Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024118 | Bacillus cytotoxicus strain CH_2 plasmid pCh2_83, complete sequence | 0 crisprs | TnsE_C | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP024117 | Bacillus cytotoxicus strain CH_2 plasmid pCh2_53, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP024116 | Bacillus cytotoxicus strain CH_2 chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas3,csa3,DinG,cas2,cas1,cas9,cas14j,cas4,cas7,cas6,DEDDh,WYL | 4 | 15 | 11 | 1 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
35017 : 42271
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024118|35017:42271|DBSCAN-SWA TATGGAACAATTTATTCGATTAGATATGAAAGGGAATTGGAAAGGGAAAGAACATTGTAGTAGTTTTGCCGGTGTTGAGGAGCATGGAATTCGGGAAGAGGGAATTAGTTGCTATCGTTTAAAAGATACTGCTTATGCACTTGAAAGTTTGAGAGAATATTGGGTTGATATGGTAGGACATACAGAAAAAGATTTTGAAAATATGCAAATTACAATTTTTGAAGGTGAACTTGTGGGGGAAGGAAGCGAATTAGAAGATCTTGCAACATGTGAACGTACTATTTTAGAAGCAGAAGCAGCGCCTATTATGAACGAAATTGTTAAATGGAAAGAGAATGTTATGCCGGACGATATGGAGCTTGATGAAGATGATCGAAATGAAGGATTAATGTATGAGGAAGAATACAACAAAAAATTACTAAATTTGTATAATAGGTTTGTGGAATCAAATAGCGAAAAGATATTCAAGGAGAAAGATGAAATATTCTCAAAAGAGTACGAGGATGTATCTGAAGAAATAGATCAAGCAAAAAGAAAATTTATGATGCAACAAATGCATAATCGAGATTATTAAATAAAAGCGAGAAAGATGTTCCCTAGCCTGGCAGCTTAAAAACCTCTTTCTCTAGATGTGGTTTTATGGTATATACGGCAGGTTGCCTATTTCTATCAATAAATGGGATGATTAAAGGTTTATAGATAGATTATTCGTGGATGTATGATACAGATATAGAACGTTAGAAATTTATCCTATAAAGGAGCAACATAGCGCCATGTTGCTCCTTTATTAAATGTTGGTTGTAATAACGATAGTATAGCGCTATGTGTAGCTTTGAAATAAAGTCGTACTATTTATAAAAAAGATGTATCGTTTTATTTCTTTTCGATTAAAGAATTCTAAGTAAGTTTTAATCAAACTTTATTACAAACCAACAATAACTGCTATAGCTTTTGAATAAAGATTGATAATTTGTAATAAAGTTCGATAATTTTAAAAAAGTTTGATAAGAAATATTCTTATCAAACTTTAATTTAAAAATATGCGTTATATCAATCCATGTTCTTTCCAGTAACACGTATCATCGCTTCATGTGTCACAAGAATTGTTCCAGCGCTCTTCCTAGCTTCTATATCTGTAAATTTACCACGATTGAACCATTGTGTAACTGTATTTGCTGACAATCCCCATTTGTCTGCGGCTTCTTTTGACGTATAAACTTTATATAGTTTGTTCATTGTTAACCTCCAAAAAAGGAGAGGACCGAACCCTCTCGTTAGAATGTAATCGTATGGTTAGTTGATTCGTCTTCTTCTTCGTCATATTCGAAGTCATATTCGAAGCTGATTGTTTCAGTATTACCACTTTTTGTATTGTGGGAGCCTAGTTCATAAGAGCAATTTGGTCCGCCTTGTGTCATTGCTGTTTCAATTACTTCTTTGATTACTTCTTCGAAGTCAACTAATTCACTTTTGCAGTTTTTGTTGATGAAGTTATAAAGATCTTTCACGTTAACAAGTGTTGTGTCGTTATAAGTGAAAGGTGTTTTTGGATTTTCTAAAGCCATACCTAAATATTTTTCTACGATTGAGTCAGTGCTTAACATAATTTTCATTATTTTCATATCCCCTTTGTTTTGTATTGAATTCCTTACACTTATAATACACCTAATCTGTATTAAATTCAATACAGATTATAAAACTTTTTATATTTTCCGTTCGAAAATTTTTTTGACAAAAGAAAAAGACTAATCCTAATGTAAATTAGAAATTTTGATCAAACTTTTTTATAAAGCTACACTATGTTATTTTTTGTTTGGATGTATTTCTATCATTTGAATTTGAAAAATGTCACTCTCCTTTATTTTAAGTACGTTCATTTCCTCTCTAAATGAACGCCAGGGCTCAATCTTAATGGATTTAGTTGTTTTATCTCGTAGCGTATATTTGTGTATATAATATGTTTTTTTGTTTTCCCTCAATGTAAATCCCTCGTCTCTCCCAAAAATAATGGAAAATAGTAGTTATATAAAAATTACACATTAAATAATGTTTTTCATCACGTGGTTGAATTATTTATAGAGTAATAATCGTAATATCTTTTTAAGGATAAGTGAGATTTAAAACCGATTTGTCCCATGATTTGCTCAGGAGTATTTTTTTGCATGATCATTTTTAAAATAAAAGTATTTCGGAAATGCTGCGCAGAAATCCCTTTTCGAAGGTTAGCGCGTTTTACTTCTAAGCGAATCATTTTCTGTATTGATATTTCAGTAAGAAACTTTGGCGCATCATTCTCATAGCTCCAACGATATGTCCCACGGATAAAATCAAAAGCAACGAATAAAGGATCATTGCTGTGGTATTTAGGACGAACAGGCTCAGGAATGGTTTTGTAGTATTGATATAAGTGTAACTTGTCATCTTCTTTCAAACAGATTGTTCTATTTATTTTTGATTCTTCAGGAATAGACAATGTATTGCTTTCGAAATGAACATGTTTCATTTGCAAAGAAACAAGATCTTGTAAAGATAATCCATAGTCCAGGAGTAATGAAATGATAGAAATATTTCGTTCCAATATCATAGGACGTACAGATTTTTGTTTTTCTGTCAGTCCTTCTAGAGAAGAAATGACTTCTTTTAAGCGCTTTTCCTCCTGGAAAGAAACGAAATCTTCTTTACGTAATGCCCGATCAGGCGGATCTATATGAATAACTCCTTCAATGGGGCTTGGTAAATCTAAGTATTCGTACAACCTATTTAACACAATATATATACGGTGTACAGTTTTGCCAGAGTACTGCCGTTCTTCTTTTAAATATTTGAAAAATGCTTCAAAATCTTTTTTATGAAGTGATTCGAAAATATTGTTTTTAGTGATTTTTTTTGATAGATGCAGCCATTGAATAAAACTTTCTACATCATATATATAGCGCTTAATAGTTGAAGGTTTTCTTCCTTTATCTAATAAATAGGAAGAGAACCCTTGTATTGTGTCCTGGATTTCTTGCATGTATAACAACCTCCTAGTTACATAAAAGCAATTACATCCTTGTTGTTTGATAGATTCTGAAGTCCTTCTAGACTATCAATTTTTCTAAATGTTAATCCCTTTGCAAAAAAATTTTCTCATGTGTTTTCTATTTCTTTCTCATATCTTTTAACTACTCTGTAAAATGTAGGACTTGTCATATTACATTTCTTCATGGCGTATAGCGCTGTGACCTTTCCATGTTTCCAATCGTTATATGCATCTATAAATTCCTGAGTTATTTTAGTTTTTGGTCTGCCCAAATGCTTTCCTTTTTTCTTTGCTGCTTCAATACCCTCACGTTGACGAGTTTTTATTTTTGTTCGTTCTTCTTCAGCAAGCCAGGACAAAATCTGGAGTACCAAATCAGTAATAAGATTACCTAAACTATCTTTATATTGAGTTGTATCTAAAAGTGGCATATCTAATACGACAATATGAGCTTGAATATTTTGGGTAATATCTTTCCACTCCTCAAGAATAGCTTCCTTATTTCTGCCGAAACGATCTAGGGAATGAATATATAGAATGTCATCTTTTCTTAACATGCGTTTTAAGAGTTGATATTGTTCACGATTAAAATCTCTTCCACTTTGTTTGTCGATAAAAATATCCCGTTCATCATTAATGAGTTGTTTCATTGTTTCGAGTTGCCGATCTTCATTTTGATCTTTGCTACTAACTCTTATATATCCGAATTTTCTTGTATTCAAAATAAATAGACATCCTTTCGAAAGTGTTTCTAATAAAATTATAACAAAAATGCTTCAAAAGGTATCTAAAATTATTTAGTGCTTCAAAATTGTGTTTTTAGACGTTTTGAAGTGCATAATTTGTTAGAGTTTAAGGTGCTAAAAAAGGTGTACCTTTTGAAGTGTCGATTAAAAATACTATTTGTATTTTTAAAAAAATTATATTTGATTTTATATAGGAATTATTAAGAATTGTATTAGAAATCACGGTATTTCAAATAGAGTTATTTTAAAAAAGAGATGCTAGAAGTGGAAAAGTAATGTTAGTTAAAATTGAACAAGAAAACGGGACTTTTTAGGATGACATTCATAGGTGTCTTTTTCTAATGTCATACACACTTTGTTTTTTTTACTAACTTTGATATAATAACTCTAGAAGTATTATATTGTTAGATTCCGTATATAATAAAAGAAGAGATGCTGGATACATCTCTTCAAGTAACTGCTACCGCAAGGGTGGCGGTTATCATAAGTTATTTTTTTCTTTGAAAACCACCCCTGTGCTTGCGACGGCGAGGAGTGGTTTTTTCATTGTTTTCTTTAAGAAAACTTCTTTTGAAAACAAATGCAGATATTTCACGCACAATTGCTTTCGCGATTTCTTTCAAAAGTTCTACAATGAAATCCATAATTATCACCTCCTTTCCTTCCAGTTGGAAAGAAGGGATAACAAACCACCCTCACAATATGCAGTTACATACAGTCTACCACACTATCCTATTAGAAGAAATATCATTGGAATAAACTAAATTCCTATTGTAACGACACCAAATATAATACCGCAACGTACAATTTTCTTTTTTCGGTCGTGTGACCTCTTATTGGATGGAAGGTGCTATGTTTATAATTGAGGATTATAGCGACATGCAGGTAACTATTTTCGAAGGTGAAGAGTTGCATGACGAATGATCTGATCATGAAGACATGGCAAATTGCATTAAAACAATTTTAGAAATGGATGCACAACCATTCATGGAAAATAACGGAAACATACGAACGATATTTTTATGAAGAAGAGTTAACAGAGGAGCAATATATTGAAAAATTGGGCGACATCATTGCGAAGGGGAGATGGAATTTTTGAAAGAAGCACTAGAAAAATAAACTGACGTAAATACTACCTAATTCAATGCTATCATTAAAGAGAAAAGGAGATGATTTGTATGATTAATTTGGAACCTTATCATTGCTGTATTTGTGATACAGATGAATCAGTGGAAATTGAGATTGATGACTTTGAAGAGAGAAGAGAAGTTTGTATGAATTGTGGTTATGTTCATTTTGGTGCAGCGGATCCATGGGGAATTGAAGAGAATGAAAAAATTGAGAAATGGATAAAGGAATCAAAGATGAAAAGAGCCGACTCATAAGAGCTGGCTCTTTCTTTTTGTTAATTTATCAAGGGTTAATATTACAATAATATGAAATGTAGGTGATAAGTGTATAGATAATAAGATACCAATAAAGGTAACATACAAACTGTGTTTTTATCTTTTGTTCTGACAAAATACAGCAAAGACCGTATGAGCTTCGTCGATAGATTCTAAGAGGTATTAATTTTTTAATATGGAATTCTCATTATAGGAGGTGCATAGCGCTATGTCAGGTGAAGAAATATTATATACCGCTAATGAAGTTTATGGACGTTTAGGAGTGAGTTCCAGTACGCTTAGGAAGTATTCAGATGTCCTGGAACGTGAAGGTTATGTAGTGAAAAAGAATGGTAGAGGGAGAAGGGAATACACTGATTTTGATATACTCCTTATTGAAAAATTAGTAGAGTTGAGTAGGGAAGATGGTATGACATTGGAGAAATCTGCAAAATTGATTGTTCAACAATTTGGAATAGATAACAAAAAAGAAGATACCCAGGGATCAGATTCATTACCATATCAAACGCAAATTCAATTTCAGCAACAATATAGCGCTATGATAGAAGAAATTAATAAGATGCAGCAAGCAAACCTATTAGAAATGGAAAAGAGACTGGGGGAACGTATAGATCAAAAGAATAAATTAATAATGGAAGATATGAAAGATCGGAAGGAACGAGAAGAAAGGATAGAACAGAGGTTAGAACTAAGAGACGATAATCTTATGAAGATGGTTAGAGAGATTCAAGAGGCAAAACGTACTATTGTATCAGCTCAAGAAGAAATAGCGGCAGCAAAGAAAAAGTTATGGTGGAAGTTTTGGTAGGTGTAGAGTAACAAAAATCTCAACTCAATTGAGCTGAGATTTTTGTTATGAACTCATCCTTCTATTGCTTTTCGTTGTTGAGCTTCTTTAAATTCCTTGTTAGCTATACCTTTTTTGCTTGTTCCGCATTTTGTATAAAAGGGTAAATATTCTTTTTGATTTTTATTTAAATCTATAAATTGTCATATTAATTTATTGAAAATATTTGCGTCATAAATCAATATGTAGTAATATTTAATAAAAATAACACTAAATATGGTGAATTTTTGTTAAGTGAGATTTTTATGGAGGGGTAATATGAATAAAGAAGGAATATATATTATTGATTCTAAAGGGGATTCAACGTATTTTTCTCCACCAGATTCAGGATTTGGGGAAATTCAGATACAATATTGCAACTCAATTCCTATTATGATGCGGGAAACAAAAACATTAAGGTTAGCCGAAACGAAAAAATCGAAGGCTGCAAGTTAGTAGAAAAGTTACTAACTTGCAGCCTTTTTTGTTTGATTCGTTTTGTGGCCAACAAGATTTATAGAAGGAGTGGATTTGTGTGTCACTAACATTTATAGATTTTTTTGCTGGTATAGGTGGTTTTAGGTTGGGAATGGAGGAAGCGTCTCATAAATGTATTGGTTATGTTGAATGGGATAAATTTGCTAGAAAATCATATGAAGCTATACATAATACGAAAGGGGAATGGACAGAACATGACATTAATAACATTAGACCAGGAACAATACCAAAAGCAGACGTGTGGACATTTGGTTTCCCATGTCAAGACATCAGTATTGCTTCAGGAAATGCCAAAGGACTTCAAGGAGCAAGATCTGGATTATTTTACAAAACGATTGACCTCCTCAAAAGCCAAAAAGAAGAAGATAAACCTAAATACTTGTTCATTGAAAACGTTAAAAACCTCTTTTCAGTTAATGGAGGATGGGATTTTTCCAGAATTCTCATTAGTTTGGATGAAGCAGGGTATGATGCAGAATGGTCTTTGCTTAACACAAAAGACTTCTCAACAGCAGCAAGACCTGTTCCGCAAAACAGAGAACGAGTATTCATTATTGGACATTCTCGAACAAAATGTACCAGAAAAGTATTTCCTATCACCGGAAATCACTCGGAGACTCGTATTAAAAAAGTCGGGAATATAAATCCTAGTGGCTGGGGGGTGAGTGGTTACATATATGATCCAAATAATCTGTCACCGACTCTCACTTGTGGGGATGCACCTAAAATTCTAATCTCGAATAAACAAGCATCTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024118|35017:42271|36066_36252_-|AWC59250.1|DBSCAN-SWA MNKLYKVYTSKEAADKWGLSANTVTQWFNRGKFTDIEARKSAGTILVTHEAMIRVTGKNMD >CP024118|35017:42271|41551_42271_+|AWC59256.1|DBSCAN-SWA MSLTFIDFFAGIGGFRLGMEEASHKCIGYVEWDKFARKSYEAIHNTKGEWTEHDINNIRPGTIPKADVWTFGFPCQDISIASGNAKGLQGARSGLFYKTIDLLKSQKEEDKPKYLFIENVKNLFSVNGGWDFSRILISLDEAGYDAEWSLLNTKDFSTAARPVPQNRERVFIIGHSRTKCTRKVFPITGNHSETRIKKVGNINPSGWGVSGYIYDPNNLSPTLTCGDAPKILISNKQAS >CP024118|35017:42271|35017_35590_+|AWC59249.1|DBSCAN-SWA MEQFIRLDMKGNWKGKEHCSSFAGVEEHGIREEGISCYRLKDTAYALESLREYWVDMVGHTEKDFENMQITIFEGELVGEGSELEDLATCERTILEAEAAPIMNEIVKWKENVMPDDMELDEDDRNEGLMYEEEYNKKLLNLYNRFVESNSEKIFKEKDEIFSKEYEDVSEEIDQAKRKFMMQQMHNRDY >CP024118|35017:42271|39962_40169_+|AWC59254.1|DBSCAN-SWA MINLEPYHCCICDTDESVEIEIDDFEERREVCMNCGYVHFGAADPWGIEENEKIEKWIKESKMKRADS >CP024118|35017:42271|38145_38760_-|AWC59253.1|DBSCAN-SWA MNTRKFGYIRVSSKDQNEDRQLETMKQLINDERDIFIDKQSGRDFNREQYQLLKRMLRKDDILYIHSLDRFGRNKEAILEEWKDITQNIQAHIVVLDMPLLDTTQYKDSLGNLITDLVLQILSWLAEEERTKIKTRQREGIEAAKKKGKHLGRPKTKITQEFIDAYNDWKHGKVTALYAMKKCNMTSPTFYRVVKRYEKEIENT >CP024118|35017:42271|37072_38029_-|AWC59252.1|integrase|DBSCAN-SWA MQEIQDTIQGFSSYLLDKGRKPSTIKRYIYDVESFIQWLHLSKKITKNNIFESLHKKDFEAFFKYLKEERQYSGKTVHRIYIVLNRLYEYLDLPSPIEGVIHIDPPDRALRKEDFVSFQEEKRLKEVISSLEGLTEKQKSVRPMILERNISIISLLLDYGLSLQDLVSLQMKHVHFESNTLSIPEESKINRTICLKEDDKLHLYQYYKTIPEPVRPKYHSNDPLFVAFDFIRGTYRWSYENDAPKFLTEISIQKMIRLEVKRANLRKGISAQHFRNTFILKMIMQKNTPEQIMGQIGFKSHLSLKRYYDYYSINNSTT >CP024118|35017:42271|40398_40998_+|AWC59255.1|DBSCAN-SWA MSGEEILYTANEVYGRLGVSSSTLRKYSDVLEREGYVVKKNGRGRREYTDFDILLIEKLVELSREDGMTLEKSAKLIVQQFGIDNKKEDTQGSDSLPYQTQIQFQQQYSAMIEEINKMQQANLLEMEKRLGERIDQKNKLIMEDMKDRKEREERIEQRLELRDDNLMKMVREIQEAKRTIVSAQEEIAAAKKKLWWKFW >CP024118|35017:42271|36290_36629_-|AWC59251.1|DBSCAN-SWA MKIMLSTDSIVEKYLGMALENPKTPFTYNDTTLVNVKDLYNFINKNCKSELVDFEEVIKEVIETAMTQGGPNCSYELGSHNTKSGNTETISFEYDFEYDEEEDESTNHTITF |
8 | Bacillus_phage(33.33%) | integrase | attL 31941:31956|attR 48149:48164 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
22572 : 29189
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024117|22572:29189|DBSCAN-SWA AATGAAACTCAAAGGAATTTTAAGCAGTTTTCTAACCATAGGATTGTTATTTTCGGGATGTTCAGCAATTCAAAGTTCAAATCATGTAAAACAAACAAGTGAATCACAAGATATTGCACAAGTTATAGAGTTTCCATCAAATAAGTATCCAGAAACCGCAGCGCATATTAAAGATGCGATTGCAAGTGGCAAGACAGATATTTGTACGATTGATCGGGATGGAGCCGCTGAAAGGAGAAAACAGTCTTTAGCAAATGTTCCAACGAAAAAAGGATATGATCGGGATGAATACCCTATGGCTATGTGTAGGGAAGGCGGTAAGGGTGCTGATATAAGGCATATAAAACCAGCTGATAATCGTGGTGCTGGTTCGTACATTGGGAATAAAGTGGAGAAATTACCGGACGGTGCAAAAGTGAAAATCGTTGTGAAGTAGTTAGTAGAGATTTTATTTAAAAGCGAAAACCTAAAACTATATAGTGGGATTGAACATACATATTATAATTTCATTTGTTAAAAAAAGAGTCTTTTTTAGGCTCTTTTTTTTATGAAAAAATACGACATAAAGAACGTTAGTTCGTGTATAATAAGAACAAATGTTCTTTTAGTTTTAGGGGGATTTTACATGTATGACTATTCCGTTTTGCCGAATCGTATTGTGATGTGCGTTGATTTTAGGTCTTTTTACGCCTCGGTGAGTTGTATTAAAAGGGGATTAGACCCGAAATATACAAAGTTAGCCGTGGTTGGAGATATAAAGCGGAGTGGTTCGGTTGTATTGGCAGCTACGCCACCTTTGAAGAAGTTAGGTGTTGGGAAACTAAGTAGACTGTATGAGATTCCCAAAAGGTCAGATATTATTGTAGTGAATCCGCAGATGGAAACGTATATAAAATGCTCAAATTACATTACTAAGTTAGCGTTGCAATATGTAGCGCCAGAGGATTTACATACTTACTCTATAGATGAGCAATTTCTTGATATGACAAGTACATTGCATTTGTTTGCAAATAATCCGATTGAATTTGCGATGAAATTTAAGAGAGAAGTATATGAGAAGACGAGGATTGAGTGTACAGTTGGTATTGGACCAAACCCGCTTATGGCAAAGGTAGCTATGGATCGTGAAGCTAAGAGGAATGAAACGGGAATTGCGTATTGGAGGTATGAAGATGTGCCGGAGAAGTTATGGCCAATACGTCCGTTAAATGAATTTTGGGGGATATCAACGAAAACTGAAGCGAAATTGAATAAGAAGGGGATTTATACAATTGGTGATTTAGCTCATTATCCCTTGAAGTATTTAAAGCAATCTTTCGGAATAATCGGTGAGGATATGCATTTGCATAGTCACGGGATTGACTTTAGTAAAATTGCAGAAAAACATGTGGCAGAATCAAAATCAATTGGTAAAAGTCAAATCTTAATGCGTGATTATTCAATTGAAGAAATACAAATTGTTTTATTAGAGCATATTGAAGAAGTGTGTTATCGATTAAGAAGAGAAAGGAAATTAGCGCAAACTATACAATTTTCTGTTAGTTATAGCAGGGCTTATAGTGGTGGGATTAGAAAAACCTGTACTTTTCCGCGTCCCACTTGTTTGACAATGGATGTTTATGAAGTTTGTATGGGATATTTACATAAATTATATACAGGTGAGCCAATTCGAAGTATATCGGTATCTTTGACTAACTTAATTAAAGATGGAGAAGAACAACTTTCGTTGTTTGATAATGTAGAAAGAAGAGAAAAAGAAATGAAATTAGCATATGTCATGGATGATATTAGGTCAAAATTCGGTAAGAACAGCATATTAAGGGGGATATCCTATTGTAATGAAAGTACAGCTAGAGAAAGAAATATGTTGTTAGGGGGCCATAAAGCATGATAAATTCTCAAATGCCAAAGGGACGGAAGATGGTCAAGTGGATGCCTTTTGCCAGTTTATCGGAGCAGTTTCAGGGGATTCGTGAGATTATCCAGGAACAAAACAAAATCAAAAAACCACTCCTGGATCAACAACAATTAGAAGAAATAGGGCGAATTTTAAACCAATCTTTATGTAGGGAAGAAGAAATACATATAAGCTATTATCGGCAGGGATATATTCACCATGAAATGGTAACGGTAATAAAAATTGACCAATATACAAGAGAAGTGATTACCACTGATGCTTTCCGGAATCGAAGTATATTTAAAATTGGGGAAATAGTAGATTGTTGTCTTGAAAAGTAATGTAGATAAGAAAAACGTGAAAAGCGCAAGGAAAACATTTGAATGTTTATTCTTGCGCTTTTTGTTGTTTGTATTATAAATGTTTTAGTATCCATTGAGTTTGTTCTTCATCAAGGTTAAACCACCAAGCGTTTTTATCAGCAGGATTTGTTTCTAATTTTGCTACAAATATTTTATCATTGTTATCTGTTACTCTATAAAGTTCTTGCGCGATGTCTTCAGCCTCTTTAGGGGATTGAACAAGCCAAACGGATTCTAATATACGTTTGTAATTTGGATAAGTTTCAATCTTCTTTTCTATTTTATCGTAATCTTGTCCTGGAGCAATTAGATCGTAAGAAATTAAATATGATTTCATGAAATACATCCTCCTAATTCGTTTGAATAACTTATGTAATATTTTAACATGCTATATTGTTAGAATAGAAGTTTATATTTAGAATTGATAGAAGATTTGAAATAAGAAAACCATGTTCATAACTTAAAGGTTTTGAACACGGTTTTCTTTTGTGATAAAATCAGTATATAGACCTACATCAAAACTTATGGTCAAAAGCGAATGTAGAAAAGGTGATTTTTTGGTTAAATATGGATATGCCAGGGTGAGTACATTGAACCAGGATTTGGAATCTCAGATTCAGATGTTAAAAAAAGAAGGTTGCGAGGAAATATACGCAGAAAAATTTACAGGGACAAAATTTGAACGTCCGAAATTCCAGCAATTGCTTTCTGTATTAAAGAGTGGAGACACACTTGTTGTGACAAAATTAGATCGTTTTGCAAGGTCTACAGTGGATGGGATTCAAACAGTAAAAATGTTATCTGATAAAGATGTTAAGGTACATATCCTTAATATGGGCTTAGTAGAAAATACACCTACAGGAAGATTAATATTTAGTGTAATGAGTGCTTTTGCTGAATTTGAAAGAGATATGATTGTAGAGCGAACTCAAGAAGGAAAAGCAATGGCTAAATTGAATCCTAATTTTAAAGAGGGGCGACCGAAAAAATATAATAAAGAGAAAATGGACTACGCCCTTAAATTATTGCAAACGGAATCTTATAGGAGAGTAGAAAAAATAACAGGGATTAGTGTGAGTACATTGCAGCGGGAAAAAAGGAAACGATCAGCGGAGAAAGAACAATAAAATAAGAATAATAGGATTATTGATATTAAGGGACGAATCGACTTGTATTATAAGGAAGGGGCTGGGGAATTGTTTATAATGTTTAGAGCTTGTCAGTCTATTAATATTCGATATTTGATAAAATCATATATGTGGGGTATTTTAATCTATTTGTTTTTTAGATGGGTGATTCCTTCGGATGAAATAGGGATGATTACTTTAATGACAGTTAATCTAATATTCTTTCCGTTTACAAGAATAGTTGTTTCCTCTATAAAGAACTTTTTCTTTGCGGATACAATGTTTATGATGACTGATAAGGGATGGTTTATATATTTGTTTGTGAAAGCTTCGGTGCTAGGGTGGTTCTTTGTGATGACGCCAATATTTGGACCAATTGGATTTTTAATTACGCTATTTCATTTTTGGAAGCTAAAGAGGAAAAAAGTGAAACTTATGCAGTGGAGAAAACAAAATGTTTCTTAGTGTATAAAAGGAAGACTCATTTCATTTCGAATGGGTCTTTTTTTGTTTGACTGTATATCGGATTTGGACTGTATTGTAAAAAAGGACAGATTCTACAAAAATGAGTCGCCGAGATTGCGATTTTAAGGCGATTATCTTTTCTTTCATGGGTAATCCATCGTTAAATTGCTCCTATGCTTCAATTGGGAAACACAGAAAATGGGGTATGTGTAGCAATGGAACAGAATCACGTAACAAGCATTAGTGGACATTAGGAATCTGTTCCTTTTCTTTTTGATGTAAAATCTGTCGTCAAATGTCTCTTGTGAACTTCGAAAATTCAGTTTTTTTAGAATTATTTGTATAAATATGGTATACTTGTTTTGTAAAAAATTTTCTAGGAGGGTTTAAGGTGAAAAAATTAGTTTCAATTTTATTATCAGCATTACTATTAGTCGGTGTTGCTCCTACTTTAAGCGTGTTTGCAGAAGAAGAGAGCAAAGAAGTAACTTTAACAACAGTTACTGAATACAGCATTGTCCCAGAAGGCTTAGAAAATGTAAGTGTAGAAGAACTACAACGTGCAGGATTTTCAGGGGGTTCGGCGACAGTTACGTGTAAAGATATAGGACATTCATTGGCAGATTGTGATACAACATATAAGGTAGTTAATGATAAAATTTCACTTATAAATACTACGGTTACAATCAACGATCCTAACGGTGGTCATATTCTAGAGGGGAAATCTGATTTCGGTATAATTAATCCATCTAGGAACCCAGTTTACAGTGCAGTAAGTTTCGTTTTACCGCCAGGTACATATCGTTCAGAAATGTGGGGTAAGATTCAAGGGGGCAAGGGTACTTATACGGTGACAAACGTTAAATCCAGAAACTTCAAAATGTCTTCATGATCCCTGAATTAAATAGAATAAATAACCCACTCAATTTCAACCGAGTGGGTTATTTATTCTATTTTTAATTTTCAAGATATTTTTTAAGTTCGTAAGCATTATATAAATTATTATCTATACAAGATTGTGCTGTTATTTTCAACCCTATTATTAGATGTTCTATTTCTTCATCCGTATACTTTTTTACGCTTCCATTCCCAGCTACTTTTGTTGTATCGTTCTCTAAATCTATAGTTATTCCTAATAGTACATTATTACTTTTCACATCTACGACTTGAATATAAAAATTTTTATTTTCCAAATCAATTGTAATAAAATTAAACCGTTCTACTAAATCAATTCGAGAAATACTTGTATAATCAGACATCATTTATCCCTCCATCTTATTTGATTCAGTTCTTGAACTACTCGCCACTTAATGCCCGAATGGACTGTTTGAAGTGGGGGGTTCTGTTAACTAGACGTTTATGTTTAATTACACTCTTTATTATAAAGAAAGATGAAATATAAATATACAGGTTTAACGCAAAGTTATTTACATTTCGTACCCAAAAACCTCGAGAAATGTTTATATATTTATACAATGTCCGCTAATGCTTGTTACGTGATTCTGTTCCATTGCTACACATACCCCAAAATAGAAAGAATATTCTAATATTTATTTATCAATTTACTTTGGAAACGTTCTTCTCATGCAATTTGTAGAATTATGGTAATATTTAGAGAAATAGAGATGTTTGAGGAGGACGTAGTGAAATGAACACAGGTGTTTTTGTGTATGAAGTAGTTATGCAGCAACTCAATGATTTTTATCAACTAATGTTATCACAACAACTGCTAAAAGCATCGGAATTAAAAAAGGAAATTGATGAGAAAATCGAACAGATTAAAGATGCAAAAGAAGAAGAAAAACAACATCAAAACTTATTATTATATTATTCTTTACTAGATTTTAAATATAGAATGCTAACGGACAGAGTAAGTATCCGAAAAGATAGTTTCGATGCAATTAATGATTCAATTGATCAAACAACAGATACGTTAATATCTTACTATTATCATTCTTTCAAAGCGGAACATGCTTTGATGTTTAGTAACTATAACGAAGCGAGAAGACAATATGAAGAGGCTGAAAGCCTCTTAGGACATATCTCTGATGAATTAGAGCATGCAGAGTTTTATCAAAAGTATGCAGTGTTGCATCATCATATTTCTCATATGTTAACATCGATTGAATACACAAATAAAGCAAAAGTAATTTTTGAAAAACATCCTGGATACGAAGTGAAAGTAGCTTCATGCGAAAACACGTTAGGGACAGCTTGTATTTTCTTAAAACAATTTGAAAAAGCAGAAGAGCATTTAAATCGTTCGATTGATCTTCTGAAAAAACATAATGAAGACAAGCTTATTTTAGTAGTCAGACATAATTTAGGATTGTTATATGCAACGCAAAACCTTTCTACATTAGCAATTCGTCATTTATCAGAAGTAACAGAAAAAATCCCAACACACTTTAAAGCACTATTCTTACAAGCACGCGAACATTATAAATTAAAAGAAACAGTTACTGCAAGGGAATTTATTATAAAAGGACTAAAGGTGTGTCAGGAAGTAGGGAATGAAGAATATATGTACCATTTCAATATTCTACGTTCTTTAAATGAAGATGCAGCAGTTGAATTATTAGAAGAAGAAGTGAAAAAAGGTATTACTTACTTCGAGGATCAAGGTTTATGGGATTATGTAGAAGAATATAGTGAGGTATTAGCAGTTCGCTTCCGTAAATTGAAAAATCATGAAAAAGTAAGTGATTATTTCGATGTATGTTATGAAGCGAAGCAAAAACTATTAAGTAAAGGAGCATTAAAATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024117|22572:29189|27378_27684_-|AWC59194.1|DBSCAN-SWA MMSDYTSISRIDLVERFNFITIDLENKNFYIQVVDVKSNNVLLGITIDLENDTTKVAGNGSVKKYTDEEIEHLIIGLKITAQSCIDNNLYNAYELKKYLEN >CP024117|22572:29189|25999_26422_+|AWC59192.1|DBSCAN-SWA MYYKEGAGELFIMFRACQSINIRYLIKSYMWGILIYLFFRWVIPSDEIGMITLMTVNLIFFPFTRIVVSSIKNFFFADTMFMMTDKGWFIYLFVKASVLGWFFVMTPIFGPIGFLITLFHFWKLKRKKVKLMQWRKQNVS >CP024117|22572:29189|28070_29189_+|AWC59195.1|DBSCAN-SWA MNTGVFVYEVVMQQLNDFYQLMLSQQLLKASELKKEIDEKIEQIKDAKEEEKQHQNLLLYYSLLDFKYRMLTDRVSIRKDSFDAINDSIDQTTDTLISYYYHSFKAEHALMFSNYNEARRQYEEAESLLGHISDELEHAEFYQKYAVLHHHISHMLTSIEYTNKAKVIFEKHPGYEVKVASCENTLGTACIFLKQFEKAEEHLNRSIDLLKKHNEDKLILVVRHNLGLLYATQNLSTLAIRHLSEVTEKIPTHFKALFLQAREHYKLKETVTAREFIIKGLKVCQEVGNEEYMYHFNILRSLNEDAAVELLEEEVKKGITYFEDQGLWDYVEEYSEVLAVRFRKLKNHEKVSDYFDVCYEAKQKLLSKGALK >CP024117|22572:29189|24882_25167_-|AWC59190.1|DBSCAN-SWA MKSYLISYDLIAPGQDYDKIEKKIETYPNYKRILESVWLVQSPKEAEDIAQELYRVTDNNDKIFVAKLETNPADKNAWWFNLDEEQTQWILKHL >CP024117|22572:29189|23196_24462_+|AWC59188.1|DBSCAN-SWA MYDYSVLPNRIVMCVDFRSFYASVSCIKRGLDPKYTKLAVVGDIKRSGSVVLAATPPLKKLGVGKLSRLYEIPKRSDIIVVNPQMETYIKCSNYITKLALQYVAPEDLHTYSIDEQFLDMTSTLHLFANNPIEFAMKFKREVYEKTRIECTVGIGPNPLMAKVAMDREAKRNETGIAYWRYEDVPEKLWPIRPLNEFWGISTKTEAKLNKKGIYTIGDLAHYPLKYLKQSFGIIGEDMHLHSHGIDFSKIAEKHVAESKSIGKSQILMRDYSIEEIQIVLLEHIEEVCYRLRRERKLAQTIQFSVSYSRAYSGGIRKTCTFPRPTCLTMDVYEVCMGYLHKLYTGEPIRSISVSLTNLIKDGEEQLSLFDNVERREKEMKLAYVMDDIRSKFGKNSILRGISYCNESTARERNMLLGGHKA >CP024117|22572:29189|24458_24809_+|AWC59189.1|DBSCAN-SWA MINSQMPKGRKMVKWMPFASLSEQFQGIREIIQEQNKIKKPLLDQQQLEEIGRILNQSLCREEEIHISYYRQGYIHHEMVTVIKIDQYTREVITTDAFRNRSIFKIGEIVDCCLEK >CP024117|22572:29189|25387_25957_+|AWC59191.1|DBSCAN-SWA MVKYGYARVSTLNQDLESQIQMLKKEGCEEIYAEKFTGTKFERPKFQQLLSVLKSGDTLVVTKLDRFARSTVDGIQTVKMLSDKDVKVHILNMGLVENTPTGRLIFSVMSAFAEFERDMIVERTQEGKAMAKLNPNFKEGRPKKYNKEKMDYALKLLQTESYRRVEKITGISVSTLQREKRKRSAEKEQ >CP024117|22572:29189|22572_23007_+|AWC59187.1|DBSCAN-SWA MKLKGILSSFLTIGLLFSGCSAIQSSNHVKQTSESQDIAQVIEFPSNKYPETAAHIKDAIASGKTDICTIDRDGAAERRKQSLANVPTKKGYDRDEYPMAMCREGGKGADIRHIKPADNRGAGSYIGNKVEKLPDGAKVKIVVK >CP024117|22572:29189|26813_27314_+|AWC59193.1|DBSCAN-SWA MKKLVSILLSALLLVGVAPTLSVFAEEESKEVTLTTVTEYSIVPEGLENVSVEELQRAGFSGGSATVTCKDIGHSLADCDTTYKVVNDKISLINTTVTINDPNGGHILEGKSDFGIINPSRNPVYSAVSFVLPPGTYRSEMWGKIQGGKGTYTVTNVKSRNFKMSS |
9 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024116_1 | 1597627-1597755 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP024116_1
|
1 spacers
spacers of CP024116_1
>1.1|1597665|53|CP024116|CRISPRCasFinder TATTTGCGTAGGGGCGTTTTTTATTGAAGGTCCTACTGTCGTTGTGTCTTCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024116_1
The CRISPR arrays of CP024116_1 >merge|CP024116|1|1597627-1597755|CRISPRCasFinder AACTAGGGTGGTACCGCGATGTTTTAATCGTCCCTACGTATTTGCGTAGGGGCGTTTTTTATTGAAGGTCCTACTGTCGTTGTGTCTTCATAACTAGGGTGGTACCGCGATATTTTAATCGTCCCTACG >CP024116|1|1|1597627-1597755|CRISPRCasFinder AACTAGGGTGGTACCGCGATGTTTTAATCGTCCCTACG TATTTGCGTAGGGGCGTTTTTTATTGAAGGTCCTACTGTCGTTGTGTCTTCAT AACTAGGGTGGTACCGCGATATTTTAATCGTCCCTACG
