Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024096 | Bacillus cytotoxicus strain CH_39 chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas3,csa3,DinG,cas2,cas1,cas9,cas14j,cas4,cas5,cas7,cas8b2,cas6,DEDDh,WYL | 3 | 15 | 11 | 1 |
CP024097 | Bacillus cytotoxicus strain CH_39 plasmid pCh39_83, complete sequence | 0 crisprs | TnsE_C | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024096_1 | 1597621-1597749 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP024096_1
|
1 spacers
spacers of CP024096_1
>1.1|1597659|53|CP024096|CRISPRCasFinder TATTTGCGTAGGGGCGTTTTTTATTGAAGGTCCTACTGTCGTTGTGTCTTCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024096_1
The CRISPR arrays of CP024096_1 >merge|CP024096|1|1597621-1597749|CRISPRCasFinder AACTAGGGTGGTACCGCGATGTTTTAATCGTCCCTACGTATTTGCGTAGGGGCGTTTTTTATTGAAGGTCCTACTGTCGTTGTGTCTTCATAACTAGGGTGGTACCGCGATATTTTAATCGTCCCTACG >CP024096|1|1|1597621-1597749|CRISPRCasFinder AACTAGGGTGGTACCGCGATGTTTTAATCGTCCCTACG TATTTGCGTAGGGGCGTTTTTTATTGAAGGTCCTACTGTCGTTGTGTCTTCAT AACTAGGGTGGTACCGCGATATTTTAATCGTCCCTACG
>CP024096.1|AWC64698.1|1595577_1597212_-|polysaccharide-biosynthesis-protein MSTSKVLKGTALLSGATMISRILGFIYFFPFQLLVGTQGVALYGYAYSWYGILLSFSTAGIPIAVSKFVAKYNALGDYSTSKKLYNSSVKLMLLMGFSGFFILFIGAPYISQFIIRSKAPDPKFIADVTLTMRALSFALIIVPAMSVTRGYFQGFQHMKPSAVSQVVEQIARVVFILAGSFVVTKLLGGSVASSVAVATFGAAVGAIASVSILIMYWKKYNHLKPPKGELKSRASTLPLKSIYMELLRYAIPIVFVGIAIPLYTLVDQYTVADALRALGEPLTTANAVFAYIANYAQKLIMIPASLATGFSLTIIPAITKSFTSGKQEELQEQITKIFQVLLFFTIPAAFGLASIAYDTFRMVYVSHDIAVGGSQYLISYAPSAVLSAIFTVSAAILQGIDYQRKTMIAFSVGILVKLIVNTPLLYVLGGHGAVLGTILGYLVSDAIMLYCIVKFAKFDIKETIKTVCLIIIYSGAMSAIVMALKAMIGWFIPGQSYIESLLIVIICGVVGGFVYLLFVLTSGLASRILGNRIQRLPILGKFIK >CP024096.1|AWC64697.1|1594590_1595508_+|cysteine-synthase-A MKLCKNVTELIGDTPVVRLSKFVPKDAADVYVKLEMFNPSRSVKDRAAYHLIHVAEEQGFIQPGDTIIEPTSGNTGIGLAMNAAAKGYKAILIMPDNMSKERMNLLKAYGAEVILTPAEQRMPGAIAKAIELQKQIPNSFIPQQFENPANPNIHRYTTALEIYEQMEGKLDAFVATAGTGGTITGTGETLKEKLPNLHIVVVEPKGSPVLSGGVPGPHKLVGTSPGFIPKNLNTEIYNEIIQIADEEALSTMRNLAKQEGLLVGPSSGASVYAAIMIAKRLGAGKKVLCIAPDTGERYLSMGLFE >CP024096.1|AWC64696.1|1593366_1594575_+|MFS-transporter MQAISKENVVTTPTIYRILFAISFGHFLNDSMQAVVPALFPILEKTMNLSYMQVGWIAFALNMTSSVMQPVFGMYSDKKPSPFLLPLGMFSSMLGMIGLAFAPNFIIVIISVLFIGLGSAVFHPEGARVAYMASGTKRGLAQAIYQVGGNTGNSLAPIFTAVIFVPLGQKGSLGFTAFAAVGILLLMYVSKWYKNELVSGAVKSKKRAALEAENAIVSAHIKFVIVLLIFLTFVRSWYGAGIGNFYQFYLIEHYGLSIKNAQYFVFAFMISGVLGTFFGGPLADRFGKKNIIVFSMLGSAPLALLLPHVSLLWVVPLFLCIGFISSSSFSVIVVYAQELVPGKVGMVSGLIVGLAFGLGALGAVVLGKLADIYSLQFIMVLCSCLPLIGLTSWLLPSDKKSV >CP024096.1|AWC64695.1|1591508_1593149_-|peptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKKTKRVAVLSLTLSLVLTACGQKQETTTNKDEKKVATKQILNIVETGEISTLDSSIATDGFSYAALNNVMEGLYMPGPGNKPVPGAAESYTLSEDGKTYIFKLRHSNWSNGDPVTAHDFEYAWKRAINPETASEYAHIMFDIKNAEKVNKKALPLDSFGVKALDDKTLEVQLEHPVPYFLGLMGFATFYPQNQKVVEAQGTNYGLEAANAVYNGPFVLNEWKHDTSYKMTKNPNYWDHKNVKLQEINVNIVKDTSAAVNLFESKQVDRITINSEFVDKYQNDPSLKKMARPSVTFFRLNQKNPLLANKNARKAISLSFDKKGITTTILNNGSIPANAFIPKGFVKGPDNKDFRSTSNVKVETSIKEAKKQWETAKKETNLQNVSLSIISTDESNDKKISEYLKGELEKNLPGLKITLNPLPVKAFLEREGNGDFEISLSTWGPDYPDPTTFLNMFVTDGPFNKMNYSNKQYDELMEKASSSLTTDLPARWKAFQDAEKILVEDDAAIAPIFQAGLIYLERPSVKGVVVRPFAGIYSYKWAYITE >CP024096.1|AWC64694.1|1589837_1591406_+|Vga-family-ABC-F-type-ribosomal-protection-protein MLLLEANRIKYYIQDRLLLDIDQLQIHQNARIGLVGRNGSGKTTLFQILAKEIVPEEGSIVQRARCELLPQLKQTDTTKSGGEVTQEYIQKAVLKDPELLLADEPTTNLDTGHIEWLEKKLGNWKGAFVIISHDRAFLDALCTTIWELDEGKIKVYTGNYSEYVKQKEIERQQEQLAYEKYEKKKKQLEEAVKLKEKKAERATKTPKKEGKLEPKITKPYFAKKQKKLQKTATAMITRLEKLGKVEKVKELPPLKMDLPNAETFKNRIILRVNDRIGKVGKRVLWKKASFHIRGGDKLAIIGANGSGKTTLVKQIMNQEYGIRFSPAVKVGYFSQNLNILDPAKSIIENVQSSSKQNETLIRTVLARMHFFREDVYKLVEVLSGGERVKVALTKLFLSDINTLILDEPTNFLDMTAVEALESLLKEYEGSVIFVSHDRRFIENIATRILTIHNQELGLFEGTYQQYKRTQVQQAQERKKDTRLLLETKLSEVLSRLSIEPSEKLEREFEKLLQEKRELDASE >CP024096.1|AWC64693.1|1588246_1589506_+|GTPase-HflX MEEFVQRAILVGVNLGHESDFQYSMEELANLAEACDVEVVGQVTQNLQRVNPSHYIGTGKIGEVAAYVKEVDANIVIFNDELSPSQIRNLEKDLDCKVIDRTILILDIFAQRAKTKEAQLQVEVAHLQYMMPRLVGLRESLGRQSGGVGTKNKGVGEKKLELDRRKIEEQISVLNKELEALVVQRKTQRKQRKKNEIPVVALVGYTNAGKSTTMNAMLEIFNGTIEKQVFEKDMLFATLETSVRNIELPDNKSFLLTDTVGFVSKLPHHLVKAFRSTLEEVAEADLLIHVVDYSNPNYEQLIEITNQTLKQIGVENIPTIYAYNKSDMMDVEIPKTKKDRVYLSAKKQIGMEELVEMIRSHIYKEYTKCEMLIPYDQGQIVSYFNEYAHVICTSYENEGTKLSLECKISDFEKYKRFAI >CP024096.1|AWC64692.1|1585964_1586429_-|hypothetical-protein MKRKIFFLLTLLCIVLPIQVSAFTFQELPVASKSKQWYIEIDKSYNSNKQARQPKQGVYDTYSLFVKNIGKDVSNVSIEIVGNDPSAKTTFKPTVPHTNVSKSHTSFDYMVFPLYFTSHTFKVVMTWEEKEFTYNGHPESKSKKMKQTFIFTEE >CP024096.1|AWC64691.1|1584532_1585909_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKKVISNVLAMTAALQVIMVPTTSFAAEKGFSDVPKSHWAYEAINDLANRNIIAGYDNGKFGLGDSVTREQVAALIYRALKPEAKAEYKNPYHDVSASTTMFPNEILALTEMGIFTGDENKNFRPKDSLTRAEMAMILQRAYHLKVKANHTFHDVDPNSWAKDAISALQSNGMAEGDGTGAFYPSKTVTREEYAQFLFNAEQSYLNLDLTLASNVTAEEIDNFLKKSRSDSPLIGHGQDFIAAQNEHGVNALYLAAHAILESGYGRSEIAYRKHNLFGLRAYDRDPFYHAKYLPTYRDSISYNANYVRERYLEKGAIYYNGPTLVGMNVKYASDPEWAGKIAGLMERIKPFDRNDYKNANRLPKNPHTLDVEALGNEIPYKDLGNREIAVQASGKYYKVPYPYDLKIKSIPDITQNEMGTLTNGSKVTVHREDPNGWVEFSMKDKQEKYWTLKSNLKM >CP024096.1|AWC67195.1|1583775_1583964_-|hypothetical-protein MPKSINFSAFIDWDCFRIETELSYIQTCIYEELSTKKRYHVYTDIPFLAIFLLAPFSVSLFL >CP024096.1|AWC64690.1|1582401_1583634_-|aspartate-kinase METIVQKFGGTSVGNIQRIQHVANLMIEEYEKGHNVVTVVSAMGKSTDKLVALATSITENPSKRELDMLLTTGEQVTISLLTMALQTKGYQAISLTGWQAGITTEPVHGNARITDIHTERIQSYLQEGTIVIVAGFQGLSEEKEITTLGRGGSDTTAVALAAALKAKKCDIYTDVTGVYTTDPRVVNNAYKLDEISYDEMLELANLGAGVLHPRAVEFAKNHNVVLEVRSSMEQENGTIVRGECNMEQQSIVKGIAFEDNITRVTIKGLEHDSLSTIFSTLAEAHINVDIIIQSITNEGTVHLSFSIHSNDLRETLEALKQNQETLHYESVEYENHLAKVSIVGSGMVSNPGVAAHMFSTLKEENIHVKMVSTSEIKISVVIDRLHLVDGVEALHQAFMTKVEPLVQMNK >CP024096.1|AWC64699.1|1597852_1599190_+|sodium-dependent-transporter MNSPQWTSKLGFVLAAAGSAIGLGAIWKFPYMAGIGGGGAFFLIFIGFTLLIGLPLLLAEFVIGRSTQKEAVDAYRQIAPKTLWPWLGKLGVVTCFILLSFYSVVGGWILLYLWNAITGRLWEGNGAYEATFGEIISNPYLAVGSQLLFILMTIFIVSKGVQNGVEKVNKYFMPALFVLFFILIIRALTLDGAGEGVRFFLQPDFSNVTSEIILYAMGQSFFSLSVGVAVMVTYSSYLPKEESLPRSAFSIVGLTLMITLLAGLAIFPVVFAFGMEPSQGPGLLFIVLPAIFSKMAFGKVFFVIFLLLFFFATVTSAISMLEISVASLTAKGNGRREKFAIIVGLLIFVVGIPSALSYGVLSDFKVFGKTVFDLADFAVSNVLMPLGVLLVSIFVPLKMKKDVLMRELGVSKHKGYTLFILWLFLLRYIAPVAIIIVFLNVIGVI >CP024096.1|AWC64700.1|1599461_1599728_+|hypothetical-protein MGYVKATAVLPESLIAEIQKYVQGETIYIPKQETEHYKWGTRSGGRKQIDMRNRKIKEAFENGIAIYQLAEEYFLSVETIKKIVYSKS >CP024096.1|AWC64701.1|1599867_1600506_+|elongation-factor-G-binding-protein MEAFIRSDQYNFIKSQTHILVHGHATANDRGVITALKSLAIEKVLHAFENLNSEQKELIETILAVENREDAEAFLLKLNPYVIPFQEVTPQALKKLFPKVKKLKLPEMEEVNMKEMSYLGWTDKGTGKRFIIAKKNNKLVGVQGTFQSINKKGICALCHGHEEVGMFLVEIKGDVPGTFVKKGNYICQDSIACNQNMTSLDKLHDFIERLKK >CP024096.1|AWC64702.1|1600567_1601959_-|transposase MFYNQKNLEITQNRKFYEAMYDQDHHLVRIEKEMNWNIVYTLVKPFYQSPVGRPSVDPLIIVKILLIQYVEGFRSVRFTCKQVKQNATYRWFLGIFPHANIPCHSTISKFLTHRIQGSSIWEDLFDHILHQIQKDGFLSRDIWIADETELKANANKRKREVWIQEVEVKEDFYTLEKGNKRRIEKGKKPFLPRPTKIETKRILKSPTDPDARLSVKHDARGRFAYFEHRMVDGLHNFIIDTHITPANVPGHRILRKRIECTKERLGYIPKEIALDAGYYNARLAEGLFQNNLFSYISYRRYASKEHPECKKNQFKQVHEDLYACPCGIPFSYKTTTRNGYHEYKPEKGSCTGCPFAKKTDRVLRISVHEEIYHKLRWQRLSDRGKILRFVRPSTVELSFAQSKELHGFRFARYRGVQKVTIQALLTAIIQNLIKWTKLLSLKEVGLYLTYQISDEIESETVTF >CP024096.1|AWC64703.1|1602081_1602618_-|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase MSKKTFELATFAGGCFWCMVKPFDELPGIQKVVSGYTGGHISNPTYEQVKSGTSGHLEVVQITFDPSIFPYQKLLDLYWSQIDPTDDDGQFFDRGPSYRTAIFYHNETQKELAEKSKQLLATSGIFNEPIVTEIRPAAPFYEAEEYHQHFYKKNPKKYAQERKESGREDFIKTNWQKK >CP024096.1|AWC64704.1|1603536_1604436_+|branched-chain-amino-acid-aminotransferase MKKQYIYMNGELVEKEKAVVSVYDHGFLYGDGVFEGIRSYGGNVFCLKEHVKRLYESAKSILLTIPMTVEEMEKAVVQTLQKNGYADAYIRLIVSRGKGDLGLDPRSCEKPSVIIIAEQLKLFPQEFYDNGLSVVSVASRRNMPDALDPRIKSMNYLNNVLVKIEAAQAGALEALMLNQQGYVCEGSGDNVFVVKDGKVVTPPSYLGALEGVTRNSVIELCDKLGIPCEERPFTRHDVYVADEVFLTGTAAELIPVVKVDAREIGDGKPGEVTKQLTEAFKRLTRERGVRVPGLAESLA >CP024096.1|AWC64705.1|1604933_1605032_+|hypothetical-protein MLVNKVYKFRIYPNKGQEILKQVVDVLQVNTS >CP024096.1|AWC64706.1|1605366_1607040_+|dihydroxy-acid-dehydratase MRSDMIKKGFDKAPHRSLLKATGLKDEDFHKPFVAICNSFIEIIPGHKHLNEFGRLVKEAVRAAGMVPFEFNTIGVDDGIAMGHIGMRYSLPSREIIADSVETVVNAHWFDGMICIPNCDKITPGMMMAAMRINIPTVFVSGGPMAAGKTSKGEVVDLSSVFEGVGAYQSGKISEEELKDIEDHGCPSCGSCSGMFTANSMNCLCEVLGLALPGNGSILATDSRREQLIQRAAESLKILMERDIKPRDIVTEEAIDDAFALDMAMGGSTNTVLHTLAIAQEAGLDYDMNRIDVVSRKVPHLCKVSPASNWHMEDIDRAGGMSAILKELSRKEGVLHLDRITVTGKTLRENIADAEIQDKEVIHSLENPHSQEGGLRILKGNLAKDGAVIKSGATEVKRFEGPCVIFNSQDEALAGIMLGKVKKGDVVVIRYEGPRGGPGMPEMLAPTSAIAGMGLGADVALLTDGRFSGASRGISVGHISPEAAAGGEIALLQQGDIVCIDVEERLLEVKVSDEELAKRRKEWKRPEPKVKTGWLGRYAQMVTSANTGAVLKMQNFD >CP024096.1|AWC64707.1|1607073_1608336_+|threonine-dehydratase MVHKVKERVKIEDILMAHNCLKDIVNKTPLQRDAVLSEKYKCEVYVKREDLQVIRSFKIRGAYNLIQSLSKEKLQNGVVCASAGNHAQGVAYTCNLLEIPANIFMPTTTPKQKVSQVKFFGGDVADIVLVGDTFDSSFQEAQRYCEENGMTFVHPFDDPHVIAGQGTVAVEILHDTEKTIDYVFTAIGGGGLASGIGTYVKGVSPNTKVIGVEPKGAASMKEAFLQNENVTLEMIDSFVDGAAVKKVGKLTFETCKDVLDDIVLVPEGKICTTILELYKKNAIVAEPAGALSIAALDFYKDEIKGKTVVCVLSGGNNDIDRMQEMKERSLIYEGIKHYFIIQFPQRSGALREFLDKGLGPEDDITRFEYIKKHNKENGPALVGVELKHKEDYEPLIARFKENHIQFLELNKNPVLFDLLT >CP024096.1|AWC64708.1|1608557_1609277_+|DUF554-domain-containing-protein MVILGAIVNGICIIIGTLLGKVLSNIPESMKGTVMHAIGLAVTVLGLRMGMKSEIFLIVILSLVIGAVVGEWLCLEEKLQKLGNWLEKKVGSKGEGSISVGFVTATLIFAIGAMGVLGALDSGIRGNHNVLYTKAIIDGFISLILTTTLGIGVLFSAVPVILYEGGIALFATKIDRFVPEQLMNQFIIEMTATGGIMIFAIGLNLLGFIKIKVANLLPGILVVGMIVSIIYGYNLFLLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP024096_2 | 2100402-2101095 | orTypeII |
NA
Consensus repeat of CP024096_2
|
10 spacers
spacers of CP024096_2
>2.1|2100438|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGATGTTTATCCATCCACTCTTCGACAA >2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTTTGGGTTGCCGATGTAGAAGTAAAAA >2.3|2100570|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACAAAAAGTGACTGAGGGGGCTTATAAC >2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTGCAAGCAATCAAAAAAGGTGCAATTGA >2.5|2100701|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAAAATTTCGGTAATGTAAAGGTGTTTAG >2.6|2100767|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAGCACGTCTTTATTACAGGACAAACGGG >2.7|2100833|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCCAATCGATGTATGGTGTGAGGAAGCT >2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAGCAATCTAAAGCTATCATGTAGTATA >2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGTCTTCCTCTACTTTTGGTTTCGGTGG >2.10|2101030|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAATGATGTTGATAAGTTGCCCCGCATA |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024096_2
The CRISPR arrays of CP024096_2 >merge|CP024096|2|2100402-2101095|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTTCGATGTTTATCCATCCACTCTTCGACAAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTGTTTTGGGTTGCCGATGTAGAAGTAAAAAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTACAAAAAGTGACTGAGGGGGCTTATAACGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATAGTGCAAGCAATCAAAAAAGGTGCAATTGAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTGAAAATTTCGGTAATGTAAAGGTGTTTAGGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTCAGCACGTCTTTATTACAGGACAAACGGGGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATATTCCAATCGATGTATGGTGTGAGGAAGCTGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATGGTAGCAATCTAAAGCTATCATGTAGTATAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTCGTCTTCCTCTACTTTTGGTTTCGGTGGGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTTTAATGATGTTGATAAGTTGCCCCGCATAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT >CP024096|2|1|2100402-2101095|PILER-CR GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTCGATGTTTATCCATCCACTCTTCGACAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGTTTTGGGTTGCCGATGTAGAAGTAAAAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TACAAAAAGTGACTGAGGGGGCTTATAAC GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT AGTGCAAGCAATCAAAAAAGGTGCAATTGA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGAAAATTTCGGTAATGTAAAGGTGTTTAG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCAGCACGTCTTTATTACAGGACAAACGGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT ATTCCAATCGATGTATGGTGTGAGGAAGCT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT GGTAGCAATCTAAAGCTATCATGTAGTATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCGTCTTCCTCTACTTTTGGTTTCGGTGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTTAATGATGTTGATAAGTTGCCCCGCATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT >CP024096|2|2|2100402-2101095|CRISPRCasFinder GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTCGATGTTTATCCATCCACTCTTCGACAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGTTTTGGGTTGCCGATGTAGAAGTAAAAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TACAAAAAGTGACTGAGGGGGCTTATAAC GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT AGTGCAAGCAATCAAAAAAGGTGCAATTGA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGAAAATTTCGGTAATGTAAAGGTGTTTAG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCAGCACGTCTTTATTACAGGACAAACGGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT ATTCCAATCGATGTATGGTGTGAGGAAGCT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT GGTAGCAATCTAAAGCTATCATGTAGTATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCGTCTTCCTCTACTTTTGGTTTCGGTGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTTAATGATGTTGATAAGTTGCCCCGCATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT >CP024096|2|1|2100402-2101095|CRT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTCGATGTTTATCCATCCACTCTTCGACAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGTTTTGGGTTGCCGATGTAGAAGTAAAAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TACAAAAAGTGACTGAGGGGGCTTATAAC GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT AGTGCAAGCAATCAAAAAAGGTGCAATTGA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGAAAATTTCGGTAATGTAAAGGTGTTTAG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCAGCACGTCTTTATTACAGGACAAACGGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT ATTCCAATCGATGTATGGTGTGAGGAAGCT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT GGTAGCAATCTAAAGCTATCATGTAGTATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCGTCTTCCTCTACTTTTGGTTTCGGTGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTTAATGATGTTGATAAGTTGCCCCGCATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT
>CP024096.1|AWC65119.1|2100133_2100298_-|hypothetical-protein MGQFSVTKVGQIWLTIYKYLIGWCGYNALSDTPSICKERDKWIRRRLRMVIWKQ >CP024096.1|AWC65118.1|2098730_2099795_-|tetratricopeptide-repeat-protein MDANVITNTQITKQLNEWYQVMRAQHVLKARQLKKEIDTNLYQIEENPDSFIYYSLLDFRYNMLIGNFDCNLATTPVKKDVFLQYYYHFFKFIYAMETGNYNDAKEHHDYADELLKDISDVYEKAEFHYRTALYYYYIDQPILSIRYATKAKDFFSKNVGYEVKTAACENVLGISCIALKQFEAAEEYLLAAINTFKKQSEEDSVLKVKYNLGLLYADQNLSELAIRYLLDAFEDEEHDYKTMFLLAREHLKLGKSEIAKTYIEKGLKASTKEYYYHFSILQNMYSEHSLEKVESVVNEGVSYFKQQSLWGYVQEYAEALAVKLYNEKEEMKSNQYFYMSYEAKKILEEKGALK >CP024096.1|AWC65117.1|2097123_2097426_-|hypothetical-protein MKKSKAERKRDLEIVNLYHKKLTEEELEKLSVKFIEWKEGKLPYCELTEHIHECHKKNQIIWTRFHNMNDEFLIFQAKKELNLFSERDMEKEQYKRWNTF >CP024096.1|AWC65116.1|2096514_2097048_-|hypothetical-protein MQLIQCTKKLADMMELKTEKVDQRESNNLHSWHANLFTINRKKCVIVMNNVTRYHFIIYGVTKKDLRNFEALFQKNLVTNLLSDGVEPEVIEHYVKSSSPMQYAATNNRSILSQMNDAVFMVDHYFYAELVEKQKPFINIEKLNQNLNKTVMLKIPKYPADMMRDALNQHLIMSKNE >CP024096.1|AWC65115.1|2095497_2096502_-|hypothetical-protein MRDQLRKIIDNMSEEEVKSLLRLVLLQLELVAEHRDEEMIHMVAEISKQLIESQKPTLHIKDSEHVHIAFGDSSAGCLKHTLKKEGFHQDYVISLSDIFSVGPIFHLDDRKGQVARQEWLSSNLSTGDFYFEEEYLPRFLSSLEEMRSISQDTSVTIWKADNAHEHVGLCFALAMLKDKKNIRIIDASEAQKELLNKEYDICGTGELAPEDIAVILEQYKEKECLKEEARADLTKEWNALSTNTALLRIWKDGTVHSVVEDYFDEYIVRCAKEIGADKGFSKAAHVIGEVLGRVEQLVGDVFLEYRLQTLIKQNIFQAKGSLKAMRYYSVKLNR >CP024096.1|AWC65114.1|2094932_2095343_-|hypothetical-protein MYNYPNYPGIGYDQTMYSQYQGYGEEAMEPRESDYEEYRPDDAEDAPTSPPPSQAPSVPSTFASPVQSSNIRSWVCNCLGRWGYLRLHRPGPFGRDLWFFPTEVRRGGVSGYTWQAGRRRKVSYRYQQISNFMCFA >CP024096.1|AWC65113.1|2093543_2094779_-|cytochrome-P450 MSVKNKVGRNIKDGIKLASPEFKEYAYEIYKESRKLQPILFVYKGELGTEWLITRYEDALSLLKDSRLKKNPENIFSQEKLKSLFSIENSDYLTKHMLNADPPDHNRLRALVQKTFTPKMISQLHNRIQHIADTLLDHVEQKRSFHFIRDFSFPLPIIVISEMLGIPKEDQAKFRIWSHAVIDSPEIPEEKIENEEKLSEFITYLQYLVDLKRKEPKEDLISRLIQAESEGGQLSAAELYSMIMLLIVAGHETTVNLMTNTVLALLENPDQLQLLKERPELIDSAIEEGLRYYSPVEVTTARWAAEPFHIHDKVIQKGDMVTISLASANRDETVFVNPDVFNITRENNRHIAFGHGGHFCLGAPLARLEAKIAIATLLKRMPRLRIKGKREDIKWEGNYLMRSLKELPLTF >CP024096.1|AWC65112.1|2091988_2093272_-|MFS-transporter MSVSAETNPKVGMSQVLKNRFVQGILISALCLQIGIWVRNFAVLLYVMEMTKGNAFAISMISVAEFAPIFIFSFIGGTFADRWKPRKTMIWCEALSSLSVFAVLLTLMFGTWKVVFFVTLISAILSQFSQPSGMKLFKQHLSAEEIQLAMSLYQTTFAIFMILGPILGTFVFQSFGIYISIVVTGVAFLLAAIVLLFLPKDVEMHAEKKQVSLLQEMADGIKYVLGKKALTLLGICFMAAGLGIGLIQPLGIFIVTEQLGLSKESLQWLLTVNGAGMIIGGALAMIFAKNVAPQKMLMIGLLAQAIGIGVIGFSTNLWITLTAQLFSGLALPCIQIGINTLIIQNSDTDFIGRVNGILSPLFTGSMVLTMSIAGSLKEMFSLSMLYEGTAVLFIVGLFVILPIYHLKPAVRAENQPAKEGSAIQQES >CP024096.1|AWC65111.1|2091760_2091916_-|DUF1540-domain-containing-protein MAQDVLCEVNNCKYWGNGNKCNADAIYVVSHKGKQASKTEETDCKTFTPEA >CP024096.1|AWC65110.1|2090911_2091490_-|cysteine-dioxygenase MLTCRKSELFQQFIHNVTASIENSKNEETIVCTIEKLLEKLLETKAWLPLEKQKANRNQYARHLLYKDPLDRFEVLALVWRDGQATPLHDHDGTWGVEGVFSGRIKVKNFLKIKQLEESIFQLKYLGHLYLGEGKTDKIIPPADCHILEIEPNEQVITIHIYGKKLEKFKVFIPTERKDIYRCKMKYIQYSS >CP024096.1|AWC65120.1|2101249_2101558_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRILVFFDLPVMTKAERKAYTRFRKFLLKDGYTMLQFSVYTRVCNGEEGAQKHLRRLRQNIPNVNGAIRSLKVTEKQFESMDILLGVQTIDEKLGTNKTDFF >CP024096.1|AWC65121.1|2101562_2102465_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAFRHIVIRNPSKLSTCDEQLLIKQEETVRIPLEDICTITIEDPAITITAALLSKCVEYHVELIVCDRKRLPAGILQPFHRHSRQKAVLDVQLGLGKPFKKRIWQQIVIRKLENQARCLELANKGEDAQKLYSISKSVESGDRTNREAYGAKVYFTALFGPNFYRREDDVRNISLNYGYSLVRSLTARALVRYGFNPSLGIFHDSQTNAFNLADDFMEVLRPFVDIIVALNVSDETEWDSKMREKLFSVLNIEAVWKEERQSITNGVEQMIKSYVSACRQNDASLLLLPELIALRQHTYE >CP024096.1|AWC65122.1|2102454_2105688_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKYSIGLDIGIASVGWAVINEDIERIEDLGVRIFDVAEQPKTGASLSTPRRLARSTRKRLRRRRHRVERVRKFMIQKGLLTQVQMEQLYDWKDGDLDIWLVRVNALERKLSDREFARILVHFAKNRGFQSNRKSELQEEDNGAVLSAVQENKRLMEEKGYQTISEMLLYDEKFEGTKRNKGGEYTHVVARSDLKREIQLIFEKQRAYGHAFATMENEDKFLQIWSSQRPFATKDDIAKKIGNCTFEPKEKRAPKSTYTFERFRALDKLNRLRILSGTSPARSLTQEERDLILNSLFSKKEVKYKELRKLLKLNDEQRFNEIFYDPNEKIEKNENRTFLSLESQYKIRKILQKIEGKSLNDTYRPVDLDTIAYALTVFKDDQDIRDYLQNQYVASNGKKELNLANRKYNDELIEELLHLSFTKFGHLSLKALRNILPFMEQGIPYHQACEKAGYQFNKKVNREKQKLLPPVPAKDIVNPVVIRSLSQVRKVINGIIKRYGSPSSIYIELAREMGRGYKERKDLEKQYNKNRQMNEGAKKHILELRPEFGDPRGHDILKYKLWQEQDCRCAYSFKSIPIKQLFEIGYAEVDHIIPYSRSFDDSNNNKVLVLAAENQNKQNRTPYEWFGHDETKWQEFTSLVTTMKVSKKKKSLLLKKNFDEEQAEEFRSRHLNDTRYITRYIKTFIEDNLQFRMEEGKKQYVHTVNGAYTSLMRKRWGFNKNRQENDLHHALDAVIVAVSLPFKHKVSAYFKRREEYAHNQLKREGEFFPEPWPGFIHELEIRMMQDSENIKLAMESLNLKTYDESFIKELKPIFVSRMPKRAMRGQIHEETLKRVRGRTDDGYIRTVKKVKLDQIPFDKNGDFPMFGKETDMKTYEAIKSRYLESGKDKKKAFNTPLYKPAKNPENAPIIRSIKIEEKANRVVMLDEKTAADNASIVRTEVFRHKETGNYFLTPVYVADVLAKKVPDRLITTKKPYSEWRKITDEYEFLFSLYPNDLIRVKMPKEKGTKTHTGEKHVWQENFMYFKGVHSGSAGVRMIDHMNSFEDEIGVRKLVVFEKYQVDPLGRMNKVHGEKRHGI >CP024096.1|AWC65123.1|2105999_2106761_-|DUF3959-domain-containing-protein MKKLDVLLMLLSGLFPVAGIMKQIPLPLSLILGGLLFFTSFGSYYTKQTSSRVCSWLAYTIFITFLMGIWDQYVTMSSLLANAKIAACIALLPAILCFRTYGITFGLLALWGALLWDVKEVQSLAVLGRMMNLLTTEKMYLLLLIAGFLVGGLFANGFRRKNDKFKQETPNVLKQKKKRMRPTFHIRIPRLPKLRMKMLTFGRTPTQSKDKRPYESMREENIHAIQQEPQHEQQEPTTLGQTRMERRRNRYHV >CP024096.1|AWC65124.1|2107017_2107437_-|hypothetical-protein MVICTWIIAILLLSFTWLELVLLQIVGLQYESNQALILFFIVYIFTDLPLSLIVDNIPKALKSLDLIQTSKGWIPFLFDAGKTYILIMTIDYFMESITISWQGVFLFAIIRGSIGLKIKKDDPEPPSYSEVTKSLKNSE >CP024096.1|AWC65125.1|2107474_2109820_-|translation-initiation-inhibitor METIQLLAFKDVIDPLFEQTVFYVQWPKHWSSLLLEHNRPYELIKKFKLLNKRLYIMFSDILFIEHDPYKLAEDSLWIICLKPLSSEQLEYICRQWYAYIHNWKPTEMPGEVLLEWQPSAISKLSLLHDKKTFYIWVPALISHLFCERALHLSIGNKQYEEIPFYPLREQHRCEAMSEPIQDKKTKEYFSYIYRFELITRGIENMFLLKVSIGKRRFYQTANQYANYMIMKKRKGTVLVSNCHNEKDKFVTLKIEDARFGVNWSKAYRELQNVFMLKKQLDLVKIMQSPKKYIKGKRIRALVIYDENIFKVPGTKIKRGISRREKEVLLQAFHQRFPHCTYIPLCKNITINQNDELFPLYIREEMKEITLELWSSQRLTEIEKILFEEGLILEKRANHSYILNSKPQIILNIVTYNPKIIKQHPYRMDYCHKYKEDRIQSVIRAISSIPIQSFQTSLSLIEIEKCDGREKIDPKQVIREAFARTNRISQFIERLDGEEIKKEHIVRAIFSLLEKIGFRKRSWESMHPSHTYVSLSIEEIYNNQFVPILSKINEGEIVYKLYGSHEWRDFTSILLNVSAHETFLPQPSKRNDIGIQFKKYITEELTAIAEEAKKENKQVYFLIDASMREYWIESLQNEHMDLHDLPYISEEFQSLSNVTAIRINNQYDVPNYIMPLEKECDETELYVDQSGLYYSVNIYPLNDTGWKEQRILEIVVLGAKQEERDQIAKIITYMCKMSIIPGERPFIPFSMQMVKLIKKYITDIDLWQSSDELDTDWLIENE >CP024096.1|AWC65126.1|2110074_2110758_-|thiaminase-II MSFSQLLRQEVAPIWQASFEHPFIKELGEGTLDLASFRYYVLQDSYYLSHFARVQTLGAAKAIELKTTARMAHHAQNTYEAELSLHENFAEKLGITEEEKASFIPAPTAYAYTSHMYRAAYEGHLGDIIAAILPCYWLYYEIGERLKECKPEEPIYQAWISAYGSDWFRTLVEEQIMRLDQIAETVTESDRKRMKQHFIISSQYEYSFWEMAYTLEKWPVEEKIATR >CP024096.1|AWC65127.1|2111076_2111781_-|Na+/myo-inositol-cotransporter MLPGIIAFHLFGDQLKNADMAYPMLVIKILPIALSGFFAAVLFGAILSSFNGALNSSITLFTLDFYKPIFKKEASEKELVKVGRIFAITLGLIAVIVSPFILYAPSGLYNYLQEMFGFYNVPIIAAVVVGFFSKKVPASAPKIALVFHIILYALSKVFLGSINFLYILSVLFPACVIVMLVIGKLKPRETDFELFDANKVDLKPWKYAKVFSIFLIIFMLGAYVLFSPVGLAAQ >CP024096.1|AWC67212.1|2112010_2112178_-|hypothetical-protein MSIIALVSILLWGAVTHELSKPSKKQNNRKIITLTSLGCLSTLVITISLIQNISF >CP024096.1|AWC65128.1|2112262_2112763_-|N-acetyltransferase MSIHTENIKLVPYKEEYKEKIATFTLPSEQVQFTANPSDLLEKAKEDITKHVVVIVDQDVPVGIFALQTGERVTEYTNNPNALLLVSFSVDYEKQGKGYAKRGLRLLQEYVTAYFPEINEVVLAVNERNIPAQKVYLKVGFEDRGQRKMGPIGRQLILYLSIKKQE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024096_3 | 2228784-2229271 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of CP024096_3
|
7 spacers
spacers of CP024096_3
>3.1|2228813|37|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT CATCAAAATCAAAAACAGTTAAATTAGATGCAGATGA >3.2|2228879|37|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTAC >3.3|2228945|36|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTCTCATTCGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTT >3.4|2229010|37|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGAATTATCGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAA >3.5|2229076|36|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAGGACCCTCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAAC >3.6|2229141|37|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTTTTAAAAGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGA >3.7|2229207|36|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTGATGGACGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAA |
cas2,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024096_3
The CRISPR arrays of CP024096_3 >merge|CP024096|3|2228784-2229271|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTCTATTCCACTACGTTCAGATAAAACCATCAAAATCAAAAACAGTTAAATTAGATGCAGATGACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTACCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACGTTCTCATTCGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTTCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTTGAATTATCGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTTAGGACCCTCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAACCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTCTTTTAAAAGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACCGTGATGGACGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024096|3|3|2228784-2229271|CRISPRCasFinder CTTTCTATTCCACTACGTTCAGATAAAAC CATCAAAATCAAAAACAGTTAAATTAGATGCAGATGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC GTTCTCATTCGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGAATTATCGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTAGGACCCTCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCTTTTAAAAGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CGTGATGGACGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024096|3|2|2228784-2229271|CRT CTTTCTATTCCACTACGTTCAGATAAAAC CATCAAAATCAAAAACAGTTAAATTAGATGCAGATGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC GTTCTCATTCGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGAATTATCGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTAGGACCCTCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCTTTTAAAAGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CGTGATGGACGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024096|3|2|2228850-2229271|PILER-CR CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC GTTCTCATTCGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGAATTATCGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTAGGACCCTCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCTTTTAAAAGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CGTGATGGACGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC
>CP024096.1|AWC65230.1|2228298_2228553_-|hypothetical-protein MKDTTKYVGLDVSKEKIAVAIADEGREEPRYLGMIPHTPESLRKLIKKLGAVEHLKACYKAGSTGYGIYRLLFSLGVDCAVIAP >CP024096.1|AWC65229.1|2227296_2227680_-|VOC-family-protein MMIHKVGQIMLYVKDQDEAVQFWTEKMGFHLIAEEDNGKGFRWIEIAPTKEAETSIVLHNKEFIAKMQPELNLNTPSMLFFTENIEQLHKQLVDKKVAVGEIVNMPTGKAFNFADDEGNYFAIMEKS >CP024096.1|AWC65228.1|2225660_2226998_-|D-serine-ammonia-lyase MWEKMIKGKTIRKWTEENPILQQLIETSEVFWENPNYSSYEKARQDFVLTTEDVKEAEARLLRFAPYIAKVFPETKEMDGIIESPLVETMHMKQYLEDAFAQEMPGRFLLKCDNNLPISGSIKARGGIYEVLQHAEKLAIEHNLLCEEDHYAKLDSDRFREFFSQYSIAVGSTGNLGLSIGIMSAKLGFQVTVHMSADAKEWKKELLRNKGVTVVEYESDYSKAVEEGRKQAEQDPHCYFIDDENSKHLFLGYAVAASRVKQQLEDKNIRVDKDHPLFVYLPCGVGGGPGGVAFGLKLLFGDAVHCFFAEPTHSPCMLLGLVTGLHDEIAVQDFEIDNVTEADGLAVGRASGFVGKIMEPLLSGCYTVEDQQLYELLKAMVDTENIRLEPSALAAVYGSVQLYRQENYVKKHKLEGKMNRSTHMMWATGGGMVPKSVFDEYYQNQ >CP024096.1|AWC65227.1|2225176_2225614_+|DUF2512-domain-containing-protein MSDIALVLIKFISCIIAFAIGLALFFPATLVQIISFSLFVTIVSYVFVDKIILERIGRSAAIMTDFLLTYLSVWIFGNILLDHYMQIAWGSILSALVFTLCEVIVQRFSHAYERHNSDNIHLNRRFSYGTEFAEEQNPLDKNKKK >CP024096.1|AWC65226.1|2221486_2225017_-|DUF4020-domain-containing-protein MTFLGKEGIRMWITSEVEIPEELFDHLEQGKLVLFVGAGVSMKGKSNLPNFDDLVDEIAKALYVEKREITEPHDYYLGKIAKTKDVHQIAKDLVNVEGSKPNPLHYAIPRLFPKDTDVRIVTTNFDQHFTTAMRESDRDFNIYYAPALPTGRAFKGLAYIHGNVEQEKENLILTDGDFGRAYLTEGWARRFLVDLFSNYTVLFIGYSHNDPVMKYLATGLPPSTRRYAFVAHGDNTYHWEHLGVKPIVYPNKANNHQALVRAVKRWAELMGDNYITKRMRIRDIVTVPPSVEQEQLSYIKQAIKKIEMLRYFVEFARDYGWVEWLEAEGKLQNLFRMTSHYDEVDELLAAWLVEQFLVSHQKELFQLIFKNHSKISPLLWKSICTYLKETKKPMDPILFAKWTLLLLETAENNSQSIEKISYLLQKCSFPEHKEISVLLLTFILDGKIKLKRVKRWEDDMQDSVELEESSCLPVSVFSHVQRIWEEKMKPHISYFAGPILVMGLEKLQMLSLRQTALQKRDGVLYHTMEFSEHDLQPKDFTFLIRIMKECLAYLCEHNKEKAAYYIAQMIDTDSILQKKIAIEAMSENTFVTADEKLMWLRKQQLIFDFTYKHEVFQFLKKHYQNALEKTKKEVIHEVMKHLENERFFDACLVLDLLYTCDANSTSTARAYRIMKRTHPHFTSNQYGEKKEEVRAPNIICDVTADGLLKLKGHEIKKQILLFSNDDSFEQRHFLEMLSKACKLNVDWSIALAYQLIGEQRVSDEIWFVCIREWRNNRKLTNEQIQKIIPLLQQFVRNPAFYWLISSFLYEISNRLEDFQENQIRVVKRFAFSLFPHIMKGESSFKVGELDFYNESIQHPVGKMTSVLLKLLAYDHLYDRNIHEYLFLFEEQIKVASERTHFMLARLTADVTFLFHIEKQWCRKYVLPYLKLNREHKAVKYAWAGLCYTQINLPLFTEIKKYIKYAAEHLELLHPHTKQVFLKWLSFVCIKCVLYWGQRTDWVYMIFIEEKEHDKIKFLKHLCYYVKTLSAREKQKFWDSWLATFLKERPKMSLITGREYVMLLRFVFYMDEVAEKGVYTILNCFPIPIEHCSEAEMKQLLLTILTRKEKVIAHVQAYAKLFFILLQIVQDASSIENEMIQMKEMLETCHVDDDILTAIQNEMIRIGIVVTNFQQES >CP024096.1|AWC65225.1|2219642_2220719_-|bifunctional-3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase/chorismate-mutase MANHELEQLRKQVDEINLQLLKLLNERGRIVQKIGEQKQLQGTKRFDPVREREVLDMIAERNEGPFETSTVQHIFKTIFKASLELQEDDNRKALLVSRKKKQENTIVDVKGERLGSGTQSFIMGPCAVESLEQVRQVAQAIKEQGLKLMRGGAFKPRTSPYDFQGLGVEGLQILRQVADEFDLAIISEILNPNDVEMALDYVDVIQVGARNMQNFDLLRAVGKVNKPVLLKRGLAATIDEFMHAAEYIIAQGNDQIILCERGIRTYEKATRNTLDISAVPILKKETHLPVVVDVTHSTGRRDLLLPTAKAALAIGADAVMAEVHPDPAVALSDSAQQMDIPEFHRFMEELKEFKNKLS >CP024096.1|AWC65224.1|2217717_2219343_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MITVSNVSLRFADRKLFEDVNIKFTPGNCYGLIGANGAGKSTFLKILSGEIEPTTGDVHITPGERLAVLKQNHFEYEEFPVLETVIMGHTRLYEVMQEKNAIYMKEDFSDEDGMRAAELEGEFAELNGWEAESEAAILLKGLGIGEELHDKKMSELTGAEKVKVLLAQALFGQPDVLLLDEPTNHLDLKAIQWLENFLMNFENTVIVVSHDRHFLNKVCTHMADLDFGKIQLYVGNYDFWYESSQLALKLTQDANKKKEEKIKELQNFIARFSSNASKAKQATSRKKLLDKITLDDIKPSSRRYPFVGFTPEREVGNDLLTVEGLSKTIDGEKVLDNVYFTLNKGDKVAFIGRNDIAMTTLFKILMGEMEPDSGSFKWGVTTSQSYFPRDNSAYFENSEYNLVEWLRQFSPQDESESFLRGFLGRMLFSGEEVKKNVSVLSGGEKVRCMLSKMMLSGANVLVLDDPTNHLDLESITALNNGLIAFKGTILFTSHDHQFVQTIANRIIEVTPNGVIDKETTYDEYLENEELQKQVSAMYQNK >CP024096.1|AWC65223.1|2215259_2217233_-|LTA-synthase-family-protein MKQLLQKSKRVLSNHFGFFIFAVVLFWLKTYAAYVTEFNLGISNTIQKFLLFFNPLSSAILFLGLALFAKGKRSYILLIVINLLLSILLYANVVYYRFFSDFITFPTLTQTNNFGEIGGSVLALLQPYDPLYFLDTIVLLVLVLTKVANPKPIRVAKYKLSLVFISAILIFSINLGLAESDRPQLLTRTFDRNYIVKYLGAYNYTIYDGIQSMKASTERAMADGDSMTEVRNYIASNYASPSAEYFGKGKGMNVIYIHLESFQNFLIDYKLNGQEVTPFINSFTKDANTLYFDNFFHQTGQGKTSDAEFMLENSMFGLPQGSVFTTKSHNTYQAAPAILGQQGYTSAVFHGNYKTFWNRDDIYKSFGFNKFFDASYYDMNEKDVVNYGLKDKPFFNESIPLLETVKQPFYTKFITLSNHFPYPIDKEEATIEPATTGDSSVDTYFQTARYLDEAVKGFVDYLKQSGLYDNSIIVMYGDHYGISDNHNRAMSQIMGKEIHSFENAQLQRVPLIVRVPGIKGGVQHQYGGEIDVLPTLLHLLGIDTKDYIQFGTDLLSPEHKQVVAFRNGNYVSPTVTALNGRYYDTTTGEPVEVTEEIKQNEQMVQQTLKLSDQVVNGDLLRFYTPEGFTPVDRSKYNYNHRDKNKTKVKTTQDTKTE >CP024096.1|AWC65222.1|2212518_2214624_-|PTS-lichenan-transporter-subunit-IIC MILDYRSAAILQQMMQADSYTSVDQLTEVLQVSKRTIYYDMKKVDDWLITEHLEPIQYVRPLGYCLDKKTKQKVAQKLQGLITVQYEYSPQERKAWLALYLLTEEKRILLEDLIKLIQVSRNTTLADLKKLKAELGKFKLSLQFHRKQGYYIKGMEQGKRNVLIAYLSQLIAKHGWEYVVSHMRNIVNHGEGEKKQTAQDKLHVIKGILSKCEEFLGVQYTDEVLENLSVYMYLFCSRIVKGRYIEMEETEKAVLRETKHFQAATYIGTQFEKLLYIKFPKDEIYYITTHLLGAKVNAQQKEYEKNDVHGIWHIVDCMIQDFQHYACVIFRDFTGLASDLYLHMKPAFYRVKYGIEIKNPLLQIIRNSYAEVYHLTKKVVHHFEQYVGKEISEDEIAFITMHFSAWMRKEGIVPSPRKTALLVCPNGIGTSRMLQYQLEQLFSNIDILQAISKREYESNTFDVDCIITTTELEKGLIPIFMVNPILTDAEKASLFRKVNATLFREDQNDSADIIMQMIHKYADVRDEHALKRELREFISGPVHFGREEKYKPMLNELLTKEYIQLQDHVDSWEGAIRIEAKPLLQTEYISEEYVQEMIANVKKLGPYIVIAPKIAIPHARPESGVKKLGMSLLQLKESVSFSEKQEHAANLIIVLAAIDNETHLKALAQLSDMLSQPENVDLLIRSNSKEQMLEMIAKYSN >CP024096.1|AWC65221.1|2212236_2212506_-|PTS-lactose-transporter-subunit-IIB MKKILVVCGNGLGSSFIVEMNVKKILDELGLQAEVSHTDLASSKSEQADLYLGSKDIICNLEDGVRTVAGLTNILDQNEIKEALQKHLM >CP024096.1|AWC65231.1|2229494_2229758_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIITYDIGEKRVGKACKKLKQYLTWTQNSVFEGELSRTQLLKCLAELDQIIISSEDSIYLYEVNNPRNIKKKVFGIEKSYEELFL >CP024096.1|AWC65232.1|2230738_2231236_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKGTYIHYYFVCHRKLWLFVHQIQLEKESERVIEGKILHDSTYQRMEHRELDIDGVGKIDGIEGEYIREIKLTSKMQEADRWQLLYYLAELKKRGVTKKGLLSYKKEKRTEEVHLTEANQQELENIQKRIQAIILSDKPPKLEKKKYCSSCAYYDFCFSGEGEGC >CP024096.1|AWC65233.1|2231298_2233524_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MFLAKSNPKETLREHTDELRSRYKKLKESYGHYFDERIWELLLYAVDYHDAGKAHEPFQLNIRRALGEGVKLQRNLEVPHNYLSPFLLPESIFSLPKKDYQALIQAIAYHHERDIEPNDTLIRQALWQDLWPKMDEINKHLNINGANLEKKFNRILAQLHRRIKYSDNKENYVDYVILKGLLHRIDHAASAHVDIEIDAKQDFKKLVDAGFQKIAEKKRVPVEEVYRDLQKHAHKHRKENLIIVAQTGMGKTEAALLWASDSKTFFTLPLRVSINALFHRVYEKMNYKNVGLLHSSSMDYLTENLEEDWEVIAEQSKHFSSKLLFTTIDQILKFPFLYRGYEKELATMAYSSVVIDEIQAYDPKIAAVLVRALEMIYLVGGKFLLMTATLPSIYLETLNESDIISSDGFRVDTFIDDCVIRHCIEVVEKPIVDDFEKIVDLGKQKKILVIANTVKRAMELYNKIKEHSDNVHVFHSMYIQKHRTLIEKELLLFDENKEATGIWITTQLVEASIDIDFDVLFTEAATLDSLCQRFGRCYRRRQYMMPQEPNVFIYAVDMSGVKYVYDEEILMKSLDILRPFNRKILLESQKIELVSQLYSRENLKGTEFLKTFDDALEQLQTFEDYTLSSKDAQKLLRDIQAELVIPRNIYDENEHLFEQLKIVNKEERARLYREIAKLTVSLRKNRVRGKTSRIPHERIQSNGKKYNLLPWIKILELQYDFDEKSKTGTGVLLDQELDNFI >CP024096.1|AWC65234.1|2233577_2234276_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVIRLKLFQETACYTKPFANKVAETYPLPPYSTVKGMIHQLLQANELLPLRFSIQGNYETKLIDYRKSYMVKKKSVSMPIIFDGLAMEVPEQEHMTSMPLYTHMLFNVELVIHIAGEEALLERIYQHFIELNQHLSLGRHEDLVRVDEVTFVELEECDEWYSKYAIYVPKYYYKTDFPAGIPYRLNWTYKIVNGIREWNKIPSLYVNGNNPHFEDGKLFHTDGEHIVLWNE >CP024096.1|AWC65235.1|2234272_2235166_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNNKALTLTIIFKASSLNYGEGTANISELKKFHRGNGEVYSFASRQAIRYDIVRLGNQLFNWNLNVVDKSKGVVQFKDDCTIADSVEMDLFGYMKTKAKAGADKRSAVVRLSHAVSLEPYRSDLEFLNNMGLASRIQENPNLATLEQHESLYTYTLTVDLSKVGVDGEIELPVDEKVNRVKQLIELTKYLNREIRGRQENLSPLFVIGGVYPIANPFFLGRISLQNFDSNLLNVKSLASVLGQTVLGHDVRTCTKIGLVDGVFANEEEISQLTDTVSVEEFYQHVMNEVEQFYKVLV >CP024096.1|AWC65236.1|2235158_2236907_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MIFVTEEIPLAAEEWTITQGLVGYYRILKHAGIKVKTTDEGILFNPEHLRNFEHYYFDYFLDRFSVAKRDEQNIRRTFLKFRAESESKGSKEAKRRMQAAKKSLDETIKKTAIEKVEKKFEDSSHKKRLVEYATLIRNQKTYNPEMDKWIEEYIQALSEPNINEKLTLNYFKATVLGTYFGQVSFLNVSHTSKDIEEQKEIFRKDYIESLLADLELQQMIARAEDSDEIMKYLEISTHEMAKKLKTKFKKMTIQQIKDYVSNEINCCSFFDSQWAFEQYSELHFSPLSMSASKALNFYWNANGTLTIPVSKLAKLILFCAPAGASIIGGKSLFVQREGRFEQVIYANETYEIGRSKDKAFDEIIFDLIAEQKTKAQHTGDSYLILEYSSEYNAKKTDLQYLHLTPGLCSFFKEKNCTKWFSRLNYVLRNQIVHAFLRYQDSKHIIHNALRKKLQEQKLANEIVYACLLRCYYLFFVKGEGKMNTDLKTSKNRIWSAFYEGVAIKNIVEEGKIRSVAYRLLNAIRSNDKKMFLDTVMRLYMSVEKPFPRVFMNILDESNIDFASIGDSFIAGLISNEEEKINE >CP024096.1|AWC65237.1|2236906_2237608_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLHIKLQTNRFPISYRMMMVSFIKEALKLSDAAYFQQIYQESKANRPFSYGVYIHDYKLNATEFHIKGYVGLTITSPDAQFMLHFYNGLMKMNDFRYKGFSLKRMKVQMVNSADINQNHVYFKTLSPLLIRDKHAKPIFIDDDKFEKELNYISDTVLKEFRGYGLKQPLIFTSKNMKKVVVKEKIHSDHDTLFFTGYHGIFSLQGAVEDLKILSEIGLGFRSSQGFGAVEVV >CP024096.1|AWC65238.1|2239844_2240171_-|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MFIETKTLTVKEGTSDLVVQRFSGEGMIEKFEGFIDLNVLVKKVRRGDEEVVIMIRWESEEAWKNWETSEEHLAGHRANRGKPKPEHILNAEHAVYYVKATKSAYQQS >CP024096.1|AWC65239.1|2240512_2240857_+|hypothetical-protein MRKAILIFIVAIFIIGIVHIAVTPINYKSYTIEALWFASAGCTLIFLAFLNYVLISIKQRQTRFFVICHTANILCTILVAFILTIAFAPHIILLFVLLVSKTLLVIGFQFSSKS >CP024096.1|AWC65240.1|2240981_2241311_-|hypothetical-protein MSFNQVLKVIDENIGKRFVLGIDGLSRLGKTTLVKQLEQKLKQKGASFYIFHIDDHIVERNKRYHTKFEEWYEYYYLQWDIEWLRYHFFQQLKWKEQFRFLGASPKTPS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024096_4 | 2238943-2239558 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of CP024096_4
