSYDYLQRLLKEKTEVIEMITNNINGGLKGSNDDSTYSFFYVNEGLPKILGYTYDEFMEMSGGSAVGAVYPPDLPKALEDCERCFAKGPTYSSEYRIRKKDGTLMWVLDSGMKSLNSDGIVKINSIITDITQLKNIESELKLERERYRIALQNITDIMFEYDIENDTLIKYQRVEIDKKIELENFETKNYSKLLESGKIIHLDDIGKLLEVLHGNLRETIEIRQVNSLTKNEWRWIRVQCSVIYDSDHNPIKTIGVLKDITEDKSKLESLINQAQRDPLTQLYNQRVSQNLIEEYLCSSDSKNNDALLVIDIDDFKTVNDTFGHLEGNEVLVAVSKILLHNTHDKDIVARIGGDEFTIFIKSLTKDLIIKITNDILNDASKIKVKDNHKITLSIGIAFTDDSTKLYKDLFSKADKALYLSKADGKNCYSTYE >CP020424.2|ARC14057.1|656882_657728_+|GGDEF-domain-containing-protein MFKEIFLRTFPGFLIIRDSNYRIIFINDNLKNLIKSYMQDNPLGMTNIEIAKKLPDNIAKFFTDSHNIQLDWEKNYPYDKISNWILEFKKDTTSYWNVLEYKVDVDEKTYIITMANDITKLYEENKRNLHYSITDPLTGAYNRKYLNDRFDIFIGDYIVLIDLDNFKMINDYEGHNVGDKILCDFVSLLNKELINSTSIIRLGGDEFIVIFSSDVDKNYVYSQLEALRENFLKVFSKYKYLSFSYGVDTVKRNLKLTIVELDKKMYKNKEKNKKKFDKNDY >CP020424.2|ARC14056.1|654617_656852_+|PAS-domain-S-box-protein MQNHNYIKMLNKKVEVLSKELDSRNFKLKTLNEIDFFSKIPNREFMYQHIDDCISKNIHIGIMLLNIDNFKLFNDIYGYLVGENLLITLTQNLLHFIPESKGIVAYLKGEGFLIVLPNVSNKELNNMGATIIESARELKIKLPNEKEIYSNVTFSIGSTIWNGEPNMTTLMLFNQVYSALKKAKSEGKNRYILFDFKDNSFYNKLENDKEFLSEISHVLQTKQIEVFYQPLYNIKNNTIVGCEALARWRHPIKGLLTPDKFIPLFEQFGLITELDLHLFEENCKNIRRWIDNNDVFVPICCNFSRLHFFNPNFPSMLKGITEKYSVSTSNFSIEITENILIENTNTIIQQLAELRSYGFSVSMDDFGSGYSSFGMLQNLPFDIIKIDRIFLSHNLNDFKNTTILYSIINIARALGMLTVCEGVETEQHVEFIKSINCDIAQGYYYAKPMECKEFEKLLSKENNSKKMFIKYSDIGKSLIEKIFDGFFIMQDMKKLRANVTEDIQWFDFYNKTEITSFPKVIEHFEKHIKGKKFSILYKSITPHNTESDSLLISGEAVLSDEASEHQKYSNFYFSANCIISENKLLLAKLHLDLIKTAGYINEFESYSIPKMTNTHLDESNILSQFYSMLPVGIIRYDLFGDMIITYMNEEMFDIIGYTKEQFFGEMGGNLRAIVHPDDLDFVYKKSLDMIDTNKIEPFLYRFIKRDGQIVTVMYTQCNLSAIDGRSIAQGMYVDVNKIKNLTKI >CP020424.2|ARC14055.1|653024_653834_-|MerR-family-transcriptional-regulator MKDYYKIGEISKIYGIGRDSLMYYEEIGILRPVRDINGYRMYNISDIWKLNLIKEFRSLNFPMKKIKEYLDDRSIESTKNILNEELDLIDKKIAEFISHKENIIKRLSSIESVIQNTKIDEIEVVYIEKRKALELNADIKRDEDFDFLIQKLQKEYEDRFNILGNNNIGSAFSTEAINKGIFNEFKSVFCFLESNEKVYNIVFDEGYYVTLNYTGSNSNNKMYMEKVFKFIEENNYKIIADPIEIYKIDIHETGIVEEFVTEIQVPITK >CP020424.2|ARC14054.1|652640_652880_-|hypothetical-protein MKCSNCGSVNIEKGILTTGGIYAETIGLKYRGDGKLDKVINKTFPVQSTIYSDLCLDCGEIVRTYIKDNTDRNWCKDKK >CP020424.2|ARC14053.1|652277_652454_+|hypothetical-protein MFRDEMDKCTHMLTAYISSLYDYCDFIDTQLDDFILEYGENVVESCLHQVMVLVSKYN >CP020424.2|ARC14052.1|651098_651773_+|MgtC/SapB-family-protein MNHHILIQFEYIARIITAGFCGALIGYERKNRLKEAGIRTHFIVALASALIIIVSKYGFNDIVGTPGIGLDPARVAAQVVSGIGFLGAGLIFIRNQSVSGLTTAAGIWATAGTGLAIGSGLYLVGIVSSIIIVIVQITLHRDRKWMKLPTAEQVSLKISNSTDSIEYIEGKFKKSNIEIINMNIKRLDGDWLEVVIYTKLPKGYKKTNLLKLFSDNPLIETLEI >CP020424.2|ARC14051.1|650324_650879_+|cysteine-hydrolase MSIALILIDIQNDYFKNGKCELFQSEETAENAKKILLFFRKNNLPVIHIQHISTDKTASFFLPNTHGSEINKIVFPLDNEEIIIKHTPDSFFETDLQSILEKKNITNLVICGMMSHMCIDTSVRTAKKLRYDITLISDACTTKNLSWNNIEINANTVHQVFMASLQNSFADVKNTDKFLSNYHK >CP020424.2|ARC14050.1|649881_650247_+|transcriptional-regulator MKIRAEYTCPLEIVHDIIKGKWKTILIFELRQSNKTFSELQHNIYGINQKMLIQQLKELRDFGIIDKISSAGYPLHVEYFLTNRGKKMLKAVEIMQEIGIEYMLEHGQQEILDNKGICYNK >CP020424.2|ARC14049.1|649516_649651_-|hypothetical-protein MNISRKAMKIIELAQKIANKRGISVEEAWSEAVTEYKNKYEHIA >CP020424.2|ARC16767.1|661505_661610_-|hypothetical-protein MDDYIYYYNNFRYQNRLNSMSPFEFRKYLSTERA >CP020424.2|ARC14059.1|662234_662480_+|hypothetical-protein MNQKKIKISIKMVIIGIFAVIISFVLSRLFVEYIDELLRSNWQYQLFESESSYIIFANCIMFSNILLEIFLIYICRKFRKI >CP020424.2|ARC14060.1|664664_666020_+|MATE-family-efflux-transporter MDTKISINENMSLGKRFFKYLAPSVVAMWVFSLYTMVDGIFVSKGVGELALAAVNISMPFINFIFAVSLLFSTGASTIIAIYLGKKDIKSANEVFSFNLVSIIILSIIILAITFFNLDRLALFLGATESTIGMVKDYLGIIIFFNGFFIVSYSLEVIIKTDGFPILATVGVIISALTNIILDYLFVIEFGWGVKGAGIATGLSQVFSTIFFLIHFLRKNSTLNFSKFRIDFKTLRKIVFIGFPDSTTELSCGIVVLLFNLSLTKYIGENALIYYSVINYINTLVLMTMMGITQGMQPLTSFYYGAGNIDNVKKLLKMGIKATIIASVAVFVICMAFSGPIVSLFIHPEETMLFNEGVRVFKIFSISFLLVGINVIISGFFVSVEKPSISTVISLGRGLVIVVLSLISMILIFGGQGIWMTTIVSEFICLILSLAFLKKNFSTLDSNLNKVA >CP020424.2|ARC14061.1|666137_666806_-|ATP-binding-protein MKEVLKLADEKFVMSFSGGKDSILALNRMLKKGYKPVALLTTISEEHGKSWTHNLEYNMLKQVSSNIGLPLLVAECGVEGYEESFERALIKAKNMGATICAYGDIDIESHRKWDTDRCEAVGMKVDLPLWQESREDLVYEFIDSGFCSVVTKVNLKHLGEEFLGKKLTRELVENIKNAGADPCGEHGEYHTFVVDGPIFKKPVEYEVKGTLIKDGYGYLEIK >CP020424.2|ARC14062.1|666872_667301_-|hypothetical-protein MTKLWAIIFALLAGGSTALEAFINGELGKSTTALVATFISLTVGAIFFLASIIVTGDLKCLVSINGFNYKLLLGGVFGGLIIYFTVKAIPNLGVSNTLILTLVSQVLVGFFIDSVILGQETMHLYKYIGVILLILGTFFIVN >CP020424.2|ARC14063.1|667452_668001_+|hypothetical-protein MYTNFNIDFNNFNKKENAIKFMLMGVLLIILGLLCLTFKTLGIKLISWTFGIALLFFAYLNLKNINELKRYATKEEIKPSINIQWVLIIACILLFVFPQKIQSIFSLFLGFYLIFNQLVALVNSKNNPYSKFTTWNIVKILFGICLILSPLFLSRFIVSIMSFFIILFGLVLFFSGNTARKY >CP020424.2|ARC16768.1|668119_669055_+|TIGR01212-family-radical-SAM-protein MDKFKYAFDNKRYHTWNYYLRNTFGEKVFKVSINAGFTCPNIDGSLGYGGCTYCSKEGSGDFAGNPKDNLISQFYNIKEMMLKKWPHAKYIGYFQAYTNTYAPLEVLKEKYETILELEDVIGLSISTRPDCLPDDVVEYLSELNKRTNLWVELGLQTIHDSTSKIINRGHDYKTFVEGVEKLKSKNIKVVVHIINGLPGEDYNMMVETAKAVGKMGVDGIKIHLLHVIKDTPMEKMLQNGMLTLMEQDEYINLVCDQLEILPETMIIHRLTGDGKRDELVGPIWSLKKWEILNQIDDTLKARNSYQGCKFV >CP020424.2|ARC14064.1|669325_670270_-|EamA-family-transporter MGEKSKGYVFIAIAGLLWATLGLFGKFLMGNGLTSEQVAFTRLFFGFIVLGVYSSIRTPQILKISKKGIIYSVIIGIICQAMFNLCYFKAIDIAGVSIAAVLLYTSPLFLAIFSKICYKENITRSKLFSLILCFIGAIMAVTGGRLDFQGLNAFGLLLGVLSAIAYALMPTISKNALKEFSSSTILVYSFLFGAIFMIPSSRPWEILNYAKDLDVLSCMLMLGIVPAALAYIFYAAGISKGVELSVAGVVASVELVGSVIIGCTILGESFSLGKLFGVMLMLISAVVALNLSYDEIRIFYKSNKLKQIEKTESI >CP020424.2|ARC14065.1|670587_672018_+|PAS-domain-S-box-protein MNLDLEFYQKILEASHDEICVSDDKGIIIYCNKAFEENYGLKKEDILGKNVSFLEDSGYSTKSPIPIVLKTKTKFSLEQDTQTGKKLIITATPIFDENGNLEFTVENCRDITELNNIKNKLEDTKKQVKKYKSEVETLYRTALRIEDTVIMDGIVMRPIINTVNHVSKTDVSVLLLGESGTGKSSLARYIHHNSNRSNGPFITINCATISPQLLESELFGYTSGAFTGASTKGKVGLVELANGGTLFLDEIGDIPQNLQAKFLQLIQDRTFTPVGSLKNKKVDIRIISATNVDLVSKVKEKKFREDLYYRLNVIEIKLPPLRERRDNLVEIIKYYFNRYSSDFNLNKTISKEAMDAIANYRFPGNIRELQNIIQKILLTCTDNHITIDDLPNILTKNIHITNNGNKTHISQINKVIISDSKSTNYKNKNFDTLIKEYEKNIILDAYEKFGSSYKVAKHLEISQSKANRLIRKYTNT >CP020424.2|ARC14066.1|672217_672802_+|hypothetical-protein MLMNTHFIMAKSILDNIDENKTFFISEKNFIYGNIKPDAFSKYKLKKHYLDESFNMIVSKINYLCSLNIDSLSKYFSVSRLSQELGVICHFLCDFFCVAHSERWEFKHSLNKHVTYERELGAFAKDVDLSKIKCGTINSSFEKFFTKLYSDYKKKTDYMNDLKFSAYTCNSVINYILDSILSNTIKSYHIANCG |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP020424_4 | 1897714-1898137 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP020424_4
|
6 spacers
spacers of CP020424_4
>4.1|1897743|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT AATTATCCATACCTTTAAAAATTATCTTGCTTCCATT >4.2|1897809|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT ATTCAAGAAGTAACTGTAATTGTTCATCTGTAAAATA >4.3|1897875|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT GATAGACAAAGCTAGTGCAGACGCTAAAGTACAATC >4.4|1897940|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTCATAACTGATGTTAAAGACTCATTATATGTACT >4.5|1898006|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGAAAGATTAAAAAATAGAATGATACTTCTTACAAC >4.6|1898071|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAATAACAATAAGAATAACAACAACAATAAAAAGGTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020424_4
The CRISPR arrays of CP020424_4 >merge|CP020424|4|1897714-1898137|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTGAATCCACATAGTTAATATAAAACAATTATCCATACCTTTAAAAATTATCTTGCTTCCATTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATTCAAGAAGTAACTGTAATTGTTCATCTGTAAAATAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGATAGACAAAGCTAGTGCAGACGCTAAAGTACAATCATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCTTTCATAACTGATGTTAAAGACTCATTATATGTACTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAGAAAGATTAAAAAATAGAATGATACTTCTTACAACATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGAATAACAATAAGAATAACAACAACAATAAAAAGGTTAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP020424|4|4|1897714-1898137|CRISPRCasFinder ATTTTGAATCCACATAGTTAATATAAAAC AATTATCCATACCTTTAAAAATTATCTTGCTTCCATT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATTCAAGAAGTAACTGTAATTGTTCATCTGTAAAATA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GATAGACAAAGCTAGTGCAGACGCTAAAGTACAATC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CTTTCATAACTGATGTTAAAGACTCATTATATGTACT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AGAAAGATTAAAAAATAGAATGATACTTCTTACAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GAATAACAATAAGAATAACAACAACAATAAAAAGGTTA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP020424|4|4|1897714-1898137|CRT ATTTTGAATCCACATAGTTAATATAAAAC AATTATCCATACCTTTAAAAATTATCTTGCTTCCATT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ATTCAAGAAGTAACTGTAATTGTTCATCTGTAAAATA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GATAGACAAAGCTAGTGCAGACGCTAAAGTACAATC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CTTTCATAACTGATGTTAAAGACTCATTATATGTACT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AGAAAGATTAAAAAATAGAATGATACTTCTTACAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GAATAACAATAAGAATAACAACAACAATAAAAAGGTTA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP020424|4|4|1897911-1898137|PILER-CR ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CTTTCATAACTGATGTTAAAGACTCATTATATGTACT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AGAAAGATTAAAAAATAGAATGATACTTCTTACAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GAATAACAATAAGAATAACAACAACAATAAAAAGGTTA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC
>CP020424.2|ARC15054.1|1897376_1897550_-|CopG-family-transcriptional-regulator MSSKMGRPKVDNPKNIDVKVRFDENTHKKLLDYCEKENLTRTEAIRKGVDLLLEEDK >CP020424.2|ARC16801.1|1896425_1896821_-|hypothetical-protein MLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEIEEEESFFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQLAVCEIIKKIDLEENEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRNWIEENNRPTKIAGEKKNYHVVYKIE >CP020424.2|ARC15053.1|1895304_1896075_-|DUF4428-domain-containing-protein MGLFGSKDNCCICGEKGKQKIADGWLCKECFKKYAVATFTPGNTLYRGLPTKLEVEKAIESKDDKEKELKNFNPTKKILKFMEFDDNNKKFIVLNGFNREKVNLSVYNYSDVIEYELLENGETVTKGGIGRALAGGALFGGVGAVVGGVTAKRTTKAFIDSLKIKITLNNLSNPNVYVNLIQLRTKSNSSIYKMAYSSAQEILSVLAIIVKDNEAVNIQNNSNDAIQQVKGLKELLDLGAITEEEFNTKKKELLNL >CP020424.2|ARC15052.1|1892868_1895238_-|hypothetical-protein MATIQTSIRIFDGMTPAFRHMTNAMNIVLSSFEQLQRTSSNAIDVNSIRTAREELARAEAGFDRLEQQIREADGQQRRLNEDINKGTSSTDRLVGSAKKLAATYLGIRTLGGLGNLSDQMTSTNARLSMINDGQQSDSGLNKMIFQSAERSRASYLDTAKIVSRIGMNAGKAFSSTKEIVGFAEQLNKKFVIAGASTEEMNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIKSIADYLDVDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLAASAETNKQFEQMPYTLGQIFTSVKNNAVMIFGAIQKKIEDTVSSGGFRTFIVNVTDSLYVLGAVGYSVFNGFIDLLSSPVFQNFFNVMIVGTSLITQGLGWIITQALSVANVFAQNWSIIAPIIYGVTIAIGIYTIAAIALAVANKVASLSAGWFNFQMTQTVIMHELATGATWMQVAAQYGLNAALYACPLTWIVLGFIAVIAVIFMVIAAINHFAGTSLTVLGIIVGAVFAAVAAIQNVMIGLLNGCITVNEAIANGWNQCVYFMKQAIAKGVIFIIEKMASLNDSVNSAGNALGKAFIDGVNIAIRGVNKLIDLINKIPGINIGKVGEATFTPVKADNSYIKQQIDSLNRWVGDAPEKVKLERMGYKDIGAAFQKGNALGTKWQNAITDKFKDTFDISKIAEKAKKDLGLDDLWDKKYGLGDGLGSAGLNSPLSDAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDADVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >CP020424.2|ARC15051.1|1892163_1892853_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MAYDFYLDGVQLPIPPPKLEIKVTNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFYRGTFRDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSRELGNKVLFNTNIKVSLEEYAISEDADNGSDTKVAIKLKQYRDYSTKKLVIAPPKNETGRPNVKIEPKRVDSVNATNTKTYTVKAGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKSMMDKANKGKNLSKYTIYKGQVLKLG >CP020424.2|ARC15050.1|1890200_1892171_-|cell-wall-hydrolase MVDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPVVLDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILEFCEGNSVRLYYKGVGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYNNQTASELVKMLAKDFNLKYNVIEDTKYKISRVEENKTLFDMVLTALDDTLREKKEMYVLYDDFGRLTLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEETGKRDVYIAQDSTHMRSWGILQMFDTVDKNMSEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNVLGDIRVRAGCLVPVFLSLGDIDLQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNTNNKNEKQNGPAQSTTSKEDTDMANKINKLLKGKLSNTGNIFVKYSNAYKVNPALMAAISMHESARGTSNIANTKNNFFGMKKNGDYMSFSSVDEGIKRGISNLSRNYIHIGRKTLESIRNKYSSSSDKEWVKCVGAFYKQITGSTYNSNSAGTGVGSNEEAEKNLKDLTYQVQNNNSNTSTNNNNKVSKVIQEAKNQLGKPYKWGGNGPKSFDCSGLMVWAFKRGAGINLKRVSADQSKDSRGKLLCNINDVKAGDLVFFAYNKGKGNVHHVGLYIGNDQYIHAPQTGDVVKISSLSGRQKKKHDFARARRFF >CP020424.2|ARC15049.1|1889926_1890187_-|DUF2577-domain-containing-protein MSQELLQIIKKAAMDAVETSNPMQIAFGTIESVNPLIVKIEQKASFEEFFLIQTETFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP020424.2|ARC15048.1|1889502_1889922_-|DUF2634-domain-containing-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKSKIDGICDDVEALKQTIFLILNTERYEHLIYSWNYGVELNDLIGEPISFVIPELERRIKEALIQDDRVENVDNFEFQNVKGKVHCKFTVHSKYGNIKAEKVVSV >CP020424.2|ARC15047.1|1888452_1889502_-|phage-tail-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAIELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLSATNTIAKGVFNIDIPLDSRFNLGEYNYIAIERISEKTYKMKCETAGPIFELGKLIPIEYIDGLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNMQNYKDEVNKIQDVGGVKVYPVWDGGGTVKLVIINSNFKVPSEDLVNLVQEEIDPIGHQGQGLGLAPIGHKVTVTGVVSTTINISAEITYKNGYTWENIKSIAEEAIDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDIANTMINEVKSNLTINSNSIVVRGEVVG >CP020424.2|ARC15046.1|1887842_1888460_-|DUF2313-domain-containing-protein MDKEINLINYLPQILQDKEEYIKVFNVGNKEIKILHDKLKDLSNDQFLEDLTISGIKRWEKIMSITPKSNESLEDRRFRIFSKYISKLPYSERFLRNWLDSIVGEGNYELTINNATYNIHLESDARNQDWFEEVHSFVSNIKPCNMTLDYTRVLISKDNYMNFGITTLMGQEITIYPWSPPDIETYGEIDVLTGNGVGYQEITIF >CP020424.2|ARC15055.1|1898874_1899036_-|hypothetical-protein MNNFLLNVIAGVIASLIFCLICKVFLKVKSHSTRGKSKSGWEFDFKIKFHKFK >CP020424.2|ARC15056.1|1899182_1899377_-|hypothetical-protein MRGGDFDASITHYCIQKLKWKPSEYMNLEVNERALAAASILIKIEDEEEAMKEAERERKRGRRR >CP020424.2|ARC15057.1|1899376_1899817_-|phage-portal-protein MSNLSAFLSQNAIKNENVMYVASDRFLDEGGKPVEWELRVLSSEEDEVLRRNCTKRVKVIGNNGKPTGQFTNEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTTFEDKVEEAKN >CP020424.2|ARC15058.1|1899885_1900362_-|hypothetical-protein MAKNITMKSKDAISASLAECYVTIEGKRYLLMQCIKVEAKFKKNKSKIPILGQTGKGNKTTGWEGTGSATVHYNTSIFRKLMLRYKETGEDIYFDMQITNEDPTSSVGRQTIILKDCNMDEVTLAKFDADSEYLDEDIDFTFDDWDMPEEFKILLGMI >CP020424.2|ARC15059.1|1900382_1901693_-|phage-tail-protein MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFVSATRATSSLSDRGIVAMPLELDWGIDEEIFTVTSDDFEKYSTKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCSIATAKYSGTRGNDLKVIVTTNIDDNTKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDTTLEASAGLVFTGGTNGESVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGSLATTAEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKNDADYEGVVSVENKVKDTGLLESSLVYWTTGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVDVNYTQIQLEEALKSGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVS >CP020424.2|ARC15060.1|1901693_1901870_-|hypothetical-protein MNKTLSKEDDYKFTKEQIVNSKKYVNRKDLLNAILKENELYSFSEVEEIINNFMKGVS >CP020424.2|ARC15061.1|1901862_1902300_-|hypothetical-protein MLNNIIDGISIKLDKSFGNEYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKVSYPSGRTLKKNSFDVHYFPRSKDKSFEINEVAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIIDNVLHFFVDYNYFTIKSNDTEKMNDVELFGGLKRGDNFE >CP020424.2|ARC15062.1|1902292_1902718_-|hypothetical-protein MARWGSVDFREFKRVCKKMEKLTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWNGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTEYASYVNFGHRTKDGKGWVKGQHFLTISEMELQSQVDKIIERKLLILLKGVFDA >CP020424.2|ARC15063.1|1902717_1903080_-|hypothetical-protein MMDKTRKAIEMLYRDKCTIIEYQPVKDPVTKRTNNKEVIVLENQPCKLSYKNINSTEEGKVAKLAQTIKLFISPNISVKAGSKLIITTQNNITREYVRSGESAIYPNHQEIILELFKDKA >CP020424.2|ARC15064.1|1903079_1903424_-|hypothetical-protein MEVERLKKLLGISKEDYSKEMILEFILEDVEEIVKNYCNVSVIPEGLNSTVLRMAIDMYKNENLGSEDIALGSISSISEGDTSVSYRSSASEFKESLLKDYKSQLNRYRKIRWK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP020424_5 | 2048565-2048644 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP020424_5
|
1 spacers
spacers of CP020424_5
>5.1|2048591|28|CP020424|CRISPRCasFinder GTTGATTCATATTGCTTTAACTTATTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020424_5
The CRISPR arrays of CP020424_5 >merge|CP020424|5|2048565-2048644|CRISPRCasFinder TTATAATATTATCCACATTATAAACAGTTGATTCATATTGCTTTAACTTATTACATTAAATATTATCCACATTATAAACA >CP020424|5|5|2048565-2048644|CRISPRCasFinder TTATAATATTATCCACATTATAAACA GTTGATTCATATTGCTTTAACTTATTAC ATTAAATATTATCCACATTATAAACA
