Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024120 | Bacillus cytotoxicus strain CH_1 chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas3,csa3,WYL,DinG,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas2,cas1,cas9,cas4,DEDDh,cas14j | 0 | 2 | 8 | 0 |
CP024119 | Bacillus cytotoxicus strain CH_1 plasmid pCh1_14, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP024121 | Bacillus cytotoxicus strain CH_1 plasmid pCh1_53, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP024122 | Bacillus cytotoxicus strain CH_1 plasmid pCh1_67, complete sequence | 0 crisprs | TnsE_C | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024120_1 | 1577469-1577597 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP024120_1
|
1 spacers
spacers of CP024120_1
>1.1|1577507|53|CP024120|CRISPRCasFinder TATTTGCGTAGGGGCGTTTTTTATTGAAGGTCCTACTGTCGTTGTGTCTTCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024120_1
The CRISPR arrays of CP024120_1 >merge|CP024120|1|1577469-1577597|CRISPRCasFinder AACTAGGGTGGTACCGCGATGTTTTAATCGTCCCTACGTATTTGCGTAGGGGCGTTTTTTATTGAAGGTCCTACTGTCGTTGTGTCTTCATAACTAGGGTGGTACCGCGATATTTTAATCGTCCCTACG >CP024120|1|1|1577469-1577597|CRISPRCasFinder AACTAGGGTGGTACCGCGATGTTTTAATCGTCCCTACG TATTTGCGTAGGGGCGTTTTTTATTGAAGGTCCTACTGTCGTTGTGTCTTCAT AACTAGGGTGGTACCGCGATATTTTAATCGTCCCTACG
>CP024120.1|AWC60682.1|1575425_1577060_-|polysaccharide-biosynthesis-protein MSTSKVLKGTALLSGATMISRILGFIYFFPFQLLVGTQGVALYGYAYSWYGILLSFSTAGIPIAVSKFVAKYNALGDYSTSKKLYNSSVKLMLLMGFSGFFILFIGAPYISQFIIRSKAPDPKFIADVTLTMRALSFALIIVPAMSVTRGYFQGFQHMKPSAVSQVVEQIARVVFILAGSFVVTKLLGGSVASSVAVATFGAAVGAIASVSILIMYWKKYNHLKPPKGELKSRASTLPLKSIYMELLRYAIPIVFVGIAIPLYTLVDQYTVADALRALGEPLTTANAVFAYIANYAQKLIMIPASLATGFSLTIIPAITKSFTSGKQEELQEQITKIFQVLLFFTIPAAFGLASIAYDTFRMVYVSHDIAVGGSQYLISYAPSAVLSAIFTVSAAILQGIDYQRKTMIAFSVGILVKLIVNTPLLYVLGGHGAVLGTILGYLVSDAIMLYCIVKFAKFDIKETIKTVCLIIIYSGAMSAIVMALKAMIGWFIPGQSYIESLLIVIICGVVGGFVYLLFVLTSGLASRILGNRIQRLPILGKFIK >CP024120.1|AWC60681.1|1574438_1575356_+|cysteine-synthase-A MKLCKNVTELIGDTPVVRLSKFVPKDAADVYVKLEMFNPSRSVKDRAAYHLIHVAEEQGFIQPGDTIIEPTSGNTGIGLAMNAAAKGYKAILIMPDNMSKERMNLLKAYGAEVILTPAEQRMPGAIAKAIELQKQIPNSFIPQQFENPANPNIHRYTTALEIYEQMEGKLDAFVATAGTGGTITGTGETLKEKLPNLHIVVVEPKGSPVLSGGVPGPHKLVGTSPGFIPKNLNTEIYNEIIQIADEEALSTMRNLAKQEGLLVGPSSGASVYAAIMIAKRLGAGKKVLCIAPDTGERYLSMGLFE >CP024120.1|AWC60680.1|1573214_1574423_+|MFS-transporter MQAISKENVVTTPTIYRILFAISFGHFLNDSMQAVVPALFPILEKTMNLSYMQVGWIAFALNMTSSVMQPVFGMYSDKKPSPFLLPLGMFSSMLGMIGLAFAPNFIIVIISVLFIGLGSAVFHPEGARVAYMASGTKRGLAQAIYQVGGNTGNSLAPIFTAVIFVPLGQKGSLGFTAFAAVGILLLMYVSKWYKNELVSGAVKSKKRAALEAENAIVSAHIKFVIVLLIFLTFVRSWYGAGIGNFYQFYLIEHYGLSIKNAQYFVFAFMISGVLGTFFGGPLADRFGKKNIIVFSMLGSAPLALLLPHVSLLWVVPLFLCIGFISSSSFSVIVVYAQELVPGKVGMVSGLIVGLAFGLGALGAVVLGKLADIYSLQFIMVLCSCLPLIGLTSWLLPSDKKSV >CP024120.1|AWC60679.1|1571356_1572997_-|peptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKKTKRVAALSLTLSLVLTACGQKQETTTNKDEKKVATKQILNIVETGEISTLDSSIATDGFSYAALNNVMEGLYMPGPGNKPVPGAAESYTLSEDGKTYIFKLRHSNWSNGDPVTAHDFEYAWKRAINPETASEYAHIMFDIKNAEKVNKKALPLDSFGVKALDDKTLEVQLEHPVPYFLGLMGFATFYPQNQKVVEAQGTNYGLEAANAVYNGPFVLNEWKHDTSYKMTKNPNYWDHKNVKLQEINVNIVKDTSAAVNLFESKQVDRITINSEFVDKYQNDPSLKKMARPSVTFFRLNQKNPLLANKNARKAISLSFDKKGITTTILNNGSIPANAFIPKGFVKGPDNKDFRSTSNVKVETNIKEAKKQWETAKKETNLQNVSLSIISTDESNDKKISEYLKGELEKNLPGLKITLNPLPVKAFLEREGNGDFEISLSTWGPDYPDPTTFLNMFVTDGPFNKMNYSNKQYDELMEKASSSLTTDLPARWKAFQDAEKILVEDDAAIAPIFQAGLIYLERPSVKGVVVRPFAGIYSYKWAYITE >CP024120.1|AWC60678.1|1569685_1571254_+|Vga-family-ABC-F-type-ribosomal-protection-protein MLLLEANRIKYYIQDRLLLDIDQLQIHQNARIGLVGRNGSGKTTLFQILAKEIVPEEGSIVQRVRCELLPQLKQTDTTKSGGEVTQEYIQKAVLKDPELLLADEPTTNLDTGHIEWLEKKLGNWKGAFVIISHDRAFLDALCTTIWELDEGKIKVYTGNYSEYVKQKEIERQQEQLAYEKYEKKKKQLEEAVKLKEKKAERATKTPKKEGKLEPKITKPYFAKKQKKLQKTATAMITRLEKLGKVEKVKELPPLKMDLPNAETFKNRIILRVNDRIGKVGKRVLWKKASFHIRGGDKLAIIGANGSGKTTLVKQIMNQEYGIRFSPAVKVGYFSQNLNILDPAKSIIENVQSSSKQNETLIRTVLARMHFFREDVYKLVEVLSGGERVKVALTKLFLSDINTLILDEPTNFLDMTAVEALESLLKEYEGSVIFVSHDRRFIENIATRILTIHNQELGLFEGTYQKYKRTQVQQAQERKKDTRLLLETKLSEVLSRLSIEPSEKLEREFEKLLQEKRELDASE >CP024120.1|AWC60677.1|1568094_1569354_+|GTPase-HflX MEEFVQRAILVGVNLGHESDFQYSMEELANLAEACDVEVVGQVTQNLQRVNPSHYIGTGKIGEVAAYVKEVDANIVIFNDELSPSQIRNLEKDLDCKVIDRTILILDIFAQRAKTKEAQLQVEVAHLQYMMPRLVGLRESLGRQSGGVGTKNKGVGEKKLELDRRKIEEQISVLNKELEALVVQRKTQRKQRKKNEIPVVALVGYTNAGKSTTMNAMLEIFNGTIEKQVFEKDMLFATLETSVRNIELPDNKSFLLTDTVGFVSKLPHHLVKAFRSTLEEVAEADLLIHVVDYSNPNYEQLIEITNQTLKQIGVENIPTIYAYNKSDMMDVEIPKTKKDRVYLSAKKQIGMEELVEMIRSHIYKEYTKCEMLIPYDQGQIVSYFNEYAHVICTSYENEGTKLSLECKISDFEKYKRFAI >CP024120.1|AWC60676.1|1566783_1567596_+|UDP-galactose-lipid-carrier-transferase MKKEWLANVDLTKKIDSKSKYNKKLKKYQRHLLALQQILKEEKVAVIMVMEGWDAAGKGGAIKRVTEHLDPRGFQVKPIAAPAPHEKRYHYLQRFWREIPRYGQIAIFDRSWYGRVLVERVEGFATQEEWARAYDEINDFEKVLTDDHYIIGKFFYHMSKDEQLKRFKERENNPLKRWKITDEDWRNREKWDEYVEAMEEMFEKTNQPNAKWHIIASNNKLYARVKTLKVMISLIEDYFLEHGIELPSYYYEIKAEQQEEFEIVQDVSMK >CP024120.1|AWC60675.1|1565811_1566276_-|hypothetical-protein MKRKIFFLLTLLCIVLPIQVSAFTFQELPVASKSKQWYIEIDKSYNSNKQAIQPKQGVYDTYSLFVKNIGKDVSNVSIEIVGNDPSAKTTFKPTVPHTNVSKSHTSFDYMVFPLYFTSHTFKVIMTWEEKEFTYNGHPESKSKKMKQTFIFTEE >CP024120.1|AWC60674.1|1564379_1565756_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKKVISNVLAMTAALQVIMVPTTSFAAEKGFSDVPKSHWAYEAINDLANRNIIAGYDNGKFGLGDSVTREQVAALIYRALKPEAKAEYKNPYHDVSASTTMFPNEILALTEMGIFTGDENKNFRPKDSLTRAEMAMILQRAYHLKVKANHTFHDVDPNSWAKDAISALQSNGMAEGDGTGAFYPSKTVTREEYAQFLFNAEQSYLNLDLTLASNVTAEEIDNFLKKSRSDSPLIGHGQDFIAAQNEHGVNALYLAAHAILESGYGRSEIAYRKHNLFGLRAYDRDPFYHAKYLPTYRDSISYNANYVRERYLEKGAIYYNGPTLVGMNVKYASDPEWAGKIAGLMERIKPFDRNDYKNANRLPKNPHTLDVEALGNEIPYKDLGNREIAVQASGKYYKVPYPYDLKIKSIPDITQNEMGTLTNGSKVTVHREDPNGWVEFSMKDKQEKYWTLKSNLKM >CP024120.1|AWC63082.1|1563623_1563812_-|hypothetical-protein MPKSINFSAFIDWGCFRIETELSYIQTCIYEELSTKKRYHVYTDIPFLAIFLLAPFSVSLFL >CP024120.1|AWC60683.1|1577700_1579038_+|sodium-dependent-transporter MNSPQWTSKLGFVLAAAGSAIGLGAIWKFPYMAGIGGGGAFFLIFIGFTLLIGLPLLLAEFVIGRSTQKEAVDAYRQIAPKTLWPWLGKLGVVTCFILLSFYSVVGGWILLYLWNAITGRLWEGNGAYEATFGEIISNPYLAVGSQLLFILMTIFIVSKGVQNGVEKVNKYFMPALFVLFFILIIRALTLDGAGEGVRFFLQPDFSNVTSEIILYAMGQSFFSLSVGVAVMVTYSSYLPKEESLPRSAFSIVGLTLMITLLAGLAIFPVVFAFGMEPSQGPGLLFIVLPAIFSKMAFGKVFFVIFLLLFFFATVTSAISMLEISVASLTAKGNGRREKFAIIVGLLIFVVGIPSALSYGVLSDFKVFGKTVFDLADFAVSNVLMPLGVLLVSIFVPLKMKKDVLMRELGVSKHKGYTLFILWLFLLRYIAPVAIIIVFLNVIGVI >CP024120.1|AWC60684.1|1579309_1579576_+|hypothetical-protein MGYVKATAVLPESLIAEIQKYVQGETIYIPKQETEHYKWGTRSGGRKQIDMRNRKIKEAFENGIAIYQLAEEYFLSVETIKKIVYSKS >CP024120.1|AWC60685.1|1579715_1580354_+|elongation-factor-G-binding-protein MEAFIRSDQYNFIKSQTHILVHGHATANDRGVITALKSLAIEKVLHAFENLNSEQKELIETILAVENREDAEAFLLKLNPYVIPFQEVTPQALKKLFPKVKKLKLPEMEEVNMKEMSYLGWTDKGTGKRFIIAKKNNKLVGVQGTFQSINKKGICALCHGHEEVGMFLVEIKGDVPGTFVKKGNYICQDSIACNQNMTSLDKLHDFIERLKK >CP024120.1|AWC60686.1|1580378_1580915_-|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase MSKKTFELATFAGGCFWCMVKPFDELPGIQKVVSGYTGGHISNPTYEQVKSGTSGHLEVVQMTFDPSIFPYQKLLDLYWSQIDPTDDGGQFFDRGPSYRTAIFYHNETQKELAEKSKQLLATSGIFNEPIVTEIRPAAPFYEAEEYHQHFYKKNPKKYAQERKESGREDFIKTNWQKK >CP024120.1|AWC60687.1|1581833_1582733_+|branched-chain-amino-acid-aminotransferase MKKQYIYMNGELVEKEKAVVSVYDHGFLYGDGVFEGIRSYGGNVFCLKEHVKRLYESAKSILLTIPMTVEEMEKAVVQTLQKNGYADAYIRLIVSRGKGDLGLDPRSCEKPSVIIIAEQLKLFPQEFYDNGLSVVSVASRRNMPDALDPRIKSMNYLNNVLVKIEAAQAGALEALMLNQQGYVCEGSGDNVFVVKDGKVVTPPSYLGALEGVTRNSVIELCDKLGIPCEERPFTRHDVYVADEVFLTGTAAELIPVVKVDAREIGDGKPGEVTKQLTEAFKRLTRERGVRVPGLAESLA >CP024120.1|AWC60688.1|1583231_1583330_+|hypothetical-protein MLVNKVYKFRIYPNKGQEILKQVVDVLQVNTS >CP024120.1|AWC60689.1|1583664_1585338_+|dihydroxy-acid-dehydratase MRSDMIKKGFDKAPHRSLLKATGLKDEDFHKPFVAICNSFIEIIPGHKHLNEFGRLVKEAVRAAGMVPFEFNTIGVDDGIAMGHIGMRYSLPSREIIADSVETVVNAHWFDGMICIPNCDKITPGMMMAAMRINIPTVFVSGGPMAAGKTSKGEVVDLSSVFEGVGAYQSGKISEEELKDIEDHGCPSCGSCSGMFTANSMNCLCEVLGLALPGNGSILATDSRREQLIQRAAESLKILMERDIKPRDIVTEEAIDDAFALDMAMGGSTNTVLHTLAIAQEAGLDYDMNRIDAVSRKVPHLCKVSPASNWHMEDIDRAGGMSAILKELSRKEGVLHFDRITVTGKTLRENIADAEIQDKEVIHSLENPHSQEGGLRILKGNLAKDGAVIKSGATEVKRFEGPCVIFNSQDEALAGIMLGKVKKGDVVVIRYEGPRGGPGMPEMLAPTSAIAGMGLGADVALLTDGRFSGASRGISVGHISPEAAAGGEIALLQQGDIVCIDVEERLLEVKVSDEELAKRRKEWKRPEPKVKTGWLGRYAQMVTSANTGAVLKMQNFD >CP024120.1|AWC60690.1|1585371_1586634_+|threonine-dehydratase MVHKVKERVKIEDILMAHNCLKDIVNKTPLQRDAVLSEKYKCEVYVKREDLQVIRSFKIRGAYNLIQSLSKEKLQNGVVCASAGNHAQGVAYTCNLLEIPANIFMPTTTPKQKVSQVKFFGGDVADIMLVGDTFDSSFQEAQRYCEENGMTFVHPFDDPHVIAGQGTVAVEILHDTEKTIDYVFTAIGGGGLASGIGTYVKGVSPNTKVIGVEPKGAASMKEAFLQNENVTLEMIDSFVDGAAVKKVGKLTFETCKDVLDDIVLVPEGKICTTILELYKKNAIVAEPAGALSIAALDFYKDEIKGKTVVCVLSGGNNDIDRMQEMKERSLIYEGIKHYFIIQFPQRSGALREFLDKGLGPEDDITRFEYIKKHNKENGPALVGVELKHKEDYEPLIARFKENHIQFLELNKNPVLFDLLT >CP024120.1|AWC60691.1|1587633_1590174_+|thiamine-biosynthesis-protein-ThiF MRLKTSLNFRGYPNRNEIVYYDGEERVIEVNEFEKLWSLLKILESPKEDVHTKIQEWKNNNDIEDEELHQILQFINENGMLYEKRCDKMDEEQLYNIRNFHYFSTHDSTIYADAIVQRIKKVKAVVIGAGTIGATLCMTLSKLGVGEIIVIDFDTVQLKNIRAQTIFQKEDTNKKKIHVIQEKLKKMDPYVKVQVYDMKIETIHDLLRVDLHDVHYIFGCFDESSLQLQKDIMNYCDKEKIQYYLMGYHNDFVKVFHVSNRNDGERLLEESFQNYHTEYVIRENRGTIIQSLAVSLIISRILFEDITKSSCTVPSGYHFDFITFQTSHNRQSISREPFVQSLQRIMPFDQEQLNRKIEFLFNIIDKKEKVTILPKVIEMDILSMHQVFDILFHIGQIASLQLEDHYNKFIELMNEIDKTEDPEHNEYEQYLQFIRSMKINYEDEVYTIFEIFEMIRNTKDYEEKKKMQSGIYEVLKQNGDTLLSFFVNSKKKYLALEIPNYYMEVFGVKEETLHILENELQKKFHTLLTKSLSMMFSNSFHEIGVDFLSYNEEEHSMITLDEAKHFIVTSLEKDGKHHFVHYIERMFEENFIQVYNNVEVNKTYYFPSMKESRIVFNYHNDMDSVFVLCHELGHAYFNQSYGHTFFDDSTQLVNEMMAYYFEIICIQSMLGNEEIKIEMKQEIARQYIKRIHQTVLSTYGVHLLEKSLVKHIEEHGTISLLDFLKIRDEYNQHSFFKGIKFKNEKYFYLNPLLKSSFMLEFGEHLLPPMAYLLAVSLYNDRSETSIPKDIRMQEAIYNGVYCTEEFLSYVAKDVPHDERMKQAIHTLLELFCKLESFTMKDEVYSN >CP024120.1|AWC60692.1|1590332_1591547_+|MFS-transporter MASWKRNLMICWLGCFTTAAGMSLVIPFLSFYIEKLGVTGTSNIAQWSGIAFGVTFLMGAIVSPLWGKLGDTHGRKLMLIRASLGMAIIMTLMGFVTNVYQLVALRFLMGAVSGFLSTAMTFIAAETPKEHSGWAISTISTGGVSGSLLGPMLGGYLSELIGMRYVFFVTGAFLFLSFIIVFFFLKEENRSVQPKKAQPKKVWTMVPAKHFIMSLFVVTFMIQLANMSIQPIITLYVKHLAGAHTAHIETIAGAVMSATGLAVILAAPRLGRLSDHIGPQKTLIVALFVAGIVFIPQAFVTSAWQLLILRFLLGIAQAGLLPSVQTLLKKHTPNHITGRIFGYNQSFQFLGNMIGPVLGGQVAAHAGFQYVFFSTAALLFIACIWVYFHNRHAEVTGKEGLKVS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024120_2 | 2037669-2037968 | TypeII |
NA
Consensus repeat of CP024120_2
|
4 spacers
spacers of CP024120_2
>2.1|2037705|30|CP024120|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCACCTTTGAAACGCGTCTGGATCAACGAG >2.2|2037771|30|CP024120|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAACCACTTATGGAATCTGTAACAATAAC >2.3|2037837|30|CP024120|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGCCAAATTTCAATGTCATCGGAAATAAT >2.4|2037903|30|CP024120|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGACGCGATTGATTTTGCTGAGTATAAA |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024120_2
The CRISPR arrays of CP024120_2 >merge|CP024120|2|2037669-2037968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATCCACCTTTGAAACGCGTCTGGATCAACGAGGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTAAACCACTTATGGAATCTGTAACAATAACGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTAGCCAAATTTCAATGTCATCGGAAATAATGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATAAAGACGCGATTGATTTTGCTGAGTATAAAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT >CP024120|2|1|2037669-2037968|PILER-CR GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT CCACCTTTGAAACGCGTCTGGATCAACGAG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TAAACCACTTATGGAATCTGTAACAATAAC GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TAGCCAAATTTCAATGTCATCGGAAATAAT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT AAAGACGCGATTGATTTTGCTGAGTATAAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT >CP024120|2|2|2037669-2037968|CRISPRCasFinder GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT CCACCTTTGAAACGCGTCTGGATCAACGAG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TAAACCACTTATGGAATCTGTAACAATAAC GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TAGCCAAATTTCAATGTCATCGGAAATAAT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT AAAGACGCGATTGATTTTGCTGAGTATAAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT >CP024120|2|1|2037669-2037968|CRT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT CCACCTTTGAAACGCGTCTGGATCAACGAG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TAAACCACTTATGGAATCTGTAACAATAAC GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TAGCCAAATTTCAATGTCATCGGAAATAAT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT AAAGACGCGATTGATTTTGCTGAGTATAAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT
>CP024120.1|AWC61085.1|2037400_2037565_-|hypothetical-protein MGQFSVTKVGQIWLTIYKYLIGWCGYNALSDTPSICKERDKWIRRRLRMVIWKQ >CP024120.1|AWC61084.1|2034400_2034703_-|hypothetical-protein MKKSKAERKRDLEIVNLYHKKLTEEELEKLSVKFIEWKEGKLPYCELTEHIHECHKKNQIIWTRFHNMNDEFLIFQAKKELNLFSERDMEKEQYKRWNTF >CP024120.1|AWC61083.1|2033791_2034325_-|hypothetical-protein MQLIQCTKKLADMMELKTEKVDQRESNNLHSWHANLFTINRKKCVIVMNNVTRYHFIIYGVTKKDLRNFEALFQKNLVTNLLSDGVEPEVIEHYVKSSSPMQYAATNNRSILSQMNDAVFMVDHYFYAELVEKQKPFINIEKLNQNLNKTVMLKIPKYPADMMRDALNQHLIMSKNE >CP024120.1|AWC61082.1|2032774_2033779_-|hypothetical-protein MRDQLRKIIDNMSEEEVKSLLRLVLLQLELVAEHRDEEMIHMVAEIPKQLIESQKPTLHIKDSEHVHIAFGDSSASCLKHTLKKEGFHQDYVISLSDIFSVGPIFHLDDRKGQVARQEWLSSNLSTGDFYFEEEYLPRFLSSLEEMRSISKDTSVTIWKADNAHEHVGLCFALAMLKDKKNIRIINASEAQKELLNKEYDICGTGELAPEDIAVILEQYKEKECLKEEARADLTKEWNALSTNTALLRIWKDGTVHSVVEDYFDEYIVRCAKEIGADKGFSKAAHVIGEVLGRVEQLVGDVFLEYRLQTLIKQNIFQAKGSLKAMRYYSVKLNR >CP024120.1|AWC61081.1|2032209_2032620_-|hypothetical-protein MYNYPNYPGIGYDQTMYSQYQGYGEEAMEPRESDYEEYRPDDAEDAPTSPPPSQAPSVPSTFASPVQSSNIRSWVCNCLGRWGYLRLHRPGPFGRDLWFFPTEVRRGGVSGYTWQAGRRRKVSYRYQQISNFMCFA >CP024120.1|AWC61080.1|2030820_2032056_-|cytochrome-P450 MSVKNKVGRNIKDGIKLASPEFKEYAYEIYKESRKLQPILFVYKGELGTEWLITRYEDALSLLKDSRLKKNPENIFFQEKLKSLFSIENSDYLTKHMLNADPPDHNRLRALVQKTFTPKMISQLHNRIQHIADTLLDHVEQKRSFHFIRDFSFPLPIIVISEMLGIPKEDQAKFRIWSHAVIDSPEIPEEKIENEEKLSEFITYLQYLVDLKRKEPKEDLISRLIQAESEGGQLSAAELYSMIMLLIVAGHETTVNLMTNTVLALLENPDQLQLLKERPELIDSAIEEGLRYYSPVEVTTARWAAEPFHIHDKVIQKGDMVTISLASANRDETVFVNPDVFNITRENNRHIAFGHGGHFCLGAPLARLEAKIAIATLLKRMPRLRIKGKREDIKWEGNYLMRSLKELPLTF >CP024120.1|AWC61079.1|2029265_2030549_-|MFS-transporter MSVSAETNPKVGMSQVLKNRFVQGILISALCLQIGIWVRNFAVLLYVMEMTKGNAFAISMISVAEFAPIFIFSFIGGTFADRWKPRKTMIWCEALSSLSVFAVLLTLMFGTWKVVFFVTLISAILSQFSQPSGMKLFKQHLSAEEIQLAMSLYQTTFAIFMILGPILGTFVFQSFGIYISIVVTGVAFLLAAIVLLFLPKDVEMHAEKKQVSLLQEMADGIKYVLGKKALTLLGICFMAAGLGIGLIQPLGIFIVTEQLGLSKESLQWLLTVNGAGMIIGGALAMIFAKNVAPQKMLMIGLLAQAIGIGVIGFSTNLWITLTAQLFSGLALPCIQIGINTLIIQNSDTDFIGRVNGILSPLFTGSMVLTMSIAGSLKEMFSLSMLYEGTAVLFIVGLFVILPIYHLKPAVRAENQPAKEGSAIQQES >CP024120.1|AWC61078.1|2029037_2029193_-|DUF1540-domain-containing-protein MAQDVLCEVNNCKYWGNGNKCNADAIYVVSHKGKQASKTEETDCKTFTPEA >CP024120.1|AWC61077.1|2028189_2028768_-|cysteine-dioxygenase MLTCRKSELFQQFIHNVTASIENSKNEETIVCTIEKLLEKLLETKAWLPLEKQKANRNQYARHLLYKDPLDRFEVLALVWRDGQATPLHDHDGTWGVEGVFSGRIKVKNFLKIKQLEESIFQLKYLGHLYLGEGKTDKIIPPADCHILEIEPNEQVITIHIYGKKLEKFKVFIPTERKDIYRCKMKYIQYSS >CP024120.1|AWC61076.1|2027133_2027988_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MKLIAIDLDGTLLSKNKMISKENAEAIRKCQEEGHVVAICTGRSIVDIERLLQEVNLQCPIIAENGAVIYKDKTMLKRYAIQNEHALDIVEYLEEQGMYYQLYTDKGVYVPKYGEENIRKEMEVIRNLDINISEEEVENIAALYLEHTAFHSIESCKSIINKELYVHKFLPFSYDQQKLKRLKEKFQHNSELIISASYWHNLEINHCDAQKGNGLYTLAEYFNIPFENTVAIGDGLNDVSMMQKANVSIAMGNAVNELKAMCHYETLTNEEHGVAHALYHYVIA >CP024120.1|AWC61086.1|2038122_2038431_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRILVFFDLPVMTKAERKAYTRFRKFLLKDGYTMLQFSVYTRVCNGEEGAQKHLRRLRQNIPNVNGAIRSLKVTEKQFESMDILLGVQTIDEKLGTNKTDFF >CP024120.1|AWC61087.1|2038435_2039338_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAFRHIVIRNPSKLSTCDEQLLIKQEETVRIPLEDICTITIEDPAITITAALLSKCVEYHVELIVCDWKRLPAGILQPFHRHSRQKAVLDVQLGLGKPFKKRIWQQIVIRKLENQARCLELANKGEDAQKLYSISKSVESGDRTNREAYGAKVYFTALFGPNFYRREDDVRNISLNYGYSLVRSLTARALVRYGFNPSLGIFHDSQTNAFNLADDFMEVLRPFVDIIVALNVSDETEWDSKMREKLFSVLNIEAVWKEERQSITNGVEQMIKSYVSACRQNDASLLLLPELIALRQHTYE >CP024120.1|AWC61088.1|2039327_2042561_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKYSIGLDIGIASVGWAVINEDIERIEDLGVRIFDVAEQPKTGASLSTPRRLARSTRKRLRRRRHRVERVRKFMIQKGLLTQVQMEQLYDWKDGDLDIWLVRVNALERKLSDREFARILVHFAKNRGFQSNRKSELQEEDNGAVLSAVQENKRLMEEKGYQTISEMLLYDEKFEGTKRNKGGEYTHVVARSDLKREIQLIFEKQRAYGHAFATMENEDKFLQIWSSQRPFATKDDIAKKIGNCTFEPKEKRAPKSTYTFERFRALDKLNRLRILSGTSPARSLTQEERDLILNSLFSKKEVKYKELRKLLKLNDEQRFNEIFYDPNEKIEKNENRTFLSLESQYKIRKILQKIEGKSLNDTYRPVDLDTIAYALTVFKDDQDIRDYLQNQYVASNGKKELNLANRKYNDELIEELLHLSFTKFGHLSLKALRNILPFMEQGIPYHQACEKAGYQFNKKVNREKQKLLPPVPAKDIVNPVVIRSLSQVRKVINGIIKRYGSPSSIYIELAREMGRGYKERKDLEKQYNKNRQMNEGAKKHILELRPEFGDPRGHDILKYKLWQEQDCRCAYSFKSIPIKQLFEIGYAEVDHIIPYSRSFDDSNNNKVLVLAAENQNKQNRTPYEWFGHDETKWQEFTSLVTTMKVSKKKKSLLLKKNFDEEQAEEFRSRHLNDTRYITRYIKTFIEDNLQFRIEEGKKTYVHTVNGAYTSLMRKRWGFNKNRQENALHHALDAVIVAVSLPFKHKVRAYFKRREEYAHNQLKREGEFFPEPWPGFIHELEIRMMQDSENIKLAMESLNLKTYDESFIKELKPIFVSRMPKRAMKGQIHEETLKRVRGRTDDGYIRTVKKVKLDQIPFDKNGDFPMFGKETDMKTYEAIKSRYLESGKDKKKAFNTPLYKPAKNPENAPIIRSIKIEEKANRVVMLDEKTAADNASIVRTEVFRHKETGNYFLTPVYVADVLAKKVPDRLITTKKPYSEWRKITDEYEFLFSLYPNDLIRVKMPKEKETKTHTGEKHVWQENFMYFKGVHSGSAGVRMIDHMNSFEDEIGVRKLVVFEKYQVDPLGRMNKVHGEKRHGI >CP024120.1|AWC61089.1|2042872_2043634_-|DUF3959-domain-containing-protein MKKLDVLLMLLSGLFPVAGIMKQIPLPLSLILGGLLFFTSFGSYYTKQTSSRVCSWLAYTIFITFLMGIWDQYVTMSSLLANAKIAACIALLPAILCFRTYGITFGLLALWGALLWDVKEVQSLAVLGRMMNLLTTEKMYLLLLIAGFLVGGLFANGFRRKNDKFKQETPNVLKQKKKRMRPTFHIRIPRLPKLRMKMLTFGRTPTQSKDKRPYESMREENIHAIQQEPQHEQQEPTTLGQTRMERRRNRYHV >CP024120.1|AWC61090.1|2043890_2044199_-|hypothetical-protein MFFIVYIFTNLPLSLIVDNIPKALKSLDLIQTSKGWIPFLFDAGKTYILIMTIDYFMESITISWQGVFLFAIIRGSIGLKIKKDDPEPPSYSEVTKSLKNNE >CP024120.1|AWC61091.1|2044347_2046693_-|translation-initiation-inhibitor METIQLLAFKDVIDPLFEQTVFYVQWPKHWSSLLLEHNRPYELIKKFKLLNKRLYIMFSDILFIEHDPYKLAEDSLWIICLKPLSSEQLEYICRQWYAYIHNWKPTEMPGEVLLEWQPSAISKLSLLHDKKTFYIWVPALISHLFCERALHLSIGNKQYEEVPFYPLREQNRCEAMSEPIQDKKTKEYFSYIYRFELITRGIENMFLLKVSIGKRRFYQTANQYANYMIMKKRKGTVLVSNCHNEKDKFVTLKIEDARFGVNWSKAYRELQNVFMLKKQLDLVKIMQSPKKYIKGKRIRALVIYDENIFKVPGTKIKRGISRREKEVLLQAFHQRFPHCTYIPLCKNVTINQNDELFPLYIREEMKEITLELWSFQRLTEIERILFEEGLILEKRANHSYILNSKPQIILNIVTYNPKIIKQHPYRMDYCHKYKEDRIQSVIRAISSIPIQSFQTSLSLIEVEKCDGREKIDPKQVIREAFARTNRISQFIERLDGEEIKKEHIVRAIFSLLEKIGFRKRSWESMHPSHTYVSLSIEEIYNNQFVPILSKINEGEIVYKLYGSHEWRDFTSILLNVSAHETFLPQPSKRNDIGIQFKKYITEELTAIAEEAKKENKQVYFLIDASMREYWIESLQNEHMDLHDLPYISEEFQSLSNVTAIRINNQYDVPNYIMPLEKECDETELYVDQSGLYYSVNIYPLNDTGWKEQRILEIVVLGAKQEERDQIAKIITYMCKMSIIPGERPFIPFPMQMVKLIKKYITDIDLWQSSDELDTDWLIENE >CP024120.1|AWC61092.1|2046946_2047630_-|thiaminase-II MSFSQLLRQEVAPIWQASFEHPFIKELGEGTLDLASFRYYVLQDSYYLSHFARVQTLGAAKAIELKTTARMAHHAQNTYEAELSLHENFAEKLGITEEEKASFIPAPTAYAYTSHMYRAAYEGHLGDIIASILPCYWLYYEIGERLKECKPEEPIYQAWISAYGSDWFRTLVEEQIMRLDQIAETVTESDRKRMKQHFIISSQYEYSFWEMAYTLEKWPVEEKIATR >CP024120.1|AWC63099.1|2047948_2048596_-|Na+/myo-inositol-cotransporter MAYPMLVIKILPIALSGFFAAVLFGAILSSFNGALNSSITLFTLDFYKPIFKKEASEKELVKVGRIFAITLGLIAVIVSPFILYAPSGLYNYLQEMFGFYNVPIIAAVVVGFFSKKVPASAPKIALVFHIILYALSKVFLGSINFLYILSVLFPACVIVMLVIGKLKPRETDFELFDANKVDLKPWKYAKVFSIFLIIFMLGAYVLFSSVGLAAQ >CP024120.1|AWC63100.1|2048882_2049050_-|hypothetical-protein MSIIALVSILLWGAVTHELSKPSKKQNNRKIITLTSLGCLSTLVIIISLIQNLSF >CP024120.1|AWC61093.1|2049134_2049635_-|N-acetyltransferase MSIHTENIKLVPYKEEYKEKIATFTLPSEQVQFTANPSDLLEKAKEDITKHVVVIVDQDVPVGIFALQTGERVTEYTNNPNALLLVSFSVDYEKQGKGYAKRGLRLLQEYVTAYFPEINEVVLAVNERNIPAQKVYLKVGFEDRGQRKMGPIGRQLILYLSIKKQE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024120_3 | 2156015-2156567 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of CP024120_3
|
8 spacers
spacers of CP024120_3
>3.1|2156044|37|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT TCCACATAGAAGCATTGTGAATCATAATTTTTGCTGT >3.2|2156110|36|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCGAATGGTATGTGCTGAAGACTATCAAAAAATAAC >3.3|2156175|35|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGCGTTCGCACAGAACGTCGTATTGGTTCCGAAT >3.4|2156239|36|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTTCTGCCACCTTTTGGTCATCCACTAGAGCGTTT >3.5|2156304|37|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCCGTTCTGTTCCAACCAATACCTACATACATCTATT >3.6|2156370|37|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGCCCGCAATAGAGTCAATAATTTGCGTTGTTTGAC >3.7|2156436|35|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTGTTATCACAACAACTGGTAACTATGAAGATGG >3.8|2156500|39|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGATTCGCTAAAAATAGATACAACAAAAAAAGAAATAA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024120_3
The CRISPR arrays of CP024120_3 >merge|CP024120|3|2156015-2156567|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTCTATTCCACTACGTTCAGATAAAACTCCACATAGAAGCATTGTGAATCATAATTTTTGCTGTCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACGCGAATGGTATGTGCTGAAGACTATCAAAAAATAACCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTAGCGTTCGCACAGAACGTCGTATTGGTTCCGAATCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTCTTCTGCCACCTTTTGGTCATCCACTAGAGCGTTTCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACCCCGTTCTGTTCCAACCAATACCTACATACATCTATTCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTTGCCCGCAATAGAGTCAATAATTTGCGTTGTTTGACCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACGTTGTTATCACAACAACTGGTAACTATGAAGATGGCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTTGATTCGCTAAAAATAGATACAACAAAAAAAGAAATAACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024120|3|3|2156015-2156567|CRISPRCasFinder CTTTCTATTCCACTACGTTCAGATAAAAC TCCACATAGAAGCATTGTGAATCATAATTTTTGCTGT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC GCGAATGGTATGTGCTGAAGACTATCAAAAAATAAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TAGCGTTCGCACAGAACGTCGTATTGGTTCCGAAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCTTCTGCCACCTTTTGGTCATCCACTAGAGCGTTT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CCCGTTCTGTTCCAACCAATACCTACATACATCTATT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGCCCGCAATAGAGTCAATAATTTGCGTTGTTTGAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC GTTGTTATCACAACAACTGGTAACTATGAAGATGG CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGATTCGCTAAAAATAGATACAACAAAAAAAGAAATAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024120|3|2|2156015-2156567|CRT CTTTCTATTCCACTACGTTCAGATAAAAC TCCACATAGAAGCATTGTGAATCATAATTTTTGCTGT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC GCGAATGGTATGTGCTGAAGACTATCAAAAAATAAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TAGCGTTCGCACAGAACGTCGTATTGGTTCCGAAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCTTCTGCCACCTTTTGGTCATCCACTAGAGCGTTT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CCCGTTCTGTTCCAACCAATACCTACATACATCTATT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGCCCGCAATAGAGTCAATAATTTGCGTTGTTTGAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC GTTGTTATCACAACAACTGGTAACTATGAAGATGG CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGATTCGCTAAAAATAGATACAACAAAAAAAGAAATAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024120|3|2|2156081-2156567|PILER-CR CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC GCGAATGGTATGTGCTGAAGACTATCAAAAAATAAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TAGCGTTCGCACAGAACGTCGTATTGGTTCCGAAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCTTCTGCCACCTTTTGGTCATCCACTAGAGCGTTT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CCCGTTCTGTTCCAACCAATACCTACATACATCTATT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGCCCGCAATAGAGTCAATAATTTGCGTTGTTTGAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC GTTGTTATCACAACAACTGGTAACTATGAAGATGG CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGATTCGCTAAAAATAGATACAACAAAAAAAGAAATAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC
>CP024120.1|AWC61181.1|2154528_2154912_-|VOC-family-protein MMIHKVGQIMLYVKDQDEAVQFWTEKMGFHLIAEEDNGKGFRWIEIAPTKEAETSIVLHNKEFIAKMQPELNLNTPSMLFFTENIEQLHKQLVDKKVEVGEIVNMPTGKAFNFADDEGNYFAIMEKS >CP024120.1|AWC61180.1|2152892_2154287_-|D-serine-ammonia-lyase MQIPMLMNRKIEAFGGGNDMWEKMIKGKTIRKWTEENPILRQLIETSEVFWENPNYSSYEKARQDFVLTTEDVKEAEARLLRFAPYIAKVFPETKEMDGIIESPLVETMHMKQYLEDAFAQEMPGRFLLKCDNNLPISGSIKARGGIYEVLQHAEKLAIEHNLLCEEDHYAKLDSDRFREFFSQYSIAVGSTGNLGLSIGIMSAKLGFQVTVHMSADAKEWKKELLRNKGVTVVEYESDYSKAVEEGRKQAEQDPHCYFIDDENSKHLFLGYAVAASRVKQQLEDKNIRVDKDHPLFVYLPCGVGGGPGGVAFGLKLLFGDAVHCFFAEPTHSPCMLLGLVTGLHDEIAVQDFEIDNVTEADGLAVGRASGFVGKIMEPLLSGCYTVEDQQLYELLKAMVDTENIRLEPSALAAVYGPVQLYRQENYVKRHKLEGKMNRSTHMMWATGGGMVPKSVFDEYYQNQ >CP024120.1|AWC61179.1|2152408_2152846_+|DUF2512-domain-containing-protein MSDIALVLIKFISCIIAFAIGLALFFPATLVQIISFSLFVTIISYVFVDKIILERIGRSAAIMTDFLLTYLSVWIFGNILLDHYMQIAWGSILSALVFTLCEVIVQRFSHAHERHNSDNIHLNRRFSYGTEFAEEQNPLDKNKKK >CP024120.1|AWC61178.1|2148718_2152249_-|DUF4020-domain-containing-protein MTFLGKEGIRMWITSEVEIPEELFDHLEQGKLVLFVGAGVSMKGKSNLPNFDDLVDEIAKALYVEKREITEPHDYYLGKIAKTKDVHQIAKDLVNVEGSKPNPLHYAIPRLFPKDTDVRIVTTNFDQHFTTAMRESDWDFNIYYAPALPTGRAFKGLAYIHGNVEQEKENLILTDGDFGRAYLTEGWARRFLVDLFSNYTVLFIGYSHNDPVMKYLATGLPPSTRRYAFVAHGDNTYHWEHLGVKPIVYPNKANNHQALVRAVKRWAELMGDNYITKRMRIRDIVTVPPSVEQEQLSYIKQAIKKIEMLRYFVEFARDYGWVEWLEAEGKLQNLFRMTSHYDEVDELLAAWLVEQFLVSHQKELFQLIFKNHSKISPLLWKSICTYLKETKKPMDPILFAKWTLLLLETAENNSQSIEKISYLLQKCSFPEHKEISVLLLTFILDGKIKLKRVKRWEDDMQDSVELEESSCLPVSVFSHVQRIWEEKMKPHISYFAGPILVMGLEKLQMLSLRQTALQKRDGVLYHTMEFSEHDLQPKDFTFLIRIMKECLAYLCEHNKEKAAYYIAQMIDTDSILQKKIAIEAMSENTFVTADEKLMWLRKQQLIFDFTYKHEVFQFLKKHYQNALEKTKKEVIQEVMKHLENERFFDACLVLDLLYTCDANSTSTARAYRIMKRTHPHFTSNQYGEKKEEVRAPNIICDVTADGLLKLKGHEIKKQILLCSNDDSFEQRHFLEMLSKACKLNVDWSIALAYQLIGEQRVSDEIWFVCIREWRNNRKLTNEQIQKIIPLLQQFVRNPAFYWLISSFLYEISNRLEDFQENQIRAVKRFAFSLFPHIMKGESSFKVGELDFYNESIQHPVGKMTSVLLKLLAYDHLYDRNIHEYLFLFEEQIKVASERTHFMLARLTADVTFLFHIEKQWCRKYVLPYLKLNREHKAVKYAWAGLCYTQINLPLFTEIKKYIKYAAEHLELLHPHTKQVFLKWLSFVCIKCVLYWGQRTDWVYMIFIEEKEHDKIKFLKHLCYYVKTLSAREKQKFWDSWLATFLKERPKMSLITGREYVMLLRFVFYMDEVAEKGVYTILNCFPIPIEHCSEAEMKQLLLTILTRKEKVIAHVQAYAKLFFILLQIVQDASSIENEMIQMKEMLETCHVDDDILTAIQNEMIRIGIVVTNFQQES >CP024120.1|AWC61177.1|2146874_2147951_-|bifunctional-3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase/chorismate-mutase MANHELEQLRKQVDEINLQLLKLLNERGRIVQKIGEQKQLQGTKRFDPVREREVLDMIAERNEGPFETSTVQHIFKTIFKASLELQEDDNRKALLVSRKKKQENTIVDVKGERLGSGTQSFIMGPCAVESLEQVRQVAQAIKEQGLKLMRGGAFKPRTSPYDFQGLGVEGLQILRQVADEFDLAIISEILNPNDVEMALDYVDVIQVGARNMQNFDLLRAVGKVNKPVLLKRGLAATIDEFMHAAEYIIAQGNDQIILCERGIRTYEKATRNTLDISAVPILKKETHLPVVVDVTHSTGRRDLLLPTAKAALAIGADAVMAEVHPDPAVALSDSAQQMDIPEFHRFMEELKEFKNKLS >CP024120.1|AWC61176.1|2144842_2146468_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MITVSNVSLRFADRKLFEDVNIKFTPGNCYGLIGANGAGKSTFLKILSGEIEPTTGDVHITPGERLAVLKQNHFEYEEFPVLETVIMGHTRLYEVMQEKNAIYMKEDFSDEDGMRAAELEGEFAELNGWEAESEAAILLKGLGIGEELHDKKMSELTGAEKVKVLLAQALFGQPDVLLLDEPTNHLDLKAIQWLENFLMNFENTVIVVSHDRHFLNKVCTHMADLDFGKIQLYVGNYDFWYESSQLALKLTQDANKKKEEKIKELQNFIARFSSNASKAKQATSRKKLLDKITLDDIKPSSRRYPFVGFTPEREVGNDLLTVEGLSKTIDGEKVLDNVYFTLNKGDKVAFIGRNDIAMTTLFKILMGEMEPDSGSFKWGVTTSQSYFPRDNSAYFENSEYNLVEWLRQFSPQDESESFLRGFLGRMLFSGEEVKKNVSVLSGGEKVRCMLSKMMLSGANVLVLDDPTNHLDLESITALNNGLIAFKGTILFTSHDHQFVQTIANRIIEVTPNGVIDKETTYDEYLENEELQKQVSAMYQNK >CP024120.1|AWC61175.1|2142395_2144369_-|LTA-synthase-family-protein MKQLLQKSKRVLSNHFGFFIFAVVLFWLKTYAAYVTEFNLGISNTIQKFLLFFNPLSSAILFLGLALFAKGKRSYILLIVINLLLSILLYANVVYYRFFSDFITFPTLTQTNNFGEIGGSVLALLQPYDPLYFLDTIVLLVLVLTKVANPKPIRVAKYKLSLVFISAILIFSINLGLAESDRPQLLTRTFDRNYIVKYLGAYNYTIYDGIQSMKASTERAMADGDSMTEVRNYIASNYASPSAEYFGKGKGMNVIYIHLESFQNFLIDYKLNGQEVTPFINSFTKDANTLYFDNFFHQTGQGKTSDAEFMLENSMFGLPQGSVFTTKSHNTYQAAPAILGQQGYTSAVFHGNYKTFWNRDDIYKSFGFNKFFDASYYDMNEKDVVNYGLKDKPFFNESIPLLETVKQPFYTKFITLSNHFPYPIDKEEATIEPATTGDSSVDTYFQTARYLDEAVKGFVDYLKQSGLYDNSIIVMYGDHYGISDNHNRAMSQIMGKEIHSFENAQLQRVPLIVRVPGIKGGVQHQYGGEIDVLPTLLHLLGIDTKDYIQFGTDLLSPEHKQVVAFRNGNYVSPTVTALNGRYYDTTTGEPVEVTEEIKQNEQMVQQTLKLSDQVVNGDLLRFYTPEGFTPVDRSKYNYNHRDKNKTKVKTTQDTKTE >CP024120.1|AWC61174.1|2139654_2141760_-|PTS-lichenan-transporter-subunit-IIC