Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024114 | Bacillus cytotoxicus strain CH_3 plasmid pCh3_53, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP024115 | Bacillus cytotoxicus strain CH_3 plasmid pCh3_83, complete sequence | 0 crisprs | TnsE_C | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP024113 | Bacillus cytotoxicus strain CH_3 chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas3,csa3,DinG,cas2,cas1,cas9,cas14j,cas4,cas5,cas7,cas8b2,cas6,DEDDh,WYL | 3 | 15 | 10 | 1 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
59677 : 66931
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024115|59677:66931|DBSCAN-SWA CTTAAGATGCTTGTTTATTCGAGATTAGAATTTTAGGTGCATCCCCACAAGTGAGAGTCGGTGACAGATTATTTGGATCATATATGTAACCACTCACCCCCCAGCCACTAGGATTTATATTCCCGACTTTTTTAATACGAGTCTCCGAGTGATTTCCGGTGATAGGAAATACTTTTCTGGTACATTTTGTTCGAGAATGTCCAATAATGAATACTCGTTCTCTGTTTTGCGGAACAGGTCTTGCTGCTGTTGAGAAGTCTTTTGTGTTAAGCAAAGACCATTCTGCATCATACCCTGCTTCATCCAAACTAATGAGAATTCTGGAAAAATCCCATCCTCCATTAACTGAAAAGAGGTTTTTAACGTTTTCAATGAACAAGTATTTAGGTTTATCTTCTTCTTTTTGGCTTTTGAGGAGGTCAATCGTTTTGTAAAATAATCCAGATCTTGCTCCTTGAAGTCCTTTGGCATTTCCTGAAGCAATACTGATGTCTTGACATGGGAAACCAAATGTCCACACGTCTGCTTTTGGTATTGTTCCTGGTCTAATGTTATTAATGTCATGTTCTGTCCATTCCCCTTTCGTATTATGTATAGCTTCATATGATTTTCTAGCAAATTTATCCCATTCAACATAACCAATACATTTATGAGACGCTTCCTCCATTCCCAACCTAAAACCACCTATACCAGCAAAAAAATCTATAAATGTTAGTGACACACAAATCCACTCCTTCTATAAATCTTGTTGGCCACAAAACGAATCAAACAAAAAAGGCTGCAAGTTAGTAACTTTTCTACTAACTTGCAGCCTTCGATTTTTTCGTTTCGGCTAACCTTAATGTTTTTGTTTCCCGCATCATAATAGGAATTGAGTTGCAATATTGTATCTGAATTTCCCCAAATCCTGAATCTGGTGGAGAAAAATACGTTGAATCCCCTTTAGAATCAATAATATATATTCCTTCTTTATTCATATTACCCCTCCATAAAAATCTCACTTAACAAAAATTCACCATATTTAGTGTTATTTTTATTAAATATTACTACATATTGATTTATGACGCAAATATTTTCAATAAATTAATATGACAATTTATAGATTTAAATAAAAATCAAAAAGAATATTTACCCTTTTATACAAAATGCGGAACAAGCAAAAAAGGTATAGCTAACAAGGAATTTAAAGAAGCTCAACAACGAAAAGCAATAGAAGGATGAGTTCATAACAAAAATCTCAGCTCAATTGAGTTGAGATTTTTGTTACTCTACACCTACCAAAACTTCCACCATAACTTTTTCTTTGCTGCCGCTATTTCTTCTTGAGCTGATACAATAGTACGTTTTGCCTCTTGAATCTCTCTAACCATCTTCATAAGATTATCGTCTCTTAGTTCTAACCTCTGTTCTATCCTTTCTTCTCGTTCCTTCCGATCTTTCATATCTTCCATTATTAATTTATTCTTTTGATCTATACGTTCCCCCAGTCTCTTTTCCATTTCTAATAGGTTTGCTTGCTGCATCTTATTAATTTCTTCTATCATAGCGCTATATTGTTGCTGAAATTGAATTTGCGTTTGATATGGTAATGAATCTGATCCCTGGGTATCTTCTTTTTTGTTATCTATTCCAAATTGTTGAACAATCAATTTTGCAGATTTCTCCAATGTCATACCATCTTCCCTACTCAACTCTACTAATTTTTCAATAAGGAGTATATCAAAATCAGTGTATTCCCTTCTCCCTCTACCATTCTTTTTCACTACATAACCTTCACGTTCCAGGACATCTGAATACTTCCTAAGCGTACTGGAACTCACTCCTAAACGTCCATAAACTTCATTAGCGGTATATAATATTTCTTCACCTGACATAGCGCTATGCACCTCCTATAATGAGAATTCCATATTAAAAAATTAATACCTCTTAGAATCTATCGACGAAGCTCATACGGTCTTTGCTGTATTTTGTCAGAACAAAAGATAAAAACACAGTTTGTATGTTACCTTTATTGGTATCTTATTATCTATACACTTATCACCTACATTTCATATTATTGTAATATTAACCCTTGATAAATTAACAAAAAGAAAGAGCCAGCTCTTATGAGTCGGCTCTTTTCATCTTTGATTCCTTTATCCATTTCTCAATTTTTTCATTCTCTTCAATTCCCCATGGATCCGCTGCACCAAAATGAACATAACCACAATTCATACAAACTTCTCTTCTCTCTTCAAAGTCATCAATCTCAATTTCCACTGATTCATCTGTATCACAAATACAGCAATGATAAGGTTCCAAATTAATCATACAAATCATCTCCTTTTCTCTTTAATGATAGCATTGAATTAGGTAGTATTTACGTCAGTTTATTTTTCTAGTGCTTCTTTCAAAAATTCCATCTCCCCTTCGCAATGATGTCGCCCAATTTTTCAATATATTGCTCCTCTGTTAACTCTTCTTCATAAAAATATCGTTCGTATGTTTCCGTTATTTTCCATGAATGGTTGTGCATCCATTTCTAAAATTGTTTTAATGCAATTTGCCATGTCTTCATGATCAGATCATTCGTCATGCAACTCTTCACCTTCGAAAATAGTTACCTGCATGTCGCTATAATCCTCAATTATAAACATAGCACCTTCCATCCAATAAGAGGTCACACGACCGAAAAAAGAAAATTGTACGTTGCGGTATTATATTTGGTGTCGTTACAATAGGAATTTAGTTTATTCCAATGATATTTCTTCTAATAGGATAGTGTGGTAGACTGTATGTAACTGCATATTGTGAGGGTGGTTTGTTATCCCTTCTTTCCAACTGGAAGGAAAGGAGGTGATAATTATGGATTTCATTGTAGAACTTTTGAAAGAAATCGCGAAAGCAATTGTGCGTGAAATATCTGCATTTGTTTTCAAAAGAAGTTTTCTTAAAGAAAACAATGAAAAAACCACTCCTCGCCGTCGCAAGCACAGGGGTGGTTTTCAAAGAAAAAAATAACTTATGATAACCGCCACCCTTGCGGTAGCAGTTACTTGAAGAGATGTATCCAGCATCTCTTCTTTTATTATATACGGAATCTAACAATATAATACTTCTAGAGTTATTATATCAAAGTTAGTAAAAAAAACAAAGTGTGTATGACATTAGAAAAAGACACCTATGAATGTCATCCTAAAAAGTCCCGTTTTCTTGTTCAATTTTAACTAACATTACTTTTCCACTTCTAGCATCTCTTTTTTAAAATAACTCTATTTGAAATACCGTGATTTCTAATACAATTCTTAATAATTCCTATATAAAATCAAATATAATTTTTTTAAAAATACAAATAGTATTTTTAATCGACACTTCAAAAGGTACACCTTTTTTAGCACCTTAAACTCTAACAAATTATGCACTTCAAAACGTCTAAAAACACAATTTTGAAGCACTAAATAATTTTAGATACCTTTTGAAGCATTTTTGTTATAATTTTATTAGAAACACTTTCGAAAGGATGTCTATTTATTTTGAATACAAGAAAATTCGGATATATAAGAGTTAGTAGCAAAGATCAAAATGAAGATCGGCAACTCGAAACAATGAAACAACTCATTAATGATGAACGGGATATTTTTATCGACAAACAAAGTGGAAGAGATTTTAATCGTGAACAATATCAACTCTTAAAACGCATGTTAAGAAAAGATGACATTCTATATATTCATTCCCTAGATCGTTTCGGCAGAAATAAGGAAGCTATTCTTGAGGAGTGGAAAGATATTACCCAAAATATTCAAGCTCATATTGTCGTATTAGATATGCCACTTTTAGATACAACTCAATATAAAGATAGTTTAGGTAATCTTATTACTGATTTGGTACTCCAGATTTTGTCCTGGCTTGCTGAAGAAGAACGAACAAAAATAAAAACTCGTCAACGTGAGGGTATTGAAGCAGCAAAGAAAAAAGGAAAGCATTTGGGCAGACCAAAAACTAAAATAACTCAGGAATTTATAGATGCATATAACGATTGGAAACATGGAAAGGTCACAGCGCTATACGCCATGAAGAAATGTAATATGACAAGTCCTACATTTTACAGAGTAGTTAAAAGATATGAGAAAGAAATAGAAAACACATGAGAAAATTTTTTTGCAAAGGGATTAACATTTAGAAAAATTGATAGTCTAGAAGGACTTCAGAATCTATCAAACAACAAGGATGTAATTGCTTTTATGTAACTAGGAGGTTGTTATACATGCAAGAAATCCAGGACACAATACAAGGGTTCTCTTCCTATTTATTAGATAAAGGAAGAAAACCTTCAACTATTAAGCGCTATATATATGATGTAGAAAGTTTTATTCAATGGCTGCATCTATCAAAAAAAATCACTAAAAACAATATTTTCGAATCACTTCATAAAAAAGATTTTGAAGCATTTTTCAAATATTTAAAAGAAGAACGGCAGTACTCTGGCAAAACTGTACACCGTATATATATTGTGTTAAATAGGTTGTACGAATACTTAGATTTACCAAGCCCCATTGAAGGAGTTATTCATATAGATCCGCCTGATCGGGCATTACGTAAAGAAGATTTCGTTTCTTTCCAGGAGGAAAAGCGCTTAAAAGAAGTCATTTCTTCTCTAGAAGGACTGACAGAAAAACAAAAATCTGTACGTCCTATGATATTGGAACGAAATATTTCTATCATTTCATTACTCCTGGACTATGGATTATCTTTACAAGATCTTGTTTCTTTGCAAATGAAACATGTTCATTTCGAAAGCAATACATTGTCTATTCCTGAAGAATCAAAAATAAATAGAACAATCTGTTTGAAAGAAGATGACAAGTTACACTTATATCAATACTACAAAACCATTCCTGAGCCTGTTCGTCCTAAATACCACAGCAATGATCCTTTATTCGTTGCTTTTGATTTTATCCGTGGGACATATCGTTGGAGCTATGAGAATGATGCGCCAAAGTTTCTTACTGAAATATCAATACAGAAAATGATTCGCTTAGAAGTAAAACGCGCTAACCTTCGAAAAGGGATTTCTGCGCAGCATTTCCGAAATACTTTTATTTTAAAAATGATCATGCAAAAAAATACTCCTGAGCAAATCATGGGACAAATCGGTTTTAAATCTCACTTATCCTTAAAAAGATATTACGATTATTACTCTATAAATAATTCAACCACGTGATGAAAAACATTATTTAATGTGTAATTTTTATATAACTACTATTTTCCATTATTTTTGGGAGAGACGAGGGATTTACATTGAGGGAAAACAAAAAAACATATTATATACACAAATATACGCTACGAGATAAAACAACTAAATCCATTAAGATTGAGCCCTGGCGTTCATTTAGAGAGGAAATGAACGTACTTAAAATAAAGGAGAGTGACATTTTTCAAATTCAAATGATAGAAATACATCCAAACAAAAAATAACATAGTGTAGCTTTATAAAAAAGTTTGATCAAAATTTCTAATTTACATTAGGATTAGTCTTTTTCTTTTGTCAAAAAAATTTTCGAACGGAAAATATAAAAAGTTTTATAATCTGTATTGAATTTAATACAGATTAGGTGTATTATAAGTGTAAGGAATTCAATACAAAACAAAGGGGATATGAAAATAATGAAAATTATGTTAAGCACTGACTCAATCGTAGAAAAATATTTAGGTATGGCTTTAGAAAATCCAAAAACACCTTTCACTTATAACGACACAACACTTGTTAACGTGAAAGATCTTTATAACTTCATCAACAAAAACTGCAAAAGTGAATTAGTTGACTTCGAAGAAGTAATCAAAGAAGTAATTGAAACAGCAATGACACAAGGCGGACCAAATTGCTCTTATGAACTAGGCTCCCACAATACAAAAAGTGGTAATACTGAAACAATCAGCTTCGAATATGACTTCGAATATGACGAAGAAGAAGACGAATCAACTAACCATACGATTACATTCTAACGAGAGGGTTCGGTCCTCTCCTTTTTTGGAGGTTAACAATGAACAAACTATATAAAGTTTATACGTCAAAAGAAGCCGCAGACAAATGGGGATTGTCAGCAAATACAGTTACACAATGGTTCAATCGTGGTAAATTTACAGATATAGAAGCTAGGAAGAGCGCTGGAACAATTCTTGTGACACATGAAGCGATGATACGTGTTACTGGAAAGAACATGGATTGATATAACGCATATTTTTAAATTAAAGTTTGATAAGAATATTTCTTATCAAACTTTTTTAAAATTATCGAACTTTATTACAAATTATCAATCTTTATTCAAAAGCTATAGCAGTTATTGTTGGTTTGTAATAAAGTTTGATTAAAACTTACTTAGAATTCTTTAATCGAAAAGAAATAAAACGATACATCTTTTTTATAAATAGTACGACTTTATTTCAAAGCTACACATAGCGCTATACTATCGTTATTACAACCAACATTTAATAAAGGAGCAACATGGCGCTATGTTGCTCCTTTATAGGATAAATTTCTAACGTTCTATATCTGTATCATACATCCACGAATAATCTATCTATAAACCTTTAATCATCCCATTTATTGATAGAAATAGGCAACCTGCCGTATATACCATAAAACCACATCTAGAGAAAGAGGTTTTTAAGCTGCCAGGCTAGGGAACATCTTTCTCGCTTTTATTTAATAATCTCGATTATGCATTTGTTGCATCATAAATTTTCTTTTTGCTTGATCTATTTCTTCAGATACATCCTCGTACTCTTTTGAGAATATTTCATCTTTCTCCTTGAATATCTTTTCGCTATTTGATTCCACAAACCTATTATACAAATTTAGTAATTTTTTGTTGTATTCTTCCTCATACATTAATCCTTCATTTCGATCATCTTCATCAAGCTCCATATCGTCCGGCATAACATTCTCTTTCCATTTAACAATTTCGTTCATAATAGGCGCTGCTTCTGCTTCTAAAATAGTACGTTCACATGTTGCAAGATCTTCTAATTCGCTTCCTTCCCCCACAAGTTCACCTTCAAAAATTGTAATTTGCATATTTTCAAAATCTTTTTCTGTATGTCCTACCATATCAACCCAATATTCTCTCAAACTTTCAAGTGCATAAGCAGTATCTTTTAAACGATAGCAACTAATTCCCTCTTCCCGAATTCCATGCTCCTCAACACCGGCAAAACTACTACAATGTTCTTTCCCTTTCCAATTCCCTTTCATATCTAATCGAATAAATTGTTCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024115|59677:66931|63188_63803_+|AWC55158.1|DBSCAN-SWA MNTRKFGYIRVSSKDQNEDRQLETMKQLINDERDIFIDKQSGRDFNREQYQLLKRMLRKDDILYIHSLDRFGRNKEAILEEWKDITQNIQAHIVVLDMPLLDTTQYKDSLGNLITDLVLQILSWLAEEERTKIKTRQREGIEAAKKKGKHLGRPKTKITQEFIDAYNDWKHGKVTALYAMKKCNMTSPTFYRVVKRYEKEIENT >CP024115|59677:66931|65319_65658_+|AWC55160.1|DBSCAN-SWA MKIMLSTDSIVEKYLGMALENPKTPFTYNDTTLVNVKDLYNFINKNCKSELVDFEEVIKEVIETAMTQGGPNCSYELGSHNTKSGNTETISFEYDFEYDEEEDESTNHTITF >CP024115|59677:66931|66358_66931_-|AWC55162.1|DBSCAN-SWA MEQFIRLDMKGNWKGKEHCSSFAGVEEHGIREEGISCYRLKDTAYALESLREYWVDMVGHTEKDFENMQITIFEGELVGEGSELEDLATCERTILEAEAAPIMNEIVKWKENVMPDDMELDEDDRNEGLMYEEEYNKKLLNLYNRFVESNSEKIFKEKDEIFSKEYEDVSEEIDQAKRKFMMQQMHNRDY >CP024115|59677:66931|61779_61986_-|AWC55157.1|DBSCAN-SWA MINLEPYHCCICDTDESVEIEIDDFEERREVCMNCGYVHFGAADPWGIEENEKIEKWIKESKMKRADS >CP024115|59677:66931|59677_60397_-|AWC55155.1|DBSCAN-SWA MSLTFIDFFAGIGGFRLGMEEASHKCIGYVEWDKFARKSYEAIHNTKGEWTEHDINNIRPGTIPKADVWTFGFPCQDISIASGNAKGLQGARSGLFYKTIDLLKSQKEEDKPKYLFIENVKNLFSVNGGWDFSRILISLDEAGYDAEWSLLNTKDFSTAARPVPQNRERVFIIGHSRTKCTRKVFPITGNHSETRIKKVGNINPSGWGVSGYIYDPNNLSPTLTCGDAPKILISNKQAS >CP024115|59677:66931|65696_65882_+|AWC55161.1|DBSCAN-SWA MNKLYKVYTSKEAADKWGLSANTVTQWFNRGKFTDIEARKSAGTILVTHEAMIRVTGKNMD >CP024115|59677:66931|63919_64876_+|AWC55159.1|integrase|DBSCAN-SWA MQEIQDTIQGFSSYLLDKGRKPSTIKRYIYDVESFIQWLHLSKKITKNNIFESLHKKDFEAFFKYLKEERQYSGKTVHRIYIVLNRLYEYLDLPSPIEGVIHIDPPDRALRKEDFVSFQEEKRLKEVISSLEGLTEKQKSVRPMILERNISIISLLLDYGLSLQDLVSLQMKHVHFESNTLSIPEESKINRTICLKEDDKLHLYQYYKTIPEPVRPKYHSNDPLFVAFDFIRGTYRWSYENDAPKFLTEISIQKMIRLEVKRANLRKGISAQHFRNTFILKMIMQKNTPEQIMGQIGFKSHLSLKRYYDYYSINNSTT >CP024115|59677:66931|60950_61550_-|AWC55156.1|DBSCAN-SWA MSGEEILYTANEVYGRLGVSSSTLRKYSDVLEREGYVVKKNGRGRREYTDFDILLIEKLVELSREDGMTLEKSAKLIVQQFGIDNKKEDTQGSDSLPYQTQIQFQQQYSAMIEEINKMQQANLLEMEKRLGERIDQKNKLIMEDMKDRKEREERIEQRLELRDDNLMKMVREIQEAKRTIVSAQEEIAAAKKKLWWKFW |
8 | Bacillus_phage(33.33%) | integrase | attL 53785:53800|attR 69993:70008 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024113_1 | 1589943-1590071 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP024113_1
|
1 spacers
spacers of CP024113_1
>1.1|1589981|53|CP024113|CRISPRCasFinder TATTTGCGTAGGGGCGTTTTTTATTGAAGGTCCTACTGTCGTTGTGTCTTCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024113_1
The CRISPR arrays of CP024113_1 >merge|CP024113|1|1589943-1590071|CRISPRCasFinder AACTAGGGTGGTACCGCGATGTTTTAATCGTCCCTACGTATTTGCGTAGGGGCGTTTTTTATTGAAGGTCCTACTGTCGTTGTGTCTTCATAACTAGGGTGGTACCGCGATATTTTAATCGTCCCTACG >CP024113|1|1|1589943-1590071|CRISPRCasFinder AACTAGGGTGGTACCGCGATGTTTTAATCGTCCCTACG TATTTGCGTAGGGGCGTTTTTTATTGAAGGTCCTACTGTCGTTGTGTCTTCAT AACTAGGGTGGTACCGCGATATTTTAATCGTCCCTACG
>CP024113.1|AWC52438.1|1587899_1589534_-|polysaccharide-biosynthesis-protein MSTSKVLKGTALLSGATMISRILGFIYFFPFQLLVGTQGVALYGYAYSWYGILLSFSTAGIPIAVSKFVAKYNALGDYSTSKKLYNSSVKLMLLMGFSGFFILFIGAPYISQFIIRSKAPDPKFIADVTLTMRALSFALIIVPAMSVTRGYFQGFQHMKPSAVSQVVEQIARVVFILAGSFVVTKLLGGSVASSVAVATFGAAVGAIASVSILIMYWKKYNHLKPPKGELKSRASTLPLKSIYMELLRYAIPIVFVGIAIPLYTLVDQYTVADALRALGEPLTTANAVFAYIANYAQKLIMIPASLATGFSLTIIPAITKSFTSGKQEELQEQITKIFQVLLFFTIPAAFGLASIAYDTFRMVYVSHDIAVGGSQYLISYAPSAVLSAIFTVSAAILQGIDYQRKTMIAFSVGILVKLIVNTPLLYVLGGHGAVLGTILGYLVSDAIMLYCIVKFAKFDIKETIKTVCLIIIYSGAMSAIVMALKAMIGWFIPGQSYIESLLIVIICGVVGGFVYLLFVLTSGLASRILGNRIQRLPILGKFIK >CP024113.1|AWC52437.1|1586912_1587830_+|cysteine-synthase-A MKLCKNVTELIGDTPVVRLSKFVPKDAADVYVKLEMFNPSRSVKDRAAYHLIHVAEEQGFIQPGDTIIEPTSGNTGIGLAMNAAAKGYKAILIMPDNMSKERMNLLKAYGAEVILTPAEQRMPGAIAKAIELQKQIPNSFIPQQFENPANPNIHRYTTALEIYEQMEGKLDAFVATAGTGGTITGTGETLKEKLPNLHIVVVEPKGSPVLSGGVPGPHKLVGTSPGFIPKNLNTEIYNEIIQIADEEALSTMRNLAKQEGLLVGPSSGASVYAAIMIAKRLGAGKKVLCIAPDTGERYLSMGLFE >CP024113.1|AWC52436.1|1585688_1586897_+|MFS-transporter MQAISKENVVTTPTIYRILFAISFGHFLNDSMQAVVPALFPILEKTMNLSYMQVGWIAFALNMTSSVMQPVFGMYSDKKPSPFLLPLGMFSSMLGMIGLAFAPNFIIVIISVLFIGLGSAVFHPEGARVAYMASGTKRGLAQAIYQVGGNTGNSLAPIFTAVIFVPLGQKGSLGFTAFAAVGILLLMYVSKWYKNELVSGAVKSKKRAALEAENAIVSAHIKFVIVLLIFLTFVRSWYGAGIGNFYQFYLIEHYGLSIKNAQYFVFAFMISGVLGTFFGGPLADRFGKKNIIVFSMLGSAPLALLLPHVSLLWVVPLFLCIGFISSSSFSVIVVYAQELVPGKVGMVSGLIVGLAFGLGALGAVVLGKLADIYSLQFIMVLCSCLPLIGLTSWLLPSDKKSV >CP024113.1|AWC52435.1|1583830_1585471_-|peptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKKTKRVAVLSLTLSLVLTACGQKQETTTNKDEKKVATKQILNIVETGEISTLDSSIATDGFSYAALNNVMEGLYMPGPGNKPVPGAAESYTLSEDGKTYIFKLRHSNWSNGDPVTAHDFEYAWKRAINPETASEYAHIMFDIKNAEKVNKKALPLDSFGVKALDDKTLEVQLEHPVPYFLGLMGFATFYPQNQKVVEAQGTNYGLEAANAVYNGPFVLNEWKHDTSYKMTKNPNYWDHKNVKLQEINVNIVKDTSAAVNLFESKQVDRITINSEFVDKYQNDPSLKKMARPSVTFFRLNQKNPLLANKNARKAISLSFDKKGITTTILNNGSIPANAFIPKGFVKGPDNKDFRSTSNVKVETSIKEAKKQWETAKKETNLQNVSLSIISTDESNDKKISEYLKGELEKNLPGLKITLNPLPVKAFLEREGNGDFEISLSTWGPDYPDPTTFLNMFVTDGPFNKMNYSNKQYDELMEKASSSLTTDLPARWKAFQDAEKILVEDDAAIAPIFQAGLIYLERPSVKGVVVRPFAGIYSYKWAYITE >CP024113.1|AWC52434.1|1582159_1583728_+|Vga-family-ABC-F-type-ribosomal-protection-protein MLLLEANRIKYYIQDRLLLDIDQLQIHQNARIGLVGRNGSGKTTLFQILAKEIVPEEGSIVQRARCELLPQLKQTDTTKSGGEVTQEYIQKAVLKDPELLLADEPTTNLDTGHIEWLEKKLGNWKGAFVIISHDRAFLDALCTTIWELDEGKIKVYTGNYSEYVKQKEIERQQEQLAYEKYEKKKKQLEEAVKLKEKKAERATKTPKKEGKLEPKITKPYFAKKQKKLQKTATAMITRLEKLGKVEKVKELPPLKMDLPNAETFKNRIILRVNDRIGKVGKRVLWKKASFHIRGGDKLAIIGANGSGKTTLVKQIMNQEYGIRFSPAVKVGYFSQNLNILDPAKSIIENVQSSSKQNETLIRTVLARMHFFREDVYKLVEVLSGGERVKVALTKLFLSDINTLILDEPTNFLDMTAVEALESLLKEYEGSVIFVSHDRRFIENIATRILTIHNQELGLFEGTYQQYKRTQVQQAQERKKDTRLLLETKLSEVLSRLSIEPSEKLEREFEKLLQEKRELDASE >CP024113.1|AWC52433.1|1580568_1581828_+|GTPase-HflX MEEFVQRAILVGVNLGHESDFQYSMEELANLAEACDVEVVGQVTQNLQRVNPSHYIGTGKIGEVAAYVKEVDANIVIFNDELSPSQIRNLEKDLDCKVIDRTILILDIFAQRAKTKEAQLQVEVAHLQYMMPRLVGLRESLGRQSGGVGTKNKGVGEKKLELDRRKIEEQISVLNKELEALVVQRKTQRKQRKKNEIPVVALVGYTNAGKSTTMNAMLEIFNGTIEKQVFEKDMLFATLETSVRNIELPDNKSFLLTDTVGFVSKLPHHLVKAFRSTLEEVAEADLLIHVVDYSNPNYEQLIEITNQTLKQIGVENIPTIYAYNKSDMMDVEIPKTKKDRVYLSAKKQIGMEELVEMIRSHIYKEYTKCEMLIPYDQGQIVSYFNEYAHVICTSYENEGTKLSLECKISDFEKYKRFAI >CP024113.1|AWC52432.1|1578286_1578751_-|hypothetical-protein MKRKIFFLLTLLCIVLPIQVSAFTFQELPVASKSKQWYIEIDKSYNSNKQARQPKQGVYDTYSLFVKNIGKDVSNVSIEIVGNDPSAKTTFKPTVPHTNVSKSHTSFDYMVFPLYFTSHTFKVVMTWEEKEFTYNGHPESKSKKMKQTFIFTEE >CP024113.1|AWC52431.1|1576854_1578231_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKKVISNVLAMTAALQVIMVPTTSFAAEKGFSDVPKSHWAYEAINDLANRNIIAGYDNGKFGLGDSVTREQVAALIYRALKPEAKAEYKNPYHDVSASTTMFPNEILALTEMGIFTGDENKNFRPKDSLTRAEMAMILQRAYHLKVKANHTFHDVDPNSWAKDAISALQSNGMAEGDGTGAFYPSKTVTREEYAQFLFNAEQSYLNLDLTLASNVTAEEIDNFLKKSRSDSPLIGHGQDFIAAQNEHGVNALYLAAHAILESGYGRSEIAYRKHNLFGLRAYDRDPFYHAKYLPTYRDSISYNANYVRERYLEKGAIYYNGPTLVGMNVKYASDPEWAGKIAGLMERIKPFDRNDYKNANRLPKNPHTLDVEALGNEIPYKDLGNREIAVQASGKYYKVPYPYDLKIKSIPDITQNEMGTLTNGSKVTVHREDPNGWVEFSMKDKQEKYWTLKSNLKM >CP024113.1|AWC54937.1|1576097_1576286_-|hypothetical-protein MPKSINFSAFIDWDCFRIETELSYIQTCIYEELSTKKRYHVYTDIPFLAIFLLAPFSVSLFL >CP024113.1|AWC52430.1|1574723_1575956_-|aspartate-kinase METIVQKFGGTSVGNIQRIQHVANLMIEEYEKGHNVVTVVSAMGKSTDKLVALATSITENPSKRELDMLLTTGEQVTISLLTMALQTKGYQAISLTGWQAGITTEPVHGNARITDIHTERIQSYLQEGTIVIVAGFQGLSEEKEITTLGRGGSDTTAVALAAALKAKKCDIYTDVTGVYTTDPRVVNNAYKLDEISYDEMLELANLGAGVLHPRAVEFAKNHNVVLEVRSSMEQENGTIVRGECNMEQQSIVKGIAFEDNITRVTIKGLEHDSLSTIFSTLAEAHINVDIIIQSITNEGTVHLSFSIHSNDLRETLEALKQNQETLHYESVEYENHLAKVSIVGSGMVSNPGVAAHMFSTLKEENIHVKMVSTSEIKISVVIDRLHLVDGVEALHQAFMTKVEPLVQMNK >CP024113.1|AWC52439.1|1590174_1591512_+|sodium-dependent-transporter MNSPQWTSKLGFVLAAAGSAIGLGAIWKFPYMAGIGGGGAFFLIFIGFTLLIGLPLLLAEFVIGRSTQKEAVDAYRQIAPKTLWPWLGKLGVVTCFILLSFYSVVGGWILLYLWNAITGRLWEGNGAYEATFGEIISNPYLAVGSQLLFILMTIFIVSKGVQNGVEKVNKYFMPALFVLFFILIIRALTLDGAGEGVRFFLQPDFSNVTSEIILYAMGQSFFSLSVGVAVMVTYSSYLPKEESLPRSAFSIVGLTLMITLLAGLAIFPVVFAFGMEPSQGPGLLFIVLPAIFSKMAFGKVFFVIFLLLFFFATVTSAISMLEISVASLTAKGNGRREKFAIIVGLLIFVVGIPSALSYGVLSDFKVFGKTVFDLADFAVSNVLMPLGVLLVSIFVPLKMKKDVLMRELGVSKHKGYTLFILWLFLLRYIAPVAIIIVFLNVIGVI >CP024113.1|AWC52440.1|1591783_1592050_+|hypothetical-protein MGYVKATAVLPESLIAEIQKYVQGETIYIPKQETEHYKWGTRSGGRKQIDMRNRKIKEAFENGIAIYQLAEEYFLSVETIKKIVYSKS >CP024113.1|AWC52441.1|1592189_1592828_+|elongation-factor-G-binding-protein MEAFIRSDQYNFIKSQTHILVHGHATANDRGVITALKSLAIEKVLHAFENLNSEQKELIETILAVENREDAEAFLLKLNPYVIPFQEVTPQALKKLFPKVKKLKLPEMEEVNMKEMSYLGWTDKGTGKRFIIAKKNNKLVGVQGTFQSINKKGICALCHGHEEVGMFLVEIKGDVPGTFVKKGNYICQDSIACNQNMTSLDKLHDFIERLKK >CP024113.1|AWC52442.1|1592889_1594281_-|transposase MFYNQKNLEITQNRKFYEAMYDQDHHLVRIEKEMNWNIVYTLVKPFYQSPVGRPSVDPLIIVKILLIQYVEGFRSVRFTCKQVKQNATYRWFLGIFPHANIPCHSTISKFLTHRIQGSSIWEDLFDHILHQIQKDGFLSRDIWIADETELKANANKRKREVWIQEVEVKEDFYTLEKGNKRRIEKGKKPFLPRPTKIETKRILKSPTDPDARLSVKHDARGRFAYFEHRMVDGLHNFIIDTHITPANVPGHRILRKRIECTKERLGYIPKEIALDAGYYNARLAEGLFQNNLFSYISYRRYASKEHPECKKNQFKQVHEDLYACPCGIPFSYKTTTRNGYHEYKPEKGSCTGCPFAKKTDRVLRISVHEEIYHKLRWQRLSDRGKILRFVRPSTVELSFAQSKELHGFRFARYRGVQKVTIQALLTAIIQNLIKWTKLLSLKEVGLYLTYQISDEIESETVTF >CP024113.1|AWC52443.1|1594403_1594940_-|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase MSKKTFELATFAGGCFWCMVKPFDELPGIQKVVSGYTGGHISNPTYEQVKSGTSGHLEVVQITFDPSIFPYQKLLDLYWSQIDPTDDDGQFFDRGPSYRTAIFYHNETQKELAEKSKQLLATSGIFNEPIVTEIRPAAPFYEAEEYHQHFYKKNPKKYAQERKESGREDFIKTNWQKK >CP024113.1|AWC52444.1|1595858_1596758_+|branched-chain-amino-acid-aminotransferase MKKQYIYMNGELVEKEKAVVSVYDHGFLYGDGVFEGIRSYGGNVFCLKEHVKRLYESAKSILLTIPMTVEEMEKAVVQTLQKNGYADAYIRLIVSRGKGDLGLDPRSCEKPSVIIIAEQLKLFPQEFYDNGLSVVSVASRRNMPDALDPRIKSMNYLNNVLVKIEAAQAGALEALMLNQQGYVCEGSGDNVFVVKDGKVVTPPSYLGALEGVTRNSVIELCDKLGIPCEERPFTRHDVYVADEVFLTGTAAELIPVVKVDAREIGDGKPGEVTKQLTEAFKRLTRERGVRVPGLAESLA >CP024113.1|AWC52445.1|1597255_1597354_+|hypothetical-protein MLVNKVYKFRIYPNKGQEILKQVVDVLQVNTS >CP024113.1|AWC52446.1|1597688_1599362_+|dihydroxy-acid-dehydratase MRSDMIKKGFDKAPHRSLLKATGLKDEDFHKPFVAICNSFIEIIPGHKHLNEFGRLVKEAVRAAGMVPFEFNTIGVDDGIAMGHIGMRYSLPSREIIADSVETVVNAHWFDGMICIPNCDKITPGMMMAAMRINIPTVFVSGGPMAAGKTSKGEVVDLSSVFEGVGAYQSGKISEEELKDIEDHGCPSCGSCSGMFTANSMNCLCEVLGLALPGNGSILATDSRREQLIQRAAESLKILMERDIKPRDIVTEEAIDDAFALDMAMGGSTNTVLHTLAIAQEAGLDYDMNRIDVVSRKVPHLCKVSPASNWHMEDIDRAGGMSAILKELSRKEGVLHLDRITVTGKTLRENIADAEIQDKEVIHSLENPHSQEGGLRILKGNLAKDGAVIKSGATEVKRFEGPCVIFNSQDEALAGIMLGKVKKGDVVVIRYEGPRGGPGMPEMLAPTSAIAGMGLGADVALLTDGRFSGASRGISVGHISPEAAAGGEIALLQQGDIVCIDVEERLLEVKVSDEELAKRRKEWKRPEPKVKTGWLGRYAQMVTSANTGAVLKMQNFD >CP024113.1|AWC52447.1|1599395_1600658_+|threonine-dehydratase MVHKVKERVKIEDILMAHNCLKDIVNKTPLQRDAVLSEKYKCEVYVKREDLQVIRSFKIRGAYNLIQSLSKEKLQNGVVCASAGNHAQGVAYTCNLLEIPANIFMPTTTPKQKVSQVKFFGGDVADIVLVGDTFDSSFQEAQRYCEENGMTFVHPFDDPHVIAGQGTVAVEILHDTEKTIDYVFTAIGGGGLASGIGTYVKGVSPNTKVIGVEPKGAASMKEAFLQNENVTLEMIDSFVDGAAVKKVGKLTFETCKDVLDDIVLVPEGKICTTILELYKKNAIVAEPAGALSIAALDFYKDEIKGKTVVCVLSGGNNDIDRMQEMKERSLIYEGIKHYFIIQFPQRSGALREFLDKGLGPEDDITRFEYIKKHNKENGPALVGVELKHKEDYEPLIARFKENHIQFLELNKNPVLFDLLT >CP024113.1|AWC52448.1|1600879_1601599_+|DUF554-domain-containing-protein MVILGAIVNGICIIIGTLLGKVLSNIPESMKGTVMHAIGLAVTVLGLRMGMKSEIFLIVILSLVIGAVVGEWLCLEEKLQKLGNWLEKKVGSKGEGSISVGFVTATLIFAIGAMGVLGALDSGIRGNHNVLYTKAIIDGFISLILTTTLGIGVLFSAVPVILYEGGIALFATKIDRFVPEQLMNQFIIEMTATGGIMIFAIGLNLLGFIKIKVANLLPGILVVGMIVSIIYGYNLFLLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024113_2 | 2092555-2093248 | orTypeII |
NA
Consensus repeat of CP024113_2
|
10 spacers
spacers of CP024113_2
