Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP034574 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC77 plasmid pUC77D, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP016713 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC77 plasmid pUC77A, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP034573 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC77 plasmid pUC77C, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP016714 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC77 plasmid pUC77B, complete sequence | 0 crisprs | RT,csa3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP015906 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC77 chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas3,DEDDh,csa3,DinG | 0 | 0 | 15 | 0 |
CP034575 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC77 plasmid pUC77E, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP015906_1 | 1469901-1470079 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP015906_1
|
1 spacers
spacers of CP015906_1
>1.1|1469944|93|CP015906|CRISPRCasFinder ATTGCTGAACCTTCTTTTATTCATCGATAAAATGCTCATGTTAATCGCATTGCTGACAGAAAGTTCAGCTTGCTGAACCTTCTTTTATTCATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP015906_1
The CRISPR arrays of CP015906_1 >merge|CP015906|1|1469901-1470079|CRISPRCasFinder GATAAAATGCTCATGTTAATCGCATTACTGACAGAAAGTTCAGATTGCTGAACCTTCTTTTATTCATCGATAAAATGCTCATGTTAATCGCATTGCTGACAGAAAGTTCAGCTTGCTGAACCTTCTTTTATTCATCGATAAAATGCTCATGTTAATCGCATTGCTGACAGAAAGTTCAG >CP015906|1|1|1469901-1470079|CRISPRCasFinder GATAAAATGCTCATGTTAATCGCATTACTGACAGAAAGTTCAG ATTGCTGAACCTTCTTTTATTCATCGATAAAATGCTCATGTTAATCGCATTGCTGACAGAAAGTTCAGCTTGCTGAACCTTCTTTTATTCATC GATAAAATGCTCATGTTAATCGCATTGCTGACAGAAAGTTCAG
>CP015906.1|ARE08607.1|1469051_1469840_-|Dihydroorotate-dehydrogenase-electron-transfer-subunit MPKLQEMMTIVSQREVASNIFEMVLKGELVEEMDLPGQFLHLAVPNASMLLRRPISISSWDKVAKTCTILYRIGDETSGTYEISKLQSGAKIDVMGPLGNGFPVDEVVSTDKILIVGGGIGVPPLYELAKQLEEKNCQMTILLGFASEKVKILEKEFAELKNVSLKIATDDGSYGTKGHVGMLMEEIDFEVDALYTCGAPAMLKAVAKKYEQLERLYISMESRMACGIGACYACVEHDKEDENHALKVCEDGPVFLGKQLLL >CP015906.1|ARE08606.1|1468043_1469009_-|dihydroorotate-dehydrogenase-1B MIVTKKLGEKMTENNRLSVKLPGLDLKNPIIPASGCFGFGEEYAKYYDLNKLGSIMVKATTLHPRFGNPTPRVAETASGMLNAIGLQNPGLEVIMAEKLPWLNENFPDLPIIANVAGSEEDDYVAVCAKIGDAPNVKVIELNISCPNVKHGGQAFGTDPDVAAALVKACKAVSKVPLYVKLSPNVTDIVPIAKAVEAAGADGLTMINTLMGVRFDLKTRKPVLANITGGLSGPAIKPVALKLIHQVAQVVDIPIIGMGGVESAQDVLEMYMAGASAVAVGTANFADPFVCPKIIEKLPEVMDQYGIDSLENLIQEVKNSKK >CP015906.1|ARE08605.1|1467180_1467894_-|orotidine-5-phosphate-decarboxylase MQENRPVIALDFPEFSDVKDFLEKFDPSEQLYIKLGMELFYTAGPQVVYYVKSLGHSVFLDLKLHDIPNTVESSMHVLARLGVDMVNVHAAGGVEMMVAAKRGLEAGTPVGRQRPKLIAVTQLTSTSEEIMQNDQKIMTSLEESVINYAQKTAQAGLDGVVCSAHEVEKIKAATSKEFICLTPGIRPEGASKGDQKRVMTPKEARTIGSDYIVVGRPITQAKDPVASYHAIKAEWNR >CP015906.1|ARE08604.1|1466927_1467179_-|hypothetical-protein MKKLLHFLVVLLGIFVAFILARLFIEIYTIVGDVYLQVDNKTITLYKVLAEIDYLSVGITFAMVFAYMAPIRLNCCRRRKIMV >CP015906.1|ARE08603.1|1465981_1466698_+|16S-rRNA-methyltransferase-GidB MTPDEFLSALTEFDIQLSDKQIKQFERYFELLVEWNEKINLTAITEKNEVYLKHFYDSIAPILYGLITDQPVSILDIGAGAGFPSLPMKIIFPELKVTIIDSLNKRINFLSLLTEELGLENVTLLHGRAEDFGQDANYRGTFDFVTARAVARLSVLTEFTIPFLKKNGILLSLKAAQFEEELNDAKKAIATLGGKFIKEVAYELPNGDERHIALIEKKKETPKKYPRKAGTPAKNPIK >CP015906.1|ARE08602.1|1465025_1465985_+|Geranylgeranyl-pyrophosphate-synthase MDLKNNFWKDYPELEKELVQVQQLMKSHVTIKNSDVKSAIFDIFDAGGKMLRPAYLLLFSGFTDLSESERLALAASVEMMHTATLVHDDVIDHADTRRGVATLSAKYGPEIAVYAGDYLFIAVFRLMSEHSLELSNLTKNIGSIERLLGGELGQLNHHFNLQQTLDDYIENISGKTGELFALSASVAPLISKNNTLTKRAYKIGMNIGISFQIMDDYLDYASTAQTLGKPVLEDIKQGIYSAPVLFALQENNALVSELIKNEKFDEVYDFIKTSDALEKTKALAKSYTLSALNLIDKLPKGKNRELIAEITRKLLERTL >CP015906.1|ARE08601.1|1464504_1465035_+|membrane-protein MNIKEYVYVSLLTAAAVVMGIIESSLPPFFAFAPGAKVGLANLVMIIAVFTLRWRQVWVMQILRLLITALFTGFSVFLYSFAGGILSLLAMYLMKQFGPKLVSMIGISTVGGFFHNFGQLAMASLLAKTTSVMLYLPWLAFFGILAGFAIGIAGNQLITRVKPIQELFIKESKQWT >CP015906.1|ARE08600.1|1464100_1464508_+|hypothetical-protein MNFFKNTVNFFKSIKTKPLDFVIIFLLFIASFSTLFFFATGSKGAQAELRISGKVIKTFNLNKNQTWTYRDKDGDYNKIQVKNGEIAVVEANCKDQIDVQRGYISKTGETIVCLPHNLVIEVMSGQKDEQVDYKV >CP015906.1|ARE08599.1|1463088_1464030_+|UDP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase MKQNIIPTKARKVRKAVIPAAGLGTRFLPATKAIAKEMLPIVDKPTIQFIVEEALKSGIEDILIVTGKAKRPIEDHFDSNIELEQNLLEKGKTELLKLVEETTDINLHFIRQSHPKGLGHAVLQAKAFVGNEPFVVMLGDDLMNITGNETPLTKDLINDYEKTHASTIAVMKVPHDDVDKYGVIDPNGEVSKGLYNVERFVEKPNVDEAPSDLAIIGRYLLTPEIFDVLETQVPGAGNEIQLTDAIERLNKTQRVFAHEFTGKRYDVGDKLGFVETTIEYGLEHPQIGANLKNYIIEKAKELSKDDSKNITKK >CP015906.1|ARE08598.1|1462019_1463045_+|glycerol-3-phosphate-dehydrogenase-(NAD(P)+) MNPQKIAVLGPGSWGTALSQVLNDNGHEVRIWGNNPEQMAEINEKHTNTRYFKDVVLDEKIKAFDRLDLALEDVDAILFVVPTKVTRLVAKQVAEVLKHKVHILHASKGLEQGTHERISTILEEEIPAQLRGEIVVVSGPSHAEETIVRDITLISAASKDHDEAKYAQAIFSNDYFRLYTNTDVIGVETAGALKNIIAVGAGALHGLGFGDNAKAAIITRGLAEITRLGVAMGAEPLTYSGLSGVGDLIVTGTSIHSRNWRAGDALGRGEKLADIEKNMGMVIEGVSTTKAAFELAQQLGIDMPITETIYKVLYENLDAKTGILDIMRRETRAENEFINNK >CP015906.1|ARE08608.1|1470374_1471739_-|Multidrug-resistance-protein-B-MF-superfamily MNKNNHFHLLGAVIATGILSFSGVLIETAMNVTFPTLINEFGLSTSKIQWVTTIYLLVIAITIPLSSYFNERFSARKLFLVANLIFLVGVLTNCFSPNFAMLLFGRLLQGVGTGIGLPLMFHLILTKAPLHKRGMMMGIGTLTTSIAPAIGPTYGGIISNSLDWRYIYIFLLPLVVISLVLGLACLPREGEKTPKKLALRPVISLSIMFFAFISALSAEHLMTFALLFIVGLVGAFLFVQFNRKESLIDLGILKNHRFVALIFSLLVYQALLLGLSFVLPSFIQVSAGFSSSVAGLFMFSGALIGAVLAPISGKVLDQIGARKPITTGLILAALGLALIFVFLPTKSLALLLGAHIVLMLGLGISYSNLMTCSLSTLATDQLSDGNALVNTLQQFIGAVATAVVATTLSIFQGLNGFKVGTSHGTSIILALFFILIIVSLIVSFPNLKKIRANH >CP015906.1|ARE08609.1|1472115_1473327_+|hypothetical-protein MGIIKAATGSLGGALADQWLEVIEPNEMSDQTVFTKGIKVRKDAKRGSNRKGTEDVITDGSIVHVYENMMMILVDGGKIIDYTAEPGYYTVKNDTAPSLFNGDLRDSIQESFFRFKFGGTTPQKQEVYYVNLQEIKGIKFGTATPLQYFDNFYNAELFLRTHGTYSIKITDPLAFYANVIPKNADHVEIQEINDQYLAEFLTALNTSINQYSAQGERVSFLTSKSMELSKYMASVLDEDWKQLRGMEIVSVAVASISYTDDSQKLINMRNQGAMLGDPSIREGFVQGAVARGLEAAGSNTGGATNAFMGMNMGGQNLAGFSQTNQAQMQAQAENKADTWTCPECNTKNTGKFCSNCGQAKPSATPVMPELNMACNECGAVVNLANGVPKFCPECGKPFVAKAL >CP015906.1|ARE08610.1|1473486_1474626_+|hypothetical-protein MSESQVLTHKCPNCGGPLLFEPKNQKFHCEYCGSTFTEQEVSDFEAKQEAAKVTDSPISSVSNAETTDEKEKITDSDQKRADENTDEEIGLFLCPSCGAEIVTDATTASTWCYYCHNPVVLTERLSGKFLPEKILPFQIERKAAEEQFLDWVGKKKFVPKAFFDKKQIQNLSGVYFPYWAVDAELSGGISAQATNLRVWIVGDTEYTEHSQYEIQRGGETKFKDLIKNALKKNLSDKMVGAVQPFDMTAAIPFKNQYLSGFLTEKRDIEFPDMKENVEREFRQYADGLMESTIIGYTSVSNLQSNQQIKNIDEDYVLLPIWLVTYKEAGNDRLFYYAMNGQTGKVAGLLPIDKKKLWTVAIGIFILVLLLGIIVGYLLS >CP015906.1|ARE08611.1|1474622_1475408_+|hypothetical-protein MRKKLVFLSLFFLSFFFLLLAPKTAAATFSSGLEDNLQLLGGNVTLLEQEAQKLANETKAGVYVVTTDSSTPASQMAKTYLADKVGAKNNGVVLVINMNLRKVYIWATGNLKYYLPSSRIEKTLDIVQPELTDNNYYQAVSGFFDQVSKYYQAGIPTSRKYSINSETGAVTFHRSFQPLSILIALIISLIAAGGFVWAIYRRYQMKDAHAVWRYDYGRNGNLELHQREDILVNTFITTRIIPRPSSDNNNFSDGSGGGRSF >CP015906.1|ARE08612.1|1475437_1475995_-|ribosomal-large-subunit-pseudouridine-synthase-E MNFCKKIMIILFNKPYDVLTKFTDGEGRKTLKDYIKIPNVYAAGRLDKDSEGLLLLTDDGKLNHLLTDPKSKSYKTYLVQVEGEFSPEAAQKLQKGLLLKDGKTLPAKVKLIDEPDWLWERTPPIRERKAIPTSWVEISIKEGKNRQIRRMTAAVGFPTLRLIRWSIGQYSLGNLKSGEYKIIQK >CP015906.1|ARE08613.1|1476312_1477476_-|cell-surface-protein MKKLQLFLSAIFLTLSFGLAQTGYARTDDYTVKPIIPENQSNKDLGYFDILLGADKEQTLQVELSNNTEQEIKIDVTLSSAVTNMTGLVVYEPTEIVADSSLKYNLKDYVNTPKVVTLPPLTRQKLDLKVKMPNEAFDGQIAGGITFSKEGQNDKEEDSEGITVKNTYSYTIALLMRQNDNEVSPDLKLKTVSPSQINGRNVINVNLQNPTMTYINTMNVKATISGISNTDIKYTYSNSMMQMAPNTSFDLPIPTSNQSAATRVSEPLKPGKYRLQLVVNARTDNQGKYEAQVDNKTARYKYQWTFDQEFTISDNQAQKLNDSDPTVKKEKDWTWRLFVIGILLLVLFLIILLWKRRKKSQKEEEEKQALREKIEAQEKIIDDLNKK >CP015906.1|ARE08614.1|1477553_1478366_-|hypothetical-protein MKKTILSLSGVAVITATLLSTSVLEVSAASVGSTTSGANVAFQPKKTPTNPVSPGDGKTPISPTTPGVPNTSNPVASDDGLTLDYVPAINFGTHYVDASTAHTWSAWAANDGSGKAIPQFLQVTDNRGTATGPTGWSVSLTQTAQFKGTKAGDLVNAVMTFNNDKTNTVVSTSMNKASSTVNTATNALVPGTAVNIFQADAGTGTGTNLLSFGAGDGSTLVTDPETLDSATNTTGKVDPNITLNVPAGSAKVDTYTTTLNWNLYSAPGNA >CP015906.1|ARE08615.1|1478340_1478685_-|hypothetical-protein MKIKYILWVICALLLLNTSVILAQEIGGTNTTGKVGFLEKEPIEKPPVTSSSQATGQSQILTNQNLPIVGTNQNDSLMPFVVGLVTIGVGSLMIKKTKRIRIKENFNEKNNTQP >CP015906.1|ARE08616.1|1478731_1479736_-|cell-surface-protein MKKVYKLIFLSILSILLIVQSKVAYSESPTSDFSVEAILEGHQKDKSITYWWLQVEKTQSINLKLKISNGNEENNFEITSNQAVNNNNFTLDYSLSAEEVSQYLHHKNSNFNFYQDIYFDETQEAGKLKITLAPNEVREITINLKIPKEGIKGQLIGGINVTKVPKESDRQEGILNVYSNVVALVMEDKDYSESHKQNLEFALEKSNEKEQVIKIKNSNSFLLSNMNIKAVIKDQKGEVVSEFSNPKTAVVPNASVSIKLNNQKELVKGAKYYLTVDSSNQTFKRNLIVSDSGNLKILEKKKEEIQPLNKKSVGLSLILMVVISSGGIYAYFKK >CP015906.1|ARE08617.1|1479747_1480872_-|hypothetical-protein MYYDDGSLLTVGALNWNINGSFVINGTVNTSSTYAGGWFMALNTLNSWNLNVGQNATLKVTTGGVISLDAFLTGAVKWNFAQGSSVLFNNLNPNQNVVSLAPGLGSSITMTDPKVVTFNTAGGSVFSTTVLTFPITISGSGLRTHSSSTGYTFDSTYDLITPNKGTITPTSSDIWYRMNTGTLTTFNPTLQVTNLSPNSYGSDASSIAAGKYISWYQPLGFQLNATLSSMNRTFNVSLDPTLTQGTPVDGSWSSLINGASTETLVVGDDRAQNPNIHVLVKMTQNNFPNGLQYYWVDPTTKTTSQLILNSALQIASITSDSTLPSWIKMTGAGSWYTLTFPTDSGLNIKANNSLLTQTNTNAGTFQYTVANGPS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP015906_2 | 1927806-1927900 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP015906_2
|
1 spacers
spacers of CP015906_2
>2.1|1927830|47|CP015906|CRISPRCasFinder TTTGCTGACAAATCCTTCATCCATTGATAAAAAGCTCAATTCAATCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP015906_2
The CRISPR arrays of CP015906_2 >merge|CP015906|2|1927806-1927900|CRISPRCasFinder TTTATTACTGACAGACTTGTCAGCTTTGCTGACAAATCCTTCATCCATTGATAAAAAGCTCAATTCAATCGCTTTTTACTGACAGACTTGTCAGC >CP015906|2|2|1927806-1927900|CRISPRCasFinder TTTATTACTGACAGACTTGTCAGC TTTGCTGACAAATCCTTCATCCATTGATAAAAAGCTCAATTCAATCG CTTTTTACTGACAGACTTGTCAGC
>CP015906.1|ARE09055.1|1926372_1927785_-|Cysteine-desulfurase-activator-complex-subunit-SufB MTENSTQEVVKDLEEYKFGFHDNAELEFTTGLGLTEEVIREISETKNEPEWMLEFRLKSFEAFKKLDMPKWGPDLSGIDFNDIVYYQKPSAKAARSWEDVPQEIKDTFEKIGIPEAERSYLAGASAQYESEVVYHNMKDEFEKLGIIFTDTDSGLRDYPEIFKKYFSKLVPPTDNKLAALNSAVWSGGSFVYVPKGVKCEIPIQAYFRINNEKSGQFERTLIIVEEGASIQYVEGCTAPTYSASSLHAAVVEIFVEEGGYMRYSTIQNWSDNVYNLVTKRAAAEKNATVEWIDGNLGSKVSMKYPAVHLNGPGARGTMLSIAFAGANQNQDTGAKMIHNAPNTSSSIISKSIAKNGGAVNYRGQVTFGKNSKKSASHIECDTILMDDLSKSDTVPFNEIHNSQVALEHEAKVSKISEEQLYYLMSRGLTEKEATDMIVMGFIEPFTKELPMEYAVELNRLISYSMEGSIG >CP015906.1|ARE09054.1|1925386_1926232_+|Dioxygenase MTWYHELGIKYPLFQGGMAWASNAELVAAVSNNGALGIIGSGGRTANELRRMIRKTKTLTSQPFGVNLMLLDKNIKQLLEVICEEKISVVTTGAGSPKEIIDTIIANNIKLFPVVPNKEIALKMLNLPISGIIVEGNEAGGHVGSQNLASLLKEIAPICPLPLIAAGGIYDHHTASLANILGANGVQVGTAFLLAKECQISPIYQELICKGEENGTSLISDKNGHLTRLLNISSEYPLNKSLKAAVEKGDLINGAFMAGSSSAYLEKIEPVENIIQRIMKK >CP015906.1|ARE09053.1|1924617_1925364_+|3-oxoacyl-acyl-carrier-protein-reductase MNKRTILITGATRGIGWAIAQKAAQANHKVILTGRDPLSLKSRAEELKKKFPKTEIQAIPLDVSNRSSVANAAKLIKDIDILINNAGITADSTFKKMSPEIWDEVISVNLTGVFNSTHALLDKINQGGQIITLTSKSALFGNFGQANYAASKAGIIAFTKTLAKELQKSMIRVNSVSPAAVTDMTLPVLKSLKETYGQNIPDEWKMGSSSDVANFIINDLIESEMTGKIFSINGSEIGYWQEPTFHKL >CP015906.1|ARE09052.1|1924327_1924621_+|hypothetical-protein MKLYKKINKADLIDYLQSVKDTNSLHYGKNPIIPGNFLLFILEEMYQEFYSMPLSYLKANFCSPAYLNERFCFIFNQNAFQITDRNQTLILKGEWKQ >CP015906.1|ARE09051.1|1923990_1924353_+|hypothetical-protein MVSKMILIAQKSLPRHFKLEGQKNFLSLLPQLWQELEGIPYSLKNGENWLLSEEIIRYPSSNYSFDKLKLYLLSEHITRHSKKYIINLSLEITSNTKLLAQINLSLLSEDSWNEIIQKNQ >CP015906.1|ARE09050.1|1922857_1924006_+|Acetyl-CoA-acetyltransferase