>CP020424.2|ARC15183.1|2035219_2036059_-|TIGR00159-family-protein MLDINSFLNGFFNIILRMSIYDLIDISIVAYIFYKIFMFIKDTRAEQVFKGIIFLLLATQLSNTFKLHTVYWISLKALDYGVIAALIIFQPEFRAGLEHIGRAKFNLFGKNVNTSEETLNRNIEEIVEALYSLSRQKIGALIIMERETRISDIINTGTIIDAEISRQLLINIFIPNTPLHDGAVVIRDSKVKAAACFLPLTESKDLSKDLGTRHRAGIGVSEVSDCITLIVSEETGGVSIAKAGKLYRDISRERMMNILRSNLKTNTETRSFFKGGIFK >CP020424.2|ARC15182.1|2034041_2035223_-|hypothetical-protein MINRLKNNTKIKIISFLSAIALWMYVMAVVDPEETKGFEDIPVSISNMSDLKDKNLVIYPDEKLTADVYIKGSLSKVQSVKKEDIHVYGTIEDPIQGQKEVYLKANIPQGVTLEFKHDVLVVNLEKNIKEKRDIKVEVSGNSKRNINKIELSKEFVDVSGPRTLVKEVKSVRANLDVGNETDDFSKKLQLIPLNSDGTKVEGVTLSSSFVTAKIELLKEKIVPIRVSLNDNKDNDVLKNYKLSKEQVTIKGKKEDIDKISYIKTKPIDLADLANGEEKEVSLEIPEGITLEDSSITIKLNDTKQLSAEFLYNAGDIELRNIPTNMDNPNVISDVDIKVVVESTEDLSKLNKKDISLYIDLSQGPEEDSKYKIKYETTYQFKKINIEPNIVEVE >CP020424.2|ARC15181.1|2033925_2034045_-|hypothetical-protein MNKYFEYLVVTRCDKKTYKIKFVNFMFLLHLVYFSYIIK >CP020424.2|ARC15180.1|2032835_2033738_-|phosphate-butyryltransferase MRSFEEVIKFAKERGPKTISVACCQDKEVLMAVEMARKEKIANAILVGDIEKTKEIAKSIDMDIENYELIDIKDLAEASLKSVELVSQGKADMVMKGLVDTSIILKAVLNKEVGLRTGNVLSHVAVFDVEGYDRLFFVTDAAMNLAPDTNTKKQIIENACTVAHSLDISEPKVAAICAKEKVNPKMKDTVEAKELEEMYERGEIKGCMVGGPFAIDNAVSLEAAKHKGINHPVAGRADILLAPDIEGGNILYKALVFFSKSKNAGVIVGAKAPIILTSRADSEETKLNSIALGVLMAAKA >CP020424.2|ARC15179.1|2031734_2032814_-|butyrate-kinase MSKIFKILTINPGSTSTKIAVFDNEDLVFEKTLRHSSEEIGKYEKVSDQFEFRKQVIEEALKEGGVKTSELDAVVGRGGLLKPIKGGTYSVSAAMIEDLKVGVLGEHASNLGGIIAKQIGEEVNVPSYIVDPVVVDELEDVARISGMPEISRASVVHALNQKAIARRYAREINKKYEDINLIVAHMGGGVSVGAHKNGKIVDVANALDGEGPFSPERSGGLPVGALVKMCFSGKYTQDEIKKKIKGNGGLVAYLNTNDAREVEERIEAGDEKAKLVYEAMAYQISKEIGASAAVLKGDVKAILLTGGIAYSKMFTEMIADRVKFIADVKVYPGEDEMIALAQGGLRVLTGEEEAQVYDN >CP020424.2|ARC15178.1|2031067_2031745_-|ATP-binding-protein MITNDKRIRIITGHYGSGKSEFAMNYVVKLRDMVSGKVAIADLDVVNVYFRTREKKELMKSLGIQPIDSSINAPTLDLPAVSAEVMSPMVDHSYNSVIDLGGDNVGARVIGRFSHLLKEGDYDMLFVINANREKTQTSEEVIQYIKEIEKSSKLKVTGLINNTHLIRFTTIDDVLRGQKVAKEVSEKCNIPIRYVACLENLVEQLPKDLEGEIFPIKLYMREDWM >CP020424.2|ARC15177.1|2030809_2031025_-|2-oxoacid:acceptor-oxidoreductase MAKGKVSFNQERCKGCGLCVEACPVKIIQLDSNVINKKGYNPATVFEMEKCIGCASCATMCPDVVITVERD >CP020424.2|ARC15176.1|2029701_2030781_-|3-methyl-2-oxobutanoate-dehydrogenase-subunit-VorB MAKILMKGNEAFGKAAIEAGCKYFFGYPITPQSELPEYLSRELPKIGGAFVQAESEVSAINMVYGGAGAGARVMTSSSSPGVALKQEGITYAVGAEVPCVVLNVMRGGPGLGSIQPSQADYFMSTRGGGNGDYRTPVFAPATVQEAVDMIMEAFDVADYYRSPVMVVADGMIGQMMEPVEFRAPEKKRELPPKDWATVGTKGKRKPNVINSLYLEPEVLEDHCWHLQEKFDAMEKNEVQYEMYKTEDAEFVFAAYGTTSRVVKSAIDILREEGIKAGLIRPKVLWPFPFEAFNQIPNARNILTVEMSMGQMVEDVKMAVEGKLPVYFHGRPGGMTPTPAEIVEKAKKIIAGELVAGGAR >CP020424.2|ARC15175.1|2028949_2029702_-|2-oxoglutarate-oxidoreductase MAVVFKKTEGLQDTQTHYCPGCTHGIIHRLVGEVLEELGVLGDAVGVVPVGCSVLGYKYFNCDTQEAAHGRAPAAATGIKRVHPENTVFTYQGDGDLASIGTAEIVHAAARGEKITTIFVNNTTYGMTGGQMAPTTLVGQRATTAQSGRNAETQGYPIRVSEMLATLTGAVFVERVAVDTPAHVRQAKKAIKKAFQVQQAGLGFGIVEVLSTCPTNWGLAPNDALQWLRDNMIPYYPLGNFKNVEVEEVK >CP020424.2|ARC15174.1|2028391_2028949_-|2-oxoacid:ferredoxin-oxidoreductase-subunit-gamma MSTARVICAGFGGQGVMSMGQLLTYAGMLEGKEVSWLPSYGPEMRGGTANCAVTVSNEPVGSPLITDDATAAILLNIPAFEKFKDDVIPGGKIIVNSSLIKEKVDRTDVDVYYIPANELAAELGNDKVANMIMLGAYLKVSDTVDIESVLEAFKKVFGPRKEKFVPLNREALQKGMDATCSKATN >CP020424.2|ARC15184.1|2049124_2049664_-|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MKIRMSSTISYDSIVDGPGLRMVIWTQGCIHNCKECHNPQTHDLCGGFYMDTEEIINKVKSLKLQKGITLSGGEPFLQPEPLEEIAREAKINGLDVWSYTGFTFEQLLDKKNRAYFKNLNLLKQIDILVDGKFIAEKKDISLKFRGSSNQRIIDVQKSLKYKKVFLVEQYMKDDLSIAE >CP020424.2|ARC15185.1|2049685_2052037_-|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase MVEFVKKRDGRVIPFNEDRITRAIFLAATNVAEREGIVPDYKLSEQLTQEVIKFLNHKYSESVPSVEDIQDSVVKVLIETGHAKTSEEYIIYRTERSRIRNSKTRLMKAIEEITFEDAEDADIKRENANINGNTAMGTMLQYGSTVSKEFCKTHILKPEHSFAHDNGDIHIHDMDFLNMGTLTCCQIDVKKLFNGGFSTGHGFLREPQDIISYGALAAIAIQSNQNDQHGGQSIPFFDYGLAEGVYKTFKKFYIGNLAKALKLFKGIENNDVIKNIVYNTEKETNQKVGLKRDELYLNLEKEKLIQTFDIDDELVNKMQNFAFEESYRETDKKTYQSMEAFIHNLNTMHSRAGAQVPFSSVNFGTDTSEEGRMVTKNLLLSQERGLGNGETPIFPILIFKVKEGINLNPEDPNYDLFKLSCRVSAKRLFPNFSFLDAPFNAKYYKKGEPDTEATYMGCRTRVLSNVCGSETVSGRGNISFTTVNLPRLGIKHGIINNEKANLDGFFEELDEKINLIIEQLLERLEVQGNKKMKNFPFLMGQGVWKGSDNLGPEDTLKEVIKQGTLTIGFIGLAECLIALIGKHHGESKEAQELGLKIVSHMRHKMDEATDKYKLNFSLMGTPAEGLSGRFTKIDKKVYGEIKGITDKEYYTNSFHVPVYYNISAYDKIEIEAPYHELTNAGHITYVELDGDPSDNLEAFETVIKAMKDLGIGYGSINHPVDRDPICGFSGVITSNICPVCGRNEDESDIKFERIRRITGYLVGTVDRFNNAKKAEVRDRVKHR >CP020424.2|ARC15186.1|2052409_2053594_+|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase MLSKRLNFITPSYTIGISSKVKEMESNGVKVINLSIGEPDFNVPNNAKSYGIDSLNKDYTKYDLVPGLKILREEICKKLIEENNCNYSIDEIVVSSGAKNSITNTLLALTDEGDEVLLPKPYWVSYPEMIKLVNAVPVFIDTKKENGFKLTKEELEKSITDKTKILVINNPSNPTGSVYTKDELIEIVDVCIQNKIYILADEIYEKICYTGEFTSIASLSEEAKDITITINGFSKSAAMTGLRLGYTASNKTIAKAMSSIQGHLISHPSLTAQYIAYGALKDCSIDIDNMVKTYKSRRDLIKSKLDSIDNVGYVNPNGAFYIFIDLSKVSEKFEYKDSFSIEFCNQFLEEYNVAVVPGIAFGMDKYIRISYACSENTFLSGLDKLKEFVYKIMA >CP020424.2|ARC16806.1|2066124_2066829_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-CwlD MRKYIKHIIFSFAMICLVVVSIFEIKNISEDVIKYMPVTNKTIILDAGHGGIDPGALNKDKSTSEKDINLAITLKLRELIESSGGLVILTREDDSSLYKEENNKTTRQKYNENLKNRKEIISNSNANMFVSIHLNAFEQSKYYGAQTFYPKDKQDSKALSKCIQEELKRVVDKTNNREVKPRDDIYLLKENNIPSVLIECGFLSNEKECKLLTDETYQEKIAWAIYIGIQKYLS >CP020424.2|ARC15187.1|2067335_2067728_-|30S-ribosomal-protein-S9 MANVQYYGTGRRKSSVARVRLVAGEGNILVNGRALENYFNYETLIRDVKQPLVLTGNENKYDVIVKVEGGGFTGQAGAIRHGISRALLKADLDLRPALKKEGFLTRDARMKERKKYGLKAARRAPQFSKR >CP020424.2|ARC15188.1|2067756_2068188_-|50S-ribosomal-protein-L13 MKSYIAKPADVQRKWYLVDAEGKTLGRLATEIATVLRGKHKPTFTPHVDGGDFVVVVNAEKIVLSGKKLDQKYYRYHTGYVGGLKEISYRDMMDKKPEEVISHAVSGMLPKNKLRSRMMTRLRVFAGAEHTHAAQNPEVLNFK >CP020424.2|ARC15189.1|2068307_2069039_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRNIKIKIQYNGKNYCGWQKQPDSLGIQGTIERAIYDITKEETSLIGSGRTDSGVHAIGQIANFKINSGISIESIPMALNAKLPKDISVIEACEVNDDFHSRYSAKGKTYKYLVYNSKFRNPILSEISYQVKYELDFDKMCSEAKSLLGTHDFKGFMSSGSSVKDTVRTIYDIDISKKDDLITFEISGNGFLYNMVRIIVGTLVDMGRGRINEPFLDIIQSKTRSRCGHTAPAQGLFLKKVHY >CP020424.2|ARC15190.1|2069070_2069874_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MLKDITIGQYYPTSSAIHKLDPRIKLVATIVFMVSIFVVNKFWPYIVVLLCLLAMIKLANIPVKYIVKGVKPLKWIILFTFLINIFFLPGDEIWSFGFLAITKQGLRQAIFMAIRLIFLVVGTSLLTLTTSPIELTDGIERLLNPFKKIGLPVHELAMMMTIALRFIPTLLDETDKIMKAQMSRGADFESKNLINRAKNLVPLLVPLFVSAFRRADELAMAMEARCYRGGHNRTKMRESVILRRDYMACVFQVVYLGAIIATRFIAI >CP020424.2|ARC15191.1|2069867_2070734_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MSIIVKNLTHIYNEGMPFASKALDDVSFEIKDRDFVGLIGHTGSGKSTLIQHLNGLLKPSSGEIFINDFNITDKNLNLTEIRKRVGVVFQYPEYQLFEETIDKDIAFGPSNLGLEESEIHNRVKASMEAVGLDYEGFKDKSPFELSGGQKRRVAIAGVIAMNPEVLILDEPTAGLDPGGRDEIFNLIKDLHEKKNMTIILSSHSMDDMAKLAKTLIVMNHGSVEFMGTPREVFKSNASKLKDIGLDIPQVLELALKLREKGFDISEDILTLEEAKQEILKVVRGRGLC >CP020424.2|ARC15192.1|2070721_2071555_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MDNIVKVNNISFEYITDEAKLKAIDNLSLDVKKGEFVAIIGHNGSGKSTLSKNLNAILMPTEGNILIDDMDTKEEERLWDIRQTAGMVFQNPDNQIVATIVEEDVAFGPENLGIEPKEIRRIVEESLKSVGMYDLRDRQPHLLSGGQKQRVAIAGIIAMRPKCIIFDEATAMLDPSGRKEVMKTIKRLNKEENITVIHITHFMEEAVEADRVVVMEKGKKILEGTPREVFSKIKMLKEIGLDVPCMTELSSLLIEEGINISSDILTVDEMVMELCQL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP020424_6 | 2064038-2064126 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP020424_6
|
1 spacers
spacers of CP020424_6
>6.1|2064065|35|CP020424|CRISPRCasFinder AGCGCCAACAAACAAACTTCACATGCGTTCAGTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020424_6
The CRISPR arrays of CP020424_6 >merge|CP020424|6|2064038-2064126|CRISPRCasFinder ATTCCGTTACTTAAAGTGCTAACGCACAGCGCCAACAAACAAACTTCACATGCGTTCAGTTTATTCTGTTGCTTAAAGTGCTAACACAC >CP020424|6|6|2064038-2064126|CRISPRCasFinder ATTCCGTTACTTAAAGTGCTAACGCAC AGCGCCAACAAACAAACTTCACATGCGTTCAGTTT ATTCTGTTGCTTAAAGTGCTAACACAC
>CP020424.2|ARC15186.1|2052409_2053594_+|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase MLSKRLNFITPSYTIGISSKVKEMESNGVKVINLSIGEPDFNVPNNAKSYGIDSLNKDYTKYDLVPGLKILREEICKKLIEENNCNYSIDEIVVSSGAKNSITNTLLALTDEGDEVLLPKPYWVSYPEMIKLVNAVPVFIDTKKENGFKLTKEELEKSITDKTKILVINNPSNPTGSVYTKDELIEIVDVCIQNKIYILADEIYEKICYTGEFTSIASLSEEAKDITITINGFSKSAAMTGLRLGYTASNKTIAKAMSSIQGHLISHPSLTAQYIAYGALKDCSIDIDNMVKTYKSRRDLIKSKLDSIDNVGYVNPNGAFYIFIDLSKVSEKFEYKDSFSIEFCNQFLEEYNVAVVPGIAFGMDKYIRISYACSENTFLSGLDKLKEFVYKIMA >CP020424.2|ARC15185.1|2049685_2052037_-|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase MVEFVKKRDGRVIPFNEDRITRAIFLAATNVAEREGIVPDYKLSEQLTQEVIKFLNHKYSESVPSVEDIQDSVVKVLIETGHAKTSEEYIIYRTERSRIRNSKTRLMKAIEEITFEDAEDADIKRENANINGNTAMGTMLQYGSTVSKEFCKTHILKPEHSFAHDNGDIHIHDMDFLNMGTLTCCQIDVKKLFNGGFSTGHGFLREPQDIISYGALAAIAIQSNQNDQHGGQSIPFFDYGLAEGVYKTFKKFYIGNLAKALKLFKGIENNDVIKNIVYNTEKETNQKVGLKRDELYLNLEKEKLIQTFDIDDELVNKMQNFAFEESYRETDKKTYQSMEAFIHNLNTMHSRAGAQVPFSSVNFGTDTSEEGRMVTKNLLLSQERGLGNGETPIFPILIFKVKEGINLNPEDPNYDLFKLSCRVSAKRLFPNFSFLDAPFNAKYYKKGEPDTEATYMGCRTRVLSNVCGSETVSGRGNISFTTVNLPRLGIKHGIINNEKANLDGFFEELDEKINLIIEQLLERLEVQGNKKMKNFPFLMGQGVWKGSDNLGPEDTLKEVIKQGTLTIGFIGLAECLIALIGKHHGESKEAQELGLKIVSHMRHKMDEATDKYKLNFSLMGTPAEGLSGRFTKIDKKVYGEIKGITDKEYYTNSFHVPVYYNISAYDKIEIEAPYHELTNAGHITYVELDGDPSDNLEAFETVIKAMKDLGIGYGSINHPVDRDPICGFSGVITSNICPVCGRNEDESDIKFERIRRITGYLVGTVDRFNNAKKAEVRDRVKHR >CP020424.2|ARC15184.1|2049124_2049664_-|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MKIRMSSTISYDSIVDGPGLRMVIWTQGCIHNCKECHNPQTHDLCGGFYMDTEEIINKVKSLKLQKGITLSGGEPFLQPEPLEEIAREAKINGLDVWSYTGFTFEQLLDKKNRAYFKNLNLLKQIDILVDGKFIAEKKDISLKFRGSSNQRIIDVQKSLKYKKVFLVEQYMKDDLSIAE >CP020424.2|ARC15183.1|2035219_2036059_-|TIGR00159-family-protein MLDINSFLNGFFNIILRMSIYDLIDISIVAYIFYKIFMFIKDTRAEQVFKGIIFLLLATQLSNTFKLHTVYWISLKALDYGVIAALIIFQPEFRAGLEHIGRAKFNLFGKNVNTSEETLNRNIEEIVEALYSLSRQKIGALIIMERETRISDIINTGTIIDAEISRQLLINIFIPNTPLHDGAVVIRDSKVKAAACFLPLTESKDLSKDLGTRHRAGIGVSEVSDCITLIVSEETGGVSIAKAGKLYRDISRERMMNILRSNLKTNTETRSFFKGGIFK >CP020424.2|ARC15182.1|2034041_2035223_-|hypothetical-protein MINRLKNNTKIKIISFLSAIALWMYVMAVVDPEETKGFEDIPVSISNMSDLKDKNLVIYPDEKLTADVYIKGSLSKVQSVKKEDIHVYGTIEDPIQGQKEVYLKANIPQGVTLEFKHDVLVVNLEKNIKEKRDIKVEVSGNSKRNINKIELSKEFVDVSGPRTLVKEVKSVRANLDVGNETDDFSKKLQLIPLNSDGTKVEGVTLSSSFVTAKIELLKEKIVPIRVSLNDNKDNDVLKNYKLSKEQVTIKGKKEDIDKISYIKTKPIDLADLANGEEKEVSLEIPEGITLEDSSITIKLNDTKQLSAEFLYNAGDIELRNIPTNMDNPNVISDVDIKVVVESTEDLSKLNKKDISLYIDLSQGPEEDSKYKIKYETTYQFKKINIEPNIVEVE >CP020424.2|ARC15181.1|2033925_2034045_-|hypothetical-protein MNKYFEYLVVTRCDKKTYKIKFVNFMFLLHLVYFSYIIK >CP020424.2|ARC15180.1|2032835_2033738_-|phosphate-butyryltransferase MRSFEEVIKFAKERGPKTISVACCQDKEVLMAVEMARKEKIANAILVGDIEKTKEIAKSIDMDIENYELIDIKDLAEASLKSVELVSQGKADMVMKGLVDTSIILKAVLNKEVGLRTGNVLSHVAVFDVEGYDRLFFVTDAAMNLAPDTNTKKQIIENACTVAHSLDISEPKVAAICAKEKVNPKMKDTVEAKELEEMYERGEIKGCMVGGPFAIDNAVSLEAAKHKGINHPVAGRADILLAPDIEGGNILYKALVFFSKSKNAGVIVGAKAPIILTSRADSEETKLNSIALGVLMAAKA >CP020424.2|ARC15179.1|2031734_2032814_-|butyrate-kinase MSKIFKILTINPGSTSTKIAVFDNEDLVFEKTLRHSSEEIGKYEKVSDQFEFRKQVIEEALKEGGVKTSELDAVVGRGGLLKPIKGGTYSVSAAMIEDLKVGVLGEHASNLGGIIAKQIGEEVNVPSYIVDPVVVDELEDVARISGMPEISRASVVHALNQKAIARRYAREINKKYEDINLIVAHMGGGVSVGAHKNGKIVDVANALDGEGPFSPERSGGLPVGALVKMCFSGKYTQDEIKKKIKGNGGLVAYLNTNDAREVEERIEAGDEKAKLVYEAMAYQISKEIGASAAVLKGDVKAILLTGGIAYSKMFTEMIADRVKFIADVKVYPGEDEMIALAQGGLRVLTGEEEAQVYDN >CP020424.2|ARC15178.1|2031067_2031745_-|ATP-binding-protein MITNDKRIRIITGHYGSGKSEFAMNYVVKLRDMVSGKVAIADLDVVNVYFRTREKKELMKSLGIQPIDSSINAPTLDLPAVSAEVMSPMVDHSYNSVIDLGGDNVGARVIGRFSHLLKEGDYDMLFVINANREKTQTSEEVIQYIKEIEKSSKLKVTGLINNTHLIRFTTIDDVLRGQKVAKEVSEKCNIPIRYVACLENLVEQLPKDLEGEIFPIKLYMREDWM >CP020424.2|ARC15177.1|2030809_2031025_-|2-oxoacid:acceptor-oxidoreductase MAKGKVSFNQERCKGCGLCVEACPVKIIQLDSNVINKKGYNPATVFEMEKCIGCASCATMCPDVVITVERD >CP020424.2|ARC16806.1|2066124_2066829_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-CwlD MRKYIKHIIFSFAMICLVVVSIFEIKNISEDVIKYMPVTNKTIILDAGHGGIDPGALNKDKSTSEKDINLAITLKLRELIESSGGLVILTREDDSSLYKEENNKTTRQKYNENLKNRKEIISNSNANMFVSIHLNAFEQSKYYGAQTFYPKDKQDSKALSKCIQEELKRVVDKTNNREVKPRDDIYLLKENNIPSVLIECGFLSNEKECKLLTDETYQEKIAWAIYIGIQKYLS >CP020424.2|ARC15187.1|2067335_2067728_-|30S-ribosomal-protein-S9 MANVQYYGTGRRKSSVARVRLVAGEGNILVNGRALENYFNYETLIRDVKQPLVLTGNENKYDVIVKVEGGGFTGQAGAIRHGISRALLKADLDLRPALKKEGFLTRDARMKERKKYGLKAARRAPQFSKR >CP020424.2|ARC15188.1|2067756_2068188_-|50S-ribosomal-protein-L13 MKSYIAKPADVQRKWYLVDAEGKTLGRLATEIATVLRGKHKPTFTPHVDGGDFVVVVNAEKIVLSGKKLDQKYYRYHTGYVGGLKEISYRDMMDKKPEEVISHAVSGMLPKNKLRSRMMTRLRVFAGAEHTHAAQNPEVLNFK >CP020424.2|ARC15189.1|2068307_2069039_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRNIKIKIQYNGKNYCGWQKQPDSLGIQGTIERAIYDITKEETSLIGSGRTDSGVHAIGQIANFKINSGISIESIPMALNAKLPKDISVIEACEVNDDFHSRYSAKGKTYKYLVYNSKFRNPILSEISYQVKYELDFDKMCSEAKSLLGTHDFKGFMSSGSSVKDTVRTIYDIDISKKDDLITFEISGNGFLYNMVRIIVGTLVDMGRGRINEPFLDIIQSKTRSRCGHTAPAQGLFLKKVHY >CP020424.2|ARC15190.1|2069070_2069874_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MLKDITIGQYYPTSSAIHKLDPRIKLVATIVFMVSIFVVNKFWPYIVVLLCLLAMIKLANIPVKYIVKGVKPLKWIILFTFLINIFFLPGDEIWSFGFLAITKQGLRQAIFMAIRLIFLVVGTSLLTLTTSPIELTDGIERLLNPFKKIGLPVHELAMMMTIALRFIPTLLDETDKIMKAQMSRGADFESKNLINRAKNLVPLLVPLFVSAFRRADELAMAMEARCYRGGHNRTKMRESVILRRDYMACVFQVVYLGAIIATRFIAI >CP020424.2|ARC15191.1|2069867_2070734_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MSIIVKNLTHIYNEGMPFASKALDDVSFEIKDRDFVGLIGHTGSGKSTLIQHLNGLLKPSSGEIFINDFNITDKNLNLTEIRKRVGVVFQYPEYQLFEETIDKDIAFGPSNLGLEESEIHNRVKASMEAVGLDYEGFKDKSPFELSGGQKRRVAIAGVIAMNPEVLILDEPTAGLDPGGRDEIFNLIKDLHEKKNMTIILSSHSMDDMAKLAKTLIVMNHGSVEFMGTPREVFKSNASKLKDIGLDIPQVLELALKLREKGFDISEDILTLEEAKQEILKVVRGRGLC >CP020424.2|ARC15192.1|2070721_2071555_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MDNIVKVNNISFEYITDEAKLKAIDNLSLDVKKGEFVAIIGHNGSGKSTLSKNLNAILMPTEGNILIDDMDTKEEERLWDIRQTAGMVFQNPDNQIVATIVEEDVAFGPENLGIEPKEIRRIVEESLKSVGMYDLRDRQPHLLSGGQKQRVAIAGIIAMRPKCIIFDEATAMLDPSGRKEVMKTIKRLNKEENITVIHITHFMEEAVEADRVVVMEKGKKILEGTPREVFSKIKMLKEIGLDVPCMTELSSLLIEEGINISSDILTVDEMVMELCQL >CP020424.2|ARC15193.1|2071674_2072016_-|50S-ribosomal-protein-L17 MAKYRKLGRETAHRNLMLRNLVTCLLRSGRIETTVTRAKETRRMAEKMITLAKRGDLHARRQVLAYVMDETVVNNLFTDLAPKYAERNGGYTRIIKIGPRKGDAAEMAFIELV >CP020424.2|ARC15194.1|2072036_2072984_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MIEIEKPKVDIVELSEDYRYGKFVIEPLERGYGITIGNALRRILLSSLPGVAVNAIKIDGVLHEFSTIPGVKEDVTEIILTLKELSATIDGEGSRTLKIEAQGPCSITGADIICPPDVEILSKDLAIATLDDNAKLNMEIFVDKGRGYVSAEENKTENVPIGVLPVDSIYTPVEKVSYHVENTRVGQKTDYDKLVLEVWTNGSINPQEGISLAAKVLVEHLNLFIDLTEHVSSVEIMVEKEEDQKEKVLEMTIEELDLSVRSYNCLKRAGINTVEELANKSEDDMMKVRNLGKKSLEEVIQKLEELGLGLKPSEE >CP020424.2|ARC15195.1|2073061_2073685_-|30S-ribosomal-protein-S4 MARYTGASCRQCRREGMKLFLKGDRCYTDKCAIVKRNYAPGQHGQGRKKVSNYGLQLREKQKVKRIYGVLETQFRNLYERAENMPGKAGENLLSLLERRLDNVVYRMGLASSRKEARQLVTHGHFTLNGNKVDIPSLIVKVGDVIEVKEKSRSSAKFKNLVEVNSRIAPKWLEANVEGMTAKVVGVPTREDIDLEIAEHLIIELYSK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP020424_7 | 3041318-3042060 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of CP020424_7
|
11 spacers
spacers of CP020424_7
>7.1|3041347|36|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCCCTGCATTAACAAAATCTTCAACATTCAAAAA >7.2|3041412|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATGAATATATTACATAATCATAAAGATTTACAAATG >7.3|3041478|36|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAATTATATATTGCAAAAAAATATGGAGTCACAGAG >7.4|3041543|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTCAAAAAAAATGGAACAATCATACAAAATGATT >7.5|3041609|34|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTATAATTATGCGTGATTTGATTGGTAGAAACC >7.6|3041672|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCATAACCAAAAACTTCAAAATCAAGACCTCGAATTT >7.7|3041738|36|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCGCAATAACATGCTGAAAACTGCAATTTCGAAGT >7.8|3041803|35|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAAAGCAACTAAAGCATATGATTTATCTAACAAC >7.9|3041867|37|CP020424|CRT AGGATAAAGAAAAGACTCACACAAGGCACAGTGTCAG >7.10|3041933|35|CP020424|CRT GAATATTAGCAATATCAACGAGTATTTAGAAACTT >7.11|3041997|35|CP020424|CRT,CRISPRCasFinder TTGTAGAATCAACAATAGCATATACTAAAACATCC |
cas2,cas1,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020424_7
The CRISPR arrays of CP020424_7 >merge|CP020424|7|3041318-3042060|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTTCCCTGCATTAACAAAATCTTCAACATTCAAAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTATGAATATATTACATAATCATAAAGATTTACAAATGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGAATTATATATTGCAAAAAAATATGGAGTCACAGAGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGTTTTCAAAAAAAATGGAACAATCATACAAAATGATTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTCTATAATTATGCGTGATTTGATTGGTAGAAACCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGCATAACCAAAAACTTCAAAATCAAGACCTCGAATTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTGCGCAATAACATGCTGAAAACTGCAATTTCGAAGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCTAAAGCAACTAAAGCATATGATTTATCTAACAACGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGGATAAAGAAAAGACTCACACAAGGCACAGTGTCAGGTTTTATATCAACTAAGGGTAGATAAGTAGAATATTAGCAATATCAACGAGTATTTAGAAACTTATTTTATATTAATAAAGCAGTATATAAAATTGTAGAATCAACAATAGCATATACTAAAACATCCACCTTATATTAACTAAATCATATCTAAAT >CP020424|7|5|3041318-3041866|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTTCCCTGCATTAACAAAATCTTCAACATTCAAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TATGAATATATTACATAATCATAAAGATTTACAAATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAATTATATATTGCAAAAAAATATGGAGTCACAGAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTTTCAAAAAAAATGGAACAATCATACAAAATGATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCTATAATTATGCGTGATTTGATTGGTAGAAACC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GCATAACCAAAAACTTCAAAATCAAGACCTCGAATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGCGCAATAACATGCTGAAAACTGCAATTTCGAAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTAAAGCAACTAAAGCATATGATTTATCTAACAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT >CP020424|7|7|3041318-3041867|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTTCCCTGCATTAACAAAATCTTCAACATTCAAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TATGAATATATTACATAATCATAAAGATTTACAAATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAATTATATATTGCAAAAAAATATGGAGTCACAGAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTTTCAAAAAAAATGGAACAATCATACAAAATGATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCTATAATTATGCGTGATTTGATTGGTAGAAACC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GCATAACCAAAAACTTCAAAATCAAGACCTCGAATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGCGCAATAACATGCTGAAAACTGCAATTTCGAAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTAAAGCAACTAAAGCATATGATTTATCTAACAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGGATAAAGAAAAGACTCACACAAGGCACAGTGTCAGGTTTTATATCAACTAAGGGTAGATAAGTAGAATATTAGCAATATCAACGAGTATTTAGAAACTTATTTTATATTAATAAAGCAGTATATAAAA TTGTAGAATCAACAATAGCATATACTAAAACATCC >CP020424|7|5|3041318-3042060|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTTCCCTGCATTAACAAAATCTTCAACATTCAAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TATGAATATATTACATAATCATAAAGATTTACAAATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAATTATATATTGCAAAAAAATATGGAGTCACAGAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTTTCAAAAAAAATGGAACAATCATACAAAATGATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCTATAATTATGCGTGATTTGATTGGTAGAAACC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GCATAACCAAAAACTTCAAAATCAAGACCTCGAATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGCGCAATAACATGCTGAAAACTGCAATTTCGAAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTAAAGCAACTAAAGCATATGATTTATCTAACAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGGATAAAGAAAAGACTCACACAAGGCACAGTGTCAG GTTTTATATCAACTAAGGGTAGATAAGTA GAATATTAGCAATATCAACGAGTATTTAGAAACTT ATTTTATATTAATAAAGCAGTATATAAAA TTGTAGAATCAACAATAGCATATACTAAAACATCC ACCTTATATTAACTAAATCATATCTAAAT >CP020424|7|8|3041968-3042060|CRISPRCasFinder TTTCCCTGCATTAACAAAATCTTCAACATTCAAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TATGAATATATTACATAATCATAAAGATTTACAAATG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAATTATATATTGCAAAAAAATATGGAGTCACAGAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GTTTTCAAAAAAAATGGAACAATCATACAAAATGATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCTATAATTATGCGTGATTTGATTGGTAGAAACC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GCATAACCAAAAACTTCAAAATCAAGACCTCGAATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGCGCAATAACATGCTGAAAACTGCAATTTCGAAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTAAAGCAACTAAAGCATATGATTTATCTAACAAC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGGATAAAGAAAAGACTCACACAAGGCACAGTGTCAGGTTTTATATCAACTAAGGGTAGATAAGTAGAATATTAGCAATATCAACGAGTATTTAGAAACTTATTTTATATTAATAAAGCAGTATATAAAA TTGTAGAATCAACAATAGCATATACTAAAACATCC ACCTTATATTAACTAAATCATATCTAAAT
