Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019593 | Staphylococcus aureus strain GD705 chromosome, complete genome | 11 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,TnsE_C,WYL | 7 | 5 | 10 | 3 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019593_1 | 260724-260923 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019593_1
|
3 spacers
spacers of CP019593_1
>1.1|260755|25|CP019593|CRISPRCasFinder GGCGAAAATACAGCTTACAATAATG >1.2|260811|25|CP019593|CRISPRCasFinder TTGGAACAGCAATTTCTACAGACAA >1.3|260867|26|CP019593|CRISPRCasFinder AGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019593_1
The CRISPR arrays of CP019593_1 >merge|CP019593|1|260724-260923|CRISPRCasFinder GTTATATTGGCGGATCCCCAACACAGAAGCTGGCGAAAATACAGCTTACAATAATGTGCGAGTTGGCAGGCCTCCAACACAGAGAAATTGGAACAGCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTAGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGGCCCCAACACAGAAGCT >CP019593|1|1|260724-260923|CRISPRCasFinder GTTATATTGGCGGATCCCCAACACAGAAGCT GGCGAAAATACAGCTTACAATAATG TGCGAGTTGGCAGGCCTCCAACACAGAGAAA TTGGAACAGCAATTTCTACAGACAA TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCT AGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGT GCAAGTTGGCGGGGGCCCCAACACAGAAGCT
>CP019593.2|ARH71002.1|259221_260658_+|6-phospho-beta-glucosidase MTKLPQSFMWGGALAANQFEGGYDKGGKGLSVIDVMTSGAHGKARQITESIDPNHYYPNHEGIDFYHRYKEDIALFKEMGLKCLRTSIAWTRIFPNGDEDVPNEEGLAFYDRIFDELIAQGIEPVVTLSHFEMPLHLAKHYGGFRNREVVDYFVHFARVVFERYKDKVTYWMTFNEINNQMDTSNPIFLWTNSGVALTENDNPEEVLYQVAHHELLASALAVRLGKEINPKFKIGTMISHVPIYPYSCHPKDMMEAQIANRLRFFFPDVQVRGYYPSYAKKMLARKGYDVGWQEGDDSILQQGTVDYIGFSYYMSTAVKHDVNTTVENNIVNGGLNHSVENPHIATSDWGWAIDPDGLRYTLNVLYDRYQLPLFIVENGFGAVDEVVDGHIHDDYRIEYLKAHITAAIEAVDQDGVDLIGYTPWGIIDIVSFTTGEMKKRYGLIYVDRDNDGHGTMERLKKDSFYWYQQVIASNGDKL >CP019593.2|ARH71001.1|258414_259206_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIABC MSNKYKDQAQDILTAVGGVENIVDVSYDTVRMTIHMHHAIPSTANEVTQIDGVASVDENETQLVIVFNEEVKYVYQQLQLLMDDAKHQEDTNHDAVDTQETEQKAQAKVTTPILVKAPIAGRRILLKEVRDSIFREKMVGEGLAIKAHKEFKVIAPFSGKVSMIVPTKHAVGIQSEDGVDIVIHIGVNTVDLEGKGFKCFVKQNDRVEAGQTLLQFDQQYIQEQGYNSDVIVVISNSSDFNKVELTMNEIITTEDVIFKIFKN >CP019593.2|ARH71000.1|257561_258266_-|GntR-family-transcriptional-regulator MLKYEHIAKQLNAFIHQSNFKPGDKLPSVTQLKERYQVSKSTIIKALGLLEQDGLIYQAQGSGIYVRNIADANRINVFKTNGFSKSLGEHRMTSKVLVFKEIATPPKSVQDELQLNADDTVYYLERLRFVDDDVLCIEYSYYHKEIVKYLNDDIAKGSIFDYLESNMKLRIGFSDIFFNVDQLTSSEASLLQLSTGEPCLRYHQTFYTMTGKPFDSSDIVFHYRHAQFYIPSKK >CP019593.2|ARH70999.1|255044_257336_+|nitric-oxide-reductase-large-subunit MSMQSSYKRLVKVLLTILVIVFSILLVGGWYIFKNEAPRPTKIVDQQGHTLVTKGELISGQAIYEKYGLTDYGSYLGNGSYLGPDYTAEALHHYLIGMRKYYAQDIYHKQLHKLNHVEIAVVKDKVMKEIRINRYSEKEDQLVLTPGQVYGLKYLQDYYKKEFVNNPKQVGLNENMIKQFQNDDYMVAGNKIEHLSQFFFWGAWLSSTDRPGKTFSYTNNWPYDVDAGNTLPSAGILWTAISVTLLIAGLAFIIYIQKRYEFDMKPTYESERELPKIEVDSKITDSQRKVGKYLVVVMLLFLVQILLGELLAHYYVENKFFGIEIQRLFPFNIVKTWHVQLVIFWVATTWLAAGIYIVPKVLGNEPKKQGVLVDILFWALIIVVMGSMIGEWSHILGWIDSHWWLFGHFGWEYIELGKFWQILFIVGMVLWVIILCRGFLPAIRNKVQVNHDKRHLLTLLFVGAIAIPLFYLASLFIMPNSHVTFADYWRWWIVHLWVEGIFEAFAVVLIGFLMVNMKLTTIETTIRALYFQLILLLGTGIVGMGHHYYWQGDHSIWLALGSCFSALEVVPLCLLIWEAYTHYRLYKKSDIAFPYKGTFIFLASTGLWNAIGAGALGFLINTPAVNYFEHGTQWTAAHAHGSMAGVYGMFSIAIALYVFKNITKKEFWTPKVEKWIKISCWALNVGLAGMVFVTLIPVGYIQLKDGLEDGYWHSRLTSFYEQPLVKAIMWGRMPWDIIFTVGVIILVVIFIRGYRHLKPKYRV >CP019593.2|ARH70998.1|254002_254704_+|antiholin-like-protein-LrgB MINHLALNTPYFGILLSVIPFFLATILFEKTNRFFLFAPLFVSMVFGVAFLYLTGIPYKTYKIGGDIIYFFLEPATICFAIPLYKKREVLVKHWHRIIGGIGIGTVVALLIILTFAKLAQFANDVILSMLPQAATTAIALPVSAGIGGIKELTSLAVILNGVIIYALGNKFLKLFRITNPIARGLALGTSGHTLGVAPAKELGPVEESMASIALVLVGVVVVAVVPVFVAIFF >CP019593.2|ARH70997.1|253566_254010_+|antiholin-like-murein-hydrolase-modulator-LrgA MVVKQQKDASKPAHFFHQVIVIALVLFVSKIIESFMPIPMPASVIGLVLLFVLLCTGAVKLGEVEKVGTTLTNNIGLLFVPAGISVVNSLGVISQAPFLIIGLIIVSTILLLICTGYVTQIIMKVTSRSKGDKVTKKIKIEEAQAHD >CP019593.2|ARH70996.1|252713_253454_+|DNA-binding-response-regulator MKALIIDDEPLARNELTYLLNEIGGFEEINEAENVKETLEALLINQYDIIFLDVNLMDENGIELGAKIQKMKEPPAIIFATAHDQYAVQAFELNATDYILKPFGQKRIEQAVNKVRATKAKDDNSASTIANDMSANFDQSLPVEIDDKIHMLKQQNIIGIGTHNGITTIHTTNHKYETTEPLNRYEKRLNPAYFIRIHRSYIINTKHIKEVQQWFNYTYMVILTNGVKMQVGRSFMKDFKASIGLL >CP019593.2|ARH70995.1|250971_252711_+|sensor-histidine-kinase MLLLERVGLIIILAYVLMNIPYFKNLMNRRRTWKARWQLCIIFSLFALMSNLTGIVIDHQHSLSGSVYFRLDDDVSLANTRVLTIGVAGLVGGPFVGLFVGVISGIFRVYMGGADAQVYLISSIFIGIIAGYFGLQAQRRKRYPSIAKSAMIGIVMEMIQMLSILTFSHDKAYAVDLISLIALPMIIVNSVGTAIFMSIIISTLKQEEQMKAVQTHDVLQLMNQTLPYFKEGLNRESAQQIAMIIKNLMKVSAVAITSKNEILSHVGAGSDHHIPTNEILTSLSKDVLKSGKLKEVHTKEEIGCSHPNCPLRAAIVIPLEMHGSIVGTLKMYFTNPNDLTFVERQLAEGLANIFSSQIELGEAETQSKLLKDAEIKSLQAQVSPHFFFNSINTISALVRINSEKARELLLELSYFFRANLQGSKQHTITLDKELSQVRAYLSLEQARYPGRFNININVEDKYRDVLVPPFLIQILVENAIKHAFTNRKQGNDIDVSVIKETATHVRIIVQDNGQGISKDKMHLLGETSVESESGTGSALENLNLRLKGLFGKSAALQFESTSSGTTFWCVLPYERQEEE >CP019593.2|ARH70994.1|250035_250710_+|iron-sulfur-cluster-repair-di-iron-protein-ScdA MINKNDIVADVVTDYPKAADIFRSVGIDFCCGGQVSIEAASLEKKNVDLNELLQRLNEVEQTNTPGSLNPKFLNVSSLIQYIQAAYHEPLREEFKNLTPYVTKLSKVHGPNHPYLVELKETYDTFKNGMLEHMQKEDDVDFPKLIKYEQGEVVDDINTVIDDLVSDHIATGQLLVKMSDLTSSYEPPIEACGTWRLVYQRLKALEVLTHEHVHLENHVLFKKVS >CP019593.2|ARH70993.1|248170_249892_+|glycosyltransferase-family-2-protein MMKFSVIVPTYNSEKYITELLNSLAKQDFPKTEFEVVVVDDCSTDQTLQIVEKYRNKLNLKVSQLETNSGGPGKPRNVALKQAEGEFVLFVDSDDYINKETLKDAAAFIDEHHSDVLLIKMKGVNGRGVPQSMFKETAPEVTLLNSRIIYTLSPTKIYRTALLKDNDIYFPEELKSAEDQLFTMKAYLNANRISVLSDKAYYYATKREGEHMSSAYVSPEDFYEVMRLIAVEILNADLEEAHKDQILAEFLNRHFSFSRTNGFSLKVKVEDQPQWINALGDFIQAVPVRVDALVMSKLRPLLHYARAKDIDNYRTVEESYRQGQYYRFDIVDGKLNIQFNEGEPYFEGIDIAKPKVKMTAFKFDNHKIVTELTLNEFMIGEGQYDVRLKLHSRNKKHTMYVPLSVNANKQYRFNIMLEDIKAYLPKEKIWDVFLEVQIGTEVFEVRVGNQRNKYAYTAETSALIHLNNDFYRLTPYFTKDFNNISLYFTAITLTDSISMKLKGKNKIILTGLDRGYVFEEGMASVVLKDDMVMGMLSQTSENEVQILLSKDIKKRDFKNIVKLNTAHMTYSLK >CP019593.2|ARH71004.1|261233_261995_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSKEAGHTFLAKLGKTRLRPGGKAATDWLIQQGAFSQDKHVLEVACNMCTTSIYLAHTYGCHIQGVDINKKALEKAQENISAAGLESYIQVQQANAVKLPFDDNQFDIVLNEAMLTMLPIAIKEKALREYYRVLKPGGILLTHDIVIVNESHATHVVKSLSAAINVNVSPQTKLGWLDLYHQAGFNHVHYHTGPMSLMTPKGLIYDEGIVGTIKIINNALKKENRPMFCKMFKTMTRLRKDMNYITFVAKKEH >CP019593.2|ARH71005.1|262246_263161_-|ribokinase MTNKVVILGSTNVDQFLTVERYAQPGETLHVEEAQKAFGGGKGANQAIATARMQADTTFITKIGTDGVADFILEDFKAAHIDTSYIIKTTEEKTGQAFITVNAEGQNTIYVYGGANMTMTPEDVINAKDAIINADFVVAQLEIPIPAIISAFEIAKAHGVTTVLNPAPAKALPNELLSLIDIIVPNETEAELLSGIKVTNEQSMKDNANYFLSLGIKTVLITLGKQGTYFATKNQSQHIEAYKVNAIDTTAAGDTFIGAFVSRLNKSQDNLADAIDFGNKASSLTVQKHGAQASIPLLEEVNQV >CP019593.2|ARH71006.1|263188_263593_-|D-ribose-pyranase MKKTAVLNEHISKAIATIGHFDLLTINDAGMPIPNDHRRIDLAVTKNLPRFIDVLATVLEEMEIQKIYLAEEIKEHNPTQLQQIKQLISSEIEIIFIPHEEMKSNLAHPLNKGNIRTGETTPYSNIALESNVTF >CP019593.2|ARH71007.1|263607_264489_-|ribose-transporter-RbsU MSIVALLIGLGPLIGWGFFPTVASKFGGKPVHQIIGATVGTLIFAIILAVVTSSGFPTGTNLLFALLSGAGWGFGQIITFKAFELVGSSRAMPVTTAFQLLGASLWGVFALGNWPGIGHRIIGFTALVVILIGARMTVWSERKEASNAKNLRRAVVLLLIGEFGYWLYSAAPQATSIDGLTAFLPQAMGMVIVAVIYGFMNMKAENPFRNKITWLQIISGFFFAFGALTYLISAQPNMNGLATGFILSQTSVVLATLTGIYFLKQHKTSKEMVITIIGLVLILVAASVTVFIK >CP019593.2|ARH71008.1|264720_265719_-|LacI-family-transcriptional-regulator MKKVSIKDVAREAGVSVTTVSHILNHNDSRFSATTIKNVHAVSECLGYAPNKHAKQLRGSKIQTIGVILPSLTNPFFSALMQSIHDHKPSDVDLCFLTSTATDLYDNIKHLIDRGIDGLIIAQYISSPDALNNYLKKHHVPYVVLDQNDHQGYTDFVRTNEYQGGQLAAQHLIELGHNNMMIVAPYDMMANMSTRVTGFVDTLRANQLPEPQIVHTELSKRGGLTIVDDIMVQSATAIFAINDELAIGILRGLIEHGISIPKDISLIGYDDIDYAAYVSPPLTTVAQPITDIGKTSLTLLLQRLQHLDKSIDMIELPTTLKIRATTGYHLSN >CP019593.2|ARH71010.1|266099_266492_+|hypothetical-protein MQFKLKEEEIISFLELKYPEKEFEYGRLLVGQHKRDDLDVYYFGDTFLMCTIISFKTFEIKETVELSYDAVNRIVLKDGWLFRKMRIETMQKVLKYGTSKLMLTDFQKDNYNKYIQGQKQRVIFENGHFV >CP019593.2|ARH71011.1|266620_267997_-|MFS-transporter MNNTQSSPRSNIIIAIMLSALTYWLFAQSFINIGPLVGQTYQTSPAVLNLSISLTSFATGIFMVAAGDIADKIGQLRMTYMGLIISMFASLLLIISDITALLIIGRILQGLSAAILLPSTVGVLNNQFKGDHLRRAISYLMISTVGGIGLAGVIGGLIATNFGWQTNFIISIVIAFIAILLLKGTPEKVSQHSHRHPFDYKGMSIFAVMIGSFTLLLTQGFEQGWFSTFSFICLSIIIITTLIFIIIERRHEVPFIDFSVLRNRPFIGAFLNNFVLNSGLGVTVVFFIYAQTHLGLSAAQSGLVTLPYAIVAVAMIRLGEKATLRFGGKLMLIIGPLFPVIGITIISMTSLQPSQYIIAVVIGFVICAIGNGLVATPGLTIAIFSMPNEKVGLATGLYKMSGTLGGAFGIALSTTVFSMLQLNYAPSVAATITFIVSIVLMILGSLSAYMIIPKTVKS >CP019593.2|ARH71012.1|268230_269223_+|linear-amide-C-N-hydrolase MCTGFTIQTLNNQVLLGRTMDYDYPLDGSPAVTPRNYRWTSRTGTTGQTQYGFIGTGTDMEGFIYGDGVNEHGVAISTQYFRGYSSYGSIHKADAMNITQNEIVTWILGYTTSIEDMKQQASQIHVVAVYLNDIGEVPPLHYHVSDATGHSVEVSFKEGEVVIKDNPIGVLTNHPDLDWHYSNLRQYINISPYPAPANLLEGVTIEPLGNEAGTFGLPGGFTSTERFVRMAFMKANIAQNNDKEMDLMNAFYLLDAVNIPIGIVRPHDADNHYTMYQTVINLTTRTLYIKYYGSNEIVALKLTDDLINRKDMTIFKPEKHITIRKLNDNQ >CP019593.2|ARH71013.1|269548_270499_+|glycine-glycine-endopeptidase-LytM MKKLTAAAIATMGFATFTMAHQADAAETTNTQQAHTQMSTQSQDVSYGTYYTIDSNGDYHHTPDGNWNQAMFDNKEYSYTFVDAQGHTHYFYNCYPKNANANGSGQTYVNPATAGDNNDYTASQSQQHINQYGYQSNVGPDASYYSHSNNNQAYNSHDGNGKVNYPNGTSNQNGGSASKATASGHAKDASWLTSRKQLQPYGQYHGGGAHYGVDYAMPENSPVYSLTDGTVVQAGWSNYGGGNQVTIKEANSNNYQWYMHNNRLTVSAGDKVKAGDQIAYSGSTGNSTAPHVHFQRMSGGIGNQYAVDPTSYLQSR >CP019593.2|ARH71014.1|270550_271210_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIEINNLSKRYRNKQIFNHLTMSFDSNRLTVLLGDNGAGKSTLLRMIAGIEKANDGTINYFGEKWNQRQIQNHIGYVPQDIALFEHMTVAENIKFFKSLCKNSINDTTINEYLQQLNFNDTSAKVSTLSGGNKRKINILVGLLGQPRILILDEPTVGIDLKSRHDIHQLLNIMKSKCLIILTTHHLDEVEALADDIKLIGQDPFYQHVLEDKQWAYTYY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019593_2 | 614719-614827 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019593_2
|
1 spacers
spacers of CP019593_2
>2.1|614758|31|CP019593|CRISPRCasFinder AGCCTCTAATCACTAGAGTTCAAGAGGCTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019593_2
The CRISPR arrays of CP019593_2 >merge|CP019593|2|614719-614827|CRISPRCasFinder AAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATCACTAGAGTTCAAGAGGCTTTAAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAA >CP019593|2|2|614719-614827|CRISPRCasFinder AAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAA AGCCTCTAATCACTAGAGTTCAAGAGGCTTT AAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAA
>CP019593.2|ARH71320.1|613913_614549_+|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKLLYRHMGPQNWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIRPSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKAELRKELLTLKGIGSETADVLLVYIFERIEFIPDSYTRKIYNKLGYENTKSYDQLKKVITLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >CP019593.2|ARH71319.1|611767_613429_+|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNILLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVAAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIVKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >CP019593.2|ARH73457.1|611387_611771_+|DUF1934-family-protein MLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQATTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >CP019593.2|ARH71318.1|610068_611079_+|alcohol-dehydrogenase-AdhP MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADVIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >CP019593.2|ARH73456.1|609048_609570_+|hypothetical-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKVILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >CP019593.2|ARH71317.1|607725_609021_+|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVSPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGKIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >CP019593.2|ARH71316.1|607209_607686_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >CP019593.2|ARH71315.1|606503_607040_+|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQGLDYQWIDVTQHRFKPIRDVRHIEESITDYEDDYQEILDKVLASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTANKPGDIMKDNYALARATEWNQLLQ >CP019593.2|ARH71314.1|605119_606058_+|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINFLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDDNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVNALEKIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVIENIKAADIVLSKDEIQYIDELFPIED >CP019593.2|ARH71313.1|604223_604850_+|DUF443-domain-containing-protein MLLCESKIINKNPKYRIIKYNDEYLMVDIISTWISLFFPFINWFIPKRYVKISKEDFENLNIVKPAKKNVFWPVAGISALFAVTLRKYTHLLDTQLDKKLVIAICCITFIGILIFYVRLIKKSSLNIYNPKNERSKIILIPTLKNFCFTLFGYILFGGLTMLFLDALLSMSHQNIIVYFTWIAVIMGFFLVNIALIIDKNIYVILKNQ >CP019593.2|ARH73458.1|614938_615766_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKDNDKQSSDDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >CP019593.2|ARH73459.1|615916_616867_+|iron-ABC-transporter-permease MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVIGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >CP019593.2|ARH71321.1|616921_617641_+|HAD-family-hydrolase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKIDNKGENYGSIY >CP019593.2|ARH71322.1|617624_618425_+|alpha/beta-hydrolase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMSGIIGADISVRYPEFTSSLMLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV >CP019593.2|ARH71323.1|618560_619067_+|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLANTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNENGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >CP019593.2|ARH71324.1|619228_619945_+|hypothetical-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFILNFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTLDAMIHNPQSAQTFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >CP019593.2|ARH71325.1|620113_620902_+|alpha/beta-hydrolase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLESHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFLSYYLNFLKSVS >CP019593.2|ARH71326.1|621165_621540_-|transcriptional-regulator MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >CP019593.2|ARH71327.1|622487_623417_-|DMT-family-transporter MLLFYIIGVIVGMFIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIVLNIFINPDVFSLHFFSNQTFNYTWFVGGLLGVGYLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIVGIITMNQINKCNLLLTNQKHLIFWLLLGFTFGFFPPIQTTINSLLASHTHSPAFASLVSFTIGSITLLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF >CP019593.2|ARH71328.1|623609_623834_-|DUF2922-domain-containing-protein MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLPQLNNIVTEQVARDSMNALVDLNILKSNSGAITKVHSAQIIDKTTTVLFEAKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019593_3 | 776805-776893 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019593_3