>CP024116.1|AWC56572.1|1595583_1597218_-|polysaccharide-biosynthesis-protein MSTSKVLKGTALLSGATMISRILGFIYFFPFQLLVGTQGVALYGYAYSWYGILLSFSTAGIPIAVSKFVAKYNALGDYSTSKKLYNSSVKLMLLMGFSGFFILFIGAPYISQFIIRSKAPDPKFIADVTLTMRALSFALIIVPAMSVTRGYFQGFQHMKPSAVSQVVEQIARVVFILAGSFVVTKLLGGSVASSVAVATFGAAVGAIASVSILIMYWKKYNHLKPPKGELKSRASTLPLKSIYMELLRYAIPIVFVGIAIPLYTLVDQYTVADALRALGEPLTTANAVFAYIANYAQKLIMIPASLATGFSLTIIPAITKSFTSGKQEELQEQITKIFQVLLFFTIPAAFGLASIAYDTFRMVYVSHDIAVGGSQYLISYAPSAVLSAIFTVSAAILQGIDYQRKTMIAFSVGILVKLIVNTPLLYVLGGHGAVLGTILGYLVSDAIMLYCIVKFAKFDIKETIKTVCLIIIYSGAMSAIVMALKAMIGWFIPGQSYIESLLIVIICGVVGGFVYLLFVLTSGLASRILGNRIQRLPILGKFIK >CP024116.1|AWC56571.1|1594596_1595514_+|cysteine-synthase-A MKLCKNVTELIGDTPVVRLSKFVPKDAADVYVKLEMFNPSRSVKDRAAYHLIHVAEEQGFIQPGDTIIEPTSGNTGIGLAMNAAAKGYKAILIMPDNMSKERMNLLKAYGAEVILTPAEQRMPGAIAKAIELQKQIPNSFIPQQFENPANPNIHRYTTALEIYEQMEGKLDAFVATAGTGGTITGTGETLKEKLPNLHIVVVEPKGSPVLSGGVPGPHKLVGTSPGFIPKNLNTEIYNEIIQIADEEALSTMRNLAKQEGLLVGPSSGASVYAAIMIAKRLGAGKKVLCIAPDTGERYLSMGLFE >CP024116.1|AWC56570.1|1593372_1594581_+|MFS-transporter MQAISKENVVTTPTIYRILFAISFGHFLNDSMQAVVPALFPILEKTMNLSYMQVGWIAFALNMTSSVMQPVFGMYSDKKPSPFLLPLGMFSSMLGMIGLAFAPNFIIVIISVLFIGLGSAVFHPEGARVAYMASGTKRGLAQAIYQVGGNTGNSLAPIFTAVIFVPLGQKGSLGFTAFAAVGILLLMYVSKWYKNELVSGAVKSKKRAALEAENAIVSAHIKFVIVLLIFLTFVRSWYGAGIGNFYQFYLIEHYGLSIKNAQYFVFAFMISGVLGTFFGGPLADRFGKKNIIVFSMLGSAPLALLLPHVSLLWVVPLFLCIGFISSSSFSVIVVYAQELVPGKVGMVSGLIVGLAFGLGALGAVVLGKLADIYSLQFIMVLCSCLPLIGLTSWLLPSDKKSV >CP024116.1|AWC56569.1|1591514_1593155_-|peptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKKTKRVAVLSLTLSLVLTACGQKQETTTNKDEKKVATKQILNIVETGEISTLDSSIATDGFSYAALNNVMEGLYMPGPGNKPVPGAAESYTLSEDGKTYIFKLRHSNWSNGDPVTAHDFEYAWKRAINPETASEYAHIMFDIKNAEKVNKKALPLDSFGVKALDDKTLEVQLEHPVPYFLGLMGFATFYPQNQKVVEAQGTNYGLEAANAVYNGPFVLNEWKHDTSYKMTKNPNYWDHKNVKLQEINVNIVKDTSAAVNLFESKQVDRITINSEFVDKYQNDPSLKKMARPSVTFFRLNQKNPLLANKNARKAISLSFDKKGITTTILNNGSIPANAFIPKGFVKGPDNKDFRSTSNVKVETSIKEAKKQWETAKKETNLQNVSLSIISTDESNDKKISEYLKGELEKNLPGLKITLNPLPVKAFLEREGNGDFEISLSTWGPDYPDPTTFLNMFVTDGPFNKMNYSNKQYDELMEKASSSLTTDLPARWKAFQDAEKILVEDDAAIAPIFQAGLIYLERPSVKGVVVRPFAGIYSYKWAYITE >CP024116.1|AWC56568.1|1589843_1591412_+|Vga-family-ABC-F-type-ribosomal-protection-protein MLLLEANRIKYYIQDRLLLDIDQLQIHQNARIGLVGRNGSGKTTLFQILAKEIVPEEGSIVQRARCELLPQLKQTDTTKSGGEVTQEYIQKAVLKDPELLLADEPTTNLDTGHIEWLEKKLGNWKGAFVIISHDRAFLDALCTTIWELDEGKIKVYTGNYSEYVKQKEIERQQEQLAYEKYEKKKKQLEEAVKLKEKKAERATKTPKKEGKLEPKITKPYFAKKQKKLQKTATAMITRLEKLGKVEKVKELPPLKMDLPNAETFKNRIILRVNDRIGKVGKRVLWKKASFHIRGGDKLAIIGANGSGKTTLVKQIMNQEYGIRFSPAVKVGYFSQNLNILDPAKSIIENVQSSSKQNETLIRTVLARMHFFREDVYKLVEVLSGGERVKVALTKLFLSDINTLILDEPTNFLDMTAVEALESLLKEYEGSVIFVSHDRRFIENIATRILTIHNQELGLFEGTYQQYKRTQVQQAQERKKDTRLLLETKLSEVLSRLSIEPSEKLEREFEKLLQEKRELDASE >CP024116.1|AWC56567.1|1588252_1589512_+|GTPase-HflX MEEFVQRAILVGVNLGHESDFQYSMEELANLAEACDVEVVGQVTQNLQRVNPSHYIGTGKIGEVAAYVKEVDANIVIFNDELSPSQIRNLEKDLDCKVIDRTILILDIFAQRAKTKEAQLQVEVAHLQYMMPRLVGLRESLGRQSGGVGTKNKGVGEKKLELDRRKIEEQISVLNKELEALVVQRKTQRKQRKKNEIPVVALVGYTNAGKSTTMNAMLEIFNGTIEKQVFEKDMLFATLETSVRNIELPDNKSFLLTDTVGFVSKLPHHLVKAFRSTLEEVAEADLLIHVVDYSNPNYEQLIEITNQTLKQIGVENIPTIYAYNKSDMMDVEIPKTKKDRVYLSAKKQIGMEELVEMIRSHIYKEYTKCEMLIPYDQGQIVSYFNEYAHVICTSYENEGTKLSLECKISDFEKYKRFAI >CP024116.1|AWC56566.1|1585970_1586435_-|hypothetical-protein MKRKIFFLLTLLCIVLPIQVSAFTFQELPVASKSKQWYIEIDKSYNSNKQARQPKQGVYDTYSLFVKNIGKDVSNVSIEIVGNDPSAKTTFKPTVPHTNVSKSHTSFDYMVFPLYFTSHTFKVVMTWEEKEFTYNGHPESKSKKMKQTFIFTEE >CP024116.1|AWC56565.1|1584538_1585915_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKKVISNVLAMTAALQVIMVPTTSFAAEKGFSDVPKSHWAYEAINDLANRNIIAGYDNGKFGLGDSVTREQVAALIYRALKPEAKAEYKNPYHDVSASTTMFPNEILALTEMGIFTGDENKNFRPKDSLTRAEMAMILQRAYHLKVKANHTFHDVDPNSWAKDAISALQSNGMAEGDGTGAFYPSKTVTREEYAQFLFNAEQSYLNLDLTLASNVTAEEIDNFLKKSRSDSPLIGHGQDFIAAQNEHGVNALYLAAHAILESGYGRSEIAYRKHNLFGLRAYDRDPFYHAKYLPTYRDSISYNANYVRERYLEKGAIYYNGPTLVGMNVKYASDPEWAGKIAGLMERIKPFDRNDYKNANRLPKNPHTLDVEALGNEIPYKDLGNREIAVQASGKYYKVPYPYDLKIKSIPDITQNEMGTLTNGSKVTVHREDPNGWVEFSMKDKQEKYWTLKSNLKM >CP024116.1|AWC59058.1|1583781_1583970_-|hypothetical-protein MPKSINFSAFIDWDCFRIETELSYIQTCIYEELSTKKRYHVYTDIPFLAIFLLAPFSVSLFL >CP024116.1|AWC56564.1|1582407_1583640_-|aspartate-kinase METIVQKFGGTSVGNIQRIQHVANLMIEEYEKGHNVVTVVSAMGKSTDKLVALATSITENPSKRELDMLLTTGEQVTISLLTMALQTKGYQAISLTGWQAGITTEPVHGNARITDIHTERIQSYLQEGTIVIVAGFQGLSEEKEITTLGRGGSDTTAVALAAALKAKKCDIYTDVTGVYTTDPRVVNNAYKLDEISYDEMLELANLGAGVLHPRAVEFAKNHNVVLEVRSSMEQENGTIVRGECNMEQQSIVKGIAFEDNITRVTIKGLEHDSLSTIFSTLAEAHINVDIIIQSITNEGTVHLSFSIHSNDLRETLEALKQNQETLHYESVEYENHLAKVSIVGSGMVSNPGVAAHMFSTLKEENIHVKMVSTSEIKISVVIDRLHLVDGVEALHQAFMTKVEPLVQMNK >CP024116.1|AWC56573.1|1597858_1599196_+|sodium-dependent-transporter MNSPQWTSKLGFVLAAAGSAIGLGAIWKFPYMAGIGGGGAFFLIFIGFTLLIGLPLLLAEFVIGRSTQKEAVDAYRQIAPKTLWPWLGKLGVVTCFILLSFYSVVGGWILLYLWNAITGRLWEGNGAYEATFGEIISNPYLAVGSQLLFILMTIFIVSKGVQNGVEKVNKYFMPALFVLFFILIIRALTLDGAGEGVRFFLQPDFSNVTSEIILYAMGQSFFSLSVGVAVMVTYSSYLPKEESLPRSAFSIVGLTLMITLLAGLAIFPVVFAFGMEPSQGPGLLFIVLPAIFSKMAFGKVFFVIFLLLFFFATVTSAISMLEISVASLTAKGNGRREKFAIIVGLLIFVVGIPSALSYGVLSDFKVFGKTVFDLADFAVSNVLMPLGVLLVSIFVPLKMKKDVLMRELGVSKHKGYTLFILWLFLLRYIAPVAIIIVFLNVIGVI >CP024116.1|AWC56574.1|1599467_1599734_+|hypothetical-protein MGYVKATAVLPESLIAEIQKYVQGETIYIPKQETEHYKWGTRSGGRKQIDMRNRKIKEAFENGIAIYQLAEEYFLSVETIKKIVYSKS >CP024116.1|AWC56575.1|1599873_1600512_+|elongation-factor-G-binding-protein MEAFIRSDQYNFIKSQTHILVHGHATANDRGVITALKSLAIEKVLHAFENLNSEQKELIETILAVENREDAEAFLLKLNPYVIPFQEVTPQALKKLFPKVKKLKLPEMEEVNMKEMSYLGWTDKGTGKRFIIAKKNNKLVGVQGTFQSINKKGICALCHGHEEVGMFLVEIKGDVPGTFVKKGNYICQDSIACNQNMTSLDKLHDFIERLKK >CP024116.1|AWC56576.1|1600573_1601965_-|transposase MFYNQKNLEITQNRKFYEAMYDQDHHLVRIEKEMNWNIVYTLVKPFYQSPVGRPSVDPLIIVKILLIQYVEGFRSVRFTCKQVKQNATYRWFLGIFPHANIPCHSTISKFLTHRIQGSSIWEDLFDHILHQIQKDGFLSRDIWIADETELKANANKRKREVWIQEVEVKEDFYTLEKGNKRRIEKGKKPFLPRPTKIETKRILKSPTDPDARLSVKHDARGRFAYFEHRMVDGLHNFIIDTHITPANVPGHRILRKRIECTKERLGYIPKEIALDAGYYNARLAEGLFQNNLFSYISYRRYASKEHPECKKNQFKQVHEDLYACPCGIPFSYKTTTRNGYHEYKPEKGSCTGCPFAKKTDRVLRISVHEEIYHKLRWQRLSDRGKILRFVRPSTVELSFAQSKELHGFRFARYRGVQKVTIQALLTAIIQNLIKWTKLLSLKEVGLYLTYQISDEIESETVTF >CP024116.1|AWC56577.1|1602087_1602624_-|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase MSKKTFELATFAGGCFWCMVKPFDELPGIQKVVSGYTGGHISNPTYEQVKSGTSGHLEVVQITFDPSIFPYQKLLDLYWSQIDPTDDDGQFFDRGPSYRTAIFYHNETQKELAEKSKQLLATSGIFNEPIVTEIRPAAPFYEAEEYHQHFYKKNPKKYAQERKESGREDFIKTNWQKK >CP024116.1|AWC56578.1|1603542_1604442_+|branched-chain-amino-acid-aminotransferase MKKQYIYMNGELVEKEKAVVSVYDHGFLYGDGVFEGIRSYGGNVFCLKEHVKRLYESAKSILLTIPMTVEEMEKAVVQTLQKNGYADAYIRLIVSRGKGDLGLDPRSCEKPSVIIIAEQLKLFPQEFYDNGLSVVSVASRRNMPDALDPRIKSMNYLNNVLVKIEAAQAGALEALMLNQQGYVCEGSGDNVFVVKDGKVVTPPSYLGALEGVTRNSVIELCDKLGIPCEERPFTRHDVYVADEVFLTGTAAELIPVVKVDAREIGDGKPGEVTKQLTEAFKRLTRERGVRVPGLAESLA >CP024116.1|AWC56579.1|1604939_1605038_+|hypothetical-protein MLVNKVYKFRIYPNKGQEILKQVVDVLQVNTS >CP024116.1|AWC56580.1|1607078_1608341_+|threonine-dehydratase MVHKVKERVKIEDILMAHNCLKDIVNKTPLQRDAVLSEKYKCEVYVKREDLQVIRSFKIRGAYNLIQSLSKEKLQNGVVCASAGNHAQGVAYTCNLLEIPANIFMPTTTPKQKVSQVKFFGGDVADIVLVGDTFDSSFQEAQRYCEENGMTFVHPFDDPHVIAGQGTVAVEILHDTEKTIDYVFTAIGGGGLASGIGTYVKGVSPNTKVIGVEPKGAASMKEAFLQNENVTLEMIDSFVDGAAVKKVGKLTFETCKDVLDDIVLVPEGKICTTILELYKKNAIVAEPAGALSIAALDFYKDEIKGKTVVCVLSGGNNDIDRMQEMKERSLIYEGIKHYFIIQFPQRSGALREFLDKGLGPEDDITRFEYIKKHNKENGPALVGVELKHKEDYEPLIARFKENHIQFLELNKNPVLFDLLT >CP024116.1|AWC56581.1|1608562_1609282_+|DUF554-domain-containing-protein MVILGAIVNGICIIIGTLLGKVLSNIPESMKGTVMHAIGLAVTVLGLRMGMKSEIFLIVILSLVIGAVVGEWLCLEEKLQKLGNWLEKKVGSKGEGSISVGFVTATLIFAIGAMGVLGALDSGIRGNHNVLYTKAIIDGFISLILTTTLGIGVLFSAVPVILYEGGIALFATKIDRFVPEQLMNQFIIEMTATGGIMIFAIGLNLLGFIKIKVANLLPGILVVGMIVSIIYGYNLFLLK >CP024116.1|AWC56582.1|1612489_1613938_+|MFS-transporter MQQRHNLDFGPQDVNIINPKQAKKAVVATGIGNMMEWFDFGLYAYLAVILSQLFFSNVHNSSLQLVLTFGTFAAAFLVRPIGGIFFGRIGDKYGRKVVLSTTIILMALSTLFIALLPTYEQIGIWAPIFLLVARIVQGFSTGGEYSGAMVYIAESSPDKKRGILGSGLEIGTLSGYIAASGIVTILTVLLTNEQMLSWGWRIPFLIAAPIGLVGLYLRRHLSESPVFQEMEKEKAQEEYKDDKQIPLIYILKYYKKDFLLSIVIVAFFNITNYMILSFIPSYLTQIVKMKETTGLIIISITMTLMIPLAFYFGKLSDKVGNKRVVQFGLLGLTLCSIPAFLLIRHGHIVAIFAGIFVLGFFLSIYEGTLPSLLPSLFFTDVRYRALSISFNISVSIFGGTTPLVSSYLVHITDNALAPAFYLTGVSLIGLIVFSLLFVTTSGRALKGAYPTVETKKEAYEVAKQAPEEALWWHEEALEVKKS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP024116_2 | 2100236-2100929 | TypeII |
NA
Consensus repeat of CP024116_2
|
10 spacers
spacers of CP024116_2
>2.1|2100272|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGATGTTTATCCATCCACTCTTCGACAA >2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTTTGGGTTGCCGATGTAGAAGTAAAAA >2.3|2100404|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACAAAAAGTGACTGAGGGGGCTTATAAC >2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTGCAAGCAATCAAAAAAGGTGCAATTGA >2.5|2100535|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAAAATTTCGGTAATGTAAAGGTGTTTAG >2.6|2100601|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAGCACGTCTTTATTACAGGACAAACGGG >2.7|2100667|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCCAATCGATGTATGGTGTGAGGAAGCT >2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAGCAATCTAAAGCTATCATGTAGTATA >2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGTCTTCCTCTACTTTTGGTTTCGGTGG >2.10|2100864|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAATGATGTTGATAAGTTGCCCCGCATA |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024116_2
The CRISPR arrays of CP024116_2 >merge|CP024116|2|2100236-2100929|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTTCGATGTTTATCCATCCACTCTTCGACAAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTGTTTTGGGTTGCCGATGTAGAAGTAAAAAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTACAAAAAGTGACTGAGGGGGCTTATAACGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATAGTGCAAGCAATCAAAAAAGGTGCAATTGAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTGAAAATTTCGGTAATGTAAAGGTGTTTAGGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTCAGCACGTCTTTATTACAGGACAAACGGGGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATATTCCAATCGATGTATGGTGTGAGGAAGCTGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATGGTAGCAATCTAAAGCTATCATGTAGTATAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTCGTCTTCCTCTACTTTTGGTTTCGGTGGGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTTTAATGATGTTGATAAGTTGCCCCGCATAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT >CP024116|2|1|2100236-2100929|PILER-CR GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTCGATGTTTATCCATCCACTCTTCGACAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGTTTTGGGTTGCCGATGTAGAAGTAAAAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TACAAAAAGTGACTGAGGGGGCTTATAAC GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT AGTGCAAGCAATCAAAAAAGGTGCAATTGA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGAAAATTTCGGTAATGTAAAGGTGTTTAG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCAGCACGTCTTTATTACAGGACAAACGGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT ATTCCAATCGATGTATGGTGTGAGGAAGCT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT GGTAGCAATCTAAAGCTATCATGTAGTATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCGTCTTCCTCTACTTTTGGTTTCGGTGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTTAATGATGTTGATAAGTTGCCCCGCATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT >CP024116|2|2|2100236-2100929|CRISPRCasFinder GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTCGATGTTTATCCATCCACTCTTCGACAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGTTTTGGGTTGCCGATGTAGAAGTAAAAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TACAAAAAGTGACTGAGGGGGCTTATAAC GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT AGTGCAAGCAATCAAAAAAGGTGCAATTGA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGAAAATTTCGGTAATGTAAAGGTGTTTAG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCAGCACGTCTTTATTACAGGACAAACGGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT ATTCCAATCGATGTATGGTGTGAGGAAGCT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT GGTAGCAATCTAAAGCTATCATGTAGTATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCGTCTTCCTCTACTTTTGGTTTCGGTGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTTAATGATGTTGATAAGTTGCCCCGCATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT >CP024116|2|1|2100236-2100929|CRT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTCGATGTTTATCCATCCACTCTTCGACAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGTTTTGGGTTGCCGATGTAGAAGTAAAAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TACAAAAAGTGACTGAGGGGGCTTATAAC GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT AGTGCAAGCAATCAAAAAAGGTGCAATTGA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGAAAATTTCGGTAATGTAAAGGTGTTTAG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCAGCACGTCTTTATTACAGGACAAACGGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT ATTCCAATCGATGTATGGTGTGAGGAAGCT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT GGTAGCAATCTAAAGCTATCATGTAGTATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCGTCTTCCTCTACTTTTGGTTTCGGTGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTTAATGATGTTGATAAGTTGCCCCGCATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT
>CP024116.1|AWC56992.1|2099967_2100132_-|hypothetical-protein MGQFSVTKVGQIWLTIYKYLIGWCGYNALSDTPSICKERDKWIRRRLRMVIWKQ >CP024116.1|AWC56991.1|2098564_2099629_-|tetratricopeptide-repeat-protein MDANVITNTQITKQLNEWYQVMRAQHVLKARQLKKEIDTNLYQIEENPDSFIYYSLLDFRYNMLIGNFDCNLATTPVKKDVFLQYYYHFFKFIYAMETGNYNDAKEHHDYADELLKDISDVYEKAEFHYRTALYYYYIDQPILSIRYATKAKDFFSKNVGYEVKTAACENVLGISCIALKQFEAAEEYLLAAINTFKKQSEEDSVLKVKYNLGLLYADQNLSELAIRYLLDAFEDEEHDYKTMFLLAREHLKLGKSEIAKTYIEKGLKASTKEYYYHFSILQNMYSEHSLEKVESVVNEGVSYFKQQSLWGYVQEYAEALAVKLYNEKEEMKSNQYFYMSYEAKKILEEKGALK >CP024116.1|AWC56990.1|2096957_2097260_-|hypothetical-protein MKKSKAERKRDLEIVNLYHKKLTEEELEKLSVKFIEWKEGKLPYCELTEHIHECHKKNQIIWTRFHNMNDEFLIFQAKKELNLFSERDMEKEQYKRWNTF >CP024116.1|AWC56989.1|2096348_2096882_-|hypothetical-protein MQLIQCTKKLADMMELKTEKVDQRESNNLHSWHANLFTINRKKCVIVMNNVTRYHFIIYGVTKKDLRNFEALFQKNLVTNLLSDGVEPEVIEHYVKSSSPMQYAATNNRSILSQMNDAVFMVDHYFYAELVEKQKPFINIEKLNQNLNKTVMLKIPKYPADMMRDALNQHLIMSKNE >CP024116.1|AWC56988.1|2095331_2096336_-|hypothetical-protein MRDQLRKIIDNMSEEEVKSLLRLVLLQLELVAEHRDEEMIHMVAEISKQLIESQKPTLHIKDSEHVHIAFGDSSAGCLKHTLKKEGFHQDYVISLSDIFSVGPIFHLDDRKGQVARQEWLSSNLSTGDFYFEEEYLPRFLSSLEEMRSISQDTSVTIWKADNAHEHVGLCFALAMLKDKKNIRIIDASEAQKELLNKEYDICGTGELAPEDIAVILEQYKEKECLKEEARADLTKEWNALSTNTALLRIWKDGTVHSVVEDYFDEYIVRCAKEIGADKGFSKAAHVIGEVLGRVEQLVGDVFLEYRLQTLIKQNIFQAKGSLKAMRYYSVKLNR >CP024116.1|AWC56987.1|2094766_2095177_-|hypothetical-protein MYNYPNYPGIGYDQTMYSQYQGYGEEAMEPRESDYEEYRPDDAEDAPTSPPPSQAPSVPSTFASPVQSSNIRSWVCNCLGRWGYLRLHRPGPFGRDLWFFPTEVRRGGVSGYTWQAGRRRKVSYRYQQISNFMCFA >CP024116.1|AWC56986.1|2093377_2094613_-|cytochrome-P450 MSVKNKVGRNIKDGIKLASPEFKEYAYEIYKESRKLQPILFVYKGELGTEWLITRYEDALSLLKDSRLKKNPENIFSQEKLKSLFSIENSDYLTKHMLNADPPDHNRLRALVQKTFTPKMISQLHNRIQHIADTLLDHVEQKRSFHFIRDFSFPLPIIVISEMLGIPKEDQAKFRIWSHAVIDSPEIPEEKIENEEKLSEFITYLQYLVDLKRKEPKEDLISRLIQAESEGGQLSAAELYSMIMLLIVAGHETTVNLMTNTVLALLENPDQLQLLKERPELIDSAIEEGLRYYSPVEVTTARWAAEPFHIHDKVIQKGDMVTISLASANRDETVFVNPDVFNITRENNRHIAFGHGGHFCLGAPLARLEAKIAIATLLKRMPRLRIKGKREDIKWEGNYLMRSLKELPLTF >CP024116.1|AWC56985.1|2091822_2093106_-|MFS-transporter MSVSAETNPKVGMSQVLKNRFVQGILISALCLQIGIWVRNFAVLLYVMEMTKGNAFAISMISVAEFAPIFIFSFIGGTFADRWKPRKTMIWCEALSSLSVFAVLLTLMFGTWKVVFFVTLISAILSQFSQPSGMKLFKQHLSAEEIQLAMSLYQTTFAIFMILGPILGTFVFQSFGIYISIVVTGVAFLLAAIVLLFLPKDVEMHAEKKQVSLLQEMADGIKYVLGKKALTLLGICFMAAGLGIGLIQPLGIFIVTEQLGLSKESLQWLLTVNGAGMIIGGALAMIFAKNVAPQKMLMIGLLAQAIGIGVIGFSTNLWITLTAQLFSGLALPCIQIGINTLIIQNSDTDFIGRVNGILSPLFTGSMVLTMSIAGSLKEMFSLSMLYEGTAVLFIVGLFVILPIYHLKPAVRAENQPAKEGSAIQQES >CP024116.1|AWC56984.1|2091594_2091750_-|DUF1540-domain-containing-protein MAQDVLCEVNNCKYWGNGNKCNADAIYVVSHKGKQASKTEETDCKTFTPEA >CP024116.1|AWC56983.1|2090745_2091324_-|cysteine-dioxygenase MLTCRKSELFQQFIHNVTASIENSKNEETIVCTIEKLLEKLLETKAWLPLEKQKANRNQYARHLLYKDPLDRFEVLALVWRDGQATPLHDHDGTWGVEGVFSGRIKVKNFLKIKQLEESIFQLKYLGHLYLGEGKTDKIIPPADCHILEIEPNEQVITIHIYGKKLEKFKVFIPTERKDIYRCKMKYIQYSS >CP024116.1|AWC56993.1|2101083_2101392_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRILVFFDLPVMTKAERKAYTRFRKFLLKDGYTMLQFSVYTRVCNGEEGAQKHLRRLRQNIPNVNGAIRSLKVTEKQFESMDILLGVQTIDEKLGTNKTDFF >CP024116.1|AWC56994.1|2101396_2102299_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAFRHIVIRNPSKLSTCDEQLLIKQEETVRIPLEDICTITIEDPAITITAALLSKCVEYHVELIVCDRKRLPAGILQPFHRHSRQKAVLDVQLGLGKPFKKRIWQQIVIRKLENQARCLELANKGEDAQKLYSISKSVESGDRTNREAYGAKVYFTALFGPNFYRREDDVRNISLNYGYSLVRSLTARALVRYGFNPSLGIFHDSQTNAFNLADDFMEVLRPFVDIIVALNVSDETEWDSKMREKLFSVLNIEAVWKEERQSITNGVEQMIKSYVSACRQNDASLLLLPELIALRQHTYE >CP024116.1|AWC56995.1|2102288_2105522_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKYSIGLDIGIASVGWAVINEDIERIEDLGVRIFDVAEQPKTGASLSTPRRLARSTRKRLRRRRHRVERVRKFMIQKGLLTQVQMEQLYDWKDGDLDIWLVRVNALERKLSDREFARILVHFAKNRGFQSNRKSELQEEDNGAVLSAVQENKRLMEEKGYQTISEMLLYDEKFEGTKRNKGGEYTHVVARSDLKREIQLIFEKQRAYGHAFATMENEDKFLQIWSSQRPFATKDDIAKKIGNCTFEPKEKRAPKSTYTFERFRALDKLNRLRILSGTSPARSLTQEERDLILNSLFSKKEVKYKELRKLLKLNDEQRFNEIFYDPNEKIEKNENRTFLSLESQYKIRKILQKIEGKSLNDTYRPVDLDTIAYALTVFKDDQDIRDYLQNQYVASNGKKELNLANRKYNDELIEELLHLSFTKFGHLSLKALRNILPFMEQGIPYHQACEKAGYQFNKKVNREKQKLLPPVPAKDIVNPVVIRSLSQVRKVINGIIKRYGSPSSIYIELAREMGRGYKERKDLEKQYNKNRQMNEGAKKHILELRPEFGDPRGHDILKYKLWQEQDCRCAYSFKSIPIKQLFEIGYAEVDHIIPYSRSFDDSNNNKVLVLAAENQNKQNRTPYEWFGHDETKWQEFTSLVTTMKVSKKKKSLLLKKNFDEEQAEEFRSRHLNDTRYITRYIKTFIEDNLQFRMEEGKKQYVHTVNGAYTSLMRKRWGFNKNRQENDLHHALDAVIVAVSLPFKHKVSAYFKRREEYAHNQLKREGEFFPEPWPGFIHELEIRMMQDSENIKLAMESLNLKTYDESFIKELKPIFVSRMPKRAMRGQIHEETLKRVRGRTDDGYIRTVKKVKLDQIPFDKNGDFPMFGKETDMKTYEAIKSRYLESGKDKKKAFNTPLYKPAKNPENAPIIRSIKIEEKANRVVMLDEKTAADNASIVRTEVFRHKETGNYFLTPVYVADVLAKKVPDRLITTKKPYSEWRKITDEYEFLFSLYPNDLIRVKMPKEKGTKTHTGEKHVWQENFMYFKGVHSGSAGVRMIDHMNSFEDEIGVRKLVVFEKYQVDPLGRMNKVHGEKRHGI >CP024116.1|AWC56996.1|2105833_2106595_-|DUF3959-domain-containing-protein MKKLDVLLMLLSGLFPVAGIMKQIPLPLSLILGGLLFFTSFGSYYTKQTSSRVCSWLAYTIFITFLMGIWDQYVTMSSLLANAKIAACIALLPAILCFRTYGITFGLLALWGALLWDVKEVQSLAVLGRMMNLLTTEKMYLLLLIAGFLVGGLFANGFRRKNDKFKQETPNVLKQKKKRMRPTFHIRIPRLPKLRMKMLTFGRTPTQSKDKRPYESMREENIHAIQQEPQHEQQEPTTLGQTRMERRRNRYHV >CP024116.1|AWC56997.1|2106851_2107271_-|hypothetical-protein MVICTWIIAILLLSFTWLELVLLQIVGLQYESNQALILFFIVYIFTDLPLSLIVDNIPKALKSLDLIQTSKGWIPFLFDAGKTYILIMTIDYFMESITISWQGVFLFAIIRGSIGLKIKKDDPEPPSYSEVTKSLKNSE >CP024116.1|AWC56998.1|2107308_2109654_-|translation-initiation-inhibitor METIQLLAFKDVIDPLFEQTVFYVQWPKHWSSLLLEHNRPYELIKKFKLLNKRLYIMFSDILFIEHDPYKLAEDSLWIICLKPLSSEQLEYICRQWYAYIHNWKPTEMPGEVLLEWQPSAISKLSLLHDKKTFYIWVPALISHLFCERALHLSIGNKQYEEIPFYPLREQHRCEAMSEPIQDKKTKEYFSYIYRFELITRGIENMFLLKVSIGKRRFYQTANQYANYMIMKKRKGTVLVSNCHNEKDKFVTLKIEDARFGVNWSKAYRELQNVFMLKKQLDLVKIMQSPKKYIKGKRIRALVIYDENIFKVPGTKIKRGISRREKEVLLQAFHQRFPHCTYIPLCKNITINQNDELFPLYIREEMKEITLELWSSQRLTEIEKILFEEGLILEKRANHSYILNSKPQIILNIVTYNPKIIKQHPYRMDYCHKYKEDRIQSVIRAISSIPIQSFQTSLSLIEIEKCDGREKIDPKQVIREAFARTNRISQFIERLDGEEIKKEHIVRAIFSLLEKIGFRKRSWESMHPSHTYVSLSIEEIYNNQFVPILSKINEGEIVYKLYGSHEWRDFTSILLNVSAHETFLPQPSKRNDIGIQFKKYITEELTAIAEEAKKENKQVYFLIDASMREYWIESLQNEHMDLHDLPYISEEFQSLSNVTAIRINNQYDVPNYIMPLEKECDETELYVDQSGLYYSVNIYPLNDTGWKEQRILEIVVLGAKQEERDQIAKIITYMCKMSIIPGERPFIPFSMQMVKLIKKYITDIDLWQSSDELDTDWLIENE >CP024116.1|AWC56999.1|2109908_2110592_-|thiaminase-II MSFSQLLRQEVAPIWQASFEHPFIKELGEGTLDLASFRYYVLQDSYYLSHFARVQTLGAAKAIELKTTARMAHHAQNTYEAELSLHENFAEKLGITEEEKASFIPAPTAYAYTSHMYRAAYEGHLGDIIAAILPCYWLYYEIGERLKECKPEEPIYQAWISAYGSDWFRTLVEEQIMRLDQIAETVTESDRKRMKQHFIISSQYEYSFWEMAYTLEKWPVEEKIATR >CP024116.1|AWC57000.1|2110910_2111615_-|Na+/myo-inositol-cotransporter MLPGIIAFHLFGDQLKNADMAYPMLVIKILPIALSGFFAAVLFGAILSSFNGALNSSITLFTLDFYKPIFKKEASEKELVKVGRIFAITLGLIAVIVSPFILYAPSGLYNYLQEMFGFYNVPIIAAVVVGFFSKKVPASAPKIALVFHIILYALSKVFLGSINFLYILSVLFPACVIVMLVIGKLKPRETDFELFDANKVDLKPWKYAKVFSIFLIIFMLGAYVLFSPVGLAAQ >CP024116.1|AWC59075.1|2111844_2112012_-|hypothetical-protein MSIIALVSILLWGAVTHELSKPSKKQNNRKIITLTSLGCLSTLVITISLIQNISF >CP024116.1|AWC57001.1|2112096_2112597_-|N-acetyltransferase MSIHTENIKLVPYKEEYKEKIATFTLPSEQVQFTANPSDLLEKAKEDITKHVVVIVDQDVPVGIFALQTGERVTEYTNNPNALLLVSFSVDYEKQGKGYAKRGLRLLQEYVTAYFPEINEVVLAVNERNIPAQKVYLKVGFEDRGQRKMGPIGRQLILYLSIKKQE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP024116_3 | 2228617-2229103 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of CP024116_3
|
7 spacers
spacers of CP024116_3
>3.1|2228646|37|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT CATCAAAATCAAAAACAGTTAAATTAGATGCAGATGA >3.2|2228712|36|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT TAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTA >3.3|2228777|36|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT GTTCTCATTCGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTT >3.4|2228842|37|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT TTGAATTATCGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAA >3.5|2228908|36|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT TTAGGACCCTCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAAC >3.6|2228973|37|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT TCTTTTAAAAGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGA >3.7|2229039|36|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT CGTGATGGACGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAA >3.8|2228712|45|CP024116|PILER-CR TAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTACCTTTATAT >3.9|2228786|36|CP024116|PILER-CR GTTCTCATTCGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTT >3.10|2228851|37|CP024116|PILER-CR TTGAATTATCGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAA >3.11|2228917|36|CP024116|PILER-CR TTAGGACCCTCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAAC >3.12|2228982|37|CP024116|PILER-CR TCTTTTAAAAGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGA >3.13|2229048|36|CP024116|PILER-CR CGTGATGGACGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAA |
cas2,cas4,cas7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024116_3