>2.1|2092591|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGATGTTTATCCATCCACTCTTCGACAA >2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTTTGGGTTGCCGATGTAGAAGTAAAAA >2.3|2092723|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACAAAAAGTGACTGAGGGGGCTTATAAC >2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTGCAAGCAATCAAAAAAGGTGCAATTGA >2.5|2092854|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAAAATTTCGGTAATGTAAAGGTGTTTAG >2.6|2092920|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAGCACGTCTTTATTACAGGACAAACGGG >2.7|2092986|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCCAATCGATGTATGGTGTGAGGAAGCT >2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAGCAATCTAAAGCTATCATGTAGTATA >2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGTCTTCCTCTACTTTTGGTTTCGGTGG >2.10|2093183|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAATGATGTTGATAAGTTGCCCCGCATA |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024113_2
The CRISPR arrays of CP024113_2 >merge|CP024113|2|2092555-2093248|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTTCGATGTTTATCCATCCACTCTTCGACAAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTGTTTTGGGTTGCCGATGTAGAAGTAAAAAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTACAAAAAGTGACTGAGGGGGCTTATAACGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATAGTGCAAGCAATCAAAAAAGGTGCAATTGAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTGAAAATTTCGGTAATGTAAAGGTGTTTAGGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTCAGCACGTCTTTATTACAGGACAAACGGGGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATATTCCAATCGATGTATGGTGTGAGGAAGCTGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATGGTAGCAATCTAAAGCTATCATGTAGTATAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTCGTCTTCCTCTACTTTTGGTTTCGGTGGGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGATTTTAATGATGTTGATAAGTTGCCCCGCATAGCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT >CP024113|2|1|2092555-2093248|PILER-CR GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTCGATGTTTATCCATCCACTCTTCGACAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGTTTTGGGTTGCCGATGTAGAAGTAAAAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TACAAAAAGTGACTGAGGGGGCTTATAAC GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT AGTGCAAGCAATCAAAAAAGGTGCAATTGA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGAAAATTTCGGTAATGTAAAGGTGTTTAG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCAGCACGTCTTTATTACAGGACAAACGGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT ATTCCAATCGATGTATGGTGTGAGGAAGCT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT GGTAGCAATCTAAAGCTATCATGTAGTATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCGTCTTCCTCTACTTTTGGTTTCGGTGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTTAATGATGTTGATAAGTTGCCCCGCATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT >CP024113|2|2|2092555-2093248|CRISPRCasFinder GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTCGATGTTTATCCATCCACTCTTCGACAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGTTTTGGGTTGCCGATGTAGAAGTAAAAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TACAAAAAGTGACTGAGGGGGCTTATAAC GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT AGTGCAAGCAATCAAAAAAGGTGCAATTGA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGAAAATTTCGGTAATGTAAAGGTGTTTAG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCAGCACGTCTTTATTACAGGACAAACGGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT ATTCCAATCGATGTATGGTGTGAGGAAGCT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT GGTAGCAATCTAAAGCTATCATGTAGTATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCGTCTTCCTCTACTTTTGGTTTCGGTGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTTAATGATGTTGATAAGTTGCCCCGCATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT >CP024113|2|1|2092555-2093248|CRT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTCGATGTTTATCCATCCACTCTTCGACAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGTTTTGGGTTGCCGATGTAGAAGTAAAAA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TACAAAAAGTGACTGAGGGGGCTTATAAC GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT AGTGCAAGCAATCAAAAAAGGTGCAATTGA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TGAAAATTTCGGTAATGTAAAGGTGTTTAG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCAGCACGTCTTTATTACAGGACAAACGGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT ATTCCAATCGATGTATGGTGTGAGGAAGCT GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT GGTAGCAATCTAAAGCTATCATGTAGTATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TCGTCTTCCTCTACTTTTGGTTTCGGTGG GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT TTTAATGATGTTGATAAGTTGCCCCGCATA GCCATAATTCCTCTTTAAATCTTGGTATGATATGAT
>CP024113.1|AWC52860.1|2092286_2092451_-|hypothetical-protein MGQFSVTKVGQIWLTIYKYLIGWCGYNALSDTPSICKERDKWIRRRLRMVIWKQ >CP024113.1|AWC52859.1|2090883_2091948_-|tetratricopeptide-repeat-protein MDANVITNTQITKQLNEWYQVMRAQHVLKARQLKKEIDTNLYQIEENPDSFIYYSLLDFRYNMLIGNFDCNLATTPVKKDVFLQYYYHFFKFIYAMETGNYNDAKEHHDYADELLKDISDVYEKAEFHYRTALYYYYIDQPILSIRYATKAKDFFSKNVGYEVKTAACENVLGISCIALKQFEAAEEYLLAAINTFKKQSEEDSVLKVKYNLGLLYADQNLSELAIRYLLDAFEDEEHDYKTMFLLAREHLKLGKSEIAKTYIEKGLKASTKEYYYHFSILQNMYSEHSLEKVESVVNEGVSYFKQQSLWGYVQEYAEALAVKLYNEKEEMKSNQYFYMSYEAKKILEEKGALK >CP024113.1|AWC52858.1|2089276_2089579_-|hypothetical-protein MKKSKAERKRDLEIVNLYHKKLTEEELEKLSVKFIEWKEGKLPYCELTEHIHECHKKNQIIWTRFHNMNDEFLIFQAKKELNLFSERDMEKEQYKRWNTF >CP024113.1|AWC52857.1|2088667_2089201_-|hypothetical-protein MQLIQCTKKLADMMELKTEKVDQRESNNLHSWHANLFTINRKKCVIVMNNVTRYHFIIYGVTKKDLRNFEALFQKNLVTNLLSDGVEPEVIEHYVKSSSPMQYAATNNRSILSQMNDAVFMVDHYFYAELVEKQKPFINIEKLNQNLNKTVMLKIPKYPADMMRDALNQHLIMSKNE >CP024113.1|AWC52856.1|2087650_2088655_-|hypothetical-protein MRDQLRKIIDNMSEEEVKSLLRLVLLQLELVAEHRDEEMIHMVAEISKQLIESQKPTLHIKDSEHVHIAFGDSSAGCLKHTLKKEGFHQDYVISLSDIFSVGPIFHLDDRKGQVARQEWLSSNLSTGDFYFEEEYLPRFLSSLEEMRSISQDTSVTIWKADNAHEHVGLCFALAMLKDKKNIRIIDASEAQKELLNKEYDICGTGELAPEDIAVILEQYKEKECLKEEARADLTKEWNALSTNTALLRIWKDGTVHSVVEDYFDEYIVRCAKEIGADKGFSKAAHVIGEVLGRVEQLVGDVFLEYRLQTLIKQNIFQAKGSLKAMRYYSVKLNR >CP024113.1|AWC52855.1|2087085_2087496_-|hypothetical-protein MYNYPNYPGIGYDQTMYSQYQGYGEEAMEPRESDYEEYRPDDAEDAPTSPPPSQAPSVPSTFASPVQSSNIRSWVCNCLGRWGYLRLHRPGPFGRDLWFFPTEVRRGGVSGYTWQAGRRRKVSYRYQQISNFMCFA >CP024113.1|AWC52854.1|2085696_2086932_-|cytochrome-P450 MSVKNKVGRNIKDGIKLASPEFKEYAYEIYKESRKLQPILFVYKGELGTEWLITRYEDALSLLKDSRLKKNPENIFSQEKLKSLFSIENSDYLTKHMLNADPPDHNRLRALVQKTFTPKMISQLHNRIQHIADTLLDHVEQKRSFHFIRDFSFPLPIIVISEMLGIPKEDQAKFRIWSHAVIDSPEIPEEKIENEEKLSEFITYLQYLVDLKRKEPKEDLISRLIQAESEGGQLSAAELYSMIMLLIVAGHETTVNLMTNTVLALLENPDQLQLLKERPELIDSAIEEGLRYYSPVEVTTARWAAEPFHIHDKVIQKGDMVTISLASANRDETVFVNPDVFNITRENNRHIAFGHGGHFCLGAPLARLEAKIAIATLLKRMPRLRIKGKREDIKWEGNYLMRSLKELPLTF >CP024113.1|AWC52853.1|2084141_2085425_-|MFS-transporter MSVSAETNPKVGMSQVLKNRFVQGILISALCLQIGIWVRNFAVLLYVMEMTKGNAFAISMISVAEFAPIFIFSFIGGTFADRWKPRKTMIWCEALSSLSVFAVLLTLMFGTWKVVFFVTLISAILSQFSQPSGMKLFKQHLSAEEIQLAMSLYQTTFAIFMILGPILGTFVFQSFGIYISIVVTGVAFLLAAIVLLFLPKDVEMHAEKKQVSLLQEMADGIKYVLGKKALTLLGICFMAAGLGIGLIQPLGIFIVTEQLGLSKESLQWLLTVNGAGMIIGGALAMIFAKNVAPQKMLMIGLLAQAIGIGVIGFSTNLWITLTAQLFSGLALPCIQIGINTLIIQNSDTDFIGRVNGILSPLFTGSMVLTMSIAGSLKEMFSLSMLYEGTAVLFIVGLFVILPIYHLKPAVRAENQPAKEGSAIQQES >CP024113.1|AWC52852.1|2083913_2084069_-|DUF1540-domain-containing-protein MAQDVLCEVNNCKYWGNGNKCNADAIYVVSHKGKQASKTEETDCKTFTPEA >CP024113.1|AWC52851.1|2083064_2083643_-|cysteine-dioxygenase MLTCRKSELFQQFIHNVTASIENSKNEETIVCTIEKLLEKLLETKAWLPLEKQKANRNQYARHLLYKDPLDRFEVLALVWRDGQATPLHDHDGTWGVEGVFSGRIKVKNFLKIKQLEESIFQLKYLGHLYLGEGKTDKIIPPADCHILEIEPNEQVITIHIYGKKLEKFKVFIPTERKDIYRCKMKYIQYSS >CP024113.1|AWC52861.1|2093402_2093711_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRILVFFDLPVMTKAERKAYTRFRKFLLKDGYTMLQFSVYTRVCNGEEGAQKHLRRLRQNIPNVNGAIRSLKVTEKQFESMDILLGVQTIDEKLGTNKTDFF >CP024113.1|AWC52862.1|2093715_2094618_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAFRHIVIRNPSKLSTCDEQLLIKQEETVRIPLEDICTITIEDPAITITAALLSKCVEYHVELIVCDRKRLPAGILQPFHRHSRQKAVLDVQLGLGKPFKKRIWQQIVIRKLENQARCLELANKGEDAQKLYSISKSVESGDRTNREAYGAKVYFTALFGPNFYRREDDVRNISLNYGYSLVRSLTARALVRYGFNPSLGIFHDSQTNAFNLADDFMEVLRPFVDIIVALNVSDETEWDSKMREKLFSVLNIEAVWKEERQSITNGVEQMIKSYVSACRQNDASLLLLPELIALRQHTYE >CP024113.1|AWC52863.1|2094607_2097841_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKYSIGLDIGIASVGWAVINEDIERIEDLGVRIFDVAEQPKTGASLSTPRRLARSTRKRLRRRRHRVERVRKFMIQKGLLTQVQMEQLYDWKDGDLDIWLVRVNALERKLSDREFARILVHFAKNRGFQSNRKSELQEEDNGAVLSAVQENKRLMEEKGYQTISEMLLYDEKFEGTKRNKGGEYTHVVARSDLKREIQLIFEKQRAYGHAFATMENEDKFLQIWSSQRPFATKDDIAKKIGNCTFEPKEKRAPKSTYTFERFRALDKLNRLRILSGTSPARSLTQEERDLILNSLFSKKEVKYKELRKLLKLNDEQRFNEIFYDPNEKIEKNENRTFLSLESQYKIRKILQKIEGKSLNDTYRPVDLDTIAYALTVFKDDQDIRDYLQNQYVASNGKKELNLANRKYNDELIEELLHLSFTKFGHLSLKALRNILPFMEQGIPYHQACEKAGYQFNKKVNREKQKLLPPVPAKDIVNPVVIRSLSQVRKVINGIIKRYGSPSSIYIELAREMGRGYKERKDLEKQYNKNRQMNEGAKKHILELRPEFGDPRGHDILKYKLWQEQDCRCAYSFKSIPIKQLFEIGYAEVDHIIPYSRSFDDSNNNKVLVLAAENQNKQNRTPYEWFGHDETKWQEFTSLVTTMKVSKKKKSLLLKKNFDEEQAEEFRSRHLNDTRYITRYIKTFIEDNLQFRMEEGKKQYVHTVNGAYTSLMRKRWGFNKNRQENDLHHALDAVIVAVSLPFKHKVSAYFKRREEYAHNQLKREGEFFPEPWPGFIHELEIRMMQDSENIKLAMESLNLKTYDESFIKELKPIFVSRMPKRAMRGQIHEETLKRVRGRTDDGYIRTVKKVKLDQIPFDKNGDFPMFGKETDMKTYEAIKSRYLESGKDKKKAFNTPLYKPAKNPENAPIIRSIKIEEKANRVVMLDEKTAADNASIVRTEVFRHKETGNYFLTPVYVADVLAKKVPDRLITTKKPYSEWRKITDEYEFLFSLYPNDLIRVKMPKEKGTKTHTGEKHVWQENFMYFKGVHSGSAGVRMIDHMNSFEDEIGVRKLVVFEKYQVDPLGRMNKVHGEKRHGI >CP024113.1|AWC52864.1|2098152_2098914_-|DUF3959-domain-containing-protein MKKLDVLLMLLSGLFPVAGIMKQIPLPLSLILGGLLFFTSFGSYYTKQTSSRVCSWLAYTIFITFLMGIWDQYVTMSSLLANAKIAACIALLPAILCFRTYGITFGLLALWGALLWDVKEVQSLAVLGRMMNLLTTEKMYLLLLIAGFLVGGLFANGFRRKNDKFKQETPNVLKQKKKRMRPTFHIRIPRLPKLRMKMLTFGRTPTQSKDKRPYESMREENIHAIQQEPQHEQQEPTTLGQTRMERRRNRYHV >CP024113.1|AWC52865.1|2099170_2099590_-|hypothetical-protein MVICTWIIAILLLSFTWLELVLLQIVGLQYESNQALILFFIVYIFTDLPLSLIVDNIPKALKSLDLIQTSKGWIPFLFDAGKTYILIMTIDYFMESITISWQGVFLFAIIRGSIGLKIKKDDPEPPSYSEVTKSLKNSE >CP024113.1|AWC52866.1|2099627_2101973_-|translation-initiation-inhibitor METIQLLAFKDVIDPLFEQTVFYVQWPKHWSSLLLEHNRPYELIKKFKLLNKRLYIMFSDILFIEHDPYKLAEDSLWIICLKPLSSEQLEYICRQWYAYIHNWKPTEMPGEVLLEWQPSAISKLSLLHDKKTFYIWVPALISHLFCERALHLSIGNKQYEEIPFYPLREQHRCEAMSEPIQDKKTKEYFSYIYRFELITRGIENMFLLKVSIGKRRFYQTANQYANYMIMKKRKGTVLVSNCHNEKDKFVTLKIEDARFGVNWSKAYRELQNVFMLKKQLDLVKIMQSPKKYIKGKRIRALVIYDENIFKVPGTKIKRGISRREKEVLLQAFHQRFPHCTYIPLCKNITINQNDELFPLYIREEMKEITLELWSSQRLTEIEKILFEEGLILEKRANHSYILNSKPQIILNIVTYNPKIIKQHPYRMDYCHKYKEDRIQSVIRAISSIPIQSFQTSLSLIEIEKCDGREKIDPKQVIREAFARTNRISQFIERLDGEEIKKEHIVRAIFSLLEKIGFRKRSWESMHPSHTYVSLSIEEIYNNQFVPILSKINEGEIVYKLYGSHEWRDFTSILLNVSAHETFLPQPSKRNDIGIQFKKYITEELTAIAEEAKKENKQVYFLIDASMREYWIESLQNEHMDLHDLPYISEEFQSLSNVTAIRINNQYDVPNYIMPLEKECDETELYVDQSGLYYSVNIYPLNDTGWKEQRILEIVVLGAKQEERDQIAKIITYMCKMSIIPGERPFIPFSMQMVKLIKKYITDIDLWQSSDELDTDWLIENE >CP024113.1|AWC52867.1|2102227_2102911_-|thiaminase-II MSFSQLLRQEVAPIWQASFEHPFIKELGEGTLDLASFRYYVLQDSYYLSHFARVQTLGAAKAIELKTTARMAHHAQNTYEAELSLHENFAEKLGITEEEKASFIPAPTAYAYTSHMYRAAYEGHLGDIIAAILPCYWLYYEIGERLKECKPEEPIYQAWISAYGSDWFRTLVEEQIMRLDQIAETVTESDRKRMKQHFIISSQYEYSFWEMAYTLEKWPVEEKIATR >CP024113.1|AWC52868.1|2103229_2103934_-|Na+/myo-inositol-cotransporter MLPGIIAFHLFGDQLKNADMAYPMLVIKILPIALSGFFAAVLFGAILSSFNGALNSSITLFTLDFYKPIFKKEASEKELVKVGRIFAITLGLIAVIVSPFILYAPSGLYNYLQEMFGFYNVPIIAAVVVGFFSKKVPASAPKIALVFHIILYALSKVFLGSINFLYILSVLFPACVIVMLVIGKLKPRETDFELFDANKVDLKPWKYAKVFSIFLIIFMLGAYVLFSPVGLAAQ >CP024113.1|AWC54954.1|2104163_2104331_-|hypothetical-protein MSIIALVSILLWGAVTHELSKPSKKQNNRKIITLTSLGCLSTLVITISLIQNISF >CP024113.1|AWC52869.1|2104415_2104916_-|N-acetyltransferase MSIHTENIKLVPYKEEYKEKIATFTLPSEQVQFTANPSDLLEKAKEDITKHVVVIVDQDVPVGIFALQTGERVTEYTNNPNALLLVSFSVDYEKQGKGYAKRGLRLLQEYVTAYFPEINEVVLAVNERNIPAQKVYLKVGFEDRGQRKMGPIGRQLILYLSIKKQE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024113_3 | 2220937-2221424 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of CP024113_3
|
7 spacers
spacers of CP024113_3
>3.1|2220966|37|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT CATCAAAATCAAAAACAGTTAAATTAGATGCAGATGA >3.2|2221032|37|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTAC >3.3|2221098|36|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTCTCATTCGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTT >3.4|2221163|37|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGAATTATCGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAA >3.5|2221229|36|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAGGACCCTCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAAC >3.6|2221294|37|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTTTTAAAAGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGA >3.7|2221360|36|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTGATGGACGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAA |
cas2,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024113_3
The CRISPR arrays of CP024113_3 >merge|CP024113|3|2220937-2221424|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTCTATTCCACTACGTTCAGATAAAACCATCAAAATCAAAAACAGTTAAATTAGATGCAGATGACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTACCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACGTTCTCATTCGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTTCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTTGAATTATCGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTTAGGACCCTCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAACCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTCTTTTAAAAGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACCGTGATGGACGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024113|3|3|2220937-2221424|CRISPRCasFinder CTTTCTATTCCACTACGTTCAGATAAAAC CATCAAAATCAAAAACAGTTAAATTAGATGCAGATGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC GTTCTCATTCGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGAATTATCGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTAGGACCCTCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCTTTTAAAAGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CGTGATGGACGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024113|3|2|2220937-2221424|CRT CTTTCTATTCCACTACGTTCAGATAAAAC CATCAAAATCAAAAACAGTTAAATTAGATGCAGATGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC GTTCTCATTCGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGAATTATCGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTAGGACCCTCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCTTTTAAAAGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CGTGATGGACGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024113|3|2|2221003-2221424|PILER-CR CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TAATAAAGCCGCCTAGACTGATACCAATTAATATTAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC GTTCTCATTCGTACCAGATATGAGTGACGAATCGTT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGAATTATCGTTTACAATATCCTCATATTCATAGAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTAGGACCCTCTCGTACACATACCTTCGAAAGAAAC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCTTTTAAAAGCTGTAGTATTTGTTTTTCGTATTCGA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CGTGATGGACGATATGTCTTAATTCACGGCTCACAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC
>CP024113.1|AWC52971.1|2220451_2220706_-|hypothetical-protein MKDTTKYVGLDVSKEKIAVAIADEGREEPRYLGMIPHTPESLRKLIKKLGAVEHLKACYKAGSTGYGIYRLLFSLGVDCAVIAP >CP024113.1|AWC52970.1|2219449_2219833_-|VOC-family-protein MMIHKVGQIMLYVKDQDEAVQFWTEKMGFHLIAEEDNGKGFRWIEIAPTKEAETSIVLHNKEFIAKMQPELNLNTPSMLFFTENIEQLHKQLVDKKVAVGEIVNMPTGKAFNFADDEGNYFAIMEKS >CP024113.1|AWC52969.1|2217813_2219151_-|D-serine-ammonia-lyase MWEKMIKGKTIRKWTEENPILQQLIETSEVFWENPNYSSYEKARQDFVLTTEDVKEAEARLLRFAPYIAKVFPETKEMDGIIESPLVETMHMKQYLEDAFAQEMPGRFLLKCDNNLPISGSIKARGGIYEVLQHAEKLAIEHNLLCEEDHYAKLDSDRFREFFSQYSIAVGSTGNLGLSIGIMSAKLGFQVTVHMSADAKEWKKELLRNKGVTVVEYESDYSKAVEEGRKQAEQDPHCYFIDDENSKHLFLGYAVAASRVKQQLEDKNIRVDKDHPLFVYLPCGVGGGPGGVAFGLKLLFGDAVHCFFAEPTHSPCMLLGLVTGLHDEIAVQDFEIDNVTEADGLAVGRASGFVGKIMEPLLSGCYTVEDQQLYELLKAMVDTENIRLEPSALAAVYGSVQLYRQENYVKKHKLEGKMNRSTHMMWATGGGMVPKSVFDEYYQNQ >CP024113.1|AWC52968.1|2217329_2217767_+|DUF2512-domain-containing-protein MSDIALVLIKFISCIIAFAIGLALFFPATLVQIISFSLFVTIVSYVFVDKIILERIGRSAAIMTDFLLTYLSVWIFGNILLDHYMQIAWGSILSALVFTLCEVIVQRFSHAYERHNSDNIHLNRRFSYGTEFAEEQNPLDKNKKK >CP024113.1|AWC52967.1|2213639_2217170_-|DUF4020-domain-containing-protein MTFLGKEGIRMWITSEVEIPEELFDHLEQGKLVLFVGAGVSMKGKSNLPNFDDLVDEIAKALYVEKREITEPHDYYLGKIAKTKDVHQIAKDLVNVEGSKPNPLHYAIPRLFPKDTDVRIVTTNFDQHFTTAMRESDRDFNIYYAPALPTGRAFKGLAYIHGNVEQEKENLILTDGDFGRAYLTEGWARRFLVDLFSNYTVLFIGYSHNDPVMKYLATGLPPSTRRYAFVAHGDNTYHWEHLGVKPIVYPNKANNHQALVRAVKRWAELMGDNYITKRMRIRDIVTVPPSVEQEQLSYIKQAIKKIEMLRYFVEFARDYGWVEWLEAEGKLQNLFRMTSHYDEVDELLAAWLVEQFLVSHQKELFQLIFKNHSKISPLLWKSICTYLKETKKPMDPILFAKWTLLLLETAENNSQSIEKISYLLQKCSFPEHKEISVLLLTFILDGKIKLKRVKRWEDDMQDSVELEESSCLPVSVFSHVQRIWEEKMKPHISYFAGPILVMGLEKLQMLSLRQTALQKRDGVLYHTMEFSEHDLQPKDFTFLIRIMKECLAYLCEHNKEKAAYYIAQMIDTDSILQKKIAIEAMSENTFVTADEKLMWLRKQQLIFDFTYKHEVFQFLKKHYQNALEKTKKEVIHEVMKHLENERFFDACLVLDLLYTCDANSTSTARAYRIMKRTHPHFTSNQYGEKKEEVRAPNIICDVTADGLLKLKGHEIKKQILLFSNDDSFEQRHFLEMLSKACKLNVDWSIALAYQLIGEQRVSDEIWFVCIREWRNNRKLTNEQIQKIIPLLQQFVRNPAFYWLISSFLYEISNRLEDFQENQIRVVKRFAFSLFPHIMKGESSFKVGELDFYNESIQHPVGKMTSVLLKLLAYDHLYDRNIHEYLFLFEEQIKVASERTHFMLARLTADVTFLFHIEKQWCRKYVLPYLKLNREHKAVKYAWAGLCYTQINLPLFTEIKKYIKYAAEHLELLHPHTKQVFLKWLSFVCIKCVLYWGQRTDWVYMIFIEEKEHDKIKFLKHLCYYVKTLSAREKQKFWDSWLATFLKERPKMSLITGREYVMLLRFVFYMDEVAEKGVYTILNCFPIPIEHCSEAEMKQLLLTILTRKEKVIAHVQAYAKLFFILLQIVQDASSIENEMIQMKEMLETCHVDDDILTAIQNEMIRIGIVVTNFQQES >CP024113.1|AWC52966.1|2211795_2212872_-|bifunctional-3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase/chorismate-mutase MANHELEQLRKQVDEINLQLLKLLNERGRIVQKIGEQKQLQGTKRFDPVREREVLDMIAERNEGPFETSTVQHIFKTIFKASLELQEDDNRKALLVSRKKKQENTIVDVKGERLGSGTQSFIMGPCAVESLEQVRQVAQAIKEQGLKLMRGGAFKPRTSPYDFQGLGVEGLQILRQVADEFDLAIISEILNPNDVEMALDYVDVIQVGARNMQNFDLLRAVGKVNKPVLLKRGLAATIDEFMHAAEYIIAQGNDQIILCERGIRTYEKATRNTLDISAVPILKKETHLPVVVDVTHSTGRRDLLLPTAKAALAIGADAVMAEVHPDPAVALSDSAQQMDIPEFHRFMEELKEFKNKLS >CP024113.1|AWC52965.1|2209870_2211496_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MITVSNVSLRFADRKLFEDVNIKFTPGNCYGLIGANGAGKSTFLKILSGEIEPTTGDVHITPGERLAVLKQNHFEYEEFPVLETVIMGHTRLYEVMQEKNAIYMKEDFSDEDGMRAAELEGEFAELNGWEAESEAAILLKGLGIGEELHDKKMSELTGAEKVKVLLAQALFGQPDVLLLDEPTNHLDLKAIQWLENFLMNFENTVIVVSHDRHFLNKVCTHMADLDFGKIQLYVGNYDFWYESSQLALKLTQDANKKKEEKIKELQNFIARFSSNASKAKQATSRKKLLDKITLDDIKPSSRRYPFVGFTPEREVGNDLLTVEGLSKTIDGEKVLDNVYFTLNKGDKVAFIGRNDIAMTTLFKILMGEMEPDSGSFKWGVTTSQSYFPRDNSAYFENSEYNLVEWLRQFSPQDESESFLRGFLGRMLFSGEEVKKNVSVLSGGEKVRCMLSKMMLSGANVLVLDDPTNHLDLESITALNNGLIAFKGTILFTSHDHQFVQTIANRIIEVTPNGVIDKETTYDEYLENEELQKQVSAMYQNK >CP024113.1|AWC52964.1|2207413_2209387_-|LTA-synthase-family-protein MKQLLQKSKRVLSNHFGFFIFAVVLFWLKTYAAYVTEFNLGISNTIQKFLLFFNPLSSAILFLGLALFAKGKRSYILLIVINLLLSILLYANVVYYRFFSDFITFPTLTQTNNFGEIGGSVLALLQPYDPLYFLDTIVLLVLVLTKVANPKPIRVAKYKLSLVFISAILIFSINLGLAESDRPQLLTRTFDRNYIVKYLGAYNYTIYDGIQSMKASTERAMADGDSMTEVRNYIASNYASPSAEYFGKGKGMNVIYIHLESFQNFLIDYKLNGQEVTPFINSFTKDANTLYFDNFFHQTGQGKTSDAEFMLENSMFGLPQGSVFTTKSHNTYQAAPAILGQQGYTSAVFHGNYKTFWNRDDIYKSFGFNKFFDASYYDMNEKDVVNYGLKDKPFFNESIPLLETVKQPFYTKFITLSNHFPYPIDKEEATIEPATTGDSSVDTYFQTARYLDEAVKGFVDYLKQSGLYDNSIIVMYGDHYGISDNHNRAMSQIMGKEIHSFENAQLQRVPLIVRVPGIKGGVQHQYGGEIDVLPTLLHLLGIDTKDYIQFGTDLLSPEHKQVVAFRNGNYVSPTVTALNGRYYDTTTGEPVEVTEEIKQNEQMVQQTLKLSDQVVNGDLLRFYTPEGFTPVDRSKYNYNHRDKNKTKVKTTQDTKTE >CP024113.1|AWC52963.1|2204672_2206778_-|PTS-lichenan-transporter-subunit-IIC