>CP020424.2|ARC15945.1|3040867_3041134_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIVTYDIVEARSLNRIRRILRKYLTWTQNSVFEGNITEGKLHKCISEIENIIDNSEDSIYVYEIKNPNSIKKKCYGIDKYSDEMFI >CP020424.2|ARC15944.1|3039884_3040865_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MYKDYYIISNGDIKRKENTIYYYNLEGEKKILPVEQVDDIHIYGEVDLNTKLINYISKYGVMLHFYNYYGYYSGTYYPRKKNVSGFSLVCQSACYLDKNERLYLAKSFVESASYHILRNMRYYKVDESLIDTIKDELNDLNDVKEISELMGKEGRIRKTYYKSFNQILKDDFEFYKREKRPPKDPVNALMSFGNSIMYTNVLSEIYKTQLDPTISFLHEPSTKRFSLSLDIAEIFKPIIVDTIIFSLINNKRINKNDFEYQDKICYLSEKGKKKFLQEFENKMQTTIKHRNLNRKVSYRMFIRLECYKLIKHFINDERYKVLKVWW >CP020424.2|ARC15943.1|3036994_3039316_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MLYAKSNPVETLREHTDELLKQMNVLRESYGKNINSLDFLEEEIFWQLLDFVIEFHDIGKAFSPFQELIKSRMDTKINEPKIVTHLENNVGHNYLSPAFIDYSYIDRKKNKELRAVLNQVIVYHHERDIFIDKDFKNLIQKILDEDLINKVYELQHEFKVRYPIKTERLSKVYLQSVEKRIDKNHKYYNLYIMLKGILHRLDHSASAHEVVECNNVINIGEQTENYLMKEFGSLREAQSFAKSNRNKNIILIASTGMGKTETALIWIDKDKAFFTLPLRVSINALFDRAKNIVGVGESNDTFLGLLHSTAIDYLEESNQENSSEIVDLAKLLSCKLTFSTIDQIFKFPFLYRGYEKVYSTLAYSKVVIDEIQAYSPEIAAVLVKGIEMIHKIGGRFMIMTATMPTIYIDELKKRGVMNSNLADLTCNTEKIRHCVSIVENSIDENLGKIIQSGMNKKVLVIVNTVKSAVEKYELIEEIVKPKGIDVNLNLLHSMYIQEDRAKLEKYIKEFADSDSNGIWITTQLVEASLDIDFDELHTENSTLDSLFQRFGRCYRSREYEENSPNIFIYTEKATGIGSIYDKDIVEKGLELLKTFINGKECVKMKEKYKVEMVKILYSKESLEGTAFEKRFTSALNILDTITPYSLGSKDAQNILRNIEGYTVIPEDIYNKIEETLIKDYEELGQELINAYSNDDRQLINKIKSKRKKARREIIKKTVNLPIYKAKQNVIDIQVKGLEDLKILLYKYDIHENKHTKQIFGKGVLISNEIDQFI >CP020424.2|ARC15942.1|3036282_3036984_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVLKLDLFQETACYKKPFAMKITETYPLPPYSTINGLIHKVLNATEYIPFNISVQGTYESIFNNYQTTYFYKKDSITSMPMNSHMLLNVNLIIHIGGDFDLLEEIYDSLLNYDEHLSLGRKEDLVRINDIRFVEVNKFEVDEDIQLDDYENYKLSECNIRMPIYIPKTSLQDTDIDGISYRLNNYYDNNAVEDKKRVWNKVDSYYVEDGNTISIGDILLDNEGDLLYFNNIN >CP020424.2|ARC15941.1|3035366_3036281_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKRGLTFTVIAQAQSLNYGEGIGNISELKKLSRADGNMYTFASRQCLRYDIVRLAAELFNWNLQVVDKEKGTIQFKDNISIRESEEMDLFGYMKTNKKDEKDKKGGSLTREATVRLSNAISLEPYRSDMDFLNNKGFADRIGEHPNLANIEQHLSYYTYTVTIDLSKIGKDGDIELDNKEKCRRVVEFLEIIKVLNRNIRGRQENLSPLFVVGGVYEIANPFFLGRIKLKGDKNGFKINKQAIEEVIQGTFLGKDLKEFTYVGMVDGVFINKEEFKGLFEDNFLSVDKFFGQLVKEVKEYYGVN >CP020424.2|ARC15940.1|3033487_3035365_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MKLRVYRGDWFFNMGIVGFLNIIKKADKQAEIFIMEDYIEFDSLFLENFHEYYFNYFMDEYDVSKRIKKNIDYSINFIKSKPDRIKDGIKKIKDSVKQQNDKIKKFDEEKFNLIKEKLDSMSKIKSYDEFDSLESLVDETIDIFKIKSINDRLTANLYKYVVQDNYFGQVSFFNVAKAKLDLDGLKQVMFNDYLRQIIYFGELEDLLEENDYDKLKNYLNDRLNSIAKDINEKKVSKSSINTIEKIMKEINKNFIKKNKSIEDIKEYMDSLEVCEMCGLYKGILDEYSESNFAPLGVSTNNARNMFWNQEYVSSICDVCKLILFCTPAGATYTRKNYLINEENEFYLFVNMDTSINELFERNNSLKAQKSESSDSKDENPFNQLIKSIVEENTLKSEWQLRNILFVEFKASIDSKKCKINYFNIPTYLAKFFTDKYANKKIQSIYDYKLKSNVLDLLLKNRDLKHLTNNILRNKVKNDMESNNKSNISGIDCFRVVQLRVLINSYKKGVYKMDSKNLEKNDEKLKIIYYLGCDIHDYFVNKNSKNKIDGVSYKLLNSVKVGNKSDFMDTIIRVFMSAEKQIPAFILDIEIEKDLDFESIGHAFISGLISGKYEGKDKLPNEKEEK >CP020424.2|ARC15939.1|3032744_3033482_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKMKIEFSTGCIPISYNSLFMSIIKEAIRKSNEDYYKNMYYYKEKNNKKTKNFTFSVYIKKYSIEGDNFIIEDKVILNISTPDLELGFHIYNGLMTSKKCLYKAYELTRIRIDLSREKKVTEERVLFNALSPICVKSKEGKFLEITDDRYIEELNYITNEVVKNYRGNGLKRKLEFENIGLKKVVVKESLREFKKITGKEYQYINGYKGKFILKGDIDDLNLIYNLGIGFRRAHGFGDVDILEWR >CP020424.2|ARC15938.1|3031749_3032667_+|WYL-domain-containing-protein MMILIQSRGKMKCKELSEELEVSERQIKSYKMYLEQAGIFINSTPGIYGGYEIDKCNSISLIKLLDSEVSILDMINSQLEYNNDIYKNEFNNIVEKIKAVLNTGEKSDTYMDYFTVQAQRNCDYESEKNKCNEIIRAYTTKHKFWIEYYSLNSGNSERIVHPYGLFNYKSDTYMVAFCEKRFKFIDFKLCRIKDYKVLEEKYNVDKSFSWDEYSKNSIGIYKGEEINVVIKISHPFSTIIKEKVWVNNQQIIEYDDKSIMFKAKMRGYEEIKSWILSMGAYVEVVEPDRLRNDILSEIEKMKKIY >CP020424.2|ARC15937.1|3029554_3031471_+|ABC-transporter-permease MNIKQFAINNISRNIKAYLGYLASIVISSSLLFSFIMFTSHPDLDVSQFPDYLKEGLKMSKIIAYLFLFFFVFYSVSVFLKSRYKEFGILYITGISKRQVMKLIFIENMIINIVSSVIGIIIGLIFAKIFLVVMSTFLELSPLKFYIPFNAILSTLIYFMILAVLTSIFTSFIVKENQVLKLLKGTKTPKPEPKTSLMLAILSICLFIIAYYNAITSTDQYTTYLRLVPVTSLTIVATYLFFSQFSVFFMKKLKLNKRFYRKNTNMLWISNLIYKVKDNARIFFLITITSAVAFTAIGTVYSFWKDVERQINLIYPNTIYYSTMTLHNDPKKPDSKEKDKERMMFIENNLKKEDVDYTRTNGEFKTVFPKKSDFNVRIMKESKYLEITETIGVKPISFEDNECISLLSSSLPGNNNVKENIIVGNRGLKVAKQVEECVMPAYYKNMYVVKDNFYDSIESKFIVDRFTAFEVEDSSKTIEICREFENKFNNESGMQPYLFFSKELMIGTGKLMYSTFIFLAIFIGLIFFVTTSSFLYNKFYMDCQVDKKKYEQLNKLGMTYNEIKKASTIEIGIVFLFPYVVAVIHSIFALTALKNSFDIEVASSAVLVMGSLFLVQIVYFLIVRNNYLKEIRLNLVNF >CP020424.2|ARC15936.1|3028808_3029555_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MKILTVNNLSKVYGKKIIFNALNDINFSIEDGEFVGIMGPSGSGKTTLLNMISTIDKPTTGTMELKGKNPLLLRGEELALFRRRELGFVFQDFNLLDTLTIGENIVLPLTLDKVSVKEQDERLNEVSTILGIKDLLGKRTFEVSGGQAQRTAIARALINNPSILLADEPTGNLDSKSSKVVMELFQKINKENKVTTMMVTHDPLAASYCSRILFIKDGYIYNEIYKGSSREQFYQEIMDVLTLLGGDN >CP020424.2|ARC15946.1|3042120_3042549_+|N-acetyltransferase MIKKLNNKDINKIMEIWEKSTIKAHDFISKEYWQNNYNTVKNEYIPISDTFVYDDGDEIKGFISIIDKSFIGALFIKPKYQNLGIGGKLLDYATKKYKSLSLAVYKDNKKAVVFYNKKGFNIVKEQVNEDSGFKEYIMEYSK >CP020424.2|ARC15947.1|3043003_3043783_-|hypothetical-protein MKVNENNINNIDEELDELSRKVYLESPDFWISISDKIIDKVFDEMLLFFAVKYNYFNIVCFAIENNYLDLNMPSKNKKYTNIMEHLLDTSKQNEDKKIYNYLLSLNKGNNLDERPILDELNCNISSDTFEKKDIYLPKYLCPSCNSNIFDTGYKVSNDITYKFSSKEAEPIEMCSEVSSIRCCNCDELLEDITLDKLYNLCKIQNCNNCGSNLTKVGIIAKKKMNFDENTEKFKDVSTSYCCGNCDSEINLSQREHFKI >CP020424.2|ARC15948.1|3044106_3044652_+|biotin-transporter-BioY MKNTKVNIQDLTKMSICVALLCISSYIYIPLPFTPAGVTAQTIMINLIALILTPRQAFSTVGVYIMIGLIGIPVFGGGTSGIGKLLSPTGGFYFGFLFAALIISLLKGRNNDIKRYILITIFVGMPIIYFMGTVFMCYFNQMTVEAALFAAVVPFLIGDTIKSVIASFLGTKLNNVLRRNL >CP020424.2|ARC15949.1|3044683_3045820_+|acetyl-CoA-C-acyltransferase MKEVFILGGLRSHIGLKNGIFQFVQPELLGASVLKDLIKKYEIDKIDEIICGNAVGTGGNIARLMTLTAGVSNEVPAFTVDMQCASAMMSIDIAFSKVKSGQCDLIIAGGFESSSLQPMRTYHKNDKRYNTNNPNYTVAQFSPDDNSQNSMLEGAERVAELYQIEKADLDFWVKESHKRAKEAREEKILEDIISPINNSTYDEGIRDKMSQRLLDRMPSILGKETITNAANSCLINDGASFIIICSKKYLEHVKKKPKAKIINTCTIGTDATLSPTSAIQAMDKLLEIESLNYLDVSAVEFNEAFAVIDVLFQRKYPELIDRYNIFGGALAYGHPYGASGAIIALHLLKALEETKGRYGICSIAAAGGLGSALLLERV >CP020424.2|ARC15950.1|3045823_3047215_+|AMP-binding-protein MNYYELLRIKKERHKNKNFLIIDGEKYTYENLLSYSEELGKQISLGENIPILIYSKNIMFQLISFFAINYSKNIPIICHYNLSKKVLDDILLKNNISIIISDESMDVIDLYDDNNNEVAKKVNFSIFNPKFNIYMYQYKKLINYLDKSICMGALSSGSTSVPKVLYRTYESWAGFFPIQNGIFNISGESILFVNGTLSFTGNLNSIMSVLYEGGSIVISSGLNCKSWIRTIKQYNVTNIYLIPTKLQLLVKHLKEPVLKVVSIFTGSQLLFEDTARNLKKYMPKSEIILYYGASELNYITYLCYDELIEKPLSVGRPFPGIDIYIREGKIFVNTEYAVYNATKPYSVNDIGYYDNDGYLIFEGRSDDILNIGGFKVSSTKIENEVKKIPQIEDAIVLPYSDTIRGNQIVLFVITIDKITKKDLLIKMKDNLMKNEIPKKIIFLNSFPYTSSEKIDRLALLKML >CP020424.2|ARC15951.1|3047290_3048166_+|dipicolinate-synthase-subunit-DpsA MSNQYDITVIGGDLRQVYMVKKLINKGYSVVTYGISNEIINGIVGKSTSLAEALSKSSIILCPIPFTKNQVNIENTDDCLDATIDNLLINLSPNQILFGGNIPTKVCKFCEQHSIQIYDFMKMNDVAILNAVATAEGAIAEAIKRSIINIHQSNCLVLGYGRCAQILAKKLYTLDANVCVGARNNDARSTANAFGYSSISLSQLDEKLLQFDYIFNTIPECILTKERLEKVSQEVTIIDIASSPGGVDYSVVKEAGINATLCLGLPGKYSPKTSGEILVNAIENIINERRD >CP020424.2|ARC15952.1|3048168_3048759_+|dipicolinate-synthase-subunit-B MRLEGLTIGVGFTGSFCTYDKIFIELENLVKEGANVHTIFSDVSQNIDCRFGNSEEFMKKAYELTGNKPIVTIEEAEPFGPKGIADIIIIAPCTGNTAAKLANGITDSPVLMAAKGHLRNDKPLVISISTNDALSFNFKNIGILLNSKNIYFVPFGQDNCKAKPNSMIAHTELIIPTIELALENKQLQPVIKSPHQ >CP020424.2|ARC15953.1|3048965_3049166_-|hypothetical-protein MKKLKTISIFSLIISVILTIGGIGIVTYYVDNLFIRGLSVFVLIMSSSFVSTTVRLIFEESKRYKF >CP020424.2|ARC15954.1|3049669_3052324_+|bifunctional-acetaldehyde-CoA/alcohol-dehydrogenase MAHKEQVIIENKKENEVMSVGLDTVNNVESLVKKLAKIREAQKIFATYSQEQVDKIFLAASLAANKQRVPLAIMAQKETGMGIAEDKVIKNHYASEYIYNAYKETKTCGVIEKDEAFGMTKIAEPIGVIAAVVPTTNPTSTAIFKALLALKTRNGIIFSPHPRAKNSTIEAAKVVLEAAVLAGAPEGIIGWIDEPSLELTTTVMKEVDLTLATGGPGMVKSAYSSGKPAIGVGAGNTPAIIDDSADIKTAVNSILVSKTFDNGMICASEQSVIVLENIYNEVKKEFKERGAYLLDKDETEKIRNIILVNGGLNSKIVGQTACTIAKLAGFEVPVDTKVLIGEVESVEIEEAFAHEKLSPVLAMYKASDFDDAVRKAEKLVEDGGFGHTSSLYIDDVNQREKLDKFTSAMKTCRILINTPSSQGGIGDLYNFKLAPSLTLGCGSWGGNSVSENVGVKHLLNIKTVAERRENMLWFRAPEKVYFKKGCLGVALKELKDVMNKKRAFIVTDTFLYNNGYTKAVTDLLDEMNIKHTTFFEVEPDPTLECAKIGAKAMREFNPDVIISIGGGSAMDAGKIMWTLYEHPDVDFQDLAMRFMDIRKRVYTFPKMGEKANFVAIPTSAGTGSEVTPFAVITDQDTGVKYPLADYELMPNMAIVDSDMMMNMPKSLTSASGIDALTHALEAYVSMLATDYTNGLALQAIKSIFEYLPRAYDNGAKDPEAREKMANASTMAGMAFANAFLGVCHSMAHKLGAFHHVPHGVANALLITEVMKFNSSDAPKKMGAFSQYKYPEALKRYAEIASFLGLKGNSDEEKFQSLLVAIEDLKLKVGIPKSIKEFGVEESKFMDSIDEMVIQAFDDQCTGANPRYPLMNEIKDMYLNSYYGR >CP020424.2|AVI58942.1|3052599_3054819_+|sensor-domain-containing-phosphodiesterase MTGRNKSFTLITILFLTSLFLTMGYIYIEDTKHLLMSEAKIHIKEVAVQGSQLAQRQIEKDLDVLNIFSNYYASNPDIPNEEKMKNLLDEMENQKFYTMAIVDINGNAENTKGDKFSVKDREFFKNSIKGKKYVSSPYVDEVNKSIKKIAISVPLLNNDKVVGVLYCTYNINTLMKLINISFYENNSISYVVKNNGTIILHPQGDSLSKNIYKLLKQDNDIQEVNRLKKELQENKTGATVLNMLEERRYLGYATMDNGNSENNYIKDWNLIFSIPETVVFSNSKQIINRAVYAVLSIVLIFIAIIFYIIYIKKSNEKEILSLAYEDKVTYIGNQNKFYRECSKYLLDKPSLNYIIVYFDINNFKMINDTFGYEFGDNLLITIAKALKEELTEGEVYARLSSDYFAIFCDYKNGRNKIIRKLDNIRSNIESNLSIVFEISLCVGIYFVEEGEVDIQKAVNKANMARSVAKGKNINYAIYNEDVRNKLSEESMILDDIKIALVKNQFEVYYQPKFSLVTGEMIGSEALIRWNHPEHGFISPAVFIPIAEKSKLILKIGRFVFERVCNDLYEWKKQGKKIVPVSVNLSRVELYQPDIVKFINKTIKMYNLSSDFIEIEITETVAINELNILKNVLNELRTYGFSISMDDFGTGYSSISCLRDMPIDILKLDKSFLGGIEHDERSRNIAKSIVSLAKSLDLVVIIEGVESKEQAELMKQFGCDLVQGFYFARPMPAKNFLDLL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP020424_12 | 3539206-3539767 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP020424_12
|
8 spacers
spacers of CP020424_12
>12.1|3539235|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAGCATCTATGCCATTTACTTTATTAACTTCCTCAT >12.2|3539301|38|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTATTTCAGCAATTTTACTTTTAATAACTTTATCAGC >12.3|3539368|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAATTTACCGTTTTTTTCAAATCTCACAACATCAGA >12.4|3539434|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATCGGCTTCTTGAAAAGCCTCATCTGCTCTATTTA >12.5|3539500|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCATTAAATCCCCAACCGAATTATCTTTCAGCATTT >12.6|3539566|39|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATGCTGATAAGAATCTCTATGAACTTCGGAGGGAACCG >12.7|3539634|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGGTATTTTGCTAAAAATAAAGCTATTAAATTAGA >12.8|3539700|39|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTATTAACACCTGTTCGGCACTATCACAATAAACACAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020424_12
The CRISPR arrays of CP020424_12 >merge|CP020424|12|3539206-3539767|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTCAGCATCTATGCCATTTACTTTATTAACTTCCTCATGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATAGTATTTCAGCAATTTTACTTTTAATAACTTTATCAGCGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTCAATTTACCGTTTTTTTCAAATCTCACAACATCAGAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCTATCGGCTTCTTGAAAAGCCTCATCTGCTCTATTTAGTTTTACATTAACTATATGGAATGTAAATTTCATTAAATCCCCAACCGAATTATCTTTCAGCATTTGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCATGCTGATAAGAATCTCTATGAACTTCGGAGGGAACCGGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTGGGTATTTTGCTAAAAATAAAGCTATTAAATTAGAGCTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCGTATTAACACCTGTTCGGCACTATCACAATAAACACAAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT >CP020424|12|6|3539206-3539767|PILER-CR GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAGCATCTATGCCATTTACTTTATTAACTTCCTCAT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AGTATTTCAGCAATTTTACTTTTAATAACTTTATCAGC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAATTTACCGTTTTTTTCAAATCTCACAACATCAGA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTATCGGCTTCTTGAAAAGCCTCATCTGCTCTATTTA GTTTTACATTAACTATATGGAATGTAAAT TTCATTAAATCCCCAACCGAATTATCTTTCAGCATTT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CATGCTGATAAGAATCTCTATGAACTTCGGAGGGAACCG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGGGTATTTTGCTAAAAATAAAGCTATTAAATTAGA GCTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CGTATTAACACCTGTTCGGCACTATCACAATAAACACAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT >CP020424|12|13|3539206-3539767|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAGCATCTATGCCATTTACTTTATTAACTTCCTCAT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AGTATTTCAGCAATTTTACTTTTAATAACTTTATCAGC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAATTTACCGTTTTTTTCAAATCTCACAACATCAGA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTATCGGCTTCTTGAAAAGCCTCATCTGCTCTATTTA GTTTTACATTAACTATATGGAATGTAAAT TTCATTAAATCCCCAACCGAATTATCTTTCAGCATTT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CATGCTGATAAGAATCTCTATGAACTTCGGAGGGAACCG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGGGTATTTTGCTAAAAATAAAGCTATTAAATTAGA GCTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CGTATTAACACCTGTTCGGCACTATCACAATAAACACAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT >CP020424|12|6|3539206-3539767|CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAGCATCTATGCCATTTACTTTATTAACTTCCTCAT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AGTATTTCAGCAATTTTACTTTTAATAACTTTATCAGC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCAATTTACCGTTTTTTTCAAATCTCACAACATCAGA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTATCGGCTTCTTGAAAAGCCTCATCTGCTCTATTTA GTTTTACATTAACTATATGGAATGTAAAT TTCATTAAATCCCCAACCGAATTATCTTTCAGCATTT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CATGCTGATAAGAATCTCTATGAACTTCGGAGGGAACCG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTGGGTATTTTGCTAAAAATAAAGCTATTAAATTAGA GCTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CGTATTAACACCTGTTCGGCACTATCACAATAAACACAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT
>CP020424.2|ARC16299.1|3538761_3538920_+|hypothetical-protein MDNFLQGILASLSASLIVYIASKLFRKRKKPLKAATKSGWEFDLKIRFHKTK >CP020424.2|AVI58979.1|3537032_3538403_+|cell-wall-binding-protein-Cwp29 MKLKKLLSLGLAVSMFAAGPISANALDTIYTIQGKDKYETAALIADEQNYTTAILINADSTMADGLSASGLAGATNAPIFLTKKNNIPNATLKRVEKAKKVYIIGGESSIDKATETLLKDKGIEAKRLQGSDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAAPVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTGVESYVIGGTSSMSDKLVNDTNSTRLGGVDRYDTNKKIVNKFYNGAKEFYIASGTDLVYALVASPMAKNNPIVLVDIGSNKDILKNAAKVTGIGNLSDKIMLECENTINNISLPSSNKNIICGLKIDFDSKHIIWQDKGSYLECYDDNLEYYTEKYKDPTVPINIENTSTQNLDVTKLKVYGEANSTLYMGQYAKIKMDFNSFGVLKPGEKCTIYLDIISLDPSRSMTLTFSYVGDKENYKYEQGLASRILFYNPDGEDFFEYK >CP020424.2|ARC16298.1|3535708_3535981_-|integrase MSKHQFKSVSTFFTKKNVSQFYKKNNLKKIRIHDLRYTSATLLLLGGTNMKVVSERLGHTDIKITMNRYSHVLKEMDKEASDNLSELLFK >CP020424.2|ARC16297.1|3534557_3535226_+|VanZ-family-protein METVTNNQSGVEIQLSLFEAIKDLLLINPIFLLGIILIGIFLVVIFKKNSDIPKVKTSILSLAMYYYLCLTLSHIVGIPTFGEYIRLSQLGETFFNPNINLIPFSDGFSLSFILNILLFVPLGFLCPLISKTFERLRNTFLIGFGLSLFIETIQLFTLHRATDIDDLLTNVIGTIIGYFCFKLIAKLRIVKLHSDDDSMEQDYTVCIPIAIIIVALILGFFS >CP020424.2|ARC16296.1|3531301_3533722_+|leucine--tRNA-ligase MSVYNFKEVESKWQKIWKDNNQYKMDTAQTEKPNYYTLEMFPYPSGKIHMGHVRNYSIGDVVARFKKMEGYNVLHPMGWDSFGLPAENAAIKHGIHPHKWTMENIEEMKEQLNLLGISYDWDKEVATSTPEYYRFTQEIFLKFLEHGLAYKKKSYVNWCPSCETVLANEQVVQGACERCKATVLKKDLEQWYFKTTEFAEELLNDLDTLDGWPEKVKTMQKNWIGKSTGADLVFDIDGTDKSMTVFTTRPDTTYGVTYMVLAPEHELVKELVAGTEYEADVETFVQKMHTMTEIERTAADVEKEGMFIGRYVINPLNGKKVPLWIANYVLVEYGTGAIMAVPAHDERDRDFAEKYNLDIIDVITEDNKMINSEEFNGLDASEGFEGIIDKLEKEGRGKRTINYRLRDWLVSRQRYWGCPIPVVYCDECGIVPVKKEDLPVLLPTDVEFTGKGESPLTTSKQFMSTTCPHCGKPARREVDTMDTFVDSSWYFLRYVDSNNENEPFSKELVNRWHPVDQYIGGVEHAIMHLLYARWFVKAFKSMGMVDFNEPFKNLLTQGMVLMDGSKMSKSKGNTVSPMDIIDEYGADTARLFVLFAAPPERDLDWSEQGVDGCFRFLNRVYRLVDELADVVKKDVEFGELNSQDKDMRYTIHSTLKKVTADLSEKFGFNTAISALMELINDMYKYKELDNINEAVIKEGVQTIVTIIAPFAPHLGEELWTMIGKEGSVFDIDWPKYDEKALVKDEIEVVVQVNGKVRGKLTVNSNISKDEMEKVALEDEKIKGLVEGKTIVKVVAVPKKLVNIVVK >CP020424.2|ARC16295.1|3530597_3530948_+|ribosome-silencing-factor MTVEQMTKIAYDAIEDKLGQDTVIINIGKVSSLCDYFIITTASSQRQVKAIADNVEDELAKLGLEPRGKEGQGTQTWVLLDYGDIMVHVFNEENRGFYNLEKLWKDAPYIDIDTLA >CP020424.2|ARC16294.1|3529908_3530481_+|HDIG-domain-containing-protein MNLENINQRLNQMLPVGRLSHSKNVAKCAEKLCEIYGCDKEKAYLAGMIHDCAKYLSDKEIEDYVNKYEIYLDPIEDGNRSLSHSVIGAYICEYEFEVEDEDIINAIKYHTTGREDMSLLEKIIYIADLIEEGRKFPVVDTLRELAYGGKLDEALLTSFNNTLMFVINKKEEIHPRTVMARNYLIKEKLL >CP020424.2|ARC16293.1|3529218_3529908_+|nicotinate-nucleotide-adenylyltransferase MRSENLVKMAELKNTEKLEKFNRHKGKIKIGILGGTFDPIHYAHLATAEFIRDKYDIDKIIFIPSGNPPHKLCITTDKYDRYNMTLLATESNEDFLVSKVEIERKKRTYTIDTLKYLKKKYKNADIYFITGADAICSVEEWKDVKKNFELATFIAATRPGISLLRSQETIEKLTKKYNADIITVYVPSLDISSTYIREQLNEGKSIRYLVPENVENYLYENKLYQYGDD >CP020424.2|ARC16292.1|3528304_3528943_-|regulatory-protein-RecX MGIITKIEQQKRNDDRVNIYVDDKFFIAIFKELVYTFNLKKGNEINEEELKPILDDEMYIKAKNKALNILSHADQSEKKLKEKLSSEFDENIIERVIDFLKSYNLVNDSVLAQKIVNTNVNLNKCGKNRIKQNLYNKGINRSTINEAVSELDKDTEFENAMYLAKKRYERVKKEDKKKIYQKISQHLSYKGFDYDIIKRVLNKLLNFDEYDI >CP020424.2|ARC16291.1|3526148_3528152_-|1,4-alpha-glucan-branching-enzyme MKSQKRFKILDIDVYLQPFESDIKKRMKHYEDMKSKTLKNYKDFSSFANAHLYYGFHQTNDGFFYREWAPNADSLSLIGDFNNWNRKSHPLRKIGSGNWEIFIPGQNSLPHKSEVKVQVTANGKTFDRIPLYIKRVIQKDFGGFNGQIWQPKTPFIWTDNNFDLKNITSPLIYECHIGMSTESESIGTYNEFTEKILPKIKKAGYNTIQLMAIMEHPYYASFGYQVSNFYAISSRFGTPEDLKNLINTAHSMGIAVLLDLVHSHAVKNTLEGINEFDGSEHQFFHSGSKGNHPAWGTKLFNYGKPEVIHFLLSNIKFWLNEYHFDGFRFDGVTSMLYHNHGLGVSFDSYEKYFSMNTDIEAITYLQFANELIKEIKPNSISIAEDMSGMPGMCIPIKDGGIGFDYRLAMGVPDFWIKTISNLSDEDWDLGKMWYELTTRRPGEKNIGYCESHDQALVGDKTIIFWLADKEMYWNMEINSNNHVINRAISLIKLIKLITFSLAGEGYLNFMGNEFGHPEWIDFPREGNNWSYKYARRQWSLSEDNNLKYKQLLNFDKSMLELTKYSDIFIQNSHELIHMDNDKKILVYSKGKYLFIFNFHPNLIQSVDISKFQNTNYKTILNTDMVEFGGNTKKENLRDYDVYFNSTPPSSKMPIASRTAIVLLDNGI >CP020424.2|ARC16300.1|3540803_3541799_-|asparaginase MSIKKKVAIVFTGGTISMTVDDKVGAAIPTLSGEQILSMVTNIDKVADVEVFNFDEIPGPHITPYRMMELKNYVNDLLARKDITGVVITHGTDSLEETAYFLDLTIDNIKPVIVTGAMRSSSELGYDGSSNLSASVCTAVSKDAMGKGVLVVLNNEVLLASEATKTNTLSLNTFKSLTSGPLGIIDCNELVLTRDIVNRTIIDTDKVESKVALFKAYVGENADFIRFAVDSGYKGIVIEAMGRGNIPPQMLSGVEYAREKGLPVVIVSRCHSGRVFDSYGYFGSGRDLKNLGCIFGGDLPGQKARIKLILALGKTDNLDEIKDFFEKGIYC >CP020424.2|ARC16301.1|3541919_3543548_-|aspartate-4-decarboxylase