The CRISPR arrays of CP024116_3 >merge|CP024116|3|2228617-2229103|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTCTATTCCACTACGTTCAGATAAAACCATCAAAATCAAAAACAGTTAAATTAGATGCAGATGACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTACCTTTATATCCACTACGTTCAGATAAAACGTTCTCATTCGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTTCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTTGAATTATCGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTTAGGACCCTCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAACCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTCTTTTAAAAGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACCGTGATGGACGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024116|3|3|2228617-2229103|CRISPRCasFinder CTTTCTATTCCACTACGTTCAGATAAAAC CATCAAAATCAAAAACAGTTAAATTAGATGCAGATGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTA CCTTTATATCCACTACGTTCAGATAAAAC GTTCTCATTCGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGAATTATCGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTAGGACCCTCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCTTTTAAAAGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CGTGATGGACGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024116|3|2|2228617-2229103|CRT CTTTCTATTCCACTACGTTCAGATAAAAC CATCAAAATCAAAAACAGTTAAATTAGATGCAGATGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTA CCTTTATATCCACTACGTTCAGATAAAAC GTTCTCATTCGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGAATTATCGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTAGGACCCTCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCTTTTAAAAGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CGTGATGGACGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024116|3|2|2228683-2229103|PILER-CR CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTACCTTTATAT CCACTACGTTCAGATAAAACGTTCTCATT CGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTTCTTTATATC CCACTACGTTCAGATAAAACTTGAATTAT CGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAACTTTATATC CCACTACGTTCAGATAAAACTTAGGACCC TCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAACCTTTATATC CCACTACGTTCAGATAAAACTCTTTTAAA AGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGACTTTATATC CCACTACGTTCAGATAAAACCGTGATGGA CGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAACTTTATATC CCACTACGTTCAGATAAAAC
>CP024116.1|AWC57103.1|2228132_2228387_-|hypothetical-protein MKDTTKYVGLDVSKEKIAVAIADEGREEPRYLGMIPHTPESLRKLIKKLGAVEHLKACYKAGSTGYGIYRLLFSLGVDCAVIAP >CP024116.1|AWC57102.1|2227130_2227514_-|VOC-family-protein MMIHKVGQIMLYVKDQDEAVQFWTEKMGFHLIAEEDNGKGFRWIEIAPTKEAETSIVLHNKEFIAKMQPELNLNTPSMLFFTENIEQLHKQLVDKKVAVGEIVNMPTGKAFNFADDEGNYFAIMEKS >CP024116.1|AWC57101.1|2225494_2226832_-|D-serine-ammonia-lyase MWEKMIKGKTIRKWTEENPILQQLIETSEVFWENPNYSSYEKARQDFVLTTEDVKEAEARLLRFAPYIAKVFPETKEMDGIIESPLVETMHMKQYLEDAFAQEMPGRFLLKCDNNLPISGSIKARGGIYEVLQHAEKLAIEHNLLCEEDHYAKLDSDRFREFFSQYSIAVGSTGNLGLSIGIMSAKLGFQVTVHMSADAKEWKKELLRNKGVTVVEYESDYSKAVEEGRKQAEQDPHCYFIDDENSKHLFLGYAVAASRVKQQLEDKNIRVDKDHPLFVYLPCGVGGGPGGVAFGLKLLFGDAVHCFFAEPTHSPCMLLGLVTGLHDEIAVQDFEIDNVTEADGLAVGRASGFVGKIMEPLLSGCYTVEDQQLYELLKAMVDTENIRLEPSALAAVYGSVQLYRQENYVKKHKLEGKMNRSTHMMWATGGGMVPKSVFDEYYQNQ >CP024116.1|AWC57100.1|2225010_2225448_+|DUF2512-domain-containing-protein MSDIALVLIKFISCIIAFAIGLALFFPATLVQIISFSLFVTIVSYVFVDKIILERIGRSAAIMTDFLLTYLSVWIFGNILLDHYMQIAWGSILSALVFTLCEVIVQRFSHAYERHNSDNIHLNRRFSYGTEFAEEQNPLDKNKKK >CP024116.1|AWC57099.1|2221320_2224851_-|DUF4020-domain-containing-protein MTFLGKEGIRMWITSEVEIPEELFDHLEQGKLVLFVGAGVSMKGKSNLPNFDDLVDEIAKALYVEKREITEPHDYYLGKIAKTKDVHQIAKDLVNVEGSKPNPLHYAIPRLFPKDTDVRIVTTNFDQHFTTAMRESDRDFNIYYAPALPTGRAFKGLAYIHGNVEQEKENLILTDGDFGRAYLTEGWARRFLVDLFSNYTVLFIGYSHNDPVMKYLATGLPPSTRRYAFVAHGDNTYHWEHLGVKPIVYPNKANNHQALVRAVKRWAELMGDNYITKRMRIRDIVTVPPSVEQEQLSYIKQAIKKIEMLRYFVEFARDYGWVEWLEAEGKLQNLFRMTSHYDEVDELLAAWLVEQFLVSHQKELFQLIFKNHSKISPLLWKSICTYLKETKKPMDPILFAKWTLLLLETAENNSQSIEKISYLLQKCSFPEHKEISVLLLTFILDGKIKLKRVKRWEDDMQDSVELEESSCLPVSVFSHVQRIWEEKMKPHISYFAGPILVMGLEKLQMLSLRQTALQKRDGVLYHTMEFSEHDLQPKDFTFLIRIMKECLAYLCEHNKEKAAYYIAQMIDTDSILQKKIAIEAMSENTFVTADEKLMWLRKQQLIFDFTYKHEVFQFLKKHYQNALEKTKKEVIHEVMKHLENERFFDACLVLDLLYTCDANSTSTARAYRIMKRTHPHFTSNQYGEKKEEVRAPNIICDVTADGLLKLKGHEIKKQILLFSNDDSFEQRHFLEMLSKACKLNVDWSIALAYQLIGEQRVSDEIWFVCIREWRNNRKLTNEQIQKIIPLLQQFVRNPAFYWLISSFLYEISNRLEDFQENQIRVVKRFAFSLFPHIMKGESSFKVGELDFYNESIQHPVGKMTSVLLKLLAYDHLYDRNIHEYLFLFEEQIKVASERTHFMLARLTADVTFLFHIEKQWCRKYVLPYLKLNREHKAVKYAWAGLCYTQINLPLFTEIKKYIKYAAEHLELLHPHTKQVFLKWLSFVCIKCVLYWGQRTDWVYMIFIEEKEHDKIKFLKHLCYYVKTLSAREKQKFWDSWLATFLKERPKMSLITGREYVMLLRFVFYMDEVAEKGVYTILNCFPIPIEHCSEAEMKQLLLTILTRKEKVIAHVQAYAKLFFILLQIVQDASSIENEMIQMKEMLETCHVDDDILTAIQNEMIRIGIVVTNFQQES >CP024116.1|AWC57098.1|2219476_2220553_-|bifunctional-3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase/chorismate-mutase MANHELEQLRKQVDEINLQLLKLLNERGRIVQKIGEQKQLQGTKRFDPVREREVLDMIAERNEGPFETSTVQHIFKTIFKASLELQEDDNRKALLVSRKKKQENTIVDVKGERLGSGTQSFIMGPCAVESLEQVRQVAQAIKEQGLKLMRGGAFKPRTSPYDFQGLGVEGLQILRQVADEFDLAIISEILNPNDVEMALDYVDVIQVGARNMQNFDLLRAVGKVNKPVLLKRGLAATIDEFMHAAEYIIAQGNDQIILCERGIRTYEKATRNTLDISAVPILKKETHLPVVVDVTHSTGRRDLLLPTAKAALAIGADAVMAEVHPDPAVALSDSAQQMDIPEFHRFMEELKEFKNKLS >CP024116.1|AWC57097.1|2217551_2219177_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MITVSNVSLRFADRKLFEDVNIKFTPGNCYGLIGANGAGKSTFLKILSGEIEPTTGDVHITPGERLAVLKQNHFEYEEFPVLETVIMGHTRLYEVMQEKNAIYMKEDFSDEDGMRAAELEGEFAELNGWEAESEAAILLKGLGIGEELHDKKMSELTGAEKVKVLLAQALFGQPDVLLLDEPTNHLDLKAIQWLENFLMNFENTVIVVSHDRHFLNKVCTHMADLDFGKIQLYVGNYDFWYESSQLALKLTQDANKKKEEKIKELQNFIARFSSNASKAKQATSRKKLLDKITLDDIKPSSRRYPFVGFTPEREVGNDLLTVEGLSKTIDGEKVLDNVYFTLNKGDKVAFIGRNDIAMTTLFKILMGEMEPDSGSFKWGVTTSQSYFPRDNSAYFENSEYNLVEWLRQFSPQDESESFLRGFLGRMLFSGEEVKKNVSVLSGGEKVRCMLSKMMLSGANVLVLDDPTNHLDLESITALNNGLIAFKGTILFTSHDHQFVQTIANRIIEVTPNGVIDKETTYDEYLENEELQKQVSAMYQNK >CP024116.1|AWC57096.1|2215093_2217067_-|LTA-synthase-family-protein MKQLLQKSKRVLSNHFGFFIFAVVLFWLKTYAAYVTEFNLGISNTIQKFLLFFNPLSSAILFLGLALFAKGKRSYILLIVINLLLSILLYANVVYYRFFSDFITFPTLTQTNNFGEIGGSVLALLQPYDPLYFLDTIVLLVLVLTKVANPKPIRVAKYKLSLVFISAILIFSINLGLAESDRPQLLTRTFDRNYIVKYLGAYNYTIYDGIQSMKASTERAMADGDSMTEVRNYIASNYASPSAEYFGKGKGMNVIYIHLESFQNFLIDYKLNGQEVTPFINSFTKDANTLYFDNFFHQTGQGKTSDAEFMLENSMFGLPQGSVFTTKSHNTYQAAPAILGQQGYTSAVFHGNYKTFWNRDDIYKSFGFNKFFDASYYDMNEKDVVNYGLKDKPFFNESIPLLETVKQPFYTKFITLSNHFPYPIDKEEATIEPATTGDSSVDTYFQTARYLDEAVKGFVDYLKQSGLYDNSIIVMYGDHYGISDNHNRAMSQIMGKEIHSFENAQLQRVPLIVRVPGIKGGVQHQYGGEIDVLPTLLHLLGIDTKDYIQFGTDLLSPEHKQVVAFRNGNYVSPTVTALNGRYYDTTTGEPVEVTEEIKQNEQMVQQTLKLSDQVVNGDLLRFYTPEGFTPVDRSKYNYNHRDKNKTKVKTTQDTKTE >CP024116.1|AWC57095.1|2212352_2214458_-|PTS-lichenan-transporter-subunit-IIC MILDYRSAAILQQMMQADSYTSVDQLTEVLQVSKRTIYYDMKKVDDWLITEHLEPIQYVRPLGYCLDKKTKQKVAQKLQGLITVQYEYSPQERKAWLALYLLTEEKRILLEDLIKLIQVSRNTTLADLKKLKAELGKFKLSLQFHRKQGYYIKGMEQGKRNVLIAYLSQLIAKHGWEYVVSHMRNIVNHGEGEKKQTAQDKLHVIKGILSKCEEFLGVQYTDEVLENLSVYMYLFCSRIVKGRYIEMEETEKAVLRETKHFQAATYIGTQFEKLLYIKFPKDEIYYITTHLLGAKVNAQQKEYEKNDVHGIWHIVDCMIQDFQHYACVIFRDFTGLASDLYLHMKPAFYRVKYGIEIKNPLLQIIRNSYAEVYHLTKKVVHHFEQYVGKEISEDEIAFITMHFSAWMRKEGIVPSPRKTALLVCPNGIGTSRMLQYQLEQLFSNIDILQAISKREYESNTFDVDCIITTTELEKGLIPIFMVNPILTDAEKASLFRKVNATLFREDQNDSADIIMQMIHKYADVRDEHALKRELREFISGPVHFGREEKYKPMLNELLTKEYIQLQDHVDSWEGAIRIEAKPLLQTEYISEEYVQEMIANVKKLGPYIVIAPKIAIPHARPESGVKKLGMSLLQLKESVSFSEKQEHAANLIIVLAAIDNETHLKALAQLSDMLSQPENVDLLIRSNSKEQMLEMIAKYSN >CP024116.1|AWC57094.1|2212070_2212340_-|PTS-lactose-transporter-subunit-IIB MKKILVVCGNGLGSSFIVEMNVKKILDELGLQAEVSHTDLASSKSEQADLYLGSKDIICNLEDGVRTVAGLTNILDQNEIKEALQKHLM >CP024116.1|AWC57104.1|2229305_2229590_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIITYDIGEKRVGKACKKLKQYLTWTQNSVFEGELSRTQLLKCLAELDQIIISSEDSIYLYEVNNPRNIKKKVFGIEKVTKSYFSKHDFIIY >CP024116.1|AWC57105.1|2230568_2231063_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKGTYIHYYFVCHRKLWLFVHQIQLEKESERVIEGKILHDSTYQRMEHRELDIDGVGKIDGIEGEYIREIKLTSKMQEADRWQLLYYLAELKKRGVTKKGLLSYKKEKRTEEVHLTEANQQELENIQKRIQAIILSDKPPKLEKKKYCSSCAYYDFFFWEGEGC >CP024116.1|AWC57106.1|2234107_2234995_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNNKALTLTIIFKASSLNYGEGTANISELKKFHRGNGEVYSFASRQAIRYDIVRLGNQLFNWNLNVVDKSKGVVQFKDDCTIADSVEMDLFGYMKTKAKAGADKRSAVVRLSHAVSLEPYRSDLEFLNNMGLASRIQENPNLATLEQHESLYTYTLTVDLSKVGVDGEIELPVDEKVNRVKQLIELTKYLNREIRGRQENLSPLFVIGGVYPIANPFFLGRISLQNFDSNLLNVKSLASVLGQTVLGHDVRTCTKIGLVDGVFANEEEISQLTDTVSVEEFYQHVMNEVEQFIRC >CP024116.1|AWC57107.1|2236736_2237438_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLHIKLQTNRFPISYRMMMVSFIKEALKLSDAAYFQQIYQESKANRPFSYGVYIHDYKLNATEFHIKGYVGLTITSPDAQFMLHFYNGLMKMNDFRYKGFSLKRMKVQMVNSADINQNHVYFKTLSPLLIRDKHAKPIFIDDDKFEKELNYISDTVLKEFRGYGLKQPLIFTSKNMKKVVVKEKIHSDHDTLFFTGYHGIFSLQGAVEDLKILSEIGLGFRSSQGFGAVEVV >CP024116.1|AWC57108.1|2239673_2240000_-|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MFIETKTLTVKEGTSDLVVQRFSGEGMIEKFEGFIDLNVLVKKVRRGDEEVVIMIRWESEEAWKNWETSEEHLAGHRANRGKPKPEHILNAEHAVYYVKATKSAYQQS >CP024116.1|AWC57109.1|2240341_2240686_+|hypothetical-protein MRKAILIFIVAIFIIGIVHIAVTPINYKSYTIEALWFASAGCTLIFLAFLNYVLISIKQRQTRFFVICHTANILCTILVAFILTIAFAPHIILLFVLLVSKTLLVIGFQFSSKS >CP024116.1|AWC57110.1|2240810_2241140_-|hypothetical-protein MSFNQVLKVIDENIGKRFVLGIDGLSRLGKTTLVKQLEQKLKQKGASFYIFHIDDHIVERNKRYHTKFEEWYEYYYLQWDIEWLRYHFFQQLKWKEQFRFLGASPKTPS >CP024116.1|AWC57111.1|2241118_2241685_-|N-acetyltransferase MGFPTLETERFILRELTLLDAENMFHYFQKESVMRYFGMDAIRNMEQVKRMIQMFSKKYKEGSQVRWGIELKGTNRFIGTCGFHFINLNHKRAEIGYELDDAYWGKGYATEAVQTIVTYAFQTMKLIRIGAVVYKENEASHKLLKKIGFQKEGLLRKYMIQNNVEYDTIIYSLLAEDWEKRSCLSIKY >CP024116.1|AWC57112.1|2242054_2242300_+|DNA-alkylation-repair-protein MEPMLCPNCKTNRTRFNILEQQVKPVKLNPQTGQIEEEYTNETLNVFHMSYQGPTYRVQCAVCGLVENPEQFIKPAQNKLF >CP024116.1|AWC57113.1|2242537_2243074_-|DUF2812-domain-containing-protein MEIKKTFKFFTAWNLEKEEAYLREMHQKGWAFQKYHFMYTFKKTEPKDVVYKADFNFDFQKSLKNQREYLEIYEMSGWKYVSSFTKWHYFCKEVVDKNELPDIYSETETRIEKLKDLLNHLVIIFLSILPAISISCLESPANKLSIIIKGFIGFVVCIHMYMFVRLILKIRKLKKEII |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024116_4 | 2238772-2239387 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of CP024116_4
|
9 spacers
spacers of CP024116_4
>4.1|2238801|36|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT TTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGG >4.2|2238866|37|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT TGGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAA >4.3|2238932|36|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT AGGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCC >4.4|2238997|37|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT CACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCC >4.5|2239063|36|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT CAAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACAT >4.6|2239128|35|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT TTGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCA >4.7|2239192|36|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT TGTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCAT >4.8|2239257|37|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT TGAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAG >4.9|2239323|36|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT TCAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATA >4.10|2238867|37|CP024116|PILER-CR TGGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAA >4.11|2238933|36|CP024116|PILER-CR AGGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCC >4.12|2238998|37|CP024116|PILER-CR CACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCC >4.13|2239064|36|CP024116|PILER-CR CAAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACAT >4.14|2239129|35|CP024116|PILER-CR TTGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCA >4.15|2239193|36|CP024116|PILER-CR TGTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCAT >4.16|2239258|37|CP024116|PILER-CR TGAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAG >4.17|2239324|36|CP024116|PILER-CR TCAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATA |
cas6,cas7,cas4,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024116_4
The CRISPR arrays of CP024116_4 >merge|CP024116|4|2238772-2239387|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATCTTATCCACTACGTTCAGATAAAACTTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGGATTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTGGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACAGGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCCCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACCACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCCCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACCAAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACATCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTTGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTGTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCATCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTGAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAGCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTCAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024116|4|4|2238772-2239387|CRISPRCasFinder TTATCTTATCCACTACGTTCAGATAAAAC TTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGG ATTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC AGGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CAAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAG CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024116|4|3|2238772-2239387|CRT TTATCTTATCCACTACGTTCAGATAAAAC TTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGG ATTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC AGGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CAAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAG CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024116|4|3|2238838-2239387|PILER-CR TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT GGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAAC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACA GGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCCC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACC ACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCCC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACC AAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACATC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT TGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCAC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT GTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCATC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT GAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAGC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT CAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATAC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC
>CP024116.1|AWC57107.1|2236736_2237438_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLHIKLQTNRFPISYRMMMVSFIKEALKLSDAAYFQQIYQESKANRPFSYGVYIHDYKLNATEFHIKGYVGLTITSPDAQFMLHFYNGLMKMNDFRYKGFSLKRMKVQMVNSADINQNHVYFKTLSPLLIRDKHAKPIFIDDDKFEKELNYISDTVLKEFRGYGLKQPLIFTSKNMKKVVVKEKIHSDHDTLFFTGYHGIFSLQGAVEDLKILSEIGLGFRSSQGFGAVEVV >CP024116.1|AWC57106.1|2234107_2234995_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNNKALTLTIIFKASSLNYGEGTANISELKKFHRGNGEVYSFASRQAIRYDIVRLGNQLFNWNLNVVDKSKGVVQFKDDCTIADSVEMDLFGYMKTKAKAGADKRSAVVRLSHAVSLEPYRSDLEFLNNMGLASRIQENPNLATLEQHESLYTYTLTVDLSKVGVDGEIELPVDEKVNRVKQLIELTKYLNREIRGRQENLSPLFVIGGVYPIANPFFLGRISLQNFDSNLLNVKSLASVLGQTVLGHDVRTCTKIGLVDGVFANEEEISQLTDTVSVEEFYQHVMNEVEQFIRC >CP024116.1|AWC57105.1|2230568_2231063_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKGTYIHYYFVCHRKLWLFVHQIQLEKESERVIEGKILHDSTYQRMEHRELDIDGVGKIDGIEGEYIREIKLTSKMQEADRWQLLYYLAELKKRGVTKKGLLSYKKEKRTEEVHLTEANQQELENIQKRIQAIILSDKPPKLEKKKYCSSCAYYDFFFWEGEGC >CP024116.1|AWC57104.1|2229305_2229590_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIITYDIGEKRVGKACKKLKQYLTWTQNSVFEGELSRTQLLKCLAELDQIIISSEDSIYLYEVNNPRNIKKKVFGIEKVTKSYFSKHDFIIY >CP024116.1|AWC57103.1|2228132_2228387_-|hypothetical-protein MKDTTKYVGLDVSKEKIAVAIADEGREEPRYLGMIPHTPESLRKLIKKLGAVEHLKACYKAGSTGYGIYRLLFSLGVDCAVIAP >CP024116.1|AWC57102.1|2227130_2227514_-|VOC-family-protein MMIHKVGQIMLYVKDQDEAVQFWTEKMGFHLIAEEDNGKGFRWIEIAPTKEAETSIVLHNKEFIAKMQPELNLNTPSMLFFTENIEQLHKQLVDKKVAVGEIVNMPTGKAFNFADDEGNYFAIMEKS >CP024116.1|AWC57101.1|2225494_2226832_-|D-serine-ammonia-lyase MWEKMIKGKTIRKWTEENPILQQLIETSEVFWENPNYSSYEKARQDFVLTTEDVKEAEARLLRFAPYIAKVFPETKEMDGIIESPLVETMHMKQYLEDAFAQEMPGRFLLKCDNNLPISGSIKARGGIYEVLQHAEKLAIEHNLLCEEDHYAKLDSDRFREFFSQYSIAVGSTGNLGLSIGIMSAKLGFQVTVHMSADAKEWKKELLRNKGVTVVEYESDYSKAVEEGRKQAEQDPHCYFIDDENSKHLFLGYAVAASRVKQQLEDKNIRVDKDHPLFVYLPCGVGGGPGGVAFGLKLLFGDAVHCFFAEPTHSPCMLLGLVTGLHDEIAVQDFEIDNVTEADGLAVGRASGFVGKIMEPLLSGCYTVEDQQLYELLKAMVDTENIRLEPSALAAVYGSVQLYRQENYVKKHKLEGKMNRSTHMMWATGGGMVPKSVFDEYYQNQ >CP024116.1|AWC57100.1|2225010_2225448_+|DUF2512-domain-containing-protein MSDIALVLIKFISCIIAFAIGLALFFPATLVQIISFSLFVTIVSYVFVDKIILERIGRSAAIMTDFLLTYLSVWIFGNILLDHYMQIAWGSILSALVFTLCEVIVQRFSHAYERHNSDNIHLNRRFSYGTEFAEEQNPLDKNKKK >CP024116.1|AWC57099.1|2221320_2224851_-|DUF4020-domain-containing-protein MTFLGKEGIRMWITSEVEIPEELFDHLEQGKLVLFVGAGVSMKGKSNLPNFDDLVDEIAKALYVEKREITEPHDYYLGKIAKTKDVHQIAKDLVNVEGSKPNPLHYAIPRLFPKDTDVRIVTTNFDQHFTTAMRESDRDFNIYYAPALPTGRAFKGLAYIHGNVEQEKENLILTDGDFGRAYLTEGWARRFLVDLFSNYTVLFIGYSHNDPVMKYLATGLPPSTRRYAFVAHGDNTYHWEHLGVKPIVYPNKANNHQALVRAVKRWAELMGDNYITKRMRIRDIVTVPPSVEQEQLSYIKQAIKKIEMLRYFVEFARDYGWVEWLEAEGKLQNLFRMTSHYDEVDELLAAWLVEQFLVSHQKELFQLIFKNHSKISPLLWKSICTYLKETKKPMDPILFAKWTLLLLETAENNSQSIEKISYLLQKCSFPEHKEISVLLLTFILDGKIKLKRVKRWEDDMQDSVELEESSCLPVSVFSHVQRIWEEKMKPHISYFAGPILVMGLEKLQMLSLRQTALQKRDGVLYHTMEFSEHDLQPKDFTFLIRIMKECLAYLCEHNKEKAAYYIAQMIDTDSILQKKIAIEAMSENTFVTADEKLMWLRKQQLIFDFTYKHEVFQFLKKHYQNALEKTKKEVIHEVMKHLENERFFDACLVLDLLYTCDANSTSTARAYRIMKRTHPHFTSNQYGEKKEEVRAPNIICDVTADGLLKLKGHEIKKQILLFSNDDSFEQRHFLEMLSKACKLNVDWSIALAYQLIGEQRVSDEIWFVCIREWRNNRKLTNEQIQKIIPLLQQFVRNPAFYWLISSFLYEISNRLEDFQENQIRVVKRFAFSLFPHIMKGESSFKVGELDFYNESIQHPVGKMTSVLLKLLAYDHLYDRNIHEYLFLFEEQIKVASERTHFMLARLTADVTFLFHIEKQWCRKYVLPYLKLNREHKAVKYAWAGLCYTQINLPLFTEIKKYIKYAAEHLELLHPHTKQVFLKWLSFVCIKCVLYWGQRTDWVYMIFIEEKEHDKIKFLKHLCYYVKTLSAREKQKFWDSWLATFLKERPKMSLITGREYVMLLRFVFYMDEVAEKGVYTILNCFPIPIEHCSEAEMKQLLLTILTRKEKVIAHVQAYAKLFFILLQIVQDASSIENEMIQMKEMLETCHVDDDILTAIQNEMIRIGIVVTNFQQES >CP024116.1|AWC57098.1|2219476_2220553_-|bifunctional-3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase/chorismate-mutase MANHELEQLRKQVDEINLQLLKLLNERGRIVQKIGEQKQLQGTKRFDPVREREVLDMIAERNEGPFETSTVQHIFKTIFKASLELQEDDNRKALLVSRKKKQENTIVDVKGERLGSGTQSFIMGPCAVESLEQVRQVAQAIKEQGLKLMRGGAFKPRTSPYDFQGLGVEGLQILRQVADEFDLAIISEILNPNDVEMALDYVDVIQVGARNMQNFDLLRAVGKVNKPVLLKRGLAATIDEFMHAAEYIIAQGNDQIILCERGIRTYEKATRNTLDISAVPILKKETHLPVVVDVTHSTGRRDLLLPTAKAALAIGADAVMAEVHPDPAVALSDSAQQMDIPEFHRFMEELKEFKNKLS >CP024116.1|AWC57108.1|2239673_2240000_-|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MFIETKTLTVKEGTSDLVVQRFSGEGMIEKFEGFIDLNVLVKKVRRGDEEVVIMIRWESEEAWKNWETSEEHLAGHRANRGKPKPEHILNAEHAVYYVKATKSAYQQS >CP024116.1|AWC57109.1|2240341_2240686_+|hypothetical-protein MRKAILIFIVAIFIIGIVHIAVTPINYKSYTIEALWFASAGCTLIFLAFLNYVLISIKQRQTRFFVICHTANILCTILVAFILTIAFAPHIILLFVLLVSKTLLVIGFQFSSKS >CP024116.1|AWC57110.1|2240810_2241140_-|hypothetical-protein MSFNQVLKVIDENIGKRFVLGIDGLSRLGKTTLVKQLEQKLKQKGASFYIFHIDDHIVERNKRYHTKFEEWYEYYYLQWDIEWLRYHFFQQLKWKEQFRFLGASPKTPS >CP024116.1|AWC57111.1|2241118_2241685_-|N-acetyltransferase MGFPTLETERFILRELTLLDAENMFHYFQKESVMRYFGMDAIRNMEQVKRMIQMFSKKYKEGSQVRWGIELKGTNRFIGTCGFHFINLNHKRAEIGYELDDAYWGKGYATEAVQTIVTYAFQTMKLIRIGAVVYKENEASHKLLKKIGFQKEGLLRKYMIQNNVEYDTIIYSLLAEDWEKRSCLSIKY >CP024116.1|AWC57112.1|2242054_2242300_+|DNA-alkylation-repair-protein MEPMLCPNCKTNRTRFNILEQQVKPVKLNPQTGQIEEEYTNETLNVFHMSYQGPTYRVQCAVCGLVENPEQFIKPAQNKLF >CP024116.1|AWC57113.1|2242537_2243074_-|DUF2812-domain-containing-protein MEIKKTFKFFTAWNLEKEEAYLREMHQKGWAFQKYHFMYTFKKTEPKDVVYKADFNFDFQKSLKNQREYLEIYEMSGWKYVSSFTKWHYFCKEVVDKNELPDIYSETETRIEKLKDLLNHLVIIFLSILPAISISCLESPANKLSIIIKGFIGFVVCIHMYMFVRLILKIRKLKKEII >CP024116.1|AWC57114.1|2243075_2243399_-|PadR-family-transcriptional-regulator MDEKAKKYIPLTEATYYILLSFAKRIHGYGVMQMVEEMTDGEVKLGPGTLYGNITKLLTEKLIVEVDSTDRKKCYMLTPFGREVLELEFKRLQRSVQNGKQILREKM >CP024116.1|AWC57115.1|2244000_2244984_-|DUF4003-domain-containing-protein MITLQQKLEQYTSIYKQLKRELKWKTSDSRTGMMIAAMYTSSDKPFDLERFLQISHYIKSQVGMFSYLKSYHRFVVAATLDIHFTHYKTAFQQFLDLYERFIASGFSRSIFTYLAAATLLPDDREQYEARIQRSVKVYKRMKEDHFFLTSTSDYPLAVLLAGQQEEIGPLMDRVERLYQKLATSGLRKGNDLQFLSHILSLKKDIREDMLVARCTNIWNLFKQEKVKVKQMHYPAIGLLALLEDGEKEVSSIRTFMEKLQGDKLFRWQTDTNILIAIQLFVSQKGMEHQAANTGLQTMIEILIQAQQAAFIAAISASTAATSASSNS >CP024116.1|AWC57116.1|2245067_2245532_-|NUDIX-domain-containing-protein MDLTFQVNQSCFNYRVGAICKHDNKILMLQNEGEDFWYVPGGRVQLLETSEVAIKRELKEELGVDVAVKRPLWIVENFFTYDSRQFHEISLYYEVNLLTLPVKGADSFLFEEEGRKYKFQWIPLEQICEYNVKPEFLKDKMTQLPLHVEHIVKN >CP024116.1|AWC57117.1|2245890_2246136_-|hypothetical-protein MKGIFWLNLYMSLHVRMGETLYYGLGVRITNSHSEEKVIRHSGLTPNSHAKMFFIPKTDWGGVILTNKNHIFEEEALPQLK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024116_3 | 3.6|2228973|37|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT | 2228973-2229009 | 37 | CP024116.1 | 811958-811994 | 0 | 1.0 |
CP024116_3 | 3.12|2228982|37|CP024116|PILER-CR | 2228982-2229018 | 37 | CP024116.1 | 811958-811994 | 0 | 1.0 |
CP024116_4 | 4.7|2239192|36|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT | 2239192-2239227 | 36 | CP024116.1 | 3185056-3185091 | 0 | 1.0 |
CP024116_4 | 4.15|2239193|36|CP024116|PILER-CR | 2239193-2239228 | 36 | CP024116.1 | 3185056-3185091 | 0 | 1.0 |
1. spacer 3.6|2228973|37|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 811958-811994, mismatch: 0, identity: 1.0
tcttttaaaagctgtagtatttgtttttcgtattcga CRISPR spacer tcttttaaaagctgtagtatttgtttttcgtattcga Protospacer *************************************
2. spacer 3.12|2228982|37|CP024116|PILER-CR matches to position: 811958-811994, mismatch: 0, identity: 1.0
tcttttaaaagctgtagtatttgtttttcgtattcga CRISPR spacer tcttttaaaagctgtagtatttgtttttcgtattcga Protospacer *************************************
3. spacer 4.7|2239192|36|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 3185056-3185091, mismatch: 0, identity: 1.0
tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat Protospacer ************************************
4. spacer 4.15|2239193|36|CP024116|PILER-CR matches to position: 3185056-3185091, mismatch: 0, identity: 1.0
tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat Protospacer ************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | NZ_AP014870 | Bacillus thuringiensis serovar tolworthi strain Pasteur Institute Standard strain plasmid pKK6 | 12518-12546 | 0 | 1.0 |
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | NZ_CP010096 | Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMBLin15, complete sequence | 5323-5351 | 0 | 1.0 |
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | NZ_CP004882 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMBLin15, complete sequence | 5325-5353 | 1 | 0.966 |
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | NZ_CP011355 | Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC10, complete sequence | 2221-2249 | 1 | 0.966 |
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | NC_006945 | Bacillus phage GIL16c, complete genome | 5316-5344 | 1 | 0.966 |
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | AY701338 | Bacillus thuringiensis phage GIL16c, complete genome | 5316-5344 | 1 | 0.966 |
CP024116_2 | 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100733-2100762 | 30 | EU408779 | Bacillus phage AP50, complete genome | 2485-2514 | 2 | 0.933 |
CP024116_2 | 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100733-2100762 | 30 | NZ_CP004882 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMBLin15, complete sequence | 2435-2464 | 2 | 0.933 |
CP024116_2 | 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100733-2100762 | 30 | NZ_CP053974 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed5, complete sequence | 10677-10706 | 2 | 0.933 |
CP024116_2 | 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100733-2100762 | 30 | NZ_CP009346 | Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 5, complete sequence | 12464-12493 | 2 | 0.933 |
CP024116_2 | 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100733-2100762 | 30 | NZ_CP010096 | Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMBLin15, complete sequence | 2433-2462 | 2 | 0.933 |
CP024116_2 | 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100733-2100762 | 30 | NZ_CP045027 | Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p5, complete sequence | 12462-12491 | 2 | 0.933 |
CP024116_2 | 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100733-2100762 | 30 | NC_005258 | Bacillus phage Bam35c, complete genome | 2443-2472 | 2 | 0.933 |
CP024116_2 | 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100733-2100762 | 30 | AY257527 | Bacillus thuringiensis bacteriophage Bam35c, complete genome | 2443-2472 | 2 | 0.933 |
CP024116_2 | 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100733-2100762 | 30 | AJ536073 | Bacillus phage pGIL01, complete genome | 2441-2470 | 2 | 0.933 |
CP024116_2 | 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100733-2100762 | 30 | CP013282 | Bacillus phage pGIL02, complete sequence | 12464-12493 | 2 | 0.933 |
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | NZ_CP053974 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed5, complete sequence | 7661-7689 | 2 | 0.931 |
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | NZ_CP009346 | Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 5, complete sequence | 9437-9465 | 2 | 0.931 |
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | NZ_CP045027 | Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p5, complete sequence | 9435-9463 | 2 | 0.931 |
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | CP013282 | Bacillus phage pGIL02, complete sequence | 9437-9465 | 2 | 0.931 |
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | NC_005258 | Bacillus phage Bam35c, complete genome | 5471-5499 | 2 | 0.931 |
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | KC152966 | Bacillus phage Emet putative gene regulator and hypothetical proteins genes, complete cds | 1009-1037 | 2 | 0.931 |
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | KC152967 | Bacillus phage Sole hypothetical protein, putative gene regulators, and hypothetical protein genes, complete cds | 1045-1073 | 2 | 0.931 |
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | AY257527 | Bacillus thuringiensis bacteriophage Bam35c, complete genome | 5471-5499 | 2 | 0.931 |
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | AJ536073 | Bacillus phage pGIL01, complete genome | 5469-5497 | 2 | 0.931 |
CP024116_2 | 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100338-2100367 | 30 | NC_048762 | Bacillus phage vB_BtS_B83, complete genome | 26059-26088 | 3 | 0.9 |
CP024116_2 | 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100338-2100367 | 30 | NZ_CP020004 | Bacillus thuringiensis strain Bacillus thuringiensis L-7601 plasmid unnamed2, complete sequence | 17949-17978 | 3 | 0.9 |
CP024116_2 | 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100733-2100762 | 30 | NZ_CP034552 | Bacillus cereus ATCC 14579 plasmid unnamed, complete sequence | 2356-2385 | 3 | 0.9 |
CP024116_2 | 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100733-2100762 | 30 | NC_004721 | Bacillus cereus ATCC 14579 plasmid pBClin15, complete sequence | 2418-2447 | 3 | 0.9 |
CP024116_2 | 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100469-2100498 | 30 | GU071094 | Synechococcus phage S-SM1, complete genome | 54124-54153 | 4 | 0.867 |
CP024116_2 | 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100338-2100367 | 30 | NZ_CP014285 | Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850055, complete sequence | 27260-27289 | 5 | 0.833 |
CP024116_2 | 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100338-2100367 | 30 | NC_004821 | Bacillus prophage phBC6A52, complete genome | 37850-37879 | 5 | 0.833 |
CP024116_2 | 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100338-2100367 | 30 | NC_049968 | Bacillus phage DK2, complete genome | 22476-22505 | 5 | 0.833 |
CP024116_2 | 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100338-2100367 | 30 | KX190832 | Bacillus phage vB_BtS_BMBtp13, complete genome | 23253-23282 | 5 | 0.833 |
CP024116_2 | 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100338-2100367 | 30 | MK284528 | Bacillus phage DK3, complete genome | 23164-23193 | 5 | 0.833 |
CP024116_2 | 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100338-2100367 | 30 | NZ_CP032612 | Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.4, complete sequence | 34550-34579 | 5 | 0.833 |
CP024116_2 | 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100338-2100367 | 30 | NC_018502 | Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p05, complete sequence | 5059-5088 | 5 | 0.833 |
CP024116_4 | 4.2|2238866|37|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT | 2238866-2238902 | 37 | NZ_CP007513 | Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome | 248075-248111 | 5 | 0.865 |
CP024116_4 | 4.10|2238867|37|CP024116|PILER-CR | 2238867-2238903 | 37 | NZ_CP007513 | Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome | 248075-248111 | 5 | 0.865 |
CP024116_2 | 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100338-2100367 | 30 | GU233956 | Bacillus phage 11143, partial sequence | 20685-20714 | 6 | 0.8 |
CP024116_2 | 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100469-2100498 | 30 | NC_011738 | Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742401, complete sequence | 213020-213049 | 6 | 0.8 |
CP024116_2 | 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100469-2100498 | 30 | NC_007051 | Staphylococcus phage 2638A, complete genome | 13284-13313 | 6 | 0.8 |
CP024116_2 | 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100469-2100498 | 30 | AY954954 | Bacteriophage 2638A, complete genome | 13284-13313 | 6 | 0.8 |
CP024116_2 | 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100469-2100498 | 30 | NZ_CP034567 | Vibrio parahaemolyticus strain D3112 plasmid p1, complete sequence | 45690-45719 | 6 | 0.8 |
CP024116_2 | 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100469-2100498 | 30 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 675072-675101 | 6 | 0.8 |
CP024116_2 | 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100799-2100827 | 29 | NC_022088 | Bacillus phage Troll, complete genome | 4906-4934 | 6 | 0.793 |
CP024116_2 | 2.10|2100864|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100864-2100893 | 30 | NZ_CP053575 | Citrobacter sp. TSA-1 plasmid unnamed2, complete sequence | 7553-7582 | 6 | 0.8 |
CP024116_2 | 2.10|2100864|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100864-2100893 | 30 | MG945606 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 4483-1602, complete genome | 1967-1996 | 6 | 0.8 |
CP024116_2 | 2.1|2100272|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100272-2100301 | 30 | MN856040 | Bacteriophage sp. isolate 317, complete genome | 2411-2440 | 8 | 0.733 |
CP024116_2 | 2.3|2100404|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100404-2100432 | 29 | NZ_CP050068 | Klebsiella aerogenes strain 035 plasmid p35, complete sequence | 377728-377756 | 8 | 0.724 |
CP024116_2 | 2.3|2100404|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100404-2100432 | 29 | NZ_CP020848 | Klebsiella variicola strain KPN1481 plasmid pKPN1481-1, complete sequence | 153139-153167 | 8 | 0.724 |
CP024116_2 | 2.3|2100404|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100404-2100432 | 29 | NZ_CP043927 | Klebsiella quasipneumoniae subsp. quasipneumoniae strain M17277 plasmid p17277A_477, complete sequence | 113729-113757 | 8 | 0.724 |
CP024116_2 | 2.3|2100404|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100404-2100432 | 29 | NZ_CP021699 | Klebsiella pneumoniae strain AR_0158 plasmid tig00000727, complete sequence | 347755-347783 | 8 | 0.724 |
CP024116_2 | 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100469-2100498 | 30 | KX827371 | Staphylococcus phage SpT99F3, complete genome | 30241-30270 | 8 | 0.733 |
CP024116_2 | 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100469-2100498 | 30 | MK075002 | Staphylococcus phage phiSP38-1, complete genome | 32276-32305 | 8 | 0.733 |
CP024116_2 | 2.5|2100535|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2100535-2100564 | 30 | MN047793 | Xanthomonas phage Xoo-sp13, complete genome | 181943-181972 | 8 | 0.733 |
CP024116_4 | 4.8|2239257|37|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT | 2239257-2239293 | 37 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 92131-92167 | 8 | 0.784 |
CP024116_4 | 4.16|2239258|37|CP024116|PILER-CR | 2239258-2239294 | 37 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 92131-92167 | 8 | 0.784 |
CP024116_4 | 4.7|2239192|36|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT | 2239192-2239227 | 36 | NZ_CP020750 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed7, complete sequence | 37822-37857 | 9 | 0.75 |
CP024116_4 | 4.15|2239193|36|CP024116|PILER-CR | 2239193-2239228 | 36 | NZ_CP020750 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed7, complete sequence | 37822-37857 | 9 | 0.75 |
CP024116_3 | 3.1|2228646|37|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT | 2228646-2228682 | 37 | LC168164 | Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome | 180412-180448 | 11 | 0.703 |
1. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP014870 (Bacillus thuringiensis serovar tolworthi strain Pasteur Institute Standard strain plasmid pKK6) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg Protospacer *****************************
2. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010096 (Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMBLin15, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg Protospacer *****************************
3. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004882 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMBLin15, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggcttcggtgg Protospacer ********************.********
4. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011355 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC10, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggcttcggtgg Protospacer ********************.********
5. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_006945 (Bacillus phage GIL16c, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggcttcggtgg Protospacer ********************.********
6. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY701338 (Bacillus thuringiensis phage GIL16c, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggcttcggtgg Protospacer ********************.********
7. spacer 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to EU408779 (Bacillus phage AP50, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatctaaggctatcatgtagtatc Protospacer *************.***************
8. spacer 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004882 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMBLin15, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
9. spacer 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053974 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
10. spacer 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009346 (Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
11. spacer 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010096 (Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMBLin15, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
12. spacer 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045027 (Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
13. spacer 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005258 (Bacillus phage Bam35c, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
14. spacer 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY257527 (Bacillus thuringiensis bacteriophage Bam35c, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
15. spacer 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AJ536073 (Bacillus phage pGIL01, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
16. spacer 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP013282 (Bacillus phage pGIL02, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
17. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053974 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
18. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009346 (Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
19. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045027 (Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
20. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP013282 (Bacillus phage pGIL02, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
21. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005258 (Bacillus phage Bam35c, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
22. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KC152966 (Bacillus phage Emet putative gene regulator and hypothetical proteins genes, complete cds) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctccactttcggtttcggtgg Protospacer ***********.*****.***********
23. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KC152967 (Bacillus phage Sole hypothetical protein, putative gene regulators, and hypothetical protein genes, complete cds) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
24. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY257527 (Bacillus thuringiensis bacteriophage Bam35c, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
25. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AJ536073 (Bacillus phage pGIL01, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
26. spacer 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048762 (Bacillus phage vB_BtS_B83, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer tattttgggtagctgatgtagaagtaaaaa Protospacer *.******** **.****************
27. spacer 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020004 (Bacillus thuringiensis strain Bacillus thuringiensis L-7601 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer tattttgggtagctgatgtagaagtaaaaa Protospacer *.******** **.****************
28. spacer 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034552 (Bacillus cereus ATCC 14579 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatctaaggctgtcatgtagtatc Protospacer *************.***.***********
29. spacer 2.8|2100733|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004721 (Bacillus cereus ATCC 14579 plasmid pBClin15, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatctaaggctgtcatgtagtatc Protospacer *************.***.***********
30. spacer 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU071094 (Synechococcus phage S-SM1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
-agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer tagtgcta-caatcaaaaaaggtgctattgc Protospacer ***** * **************** ****
31. spacer 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014285 (Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850055, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtctgggttgctgatgtagaagtaaaaa Protospacer .. *.********.****************
32. spacer 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004821 (Bacillus prophage phBC6A52, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtctgggttgctgatgtagaagtaaaaa Protospacer .. *.********.****************
33. spacer 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049968 (Bacillus phage DK2, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtttgggttgctgatgttgaagtaaaaa Protospacer .. **********.***** **********
34. spacer 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX190832 (Bacillus phage vB_BtS_BMBtp13, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtctgggttgctgatgtagaagtaaaaa Protospacer .. *.********.****************
35. spacer 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK284528 (Bacillus phage DK3, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtttgggttgctgatgttgaagtaaaaa Protospacer .. **********.***** **********
36. spacer 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032612 (Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtctgggttgctgatgtagaagtaaaaa Protospacer .. *.********.****************
37. spacer 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018502 (Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p05, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cggtatgggttgctgatgtagaagtgaaaa Protospacer .* * ********.***********.****
38. spacer 4.2|2238866|37|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007513 (Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865
tgggacaaacatgctactttcttgaacgctcagtcaa- CRISPR spacer tgggacaaacatgctacttttttaaa-gcccaatcaag Protospacer ********************.**.** **.**.****
39. spacer 4.10|2238867|37|CP024116|PILER-CR matches to NZ_CP007513 (Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865
tgggacaaacatgctactttcttgaacgctcagtcaa- CRISPR spacer tgggacaaacatgctacttttttaaa-gcccaatcaag Protospacer ********************.**.** **.**.****
40. spacer 2.2|2100338|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU233956 (Bacillus phage 11143, partial sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtctgggtggctgatgtagaagtaaaaa Protospacer .. *.***** **.****************
41. spacer 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011738 (Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742401, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer ataacaagctatcaaaaaaggtgctattgt Protospacer * .***** ************** ****
42. spacer 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007051 (Staphylococcus phage 2638A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer atttgcaaaaatcaaaaaaggtgcaattga Protospacer * * *. *********************
43. spacer 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY954954 (Bacteriophage 2638A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer atttgcaaaaatcaaaaaaggtgcaattga Protospacer * * *. *********************
44. spacer 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034567 (Vibrio parahaemolyticus strain D3112 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer cgtgcaagcaatgaaacaaggtgcatatca Protospacer *********** *** ******** * *
45. spacer 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer agggcaagcaatcaaaaaagctgtagggga Protospacer ** ***************** **.*. **
46. spacer 2.9|2100799|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022088 (Bacillus phage Troll, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer ttttgttcttctacttttggttccggtgt Protospacer *. * ***.*************.*****
47. spacer 2.10|2100864|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053575 (Citrobacter sp. TSA-1 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tttaatgatgttgataagttgccccgcata CRISPR spacer atgagtgatattgataagttgtcccgcaaa Protospacer * *.****.***********.****** *
48. spacer 2.10|2100864|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG945606 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 4483-1602, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tttaatgatgttgataagttgccccgcata CRISPR spacer tttgatgatgttgataatttgcctcagatt Protospacer ***.************* *****.*. **
49. spacer 2.1|2100272|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN856040 (Bacteriophage sp. isolate 317, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttcgatgtttatccatccactcttcgacaa CRISPR spacer ctcgatgtttttccatccactcagcagctg Protospacer .********* *********** *..* .