MILDYRSAAILQQMMQADSYTSVDQLTEVLQVSKRTIYYDMKKVDDWLITEHLEPIQYVRPLGYCLDKKTKQKVAQKLQGLITVQYEYSPQERKAWLALYLLTEEKRILLEDLIKLIQVSRNTTLADLKKLKAELGKFKLSLQFHRKQGYYIKGMEQGKRNVLIAYLSQLIAKHGWEYVVSHMRNIVNHGEGEKKQTAQDKLHVIKGILSKCEEFLGVQYTDEVLENLSVYMYLFCSRIVKGRYIEMEETEKAVLRETKHFQAATYIGTQFEKLLYIKFPKDEIYYITTHLLGAKVNAQQKEYEKNDVHGIWHIVDCMIQDFQHYACVIFRDFTGLASDLYLHMKPAFYRVKYGIEIKNPLLQIIRNSYAEVYHLTKKVVHHFEQYVGKEISEDEIAFITMHFSAWMRKEGIVPSPRKTALLVCPNGIGTSRMLQYQLEQLFSNIDILQAISKREYESNTFDVDCIITTTELEKGLIPIFMVNPILTDAEKASLFRKVNATLFREDQNDSADIIMQMIHKYADVRDEHALKRELREFISGPVHFGREEKYKPMLNELLTKEYIQLQDHVDSWEGAIRIEAKPLLQTEYISEEYVQEMIANVKKLGPYIVIAPKIAIPHARPESGVKKLGMSLLQLKESVSFSEKQEHAANLIIVLAAIDNETHLKALAQLSDMLSQPENVDLLIRSNSKEQMLEMIAKYSN >CP024113.1|AWC52962.1|2204390_2204660_-|PTS-lactose-transporter-subunit-IIB MKKILVVCGNGLGSSFIVEMNVKKILDELGLQAEVSHTDLASSKSEQADLYLGSKDIICNLEDGVRTVAGLTNILDQNEIKEALQKHLM >CP024113.1|AWC52972.1|2221647_2221911_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIITYDIGEKRVGKACKKLKQYLTWTQNSVFEGELSRTQLLKCLAELDQIIISSEDSIYLYEVNNPRNIKKKVFGIEKSYEELFL >CP024113.1|AWC52973.1|2222891_2223389_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKGTYIHYYFVCHRKLWLFVHQIQLEKESERVIEGKILHDSTYQRMEHRELDIDGVGKIDGIEGEYIREIKLTSKMQEADRWQLLYYLAELKKRGVTKKGLLSYKKEKRTEEVHLTEANQQELENIQKRIQAIILSDKPPKLEKKKYCSSCAYYDFCFSGEGEGC >CP024113.1|AWC52974.1|2223451_2225677_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MFLAKSNPKETLREHTDELRSRYKKLKESYGHYFDERIWELLLYAVDYHDAGKAHEPFQLNIRRALGEGVKLQRNLEVPHNYLSPFLLPESIFSLPKKDYQALIQAIAYHHERDIEPNDTLIRQALWQDLWPKMDEINKHLNINGANLEKKFNRILAQLHRRIKYSDNKENYVDYVILKGLLHRIDHAASAHVDIEIDAKQDFKKLVDAGFQKIAEKKRVPVEEVYRDLQKHAHKHRKENLIIVAQTGMGKTEAALLWASDSKTFFTLPLRVSINALFHRVYEKMNYKNVGLLHSSSMDYLTENLEEDWEVIAEQSKHFSSKLLFTTIDQILKFPFLYRGYEKELATMAYSSVVIDEIQAYDPKIAAVLVRALEMIYLVGGKFLLMTATLPSIYLETLNESDIISSDGFRVDTFIDDCVIRHCIEVVEKPIVDDFEKIVDLGKQKKILVIANTVKRAMELYNKIKEHSDNVHVFHSMYIQKHRTLIEKELLLFDENKEATGIWITTQLVEASIDIDFDVLFTEAATLDSLCQRFGRCYRRRQYMMPQEPNVFIYAVDMSGVKYVYDEEILMKSLDILRPFNRKILLESQKIELVSQLYSRENLKGTEFLKTFDDALEQLQTFEDYTLSSKDAQKLLRDIQAELVIPRNIYDENEHLFEQLKIVNKEERARLYREIAKLTVSLRKNRVRGKTSRIPHERIQSNGKKYNLLPWIKILELQYDFDEKSKTGTGVLLDQELDNFI >CP024113.1|AWC52975.1|2225730_2226429_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVIRLKLFQETACYTKPFANKVAETYPLPPYSTVKGMIHQLLQANELLPLRFSIQGNYETKLIDYRKSYMVKKKSVSMPIIFDGLAMEVPEQEHMTSMPLYTHMLFNVELVIHIAGEEALLERIYQHFIELNQHLSLGRHEDLVRVDEVTFVELEECDEWYSKYAIYVPKYYYKTDFPAGIPYRLNWTYKIVNGIREWNKIPSLYVNGNNPHFEDGKLFHTDGEHIVLWNE >CP024113.1|AWC52976.1|2226425_2227319_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNNKALTLTIIFKASSLNYGEGTANISELKKFHRGNGEVYSFASRQAIRYDIVRLGNQLFNWNLNVVDKSKGVVQFKDDCTIADSVEMDLFGYMKTKAKAGADKRSAVVRLSHAVSLEPYRSDLEFLNNMGLASRIQENPNLATLEQHESLYTYTLTVDLSKVGVDGEIELPVDEKVNRVKQLIELTKYLNREIRGRQENLSPLFVIGGVYPIANPFFLGRISLQNFDSNLLNVKSLASVLGQTVLGHDVRTCTKIGLVDGVFANEEEISQLTDTVSVEEFYQHVMNEVEQFYKVLV >CP024113.1|AWC52977.1|2227311_2229060_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MIFVTEEIPLAAEEWTITQGLVGYYRILKHAGIKVKTTDEGILFNPEHLRNFEHYYFDYFLDRFSVAKRDEQNIRRTFLKFRAESESKGSKEAKRRMQAAKKSLDETIKKTAIEKVEKKFEDSSHKKRLVEYATLIRNQKTYNPEMDKWIEEYIQALSEPNINEKLTLNYFKATVLGTYFGQVSFLNVSHTSKDIEEQKEIFRKDYIESLLADLELQQMIARAEDSDEIMKYLEISTHEMAKKLKTKFKKMTIQQIKDYVSNEINCCSFFDSQWAFEQYSELHFSPLSMSASKALNFYWNANGTLTIPVSKLAKLILFCAPAGASIIGGKSLFVQREGRFEQVIYANETYEIGRSKDKAFDEIIFDLIAEQKTKAQHTGDSYLILEYSSEYNAKKTDLQYLHLTPGLCSFFKEKNCTKWFSRLNYVLRNQIVHAFLRYQDSKHIIHNALRKKLQEQKLANEIVYACLLRCYYLFFVKGEGKMNTDLKTSKNRIWSAFYEGVAIKNIVEEGKIRSVAYRLLNAIRSNDKKMFLDTVMRLYMSVEKPFPRVFMNILDESNIDFASIGDSFIAGLISNEEEKINE >CP024113.1|AWC52978.1|2229059_2229761_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLHIKLQTNRFPISYRMMMVSFIKEALKLSDAAYFQQIYQESKANRPFSYGVYIHDYKLNATEFHIKGYVGLTITSPDAQFMLHFYNGLMKMNDFRYKGFSLKRMKVQMVNSADINQNHVYFKTLSPLLIRDKHAKPIFIDDDKFEKELNYISDTVLKEFRGYGLKQPLIFTSKNMKKVVVKEKIHSDHDTLFFTGYHGIFSLQGAVEDLKILSEIGLGFRSSQGFGAVEVV >CP024113.1|AWC52979.1|2231997_2232324_-|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MFIETKTLTVKEGTSDLVVQRFSGEGMIEKFEGFIDLNVLVKKVRRGDEEVVIMIRWESEEAWKNWETSEEHLAGHRANRGKPKPEHILNAEHAVYYVKATKSAYQQS >CP024113.1|AWC52980.1|2232665_2233010_+|hypothetical-protein MRKAILIFIVAIFIIGIVHIAVTPINYKSYTIEALWFASAGCTLIFLAFLNYVLISIKQRQTRFFVICHTANILCTILVAFILTIAFAPHIILLFVLLVSKTLLVIGFQFSSKS >CP024113.1|AWC52981.1|2233134_2233464_-|hypothetical-protein MSFNQVLKVIDENIGKRFVLGIDGLSRLGKTTLVKQLEQKLKQKGASFYIFHIDDHIVERNKRYHTKFEEWYEYYYLQWDIEWLRYHFFQQLKWKEQFRFLGASPKTPS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP024113_4 | 2231096-2231711 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of CP024113_4
|
9 spacers
spacers of CP024113_4
>4.1|2231125|36|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT TTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGG >4.2|2231190|37|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT TGGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAA >4.3|2231256|36|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT AGGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCC >4.4|2231321|37|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT CACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCC >4.5|2231387|36|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT CAAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACAT >4.6|2231452|35|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT TTGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCA >4.7|2231516|36|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT TGTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCAT >4.8|2231581|37|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT TGAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAG >4.9|2231647|36|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT TCAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATA >4.10|2231191|37|CP024113|PILER-CR TGGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAA >4.11|2231257|36|CP024113|PILER-CR AGGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCC >4.12|2231322|37|CP024113|PILER-CR CACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCC >4.13|2231388|36|CP024113|PILER-CR CAAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACAT >4.14|2231453|35|CP024113|PILER-CR TTGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCA >4.15|2231517|36|CP024113|PILER-CR TGTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCAT >4.16|2231582|37|CP024113|PILER-CR TGAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAG >4.17|2231648|36|CP024113|PILER-CR TCAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATA |
cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3,cas4,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024113_4
The CRISPR arrays of CP024113_4 >merge|CP024113|4|2231096-2231711|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATCTTATCCACTACGTTCAGATAAAACTTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGGATTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTGGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACAGGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCCCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACCACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCCCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACCAAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACATCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTTGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTGTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCATCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTGAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAGCTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACTCAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATACTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024113|4|4|2231096-2231711|CRISPRCasFinder TTATCTTATCCACTACGTTCAGATAAAAC TTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGG ATTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC AGGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CAAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAG CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024113|4|3|2231096-2231711|CRT TTATCTTATCCACTACGTTCAGATAAAAC TTTCTAACAATGTCCAAAAACCATTGAATACATTGG ATTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC AGGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCC CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC CAAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TTGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCAT CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TGAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAG CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC TCAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATA CTTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC >CP024113|4|3|2231162-2231711|PILER-CR TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT GGGACAAACATGCTACTTTCTTGAACGCTCAGTCAAC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACA GGATTTCACGGAGCGATTGCAAAGAAAAACATCCCC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACC ACTGAAATTAGTGTCGTCTAAAACAGAGACGTTTCCC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACC AAATGAAACAAATCATAAAATCGAGGTGAAAACATC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT TGAAGGTGGCTTTGTACTAGAAGGACTCGACGCAC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT GTAGCGAACCGTTTTATTTAGAAGAATTAACTCATC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT GAACCATTTTTCAATAATCAATATTCCTTTCTTAAGC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAACT CAAAGTCCTCGCGCTCTCCTGGAACCAACGGCATAC TTTATATCCCACTACGTTCAGATAAAAC
>CP024113.1|AWC52978.1|2229059_2229761_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLHIKLQTNRFPISYRMMMVSFIKEALKLSDAAYFQQIYQESKANRPFSYGVYIHDYKLNATEFHIKGYVGLTITSPDAQFMLHFYNGLMKMNDFRYKGFSLKRMKVQMVNSADINQNHVYFKTLSPLLIRDKHAKPIFIDDDKFEKELNYISDTVLKEFRGYGLKQPLIFTSKNMKKVVVKEKIHSDHDTLFFTGYHGIFSLQGAVEDLKILSEIGLGFRSSQGFGAVEVV >CP024113.1|AWC52977.1|2227311_2229060_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MIFVTEEIPLAAEEWTITQGLVGYYRILKHAGIKVKTTDEGILFNPEHLRNFEHYYFDYFLDRFSVAKRDEQNIRRTFLKFRAESESKGSKEAKRRMQAAKKSLDETIKKTAIEKVEKKFEDSSHKKRLVEYATLIRNQKTYNPEMDKWIEEYIQALSEPNINEKLTLNYFKATVLGTYFGQVSFLNVSHTSKDIEEQKEIFRKDYIESLLADLELQQMIARAEDSDEIMKYLEISTHEMAKKLKTKFKKMTIQQIKDYVSNEINCCSFFDSQWAFEQYSELHFSPLSMSASKALNFYWNANGTLTIPVSKLAKLILFCAPAGASIIGGKSLFVQREGRFEQVIYANETYEIGRSKDKAFDEIIFDLIAEQKTKAQHTGDSYLILEYSSEYNAKKTDLQYLHLTPGLCSFFKEKNCTKWFSRLNYVLRNQIVHAFLRYQDSKHIIHNALRKKLQEQKLANEIVYACLLRCYYLFFVKGEGKMNTDLKTSKNRIWSAFYEGVAIKNIVEEGKIRSVAYRLLNAIRSNDKKMFLDTVMRLYMSVEKPFPRVFMNILDESNIDFASIGDSFIAGLISNEEEKINE >CP024113.1|AWC52976.1|2226425_2227319_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNNKALTLTIIFKASSLNYGEGTANISELKKFHRGNGEVYSFASRQAIRYDIVRLGNQLFNWNLNVVDKSKGVVQFKDDCTIADSVEMDLFGYMKTKAKAGADKRSAVVRLSHAVSLEPYRSDLEFLNNMGLASRIQENPNLATLEQHESLYTYTLTVDLSKVGVDGEIELPVDEKVNRVKQLIELTKYLNREIRGRQENLSPLFVIGGVYPIANPFFLGRISLQNFDSNLLNVKSLASVLGQTVLGHDVRTCTKIGLVDGVFANEEEISQLTDTVSVEEFYQHVMNEVEQFYKVLV >CP024113.1|AWC52975.1|2225730_2226429_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVIRLKLFQETACYTKPFANKVAETYPLPPYSTVKGMIHQLLQANELLPLRFSIQGNYETKLIDYRKSYMVKKKSVSMPIIFDGLAMEVPEQEHMTSMPLYTHMLFNVELVIHIAGEEALLERIYQHFIELNQHLSLGRHEDLVRVDEVTFVELEECDEWYSKYAIYVPKYYYKTDFPAGIPYRLNWTYKIVNGIREWNKIPSLYVNGNNPHFEDGKLFHTDGEHIVLWNE >CP024113.1|AWC52974.1|2223451_2225677_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MFLAKSNPKETLREHTDELRSRYKKLKESYGHYFDERIWELLLYAVDYHDAGKAHEPFQLNIRRALGEGVKLQRNLEVPHNYLSPFLLPESIFSLPKKDYQALIQAIAYHHERDIEPNDTLIRQALWQDLWPKMDEINKHLNINGANLEKKFNRILAQLHRRIKYSDNKENYVDYVILKGLLHRIDHAASAHVDIEIDAKQDFKKLVDAGFQKIAEKKRVPVEEVYRDLQKHAHKHRKENLIIVAQTGMGKTEAALLWASDSKTFFTLPLRVSINALFHRVYEKMNYKNVGLLHSSSMDYLTENLEEDWEVIAEQSKHFSSKLLFTTIDQILKFPFLYRGYEKELATMAYSSVVIDEIQAYDPKIAAVLVRALEMIYLVGGKFLLMTATLPSIYLETLNESDIISSDGFRVDTFIDDCVIRHCIEVVEKPIVDDFEKIVDLGKQKKILVIANTVKRAMELYNKIKEHSDNVHVFHSMYIQKHRTLIEKELLLFDENKEATGIWITTQLVEASIDIDFDVLFTEAATLDSLCQRFGRCYRRRQYMMPQEPNVFIYAVDMSGVKYVYDEEILMKSLDILRPFNRKILLESQKIELVSQLYSRENLKGTEFLKTFDDALEQLQTFEDYTLSSKDAQKLLRDIQAELVIPRNIYDENEHLFEQLKIVNKEERARLYREIAKLTVSLRKNRVRGKTSRIPHERIQSNGKKYNLLPWIKILELQYDFDEKSKTGTGVLLDQELDNFI >CP024113.1|AWC52973.1|2222891_2223389_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKGTYIHYYFVCHRKLWLFVHQIQLEKESERVIEGKILHDSTYQRMEHRELDIDGVGKIDGIEGEYIREIKLTSKMQEADRWQLLYYLAELKKRGVTKKGLLSYKKEKRTEEVHLTEANQQELENIQKRIQAIILSDKPPKLEKKKYCSSCAYYDFCFSGEGEGC >CP024113.1|AWC52972.1|2221647_2221911_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIITYDIGEKRVGKACKKLKQYLTWTQNSVFEGELSRTQLLKCLAELDQIIISSEDSIYLYEVNNPRNIKKKVFGIEKSYEELFL >CP024113.1|AWC52971.1|2220451_2220706_-|hypothetical-protein MKDTTKYVGLDVSKEKIAVAIADEGREEPRYLGMIPHTPESLRKLIKKLGAVEHLKACYKAGSTGYGIYRLLFSLGVDCAVIAP >CP024113.1|AWC52970.1|2219449_2219833_-|VOC-family-protein MMIHKVGQIMLYVKDQDEAVQFWTEKMGFHLIAEEDNGKGFRWIEIAPTKEAETSIVLHNKEFIAKMQPELNLNTPSMLFFTENIEQLHKQLVDKKVAVGEIVNMPTGKAFNFADDEGNYFAIMEKS >CP024113.1|AWC52969.1|2217813_2219151_-|D-serine-ammonia-lyase MWEKMIKGKTIRKWTEENPILQQLIETSEVFWENPNYSSYEKARQDFVLTTEDVKEAEARLLRFAPYIAKVFPETKEMDGIIESPLVETMHMKQYLEDAFAQEMPGRFLLKCDNNLPISGSIKARGGIYEVLQHAEKLAIEHNLLCEEDHYAKLDSDRFREFFSQYSIAVGSTGNLGLSIGIMSAKLGFQVTVHMSADAKEWKKELLRNKGVTVVEYESDYSKAVEEGRKQAEQDPHCYFIDDENSKHLFLGYAVAASRVKQQLEDKNIRVDKDHPLFVYLPCGVGGGPGGVAFGLKLLFGDAVHCFFAEPTHSPCMLLGLVTGLHDEIAVQDFEIDNVTEADGLAVGRASGFVGKIMEPLLSGCYTVEDQQLYELLKAMVDTENIRLEPSALAAVYGSVQLYRQENYVKKHKLEGKMNRSTHMMWATGGGMVPKSVFDEYYQNQ >CP024113.1|AWC52979.1|2231997_2232324_-|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MFIETKTLTVKEGTSDLVVQRFSGEGMIEKFEGFIDLNVLVKKVRRGDEEVVIMIRWESEEAWKNWETSEEHLAGHRANRGKPKPEHILNAEHAVYYVKATKSAYQQS >CP024113.1|AWC52980.1|2232665_2233010_+|hypothetical-protein MRKAILIFIVAIFIIGIVHIAVTPINYKSYTIEALWFASAGCTLIFLAFLNYVLISIKQRQTRFFVICHTANILCTILVAFILTIAFAPHIILLFVLLVSKTLLVIGFQFSSKS >CP024113.1|AWC52981.1|2233134_2233464_-|hypothetical-protein MSFNQVLKVIDENIGKRFVLGIDGLSRLGKTTLVKQLEQKLKQKGASFYIFHIDDHIVERNKRYHTKFEEWYEYYYLQWDIEWLRYHFFQQLKWKEQFRFLGASPKTPS >CP024113.1|AWC52982.1|2233442_2234009_-|N-acetyltransferase MGFPTLETERFILRELTLLDAENMFHYFQKESVMRYFGMDAIRNMEQVKRMIQMFSKKYKEGSQVRWGIELKGTNRFIGTCGFHFINLNHKRAEIGYELDDAYWGKGYATEAVQTIVTYAFQTMKLIRIGAVVYKENEASHKLLKKIGFQKEGLLRKYMIQNNVEYDTIIYSLLAEDWEKRSCLSIKY >CP024113.1|AWC52983.1|2234378_2234624_+|DNA-alkylation-repair-protein MEPMLCPNCKTNRTRFNILEQQVKPVKLNPQTGQIEEEYTNETLNVFHMSYQGPTYRVQCAVCGLVENPEQFIKPAQNKLF >CP024113.1|AWC52984.1|2234861_2235398_-|DUF2812-domain-containing-protein MEIKKTFKFFTAWNLEKEEAYLREMHQKGWAFQKYHFMYTFKKTEPKDVVYKADFNFDFQKSLKNQREYLEIYEMSGWKYVSSFTKWHYFCKEVVDKNELPDIYSETETRIEKLKDLLNHLVIIFLSILPAISISCLESPANKLSIIIKGFIGFVVCIHMYMFVRLILKIRKLKKEII >CP024113.1|AWC52985.1|2235399_2235723_-|PadR-family-transcriptional-regulator MDEKAKKYIPLTEATYYILLSFAKRIHGYGVMQMVEEMTDGEVKLGPGTLYGNITKLLTEKLIVEVDSTDRKKCYMLTPFGREVLELEFKRLQRSVQNGKQILREKM >CP024113.1|AWC52986.1|2236324_2237308_-|DUF4003-domain-containing-protein MITLQQKLEQYTSIYKQLKRELKWKTSDSRTGMMIAAMYTSSDKPFDLERFLQISHYIKSQVGMFSYLKSYHRFVVAATLDIHFTHYKTAFQQFLDLYERFIASGFSRSIFTYLAAATLLPDDREQYEARIQRSVKVYKRMKEDHFFLTSTSDYPLAVLLAGQQEEIGPLMDRVERLYQKLATSGLRKGNDLQFLSHILSLKKDIREDMLVARCTNIWNLFKQEKVKVKQMHYPAIGLLALLEDGEKEVSSIRTFMEKLQGDKLFRWQTDTNILIAIQLFVSQKGMEHQAANTGLQTMIEILIQAQQAAFIAAISASTAATSASSNS >CP024113.1|AWC52987.1|2237391_2237856_-|NUDIX-domain-containing-protein MDLTFQVNQSCFNYRVGAICKHDNKILMLQNEGEDFWYVPGGRVQLLETSEVAIKRELKEELGVDVAVKRPLWIVENFFTYDSRQFHEISLYYEVNLLTLPVKGADSFLFEEEGRKYKFQWIPLEQICEYNVKPEFLKDKMTQLPLHVEHIVKN >CP024113.1|AWC52988.1|2238214_2238460_-|hypothetical-protein MKGIFWLNLYMSLHVRMGETLYYGLGVRITNSHSEEKVIRHSGLTPNSHAKMFFIPKTDWGGVILTNKNHIFEEEALPQLK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024113_3 | 3.6|2221294|37|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2221294-2221330 | 37 | CP024113.1 | 811959-811995 | 0 | 1.0 |
CP024113_4 | 4.7|2231516|36|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT | 2231516-2231551 | 36 | CP024113.1 | 3177462-3177497 | 0 | 1.0 |
CP024113_4 | 4.15|2231517|36|CP024113|PILER-CR | 2231517-2231552 | 36 | CP024113.1 | 3177462-3177497 | 0 | 1.0 |
1. spacer 3.6|2221294|37|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 811959-811995, mismatch: 0, identity: 1.0
tcttttaaaagctgtagtatttgtttttcgtattcga CRISPR spacer tcttttaaaagctgtagtatttgtttttcgtattcga Protospacer *************************************
2. spacer 4.7|2231516|36|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 3177462-3177497, mismatch: 0, identity: 1.0
tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat Protospacer ************************************
3. spacer 4.15|2231517|36|CP024113|PILER-CR matches to position: 3177462-3177497, mismatch: 0, identity: 1.0
tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat Protospacer ************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | NZ_AP014870 | Bacillus thuringiensis serovar tolworthi strain Pasteur Institute Standard strain plasmid pKK6 | 12518-12546 | 0 | 1.0 |
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | NZ_CP010096 | Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMBLin15, complete sequence | 5323-5351 | 0 | 1.0 |
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | NZ_CP004882 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMBLin15, complete sequence | 5325-5353 | 1 | 0.966 |
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | NZ_CP011355 | Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC10, complete sequence | 2221-2249 | 1 | 0.966 |
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | NC_006945 | Bacillus phage GIL16c, complete genome | 5316-5344 | 1 | 0.966 |
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | AY701338 | Bacillus thuringiensis phage GIL16c, complete genome | 5316-5344 | 1 | 0.966 |
CP024113_2 | 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093052-2093081 | 30 | EU408779 | Bacillus phage AP50, complete genome | 2485-2514 | 2 | 0.933 |
CP024113_2 | 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093052-2093081 | 30 | NZ_CP004882 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMBLin15, complete sequence | 2435-2464 | 2 | 0.933 |
CP024113_2 | 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093052-2093081 | 30 | NZ_CP053974 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed5, complete sequence | 10677-10706 | 2 | 0.933 |
CP024113_2 | 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093052-2093081 | 30 | NZ_CP009346 | Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 5, complete sequence | 12464-12493 | 2 | 0.933 |
CP024113_2 | 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093052-2093081 | 30 | NZ_CP010096 | Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMBLin15, complete sequence | 2433-2462 | 2 | 0.933 |
CP024113_2 | 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093052-2093081 | 30 | NZ_CP045027 | Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p5, complete sequence | 12462-12491 | 2 | 0.933 |
CP024113_2 | 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093052-2093081 | 30 | NC_005258 | Bacillus phage Bam35c, complete genome | 2443-2472 | 2 | 0.933 |
CP024113_2 | 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093052-2093081 | 30 | AY257527 | Bacillus thuringiensis bacteriophage Bam35c, complete genome | 2443-2472 | 2 | 0.933 |