|
1 spacers
spacers of CP019593_3
>3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder GCTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019593_3
The CRISPR arrays of CP019593_3 >merge|CP019593|3|776805-776893|CRISPRCasFinder TCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTCGCATT >CP019593|3|3|776805-776893|CRISPRCasFinder TCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATT GCTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATT CTCTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTCGCATT
>CP019593.2|ARH71480.1|775468_776404_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIETKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >CP019593.2|ARH71479.1|773962_775402_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMANQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVIENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >CP019593.2|ARH71478.1|773469_773955_+|acetyltransferase MRKFLSKTYHHTNPLWHVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >CP019593.2|ARH71477.1|772622_773462_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPGEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >CP019593.2|ARH71476.1|771684_772617_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >CP019593.2|ARH71475.1|771350_771446_-|hypothetical-protein MAGSQHREIGFSISTDNASWGGTQHKEILFL >CP019593.2|ARH71474.1|771104_771335_-|hypothetical-protein MYEFYSCIPIFKYTIAVANDKEPIHNKSLVILYHFCPAPSFDLCLATLDRSYLNIILFTHLFFLLFITKLIKRSEG >CP019593.2|ARH71473.1|768228_771075_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNINLSEQDQAIANQILKEIISRLAFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKINRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDN >CP019593.2|ARH71472.1|766235_768221_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >CP019593.2|ARH71471.1|765730_765967_+|DUF2198-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >CP019593.2|ARH71481.1|777171_778083_+|RNase-adaptor-protein-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >CP019593.2|ARH71482.1|778079_779075_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >CP019593.2|ARH71483.1|779183_780128_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >CP019593.2|ARH71484.1|780697_781285_+|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >CP019593.2|ARH71485.1|781467_783102_+|NAD-dependent-malic-enzyme MKGIELLNNPFLNKGIAFTNEERKQLGLEGLLPANVRTLEQQAEQCYEQFKAKQTDFEKRLFLMAIFNRNRTLFYKLTSEHLVEFMPIIYDPVIAQSIEQYNENFSRPQDAVFLSVDRQDQIEQELRNVANGRDIRLIVVTDAEGILGIGDWGVDGVDIAIGKLIVYTAAAGINPSQVLPVSLDVGTNNEQLLNDDLYLGNRHKRVDDETYYAFVDKFVSAVRKEYPNALLHWEDFGRGHAKNILDKYEDTLPTFNDDIQGTGIVTLAGVLGALNISKVNYTNQTFLVYGGGTAGMGITNILKDELIKQGVSEEKANQHFYIMDKQGLLFDDMDDLTEAQQVFAKNRNEFSKTVNWKNLKEVIENIKPTVLIGTSTQTGAFTEDAVKEMLKHTERPMIFPLSNPTKLAEATAQDLLKWTNGKALIGTGIPYNDIEYNGVNYSIGQANNALMYPGLGLGLIASKAKKVNQQILSAASHALGGMVNPDEPGAAVLPPVEKIHQCSRAIAKAVAQSVIDQGLNAETIYDIDKAIEAEIWYPEYKSYI >CP019593.2|ARH71486.1|783308_784211_-|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQKIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLISK >CP019593.2|ARH71487.1|784913_785543_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQNQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >CP019593.2|ARH71489.1|786317_787331_+|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >CP019593.2|ARH71490.1|787383_788394_+|aldehyde-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >CP019593.2|ARH71491.1|788532_789723_+|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPDLGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019593_4 | 826269-826349 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019593_4
|
1 spacers
spacers of CP019593_4
>4.1|826294|31|CP019593|CRISPRCasFinder AAGAACCAATACATAATAAAGCATAAGTGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019593_4
The CRISPR arrays of CP019593_4 >merge|CP019593|4|826269-826349|CRISPRCasFinder TCTTTATCATTTCTGTCCCACTCCCAAGAACCAATACATAATAAAGCATAAGTGATTCTTTATCATTTCTCTCCCACTCCC >CP019593|4|4|826269-826349|CRISPRCasFinder TCTTTATCATTTCTGTCCCACTCCC AAGAACCAATACATAATAAAGCATAAGTGAT TCTTTATCATTTCTCTCCCACTCCC
>CP019593.2|AXB22386.1|825842_826037_-|hypothetical-protein MLGPTPTCTVYKISFRNPLCWGPAIIVKRLLQSYFHSINNCLYNIVNLWTLIEITEAYRPSLYI >CP019593.2|ARH71532.1|824862_825684_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGSKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGNVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >CP019593.2|ARH71531.1|824149_824845_+|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >CP019593.2|ARH71530.1|823131_824157_+|methionine-import-ATP-binding-protein-MetN-2 MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >CP019593.2|ARH71529.1|822585_822882_+|thioredoxin MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFQSVTDLLENLK >CP019593.2|ARH71528.1|822206_822593_+|topiosmerase MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKFDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPFLPNINNERLVLVNE >CP019593.2|ARH71527.1|820626_821505_+|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPILPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPISDLSLKDIQAHLKSLNADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQGLKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >CP019593.2|ARH71526.1|820511_820625_+|hypothetical-protein MKENLLGTIIWSIATFYYSRMMKIMNLAILKIKIGGS >CP019593.2|ARH71525.1|820066_820447_+|glycine-cleavage-system-protein-H MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEVSDESQLEALLSAEKYAEMIGE >CP019593.2|ARH71524.1|819552_819909_+|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >CP019593.2|ARH71533.1|826491_826686_+|CsbD-family-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >CP019593.2|ARH71534.1|826919_827771_-|DUF368-domain-containing-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEFVKLNFAGLPILLAVGFGVLSGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >CP019593.2|ARH71535.1|828098_828860_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >CP019593.2|ARH71536.1|828958_830266_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKYFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDENASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >CP019593.2|ARH71537.2|830380_831622_+|cysteine-desulfurase MAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPVQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSTIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF >CP019593.2|ARH71538.1|831611_832076_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MNFNNLDQLYRSVIMDHYKNPRNKGVLDNGSMTVDMNNPTCGDRIRLTFDIEDGIIKDAKFEGEGCSISMASASMMTQAVKGHSLGEAMQMSQEFTKMMLGEDYVITEEMGDIEALQGVSQFPARIKCATLAWKALEKGTVAKEGKAEGTTEEE >CP019593.2|ARH71539.1|832226_833624_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MAKKAPDVGDYKYGFHDDDVSIFRSERGLTENIVREISNMKNEPEWMLDFRLKSLKLFYKMPMPQWGGDLSELNFDDITYYVKPSEQAERSWDEVPEEIKRTFDKLGIPEAEQKYLAGVSAQYESEVVYHNMEKELEEKGIIFKDTDSALQENEELFKKYFASVVPAADNKFAALNSAVWSGGSFIYVPKNIKLDTPLQAYFRINSENMGQFERTLIIADEGASVHYVEGCTAPVYTTSSLHSAVVEIIVHKDAHVRYTTIQNWANNVYNLVTKRTFVYENGNMEWVDGNLGSKLTMKYPNCVLLGEGAKGSTLSIAFAGKGQVQDAGAKMIHKAPNTSSTIVSKSISKNGGKVIYRGIVHFGRKAKGARSNIECDTLILDNESTSDTIPYNEVFNDQISLEHEAKVSKVSEEQLFYLMSRGISEEEATEMIVMGFIEPFTKELPMEYAVEMNRLIKFEMEGSIG >CP019593.2|ARH71540.1|833955_834270_-|hypothetical-protein MYFVLAIFTIISASVSLGYSIQACASSHNINAYYALSRSLPLFLLAIFSLVIHSAIFLITISIAMILVQFLDAIVGYKSNDVFKTYGPLATSVVNLILLIVFLF >CP019593.2|ARH71541.1|834638_835679_+|DUF21-domain-containing-protein MIIAIIILIFISFFFSGSETALTAANKTKFKTEADKGDKKAKGIVKLLEKPSEFITTILIGNNVANILLPTLVTIMALRWGISVGIASAVLTVVIILISEVIPKSVAATFPDKITRLVYPIINICVIVFRPITLLLNKLTDSINRCLSKGQPQEHQFSKEEFKTMLAIAGHEGALNEIETSRLEGVINFENLKVKDVDTTPRINVTAFASNATYEEVYETVMNKPYTRYPVYEGDIDNIIGVFHSKYLLAWSNKKEDQITNYSAKPLFVNEHNKAEWVLRKMTISRKHLAIVLDEFGGTEAIVSHEDLIEELLGMEIEDEMDKKEKEKLSQQQIQFQQRKNRNVSI >CP019593.2|ARH71542.1|835692_836760_+|nitronate-monooxygenase MWNKNRLTQMLSIEFPIIQAGMAGSTTPKLVASVSNSGGLGTIGAGYFNTQQLEDEIDYVRQLTSNSFGVNVFVPSQQSYTSNQIENMNAWLKPYRRALHLEEPVVKITEEQQFKCHIDTIIKKQVPVCCFTFGIPNESIIKRLKEANIKLIGTATSVDEAIANEKAGMDAIVAQGSEAGGHRGSFLKPKNQLPMVGTISLVPQIVDVVSIPVIAAGGIMDGRGVLASIVLGAEGVQMGTAFLTSQDSNASELLRDAIINSKETDTVITKAFSGKLARGINNRFIEEMSQYEGDIPDYPIQNELTSSIRKAAANIGDKELTHMWSGQSPRLATTHPANTIMSNIINQINQIMQYK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019593_5 | 1738810-1738943 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019593_5
|
2 spacers
spacers of CP019593_5
>5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAA >5.2|1738899|29|CP019593|PILER-CR AGGTGACGTAATGTCAGCTTACTTTAATG >5.3|1738883|29|CP019593|CRISPRCasFinder AGGTGACGTAATGTCAGCTTACTTTAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019593_5
The CRISPR arrays of CP019593_5 >merge|CP019593|5|1738810-1738943|PILER-CR,CRISPRCasFinder GGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGAAGGTGACGTAATGTCAGCTTACTTTAATGTGCAAGTTGGGCTGGGGCCCCAACATAGAGAA >CP019593|5|1|1738810-1738943|PILER-CR GGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGAAAAGAAA TTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGT GGGGCCCCAACATAGAAGGTGACGTAATGTCA GCTTACTTTAATGTGCAAGTTGGGCTGGG GCCCCAACATAGAGAA >CP019593|5|5|1738854-1738940|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGA AGGTGACGTAATGTCAGCTTACTTTAATG TGCAAGTTGGGCTGGGGCCCCAACATAGA
>CP019593.2|ARH72422.1|1737720_1738662_-|bifunctional-oligoribonuclease/PAP-phosphatase-NrnA MISTMNEIMKCIEDNDTIIIHRHVRPDPDAYGSQLGLKYYIQQKFPQKQVFAVGEAESSLSFIGELDNIDDKTYQDALVIVCDTANAPRIDDERYSTGRKLIKIDHHPAVDQYGDINLVNTNASSTSEIIYDLISHFNDEAIVNKDIASVLYLGIVGDTGRFLFNNTSEHTMEIAGKLIGHDIDHNALLNKMMEKDPKMLPFQGYVLQHFELMDDGFCQVKITEDVLKQFGIQPNEASQFVNTIADIKGLKIWVFAVDEGSEIRCRLRSKGQLIINDIAQDFGGGGHPNASGVSVNSWDEFEQLAKALRTKLN >CP019593.2|ARH72421.1|1734502_1737700_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MVAYLNIHTAYDLLNSSLKIEDAVRLAVSENVDALAITDTNVLYGFPKFYDTCIANNIKPIFGMTIYVTNGLNTVETVVLAKDNNGLKDLYQLSSEIKMNALEHVSFELLKRFSNNMIIIFKNVADEHRDIVQVFDSHEDTYLDHRSVLVQGIKHVWIQDVCYQTRHDADTISALAAIRDNTKLDLIHDQEDFGAHFLTENEIQQLDVNPEYFTQADRIAQKCDAELKYHQSLLPQYQAPNDESAKKYLWRVLVTQLKKLELNYDVYLERLKYEYKVITNMGFEDYFLIVSDLIHYAKTNDVMVGPGRGSSAGSLVSYLLGITTIDPIKFNLLFERFLNPERVTMPDIDIDFEDTRREKVIQYVQEKYGELHVSGIVTFGHLLARAVARDVGRIMGFDEVTLNEISSLIPHKLGITLDEAYQIDDFKKFVHRNHRHERWFSICKKLEGLPRHTSTHAAGIIINDHPLYEYAPLTKGDTGLLTQWTMTEAERIGLLKIDFLGLRNLSIIHQILTQVKKDLGINIDIEKIPFDDQKVFELLSQGDTTGIFQLESDGVRSVLKKLKPEHFEDIVAVTSLYRPGPMEEIPTYITRRHDPSKVQYLHPHLEPILKNTYGVIIYQEQIMQIASTFANFSYGEADILRRAMSKKNRAVLESERQHFIEGAKQNGYHEDISKQIFDLILKFADYGFPRAHAVSYSKIAYIMSFLKVHYPNYFYANILSNVIGSEKKTAQMIEEAKKQGITILPPNINESHWFYKPSQEGIYLSIGTIKGVGYQSVKVIVEERYQNGKFKDFFDFARRIPKRVKTRKLLEALILVGAFDAFGKTRSTLLQAIDQVLDGDLNIEQDGFLFDILTPKQMYEDKEELPDALISQYEKEYLGFYVSQHPVDKKFVAKQYLTIFKLSNAQNNKPILVQFDKVKQIRTKNGQNMAFVTLNDGIETLDGVIFPNQFKKYEELLSHNDLFIVSGKFDLRKQQRQLIINEIQTLATFEEQKLAFAKQIIIRNKSQIDMFEEMIKATKENANDVVLSFYDETIKQMTTLGYINQKDSMFNNFIQSFNPSDIRLI >CP019593.2|ARH72420.1|1732824_1734054_-|NAD-dependent-malic-enzyme MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTMAGLVNALRVVNKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADVFIGVSVANALSQDMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVDPQDVYDKTMKLTDLQ >CP019593.2|ARH72419.1|1731772_1732630_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyl-transferase-subunit-beta MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYLEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK >CP019593.2|ARH72418.1|1730828_1731773_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyl-transferase-subunit-alpha MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVEQLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYIE >CP019593.2|ARH72417.1|1729591_1730560_-|ATP-dependent-6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTAQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI >CP019593.2|ARH72416.1|1727812_1729570_-|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMIEKLINAGMNVARLNFSHGSHEEHKGRIDTIRKVAKRLDKIVAILLDTKGPEIRTHNMKDGIIELERGNEVIVSMNEVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLIELQVKDIDHAKKEVKCDILNSGELKNKKGVNLPGVRVSLPGITEKDAEDIRFGIKENVDFIAASFVRRPSDVLEIREILEEQKANISVFPKIENQEGIDNIEEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPEKVPMVQKDLIRQCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSLVNAIGISVAHTALNLNVKAIVAATESGSTARTISKYRPHSDIIAVTPSEETARQCSIVWGVQPVVKKGRKSTDALLNNAVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGETGTTNMMKIHLVGDEIANGQGIGRGSVVGTTLVAETVKDLEGKDLSDKVIVTNSIDETFVPYVEKALGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTVVGVEKAVKNISNNMLVTIDAAQGKIFEGYANVL >CP019593.2|ARH72415.1|1726107_1727469_+|amino-acid-permease MAEKLQRELSNRHIQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIALTGPSILLTYIIIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNTYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPEIPNWISALFCVLLLMSFNLLSARLFGELEFWFSIIKIATIIGLIVVGFVMILFAYKTQFGHASFTNLYEHGVFPKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPVKTIPKAINSVPIRILIFYVGALAVIMSIIPWQQVDPDNSPFVKLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLSSQQQAPPNFSKTNKYGVPHVAIFASSALLLVAALLNYIFPDATKVFTYVTTISTVLFLVVWGLIIIAYINYSRKNPDLHKKATYKLFGGKYMGYLIFVFFIFVFGLLFINVETRRAIYFIPIWFILLGFMYLRYKRIAAKSNN >CP019593.2|ARH72414.1|1724638_1725760_-|citrate-synthase MAELQRGLEGVIAAETKISSIIESQLTYAGYDIDDLAENAQFEEVIFLLWNYRLPNEEELAHLKGKLNQYMTLNPRVYTHFEEYVTDHVHPMTALRTSLSYIAHFDPDAENESDENRYERAMRIQAKVASLVTAFARVRQDKEPLKPNPDLSYAANFLYMLRGELPTDIEVEAFNKALILHADHELNASAFTARCAVSSLSDMYSGIVAAVGSLKGPLHGGANEQVMTMLSEIGSIENVDAYLDEKFANKDKVMGFGHRVYKDGDPRAKYLREMSRQITKDAGREELFEMSVKMEKRMAEEKGLIPNVDFYSASVYHCMEIPHDLFTPIFAVSRSAGWIAHILEQYKDNRIMRPRAKYIGETNRKYIPLEERK >CP019593.2|ARH72413.1|1723321_1724590_-|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase MTAEKITQGTEGLNVPNEPIIPFIIGDGIGPDIWKAASRVIDAAVEKAYNGEKRIEWKEVLAGQKAFDTTGEWLPQETLDTIKEYLIAVKGPLTTPIGGGIRSLNVALRQELDLFTCLRPVRWFKGVPSPVKRPQDVDMVIFRENTEDIYAGIEFKEGTTEVEKVIDFLQNEMGATNIRFPETSGIGIKPVSKEGTERLVRAAIQYAIDNNRKSVTLVHKGNIMKFTEGSFKQWGYDLALTEFGDQVFTWQQYDEIVEKEGRDAANVAQEKAEKEGKIIIKDSIADIFLQQILTRPAEHDVVATMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYETGHAIFEATHGTAPKYAGLNKVNPSSVILSSVLMLEHLGWQEAADKITDSIEDTIASKVVTYDFARLMDGAEEVSTSAFADELIKNLK >CP019593.2|ARH72423.1|1739031_1740330_-|CBS-domain-containing-protein MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVIDFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANQTGHTRFPVVNESYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV >CP019593.2|ARH72424.1|1740534_1740948_+|universal-stress-protein MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >CP019593.2|ARH72425.1|1741453_1742143_-|metal-dependent-hydrolase MKLSFHGQSTIYLEGNNKKVIVDPFISNNPKCDLNIETVQVDYIVLTHGHFDHFGDVVELAKKTGATVIGSAEMADYLSSYHGVENVHGMNIGGKANFDFGSVKFVQAFHSSSFTHENGIPVYLGMPMGIVFEVEGKTIYHTGDTGLFSDMSLIAKRHPVDVCFVPIGDNFTMGIDDASYAINEFIKPKISVPIHYDTFPLIEQDPQQFKDAVNVGDVQILKPGESVQF >CP019593.2|ARH72426.1|1742317_1743373_+|aminopeptidase-P-family-protein MTKISKIIDELNNQQADAAWITTPLNVYYFTGYRSEPHERLFALLIKKDGKQVLFCPKMEVEEVKASPFTGEIVGYLDTENPFSLYPQTINKLLIESEHLTVARQKQLISGFNVNSFGDVDLTIKQLRNIKSEDEINKIRKAAELADKCIEIGVSYLKEGVTEREVVNHIEQTIKQYGVNEMSFDTMVLFGDHAASPHGTPGDRRLKSNEYVLFDLGVIYEHYCSDMTRTIKFGEPSQEAQEIYNIVLEAETSAIQAIKPGIPLKDIDHIARNIISEKGYGEYFPHRLGHGLGLQEHEYQDVSSTNSNLLEAGMVITIEPGIYVPGVAGVRIEDDILVTNEGYEVLTHYEK >CP019593.2|ARH72427.1|1743688_1744807_-|alanine-dehydrogenase MKIGIPREIKNNENRVGLSPSGVHALVESGHTVLVETNAGSGSFFEDVDYKEAGAEIVAEQAKVWDVDMVIKVKEPLESEYPYFKEGLVLFTYLHLANEEKLTQALIDRKVISIAYETVQLPDRSLPLLSPMSEVAGRMSAQVGAEFLQKLNGGMGILLGGVPGVPKGKVTIIGGGQAGTNAAKIALGLGADVTILDVNPKRLQQLDDLFGGRVHTIMSNPLNIELYVKQSDLVIGAVLIPGAKAPRLVTEDMIKQMKNGSVIIDIAIDQGGIFETTDKITTHDNPTYIKHGVVHYAVANMPGAVPRTSTLALNNATLPYALMLANKGYREAFKSNQPLSLGLNTYKGHVTNKGVAEAFEMEYKSVEEALQL >CP019593.2|ARH72428.1|1744947_1745448_+|universal-stress-protein-UspA MITYKNILIAVDGSHEAEWAFNRAVGVAKRNDAKLTIVNVIDSRTYSSYEVYDAQFTEKSKHFAEELLNGYKEVATNAGVKDVETRLEFGSPKSIIPKKLAHEINADLIMSGTSGLNAVERFIVGSVSESIVRHAPCDVLVVRTEELPADFQPQVATTQLREKYQN >CP019593.2|ARH72429.1|1745694_1746897_-|acetate-kinase 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CP019593_6 | 1741274-1741356 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019593_6