50. spacer 2.3|2100404|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP050068 (Klebsiella aerogenes strain 035 plasmid p35, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
tacaaaaagtgactgagggggcttataac CRISPR spacer ccgggaaagtgattgagggggcttatgaa Protospacer . ..*******.*************.*
51. spacer 2.3|2100404|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020848 (Klebsiella variicola strain KPN1481 plasmid pKPN1481-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
tacaaaaagtgactgagggggcttataac CRISPR spacer ccgggaaagtgattgagggggcttatgaa Protospacer . ..*******.*************.*
52. spacer 2.3|2100404|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043927 (Klebsiella quasipneumoniae subsp. quasipneumoniae strain M17277 plasmid p17277A_477, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
tacaaaaagtgactgagggggcttataac CRISPR spacer ccgggaaagtgattgagggggcttatgaa Protospacer . ..*******.*************.*
53. spacer 2.3|2100404|29|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021699 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0158 plasmid tig00000727, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
tacaaaaagtgactgagggggcttataac CRISPR spacer ccgggaaagtgattgagggggcttatgaa Protospacer . ..*******.*************.*
54. spacer 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX827371 (Staphylococcus phage SpT99F3, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer tttcaacaaaattaaaaaaggtgcaattga Protospacer * * . ***.*****************
55. spacer 2.4|2100469|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK075002 (Staphylococcus phage phiSP38-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer tttcaacaaaattaaaaaaggtgcaattga Protospacer * * . ***.*****************
56. spacer 2.5|2100535|30|CP024116|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN047793 (Xanthomonas phage Xoo-sp13, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgaaaatttcggtaatgtaaaggtgtttag CRISPR spacer cgaagatttcggtaatgtaaagacccgtac Protospacer .***.*****************.. . **
57. spacer 4.8|2239257|37|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tgaacc---atttttcaataatcaatattcctttcttaag CRISPR spacer ---actttaatttttcaaaaattaatattcctttcttatt Protospacer **. ********* ***.***************
58. spacer 4.16|2239258|37|CP024116|PILER-CR matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tgaacc---atttttcaataatcaatattcctttcttaag CRISPR spacer ---actttaatttttcaaaaattaatattcctttcttatt Protospacer **. ********* ***.***************
59. spacer 4.7|2239192|36|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020750 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed7, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgcagtgaaccgttttatttagaagagcttgctgca Protospacer **.**.********************..* .**
60. spacer 4.15|2239193|36|CP024116|PILER-CR matches to NZ_CP020750 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed7, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgcagtgaaccgttttatttagaagagcttgctgca Protospacer **.**.********************..* .**
61. spacer 3.1|2228646|37|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT matches to LC168164 (Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
----catcaaaatcaaaaacagttaaattagatgcagatga CRISPR spacer gtgttacagaaac----aacagttgaattagatgcagatgg Protospacer .*. .***. *******.***************.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
157126 : 210994
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024116|157126:210994|DBSCAN-SWA GGTGGCTTTTTTCGTGCTCATAAGATATGCCATAAAAGAGTTTCTCTCTGAGAAAGAATACGAGAACTTATCCACTAACACCCTCAAAGCTTATCAAATGCTCTTTGATGACTTCCTGAGATGGACTGAGGAGCAAGGCTTCTCCAGAGTCCAAGATTTGAACACAAGAGCTATTAAGAATTATCTCTCCCTTTGTAAGACTGAGAAAGGGAATAACCCCACGAGCTTGAACACCAAGAGAAGGCAATTCAGAGCTTTCTTTAATTTCCTTGTTCAAGAGGATATTGTCAAAGACAACCCCACAGACCCTATAAAGAAAGTAAAAGAGGATATACGCATAAAGACCTTCACTGATGAGGAAGTCAAAGAGATTCTTTCCCACCTCAGGAGGATAAAGAGGAGAGAAGACACTCTCTTTTCTATTCGCAATTACACTATATTTCTTACCCTTATTGGAACTGGCTTGAGGGCTTCTGAGTGTACTGGCTTGAAATGGTCTTCAGTTGACCTCATAAATAGAAGCATTAAGGTGTTTGGAAAGAACAGAATAGAACAAACCGTTCCAATTTCAGAAACACTTGTTAAGGAGCTAAGCTACTGGAAGGAATATTGCTTGAGACAGTTTGGGGAGCTCTCCCCTTGGGTGTTTGTTACCCAGCAAAACAAGCAATTTACTGTCAATGGCTTAAAGTGCTGGTTCAAGCGTTTAGCTCAATTGATGGACTTCCCAGAGACACGCTGTTCAGCTCACTCTTGTAGACACTACTTTGCAAAGAAATGGATTCAGTCTGGAGGGGATATTTCAACACTCTCCAAGGTACTGAGACATACAAGCATAAAGACCACAGAGAAGTATCTCCAGTTCTGGGGTAATGAAGTTGCTGACGACTATGACAAGTTTAATCCATTAAGGGAGTTGAGTTTGTGAACTGGGAAGAGTTCTGTCAAGAAATGTTTTGTTATGGTTATGAAGTTGGACTAACAAAGGAAGACATTGTGAAGGCAATTCGAGAAAATGAGGAATTGTTGAGCTGGATATTCAAGAAGTAAAACAAAAGGAAGCCCCCTCTCAAGTTTGGCGACTTCAGGGAGCTTCCTAGTAAAACTCAAAGAGAGGTTGTTCCTCTCCTTTTTATTTTACAATGAGAAGGGCTCTGAGGGCAACCTCCAGAACTTGGAGGGTTATTTGTGGAAAGCTTGAGAGAGTATGAGACCTTTCAGAGCGTCTCTGAGATGGATGAATACATAAATAAGGTTCTGGCTCATATAGAGCTTAAAAAGACCGAGAGGGAGCTTCTATGGCTTCTAGGAGGGCACTCTGTAAAGTTTATTGGGGTGTCCTTTTTGAAGTTGGACTCTATGGCTCAACTCCTGAAGGTGTCAAAGAAGACCATTCAAAGAGCACTCAGCAAGTTGCAAGCTCTGGGAGTAATCAAGAGAGTAAGAACGATAAGACCAGTAAAAGGAGGTTTTGGGGCTAGTATTACTCAAATATGTCCAGTCGAATTGTCCACTCGCTCTGAAGGTGAAACTCCAGAGGAGACAAGGGAAGAGACCACCTCACAAAAGAAAGAAACATTTTCTTTTAAAGCATTTTCAAAAGATATTAAATACATACGACAACAAGAGGAGATTGACTACAGCTATTTAAGTGAATTTGTTCCTCAAGAGTTCATACAAGCAACGAAACCTTTCATGAGCCCTGAAGAGGTTTATTCCTTATGGGGTAAAACTCATGTGGTAGCTAAAAGATATGCTCCAGATGTTCTGGATATTCTTGAGCCAGCAATTAGAGCTTTCAAAGCTTCAGTGTTAGCTTACAAGACCAAGAGAGTGAAAAAGAGCTTTGGAGCGTACTTCTGGGGAGCCTTGCAAGGTGTCTTTGGAGTGGAGCAAAGAAGAGCTGTTGCTGGCTCAAGGGGTGGACTGTTAAGCTGGAACTGGTTAGAGGACTATTGAGGGAAACTCCCAGAAGCTTTAAGAAGGTTAGCTTCAGAACAATAGAATAAAATAAAAGAGAAGCTGTCACTCAGTTGATGAGTCTCAGAAGGTTAGCTCCAGTATGTAAGAAGAAATATATGAGACAGAATAAAAGAAGGTGTAAAATAGATTGAACTTGATGAGCTGAGCTGGTTAGTAGTGCTTGTATGATTCAGCTTGAGAGGTTCAACTGTTTAATGGGTTGTGCTGAGATGGAGGCTCCAGAGGTAGCCTTGAGAGGTTAAGCTGGTTCATAGGTGGCTTGAGGGAAAACTCCAGAGGTAGCTTGAGAGGGAGCTTGAGAGGAAACTCCAGGGGTAGCTTGAGAGGAAACTCCAGAGGTAGCTAAAAGGGTTAAACCCCCATGTCCTCACGAGGGCTTCCTCATTTCCCCCATTTAGAGTAATTTCCTTGAGAGGTAAACCCCCAGAGCAACACCTCCAGAGCCCCTGAGAAGCCTTCTAGTGACCCTCATAAGGTGAATATACCAGACACCCCTGAGAAGCCTTCCTGAGCCCTTCTGAGAGCCCTGAAGAGGAACGCTGGAATAGAGACCAGCTCCAGAGTCCACCTCAAGAACAAGACCACTTTACTTGCTGAGATAGCCCTCTCAGACCACTTTACAAGTGACCTCCAGAGTAAAACCCCCAGAGTAAGCCATTCTTGTGACCACTTTCTACACACAGAAGTAGTCCAGCTCTTGAGTTCCCAGCTCATAGGGTCTTTGAGTCGTTCACTGAGAGAGTAACCCCCAGAGTAAAGCTCCAGAGTAACACCCCCAGAGAAGCCCCTGAGAGGACACCAGAGAGCTTCCATTGGAGCCAGAGTGTTATGAGTCCACCTCATACAAAGACCCCTGAGAAGGGCTCCAGTGCTCCCTCAAGAGTACCACCTCACAAGGCAACACCTTCTCTTTTGTTTGTTCTTTTTCTTCTGGTGTAGCTCAAGAGGAACAACACACTAGAACACCACATGAGAAGCTCATACAAGGCTTCTGAGGGCTTCTGAGTATAACCTGAAGGGTAAACCATTAGAAAGCAATAAAAGGGCTCTAAAAGGCTTCTAAGGAGTTGCCAGCTCATAGGGTTGACTAGAGGAGAAATGTGTGGTAATAGCACAAATGAGGTAGACTGTCAAGGTCAGCTCAAAAAAATCAGGCTAGGGGGGTCACAAAAACACACATAGTCTGGTTTTTACAAAATATATTTTTCAAAACAGCCCTTGAGAGTTACCTTGAGAGTCTTCCCCAGCCCTTGAGAGTTACCCTTGAGAGGTAAACCCTAATTGACAACCCCTTGAGTGCTCCCCTGAGAGGTCAATTTGAGAGCATAACCCTGAGAAGTTACCACCTCAAGACCACTATAACCAAAGAGTTGACCTCAATAGTACACCTCAAAATTTATTTCTAAAATTTTTTTTAAATGTTGTCATATCAAGGGTTCAAGAGGGTTTTCTCTGGAGTTGGTTCTGGAGTGTTTAACTAAAAAAAGTCACACCTTTTGAAAAGAACTAATGATTTAGCTAAAAAGTTACAACAAATAATATTCCTTCTCATAAAAACAAATACAATGAAAAGAAGTTTCCACCTCATAACAAACAATAAAAAAAATAAATGAAGTGGAAAAGAGGTTGTACTAAAGAGTTACAACTCATAATAAAACAATAGATAAAAAAGAAGTTGAAACTAATAGATGACAACTCATACTTAAAATAAAGATAAAAATAAAAGAAATAATGAGATGACAACTCAAGAGTTTACCTTATAAGGGGTAGACTCTTTTTTTTTGTATATGATTCAGCACAAGAGAGGACAACTCATATTTTATTTTTATTTTACTTCCCTTGAAAAGCCCACTAGAAAACACAAAAGAAAAATAATGAGATGGCAAAAAGGAGCTTACGCTCCAGAACACCACTCAAAACCCCCTTGAGCCAGATTCTCTAATAAGTAATAAGTGTCAACTCCCCTGAAGTGCCTTCAGCCTTACTCTCCCAAGGGTTAGACCCTATTTTAATACAGTGCATATTTTGCACTCAAAGTGGCTAATACGGTGCATATTTTGCACTGGGAAAATTACAAGGAGTAGGGGGGCTTCCCAGATTCCCCTCCAAGGTTTTCTTCAAAAGGTAATTTTCAAACCAGCCTTGTGAGGTGGAACTCCACGAGACGCTCTCAGAGCACTTCTGAGCGTTTTTAACCCCTTCAGGTCTTATTGCATTACCCTCCTGAGAAAAAGCTCTCAGAGAAGCTTCAGTGAGTTCTCAAATAACCCTTTCACGAAAAGAGTAATGGAGAAGACCTTGTGAGGTGGCAAAGAAAATGAAACCCTTATACCACTCAAGTGTCTACAAAAATGGGGGTTTGAAATATTTTTTTTAAAAAAAATTGAATTTTTTTTTAGCCCTACAGCCCCAAGGGGTTTGGACTTCATAGTTCTCTCTTCAGGTACTAAAAAAACAGAAGTGTATTAACAAAAATGTCACACCTCTTGAAAAGTATATAGTGAGGGGGCAAAAAGAGAGTCATTAAAGAGCTTACTAATTCATCCTAGCTCAGCTAGGCTCTCCAGTTGTCTTGCTTTTTCAAAGTTACCATGCACGTTCAAACACCTCAATGGGGAGACGGAAACTCCCCAAAACATCAGCTCCCTTGTGGAGCATTAAAACACACTCCTACTGGAAAATGAGCTTGCCAAGACCTCCCAAGAGGGAGCGAGCGAGCCATTCTCCCCAGTACCAAAACCTAGCAAACATCTTTCTTTCCCTAGCAAGCTGACGAGCTTGCAACTTTTTTTGGGAAAGAGTTAACAAATTCGTGAACTGTACGGAGGGAAAGAAAATGAAAATTGTAAAGGAGACAAAGAGAACAAGACAATTAGAGATTTACAGTGAAACTGGTGAACTGGTTCAAAGGGTTTGCAGAACGTGCCAGCTTGTAAAGTTGCCAGAAGACTTTCCAAAGTACACTCAAGGTTATTTGAGACCAGATTGCCATGAGTGCCACAAAAAGAAACAAAGAA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MERFIFVHGEYTFKVYPEQVVFTRNNVFKVSQGEWETYEELLERLLKDIQKALEAKGCELLEVNFSESHELAYMRDMMKPEQRVRHKILTKKHKRENNRAGH |
55 | Bacillus_phage(26.67%) | protease,integrase,transposase | attL 156919:156967|attR 174087:174135 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
287352 : 295330
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP024116|287352:295330|DBSCAN-SWA CATGCTAAAGCCATTAGGTGATCGCGTTGTAATTGAACTTGTTCAAGCGGAAGAAAAAACAGCAAGCGGTATTGTATTACCAGACACTGCAAAAGAAAAACCACAAGAGGGTAAAGTTATTGCAGTAGGTACTGGGCGAGTGCTTGAAAATGGTGAGCGTGTTGCTTTAGAGGTAGCAGCAGGCGATCGTATCATCTTCTCAAAATATGCAGGTACTGAAGTGAAATATGAAGGTACAGACTACTTGATTTTACGCGAAAGTGACATTTTAGCAGTTATCGGTTAATTATATATTTAAAAAATCCAAGGGGGTCAATATTATGGCAAAAGATATTAAATTTAGTGAAGAAGCACGTCGTTCGATGCTTCGCGGTGTCGACACTCTTGCAAACGCAGTAAAAGTAACACTTGGACCAAAAGGTCGCAACGTTGTACTTGAGAAAAAATTTGGTTCACCACTTATTACAAATGACGGTGTAACAATCGCAAAAGAAATTGAATTAGAAGATGCTTTTGAAAACATGGGTGCAAAATTAGTAGCAGAAGTTGCTAGCAAAACAAATGATGTAGCTGGTGACGGAACAACAACTGCAACTGTATTAGCACAAGCTATGATTCGTGAAGGTTTGAAAAACGTAACAGCTGGTGCAAACCCAATGGGTCTTCGCAAAGGTATTGAAAAAGCTGTTGCTACAGCAGTAGAAGAGTTAAAAACAATTTCTAAGCCAATTGAAGGTAAATCTTCTATCGCACAAGTAGCGGCTATTTCTGCTGCTGACGAAGAAGTAGGTCAATTAATTGCAGAAGCGATGGAACGCGTTGGTAATGATGGCGTTATTACATTAGAAGAATCTAAAGGATTCACAACAGAATTAGATGTAGTAGAAGGTATGCAATTTGATCGTGGATATGCATCTCCTTACATGATTACTGATTCTGACAAAATGGAAGCAGTTCTTGATAACCCATATATCTTAATTACTGACAAAAAGATTTCTAACATTCAAGAGATCTTACCAGTGTTAGAACAAGTGGTCCAACAAGGTAAACCACTTCTTATTATCGCTGAAGATGTAGAAGGTGAAGCGTTAGCTACATTAGTAGTAAACAAACTTCGCGGTACATTCAATGTAGTAGCTGTTAAAGCTCCAGGATTTGGTGACCGTCGTAAAGCAATGTTAGAAGATATCGCAATCTTAACGGATGGCGAAGTAATCACTGAAGAACTAGGCCGCGACTTAAAATCAGCTACAATTGAGTCTTTAGGACGCGCTGGTAAAGTTGTGGTAACGAAAGAAAACACAACAATCGTAGAAGGTGTAGGAAGCACTGAACAAATCGAAGCTCGCATCGGTCAAATCCGTGCGCAATTAGAAGAAACAACTTCTGAATTCGATCGTGAAAAATTACAAGAACGTCTTGCTAAACTTGCAGGTGGCGTTGCAGTAATTAAAGTAGGTGCAGCAACTGAAACTGAGTTAAAAGAACGTAAACTTCGCATTGAAGATGCACTTAACTCAACTCGTGCAGCAGTAGAAGAAGGTATTGTTGCAGGTGGCGGTACTTCACTTATGAATGTATACGCTAAAGTAGCTTCTATTGCAGCTGAAGGCGACGAAGCAACAGGTATCAACATTGTACTTCGTGCATTAGAAGAGCCAGTTCGCCAAATCGCAATCAACGCTGGTCTAGAAGGATCTGTAGTGGTAGAACGTCTAAAAGGCGAAAAAGTAGGTGTTGGTTTCAACGCAGCAACAGGCGAATGGGTAAACATGCTTGAGTCTGGTATCGTAGACCCAGCAAAAGTAACTCGTTCTGCACTTCAAAACGCAGCATCTGTTGCAGCAATGTTCTTAACAACAGAAGCAGTAGTAGCTGACAAACCAGAAGAAAATAAACCGGCAATGCCAGACATGGGTGCAATGGGCGGCATGCCAGGAATGATGTAATTTCATTATTCGCTAAAACACTCATCTCTTTTCGAGAGATGGGTGTTTTTTGTTATCAAATTTCTCGAAATTATAGTAAAAAAGGTTTTATCGTAACCGAAATATAATTTCTGTAGAATTTTGTCGTGTTCTCTCTTGACCGTATTGATATTTCATTGTTAGAATCTAGAAAGATAATATAAAACAATCCTTCATATATCCTCAATAATATGGTTTGAGAGTCTCTACCGGGTTACCGTAAACAACCTGACTATGAAGGCAGTGCGTCTTATTGTTTATAAAGAGCAACATACTATCTTTATAAAGCTAGACTCCTGCCTTTTCTTTATTATGAGACGAGAGGTGGGGGACTGGCTTTTTTTATTATATTGGTAATGCTTTTTGCCTAATTTGGTGAAAATATTTATATACAGAACTAACGTTGGGGTGATTATTTTGAAAAAACAGCACGATACGATTATCGTTTTAGACTTTGGAAGTCAGTACAACCAATTAATTGCACGTCGCATTCGTGAGTTCGGTGTGTACAGTGAGCTTCATCCACACACAATTACTGCGGAAGAAATTAAAGCAATGAATCCAAAAGGTATCATTTTCTCTGGTGGACCAAATAGTGTATACGGCGAAAATGCATTCCACTGTGATGAGAAAATTTTTGAGCTAGGATTACCTATTTTTGGTATTTGTTACGGCATGCAGCTGATGACAAAACACTTTGGTGGAAAAGTAGAGCGAGCAAACCATCGTGAGTACGGAAAAGCAGTTCTGAAAGTAGAGAATGAATCAAAATTATATACAAACCTGCCAGAAGAACAAGTTGTATGGATGAGCCATGGTGACTTAGTAACAGGTTTACCAGAAGGCTTTGTAGTAGATGCAACGAGCGAATCTTGTCCAATTGCTGGTATGAGCAATGAAGAAAAGCAATTATACGGTGTACAATTCCATCCAGAAGTACGTCACTCTGAGCACGGTAATGATTTAATTAAAAACTTCGTATTCGGCGTATGCGGTTGTTCTGAAGGCTGGAACATGGAGAACTTTATTGAAGTAGAATTAGAAAAAATTCGTGAAACAGTTGGCGATAAAAAAGTGCTATGTGCACTTAGCGGTGGTGTAGATTCTTCTGTTGTAGCTGTATTAATTCATAAAGCAATCGGTGATCAGTTAACATGTATTTTTGTTGACCACGGTTTACTTCGTAAAGGTGAAGCAGAAGGTGTTATGAAAACATTTAGCGAAGGCTTCCATATGAATGTTATTAAAATCGATGCTAGAGAACGCTTCATGAAAAAGCTAAAAGGTGTAGAAGATCCTGAACAAAAACGTAAAATTATCGGTAACGAATTCATTTATGTTTTTGATGATGAAGCTGCTAAATTAGAAGGAATAGACTTCTTAGCGCAAGGTACACTGTACACAGACATTATTGAAAGTGGTACAGCAACTGCGCAAACAATTAAATCTCACCATAACGTAGGTGGACTTCCAGAAGATATGCAGTTCAAATTAATCGAGCCTTTAAATACGTTATTTAAAGATGAAGTACGTGTATTAGGATCAGAACTAGGAATTCCTGATGAAATTGTATGGCGTCAACCATTCCCAGGTCCTGGACTTGGTATTCGTGTATTAGGTGAAATTACAGAAGAAAAATTAGAAATTGTTCGTGAATCTGATGCGATTTTACGTGAGGAAATCCAAAAAGCAGGATTAGACCGTGAAATTTGGCAATACTTCACTGCGCTTCCTGGTATGCGCAGCGTAGGTGTTATGGGTGACGAGCGTACTTACGATTATACAGTAGGTATCCGTGCCGTAACATCAATTGACGGTATGACAGCTGACTGGGCACGTATCCCTTGGGACGTATTAGAGAAAATCTCTGTACGTATCGTAAACGAAGTAAAACACGTGAACCGCGTTGTATATGATATTACTTCTAAGCCACCAGCAACGATTGAGTGGGAATAAAACTATTTATTTGCAGGAAGATCCATCTTATATATAGATGGATCTTTTTTATACGAACAAAAAAAGTTTAACTTATAAAATTGTTCGTTTTTAAGTTGACATATATTTTTTTGTACGCTAATATGATTATATGATTGATACAAAAAGTGAATATTATAGCCGTCGTATAATCTCGGGGATATGGCCCGAAAGTTTCTACCTAGCTACCGTAAATGGCTTGACTACGAGGCGTTTTTATAAAGATAAGGGGAATTTATCTTTATTTATAGAACGCTTCCATGTATATAGGCAATGGAAGCCTTTTTTATTTTTTAGGATAAAAGAGGGCTAGGATGAAGTGCGACGAGTCATTATACAACGGAGGAAACGTAAGATGAAACGTTATTTTCAGTTTGATGAGCTCGGTACAAATTATAAGACTGAGTTCATTGCAGGGTTAACAACATTTTTATCTATGGCTTACGTACTATTTGTTAATCCTGCCACACTGTCACTTGGAAACATTAAAGGACTGCCGGCAGGAACCGGAATGGATCCGGGAGCAGTATTCGTTGCCACTGCATTAGCGGCAGCAATCGGTTCTTTAATTATGGGGATTTTTGCAAAATATCCAATAGCATTAGCGCCAGGTGTAGGGATTACTTCTTTCTTTGCTTACACAGCGGTATTAACAATGGGAGTTCCATGGCAGACAGCAATTGCGGGAACACTCGTATCAGGTATTATCTTTATTATTATTACAGCTCTTGGTATCCGTGAAAAAATTATTAATGCAATTCCTGCAGAGTTAAAACTTGCGGTAGCAGCAGGTATTGGCTTATTTATCGCCTTTTTGGGTTTTCAAAATGCCGGAATTATCGTGAAAAATGATGCGGTTCTTGTTGGATTAGGAGACTTAACAAAGGGCGCAACGTTGTTAGCGATTTTCGGAGTAGTTGTTACGATTATTTTAATGATTAAAAAGATAAATGGTGCAGTGTTCTATGGGATGATTCTTACAGCTATTCTTGGAATGGCAACAGGATTAATTGATACGCCAAAAGCTGTAGTAGGAGCAATTCCAAGTTTAGAACCGAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP024116|287352:295330|287352_287637_+|AWC55446.1|DBSCAN-SWA MLKPLGDRVVIELVQAEEKTASGIVLPDTAKEKPQEGKVIAVGTGRVLENGERVALEVAAGDRIIFSKYAGTEVKYEGTDYLILRESDILAVIG >CP024116|287352:295330|289726_291274_+|AWC55448.1|DBSCAN-SWA MIILKKQHDTIIVLDFGSQYNQLIARRIREFGVYSELHPHTITAEEIKAMNPKGIIFSGGPNSVYGENAFHCDEKIFELGLPIFGICYGMQLMTKHFGGKVERANHREYGKAVLKVENESKLYTNLPEEQVVWMSHGDLVTGLPEGFVVDATSESCPIAGMSNEEKQLYGVQFHPEVRHSEHGNDLIKNFVFGVCGCSEGWNMENFIEVELEKIRETVGDKKVLCALSGGVDSSVVAVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEAEGVMKTFSEGFHMNVIKIDARERFMKKLKGVEDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEAAKLEGIDFLAQGTLYTDIIESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRVLGSELGIPDEIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRESDAILREEIQKAGLDREIWQYFTALPGMRSVGVMGDERTYDYTVGIRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVKHVNRVVYDITSKPPATIEWE >CP024116|287352:295330|293842_295330_+|AWC59014.1|DBSCAN-SWA MSGILKKIIYKGICGVQKSLRVQLITTFALCSLLGIMGVWASSPFFQGINKYSVIDYSSGMRFIDTTAESLVAAIVREGASVNVQEVLERPEYQRELKVLIVDENGKVIYKTKGAQEEQINLHSTIRNIMSFKINRSQYEYQKDVIDNEIERERKEFTTFYPLTIEEKNMYMIASGIPQGNIREVQNDSPFPFLIGFVLFLFSFFYLTKRKMKQIEAMAEGVKEITKGNLQHRIPEKGQDELSLLAVNMNQMAEELFSNIEKERRIEKQKNELITNVSHDLRTPLTSIMGYLRLLRDSKYENKEQHDEYTRIAFTKSEQLKNLIEDLFEYTKLTNEKVILEKQEVCINELLEQLIEELVPQAEEEGLTFIKHFPEERMYATIDSEKMVRVFENLLMNAIKYSKDNGEIKVSLQRQRRDIQIIVANYSEEFTKEELANLFERFYKKDQSRSRVKEGSGLGLAIAKSIVELQGGQIRAHYEDGEIQFIVSLPIMEEK >CP024116|287352:295330|293115_293817_+|AWC55450.1|DBSCAN-SWA MRQETILVVDDEKEIRDLITIYLKNEGYNILQAGDGAEGLEVLENNEVHLVVLDIMMPKIDGIHMCMKVREQKEMPIIMLSAKTQDMDKILGLTTGADDYVTKPFNPLELVARVKSQLRRYMKMSGFMIENENEIEIGDIKINVSTHEVVVADREVKLTPREFSILELLVRNSGMVFSTEQIYEKVWNERSFQSDNTVMVHIRKIREKVEENARKPRYIKTVWGVGYKVEKEN >CP024116|287352:295330|291647_292973_+|AWC55449.1|DBSCAN-SWA MKRYFQFDELGTNYKTEFIAGLTTFLSMAYVLFVNPATLSLGNIKGLPAGTGMDPGAVFVATALAAAIGSLIMGIFAKYPIALAPGVGITSFFAYTAVLTMGVPWQTAIAGTLVSGIIFIIITALGIREKIINAIPAELKLAVAAGIGLFIAFLGFQNAGIIVKNDAVLVGLGDLTKGATLLAIFGVVVTIILMIKKINGAVFYGMILTAILGMATGLIDTPKAVVGAIPSLEPTFGMALTHFGDIFTVQMGIVIITFFFIDFFDTAGTLVAVVNQAGLMKDNKLPRAGKALFADAIATVIGAILGTSTTTSYIESSAGVAAGGRSGFTAVVTAGFFLLALFFSPLLSVITPAVTAPALIIVGILMVSSLGEIEWKKFEIAVPAFFTIISMPLTYSIATGIAIGFIFYPITMVVSGRRKEVHPIMYVMGVLFVLYFIYVRK >CP024116|287352:295330|287671_289300_+|AWC55447.1|DBSCAN-SWA MAKDIKFSEEARRSMLRGVDTLANAVKVTLGPKGRNVVLEKKFGSPLITNDGVTIAKEIELEDAFENMGAKLVAEVASKTNDVAGDGTTTATVLAQAMIREGLKNVTAGANPMGLRKGIEKAVATAVEELKTISKPIEGKSSIAQVAAISAADEEVGQLIAEAMERVGNDGVITLEESKGFTTELDVVEGMQFDRGYASPYMITDSDKMEAVLDNPYILITDKKISNIQEILPVLEQVVQQGKPLLIIAEDVEGEALATLVVNKLRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTDGEVITEELGRDLKSATIESLGRAGKVVVTKENTTIVEGVGSTEQIEARIGQIRAQLEETTSEFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAATETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTSLMNVYAKVASIAAEGDEATGINIVLRALEEPVRQIAINAGLEGSVVVERLKGEKVGVGFNAATGEWVNMLESGIVDPAKVTRSALQNAASVAAMFLTTEAVVADKPEENKPAMPDMGAMGGMPGMM |