CP024113_2 | 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093052-2093081 | 30 | AJ536073 | Bacillus phage pGIL01, complete genome | 2441-2470 | 2 | 0.933 |
CP024113_2 | 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093052-2093081 | 30 | CP013282 | Bacillus phage pGIL02, complete sequence | 12464-12493 | 2 | 0.933 |
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | NZ_CP053974 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed5, complete sequence | 7661-7689 | 2 | 0.931 |
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | NZ_CP009346 | Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 5, complete sequence | 9437-9465 | 2 | 0.931 |
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | NZ_CP045027 | Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p5, complete sequence | 9435-9463 | 2 | 0.931 |
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | CP013282 | Bacillus phage pGIL02, complete sequence | 9437-9465 | 2 | 0.931 |
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | NC_005258 | Bacillus phage Bam35c, complete genome | 5471-5499 | 2 | 0.931 |
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | KC152966 | Bacillus phage Emet putative gene regulator and hypothetical proteins genes, complete cds | 1009-1037 | 2 | 0.931 |
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | KC152967 | Bacillus phage Sole hypothetical protein, putative gene regulators, and hypothetical protein genes, complete cds | 1045-1073 | 2 | 0.931 |
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | AY257527 | Bacillus thuringiensis bacteriophage Bam35c, complete genome | 5471-5499 | 2 | 0.931 |
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | AJ536073 | Bacillus phage pGIL01, complete genome | 5469-5497 | 2 | 0.931 |
CP024113_2 | 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092657-2092686 | 30 | NC_048762 | Bacillus phage vB_BtS_B83, complete genome | 26059-26088 | 3 | 0.9 |
CP024113_2 | 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092657-2092686 | 30 | NZ_CP020004 | Bacillus thuringiensis strain Bacillus thuringiensis L-7601 plasmid unnamed2, complete sequence | 17949-17978 | 3 | 0.9 |
CP024113_2 | 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093052-2093081 | 30 | NZ_CP034552 | Bacillus cereus ATCC 14579 plasmid unnamed, complete sequence | 2356-2385 | 3 | 0.9 |
CP024113_2 | 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093052-2093081 | 30 | NC_004721 | Bacillus cereus ATCC 14579 plasmid pBClin15, complete sequence | 2418-2447 | 3 | 0.9 |
CP024113_2 | 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092788-2092817 | 30 | GU071094 | Synechococcus phage S-SM1, complete genome | 54124-54153 | 4 | 0.867 |
CP024113_2 | 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092657-2092686 | 30 | NZ_CP014285 | Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850055, complete sequence | 27260-27289 | 5 | 0.833 |
CP024113_2 | 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092657-2092686 | 30 | NC_004821 | Bacillus prophage phBC6A52, complete genome | 37850-37879 | 5 | 0.833 |
CP024113_2 | 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092657-2092686 | 30 | NC_049968 | Bacillus phage DK2, complete genome | 22476-22505 | 5 | 0.833 |
CP024113_2 | 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092657-2092686 | 30 | KX190832 | Bacillus phage vB_BtS_BMBtp13, complete genome | 23253-23282 | 5 | 0.833 |
CP024113_2 | 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092657-2092686 | 30 | MK284528 | Bacillus phage DK3, complete genome | 23164-23193 | 5 | 0.833 |
CP024113_2 | 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092657-2092686 | 30 | NZ_CP032612 | Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.4, complete sequence | 34550-34579 | 5 | 0.833 |
CP024113_2 | 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092657-2092686 | 30 | NC_018502 | Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p05, complete sequence | 5059-5088 | 5 | 0.833 |
CP024113_4 | 4.2|2231190|37|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT | 2231190-2231226 | 37 | NZ_CP007513 | Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome | 248075-248111 | 5 | 0.865 |
CP024113_4 | 4.10|2231191|37|CP024113|PILER-CR | 2231191-2231227 | 37 | NZ_CP007513 | Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome | 248075-248111 | 5 | 0.865 |
CP024113_2 | 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092657-2092686 | 30 | GU233956 | Bacillus phage 11143, partial sequence | 20685-20714 | 6 | 0.8 |
CP024113_2 | 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092788-2092817 | 30 | NC_011738 | Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742401, complete sequence | 213020-213049 | 6 | 0.8 |
CP024113_2 | 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092788-2092817 | 30 | NC_007051 | Staphylococcus phage 2638A, complete genome | 13284-13313 | 6 | 0.8 |
CP024113_2 | 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092788-2092817 | 30 | AY954954 | Bacteriophage 2638A, complete genome | 13284-13313 | 6 | 0.8 |
CP024113_2 | 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092788-2092817 | 30 | NZ_CP034567 | Vibrio parahaemolyticus strain D3112 plasmid p1, complete sequence | 45690-45719 | 6 | 0.8 |
CP024113_2 | 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092788-2092817 | 30 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 675072-675101 | 6 | 0.8 |
CP024113_2 | 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093118-2093146 | 29 | NC_022088 | Bacillus phage Troll, complete genome | 4906-4934 | 6 | 0.793 |
CP024113_2 | 2.10|2093183|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093183-2093212 | 30 | NZ_CP053575 | Citrobacter sp. TSA-1 plasmid unnamed2, complete sequence | 7553-7582 | 6 | 0.8 |
CP024113_2 | 2.10|2093183|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2093183-2093212 | 30 | MG945606 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 4483-1602, complete genome | 1967-1996 | 6 | 0.8 |
CP024113_2 | 2.1|2092591|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092591-2092620 | 30 | MN856040 | Bacteriophage sp. isolate 317, complete genome | 2411-2440 | 8 | 0.733 |
CP024113_2 | 2.3|2092723|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092723-2092751 | 29 | NZ_CP050068 | Klebsiella aerogenes strain 035 plasmid p35, complete sequence | 377728-377756 | 8 | 0.724 |
CP024113_2 | 2.3|2092723|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092723-2092751 | 29 | NZ_CP020848 | Klebsiella variicola strain KPN1481 plasmid pKPN1481-1, complete sequence | 153139-153167 | 8 | 0.724 |
CP024113_2 | 2.3|2092723|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092723-2092751 | 29 | NZ_CP043927 | Klebsiella quasipneumoniae subsp. quasipneumoniae strain M17277 plasmid p17277A_477, complete sequence | 113729-113757 | 8 | 0.724 |
CP024113_2 | 2.3|2092723|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092723-2092751 | 29 | NZ_CP021699 | Klebsiella pneumoniae strain AR_0158 plasmid tig00000727, complete sequence | 347755-347783 | 8 | 0.724 |
CP024113_2 | 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092788-2092817 | 30 | KX827371 | Staphylococcus phage SpT99F3, complete genome | 30241-30270 | 8 | 0.733 |
CP024113_2 | 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092788-2092817 | 30 | MK075002 | Staphylococcus phage phiSP38-1, complete genome | 32276-32305 | 8 | 0.733 |
CP024113_2 | 2.5|2092854|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2092854-2092883 | 30 | MN047793 | Xanthomonas phage Xoo-sp13, complete genome | 181943-181972 | 8 | 0.733 |
CP024113_4 | 4.8|2231581|37|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT | 2231581-2231617 | 37 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 92131-92167 | 8 | 0.784 |
CP024113_4 | 4.16|2231582|37|CP024113|PILER-CR | 2231582-2231618 | 37 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 92131-92167 | 8 | 0.784 |
CP024113_4 | 4.7|2231516|36|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT | 2231516-2231551 | 36 | NZ_CP020750 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed7, complete sequence | 37822-37857 | 9 | 0.75 |
CP024113_4 | 4.15|2231517|36|CP024113|PILER-CR | 2231517-2231552 | 36 | NZ_CP020750 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed7, complete sequence | 37822-37857 | 9 | 0.75 |
CP024113_3 | 3.1|2220966|37|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT | 2220966-2221002 | 37 | LC168164 | Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome | 180412-180448 | 11 | 0.703 |
1. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP014870 (Bacillus thuringiensis serovar tolworthi strain Pasteur Institute Standard strain plasmid pKK6) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg Protospacer *****************************
2. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010096 (Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMBLin15, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg Protospacer *****************************
3. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004882 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMBLin15, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggcttcggtgg Protospacer ********************.********
4. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011355 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC10, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggcttcggtgg Protospacer ********************.********
5. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_006945 (Bacillus phage GIL16c, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggcttcggtgg Protospacer ********************.********
6. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY701338 (Bacillus thuringiensis phage GIL16c, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctctacttttggcttcggtgg Protospacer ********************.********
7. spacer 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to EU408779 (Bacillus phage AP50, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatctaaggctatcatgtagtatc Protospacer *************.***************
8. spacer 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004882 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMBLin15, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
9. spacer 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053974 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
10. spacer 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009346 (Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
11. spacer 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010096 (Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMBLin15, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
12. spacer 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045027 (Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
13. spacer 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005258 (Bacillus phage Bam35c, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
14. spacer 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY257527 (Bacillus thuringiensis bacteriophage Bam35c, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
15. spacer 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AJ536073 (Bacillus phage pGIL01, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
16. spacer 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP013282 (Bacillus phage pGIL02, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatcggaagctatcatgtagtata Protospacer ********** .******************
17. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053974 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
18. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009346 (Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
19. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045027 (Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
20. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP013282 (Bacillus phage pGIL02, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
21. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005258 (Bacillus phage Bam35c, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
22. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KC152966 (Bacillus phage Emet putative gene regulator and hypothetical proteins genes, complete cds) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcgtcttcctccactttcggtttcggtgg Protospacer ***********.*****.***********
23. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KC152967 (Bacillus phage Sole hypothetical protein, putative gene regulators, and hypothetical protein genes, complete cds) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
24. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY257527 (Bacillus thuringiensis bacteriophage Bam35c, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
25. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AJ536073 (Bacillus phage pGIL01, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer tcctcttcctcgacttttggtttcggtgg Protospacer ** ******** *****************
26. spacer 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048762 (Bacillus phage vB_BtS_B83, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer tattttgggtagctgatgtagaagtaaaaa Protospacer *.******** **.****************
27. spacer 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020004 (Bacillus thuringiensis strain Bacillus thuringiensis L-7601 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer tattttgggtagctgatgtagaagtaaaaa Protospacer *.******** **.****************
28. spacer 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034552 (Bacillus cereus ATCC 14579 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatctaaggctgtcatgtagtatc Protospacer *************.***.***********
29. spacer 2.8|2093052|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004721 (Bacillus cereus ATCC 14579 plasmid pBClin15, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ggtagcaatctaaagctatcatgtagtata CRISPR spacer ggtagcaatctaaggctgtcatgtagtatc Protospacer *************.***.***********
30. spacer 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU071094 (Synechococcus phage S-SM1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
-agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer tagtgcta-caatcaaaaaaggtgctattgc Protospacer ***** * **************** ****
31. spacer 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014285 (Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850055, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtctgggttgctgatgtagaagtaaaaa Protospacer .. *.********.****************
32. spacer 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004821 (Bacillus prophage phBC6A52, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtctgggttgctgatgtagaagtaaaaa Protospacer .. *.********.****************
33. spacer 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049968 (Bacillus phage DK2, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtttgggttgctgatgttgaagtaaaaa Protospacer .. **********.***** **********
34. spacer 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX190832 (Bacillus phage vB_BtS_BMBtp13, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtctgggttgctgatgtagaagtaaaaa Protospacer .. *.********.****************
35. spacer 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK284528 (Bacillus phage DK3, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtttgggttgctgatgttgaagtaaaaa Protospacer .. **********.***** **********
36. spacer 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032612 (Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtctgggttgctgatgtagaagtaaaaa Protospacer .. *.********.****************
37. spacer 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018502 (Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p05, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cggtatgggttgctgatgtagaagtgaaaa Protospacer .* * ********.***********.****
38. spacer 4.2|2231190|37|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007513 (Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865
tgggacaaacatgctactttcttgaacgctcagtcaa- CRISPR spacer tgggacaaacatgctacttttttaaa-gcccaatcaag Protospacer ********************.**.** **.**.****
39. spacer 4.10|2231191|37|CP024113|PILER-CR matches to NZ_CP007513 (Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865
tgggacaaacatgctactttcttgaacgctcagtcaa- CRISPR spacer tgggacaaacatgctacttttttaaa-gcccaatcaag Protospacer ********************.**.** **.**.****
40. spacer 2.2|2092657|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU233956 (Bacillus phage 11143, partial sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tgttttgggttgccgatgtagaagtaaaaa CRISPR spacer cagtctgggtggctgatgtagaagtaaaaa Protospacer .. *.***** **.****************
41. spacer 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011738 (Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742401, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer ataacaagctatcaaaaaaggtgctattgt Protospacer * .***** ************** ****
42. spacer 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007051 (Staphylococcus phage 2638A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer atttgcaaaaatcaaaaaaggtgcaattga Protospacer * * *. *********************
43. spacer 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY954954 (Bacteriophage 2638A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer atttgcaaaaatcaaaaaaggtgcaattga Protospacer * * *. *********************
44. spacer 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034567 (Vibrio parahaemolyticus strain D3112 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer cgtgcaagcaatgaaacaaggtgcatatca Protospacer *********** *** ******** * *
45. spacer 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer agggcaagcaatcaaaaaagctgtagggga Protospacer ** ***************** **.*. **
46. spacer 2.9|2093118|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022088 (Bacillus phage Troll, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tcgtcttcctctacttttggtttcggtgg CRISPR spacer ttttgttcttctacttttggttccggtgt Protospacer *. * ***.*************.*****
47. spacer 2.10|2093183|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053575 (Citrobacter sp. TSA-1 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tttaatgatgttgataagttgccccgcata CRISPR spacer atgagtgatattgataagttgtcccgcaaa Protospacer * *.****.***********.****** *
48. spacer 2.10|2093183|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG945606 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 4483-1602, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tttaatgatgttgataagttgccccgcata CRISPR spacer tttgatgatgttgataatttgcctcagatt Protospacer ***.************* *****.*. **
49. spacer 2.1|2092591|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN856040 (Bacteriophage sp. isolate 317, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttcgatgtttatccatccactcttcgacaa CRISPR spacer ctcgatgtttttccatccactcagcagctg Protospacer .********* *********** *..* .