MILDYRSAAILQQMMQADSYTSVDQLTEVLQVSKRTIYYDMKKVDDWLITEHLEPIQYVRPLGYCLDKKTKQKVAQKLQGLITVQYEYSPQERKAWLALYLLTEEKRILLEDLIKLIQVSRNTTLADLKKLKAELGKFKLSLQFHRKQGYYIKGMEQGKRNVLIAYLSQLIAKHGWEYVVSHMRNIVNHGEGEKKQTAQDKLHVIKGILSKCEEFLGVQYTDEVLENLSVYMYLFCSRIVKGRYIEMEETEKAVLRETKHFQAATYIGTQFEKLLYIKFPKDEIYYITTHLLGAKVNAQQKEYEKNDVHGIWHIVDCMIQDFQHYACVIFRDFTGLASDLYLHMKPAFYRVKYGIEIKNPLLQIIRNSYAEVYHLTKKVVHHFEQYVGKEISEDEIAFITMHFSAWMRKEGIVPSPRKTALLVCPNGIGTSRMLQYQLEQLFSNMDILQAISKREYESNTFDVDCIITTTELEKGLIPIFMVNPILTDAEKASLFRKVNATLFREDQNDSADIIMQMIHKYADVRDEHALKRELREFISGPVHFGREEKYKPMLNELLTKEYIQLQDHVDSWEGAIRIAAKPLLQTEYISEEYVQEMIANVKKLGPYIVIAPKIAIPHARPESGVKKLGMSLLQLKESVSFSEKQEHAVNLIIVLAAIDNETHLKALAQLSDMLSQPENVDLLIRSNSKEQMLEMIAKYSN >CP024120.1|AWC61173.1|2139372_2139642_-|PTS-lactose-transporter-subunit-IIB MKKILVVCGNGLGSSFIVEMNVKKILDELGLQAEVSHTDLASSKSEQADLYLGSKDIICNLEDGVRTVAGLTNILDQNEIKEALQKHLM >CP024120.1|AWC61172.1|2138033_2139293_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MFDLIMKDILGQPAILVGLFAMCGLLLQKKNFADTVSGTLKTIMGFIVLGGGATILTGSLDIFGKMFDKAFHIKGIIPNNEAIVAIAQQTLGKETAFIMVFGMIVNLLIARFTKLKYVFLTGHHTLFMACLISAVFSTAGLKGFSLVLIGSILLGVLMVIFPALLQPYVRKITGMDDIAIGHFGSVGYLAAGFVGSKFGNKEKSTELIQVPKSLGFLRDTSVSMSLTMAVLFFIVAPFAGKQFIEAELSNGQNFLVYSFMQAITFAAGVYIILAGVRMLIAEIVPAFKGIADKLVPNAKPALDCPTIFPFAPNAVIIGFLTSFIAGLLSMFILPVIGLSVIVPGLIPHFFTGATAAVFGNATGGRRGAILGSFVNGLLISFLPALLLPVLGGLGFENTTFGDSDFAVIGILISEITKLF >CP024120.1|AWC61182.1|2156790_2157054_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIITYDIGEKRVGKACKKLKQYLTWTQNSVFEGELSRTQLLKCLAELDQIIISSEDSIYLYEVNNPRNIKKKVFGIEKSYEELFL >CP024120.1|AWC61183.1|2157058_2158042_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MLRDFYIFSNGRMKRKDNTFYFINEEEKKRSLPIAQIDNLYVFGQVDFNTKLLNFLNQHQIHVHFFNYYGFYSGSFTPRESNLSGFTLVQQSAHYLDTDKRLILAKAFVSSAVFHMLRTLRGYKQITAEMLGEIIRLTPQISQASTIQQLMGVEGLIRQEYYSMFNYILPPEFSFYKRSKKPPQDEINALISFGNSLCYTTVLSEIYKTQLNPTISYLHEPSSKRYSLSLDIAEIFKPLIVDPLIFTLVNKKMISLKHFESLDEMVLLNEQGRKKFLQAWEGKLGQTVMHRRLKRKVSYKYFIRLECYKLIKHMIGDELYKPLKAWW >CP024120.1|AWC61184.1|2158035_2158533_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKGTYIHYYFVCHRKLWLFVHQIQLEIESERVIEGKILHDSTYQRMEHRELDIDGVGKIDGIEGEYIREIKLTSKMQEADRWQLLYYLAELKKRGVTKKGLLSYKKEKRTEEVHLTEANQQELENIQKRIQAIILSDKPPKLEKKKYCSSCAYYDFCFSGEGEGC >CP024120.1|AWC61185.1|2158595_2160821_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MFLAKSNPKETLREHTDELRSRYKKLKESYGHYFDERIWELLLYAVDYHDAGKAHEPFQLKIRRALGEGVKLQRNLEVPHNYLSPFLLPESIFSLPKKDYQALIQAIAYHHERDIEPNDTLIRQALWQDLWPKMDEINKHLNINGANLEKKFNRILAQLHRRIKYSDNKENYVDYVILKGLLHRIDHAASAHVDIEIDAKQDFKKLVDAGFQKIAEKKRVPVEEVYRDLQKHAHKHRKENLIIVAQTGMGKTEAALLWASDSKTFFTLPLRVSINALFHRVYEKMNYKNVGLLHSSSMDYLTENLEEDWEVIAEQSKHFSSKLLFTTIDQILKFPFLYRGYEKELATMAYSSVVIDEIQAYDPKIAAVLVRALEMIYLVGGKFLLMTATLPSIYLETLNESEIISSDGFRVDTFIDDCVIRHCIEVVEKPIVDDFEKIVDLGKQKKILVIANTVKRAMELYNKIKEHSDNVHVFHSMYIQKHRTLIEKELLLFDENKEATGIWITTQLVEASIDIDFDVLFTEAATLDSLCQRFGRCYRRRQYMMHQEPNVFIYAVDMSGVKYVYDEEILMKSLDILRPFNRKILLESQKIELVSQLYSRENLKGTEFLKTFDDALEQLQTFEDYTLSSKDAQKLLRDIQAELVIPRNIYDENEHLFEQLKIVNKEERARLYREIAKLTVSLRKNRVRGKTSRIPHERIQSNGKKYNLLPWIKILELQYDFDEKSKTGTGVLLDQELDNFI >CP024120.1|AWC61186.1|2160874_2161573_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVIRLKLFQETACYTKPFANKVAETYPLPPYSTVKGMIHQLLQANELLPLRFSIQGNYETKLIDYRKSYMVKKKSVSMPIIFDGLAMEVPEQEHMTSMPLYTHMLFNVELVIHIAGEEALLERIYQHFIELNQHLSLGRHEDLVRVDEVTFVELEECDEWYSKYAIYAPKYYYKTDFPAGIPYRLNWTYKIVNGIREWNKIPSLYVNGNNPHFEDGKLFHTDGEHIVLWNE >CP024120.1|AWC61187.1|2161569_2162463_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNNKALTLTIIFKASSLNYGEGTANISELKKFHRGNGEVYSFASRQAIRYDIVRLGNQLFNWNLNVVDKSKGVVQFKDDCTIADSVEMDLFGYMKTKAKAGADKRSAVVRLSHAVSLEPYRSDLEFLNNMGLASRIQENPNLATLEQHESLYTYTLTVDLSKVGVDGEIELPVDEKVNRVKQLIELTKYLNREIRGRQENLSPLFVIGGVYPIANPFFLGRISLQNFDSNLLNVKSLASVLGQTVLGHDVRTCTKIGLVDGVFANEEEISQLTDTVSVEEFYQHVMNEVEQFYKVLV >CP024120.1|AWC61188.1|2162455_2164204_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MIFVTEEIPLAAEEWTITQGLVGYYRILKHAGIKVKTTDEGILFNPEHLRNFEHYYFDYFLDRFSVAKRDEQNIRRTFLKFRAESELKGSKEAKRRMQAAKKSLDETIKKTAIEKVEKKFEDSSHKKRLVEYATLIRNQKTYNPEMDKWIEEYIQALSEPNINEKLTLNYFKATVLGTYFGQVSFLNVSHTSKDIEEQKEIFRKDYIESLLADLELQQMIARAEDSDEIMKYLEISTHEMAKKLKTKFKKMTIQQIKDYVSNEINCCSFFDSQWAFEQYSELHFSPLSMSASKALNFYWNANGTLTIPVSKLAKLILFCAPAGASIIGGKSLFVQREGRFEQVIYANETYEIGRSKDKAFDEIIFDLIAEQKTKAQHTGDSYLILEYSSEYNAKKTDLQYLHLTPGLCSFFKEKNCTKWFSRLNYVLRNQIVHAFLRYQDSKHIIHNALRKKLQEQKLANEIVYACLLRCYYLFFVKGEGKMNTDLKTSKNRIWSAFYEGVAIKNIVEEGKIRSVAYRLLNAIRSNDKKMFLDTVMRLYMSVEKPLPRVFMNILDESNIDFASIGDSFIAGLISKEEEKINE >CP024120.1|AWC61189.1|2164203_2164905_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLHIKLQTNRFPISYRMMMVSFIKEALKLSDAAYFQQIYQESKANRPFSYGVYIHDYKLNATEFHIKGYVGLTITSPDAQFMLHFYNGLMKMNDFRYKGFSLKRMKVQMVNSADINQNHVYFKTLSPLLIRDKHAKPIFIDDDKFEKELNYISDTVLKEFRGYGLKQPLIFTSKNMKKVVVKEKIHSDHDTLFFTGYHGIFSLQGAVEDLKILSEIGLGFRSSQGFGAVEVV >CP024120.1|AWC61190.1|2165116_2165368_-|hypothetical-protein MAGTNRFLQVNVRFLEAFTYIVDGGRLFIIMKWTFSVPPFVASSFSVEVLVTNRVTLLTDLVFFHFFDASSVYIVHSISNDIR >CP024120.1|AWC61191.1|2166936_2167263_-|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MFIETKTLTVKEGTSDLVVQRFSGEGMIEKFEGFIDLNVLVKKVRRGDEEVVIMIRWESEEAWKNWETSEEHLAGHRANRGKPKPEHILNAEHAVYYVKATKSAYQQS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024120_4 | 2165898-2166650 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of CP024120_4
|
11 spacers
spacers of CP024120_4
>4.1|2165927|36|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT TTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGG >4.2|2165992|36|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT TAATTCATCAAATTCTTTTCCGCCTGCGCTAATTAC >4.3|2166057|36|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT GTACTCATTAAACAAAAATAAATCTATAAAATCCGA >4.4|2166122|37|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT AAAAGCGTGGTCGTGAAACTGGTAAAGAGGTAACGCT >4.5|2166188|35|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT CGTCGCATTGGTTCCGAATTGGACAAGTTCACCGC >4.6|2166252|37|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT CCGTTGATTATTTACTTGGATTAACTTCTGCAAGACG >4.7|2166318|37|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT CAAGTCGTGGACAGTCTACCAACCACGATACGACTTT >4.8|2166384|39|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT TACCACAAACCTGTCACGTATCATTTTCATCAGCAATGA >4.9|2166452|38|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT TGAATCCGAGATTGGAATGGTGTTTTGTAATGTGTCAA >4.10|2166519|37|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT TTATTTTCTCAAAGTGTGAAATAAACTCGCGAAAAAT >4.11|2166585|37|CP024120|CRISPRCasFinder,CRT CAAGTCGTGGACAGTCTACCCACAACGATTCGACTTT >4.12|2165993|36|CP024120|PILER-CR TAATTCATCAAATTCTTTTCCGCCTGCGCTAATTAC >4.13|2166058|36|CP024120|PILER-CR GTACTCATTAAACAAAAATAAATCTATAAAATCCGA >4.14|2166123|37|CP024120|PILER-CR AAAAGCGTGGTCGTGAAACTGGTAAAGAGGTAACGCT >4.15|2166189|35|CP024120|PILER-CR CGTCGCATTGGTTCCGAATTGGACAAGTTCACCGC >4.16|2166253|37|CP024120|PILER-CR CCGTTGATTATTTACTTGGATTAACTTCTGCAAGACG >4.17|2166319|37|CP024120|PILER-CR CAAGTCGTGGACAGTCTACCAACCACGATACGACTTT >4.18|2166385|39|CP024120|PILER-CR TACCACAAACCTGTCACGTATCATTTTCATCAGCAATGA >4.19|2166453|38|CP024120|PILER-CR TGAATCCGAGATTGGAATGGTGTTTTGTAATGTGTCAA >4.20|2166520|37|CP024120|PILER-CR TTATTTTCTCAAAGTGTGAAATAAACTCGCGAAAAAT >4.21|2166586|37|CP024120|PILER-CR CAAGTCGTGGACAGTCTACCCACAACGATTCGACTTT |
cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024120_4
The CRISPR arrays of CP024120_4 >merge|CP024120|4|2165898-2166650|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATCTTATCCACTACGTTCAGATAAAACTTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGGATTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTAATTCATCAAATTCTTTTCCGCCTGCGCTAATTACCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACGTACTCATTAAACAAAAATAAATCTATAAAATCCGACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACAAAAGCGTGGTCGTGAAACTGGTAAAGAGGTAACGCTCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACCGTCGCATTGGTTCCGAATTGGACAAGTTCACCGCCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACCCGTTGATTATTTACTTGGATTAACTTCTGCAAGACGCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACCAAGTCGTGGACAGTCTACCAACCACGATACGACTTTCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTACCACAAACCTGTCACGTATCATTTTCATCAGCAATGACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTGAATCCGAGATTGGAATGGTGTTTTGTAATGTGTCAACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTTATTTTCTCAAAGTGTGAAATAAACTCGCGAAAAATCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACCAAGTCGTGGACAGTCTACCCACAACGATTCGACTTTCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024120|4|4|2165898-2166650|CRISPRCasFinder TTATCTTATCCACTACGTTCAGATAAAAC TTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGG ATTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TAATTCATCAAATTCTTTTCCGCCTGCGCTAATTAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC GTACTCATTAAACAAAAATAAATCTATAAAATCCGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC AAAAGCGTGGTCGTGAAACTGGTAAAGAGGTAACGCT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CGTCGCATTGGTTCCGAATTGGACAAGTTCACCGC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CCGTTGATTATTTACTTGGATTAACTTCTGCAAGACG CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CAAGTCGTGGACAGTCTACCAACCACGATACGACTTT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TACCACAAACCTGTCACGTATCATTTTCATCAGCAATGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGAATCCGAGATTGGAATGGTGTTTTGTAATGTGTCAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTATTTTCTCAAAGTGTGAAATAAACTCGCGAAAAAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CAAGTCGTGGACAGTCTACCCACAACGATTCGACTTT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024120|4|3|2165898-2166650|CRT TTATCTTATCCACTACGTTCAGATAAAAC TTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGG ATTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TAATTCATCAAATTCTTTTCCGCCTGCGCTAATTAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC GTACTCATTAAACAAAAATAAATCTATAAAATCCGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC AAAAGCGTGGTCGTGAAACTGGTAAAGAGGTAACGCT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CGTCGCATTGGTTCCGAATTGGACAAGTTCACCGC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CCGTTGATTATTTACTTGGATTAACTTCTGCAAGACG CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CAAGTCGTGGACAGTCTACCAACCACGATACGACTTT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TACCACAAACCTGTCACGTATCATTTTCATCAGCAATGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGAATCCGAGATTGGAATGGTGTTTTGTAATGTGTCAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTATTTTCTCAAAGTGTGAAATAAACTCGCGAAAAAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CAAGTCGTGGACAGTCTACCCACAACGATTCGACTTT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024120|4|3|2165964-2166650|PILER-CR TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT AATTCATCAAATTCTTTTCCGCCTGCGCTAATTACC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACG TACTCATTAAACAAAAATAAATCTATAAAATCCGAC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACA AAAGCGTGGTCGTGAAACTGGTAAAGAGGTAACGCTC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACC GTCGCATTGGTTCCGAATTGGACAAGTTCACCGCC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACC CGTTGATTATTTACTTGGATTAACTTCTGCAAGACGC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACC AAGTCGTGGACAGTCTACCAACCACGATACGACTTTC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT ACCACAAACCTGTCACGTATCATTTTCATCAGCAATGAC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT GAATCCGAGATTGGAATGGTGTTTTGTAATGTGTCAAC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT TATTTTCTCAAAGTGTGAAATAAACTCGCGAAAAATC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACC AAGTCGTGGACAGTCTACCCACAACGATTCGACTTTC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC
>CP024120.1|AWC61190.1|2165116_2165368_-|hypothetical-protein MAGTNRFLQVNVRFLEAFTYIVDGGRLFIIMKWTFSVPPFVASSFSVEVLVTNRVTLLTDLVFFHFFDASSVYIVHSISNDIR >CP024120.1|AWC61189.1|2164203_2164905_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLHIKLQTNRFPISYRMMMVSFIKEALKLSDAAYFQQIYQESKANRPFSYGVYIHDYKLNATEFHIKGYVGLTITSPDAQFMLHFYNGLMKMNDFRYKGFSLKRMKVQMVNSADINQNHVYFKTLSPLLIRDKHAKPIFIDDDKFEKELNYISDTVLKEFRGYGLKQPLIFTSKNMKKVVVKEKIHSDHDTLFFTGYHGIFSLQGAVEDLKILSEIGLGFRSSQGFGAVEVV >CP024120.1|AWC61188.1|2162455_2164204_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MIFVTEEIPLAAEEWTITQGLVGYYRILKHAGIKVKTTDEGILFNPEHLRNFEHYYFDYFLDRFSVAKRDEQNIRRTFLKFRAESELKGSKEAKRRMQAAKKSLDETIKKTAIEKVEKKFEDSSHKKRLVEYATLIRNQKTYNPEMDKWIEEYIQALSEPNINEKLTLNYFKATVLGTYFGQVSFLNVSHTSKDIEEQKEIFRKDYIESLLADLELQQMIARAEDSDEIMKYLEISTHEMAKKLKTKFKKMTIQQIKDYVSNEINCCSFFDSQWAFEQYSELHFSPLSMSASKALNFYWNANGTLTIPVSKLAKLILFCAPAGASIIGGKSLFVQREGRFEQVIYANETYEIGRSKDKAFDEIIFDLIAEQKTKAQHTGDSYLILEYSSEYNAKKTDLQYLHLTPGLCSFFKEKNCTKWFSRLNYVLRNQIVHAFLRYQDSKHIIHNALRKKLQEQKLANEIVYACLLRCYYLFFVKGEGKMNTDLKTSKNRIWSAFYEGVAIKNIVEEGKIRSVAYRLLNAIRSNDKKMFLDTVMRLYMSVEKPLPRVFMNILDESNIDFASIGDSFIAGLISKEEEKINE >CP024120.1|AWC61187.1|2161569_2162463_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNNKALTLTIIFKASSLNYGEGTANISELKKFHRGNGEVYSFASRQAIRYDIVRLGNQLFNWNLNVVDKSKGVVQFKDDCTIADSVEMDLFGYMKTKAKAGADKRSAVVRLSHAVSLEPYRSDLEFLNNMGLASRIQENPNLATLEQHESLYTYTLTVDLSKVGVDGEIELPVDEKVNRVKQLIELTKYLNREIRGRQENLSPLFVIGGVYPIANPFFLGRISLQNFDSNLLNVKSLASVLGQTVLGHDVRTCTKIGLVDGVFANEEEISQLTDTVSVEEFYQHVMNEVEQFYKVLV >CP024120.1|AWC61186.1|2160874_2161573_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVIRLKLFQETACYTKPFANKVAETYPLPPYSTVKGMIHQLLQANELLPLRFSIQGNYETKLIDYRKSYMVKKKSVSMPIIFDGLAMEVPEQEHMTSMPLYTHMLFNVELVIHIAGEEALLERIYQHFIELNQHLSLGRHEDLVRVDEVTFVELEECDEWYSKYAIYAPKYYYKTDFPAGIPYRLNWTYKIVNGIREWNKIPSLYVNGNNPHFEDGKLFHTDGEHIVLWNE >CP024120.1|AWC61185.1|2158595_2160821_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MFLAKSNPKETLREHTDELRSRYKKLKESYGHYFDERIWELLLYAVDYHDAGKAHEPFQLKIRRALGEGVKLQRNLEVPHNYLSPFLLPESIFSLPKKDYQALIQAIAYHHERDIEPNDTLIRQALWQDLWPKMDEINKHLNINGANLEKKFNRILAQLHRRIKYSDNKENYVDYVILKGLLHRIDHAASAHVDIEIDAKQDFKKLVDAGFQKIAEKKRVPVEEVYRDLQKHAHKHRKENLIIVAQTGMGKTEAALLWASDSKTFFTLPLRVSINALFHRVYEKMNYKNVGLLHSSSMDYLTENLEEDWEVIAEQSKHFSSKLLFTTIDQILKFPFLYRGYEKELATMAYSSVVIDEIQAYDPKIAAVLVRALEMIYLVGGKFLLMTATLPSIYLETLNESEIISSDGFRVDTFIDDCVIRHCIEVVEKPIVDDFEKIVDLGKQKKILVIANTVKRAMELYNKIKEHSDNVHVFHSMYIQKHRTLIEKELLLFDENKEATGIWITTQLVEASIDIDFDVLFTEAATLDSLCQRFGRCYRRRQYMMHQEPNVFIYAVDMSGVKYVYDEEILMKSLDILRPFNRKILLESQKIELVSQLYSRENLKGTEFLKTFDDALEQLQTFEDYTLSSKDAQKLLRDIQAELVIPRNIYDENEHLFEQLKIVNKEERARLYREIAKLTVSLRKNRVRGKTSRIPHERIQSNGKKYNLLPWIKILELQYDFDEKSKTGTGVLLDQELDNFI >CP024120.1|AWC61184.1|2158035_2158533_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKGTYIHYYFVCHRKLWLFVHQIQLEIESERVIEGKILHDSTYQRMEHRELDIDGVGKIDGIEGEYIREIKLTSKMQEADRWQLLYYLAELKKRGVTKKGLLSYKKEKRTEEVHLTEANQQELENIQKRIQAIILSDKPPKLEKKKYCSSCAYYDFCFSGEGEGC >CP024120.1|AWC61183.1|2157058_2158042_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MLRDFYIFSNGRMKRKDNTFYFINEEEKKRSLPIAQIDNLYVFGQVDFNTKLLNFLNQHQIHVHFFNYYGFYSGSFTPRESNLSGFTLVQQSAHYLDTDKRLILAKAFVSSAVFHMLRTLRGYKQITAEMLGEIIRLTPQISQASTIQQLMGVEGLIRQEYYSMFNYILPPEFSFYKRSKKPPQDEINALISFGNSLCYTTVLSEIYKTQLNPTISYLHEPSSKRYSLSLDIAEIFKPLIVDPLIFTLVNKKMISLKHFESLDEMVLLNEQGRKKFLQAWEGKLGQTVMHRRLKRKVSYKYFIRLECYKLIKHMIGDELYKPLKAWW >CP024120.1|AWC61182.1|2156790_2157054_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIITYDIGEKRVGKACKKLKQYLTWTQNSVFEGELSRTQLLKCLAELDQIIISSEDSIYLYEVNNPRNIKKKVFGIEKSYEELFL >CP024120.1|AWC61181.1|2154528_2154912_-|VOC-family-protein MMIHKVGQIMLYVKDQDEAVQFWTEKMGFHLIAEEDNGKGFRWIEIAPTKEAETSIVLHNKEFIAKMQPELNLNTPSMLFFTENIEQLHKQLVDKKVEVGEIVNMPTGKAFNFADDEGNYFAIMEKS >CP024120.1|AWC61191.1|2166936_2167263_-|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MFIETKTLTVKEGTSDLVVQRFSGEGMIEKFEGFIDLNVLVKKVRRGDEEVVIMIRWESEEAWKNWETSEEHLAGHRANRGKPKPEHILNAEHAVYYVKATKSAYQQS >CP024120.1|AWC61192.1|2167604_2167949_+|hypothetical-protein MRKAILIFIVAIFIIGIVHIAVTPINYKSYTIEALWFASAGCTLIFLAFLNYVLISIKQRQTRFFVICHTANILCTILVAFILTIAFAPHIILLFVLLVSKTLLVIGFQFSSKS >CP024120.1|AWC61193.1|2168073_2168403_-|hypothetical-protein MSFNQVLKVIDENIGKRFVLGIDGLSRLGRTTLVKQLEQKLKQKGASFYIFHIDDHIVERNKRYHTKFEEWYEYYYLQWDIEWLRYHFFQQLKWKEQFRFLGASPKTPS >CP024120.1|AWC61194.1|2168381_2168948_-|N-acetyltransferase MGFPTLETERFILRELTLLDAENMFHYFQKESVMRYFGMDAIRNMEQVKRMIQMFSKKYKEGSQVRWGIELKGTNRFIGTCGFHFINLNHKRAEIGYELDDAYWGKGYATEAVQTIVTYAFQTMKLIRIGAVVYKENEASHKLLKKIGFQKEGLLRKYMIQNNVEYDTIIYSLLAEDWEKKSCLSIKY >CP024120.1|AWC61195.1|2169317_2169563_+|DNA-alkylation-repair-protein MEPMLCPNCKTNRTRFNILEQQVKPVKLNPQTGQIEEEYTNETLNVFHMSYQGPTYRVQCAVCGLVENPEQFIKPAQNKLF >CP024120.1|AWC61196.1|2169800_2170337_-|DUF2812-domain-containing-protein MEIKKTFKFFTAWNLEKEEAYLREMHQKGWAFQKYHFMYTFKKTEPKDVVYKADFNFDFQKSLKNQREYLEIYEMSGWKYVSSFTKWHYFCKEVVDKNELPDIYSETETRIEKLKDLLNHLVIIFLSILPAISISCLESPANKLSIIIKGFIGFVVCIHMYMFVRLILKIRKLKKEII >CP024120.1|AWC61197.1|2170338_2170662_-|PadR-family-transcriptional-regulator MDEKAKKYIPLTEATYYILLSFAKRIHGYGVMQMVEEMTDGEVKLGPGTLYGNITKLLTEKLIVEVDSTDRKKCYMLTPFGREVLELEFKRLQRSVQNGKQILREKM >CP024120.1|AWC61198.1|2171263_2172247_-|DUF4003-domain-containing-protein MITLQQKLEQYTSIYKQLKRELKWKTSDSRTGMMIAAMYTSSDKPFDLERFLQISHYIKSQVGMFSYLKSYHRFVVAATLDIHFTHYKTAFQQFLDLYERFIASGFSRSIFTYLAAATLLPDDREQYEARIQRSVKVYKRMKEDHFFLTSTSDYPLAVLLAGQQEEIGPLMDRVERLYQKLATSGLRKGNDLQFLSHILSLKKDIREDMLVARCTNIWNLFKQEKVKVKQMHYPAIGLLALLEDGEKEVSSIRTFMEKLQGDKLFRWQTDTNILIAIQLFVSQKGMEHQAANTGLQTMIEILIQAQQAAFIAAISASTAATSASSNS >CP024120.1|AWC61199.1|2172327_2172795_-|NUDIX-domain-containing-protein MDLTFQVNQSCFNYRVGAICKHDNKILMLQNEGEDFWYVPGGRVQLLETSEVAIKRELKEELGVDVAVKRPLWIVENFFTYDSRQFHEISLYYEVNLLTLPVKGADSFLFEEEGRKYKFQWIPLEQICEYNVKPEFLKDKMTQLPLHVEHIVKSQ >CP024120.1|AWC61200.1|2173153_2173399_-|hypothetical-protein MKGIFWLNLYMSLHVRMGETLYYGLGVRITNSHSEEKVIRHSGLTPNSHAKMFFIPKTDWGGVILTNKNHIFEEEALPQLK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024120_2 | 2.1|2037705|30|CP024120|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2037705-2037734 | 30 | NZ_CP051687 | Duganella sp. GN2-R2 plasmid unnamed2, complete sequence | 5370-5399 | 7 | 0.767 |
CP024120_2 | 2.3|2037837|30|CP024120|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2037837-2037866 | 30 | NZ_CP016619 | Microvirga ossetica strain V5/3m plasmid unnamed2, complete sequence | 891211-891240 | 7 | 0.767 |
1. spacer 2.1|2037705|30|CP024120|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP051687 (Duganella sp. GN2-R2 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ccacctt--tgaaacgcgtctggatcaacgag CRISPR spacer --gacttggcgaaacgcgtctggatccacgat Protospacer . *** .**************** ****
2. spacer 2.3|2037837|30|CP024120|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016619 (Microvirga ossetica strain V5/3m plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tagccaaatttcaatgtcatcggaaataat CRISPR spacer aagccaaatttccatgtcatcggtgaggtt Protospacer *********** ********** .* . *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
269592 : 277570
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024120|269592:277570|DBSCAN-SWA CATGCTAAAGCCATTAGGTGATCGCGTTGTAATTGAACTTGTTCAAGCGGAAGAAAAAACAGCAAGCGGTATTGTATTACCAGACACTGCAAAAGAAAAACCACAAGAGGGTAAAGTTATTGCAGTAGGTACTGGGCGAGTGCTTGAAAATGGTGAGCGTGTTGCTTTAGAGGTAGCAGCAGGCGATCGTATCATCTTCTCAAAATATGCAGGTACTGAAGTGAAATATGAAGGTACAGACTACTTGATTTTACGCGAAAGTGACATTTTAGCAGTTATCGGTTAATTATATATTTAAAAAATCCAAGGGGGTCAATATTATGGCAAAAGATATTAAATTTAGTGAAGAAGCACGTCGTTCGATGCTTCGCGGTGTCGACACTCTTGCAAACGCAGTAAAAGTAACACTTGGACCAAAAGGTCGCAACGTTGTACTTGAGAAAAAATTTGGTTCACCACTTATTACAAATGACGGTGTAACAATCGCAAAAGAAATTGAATTAGAAGATGCTTTTGAAAACATGGGTGCAAAATTAGTAGCAGAAGTTGCTAGCAAAACAAATGATGTAGCTGGTGACGGAACAACAACTGCAACTGTATTAGCACAAGCTATGATTCGTGAAGGTTTGAAAAACGTAACAGCTGGTGCAAACCCAATGGGTCTTCGCAAAGGTATTGAAAAAGCTGTTGCTACAGCAGTAGAAGAGTTAAAAACAATTTCTAAGCCAATTGAAGGTAAATCTTCTATCGCACAAGTAGCGGCTATTTCTGCTGCTGACGAAGAAGTAGGTCAATTAATTGCAGAAGCGATGGAACGCGTTGGTAATGATGGCGTTATTACATTAGAAGAATCTAAAGGATTCACAACAGAATTAGATGTAGTAGAAGGTATGCAATTTGATCGTGGATATGCATCTCCTTACATGATTACTGATTCTGACAAAATGGAAGCAGTTCTTGATAACCCATATATCTTAATTACTGACAAAAAGATTTCTAACATTCAAGAGATCTTACCAGTGTTAGAACAAGTGGTCCAACAAGGTAAACCACTTCTTATTATCGCTGAAGATGTAGAAGGTGAAGCGTTAGCTACATTAGTAGTAAACAAACTTCGCGGTACATTCAATGTAGTAGCTGTTAAAGCTCCAGGATTTGGTGACCGTCGTAAAGCAATGTTAGAAGATATCGCAATCTTAACGGATGGCGAAGTAATCACTGAAGAACTAGGCCGCGACTTAAAATCAGCTACAATTGAGTCTTTAGGACGCGCTGGTAAAGTTGTGGTAACGAAAGAAAACACAACAATCGTAGAAGGTGTAGGAAGCACTGAACAAATCGAAGCTCGCATCGGTCAAATCCGTGCGCAATTAGAAGAAACAACTTCTGAATTCGATCGTGAAAAATTACAAGAACGTCTTGCTAAACTTGCAGGTGGCGTTGCAGTAATTAAAGTAGGTGCAGCAACTGAAACTGAGTTAAAAGAACGTAAACTTCGCATTGAAGATGCACTTAACTCAACTCGTGCAGCAGTAGAAGAAGGTATTGTTGCAGGTGGCGGTACTTCACTTATGAATGTATACGCTAAAGTAGCTTCTATTGCAGCTGAAGGCGACGAAGCAACAGGTATCAACATTGTACTTCGTGCATTAGAAGAGCCAGTTCGCCAAATCGCAATCAACGCTGGTCTAGAAGGATCTGTAGTGGTAGAACGTCTAAAAGGCGAAAAAGTAGGTGTTGGTTTCAACGCAGCAACAGGCGAATGGGTAAACATGCTTGAGTCTGGTATCGTAGACCCAGCAAAAGTAACTCGTTCTGCACTTCAAAACGCAGCATCTGTTGCAGCAATGTTCTTAACAACAGAAGCAGTAGTAGCTGACAAACCAGAAGAAAATAAACCGGCAATGCCAGACATGGGTGCAATGGGCGGCATGCCAGGAATGATGTAATTTCATTATTCGCTAAAACACTCATCTCTTTTCGAGAGATGGGTGTTTTTTGTTATCAAATTTCTCGAAATTATAGTAAAAAAGGTTTTATCGTAACCGAAATATAATTTCTGTAGAATTTTGTCGTGTTCTCTCTTGACCGTATTGATATTTCATTGTTAGAATCTAGAAAGATAATATAAAACAATCCTTCATATATCCTCAATAATATGGTTTGAGAGTCTCTACCGGGTTACCGTAAACAACCTGACTATGAAGGCAGTGCGTCTTATTGTTTATAAAGAGCAACATACTATCTTTATAAAGCTAGACTCCTGCCTTTTCTTTATTATGAGACGAGAGGTGGGGGACTGGCTTTTTTTATTATATTGGTAATGCTTTTTGCCTAATTTGGTGAAAATATTTATATACAGAACTAACGTTGGGGTGATTATTTTGAAAAAACAGCACGATACGATTATCGTTTTAGACTTTGGAAGTCAGTACAACCAATTAATTGCACGTCGCATTCGTGAGTTCGGTGTGTACAGTGAGCTTCATCCACACACAATTACTGCGGAAGAAATTAAAGCAATGAATCCAAAAGGTATCATTTTCTCTGGTGGACCAAATAGTGTATACGGCGAAAATGCATTCCACTGTGATGAGAAAATTTTTGAGCTAGGATTACCTATTTTTGGTATTTGTTACGGCATGCAGCTGATGACAAAACACTTTGGTGGAAAAGTAGAGCGAGCAAACCATCGTGAGTACGGAAAAGCAGTTCTGAAAGTAGAGAATGAATCAAAATTATATACAAACCTGCCAGAAGAACAAGTTGTATGGATGAGCCATGGTGACTTAGTAACAGGTTTACCAGAAGGCTTTGTAGTAGATGCAACGAGCGAATCTTGTCCAATTGCTGGTATGAGCAATGAAGAAAAGCAATTATACGGTGTACAATTCCATCCAGAAGTACGTCACTCTGAGCACGGTAATGATTTAATTAAAAACTTCGTATTCGGCGTATGCGGTTGTTCTGAAGGCTGGAACATGGAGAACTTTATTGAAGTAGAATTAGAAAAAATTCGTGAAACAGTTGGCGATAAAAAAGTACTATGTGCACTTAGCGGTGGTGTAGATTCTTCTGTTGTAGCTGTATTAATTCATAAAGCAATCGGTGATCAGTTAACATGTATTTTTGTTGACCACGGTTTACTTCGTAAAGGTGAAGCAGAAGGTGTTATGAAAACATTTAGCGAAGGCTTCCATATGAATGTTATTAAAATCGATGCTAGAGAACGCTTCATGAAAAAGCTAAAAGGTGTAGAAGATCCTGAACAAAAACGTAAAATTATCGGTAACGAATTCATTTATGTTTTTGATGATGAAGCTGCTAAATTAGAAGGAATAGACTTCTTAGCGCAAGGTACACTGTACACAGACATTATTGAAAGTGGTACAGCAACTGCGCAAACAATTAAATCTCACCATAACGTAGGTGGACTTCCAGAAGATATGCAGTTCAAATTAATCGAGCCTTTAAATACGTTATTTAAAGATGAAGTACGTGTATTAGGATCAGAACTAGGAATTCCTGATGAAATTGTATGGCGTCAACCATTCCCAGGTCCTGGACTTGGTATTCGTGTATTAGGTGAAATTACAGAAGAAAAATTAGAAATTGTTCGTGAATCTGATGCGATTTTACGTGAGGAAATCCAAAAAGCAGGATTAGACCGTGAAATTTGGCAATACTTCACTGCGCTTCCTGGTATGCGCAGCGTAGGTGTTATGGGTGACGAGCGTACTTACGATTATACAGTAGGTATCCGTGCCGTAACATCAATTGACGGTATGACAGCTGACTGGGCACGTATCCCTTGGGACGTATTAGAGAAAATCTCTGTACGTATCGTAAACGAAGTAAAACACGTGAACCGCGTTGTATATGATATTACTTCTAAGCCACCAGCAACGATTGAGTGGGAATAAAACTATTTATTTGCAGGAAGATCCATCTTATATATAGATGGATCTTTTTTATACGAACAAAAAAAGTTTAACTTATAAAATTGTTCGTTTTTAAGTTGACATATATTTTTTTGTACGCTAATATGATTATATGATTGATACAAAAAGTGAATATTATAGCCGTCGTATAATCTCGGGGATATGGCCCGAAAGTTTCTACCTAGCTACCGTAAATGGCTTGACTACGAGGCGTTTTTATAAAGATAAGGGGAATTTATCTTTATTTATAGAACGCTTCCATGTATATAGGCAATGGAAGCCTTTTTTATTTTTTAGGATAAAAGAGGGCTAGGATGAAGTGCGACGAGTCATTATACAACGGAGGAAACGTAAGATGAAACGTTATTTTCAGTTTGATGAGCTCGGTACAAATTATAAGACTGAGTTCATTGCAGGGTTAACAACATTTTTATCTATGGCTTACGTACTATTTGTTAATCCTGCCACACTGTCACTTGGAAACATTAAAGGACTGCCGGCAGGAACCGGAATGGATCCGGGAGCAGTATTCGTTGCCACTGCATTAGCGGCAGCAATCGGTTCTTTAATTATGGGGATTTTTGCAAAATATCCAATAGCATTAGCGCCAGGTGTAGGGATTACTTCTTTCTTTGCTTACACAGCGGTATTAACAATGGGAGTTCCATGGCAGACAGCAATTGCGGGAACACTCGTATCAGGTATTATCTTTATTATTATTACAGCTCTTGGTATCCGTGAAAAAATTATTAATGCAATTCCTGCAGAGTTAAAACTTGCAGTAGCAGCAGGTATTGGCTTATTTATCGCCTTTTTGGGTTTTCAAAATGCCGGAATTATCGTGAAAAATGATGCGGTTCTTGTTGGATTAGGAGACTTAACAAAGGGCGCAACGTTGTTAGCGATTTTCGGAGTAGTTGTTACGATTATTTTAATGATTAAAAAGATAAATGGTGCAGTGTTCTATGGGATGATTCTTACAGCTATTCTTGGAATGGCAACAGGATTAATTGATACGCCAAAAGCTGTAGTAGGAGCAATTCCAAGTTTAGAACCGACGTTCGGTATGGCGTTAACGAACTTTGGAGATATTTTTACTGTTCAAATGGGGATTGTTATTATAACATTCTTCTTTATCGATTTCTTTGATACAGCAGGTACACTCGTAGCGGTTGTCAATCAAGCGGGTTTAATGAAGGATAATAAATTACCACGTGCAGGGAAAGCATTATTTGCAGATGCGATTGCGACTGTAATTGGTGCGATTCTAGGTACTTCTACAACAACTTCCTATATTGAGTCGTCTGCAGGGGTAGCAGCGGGAGGACGTTCTGGATTTACAGCAGTTGTAACAGCAGGATTCTTCTTACTGGCACTTTTCTTTTCGCCGCTATTAAGTGTTATAACGCCAGCTGTAACGGCGCCAGCTTTAATTATTGTAGGGATTTTAATGGTTTCATCTTTAGGGGAAATTGAGTGGAAAAAGTTCGAGATTGCTGTACCAGCATTTTTCACAATTATTTCAATGCCACTTACGTATAGTATCGCAACGGGAATTGCAATTGGATTCATCTTCTATCCAATTACAATGGTTGTAAGTGGACGACGTAAAGAAGTTCATCCAATTATGTATGTAATGGGAGTTTTATTCGTACTATATTTCATCTATGTTCGGAAGTAGAGGGGTTTTTAAAGGTCTAGACTAAGAGGGGGTCTAGACCTTTTTTACGTCTTCAGAAAATCTTAAGGATTTCGCACCGTTTTTCTTTAGAAATTTTTTTATAATGGAAAGTAGGGAGTTTAAGAATTTTGGGGGAGATATTGTGAGACAAGAAACAATACTTGTTGTAGATGATGAAAAAGAAATTAGAGATTTAATTACAATTTATTTAAAGAATGAAGGATATAACATACTGCAAGCAGGAGATGGAGCAGAAGGGTTAGAGATATTAGAAAACAATGAAGTCCATTTAGTTGTACTAGATATTATGATGCCGAAAATTGATGGGATTCATATGTGCATGAAAGTAAGAGAACAAAAAGAAATGCCGATTATTATGTTATCGGCTAAAACACAAGATATGGATAAAATTTTAGGATTAACAACAGGTGCAGATGATTATGTGACAAAACCATTTAATCCGTTAGAACTTGTAGCAAGAGTGAAATCACAACTTCGTCGATATATGAAAATGAGCGGATTTATGATTGAAAACGAAAATGAAATAGAGATTGGGGATATAAAAATAAATGTTTCTACACATGAGGTAGTTGTAGCGGATCGAGAGGTGAAATTAACACCAAGGGAATTTTCAATTTTAGAGTTACTAGTGCGCAATTCAGGGATGGTATTTAGTACAGAACAAATTTATGAAAAGGTGTGGAATGAAAGGTCTTTTCAGTCAGACAATACTGTAATGGTACATATTCGAAAAATTCGCGAGAAGGTTGAAGAAAATGCAAGAAAGCCGAGATACATAAAAACAGTATGGGGAGTGGGGTATAAGGTTGAGAAGGATAATTAAAAATATATTTAGACCAATTGGTTGGATAAGTGGGATTTTAAAAAAAATAATATATAAAGGAATATGTGGGGTACAAAAGAGTTTGCGTGTACAACTGATAACGACGTTTGCTCTCTGTAGCTTGCTGGGAATCATGGGAGTGTGGGCATCATCTCCGTTTTTTCAAGGAATAAATAAATATTCTGTAATTGATTATTCATCTGGTATGCGATTTATTGATACAACCGCTGAAAGTCTTGTAGCGGCTATTGTAAGGGAAGGGGCTTCTGTTAACGTCCAAGAAGTTTTGGAACGTCCAGAATATCAAAGAGAGTTAAAAGTTCTAATTGTTGATGAGAACGGGAAAGTTATATATAAGACGAAAGGTGCTCAAGAAGAACAAATTAATCTTCATAGTACAATTCGTAATATTATGAGTTTCAAAATAAATCGTTCTCAATATGAATATCAAAAAGATGTAATAGATAATGAAATAGAAAGAGAACGTAAAGAGTTTACAACTTTTTATCCTTTGACAATTGAAGAGAAAAATATGTATATGATTGCAAGTGGTATACCACAAGGGAATATTCGAGAAGTACAGAATGATGGCCCGTTTCCGTTTCTAATAGGATTTGTTCTTTTTTTATTTTCTTTCTTTTATCTAACAAAAAGAAAAATGAAGCAGATTGAGGCAATGGCCGAAGGGGTAAAAGAAATTACAAAAGGAAATCTACAACATAGAATTCCAGAGAAGGGACAAGATGAGTTAAGTTTGTTGGCTGTGAATATGAATCAGATGGCAGAAGAATTGTTTTCTAATATAGAAAAAGAAAGACGGATAGAAAAGCAAAAAAATGAATTGATTACAAACGTATCTCATGATTTACGAACACCCCTTACTTCTATTATGGGGTATTTACGATTGCTTCGTGATTCTAAATACGAAAATAAAGAACAGCATGATGAATATACAAGAATTGCTTTTACGAAGTCGGAGCAGTTAAAGAATTTAATAGAAGATTTATTCGAGTATACGAAATTAACGAATGAAAAGGTCATATTAGAAAAGCAAGAAGTATGTATCAATGAACTTCTAGAACAATTAATAGAAGAGTTAGTCCCGCAGGCTGAAGAAGAAGGACTGACATTCATAAAACATTTTCCTGAAGAACGTATGTATGCTACGATTGATTCGGAGAAGATGGTTCGTGTGTTTGAGAATTTATTAATGAATGCGATTAAGTATAGTAAAGATAATGGAGAGATTAAAGTATCACTTCAAAGACAAAGACGTGATATCCAAATCATTGTGGCAAATTATAGTGAAGAATTTACAAAAGAAGAATTGGCTAATTTATTCGAGCGTTTTTATAAGAAAGATCAATCGCGAAGTAGAGTCAAAGAAGGATCTGGGCTTGGTCTCGCGATTGCAAAAAGTATTGTAGAACTCCAGGGAGGTCAAATTCGAGCTCATTATGAAGATGGAGAGATTCAGTTTATCGTTTCATTACCTATCATGGAAGAGAAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024120|269592:277570|273887_275213_+|AWC59559.1|DBSCAN-SWA MKRYFQFDELGTNYKTEFIAGLTTFLSMAYVLFVNPATLSLGNIKGLPAGTGMDPGAVFVATALAAAIGSLIMGIFAKYPIALAPGVGITSFFAYTAVLTMGVPWQTAIAGTLVSGIIFIIITALGIREKIINAIPAELKLAVAAGIGLFIAFLGFQNAGIIVKNDAVLVGLGDLTKGATLLAIFGVVVTIILMIKKINGAVFYGMILTAILGMATGLIDTPKAVVGAIPSLEPTFGMALTNFGDIFTVQMGIVIITFFFIDFFDTAGTLVAVVNQAGLMKDNKLPRAGKALFADAIATVIGAILGTSTTTSYIESSAGVAAGGRSGFTAVVTAGFFLLALFFSPLLSVITPAVTAPALIIVGILMVSSLGEIEWKKFEIAVPAFFTIISMPLTYSIATGIAIGFIFYPITMVVSGRRKEVHPIMYVMGVLFVLYFIYVRK >CP024120|269592:277570|275355_276057_+|AWC59560.1|DBSCAN-SWA MRQETILVVDDEKEIRDLITIYLKNEGYNILQAGDGAEGLEILENNEVHLVVLDIMMPKIDGIHMCMKVREQKEMPIIMLSAKTQDMDKILGLTTGADDYVTKPFNPLELVARVKSQLRRYMKMSGFMIENENEIEIGDIKINVSTHEVVVADREVKLTPREFSILELLVRNSGMVFSTEQIYEKVWNERSFQSDNTVMVHIRKIREKVEENARKPRYIKTVWGVGYKVEKDN >CP024120|269592:277570|269592_269877_+|AWC59556.1|DBSCAN-SWA MLKPLGDRVVIELVQAEEKTASGIVLPDTAKEKPQEGKVIAVGTGRVLENGERVALEVAAGDRIIFSKYAGTEVKYEGTDYLILRESDILAVIG >CP024120|269592:277570|276082_277570_+|AWC63036.1|DBSCAN-SWA MSGILKKIIYKGICGVQKSLRVQLITTFALCSLLGIMGVWASSPFFQGINKYSVIDYSSGMRFIDTTAESLVAAIVREGASVNVQEVLERPEYQRELKVLIVDENGKVIYKTKGAQEEQINLHSTIRNIMSFKINRSQYEYQKDVIDNEIERERKEFTTFYPLTIEEKNMYMIASGIPQGNIREVQNDGPFPFLIGFVLFLFSFFYLTKRKMKQIEAMAEGVKEITKGNLQHRIPEKGQDELSLLAVNMNQMAEELFSNIEKERRIEKQKNELITNVSHDLRTPLTSIMGYLRLLRDSKYENKEQHDEYTRIAFTKSEQLKNLIEDLFEYTKLTNEKVILEKQEVCINELLEQLIEELVPQAEEEGLTFIKHFPEERMYATIDSEKMVRVFENLLMNAIKYSKDNGEIKVSLQRQRRDIQIIVANYSEEFTKEELANLFERFYKKDQSRSRVKEGSGLGLAIAKSIVELQGGQIRAHYEDGEIQFIVSLPIMEEK >CP024120|269592:277570|269911_271540_+|AWC59557.1|DBSCAN-SWA MAKDIKFSEEARRSMLRGVDTLANAVKVTLGPKGRNVVLEKKFGSPLITNDGVTIAKEIELEDAFENMGAKLVAEVASKTNDVAGDGTTTATVLAQAMIREGLKNVTAGANPMGLRKGIEKAVATAVEELKTISKPIEGKSSIAQVAAISAADEEVGQLIAEAMERVGNDGVITLEESKGFTTELDVVEGMQFDRGYASPYMITDSDKMEAVLDNPYILITDKKISNIQEILPVLEQVVQQGKPLLIIAEDVEGEALATLVVNKLRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTDGEVITEELGRDLKSATIESLGRAGKVVVTKENTTIVEGVGSTEQIEARIGQIRAQLEETTSEFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAATETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTSLMNVYAKVASIAAEGDEATGINIVLRALEEPVRQIAINAGLEGSVVVERLKGEKVGVGFNAATGEWVNMLESGIVDPAKVTRSALQNAASVAAMFLTTEAVVADKPEENKPAMPDMGAMGGMPGMM >CP024120|269592:277570|271966_273514_+|AWC59558.1|DBSCAN-SWA MIILKKQHDTIIVLDFGSQYNQLIARRIREFGVYSELHPHTITAEEIKAMNPKGIIFSGGPNSVYGENAFHCDEKIFELGLPIFGICYGMQLMTKHFGGKVERANHREYGKAVLKVENESKLYTNLPEEQVVWMSHGDLVTGLPEGFVVDATSESCPIAGMSNEEKQLYGVQFHPEVRHSEHGNDLIKNFVFGVCGCSEGWNMENFIEVELEKIRETVGDKKVLCALSGGVDSSVVAVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEAEGVMKTFSEGFHMNVIKIDARERFMKKLKGVEDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEAAKLEGIDFLAQGTLYTDIIESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRVLGSELGIPDEIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRESDAILREEIQKAGLDREIWQYFTALPGMRSVGVMGDERTYDYTVGIRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVKHVNRVVYDITSKPPATIEWE |
