Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP025491 | Legionella sainthelensi strain LA01-117 chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas3,WYL,DinG,DEDDh,csa3,RT | 0 | 1 | 3 | 0 |
CP025492 | Legionella sainthelensi strain LA01-117 plasmid pLA01-117_150k, complete sequence | 0 crisprs | DinG,WYL | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP025493 | Legionella sainthelensi strain LA01-117 plasmid pLA01-117_113k, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh,DinG | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP025491_1 | 1396183-1396300 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP025491_1
|
1 spacers
spacers of CP025491_1
>1.1|1396214|56|CP025491|CRISPRCasFinder AATTCCTGCTTAAATCAAGCGTGGTTATCTCTTGTGGCATGGTAGCAAAAGCTTGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP025491_1
The CRISPR arrays of CP025491_1 >merge|CP025491|1|1396183-1396300|CRISPRCasFinder GCCAATTCTGCGCCTGATATTTCGCCAAGCGAATTCCTGCTTAAATCAAGCGTGGTTATCTCTTGTGGCATGGTAGCAAAAGCTTGAGCCAATTCTGCTCCTGATATTTCGCCAAGCG >CP025491|1|1|1396183-1396300|CRISPRCasFinder GCCAATTCTGCGCCTGATATTTCGCCAAGCG AATTCCTGCTTAAATCAAGCGTGGTTATCTCTTGTGGCATGGTAGCAAAAGCTTGA GCCAATTCTGCTCCTGATATTTCGCCAAGCG
>CP025491.2|AUH72809.1|1394532_1395015_-|hypothetical-protein MIRIYLNEAAKIDLIRLSRSQKSNIGERAYYVLLCGEGHSVSETAKITGRNEHTIRLWLKRYITCGITGLKSRSQPGRPARKAPIIESQLEESLGKSPQEYGYQEAGWQINLLRDWFEKQGMTACDNTLVKSLNRLVLCINDFQKSYQQMHHPRLRKNHG >CP025491.2|AUH72808.1|1394177_1394396_-|hypothetical-protein MKARLSKTIFGALNMRTSRFYWKQADTGNSQQFIMFLHQFHKANPNKKLMIILDNRPIHKSKKVQKFVRKND >CP025491.2|AUH72807.1|1393988_1394177_-|hypothetical-protein MNLFFLPAYSSEYNPIERFWQWLKQRVYGCKSFSTMEELLQQIRKLVWHFREGRTVSKINFN >CP025491.2|AUH72806.1|1393463_1393913_-|LuxR-family-transcriptional-regulator MNNAFGFYREYDGYKFMCVFARKKESVAPKLNFSAEKSMMNIVWKFLNQILPYYQQENSALKYSRISQDASFRKNFIFGQYKSSFLELKDRERGCLFWARYGKSTSETSKILGLKRATVKKYLEGVREKCQVSSIQEAITLALQHQFIS >CP025491.2|AUH72805.1|1392201_1393467_-|MFS-transporter MSYHMENKKKRVTVASIGTFLEWAEFTYFAYIANIIAALFFPELSSRLGLIATFSVFAVGYFFRPLGSLYFGYLGDKLGRRVALQASIMLMGISSLLIGCLPTYNTIGILAPTLLVLLRCTQGFAVSGEFNGSAIYLIEHDVEKPCQAGSWTGFASALGMMFGGLMATLISYHQMPVWAWRIPFLFGTLSCFCALYFRRNLSESPAFLSMTKERSVNPLKILFKNYKNKLLKAASLIAALSIYIYIMNVFYATHLAKYTTLQATETKLIVTFAQGLVALFIFSIGILADKINEQRLITMGFIGYFIAAPLAYWVPQTNSFILILLAQIPYALCNALVGVPIFKILNDFFPTQIRYSGVSIAWGVSTAIFGGTAPLVAVYLQNLFNLSIAPIFYILLSATIALLVLQNKKRYKVTSMKLELR >CP025491.2|AUH72804.1|1391869_1392202_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MTIVERRGLWNPEHYFKNSATQFGHATELLKNYPFKGDELILDVGCGDGKITVALANLVPNGQVIGLDKNSTTINFAQEKFPSNSYPNLSFLHGDVTHPSNLGKFSNRFI >CP025491.2|AUH72803.1|1391418_1391787_-|hypothetical-protein MLYRKCKAQWDALNKTSAHTKWSHYFKNYDPGYYEYLPTSYQELLNASGLGRFKAEFTTEEQISYEDIETFTNFMKGWLPHLNILPKEHHDEFLSLFITDYLNNLNTSISKITIPFVRLIIA >CP025491.2|AUH72802.1|1390413_1390794_-|DUF4949-domain-containing-protein MKFRAKLFSFTLASILTGSVFSVQFECPKIEVIKTEDFLFAEKIKENFYLTYNISKFETDSYWVFVLRPIEAETANKAKHRANEVLSKMYEQGVFMEEDGESFCQYPTGDNTLLARAAPENLLSTM >CP025491.2|AUH72801.1|1389834_1390368_-|hypothetical-protein MKQSIKFEMSLPDSSFSLYLRQLHEESNRLVVILEVVESDVGFSFSMVQDMFLNLIIYTKCNHELPVICFVIQDTEPNYWLEKVNHVRSNKEIILSADAICIYNGELKVPKQFMMVPKYYEIHNGQAIETTINSPQETKVSNTGMFSSSKNDTDDTKNGKDDTVEADKSYFSQCTII >CP025491.2|AUH72800.1|1388681_1388939_+|ATP-binding-protein MLLSLAQDEGFIKIVGEVGTGKTLLCRILLNQLAEDYVTVYIPNPDQTAKSMRFAIASELGIPAETHWNQHQTLEAIKLRLLELT >CP025491.2|AUH72810.1|1396680_1396863_-|hypothetical-protein