MSFKNPVGIIAANRLPIGKINGFYKKISPETLYQNLIKQQFNKNLLLKKADIDYIILGNVTNQGGNLARRCALKAGFSSQVPAFTIDQQCGSGLTAMISSANYIISGEASVICTGGVESTSQANIVLDSESYQPINRFKMAPEPYEDFDMGTIADMTALKYNIPRSVQDLYALNSHKKATQAIEGKLLENEVFPYQDEGFTISSDQTVRPKSSMEALSKLTPAFTTNGTATAGNSCPINDGASSIILSSTNNPFDFQGYYLGQTTIALSPSDFLLGPIKATEKLLQKFNLKLNDIEAIELNEAFASQAILFQNYFKLDDIKLNAYGGSLAFGHPYGATGGILISRLLNRLNQVQKPCLGIATLCVAGGMGISVLIGNQWYQK >CP015906.1|ARE09049.1|1921626_1922868_+|Acyl-CoA-synthetase-(AMP-forming)/AMP-acid-ligase-II MEKNKFNFSKLAALFTDYPALKIGEISYSYQQINDLIQRKLTDYSHSSKTVITLINDSPLNFIIDFLAIIESGNYPLVVDKSFKKKSFKFGLIPEDTLFLASTSGTTGPPKIYYRNWESWKMGFEVCDDLFHLSNSQALATTSPLTTSLGLHTLMCALYLGKTFLTITNPSQFINITENYSLFTVPTYLLNNLNELFALTSPEIIFLGGGTLSPEAINKVRKKLPQTQMIEFYGSSETSFISWQAVNEGKKTSSVGKLFPHVELTLGPKYRLTVKSPYLFSGYLNQPYPQSWTTDDLGTLKNNHLYLFGRRSDIIEHGANKIFPEEIERMAKDLCEDCIAFGVFDERYSQKIALLLLKPIEKEKLIKILAQRLPKYKLPQIYLETPTLNFTKNQKISRKELEKEYFRGVYHEL >CP015906.1|ARE09048.1|1920912_1921482_-|Biotin-transporter-component MTKNQKVKTLTYSAFMTAFIIILGFLPGIPIGFIPVPIILQNMGIMMAGGLLGPKYGTISVGAFLTLALIGLPVLTGGNGGAASFLGPSGGYRMAWLFTPFLIGFFLKKLQITASKNWIGELIIVLVFGVIFVDLVGAIWLSIQSNIPLITSLISNLVFIPGDCIKAILTVLIVRRLRKEGGFEMYFRK >CP015906.1|ARE09047.1|1919935_1920907_-|biotin--[acetyl-CoA-carboxylase]-ligase-and-biotin-operon-repressor MRTTKQFVLLKLLQQKGNWVSGDELAEELKLSRESIWKAINTLKRKGNQIESRKNLGYKYVGNESLDEDTINFYSGMKFEDKIFVFDEVTSTQELAKQYLSSHEVKQPFIFVANNQTEGHGRRGRNFYSPSDTGLYFSLILPNPSHDILKIGLLTTSTAVAVVKVLEQFYKDKNFQLKWVNDIYLGTYKVGGIITEAALDLESSSAGNFIMGIGLNLSTKDFPADLSEKAQGINPEFKIDRNQLLAEMAKEVINNFANYRQPDLIDEYRKRSLLFGKNVTLKLGTKAVNGKVEGISDDGSLILKAKSGELQTFKSGEVVKVDW >CP015906.1|ARE09046.1|1918921_1919578_-|transcriptional-activator-TenA MLFTELAREKSSIFWERSFEHPFIQGLVSGELAPEVFRYYLLQDRYYLEHFSKLYFLIAKKSASEEIQAHLRLNAEELKNGEIFVREGFFKELEIGEQEILETPVAPTAYHYVSHMYRQLIDGSVNSAIAGMLPCAWLYHEIGLRLIEVGSPNPLYQKWIETYASEEATVQIAKECDIINRLYQESDEQEQEQMLEAFLISSKMEADFWEMALVLEKW >CP015906.1|ARE09056.1|1928018_1928477_-|NifU-like-protein-for-Fe-S-cluster-formation MALSKLDNLYRAVILDHSSNPRHAGELQTGCMVDLNNPTCGDVIRLTVEFENDVISNIAFSGHGCTISTASASMMTVAVLGKTKEEAKELATIFSAMVTGETDERQEKLGDAQFLAGVSKFPARVKCSTLAWNALKKAIDVGEAQETVIHGE >CP015906.1|ARE09057.1|1928592_1929084_-|hypothetical-protein MINMLNWVASLPLWLATTFLFVVVFFRAQCTFWLGKLSYHGILKTKWGKKLEKNSETSAGILAIQKMGWPIIPLSFLTVGFQTAVQFGAGLTNWSWYKYTLAAIPGYLAWGFIYASGGLSLFRSLVQGSIGLLILFIIIILAVVIAANLVLRYIRKNGIKTDD >CP015906.1|ARE09058.1|1929076_1930294_-|SUF-system-cysteine-desulfurase-SufS-subfamily MLEGIKKDFPVLNQIVNDEPLVYLDNAATTQKPLKVLAAIKDYYENDNANVHRGVHTLAERATEKYEAAREKVRQFINAKSTKEVLFTRGTTTSINWVAQFAGQILKTGDEIVISIMEHHSNIVPWQEVAKKTGAILKFVYLKDGQLDMDDLRKKITNQTKFVSIAHVSNVLGTINPVEEITKIAHEHGAYMAVDGAQSTPHMAIDLQKMDVDFFAFSGHKMMGPTGIGVLYGKEELLNQFEPVEFGGEMIDFVYESHSTWTELPWKFEAGTPNIAGAIALGAAIDYIQELGIDQIHQHEIELIDYLMPKLQEIEGLKIYGPKDNVKRGGLIAFNIEGLHPHDVATALDMEGVAVRAGHHCAQPLLNYLETPATARASFYLYNTKADCDKLVEALKKTKEFFNLD >CP015906.1|ARE09059.1|1930293_1931550_-|SUF-system-FeS-cluster-assembly-protein-SufD MNQEILNFSQMHAEPAWLSDLRQKAALEFENLELPNIERVKINRWGLDHLSISENEEIGSVPTFTEIPNHPLLVQVGSQTVMEQMTPNLAEQGVIFTDFNSALTEIPELLEENFGSVVPFNESRLTAANTVTFNSGLVLYVPDGVEVLEPIESILMQEGSSEVPFNKRILIIVGKNAKVDYLERLETSDEQSSKAKANIVVEVIAKAGAQVKFAAIDRLGENVTASVVRRGLIGDNATVDWSVGVMNDGNVVADFDSDLKGNGSHSQIKVVGISTGHQTQGIDTRVTNFGLNSVGHILQNGVILDKGTLTFNAIGHIIKGAKNADAQQSSHVLMLSDKGRGDANPILLIDENEVTAGHAASVGQVDEEDLFYLQSRGLDEETAKRLVIRGFLGSVVSEIPVKSVQAEFIETIERKLGM >CP015906.1|ARE09060.1|1931687_1932458_-|Iron-regulated-ABC-transporter-ATPase-subunit-SufC MATLEIKNLHVAIEDKEILKGVNLVINTNEIHAIMGPNGTGKSTLSAAIMGNPNYSVTQGEVLFDGQNVLEMSVDERARLGLFLAMQYPSEIPGITNAEFLRAAMNAKRAEDDKVSVMEFIKKLDKNMEVLSMKEEMAERYLNEGFSGGEKKRNEILQLLMLEPTFAILDEIDSGLDIDALKVVAKGVNSMRGEKFGALIITHYQRLLDYITPDVVHIMMDGRVVKTGGAELAKRLETEGYVNIAEELGLEYKEEV >CP015906.1|ARE09061.1|1932632_1933964_-|UDP-N-acetylmuramyl-pentapeptide-phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate-transferase 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
35339 : 49551
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP015906|35339:49551|DBSCAN-SWA 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>CP015906|35339:49551|40964_41246_-|ARE07158.1|DBSCAN-SWA MNDDTLTNLVARGLVDEVIHLFNKYLGTQLKIRNEKRVLPYISKKRVMEDLDISDGTLDNWEKHGLNRYKPRYKTSLIYYLIDDICKFIVIDT >CP015906|35339:49551|35687_36098_-|ARE07150.1|DBSCAN-SWA MKDKTDRIISDYINGRTQAKIKAIESRYIYRVKQDNLGIRTAYKGTAEPEGNTLDKERMEEDKELIGLRRTLELLGALYNTLTVSEKRIIELRYKGYNGYTWYRVAMELESAGIDIPIKRAKKIYFAFKEDVSRVL >CP015906|35339:49551|39924_40254_-|ARE07155.1|DBSCAN-SWA MKITDLQTLDQNIIKFLAEHRGIDRAVKGKILAQALDIDFRTLQSRIEYLHKQGCAIGSIDNGYFIPTNEDERRAGIIKKQRTGIAINNAVNGYTLAELDWIDQLFKEE >CP015906|35339:49551|45612_45825_+|ARE07169.1|DBSCAN-SWA MITKKEIKDRFERTSGGILSGVEIITDKNTGVQYMVVNKDSDGCGITPLIDKNGKPLLAKPDSESHFDLY |
25 | Lactococcus_phage(100.0%) | integrase,terminase | attL 34731:34758|attR 49660:49687 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
136175 : 177897
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP015906|136175:177897|DBSCAN-SWA 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>CP015906|136175:177897|136773_137454_+|ARE07268.1|protease|DBSCAN-SWA MIERIKKFLRTKFKPLLLLLVTVILYNGWTPHLGIFPPTFYDFAFNYYGFVDILTFLVIIVIAYKNDAFKKIFDIFRPKNLLFILFFIVGGNIFIALAHHLYFQMTPALEAFPEHSIDLANYFARTPFWTHSLDLFVIGPISEELIYREYLYRLFDKKCLACFVSVTMFAWVHTGFTYSFFLYLPISLVVTLAYHRRKAIGESIALHSSINLINTYLPNLLSFWVF |
41 | Shigella_phage(20.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
294326 : 302433
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP015906|294326:302433|DBSCAN-SWA AATGAAAGAACTCACTAACGAAGAACTTCGGGGAATACAATTAGAACAACTAAAATATATCGACCGGATTTGTCGAGAAAATGGTATTGAATATACGCTTGCAGGTGGTTCTCTAATTGGGGCAATTCGACATGGGGGATATATTCCTTGGGACGACGATATTGATATAGAGTTGACCCGGCCGCATTATGACCATTTAATTAGTGTTTTGATGGATCAACTGCCAAATGAAAAGTATGCGCTCTTACATTATAAAGTAAGGGAAACTTATCTCCCTTTTGCTAAACTTTATGATACTCGTACAAGTTTTACAAGTAAAATTGACAACTTAAATCGTGGGACTGGTGTCTTTTTAGATATCTTTCCAATGGATATCTTACCTGACAATGAAGAAGAAAGACAAGTCTTTAAAAAAGAGTTTTTGAAAAAGGCGATTCAACTAACTGCTTCCAACCCTCATGGCTTAGATTTTGCAAGTTCAAGTAAAAAAATATATTTTTGGGGTAAACTTGTTTTATGGATGCCTCAACACATTCGTTTCTATGGGAAATATCGAATTTTGGCTGAAAAATTAGATGAATTCATGCAAAAATATCGTAATAGCGATAATCAGTTAATTAGCTATCTTTACACTGGCTATAAAAAAGCTATCTTCCCTAAAGAAATTTGGGAAGAATACGAAGATGTTAAGTTTGAAGGGTTAACTGCTCGTAAACTCAAAAATCATGAGGAATATTTAACTCGTCAATATGGTGATTACATGAAACTTCCACCAGAGAATGAGCGAGTTAATCACGATTATTATAAATGGTACTGGAAGGAAAAAAATGAAATTTAGTGTAATAATACCAGTATACAACGCTTCTAAGTTTATTGATTATTGTGTTGAATCAGTATTGAGTCAATCTTATTCAGATATAGAAGTTATCCTTATAAATGATGGTTCGACAGATAAATCAGGAGAAATTTGTGAGGGGTTCGCTAGAAAAGATAATCGAGTGAAAGTCTATCATCAAGAAAATCAAGGTGCAGCTGTCGCTAGAAATCATGGAATTCGTAAAGCAACAGGTGATTATCTACTATTTCCTGATAGTGATGACTATTATGCCTCTTCTCTCGGCTTTGAAGAAATTAATAATCAATTAGAAGAAACCAAAGCGGACGTTTTAATTCATGACTCTTTTGTTGAAAGAGGTAATGGAACTCCCGATGATTTGCATTCTTCTCTTTTAAGAGAAGAAGTTTTAAAGCTAGAGAAAATAGAGTTTATAGAGTATTTAATTAAAAAAGATAAATTAACACGTTCAGCATGGACGAAAGTAATAAGTAGAAGTTTTCTATCTAAAAATAATATTTTATTTCCTACTGTAAGACAAACAGAAGATACAGGTTTCACTGCAGAGCTTGTTAGACTAGGGAATTCTTTTGATTGGTATGAGAAACAATTTTATGCTTATGTAAAACACGATGAAAGTGTTACTGCAAAAAGACTCCCAGAATCAATCATCCATGATTCATTTTCTGTTATTAAAACAGCGGTAATAAATGGAGAATTAATTAAAGATAGTAGATACCGAGAGGCTTATTATTCTTACCTTGCTTATCCTTACGTTGTTCTTATTGGACAGACAAAAGAGGCAATCAATAGAGGGGTAATAAAAGAAAATACTATCTTAAATGATTTAAAACAATACTCATTTCTTATGAAATATAATTTAAACCCCAAGCTGAAAGTTATAAAACACTTATATAAATTATTTGGTTATTTAATGATTGTCTTTCTTTTGAGTGTAATGATGGAGCTAACATACCGAAAGCAAGGAGTATAATATGACAACTACTTTAACAATTTTAACCCCAACATATAATAGAGCGTATATTCTCCCCAAGTTATATGCTAGTCTAGTTGAGCAAACTAACAAACACTTTGATTGGATGGTTGTTGATGATGGCAGCACTGATAATACTGAGCAATTAATATCAGAATTTATAGCCGATGGGAAGATAAACATTGTCTATATCAAGCAGAAAAATGGTGGTAAGCACAGAGCCTTGAACACGGGTGCTCAGTCTATTAATTCTGATTATATTTTTATCGTAGATAGCGATGACTATTTGACGAACGATGCTATTGACATAATTTTAGAAAACTCTCACTATTTGAAAGAAAAGAACCTAATGGGGATGACCTTGTTAAGGGGCTATGCTCCTGATAAAGTCATAGGTGAAAAATATCCTGAAGATTTTATGATAAAGAATTTTAATCAAGTTCGATATAATATGGGAATAAAAGGTGATAAAGCTGAGGTTGTATCAACTAAGATATTTAGAGAAACTCCTTTTCCTGAAATTCCAGGAGAAAGATTTATGAGTGAAGGAGTCGCTTGGAAACAGTTAGCACACAAAGGTGATTCATTATTTATAAATAAAATTGTATACATTACAGAGTATTTGGAAGATGGGCTTACTCATTCAGGGAGACTCTTATTGATAAAAAATCCACTTGGTGCAATGTTAAACGCAAAGTTGGCAATGACTAAAGAATTTTCATTCAAAATAAGAGAAAAGAACTCCCTTCTTTACATAGCTTATGGATTTTTTGCAAAGAAGAAAGTAAGGGAAATTATAACTGAAAGTGGTCAAAGAAAATTGGTCAGAGTTAATCTGCTATTTGGTTGGATGATTTACTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCCATGCCAAGATTCAAGACTGGCATTATGATAAGGGTATCCCCTTCGACTGAAAGAGTGAGTCATCCCATAATACTTAAGCAACTCTTCATACTCTAGACTCGTATACTGGCTTCCTTGGTCAGAATGAAGAATAACAGCTTCTGGATAGTCTTGTGATTTAATGGCCTTATTTAAAGTTCTTTGCACTAATTCTACAGTCATTCGCTTGCCCAAATCCCAAGCAATGACTTTTTTAGTATAACGATCCATAATGGTTGAGAGATAAGCCCATCCTTGTTGAGTAGGAATATAAGTAATGTCGGTTGACCAAACCTTATTTTTCTTTGTAGGTTCAGTCTGTATGAGATTTTTTCGATTGATGTGATCACTTAGTGAGTATCCAGGCTTAAATTTCTTAATGACTACAGACTTGAGTTGAAGTTGTTTCATTAGCTTCTGTACCAGTTTTAACCCGACTTTTTCCCCTTGTTTAAGTAGAAGATGATGAATTTTAGGAGCACCATAGATTCCTCGGTTAGCATTGAAGAGTTGAGAAATTTTGAGTGACAGGTATTGTCTCCTTAATTGAGTTTTAGATGGATGTCGGTTAATCCGTTCATAATAACTTGATTCAGGAACATCAAGGAGTTGACAGCTTAGTCTGACATTGAGTGCTAAAGTTTGTATGGTTTGAGCCATATCCGCAGCACTCACTTCTTTTTCTCGGCGAATATGGTCAATACTTTTTTTAAGATGTCTCGTTCTTCCTTAACTTTAGCCAGTTGTCTTTTTAATTCTAGAAAATCAGCTTTAGAGACGGAGCTTTCATTAGATTTAGAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAAGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCATACGTAATATGGAAAATAAAATATAAATTATGATAGAAACGACTTTGGTAAAAATGAAAAAAATTGATTTAAAAATTATTTTTGTGTTTGTACTGGTAATATTTGGAATGTCTTATGAACTTAGGGGATTTGCTGATGATACCAGTTCTCCTACTCCTGTTTATCGGGTTTATAATCCAAGAAATTTAGAACATTTATATACCTCTAGCCTTAACGAAAAGAATACGTTGGTACGTATTGGTTGGGGGAGGTTTGAGGGAGTAACTTTCTATGGAAAAAATAATGGTGATACACCTATATATAGGCTTTATAACTTTTCGATTAGGCAGCATCTGTATACTGCTGATCTTAATGAAGCAAGGGTGTTAAGCCGCAGTGGTTGGAAGAATGAAGGAATTGTTTTTCGAGCGACAGTAGCGGGAAGCGTTCCAGTATATAGATTGTATAGTTCAAAGATTAAACAGCATTTATTCACTACTGATGCGAACGAGAAAAGAGTTTTAAGTGCTGGAAATTTTTGGAGATATGAAGGTATTGCTTGGTACGGTGTTTCTGCTACAAATAGTGACTCTGATGATATACTTTTGGTAAATCATAGAGGTAATCACACAGAGTTTCCAGAGAACTCTGTTGAATCAGTTCTTTCAGCAAAATATTCAGCGGTAGAAACTGATATTCAAACAACTTCTGATGGGCAATGGGTTAATATGCATGATGCAACTGTTGATAGAACAACTAATGGACATGGAGCTGTTGCAGATCTTACTCTTGCCCAAATTCAAAATTTATATCTAAAAAATAATTCTGGTCAAATAACACAGTACAAAGTTCCAACTTTAGATCAATACCTTGCAGCTTGTAAGCAAAAGGGAGTTATTCCATTAATAGAAATTAAACAGGCAACCGCTACCCCTGAACAGTATTCAGATATTGCTATGAAATTTGAACAGTATGGTTTTTCTTCAACAGGGTATATTATTTCAGGTTATGAAGAGCCACTAAGTAAGATTGAGTCTTTAATCCCAACAGTTAATGTTATGTATATTGTGGAAGGGTATTCTACTGAAAATGTTACTTTTGCAGTATCTTTAGGAATTAAATCTGGACTGGATATGGGATATACTAACATTAATCAGCAGGTGGTTGAGGCAGTTCATGCATCAGGAATAAAAGTTGGGGCCTGGACAGTTGGAGATATTAATACATTAAAATATTTGCAAAGTATTGGCGTTGATGTTTTGACTACTAACTATTAAGGAGATATTTATGAAAGATAATGAAAAACAGAGGATTGTTCTTGTAGCAGGAACATTTGATATATTACATGAAAGTCATATCAATATGCTTCGTAATGCGCGCAATCTTGGTGATAAACTAATTGTAATGCTCTCTACAGATGAATTTAATGCCACAAAAGGTAAGAAGTCATATCAAGAGTATGATACAAGAAAATATGTCTTAGAATCCGTAAGATATGTTGACTTGGTTATTCCGGAACAATCATGGGATGATAAAGCACTTTATATTGATATGTTTGATGTTGATATATTTGCTATGGGAGATGATTGGCGAGGTAAGTTTGATTTTTTGAAGGATGAATTTCCTCATCTTAAGATAATGTATTTTCCGCGTGGTAAGATTTCCTCAAGTAAAGTTAAGGAAGAATTAGGAAAATTATATCAAAAAAGAAAGTGACTGATTGTCCCATATAATTTTTTTGAGCGTATGCTTGGATTTTGCCATGAATATCAAAAGTACCTAAGAATAAATATTAAAAAAATCAGAAAACTAACTCTGATTTTTTTACTTTGGGATTATAATTATGATTTTAACCCATACCAAGCTATACCTTCATAACTCCATCCTAATGTGGATAATACATTTTTTTCGTTACTATCAGTTGTAAATAAATGCTGTTTTATACCAGAGTTATATAATCGATAAACAGGAATATTTTCTATACTTGATGTGGAGGCATAAAATACAATACCTTCGTAATTCCAGCCCGATTTAGAGAGAACATTTTTCTCATTAGTATCTGTAGTATAAATATGGATCTTTAGTCCCTTTCTTGGCAAGGTGTTATCATCGGATTTAAGATCAGAAGGAGCGTTACTAGCTGGAACTGCTGCAAATGAGCGGGCTCTAATATTGGGAGTAGTAGAAGAATCACTGGTGCTCTCTGTTGAAGCTTCTTGACTTTGTTCTTGCTCAATATAGTGCCCCATTGGGGTATTGTCTGAACTAATAACCTCTTCAGCAAATACTGGTTTGGCGATTAATAATCCTGAAAACAGAATTAGGGGAATAATGTGGGATTTTTTCAGTTTCATTTCTAAATTTTCAGCTTTCCTTTGTGTGGATGAAAAATAAATGGTTTCATATAATATTTTACAATGAGGACAACAAAGCTTTGTTGCGTTTTAGTAAAAAATAACTAACATTTTAACGAAAATGTTTTCTTTGGATTTTAAATGTAATTTCAAACAGTCTTTTTTTACCCTGTATAATATATGTTACCATATTTAAGGCGAGTTTATGAAATAATAAGGTAATTATGAGTTTAAATTATGCATATTTTTTATTTAATCTGTTTTCTACTGTTGAAATGCTTTGGGAATAGTGGTAGAATAGTAAAAATAAAATATTGGCGAATGCCATAGAAATATAGCTATATTGCGTATATATAGCACGATAATGGAGGAATATTTTCGATGTCAAACTGGGAAACTAAGTTTTTGAAAAAGGGATTTACTTTTGATGATGTATTGCTGATTCCAGCAGAGTCTCATGTTTTACCAAATGAGGTGAGTATGAAGACAAAGTTGGCTAAAAATTTGACTTTGAATATTCCAATTATCTCTGCTGCCATGGATACTGTAACTGACTCAAAAATGGCTATTTCAATGGCGCGTCAAGGTGGACTTGGTGTAGTTCATAAAAATATGTCTGTTGAGGAACAAGCTGAAGAAATTCATAAAGTGAAACGTTCAGAATCTGGTGTTATTACAGATCCATTTTTCTTGACTCCAAATCATAAAATTGAAGAAGCTGAAAACTTGATGGCAACTTACCGAATTTCTGGTGTACCAATCGTTGATACGCTTGAAAATCGTAAATTGGTAGGGATTATTACTAACCGTGATTTGCGTTTTATTACGGATTATAATCAACAAATCAAAAATATGATGACTTCTGAAAATCTGATTACTGCTCCGGTTGGAACAACTTTAGATACAGCTGCTCGTATTTTGCAAGAGCATAAAATTGAAAAATTACCTTTGGTTGATGAAGCTGGTAAATTGGCTGGTTTGATTACAATTAAAGATATTGAACGTGTGATTGAATTCCCAAATGCTGCTAAAGATGAGCAAGGTCGTTTGCTTGTTGCTGGAGCAGTTGGTGTATCTTCTGATACTTTTGAGCGTGCGGAAGCTTTGTTTGCTGCAGGGGCTGATGCGATTGTTATTGATACGGCTCATGGACATTCAGCTGGTGTTTTACGTAAAATCCGTGAAATACGTAATCATTTCCCAGACCGTACTTTGATTGCTGGTAATATTGCTACTGGTGAGGGTGCTCGTGCTTTGTTTGAAGCTGGTGTTGATGTGGTTAAAGTTGGGATTGGTCCTGGTTCTATCTGTACGACTCGTGTTGTTGCTGGTGTAGGTGTTCCGCAAATTACAGCCATTTATGATGCGGCAAATGTGGCGCGTGAATTTGGTAAAACAATTATCGCTGATGGTGGGATTAAATATTCTGGTGATATTGTTAAGGCGCTTGCTGCTGGTGGAGACGCTGTTATGCTTGGTTCAATGCTTGCAGGTACTGACGAATCTCCTGGGGAATTTGAAATCTTCCAAGGTCGTAAGTTTAAAACTTACCGTGGAATGGGTAGCTTGGCAGCAATGAAAAAAGGTTCTAAAGACCGTTATTTCCAAGGGGCTGTTAATGAAGCTAACAAACTTGTTCCAGAGGGAATTGAAGGACGTGTGGCTTATAAAGGGACAGCGACAGATATCGTTTTCCAAATGCTTGGTGGTTTGAAAGCAGGAATGGGATATACTGGTGCGGCTGATATTACTGCTTTGCATGATTCAGCACAATTTATCGAAATGTCTGGTGCTGGTTTGAAAGAATCACATCCGCATGATGTACAAATTACTAAAGAAGCACCTAACTATTCTGTACAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP015906|294326:302433|296155_297016_+|ARE07433.1|DBSCAN-SWA MTTTLTILTPTYNRAYILPKLYASLVEQTNKHFDWMVVDDGSTDNTEQLISEFIADGKINIVYIKQKNGGKHRALNTGAQSINSDYIFIVDSDDYLTNDAIDIILENSHYLKEKNLMGMTLLRGYAPDKVIGEKYPEDFMIKNFNQVRYNMGIKGDKAEVVSTKIFRETPFPEIPGERFMSEGVAWKQLAHKGDSLFINKIVYITEYLEDGLTHSGRLLLIKNPLGAMLNAKLAMTKEFSFKIREKNSLLYIAYGFFAKKKVREIITESGQRKLVRVNLLFGWMIY >CP015906|294326:302433|294326_295163_+|ARE07431.1|holin|DBSCAN-SWA MKELTNEELRGIQLEQLKYIDRICRENGIEYTLAGGSLIGAIRHGGYIPWDDDIDIELTRPHYDHLISVLMDQLPNEKYALLHYKVRETYLPFAKLYDTRTSFTSKIDNLNRGTGVFLDIFPMDILPDNEEERQVFKKEFLKKAIQLTASNPHGLDFASSSKKIYFWGKLVLWMPQHIRFYGKYRILAEKLDEFMQKYRNSDNQLISYLYTGYKKAIFPKEIWEEYEDVKFEGLTARKLKNHEEYLTRQYGDYMKLPPENERVNHDYYKWYWKEKNEI >CP015906|294326:302433|300951_302433_+|ARE07439.1|DBSCAN-SWA MSNWETKFLKKGFTFDDVLLIPAESHVLPNEVSMKTKLAKNLTLNIPIISAAMDTVTDSKMAISMARQGGLGVVHKNMSVEEQAEEIHKVKRSESGVITDPFFLTPNHKIEEAENLMATYRISGVPIVDTLENRKLVGIITNRDLRFITDYNQQIKNMMTSENLITAPVGTTLDTAARILQEHKIEKLPLVDEAGKLAGLITIKDIERVIEFPNAAKDEQGRLLVAGAVGVSSDTFERAEALFAAGADAIVIDTAHGHSAGVLRKIREIRNHFPDRTLIAGNIATGEGARALFEAGVDVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDAANVAREFGKTIIADGGIKYSGDIVKALAAGGDAVMLGSMLAGTDESPGEFEIFQGRKFKTYRGMGSLAAMKKGSKDRYFQGAVNEANKLVPEGIEGRVAYKGTATDIVFQMLGGLKAGMGYTGAADITALHDSAQFIEMSGAGLKESHPHDVQITKEAPNYSVQ >CP015906|294326:302433|298290_299493_+|ARE07436.1|DBSCAN-SWA MKKIDLKIIFVFVLVIFGMSYELRGFADDTSSPTPVYRVYNPRNLEHLYTSSLNEKNTLVRIGWGRFEGVTFYGKNNGDTPIYRLYNFSIRQHLYTADLNEARVLSRSGWKNEGIVFRATVAGSVPVYRLYSSKIKQHLFTTDANEKRVLSAGNFWRYEGIAWYGVSATNSDSDDILLVNHRGNHTEFPENSVESVLSAKYSAVETDIQTTSDGQWVNMHDATVDRTTNGHGAVADLTLAQIQNLYLKNNSGQITQYKVPTLDQYLAACKQKGVIPLIEIKQATATPEQYSDIAMKFEQYGFSSTGYIISGYEEPLSKIESLIPTVNVMYIVEGYSTENVTFAVSLGIKSGLDMGYTNINQQVVEAVHASGIKVGAWTVGDINTLKYLQSIGVDVLTTNY >CP015906|294326:302433|297067_297907_-|ARE07434.1|DBSCAN-SWA MAQTIQTLALNVRLSCQLLDVPESSYYERINRHPSKTQLRRQYLSLKISQLFNANRGIYGAPKIHHLLLKQGEKVGLKLVQKLMKQLQLKSVVIKKFKPGYSLSDHINRKNLIQTEPTKKNKVWSTDITYIPTQQGWAYLSTIMDRYTKKVIAWDLGKRMTVELVQRTLNKAIKSQDYPEAVILHSDQGSQYTSLEYEELLKYYGMTHSFSRRGYPYHNASLESWHGHLKREWVYQFKYKNFEEAYQSIFWYIEAFYNSKRIHQSLGYLTPNQFEKVSA >CP015906|294326:302433|299503_299932_+|ARE07437.1|DBSCAN-SWA MKDNEKQRIVLVAGTFDILHESHINMLRNARNLGDKLIVMLSTDEFNATKGKKSYQEYDTRKYVLESVRYVDLVIPEQSWDDKALYIDMFDVDIFAMGDDWRGKFDFLKDEFPHLKIMYFPRGKISSSKVKEELGKLYQKRK >CP015906|294326:302433|300057_300570_-|ARE07438.1|DBSCAN-SWA MKLKKSHIIPLILFSGLLIAKPVFAEEVISSDNTPMGHYIEQEQSQEASTESTSDSSTTPNIRARSFAAVPASNAPSDLKSDDNTLPRKGLKIHIYTTDTNEKNVLSKSGWNYEGIVFYASTSSIENIPVYRLYNSGIKQHLFTTDSNEKNVLSTLGWSYEGIAWYGLKS >CP015906|294326:302433|297918_298179_-|ARE07435.1|DBSCAN-SWA MQKRYSKEFKETLIAFYHSGQSVTQLSKEYDVAPATIYKWIDLYSKSNESSVSKADFLELKRQLAKVKEERDILKKVLTIFAEKKK >CP015906|294326:302433|295152_296154_+|ARE07432.1|DBSCAN-SWA MKFSVIIPVYNASKFIDYCVESVLSQSYSDIEVILINDGSTDKSGEICEGFARKDNRVKVYHQENQGAAVARNHGIRKATGDYLLFPDSDDYYASSLGFEEINNQLEETKADVLIHDSFVERGNGTPDDLHSSLLREEVLKLEKIEFIEYLIKKDKLTRSAWTKVISRSFLSKNNILFPTVRQTEDTGFTAELVRLGNSFDWYEKQFYAYVKHDESVTAKRLPESIIHDSFSVIKTAVINGELIKDSRYREAYYSYLAYPYVVLIGQTKEAINRGVIKENTILNDLKQYSFLMKYNLNPKLKVIKHLYKLFGYLMIVFLLSVMMELTYRKQGV |
9 | Catovirus(28.57%) | holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
475059 : 487190
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP015906|475059:487190|DBSCAN-SWA 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ATCAAGAAAGAATGAGTCAGGAACTTTTAAAAACATTTCAGGCAATAAAAATGTGGAAAAGCAATGTCCGATTTGAGTCAAGTTTAACTTTTCTTGTTTTATGAAACTTGTCAAACTTATCCTTTGATTGAAAAATCTTATATCAGGAGAATATTATGATTTATGAAATAAAATTTGCACATGGCGAATCAAATGTATTTGCAATAAGTGATATAGAACTTGCTCCACAAACAGAAGTTATCCTTCGTTCAGATAAGGGAAACTTTTACGGAAAAATTGTACGTGAAATTTCTGAAGAAGCGAATCTTGAAATTCACCACACGATTGTGCGTGAAGTAAATGAGGATGATCTCCAAGTTATTGCAAAACTTGAAGAACGTTCTAAACAAGCCAAAGATAAAGTTCGCCAACTTGTCATCGAACAAGGTTTGGAAATGAAAATTATTGATGTTGCTTATAATTTCGACCAAATGCAACTTTTTATTTCGTTTACAGCAGAGAATCGTGTTGATTTTCGATTGCTTTTGCGTGAGTTGGCAACAACTTTTAGAATTAGGATTGAACTTCGCCAAATTGGGCCAAGAGATGCGGCTAAAATTCATGGTGGACTTGGACCTTGTGGACGTCCTTTGTGCTGTTCTGAGTTTGTTTATGAATTTCCAAATGTTTCAATCAAAATGGCCAAAAATCAAAATCTATCTTTGAAACAAAATAAATTGAACGGTCTTTGCGGTCGTTTGATGTGCTGTTTAACTTATGAAGATAGTTTTTATAAAGAAGCCCAACAACTTTTCCCAGATTTTGGTGAGTTTGTAACTACCTCAGAAGGAAAAGGAAAAGTTGTTGGCTTAAATGTTTTAAAAAATAGAGTAAAAATCCGCTTTGGAGAATATAGCAAGGATTTTGAACTTGCAGAAATTGAGGTGAATCATGGCTGATAAATATAATGTTTTCGACCAACTGGGAGAACTTGAAAATACATTAAATACCACATTAACGCAAATTTCAGGAATTCGCCAAGTGCTTGAATCATCAATGACTGAAAATGCAACCTTACGCATGGAATTAGAAAAATTGCGTGACCGTTTGGCAGAATTTGAGAAAAAAGAAGTTAAAAAAGAAACGCCTAAAGACCAGCCAAATCCTAACTTGATTCAAATTTTTAATGAAGGTTTCCATGTTTGCCATCTGCATTATGCAGAACGATTGGCTGAAGGGGAATCTTGTTTAGATTGTTTGGAGCTTTTGTATCGCTGATGGAAAATAAATTTAGTATTCAACGGTCATTTAAAGGCCTAAAAACTGCTGGAAGTCTTTATTTGGTTCCAACACCAATTGGCAATATGCAAGATATGACTCTACGTTCTCTTGAAACTTTGAAAACTGTAGATTTGATTTGTTCAGAAGATACGCGAAATACTTTGCGCCTTTTAAACCATTTTGAAATTAAAGTTCCGCAAGAGTCGTTTCATGAACATAATTCCCAAGAAAAAATTCCTAAATTAATTGATTTTTTGAAAAAAGGACAATCTATTGCACAGGTTTCTGATGCTGGAATGCCTTCAATTTCTGACCCAGGCCATGATTTAGTTTTAGCTGCAATTGATGAAGGAATTGATGTTATCGCTCTTCCTGGTGCCTCAGCAGGAATTACTGCCTTGATTGCCTCAGGATTAGTTCCTCAACCTCATATTTTTTATGGCTTCCTTCCTAGAAAAAAAGGGGAGCAGCAAAAGTTCTTGAAAAGTAAGCTTTCTTATCCAGAAACACAAATTTTCTATGAGAGTCCTTTTAGAGTTGGGGATACTTTGGCTAACATGCAGGAAATTTATGGGGATAGAGAAGTTGTTTTAGTTCGCGAATTAACGAAGATTTATGAAGAATATCGTCGTGGTAAGATTTCAGAGGTTTTAGAATCTTTAACAGACCAACCAATAAAAGGGGAATGTCTAATTATTGTTTCAGGAGCGGATGAAGTGGCTCAAGAAGTTCAAGAGCCAGAATTGACAGCGCTCGAAGCAGTTAAAGTTTTAGTTGAACAAAGTGTAAAACCCAATGTTGCCATTAAACAAATTGCTAAAGAACGAGGTCTAAATCGTCAAGAATTATATGCAGAATTTCATGATTTATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP015906|475059:487190|485213_485996_+|ARE07619.1|DBSCAN-SWA MIYEIKFAHGESNVFAISDIELAPQTEVILRSDKGNFYGKIVREISEEANLEIHHTIVREVNEDDLQVIAKLEERSKQAKDKVRQLVIEQGLEMKIIDVAYNFDQMQLFISFTAENRVDFRLLLRELATTFRIRIELRQIGPRDAAKIHGGLGPCGRPLCCSEFVYEFPNVSIKMAKNQNLSLKQNKLNGLCGRLMCCLTYEDSFYKEAQQLFPDFGEFVTTSEGKGKVVGLNVLKNRVKIRFGEYSKDFELAEIEVNHG >CP015906|475059:487190|475462_476083_+|ARE07609.1|DBSCAN-SWA MIATYNTNVGDVLMLITANDKGEKVNFERKGKVARVFIEETGATVAWNIFEAKSLLANLSGNGQVVLSSDDIETLNKELGKSGFSDVLVHDAQPKFVVAEIVEMEDHPDSDHLHICKVNVGFADPVQIVCGAPNAALGLKTVAALPGAMMPNGSLIFPGALRGVQSYGMLCSARELELPNAPEVRGIIELSSDLSAGKAFDSETMW >CP015906|475059:487190|476251_477592_+|ARE07610.1|DBSCAN-SWA MKIVVIGTNHAGIATANTLIDQYPGHEIVMIDRNSNMSYLGCGTAIWVGRQIEKPDELFYAKAEDFEKKGVKILTETEVSEIDFTNKMIYAKSKTGEKITESYDKLVLATGSRPIIPNLPGKDLKGIHFLKLFQEGQAIDEEFAKNDVKRIAVIGAGYIGTEIAEAAKRRGKEVLLFDAESTSLASYYDEEFAKGMDENLAQHGIELHFGELAQEFKANEKGHVSQIVTNKSTYDVDLVINCIGFTANSALAGEHLETFKNGAIKVDKHQQSSDPDVSAVGDVATIYSNALQDFTYIALASNAVRSGIVAGHNIGGKSIESVGVQGSNGISIFGYNMTSTGLSVKAAKKIGLEVSFSDFEDKQKAWFLHENNDSVKIRIVYETKNRRIIGAQLASKSEIIAGNINMFSLAIQEKKTIDELALLDLFFLPHFNSPYNYMTVAALNAK >CP015906|475059:487190|475059_475377_+|ARE07608.1|DBSCAN-SWA MIIPENIENLAELVKGPEKTVFFFTAGWCGDCNFIKPKMPEIEVENPDFKFVEVDRDEYMDLAIEWGIMGIPSFVVIEDGKEKARLVNKLRKTKEEVNTFLASAK >CP015906|475059:487190|477681_478071_+|ARE07611.1|DBSCAN-SWA MNKTMLIGRLTSAPEISKTTNDKSYVRVTLAVNRRFKNEKGEREADFISIIIWGKSAETLVSYAKKGSLISIEGEIRTRNYTDKQNQKHYVTEILGLSYDLLESRATIALRESAIKTEETLLDAEELPF >CP015906|475059:487190|480236_481049_-|ARE07614.1|DBSCAN-SWA MTEQNGFKYSILASGSTGNSFYLETPKKKILVDAGLSGKKIESLLSEIDRDIHDIDALLITHEHSDHIKGIGVLARKYGIDLYANEDTWSELDSKNALGKIPVEQKHLFEMGKTMTFGDIDIESFGVSHDAIAPQFYRFMKDNKSFVMLTDTGYVSDRMRGTIENADAYLMESNHDIEILRMGAYPWRTKQRILSDQGHLSNEDGAEAAFSIHGNKTKRIFLGHLSLNNNIKELAHLTMDGYLQQHDVDTKKDLKILDTSHEHASQLYDI >CP015906|475059:487190|484301_485162_+|ARE07618.1|DBSCAN-SWA MEIKDIQPQLYKQFSTILQHGKLSHAYLFSGGFGSFELAIWLSQALFCENPENALPCGHCRSCRLVAQQEFTDLHIVEPDGQTIKTAQIRELTQVFNESGYEGNQQVLLIKEAEKMHPNAANALLKSIEEPETEIVVFLLTDNENMILQTIKSRTQIINFPKNVQYLQDFLEKNGILKTQAELLAEICNSTDKALELAQQSWFNEGLQRLQQFVKLLKTSADEAFLYLKELVEIFDDKEKQNQAFELLLQLFNQERMSQELLKTFQAIKMWKSNVRFESSLTFLVL >CP015906|475059:487190|478562_480191_+|ARE07613.1|DBSCAN-SWA MSKDIKFSSDARTAMMRGIDILADTVKTTLGPKGRNVVLEKSYGSPLITNDGVTIAKEIELEDHFENMGAKLVSEVASKTNDIAGDGTTTATVLTQAIVREGLKNVTAGANPVGIRRGIELAAETAVASIKEMAIPVHDKSAIAQVATVSSRSEKVGEYISDAMERVGSDGVITIEESKGMQTELDVVEGMQFDRGYLSQYMVSNTEKMVAELDNPYILITDKKISNIQEILPLLEQILKTNRPLLIVADDVDGEALPTLVLNKIKGVFNVVAVKAPGFGDRRKAQLEDLAILTGGTVITEELGLDLKDATLEALGQAAKATVDKDHTTIVEGAGSADAISDRVAIIKAQIEKTTSDFDREKLQERLAKLAGGVAVVKVGAATETELKAMKLLIEDALNATRAAVEEGIVSGGGTALVNAIAALDKLSEEGDIQTGINIVRRALEEPVRQIAANAGYEGSVIIDKLRSEEVGTGFNAATGQWVNMIEEGIVDPAKVTRSALQNAASVAGLILTTEAVVANKPEPAAPAMPPMDPSMGMGGMM >CP015906|475059:487190|478190_478475_+|ARE07612.1|DBSCAN-SWA MLKPLENRVVLRVKEEEEKSMGGIVLTSASQEKPQTAEVVAVGEGKTNHHGTLISPLVKVGDTVIFEKFAGTTVKMDGEEFLILKDSDLLAIVE >CP015906|475059:487190|483533_484169_+|ARE07617.1|DBSCAN-SWA MNGILISLEGPDGAGKTTVLKEILPEIQKMKREIVPTREPGGVRVAEEIRQIILDPKNTDIDSKTELMLFAAARRLHMQEKMLPALQAGKVVIVDRFIDSSVAYQGYGRDLGVEVVDWLNYFATDGLKPDLTLYFDVDTDVALERIMKNRADEVNRLDLERAEMHRKVREGYLEIVVKEPERFVKIDASQPLEKVVADTLSVLKKRFVSEF >CP015906|475059:487190|486314_487190_+|ARE07621.1|DBSCAN-SWA MENKFSIQRSFKGLKTAGSLYLVPTPIGNMQDMTLRSLETLKTVDLICSEDTRNTLRLLNHFEIKVPQESFHEHNSQEKIPKLIDFLKKGQSIAQVSDAGMPSISDPGHDLVLAAIDEGIDVIALPGASAGITALIASGLVPQPHIFYGFLPRKKGEQQKFLKSKLSYPETQIFYESPFRVGDTLANMQEIYGDREVVLVRELTKIYEEYRRGKISEVLESLTDQPIKGECLIIVSGADEVAQEVQEPELTALEAVKVLVEQSVKPNVAIKQIAKERGLNRQELYAEFHDL >CP015906|475059:487190|481219_482662_-|ARE07615.1|DBSCAN-SWA MIKFFNSMIFKGVVAHLLLFVILFMSSFDYNFAHLSTFIGYYLFSLVFVLVFLNQQHRMIVNVSKQMNDIKNGYLNRDKIPKGTSEINELYDEILKLGEDIVRTQNNLENQRNQLDSILAYMVDGVIATDRRGNIIMANKSALHYLNTDNDLLMQKNIVEVLKITDQYNFYDLLEKEPEITIETHDSGNESISLHIKFALFRRESGFISGIIAVLHDMTEQDKAERERRLFVSNVSHELRTPLTSVKAYLEALEDGAIEDKETASSFINVSLTETNRMIRMISDLLTLSRMDQDRIVLNKEMINLIAFLDYQINRLDQILETESNDLISSNFTLVRKYSEQPIWVEIDTDKIAQVIDNIIGNAIKYSPKGGTITISVEKRESDVLISISDQGMGIPKSDLLKIFDRFYRVDNASRNSKVGGTGLGLSIVHDIVKIHGGTIFASSEGEGKGTTFSFTLPYSLEAADDWDDGTDEFEFEDNE >CP015906|475059:487190|482654_483356_-|ARE07616.1|DBSCAN-SWA MKKILVVDDEKPISDIVKFNLTKEGFEVFTAFDGEEALEAFKEVQPDLILLDLMLPKLDGLDVAREIRKTSDTPIIMVSAKDSEFDKVIGLELGADDYVTKPFSNRELLARIKANLRRINVAPAESTDNVKKELIIGNLRINPAHYAAYKNDKQLDLTHREFELLYYLAQHLGEVITRENLLETVWGYDYFGDVRTVDVTVRRLREKVEDTPSRPQYVSTRRGVGYYMSNPHD >CP015906|475059:487190|485988_486315_+|ARE07620.1|DBSCAN-SWA MADKYNVFDQLGELENTLNTTLTQISGIRQVLESSMTENATLRMELEKLRDRLAEFEKKEVKKETPKDQPNPNLIQIFNEGFHVCHLHYAERLAEGESCLDCLELLYR |