|
1 spacers
spacers of CP019593_6
>6.1|1741299|33|CP019593|CRISPRCasFinder TATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019593_6
The CRISPR arrays of CP019593_6 >merge|CP019593|6|1741274-1741356|CRISPRCasFinder GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTACTATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC >CP019593|6|6|1741274-1741356|CRISPRCasFinder GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC TATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACA GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC
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>CP019593.2|ARH72499.1|1828700_1829321_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MFSRNNNIFVDDLSVTKDNYLIAVLKMLVIFLVINYGTDVSYDHEYVGLFIILLGVVLLKILNINLLSFKKLKFTHMLYIIFGFLLMYGLDYLYDTFAPPTLNEILIDEESEDAPYHIALLSTAIIPPITEEIICRGLIIRILFRNHLFLGFIVSTVFFTLIHESDTLIGYLPYFYSGLIFGYTYLKTKRLEVPILIHFINNLLAM >CP019593.2|ARH72498.1|1827898_1828534_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MQKFKDLFYDDLSVARGNYFLTLLSAFLITIILLIGFVVSDTHILYGVFIVLIGIVLLRLFKINLLSFKKLTMSQVIYIIGGALLIYGLDYLYLHFHDVPTNEQELDRELQHMPLYMSIVTIAIIPAIVEEIVFRGMIIRVVFRKHLFIGLVVSSLVFASLHESDTWIGYLPYLYSGVIFGLIYLKTKRLEVVILIHFINNLSSLLILLWG >CP019593.2|ARH72497.1|1827157_1827601_-|hypothetical-protein MNKASFDKKVKKQLWFLNKKEKQALDQRLSSITDKDNVNFNKPITFANTYLRENVFRSKETKSYSIFVTLVVMMFAYVALLGLFLFGLITSLSGVQFFVNPKVDLSTTVVILTIIGAILLMLVSIYLIKITTSYFTKKLLEHKFNGH >CP019593.2|ARH72496.1|1826727_1827171_+|competence-protein-ComK MQDNSTKYLLYIQTATSNHLETNCVFLHCDYILKVPINKLVSYYAKLHLSSQSVLIETAKNILNINKLVPIYINAKTILFPLKHKRAPIQIYINAHYIVGMTAIENSTLIHFQEGIQLEVDEPFSLVSKKCHESLALKHFIENTNDH >CP019593.2|ARH72495.1|1826144_1826615_+|RNA-polymerase-sigma-factor MKFNDVYNKHHKIIHHLLKKYNISYNYDEYYQLLLIKMWQLSQIYKPSSNQSLSSFLFMRLNFYLIDLFRQQKRLNDIILCENHSPILTEQPTYFNEYDLRLQDVCALLKHRERQWLMLYLEGYKQYEIADIMSLSTSTIKLIKASVKRKCQRFLN >CP019593.2|ARH72494.1|1825721_1825946_-|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK >CP019593.2|ARH72493.1|1824591_1825446_-|autolysin MNKHKKGSIFGIIGLVVIFAVVSFLFFSMISDQIFFKHVKSDIKIEKLNVTLNDAAKKQINNYTSQQVSNKKNDAWRDASATEIKSAMDSGTFIDNEKQKYQFLDLSKYQGIDKNRIKRMLVDRPTLLKHTDDFLKAAKDKHVNEVYLISHALLETGAVKSELANGVEIDGKKYYNFYGVGALDKDPIKTGAEYAKKHGWDTPEKAISGGADFIHKHFLSSTDQNTLYSMRWNPKNPGEHQYATDIKWAESNATIIADFYKNMKTEGKYFKYFVYKDDSKHLKK >CP019593.2|ARH72492.1|1823212_1824505_+|arsenical-efflux-pump-membrane-protein-ArsB MMTTLATFIFLVTLLFVLWQPKGLDIGFTALAGAFIAVITGVVSFSDVFEVTGIVWNATLTFVSVILISLILDKIGFFEWSAIHMLHASKGSGLKMFVYIILLGAVVAAFFANDGAALILTPIVLAMVKNIGFSKRAIFPFIIASGFIADTTSLPLIVSNLVNIISADYFNISFSQYLSRMIIPNLFSLLASLLVLWLYFRKAIPKSFDANHIKKPIDAINDLKLFKISWIVLVILLFGYLISEFTKIPVSIFTGIIAFIFLILARKSNAVNIKQVIKGAPWNIVLFSIGMYIVIFGLRNAGITLILAKILEYISNYGLFSTILGMGFISAFLSSIMNNMPTVLIDAIAIGQSNVHGMLKEGLIYANVIGSDLGPKITPIGSLATLLWLHVLTQKDVKISWGTYFKTGIIITIPVLFFTLIGLYLTLILF >CP019593.2|ARH72491.1|1822898_1823213_+|ArsR-family-transcriptional-regulator MTYKELATYLKVLSDSSRLEILDLLSCGELCACDLLEHFQFSQPTLSYHMKALVKTNLVTTRKIGNKHLYQLNHNIFESVINNLSKVHTSNQRCICHNLKTGEC >CP019593.2|ARH72490.1|1820753_1822256_-|pyridine-nucleotide-disulfide-oxidoreductase MRVAIIGMGTAGVSVLRELVKHPKFNQLDIDLYDDKVNMGQGVPFQNDSSELLINMPSKKMSLNLDDETEFWKWYKQQTDFNFDEPAYLPRFVFGHYMKSYLSMFTKKYPNISTNYNKVQEIYTNSNIDETNLTYYICTTNSEQSWQAYDYVFLTCGTFAYHDPYNLKGKKGYIATPYPTYNTLDEVNELDDIAIIGTGLASLDVVRYVAAHHPKLPITMTSRSANLPSVRGTMIDVTFKYLTKDKLNDIKKHHFGNAPLDTLVSLFLKECAEYDIDFEKLVHRRTGNHIADLKYDLARPTEMGIFQSIIEHLKENLNWIWNSLSIEDQHQFNQKYSKMIQLNSNPMPPRTAELIIELIENKSLILKKDLEDVKHDGKLYYFSYKNQESVDIYKVVINATGAKSHLNELDQDDQLIKNLENRQIVQAHPMGGIQIIPETNQVISPRFGTLTNMIAIGQMTNGVNKLRNGVKMIVEQVAHTVSQLYDALESNEQEQRSDNQ >CP019593.2|ARH72500.1|1829883_1830597_-|transaldolase MAKLNVEVFADGADIEEMKAAYKNKQVDGFTTNPSLMAKAGVTDYKAFAEEAVKEIPDASISFEVFADDLETMEKEAAILKQYGENVFVKIPIVNTKGESTIPLIKKLSADNVRLNVTAVYTIEQVKEITEAVTEGVPTYVSVFAGRIADTGVDPLPLMKEAVKVTHSKDGVKLLWASCRELFNVIQADEIGADIITCPADVVKKVNTNLGRDINELSVDTVKGFAKDIQSSGLSIL >CP019593.2|ARH72501.1|1830855_1831158_+|hypothetical-protein MSRSKKYFYLSSLMIILSFFFNTNNVFLSGLFNSFIKLILFCSVINSIILILSIIFADRSIKSLKPDADWIRIASKSLPWIILIVILVHIFSIVHTFGFI >CP019593.2|ARH72502.1|1831412_1831778_+|fluoride-efflux-transporter-CrcB MQYVYIFIGGALGALLRYLISFLNTDGGFPIGTLIANLTGAFVMGLLTALTIEFFSNHPTLKKAITTGFLGALTTFSTFQLELIHMFDYQQFITLLLYAVTSYVFGILLCYVGIKLGGGLS >CP019593.2|ARH72503.1|1831774_1832128_+|CrcB-family-protein MISIILVMIGGGLGAIARSAVTDYFNHIFTSKLPIATLIVNLVGSFLIGLTIGLSISISWFPAFFVTGFLGGLTTFSTLAKELTLMMTPKFDIKLFLNYSLLQFIIGFIACYIGYHI >CP019593.2|ARH72504.1|1832377_1833211_-|aldo/keto-reductase MEVKTFYNGNTMPQIGLGTFRVENDENCMESVKYAIEQGYRSIDTAKVYGNEEQVGAGIRAGLESTGIAREDLFITSKLYFEDFGRENVAAAYEASLSRLGLKYLDLYLVHWPGTNEAIMVDTWKGMEDLYKNNKVKNIGVSNFEPEHLEALLAQVSIKPVINQVEYHPYLTQHKLKLYLAAQHIVMESWSPLMNAQILNDETIKDIAQELGKSPAQVVLRWNVQHGVVTIPKSVTPNRISENFRIFDFELSDEQMTRIDDLNQDKRIGPDPKTFEG >CP019593.2|ARH72505.1|1833422_1834331_-|NERD-domain-containing-protein MDLSSPVVIGLIIAVVIALIFFVLFLVALGSKKKVKRQTEEKYEQQEQNIKKSHEEALEKERIQNKKTITKQQEDYNHMISTKDREIDALKLFSKNHSEYVTDMRLIGIRERLVKEKRIRPEDMHIMANIFLPKDGFNNIERISHLVLTRTGLYIIDSQLLKGHVYNGISGGQFKDLPPMEQVFDTLDLDKSRPQTIVMDQNDDKRSLSFVNYSDQIEAIKQLAEDLQKHLGAKYTPTSILYFNPKNEGDVTISNYNQNSAVKVLVGAEQLDEFFNKFVFHGRIQYNVEDLQQMMDKIESFN >CP019593.2|ARH72506.1|1834455_1835649_-|S-adenosylmethionine-synthase MLNNKRLFTSESVTEGHPDKIADQVSDAILDAILKDDPNARVACETTVTTGMALIAGEISTTTYVDIPKVVRETIKEIGYTRAKYGYDYETMAILTAIDEQSPDIAQGVDKALEYRDKDSEEEIEATGAGDQGLMFGYATNETETYMPLAIYLSHQLAKRLSDVRKDGTLNYLRPDGKVQVTVEYDENDNPVRIDTIVVSTQHAEDVTLEQIQEDIKAHVIYPTVPENLINEQTKFYINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGYARHGGGCFSGKDPTKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLADQCEVQLAYAIGVAEPVSIAIDTFGTGKVSEGQLVEAVRKHFDLRPAGIIKMLDLKQPIYKQTAAYGHFGRTDVLFPWEKLDKVEELKDAVK >CP019593.2|ARH72507.1|1836020_1837613_+|phosphoenolpyruvate-carboxykinase-(ATP) MSVDTYTETTKIDKLLKKPTSHFQLSTTQLYNKILDNNEGVLTELGAVNASTGKYTGRSPKDKFFVSEPSYRDNIDWGEINQPIDEETFLKLYHKVLDYLDKKDELYVFKGYAGSDKDTMLKLTVINELAWHNLFAKNMFIRPESKEEATKIKPNFTIVSAPHFKADPEVDGTKSETFVIISFKHKVILIGGTEYAGEMKKGIFSVMNYLLPMQDIMSMHCSANVGEKGDVALFFGLSGTGKTTLSADPHRKLIGDDEHGWNKNGVFNIEGGCYAKAINLSKEKEPQIFDAIKYGAILENTVVSEDGSVDFEDNRYTENTRAAYPINHIDNIVVPSKAAHPNTIIFLTADAFGVIPPISKLNKDQAMYHFLSGFTSKLAGTERGVTEPEPSFSTCFGAPFFPLHPTVYADLLGELIDLHDVDVYLVNTGWTGGKYGVGRRISLHYTRQMVNQAISGKLKNAKYTKDSTFGLSIPVEIEDVPKTILNPINAWSDKEKYKAQAEDLIQRFEKNFEKFGEKVEHIAEKGSFNK >CP019593.2|ARH73503.1|1837909_1838656_-|S9-family-peptidase MPIESFTHQFEEITYLSDDLQVKALMMTPHHEVKRIVVYLRGGKGQVGRVRAGRLMQFSDSQTLVIGPYYRGNNGSEGKDEFYRGDLNDVTQLLRLLHDKYPQAFIHMVGFSRGGLQGLLTFQDLPVSSYIIWGGVSDIDLMYEERVDLRGMLRRMIGHPKKDRAAYEARQAIPNINENSPPILIVHGGKDQQVGIHHAYYLADQLELKGAAHETFYQMAEGHVPRPPAMVETLTYIKEFMNQVELHR >CP019593.2|ARH72508.1|1838660_1839134_-|nucleoside-triphosphatase-YtkD MKFRDKDNRQVNLTFKKDNEIADGNHVLAIPTFKNQLLFTKHNLRGIEFPGGKRERGESSAEAVTRELYEETGAKVKNIHYIAQYTIETHDQTDFVKDVYFIEVESLVSKNDYLETAGPVLFNCINDIELAQRSFLLQDSTILKCVERVQSLGFYQT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019593_8 | 1893076-1893203 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019593_8
|
1 spacers
spacers of CP019593_8
>8.1|1893114|52|CP019593|CRISPRCasFinder ATTCCAGGAAGGAATGTATTCTAAGAGTTGAAATACTCCCGCATTATTATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019593_8
The CRISPR arrays of CP019593_8 >merge|CP019593|8|1893076-1893203|CRISPRCasFinder AATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTACACCTATACCTCATTCCAGGAAGGAATGTATTCTAAGAGTTGAAATACTCCCGCATTATTATTAAATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTGCACCTATACCTC >CP019593|8|8|1893076-1893203|CRISPRCasFinder AATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTACACCTATACCTC ATTCCAGGAAGGAATGTATTCTAAGAGTTGAAATACTCCCGCATTATTATTA AATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTGCACCTATACCTC
>CP019593.2|ARH72561.1|1891351_1892413_-|PTS-transporter-subunit-IIC MSNAKNADNKQFFSKILNSIGAGVVIALVPNALLGEVLKIFKSGNEILELTYQLVILIQSFMAFIIGVLAAHQFKFNGAGAAIVGTSAMIGSGAVVYSNNSFMLKGIGDIINTSLVVIIACLIYMVLQNKLGSFELIILPVLVPIVSGGIGLITLPYIRKITQAIGNVIHSFTDLNPLLMSILISVAFSLLMVTPISLVAIATAISLNGLGSGAANLGIVAACVTFLFGSLRVNSIGVNAVLLIGAAKMMIPVYLKNLIISIPLTINGIITGIIAYVLQVKGTPLSAGFGYTGLVGPINAFNRMSGDPTMNIILLALGYFVIPFVSAFIVHELCKKFIPIYSNDIYKFEVPKQ >CP019593.2|ARH72560.1|1889637_1891095_-|ABC-transporter-permease-subunit MKCLIRFILVLGLLISSAMVYINPTAHAEQDQTWEKIKERGELRVGLSADYAPMEFEHTVNGKTEYAGVDIDLAKKIAKDNNLKLKIVNMSFDSLLGALKTGKIDIIISGMTSTPERKKQVDFSDSYMMTKNIMLVKKDKVNEYKDIKDFNNKKVGAQKGTEQEKIAQTEIENASITSLSRLPDVILALKSGKVEGAVVEKPVAEAYLKQNPKLGISNVKFNEEEKDTVIAVPKDSPKLLSQINKTIKEVKDKGLIDKYMTNAANAMNDDSGFISKYGSFFLKGIKITILISLIGVALGSILGAFVALMKLSKIKIISWIASIYIEILRGTPMLVQVFIVFFGITAALGLDISALVCGTIALVINSSAYIAEIIRAGINAVDKGQMEAARSLGLNYRQTMKSVIMPQAIKNILPALGNEFVTLIKESSIVSTIGVGEIMFNAQVVQGISFDPFTPLLVAAALYFVLTFVLTRIMNMIEGRLNASD >CP019593.2|ARH72559.1|1888922_1889651_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MPVIKINNLNKVFGDNEVLKDINLEINQGEVVAIIGPSGSGKSTLLRCMNLLEVPTKGQVIFEGNDLTEKRTQVDKLRQKMGMVFQNFNLFPHKKVVDNIILAPKLLKKDNNDELHKEALSLLDKVGLKEKADVYPNQLSGGQKQRVAIARALAMHPDVILFDEPTSALDPEVVGDVLKVMKDLAKEGMTMVVVTHEMGFAKDVSDKVIFMADGVVVESGTPVEIFEQPQHERTQNFLARVL >CP019593.2|ARH72558.1|1887644_1888787_-|epoxyqueuosine-reductase MGGIRLDTKQLKQDIIDYAYTIGIDSIGFTTADPFDELKQKLEAYHANGYASGFEESDIALRTEPKLSLPTARSIIAIAVGYPNKLKGAPKSVRGDRRGLFARASWGQDYHTIMRKRLDMLAAFIESKVPDVEIKSMVDTGVLSDRAVAERAGLGFVGRNGFVINPKLGTWTYLGEMLVSIPFEPDDPLLDSCGDCTICVDRCPTSALVGNGQLNSQKCISFLTQTKGYMPDQYRYKIGNRLYGCDTCQQVCPKNRGINTEQDDIILEPEILKPRLVPLLRMSNKEFKQTYGHLAGAWRGKKPIQRNAILALAHFNEVDAIPELKKVATTDERPMIRATAYWAIGQILGEEARDFINANYDQEDAEVQNEMIKGLDTRRE >CP019593.2|ARH72557.1|1887169_1887640_-|tRNA-(uridine(34)/cytosine(34)/5--carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)--methyltransferase-TrmL MTNHIVLYQPEIPANTGNIARTCAGTNTHLHLIKPLGFRTDDKMLKRAGLDYWEFVNITYHDSIEAFFEATNGEYYLLTKFGKKTYSDFDFSNHDKDFYFIFGKETTGLPDWVKEKYQDTALRIPMSEHIRSLNLSNTAALLIYEALRQQDFPGLN >CP019593.2|ARH72556.1|1886411_1887011_-|glucosamine-6-phosphate-isomerase MAMNFKVFDNSQLVAEYAADIIRKQFNNNPTTIAGFHLDTDQAPVLDELKKNVEKHAVDFSQINILDYDDKKSYFEALGVPAGQVYPIAYEKDAIELIADKIKTKENKGKLTLQVVSIDEQGKLNVSIRQGLMEAREIFLVVTGANKRDVVEKLYQENGKTSFEPADLKAHRMVNVILDKEAAAGLPEDVKAYFTSRFA >CP019593.2|ARH72555.1|1886234_1886387_-|hypothetical-protein MSKDKDPKLNYHEEENSMVTDFEDLKELGKEMEQISDQNDQEKNSEEDSQ >CP019593.2|AXB22388.1|1885966_1886170_+|hypothetical-protein MAESQLTITCKLAGFQHSEIGSSISTDNASWRTTNTEASGKSASMNIIKKLGNKMLPNFIFKIINPI >CP019593.2|ARH72553.1|1885296_1885692_-|hypothetical-protein MLGKYWIQLLIATVIISLISIKAFPLAIGALYLPIIFKVIKLQLNLSKGLIDDVNAQTFIKSNQSGIVISVICCLLITGILYYTLDGFYASLTGVLGTLVALNPYTTIVSAILYILTAIATVEATKTKYRN >CP019593.2|ARH72552.1|1883715_1885101_-|class-II-fumarate-hydratase MSVRIEHDTFGEIEVPADKYWGAQTERSKRNFPVGKERMPIEVVYGFAQLKRAAALANFDLGKLSEAKKDAIVYACDQILSGELDEHFPLVVWQTGSGTQSNMNVNEVVSYVANMYLKDHQSDESIHPNDDVNKSQSSNDTFPTAMHVALYQEVETKLEPALKLLRNTLKEKEDKFDSIIKIGRTHLQDATPIKLGQEISGWRYMLDRCETMLSESKKHILNLAIGGTAVGTGINAHPEFGDKVAQYISENTGYPFVSSENKFHALTAHDEVVQLHGTLKALAGDLMKIANDVRWLASGPRAGLAEISIPENEPGSSIMPGKVNPTQCEMLTMVAVQVMGNDTVVGFASSQGNFELNVYKPVIMHNTLQSIYLLADGMETFNNNCAVGIEPIEENIDNYLNQSLMLVTALNPHIGYEKAAQIAKKAHKEGLTLKESAIQTGYVTEEQFEAWIKPEDMVDPH >CP019593.2|ARH72562.1|1901270_1901717_-|transcriptional-repressor MSVEIESIEHELEESIASLRQAGVRITPQRQAILRYLISSHTHPTADEIYQALSPDFPNISVATIYNNLRVFKDIGIVKELTYGDSSSRFDFNTHNHYHIICEQCGKIVDFQYPQLNEIERLAQHMTDFDVTHHRMEIYGVCKECQDK >CP019593.2|ARH72563.1|1901813_1902764_-|hydroxyacid-dehydrogenase MKVVGLNRMREVETELQQRFSDVDFKFYKKASEIPESDLANLDILVGYDGGINEAFLRRCTNLKWIAWFATGVNTLPLDYIADHGILLTNGKGVQAKQLSEYILAFILDDYKKMKLSYDNQRQHIYDSKITGKRLSGQTVLFLGTGAIATRTAKLAKAFNMNLIGLSKSGQNKDEFDEIYTIESLESTLPNADIVINALPETQETIHLLKKKHFELMKDEALFINIGRGSIVKETLLIEVLKSRVIRHAYLDVFENEPLKPNHELYELDNVTITAHITGNDYEAKYDLLDIFKNNLVNFLNKNGLIENEVDAKKGY >CP019593.2|ARH72564.1|1902769_1903225_-|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase MLQKGEQFPIFKLENQDGTVITNDTLKGKKAIIYFYPRDNTPTCTTEACDFRDNLEMFNDLDVAVYGISGDSKKKHQNFIEKHGLNFDLLVDEDFKLAKETGVYQLKKSFGKESMGIVRTTFIIDEQGKVLDVIEKVKVKTQIEELKNILG >CP019593.2|ARH72565.1|1903305_1904595_+|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase MNFSESERLQQLSNEYILGGVNSPSRSYKAVGGGAPVVMKEGHGAYLYDVDGNKFIDYLQAYGPIITGHAHPHITKAIQEQAAKGVLFGTPTELEIEFSKKLRDAIPSLEKIRFVNSGTEAVMTTIRVARAYTKRNKIIKFAGSYHGHSDLVLVAAGSGPSQLGSPDSAGVPESVAREVITVPFNDINAYKEAIEFWGDEIAAVLVEPIVGNFGMVMPQPGFLEEVNEISHSNGTLVIYDEVITAFRFHYGAAQDLLGVIPDLTAFGKIVGGGLPIGGYGGRQDIMEQVAPLGPAYQAGTMAGNPLSMKAGIALLEVLEQDGVYEKLDSLGQQLEEGLLKLIEKHNITATINRIYGSLTLYFTDEKVTHYDQVEHSDGEAFGKFFKLMLNQGINLAPSKFEAWFLTTEHTEEDIKQTLKAADYAFSQMK >CP019593.2|ARH73506.1|1904887_1905982_+|aromatic-acid-exporter-family-protein MRLGARIFKTGIAIILAMSIASLLPDDVGLKALAGVSAVVAMQPSIYRSFKTVSDQALGNIIGAILSVTMVTIFSDNFIIMGVTVVVLIAILFKFNLAHVATLASVTALIIMGQHTGSFYITAFYRFVLVMIGVISSSLVNFVFLPPKFETKIYYNSLNISSDIFMWFKLVLNDTTEFNNIKQDSHNLKQRVEKLEKIYDYYSEERPITKKHIHQQNRKKILFREVVQTTRQAYEVLNKLSRYQNDLYLLNNNFLLQIKLDLDSLTAFHEQILASLSKKARYNVTHVDYELDNPQKKDLLSTFQHELINHPYQTEYSFANVMQIVAAIEEYRHHLEHLDRIRISFFTYHRSDADIEIVEEDFDL >CP019593.2|ARH72566.1|1906172_1907909_-|SAV1866-family-putative-multidrug-efflux-ABC-transporter MIKRYLQFVKPYKYRIFATIIVGIIKFGIPMLIPLLIKYAIDGVINNHALTTDEKVHHLTIAIGIALFIFVIVRPPVEFIRQYLAQWTSNKILYDIRKKLYNHLQALSARFYANNQVGQVISRVINDVEQTKDFILTGLMNIWLDCITIIIALSIMFFLDVKLTLAALFIFPFYILTVYVFFGRLRKLTRERSQALAEVQGFLHERVQGISVVKSFAIEDNEAKNFDKKNTNFLIRALKHTRWNAYSFAAINTVTDIGPIIVIGVGAYLAISGSITVGTLAAFVGYLELLFGPLRRLVASFTTLTQSFASMDRVFQLIDEDYDIKNGVGAQPIEIKQGRIDIDHVSFQYNDNEAPILKDINLSIEKGETVAFVGMSGGGKSTLINLIPRFYDVTSGQILIDGHNIKDFLTGSLRNQIGLVQQDNILFSDTVKENILLGRPTATDEEVVEAAKMANAHDFIMNLPQGYDTEVGERGVKLSGGQKQRLSIARIFLNNPPILILDEATSALDLESESIIQEALDVLSKDRTTLIVAHRLSTITHADKIVVIENGHIVETGTHHELIAKQGAYEHLYSIQNL >CP019593.2|ARH72567.1|1908199_1908742_-|DUF402-domain-containing-protein MVRESIPKEGENIKIQSYKHDGKIHRVWSETTILKGTDHVVIGGNDHTLVTESDGRTWITREPAIVYFHSEYWFNVICMFREDGIYYYCNLSSPFVCDEEALKYIDYDLDIKVYPNGKYHLLDEDEYEQHMNQMNYPHDIDIILRRNVDILQQWIEQKKGPFAPDFIKVWKERYKKIRQY >CP019593.2|ARH72568.1|1909044_1910082_-|A/G-specific-adenine-glycosylase MYQQSSFKENLIHWFDENQREMPWRQTTNPYYIWLSEVMLQQTQVKTVIDYYHRFVERFPTVEVLSQASEDEVLKYWEGLGYYSRARNFHTAIKEVHDKYEGLVPKDPDQFKALKGVGPYTQAAVMSIAYNVPLATVDGNVFRVWSRLNDDYRDIKLQSTRKSYEQELLPYVTTEAGTFNQAMMELGALICTPKNPLCLFCPVQENCEAFDKGTFEKLPVKSKNVSKKVIEQSVFLIRNNQGQYLLQKRSEKLLHGMWQFPMFESEHARREMTEKIGHDIQPVETPIFELKHQFTHLTWKIKVYAVSGTINIERLPDDMIWFDLSDRDQYTFPVPMSKIYQFING >CP019593.2|ARH72569.1|1910233_1911211_+|metal-dependent-hydrolase MDTATHIAIGVGLTALATQDPAMASTFGATATTLIVGSLIPDGDTVLKLKDNATYISHHRGITHSIPFTILWPILITFLIFTFFSGTNPFHVWMWAQLAVFLHVFVDIFNSYGTQALRPITNKWIQLSVINTFDPIIFTVLCIGIVLWVVGLHPFAVFFPIIALLIIYYMIRFKMRAVIKQQALKAIQQEHHPVKVFVAPTIKFMEWRVAIQTDAHDYVGKAYGRNVVFSDKVERQKLSTDSILWKVKGNKDIRTFLNFSSIYRWQTTTLADGSTEIRLIDLRYLKNDHYSFVAIAHVTNDNVIDHSYIGWVFTEDKLQRKLYAK >CP019593.2|ARH72570.1|1911314_1911545_+|hypothetical-protein MNAFTKPNIYIVANKLPLMTRNIKISIGKQYLDYILIVSDSHRLIYTTGQLNIMKKYPPRLYYLLKHPVVYQFVSL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019593_9 | 2104152-2104364 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019593_9
|
2 spacers
spacers of CP019593_9
>9.1|2104199|34|CP019593|CRISPRCasFinder TGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTA >9.2|2104280|38|CP019593|CRISPRCasFinder TGCTGTTGTGGGAGCTTGGTGTTGGTGCCATGTTACTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019593_9
The CRISPR arrays of CP019593_9 >merge|CP019593|9|2104152-2104364|CRISPRCasFinder TGACGTATTGTTGCGGGAACTTGGTGTCATGACATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCGTGCCATGCTACTTTGATGTGCTGTTGTGGGAGCTTGGTGTTGGTGCCATGTTACTTTGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCATGCCATGCTACTTTGATG >CP019593|9|9|2104152-2104364|CRISPRCasFinder TGACGTATTGTTGCGGGAACTTGGTGTCATGACATGTTACTTTGATG TGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTA TGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCGTGCCATGCTACTTTGATG TGCTGTTGTGGGAGCTTGGTGTTGGTGCCATGTTACTT TGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCATGCCATGCTACTTTGATG
>CP019593.2|ARH72772.1|2103470_2104118_+|HD-domain-containing-protein MQQSDIISAAKKYMESIHQNDYTGHDIAHVYRVTALAKSIAENEGVNDTLVIELACLLHDTVDEKVVDANKQYAELKSFLSSLSLSTEDQEHILFIINNMSYRNGKNDHVTLTLEGQIVRDADRLDAIGAIGVARTFQFAGHFGEPMWTEQMSLDKINDDLVEQLPPSAIKHFFEKLLKLESLMHTDTAKMIAKERHDFMMIYLKQFFTEWNYHD >CP019593.2|ARH72771.1|2101958_2103443_+|cardiolipin-synthase MIELLSIALKHSNIILNSIFIGAFILNLLFAFTIIFMERRSANSIWAWLLVLVFLPLFGFILYLLLGRQIQRDQIFKIDKEDKKGLELIVDEQLAALKNENFSNSNYQIVKFKEMIQMLLYNNAAFLTTDNDLKIYTDGQEKFDDLIQDIRNATDYIHFQYYIIQNDELGRTILNELGKKAEQGVEVKILYDDMGSRGLRKKGLRPFRNKGGHAEAFFPSKLPLINLRMNNRNHRKIVVIDGQIGYVGGFNVGDEYLGKSKKFGYWRDTHLRIVGDAVNALQLRFILDWNSQATRDHISYDDRYFPDVNSGGTIGVQIASSGPDEEWEQIKYGYLKMISSAKKSIYIQSPYFIPDQAFLDSIKIAALGGVDVNIMIPNKPDHPFVFWATLKNAASLLDAGVKVFHYDNGFLHSKTLVIDDEIASVGTANMDHRSFTLNFEVNAFIYDQQIAKKLKQAFIDDLAVSSELTKARYANRSLWIKFKEGISQLLSPIL >CP019593.2|ARH72770.1|2101499_2101793_-|CsoR-family-transcriptional-regulator MTEQDNAHHSEQIKTNLKSRLNRIEGQVRAINRMIEEDVYCDDVLTQIRATRSALNSVAIKLLEQHMKSCIMNKVNQGAQEEAMEELLVTFQKLIKD >CP019593.2|ARH72769.1|2101278_2101488_-|heavy-metal-associated-domain-containing-protein MIHQNTIYTAGIETEEQVSQLTERISNMIGVHQVNINIIDGQVTVSYETPANLNSIEKEIYDEGYKIVF >CP019593.2|ARH72768.1|2101013_2101151_-|hypothetical-protein MKRPEKIQNVVKLLSSLGVNIKKTKSRLDIINTLPASNKVSHELK >CP019593.2|ARH72767.1|2099547_2100750_+|rod-shape-determining-protein-RodA MNYSSRQQPDKHWLRKVDWVLVATIAVLAIFSVLLINSAMGGGQYSANFGIRQIFYYILGAIFAGIIMFISPKKIKHYTYLLYFLICLLLIGLLVIPESPITPIINGAKSWYTFGPISIQPSEFMKIILILALARVVSRHNQFTFNKSFQSDLLLFFKIIGVSLVPSILILLQNDLGTTLVLAAIIAGVMLVSGITWRILAPIFITGIVGAMTVILGILYAPALIENLLGVQLYQMGRINSWLDPYTYSSGDGYHLTESLKAIGSGQLLGKGYNHGEVYIPENHTDFIFSVIGEELGFIGSVILILIFLFLIFHLIRLAAKIEDQFNKIFIVGFVTLLVFHILQNIGMTIQLLPITGIPLPFISYGGSALWSMMTGIGIVLSIYYHEPKRYVDLYHPKSN >CP019593.2|ARH72766.1|2098159_2099230_-|D-alanine--D-alanine-ligase MTKENICIVFGGKSAEHEVSILTAQNVLNAIDKDKYHVDIIYITNDGDWRKQNNITTEIKSTDELHLENGEALEISQLLKESSSGQPYDAVFPLLHGPNGEDGTIQGLFEVLDVPYVGNGVLSAASSMDKLVMKQLFEHRGLPQLPYISFLRSEYEKYEHNILKLVNDKLNYPVFVKPANLGSSVGISKCNNEAELKEGIKEAFQFDRKLVIEQGVNAREIEVAVLGNDYPEATWPGEVVKDVAFYDYKSKYKDGKVQLQIPADLDEDVQLTLRNMALEAFKATDCSGLVRADFFVTEDNQIYINETNAMPGFTAFSMYPKLWENMGLSYPELITKLIELAKERHQDKQKNKYKID >CP019593.2|ARH72765.1|2096789_2098145_-|UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D--alanine-ligase MINVTLKQIQSWIPCEIEDQFLNQEINGVTIDSRAISKNMLFIPFKGENVDGHRFVSKALQDGAGAAFYQKGTPIDENVSGPIIWVEDTLTALQQLAQAYLRHVNPKVIAVTGSNGKTTTKDMIESVLHTEFKVKKTQGNYNNEIGLPLTILELDNDTEISILEMGMSGFHEIEFLSNLAQPDIAVITNIGESHMQDLGSREGIAKAKSEITIGLKDNGTFIYDGDEPLLKPHVKEVENAKCISIGVATDNALVCSVDDRDTTGISFTINNEHYDLPILGKHNMKNATIAIAVGHELGLTYNIIYQNLKNVSLTGMRMEQHTLENDITVINDAYNASPTSMRAAIDTLSTLTGRRILILGDVLELGENSKEMHIGVGNYLEEKHIDVLYTFGNEAKYIYDSGQQHVEKAQHFNSKDDMIEVLTSDLKAHDRVLVKGSRGMKLEEVVNALIS >CP019593.2|ARH72764.1|2094753_2096274_-|DEAD/DEAH-box-family-ATP-dependent-RNA-helicase MQNFKELGISDNTVQSLESMGFKEPTPIQKDSIPYALQGIDILGQAQTGTGKTGAFGIPLIEKVVGKQGVQSLILAPTRELAMQVAEQLREFSRGQGVQVVTVFGGMPIERQIKALKKGPQIVVGTPGRVIDHLNRRTLKTDGIHTLILDEADEMMNMGFIDDMRFIMDKIPAVQRQTMLFSATMPKAIQALVQQFMKSPKIIKTMNNEMSDPQIEEFYTIVKELEKFDTFTNFLDVHQPELAIVFGRTKRRVDELTSALISKGYKAEGLHGDITQAKRLEVLKKFKNDQINILVATDVAARGLDISGVSHVYNFDIPQDTESYTHRIGRTGRAGKEGIAVTFVNPIEMDYIRQIEDANGRKMSALRPPHRKEVLQAREDDIKEKVENWMSKDSESRLKRISTELLNEYNDVDLVAALLQELVEANDEVEVQLTFEKPLSRKGRNGKPSGSRNRNSKRGNPKFDSKSKRSKGYSSKKKSTKKFDRKEKSSGGSRPMKGRTFADHQK >CP019593.2|ARH72763.1|2093705_2094401_+|DNA-binding-response-regulator MQSKILIIEDDHAITHLLDVALTLDYYNVTTADNATQAHFKIQIDKPDVILLDLGLPDKDGLCLISEIRQHTDIPIIVISARQEEQTIIQALDNGANDYMTKPFNVDELRARIRVIERIAKSHQETNFVFTNGLLSIDFGSKSVVINNQEVHLTPNEFSLLELLSNHKGKVLTYEMILKRIYGYVNKTEMPSLRVHMTSLRQKLSQCHEDAKDIIKTHPRIGYQMLQWKEK >CP019593.2|ARH72773.1|2104397_2104718_+|hypothetical-protein MIWRCGVMGGIARGIDAMPLQFYDMALGRCNVYYAVVTLLFHTVTCICELLWKCCDIYCYTDESLCQDDIAMMNSNSVINHFLHAEISLILFGSMSNWTDAFNIGS >CP019593.2|ARH72776.1|2106359_2107232_-|membrane-protein-insertase-YidC MKKKALLPLFLGIMVFLAGCDYSKPEKRSGFFYNTFVDPMKNVLDWLGNNLLNDNYGLAIIILVLVIRIILLPFMLSNYKNSHMMRQKMKVAKPEVEKIQEKVKRARTQEEKMAANQELMQVYKKYDMNPIKSMLGCLPMLIQLPIIMGLYFVLKDQLVDGLFKYPHFLWFDLGRPDIWITIIAGVLYFIQAYVSSKTMPDEQRQMGYMMMVISPIMIIWISLSSASALGLYWSVSAAFLVVQTHFANIYYEKVAKKEVQPFIEAYEREHNGGNNKKGKNTQVVSKKKKK >CP019593.2|ARH72777.1|2107317_2107959_-|thiamine-phosphate-synthase MFNQSYLNVYFICGTSDVPSHRTIHEVLEAALKAGITLFQFREKGESALKGNDKLVLAKELQHLCHQYDVPFIVNDDVSLAKEINADGIHVGQDDAKVKEIAQYFTDKIIGLSISDLGEYAKSDLTHVDYIGVGPIYPTPSKNDAHTPVGPEMIATFKEMNPQLPIVAIGGINTSNVAPIVEAGANGISVISAISKSENIEKTVNRFKDFFNN >CP019593.2|ARH72778.1|2107960_2108752_-|hydroxyethylthiazole-kinase MNYLNKIRIENPLTICYTNDVVKNFTANGLLSIGASPAMSEAPEEAEEFYKVAQALLINIGTLTAQNEQDIIAIAQTANEAGLPIVFDPVAVGASTYRKQFCKLLLKSAKVSVIKGNASEILALIDDTATMKGTDSDANLDAVAIAKKAYAIYKTAIVITGKEDVIVQGDKAIVLANGSPLLARVTGAGCLLGGVIAGFLFRETEPDIEALIEAVSVFNIAAEVAAENENCGGPGTFSPLLLDTLYHLNETTYQQRIRIQEVE >CP019593.2|ARH72779.1|2108735_2109566_-|bifunctional-hydroxymethylpyrimidine-kinase/phosphomethylpyrimidine-kinase MIKPKIALTIAGTDPTGGAGVMADLKSFHSCGVYGMGVVTSIVAQNTLGVQNIHNLNHQWVDEQLDSVFNDTLPHAIKTGMIATADTMETIRHYLMQHESIPYVIDPVMLAKSGDSLMDNDTKQNLQHTLLPLADVVTPNLPEAEEITGLTIDSEEKIMQAGRIFINEIGSKGVIVKGGHSNDTDIAKDYLFTKEGVQTFENERFKTKHTHGTGCTFSAVITAELAKGRPLFDAVQKAKKFISMSIQYTPEIGRGRGPVNHFAYLKKEGLDDELSK >CP019593.2|ARH72780.1|2109558_2110248_-|thiaminase-II MEFSQKLYQAAKPIINDIYEDDFIQKMLLGNIQADALRHYLQADAAYLKEFTNLYALLIPKMNSMNDVKFLVEQIEFMVEGEVLAHDILAQIVGESYEEIIKTKVWPPSGDHYIKHMYFQAHSRENAIYTIAAMAPCPYIYAELAKRSQSDHKLNREKDTAKWFDFYSTEMDDIINVFESLMNKLAESMSDKELEQVKQVFLESCIHERRFFNMAMTLEQWEFGGKVND >CP019593.2|ARH72781.1|2110634_2111330_-|lytic-transglycosylase-SceD MKKTLLASSLAVGLGIVAGNAGHEAHASEADLNKASLAQMAQSNDQTLNQKPIEAGAYNYTFDYEGFTYHFESDGTHFAWNYHATGANGADMSAQAPATNNVAPSADQANQVQSQEVEAPQNAQTQQPQASTSNNSQVTATPTESKASEGSSVNVNDHLKQIAQRESGGNIHAVNPTSGAAGKYQFLQSTWDSVAPAKYKGVSPANAPESVQDAAAVKLYNTGGAGHWVTA >CP019593.2|ARH72782.1|2111718_2112114_-|single-stranded-DNA-binding-protein MLNKIVIVGRLTKDAQIFEKEDRKIATFCVATHRNYKDENGEIVCDYLFCKAFGKLASNIEKYTNQGTLVGITGQMRSRKYDKDGQTHFVTELYVETIKFMSPKSQNNEILSDSILDIDSQNIDNHDLLEI >CP019593.2|ARH72783.1|2112244_2112748_+|hypothetical-protein MTLNLLNNSKIINIKLMGCGNMKTFKAVRFQIVNEHGRIIEYELEDGVIINKEESGTGWLLEIVISNEHYETFKEYQDNEQLLDIRVVITRPANDPALFESTVKSIKNFKTTMSIVFECHIYTLRQQYAESLLEQLIDDGLSGEELKKSFNRMMQSKPKLKDEKLEE >CP019593.2|ARH72784.1|2112804_2113245_-|beta-hydroxyacyl-ACP-dehydratase METIFDYNQIKQIIPHRQPFLLIDKVVEYEEGQRCVAIKQVSGNEPFFQGHFPEYAVMPGVLITEALAQTGAVAILNSEENKGKIALFAGIDKCRFKRQVVPGDTLTLEVEITKIKGPIGKGNAKATVDGQLACSCELTFAIQDVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019593_10 | 2159783-2159933 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019593_10
|
2 spacers
spacers of CP019593_10
>10.1|2159811|29|CP019593|CRISPRCasFinder TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA >10.2|2159868|38|CP019593|CRISPRCasFinder GTTGATGCATAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019593_10
The CRISPR arrays of CP019593_10 >merge|CP019593|10|2159783-2159933|CRISPRCasFinder AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTAAACTTTAGTTGTAAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCATAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGAGCTTCTTTCTA >CP019593|10|10|2159783-2159933|CRISPRCasFinder AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA AACTTTAGTTGTAAGGGGCTCTTATGCA GTTGATGCATAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC AACTTTAGTTGTTAGGAGCTTCTTTCTA
>CP019593.2|ARH72835.1|2158673_2159765_+|transcriptional-regulator MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYVQTIAIYSQFGQKPPGDAYLKVIALLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLVGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPVFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILYVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >CP019593.2|ARH72834.1|2157427_2158408_+|cation-transporter MSHSHHHHDHMHSHVNTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALIAFIYAEKNATATKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >CP019593.2|ARH72833.1|2157105_2157426_+|ArsR-family-transcriptional-regulator MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >CP019593.2|ARH72832.1|2156288_2156954_-|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFEGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDQDIKDALTQFENETD >CP019593.2|ARH72831.1|2154916_2155855_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >CP019593.2|ARH72830.1|2154655_2154886_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQTSASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >CP019593.2|ARH72829.1|2152610_2153984_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >CP019593.2|ARH72828.1|2151739_2152153_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQQPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIQLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >CP019593.2|ARH72827.1|2151096_2151540_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLEKAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >CP019593.2|ARH72826.1|2150265_2150976_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >CP019593.2|ARH72836.1|2160262_2160367_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >CP019593.2|AXB22374.1|2160799_2160982_-|hypothetical-protein MIIFRFKVNAFFPVKLCLMIRFCLESCCIFRRHLLITFHNIRSKFIMFKYISSKCIICTG >CP019593.2|ARH73514.1|2161046_2161205_+|integrase MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >CP019593.2|ARH72837.1|2161640_2161733_+|erm-Leader-peptide MTYGSIVAILCALFAIFFIPYMEKKDKKKK >CP019593.2|ARH72838.1|2161862_2162720_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINRLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQIINLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWLRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIEHFGINQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >CP019593.2|ARH72839.1|2162787_2163570_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQVGRMKQGKTILKNISWQINGGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGSVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHQLLKLVGMSAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >CP019593.2|ARH72840.1|2163859_2164468_-|hypothetical-protein MARKTFISYKYSEAKDLRDKIVESLGEDAKYYQGETSDSPDMSDRITEYIKKELKNKIYSTSVTIVVISPNMKESNWIDWEIEYSVKQMKRGDRTSSTNGVVGVVMKHNGDYSWLRNSVINSDGHTAIHTDNSYLYDIIVKNRFNQEPIEYTCDECKNIDALTGSFISLVEEDEFLGNPTKYIENAYEKSKKATNYNICRRK >CP019593.2|ARH72841.1|2164495_2165530_-|toll/interleukin-1-receptor-domain-containing-protein MKYPIRQVAEVLPEKYTRYILLKEFQRLFPYQWNIIVERQQTYKEKAQHLYKVKKIKNRYNTKSAEEYFFSIPQVKYILSAGRMKKHKENYNASEIKIKKAALEKSRKNKNWKIEERLIKAKRYTQKVDPEYLNIYMKAYHKKDITTEEKLEILTELKKFDTENIVRFFRKLNDAEQNKMIRNLAFKYLQDYGHYVKLRKNFKGKKKVYQTERASLDTKKPEDLYNDLTNKNIQSQKVYDIFISHSTKDKKTVEDIIRVFNEQNKTCYCDWTMDQDYLKRKYVGEYTKQVLKARMEQSKMLVLLRTENSVQSDWVSFEIEYFENLKKPIYIVESLEELLEAFSD >CP019593.2|ARH72842.1|2165623_2167093_-|hypothetical-protein MNGDGKMTIDKKKFIEKYVKALESNTAAIFAGAGLSCGAGYVNWKTLLNEAAEELELNIDKEEHDLVGLAQHYINKKRSRGNLNTVIMEQFSTRAELTENHKLLAKLPIDTYWTTNYDCMIEKALDSEGRIVDVKRNQNQLTVSVADKDATVYKMHGDIDSIDKIILTRDDYEKYNLTHPKFREILEGDLLSKTFLFIGFSFTDPNISYILSRIRLVLEDNTRPHYCILKEVEEKEYDNTEEFMYAKIKQQLHIEDLSRFSIETLLVKDYIEITEILESIYKRYRRKTIFISGSATEYLPFNSETGKYFLHQLSKKLVENDFKLVTGFGLGVGSYVINGVADYINSNKKSKLQNHLNILPFSQDSSGDLDLKEVWKKNRLEMISECGMALFLFGNKEKDGKIVLADGLEEEYKIAERQELVRLPINVTGYKTKNLSEQYNEEINIQFKEKILKMYNEINEYKCDFSNKQSIDELVQKIVNLVIEIKKTK >CP019593.2|ARH72843.2|2167152_2167443_-|DUF3387-domain-containing-protein MVMEENAFYDALASHDTAEHVLGDDTLKIIAHELTQSIKENMSIDWNLCESARAKMRVIVRRLLKKYGYPPEISKQAVETVIEQAELMSEQLAMEL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019593_11 | 2337168-2337253 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019593_11