MFLIFQAMIIMSAKPIKHDACSKIYVQIMNERFNVKVWPIINTFYDIISAHDLRDLFKLS >CP025491.2|AUH72811.1|1397442_1397670_+|hypothetical-protein MGIPIRIDETIYYEAKKVAAAEFRSIPNQIEYWAKLGKCALDNPDLPIEFIKDVLLSKLQDKSLAEPFQFEGEGG >CP025491.2|AUH73985.1|1397686_1397941_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MPAFKKAYKKLPSSHKSIINEAVRIIVNNPKVGEEKKGDLAGVYVYKFKMNHQQFLLAYEWEPTLRILVALGVHENFYRDLKRK >CP025491.2|AUH72812.2|1399308_1401279_-|hypothetical-protein MLPLFPKEDQPITIEQGRVGDCYLLAAIDCLYNSKDGKKRLTNMFTELSNGDIEVRIQYSKQSQYLKPEKVKLKYQYKNNIENDIITIPKDRLELIAKDQRGVKTNSLAVLILEHLSPYFFTVAREDSLLAHNHIIRYEGTDADFIAKLVGFEAGYLEDINQVIKLKTIAPHEPVYFTLDYGQQDRRGVYHSRHALRVDKITPNPQIPGGYEFSLVNPWNTRIIETWSQEDIKKRRPKYACFYKNKEKKAFSLKILSIAEHEAGFIFNHSELKENLFSLFRTRNDVNTQFLLNGVSLYKRFPSIFDKIPSIASRELSIFNSSIQKDALIACLKSSPEQFENNYKLLIKKCFPNTDFASQEEVNKLTDLINQNVRRQSGAPIEKPEEKIMDFYFFQDFEKLPPGNIRNTFIHPETIAAVPQLKKKLLARGLHLLAINDIGQFGVDGKDFLKSEHPVDQQLYKDIRAQEKNFLNPLKSIFNVRSINPSLSKQLLKLAKEDLAKTNVKTIKTMIDKQPDDAFKAWLKSMFDSDIELRTKWNNNLALEIRALLKDPSQLSSLPAFFEKINNDDFINKYIKVYEKHFGIVPKKEIGDIVLNEWQRKMNNERHQRKKPLGESTPNDAPVRNLNLLFKPFPQPSFNKDLNNDNEETYRKNPLA >CP025491.2|AUH72813.1|1401949_1403368_-|hypothetical-protein MSYSNLETVRSTNLTTLNVWLCNDGDFNTDIQKAEKYLQNMGNFILSSVDFTPLEFAEKMEVKLKRILGQADNTIQEEKLNDCINKIENYKKFLKLNLPAAEKKANNLIKQYKNVTDIKEECLNEMLRAKPKLHRARNLFIKVAQQADKSIFQRGINSYQILWDQLSTNLKIFKDIVKKYPENQLALLLHDPQSFIEALEDGKIPLGGELGALALQRIFSEYPQLTVRQKVSIATLIEKTQIERDTHCNSVALKSEIIKLQLYAQYCRDNDLPLVAWIGSARPVFSMIADHPGEGAYLNCDDAKWSPELNSTWLLIVSSMGYEIKLVEQHYPKVVDALTSGNILNYVSALIDEIRPFRKEFDSQYHGGDQPTATPQEILRLMSIGCKAKKNDDGSVSLTPPKSWVAEDYRSRKIKGLPQKDNIGRESQDVGVSRTRRHSVAFFKGSAQPVKKSLFEHPGESEEIRKNEKPKL >CP025491.2|AUH72814.1|1404614_1405055_-|hypothetical-protein MAKIFWGISFLSTLGAILYYNLFTPNSAPQQAALAAMTLVIAILPYCLARAVAEAEKIAEVKEKTELHKEINSTFLDYFILNRISLLFTLTNVEHLSTPTYEQIINRVNYLKKLLDEDLISNDEYEQARNYLLVTLKDNLKQQIER >CP025491.2|AUH72815.1|1405475_1405661_+|hypothetical-protein MDLPFYFERQRKGGKLYLNLHHQNKRYRKRYGSPKRTGPIKNCRLNLCRCQAFKIIQNLNE >CP025491.2|AUH72816.1|1406046_1406226_+|hypothetical-protein MKKPGSIADKSGQYEIVGPRGGKTGEERTVTKGEPLPPTPKPGQGYILVDSSKNKSGKK >CP025491.2|AUH72817.1|1407040_1407709_+|SOS-response-associated-peptidase MCGRFSYIASYETLKYQFNSTNSVEITPKFNIAPGTDVLCLIKTNSNEVQSVLLHWGLIPSWATDRKKIGSLINARAETLFEKPAFRNAMKSKRCLMPMSGFYEWHMESGVKQPYFFRLKNQELLAVAALWDTWQSATEVIHSCCLITTEANSVMQSVHHRMPVILDKEGQSLWLDNSQCPKEELLALLKPYSNEDLQGYRVSTLVNNADFEHPLVIEPLPQ >CP025491.2|AUH72818.1|1407845_1408352_+|DNA-polymerase-V MSPRGGTRPGAGRPKGEPTKTVRLPVSLLAELEQLKERPNYQLPIFSSKVQAGFPSPADDYIEGYLDLNTKFIKHPSATFVLQVMGDSMVEAGIFSGDWLLVDRSIEATDGRIVIAAVNGELTVKRLSKKEGKIQLLPANPKFKPIDITQDCEMVVWGVVTLVLHELV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP025491_2 | 3029564-3029732 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP025491_2
|
2 spacers
spacers of CP025491_2
>2.1|3029591|44|CP025491|CRISPRCasFinder TTAGGAATTTATAATAAATAAATATGGGAAAATCAGGAAATCAA >2.2|3029662|44|CP025491|CRISPRCasFinder ATGGTGAATTAATGCAAAGAAATACAATAATAAATTTATTTTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP025491_2
The CRISPR arrays of CP025491_2 >merge|CP025491|2|3029564-3029732|CRISPRCasFinder TCAAATTTACCGCGATAACAGTAATTTTTAGGAATTTATAATAAATAAATATGGGAAAATCAGGAAATCAATCAAATTTACCGCCATAACAGTAATTTATGGTGAATTAATGCAAAGAAATACAATAATAAATTTATTTTTATCATTTTTACTGCTATAACAGTAATAT >CP025491|2|2|3029564-3029732|CRISPRCasFinder TCAAATTTACCGCGATAACAGTAATTT TTAGGAATTTATAATAAATAAATATGGGAAAATCAGGAAATCAA TCAAATTTACCGCCATAACAGTAATTT ATGGTGAATTAATGCAAAGAAATACAATAATAAATTTATTTTTA TCATTTTTACTGCTATAACAGTAATAT