14 | Streptococcus_phage(40.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
526902 : 562911
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP015906|526902:562911|DBSCAN-SWA 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53 | Lactococcus_phage(100.0%) | protease,capsid,transposase,holin,integrase,head,tail | attL 526810:526840|attR 563731:563761 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
582004 : 600152
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP015906|582004:600152|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP015906|582004:600152|583661_584153_-|ARE07728.1|DBSCAN-SWA MKKILITIMGLLLILSLFSFSDIASAKTKKSVKKKSFTVHNVYKIYYSKVDSKTTGVITETGPDVARFIRVGYSAKVDTLKNAEKAKKNAKLFLNNVVKNIKPPKNEDDVIIIQYGEGEGFDRSKNFQTFFNILLNKNSYNILKENKGDFTKLDKQDYSNNGY >CP015906|582004:600152|584549_585137_-|ARE07730.1|DBSCAN-SWA MNEQELIGYLLLEMEKQNIHITCDDCFPKNAMVNIKRKLMIYNPTKITAFKIAHELSHVINKDICRGSENDALNPQEFRANHEAILLLWEIFEANGGSYEYFNVFVDITESPFELAESIIKNEYLELHEAITEIFEDEIKVSINKQEMHDYIVDYIGYFDVIEAINVYQFLDRYHLSHNFFNMAEKEFQQLLGVG >CP015906|582004:600152|597521_598019_-|ARE07753.1|DBSCAN-SWA MKVILRKALPDDYEQIAFVHYKAWLETYTGLLPESFLKNRTLESSINIFKNNLCSNTVVAIVEGKIIGFCGWGPLRNNSFEENFGEIHGIYLLDSYKKHKIGRKMLEFALEKLSTKNYPKVGLWVLSSNENAIHFYKKLGFSDTGIVKEENLGEIITESFFTKEI >CP015906|582004:600152|591852_592443_+|ARE07745.1|DBSCAN-SWA 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MELLTIRLNKIVAKKLMKGGGETLILEKEDFYQYVYLVPNNMSFSGHFDSVLDISVSQHWEIFNFLTSKYQEQGYKKVHYKHPAHPSNKFMKFLNKLQRDQSEKVATVYRQNAFEKFKDEIVMHQGFLNSKNMMKFIILGKKHGYNYKYLMMWAVSEIEATCDGTQKQGLLADFISLADEYFDEKEREVLSD >CP015906|582004:600152|590262_590847_+|ARE07742.1|DBSCAN-SWA MNNSYPKSWSRIMTQTIAELNKKKNLTRLDLKRGALALVKGLNVRNKKINAESEANYIKAVWDNFQLYEMALSVIGMLTPKEVIETFPIYKRYDGHKYETKDYFSVQKSLAAYDLNQPINTVDDKAFEFLWDYDNDDLVEFAVDFMGAMSHINRLEKGKDLFSQFLEETQGIKSRVIEINGIEVITFDNDDELD >CP015906|582004:600152|593732_594005_-|ARE07748.1|DBSCAN-SWA MFIFYVFVAALIWAGVSYWLHKNKPLKNAGEVQQVYLIITSISVIIIALIILVFLIYMMVSSKSLDNLSWAIICILVIAVAALFFKENKI >CP015906|582004:600152|587095_587335_+|ARE07736.1|DBSCAN-SWA MQNIIRACPYVAGIDSVGLRSLKDYHTELTDKQIEKLDPLNANTGTVDYSFKVRKYKQGVRFEGEKEGGEISLFDEVAK >CP015906|582004:600152|596780_596981_+|ARE07752.1|DBSCAN-SWA MANGTVKWFNADKGFGFITSEEGKDLFAHFSAIQSDGFKSLDEGQKVEFDVEEGQRGLQAVNITKA >CP015906|582004:600152|585148_585517_-|ARE07731.1|DBSCAN-SWA MDLYEKIKELAAQKHTSIRKIEEHLGYGNGTIRRWNKNKPNYDKIQAVAKYFNVSVDYLLGNEELKKTNKPVDLKKVISEKKPTSWDDPRIDWNEWVSFDGEPISDDVKKILFAIYGDKLTD >CP015906|582004:600152|587763_588090_+|ARE07739.1|DBSCAN-SWA MKITDLQKIDQNIIKILADHKGIDKAINGKMLAQSLNVDFRTLQGRISFLQGKGCAIGSIDNIGYFAPTNEEERTKGITKKENMAYSTLKAVMGVRSASLDWLDEMID |
31 | Lactococcus_phage(89.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1082821 : 1096605
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP015906|1082821:1096605|DBSCAN-SWA TATGAGTATTATAAAATTAAGCAACGTTTCCAAGAAATATTCTAATGGAACAACGGCTTTGCGTAATATCTCGCTTGAAATTGAGCCGGGAGAATTTACCTATATCGTTGGTCCATCAGGAGCCGGGAAATCGACCTTTATCAAACTACTTTATCGTGAATTAAAGATTGACCGTGGTTCTGGAACAGTTGCGCAATATGATTTATCTAAATTAAAACGTCGTGATGTGCCAATGCTTCGTCGCTCTTTTGGAGTTGTTTTCCAAGACTATAAACTTTTGCCAAAGAAAACTGTTTTTGAAAATATCTCCTACGCCATGGAAGTTATTGGGAAAAGTCCTCGTGAAATTAAAAAACGAGTGAATGAAGTGCTTGACCTTGTTGGTCTGAAACACAAAATTCGTTCATTTCCAAATGAACTCTCAGGTGGGGAACAGCAGCGTGTAGCAATTGCTCGTTCAATTGCCAATGCACCAAAAGTATTGATTGCTGATGAACCTACAGGGAACTTAGACCCTGAAAACTCTTGGGAAATCATGAATCTGCTTGAAAAAATTAATCTTCAAGGGACAACCATTTTGATGGCAACCCACAATAGCCAAATCGTTAACACTTTAAAACATCGTGTTATCGCAATTGAAAACGGACGAATTGTCCGCGACCAAGAGGAAGGAGTTTACGGCTACGATGATTAGAAATTTCTTCAAACACCTTTTGGAGTCGCTCAAAAACTTAAAACGTAATGGTTGGATGACAGTTGCGGCTGTTTCATCAGTAACAATTACTTTAGTTTTAGTTGGACTTTTCCTTTCAGTTATCTTGAATACTTCAAAAATATCTAATGGGATTGAAAACAATGTTCGGATTGTTGCCTACATGAAATTAGATGTTCATGATCAAGAGACAAAAATTCAAGATCCAAAAGATAATAAAAAAACAATCAATAATCCTGACCACCTGAAGATTTACGATTCAATCAAAAAAGTTCCTAATGTAAAAACAGTTGAATTCTCAAGTAAAGAAGCTCAGTTGAAAGAACTGACAAAGGCCTTAGGAAATAACTGGAATCTCTTTAAAGGTGATGCCAATCCACTTTACGATGCTTATATTGTTGAAGCTGATAAACCAGCAAATGTAAAATCAGTCACTTCAAAAATATCAAAACTTTCAGGAATTGAAAAAGCTACTTATGGTGGTGCAAATACTGCAAAACTTTTCCAAATTGCTCAGGGAATTCGAACTTGGGGAACTGCAGCGGCTATTCTGTTAATTTTCGTTGCTGTCTTCTTGATTTCTAACACCATTCGAATTACTATCCTATCAAGACAACGTGAAATTCAAATTATGCGTCTGGTTGGGGCTAAAAATGGTTATATCCGTTGGCCTTTCTTCTTGGAAGGCGCTTGGGTTGGACTTTTAGGTTCAATTATTCCAGGACTTATTGTTGCTTGGGCTTATCGTCTTGCTTTTGTTAGCTTGACACCAAGTCTTCAGTCACAAAAACTTGCAATGTTTGCTCCTAAAGAGTTCATTCCTGCAATAGTTGGATTGATGGCCGTGATTGGTATTTTGATTGGTTCATTTGGAGCCCTCTTATCAATGCGTCGTTTCCTTAAAATTTAATAAAAATAAAAGAGAAGTTAAATCTTCTCTTTTTTTGCTAAAAAAAGCTGTCAGTAAATAAGTTTTTACTTATTTACTGACAGACTCTTAAATTTGTTTAATTAGATCTCATAATCTTCATCAGACATGGCTTCCACTTCACCAAGAAGGTATGAATTACCAACTTGTGAGAAGAAGTCGTGGTTTGATGACGAAGTTGAAATTCCATTCATAACCACTGGGTTAACGTCTGCTGCGGTATCAGGGAAAAGTGGATCTTGTCCAAGATTCATCAAAGCTTTATTGGCATTATAACGCAAGAAAGTTAAAACTTCATCAGTCCAACCAACTTTGTCATAAAGTAAATGAGAATATTTTTCTTCATTTTCATAAAGTTGATAAAGCAATTCATACATCCAATCACGGAATTCACCTTGCTCATCTTCAGATAACTCATTAAAACCAAGTTGGAATTTGTAACCAATATAAGTACCGTGAACTGACTCATCACGAATAATTAATTTAATAATTTCCGCTGAGTTAATCATTTTGTTATTTCCAAGATAGCGCAAAGGGGTATAGAAACCAGAGTAGAAGAGGCAAGTTTCAAGGAAAACAGAAGCCACTTTCTTTTGCAAAGGAGTACCAGATTCATAAATTTTATTGATGATTTCGGCTTTTGTTTGCATATAAACATTGGTATCTACCCAATTAAAAAGTTCTTCAATTTCTTTTTTCGTGTTTAGAGTTGAAAAAATTGTTGAATAAGACTTTGCATGAACAGATTCCATAAATTGGATATTGTTGAAACAGGCAATTTCTTGAGGTGTTCTTGCATCATGTTTGAGCACTTCAGCACCATCAACAGATTGCAAAGTATCAAGCAATGTCAAACCAGCAAAGGCCTTAGCAAAGGTATCACGTTCCAATTGAGGAAGTTTACGCCAGTCATCTAAATCGTTAGATACAGGAACACGAGTATCTAACCAAAATTGACTTGTTAATTTTTCCCAAGTATATTTGTCAATAGAATCCTCAATAGAATTCCAGTCAATGGCACTGTAATAAGTGGGGACAGTAAGATTTTCAGTTTCAGACATATTTTAAGATATGAGCCTGCTTTAAAAAGGGCAAACTCAATTCCTTTCTCTCATTTATTTACTGACAGAAAATACTGTCAGTATTTTTAGCTTAGTCATAAATTCTGTCAGTAAATTTTCACTTACCAACGAAGCTGTCAGTAAAAATAGGGACTCATTAGACCAAAAACTTTCGATAATTTATCAAAAGTTAATGTCAATAATCGTTTTAGAACATTTCGCAAATGCTTACCCCATTTTCATTCATTGATGATACTTTAATGAATGAAAACAAGTAAGAAAATAGAAAGTCCGTCTTAGCGGCTTCCGTAGAAGCAATAGATGCTTTAGCACCAATGCTTCTGTTGTATTAAATAACGCAACTTTCACATTGGTTAGCACCGACTTCTTCTTGGTCGTCAGTAAATGTACGAATGTAGTAAATTGTTTTGATTCCTTTTTTGTAAGCATAGTTACGCAAAATAGACAAGTCACGAGTTGTCATTTTATTATTTGCCACTTTCCATTCATAGAGACCTTCAGGTAAAGTTGAACGCATAAATAAAGTGAGTGACAAACCTTGGTCAACATGTTCTGTAGCAGCTGCATAAACGTCAATTACTGCACGCATATCTGTATCATAAGCTGATTTGTAATAAGGAATTGTTTCAGTGGCAAGTCCAGCAGCTGGATAATAAATTTTCCCAACTTTCTTTTCTTGACGTTCTTCGATGCGATTGACAATTGGGTGAATAGAAGAAGAACAGTCATTGATATAAGAAATAGAACCATTTGGAGCCACAGCCATACGGTATGAATTATAGAGTCCAGAAGTTTTTACTGTGTCACGTAAAGCAGTCCAATCCTCGATTGTTGGAACAGCAATCCCTTTGAAAAGTTCTTGAACTTTAGAAGAGACAGCTGCAAAATAATCATGTGTTAAATATTTATCAAAATAAGAACCATCAGCATAGGCAGATTTTTCAAAATTCTTGAAGCTAGACCCTTTTTCAACAGCTAATTTATTTGAAGCCACTAAAGTATAATAGTTCAACAACATGAAATAAACACTAGTAAATTCAACGGCTTCTTTGCTGTCATAATGAATTTGATTTTGTGCTAAGAAAGAATGTAAGCCCATTGCTCCAAGCCCAATCGCATGCATTTCATCATTACCTTTACGAACAGTTGGAACAGTATCGAGGTTTGAAGTTTCGGAGATGAAAGTTAAAGCGCGAACCATTGCTTCAATAGAAGTTCCAAATTCATTGCTAGAAGTCATCATATTCAAAACATTAGTTGAACCCAAGTTACAAGCGACGTCAGTTCCAACCACCTTATAAGTTTGGTCATCGTTCAAAACAGAAGGCGTTTGGACTTGCAAAATTTCAGAACAAAGGTTAGACATTGAAATTACACCATCAACAGGGTTAGCTTGATTGACTGTGTCAACATTTACGATGTAAGGATAACCAGATTCTTGTTGAAGTTTTGAAAGTTCTTGTTCAAGTTCACGGGCATTAATCGATGTTTTACGAATTTCTGGATTGGCTACCATTTTGTCATATTCAGCTGTAATATCGACTTCGGCAAAAGGTTTACCATAATATTTTTCAACAAAATATGGCTCAAAGAGATACATTGTTTCTCCCTTTTTAACCAATTCATAGAATTTATCAGGAACAGTAACCCCAAGAGAGAGTGTTTTAACACGAATTTTTTCATCCGCATTTTCTTTTTTAGTGGACAAGAATTCCATAATATCTGGATGGAATAGTGATAAATAAACAACACCAGCACCTTGACGTTGCCCCAATTGATTGGCATAAGAAAAGGCGTCTTCAAAAAGTTTCATGACAGGAACGACACCAGCTGCCACTCCATCGTAACCTTTGATAGGTGCACCAGCAGCACGTAAATTAGTCAAGTTTAGACCAACACCACCACCATTTTTAGAAAGTTGCAAGGCAGAGTTAATTGTTCGTCCAATTGAATTCATATCATCAGTTAATTGTAGAAGGAAACAAGAAACAAATTCACCACGACGCTTACGTCCAGCATTTAGAAAAGTCGGAGTCGCAGGTTGATAACGACGATTAATCATTGCAAAAGCAAGATTATTAGCTAATTTTTCATCGCCGTCAGCCATGTATAAAGCATTCATTAACACACGGTCTTCAAAATCTTCAAGATAGAGAGAACCGTCATTGTTTTTCATGGCATATTGATTATAAAATTTGTAAGCAGCCATAAATGAATCAAAATGAAATTCAAATTTACTCAATTCTTTCCGAAGATTGGTAATAAATTCGGGTTTATA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP015906|1082821:1096605|1089906_1091841_+|ARE08214.1|DBSCAN-SWA MVIDINNYDDSAIQVLEGLDAVRKRPGMYIGSTDGTGLHHLVWEIVDNAVDEALSGFGNRISVTINADGSLSVEDEGRGMPVGKHAMGIPTVEVIFTILHAGGKFGQGGYKTSGGLHGVGSSVVNALSTWLEVEITRDGTVYRQRFENGGHPATTLVKIGKAPKSKTGTKVTFMPDSSIFSTTEFKYNIISERLNESAFLLKEVTISLEDKRTDEKEEFHYENGVQDFVSYLNEDKDSLTPVLYFEGKQDGFEVEVALQYNDGYSENILSFVNNVRTKDGGTHEAGLKTAITKAMNEYARKVNLLKEKDKNLEGSDYREGLTAVLSVLIPEEHLQFEGQTKDKLGSPLARPVVDSLVSEKLSFYLMENGELAQNLIRKAIKAREAREAARKAREDSRNGKKSKKDKGLLSGKLTPAQTKNPNKNELYLVEGDSAGGSAKQGRDRKFQAILPLRGKVINTEKAKMQDILKNEEINTMIYTIGAGVGADFTLADRNYDKIIIMTDADTDGAHIQTLLLTFFYRYMKPLVEAGHVYIALPPLYKMSEGKGKKEKIEYAWTDGELAELRKQFGKNANLQRYKGLGEMNADQLWETTMDPETRTLIQVTIDDAAQAEKRVSVLMGDKVEPRRKWIENNVKFTMEEETVF >CP015906|1082821:1096605|1084543_1085521_-|ARE08209.1|DBSCAN-SWA MSETENLTVPTYYSAIDWNSIEDSIDKYTWEKLTSQFWLDTRVPVSNDLDDWRKLPQLERDTFAKAFAGLTLLDTLQSVDGAEVLKHDARTPQEIACFNNIQFMESVHAKSYSTIFSTLNTKKEIEELFNWVDTNVYMQTKAEIINKIYESGTPLQKKVASVFLETCLFYSGFYTPLRYLGNNKMINSAEIIKLIIRDESVHGTYIGYKFQLGFNELSEDEQGEFRDWMYELLYQLYENEEKYSHLLYDKVGWTDEVLTFLRYNANKALMNLGQDPLFPDTAADVNPVVMNGISTSSSNHDFFSQVGNSYLLGEVEAMSDEDYEI >CP015906|1082821:1096605|1088990_1089632_-|ARE08213.1|DBSCAN-SWA MLTIILLLIASYLLGAIPFGLWIGKIFFKKNLHDYGSGNTGTTNTFRILGVKAGISVFAFDLLKGTLATLLPLFFHINGVSPLIFGLLAVIGHTFSIFDRFKGGKAVATSAGVILGFSPLFLIYLLVVFIIVLWLFSMISLSSVIGAVFALLGILIFPSIGFILTSYDLLFSIIIFVLAIIIILRHRTNLKRIKNHCESLVPFGLNLSKQKEK >CP015906|1082821:1096605|1088598_1088817_-|ARE08212.1|DBSCAN-SWA MVTVYSKNNCMQCKMVKKWLSEHEIAFDEINIDEQPEFVEKVIEMGFRAAPVITKDDFAFSGFRPSELAKLA >CP015906|1082821:1096605|1088174_1088597_-|ARE08211.1|DBSCAN-SWA MKLAYFSVTGQTRRFVSKTNLPNVEISPDDDIEMNEPFLLITPSYAEESPTVSKSIDVMDPVFDFMAYNDNYKHCLGIIGTGNRNFAGIYIFTAKELSAKYQIPLLYDFEFNGTPADVAAVEKLATQLDKGAKVTFKNPL >CP015906|1082821:1096605|1083506_1084442_+|ARE08208.1|DBSCAN-SWA MIRNFFKHLLESLKNLKRNGWMTVAAVSSVTITLVLVGLFLSVILNTSKISNGIENNVRIVAYMKLDVHDQETKIQDPKDNKKTINNPDHLKIYDSIKKVPNVKTVEFSSKEAQLKELTKALGNNWNLFKGDANPLYDAYIVEADKPANVKSVTSKISKLSGIEKATYGGANTAKLFQIAQGIRTWGTAAAILLIFVAVFLISNTIRITILSRQREIQIMRLVGAKNGYIRWPFFLEGAWVGLLGSIIPGLIVAWAYRLAFVSLTPSLQSQKLAMFAPKEFIPAIVGLMAVIGILIGSFGALLSMRRFLKI >CP015906|1082821:1096605|1094130_1096605_+|ARE08217.1|DBSCAN-SWA