6 | uncultured_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
310546 : 318918
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP024120|310546:318918|DBSCAN-SWA GATGATTAGTCGTTATACACGCCCTGAGATGGGTGCGATTTGGACGGAAGAAAATAAATTTAAAGCATGGTTGGAAGTGGAGATTTTAGCTTGTGAAGCATGGGCGGAACTTGGTGAAATTCCAAAAGAAGATGTGAAAAAAATTCGCGAAAATGCATCATTTAATATGGATCGTATTTATGAAATTGAAAAAGAAACACGTCATGATGTAGTAGCATTTACTCGTGCAGTATCAGAAACACCTGCATTAGGGGAAGAACGCAAATGGATTCACTACGGTTTAACATCAACAGACGTAGTAGATACAGCATTGTCTTATATTTTAAAACAAGCAAATGAAATCTTATTAAAGGACTTAGAAAACTTTATTGAGATTTTAGCAAATAAAGCGAAAGAACATAAATACACAGTTATGATGGGGCGAACACATGGTGTTCATGCAGAACCAACAACGTTTGGTTTAAAACTTGGTCTTTGGTATGAAGAAATGAAACGTAACTTGGAACGTTTCAAACAAGCAGCTAATACAGTTCGCGTCGGTAAATTATCAGGTGCAGTTGGTACGTATGCAAACATTAATCCATTTGTAGAAAAATATGTTTGTGAAAACTTAGGATTAGAAGCAGCGCCAATTTCTACACAAACATTGCAACGTGATCGCCATGCGCATTACATGTCAACACTTGCATTGATTGCCACATCTATTGAAAAGATGGCAGTTGAAATTCGCGGTTTACAAAAGAGTGAAACTCGTGAAGTAGAAGAGTTTTTCGCAAAAGGTCAAAAAGGTTCTTCTGCTATGCCGCATAAACGTAACCCGATTGGCTCTGAAAATATGACTGGTATGGCACGTGTTATTCGCGGTTATATGTTAACAGCTTATGAAAATGTTCCATTATGGCATGAGCGTGATATTTCGCACTCTTCTGCAGAACGTGTTATCTTACCCGATGCAACTATTGCATTAAACTATATGTTAAACCGCTTCGGTAATATCGTGAAAAACTTAACGGTATTCCCAGAGAACATGAAACGCAATATGCAAAGAACATACGGTTTAATTTATTCGCAACGTGTCATGCTTACTCTTATCGACAAAGGTATGGTACGTGAAGAAGCTTATGATATCGTACAGCCTAAAGCGATGGAAGCGTGGGAGACACAAGTACAATTTAAAGATCTTGTAGAGGCAGATGAGCGTATTACAAACAAGTTAACACAAGAAGAAATCAACGAATGTTTCAACTATGAATATCACTTACAACATGTTGATACTATTTTTGAACGTCTTGGACTAAACTAAGCAGAAAATTTTATATGGCACAGAATAGCGTTATTCTGTGCCATTCTTTATAAAAATATTATTCACATTTTTCAAACTACAGGGGGCTTGCGAAATGCAAAAGCTAGAATTGCTGTATGAAGGTAAGGCAAAAAGAATATATCGTACAGAAGCAGCAGATATGGTTTGGATAGAGTACAAAGATAGTGCTACTGCTTTCAATGGAGAGAAAAAAGCGACCATTACAGGAAAAGGTCGTTTGAACAATGAAATTACAACTTTTTTGTTCAGAAAGTTGCAAGAAGTGGGAATTGAAACACATTTTGTAAAGAAGCTATCAGATACAGAACAACTTGTGAAAAAAGTAAGTATTATTCCATTAGAAGTTGTTACAAGAAACGTCATTGCAGGGAGCCTTTCCAAACGATTAGGAATGGAAGAGGGAATACCACTTACGAAACCAATCGTAGAATTTTACTACAAAGATGATGATTTAGGAGATCCTCTTGTAACAGAAGATCATATTCGTGTGTTAAACGCTGCAACATTAGAGCAGATAAGTACATTACGAGAAAAGGCTCTACGAATCAATCAAGTTTTGATTGAGCATTTCGCAAGCTGTCGTGTAAGGTTAATAGATTTTAAATTAGAGTTTGGTATTACAGAGGAAGGCAAGATTGTATTAGCGGATGAAATCTCACCAGATACTTGTCGTTTATGGGATGAAGAGAGCAATGAGAAATTTGATAAAGATGTATTTCGCCGCGATTTAGGTAATTTAACCGAGGCATATGAAGAAATTTTAAAACGTTTAGGAGGGGCTTCACATGTATAAAGTTAAGGTATATGTAACATTAAGAGAGAGTGTATTAGATCCACAAGGAACAGCAGTAAAAGGTGCTCTTCACAGCCTTTCCTTTACAGAAGTACAAGATGTGCGCATTGGTAAATATATGGAGTTAACAATTGATAAATCGGTAACTGATCTTGATAGAAAAGTAAAAGAAATGTGTGAAAAACTATTAGCAAACGTTGTAATGGAAGATTTCCGTTATGAAATTGAGGAGGTTGTCGCACAGTGAAATTTGCCGTAATCGTTTTTCCAGGTTCGAACTGTGATGTTGATATGTTTCATGCAATTAAAGATGAGCTTGGTGAAGATGTAGATTATGTTTGGCATGATGCAGAGAACTTAGACGAATATGATGCGATTCTTTTACCAGGTGGATTCTCTTATGGTGATTACCTTCGCTGCGGTGCCATTTCTCGATTTGCGAATGCAATGAAAGCAGTGCAAAAAGCTGCTGAGCAAGGAAAGCCTATTTTAGGCGTGTGTAATGGATTCCAGATTCTTGTTGAATCAGGATTATTACCAGGGGTATTGATACGAAATCAAAACTTAAAATTCATGTGCCGAACTGTTCCGTTACGTGTTGAAAATAATGAAACGATGTTTACATCACAATATAACAAGGGGGAAATCATTCATATCCCAATTGCACATGGTGAAGGAAATTATTATTGTGATGAAGCAACTCTTAAAAAATTAGAGCAGAAGAATCAAATTGTATTCCGTTATGTAGACAATCCAAACGGAAGTGTTTCAGATATTGCAGGTATTGTAAATGAAAAAGGTAATGTGCTTGGCATGATGCCACACCCAGAGCGTGCTGTGAATGAAATTCTTGGCGGTGCAGAAGGGTTAAAAGTCTTTCAATCTATTTTGAAATATTGGAGGGAAACATATGTCGTTAATGCTTGAACCAAATCCAACACAAATTAAAGAAGAACGTATATATGCGGAAATGGGGTTAACAGACGAAGAGTTTGCCATGATTGAAAAGATTTTAGGACGTCTGCCGAACTATACGGAAACAGGGCTTTTCTCTGTTATGTGGTCAGAGCATTGTAGTTATAAAAACTCAAAACCAGTTCTTCGCAAGTTCCCAACAACAGGAGAACGTGTATTACAAGGACCTGGAGAAGGCGCAGGTATTGTAGATATTGGTGATAATCAAGCAGTTGTATTTAAAATGGAAAGTCACAATCATCCTTCGGCAATTGAGCCGTATCAAGGTGCAGCAACAGGGGTTGGCGGTATTATTCGTGATGTATTCTCTATGGGAGCACGTCCGGTTGCATTATTGAACTCACTGCGCTTCGGTGAACTCCAATCACCACGCGTGAAGTATTTATTTGAAGAAGTAGTTGCAGGGATTGCAGGATACGGTAACTGTATTGGTATTCCAACTGTTGGCGGAGAAGTACAATTTGATCCATGTTATGAAGGAAACCCACTTGTCAATGCAATGTGCGTTGGGTTAATTCATCATGAAGATATAAAAAAAGGGCAAGCGCACGGTGCTGGTAACACGGTTATGTATGTCGGTGCTTCAACAGGACGAGACGGTATTCATGGTGCAACTTTCGCATCAGAAGAACTATCTGAGAGTTCAGAAGCAAAACGCCCAGCAGTACAAGTAGGCGATCCGTTTATGGAGAAACTTCTTATTGAAGCATGCTTAGAGTTAATCCAATCTGATGCGCTTGTTGGAATTCAAGATATGGGCGCTGCGGGCTTAACATCATCTTCTGCGGAAATGGCAAGTAAAGCGGGAATGGGTATTGAAATGTATTTAGACGATGTGCCACAGCGTGAAACAGGTATGACACCATATGAAATGATGTTATCTGAATCACAGGAACGTATGTTGATTGTGGTGAAAAAAGGTAGAGAGCAAGAAGTTGTAGAGTTATTTGAAAAGTATGGCTTAGCGGCAGTTGCGATGGGAAAAGTAACGGAAGATAAAATGCTTCGTTTATTCCATAAAGGTGAAATGGTAGCAGAAGTACCTGCGGATGCATTAGCAGAAGAAGCGCCAATTTATCATAAACCTTCAAAAGAGGCAGCATATTTTAAGGAATTTCAAGAAATGAAAATGAAGACGCCAAAAGTAGATAACTATAAAGAAACATTACTAGCTTTATTACAACAACCAACGATTGCAAGTAAAGAATGGGTATATGATCAGTATGATTATCAAGTACGCACAAGTACTGTTGTTACACCAGGATCAGATGCAGCGGTGGTGCGAGTACGTGGTACAGAGAAGGCATTAGCAATCACAACGGACTGTAACTCTCGTTATATTTACTTAGATCCTGAAACGGGCGGTAAAATTGCAGTAGCAGAAGCTGCGCGTAATATTGTATGTTCTGGCGGAGAACCACTTGCAATCACAGATTGCTTAAATTTTGGTAATCCAGAGAAACCAGAAATTTTCTGGCAAATTGAGAAATCAGTAGATGGTATGAGCGAAGCTTGTCGTACATTACAAACTCCAGTTATTGGTGGAAATGTATCAATGTACAACGAGCGCAGCGGTGAAGCTGTATATCCAACACCAACTGTTGGAATGGTTGGGCTTGTTCACGATTTAAAACATGTAACAACACAAGAATTTAAGCAAGCTGGGGATCTTATTTATGTTATGGGTGAAACGAAAGCTGAATTTGGTGGAAGTGAATTACAGAAGATGATGTACGGTAAAATCTTCGGTCAATCACCAAGTATTGATTTAGAAGTAGAAGCAAAACGTCAAAAACAATTACTAGAAGCAATTCAGGCGGGACTTGTTCAATCGGCACATGACGTTGCAGAAGGCGGATTAGCAGTTGCGATTGCTGAAAGTGCAATCGGCGCGAAAGGCTTAGGTGCTACTGTGAAATTAGCTGGGGAGGCAACAGCGGCATTATTCGCAGAATCACAATCTCGTTTTGTTGTAACAGTAAAACGTGAACAACAAGAAGCGTTTGAAAAAGTAGTAGAAGCAATTCAAGTTGGTGAAGTCACAAATACAAATGAAGTAACAATTCATAATGAAGAAAATGAAGTACTACTTACAGCAAATGTTGATGAAATGAGAAAGGCTTGGAAAGGGGCAATCCCATGCTTGCTGAAATAAAGGGGTTAAATGAAGAATGTGGCATCTTCGGAATTTGGGGGCATGAAAATGCAGCACAAGTTACGTACTACGGATTGCATAGTTTACAGCACCGTGGGCAAGAAGGTGCAGGTATTGTGGTGAATAATGGGGAGAAAATTATTGGTCATAAGGGGTTAGGTTTAGTATCAGAAGTGTTTTCAAGAGGCGAGTTAGAAGGTTTAAATGGAAAATCGGCCATTGGCCATGTGCGTTATGCAACAGCGGGCGGAAGTGAAGTAGCAAACGTTCAGCCATTACTATTTCGTTTCTCTGATCATAGTATGGCATTAGCTCACAATGGGAATTTAATTAATGCCAAAATGCTTCGCCGTGAATTAGAGGCAGAAGGAAGTATCTTTCAAACAAGTTCAGATACAGAAGTATTGCTGCATTTAATTAAGCGAAATACGAAAGGGTCATTAATCGAGAGTGTAAAGGATGCGTTAAATAAAGTAAAAGGTGCATTTGCATATTTGTTACTAACAAGTCATGAAATGATTGTTGCACTAGACCCAAATGGGTTTCGCCCGCTTTCGATTGGGAAAATGGGGGATGCCTATGTTGTAGCATCTGAAACATGTGCTTTCGATGTAGTTGGTGCGACATATATTCGTGATGTTGAACCTGGAGAACTTCTTATCATAAATGATGAAGGGATTCAAGTAGATCGTTTTACAAATGAAGTAGAGCACGCAATTTGTAGTATGGAATATATTTATTTTGCACGACCAGACTCTAATATTGCCGGCGTCAATGTTCATGCGGCGCGTAAAAATATGGGGAAACGTTTAGCAATGGAAGCACCTATTGCGGCAGATGTTGTAACAGGGGTACCTGATTCTAGCATCTCAGCAGCCATTGGTTATGCAGAAGCAACGGGAATTCCATATGAATTAGGATTAATTAAAAATCGTTATGTCGGACGTACCTTTATTCAACCATCCCAAGAGCTGCGTGAGCAAGGGGTGAAAATGAAGCTTTCTGCAGTACGCGGTGTAGTTGAAGGAAAACGTGTTGTCATGATTGATGACTCAATTGTAAGAGGGACAACCAGTAAGCGGATTGTTCGCATGCTTCGTGAAGCAGGAGCGACAGAAGTGCATGTAAGAATTGCTTCCCCTCCTCTTAAGTATCCATGTTTCTATGGCATTGACATTCAAACGAGAAAAGAATTAATCGCTGCAAATCACTCTGTAGAGGAAATCTGTCAAATCATCGGTGCAGATTCTCTAACATTTTTAAGTGAAGATGGATTAGTAGATGCAATTGGACGTCCATATGAAGGGAAATACGGCGGGTTATGCATGGCTTACTTTAATGGAGATTATCCGACCGCTCTTTACGATTATGAACAAGAACTTTTAGAAAGTATGAAATAAAAAAGAAAAGAAGCTTCTACTTCTTTCTATGTAGAAGCTAGCTTCTTTCTGAAAACGGTCGCCCTAGATGGGGAGAAATTAAAAGACGAGGTGTGAAAAACAATGGCGAATGCGTATAAGCAAGCAGGAGTAGATATTGAAGCTGGATATGAAGCGGTATCTCGCATGAAAAAACACGTACAAACAACAATGAGAAAAGAAGTGCTAGGCGGTCTAGGTGGTTTTGGGGGTATGTTTGATTTATCAAAATTGCCATTAGAAGAACCTGTATTAGTATCAGGAACAGATGGTGTAGGTACAAAGTTAATGCTTGCTTTCATGGCAGATAAACATGACACAATTGGCATCGATGCAGTAGCAATGTGTGTAAATGATATCGTTGTTCAAGGAGCAGAACCATTATTTTTCCTTGACTATATTGCTTGTGGTAAAGCTGATCCAAGTAAAATTGAGCACATCGTCAAAGGTATAGCGGAAGGTTGTCGGCAAGCTGGATGCTCACTAATTGGAGGGGAAACAGCAGAAATGCCAGGTATGTATTCCAAGGAAGAGTATGATTTAGCAGGATTTACTGTTGGGATTGTTGATAAAAAGAAAATTATAACAGGTCATTCGCTTGATGAGGGGCATGTGTTAATTGGTTTAGCTTCTAGTGGGATTCATAGTAACGGTTATTCCTTAGTTCGCAAAGTATTATTAGAAGACGGACAGATGTCTTTAGACCGTATATATGGACGGTTAGAACTACCTCTTGGTGAAGAGTTATTAAAGCCGACGAAAATTTATGTCAAACCTATTTTAGAACTATTGAAGAAATATGAAGTGTATGGCATGGCACATATTACAGGTGGTGGTTTTATTGAAAATATTCCACGTATGTTACCGAAAGGAATTGGAGCAGAAATTGACCTTGGCTCTTGGAACATTCAACCGATTTTTAGCCTAATTCAAGAGGTTGGAAAGATAGAAGAGAAGGAAATGTTCAATATTTTTAACATGGGTATTGGTATGGTAGTAGCGGTGAAAGAAGAAAATGCAAAAGCGGTTGTTCGTCTTCTTGAAGAACAAGGAGAAAAAGCGTATATCATTGGACGCACTGTAAAAGGATCAGGTGTTGCTTTTAATGGAGGAATAGATCATGAATAGATTGGCAATATTTGCCTCTGGAAGCGGATCTAACTTTCAAGCATTCGTTAACGCAGTAGAAGAAAATAGATTACATGCTGAAATTAGTTTGCTAGTATGTGATCAACCCGAGGCGCGTGTAATCGGAAGAGCGCATTATCATCATGTTCCATGCTTTGCTTTTTCGGCGAAAGCATATGAATCAAAGGAAGCGTTTGAAAAAGAGATATTAAAAAAATTACGAGAATACGAGATTGATTTTGTTATTTTAGCGGGATATATGCGTCTTATCGGACCGACATTACTAGAAGCATATGGGGGAAAAATCATTAATATTCATCCATCGTTATTACCGAGCTTTCCAGGAAAAGATGCTATTGGCCAAGCGTTAAAAGCAGGGGTGGGAGTAACTGGAGTAACGATTCACTATGTAGATGCTGGTATGGATACAGGACCGGTTATTGCACAAGAAGCAGTGCAGGTTTCTGAAAATGATACGAGAGATAGTTTGCAAAAGAAAATTCAACAAGTGGAACATCGTTTATATGTAAATACGGTAAATAAAATCATTCAATCTATGAAAGAACGAACTGTGAAATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP024120|310546:318918|317294_318338_+|AWC59577.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVSRMKKHVQTTMRKEVLGGLGGFGGMFDLSKLPLEEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMADKHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYIACGKADPSKIEHIVKGIAEGCRQAGCSLIGGETAEMPGMYSKEEYDLAGFTVGIVDKKKIITGHSLDEGHVLIGLASSGIHSNGYSLVRKVLLEDGQMSLDRIYGRLELPLGEELLKPTKIYVKPILELLKKYEVYGMAHITGGGFIENIPRMLPKGIGAEIDLGSWNIQPIFSLIQEVGKIEEKEMFNIFNMGIGMVVAVKEENAKAVVRLLEEQGEKAYIIGRTVKGSGVAFNGGIDHE >CP024120|310546:318918|311942_312662_+|AWC59572.1|DBSCAN-SWA MQKLELLYEGKAKRIYRTEAADMVWIEYKDSATAFNGEKKATITGKGRLNNEITTFLFRKLQEVGIETHFVKKLSDTEQLVKKVSIIPLEVVTRNVIAGSLSKRLGMEEGIPLTKPIVEFYYKDDDLGDPLVTEDHIRVLNAATLEQISTLREKALRINQVLIEHFASCRVRLIDFKLEFGITEEGKIVLADEISPDTCRLWDEESNEKFDKDVFRRDLGNLTEAYEEILKRLGGASHV >CP024120|310546:318918|318330_318918_+|AWC59578.1|DBSCAN-SWA MNRLAIFASGSGSNFQAFVNAVEENRLHAEISLLVCDQPEARVIGRAHYHHVPCFAFSAKAYESKEAFEKEILKKLREYEIDFVILAGYMRLIGPTLLEAYGGKIINIHPSLLPSFPGKDAIGQALKAGVGVTGVTIHYVDAGMDTGPVIAQEAVQVSENDTRDSLQKKIQQVEHRLYVNTVNKIIQSMKERTVK >CP024120|310546:318918|310546_311848_+|AWC59571.1|DBSCAN-SWA MISRYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGEIPKEDVKKIRENASFNMDRIYEIEKETRHDVVAFTRAVSETPALGEERKWIHYGLTSTDVVDTALSYILKQANEILLKDLENFIEILANKAKEHKYTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGLWYEEMKRNLERFKQAANTVRVGKLSGAVGTYANINPFVEKYVCENLGLEAAPISTQTLQRDRHAHYMSTLALIATSIEKMAVEIRGLQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGMARVIRGYMLTAYENVPLWHERDISHSSAERVILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMQRTYGLIYSQRVMLTLIDKGMVREEAYDIVQPKAMEAWETQVQFKDLVEADERITNKLTQEEINECFNYEYHLQHVDTIFERLGLN >CP024120|310546:318918|312905_313589_+|AWC59574.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMFHAIKDELGEDVDYVWHDAENLDEYDAILLPGGFSYGDYLRCGAISRFANAMKAVQKAAEQGKPILGVCNGFQILVESGLLPGVLIRNQNLKFMCRTVPLRVENNETMFTSQYNKGEIIHIPIAHGEGNYYCDEATLKKLEQKNQIVFRYVDNPNGSVSDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVNEILGGAEGLKVFQSILKYWRETYVVNA >CP024120|310546:318918|315776_317192_+|AWC59576.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGIFGIWGHENAAQVTYYGLHSLQHRGQEGAGIVVNNGEKIIGHKGLGLVSEVFSRGELEGLNGKSAIGHVRYATAGGSEVANVQPLLFRFSDHSMALAHNGNLINAKMLRRELEAEGSIFQTSSDTEVLLHLIKRNTKGSLIESVKDALNKVKGAFAYLLLTSHEMIVALDPNGFRPLSIGKMGDAYVVASETCAFDVVGATYIRDVEPGELLIINDEGIQVDRFTNEVEHAICSMEYIYFARPDSNIAGVNVHAARKNMGKRLAMEAPIAADVVTGVPDSSISAAIGYAEATGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVRMLREAGATEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHSVEEICQIIGADSLTFLSEDGLVDAIGRPYEGKYGGLCMAYFNGDYPTALYDYEQELLESMK >CP024120|310546:318918|313572_315792_+|AWC59575.1|DBSCAN-SWA MSLMLEPNPTQIKEERIYAEMGLTDEEFAMIEKILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTTGERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELQSPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEVQFDPCYEGNPLVNAMCVGLIHHEDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSESSEAKRPAVQVGDPFMEKLLIEACLELIQSDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMYLDDVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLIVVKKGREQEVVELFEKYGLAAVAMGKVTEDKMLRLFHKGEMVAEVPADALAEEAPIYHKPSKEAAYFKEFQEMKMKTPKVDNYKETLLALLQQPTIASKEWVYDQYDYQVRTSTVVTPGSDAAVVRVRGTEKALAITTDCNSRYIYLDPETGGKIAVAEAARNIVCSGGEPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSVDGMSEACRTLQTPVIGGNVSMYNERSGEAVYPTPTVGMVGLVHDLKHVTTQEFKQAGDLIYVMGETKAEFGGSELQKMMYGKIFGQSPSIDLEVEAKRQKQLLEAIQAGLVQSAHDVAEGGLAVAIAESAIGAKGLGATVKLAGEATAALFAESQSRFVVTVKREQQEAFEKVVEAIQVGEVTNTNEVTIHNEENEVLLTANVDEMRKAWKGAIPCLLK >CP024120|310546:318918|312654_312909_+|AWC59573.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGTAVKGALHSLSFTEVQDVRIGKYMELTIDKSVTDLDRKVKEMCEKLLANVVMEDFRYEIEEVVAQ |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