>CP025491.2|AUH70819.1|3028657_3029365_+|hypothetical-protein MEFAKPVKVAFGRLEHIAFIKRHLDVYKKPDITQYPIAAYEFDFLDFIYSLGLINILTFVCISLFPSYFKYDPFKIFNIIPIMLLLIANTVLIAAVIVLFHWGLCKCIGFIYKIKTHTFYEAGIFWRVFRVLSLSYLLITIPLLIQINSIFTHEGLGTTLNLISLLTIILMLMLQIKLFILPLYKIGKQFGKALGSIQSLLVIASALLINNFFWKQIPPSIFVNIQEVIKLFSAQ >CP025491.2|AUH70818.1|3027109_3028621_+|Fic-family-protein MKPSEKLAQSLEVLHNLQKQGKYAIQSKDISRTHRERLIENAFLEEVVKGWYVPIKPDEQKGESTAWYASFWSFCASYLNERFGDEWCLSPEQSLLLHSENWTVPKQLMIRSPKGTNRNMELPHNTSLFSVQYKMPATQDIEIKQDIRVYSIVPALLYCSPKFFSQYPTEARSVLSMFNSASDLLHYLLEEGHSWIAGRICGALQNIGKSHVAEEIKKTMESAGYQIREEDPFLTNTPIDFSVIYKPAYRSRLEVMWHDMRNIVRENFPKPRPTTIDIKGYLEQVDENYVSDAYHSLSIEGYQVSPDLIQKVRFGQWDPDATKQDRNHRSALAARGYWQAFQAVKKSLIEILNGENPGKVIQKEHRDWYRELFQPGVAVGLLKPTDLAGYRRSPVFIRQSKHIPPRWQIVGELMEEFFQLIIQEKEPGVRVVLGHFFFVYIHPYSDGNGRIGRFLMNVMLASGHYPWTIIPVERRNEYMEALEQASADQNIIPFTKFIASCIE >CP025491.2|AUH70817.1|3025631_3026852_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HipA-family-toxin MKNHKLGVYLNQILAGQLSIDTRGDMSFEYDNYYLENKQNRPLSHSLPLQKASYSTKQCRPFFSGLLPEAHMRTAIARQLGISEKNDFALLAAIGGECAGAVMILPQNTSIAQLKPDYKIIKKKDVLEILQTMHQRPMIVGEDGVRLSLAGAQDKLPVAIIEENLAIPMNGAPSTHILKPINRDFPTLIENECFCLNLAQKIGLNAVDAAIHYADDTPYLLVKRYDRVETEQGIQRLHQEDFCQALGISPEMKYQREGGPKISECFGLIREISSLPIFDIKELLQGILFNVIIGNNDAHSKNFSLLYHGSKTRLAPFYDMISTIYYPNLSSKMAMKVGSKYDFDGLFPRHFTQMAEEALLSGALVRKEVLDLVSKIQKNITASPFTGIILQRADKLFQRFQKSSAE >CP025491.2|AUH70816.1|3025417_3025645_+|transcriptional-regulator MIQSPEKIGCYIRKVRKELNVTQKDLALTAGTGLRFIIDLENGKPTCQIGKILQVLQVLGIQLNLSHADFENEKS >CP025491.2|AUH70815.1|3024497_3024773_-|DNA-binding-protein MTLKKLSRLNLLNEFESAPHSALFNQQTIAAVLSCSTQLLERNRWAGGGVPYLKIGRKVLYRKSDVLNFLQQQKIYYSTSDEGQIQPVENA >CP025491.2|AYK03071.1|3021995_3022361_-|conjugal-transfer-protein-TraK MKKSLTENLMISKHSQQITNSRKNKVAFLAMREDISEALEKGWSITVIWKTLRDEGSFTATYNTFRLYVLKYLNGQKSGYSQMEAIEQRTTKPVESQTKEKKPTAISSFSFNPIPNLKELL >CP025491.2|AUH70814.1|3021090_3021618_-|hypothetical-protein MTKIPQIPAGKGSNIGEFDLADCFFQSGEMLYAAAYDGITKNATRRIGFPTDEYFHGHFIVAFYNFRHAIELKMKQLALLLGITKRYGHKLSDLWDEVLKHAKITANETIVTEALLVLADYDVLQDEELFRYSQRNKSPNQLLQDYPAIQSDSFHLLGKAYCLLSEAILLLTPGK >CP025491.2|AUH70813.2|3020129_3020897_+|hypothetical-protein MEHWLYLKTQQKYFQIFLILNIWYIGGWCPVLRNTSKIKHPGTLDVDILFKESYKSGYLQNVIKSFINTGFMPSAKHPFQLLKPKEINGERIIYNVDILHPNMTEYSDQIGMFVDHLELDVPLNNSEKELKKMMSIVLPNSEILFREGLFDEFSRSGEVFKLVSFLGMFITKMDSCQKQKRERDSFDIYLAFLSDGIDVNKIEAIALGDGRIKESLESFKKHLNNDSDTFDKNVQHFCKSIEDSPANFILNKLNA >CP025491.2|AUH70812.1|3019307_3019883_+|hypothetical-protein MLQDFLKDKVTLVKNNGTKVRSEIPAQVSSNRIIIFDSSLPIEVGDHILRQLKSGLVEDFIVDDPCFQTGHGSIPDSFQIKVHRSDEPTAKPEVIINQISGNNARINIHSTDNSTNIVGDHNQLFSTMNQLIEDNIDSDDERERLRVLVSELKENVGKPNFKNAYDKFIEGAANHMTIFVPIISALSLLLS >CP025491.2|AUH70811.1|3019041_3019254_+|hypothetical-protein MSNKQQISVNTDELKTEIDSYESQMTRLTNNLNQKLKEQFINKPDIYPNFYRYKAAVISFWQNFFKKDFN >CP025491.2|AUH70820.1|3029753_3029981_+|transcriptional-regulator MPTHEIANLIHYYRKQSGLSQQELARLAGVGKTVIYDIEKGKESVRLNTLLKVLDVLNIQIKFETPFPQTTDNNT >CP025491.2|AUH70821.1|3029977_3030286_+|toxin-HipA MRKAYVSVNGIKAGVLEELEGKKYQFTYLNDYQGAPVSLTMPLTNKIYDFDVFPPFFEGLLPEGIMLEALLRKYKIDKNDYFGQLILVGQDVVGAVTIEELR >CP025491.2|AUH70822.1|3030282_3031221_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HipA-family-toxin MKRCPITYDVISDQENYSQRGLHLLSPQLKNLSPLDLSADEQRQEAIARVGKMSIQGVQKKLSAKLKIKEGCFEIVDQKGQYILKPQSDIYPELPENEAITMTLAKTIGLEVPVHGLIYSKDNSFTYFIKRFDRIGHNKKLAVEDFAQLSGEDRHTKYKSSMEKVIAVIAQFCTFPKIEFVKLFKLTLFNFLVGNEDMHLKNFSLITKERKISISPAYDLLNSTIAQKNTKEELALPLKGKKNNVTKSDFLKYFAIEKLGLNQNVIDGIVQEFHQVIPKWQELIGSSFLSQSMQEKYLELLEQRCKRLNFFD >CP025491.2|AUH70823.1|3031916_3033647_+|hypothetical-protein MNSTKDFFTIVSTPREENGKLYYRSFPSINYNGMCLIADKYNSKYFINESNKRIIVAASKIGFQQQLEPYLKSNKDCMIGFSVPQREGASGHPTPVIFEIHNGKKYLFINDSVGYDTLANSLQLFCEKNNVDLYENPYGRQVDNGSCKSDCLAYLKNSLQMESIAASVTLLNKEETTQYLSQTPSDRPGMPKHKIFLPTGDMLKTIQTSKVLGQNQLDVNQPLVSTKSKNTYMEKMSGYHKGETYYETIDRNTHVKSGDTKVWKERTYLRQKTETHHKQIIDILENKESDYINAAICRAANVFDLNTAIAQKNYPLIDIFREKNTQEPIKEENQELYVEYFKFKLRELLKECITDYKKNVENFNEEKLLPILENPKIQIEEKLNKLLSPEVPISDNFRAHLKFHSIFQENGAPSILLEHAIQVFIEDAKNKENGNKKEHINIIIDKHLHLFTTKAKWMALQGAEYSNASWAMDEIVRTIKRERELFNQAPLSQFDQAQQWLLASCTDIIDRSKDILGKHRGYKELFVQFLSGVTSVSTLGVANYATKKSFYGLFPARTDSAKMLDNFTEEMKGCSH >CP025491.2|AYK03072.1|3033913_3035284_-|MFS-transporter MALLNFLKPAPYLDEIQDKTIVKQQYRYWRIRTFYAMYIGYALFYFTRKSFTFAMPALQSALGMTKTELGLIASILSLSYGISKFLSGILGDKSNPRYLMAIGLILTGIVNILFGLSSTWWLFAIFWGLNGWFQGWGWPGCTKLLTHWYSQSERGRWWSIWNTSHNVGGALIPLIVAMCAQYFGWRSAMFVPGIICILGGVFLINRLRDTPQSLGLPAIEQYKEEFSGSSNHHQEKIELSVKEILWNYVLSNQYIWILSISYLFIYIVRTAINDWSMLYLTEVKDYSLITAGSCIIWFEVGGFFGNLVAGWLSDKVFQGKRNPINVLFTAGVFATLILFTVTKEYIPFLDSLFLFFFGFFIFGPQMMIGMACAELTHKKAAATATGFAGFFAYCLGAVLAGAPLGAIIKNYGWDNFFLTLFICCLIPLLMMLPLWHVKVHPKSRKSEFSAKSEFAS >CP025491.2|AUH73882.1|3035464_3037135_+|hypothetical-protein MKEIVSLLELEQDQIDFAIHKREVIMVLRRKFRTQKDWIIASFNQYQFTKEESQKVQQAILNGDLRITDLLERPFSHYFWSFFTFKWGEILSGGKRLSKQEVLQVATYSSNGQEFARTPIQNRNRLIKGVPLVIGKVVTSMALCMVFCLGLLSTLGAPFALGLALAIVLSLCNGIVCLLSRGQAMLDSAGFQPKKQKTFKTLEENLKQKTIFDKGQKLFFGIVTLLACISAGISGYAGLVGLLTFLGAGMLASNPLVLIVTIGLSLIAAVSFYSFQAVGIRENYEKFKNLFIEDYKKPYGLLRCILLGVVSTIFLAVYATLTWFTTVSGINKLFNALGSNPDTFLAHVLSMICTSTTMVVNTFSQVYKVFNPKTYVDLKEKFESIHQPPEEYQTKAQKIKYGAINVLKLCALIGDSLAYSVAGGIRSGIHVGETLGEAIGAKLALTITMAILSPVILVFVSIAFTWPTVFQSKKTTQYPSQMEKPLIEKVSQSHNPNALQNNTLLSTSEKFPKTNNSKIRQAGLRFFDASLNEEPIVKPNCSSTLERRTVVTSYSL >CP025491.2|AUH73883.1|3037198_3038800_+|hypothetical-protein MFPYLTLAITTSSVWSKNIQSSSSCDPYRNYSCLDSYLGEDFITRFFRYYKLEIGHAAAPSDPHAPTSHRASWPATPESTPPMPFTEWPYGATTSLGVSLPNSVDSPLMVGLANAPVGKWLQKNHIQIYGWVNGGGNLSTNTEKPAGNAPMAYLYTPNTIQLDQAVLYMERVPDTVQTNHVDWGFRLSGIYGENYRYTTAYGIASYQLLNNNSVYGYDFPMVYGELYIPNVAQGLLFRVGRYISIPDIEAQLAPNNYMYSHSMTYTFDNYTNEGIVASLAVAKNVIFQLGLVGGTDTAIWNIGKKVKNPAPNPLYPNPTFLKDPGARISAVACARFTWNDGKDTFYPCMDGINNGVWGYNNLQWYGFTYYHKFNERWHIAYEIYTLHQNNVANINNPIAAALIATGGTPFSPQYIPFNAPNAAQCNSTSALSCTASVLATVAYINYQFSPLDNISFRPEFYDDKQGQRTGVKTRYLNFGLGWQHWLSPQIELRPEIDYDYALDRNAFNGNANAGISPSKRYTVLGAMDIIAHF >CP025491.2|AUH70824.1|3038871_3040131_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MEEIIDEEIIKILQKNNLFSSLSNKQLNDLMPLIRVIDFDANKLIIYENDNPIDLYIIWKGEVEVLKKAKDGTELRISTLQSGEAIGEMGLIDNSPRSATIRTIVPTKLLVFSIADLKNLTKNTLFYNQLISKLSDVINELQFYINEQPTYLTLISNLAGTLSNRIRQTNQLTVDTLRSDLEHTKARIAMGKFMIDVLLVVVIYMYTFSVLAKLAHSHQSTSIVSIPLIIFFGIIVLFMMKNSSYPLQFYGLTLNNWRRALWEGILLSIPLILLIVLIKWLVINLVPQFSHLTLINAAILTGNDMHPNHNLPSLIALVLAYLVFTPIQELIARGALQSSLQEFLIGPNRIWWAILMSNILFSVTHLHVSISLAIAVLIPGFFWGWLYYRHKTLIGVSISHLIVGGLAFFVFDIRSIFAF >CP025491.2|AUH70825.1|3040466_3040694_+|hypothetical-protein MSKYIKSLLLSSSLSFTIFTPGILFADDCDVDCAKGSNQIDCPGKGCGCWCDKDQNAKCKCTQPLDENNTNTKNK >CP025491.2|AUH70826.1|3040985_3041477_+|Hsp20/alpha-crystallin-family-protein MSKIAKLKHIHPAEHPSSPFIRLHNEVDRLFGEFSDFFSPTRFRGLEQFEQLNLAPSMDVVEDKDHFSIQLEMPGMDEKDIHLSITDNVLTISGEKSISKKNKHKKYVSREISYGKYERSISLPSSVNVDEVKANFKKGMLWVQLPKKEEATSGSRDIKIEQA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP025491_2 | 2.2|3029662|44|CP025491|CRISPRCasFinder | 3029662-3029705 | 44 | NZ_LR134418 | Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 9 | 257659-257702 | 2 | 0.955 |