|
1 spacers
spacers of CP019593_11
>11.1|2337198|26|CP019593|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019593_11
The CRISPR arrays of CP019593_11 >merge|CP019593|11|2337168-2337253|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >CP019593|11|11|2337168-2337253|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>CP019593.2|ARH73015.1|2336869_2337109_-|hypothetical-protein MKFSVLGPLTRVEKSLLQAHFHSVNYCQYNIIDPRTLIYVPSSHIIVTNVHYVNEYCCLNMHVIYNGADNTLKSLKMKR >CP019593.2|ARH73014.1|2335672_2336797_-|hypothetical-protein MKIAIIGAGIGGLTAAALLQEQGHTIKVFEKNESVKEIGAGIGIGDNVLKKLGNHDLAKGIKNAGQILSTMTVLDDKDRPLTTVKLKSNTLNVTLPRQTLIDIIKSYVKDDAIFTNHEVTHIDNETDKVTIHFAEQESEAFDLCIGADGIHSKVRQSVNADSKVLYQGYTCFRGLIDDIDLKHPDCAKEYWGRKGRVGIVPLLNNQAYWFITINSKENNHKYSSFGKPHLQAYFNHYPNEVREILDKQSETGILLHNIYDLKPLKSFVYGRTILLGDAAHATTPNMGQGAGQAMEDAIVLVNCFNAYDFEKALQRYDKIRVKHTAKVIKRSRKIGKIAQYRSRLVVAVRNRIMKMMPNALAAGQTKFLYKSKEK >CP019593.2|ARH73013.1|2334627_2335581_+|hydroxyacid-dehydrogenase MEKVYVAGAIPEVGLKLLQEHFEVEMYEGKGLVDKDTLIKGVKDATALISLLSTNVDKDVIDAGKDLKIIANYGAGFNNIDIEYAREKSIDVTNTPKASTNATADLTIGLVLAVARRIVEGDQLSRTTGFDGWAPLFFRGREVSGKTIGIIGLGEIGSAVARRARAFDMDVLYTGPNRKEEKEREIGAKYVDLDTLLKNADFITINAAYNPKMHHLIDTEQFKMMKSTAYLINASRGPIVHEQALVQALKNNEIEGAALDVYEFEPDITDDLKSLNNVVLTPHIGNATFEARDMMSKIVANAAISAVQGEKPQFVVN >CP019593.2|AXB22377.1|2334275_2334554_+|hypothetical-protein MIHIVLKLNSSTYVIKNFELSFIGEALFLLFFVATHLYIFFSPIFIILIFFNTINFKTTLSNLIDPVFHITIFIVLQCLSYITSIKSTRLHH >CP019593.2|ARH73012.1|2333764_2334265_+|CHAP-domain-containing-protein MKKLVTATTLTAGIGTALVGHAQHADAAENYTNYNNYNYNTTQTTTTTTTTTTTSSISHSGNLYTAGQCTWYVYDKVGGEIGSTWGNANNWAAAAQGAGFTVNHTPSKGAILQSSEGPFGHVAYVESVNSDGSVTISEMNYSGGPFSVSSRTISASEAGNYNYIHI >CP019593.2|ARH73011.1|2333105_2333528_+|DUF4870-domain-containing-protein MTTEMNDVTNHQPNRKSNDENIMAMLIYLLSLFTSIIGPLIIWLLKKDESKLVDRAGKNYLNYTISYIIWSIVLVVITFIGVFLIATDIDFIIIIGFIITFIGILSIFAFSILSFVFTIIACVKYYNGQEYVIPLTIRFI >CP019593.2|ARH73010.1|2331775_2332858_-|octopine-dehydrogenase MKIAIVGSGNGAVTAAVDMVSKGHDVKLYCRNQSISKFQNAIEKGGFDFNNEGEERFVKFTDISDDMEYVLKDAEIVQVIIPSSYIEYYADVMAEHVTDNQLIFFNMAAAMGSIRFMNVLEDRHIETKPQLAEANTLTYGTRVDFENAAVDLSLNVRRIFFSTYDRSCLNDCYDKVSSIYDHLVKEESLIKTNLENGNPEVHPGPTLLNVGRIDYAGEFALYKEGITKHTVRLLHAIELERLNLGRRLGFELSTAKESRIERGYLERDKEDEPLNRLFNTSPVFSQIPGPNHVESRYLTEDIAYGLVLWSSLGRVIDVPTPNIDAVIVIASTILERDFFEEGLTVESIGLDKLDLEKYLK >CP019593.2|ARH73009.1|2330280_2331681_-|Na+/H+-antiporter-NhaC MMTRKPTFLESISTMIVMVIVVVTGFVFFDIPIQVLLIIASAYAAWIAKRVGLTWQDLEKGIAERLNTAMPAILIILAVGIIVGSWMFSGTVPALIYYGLDLLNPSYFLISAFFISAVTSVATGTAWGSASTAGIALISIGNQLSISPGMAAGAIIAGAVFGDKMSPLSDTTNLAALVTKVNIFKHIRSMMWTTIPASIIGLLVWFIAGFQFKGHSNDKQIQTLLSELAHIYQINIWVWVPLIVIIVCLLFKMATVPAMLISSFSAIIVGTFNHHFKMTDGFKAIFSGFNDSMIHQSHISSSVKSLLEQGGMMSMTQILVTIFCGYAFAGIVEKAGCLEVLLTTISKGIHSVGSLICITVICCIALVFAAGVASIVIIMVGVLMKDLFEKYQVSRSVLSRTLEDSSTMVLPLIPWGTSGIYYTNQLHVSVGEFFIWTVPCYLCAIIAIIYGFTGIGIKKSSNSRLT >CP019593.2|ARH73008.1|2329912_2330107_-|hypothetical-protein MTKLIENLKASIFVSTLTKNLSMYSRFDAPKFGCVNGCMLFILYYRVNRIGENRSFEISTNPIF >CP019593.2|ARH73007.1|2329034_2329844_+|CHAP-domain-containing-protein MKKIATATIATAGFATIAIASGNQAHASEQDNYGYNPNDPTSYSYTYTIDAQGNYHYTWKGNWHPSQLNQDNGYYSYYYYNGYNNYSYNNYNNGYSYNNYSRYNNYSNNNQSYNYNNYNSYNTNSYRTGGLGASYSTSSNNVQVTTTMAPSSNGRSISSGYTSGRNLYTSGQCTYYVFDRVGGKIGSTWGNASNWANAAARAGYTVNNTPKAGAIMQTTQGAYGHVAYVESVNSNGSVRVSEMNYGYGPGVVTSRTISASQAAGYNFIH >CP019593.2|ARH73520.1|2337405_2338044_-|autolysin MQQGKGIVQTKEEDGKFVEANNNEIAKAMTISHKDNDMKYMDITEKVPMSESEVNQLLKGKGILENRGKVFLEAQEKYEVNVIYLVSHALVETGNGKSELAKGIKDGKKRYYNFFGIGAFDSSAVRSGKSYAEKEQWTSPDKAILGGAKFIRNEYFENNQLNLYQMRWNPENPAQHQYASDIRWADKIAKLMDKSYKQFGIKKDDIRQTYYK >CP019593.2|ARH73016.1|2338203_2338437_-|hypothetical-protein MLKTSAVISNTLLVIGLVCLFMMKLVLAITFFAVSLSISLVVFNMMFRDRTTMKVIVNASFLIVILAIVVAYFLLSK >CP019593.2|ARH73017.1|2338731_2339205_-|DUF1641-domain-containing-protein MAERISSKIRRLEKSEEQIKLESLNEVTEAIAANKDSILKAIKLIKVLDDAKILDALNGAVRGRQVIINKFAVELNKDIYTGLLSNMASMVFLLGELNVSDLSDFLNKVNKGLHVANQASPNAKTSVRSLFGVLKDDDMNRSLTYMLNMLKGMSRED >CP019593.2|ARH73018.1|2339204_2342159_-|formate-dehydrogenase-subunit-alpha MQEHLVVTLDGKDYLVEPGTNLLEFIKSQDTFVPSICYNESMGPIQTCDTCTVEIDGKIERSCSTVIDRPMTVNTVNNDVKDAQKEALDRILEKHMLYCTVCDYNNGDCEIHNTMDAWGLQHQTYEYKEKPYEKDYGPFYRYDPNQCILCGRCVEACQDIEVNETIRIDWDREHPRVIWDNDVPINESSCVSCGQCATVCPCNAMMEVNMEGNAGYMTDTEPGSLAAMIDLTKKAEPGYGPLFAISDSEAEMRKERIKKTKTVCTYCGVGCSFEVWTKDREILKVQPSHDSPANKIATCVKGKFSWGHINSDQRLTKPLVRKNGEFHEVEWDEALNVIADNFTSIKEKHGPDALSFISSSKATNEESYLMQKLARQVIGTNNVDNCSRYCQAPATKGLFRTVGHGGDSGSIEDLEKAAMSVLIGTNTAEAHPVIASRMKRAQKLFGQKIHVFDIRKHEMAERADRFYQPKPGTDLAWLSAVTKYIIDHDLHDKAFIEEWVEDFDEYYKSLETFTMAFAEEATGIPEAELIKFAEECAKAESVVICWAMGITQQDIGSDSSTAISNLLLVTGNYRRPGTGAYPLRGHNNVQGCSDMGSMPDKITGYQSIEADDIRAKFEKEYGVKLNPKAGKDNHEMVEGIHDGQIHSLYLYGEDTGIVDSNINFVQAAFEKLDFMVVQDEFLTFTATFADVVLPASPSLEKDGTFTNTERRIQRLYQALKPLGESKPDWKIFQAIANKLGFDWNYKHPSEIMDEIARLTPLYAGVSYERLEGFNSLQWPVHPDGTDEPILYLEGFNFDNGKAKLFPLSFDNYFKQDEVYDIHVNNGRLLEHFHEGNMTYQTPMLKYKVPRAFVEISPELAEDRGIHEGAEVKLISETGEAVLQVHVTDRVKGKEIYIPLNNDAMENGDLGAINLLTNSDVDQYTDTPSYKRTSCRLEVITKRGKSPLNPNNFRVNKKRHPQYSVQVQKKWERPDYVFPGNQVDK >CP019593.2|ARH73521.1|2342760_2343684_-|LytR-family-transcriptional-regulator MSLPKKIFLWVFGILVILAIVAVVYVAAKIFITGNKIHNPLDRNHSELRDKKVSLNDGDPFTIALFGVDSDADRKKKGGGERSDSIMILSINPKTKKTEIVSIPRDTRAEIVGRDTTEKIAHAYAYGGPNMAVKSLEKLMNVPIDHYATIDMDGLHNMIDSIGGVDVVSNDTFTVDGVRFTKGQQTHVNGDQALKFIRSRKEEGAGGDFGRQQRQQIVLEAMANKIASPSSITHFNSLMNEIQNNVKTDLTLGDLNTIRSNYKDANDTINKHQLSGQGGIQSDGLYYFIPSEQSKAESTKLLKDNLE >CP019593.2|ARH73019.1|2343840_2344638_-|inositol-monophosphatase MTDKTLQQIDKLICSWLKQIDNVIPQLIMEMTTETKRHRFDLVTNVDKQIQQQFQQFLATHFQEHQLLAEEKSNEMITNEINHLWIMDPIDGTANLVKQQEDYCIILAYFYEGKPMLSYVYDYPHKKLYKAIRGEGAFCNGIKMEEPPSLKLEDAIISFNAQVMNLDTVQDLFDASFSYRLVGACGLDSMRVAKGQFGAHINTNPKPWDIAAQFLFAELLNLKMTTLDGKAIDHLKGAPFIISNKACHETVLKILNANGGYQKYR >CP019593.2|ARH73020.1|2345022_2345715_+|YafY-family-transcriptional-regulator MNKAERQNLIITAIQQNKKMTALELAKYCNVSKRTILRDIDDLENQGVKIYAHYGKNGGYQIQQAQSKIALNLSETQLSALFLVLNESQSYSTLPYKSEINAIIKQCLSLPQTRLRKLLKRMDFYIKFDDTQHMTLPMLFSDILIYCTERNVMLVDHRVDDNIKAENVIFIGLLCKHGHWHAVIYDIAQDKTAELEIENIIDISYSFGKTIQTRDISIDNYHQFLNPIDS >CP019593.2|ARH73021.1|2345739_2346477_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease-SdpB MENEKKKYTFKDIAWRDLFIIPIIGVLSFALTIAAYIVPILFGYYEIDSNLIFVGTITQALAYTIGIGAFYLFHLKVMPSRLRAGFAYIKKYWLRLSITYIIALILIYTYEYMTQFLPKHLQYSETANELELNKMFEVPVFLPVAFLLIVIVGPIVEEIVFRHILIGELGKKFNFIAMSIVSVFLFAFIHVTDAKSPFEFGPYLILSIILVFTYIKSGRNLGSTIALHIANNFVSFVISVISIYA >CP019593.2|ARH73022.1|2346525_2346855_+|hypothetical-protein MINETKYMRQQITNLIQIIDTIKYNTLMTDWNIQTHIYKFNQIVTNELNKFKGFETSYIINENQVFYYEIITLLNKRPLRQVDYGNKIQYLNFYHTELSNALFAIKFAH >CP019593.2|ARH73023.1|2347299_2348172_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MSNVLTEIDSQYPYMTKNEKKIAKFILNSPQKVIKMRSQDLASLLDISTSSVIRFSKKITDGGFHDLKINISKYVPKASSIYNVELMNNESTESLRTKLHTRTTRALNHANNELNDKTIDQICHCLKRSETIFIYGFGASFVVATDLYQKLSRIGLNIQLVQETHIFATLLATHNSNDSVILITNNGTQSEMQSMVKVIDDYHIPIITITSTRDNPVAQASNIVLTYGKTDENEMHMGATTSLFAQMFTIDILYYRYVALNYHASLDYITQSKMALDNYRKHLSNINFKH |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 891983-892007 | 0 | 1.0 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 730521-730545 | 0 | 1.0 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 2029394-2029418 | 0 | 1.0 |
CP019593_7 | 7.1|1829653|35|CP019593|CRISPRCasFinder | 1829653-1829687 | 35 | CP019593.2 | 1927338-1927372 | 0 | 1.0 |
CP019593_11 | 11.1|2337198|26|CP019593|CRISPRCasFinder | 2337198-2337223 | 26 | CP019593.2 | 1618818-1618843 | 0 | 1.0 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 242726-242750 | 1 | 0.96 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 242784-242808 | 1 | 0.96 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 242842-242866 | 1 | 0.96 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 336521-336545 | 1 | 0.96 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 606202-606226 | 1 | 0.96 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 871217-871241 | 1 | 0.96 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 984951-984975 | 1 | 0.96 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 1085275-1085299 | 1 | 0.96 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 1085329-1085353 | 1 | 0.96 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 1829605-1829629 | 1 | 0.96 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 1927281-1927305 | 1 | 0.96 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 1927391-1927415 | 1 | 0.96 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 2291982-2292006 | 1 | 0.96 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 2737798-2737822 | 1 | 0.96 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 730312-730336 | 1 | 0.96 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 821850-821874 | 1 | 0.96 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 891981-892005 | 1 | 0.96 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 1741222-1741246 | 1 | 0.96 |
CP019593_11 | 11.1|2337198|26|CP019593|CRISPRCasFinder | 2337198-2337223 | 26 | CP019593.2 | 821926-821951 | 1 | 0.962 |
CP019593_1 | 1.1|260755|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 260755-260779 | 25 | CP019593.2 | 260924-260948 | 2 | 0.92 |
CP019593_1 | 1.2|260811|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 260811-260835 | 25 | CP019593.2 | 2115226-2115250 | 2 | 0.92 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 785818-785842 | 2 | 0.92 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 1085221-1085245 | 2 | 0.92 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 1652827-1652851 | 2 | 0.92 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | CP019593.2 | 2337102-2337126 | 2 | 0.92 |
CP019593_4 | 4.1|826294|31|CP019593|CRISPRCasFinder | 826294-826324 | 31 | CP019593.2 | 771244-771274 | 2 | 0.935 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 242724-242748 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 242782-242806 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 242840-242864 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 336523-336547 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 606204-606228 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 871219-871243 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 984949-984973 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 1085166-1085190 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 1085277-1085301 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 1085331-1085355 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 1829607-1829631 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 1927279-1927303 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 1927389-1927413 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 2291980-2292004 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 2302728-2302752 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 2302783-2302807 | 2 | 0.92 |
CP019593_5 | 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | CP019593.2 | 2302838-2302862 | 2 | 0.92 |
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44. spacer 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR matches to position: 1927389-1927413, mismatch: 2, identity: 0.92
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48. spacer 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR matches to position: 2302838-2302862, mismatch: 2, identity: 0.92
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49. spacer 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR matches to position: 2440900-2440924, mismatch: 2, identity: 0.92
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50. spacer 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR matches to position: 2737796-2737820, mismatch: 2, identity: 0.92
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cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacatagtagcaggcgg Protospacer **************** *** *****
52. spacer 11.1|2337198|26|CP019593|CRISPRCasFinder matches to position: 871006-871031, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagaagctggtgg Protospacer *************.*********.**
53. spacer 11.1|2337198|26|CP019593|CRISPRCasFinder matches to position: 1289804-1289829, mismatch: 2, identity: 0.923
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54. spacer 11.1|2337198|26|CP019593|CRISPRCasFinder matches to position: 2115264-2115289, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacaaaagctggcgg Protospacer *************.*.**********
55. spacer 11.1|2337198|26|CP019593|CRISPRCasFinder matches to position: 2469094-2469119, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagtagctggcgg Protospacer *************.** *********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019593_1 | 1.1|260755|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 260755-260779 | 25 | NC_014792 | Enterobacteria phage vB_EcoM-VR7, complete genome | 154175-154199 | 3 | 0.88 |