MKNHTYKEIKNIYGKISPFEFKDKLIDIAKYTAKENNRELLDAGRGNPNWTCSTAREAFFTFGHFAITETRSNWDLGHLAGMPQKKGIKERFFKFINENIDMPGAYLARDIINFGINELGFDGDEFVHELADGIIGDNYPLPDRMLPHMEKIVHDYLVQEMKYDISGKYGDVEIFAVEGATAAMCYIFDSLMANELLKKGDTIALMTPIFTPYLEIPNLPRYDFKVVNINANEVDEKGAHTWQYTKKELEKLRDKSIKALFVVNPNNPASIAMDETSCNNLIDVIENYNKDLMIISDDVYGTFVEDFSSLMSKLPYNTVGVYSYSKYFGVTGWRLGTFALHKKNVFDKKINDLTGELKKSVDKRYSDMSLNPSSLSFMERVVADSRLVALNHTAGLSTPQQVQMAFFSAFALIDKVDAYKKLNMSICHRRQKLLFEALELPINENKNNAAYYTQFDIEEWAKLNYGEGLFKFISKNASPVDVLYKLANDYSVVLLSGNGFYGPEWSIRISLANLYDEAYTKIGKAIREILNGYIVEWQKIKK >CP020424.2|ARC16302.1|3544206_3545424_+|threonine-ammonia-lyase MMNVTLTDVKEARETIKNIVKRTDLLESVKLSEKTGANVFYKCENLQKTGSFKLRGACNKIASLTDEEKANGVIASSAGNHAQGVALGAKMTGIKSTIVMPATAPLAKVSATKGYGAEVVLNGAVYDDAYAKAVEIQKETGATFLHPFNDKYVIAGQGTISLEIFEQLDNKVDTILCPVGGGGIISGVAVAAKALNPNVKIVGVQTANIPSMKESIKNGKVTTAFNDTTIADGIAVKTPGDLTFEIINELVDEIVVVEETEIAESILFMMESQKIVSEGAGAVCTAAILSGKYVPAKDENVVCIISGGNIDINTLYRIIGVALAKEGRRYSFSTIMEDKPGNFAELTRIISENGGNILSANQGKLSAGEALGKQSAEFILETIDYDHIARIKKAIEEKGFKIIEL >CP020424.2|ARC16303.1|3545518_3545899_+|RidA-family-protein MKHEVIHTNDAPAALGPYSQAIKAGNLLFVSGQVPLVPETMEVVEGDVQAQTAQSLKNLKAILAESGADFSNVVKTTVFIKDMNEFGAINEVYAEYFGENKPARACVEVARLPKDVKVEIEVIAVL >CP020424.2|ARC16304.1|3546182_3546665_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MLNFFKKNKSYKLHAVVSGNSINIEKVNDSVFSKKLMGDGVAIIPNSDVVVAPCNGKVTVLTESKHAFGMVSDEGVEILVHIGIDTVSLQGEGFKNEVSQGDTVKKGSPIISFEREKINSQGIDCTTIIIVLNHSEFSEINCMVENEVVAGQDTVIEIMK >CP020424.2|ARC16305.1|3546685_3547501_+|transcriptional-antiterminator MRVVKIFNNNALSTVTNDRKEAILLGLGIGFNKRPGDKVNEDKIEKIYYVQDHMQTKFLELLKNVSPEVMDASQQIISLIPGNEGKFNNKGILSLVEHISFAIDRMKNNVFLPNLMLLDIKMMYSKEFELGVKALEIIYRVCHIHLPEDEAGYIALHFVNLQSNDNLAYDTLKFVKGSIDLIKECYGLELDESSLSTLRFRTHLKFLAQRIFKNEICQDDKMIEMYDYLINNHPKNKEYLEKLNVYIEKEFRYKLDKPEKIYLLLHLTKIL >CP020424.2|ARC16306.1|3547553_3549104_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIBC MKEKLLGGLETFAKAMVQPLMYLSSAGILMVVGVLLTNDMLLGVLPFFKWEPIQIFGSLIYNCIMAIINNLAVIFAIGIPAALAKKEKHKAALIGFMSYIIYLTASNTMLTSLGQLAKESKMLGLIGTGQATILGIQVVDTSVFGGIILGCIAGYVFNRTSNKTFKGALQIYSGANFSFICMFFVSILIGVVSNFIWPLAQQGIASLANVIKDTGTFGLFLYGFLERILVPTGLHHLIYTPFQFSDLGGVLKVGADTVSGAYAIVMTEMNLPVERFSDSIYYMATGFTKMFGYIGIGAAFIYTAYKQNKKKVKATIIPLIITAVLASVTEPLDFMFVFCAPLLFFVHAVIAGLFIALLKIFDVTALCGGNLLVSIIMNTTVGVEKTHWPVMMILGLAQIIVYFVVFSFLIKKFNYKTPGREDESTATGEEQSKQLNLDAGIENIIDGLGGKENINTVENCITRLRVNVKDESKINEDIINLTPNSGIVRKGKDIQIIFGLHVHEVRRAVEDFLEAY >CP020424.2|ARC16307.1|3549200_3550553_+|6-phospho-alpha-glucosidase MIITIVGGGSTFTPGIVKSIALREKELELEEIRLFDIDKKRQDKVAVVVNWILKEDVKTDVKLTVTNCEKEAYTDATFIFAQMRVGKYEMREQDEKIPLKYGCVGQETCGCGGMAYGLRTIQPMIKVIDDVEKYAKKDYWILNYSNPAAIVSEACRKLRPNARIINICDMPIAIIDMIAGSLNINDVHNIRYDYFGLNHFGWFTSIDYKHRDLMEEIKEYIKENKILLPKSYIENLNKSRSTGNRHAVSSWIHVWESVYTMLESFPKYLPNTYLTYYLLSKETVEHSNINRTRANEVMESREKDLFEGVRHYLETGEISEKAFYAGLHGDWISDLAVSIKNDTRSRFLVITENRGAIPNMPYDAMVEIPAYIGKDGPEVIARGPIPLFQQGLMMQQLNSEKLIVEAYIENSYEKALQAFTLNKTIPSMNVAKEILDEMIEVNKEYWPELR >CP020424.2|ARC16308.1|3550683_3551442_+|AraC-family-transcriptional-regulator MNIINKIFWQEDRIGMITNNLEADTHSHCMLQLFLGIEDSIEITVNEKLVKCNCIIVDKNISHSFSARKKVYYSAIIEPTSIYAEQLTSKMNDFGYWICDNNGLEKLRQQGTFLIDNSSKEQYLRFMEMLNNYLNIPITLKHYDDRITELLNLLRTCNCDNHTISSFADKVSLSASRLSHLFKEQIGIPLKSYILFHQMECAFRELLSGKNVTEASMTAGFDTPSHFAGTVKRMMGMPVSLSLKDSEFLKVY >CP020424.2|ARC16309.1|3551488_3552208_+|transglutaminase-domain-containing-protein MNKEYLEETKMLNYNEPQLKLLVSSKNWLELDDFHKIKSIYEFVQNDILFGYNASDMLSATQVLNDGMGQCNTKATLLMALLRAVNIPCRLHAFDVTKDFQRGATSKLISLLAPKYILHTWVEVFYQDRWIALEGVITDKKYLEAIQKKFFNHGGTFKKYAIATNDLKNTSIDWDGKDTFIQKEAIVYDYGIFPSPDVFFSTHSQHMSKLKNFIYVHLIRKIMTKNVCKARNNYIDKNE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP020424_13 | 3786440-3786926 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP020424_13
|
7 spacers
spacers of CP020424_13
>13.1|3786468|37|CP020424|PILER-CR,CRT AATTTTTGACGCTATGAAGAAATTTACTACAAAATTT >13.2|3786533|37|CP020424|PILER-CR,CRT AACTTTTTTCATCCTCCCAAACCTCTTGTTCGCTGTC >13.3|3786598|39|CP020424|PILER-CR,CRT AAAGAAAATAAGTTTAAAAAAAGGTTTCATTATTATATC >13.4|3786665|37|CP020424|PILER-CR,CRT ACCAATTATGTACAGTTTAGTTACTGTGTTAAGTCTT >13.5|3786730|38|CP020424|PILER-CR,CRT ATCCTTTTATAAATATCTTCTGACATGTGTATATGCTT >13.6|3786796|37|CP020424|PILER-CR,CRT TCGGCTACAACGGTATAAATTAAATTTAGCAGGGTAC >13.7|3786469|36|CP020424|CRISPRCasFinder ATTTTTGACGCTATGAAGAAATTTACTACAAAATTT >13.8|3786534|36|CP020424|CRISPRCasFinder ACTTTTTTCATCCTCCCAAACCTCTTGTTCGCTGTC >13.9|3786599|38|CP020424|CRISPRCasFinder AAGAAAATAAGTTTAAAAAAAGGTTTCATTATTATATC >13.10|3786666|36|CP020424|CRISPRCasFinder CCAATTATGTACAGTTTAGTTACTGTGTTAAGTCTT >13.11|3786731|37|CP020424|CRISPRCasFinder TCCTTTTATAAATATCTTCTGACATGTGTATATGCTT >13.12|3786797|36|CP020424|CRISPRCasFinder CGGCTACAACGGTATAAATTAAATTTAGCAGGGTAC >13.13|3786862|36|CP020424|CRISPRCasFinder TGCTGTGATTTCAATAATAAAACAATTAATAATTGT >13.14|3786861|37|CP020424|CRT TTGCTGTGATTTCAATAATAAAACAATTAATAATTGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020424_13
The CRISPR arrays of CP020424_13 >merge|CP020424|13|3786440-3786926|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAAATTTTTGACGCTATGAAGAAATTTACTACAAAATTTGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAAACTTTTTTCATCCTCCCAAACCTCTTGTTCGCTGTCGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAAAAGAAAATAAGTTTAAAAAAAGGTTTCATTATTATATCGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAACCAATTATGTACAGTTTAGTTACTGTGTTAAGTCTTGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAATCCTTTTATAAATATCTTCTGACATGTGTATATGCTTGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATCGGCTACAACGGTATAAATTAAATTTAGCAGGGTACATTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTGCTGTGATTTCAATAATAAAACAATTAATAATTGTGTTTTAGATTAACTATGTGGATTCAAAAT >CP020424|13|7|3786440-3786860|PILER-CR GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA AATTTTTGACGCTATGAAGAAATTTACTACAAAATTT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA AACTTTTTTCATCCTCCCAAACCTCTTGTTCGCTGTC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA AAAGAAAATAAGTTTAAAAAAAGGTTTCATTATTATATC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA ACCAATTATGTACAGTTTAGTTACTGTGTTAAGTCTT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA ATCCTTTTATAAATATCTTCTGACATGTGTATATGCTT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TCGGCTACAACGGTATAAATTAAATTTAGCAGGGTAC ATTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA >CP020424|13|14|3786440-3786926|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAA ATTTTTGACGCTATGAAGAAATTTACTACAAAATTT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAA ACTTTTTTCATCCTCCCAAACCTCTTGTTCGCTGTC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAA AAGAAAATAAGTTTAAAAAAAGGTTTCATTATTATATC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAA CCAATTATGTACAGTTTAGTTACTGTGTTAAGTCTT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAA TCCTTTTATAAATATCTTCTGACATGTGTATATGCTT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CGGCTACAACGGTATAAATTAAATTTAGCAGGGTAC ATTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TGCTGTGATTTCAATAATAAAACAATTAATAATTGT GTTTTAGATTAACTATGTGGATTCAAAAT >CP020424|13|7|3786440-3786925|CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA AATTTTTGACGCTATGAAGAAATTTACTACAAAATTT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA AACTTTTTTCATCCTCCCAAACCTCTTGTTCGCTGTC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA AAAGAAAATAAGTTTAAAAAAAGGTTTCATTATTATATC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA ACCAATTATGTACAGTTTAGTTACTGTGTTAAGTCTT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA ATCCTTTTATAAATATCTTCTGACATGTGTATATGCTT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TCGGCTACAACGGTATAAATTAAATTTAGCAGGGTAC ATTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAA TTGCTGTGATTTCAATAATAAAACAATTAATAATTGT GTTTTAGATTAACTATGTGGATTCAAAA
>CP020424.2|ARC16504.1|3785249_3786134_+|hypothetical-protein MVGAFVLPNYAIILSEMSNLWGNFIMWILVPIITIVLLIIAVSSMQYILVMIAFLLIIYSFIEKKIVMGLVSVLFFTYSIYLCATWEDKSLIADNKVETVKAQRETVEREKEMERRRIQEEVDKERYIEKHGMEISENDLKVKLEALVPQEYKGKKYELKVGKFKRYSMYFDLTVQNEKFSNSEECKKFVKEIANDLKKIKISKAYFKFHSKDDGGIYNSVYIDYFRNIQNNVDNVENLEFNEFELKTEEEEKREQEKIEQEKNSYNNYIQNRVVDPLDRIKKLKELLDSGAIT >CP020424.2|ARC16503.1|3784903_3785056_+|hypothetical-protein MDNFLFNVLASVTASYIVYLISKLIKKVKSHSTAKSDLKIDINFKYHRKK >CP020424.2|AVI58993.1|3784297_3784630_+|hypothetical-protein MNDMARDVFSVKMTPLEAQKMVEKNLEADLVSVDIYNLENNKSIIVTIFEKYYARSNSDAGLVVICENTTGKTLVKITSTGSAIGLFQIDWGTGNNLIKRVKKILIDYII >CP020424.2|ARC16502.1|3784016_3784271_+|hypothetical-protein MENKDIKLTICIFAFVIGIIVLFCCIGLGQFNMDCIIKQNGGSIATEQYNIYLEQSISQYRNFGSILVLLGGIGILFDKSVRKY >CP020424.2|ARC16500.1|3781924_3782299_+|BlaI/MecI/CopY-family-transcriptional-regulator MKEEILIEKLLRAELIVMEYLWKKDTLMPKKEIVKEIKQIYGWHKSTIKILLKRLVAKRYLARYIINSQSHYKIIDSKEYYTFKKKVLKSSKSIKIMRSLTTTHKNVSKEKLDLLDEYYRNLKE >CP020424.2|ARC16499.1|3780632_3781121_-|prepilin-type-N-terminal-cleavage/methylation-domain-containing-protein MKNKKGFTLVELLVVIAIIGILAIVALPALFKNIEKAKIAKLEADISAIKSASLSYYADESKYTEGNIIWWTKKDGKITVNSGIGDEDPLAHKIENLGMPYNGSYTLVSSNGSEEYLELNIIIDGEISKSGLDKLEEDYGSSITIPNDKNMIITFLSNKSDN >CP020424.2|ARC16497.1|3778895_3779246_-|DUF3796-domain-containing-protein MIQKKFFMGFCGFLGFLSLRYFSSGNVADLTYIGFFAFFSNFIIAKINGDKADERYVQDEKAAMAFTGQLAIIELFILWCITIVSRNIELMCVLLSITYAITLNVYAIKLYILEEK >CP020424.2|ARC16496.1|3778693_3778894_-|transcriptional-regulator MPKFTCNLKKYRQLKELTQEQLAEKVGVRRETIMRLEAGKYNPSLKLAIDISKIVDTPIDELFIFD >CP020424.2|ARC16495.1|3778194_3778371_-|hypothetical-protein MFRDKMDKCTHMLTAYIGSSYDYCDFIDTQLDDFILEYGEKVVESCLHQVMVLVSKYN >CP020424.2|ARC16494.1|3777769_3777970_-|cold-shock-protein MNNGIVKWFNNEKGFGFISMESGDDVFAHFSAIQTSGFKSLEEGQKVSFDIVKGARGPQAENITIL >CP020424.2|ARC16505.1|3787388_3787754_+|hypothetical-protein MKNELMMFEGKEIEVFEFEGRILFNSKDVVNCLDIKNVNENIRLMNEKQVVKLRNSDISNTDIRKLNNAGENFLTESGVYKLIFKSRKEEAERFQGWISDEVLPSIRQTGAYINNNAIPKS >CP020424.2|ARC16852.1|3787807_3788203_+|hypothetical-protein MLKELLDDAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEDGEVKGVWEINGSWTGTVNKYTKSVIDKVRTWIEENNRPTKIAGEKKNYYVFYKIE >CP020424.2|ARC16506.1|3788254_3788416_+|hypothetical-protein MCENLLDNMYIEKRKEEYRIKLLKIRETDIDIYNKLESIVYKLSEKKLEKNNK >CP020424.2|AVI58994.1|3788743_3789208_-|hypothetical-protein MDFGEVKSELSDKDLKDNEEALNKYKKYYLKVYKYYSEMDSIKSIQDIEIEQSRLKGQLQKNSNPIFALYISIMAVVFSTTINLTFDLSDITNYFIRMIMTLLFIVLLIFLVNKGILPIAIPYRNNIQFYTTALDVFEDMKNKILRERKYKKRR >CP020424.2|ARC16507.1|3789343_3789661_-|hypothetical-protein MDFGNINLILIGIIVIIGTTIIYLIKPKTAFCSKKYFNKLESIYGNIDKKKTVKLEVLYRYVTGLEYIAIGLFTRRLDITIIAIILVAIITTALYYLIRKKYITI >CP020424.2|ARC16508.1|3789943_3790240_-|hypothetical-protein MYFKTYILKREVNNKQLEITRSFDLDNLICTATEILKDNEIDLIITDEVNNVVWRNEKSTPPARECLVIAIEVYWWYTSIFLLYHINYVIKKSYLNRF >CP020424.2|ARC16509.1|3790258_3790672_-|hypothetical-protein MKVKSKRSFIVGIIVCVLCCASLVIYCILKDKRFLISSFLLIVIAIFNFCNAFSRKGIVEELHDSTDERDLYLTMKTSHILVKIMNYTLFTFTFLFIIAYSAWKNQSLLVIAITLCVIEIFLFVAYLLINIFLEKKE >CP020424.2|ARC16510.1|3790655_3790889_-|transcriptional-regulator MKTKVREFRTNMGLTQQQLADLVHVSNRTIISIEKEQYSPSLMLAYRMAQVFGTTIEELCCLKENKEMEDKKHESKE >CP020424.2|ARC16511.1|3791107_3791482_+|transcriptional-regulator MKISKLPEAELKVMRYICEANKVLTSRELVAAMEEKYEWNESTTFTVLKRLERREFLSTEKIGKLTHYNILVKEKKYLRFETKEFLKNIHKNSISSLMSALHGEDDEVDEDKLSELEECFKNLK >CP020424.2|ARC16512.1|3792093_3792786_+|DNA-binding-response-regulator MYNILVVDDDKEIVDSIEIYLKSEGFKIYKAYDGMKALEIITENDIHLILMDIMMPKLDGIKATVKIREERNIPIILISAKSEDTDKIIGLNIGADDYITKPFNLLELIARVKSNLRRYVTLGNYEDTCKEILKSGALELNTLTKEVKIDGENIKMTPIEYKIIELLLENKGRVFSIDEIYEKVWNEESFNSENTVAVHIRRIREKIEINPKEPRFLKVVWGVGYKIEKF |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP020424_6 | 6.1|2064065|35|CP020424|CRISPRCasFinder | 2064065-2064099 | 35 | CP020424.2 | 1040691-1040725 | 0 | 1.0 |
| CP020424_6 | 6.1|2064065|35|CP020424|CRISPRCasFinder | 2064065-2064099 | 35 | CP020424.2 | 2046570-2046604 | 0 | 1.0 |
| CP020424_6 | 6.1|2064065|35|CP020424|CRISPRCasFinder | 2064065-2064099 | 35 | CP020424.2 | 2163127-2163161 | 0 | 1.0 |
| CP020424_6 | 6.1|2064065|35|CP020424|CRISPRCasFinder | 2064065-2064099 | 35 | CP020424.2 | 2177464-2177498 | 0 | 1.0 |
| CP020424_6 | 6.1|2064065|35|CP020424|CRISPRCasFinder | 2064065-2064099 | 35 | CP020424.2 | 2478068-2478102 | 1 | 0.971 |
1. spacer 6.1|2064065|35|CP020424|CRISPRCasFinder matches to position: 1040691-1040725, mismatch: 0, identity: 1.0
agcgccaacaaacaaacttcacatgcgttcagttt CRISPR spacer agcgccaacaaacaaacttcacatgcgttcagttt Protospacer ***********************************
2. spacer 6.1|2064065|35|CP020424|CRISPRCasFinder matches to position: 2046570-2046604, mismatch: 0, identity: 1.0
agcgccaacaaacaaacttcacatgcgttcagttt CRISPR spacer agcgccaacaaacaaacttcacatgcgttcagttt Protospacer ***********************************
3. spacer 6.1|2064065|35|CP020424|CRISPRCasFinder matches to position: 2163127-2163161, mismatch: 0, identity: 1.0
agcgccaacaaacaaacttcacatgcgttcagttt CRISPR spacer agcgccaacaaacaaacttcacatgcgttcagttt Protospacer ***********************************
4. spacer 6.1|2064065|35|CP020424|CRISPRCasFinder matches to position: 2177464-2177498, mismatch: 0, identity: 1.0
agcgccaacaaacaaacttcacatgcgttcagttt CRISPR spacer agcgccaacaaacaaacttcacatgcgttcagttt Protospacer ***********************************
5. spacer 6.1|2064065|35|CP020424|CRISPRCasFinder matches to position: 2478068-2478102, mismatch: 1, identity: 0.971
agcgccaacaaacaaacttcacatgcgttcagttt CRISPR spacer agcgctaacaaacaaacttcacatgcgttcagttt Protospacer *****.*****************************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP020424_1 | 1.9|375110|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 375110-375146 | 37 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 14871-14907 | 0 | 1.0 |
| CP020424_2 | 2.3|549437|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 549437-549472 | 36 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 39008-39043 | 0 | 1.0 |
| CP020424_5 | 5.1|2048591|28|CP020424|CRISPRCasFinder | 2048591-2048618 | 28 | NZ_CP033215 | Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence | 5105-5132 | 0 | 1.0 |
| CP020424_7 | 7.3|3041478|36|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3041478-3041513 | 36 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 3353-3388 | 0 | 1.0 |
| CP020424_12 | 12.1|3539235|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3539235-3539271 | 37 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 5974-6010 | 0 | 1.0 |
| CP020424_12 | 12.1|3539235|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3539235-3539271 | 37 | NZ_CP029156 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence | 40297-40333 | 0 | 1.0 |
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| CP020424_13 | 13.5|3786730|38|CP020424|PILER-CR,CRT | 3786730-3786767 | 38 | JX145342 | Clostridium phage phiMMP04, complete genome | 12593-12630 | 2 | 0.947 |
| CP020424_13 | 13.13|3786862|36|CP020424|CRISPRCasFinder | 3786862-3786897 | 36 | NZ_MG973074 | Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence | 22132-22167 | 2 | 0.944 |
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| CP020424_4 | 4.5|1898006|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1898006-1898041 | 36 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 17906-17941 | 3 | 0.917 |
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| CP020424_1 | 1.11|375242|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 375242-375278 | 37 | NZ_CP011969 | Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence | 25214-25250 | 4 | 0.892 |
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| CP020424_7 | 7.4|3041543|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3041543-3041579 | 37 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 28341-28377 | 6 | 0.838 |
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| CP020424_7 | 7.4|3041543|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3041543-3041579 | 37 | NC_048665 | Clostridium phage phiCDHM14, complete genome | 22171-22207 | 7 | 0.811 |
| CP020424_7 | 7.4|3041543|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3041543-3041579 | 37 | HG796225 | Clostridium phage phiCDHM13 complete genome | 21671-21707 | 7 | 0.811 |
| CP020424_7 | 7.4|3041543|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3041543-3041579 | 37 | LN681538 | Clostridium phage phiCD481-1, complete genome | 21411-21447 | 7 | 0.811 |
| CP020424_7 | 7.4|3041543|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3041543-3041579 | 37 | HG798901 | Clostridium phage phiCDHM11 complete genome | 21671-21707 | 7 | 0.811 |
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| CP020424_12 | 12.2|3539301|38|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3539301-3539338 | 38 | MK448769 | Streptococcus phage Javan471, complete genome | 1703-1740 | 9 | 0.763 |
| CP020424_12 | 12.2|3539301|38|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3539301-3539338 | 38 | MK448684 | Streptococcus phage Javan151, complete genome | 1703-1740 | 9 | 0.763 |
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| CP020424_1 | 1.9|375110|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 375110-375146 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 5167-5203 | 10 | 0.73 |
| CP020424_1 | 1.9|375110|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 375110-375146 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 15234-15270 | 10 | 0.73 |
| CP020424_1 | 1.9|375110|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 375110-375146 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 14730-14766 | 10 | 0.73 |
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| CP020424_4 | 4.6|1898071|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1898071-1898108 | 38 | NZ_CP053963 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_802 plasmid unnamed3, complete sequence | 113574-113611 | 10 | 0.737 |
| CP020424_4 | 4.6|1898071|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1898071-1898108 | 38 | NZ_CP047143 | Lactobacillus sp. C25 plasmid unnamed, complete sequence | 158818-158855 | 10 | 0.737 |
| CP020424_4 | 4.6|1898071|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1898071-1898108 | 38 | NZ_CP049229 | Lactobacillus iners strain C0210C1 plasmid pC0210C1, complete sequence | 9438-9475 | 10 | 0.737 |