|
9 spacers
spacers of CP024096_4
>4.1|2238972|36|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT TTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGG >4.2|2239037|37|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT TGGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAA >4.3|2239103|36|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT AGGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCC >4.4|2239168|37|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT CACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCC >4.5|2239234|36|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT CAAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACAT >4.6|2239299|35|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT TTGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCA >4.7|2239363|36|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT TGTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCAT >4.8|2239428|37|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT TGAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAG >4.9|2239494|36|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT TCAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATA >4.10|2239038|37|CP024096|PILER-CR TGGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAA >4.11|2239104|36|CP024096|PILER-CR AGGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCC >4.12|2239169|37|CP024096|PILER-CR CACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCC >4.13|2239235|36|CP024096|PILER-CR CAAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACAT >4.14|2239300|35|CP024096|PILER-CR TTGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCA >4.15|2239364|36|CP024096|PILER-CR TGTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCAT >4.16|2239429|37|CP024096|PILER-CR TGAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAG >4.17|2239495|36|CP024096|PILER-CR TCAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATA |
cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3,cas4,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024096_4
The CRISPR arrays of CP024096_4 >merge|CP024096|4|2238943-2239558|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATCTTATCCACTACGTTCAGATAAAACTTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGGATTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTGGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACAGGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCCCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACCACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCCCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACCAAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACATCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTTGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTGTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCATCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTGAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAGCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTCAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024096|4|4|2238943-2239558|CRISPRCasFinder TTATCTTATCCACTACGTTCAGATAAAAC TTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGG ATTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC AGGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CAAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAG CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024096|4|3|2238943-2239558|CRT TTATCTTATCCACTACGTTCAGATAAAAC TTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGG ATTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC AGGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CAAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAG CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024096|4|3|2239009-2239558|PILER-CR TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT GGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAAC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACA GGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCCC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACC ACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCCC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACC AAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACATC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT TGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCAC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT GTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCATC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT GAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAGC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT CAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATAC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC
>CP024096.1|AWC65237.1|2236906_2237608_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLHIKLQTNRFPISYRMMMVSFIKEALKLSDAAYFQQIYQESKANRPFSYGVYIHDYKLNATEFHIKGYVGLTITSPDAQFMLHFYNGLMKMNDFRYKGFSLKRMKVQMVNSADINQNHVYFKTLSPLLIRDKHAKPIFIDDDKFEKELNYISDTVLKEFRGYGLKQPLIFTSKNMKKVVVKEKIHSDHDTLFFTGYHGIFSLQGAVEDLKILSEIGLGFRSSQGFGAVEVV >CP024096.1|AWC65236.1|2235158_2236907_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MIFVTEEIPLAAEEWTITQGLVGYYRILKHAGIKVKTTDEGILFNPEHLRNFEHYYFDYFLDRFSVAKRDEQNIRRTFLKFRAESESKGSKEAKRRMQAAKKSLDETIKKTAIEKVEKKFEDSSHKKRLVEYATLIRNQKTYNPEMDKWIEEYIQALSEPNINEKLTLNYFKATVLGTYFGQVSFLNVSHTSKDIEEQKEIFRKDYIESLLADLELQQMIARAEDSDEIMKYLEISTHEMAKKLKTKFKKMTIQQIKDYVSNEINCCSFFDSQWAFEQYSELHFSPLSMSASKALNFYWNANGTLTIPVSKLAKLILFCAPAGASIIGGKSLFVQREGRFEQVIYANETYEIGRSKDKAFDEIIFDLIAEQKTKAQHTGDSYLILEYSSEYNAKKTDLQYLHLTPGLCSFFKEKNCTKWFSRLNYVLRNQIVHAFLRYQDSKHIIHNALRKKLQEQKLANEIVYACLLRCYYLFFVKGEGKMNTDLKTSKNRIWSAFYEGVAIKNIVEEGKIRSVAYRLLNAIRSNDKKMFLDTVMRLYMSVEKPFPRVFMNILDESNIDFASIGDSFIAGLISNEEEKINE >CP024096.1|AWC65235.1|2234272_2235166_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNNKALTLTIIFKASSLNYGEGTANISELKKFHRGNGEVYSFASRQAIRYDIVRLGNQLFNWNLNVVDKSKGVVQFKDDCTIADSVEMDLFGYMKTKAKAGADKRSAVVRLSHAVSLEPYRSDLEFLNNMGLASRIQENPNLATLEQHESLYTYTLTVDLSKVGVDGEIELPVDEKVNRVKQLIELTKYLNREIRGRQENLSPLFVIGGVYPIANPFFLGRISLQNFDSNLLNVKSLASVLGQTVLGHDVRTCTKIGLVDGVFANEEEISQLTDTVSVEEFYQHVMNEVEQFYKVLV >CP024096.1|AWC65234.1|2233577_2234276_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVIRLKLFQETACYTKPFANKVAETYPLPPYSTVKGMIHQLLQANELLPLRFSIQGNYETKLIDYRKSYMVKKKSVSMPIIFDGLAMEVPEQEHMTSMPLYTHMLFNVELVIHIAGEEALLERIYQHFIELNQHLSLGRHEDLVRVDEVTFVELEECDEWYSKYAIYVPKYYYKTDFPAGIPYRLNWTYKIVNGIREWNKIPSLYVNGNNPHFEDGKLFHTDGEHIVLWNE >CP024096.1|AWC65233.1|2231298_2233524_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MFLAKSNPKETLREHTDELRSRYKKLKESYGHYFDERIWELLLYAVDYHDAGKAHEPFQLNIRRALGEGVKLQRNLEVPHNYLSPFLLPESIFSLPKKDYQALIQAIAYHHERDIEPNDTLIRQALWQDLWPKMDEINKHLNINGANLEKKFNRILAQLHRRIKYSDNKENYVDYVILKGLLHRIDHAASAHVDIEIDAKQDFKKLVDAGFQKIAEKKRVPVEEVYRDLQKHAHKHRKENLIIVAQTGMGKTEAALLWASDSKTFFTLPLRVSINALFHRVYEKMNYKNVGLLHSSSMDYLTENLEEDWEVIAEQSKHFSSKLLFTTIDQILKFPFLYRGYEKELATMAYSSVVIDEIQAYDPKIAAVLVRALEMIYLVGGKFLLMTATLPSIYLETLNESDIISSDGFRVDTFIDDCVIRHCIEVVEKPIVDDFEKIVDLGKQKKILVIANTVKRAMELYNKIKEHSDNVHVFHSMYIQKHRTLIEKELLLFDENKEATGIWITTQLVEASIDIDFDVLFTEAATLDSLCQRFGRCYRRRQYMMPQEPNVFIYAVDMSGVKYVYDEEILMKSLDILRPFNRKILLESQKIELVSQLYSRENLKGTEFLKTFDDALEQLQTFEDYTLSSKDAQKLLRDIQAELVIPRNIYDENEHLFEQLKIVNKEERARLYREIAKLTVSLRKNRVRGKTSRIPHERIQSNGKKYNLLPWIKILELQYDFDEKSKTGTGVLLDQELDNFI >CP024096.1|AWC65232.1|2230738_2231236_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKGTYIHYYFVCHRKLWLFVHQIQLEKESERVIEGKILHDSTYQRMEHRELDIDGVGKIDGIEGEYIREIKLTSKMQEADRWQLLYYLAELKKRGVTKKGLLSYKKEKRTEEVHLTEANQQELENIQKRIQAIILSDKPPKLEKKKYCSSCAYYDFCFSGEGEGC >CP024096.1|AWC65231.1|2229494_2229758_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIITYDIGEKRVGKACKKLKQYLTWTQNSVFEGELSRTQLLKCLAELDQIIISSEDSIYLYEVNNPRNIKKKVFGIEKSYEELFL >CP024096.1|AWC65230.1|2228298_2228553_-|hypothetical-protein MKDTTKYVGLDVSKEKIAVAIADEGREEPRYLGMIPHTPESLRKLIKKLGAVEHLKACYKAGSTGYGIYRLLFSLGVDCAVIAP >CP024096.1|AWC65229.1|2227296_2227680_-|VOC-family-protein MMIHKVGQIMLYVKDQDEAVQFWTEKMGFHLIAEEDNGKGFRWIEIAPTKEAETSIVLHNKEFIAKMQPELNLNTPSMLFFTENIEQLHKQLVDKKVAVGEIVNMPTGKAFNFADDEGNYFAIMEKS >CP024096.1|AWC65228.1|2225660_2226998_-|D-serine-ammonia-lyase MWEKMIKGKTIRKWTEENPILQQLIETSEVFWENPNYSSYEKARQDFVLTTEDVKEAEARLLRFAPYIAKVFPETKEMDGIIESPLVETMHMKQYLEDAFAQEMPGRFLLKCDNNLPISGSIKARGGIYEVLQHAEKLAIEHNLLCEEDHYAKLDSDRFREFFSQYSIAVGSTGNLGLSIGIMSAKLGFQVTVHMSADAKEWKKELLRNKGVTVVEYESDYSKAVEEGRKQAEQDPHCYFIDDENSKHLFLGYAVAASRVKQQLEDKNIRVDKDHPLFVYLPCGVGGGPGGVAFGLKLLFGDAVHCFFAEPTHSPCMLLGLVTGLHDEIAVQDFEIDNVTEADGLAVGRASGFVGKIMEPLLSGCYTVEDQQLYELLKAMVDTENIRLEPSALAAVYGSVQLYRQENYVKKHKLEGKMNRSTHMMWATGGGMVPKSVFDEYYQNQ >CP024096.1|AWC65238.1|2239844_2240171_-|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MFIETKTLTVKEGTSDLVVQRFSGEGMIEKFEGFIDLNVLVKKVRRGDEEVVIMIRWESEEAWKNWETSEEHLAGHRANRGKPKPEHILNAEHAVYYVKATKSAYQQS >CP024096.1|AWC65239.1|2240512_2240857_+|hypothetical-protein MRKAILIFIVAIFIIGIVHIAVTPINYKSYTIEALWFASAGCTLIFLAFLNYVLISIKQRQTRFFVICHTANILCTILVAFILTIAFAPHIILLFVLLVSKTLLVIGFQFSSKS >CP024096.1|AWC65240.1|2240981_2241311_-|hypothetical-protein MSFNQVLKVIDENIGKRFVLGIDGLSRLGKTTLVKQLEQKLKQKGASFYIFHIDDHIVERNKRYHTKFEEWYEYYYLQWDIEWLRYHFFQQLKWKEQFRFLGASPKTPS >CP024096.1|AWC65241.1|2241289_2241856_-|N-acetyltransferase MGFPTLETERFILRELTLLDAENMFHYFQKESVMRYFGMDAIRNMEQVKRMIQMFSKKYKEGSQVRWGIELKGTNRFIGTCGFHFINLNHKRAEIGYELDDAYWGKGYATEAVQTIVTYAFQTMKLIRIGAVVYKENEASHKLLKKIGFQKEGLLRKYMIQNNVEYDTIIYSLLAEDWEKRSCLSIKY >CP024096.1|AWC65242.1|2242225_2242471_+|DNA-alkylation-repair-protein MEPMLCPNCKTNRTRFNILEQQVKPVKLNPQTGQIEEEYTNETLNVFHMSYQGPTYRVQCAVCGLVENPEQFIKPAQNKLF >CP024096.1|AWC65243.1|2242708_2243245_-|DUF2812-domain-containing-protein MEIKKTFKFFTAWNLEKEEAYLREMHQKGWAFQKYHFMYTFKKTEPKDVVYKADFNFDFQKSLKNQREYLEIYEMSGWKYVSSFTKWHYFCKEVVDKNELPDIYSETETRIEKLKDLLNHLVIIFLSILPAISISCLESPANKLSIIIKGFIGFVVCIHMYMFVRLILKIRKLKKEII >CP024096.1|AWC65244.1|2243246_2243570_-|PadR-family-transcriptional-regulator MDEKAKKYIPLTEATYYILLSFAKRIHGYGVMQMVEEMTDGEVKLGPGTLYGNITKLLTEKLIVEVDSTDRKKCYMLTPFGREVLELEFKRLQRSVQNGKQILREKM >CP024096.1|AWC65245.1|2244171_2245155_-|DUF4003-domain-containing-protein MITLQQKLEQYTSIYKQLKRELKWKTSDSRTGMMIAAMYTSSDKPFDLERFLQISHYIKSQVGMFSYLKSYHRFVVAATLDIHFTHYKTAFQQFLDLYERFIASGFSRSIFTYLAAATLLPDDREQYEARIQRSVKVYKRMKEDHFFLTSTSDYPLAVLLAGQQEEIGPLMDRVERLYQKLATSGLRKGNDLQFLSHILSLKKDIREDMLVARCTNIWNLFKQEKVKVKQMHYPAIGLLALLEDGEKEVSSIRTFMEKLQGDKLFRWQTDTNILIAIQLFVSQKGMEHQAANTGLQTMIEILIQAQQAAFIAAISASTAATSASSNS >CP024096.1|AWC65246.1|2245238_2245703_-|NUDIX-domain-containing-protein MDLTFQVNQSCFNYRVGAICKHDNKILMLQNEGEDFWYVPGGRVQLLETSEVAIKRELKEELGVDVAVKRPLWIVENFFTYDSRQFHEISLYYEVNLLTLPVKGADSFLFEEEGRKYKFQWIPLEQICEYNVKPEFLKDKMTQLPLHVEHIVKN >CP024096.1|AWC65247.1|2246061_2246307_-|hypothetical-protein MKGIFWLNLYMSLHVRMGETLYYGLGVRITNSHSEEKVIRHSGLTPNSHAKMFFIPKTDWGGVILTNKNHIFEEEALPQLK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024096_3 | 3.6|2229141|37|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2229141-2229177 | 37 | CP024096.1 | 811948-811984 | 0 | 1.0 |
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1. spacer 3.6|2229141|37|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 811948-811984, mismatch: 0, identity: 1.0
tcttttaaaagctgtagtatttgtttttcgtattcga CRISPR spacer tcttttaaaagctgtagtatttgtttttcgtattcga Protospacer *************************************
2. spacer 4.7|2239363|36|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 3185267-3185302, mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 4.15|2239364|36|CP024096|PILER-CR matches to position: 3185267-3185302, mismatch: 0, identity: 1.0
tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat Protospacer ************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024096_2 | 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100965-2100993 | 29 | NZ_AP014870 | Bacillus thuringiensis serovar tolworthi strain Pasteur Institute Standard strain plasmid pKK6 | 12518-12546 | 0 | 1.0 |
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CP024096_2 | 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100965-2100993 | 29 | NZ_CP004882 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMBLin15, complete sequence | 5325-5353 | 1 | 0.966 |
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CP024096_2 | 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100899-2100928 | 30 | EU408779 | Bacillus phage AP50, complete genome | 2485-2514 | 2 | 0.933 |
CP024096_2 | 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100899-2100928 | 30 | NZ_CP004882 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMBLin15, complete sequence | 2435-2464 | 2 | 0.933 |
CP024096_2 | 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100899-2100928 | 30 | NZ_CP053974 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed5, complete sequence | 10677-10706 | 2 | 0.933 |
CP024096_2 | 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100899-2100928 | 30 | NZ_CP009346 | Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 5, complete sequence | 12464-12493 | 2 | 0.933 |
CP024096_2 | 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100899-2100928 | 30 | NZ_CP010096 | Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMBLin15, complete sequence | 2433-2462 | 2 | 0.933 |
CP024096_2 | 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100899-2100928 | 30 | NZ_CP045027 | Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p5, complete sequence | 12462-12491 | 2 | 0.933 |
CP024096_2 | 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100899-2100928 | 30 | NC_005258 | Bacillus phage Bam35c, complete genome | 2443-2472 | 2 | 0.933 |
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CP024096_2 | 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100899-2100928 | 30 | AJ536073 | Bacillus phage pGIL01, complete genome | 2441-2470 | 2 | 0.933 |
CP024096_2 | 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100899-2100928 | 30 | CP013282 | Bacillus phage pGIL02, complete sequence | 12464-12493 | 2 | 0.933 |
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CP024096_2 | 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100965-2100993 | 29 | NZ_CP009346 | Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 5, complete sequence | 9437-9465 | 2 | 0.931 |
CP024096_2 | 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100965-2100993 | 29 | NZ_CP045027 | Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p5, complete sequence | 9435-9463 | 2 | 0.931 |
CP024096_2 | 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100965-2100993 | 29 | CP013282 | Bacillus phage pGIL02, complete sequence | 9437-9465 | 2 | 0.931 |
CP024096_2 | 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100965-2100993 | 29 | NC_005258 | Bacillus phage Bam35c, complete genome | 5471-5499 | 2 | 0.931 |
CP024096_2 | 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100965-2100993 | 29 | KC152966 | Bacillus phage Emet putative gene regulator and hypothetical proteins genes, complete cds | 1009-1037 | 2 | 0.931 |
CP024096_2 | 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100965-2100993 | 29 | KC152967 | Bacillus phage Sole hypothetical protein, putative gene regulators, and hypothetical protein genes, complete cds | 1045-1073 | 2 | 0.931 |
CP024096_2 | 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100965-2100993 | 29 | AY257527 | Bacillus thuringiensis bacteriophage Bam35c, complete genome | 5471-5499 | 2 | 0.931 |
CP024096_2 | 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100965-2100993 | 29 | AJ536073 | Bacillus phage pGIL01, complete genome | 5469-5497 | 2 | 0.931 |
CP024096_2 | 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100504-2100533 | 30 | NC_048762 | Bacillus phage vB_BtS_B83, complete genome | 26059-26088 | 3 | 0.9 |
CP024096_2 | 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100504-2100533 | 30 | NZ_CP020004 | Bacillus thuringiensis strain Bacillus thuringiensis L-7601 plasmid unnamed2, complete sequence | 17949-17978 | 3 | 0.9 |