6 | uncultured_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
328310 : 336682
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP024116|328310:336682|DBSCAN-SWA GATGATTAGTCGTTATACACGCCCTGAGATGGGTGCGATTTGGACGGAAGAAAATAAATTTAAAGCATGGTTGGAAGTGGAGATTTTAGCTTGTGAAGCATGGGCGGAACTTGGTGAAATTCCAAAAGAAGATGTGAAAAAAATTCGCGAAAATGCATCATTTAATATGGATCGTATTTATGAAATTGAAAAAGAAACACGTCATGATGTAGTAGCATTTACTCGTGCAGTATCAGAAACACCTGCATTAGGGGAAGAACGCAAATGGATTCACTACGGTTTAACATCAACAGACGTAGTAGATACAGCATTGTCTTATATTTTAAAACAAGCAAATGAAATCTTATTAAAGGACTTAGAAAACTTTATTGAGATTTTAGCAAATAAAGCGAAAGAACATAAATACACAGTTATGATGGGGCGAACACATGGTGTTCATGCAGAACCAACAACGTTTGGTTTAAAACTTGGTCTTTGGTATGAAGAAATGAAACGTAACTTGGAACGTTTCAAACAAGCAGCTAATACAGTTCGCGTCGGTAAATTATCAGGTGCAGTTGGTACGTATGCAAACATTAATCCATTTGTAGAAAAATATGTTTGTGAAAACTTAGGATTAGAAGCAGCGCCAATTTCTACACAAACATTGCAACGTGATCGCCATGCGCATTACATGTCAACACTTGCATTGATTGCCACATCTATTGAAAAGATGGCAGTTGAAATTCGCGGTTTACAAAAGAGTGAAACTCGTGAAGTAGAAGAGTTTTTCGCAAAAGGTCAAAAAGGTTCTTCTGCTATGCCGCATAAACGTAACCCGATTGGCTCTGAAAATATGACTGGTATGGCACGTGTTATTCGCGGTTATATGTTAACAGCTTATGAAAATGTTCCATTATGGCATGAGCGTGATATTTCGCACTCTTCTGCAGAACGTGTTATCTTACCCGATGCAACTATTGCATTAAACTATATGTTAAACCGCTTCGGTAATATCGTGAAAAACTTAACGGTATTCCCAGAGAACATGAAACGCAATATGCAAAGAACATACGGTTTAATTTATTCGCAACGTGTCATGCTTACTCTTATCGACAAAGGTATGGTACGTGAAGAAGCTTATGATATCGTACAGCCTAAAGCGATGGAAGCGTGGGAGACACAAGTACAATTTAAAGATCTTGTAGAGGCAGATGAGCGTATTACAAGCAAGTTAACACAAGAAGAAATCAACGAATGTTTCAACTATGAATATCACTTACAACATGTTGATACTATTTTTGAACGTCTTGGACTAAACTAAGCAGAAAATTTTATATGGCACAGAATAGCGTTATTCTGTGCCATTCTTTATAAAAATATTATTCACATTTTTCAAACTACAGGGGGCTTGCGAAATGCAAAAGCTAGAATTGCTGTATGAAGGTAAGGCAAAAAGAATATATCGTACAGAAGCAGCAGATATGGTTTGGATAGAGTACAAAGATAGTGCTACTGCTTTCAATGGAGAGAAAAAAGCGACCATTACAGGAAAAGGTCGTTTGAACAATGAAATTACAACTTTTTTGTTCAGAAAGTTGCAAGAAGTGGGAATTGAAACACATTTTGTAAAGAAGCTATCAGATACAGAACAACTTGTGAAAAAAGTAAGTATTATTCCATTAGAAGTTGTTACAAGAAACGTCATTGCAGGGAGCCTTTCCAAACGATTAGGAATGGAAGAGGGAATACCACTTGCCAAACCAATCGTAGAATTTTACTACAAAGATGATGATTTAGGAGATCCTCTTGTAACAGAAGATCATATTCGTGTGTTAAACGTTGCAACATTAGAGCAGATAAGTACATTACGAGAAAAGGCTCTACGAATCAATCAAGTTTTGATTGAGCATTTCGCAAGCTGTCGTGTAAGGTTAATAGATTTTAAATTAGAGTTTGGTATTACAGAGGAAGGCAAGATTGTATTAGCGGATGAAATCTCACCAGATACTTGTCGTTTATGGGATGAAGAGAGCAATGAGAAATTTGATAAAGATGTATTTCGCCGCGATTTAGGTAATTTAACCGAGGCATATGAAGAAATTTTAAAACGTTTAGGAGGGGCTTCACATGTATAAAGTTAAGGTATATGTAACATTAAGAGAGAGTGTATTAGATCCACAAGGAACAGCAGTAAAAGGTGCTCTTCACAGCCTTTCCTTTACAGAAGTACAAGATGTGCGCATTGGTAAATATATGGAGTTAACAATTGATAAATCGGTAACTGATCTTGATAGAAAAGTAAAAGAAATGTGTGAAAAACTATTAGCAAACGTTGTAATGGAAGATTTCCGTTATGAAATTGAGGAGGTTGTCGCACAGTGAAATTTGCCGTAATCGTTTTTCCAGGTTCGAACTGTGATGTTGATATGTTTCATGCAATTAAAGATGAGCTTGGTGAAGATGTAGATTATGTTTGGCATGATGCAGAGAACTTAGACGAATATGATGCGATTCTTTTACCAGGTGGATTCTCTTATGGTGATTACCTTCGCTGCGGTGCCATTTCTCGATTTGCGAATGCAATGAAAGCAGTGCAAAAAGTTGCTGAGCAAGGAAAGCCTATTTTAGGCGTGTGTAATGGATTCCAGATTCTTGTTGAATCAGGATTATTACCAGGGGTATTGATACGAAATCAAAACTTAAAATTCATGTGCCGAACTGTTCCGTTACGTGTTGAAAATAATGAAACGATGTTTACATCACAATATAACAAGGGGGAAATCATTCATATCCCAATTGCACATGGTGAAGGAAATTATTATTGTGATGAAGCAACTCTTAAAAAATTAGAGCAGAAGAATCAAATTGTATTCCGTTATGTAGACAATCCAAACGGAAGTGTTTCAGATATTGCAGGTATTGTAAATGAAAAAGGTAATGTGCTTGGCATGATGCCACACCCAGAGCGTGCTGTGAATGAAATTCTTGGCGGTGCAGAAGGGTTAAAAGTCTTTCAATCTATTTTGAAATATTGGAGGGAAACATATGTCGTTAATGCTTGAACCAAATCCAACACAAATTAAAGAAGAACGTATATATGCGGAAATGGGGTTAACAGACGAAGAGTTTGCCATGATTGAAAAGATTTTAGGACGTCTGCCGAACTATACGGAAACAGGGCTTTTCTCTGTTATGTGGTCAGAGCATTGTAGTTATAAAAACTCAAAACCAGTTCTTCGCAAGTTCCCAACAACAGGAGAACGTGTATTACAAGGACCTGGAGAAGGCGCAGGTATTGTAGATATTGGTGATAATCAAGCAGTTGTATTTAAAATGGAAAGTCACAATCATCCTTCGGCAATTGAGCCGTATCAAGGTGCAGCAACAGGGGTTGGCGGTATTATTCGTGATGTATTCTCTATGGGAGCACGTCCGGTTGCATTATTGAACTCACTGCGCTTCGGTGAACTCCAATCACCACGCGTGAAGTATTTATTTGAAGAAGTAGTTGCAGGGATTGCAGGATACGGTAACTGTATTGGTATTCCAACTGTTGGCGGAGAAGTACAATTTGATCCATGTTATGAAGGAAACCCACTTGTCAATGCAATGTGCGTTGGGTTAATTCATCATGAAGATATAAAAAAAGGGCAAGCGCACGGTGCTGGTAACACGGTTATGTATGTCGGTGCTTCAACAGGACGAGACGGTATTCATGGTGCAACTTTCGCATCAGAAGAACTATCTGAGAGTTCAGAAGCAAAACGCCCAGCAGTACAAGTAGGCGATCCGTTTATGGAGAAACTTCTTATTGAAGCATGCTTAGAGTTAATCCAATCTGATGCGCTTGTTGGAATTCAAGATATGGGCGCTGCGGGCTTAACATCATCTTCTGCGGAAATGGCAAGTAAAGCGGGAATGGGTATTGAAATGTATTTAGACGATGTGCCACAGCGTGAAACAGGTATGACACCATATGAAATGATGTTATCTGAATCACAGGAACGTATGTTGATTGTGGTGAAAAAAGGTAGAGAGCAAGAAGTTGTAGAGTTATTTGAAAAGTATGGCTTAGCGGCAGTTGCGATGGGAAAAGTAACGGAAGATAAAATGCTTCGTTTATTCCATAAAGGTGAAATGGTAGCAGAAGTACCTGCGGATGCATTAGCAGAAGAAGCGCCAATTTATCATAAACCTTCAAAAGAGGCAGCATATTTTAGGGAATTTCAAGAAATGAAAATGAAGACGCCAAAAGTAGATAACTATAAAGAAACATTACTAGCTTTATTACAACAACCAACGATTGCAAGTAAAGAATGGGTATATGATCAGTATGATTATCAAGTACGCACAAGTACTGTTGTTACACCAGGATCAGATGCAGCGGTGGTGCGAGTACGTGGTACAGAGAAGGCATTAGCAATCACAACGGACTGTAACTCTCGTTATATTTACTTAGATCCTGAAACGGGCGGTAAAATTGCAGTAGCAGAAGCTGCGCGTAATATTGTATGTTCTGGCGGAGAACCACTTGCAATCACAGATTGCTTAAATTTTGGTAATCCAGAGAAACCAGAAATTTTCTGGCAAATTGAGAAATCAGTAGATGGTATGAGCGAAGCTTGTCGTACATTACAAACTCCAGTTATTGGTGGAAATGTATCAATGTACAACGAGCGCAGCGGTGAAGCTGTATATCCAACACCAACTGTTGGAATGGTTGGGCTTGTTCACGATTTAAAACATGTAACAACACAAGAATTTAAGCAAGCTGGGGATCTTATTTATGTTATGGGTGAAACGAAAGCTGAATTTGGTGGAAGTGAATTACAGAAGATGATGTACGGTAAAATCTTCGGTCAATCACCAAGTATTGATTTAGAAGTAGAAGCAAAACGTCAAAAACAATTACTAGAAGCAATTCAGGCGGGACTTGTTCAATCGGCACATGACGTTGCAGAAGGCGGATTAGCAGTTGCGATTGCTGAAAGTGCAATCGGTGCGAAAGGATTAGGTGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP024116|328310:336682|331336_333556_+|AWC55465.1|DBSCAN-SWA MSLMLEPNPTQIKEERIYAEMGLTDEEFAMIEKILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTTGERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELQSPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEVQFDPCYEGNPLVNAMCVGLIHHEDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSESSEAKRPAVQVGDPFMEKLLIEACLELIQSDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMYLDDVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLIVVKKGREQEVVELFEKYGLAAVAMGKVTEDKMLRLFHKGEMVAEVPADALAEEAPIYHKPSKEAAYFREFQEMKMKTPKVDNYKETLLALLQQPTIASKEWVYDQYDYQVRTSTVVTPGSDAAVVRVRGTEKALAITTDCNSRYIYLDPETGGKIAVAEAARNIVCSGGEPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSVDGMSEACRTLQTPVIGGNVSMYNERSGEAVYPTPTVGMVGLVHDLKHVTTQEFKQAGDLIYVMGETKAEFGGSELQKMMYGKIFGQSPSIDLEVEAKRQKQLLEAIQAGLVQSAHDVAEGGLAVAIAESAIGAKGLGATVKLAGEATAALFAESQSRFVVTVKREQQEAFEKVVEAIQVGEVTNTNEVTIHNEENEVLLTANVDEMRKAWKGAIPCLLK >CP024116|328310:336682|330418_330673_+|AWC55463.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGTAVKGALHSLSFTEVQDVRIGKYMELTIDKSVTDLDRKVKEMCEKLLANVVMEDFRYEIEEVVAQ >CP024116|328310:336682|330669_331353_+|AWC55464.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMFHAIKDELGEDVDYVWHDAENLDEYDAILLPGGFSYGDYLRCGAISRFANAMKAVQKVAEQGKPILGVCNGFQILVESGLLPGVLIRNQNLKFMCRTVPLRVENNETMFTSQYNKGEIIHIPIAHGEGNYYCDEATLKKLEQKNQIVFRYVDNPNGSVSDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVNEILGGAEGLKVFQSILKYWRETYVVNA >CP024116|328310:336682|335058_336102_+|AWC55467.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVSRMKKHVQTTMRKEVLGGLGGFGGMFDLSKLPLEEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMADKHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYIACGKADPSKIEHIVKGIAEGCRQAGCSLIGGETAEMPGMYSKEEYDLAGFTVGIVDKKKIITGHSLDEGHVLIGLASSGIHSNGYSLVRKVLLEDGQMSLDRIYGRLELPLGEELLKPTKIYVKPILELLKKYEVYGMAHITGGGFIENIPRMLPKGIGAEIDLGSWNIQPIFSLIQEVGKIEEKEMFNIFNMGIGMVVAVKEENAKAVVRLLEEQGEKAYIIGRTVKGSGVAFNGGIDHE >CP024116|328310:336682|328310_329612_+|AWC55461.1|DBSCAN-SWA MISRYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGEIPKEDVKKIRENASFNMDRIYEIEKETRHDVVAFTRAVSETPALGEERKWIHYGLTSTDVVDTALSYILKQANEILLKDLENFIEILANKAKEHKYTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGLWYEEMKRNLERFKQAANTVRVGKLSGAVGTYANINPFVEKYVCENLGLEAAPISTQTLQRDRHAHYMSTLALIATSIEKMAVEIRGLQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGMARVIRGYMLTAYENVPLWHERDISHSSAERVILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMQRTYGLIYSQRVMLTLIDKGMVREEAYDIVQPKAMEAWETQVQFKDLVEADERITSKLTQEEINECFNYEYHLQHVDTIFERLGLN >CP024116|328310:336682|329706_330426_+|AWC55462.1|DBSCAN-SWA MQKLELLYEGKAKRIYRTEAADMVWIEYKDSATAFNGEKKATITGKGRLNNEITTFLFRKLQEVGIETHFVKKLSDTEQLVKKVSIIPLEVVTRNVIAGSLSKRLGMEEGIPLAKPIVEFYYKDDDLGDPLVTEDHIRVLNVATLEQISTLREKALRINQVLIEHFASCRVRLIDFKLEFGITEEGKIVLADEISPDTCRLWDEESNEKFDKDVFRRDLGNLTEAYEEILKRLGGASHV >CP024116|328310:336682|336094_336682_+|AWC55468.1|DBSCAN-SWA MNRLAIFASGSGSNFQAFVNAVEENRLHAEISLLVCDQPEARVIGRAHYHHVPCFAFSAKAYESKEAFEKEILKKLREYEIDFVILAGYMRLIGPTLLEAYGGKIINIHPSLLPSFPGKDAIGQALKAGVGVTGVTIHYVDAGMDTGPVIAQEAVQVSENDTRDSLQKKIQQVEHRLYVNTVNKIIQSMKERTVK >CP024116|328310:336682|333540_334956_+|AWC55466.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGIFGIWGHENAAQVTYYGLHSLQHRGQEGAGIVVNNGEKIIGHKGLGLVSEVFSRGELEGLNGKSAIGHVRYATAGGSEVANVQPLLFRFSDHSMALAHNGNLINAKMLRRELEAEGSIFQTSSDTEVLLHLIKRNTKGSLIESVKDALNKVKGAFAYLLLTSHEMIVALDPNGFRPLSIGKMGDAYVVASETCAFDVVGATYIRDVEPGELLIINDEGIQVDRFTNEVEHAICSMEYIYFARPDSNIAGVNVHAARKNMGKRLAMEAPIAADVVTGVPDSSISAAIGYAEATGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVRMLREAGATEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHSVEEICQIIGADSLTFLSEEGLVDAIGRPYEGKYGGLCMAYFNGDYPTALYDYEQELLESMK |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
758224 : 796413
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP024116|758224:796413|DBSCAN-SWA 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39 | Thermus_phage(20.0%) | coat,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1109704 : 1177156
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP024116|1109704:1177156|DBSCAN-SWA 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60 | Bacillus_phage(36.36%) | coat,integrase,bacteriocin | attL 1170590:1170607|attR 1178026:1178043 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2353062 : 2421038
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP024116|2353062:2421038|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_phage(36.84%) | integrase,tail,holin,bacteriocin,transposase | attL 2348228:2348244|attR 2382038:2382054 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2429385 : 2442496
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP024116|2429385:2442496|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP024116|2429385:2442496|2439128_2439656_-|AWC57297.1|DBSCAN-SWA MTNRKKTFRVLSVDTSLGSPGIAVIDVINGKPKLIDVSHVKTKSTEPIALRTKTIEAWAHLFIRKHAPYDLIVREGFASKIPHTNYTVFSAWNAVDRALNDFGLKVDDSIGQASVKKKLLGKGRAEKEEVEAGVRRYVEWGVFKTSDESDACAIGLAYLIDKGIVMKVNPKEETE >CP024116|2429385:2442496|2431088_2431562_-|AWC57286.1|DBSCAN-SWA MSDKKRRLETQLTREQITAATLLSINKFLPKASTIDDPEELARAKENGQVRLNLEEIAEKSNISVRQLYTWRHRDSNFIEYVNLLSSDAFMSHLPDVMQKHLDMMLKGQGSMKGIELFYKFGGLLVDKQEVKTESADSGLTMEERLARLKERTGGGQ >CP024116|2429385:2442496|2441992_2442496_-|AWC57301.1|DBSCAN-SWA MRSLDRYVPKRNGQKQFFRGKIISTYINNSGYECVDLARGGKKVKNTVHRLVAKHFCKGYREKLDVNHIDADRLNNKAENLEWMSRIENIRDCIKRGTHNVDSAHKIAREKNQKPVAMLDLDGNVLRTFPSIKEAREQTGAIKIGEVCNGNRRMAGGYKWRFISKAG >CP024116|2429385:2442496|2435840_2436074_-|AWC57291.1|DBSCAN-SWA MTNVIVYTKNACPTCKQVLWSLNAANVPYKTRNIDEDPSHAAWMADKGYMSAPVTVFPSGKEVVGFDMGEFAVELGL >CP024116|2429385:2442496|2429385_2431089_-|AWC57285.1|DBSCAN-SWA MAWLDGKWLARQERQQAINDRLLLRKEYEKLASKGDLLEHDVTQWEALEDELEKLQRVHACEHDVLRFTYEYFSDELNPDNESNLIPAGQTLETAADFHRTLCSLLNDITEGKTKSNVGWSVGRRHAKTAYLSNSYLCHQVVYRLQKYIVEVSETTDVAGDFIKWTVNQLKFNEKLREDFGGILHPKPSMNEVDNKYEFITSTGTKVEAKGIGTQMRGLRHLSERPGLFILDDLESGENTNTPELRAKNLHWFRSEMIEALGFGGICVYMGTIVHYDSLLNHVLTKRKDFISRKFPAVLSWSEREDLWEEWRKLYNADEKDAVDQADAFYEANKDEMLRGTQVLWPQAYDYKYFMEKRESMGARAFNQEYLGNPVDEESQVFKPEYFTYWTDKDIENKQLEYFCGIDFAMGKEKGDYSVILTVGRSPNGIFYVVDTFIERVHPDILLKKAVEKSLQYQYSGIAVEAQQAQEWFADKLSQALQQAGYPSATRMKQIKQRTRKALRIESLLPDIQSGRIRFKKEQRLLLEMLEMYPNHNHDDGPDALHMAVSTGSNSHTVVRTIRKRMR >CP024116|2429385:2442496|2438139_2438448_-|AWC57295.1|DBSCAN-SWA MKPVKAQCETCNHVFIARFHKLRLPNRVDKHFFICPNCKEEYVSYYSNRKMRQLQREISEMYGKFRKCRTEEEAELLNMKLQKKQAEYRRVRDELKTEVEGE >CP024116|2429385:2442496|2439652_2439877_-|AWC57298.1|DBSCAN-SWA MKTVNVTYFKRSGKYYTSETIEISEELNGYEALAEEIPKHHRIKEMVMLVQDSEDGKEPYIVPHLYNPKVGSFE >CP024116|2429385:2442496|2433850_2434417_-|AWC57288.1|DBSCAN-SWA MNSMSNSIINELYTCLKNDIPYRLIGADYDLRNRLERATVVDILSNYYTMDERSLKRLSDFLVNEELTDSHPDKMSREEYPFMSDTQLSRRVAGIHRKRDGKGILEVQIGLAENYGTDGRNYNRPLRRKRTFKENMYVDEQVLSRNKERRKKYSSFINGKTNGVYTVDLETGDKTVHDDKKYEEIYQK >CP024116|2429385:2442496|2436070_2436676_-|AWC57292.1|DBSCAN-SWA MTAIECVGKSDRGAFLWKFKCDCGNEVVKEGRTVKRGDIKSCGCLVVEHAKYLNYSNGFGRTKLYGVYKGILDRCNNPENKSFKDYGGRGIKVIEEWEADYLVFMEWALANGYKDGLSIDRIDVNKGYSPENCRWATRDVQANNKRNTILINYKGKTQSLKRWCKELNLNYYTIHSRITRNNYSYIDALEKPIKYRKEETK >CP024116|2429385:2442496|2435190_2435829_-|AWC57290.1|DBSCAN-SWA MKRYYLPEMDVFNRYEPKVRNKLIKGYHRKLASKHRYFVRYQVSKERPFYTDADLSEIISVLDDIEIINCRWDAKEWNITPWNYFVNSGKVYEGYKDMNAIPFAQGYSGDDVGKRTDDGFYYKYFNGNNCAYWRDRNSETPTWHLRYGNQYVNLRNDNFYVGIFGSTKETKHVPAELVLPLLKQMNAKKWRGFYDDEIDFILEQTGIERRLL >CP024116|2429385:2442496|2438447_2438843_-|AWC57296.1|DBSCAN-SWA MSDKLNELFELQSELDNRIISERNINKSIDEWVVGITLAMESEIDEIRREVNWKWWKNEKEIDKEALQGEVIDMWHFLISLSLKCGLSSEDVYRIYLEKNRENHARQDGTSSKEGYAVGQLEFDFENGGVK >CP024116|2429385:2442496|2434428_2434806_-|AWC57289.1|DBSCAN-SWA MGVSKYDNEAAHRRIEQNYALDNPKSIDLLLRHLPYMQERRFNGDYAASDILIDLETAISTADLTDRQRQVLRLVYWDDLTQEMVGERLGVRQEAVKRHIRIAVVKISRVFECWARRGEGYKLTV >CP024116|2429385:2442496|2440936_2441092_-|AWC57300.1|DBSCAN-SWA MINLSEVSTKELSEELERREGVMTVKVEPYEKIEVGGIVVNGPAIVLINQD >CP024116|2429385:2442496|2432630_2433455_-|AWC57287.1|DBSCAN-SWA MSTLRIIDVTTGEDRTQEYSLVNRKQAEGYKRAIEKEQYRLLTRGKNWVASYHDPIREVITGLTLKEAGAIIKLLPFLRFKSDGKLIKDGKPLKQQDIQRIFKRGKAATTKILNRLEELSVIHVIKEGRSNVYYISANFHTMGDVKDGESFTKLYQVKTQEIVADLDLNEVGLLYKILPFFHFQTYYLCSNPNEQDAKEIKHLNREELAEVTGHDLATISVTVNKLRSKGVIMTTNSRNSVRYLVHPDVMYRKDTEDEYTEVVRRMFAEHIAQI >CP024116|2429385:2442496|2439876_2440923_-|AWC57299.1|DBSCAN-SWA MVTKTNAAQLLRQNTQETFAYEIAEEFRQFLETWHSYSEPYDTSLDIWLHESYAKVLSKGTFLDYRSLPYFSPSSANSCPRELYEKALRSPRDQTEVKPWQRRWQFLGTSVGDAIQRDILLAERHYEKFTGEKPRFKFERTKDGYPAFEDFVKTRKVIEHNNQQFALIGTCDGILEYIDEHGVITRVGLEIKSKQTTYSKTSEYSLREPGADHVKQVTCYSLMYDLDYYIVLYMNASKKAWNMSEEDYMKYPDFRAFGVAITDDMRDEVLNKFASVVAAVKTKQPPKLDIEHWTFNNFKTACAQSLSDGEYEEIKTQVSRVKRSSLSDAKKAPYIGALEFIAKVREGM >CP024116|2429385:2442496|2436736_2437363_-|AWC57293.1|DBSCAN-SWA MLCNAKKIAITGKARSGKTELSHYAWMLYGFKEFDFSTVLKDEFHRLFPHIPRDPKPRAYYQKFGQWLREIDPDIWVKMTMDNVHKYCFEDSLNKVNHKPKVLVNGVRQPNEYQWLREEGFIIIRVNASDDLRIDRTHSAGDIFTESDLKHETESHIDTFKVDYEINNLGSIGEMYDQFDAIMRNIGVQSVSNKEIMADAFSDLRVIL >CP024116|2429385:2442496|2437364_2437997_-|AWC57294.1|DBSCAN-SWA MAEIVKIESKDGNIYEVDGKRYRELTKEPAIGDTVLVVDAWEDGEGYEEGEVHTLTKILSRNHEDVNAVRFVDKEGRNNYLKLSEFVIVEPIESETPSHLPYLSDILDDIKTKLTRLEERTEENHRNILTFSQTAESARSDASKAIGGVNALDEQLDLVREDIVFLDEKIDELKETTQTQGTPQNITININVLDIGSAKAIVESFTKGRE |
17 | Bacillus_phage(41.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2448104 : 2458901