| CP020424_4 | 4.6|1898071|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1898071-1898108 | 38 | NZ_CP049229 | Lactobacillus iners strain C0210C1 plasmid pC0210C1, complete sequence | 18472-18509 | 10 | 0.737 |
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| CP020424_7 | 7.3|3041478|36|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3041478-3041513 | 36 | MK448421 | Streptococcus satellite phage Javan312, complete genome | 4648-4683 | 10 | 0.722 |
| CP020424_7 | 7.2|3041412|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3041412-3041448 | 37 | NZ_CP023496 | Staphylococcus simulans strain FDAARGOS_383 plasmid unnamed, complete sequence | 97606-97642 | 11 | 0.703 |
| CP020424_12 | 12.7|3539634|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3539634-3539670 | 37 | MN693317 | Marine virus AFVG_25M47, complete genome | 11036-11072 | 11 | 0.703 |
1. spacer 1.9|375110|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggcttgcaaaccattcgacaatgctatttattatttc CRISPR spacer ggcttgcaaaccattcgacaatgctatttattatttc Protospacer *************************************
2. spacer 2.3|549437|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cttagagaaagcgaaaacgtaccattaaaatcaaat CRISPR spacer cttagagaaagcgaaaacgtaccattaaaatcaaat Protospacer ************************************
3. spacer 5.1|2048591|28|CP020424|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttgattcatattgctttaacttattac CRISPR spacer gttgattcatattgctttaacttattac Protospacer ****************************
4. spacer 7.3|3041478|36|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaattatatattgcaaaaaaatatggagtcacagag CRISPR spacer gaattatatattgcaaaaaaatatggagtcacagag Protospacer ************************************
5. spacer 12.1|3539235|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcagcatctatgccatttactttattaacttcctcat CRISPR spacer tcagcatctatgccatttactttattaacttcctcat Protospacer *************************************
6. spacer 12.1|3539235|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcagcatctatgccatttactttattaacttcctcat CRISPR spacer tcagcatctatgccatttactttattaacttcctcat Protospacer *************************************
7. spacer 12.1|3539235|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcagcatctatgccatttactttattaacttcctcat CRISPR spacer tcagcatctatgccatttactttattaacttcctcat Protospacer *************************************
8. spacer 12.7|3539634|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN680005 (Clostridium phage phiCDHM4 gp01 gene for putative capsid protein) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgggtattttgctaaaaataaagctattaaattaga CRISPR spacer ttgggtattttgctaaaaataaagctattaaattaga Protospacer *************************************
9. spacer 13.4|3786665|37|CP020424|PILER-CR,CRT matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
accaattatgtacagtttagttactgtgttaagtctt CRISPR spacer accaattatgtacagtttagttactgtgttaagtctt Protospacer *************************************
10. spacer 13.10|3786666|36|CP020424|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ccaattatgtacagtttagttactgtgttaagtctt CRISPR spacer ccaattatgtacagtttagttactgtgttaagtctt Protospacer ************************************
11. spacer 1.9|375110|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ggcttgcaaaccattcgacaatgctatttattatttc CRISPR spacer ggcttacaaaccattcgacaatgctatttattatttc Protospacer *****.*******************************
12. spacer 1.9|375110|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ggcttgcaaaccattcgacaatgctatttattatttc CRISPR spacer ggcttacaaaccattcgacaatgctatttattatttc Protospacer *****.*******************************
13. spacer 1.9|375110|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ggcttgcaaaccattcgacaatgctatttattatttc CRISPR spacer ggcttacaaaccattcgacaatgctatttattatttc Protospacer *****.*******************************
14. spacer 3.6|660385|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
atgtatttatttgttcttgtactattgttttactct CRISPR spacer atgtatttatttgttcttgtactattgttttacttt Protospacer **********************************.*
15. spacer 3.6|660385|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
atgtatttatttgttcttgtactattgttttactct CRISPR spacer atgtatttatttgttcttgtactattgttttacttt Protospacer **********************************.*
16. spacer 3.10|660647|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ttgtaaggataagcctagagagaatagcccttctctct CRISPR spacer ctgtaaggataagcctagagagaatagcccttctctct Protospacer .*************************************
17. spacer 3.10|660647|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ttgtaaggataagcctagagagaatagcccttctctct CRISPR spacer ctgtaaggataagcctagagagaatagcccttctctct Protospacer .*************************************
18. spacer 6.1|2064065|35|CP020424|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
agcgccaacaaacaaacttcacatgcgttcagttt CRISPR spacer agcgccaacaaacaaacttcacatgtgttcagttt Protospacer *************************.*********
19. spacer 7.4|3041543|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gttttcaaaaaaaatggaacaatcatacaaaatgatt CRISPR spacer gtttttaaaaaaaatggaacaatcatacaaaatgatt Protospacer *****.*******************************
20. spacer 12.4|3539434|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ctatcggcttcttgaaaagcctcatctgctctattta CRISPR spacer ctatcggcttcttgaaaagcctcatctgctctatcta Protospacer **********************************.**
21. spacer 12.4|3539434|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ctatcggcttcttgaaaagcctcatctgctctattta CRISPR spacer ctatcggcttcttgaaaagcctcatctgctctatcta Protospacer **********************************.**
22. spacer 12.4|3539434|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ctatcggcttcttgaaaagcctcatctgctctattta CRISPR spacer ctatcggcttcttgaaaagcctcatctgctctatcta Protospacer **********************************.**
23. spacer 12.5|3539500|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttcattaaatccccaaccgaattatctttcagcattt CRISPR spacer ttcattaaatccccaaccgaattatctttcaacattt Protospacer *******************************.*****
24. spacer 12.5|3539500|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
ttcattaaatccccaaccgaattatctttcagcattt CRISPR spacer ttcattaaatccccaaccgaattatctttcaacattt Protospacer *******************************.*****
25. spacer 13.9|3786599|38|CP020424|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aagaaaataagtttaaaaaaaggtttcattattatatc CRISPR spacer aagaaaataagtttaaaaaaaggtttcattattctatc Protospacer ********************************* ****
26. spacer 13.11|3786731|37|CP020424|CRISPRCasFinder matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
tccttttataaatatcttctgacatgtgtatatgctt CRISPR spacer accttttataaatatcttctgacatgtgtatatgctt Protospacer ************************************
27. spacer 1.11|375242|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
tagtctcaactttcaaataatcttctttttctatcag CRISPR spacer tagtctcaactttcaaataatcttctttttctaccaa Protospacer *********************************.**.
28. spacer 3.10|660647|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ttgtaaggataagcctagagagaatagcccttctctct CRISPR spacer ctgtaaggataagcctagagggaatagcccttctctct Protospacer .*******************.*****************
29. spacer 3.10|660647|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ttgtaaggataagcctagagagaatagcccttctctct CRISPR spacer ctgtaaggataagcctagagggaatagcccttctctct Protospacer .*******************.*****************
30. spacer 3.10|660647|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ttgtaaggataagcctagagagaatagcccttctctct CRISPR spacer ctgtaaggataagcctagagggaatagcccttctctct Protospacer .*******************.*****************
31. spacer 3.10|660647|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ttgtaaggataagcctagagagaatagcccttctctct CRISPR spacer ctgtaaggataagcctagagggaatagcccttctctct Protospacer .*******************.*****************
32. spacer 3.10|660647|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ttgtaaggataagcctagagagaatagcccttctctct CRISPR spacer ctgtaaggataagcctagagggaatagcccttctctct Protospacer .*******************.*****************
33. spacer 3.10|660647|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
ttgtaaggataagcctagagagaatagcccttctctct CRISPR spacer ctgtaaggataagcctagagggaatagcccttctctct Protospacer .*******************.*****************
34. spacer 7.5|3041609|34|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tctataattatgcgtgatttgattggtagaaacc CRISPR spacer tccataatcatgcgtgatttgattggtagaaacc Protospacer **.*****.*************************
35. spacer 7.5|3041609|34|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tctataattatgcgtgatttgattggtagaaacc CRISPR spacer tctataattatgcgagatttaattggtagaaacc Protospacer ************** *****.*************
36. spacer 12.1|3539235|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
tcagcatctatgccatttactttattaacttcctcat CRISPR spacer ttagtatctatgccatttactttattaacttcctcat Protospacer *.**.********************************
37. spacer 12.1|3539235|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
tcagcatctatgccatttactttattaacttcctcat CRISPR spacer ttagtatctatgccatttactttattaacttcctcat Protospacer *.**.********************************
38. spacer 12.2|3539301|38|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
agtatttcagcaattttacttttaataactttatcagc CRISPR spacer agtgtttcagcaattttccttttaataactttatcagc Protospacer ***.************* ********************
39. spacer 13.3|3786598|39|CP020424|PILER-CR,CRT matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.949
aaagaaaataagtttaaaaaaaggtttcattattatatc CRISPR spacer taagaaaataagtttaaaaaaaggtttcattattctatc Protospacer ********************************* ****
40. spacer 13.5|3786730|38|CP020424|PILER-CR,CRT matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
atccttttataaatatcttctgacatgtgtatatgctt CRISPR spacer caccttttataaatatcttctgacatgtgtatatgctt Protospacer ************************************
41. spacer 13.13|3786862|36|CP020424|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tgctgtgatttcaataataaaacaattaataattgt CRISPR spacer tgctgtgattttattaataaaacaattaataattgt Protospacer ***********.* **********************
42. spacer 13.14|3786861|37|CP020424|CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ttgctgtgatttcaataataaaacaattaataattgt CRISPR spacer ttgctgtgattttattaataaaacaattaataattgt Protospacer ************.* **********************
43. spacer 3.10|660647|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
-ttgtaaggataagcctagagagaatagcccttctctct CRISPR spacer gctgtaaggat-agcctagagagaataacccttctctct Protospacer .********* ***************.***********
44. spacer 4.5|1898006|36|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
agaaagattaaaaaatagaatgatacttcttacaac CRISPR spacer agaaagattaaaaaatagaatgatacttcctccaat Protospacer *****************************.* ***.
45. spacer 1.11|375242|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
tagtctcaactttcaaataatcttctttttctatcag CRISPR spacer tagtctcaacttttaaatattcttctttttctattaa Protospacer *************.***** **************.*.
46. spacer 1.11|375242|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
tagtctcaactttcaaataatcttctttttctatcag CRISPR spacer tagtctcaacttttaaatattcttctttttctattaa Protospacer *************.***** **************.*.
47. spacer 2.1|549303|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.895
ataagtaatataaatttatgtaaagcaacaaaagatag CRISPR spacer gtaagtaatataaatctatgcaaagcaacaaaagatgg Protospacer .**************.****.***************.*
48. spacer 4.6|1898071|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
gaataacaataagaataacaacaacaataaaaaggtta CRISPR spacer gaataacaataagaataacaacaacaataaggatgatt Protospacer ******************************..* * *
49. spacer 5.1|2048591|28|CP020424|CRISPRCasFinder matches to KY971610 (Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
gttgattcatattgctttaacttattac CRISPR spacer gatgattcgtattgctgtaacttatcgt Protospacer * ******.******* ********...
50. spacer 7.4|3041543|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
---gttttcaaaaaaaatggaacaatcatacaaaatgatt CRISPR spacer ccgatttt---gaaaaatggaacaatcgtacaaaatgatt Protospacer .**** .***************.************
51. spacer 7.4|3041543|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
---gttttcaaaaaaaatggaacaatcatacaaaatgatt CRISPR spacer ccgatttt---gaaaaatggaacaatcgtacaaaatgatt Protospacer .**** .***************.************
52. spacer 7.4|3041543|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
---gttttcaaaaaaaatggaacaatcatacaaaatgatt CRISPR spacer ccgatttt---gaaaaatggaacaatcgtacaaaatgatt Protospacer .**** .***************.************
53. spacer 7.4|3041543|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
---gttttcaaaaaaaatggaacaatcatacaaaatgatt CRISPR spacer ccgatttt---gaaaaatggaacaatcgcacaaaatgatt Protospacer .**** .***************..***********
54. spacer 7.4|3041543|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
---gttttcaaaaaaaatggaacaatcatacaaaatgatt CRISPR spacer ccgatttt---gaaaaatggaacaatcgcacaaaatgatt Protospacer .**** .***************..***********
55. spacer 7.4|3041543|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
---gttttcaaaaaaaatggaacaatcatacaaaatgatt CRISPR spacer ccgatttt---gaaaaatggaacaatcgcacaaaatgatt Protospacer .**** .***************..***********
56. spacer 7.4|3041543|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
---gttttcaaaaaaaatggaacaatcatacaaaatgatt CRISPR spacer ccgatttt---gaaaaatggaacaatcgcacaaaatgatt Protospacer .**** .***************..***********
57. spacer 7.1|3041347|36|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693244 (Marine virus AFVG_25M166, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tttccctgcattaacaaaatcttcaacattcaaaaa CRISPR spacer ataaataccattagcaaaatcttcatcattcaaaaa Protospacer * . *****.*********** **********
58. spacer 12.2|3539301|38|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448895 (Streptococcus phage Javan274, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
--agtatttcagcaattttacttttaataactttatcagc CRISPR spacer ctattgattt--cagttttacttttagtaactttatcaga Protospacer * *. **. **.***********.************
59. spacer 12.2|3539301|38|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448769 (Streptococcus phage Javan471, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
--agtatttcagcaattttacttttaataactttatcagc CRISPR spacer ctattgattt--cagttttacttttagtaactttatcaga Protospacer * *. **. **.***********.************
60. spacer 12.2|3539301|38|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448684 (Streptococcus phage Javan151, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
--agtatttcagcaattttacttttaataactttatcagc CRISPR spacer ctattgattt--cagttttacttttagtaactttatcaga Protospacer * *. **. **.***********.************
61. spacer 1.9|375110|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ggcttgcaaaccattcgacaatgctatttattatttc CRISPR spacer tttgtttaaaccattcgacaatattatttattatagc Protospacer . * .***************..********** *
62. spacer 1.9|375110|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ggcttgcaaaccattcgacaatgctatttattatttc CRISPR spacer tttgtttaaaccattcgacaatattatttattatagc Protospacer . * .***************..********** *
63. spacer 1.9|375110|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ggcttgcaaaccattcgacaatgctatttattatttc CRISPR spacer tttgtttaaaccattcgacaatattatttattatagc Protospacer . * .***************..********** *
64. spacer 1.9|375110|37|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ggcttgcaaaccattcgacaatgctatttattatttc CRISPR spacer tttgtttaaaccattcgacaatattatttattatagc Protospacer . * .***************..********** *
65. spacer 4.6|1898071|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009639 (Bacillus cereus 03BB108 plasmid pBFI_1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
gaataacaataagaataacaacaacaataaaaaggtta CRISPR spacer caataacaataacaataacaataacaattcgaataatg Protospacer *********** ********.****** .** . *.
66. spacer 4.6|1898071|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP053963 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_802 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
gaataacaataagaataacaacaacaataaaaaggtta CRISPR spacer caataacaataacaataacaataacaattcgaataatg Protospacer *********** ********.****** .** . *.
67. spacer 4.6|1898071|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP047143 (Lactobacillus sp. C25 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
gaataacaataagaataacaacaacaataaaaaggtta CRISPR spacer taataacaacaataataacaacaacaataactcatcaa Protospacer ********.** ***************** . . *
68. spacer 4.6|1898071|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP049229 (Lactobacillus iners strain C0210C1 plasmid pC0210C1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
gaataacaataagaataacaacaacaataaaaaggtta CRISPR spacer taataacaataataataacaataacaatagttctaata Protospacer *********** ********.*******. . **
69. spacer 4.6|1898071|38|CP020424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP049229 (Lactobacillus iners strain C0210C1 plasmid pC0210C1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
gaataacaataagaataacaacaacaataaaaaggtta CRISPR spacer taataacaataataataacaataacaatagttctaata Protospacer *********** ********.*******. . **
70. spacer 7.1|3041347|36|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019782 (Lactobacillus phage AQ113, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tttccctgcattaacaaaatcttcaacattcaaaaa CRISPR spacer actttcaacattaataaaatcttcaacattaaaatt Protospacer .*..* .******.*************** ***
71. spacer 7.3|3041478|36|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448421 (Streptococcus satellite phage Javan312, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
gaattatatattgcaaaaaaatatggagtcacagag--- CRISPR spacer cgtttatatattgcaaaaaaatataaagt---ggatttt Protospacer . *********************..*** .**
72. spacer 7.2|3041412|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023496 (Staphylococcus simulans strain FDAARGOS_383 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
tatgaatatattacataatcataaagatttacaaatg CRISPR spacer ttaagatatattacataatcccaaagatttaagataa Protospacer * ..*************** .********* .* .