MSNIQTLPLEDIMGDRFGRYSKYIIQERALPDIRDGLKPVQRRILYSMNKDGNTFDKSYRKSAKSVGNVMGNFHPHGDSSIYEAMIRMSQDWKMGEPLIEMHGNNGSMDGDPPAAMRYTEARLSEISGYLLADIEKDTVSQAWNFDDTEKEPTVLPAAFPNLLVNGSTGISAGYATDIPPHNLGEVIDATIHMIDHPKADVEKIMEFLPGPDFPTGGIIQGKGEIRKAYEKGKGRIVVRSKVDIEPMKGGREQLIVTEIPFELNKANLVKKIDDVRVNAKVPGIAEVRDESDREGLRIAIELKKEADSQLVLNYLFKNTDLQVNYNFNMVAIDNMTPVQTGVLQMLRSYVKHREDVIVKRSQFDLNKAEKRLHIVEGLIRMVSILDEVVATIRASENKADAKENIKVSFGFTEEQAEAIVTLQLYRLTNTDIVTLQNEQAELEQKILELKAIINDERTLFNLMKRELREVKKKFAKPRRSELQDEVQTIEIEASELIVAEDTVVSVTRSGYIKRTSPRSFASSALEEIGKRDDDELLYYANAKTTQHLLLFTNLGNVIYRPIHELSDIRWKDIGEHLSQSLSNFSADEKVIFVQIVDEFAGENLLVVTRNGQIKQIERESFSPWRTYRSKSTPYAKLKGEDDEIVLITPVQFADLMLISENGYALRFNLDDVPVLGARAAGVKAMNLKNGDKIKSAFFVNSNSWYLLTQRAFIKRVKTDDIPATSRANRGLQVLRTLKTNNHTVFAAGLINSTADLSALTEELDLFSQAKAPATKETDEQVLEVISETGKKYDINLCDLSLSDRTSNGHPIADDLEKIASVKIK >CP015906|1082821:1096605|1082821_1083514_+|ARE08207.1|DBSCAN-SWA MSIIKLSNVSKKYSNGTTALRNISLEIEPGEFTYIVGPSGAGKSTFIKLLYRELKIDRGSGTVAQYDLSKLKRRDVPMLRRSFGVVFQDYKLLPKKTVFENISYAMEVIGKSPREIKKRVNEVLDLVGLKHKIRSFPNELSGGEQQRVAIARSIANAPKVLIADEPTGNLDPENSWEIMNLLEKINLQGTTILMATHNSQIVNTLKHRVIAIENGRIVRDQEEGVYGYDD >CP015906|1082821:1096605|1093406_1093856_+|ARE08216.1|DBSCAN-SWA MTAIWKEKSFNQLTLDEMYQLLSLRTAVFVVEQNCPYQELDGKDQVAKHLWLENENGQLMALCRLLPKGISFAEASIGRVLVNPEFRGQNLGRGLIEKALEVLKEDGEEAVTIEAQYYLRDFYASFGFVENSEPFYEDDIKHVNMILKF >CP015906|1082821:1096605|1085870_1088039_-|ARE08210.1|DBSCAN-SWA MSLKQLKDVTYFKLNNEINIPVNGSIPLAKDKEAITAFFKENVEPNRYEADTYIDKLNWLVKEEYLEAEFLEKYKPEFITNLRKELSKFEFHFDSFMAAYKFYNQYAMKNNDGSLYLEDFEDRVLMNALYMADGDEKLANNLAFAMINRRYQPATPTFLNAGRKRRGEFVSCFLLQLTDDMNSIGRTINSALQLSKNGGGVGLNLTNLRAAGAPIKGYDGVAAGVVPVMKLFEDAFSYANQLGQRQGAGVVYLSLFHPDIMEFLSTKKENADEKIRVKTLSLGVTVPDKFYELVKKGETMYLFEPYFVEKYYGKPFAEVDITAEYDKMVANPEIRKTSINARELEQELSKLQQESGYPYIVNVDTVNQANPVDGVISMSNLCSEILQVQTPSVLNDDQTYKVVGTDVACNLGSTNVLNMMTSSNEFGTSIEAMVRALTFISETSNLDTVPTVRKGNDEMHAIGLGAMGLHSFLAQNQIHYDSKEAVEFTSVYFMLLNYYTLVASNKLAVEKGSSFKNFEKSAYADGSYFDKYLTHDYFAAVSSKVQELFKGIAVPTIEDWTALRDTVKTSGLYNSYRMAVAPNGSISYINDCSSSIHPIVNRIEERQEKKVGKIYYPAAGLATETIPYYKSAYDTDMRAVIDVYAAATEHVDQGLSLTLFMRSTLPEGLYEWKVANNKMTTRDLSILRNYAYKKGIKTIYYIRTFTDDQEEVGANQCESCVI >CP015906|1082821:1096605|1092576_1093410_+|ARE08215.1|DBSCAN-SWA MSEKYVVFDFETTGFSAQKNEIIQIGAVKYDENNQEQARFNQLVKNQRSYVSTEITQLTGIKPADLLNQPTIEEILPEFLDFIKGHLLVAHNAPFDISFLYQAIIDCAITDVEAFRVYDTLAESKKLLTMSSYALENFKDLLEMNDLRSHDALNDCLITAKLYQYLQKIEEVELSVESEVTDELGQLDLFGDSSDEITDSLRRKLNLPITKALVYYQQNLERKWERFEVLGISIEREYSVGSSLNIRLHNSEKVKIHSDFLKEMQKANFVTIMEEEK |
11 | Enterococcus_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1105263 : 1113531
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP015906|1105263:1113531|DBSCAN-SWA GATGAAAAAAGACGAATACTACATGGATTTAGCAATTGTACTTGCAAACAAAGGAGGTGGTAATGTCAACCCTAACCCTCAAGTAGGAGCCCTTATTGTCAAAGAAGGGAGAATTATTGGTCAAGGTTATCATGAAAAATATGGGAAAGCTCACGCGGAAATCAATGCTTTTAAGGATTGTAACGAATCTCCCGAAGGAGCCACGCTTTATGTGACCTTAGAGCCTTGTGCGCATCAGGGAAAACAACCCCCTTGTTTTGAAGCGATTATAAAAAATGGAATTAAGCGTGTTGTTATCGGGCATTTAGACCCCAATCCCTTGGTTTCAGGAAAAGGAATTAAAGCAATGAGAGAAGCTGGAATTGAAGTTTCTCTCAATGTTTTAGAAAAAGAATGTGAAGAATTAAATAAAATTTTCTTTTATTATGTTAGTCAAGGGCTTCCCTATGTCATGATGAAGTATGCAATGACTTTAGACGGAAAAATTGCGACATCAGCAGGTCAATCAAAATGGATTACAGGTGAAATTGCAAGACAGAAAGTACATCAAGACCGTTCACGTTTTATGGCAATTATGATTGGTGTTGAAACGCTTATTTTAGATGATCCACAACTCTCTGTCAGGTTGGAAAATGGAAAAAATCCGATAAGAATCATTTGTGATACTCATTTAAGAAGTCCTTTGGCTTCCAAGATTGTTTCCACAGCTACTGAAATTCCAACGATTATTGCTACAGCTGAGTCTGACCCCGAAAAACAAGCTCCCTTTCTTAAAGCGGGTTGTGAAATTATCTTAGTTTCTTGCCTAGAAGGAAGATTGAATTTGAAAGAATTGACCAAAAAGTTAGGAGAAAAGGGGATTGACAGTATCATCTTGGAAGGTGGAGGAACATTAAATGCTTCGGCATTAAAAGCAGGGATAGTCCAAAAAGTTCAAACTTATATTGCCCTTAAAATATTTGGTGGAAAAGAAGCACCAAGTCCAGTTGAAGGACATGGAATCGAGCAACCCAATCAAGCCTATCTCCTAGAAGGGGCTCAAATAACCTATCTAGGAGAAGATATTTTATTAGAAAGTGAGCTTCTTTAATGTTTACAGGAATAATTGAAGAATTAGGGGAAGTGAGTCGCCTGCAAAAAAGAGAAAAATCCTTCAAAATTAGTATCCGTGCTTCCTTGATTTTAGAGGATATGAAACTTGGAGATTCTATTTCAACAAATGGTTTATGCCTGACCGTTTCTGAATTTAATCAAAAAGAATTTACGGCTGATATTATGCCTGAAAGTCTAAATCGCTCAAATCTTGGGACCTTAAATGTGGGTGCCAAAGTTAACTTAGAACGAGCGATGCCATTAAATGGCCGATTTGGTGGGCATATTGTGTCAGGGCATATTGATGGAGTTGGCCAGATTTTAGAAGTAAAAAAAGAAGAAAATGCCATCTGGTTTGAAATCAAAACGAGCTTAAATTTAATGAGATACACCGTCGAAAAAGGCTCGATTACGATTGATGGGATTAGTCTTACAGTTGCTCAGGTTAAGTCGAAATCTTTTAGTGTTTCCATTATTCCACATACGCTCAAAGAAACGATAATGGCAGATAAAAAAGTGGGTGATACTGTTAATTTAGAAAATGATATTTTGGGGAAATATATAGAAAAATTATGGGGCGATAGTAGTTCTTCGATGAAAGAATCTTCAGTAACTAAAGAAAAGCTATTTAACAACGGATTTTTATAGGAGATAAAATGTTCCAATATAATAAAGTAGAAGAAGCACTTGCTGCACTTAAAGCAGGGGAAATGATTATCGTTAGTGACGATGAAAATAGAGAAAATGAGGGCGACCTTATCTGTGCGGCCGAATTTATCAGTCCAGAAATAATTAATTTTATGGCAAGTGAGGCCAAAGGATTGATATGCGCACCACTCAGTGAAACTTATGCTAAGAATTTACAATTAGAAGCAATGGTAGAGAAAAATACAGATAATCATGGAACAGCTTTTACAGTTTCGGTTGATCATATTGAAACTAGCACAGGAATTTCGGCTTTTGAACGGGCCTTAACCATAAAAAAACTTGTTGATGCCGAGAGTTTACCAAGTGATTTTCGTAGACCAGGTCATGTATTTCCACTTATTGCCAAGAAAAATGGTCTTTTTGAGCGAAATGGTCATACTGAGGCTACGGTTGACTTGTTGCGTCTGGCTGGTTTAAAAGAAGTAGGTGTCTGCGTTGAAATAATGGACGAAGATGGAACAATGATGCATAAGGAGAAACTGAAGGAAAAAGCGCAAGAGTGGGGCTTGAAATATATCACAATTAAAGCTATTCAAGAGTATCTTAAGCAAAATGAACTACAAGTAGAACAGGTGACTAGAGCTAAACTACCGACGAAATATGGTATGTTTGATATTTTAGGATTTGTCAATAAAATAAATGGTGAGCACCATGTTGCTTTAGTTAAAGGAGATATTGGTGACGGTCAAGCTATTCTTTGCCGCGTTCACTCAGAATGCTTAACTAGTGATGCTTTTGGTTCTTTGAAATGTGACTGCGGTGGACAATTAGAAGAAGCATTAAAAAAAATAAATGATGAGGGGCGTGGCGTGCTTTTATATCTTCGACAAGAAGGACGTGGAATTGGTTTGATTAATAAACTTCGTGCCTACTCACTTCAAGATGAAGGACTTGATACGGTTGAAGCTAATTTAGCTTTGGGGTTTGAAGAAGATGAGCGAGAATATTCTATTGGAGCACAAATTTTAAAAATAATTGGGGTGAAATCATTGAAATTAATGACTAATAATCCGCAAAAGATTAATGATTTTCAAAAATATGGTCTAGTAGTTGAAGAAAGAGTAGCTCTCCAAATCAAAGATAACCCCTTTGACCTTGATTATTTAAAAGTAAAACAAAATAAAATGGGACATTTGTTTGACTAAAGTAAAATAGAAAGTAAGGATAGAAATATGACAATTATTGAAGGAAATTTAAGAACAGAGAATGCAAAATATGGGATTGTAGTTGCTCAATTTAATGAATTTATCAATGCAAAACTTTTGTCAGGAGCATTAGATGCACTCAAAAGACATGGAGTCCAGGAAGAAGAAATTGATATAGCATGGGTTCCAGGTGCATTTGAAATTCCCATTATTGCCCAAAAAATGGCGACTTCCAATAAATATGAAGCAATTATATGTTTAGGGACTGTCATCAGAGGCTCAACTTCTCATTATGATTTTGTTTGTAATGAAGTTTCTAAGGGGATTGCTCATGTTTCCTTAAACTCTAATATTCCGGTCATGTTTGGTGTACTAACAACTGAAAATATAGAACAAGCCATTGAGCGTGCAGGCACAAAAGCTGGAAATAAAGGTTTTGAAGTAGCGGTTGGAGCAATTGAAATGGTTGATTTAATGAGAAAGATTGGCTAATTTATCTATAAGTGCATTTATTTAAATGCGCTTTTTATTTTGAAATAGGATAAAAACTGTTCTAGCGAGCTATCAGATTGCGAAATATGCTATAATTAAAGCATGAAAAAACTACTGTCACTTGTTATTATCGTTGTCGGAATTGTTGCTGACCAAATTTTTAAAAATTGGATTGTTGCTAATATTCAGCTTGGAGATACAGAAAAAATTTGGCCTAATGTTCTTAGTTTAACTTATATCAAAAATGATGGAGCAGCTTGGTCTTCATTTTCAGGTCAACAATGGTTTTTCCTTATCTTAACACCGATCGTCTTAGTTGTTGCCCTTTGGTTTTTATGGAAAAAAATGGCACAAAACTGGTATTTTATTGGATTAACTTTAATTATTGCGGGTGCTTTGGGAAATTTTATTGACCGAATTCGTCAAGGATTTGTTGTTGATATGTTCCAAACTGAATTTATTAATTTTCCAATTTTTAATATTGCGGATATCTTATTATCTGTTGGTTTTGTTCTTCTTTTCATTGCAATTTTGACAGACAAAGAAACAAAATAAATTGATTAAAAAATCACTGACAGAAAGTTTTATTTAACATTTATAAAAAGGAAAACACACTTGCCTATCATAAAAATTAACGAAGAAAACAAAGGCTTACGTCTTGACAAGGCGCTTGCCAATCAAACAGAATACTCACGGAGCTTACTGACAGAACTTATCAAAAATGATAAAGTATTTGTTAACAGTGAAGCAAAAAAAGCAAAGTATAAAGTAAAAGTAGGGGACAGGATTGAATTTGAAGTTCCGGAAGCGGAAGTTCTTGATATTGTTGCTGAAGATTTGCCACTAGAAATCATTTATGAAGATTCAGATGTTGCAGTAGTAAATAAACCTCAAGGAATGGTAGTTCATCCTGCAGCCGGTCATGCTTCAGGGACATTGGTTAATGCAATCATGTATCATATCAAAGATCTTTCAAGCATTAATGGTGTAATTCGTCCAGGAATTGTGCATCGTATTGATAAGGATACGAGTGGTCTTTTGATGATTGCCAAAAATGATAAAGCACACGAAAGTTTGGCAGCACAATTAAAAGATAAGACTAGCAAACGTCGTTATTTAGCGATTGTCCACGGTGAAATTGCTAATGATAAAGGAACCATTGAAGCGCCAATTGGTCGTAATCTTAAAGATCGCAAAAAACAAGCCGTAGTTTCTGGCGGAAAACCAGCCGTGACTCATTTTGAGGTTTTAGAACGATTTTATGGCTATACTTTGATTGCATTACGCTTGGAAACTGGGCGTACACATCAGATTCGTGTACATATGAATTACATTGGTCATCCTGTGGCTGGTGATCCACTCTATGGGCCAAATAAAACATTGACACCTAATAAAGGGCAATTTTTGCATGCTGAAACATTAGGTTTTGACCATCCAACAACTGGTGAGTTTATGGAATTCCAAGTTGATGCTCCTGAGATATTCAATGAACAATTAGAAAAGCTTAGAGAACAAGTTTAAACTTGTTTTTTTTGTATTTAAAAAAGAACTATATTTACTGAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP015906|1105263:1113531|1107010_1108207_+|ARE08228.1|DBSCAN-SWA MFQYNKVEEALAALKAGEMIIVSDDENRENEGDLICAAEFISPEIINFMASEAKGLICAPLSETYAKNLQLEAMVEKNTDNHGTAFTVSVDHIETSTGISAFERALTIKKLVDAESLPSDFRRPGHVFPLIAKKNGLFERNGHTEATVDLLRLAGLKEVGVCVEIMDEDGTMMHKEKLKEKAQEWGLKYITIKAIQEYLKQNELQVEQVTRAKLPTKYGMFDILGFVNKINGEHHVALVKGDIGDGQAILCRVHSECLTSDAFGSLKCDCGGQLEEALKKINDEGRGVLLYLRQEGRGIGLINKLRAYSLQDEGLDTVEANLALGFEEDEREYSIGAQILKIIGVKSLKLMTNNPQKINDFQKYGLVVEERVALQIKDNPFDLDYLKVKQNKMGHLFD >CP015906|1105263:1113531|1111000_1112572_+|ARE08233.1|DBSCAN-SWA MIGIFLLINGIAISLTQVLNADHIIALLLGNILLIAAYFYFVGIYKLSKKLFDSKNKNETTDKSVSKIELLTDLSVTKYYRISFWLVALLTFILPFLFMIHVPDSKHAWDYFVIFNSTTELHGQSFGLLPETASRLGYFLRYPNNQFLGILFNQVFSPFAGSVELKMWVVTAVSALLTSLGVLAGTLSVKALSGKRHALLYNVCALGFLPFYVYGAQLYSDTITLPFVSFSLLFFIYAIKSQKITQQVLWYFLATVLAVIGYEFKPTVLIVLIAVLIFLGLNKKWKQLLLLLPMFAILFVGGHFMVKATIATEPAFSQEANERRNLPMMHWIAMSWSPTNKTGGFNKKVRLYSESFPTYEAKKEADKQLFIDNLKKMGPVGVVRQIGRKLAYTWLYGDLNSSFYTYHHENKFINRYFDYLSGTSFSLDGPGNITGWFMLKAVQTLYWIGLVVLLWRQIWRILISKRNWSNPWFIPALAFVGLSFFLILWETNSRYLYQFAPVMIALASLGLIDKQFKKKKIKE >CP015906|1105263:1113531|1106351_1107002_+|ARE08227.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEELGEVSRLQKREKSFKISIRASLILEDMKLGDSISTNGLCLTVSEFNQKEFTADIMPESLNRSNLGTLNVGAKVNLERAMPLNGRFGGHIVSGHIDGVGQILEVKKEENAIWFEIKTSLNLMRYTVEKGSITIDGISLTVAQVKSKSFSVSIIPHTLKETIMADKKVGDTVNLENDILGKYIEKLWGDSSSSMKESSVTKEKLFNNGFL >CP015906|1105263:1113531|1112574_1113531_+|ARE08234.1|DBSCAN-SWA MTKILYMVVPCYNEELVLDETSERLKAKYEQLISNNIISPKSRVVYVNDGSKDKTWEKIQEKHNENPMFSGINLSRNRGHQNALLAGLMTVRNLADCVISMDADLQDDINAIDEMLEKFENENCDIVYGVRDNRDTDTVFKRRTAGAFYKLMQGLGSQSVPNHADFRLMSRRALDGLAQFPEQNLFLRGMVPLVGYKSDIVYYKRGERFAGESKYPLKKMISFALDGITSTSAAPMRLIFWIGLIWFLLAIVGAIYIIARHFINGSDVAGWASTMLAIIGFGGANLLALGVIGEYIGKIFLEVKQRPRYLIEDFINED >CP015906|1105263:1113531|1108801_1109254_+|ARE08230.1|DBSCAN-SWA MKKLLSLVIIVVGIVADQIFKNWIVANIQLGDTEKIWPNVLSLTYIKNDGAAWSSFSGQQWFFLILTPIVLVVALWFLWKKMAQNWYFIGLTLIIAGALGNFIDRIRQGFVVDMFQTEFINFPIFNIADILLSVGFVLLFIAILTDKETK >CP015906|1105263:1113531|1105263_1106352_+|ARE08226.1|DBSCAN-SWA MKKDEYYMDLAIVLANKGGGNVNPNPQVGALIVKEGRIIGQGYHEKYGKAHAEINAFKDCNESPEGATLYVTLEPCAHQGKQPPCFEAIIKNGIKRVVIGHLDPNPLVSGKGIKAMREAGIEVSLNVLEKECEELNKIFFYYVSQGLPYVMMKYAMTLDGKIATSAGQSKWITGEIARQKVHQDRSRFMAIMIGVETLILDDPQLSVRLENGKNPIRIICDTHLRSPLASKIVSTATEIPTIIATAESDPEKQAPFLKAGCEIILVSCLEGRLNLKELTKKLGEKGIDSIILEGGGTLNASALKAGIVQKVQTYIALKIFGGKEAPSPVEGHGIEQPNQAYLLEGAQITYLGEDILLESELL >CP015906|1105263:1113531|1110366_1110810_+|ARE08232.1|DBSCAN-SWA MNFFNQIFHNQILMTAIVSWALAQLIKIIIELIRTHRINWQLIFATGGMPSSHSSLVVALATATGLRQGFDSSLFAIATVLAFVVLYDAQGIRRQAGNQARIINRMLQNVENAGIKVDKNLKELLGHTPIQVMGGTILGIIVALVMN >CP015906|1105263:1113531|1108234_1108699_+|ARE08229.1|DBSCAN-SWA MTIIEGNLRTENAKYGIVVAQFNEFINAKLLSGALDALKRHGVQEEEIDIAWVPGAFEIPIIAQKMATSNKYEAIICLGTVIRGSTSHYDFVCNEVSKGIAHVSLNSNIPVMFGVLTTENIEQAIERAGTKAGNKGFEVAVGAIEMVDLMRKIG >CP015906|1105263:1113531|1109314_1110220_+|ARE08231.1|DBSCAN-SWA MPIIKINEENKGLRLDKALANQTEYSRSLLTELIKNDKVFVNSEAKKAKYKVKVGDRIEFEVPEAEVLDIVAEDLPLEIIYEDSDVAVVNKPQGMVVHPAAGHASGTLVNAIMYHIKDLSSINGVIRPGIVHRIDKDTSGLLMIAKNDKAHESLAAQLKDKTSKRRYLAIVHGEIANDKGTIEAPIGRNLKDRKKQAVVSGGKPAVTHFEVLERFYGYTLIALRLETGRTHQIRVHMNYIGHPVAGDPLYGPNKTLTPNKGQFLHAETLGFDHPTTGEFMEFQVDAPEIFNEQLEKLREQV |
9 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1116861 : 1159657