CP024096_2 | 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100899-2100928 | 30 | NZ_CP034552 | Bacillus cereus ATCC 14579 plasmid unnamed, complete sequence | 2356-2385 | 3 | 0.9 |
CP024096_2 | 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100899-2100928 | 30 | NC_004721 | Bacillus cereus ATCC 14579 plasmid pBClin15, complete sequence | 2418-2447 | 3 | 0.9 |
CP024096_2 | 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100635-2100664 | 30 | GU071094 | Synechococcus phage S-SM1, complete genome | 54124-54153 | 4 | 0.867 |
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CP024096_2 | 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100504-2100533 | 30 | NC_004821 | Bacillus prophage phBC6A52, complete genome | 37850-37879 | 5 | 0.833 |
CP024096_2 | 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100504-2100533 | 30 | NC_049968 | Bacillus phage DK2, complete genome | 22476-22505 | 5 | 0.833 |
CP024096_2 | 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100504-2100533 | 30 | KX190832 | Bacillus phage vB_BtS_BMBtp13, complete genome | 23253-23282 | 5 | 0.833 |
CP024096_2 | 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100504-2100533 | 30 | MK284528 | Bacillus phage DK3, complete genome | 23164-23193 | 5 | 0.833 |
CP024096_2 | 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100504-2100533 | 30 | NZ_CP032612 | Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.4, complete sequence | 34550-34579 | 5 | 0.833 |
CP024096_2 | 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100504-2100533 | 30 | NC_018502 | Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p05, complete sequence | 5059-5088 | 5 | 0.833 |
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CP024096_4 | 4.10|2239038|37|CP024096|PILER-CR | 2239038-2239074 | 37 | NZ_CP007513 | Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome | 248075-248111 | 5 | 0.865 |
CP024096_2 | 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100504-2100533 | 30 | GU233956 | Bacillus phage 11143, partial sequence | 20685-20714 | 6 | 0.8 |
CP024096_2 | 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100635-2100664 | 30 | NC_011738 | Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742401, complete sequence | 213020-213049 | 6 | 0.8 |
CP024096_2 | 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100635-2100664 | 30 | NC_007051 | Staphylococcus phage 2638A, complete genome | 13284-13313 | 6 | 0.8 |
CP024096_2 | 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100635-2100664 | 30 | AY954954 | Bacteriophage 2638A, complete genome | 13284-13313 | 6 | 0.8 |
CP024096_2 | 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100635-2100664 | 30 | NZ_CP034567 | Vibrio parahaemolyticus strain D3112 plasmid p1, complete sequence | 45690-45719 | 6 | 0.8 |
CP024096_2 | 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100635-2100664 | 30 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 675072-675101 | 6 | 0.8 |
CP024096_2 | 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100965-2100993 | 29 | NC_022088 | Bacillus phage Troll, complete genome | 4906-4934 | 6 | 0.793 |
CP024096_2 | 2.10|2101030|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2101030-2101059 | 30 | NZ_CP053575 | Citrobacter sp. TSA-1 plasmid unnamed2, complete sequence | 7553-7582 | 6 | 0.8 |
CP024096_2 | 2.10|2101030|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2101030-2101059 | 30 | MG945606 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 4483-1602, complete genome | 1967-1996 | 6 | 0.8 |
CP024096_2 | 2.1|2100438|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100438-2100467 | 30 | MN856040 | Bacteriophage sp. isolate 317, complete genome | 2411-2440 | 8 | 0.733 |
CP024096_2 | 2.3|2100570|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100570-2100598 | 29 | NZ_CP050068 | Klebsiella aerogenes strain 035 plasmid p35, complete sequence | 377728-377756 | 8 | 0.724 |
CP024096_2 | 2.3|2100570|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100570-2100598 | 29 | NZ_CP020848 | Klebsiella variicola strain KPN1481 plasmid pKPN1481-1, complete sequence | 153139-153167 | 8 | 0.724 |
CP024096_2 | 2.3|2100570|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100570-2100598 | 29 | NZ_CP043927 | Klebsiella quasipneumoniae subsp. quasipneumoniae strain M17277 plasmid p17277A_477, complete sequence | 113729-113757 | 8 | 0.724 |
CP024096_2 | 2.3|2100570|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100570-2100598 | 29 | NZ_CP021699 | Klebsiella pneumoniae strain AR_0158 plasmid tig00000727, complete sequence | 347755-347783 | 8 | 0.724 |
CP024096_2 | 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100635-2100664 | 30 | KX827371 | Staphylococcus phage SpT99F3, complete genome | 30241-30270 | 8 | 0.733 |
CP024096_2 | 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100635-2100664 | 30 | MK075002 | Staphylococcus phage phiSP38-1, complete genome | 32276-32305 | 8 | 0.733 |
CP024096_2 | 2.5|2100701|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100701-2100730 | 30 | MN047793 | Xanthomonas phage Xoo-sp13, complete genome | 181943-181972 | 8 | 0.733 |
CP024096_4 | 4.8|2239428|37|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT | 2239428-2239464 | 37 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 92131-92167 | 8 | 0.784 |
CP024096_4 | 4.16|2239429|37|CP024096|PILER-CR | 2239429-2239465 | 37 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 92131-92167 | 8 | 0.784 |
CP024096_4 | 4.7|2239363|36|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT | 2239363-2239398 | 36 | NZ_CP020750 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed7, complete sequence | 37822-37857 | 9 | 0.75 |
CP024096_4 | 4.15|2239364|36|CP024096|PILER-CR | 2239364-2239399 | 36 | NZ_CP020750 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed7, complete sequence | 37822-37857 | 9 | 0.75 |
CP024096_3 | 3.1|2228813|37|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT | 2228813-2228849 | 37 | LC168164 | Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome | 180412-180448 | 11 | 0.703 |
1. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP014870 (Bacillus thuringiensis serovar tolworthi strain Pasteur Institute Standard strain plasmid pKK6) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg Protospacer *****************************
2. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010096 (Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMBLin15, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg Protospacer *****************************
3. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004882 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMBLin15, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggcttcggtgg Protospacer ********************.********
4. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011355 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC10, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggcttcggtgg Protospacer ********************.********
5. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_006945 (Bacillus phage GIL16c, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggcttcggtgg Protospacer ********************.********
6. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY701338 (Bacillus thuringiensis phage GIL16c, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggcttcggtgg Protospacer ********************.********
7. spacer 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to EU408779 (Bacillus phage AP50, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatctaaggctatcatgtagtatc Protospacer *************.***************
8. spacer 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004882 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMBLin15, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
9. spacer 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053974 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
10. spacer 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009346 (Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
11. spacer 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010096 (Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMBLin15, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
12. spacer 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045027 (Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
13. spacer 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005258 (Bacillus phage Bam35c, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
14. spacer 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY257527 (Bacillus thuringiensis bacteriophage Bam35c, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
15. spacer 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AJ536073 (Bacillus phage pGIL01, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
16. spacer 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP013282 (Bacillus phage pGIL02, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
17. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053974 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
18. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009346 (Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
19. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045027 (Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
20. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP013282 (Bacillus phage pGIL02, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
21. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005258 (Bacillus phage Bam35c, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
22. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KC152966 (Bacillus phage Emet putative gene regulator and hypothetical proteins genes, complete cds) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctccactttcggtttcggtgg Protospacer ***********.*****.***********
23. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KC152967 (Bacillus phage Sole hypothetical protein, putative gene regulators, and hypothetical protein genes, complete cds) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
24. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY257527 (Bacillus thuringiensis bacteriophage Bam35c, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
25. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AJ536073 (Bacillus phage pGIL01, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
26. spacer 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048762 (Bacillus phage vB_BtS_B83, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer tattttgggtagctgatgtagaagtaaaaa Protospacer *.******** **.****************
27. spacer 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020004 (Bacillus thuringiensis strain Bacillus thuringiensis L-7601 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer tattttgggtagctgatgtagaagtaaaaa Protospacer *.******** **.****************
28. spacer 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034552 (Bacillus cereus ATCC 14579 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatctaaggctgtcatgtagtatc Protospacer *************.***.***********
29. spacer 2.8|2100899|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004721 (Bacillus cereus ATCC 14579 plasmid pBClin15, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatctaaggctgtcatgtagtatc Protospacer *************.***.***********
30. spacer 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU071094 (Synechococcus phage S-SM1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
-agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer tagtgcta-caatcaaaaaaggtgctattgc Protospacer ***** * **************** ****
31. spacer 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014285 (Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850055, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtctgggttgctgatgtagaagtaaaaa Protospacer .. *.********.****************
32. spacer 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004821 (Bacillus prophage phBC6A52, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtctgggttgctgatgtagaagtaaaaa Protospacer .. *.********.****************
33. spacer 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049968 (Bacillus phage DK2, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtttgggttgctgatgttgaagtaaaaa Protospacer .. **********.***** **********
34. spacer 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX190832 (Bacillus phage vB_BtS_BMBtp13, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtctgggttgctgatgtagaagtaaaaa Protospacer .. *.********.****************
35. spacer 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK284528 (Bacillus phage DK3, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtttgggttgctgatgttgaagtaaaaa Protospacer .. **********.***** **********
36. spacer 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032612 (Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtctgggttgctgatgtagaagtaaaaa Protospacer .. *.********.****************
37. spacer 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018502 (Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p05, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cggtatgggttgctgatgtagaagtgaaaa Protospacer .* * ********.***********.****
38. spacer 4.2|2239037|37|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007513 (Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865
tgggacaaacatgctactttcttgaacgctcagtcaa- CRISPR spacer tgggacaaacatgctacttttttaaa-gcccaatcaag Protospacer ********************.**.** **.**.****
39. spacer 4.10|2239038|37|CP024096|PILER-CR matches to NZ_CP007513 (Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865
tgggacaaacatgctactttcttgaacgctcagtcaa- CRISPR spacer tgggacaaacatgctacttttttaaa-gcccaatcaag Protospacer ********************.**.** **.**.****
40. spacer 2.2|2100504|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU233956 (Bacillus phage 11143, partial sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtctgggtggctgatgtagaagtaaaaa Protospacer .. *.***** **.****************
41. spacer 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011738 (Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742401, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer ataacaagctatcaaaaaaggtgctattgt Protospacer * .***** ************** ****
42. spacer 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007051 (Staphylococcus phage 2638A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer atttgcaaaaatcaaaaaaggtgcaattga Protospacer * * *. *********************
43. spacer 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY954954 (Bacteriophage 2638A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer atttgcaaaaatcaaaaaaggtgcaattga Protospacer * * *. *********************
44. spacer 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034567 (Vibrio parahaemolyticus strain D3112 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer cgtgcaagcaatgaaacaaggtgcatatca Protospacer *********** *** ******** * *
45. spacer 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer agggcaagcaatcaaaaaagctgtagggga Protospacer ** ***************** **.*. **
46. spacer 2.9|2100965|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022088 (Bacillus phage Troll, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer ttttgttcttctacttttggttccggtgt Protospacer *. * ***.*************.*****
47. spacer 2.10|2101030|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053575 (Citrobacter sp. TSA-1 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tttaatgatgttgataagttgccccgcata CRISPR spacer atgagtgatattgataagttgtcccgcaaa Protospacer * *.****.***********.****** *
48. spacer 2.10|2101030|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG945606 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 4483-1602, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tttaatgatgttgataagttgccccgcata CRISPR spacer tttgatgatgttgataatttgcctcagatt Protospacer ***.************* *****.*. **
49. spacer 2.1|2100438|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN856040 (Bacteriophage sp. isolate 317, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttcgatgtttatccatccactcttcgacaa CRISPR spacer ctcgatgtttttccatccactcagcagctg Protospacer .********* *********** *..* .