73. spacer 12.7|3539634|37|CP020424|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693317 (Marine virus AFVG_25M47, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ttgggtattttgctaaaaataaagctattaaattaga CRISPR spacer ctgaaagcagagctaaaaataaagctggtaaattaga Protospacer .**.. .. ***************. *********
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
620168 : 629895
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020424|620168:629895|DBSCAN-SWA TTTAGTCTAAATAATCTCTAAGTTTTTTTGATCTACTTGGATGTCTTAGTTTTCTTAGTGCTTTTGCTTCTATCTGTCTTATTCTCTCTCTAGTTACATCAAACTCTTTTCCAACTTCCTCAAGAGTTCTGGCTCTACCATCCTCAAGACCAAATCTAAGCTTTAATACTTTTTGTTCTCTATCATTTAATGAACCAAGTACATCTTCTATTTGTTCTTTTAATAAAGAATATGCTGCTGCCTCTGCTGGGGCTGGAGCATCATCATCTGGAATAAAGTCACCTAAATGGCTATCTTCTTCTTCTCCTATTGGTGTTTCTAAAGACACAGGGTCTTGAGCTATTTTCATTATTTCTCTTACTTTATCTTCTGTCATTTCCATTTCTTTTGCAATTTCTTCTGGTTTTGGATCTCTTCCAAGTTCTTGAAGTAGTTGTCTTGATACTCTTATTAGCTTATTTATAGTCTCTACCATATGAACTGGTATTCTTATAGTTCTAGCTTGGTCTGCAATAGCACGTGTTATAGCTTGTCTTATCCACCATGTTGCATAAGTACTAAACTTATATCCTTTTGTATAGTCAAATTTTTCGACTGCTTTTATAAGACCTAAATTTCCCTCTTGTATTAAATCCAAGAAAAGCATACCTCTTCCTACATATCTTTTTGCTATACTTACAACTAGTCTTAAGTTTGCTTCAACTAACCTTTGTTTTGCTATCTCATCACCTTCGTGCATCCTTCTAGCAAATTCTACTTCTTCATGTGGTTTAAGTAGAGGAATTTTTCCTATTTCTTTTAAGTACATTCTTACAGGGTCATCTATACTTATCCCTTTTGGTAAAGATAAATCCACAGTTTCTATTTCTATTGCAGAAGAGTCATCATGTGAAATTGCCTCTGCATCTTCATCTAAGTGGCCTATACTTAAATCGTCATCAGCAACCGAAAAATCTATATCAGCTTTATAGTTTTTTGTTTCTGTTATTTCTATTCCCAAATTTCCTAAAGTCTCATAAAGATTTTCTACTTGATCCTTATCAAGTTCAGTCTCCGAAAAAGCTTCCATTATCTCTGCAAGTGTCAGAGAACCTTGCTTTTTTCCTTTTTCTATTAATGTCTTAGCAGTAACCTTTTTTAACTCTTTTTTATTCGATTTATTTTCCACACTCAAACCTCCTTTCTCTACAAGCTCTTTAAAATTTTATTTATCTCAACTATTTTTAAAGCAATTTCCATAACTCTACCATCTACCTCTTTCATATCATTATTATTTTCTAATTCTTGTTGTTCTCTCAACAAGCTATTAATTTGCTCTTCTAATGAGTTTTTTCTGATATTTGTTATTATTCCTTCTATTTCTTTTGTGTTCTCTAAGTTTATACTATTCAAAGAAATTGAATTTAATTCTTTTAAGTATTCTTCGGATATGTTTAAACTTTTCAATTTGTCAATAGTTATTTTGTCCAATTCTTGATTTTTAATCATGTAATTTAAAATTTCTTTACTTTCTTTCAATAAAAAATCACTTTCTTCTACTTTAAGTAACGCTATTTCTCTAATTTTTTTGTCTTCTAACATTATTTTTATTAGAGTTTCTTCAACTAATTGTTTTCCGTCTTGTCTGACTTCGACTTTTTCAATTACTTTTTCTTCTATTTTCTTTTGATTTTTGTTATTATATGGCTTATTGTAATTTTTACCATAAACTTCTCTCTTTATAGACTCGACATTAATATCTATTTGATTGCTTAAATACTTTGTATAAAAATCAATTTCAACAGGACTTGTCAATTGTTTTATAATTTTAGAAGCTTCTTTTGCGAACTTCACTCGTTCTTCATCTTTTTGAATGTTAAATTCTTTTTTAAGATGATCTATTTTATATTTTATGTAGTGAGTAGAAACATCCATAGCTTTTTTATAATCACTAAGTCCGTATTTTCTTACAAATTCATCTGGGTCTTTAGCATCTTTTAAGTCTAACACTTTTACATTGATACCTAATTTAGTAAGTATATCTATAGCTCTTAAAGTCGCTTTTATTCCTGCTTCATCAGAATCATAAGATATAATAGCAGTGTCCGCATATCTCTTTATTAAAATGCCTTGTTGTTCAGTCAAGGCTGTTCCAAGGGTTGCTACTACATTTTTTATACCATACTGATAAAGTGAAATTAAATCCATATATCCTTCAACTAAGACTATAGTTTTACTTTCTAAATTTTTTCTAGCAAAATTTAATCCGTATAAGTTCTGTTTTTTATTAAAAATTAATGTGTCTGGAGAATTTAAGTATTTTGGCAAAGAATCGTCTAATACTCTTCCCCCAAATCCTATTATATTTCCTCTATAATCGAATATAGGAAACATAACTCTATTTCTAAATTTATCATAGCAATTAGTTCCATCTCTATTTTTTGCAATTAGACCGCACTCCAATAAGTCTTGTTTTTTATATCCTTTACTGATTAGAGTATTCATAAGTGAATTCCATGAATCCAAAGAAAATCCTAAACCAAATTTCTTAATAATTTTATCATCTAGTCCTCTTATTCTTAAATATTCATACCCAAGATTTTTGCTTCCCAATAAGTTTGAAAGATAAAATCTAGCTGCTTCCGTATGAATATCTTGAAATTTCTTAGATTTTTCTATTTTAATCCTAGTTTCTTCATTCATGTTAGTATTAATTTCTATACCGCATTTATTTGCTAAAATTTTTACAGCATCCATAAAATCCAAATTTTCCATTTTCATGACAAAATTTATTACGTCTCCACCTTCACCACAACCAAAACACTTATAAATCTGTTTTGATGTATTTATATAAAAAGAAGGTGTCTTTTCGCCATGAAATGGACATAATCCTTTGTAATTAGCTCCAGATTGTTTTATATTCATATATTCAGATATTATACTTGCTATATCGCATCTAGCTTTTATTTCTTCAATAATGTCTTTTATATCATTCATATTATCACCTTCTGGTGTAATTTTTTGTGTTAACATTTCTATTCTACACTATATTCTAAATTTGTCAATCACTCAATATACACAATTCGACTTTTTTTATTGATATCCTTCTTATTAATCAAAAAATTTTTATTTTTTATATTAATTCTATCAATATTAAATCTTTATTTATATTAAATAATCTAACTATCAAATTATAACTTATAAATTTACCTCAGCAACGATTACGAATAAAAAAGAGGCTCTTGCCTCTTTTAATAATTATTAATTGATTTCATTAAATCTTCAAATTCATTAAAGCAAAGAGATTGAGCACCATCTGACAAAGCATTTTCTGGGTCAGGATGTACTTCTACCATTATTCCATCTGCTCCACATGCAAAAGATGCCAGTGACATAGGTTTTACCAAATATCTAACTCCAGTGGCATGGCTTGGGTCTACCACAACAGGAAGACCTGTTTCCTTTTGAATAATGGGTACCGCAGCTAAATCTAATGTATTTCTAGTATAATCATTATACGTTCTTATACCTCTCTCACACATTATAATATTACTATTTCCTTCTATTGCTATATATTCAGAAGCACCTATCCATTCAGTAATTGTGGATGCTATTCCTCTTTTTAACATAACAGGTTTATTTTGTTTTCCCACTTCACTTAAAAGAGTAAAGTTTTGCATATTTCTTGACCCAATTTGAATTATATCACTTATACTATACAGTTCGTCCATATCTCTTACATCCATAAGTTCTGTAATAACAGCCATACCAACTTCGTCTTTAACCGCTTTTAATATTTCAAGACCTTCTTTTTTTAATCCTTGAAATGAATTTGGAGATGTTCTTGGCTTGTATGCTCCACCTCTTAAAATATTTGCTCCCTGACTTTTTACAAATTTAGCAGTCTCCAAAAGTTGCTCATAACTCTCTATTGCACATGGTCCAGCTATTATAAGTTTATCTTTTTTTACAGTTATCTTTTTGTTATTTGTATTTATCTCTATCTTTGAATTATTATTAAATAGGTTTTCTTTCATAACCTACAAGCTCCTTTACTTCTTCTCTTTCTTCAGCAGATAGGAGGTTTAAATGTTCTTTTATTGTTTTTTCATTTATTATAAGTTTTTCATTTAAATCCATAAGTGGTATCAAAACGAAAGCTCTATCTTGAATCCTTGGATGAGGTATTGTTAGTCTTTCATCAGTGGAAACTACATCATTAAAAAATAGTACGTCTACATCTATAGTTCTTGGTCCCCAATGAACTATTCTCTCTCTGTGTAGTTCTCTCTCTATTTCTTGACAATATTCTAACAACTCATAAGGTTCAAACTCTGTTTCTATTTCTACACACATATTTAGAAAATCTGCTTGTTCTGTATATCCCCATGGTTTTGTTTCGTATAAGCTTGATTCTTTTACTTTATATATAGAATCACTATTTTTCAAAAGTTCACATGCTCTTGATAAATTATCAAATCTATCACCCATGTTAGTACCTATTCCCAAATAAGCCTTATTCATCTCTTGCTCTCCTTATCTCAACACCAAAATAGTCATAAATACCATTTACAGGAGCCTCAGGCTTTCTAACTCTGACCCTAACTCCATTTATAAGTATAAATTTATTCAAGACTTCTTCAGCAATATTTTCCGCTAAAGCCTCCAAAAGATTAAATTGTTTATTTTCAGTAATATCTTTAACAACATTGTAAACCTCGGCATAGCTTACAGATTTATTTATATCGTCACTAAGACCTGCTTCTCTTGAATCAATATAAAGTTCCATGTCGACAAAGAATTTCTGACCTAGAAAATTTTCTTCTTTAAGAACACCATGATATCCATAGAATCCTAGATTACTAAGTAATATTTTATCCATTATATTATACCTACTTTCTATATATTGCATCAGTCATTCTAGCTGCCATTAAATTTTCATAAACATCATGTACTCTAACTATATCTACGCCATCTCTTATACCAAGAACAGTAGTAGCTATTGTACCTTCTAATCTTTTTTTAGGCTCAACTGGAAGTACTTTTCCTATTACTGATTTTCTGGATGTCCCAAGCAAAATAGGATACCCTAAATCTTTTAATTCATTTAATCTTCTCAATACTTCAATATTTTGTTCAAAATCCTTGCCAAATCCTACACCTGGGTCAAGTACTATTTTTTCTTTTTTTACACCATAACTCATTGCCATTTCTATACTTACCTTAAAAAAGTCTTTTATTGACTCCATTATATCTTTGTCATAGTTTGTCCCATCTTGATTATGCATTATACACACTTCTGCATCATATTTTCCTATTACAGAAGCCATATTTTTATCTTTTCTAAGGCCCCAAACATCATTTACCATAGTGACACCTAATTTTAATGCTTCTTCTGCAACATCTGCCTTATAAGTGTCTATTGATATTGGTATATCCAATTCCTGTTTAAGTTTTTTTATTACAGGGATTACTCTTCTTAGCTCTTCGTCTGAGTCTACATAGCTATGACCTGGGCGTGTAGACTCTCCTCCTAGGTCTATTATATCTGCACCTTGGTCAACCATATCTTTTGCATGTTGTATTGCTATGTCCAAGTTATTAAAATCTCCTCCATCAGAAAAACTATCTGGAGTTACATTTAATATTCCCATTATATAAGTTCTTTTACCATAATCAAACACAATTAATGACACTCCCTTAAATTAAATTTTATCTCAATAAATGATTATATCTATAATAAATTGCTACTTCATAGTAATCAAACTCATAGCCTCGGCTCTAGACGCAATGTCCTTTTCAAATATTCCTCTCACTGCTGATGTAACAGTTTTTGAACCTGGTTTTTTTACGCCTCTCATTGTCATGCACATATGTTCAGCTTCTACTACTACTAAGACACCATAAGGTTGTAATTCTTCCATTATTATATCTGCAGCATTTTTAGTGATTCTTTCTTGTAATTGTGGTCTTTTTGCCAATGTATCTATTACTCTAGCAAGTTTAGAAAGCCCTGTAAGTCTTCCTCCTTTTGGTAAATAAGCAATATGAGCTTTTCCAAAGAAAGGAACTAGATGATGCTCACAACATGAATAAAATGGAATATCTTTTACCAATACTAACTCTTCATGTTTTTCATCTGCAAAAAGAACTTTTAAATGGTCTCTTGGTTCTTCACTAAGACCAGAGAATATCTCTTCATACATCCTAGCAACTCTATTTGGAGTTTCGATTAGACCTTCTCTATCTGGGTCTTCCCCAATTGCCTCTAGTATTTCTCTTACTGCATGTTGTATCTTTTCTTTATCAACTTTATTCATTTAAACTCCCCCCATTGATTTGTGACTAGAAGATTAGTTTTATAACCTCTTTTGTCTCAATTTCTTTAAAAATATAATTATAAACATCTAAAAGTCTTTGATAGTCATAATTTTCACTTACTTTTGACACTAGTTCAAAAAGCTCATTATTTTCTTTTTTTAAAACTTTTAGCAATTTTTTGTCTTTTGGTACCCATTTATCATTTATATTAAAGTACCCAATTATTATATCTTTTAAATATAAATTCGTCAAAAAATGATATTCAAAAACATCAAATTTTTCTTTATTTTTTAAATTCGATATTTTTGCTCCAATATCTTGCTTTATAAAAGACTTTTCCTCTAATGACATTTTACTGGGTCCTTCTAAGTAAATATTTCTACTTATATCTTTTATAATATGTGATATATTCTCCCTATCAAACAGTACTTTAGCATCTTTCATTTCTTTCACAAAGAAATATTCCCTATTTGATAATAATTTTTTTACACCATCTTTTGAAAAGTAATTTACATCAAATTCTATTCCCTTTTTTTTAAACAGTATTCTCTCTTGTTTTTCCCCTTCTTTTACAAAAACGAACACATCAATATCGTTTATCTCTACATCATAAAGAGTAAAATCTACGTCTTTACTAGAACCCACTAAATATACAGCCAAAGTGTTTTGGTTTTCTATTATTTTAGTTATCTCTTCATTGTATACTTCATAAATACAACCTATCATCTTTTGTCTCCAACAAATTGTTAATATTTTAATTTATTCTAATAACTTCACTATTTTATCAAAAACAACATTTTCTTTATTAAATTTTATTTTGTCAATTTCTGTAACCTTTATAGCGCCCATAAGACTATTTGTGACAAAAACAAAATCAAAACTACTAATTTCTGATATATTAATTTCATTTTCTATCAACTCTATATGTAATTCGTCACAAATCTCTATAATCCTTTTTTTTATTATTCCATTTAATATCGGTAATCTATCACTAGGAGTGTACACTCTTTCTCCTTTTATAAAGAAAATATTGCTCATAGAACATTCTAATATTACACCTTCTGAATTTAAAAATATACCATCATTATAACCAGTCTTATTTGCGATATTTTTGGTATATATGTTTTCAAAATAATTAGTAGTCTTATGTCTATGAATTAAACTATTCCCCCTAACTATTGGAGATATAGCTAATTTAAACCCCTTCTCATACGTCTCTTGATTATATGGAACATCCCTAATAGATATATTATAACCTTCATCAAAAACAGTAATTCTAAGTGCTTTATTAATGACATTTTCTTTTTTTATATATGTAACAATTTCATTTATCAAGAAATCTTTTGTATAGTTTATATCTAAATCCAAACAATTTATTGAGCTTAGCATTCTTTCTATATGGATATCTAAATCTACTGCTATTCCATTTTTAACTCTAATAGTTTCAAACAAACCAATTCCAAATTTACTTAAACTACTATCAAAACCTACATTATTCTTCATAATATCCCCTCAAAGCCTTCATTATGGATTTAGCTTTATCAAGTGTTTCTTGATATTCTTCATCTGGGTCAGAATCCCAAGTCATTCCTCCTCCAACTTGAAAGTAGACTTTTTTGTCATTTTTGATTATTGTTCTAATTGCTATATTAAAATCCATATCACCATTAAAACCTATATAACCTATTGAACCAGTATATACATTTCTTTGCGTTGGCTCTAATTCGTCTATAATTTCCATTGCTCTAATCTTAGGTGCTCCTGTTATAGACCCCCCTGGAAAAGTTGCTTTTATTACATCAGTAGCATCTTTATCATCTTTTAACTCACCTACAACTGTGGAAACTAAGTGATTTACATTTGCATATGGTTCAATTACAAATAGCTCTGGAACTTTAACACTTCCAGTTTTAGATATTCTCCCAATATCATTTCTTTCTAAATCTACTATCATAAGTAGTTCAGCTCTATCTTTTTCACTATTTCTAAGTTCTTGTTGAAGTCTTAAATCTTCTTCTTTATCTTTCCCTCTTGGACGAGTACCTTTTATTGGTCTAGTTTCTATTCTCTTATTAACACATCTTATAAATCTTTCTGGAGAATTTGATAATATATGTGCATCTTCAAAGTTTAAGAATGCCCCAAATGGTGCTGGGCTAAATCTTCTTAAGTCCCTATACAATTCAAAGCTTGTAAGTTCTGTTTCTCCACTGAACCTTTGTGTTAAATTAGCTTGATATATATCTCCTTGTCTTATGTACTCTCTAACACTTTGAACTGCATTTTTAAATTCTTCCTTTGTAAAATTAGATTTAAGTCTTATAGATGTTACTTCTTTTTCTTCATAACATATGCTATCTATACCTTTTTTCTCTTCTTTTAATATTCTTTGTTCTATATCATCTATTATCTTTTCTTCTAATTCGATATCTATGTTTGGAGTAGCTATATAAGTTTTTTGCACAAGATGGTCTATAACTATTACATGATTATAAAATCCAAAATACATATCAGGCATCTCAATATCATCTACAGCAGTTCTAGGTAAATTTTCTATGTAATTACCTAAATCATAAGATAAATATCCCACAGCACCTCCTACAAATGGAAGATTAGTATCATTTACAACCCTATACTTATGTAGTTCTTCTTTTAAAACTTCTAAAGGATTTTCATCAGTATCTTTATACTTTAATACCTTAAATGGTTGGCTACTTATAAAAGAATATCTTCCCAATTTTTCTTTATCCATAGCACTGTCTAATATAAAACTGTCATGTTCATTTCTAAAAATAGTAAATATCTCAAAAGAATTTAATTTAGTATTTATCTCTCTTATCATATTACATATGTACCCTTTCTCTAGCTTCTGTTATAAAATTTTTAAGCATTTCATGACCATACTCTGACAAAATAGCTTCTGGATGAAACTGTACTCCTTCTATTAAATATTTCTTATGCCTAATCCCCATTATTTCCCCTTTATCAGTAATTGCTGTAATTTCTAATTCTTTTGGAACTGTATTGGAGTCAACTATTAGTGAATGATACCTAGTGACATTTAAAGGATTTTTAAGTCCCCTAAAAACTCCTTTATTAGTATGGTTGATACTATATACTTTTCCATGCACAGGCTGTTGTGCTTTTATAATATCTCCTCCAAAAACATGTCCAATAGTTTGGTGACCTAAACAAATTCCTAGTATAGGTTTTTTCCCCTTAAAATGCTCAACAATATCTATGCAAATACCAGCTTCTTTTGGAGAACACGGTCCTGGAGATAACACAATTACCTCTGGATTTAGTTCTTCAATGTCACTTATTTTGATTTCATTATTTCTTTTTACTACAACTGTTTCCCCTAATTCTTCTATATATTGGACTAGGTTGTATACAAAAGAATCATAATTGTCTATCATAAGAATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020424|620168:629895|625893_626466_-|ARC14031.1|DBSCAN-SWA MNKVDKEKIQHAVREILEAIGEDPDREGLIETPNRVARMYEEIFSGLSEEPRDHLKVLFADEKHEELVLVKDIPFYSCCEHHLVPFFGKAHIAYLPKGGRLTGLSKLARVIDTLAKRPQLQERITKNAADIIMEELQPYGVLVVVEAEHMCMTMRGVKKPGSKTVTSAVRGIFEKDIASRAEAMSLITMK >CP020424|620168:629895|624163_624670_-|ARC14030.1|DBSCAN-SWA MNKAYLGIGTNMGDRFDNLSRACELLKNSDSIYKVKESSLYETKPWGYTEQADFLNMCVEIETEFEPYELLEYCQEIERELHRERIVHWGPRTIDVDVLFFNDVVSTDERLTIPHPRIQDRAFVLIPLMDLNEKLIINEKTIKEHLNLLSAEEREEVKELVGYERKPI >CP020424|620168:629895|627959_629318_-|ARC14034.1|DBSCAN-SWA MCNMIREINTKLNSFEIFTIFRNEHDSFILDSAMDKEKLGRYSFISSQPFKVLKYKDTDENPLEVLKEELHKYRVVNDTNLPFVGGAVGYLSYDLGNYIENLPRTAVDDIEMPDMYFGFYNHVIVIDHLVQKTYIATPNIDIELEEKIIDDIEQRILKEEKKGIDSICYEEKEVTSIRLKSNFTKEEFKNAVQSVREYIRQGDIYQANLTQRFSGETELTSFELYRDLRRFSPAPFGAFLNFEDAHILSNSPERFIRCVNKRIETRPIKGTRPRGKDKEEDLRLQQELRNSEKDRAELLMIVDLERNDIGRISKTGSVKVPELFVIEPYANVNHLVSTVVGELKDDKDATDVIKATFPGGSITGAPKIRAMEIIDELEPTQRNVYTGSIGYIGFNGDMDFNIAIRTIIKNDKKVYFQVGGGMTWDSDPDEEYQETLDKAKSIMKALRGYYEE >CP020424|620168:629895|625038_625842_-|AVI58798.1|DBSCAN-SWA MSLIVFDYGKRTYIMGILNVTPDSFSDGGDFNNLDIAIQHAKDMVDQGADIIDLGGESTRPGHSYVDSDEELRRVIPVIKKLKQELDIPISIDTYKADVAEEALKLGVTMVNDVWGLRKDKNMASVIGKYDAEVCIMHNQDGTNYDKDIMESIKDFFKVSIEMAMSYGVKKEKIVLDPGVGFGKDFEQNIEVLRRLNELKDLGYPILLGTSRKSVIGKVLPVEPKKRLEGTIATTVLGIRDGVDIVRVHDVYENLMAARMTDAIYRK >CP020424|620168:629895|626491_627193_-|ARC14032.1|DBSCAN-SWA MIGCIYEVYNEEITKIIENQNTLAVYLVGSSKDVDFTLYDVEINDIDVFVFVKEGEKQERILFKKKGIEFDVNYFSKDGVKKLLSNREYFFVKEMKDAKVLFDRENISHIIKDISRNIYLEGPSKMSLEEKSFIKQDIGAKISNLKNKEKFDVFEYHFLTNLYLKDIIIGYFNINDKWVPKDKKLLKVLKKENNELFELVSKVSENYDYQRLLDVYNYIFKEIETKEVIKLIF >CP020424|620168:629895|627226_627970_-|ARC14033.1|DBSCAN-SWA MKNNVGFDSSLSKFGIGLFETIRVKNGIAVDLDIHIERMLSSINCLDLDINYTKDFLINEIVTYIKKENVINKALRITVFDEGYNISIRDVPYNQETYEKGFKLAISPIVRGNSLIHRHKTTNYFENIYTKNIANKTGYNDGIFLNSEGVILECSMSNIFFIKGERVYTPSDRLPILNGIIKKRIIEICDELHIELIENEINISEISSFDFVFVTNSLMGAIKVTEIDKIKFNKENVVFDKIVKLLE >CP020424|620168:629895|620168_621341_-|ARC14027.1|DBSCAN-SWA MSVENKSNKKELKKVTAKTLIEKGKKQGSLTLAEIMEAFSETELDKDQVENLYETLGNLGIEITETKNYKADIDFSVADDDLSIGHLDEDAEAISHDDSSAIEIETVDLSLPKGISIDDPVRMYLKEIGKIPLLKPHEEVEFARRMHEGDEIAKQRLVEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNLGLIKAVEKFDYTKGYKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVSRQLLQELGRDPKPEEIAKEMEMTEDKVREIMKIAQDPVSLETPIGEEEDSHLGDFIPDDDAPAPAEAAAYSLLKEQIEDVLGSLNDREQKVLKLRFGLEDGRARTLEEVGKEFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKKLRDYLD >CP020424|620168:629895|621352_623143_-|ARC14028.1|DBSCAN-SWA MNDIKDIIEEIKARCDIASIISEYMNIKQSGANYKGLCPFHGEKTPSFYINTSKQIYKCFGCGEGGDVINFVMKMENLDFMDAVKILANKCGIEINTNMNEETRIKIEKSKKFQDIHTEAARFYLSNLLGSKNLGYEYLRIRGLDDKIIKKFGLGFSLDSWNSLMNTLISKGYKKQDLLECGLIAKNRDGTNCYDKFRNRVMFPIFDYRGNIIGFGGRVLDDSLPKYLNSPDTLIFNKKQNLYGLNFARKNLESKTIVLVEGYMDLISLYQYGIKNVVATLGTALTEQQGILIKRYADTAIISYDSDEAGIKATLRAIDILTKLGINVKVLDLKDAKDPDEFVRKYGLSDYKKAMDVSTHYIKYKIDHLKKEFNIQKDEERVKFAKEASKIIKQLTSPVEIDFYTKYLSNQIDINVESIKREVYGKNYNKPYNNKNQKKIEEKVIEKVEVRQDGKQLVEETLIKIMLEDKKIREIALLKVEESDFLLKESKEILNYMIKNQELDKITIDKLKSLNISEEYLKELNSISLNSINLENTKEIEGIITNIRKNSLEEQINSLLREQQELENNNDMKEVDGRVMEIALKIVEINKILKSL >CP020424|620168:629895|629310_629895_-|ARC14035.1|DBSCAN-SWA MILMIDNYDSFVYNLVQYIEELGETVVVKRNNEIKISDIEELNPEVIVLSPGPCSPKEAGICIDIVEHFKGKKPILGICLGHQTIGHVFGGDIIKAQQPVHGKVYSINHTNKGVFRGLKNPLNVTRYHSLIVDSNTVPKELEITAITDKGEIMGIRHKKYLIEGVQFHPEAILSEYGHEMLKNFITEARERVHM >CP020424|620168:629895|624662_625028_-|ARC16765.1|DBSCAN-SWA MDKILLSNLGFYGYHGVLKEENFLGQKFFVDMELYIDSREAGLSDDINKSVSYAEVYNVVKDITENKQFNLLEALAENIAEEVLNKFILINGVRVRVRKPEAPVNGIYDYFGVEIRRARDE >CP020424|620168:629895|623397_624183_-|ARC14029.1|DBSCAN-SWA MKENLFNNNSKIEINTNNKKITVKKDKLIIAGPCAIESYEQLLETAKFVKSQGANILRGGAYKPRTSPNSFQGLKKEGLEILKAVKDEVGMAVITELMDVRDMDELYSISDIIQIGSRNMQNFTLLSEVGKQNKPVMLKRGIASTITEWIGASEYIAIEGNSNIIMCERGIRTYNDYTRNTLDLAAVPIIQKETGLPVVVDPSHATGVRYLVKPMSLASFACGADGIMVEVHPDPENALSDGAQSLCFNEFEDLMKSINNY |