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP015906|1116861:1159657|DBSCAN-SWA ATTATTTAGCCATGACTTGATACCCGATAGAATATCTTAAAGTCTCTGGTTCCAGTGATTTAGCTGATTTTAACAGTAAAGAATACGCTAAAAGTATCATCTCTAATTTCAATTGAAAACCTTGAGGCGAACGACTTTTACAACGCTCAGCTCCTAGATTTGTCAAAAAAGAGAAAACTCGCTCAATCACTTTTCTACGTTTTGAAAAATTAGGGAAAAGGATTTTCTTTTGCTTCATGTTCTTCCTGACAGGTGTAATTAGATTAATTCCTTTTAATTCCAGCCTATCATGCAGTGACTGACCTAAATATCCCATATCTCCAAGGACTGTTGGTGTCCCAAATTGACTCAACACTTCCTCGGTCATTGAACTATCAGCCATTGAAGCAGGAGTAATTGTGTAGTCTATGACATAGCCTGATTCACTGACTAAAGCATGACATTTACATCCATAGAAGTACTGTCCCTTTGTAGCATTGTAGCCAACATTTGCATAATCTCCAAGAACTTTGCTTCTGAAATTACGAATAGGCTGACACAAAGGAATGGGGAAGCTGTCAATAATGGATACACTCATTCCTTCAACCTCTTTAAAGACGAGTGCTTGGCGAATGACTTGGATACTCGGTAAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCCAATTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTATTAAGTATCAAGAAAAATCTAAAAAAACCAATTGATATCAATTGGTTTTTATTAACGTCGAAAATAAATTATACCAATTATCGTCTTTTTGAGTTTTATTAGAAGTTTTATACTTGACAATGATAAATAAGTGTAATATAATGCTATTTATAAATAAATATTAGAAAAATAATTAACTATACCAATTTTAAGGGTGAGTTAAATGGAGCTTTATTATGTGTGGGATTGTTGGTGTTGTAGGTAGTAAAAATGCAACTGATATTTTGATGCAAGGACTAGAAAAACTTGAATATCGTGGTTATGATTCAGCAGGTATTTTTGTAAATGGTCAAGAAACAGCAGCAAAATTAGTTAAATCTGTCGGACGTATTGCAGACTTAAGAGGAAAGTTAGGGATTGATGTTTCAGGAACAGCCGGCATTGGTCACACACGTTGGGCTACTCATGGTAAACCAACGGAAGACAATGCTCATCCACATACTTCAACATCAGGTCGCTTTATTTTAGTACATAATGGTGTGATTGAAAATTTTGTTGAACTTAAAAACGAATTTTTGATGAATGATACTTTTAAAGGACAAACCGATACTGAAATTGCGGTTCATTTAATTGCTAAATTTGCTGAAGAAGAAGGACTATCAACACTTGAAGCATTCAAAAAAGCTCTAAGCTTAATTCAAGGTTCTTATGCCTTTGCTCTTATGGATAGCGAAGATGCAGAAGTGATTTATGTTGCCAAAAATAAATCACCATTATTAATCGGCCTTGGCGAAGGCTACAACATGGTCTGCTCAGATGCTATGGCGATGATTCGTGAAACGTCTGAATTTATGGAAATTCACGATAAAGAGCTTGTTGTGTTAACAAAAGATAATGTTACAGTTATGGATTACGAAGGTAATGTACTTTCACGTGAGTCATACACAGCTGAACTTGATTTATCTGACATTGGAAAAGGAACTTATCCTTTCTACATGCTCAAAGAAATTGATGAGCAACCCGCAGTTATGCGTAAACTCATTGCGACTTATGCAAATGAAGACGGAACAATGAAAGTCGATCAAGACATTATCAAAGGAATTCAAGAGGCTGATCGTATTTATATTATTGCCGCCGGAACGTCTTATCATGCAGGTTTTGGGGCAAAAATGATGCTTGAATCTTTGACAAATACACCGGTTGAACTTGGTCTTGCTTCAGAATGGGGCTATGATATGCCTTTGCTGAGCCAAAAACCATTCTTTATTTTCCTTTCACAGTCTGGTGAAACGGCTGACAGCCGTCAGGTTTTAGTAAAAGTAAATGAATTAGGACTTCCAAGCTTAACAGTTACAAATGTTCCCGGTTCTACTTTGTCACGCGAAGCAACTTATACAATGTTAATCGGTGCTGGACCAGAAATTGCAGTTGCTTCAACCAAATCATATACAGGACAAATTGCAACTTTGGCTTTTCTTGCAAAGGCAGTTGGTGAGGCTGAAGGGGAAGTTAAAGCAAAAGAATTTGATTTAGTTAAAGAATTGTCTTTAGTTGCTCAATCAATTGAAGCCACTTTATCTGAAAAGGATGAAATTGCAGCAATTGTAGCTGACTTATTGCCAACTACTCGCAATGCCTTCTATATTGGTCGAAAACAAGATTATTATGTAGCAATGGAAGCTTCTCTCAAATTAAAAGAAATTTCTTATATTCAATGTGAAGGATTTGCTGCTGGAGAATTAAAACATGGAACGATTTCATTGATTGAAAAAGGAACTCCAGTACTTGCTTTAATTTCTAATAATGAAGAAGTAGCAGCTCATACTCGTGGAAATGTAATGGAAACAGTGGCTCGTGGAGCCTCAGCTATCACAATTGTTGAAGAAGGAGTGGCTCGTGAAGATGATACAATTGTTGTCAACCAAGTTCATCCTTATTTGTCAGCAATTTCAATGGTTATTCCAACACAATTAATTGCTTATTATGCGTCAATGCAGCGTGGACTTGATGTTGATAAACCACGTAACTTAGCTAAAGCAGTAACAGTTGAATAAAAGTTACTGACAGAAATCTCTGTCAGTAAAATGATAACTAAAAATAAAAAGTTCTGAGATTCATCAGAACTTTTTTGGTTAATTAATCTTTTGTCAGTGACAAAGGCCAGATTTTTCCGTATATAATAGTATGTATGAACTAAAAGAAAATCCGTATCCGATGCAACCTAGGGAACGCTTAGAATTTTTAGGAGAAGAGTGCTTGTCTGATGTTGAGCTGTTAGCGATATTATTGCGAACAGGGACAAAAAAATACTCATCATTAAATTTGGCCTTGGAAATTCTTCAACATTTTGAAACTTTGGATAATTTGCGCAAAGCTTCGATTAATGAACTCAGAGAAATTTCAGGCATTGGACTGGCAAAATCCATTGAAATTCGAGCAATGATTGAATTTGGAAAAAGGATACAAACCACTAATAGAAAACGTTACGGTCAAGTTTTGAGTTCCAGAGAATATGGCTTGAGTCTTGCTTTTGAAATGCAAAATTTTGAGCAAGAGCATCTTGTGGCGACTTATTTAGATGGTCAAAATCGAATTATTGAAAAAAAGACAATTTTTATAGGGGCGGTTAATCAGGCAACTGCAAGCCCTAGAGAGATTCTTTATCATGCAATAAAAAATCTCTCAGTAGGACTGTTAGTTGCACATAATCATCCCTCAGGAAATTTAAAACCAAGTCAAGCTGATAAAATATTTACTACCAAAATAAAAAAATCTTGCGAGGATGTGGGGATCAATTTTATTGATCATATTATTGTAGGGGCTGGTAATTATTTTAGCTTTCGGGAAGAAGAGATCAGAAAATGAAGGATTATATAACAAACAATCACTTCTCAACTATAAAGCAAAGAAAAAGAACAGTCAATAAAAACTGTTCTTTTATTTTGTACTAATTTAGTTTTCTTGAGCTCCCATGAAAAACTACATAGTAAAGGATAGATATGCTTTAGATAATGGCTTTATTCTTGATTTTTAATGATTTGTTGTATTTTTGTTGTAAGAAAATTATAACTCCATTAGTAGCTCAATTATTTTATCCTTATCTTTATTTTCTAGCTCTTTTATAATATGGATATAGGTTTGCTGTGTGATAGCCACACTTGCGTGTCCTAGGCGTTTTGAAACAGTCATGATATCAACTCCATGATAGAGGAGAACAGAAGCATGAGTATGCCTTAAACCGTGTACAGTAAGTGGAGTAGAAATATTTAGTTTTTTCAATGCATGATCTAATGTATTTTGCAAAGCTGAGAGAGTTATTATTTTTCTATAAGGATGATAACAAACAAAGTCATGTATCGGTTTTATACCCAAACTTTCAAATAATGTTTTTTGCTGTTCTCTAAAATCTTTTAGCAATTGCATACTTTCATCATCTATAACAATATCTCTTATTCCAGCATCTGTTTTGGGCTTTTTGAAACCACCTACTTTATTTCTGTAATTCCAAGTTCTGCGACACTTGATAGTGTTATTATTAAAATCAATATCATCCCAGACTAAGCCAAAAGCTTCACTGGCTCTCATGCCAGTAATTGAAATTATAAACAGCATAGTGGGAGATGAATAGTTTGGATTAAGCCTATTTCTGAAATAATCAACTAATTGCTTGTATTCATCAAAATTTACAAACTTGTCTTGCTCGGCTTTATCATTTCCATTACCTTTAACTACTGCACGAGTGGTAAAATCTTTTTGCAGTCGTCCCTCTTCAATGAGTGGTTGAATAGATGCTCTAACTCTAGTATGAAACCCTTTTGTAGATGCTTTGGCGTGTGTTTCAGCAAATTTATTTAGCGCTCTTTGATAAGAAGATGCTGTTATTTCGGAAATTAAAACATTTGGCATATAGGTTTTTAAATATTTTAACGTTTGCTCATAACCTTTATAAGTCATTTCATCAATTGCATTTTTCTTATAAAGTTCCATCCAGTCTTTAAAATATTCGGAAATTTCTTGCTTAATGGGGTCAACAATAAA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>CP015906|1116861:1159657|1125222_1125351_+|ARE08249.1|DBSCAN-SWA MNYTYIVNPETGEILFDLFHDLITQNIRAIKLIAKKLNAVLR >CP015906|1116861:1159657|1133941_1134106_+|ARE08268.1|DBSCAN-SWA MIEYAIYKGEKFIAEGTADELAKLLNVKPTTIKWWSSPVNSRRDKGNRKIAVKL >CP015906|1116861:1159657|1143795_1144113_+|ARE08286.1|DBSCAN-SWA MTLEELKVILDQTGLKVGYRLWAVGQAPPLPYILYYVDEEIGFKADNQIYAKNKDITIELYSNLKNEREEQKLEKLLDDNKIVYEIYESYLDSEKMYLRAYEINI |
64 | Lactococcus_phage(96.67%) | terminase,capsid,transposase,holin,integrase | attL 1110873:1110889|attR 1157070:1157086 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1602507 : 1612808
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP015906|1602507:1612808|DBSCAN-SWA ATTAATGTCTAAAATGACGAAGTCCTGTGAAGACCATCGCAATTCCATATTTATCACAGGCATCAATCACTTCTTGGTCTCGTACAGAGCCACCTGGTTGAACAATTGCTTTAATTCCTGCCTTAGCAATTTCATCGATATTGTCAGCAAATGGGAAAAAGGCATCCGAACCAAGAACCGCATTTTCTTGAAGTTCTACTGATTTATCTGCGGTTGCCTCTAAGGCAATTTTTACTGAGCCCACACGGTTAGTTTGGCCAGGACCAACACCAAGCGTCTGGTGGTCATTGGTCACAATAATCCCATTTGATTTGACAAACTTAACTGCTTTCCAAGCAAACTTCATGGCCTCCATTTGTCTATCAGTTGGTTGAACTTTAGTCGCCACTGTCCATTCTTTTGGATTTTCAACAATGACATCTTGATTTTGAACAAGTAGTCCTCCAAGAACCCCTGTTACAAGCGCTTCTTTTTCTGAGGCTTCTTTTTTAGAAAAATCAACGGTTAAAAGTCGAATATTTTTCTTTTTACTTAAAACTTCCAAGGCTTCTTTGCTATAAGAGGGTGCGATAATAATTTCAAGGAAAATCTTACTCATTTTTTGCGCAGTTGCCAAAGTTACTTCTCGATTTAAAACGATAATTCCACCGAAAATTGAAACTGGGTCTGCTTCATAGGCATAATCCCAAGCTTTTTCGATATCCGTTGCTGTTCCAATCCCACATGGATTCATATGTTTGAGGGCTACAACTGTTGGTTCTTCAAAATCTCTTGCAATCTGTAAAGCAGCATCTGCATCACGAACGTTGTTATAGCTTAGTTCTTTACCATGAATTTGCTTACTTTGGGCAATTGAATAAGTCGTAGGTATTCCTGACTCATAAAAATCTGCATTTTGTTGCGGATTTTCACCATAACGCATTCCTTGTTTAAGGTCGTAAGTCAAGGTTAATTTTTCTGGTTTTACATTTTCTACCGGAAATTCTTCTGTCAAATATTGTGCAATTAAAGCATCATAACTTGCAGTGTGGCGAAATACTTTTGCTGCAAGTTGCTGACGAAAACTTAAACTTGTTTCGCCTTTTACTGACAGCTCTGTCAGTACTTTTTCATAATCATTTGGGTCACAAACGACTGTGACTGACGCATGGTTTTTAGCTGCTGAACGCAACATTGAAGGACCACCAATATCAATCTTCTCAATCATTTCTGCTTGACTGCCCCCAGCAAGCAAAGTTTCTTTGAAAGGATATAAGTTTACAACAACCAAATCAATTGGAGAAATATGATGTTCTGTCATTGATTTCATGTGACTTTCCAAGTCTCTACGTCCAAGAAGGGCTCCATGAATTAGTGGATGCAATGTTTTAAGGCGCCCATCCATCATTTCTGGAAATCCTGTTACTTCATCAATTGCAATATTCGGAATTTCTTCTTGGTCCAGAACGGCTTTCGTTCCACCCGTTGAGATAATTTCCCAACCTAATTCTCGAATTTCCTTAGCAAATTCTACAATACCTTCTTTGTCTGAAACACTGATAAGTGCACGTTTTGACATGATTCCCTCCAAGTTTTCTGCTGACAATTCTGTCAGTAATATTTTTCTTATAAAAGAACTGACAGAACTGTCAGTAAATATTTATCATGTCTTTATTTTACATTTATCGTTTGGAAATAAAAAGCACCAGTTTTAAAACTGGGCTTTTTTTATTATAATTGTTCGGAAATTACTTTTAGTCTTTAATTAAAAACTCTTCATTGAAAATTCCAATATATGGCAACTGACGGTAACGTTCGGCATAATCAATTCCATAGCCCACAATAAAGGCATCCGGTACTTCAAAGCCAACATAATCAGCGTCAATATCAACTTTACGACCACTTGGTTTATCTAATAAAGAGATAATTTTTACTGAATGTGCTTGACGTCCTGTCAGCAATTTTTTAAGATAGAGCAGAGTATTCCCAGTGTCAATGATATCTTCAACAATCAAAATATCACGTCCATGAGCCACGGTTGATAAATCTTTCAAAATTCTAACTTCTCCAGAAGATGAAATCCCATAACCATAACTGGTAACATCCATAAAATCAACTTCAGCATCAATTGATAATTCTTTAAGCAGATCAACCGTAAACATGATTGACCCTTTTAATATTCCAACAACAAGTGGATTTTTTCCTTCATAATCGCGTGAAACAACTTCCGCAAGCTCTTTGACACGTTCGGCAATTTGTTCTCTGGTAAATAAAACTTCTTTTAAATGTGGATGCATTTTTCTCTCCAATTTTTTTCACAATATGTTTCTATTTTAGACTTTTTTAGAGAGAAGAAAAAGACCAGAAGTCTGACTTTGGTCTTTTTTAGCTTACAACGTTCGGAAATAGAAAATTTTCAAAACTATAATTTTCTTAATCAACTTTAATAACTCCCAAATCCAACATCGTTTGTGCCGTTTGAATAATCGCTGCTTCACCTGAACGTGGTTTCCAGCCTAAAAGTTTAACTGATTTTTCATTTGAACAAGCTGTGTTTTGCCCCAAAAATGTAGCTGGCATCGCCAAACTTTTATCAAATCGAGCTAAAATTTTAACTAAAAAGTCGGGAATTACCTGAGTAGATACTTTTTTAGCTTTTGTACCAAATTCCTTTTTCAAAAACTCAGCTTGCTTTTTGTAAGTAATATTTTGGCCTGAAGTTGCAATGAAACGCTGACCAATCGCTTCTTTTTTCTCAAGAGCTAGCAAATGTAAATCAGCAACATCACGAACGTCAACATAATCAAATGCTAAATTTAAAAGTCTGGGCATTTTACCTTCAAACATATTTTTTATAGCCGCACTAGAATGTGAAAAATCATTTCCAAGAATTGGACCCATAACAGCTGTAGGTAAAACCGATGCTCCTTCAATACCATAAGCTTCTGCAAGTTTCCAAAACTCCATTTCCGCCATCGTTTTAGAACGTTGATATGCATTAATTGGAGCATCAAGGTTTGTCCAATCTCTCTCTGTGAAGATTTCTGGATGATCCTTATGCCCCGCTAAAACTGCTCCCGATGCTGAGGTCAAAACCACTCGTTCAACTCCTGCTTCCTTGGCCGCTTTCATCACAAACTTCACTCCATCTACAGCCATTTTCACCATTAAATCATCAGCGTCAGGACGTTGCAAAGGTGTTGGTGAAGACACATGAATCACAGAATCAACACCAGTCATGGCTTGACTCCATCCTTCTTCTTTTGTCAAATCAGTTTGTACAAAATCTAAATCTGTAAAATCTGAAATTCCGCCTTGTGCCATCATTTTTTTCACTTCTTCTTGTCGAGACATCGTCCGCAATGTCGCCCGTACTCGATAGCCTTTTTTCAATAAAGCAATCATGATAAACATAGCAATATATCCAGAACCACCTGTTACAAGAATTGTTTTTTTATTTGTATTTGTCATTTAATTTTTTCCTCTATTTTTCTTAATTCACATCTGTTACACTTGAAACTTATGTAAAATTATTGTACGATAGAAGTGTAAAAAATACAAGCCTTTGAAAAGCTTGTGTGACACAATCAGGAGAAGTGTAATGGCAGCGACAAACTATTCCCAAACTATCAAAAACGATACAAAAGATTTTATTACTACAGCAATTTTGCAACTATTAGGAATTCAAAAAACATTTGAAAAACCGAAAAATCTTGCTCAACTCACGGTTTCAAACGTTTGTAAGAGGGCCGGAGTTAGCAGAATGGCTTTTTATCGTAACTTTGAGTCCATTGACCAGGTCATTTATCAATACTATCAGCCTCAAATTTCTCAAAGTTTTGAAATCATTCGTCAGAATGTTTCTGCCAGTTCAAAAATTGAAAACCAATTAAAATTCTTTGAAGAATTTAAAGATGACCTCTTCCTTTCTGAAAGTCAAGGTTACGAACCAATTATTCGTCAGATTTATATTGAAGAAATTGAGAAATTTTATGAAAAGACAAATGACGAATATTTCATTACTTTTGTCGCAAATGGAGTTTATGCTCTTTGGCGTAAATGGTTAATGAACGGTCAAGATAAGTCAATTGAAGAAATACATGAACTCATTAGAAAAATTGTTACAATTTAAGTAAAAATAAAAAGACACTTGCACGTGTCTTTTTAATATAAATTTATTTTTTAAGCAATTTCCTGTCCTAAATGAATCACCTCATCCAAATAACTTTGAGTTTCATCATATAGATGGTGTGTAATCATAATCACCGTCAAATCAGGATTTTCTAAAATATTTTTTTCTACAGCTAGAGCTGTTTTTTTGTCAACACTCGCCGTACTTTCATCCATCACTAAAATTGGCTTACTGCCCATTAATTCTCTAGCAACAGATAATCTTTCTTGCTGACCTCCTGATAAATTTTTATCATAAACCGTATCAAGTTTATTAAATACAAAGTCATCAGCACAAGCAATTCTAATCGACTTATCAAAGATATCTGGCGAAATTTTACGCCCTAAAGTCAAATTTTCTTCTACTGTTTCCTTAAAAAGATAGGGAAATTGCATAATCACACTCATAAAATGAGGCAAAGATTTTCGATTAATTCCTTTATAATCTTTCCCGTCTAATAAAATTTCTCCTTCATAGTCTTGCTTATTCCCAACCAACAAATTAATCAAGGTTGATTTTCCACTTCCACTATCGCCAATAATCGCGTATTTTTTTCCTTTTTCAATGACAATTTCTGGATACTCAATTTTTTGCCCATCAGGAAATGCAACTGCCAGATTTTTTAATTCTAATTTACTTTCAAAAGCTGTCACTTCTTCTCCGTCAGTAACTTTTGATTCGTCAGTAATTTTTCCATATTTCTCTAGCAGCTTTCCAGTTGCATTGAGCAATATTAAACTATTTGCTACACTTTTTGAGTAATTAGTTACTGTTCCTGACAAATTTCCGACACTCATGACAACACCAATGCCAATTTGCCCATTCATGATAAGAAAACCAGCAACAGCTA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TTTTGCGCAATTTTGTCTGCTTCAGTAAATATTTGGAACAAATCTGGACTTAGGTTTTGACCATAAGTAATATTTGAACCTTCTACTGAATTAATTTTGTCAATTTCTTTTTCAATTAAATTTGTATAGTCATCTAGGTCAATCCCTAAATCTTTATAAAAGTTCGCCCCAAAACTATTAGGTTGAACAAAAATTCGCCATAAATGTGGAACTTCAATCACTTGGTGATGACGAACTTGCGCAATTTGTTGCGCTGAACCAAGTGCTTCTTGCATCGTTGTTGTCATTTTTTCGATGTCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP015906|1602507:1612808|1604918_1605956_-|ARE08722.1|DBSCAN-SWA MTNTNKKTILVTGGSGYIAMFIMIALLKKGYRVRATLRTMSRQEEVKKMMAQGGISDFTDLDFVQTDLTKEEGWSQAMTGVDSVIHVSSPTPLQRPDADDLMVKMAVDGVKFVMKAAKEAGVERVVLTSASGAVLAGHKDHPEIFTERDWTNLDAPINAYQRSKTMAEMEFWKLAEAYGIEGASVLPTAVMGPILGNDFSHSSAAIKNMFEGKMPRLLNLAFDYVDVRDVADLHLLALEKKEAIGQRFIATSGQNITYKKQAEFLKKEFGTKAKKVSTQVIPDFLVKILARFDKSLAMPATFLGQNTACSNEKSVKLLGWKPRSGEAAIIQTAQTMLDLGVIKVD >CP015906|1602507:1612808|1608999_1610016_-|ARE08726.1|DBSCAN-SWA MSENAYAKSGVDVEAGYEVVSRIKKHVAKTERLGVLGALGGFGGSFDLSVLDVKEPVLISGTDGVGTKLMLAIQADKHDTIGIDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNIPEKLEQVVAGVAEGCLQAGAALIGGETAEMPGMYDEDDYDLAGFAVGVAEKSQLIDGEKDVEAGDVLLGLASSGIHSNGYSLVRKVFSDFDLNESLPELDQSLIDTLLTPTKIYVKELLPLIKQNKIKGIAHITGGGFHENLPRMFGNSLSAEIVEGSWNILPIFKALEKYGDIKHEEMYEIFNMGIGMVIAVAPENAEALKKVLNAFEIGKMVKRQDSAVVIKK >CP015906|1602507:1612808|1610204_1612808_-|ARE08727.1|protease|DBSCAN-SWA MDIEKMTTTMQEALGSAQQIAQVRHHQVIEVPHLWRIFVQPNSFGANFYKDLGIDLDDYTNLIEKEIDKINSVEGSNITYGQNLSPDLFQIFTEADKIAQKMGDEYLSTEIILLALFELKQNPLTSYLVSHGLTKAKAQAAIEKLRGGDKVTSQNAEETYKALEKYGVDLVAQVKSGKQDPVIGRDEEIRDVIRVLSRKTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLAQRIVRKDVPENLKDKTIFSLDMGALIAGAKYRGEFEERLKAVLNEVKKSDGQIILFIDELHTIVGAGKTEGSMDAGNLLKPMLARGELHLIGATTLDEYRKYMETDKALERRFQKVLVTEPTVEDTISILRGLKERFEIHHGVTIHDNALVAAATLSNRYITDRFLPDKAIDLVDEASATIRVEMNSLPTELDQANRRLMQLEIEEAALKKERDDASKKRLEIIRGEIAELREENNQLKAQWEAEKKEVGNISEKRNELEHARHELEEAQNEGNLEKAAALRYGKIPEIEKELKAIEEKAKSDDLSLVQESVTEEQITEVVGRMTGIPITKLVEGEREKLLHLPETLHQRVVGQDEAVEAVSDAIIRARAGIQDPNRPLGSFLFLGPTGVGKTELAKALAENLFDSEEHMVRIDMSEYMEKHSVSRLVGAPPGYVGYDEGGQLTEAVRRNPYTIILLDEIEKAHPDVFNILLQVLDDGRLTDSKGVLVDFKNTVLIMTSNVGSQYLLDNVGENGEISEETTENVMSQLRAHFKPEFLNRIDDTILFKPLALEDIKNIIVKMTSQLSHRLEEMDVQLELSEEVKVWIAENAYEPAYGARPLKRYLTKVIENPLAKLIIGGKIPPKSKVIVTLVENKIDFDIQTIAE >CP015906|1602507:1612808|1606667_1608257_-|ARE08724.1|DBSCAN-SWA MVKYLKEFKFENFMVFLLITIDIALAVLSSVFLANVLNSLIAKEMNQFFLWLAIDIILWMVDSFVQGARDVWKEIAIQKQLNAVRRDIIEPLTEISYSDFEKNSKEDYNSWLNNDTKLLYDNGFHQIYFVYTGIVAMLFSGIAIIFFHWVLLLTTLLVGALLFYFPKMFKQSVERDTEQVSELANDALATSTDYLRGYEVLYHNKQLGLMQERTMGKFNQLATANVKLIFTRAWMQYSLLGTSMLGQFLILAVAGFLIMNGQIGIGVVMSVGNLSGTVTNYSKSVANSLILLNATGKLLEKYGKITDESKVTDGEEVTAFESKLELKNLAVAFPDGQKIEYPEIVIEKGKKYAIIGDSGSGKSTLINLLVGNKQDYEGEILLDGKDYKGINRKSLPHFMSVIMQFPYLFKETVEENLTLGRKISPDIFDKSIRIACADDFVFNKLDTVYDKNLSGGQQERLSVARELMGSKPILVMDESTASVDKKTALAVEKNILENPDLTVIMITHHLYDETQSYLDEVIHLGQEIA >CP015906|1602507:1612808|1604239_1604782_-|ARE08721.1|DBSCAN-SWA MHPHLKEVLFTREQIAERVKELAEVVSRDYEGKNPLVVGILKGSIMFTVDLLKELSIDAEVDFMDVTSYGYGISSSGEVRILKDLSTVAHGRDILIVEDIIDTGNTLLYLKKLLTGRQAHSVKIISLLDKPSGRKVDIDADYVGFEVPDAFIVGYGIDYAERYRQLPYIGIFNEEFLIKD >CP015906|1602507:1612808|1602507_1604064_-|ARE08720.1|DBSCAN-SWA MSKRALISVSDKEGIVEFAKEIRELGWEIISTGGTKAVLDQEEIPNIAIDEVTGFPEMMDGRLKTLHPLIHGALLGRRDLESHMKSMTEHHISPIDLVVVNLYPFKETLLAGGSQAEMIEKIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVCDPNDYEKVLTELSVKGETSLSFRQQLAAKVFRHTASYDALIAQYLTEEFPVENVKPEKLTLTYDLKQGMRYGENPQQNADFYESGIPTTYSIAQSKQIHGKELSYNNVRDADAALQIARDFEEPTVVALKHMNPCGIGTATDIEKAWDYAYEADPVSIFGGIIVLNREVTLATAQKMSKIFLEIIIAPSYSKEALEVLSKKKNIRLLTVDFSKKEASEKEALVTGVLGGLLVQNQDVIVENPKEWTVATKVQPTDRQMEAMKFAWKAVKFVKSNGIIVTNDHQTLGVGPGQTNRVGSVKIALEATADKSVELQENAVLGSDAFFPFADNIDEIAKAGIKAIVQPGGSVRDQEVIDACDKYGIAMVFTGLRHFRH >CP015906|1602507:1612808|1606086_1606617_+|ARE08723.1|DBSCAN-SWA MAATNYSQTIKNDTKDFITTAILQLLGIQKTFEKPKNLAQLTVSNVCKRAGVSRMAFYRNFESIDQVIYQYYQPQISQSFEIIRQNVSASSKIENQLKFFEEFKDDLFLSESQGYEPIIRQIYIEEIEKFYEKTNDEYFITFVANGVYALWRKWLMNGQDKSIEEIHELIRKIVTI >CP015906|1602507:1612808|1608423_1608972_-|ARE08725.1|DBSCAN-SWA MKFAVFASGNGSNFQTLAEQFPDQVKFVFSDHHDAYVLERAERLGVAKASLELKEFSSKVDYEKALVEILKDQEIDLILLAGYMKIIGATVLSKYKGKIINVHPSYLPDFAGSPHAIEESHEAKKGLGISIHYVDEGVDTGELIAQISLAYHEDLEVYERSVHEAEHKLYPEVVRQIILHQQ |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1688200 : 1727896
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP015906|1688200:1727896|DBSCAN-SWA 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60 | Lactococcus_phage(90.38%) | terminase,capsid,portal,holin,integrase | attL 1695620:1695635|attR 1727968:1727983 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1851364 : 1861223
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP015906|1851364:1861223|DBSCAN-SWA TTTATCCAAATTTACCAGAAATATAATCAGAAGTTTCTTGTTTTTCTGGATTTAAGAAAATACTTTTCGTATCATTATACTCAATCAGATTTCCGTCTAACATAAAGGCGGTACGGTCTGAAATTCGTGATGCTTGTTGCATACTATGTGTAACAATCGCGATTGTATAATCTTTTTTAAGTTCAAGCATGGTTTCTTCGACACGAGCCGCTGAAATTGGGTCAAGGGCTGATGTTGGTTCATCCATTAGGATAATTTCGGGATTGACAGCAAGGACACGTGCGATACAAACCCTTTGTTGTTGCCCACCTGAAAGTCCAAGTGCTGAACTGTGCAAAATATCCTTAACTTCATCCCAAATATTTGCTGCTTTGAGTGAATTTTCCACCACTTCATCAAGAAGTGCCTTATCTTTCACTCCTTTTAAACGCAATCCATAAACCACATTTTCATAAATTGAAAATGGAAAAGGATTGGGTTGTTGGAAAACCATGCCAATTTCTTTACGTAAATCAACAGTATCAACTTTAGGACTGTAAATATTTTTACCTTTATAATCAATGGCTCCAGTAATTGTTACTGTTGGAATCAAATCATTCATTCGATTGATTGAACGTAAAAGCGTTGATTTTCCACATCCTGAGGGACCAATGAGCGCTGTAATTTCATTCTTATAGAATGTCATGTTTATCGTATTCAACGCTTTTTTCTTGCTGTAATAAAGCGATAAGTCGCTGACGGTTAAAACTGCTTCTTTTTCCATATTTTACCTTTTTATAAGTTACTGATACAACTACTAGCACATTCGTAATGTACTAAAGTACAAACGACTGTCCTATGACGGACAAGTTTTTCGACAAATCAAGAATCCGTCAGTAGTTTTTTTACTAACGAAAATTCCGTCAGTAATTTTAAACTTTATTTTCTCTTAACCAAAGTGACCAGAAACATAATCTTCTGTTGATTGCAAACTAGGTTGAGTAAAAATTGTGCTTGTTTTATCATACTCAATCAAATCTCCTGAATAGAAGAAAGCTGTATTGTCAGAGGCCCGAGAAGCCTGAGCCATATTGTGAGTCACAATGATAATCGTATAATTTTCTTTAAGTTCCATCATTGTTTCTTCAATTTGCATTGTTGAAATTGGGTCAAGAGCTGACGCTGGTTCATCCATCAAAATAATTTCTGGTTTTACTGACAATGCTCTTGCAATACATAAGCGCTGTGCTTGTCCACCGGACATGGCAAGTGCGGATTGATTAAGATTATCTTTTACTTGATCCCACAAAGCAGCTTGCTTTAATGAAGTTTCAACAATCTCATCCAGTTTTTTCCTGTCTCTCACGCCATCACGACGATGAATGAAGGCAATATTTTCATAAATTGATTTTGGAAATGGATTAGGTCTTTGGAAAACCATCCCAATTTGCTTACGAACTTCAAAAACATTCACTTTATTTTCGTTAATATTGACCCCTTCATAATTGATTTCGCCAGTCACCCGAGCGCCATCAATCGTGTCATTCATGCGATTCAAAGCACGTAAATAGGTTGATTTACCAGAACCTGAAGGACCAATAAGTGCTGTGATTTCATTTTTAGGAAAAGACATTGTCACGCCATGGATTGCTTCTTTTGTTCCGTTATAGAAAACACGCAAATCATTTGTTGATAATGCAATTTCTTCTTTCTCAGGCACCATAATTTTGCGCTGAGACCAGTCATATGTTGTTGCCATAATTATTCTTTCTCTATAAAATCTTTGATTTTCTTAGTTAGAAGATGTTAACTTCTTGTGAATTCTATTTCCAAGGAAACGTGCCCCCAAGTTAAAGAGGAGAACAAAGATAATCAATACTGCTGAAGCTCCTGCAGAAATTTGTTGTGCTGTTGAAATCGTTCCTTCGGTATTAAGTGCCCAGATATGAACAGCCAAAGTTTCAGCTGGTCTGAAAAGTGAGAGTGGCGAAGTCAAGCTCATCGGATTCCAGTTTGCCCAGTTAATTGGTAAGTTCGTTTGTCCAGCAGTGTAAATCAAAGCCGCAGCTTCACCAAAAACGCGTCCTGAAGATAAGATAACCCCAGTAATGATTCCGGGCACAGCAGCTGGTAAAATGACTTGTGTTGCCGTTTCCCAACGTGACATTCCGAGTGCCAAACCACCCTCACGTTGTGAAGTTGGAATTGCTCGAAGTGATTCTTCAACATTCCGAGTCATCAATGGTAAGTTGAACACAGTTAGTGCCAAGGCACCTGATAGAACTGAGAAACCAAGACCAAATTGTAATACGAAAATTAACATCCCGAAAAGTCCAACAACGATTGAAGGAAGTGAAGATAAAACTTCAATAGCTGAGCGAACAACACCAGTTAACCAATGTTTTTGATTCGCATACTCAGACAGATAAATTCCTGCGCCAAGTGATAAAGGAACAGAAATAATCAAAGTGACTATCAAAAGATAAACAGAGTTAAAAAGTTGGACTGCAATCCCACCACCTGTCAATGGATTTGACGCGGTGATGATAAATTTAGGATCTTTAAAGATAACTGGCAAACCTTTAATTAAAATATAAGCCAGTAAAAAAGCGAGGATAAGAACAATGATGCCAGAAAGGACGTAAAGGACACCAGTGGCAATCTTGTCAGAGCGTTTAGCGTTCATTATTTAAGACTTCCTTTCTTAGCAATAGCACGCATTGCGAGGTTGAAAAAGAGTGACATAATCAAAAGGAGTAAGGCAAGTGAGCAAAGTGCATTCAATTGAATACCAGGTGTTGCATTTGGAATTCCTGATGTCAAGATTGAAGTCAAGGTTGAAGCTGGTGAAATCAAATCTTTTGGCATCATTACAGCATTACCTACCACCATTTGAATAGCAAGAGCTTCACCAAAAGCACGCGCCATTCCAAAGATAACAGCGGTCAAAATCCCTGGTGTTGCGGCTCTTAGAAGAACACGCCAAATTGTTTGCCAACGCGTTGCACCAAGTCCGAGTGACGCTTCTTTATAATAAGAAGGGACAGCTTTCATAGCATCCACAGTCATTGAGGTTACAGTTGGTAAAATCATGACAAAGAGTACAAACACACCTGACAAGAGACCCAAACCAGTTCCACCAAAAACATTACGAATGGCTGGAACAACAACAGTCAAACCAATGAAGCCATAAACAACTGAAGGAATACCAACAAGAAGTTCAATGACAGGTTGCAAAATTTTCTTACCATATTTTGGTGAAATTTCTGTCATATAAATTCCCGCACCAATCGCAAATGGAGTGGCAACAAGGGCTGAAAGTACAGTAACAATCAATGACCCCGTAAACATCGGCAATGCGCCAACTGCGGGTTTACCGTCAGGGCCAAGATTACCTGGTGACCAATTTGTTCCAAAAAGGAAACGGAAAGGATTAACACCATCTGAATAGAAAGTTGACAGACCTTTTTGAGCAACAAAGACAAGAATTGCACCTACAACGAAGACAATAAGGGCAATACATAAGAAAGTTAAACTCTTACCAAATTTTTCAAGTCTTGAATTTTTATTGCTTGAAAGCAATTTTTCTTTGATTTTTGAATTTTCCATAGGGACCTAACTATTTTTGTTAATTTGCATCTATCTGATTAATGCAAATGAAGTTATTGATTAAACTTATTTTGACTAATTTTTTTACTGACGGAGGATAAGTTTAATTTCCATCAGTAATTATTTAATTTTTTCAACATTTCCTTTAGCATCACGGTCAACCTTCATTTCAGAAACACGGATATAACCAAGCTGCTCTAGGGTTTTCTTATCATTTTGAACGTATTCGATAAATTTATTTTCGATTGTGTTCTTACGAGATTTGTTGGTGTACATATGCTCATATGACCAAATTTTCCATGCATTAGTTTTTACATTGTCATAAGTTGGCTCAACACCATCAACATTAACCGCCTTTACACCGGGTTTGTTGGTGTAACTGAAAGCAACATATGAAATAGCCCCTGGCGTTTGCCCAACTAATTGGACAACAGAACCTGAAGCATCTTGAGTTGGACCATTCACTTCTGTGGCACCATTCAAAGCATATTTATCAAAATTTACTCGCGTTCCTGAACCAGCAGTACGACCAATGACCGTAATTTTTTGGTCTTGACCTCCTACTTCTTTCCAGTTGGTAATTTTACCAGTGAAAATATCAATCAGTTCTTGTTGAGTCAAATTTGAAACTTTTAACTTTTTGTTGATAATTGGTGCAAAACCAATGACAGCAACTTTATGGTCAATAATTTTATCAACTGCTATTCCTGATTTTTCTTCAGCGAAAATATCAGAATTCCCAATCTGGAAAGAACCAGCCGCAACTTGAGCCAATCCGACACCAGAACCACCACCTTGAACCATAATAATTTCATCAGGATTTTGCTTCATATATGCCATAGAAGCATGTTCAACCATGGGTTGCAAGGCAGTTGAGCCACCTGCTGTGACCTGTTTATTTCCAGAACCACAAGCTGCCAATGCAAATAAACTCACACTGGCCATCAAAGCAATAAAAATTTTCTTCTTCATAGCTTAATTATACCATAATGGCCTATCAATGAGCGGTTGATGATAGCGTTCTTATGTAAATGTTTTGTAAATAATACGGGAAAATGCCCAACTCTGAAAAAGAGTGAGCAATTTCCTGTCTTTTAGGGAAAGAATTATGAAGAAAAATTTAAAGATAGTCTCTCATCAGTTCATCCTGTTTATGTTCACTGATAAAATTTTTATAAAAAAGGAGTCAAACTTTTAAATTTTAATTTATGAAGAAGAAAATTTTTATTGCTTTGAATCCTATGGTTATAAACTAATTTATTAATTGTTAAATTTACTGACAGACTTAAATTATTTTGAAATTGACTTACTGTCAGTATTATTTTTTAGTGATATTTCCGTCAGCGTCACGTTCAACTTTCATGTCACTGATTGGAATGTATCCCAATTTTTTGATGTCCTTGTTGTTTTCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP015906|1851364:1861223|1855071_1855896_-|ARE08986.1|DBSCAN-SWA MASVSLFALAACGSGNKQVTAGGSTALQPMVEHASMAYMKQNPDEIIMVQGGGSGVGLAQVAAGSFQIGNSDIFAEEKSGIAVDKIIDHKVAVIGFAPIINKKLKVSNLTQQELIDIFTGKITNWKEVGGQDQKITVIGRTAGSGTRVNFDKYALNGATEVNGPTQDASGSVVQLVGQTPGAISYVAFSYTNKPGVKAVNVDGVEPTYDNVKTNAWKIWSYEHMYTNKSRKNTIENKFIEYVQNDKKTLEQLGYIRVSEMKVDRDAKGNVEKIK >CP015906|1851364:1861223|1852291_1853101_-|ARE08983.1|DBSCAN-SWA MATTYDWSQRKIMVPEKEEIALSTNDLRVFYNGTKEAIHGVTMSFPKNEITALIGPSGSGKSTYLRALNRMNDTIDGARVTGEINYEGVNINENKVNVFEVRKQIGMVFQRPNPFPKSIYENIAFIHRRDGVRDRKKLDEIVETSLKQAALWDQVKDNLNQSALAMSGGQAQRLCIARALSVKPEIILMDEPASALDPISTMQIEETMMELKENYTIIIVTHNMAQASRASDNTAFFYSGDLIEYDKTSTIFTQPSLQSTEDYVSGHFG >CP015906|1851364:1861223|1857443_1857911_-|ARE08988.1|DBSCAN-SWA MVKNTEDKPLAQNKKARHDYEIYETFEAGIVLTGTEIKSVRQAKIQLKDGFARVRNGEVWLSNVHIAPFEQGNIFNVEELRTRKLLLNKKEIAKIDKELSGTGITFIPLKVYLKNGFAKVLMGLARGKKDYDKRETLKRKEQNRDIARQIKAYNR >CP015906|1851364:1861223|1853134_1854028_-|ARE08984.1|DBSCAN-SWA MNAKRSDKIATGVLYVLSGIIVLILAFLLAYILIKGLPVIFKDPKFIITASNPLTGGGIAVQLFNSVYLLIVTLIISVPLSLGAGIYLSEYANQKHWLTGVVRSAIEVLSSLPSIVVGLFGMLIFVLQFGLGFSVLSGALALTVFNLPLMTRNVEESLRAIPTSQREGGLALGMSRWETATQVILPAAVPGIITGVILSSGRVFGEAAALIYTAGQTNLPINWANWNPMSLTSPLSLFRPAETLAVHIWALNTEGTISTAQQISAGASAVLIIFVLLFNLGARFLGNRIHKKLTSSN >CP015906|1851364:1861223|1854027_1854951_-|ARE08985.1|DBSCAN-SWA MENSKIKEKLLSSNKNSRLEKFGKSLTFLCIALIVFVVGAILVFVAQKGLSTFYSDGVNPFRFLFGTNWSPGNLGPDGKPAVGALPMFTGSLIVTVLSALVATPFAIGAGIYMTEISPKYGKKILQPVIELLVGIPSVVYGFIGLTVVVPAIRNVFGGTGLGLLSGVFVLFVMILPTVTSMTVDAMKAVPSYYKEASLGLGATRWQTIWRVLLRAATPGILTAVIFGMARAFGEALAIQMVVGNAVMMPKDLISPASTLTSILTSGIPNATPGIQLNALCSLALLLLIMSLFFNLAMRAIAKKGSLK >CP015906|1851364:1861223|1851364_1852126_-|ARE08982.1|DBSCAN-SWA MEKEAVLTVSDLSLYYSKKKALNTINMTFYKNEITALIGPSGCGKSTLLRSINRMNDLIPTVTITGAIDYKGKNIYSPKVDTVDLRKEIGMVFQQPNPFPFSIYENVVYGLRLKGVKDKALLDEVVENSLKAANIWDEVKDILHSSALGLSGGQQQRVCIARVLAVNPEIILMDEPTSALDPISAARVEETMLELKKDYTIAIVTHSMQQASRISDRTAFMLDGNLIEYNDTKSIFLNPEKQETSDYISGKFG >CP015906|1851364:1861223|1858604_1861223_-|ARE08990.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKTMTSAEVRQMFLDFFKSKGHTVEPSQSLVPVNDPTLLWINSGVATLKKYFDGSVVPENPRLTNAQKAIRTNDIENVGKTARHHTMFEMLGNFSIGDYFRKEAIAFAWELLTSSEWFEFPAEKLYITYYPADKDTYNRWVEVGVDPTHLVPIEDNFWEIGAGPSGPDTEIFFDRGEVYDPEHVGLKLLAEDIENDRYIEIWNIVLSQFNADPSIPRSEYPELPQKNIDTGMGLERMVCIIQGGKTNFDTDLFLPIIREIEKLSGKTYSPDSENMSFKVIADHIRSLSFAIGDGALPGNEGRGYVLRRLLRRAVMHGKKLGIQGKFLASLVPTVGKIMQSYYPEVLEKEDFIMQIIDREEETFNRTIDAGQKLIDELLLNLKSEGKDRLEGADIFRLYDTYGFPVELTEELAEDEGFKIDHEGFKVAMKAQQERARAAVVKGGSMGAQNETLSSIEVESEFLYEDKTTQGKLLVSIQDDEIVDEVSGKAQLVFDVTPFYAEMGGQVADHGVIKDAEGQVVANVLDVQHAPHGQNLHSVETLSPLKVGESYTLEIDKERRAAVVKNHTATHLLHAALHNIVGNHALQAGSLNEVEFLRFDFTHFAQVTKEELAEIERQVNEVIWQSLKVETVETDIATAKEMGAMALFGEKYGKNVRVVKIGDYSIELCGGTHTQTTSEIGLFKIVKEEGIGSGVRRIIAVTGQKAYEAFKDAENTLNEVATMVKAPQTSQVLAKVTSLQDELKTAQKENDALAGKLAASQSDEIFKNVQTAGSLNFIASEVTVPDANGLRNLADIWKQKELSDVLVLVAKIGEKVSLLVASKSSDVKAGNLVKELAPFVDGRGGGKPDMAMAGGSKAAGIPELLAAVAEKLA >CP015906|1851364:1861223|1857942_1858500_-|ARE08989.1|DBSCAN-SWA MKITIFGDSITNGFGMDEGGSSNIIARLIEKNEPKLKVVLHGINGDDTYGGLLRLKYVLEEEADLNFIFFGANDASPYHLIRPAEFRENLLKMISQLGVERTVLITPPFYNDDEPTHYSKLSEVELFREVILNLGKEKSLKVIDIFQIMKSSENPKNLLRADGLHFTSRAYELLVREILSVIKNP >CP015906|1851364:1861223|1856269_1857166_-|ARE08987.1|DBSCAN-SWA MKKKILVGLITAGALLTLAACGSSNGSSSSSSSSSDKALSGKIIAGGSTALQPLAQQSSTEFMAKNTGVQVTVQGGGSGVGLTQVAAGSFQIGNSDIFAEEKSGIDASAITDHKVAVVGFAPIVNAKIDVKNLTSQQLQDVFTGKVTNWKDVGGSDQKITVIGRTEGSGTRVNFDKFALGGATEVKGPTQDASGSVVQMVGQTPGAISYVALSYVDTSKDIKDISIDGVEPTEANVVTNDYKVWSYEHMYTNTKKETAADKAFIKYVAENNKDIKKLGYIPISDMKVERDADGNITKK |
