Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019594 | Staphylococcus aureus strain GD1539 chromosome, complete genome | 11 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,TnsE_C,WYL | 6 | 4 | 11 | 4 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019594_1 | 260647-260846 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019594_1
|
3 spacers
spacers of CP019594_1
>1.1|260678|25|CP019594|CRISPRCasFinder GGCGAAAATACAGCTTACAATAATG >1.2|260734|25|CP019594|CRISPRCasFinder TTGGAACAGCAATTTCTACAGACAA >1.3|260790|26|CP019594|CRISPRCasFinder AGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019594_1
The CRISPR arrays of CP019594_1 >merge|CP019594|1|260647-260846|CRISPRCasFinder GTTATATTGGCGGATCCCCAACACAGAAGCTGGCGAAAATACAGCTTACAATAATGTGCGAGTTGGCAGGCCTCCAACACAGAGAAATTGGAACAGCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTAGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGGCCCCAACACAGAAGCT >CP019594|1|1|260647-260846|CRISPRCasFinder GTTATATTGGCGGATCCCCAACACAGAAGCT GGCGAAAATACAGCTTACAATAATG TGCGAGTTGGCAGGCCTCCAACACAGAGAAA TTGGAACAGCAATTTCTACAGACAA TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCT AGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGT GCAAGTTGGCGGGGGCCCCAACACAGAAGCT
>CP019594.2|ARH73748.1|259144_260581_+|6-phospho-beta-glucosidase MTKLPQSFMWGGALAANQFEGGYDKGGKGLSVIDVMTSGAHGKARQITESIDPNHYYPNHEGIDFYHRYKEDIALFKEMGLKCLRTSIAWTRIFPNGDEDVPNEEGLAFYDRIFDELIAQGIEPVVTLSHFEMPLHLAKHYGGFRNREVVDYFVHFARVVFERYKDKVTYWMTFNEINNQMDTSNPIFLWTNSGVALTENDNPEEVLYQVAHHELLASALAVRLGKEINPKFKIGTMISHVPIYPYSCHPKDMMEAQIANRLRFFFPDVQVRGYYPSYAKKMLARKGYDVGWQEGDDSILQQGTVDYIGFSYYMSTAVKHDVNTTVENNIVNGGLNHSVENPHIATSDWGWAIDPDGLRYTLNVLYDRYQLPLFIVENGFGAVDEVVDGHIHDDYRIEYLKAHITAAIEAVDQDGVDLIGYTPWGIIDIVSFTTGEMKKRYGLIYVDRDNDGHGTMERLKKDSFYWYQQVIASNGDKL >CP019594.2|ARH73747.1|258337_259129_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIABC MSNKYKDQAQDILTAVGGVENIVDVSYDTVRMTIHMHHAIPSTANEVTQIDGVASVDENETQLVIVFNEEVKYVYQQLQLLMDDAKHQEDTNHDAVDTQETEQKAQAKVTTPILVKAPIAGRRILLKEVRDSIFREKMVGEGLAIKAHKEFKVIAPFSGKVSMIVPTKHAVGIQSEDGVDIVIHIGVNTVDLEGKGFKCFVKQNDRVEAGQTLLQFDQQYIQEQGYNSDVIVVISNSSDFNKVELTMNEIITTEDVIFKIFKN >CP019594.2|ARH73746.1|257484_258189_-|GntR-family-transcriptional-regulator MLKYEHIAKQLNAFIHQSNFKPGDKLPSVTQLKERYQVSKSTIIKALGLLEQDGLIYQAQGSGIYVRNIADANRINVFKTNGFSKSLGEHRMTSKVLVFKEIATPPKSVQDELQLNADDTVYYLERLRFVDDDVLCIEYSYYHKEIVKYLNDDIAKGSIFDYLESNMKLRIGFSDIFFNVDQLTSSEASLLQLSTGEPCLRYHQTFYTMTGKPFDSSDIVFHYRHAQFYIPSKK >CP019594.2|ARH73745.1|253948_254650_+|antiholin-like-protein-LrgB MINHLALNTPYFGILLSVIPFFLATILFEKTNRFFLFAPLFVSMVFGVAFLYLTGIPYKTYKIGGDIIYFFLEPATICFAIPLYKKREVLVKHWHRIIGGIGIGTVVALLIILTFAKLAQFANDVILSMLPQAATTAIALPVSAGIGGIKELTSLAVILNGVIIYALGNKFLKLFRITNPIARGLALGTSGHTLGVAPAKELGPVEESMASIALVLVGVVVVAVVPVFVAIFF >CP019594.2|ARH73744.1|253512_253956_+|antiholin-like-murein-hydrolase-modulator-LrgA MVVKQQKDASKPAHFFHQVIVIALVLFVSKIIESFMPIPMPASVIGLVLLFVLLCTGAVKLGEVEKVGTTLTNNIGLLFVPAGISVVNSLGVISQAPFLIIGLIIVSTILLLICTGYVTQIIMKVTSRSKGDKVTKKIKIEEAQAHD >CP019594.2|ARH73743.1|252659_253400_+|DNA-binding-response-regulator MKALIIDDEPLARNELTYLLNEIGGFEEINEAENVKETLEALLINQYDIIFLDVNLMDENGIELGAKIQKMKEPPAIIFATAHDQYAVQAFELNATDYILKPFGQKRIEQAVNKVRATKAKDDNSASTIANDMSANFDQSLPVEIDDKIHMLKQQNIIGIGTHNGITTIHTTNHKYETTEPLNRYEKRLNPAYFIRIHRSYIINTKHIKEVQQWFNYTYMVILTNGVKMQVGRSFMKDFKASIGLL >CP019594.2|ARH73742.1|250917_252657_+|sensor-histidine-kinase MLLLERVGLIIILAYVLMNIPYFKNLMNRRRTWKARWQLCIIFSLFALMSNLTGIVIDHQHSLSGSVYFRLDDDVSLANTRVLTIGVAGLVGGPFVGLFVGVISGIFRVYMGGADAQVYLISSIFIGIIAGYFGLQAQRRKRYPSIAKSAMIGIVMEMIQMLSILTFSHDKAYAVDLISLIALPMIIVNSVGTAIFMSIIISTLKQEEQMKAVQTHDVLQLMNQTLPYFKEGLNRESAQQIAMIIKNLMKVSAVAITSKNEILSHVGAGSDHHIPTNEILTSLSKDVLKSGKLKEVHTKEEIGCSHPNCPLRAAIVIPLEMHGSIVGTLKMYFTNPNDLTFVERQLAEGLANIFSSQIELGEAETQSKLLKDAEIKSLQAQVSPHFFFNSINTISALVRINSEKARELLLELSYFFRANLQGSKQHTITLDKELSQVRAYLSLEQARYPGRFNININVEDKYRDVLVPPFLIQILVENAIKHAFTNRKQGNDIDVSVIKETATHVRIIVQDNGQGISKDKMHLLGETSVESESGTGSALENLNLRLKGLFGKSAALQFESTSSGTTFWCVLPYERQEEE >CP019594.2|ARH73741.1|249981_250656_+|iron-sulfur-cluster-repair-di-iron-protein-ScdA MINKNDIVADVVTDYPKAADIFRSVGIDFCCGGQVSIEAASLEKKNVDLNELLQRLNEVEQTNTPGSLNPKFLNVSSLIQYIQAAYHEPLREEFKNLTPYVTKLSKVHGPNHPYLVELKETYDTFKNGMLEHMQKEDDVDFPKLIKYEQGEVVDDINTVIDDLVSDHIATGQLLVKMSDLTSSYEPPIEACGTWRLVYQRLKALEVLTHEHVHLENHVLFKKVS >CP019594.2|ARH73740.1|248116_249838_+|glycosyltransferase-family-2-protein MMKFSVIVPTYNSEKYITELLNSLAKQDFPKTEFEVVVVDDCSTDQTLQIVEKYRNKLNLKVSQLETNSGGPGKPRNVALKQAEGEFVLFVDSDDYINKETLKDAAAFIDEHHSDVLLIKMKGVNGRGVPQSMFKETAPEVTLLNSRIIYTLSPTKIYRTALLKDNDIYFPEELKSAEDQLFTMKAYLNANRISVLSDKAYYYATKREGEHMSSAYVSPEDFYEVMRLIAVEILNADLEEAHKDQILAEFLNRHFSFSRTNGFSLKVKVEDQPQWINALGDFIQAVPVRVDALVMSKLRPLLHYARAKDIDNYRTVEESYRQGQYYRFDIVDGKLNIQFNEGEPYFEGIDIAKPKVKMTAFKFDNHKIVTELTLNEFMIGEGQYDVRLKLHSRNKKHTMYVPLSVNANKQYRFNIMLEDIKAYLPKEKIWDVFLEVQIGTEVFEVRVGNQRNKYAYTAETSALIHLNNDFYRLTPYFTKDFNNISLYFTAITLTDSISMKLKGKNKIILTGLDRGYVFEEGMASVVLKDDMVMGMLSQTSENEVQILLSKDIKKRDFKNIVKLNTAHMTYSLK >CP019594.2|ARH73739.1|246395_248084_+|CDP-glycerol-glycerophosphotransferase-family-protein MVKSKIYIDKIYWERVQLFVEGHSENLDLEDSNFVLRNLTETRTMKANDVKIDGNQFVCRFNVAILDNGYYLPEDKYLLVNEQELDYIAQLNPDVINDAYQNLKPEQEEEYNELETQNGKINFLLQTYLKEFRKGGISKKTVYTVTPEISSDVNEFVLDVVVTTPEVKSIYIVRKYKELRKYFRKQSFNTRQFIFKAIFNTTKFFHLKKGNTVLFTSDSRPTMSGNFEYIYNEMLRQNLDKKYDIHTVFKANITDRRGIIDKFRLPYLLGKADYIFVDDFHPLIYTVRFRRSQEVIQVWHAVGAFKTVGFSRTGKKGGPFIDSLNHRSYTKAYVSSETDIPFYAEAFGIKEKNVVPTGVPRTDVLFDEAYATQIKQEMEDELPIIKGKKVILFAPTFRGSGHGTAHYPFFKIDFERLARYCEKNNAVVLFKMHPFVKNRLNIADKHKQYFVDVSDFREVNDILFITDLLISDYSSLIYEYAVFKKPMIFYAFDLEDYITTRDFYEPYESFVPGKIVQSFDALMDALDNEDYEGEKVIPFLDKHFKYQDGRSSERLVRNLFGS >CP019594.2|ARH73750.1|261156_261918_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSKEAGHTFLAKLGKTRLRPGGKAATDWLIQQGAFSQDKHVLEVACNMCTTSIYLAHTYGCHIQGVDINKKALEKAQENISAAGLESYIQVQQANAVKLPFDDNQFDIVLNEAMLTMLPIAIKEKALREYYRVLKPGGILLTHDIVIVNESHATHVVKSLSAAINVNVSPQTKLGWLDLYHQAGFNHVHYHTGPMSLMTPKGLIYDEGIVGTIKIINNALKKENRPMFCKMFKTMTRLRKDMNYITFVAKKEH >CP019594.2|ARH73751.1|262169_263084_-|ribokinase MTNKVVILGSTNVDQFLTVERYAQPGETLHVEEAQKAFGGGKGANQAIATARMQADTTFITKIGTDGVADFILEDFKAAHIDTSYIIKTTEEKTGQAFITVNAEGQNTIYVYGGANMTMTPEDVINAKDAIINADFVVAQLEIPIPAIISAFEIAKAHGVTTVLNPAPAKALPNELLSLIDIIVPNETEAELLSGIKVTNEQSMKDNANYFLSLGIKTVLITLGKQGTYFATKNQSQHIEAYKVNAIDTTAAGDTFIGAFVSRLNKSQDNLADAIDFGNKASSLTVQKHGAQASIPLLEEVNQV >CP019594.2|ARH73752.1|263111_263516_-|D-ribose-pyranase MKKTAVLNEHISKAIATIGHFDLLTINDAGMPIPNDHRRIDLAVTKNLPRFIDVLATVLEEMEIQKIYLAEEIKEHNPTQLQQIKQLISSEIEIIFIPHEEMKSNLAHPLNKGNIRTGETTPYSNIALESNVTF >CP019594.2|ARH73753.1|263530_264412_-|ribose-transporter-RbsU MSIVALLIGLGPLIGWGFFPTVASKFGGKPVHQIIGATVGTLIFAIILAVVTSSGFPTGTNLLFALLSGAGWGFGQIITFKAFELVGSSRAMPVTTAFQLLGASLWGVFALGNWPGIGHRIIGFTALVVILIGARMTVWSERKEASNAKNLRRAVVLLLIGEFGYWLYSAAPQATSIDGLTAFLPQAMGMVIVAVIYGFMNMKAENPFRNKITWLQIISGFFFAFGALTYLISAQPNMNGLATGFILSQTSVVLATLTGIYFLKQHKTSKEMVITIIGLVLILVAASVTVFIK >CP019594.2|ARH73754.1|264643_265642_-|LacI-family-transcriptional-regulator MKKVSIKDVAREAGVSVTTVSHILNHNDSRFSATTIKNVHAVSECLGYAPNKHAKQLRGSKIQTIGVILPSLTNPFFSALMQSIHDHKPSDVDLCFLTSTATDLYDNIKHLIDRGIDGLIIAQYISSPDALNNYLKKHHVPYVVLDQNDHQGYTDFVRTNEYQGGQLAAQHLIELGHNNMMIVAPYDMMANMSTRVTGFVDTLRANQLPEPQIVHTELSKRGGLTIVDDIMVQSATAIFAINDELAIGILRGLIEHGISIPKDISLIGYDDIDYAAYVSPPLTTVAQPITDIGKTSLTLLLQRLQHLDKSIDMIELPTTLKIRATTGYHLSN >CP019594.2|ARH73756.1|266022_266415_+|hypothetical-protein MQFKLKEEEIISFLELKYPEKEFEYGRLLVGQHKRDDLDVYYFGDTFLMCTIISFKTFEIKETVELSYDAVNRIVLKDGWLFRKMRIETMQKVLKYGTSKLMLTDFQKDNYNKYIQGQKQRVIFENGHFV >CP019594.2|ARH73757.1|266543_267920_-|MFS-transporter MNNTQSSPRSNIIIAIMLSALTYWLFAQSFINIGPLVGQTYQTSPAVLNLSISLTSFATGIFMVAAGDIADKIGQLRMTYMGLIISMFASLLLIISDITALLIIGRILQGLSAAILLPSTVGVLNNQFKGDHLRRAISYLMISTVGGIGLAGVIGGLIATNFGWQTNFIISIVIAFIAILLLKGTPEKVSQHSHRHPFDYKGMSIFAVMIGSFTLLLTQGFEQGWFSTFSFICLSIIIITTLIFIIIERRHEVPFIDFSVLRNRPFIGAFLNNFVLNSGLGVTVVFFIYAQTHLGLSAAQSGLVTLPYAIVAVAMIRLGEKATLRFGGKLMLIIGPLFPVIGITIISMTSLQPSQYIIAVVIGFVICAIGNGLVATPGLTIAIFSMPNEKVGLATGLYKMSGTLGGAFGIALSTTVFSMLQLNYAPSVAATITFIVSIVLMILGSLSAYMIIPKTVKS >CP019594.2|ARH73758.1|268153_269146_+|linear-amide-C-N-hydrolase MCTGFTIQTLNNQVLLGRTMDYDYPLDGSPAVTPRNYRWTSRTGTTGQTQYGFIGTGTDMEGFIYGDGVNEHGVAISTQYFRGYSSYGSIHKADAMNITQNEIVTWILGYTTSIEDMKQQASQIHVVAVYLNDIGEVPPLHYHVSDATGHSVEVSFKEGEVVIKDNPIGVLTNHPDLDWHYSNLRQYINISPYPAPANLLEGVTIEPLGNEAGTFGLPGGFTSTERFVRMAFMKANIAQNNDKEMDLMNAFYLLDAVNIPIGIVRPHDADNHYTMYQTVINLTTRTLYIKYYGSNEIVALKLTDDLINRKDMTIFKPEKHITIRKLNDNQ >CP019594.2|ARH73759.1|269471_270422_+|glycine-glycine-endopeptidase-LytM MKKLTAAAIATMGFATFTMAHQADAAETTNTQQAHTQMSTQSQDVSYGTYYTIDSNGDYHHTPDGNWNQAMFDNKEYSYTFVDAQGHTHYFYNCYPKNANANGSGQTYVNPATAGDNNDYTASQSQQHINQYGYQSNVGPDASYYSHSNNNQAYNSHDGNGKVNYPNGTSNQNGGSASKATASGHAKDASWLTSRKQLQPYGQYHGGGAHYGVDYAMPENSPVYSLTDGTVVQAGWSNYGGGNQVTIKEANSNNYQWYMHNNRLTVSAGDKVKAGDQIAYSGSTGNSTAPHVHFQRMSGGIGNQYAVDPTSYLQSR >CP019594.2|ARH73760.1|270473_271133_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIEINNLSKRYRNKQIFNHLTMSFDSNRLTVLLGDNGAGKSTLLRMIAGIEKANDGTINYFGEKWNQRQIQNHIGYVPQDIALFEHMTVAENIKFFKSLCKNSINDTTINEYLQQLNFNDTSAKVSTLSGGNKRKINILVGLLGQPRILILDEPTVGIDLKSRHDIHQLLNIMKSKCLIILTTHHLDEVEALADDIKLIGQDPFYQHVLEDKQWAYTYY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019594_2 | 611748-611856 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019594_2
|
1 spacers
spacers of CP019594_2
>2.1|611787|31|CP019594|CRISPRCasFinder AGCCTCTAATCACTAGAGTTCAAGAGGCTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019594_2
The CRISPR arrays of CP019594_2 >merge|CP019594|2|611748-611856|CRISPRCasFinder AAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATCACTAGAGTTCAAGAGGCTTTAAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAA >CP019594|2|2|611748-611856|CRISPRCasFinder AAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAA AGCCTCTAATCACTAGAGTTCAAGAGGCTTT AAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAA
>CP019594.2|ARH74064.1|610942_611578_+|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKLLYRHMGPQNWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIRPSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKAELRKELLTLKGIGSETADVLLVYIFERIEFIPDSYTRKIYNKLGYENTKSYDQLKKVITLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >CP019594.2|ARH74063.1|608796_610458_+|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNILLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVAAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIVKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >CP019594.2|ARH76222.1|608416_608800_+|DUF1934-family-protein MLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQATTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >CP019594.2|ARH74062.1|607097_608108_+|alcohol-dehydrogenase-AdhP MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADVIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >CP019594.2|ARH76221.1|606077_606599_+|hypothetical-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKVILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >CP019594.2|ARH74061.1|604754_606050_+|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVSPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGKIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >CP019594.2|ARH74060.1|604238_604715_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >CP019594.2|ARH74059.1|603532_604069_+|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQGLDYQWIDVTQHRFKPIRDVRHIEESITDYEDDYQEILDKVLASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTANKPGDIMKDNYALARATEWNQLLQ >CP019594.2|ARH74058.1|602148_603087_+|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINFLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDDNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVNALEKIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVIENIKAADIVLSKDEIQYIDELFPIED >CP019594.2|ARH74057.1|601252_601879_+|DUF443-domain-containing-protein MLLCESKIINKNPKYRIIKYNDEYLMVDIISTWISLFFPFINWFIPKRYVKISKEDFENLNIVKPAKKNVFWPVAGISALFAVTLRKYTHLLDTQLDKKLVIAICCITFIGILIFYVRLIKKSSLNIYNPKNERSKIILIPTLKNFCFTLFGYILFGGLTMLFLDALLSMSHQNIIVYFTWIAVIMGFFLVNIALIIDKNIYVILKNQ >CP019594.2|ARH76223.1|611967_612795_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKDNDKQSSDDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >CP019594.2|ARH76224.1|612945_613896_+|iron-ABC-transporter-permease MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVIGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >CP019594.2|ARH74065.1|613950_614670_+|HAD-family-hydrolase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKIDNKGENYGSIY >CP019594.2|ARH74066.1|614653_615454_+|alpha/beta-hydrolase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLMLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV >CP019594.2|ARH74067.1|615589_616096_+|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLANTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNENGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >CP019594.2|ARH74068.1|616257_616974_+|hypothetical-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFILNFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTLDAMIHNPQSAQTFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >CP019594.2|ARH74069.1|617142_617931_+|alpha/beta-hydrolase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLESHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFLSYYLNFLKSVS >CP019594.2|ARH74070.1|618182_618557_-|transcriptional-regulator MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >CP019594.2|ARH74071.1|619504_620434_-|DMT-family-transporter MLLFYIIGVIVGMFIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIVLNIFINPDVFSLHFFSNQTFNYTWFVGGLLGVGYLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIVGIITMNQINKCNLLLTNQKHLIFWLLLGFTFGFFPPIQTTINSLLASHTHSPAFASLVSFTIGSITLLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF >CP019594.2|ARH74072.1|620626_620851_-|DUF2922-domain-containing-protein MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLPQLNNIVTEQVARDSMNALVDLNILKSNSGAITKVHSAQIIDKTTTVLFEAKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019594_3 | 774857-774939 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019594_3
|
1 spacers
spacers of CP019594_3
>3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder TTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019594_3
The CRISPR arrays of CP019594_3 >merge|CP019594|3|774857-774939|CRISPRCasFinder CACCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAA >CP019594|3|3|774857-774939|CRISPRCasFinder CACCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAA TTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC CACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAA
>CP019594.2|ARH74225.1|773504_774440_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIETKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >CP019594.2|ARH74224.1|771998_773438_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMANQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVIENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >CP019594.2|ARH74223.1|771505_771991_+|acetyltransferase MRKFLSKTYHHTNPLWHVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >CP019594.2|ARH74222.1|770658_771498_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPGEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >CP019594.2|ARH74221.1|769720_770653_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >CP019594.2|ARH74220.1|769386_769482_-|hypothetical-protein MAGSQHREIGFSISTDNASWGGTQHKEILFL >CP019594.2|ARH74219.1|769140_769371_-|hypothetical-protein MYEFYSCIPIFKYTIAVANDKEPIHNKSLVILYHFCPAPSFDLCLATLDRSYLNIILFTHLFFLLFITKLIKRSEG >CP019594.2|ARH74218.1|766264_769111_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNINLSEQDQAIANQILKEIISRLAFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKINRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDN >CP019594.2|ARH74217.1|764271_766257_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTNSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >CP019594.2|ARH74216.1|763766_764003_+|DUF2198-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >CP019594.2|ARH74226.1|775207_776119_+|RNase-adaptor-protein-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >CP019594.2|ARH74227.1|776115_777111_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >CP019594.2|ARH74228.1|777219_778164_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >CP019594.2|ARH74229.1|778733_779321_+|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >CP019594.2|ARH74230.1|779503_781138_+|NAD-dependent-malic-enzyme MKGIELLNNPFLNKGIAFTNEERKQLGLEGLLPANVRTLEQQAEQCYEQFKAKQTDFEKRLFLMAIFNRNRTLFYKLTSEHLVEFMPIIYDPVIAQSIEQYNENFSRPQDAVFLSVDRQDQIEQELRNVANGRDIRLIVVTDAEGILGIGDWGVDGVDIAIGKLIVYTAAAGINPSQVLPVSLDVGTNNEQLLNDDLYLGNRHKRVDDETYYAFVDKFVSAVRKEYPNALLHWEDFGRGHAKNILDKYEDTLPTFNDDIQGTGIVTLAGVLGALNISKVNYTNQTFLVYGGGTAGMGITNILKDELIKQGVSEEKANQHFYIMDKQGLLFDDMDDLTEAQQVFAKNRNEFSKTVNWKNLKEVIENIKPTVLIGTSTQTGAFTEDAVKEMLKHTERPMIFPLSNPTKLAEATAQDLLKWTNGKALIGTGIPYNDIEYNGVNYSIGQANNALMYPGLGLGLIASKAKKVNQQILSAASHALGGMVNPDEPGAAVLPPVEKIHQCSRAIAKAVAQSVIDQGLNAETIDDIDKAIEAEIWYPEYKSYI >CP019594.2|ARH74231.1|781344_782247_-|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQKIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLISK >CP019594.2|ARH74232.1|782949_783579_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLVLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQNQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >CP019594.2|ARH74234.1|784353_785367_+|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >CP019594.2|ARH74235.1|785419_786430_+|aldehyde-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >CP019594.2|ARH74236.1|786568_787759_+|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPDLGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019594_4 | 824221-824301 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019594_4