50. spacer 2.3|2100570|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP050068 (Klebsiella aerogenes strain 035 plasmid p35, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
tacaaaaagtgactgagggggcttataac CRISPR spacer ccgggaaagtgattgagggggcttatgaa Protospacer . ..*******.*************.*
51. spacer 2.3|2100570|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020848 (Klebsiella variicola strain KPN1481 plasmid pKPN1481-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
tacaaaaagtgactgagggggcttataac CRISPR spacer ccgggaaagtgattgagggggcttatgaa Protospacer . ..*******.*************.*
52. spacer 2.3|2100570|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043927 (Klebsiella quasipneumoniae subsp. quasipneumoniae strain M17277 plasmid p17277A_477, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
tacaaaaagtgactgagggggcttataac CRISPR spacer ccgggaaagtgattgagggggcttatgaa Protospacer . ..*******.*************.*
53. spacer 2.3|2100570|29|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021699 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0158 plasmid tig00000727, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
tacaaaaagtgactgagggggcttataac CRISPR spacer ccgggaaagtgattgagggggcttatgaa Protospacer . ..*******.*************.*
54. spacer 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX827371 (Staphylococcus phage SpT99F3, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer tttcaacaaaattaaaaaaggtgcaattga Protospacer * * . ***.*****************
55. spacer 2.4|2100635|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK075002 (Staphylococcus phage phiSP38-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer tttcaacaaaattaaaaaaggtgcaattga Protospacer * * . ***.*****************
56. spacer 2.5|2100701|30|CP024096|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN047793 (Xanthomonas phage Xoo-sp13, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgaaaatttcggtaatgtaaaggtgtttag CRISPR spacer cgaagatttcggtaatgtaaagacccgtac Protospacer .***.*****************.. . **
57. spacer 4.8|2239428|37|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tgaacc---atttttcaataatcaatattcctttcttaag CRISPR spacer ---actttaatttttcaaaaattaatattcctttcttatt Protospacer **. ********* ***.***************
58. spacer 4.16|2239429|37|CP024096|PILER-CR matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tgaacc---atttttcaataatcaatattcctttcttaag CRISPR spacer ---actttaatttttcaaaaattaatattcctttcttatt Protospacer **. ********* ***.***************
59. spacer 4.7|2239363|36|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020750 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed7, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgcagtgaaccgttttatttagaagagcttgctgca Protospacer **.**.********************..* .**
60. spacer 4.15|2239364|36|CP024096|PILER-CR matches to NZ_CP020750 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed7, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgcagtgaaccgttttatttagaagagcttgctgca Protospacer **.**.********************..* .**
61. spacer 3.1|2228813|37|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT matches to LC168164 (Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
----catcaaaatcaaaaacagttaaattagatgcagatga CRISPR spacer gtgttacagaaac----aacagttgaattagatgcagatgg Protospacer .*. .***. *******.***************.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
157129 : 210997
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024096|157129:210997|DBSCAN-SWA 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55 | Bacillus_phage(26.67%) | transposase,protease,integrase | attL 156922:156970|attR 174090:174138 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
287355 : 295333
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP024096|287355:295333|DBSCAN-SWA CATGCTAAAGCCATTAGGTGATCGCGTTGTAATTGAACTTGTTCAAGCGGAAGAAAAAACAGCAAGCGGTATTGTATTACCAGACACTGCAAAAGAAAAACCACAAGAGGGTAAAGTTATTGCAGTAGGTACTGGGCGAGTGCTTGAAAATGGTGAGCGTGTTGCTTTAGAGGTAGCAGCAGGCGATCGTATCATCTTCTCAAAATATGCAGGTACTGAAGTGAAATATGAAGGTACAGACTACTTGATTTTACGCGAAAGTGACATTTTAGCAGTTATCGGTTAATTATATATTTAAAAAATCCAAGGGGGTCAATATTATGGCAAAAGATATTAAATTTAGTGAAGAAGCACGTCGTTCGATGCTTCGCGGTGTCGACACTCTTGCAAACGCAGTAAAAGTAACACTTGGACCAAAAGGTCGCAACGTTGTACTTGAGAAAAAATTTGGTTCACCACTTATTACAAATGACGGTGTAACAATCGCAAAAGAAATTGAATTAGAAGATGCTTTTGAAAACATGGGTGCAAAATTAGTAGCAGAAGTTGCTAGCAAAACAAATGATGTAGCTGGTGACGGAACAACAACTGCAACTGTATTAGCACAAGCTATGATTCGTGAAGGTTTGAAAAACGTAACAGCTGGTGCAAACCCAATGGGTCTTCGCAAAGGTATTGAAAAAGCTGTTGCTACAGCAGTAGAAGAGTTAAAAACAATTTCTAAGCCAATTGAAGGTAAATCTTCTATCGCACAAGTAGCGGCTATTTCTGCTGCTGACGAAGAAGTAGGTCAATTAATTGCAGAAGCGATGGAACGCGTTGGTAATGATGGCGTTATTACATTAGAAGAATCTAAAGGATTCACAACAGAATTAGATGTAGTAGAAGGTATGCAATTTGATCGTGGATATGCATCTCCTTACATGATTACTGATTCTGACAAAATGGAAGCAGTTCTTGATAACCCATATATCTTAATTACTGACAAAAAGATTTCTAACATTCAAGAGATCTTACCAGTGTTAGAACAAGTGGTCCAACAAGGTAAACCACTTCTTATTATCGCTGAAGATGTAGAAGGTGAAGCGTTAGCTACATTAGTAGTAAACAAACTTCGCGGTACATTCAATGTAGTAGCTGTTAAAGCTCCAGGATTTGGTGACCGTCGTAAAGCAATGTTAGAAGATATCGCAATCTTAACGGATGGCGAAGTAATCACTGAAGAACTAGGCCGCGACTTAAAATCAGCTACAATTGAGTCTTTAGGACGCGCTGGTAAAGTTGTGGTAACGAAAGAAAACACAACAATCGTAGAAGGTGTAGGAAGCACTGAACAAATCGAAGCTCGCATCGGTCAAATCCGTGCGCAATTAGAAGAAACAACTTCTGAATTCGATCGTGAAAAATTACAAGAACGTCTTGCTAAACTTGCAGGTGGCGTTGCAGTAATTAAAGTAGGTGCAGCAACTGAAACTGAGTTAAAAGAACGTAAACTTCGCATTGAAGATGCACTTAACTCAACTCGTGCAGCAGTAGAAGAAGGTATTGTTGCAGGTGGCGGTACTTCACTTATGAATGTATACGCTAAAGTAGCTTCTATTGCAGCTGAAGGCGACGAAGCAACAGGTATCAACATTGTACTTCGTGCATTAGAAGAGCCAGTTCGCCAAATCGCAATCAACGCTGGTCTAGAAGGATCTGTAGTGGTAGAACGTCTAAAAGGCGAAAAAGTAGGTGTTGGTTTCAACGCAGCAACAGGCGAATGGGTAAACATGCTTGAGTCTGGTATCGTAGACCCAGCAAAAGTAACTCGTTCTGCACTTCAAAACGCAGCATCTGTTGCAGCAATGTTCTTAACAACAGAAGCAGTAGTAGCTGACAAACCAGAAGAAAATAAACCGGCAATGCCAGACATGGGTGCAATGGGCGGCATGCCAGGAATGATGTAATTTCATTATTCGCTAAAACACTCATCTCTTTTCGAGAGATGGGTGTTTTTTGTTATCAAATTTCTCGAAATTATAGTAAAAAAGGTTTTATCGTAACCGAAATATAATTTCTGTAGAATTTTGTCGTGTTCTCTCTTGACCGTATTGATATTTCATTGTTAGAATCTAGAAAGATAATATAAAACAATCCTTCATATATCCTCAATAATATGGTTTGAGAGTCTCTACCGGGTTACCGTAAACAACCTGACTATGAAGGCAGTGCGTCTTATTGTTTATAAAGAGCAACATACTATCTTTATAAAGCTAGACTCCTGCCTTTTCTTTATTATGAGACGAGAGGTGGGGGACTGGCTTTTTTTATTATATTGGTAATGCTTTTTGCCTAATTTGGTGAAAATATTTATATACAGAACTAACGTTGGGGTGATTATTTTGAAAAAACAGCACGATACGATTATCGTTTTAGACTTTGGAAGTCAGTACAACCAATTAATTGCACGTCGCATTCGTGAGTTCGGTGTGTACAGTGAGCTTCATCCACACACAATTACTGCGGAAGAAATTAAAGCAATGAATCCAAAAGGTATCATTTTCTCTGGTGGACCAAATAGTGTATACGGCGAAAATGCATTCCACTGTGATGAGAAAATTTTTGAGCTAGGATTACCTATTTTTGGTATTTGTTACGGCATGCAGCTGATGACAAAACACTTTGGTGGAAAAGTAGAGCGAGCAAACCATCGTGAGTACGGAAAAGCAGTTCTGAAAGTAGAGAATGAATCAAAATTATATACAAACCTGCCAGAAGAACAAGTTGTATGGATGAGCCATGGTGACTTAGTAACAGGTTTACCAGAAGGCTTTGTAGTAGATGCAACGAGCGAATCTTGTCCAATTGCTGGTATGAGCAATGAAGAAAAGCAATTATACGGTGTACAATTCCATCCAGAAGTACGTCACTCTGAGCACGGTAATGATTTAATTAAAAACTTCGTATTCGGCGTATGCGGTTGTTCTGAAGGCTGGAACATGGAGAACTTTATTGAAGTAGAATTAGAAAAAATTCGTGAAACAGTTGGCGATAAAAAAGTGCTATGTGCACTTAGCGGTGGTGTAGATTCTTCTGTTGTAGCTGTATTAATTCATAAAGCAATCGGTGATCAGTTAACATGTATTTTTGTTGACCACGGTTTACTTCGTAAAGGTGAAGCAGAAGGTGTTATGAAAACATTTAGCGAAGGCTTCCATATGAATGTTATTAAAATCGATGCTAGAGAACGCTTCATGAAAAAGCTAAAAGGTGTAGAAGATCCTGAACAAAAACGTAAAATTATCGGTAACGAATTCATTTATGTTTTTGATGATGAAGCTGCTAAATTAGAAGGAATAGACTTCTTAGCGCAAGGTACACTGTACACAGACATTATTGAAAGTGGTACAGCAACTGCGCAAACAATTAAATCTCACCATAACGTAGGTGGACTTCCAGAAGATATGCAGTTCAAATTAATCGAGCCTTTAAATACGTTATTTAAAGATGAAGTACGTGTATTAGGATCAGAACTAGGAATTCCTGATGAAATTGTATGGCGTCAACCATTCCCAGGTCCTGGACTTGGTATTCGTGTATTAGGTGAAATTACAGAAGAAAAATTAGAAATTGTTCGTGAATCTGATGCGATTTTACGTGAGGAAATCCAAAAAGCAGGATTAGACCGTGAAATTTGGCAATACTTCACTGCGCTTCCTGGTATGCGCAGCGTAGGTGTTATGGGTGACGAGCGTACTTACGATTATACAGTAGGTATCCGTGCCGTAACATCAATTGACGGTATGACAGCTGACTGGGCACGTATCCCTTGGGACGTATTAGAGAAAATCTCTGTACGTATCGTAAACGAAGTAAAACACGTGAACCGCGTTGTATATGATATTACTTCTAAGCCACCAGCAACGATTGAGTGGGAATAAAACTATTTATTTGCAGGAAGATCCATCTTATATATAGATGGATCTTTTTTATACGAACAAAAAAAGTTTAACTTATAAAATTGTTCGTTTTTAAGTTGACATATATTTTTTTGTACGCTAATATGATTATATGATTGATACAAAAAGTGAATATTATAGCCGTCGTATAATCTCGGGGATATGGCCCGAAAGTTTCTACCTAGCTACCGTAAATGGCTTGACTACGAGGCGTTTTTATAAAGATAAGGGGAATTTATCTTTATTTATAGAACGCTTCCATGTATATAGGCAATGGAAGCCTTTTTTATTTTTTAGGATAAAAGAGGGCTAGGATGAAGTGCGACGAGTCATTATACAACGGAGGAAACGTAAGATGAAACGTTATTTTCAGTTTGATGAGCTCGGTACAAATTATAAGACTGAGTTCATTGCAGGGTTAACAACATTTTTATCTATGGCTTACGTACTATTTGTTAATCCTGCCACACTGTCACTTGGAAACATTAAAGGACTGCCGGCAGGAACCGGAATGGATCCGGGAGCAGTATTCGTTGCCACTGCATTAGCGGCAGCAATCGGTTCTTTAATTATGGGGATTTTTGCAAAATATCCAATAGCATTAGCGCCAGGTGTAGGGATTACTTCTTTCTTTGCTTACACAGCGGTATTAACAATGGGAGTTCCATGGCAGACAGCAATTGCGGGAACACTCGTATCAGGTATTATCTTTATTATTATTACAGCTCTTGGTATCCGTGAAAAAATTATTAATGCAATTCCTGCAGAGTTAAAACTTGCGGTAGCAGCAGGTATTGGCTTATTTATCGCCTTTTTGGGTTTTCAAAATGCCGGAATTATCGTGAAAAATGATGCGGTTCTTGTTGGATTAGGAGACTTAACAAAGGGCGCAACGTTGTTAGCGATTTTCGGAGTAGTTGTTACGATTATTTTAATGATTAAAAAGATAAATGGTGCAGTGTTCTATGGGATGATTCTTACAGCTATTCTTGGAATGGCAACAGGATTAATTGATACGCCAAAAGCTGTAGTAGGAGCAATTCCAAGTTTAGAACCGAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP024096|287355:295333|291650_292976_+|AWC63572.1|DBSCAN-SWA MKRYFQFDELGTNYKTEFIAGLTTFLSMAYVLFVNPATLSLGNIKGLPAGTGMDPGAVFVATALAAAIGSLIMGIFAKYPIALAPGVGITSFFAYTAVLTMGVPWQTAIAGTLVSGIIFIIITALGIREKIINAIPAELKLAVAAGIGLFIAFLGFQNAGIIVKNDAVLVGLGDLTKGATLLAIFGVVVTIILMIKKINGAVFYGMILTAILGMATGLIDTPKAVVGAIPSLEPTFGMALTHFGDIFTVQMGIVIITFFFIDFFDTAGTLVAVVNQAGLMKDNKLPRAGKALFADAIATVIGAILGTSTTTSYIESSAGVAAGGRSGFTAVVTAGFFLLALFFSPLLSVITPAVTAPALIIVGILMVSSLGEIEWKKFEIAVPAFFTIISMPLTYSIATGIAIGFIFYPITMVVSGRRKEVHPIMYVMGVLFVLYFIYVRK >CP024096|287355:295333|293845_295333_+|AWC67152.1|DBSCAN-SWA MSGILKKIIYKGICGVQKSLRVQLITTFALCSLLGIMGVWASSPFFQGINKYSVIDYSSGMRFIDTTAESLVAAIVREGASVNVQEVLERPEYQRELKVLIVDENGKVIYKTKGAQEEQINLHSTIRNIMSFKINRSQYEYQKDVIDNEIERERKEFTTFYPLTIEEKNMYMIASGIPQGNIREVQNDSPFPFLIGFVLFLFSFFYLTKRKMKQIEAMAEGVKEITKGNLQHRIPEKGQDELSLLAVNMNQMAEELFSNIEKERRIEKQKNELITNVSHDLRTPLTSIMGYLRLLRDSKYENKEQHDEYTRIAFTKSEQLKNLIEDLFEYTKLTNEKVILEKQEVCINELLEQLIEELVPQAEEEGLTFIKHFPEERMYATIDSEKMVRVFENLLMNAIKYSKDNGEIKVSLQRQRRDIQIIVANYSEEFTKEELANLFERFYKKDQSRSRVKEGSGLGLAIAKSIVELQGGQIRAHYEDGEIQFIVSLPIMEEK >CP024096|287355:295333|287355_287640_+|AWC63569.1|DBSCAN-SWA MLKPLGDRVVIELVQAEEKTASGIVLPDTAKEKPQEGKVIAVGTGRVLENGERVALEVAAGDRIIFSKYAGTEVKYEGTDYLILRESDILAVIG >CP024096|287355:295333|287674_289303_+|AWC63570.1|DBSCAN-SWA MAKDIKFSEEARRSMLRGVDTLANAVKVTLGPKGRNVVLEKKFGSPLITNDGVTIAKEIELEDAFENMGAKLVAEVASKTNDVAGDGTTTATVLAQAMIREGLKNVTAGANPMGLRKGIEKAVATAVEELKTISKPIEGKSSIAQVAAISAADEEVGQLIAEAMERVGNDGVITLEESKGFTTELDVVEGMQFDRGYASPYMITDSDKMEAVLDNPYILITDKKISNIQEILPVLEQVVQQGKPLLIIAEDVEGEALATLVVNKLRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTDGEVITEELGRDLKSATIESLGRAGKVVVTKENTTIVEGVGSTEQIEARIGQIRAQLEETTSEFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAATETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTSLMNVYAKVASIAAEGDEATGINIVLRALEEPVRQIAINAGLEGSVVVERLKGEKVGVGFNAATGEWVNMLESGIVDPAKVTRSALQNAASVAAMFLTTEAVVADKPEENKPAMPDMGAMGGMPGMM >CP024096|287355:295333|293118_293820_+|AWC63573.1|DBSCAN-SWA MRQETILVVDDEKEIRDLITIYLKNEGYNILQAGDGAEGLEVLENNEVHLVVLDIMMPKIDGIHMCMKVREQKEMPIIMLSAKTQDMDKILGLTTGADDYVTKPFNPLELVARVKSQLRRYMKMSGFMIENENEIEIGDIKINVSTHEVVVADREVKLTPREFSILELLVRNSGMVFSTEQIYEKVWNERSFQSDNTVMVHIRKIREKVEENARKPRYIKTVWGVGYKVEKEN >CP024096|287355:295333|289729_291277_+|AWC63571.1|DBSCAN-SWA MIILKKQHDTIIVLDFGSQYNQLIARRIREFGVYSELHPHTITAEEIKAMNPKGIIFSGGPNSVYGENAFHCDEKIFELGLPIFGICYGMQLMTKHFGGKVERANHREYGKAVLKVENESKLYTNLPEEQVVWMSHGDLVTGLPEGFVVDATSESCPIAGMSNEEKQLYGVQFHPEVRHSEHGNDLIKNFVFGVCGCSEGWNMENFIEVELEKIRETVGDKKVLCALSGGVDSSVVAVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEAEGVMKTFSEGFHMNVIKIDARERFMKKLKGVEDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEAAKLEGIDFLAQGTLYTDIIESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRVLGSELGIPDEIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRESDAILREEIQKAGLDREIWQYFTALPGMRSVGVMGDERTYDYTVGIRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVKHVNRVVYDITSKPPATIEWE |
6 | uncultured_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
328313 : 336685