50. spacer 2.3|2092723|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP050068 (Klebsiella aerogenes strain 035 plasmid p35, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
tacaaaaagtgactgagggggcttataac CRISPR spacer ccgggaaagtgattgagggggcttatgaa Protospacer . ..*******.*************.*
51. spacer 2.3|2092723|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020848 (Klebsiella variicola strain KPN1481 plasmid pKPN1481-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
tacaaaaagtgactgagggggcttataac CRISPR spacer ccgggaaagtgattgagggggcttatgaa Protospacer . ..*******.*************.*
52. spacer 2.3|2092723|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043927 (Klebsiella quasipneumoniae subsp. quasipneumoniae strain M17277 plasmid p17277A_477, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
tacaaaaagtgactgagggggcttataac CRISPR spacer ccgggaaagtgattgagggggcttatgaa Protospacer . ..*******.*************.*
53. spacer 2.3|2092723|29|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021699 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0158 plasmid tig00000727, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
tacaaaaagtgactgagggggcttataac CRISPR spacer ccgggaaagtgattgagggggcttatgaa Protospacer . ..*******.*************.*
54. spacer 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX827371 (Staphylococcus phage SpT99F3, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer tttcaacaaaattaaaaaaggtgcaattga Protospacer * * . ***.*****************
55. spacer 2.4|2092788|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK075002 (Staphylococcus phage phiSP38-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agtgcaagcaatcaaaaaaggtgcaattga CRISPR spacer tttcaacaaaattaaaaaaggtgcaattga Protospacer * * . ***.*****************
56. spacer 2.5|2092854|30|CP024113|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN047793 (Xanthomonas phage Xoo-sp13, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgaaaatttcggtaatgtaaaggtgtttag CRISPR spacer cgaagatttcggtaatgtaaagacccgtac Protospacer .***.*****************.. . **
57. spacer 4.8|2231581|37|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tgaacc---atttttcaataatcaatattcctttcttaag CRISPR spacer ---actttaatttttcaaaaattaatattcctttcttatt Protospacer **. ********* ***.***************
58. spacer 4.16|2231582|37|CP024113|PILER-CR matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tgaacc---atttttcaataatcaatattcctttcttaag CRISPR spacer ---actttaatttttcaaaaattaatattcctttcttatt Protospacer **. ********* ***.***************
59. spacer 4.7|2231516|36|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020750 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed7, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgcagtgaaccgttttatttagaagagcttgctgca Protospacer **.**.********************..* .**
60. spacer 4.15|2231517|36|CP024113|PILER-CR matches to NZ_CP020750 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed7, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgcagtgaaccgttttatttagaagagcttgctgca Protospacer **.**.********************..* .**
61. spacer 3.1|2220966|37|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT matches to LC168164 (Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
----catcaaaatcaaaaacagttaaattagatgcagatga CRISPR spacer gtgttacagaaac----aacagttgaattagatgcagatgg Protospacer .*. .***. *******.***************.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
157129 : 210997
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024113|157129:210997|DBSCAN-SWA GGTGGCTTTTTTCGTGCTCATAAGATATGCCATAAAAGAGTTTCTCTCTGAGAAAGAATACGAGAACTTATCCACTAACACCCTCAAAGCTTATCAAATGCTCTTTGATGACTTCCTGAGATGGACTGAGGAGCAAGGCTTCTCCAGAGTCCAAGATTTGAACACAAGAGCTATTAAGAATTATCTCTCCCTTTGTAAGACTGAGAAAGGGAATAACCCCACGAGCTTGAACACCAAGAGAAGGCAATTCAGAGCTTTCTTTAATTTCCTTGTTCAAGAGGATATTGTCAAAGACAACCCCACAGACCCTATAAAGAAAGTAAAAGAGGATATACGCATAAAGACCTTCACTGATGAGGAAGTCAAAGAGATTCTTTCCCACCTCAGGAGGATAAAGAGGAGAGAAGACACTCTCTTTTCTATTCGCAATTACACTATATTTCTTACCCTTATTGGAACTGGCTTGAGGGCTTCTGAGTGTACTGGCTTGAAATGGTCTTCAGTTGACCTCATAAATAGAAGCATTAAGGTGTTTGGAAAGAACAGAATAGAACAAACCGTTCCAATTTCAGAAACACTTGTTAAGGAGCTAAGCTACTGGAAGGAATATTGCTTGAGACAGTTTGGGGAGCTCTCCCCTTGGGTGTTTGTTACCCAGCAAAACAAGCAATTTACTGTCAATGGCTTAAAGTGCTGGTTCAAGCGTTTAGCTCAATTGATGGACTTCCCAGAGACACGCTGTTCAGCTCACTCTTGTAGACACTACTTTGCAAAGAAATGGATTCAGTCTGGAGGGGATATTTCAACACTCTCCAAGGTACTGAGACATACAAGCATAAAGACCACAGAGAAGTATCTCCAGTTCTGGGGTAATGAAGTTGCTGACGACTATGACAAGTTTAATCCATTAAGGGAGTTGAGTTTGTGAACTGGGAAGAGTTCTGTCAAGAAATGTTTTGTTATGGTTATGAAGTTGGACTAACAAAGGAAGACATTGTGAAGGCAATTCGAGAAAATGAGGAATTGTTGAGCTGGATATTCAAGAAGTAAAACAAAAGGAAGCCCCCTCTCAAGTTTGGCGACTTCAGGGAGCTTCCTAGTAAAACTCAAAGAGAGGTTGTTCCTCTCCTTTTTATTTTACAATGAGAAGGGCTCTGAGGGCAACCTCCAGAACTTGGAGGGTTATTTGTGGAAAGCTTGAGAGAGTATGAGACCTTTCAGAGCGTCTCTGAGATGGATGAATACATAAATAAGGTTCTGGCTCATATAGAGCTTAAAAAGACCGAGAGGGAGCTTCTATGGCTTCTAGGAGGGCACTCTGTAAAGTTTATTGGGGTGTCCTTTTTGAAGTTGGACTCTATGGCTCAACTCCTGAAGGTGTCAAAGAAGACCATTCAAAGAGCACTCAGCAAGTTGCAAGCTCTGGGAGTAATCAAGAGAGTAAGAACGATAAGACCAGTAAAAGGAGGTTTTGGGGCTAGTATTACTCAAATATGTCCAGTCGAATTGTCCACTCGCTCTGAAGGTGAAACTCCAGAGGAGACAAGGGAAGAGACCACCTCACAAAAGAAAGAAACATTTTCTTTTAAAGCATTTTCAAAAGATATTAAATACATACGACAACAAGAGGAGATTGACTACAGCTATTTAAGTGAATTTGTTCCTCAAGAGTTCATACAAGCAACGAAACCTTTCATGAGCCCTGAAGAGGTTTATTCCTTATGGGGTAAAACTCATGTGGTAGCTAAAAGATATGCTCCAGATGTTCTGGATATTCTTGAGCCAGCAATTAGAGCTTTCAAAGCTTCAGTGTTAGCTTACAAGACCAAGAGAGTGAAAAAGAGCTTTGGAGCGTACTTCTGGGGAGCCTTGCAAGGTGTCTTTGGAGTGGAGCAAAGAAGAGCTGTTGCTGGCTCAAGGGGTGGACTGTTAAGCTGGAACTGGTTAGAGGACTATTGAGGGAAACTCCCAGAAGCTTTAAGAAGGTTAGCTTCAGAACAATAGAATAAAATAAAAGAGAAGCTGTCACTCAGTTGATGAGTCTCAGAAGGTTAGCTCCAGTATGTAAGAAGAAATATATGAGACAGAATAAAAGAAGGTGTAAAATAGATTGAACTTGATGAGCTGAGCTGGTTAGTAGTGCTTGTATGATTCAGCTTGAGAGGTTCAACTGTTTAATGGGTTGTGCTGAGATGGAGGCTCCAGAGGTAGCCTTGAGAGGTTAAGCTGGTTCATAGGTGGCTTGAGGGAAAACTCCAGAGGTAGCTTGAGAGGGAGCTTGAGAGGAAACTCCAGGGGTAGCTTGAGAGGAAACTCCAGAGGTAGCTAAAAGGGTTAAACCCCCATGTCCTCACGAGGGCTTCCTCATTTCCCCCATTTAGAGTAATTTCCTTGAGAGGTAAACCCCCAGAGCAACACCTCCAGAGCCCCTGAGAAGCCTTCTAGTGACCCTCATAAGGTGAATATACCAGACACCCCTGAGAAGCCTTCCTGAGCCCTTCTGAGAGCCCTGAAGAGGAACGCTGGAATAGAGACCAGCTCCAGAGTCCACCTCAAGAACAAGACCACTTTACTTGCTGAGATAGCCCTCTCAGACCACTTTACAAGTGACCTCCAGAGTAAAACCCCCAGAGTAAGCCATTCTTGTGACCACTTTCTACACACAGAAGTAGTCCAGCTCTTGAGTTCCCAGCTCATAGGGTCTTTGAGTCGTTCACTGAGAGAGTAACCCCCAGAGTAAAGCTCCAGAGTAACACCCCCAGAGAAGCCCCTGAGAGGACACCAGAGAGCTTCCATTGGAGCCAGAGTGTTATGAGTCCACCTCATACAAAGACCCCTGAGAAGGGCTCCAGTGCTCCCTCAAGAGTACCACCTCACAAGGCAACACCTTCTCTTTTGTTTGTTCTTTTTCTTCTGGTGTAGCTCAAGAGGAACAACACACTAGAACACCACATGAGAAGCTCATACAAGGCTTCTGAGGGCTTCTGAGTATAACCTGAAGGGTAAACCATTAGAAAGCAATAAAAGGGCTCTAAAAGGCTTCTAAGGAGTTGCCAGCTCATAGGGTTGACTAGAGGAGAAATGTGTGGTAATAGCACAAATGAGGTAGACTGTCAAGGTCAGCTCAAAAAAATCAGGCTAGGGGGGTCACAAAAACACACATAGTCTGGTTTTTACAAAATATATTTTTCAAAACAGCCCTTGAGAGTTACCTTGAGAGTCTTCCCCAGCCCTTGAGAGTTACCCTTGAGAGGTAAACCCTAATTGACAACCCCTTGAGTGCTCCCCTGAGAGGTCAATTTGAGAGCATAACCCTGAGAAGTTACCACCTCAAGACCACTATAACCAAAGAGTTGACCTCAATAGTACACCTCAAAATTTATTTCTAAAATTTTTTTTAAATGTTGTCATATCAAGGGTTCAAGAGGGTTTTCTCTGGAGTTGGTTCTGGAGTGTTTAACTAAAAAAAGTCACACCTTTTGAAAAGAACTAATGATTTAGCTAAAAAGTTACAACAAATAATATTCCTTCTCATAAAAACAAATACAATGAAAAGAAGTTTCCACCTCATAACAAACAATAAAAAAAATAAATGAAGTGGAAAAGAGGTTGTACTAAAGAGTTACAACTCATAATAAAACAATAGATAAAAAAGAAGTTGAAACTAATAGATGACAACTCATACTTAAAATAAAGATAAAAATAAAAGAAATAATGAGATGACAACTCAAGAGTTTACCTTATAAGGGGTAGACTCTTTTTTTTTGTATATGATTCAGCACAAGAGAGGACAACTCATATTTTATTTTTATTTTACTTCCCTTGAAAAGCCCACTAGAAAACACAAAAGAAAAATAATGAGATGGCAAAAAGGAGCTTACGCTCCAGAACACCACTCAAAACCCCCTTGAGCCAGATTCTCTAATAAGTAATAAGTGTCAACTCCCCTGAAGTGCCTTCAGCCTTACTCTCCCAAGGGTTAGACCCTATTTTAATACAGTGCATATTTTGCACTCAAAGTGGCTAATACGGTGCATATTTTGCACTGGGAAAATTACAAGGAGTAGGGGGGCTTCCCAGATTCCCCTCCAAGGTTTTCTTCAAAAGGTAATTTTCAAACCAGCCTTGTGAGGTGGAACTCCACGAGACGCTCTCAGAGCACTTCTGAGCGTTTTTAACCCCTTCAGGTCTTATTGCATTACCCTCCTGAGAAAAAGCTCTCAGAGAAGCTTCAGTGAGTTCTCAAATAACCCTTTCACGAAAAGAGTAATGGAGAAGACCTTGTGAGGTGGCAAAGAAAATGAAACCCTTATACCACTCAAGTGTCTACAAAAATGGGGGTTTGAAATATTTTTTTTAAAAAAAATTGAATTTTTTTTTAGCCCTACAGCCCCAAGGGGTTTGGACTTCATAGTTCTCTCTTCAGGTACTAAAAAAACAGAAGTGTATTAACAAAAATGTCACACCTCTTGAAAAGTATATAGTGAGGGGGCAAAAAGAGAGTCATTAAAGAGCTTACTAATTCATCCTAGCTCAGCTAGGCTCTCCAGTTGTCTTGCTTTTTCAAAGTTACCATGCACGTTCAAACACCTCAATGGGGAGACGGAAACTCCCCAAAACATCAGCTCCCTTGTGGAGCATTAAAACACACTCCTACTGGAAAATGAGCTTGCCAAGACCTCCCAAGAGGGAGCGAGCGAGCCATTCTCCCCAGTACCAAAACCTAGCAAACATCTTTCTTTCCCTAGCAAGCTGACGAGCTTGCAACTTTTTTTGGGAAAGAGTTAACAAATTCGTGAACTGTACGGAGGGAAAGAAAATGAAAATTGTAAAGGAGACAAAGAGAACAAGACAATTAGAGATTTACAGTGAAACTGGTGAACTGGTTCAAAGGGTTTGCAGAACGTGCCAGCTTGTAAAGTTGCCAGAAGACTTTCCAAAGTACACTCAAGGTTATTTGAGACCAGATTGCCATGAGTGCCACAAAAAGAAACAAAGAA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55 | Bacillus_phage(26.67%) | integrase,protease,transposase | attL 156922:156970|attR 174090:174138 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
287355 : 295333
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP024113|287355:295333|DBSCAN-SWA CATGCTAAAGCCATTAGGTGATCGCGTTGTAATTGAACTTGTTCAAGCGGAAGAAAAAACAGCAAGCGGTATTGTATTACCAGACACTGCAAAAGAAAAACCACAAGAGGGTAAAGTTATTGCAGTAGGTACTGGGCGAGTGCTTGAAAATGGTGAGCGTGTTGCTTTAGAGGTAGCAGCAGGCGATCGTATCATCTTCTCAAAATATGCAGGTACTGAAGTGAAATATGAAGGTACAGACTACTTGATTTTACGCGAAAGTGACATTTTAGCAGTTATCGGTTAATTATATATTTAAAAAATCCAAGGGGGTCAATATTATGGCAAAAGATATTAAATTTAGTGAAGAAGCACGTCGTTCGATGCTTCGCGGTGTCGACACTCTTGCAAACGCAGTAAAAGTAACACTTGGACCAAAAGGTCGCAACGTTGTACTTGAGAAAAAATTTGGTTCACCACTTATTACAAATGACGGTGTAACAATCGCAAAAGAAATTGAATTAGAAGATGCTTTTGAAAACATGGGTGCAAAATTAGTAGCAGAAGTTGCTAGCAAAACAAATGATGTAGCTGGTGACGGAACAACAACTGCAACTGTATTAGCACAAGCTATGATTCGTGAAGGTTTGAAAAACGTAACAGCTGGTGCAAACCCAATGGGTCTTCGCAAAGGTATTGAAAAAGCTGTTGCTACAGCAGTAGAAGAGTTAAAAACAATTTCTAAGCCAATTGAAGGTAAATCTTCTATCGCACAAGTAGCGGCTATTTCTGCTGCTGACGAAGAAGTAGGTCAATTAATTGCAGAAGCGATGGAACGCGTTGGTAATGATGGCGTTATTACATTAGAAGAATCTAAAGGATTCACAACAGAATTAGATGTAGTAGAAGGTATGCAATTTGATCGTGGATATGCATCTCCTTACATGATTACTGATTCTGACAAAATGGAAGCAGTTCTTGATAACCCATATATCTTAATTACTGACAAAAAGATTTCTAACATTCAAGAGATCTTACCAGTGTTAGAACAAGTGGTCCAACAAGGTAAACCACTTCTTATTATCGCTGAAGATGTAGAAGGTGAAGCGTTAGCTACATTAGTAGTAAACAAACTTCGCGGTACATTCAATGTAGTAGCTGTTAAAGCTCCAGGATTTGGTGACCGTCGTAAAGCAATGTTAGAAGATATCGCAATCTTAACGGATGGCGAAGTAATCACTGAAGAACTAGGCCGCGACTTAAAATCAGCTACAATTGAGTCTTTAGGACGCGCTGGTAAAGTTGTGGTAACGAAAGAAAACACAACAATCGTAGAAGGTGTAGGAAGCACTGAACAAATCGAAGCTCGCATCGGTCAAATCCGTGCGCAATTAGAAGAAACAACTTCTGAATTCGATCGTGAAAAATTACAAGAACGTCTTGCTAAACTTGCAGGTGGCGTTGCAGTAATTAAAGTAGGTGCAGCAACTGAAACTGAGTTAAAAGAACGTAAACTTCGCATTGAAGATGCACTTAACTCAACTCGTGCAGCAGTAGAAGAAGGTATTGTTGCAGGTGGCGGTACTTCACTTATGAATGTATACGCTAAAGTAGCTTCTATTGCAGCTGAAGGCGACGAAGCAACAGGTATCAACATTGTACTTCGTGCATTAGAAGAGCCAGTTCGCCAAATCGCAATCAACGCTGGTCTAGAAGGATCTGTAGTGGTAGAACGTCTAAAAGGCGAAAAAGTAGGTGTTGGTTTCAACGCAGCAACAGGCGAATGGGTAAACATGCTTGAGTCTGGTATCGTAGACCCAGCAAAAGTAACTCGTTCTGCACTTCAAAACGCAGCATCTGTTGCAGCAATGTTCTTAACAACAGAAGCAGTAGTAGCTGACAAACCAGAAGAAAATAAACCGGCAATGCCAGACATGGGTGCAATGGGCGGCATGCCAGGAATGATGTAATTTCATTATTCGCTAAAACACTCATCTCTTTTCGAGAGATGGGTGTTTTTTGTTATCAAATTTCTCGAAATTATAGTAAAAAAGGTTTTATCGTAACCGAAATATAATTTCTGTAGAATTTTGTCGTGTTCTCTCTTGACCGTATTGATATTTCATTGTTAGAATCTAGAAAGATAATATAAAACAATCCTTCATATATCCTCAATAATATGGTTTGAGAGTCTCTACCGGGTTACCGTAAACAACCTGACTATGAAGGCAGTGCGTCTTATTGTTTATAAAGAGCAACATACTATCTTTATAAAGCTAGACTCCTGCCTTTTCTTTATTATGAGACGAGAGGTGGGGGACTGGCTTTTTTTATTATATTGGTAATGCTTTTTGCCTAATTTGGTGAAAATATTTATATACAGAACTAACGTTGGGGTGATTATTTTGAAAAAACAGCACGATACGATTATCGTTTTAGACTTTGGAAGTCAGTACAACCAATTAATTGCACGTCGCATTCGTGAGTTCGGTGTGTACAGTGAGCTTCATCCACACACAATTACTGCGGAAGAAATTAAAGCAATGAATCCAAAAGGTATCATTTTCTCTGGTGGACCAAATAGTGTATACGGCGAAAATGCATTCCACTGTGATGAGAAAATTTTTGAGCTAGGATTACCTATTTTTGGTATTTGTTACGGCATGCAGCTGATGACAAAACACTTTGGTGGAAAAGTAGAGCGAGCAAACCATCGTGAGTACGGAAAAGCAGTTCTGAAAGTAGAGAATGAATCAAAATTATATACAAACCTGCCAGAAGAACAAGTTGTATGGATGAGCCATGGTGACTTAGTAACAGGTTTACCAGAAGGCTTTGTAGTAGATGCAACGAGCGAATCTTGTCCAATTGCTGGTATGAGCAATGAAGAAAAGCAATTATACGGTGTACAATTCCATCCAGAAGTACGTCACTCTGAGCACGGTAATGATTTAATTAAAAACTTCGTATTCGGCGTATGCGGTTGTTCTGAAGGCTGGAACATGGAGAACTTTATTGAAGTAGAATTAGAAAAAATTCGTGAAACAGTTGGCGATAAAAAAGTGCTATGTGCACTTAGCGGTGGTGTAGATTCTTCTGTTGTAGCTGTATTAATTCATAAAGCAATCGGTGATCAGTTAACATGTATTTTTGTTGACCACGGTTTACTTCGTAAAGGTGAAGCAGAAGGTGTTATGAAAACATTTAGCGAAGGCTTCCATATGAATGTTATTAAAATCGATGCTAGAGAACGCTTCATGAAAAAGCTAAAAGGTGTAGAAGATCCTGAACAAAAACGTAAAATTATCGGTAACGAATTCATTTATGTTTTTGATGATGAAGCTGCTAAATTAGAAGGAATAGACTTCTTAGCGCAAGGTACACTGTACACAGACATTATTGAAAGTGGTACAGCAACTGCGCAAACAATTAAATCTCACCATAACGTAGGTGGACTTCCAGAAGATATGCAGTTCAAATTAATCGAGCCTTTAAATACGTTATTTAAAGATGAAGTACGTGTATTAGGATCAGAACTAGGAATTCCTGATGAAATTGTATGGCGTCAACCATTCCCAGGTCCTGGACTTGGTATTCGTGTATTAGGTGAAATTACAGAAGAAAAATTAGAAATTGTTCGTGAATCTGATGCGATTTTACGTGAGGAAATCCAAAAAGCAGGATTAGACCGTGAAATTTGGCAATACTTCACTGCGCTTCCTGGTATGCGCAGCGTAGGTGTTATGGGTGACGAGCGTACTTACGATTATACAGTAGGTATCCGTGCCGTAACATCAATTGACGGTATGACAGCTGACTGGGCACGTATCCCTTGGGACGTATTAGAGAAAATCTCTGTACGTATCGTAAACGAAGTAAAACACGTGAACCGCGTTGTATATGATATTACTTCTAAGCCACCAGCAACGATTGAGTGGGAATAAAACTATTTATTTGCAGGAAGATCCATCTTATATATAGATGGATCTTTTTTATACGAACAAAAAAAGTTTAACTTATAAAATTGTTCGTTTTTAAGTTGACATATATTTTTTTGTACGCTAATATGATTATATGATTGATACAAAAAGTGAATATTATAGCCGTCGTATAATCTCGGGGATATGGCCCGAAAGTTTCTACCTAGCTACCGTAAATGGCTTGACTACGAGGCGTTTTTATAAAGATAAGGGGAATTTATCTTTATTTATAGAACGCTTCCATGTATATAGGCAATGGAAGCCTTTTTTATTTTTTAGGATAAAAGAGGGCTAGGATGAAGTGCGACGAGTCATTATACAACGGAGGAAACGTAAGATGAAACGTTATTTTCAGTTTGATGAGCTCGGTACAAATTATAAGACTGAGTTCATTGCAGGGTTAACAACATTTTTATCTATGGCTTACGTACTATTTGTTAATCCTGCCACACTGTCACTTGGAAACATTAAAGGACTGCCGGCAGGAACCGGAATGGATCCGGGAGCAGTATTCGTTGCCACTGCATTAGCGGCAGCAATCGGTTCTTTAATTATGGGGATTTTTGCAAAATATCCAATAGCATTAGCGCCAGGTGTAGGGATTACTTCTTTCTTTGCTTACACAGCGGTATTAACAATGGGAGTTCCATGGCAGACAGCAATTGCGGGAACACTCGTATCAGGTATTATCTTTATTATTATTACAGCTCTTGGTATCCGTGAAAAAATTATTAATGCAATTCCTGCAGAGTTAAAACTTGCGGTAGCAGCAGGTATTGGCTTATTTATCGCCTTTTTGGGTTTTCAAAATGCCGGAATTATCGTGAAAAATGATGCGGTTCTTGTTGGATTAGGAGACTTAACAAAGGGCGCAACGTTGTTAGCGATTTTCGGAGTAGTTGTTACGATTATTTTAATGATTAAAAAGATAAATGGTGCAGTGTTCTATGGGATGATTCTTACAGCTATTCTTGGAATGGCAACAGGATTAATTGATACGCCAAAAGCTGTAGTAGGAGCAATTCCAAGTTTAGAACCGAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP024113|287355:295333|291650_292976_+|AWC51320.1|DBSCAN-SWA