|
1 spacers
spacers of CP019594_4
>4.1|824246|31|CP019594|CRISPRCasFinder AAGAACCAATACATAATAAAGCATAAGTGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019594_4
The CRISPR arrays of CP019594_4 >merge|CP019594|4|824221-824301|CRISPRCasFinder TCTTTATCATTTCTGTCCCACTCCCAAGAACCAATACATAATAAAGCATAAGTGATTCTTTATCATTTCTCTCCCACTCCC >CP019594|4|4|824221-824301|CRISPRCasFinder TCTTTATCATTTCTGTCCCACTCCC AAGAACCAATACATAATAAAGCATAAGTGAT TCTTTATCATTTCTCTCCCACTCCC
>CP019594.2|AXB22705.1|823794_823989_-|hypothetical-protein MLGPTPTCTVYKISFRNPLCWGPAIIVKRLLQSYFHSINNCLYNIVNLWTLIEITEAYRPSLYI >CP019594.2|ARH74277.1|822814_823636_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGSKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGNVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >CP019594.2|ARH74276.1|822101_822797_+|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >CP019594.2|ARH74275.1|821083_822109_+|methionine-import-ATP-binding-protein-MetN-2 MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >CP019594.2|ARH74274.1|820537_820834_+|thioredoxin MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPICGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFQSVTDLLENLK >CP019594.2|ARH74273.1|820158_820545_+|topiosmerase MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKFDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPFLPNINNERLVLVNE >CP019594.2|ARH74272.1|818578_819457_+|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPILPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPISDLSLKDIQAHLKSLNADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQGLKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >CP019594.2|ARH74271.1|818463_818577_+|hypothetical-protein MKENLLGTIIWSIATFYYSRMMKIMNLAILKIKIGGS >CP019594.2|ARH74270.1|818018_818399_+|glycine-cleavage-system-protein-H MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEVSDESQLEALLSAEKYAEMIGE >CP019594.2|ARH74269.1|817504_817861_+|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >CP019594.2|ARH74278.1|824443_824638_+|CsbD-family-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >CP019594.2|ARH74279.1|824871_825723_-|DUF368-domain-containing-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEFVKLNFAGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >CP019594.2|ARH74280.1|826050_826812_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >CP019594.2|ARH74281.1|826910_828218_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKYFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDENASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >CP019594.2|ARH74282.2|828332_829574_+|cysteine-desulfurase MAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPVQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSTIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF >CP019594.2|ARH74283.1|829563_830028_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MNFNNLDQLYRSVIMDHYKNPRNKGVLDNGSMTVDMNNPTCGDRIRLTFDIEDGIIKDAKFEGEGCSISMASASMMTQAVKGHSLGEAMQMSQEFTKMMLGEDYVITEEMGDIEALQGVSQFPARIKCATLAWKALEKGTVAKEGKAEGTTEEE >CP019594.2|ARH74284.1|830178_831576_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MAKKAPDVGDYKYGFHDDDVSIFRSERGLTENIVREISNMKNEPEWMLDFRLKSLKLFYKMPMPQWGGDLSELNFDDITYYVKPSEQAERSWDEVPEEIKRTFDKLGIPEAEQKYLAGVSAQYESEVVYHNMEKELEEKGIIFKDTDSALQENEELFKKYFASVVPAADNKFAALNSAVWSGGSFIYVPKNIKLDTPLQAYFRINSENMGQFERTLIIADEGASVHYVEGCTAPVYTTSSLHSAVVEIIVHKDAHVRYTTIQNWANNVYNLVTKRTFVYENGNMEWVDGNLGSKLTMKYPNCVLLGEGAKGSTLSIAFAGKGQVQDAGAKMIHKAPNTSSTIVSKSISKNGGKVIYRGIVHFGRKAKGARSNIECDTLILDNESTSDTIPYNEVFNDQISLEHEAKVSKVSEEQLFYLMSRGISEEEATEMIVMGFIEPFTKELPMEYAVEMNRLIKFEMEGSIG >CP019594.2|ARH74285.1|831643_832693_-|site-specific-integrase MPVYKNDNTGKWYFSIRYKDVYGNNKRKMQRGFSTKREAKRAEAIFLNDVNEGYSDSKTFDYVFHHYLENSDLRPKTKRRKQNEYHKHFKAKFGHIKMNKITQNQCQEFRKYLIENVASTNSARTIWSGFKVVINYAKKYFGLLTDPTISIKPIPRVKPKPKFMMREEFEERIKDIEEQDYRELFTLMFYTGLRIGEAMALVWTDYNKYKKEISINKTMDISNRTIYPRPKTDSSEDIVPLPKFINKMLTERHQREKELNKYFDERSYFIFGGMAPKHYSHVQKKFQKAFPHYNIHALRHSYASYLANNGVDIFVLQSLMRHAQITETMGTYSHLYTQKKHDAIAIFDK >CP019594.2|ARH74286.1|832805_832985_+|excisionase MCVKFTDAEIAYIKESVENYSSEFDIYDDEQELKLKIYEQIMLKIESEYKDIYLFRLIN >CP019594.2|ARH74287.1|832964_833897_-|hypothetical-protein MEENKTLKEYLRNFLEGYKYVVENRYIYQFSSNPEAFPFMRKDDYKISIFYLNQSFFEEPCIVVISNDSKLKEIYNFRNTDIKHLSKHFTSYIYDSKKYVEEQSGLLDFNNYIYYTSIYYGKYIGTVIIQNNLDLFFNYGKRLANDHYNTLISKSKEKLINKAHDEIQPFNHLDLNSMKKIVDDITFSYQIEQGLQAYKRELYLPAAATFAVAIETFLIKLKKVNKIKHKDTDSTMYTKLLGELTKEGKVNYRTKKRVEIAYSMRNIINHSQAGAVAKGDCDFLLNTLKDIVDENERILTEYSKSINKTE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019594_5 | 1766473-1766606 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019594_5
|
2 spacers
spacers of CP019594_5
>5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAA >5.2|1766562|29|CP019594|PILER-CR AGGTGACGTAATGTCAGCTTACTTTAATG >5.3|1766546|29|CP019594|CRISPRCasFinder AGGTGACGTAATGTCAGCTTACTTTAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019594_5
The CRISPR arrays of CP019594_5 >merge|CP019594|5|1766473-1766606|PILER-CR,CRISPRCasFinder GGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGAAGGTGACGTAATGTCAGCTTACTTTAATGTGCAAGTTGGGCTGGGGCCCCAACATAGAGAA >CP019594|5|1|1766473-1766606|PILER-CR GGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGAAAAGAAA TTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGT GGGGCCCCAACATAGAAGGTGACGTAATGTCA GCTTACTTTAATGTGCAAGTTGGGCTGGG GCCCCAACATAGAGAA >CP019594|5|5|1766517-1766603|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGA AGGTGACGTAATGTCAGCTTACTTTAATG TGCAAGTTGGGCTGGGGCCCCAACATAGA
>CP019594.2|ARH75210.1|1765383_1766325_-|bifunctional-oligoribonuclease/PAP-phosphatase-NrnA MISTMNEIMKCIEDNDTIIIHRHVRPDPDAYGSQLGLKYYIQQKFPQKQVFAVGEAESSLSFIGELDNIDDKTYQDALVIVCDTANAPRIDDERYSTGRKLIKIDHHPAVDQYGDINLVNTNASSTSEIIYDLISHFNDEAIVNKDIASVLYLGIVGDTGRFLFNNTSEHTMEIAGKLIGHDIDHNALLNKMMEKDPKMLPFQGYVLQHFELMDDGFCQVKITEDVLKQFGIQPNEASQFVNTIADIKGLKIWVFAVDEGSEIRCRLRSKGQLIINDIAQDFGGGGHPNASGVSVNSWDEFEQLAKALRTKLN >CP019594.2|ARH75209.1|1762165_1765363_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MVAYLNIHTAYDLLNSSLKIEDAVRLAVSENVDALAITDTNVLYGFPKFYDTCIANNIKPIFGMTIYVTNGLNTVETVVLAKDNNGLKDLYQLSSEIKMNALEHVSFELLKRFSNNMIIIFKNVADEHRDIVQVFDSHEDTYLDHRSVLVQGIKHVWIQDVCYQTRHDADTISALAAIRDNTKLDLIHDQEDFGAHFLTENEIQQLDVNPEYFTQADRIAQKCDAELKYHQSLLPQYQAPNDESAKKYLWRVLVTQLKKLELNYDVYLERLKYEYKVITNMGFENYFLIVSDLIHYAKTNDVMVGPGRGSSAGSLVSYLLGITTIDPIKFNLLFERFLNPERVTMPDIDIDFEDTRREKVIQYVQEKYGELHVSGIVTFGHLLARAVARDVGRIMGFDEVTLNEISSLIPHKLGITLDEAYQIDDFKKFVHRNHRHERWFSICKKLEGLPRHTSTHAAGIIINDHPLYEYAPLTKGDTGLLTQWTMTEAERIGLLKIDFLGLRNLSIIHQILTQVKKDLGINIDIEKIPFDDQKVFELLSQGDTTGIFQLESDGVRSVLKKLKPEHFEDIVAVTSLYRPGPMEEIPTYITRRHDPSKVQYLHPHLEPILKNTYGVIIYQEQIMQIASTFANFSYGEADILRRAMSKKNRAVLESERQHFIEGAKQNGYHEDISKQIFDLILKFADYGFPRAHAVSYSKIAYIMSFLKVHYPNYFYANILSNVIGSEKKTAQMIEEAKKQGITILPPNINESHWFYKPSQEGIYLSIGTIKGVGYQSVKVIVEERYQNGKFKDFFDFARRIPKRVKTRKLLEALILVGAFDAFGKTRSTLLQAIDQVLDGDLNIEQDGFLFDILTPKQMYEDKEELPDALISQYEKEYLGFYVSQHPVDKKFVAKQYLTIFKLSNAQNNKPILVQFDKVKQIRTKNGQNMAFVTLNDGIETLDGVIFPNQFKKYEELLSHNDLFIVSGKFDLRKQQRQLIINEIQTLATFEEQKLAFAKQIIIRNKSQIDMFEEMIKATKENANDVVLSFYDETIKQMTTLGYINQKDSMFNNFIQSFNPSDIRLI >CP019594.2|ARH75208.1|1760487_1761717_-|NAD-dependent-malic-enzyme MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTMAGLVNALRVVNKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADVFIGVSVANALSQDMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVDPQDVYDKTMKLTDLQ >CP019594.2|ARH75207.1|1759435_1760293_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyl-transferase-subunit-beta MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYLEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK >CP019594.2|ARH75206.1|1758491_1759436_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyl-transferase-subunit-alpha MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVEQLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYIE >CP019594.2|ARH75205.1|1757254_1758223_-|ATP-dependent-6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTAQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI >CP019594.2|ARH75204.1|1755475_1757233_-|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMIEKLINAGMNVARLNFSHGSHEEHKGRIDTIRKVAKRLDKIVAILLDTKGPEIRTHNMKDGIIELERGNEVIVSMNEVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLIELQVKDIDHAKKEVKCDILNSGELKNKKGVNLPGVRVSLPGITEKDAEDIRFGIKENVDFIAASFVRRPSDVLEIREILEEQKANISVFPKIENQEGIDNIEEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPEKVPMVQKDLIRQCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSLVNAIGISVAHTALNLNVKAIVAATESGSTARTISKYRPHSDIIAVTPSEETARQCSIVWGVQPVVKKGRKSTDALLNNAVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGETGTTNMMKIHLVGDEIANGQGIGRGSVVGTTLVAETVKDLEGKDLSDKVIVTNSIDETFVPYVEKALGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTVVGVEKAVKNISNNMLVTIDAAQGKIFEGYANVL >CP019594.2|ARH75203.1|1753770_1755132_+|amino-acid-permease MAEKLQRELSNRHIQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIALTGPSILLTYIIIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNTYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPEIPNWISALFCVLLLMSFNLLSARLFGELEFWFSIIKIATIIGLIVVGFVMILFAYKTQFGHASFTNLYEHGVFPKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPVKTIPKAINSVPIRILIFYVGALAVIMSIIPWQQVDPDNSPFVKLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLSSQQQAPPNFSKTNKYGVPHVAIFASSALLLVAALLNYIFPDATKVFTYVTTISTVLFLVVWGLIIIAYINYSRKNPDLHKKATYKLFGGKYMGYLIFVFFIFVFGLLFINVETRRAIYFIPIWFILLGFMYLRYKRIAAKSNN >CP019594.2|ARH75202.1|1752301_1753423_-|citrate-synthase MAELQRGLEGVIAAETKISSIIESQLTYAGYDIDDLAENAQFEEVIFLLWNYRLPNEEELAHLKGKLNQYMTLNPRVYTHFEEYVTDHVHPMTALRTSLSYIAHFDPDAENESDENRYERAMRIQAKVASLVTAFARVRQDKEPLKPNPDLSYAANFLYMLRGELPTDIEVEAFNKALILHADHELNASAFTARCAVSSLSDMYSGIVAAVGSLKGPLHGGANEQVMTMLSEIGSIENVDAYLDEKFANKDKVMGFGHRVYKDGDPRAKYLREMSRQITKDAGREELFEMSVKMEKRMAEEKGLIPNVDFYSASVYHCMEIPHDLFTPIFAVSRSAGWIAHILEQYKDNRIMRPRAKYIGETNRKYIPLEERK >CP019594.2|ARH75201.1|1750984_1752253_-|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase MTAEKITQGTEGLNVPNEPIIPFIIGDGIGPDIWKAASRVIDAAVEKAYNGEKRIEWKEVLAGQKAFDTTGEWLPQETLDTIKEYLIAVKGPLTTPIGGGIRSLNVALRQELDLFTCLRPVRWFKGVPSPVKRPQDVDMVIFRENTEDIYAGIEFKEGTTEVEKVIDFLQNEMGATNIRFPETSGIGIKPVSKEGTERLVRAAIQYAIDNNRKSVTLVHKGNIMKFTEGSFKQWGYDLALTEFGDQVFTWQQYDEIVEKEGRDAANVAQEKAEKEGKIIIKDSIADIFLQQILTRPAEHDVVATMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYETGHAIFEATHGTAPKYAGLNKVNPSSVILSSVLMLEHLGWQEAADKITDSIEDTIASKVVTYDFARLMDGAEEVSTSAFADELIKNLK >CP019594.2|ARH75211.1|1766694_1767993_-|CBS-domain-containing-protein MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVIDFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANQTGHTRFPVVNESYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV >CP019594.2|ARH75212.1|1768197_1768611_+|universal-stress-protein MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >CP019594.2|ARH75213.1|1769116_1769806_-|metal-dependent-hydrolase MKLSFHGQSTIYLEGNNKKVIVDPFISNNPKCDLNIETVQVDYIVLTHGHFDHFGDVVELAKKTGATVIGSAEMADYLSSYHGVENVHGMNIGGKANFDFGSVKFVQAFHSSSFTHENGIPVYLGMPMGIVFEVEGKTIYHTGDTGLFSDMSLIAKRHPVDVCFVPIGDNFTMGIDDASYAINEFIKPKISVPIHYDTFPLIEQDPQQFKDAVNVGDVQILKPGESVQF >CP019594.2|ARH75214.1|1769980_1771036_+|aminopeptidase-P-family-protein MTKISKIIDELNNQQADAAWITTPLNVYYFTGYRSEPHERLFALLIKKDGKQVLFCPKMEVEEVKASPFTGEIVGYLDTENPFSLYPQTINKLLIESEHLTVARQKQLISGFNVNSFGDVDLTIKQLRNIKSEDEINKIRKAAELADKCIEIGVSYLKEGVTEREVVNHIEQTIKQYGVNEMSFDTMVLFGDHAASPHGTPGDRRLKSNEYVLFDLGVIYEHYCSDMTRTIKFGEPSQEAQEIYNIVLEAETSAIQAIKPGIPLKDIDHIARNIISEKGYGEYFPHRLGHGLGLQEHEYQDVSSTNSNLLEAGMVITIEPGIYVPGVAGVRIEDDILVTNEGYEVLTHYEK >CP019594.2|ARH75215.1|1771350_1772469_-|alanine-dehydrogenase MKIGIPREIKNNENRVGLSPSGVHALVESGHTVLVETNAGSGSFFEDVDYKEAGAEIVAEQAKVWDVDMVIKVKEPLESEYPYFKEGLVLFTYLHLANEEKLTQALIDRKVISIAYETVQLPDRSLPLLSPMSEVAGRMSAQVGAEFLQKLNGGMGILLGGVPGVPKGKVTIIGGGQAGTNAAKIALGLGADVTILDVNPKRLQQLDDLFGGRVHTIMSNPLNIELYVKQSDLVIGAVLIPGAKAPRLVTEDMIKQMKNGSVIIDIAIDQGGIFETTDKITTHDNPTYIKHGVVHYAVANMPGAVPRTSTLALNNATLPYALMLANKGYREAFKSNQPLSLGLNTYKGHVTNKGVAEAFEMEYKSVEEALQL >CP019594.2|ARH75216.1|1772609_1773110_+|universal-stress-protein-UspA MITYKNILIAVDGSHEAEWAFNRAVGVAKRNDAKLTIVNVIDSRTYSSYEVYDAQFTEKSKHFAEELLNGYKEVATNAGVKDVETRLEFGSPKSIIPKKLAHEINADLIMSGTSGLNAVERFIVGSVSESIVRHAPCDVLVVRTEELPADFQPQVATTQLREKYQN >CP019594.2|ARH75217.1|1773356_1774559_-|acetate-kinase MSKLILAINAGSSSLKFQLIRMPEEELVTKGLVERIGLKDSIFTIEVDGEKVKTVQDIKDHVEAVDIMLDAFKKHNIINDINDIDGTGHRVVHGGEKFPESAAITDEVEKEIEELSELAPLHNPANLMGIRAFRKLLPNIPHVAIFDTAFHQTMPEKAYLYSLPYHYYKDYGIRKYGFHGTSHKFVSQRAAEMLDKPIEDLRIISCHIGNGASIAAIDGGKSIDTSMGFTPLAGVTMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLEILNKESGLLGLSGTSSDLRDLSEEAESGKARSQMALDVFASKIHKYIGSYAARMHGVDVIVFTAGIGENSVEIRAKVLEGLEFMGVYWDPKKNENLQRGKEGFINYPHSPVKVVVIPTDEESMIARDVMTYGGLK >CP019594.2|ARH75218.1|1774646_1775594_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAEQQTIMERLFHTLDEKAKTLNNENGQSFIENLGLAMEQVYTNERGLLEQSTLQDRRKAFQFAYLSLMQEEKIQANHQITPDSIGLILGFLVERFMNNQEELHIVDIASGAGHLSATVKEVLPEIAVMHHLIEVDPVLSRVSVHLANFLEIPFDVYPQDAIMPLPLEEADIVIGDFPVGYYPIDERSRDFKLGFEEGHSYSHYLLIEQAINALKDAGYAFLVVPSNIFTGEHVKQLEKYIATETEMQAFLNLPPTLFKNEKARKSILILQKKKSGETKPVEVLLANIPDFKNPSQFQGFMTELNQWMDTNRPKK >CP019594.2|ARH75219.1|1775716_1776211_-|thiol-peroxidase MTEITFKGGPIHLKGQLINEGDFAPDFTVLDNDLNQVTLADYAGKKKLISVVPSIDTGVCDQQTRKFNSEASKEEGIVLTISADLPFAQKRWCASAGLDNVITLSDHRDLSFGENYGVVMEELRLLARAVFVLDADNKVVYKEIVSEGTDFPDFDAALAAYKNI >CP019594.2|ARH75220.1|1776308_1777079_-|hypothetical-protein MDLNLTMIIIIILFGFIAAFIDSVVGGGGLISTPALLAIGLPPSVALGTNKLASSFGSLTSAIKFIRSGKVDLYVVAKLFGFVFLASACGAYIATMVPSQILKPLIIIALSSVFIFTLLKKDWGNTRTFTQFTFKKAILFAALFILIGFYDGFVGGGTGSFMLFVLLIFGFDFLSAAGNAKVLNFASNIGALVLFMVLGQVDYVIGLVMAASMIVGSYAGAHFAIKQGVGYVKVLFIIITAILILKNAFDYIQQFV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019594_6 | 1768937-1769019 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019594_6
|
1 spacers
spacers of CP019594_6
>6.1|1768962|33|CP019594|CRISPRCasFinder TATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019594_6
The CRISPR arrays of CP019594_6 >merge|CP019594|6|1768937-1769019|CRISPRCasFinder GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTACTATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC >CP019594|6|6|1768937-1769019|CRISPRCasFinder GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC TATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACA GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC
>CP019594.2|ARH75212.1|1768197_1768611_+|universal-stress-protein MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >CP019594.2|ARH75211.1|1766694_1767993_-|CBS-domain-containing-protein MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVIDFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANQTGHTRFPVVNESYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV >CP019594.2|AXB22688.1|1766555_1766660_+|nitrogen-fixation-protein-NifR MSAYFNVQVGLGPQHREIGFPISTDNASWAPTFV >CP019594.2|ARH75210.1|1765383_1766325_-|bifunctional-oligoribonuclease/PAP-phosphatase-NrnA MISTMNEIMKCIEDNDTIIIHRHVRPDPDAYGSQLGLKYYIQQKFPQKQVFAVGEAESSLSFIGELDNIDDKTYQDALVIVCDTANAPRIDDERYSTGRKLIKIDHHPAVDQYGDINLVNTNASSTSEIIYDLISHFNDEAIVNKDIASVLYLGIVGDTGRFLFNNTSEHTMEIAGKLIGHDIDHNALLNKMMEKDPKMLPFQGYVLQHFELMDDGFCQVKITEDVLKQFGIQPNEASQFVNTIADIKGLKIWVFAVDEGSEIRCRLRSKGQLIINDIAQDFGGGGHPNASGVSVNSWDEFEQLAKALRTKLN >CP019594.2|ARH75209.1|1762165_1765363_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MVAYLNIHTAYDLLNSSLKIEDAVRLAVSENVDALAITDTNVLYGFPKFYDTCIANNIKPIFGMTIYVTNGLNTVETVVLAKDNNGLKDLYQLSSEIKMNALEHVSFELLKRFSNNMIIIFKNVADEHRDIVQVFDSHEDTYLDHRSVLVQGIKHVWIQDVCYQTRHDADTISALAAIRDNTKLDLIHDQEDFGAHFLTENEIQQLDVNPEYFTQADRIAQKCDAELKYHQSLLPQYQAPNDESAKKYLWRVLVTQLKKLELNYDVYLERLKYEYKVITNMGFENYFLIVSDLIHYAKTNDVMVGPGRGSSAGSLVSYLLGITTIDPIKFNLLFERFLNPERVTMPDIDIDFEDTRREKVIQYVQEKYGELHVSGIVTFGHLLARAVARDVGRIMGFDEVTLNEISSLIPHKLGITLDEAYQIDDFKKFVHRNHRHERWFSICKKLEGLPRHTSTHAAGIIINDHPLYEYAPLTKGDTGLLTQWTMTEAERIGLLKIDFLGLRNLSIIHQILTQVKKDLGINIDIEKIPFDDQKVFELLSQGDTTGIFQLESDGVRSVLKKLKPEHFEDIVAVTSLYRPGPMEEIPTYITRRHDPSKVQYLHPHLEPILKNTYGVIIYQEQIMQIASTFANFSYGEADILRRAMSKKNRAVLESERQHFIEGAKQNGYHEDISKQIFDLILKFADYGFPRAHAVSYSKIAYIMSFLKVHYPNYFYANILSNVIGSEKKTAQMIEEAKKQGITILPPNINESHWFYKPSQEGIYLSIGTIKGVGYQSVKVIVEERYQNGKFKDFFDFARRIPKRVKTRKLLEALILVGAFDAFGKTRSTLLQAIDQVLDGDLNIEQDGFLFDILTPKQMYEDKEELPDALISQYEKEYLGFYVSQHPVDKKFVAKQYLTIFKLSNAQNNKPILVQFDKVKQIRTKNGQNMAFVTLNDGIETLDGVIFPNQFKKYEELLSHNDLFIVSGKFDLRKQQRQLIINEIQTLATFEEQKLAFAKQIIIRNKSQIDMFEEMIKATKENANDVVLSFYDETIKQMTTLGYINQKDSMFNNFIQSFNPSDIRLI >CP019594.2|ARH75208.1|1760487_1761717_-|NAD-dependent-malic-enzyme MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTMAGLVNALRVVNKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADVFIGVSVANALSQDMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVDPQDVYDKTMKLTDLQ >CP019594.2|ARH75207.1|1759435_1760293_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyl-transferase-subunit-beta MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYLEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK >CP019594.2|ARH75206.1|1758491_1759436_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyl-transferase-subunit-alpha MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVEQLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYIE >CP019594.2|ARH75205.1|1757254_1758223_-|ATP-dependent-6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTAQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI >CP019594.2|ARH75204.1|1755475_1757233_-|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMIEKLINAGMNVARLNFSHGSHEEHKGRIDTIRKVAKRLDKIVAILLDTKGPEIRTHNMKDGIIELERGNEVIVSMNEVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLIELQVKDIDHAKKEVKCDILNSGELKNKKGVNLPGVRVSLPGITEKDAEDIRFGIKENVDFIAASFVRRPSDVLEIREILEEQKANISVFPKIENQEGIDNIEEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPEKVPMVQKDLIRQCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSLVNAIGISVAHTALNLNVKAIVAATESGSTARTISKYRPHSDIIAVTPSEETARQCSIVWGVQPVVKKGRKSTDALLNNAVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGETGTTNMMKIHLVGDEIANGQGIGRGSVVGTTLVAETVKDLEGKDLSDKVIVTNSIDETFVPYVEKALGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTVVGVEKAVKNISNNMLVTIDAAQGKIFEGYANVL >CP019594.2|ARH75213.1|1769116_1769806_-|metal-dependent-hydrolase MKLSFHGQSTIYLEGNNKKVIVDPFISNNPKCDLNIETVQVDYIVLTHGHFDHFGDVVELAKKTGATVIGSAEMADYLSSYHGVENVHGMNIGGKANFDFGSVKFVQAFHSSSFTHENGIPVYLGMPMGIVFEVEGKTIYHTGDTGLFSDMSLIAKRHPVDVCFVPIGDNFTMGIDDASYAINEFIKPKISVPIHYDTFPLIEQDPQQFKDAVNVGDVQILKPGESVQF >CP019594.2|ARH75214.1|1769980_1771036_+|aminopeptidase-P-family-protein MTKISKIIDELNNQQADAAWITTPLNVYYFTGYRSEPHERLFALLIKKDGKQVLFCPKMEVEEVKASPFTGEIVGYLDTENPFSLYPQTINKLLIESEHLTVARQKQLISGFNVNSFGDVDLTIKQLRNIKSEDEINKIRKAAELADKCIEIGVSYLKEGVTEREVVNHIEQTIKQYGVNEMSFDTMVLFGDHAASPHGTPGDRRLKSNEYVLFDLGVIYEHYCSDMTRTIKFGEPSQEAQEIYNIVLEAETSAIQAIKPGIPLKDIDHIARNIISEKGYGEYFPHRLGHGLGLQEHEYQDVSSTNSNLLEAGMVITIEPGIYVPGVAGVRIEDDILVTNEGYEVLTHYEK >CP019594.2|ARH75215.1|1771350_1772469_-|alanine-dehydrogenase MKIGIPREIKNNENRVGLSPSGVHALVESGHTVLVETNAGSGSFFEDVDYKEAGAEIVAEQAKVWDVDMVIKVKEPLESEYPYFKEGLVLFTYLHLANEEKLTQALIDRKVISIAYETVQLPDRSLPLLSPMSEVAGRMSAQVGAEFLQKLNGGMGILLGGVPGVPKGKVTIIGGGQAGTNAAKIALGLGADVTILDVNPKRLQQLDDLFGGRVHTIMSNPLNIELYVKQSDLVIGAVLIPGAKAPRLVTEDMIKQMKNGSVIIDIAIDQGGIFETTDKITTHDNPTYIKHGVVHYAVANMPGAVPRTSTLALNNATLPYALMLANKGYREAFKSNQPLSLGLNTYKGHVTNKGVAEAFEMEYKSVEEALQL >CP019594.2|ARH75216.1|1772609_1773110_+|universal-stress-protein-UspA MITYKNILIAVDGSHEAEWAFNRAVGVAKRNDAKLTIVNVIDSRTYSSYEVYDAQFTEKSKHFAEELLNGYKEVATNAGVKDVETRLEFGSPKSIIPKKLAHEINADLIMSGTSGLNAVERFIVGSVSESIVRHAPCDVLVVRTEELPADFQPQVATTQLREKYQN >CP019594.2|ARH75217.1|1773356_1774559_-|acetate-kinase MSKLILAINAGSSSLKFQLIRMPEEELVTKGLVERIGLKDSIFTIEVDGEKVKTVQDIKDHVEAVDIMLDAFKKHNIINDINDIDGTGHRVVHGGEKFPESAAITDEVEKEIEELSELAPLHNPANLMGIRAFRKLLPNIPHVAIFDTAFHQTMPEKAYLYSLPYHYYKDYGIRKYGFHGTSHKFVSQRAAEMLDKPIEDLRIISCHIGNGASIAAIDGGKSIDTSMGFTPLAGVTMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLEILNKESGLLGLSGTSSDLRDLSEEAESGKARSQMALDVFASKIHKYIGSYAARMHGVDVIVFTAGIGENSVEIRAKVLEGLEFMGVYWDPKKNENLQRGKEGFINYPHSPVKVVVIPTDEESMIARDVMTYGGLK >CP019594.2|ARH75218.1|1774646_1775594_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAEQQTIMERLFHTLDEKAKTLNNENGQSFIENLGLAMEQVYTNERGLLEQSTLQDRRKAFQFAYLSLMQEEKIQANHQITPDSIGLILGFLVERFMNNQEELHIVDIASGAGHLSATVKEVLPEIAVMHHLIEVDPVLSRVSVHLANFLEIPFDVYPQDAIMPLPLEEADIVIGDFPVGYYPIDERSRDFKLGFEEGHSYSHYLLIEQAINALKDAGYAFLVVPSNIFTGEHVKQLEKYIATETEMQAFLNLPPTLFKNEKARKSILILQKKKSGETKPVEVLLANIPDFKNPSQFQGFMTELNQWMDTNRPKK >CP019594.2|ARH75219.1|1775716_1776211_-|thiol-peroxidase MTEITFKGGPIHLKGQLINEGDFAPDFTVLDNDLNQVTLADYAGKKKLISVVPSIDTGVCDQQTRKFNSEASKEEGIVLTISADLPFAQKRWCASAGLDNVITLSDHRDLSFGENYGVVMEELRLLARAVFVLDADNKVVYKEIVSEGTDFPDFDAALAAYKNI >CP019594.2|ARH75220.1|1776308_1777079_-|hypothetical-protein MDLNLTMIIIIILFGFIAAFIDSVVGGGGLISTPALLAIGLPPSVALGTNKLASSFGSLTSAIKFIRSGKVDLYVVAKLFGFVFLASACGAYIATMVPSQILKPLIIIALSSVFIFTLLKKDWGNTRTFTQFTFKKAILFAALFILIGFYDGFVGGGTGSFMLFVLLIFGFDFLSAAGNAKVLNFASNIGALVLFMVLGQVDYVIGLVMAASMIVGSYAGAHFAIKQGVGYVKVLFIIITAILILKNAFDYIQQFV >CP019594.2|ARH75221.1|1777122_1778346_-|tRNA-4-thiouridine(8)-synthase-ThiI MKYDHLLVRYGELTLKGSNRKKFVNQLRNNVNKSLKGLDGFVVKGKRDRMYIELEDHADINEITYRLSKIFGIKSISPVLKVEKTLEAMSATAIKFAQQFEENSTFKIDVKRADKNYPMDTYELQRELGGAVLKHFDNISVNVKRPDHEIRVEVRLDAIYMYEEVVQGAGGLPVGTGGKTLLMLSGGIDSPVAGMEVMRRGVTIEAIHFHSPPFTSDQAKEKVIELTRILAERVGPIKLHIVPFTELQKQVNKVVHPRYTMTSTRRMMMRVADKLVHQIGAYAIVNGENLGQVASQTLHSMYAINNVTSTPVLRPLLTYDKEEIIIKSKEIGTFETSIQPFEDCCTIFTPKNPVTEPNFDKVVQYESVFDFEEMINRAVENIETLEITSDYKTIKEQQTNQLINDFL >CP019594.2|ARH76266.1|1778345_1779494_-|cysteine-desulfurase MFILIYLDNAATTKAFEEVLDTYLKVNQSMYYNPNSPHKAGLQADQLLQQAKVQINDMVNTNMTYDVVFTSGATESNNIALKGVAYRKFDTAREIITSVLEHPSVLEVVRYLEEREGFKVKYVDVTKDGSINLEHFKELMSDKVGLVTCMYVNNVTGQIQPIPQMADVIKNYPKAHFHVDAVQAFGKISMDFNNVDSISLSGHKFNGLKGQGVLLVNHIQNVEPTVHGGGQEYGVRSGTVNLPNDIAMVKAMKIANENLEALNAFVTELNNDVRQFLNKYHGVYINSSTSGSPFVLNVSFPGVKGEVLVNAFSKYDIMISTTSACSSKRNKLNEVLTAMGLSDKAIEGSIRLSFGAMTTKEDITKFKETFTIIYEEIKELLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019594_7 | 1857290-1857383 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019594_7
|
1 spacers
spacers of CP019594_7
>7.1|1857324|26|CP019594|CRISPRCasFinder AGAATTTCAAAAAAGAAATTCTACAG |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019594_7
The CRISPR arrays of CP019594_7 >merge|CP019594|7|1857290-1857383|CRISPRCasFinder GCAATGCGCGTTGGGGTGTGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCAAAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCGCGTTGGGGTGTGGGGCCTCAACATAG >CP019594|7|7|1857290-1857383|CRISPRCasFinder GCAATGCGCGTTGGGGTGTGGGGCCCCAACATAG AGAATTTCAAAAAAGAAATTCTACAG GCAATGCGCGTTGGGGTGTGGGGCCTCAACATAG
>CP019594.2|ARH75285.1|1856362_1856983_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MFSRNNNIFVDDLSVTKDNYLIAVLKMLVIFLVINYGTDVSYDHEYVGLFIILLGVVLLKILNINLLSFKKLKFTHMLYIIFGFLLMYGLDYLYDTFAPPTLNEILIDEESEDAPYHIALLSTAIIPPITEEIICRGLIIRILFRNHLFLGFIVSTVFFTLIHESDTLIGYLPYFYSGLIFGYTYLKTKRLEVPILIHFINNLLAM >CP019594.2|ARH75284.1|1855560_1856196_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MQKFKDLFYDDLSVARGNYFLTLLSAFLITIILLIGFVVSDTHILYGVFIVLIGIVLLRLFKINLLSFKKLTMSQVIYIIGGALLIYGLDYLYLHFHDVPTNEQELDRELQHMPLYMSIVTIAIIPAIVEEIVFRGMIIRVVFRKHLFIGLVVSSLVFASLHESDTWIGYLPYLYSGVIFGLIYLKTKRLEVVILIHFINNLSSLLILLWG >CP019594.2|ARH75283.1|1854819_1855263_-|hypothetical-protein MNKASFDKKVKKQLWFLNKKGKQALDQRLSSITDKDNVNFNKPITFANTYLRENVFRSKETKSYSIFVTLVVMMFAYVALLGLFLFGLITSLSGVQFFVNPKVDLSTTVVILTIIGAILLMLVSIYLIKITTSYFTKKLLEHKFNGH >CP019594.2|ARH75282.1|1854389_1854833_+|competence-protein-ComK MQDNSTKYLLYIQTATSNHLETNCVFLHCDYILKVPINKLVSYYAKLHLSSQSVLIETAKNILNINKLVPIYINAKTILFPLKHKRAPIQIYINAHYIVGMTAIENSTLIHFQEGIQLEVDEPFSLVSKKCHESLALKHFIENTNDH >CP019594.2|ARH75281.1|1853806_1854277_+|RNA-polymerase-sigma-factor MKFNDVYNKHHKIIHHLLKKYNISYNYDEYYQLLLIKMWQLSQIYKPSSNQSLSSFLFMRLNFYLIDLFRQQKRLNDIILCENHSPILTEQPTYFNEYDLRLQDVCALLKHRERQWLMLYLEGYKQYEIADIMSLSTSTIKLIKASVKRKCQRFLN >CP019594.2|ARH75280.1|1853383_1853608_-|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK >CP019594.2|ARH75279.1|1852253_1853108_-|autolysin MNKHKKGSIFGIIGLVVIFAVVSFLFFSMISDQIFFKHVKSDIKIEKLNVTLNDAAKKQINNYTSQQVSNKKNDAWRDASATEIKSAMDSGTFIDNEKQKYQFLDLSKYQGIDKNRIKRMLVDRPTLLKHTDDFLKAAKDKHVNEVYLISHALLETGAVKSELANGVEIDGKKYYNFYGVGALDKDPIKTGAEYAKKHGWDTPEKAISGGADFIHKHFLSSTDQNTLYSMRWNPKNPGEHQYATDIKWAESNATIIADFYKNMKTEGKYFKYFVYKDDSKHLKK >CP019594.2|ARH75278.1|1850874_1852167_+|arsenical-efflux-pump-membrane-protein-ArsB MMTTLATFIFLVTLLFVLWQPKGLDIGFTALAGAFIAVITGVVSFSDVFEVTGIVWNATLTFVSVILISLILDKIGFFEWSAIHMLHASKGSGLKMFVYIILLGAVVAAFFANDGAALILTPIVLAMVKNIGFSKRAIFPFIIASGFIADTTSLPLIVSNLVNIISADYFNISFSQYLSRMIIPNLFSLLASLLVLWLYFRKAIPKSFDANHIKKPIDAINDLKLFKISWIVLVILLFGYLISEFTKIPVSIFTGIIAFIFLILARKSNAVNIKQVIKGAPWNIVLFSIGMYIVIFGLRNAGITLILAKILEYISNYGLFSTILGMGFISAFLSSIMNNMPTVLIDAIAIGQSNVHGMLKEGLIYANVIGSDLGPKITPIGSLATLLWLHVLTQKDVKISWGTYFKTGIIITIPVLFFTLIGLYLTLILF >CP019594.2|ARH75277.1|1850560_1850875_+|ArsR-family-transcriptional-regulator MTYKELATYLKVLSDSSRLEILDLLSCGELCACDLLEHFQFSQPTLSYHMKALVKTNLVTTRKIGNKHLYQLNHNIFESVINNLSKVHTSNQRCICHNLKTGEC >CP019594.2|ARH75276.1|1848415_1849918_-|pyridine-nucleotide-disulfide-oxidoreductase MRVAIIGMGTAGVSVLRELVKHPKFNQLDIDLYDDKVNMGQGVPFQNDSSELLINMPSKKMSLNLDDETEFWKWYKQQTDFNFDEPAYLPRFVFGHYMKSYLSMFTKKYPNISTNYNKVQEIYTNSNIDETNLTYYICTTNSEQSWQAYDYVFLTCGTFAYHDPYNLKGKKGYIATPYPTYNTLDEVNELDDIAIIGTGLASLDVVRYVAAHHPKLPITMTSRSANLPSVRGTMIDVTFKYLTKDKLNDIKKHHFGNAPLDTLVSLFLKECAEYDIDFEKLVHRRTGNHIADLKYDLARPTEMGIFQSIIEHLKENLNWIWNSLSIEDQHQFNQKYSKMIQLNSNPMPPRTAELIIELIENKSLILKKDLEDVKHDGKLYYFSYKNQESVDIYKVVINATGAKSHLNELDQDDQLIKNLENRQIVQAHPMGGIQIIPETNQVISPRFGTLTNMIAIGQMTNGVNKLRNGVKMIVEQVAHTVSQLYDALESNEQEQRSDNQ >CP019594.2|ARH75286.1|1857545_1858259_-|transaldolase MAKLNVEVFADGADIEEMKAAYKNKQVDGFTTNPSLMAKAGVTDYKAFAEEAVKEIPDASISFEVFADDLETMEKEAAILKQYGENVFVKIPIVNTKGESTIPLIKKLSADNVRLNVTAVYTIEQVKEITEAVTEGVPTYVSVFAGRIADTGVDPLPLMKEAVKVTHSKDGVKLLWASCRELFNVIQADEIGADIITCPADVVKKVNTNLGRDINELSVDTVKGFAKDIQSSGLSIL >CP019594.2|ARH75287.1|1858517_1858820_+|hypothetical-protein MSRSKKYFYLSSLMIILSFFFNTNNVFLSGLFNSFIKLILFCSVINSIILILSIIFADRSIKSLKPDADWIRIASKSLPWIILIVILVHIFSIVHTFGFI >CP019594.2|ARH75288.1|1859074_1859440_+|fluoride-efflux-transporter-CrcB MQYVYIFIGGALGALLRYLISFLNTDGGFPIGTLIANLTGAFVMGLLTALTIEFFSNHPTLKKAITTGFLGALTTFSTFQLELIHMFDYQQFITLLLYAVTSYVFGILLCYVGIKLGGGLS >CP019594.2|ARH75289.1|1859436_1859790_+|CrcB-family-protein MISIILVMIGGGLGAIARSAVTDYFNHIFTSKLPIATLIVNLVGSFLIGLTIGLSISISWFPAFFVTGFLGGLTTFSTLAKELTLMMTPKFDIKLFLNYSLLQFIIGFIACYIGYHI >CP019594.2|ARH75290.1|1860039_1860873_-|aldo/keto-reductase MEVKTFYNGNTMPQIGLGTFRVENDENCMESVKYAIEQGYRSIDTAKVYGNEEQVGAGIRAGLESTGIAREDLFITSKLYFEDFGRENVAAAYEASLSRLGLKYLDLYLVHWPGTNEAIMVDTWKGMEDLYKNNKVKNIGVSNFEPEHLEALLAQVSIKPVINQVEYHPYLTQHKLKLYLAAQHIVMESWSPLMNAQILNDETIKDIAQELGKSPAQVVLRWNVQHGVVTIPKSVTPNRISENFRIFDFELSDEQMTRIDDLNQDKRIGPDPKTFEG >CP019594.2|ARH75291.1|1861084_1861993_-|NERD-domain-containing-protein MDLSSPVVIGLIIAVVIALIFFVLFLVALGSKKKVKRQTEEKYEQQEQNIKKSHEEALEKERIQNKKTITKQQEDYNHMISTKDREIDALKLFSKNHSEYVTDMRLIGIRERLVKEKRIRPEDMHIMANIFLPKDGFNNIERISHLVLTRTGLYIIDSQLLKGHVYNGISGGQFKDLPPMEQVFDTLDLDKSRPQTIVMDQNDDKRSLSFVNYSDQIEAIKQLAEDLQKHLGAKYTPTSILYFNPKNEGDVTISNYNQNSAVKVLVGAEQLDEFFNKFVFHGRIQYNVEDLQQMMDKIESFN >CP019594.2|ARH75292.1|1862117_1863311_-|S-adenosylmethionine-synthase MLNNKRLFTSESVTEGHPDKIADQVSDAILDAILKDDPNARVACETTVTTGMALIAGEISTTTYVDIPKVVRETIKEIGYTRAKYGYDYETMAILTAIDEQSPDIAQGVDKALEYRDKDSEEEIEATGAGDQGLMFGYATNETETYMPLAIYLSHQLAKRLSDVRKDGTLNYLRPDGKVQVTVEYDENDNPVRIDTIVVSTQHAEDVTLEQIQEDIKAHVIYPTVPENLINEQTKFYINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGYARHGGGCFSGKDPTKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLADQCEVQLAYAIGVAEPVSIAIDTFGTGKVSEGQLVEAVRKHFDLRPAGIIKMLDLKQPIYKQTAAYGHFGRTDVLFPWEKLDKVEELKDAVK >CP019594.2|ARH75293.1|1863682_1865275_+|phosphoenolpyruvate-carboxykinase-(ATP) MSVDTYTETTKIDKLLKKPTSHFQLSTTQLYNKILDNNEGVLTELGAVNASTGKYTGRSPKDKFFVSEPSYRDNIDWGEINQPIDEETFLKLYHKVLDYLDKKDELYVFKGYAGSDKDTMLKLTVINELAWHNLFAKNMFIRPESKEEATKIKPNFTIVSAPHFKADPEVDGTKSETFVIISFKHKVILIGGTEYAGEMKKGIFSVMNYLLPMQDIMSMHCSANVGEKGDVALFFGLSGTGKTTLSADPHRKLIGDDEHGWNKNGVFNIEGGCYAKAINLSKEKEPQIFDAIKYGAILENTVVSEDGSVDFEDNRYTENTRAAYPINHIDNIVVPSKAAHPNTIIFLTADAFGVIPPISKLNKDQAMYHFLSGFTSKLAGTERGVTEPEPSFSTCFGAPFFPLHPTVYADLLGELIDLHDVDVYLVNTGWTGGKYGVGRRISLHYTRQMVNQAISGKLKNAKYTKDSTFGLSIPVEIEDVPKTILNPINAWSDKEKYKAQAEDLIQRFEKNFEKFGEKVEHIAEKGSFNK >CP019594.2|ARH76269.1|1865571_1866318_-|S9-family-peptidase MPIESFTHQFEEITYLSDDLQVKALMMTPHHEVKRIVVYLRGGKGQVGRVRAGRLMQFSDSQTLVIGPYYRGNNGSEGKDEFYRGDLNDVTQLLRLLHDKYPQAFIHMVGFSRGGLQGLLTFQDLPVSSYIIWGGVSDIDLMYEERVDLRGMLRRMIGHPKKDRAAYEARQAIPNINENSPPILIVHGGKDQQVGIHHAYYLADQLELKGAAHETFYQMAEGHVPRPPAMVETLTYIKEFMNQVELHR >CP019594.2|ARH75294.1|1866322_1866796_-|nucleoside-triphosphatase-YtkD MKFRDKDNRQVNLTFKKDNEIADGNHVLAIPTFKNQLLFTKHNLRGIEFPGGKRERGESSAEAVTRELYEETGAKVKNIHYIAQYTIETHDQTDFVKDVYFIEVESLVSKNDYLETAGPVLFNCINDIELAQRSFLLQDSTILKCVERVQSLGFYQT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019594_8 | 2132857-2133069 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019594_8
|
2 spacers
spacers of CP019594_8
>8.1|2132904|34|CP019594|CRISPRCasFinder TGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTA >8.2|2132985|38|CP019594|CRISPRCasFinder TGCTGTTGTGGGAGCTTGGTGTTGGTGCCATGTTACTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019594_8
The CRISPR arrays of CP019594_8 >merge|CP019594|8|2132857-2133069|CRISPRCasFinder TGACGTATTGTTGCGGGAACTTGGTGTCATGACATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCGTGCCATGCTACTTTGATGTGCTGTTGTGGGAGCTTGGTGTTGGTGCCATGTTACTTTGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCATGCCATGCTACTTTGATG >CP019594|8|8|2132857-2133069|CRISPRCasFinder TGACGTATTGTTGCGGGAACTTGGTGTCATGACATGTTACTTTGATG TGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTA TGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCGTGCCATGCTACTTTGATG TGCTGTTGTGGGAGCTTGGTGTTGGTGCCATGTTACTT TGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCATGCCATGCTACTTTGATG
>CP019594.2|ARH75566.1|2132175_2132823_+|HD-domain-containing-protein MQQSDIISAAKKYMESIHQNDYTGHDIAHVYRVTALAKSIAENEGVNDTLVIELACLLHDTVDEKVVDANKQYAELKSFLSSLSLSTEDQEHILFIINNMSYRNGKNDHVTLTLEGQIVRDADRLDAIGAIGVARTFQFAGHFGEPMWTEQMSLDKINDDLVEQLPPSAIKHFFEKLLKLESLMHTDTAKMIAKERHDFMMIYLKQFFTEWNYHD >CP019594.2|ARH75565.1|2130663_2132148_+|cardiolipin-synthase MIELLSIALKHSNIILNSIFIGAFILNLLFAFTIIFMERRSANSIWAWLLVLVFLPLFGFILYLLLGRQIQRDQIFKIDKEDKKGLELIVDEQLAALKNENFSNSNYQIVKFKEMIQMLLYNNAAFLTTDNDLKIYTDGQEKFDDLIQDIRNATDYIHFQYYIIQNDELGRTILNELGKKAEQGVEVKILYDDMGSRGLRKKGLRPFRNKGGHAEAFFPSKLPLINLRMNNRNHRKIVVIDGQIGYVGGFNVGDEYLGKSKKFGYWRDTHLRIVGDAVNALQLRFILDWNSQATRDHISYDDRYFPDVNSGGTIGVQIASSGPDEEWEQIKYGYLKMISSAKKSIYIQSPYFIPDQAFLDSIKIAALGGVDVNIMIPNKPDHPFVFWATLKNAASLLDAGVKVFHYDNGFLHSKTLVIDDEIASVGTANMDHRSFTLNFEVNAFIYDQQIAKKLKQAFIDDLAVSSELTKARYANRSLWIKFKEGISQLLSPIL >CP019594.2|ARH75564.1|2130204_2130498_-|CsoR-family-transcriptional-regulator MTEQDNAHHSEQIKTNLKSRLNRIEGQVRAINRMIEEDVYCDDVLTQIRATRSALNSVAIKLLEQHMKSCIMNKVNQGAQEEAMEELLVTFQKLIKD >CP019594.2|ARH75563.1|2129983_2130193_-|heavy-metal-associated-domain-containing-protein MIHQNTIYTAGIETEEQVSQLTERISNMIGVHQVNINIIDGQVTVSYETPANLNSIEKEIYDEGYKIVF >CP019594.2|ARH75562.1|2129718_2129856_-|hypothetical-protein MKRPEKIQNVVKLLSSLGVNIKKTKSRLDIINTLPASNKVSHELK >CP019594.2|ARH75561.1|2128252_2129455_+|rod-shape-determining-protein-RodA MNYSSRQQPDKHWLRKVDWVLVATIAVLAIFSVLLINSAMGGGQYSANFGIRQIFYYILGAIFAGIIMFISPKKIKHYTYLLYFLICLLLIGLLVIPESPITPIINGAKSWYTFGPISIQPSEFMKIILILALARVVSRHNQFTFNKSFQSDLLLFFKIIGVSLVPSILILLQNDLGTTLVLAAIIAGVMLVSGITWRILAPIFITGIVGAMTVILGILYAPALIENLLGVQLYQMGRINSWLDPYTYSSGDGYHLTESLKAIGSGQLLGKGYNHGEVYIPENHTDFIFSVIGEELGFIGSVILILIFLFLIFHLIRLAAKIEDQFNKIFIVGFVTLLVFHILQNIGMTIQLLPITGIPLPFISYGGSALWSMMTGIGIVLSIYYHEPKRYVDLYHPKSN >CP019594.2|ARH75560.1|2126864_2127935_-|D-alanine--D-alanine-ligase MTKENICIVFGGKSAEHEVSILTAQNVLNAIDKDKYHVDIIYITNDGDWRKQNNITTEIKSTDELHLENGEALEISQLLKESSSGQPYDAVFPLLHGPNGEDGTIQGLFEVLDVPYVGNGVLSAASSMDKLVMKQLFEHRGLPQLPYISFLRSEYEKYEHNILKLVNDKLNYPVFVKPANLGSSVGISKCNNEAELKEGIKEAFQFDRKLVIEQGVNAREIEVAVLGNDYPEATWPGEVVKDVAFYDYKSKYKDGKVQLQIPADLDEDVQLTLRNMALEAFKATDCSGLVRADFFVTEDNQIYINETNAMPGFTAFSMYPKLWENMGLSYPELITKLIELAKERHQDKQKNKYKID >CP019594.2|ARH75559.1|2125494_2126850_-|UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D--alanine-ligase MINVTLKQIQSWIPCEIEDQFLNQEINGVTIDSRAISKNMLFIPFKGENVDGHRFVSKALQDGAGAAFYQKGTPIDENVSGPIIWVEDTLTALQQLAQAYLRHVNPKVIAVTGSNGKTTTKDMIESVLHTEFKVKKTQGNYNNEIGLPLTILELDNDTEISILEMGMSGFHEIEFLSNLAQPDIAVITNIGESHMQDLGSREGIAKAKSEITIGLKDNGTFIYDGDEPLLKPHVKEVENAKCISIGVATDNALVCSVDDRDTTGISFTINNEHYDLPILGKHNMKNATIAIAVGHELGLTYNIIYQNLKNVSLTGMRMEQHTLENDITVINDAYNASPTSMRAAIDTLSTLTGRRILILGDVLELGENSKEMHIGVGNYLEEKHIDVLYTFGNEAKYIYDSGQQHVEKAQHFNSKDDMIEVLTSDLKAHDRVLVKGSRGMKLEEVVNALIS >CP019594.2|ARH75558.1|2123458_2124979_-|DEAD/DEAH-box-family-ATP-dependent-RNA-helicase MQNFKELGISDNTVQSLESMGFKEPTPIQKDSIPYALQGIDILGQAQTGTGKTGAFGIPLIEKVVGKQGVQSLILAPTRELAMQVAEQLREFSRGQGVQVVTVFGGMPIERQIKALKKGPQIVVGTPGRVIDHLNRRTLKTDGIHTLILDEADEMMNMGFIDDMRFIMDKIPAVQRQTMLFSATMPKAIQALVQQFMKSPKIIKTMNNEMSDPQIEEFYTIVKELEKFDTFTNFLDVHQPELAIVFGRTKRRVDELTSALISKGYKAEGLHGDITQAKRLEVLKKFKNDQINILVATDVAARGLDISGVSHVYNFDIPQDTESYTHRIGRTGRAGKEGIAVTFVNPIEMDYIRQIEDANGRKMSALRPPHRKEVLQAREDDIKEKVENWMSKDSESRLKRISTELLNEYNDVDLVAALLQELVEANDEVEVQLTFEKPLSRKGRNGKPSGSRNRNSKRGNPKFDSKSKRSKGYSSKKKSTKKFDRKEKSSGGSRPMKGRTFADHQK >CP019594.2|ARH75557.1|2122410_2123106_+|DNA-binding-response-regulator MQSKILIIEDDHAITHLLDVALTLDYYNVTTADNATQAHFKIQIDKPDVILLDLGLPDKDGLCLISEIRQHTDIPIIVISARQEEQTIIQALDNGANDYMTKPFNVDELRARIRVIERIAKSHQETNFVFTNGLLSIDFGSKSVVINNQEVHLTPNEFSLLELLSNHKGKVLTYEMILKRIYGYVNKTEMPSLRVHMTSLRQKLSQCHEDAKDIIKTHPRIGYQMLQWKEK >CP019594.2|ARH75567.1|2133102_2133423_+|hypothetical-protein MIWRCGVMGGIARGIDAMPLQFYDMALGRCNVYYAVVTLLFHTVTCICELLWKCCDIYCYTDESLCQDDIAMMNSNSVINHFLHAEISLILFGSMSNWTDAFNIGS >CP019594.2|ARH75570.1|2135064_2135937_-|membrane-protein-insertase-YidC MKKKALLPLFLGIMVFLAGCDYSKPEKRSGFFYNTFVDPMKNVLDWLGNNLLNDNYGLAIIILVLVIRIILLPFMLSNYKNSHMMRQKMKVAKPEVEKIQEKVKRARTQEEKMAANQELMQVYKKYDMNPIKSMLGCLPMLIQLPIIMGLYFVLKDQLVDGLFKYPHFLWFDLGRPDIWITIIAGVLYFIQAYVSSKTMPDEQRQMGYMMMVISPIMIIWISLSSASALGLYWSVSAAFLVVQTHFANIYYEKVAKKEVQPFIEAYEREHNGGNNKKGKNTQVVSKKKKK >CP019594.2|ARH75571.1|2136022_2136664_-|thiamine-phosphate-synthase MFNQSYLNVYFICGTSDVPSHRTIHEVLEAALKAGITLFQFREKGESALKGNDKLVLAKELQHLCHQYDVPFIVNDDVSLAKEINADGIHVGQDDAKVKEIAQYFTDKIIGLSISDLGEYAKSDLTHVDYIGVGPIYPTPSKNDAHTPVGPEMIATFKEMNPQLPIVAIGGINTSNVAPIVEAGANGISVISAISKSENIEKTVNRFKDFFNN >CP019594.2|ARH75572.1|2136665_2137457_-|hydroxyethylthiazole-kinase MNYLNKIRIENPLTICYTNDVVKNFTANGLLSIGASPAMSEAPEEAEEFYKVAQALLINIGTLTAQNEQDIIAIAQTANEAGLPIVFDPVAVGASTYRKQFCKLLLKSAKVSVIKGNASEILALIDDTATMKGTDSDANLDAVAIAKKAYAIYKTAIVITGKEDVIVQGDKAIVLANGSPLLARVTGAGCLLGGVIAGFLFRETEPDIEALIEAVSVFNIAAEVAAENENCGGPGTFSPLLLDTLYHLNETTYQQRIRIQEVE >CP019594.2|ARH75573.1|2137440_2138271_-|bifunctional-hydroxymethylpyrimidine-kinase/phosphomethylpyrimidine-kinase MIKPKIALTIAGTDPTGGAGVMADLKSFHSCGVYGMGVVTSIVAQNTLGVQNIHNLNHQRVDEQLDSVFNDTLPHAIKTGMIATADTMETIRHYLMQHESIPYVIDPVMLAKSGDSLMDNDTKQNLQHTLLPLADVVTPNLPEAEEITGLTIDSEEKIMQAGRIFINEIGSKGVIVKGGHSNDTDIAKDYLFTKEGVQTFENERFKTKHTHGTGCTFSAVITAELAKGRPLFDAVQKAKKFISMSIQYTPEIGRGRGPVNHFAYLKKEGLDDELSK >CP019594.2|ARH75574.1|2138263_2138953_-|thiaminase-II MEFSQKLYQAAKPIINDIYEDDFIQKMLLGNIQADALRHYLQADAAYLKEFTNLYALLIPKMNSMNDVKFLVEQIEFMVEGEVLAHDILAQIVGESYEEIIKTKVWPPSGDHYIKHMYFQAHSRENAIYTIAAMAPCPYIYAELAKRSQSDHKLNREKDTAKWFDFYSTEMDDIINVFESLMNKLAESMSDKELEQVKQVFLESCIHERRFFNMAMTLEQWEFGGKVND >CP019594.2|ARH75575.1|2139339_2140035_-|lytic-transglycosylase-SceD MKKTLLASSLAVGLGIVAGNAGHEAHASEADLNKASLAQMAQSNDQILNQKPIEAGAYNYTFDYEGFTYHFESDGTHFAWNYHATGANGADMSAQAPATNNVAPSADQANQVQSQEVEAPQNAQTQQPQASTSNNSQVTATPTESKASEGSSVNVNDHLKQIAQRESGGNIHAVNPTSGAAGKYQFLQSTWDSVAPAKYKGVSPANAPESVQDAAAVKLYNTGGAGHWVTA >CP019594.2|ARH75576.1|2140423_2140819_-|single-stranded-DNA-binding-protein MLNKIVIVGRLTKDAQIFEKEDRKIATFCVATHRNYKDENGEIVCDYLFCKAFGKLASNIEKYTNQGTLVGITGQMRSRKYDKDGQTHFVTELYVETIKFMSPKSQNNEILSDSILDIDSQNIDNHDLLEI >CP019594.2|ARH75577.1|2140949_2141453_+|hypothetical-protein MTLNLLNNSKIINIKLMGCGNMKTFKAVRFQIVNEHGRIIEYELEDGVIINKEESGTGWLLEIVISNEHYETFKEYQDNEQLLDIRVVITRPANDPALFESTVKSIKNFKTTMSIVFECHIYTLRQQYAESLLEQLIDDGLSGEELKKSFNRMMQSKPKLKDEKLEE >CP019594.2|ARH75578.1|2141509_2141950_-|beta-hydroxyacyl-ACP-dehydratase METIFDYNQIKQIIPHRQPFLLIDKVVEYEEGQRCVAIKQVSGNEPFFQGHFPEYAVMPGVLITEALAQTGAVAILNSEENKGKIALFAGIDKCRFKRQVVPGDTLTLEVEITKIKGPIGKGNAKATVDGQLACSCELTFAIQDVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019594_9 | 2188490-2188640 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019594_9
|
2 spacers
spacers of CP019594_9
>9.1|2188518|29|CP019594|CRISPRCasFinder TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA >9.2|2188575|38|CP019594|CRISPRCasFinder GTTGATGCATAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019594_9
The CRISPR arrays of CP019594_9 >merge|CP019594|9|2188490-2188640|CRISPRCasFinder AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTAAACTTTAGTTGTAAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCATAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGAGCTTCTTTCTA >CP019594|9|9|2188490-2188640|CRISPRCasFinder AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA AACTTTAGTTGTAAGGGGCTCTTATGCA GTTGATGCATAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC AACTTTAGTTGTTAGGAGCTTCTTTCTA
>CP019594.2|ARH75629.1|2187380_2188472_+|transcriptional-regulator MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYVQTIAIYSQFGQKPPGDAYLKVIALLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLVGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPVFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILYVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >CP019594.2|ARH75628.1|2186134_2187115_+|cation-transporter MSHSHHHHDHMHSHVNTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALIAFIYAEKNATATKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >CP019594.2|ARH75627.1|2185812_2186133_+|ArsR-family-transcriptional-regulator MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >CP019594.2|ARH75626.1|2184995_2185661_-|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFEGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDQDIKDALTQFENETD >CP019594.2|ARH75625.1|2183623_2184562_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >CP019594.2|ARH75624.1|2183362_2183593_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQTSASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >CP019594.2|ARH75623.1|2181317_2182691_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >CP019594.2|ARH75622.1|2180446_2180860_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQQPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIQLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >CP019594.2|ARH75621.1|2179803_2180247_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLEKAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >CP019594.2|ARH75620.1|2178972_2179683_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >CP019594.2|ARH75630.1|2188969_2189074_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >CP019594.2|AXB22692.1|2189506_2189689_-|hypothetical-protein MIIFRFKVNAFFPVKLCLMIRFCLESCCIFRRHLLITFHNIRSKFIMFKYISSKCIICTG >CP019594.2|ARH76280.1|2189753_2189912_+|integrase MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >CP019594.2|ARH75631.1|2190347_2190440_+|erm-Leader-peptide MTYGSIVAILCALFAIFFIPYMEKKDKKKK >CP019594.2|ARH75632.1|2190569_2191427_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINRLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQIINLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWLRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIEHFGINQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >CP019594.2|ARH75633.1|2191494_2192277_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQVGRMKQGKTILKNISWQINGGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGSVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHQLLKLVGMSAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >CP019594.2|ARH75634.1|2192566_2193175_-|hypothetical-protein MARKTFISYKYSEAKDLRDKIVESLGEDAKYYQGETSDSPDMSDRITEYIKKELKNKIYSTSVTIVVISPNMKESNWIDWEIEYSVKQMKRGDRTSSTNGVVGVVMKHNGDYSWLRNSVINSDGHTAIHTDNSYLYDIIVKNRFNQEPIEYTCDECKNIDALTGSFISLVEEDEFLGNPTKYIENAYEKSKKATNYNICRRK >CP019594.2|ARH75635.1|2193202_2194237_-|toll/interleukin-1-receptor-domain-containing-protein MKYPIRQVAEVLPEKYTRYILLKEFQRLFPYQWNIIVERQQTYKEKAQHLYKVKKIKNRYNTKSAEEYFFSIPQVKYILSAGRMKKHKENYNASEIKIKKAALEKSRKNKNWKIEERLIKAKRYTQKVDPEYLNIYMKAYHKKDITTEEKLEILTELKKFDTENIVRFFRKLNDAEQNKMIRNLAFKYLQDYGHYVKLRKNFKGKKKVYQTERASLDTKKPEDLYNDLTNKNIQSQKVYDIFISHSTKDKKTVEDIIRVFNEQNKTCYCDWTMDQDYLKRKYVGEYTKQVLKARMEQSKMLVLLRTENSVQSDWVSFEIEYFENLKKPIYIVESLEELLEAFSD >CP019594.2|ARH75636.1|2194299_2195799_-|hypothetical-protein MNGDGKMTIDKKKFIEKYVKALESNTAAIFAGAGLSCGAGYVNWKTLLNEAAEELELNIDKEEHDLVGLAQHYINKKRSRGNLNTVIMEQFSTRAELTENHKLLAKLPIDTYWTTNYDCMIEKALDSEGRIVDVKRNQNQLTVSVADKDATVYKMHGDIDSIDKIILTRDDYEKYNLTHPKFREILEGDLLSKTFLFIGFSFTDPNISYILSRIRLVLEDNTRPHYCILKEVEEKEYDNTEEFMYAKIKQQLHIEDLSRFSIETLLVKDYIEITEILESIYKRYRRKTIFISGSATEYLPFNSETGKYFLHQLSKKLVENDFKLVTGFGLGVGSYVINGVADYINSNKKSKLQNHLNILPFSQDSSGDLDLKEVWKKNRLEMISECGMALFLFGNKEKDGKIVLADGLEEEYKIAERQELVRLPINVTGYKTKNLSEQYNEEINIQFKEKILKMYNEINEYKCDFSNKQSIDELVQKIVNLVIEIKKQNNSWGFNALER >CP019594.2|ARH75637.2|2195858_2196149_-|DUF3387-domain-containing-protein MVMEENAFYDALASHDTAEHVLGDDTLKIIAHELTQSIKENMSIDWNLCESARAKMRVIVRRLLKKYGYPPEISKQAVETVIEQAELMSEQLAMEL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019594_10 | 2352069-2352154 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019594_10
|
1 spacers
spacers of CP019594_10
>10.1|2352099|26|CP019594|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019594_10
The CRISPR arrays of CP019594_10 >merge|CP019594|10|2352069-2352154|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >CP019594|10|10|2352069-2352154|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>CP019594.2|ARH75795.1|2351770_2352010_-|hypothetical-protein MKFSVLGPLTRVEKSLLQAHFHSVNYCQYNIIDPRTLIYVPSSHIIVTNVHYVNEYCCLNMHVIYNGADNTLKSLKMKR >CP019594.2|ARH75794.1|2350573_2351698_-|hypothetical-protein MKIAIIGAGIGGLTAAALLQEQGHTIKVFEKNESVKEIGAGIGIGDNVLKKLGNHDLAKGIKNAGQILSTMTVLDDKDRPLTTVKLKSNTLNVTLPRQTLIDIIKSYVKDDAIFTNHEVTHIDNETDKVTIHFAEQESEAFDLCIGADGIHSKVRQSVNADSKVLYQGYTCFRGLIDDIDLKHPDCAKEYWGRKGRVGIVPLLNNQAYWFITINSKENNHKYSSFGKPHLQAYFNHYPNEVREILDKQSETGILLHNIYDLKPLKSFVYGRTILLGDAAHATTPNMGQGAGQAMEDAIVLVNCFNAYDFEKALQRYDKIRVKHTAKVIKRSRKIGKIAQYRSRLVVAVRNRIMKMMPNALAAGQTKFLYKSKEK >CP019594.2|ARH75793.1|2349528_2350482_+|hydroxyacid-dehydrogenase MEKVYVAGAIPEVGLKLLQEHFEVEMYEGKGLVDKDTLIKGVKDATALISLLSTNVDKDVIDAGKDLKIIANYGAGFNNIDIEYAREKSIDVTNTPKASTNATADLTIGLVLAVARRIVEGDQLSRTTGFDGWAPLFFRGREVSGKTIGIIGLGEIGSAVARRARAFDMDVLYTGPNRKEEKEREIGAKYVDLDTLLKNADFITINAAYNPKMHHLIDTEQFKMMKSTAYLINASRGPIVHEQALVQALKNNEIEGAALDVYEFEPDITDDLKSLNNVVLTPHIGNATFEARDMMSKIVANAAISAVQGEKPQFVVN >CP019594.2|AXB22697.1|2349176_2349455_+|hypothetical-protein MIHIVLKLNSSTYVIKNFELSFIGEALFLLFFVATHLYIFFSPIFIILIFFNTINFKTTLSNLIDPVFHITIFIVLQCLSYITSIKSTRLHH >CP019594.2|ARH75792.1|2348665_2349166_+|CHAP-domain-containing-protein MKKLVTATTLTAGIGTALVGHAQHADAAENYTNYNNYNYNTTQTTTTTTTTTTTSSISHSGNLYTAGQCTWYVYDKVGGEIGSTWGNANNWAAAAQGAGFTVNHTPSKGAILQSSEGPFGHVAYVESVNSDGSVTISEMNYSGGPFSVSSRTISASEAGNYNYIHI >CP019594.2|ARH75791.1|2348006_2348429_+|DUF4870-domain-containing-protein MTTEMNDVTNHQPNRKSNDENIMAMLIYLLSLFTSIIGPLIIWLLKKDESKLVDRAGKNYLNYTISYIIWSIVLVVITFIGVFLIATDIDFIIIIGFIITFIGILSIFAFSILSFVFTIIACVKYYNGQEYVIPLTIRFI >CP019594.2|ARH75790.1|2346676_2347759_-|octopine-dehydrogenase MKIAIVGSGNGAVTAAVDMVSKGHDVKLYCRNQSISKFQNAIEKGGFDFNNEGEERFVKFTDISDDMEYVLKDAEIVQVIIPSSYIEYYADVMAEHVTDNQLIFFNMAAAMGSIRFMNVLEDRHIETKPQLAEANTLTYGTRVDFENAAVDLSLNVRRIFFSTYDRSCLNDCYDKVSSIYDHLVKEESLIKTNLENGNPEVHPGPTLLNVGRIDYAGEFALYKEGITKHTVRLLHAIELERLNLGRRLGFELSTAKESRIERGYLERDKEDEPLNRLFNTSPVFSQIPGPNHVESRYLTEDIAYGLVLWSSLGRVIDVPTPNIDAVIVIASTILERDFFEEGLTVESIGLDKLDLEKYLK >CP019594.2|ARH75789.1|2345181_2346582_-|Na+/H+-antiporter-NhaC MMTRKPTFLESISTMIVMVIVVVTGFVFFDIPIQVLLIIASAYAAWIAKRVGLTWQDLEKGIAERLNTAMPAILIILAVGIIVGSWMFSGTVPALIYYGLDLLNPSYFLISAFFISAVTSVATGTAWGSASTAGIALISIGNQLSISPGMAAGAIIAGAVFGDKMSPLSDTTNLAALVTKVNIFKHIRSMMWTTIPASIIGLLVWFIAGFQFKGHSNDKQIQTLLSELAHIYQINIWVWVPLIVIIVCLLFKMATVPAMLISSFSAIIVGTFNHHFKMTDGFKAIFSGFNDSMIHQSHISSSVKSLLEQGGMMSMTQILVTIFCGYAFAGIVEKAGCLEVLLTTISKGIHSVGSLICITVICCIALVFAAGVASIVIIMVGVLMKDLFEKYQVSRSVLSRTLEDSSTMVLPLIPWGTSGIYYTNQLHVSVGEFFIWTVPCYLCAIIAIIYGFTGIGIKKSSNSRLT >CP019594.2|ARH75788.1|2344813_2345008_-|hypothetical-protein MTKLIENLKASIFVSTLTKNLSMYSRFDAPKFGCVNGCMLFILYYRVNRIGENRSFEISTNPIF >CP019594.2|ARH75787.1|2343935_2344745_+|CHAP-domain-containing-protein MKKIATATIATAGFATIAIASGNQAHASEQDNYGYNPNDPTSYSYTYTIDAQGNYHYTWKGNWHPSQLNQDNGYYSYYYYNGYNNYSYNNYNNGYSYNNYSRYNNYSNNNQSYNYNNYNSYNTNSYRTGGLGASYSTSSNNVQVTTTMAPSSNGRSISSGYTSGRNLYTSGQCTYYVFDRVGGKIGSTWGNASNWANAAARAGYTVNNTPKAGAIMQTTQGAYGHVAYVESVNSNGSVRVSEMNYGYGPGVVTSRTISASQAAGYNFIH >CP019594.2|ARH76285.1|2352306_2352945_-|autolysin MQQGKGIVQTKEEDGKFVEANNNEIAKAMTISHKDNDMKYMDITEKVPMSESEVNQLLKGKGILENRGKVFLEAQEKYEVNVIYLVSHALVETGNGKSELAKGIKDGKKRYYNFFGIGAFDSSAVRSGKSYAEKEQWTSPDKAILGGAKFIRNEYFENNQLNLYQMRWNPENPAQHQYASDIRWADKIAKLMDKSYKQFGIKKDDIRQTYYK >CP019594.2|ARH75796.1|2353104_2353338_-|hypothetical-protein MLKTSAVISNTLLVIGLVCLFMMKLVLAITFFAVSLSISLVVFNMMFRDRTTMKVIVNASFLIVILAIVVAYFLLSK >CP019594.2|ARH75797.1|2353632_2354106_-|DUF1641-domain-containing-protein MAERISSKIRRLEKSEEQIKLESLNEVTEAIAANKDSILKAIKLIKVLDDAKILDALNGAVRGRQVIINKFAVELNKDIYTGLLSNMASMVFLLGELNVSDLSDFLNKVNKGLHVANQASPNAKTSVRSLFGVLKDDDMNRSLTYMLNMLKGMSRED >CP019594.2|ARH75798.1|2354105_2357060_-|formate-dehydrogenase-subunit-alpha MQEHLVVTLDGKDYLVEPGTNLLEFIKSQDTFVPSICYNESMGPIQTCDTCTVEIDGKIERSCSTVIDRPMTVNTVNNDVKDAQKEALDRILEKHMLYCTVCDYNNGDCEIHNTMDAWGLQHQTYEYKEKPYEKDYGPFYRYDPNQCILCGRCVEACQDIEVNETIRIDWDREHPRVIWDNDVPINESSCVSCGQCATVCPCNAMMEVNMEGNAGYMTDTEPGSLAAMIDLTKKAEPGYGPLFAISDSEAEMRKERIKKTKTVCTYCGVGCSFEVWTKDREILKVQPSHDSPANKIATCVKGKFSWGHINSDQRLTKPLVRKNGEFHEVEWDEALNVIADNFTSIKEKHGPDALSFISSSKATNEESYLMQKLARQVIGTNNVDNCSRYCQAPATKGLFRTVGHGGDSGSIEDLEKAAMSVLIGTNTAEAHPVIASRMKRAQKLFGQKIHVFDIRKHEMAERADRFYQPKPGTDLAWLSAVTKYIIDHDLHDKAFIEEWVEDFDEYYKSLETFTMAFAEEATGIPEAELIKFAEECAKAESVVICWAMGITQQDIGSDSSTAISNLLLVTGNYRRPGTGAYPLRGHNNVQGCSDMGSMPDKITGYQSIEADDIRAKFEKEYGVKLNPKAGKDNHEMVEGIHDGQIHSLYLYGEDTGIVDSNINFVQAAFEKLDFMVVQDEFLTFTATFADVVLPASPSLEKDGTFTNTERRIQRLYQALKPLGESKPDWKIFQAIANKLGFDWNYKHPSEIMDEIARLTPLYAGVSYERLEGFNSLQWPVHPDGTDEPILYLEGFNFDNGKAKLFPLSFDNYFKQDEVYDIHVNNGRLLEHFHEGNMTYQTPMLKYKVPRAFVEISPELAEDRGIHEGAEVKLISETGEAVLQVHVTDRVKGKEIYIPLNNDAMENGDLGAINLLTNSDVDQYTDTPSYKRTSCRLEVITKRGKSPLNPNNFRVNKKRHPQYSVQVQKKWERPDYVFPGNQVDK >CP019594.2|ARH76286.1|2357661_2358585_-|LytR-family-transcriptional-regulator MSLPKKIFLWVFGILVILAIVAVVYVAAKIFITGNKIHNPLDRNHSELRDKKVSLNDGDPFTIALFGVDSDADRKKKGGGERSDSIMILSINPKTKKTEIVSIPRDTRAEIVGRDTTEKIAHAYAYGGPNMAVKSLEKLMNVPIDHYATIDMDGLHNMIDSIGGVDVVSNDTFTVDGVRFTKGQQTHVNGDQALKFIRSRKEEGAGGDFGRQQRQQIVLEAMANKIASPSSITHFNSLMNEIQNNVKTDLTLGDLNTIRSNYKDANDTINKHQLSGQGGIQSDGLYYFIPSEQSKAESTKLLKDNLE >CP019594.2|ARH75799.1|2358741_2359539_-|inositol-monophosphatase MTDKTLQQIDKLICSWLKQIDNVIPQLIMEMTTETKRHRFDLVTNVDKQIQQQFQQFLATHFQEHQLLAEEKSNEMITNEINHLWIMDPIDGTANLVKQQEDYCIILAYFYEGKPMLSYVYDYPHKKLYKAIRGEGAFCNGIKMEEPPSLKLEDAIISFNAQVMNLDTVQDLFDASFSYRLVGACGLDSMRVAKGQFGAHINTNPKPWDIAAQFLFAELLNLKMTTLDGKAIDHLKGAPFIISNKACHETVLKILNANGGYQKYR >CP019594.2|ARH75800.1|2359923_2360616_+|YafY-family-transcriptional-regulator MNKAERQNLIITAIQQNKKMTALELAKYCNVSKRTILRDIDDLENQGVKIYAHYGKNGGYQIQQAQSKIALNLSETQLSALFLVLNESQSYSTLPYKSEINAIIKQCLSLPQTRLRKLLKRMDFYIKFDDTQHMTLPMLFSDILIYCTERNVMLVDHRVDDNIKAENVIFIGLLCKHGHWHAVIYDIAQDKTAELEIENIIDISYSFGKTIQTRDISIDNYHQFLNPIDS >CP019594.2|ARH75801.1|2360640_2361378_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease-SdpB MENEKKKYTFKDIAWRDLFIIPIIGVLSFALTIAAYIVPILFGYYEIDSNLIFVGTITQALAYTIGIGAFYLFHLKVMPSRLRAGFAYIKKYWLRLSITYIIALILIYTYEYMTQFLPKHLQYSETANELELNKMFEVPVFLPVAFLLIVIVGPIVEEIVFRHILIGELGKKFNFIAMSIVSVFLFAFIHVTDAKSPFEFGPYLILSIILVFTYIKSGRNLGSTIALHIANNFVSFVISVISIYA >CP019594.2|ARH75802.1|2361426_2361756_+|hypothetical-protein MINETKYMRQQITNLIQIIDTIKYNTLMTDWNIQTHIYKFNQIVTNELNKFKGFETSYIINENQVFYYEIITLLNKRPLRQVDYGNKIQYLNFYHTELSNALFAIKFAH >CP019594.2|ARH75803.1|2362200_2363073_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MSNVLTEIDSQYPYMTKNEKKIAKFILNSPQKVIKMRSQDLASLLDISTSSVIRFSKKITDGGFHDLKINISKYVPKASSIYNVELMNNESTESLRTKLHTRTTRALNHANNELNDKTIDQICHCLKRSETIFIYGFGASFVVATDLYQKLSRIGLNIQLVQETHIFATLLATHNSNDSVILITNNGTQSEMQSMVKVIDDYHIPIITITSTRDNPVAQASNIVLTYGKTDENEMHMGATTSLFAQMFTIDILYYRYVALNYHASLDYITQSKMALDNYRKHLSNINFKH |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019594_11 | 2528285-2528379 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019594_11
|
1 spacers
spacers of CP019594_11
>11.1|2528313|39|CP019594|CRISPRCasFinder GCAACTGTATTCCTCTAAAACTGTAATTTTAATTACTAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019594_11
The CRISPR arrays of CP019594_11 >merge|CP019594|11|2528285-2528379|CRISPRCasFinder AGGCTCTTATGCAGTTGGTGCGAAGCAAGCAACTGTATTCCTCTAAAACTGTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAA >CP019594|11|11|2528285-2528379|CRISPRCasFinder AGGCTCTTATGCAGTTGGTGCGAAGCAA GCAACTGTATTCCTCTAAAACTGTAATTTTAATTACTAG AGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAA
>CP019594.2|ARH75958.1|2527277_2528099_-|histidine-racemase-CntK MNRQVIEFSKYNPSGNMTILVHSKHDASEYASIANQLMAATHVCCEQVGFIESTQNDDGNDFHLVMSGNEFCGNATMSYIHHLQESHLLKDQQFKVKVSGCSDLVQCAIHDCQYYEVQMPQAHRVVPTTINMGNHSWKAIEIIYETYVHYVIPVKQVTTEIQHLVETYVRKQQWNHKYKTVGMMLFDEQRQFLQPLIYIPEIQSLIWENSCGSGTASIGVFNNYQRNDACKDFTVHQPGGSILVTSKRCHQLGYQTSIKGQVTTVATGKAYIE >CP019594.2|ARH75957.1|2526448_2527267_-|staphylopine-biosynthesis-enzyme-CntL MNNFNNEIKLILQQYLEKFEAHYERVLQDDQYIEALETLMDDYSEFILNPIYEQQFNAWRDVEEKAQLINSLQYITAQCVKQVEVIRARRLLDGQASTTGYFDNIEHCIDEEFGQCSIASNDKLLLVGSGAYPMTLIQVAKETGASVIGIDIDPQAVDLGRRIVNVLAPNEDITITDQKVSELKDIKDVTHIIFSSTIPLKYSILEELYDLTNENVVVAMRFGDGIKAIFNYPSQETAEDKWQCVNKHMRPQQIFDIALYKKAAIKVGITDV >CP019594.2|ARH75956.1|2525154_2526456_-|staphylopine-biosynthesis-dehydrogenase MSKLLMIGTGPVAIQLANICYLKSDYEIDMVGRASTSEKSKRLYQAYKKEKQFEVKIQNEAHQHLEGKFEINRLYKDVKNVKGEYETVVMACTADAYYDTLQQLSLETLQSVKHVILISPTFGSQMIVEQFMSKFSQDIEVISFSTYLGDTRIVDKEAPNHVLTTGVKKKLYMGSTYSNSTMCQRISVLAEQLKIQLEVVESPLHAETRNSSLYVHPPLFMNDFSLKAIFEGTDVPVYVYKLFPEGPITMTLIREMRLMWKEMMAILQAFRVPSVNLLQFMVKENYPVRPETLDEGDIEHFEILPDILQEYLLYVRYTAILIDPFSQPDENGHYFDFSAVPFKQVYKNEQDVVQIPRMPSEDYYRTAMIQHIGKMLGIKTPMIDQFLTRYEASCQAYKDMHQDQHLSSQFNTNLFEEDKALVTKFLEINRTLS >CP019594.2|ARH75955.1|2523413_2525012_-|staphylopine-dependent-metal-ABC-transporter-substrate-binding-protein-CntA MRKLTKMSAMLLASGLILTGCGGNKGLEEKKENKQLTYTTVKDIGDMNPHVYGGSMSAESMIYEPLVRNTKDGIKPLLAKKWDVSEDGKTYTFHLRDDVKFHDGTPFDADAVKKNIDAVQENKKLHSWLKISTLIDNVKVKDKYTVELNLKEAYQPALAELAMPRPYVFVSPKDFKNGTTKDGVKKFDGTGPFKLGEHKKDESADFNKNDQYWGEKSKLNKVQAKVMPAGETAFLSMKKGETNFAFTDDRGTDSLDKDSLKQLKDTGDYQVKRSQPMNTKMLVVNSGKKDNAVSDKTVRQAIGHMVNRDKIAKEILDGQEKPATQLFAKNVTDINFDMPTRKYDLKKAESLLDEAGWKKGKDSDVRQKDGKNLEMAMYYDKGSSSQKEQAEYLQAEFKKMGIKLNINGETSDKIAERRTSGDYDLMFNQTWGLLYDPQSTIAAFKAKNGYESATSGIENKDKIYNSIDDAFKIQNGKERSDAYKNILKQIDDEGIFIPISHGSMTVVAPKDLEKVSFTQSQYELPFNEMQYK >CP019594.2|ARH75954.1|2522465_2523401_-|ABC-transporter-permease MFKFILKRIALMFPLMIVVSFMTFLLTYITNENPAVTILHAQGTPNVTPELIAETNEKYGFNDPLLIQYKNWLLEAMQFNFGTSYITGDPVAERIGPAFMNTLKLTIISSVMVMITSIILGVVSALKRGKFTDRAIRSVAFFLTALPSYWIASILIIYVSVKLNILPTSGLTGPESYILPVIVITIAYAGIYFRNVRRSMVEQLNEDYVLYLRASGVKSITLMLHVLRNALQVAVSIFCMSIPMIMGGLVVIEYIFAWPGLGQLSLKAILEHDFPVIQAYVLIVAVLFIVFNTLADIINALLNPRLREGAR >CP019594.2|ARH75953.1|2521599_2522469_-|ABC-transporter-permease MIILKRLLQDKGAVIALGIIVLYVFLGLAAPLVTFYDPNHIDTANKFAGMSFQHLLGTDHLGRDILTRLIYAIRPSLLYVFVALFVSVLIGSILGFLSGYFQGFVDALIMRACDVMLAFPSYVVTLALIALFGMGAENIIMAFILTRWAWFCRVIRTSVMQYTASDHVRFAKTIGMNDMKIIHKHIMPLTLADIAIISSSSMCSMILQISGFSFLGLGVKAPTAEWGMMLNEARKVMFTHPEMMFAPGIAIVIIVMAFNFLSDALQIAIDPRISSKDKLRSVKKGVMQS >CP019594.2|ARH75952.1|2520787_2521603_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTLLTVKHLTITDTWTDQPLVSDVNFTLTKGETLGVIGESGSGKSITCKSIVGLNPERLRVTGDITFDGTSMLSLSESQLKKYRGKDIAMVMQQGSRAFDPSTTVGKQMFETMKVHTSMSTQEIEKTLIEYMDYLSLKDPKRILKSYPYMLSGGMLQRLMIALALALKPKLIIADEPTTALDTITQYDVLEAFIDIKKHFDCAMIFISHDLTVINKIADRVVVMKNGQLIEHGTRESVLHHPEHVYTKYLLSTKKKINDHFKHVMRGDVCD >CP019594.2|ARH75951.1|2520045_2520795_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKIKDVEKSYQSAHVFKRRRTPIVKGVSFECPIGATIAIIGESGSGKSTLSRMILGIEKPDKGCVTLNDQPMHKKKVRRHQIGAVFQDYTSSLHPFQTVREILFEVMCQCDGQPKDVMEVQAITLLEEVGLSKAYMDKYPNMLSGGEAQRVAIARAICINPKYILFDEAISSLDMSIQTQILDLLIHLRETRQLSYIFITHDIQAATYLCDQLIIFKNGKIEEQIPTSALHKSDNAYTRELIEKQLSF >CP019594.2|ARH75950.1|2518840_2520034_-|MFS-transporter MKGAMAWPFLRLYILTLMFFSANAILNVFIPLRGHDLGATNTVIGIVMGAYMLTAMVFRPWAGQIIARVGPIKVLRIILIINAIALIIYGFTGLEGYFVARVMQGVCTAFFSMSLQLGIIDALPEEHRSEGVSLYSLFSTIPNLIGPLVAVGIWNANNISLFAIVIIFIALTTTFFGYRVTFAEQEPDTSDKIEKMPFNAVTVFAQFFKNKELLNSGIIMIVASIVFGAVSTFVPLYTVSLGFANAGIFLTIQAIAVVVARFYLRKYIPSDGMWHPKYMVSVLSLLVIASFIVAFGPQVGAIIFYGSAILIGMTQAMVYPTLTSYLSFVLPKVGRNMLLGLFIACADLGISLGGALMGPISDLVGFKWMYLICGMLVIVIMIMSLLKKPTPRPANSL >CP019594.2|ARH75949.1|2517870_2518617_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MSNTNKHYIEEYATEQSRFFKRDIGFIFLYIFLVNILPIIIVFLTFGLVAVFTQQAPWGFSFPISMNISYLLAVIISLAIFRLMHEDAFIPMIRSQIVASAKYKWHILISFTLSIVLFLLLNHFDIFALNVDSFTVFDIYPLIREYGSISLIAIFSLTIILNTLICQLIFRHILIQELSRLIPLKITIVLSVILETLYYYPYINTWWEFIPALILASSATYLYLKSNRNFMVSYFYQLAVILVLHIFM >CP019594.2|ARH75959.1|2529047_2529410_-|hypothetical-protein MLKEKESFRLLYQAIREIADKIGDNQLETNSVSLLLLDFDFEHEVFDELYLAILKYLNTVSIENISHSELLNLIENTIPEDREINTFVKNKIIIGFANNYFPELQVLANEIKSDMASSLK >CP019594.2|ARH75960.1|2529672_2530491_-|short-chain-dehydrogenase MKRLENKVAVVTGASTGIGQASAIALAQEGAYVLAVDIAEAVSETVDKIKSNGDNAKAYTVDISDEQQVVDFVSDIKEQFGRIDVLFNNAGVDNAAGRIHEYPTDVYDKIMNVDMRGTFLMTKMMLPLMMTKGGSIVNTSSFSGQAADLYRSGYNAAKGAVINFTKSIAIEYGRDGIRANAIAPGTIETPLVDKLTGTSEDKEGKTFRENQKWMTPLGRLGKPEEVGKLVVFLASDESSFITGETIRIDGGVMAYTWPGEMLSDDSWKRTLE >CP019594.2|ARH75961.1|2530724_2532263_+|AbgT-family-transporter MTSKHQQKGSIVNRFLNSVEKIGNKLPDPSVLFFLMCVGLAIMTWVISLFNVSVKHPGTHQTIYIKNIISHDGFTMIMNDTIKNFSEFPALGLVLAVMIGIGVAEKTGYFDKLMISVVNRAPRFLILPTIILIGILGSTAGDAATIILPPLAAMLFIKIGYHPIAGLTMAYASAVGGFAANIVVGMQDALVYSFTEPATRIVSDSIKTNVAMNWYFIAASVIVLLPTILLVTTKLIIPRLGQYDDRLMHDDHEETSSHITDKEAHALKWANISFIVTIILLIITAIPEHSFLRNAKTGSLLDDAPLINGVGLIILVVFLVPGLVYGILSKEIKNTKDLGKMFGDAVGSMGTFIVIVFFAAQLLAYLKWSNLGIIAAVKGAKLLEHQNGIVLILGIIVLSAMVNMLIGSASAKWGILGPIFVPMLILIGFHPAFTQVIYRVGDSITNPITPMMPYLPLLLTYAQKYDKRMKLGALLSSLMPYSIALSIVWTVFVIIWFLLGIPVGPGGPIFVK >CP019594.2|ARH75962.1|2532374_2532797_-|carboxymuconolactone-decarboxylase-family-protein MPYNYKKQNGELMSVMSQGEKFIHQSPVNDELSALIKLLISKINGCHYCVDIHKKELKELGVTQMKIDEVLSFRHLDLFTDQEKVTLEFAEMLNSIKDFKKFEIIDRLKSFYDEEQIIDLVFVVNQINGWNRLNIISDRL >CP019594.2|ARH75963.1|2533268_2533667_-|DUF1433-domain-containing-protein MNKKHVFIIIGVILCIRIVATVIYLKVKYDEKEKQKAIYYKEQQERITLYLKHNTKEPNTIKSVHFTSLKTGPMGDAVIEGYINENKKADFVAYGSPEHNYQFGGDMIESEKLSELLKPAQELKSQKKSKKN >CP019594.2|ARH75964.1|2533693_2534104_-|DUF1433-domain-containing-protein MSKKHVFIIIGVILCICIVVTAMHLKMKYDEKEKRKAIYYKEQQARITLYLKHNTKEPNTIKSVHFTNLETSPMGSAVIEGYINENKKDNFTAYATPEHNYQFGGAMIKSEGVDKLLKPAHERKSPDDIKKELNKK >CP019594.2|ARH75965.1|2534558_2534942_-|DUF1433-domain-containing-protein MLIILIIIVCVYLKIKIDEKEKQKAIYYKEQQERITLYLKHNTEEPNTIKSVHFTSLKRGPMGDAVIEGYINENKEDDFVAYGSPEHNYQFGGDMVESERLSELLKPAHERKSPDDIKKELNKKKNH >CP019594.2|ARH75966.1|2535008_2536217_+|hypothetical-protein MNSIYDKDTTYRALAKEAYHLEPDQEKIFVPYSKEKKIEFRIVAFRQNKFNGLKMAGLSPVEKGAKLNTDELYIVYAGTDPDLLADFGSDSIEDLKVGMAKFGGGLRIPPTKKERAIYGNLNKKMIDYDDGISGISQNIMTNPISQSKESYIFTGALINKQKPKHVYGAAHSLGGGLALLNGVMYNFDGVRAFSAPNTFDLLPDEVKANYRSEKYDGKFINYLHRSDIIGNSDLFAQRIGTQIYGKDVGRFSLLNPILGHGMDTFEFKGDNVRIKMDTEEMSKIASDLKASCEFVNDAIKSYQKYMDDTKAAAKRIERKYTKKIRTGNYKHIKPSDIEDYMEELSVSGKYEFYNDTAFETVMSELNRIRKNVESFADKLKHAGEKMESRDKEIGELYKIFER >CP019594.2|ARH75967.1|2536222_2536537_+|hypothetical-protein MGFLDDLAESIEEQSDLSEFKQAMKSELQTKVEEAKAKIESIDEDIWDWQTTVNNKRDAIEEYCEGKTAEHAIERLMQDKQDIAGMRWTAEDAEKSCKVGSWFW >CP019594.2|ARH75968.1|2538413_2538833_-|DUF1433-domain-containing-protein MPKKTIFIIIGVILCISIVTGGIYLKMKHDEKEKQKEIYYKEQQERITLYLKHNTKEPNTIKTVHFTNLKTGPMGDIEIYGYINSKKDYDFIAYNSPEENYQFTGGLTGSNEVLGKLKNAENLKSPEKIKEELNNKKDH |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 911960-911990 | 0 | 1.0 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 932752-932782 | 0 | 1.0 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 1954883-1954913 | 0 | 1.0 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 2058372-2058402 | 0 | 1.0 |
CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 728558-728582 | 0 | 1.0 |
CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 2058360-2058384 | 0 | 1.0 |
CP019594_10 | 10.1|2352099|26|CP019594|CRISPRCasFinder | 2352099-2352124 | 26 | CP019594.2 | 1646481-1646506 | 0 | 1.0 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 242740-242770 | 1 | 0.968 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 242798-242828 | 1 | 0.968 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 334357-334387 | 1 | 0.968 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 603215-603245 | 1 | 0.968 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 728540-728570 | 1 | 0.968 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 819814-819844 | 1 | 0.968 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 1025820-1025850 | 1 | 0.968 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 1127193-1127223 | 1 | 0.968 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 1127247-1127277 | 1 | 0.968 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 1857251-1857281 | 1 | 0.968 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 2306893-2306923 | 1 | 0.968 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 2351987-2352017 | 1 | 0.968 |
CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 728349-728373 | 1 | 0.96 |
CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 819802-819826 | 1 | 0.96 |
CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 932740-932764 | 1 | 0.96 |
CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 1768885-1768909 | 1 | 0.96 |
CP019594_10 | 10.1|2352099|26|CP019594|CRISPRCasFinder | 2352099-2352124 | 26 | CP019594.2 | 819878-819903 | 1 | 0.962 |
CP019594_1 | 1.1|260678|25|CP019594|CRISPRCasFinder | 260678-260702 | 25 | CP019594.2 | 260847-260871 | 2 | 0.92 |
CP019594_1 | 1.2|260734|25|CP019594|CRISPRCasFinder | 260734-260758 | 25 | CP019594.2 | 2143931-2143955 | 2 | 0.92 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 783864-783894 | 2 | 0.935 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 823922-823952 | 2 | 0.935 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 1336165-1336195 | 2 | 0.935 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 1382254-1382284 | 2 | 0.935 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 2317641-2317671 | 2 | 0.935 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 2317696-2317726 | 2 | 0.935 |
CP019594_3 | 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder | 774883-774913 | 31 | CP019594.2 | 2754287-2754317 | 2 | 0.935 |
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CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 242786-242810 | 2 | 0.92 |
CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 334375-334399 | 2 | 0.92 |
CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 603233-603257 | 2 | 0.92 |
CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 911978-912002 | 2 | 0.92 |
CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 1025808-1025832 | 2 | 0.92 |
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CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 1857269-1857293 | 2 | 0.92 |
CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 1954871-1954895 | 2 | 0.92 |
CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 2306881-2306905 | 2 | 0.92 |
CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 2317629-2317653 | 2 | 0.92 |
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CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 2317739-2317763 | 2 | 0.92 |
CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 2455801-2455825 | 2 | 0.92 |
CP019594_5 | 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR | 1766505-1766529 | 25 | CP019594.2 | 2754275-2754299 | 2 | 0.92 |
CP019594_10 | 10.1|2352099|26|CP019594|CRISPRCasFinder | 2352099-2352124 | 26 | CP019594.2 | 824023-824048 | 2 | 0.923 |
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CP019594_10 | 10.1|2352099|26|CP019594|CRISPRCasFinder | 2352099-2352124 | 26 | CP019594.2 | 1331836-1331861 | 2 | 0.923 |
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CP019594_10 | 10.1|2352099|26|CP019594|CRISPRCasFinder | 2352099-2352124 | 26 | CP019594.2 | 2483997-2484022 | 2 | 0.923 |
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43. spacer 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR matches to position: 1127265-1127289, mismatch: 2, identity: 0.92
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50. spacer 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR matches to position: 2455801-2455825, mismatch: 2, identity: 0.92
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cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacatagtagcaggcgg Protospacer **************** *** *****
53. spacer 10.1|2352099|26|CP019594|CRISPRCasFinder matches to position: 911765-911790, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagaagctggtgg Protospacer *************.*********.**
54. spacer 10.1|2352099|26|CP019594|CRISPRCasFinder matches to position: 1331836-1331861, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagaaactggcgg Protospacer *************.****.*******
55. spacer 10.1|2352099|26|CP019594|CRISPRCasFinder matches to position: 2143969-2143994, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacaaaagctggcgg Protospacer *************.*.**********
56. spacer 10.1|2352099|26|CP019594|CRISPRCasFinder matches to position: 2483997-2484022, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagtagctggcgg Protospacer *************.** *********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019594_1 | 1.1|260678|25|CP019594|CRISPRCasFinder | 260678-260702 | 25 | NC_014792 | Enterobacteria phage vB_EcoM-VR7, complete genome | 154175-154199 | 3 | 0.88 |
CP019594_1 | 1.2|260734|25|CP019594|CRISPRCasFinder | 260734-260758 | 25 | MW117966 | Synechococcus phage S-H9-1, complete genome | 42366-42390 | 4 | 0.84 |
CP019594_7 | 7.1|1857324|26|CP019594|CRISPRCasFinder | 1857324-1857349 | 26 | NZ_CP053838 | Aliiarcobacter faecis strain CCUG 66484 plasmid pAFAEC, complete sequence | 17379-17404 | 4 | 0.846 |
CP019594_7 | 7.1|1857324|26|CP019594|CRISPRCasFinder | 1857324-1857349 | 26 | NZ_CP017210 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp9, complete sequence | 2023-2048 | 4 | 0.846 |
CP019594_1 | 1.2|260734|25|CP019594|CRISPRCasFinder | 260734-260758 | 25 | NZ_CP038259 | Acinetobacter baumannii strain 39741 plasmid pEH_gr13, complete sequence | 11151-11175 | 5 | 0.8 |
CP019594_7 | 7.1|1857324|26|CP019594|CRISPRCasFinder | 1857324-1857349 | 26 | NC_008443 | Borrelia burgdorferi strain Ip21 plasmid, complete sequence | 5652-5677 | 5 | 0.808 |
CP019594_7 | 7.1|1857324|26|CP019594|CRISPRCasFinder | 1857324-1857349 | 26 | NC_010631 | Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN01, complete sequence | 3460-3485 | 5 | 0.808 |
CP019594_7 | 7.1|1857324|26|CP019594|CRISPRCasFinder | 1857324-1857349 | 26 | NC_010632 | Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02, complete sequence | 13739-13764 | 5 | 0.808 |
CP019594_1 | 1.2|260734|25|CP019594|CRISPRCasFinder | 260734-260758 | 25 | NZ_CP047617 | Lactococcus raffinolactis strain Lr_19_5 plasmid pLraf_19_5_1, complete sequence | 79395-79419 | 6 | 0.76 |
CP019594_7 | 7.1|1857324|26|CP019594|CRISPRCasFinder | 1857324-1857349 | 26 | MK448662 | Streptococcus satellite phage Javan97, complete genome | 6198-6223 | 6 | 0.769 |
CP019594_8 | 8.1|2132904|34|CP019594|CRISPRCasFinder | 2132904-2132937 | 34 | NC_027332 | Acinetobacter phage YMC13/03/R2096, complete genome | 68639-68672 | 11 | 0.676 |
CP019594_8 | 8.1|2132904|34|CP019594|CRISPRCasFinder | 2132904-2132937 | 34 | KY000079 | Acinetobacter phage AM24, complete genome | 74925-74958 | 11 | 0.676 |
1. spacer 1.1|260678|25|CP019594|CRISPRCasFinder matches to NC_014792 (Enterobacteria phage vB_EcoM-VR7, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
ggcgaaaatacagcttacaataatg CRISPR spacer gacgaaaatacatattacaataatg Protospacer *.********** ***********
2. spacer 1.2|260734|25|CP019594|CRISPRCasFinder matches to MW117966 (Synechococcus phage S-H9-1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ttggaacagcaatttctactggtat Protospacer ******************* *..*
3. spacer 7.1|1857324|26|CP019594|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053838 (Aliiarcobacter faecis strain CCUG 66484 plasmid pAFAEC, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer agaatttcaaaaaataaaatctattg Protospacer ************** *** ****. *
4. spacer 7.1|1857324|26|CP019594|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017210 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp9, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer acaatttcaaaaaagaaatattacac Protospacer * ***************** .****
5. spacer 1.2|260734|25|CP019594|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038259 (Acinetobacter baumannii strain 39741 plasmid pEH_gr13, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.8
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ctggaacagcaatttctccagaggt Protospacer .**************** **** .
6. spacer 7.1|1857324|26|CP019594|CRISPRCasFinder matches to NC_008443 (Borrelia burgdorferi strain Ip21 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer ccaatttcaaaaaagaaattttccac Protospacer ******************.* **
7. spacer 7.1|1857324|26|CP019594|CRISPRCasFinder matches to NC_010631 (Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer tgaatgtcaaaaaagaaattcttgaa Protospacer **** **************** *.
8. spacer 7.1|1857324|26|CP019594|CRISPRCasFinder matches to NC_010632 (Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer tgaatgtcaaaaaagaaattcttgaa Protospacer **** **************** *.