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP024116|2448104:2458901|DBSCAN-SWA GTTAAGCACAAACAACCCTAGAATCGCTACTAAACCCACAGAAACTCCTAACAAAATCTTCTTCAAACTGAATTCCTCCCTTTTCATTTTCAATATTTACTTTAAAGTCTATAAGTGACTTGGTCAATCCAGAACGATCTCCTCGTTCGTAGATTTCCCTAGCAACCAGACTAGAGAAAAAGAAGTTTGAGTTAGAAAAGAAGTGTTGAAAACATTCATAAAGTTCTGAGAACGAATTATAGGAGCGAGCTTTGTATAAGAGTAAAAAGTCTTTTTCTCCCCTTTCTTCTATAATACTATCTATTAATTGTCCTTTTGTATTATCCTTTTGATATTCAATAAGTCTTGTGTCTGATTTCGCTCCTAATGGTATTCCCAAATAAATTTTAACACAATCTAATCTATCTCTTGCTTGTACCTTGAACCTCTCTACTCCAATCGTCTTGGCAATGACGTAACTATTATGAAGATATTTTAGACATCTTTCGTTGTCTTCATTCAAATACGTCATCCCTACATAGTATGACGCATCTGCAACGGTTTTCGCGCAAATATTGGCATTGATTATTAAAGAAGCACATTTTCTTGCTAAATGTAATTGATTACGATGTAAAAAAATGGGAGCGAGAATTTCAGCCAACCTATGTAAAAAACACTCCTTAATAAATAATTTCCTACTATCACTTAAATCTTCTATCATGGAGGATGCCTCCCGTGCTACCTCTAACATGATATGAATTTTTTTCTGAGCAAAATAATTATAACATTTAATAATGTTTACAAGGATATTTAATGTACTATCTTCCACACGACCGATCTTATTTAGACTCTTGATTAAATCAACTCCTTTTATTTTTCCCTGCATGTAGCTATAAATAATGCTATAAACGTTTATATAATCTTTAATTACTCCGTCGCTTTTTCTGTGTATTTGAATTAATTGTCTTAGTAGCTTTACGTTTCGAGTTATCGCAGCGTACTCTAAACTCTGCTGTATTGATTCAGCAGAATCTAGTTGTAAGCACCATTTCTCCATCTTCTCACGTTGTTCGTCTGGAAACAGATAATAGGAGAGTCTCAAGAGTTTTCTAAACCCTATAGTCCCATCCTTTTTAAATTTAGACATACACTGCTTAGATACTCCTATTTTTTCTGCTACACTTGAAAATGTTATATCATCTCTATCATTGATAGTATCGCATATCTCTCTATGAAACCCTAACACTTGAAAACCCTCCTATGCTGTATAAGAAAATTTTGGTATAATGTAATTATAACCCAAATGTGCACAAAAGTACACATTTGAATATTGAGAAATATTTTTCAAGGATGTGTTAAAATGATTGACTACACCCCTCTCCATGTCACACTAAAAGAAAAAGACATGGTGATAAGCGATTTAAGAGATAAAGTATTACATAGTAAAACAATTGCTAGAATTAACAGAGGAATGTCCGTACACTTAAGTACCGTAGAAGCTATTTGTTTACACCTTGATGTACCTATTGAAAAAGTAGTTAAAATTGCTGCCACTGAAGAGTAATAGTTTTAAACCTCCGATTTAAGAAAGGAGGTGATTACATCGTTAAAAGTCGGAAGGTGCCGTATTCCCGAACTATGTAAAAAGAACGGCATTACACAAGCTGAACTCGCTCTAAAAGTCGGTATTACACCGCAATCCATAACGGATTATGTCAGCCTGCGTAATTTGCCTAACGTAGAAAGAGCGCGTAATATTGCCGCTAAGCTACATTGTGACATCGAAGAATTGTACGAATGGGAAACGGAATAACATCTATTTACCGGGAAGGTTTCGTATCTTCCCTCCGACCGAAAATACGTGAATTCACGTATGATAATTTTAATCGAACTGGCTCCGCATTATCAACTACAGATATCAACGAATCCTTTCCTTCTTTTAGTAACGAGTCATTCGCATCCTTAAATTCACAAACATATCCATTTGTCAAGCGCATTTTGCCATTTAAATATTTCTCAAGTTCTTTTCGAAGTTTCTCGCCTGCTGGATCGTTATCCGCTACGATAACTAATTCTTCTATCGGCGACTTCAATATTTGCTCTGCCTTTCGTTGGTTAAACGACGAGGATCCGTTTGCCAGTCCGAAAACCCCAGCCGTCATAAATGACATCGCATCTATTTCCGCCTCACAATATACTGCCCGCTTAATATTTCGTTTATAAGCGAGATGTAATCCGTATATCAAATCTCCAATTGGCTTTCCGTCCTTTTCGTACCAGAATGCTTTGCCGCGCGTTTTCCGATACTTAATATTCGCCAATCTACCGTTTGTATCAAACCACGGAATTACCACCGCCTGCCTAAAGCGGTCGTAACCGATCTTCATTTGCCGTTGTACTTCCTCACTAATACCTCGCTGTCCTAAATACGGGTGGCGATAAGCGTATTCTTGCAACCGACCAAAATCGAGGGCCTTATGGCCGCTTTCAATCCGGAGTTTCGGCGGCTTAAGTACGAGGTTGTCGTAGGTGTAACATGTACCATATGATTCTAACAGGTATGCTTCCGTCTCTTCATAGGTCTCATTTCGCAAGTAAGATAACAATCTGGTAAAGTTGCCGCTTTCCCATTCGCTATCAAATGCACCCGAGTCTTTCCACGTACCAGCGTAATCCCCGTCTAAGTTAACGAAAAAGCTCGGCGTGTGTTCATATCGAAATGGCGAGGCTGCAATTAGTTTATCAGAAGTCCATCTTTCGTTAGTCCAAGAAAACTGCCGAAGTTCATACTCGATGTCTACATTTACGTCCTGCCCACGTATTTGAATACTTGACAAGGTGACCCACCTACCGTTCTTTTAAATTAAAACACGCTCGTAAATTGTTTCGCTGCTTCCTCTCCTGTTTCCATTTCCTTAATCACGCCAATCTGCGGCATGTAAATGATTTCGGCGCTTTCGCCTTCACCACCGTCACGACCTTTATTAATACCGATTATACCTCGTCCTTGTTTTGCATCAGTATCAACCGCAATCAATAACGCCGCATCCTCTAAGAGTGCTTTCGTTTTCTTTACTTCGCTACGTTTCGGTAAGCGTAATTCTCTTTGGCCATCCTCGTCCTCGCTGTTATCGACTTCGTCTGCTTGTGTAATAGCGAACATAACCACTCCTGTTTTACCGGCTAATCGACGTAAAGCCTTCGATGTAGCCGCTGCGTCCCCGCCTGCTGTCTTTGACGTGTTCTTTTCGTAATCTAAATAATAGAACGGGTCCACAATTACGACATCTGCATTTGTCTCACTTATATCTACTTCTAACTGTCGTAAATCCCTTCGATGAAAGTCGTAATCATCTACGCCTCGGACAACAATATTACCTGGTAGAATTTCATTGATATTCGCTAGGAACATTTTAAACCCTTGTTCAAATTCTTCTGATAGTTTACCATGACGGATTTCCTTCGAATCAAAACCAGCTTCTAAATTTATACCGTCTAGTTCGGCTACAGTCGCTCCAATACGTGATGAGATTGAAGTGTATAAGCGTACCATCCCTTCGAACCATCCCATTTCCATTAGCCAGATAAGCACGTTTGCACCTTGAAACGCCATTTCTACGCCCTCTTCGATAGTCGTTGCGGATTTACCACGCCCTGACTTTCCATAGATTGTGTATACGTTCGAGCTTACGTAACCGCCAATCGCCTTATTGATGAATGAAAATCGAGACTTCCAAATGCGATAAGACTCGCCCTTTTTACGACGTTCGTATTCTTCTAGGAATTTAGACGTATCTGCCTTCAAACTTGTTCCCACTTTATCACGAACGTCTGTTCTTATTATAACGCTGTCAACTCTATCTCGCAACCATTCTAGGAAAGAATTTCCGTCTAGTTGCTCAAATTGTTCAGGCGCTTCGTTTTGTAAGAATTCCATCGCTTCGACCTTTGCCGAATAAGACTTGATTTGTTTCGTTAAATACTCGAAACTATCCTCGACATTTGGTACGTAAGTGAATCCGTCGACTTCTGCTACTAGCGTACGGAAGTCGGGGACACGCCCGCGATTAGTTTCTACGTAATCTTTAATAAAACGATACGCCTTACGTTCAGCTTCCGTAACAAAATCTCGCTCTGTTACATGATTCAATTGTATCGGATTAGCCGTATCTATTACTTTCGATAAGAGCATTTCTCCGTAGTTCATTAACTACACCTCCAATTTACCATCTATATAAATATTGTGTAAGGCAACAAATGTACTAATTTTAGCGAACAAACCGAACGTAGTTTTGCAGTTTGATTACAGGAGTGTTCGAACCGCTCGCATTCTCTCCGCCATCTTTCGTTTCTGATCCTCGCTATACTGACGTAATCGCTTCATACTTACCTGCTTTTCACCTAACGTGCAACGCACTGCTAGCGGTTTTCCATCGTCGTCACTTTCGATAACTGTAACGTTTTCTTCACCAATTATCCCTACTAACTTACGAATGTGTTTTGGAACGCAAGAGTATGCGTTCCATTCCTTCGTTTCGTTGTCGAAAGTCAATACGGTTTCTTGTTCTTTTGTTGAGTATAAACTCATTGATTAGCCTCCTCCGTTTCTATTAAAATAGCGTTTTTGTTATAAACCATTGTATATGGTAAAATATAGTGACAACATGTTTTAAGGAGGTTTTAATATGCCACACGAAGTTTGGTTTCCTATACTCCTAGCAATATTCGTCGTATTTTTCCTTAATAAAGAGGAAAAACACAAACAATAACTTTATTTGTTCCAGCTTAAATGTATGTACGCAATATTTAAGCTGGTATTCTTTCAAATAAGGATTTTATTTTGTTTGGTTTTTCAGTAACTCTGGGTTTTCGTAGATGTTTCCAATGACTATAAACTCATAAATTTCACCGTATACACACTTTTGATAACCTTCCCCAATTTCAAAAGGTAACCATCCGAAGTTGCCCCATTTAACAACATGCTCAGCAAGTGATTCTTCTTGGAAATGAATACCTCCGTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP024116|2448104:2458901|2455266_2455941_-|AWC57316.1|DBSCAN-SWA MARSKFTFEEVKALFDSKGYDLLETDYINARTPMRCKCRQHPESIIQITAGNMRKGFGGCRQCKRQQHKYRTRTIEEVRKEFAERGYTLLETVYKNNRTKMRYTCPYHPNEKPSIAYMHFKRGVGCPSCGREKTLLARRNEFPKCTYNNIEKEEARSKVLRILNNHCFDCPFNELIRMGAVEDKCYKQCPYGMELRKGGAVLAGEDIKAVTEYYEDKFAGEALV >CP024116|2448104:2458901|2453652_2453904_-|AWC57313.1|DBSCAN-SWA MVNLTPFMYAPHYAPDKPYLVYSVNCDRPETTSGYMQGYWECTHCGEGSQFRFYDDTYHPKYIAKCPKCNKEFIAIDDTDYDD >CP024116|2448104:2458901|2452917_2453334_-|AWC57311.1|DBSCAN-SWA MREIKFDAIYKPTGEHFTPVNINFESKTTHGNFDGQVNDWCHFSLDGKYGDAILRQYTGLKDKNGKEIYEGDIVSRHDGGIHFQEESLAEHVVKWGNFGWLPFEIGEGYQKCVYGEIYEFIVIGNIYENPELLKNQTK >CP024116|2448104:2458901|2456907_2457252_-|AWC57319.1|DBSCAN-SWA MRNVKKRLQRILSELESLESDMQQTNIRKSQTDLAQQDILHTIEIETFTTARGNYLLKELKRIRKERRKAKDDQAVLQSVMHTLKGVKQKVECSIGSVTGVIERQQERKVTKGY >CP024116|2448104:2458901|2449709_2449895_+|AWC59093.1|DBSCAN-SWA MPELCKKNGITQAELALKVGITPQSITDYVSLRNLPNVERARNIAAKLHCDIEELYEWETE >CP024116|2448104:2458901|2452385_2452670_-|AWC57310.1|DBSCAN-SWA MSLYSTKEQETVLTFDNETKEWNAYSCVPKHIRKLVGIIGEENVTVIESDDDGKPLAVRCTLGEKQVSMKRLRQYSEDQKRKMAERMRAVRTLL >CP024116|2448104:2458901|2453950_2454139_-|AWC57314.1|DBSCAN-SWA MKKHELTCMMEEEDTIEFITNEKKKLINVFMKVNSSEDYTHVVINAREFLMMTDEIRKELEI >CP024116|2448104:2458901|2457381_2457996_-|AWC57320.1|DBSCAN-SWA MFKYEKNAEGQGVLTLLSEEFEQKIMPLVYQQTTNELSTQVEGGHLDDDLTEFAKHISRQTTHAVIGSMQELIIKPLVEELSFKIDQLSYTQKQQPKKRKTQPVQGEPKLTLNMSGMKVDNSKIPHEDQREKIDILHKDMCHSLKLLHPYAWTEVYNRMFLDYNINAKEILLQSKEKTRVWAVIKAGYGHKMIEAMENILRERR >CP024116|2448104:2458901|2450945_2452289_-|AWC57309.1|DBSCAN-SWA MNYGEMLLSKVIDTANPIQLNHVTERDFVTEAERKAYRFIKDYVETNRGRVPDFRTLVAEVDGFTYVPNVEDSFEYLTKQIKSYSAKVEAMEFLQNEAPEQFEQLDGNSFLEWLRDRVDSVIIRTDVRDKVGTSLKADTSKFLEEYERRKKGESYRIWKSRFSFINKAIGGYVSSNVYTIYGKSGRGKSATTIEEGVEMAFQGANVLIWLMEMGWFEGMVRLYTSISSRIGATVAELDGINLEAGFDSKEIRHGKLSEEFEQGFKMFLANINEILPGNIVVRGVDDYDFHRRDLRQLEVDISETNADVVIVDPFYYLDYEKNTSKTAGGDAAATSKALRRLAGKTGVVMFAITQADEVDNSEDEDGQRELRLPKRSEVKKTKALLEDAALLIAVDTDAKQGRGIIGINKGRDGGEGESAEIIYMPQIGVIKEMETGEEAAKQFTSVF >CP024116|2448104:2458901|2449442_2449646_+|AWC57307.1|DBSCAN-SWA MIDYTPLHVTLKEKDMVISDLRDKVLHSKTIARINRGMSVHLSTVEAICLHLDVPIEKVVKIAATEE >CP024116|2448104:2458901|2456667_2456826_-|AWC57318.1|DBSCAN-SWA MQLHDLLLKEIYIEALIRRNVFKTEDGRDLWQASNEELHAQLFDEEGQNDFT >CP024116|2448104:2458901|2449902_2450919_-|AWC57308.1|DBSCAN-SWA MSSIQIRGQDVNVDIEYELRQFSWTNERWTSDKLIAASPFRYEHTPSFFVNLDGDYAGTWKDSGAFDSEWESGNFTRLLSYLRNETYEETEAYLLESYGTCYTYDNLVLKPPKLRIESGHKALDFGRLQEYAYRHPYLGQRGISEEVQRQMKIGYDRFRQAVVIPWFDTNGRLANIKYRKTRGKAFWYEKDGKPIGDLIYGLHLAYKRNIKRAVYCEAEIDAMSFMTAGVFGLANGSSSFNQRKAEQILKSPIEELVIVADNDPAGEKLRKELEKYLNGKMRLTNGYVCEFKDANDSLLKEGKDSLISVVDNAEPVRLKLSYVNSRIFGRREDTKPSR >CP024116|2448104:2458901|2454502_2455267_-|AWC57315.1|DBSCAN-SWA MQCILSDHCSLYKSESCNRQCPSYIALHGFNGKGGRMAATNLPKEYRHLTLLNSPVKDTQPKVYKSIEAYVTTFSRQFEADEATDVKDKIKSMYLFSEETGTGKTTTAAVILNEWLIRHYIGSLQRNRQSLQVPGYFLDVNEWQTLFNEFNRSNIPRETAEKSAKEYYRRMTNAKTAPFAILDDIGVRSATEAFRGDLHAVINHRITNGLPTVYTSNIPIDELESVFDRRLYDRVRDLCVVLPFEGDSKRGMRR >CP024116|2448104:2458901|2453354_2453606_-|AWC57312.1|DBSCAN-SWA MGLFKERLKELCLMIIAFVILCVIGLIFVSPLFILDSIHEGWGGLVYMVVILSIVAISVIYNACKFIYWLLIEPFKNMRNQTK >CP024116|2448104:2458901|2448104_2449328_-|AWC57306.1|DBSCAN-SWA MLGFHREICDTINDRDDITFSSVAEKIGVSKQCMSKFKKDGTIGFRKLLRLSYYLFPDEQREKMEKWCLQLDSAESIQQSLEYAAITRNVKLLRQLIQIHRKSDGVIKDYINVYSIIYSYMQGKIKGVDLIKSLNKIGRVEDSTLNILVNIIKCYNYFAQKKIHIMLEVAREASSMIEDLSDSRKLFIKECFLHRLAEILAPIFLHRNQLHLARKCASLIINANICAKTVADASYYVGMTYLNEDNERCLKYLHNSYVIAKTIGVERFKVQARDRLDCVKIYLGIPLGAKSDTRLIEYQKDNTKGQLIDSIIEERGEKDFLLLYKARSYNSFSELYECFQHFFSNSNFFFSSLVAREIYERGDRSGLTKSLIDFKVNIENEKGGIQFEEDFVRSFCGFSSDSRVVCA >CP024116|2448104:2458901|2458007_2458901_-|AWC57321.1|DBSCAN-SWA MSSSLIELSNDINVITAEINAYQRVAGEAIFEIGRRLHEVKYNPEKYGLPKGIDVEGRAIVARGAWGRWLTSVNIHERKAQRFIKVFKRFELTDTGVGLPDSLSVLEVLTDFDDEELEKPREMPDGSTKKLTEMSRREIEEFKRRERRVIEEKEAAVRAAEEAERRAEQAEEDKRKLGQLLTEERNKTPEVQYVKDTESEEQLRLYRERYGEISENVYRITNETEISGMVMEFSEHTRDFIKQYAFLKHYEGEFHALNRRSKAEYESTLNALRDFLNDVQRVVEYSKTNEQVIIDIK >CP024116|2448104:2458901|2455956_2456343_-|AWC59094.1|DBSCAN-SWA MKRVSTKDFRNLPIEKWNVTTFREYLKHEHEERYKIPYVTRSYAMEGRMLKTFIAEYKPEATKQFIDACFADYKPTREYPGLNFAFMYSYMRGRILPRVLDELRREEAKLQRQTEVMEVSTEEIIDYL >CP024116|2448104:2458901|2456348_2456681_-|AWC57317.1|DBSCAN-SWA MILRKFPVVGRYRNYEIEIEEVTFINTFYQVRIYLPLTRNILGLTFRRRRMLYGVKYAKVERAGEFVEIAKESVNKYESFLDKQIRVETLHETGIDDFKHWDGLVEEATK |
18 | uncultured_Caudovirales_phage(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2620588 : 2636069
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP024116|2620588:2636069|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP024116|2620588:2636069|2632721_2633558_-|AWC57484.1|DBSCAN-SWA MTDQLTVANELHILGKQYIAGYEFTGIEGGFGEGKKAMLVKEIAEIHEKEVKHINLRINENRSRFKDSIDIVDLKVSPFGGPSLEQLGFTKQSIANSKNIYLLSERGYAKLLKILEDDTAWELYDQFVDGYFNMREQQPRVLNEKESLLANMQATILLNEEVSTMKEDMNSVKAEVKDLKENTPLYATECDEIVKTVNKTAVRLLGGKQSNAYQNKSTRGKVYKDIYRELRRHFDVKSYKAIKRRYLEASKKKIVEYELPIVLSEEIAQVNNQLTAEL >CP024116|2620588:2636069|2621045_2621261_-|AWC57462.1|DBSCAN-SWA MINNLISFLLESSKWAEYLKVFTALFTTYRTVKVITSQVKKRFKKKTKKKKRPRRKGKRVLPRRLPKRIRR >CP024116|2620588:2636069|2624535_2624742_-|AWC57469.1|DBSCAN-SWA MKKDIKKLIELIWSDATDDEVVNEVISFLQSEDVNNGYKVDLLATLAERANHNYYVDKMREFDERNSQ >CP024116|2620588:2636069|2626610_2627399_-|AWC57474.1|DBSCAN-SWA MSKFKKGDRVYFMSYGEKRVGTFDHQDDWKGWCLFDGNDVLTFAAIEDLRLLEEETMKTYTGFEAIERMKTHWITTQEKGCAWKIKEDEIWKRFDDTEWTATELINFFFRNEFIDYVEPLKFEDGEMFVMEMENAKWYAVFGSEDDYKYNVKISYPVNTMRVYEGGFLWKGDDCTFRKPTDEELEEFERFMVFHKKGRKMDEFKLGDIVEREDALYIVVNQTEDNKFERVIGCVEINDDDAPVKYFPTNDVELRFCMEDAVG >CP024116|2620588:2636069|2621591_2622059_-|AWC57463.1|DBSCAN-SWA MQIAYLEVLHMEEATLNLEMKELDRKASARKALRALRKYRMYMLSVDDEYLPKVTATYSLTPPSRTNQFHSSTENIIEIIDREREKESYMNRIWKGINRLSAEYRKLIIEKYMGRDELFDFEVYNKMGISKPNFDRKKRKALSDLACALGIEVYK >CP024116|2620588:2636069|2633554_2633743_-|AWC57485.1|DBSCAN-SWA MDKTFGVKVKMWLFVNGIKQEELAKMLNISGPYLSDILLGKRDGKKVKEKINRILESEEIAQ >CP024116|2620588:2636069|2623040_2623238_-|AWC57464.1|DBSCAN-SWA MNRMSNSSNYLIIVMSLFYSIYLRDIIQEGALKTTLDILLILVLIFCIVDTVLRLYRFFKNRRGE >CP024116|2620588:2636069|2634911_2636069_+|AWC57488.1|integrase|DBSCAN-SWA MASFHKYKKKGSNKDFWEYRIRYKDSITQKYKEKCKKGFTSKAEAKIAAEEMEKQLREGFEQTDESLKSYLETWLYEYKKGTVAKNTLSLHQNSIKNHIVPYFKNIPLKDIKPILYQKFINHLTEKGYSRRTIEIVHGTMHNAMEKAIILEKIAKNPCTGAEIKLKKKESKIQFIESEHISDFLREAYRYDYIYWLFFKALIETGMRKGEAAALQWTDIDLKERTININKSLDFQVAARNPDMMFGDTKNYNSKRIITISQGLANDLLFHKKYQNQNKVALNDSYHFDLNLVFCRNDGNYMPKSSLFNSFSRILKKANLPSLPIHSLRHTHAVLQLEAGVSMKYLQERLGHGSVQITSDVYSHISKKIDRDAMNKFEEHMQNILE >CP024116|2620588:2636069|2634015_2634435_+|AWC57486.1|DBSCAN-SWA MGITEIIKQLCQKRGISISKLEEELGFGQNTIYQWKKRTPSVERVQKVADYFNVSTDYLLGRTKNKYWELTEKDEKDIQKKLEELIEDMGNADALAFSKGSEPMSEETKQLLIISLENALRLGKQMAKKKFTPKKYRDE >CP024116|2620588:2636069|2624783_2625026_-|AWC57470.1|DBSCAN-SWA MKFWALAYQYQEDVFYDFAKEENTMDLSESCLLPTKEVAEDFISQQLDDDYVPVEIELETLQKNGILSWSRGRVERWDEE >CP024116|2620588:2636069|2627564_2627780_-|AWC57476.1|DBSCAN-SWA MSITVMRPNVHITSVSSWGMVFTLPPSKNAHTREEYVETTGKWIEEQLKEREKQIIDIDKQKEVYLQCEIS >CP024116|2620588:2636069|2631636_2631876_-|AWC57481.1|DBSCAN-SWA MAKTEEMLLVEKMNQAVNNQWKAMLNNDRQGFKYFAKEHLCLSKKLEVLELEKELTEDLNNYLNEKEKTPVAAGVQNQK >CP024116|2620588:2636069|2625323_2625962_-|AWC57472.1|DBSCAN-SWA MTKVTVELTTKQEEFLKLFAEKQYDDAEDNVCTSDPIHVVQKRRKQYIPYSLDLEGYFDNSTLEFCTDSDRELWHDNEVEAVESFYEWKDEECPIEVRSFENLQYEDVESVNGKMVFVSDIYDYFKVYGIEDELALAWVETEWENEAFFFILDEAKRYQKYQAHNLGRSRIYTYSAGYDNRGDFVHFRNLLMKIGQELNKQSQEETEVVAVK >CP024116|2620588:2636069|2625993_2626197_-|AWC57473.1|DBSCAN-SWA MSEFQGKKIKIISSDSKQNWYNDKIGETFIVNSLCSRNKDNLIVRTKIEQSGWKYGWVSKKDCVFVN >CP024116|2620588:2636069|2623986_2624274_-|AWC57467.1|DBSCAN-SWA MGKSQRDKGARREREFASLIGGERVPLSGAMQGYANDVKGLGLEWEVKARKDGFKTLYNWLEDEREQPDALAIKADRKPWLVVMPLDTFLKMVRE >CP024116|2620588:2636069|2634449_2634875_+|AWC57487.1|DBSCAN-SWA MVSKQQINLKIDELLRRYNTRDPFFIAEAKGIVVITENLGDIFGYYHKVSRIPFIHINERLSYQNQVFTCFHELGHAIFHPDENTPKLSLVSLCSEIRIEAEANYFATRFLIDGSHHDYYIQTKQQLLQYYGIPKEMERFI >CP024116|2620588:2636069|2632419_2632695_-|AWC57483.1|DBSCAN-SWA MLNIQIDETVVKELCVEEIRKKMKEYDAELAFWDTKELKKRVCMSWNTIQDQFFFDPRFPKFKVGQKWYFPAKQTQKFLLEWAEEKMVGKK >CP024116|2620588:2636069|2622796_2623072_-|AWC59100.1|DBSCAN-SWA MDFSRIEGVNKMYKFANKNELLSFLQEEVLTTPEVMDVLGVSKSRISKMIKDGKLVPFKKMERVSLFLREDIEEKKKELEVLRVKYRPYDE >CP024116|2620588:2636069|2627790_2628663_-|AWC57477.1|DBSCAN-SWA MYQKKLEEESNQPITEDSQKQSVECKKCGDRGYIFEKQPSEFLNGKYVDVAIECECLERKNLKARFKNAMIPSEFENARFDNYVRETAVQQTLYNAMVEYLKIFNEIRDSKINSIGFIAEVGETKLKALPPGERNQMRQANNSYGLGKTHLQVAAAKYALNHFKVTDKHTGRPRGVRVLCVQDVNIMAEIQSAAFLNDNKKRLNELLHDLCTCDILIWDDIAKSKYSEFKEDMYYKIINERYLYNLPIWYTSNEDLDTLEDKIGFAAADRLFGMSKDYLYQVKGASYRTT >CP024116|2620588:2636069|2623311_2623503_-|AWC57465.1|DBSCAN-SWA MAKLALILGLILTGLTIIEKVLVIYEKVLGLYKKVKKLKIKRKRRPRRKRRPRRKRQTRRKRK >CP024116|2620588:2636069|2629631_2630486_-|AWC57480.1|DBSCAN-SWA MSTNETLKQQMVAQQTTGVSTETNLNKQLKLMFKDSFKTIESVLPKHMTPERLIRVGLNATTRNPALLECAPETIVGAVVNCGSLGLEPNLLGHAYIVPFYNNKTKRKEAQFQLGYKGIMELVRRSGEVKAIYAHEVYEGDEFEYEYGLEKNIVHKPCGEEDQNKITHFYAVYKLKDGSYDFVVMSRKQVESHRDRFTKSQKNGAVFGPWKDHFVEMAKKTVIIKLLKSAPLSIEREESRQVIEAANQDNGIMKVKENNTGVEADAGFIDVEYAEVSENENHNS >CP024116|2620588:2636069|2623601_2623982_-|AWC57466.1|DBSCAN-SWA MLDIELPELNKEETKKNVLKALKKYRLFLSSITEEIIERVKNDETEGISEKNIKRAEFILDIRKGVSKLNLYDKQLIELAYLGKEKHSWVKMCRVLNMTQGDYYRKRNKAFYELAYKLGIEVEENR >CP024116|2620588:2636069|2632202_2632385_-|AWC57482.1|DBSCAN-SWA MQNYLVINKTTFATSVYECETQEEVKEIVSQLIEKGAHPAAIRVTQEIPVDITVKVDVEF >CP024116|2620588:2636069|2627391_2627580_-|AWC57475.1|DBSCAN-SWA MRDQLEKLIEELKLSQSLLGSRSLNLLDDGDLEKYGYYNGQRVVCERMQKKLEQILEGEENE >CP024116|2620588:2636069|2629381_2629651_-|AWC57479.1|DBSCAN-SWA MKTIIRDGSIPLALNKSSRTRYLRDRRLSELIKRCRRLEKEGFDYLFPIRKVLETVRHEKDENPHLFKGCFVLDRDRGFYYEVVMKKVK >CP024116|2620588:2636069|2620588_2620798_-|AWC57461.1|DBSCAN-SWA MYNFKNDEELSKFIAEEIVNTSEAIEILGCTRQNIAYLVTNGRIKPIKEMARDRLFFKKDILKWKELNK >CP024116|2620588:2636069|2628592_2629381_-|AWC57478.1|DBSCAN-SWA MGIYRVVKDSNYTTINNTGLKDERLSWKAKGILAYILSLPDDWVFYREELATHAKDGLDSLRAGMNELKEHGYLHRFPVKDDKNKIVKWETVIYEIPKKEPVAEIPLVEKPLVEKPPVENPELLNTKEPNTKELNTDINKYIVEIVDYLNDVCSSSYRSTTKKTQSLIKVRLKEKFTVDDFKKVIDVKHAEWTGTSRAKYLRPETLFGTKFESYLQQWELWKNGKTRGYNVGSYGKGADHVPEEARRGIKPADNRGFAKTIG >CP024116|2620588:2636069|2624303_2624504_-|AWC57468.1|DBSCAN-SWA MKCQHKWIDMEDGTNDKFCVKCSQKAKQMQITLPISLPISINADEWEAEFYRKRGIGIDSIRNSKK >CP024116|2620588:2636069|2625055_2625283_-|AWC57471.1|DBSCAN-SWA MSSGCILGECPICDELIFEDEIDFDQYNNMVHRRCLNLRNNNSKTIHLLHQEIQRLEKRIKELEEQNKSGQMTLF |
29 | Bacillus_phage(72.73%) | integrase | attL 2632303:2632317|attR 2638827:2638841 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2818261 : 2892229