11 | Pandoravirus(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
711931 : 764126
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020424|711931:764126|DBSCAN-SWA TGTGGATACTTTAGGAAAAAGAATTGCTTATTTGAGAAACTCCAAAAAACTTACTCAGCGCAAACTTATGGATATTTTAAAATTTGAAAACTTAGGCAAGTATGAAACAGGAGATAGAAAACCTAATTGTGATATACTAATGTCAATAGCTGATTATTTTAATGTTACGACTGACTGGCTTCTCTATGGTAAAGAGAAGGTAAATGTCAATAGTAGTGTAAAAGAAGATAAAGAAGATTACTTACATGTTACTAATGATGAAATGATGATATTAAATCTATACAGACAACTAAACGAACGTGATAAAATAAAAATAGAAGGAATACTTGAACTTAAGATATCTGAATATAAAGACTTAAAAAAGCATTCCTCTAATAATAATGAAGATAAAATGGTTTAAACATACATAATTTGATACGATTTTACATCATCTATTAACCTTCTTTTTTTGTAGTATATTACTAAAATATGGATATTGGATTATTTAAAAACAAGTATAGTCTAATTTCAAGCACATTTATAATATTTAGATTATCTTATCCATATTTTAGTTTAAGTACTTTGAAAAATATAATACATCTCTATGTATAACTTAGATTCCTAAGAAATGCATTACTCATGTTTTTAATTCTTCCAACATCTTTCTATACACAATTGTACATCCTTCATAATTCCCCTCTTTAAGAAGGATTGAACATGTACTAGAATATTTAGTTAAAGTATTTAATCTTTCCATATTTAAGCTTTTTATATTACTGAGTGCTGTAATAAAATCATCAATTGCTCTACAACACTCTATAACCCCATCTGAATCCAATTTACACACAAGAATATTCACCTACTTTATATACTATTTATTAATCATCTTCTGAATATTCTATATTAAGTAATTGATAAATTGATGATTTATATTTTTTACCTGTTCTTCTTCCATTTAAAATAGCTGACAAATAGTTTTCATTAACACCTATTTTCTTCGCTAATTCCCTTTGAGTCATATTTAATTCAATAAGTCTTTGCTTGACTTGCACTCCCAAAAAAGGTATCCATTTTTTTCGAGCATCCATTTATCAACTTCCTTTCTAAGTGATTTATATTTACTTTTATATTATTTTAGCTTACACACCCCCTCTATTTAGTATATATTTTTAATATGTACACATATTAAGTATATAAATTTATTTAATACTAAATAAGATTTTTTGATTACTTTGTGCTAAAATTAGGATGTAAATTCGTATCATTAAGTTAATTATAAAGTCATTTTGACCTTAAGTCAATGGTTTTTATGTCATTTTGACCTTTAATTTGAAACTATTTACATCTTAAAAAGTCTTTTTGACATTAATTGAATGGAGAGTGTTTATGGATACTTTAGGAGAAAGAATTGTTTATTTGAGAAAAGCAAAAAACCTTAAACAATATGAACTAGAAGAAATGTTGGGCTGTGACAACTTAAGTAAATTTGAGAGAAACATTAGAAAACCAAATTATGAAATATTAAAATCTATAGCTGAGATATTTAATGTTTCAGTAGACTGGCTATTAAATGGAGATAATCTATCACATAAATCAGATTTAATTTGCGATTCCTCCTCAAACTATCCACTTAATAGCATAAACTCTAATGAAATAAAACTTTTAAACAACTTTAGAAAGTTAAATGATTATGATAAAGCCAAAATAGAAGGTATGATTGAATTAAAACTTCATGAATATGAAAAAGAGAAGGATTTAGGAAAAATTGAGTATAACAAAAATAAAGATGAGAAAATAGATAAATAATTTTTATGTTGCTTTTGATACGATTTTACATCATTTCTTTGTTCTAATATTTTTATTTCATTTATTTTCTTTTTTATAATTTTATGATAAAATAATTAGTATATTTTGCTTTACTTGAATGTAATTATTTATACAAAAGTCAAACATAATATAAATGTAGTAAATTTTTAGTTTCAAGTAATATCTCGTTATTATAACTAAATATTTATTAAAATTAGGAGGATAAAATGGGCTTAAGAGACAAATTCGCGCAATCATTTGCTAGATCAAAAACTATGAGTGGCCCTGAGAAAAAGGCTAATGAAATAATGGGTAAATTGCTTCTTAAGAAAGCTATATTACCTATCGTTTTAATGTTCGTGATAATAATCGCTGGAGCTATGCTTAAAATCAATTCTTGGGTTACACTTGGCATAAATTTAGTTATTGCTGTTGGTGCTTTCTTCTACATAAGAAATTCTAGTAAAAAGTATCAGAACTTTAAACCTTATGTTGGCAATTTGATTAGTTTAGAGAAAAAAGGTAAAAAAGAGTACGTTGCTATTATAAAACAAGGTAAGTTACCAGTTAAGTTACAAATAGCTTATGGTGGTGAAGACCTTGAACATGTTAAGAAAAATCAAATGGTTCAAATAAGTTATAATCCAGATGCTAAAATAGCTATTTTGGTTAATAGACAATAATTTAATAAAAAAAAAGAGTTGTCTTAAAATTGATTTTTCACAATCAAGTTTAAGCTCAACTCCTTTTTTAATTTTTATATGTTATTTTTATTACTTTTTTATTAATATCTCTAAGTTATAAAATTCCAGTCTATACAATATTCCATTTTTTATTTTTATATTGGTAACATATCTTTTATATCATTAATCAAACTAATTCTAGCAGTATTTACACTAGTACATAACTCATCTATAGCTCCTTGAACATTTGTAGCAGCAAGTTTACTTACTGTATTATCATAACTTGTTTTCTCTGCTGTTGTTTCTATGCTATCAAGACCTTCTTTTACCTCATTGACTGCATTTACAAGACTTGTTTTATCAGTTGTATTGAGTAGAGTTGTATCTCCTATTTTACTAGTGACATCTGTCTTAGTATTATCTATTTTAGTATTTAACTCTATTTTAGTAGTTTCTATACCACTTGTTAATGTTATTTTAGTTGTATCTATTTTTTTATCTAACTCTTGTATATCTTTTAAAGTTGCCAAGATGACAGTTGGGTCAACTTTTAAATTTACACTTGAAGTATTAGAAACTACCAATATAATTCTTATAATTAAATCTTTTACACTTCCAGAATCAGCAGTTGGTTTATAAGTTTCTGGATATTTAGATATAGCTATAAGCTTATTTTCTGAATCAAATATACCAACTTCTCTTATCATAAAACCGCCAATACTACCTGGTATTACAGTTTCTATAACTATCCAGTTAGAGTTGTCATCATCTATTTTTACATTACTTATATTGCCTTCCCAGACAACTTCTTTAAGAGATGTTTGTTCTTCTGTAGGACTATACTCACTTCCTCCACCATCTCCAAGTTGTAGTTTAACTAAATCTACTTTTTTACCAAGAGCAGTTGCATTTGCAATAGATGCTTTACCTGCTTTAGTTAAAAGTGTATAGTATTTTTGTTCTGCCAATTTATATCGCCTCCTGTTTAGGATATAAGATTACTTTTTCCATACTTCTATCATTTCCTGTAGAAATGGTTATCTCTCCAAATATCTCTATATTTGATGGTGTCCACGGATATACAGTAACAGTTTCTCCTGTATTTATAGCAGTTCCACAAAATAGTTCATTTTTATTTAACAAAATCATTTTAAATTTATGTTCCAGATGACATGGCTTTACATTTTCTAATACTTTATCCAACTCTACAATAGAATTATAACTACAATTATTAACTATAAACTCTAATATAAATATAAATTCATTGCTGAGTACTGTTACTTCAACATCAGTCTTTGTATAAGCTTCACAAATGTTTTTTATAACCTTCAATTTAGTTGTTCCTAAACTTCTCATTTTAGCCTTTATATTGCTTCTTCTAGTCTCATAATTTAAATCTTCATTATTTTGAATACACAATATACTTTCCCACATATCAAGACCCCATGTGGATGTATTGACAAACATTTGATTTATAGTATCATCTATATTTTCTTTTAATGAAGATAATTCACTATCATAAGAATCTTGTATTGCTTCAACCATATAATTTTTATAAAATGATGGTAGTTTATCAATTAATTTCATTAAACCTCCACCTCACTAAAATCTAAAGTTGTAACACTAGGTATTTTATCATCTTCAATAGTTATATTGTCTGTTGAGTTATTGACAAGTAAATTGCTTAAATCATGGACTCCAGAAGTACTTATTAGAATCCCCATGATTTTCGTGTATACAATTTCTCCTGTTATACTTCTAAAATATTGATTTATATTTTCTATAAAACTATTTTTTACCATATCTAAGGTATATCCACTTTCTAGCTCCATAGATGCACTTATAGTTATATTTAGTGGGATTGGAGTAGTTACTGTTAGTGTAGCTCCTATTGGCATTTCTTCCTCAATATGTTCTCTACACTTAGTTATTATTTCTTCTTCAACCGCTTGATTATTTTGTCCAAACAATAAAACCTTAACTGTCCCTGCTCCATTCCATCTTGGATATACTTTTGCATTATATACACCATCAACTTCTAAAGCCCATTCTTCATAATGTGCTTTATTCCCACTTGTTGCTTGATTTTTTTGTACTCTAAAAAACCTTTCTCTCAGTTCTTCATCAGTTTCAATTTCTGTACCACCTGAAAATTTATTTATATTTGTTATCTTTTCAATTCCAAATATATTATCATTTACCTTAAATTCACAATCAGATGGTAAATTATATCTAGTTCCAATTTCTAGTGCTTCGACTGGACTTATATTTCCTTCTTCACCACCAATGACAATATCCTTTATTACCACAAATGATAAATCTTTATAGGATATAATTGTTCCATTTGATATTTCAACACCATTTTCACCTATAAATTCTACTTCTCCAGTAGCCTCAGTACCCAATTTTCTATATACACCAAATTCATTCACTCTCTTATCTAATAATTGATTATAAGTGTCTTCAATAAAAGCCATTTTATATATGTTAGAAAGTTCAACATACATTTTTGAAAGTTCAAAGGTATTTCCA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55 | Clostridium_phage(43.48%) | plate,portal,tRNA,tail,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1842103 : 1935065
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020424|1842103:1935065|DBSCAN-SWA 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113 | Clostridium_phage(74.7%) | integrase,head,terminase,portal,coat,capsid,tail | attL 1876753:1876769|attR 1929175:1929191 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
2521362 : 2543517
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020424|2521362:2543517|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020424|2521362:2543517|2536030_2538694_+|ARC15576.2|DBSCAN-SWA MSKATLFDSRIKKYAYCRTSEIYRDIGSSPDGLSIEQIGSMREKYGANSFNGRKNDTTMQRLRRAFINPFHVILFVLGIVSLVTDVFVASNFARNATTAIIIFSMIVISGVIRLIQELRAKSAAAQLDRLVHESVTVRRDGKLIEIPGEELVVGDIVLFSAGDRVPADIRLTKITDLFISQAAITGESAIIEKSCRKLSYGEQDTLTQLENLAFMATTVISGKGEGIVLAVGKDTLYGGFTKPDSDDKNSFKKGADSIAWVMIRFMAILVPIVFILLGITDGKWMESFAFALSVAVGLMPEMLPMVITACLAKGSLAMSKKQTIIKDINAMQSFGSMDVLCMDKTGTLTNESILLEYYMDIFGNENAEVLDLAYLNSCYHSGVCNTIDNAILACNTMPGREAHYANLLTKFQKADEIPFDYARKFVSTLVQDSNGNSQLIMKGDIEHIFSRCNHVEYRGKLLPMGQDARQSVSSVVGEMLQDGMKVIAVARKNVGAQKKITPDDEWGMTLVGYLSFFDAPKQTAKESVTALKRLKVIPKILTGDQAAIAVSVCRRVGIYTERILTGTQLDEMTDCELKKAVEHTHVFAELTPGHKVRLVSAMQDNGHSVGFLGDGVNDIPALNEANVGISVDTAVDAAKDAADVVLLQKDLNVLEQGVMEGRKTFTNMLKYIKITASSNFGNIFSIICASAFLPFLPMTSIQILLLNLLYDTLCIVLPWDNVDEEEMLSPRDWSGKTLRQFMLSFGPISSLFDIVTFLFLYYFLCPMLCGGATYLQLTDPSLQLQYVALFQTGWFLESMWTQVLILHFLRTSKIPFFQSRASAPVISITLVGIIAFTSLTFVGGASLFGLTKLPLWYFVFLLLVVSLYMLLNSVAKYFYKKKYQELI >CP020424|2521362:2543517|2539350_2540028_+|ARC15578.1|DBSCAN-SWA MFYTDFILRIALSLTLGFLIGLERQLTGHPAGIRINVLICMGTSFFTLFPMLYGSDQVFRVGSSIISGVGFLCSGVIFKDRGTVRGMNTAATLWCTAAIGILASTGMYAMAITAATILIGSNLILRPFARKFHPITSSDESEKQYRISVTCQEKAEQDIRLLLINSNSCKTLFLNNLESGDVVGDKVEIVAEYCSVGKSKNNILEGIVGQVLVIPEVISAGWEVL >CP020424|2521362:2543517|2526210_2526852_+|ARC15567.1|DBSCAN-SWA MEYKYTKIDLEKWNRGKLFQSYIDDMRIVMSLTVDIDVTNLIEFSKSHDLKFYPAMIWVVSKVVNEHDEFKYSWDNKGNLIKWDYISPSYAEFHKEDENFTKMVTDFSDSIFEFHERFMLDREKHKMERAFVANQPLNFFDVSCLPWVKYNHFDVHVFDEGKFLAPVITWGKYELERERYIMPLTMNIHHAVADGFHLSRFFNEVQELINSIS >CP020424|2521362:2543517|2522178_2522793_+|ARC15562.1|DBSCAN-SWA MSEKLLDLLKIFLEKYLVPTVIAIVFSFIAYYVTPTDNKLLVKFTIWGYAVFLFCVWFLIIELVIWLVQKIQYHNYSKGVEQRNKQRQAEEWQQSLEFLWTDVDNLSSSDYKLLLRFIKNENQPYCSSGTPMGHCLLNSDWVHKTVSKPAKRVLIKSNQRTSSKAIPIPVYETISETYQYILREDIYQMLKYSYEKYGKISHFK >CP020424|2521362:2543517|2528291_2528690_+|ARC15570.1|DBSCAN-SWA 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>CP020424|2521362:2543517|2535728_2535938_+|ARC15575.1|DBSCAN-SWA MVKVKIKKKFVSTHMCQGEMPIYVRERYEKMLAVSIRAPNLEGMVENFDKDLSRPNETDLIELKNAISK >CP020424|2521362:2543517|2540274_2540586_+|ARC15580.1|DBSCAN-SWA MDFTCIFFGILFTLAGFWLAFGKGYRHLSLWKNMPQEEKDKINIVPLCRNVGEMIALNGIIFLMKGFLPGFSNHWFVFAIIAWLIVAGFDVWYIEKSVRYRNQ >CP020424|2521362:2543517|2525781_2526003_+|ARC15566.1|DBSCAN-SWA MNFGQNLYQWFLSNAQSLVLMAIVVIGIYLGFKREFSKLIGFLVVALIAVGLVFNAGGVKDVLLELFNKIIGA >CP020424|2521362:2543517|2522859_2524254_+|ARC15563.1|DBSCAN-SWA MRKIWNKGHRIRASDKHLVYHFSIGTLLFVFVAVLLLLNIKQLMRTDWEHFSLLEKGLTLSPYNLITILIATGVCALVAFLYYRFCYDSFKKLLHRQKLARMILENKWYEADTVQDSGFFTDLQSRSREKIVWFPKIYYQMEKGLLHIRCEITLGKYQDQLLRLEDKLESGLYCELTDKTLHDGYIEYTLLYDMIANRITIDEVRAENGCLRLMKNLIWEYDALPHALIAGGTGGGKTYFLLTLIEALLHTNAVLYILDPKNADLADLGTVMGNVYHTKEEMIDCVNSFYEGMVQRSEEMKQHSNYKTGENYAYLGLPPCFLIFDEYVAFFEMLGTKESVSLLSQLKKIVMLGRQAGYFLIVACQRPDAKYFSDGIRDNFNFRVGLGRISELGYGMLFGSDVKKQFFQKRIKGRGYCDVGTSVISEFYTPLVPKGHDFLKTIGSLAQARQDGTATCEAKGDGTD >CP020424|2521362:2543517|2526934_2527231_+|ARC16816.1|DBSCAN-SWA MNDIFKDMQAKVGCEYISDLPSYKRKVWHEMKRLNPADYEEKQLEDFSKYVFGMSYQTIKDVRKQQKGREEQCRKQGCWWKREEQLAKKQYHTGLTCR |
24 | Streptococcus_phage(73.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
3220562 : 3229515
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP020424|3220562:3229515|DBSCAN-SWA AATGTTAATATCATTAATAATGCCAACATTAAATAGATATGATGATATATACTTACTTATGGACAGCTTAGAAAATCAAACTTACAAAAACTTTGAACTTATAGTAGTAGACCAAAATGATAATAGCAAAGTTAAAGAAATAGTTGATAAATACATTGATAAGTTAGATATAAAGTATATAAAAAGCTCTAAAAAAGGATTGAGTTATAACAGAAATGTAGGCATAGACAATGCTGTAGGGCAAATTATAGGTTTCCCTGATGATGATTGTGTCTACGAAAATGATACATTAGAAAAAGTTATAAATTTCTTTAATAAAAATAAAGATTATAAAATATACAGTTGCAAAACTATGGATTCAAATAAAGTTGATGCATTTAAGAAAATGTATGATGGAACTTGTGATATCACAAGTTCCAACGTTTTGGATACTATAACATCCATAACTTTTTTTATTGATTTTGAAGGTAAAGACTATACAAGATTTGATGAGAAATTGGGTGTTGGTGGAGAGTTTGGTGCTGGTGAAGAGATAGATTATGTTTTAAACTTATTGAGTTTAGGTTTTAAAGGAAAATACTTTGGAAATGATATAATTTACCATCCTGCAAAAAAACATTCTAAATCTAAAGAAAAGTATCAAAAAGATTATAACTATGGAAGAGGCTTTGGAGCGCTTTGCAAAAAGGAAATAGTCTATAGAAAAAATTATAAGTTTGCAAAAGTTATGGTATCAAAACTTGTAAGAAATATAGGAGGTCTTATATTGAGTTCCAATAGAGATTATCATAGTGCCACTATAAAAGGAAGAATTAATGGATTTAGACAGTACAAGTTATAATGAGGATGGTGTTTATGGACAAGGTTAAATTTTTAATAAATATGCTTTTGGCTTTTTTTATATATCCATTTAATAAGCATAAGTTTAATGGTAGAGATATCTGGCTTATAGGTGGACATTCAGGGGATATATACAATGATAATTCAAAGTTTTTTTATGAGTATATGCTAAAAGAACATAATGATGTAGAAACTTATTGGGTAGTAAATAAAGACAGTAAAGTATTTGATAAAATTCCAGGCAAAAAATTAATAAGAGGAAGTGTAGAAAACTATCTGTATTATTACAATTCAAAAGCTATAGTATTTTCACATGCACCATCAGCAGATATAGCACCATACAATTTTGCTGTACCTGTTCTTAATTATTTTCATAAAAAAACGATAAAAGTGTTTTTAAATCATGGGACTATAAGTTTTAAAAAAAGAAAACCTATGAACAAAAAGTTCAAAAATATTATAGATAACCTATATAAAAGCTATAATATAGTTACAGCAAGTTCTGAATTTGAAAGAAATGTTATGGTAAATGATTGGGGAATGTTAGATGACTCAGTTTATATAATTGGAAATGCAAGATATGACAATTTACCAACAAATGAAGTTGCACAAACTCGAGATATATTATATACTCCTACATGGAGAGATTGGATAAAATTTAGTTCAGGAAAATTTACGGATACAGATTATTTTAAAAATATAATGAATTTTTTAAATGATGACAAATTAAATAAAATATTAGATGAGAAAGATATAAATGTAAAAATTTATATGCATCATCTTATGCATGAGTTTATAGATGATATAAAAGAAAATATAACAGGAAAACGAATTGTGTTTTTAGATAAAGGGGTAACTCTAGCAAATGAAATCAGAAAATCAGCTGCAAATATAACTGATTATTCAAGTGTAGCCATAGACTTTTTGTATATGAATAGACCTATCTTGTTTTACCAATTCGATTTGGATGAATATATGGAAAAAGTTGATTCATATATAGATTTAAAAAGTGAAATGTTTGGGTCTTTGGCTTATAATAATGATGAAGCCGTGAATAAACTTATTGATATTATTGAAAATAATTTTGAGGTTATGGATAACCAAAAAAATGAAAGAAATAAGTTTTTCAGATATAATGATAATAAGAACTGCAAGAGGATATATGATTGTGTATTAAGTAAAATTAAATAAATATTTTATAAATGATGAGGAAGGTAATATGAAGAAGAATTTAGTATCTATAATTACTCCCATGTATAATTCTGAAAAATTTATTGAAGCAACCATAAAATCAGTATTAAACCAAACTTATCAAGAATGGGAAATGTTAATTATTGATGATTGCTCAACAGATAATAGTCCTAATATAGTCAAATCTTATATGCAACAGGATAGTAGAATAAAATGTATAAAGACTGAGACTAATAAGGGTGTCTCTAATGCTAGAAATTTAGCACTAAGTAAGGCAACAGGACAATTTATAGCTTTTTTAGATAGTGATGACCAATGGAATAGTAGTAAGTTAGAAAAACAAGTAAATTTTATGTTAGAAAATGACTATGTAATTTCATTTACTTCATATGAACTGATGGATGAAAATGATAAAAAATTAAACAAAGTAATAAAAGTTCCACCTAATGTAGATTATAGAAGATTATTAAAAGGAAATATCTTAGGATGTCTTACTGTTGTGATTGATAAGTCTAAATTGGATTTTGAAATAAGAATGAGTGGTGTAAGACATGAAGATTATGTTTTATGGTTATCGATATTGAAAAAAGGGCATATTGCTCATGGAATAAATGAAGTTCTAGCATTATATAGAAAATCTAGCAATTCCCTAAGTGGTAATAAAATAAAAGCTGCTATGTGGACTTGGAATATATATAGAAATATAGAAAAAATACCTTTATACAAAGCTATATACTACTTTATTAATTATGGAATAAACGGAATCAAAAAAAGTTAGACAGAGAGGAAGATTTAATTAATGTATAAATATAAATTTACTGTATTTACTCCGACGTATAACAGAGCTCATTTACTTGAAAATTTGTACAATGATTTAAAAGCTCAAACTTATGATTTCAATGATTTTGAATGGTTGATTGTTGATGATGGAAGTAGCGACAGTACTAAAGAGTTAGTTGAAAAATTTATATCAGAAAATAAATTAAATATAAGATATATATACAAAGAAAATGGAGGAAAACATACTGCAATAAATCTAGGTGTAAAAAATGCAGATGGAGAGCTATTTTTCATTGTAGATAGTGATGATGGTTTAATTAAAGATTCTCTTGAAATTGCTAATGATGAGTGGGATTCTTTAGAGAATAAAGAAGGATTTAGTGGAGTTGTTGGACTTTGTGTATATCCAAGTGGAGATTTGATAGGGACAGAAATGCCTGAAGATAAGAAAATATGTCACTTTGCAGACCTATATTTTAAGTATGGCGTTAAGGGAGATAAAAGCATAGTATTTGTAACTGATGAGCTTATAAAATTTCCTTTTCCAGAAAGAAAAGAAGTGAGATTTTTACCAGAAAGTGTAGTATGGAATGAAATGTCTAAATACTATAAAGTTATATGTGTAAATAAACCTATGATAATAAGAGATTATTTGGATGATGGTTTGACTAAGAATATATTAAGTAAAAATGCATTAAGAGGTAGAGCATTAGAGTTTTTATATTTAATAAATCAAAATACATATCCATTAAGTAGATATCCATATATGTGGATAAAAAATTACATAAATTTAGCCAGATACTCATTGTTGTCTGATAGTCATTATTTTGGTGAATTAAGAAAAGTATCTGATAAATTGTTGTATTTAGCATTATTCCCATTAGGATATTACAAATATATTGGACAAAGAAAATTAGTATCTAAGTAAACTTGTTGGTATAGTACTGCTAGTTGCTATATAAGGAGAGTAAAAATATGAATGAGCCTTTAGTATCGATAATTACTCCTGTTTATAATTCAGAAGAGTTTTTATCAGAGACGATAAAGTCAATCCAAAATCAAACTTATAAAAATTGGCAGCTTTTATTAGTGGATGATTGTTCTAAGGACAATTCAAGTGAAATTATAAAAAGTTTTCGAAAAGAAGATGCTAGAATAAAATATATAAAGCTTGAAAAAAATTCTGGAGCTGCAGTATCTAGAAATGTTGGTATTAAGAATGCGGAAGGTCGATTTATTGCATTTGTAGATAGTGATGATTTATGGGATAGTAGAAAATTAGAGATTCAGATAGAATATATGTTAAAAGAAAATGTAGGTTTTTCTTTTACATCTTATAGATATATGAGACAAGATGGGTCAAAAACGAATAAGGTTGCAAGAGCTCCTAAGAAAATTGACTATGAAGGATTACTTAGAAATACTATAATAGGATGTTCTACAGTGGTCATTGATAAGGAGATTGTAGGAGAGTTCAGCATGCCTTTGGTAAGAAGAGGACAAGATACTGCAACCTGGTTACAGTTACTTAAAAAGGAAAAATATGCATATGGGATTCAAGAAGATTTAGTGAATTACAGATTAGTTGGAAATTCTATATCAAGTAACAAGATAAAAGCATTAAAACGAACTTGGAATACTTATAGAAATGTTGAAAATTTAAGTTTACCAAAAAGTCTATATGTATTTTGTTTCTATGTTTTTAATGCCATTAAAAAAAGAGTATAAGTTTTATATACTTGGAGGTAAAAAAATGAAAATAGCTATAGCTGGGACGGGATATGTAGGTTTGGTTACAGGTGTTTGTCTAGCAGAGGTAGGCAATGAAAATGTAGTCTGTGTTGATGTAGATGAACAAAAGGTTAAATCAATGAAACTTGGAATAGCACCTATATATGAAGAAGGCCTAGAAGAACTTATGGTTAAAAATTACAACAGAGGAAGAATAGATTACACTACAGACTATAAAAAAGCTTATGAAGATGTAGATGTAATATTAATAGCTGTAGGTACACCTGAGAGAAGTGATGGCTCAGCCAACCTAGATTATATAAAGGCAGTTGCAAAGCAAATAGCTGAAACTGTGACAAAAGATACTCTAGTAGTAATAAAATCTACAGTTCCAATTGGTACAAATGAAGAGATAGAAGATTATATAAATAGAAACCTAAAAAATGATGTAAAAGTAGAACTTGCATCTAATCCAGAGTTTTTATCACAAGGAACAGCAGTAAAAGATACTCTACATGCTTCAAGAATCGTTATAGGTGTAGAAAGTGAATGGGCTAGAGAAATATTAGAGGAAATCTATAAGCCTTTTAATCAACCTATAATAGTTACAAATAGAAATAGTGCTGAGATGATAAAATACGCATCAAATAACTTCTTAGCTCTTAAAATATCATTTATGAATGATATTGCAAATCTTTGTGAAATAGCAGGAGCTAACATAGAAGATGTAGCTTTAGGAATGAGTTATGATGATAGAATAGGAAGTAAGTTTTTAAAGGCGGGAATAGGATATGGTGGTTCTTGCTTTCCAAAAGACACAAAAGCTCTTCACTGGTTATCTGAACATAATGGTTATGAATTAAAAACAGTAAAAGCTGCAATAGAAGTTAATGAAAGTCAAAAACTTAAATTAGTTAGAAAGGCATCTAAGTTAGTAGAGAGCTTTCAAGATATGAAGGTTGCTGTTTTAGGTTTGACTTTTAAGCCAGATACTGATGATATAAGAGAAGCACCATCTATACCAAATATAAAATATTTGCTCGAAAGAGGGGCAAGAGTTACTGTATATGACCCAATTGGTGTAAATAATACTAAGAAAATATTTGGTGATTCTATACTTTATGCTGATTCTGTAGATGATGCGATAGAAGATGCAGAGATATGTTTTATAATGACAGAATGGAAAGATGTATTAAATTATGATATACATAAGTATAAGGAAAAGATGAAAAATCCTTTAGTCCTTGATGGAAGAAATTGTTATAAAATTAAAGATATGGAAGAGTTAGGAATTGAGTATTATTCGATAGGAAGGTAAATATTATGAAGACTGTTTGTTATTTAGCTGATGGGTCAAATCCTCATACTTTAAAATGGTGTAGTTTTTTTAAAAATAAAGGATATGACATTCATGTAATCTCTTTAAATGGAGGTCACATGGAAGGAATAAAAATTTATAATTTTGGTTCTAATGTAGAAGAACTAAAAAATGAAAATATTTCTAAAAAAACGGGATACTTAGGTTCAATAAAGCAGATAAAGAAGCTAGTAAATGAAATAAAGCCAGATATATTGCATGCACAGTATGCAAGTAGTTATGGATTTATAGGCAGTCTACTTGGGTATCATCCATATATTATTTCTGTTTGGGGTACTGATATTTATGATTTCCCTAATAATGGTTTTATACAAAAACAAATTATAAAACATAACTTTAGAAAAGCAGACTATATCTTTTCAAATAGTAGAGATATGGCTAAAGAGGCTAATAAATATACAGCTAAACATGTAGATGTAACCTTTTTTGGAGTAGATATGGATAGGTTTAAGCCTATGGAAGTAGAAAAAGAAGACGCTTTTGTAATAGGAATTATAAAGAGTTTAGAAAAAAAATATGGAATAGAATATTTAATACAAGCATTTAAGATGCTTAAAGATGAATATAAAGATAAGAAAATAATTCTTAAAATAGGTGGCTCTGGAAGTCAGATGGACAACCTAATAAATTTAGCTAAAGAATTGGGTATAGAAAATGATGTTCAGTTTTTAGGAAGAATATCTCCAGAAAATGTAAGCAAGACTTTTAATTCTTTTGATGTAACTGTATTTCCTTCTTTAAGAGAGGGATTTGGAGTGGCAGCTATAGAATCAGAAGCATGTGAAGTACCTGTTATAGTTACAAATGTAGGAGGACATCCAGAATCTGTATGGGAAAATGAAACTGGCTTAATTGTAGAACCAAAACAACCAGAAGAAATAAAAAATGCTATAATAAAACTAATGGAAAATGATGAACTTAGACTTAATATGGGTAAGAAAGGGCGTCAATTTGTTAGAGAAAATTATGAGGTTAATTTAAACTTTAATGATATAGAAAAAATTTATGATTCTATATTTGATAAATATAAAAAATAAAATGAAAAAATACAGCAAAAGATAGATGTTGTTGGCTATGCTTAGGTGCGTAGCTTTTGCTGTTTAAAGGAGGGCTTCTAGTTATGCGAGAAAGTATAGATTTAGAGAAAGAAAGCTTTTTTAATAGGCTTTTTAAAAAATATAAATTTAGACATTTAACACTATTAATTCTAGATATTTGTAGCGTACTAGTAGCGTTTCGAATGTCTTTAAGCTTGACAGGTAATTTAAATGCATTTACCACTAATGATATAATAATTTCAGTGTGTATATATATAGTACTTCATATAGTATCATTTAGATTGTTTAAGTGCTACAACACATTATGGAGATATGCAGGAGAAGAAGAAATTATATCTATTTTTGTGGCAACTTTAGCTTATTTAATTCCGATTTATATAATAAATAAATTATTAGGGTTTGATTATCCTATAATGTTTTATGTATTAAATACAATATTTATTATAATGTTTACAAGTGGCGCAAGAATAGCCTATAGAGCTATAAGAATAGTCATGAACAAGACATATTCTAGAGGAAAGGTTTCAAATATCCTTATAATTGGTGCAGGAGATGCAGGAGAAATGGTTATACAGGAACTAAAAAGAAATCCAGAACTTAAAAAAGTAGCAGTGGCTATAATTGATGATGATAAAAATAAAATTGGAAGAATAATCCATAATGTGAAAATTGTAGGAACAACTTCAGATATAAAAGATGTGGTAGAAAAGTACAATGTAGATGAGATAATCTTTTCAATAGCAAACATAGAGAAACGTAGAAAAAAAGATATTATTGATATATGTAAAAACACTAACTGTAAAATAAAGACAATACCAGGAATTTACGAAATTATAGATGGAAAAGTTGATATAAAACAGATTAGAGAAGTAGAGATAGAAGACTTGTTGGGTAGAGAGCCTATAAAAACAAATTTAAGAGAGATAAGTAATTACATTGAGGGAAAAGTAATCTTAATAACTGGAGGAGGAGGCTCAATTGGTTCAGAGCTTTGCAGACAGATTGCAGGATTTAATCCTAAAGAGCTTATTATAGTTGATAATTATGAAAATAATGCTTACTCAATACAACAAGAATTACTTAGAAAATATAAAAATAAATTAGATTTAAAAACAGTAATAGCATCAATAAGAGAAGAAAAAAGAATGGATGAAATATTTAATAAATATAAACCAGAAGTGGTATTTCATGCAGCAGCACATAAACATGTTCCTCTTATGGAATCGAGCCCTGGCGAAGCTATAAAGAATAATATATTTGGAACTTTAAACATAGCTGGCTTGTCTTCAAAATATAGAGCTAAGAAATTTGTCCTTATATCTACAGATAAGGCTGTAAACCCTACTAACATAATGGGAGCTACTAAAAGAGCTGCTGAAATGATTATACAGACTATGAATGCTGAAAGCCAGACTGAATTTGTTGCTGTTAGATTTGGAAATGTGCTTGGTAGTAATGGTAGTGTAATTCCACTTTTTAAGAAGCAAATTGAAGATGGCGGACCAGTGACAGTTACTCATCCAGATATTATTAGATATTTTATGACAATACCAGAAGCAGTAGGCTTAGTCATACAAGCTGGGGCTATGGCTAAAGGTGGAGAAATATTTGTACTTGATATGGGAGAACCTGTAAGAATATTGGATTTAGCAAAAAACTTAATTAAATTCAGTGGATTTGAGCCAGATGTTGATATAAAAATTGAATTTTCTGGTCTTAGACCAGGAGAAAAGTTGTATGAAGAACTACTTATGTCAGAAGAAGGTCTGTTGGATACAGAGCATAAAAAGATTTTTATTGGTAGACCAATAGATGTTGATAGAGAAAAAATAACAAAATACTTAAAACTTTTAAGAGAAATTACTAACAATGAAGAGGTTGAAAAAATAGATGGTATTATGAGGGAATTAGTGCCAACTTATATTAAACCAGAAGATGCTAATATCAAAGAAATTGCAACAACTAGAGAAAAGTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP020424|3220562:3229515|3224347_3225100_+|AVI58958.1|DBSCAN-SWA MNEPLVSIITPVYNSEEFLSETIKSIQNQTYKNWQLLLVDDCSKDNSSEIIKSFRKEDARIKYIKLEKNSGAAVSRNVGIKNAEGRFIAFVDSDDLWDSRKLEIQIEYMLKENVGFSFTSYRYMRQDGSKTNKVARAPKKIDYEGLLRNTIIGCSTVVIDKEIVGEFSMPLVRRGQDTATWLQLLKKEKYAYGIQEDLVNYRLVGNSISSNKIKALKRTWNTYRNVENLSLPKSLYVFCFYVFNAIKKRV >CP020424|3220562:3229515|3226426_3227518_+|AVI58959.1|DBSCAN-SWA MKTVCYLADGSNPHTLKWCSFFKNKGYDIHVISLNGGHMEGIKIYNFGSNVEELKNENISKKTGYLGSIKQIKKLVNEIKPDILHAQYASSYGFIGSLLGYHPYIISVWGTDIYDFPNNGFIQKQIIKHNFRKADYIFSNSRDMAKEANKYTAKHVDVTFFGVDMDRFKPMEVEKEDAFVIGIIKSLEKKYGIEYLIQAFKMLKDEYKDKKIILKIGGSGSQMDNLINLAKELGIENDVQFLGRISPENVSKTFNSFDVTVFPSLREGFGVAAIESEACEVPVIVTNVGGHPESVWENETGLIVEPKQPEEIKNAIIKLMENDELRLNMGKKGRQFVRENYEVNLNFNDIEKIYDSIFDKYKK >CP020424|3220562:3229515|3223391_3224300_+|ARC16066.1|DBSCAN-SWA MYKYKFTVFTPTYNRAHLLENLYNDLKAQTYDFNDFEWLIVDDGSSDSTKELVEKFISENKLNIRYIYKENGGKHTAINLGVKNADGELFFIVDSDDGLIKDSLEIANDEWDSLENKEGFSGVVGLCVYPSGDLIGTEMPEDKKICHFADLYFKYGVKGDKSIVFVTDELIKFPFPERKEVRFLPESVVWNEMSKYYKVICVNKPMIIRDYLDDGLTKNILSKNALRGRALEFLYLINQNTYPLSRYPYMWIKNYINLARYSLLSDSHYFGELRKVSDKLLYLALFPLGYYKYIGQRKLVSK >CP020424|3220562:3229515|3227601_3229515_+|ARC16068.1|DBSCAN-SWA MRESIDLEKESFFNRLFKKYKFRHLTLLILDICSVLVAFRMSLSLTGNLNAFTTNDIIISVCIYIVLHIVSFRLFKCYNTLWRYAGEEEIISIFVATLAYLIPIYIINKLLGFDYPIMFYVLNTIFIIMFTSGARIAYRAIRIVMNKTYSRGKVSNILIIGAGDAGEMVIQELKRNPELKKVAVAIIDDDKNKIGRIIHNVKIVGTTSDIKDVVEKYNVDEIIFSIANIEKRRKKDIIDICKNTNCKIKTIPGIYEIIDGKVDIKQIREVEIEDLLGREPIKTNLREISNYIEGKVILITGGGGSIGSELCRQIAGFNPKELIIVDNYENNAYSIQQELLRKYKNKLDLKTVIASIREEKRMDEIFNKYKPEVVFHAAAHKHVPLMESSPGEAIKNNIFGTLNIAGLSSKYRAKKFVLISTDKAVNPTNIMGATKRAAEMIIQTMNAESQTEFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIEDGGPVTVTHPDIIRYFMTIPEAVGLVIQAGAMAKGGEIFVLDMGEPVRILDLAKNLIKFSGFEPDVDIKIEFSGLRPGEKLYEELLMSEEGLLDTEHKKIFIGRPIDVDREKITKYLKLLREITNNEEVEKIDGIMRELVPTYIKPEDANIKEIATTREK >CP020424|3220562:3229515|3220562_3221402_+|AVI58956.1|DBSCAN-SWA MLISLIMPTLNRYDDIYLLMDSLENQTYKNFELIVVDQNDNSKVKEIVDKYIDKLDIKYIKSSKKGLSYNRNVGIDNAVGQIIGFPDDDCVYENDTLEKVINFFNKNKDYKIYSCKTMDSNKVDAFKKMYDGTCDITSSNVLDTITSITFFIDFEGKDYTRFDEKLGVGGEFGAGEEIDYVLNLLSLGFKGKYFGNDIIYHPAKKHSKSKEKYQKDYNYGRGFGALCKKEIVYRKNYKFAKVMVSKLVRNIGGLILSSNRDYHSATIKGRINGFRQYKL >CP020424|3220562:3229515|3225125_3226421_+|AVI59029.1|DBSCAN-SWA MKIAIAGTGYVGLVTGVCLAEVGNENVVCVDVDEQKVKSMKLGIAPIYEEGLEELMVKNYNRGRIDYTTDYKKAYEDVDVILIAVGTPERSDGSANLDYIKAVAKQIAETVTKDTLVVIKSTVPIGTNEEIEDYINRNLKNDVKVELASNPEFLSQGTAVKDTLHASRIVIGVESEWAREILEEIYKPFNQPIIVTNRNSAEMIKYASNNFLALKISFMNDIANLCEIAGANIEDVALGMSYDDRIGSKFLKAGIGYGGSCFPKDTKALHWLSEHNGYELKTVKAAIEVNESQKLKLVRKASKLVESFQDMKVAVLGLTFKPDTDDIREAPSIPNIKYLLERGARVTVYDPIGVNNTKKIFGDSILYADSVDDAIEDAEICFIMTEWKDVLNYDIHKYKEKMKNPLVLDGRNCYKIKDMEELGIEYYSIGR >CP020424|3220562:3229515|3222620_3223370_+|ARC16065.1|DBSCAN-SWA MKKNLVSIITPMYNSEKFIEATIKSVLNQTYQEWEMLIIDDCSTDNSPNIVKSYMQQDSRIKCIKTETNKGVSNARNLALSKATGQFIAFLDSDDQWNSSKLEKQVNFMLENDYVISFTSYELMDENDKKLNKVIKVPPNVDYRRLLKGNILGCLTVVIDKSKLDFEIRMSGVRHEDYVLWLSILKKGHIAHGINEVLALYRKSSNSLSGNKIKAAMWTWNIYRNIEKIPLYKAIYYFINYGINGIKKS >CP020424|3220562:3229515|3221401_3222592_+|AVI58957.1|DBSCAN-SWA MRMVFMDKVKFLINMLLAFFIYPFNKHKFNGRDIWLIGGHSGDIYNDNSKFFYEYMLKEHNDVETYWVVNKDSKVFDKIPGKKLIRGSVENYLYYYNSKAIVFSHAPSADIAPYNFAVPVLNYFHKKTIKVFLNHGTISFKKRKPMNKKFKNIIDNLYKSYNIVTASSEFERNVMVNDWGMLDDSVYIIGNARYDNLPTNEVAQTRDILYTPTWRDWIKFSSGKFTDTDYFKNIMNFLNDDKLNKILDEKDINVKIYMHHLMHEFIDDIKENITGKRIVFLDKGVTLANEIRKSAANITDYSSVAIDFLYMNRPILFYQFDLDEYMEKVDSYIDLKSEMFGSLAYNNDEAVNKLIDIIENNFEVMDNQKNERNKFFRYNDNKNCKRIYDCVLSKIK |
8 | Catovirus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
104 : 91744
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020426|104:91744|DBSCAN-SWA 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120 | Clostridium_phage(91.67%) | tail,transposase,integrase,protease | attL 63057:63076|attR 98401:98420 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
102264 : 130524
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020426|102264:130524|DBSCAN-SWA ATTAACACGCCAAAAGTTTAGCATTTTGTACAGATTCATTTCCTCCAATTATCAAAGCAACAGAGTCTTCCATTGAAACACCTGCTGATGATAACATACTTGCACTTCTTTGTAATGCAGCTCCTACATCGCCAGTTGTTATTGCAAAATTATTACCTGCATAGTTCGATAAATCAAGAAATTTTGTAAGATTATCATAATCTTTACTCATTCCTTTGATTTGAACTCTAGTATCTTTAATTGGTTTTAATGCTTTTGTCATTCCACCATAAGCGGACATAACACTAGTTAAGTACTTATCAGCAGTTTCTTGGTCTAAATCACCAACATTTGCAAAAACTGCTGATTGTTTAGCTATCTTCAAACTGTCTGATACCGATTTTACACCAGTTTGTAGAGCTTTAGATGCCCCCTGAATTATATCTTCTGATGCTCTAGCCGTATCTTTCCCTATTGAGATTGCTTCATTTTTTACATTCTTTAATTGCTCACTTGTTCCTTCAAAATTATTAGGTGCTACTTTCATCATATCTCTTAAAGCACTATCTAATTCAACAATAGTTGTTTTAATATTTCTTACACCATTTGTAATAGACATACCTATCATATTACCTAAAGTATAAGTTCTCATCGAATTATATAGGTCACTAAAAAATCCACTTGTTGCTTTTACACTAGTTCCTAATCCTGTGAAATTAGATTTCATATTGCTTAATCTACTTTTTATTGAATCTAATTCCTTTACTTTTTGACCTAGAGGCATACCATTTAATTGCATTAATTCTTTTTCTAGTTTATCAATTCCAGCAGTTGATTGACCCAATTCTAAACATTTTTGTCTAAGCCTATTTAAATCTGAAATTACTTTGGAAAGATTCATATTAAACTTAGCATCTAATTTAGTATTTTTAGTAGCATTTTCTACTTCTTTAACTTTATTTTTTAATTGTTCTAGTTTTTGTATTTCTGATTGTATTTGATTAGAAGTTAGATTTTTAAGATTCAAATTTTGAATTGACTTTAATGAATTTGATAAAGCTTGTAGTTTAGATGTATCTGCATATCCAGACTTACCCAATGTTTCTATTTTATTAGCTAATTTTCCAGCTTCATTTTGAAGAGTTTTAAATTGAGAAGCCATTTTTGTATTCATATCTGGTATTTTCATATTAGCCAACTTAGACTGAACATTTGATAAATCTGATAGAGCCTTTGAATTTAGACCACCTAATTTAATATTAGATAATCTTTTCAATTCTCCTGATAATTTGTTAATTTCTCCTATTTGCTTATTGTCTAAAATATTTGTCTGAGTAAATTTCTTTAATTGTCTTTGAGTAGACTCTATTTTTTTTCTAAAGTTATCGTATTGAGAAGTTAATTTATTTATATTCCCATTTGAATTACCTTTTCCGCCAAATAATCCATTTTGGGTTTCTCTACTAAGTTTATTAATTTGTTTTAACGTGTTCTCTAATTGCTTTAAATTATTTAATGAGGATGTATTCATCTCCACATTTAACTTTATATTATTTTCTTTTGCAGATGTCTTCAGTGATGCTAATTGTTTCCTAGCTTTTTTATCATCAAGTTCTATACTGGTCTTAATTTTAAATTCTTCTGCCATTCAACCAACTCCTTTTTTAAAGCATAAAAAAAGACAGTTAATATACTGTCTTAATATTTTTATTTAATTTTCTCTAATAATACTTTTTTCTTTTCATTAAATTCTTCTTCTGTTAATATCTCTTGGTCTTTCAAACTCTGTAATTCTTTTAATGAATTTGAAATTTTTGATATATCATCATCATCTTTTTTTATATCACTGTTATTTTCTGACTTAGCATTTTTAAATTTTTCAACTTCATTCTCTACAACCAATTTAAATCTCTCCATTTCATCTATATCATATTGGATTATTGGATTAGTAATATTTTTATATTCAGGGATAATGAAAATTTCTTCAGTGCTATTTGCAAATATAAATTTTAACGATATTTTTTCCACCATTGTATGTTTGTCATATGTAGGCAAAATGGAAATAACTTTCATAACATTTTTTTCTCTTATCTGTATATCAAGCTTAATCTGTAATAAATCATCTAATTTTTTAATGAGTACACTGCTACGATTTCTTGCTTTAAATACCAATCTATTATCTGATGTTAATATTATATCTCTACTTCCTTCATTTCCCTCAAAAGCATCTTTTGACAAATCTACTGCTTTTGATATAATTTGTCTCGTTGTTAGTGGAGCATCTTTAGGTCTATTTCTCTCTTCTTCAACTTCAGCCCTAATTCTTGCTGTTCGTTTTTCCTCTTCTTCCTTTTTTTCTTTTTCTTTTACACACTTGAAAATAAAATTAAAGAAAATAAATATAACTATACCAATTATTAAAATTAAAAAAAATGAATATTCACTATCAAACATAATATCCCCCCCTATTCTGATACATTAATTATATCAAGTCTAAAGGAAAATTTATACTAAAAAAGGAAATAGAAGCCAAAACTTCTATTTCCATAACATCATTTCAAATATTTATTAATATCTTCTTTACTAGCTTCTTCTATGTAATCTATCATACAGATTGGAATGTCTCTACTCCTAGAAATATCTCCGATTTCTTCTACTCTTATTTTCTCATTTCTTACACTCTTTAATATTCCAATAAATCCATAGTACTCATGGTCATATATAGCATATGTTTTGCCTATCTCAACCATTACACCTTTTATGTAATCATTATTTATCATAAATCTCTTAAGTACCTGACTATTCTCTTTCAATATTTTATTAAGAAAATATATTTGTCCTTTTCCAGTTACAATAGGAGTGTATCTAACTATCGTATTCCCATCTTTATCTACACCAGTACTCTCAGAAACCTCTAATACTTTTAAATCCATTGACTTTTGAGTTGGTGTATTATGGTCAGCTCTTTTCTTCCTAATTAAATATTCATTGTTTCTCATCCACTCAAATAATCTATTCTGTCCTATATCTACACCATTCTGATTTAATATCTTAGATAGTTGAGCAATTAGTATTGAGCTTGATGAACTTTCTATAGCATTAGCTAGTTCAAGTTTAGGTTTATTTTTCTCTTGCTCTACTCTTAATTTTTCTTTAGTAGCTCTCTCTTTCTTTAGCTCTGTGAGTAGTTGTATTGTCCAATCTGGGTCATTGATTGCCTTCTCTAGTGCTTCATTAGTCATATAAGCTCCATGTTTCCTTATTGTGGGTAATACTTCATTTGTCACCCATTTTTTGAATGGTCTACATTTTGCTGTTTTAGCTTCTAGCATAAAATCGTATAGTTGAGGCTCAGTTAAATATTTTGTACCACTGCGGTCCAATGGCTTAATTTCAGCCTTTTCAATAACATTATCAATTCTATCTCTTCTTATTTGAAGATATCTCTTACCACCACTTGGATTATTTCTAGTATAACCAAGTGCAGCTCCAGTAGAATATAATTCAAACAATAACTCTCCATTTAATTCAATTATTTCTACATCCATACCTTCAAACTTCTTACTTAATTCAGATTCCTCAAAACTCATTATTTCGTTTACATTTTCTCTATTAATTATTCCCATAATTAATACCTCCTTATAAGTTGTATTTTTTATAAGGAATGGTATATAATATCATTAGGGTGAATTATATACCATAAGGGGTTATTCAAACTTGGTCGGGCGAATAACCCCTTTTCTTATCCTTATTTTTCTAGCTCATCATAAACTTTTTTGATACCCAATCTAACTACATCTGCCTTAGTAAGTTTTAACTCTTTACAGCAATGATTAAGTATCTCAAGTTCATCATCTGACATCCTAATTCTATATTCATTTTTTTTAGGATTATCAGATGGAGGTCTCCCTGTTCTTGGTGTCATTCCAAACCTCCTGACTTATTGGTGATACATTTATTATATTATTGGTGACACAAAAAGTCAATATGCTATTTAATTTTTTGTAATATGCTCAATATCACCTTAATTTAATTATATATCATAAGGGGCTATTCAAACTTGATAGGGGAGAATAGCCCCTTTTCCTATCCTTATTTATTTTTATAACGTTTAGTATTTTATAATACTTATTGTTATATTTATATTATATTGCCAACATTTTGTTATGTCAAGTATATATTTTATAACTTTTTGTGTTATAATATATGTATAGGAGGTCTTAGAACATGATTGGAGAAAAATTAAAACAACTTAGAATTAAAAATAACTTAAAGCAATCCGATTTGGCAAGAATATTAGATGTAACACAAGGAGCTGTAGGTATGTATGAAAATGATAAAAGAACTCCATCTCCAGAATTGATAGTTAAACTAGCTGAATACTTTAATGTCACTACAGATTATCTTTTAGGTCATACAAAAACCAACTATTCAGTCAGTGCAAATATACCTGGTATGCCATCAATCGTATGTGAAGATAATTCCATCTATGATATACTTGATGGGAAAAAAGACATTAAATCTTTAAAAGATATGAATAAATTCTTAGAAAATACTGATTACAATAATGAAGTCAAAGAAGTTCTTAAAAAATATATGCAACTAGATGAAATGGATAGAAAAGCTATAGAGAGAATGATAGATAATGCATATGAACGACTAAAAGAGGATAATTAATATACACCTCTTTTTTTTATACCATATTAGCCCAATGTTGGAATTTTAACATGCGTCCACAGTGGATGCCATTTATTATATTTCTATTCTCCTTTAGTGAAGAATTATTATATCAACAGGAGTTATTAATTTGGTATATCCTCAATCCTATCACACTCAAAGTAGTGACCACTCAAACATCAAAATAAGCTCTTATGGTGGCTAAACACCAAACAAAATGTTCCTCTCAGGAACACTTGTTGAAATTCCAATACTTTCAACCATAAAAATCAACCTCTTATGTTCGATTCTAAGCAATTAAGGTATAAACACAAGCAGTCATTTTTACAAAACCTTAGAGAGTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020426|102264:130524|108768_109227_-|ARC17040.1|DBSCAN-SWA MGKIQVDKLIQDEVRAIIPIIDENGKEEYIEVRNPDKETKEEILNKIWVGMENPDLALSQEDILKMLIDKLTNIELNIEIEDLVDSNISSELETVMYHICQIGNELTASLLMNTDVKLGQMKNEILQDRVLKEIEETEEIEKMNNIKDKVVN >CP020426|102264:130524|114622_115633_-|ARC17048.1|DBSCAN-SWA MATAKTLKRIAHELYTDTFREYTDRDGNTITYRDAESAIKNKLKEMMGGEKYNYYKFQENKWGFYNLISELISDDINRLNEEVFSPFCDFENFDLGDKKEFTVENTNLFKVANIADGVNSTRRQRLLNKKVPTTAFKLSVAIYEEAERFITGRINWVVFVNRVSDSYHYDIARRIAKTFEGAYSTINAKFQATGNSDKVLLELIAKVEGATGKKPIIYGTPLALSNLEGVQTDLEKEEKRKYGFIQTFRGGYKVLSLPNAYDENAAEGKEWALDNKAIYVIPDGEKIIKLGTEGDVLVIENTDEKERDDQQIEYFMAQKIHLGVVTAAKFGVYKIQ >CP020426|102264:130524|117866_119345_-|AVI59044.1|DBSCAN-SWA 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29 | Clostridium_phage(96.55%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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