MKRYFQFDELGTNYKTEFIAGLTTFLSMAYVLFVNPATLSLGNIKGLPAGTGMDPGAVFVATALAAAIGSLIMGIFAKYPIALAPGVGITSFFAYTAVLTMGVPWQTAIAGTLVSGIIFIIITALGIREKIINAIPAELKLAVAAGIGLFIAFLGFQNAGIIVKNDAVLVGLGDLTKGATLLAIFGVVVTIILMIKKINGAVFYGMILTAILGMATGLIDTPKAVVGAIPSLEPTFGMALTHFGDIFTVQMGIVIITFFFIDFFDTAGTLVAVVNQAGLMKDNKLPRAGKALFADAIATVIGAILGTSTTTSYIESSAGVAAGGRSGFTAVVTAGFFLLALFFSPLLSVITPAVTAPALIIVGILMVSSLGEIEWKKFEIAVPAFFTIISMPLTYSIATGIAIGFIFYPITMVVSGRRKEVHPIMYVMGVLFVLYFIYVRK >CP024113|287355:295333|293845_295333_+|AWC54892.1|DBSCAN-SWA MSGILKKIIYKGICGVQKSLRVQLITTFALCSLLGIMGVWASSPFFQGINKYSVIDYSSGMRFIDTTAESLVAAIVREGASVNVQEVLERPEYQRELKVLIVDENGKVIYKTKGAQEEQINLHSTIRNIMSFKINRSQYEYQKDVIDNEIERERKEFTTFYPLTIEEKNMYMIASGIPQGNIREVQNDSPFPFLIGFVLFLFSFFYLTKRKMKQIEAMAEGVKEITKGNLQHRIPEKGQDELSLLAVNMNQMAEELFSNIEKERRIEKQKNELITNVSHDLRTPLTSIMGYLRLLRDSKYENKEQHDEYTRIAFTKSEQLKNLIEDLFEYTKLTNEKVILEKQEVCINELLEQLIEELVPQAEEEGLTFIKHFPEERMYATIDSEKMVRVFENLLMNAIKYSKDNGEIKVSLQRQRRDIQIIVANYSEEFTKEELANLFERFYKKDQSRSRVKEGSGLGLAIAKSIVELQGGQIRAHYEDGEIQFIVSLPIMEEK >CP024113|287355:295333|287355_287640_+|AWC51317.1|DBSCAN-SWA MLKPLGDRVVIELVQAEEKTASGIVLPDTAKEKPQEGKVIAVGTGRVLENGERVALEVAAGDRIIFSKYAGTEVKYEGTDYLILRESDILAVIG >CP024113|287355:295333|287674_289303_+|AWC51318.1|DBSCAN-SWA MAKDIKFSEEARRSMLRGVDTLANAVKVTLGPKGRNVVLEKKFGSPLITNDGVTIAKEIELEDAFENMGAKLVAEVASKTNDVAGDGTTTATVLAQAMIREGLKNVTAGANPMGLRKGIEKAVATAVEELKTISKPIEGKSSIAQVAAISAADEEVGQLIAEAMERVGNDGVITLEESKGFTTELDVVEGMQFDRGYASPYMITDSDKMEAVLDNPYILITDKKISNIQEILPVLEQVVQQGKPLLIIAEDVEGEALATLVVNKLRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTDGEVITEELGRDLKSATIESLGRAGKVVVTKENTTIVEGVGSTEQIEARIGQIRAQLEETTSEFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAATETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTSLMNVYAKVASIAAEGDEATGINIVLRALEEPVRQIAINAGLEGSVVVERLKGEKVGVGFNAATGEWVNMLESGIVDPAKVTRSALQNAASVAAMFLTTEAVVADKPEENKPAMPDMGAMGGMPGMM >CP024113|287355:295333|293118_293820_+|AWC51321.1|DBSCAN-SWA MRQETILVVDDEKEIRDLITIYLKNEGYNILQAGDGAEGLEVLENNEVHLVVLDIMMPKIDGIHMCMKVREQKEMPIIMLSAKTQDMDKILGLTTGADDYVTKPFNPLELVARVKSQLRRYMKMSGFMIENENEIEIGDIKINVSTHEVVVADREVKLTPREFSILELLVRNSGMVFSTEQIYEKVWNERSFQSDNTVMVHIRKIREKVEENARKPRYIKTVWGVGYKVEKEN >CP024113|287355:295333|289729_291277_+|AWC51319.1|DBSCAN-SWA MIILKKQHDTIIVLDFGSQYNQLIARRIREFGVYSELHPHTITAEEIKAMNPKGIIFSGGPNSVYGENAFHCDEKIFELGLPIFGICYGMQLMTKHFGGKVERANHREYGKAVLKVENESKLYTNLPEEQVVWMSHGDLVTGLPEGFVVDATSESCPIAGMSNEEKQLYGVQFHPEVRHSEHGNDLIKNFVFGVCGCSEGWNMENFIEVELEKIRETVGDKKVLCALSGGVDSSVVAVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEAEGVMKTFSEGFHMNVIKIDARERFMKKLKGVEDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEAAKLEGIDFLAQGTLYTDIIESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRVLGSELGIPDEIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRESDAILREEIQKAGLDREIWQYFTALPGMRSVGVMGDERTYDYTVGIRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVKHVNRVVYDITSKPPATIEWE |
6 | uncultured_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
328309 : 336681
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP024113|328309:336681|DBSCAN-SWA GATGATTAGTCGTTATACACGCCCTGAGATGGGTGCGATTTGGACGGAAGAAAATAAATTTAAAGCATGGTTGGAAGTGGAGATTTTAGCTTGTGAAGCATGGGCGGAACTTGGTGAAATTCCAAAAGAAGATGTGAAAAAAATTCGCGAAAATGCATCATTTAATATGGATCGTATTTATGAAATTGAAAAAGAAACACGTCATGATGTAGTAGCATTTACTCGTGCAGTATCAGAAACACCTGCATTAGGGGAAGAACGCAAATGGATTCACTACGGTTTAACATCAACAGACGTAGTAGATACAGCATTGTCTTATATTTTAAAACAAGCAAATGAAATCTTATTAAAGGACTTAGAAAACTTTATTGAGATTTTAGCAAATAAAGCGAAAGAACATAAATACACAGTTATGATGGGGCGAACACATGGTGTTCATGCAGAACCAACAACGTTTGGTTTAAAACTTGGTCTTTGGTATGAAGAAATGAAACGTAACTTGGAACGTTTCAAACAAGCAGCTAATACAGTTCGCGTCGGTAAATTATCAGGTGCAGTTGGTACGTATGCAAACATTAATCCATTTGTAGAAAAATATGTTTGTGAAAACTTAGGATTAGAAGCAGCGCCAATTTCTACACAAACATTGCAACGTGATCGCCATGCGCATTACATGTCAACACTTGCATTGATTGCCACATCTATTGAAAAGATGGCAGTTGAAATTCGCGGTTTACAAAAGAGTGAAACTCGTGAAGTAGAAGAGTTTTTCGCAAAAGGTCAAAAAGGTTCTTCTGCTATGCCGCATAAACGTAACCCGATTGGCTCTGAAAATATGACTGGTATGGCACGTGTTATTCGCGGTTATATGTTAACAGCTTATGAAAATGTTCCATTATGGCATGAGCGTGATATTTCGCACTCTTCTGCAGAACGTGTTATCTTACCCGATGCAACTATTGCATTAAACTATATGTTAAACCGCTTCGGTAATATCGTGAAAAACTTAACGGTATTCCCAGAGAACATGAAACGCAATATGCAAAGAACATACGGTTTAATTTATTCGCAACGTGTCATGCTTACTCTTATCGACAAAGGTATGGTACGTGAAGAAGCTTATGATATCGTACAGCCTAAAGCGATGGAAGCGTGGGAGACACAAGTACAATTTAAAGATCTTGTAGAGGCAGATGAGCGTATTACAAGCAAGTTAACACAAGAAGAAATCAACGAATGTTTCAACTATGAATATCACTTACAACATGTTGATACTATTTTTGAACGTCTTGGACTAAACTAAGCAGAAAATTTTATATGGCACAGAATAGCGTTATTCTGTGCCATTCTTTATAAAAATATTATTCACATTTTTCAAACTACAGGGGGCTTGCGAAATGCAAAAGCTAGAATTGCTGTATGAAGGTAAGGCAAAAAGAATATATCGTACAGAAGCAGCAGATATGGTTTGGATAGAGTACAAAGATAGTGCTACTGCTTTCAATGGAGAGAAAAAAGCGACCATTACAGGAAAAGGTCGTTTGAACAATGAAATTACAACTTTTTTGTTCAGAAAGTTGCAAGAAGTGGGAATTGAAACACATTTTGTAAAGAAGCTATCAGATACAGAACAACTTGTGAAAAAAGTAAGTATTATTCCATTAGAAGTTGTTACAAGAAACGTCATTGCAGGGAGCCTTTCCAAACGATTAGGAATGGAAGAGGGAATACCACTTGCCAAACCAATCGTAGAATTTTACTACAAAGATGATGATTTAGGAGATCCTCTTGTAACAGAAGATCATATTCGTGTGTTAAACGTTGCAACATTAGAGCAGATAAGTACATTACGAGAAAAGGCTCTACGAATCAATCAAGTTTTGATTGAGCATTTCGCAAGCTGTCGTGTAAGGTTAATAGATTTTAAATTAGAGTTTGGTATTACAGAGGAAGGCAAGATTGTATTAGCGGATGAAATCTCACCAGATACTTGTCGTTTATGGGATGAAGAGAGCAATGAGAAATTTGATAAAGATGTATTTCGCCGCGATTTAGGTAATTTAACCGAGGCATATGAAGAAATTTTAAAACGTTTAGGAGGGGCTTCACATGTATAAAGTTAAGGTATATGTAACATTAAGAGAGAGTGTATTAGATCCACAAGGAACAGCAGTAAAAGGTGCTCTTCACAGCCTTTCCTTTACAGAAGTACAAGATGTGCGCATTGGTAAATATATGGAGTTAACAATTGATAAATCGGTAACTGATCTTGATAGAAAAGTAAAAGAAATGTGTGAAAAACTATTAGCAAACGTTGTAATGGAAGATTTCCGTTATGAAATTGAGGAGGTTGTCGCACAGTGAAATTTGCCGTAATCGTTTTTCCAGGTTCGAACTGTGATGTTGATATGTTTCATGCAATTAAAGATGAGCTTGGTGAAGATGTAGATTATGTTTGGCATGATGCAGAGAACTTAGACGAATATGATGCGATTCTTTTACCAGGTGGATTCTCTTATGGTGATTACCTTCGCTGCGGTGCCATTTCTCGATTTGCGAATGCAATGAAAGCAGTGCAAAAAGTTGCTGAGCAAGGAAAGCCTATTTTAGGCGTGTGTAATGGATTCCAGATTCTTGTTGAATCAGGATTATTACCAGGGGTATTGATACGAAATCAAAACTTAAAATTCATGTGCCGAACTGTTCCGTTACGTGTTGAAAATAATGAAACGATGTTTACATCACAATATAACAAGGGGGAAATCATTCATATCCCAATTGCACATGGTGAAGGAAATTATTATTGTGATGAAGCAACTCTTAAAAAATTAGAGCAGAAGAATCAAATTGTATTCCGTTATGTAGACAATCCAAACGGAAGTGTTTCAGATATTGCAGGTATTGTAAATGAAAAAGGTAATGTGCTTGGCATGATGCCACACCCAGAGCGTGCTGTGAATGAAATTCTTGGCGGTGCAGAAGGGTTAAAAGTCTTTCAATCTATTTTGAAATATTGGAGGGAAACATATGTCGTTAATGCTTGAACCAAATCCAACACAAATTAAAGAAGAACGTATATATGCGGAAATGGGGTTAACAGACGAAGAGTTTGCCATGATTGAAAAGATTTTAGGACGTCTGCCGAACTATACGGAAACAGGGCTTTTCTCTGTTATGTGGTCAGAGCATTGTAGTTATAAAAACTCAAAACCAGTTCTTCGCAAGTTCCCAACAACAGGAGAACGTGTATTACAAGGACCTGGAGAAGGCGCAGGTATTGTAGATATTGGTGATAATCAAGCAGTTGTATTTAAAATGGAAAGTCACAATCATCCTTCGGCAATTGAGCCGTATCAAGGTGCAGCAACAGGGGTTGGCGGTATTATTCGTGATGTATTCTCTATGGGAGCACGTCCGGTTGCATTATTGAACTCACTGCGCTTCGGTGAACTCCAATCACCACGCGTGAAGTATTTATTTGAAGAAGTAGTTGCAGGGATTGCAGGATACGGTAACTGTATTGGTATTCCAACTGTTGGCGGAGAAGTACAATTTGATCCATGTTATGAAGGAAACCCACTTGTCAATGCAATGTGCGTTGGGTTAATTCATCATGAAGATATAAAAAAAGGGCAAGCGCACGGTGCTGGTAACACGGTTATGTATGTCGGTGCTTCAACAGGACGAGACGGTATTCATGGTGCAACTTTCGCATCAGAAGAACTATCTGAGAGTTCAGAAGCAAAACGCCCAGCAGTACAAGTAGGCGATCCGTTTATGGAGAAACTTCTTATTGAAGCATGCTTAGAGTTAATCCAATCTGATGCGCTTGTTGGAATTCAAGATATGGGCGCTGCGGGCTTAACATCATCTTCTGCGGAAATGGCAAGTAAAGCGGGAATGGGTATTGAAATGTATTTAGACGATGTGCCACAGCGTGAAACAGGTATGACACCATATGAAATGATGTTATCTGAATCACAGGAACGTATGTTGATTGTGGTGAAAAAAGGTAGAGAGCAAGAAGTTGTAGAGTTATTTGAAAAGTATGGCTTAGCGGCAGTTGCGATGGGAAAAGTAACGGAAGATAAAATGCTTCGTTTATTCCATAAAGGTGAAATGGTAGCAGAAGTACCTGCGGATGCATTAGCAGAAGAAGCGCCAATTTATCATAAACCTTCAAAAGAGGCAGCATATTTTAGGGAATTTCAAGAAATGAAAATGAAGACGCCAAAAGTAGATAACTATAAAGAAACATTACTAGCTTTATTACAACAACCAACGATTGCAAGTAAAGAATGGGTATATGATCAGTATGATTATCAAGTACGCACAAGTACTGTTGTTACACCAGGATCAGATGCAGCGGTGGTGCGAGTACGTGGTACAGAGAAGGCATTAGCAATCACAACGGACTGTAACTCTCGTTATATTTACTTAGATCCTGAAACGGGCGGTAAAATTGCAGTAGCAGAAGCTGCGCGTAATATTGTATGTTCTGGCGGAGAACCACTTGCAATCACAGATTGCTTAAATTTTGGTAATCCAGAGAAACCAGAAATTTTCTGGCAAATTGAGAAATCAGTAGATGGTATGAGCGAAGCTTGTCGTACATTACAAACTCCAGTTATTGGTGGAAATGTATCAATGTACAACGAGCGCAGCGGTGAAGCTGTATATCCAACACCAACTGTTGGAATGGTTGGGCTTGTTCACGATTTAAAACATGTAACAACACAAGAATTTAAGCAAGCTGGGGATCTTATTTATGTTATGGGTGAAACGAAAGCTGAATTTGGTGGAAGTGAATTACAGAAGATGATGTACGGTAAAATCTTCGGTCAATCACCAAGTATTGATTTAGAAGTAGAAGCAAAACGTCAAAAACAATTACTAGAAGCAATTCAGGCGGGACTTGTTCAATCGGCACATGACGTTGCAGAAGGCGGATTAGCAGTTGCGATTGCTGAAAGTGCAATCGGTGCGAAAGGATTAGGTGCTACTGTGAAATTAGCTGGGGAGGCAACAGCGGCATTATTCGCAGAATCACAATCTCGTTTTGTTGTAACAGTAAAACGTGAACAACAAGAAGCGTTTGAAAAAGTAGTAGAAGCAATTCAAGTTGGTGAAGTCACAAATACAAATGAAGTAACAATTCATAATGAAGAAAATGAAGTACTACTTACAGCAAATGTTGATGAAATGAGAAAGGCTTGGAAAGGGGCAATCCCATGCTTGCTGAAATAAAGGGGTTAAATGAAGAATGTGGCATCTTCGGAATTTGGGGGCATGAAAATGCAGCACAAGTTACGTACTACGGATTGCATAGTTTACAGCACCGTGGGCAAGAAGGTGCAGGTATTGTGGTGAATAATGGGGAGAAAATTATTGGTCATAAGGGGTTAGGTTTAGTATCAGAAGTGTTTTCAAGAGGCGAGTTAGAAGGTTTAAATGGAAAATCAGCCATTGGCCATGTGCGTTATGCAACAGCGGGCGGAAGTGAAGTAGCAAACGTTCAGCCATTACTATTTCGTTTCTCTGATCATAGTATGGCATTAGCTCACAATGGGAATTTAATTAATGCCAAAATGCTTCGCCGTGAATTAGAGGCAGAAGGAAGTATCTTTCAAACAAGTTCAGATACAGAAGTATTGCTGCATTTAATTAAGCGAAATACGAAAGGGTCATTAATCGAGAGTGTAAAGGATGCGTTAAATAAAGTAAAAGGTGCATTTGCATATTTGTTACTAACAAGTCATGAAATGATTGTTGCACTAGACCCAAATGGGTTTCGCCCGCTTTCGATTGGGAAAATGGGGGATGCCTATGTTGTAGCATCTGAAACATGTGCTTTCGATGTAGTTGGTGCGACATATATTCGTGATGTTGAACCTGGAGAACTTCTTATCATAAATGATGAAGGGATTCAAGTAGATCGTTTTACAAATGAAGTAGAGCACGCAATTTGTAGTATGGAATATATTTATTTTGCACGACCAGACTCTAATATTGCCGGCGTCAATGTTCATGCGGCGCGTAAAAATATGGGGAAACGTTTAGCAATGGAAGCACCTATTGCGGCAGATGTTGTAACAGGGGTACCTGATTCTAGCATCTCAGCAGCCATTGGTTATGCAGAAGCAACGGGAATTCCATATGAATTAGGATTAATTAAAAATCGTTATGTCGGACGTACCTTTATTCAACCATCCCAAGAGCTGCGTGAGCAAGGGGTGAAAATGAAGCTTTCTGCAGTACGCGGTGTAGTTGAAGGAAAACGTGTTGTCATGATTGATGACTCAATTGTAAGAGGGACAACCAGTAAGCGGATTGTTCGCATGCTTCGTGAAGCAGGAGCGACAGAAGTGCATGTAAGAATTGCTTCGCCTCCTCTTAAGTATCCATGTTTCTATGGCATTGACATTCAAACGAGAAAAGAATTAATCGCTGCAAATCACTCTGTAGAGGAAATCTGTCAAATCATCGGTGCAGATTCTCTAACATTTTTAAGTGAAGAAGGATTAGTAGATGCAATTGGACGTCCATATGAAGGGAAATACGGCGGGTTATGCATGGCTTATTTTAATGGAGATTATCCGACCGCTCTTTACGATTATGAACAAGAACTTTTAGAAAGTATGAAATAAAAAAGAAAAGAAGCTTCTACTTCTTTCTATGTAGAAGCTAGCTTCTTTCTGAAAACGGTCGCCCTAGATGGGGAGAAATTAAAAGACGAGGTGTGAAAAACAATGGCGAATGCGTATAAGCAAGCAGGAGTAGATATTGAAGCTGGATATGAAGCGGTATCTCGCATGAAAAAACACGTACAAACAACAATGAGAAAAGAAGTGCTAGGCGGTCTAGGTGGTTTTGGGGGTATGTTTGATTTATCAAAATTGCCATTAGAAGAACCTGTATTAGTATCAGGAACAGATGGTGTAGGTACAAAGTTAATGCTTGCTTTCATGGCAGATAAACATGACACAATTGGCATCGATGCAGTAGCAATGTGTGTAAATGATATCGTTGTTCAAGGAGCAGAACCATTATTTTTCCTTGACTATATTGCTTGTGGTAAAGCTGATCCAAGTAAAATTGAGCACATCGTCAAAGGTATAGCGGAAGGTTGTCGGCAAGCTGGATGCTCACTAATTGGAGGGGAAACAGCAGAAATGCCAGGTATGTATTCCAAGGAAGAGTATGATTTAGCAGGATTTACTGTTGGGATTGTTGATAAAAAGAAAATTATAACAGGTCATTCGCTTGATGAGGGGCATGTGTTAATTGGTTTAGCTTCTAGTGGGATTCATAGTAACGGTTATTCCTTAGTTCGCAAAGTATTATTAGAAGACGGACAGATGTCTTTAGACCGTATATATGGACGGTTAGAACTACCTCTTGGTGAAGAGTTATTAAAGCCGACGAAAATTTATGTCAAACCTATTTTAGAACTATTGAAGAAATATGAAGTGTATGGCATGGCACATATTACAGGTGGTGGTTTTATTGAAAATATTCCACGTATGTTACCGAAAGGAATTGGAGCAGAAATTGACCTTGGCTCTTGGAACATTCAACCGATTTTTAGCCTAATTCAAGAGGTTGGAAAGATAGAAGAGAAGGAAATGTTCAATATTTTTAACATGGGTATTGGTATGGTAGTAGCGGTGAAAGAAGAAAATGCAAAAGCGGTTGTTCGTCTTCTTGAAGAACAAGGAGAAAAAGCGTATATCATTGGACGCACTGTAAAAGGATCAGGTGTTGCTTTTAATGGAGGAATAGATCATGAATAGATTGGCAATCTTTGCCTCTGGAAGCGGATCTAACTTTCAAGCATTCGTTAACGCAGTAGAAGAAAATAGATTACATGCTGAAATTAGTTTGCTAGTATGTGATCAACCCGAGGCGCGTGTAATCGGAAGAGCGCATTATCATCATGTTCCATGCTTTGCTTTTTCGGCGAAAGCATATGAATCAAAGGAAGCGTTTGAAAAAGAGATATTAAAAAAATTACGAGAATACGAGATTGATTTTGTTATTTTAGCGGGATATATGCGTCTTATCGGACCGACATTGCTAGAAGCATATGGGGGAAAAATCATTAATATTCATCCATCGTTATTACCGAGCTTTCCAGGAAAAGATGCTATTGGCCAAGCGTTAAAAGCAGGGGTGGGAGTAACTGGAGTAACGATTCACTATGTAGATGCTGGTATGGATACAGGACCGGTTATTGCACAAGAAGCAGTGCAGGTTTCTGAAAATGATACGAGAGATAGTTTGCAAAAGAAAATTCAACAAGTGGAACATCGTTTATATGTAAATACGGTAAATAAAATCATTCAATCTATGAAAGAACGAACTGTGAAATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP024113|328309:336681|328309_329611_+|AWC51332.1|DBSCAN-SWA MISRYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGEIPKEDVKKIRENASFNMDRIYEIEKETRHDVVAFTRAVSETPALGEERKWIHYGLTSTDVVDTALSYILKQANEILLKDLENFIEILANKAKEHKYTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGLWYEEMKRNLERFKQAANTVRVGKLSGAVGTYANINPFVEKYVCENLGLEAAPISTQTLQRDRHAHYMSTLALIATSIEKMAVEIRGLQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGMARVIRGYMLTAYENVPLWHERDISHSSAERVILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMQRTYGLIYSQRVMLTLIDKGMVREEAYDIVQPKAMEAWETQVQFKDLVEADERITSKLTQEEINECFNYEYHLQHVDTIFERLGLN >CP024113|328309:336681|331335_333555_+|AWC51336.1|DBSCAN-SWA MSLMLEPNPTQIKEERIYAEMGLTDEEFAMIEKILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTTGERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELQSPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEVQFDPCYEGNPLVNAMCVGLIHHEDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSESSEAKRPAVQVGDPFMEKLLIEACLELIQSDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMYLDDVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLIVVKKGREQEVVELFEKYGLAAVAMGKVTEDKMLRLFHKGEMVAEVPADALAEEAPIYHKPSKEAAYFREFQEMKMKTPKVDNYKETLLALLQQPTIASKEWVYDQYDYQVRTSTVVTPGSDAAVVRVRGTEKALAITTDCNSRYIYLDPETGGKIAVAEAARNIVCSGGEPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSVDGMSEACRTLQTPVIGGNVSMYNERSGEAVYPTPTVGMVGLVHDLKHVTTQEFKQAGDLIYVMGETKAEFGGSELQKMMYGKIFGQSPSIDLEVEAKRQKQLLEAIQAGLVQSAHDVAEGGLAVAIAESAIGAKGLGATVKLAGEATAALFAESQSRFVVTVKREQQEAFEKVVEAIQVGEVTNTNEVTIHNEENEVLLTANVDEMRKAWKGAIPCLLK >CP024113|328309:336681|336093_336681_+|AWC51339.1|DBSCAN-SWA MNRLAIFASGSGSNFQAFVNAVEENRLHAEISLLVCDQPEARVIGRAHYHHVPCFAFSAKAYESKEAFEKEILKKLREYEIDFVILAGYMRLIGPTLLEAYGGKIINIHPSLLPSFPGKDAIGQALKAGVGVTGVTIHYVDAGMDTGPVIAQEAVQVSENDTRDSLQKKIQQVEHRLYVNTVNKIIQSMKERTVK >CP024113|328309:336681|330668_331352_+|AWC51335.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMFHAIKDELGEDVDYVWHDAENLDEYDAILLPGGFSYGDYLRCGAISRFANAMKAVQKVAEQGKPILGVCNGFQILVESGLLPGVLIRNQNLKFMCRTVPLRVENNETMFTSQYNKGEIIHIPIAHGEGNYYCDEATLKKLEQKNQIVFRYVDNPNGSVSDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVNEILGGAEGLKVFQSILKYWRETYVVNA >CP024113|328309:336681|335057_336101_+|AWC51338.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVSRMKKHVQTTMRKEVLGGLGGFGGMFDLSKLPLEEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMADKHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYIACGKADPSKIEHIVKGIAEGCRQAGCSLIGGETAEMPGMYSKEEYDLAGFTVGIVDKKKIITGHSLDEGHVLIGLASSGIHSNGYSLVRKVLLEDGQMSLDRIYGRLELPLGEELLKPTKIYVKPILELLKKYEVYGMAHITGGGFIENIPRMLPKGIGAEIDLGSWNIQPIFSLIQEVGKIEEKEMFNIFNMGIGMVVAVKEENAKAVVRLLEEQGEKAYIIGRTVKGSGVAFNGGIDHE >CP024113|328309:336681|330417_330672_+|AWC51334.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGTAVKGALHSLSFTEVQDVRIGKYMELTIDKSVTDLDRKVKEMCEKLLANVVMEDFRYEIEEVVAQ >CP024113|328309:336681|329705_330425_+|AWC51333.1|DBSCAN-SWA MQKLELLYEGKAKRIYRTEAADMVWIEYKDSATAFNGEKKATITGKGRLNNEITTFLFRKLQEVGIETHFVKKLSDTEQLVKKVSIIPLEVVTRNVIAGSLSKRLGMEEGIPLAKPIVEFYYKDDDLGDPLVTEDHIRVLNVATLEQISTLREKALRINQVLIEHFASCRVRLIDFKLEFGITEEGKIVLADEISPDTCRLWDEESNEKFDKDVFRRDLGNLTEAYEEILKRLGGASHV >CP024113|328309:336681|333539_334955_+|AWC51337.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGIFGIWGHENAAQVTYYGLHSLQHRGQEGAGIVVNNGEKIIGHKGLGLVSEVFSRGELEGLNGKSAIGHVRYATAGGSEVANVQPLLFRFSDHSMALAHNGNLINAKMLRRELEAEGSIFQTSSDTEVLLHLIKRNTKGSLIESVKDALNKVKGAFAYLLLTSHEMIVALDPNGFRPLSIGKMGDAYVVASETCAFDVVGATYIRDVEPGELLIINDEGIQVDRFTNEVEHAICSMEYIYFARPDSNIAGVNVHAARKNMGKRLAMEAPIAADVVTGVPDSSISAAIGYAEATGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVRMLREAGATEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHSVEEICQIIGADSLTFLSEEGLVDAIGRPYEGKYGGLCMAYFNGDYPTALYDYEQELLESMK |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