1. spacer 2.2|3029662|44|CP025491|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134418 (Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 9) position: , mismatch: 2, identity: 0.955
atggtgaattaatgcaaagaaatacaataataaatttattttta CRISPR spacer atggtgaattaatgcaaataaatgcaataataaatttattttta Protospacer ****************** ****.********************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1041004 : 1119234
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP025491|1041004:1119234|DBSCAN-SWA 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51 | Bacillus_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2003669 : 2010471
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP025491|2003669:2010471|DBSCAN-SWA CTCAAACATCTAATAGCTCCTCTGTATAAGGCCTGGCAGGATAATGAAAGCGCACTACTCCATCTGCTTCCCCATGCATAAATTGTTTCACCTGAGGTTCAGTAGATTGCAGTAGTTCCTGCGGTGTTCCTTCTCCTATGATTTTTCCGCCAAAAATAAGATATACATAATCAGCGATTGAACACGTTTCTTCTACATCATGAGAGACAATAATCGTTGTCGTATGCAACAATTCATTTAATCTTTTAATCAGGCGAACCAGAACTCCCAAGGAAATAGGATCTTGTCCAGTAAAAGGCTCATCGTACATCATAAGCTCGGGATCCAGCGCAATTGTACGTGCTAAAGCGACTCGTCGTGCCATTCCACCAGACAACTGAGCTGGCATTAAATCAACGGCTCCGCGTAAACCAACCGCCTCAAGCTTCATCAATACAATGTTACGCAACATGGATGCATTTAATTGCGTATGTTCTCTCAGAGGAAAAGCAACATTTTCAAATACTGATAGATGAGTAAACAATGCAGAGCTTTGAAAAAGAAGCCCCATATTACGTCTTGCTTCATATAAAGCTTTCCGAGGCAATTGATGCATATTTTGACCATTTACATGAATAACACCACTATCGGGCTTTAATTGTGCACCAATTAGCTGCAATAAAGTCGTCTTTCCAGAACCGCTCGGCCCCATAATCGCAGTAATATTACCTCGTTTCACTTTCATATTAATGCCATCGAAGATACGGCGCTTTTCACGAGTAAATATTAAATTCTTTATTTCAACCCAATTTTCAGGCATTCTCTCTTTTTCCGGTTTAGCCAAAAGTAGGAGTATATACTGGATCACAAAAAAAAATGAGCGATTTAATTCTATTTATTCAAATGTTTTTTTGTTAGAATCAAAATTAAACAAAAAACAAAAAATAAGCTTATGAATTTTTGTAAATTAGGCCTTGCAGTTATTGAAACTGAAGCACAAGCCGTATTTGAGCTAAGCCAACGAATTGATAACCGATTTGAAAAAGCCTGTGAGTTTTTGCTTGCCTGTAAAGGACGGATCGTTGTAACAGGCATGGGAAAATCAGGGCATATAGCCAATAAAATTGCTGCTACTTTATCAAGCACAGGCAGTCCTTCATTTTTTATGCATCCAGGTGAAGCAAGTCATGGTGATCTGGGAATGATTACCCGACAAGACACAGTAATCGCCATCTCTCATTCGGGGAATACTGTGGAGTTGGTTACTTTACTTCCTTTATTGAAGCGCTTAGAAGTCCCACTTATATCCTTAACTGGTAATCCTGAGTCTGCTTTAGCAAAAGCCTCCGATGTTAATTTAGATGTCAGTATTAAACAAGAAGCCTGCCCGCTTGGCTTAGCACCTACAACCAGTACCACAGTAGCATTGGTAATGGGGGATGCACTTGCTATCGCTCTTTTGCAAGCGCGAGGGTTCAGTGAAGAGGACTTTGCTTTATCTCATCCTGGAGGCTCTTTGGGTAAACGGCTTTTATTACGTATTGACGAGCTCTGTCACCAAGGCGAACAATTACCGCTTGTTCAGGAAAATGCGACTGTCAGTGAAGCCCTTATTGAAGTCACCGATAAAAAGCTCGGCATGACTTGTGTTGTTGATAATAAAGGATATCTTACTGGTATTTATACTGATGGAGACATTCGACGAACTTTAACACGTCAATATGACATTAACACGACTCCAATTAAAGAAGTTATGACGCGTAATGCACGCACTATTTATAAAGGGATGCTTGCTGCCGAGGCCTTGGCTATGATGCAAAAATACAGTATAACGTCACTGATTGTTATTGATGAAGATACAAGACCTGCTGCTGTGCTTCATCTTCATGATTTGTTAAAGGCTGGTGTATTTTAATGATCAAGTTAATAGAAAAAGCAAAAAATGTAAAATGCCTCATTTGTGATCTCGATGGGGTACTCACAGATGGCTTTTTATACATTGATACCCATTGTAATGAGCAGAAAACATTTCATATTCATGATGGCGTTGGCTTAAAACTACTCATGGCAATCGGCATTGAAGTTGCTGTTATTACGGGCTCTCATAATCCGTTAGTTGATCATCGCATGCAGCAATTAGGTATTCTTCATTATTATAAAGATAAAAGAGATAAAAAAGAGGCTTACAACCAGCTCAAAATGACATTAAACCTAAGAGATGAGCAATTCGCTTACATAGGTGACGATATTCCAGACATTCCTATTATGCAACAGGTAGGACTTAGTGTTGCTGTTGCCGATGCAACATACTTAGTTAAAGAAATTGCTATGTGGCAAACTAGTTTACCAGGTGGTCGTGGAGCTGTACGAGAATTATGCGACTTTATTCTTAACGCACAGAGCAAAATGGATTTAGCCATAGCAGGTTATTTAAAACAATGAACGCAGCAAAACAATTCATGTGGCTTTTTTTTACATTAATTCTTCTAGCATGTTCAGGATGGTATTACAGCCATTCTACAACGCTAATTCGCCTGGATCACGAAACTTTGGCGAATTCAGTAGACACTACAATTGCTCACGTAACAGTACGCCAGTTTAATCAAAAAGGTACGCTCACAAATTTATTAACCGCACCACTCATGCAACATATTCAAAAAGGCAATGTTTATTTATTTGAAAATCCTCATATTATTGTAAGCCAAGATGAACAACAACCACCTTGGGATATTCGTTCTGAAAAAGGCAAGTCGATTGACGGAGGGAAACAAGTCACGTTTCTTGGTAACGTGATTGTACATCAGAAAAGAGGAAGTAAATCACAAGAAAGTACCTTAAAAACAGAGGAAGTCACCTACTTTCCAAAAGAAAAAAAAGCAATTTCTAATGTTTTGGTAACTTATGAACAATCAGGTAACATCATTCAATCTACTGGAATGAATGCTTATCTAGATGAAAAAAGAGTAGAGTTACTTCATCGAGCCCGAGGAAGTTATGTTCCAGCGAATGGTTAGTTACAAGGTGTCACATCACTGTAAATTTTGGTTTAGCTTATGGTTTTTTTTAACATTTGCTTGTTCTTCATACGCATTGTCTGAAGATAAAGAAAAAGTAATGCATGTGATGGCCGACTCAGCAGATTTGAGCCAACAACAACATAAAGGCATTTATACGGGCAATGTTGAATTAATTCAAGGAACAACAAATCTACGGGCAACTAAAGCAATTACTCTTGGTAACGAAAAAAATCAGCTTGTTGTCGCCATTGCGAGTGGAGCTCCAGGACAGCAGGCCCATTATTGGACAACGACCGATCCTAAAAAACCGCCCCTTCATGCCTATGCCGATACCATACGTTATTATCCACTACGTCATTTAATTGAGTTAATAGGAAACGCTCGTGTTGAACAAGGAAGTAATTCATTCTCAGCAACAAAAATAAGTTATGATACTGAAAAGCAGCATGTTTTATCTCAGGGCGATGGCAGCAAAAGAATAATGATTATTTATCATCCAGAAAAGAAACCATCATGAGTATTCTAGAAGCACGAAACCTCAAAAAATCTTTTAAATCACGCACCGTGGTTGATGGAATTACCCTTCACATAAACAAAGGCGAATGTGTTGGATTGTTAGGACCTAATGGTGCTGGAAAAACGACTTGTTTTTACATGATAGTAGGCCTACAAGCGTGTGATGAAGGTGAAATTTTTTTATCTGAGAAGGATATTACTTCAAGTGCCATGCATCAACGAGCTCGATTAGGAATCAGCTATCTCCCCCAAGAGGCCTCTGTATTCCGTAAACTTACTGTTGCAGAAAATATTATGGCGATATTGGAATTGAGAGCTGATTTAAGCGAACAAGCCCGTGAAGAAAAACTTGACCTCTTGCTTCAAGAGTTTCACATTTCCCATCTAGACAAAAGTCTTGGTATGTCCTTATCGGGAGGAGAGCGACGACGGGTTGAAATTGCAAGAGCTTTAGCCATAGAACCCTCTTTTATTTTACTCGATGAGCCTTTTGCTGGAGTTGATCCAATTTCAGTGATTGATATTAAAAAAATTATTCAACACTTATGTAATAAAGGCATTGGAGTACTTATCACTGATCATAATGTAAGAGAAACCTTGGATATCTGTGAGCGCGCCTATATTGTCAGCCAAGGAAAAATATTGTGTGAAGGAACACCTGATATTATACTGGCCAACCAACAGGTAAGGGCTGTTTACTTAGGTGAAGACTTTACTTTATAAACATAGCACTAAGAAAAGCTTGGCAAGCAACGTCCCGCAGTTGGTTCTCGAGAATTTCTCACTAAATTGAACTAAAAAATACTTTTGAACCATGAGTTACCTGGATCAATGAAAACAGAAAGAACATTTGGGTCGTAGCGCAACAGAACTCGAAAATACAAGCGACTACGTTAAACTACGATTATAAATCAAATTTTAATTTAATATGTTACTCATCATCGATAATTACGACTCATTTACCTACAATCTAGTACAATATTTTCAATGCTTAAACCAAGAAGTAATTGTTTTCACTCACGATCAAATTAGCTTGACGCAAATAAAGAAGCTTAATCCTAGCTACCTAGTGATTTCTCCTGGGCCCAAAGCCCCCAAGGATGCCGGGATTTCAATGGAAGTAATTTATAATTTTTATCAAGATATACCTATATTAGGAATTTGCCTAGGGCATCAATGTATTGCAGAAGTTTTTGGCGGTAAAATTATATCTGCTCCAGAAATAATGCATGGAAAAACATCAACTATTATACATAATCAACAAGGAATATTTAAAAATATTCCGAACCAATTCAAAGCAACCCGATACCATTCCCTTGCGGTTGATAAAGACAGTCTGCCTGATTTTTTATCGATTGATGCATGGGCAGATAATACAATTATGGCAATTTCACATCGTCAATATCCCATTTTTGGTCTACAATTCCATCCAGAGGCAATATTAAGTCAGCATGGACTAAAACTATTAGAAAATTTTTTAAAATATGAAACCTAATCTTCTATTTGAACACCTAATTGCAAAAAAAAATTTAAACAGTAAGCAAATGCACGATGTTCTTCATGCTTCTATGTCTGGTGAATATAGCGATGTCCAAATTGCTACTTTTTTAGCGCTTATGCGTATGAAAGGTGAAACGACTGATGAGCTAATTGCAGCAGCGGAAGTAATGCAGCAATTAGCTCACCATATAGAATTAGGTACAAATTTAACTGACATAGTAGGTACTGGTGGAGACGGAAAAAACACGTTTAATGTTTCTACTGCCTGTAGCTTTGTCGTCGCAAGCGCGGGATTTCCTGTTGCTAAACATGGTAATCGTTCAGTCTCCAGTCGTAGTGGAAGTGCCGATTTATTGGAGAAAGCAGGATTTATACTAAATCTTACAGATGAACAAATGCAAATTTGTATGAACCAATGCGGCTTAGCATTTTTATTTGCCCCCCATTATCATCCAGCGATGCAATACGCTCGGGCTGCGCGTCAACAATTAGGAATTAGAACTTTATTTAACTTACTTGGTCCATTAATTAACCCTGCTCGTGTAAAAAGACAAGTGGTAGGAGTATTTTCAGCAATTTGGCAAAAGCCCCTTGCTTCTGTTCTTGCTCGCTTAGGAAGTGAAAGAGCATTAGTTGTTAGCTCTCAAGATGGATTGGATGAAATCAGTATCGTTGCTCCCACAAATATCATTGAATATCGAGAGGGAAAATATAATCACTGGATTCTCAATCCTAAAGATTATGGCATCCAGCATCACTCATTAAGTGAAATCATTATTGATTCACCTGATCAAAGTTTAGATTATATCCAAGCTGTATTTTCCGGAGAATTAGGGGCAGCACGGGATATAGTACTCTTAAACGCCGCAGCAGCCATTTATTGTGCTGGTAACGAACTATCTTTTGAACAAGCATTAGAACACGCTAAAATCGCCATAGATAGCGGCCAAGCGAAGCAATGCTTTACACGACTTCGCCAATTAACTCAAACTTTAAATAAAGAATCAAATCATGAATAGTGTCCTAGAACGTATTACTCAAAAAAAATTAGAAGAAATTTGTTTGGCTAAGAAAAATAAGCCATTAGATTTGCTCAAGCAACAACCCATGATGGAGCAAAGAAACTTCCTTAATGCCCTACAAAATCAAGAAACACCTGCCATTATCGCTGAGATTAAACGAGCCTCCCCCAGCAAAGGAATCATTCGAGAAGATTTTAATGTAGCAGAAATTGCAACAATATACGGACTACATGGAGCACGTTGTCTTTCTGTGCTTACTGATATTGACTTTTTCCAAGGCCATCCGGATTATATTGCTCAAGCAAAAATGAATAGTAACCTGCCGGTATTGCGCAAAGATTTTATTCTGGATACTTATCAAATTTATGAAAGCCTGGCCTTAGGTGCTGACTGTATTTTACTTATTGTCGCATTACTTGATGATGCCCAGTTAATTGAGTTTTGCCAATTAGCTCAGGAGCTTGGTATGGCCGTCCTTGTAGAAAGCCATACTCAAGAAGAACTTGAGCGTGCTTTACGTTTACCTACGCCGTTAATAGGAGTCAATAATCGCAGTCTTCATACGTTTCATACAAATATACAGTTGAGTATTGATTTAAAACACTATATTCCCAATGATAGAATAACTATTACGGAAAGTGGGATAAATAATCATGCAGATATTCGTTTGATGCAATCTCATGGTATAAACACCTTTCTTGTCGGAGAAAGCTTAATGAGGGCTAAAGATATTGGTAACGCATTGGATCAACTCATCAAGGGGGACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP025491|2003669:2010471|2003669_2004467_-|AUH73298.1|DBSCAN-SWA MPENWVEIKNLIFTREKRRIFDGINMKVKRGNITAIMGPSGSGKTTLLQLIGAQLKPDSGVIHVNGQNMHQLPRKALYEARRNMGLLFQSSALFTHLSVFENVAFPLREHTQLNASMLRNIVLMKLEAVGLRGAVDLMPAQLSGGMARRVALARTIALDPELMMYDEPFTGQDPISLGVLVRLIKRLNELLHTTTIIVSHDVEETCSIADYVYLIFGGKIIGEGTPQELLQSTEPQVKQFMHGEADGVVRFHYPARPYTEELLDV >CP025491|2003669:2010471|2009691_2010471_+|AUH73306.1|DBSCAN-SWA MNSVLERITQKKLEEICLAKKNKPLDLLKQQPMMEQRNFLNALQNQETPAIIAEIKRASPSKGIIREDFNVAEIATIYGLHGARCLSVLTDIDFFQGHPDYIAQAKMNSNLPVLRKDFILDTYQIYESLALGADCILLIVALLDDAQLIEFCQLAQELGMAVLVESHTQEELERALRLPTPLIGVNNRSLHTFHTNIQLSIDLKHYIPNDRITITESGINNHADIRLMQSHGINTFLVGESLMRAKDIGNALDQLIKGD >CP025491|2003669:2010471|2008664_2009699_+|AUH73305.1|DBSCAN-SWA MKPNLLFEHLIAKKNLNSKQMHDVLHASMSGEYSDVQIATFLALMRMKGETTDELIAAAEVMQQLAHHIELGTNLTDIVGTGGDGKNTFNVSTACSFVVASAGFPVAKHGNRSVSSRSGSADLLEKAGFILNLTDEQMQICMNQCGLAFLFAPHYHPAMQYARAARQQLGIRTLFNLLGPLINPARVKRQVVGVFSAIWQKPLASVLARLGSERALVVSSQDGLDEISIVAPTNIIEYREGKYNHWILNPKDYGIQHHSLSEIIIDSPDQSLDYIQAVFSGELGAARDIVLLNAAAAIYCAGNELSFEQALEHAKIAIDSGQAKQCFTRLRQLTQTLNKESNHE >CP025491|2003669:2010471|2005561_2006089_+|AUH73300.1|DBSCAN-SWA MIKLIEKAKNVKCLICDLDGVLTDGFLYIDTHCNEQKTFHIHDGVGLKLLMAIGIEVAVITGSHNPLVDHRMQQLGILHYYKDKRDKKEAYNQLKMTLNLRDEQFAYIGDDIPDIPIMQQVGLSVAVADATYLVKEIAMWQTSLPGGRGAVRELCDFILNAQSKMDLAIAGYLKQ >CP025491|2003669:2010471|2006641_2007181_+|AUH73302.1|DBSCAN-SWA MFQRMVSYKVSHHCKFWFSLWFFLTFACSSYALSEDKEKVMHVMADSADLSQQQHKGIYTGNVELIQGTTNLRATKAITLGNEKNQLVVAIASGAPGQQAHYWTTTDPKKPPLHAYADTIRYYPLRHLIELIGNARVEQGSNSFSATKISYDTEKQHVLSQGDGSKRIMIIYHPEKKPS >CP025491|2003669:2010471|2007177_2007903_+|AUH73303.1|DBSCAN-SWA MSILEARNLKKSFKSRTVVDGITLHINKGECVGLLGPNGAGKTTCFYMIVGLQACDEGEIFLSEKDITSSAMHQRARLGISYLPQEASVFRKLTVAENIMAILELRADLSEQAREEKLDLLLQEFHISHLDKSLGMSLSGGERRRVEIARALAIEPSFILLDEPFAGVDPISVIDIKKIIQHLCNKGIGVLITDHNVRETLDICERAYIVSQGKILCEGTPDIILANQQVRAVYLGEDFTL >CP025491|2003669:2010471|2004599_2005562_+|AUH73299.1|DBSCAN-SWA MNFCKLGLAVIETEAQAVFELSQRIDNRFEKACEFLLACKGRIVVTGMGKSGHIANKIAATLSSTGSPSFFMHPGEASHGDLGMITRQDTVIAISHSGNTVELVTLLPLLKRLEVPLISLTGNPESALAKASDVNLDVSIKQEACPLGLAPTTSTTVALVMGDALAIALLQARGFSEEDFALSHPGGSLGKRLLLRIDELCHQGEQLPLVQENATVSEALIEVTDKKLGMTCVVDNKGYLTGIYTDGDIRRTLTRQYDINTTPIKEVMTRNARTIYKGMLAAEALAMMQKYSITSLIVIDEDTRPAAVLHLHDLLKAGVF >CP025491|2003669:2010471|2008108_2008675_+|AUH73304.1|DBSCAN-SWA MLLIIDNYDSFTYNLVQYFQCLNQEVIVFTHDQISLTQIKKLNPSYLVISPGPKAPKDAGISMEVIYNFYQDIPILGICLGHQCIAEVFGGKIISAPEIMHGKTSTIIHNQQGIFKNIPNQFKATRYHSLAVDKDSLPDFLSIDAWADNTIMAISHRQYPIFGLQFHPEAILSQHGLKLLENFLKYET >CP025491|2003669:2010471|2006085_2006661_+|AUH73301.1|DBSCAN-SWA MNAAKQFMWLFFTLILLACSGWYYSHSTTLIRLDHETLANSVDTTIAHVTVRQFNQKGTLTNLLTAPLMQHIQKGNVYLFENPHIIVSQDEQQPPWDIRSEKGKSIDGGKQVTFLGNVIVHQKRGSKSQESTLKTEEVTYFPKEKKAISNVLVTYEQSGNIIQSTGMNAYLDEKRVELLHRARGSYVPANG |