CP019593_1 | 1.2|260811|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 260811-260835 | 25 | MW117966 | Synechococcus phage S-H9-1, complete genome | 42366-42390 | 4 | 0.84 |
CP019593_3 | 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | NC_041884 | Acinetobacter phage vB_AbaM_ME3, complete genome | 74208-74232 | 4 | 0.84 |
CP019593_1 | 1.2|260811|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 260811-260835 | 25 | NZ_CP038259 | Acinetobacter baumannii strain 39741 plasmid pEH_gr13, complete sequence | 11151-11175 | 5 | 0.8 |
CP019593_1 | 1.2|260811|25|CP019593|CRISPRCasFinder | 260811-260835 | 25 | NZ_CP047617 | Lactococcus raffinolactis strain Lr_19_5 plasmid pLraf_19_5_1, complete sequence | 79395-79419 | 6 | 0.76 |
CP019593_7 | 7.1|1829653|35|CP019593|CRISPRCasFinder | 1829653-1829687 | 35 | MT150133 | Enterobacteria phage vB_EcoM_IME540, complete genome | 25913-25947 | 11 | 0.686 |
CP019593_7 | 7.1|1829653|35|CP019593|CRISPRCasFinder | 1829653-1829687 | 35 | MK234886 | Escherichia phage AnYang, complete genome | 114962-114996 | 11 | 0.686 |
CP019593_9 | 9.1|2104199|34|CP019593|CRISPRCasFinder | 2104199-2104232 | 34 | NC_027332 | Acinetobacter phage YMC13/03/R2096, complete genome | 68639-68672 | 11 | 0.676 |
CP019593_9 | 9.1|2104199|34|CP019593|CRISPRCasFinder | 2104199-2104232 | 34 | KY000079 | Acinetobacter phage AM24, complete genome | 74925-74958 | 11 | 0.676 |
1. spacer 1.1|260755|25|CP019593|CRISPRCasFinder matches to NC_014792 (Enterobacteria phage vB_EcoM-VR7, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
ggcgaaaatacagcttacaataatg CRISPR spacer gacgaaaatacatattacaataatg Protospacer *.********** ***********
2. spacer 1.2|260811|25|CP019593|CRISPRCasFinder matches to MW117966 (Synechococcus phage S-H9-1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ttggaacagcaatttctactggtat Protospacer ******************* *..*
3. spacer 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder matches to NC_041884 (Acinetobacter phage vB_AbaM_ME3, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
gcttgtagaatttcttttcgaaatt CRISPR spacer tcttgtagaagttcttttctaaatc Protospacer ********* ******** ****.
4. spacer 1.2|260811|25|CP019593|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038259 (Acinetobacter baumannii strain 39741 plasmid pEH_gr13, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.8
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ctggaacagcaatttctccagaggt Protospacer .**************** **** .
5. spacer 1.2|260811|25|CP019593|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047617 (Lactococcus raffinolactis strain Lr_19_5 plasmid pLraf_19_5_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ctggaacagcaatttctacattatc Protospacer .*******************
6. spacer 7.1|1829653|35|CP019593|CRISPRCasFinder matches to MT150133 (Enterobacteria phage vB_EcoM_IME540, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
ccaacatagagaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer atggtatagagaattttgaaaaagaaattctcttt Protospacer ....***********..************* .
7. spacer 7.1|1829653|35|CP019593|CRISPRCasFinder matches to MK234886 (Escherichia phage AnYang, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
ccaacatagagaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer atggtatagagaattttgaaaaagaaattctcttt Protospacer ....***********..************* .
8. spacer 9.1|2104199|34|CP019593|CRISPRCasFinder matches to NC_027332 (Acinetobacter phage YMC13/03/R2096, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tgctggtaccacgatgcgtcttgatgtagtgcta CRISPR spacer gatcaataccacgatgcgtcttgaagtggtagaa Protospacer .....****************** **.**. *
9. spacer 9.1|2104199|34|CP019593|CRISPRCasFinder matches to KY000079 (Acinetobacter phage AM24, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tgctggtaccacgatgcgtcttgatgtagtgcta CRISPR spacer gatcaataccacgatgcgtcttgaagtggtagaa Protospacer .....****************** **.**. *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
708694 : 716514
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019593|708694:716514|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTTCGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTCTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCAAGTGGAACAATAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCTATGACTGGTACTAGACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGCTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGAATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGATAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCAGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAATTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTTAAGTAAGAAAATATTTGTCTGAACTACTTATCACTAAAAAACACTTCTGATATAGCGAATTAAGAATATCAGAAGTGTTTTTTAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCAAAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTATTATTATTTTCAGCAGATTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAATAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCTACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGCAATCACTTCATCTAATTTTTTTAAATCAGGCGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTTACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGCTGAAAAATTAAAATCTTTATTTAATTCGAATTGATATGGATGCGTTGTACTAGGATAGATTTGTTGTAACATTTTAAAGCGCTCCTTTACTTTCAAGATATTGATTTAGTCCACGTTGACGTAAATGACAAGCTGGACATTCACCACAGCCATCCCCAATGATACCGTTATAGCATGTTAATGTTTTTGTACGAATATAATCTAAAACTTCGAGTTCATCACTTAATTTCCACGTTTCTGCTTTGTTTAACCACATTAAAGGAGTATGAATAACAAAATCTTTGTCCATAGCTAGGCTTAATGTTACGTTCATTGATTTTATAAAACTATCGCGACAGTCTGGGTAGCCTGAAAAGTCTGTTTCACATACGCCTGTAATAATATGCTTAGCCCCAATTTGATAAGCTAGAGCACCTGCAAACGACAAGAAAAGTAAATTTCTAGCTGGAACAAATGTATTAGGTATACCATCTTCATTATTAGTAATTTCCATATCATGTTGTGTTAATGCGTTTGGAGTAAGTTGTGATAATAATGACATATCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGACCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATGTTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGCCCGTTTTTAATTTATAAAATAAAAAAAGCCTATCTCCATAAAAGATAGACGAAAGAAATGGGTTGCTCCTATAATATATATTAAAGGTTTACCAACGAATGTTTGAAATTTCAATGTCTAGTTTTTTATAGAGGGTTTCAGCTAGGAACCTCTGATATTCATTTATGTACGATGAATAGAATATACCATATATTAGTTAAAATCAAGGTCAGGATAATGACAATGCCTTTAAAGTTTTAGCTACATCCAATACATATTATAAAAATAAAACACATTTAGAACGGAGTATACAATGATTCTAGTCATAGATAATAATGATTCATTTACATATAATTTAATAGACTATATTAAGACTCAAACGAAACTAACAGTTCAAGTTGTTGGTATTGATAATCTGCTGATAGAAGACGTCATTAATATGAAGCCAAAAGCAATTGTTATTTCACCTGGGCCGGGTAATCCGGATGATTATCCTATCTTGAATGAAGTGTTAGAACAATTTTATCAGCGTGTACCTATACTAGGTGTATGTTTAGGATTTCAATGTATCGTGTCTTATTTTGGTGGAAATATCATTCACGGCTATCATCCTGTACACGGACATACTACACAGTTACGCCATACCAATGAAGGTATTTTTCAAGGACTGCCTCAAAATTTCAATGTAATGCGTTATCATTCATTAATTGCTGACGGAGCTACTTTTCCAAATTGCTTAAAGATTACAGCAAAAAACGATGAAGCGATTATTATGGCAGTTGAGCATATTACATTTCCGGTTTTTGGTGTGCAATATCATCCTGAATCTATTTTGAGTGAATACGGTTATCGACAAGTTGAATTATTTTTATCGAAGGTAGGTGATTACTGTGAGAATAGAATATAATTATCGCTACTATTTAACTGAAAATGAATATAAGCAATACCATATTCAATTAAAGGGATTTATAAAGAAGTATGTTGCCACTAAGTTGGCTGATGTGGGAGAAGTGATACACTTTGCACAAGCGCAGCAACGACAAGGTAGATATGTTTCGTTATATTTAAGTTACGAAGCGGCAAAGTACTTTAATCATGTTATGTGTTCACATTCATTAGCTAAAGATGATATTTATGCAGTAGCTTATAGTTTTGAAAAAGCGGAAAGCATAAATTCAACATATGAACATCAAACTTCTTATGTATCAAAGCATCATTTTTCATTTGTTGAATCTTCTGAGGTTATGATGACTAATATTAAACGTGTCCAACAAGCAATTGTTGAAGGCGAAACGTATCAAGTGAACTATACGGCGCGCTTAACGGATAACATTTATTATCCTATTAGTACTTTATATGAACGATTAACTCAATTTAGTAATGGTAATTATACTGCGTTATTACAAACAGATGAAATCCAAGTAGCATCTATCTCACCAGAATTATTTTTTCAAAAAGGACAGTTTAACAATGTCGATAACGTTATCATAAGCAAACCGATGAAAGGGACAATGCCTAGAGGTAAAACGGAAGCTGAAGATCAACAGTATTATAAAACATTGCAAACTTCTTCGAAAGATCGTGCAGAAAATGTCATGATTGTTGATTTACTAAGAAACGATATAGGGAGAATATCACAGAGTGGCTCAATTAAGGTGTATAAACTATTTTTCATTGAGGCATATAAAACTGTATTTCAAATAACTTCGATGGTAAGTGGAACTTTAAAAACTAATACAGACTTAACTCAAATTTTAACATCGTTATTTCCTTGTGGTTCGATTACAGGTGCACCGAAACTAAATACAATGAAATATATTAAACAATTAGAAAGTTCACCTCGTGGTATATACTGCGGAGCAATTGGACTATTACTTCCAACTGAAGATGATAAAATGATTTTTAATATTCCGATTCGTACTATTGAGTATAAATATGGACAAGCGATTTATGGAGTCGGAGCAGGTATTACAATTGATTCTAAGCCAAAAGATGAAGTGAATGAATTTTACGCAAAAACCAAGATTTTGGAGATGTTATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019593|708694:716514|709749_710436_-|ARH71414.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >CP019593|708694:716514|708694_709750_-|ARH71413.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >CP019593|708694:716514|711945_712530_-|ARH71417.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDESAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLFWQKVYKF >CP019593|708694:716514|713766_714435_-|ARH71420.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >CP019593|708694:716514|714785_715379_+|ARH71421.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAVEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >CP019593|708694:716514|713345_713765_-|ARH71419.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >CP019593|708694:716514|712628_713342_-|ARH71418.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >CP019593|708694:716514|711224_711665_-|ARH71416.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLILGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >CP019593|708694:716514|715362_716514_+|ARH71422.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCSHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQITSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >CP019593|708694:716514|710410_710884_-|ARH71415.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIIVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
728484 : 742801
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019593|728484:742801|DBSCAN-SWA 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16 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
914658 : 967783
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019593|914658:967783|DBSCAN-SWA 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54 | Streptococcus_phage(33.33%) | protease,bacteriocin,holin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
986456 : 994929
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP019593|986456:994929|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP019593|986456:994929|989686_991876_+|ARH71684.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYEDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLADSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPIVGMVGLIENVDYLNDFQPQVGDKLYVIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESIDLSSEVKKGESIKTAIRQGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSLIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >CP019593|986456:994929|989022_989694_+|ARH71683.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >CP019593|986456:994929|988053_988758_+|ARH71681.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >CP019593|986456:994929|986456_986939_+|ARH73469.2|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILATRMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >CP019593|986456:994929|988757_989021_+|ARH71682.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLEDEKENA >CP019593|986456:994929|993331_994360_+|ARH71686.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIETNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >CP019593|986456:994929|986925_988050_+|ARH71680.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >CP019593|986456:994929|994362_994929_+|ARH71687.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLDSFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >CP019593|986456:994929|991854_993339_+|ARH71685.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKMLAQESPVKADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLRHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1251175 : 1257935
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP019593|1251175:1257935|DBSCAN-SWA TATGAATTGCTATGATGAAATATACAATACAATCAAAAAATTGATAGAAAACAAAGAGATATCGAGTTATCAAATTAATAAAGATACTGGGATAAGTTACGGTAATATTAATGCTATGCGCCGTGGAGAAAGAAGAATAGAAAATTTAAGCTTAAAGAATGCAAAGATCTTATATGAATATGCGAAAAAGGTATTATAATATAAGCATTGAGTTCAATAGGCATACAATAACTGCCCAAACTAGTGACTGAGTGGGTGTTTTTATAGTATTAAAAGTTTTCTAAAAGTGAAAGAAATCATGTTTAGTGGTTTACTTATGTTTTTCAAAATAGTATAATAATTTTATATAATACATAGAACTTCAGTATACCTTTTGAGTATATATGGAGTTCTTTCTTTTTTACAAGATGTATATGTATAAATGGAAATGTTTATTACATTACATAAAAACCTTTAGGTGCTCTTAGATGGATGTTAATCATAAAACAAAGTGATTTTGAAAAATATAGGTTATTATAATTTAGAATTGGAAATTATAAATCTTGTCATTGGATATGGGAATTCAAACATATCACTTACAACAATTTGTGGAATGTTAAATAACTATAAAGAGGAAAGGAGAAAAAATGATAAGAATGGTTAAAGAAAAAGAACGAATAGCAAAATTAAATTTCGAATAGCTGTGACGAGCATAATAATTCAAGTGCTTAATTTTATCAAATCGTTCTTTTAAAAAGGTAAAGAACAAAAGACCTTTACCACATTAAATAGGGAGGTGGTATTTATGACAAGAGAATTAAGGAAAAAATTAACTCTCTATCTTAACATTGCAACTTTAATATTATTTATTATTAATTTAACAAGAAAAAAATAAAATATTCTTTAATTTTTACAAAAATTACGAACCAGTTTAAAGAAATTTATAATACAATAGAAAAATTACTAAATGATAAATCAATATCTAATTATAGAATTAATCAAGACACTGGTGTTTCTTATGGTGGTATAAGTGAATTAAGAAGCGGGAAAAGAAAAGTGAATAATTTAACTTTAGAAACAGCGGAAAAACTCTATAATTACCAAAAACAATTAGAAATAATGATTGAAGATTAAAATAAGGCCATATCTTTTGAAATATCATGGAGTGAGCCTTTTAAATCATCTAATTTTAAAGTATATTAAATATGGATAGCTTAATGTGAATATAAATAAAAAATTATCAAATAATATAATATAATATAGAATAGATTGAGACAAGGAATTTTATCAATATATAATAAAAAACGCCAATACTATTAGGCATTAGTTTATGAATTAACTAGTTTGGCAACTACAAAGAAACAATGTATTGCTAAACGTAGTTACTGCATTAGGATAATTATAATTATAAATAGAAAGAGAGCGTGATTAAAAATGAATGAGATTGAAACTATTATAAGTGAAATAGAAAAGTTATTAACTAACAATACACCATATAGTATTTCAAAAAACTCAGGTGTACCACGTCAAACAGTTACTGATTTAAAGGTAGGTAATACTAAAATAAAGGATGCCAAATTTAAAACAATAATCAAGTTATACGAGTATCAAAAGTTGTCAGAAAATAATTCAGAGTGCTAATAAATATACCTTGTTTGATTAGGTGGACAAGAAATTAAATTTCTAATGATTTCATGGTTGTCTGTCCATGCTTTGTCCACCTCAATAAAATTATCTCTAGGTTTTTAAAATTGTACATGTTTAAACAATCAAATGTATGCATTTTTATATTATCATTTCCATAAAAATTTAAATGATCTTTAAGTGATGATATAGAAGGCTGAACACAGTAAATAAGTTAACTTTAATGCAGTATTCTATACTATACATATTTTGTAATAATGTTTATGTGCATAATTTTTCATTGACAATTTTTTATATTAAATTGTGTAATTGGCATATATGATGATTTGTGATAATTATATTGTAATATAGCATTTGGTTTTATGATTCTAAAATTAATAGATTTGAAAAGTATACTTTATTTCATGAAAGTTTTTGGTACATTTATTTGAAAATGTTTTTATTACAAAGTTACATGCCTAAATGTTTCTTAACAAAATTAATTCATCGAGTGTAAAGAATCGTGTGGTAAACATAATTTATATAGATTATAAGGAGGTGAAAATGGTCGAGGAAGTAAAAACGATAAAATAGTTTGAATGTTTTGATTTTAATTCTGATAGGACTATTGAATTTGCAAACTAATAAGAATGTGAGGTTTGATTTAATACGAAGTCATATTCTTTGAATAAAATATTACTTTCTCACCATTAGTAAAATGAAGATGACTATTAAAGTGCGAAAAACAAATAAAAAAGAGAAAATAGAATTTTTAATAGGGACGTTTATAATTATTTTAGTAATATTAGGGTTCAAAATTATGAAATAAATGTATAGTATTTGAGAAGTCTATATGACTCCGGAAAAATTAAAGTCTAAAGATATCTCTATATCTCAAATTTAATAGACTACTGGAGTTAGTAGTTTGAATATTGAAAGACACTAATCTAATAAAAATACATAAAAGGTTAAACATTGAAGTTTAGTAAAAGGCGTAAGGTATACAAGACAAATCGTTTGTCTTTGACAAAGTAATTGATGATGAAAAGTTGTTAATATGTAGAAACAAAAATTGAAAATATGAAATTTAACTATTATGAAGTGATGATAGCTATTAATGAATAGAAAAATAATAAAATCATTTATAAATAAAAAATACGTTGAGTTCACAGAATTTCGAAAAAAAGTAGTAAACATTGTACAGATATGGAGATGAAAAAAATGTCAGAATACAAGAAAAAGATAATTGAATTAATTGAAAGTAATTTAACAGGATATGAAATTTCTAAAAAAACTGGAGTTTCTCAATATGTACTTTCACAATTAAGACAGGGCAAACGCGAAGTAGATAATCTAACCCTGAATACAACAGAAAAATTATATGAATATGCCAATAAAGTTTTGTAATATAACTACTGTATAAATTAATCAAGCTATGTTTATTTGATTAAACTATTAATAAAAATCATATGGTGAATAGATATTATAATAATTAAAATACAAAAATAGTAGATTCCAATTTGTGAAAAAGGAGTATGTCGTTTCATTTAGAATTTATTGCACGAAATTAGCATCGAATAAGGGAAAATAAGTGTTAAGTTTTAAATGATAAAAAAGATTGGAATGGATCGTCTTGAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTCAATGTCTACTTCGAAGGGGGCATTTCCATTAAATTGTTATAGCTATTTATATTTGTATAATGAACATATAAGGTTAAGTAGGTGCGAGTGAAGGAAATAAAAAAGCTCAAATGTACTAAATTTTTAATCTTAATAAATCTCTACTTTATAAAGATTGAATGGACATTCGAGCGTTAATCAGTCAGGAGGGAATTTCACTCCTACAATGTAATAATAATACTTGCTTCACCACTATACAAGGAGTGAGTTGTTATGTTCAAAGTGAATTATTCGATTTTAAGTTATTATCCAGATATTTATCTCCATAGTAATTTAGCTGTAGGTGTGGCATTTGAAATTATAGGAGAAAGTTATCATAAGAATGAAATTAAATTTATAACCCAAAGAAGAAAAATTTCATCATTTGATGATGAAATAGACAATTTAGTACTTATTAATATGTTTTTGGATGGACTTAAATGTGAATTCGAACAAACTAATCAATCAATAAAAAATTATAAGAAAAAGTTTGTTAATAATTTTTACTTTGAGAATATTGAATATAAAATGTTTGACTCATTAAAAGAAGTTAATAATTTTATTGAAAAAACATATAAATATGTATTACATATTGGTTTAGATAAAAAAGAAAGACTTAAGAAAACTGAGAAAGAACTTTTGAATAGCTAAGTAAAAAGGTCAAACATATTGTTCTGAATATAAATAAGTAATAACCGTACCTTTATTGATGCGGTTATTTTTTATGTAAAAAAACGAAAAAAGTTTTAAAAAAAGTGTTGGATACAAAACAGGTTGGAAAGAGAAGAAAAAATGACAAATATCGCAAAAGCCAAAAGCGAAATCTTCCGCAACTACACTTTAGGCTTTGCAACACTTGCCACAATAATAAAAATGTTTTTTATAGAGGGGGATATCCCCTCCCTCGTATTATATTACGAGGTGATGAAAATGACAAACTTAACTAAAATTAGAATAATAATCTTTATTAATTATCTAATCGGAATTTTAGCTTTAATATTTGCCTTTTATATAATCTTAATGTCAATAGCGGTTTAAAAATGCTGTTTTATGGCGGTTTGAAAATGTAGTTTTTTAGCAGCTTAAGATTGTCGTATATTTAATGATTTTTCGGTTTTATAATCTTTTAATCGATATGATTCTCCAGTAATTTTAAATACTTTTGAATGGTGAACTAACCGATCAATTATAGCTGCTGATACAATCTTATTACTAAATGACTCTCCCCAACTCGAAAATGTAATATTAGTCGTAATTATTGTTGATTTCATTTCATATTTTAGTGACATTAACTGGTAGAATAAATCAGCTTGTTCTTTGGTGATGGCAGAATAACAAATTTCATCAATGATAAGTAACTCTATTCTGCTTAATTGTTTTAATGTTTTATTAATGATTTCTTTGGAATCTGTGACAGTTAATAAGTCTATTAATTCTTTGAAAGTATAGAATCTAGTCTTTATATTTTGTTTACATGCCTCAATTCCTAATGAGATTGTTAGGTGTGTTTTACCAACAACACGGTTATCTAAGAAACAAATATTTATATTATCTTCAAAAAATGTTATTTTTTTAGTCTCATTTTGTATTTTATTTTTACAGTATTCTCGTAGAATAGTATATTTACCTTCATATCCCTTTTCCTCTATATATTTAAAAATGGCCATAGCTGTATATCCTAATTCAATTTTTTTATTATTAATTTCTTTAAATGAATCTAGTTTTGATGTTTACTTATTTTGTTGTCTTTTCTTCAATCGTTCTAATTCATTTTCTTTTCCTGCTTCATAATATTTTTTAACTGTTATTGGATCACAATTATATTGTCGACCAAGCTCAGCATAATTTGGTTTAATACCTTTCGTAATGTAAAATAGCACTCCTTCATAAATGTCATGTCTCAATTAAATAAGCTCCAATCGAAGATTGAGTTAAAACATGATTATATAATTTAAAAAAGAAAAAATGTATTATAAATCAGTACGTCAAAGGAATAAGGATATAGAAGTAGATATAATTTCTAAAAATACCAATTTGAATTAAAACCTAGTTAAAAGAGCGTATGAACATTTGTTTAAGAATAAATATGATTAGATAACTGTATTAATAATTTCTATCCAGATTATAATATTGCAGTAAGTTGGCAATGTTTAAGAGAAGGAAAAACAATAAAAAACAAGATTTAATACTACTTCGTCAAGAGGCACTTGAACATTATTTGATGAATAAATATAATTATTACTATAGAGAAGCACATGGGATTGTAGAAAGAAAATACAATTTTTCTAGTTATATTGAGAAATAGGGTGATATGATTGATTATTATGAGAAAGTTAAAAGAAGATGATCAAGTTATTGTATATGAGTATATTCCACAAGATAAAATAGAAAAAGGGAAAGGTGAAATAACAGTAAATAAATTAGATTCAAAGGTAATTGACTATAAATTATCAAAAGTTGAAAATGAAAAAGGTATTTTAGTTTATAGAGATAAATCATTTCATGCAATATTAAATTTTATTGATGAAAATAAATTTCCAAATGAATATATATATGCATGGTATTAAAGCATCCTTTCTACATAGATAAAGAGAAAGTGGTGCTATTTTTATATGCTTTTTTAACTATTTACTGAAATAGCAGAATCACAAAAGTTAACATATTTAAAAGAACTTGGTGAAGATGGCGAATATAAATATGTTGCCAAAATAGATAGTAAAACATCTAAATTATGTCATTCACTCAACGGAAAAATATTTAAAGTTAAAGATATGATACCAGGTGTGAATGCGCCACCTATGCATCCTTGGTGTAGAAGTACCACAGTGCCACATGTCGGCAGTTGGCGAGACAAGTTCTTTAAAGAGCGTGAAGGTAAATATCAAGTAGAAGATGACACAACCAAAGATGAATTACAACAAGCTAAAGTATTAGGAAAGAAAATATATATTACTGATCAAGCGATTGATAAAGTAAGATACGTTGATATTCCAACACATACCAAAGAAGAAAATCAATTTATACAAGAACAACATAAAGCCTTGCTTAAAGACGCCAAAGAAAACAATGATAGCAATGAAGTAGCTTATTTATTAAAAGATGGTAAAGTTACAAAAGTATATGGTGATCAAGATAGTGTATCTTTTGCACCAGGGGAAAAAGAAACAGAATTGTTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGGCAGTCTAGTTTTTCTCTTACAGACTTGTATTTATTTATATTTAATAATTCTATTAAAACACTGACAATTGTTACAAATAAAGGTCAAACAAAGTACTTAACTAAGACAAAAGAATATTGCAAATCAACTTGTATTGATTGTATTAAAAAATATAATAAAAATAATAATATAAAAAAATTCAATCATAAGGATATTGATATGATTCTAAAGAGATTATATAATAGTGGTAACATAATATATAAAGTTAGGTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP019593|1251175:1257935|1256774_1257026_+|ARH71941.1|DBSCAN-SWA MIIMRKLKEDDQVIVYEYIPQDKIEKGKGEITVNKLDSKVIDYKLSKVENEKGILVYRDKSFHAILNFIDENKFPNEYIYAWY >CP019593|1251175:1257935|1253997_1254183_+|ARH71937.1|DBSCAN-SWA MSEYKKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYEYANKVL >CP019593|1251175:1257935|1257095_1257935_+|ARH71942.1|head|DBSCAN-SWA MAESQKLTYLKELGEDGEYKYVAKIDSKTSKLCHSLNGKIFKVKDMIPGVNAPPMHPWCRSTTVPHVGSWRDKFFKEREGKYQVEDDTTKDELQQAKVLGKKIYITDQAIDKVRYVDIPTHTKEENQFIQEQHKALLKDAKENNDSNEVAYLLKDGKVTKVYGDQDSVSFAPGEKETELLFNSKPNSIVMLHNHPGQSSFSLTDLYLFIFNNSIKTLTIVTNKGQTKYLTKTKEYCKSTCIDCIKKYNKNNNIKKFNHKDIDMILKRLYNSGNIIYKVR >CP019593|1251175:1257935|1255541_1256126_-|ARH71939.1|DBSCAN-SWA MAIFKYIEEKGYEGKYTILREYCKNKIQNETKKITFFEDNINICFLDNRVVGKTHLTISLGIEACKQNIKTRFYTFKELIDLLTVTDSKEIINKTLKQLSRIELLIIDEICYSAITKEQADLFYQLMSLKYEMKSTIITTNITFSSWGESFSNKIVSAAIIDRLVHHSKVFKITGESYRLKDYKTEKSLNIRQS >CP019593|1251175:1257935|1252587_1252794_+|ARH71935.1|DBSCAN-SWA MNEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGNTKIKDAKFKTIIKLYEYQKLSENNSEC >CP019593|1251175:1257935|1253494_1253605_+|ARH71936.1|DBSCAN-SWA MKMTIKVRKTNKKEKIEFLIGTFIIILVILGFKIMK >CP019593|1251175:1257935|1254693_1255110_+|ARH71938.1|DBSCAN-SWA MFKVNYSILSYYPDIYLHSNLAVGVAFEIIGESYHKNEIKFITQRRKISSFDDEIDNLVLINMFLDGLKCEFEQTNQSIKNYKKKFVNNFYFENIEYKMFDSLKEVNNFIEKTYKYVLHIGLDKKERLKKTEKELLNS >CP019593|1251175:1257935|1251175_1251373_+|ARH71934.1|DBSCAN-SWA MNCYDEIYNTIKKLIENKEISSYQINKDTGISYGNINAMRRGERRIENLSLKNAKILYEYAKKVL >CP019593|1251175:1257935|1252059_1252287_+|ARH73476.1|DBSCAN-SWA MFTKITNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTGVSYGGISELRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED |
9 | Staphylococcus_phage(83.33%) | head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1470276 : 1535294
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP019593|1470276:1535294|DBSCAN-SWA ATTAGTATACAGCTAGTTTTTCTAATTGTTCTTTAACTTGAATTAAGTTTGACCGTATTAGAGAGGCGGATTGATCCATCGTTTGAATTGCTTGTCCTTCATTTTCGTTCAAGCCATTACAAACAACTTCAAACTGTTGTGCCATTTGATCAAGACGCGCATGAGCTTGTGTGTTTAAAATAAACATATCGTCATAATGTGATGGTAAATTGACATTTCGTCGTTGTACGCAAATGTATAAAACCCTTGTTATACCAAGTTCTTTATTATTTTTAACCTTTTAGATTTTCCACAAGCGTTTGCCCTTTTTCAAATAATCTGCCCTTTTTTTGCCCCGAAAAAACACAAAAATAACCACACTCCTAAATTAATAGGTGGTGTGGTTTTGTTGGTTGTAGGGGGAGTAAAATAAACACACCATTTAAGATGCGATCTATACTGATTCACCGATAGGCGAATTTATTAATTTTTCCATTCTATGCTAATAACATGTGTTCTTCTCATTCTTCGATATGAACTGTTTTTACCCAGAACGTACATAGTCGCCGGACTATAAAAATCATTATTGTTAGACTTCCTTAACCCGAGTATCATAACTTGGCTGTTCTTGTCATCTATAAAAGCTACATCAATCTTTTGTGGATTAATTGAATTTTTTGGAACTATAACGCATAGCCTGATTTCTTTATCAATAAAGCATTTATGCAAAAAATTATAATTGATAAGCCTATCTTTAATGTTACTATATTCATAATGTTTTTTTATAGATTCGTGTGTAATTTTCCCTTCAGCTATTCTTCCAATGATCTTTTTAGCGCTCACTTTTTTATGTGTGTAATGCAAACCTAATAAGTGGGGTAAATTATTTTTATGAAAATTTATTTTAAAGATGGGAAGCAATTTATATTTCGTTTTAATTTCCACATAACCTTTGCAAAAGCAATTAATAAAATCATTCAAGATGTCTTGTAAATCAACATCGTTTTCACTATTTATTTTTAAATACGTTGTGTTCCCCACCTAGTACACCCCTTAAAAAATATCCCTACAAACATTAATGTAAGTAGGGATTATGTATATGAGTGATGGCAAGGAAGAAGTCTCCTGCGGGACCAACAGTCAGATATATGGCCTCTGCCGGGCTATACAATTCACTCCTGATTGTATATAACTAAATTAATAGTTACTTGACGAACTAACTACGAAAGAATGCAAGTTAGGAAGAAAGAACGGAATAGAGAGTTGACTTTCTTCATAGTTAACTATAATATCTTTTAACTTTATACGCAATAGATATGAGTAAATTTTTCATACTTTTTATTAGATAGAGTTAGTTTTGGTTAACTTGCGTTATATATAAACAACCACCCAGTAACTAGTATGGGTGGTTTAAATATGCAGTCAGCTTCTTACTGCTTTACGCAAGTAAGTCCTCTGCATAGCCGGATTGACTACCGGAAATGTAGTTTTAAGCCAGATTGGTTACTGGAAATGTAACTCTATTATAACATAAAAAATAGGCAAGTACCGAAGTACCTGCCTACTACTCACAATTTCAACTTGAGAGAGAAATGTTAAATACAGTATGTAGAAATAATACCACAATTGTTTTTTAATGTAAATAAAAAAGGCGAATGCATTATGCACTCGCCAAGAAAAGGCTCACCACAATTTTATATTAACTGATTTCTCCCCATAAGTCACCTAATACCTGATTAGGCGGGGCAGAACCATTCCATGTTCTAATAGGCAAGTAATAACGTTGCCCCTCCCATGTATATCCTACCCAAACATGATTATCTTGTAACATAACTTCATCATAATCACAATACCCACCAGGTTGGAACTGATAACCCACTGGACAAGATAAGAATGGCCCCACTTTTCTTACTGTGATTGGTTGATTGCCGTTTGTGAATCTAGCATTTTCTTCCATGTAGTAAGTACCATATTTATTACGTTTCCATGCACTCGCAACTGGTTTAACTGTATTACTTGAAGCGCTTGACTCATTAGAGACAGTGGCAACCGGTATTTTACCATCCATGTACGCCCTAATCTGCTTGATAAAGTAGTCTTTAAGTTGCAACCGCTTGTCTTCTGGCAATAGACCGCGAGTTACTGGGTCAAAACCAGTGTGTAAAACCGAACTTCTATGAGGGCATGATGTTGAAGTAAATTCATTGTGCAATCTGATTGTATTTCTGTTTGCTGGTAATCCCCATTTTTTCAACAATCTAGCGCATTCTTGGAAAGTTGCCTGTTCATTTTTTAAGAATGTCGCGTTATCTGCGCCCATTGATTGACATACTTCAATACCGTAATAATATTTATTACCTATTTGATTAGCGGTATGCCAACCTACTTGTGATTCATCTAAGGCTTGCCAAACTGTGTTACCTGATACGTAACTATGCGCAATGCCCGCTTCTAATCTTGATAAAGGTGCATTTACTAATCCGTTACGATATGCTTCAGCAGTCGCCCCTTTGCTCCCTGCGTCGTTGTGTATAACTATACCTTTAGGGTTACTACCACGCTTAGGTAGGTCATAACCTTTAACCACATCTTTGATGATTTTAAGTTCTACTGCTTTAGGTTGTGGCTTAGCTGTTTCTTTTTTAGGTGCTTGTGTAGGAGATTGAACTGATCGTGGCGCTGTCTCACTTTTAAAATTCGGACGGATAAACCACATAGGGAAATCATAAGCATGTTGTCGTCTTGTAACTTTTTCCCAACCCCAGCCGGGTTGTTCGATTCCGTCAGTCCAGCCACCGCCTAGCCAATTCTGCTCATATACAATGATATAATCTAAAGTTGCTTCAATTACCCATGCTACGTGTCCGTATCCTGCACCGTAATTGCTACCGAATACAACCATGTCGCCGGGTTGTGCCAAAAAGTCCGGTGTATTTTGGTATACAGTAGCTAGTCCATCGAAATTGTTTGCAAATGGTATATCTTTTGCACCTAAACCTTTCAGAAGTAATCCAAACAAAACTTTCCAACCAGCATTGGCATAATCAAAGCATTGAAATCCATACCATAAGTCCACATTGAATTGTTTTCCCTCAGAAGTTTTCAACCACTCTATAAACTCTTTTTTAGTTAATTTTGCTTGCATTGTCGCCACCTCCATGATGATACTCATTCACATCAAAGCCAACATCGTTAGAGGCGTCTGTGAAAGGTTGTGATGTATCATATTCTTTTGGTGCTTTCGCGCTTAATTCCGGCGTTAAACTACTGTCTTGTGATGATTTCCACGTAACTTGTTGTTCTTCTTTTTTGCTATCTCTAGGCGCTTGATATGTCTGTGCTATAGATGAATCTGAGACGCCTTTTGACGTTGGGTCAGTAATAACACCAATACCTGTAAGTAACGTGAGGATAGCGCCTATAATAGCGCTAGCTTGATTTAATTGAGTGGATAAATCTAATCCGAACAAATCCGTGATTTGCTTGATAAATAGCAACAACGCTCCAACTAAACCAGTTAGTACTGCTTTATTTTTGAATCTCAATTTCCAGTTAATATCCATTTGTTTGCTCCTTTTATCCAAAATAAAAAGCCAGTGCCGAAGCACTGACTCTTAACTATTACTTACACTTACTAAACCAGAAACACGACCAAAAGCTATATCCTAAAATTCCCTTAAGCATGGTAATCACCTCCTTTAAATGCCAAAAATAGTTTTTAACAAGGCTATAACAAATGTACTTAGAATCGTCCCTATTAATCCTAGAATCCACATCTTGATGTCTCTAATATTTTTAGCATTTTTCTCTTTATTTTTTTCATCTTCTTCTTTGTCACGCCTTAGTTCTTCGAAATTTCTATCTAACTTGTCATAAATTTTTTCTTGCGTTCTCAGACTGTCTTCTATTCTGTCGAATTTTTCAAACATAGTCTTATCATTTTCTTCTAATCGCGTTAAACGCCAATCTTGTTCGTGTCGTTTGGTAAATCCAAACATTACACCACCCACTTTATTCAAATTAAAAAGCCATAAGATTATAACCTATGACTCTAGATTTTCTGGATACTTTTCTCCTGTAATAATTGCATATTCCTCTTTATCTATAACTTCCATATCTACATACCACGCTATATCTTCTTTACTATATTCTTTCAATTGATACCATGTTTTAATATCTTCGAATGTTGGTGAAATTAATTTAAGCATTTTCAGTCTCTCCTTTAACCTCTTCTAATTTTTTATTAAGTGTCACAAGTTGTTTTGCCATTAGTGCATTTTGCTTATTAACTTGCATCGATAACTTTGTACTTTGAACAACTTGTTTCTGCATACTAGCAACCATTTTTCGTAAGATGTCATCAGAAGCGACTGTGTTTTGTTCTTTACTGTCAATCTGTTGATGCAAGTCATCTTTTTCTTCTGAATAATCTTCGTTAAAAACTATTTCCCCATTTGAATATTTAAAGGCTTTAGGTCTAAAAACTTGAGAGAAATTTTCTGGTAAATTTTCAATATCAATACCTTCTTCAAAGCCACCAATGATAGCGTATGAAATTATCTCATTACGCTTGTTAACTAATATTTGCATTATTTTCTCACTCCTATAATTTTGTTAATTGTCCCTCTATTTGCGTTCGCACCAGAGCCTCTTTGACTTCCTAAGTCGAAATAGACATCGTTTGATATAGTTAAAGATGTACGACTAGATTTAGTTAATCCAAACTCATAAACACCTCCACCATTTCCATCACCATCTGGAAGATTTGAGGGATTCAATGAAATCTTTCCTCCTCCAAAAGGACTGCCAAACTCTGTAAAGTCACCACCTGGAAAAGTCCCATAAAAAATTAATAAAATAAATTGGTCTAAACTCTCATTTAAGTACAATGTAGAGCCCACACCATTTGCTGTTCCATCAAAAATAACCGAATACCTTTTATTAAACTTGTCATCTGCGTATAATTTAGCGTTACTTTCGGCCATATTAGCTTTTGATTGGGCACTTTGAACAGTTTCAAA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86 | Staphylococcus_phage(84.72%) | transposase,integrase,terminase,protease,capsid,head,tail,portal,holin | attL 1469137:1469154|attR 1532527:1532544 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1590416 : 1598728
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP019593|1590416:1598728|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATAGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTGGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATCTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGTGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCTGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCGATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACGTCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACCACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTTCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATATTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCAGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCCTGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAAAATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGAGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGACCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTAGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCGAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCTATCGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATAATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAATAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACATCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGACCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTCTTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCAATCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATCTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATTGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTAGTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCATCATTCAAACTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGCACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCTGCTTTTTCTTGCCGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATGTAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGACTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAATTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGTGCAACATCATTTAAAGCCTTTTGTTGCAAAATCGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTACGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTATCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGTGTTTCAGGACTATTTAAGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTACGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAGTAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGGCAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP019593|1590416:1598728|1592227_1593574_-|ARH72261.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKADVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >CP019593|1590416:1598728|1595598_1596705_-|ARH72264.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >CP019593|1590416:1598728|1596928_1598728_-|ARH72265.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIARNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPVNYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >CP019593|1590416:1598728|1591327_1592218_-|ARH72260.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >CP019593|1590416:1598728|1594790_1595468_-|ARH72263.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >CP019593|1590416:1598728|1593687_1594788_-|ARH72262.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDYHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGSIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADFKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIQGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >CP019593|1590416:1598728|1590416_1591202_-|ARH72259.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1668152 : 1677195