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP024096|328313:336685|DBSCAN-SWA GATGATTAGTCGTTATACACGCCCTGAGATGGGTGCGATTTGGACGGAAGAAAATAAATTTAAAGCATGGTTGGAAGTGGAGATTTTAGCTTGTGAAGCATGGGCGGAACTTGGTGAAATTCCAAAAGAAGATGTGAAAAAAATTCGCGAAAATGCATCATTTAATATGGATCGTATTTATGAAATTGAAAAAGAAACACGTCATGATGTAGTAGCATTTACTCGTGCAGTATCAGAAACACCTGCATTAGGGGAAGAACGCAAATGGATTCACTACGGTTTAACATCAACAGACGTAGTAGATACAGCATTGTCTTATATTTTAAAACAAGCAAATGAAATCTTATTAAAGGACTTAGAAAACTTTATTGAGATTTTAGCAAATAAAGCGAAAGAACATAAATACACAGTTATGATGGGGCGAACACATGGTGTTCATGCAGAACCAACAACGTTTGGTTTAAAACTTGGTCTTTGGTATGAAGAAATGAAACGTAACTTGGAACGTTTCAAACAAGCAGCTAATACAGTTCGCGTCGGTAAATTATCAGGTGCAGTTGGTACGTATGCAAACATTAATCCATTTGTAGAAAAATATGTTTGTGAAAACTTAGGATTAGAAGCAGCGCCAATTTCTACACAAACATTGCAACGTGATCGCCATGCGCATTACATGTCAACACTTGCATTGATTGCCACATCTATTGAAAAGATGGCAGTTGAAATTCGCGGTTTACAAAAGAGTGAAACTCGTGAAGTAGAAGAGTTTTTCGCAAAAGGTCAAAAAGGTTCTTCTGCTATGCCGCATAAACGTAACCCGATTGGCTCTGAAAATATGACTGGTATGGCACGTGTTATTCGCGGTTATATGTTAACAGCTTATGAAAATGTTCCATTATGGCATGAGCGTGATATTTCGCACTCTTCTGCAGAACGTGTTATCTTACCCGATGCAACTATTGCATTAAACTATATGTTAAACCGCTTCGGTAATATCGTGAAAAACTTAACGGTATTCCCAGAGAACATGAAACGCAATATGCAAAGAACATACGGTTTAATTTATTCGCAACGTGTCATGCTTACTCTTATCGACAAAGGTATGGTACGTGAAGAAGCTTATGATATCGTACAGCCTAAAGCGATGGAAGCGTGGGAGACACAAGTACAATTTAAAGATCTTGTAGAGGCAGATGAGCGTATTACAAGCAAGTTAACACAAGAAGAAATCAACGAATGTTTCAACTATGAATATCACTTACAACATGTTGATACTATTTTTGAACGTCTTGGACTAAACTAAGCAGAAAATTTTATATGGCACAGAATAGCGTTATTCTGTGCCATTCTTTATAAAAATATTATTCACATTTTTCAAACTACAGGGGGCTTGCGAAATGCAAAAGCTAGAATTGCTGTATGAAGGTAAGGCAAAAAGAATATATCGTACAGAAGCAGCAGATATGGTTTGGATAGAGTACAAAGATAGTGCTACTGCTTTCAATGGAGAGAAAAAAGCGACCATTACAGGAAAAGGTCGTTTGAACAATGAAATTACAACTTTTTTGTTCAGAAAGTTGCAAGAAGTGGGAATTGAAACACATTTTGTAAAGAAGCTATCAGATACAGAACAACTTGTGAAAAAAGTAAGTATTATTCCATTAGAAGTTGTTACAAGAAACGTCATTGCAGGGAGCCTTTCCAAACGATTAGGAATGGAAGAGGGAATACCACTTGCCAAACCAATCGTAGAATTTTACTACAAAGATGATGATTTAGGAGATCCTCTTGTAACAGAAGATCATATTCGTGTGTTAAACGTTGCAACATTAGAGCAGATAAGTACATTACGAGAAAAGGCTCTACGAATCAATCAAGTTTTGATTGAGCATTTCGCAAGCTGTCGTGTAAGGTTAATAGATTTTAAATTAGAGTTTGGTATTACAGAGGAAGGCAAGATTGTATTAGCGGATGAAATCTCACCAGATACTTGTCGTTTATGGGATGAAGAGAGCAATGAGAAATTTGATAAAGATGTATTTCGCCGCGATTTAGGTAATTTAACCGAGGCATATGAAGAAATTTTAAAACGTTTAGGAGGGGCTTCACATGTATAAAGTTAAGGTATATGTAACATTAAGAGAGAGTGTATTAGATCCACAAGGAACAGCAGTAAAAGGTGCTCTTCACAGCCTTTCCTTTACAGAAGTACAAGATGTGCGCATTGGTAAATATATGGAGTTAACAATTGATAAATCGGTAACTGATCTTGATAGAAAAGTAAAAGAAATGTGTGAAAAACTATTAGCAAACGTTGTAATGGAAGATTTCCGTTATGAAATTGAGGAGGTTGTCGCACAGTGAAATTTGCCGTAATCGTTTTTCCAGGTTCGAACTGTGATGTTGATATGTTTCATGCAATTAAAGATGAGCTTGGTGAAGATGTAGATTATGTTTGGCATGATGCAGAGAACTTAGACGAATATGATGCGATTCTTTTACCAGGTGGATTCTCTTATGGTGATTACCTTCGCTGCGGTGCCATTTCTCGATTTGCGAATGCAATGAAAGCAGTGCAAAAAGTTGCTGAGCAAGGAAAGCCTATTTTAGGCGTGTGTAATGGATTCCAGATTCTTGTTGAATCAGGATTATTACCAGGGGTATTGATACGAAATCAAAACTTAAAATTCATGTGCCGAACTGTTCCGTTACGTGTTGAAAATAATGAAACGATGTTTACATCACAATATAACAAGGGGGAAATCATTCATATCCCAATTGCACATGGTGAAGGAAATTATTATTGTGATGAAGCAACTCTTAAAAAATTAGAGCAGAAGAATCAAATTGTATTCCGTTATGTAGACAATCCAAACGGAAGTGTTTCAGATATTGCAGGTATTGTAAATGAAAAAGGTAATGTGCTTGGCATGATGCCACACCCAGAGCGTGCTGTGAATGAAATTCTTGGCGGTGCAGAAGGGTTAAAAGTCTTTCAATCTATTTTGAAATATTGGAGGGAAACATATGTCGTTAATGCTTGAACCAAATCCAACACAAATTAAAGAAGAACGTATATATGCGGAAATGGGGTTAACAGACGAAGAGTTTGCCATGATTGAAAAGATTTTAGGACGTCTGCCGAACTATACGGAAACAGGGCTTTTCTCTGTTATGTGGTCAGAGCATTGTAGTTATAAAAACTCAAAACCAGTTCTTCGCAAGTTCCCAACAACAGGAGAACGTGTATTACAAGGACCTGGAGAAGGCGCAGGTATTGTAGATATTGGTGATAATCAAGCAGTTGTATTTAAAATGGAAAGTCACAATCATCCTTCGGCAATTGAGCCGTATCAAGGTGCAGCAACAGGGGTTGGCGGTATTATTCGTGATGTATTCTCTATGGGAGCACGTCCGGTTGCATTATTGAACTCACTGCGCTTCGGTGAACTCCAATCACCACGCGTGAAGTATTTATTTGAAGAAGTAGTTGCAGGGATTGCAGGATACGGTAACTGTATTGGTATTCCAACTGTTGGCGGAGAAGTACAATTTGATCCATGTTATGAAGGAAACCCACTTGTCAATGCAATGTGCGTTGGGTTAATTCATCATGAAGATATAAAAAAAGGGCAAGCGCACGGTGCTGGTAACACGGTTATGTATGTCGGTGCTTCAACAGGACGAGACGGTATTCATGGTGCAACTTTCGCATCAGAAGAACTATCTGAGAGTTCAGAAGCAAAACGCCCAGCAGTACAAGTAGGCGATCCGTTTATGGAGAAACTTCTTATTGAAGCATGCTTAGAGTTAATCCAATCTGATGCGCTTGTTGGAATTCAAGATATGGGCGCTGCGGGCTTAACATCATCTTCTGCGGAAATGGCAAGTAAAGCGGGAATGGGTATTGAAATGTATTTAGACGATGTGCCACAGCGTGAAACAGGTATGACACCATATGAAATGATGTTATCTGAATCACAGGAACGTATGTTGATTGTGGTGAAAAAAGGTAGAGAGCAAGAAGTTGTAGAGTTATTTGAAAAGTATGGCTTAGCGGCAGTTGCGATGGGAAAAGTAACGGAAGATAAAATGCTTCGTTTATTCCATAAAGGTGAAATGGTAGCAGAAGTACCTGCGGATGCATTAGCAGAAGAAGCGCCAATTTATCATAAACCTTCAAAAGAGGCAGCATATTTTAGGGAATTTCAAGAAATGAAAATGAAGACGCCAAAAGTAGATAACTATAAAGAAACATTACTAGCTTTATTACAACAACCAACGATTGCAAGTAAAGAATGGGTATATGATCAGTATGATTATCAAGTACGCACAAGTACTGTTGTTACACCAGGATCAGATGCAGCGGTGGTGCGAGTACGTGGTACAGAGAAGGCATTAGCAATCACAACGGACTGTAACTCTCGTTATATTTACTTAGATCCTGAAACGGGCGGTAAAATTGCAGTAGCAGAAGCTGCGCGTAATATTGTATGTTCTGGCGGAGAACCACTTGCAATCACAGATTGCTTAAATTTTGGTAATCCAGAGAAACCAGAAATTTTCTGGCAAATTGAGAAATCAGTAGATGGTATGAGCGAAGCTTGTCGTACATTACAAACTCCAGTTATTGGTGGAAATGTATCAATGTACAACGAGCGCAGCGGTGAAGCTGTATATCCAACACCAACTGTTGGAATGGTTGGGCTTGTTCACGATTTAAAACATGTAACAACACAAGAATTTAAGCAAGCTGGGGATCTTATTTATGTTATGGGTGAAACGAAAGCTGAATTTGGTGGAAGTGAATTACAGAAGATGATGTACGGTAAAATCTTCGGTCAATCACCAAGTATTGATTTAGAAGTAGAAGCAAAACGTCAAAAACAATTACTAGAAGCAATTCAGGCGGGACTTGTTCAATCGGCACATGACGTTGCAGAAGGCGGATTAGCAGTTGCGATTGCTGAAAGTGCAATCGGTGCGAAAGGATTAGGTGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP024096|328313:336685|336097_336685_+|AWC63591.1|DBSCAN-SWA MNRLAIFASGSGSNFQAFVNAVEENRLHAEISLLVCDQPEARVIGRAHYHHVPCFAFSAKAYESKEAFEKEILKKLREYEIDFVILAGYMRLIGPTLLEAYGGKIINIHPSLLPSFPGKDAIGQALKAGVGVTGVTIHYVDAGMDTGPVIAQEAVQVSENDTRDSLQKKIQQVEHRLYVNTVNKIIQSMKERTVK >CP024096|328313:336685|331339_333559_+|AWC63588.1|DBSCAN-SWA MSLMLEPNPTQIKEERIYAEMGLTDEEFAMIEKILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTTGERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELQSPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEVQFDPCYEGNPLVNAMCVGLIHHEDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSESSEAKRPAVQVGDPFMEKLLIEACLELIQSDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMYLDDVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLIVVKKGREQEVVELFEKYGLAAVAMGKVTEDKMLRLFHKGEMVAEVPADALAEEAPIYHKPSKEAAYFREFQEMKMKTPKVDNYKETLLALLQQPTIASKEWVYDQYDYQVRTSTVVTPGSDAAVVRVRGTEKALAITTDCNSRYIYLDPETGGKIAVAEAARNIVCSGGEPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSVDGMSEACRTLQTPVIGGNVSMYNERSGEAVYPTPTVGMVGLVHDLKHVTTQEFKQAGDLIYVMGETKAEFGGSELQKMMYGKIFGQSPSIDLEVEAKRQKQLLEAIQAGLVQSAHDVAEGGLAVAIAESAIGAKGLGATVKLAGEATAALFAESQSRFVVTVKREQQEAFEKVVEAIQVGEVTNTNEVTIHNEENEVLLTANVDEMRKAWKGAIPCLLK >CP024096|328313:336685|330672_331356_+|AWC63587.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMFHAIKDELGEDVDYVWHDAENLDEYDAILLPGGFSYGDYLRCGAISRFANAMKAVQKVAEQGKPILGVCNGFQILVESGLLPGVLIRNQNLKFMCRTVPLRVENNETMFTSQYNKGEIIHIPIAHGEGNYYCDEATLKKLEQKNQIVFRYVDNPNGSVSDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVNEILGGAEGLKVFQSILKYWRETYVVNA >CP024096|328313:336685|328313_329615_+|AWC63584.1|DBSCAN-SWA MISRYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGEIPKEDVKKIRENASFNMDRIYEIEKETRHDVVAFTRAVSETPALGEERKWIHYGLTSTDVVDTALSYILKQANEILLKDLENFIEILANKAKEHKYTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGLWYEEMKRNLERFKQAANTVRVGKLSGAVGTYANINPFVEKYVCENLGLEAAPISTQTLQRDRHAHYMSTLALIATSIEKMAVEIRGLQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGMARVIRGYMLTAYENVPLWHERDISHSSAERVILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMQRTYGLIYSQRVMLTLIDKGMVREEAYDIVQPKAMEAWETQVQFKDLVEADERITSKLTQEEINECFNYEYHLQHVDTIFERLGLN >CP024096|328313:336685|330421_330676_+|AWC63586.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGTAVKGALHSLSFTEVQDVRIGKYMELTIDKSVTDLDRKVKEMCEKLLANVVMEDFRYEIEEVVAQ >CP024096|328313:336685|329709_330429_+|AWC63585.1|DBSCAN-SWA MQKLELLYEGKAKRIYRTEAADMVWIEYKDSATAFNGEKKATITGKGRLNNEITTFLFRKLQEVGIETHFVKKLSDTEQLVKKVSIIPLEVVTRNVIAGSLSKRLGMEEGIPLAKPIVEFYYKDDDLGDPLVTEDHIRVLNVATLEQISTLREKALRINQVLIEHFASCRVRLIDFKLEFGITEEGKIVLADEISPDTCRLWDEESNEKFDKDVFRRDLGNLTEAYEEILKRLGGASHV >CP024096|328313:336685|333543_334959_+|AWC63589.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGIFGIWGHENAAQVTYYGLHSLQHRGQEGAGIVVNNGEKIIGHKGLGLVSEVFSRGELEGLNGKSAIGHVRYATAGGSEVANVQPLLFRFSDHSMALAHNGNLINAKMLRRELEAEGSIFQTSSDTEVLLHLIKRNTKGSLIESVKDALNKVKGAFAYLLLTSHEMIVALDPNGFRPLSIGKMGDAYVVASETCAFDVVGATYIRDVEPGELLIINDEGIQVDRFTNEVEHAICSMEYIYFARPDSNIAGVNVHAARKNMGKRLAMEAPIAADVVTGVPDSSISAAIGYAEATGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVRMLREAGATEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHSVEEICQIIGADSLTFLSEEGLVDAIGRPYEGKYGGLCMAYFNGDYPTALYDYEQELLESMK >CP024096|328313:336685|335061_336105_+|AWC63590.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVSRMKKHVQTTMRKEVLGGLGGFGGMFDLSKLPLEEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMADKHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYIACGKADPSKIEHIVKGIAEGCRQAGCSLIGGETAEMPGMYSKEEYDLAGFTVGIVDKKKIITGHSLDEGHVLIGLASSGIHSNGYSLVRKVLLEDGQMSLDRIYGRLELPLGEELLKPTKIYVKPILELLKKYEVYGMAHITGGGFIENIPRMLPKGIGAEIDLGSWNIQPIFSLIQEVGKIEEKEMFNIFNMGIGMVVAVKEENAKAVVRLLEEQGEKAYIIGRTVKGSGVAFNGGIDHE |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
758214 : 796403
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP024096|758214:796403|DBSCAN-SWA 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>CP024096|758214:796403|769599_770901_-|AWC63947.1|DBSCAN-SWA MFNLSKHKTSIKTEIMAGIITFLTMAYIIVVNPVILGDAGVPFEQAFTATIIAAIVGTLFMAIFTNLPIAIAPGMGLNAYFSYSVVKAHEGMTFTIAFSAVFVAGMILILLSFTSFRTKLMEVIPNNLKHAITAGIGLFIAFIGLRMTGIVTKHDSNLVGLGDLHSAPVLLAFAGLGITLILMSLNINGAIFIGMLLTGIIAYFTGQLTFSNGITSMPGLPEGIIVSNPITAVSDVIQYGLYGVVFSFFLVTLFDTTGTLLGVAQQGGFMKDGKLPKSGRALLSDSFSATIGSMFGTTPSTAYIESSAGVAAGGRTGLTTITVAVLFVAAAFFGPLVSAVSGVSAITSPSLIIVGSLMMGAVRNIDWDVFDEAFPAFLVILSMPLTSSISTGIALGFISYPLMKMAKGKFNAVHPLVYIFGILFAYQLIFLPH |
39 | Thermus_phage(20.0%) | coat,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1109696 : 1177149
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP024096|1109696:1177149|DBSCAN-SWA 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60 | Bacillus_phage(36.36%) | coat,integrase,bacteriocin | attL 1170583:1170600|attR 1178019:1178036 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2353185 : 2421160
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP024096|2353185:2421160|DBSCAN-SWA GTTAAATATAAGCTACTTTTATAGCCAGATCTTCTATTGTTTGAGGAGTTTTATAACCGATGCTACTATGGATTCGCTTACGATTATAAAATCCCTCAATGTATTGAAATAGTGCTAGATTTGCTTCTTCAAATGAGACATATTTTGTACGATATACTTCTTCTTTCTTTAAAATGGCGTGAAATGACTCAATACAAGCGTTATCGTATGGACAACCTTTTTTACTGAAAGAAGGCTTTATTTTATAATTCGCGAGTAAAGTTTGAAATTCCTGACTTGTATATTGTGTTCCTAAATCAGTATGTAAAATGAGCCCTTTTTGTGGTCTTTGTGTATGGTAAGCGTTTTCTAAAGCTTTTACCACAAGGTTCGTTGTCATATTTCGTGAAAATGAATATCCAATAATTTTCTTAGAATGCAAATCCATCACTGATGCAAGGTAACACCAGCCATCTTTTTGCGTGTGAATATAAGTAATATCCGCCACCCACTTTTCATTAATTGTCGTTGTAGAGAAGTCCTGTTCTAGTAGATTTATTCGTTCTTCTATAGTTGATTTTGATGAATGTGGTTTATATTTCTTTAAGATGATGGAGCGAATATTTTCTTTTTTCATGAGTCGTTGCACACGCTTTACACTTACTTGAAACCCTTGTTCCAATAGGGTTTGATGAATTTTCGGTGCACCGTAACGCCCTCCACTATCTTGATGAATTTGTATAATTTGTTTGGTTAACTCTTCATTTTCACGACTACGCTTTGACTCTGTTTTGTGCTGAGATTGGTAATACGAACTTCTCGCTATTCCAAGTGTTTGACACATTGTACGAACAGAGTGTGTTTCTTTTTGACAATCGATAAATTGATGTAATTCTGTATCATTTATTTTTTCGCGAATATGGCCATAGCCTTTTTTAATATCTCATTCTCCTCTTTCAGGCGAAGCATTTCTTTTTGCATTCGTTTTAGATCTTCTGGAGTCATTTCTTCCTCATCAATCGTTGTGATAGGAGAATATTTTTTAATCCATTTATAAATCGTTACTTCTGATATACCATACTCGCTGCTTAATTCTTTCACAGATTGGTCTGAATGATATAATTCAACAACCATCTTTTTAAATTCTTCATTAAAGTTCTTGTTTGCCATACGGACACTTCCTCCTTGAAATCCATTGTAAGGACTTAACTAAGTTGTGTCCATATGACTATACTAACTCCACCTTGAATAATAACTTTACCATTATCCGGTTCATCTAATAACCCAATTATATTAAGTAATGTAGATTTCCCTGTACCACTTTTCCCCATAATCCCAACGAACTCATTATTATAAATACTAACATTAAAATCTTTAAAAATATATTGATCCCCATACTTTTTCATGATGTTCTCTAATTTAATTTCTATTTCTTTTTTCATGTACTCACCCCTCTTTTATAACTTGTACCATTTTCTTTTGTTCACTTTTCTTAATCAATAAATAGATAAATAAATTTTCTAAAAGAAGGATACAGAAAACAAGATATATAAAATCAAACTTCTCTAATATACATAAAATCAACATTGAAACAAACCAAACGAAATTAGTAAACATCAAATATAATTTATGTCTTTTAAAATAAGAATAACCATGTATTATCTTAATAGTATGTTTCAATTTATACTGTTCTAAATAATTTAATGTTGTAAACATACTTATAAACAAATAACCCAACAAAGCAACAAATAAAACAACTAAAAACTGATATGCTCTTTCTACATGTATTTGAATTATACCTTCAATACGATCGTAGGCATTATATAATACTGGATAAAATTCTTGTAATCCTAAATTTTCAATCTGATCCTTAATATTATTATATGGTATTTCTTTATCTAATAACTTTATAAAATAGCCATTATTTCCAACAACTGTATCATACCATGCAGCTTCATTACCATTTGCATTAGTTAATATCATCGCAATACCATCATAAAAACGATTATTGGTATCTGACGCGATATCATTAGAAAAAGAAAAATACGATTGATTATTCTTTATCCAAATTATATTTATTACTATATCCTCTTTATCAGGAAGCTCTTTACCGGCATCTTTTAAAAAAGTATTTTTGACTTTATATTTTTGAAGATAATATTCTTCTTCAAAATATCTTCTTAATTCTTGCTCATCTTTTTTATACTTCTCTGGAACTAAAACCGTAAGTCTATCATCATCTTCTTTAATATCAATTAACTTATCATCTAACCCATATATTGGATTTAATTTCAAATAATTATTATTAATAAGTATTGTTTTTTCTTCATAAACAGAAACACCTTCAACTTCCATTCCCATCTGTTTTGCCCTGTAAGCATCAGAAAATCGAGCTAAGATTGCACCTCTGTCATTTGTATACTTAAATAATTTATATTTTTTATCAAACATTTCAAGAATAGCTTTAGGATCATCACCACTTGGTAAAGGAGCTTTAGTTGGCATAACTCCATATGATTTCATTTGTTCCCATTCGTTTGCGTTTTTATAATAATATCGATAGGAATCCGAAAAAGCACTATAAGAAACAAAAAGTAAATATAATATAATCACCGAAAAAATCACTTTTACCAAACTATTTACAATTTGTATTTGTTTTAAAGGCTTTTTGTTTTTTATACTTGCAGAAATTGAAATTTTTCCAACTCTTATAAAAAGAAGTGACATAATAAAACAAACTATCATTCCGATTATAAATTGATAAAACAAGTAATCAATAATTATCTTAAACCAATACAAACTAAACAATGAATTTTTCATTGTTATAAAAATCATAACAACTGTAGTAGAAATAATTAAAGCTAAAAAATACAATTTAAATATTTGTAGAAAATATCTTTTCCAAATATCTAAAGATCCATAACCATTTAACAATCTAATAGCAGAGTTTTTATACTCTAAAAAATAATAATAAATAATCATAAATAACGATAAAACATACAACAAGATAATAGGAATGATTTTTAACCAAGATGATGTATCAATAACAGAATTATACTCATAACTAAAATAATTAATTTTCATGCCTAAATCTCTCTGTAATCTATCTATAAAAAGATCAATTTTACTATTATCGTTTAAAGAAACTATATAATCTCCAGCCACTGACTTATCTTTTGGAAACATTTTTAATGGTTTAATACTAAAATTATTGTCTTCCTTATAAGAAAATATTTCTCCTGTTACACCCTTACCTTTTGATGTAGAAATATTAAATTCATCAGATTTATTATCTGGAAATACTCCATCTAACAGTAAGAAATTTTCAAAATAAGAATCTGTATCATGTGCAAAATAAACATATTCCACTGATTTTTTTTCCGAATAAACAGATTTGAATACATTTGCATTATAATCATCAGAAACCTTAAATAATAATGATAAAAACTTCTCTGAATCAATTTTTAAAGAATTTTCATTAATAGTCACAACAAAACTATCTTCTTTTCCTGCCTTTTTCATTGAATCTTCTTGTTTACTAGAAAGCAAATCAAAATATATAAAAGATGAAAAAGAAAAAACAACTATGTATAAAAGAAATAAAAATCTTTTCATATATACTCTCTTTCTTTAAATTAATGATAATTACTAAATCAATAAAAAAGGGAGCAAAAAGACATTATAAACCAAGAATTTTTATACTCCCTTTATCTGCTATTTAATTAAATTACAAATAAACTATTGAACATCATAATATGATCTATAAGTATTCAATTCCTTATAATATGATGTTAGAGCATTAGCTGGTTTCCCTGGATTTTTCCATCCACTATAATCATACTCCCCATTTGCCATAGCTGTTCCTTTATGTACTCGAGAGCTATGTTCATAATCAGAGAATTGAGCTAAATCTAGTCTCCAACCCATTTTTTGACCTTACACCATTTTCCACCATCTACATTAAGACATGTACCTGCCCCAAAACTTGCACGCTGTGTTTGTGCTTTTTGAGCTCCATTAAGAACAGGCTGTGCTCCAAATTCAACATTTGTAAAACCATGTTCAGTATAAATCATTTGTGGCCCAGTTGATGTGTTTTCCTCCGCCGCAAAACTTGTTGCAGGTGAAACTAACACAGCACCACATAATCCTAAAGATAAAATCCCCTTACATAAAACCATTACGCGACATAAAATCTCTCCATTCATAAAATATTTTACTAGTTTTAACTAGTATAAAACTAAAATTGACATATATTACAATTAAAGTAAAAAGTTTACTTTACAGAATAATAGATTAAAATAAAATTAACTTTAAAAATTCGAATAATAAATAACAAAAAATCCATATAATACGTTTAGAACTTCATAATTTTAAAATTTTGTAATAATTTGTAAGTAATTATAATATAACTAAAAAGAAAAGGAAACCCTTACATTTTTAGGGAAACCTCTATAAAAATTTCTAATGCGCTGTTTTTACCTTCTACTTCCGTTAACTTTTTCTCCTTATTAGCTAAATGCTCTTTTGTGGTAACCAATTCATTCGTAATTTCGTGTAGTTTTGAACGAGTGCTTGATTGAATTGATTTTGCAATTCCTGATTTTCTAATACTTTATCCAATTTCTTTTCTAATTCCGACTTTTCTTCTTTTGAAACAAATAAATCAAGTTCTCCATTTCGCTATGATCGAACTTAATCATAAGATCATTTTTGTCCCTGTATTTTTTCTTTAATTGCTTTTAATTCCTCTATATTTTTCTTAGAATACCTGCGGTGCCCTCCCTGACTTCGCTCTGTTTGTATATTAAATTCATTTGACCATACTTTTAATAAATCGGGAGCCACCCCTAAACAATCTGCAACAATTTTCGGTGTATACATTTTGCACTAAACATTACGCGTGAGTGATCTACTCCAACTCGAAACACAAACCATAATAAAATTAAAACGGAAAAAGAGAAAAGAATTCAAAATCAAAGAAGGAAAAACAAAGAAAGAACGCATGATTAACCTTATTT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55 | Bacillus_phage(38.89%) | tail,holin,integrase,transposase,bacteriocin | attL 2348351:2348367|attR 2382160:2382176 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2429502 : 2442613
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP024096|2429502:2442613|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP024096|2429502:2442613|2436187_2436793_-|AWC65422.1|DBSCAN-SWA MTAIECVGKSDRGAFLWKFKCDCGNEVVKEGRTVKRGDIKSCGCLVVEHAKYLNYSNGFGRTKLYGVYKGILDRCNNPENKSFKDYGGRGIKVIEEWEADYLVFMEWALANGYKDGLSIDRIDVNKGYSPENCRWATRDVQANNKRNTILINYKGKTQSLKRWCKELNLNYYTIHSRITRNNYSYIDALEKPIKYRKEETK >CP024096|2429502:2442613|2435957_2436191_-|AWC65421.1|DBSCAN-SWA MTNVIVYTKNACPTCKQVLWSLNAANVPYKTRNIDEDPSHAAWMADKGYMSAPVTVFPSGKEVVGFDMGEFAVELGL >CP024096|2429502:2442613|2439245_2439773_-|AWC65427.1|DBSCAN-SWA MTNRKKTFRVLSVDTSLGSPGIAVIDVINGKPKLIDVSHVKTKSTEPIALRTKTIEAWAHLFIRKHAPYDLIVREGFASKIPHTNYTVFSAWNAVDRALNDFGLKVDDSIGQASVKKKLLGKGRAEKEEVEAGVRRYVEWGVFKTSDESDACAIGLAYLIDKGIVMKVNPKEETE >CP024096|2429502:2442613|2436853_2437480_-|AWC65423.1|DBSCAN-SWA MLCNAKKIAITGKARSGKTELSHYAWMLYGFKEFDFSTVLKDEFHRLFPHIPRDPKPRAYYQKFGQWLREIDPDIWVKMTMDNVHKYCFEDSLNKVNHKPKVLVNGVRQPNEYQWLREEGFIIIRVNASDDLRIDRTHSAGDIFTESDLKHETESHIDTFKVDYEINNLGSIGEMYDQFDAIMRNIGVQSVSNKEIMADAFSDLRVIL >CP024096|2429502:2442613|2432747_2433572_-|AWC65417.1|DBSCAN-SWA MSTLRIIDVTTGEDRTQEYSLVNRKQAEGYKRAIEKEQYRLLTRGKNWVASYHDPIREVITGLTLKEAGAIIKLLPFLRFKSDGKLIKDGKPLKQQDIQRIFKRGKAATTKILNRLEELSVIHVIKEGRSNVYYISANFHTMGDVKDGESFTKLYQVKTQEIVADLDLNEVGLLYKILPFFHFQTYYLCSNPNEQDAKEIKHLNREELAEVTGHDLATISVTVNKLRSKGVIMTTNSRNSVRYLVHPDVMYRKDTEDEYTEVVRRMFAEHIAQI >CP024096|2429502:2442613|2435307_2435946_-|AWC65420.1|DBSCAN-SWA MKRYYLPEMDVFNRYEPKVRNKLIKGYHRKLASKHRYFVRYQVSKERPFYTDADLSEIISVLDDIEIINCRWDAKEWNITPWNYFVNSGKVYEGYKDMNAIPFAQGYSGDDVGKRTDDGFYYKYFNGNNCAYWRDRNSETPTWHLRYGNQYVNLRNDNFYVGIFGSTKETKHVPAELVLPLLKQMNAKKWRGFYDDEIDFILEQTGIERRLL >CP024096|2429502:2442613|2439769_2439994_-|AWC65428.1|DBSCAN-SWA MKTVNVTYFKRSGKYYTSETIEISEELNGYEALAEEIPKHHRIKEMVMLVQDSEDGKEPYIVPHLYNPKVGSFE >CP024096|2429502:2442613|2434545_2434923_-|AWC65419.1|DBSCAN-SWA MGVSKYDNEAAHRRIEQNYALDNPKSIDLLLRHLPYMQERRFNGDYAASDILIDLETAISTADLTDRQRQVLRLVYWDDLTQEMVGERLGVRQEAVKRHIRIAVVKISRVFECWARRGEGYKLTV >CP024096|2429502:2442613|2437481_2438114_-|AWC65424.1|DBSCAN-SWA MAEIVKIESKDGNIYEVDGKRYRELTKEPAIGDTVLVVDAWEDGEGYEEGEVHTLTKILSRNHEDVNAVRFVDKEGRNNYLKLSEFVIVEPIESETPSHLPYLSDILDDIKTKLTRLEERTEENHRNILTFSQTAESARSDASKAIGGVNALDEQLDLVREDIVFLDEKIDELKETTQTQGTPQNITININVLDIGSAKAIVESFTKGRE >CP024096|2429502:2442613|2438256_2438565_-|AWC65425.1|DBSCAN-SWA MKPVKAQCETCNHVFIARFHKLRLPNRVDKHFFICPNCKEEYVSYYSNRKMRQLQREISEMYGKFRKCRTEEEAELLNMKLQKKQAEYRRVRDELKTEVEGE >CP024096|2429502:2442613|2439993_2441040_-|AWC65429.1|DBSCAN-SWA MVTKTNAAQLLRQNTQETFAYEIAEEFRQFLETWHSYSEPYDTSLDIWLHESYAKVLSKGTFLDYRSLPYFSPSSANSCPRELYEKALRSPRDQTEVKPWQRRWQFLGTSVGDAIQRDILLAERHYEKFTGEKPRFKFERTKDGYPAFEDFVKTRKVIEHNNQQFALIGTCDGILEYIDEHGVITRVGLEIKSKQTTYSKTSEYSLREPGADHVKQVTCYSLMYDLDYYIVLYMNASKKAWNMSEEDYMKYPDFRAFGVAITDDMRDEVLNKFASVVAAVKTKQPPKLDIEHWTFNNFKTACAQSLSDGEYEEIKTQVSRVKRSSLSDAKKAPYIGALEFIAKVREGM >CP024096|2429502:2442613|2438564_2438960_-|AWC65426.1|DBSCAN-SWA MSDKLNELFELQSELDNRIISERNINKSIDEWVVGITLAMESEIDEIRREVNWKWWKNEKEIDKEALQGEVIDMWHFLISLSLKCGLSSEDVYRIYLEKNRENHARQDGTSSKEGYAVGQLEFDFENGGVK >CP024096|2429502:2442613|2429502_2431206_-|AWC65415.1|DBSCAN-SWA MAWLDGKWLARQERQQAINDRLLLRKEYEKLASKGDLLEHDVTQWEALEDELEKLQRVHACEHDVLRFTYEYFSDELNPDNESNLIPAGQTLETAADFHRTLCSLLNDITEGKTKSNVGWSVGRRHAKTAYLSNSYLCHQVVYRLQKYIVEVSETTDVAGDFIKWTVNQLKFNEKLREDFGGILHPKPSMNEVDNKYEFITSTGTKVEAKGIGTQMRGLRHLSERPGLFILDDLESGENTNTPELRAKNLHWFRSEMIEALGFGGICVYMGTIVHYDSLLNHVLTKRKDFISRKFPAVLSWSEREDLWEEWRKLYNADEKDAVDQADAFYEANKDEMLRGTQVLWPQAYDYKYFMEKRESMGARAFNQEYLGNPVDEESQVFKPEYFTYWTDKDIENKQLEYFCGIDFAMGKEKGDYSVILTVGRSPNGIFYVVDTFIERVHPDILLKKAVEKSLQYQYSGIAVEAQQAQEWFADKLSQALQQAGYPSATRMKQIKQRTRKALRIESLLPDIQSGRIRFKKEQRLLLEMLEMYPNHNHDDGPDALHMAVSTGSNSHTVVRTIRKRMR >CP024096|2429502:2442613|2433967_2434534_-|AWC65418.1|DBSCAN-SWA MNSMSNSIINELYTCLKNDIPYRLIGADYDLRNRLERATVVDILSNYYTMDERSLKRLSDFLVNEELTDSHPDKMSREEYPFMSDTQLSRRVAGIHRKRDGKGILEVQIGLAENYGTDGRNYNRPLRRKRTFKENMYVDEQVLSRNKERRKKYSSFINGKTNGVYTVDLETGDKTVHDDKKYEEIYQK >CP024096|2429502:2442613|2441053_2441209_-|AWC65430.1|DBSCAN-SWA MINLSEVSTKELSEELERREGVMTVKVEPYEKIEVGGIVVNGPAIVLINQD >CP024096|2429502:2442613|2442109_2442613_-|AWC65431.1|DBSCAN-SWA MRSLDRYVPKRNGQKQFFRGKIISTYINNSGYECVDLARGGKKVKNTVHRLVAKHFCKGYREKLDVNHIDADRLNNKAENLEWMSRIENIRDCIKRGTHNVDSAHKIAREKNQKPVAMLDLDGNVLRTFPSIKEAREQTGAIKIGEVCNGNRRMAGGYKWRFISKAG >CP024096|2429502:2442613|2431205_2431679_-|AWC65416.1|DBSCAN-SWA MSDKKRRLETQLTREQITAATLLSINKFLPKASTIDDPEELARAKENGQVRLNLEEIAEKSNISVRQLYTWRHRDSNFIEYVNLLSSDAFMSHLPDVMQKHLDMMLKGQGSMKGIELFYKFGGLLVDKQEVKTESADSGLTMEERLARLKERTGGGQ |
17 | Bacillus_phage(41.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2448221 : 2459018
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP024096|2448221:2459018|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP024096|2448221:2459018|2455383_2456058_-|AWC65446.1|DBSCAN-SWA MARSKFTFEEVKALFDSKGYDLLETDYINARTPMRCKCRQHPESIIQITAGNMRKGFGGCRQCKRQQHKYRTRTIEEVRKEFAERGYTLLETVYKNNRTKMRYTCPYHPNEKPSIAYMHFKRGVGCPSCGREKTLLARRNEFPKCTYNNIEKEEARSKVLRILNNHCFDCPFNELIRMGAVEDKCYKQCPYGMELRKGGAVLAGEDIKAVTEYYEDKFAGEALV >CP024096|2448221:2459018|2457498_2458113_-|AWC65450.1|DBSCAN-SWA MFKYEKNAEGQGVLTLLSEEFEQKIMPLVYQQTTNELSTQVEGGHLDDDLTEFAKHISRQTTHAVIGSMQELIIKPLVEELSFKIDQLSYTQKQQPKKRKTQPVQGEPKLTLNMSGMKVDNSKIPHEDQREKIDILHKDMCHSLKLLHPYAWTEVYNRMFLDYNINAKEILLQSKEKTRVWAVIKAGYGHKMIEAMENILRERR >CP024096|2448221:2459018|2453471_2453723_-|AWC65442.1|DBSCAN-SWA MGLFKERLKELCLMIIAFVILCVIGLIFVSPLFILDSIHEGWGGLVYMVVILSIVAISVIYNACKFIYWLLIEPFKNMRNQTK >CP024096|2448221:2459018|2451062_2452406_-|AWC65439.1|DBSCAN-SWA MNYGEMLLSKVIDTANPIQLNHVTERDFVTEAERKAYRFIKDYVETNRGRVPDFRTLVAEVDGFTYVPNVEDSFEYLTKQIKSYSAKVEAMEFLQNEAPEQFEQLDGNSFLEWLRDRVDSVIIRTDVRDKVGTSLKADTSKFLEEYERRKKGESYRIWKSRFSFINKAIGGYVSSNVYTIYGKSGRGKSATTIEEGVEMAFQGANVLIWLMEMGWFEGMVRLYTSISSRIGATVAELDGINLEAGFDSKEIRHGKLSEEFEQGFKMFLANINEILPGNIVVRGVDDYDFHRRDLRQLEVDISETNADVVIVDPFYYLDYEKNTSKTAGGDAAATSKALRRLAGKTGVVMFAITQADEVDNSEDEDGQRELRLPKRSEVKKTKALLEDAALLIAVDTDAKQGRGIIGINKGRDGGEGESAEIIYMPQIGVIKEMETGEEAAKQFTSVF >CP024096|2448221:2459018|2453769_2454021_-|AWC65443.1|DBSCAN-SWA MVNLTPFMYAPHYAPDKPYLVYSVNCDRPETTSGYMQGYWECTHCGEGSQFRFYDDTYHPKYIAKCPKCNKEFIAIDDTDYDD >CP024096|2448221:2459018|2449559_2449763_+|AWC65437.1|DBSCAN-SWA MIDYTPLHVTLKEKDMVISDLRDKVLHSKTIARINRGMSVHLSTVEAICLHLDVPIEKVVKIAATEE >CP024096|2448221:2459018|2456784_2456943_-|AWC65448.1|DBSCAN-SWA MQLHDLLLKEIYIEALIRRNVFKTEDGRDLWQASNEELHAQLFDEEGQNDFT >CP024096|2448221:2459018|2456465_2456798_-|AWC65447.1|DBSCAN-SWA MILRKFPVVGRYRNYEIEIEEVTFINTFYQVRIYLPLTRNILGLTFRRRRMLYGVKYAKVERAGEFVEIAKESVNKYESFLDKQIRVETLHETGIDDFKHWDGLVEEATK >CP024096|2448221:2459018|2458124_2459018_-|AWC65451.1|DBSCAN-SWA MSSSLIELSNDINVITAEINAYQRVAGEAIFEIGRRLHEVKYNPEKYGLPKGIDVEGRAIVARGAWGRWLTSVNIHERKAQRFIKVFKRFELTDTGVGLPDSLSVLEVLTDFDDEELEKPREMPDGSTKKLTEMSRREIEEFKRRERRVIEEKEAAVRAAEEAERRAEQAEEDKRKLGQLLTEERNKTPEVQYVKDTESEEQLRLYRERYGEISENVYRITNETEISGMVMEFSEHTRDFIKQYAFLKHYEGEFHALNRRSKAEYESTLNALRDFLNDVQRVVEYSKTNEQVIIDIK >CP024096|2448221:2459018|2457024_2457369_-|AWC65449.1|DBSCAN-SWA MRNVKKRLQRILSELESLESDMQQTNIRKSQTDLAQQDILHTIEIETFTTARGNYLLKELKRIRKERRKAKDDQAVLQSVMHTLKGVKQKVECSIGSVTGVIERQQERKVTKGY >CP024096|2448221:2459018|2449826_2450012_+|AWC67230.1|DBSCAN-SWA MPELCKKNGITQAELALKVGITPQSITDYVSLRNLPNVERARNIAAKLHCDIEELYEWETE >CP024096|2448221:2459018|2448221_2449445_-|AWC65436.1|DBSCAN-SWA MLGFHREICDTINDRDDITFSSVAEKIGVSKQCMSKFKKDGTIGFRKLLRLSYYLFPDEQREKMEKWCLQLDSAESIQQSLEYAAITRNVKLLRQLIQIHRKSDGVIKDYINVYSIIYSYMQGKIKGVDLIKSLNKIGRVEDSTLNILVNIIKCYNYFAQKKIHIMLEVAREASSMIEDLSDSRKLFIKECFLHRLAEILAPIFLHRNQLHLARKCASLIINANICAKTVADASYYVGMTYLNEDNERCLKYLHNSYVIAKTIGVERFKVQARDRLDCVKIYLGIPLGAKSDTRLIEYQKDNTKGQLIDSIIEERGEKDFLLLYKARSYNSFSELYECFQHFFSNSNFFFSSLVAREIYERGDRSGLTKSLIDFKVNIENEKGGIQFEEDFVRSFCGFSSDSRVVCA >CP024096|2448221:2459018|2454067_2454256_-|AWC65444.1|DBSCAN-SWA MKKHELTCMMEEEDTIEFITNEKKKLINVFMKVNSSEDYTHVVINAREFLMMTDEIRKELEI >CP024096|2448221:2459018|2456073_2456460_-|AWC67231.1|DBSCAN-SWA MKRVSTKDFRNLPIEKWNVTTFREYLKHEHEERYKIPYVTRSYAMEGRMLKTFIAEYKPEATKQFIDACFADYKPTREYPGLNFAFMYSYMRGRILPRVLDELRREEAKLQRQTEVMEVSTEEIIDYL >CP024096|2448221:2459018|2450019_2451036_-|AWC65438.1|DBSCAN-SWA MSSIQIRGQDVNVDIEYELRQFSWTNERWTSDKLIAASPFRYEHTPSFFVNLDGDYAGTWKDSGAFDSEWESGNFTRLLSYLRNETYEETEAYLLESYGTCYTYDNLVLKPPKLRIESGHKALDFGRLQEYAYRHPYLGQRGISEEVQRQMKIGYDRFRQAVVIPWFDTNGRLANIKYRKTRGKAFWYEKDGKPIGDLIYGLHLAYKRNIKRAVYCEAEIDAMSFMTAGVFGLANGSSSFNQRKAEQILKSPIEELVIVADNDPAGEKLRKELEKYLNGKMRLTNGYVCEFKDANDSLLKEGKDSLISVVDNAEPVRLKLSYVNSRIFGRREDTKPSR >CP024096|2448221:2459018|2454619_2455384_-|AWC65445.1|DBSCAN-SWA MQCILSDHCSLYKSESCNRQCPSYIALHGFNGKGGRMAATNLPKEYRHLTLLNSPVKDTQPKVYKSIEAYVTTFSRQFEADEATDVKDKIKSMYLFSEETGTGKTTTAAVILNEWLIRHYIGSLQRNRQSLQVPGYFLDVNEWQTLFNEFNRSNIPRETAEKSAKEYYRRMTNAKTAPFAILDDIGVRSATEAFRGDLHAVINHRITNGLPTVYTSNIPIDELESVFDRRLYDRVRDLCVVLPFEGDSKRGMRR >CP024096|2448221:2459018|2453034_2453451_-|AWC65441.1|DBSCAN-SWA MREIKFDAIYKPTGEHFTPVNINFESKTTHGNFDGQVNDWCHFSLDGKYGDAILRQYTGLKDKNGKEIYEGDIVSRHDGGIHFQEESLAEHVVKWGNFGWLPFEIGEGYQKCVYGEIYEFIVIGNIYENPELLKNQTK >CP024096|2448221:2459018|2452502_2452787_-|AWC65440.1|DBSCAN-SWA MSLYSTKEQETVLTFDNETKEWNAYSCVPKHIRKLVGIIGEENVTVIESDDDGKPLAVRCTLGEKQVSMKRLRQYSEDQKRKMAERMRAVRTLL |
18 | uncultured_Caudovirales_phage(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2620709 : 2636190