9 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2038065 : 2124368
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >CP015906|2038065:2124368|DBSCAN-SWA 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MVFEKTVLNKALAVAFDVPIAVTYWDGKTEKYGEGETQVHITFNKKFSFSELSSMPTLVLAEAYMNEEIEIEGSIQELVTSAYRKAGSFLTDQSGFGKSMIKLLGNHSQKQSREDIHSHYDIGNDFYNKWLDPTMTYSCAYFEHEDMTLEEAQIAKVHHILDKLDSKPGGRLLDIGCGWGTLMFKAVQEYGLSAVGVTLSEEQYYYVRKKADDLGLSDKVKVYLVDYRDLKEEPFDYITSVGMFEHVGKENLEMYFQKVSDYLKPNGRALIHGITGQHRGAGVDPFIEKYIFPGGYIPNIAENVEHIMTAGLQMDDLEPLRRHYQKTLEIWNENYLEVFDEVEKEMGRPFARMWTLYLQACAASFEAGNIDVVQYLLTKGASGQGLPMTREYMFKKH |
90 | Lactococcus_phage(86.21%) | terminase,protease,tRNA,transposase,holin,integrase,head,tail | attL 2058145:2058204|attR 2121706:2122772 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
2167709 : 2181920
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >CP015906|2167709:2181920|DBSCAN-SWA 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22 | Lactococcus_phage(90.48%) | transposase,integrase | attL 2167531:2167551|attR 2182021:2182041 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
2340565 : 2376368
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >CP015906|2340565:2376368|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_15 >CP015906|2340565:2376368|2358734_2359238_-|ARE09495.1|DBSCAN-SWA MRLHRCANVGCRELIPLKHNYCQKHYDERLGNYINQRAESKAKASLTLRGQRNQAEQNREYDQTRRKELHNGFYQDKRWSKVSEYVKARDGYVDAIEGKAWDKGDLIADHIIPRRLLSGMEQYNTDNLWLLTKSQHNKKTAIENKLSDQQLKNVGRDWWKKVLKNKK >CP015906|2340565:2376368|2365312_2365465_-|ARE09509.1|DBSCAN-SWA MIKKINVTCEKCKENFIFTTESSVVDKVLDEGHYICFTCEDEKSEDTKND >CP015906|2340565:2376368|2354495_2355083_-|ARE09490.1|head,protease|DBSCAN-SWA MENIEYRYFDSTELETRSPTNTGFIGQIAGYAIKFNTPSTAMAPFIEYIAPTALDNVDISDVLALYNHDYANVLGRVDAGTLKLSIDKVGLRFVLDMPDTTVGHDVYNNIKAGNLKGMSFGFSVADGGDSWQQGADSPIRIINQLQTLSEISVVSRPAYDDTSVQVTRSMDAFLSERTRKYKEKVKIYLGGLNEN >CP015906|2340565:2376368|2351073_2351679_-|ARE09484.1|tail|DBSCAN-SWA MAIVGLKKSYLGLIDKKTGKIITGPEGLTTDGLYISNPKDYGTASANITNIAAAGTQKFGDNGLVDVVSSKSFPQVAAVWNNLPFDIKAKIKGEVSDKKGGYVQSQDLPQVALIIESELIDRSHSIFYAFGNGHMTETALNIQTDNAAQNRVEDALTYQSLAFEAWNNQGMKTFNSADSGFDKTAMLKEVMGGYAASGLGV >CP015906|2340565:2376368|2368581_2369100_-|ARE09515.1|DBSCAN-SWA 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>CP015906|2340565:2376368|2358145_2358538_-|ARE09494.1|terminase|DBSCAN-SWA MSIKEIKKISESPPTYLGGKARYMWQRVVPILNKQLSVNDLDRTLIESLCVNYQIFRDSYDSIKENGTQYFTENGLIKSNTAVADIDRASKNIKAACDSLGMTPKSRSDLLNLADSEDEEEIDWTSKFGG |
51 | Lactococcus_phage(85.11%) | terminase,bacteriocin,protease,capsid,transposase,holin,integrase,head,tail | attL 2358169:2358183|attR 2379050:2379064 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
39784 : 45263
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP016714|39784:45263|DBSCAN-SWA TTCAAATCGTATAACTTTTAGATTTTTTAAGCCATATGATACTTCCATAGATGGAATTTAAAAACATTACTATTTGGAGCATTAACATTGAAAGAGATATAGACGTTCCATTGACCATAAATTGATTATACCAGATGATAATATTAATAATATTAATGATATTCCAAGCTACCCATTGACTACGATAGCCAAATGTCATTAATATTTGCCCCACTATTGCAAGAGGAAATAATGCGGCGTCAAGCCATATTTGAACTCCTCCTAATTTTTTTGAAATAATCACAATCATAAAGTATAGCAATATGGTACCAACAAAATATATAAGAGCTTGAAATGTGGTTAATTTTTTTGACTGAACTTCATGTTTTGTAGTCGCTCTAAGTTCTTTTCCCCAAATATATATTCCCAAAAATTGCATTATCAGATAAAAAGTTTGGCTTGCTATATCCCCTATTAATCGAGTATGAATAGCAATAATAACCCATGCAGTTGTTGTAATACTTCCCCAGAAGTAGTTTGTAATTCGTCCTCTATCTACTAATACTAAATTTATTATAGATGAGATACTTAATATAAGTACCAAAACGGAAGCATCTTTTGTAAAAAGAAAAGAAATCACTTGTGCTATTGTCATTAAAAATAGTAAAAGATATTCCTGGATATGCAATGTAGATAATTCTTCAAAAATTTTTTTTATAGAAAAGGTTTGTTTTATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAATTGATTTTTGTTCATTTAAAATGACCCCTTTGTTTTTGTTACGCCGTAAGAGAAACGCGTAATTAGTGTTAGATAGATAAATATAGTTACTAATATCACAAGTTAAACTATTATATATGATATAAAATAATAGATATAAAGTCAATATTAAGGGTAGACTTAAAAGTACACAAAGAAAATCACTAGTTATTAATACTAATGATTTGACGTTAAGTCAAGTTATTAGAGTCAGAAACGTATAATTTTAATCTATTTTTTTAAGCGATTGATTTCTCAAATTGATTAGGCGTAAGATATCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGCTTCAATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGTTTCTTCAAAGGGTTCTGTTGCAAAGTTTTCCAAAAAATCTATTTTAGTGTAAAATTGAGAAAAAAGACAGAGAGGACAGAGTAATGAATCATTTTAAAGGCAAACAATTCAAAAAAGACGTCATTATTGTCGCTGTTGGTTACTACCTGCGTTACAATCTAAGCTATCGTGAAGTTCAGGAATTGTTATATGATCGTGGAATAAATGTTTGTCATACTACGATTTATCGTTGGGTGCAAGAGTACAGCAAAGTCCTCTATTATCTTTGGGAGAAGAAAAATAGACAATCCTTCTATTCATGGAAAATGGACGAAACCTATATCAAAATTAAGGGACGTTGGCATTATCTTTATCGTGCAATTGATGCGGACGGCTTAACCTTAGATATCTGGTTACGAAAGAAACGGGATACGCAAGCAGCCTATGCTTTCTTAAAACGACTCCATAAACAGTTTGGTGAGCCGAAAGCAATTGTGACCGATAAAGCACCTTCTCTTGGCTCCGCCTTTAGAAAGTTACAGAGTGTGGGTTTATATACTAAGACAGAGCACCGAACTGTGAAGTATCTTAACAATTTAATAGAACAAGACCATCGACCTATTAAACGACGGAATAAATTTTATCAAAGTCTCCGTACAGCCTCTTCCACGATTAAGGGCATGGAGACCCTTCGAGGAATATATAAAAAGAACCGAAGAAATGGAACGCTCTTCGGCTTTTCGGTGTCTACTGAAATCAAGGTATTAATGGGAATACCAGCCTAAGATATTTGGAGTTCAGAAAGGGCGAGTTTGATTTTCAAACTTCGCAACAGAACCTTTTCATAGATAAGCCTCCTATAAACATGGAAAAGTAGTAAAAATAGTTGTTATCCTAGTTGATTAAAAAAATCTCTGATTTCCTCATCTTTTATAAAATAATATATAATTTTCCCCTCTCTTCTAGTGTCCAAGATGTTTTGATTGGCTAGTTTACGAAGATGGTGGGAGGCAGATGCCATACTGAGATTTAGTAAACAGGCTATATCGCAGACACAGAGTTCTTCAACAGCAAGGAGATAAAAGATGATATTTATCTGTTTATTATCGGTAAACTTTGATAAAATGTGAAGTGATTTTTGGACTTTTTCCTTTTCAAGGTAGTTCGTGGCGGTTGTAACATTTTGTTGATTTATAACATTCACTTGGCAGATACTATCTTTTTTCAAAATATTTTCTCCTAGTCTAACACAGTCCATAGCATGTCAAAACTGTTATTTTCAATCAGGATATATATCCCCAATCCTAAATAAACAACGGCAATAAACCATCTGCTATATTTTTCCAAAGTTTCTTCAACAGAAGGGACTTGTGCCAATTTTTGGGCAGAAAAAACCAAGAGACAAATCATGACTAGAAAGGTAAGTAAAGCCACTATCAAATTCGCTAAATTTAAGGTTAGTAAAATATGGGGACAAAGACACCAATATTGTTCAGCACCAACAACTTGCAAAAGTAATCATAGCGACTAGAAAAATCAGGTTTTTATTATCTTTGCTCAAACCTTCTTTGGCAATAGCTTCTCCATCAGAATCTCCTAAAAGCAAAACTTTGAGGCCTAGGAAAATTGGAATCAAACCGAGCAAAACCTAAAATCTCTTTACTAGGAATATAATCTAAGACAAATGCAAAAAACAAACTTAGCAATATTAAGACTAACAGAGCCTAGAAATTGTCCTAAATATATGTTAATGATGTCTTTTCTGCTTTTTCTTTTGGCAAAAAATAACATTAGGATAATAAGTAAGTCTACGGCTGTCCCAGAATACAGGATTATTGAAGTAACAACATTTTGAATCATAAAACACCTCATTCAAATATATTTTTGAATGTATTTTAACATTAAACTTTGTAGATGTCAACTTCAGCTCCACCAAAATATAGATAAAAAAGTTAGTGTACCAAATATTAAAAAGCCCTGCCATCGAAATGATAGCAGGGCTTAACTTCAATATCCAAATGATATATTCATCTAAAAAAGGTAAAGTAAAAGGTAGAGTTCTTATTGATTTATATTGCAATGTAATGAACTTTAAAAATTCAAAAATCGCTTAAAATCAATGTTTTGACGTCTAATGACGTGTAGTGAACCCCTTACTTAACTTCAGTAAAGATAAAGTTTCAGGGTGACAAAGTTATAAAAGAGTCAATATCAATAAGTTTTATTAATCGACTAGGTATTTTTATAGGTGTTGTGGGTGCTATAATAAGGTATTGGTAATCAACTGATGTTGGTATTTGTCGAAAAATTATTGGAATTAAATAGAGAAGGGATCTCTATGAGTGTCAGCTATGGAAACATGCTATTCACCTTTATAAAAAATTTGGTTTTGAGGTAGTAGAGTATAGAAGTGATGATATTTTAATGATTCTGGGTTTGAGTTCAAAATCATTTGGAATGTAGTAAAGAAAATACAATAGAGTTTTTTAATTTATGATTTGTCAAATTAAGTTAGAATAAAATGCTTCTTGTACATAGCTCAAAAATATCTCAATTGGTGTTCTGTAATTCAATGATTTTCTTGGAATATGATTACGTTGATTGCTGACACTGGAAATAAATGTCTGATTCACTTCTCTAAAATCCATTGATTTCGGCAGTCCATTACGACGCAGAATCCCGTTAGAATTCTCGTTTAATGGGCGTTGAGAATGTGTTCCAGGGTCCGCAAAATATATATCAATATCATGTTGGTTACTAATGGCTTTCCAGTTAGAAAATTCTTTTCCACAGTCAAACGTAATAGATTTAAAGAAGTTTTTAGGGAAGCGAGAAAACCATTGATTAAGGGCAGTTTCAATATCTAATGCCTTACGGCCGTTGGGTTTAATCGTGATAATTACTTTAGATAATCTTTCAACTAAAGTAATGACGGCACTTTTATGATGAATGCCAACGATCGTATCACCTTCAAGGTGACCAAACTCAGAATTGAAATCAGGATAATTATCAGGTCTATCATGGATTGAGCGCTGATATTGTTGTTTTCCCCGTTTTTCCTGATGGCCATTGGGTTTTCTTTTACCTTTCATCGGTAGTGTGTCAATATCAAATATTCCTTTAGAAAATAAACGATAAAGTGTTCTCATACCGCATGAAACAGGCCTTTCTTTTCGCCCGATAATGACGTCAGGCGTCCAACCAAGAGTGACTTTCTCTTTAATGTAATCTACTTCATGAGCAGGTAATTGAATGACTTTTCTACCACATTTTTTCTTATTTTCTTTATACTGGTGCCAATAATCAAGAGCAGTCTTGCCTTGCTTGAACTTATTGACTACATTATAAATAGTTTGTATAGCACGTCCCATTCGGTTAGCGATTTCAACCGGTTTATTATGTTGAAGATAATATGATTCTATCATTGTCAGTTCGTCTATGGTAAGATGTTTGTAGGTCATTTATGGTTACACTCCTTTGTTTTCTTTCGTCGGAAATAAAATTTGAGTGTACCATAAATGCCTTTTTATTTTTCTAACTTAATTTTACAATTCGCGTCTTTAAAAAAACGGTAGATAATAATCTTTTTCTTTGCTTTGTAAACGGTTTTATGTTATTACTATAGTATAGATTAATTATTAGAATTAGTCTAATTAAGAACAAGGAGGACTTTCTAATGACATTCGATTATAAAGATCATGGCAAAGAAAAATTTATCGTTAACATTGAGGATTATACCAAAGAAAACGAGAATTACCGTACAACAATTTGGACTGGTGAAAAACTTCAGGTTACATTAATGGCTATTGAACCCGGTGACGATATTGGTTTAGAAGTACACATGGGTATCGATCAATTCCTCCGTATCGAAGAAGGTAAAGGTTTATGCCAAATGGGAGATGCCGAAGATAATCTTACATTTGAACAAGAAGTTTCAGATGATGATGTAATTTTAGTACCTGCTGATACTTGGCATAATGTAACCAATATTGGTGACAAACCTCTGAAAATTTACTCAATTTATGCAGGTCCTGATCATGTCCCTGGTACAGTACATAAAACGCATGAGGAAGCTAAAAATGATCCTAATGAAGACTAATTTTAGTTATATGATTTGTCAAATTAAGTTAGAATAAAATGGGTTCTGTTGCGAAGTTTGAAAATCAAACGAGCCCTCTCTGAACTCAGAATATCTTAGGCTGGTATTCCCATTAATACCTTGATTTCAGTAGACACCGAAAAGCCGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTATATATTCCTCGAATGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGAAGAGGCTGTACGGAGACTTTGATAAAATTTATTCCGTCGTTTAATAGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP016714|39784:45263|42101_42374_-|ARE07101.1|DBSCAN-SWA MQVVGAEQYWCLCPHILLTLNLANLIVALLTFLVMICLLVFSAQKLAQVPSVEETLEKYSRWFIAVVYLGLGIYILIENNSFDMLWTVLD >CP016714|39784:45263|44538_44961_+|ARE07104.1|DBSCAN-SWA MTFDYKDHGKEKFIVNIEDYTKENENYRTTIWTGEKLQVTLMAIEPGDDIGLEVHMGIDQFLRIEEGKGLCQMGDAEDNLTFEQEVSDDDVILVPADTWHNVTNIGDKPLKIYSIYAGPDHVPGTVHKTHEEAKNDPNED >CP016714|39784:45263|39784_40534_-|ARE07098.1|DBSCAN-SWA MNKNQFKIFREAIKQTFSIKKIFEELSTLHIQEYLLLFLMTIAQVISFLFTKDASVLVLILSISSIINLVLVDRGRITNYFWGSITTTAWVIIAIHTRLIGDIASQTFYLIMQFLGIYIWGKELRATTKHEVQSKKLTTFQALIYFVGTILLYFMIVIISKKLGGVQIWLDAALFPLAIVGQILMTFGYRSQWVAWNIINIINIIIWYNQFMVNGTSISLSMLMLQIVMFLNSIYGSIIWLKKSKSYTI >CP016714|39784:45263|40966_41647_+|ARE07099.1|DBSCAN-SWA MNHFKGKQFKKDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQELLYDRGINVCHTTIYRWVQEYSKVLYYLWEKKNRQSFYSWKMDETYIKIKGRWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLHKQFGEPKAIVTDKAPSLGSAFRKLQSVGLYTKTEHRTVKYLNNLIEQDHRPIKRRNKFYQSLRTASSTIKGMETLRGIYKKNRRNGTLFGFSVSTEIKVLMGIPA >CP016714|39784:45263|45056_45263_-|ARE07105.1|DBSCAN-SWA MKYLNNLIEQDHRPIKRRNKFYQSLRTASSTIKGMETIRGIYKKNRRNGTLFGFSVSTEIKVLMGIPA >CP016714|39784:45263|42524_42722_-|ARE07102.1|DBSCAN-SWA MIQNVVTSIILYSGTAVDLLIILMLFFAKRKSRKDIINIYLGQFLGSVSLNIAKFVFCICLRLYS >CP016714|39784:45263|43363_44323_-|ARE07103.1|DBSCAN-SWA MTYKHLTIDELTMIESYYLQHNKPVEIANRMGRAIQTIYNVVNKFKQGKTALDYWHQYKENKKKCGRKVIQLPAHEVDYIKEKVTLGWTPDVIIGRKERPVSCGMRTLYRLFSKGIFDIDTLPMKGKRKPNGHQEKRGKQQYQRSIHDRPDNYPDFNSEFGHLEGDTIVGIHHKSAVITLVERLSKVIITIKPNGRKALDIETALNQWFSRFPKNFFKSITFDCGKEFSNWKAISNQHDIDIYFADPGTHSQRPLNENSNGILRRNGLPKSMDFREVNQTFISSVSNQRNHIPRKSLNYRTPIEIFLSYVQEAFYSNLI >CP016714|39784:45263|41751_42120_-|ARE07100.1|DBSCAN-SWA MDCVRLGENILKKDSICQVNVINQQNVTTATNYLEKEKVQKSLHILSKFTDNKQINIIFYLLAVEELCVCDIACLLNLSMASASHHLRKLANQNILDTRREGKIIYYFIKDEEIRDFFNQLG |
8 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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