975696 : 1028150
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP024120|975696:1028150|DBSCAN-SWA 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>CP024120|975696:1028150|1007707_1008880_+|AWC60139.1|capsid|DBSCAN-SWA MPNPVLIGAKLNMKRNSLSTLEGKLTELLTKRSELEASIEGIDNEEDLTALEVSIKENDDAITSTEAEKTTLTEEIEELEKELEASNRRSPNKGAKRKMPKQTETREAINAYVRSKDQTRSGFTSVEGGALIPEELLKPQKEKVDTVDLTQYVRKIPVNRGSGKYPIIKKSNGKMISVAELAKNPELAHPKFEDVSYDIETYRGYIPVSQEMIDDADYDISGLIAEDIQDQDLNTKNAEIAAIFKTATAKPVTGLDGIVTLLNTGFKQVYNVKFYVSSSLFNALDLLKDKNGRYLLQDDITVASGKRIKSKEVVVLDDDMIGTKDGDLVGFVGDAYEFCTLFDRKKASVKWTDNDIYGQLLAGFVRFDTKAVDKQAGYYITYTPEAPAGA |
64 | Bacillus_phage(43.48%) | capsid,portal,holin,tail,head,protease,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1098760 : 1164904
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP024120|1098760:1164904|DBSCAN-SWA 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59 | Escherichia_phage(18.18%) | coat,integrase,bacteriocin | attL 1138513:1138540|attR 1167526:1167553 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1978336 : 1986469
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP024120|1978336:1986469|DBSCAN-SWA TATGAGTACTTCAGTTATTATTCAAACACATAATCTATCAAAAATATACGGAACGATACATTGTGTGAATCAGGTGAATCTTCATATTGAAGAAGGAGAAATTTATGGTTTTTTAGGACCAAATGGAGCTGGAAAAACAACTACGTTAAAAATGTTACTTGGGCTTATTAAACCTTCTGAAGGAGACATTAAAGTATTCGGAGACAGTTTGAACAAATGTCGTTCGTCTATTTTAGAGCGGACAGGATCCCTTATTGAATCTCCCTCGTATTATGGACATTTAACAGGACTTGAAAATCTCAAAGTGATGCAACGCCTTCGAAATGCGCCAGATAAAAATGTGCATGAGGTTCTAAAAATTGTACGTTTAGAAAAGCAAATAAATAAAAAAGTGGATCAATACTCACTGGGAATGAAACAACGGTTAGGGATTGCTATGGCTCTTCTTACTTTTCCTAAGTTGTTAATTCTTGATGAACCAACAAATGGTCTTGACCCAGCGGGCATCGGTGAAATTAGAGAATTGATTAAGTCATTACCAAAGCGCTATGGAATCACGGTATTACTCTCTAGCCATCTTCTTTCAGAGATTGAACAAATTGCTACTTCAGTCGGTATTATTAGTGAAGGAAAACTGTTGTTTCAGGGGAGTATGGCTAATCTACAGAAAAGAAATAGAAATGCTATTTTTATTAAAACGGAAGATAATATGAAAGCAGGTCAGCTACTTACTACTCAAGGCTACAACTTTGTCCAAAGTGGTAATCGGTTGAAATTTGCTCATCTTGAGGATGCGAAAGTAGCGGAAGTAAATCGGATGCTTGTTAAAAATGAAATTTCTGTAACCCGAATTGAGAAACAGAAGAAAAGCTTAGAGAACATTTTCCTGGAGTTAACAGAAAAGGAGAGAAGCTTGTGATGAAAATGTTAGGATTAGAATACTTTAAAATTCGTCGCAAAAAAATATGGGTTATGATTCTATTATTTCTTAGCGCAGAGATGCTATGGGCATTTATCGCTCTTAGTCGATCGATGGCTACTAACTCTAGTTTTGTCTCTTGGGAAGCAATTGTTTTTAGTATTTCCTCTATGAATGGCCTTTTTATGCCCATTATTTCAGCGATTGTTGTATCACGTATTTGTGATATGGAACATAAGGGAGAAACGTTAAAAATGCTTGTTGCTACGAATGTAAAACGCAGAGATCTTTACGCAGCGAAGTATATATGTGTGAATAGTTTACTTCTGTTAAGTATTTTTGCACAGGTTGCACTTATGATTATGTTTGGATTCGTACACAAATTTTCTAGTAATTTTTCTTCTGCATTGTTTATTCAATTTGTTTTCGGAACTTTCTTAACGAATCTTGCGGTTACAGCGCTTCAGCAGTGGCTTTCTTTTACTATTAAGAATCAAGTTTTCGCGCTATGTTTAGGCATGCTAGGTGGATTTATTGGAATGACTGCAGGGTTGTTTCCAGCTGCGATTAGACGTATGTTTATTTGGGCTTATTACTTGGAACTTAGCCCGGTTACTCATTTATATAAGAGTTCCTTAAGTGCTTACATAGTCCAGTCGATCAACCTTTGGAATGTCATTGTTACAATAGCTTTAGCTATCTTATTCTATATTGTCGGAAGCGCTCGGATAAGCCGACAAGAAATGTAAGGAGGGAATAGAATGAAACGAAGTATTTTGGCGGAATGTCTTAAATTACGCCATTCTCGAATCCTACTTGTACTCGCGACACTTCCTATTATAAGTTTGCTAATTGGATGCGCGAATTATTATTATAATCAAGAAGTGCTAAAAAATGGTTGGTATAGTTTATGGACGCAAGTTAGTTTGTTTTACAGTGAGTTTTTCTTACCTATTTTAATTGCAATTTGCTGCTCATATATTTGTCGACTTGAGCATTTGAACCGAAATTGGAATATGACTATGACATCTCCTGTATCAGTTGCAAGTGTATTTCTTGCTAAATTCGTTATTGTTAGTCTTTTAATTGGGTTTGCACAAGCGTTATTTATAGGGCTCTACTGGCTTATAGGGAACTTTTTCTTCTTACCTAAAACATTTCCGCTAGAGACAATCGGTTGGGCGATGCGCGGATGGTATGCATCTCTTGCTATTATCGCTCTGCAATTAAGCTTATCGCTAAGAATCCGAAGTTTTGCTATGCCTATCGGTATGAGTTTATGTGCAGTCTTTATCGGACTTGGTATGTATATTGCTAAGTTAGGAATGTTTTTTCCTTTCTCACTGCTCACCATTGGTATGAGTGTACTGAATCAAGAAAAGTTAAGCGTGGGACAGAATTTTTTATTTTTGATGATGAGTACAGTTTTCATTATTATGTTTTCAATGATTTCAATTCAGCGATTAAAGAAAAAAGATATAATCTCATCCTAATCTCACTCAGGATGAGATTTTTATGAAACAAATAATAATATTAGGGATTACTATGATGATAAGCATTGGATTTTGGATGGGTCTATTTAGTAGAGAGGCTTATTCCTAACAGCGCTTCAGGAAAAGGGATGTATTACAGTCCTGGCATACAGAATGAGGCGGGACGTTATAACTATGAGTTGTTTACTTACAATCAACAAGGAAAGAAAAAGAGACTTGTTTTTTCTGCTCGAAACCAATTAAGGAAAGAGTCTTATATTCGGCTATATTATACGCTATTTCGGGTGTTACGTACTGGTAAGAGGTTCAATTTGAGGATTTGCCAAAAGTAGTGAAACAACGGTATAAAAAATAGGAAAAGATAACTTTATAGATTTTACTATTTTTTATATCATATCGTATTTTATGTATAATGAAATTAGGTGATGCAAGATGGGAAATTTAAAAGATAAAAAAATCTTAATTGTCGATGATGAACCAGAAATAAGAATCATGATTGAAAGGTTCTTAAGAAAAGAGGGATTTTTCCGGATTTTTAGTGCTGCTGATTGTACGTCAGCTCTATCGCTTTGTCGTGTAGATCGGCCAGATATCGTTATTCTTGATGTTATGCTACCTGATGGTGACGGCTTTTCACTTTTATCTTCGATTAGGCAGTTCTCAAATATGCCGGTTCTGTTTCTATCTGCACGAGGAGAAGATGAGGACCGGTTACTTGGATTAGGTTTAGGGGCAGATGATTATATTGTAAAGCCGTTCTTACCACGTGAACTCGTATTACGTCTTATCGCTGTTTTAAAACGAGTCTATTCTTCTCCTGTTGTAGAGCGTCTATCAATCTTTCAATTAGGGAAACAAACTGTGGACTTAGAAAGCGCTGTTGTGTATAGGGGTGAAACAGAAATGCCCTTAACAGCAAAAGAACATGCTATTCTTGTAAAGCTATATGAGAATCGAGGTCGAATTGTGACAAGCGACGCTATATGTCAAGCAGTTTGGGGAGATGATAGCTACGGTTACGAAAATACATTAATGGTCCATATTAGGCGAGTACGTGAAAAAATTGAACCAGATCCCTCCAAACCGATTTATCTTCTTACTGTGAGGGGACTAGGGTATAAATTGCTTTTGAAGGAGACGCATTAATTGAGAGGAATTATTCGTATATTACATAAATTTGCAATGGCAACGATATGCATTTCTATATTTTTACTGATTTTTAATTATGTCTTATTAGGCATAATGATATTTAAAGAAATGAATCTAGATTTATCCCCAAAAAATGTGCTGAAGCAAGTGAATGAAGGATTAAACAAACAGGATGAAAACTATCAACTTGATGAACAAGCTGTAAAGTGTCTGCAAAATAATCGCGCTTGGGCAATGTTAATTGGTGAAAATGGGCAAGTACAATGGGAGTATCAATTACCTAAAGATGTACCTAGTTCTTACAAGATGGCGGATATTGCTAAGTTTTCACGTTATTATCTTTCAGAATATCCTGTCTATACGTGGGAACATCAAGATGGGCTACTAGTAGTAGGATATCCAAAGAAAAGTCATTGGAAATATCAACTTCATTTCCTTTCTGATTCGATTCAGTCAATGCCGATGAGACTTCTCCTGCTGCTACTCTTTAATATAGGAATAACTGTATTTATCTCTATGTTGATTGGTACGCGTCTTATAAGAAAAATCCGCCCTCTTGTGTCCGGGGTTCACAAACTGGCCAAGGAAGAAGTCGTTCAGCTGGATTCAAAAGGTCTATTCGGTGATTTAGCTCAAAGTATCAATTCAGCTTCGACTAAGCTTCAAAATAAGACAGCTGCGTTGAAAATGCGAGATGAGGCACGTTCCAACTGGATTGCAGGAATTTCTCATGATATTCGAACACCGCTGTCTATTATTCTTGGTTATGCAAGTGAAATGGAAGATGATTCAGATTTGTCGGAGGATCAGAGAGAACGAGCTCGTATTATGCGACATCAAGGAGAGAAATTACGAGCGCTTGTGAGCGATTTAAACCTTGTTTCTATGCTTGAATATGAAATGCAGCCTTTATATTTAAAAAATATTCGTCTATCTGTTTTAGCAAGACAGGTTGCAACTGATTTTTTAAATAATGGATTAGATGATAAATATCAGATTGAATTAAAATTAAAGGATGACGGGGCTCAAATTAGGGGAGACGAAAAATTACTGATTCGAGCAATTAGTAATGTAGTTCAAAATAGTATCCGGCATAATCCGAATGGATGTGAAATTATTATCGAAACCGCTTTATCAAAAGATCGCTCTACATATCATTTTATTGTACAAGATAATGGACAAGGAATTCCAAATGAAAAAATAGCTGAAATTACCGAATTACCTTATTCTTCAAAAAGAAAACAAACGATTCAAGAAGGGCACGGTCTAGGCATTCCAATGGTAGCAAGAATTATGCAGGCGCACCAAGGACAGCTTATTCTAACAAACAACGAAAATCAAAAAGGTTTACAAGTTGTTATGGAATTTCCTTTAAACTCACAAAATGAAAAAGTATATAAATAAGAAATTGAAGCAAATGAAAATCTTGATTGTAAATAGATACAGGTATTGAGGTTGATTCTGGGCAAGCAGGAATATTTGATTCGGCAATTTAGAGAAAAAATGAAATTATTATGTATGAAGCGAAAAACATTTTTGATATAGATATGGATGAAGAAGAGCATAAATTTTATGTAGCTTGTTAATAATTTAACTGGTAAGGAAGGTGGTGCGTATCAACTTCAGGCTTAGGAAACAATTATTAAATTGAAAAATATCTAGATGATGGTGTACGTGGGCATTACGAGGGCAAAAAATAAAATTTGTCAAAAAAACACTCAACTGAGTGTTTTTTTTGACCTTCATCATTCTTTTTGTAATTATGCAGATGCCTTCTCTTTACGGAAGATTCCCATCAATCCTCCAATTAACAATAATACGCATGGTAGGATGTAAAACATAGAGATGCAAATTAACCCGCCAATAGCAGCAATTGTCATCATAATTCCGCCAACTTTAGCTTTACTTTTTACCATAACTGATCCAACAATACCTAAAATTGAAAGACCCACAGCTCCCCAACCTAAGCCGATAATACTATCTGCTCCGTCGGCTTCTAAAGCAGAGCCAAGTCCACCAATAAATAATGCAATAAATACACATAAAATACCAAAAATACCACCAATAAGTCCTAATACAAATTCAGTTGTTCTTTTCATTTAAACCAATTCTCCTTTATTGTGCAGTTGTGAATTCGAATTTTACAGATTTTTCATCAAACGTAAAATTAGGTTTATATGTACCTATATATTTGTCTGCTTCTGCTACATCAAATAGGACTTTTCCTTGAATTTGATTTCCAGGAGCAATGTTTTCATTCATAAATATATTATCTCCGGCGAAGTATTGTTTAAATTGATTGCCATTAGCATCTGCAATTTTTAATTCTTCAGCACCAAAATAAGCTTCTTTTTTGCCGTTATTTTTAGCATTAAAAGTGATTTCTAGTACTTTTCCTTTTTCTGCTTTTACATATTCGTTTGGTTCTATGAATTTGGCAGAATTGAAAGTGATTTGCAGACCATTAACTTCTACAGTTTCGCCTATTTTATAGACTTTGTTATCAGCTTTACTATCTTTCTTTTCCTCTTGTTTAGGAGAGTCATTTTTGCTCACTTCTGTAAGCGCACTTTGCCCATCCTTCGTTGAGACGCCAATATTTGATGCAGCAAAAGCAATTCATATCGATAAGTCTGCTATAACCAAAAAAATGAAAAAACATAAAATGATGTCTCCTCAAAAACTTGCAAAAATCGCCATCAATGGAGTCCATAAAAATAAACTTATAATCTGCCCCATGCCACTACGCAAAACAATGGATGTCATATTTACAATCTTCCCTTCAATGCATCATGCATTAGGAAGGTTTATTTGCAAAGTAGTTAGAGAAACGAAAGAATCATCTGACTCATATTGATAATTACTTCCTATAAAGTATATCATTCCATTCGGCAATCTTTTATGCTTCGATTATCGGAACGCTCCTGAGTCACTGACAATCGTATTTTGGAATCATGAAGAAGATGATGTAGAAAAGAAGCAGTATATCCAGTTTGTTCAACTTTTCAACAATTGCTTGATAGTTTACGTGCTTGTTTTAGATTTATCTATTAATTAATAAAACCTATACTTAAATATTACAATCATAAAAATAGTGTTACATTTTTAAATAAAAAGGTGTAATTAATAATATTAAAAGACAAAATGTTGAAAGTTTAATTAAAAATCACTTTGAGCTGATTACCAAATATTATAATGATAGGGAAAAAGAACTAATTCATAGTTTACAATTTGAAAAACTATGAATTAGTTTGAATTAATTTATTAGGGGGAAGGCATGTATGAAATCAACTGGAATTATCCGAAAAGTGGATGAACTTGGAAGAATTGTTATCCCAAAAGAATTAAGAGACATGTTAGATATTGGCATTAAATCACCTTTGGAAATATTTGTAGAAAATGAAAGAATCGTTTTAAAGAAATATGTACCTTACAACACTTGTCAAATAACAGGGGAAGTATCGAATGATAATATTTCACTTGCAAATGGTAAAATTATTTTAAGTCCTGAAGGGGCAAAATATTTAATTCAAGAGTTAGAGAACTATTTAGTAAAATAATGCTTTGATTTCCATTGCTTCATAAATAAGTATTGTATTTTTAGAAATAAAGTGAGATTATTTTATTATCTCTACATAATAATTAGTATTAAAGGCACCAAAAGTATAGATAGATTTCATGATTATCATTTTACATTTTAGTATGCTGTAACTAAATTAGTTTACTGTTTTATGCGCTAATAAAACATGGTTTCACAATTTTAGGAGGTTTTTTTCGAATGAAGTTACGTAAGGTGCAAAGTCTGCTACCAATATCTGCAGCAATGATTACACTAATCTCAAATCCAGTAGAAGCAGATGCTTCAACTTATACTGTCAAAAAAAATGATACTCTAAGTGATATAAGTAACCAATATGGAGTATCCGTTCAATCTCTGAAACAAGCTAACAATAAAACAACTTCTCAAATTTATGCTGGGGAACGTTTAACGATTCCAAATGTATCGAAGCCAAAACAACATACACCACAATATCATGCAGCTGAGTCTCATTCAACATACCAAGTCATTTATCAAGTAAAAAGAGGCGATACATTGGCATCTATCGCGCAACAATACAATGTTTCCATCCAACTTCTTAAACAAAATAATCATATAAACAGTGATAAAATTTATATAGGTCAGCACTTAAAAATTGATACAGGTCTTTCGCTACAAGAAGTCGATTTAATGGCCCGCTTAGTAAATGCTGAAGCTGGGGGAGAGCCGCATAAAGGGAAAGTTGCGGTAGCCAAAGTTGTTTTAAATCGTGTTCATGCAAAGGATTTTCCAGACACAATTACAGGTGTCATTTATCAACCTATTAAAAATGGTTATGCTTTTACACCAGTTACGGACGGAAGAATTAACCAACCCGCTTCACATGAAGCAAAAATGGCAGTAGAAGAAGCACTTACTTCAAAAGGCGAAAATGCCGATTGGTTATATTTTTATAATCCACAAACAGCGACTGATAAATGGATAACAACACGTCAAATCGTTGCGCAAATTGGAAATCATGTGTTTGCTAAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP024120|1978336:1986469|1980015_1980747_+|AWC61029.1|DBSCAN-SWA MKRSILAECLKLRHSRILLVLATLPIISLLIGCANYYYNQEVLKNGWYSLWTQVSLFYSEFFLPILIAICCSYICRLEHLNRNWNMTMTSPVSVASVFLAKFVIVSLLIGFAQALFIGLYWLIGNFFFLPKTFPLETIGWAMRGWYASLAIIALQLSLSLRIRSFAMPIGMSLCAVFIGLGMYIAKLGMFFPFSLLTIGMSVLNQEKLSVGQNFLFLMMSTVFIIMFSMISIQRLKKKDIISS >CP024120|1978336:1986469|1985674_1986469_+|AWC61035.1|DBSCAN-SWA MKLRKVQSLLPISAAMITLISNPVEADASTYTVKKNDTLSDISNQYGVSVQSLKQANNKTTSQIYAGERLTIPNVSKPKQHTPQYHAAESHSTYQVIYQVKRGDTLASIAQQYNVSIQLLKQNNHINSDKIYIGQHLKIDTGLSLQEVDLMARLVNAEAGGEPHKGKVAVAKVVLNRVHAKDFPDTITGVIYQPIKNGYAFTPVTDGRINQPASHEAKMAVEEALTSKGENADWLYFYNPQTATDKWITTRQIVAQIGNHVFAK >CP024120|1978336:1986469|1985177_1985456_+|AWC61034.1|DBSCAN-SWA MKSTGIIRKVDELGRIVIPKELRDMLDIGIKSPLEIFVENERIVLKKYVPYNTCQITGEVSNDNISLANGKIILSPEGAKYLIQELENYLVK >CP024120|1978336:1986469|1978336_1979254_+|AWC63098.1|DBSCAN-SWA MSTSVIIQTHNLSKIYGTIHCVNQVNLHIEEGEIYGFLGPNGAGKTTTLKMLLGLIKPSEGDIKVFGDSLNKCRSSILERTGSLIESPSYYGHLTGLENLKVMQRLRNAPDKNVHEVLKIVRLEKQINKKVDQYSLGMKQRLGIAMALLTFPKLLILDEPTNGLDPAGIGEIRELIKSLPKRYGITVLLSSHLLSEIEQIATSVGIISEGKLLFQGSMANLQKRNRNAIFIKTEDNMKAGQLLTTQGYNFVQSGNRLKFAHLEDAKVAEVNRMLVKNEISVTRIEKQKKSLENIFLELTEKERSL >CP024120|1978336:1986469|1984011_1984515_-|AWC61033.1|DBSCAN-SWA MAFAASNIGVSTKDGQSALTEVSKNDSPKQEEKKDSKADNKVYKIGETVEVNGLQITFNSAKFIEPNEYVKAEKGKVLEITFNAKNNGKKEAYFGAEELKIADANGNQFKQYFAGDNIFMNENIAPGNQIQGKVLFDVAEADKYIGTYKPNFTFDEKSVKFEFTTAQ >CP024120|1978336:1986469|1981893_1983300_+|AWC61031.1|DBSCAN-SWA MRGIIRILHKFAMATICISIFLLIFNYVLLGIMIFKEMNLDLSPKNVLKQVNEGLNKQDENYQLDEQAVKCLQNNRAWAMLIGENGQVQWEYQLPKDVPSSYKMADIAKFSRYYLSEYPVYTWEHQDGLLVVGYPKKSHWKYQLHFLSDSIQSMPMRLLLLLLFNIGITVFISMLIGTRLIRKIRPLVSGVHKLAKEEVVQLDSKGLFGDLAQSINSASTKLQNKTAALKMRDEARSNWIAGISHDIRTPLSIILGYASEMEDDSDLSEDQRERARIMRHQGEKLRALVSDLNLVSMLEYEMQPLYLKNIRLSVLARQVATDFLNNGLDDKYQIELKLKDDGAQIRGDEKLLIRAISNVVQNSIRHNPNGCEIIIETALSKDRSTYHFIVQDNGQGIPNEKIAEITELPYSSKRKQTIQEGHGLGIPMVARIMQAHQGQLILTNNENQKGLQVVMEFPLNSQNEKVYK >CP024120|1978336:1986469|1979250_1980003_+|AWC61028.1|DBSCAN-SWA MMKMLGLEYFKIRRKKIWVMILLFLSAEMLWAFIALSRSMATNSSFVSWEAIVFSISSMNGLFMPIISAIVVSRICDMEHKGETLKMLVATNVKRRDLYAAKYICVNSLLLLSIFAQVALMIMFGFVHKFSSNFSSALFIQFVFGTFLTNLAVTALQQWLSFTIKNQVFALCLGMLGGFIGMTAGLFPAAIRRMFIWAYYLELSPVTHLYKSSLSAYIVQSINLWNVIVTIALAILFYIVGSARISRQEM >CP024120|1978336:1986469|1983656_1983995_-|AWC61032.1|DBSCAN-SWA MKRTTEFVLGLIGGIFGILCVFIALFIGGLGSALEADGADSIIGLGWGAVGLSILGIVGSVMVKSKAKVGGIMMTIAAIGGLICISMFYILPCVLLLIGGLMGIFRKEKASA >CP024120|1978336:1986469|1981179_1981893_+|AWC61030.1|DBSCAN-SWA MGNLKDKKILIVDDEPEIRIMIERFLRKEGFFRIFSAADCTSALSLCRVDRPDIVILDVMLPDGDGFSLLSSIRQFSNMPVLFLSARGEDEDRLLGLGLGADDYIVKPFLPRELVLRLIAVLKRVYSSPVVERLSIFQLGKQTVDLESAVVYRGETEMPLTAKEHAILVKLYENRGRIVTSDAICQAVWGDDSYGYENTLMVHIRRVREKIEPDPSKPIYLLTVRGLGYKLLLKETH |
9 | Bacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2278338 : 2344503