9. spacer 1.2|260734|25|CP019594|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047617 (Lactococcus raffinolactis strain Lr_19_5 plasmid pLraf_19_5_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ctggaacagcaatttctacattatc Protospacer .*******************
10. spacer 7.1|1857324|26|CP019594|CRISPRCasFinder matches to MK448662 (Streptococcus satellite phage Javan97, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.769
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer gctttttcaaaaaagaaattctagac Protospacer . ******************* *
11. spacer 8.1|2132904|34|CP019594|CRISPRCasFinder matches to NC_027332 (Acinetobacter phage YMC13/03/R2096, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tgctggtaccacgatgcgtcttgatgtagtgcta CRISPR spacer gatcaataccacgatgcgtcttgaagtggtagaa Protospacer .....****************** **.**. *
12. spacer 8.1|2132904|34|CP019594|CRISPRCasFinder matches to KY000079 (Acinetobacter phage AM24, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tgctggtaccacgatgcgtcttgatgtagtgcta CRISPR spacer gatcaataccacgatgcgtcttgaagtggtagaa Protospacer .....****************** **.**. *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
706731 : 714551
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019594|706731:714551|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTTCGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTCTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCAAGTGGAACAATAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCTATGACTGGTACTAGACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGCTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGAATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGATAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCAGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAATTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTTAAGTAAGAAAATATTTGTCTGAACTACTTATCACTAAAAAACACTTCTGATATAGCGAATTAAGAATATCAGAAGTGTTTTTTAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCAAAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTATTATTATTTTCAGCAGATTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAATAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCTACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGCAATCACTTCATCTAATTTTTTTAAATCAGGCGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTTACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019594|706731:714551|711382_711802_-|ARH74164.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >CP019594|706731:714551|709261_709702_-|ARH74161.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLILGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >CP019594|706731:714551|709982_710567_-|ARH74162.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDESAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLFWQKVYKF >CP019594|706731:714551|706731_707787_-|ARH74158.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >CP019594|706731:714551|711803_712472_-|ARH74165.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGILNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >CP019594|706731:714551|707786_708473_-|ARH74159.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >CP019594|706731:714551|708447_708921_-|ARH74160.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIIVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >CP019594|706731:714551|712822_713416_+|ARH74166.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAVEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >CP019594|706731:714551|710665_711379_-|ARH74163.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >CP019594|706731:714551|713399_714551_+|ARH74167.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCSHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
726521 : 740837
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019594|726521:740837|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019594|726521:740837|740075_740837_+|ARH74192.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQMILDDISIEIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDEGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHEIVNDALDLLQLQDIRKRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVAMKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >CP019594|726521:740837|730025_730133_+|ARH74181.1|DBSCAN-SWA MVINEIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILISCI >CP019594|726521:740837|737836_738019_+|AXB22680.1|DBSCAN-SWA MTFASDMLKVFFLCLKTYTYFEKVKMTFNDVNESRKYTRYCITKGCAILLYTSKLHSYKN >CP019594|726521:740837|734598_736704_+|ARH74188.1|DBSCAN-SWA 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17 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
828332 : 873885
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019594|828332:873885|DBSCAN-SWA 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>CP019594|828332:873885|867742_869617_+|ARH74338.1|DBSCAN-SWA MGLPNPKTRKPTASEVVEWAKSNIGKRINIDNYRGSQCWDTPNFIFKRYWGFVTWGNAKDMANYRYPKGFRFYRYSSGFVPEPGDIAVWHPGNGIGSDGHTAIVVGPSNKSYFYSVDQNWVNSNSWTGSPGRLVRHPYVSVTGFVRPPYSKDTSKPSSTDTSSASKANDSTITGEAKKPQFKEVKTVKYTAYSNVLDKEEHFIDHIVVMGDERSDIQGLYIKESMHMRSVDELYTQRNKFISDYEIPHLYVDREATWLARPTNFDDPRHPNWLVIEVCGGQTDSKRQFLMNQIQALIRGVWLLSGIDKELSETTLKVDPNIWRSMKDLINYDLIKQGIPDNAKYEQVKKKMLEMYIKRDILTRENIKEVTTKTTIRISDKTSVDSASTRGPTPSDEKPSIVTETSPFTFQQALDRQMSRGNPKKSHTWGWANATRAQTSSAMNVKRIWESNTQCYQMLNLGKYQGVSVSALNKILKRKGTLDGQGKAFAEACKKNNINEIYLIAHAFLESGYGTSNFASGRYGAYNYFGIGAFDNDPDYAMKFAKNKGWTTPAKAIMGGASFVRKDYINKGQNTLYRIRWNPKNPATHQYATAIEWCQHQASTIAKLYKQIGLKGIYFIRDKYK >CP019594|828332:873885|840584_841505_+|ARH74300.1|DBSCAN-SWA 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67 | Staphylococcus_phage(76.56%) | head,plate,tail,holin,terminase,portal,capsid,integrase | attL 823184:823199|attR 880822:880837 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
955518 : 1008642
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP019594|955518:1008642|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP019594|955518:1008642|1006350_1007532_-|ARH74467.1|protease|DBSCAN-SWA MNSSCKSRVFNIISIIMVSMLILSLGAFANNNKAKADSHSKQLEINVKSDKVPQKVKDLAQQQFAGYAKALDKQSNAKTGKYELGEAFKIYKFNGEEDNSYYYPVIKDGKIVYTLTLSPKNKDDLNKSKEDMNYSVKISNFIAKDLDQIKDKNSNITVLTDEKGFYFEEDGKVRLVKATPLANNIKEKESAKTVSPQLKQELKTTVTPTKVEENEAIQEDQVQYENTLKNFKIREQQFDNSWCAGFSMAALLNATKNTDTYNAHDIMRTLYPEVSEQDLPNCATFPNQMIEYGKSQGRDIHYQEGVPSYNQVDQLTKDNVGIMILAQSVSQNPNDPHLGHALAVVGNAKINDQEKLIYWNPWDTELSIQDADSSLLHLSFNRDYNWYGSMIGY >CP019594|955518:1008642|962539_962905_-|ARH74424.1|DBSCAN-SWA MTTTPYDIIGKEALYDMIDYFYTLVEKDERLNHLFPGDFAETSRKQKQFLTQFLGGPNIYTEEHGHPMLRKRHMDFTITEFERDAWLENMQTAINRAAFPQGVGDYLFERLRLTANHMVNS >CP019594|955518:1008642|988902_989472_-|ARH74445.1|DBSCAN-SWA MYSQNIYVIRKGDMVIRPAFDDDDQRNGSEIIRFDKTRIQNPFKVQKIIERSCKFYGNTYLGKKAETNRITGISSKPPILLTPLFPTYFFPTHSDRQNENIWLNMHYIESIKELKNRKCKVTFINNESIILHVSYHSLWHQYNNSIFYYYMVDKQSRMISKNPDQPIDYNKATLNVFEALTRYSLFEDK 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54 | Streptococcus_phage(33.33%) | protease,tRNA,bacteriocin,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1027315 : 1035788
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP019594|1027315:1035788|DBSCAN-SWA AGTGAAAGTAGCAGTCATTATGGGCAGTTCTTCCGATTGGAAAATTATGCAAGAGAGTTGTAACATGTTGGATTATTTTGAAATTCCGTACGAAAAACAAGTAGTATCCGCACATCGTACGCCAAAAATGATGGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAGACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTCTTTATTATCTATTGTTCAAATGCCAGGAGGTATTCCGGTTGCAACGACTGCAATTGGTGCAGCAGGTGCTAAAAATGCAGGTATACTTGCAACAAGAATGTTGAGTATTCAAAATCCTTCTTTAGTTGAAAAACTAAATCAGTATGAATCTTCGTTAATTCAAAAAGTGGAGGACATGCAAAATGAACTTCAATAAATTAAAGTTTGGTGCGACTATTGGCATTATTGGTGGTGGTCAGCTTGGAAAGATGATGGCACAATCAGCTCAAAAAATGGGTTATAAAGTGGTTGTATTGGATCCTGCTGAAGATTGTCCATGTAGATACGTTGCACACGAATTTATACAAGCCAAGTATGACGATGAAAAGGCACTCAATCAATTAGGACAAAAATGTGATGTGATTACTTATGAATTTGAAAACATTTCAGCCCAACAATTAAAACTATTATGTGAAAAGTACAATATTCCGCAAGGTTACCAAGCTATACAGTTATTACAAGACCGCTTAACTGAAAAAGAAACATTAAAAAGTGCTGGTACCAAGGTTGTCCCATTCATTTCAGTAAAAGAATCTACAGATATTGACAAAGCAATTGAAACATTAGGATATCCTTTTATTGTAAAAACTAGATTTGGTGGCTACGATGGCAAAGGTCAAGTTTTAATTAACAACGAAAAAGACTTACAAGAAGGTTTTAAATTAATTGAAACTAGTGAATGCGTAGCTGAAAAATATTTGAATATCAAGAAAGAAGTATCACTTACTGTTACAAGAGGAAACAACAATCAAATCACTTATTTCCCATTACAAGAAAATGAGCATAGAAATCAAATACTTTTCAAAACAATTGTTCCAGCGAGAATAGATAAAACAGCTGAGGCGAAAGAGCAAGTAAATAAAATTATCCAATCGATTCATTTCATTGGAACATTTACAGTTGAATTTTTTATAGATAGTAACAACCAATTGTATGTGAACGAGATTGCACCAAGGCCTCACAATTCCGGACATTATTCAATTGAAGCATGTGATTATTCACAATTTGATACTCATATTTTAGCAGTTACCGGACAATCATTACCAAATTCAATTGAATTATTAAAGCCTGCAGTCATGATGAACTTACTAGGTAAAGACTTAGATTTATTGGAAAATGAATTTAATGAACATCCAGAGTGGCACTTACATATTTATGGTAAGTCTGAGCGTAAAGATAGCAGAAAAATGGGGCATATGACTGTACTAACGAATGATGTAAACCAAACTGAACAAGATATGTACGCTAAATTTGAGGGGAGTAATTAAAGCATGACATTACTATATGAAGGAAAAGCGAAGCGCATTTTCTCAACAAATCAAGAAAATGAATTAAGAGTTGAATATAAAGATGAAGTTACTGCTGGAAACGGGGCTAAGAAAGACACAATGGCAGGTAAGGGGCGATTAAATAATCAAATTACTTCTATTATATTTAAATATTTACAAGAAAATGGAATAGAAAGTCACTTTATTAAGCAATTATCTGAAACAGAACAATTAGTTAAGCCTGTGAAAATAATTCCATTAGAAGTAGTTGTTCGTAATATTGCTAGCGGATCTATTACAAAGCGTTTAGGTTTTGAAAATGGTGAAGTTTTTAGAGAACCACTTGTGGAATTTTTCTATAAAAATGATGCTTTAAATGATCCTTTGATTACAGATGATCACGTCAAATTACTGAATATTGCGACTGATAAAGATATTGAAACATTAAAAACGAAAGCGCTAGAAATTAATCAAGTATTAAAACAATTAATGGATGCGATGAATTTAAAATTAGTAGATTTTAAAATCGAATTTGGAAAGACTGAGACTGGTCAAATTTTGTTAGCGGATGAAATATCTCCAGATACATGTCGAATTTGGGATAAAGCTACCAATGCAAACTTTGATAAAGATGTATATAGAAATAACACTGGATCACTGATTGAAACATATCAAATATTTTTAAACAAATTGGAGGATTTAAAATAATGAAAACAATTGAACTACATATCACATTACAACCACAAGTATTAGATACGCAAGGACAAACGCTTACTCGAGCTGTACATGACTTAGGTTATGCACAAGTGAATGATATTCGTGTAGGAAAAGTATTATATATGACAGTGGATGAGGTTAGTGATGAAAAGGTACACAACATTATTACAACTCTAAGTGAAAAATTGTTTGCAAATACAGTGATTGAAGAATATAGCTATAAAGTTTTAGAAGATGAAAAGGAGAATGCATAAAATGAAATTTGCGGTTCTTGTTTTTCCAGGTTCGAATTGTGATAGAGATATGTTTAATGCTGCTATTAAAAGTGGTGTTGAAGCGGAATATGTAGATTATAGAGAAACATCACTAAGTGGATTTGATGGCGTACTTATTCCTGGTGGATTTTCATTCGGGGATTACTTAAGATCTGGGGCAATGGCTAGTGTAGCGCCGATTATTTCTGAAGTTAAACGTCTTGCAGCTGAAGGTAAGCCAGTATTAGGTGTTTGTAATGGGTTTCAAATTTTAACTGAAATAGGCTTATTACCTGGTGCATTATTGCATAACGATTCACATTTATTTATTAGTAGAAATGAAGAGTTAGAAATAGTGAATAATCAAACGGCTTTTACAAATCTTTATGAACAAGGTGAAAAAGTTATATATCCTGTAGCTCACGGCGAAGGTCATTATTATTGTACTGATGAAATATATCAACAATTAAAAGCTAACAATCAAATTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCTATGGTAAAAAGTTGGAGGGAACAACATGTCTAAATTTATCGAACCAAGCGTTGAAGAAATTAAACTTGAAAAAGTATATCAAGATATGGGATTAAGTGATCAAGAATATGAAAAAGTTTGCGATATTTTAGGCAGACAACCTAACTTTACAGAAACAGGTATCTTTTCTGTTATGTGGAGTGAACATTGCTCTTATAAACATTCTAAACCGTTTTTAAAGCAATTTCCTACGTCAGGTGAGCATGTGCTTATGGGTCCAGGTGAAGGTGCAGGGGTAGTCGATATCGGTGATAATCAAGCCGTAGTATTTAAAGTAGAGTCTCACAATCATCCATCTGCAATTGAGCCATATCAAGGTGCTGCTACAGGCGTTGGTGGAATCATTCGTGACATTGTCTCTATTGGGGCTAGACCTATTAATTTGTTAAACAGTCTTAGATTTGGAGAATTAGATAATAAACAAAACCAAAGATTACTTAAAGGTGTTGTAAAGGGTATCGGAGGTTATGGTAACTGCATTGGTATTCCAACAACTGCTGGAGAAATCGAATTTGATGAACGTTATGATGGTAATCCACTTGTTAATGCAATGTGTGTTGGTGTTATCAATCACGACATGATTCAAAAAGGCACAGCAAAAGGTGTAGGTAATTCGGTCATTTATGTTGGTTTGAAAACTGGTCGAGATGGTATTCATGGTGCTACTTTTGCATCTGAAGAATTGACGGAAGAAAGCGAAAGTAAACGACCTTCTGTACAAATCGGTGATCCATTTGTAGGTAAAAAATTAATGGAAGCAACACTTGAAGCAATTACATTTGATGAATTAGTTGGTATTCAAGATATGGGTGCTGCTGGTTTAACATCTTCATCTTCTGAAATGGCGGCAAAAGGTGGTAGTGGTTTACATTTGAGATTAGAACAAGTGCCAACACGTGAGCCAGGTATTTCTCCTTACGAAATGATGCTTTCAGAAACTCAAGAACGTATGTTACTAGTTGTTGAAAAAGGTACTGAACAAAAATTCTTAGATTTATTTGATAAGCACGAATTGGATAGTGCTGTTATAGGTGAAGTAACAGATACAAATCGTTTTGTTTTAACATATGAAGACGAAGTTTATGCTGACATTCCAGTTGAACCACTAGCTGATGAAGCACCTGTATATATTTTAGAAGGAGAAGAAAAAAATTATAATACTTCTAAAAATGATTATACACACATCGATGTTAAAGATACTTTCTTTAAATTACTTAAGCATCCGACTATAGCATCTAAACACTATTTATATGATCAATACGATCAACAAGTTGGTGCCAATACGATAATTAAGCCAGGACTTCAAGCATCGGTAGTACGTGTGGAAGGCACAAATAAGGCAATTGCTTCAACAATTGATGGTGAAGCGCGTTATGTATATAACAATCCATATGAAGGTGGAAAGATGGTAGTAGCTGAAGCTTATCGTAATTTAATTGCCGTGGGTGCAACACCATTAGCAATGACTGACTGCTTAAATTATGGTTCTCCTGAAAAGAAAGAAATTTATCAACAATTAGCAGATTCAACGAAAGGTATGGCAGAAGCTTGCGACATACTTAAGACACCTGTTGTTTCTGGAAACGTTTCTTTATACAACGAAACGAAAGGCACTTCTATTTTCCCTACACCAATTGTTGGTATGGTAGGTCTGATTGAAAACGTAGACTATTTAAATGATTTTCAACCTCAAGTTGGAGATAAGTTATATGTAATTGGTGATACTAAGGACGACTTTGGTGGTAGTCAACTTGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP019594|1027315:1035788|1029616_1029880_+|ARH74487.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLEDEKENA >CP019594|1027315:1035788|1028912_1029617_+|ARH74486.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >CP019594|1027315:1035788|1035221_1035788_+|ARH74492.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLDSFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >CP019594|1027315:1035788|1030545_1032735_+|ARH74489.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYEDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLADSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPIVGMVGLIENVDYLNDFQPQVGDKLYVIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESIDLSSEVKKGESIKTAIRQGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSLIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >CP019594|1027315:1035788|1029881_1030553_+|ARH74488.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >CP019594|1027315:1035788|1032713_1034198_+|ARH74490.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKMLAQESPVKADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >CP019594|1027315:1035788|1034190_1035219_+|ARH74491.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIETNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >CP019594|1027315:1035788|1027315_1027798_+|ARH76238.2|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILATRMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >CP019594|1027315:1035788|1027784_1028909_+|ARH74485.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1293213 : 1299968
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP019594|1293213:1299968|DBSCAN-SWA TATGAATTGCTATGATGAAATATACAATACAATCAAAAAATTGATAGAAAACAAAGAGATATCGAGTTATCAAATTAATAAAGATACTGGGATAAGTTACGGTAATATTAATGCTATGCGCCGTGGAGAAAGAAGAATAGAAAATTTAAGCTTAAAGAATGCAAAGATCTTATATGAATATGCGAAAAAGGTATTATAATATAAGCATTGAGTTCAATAGGCATACAATAACTGCCCAAACTAGTGACTGAGTGGGTGTTTTTATAGTATTAAAAGTTTTCTAAAAGTGAAAGAAATCATGTTTAGTGATTTACTTATGTTTTTCAAAATAGTATAATAATTTTATATAATACATAGAACTTCAGTATACCTTTTGAGTATATATGGAGTTCTTTCTTTTTTACAAGATGTATATGTATAAATGGAAATGTTTATTACATTACATAAAAACCTTTAGGTGCTCTTAGATGGATGTTAATCATAAAACAAAGTGATTTTGAAAAATATAGGTTATTATAATTTAGAATTGGAAATTATAAATCTTGTCATTGGATATGGGAATTCAAACATATCACTTACAACAATTTGTGGAATGTTAAATAACTATAAAGAGGAAAGGAGAAAAAATGATAAGAATGGTTAAAGAAAAAGAACGAATAGCAAAATTAAATTTCGAATAGCTGTGACGAGCATAATAATTCAAGTGCTTAATTTTATCAAATCGTTCTTTTAAAAAGGTAAAGAACAAAAGACCTTTACCACATTAAATAGGGAGGTGGTATTTATGACAAGAGAATTAAGGAAAAAATTAACTCTCTATCTTAACATTGCAACTTTAATATTATTTATTATTAATTTAACAAGAAAAAAATAAAATATTCTTTAATTTTTACAAAAATTACGAACCAGTTTAAAGAAATTTATAATACAATAGAAAAATTACTAAATGATAAATCAATATCTAATTATAGAATTAATCAAGACACTGGTGTTTCTTATGGTGGTATAAGTGAATTAAGAAGCGGGAAAAGAAAAGTGAATAATTTAACTTTAGAAACAGCGGAAAAACTCTATAATTACCAAAAACAATTAGAAATAATGATTGAAGATTAAAATAAGGCCATATCTTTTGAAATATCATGGAGTGAGCCTTTTAAATCATCTAATTTTAAAGTATATTAAATATGGATAGCTTAATGTGAATATAAATAAAAAATTATCAAATAATATAATATAGAATAGATTGAGACAAGGAATTTTATCAATATATAATAAAAAACGCCAATACTATTAGGCATTAGTTTATGAATTAACTAGTTTGGCAACTACAAAGAAACAATGTATTGCTAAACGTAGTTACTGCATTAGGATAATTATAATTATAAATAGAAAGAGAGCGTGATTAAAAATGAATGAGATTGAAACTATTATAAGTGAAATAGAAAAGTTATTAACTAACAATACACCATATAGTATTTCAAAAAACTCAGGTGTACCACGTCAAACAGTTACTGATTTAAAGGTAGGTAATACTAAAATAAAGGATGCCAAATTTAAAACAATAATCAAGTTATACGAGTATCAAAAGTTGTCAGAAAATAATTCAGAGTGCTAATAAATATACCTTGTTTGATTAGGTGGACAAGAAATTAAATTTCTAATGATTTCATGGTTGTCTGTCCATGCTTTGTCCACCTCAATAAAATTATCTCTAGGTTTTTAAAATTGTACATGTTTAAACAATCAAATGTATGCATTTTTATATTATCATTTCCATAAAAATTTAAATGATCTTTAAGTGATGATATAGAAGGCTGAACACAGTAAATAAGTTAACTTTAATGCAGTATTCTATACTATACATATTTTGTAATAATGTTTATGTGCATAATTTTTCATTGACAATTTTTTATATTAAATTGTGTAATTGGCATATATGATGATTTGTGATAATTATATTGTAATATAGCATTTGGTTTTATGATTCTAAAATTAATAGATTTGAAAAGTATACTTTATTTCATGAAAGTTTTTGGTACATTTATTTGAAAATGTTTTTATTACAAAGTTACATGCCTAAATGTTTCTTAACAAAATTAATTCATCGAGTGTAAAGAATCGTGTGGTAAACATAATTTATATAGATTATAAGGAGGTGAAAATGGTCGAGGAAGTAAAAACGATAAAATAGTTTGAATGTTTTGATTTTAATTCTGATAGGACTATTGAATTTGCAAACTAATAAGAATGTGAGGTTTGATTTAATACGAAGTCATATTCTTTGAATAAAATATTACTTTCTCACCATTAGTAAAATGAAGATGACTATTAAAGTGCGAAAAACAAATAAAAAAGAGAAAATAGAATTTTTAATAGGGACGTTTATAATTATTTTAGTAATATTAGGGTTCAAAATTATGAAATAAATGTATAGTATTTGAGAAGTCTATATGACTCCGGAAAAATTAAAGTCTAAAGATATCTCTATATCTCAAATTTAATAGACTACTGGAGTTAGTAGTTTGAATATTGAAAGACACTAATCTAATAAAAATACATAAAAGGTTAAACATTGAAGTTTAGTAAAAGGCGTAAGGTATACAAGACAAATCGTTTGTCTTTGACAAAGTAATTGATGATGAAAAGTTGTTAATATGTAGAAACAAAAATTGAAAATATGAAATTTAACTATTATGAAGTGATGATAGCTATTAATGAATAGAAAAATAATAAAATCATTTATAAATAAAAAATACGTTGAGTTCACAGAATTTCGAAAAAAAGTAGTAAACATTGTACAGATATGGAGATGAAAAAAATGTCAGAATACAAGAAAAAGATAATTGAATTAATTGAAAGTAATTTAACAGGATATGAAATTTCTAAAAAAACTGGAGTTTCTCAATATGTACTTTCACAATTAAGACAGGGCAAACGCGAAGTAGATAATCTAACCCTGAATACAACAGAAAAATTATATGAATATGCCAATAAAGTTTTGTAATATAACTACTGTATAAATTAATCAAGCTATGTTTATTTGATTAAACTATTAATAAAAATCATATGGTGAATAGATATTATAATAATTAAAATACAAAAATAGTAGATTCCAATTTGTGAAAAAGGAGTATGTCGTTTCATTTAGAATTTATTGCACGAAATTAGCATCGAATAAGGGAAAATAAGTGTTAAGTTTTAAATGATAAAAAAGATTGGAATGGATCGTCTTGAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTCAATGTCTACTTCGAAGGGGGCATTTCCATTAAATTGTTATAGCTATTTATATTTGTATAATGAACATATAAGGTTAAGTAGGTGCGAGTGAAGGAAATAAAAAAGCTCAAATGTACTAAATTTTTAATCTTAATAAATCTCTACTTTATAAAGATTGAATGGACATTCGAGCGTTAATCAGTCAGGAGGGAATTTCACTCCTACAATGTAATAATAATACTTGCTTCACCACTATACAAGGAGTGAGTTGTTATGTTCAAAGTGAATTATTCGATTTTAAGTTATTATCCAGATATTTATCTCCATAGTAATTTAGCTGTAGGTGTGGCATTTGAAATTATAGGAGAAAGTTATCATAAGAATGAAATTAAATTTATAACCCAAAGAAGAAAAATTTCATCATTTGATGATGAAATAGACAATTTAGTACTTATTAATATGTTTTTGGATGGACTTAAATGTGAATTCGAACAAACTAATCAATCAATAAAAAATTATAAGAAAAAGTTTGTTAATAATTTTTACTTTGAGAATATTGAATATAAAATGTTTGACTCATTAAAAGAAGTTAATAATTTTATTGAAAAAACATATAAATATGTATTACATATTGGTTTAGATAAAAAAGAAAGACTTAAGAAAACTGAGAAAGAACTTTTGAATAGCTAAGTAAAAAGGTCAAACATATTGTTCTGAATATAAATAAGTAATAACCGTACCTTTATTGATGCGGTTATTTTTTATGTAAAAAAACGAAAAAAGTTTTAAAAAAAGTGTTGGATACAAAACAGGTTGGAAAGAGAAGAAAAAATGACAAATATCGCAAAAGCCAAAAGCGAAATCTTCCGCAACTACACTTTAGGCTTTGCAACACTTGCCACAATAATAAAAATGTTTTTTATAGAGGGGGATATCCCCTCCCTCGTATTATATTACGAGGTGATGAAAATGACAAACTTAACTAAAATTAGAATAATAATCTTTATTAATTATCTAATCGGAATTTTAGCTTTAATATTTGCCTTTTATATAATCTTAATGTCAATAGCGGTTTAAAAATGCTGTTTTATGTCGGTTTGAAAATGTAGTTTTTTAGCAGCTTAAGATTGTCGTATATTTAATGATTTTTCGGTTTTATAATCTTTTAATCGATATGATTCTCCAGTAATTTTAAATACTTTTGAATGGTGAACTAACCGATCAATTATAGCTGCTGATACAATCTTATTACTAAATGACTCTCCCCAACTCGAAAATGTAATATTAGTCGTAATTATTGTTGATTTCATTTCATATTTTAGTGACATTAACTGGTAGAATAAATCAGCTTGTTCTTTGGTGATGGCAGAATAACAAATTTCATCAATGATAAGTAACTCTATTCTGCTTAATTGTTTTAATGTTTTATTAATGATTTCTTTGGAATCTGTGACAGTTAATAAGTCTATTAATTCTTTGAAAGTATAGAATCTAGTCTTTATATTTTGTTTACATGCCTCAATTCCTAATGAGATTGTTAGGTGTGTTTTACCAACAACACGGTTATCTAAGAAACAAATATTTATATTATCTTCAAAAAATGTTATTTTTTTAGTCTCATTTTGTATTTTATTTTTACAGTATTCTCGTAGAATAGTATATTTACCTTCATATCCCTTTTCCTCTATATATTTAAAAATGGCCATAGCTGTATATCCTAATTCAATTTTTTTATTATTAATTTCTTTAAATGAATCTAGTTTTGATGTTTACTTATTTTGTTGTCTTTTCTTCAATCGTTCTAATTCATTTTCTTTTCCTGCTTCATAATATTTTTTAACTGTTATTGGATCACAATTATATTGTCGACCAAGCTCAGCATAATTTGGTTTAATACCTTTCGTAATGTAAAATAGCACTCCTTCATAAATGTCATGTCTCAATTAAATAAGCTCCAATCGAAGATTGAGTTAAAACATGATTATATAATTTAAAAAAGAAAAAATGTATTATAAATCAGTACGTCAAAGGAATAAGGATATAGAAGTAGATATAATTTCTAAAAATACCAATTTGAATTAAAACCTAGTTAAAAGAGCGTATGAACATTTGTTTAAGAATAAATATGATTAGATAACTGTATTAATAATTTCTATCCAGATTATAATATTGCAGTAAGTTGGCAATGTTTAAGAGAAGGAAAAACAATAAAAAACAAGATTTAATACTACTTCGTCAAGAGGCACTTGAACATTATTTGATGAATAAATATAATTATTACTATAGAGAAGCACATGGGATTGTAGAAAGAAAATACAATTTTTCTAGTTATATTGAGAAATAGGGTGATATGATTGATTATTATGAGAAAGTTAAAAGAAGATGATCAAGTTATTGTATATGAGTATATTCCACAAGATAAAATAGAAAAAGGGAAAGGTGAAATAACAGTAAATAAATTAGATTCAAAGGTAATTGACTATAAATTATCAAAAGTTGAAAATGAAAAAGGTATTTTAGTTTATAGAGATAAATCATTTCATGCAATATTAAATTTTATTGATGAAAATAAATTTCCAAATGAATATATATATGCATGGTATTAAAGCATCCTTTCTACATAGATAAAGAGAAAGTGGTGCTATTTTTATATGCTTTTTTAACTATTTACTGAAATAGCAGAATCACAAAAGTTAACATATTTAAAAGAACTTGGTGAAGATGGCGAATATAAATATGTTGCCAAAATAGATAGTAAAACATCTAAATTATGTCATTCACTCAACGGAAAAATATTTAAAGTTAAAGATATGATACCAGGTGTGAATGCGCCACCTATGCATCCTTGGTGTAGAAGTACCACAGTGCCACATGTCGGCAGTTGGCGAGACAAGTTCTTTAAAGAGCGTGAAGGTAAATATCAAGTAGAAGATGACACAACCAAAGATGAATTACAACAAGCTAAAGTATTAGGAAAGAAAATATATATTACTGATCAAGCGATTGATAAAGTAAGATACGTTGATATTCCAACACATACCAAAGAAGAAAATCAATTTATACAAGAACAACATAAAGCCTTGCTTAAAGACGCCAAAGAAAACAATGATAGCAATGAAGTAGCTTATTTATTAAAAGATGGTAAAGTTACAAAAGTATATGGTGATCAAGATAGTGTATCTTTTGCACCAGGGGAAAAAGAAACAGAATTGTTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGGCAGTCTAGTTTTTCTCTTACAGACTTGTATTTATTTATATTTAATAATTCTATTAAAACACTGACAATTGTTACAAATAAAGGTCAAACAAAGTACTTAACTAAGACAAAAGAATATTGCAAATCAACTTGTATTGATTGTATTAAAAAATATAATAAAAATAATAATATAAAAAAATTCAATCATAAGGATATTGATATGATTCTAAAGAGATTATATAATAGTGGTAACATAATATATAAAGTTAGGTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP019594|1293213:1299968|1293213_1293411_+|ARH74739.1|DBSCAN-SWA MNCYDEIYNTIKKLIENKEISSYQINKDTGISYGNINAMRRGERRIENLSLKNAKILYEYAKKVL >CP019594|1293213:1299968|1295527_1295638_+|ARH74741.1|DBSCAN-SWA MKMTIKVRKTNKKEKIEFLIGTFIIILVILGFKIMK >CP019594|1293213:1299968|1298807_1299059_+|ARH74746.1|DBSCAN-SWA MIIMRKLKEDDQVIVYEYIPQDKIEKGKGEITVNKLDSKVIDYKLSKVENEKGILVYRDKSFHAILNFIDENKFPNEYIYAWY >CP019594|1293213:1299968|1296030_1296216_+|ARH74742.1|DBSCAN-SWA MSEYKKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYEYANKVL >CP019594|1293213:1299968|1294097_1294325_+|ARH76245.1|DBSCAN-SWA MFTKITNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTGVSYGGISELRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED >CP019594|1293213:1299968|1297574_1298159_-|ARH74744.1|DBSCAN-SWA MAIFKYIEEKGYEGKYTILREYCKNKIQNETKKITFFEDNINICFLDNRVVGKTHLTISLGIEACKQNIKTRFYTFKELIDLLTVTDSKEIINKTLKQLSRIELLIIDEICYSAITKEQADLFYQLMSLKYEMKSTIITTNITFSSWGESFSNKIVSAAIIDRLVHHSKVFKITGESYRLKDYKTEKSLNIRQS >CP019594|1293213:1299968|1299128_1299968_+|ARH74747.1|head|DBSCAN-SWA MAESQKLTYLKELGEDGEYKYVAKIDSKTSKLCHSLNGKIFKVKDMIPGVNAPPMHPWCRSTTVPHVGSWRDKFFKEREGKYQVEDDTTKDELQQAKVLGKKIYITDQAIDKVRYVDIPTHTKEENQFIQEQHKALLKDAKENNDSNEVAYLLKDGKVTKVYGDQDSVSFAPGEKETELLFNSKPNSIVMLHNHPGQSSFSLTDLYLFIFNNSIKTLTIVTNKGQTKYLTKTKEYCKSTCIDCIKKYNKNNNIKKFNHKDIDMILKRLYNSGNIIYKVR >CP019594|1293213:1299968|1294620_1294827_+|ARH74740.1|DBSCAN-SWA MNEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGNTKIKDAKFKTIIKLYEYQKLSENNSEC >CP019594|1293213:1299968|1296726_1297143_+|ARH74743.1|DBSCAN-SWA MFKVNYSILSYYPDIYLHSNLAVGVAFEIIGESYHKNEIKFITQRRKISSFDDEIDNLVLINMFLDGLKCEFEQTNQSIKNYKKKFVNNFYFENIEYKMFDSLKEVNNFIEKTYKYVLHIGLDKKERLKKTEKELLNS |
9 | Staphylococcus_phage(83.33%) | head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1475049 : 1557328
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP019594|1475049:1557328|DBSCAN-SWA CTTATGGATATAAACGGTTTAATAATCTTGGGAATGGTGCAGTTTCACGAACGTGTTCAACACCAGAAATCCATGCTACTGTACGCTCTAAACCTAAACCAAATCCACAGTGTGGTACACTACCATAACGACGTAAGTCTAAGTAGTAACTATATGCTTCTTCGTCTAATCCATGTTCTTTAACGCGTTGTTCTAACAATTCTAAGTCATCCACACGTTCAGATCCACCTATAATTTCACCGTATCCTTCAGGTGCAATTAAGTCTGCACATAATACAGTTTCTTCATTCTCAGGATTTGGTTGCATATAGAAAGGCTTAATTTTAGTTGGATAATTAGTAATAAACACCGGTAAATCATAATGATTAGCAATGGCAGTTTCATGTGGCGCACCAAAATCTTCGCCCCATTCAATATCATCAAAGCCTTCTGCTTTTAAGAATTCAATTGCATCATCATATGAAATTCTAGGGAATGGTGTCGCAACTTTTTCAAGTTTTGATGTATCTCGCTCTAAAATTTTCAACTCTAGTTTACAATTTTCTAAAACTGATTTTACTACATGTGTTACATATTGTTCTTGAATTTCTAAACTTTCAGCATGATTTGTGAAAGCCATTTCCCCTTCAATCATCCAGAACTCGATCAAGTGTCTACGTGTTTTTGATTTTTCAGCTCTAAAAGTTGGACCAAATGAAAATACTTTTCCGTGTGCCATAGCTGCAGCTTCTAAGTATAACTGACCACTTTGAGATAAAAACGCATCTTGATCAAAGTATTTAGTATGGAATAATTCACTTGTACCTTCTGGTGCACTTGCTGTCAAAATTGGTGGATCAACCTTTGTAAATCCATCTTTGTTGAAAAATTCATACGTTGCACGAATAACTTCATTTCTAATTTTCATTACAGCATGTTGTTTTTTAGAACGTAACCATAAATGACGGTGATCCATTAAAAATTCTGTACCGTGATTTTTAGGTGTAATCGGATAGTCATGCGCTTCTGAAATAACTTCAATTGATTTTACTTGCATTTCGTATCCTAAGTCAGAACGATTATCTTCTGTAATTGTGCCTGTAACATATAGAGATGATTCTTGAGTAATTTCTTTCGCAAGTTTGAATACCTCTTCATCAACTTCTGATTTAACTACTACGCCTTGCATAAAGCCTGTTCCATCACGTAATTGTAAAAAGGCGATTTTACCACTTGAACGTTTATTTGTTAGCCAAGCACCAATTGTAACGTCTTGGTTTAAATGATCTTTCGCTTGTTTAATCGTTGTTTTCATAACCATTCTCCTATTTATTTTTTCGTTATACAATACTCATTCATTTTAACAAAATCCGCTTTCAAGTTCTAGAACTAGACTAAAAGATAACGTGTAAATGGTAATGATTTAAGCACAGATTTGAACATTTATTTATATTAAGACAATAGAATCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCAAATTTTGACGACCAAACAAAAATTCTTGTAACAGAACATAGCACATGTCATGTCACAAGAATTTTACTTTGTATTTTACTTTTTCTTTTTTTGAATTTGTCTTAATAATTTTCCAAACTGTTGTATGTCGCCTTTTTTCTGACGATAATTTTCAAGTGTTTGTTCAAAAAAGTTTTTATAATTACTATTTATGAGTCGATCATCAAATGAAACTATTATGCCGCGATCATTTTCATTTCTAATTAATCTTCCAAGTCCTTGTCTAAAACGTGTAACTGCATCAGGTAATACATATTCCTTGAAAGTTGAAGTGAATTCAGAATCCATAAGCCAATATTTTGCATTATGCTTGTTCATAAACGGTAACTTCGCTATCATCACACATTTAATACCATTTGCTTGAAAATCAAAGCCTTCAAAAAATGTTGACGTACCAAGCAGTATGGCCTTATCAAAATTATTAAACTGTTGTACTATTTTATAATTTTGGTTCTGCTGTTGTGTTAATACAACATAATCTTCAAATTCTGGCAATTCATTTAGCATATCTTGTACCATATGCATCATTTTATAACTCGTGAATAAGACTAAACATTTTGATGACGTTATAGTCGTATATTCAATAATATAGCTTACAATCGATGCTACATACTCATCTATATTTTTATATTGATAAGATGCTACATCACTCGGTATAAATACACTTGTATTTTTTGCACTTTGTAACGACGTGTTAACTTCAAATGTATTAAAGTGAACATCTTTGTTGAATAACTGTTTAAAAGCCTCAAACGAATGATTAAATTTTAAAGTACCAGATATAAAAATGAGTGATTTAAATTTTTCCAATACTTGTTTCGTTAATACATCTTTTACAGCATAATCTTTCACATATAAACGTATTGTTGATTTTTGAGATAAATTTTTAATTGAAATGAAACTAGTATGTCCAGCTTTTAAACTTTGTTCGATATTTTTAAATTTATCTTTTAAATACAACAACTGTTTCCGTAATGATTTAACTGTTTTATGACTAATGCCATTGAATATTTCTAGCGTTTTATTTAACTTATCGATAATCGCATGTAAATCCTTCAAAATGTCTTTTGTTTCAAAAGTAAATACATTATGGAAGCGATGAATATCATCATCATAAACATCAGAATCATTGATAATCGTAAATATCGTTGAGAACAATTGCTCATTTAACTCATGAATCTCATTCATACTAGCCTTCAAGCCAAAAATATCAATTGGAGCAATATCTAATTTTTCCAAAATTCGCTGCTTTTCCAGTTGATCAATTGCCTTTAACAATTTTTCATTTTCGTTTTTACCAATCAAACCAAGCTGATATTTAATATCAGCATAACTCAACTCATTTGTCACTTGATTTAAGGCATAGTCTGGTAAGCGATGTGCTTCATCCACTATACAATCATCAAACAATTGATATATTGAATTTTCAACATCAGAATGAATTAAATGTGCATGATTTGTAATACCAATTTGAATGTTCTGTGCATTTCGCTTAATAAAATTATAATAGTGAACATCGTGACGTGCCGCTACATATGTTTCAATTTTTTGGTCAAAATACATCTTTTGACCACCTTTTAAATTTAATTCCTGTATATCTCCGGATGGCGTCTCTGTAATCCAAATCAGCAATTGCATTTTCAAGATATTCACTTCGTAATTACTTGTGTCATCTTTTAAAATTTGACTAATAAGTCCCAATGAAATGTAATCACTTTTACTTTTAATCAATAGTGCATTAATTTTAAAATTCAATGCTTCATTCATTGCTGGAATATCTTTTTCTAATAATTGACTTTGCAGTAATTTGGTATTGGTAGAAATCATAACATGCTTCCCAGTTTCAATATTATACATCAAGGCCGCAAGTAAATATGCTAATGATTTACCACTGCCTAGTGATGCTTCAATCATTGCTTTTTCACTATGCATGAGCTGATCTAATATAGTTTCCGCTAAATATAATTGTTGCGGTCGATATGTTAAGCCAAGTTGATCTACAGCTTTGCTATATAAAGACTTCAAGCTGCCATTATAATTTGTTGTCGGCTTTTTAAAATCAACTTGCTTACGATATATTATCTGTTCGAACTTTTCGTACGATTTATCCAATGGCTTTGCATCATATTGCCTAACCATCTCAAAGAAAATATCATACAAATCGTATTTCAACTGTTTACTTAAATAATATAATTGTTTTAAAGTATCTAACGGTAACTTTTCAAATTTTTCAAAAGCTAATATCATCAATTTAGCAGTAGTAGCGGCATCTTCGTCAGCTCGATGGGCATTTGCTAAGGTAATACCATGTGCCTCCGCTAATTCACTTAATTGATAACTTTTATCTGTAGGAAAAGCTATTTTAAAGATTTCTAGTGTATCTATAACTTTTTTGGGACGATATTGAATATTACAATTTTTAAATGCCTTTTTAATAAAATTTAAATCAAAATCTACATTATGAGCGACAAAAATGCAATCTTTTATCTTATCGTAGATTTCTTCTGCAACTTGATTAAAATATGGTGCTTGTTGTAGCATATTTTCTTCAATGGATGTTAACGCTTGAATGAATGGCGGAATCTCTAAATTTGTTCTAATCATAGAATGATATGTATCAATAATATGGTTATTGCGCACAAACGTTATACCAATTTGAATGATATCGTCAAAATCTAATTGGTTGCCTGTTGTTTCCAAATCCACAACGGCATAGGTTGCCATACCCATAGCTATCTCTCCTTGCTTCAGTGTTAAAAATCTATATCTGCACTAATTAAACGGTGTGATTCACCCGCTTCATCTCTAACAATTAGATAGCCATCGTAATCTAAATCAATTGCTTGTCCTTTAAACTGTTTATCATTTTCTGTAAATAGCAACGTTCTATTCCAAATATTAGAAGCTGCAATATATTCTTCACGAATTTCAGAAAAAGGTAACGTTAAAAATTGATTATATCTTTTTTCAATTTCTTGAAGTAATCTCTCTAAAAATTGATATCTATCTAATTTATTTTTATCATGTAATTGTATACTTGTTGCTCTATGTCTAATACTTTCATCAAAGTCTTCTAGTTGTTGCGTCAAATTAATACCTATACCACATATTATTGCTTCTATACCATCATTATTAGCAACCATTTCAGTTAAGAAACCACACACTTTACCATTATCAATATATATATCATTCGGCCATTTTACTTTGACTTCATCTTGACTAAAATGTTGAATCGCATCTCTTATCCCTAATGCAATAAATAAATTAAATTTAGATATCATTGAGAATGCAACGTTAGGTCTTAACACGACAGACATCCAAAGTCCTTGCCCTTTTGAAGAACTCCAATGTCTATTAAATCGCCCACGACCTTTCGTTTGTTCATCACTCAAGATAAAAAATGAAGATTGATTTCCAACAA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MSLEEIKLWLRIDYNFENDLIEGLIQSAKSELLLSGVPDYDKDDLEYPLFCTAIKYIIARDYESRGYSNDQSRSKVFNEKGLQKMILKLKKW >CP019594|1475049:1557328|1552072_1552336_-|ARH74995.1|DBSCAN-SWA MPKIIVPPTPENTYRGEEKFVKKLYATPTQIHQLFGVCRSTVYNWLKYYRKDNLGVENLYIDYSPTGTLINISKLEEYLIRKHKKWY |
104 | Staphylococcus_phage(85.53%) | protease,head,tail,holin,portal,terminase,tRNA,capsid,integrase | attL 1511440:1511460|attR 1557333:1557353 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1618079 : 1626391
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP019594|1618079:1626391|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATAGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTGGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATCTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGTGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCTGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCGATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACGTCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACCACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTTCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATATTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCCTGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAAAATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGAGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGACCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTAGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCGAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCTATCGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATAATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAATAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACATCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGACCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTCTTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCAATCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATCTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATTGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTAGTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCATCATTCAAACTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGCACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCTGCTTTTTCTTGCCGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATGTAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGACTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAATTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGTGCAACATCATTTAAAGCCTTTTGTTGCAAAATCGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTACGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTATCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGTGTTTCAGGACTATTTAAGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTACGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAGTAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGGCAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP019594|1618079:1626391|1623261_1624368_-|ARH75078.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >CP019594|1618079:1626391|1619890_1621237_-|ARH75075.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKADVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >CP019594|1618079:1626391|1621350_1622451_-|ARH75076.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDYHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGSIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADFKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIQGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >CP019594|1618079:1626391|1624591_1626391_-|ARH75079.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIARNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPVNYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >CP019594|1618079:1626391|1622453_1623131_-|ARH75077.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >CP019594|1618079:1626391|1618990_1619881_-|ARH75074.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >CP019594|1618079:1626391|1618079_1618865_-|ARH75073.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1695815 : 1704858
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP019594|1695815:1704858|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCATATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTCACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACATTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCTCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTATTTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAGTCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATATACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTATCAATAGCCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAATGCATCATGATTGACATCTGTGTCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTAAACTCTTTAATGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATCGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTGTTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAATATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAACGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAAAGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAAGCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTTGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTCGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCGGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGGTCGACTTGATAAAGTACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATGGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATTCTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTTGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAGTAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTTAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTAAATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGATTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATAGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCGTCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAATCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCAGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATACGTCCACCTTGGTCCATTTCTTTTATGCATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAGCATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATATTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCGCCAATTGTTACGGCAATCGCATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTTGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGTTTCAATAGTCGATTGGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCTAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTACCAGCTCGAGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTTACTTCCATTTCATTGGCAATAATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP019594|1695815:1704858|1698831_1701111_-|ARH75151.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQYWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >CP019594|1695815:1704858|1695815_1696334_-|ARH75149.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >CP019594|1695815:1704858|1696355_1698629_-|ARH75150.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDVNHDALQLSDMTKAIDRIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSILPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPMSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCEHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >CP019594|1695815:1704858|1703853_1704858_-|ARH75155.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDAIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >CP019594|1695815:1704858|1701385_1701646_-|ARH75152.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >CP019594|1695815:1704858|1701664_1702804_-|ARH75153.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >CP019594|1695815:1704858|1702826_1703852_-|ARH75154.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSNRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1839793 : 1876438