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP024116|2818261:2892229|DBSCAN-SWA ATTATTTTACATAATTCTCTTTTACAACAGTCGCGCAACGCTCACATAATGTTTTATACTCGTTATCGTTGCCAACTGTTTCCGAAACAACCCAGCAACGTTCACAAGTTTCACCGTTTGCTTGTGTAACAAGAACTGCCGTATGTTCATATTTTTGTGCATCCGCTGGCGCTTCCTCTATCGTTCCACCAAGTTTATATTCAGAAACGATAAATAGTTGTTTTAAATCTTCTTGAATAGATTCTAACATTTCTTTCATTTCTGCTGTTGGGAATAATGTAATGCTAGCCGTCAATGATTTACCAATCACTTTCTCATTACGCGCCACTTCTAGTGCTTTTAATACGTCACTACGAAGCGTCATAAATGCATCCCATTTTGTTTTTAACGCTTCCCCATCTTGTAATTCGATAGCTTCTGGCATATCTGTCAATTGTACGCTCTCTTCTGTAACACCTGGAATATATGGCCACACTTCATCAGCTGTATGAGGTAAAATCGGTGTTACAAGTTTCGTTAACGCAACAAGAACATCATATAACACCGTTTGAATTGCACGACGATCATGATGATTTGCCGCTTCAATGTATAAAATATCTTTTGCAAAATCTAAATAGAATGAACTTAAATCGATTGTACAGAAGTTATGAATTGCATGATATACTGCCGCAAAGTCATAAGTTTCATACGCTTCTTTCACTTTCGTAATTAAGTCATTTAATTTCACTAACATATAGCGATCCACTTCGCGAAGTTCCGCTTTTGCTACTGCATCTTGAGCTGGATTAAAGTCAGCTAAGTTTCCTAATAAGAAACGGAATGTGTTACGGATTTTGCGATATACTTCTGCAACTTGTTTTAAAATATCATCTGAAATACGTACATCAGACTGATAATCAACAGAAGATACCCAAAGGCGTAAAATATCTCCACCTAGTTGGTCCATAATCTTCTTCGGTACAACAATGTTTCCGATTGATTTACTCATTTTGCGACCTTCACCATCAAGTACGAAGCCATGGCTTAGCACACCTTTATATGGTGCTTTACCTGTTACAGCAACAGCTGTTGATAATGAAGAGTTAAACCAACCACGATATTGGTCAGATCCTTCTAAATATAAATCAGCTGGACGTTGCAAGTCGTCACGTTCTTCTAATACAGCTTGGTGAGAAGAACCAGAATCAAACCATACATCCATAATATCTGTTTCTTTACGGAATTCACCATTTGGACTAGATGGATGTGTGAATCCTTCTGGTAGTAAATCTTTCGCTTCGCGTTCAAACCATACGTTAGAACCATGTTCACGGAATAAGTTTGCTACATGATTAATTGTTTCATCTGTAATAATTGGATCATTATTTTCTGCATAGAACACAGGAATTGGTACACCCCATGCACGTTGACGAGAAATACACCAGTCACCGCGGTCACGAACCATATTATGAAGACGAGTTTCTCCCCACGCTGGTACCCATTTTGTTTCTTTCACAGCTTGTAATAATTCACTACGGAATGCCTCAATAGATGCAAACCATTGTGCTGTTGCACGGAAAATAATTGGTTTTTTCGTTCTCCAGTCATGTGGATATGAATGCGTAATAAATGTTAATTTCAGCAACGCGCCAACTTCTTCTAATTTTTCCGTAATTGGTTTGTTTGCTTTATCATAGAATAAACCTTCAAATCCAGGTGCTTCACTTGTTAATACGCCTTTATCATCAACTGGACAAAGAACTTCTAGACCATACTTTTGCCCTACAATGAAATCATCTTCCCCGTGTCCAGGTGCTGTATGTACACAACCTGTACCAGCATCTGTTGTTACATGCTCACCAAGCATAACTAAAGAATCGCGGTCATAGAATGGATGTTTTGCAACTGTATATTCAAGTTCACTACCTTTTACTGTTCTAACAACTTCAGGGTTTTCCCATTCTAATGTTTTTGCTACTGTATCAAACAGGTCAGAAGCAATGATATATTTTTCATCATTTACTTTAACGATGCTATATTCAAGTTTTGGATGAACAGAAATACCTAAGTTAGCTGGCAATGTCCAAGGCGTCGTTGTCCAAATAATAAATTTCTCGTCACCTTCTAATACGTCTTTTCCATCTTTCACTTCAAATGCAACGTAAATAGATGCTGATTTTTTATCTTTGTACTCAATTTCAGCCTCAGCTAAAGCAGATTCACTCGTTGGAGACCAGTAAACAGGTTTTTGTCCCTTATAGATATAGCCTTTTTTCGCCATTTCTCCAAATACTTTAATTTGTTGTGCTTCATATGCTGGTTCCAAAGTAATATATGGATGATCCCAATCCGCACGTACACCAAGGCGTTTAAATTGTTCACGCTGACGATTTACTTGTTCGTATGCATATTCCGCACATAATTTACGGAATTCTGCGACCGGCATTTCTTTACGCTTTACTCCCTTATTCGTTAAAGCCTGCTCAATTGGTAAACCATGCGTATCCCAACCTGGAACATAAGGAGCACAATAACCAGTCATTGATTTATAGCGTACAATAAAGTCTTTTAATACTTTATTTAGTGCGTGTCCCATATGAATATCACCATTTGCATATGGAGGACCATCGTGTAATACGAATAAAGGGCGTCCTTTTGTACGTTCTTGTACTTTTTCATAAATGTTCATTTCAGCCCATTTTTCTTGTATTGCAGGCTCACGTTTTGGTAAATTCCCACGCATTGGGAACTCTGTTTTTGGCATTAGTAATGTATTTTTGTACTCCATGCTCAATTCCTCCTTACATGTATCATAAAAAGACTTAAAAACGAAATAAAAAAGAGACTTTCACATCCCAAAAGGGACGAGAAAGTCTCCCGCGGTACCACCCTATTAAATCATATACGTATGCACATGATTCACTTTATATCCTTAACGCGAATATACGCCTACGCTTACTCATTTTTTCAGCGCGGAACTCCAGGGTGATTTCCCATTTATCTCCTTATCCTGAGCTCACACCATCCTCAGTTCGCTTTATAAGGGGTGAAAAAGGTACTTATCCCTATCTTCGTTTTTCTTAATCAATATGTTGTTTAAAATTATATGTAATAATGAGAAAAACGTCAAGTTTACACTGTTTCTTCTTTTTTCAACAGTTCGTCCACTTCGTCTTCTAATTCGATGAGCTTGTCCCAATCGTCGTTGTTTAACATTTCAAGCTGTGTTTCTAGCAACATGCGGAAACGAGTACGAAACACTTTTGCTTGTTTCTTTAGCTCTTCAATATCAAAAGCAACTTTTCTTGATTTCACTAACGCTTCATTAATGATTCGATCCGCATTTTTTTCTGCTTCACGAACGATTAGTTTTGCTTCTTTTTGTGCATTGCGTTTTACTTCTTCCGCCGCTTCTTGTGCTACAACAATAGACTTATTTAGCGTGTCTTCAATATTAGAAAAATGATCTAGCTTTCCTTCTAATTGAGCAACCTTCTCTTCTAAAGCTTTCTTTTCACGAATGACTAATTCATAATCTTTAATGACTTGATCAAGAAATTCATTCACTTGATCTTCATCATAGCCACGAAATCCGCGACTAAATTCTTTATTATGAATATCTAATGGTGTTAACGGCACAAAAGCCACCTCCAAGTAGTTATCTAAATTTTCCTCTTTTAATTATATCTTTTCTTCGACAAAATAAGAGTTTTTTCCTTCTAAAAAATCAATCATTTTAGTATACCATACAAAACTCGCCATTTGTCTTTTTTCGTTCTTCCGTCGACCGAAAACAATTTACTTCTTCCATGTCCTCTGACCGACAGAATATCTCCTGGAAGACATTCATATGAAGTTTGATCTACAACTTTCCAATTCACTTTTACAAGCCCATTCTTTATAAGGGGTTGTACTTTTTGACGTGATAGATGCAAGATTTCAGCTAACACGACGTCTAAGCGTAGTGATGAAACAGTTCCAAATTGCTCTCTCCATTCATCCTGCAATTGCAAAACATTCTCTGCTGATACACTGAAGAGAGAAACCTTTGTTTTTCCAATTGATTGTAAGTTCATTTCAATATAAGAAACAACTTCTTTTGCGACTACGATTTGGACACGATTTTCTTGAATAAAAATATCACCGTACTTTTCTCTCTTTAAACCAAGGGACATAAGTGCACCTAGTATTTGTCTATGTTCAAGCGTATAAAATTTGGAAGGATAATCAATTTCTAATACTTCTACTTGAAATTCTTCTTCATTTAAAGCAAGATAATCTGGATAAATAAGTGCCCTTTTTCTCTCCGCTTTTGGCGCTGCACCATTAAATTGTAAAGAAACATCTCCTTGCTGTCCAACTATTGTAGTTACAATTTGTTGCTGACGCGGATCAAGGAAATCTGTTAATTTTACTTGATGGTACTCTTCTACTGCTCGTTTCCATTCCAACACTTTATCAACAAAACTGGCCTCTTCAGGCCTAAAATGTTCGTAAATGCTCATGCATGCAACCTATCTTATAAAAAGTAGCCAAATAAAGTGACTAAGCCGCTGCTAGCAAGCTTTAATGCAATAATTGCAACGATCGGAGAAATATCAATTACACCAAGCGGTGGAATCACTCTCCGAAATGGCTCTAAATACGGTTCGCAAATGCGTGCTAAAAAGTCACCGACTGCTGATTCTCTAGCGCCTGGAAACCAAGTTAGAAGAATGTAGACAATAAGCGCCCAGGAGTAAATTTGAATGACTAAGAGCAAAGCTTTTAAAATTATAAACATGGCGTATTACCACCTCTTTATATTTGTCTCTTCCTCTTCACCGAATAACTCGGAAATTGCTCCAACAATATCCACATTCTCAGGTGTACACATAAATGTTTTTGGTCCTAACTTTTGAATATCCCCGCCTATAGCGTATACAGTACCACTTAAAAAGTCAACGATGCGTACTGCTTGATCGGTAGACATTCTTTGCAAATTAATGACTACAGCACGTTTTCCTTTTAGATGGTCTGCA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85 | Bacillus_phage(77.78%) | capsid,portal,integrase,tail,protease,tRNA,holin,terminase,head | attL 2849804:2849821|attR 2898950:2898967 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3162416 : 3197830
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP024116|3162416:3197830|DBSCAN-SWA 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>CP024116|3162416:3197830|3193519_3193753_-|AWC58050.1|DBSCAN-SWA MAKTEEMLLVEKMNQAVNNQWKAMLNNDRQGFKYFAKEHLYLSKKLEVLKLEKELTEDLNNYLNEKKTPVAAGVKRK >CP024116|3162416:3197830|3176143_3176560_-|AWC58025.1|DBSCAN-SWA MSWRYESKIEQAIKKMQAAERIAVKRGSEYVKGNAVTYSRKRSGDTARGFETKVAMEGNIPKGVIYNNKDNAIYEEFGTGIYAEKGGRKTPWVYKDKRTGKFYRTRGKKGTKAFRNAGENHKSETARIMISAMKGGMK >CP024116|3162416:3197830|3184289_3184670_-|AWC58035.1|DBSCAN-SWA MLDIELPEINKEETKKNVLKALKKYRLFLSSITEEIIERVKIGETDGISEKNVKRAEFILDVRKGVSKLNLYDKQLIELAYLGREKHSWVKMCRVLNMSQPDYYRKRNKALYELAYKLGIEVEENR >CP024116|3162416:3197830|3189542_3189725_-|AWC58045.1|DBSCAN-SWA MKANQDIRTAITEAGVKYWQVGEMVGVSPNTFTVWLRKELPREKKELIFQAIEKAKKEFL >CP024116|3162416:3197830|3179787_3181143_-|AWC58031.1|portal|DBSCAN-SWA MLTFEQARLLYTRFKTEEKAFKRLQKLYDYYVGEHEIMKKAERKSNKTYRIVHNFAKYITTISTGYFLGSPVSYVYSKPQFEKALNILEDNDEETVNYDNAVNCSIYGVAYELQYFDEKGEYNFVDLDPRNVITIDDGRVKPTITDAIVFSETLLKENEYKVRMDIYDDKERATYEFIHKVAEKTDVDIPYELVERVPHGFDKVPIIKYRNNKFELGDWEDCVALMDAYNHAVSGNVEDLADFTDAFLKLRNMVDTQRDDIQRAKDDKVFLLDEDGDADWLIKNVNDTFAQNIKKGLRYDIHKFSFVPDMSDESFGSNLSGVAIKYKLLALEQVRGQKARMFRKALTDRLDFINRYVGMTNSDFFDHRDVKIQFAPNLPPNLLEEADLVQKLQGILPEEVLLSLLSFIQDVKQVKEMKKKEDEEKFETYGFGQTDQEDQQTNEVADTNADN >CP024116|3162416:3197830|3189324_3189540_-|AWC58044.1|DBSCAN-SWA MSITVMRPDVHITSVSSWGMVFVSSPSQNAHTREEYVETTGKWIEEQLKKHEKQVIDIDKQKEVYLQCEIS >CP024116|3162416:3197830|3186451_3186694_-|AWC58040.1|DBSCAN-SWA MQVINLYQSNTFVGVINQVATPLQEGDIVEVINKYHDPTTVGDWVYSVRIMKTSNKELAKHNLNGIRLVACYKVDVLPKP >CP024116|3162416:3197830|3163300_3163741_+|AWC58015.1|DBSCAN-SWA MNIELPFRFTRNTMYNFLGRVISDGQPVEQEITLDFTNLDYIEPVAITILSNTLQWLDKNDIVTRFRLPNQSQIGSHRNCPIKYLDDSMFFKEYLGTPLTPAAKIRPTTRPLELINYSKSHFWIEQNKSIQLLNIVFNSKHLKKKR >CP024116|3162416:3197830|3165088_3165394_-|AWC59131.1|DBSCAN-SWA MPFMGRVVDLERTENGITVQIPFDMLDNAGLEMGTNKVEVWREVHDGTICIRVATICDICKKGARLYELDLGFVKRMVCAEDYKKIVGEYPKENEDTEQAE >CP024116|3162416:3197830|3182445_3182877_-|AWC58033.1|terminase|DBSCAN-SWA MKLTPKQQAFCDYYIETGNATEAARKAGYKGGNLNRIASENLSKLVIQQYIEERMAEKDEERVASQDEILEFLTKVMRGEMTEQVPVGQGEGYFELQDKDTYVKDRVKAAELLGKRYMMWTEKKEVEVTVPTFVDDVPLDDDE >CP024116|3162416:3197830|3176543_3176903_-|AWC58026.1|DBSCAN-SWA MRSRGITRLIKKFGIDVTVYRKEKSSGPYNRGKYKKESSLKGIVDETLQGGDVGMSYQKVTDDINAVLYCFPTDIRKGDVIVAKNKYYNVKKAANPMSADDHLEVALEETEIKPDELAV >CP024116|3162416:3197830|3176884_3177223_-|AWC58027.1|DBSCAN-SWA MITTKENVKKILRIKNDEQDDLIELFIPMVDSFIRRYTGNDFENGYPADYEIIAIRLVGYHLFSTDEDKQDGVKSERLGSHNVTYATDEEQYPKHLLKGLRKRLRTLCDPEE >CP024116|3162416:3197830|3186741_3187287_-|AWC58041.1|DBSCAN-SWA MAKTEITVEMERQIYSATTCNQGVFGCFEVTIGWFGKERVDYLTYDTKGIWRCYEIKVSLSDFRSKAHKTFVGHFNYYVMPEELYEKVKDEIPKHIGVYVGKTLMKRARKQKLAVDEEVLKDSFIRSLYREADKVLRSNNPSIVESLQRQLRNERKQKEEYRSKYQEERRKYEPRSKRVIQ >CP024116|3162416:3197830|3163815_3164637_-|AWC58016.1|DBSCAN-SWA MGHIVDISKWNGDINWPIAKQYIDFIIARVQDGSNYVDPLYKGYVQAMKQHGIPFGNYAFCRFVSENDARIEARDFWNRGDKSATVWVADVEVKTMNDMRAGTQAFIDELRRLGAQKVGLYVGHHMYAPFGMANVKSDFVWIPRYGGNKPAYECDIWQYTETGHVPGIGKCDLNKLIGNKSLAWFTNQTVEKQEGVGIKVDKFNKVVSYEFGTALVPEMLGMMDALGYESRIISYGDKQGLVRFETAYRQGNELDRATAWLDAKGIDYVYTQE >CP024116|3162416:3197830|3177259_3178102_-|AWC58028.1|DBSCAN-SWA MPIYLTEKFADKIDERFSTGALATPGVNNDYEWVGAKTIKITSVNTVPLTDYKRDGASRFGEAKELENELQEMTLTQDKAFTFTIDKMNEEETKMKAGEALARQLREVVIPHIDTYRFAKMAELAGAIVEGNLDAKTVYNAVITATETLDEAEVPENRVIFATPAVIKHLKESEGYVKASELAQSKIVFKGQVAELDGMPVVKVPSKRLGANFIVCHKSATVAPIKLAEYRIHLDPPGISGSLAEGRFYFDAFVLNNKKNAIYVHKKKAVTETKSASKAS >CP024116|3162416:3197830|3187641_3188214_-|AWC59133.1|DBSCAN-SWA MIKLHEITEVEKKQTFDITELFEMQKELDKRIGYKGNDKADMLFRALLVEIGEAWNETRAFKMWSTGFGVPKSGLLEELIDGLHFLMNIVIELDKCTWRHELIHSFCIQSIMKKNTKNVNMLFEWYMQDILTAKRAWCQYSDLTTTMGHLRRAFGIFFRICYLYGFTYEDIVHSYKEKNAENFERQDNGY >CP024116|3162416:3197830|3184674_3184962_-|AWC58036.1|DBSCAN-SWA MGKSQRDKGARREREFASLIGGERVPLSGAMQGYANDVKGLGLEWEVKARKDGFKTLYNWLEDEREQPDALAIKADRKPWLVVMPLDTFLKMVRE >CP024116|3162416:3197830|3175766_3176147_-|AWC58024.1|DBSCAN-SWA MTDLIEYVDKFLKDIFEPYEADVYYQEADKEVIKLPYVVYDSQSDAISRVREDFVFTVHIWGHEADILIQDEASQKIKDYIKDGTLKTQCAPMTIAVDFIGRSDVPVEDQQIRVKEVRFRVRYYDM >CP024116|3162416:3197830|3175116_3175749_-|AWC58023.1|DBSCAN-SWA MAAPRPNPYALVLGEGAIIMNFGIKGKEVPLGALKGGGSFTYEPEFKAVEYNGSKGDTKGFKRIISSKTQMKTGGLLEFFDPKKVVNFFPGAEVSEVKKTVDGKEKTYSVITSREKVTMDSYLENIAFVGETADGRDVIIIVLNALNDSSIEAAFEGGEEMAPEATFTGHRDPCDLDKAPFEIWIEGGGKEFVCDLPPEAAAKVNALEKK >CP024116|3162416:3197830|3171398_3174326_-|AWC58020.1|tail|DBSCAN-SWA MEVFKMFGSVFLRDEKARKGLKDLDSHAAKTSKGMGDKFGSLGGVFGKLGVSISGTVASMVAMTGAVVGVGAAIAGAVSVGMDYTKQMSKVEALSGSTGLQMAELGANARKLGAETRWSATNVAEAYEYMALAGWDSNQMIAASKPLLDLATAGALDLAKASDIVTDTMTPFGMAAEEAGRAADVFAVAQSSANLNVEQLGETMKYAAPQAATFGMDLEQTSAIAMIFANSGIKASMAGTALRAGLSRLAAPPKAAAKALDEMGVSVKNADGTLRPMRDIIADMAPKFNNMANAQQIAAAKAIFGEEAYAGWVQVLKGGVDQFDDFTEKLYTSEGAASVMADVMANNLSGAVDGVKSRAENLGLVIFSHLEPALVGATNGTNSLIKSFTDFLDPSGRAVEAAKLMQSEEQKLAQTKAILQNKVAQGKMSQEEMNAEYAKAQEQMQKNLTVEGMMAQKKEELKSKVEEGKISQEQANKILEQSEVEYQKLANGIEQTKSRQEAFNAALAPLREGVQWISEVTEAIGLMWQAAQGDQTANVEGSNLLTKLGFSPEAVIWVRETVAEVQNGIALIQSLVSGDWGAATNIMDKLGMSPEKKTEIISFAQDVHAEISNFITNVQSLISAASPVIMGIIGATWDFIKGIFETIAPYLMPLLTDVLNFVNGIIEQIASFWKENGEQIVQAVQNAFSIIQSIISVVMPVITAIVKSAWDAIKDIIQGGVNIIMGIIKFFASLLTGDFRGMWDAAKQIFSGAIQFIWGLINLSFVTKILGAAKSLAVSFGSAIRGMWTTVVNYFKEFIEHPVSLVVRMATDIGSAALKITKKLVDPIKNAWDGIKGWLKTIKDGVVNMFKGIHIPVPKVSVNGSLNPMNWVSEGLPSFSIKWAAQGALVKPGMPTVIGVGDAKGYDEAVLPLRDSTLGRIGQEIAQTMPQTTYKQSYDRPIELVVNLDKREIAREIYTDVQKFSQQQEDIRNAF >CP024116|3162416:3197830|3178775_3179801_-|AWC58030.1|head|DBSCAN-SWA MPTIEQYWIKRAEQLESNWNKEAKKLEKRLKASYLRAYREVNKETRLYLTKKGFDYNKLSEVLNKAEREMRKKGLTDYLDYLKEVDSAIKDSIEQEIKQHIDLVKVTRLDAISSEMLMKLSDQAIKDEKAIRKQMTTVYNETLLQSKYEFLKLGIETPVYVLNEKMIKEILSYPWSGENFSNRIWNNKKKLLQVLREELTQDVIQGLHADEVSERLAKKMNVEMSHAITLVHTESSYFYNRATLDSFGEAEIEQYKLHVTFDHRTSPKCRSLDTSKVYNRADASVGYNYPPLHPRCRTLPIPYFEGVSGPKYRWVRDNAGKSVKVNEPEMTYNEYKKQFLK >CP024116|3162416:3197830|3196405_3197830_+|AWC58055.1|DBSCAN-SWA MAVGIYIRVSTQEQASEGHSIESQKKKLASYCEIQGWDDYRFYIEEGISGKNTNRPKLKLLMEHIEKGKINILLVYRLDRLTRSVIDLHKLLNFLQEHGCAFKSATETYDTTTANGRMSMGIVSLLAQWETENMSERIKLNLEHKVLVEGERVGAIPYGFDLSDDEKLVKNEKSTILLDMVERVENGWSVNRIVNYLNLTNNDRNWSPNGVLRLLRNPVLYGATRWNDKIAENTHEGIISKERFNRLQQILSDRSIHHRRDVKGTYIFQGVLRCPVCDQTLSVNRFIKKRKDGTEYYGALYRCQPCAKQNKYNFAIGEARFLKALNEYMSTVEFQTEEDEVSSEKNEREILESQLQQIARKREKYQKAWASDLMSDDEFEKLMVETRETYNECKQQLENCKDPVKIDTKYLKEIVFMFHQTFNSLESEKQKEFISKFIRTIRYTIKEQQPIRPDKSKTGKGKQKVIITEVEFYQ >CP024116|3162416:3197830|3195529_3195952_+|AWC58054.1|DBSCAN-SWA MTTFDIVKKLAEEQKISISELERTLGMGKNSLYRWKKQTPSSDTLQKVADYFNVSTDYLLGRTKKKYWELTEKDEKDIQKKLEELIEDMGNADALAFSKGSEPMSEETKQLLIISLENALRLGKQMAKKKFTPKKYRDEE >CP024116|3162416:3197830|3185662_3185947_-|AWC59132.1|DBSCAN-SWA MKYFEFNKHEYYALIAVNGDVDKAIEIYVENVAGDSAEQVKEEAVPVELTREQALSTYLVSLARPTIDTPINKLHAEFCDCEDSVLLIDGSLAS >CP024116|3162416:3197830|3186212_3186416_-|AWC58039.1|DBSCAN-SWA MVKCEYCIGNSYKRKPLMQNGKGDYYVTINSCNYLEDSEVGDRNEKFSLFGERINFCPMCGRELKEN >CP024116|3162416:3197830|3188367_3189159_-|AWC58042.1|DBSCAN-SWA MRKFKKGDRVYFMSYGEKRVGTFDHQDGWKGWCLFDGNDVLTFAAIEDLRLLEEETMKTYTGFEAIERMKTHWITTQEKGCAWKIKEDEIWMRAGDNEGTVNESINFFFKNEFIDYVEPLKFEEGEMYVFESHDNEKWYAVHKEVDGNQYWPSLAVIVAKNFVFDGDGYFTKHDGTFRKPTDEELEEFERFMVFHKKGREMDEFELGDIVEREDALYIVVVQTEDNKFEHVIGCVEINDDDAPVKYFPTNDVELRFCMEDAVG >CP024116|3162416:3197830|3184989_3185412_-|AWC58037.1|DBSCAN-SWA MEELPDKIIGLDQIRINRGIGKICKCENRKFVLDTTNKRVTCHSCGSVVDPYDAIVDLANQREEFNRQAELLLEQKKQLAAYKPHLRIIKSLEKSYRGRKMLPYCPRCSEPFYLEELTHWMGISYAKRRIEKWKEQNPTK >CP024116|3162416:3197830|3174331_3174598_-|AWC58021.1|DBSCAN-SWA MSYISSLSIHEVFSLYYKAKEKQMEERRFQTWLHHIPIMALNGKMIPYEEAFSISSQKQQRRMTEEDKDRILKRAADISNRFKEMRGD >CP024116|3162416:3197830|3183640_3183886_-|AWC58034.1|DBSCAN-SWA MKYHLNSREEVENFIRNEVLTTPEAMEILEISRVRMSAMIKAGKLVPIKKLGNVSLFLRKDIAEKKKELEVLRAKYRPYDE >CP024116|3162416:3197830|3195068_3195257_-|AWC58053.1|DBSCAN-SWA MDKTFGKKVKMWLFVNDMKQAELAKMLNISGPYLSDILLGKRDGKKVKEKINRILESEEIAQ >CP024116|3162416:3197830|3189145_3189340_-|AWC58043.1|DBSCAN-SWA MRDKLEKLIEELKLSQSLLGSRALNLLDDGDLEKYGYYNGQRVVCEHMQKELEQILEGEENEKI >CP024116|3162416:3197830|3191270_3191540_-|AWC58047.1|DBSCAN-SWA MKTIIRDGSIPLALNKSSRTRYLRDRRLSELIKRCRRLEKEGFDYLFPIRKVLETVRHEKDENPHLFKGCFVLDRDRGFYYEVVMKKVK >CP024116|3162416:3197830|3194295_3195072_-|AWC58052.1|DBSCAN-SWA MTDQLTVANELHILGKQHIAGYEFTGIEGGFGKGKKSMLVKEIAVIHGKQVWHINEAINKNRNRFKDGVDIIDLLGIGLVDTEIKEYGFSQQAINSYRGKKAKGETAGIYLLSERGYAKLLKILEDDTAWELYDQFVDGYFNMREQQIPTDPFKQIELIAAGTSNLNKRVTNLEQVIEEQLTIDYGQQRVLEKAKGRRIYFLWNNGHIDKEVHNTTRKLFGLLGKNLKDAFDVNSYRDILKKDFEEAMKFIEGWRPMV >CP024116|3162416:3197830|3192587_3193475_-|AWC58049.1|DBSCAN-SWA MSKPYDVIARTTDLTREEWLEIRRQGIGGSDLAAVLNLSDWNSPMSLYLDKIGELKEKPQSEYAYWGNVLEDIVAREFTKRTGLKVRRKNEMLRSKKYPFMMANIDRELIGRKEGLECKTTSEYKRGEWKGDNIPTQYILQCQHYMAVTGYKRWHIAVLIGGNKFEFKTIERDEDIIKMAIKKCDVFWNNFVAKRIPPAVDGLKPTTDSLKEIYEKSIEGDHIILPSHSLTYAEDFETAGEQLKYWKERQDKAKNDLINILKCSEKGVHERFEVTYKTNARGSRTFKLKMKEVAK >CP024116|3162416:3197830|3164636_3165077_-|AWC58017.1|holin|DBSCAN-SWA MERIDVLLKTFIATFGGFCGYFLGGWDTTLKVLVIMAAIDYLTGVIAAGYNGQLKSKVGFKGIAKKVVLFLLVGVAAQLDSTFGSNSAIREATIFFFIGNELLSLLENAGRMGIPLPQALTNAVEILSNKSNKTSSEYDNKKGDVE >CP024116|3162416:3197830|3169892_3171386_-|AWC58019.1|tail|DBSCAN-SWA MTCDLSFFSFNGKRHDKVIPLQGVKRPAWAPLERTFLEVPHYPGGRLIRTQTKMRKVLVPVDLLYDSLEEAEKLKEEIADWLITDQPQELIFDDEKDRTYLAVIDESFDLDQLMNLGEGTLTFVCSMPYKLGRAQTHEFERTWTTEITSRFKNKGSVEAPALIKVDIENPSTFLDVWYGSYPNDRNYFRIGYPLTVEEKTVQERERVMWDEMSTTVGWTPVSQFDDMKGTGSFKVRDGYALYCEDYGQERGFHGAIAKKNIPVGPLQDFEMEAWVRLKSTNIGQMGRVEVLLLDEASNIVTRINMNDLYWDAELTKAHAKVGNVGTPGSLRKLVDTSGAHPNTFNQFYGRLRIARRGNEWSVYVARFRDGTEIDDASLVERWIDESGNPMTDRKIAQVMIAIMAWDINDPVSVMQIDDLKIWKVNKVPKNTKPYIFDKGDKVVIDTERSLVTINGKDAINIKDIFSDFPVVIRGDNRVDIMPGDVGAATISFRERYR >CP024116|3162416:3197830|3185981_3186176_-|AWC58038.1|DBSCAN-SWA MGKPWYRRIYALYKGERFITEGTIAEIHAETNKSIDFLRYMTFPIYEKRCGNSTKRLRMVLIDD >CP024116|3162416:3197830|3191536_3192376_-|AWC58048.1|DBSCAN-SWA MATNETLKQQMAAQQTTGVSTETNLNKQLKLMFKDSFKTIESVLPKHMTPERLIRVGLNATTRNPALLECAPETIVGAVVNCGSLGLEPNLLGHAYIVPFYNNKTKRKEAQFQLGYKGIMELVRRSGEVKAIYAHEVYEGDEFEYEYGLEKNIVHKPCGEEDQNKITHFYAVYKLKDGSYDFVVMSRKQVEGHRDRFTKSQKNGAVFGPWKDHFVEMAKKTVIIKLLKTAPLSIEREESRQVIEAANQDNGIMKVKENNTGVEADAGFIDVEYAEVSEE >CP024116|3162416:3197830|3189751_3190534_-|AWC59134.1|DBSCAN-SWA MNFLSNICMTCKTERKRTVRLMEIQGKVVCPVCELEKDNRKLEQEMNVFRNEQEQKRRKSVFYDKSLIKDETIKLARFSTFRVECEEDERNYALAKQALTDYLNGISFNLILVGKVGAGKSHLAYSIAYEMNENGTGTVLYVSVYELFDAIRSTFNGKSEESEHSIIEFLTSVGLLVIDDLGAELGDMDADDLKATAFVNRVLSKVFDGRQGKQTIITTNLTGKAITRSYDGRIVSRMFNDYRYIEFKETKDKRIRELPF >CP024116|3162416:3197830|3181154_3182459_-|AWC58032.1|terminase|DBSCAN-SWA MTMNKAPLNVQPKINFREVIGKGYNRFWHCKNFYRVCKGSRGSKKSKTTVINLTKRLMQYPWANILVVRRFSNTLKQSCYTDFKWAINRLKVKHLFKLNESMPEITYIPTGQKILFRGLDDPLKITSITVDVGILCWAWFEEAYEIEDQHKFETVVESIRGSWDSPDFFKQITVTFNPWSENHWLKSYFFDEETQAYDTFAITTTYKCNEWLDKQDRARYESLYEKNPRRARIVCDGEWGVADGLVYENFQVRDFDIDEIRQRKDVQSAFGLDFGYTNDPTALCCSLVDLRNETIYVFDEYYEKGMSNKRIAKMIEEKGYSKEKITADSAEPKSIDEIKSLGIRRIEGARKGKDSINNGIQFIQGFKIVIHPSCVEFIKEINNYIYATDKKTGKRLNTPIDDFNHLMDAWRYSMERFMKKGGKLKSINKSSLGL >CP024116|3162416:3197830|3190517_3191270_-|AWC58046.1|DBSCAN-SWA MGIYRVVKDSNYTTINNTGLKDERLSWKAKGILAYILSLPDDWVFYREELATHAKDGLDSLRAGMNELKEHGYLHRFPVKDDKNKIVKWETVIYEIPKKEPVAEIPLVEKPLVEKPPVENPELLNTKEPNTKELNTDINKYIVEIVDYLNDRLSELFKRKVSYKSTTADTRKRIKARLNDGYTVDDFKCVIDSRIQKWKGTKYTEYLRPSTLFGTKFESYLQQGRVGNNYGPNKGNRYSSISFEENELPF >CP024116|3162416:3197830|3194072_3194267_-|AWC58051.1|DBSCAN-SWA MQEQNYLVINKTTFGTSVYECETQEEVKEIVSQLIEKGVHPASIRVTKEIPVDITVKVDVEFQV |
47 | Bacillus_phage(87.18%) | portal,tail,holin,terminase,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024116.1|AWC58043.1|3189145_3189340_-|hypothetical-protein |
3189145_3189340_-
Protein sequences of CP024116.1|AWC58043.1|3189145_3189340_-|hypothetical-protein>CP024116.1|AWC58043.1|3189145_3189340_-|hypothetical-protein MRDKLEKLIEELKLSQSLLGSRALNLLDDGDLEKYGYYNGQRVVCEHMQKELEQILEGEENEKI |
64 aa aa | NA | NA | NA | 3162416-3197830 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.7|2239192|36|CP024116|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP024116 position: 3185091-3185056, mismatch: 0 tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat Protospacer ************************************ 2. spacer 4.15|2239193|36|CP024116|PILER-CR matches to CP024116 position: 3185091-3185056, mismatch: 0 tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat Protospacer ************************************ |