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP024120|2278338:2344503|DBSCAN-SWA CTTGATTCAAGAAATAAAGAAAGCCCATCGCTCCGGGAAATCTATCAATTCCCTAACGAAAGAATATCATTTAAATTGGAGAATGATTAAAAAATACATGAAAATGATGACTCCACCTACTACCAATCGTTGGCGCATCAGTCCAGCCCAAGGGTGTCATGAATCTATTATTCGTCTTGAAAAAGAGGGAAAAACACTTAAAACGATTGATCCACTTATCCGTAAGAAGGGGTATAACGGTACCTTTTCGGCTGTGCGCACACTTGTTGAAGGGATAAGGTGCAAACAGAAACGTGCTAATCACCCATCTCCTACCTATCAAATAGCTAGAAAACGTCTTGCCAGATGGTTTTGGATTCATCCCAATCATCTGAACACCTCAGAAAGAAGAGATTTAGAGCGTTGCTTCGAAAAATATCCTAATCTCCAAACTGTTTATGAAGTCATACAAGAGTATCGTGCAATGATAAAACAATCTGATTATGAAGGATTTTTGCAATGGCTAAGAAAACAACTTTCCCATAAAGAACAACCCTTTTATCCATATACCGTCATTTACGCAACGATTTACAAGTCGTTAAGCATGCCTTTCTTCTTCCCTATAGTAATGGCGTGTTAGAAGGACAGGTAAATCGCTTGAAATCAAACGAATGTTGTATGGACGAGCTGGTTTAGCTATATTGCAAAAGCGCATGTTATATAAACTCGGATTTATTATTTTGAAAGAATAAAATTTTATACGGTAACAACGTTATATGAGATTTCACCAAATCTGCGTAAGAACCACTTTCATTTTGCACTAAACAATCTATTATTTTGTTTAGTTATCAGTCAATTAAGTACCTTTCTTCACATTATAATGACCGTTACTCATTACATTTGCGATACTATATAAACTAAGACTATCAATGCAATGGAGGTTTACAACATGAAAAATATAATGGAATTCCTCAACAATCCATATACTAAATACCTATTAGCTATGATGTAGGTTGTTTTATAATAAAGTTAAAATATTTTTAAATCGTAAAAATATTTTATCGCATCTTTTTTCAAAGCATTGTGACTTTATTTAAAAGCGACAATAAAATTTTTTTTGCAAATTATATAATTTATACTATACTCCTAGCAAATTTAAATTAGAAACTGTTTCTCTTCCTATTGAATCATAAATTATTTTTGTTTTTCTCACACCCTTCAAATCATAGCAGTTTCTCCCGTCGAGAACGATTGGAGTTTTCATTAATTCACTATATTTCGAAATATCAAACTCTTTAATTTCATACCATTCTGTGAAGATAAAACATATATCTGCATTCTTGATAGTATCTTCAATGGAGGTACTATAGGTTATTTCATCAGGATATATTTTCTTAAAATTCTCAATACCAACAAGATCCCATACATTAACATTTGCACCCTCTTTAAGCATTATTGGAATATTTGCTAGGGAAGGTGCTTCTCTTAAATCGTCAGTATCAGGTTTGAAGGTTAGTCCCAGTATTGCTACATTTAATCCTTTGAAACTATCAAAATATTTTCGAGATTTCATGAGAGCTTGACTATAATTTTGTGGTGGTAGAAATCTTACTGGTACATTATATGCCATCGCTTCATATGTAGCAGTTAATCCTGGACTTGAAACTAACATTTTCGAATTTTGTAACTCTATCAAAAATTCTTCATGACTTAAATGTTTAAACTCTCCTCTAAATTTGTTTCCATATTCTTTTTTTAAGTATGTCATGACTTTATCATTACCTGTAACAATTATCCTATCAAACTTCGATTCATTCAAAGCTTCATAAGCATTTTCGAAAATCGTTTTCGGATATAATAACAAATCATCCATATTTTTCATAAACGGCGTTTCTAGCCCCGAAAAATTAAAAATTATTTGGTTTAATTCAGTATTTATATCTTTAGTCAATAAACTAGTGATTGGATCACAAACAATTAAATTGTTTATATCTTTTTTTAATACATTAACTTTCTGATCAATATCAAAATAGTTTTGCACAACATATGCATCTTATGACTATTTATATCATACGATTGTATTTTTGAGGCCGATATTCCTAATCCAAATCCTACCTCTAGTATATTCCCTGCATTTTTAGTGACTATCTTTGCTAACATTCCCATGTAATCAGACTCCCAAGGCTGCATGACTGGAATGACCCAAGATTTCTAGATTTCCCTCTGGAGTATATATTGCTTCTGCAGAACTCCAATTTTCCTCTAGATTTGAAAATCCAATTTCAATTCTGCTTGTTACTGTTTCTTTAAATAAATCAGTACTTTTCATAAATACTCTCCTTTTATATATACTTATCTACTTTATTAGTAGTTAGTAGCTCTTTTTTATAATAATAGAAAACAAAAGCAAATAATGGGATATGAATAACAAGCATTAAGATGATTAAGTTTTCATAACCACCTATGTCTCCTGTTAAGCCATAAATTAAAAACATAATTAACGAAATGATACTTAAAACTGTTGAAAAGAAAGAGAGTACAGTTGCTCTAACATTTTCTTGTACCAATTCATTTATCGTAAAAAATAAAGGGGGCTCTAAAATATCAATTGTGACATAGATCAGATAATACCCTATGATTGCCAAAATGATATTAGAGGATATGATGAATATTCCTCCGACAAAAAATATTCCCATAACCAATGTTGCAATGGTATTTAATTTGAATTTCATGACTAAATTAACATTTAGAGAAATAATTACACTAATAATTGTACTACCTAGATAAATAGTTCCTATAGTCGAGTTAGATAATTCTAATTCTGCAAAACGACTTTGCGTAAACATGATGACAGAATTTGTACTCGAAGAGATAATCGCCATAAATAAAATTAAAAATTGTATATATGGAAGTTTCTTTACTACTCTATATCCTGATTGCAATTTATTTATCATAGAAGGATTTTTTGTAACTTTGACTTCTTGTACACTTTCTTTAAATCTCAAAACGGCCAAAGTAGCTACAATACCTGCAATTGATTGCATTAAAAAAGGTAAACTTAAATAAGATGCAGCTGCAAATCCACCAATAAAAGCTGATAAACCTAACGCAGTAGCCACTAACGCTTCTTTAATTCCAAATATTTTTACATAATGTTTTTCCACGCCTTTTTCTTTTAAATGTTCATACACCATAGCCTGATCTGCACCACTGCAAAAAGCTGAGCCTATACCATCAAGAATGAATGCAATGATGAAAAAATAGAAATAATTAGACATATCCAAGTATGTACTTATAAATAAGAGTAGGAATGAACAACTACTCATTAGTAAGCCCATACTGATTACATTCCTTTTCCTTAGTAAATCCGCTAAAATGCCACTTGGCACATTGCTTAAAATCCTGCTCGAAAAGTAGATGATTTGTAATATACTGAATTCAAATAAACTAATCCCCTTATCTAGGATAAATATTAAAAATATCGGTCTAGTAAATCTTAAATTTGAAAAAATCATGTACATAAAATAAGTAGATAAATCTTTTATATATTTGGAGTCCTTGATTAGACCCATATGGTAACCTCCATTACTACATAGTTTTAACAACCTATCATTAAATAAAAATTAACTAGTCGATTATACCTTTAATGCTATATAAAGAATGGTAGACAAAGATACTCTGTGAGAGTCTTAATCAGCTATATATGTTTTCAAACTAATTTAGTATATGATTTCCAAATGTTTAATGGATTAGTTTTGAATTATAAAAAAGGTTACGTATTAAATTACTTTCCAATTCATTGCGAATTCCGTAGATTTGATTTATCAGTAGCTTTACTCTGTGAAGAAGATACGATTTAACATTATATAGCTCGATCCCAATGTATATACAGAATTTTTTACCGCTGATTTTTTATTTTTTGAATCATATAAATATTCAATTTATTATTAATTATAACACCACCAATAATACACTTAATACAAAAAATTTCAATATTTTTATTTTTTGTATTTTATTGCCACTTTAATAATTATTAGCAAATTAATAATTAAAACCATTGCATTTGCACATGATTCCTGTTTGAACTTATTGATATATTAGATATTTCTGGATTTTAATCTGACTATTTTCTAAAACTAGGTTCATCTAATAATATTTTTCTAGGGCTTATCCACGCTTTCAAATCTGTTAACATCGTAAACAAACAATTTTTTCACTCTCTCTATTAATAATTTATCACTTAAAATTTGTAACTACTCAGCCCCTACCCAAAATCAATACAAAGAGAGGTAATTATATCAAAAATTACCTCTCAAGCTATGTTTCGAATAATTCTATTTTTCCTGTTTTCATTACTTGTTTTATGGATGCAAACAAGTTCTTTTTTTGCTTCTTTAGTGTACTTAAAAAGCTTCGTGCCAGTGCGAAATTTTGTGCACCTGTCTCACTCCGGAACGTACCCGAGACTTTTTGTTTAACCTTTACCATTCGTAAGTCCCGCTCAGCTAAATTATTGTCGAATGGAACGTTTGGATTTTCTACAAATAGTAATATGGAATCTTGACGCTTTGAGAGTCGATTTAATCATTTTTCTGCATCATGATTCGCCATTGTAGCATTTTCCCTATACCCTTTCTCAAGAATAGCAGTATAGGTATCCTCCATCCACGCGACAGCCATGGGATTCAGAGATGTGTTTTGACGTTCTCTTTCTTGTTTTGCCAAGATGAGTATTTCTGTCATCTCCTGTGTCCATGTTTGCTTTGTTTGTTCGTGAATCGCTTTTAAATCACGAAGTAAATGGGCATTGCATACAGCGTGTTCACAATGTTCATACACAAAATACGATGCCAAGCAATCATGAACGGCAATGCCTTGGAATTTCGGTAAGACATCGATTTCGTTTATCGCATCTGTGCCACGTTTTTCATAAACATACTGTAACGTAACGTGATCCGTGCTCAATGTATGTAACCATTGTGTTTTTCTGTTACTTCGTAACCCTGTTTCATCAAAATGGA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54 | Bacillus_phage(42.86%) | transposase,bacteriocin,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2349031 : 2392738
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP024120|2349031:2392738|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_phage(46.67%) | integrase,capsid,tail,portal | attL 2340078:2340137|attR 2392828:2393349 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3038814 : 3074141
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP024120|3038814:3074141|DBSCAN-SWA 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>CP024120|3038814:3074141|3068860_3069343_-|AWC62052.1|DBSCAN-SWA MKLYELSKNFCELQQMIEDGADPEAVQDTLQAIEEAFDEKVQGAALLILNLEAQAEVIKAEEKRLADRRKSFENSVKNIKEYLHQQMSAVGKKRIKGALITVGIQKNPASLDIANDAVIPPEFMVPQEPKVDKKALLLAVKNGLRRDGITLKQGESVRIR |
46 | Bacillus_phage(90.0%) | portal,holin,tail,head,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
32758 : 39375
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024121|32758:39375|DBSCAN-SWA ATCATTTTAATGCTCCTTTACTTAATAGTTTTTGCTTCGCTTCATAACATACATCGAAATAATCACTTACTTTTTCATGATTTTTCAATTTACGGAAGCGAACTGCTAATACCTCACTATATTCTTCTACATAATCCCATAAACCTTGATCCTCGAAGTAAGTAATACCTTTTTTCACTTCTTCTTCTAATAATTCAACTGCTGCATCTTCATTTAAAGAACGTAGAATATTGAAATGGTACATATATTCTTCATTCCCTACTTCCTGACACACCTTTAGTCCTTTTATAATAAATTCCCTTGCAGTAACTGTTTCTTTTAATTTATAATGTTCGCGTGCTTGTAAGAATAGTGCTTTAAAGTGTGTTGGGATTTTTTCTGTTACTTCTGATAAATGACGAATTGCTAATGTAGAAAGGTTTTGCGTTGCATATAACAATCCTAAATTATGTCTGACTACTAAAATAAGCTTGTCTTCATTATGTTTTTTCAGAAGATCAATCGAACGATTTAAATGCTCTTCTGCTTTTTCAAATTGTTTTAAGAAAATACAAGCTGTCCCTAACGTGTTTTCGCATGAAGCTACTTTCACTTCGTATCCAGGATGTTTTTCAAAAATTACTTTTGCTTTATTTGTGTATTCAATCGATGTTAACATATGAGAAATATGATGATGCAACACTGCATACTTTTGATAAAACTCTGCATGCTCTAATTCATCAGAGATATGTCCTAAGAGGCTTTCAGCCTCTTCATATTGTCTTCTCGCTTCGTTATAGTTACTAAACATCAAAGCATGTTCCGCTTTGAAAGAATGATAATAGTAAGATATTAACGTATCTGTTGTTTGATCAATTGAATCATTAATTGCATCGAAACTATCTTTTCGGATACTTACTCTGTCCGTTAGCATTCTATATTTAAAATCTAGTAAAGAATAATATAATAATAAGTTTTGATGTTGTTTTTCTTCTTCTTTTGCATCTTTAATCTGTTCGATTTTCTCATCAATTTCCTTTTTTAATTCCGATGCTTTTAGCAGTTGTTGTGATAACATTAGTTGATAAAAATCATTGAGTTGCTGCATAACTACTTCATACACAAAAACACCTGTGTTCATTTCACTACGTCCTCCTCAAACATCTCTATTTCTCTAAATATTACCATAATTCTACAAATTGCATGAGAAGAACGTTTCCAAAGTAAATTGATAAATAAATATTAGAATATTCTTTCTATTTTGGGGTATGTGTAGCAATGGAACAGAATCACGTAACAAGCATTAGCGGACATTGTATAAATATATAAACATTTCTCGAGGTTTTTGGGTACGAAATGTAAATAACTTTGCGTTAAACCTGTATATTTATATTTCATCTTTCTTTATAATAAAGAGTGTAATTAAACATAAACGTCTAGTTAACAGAACCCCCCACTTCAAACAGTCCATTCGGGCATTAAGTGGCGAGTAGTTCAAGAACTGAATCAAATAAGATGGAGGGATAAATGATGTCTGATTATACAAGTATTTCTCGAATTGATTTAGTAGAACGGTTTAATTTTATTACAATTGATTTGGAAAATAAAAATTTTTATATTCAAGTCGTAGATGTGAAAAGTAATAATGTACTATTAGGAATAACTATAGATTTAGAGAACGATACAACAAAAGTAGCTGGGAATGGAAGCGTAAAAAAGTATACGGATGAAGAAATAGAACATCTAATAATAGGGTTGAAAATAACAGCACAATCTTGTATAGATAATAATTTATATAATGCTTACGAACTTAAAAAATATCTTGAAAATTAAAAATAGAATAAATAACCCACTCGGTTGAAATTGAGTGGGTTATTTATTCTATTTAATTCAGGGATCATGAAGACATTTTGAAGTTTCTGGATTTAACGTTTGTCACCGTATAAGTACCCTTGCCCCCTTGAATCTTACCCCACATTTCTGAACGATATGTACCTGGCGGTAAAACGAAACTTACTGCACTGTAAACTGGGTTCCTAGATGGATTAATTATACCGAAATCAGATTTCCCCTCTAGAATATGACCACCGTTAGGATCGTTGATTGTAACCGTAGTATTTATAAGTGAAATTTTATCATTAACTACCTTATATGTTGTATCACAATCTGCCAATGAATGTCCTATATCTTTACACGTAACTGTCGCCGAACCCCCTGAAAATCCTGCACGTTGTAGTTCTTCTACACTTACATTTTCTAAGCCTTCTGGGACAATGCTGTATTCAGTAACTGTTGTTAAAGTTACTTCTTTGCTCTCTTCTTCTGCAAACACGCTTAAAGTAGGAGCAACACCGACTAATAGTAATGCTGATAATAAAATTGAAACTAATTTTTTCACCTTAAACCCTCCTAGAAAATTTTTTACAAAACAAGTATACCATATTTATACAAATAATTCTAAAAAAACTGAATTTTCGAAGTTCACAAGAGACATTTGACGACAGATTTTACATCAAAAAGAAAAGGAACAGATTCCTAATGTCCACTAATGCTTGTTACGTGATTCTGTTCCATTGCTACACATACCCCATTTTCTGTGTTTCCCAATTGAAGCATAGGAGCAATTTAACGATGGATTACCCATGAAAGAAAAGATAATCGCCTTAAAATCGCAATCTCGGCGACTCATTTTTGTAGAATCTGTCCTTTTTTACAATACAGTCCAAATCCGATATACAGTCAAACAAAAAAAGACCCATTCGAAATGAAATGAGTCTTCCTTTTATACACTAAGAAACATTTTGTTTTCTCCACTGCATAAGTTTCACTTTTTTCCTCTTTAGCTTCCAAAAATGAAATAGCGTAATTAAAAATCCAATTGGTCCAAATATTGGCGTCATCACAAAGAACCACCCTAGCACCGAAGCTTTCACAAACAAATATATAAACCATCCCTTATCAGTCATCATAAACATTGTATCCGCAAAGAAAAAGTTCTTTATAGAGGAAACAACTATTCTTGTAAACGGAAAGAATATTAGATTAACTGTCATTAAAGTAATCATCCCTATTTCATCCGAAGGAATCACCCATCTAAAAAACAAATAGATTAAAATACCCCACATATATGATTTTATCAAATATCGAATATTAATAGACTGACAAGCTCTAAACATTATAAACAATTCCCCAGCCCCTTCCTTATAATACAAGTCGATTCGTCCCTTAATATCAATAATCCTATTATTCTTATTTTATTGTTCTTTCTCCGCTGATCGTTTCCTTTTTTCCCGCTGCAATGTACTCACACTAATCCCTGTTATTTTTTCTACTCTCCTATAAGATTCCGTTTGCAATAATTTAAGGGCGTAGTCCATTTTCTCTTTATTATATTTTTTCGGTCGCCCCTCTTTAAAATTAGGATTCAATTTAGCCATTGCTTTTCCTTCTTGAGTTCGCTCTACAATCATATCTCTTTCAAATTCAGCAAAAGCACTCATTACACTAAATATTAATCTTCCTGTAGGTGTATTTTCTACTAAGCCCATATTAAGGATATGTACCTTAACATCTTTATCAGATAACATTTTTACTGTTTGAATCCCATCCACTGTAGACCTTGCAAAACGATCTAATTTTGTCACAACAAGTGTGTCTCCACTCTTTAATACAGAAAGCAATTGCTGGAATTTCGGACGTTCAAATTTTGTCCCTGTAAATTTTTCTGCGTATATTTCCTCGCAACCTTCTTTTTTTAACATCTGAATCTGAGATTCCAAATCCTGGTTCAATGTACTCACCCTGGCATATCCATATTTAACCAAAAAATCACCTTTTCTACATTCGCTTTTGACCATAAGTTTTGATGTAGGTCTATATACTGATTTTATCACAAAAGAAAACCGTGTTCAAAACCTTTAAGTTATGAACATGGTTTTCTTATTTCAAATCTTCTATCAATTCTAAATATAAACTTCTATTCTAACAATATAGCATGTTAAAATATTACATAAGTTATTCAAACGAATTAGGAGGATGTATTTCATGAAATCATATTTAATTTCTTACGATCTAATTGCTCCAGGACAAGATTACGATAAAATAGAAAAGAAGATTGAAACTTATCCAAATTACAAACGTATATTAGAATCCGTTTGGCTTGTTCAATCCCCTAAAGAGGCTGAAGACATCGCGCAAGAACTTTATAGAGTAACAGATAACAATGATAAAATATTTGTAGCAAAATTAGAAACAAATCCTGCTGATAAAAACGCTTGGTGGTTTAACCTTGATGAAGAACAAACTCAATGGATACTAAAACATTTATAATACAAACAACAAAAAGCGCAAGAATAAACATTCAAATGTTTTCCTTGCGCTTTTCACGTTTTTCTTATCTACATTACTTTTCAAGACAACAATCTACTATTTCCCCAATTTTAAATATACTTCGATTCCGGAAAGCATCAGTGGTAATCACTTCTCTTGTATATTGGTCAATTTTTATTACCGTTACCATTTCATGGTGAATATATCCCTGCCGATAATAGCTTATATGTATTTCTTCTTCCCTACATAAAGATTGGTTTAAAATTCGCCCTATTTCTTCTAATTGTTGTTGATCCAGGAGTGGTTTTTTGATTTTGTTTTGTTCCTGGATAATCTCACGAATCCCCTGAAACTGCTCCGATAAACTGGCAAAAGGCATCCACTTGACCATCTTCCGTCCCTTTGGCATTTGAGAATTTATCATGCTTTATGGCCCCCTAACAACATATTTCTTTCTCTAGCTGTACTTTCATTACAATAGGATATCCCCCTTAATATGCTGTTCTTACCGAATTTTGACCTAATATCATCCATGACATATGCTAATTTCATTTCTTTTTCTCTTCTTTCTACATTATCAAACAACGAAAGTTGTTCTTCTCCATCTTTAATTAAGTTAGTCAAAGATACCGATATACTTCGAATTGGCTCACCTGTATATAATTTATGTAAATATCCCATACAAACTTCATAAACATCCATTGTCAAACAAGTGGGACGCGGAAAAGTACAGGTTTTTCTAATCCCACCACTATAAGCCCTGCTATAACTAACAGAAAATTGTATAGTTTGCGCTAATTTCCTTTCTCTTCTTAATCGATAACACACTTCTTCAATATGCTCTAATAAAACAATTTGTATTTCTTCAATTGAATAATCACGCATTAAGATTTGACTTTTACCAATTGATTTTGATTCTGCCACATGTTTTTCTGCAATTTTACTAAAGTCAATCCCGTGACTATGCAAATGCATATCCTCACCGATTATTCCGAAAGATTGCTTTAAATACTTCAAGGGATAATGAGCTAAATCACCAATTGTATAAATCCCCTTCTTATTCAATTTCGCTTCAGTTTTCGTTGATATCCCCCAAAATTCATTTAACGGACGTATTGGCCATAACTTCTCCGGCACATCTTCATACCTCCAATACGCAATTCCCGTTTCATTCCTCTTAGCTTCACGATCCATAGCTACCTTTGCCATAAGCGGGTTTGGTCCAATACCAACTGTACACTCAATCCTCGTCTTCTCATATACTTCTCTCTTAAATTTCATCGCAAATTCAATCGGATTATTTGCAAACAAATGCAATGTACTTGTCATATCAAGAAATTGCTCATCTATAGAGTAAGTATGTAAATCCTCTGGCGCTACATATTGCAACGCTAACTTAGTAATGTAATTTGAGCATTTTATATACGTTTCCATCTGCGGATTCACTACAATAATATCTGACCTTTTGGGAATCTCATACAGTCTACTTAGTTTCCCAACACCTAACTTCTTCAAAGGTGGCGTAGCTGCCAATACAACCGAACCACTCCGCTTTATATCTCCAACCACGGCTAACTTTGTATATTTCGGGTCTAATCCCCTTTTAATACAACTCACCGAGGCGTAAAAAGACCTAAAATCAACGCACATCACAATACGATTCGGCAAAACGGAATAGTCATACATGTAAAATCCCCCTAAAACTAAAAGAACATTTGTTCTTATTATACACGAACTAACGTTCTTTATGTCGTATTTTTTCATAAAAAAAAGAGCCTAAAAAAGACTCTTTTTTTAACAAATGAAATTATAATATGTATGTTCAATCCCACTATATAGTTTTAGGTTTTCGCTTTTAAATAAAATCTCTACTAACTACTTCACAACGATTTTCACTTTTGCACCGTCCGGTAATTTCTCCACTTTATTCCCAATGTACGAACCAGCACCACGATTATCAGCTGGTTTTATATGCCTTATATCAGCACCCTTACCGCCTTCCCTACACATAGCCATAGGGTATTCATCCCGATCATATCCTTTTTTCGTTGGAACATTTGCTAAAGACTGTTTTCTCCTTTCAGCGGCTCCATCCCGATCAATCGTACAAATATCTGTCTTGCCACTTGCAATCGCATCTTTAATATGCGCTGCGGTTTCTGGATACTTATTTGATGGAAACTCTATAACTTGTGCAATATCTTGTGATTCACTTGTTTGTTTTACATGATTTGAACTTTGAATTGCTGAACATCCCGAAAATAACAATCCTATGGTTAGAAAACTGCTTAAAATTCCTTTGAGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024121|32758:39375|32758_33877_-|AWC63204.1|DBSCAN-SWA MNTGVFVYEVVMQQLNDFYQLMLSQQLLKASELKKEIDEKIEQIKDAKEEEKQHQNLLLYYSLLDFKYRMLTDRVSIRKDSFDAINDSIDQTTDTLISYYYHSFKAEHALMFSNYNEARRQYEEAESLLGHISDELEHAEFYQKYAVLHHHISHMLTSIEYTNKAKVIFEKHPGYEVKVASCENTLGTACIFLKQFEKAEEHLNRSIDLLKKHNEDKLILVVRHNLGLLYATQNLSTLAIRHLSEVTEKIPTHFKALFLQAREHYKLKETVTAREFIIKGLKVCQEVGNEEYMYHFNILRSLNEDAAVELLEEEVKKGITYFEDQGLWDYVEEYSEVLAVRFRKLKNHEKVSDYFDVCYEAKQKLLSKGALK >CP024121|32758:39375|34263_34569_+|AWC63205.1|DBSCAN-SWA MMSDYTSISRIDLVERFNFITIDLENKNFYIQVVDVKSNNVLLGITIDLENDTTKVAGNGSVKKYTDEEIEHLIIGLKITAQSCIDNNLYNAYELKKYLEN >CP024121|32758:39375|37138_37489_-|AWC63210.1|DBSCAN-SWA MINSQMPKGRKMVKWMPFASLSEQFQGIREIIQEQNKIKKPLLDQQQLEEIGRILNQSLCREEEIHISYYRQGYIHHEMVTVIKIDQYTREVITTDAFRNRSIFKIGEIVDCCLEK >CP024121|32758:39375|35990_36560_-|AWC63208.1|DBSCAN-SWA MVKYGYARVSTLNQDLESQIQMLKKEGCEEIYAEKFTGTKFERPKFQQLLSVLKSGDTLVVTKLDRFARSTVDGIQTVKMLSDKDVKVHILNMGLVENTPTGRLIFSVMSAFAEFERDMIVERTQEGKAMAKLNPNFKEGRPKKYNKEKMDYALKLLQTESYRRVEKITGISVSTLQREKRKRSAEKEQ >CP024121|32758:39375|36780_37065_+|AWC63209.1|DBSCAN-SWA MKSYLISYDLIAPGQDYDKIEKKIETYPNYKRILESVWLVQSPKEAEDIAQELYRVTDNNDKIFVAKLETNPADKNAWWFNLDEEQTQWILKHL >CP024121|32758:39375|34633_35134_-|AWC63206.1|DBSCAN-SWA MKKLVSILLSALLLVGVAPTLSVFAEEESKEVTLTTVTEYSIVPEGLENVSVEELQRAGFSGGSATVTCKDIGHSLADCDTTYKVVNDKISLINTTVTINDPNGGHILEGKSDFGIINPSRNPVYSAVSFVLPPGTYRSEMWGKIQGGKGTYTVTNVKSRNFKMSS >CP024121|32758:39375|35525_35948_-|AWC63207.1|DBSCAN-SWA MYYKEGAGELFIMFRACQSINIRYLIKSYMWGILIYLFFRWVIPSDEIGMITLMTVNLIFFPFTRIVVSSIKNFFFADTMFMMTDKGWFIYLFVKASVLGWFFVMTPIFGPIGFLITLFHFWKLKRKKVKLMQWRKQNVS >CP024121|32758:39375|38940_39375_-|AWC63212.1|DBSCAN-SWA MKLKGILSSFLTIGLLFSGCSAIQSSNHVKQTSESQDIAQVIEFPSNKYPETAAHIKDAIASGKTDICTIDRDGAAERRKQSLANVPTKKGYDRDEYPMAMCREGGKGADIRHIKPADNRGAGSYIGNKVEKLPDGAKVKIVVK >CP024121|32758:39375|37485_38751_-|AWC63211.1|DBSCAN-SWA MYDYSVLPNRIVMCVDFRSFYASVSCIKRGLDPKYTKLAVVGDIKRSGSVVLAATPPLKKLGVGKLSRLYEIPKRSDIIVVNPQMETYIKCSNYITKLALQYVAPEDLHTYSIDEQFLDMTSTLHLFANNPIEFAMKFKREVYEKTRIECTVGIGPNPLMAKVAMDREAKRNETGIAYWRYEDVPEKLWPIRPLNEFWGISTKTEAKLNKKGIYTIGDLAHYPLKYLKQSFGIIGEDMHLHSHGIDFSKIAEKHVAESKSIGKSQILMRDYSIEEIQIVLLEHIEEVCYRLRRERKLAQTIQFSVSYSRAYSGGIRKTCTFPRPTCLTMDVYEVCMGYLHKLYTGEPIRSISVSLTNLIKDGEEQLSLFDNVERREKEMKLAYVMDDIRSKFGKNSILRGISYCNESTARERNMLLGGHKA |
9 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 18609