758225 : 796414
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP024113|758225:796414|DBSCAN-SWA 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39 | Thermus_phage(20.0%) | coat,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2345385 : 2413361
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP024113|2345385:2413361|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_phage(36.84%) | tail,holin,integrase,bacteriocin,transposase | attL 2340551:2340567|attR 2374361:2374377 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2421703 : 2434814
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP024113|2421703:2434814|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP024113|2421703:2434814|2423406_2423880_-|AWC53157.1|DBSCAN-SWA MSDKKRRLETQLTREQITAATLLSINKFLPKASTIDDPEELARAKENGQVRLNLEEIAEKSNISVRQLYTWRHRDSNFIEYVNLLSSDAFMSHLPDVMQKHLDMMLKGQGSMKGIELFYKFGGLLVDKQEVKTESADSGLTMEERLARLKERTGGGQ >CP024113|2421703:2434814|2432194_2433241_-|AWC53170.1|DBSCAN-SWA MVTKTNAAQLLRQNTQETFAYEIAEEFRQFLETWHSYSEPYDTSLDIWLHESYAKVLSKGTFLDYRSLPYFSPSSANSCPRELYEKALRSPRDQTEVKPWQRRWQFLGTSVGDAIQRDILLAERHYEKFTGEKPRFKFERTKDGYPAFEDFVKTRKVIEHNNQQFALIGTCDGILEYIDEHGVITRVGLEIKSKQTTYSKTSEYSLREPGADHVKQVTCYSLMYDLDYYIVLYMNASKKAWNMSEEDYMKYPDFRAFGVAITDDMRDEVLNKFASVVAAVKTKQPPKLDIEHWTFNNFKTACAQSLSDGEYEEIKTQVSRVKRSSLSDAKKAPYIGALEFIAKVREGM >CP024113|2421703:2434814|2426746_2427124_-|AWC53160.1|DBSCAN-SWA MGVSKYDNEAAHRRIEQNYALDNPKSIDLLLRHLPYMQERRFNGDYAASDILIDLETAISTADLTDRQRQVLRLVYWDDLTQEMVGERLGVRQEAVKRHIRIAVVKISRVFECWARRGEGYKLTV >CP024113|2421703:2434814|2428158_2428392_-|AWC53162.1|DBSCAN-SWA MTNVIVYTKNACPTCKQVLWSLNAANVPYKTRNIDEDPSHAAWMADKGYMSAPVTVFPSGKEVVGFDMGEFAVELGL >CP024113|2421703:2434814|2421703_2423407_-|AWC53156.1|DBSCAN-SWA MAWLDGKWLARQERQQAINDRLLLRKEYEKLASKGDLLEHDVTQWEALEDELEKLQRVHACEHDVLRFTYEYFSDELNPDNESNLIPAGQTLETAADFHRTLCSLLNDITEGKTKSNVGWSVGRRHAKTAYLSNSYLCHQVVYRLQKYIVEVSETTDVAGDFIKWTVNQLKFNEKLREDFGGILHPKPSMNEVDNKYEFITSTGTKVEAKGIGTQMRGLRHLSERPGLFILDDLESGENTNTPELRAKNLHWFRSEMIEALGFGGICVYMGTIVHYDSLLNHVLTKRKDFISRKFPAVLSWSEREDLWEEWRKLYNADEKDAVDQADAFYEANKDEMLRGTQVLWPQAYDYKYFMEKRESMGARAFNQEYLGNPVDEESQVFKPEYFTYWTDKDIENKQLEYFCGIDFAMGKEKGDYSVILTVGRSPNGIFYVVDTFIERVHPDILLKKAVEKSLQYQYSGIAVEAQQAQEWFADKLSQALQQAGYPSATRMKQIKQRTRKALRIESLLPDIQSGRIRFKKEQRLLLEMLEMYPNHNHDDGPDALHMAVSTGSNSHTVVRTIRKRMR >CP024113|2421703:2434814|2424948_2425773_-|AWC53158.1|DBSCAN-SWA MSTLRIIDVTTGEDRTQEYSLVNRKQAEGYKRAIEKEQYRLLTRGKNWVASYHDPIREVITGLTLKEAGAIIKLLPFLRFKSDGKLIKDGKPLKQQDIQRIFKRGKAATTKILNRLEELSVIHVIKEGRSNVYYISANFHTMGDVKDGESFTKLYQVKTQEIVADLDLNEVGLLYKILPFFHFQTYYLCSNPNEQDAKEIKHLNREELAEVTGHDLATISVTVNKLRSKGVIMTTNSRNSVRYLVHPDVMYRKDTEDEYTEVVRRMFAEHIAQI >CP024113|2421703:2434814|2434310_2434814_-|AWC53172.1|DBSCAN-SWA MRSLDRYVPKRNGQKQFFRGKIISTYINNSGYECVDLARGGKKVKNTVHRLVAKHFCKGYREKLDVNHIDADRLNNKAENLEWMSRIENIRDCIKRGTHNVDSAHKIAREKNQKPVAMLDLDGNVLRTFPSIKEAREQTGAIKIGEVCNGNRRMAGGYKWRFISKAG >CP024113|2421703:2434814|2431446_2431974_-|AWC53168.1|DBSCAN-SWA MTNRKKTFRVLSVDTSLGSPGIAVIDVINGKPKLIDVSHVKTKSTEPIALRTKTIEAWAHLFIRKHAPYDLIVREGFASKIPHTNYTVFSAWNAVDRALNDFGLKVDDSIGQASVKKKLLGKGRAEKEEVEAGVRRYVEWGVFKTSDESDACAIGLAYLIDKGIVMKVNPKEETE >CP024113|2421703:2434814|2431970_2432195_-|AWC53169.1|DBSCAN-SWA MKTVNVTYFKRSGKYYTSETIEISEELNGYEALAEEIPKHHRIKEMVMLVQDSEDGKEPYIVPHLYNPKVGSFE >CP024113|2421703:2434814|2426168_2426735_-|AWC53159.1|DBSCAN-SWA MNSMSNSIINELYTCLKNDIPYRLIGADYDLRNRLERATVVDILSNYYTMDERSLKRLSDFLVNEELTDSHPDKMSREEYPFMSDTQLSRRVAGIHRKRDGKGILEVQIGLAENYGTDGRNYNRPLRRKRTFKENMYVDEQVLSRNKERRKKYSSFINGKTNGVYTVDLETGDKTVHDDKKYEEIYQK >CP024113|2421703:2434814|2430457_2430766_-|AWC53166.1|DBSCAN-SWA MKPVKAQCETCNHVFIARFHKLRLPNRVDKHFFICPNCKEEYVSYYSNRKMRQLQREISEMYGKFRKCRTEEEAELLNMKLQKKQAEYRRVRDELKTEVEGE >CP024113|2421703:2434814|2429682_2430315_-|AWC53165.1|DBSCAN-SWA MAEIVKIESKDGNIYEVDGKRYRELTKEPAIGDTVLVVDAWEDGEGYEEGEVHTLTKILSRNHEDVNAVRFVDKEGRNNYLKLSEFVIVEPIESETPSHLPYLSDILDDIKTKLTRLEERTEENHRNILTFSQTAESARSDASKAIGGVNALDEQLDLVREDIVFLDEKIDELKETTQTQGTPQNITININVLDIGSAKAIVESFTKGRE >CP024113|2421703:2434814|2429054_2429681_-|AWC53164.1|DBSCAN-SWA MLCNAKKIAITGKARSGKTELSHYAWMLYGFKEFDFSTVLKDEFHRLFPHIPRDPKPRAYYQKFGQWLREIDPDIWVKMTMDNVHKYCFEDSLNKVNHKPKVLVNGVRQPNEYQWLREEGFIIIRVNASDDLRIDRTHSAGDIFTESDLKHETESHIDTFKVDYEINNLGSIGEMYDQFDAIMRNIGVQSVSNKEIMADAFSDLRVIL >CP024113|2421703:2434814|2428388_2428994_-|AWC53163.1|DBSCAN-SWA MTAIECVGKSDRGAFLWKFKCDCGNEVVKEGRTVKRGDIKSCGCLVVEHAKYLNYSNGFGRTKLYGVYKGILDRCNNPENKSFKDYGGRGIKVIEEWEADYLVFMEWALANGYKDGLSIDRIDVNKGYSPENCRWATRDVQANNKRNTILINYKGKTQSLKRWCKELNLNYYTIHSRITRNNYSYIDALEKPIKYRKEETK >CP024113|2421703:2434814|2427508_2428147_-|AWC53161.1|DBSCAN-SWA MKRYYLPEMDVFNRYEPKVRNKLIKGYHRKLASKHRYFVRYQVSKERPFYTDADLSEIISVLDDIEIINCRWDAKEWNITPWNYFVNSGKVYEGYKDMNAIPFAQGYSGDDVGKRTDDGFYYKYFNGNNCAYWRDRNSETPTWHLRYGNQYVNLRNDNFYVGIFGSTKETKHVPAELVLPLLKQMNAKKWRGFYDDEIDFILEQTGIERRLL >CP024113|2421703:2434814|2430765_2431161_-|AWC53167.1|DBSCAN-SWA MSDKLNELFELQSELDNRIISERNINKSIDEWVVGITLAMESEIDEIRREVNWKWWKNEKEIDKEALQGEVIDMWHFLISLSLKCGLSSEDVYRIYLEKNRENHARQDGTSSKEGYAVGQLEFDFENGGVK >CP024113|2421703:2434814|2433254_2433410_-|AWC53171.1|DBSCAN-SWA MINLSEVSTKELSEELERREGVMTVKVEPYEKIEVGGIVVNGPAIVLINQD |
17 | Bacillus_phage(41.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2440421 : 2451218
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP024113|2440421:2451218|DBSCAN-SWA GTTAAGCACAAACAACCCTAGAATCGCTACTAAACCCACAGAAACTCCTAACAAAATCTTCTTCAAACTGAATTCCTCCCTTTTCATTTTCAATATTTACTTTAAAGTCTATAAGTGACTTGGTCAATCCAGAACGATCTCCTCGTTCGTAGATTTCCCTAGCAACCAGACTAGAGAAAAAGAAGTTTGAGTTAGAAAAGAAGTGTTGAAAACATTCATAAAGTTCTGAGAACGAATTATAGGAGCGAGCTTTGTATAAGAGTAAAAAGTCTTTTTCTCCCCTTTCTTCTATAATACTATCTATTAATTGTCCTTTTGTATTATCCTTTTGATATTCAATAAGTCTTGTGTCTGATTTCGCTCCTAATGGTATTCCCAAATAAATTTTAACACAATCTAATCTATCTCTTGCTTGTACCTTGAACCTCTCTACTCCAATCGTCTTGGCAATGACGTAACTATTATGAAGATATTTTAGACATCTTTCGTTGTCTTCATTCAAATACGTCATCCCTACATAGTATGACGCATCTGCAACGGTTTTCGCGCAAATATTGGCATTGATTATTAAAGAAGCACATTTTCTTGCTAAATGTAATTGATTACGATGTAAAAAAATGGGAGCGAGAATTTCAGCCAACCTATGTAAAAAACACTCCTTAATAAATAATTTCCTACTATCACTTAAATCTTCTATCATGGAGGATGCCTCCCGTGCTACCTCTAACATGATATGAATTTTTTTCTGAGCAAAATAATTATAACATTTAATAATGTTTACAAGGATATTTAATGTACTATCTTCCACACGACCGATCTTATTTAGACTCTTGATTAAATCAACTCCTTTTATTTTTCCCTGCATGTAGCTATAAATAATGCTATAAACGTTTATATAATCTTTAATTACTCCGTCGCTTTTTCTGTGTATTTGAATTAATTGTCTTAGTAGCTTTACGTTTCGAGTTATCGCAGCGTACTCTAAACTCTGCTGTATTGATTCAGCAGAATCTAGTTGTAAGCACCATTTCTCCATCTTCTCACGTTGTTCGTCTGGAAACAGATAATAGGAGAGTCTCAAGAGTTTTCTAAACCCTATAGTCCCATCCTTTTTAAATTTAGACATACACTGCTTAGATACTCCTATTTTTTCTGCTACACTTGAAAATGTTATATCATCTCTATCATTGATAGTATCGCATATCTCTCTATGAAACCCTAACACTTGAAAACCCTCCTATGCTGTATAAGAAAATTTTGGTATAATGTAATTATAACCCAAATGTGCACAAAAGTACACATTTGAATATTGAGAAATATTTTTCAAGGATGTGTTAAAATGATTGACTACACCCCTCTCCATGTCACACTAAAAGAAAAAGACATGGTGATAAGCGATTTAAGAGATAAAGTATTACATAGTAAAACAATTGCTAGAATTAACAGAGGAATGTCCGTACACTTAAGTACCGTAGAAGCTATTTGTTTACACCTTGATGTACCTATTGAAAAAGTAGTTAAAATTGCTGCCACTGAAGAGTAATAGTTTTAAACCTCCGATTTAAGAAAGGAGGTGATTACATCGTTAAAAGTCGGAAGGTGCCGTATTCCCGAACTATGTAAAAAGAACGGCATTACACAAGCTGAACTCGCTCTAAAAGTCGGTATTACACCGCAATCCATAACGGATTATGTCAGCCTGCGTAATTTGCCTAACGTAGAAAGAGCGCGTAATATTGCCGCTAAGCTACATTGTGACATCGAAGAATTGTACGAATGGGAAACGGAATAACATCTATTTACCGGGAAGGTTTCGTATCTTCCCTCCGACCGAAAATACGTGAATTCACGTATGATAATTTTAATCGAACTGGCTCCGCATTATCAACTACAGATATCAACGAATCCTTTCCTTCTTTTAGTAACGAGTCATTCGCATCCTTAAATTCACAAACATATCCATTTGTCAAGCGCATTTTGCCATTTAAATATTTCTCAAGTTCTTTTCGAAGTTTCTCGCCTGCTGGATCGTTATCCGCTACGATAACTAATTCTTCTATCGGCGACTTCAATATTTGCTCTGCCTTTCGTTGGTTAAACGACGAGGATCCGTTTGCCAGTCCGAAAACCCCAGCCGTCATAAATGACATCGCATCTATTTCCGCCTCACAATATACTGCCCGCTTAATATTTCGTTTATAAGCGAGATGTAATCCGTATATCAAATCTCCAATTGGCTTTCCGTCCTTTTCGTACCAGAATGCTTTGCCGCGCGTTTTCCGATACTTAATATTCGCCAATCTACCGTTTGTATCAAACCACGGAATTACCACCGCCTGCCTAAAGCGGTCGTAACCGATCTTCATTTGCCGTTGTACTTCCTCACTAATACCTCGCTGTCCTAAATACGGGTGGCGATAAGCGTATTCTTGCAACCGACCAAAATCGAGGGCCTTATGGCCGCTTTCAATCCGGAGTTTCGGCGGCTTAAGTACGAGGTTGTCGTAGGTGTAACATGTACCATATGATTCTAACAGGTATGCTTCCGTCTCTTCATAGGTCTCATTTCGCAAGTAAGATAACAATCTGGTAAAGTTGCCGCTTTCCCATTCGCTATCAAATGCACCCGAGTCTTTCCACGTACCAGCGTAATCCCCGTCTAAGTTAACGAAAAAGCTCGGCGTGTGTTCATATCGAAATGGCGAGGCTGCAATTAGTTTATCAGAAGTCCATCTTTCGTTAGTCCAAGAAAACTGCCGAAGTTCATACTCGATGTCTACATTTACGTCCTGCCCACGTATTTGAATACTTGACAAGGTGACCCACCTACCGTTCTTTTAAATTAAAACACGCTCGTAAATTGTTTCGCTGCTTCCTCTCCTGTTTCCATTTCCTTAATCACGCCAATCTGCGGCATGTAAATGATTTCGGCGCTTTCGCCTTCACCACCGTCACGACCTTTATTAATACCGATTATACCTCGTCCTTGTTTTGCATCAGTATCAACCGCAATCAATAACGCCGCATCCTCTAAGAGTGCTTTCGTTTTCTTTACTTCGCTACGTTTCGGTAAGCGTAATTCTCTTTGGCCATCCTCGTCCTCGCTGTTATCGACTTCGTCTGCTTGTGTAATAGCGAACATAACCACTCCTGTTTTACCGGCTAATCGACGTAAAGCCTTCGATGTAGCCGCTGCGTCCCCGCCTGCTGTCTTTGACGTGTTCTTTTCGTAATCTAAATAATAGAACGGGTCCACAATTACGACATCTGCATTTGTCTCACTTATATCTACTTCTAACTGTCGTAAATCCCTTCGATGAAAGTCGTAATCATCTACGCCTCGGACAACAATATTACCTGGTAGAATTTCATTGATATTCGCTAGGAACATTTTAAACCCTTGTTCAAATTCTTCTGATAGTTTACCATGACGGATTTCCTTCGAATCAAAACCAGCTTCTAAATTTATACCGTCTAGTTCGGCTACAGTCGCTCCAATACGTGATGAGATTGAAGTGTATAAGCGTACCATCCCTTCGAACCATCCCATTTCCATTAGCCAGATAAGCACGTTTGCACCTTGAAACGCCATTTCTACGCCCTCTTCGATAGTCGTTGCGGATTTACCACGCCCTGACTTTCCATAGATTGTGTATACGTTCGAGCTTACGTAACCGCCAATCGCCTTATTGATGAATGAAAATCGAGACTTCCAAATGCGATAAGACTCGCCCTTTTTACGACGTTCGTATTCTTCTAGGAATTTAGACGTATCTGCCTTCAAACTTGTTCCCACTTTATCACGAACGTCTGTTCTTATTATAACGCTGTCAACTCTATCTCGCAACCATTCTAGGAAAGAATTTCCGTCTAGTTGCTCAAATTGTTCAGGCGCTTCGTTTTGTAAGAATTCCATCGCTTCGACCTTTGCCGAATAAGACTTGATTTGTTTCGTTAAATACTCGAAACTATCCTCGACATTTGGTACGTAAGTGAATCCGTCGACTTCTGCTACTAGCGTACGGAAGTCGGGGACACGCCCGCGATTAGTTTCTACGTAATCTTTAATAAAACGATACGCCTTACGTTCAGCTTCCGTAACAAAATCTCGCTCTGTTACATGATTCAATTGTATCGGATTAGCCGTATCTATTACTTTCGATAAGAGCATTTCTCCGTAGTTCATTAACTACACCTCCAATTTACCATCTATATAAATATTGTGTAAGGCAACAAATGTACTAATTTTAGCGAACAAACCGAACGTAGTTTTGCAGTTTGATTACAGGAGTGTTCGAACCGCTCGCATTCTCTCCGCCATCTTTCGTTTCTGATCCTCGCTATACTGACGTAATCGCTTCATACTTACCTGCTTTTCACCTAACGTGCAACGCACTGCTAGCGGTTTTCCATCGTCGTCACTTTCGATAACTGTAACGTTTTCTTCACCAATTATCCCTACTAACTTACGAATGTGTTTTGGAACGCAAGAGTATGCGTTCCATTCCTTCGTTTCGTTGTCGAAAGTCAATACGGTTTCTTGTTCTTTTGTTGAGTATAAACTCATTGATTAGCCTCCTCCGTTTCTATTAAAATAGCGTTTTTGTTATAAACCATTGTATATGGTAAAATATAGTGACAACATGTTTTAAGGAGGTTTTAATATGCCACACGAAGTTTGGTTTCCTATACTCCTAGCAATATTCGTCGTATTTTTCCTTAATAAAGAGGAAAAACACAAACAATAACTTTATTTGTTCCAGCTTAAATGTATGTACGCAATATTTAAGCTGGTATTCTTTCAAATAAGGATTTTATTTTGTTTGGTTTTTCAGTAACTCTGGGTTTTCGTAGATGTTTCCAATGACTATAAACTCATAAATTTCACCGTATACACACTTTTGATAACCTTCCCCAATTTCAAAAGGTAACCATCCGAAGTTGCCCCATTTAACAACATGCTCAGCAAGTGATTCTTCTTGGAAATGAATACCTCCGTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP024113|2440421:2451218|2446267_2446456_-|AWC53185.1|DBSCAN-SWA MKKHELTCMMEEEDTIEFITNEKKKLINVFMKVNSSEDYTHVVINAREFLMMTDEIRKELEI >CP024113|2440421:2451218|2442219_2443236_-|AWC53179.1|DBSCAN-SWA MSSIQIRGQDVNVDIEYELRQFSWTNERWTSDKLIAASPFRYEHTPSFFVNLDGDYAGTWKDSGAFDSEWESGNFTRLLSYLRNETYEETEAYLLESYGTCYTYDNLVLKPPKLRIESGHKALDFGRLQEYAYRHPYLGQRGISEEVQRQMKIGYDRFRQAVVIPWFDTNGRLANIKYRKTRGKAFWYEKDGKPIGDLIYGLHLAYKRNIKRAVYCEAEIDAMSFMTAGVFGLANGSSSFNQRKAEQILKSPIEELVIVADNDPAGEKLRKELEKYLNGKMRLTNGYVCEFKDANDSLLKEGKDSLISVVDNAEPVRLKLSYVNSRIFGRREDTKPSR >CP024113|2440421:2451218|2449698_2450313_-|AWC53191.1|DBSCAN-SWA MFKYEKNAEGQGVLTLLSEEFEQKIMPLVYQQTTNELSTQVEGGHLDDDLTEFAKHISRQTTHAVIGSMQELIIKPLVEELSFKIDQLSYTQKQQPKKRKTQPVQGEPKLTLNMSGMKVDNSKIPHEDQREKIDILHKDMCHSLKLLHPYAWTEVYNRMFLDYNINAKEILLQSKEKTRVWAVIKAGYGHKMIEAMENILRERR >CP024113|2440421:2451218|2441759_2441963_+|AWC53178.1|DBSCAN-SWA MIDYTPLHVTLKEKDMVISDLRDKVLHSKTIARINRGMSVHLSTVEAICLHLDVPIEKVVKIAATEE >CP024113|2440421:2451218|2448273_2448660_-|AWC54973.1|DBSCAN-SWA MKRVSTKDFRNLPIEKWNVTTFREYLKHEHEERYKIPYVTRSYAMEGRMLKTFIAEYKPEATKQFIDACFADYKPTREYPGLNFAFMYSYMRGRILPRVLDELRREEAKLQRQTEVMEVSTEEIIDYL >CP024113|2440421:2451218|2448984_2449143_-|AWC53189.1|DBSCAN-SWA MQLHDLLLKEIYIEALIRRNVFKTEDGRDLWQASNEELHAQLFDEEGQNDFT >CP024113|2440421:2451218|2443262_2444606_-|AWC53180.1|DBSCAN-SWA MNYGEMLLSKVIDTANPIQLNHVTERDFVTEAERKAYRFIKDYVETNRGRVPDFRTLVAEVDGFTYVPNVEDSFEYLTKQIKSYSAKVEAMEFLQNEAPEQFEQLDGNSFLEWLRDRVDSVIIRTDVRDKVGTSLKADTSKFLEEYERRKKGESYRIWKSRFSFINKAIGGYVSSNVYTIYGKSGRGKSATTIEEGVEMAFQGANVLIWLMEMGWFEGMVRLYTSISSRIGATVAELDGINLEAGFDSKEIRHGKLSEEFEQGFKMFLANINEILPGNIVVRGVDDYDFHRRDLRQLEVDISETNADVVIVDPFYYLDYEKNTSKTAGGDAAATSKALRRLAGKTGVVMFAITQADEVDNSEDEDGQRELRLPKRSEVKKTKALLEDAALLIAVDTDAKQGRGIIGINKGRDGGEGESAEIIYMPQIGVIKEMETGEEAAKQFTSVF >CP024113|2440421:2451218|2449224_2449569_-|AWC53190.1|DBSCAN-SWA MRNVKKRLQRILSELESLESDMQQTNIRKSQTDLAQQDILHTIEIETFTTARGNYLLKELKRIRKERRKAKDDQAVLQSVMHTLKGVKQKVECSIGSVTGVIERQQERKVTKGY >CP024113|2440421:2451218|2445671_2445923_-|AWC53183.1|DBSCAN-SWA MGLFKERLKELCLMIIAFVILCVIGLIFVSPLFILDSIHEGWGGLVYMVVILSIVAISVIYNACKFIYWLLIEPFKNMRNQTK >CP024113|2440421:2451218|2442026_2442212_+|AWC54972.1|DBSCAN-SWA MPELCKKNGITQAELALKVGITPQSITDYVSLRNLPNVERARNIAAKLHCDIEELYEWETE >CP024113|2440421:2451218|2447583_2448258_-|AWC53187.1|DBSCAN-SWA MARSKFTFEEVKALFDSKGYDLLETDYINARTPMRCKCRQHPESIIQITAGNMRKGFGGCRQCKRQQHKYRTRTIEEVRKEFAERGYTLLETVYKNNRTKMRYTCPYHPNEKPSIAYMHFKRGVGCPSCGREKTLLARRNEFPKCTYNNIEKEEARSKVLRILNNHCFDCPFNELIRMGAVEDKCYKQCPYGMELRKGGAVLAGEDIKAVTEYYEDKFAGEALV >CP024113|2440421:2451218|2440421_2441645_-|AWC53177.1|DBSCAN-SWA MLGFHREICDTINDRDDITFSSVAEKIGVSKQCMSKFKKDGTIGFRKLLRLSYYLFPDEQREKMEKWCLQLDSAESIQQSLEYAAITRNVKLLRQLIQIHRKSDGVIKDYINVYSIIYSYMQGKIKGVDLIKSLNKIGRVEDSTLNILVNIIKCYNYFAQKKIHIMLEVAREASSMIEDLSDSRKLFIKECFLHRLAEILAPIFLHRNQLHLARKCASLIINANICAKTVADASYYVGMTYLNEDNERCLKYLHNSYVIAKTIGVERFKVQARDRLDCVKIYLGIPLGAKSDTRLIEYQKDNTKGQLIDSIIEERGEKDFLLLYKARSYNSFSELYECFQHFFSNSNFFFSSLVAREIYERGDRSGLTKSLIDFKVNIENEKGGIQFEEDFVRSFCGFSSDSRVVCA >CP024113|2440421:2451218|2448665_2448998_-|AWC53188.1|DBSCAN-SWA MILRKFPVVGRYRNYEIEIEEVTFINTFYQVRIYLPLTRNILGLTFRRRRMLYGVKYAKVERAGEFVEIAKESVNKYESFLDKQIRVETLHETGIDDFKHWDGLVEEATK >CP024113|2440421:2451218|2445969_2446221_-|AWC53184.1|DBSCAN-SWA MVNLTPFMYAPHYAPDKPYLVYSVNCDRPETTSGYMQGYWECTHCGEGSQFRFYDDTYHPKYIAKCPKCNKEFIAIDDTDYDD >CP024113|2440421:2451218|2445234_2445651_-|AWC53182.1|DBSCAN-SWA MREIKFDAIYKPTGEHFTPVNINFESKTTHGNFDGQVNDWCHFSLDGKYGDAILRQYTGLKDKNGKEIYEGDIVSRHDGGIHFQEESLAEHVVKWGNFGWLPFEIGEGYQKCVYGEIYEFIVIGNIYENPELLKNQTK >CP024113|2440421:2451218|2446819_2447584_-|AWC53186.1|DBSCAN-SWA MQCILSDHCSLYKSESCNRQCPSYIALHGFNGKGGRMAATNLPKEYRHLTLLNSPVKDTQPKVYKSIEAYVTTFSRQFEADEATDVKDKIKSMYLFSEETGTGKTTTAAVILNEWLIRHYIGSLQRNRQSLQVPGYFLDVNEWQTLFNEFNRSNIPRETAEKSAKEYYRRMTNAKTAPFAILDDIGVRSATEAFRGDLHAVINHRITNGLPTVYTSNIPIDELESVFDRRLYDRVRDLCVVLPFEGDSKRGMRR >CP024113|2440421:2451218|2444702_2444987_-|AWC53181.1|DBSCAN-SWA MSLYSTKEQETVLTFDNETKEWNAYSCVPKHIRKLVGIIGEENVTVIESDDDGKPLAVRCTLGEKQVSMKRLRQYSEDQKRKMAERMRAVRTLL >CP024113|2440421:2451218|2450324_2451218_-|AWC53192.1|DBSCAN-SWA MSSSLIELSNDINVITAEINAYQRVAGEAIFEIGRRLHEVKYNPEKYGLPKGIDVEGRAIVARGAWGRWLTSVNIHERKAQRFIKVFKRFELTDTGVGLPDSLSVLEVLTDFDDEELEKPREMPDGSTKKLTEMSRREIEEFKRRERRVIEEKEAAVRAAEEAERRAEQAEEDKRKLGQLLTEERNKTPEVQYVKDTESEEQLRLYRERYGEISENVYRITNETEISGMVMEFSEHTRDFIKQYAFLKHYEGEFHALNRRSKAEYESTLNALRDFLNDVQRVVEYSKTNEQVIIDIK |