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP019593|1668152:1677195|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCATATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTCACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACATTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCTCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTATTTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAATATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAGTCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATATACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTATCAATAGCCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAATGCATCATGATTGACATCTGTGTCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTAAACTCTTTAATGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATCGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTGTTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAATATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAACGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAAAGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAAGCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTTGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTCGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCGGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGGTCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATGGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATTCTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTTGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAGTAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTTAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTAAATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGATTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATAGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCGTCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAATCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCAGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATACGTCCACCTTGGTCCATTTCTTTTATGCATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAGCATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATATTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCGCCAATTGTTACGGCAATCGCATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTTGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGTTTCAATAGTCGATTGGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCTAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTACCAGCTCGAGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTTACTTCCATTTCATTGGCAATAATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP019593|1668152:1677195|1676190_1677195_-|ARH72367.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDAIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >CP019593|1668152:1677195|1674001_1675141_-|ARH72365.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >CP019593|1668152:1677195|1668152_1668671_-|ARH72361.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >CP019593|1668152:1677195|1673722_1673983_-|ARH72364.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >CP019593|1668152:1677195|1675163_1676189_-|ARH72366.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSNRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >CP019593|1668152:1677195|1668692_1670966_-|ARH72362.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDVNHDALQLSDMTKAIDRIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSILPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPMSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCEHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >CP019593|1668152:1677195|1671168_1673448_-|ARH72363.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQYWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1800930 : 1848776
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP019593|1800930:1848776|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCATTTTTATTACGTCTTCTAGCTAATAATGCTGCGCCTGTAATTAGTGCTAATTCTTTTAATGGTAAATCCATTTCTTCAGAACCAGTATTTGGAAGTTCTTTTACAACTTTTCGTACTTCTTGTTTATCTACTTTTTTAATAGACGTACAAAGTTTTGGAGCAGGTTGCCCCACTTTTGGTAATACTTTCGTCGCTTCAGCTGGTAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAACAATGAATTGCGTATGTTGTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCAATCATTCTTATGCCATCTGCAACATATTGATCAATTAATGCTTTTACTTTAGCTAATTGTTCTGGTGTTGCGATCGCTTTGAATTTCGCATATGTTTGTTGAGCAATGTTATCAATGCGCAGTAAGCTATTTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCCTAATGCAACATTAAATCGTTTTAAAACTGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTGTTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAATGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCAGCCTTATTACGATCACTTACTTTTCGATAATTTTGCACTAAATGTGTAACACGTGCAAGATCATCATTAATCGTTTTTTCAGCATCTGGCTTTTTAATAGGATGTACATCTAAATCATGTATTGTTTGTAGATTTAATGATGCTGTTTTATCAACTTGTGCATTGCTACGATCTTGATCAATTTGTCCAATAGCAGTGTCATAAATGTTTTGTAACTGTGCTAAAATACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGAACATTCGCTTCAATTGCTAGTTTCTTATCGTTGAATAATGTTGTTAATTGTTCTCGCGCAGTTGCTTTTTTATTAATAACAGGTTCGATTTCACGAATTTCGTTTTTCCCATCATGCAATAAATATGCCACATCAGCATTAGTCACTGCACTAGCAATTTGTTGTTTAGCTTTAATTAACTCTTTTTCAACTTGTACTATTGCAGCATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCGTTATTTGCTTTAATTAAATTAATTTTATTTGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAATGCTGTTGCTTTAACTGTTGTCGCTGGTTTAATTTTTGAAATAATATTTTGAGCATCGATACTATTTTGATTAACTTGCGCAGTCTTATCTGCATGATTGATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGTTCTACTAAATGTTTAGCAGCTAATCTTTCTTCTTCGGTAGATAAATCACTTTGATCAATAAGTGCATTTTGAGCTTCAGCTTTTGCGCTGACAGATTGACGCGCTGCTGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAAAATCACTTTGATGTTGTTGTTACCATCAGCCTCAGTTTGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGTGCAATATCATTTTTAATTGCATTAACAATTTTATTTAACGCAGCAATAGCAACATTTCGTTCATCTTGCGTTGTATCTAGCGTATTTCGTATTGCATCGAGTTGATTATTATTACTTTCATCAATGTTATCCAACGCTGCACGTTTGCGTCTAACTTTCGGTTTAATTTGTTCGATTGCCTTAATCGTTTGATTTCTAACATCATTGACAGCTGTATCTTGTGTCGTATTGTCTATATCTTGTTGACCTTGTTTAAGTGTGTCGTTTATTTGTTGGTTTGCTTCATCTAATTCATCAGTCGTAGCATGTGGTGTATCTTTTATAGATTCTACTTGGTTATCTGCGCTCGCTTTTATGGCTTCTTGAGCTTCAGGTTTAACCACAATGTGCGGTTCTACGCCTTTTAACGTAGCAATACCATTTGATTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGTGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGTTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAATGCAATGTCGTCAAGCGCTTGATTTGTTGAGTCATTAACTTGCTGATTTGTTCTATCATTCGTGATATTTGTCATAGCTTTAGCAACTAAATCATTGATTTTATCTAACGCCGCTTGTCTTTCTTCTGCTGTCGCTTCTTTATCTTGATTAATTTGCGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCTGCTGGTTTAACTTTTGTTTCAGGTTGAATAATTTTAATCGCTGATACACCATTTGTTGCCGCTTGATTCACCTGACTATTCGTTTGAGCTTGGTCAATAGCTGCAAGTGCTTTTTCTTTTTCTTTAGCTAATGCTAGTAAAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAAGACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTTAGCTTCAACATTATCTATAGCATTAATCGCTTGATTTGTAGTTGCGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGATTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACAGCAGCCTGCTTTTCTTCGTCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGCTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGCGCTGCTTGTTTTTTTACAACGTCAACTTGAACAGCATCGATATTATTCTCTGCCACTGTCGCAGCTTGGTCTACTTCCGCATTTGTATTCGCTTGTTTAATACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTTAAAGTATTGATCGCAGCATTTTTCTCATCATCTGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATGCTGTAGGTTTTTTTACAATATTTGGCTGAATCGCATTAATTGCTTTTGTACCTAATTGTTGCGCTTGATCTACTTCTGCATTAGTATCAGCTTGATTTATATTATTAATTGCCGTTGCTAAATCTTGGTCTACTTGATTTAATGCTACTTGCTTTTCTTCATCAGTTGCATTTGTATTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAGTCCGTTAATACACCTGTAGCAGTTTGTTTCTTCGTTACATGCGGTTGAACTGCACCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCATTTAATGCTCTATTTTTAAGTGTATTGACACGATTTATCGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCGCCAGGTGTAGCATTGATATTTGTTATCGCCTCTCGCGCTTTATCATTTACAGCATTGCGTGCATCCGTTTTAACTTGTGTTGCCGGTTGAATCACAACTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGCAATTGTTGTGCTGCTTGTTGCTCTTCTAAGGTCGCATCATTATTATTAAATATCGCATTATGTTGCGTTTCCGCACTTTGATCAATAGCGTTTTTAGCATCTGTTTTAACCTTTGTAGCTGGTTCAATGGCTTGTATACCTTGAATTGCATTTGTCTTTACTTGCTCAACATCAGCATTGGTATTAGCATTTAAAATATTAGTATTCGCAGCAGCTACAGCAGCATTTACTTTCTCAATTGCTGCTTGTCTTTCTTCTTGAGTCGCATCAGGATTTGCATTGATCTCTGCGATATGCTGTTGTGCATCATGTGATACAGCATCTCTTGCTGCTTGCTTGACAACAGTTACAGGCGCAATAGGATTAATGGCATTCAGACCATCACCTTTGGCAGTATCTACATCATCATTGGTTGTCGCTTGATTGATTTGTTCTAATGCGTGGTTCGTGGCTTGCGTTAATTCATTCAATGCTGCATTTTTCTCTTCTTGTGTTGCTTCTCTATTGCTATTTATTTGTTGTCTTTTCGTTGCTGTCGCTTGGTTAATTGCATCTCTTGCTGCTTGTTTGTGTGTCACTTGTGGCGCAACTGCACCAATTGTATTAATACCATTATTTTTAGCTGTTTCAACATCAGCATTGGTAGTAGCATTCGTAACATTATCAATAGCATCTGTTTCATCCGTTGTTAATTGATTTAATGCATCTTGAATTTCGTCTTGAGTAGCATCTGGTGTGTTATTGATAATTTCTCTTTGTTTCGCTGCTTTATCACGTATAGCTTGTTTAGCATTTGGTTTAACAACTGGTGTTGCAGTGTCTCCACTTAAAGTCTGTATACCTTGATCTTTAATTCTAGTAACGCCATCATCAGTCGTTTGGTCACCAATATTCCCAATAATTTCATTTTTATGTTCCTCGATGACTTGAATCGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAGTTCATCATTTTGGTTAACTAAATCTTCCATGTCATCAACTTTTCTATTAACGGCATTTTCAGCGTCAACACTTCGAATTAACGTATGTTGCATCTGATTTACTAATGAATCGATATCTGCTTGAGAAACTCTTTTGTTTAAAGGTACATTGTTACGGTTTTCATCTAAAATTGTTTGTGCGCGTCTTTTAAGTTCATTAAAAATATCTAATGATGCAAATGTATAATCCGCTTGTTGAATACGTCTATCGACTTCGGCTTGCAATGCGTCTTTATTCATTATGATATCGATAGTATATGGATTTGTACTTACAGTATGACTTTCAGCAGGTGAATTAATAAAATCTTGTGTATATGTTTTATACGTTAATATATCATTAAATGTTACTGTTCTTGGTGTTGGCACATTGTTCACACGTAGCTTATACTTCAAATCCAATATTTTATCAGGCATAAGTCGTGCCGGCGAATTCCCTGTACCT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48 | Staphylococcus_phage(91.89%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1941392 : 2035621
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP019593|1941392:2035621|DBSCAN-SWA 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>CP019593|1941392:2035621|1976623_1976800_-|ARH72641.1|DBSCAN-SWA MKHLTKIFVALAIILFIVGYYLQATNHESQGIKLLLAAIMFMICAFISRSNDRRKNNK >CP019593|1941392:2035621|2021637_2021823_+|ARH72701.1|DBSCAN-SWA MSSYKEIEHLHINTGGKELTQEQIEEAKAFIDSQEFKDMIREAKESRQRVMESKITDRTKM >CP019593|1941392:2035621|2020775_2021483_+|ARH72700.1|DBSCAN-SWA MSSFSSNLERLMNKRDMSDSELAELVDVNRTTVTRWRKGIRSPKLDKLPEIANVFGVKPLDLIHDMDDSKIIEEIHNVSSQLTPPRQSNVLKYATNQLEEQNNDSDNLVDFNSYIQEKSEVDIYGCASAGIGERLYNEPISKEFVRGYVPAHDIALKVNGDSMEPLFKNGQIIFIEKSHTIKDGQIGVFIINGDAYVKKVYVEDNRLTLVSLNKKYKDLHFYDNESVRLVGKVIL >CP019593|1941392:2035621|2007545_2007845_-|ARH72674.1|DBSCAN-SWA MMTKDERIRFYKSKEWQITRKRVLERDNYECQQCKRDGKLTTYDKSKRKSLDVDHILSLEHHPEFAHDLNNLETLCIKCHNKKEKRFIKKENKWKDEKW >CP019593|1941392:2035621|2016942_2017203_-|ARH72691.1|DBSCAN-SWA MYYKTGDVCQKIINVDGFDFRLRVKKRAYSVEIVVLDPERNSIDGLLVSDENDLYTALDILKQSIYEWIENNTDEQDKLMNLVMKW >CP019593|1941392:2035621|1974411_1975092_-|ARH72638.1|DBSCAN-SWA MKALLIRNFKLRRYTLIIYVLLLTLYPIYIMLDSTKFFYLLQSFISPTILIIWILDAGHLFRLNRRLGGNDSYYFYMSLPVSKKQLLNANYITCIVLTLIGTLVISLYAYEADVIEPNSIYFSTAYAFAISNFLSIPIAFSQFTELRRVKVPYGIYVFTIIILVPFLFSIAIVLVNYFVLSQSSFPDLYSYILNIGFLIISIVILIVNYFKQLNKINTRKFKGGSR |
111 | Staphylococcus_phage(85.71%) | integrase,terminase,protease,tRNA,capsid,head,tail,portal,holin | attL 2001642:2001659|attR 2025484:2025501 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019593.2|ARH72494.1|1825721_1825946_-|hypothetical-protein |
1825721_1825946_-
Protein sequences of CP019593.2|ARH72494.1|1825721_1825946_-|hypothetical-protein>CP019593.2|ARH72494.1|1825721_1825946_-|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK |
74 aa aa | NA | NA | NA | 1800930-1848776 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.1|776837|25|CP019593|CRISPRCasFinder matches to CP019593 position: 1829629-1829605, mismatch: 1 gcttgtagaatttcttttcgaaatt CRISPR spacer gcttgtagaatttcttgtcgaaatt Protospacer **************** ******** 2. spacer 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR matches to CP019593 position: 1829607-1829631, mismatch: 2 tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcgacaagaaattctacaagcaa Protospacer ****** **************.*** |
|||||||||||||||||||||
CP019593.2|ARH72641.1|1976623_1976800_-|hypothetical-protein |
1976623_1976800_-
Protein sequences of CP019593.2|ARH72641.1|1976623_1976800_-|hypothetical-protein>CP019593.2|ARH72641.1|1976623_1976800_-|hypothetical-protein MKHLTKIFVALAIILFIVGYYLQATNHESQGIKLLLAAIMFMICAFISRSNDRRKNNK |
58 aa aa | NA | NA | NA | 1941392-2035621 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR matches to CP019593 position: 2029418-2029394, mismatch: 0 tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaaacaa Protospacer ************************* |
|||||||||||||||||||||
CP019593.2|ARH72642.1|1977041_1977140_-|hypothetical-protein |
1977041_1977140_-
Protein sequences of CP019593.2|ARH72642.1|1977041_1977140_-|hypothetical-protein>CP019593.2|ARH72642.1|1977041_1977140_-|hypothetical-protein MMWWQEGMMTLITGGLLIIFRLWLELKWKNKK |
32 aa aa | NA | NA | NA | 1941392-2035621 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 5.1|1738842|25|CP019593|PILER-CR matches to CP019593 position: 2029418-2029394, mismatch: 0 tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaaacaa Protospacer ************************* |