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP024096|2620709:2636190|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP024096|2620709:2636190|2622917_2623193_-|AWC67236.1|DBSCAN-SWA MDFSRIEGVNKMYKFANKNELLSFLQEEVLTTPEVMDVLGVSKSRISKMIKDGKLVPFKKMERVSLFLREDIEEKKKELEVLRVKYRPYDE >CP024096|2620709:2636190|2635032_2636190_+|AWC65620.1|integrase|DBSCAN-SWA MASFHKYKKKGSNKDFWEYRIRYKDSITQKYKEKCKKGFTSKAEAKIAAEEMEKQLREGFEQTDESLKSYLETWLYEYKKGTVAKNTLSLHQNSIKNHIVPYFKNIPLKDIKPILYQKFINHLTEKGYSRRTIEIVHGTMHNAMEKAIILEKIAKNPCTGAEIKLKKKESKIQFIESEHISDFLREAYRYDYIYWLFFKALIETGMRKGEAAALQWTDIDLKERTININKSLDFQVAARNPDMMFGDTKNYNSKRIITISQGLANDLLFHKKYQNQNKVALNDSYHFDLNLVFCRNDGNYMPKSSLFNSFSRILKKANLPSLPIHSLRHTHAVLQLEAGVSMKYLQERLGHGSVQITSDVYSHISKKIDRDAMNKFEEHMQNILE >CP024096|2620709:2636190|2633675_2633864_-|AWC65617.1|DBSCAN-SWA MDKTFGVKVKMWLFVNGIKQEELAKMLNISGPYLSDILLGKRDGKKVKEKINRILESEEIAQ >CP024096|2620709:2636190|2623432_2623624_-|AWC65597.1|DBSCAN-SWA MAKLALILGLILTGLTIIEKVLVIYEKVLGLYKKVKKLKIKRKRRPRRKRRPRRKRQTRRKRK >CP024096|2620709:2636190|2632842_2633679_-|AWC65616.1|DBSCAN-SWA 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MKKDIKKLIELIWSDATDDEVVNEVISFLQSEDVNNGYKVDLLATLAERANHNYYVDKMREFDERNSQ >CP024096|2620709:2636190|2620709_2620919_-|AWC65593.1|DBSCAN-SWA MYNFKNDEELSKFIAEEIVNTSEAIEILGCTRQNIAYLVTNGRIKPIKEMARDRLFFKKDILKWKELNK >CP024096|2620709:2636190|2629502_2629772_-|AWC65611.1|DBSCAN-SWA MKTIIRDGSIPLALNKSSRTRYLRDRRLSELIKRCRRLEKEGFDYLFPIRKVLETVRHEKDENPHLFKGCFVLDRDRGFYYEVVMKKVK >CP024096|2620709:2636190|2623161_2623359_-|AWC65596.1|DBSCAN-SWA MNRMSNSSNYLIIVMSLFYSIYLRDIIQEGALKTTLDILLILVLIFCIVDTVLRLYRFFKNRRGE >CP024096|2620709:2636190|2629752_2630607_-|AWC65612.1|DBSCAN-SWA MSTNETLKQQMVAQQTTGVSTETNLNKQLKLMFKDSFKTIESVLPKHMTPERLIRVGLNATTRNPALLECAPETIVGAVVNCGSLGLEPNLLGHAYIVPFYNNKTKRKEAQFQLGYKGIMELVRRSGEVKAIYAHEVYEGDEFEYEYGLEKNIVHKPCGEEDQNKITHFYAVYKLKDGSYDFVVMSRKQVESHRDRFTKSQKNGAVFGPWKDHFVEMAKKTVIIKLLKSAPLSIEREESRQVIEAANQDNGIMKVKENNTGVEADAGFIDVEYAEVSENENHNS >CP024096|2620709:2636190|2632323_2632506_-|AWC65614.1|DBSCAN-SWA MQNYLVINKTTFATSVYECETQEEVKEIVSQLIEKGAHPAAIRVTQEIPVDITVKVDVEF >CP024096|2620709:2636190|2634136_2634556_+|AWC65618.1|DBSCAN-SWA MGITEIIKQLCQKRGISISKLEEELGFGQNTIYQWKKRTPSVERVQKVADYFNVSTDYLLGRTKNKYWELTEKDEKDIQKKLEELIEDMGNADALAFSKGSEPMSEETKQLLIISLENALRLGKQMAKKKFTPKKYRDE >CP024096|2620709:2636190|2627911_2628784_-|AWC65609.1|DBSCAN-SWA MYQKKLEEESNQPITEDSQKQSVECKKCGDRGYIFEKQPSEFLNGKYVDVAIECECLERKNLKARFKNAMIPSEFENARFDNYVRETAVQQTLYNAMVEYLKIFNEIRDSKINSIGFIAEVGETKLKALPPGERNQMRQANNSYGLGKTHLQVAAAKYALNHFKVTDKHTGRPRGVRVLCVQDVNIMAEIQSAAFLNDNKKRLNELLHDLCTCDILIWDDIAKSKYSEFKEDMYYKIINERYLYNLPIWYTSNEDLDTLEDKIGFAAADRLFGMSKDYLYQVKGASYRTT >CP024096|2620709:2636190|2627512_2627701_-|AWC65607.1|DBSCAN-SWA MRDQLEKLIEELKLSQSLLGSRSLNLLDDGDLEKYGYYNGQRVVCERMQKKLEQILEGEENE >CP024096|2620709:2636190|2621712_2622180_-|AWC65595.1|DBSCAN-SWA MQIAYLEVLHMEEATLNLEMKELDRKASARKALRALRKYRMYMLSVDDEYLPKVTATYSLTPPSRTNQFHSSTENIIEIIDREREKESYMNRIWKGINRLSAEYRKLIIEKYMGRDELFDFEVYNKMGISKPNFDRKKRKALSDLACALGIEVYK >CP024096|2620709:2636190|2627685_2627901_-|AWC65608.1|DBSCAN-SWA MSITVMRPNVHITSVSSWGMVFTLPPSKNAHTREEYVETTGKWIEEQLKEREKQIIDIDKQKEVYLQCEIS >CP024096|2620709:2636190|2631757_2631997_-|AWC65613.1|DBSCAN-SWA MAKTEEMLLVEKMNQAVNNQWKAMLNNDRQGFKYFAKEHLCLSKKLEVLELEKELTEDLNNYLNEKEKTPVAAGVQNQK >CP024096|2620709:2636190|2624424_2624625_-|AWC65600.1|DBSCAN-SWA MKCQHKWIDMEDGTNDKFCVKCSQKAKQMQITLPISLPISINADEWEAEFYRKRGIGIDSIRNSKK >CP024096|2620709:2636190|2632540_2632816_-|AWC65615.1|DBSCAN-SWA MLNIQIDETVVKELCVEEIRKKMKEYDAELAFWDTKELKKRVCMSWNTIQDQFFFDPRFPKFKVGQKWYFPAKQTQKFLLEWAEEKMVGKK >CP024096|2620709:2636190|2624904_2625147_-|AWC65602.1|DBSCAN-SWA MKFWALAYQYQEDVFYDFAKEENTMDLSESCLLPTKEVAEDFISQQLDDDYVPVEIELETLQKNGILSWSRGRVERWDEE >CP024096|2620709:2636190|2625176_2625404_-|AWC65603.1|DBSCAN-SWA MSSGCILGECPICDELIFEDEIDFDQYNNMVHRRCLNLRNNNSKTIHLLHQEIQRLEKRIKELEEQNKSGQMTLF >CP024096|2620709:2636190|2624107_2624395_-|AWC65599.1|DBSCAN-SWA MGKSQRDKGARREREFASLIGGERVPLSGAMQGYANDVKGLGLEWEVKARKDGFKTLYNWLEDEREQPDALAIKADRKPWLVVMPLDTFLKMVRE >CP024096|2620709:2636190|2628713_2629502_-|AWC65610.1|DBSCAN-SWA MGIYRVVKDSNYTTINNTGLKDERLSWKAKGILAYILSLPDDWVFYREELATHAKDGLDSLRAGMNELKEHGYLHRFPVKDDKNKIVKWETVIYEIPKKEPVAEIPLVEKPLVEKPPVENPELLNTKEPNTKELNTDINKYIVEIVDYLNDVCSSSYRSTTKKTQSLIKVRLKEKFTVDDFKKVIDVKHAEWTGTSRAKYLRPETLFGTKFESYLQQWELWKNGKTRGYNVGSYGKGADHVPEEARRGIKPADNRGFAKTIG >CP024096|2620709:2636190|2634570_2634996_+|AWC65619.1|DBSCAN-SWA MVSKQQINLKIDELLRRYNTRDPFFIAEAKGIVVITENLGDIFGYYHKVSRIPFIHINERLSYQNQVFTCFHELGHAIFHPDENTPKLSLVSLCSEIRIEAEANYFATRFLIDGSHHDYYIQTKQQLLQYYGIPKEMERFI >CP024096|2620709:2636190|2625444_2626083_-|AWC65604.1|DBSCAN-SWA MTKVTVELTTKQEEFLKLFAEKQYDDAEDNVCTSDPIHVVQKRRKQYIPYSLDLEGYFDNSTLEFCTDSDRELWHDNEVEAVESFYEWKDEECPIEVRSFENLQYEDVESVNGKMVFVSDIYDYFKVYGIEDELALAWVETEWENEAFFFILDEAKRYQKYQAHNLGRSRIYTYSAGYDNRGDFVHFRNLLMKIGQELNKQSQEETEVVAVK >CP024096|2620709:2636190|2621166_2621382_-|AWC65594.1|DBSCAN-SWA MINNLISFLLESSKWAEYLKVFTALFTTYRTVKVITSQVKKRFKKKTKKKKRPRRKGKRVLPRRLPKRIRR |
29 | Bacillus_phage(72.73%) | integrase | attL 2632424:2632438|attR 2638948:2638962 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2818472 : 2892440
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP024096|2818472:2892440|DBSCAN-SWA ATTATTTTACATAATTCTCTTTTACAACAGTCGCGCAACGCTCACATAATGTTTTATACTCGTTATCGTTGCCAACTGTTTCCGAAACAACCCAGCAACGTTCACAAGTTTCACCGTTTGCTTGTGTAACAAGAACTGCCGTATGTTCATATTTTTGTGCATCCGCTGGCGCTTCCTCTATCGTTCCACCAAGTTTATATTCAGAAACGATAAATAGTTGTTTTAAATCTTCTTGAATAGATTCTAACATTTCTTTCATTTCTGCTGTTGGGAATAATGTAATGCTAGCCGTCAATGATTTACCAATCACTTTCTCATTACGCGCCACTTCTAGTGCTTTTAATACGTCACTACGAAGCGTCATAAATGCATCCCATTTTGTTTTTAACGCTTCCCCATCTTGTAATTCGATAGCTTCTGGCATATCTGTCAATTGTACGCTCTCTTCTGTAACACCTGGAATATATGGCCACACTTCATCAGCTGTATGAGGTAAAATCGGTGTTACAAGTTTCGTTAACGCAACAAGAACATCATATAACACCGTTTGAATTGCACGACGATCATGATGATTTGCCGCTTCAATGTATAAAATATCTTTTGCAAAATCTAAATAGAATGAACTTAAATCGATTGTACAGAAGTTATGAATTGCATGATATACTGCCGCAAAGTCATAAGTTTCATACGCTTCTTTCACTTTCGTAATTAAGTCATTTAATTTCACTAACATATAGCGATCCACTTCGCGAAGTTCCGCTTTTGCTACTGCATCTTGAGCTGGATTAAAGTCAGCTAAGTTTCCTAATAAGAAACGGAATGTGTTACGGATTTTGCGATATACTTCTGCAACTTGTTTTAAAATATCATCTGAAATACGTACATCAGACTGATAATCAACAGAAGATACCCAAAGGCGTAAAATATCTCCACCTAGTTGGTCCATAATCTTCTTCGGTACAACAATGTTTCCGATTGATTTACTCATTTTGCGACCTTCACCATCAAGTACGAAGCCATGGCTTAGCACACCTTTATATGGTGCTTTACCTGTTACAGCAACAGCTGTTGATAATGAAGAGTTAAACCAACCACGATATTGGTCAGATCCTTCTAAATATAAATCAGCTGGACGTTGCAAGTCGTCACGTTCTTCTAATACAGCTTGGTGAGAAGAACCAGAATCAAACCATACATCCATAATATCTGTTTCTTTACGGAATTCACCATTTGGACTAGATGGATGTGTGAATCCTTCTGGTAGTAAATCTTTCGCTTCGCGTTCAAACCATACGTTAGAACCATGTTCACGGAATAAGTTTGCTACATGATTAATTGTTTCATCTGTAATAATTGGATCATTATTTTCTGCATAGAACACAGGAATTGGTACACCCCATGCACGTTGACGAGAAATACACCAGTCACCGCGGTCACGAACCATATTATGAAGACGAGTTTCTCCCCACGCTGGTACCCATTTTGTTTCTTTCACAGCTTGTAATAATTCACTACGGAATGCCTCAATAGATGCAAACCATTGTGCTGTTGCACGGAAAATAATTGGTTTTTTCGTTCTCCAGTCATGTGGATATGAATGCGTAATAAATGTTAATTTCAGCAACGCGCCAACTTCTTCTAATTTTTCCGTAATTGGTTTGTTTGCTTTATCATAGAATAAACCTTCAAATCCAGGTGCTTCACTTGTTAATACGCCTTTATCATCAACTGGACAAAGAACTTCTAGACCATACTTTTGCCCTACAATGAAATCATCTTCCCCGTGTCCAGGTGCTGTATGTACACAACCTGTACCAGCATCTGTTGTTACATGCTCACCAAGCATAACTAAAGAATCGCGGTCATAGAATGGATGTTTTGCAACTGTATATTCAAGTTCACTACCTTTTACTGTTCTAACAACTTCAGGGTTTTCCCATTCTAATGTTTTTGCTACTGTATCAAACAGGTCAGAAGCAATGATATATTTTTCATCATTTACTTTAACGATGCTATATTCAAGTTTTGGATGAACAGAAATACCTAAGTTAGCTGGCAATGTCCAAGGCGTCGTTGTCCAAATAATAAATTTCTCGTCACCTTCTAATACGTCTTTTCCATCTTTCACTTCAAATGCAACGTAAATAGATGCTGATTTTTTATCTTTGTACTCAATTTCAGCCTCAGCTAAAGCAGATTCACTCGTTGGAGACCAGTAAACAGGTTTTTGTCCCTTATAGATATAGCCTTTTTTCGCCATTTCTCCAAATACTTTAATTTGTTGTGCTTCATATGCTGGTTCCAAAGTAATATATGGATGATCCCAATCCGCACGTACACCAAGGCGTTTAAATTGTTCACGCTGACGATTTACTTGTTCGTATGCATATTCCGCACATAATTTACGGAATTCTGCGACCGGCATTTCTTTACGCTTTACTCCCTTATTCGTTAAAGCCTGCTCAATTGGTAAACCATGCGTATCCCAACCTGGAACATAAGGAGCACAATAACCAGTCATTGATTTATAGCGTACAATAAAGTCTTTTAATACTTTATTTAGTGCGTGTCCCATATGAATATCACCATTTGCATATGGAGGACCATCGTGTAATACGAATAAAGGGCGTCCTTTTGTACGTTCTTGTACTTTTTCATAAATGTTCATTTCAGCCCATTTTTCTTGTATTGCAGGCTCACGTTTTGGTAAATTCCCACGCATTGGGAACTCTGTTTTTGGCATTAGTAATGTATTTTTGTACTCCATGCTCAATTCCTCCTTACATGTATCATAAAAAGACTTAAAAACGAAATAAAAAAGAGACTTTCACATCCCAAAAGGGACGAGAAAGTCTCCCGCGGTACCACCCTATTAAATCATATACGTATGCACATGATTCACTTTATATCCTTAACGCGAATATACGCCTACGCTTACTCATTTTTTCAGCGCGGAACTCCAGGGTGATTTCCCATTTATCTCCTTATCCTGAGCTCACACCATCCTCAGTTCGCTTTATAAGGGGTGAAAAAGGTACTTATCCCTATCTTCGTTTTTCTTAATCAATATGTTGTTTAAAATTATATGTAATAATGAGAAAAACGTCAAGTTTACACTGTTTCTTCTTTTTTCAACAGTTCGTCCACTTCGTCTTCTAATTCGATGAGCTTGTCCCAATCGTCGTTGTTTAACATTTCAAGCTGTGTTTCTAGCAACATGCGGAAACGAGTACGAAACACTTTTGCTTGTTTCTTTAGCTCTTCAATATCAAAAGCAACTTTTCTTGATTTCACTAACGCTTCATTAATGATTCGATCCGCATTTTTTTCTGCTTCACGAACGATTAGTTTTGCTTCTTTTTGTGCATTGCGTTTTACTTCTTCCGCCGCTTCTTGTGCTACAACAATAGACTTATTTAGCGTGTCTTCAATATTAGAAAAATGATCTAGCTTTCCTTCTAATTGAGCAACCTTCTCTTCTAAAGCTTTCTTTTCACGAATGACTAATTCATAATCTTTAATGACTTGATCAAGAAATTCATTCACTTGATCTTCATCATAGCCACGAAATCCGCGACTAAATTCTTTATTATGAATATCTAATGGTGTTAACGGCACAAAAGCCACCTCCAAGTAGTTATCTAAATTTTCCTCTTTTAATTATATCTTTTCTTCGACAAAATAAGAGTTTTTTCCTTCTAAAAAATCAATCATTTTAGTATACCATACAAAACTCGCCATTTGTCTTTTTTCGTTCTTCCGTCGACCGAAAACAATTTACTTCTTCCATGTCCTCTGACCGACAGAATATCTCCTGGAAGACATTCATATGAAGTTTGATCTACAACTTTCCAATTCACTTTTACAAGCCCATTCTTTATAAGGGGTTGTACTTTTTGACGTGATAGATGCAAGATTTCAGCTAACACGACGTCTAAGCGTAGTGATGAAACAGTTCCAAATTGCTCTCTCCATTCATCCTGCAATTGCAAAACATTCTCTGCTGATACACTGAAGAGAGAAACCTTTGTTTTTCCAATTGATTGTAAGTTCATTTCAATATAAGAAACAACTTCTTTTGCGACTACGATTTGGACACGATTTTCTTGAATAAAAATATCACCGTACTTTTCTCTCTTTAAACCAAGGGACATAAGTGCACCTAGTATTTGTCTATGTTCAAGCGTATAAAATTTGGAAGGATAATCAATTTCTAATACTTCTACTTGAAATTCTTCTTCATTTAAAGCAAGATAATCTGGATAAATAAGTGCCCTTTTTCTCTCCGCTTTTGGCGCTGCACCATTAAATTGTAAAGAAACATCTCCTTGCTGTCCAACTATTGTAGTTACAATTTGTTGCTGACGCGGATCAAGGAAATCTGTTAATTTTACTTGATGGTACTCTTCTACTGCTCGTTTCCATTCCAACACTTTATCAACAAAACTGGCCTCTTCAGGCCTAAAATGTTCGTAAATGCTCATGCATGCAACCTATCTTATAAAAAGTAGCCAAATAAAGTGACTAAGCCGCTGCTAGCAAGCTTTAATGCAATAATTGCAACGATCGGAGAAATATCAATTACACCAAGCGGTGGAATCACTCTCCGAAATGGCTCTAAATACGGTTCGCAAATGCGTGCTAAAAAGTCACCGACTGCTGATTCTCTAGCGCCTGGAAACCAAGTTAGAAGAATGTAGACAATAAGCGCCCAGGAGTAAATTTGAATGACTAAGAGCAAAGCTTTTAAAATTATAAACATGGCGTATTACCACCTCTTTATATTTGTCTCTTCCTCTTCACCGAATAACTCGGAAATTGCTCCAACAATATCCACATTCTCAGGTGTACACATAAATGTTTTTGGTCCTAACTTTTGAATATCCCCGCCTATAGCGTATACAGTACCACTTAAAAAGTCAACGATGCGTACTGCTTGATCGGTAGACATTCTTTGCAAATTAATGACTACAGCACGTTTTCCTTTTAGATGGTCTGCA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85 | Bacillus_phage(77.78%) | tail,capsid,holin,portal,protease,head,integrase,tRNA,terminase | attL 2850015:2850032|attR 2899161:2899178 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3162627 : 3198041
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP024096|3162627:3198041|DBSCAN-SWA 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MTCDLSFFSFNGKRHDKVIPLQGVKRPAWAPLERTFLEVPHYPGGRLIRTQTKMRKVLVPVDLLYDSLEEAEKLKEEIADWLITDQPQELIFDDEKDRTYLAVIDESFDLDQLMNLGEGTLTFVCSMPYKLGRAQTHEFERTWTTEITSRFKNKGSVEAPALIKVDIENPSTFLDVWYGSYPNDRNYFRIGYPLTVEEKTVQERERVMWDEMSTTVGWTPVSQFDDMKGTGSFKVRDGYALYCEDYGQERGFHGAIAKKNIPVGPLQDFEMEAWVRLKSTNIGQMGRVEVLLLDEASNIVTRINMNDLYWDAELTKAHAKVGNVGTPGSLRKLVDTSGAHPNTFNQFYGRLRIARRGNEWSVYVARFRDGTEIDDASLVERWIDESGNPMTDRKIAQVMIAIMAWDINDPVSVMQIDDLKIWKVNKVPKNTKPYIFDKGDKVVIDTERSLVTINGKDAINIKDIFSDFPVVIRGDNRVDIMPGDVGAATISFRERYR >CP024096|3162627:3198041|3186952_3187498_-|AWC66175.1|DBSCAN-SWA MAKTEITVEMERQIYSATTCNQGVFGCFEVTIGWFGKERVDYLTYDTKGIWRCYEIKVSLSDFRSKAHKTFVGHFNYYVMPEELYEKVKDEIPKHIGVYVGKTLMKRARKQKLAVDEEVLKDSFIRSLYREADKVLRSNNPSIVESLQRQLRNERKQKEEYRSKYQEERRKYEPRSKRVIQ >CP024096|3162627:3198041|3175977_3176358_-|AWC66158.1|DBSCAN-SWA MTDLIEYVDKFLKDIFEPYEADVYYQEADKEVIKLPYVVYDSQSDAISRVREDFVFTVHIWGHEADILIQDEASQKIKDYIKDGTLKTQCAPMTIAVDFIGRSDVPVEDQQIRVKEVRFRVRYYDM >CP024096|3162627:3198041|3186662_3186905_-|AWC66174.1|DBSCAN-SWA MQVINLYQSNTFVGVINQVATPLQEGDIVEVINKYHDPTTVGDWVYSVRIMKTSNKELAKHNLNGIRLVACYKVDVLPKP >CP024096|3162627:3198041|3184500_3184881_-|AWC66169.1|DBSCAN-SWA MLDIELPEINKEETKKNVLKALKKYRLFLSSITEEIIERVKIGETDGISEKNVKRAEFILDVRKGVSKLNLYDKQLIELAYLGREKHSWVKMCRVLNMSQPDYYRKRNKALYELAYKLGIEVEENR |
47 | Bacillus_phage(87.18%) | tail,holin,portal,head,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024096.1|AWC66177.1|3189356_3189551_-|hypothetical-protein |
3189356_3189551_-
Protein sequences of CP024096.1|AWC66177.1|3189356_3189551_-|hypothetical-protein>CP024096.1|AWC66177.1|3189356_3189551_-|hypothetical-protein MRDKLEKLIEELKLSQSLLGSRALNLLDDGDLEKYGYYNGQRVVCEHMQKELEQILEGEENEKI |
64 aa aa | NA | NA | NA | 3162627-3198041 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.7|2239363|36|CP024096|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP024096 position: 3185302-3185267, mismatch: 0 tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat Protospacer ************************************ 2. spacer 4.15|2239364|36|CP024096|PILER-CR matches to CP024096 position: 3185302-3185267, mismatch: 0 tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat Protospacer ************************************ |