18 | uncultured_Caudovirales_phage(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2612907 : 2628388
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP024113|2612907:2628388|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP024113|2612907:2628388|2616622_2616823_-|AWC53341.1|DBSCAN-SWA MKCQHKWIDMEDGTNDKFCVKCSQKAKQMQITLPISLPISINADEWEAEFYRKRGIGIDSIRNSKK >CP024113|2612907:2628388|2615359_2615557_-|AWC53337.1|DBSCAN-SWA MNRMSNSSNYLIIVMSLFYSIYLRDIIQEGALKTTLDILLILVLIFCIVDTVLRLYRFFKNRRGE >CP024113|2612907:2628388|2617374_2617602_-|AWC53344.1|DBSCAN-SWA MSSGCILGECPICDELIFEDEIDFDQYNNMVHRRCLNLRNNNSKTIHLLHQEIQRLEKRIKELEEQNKSGQMTLF >CP024113|2612907:2628388|2626334_2626754_+|AWC53359.1|DBSCAN-SWA MGITEIIKQLCQKRGISISKLEEELGFGQNTIYQWKKRTPSVERVQKVADYFNVSTDYLLGRTKNKYWELTEKDEKDIQKKLEELIEDMGNADALAFSKGSEPMSEETKQLLIISLENALRLGKQMAKKKFTPKKYRDE >CP024113|2612907:2628388|2619710_2619899_-|AWC53348.1|DBSCAN-SWA MRDQLEKLIEELKLSQSLLGSRSLNLLDDGDLEKYGYYNGQRVVCERMQKKLEQILEGEENE >CP024113|2612907:2628388|2626768_2627194_+|AWC53360.1|DBSCAN-SWA MVSKQQINLKIDELLRRYNTRDPFFIAEAKGIVVITENLGDIFGYYHKVSRIPFIHINERLSYQNQVFTCFHELGHAIFHPDENTPKLSLVSLCSEIRIEAEANYFATRFLIDGSHHDYYIQTKQQLLQYYGIPKEMERFI 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MQNYLVINKTTFATSVYECETQEEVKEIVSQLIEKGAHPAAIRVTQEIPVDITVKVDVEF >CP024113|2612907:2628388|2618312_2618516_-|AWC53346.1|DBSCAN-SWA MSEFQGKKIKIISSDSKQNWYNDKIGETFIVNSLCSRNKDNLIVRTKIEQSGWKYGWVSKKDCVFVN >CP024113|2612907:2628388|2623955_2624195_-|AWC53354.1|DBSCAN-SWA MAKTEEMLLVEKMNQAVNNQWKAMLNNDRQGFKYFAKEHLCLSKKLEVLELEKELTEDLNNYLNEKEKTPVAAGVQNQK >CP024113|2612907:2628388|2616854_2617061_-|AWC53342.1|DBSCAN-SWA MKKDIKKLIELIWSDATDDEVVNEVISFLQSEDVNNGYKVDLLATLAERANHNYYVDKMREFDERNSQ >CP024113|2612907:2628388|2617642_2618281_-|AWC53345.1|DBSCAN-SWA MTKVTVELTTKQEEFLKLFAEKQYDDAEDNVCTSDPIHVVQKRRKQYIPYSLDLEGYFDNSTLEFCTDSDRELWHDNEVEAVESFYEWKDEECPIEVRSFENLQYEDVESVNGKMVFVSDIYDYFKVYGIEDELALAWVETEWENEAFFFILDEAKRYQKYQAHNLGRSRIYTYSAGYDNRGDFVHFRNLLMKIGQELNKQSQEETEVVAVK >CP024113|2612907:2628388|2627230_2628388_+|AWC53361.1|integrase|DBSCAN-SWA MASFHKYKKKGSNKDFWEYRIRYKDSITQKYKEKCKKGFTSKAEAKIAAEEMEKQLREGFEQTDESLKSYLETWLYEYKKGTVAKNTLSLHQNSIKNHIVPYFKNIPLKDIKPILYQKFINHLTEKGYSRRTIEIVHGTMHNAMEKAIILEKIAKNPCTGAEIKLKKKESKIQFIESEHISDFLREAYRYDYIYWLFFKALIETGMRKGEAAALQWTDIDLKERTININKSLDFQVAARNPDMMFGDTKNYNSKRIITISQGLANDLLFHKKYQNQNKVALNDSYHFDLNLVFCRNDGNYMPKSSLFNSFSRILKKANLPSLPIHSLRHTHAVLQLEAGVSMKYLQERLGHGSVQITSDVYSHISKKIDRDAMNKFEEHMQNILE >CP024113|2612907:2628388|2618929_2619718_-|AWC53347.1|DBSCAN-SWA MSKFKKGDRVYFMSYGEKRVGTFDHQDDWKGWCLFDGNDVLTFAAIEDLRLLEEETMKTYTGFEAIERMKTHWITTQEKGCAWKIKEDEIWKRFDDTEWTATELINFFFRNEFIDYVEPLKFEDGEMFVMEMENAKWYAVFGSEDDYKYNVKISYPVNTMRVYEGGFLWKGDDCTFRKPTDEELEEFERFMVFHKKGRKMDEFKLGDIVEREDALYIVVNQTEDNKFERVIGCVEINDDDAPVKYFPTNDVELRFCMEDAVG >CP024113|2612907:2628388|2620911_2621700_-|AWC53351.1|DBSCAN-SWA MGIYRVVKDSNYTTINNTGLKDERLSWKAKGILAYILSLPDDWVFYREELATHAKDGLDSLRAGMNELKEHGYLHRFPVKDDKNKIVKWETVIYEIPKKEPVAEIPLVEKPLVEKPPVENPELLNTKEPNTKELNTDINKYIVEIVDYLNDVCSSSYRSTTKKTQSLIKVRLKEKFTVDDFKKVIDVKHAEWTGTSRAKYLRPETLFGTKFESYLQQWELWKNGKTRGYNVGSYGKGADHVPEEARRGIKPADNRGFAKTIG >CP024113|2612907:2628388|2625040_2625877_-|AWC53357.1|DBSCAN-SWA MTDQLTVANELHILGKQYIAGYEFTGIEGGFGEGKKAMLVKEIAEIHEKEVKHINLRINENRSRFKDSIDIVDLKVSPFGGPSLEQLGFTKQSIANSKNIYLLSERGYAKLLKILEDDTAWELYDQFVDGYFNMREQQPRVLNEKESLLANMQATILLNEEVSTMKEDMNSVKAEVKDLKENTPLYATECDEIVKTVNKTAVRLLGGKQSNAYQNKSTRGKVYKDIYRELRRHFDVKSYKAIKRRYLEASKKKIVEYELPIVLSEEIAQVNNQLTAEL >CP024113|2612907:2628388|2621700_2621970_-|AWC53352.1|DBSCAN-SWA MKTIIRDGSIPLALNKSSRTRYLRDRRLSELIKRCRRLEKEGFDYLFPIRKVLETVRHEKDENPHLFKGCFVLDRDRGFYYEVVMKKVK >CP024113|2612907:2628388|2615630_2615822_-|AWC53338.1|DBSCAN-SWA MAKLALILGLILTGLTIIEKVLVIYEKVLGLYKKVKKLKIKRKRRPRRKRRPRRKRQTRRKRK >CP024113|2612907:2628388|2621950_2622805_-|AWC53353.1|DBSCAN-SWA MSTNETLKQQMVAQQTTGVSTETNLNKQLKLMFKDSFKTIESVLPKHMTPERLIRVGLNATTRNPALLECAPETIVGAVVNCGSLGLEPNLLGHAYIVPFYNNKTKRKEAQFQLGYKGIMELVRRSGEVKAIYAHEVYEGDEFEYEYGLEKNIVHKPCGEEDQNKITHFYAVYKLKDGSYDFVVMSRKQVESHRDRFTKSQKNGAVFGPWKDHFVEMAKKTVIIKLLKSAPLSIEREESRQVIEAANQDNGIMKVKENNTGVEADAGFIDVEYAEVSENENHNS >CP024113|2612907:2628388|2615920_2616301_-|AWC53339.1|DBSCAN-SWA MLDIELPELNKEETKKNVLKALKKYRLFLSSITEEIIERVKNDETEGISEKNIKRAEFILDIRKGVSKLNLYDKQLIELAYLGKEKHSWVKMCRVLNMTQGDYYRKRNKAFYELAYKLGIEVEENR >CP024113|2612907:2628388|2615115_2615391_-|AWC54978.1|DBSCAN-SWA MDFSRIEGVNKMYKFANKNELLSFLQEEVLTTPEVMDVLGVSKSRISKMIKDGKLVPFKKMERVSLFLREDIEEKKKELEVLRVKYRPYDE >CP024113|2612907:2628388|2613910_2614378_-|AWC53336.1|DBSCAN-SWA MQIAYLEVLHMEEATLNLEMKELDRKASARKALRALRKYRMYMLSVDDEYLPKVTATYSLTPPSRTNQFHSSTENIIEIIDREREKESYMNRIWKGINRLSAEYRKLIIEKYMGRDELFDFEVYNKMGISKPNFDRKKRKALSDLACALGIEVYK >CP024113|2612907:2628388|2619883_2620099_-|AWC53349.1|DBSCAN-SWA MSITVMRPNVHITSVSSWGMVFTLPPSKNAHTREEYVETTGKWIEEQLKEREKQIIDIDKQKEVYLQCEIS >CP024113|2612907:2628388|2616305_2616593_-|AWC53340.1|DBSCAN-SWA MGKSQRDKGARREREFASLIGGERVPLSGAMQGYANDVKGLGLEWEVKARKDGFKTLYNWLEDEREQPDALAIKADRKPWLVVMPLDTFLKMVRE >CP024113|2612907:2628388|2617102_2617345_-|AWC53343.1|DBSCAN-SWA MKFWALAYQYQEDVFYDFAKEENTMDLSESCLLPTKEVAEDFISQQLDDDYVPVEIELETLQKNGILSWSRGRVERWDEE |
29 | Bacillus_phage(72.73%) | integrase | attL 2624622:2624636|attR 2631146:2631160 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2810669 : 2884637
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP024113|2810669:2884637|DBSCAN-SWA ATTATTTTACATAATTCTCTTTTACAACAGTCGCGCAACGCTCACATAATGTTTTATACTCGTTATCGTTGCCAACTGTTTCCGAAACAACCCAGCAACGTTCACAAGTTTCACCGTTTGCTTGTGTAACAAGAACTGCCGTATGTTCATATTTTTGTGCATCCGCTGGCGCTTCCTCTATCGTTCCACCAAGTTTATATTCAGAAACGATAAATAGTTGTTTTAAATCTTCTTGAATAGATTCTAACATTTCTTTCATTTCTGCTGTTGGGAATAATGTAATGCTAGCCGTCAATGATTTACCAATCACTTTCTCATTACGCGCCACTTCTAGTGCTTTTAATACGTCACTACGAAGCGTCATAAATGCATCCCATTTTGTTTTTAACGCTTCCCCATCTTGTAATTCGATAGCTTCTGGCATATCTGTCAATTGTACGCTCTCTTCTGTAACACCTGGAATATATGGCCACACTTCATCAGCTGTATGAGGTAAAATCGGTGTTACAAGTTTCGTTAACGCAACAAGAACATCATATAACACCGTTTGAATTGCACGACGATCATGATGATTTGCCGCTTCAATGTATAAAATATCTTTTGCAAAATCTAAATAGAATGAACTTAAATCGATTGTACAGAAGTTATGAATTGCATGATATACTGCCGCAAAGTCATAAGTTTCATACGCTTCTTTCACTTTCGTAATTAAGTCATTTAATTTCACTAACATATAGCGATCCACTTCGCGAAGTTCCGCTTTTGCTACTGCATCTTGAGCTGGATTAAAGTCAGCTAAGTTTCCTAATAAGAAACGGAATGTGTTACGGATTTTGCGATATACTTCTGCAACTTGTTTTAAAATATCATCTGAAATACGTACATCAGACTGATAATCAACAGAAGATACCCAAAGGCGTAAAATATCTCCACCTAGTTGGTCCATAATCTTCTTCGGTACAACAATGTTTCCGATTGATTTACTCATTTTGCGACCTTCACCATCAAGTACGAAGCCATGGCTTAGCACACCTTTATATGGTGCTTTACCTGTTACAGCAACAGCTGTTGATAATGAAGAGTTAAACCAACCACGATATTGGTCAGATCCTTCTAAATATAAATCAGCTGGACGTTGCAAGTCGTCACGTTCTTCTAATACAGCTTGGTGAGAAGAACCAGAATCAAACCATACATCCATAATATCTGTTTCTTTACGGAATTCACCATTTGGACTAGATGGATGTGTGAATCCTTCTGGTAGTAAATCTTTCGCTTCGCGTTCAAACCATACGTTAGAACCATGTTCACGGAATAAGTTTGCTACATGATTAATTGTTTCATCTGTAATAATTGGATCATTATTTTCTGCATAGAACACAGGAATTGGTACACCCCATGCACGTTGACGAGAAATACACCAGTCACCGCGGTCACGAACCATATTATGAAGACGAGTTTCTCCCCACGCTGGTACCCATTTTGTTTCTTTCACAGCTTGTAATAATTCACTACGGAATGCCTCAATAGATGCAAACCATTGTGCTGTTGCACGGAAAATAATTGGTTTTTTCGTTCTCCAGTCATGTGGATATGAATGCGTAATAAATGTTAATTTCAGCAACGCGCCAACTTCTTCTAATTTTTCCGTAATTGGTTTGTTTGCTTTATCATAGAATAAACCTTCAAATCCAGGTGCTTCACTTGTTAATACGCCTTTATCATCAACTGGACAAAGAACTTCTAGACCATACTTTTGCCCTACAATGAAATCATCTTCCCCGTGTCCAGGTGCTGTATGTACACAACCTGTACCAGCATCTGTTGTTACATGCTCACCAAGCATAACTAAAGAATCGCGGTCATAGAATGGATGTTTTGCAACTGTATATTCAAGTTCACTACCTTTTACTGTTCTAACAACTTCAGGGTTTTCCCATTCTAATGTTTTTGCTACTGTATCAAACAGGTCAGAAGCAATGATATATTTTTCATCATTTACTTTAACGATGCTATATTCAAGTTTTGGATGAACAGAAATACCTAAGTTAGCTGGCAATGTCCAAGGCGTCGTTGTCCAAATAATAAATTTCTCGTCACCTTCTAATACGTCTTTTCCATCTTTCACTTCAAATGCAACGTAAATAGATGCTGATTTTTTATCTTTGTACTCAATTTCAGCCTCAGCTAAAGCAGATTCACTCGTTGGAGACCAGTAAACAGGTTTTTGTCCCTTATAGATATAGCCTTTTTTCGCCATTTCTCCAAATACTTTAATTTGTTGTGCTTCATATGCTGGTTCCAAAGTAATATATGGATGATCCCAATCCGCACGTACACCAAGGCGTTTAAATTGTTCACGCTGACGATTTACTTGTTCGTATGCATATTCCGCACATAATTTACGGAATTCTGCGACCGGCATTTCTTTACGCTTTACTCCCTTATTCGTTAAAGCCTGCTCAATTGGTAAACCATGCGTATCCCAACCTGGAACATAAGGAGCACAATAACCAGTCATTGATTTATAGCGTACAATAAAGTCTTTTAATACTTTATTTAGTGCGTGTCCCATATGAATATCACCATTTGCATATGGAGGACCATCGTGTAATACGAATAAAGGGCGTCCTTTTGTACGTTCTTGTACTTTTTCATAAATGTTCATTTCAGCCCATTTTTCTTGTATTGCAGGCTCACGTTTTGGTAAATTCCCACGCATTGGGAACTCTGTTTTTGGCATTAGTAATGTATTTTTGTACTCCATGCTCAATTCCTCCTTACATGTATCATAAAAAGACTTAAAAACGAAATAAAAAAGAGACTTTCACATCCCAAAAGGGACGAGAAAGTCTCCCGCGGTACCACCCTATTAAATCATATACGTATGCACATGATTCACTTTATATCCTTAACGCGAATATACGCCTACGCTTACTCATTTTTTCAGCGCGGAACTCCAGGGTGATTTCCCATTTATCTCCTTATCCTGAGCTCACACCATCCTCAGTTCGCTTTATAAGGGGTGAAAAAGGTACTTATCCCTATCTTCGTTTTTCTTAATCAATATGTTGTTTAAAATTATATGTAATAATGAGAAAAACGTCAAGTTTACACTGTTTCTTCTTTTTTCAACAGTTCGTCCACTTCGTCTTCTAATTCGATGAGCTTGTCCCAATCGTCGTTGTTTAACATTTCAAGCTGTGTTTCTAGCAACATGCGGAAACGAGTACGAAACACTTTTGCTTGTTTCTTTAGCTCTTCAATATCAAAAGCAACTTTTCTTGATTTCACTAACGCTTCATTAATGATTCGATCCGCATTTTTTTCTGCTTCACGAACGATTAGTTTTGCTTCTTTTTGTGCATTGCGTTTTACTTCTTCCGCCGCTTCTTGTGCTACAACAATAGACTTATTTAGCGTGTCTTCAATATTAGAAAAATGATCTAGCTTTCCTTCTAATTGAGCAACCTTCTCTTCTAAAGCTTTCTTTTCACGAATGACTAATTCATAATCTTTAATGACTTGATCAAGAAATTCATTCACTTGATCTTCATCATAGCCACGAAATCCGCGACTAAATTCTTTATTATGAATATCTAATGGTGTTAACGGCACAAAAGCCACCTCCAAGTAGTTATCTAAATTTTCCTCTTTTAATTATATCTTTTCTTCGACAAAATAAGAGTTTTTTCCTTCTAAAAAATCAATCATTTTAGTATACCATACAAAACTCGCCATTTGTCTTTTTTCGTTCTTCCGTCGACCGAAAACAATTTACTTCTTCCATGTCCTCTGACCGACAGAATATCTCCTGGAAGACATTCATATGAAGTTTGATCTACAACTTTCCAATTCACTTTTACAAGCCCATTCTTTATAAGGGGTTGTACTTTTTGACGTGATAGATGCAAGATTTCAGCTAACACGACGTCTAAGCGTAGTGATGAAACAGTTCCAAATTGCTCTCTCCATTCATCCTGCAATTGCAAAACATTCTCTGCTGATACACTGAAGAGAGAAACCTTTGTTTTTCCAATTGATTGTAAGTTCATTTCAATATAAGAAACAACTTCTTTTGCGACTACGATTTGGACACGATTTTCTTGAATAAAAATATCACCGTACTTTTCTCTCTTTAAACCAAGGGACATAAGTGCACCTAGTATTTGTCTATGTTCAAGCGTATAAAATTTGGAAGGATAATCAATTTCTAATACTTCTACTTGAAATTCTTCTTCATTTAAAGCAAGATAATCTGGATAAATAAGTGCCCTTTTTCTCTCCGCTTTTGGCGCTGCACCATTAAATTGTAAAGAAACATCTCCTTGCTGTCCAACTATTGTAGTTACAATTTGTTGCTGACGCGGATCAAGGAAATCTGTTAATTTTACTTGATGGTACTCTTCTACTGCTCGTTTCCATTCCAACACTTTATCAACAAAACTGGCCTCTTCAGGCCTAAAATGTTCGTAAATGCTCATGCATGCAACCTATCTTATAAAAAGTAGCCAAATAAAGTGACTAAGCCGCTGCTAGCAAGCTTTAATGCAATAATTGCAACGATCGGAGAAATATCAATTACACCAAGCGGTGGAATCACTCTCCGAAATGGCTCTAAATACGGTTCGCAAATGCGTGCTAAAAAGTCACCGACTGCTGATTCTCTAGCGCCTGGAAACCAAGTTAGAAGAATGTAGACAATAAGCGCCCAGGAGTAAATTTGAATGACTAAGAGCAAAGCTTTTAAAATTATAAACATGGCGTATTACCACCTCTTTATATTTGTCTCTTCCTCTTCACCGAATAACTCGGAAATTGCTCCAACAATATCCACATTCTCAGGTGTACACATAAATGTTTTTGGTCCTAACTTTTGAATATCCCCGCCTATAGCGTATACAGTACCACTTAAAAAGTCAACGATGCGTACTGCTTGATCGGTAGACATTCTTTGCAAATTAATGACTACAGCACGTTTTCCTTTTAGATGGTCTGCA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85 | Bacillus_phage(77.78%) | tail,head,terminase,capsid,holin,tRNA,portal,integrase,protease | attL 2842212:2842229|attR 2891358:2891375 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3154822 : 3190236
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP024113|3154822:3190236|DBSCAN-SWA 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>CP024113|3154822:3190236|3187935_3188358_+|AWC53927.1|DBSCAN-SWA MTTFDIVKKLAEEQKISISELERTLGMGKNSLYRWKKQTPSSDTLQKVADYFNVSTDYLLGRTKKKYWELTEKDEKDIQKKLEELIEDMGNADALAFSKGSEPMSEETKQLLIISLENALRLGKQMAKKKFTPKKYRDEE |
47 | Bacillus_phage(87.18%) | tail,head,terminase,holin,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024113.1|AWC53916.1|3181551_3181746_-|hypothetical-protein |
3181551_3181746_-
Protein sequences of CP024113.1|AWC53916.1|3181551_3181746_-|hypothetical-protein>CP024113.1|AWC53916.1|3181551_3181746_-|hypothetical-protein MRDKLEKLIEELKLSQSLLGSRALNLLDDGDLEKYGYYNGQRVVCEHMQKELEQILEGEENEKI |
64 aa aa | NA | NA | NA | 3154822-3190236 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.7|2231516|36|CP024113|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP024113 position: 3177497-3177462, mismatch: 0 tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat Protospacer ************************************ 2. spacer 4.15|2231517|36|CP024113|PILER-CR matches to CP024113 position: 3177497-3177462, mismatch: 0 tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat CRISPR spacer tgtagcgaaccgttttatttagaagaattaactcat Protospacer ************************************ |