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP019594|1839793:1876438|DBSCAN-SWA TATGGGCAATCATTTCCAATACGCTTTTGAAAACAAACGTTATCACACATGGAATTACCATTTAAAAAATAAATTTGGACAAAAAATATTTAAAGTTGCATTGGATGGCGGGTTTGACTGTCCTAACCGCGATGGCACTGTAGCACATGGTGGATGTACATTTTGTTCTGCTGCAGGTAGCGGAGACTTTGCAGGTAATCGTGCAGATTCAATCGCAGTACAATTTAAAGAAATTAAGGAAAACATGCATGAGAAATGGCACGAAGGAAAATATATTGCTTATTTTCAGGCATTTACAAATACACATGCACCAGTTGAAGTATTAAAAGAAAAATTCGAACCTGTACTTAAAGAACCGGGTGTTGTGGGATTATCTATTGGTACGCGTCCTGACTGTCTACCAGACGATGTTGTCGAATATTTAGCAGATTTGAATCAACGAACATACTTATGGGTTGAATTAGGACTACAAACAATCCATCAATCAACATCTGATTTAATCAATCGTGCCCATGATATGCAAACGTATTATGATGGTGTGGCAAAATTACGTAAGCATAATATCAATGTATGTACACACATCATTAATGGCTTACCTGGCGAAGACTATGACATGATGATGGCTACTGCCAAAGAAGTTGCACAAATGGATGTACAAGGTATTAAAATTCATTTACTTCATTTGTTAAAAGGTACACCGATGGTAAAACAATACGATAAAGGTTTATTAACTTTTATGACTCAAGAAGAATACACAAACCTAGTTGTGGACCAATTAGAAGTGATTCCCCCTGAAATGATCGTTCACCGAATTACCGGTGATGGTCCAATAGATATCATGGTCGGTCCAATGTGGAGTGTTAATAAATGGGAAGTATTAAATGGCATCGATGCTGAATTAGCACGTAGAAATTCTTATCAAGGCTTGCGTTACAAGTCTAAGGTGAAGCAATGAAATTAGAACGTATACTCCCTTTTTCAAAAACACTTATTAAACAACATATAACACCAGAAAGTATTGTTGTAGACGCAACTTGCGGTAACGGCAATGACACTTTATTTTTAGCCGAACAAGTACCAGAAGGACATGTTTATGGTTTCGACATTCAAGATTTAGCTTTGGAAAATACACGTGATAAAGTTAAGGATTTCAATTATGTTTCTTTAATAAAAGATGGACATGAAAATATTGAACATCATATAAATGATGCACATAAAGGTCATATTGATGCAGCCATCTTTAACCTAGGTTATTTGCCTAAAGGTGATAAATCTATCGTGACAAAGCCTGACACGACAATCCAAGCTATTAAAGCGTTATTATCTTTAATGTCAACGGAAGGTATTATCGTATTAGTTATCTATCATGGTCATAGTGAAGGCCAACTTGAAAAGCAAGCTTTGCTTGATTACTTGAGTAATTTGGATCAAAAGCATGCGCAAGTTTTGCAGTATCAATTTTTAAATCAACGAAATCATGCTCCATTCATTTGTGCCATAGAAAAAATTTCTTAAGTATTTGCTTCACTATTCTATTTATAATTTAGATTGAGTAGTCAACATTTGAAAAATTAATACCAACAACAAAAAGAGGTTTTCATTAAGTTGAAAACCTCTTTTTATGCTATTAAACTTACACAGCAATAATTGCGTTTAAACTATTTTGCATTGCTGTTGCTCTACTTGCAATCGCATCACTGATGAAATTCAACAACTCTACTTTCTCTTGTTGTAACTTTTCATTGAAATGAATAATAACTGTTCTTTCATCGTCAACAGGACGCTCTTTGTAAATCCATTCTAATTCAACTAAATTATTATACGTTCTAGTACGCTTATACGGTTTAACTTCAACAAATCTGTCCATTTCTTTAAGCGTCATAGAACCTTTTTGCCATAAAGTTAGTAAAATTAAAATTTCTTCTCTAGACATTTTGTACTCGCTTTCAATCTCGCTGAAAATTGAGTTAATGTCACCCAAAAGTGTTTCTAATTGCAAAATCCCAAATACAGTATCGTTATTTACTTTTTTCATGCTATACATCTCCCAATTAATAATCACATATTTAGCTACCATACAAGTATTAACAAACATCCCAACAATCCCAAAACTTATATGTGCTAACTTATGCATAAAACTACAAGTGTAAATAAACTTGCTTTCTATTCAATTGTCTAAGTTGAATAAAATTAAATAAGTATAAAAACCAATAATCACTAGAGTTAATATTTAGAAATAAGATAATAGTACATAAAACAAATCACTCTATTACATATTAATTTTATAATTTATATACAAAGAAAATATATCAATATTACCATTAAATTGCAACAATTCTACATATATTTCTTCAAAAAAGATACGCATTGAATTTTTATTACATATAACTCTCATGAAAATTGATTAAACTAAATTAATTAGTAAGCCTTAAATTTAACAAATTAAACCAAACCGAATGAGGCTAAATTGGTTATTTTTCAAGATATGATTTGTATAAATCAAAACATTTCTTACAAATCAAATGTGTATAAAATGTGATATACATTCTCAACCTTAAAAAAGTTTAAAAAAAAGATGAGCATCTACTGTCTCATCTTTTTAGAATATTAAATTTCTACAATTTCGTCATCTTCAACAATAAAGCCCATTGTATTGACGCTATTATTTAAGAAAGTCAGAATATAACGCATTACTTCATCGCGTTCTGGCTCATTGTGAACCTCGTGGTAAAAACCTTGCCAAGCTTTAAAATATAATTCAGGTGTTTGATATTTTTCTTTAAACTCATCAATTGCCCTAGTATCAACAATTAAATCCTTCGTTCCATACATTAATAGTGTTGGCATTGGTTGAATGTCATGAATATGAGCCATCGTATCTTTCATCGTCTCATTAATTGTGTTATACCAATGATACGTTGCTTTTTTTAACATTAAACCATCGTTAACTGTTTCTTCAACAATTTCTAAATTACGTGTTAAATCTTTTGGTTCTACACCAACATTAAAACGTGTGTCTTTTGAAATTTTACCTATATTTGAAACAAGTTTATCTTTACGATTTTTTCCATTCTTTTGAAGTTCTAGCATAGGAGAAATTAACATCATCCCCTCGATTGGCAATTCTACTTTTTCAAGTAAATTTAATAAAATCAAACCGCCAAGTCCTACCCCTAATACATAAGTAGGAATTTTATATTCATTAGCTATCTTTAACCAGTCTAGCAAACTTTCGTGATACGTTTGAAAGTTTTCAATTTGTCCTTTATTAGCTCTTGAAGTTTGACCTTGACCAGGCAAATCTCCCATAATCACATGATAGCCATTTCTTCTTAACATCGTAATAACATATGCATATCTTCCCGTATGTTCTAATATATTATGAGCAATAACAACGACGCCTTTCGCATCATTTTCAGCTTCCCACTTCCACATTATTATACTGCCCCTTTTTCATTAATCTTCAATAACATAATTATAGCAAATTCACTATGTAGATTTCTATTTATAGTATTATTGTTGTCCATATTATTATATACAAATGAAATCAACATCAATAATAGTGTAATTATACATAATTATTTTTGATTGTTTTTGATGAAAACGCTTTCTCGAATATTTTTTTCATGCTAAACTTATTGTAAACACAAGGGTTTGGAGGAGTAGCAATGGCACTATTAAAGAATTTTTTTATCGGATTATCTAATAATAGTTTTTTAAACAACGCAGCAAAAAAAGTGGGCCCACGTTTGGGTGCCAATAAAGTCGTTGCCGGAAATACAATTCCAGAGTTAATTAATACAATCGAATACTTAAATGACAAGAATATCGCTGTTACGGTAGACAATTTAGGGGAATTTGTCGGTACAGTTGAAGAAAGTAATCATGCTAAAGAACAAATTTTAACAATTATGGACGCGCTTCATCAACATGGCGTAAAGGCACATATGTCTGTTAAATTGAGTCAGTTAGGTGCAGAATTCGACTTAGAATTAGCTTACCAAAATTTAAGAGAGATTTTACTTAAAGCAAATACTTACAACAATATGCATATAAATATTGATACTGAAAAATATGCTAGCCTGCAACAAATTGTTCAAGTTTTAGATCGATTAAAAGGCGAATTTAGAAATGTTGGTACTGTAATTCAAGCATATTTATACGATAGCCATGAATTAGTTGATAAGTACCAAGATTTACGATTACGTTTGGTTAAAGGTGCATATAAAGAAAACGAATCAATTGCATTTCAATCTAAGGAAGACGTAGATGCAAATTACATCAAAATAATTGAACAACGTTTGTTAAACGCACGCAATTTCACTTCAATTGCAACACATGACCATCGCATTATTAATCATGTAAAACAATTTATGAAAGAAAATCACATTGAAAAAGATCGTATGGAATTCCAAATGCTCTATGGTTTTAGATCAGAGTTAGCAGAAGAAATCGCAAATGAAGGCTATAATTTCACTATTTATGTACCTTATGGCGATGATTGGTTTGCTTATTTTATGAGAAGATTAGCAGAACGCCCACAAAACCTATCTCTTGCTGTAAAAGAATTTGTGAAACCTGCTGGCTTAAAACGTGTTGGCATAATTGCAGCTTTAGGAGCTACAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCATGGCATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAATCATTTATAAATCTTTGATTATGAACTCACAACAGCACTCTATGCTTATATAGATTTTAATAAATTAGCCATTTCAATTGCACTTACTGCTGCTTCGGCACCTTTATTGCCAGCTTTCGTACCTGCTCTTTCAACAGCTTGTTCAATACTTTCAGTCGTTAAAATACCAAATATGACTGGTACATTAGTTTGATCATTTACTTTAGAAACACCTTTTGCGACTTCATTACAAACATAATCATAATGAG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MKLTAVHFYKYSEPFKSKIVTPKVTLTHRDCLFIEIIDDKGNAYFGECNAFQTDWYDFETIDSVKEALQQWFIDIKNKSFESYEAALELLSPLEDTPAARATVVMALYQMFHTLPSFSVAYGATVSGLSNKQLAALKETKPARIKLKWTPQIIDQIKSLRELNFQFQLVIDANESLTRQDMTQLQLLAHENILYIEEPFKEISMIDEVVAEKTPPIALDEKATSLSAIINLIELYNVKVVVLKPFRLGGIDKVQTAIDTLKSHGVKVVIGGMYEYGLSRYFTAMLARKGDYPGDVTPAGYYFEQDVVAHSGILKEGRLEFRPPLVDITQLQPY >CP019594|1839793:1876438|1855560_1856196_+|ARH75284.1|protease|DBSCAN-SWA MQKFKDLFYDDLSVARGNYFLTLLSAFLITIILLIGFVVSDTHILYGVFIVLIGIVLLRLFKINLLSFKKLTMSQVIYIIGGALLIYGLDYLYLHFHDVPTNEQELDRELQHMPLYMSIVTIAIIPAIVEEIVFRGMIIRVVFRKHLFIGLVVSSLVFASLHESDTWIGYLPYLYSGVIFGLIYLKTKRLEVVILIHFINNLSSLLILLWG >CP019594|1839793:1876438|1876156_1876438_-|ARH75306.1|transposase|DBSCAN-SWA MTRERRSFSSEFKLQMVRLYENGKPRNEIIREYDLTPSALGKWIKQHQNTGTFNHHDNLSDEEKELIKLRKEVQHLKMENDILKQAALIMGQK >CP019594|1839793:1876438|1854389_1854833_+|ARH75282.1|DBSCAN-SWA 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>CP019594|1839793:1876438|1860039_1860873_-|ARH75290.1|DBSCAN-SWA MEVKTFYNGNTMPQIGLGTFRVENDENCMESVKYAIEQGYRSIDTAKVYGNEEQVGAGIRAGLESTGIAREDLFITSKLYFEDFGRENVAAAYEASLSRLGLKYLDLYLVHWPGTNEAIMVDTWKGMEDLYKNNKVKNIGVSNFEPEHLEALLAQVSIKPVINQVEYHPYLTQHKLKLYLAAQHIVMESWSPLMNAQILNDETIKDIAQELGKSPAQVVLRWNVQHGVVTIPKSVTPNRISENFRIFDFELSDEQMTRIDDLNQDKRIGPDPKTFEG >CP019594|1839793:1876438|1852253_1853108_-|ARH75279.1|DBSCAN-SWA MNKHKKGSIFGIIGLVVIFAVVSFLFFSMISDQIFFKHVKSDIKIEKLNVTLNDAAKKQINNYTSQQVSNKKNDAWRDASATEIKSAMDSGTFIDNEKQKYQFLDLSKYQGIDKNRIKRMLVDRPTLLKHTDDFLKAAKDKHVNEVYLISHALLETGAVKSELANGVEIDGKKYYNFYGVGALDKDPIKTGAEYAKKHGWDTPEKAISGGADFIHKHFLSSTDQNTLYSMRWNPKNPGEHQYATDIKWAESNATIIADFYKNMKTEGKYFKYFVYKDDSKHLKK >CP019594|1839793:1876438|1868121_1869600_-|ARH75297.1|DBSCAN-SWA 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MPIESFTHQFEEITYLSDDLQVKALMMTPHHEVKRIVVYLRGGKGQVGRVRAGRLMQFSDSQTLVIGPYYRGNNGSEGKDEFYRGDLNDVTQLLRLLHDKYPQAFIHMVGFSRGGLQGLLTFQDLPVSSYIIWGGVSDIDLMYEERVDLRGMLRRMIGHPKKDRAAYEARQAIPNINENSPPILIVHGGKDQQVGIHHAYYLADQLELKGAAHETFYQMAEGHVPRPPAMVETLTYIKEFMNQVELHR >CP019594|1839793:1876438|1856362_1856983_+|ARH75285.1|protease|DBSCAN-SWA MFSRNNNIFVDDLSVTKDNYLIAVLKMLVIFLVINYGTDVSYDHEYVGLFIILLGVVLLKILNINLLSFKKLKFTHMLYIIFGFLLMYGLDYLYDTFAPPTLNEILIDEESEDAPYHIALLSTAIIPPITEEIICRGLIIRILFRNHLFLGFIVSTVFFTLIHESDTLIGYLPYFYSGLIFGYTYLKTKRLEVPILIHFINNLLAM >CP019594|1839793:1876438|1863682_1865275_+|ARH75293.1|DBSCAN-SWA 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MAKLNVEVFADGADIEEMKAAYKNKQVDGFTTNPSLMAKAGVTDYKAFAEEAVKEIPDASISFEVFADDLETMEKEAAILKQYGENVFVKIPIVNTKGESTIPLIKKLSADNVRLNVTAVYTIEQVKEITEAVTEGVPTYVSVFAGRIADTGVDPLPLMKEAVKVTHSKDGVKLLWASCRELFNVIQADEIGADIITCPADVVKKVNTNLGRDINELSVDTVKGFAKDIQSSGLSIL >CP019594|1839793:1876438|1872997_1873342_+|ARH75301.1|DBSCAN-SWA MITFENIQQLEKYTLMTMHGLFNQLKLGIISIDNAEHTLFTPYMMETLSSLGVKRDIINLIHKGTELEDFAAFNLSIEDTVTVCLQRTEELLNQYKNVEFNDKILINWRIMQEK >CP019594|1839793:1876438|1850560_1850875_+|ARH75277.1|DBSCAN-SWA MTYKELATYLKVLSDSSRLEILDLLSCGELCACDLLEHFQFSQPTLSYHMKALVKTNLVTTRKIGNKHLYQLNHNIFESVINNLSKVHTSNQRCICHNLKTGEC >CP019594|1839793:1876438|1875324_1875708_-|ARH75305.1|DBSCAN-SWA MSNQNLFDELEKKGYKLEDIFTKEEIKKYKAEDQLRAGKTQYVETGKDTATLYLSSAYTKTIAALGAGAISVISALTGGLVGAGVGGFLGSIAASNIDTSKGIYLKLKTKKNAAWEYVLIGEKWGYQ >CP019594|1839793:1876438|1872330_1872957_+|ARH75300.1|DBSCAN-SWA 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>CP019594|1839793:1876438|1853383_1853608_-|ARH75280.1|DBSCAN-SWA MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK >CP019594|1839793:1876438|1859074_1859440_+|ARH75288.1|DBSCAN-SWA MQYVYIFIGGALGALLRYLISFLNTDGGFPIGTLIANLTGAFVMGLLTALTIEFFSNHPTLKKAITTGFLGALTTFSTFQLELIHMFDYQQFITLLLYAVTSYVFGILLCYVGIKLGGGLS >CP019594|1839793:1876438|1853806_1854277_+|ARH75281.1|DBSCAN-SWA MKFNDVYNKHHKIIHHLLKKYNISYNYDEYYQLLLIKMWQLSQIYKPSSNQSLSSFLFMRLNFYLIDLFRQQKRLNDIILCENHSPILTEQPTYFNEYDLRLQDVCALLKHRERQWLMLYLEGYKQYEIADIMSLSTSTIKLIKASVKRKCQRFLN >CP019594|1839793:1876438|1841425_1841827_-|ARH75268.1|DBSCAN-SWA MKKVNNDTVFGILQLETLLGDINSIFSEIESEYKMSREEILILLTLWQKGSMTLKEMDRFVEVKPYKRTRTYNNLVELEWIYKERPVDDERTVIIHFNEKLQQEKVELLNFISDAIASRATAMQNSLNAIIAV >CP019594|1839793:1876438|1845060_1846242_-|ARH75274.1|DBSCAN-SWA MQFDNIDSALMALKNGETIIVVDDENRENEGDLVAVTEWMNDNTINFMAKEARGLICAPVSKDIAQRLDLVQMVDDNSDIFGTQFTVSIDHVDTTTGISAYERTLTAKKLIDPSSEAKDFNRPGHLFPLVAQDKGVLARNGHTEAAVDLAKLTGAKPAGVICEIMNDDGTMAKGQDLQKFKEKHQLKMITIDDLIEYRKKLEPEIEFKAKVKMPTDFGTFDMYGFKATYTDEEIVVLTKGAIRQHENVRLHSACLTGDIFHSQRCDCGAQLESSMKYINEHGGMIIYLPQEGRGIGLLNKLRAYELIEQGYDTVTANLALGFDEDLRDYHIAAQILKYFNIEHINLLSNNPSKFEGLIQYGIDIAERIEVIVPETVHNHDYMETKKIKMGHLI >CP019594|1839793:1876438|1873439_1874012_+|ARH75302.1|DBSCAN-SWA MEKNEYTAKYNEYSQLLDVTYSQAVAYLLNKYGAVTDDYYKEKSYTRFLNGEIKSISKGKYTRASEGLYCHHISEDKFQNLSDLRFISEFKYSYNYQKKENLVYCDLIEHLILHAIITKESNGQFGVAGLCQMIKPTVIDWYIGEYNPKPAWMQATKARAYLPRILVEKLLIKIDDMLKGIEIYDFLESR |
44 | Staphylococcus_phage(90.91%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1979997 : 2064587
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP019594|1979997:2064587|DBSCAN-SWA 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MKFERVQKHFKYKTRHIAGCLITHEHGDHAKYTKQFVDNGVISYMTAGTQQAMNFESHRLCTIKAKQELRIGTWSILPFDIEHDANEPVAFLLQSTLGYKVLYVTDTKYLKYKFNGITHMMLEVNYIYEQMQENIKNGSVHSTLANRIMESHFSLEHAIGMLKANDLTRLEEIHLIHLSSQNSNAKYIKSEIQKVTGAPVYVGGL >CP019594|1979997:2064587|2045217_2045538_-|ARH75484.1|DBSCAN-SWA MPHILNVTVPIPETHVLITKDEYDELIGYSLDPVWNMSDLKKKLKIASDETIKDRLLFHPRFEKELRAQGIVHYPDENFNRWRFNARKMNKFVDEHFNEIYKERIK >CP019594|1979997:2064587|2060349_2060691_-|AXB22708.1|DBSCAN-SWA MLDKISNTLKKKLYQKGETHSGNDNLIIQGYLIAQIGKNYSEEALATKSINGNDLLTLAYEKVLEGASIFGGSYIWIEYEDVDRLREFYRKFGFTEIKDHTSENNLKMAILKI >CP019594|1979997:2064587|2044706_2044967_-|ARH75482.1|DBSCAN-SWA MYYKIGDVCQKVINVDGFDFKLAVKKQDYSILVNVLDLEDRFIDGINITDENDLYTALDILNQSIYEWIEENTDERDRLINLVMRW >CP019594|1979997:2064587|2036148_2036298_-|ARH75467.1|DBSCAN-SWA MVKRILKIWFTIAMYELGKYVTEQVYIMMTANDDVEAPSDYVFRAEVSE >CP019594|1979997:2064587|2026299_2026524_-|ARH75451.1|DBSCAN-SWA MPDSIKTLKVGDTYDLNVVVEPSNQSKLLKYTTDQTNIVSINSDGQVTAEAQGIATVKATVGNMSDTITINVEA >CP019594|1979997:2064587|1990619_1991180_+|ARH75409.1|DBSCAN-SWA MTHRALLVVDYSYDFIADDGLLTCGKPGQNIEDFIVSRINDFNYYQDHIFFLMDLHYLHDIHHPESKLFPPHNIVDTSGRELYGKVGKLYETIKAQPNVHFIDKTRYDSFFGTPLDSLLRERSINQVEIVGVCTDICVLHTAISAYNLGYKISVPAEGVASFNQKGHEWALAHFKNSLGAEVEQHV >CP019594|1979997:2064587|2028939_2030085_-|ARH75458.1|capsid|DBSCAN-SWA MTINLSETFANAKNEFINAVNNGEPQERQNELYGDMINQLFEETKLQAKAEAERVSSLPKSAQSLSANQRSFFMDINKNVNYKEEKLLPEETIDRIFEDLTTNHPLLADLGIKNAGLRLKFLKSETSGVAVWGKIYGEIKGQLDAAFSEETAIQNKLTAFVVLPKDLNDFGPAWIERFVRVQIEEAFAVALETAFLKGTGKDQPIGLNRQVQKGVSVTEGAYPEKEEQGTLTFANPRATVNELTQVFKYHSTNEKGKSVAVKGNVTMVVNPSDAFEVQAQYTHLNANGVYVTALPFNLNVIESTVQEAGKVLTYVKGLYDGYLAGGINVQKFKETLALDDMDLYTAKQFAYGKAKDNKVAAVWKLDLKGHKPALEGTEETL >CP019594|1979997:2064587|2046414_2046612_-|ARH75487.1|DBSCAN-SWA MQAQNKKVIYYYYDEEGNRRPVNIQYNDGYDLMIDPRFIEMTLERHPHLKNNFYGLIDGKEFKLD >CP019594|1979997:2064587|2038872_2039277_-|ARH75474.1|DBSCAN-SWA MEIEIKFNEVFNAPMGSPRPRFRKTGRYAHTYMPTKYTEHKKYLQNQMPKLNLENALKIELEFYFPLLKSWSKKKKSEMVGQYKVTKPDIDNLIKTVLDACNGHVWKDDNQITEITSSKRYGIEPKIIIRIEEI >CP019594|1979997:2064587|2051387_2051570_+|ARH75496.1|DBSCAN-SWA MKITNCKIKRETVIYEVLTSGNQPFTYELPKDLSSHNARKYLEFISQKLDGDKLTKEDSL >CP019594|1979997:2064587|2042482_2044426_-|ARH75480.1|DBSCAN-SWA MKINKLTISNFAGIKEVTFNFDGKDAKIYGNNATGKTTTATALQWLLFDKGLDGSTKSFNPVPLNEKNEENYELIPTVFAEFEIDGKITTFKKESHPKYTINQKTNRKEYSRSRTKKQYINDESIKVKDYKARIDELIDEDVFKLITNPQAFNLLDWKKRRSLLFEIAKPINDEDVIKTNDDFKELNNILGDHEIETKKKILTDKIKQINKDIKDIPIRINQTQQNKQDVPEFDNDRYAIIKQEIEQLENERIDIQNGKEEINLRNQLADKQSELKRIEDNNSASNENKIHALTNELHVENGTVANLKTRLKQNKQQITHEENRRNQLLENHKGLKSDLEKAKNQKFEYLDDNVCSCCGQQLPAEQVNEAREKALQKFNAGKSKELETIQTSINHIISEGKKIKPIIEKLEDDNNNLQIKINEAEERSARIQNKINKLKTTHVDVTQTDEYKAVMLEINEINQKRSNIRKTIQDKVSGIDDKISELTQEKSEIEVSRSIEKSNKHLDDVISELRNEEDRLLDEKEKYSHDLYILKEFTTTKVKMLTENINNEFEIAEFKLFNTLVNGELEETCSTTVNGVEYDSGLNNASRINVGLDIINTLSKHFKVTAPIFIDNAESVTELIKTESQQIQLIVNEQDKKLRMETI >CP019594|1979997:2064587|2013454_2014210_-|ARH75440.1|DBSCAN-SWA MKTYSEARARLRWYQGRYIDFDGWYGYQCADLAVDYIYWLLEIRMWGNAKDAINNDFKNMATVYENTPSFVPQIGDVAVFTKGIYKQYGHIGLVFNGGNTNQFLILEQNYDGNANTPAKLRWDNYYGCTHFIRPKYKSEGLMNKITNKVKPPAQKAVGKSASKITVGSKAPYNLKWSKGAYFNAKIDGLGATSATRYGDNRTNYRFDVGQAVYAPGTLIYVFEIIDGWCRIYWNNHNEWIWHERLIVKEVF >CP019594|1979997:2064587|2036950_2037460_-|ARH75469.1|DBSCAN-SWA MTNTLQVKLLSKDARMPERNHKTDAGYDIFSAETVVLEPQEKAVIKTDVAVSIPEGYVGLLTSRSGVSSKTHLVIETGKIDAGYHGNLGINIKNDAIASNGYITPGVFDIKGEIDLSDAIRQYGTYQINEGDKLAQLVIVPIWTPELKQVEEFESVSERGAKGFGSSGV >CP019594|1979997:2064587|2000284_2001025_-|ARH75421.1|DBSCAN-SWA MRILNLVKYDFYSIFKSPLTYLAILVVSSLIATQSILMANSMDNPKHIIVYGSVFAAAKWLLLIIGLMFVVKTITRDFSQGTIQLYMSKVKTRVGYIISKTISIILISILFALIHYVILIVVQASSNGKNLAFSKYVDNLWFFLIFLLFFGLFLFLITLASQKTAMIFSLGVFLVLIVPFIKPFITFIPRYGDKVLDAFDYIPFAYLTDKMISSNFDFSNWQWVISLGSIVIFFILNILYVAKKDI |
108 | Staphylococcus_phage(84.62%) | transposase,protease,head,tail,holin,terminase,portal,capsid,integrase | attL 2028261:2028278|attR 2054450:2054467 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019594.2|ARH75280.1|1853383_1853608_-|hypothetical-protein |
1853383_1853608_-
Protein sequences of CP019594.2|ARH75280.1|1853383_1853608_-|hypothetical-protein>CP019594.2|ARH75280.1|1853383_1853608_-|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK |
74 aa aa | NA |
LuxR_C_like
LuxR_C_like HTH domain information
|
NA | 1839793-1876438 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder matches to CP019594 position: 1857281-1857251, mismatch: 1 tttcttttcgaaattctctgtgttggggccc CRISPR spacer tttcttgtcgaaattctctgtgttggggccc Protospacer ****** ************************ 2. spacer 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR matches to CP019594 position: 1857269-1857293, mismatch: 2 tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcgacaagaaattctacaagcaa Protospacer ****** **************.*** |
|||||||||||||||||||||||||
CP019594.2|ARH75426.1|2004105_2004282_-|hypothetical-protein |
2004105_2004282_-
Protein sequences of CP019594.2|ARH75426.1|2004105_2004282_-|hypothetical-protein>CP019594.2|ARH75426.1|2004105_2004282_-|hypothetical-protein MKHLTKIFVALAIILFIVGYYLQATNHESQGIKLLLAAIMFMICAFISRSNDRRKNNK |
58 aa aa | NA |
WHTH_GntR
WHTH_GntR HTH domain information
|
NA | 1979997-2064587 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder matches to CP019594 position: 2058372-2058402, mismatch: 0 tttcttttcgaaattctctgtgttggggccc CRISPR spacer tttcttttcgaaattctctgtgttggggccc Protospacer ******************************* 2. spacer 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR matches to CP019594 position: 2058384-2058360, mismatch: 0 tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaaacaa Protospacer ************************* |
|||||||||||||||||||||||||
CP019594.2|ARH75427.1|2004523_2004622_-|hypothetical-protein |
2004523_2004622_-
Protein sequences of CP019594.2|ARH75427.1|2004523_2004622_-|hypothetical-protein>CP019594.2|ARH75427.1|2004523_2004622_-|hypothetical-protein MMWWQEGMMTLITGGLLIIFRLWLELKWKNKK |
32 aa aa | NA |
WHTH_GntR
WHTH_GntR HTH domain information
|
NA | 1979997-2064587 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder matches to CP019594 position: 2058372-2058402, mismatch: 0 tttcttttcgaaattctctgtgttggggccc CRISPR spacer tttcttttcgaaattctctgtgttggggccc Protospacer ******************************* 2. spacer 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR matches to CP019594 position: 2058384-2058360, mismatch: 0 tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaaacaa Protospacer ************************* |
|||||||||||||||||||||||||
CP019594.2|ARH75490.1|2048002_2048263_-|transcriptional-regulator |
2048002_2048263_-
Protein sequences of CP019594.2|ARH75490.1|2048002_2048263_-|transcriptional-regulator>CP019594.2|ARH75490.1|2048002_2048263_-|transcriptional-regulator MEQITLTKEECVEQCINKDLKLLDYRVQQILEGVLSESTTYGDARNKLETLKIIAESHFKTEHASVIYKLALKKLDEKINATPIKE |
86 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1979997-2064587 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.1|774883|31|CP019594|CRISPRCasFinder matches to CP019594 position: 2058372-2058402, mismatch: 0 tttcttttcgaaattctctgtgttggggccc CRISPR spacer tttcttttcgaaattctctgtgttggggccc Protospacer ******************************* 2. spacer 5.1|1766505|25|CP019594|PILER-CR matches to CP019594 position: 2058384-2058360, mismatch: 0 tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaaacaa Protospacer ************************* |