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024122|0:18609|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024122|0:18609|6214_6787_-|AWC63238.1|DBSCAN-SWA MANKDNPKFYTISTKYIDYLRETDNKVPFNKDEQHSRPYVGVLEKINGHDYFVPLTSRNDKNFNSQVSVKLFDKDNPEKRIGVLLVNNMIPVPEKECKEIDIAEKMETDPKYGNLMLKQYLFLKENMDRLSHKVEKVYKDVTVQGKPSKKQKFLKGICCDFSTLEEKCQEYKEKNQARRIAYMRQMGRER >CP024122|0:18609|7048_8071_-|AWC63239.1|DBSCAN-SWA MGQQVKNTKKYTKDEIEKAASLDIVDYCMQNDIPVKCDSERYYRLVEHDSLIIDRKKNQFYWNSRGVSGNIINFVQEVEGASFPGAMQRLLDGEKDYEKSSDVTFVTEPYDYEQFAQKEVDRFDRAKEYLVNDRKIDSQVVDALHNKGLIKQDKYNNVLFLWKDRETGAVMGGSEQGVVKSDKYKRGTWKMIQKNSTANYGFNVLNGEPKNLKFFESSIDLLSYASLHKHDLKDTHLISMEGLKPQVVFNYYMKSCERIGDVPDSLSLCVDNDKAGKNFVERLNHFRYEKNDGSIVSFQPEYPKAPVEGQKWDWNDECKRVAKQREQGRQAYLQQRGMER >CP024122|0:18609|4423_5314_-|AWC63236.1|DBSCAN-SWA MAKNNEIETIEEYFSMALGVSKSETYGYIARYSEEVPVWCFLLKRDGAKGEKYYGEHCPLNNINLEDLIKVFSLFSKQDRKIIVDTEGYLYKDRDYLFKNQFVLNPKPLEKNALNLEHCTLEEFIIENNLIGSDKEDYGYIARASEEEPVWCLFLRSEDSDGEKYCSGHYPLHITDMEDMIKVFSWYSKQEKRLIVNTESYFFEREIREMTYPNRVENNLSNSTNYLIEKECDNRFLIHRELEDKEISRYSKDKTCVYNGKQYLEAIVVCSSEDEAVAVVKSYWRGVDTLIEHFGG >CP024122|0:18609|665_1055_-|AWC63235.1|DBSCAN-SWA MQDLKYIDWKGWIILFVLLVFFASLDIMTNGQKTSDITEKYTYKNIEIAENLVTSELNKESKYVKLFDLQGSELNSENYADNPNWTQKDLKCLVKTNDGIYRVYFNVEQVADKEIYTPKSIKKLVREEK >CP024122|0:18609|16462_16741_-|AWC63250.1|DBSCAN-SWA MLLSELKSNYDYSKEGKYIIIKLRKRKNDYQEIAIDWFDYNPGNKFEWLLVRECQINRQGKKKYTNYKLKNICPLVKVQVQVFQKGEEEVCV >CP024122|0:18609|5685_6066_-|AWC63237.1|DBSCAN-SWA MEKLQIAKELLANSLNIYIKMKIEEYIFHFEGLESGVYCNKKNREDDSLIRFHNCITYIHETGFNIKGWTLYEIPIYYSHCFYNKSMEKRFDLMVLKIGEVIPAYLDYSEEKTAETIEEAIKKYSY >CP024122|0:18609|11627_11837_-|AWC63243.1|DBSCAN-SWA MSQNNFYMIEHVDQVKNEVHLNKYLFNKQVIVKVSEEEAAAYTEFMDGAAEHDSLPFVKYDEERGVICE >CP024122|0:18609|12852_14418_-|AWC63246.1|DBSCAN-SWA 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MDNFEVVIAIQQKANQEVFEKIGLNLERHWEEYEIQLSEDNRVVEDILPNMRLNLGELATVVSRYGTEQEQKDIDEIENYLEPYYQADLIKTEFYETPIVKISTDRQHNLKVECISEYVKDSDINFDFNNSVVRTLNHINHSITEAHRNVMDGDVEYQGLYPVDENEVIYCEKTGKPLEQDEEVFYKEGKGYIVPEKVDPKDIKNGNVYFTTIGYEDVEEKRIAPIQYIEEKTYQDGDIHFNPLDGISNDYEDETEVYRMESTKTVGSVKKGYGAMQLKEAKSNPSAGKRYIGKDTVHHEEHAHVSQDREQARKQYMMRQMGGRDY |
18 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
24142 : 27815
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP024122|24142:27815|DBSCAN-SWA TTCACTCTTTAACTAATAATTCGACAAAAACCTCGGTTGCTTTTGTTTGAAATTTGGAAGGTGTAGTTACAAGCGAAAAATTTCTTTTGATTGGAAAACCATTAATATTCAGCAATTTTAACTTTTCTAGTTCCAGTTCATTTCTTATAGCTGAATGCGAAAGCAAAGAAATCCCTAAACCAGCCTCAATTGATTCCTTGATCACTTGCGTACTCCCAAAGGTCATAATATTTTTGGGATAGAAACCCAATTTTTCAAAGCCCTTATCCTGCATTTTCCTCGTCCCTGAACCCTCTTCACGAATAAGCCATGTCTCCTGACTCAAATCAAAAGGTTTTATTTTATGTGTGTTTAGTAAGTGATGGTTTGATGCTACGGTGATTGATAAATAATCACAGGCAAATGGCATGATATTAATTTTCTCATTTGTAACATCTCCTTCTATTATCCCCACATCAATTTGATGATGCATAACTAATTCAACAATTTCATTCGAATTCTTTATTGTGATATTTGGAATTAGCTTTGGATAGATCTTAAGTAAGTTGGCAATTTTATAGGGAAGAATGTATTCCCCGTAGGTATAGCTAGAACCAATAGATAGGATACCACTTGCAGTATGTTTTAGTTCAACCAAAAGATTTTCCATTCTGGTATATAGACCTAAAATATTCTTTGCATGGTGATAAACAATTTCGCCAGCTTTATTAAGCCTGACAAACTTATTGGTTCTTTCTAATAATTTTATATCCATCGATCGCTCTAAGTTCTGTATATAACTGCTGACGGCTGGCTGTGTCATATGAAGAATTTCAGCAGCACGTGTGAAATTTTTTTGTTCTGCAACCGTGACAAAAACATGTAATGATTGGTCCATTTCTTCTCCACCTTTAATTTCACTTCAGAAAGTATGATAAATAATTACTTATCATAGTAATCATTATAACTGATTTTACTTATCATTTAATAGAGCCTATTATAAAAACAAGAAATCATTTAAAGGAGTTTTTAATATGACAGACACATTAGCTAAGCGAAAGTCATTTTCATTAGGAAATTGGCTTGGAGGAATTGGCTTTACTTTTATTATTGCATTGGTGGGTTTTGGATTATCCAAATTACCTGTACTTGATCATATCGGGCAACTTGCTTGTGCCATCATTATCGCCGTTATTTATCGACAAATACGGGGATATCCAGAGAAGTTTCGTACAGGCATACAATTTTCCGCCAAAAGGCTTTTAAGGTTTGCAATTATACTTTTTGGATTAAAACTTAATATCGACGTTGTTTTACACCAAGGGTTAGGATTACTTGTTAGGGATGTCGGTTCCATTGTCTTTGCAATATTTCTTACCATATTGATTGGGAAATTGCTAAAAGCAGACTCTTCATTATCCCTATTACTAGGGATTGGAACGGGAGTTTGTGGTGCGGCAGCGATTGCCGCTGTCTCACCAATTTTGAAAGCAAAAGATGAAGATACTGCAATAGGCGCAGGTATTATCGCCCTAGTTGGTACTATTTTTGCCATTGGATACACCATCTTAAGACCTTTTCTACCATTAACTGATTTACAATACGGTATTTGGTCAGGCGTTGGTTTACATGAGATTGCACACGTAGCCCTAGCTGGTGCACCAGCGGGCCCAGATGGCCTTGCAATTGCTTTGTTAGCCAAACTAGGACGGGTATTCTTACTTGTTCCACTAAGCTTTATTCTTATGTACTGGATGAAACGTAAAGGAAAATCAGATTCTGATTCCGATACAAAAATTGAATTCCCATGGTTTCTTATAGGGTTTATTATCATGAGCCTATTCGGAAGCTATGTACTTGGTAATATGATTACGATTCCAACTAATATCATGAATGGGGTATCCTTCTTCACTTCATTTATATTGACAATGGCAATGATTGGATTAGGTTTGAATGTTAGCCTTAAGGATCTTCGCACGAAGGCGTTACGACCACTTCTTGCCATGACCATTACATCCGTTCTTCTATCAGTCATTACGTATTTCACGATGTAACTAATCATTATTAGGAGGTTTACAAATGGAAAAAATTTTATTTGCTACAGATGGCTCGACTTATTCCGAGCATGCCGCAAAAATGACGGGGGAATTCTTAGAAGCTTGGCCAAATGCAACATGTATCGTGCTTTACGTTTCGGCAAAGGAAAATTACGCCTATGATTTAGCACCGGAAGCAGTTGACCGATTTGAAGAAGAACTTAGTAGCCGTATTGAAAAACAAATCATAGAGGGTGTACTTTCCAATTGGAAAGAACGACTTCTATTTAGTCATCAAACAGGGCATCCCAGTCGAACAATTTGTAATGTTGCTCAATCGGAAAAAGTTGATCTTATTGTATTAGGAAGTCATGGAAGAGGAGCCATAGATCGAGCGCTATTGGGAAGTGTGGCACATGGTGTACTGCACCGTTCCCAAATCCCTGTATTAATCGTAAAAAAATAAGTTACATCATTGTATCCCATACAAAAAAAGAGATGTAATAAATGCTACCAAAGGAGGTGGTTTCAGCATATCACCAAACTTAGTAAACAATAATTTTTTACAAAGGTGGTTAATAAAATGGGAAGAGTAAAAGGGAAAATCGCCCTTGTAACTGGTGGGGCTTCTGGTATAGCGTTGTCCTCTGCGACATTGTTGGCGAAAGAAGGAGCAAAGGTTGTAATTGCCGATTATAATACTGATGGCGCGAAAAATGCCAGGATTGGCGATTTCCTCCATCGTCGCCCATCCTGCTTATGAATATATTTTTGATTATACGGGAAGTTATACTCCGGCTTTATATGCTATTGTCGTGATGTTGGTTATTAATATTGTTTGTATCTTTATCTCCTTCAATGGGAAAAAGAAATTAGAACAAGCAGGTTTTTGGAATTAAAGTTTATATTGAGGAGTGAAGAGTAATGGGGAAATTGGAAAATAAAGTCGCAATTATTACTGGTGGTGCTTCAGGTATCGGCGAAAAGATGGTAGATTTATTTAGCAAGGAAGGTGCGATTGTCATTGCCGCAGATATTAATGAAGCTGCACTTGAAAAAGCAAGCCAAAAAGAAAACGTTTATGGAATGAAACTAAATGTTGCATCTGATGATGACTGGGCAGCATTAACCAAAGAAGTAAACGACCGTTTCGGAAAAATTGACATTCTTATTAACAACGCTGGGATTTCATCAGAAAAGCCTTATACAGAAATCAATCTGGATGATTGGCAAAAGATGCTATCAATTAATGGATTTGGCCCATTTGCTGGAATGAAGCATGTTGCACCCTATATGATGGAACAAAAGAATGGTGCTATTGTCAACATATCTTCTTATACAGCATTAATTGGGCAAGGGCTTAATCACTATTCAGCTTCCAAAGGTGCGGTTCGTGCTATATCTAAAGCAGCTGCGGCAGCATTTGGATATCATGGAGTTCGGGTGAATGCTCTATTCCCTGGAATCATTGAAACTCCGATGGTACAATCTCTAAGCACATCAAAGGAACTTCTTAATCAATTAATTCAGGCAACACCATTGCAACGTTTAGGACAGCCTATGGATATTGCGCACGCGGTATTGTTCCTAGCATCTGATGACTCTTCATATATTTCTGGTGCTGAACTTGTTATTGATGGTGGTTTCTCTGCTCAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP024122|24142:27815|25154_26174_+|AWC63260.1|DBSCAN-SWA MTDTLAKRKSFSLGNWLGGIGFTFIIALVGFGLSKLPVLDHIGQLACAIIIAVIYRQIRGYPEKFRTGIQFSAKRLLRFAIILFGLKLNIDVVLHQGLGLLVRDVGSIVFAIFLTILIGKLLKADSSLSLLLGIGTGVCGAAAIAAVSPILKAKDEDTAIGAGIIALVGTIFAIGYTILRPFLPLTDLQYGIWSGVGLHEIAHVALAGAPAGPDGLAIALLAKLGRVFLLVPLSFILMYWMKRKGKSDSDSDTKIEFPWFLIGFIIMSLFGSYVLGNMITIPTNIMNGVSFFTSFILTMAMIGLGLNVSLKDLRTKALRPLLAMTITSVLLSVITYFTM >CP024122|24142:27815|24142_25018_-|AWC63259.1|DBSCAN-SWA MDQSLHVFVTVAEQKNFTRAAEILHMTQPAVSSYIQNLERSMDIKLLERTNKFVRLNKAGEIVYHHAKNILGLYTRMENLLVELKHTASGILSIGSSYTYGEYILPYKIANLLKIYPKLIPNITIKNSNEIVELVMHHQIDVGIIEGDVTNEKINIMPFACDYLSITVASNHHLLNTHKIKPFDLSQETWLIREEGSGTRKMQDKGFEKLGFYPKNIMTFGSTQVIKESIEAGLGISLLSHSAIRNELELEKLKLLNINGFPIKRNFSLVTTPSKFQTKATEVFVELLVKE >CP024122|24142:27815|27080_27815_+|AWC63262.1|DBSCAN-SWA MGKLENKVAIITGGASGIGEKMVDLFSKEGAIVIAADINEAALEKASQKENVYGMKLNVASDDDWAALTKEVNDRFGKIDILINNAGISSEKPYTEINLDDWQKMLSINGFGPFAGMKHVAPYMMEQKNGAIVNISSYTALIGQGLNHYSASKGAVRAISKAAAAAFGYHGVRVNALFPGIIETPMVQSLSTSKELLNQLIQATPLQRLGQPMDIAHAVLFLASDDSSYISGAELVIDGGFSAQ >CP024122|24142:27815|26199_26622_+|AWC63261.1|DBSCAN-SWA MEKILFATDGSTYSEHAAKMTGEFLEAWPNATCIVLYVSAKENYAYDLAPEAVDRFEEELSSRIEKQIIEGVLSNWKERLLFSHQTGHPSRTICNVAQSEKVDLIVLGSHGRGAIDRALLGSVAHGVLHRSQIPVLIVKK |
4 | Lactobacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
43682 : 44906
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP024122|43682:44906|DBSCAN-SWA TTCATATAGCACCACCCTCATATATTATACCATTTTTATTAAATTCTACCACCATTTTTTTAGGGAACTTGCAATAGAACCTATTACCAGCACACTCAAACAGCTCAATTGCCTTTTCGATTAAAGTAATATCATTTTTCGCTATTCCCAAATAACAATATTGCATTGGAGTTAAAAAACCATTTTTCTTTTCTAAATCATTAAGAATAGTAACTGCATTTTTGTAATTCCCCTTAATGATCTCTAAGAAAGATTCCTCAGCAGGATGATATATTTTGATTTTATCCAATTCTTTTTTATTAACTAGCTTAATAAATGCATATGTATTAAGAATTTCTTGTCGCCTTTGCTTCTCTCTTTCAAAGTAATATGGCTCTAATTGTTCCAGGGACTCTTTTATATACTTAGATGCACTATCGTAACACTCGAAAGTAAATGACTCCGCTAAATATACGAGCGCTGATGCCCTTAAAAGATTAAAACAACTCTCAGGATCTTCTAGTTCTAAAATCTCATGACATGTATTTCTCAGATTTTCAAGTTTGTCCTGGACTAAGTAAGCAAATGACAAACACTCTTTTATTCTGCCTAAATAAGCTGTCTTAATAAAACTATCGGATATATCTTCAACTTTTGGTAGTAATACGTCAGCATATTCAAATAATGAGGTGTAAGTTTCTAAATCACACATAGTATAGCAAGTTAATATGCCATACAAAACCTTCATTTCCTTTGTTTTAATAACCTTACTACCTTTACGATCTTCGAGTTTATCTAGCAATTCTTGTTTTGCAATGACACCGCTGCTACGCTGCCATACTAATTCATATACATATGCCCATTCTCGATTCATCGCAAGAGATGAATTCTTTTCCTGGTCTACAATAAATTTCAATAACAGTAAATCACCTTTAGCATTTGCATACTCCATAGCAATTCTTAGATTCTTTTTGCTTGTTGTAACAGAACAAAACGCACATAACATCTTACGCTTTTTGTTAATGTCATTCTCATATAATATGTCCAATAATTTAACTAAATTCCAAAAACCAAATTGAGTTTTCCCTGTTAAATTCTTCGAAAAAGTTCCAGGGGCAATACCAATTTCTTTAGCAATATCCTCCTGGTTCTTTTTTTGGAAATCAATCTCATCAATAATTTCACTCAAGAAATTTTTAAATATCTTTTCTGATGCTCCATCTTCTCTCTTAAGTACTCGATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP024122|43682:44906|43682_44906_-|AWC63275.1|DBSCAN-SWA MNRVLKREDGASEKIFKNFLSEIIDEIDFQKKNQEDIAKEIGIAPGTFSKNLTGKTQFGFWNLVKLLDILYENDINKKRKMLCAFCSVTTSKKNLRIAMEYANAKGDLLLLKFIVDQEKNSSLAMNREWAYVYELVWQRSSGVIAKQELLDKLEDRKGSKVIKTKEMKVLYGILTCYTMCDLETYTSLFEYADVLLPKVEDISDSFIKTAYLGRIKECLSFAYLVQDKLENLRNTCHEILELEDPESCFNLLRASALVYLAESFTFECYDSASKYIKESLEQLEPYYFEREKQRRQEILNTYAFIKLVNKKELDKIKIYHPAEESFLEIIKGNYKNAVTILNDLEKKNGFLTPMQYCYLGIAKNDITLIEKAIELFECAGNRFYCKFPKKMVVEFNKNGIIYEGGAI |
1 | Bacillus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
48244 : 65015
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP024122|48244:65015|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP024122|48244:65015|49515_49737_+|AWC63280.1|DBSCAN-SWA MRKIGILALAILSLVFFNVISLQTIGTLALLMAAGIGLYILFYTLIAFLALGLSIVGVIAAISLITYATTNLI >CP024122|48244:65015|62668_63241_-|AWC63297.1|DBSCAN-SWA MEQFIRLDMKGNWKGKEHCSSFAGVEEHGIREEGISCYRLKDTAYALESLREYWVDMVGHTEKDFENMQITIFEGELVGEGSELEDLATCERTILEAEAAPIMNEIVKWKENVMPDDMELDEDDRNEGLMYEEEYNKKLLNLYNRFVESNSEKIFKEKDEIFSKEYEDVSEEIDQAKRKFMMQQMHNRDY >CP024122|48244:65015|50944_51127_+|AWC63285.1|DBSCAN-SWA MSKYFKCLHLEKDEDMTMKNFETFSESYSVTFETKRVDAKNVNIKIYEPVKIIKIIKEQS >CP024122|48244:65015|61629_61968_+|AWC63295.1|DBSCAN-SWA MKIMLSTDSIVEKYLGMALENPKTPFTYNDTTLVNVKDLYNFINKNCKSELVDFEEVIKEVIETAMTQGGPNCSYELGSHNTKSGNTETISFEYDFEYDEEEDESTNHTITF >CP024122|48244:65015|55987_56707_-|AWC63290.1|DBSCAN-SWA 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MQEIQDTIQGFSSYLLDKGRKPSTIKRYIYDVESFIQWLHLSKKITKNNIFESLHKKDFEAFFKYLKEERQYSGKTVHRIYIVLNRLYEYLDLPSPIEGVIHIDPPDRALRKEDFVSFQEEKRLKEVISSLEGLTEKQKSVRPMILERNISIISLLLDYGLSLQDLVSLQMKHVHFESNTLSIPEESKINRTICLKEDDKLHLYQYYKTIPEPVRPKYHSNDPLFVAFDFIRGTYRWSYENDAPKFLTEISIQKMIRLEVKRANLRKGISAQHFRNTFILKMIMQKNTPEQIMGQIGFKSHLSLKRYYDYYSINNSTT >CP024122|48244:65015|58089_58296_-|AWC63292.1|DBSCAN-SWA MINLEPYHCCICDTDESVEIEIDDFEERREVCMNCGYVHFGAADPWGIEENEKIEKWIKESKMKRADS >CP024122|48244:65015|50531_50867_+|AWC63284.1|DBSCAN-SWA MDTILNKEVSTSFFDQFFSENKVENDVFVISVNKKYFFIESNTVIDMIKKFSPKDQQYIKRHLLLCNLLNRDLSTCLKEIATDYVRTFFGDTDDKKIECKLLPLHSIYNMN >CP024122|48244:65015|57260_57860_-|AWC63291.1|DBSCAN-SWA MSGEEILYTANEVYGRLGVSSSTLRKYSDVLEREGYVVKKNGRGRREYTDFDILLIEKLVELSREDGMTLEKSAKLIVQQFGIDNKKEDTQGSDSLPYQTQIQFQQQYSAMIEEINKMQQANLLEMEKRLGERIDQKNKLIMEDMKDRKEREERIEQRLELRDDNLMKMVREIQEAKRTIVSAQEEIAAAKKKLWWKFW >CP024122|48244:65015|52393_52552_+|AWC63287.1|DBSCAN-SWA MNKFIGMILGLTLSSVLSIGLASPTQLEAKKHIEPPNSNTIMYLEASHGDSW >CP024122|48244:65015|63254_63722_-|AWC63298.1|DBSCAN-SWA MIKALKKKFLNSTGISKHENTILELNQYPEVEKELRVLTEDMLFKVGYAVLTDAITILRNLSNSQLILEILKISNDKIDFWFSHITTAIHNLPEKLERKDTSYLKEEIYNAINVLYSLKRSNPELAHCIPISTPRTDLIIMVGEKNDKLILESEK >CP024122|48244:65015|62006_62192_+|AWC63296.1|DBSCAN-SWA MNKLYKVYTSKEAADKWGLSANTVTQWFNRGKFTDIEARKSAGTILVTHEAMIRVTGKNMD >CP024122|48244:65015|52641_54285_-|AWC63288.1|DBSCAN-SWA MLKKVTPFVASIIGVSLLLTSCSSGETKNVSKVKEKDKNSKKQSVHLPYIAEIPTMDVTKATDGESMNVMRNVFEGLYTLGEGNELIPGVAKSYDVSADQKTYTFHLRDSKWSNGTPVTAEDFVFSWKRAVNPDTTAEYAFLFFDIKNAKKINSKELPVDQLGIKAVDSKTLEVQLEQPVPYFIYLTTFSTFLPINEKYFESKGNRYGLESDQLLYNGAFTLSNWKHEQSFQLKKNENYWGAKTVKVDEINFDIVKDKSTEINLYESGQLDRVGLTGEFVDKYRSDPDFKQRPGVTVQFLRLNQKNEILKNKNVRLAISKAMNKKTFVETVLNNGSIPAEGIVPTGLAKGRNGKDFREENGILVKDDVNGAKENWKKAKEELGREQISLELLTSDNAIAKKNAEYLKGELEKNLNGLTVNIKTQPRKQQIKLLLNSDYDIGVDVWGPDIPDPITFLDLFTTDSTYNFDKYSNKEYDELIHKVKNDLAGDKDARWEAMKKAEKILLEDGAVAPFYQQGRSYLQRSSVKGIVVNDFGAEFNYKWVEVKK >CP024122|48244:65015|49758_49986_+|AWC63281.1|DBSCAN-SWA MELAKELEIILRCKQLLSAAYSVGGSERIEFIRKGHTYMYFAITSPYEETRYYRIDDLLDTHQLEGNKWVYSMTI >CP024122|48244:65015|49064_49427_+|AWC63279.1|DBSCAN-SWA MNNNIAKEELGMIKNRKKKTQGSENFLPENQEEQKRSFPEDELMFVKPKKKLTTKDLPKSIRISIETHAAISALATLQGLNIYEVVNQMVEEKVASLPPAQQKLVKNTVKQVIELKKNKG >CP024122|48244:65015|54659_55424_-|AWC63289.1|DBSCAN-SWA MLNQVFNMDCLEGMKMIEDKSIDMILCDLPYGTTACKWDEIIPFEPLWEQYERIIKDNGAILLTASQPFTTKLIASNMKLFRYEWIWKKGNHTTGFPNANRMPLKNHENVLVFYKKLPKYYPQDLIKLEKPIYRKSTSRKLKIFGKRNNESLNKVHVTKYTNYPKSVINFPRDSKTFHPTQKPVALFEYLIKTYTKEGDIVLDNCMGSFTTAIACINTNRNYIGFELDKGYWEKGNERVEKHLQTVNLTVPNRF >CP024122|48244:65015|50016_50208_+|AWC63282.1|DBSCAN-SWA MAKTKGKQIIEATIKAQVAQSYYECQKWINETLRLMAKDTKLEQDVNWALEICNNFSNLKNKH >CP024122|48244:65015|64292_65015_-|AWC63300.1|DBSCAN-SWA MLPDKYEKFDRIILNTENIEFMNNYMNEIAEVELHIPLNKGVLIIEKWFNSEADVFFPFWQDRDTLVIEIFTEEFGKKRIAKVEVDSNGKIDIVDTIMMDLSFQHLSFQEKQLMIKEIYNFANLATNALVRVFYLMITYKEQKVVTLKEKTIHVSKNKTNKNKKNKSISRKIKRVEYKLSSEVLEQMEITAKRKRYTRHTNSWARRGHWRQYKSGKRVWIKPTTIKLSDNNDIAPVEYRL >CP024122|48244:65015|63971_64226_-|AWC63299.1|DBSCAN-SWA MKCVELEVLKEYGSPTVYFCEHEMKHSCLIAIPRWNWSFLMDYAIDFKDEKPMLMEALEQHISEPADIENVANVIYDFALADFN >CP024122|48244:65015|50220_50505_+|AWC63283.1|DBSCAN-SWA MITQKQNKISEKDLEILKLLAHPARFKITLELLHNQKLNVTQLTSLVDLPQSTISQHLSRMKGKILGFDRKGLEVYYYINNETARKVVLTLLDK >CP024122|48244:65015|51299_52394_+|AWC63286.1|DBSCAN-SWA MDHQLKTNDKITQLLNKWYQEIRAQHKKGATNLKNEIDNYINNINEDPNLLFHYSLLTFRFNVLIDHLSITPSSFQEIDSLDVPQNELLSYYYYFFKGIHATLISNNNEAWEYYEKAERLLQNIHDDLEVAEFSYRFANFYLHTYQSLLAIQYVTTAKEIFSKHNGYENNIAACENLYGLACIDIRQFPIAEEKFNSAIDILRKNNEDSLILRVRNNLGFLYSSQNLSTLALRHLTEVTTKSPNHFKALFLEAREHFKLGEVNQSAELIERGLAICKRLDNKEYLYHFKILDVLNKDVSASVLEELFLEAISFFDTQQLYNYTQEYTEKLAVKFYEENNDLKASKYFYLSHQAKEKTFEKGALK |
23 | Bacillus_phage(30.0%) | integrase | attL 50095:50110|attR 66303:66318 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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