9 | Acinetobacter_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2540858 : 2550329
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP025491|2540858:2550329|DBSCAN-SWA ATTATAGGTAACACCCTACCCCATCATAACCAATAACCTGACATTCTTTATAAGCACTTTGATCAAGGTGATAACTTATCGAGCCATAATGAGCAATAATAGCACCATTTTTAGTTTGCTCTATATGAGGTTTTTGAAAACTATCCAGAGTTTCACAAGCCGCGTTATTTAGTACCCAAGTCACACCATCGATAACAACCCGCGACTTACCTGGTGTTAATGAATTTTTCCCACAATTTTTCATCGCTAAACTTTTGGTTTTAGGGGATGAAAAGAGTAAATCATACCCTGCTGCTGCAGCTTTAACGGCATTTTCAGCATCCAAAATTCCATGTCCGCAAGGTTTCTTACCTACACAAGATTTATTCGAGTCAGAACTTACTCCAAAATCATGTGTTGTAATATAAAGTAACTGCTCAATTTGCTCAGAGCTTAGTGCTTTATTACTTGCGGCAAGAATTAATCCTGCAACACCTGCAACATGGGGCGTTGCCATACTCGTTCCTTGATAAAAATCAAATCCAGATCCTCCATAGCCACCTCCTGGATTCACCGTGGATAAGATACCACCCCAAAGTCCATAACGTTTGTCTCCTCCTGGAGCAGCTAATGTCACACTAGGTCCATAGTTAGAAAAATAGGATCGAAGCCCCTCTGGCCCAGTAGATGCGACTTTAATAGTTCCATTACAAATTGCCGGGGCATTAAAATGCTCCCATACATTATCATTTCCTGCTGCCACAGCTAGAACCGCGCCATGTTCACGTGCAAAAAAGACCGCCTCTTGTAACGCCTCATCGCAATAATCAATCTCTTGATTCGGTCCTTTATCCACACCAAAACTCATATTCAATATTTTTGCCGGATGAATATTTTTTGGAACTCCGGGAACATCGCCACCTACAGCCCAATAAATGGCATTGATTACAGAACTTTCATAGAACATTCCATTAGCACCAGGAATTTTTAGCGGAAGAATTTTTAAGTCTTCGCCCATACCACTCATCACATGACCATAACCTCCTATTGTTCCAGCAACATGAGTACCATGATAGGATCTGGTCTCATCCATTAAATTATTATTATTTCCCGCAAAGTTCCAACCCCATATATTACCAGCATCATCTTTAACAAGATTATTTATTAAATTTTCATTTAAGGCTATTCCAGTATCTAATACTGCAACTACAACAGGTTCTTTAGACAAACCGGTAGTATAAAACCAAGCACCATCTCGAGAGCCCGGCTTAGATTCCAACATGATTCCTGCAGGACGTGAAAATTCATCCCATTGAATTTCATGGGATAATAGACTACCAGCATCCAAAATTTCTGGATCAGGAACTGGTTTAAAGTAACTTACTCGGTCTTTCACTGCATATAAAACTTGTGGATTTTTACGCAGACGATCCAAAACTAAGGAAGTAGTATCCTCATTATCTATTTCTTTAGAAAGAGAGCCATTTGTAGTATCTAAAATTAATAAATAAGCTCCATTCGCCATAGGATTTATTTGCTTCACAGGTAATTGGGTAATTTGTTTTATTTGCGATTTTAAAGAAGAAACACTCGTTATTTGTTCTTTATACTTGATTATCACTCTCACAGCATCATTTGCGGGTGCCGCAAATGCATTATGGGCGATAGACAAAAGGCTAAGACTTAAAATCCCTAACTTCAACATGCAAAATCTCCTTATAAAAATGCATAGCCAATCAGTATGCAATAAGATAAATCGCAAAACAAGAGCAAAATTATCTCAAAATGCTATTACTATATACGGTAAAGAAAGAAAAAAATAAATCTAGCTTATTGATAAATAATAAATTATTAAAAATTAAGGTTTGTTGGCAATTCATATTCTAAGACCCAGCGTCGGGAGGAAAAGCCTCAAGATGCCAGGAGATGAATTGTCAACAGCCCCTTGTATGCACTATCAACATAATTGATTGGACTAAAACCGAGGAGCACTGCCATTGACTTAAGAAATTTATAGTCATCCTCACGCATAGATAGGAGAACACATAATGGATTTTCGCTTTCGCGAAAATGATGTTCTCTTCAGTCAATGGCAGTAGAACAGAGCACTTACCTTTAATTAGTAACGATAATGATCCGGTTTAAAGGGACCGTTGATCTCAACCCCTAAATATTGAGCTTGCTCATCAGTTAATCGAGTTAGCTTCACACCAATGCGATCTAAATGCAGCCGAGCAACTTTTTCATCCAACAATTTAGGAAGAACATAAACTTGTTTTTCATATTGAGCAGCATTTTTGAATAATTCAATTTGCGCTAAAACTTGATTGGAAAAAGAGGCCGACATCACAAAACTAGGGTGACCTGTTGCACAACCTAAATTAACCAAACGTCCTTCAGCTAAAAGTATAATGCGTTTCCCATCAGGAAAAATAACATGATCCACTTGGGGCTTAATATTTTCCCATTGATATTTTTTCAAGCTTTGTACATCGATTTCGGAATCAAAATGACCAATATTACATAAAATAGCTTGATTTCGCATTCTTTTCATATGTTCATGCGTGACTACATGATAATTACCTGTAGCAGTAACCACAATGTCTACTTGCTCTGCAACATCATCTAAAGTAACAACGCGATAACCTTCCATCGCCGCTTGAAGAGCGCAAATAGGATCAATTTCAGCAATTAAAACAATAGCACCTTGGCCCCGTAGAGCTTGAGCGCAGCCTTTGCCTACATCTCCATAACCTAAAATAAGAGCAACTTTTCCTGCAACCATCACGTCAGTGGCTCGTTTTAAACCATCCAATAAAGATTCGCGACATCCGTATAAATTATCAAACTTAGACTTAGTTACCGAATCATTCACATTAATTGCAGGAATACTTAATTCACCATGTTTGGCCATTTCATACAACCGAGCAACACCTGTAGTCGTCTCTTCTGAAACACCTTTAATATCAGGTAATAGTTGCGGATATTTTTGATGAATGATTTGTGTTAAATCACCACCGTCATCAAGCAATAAATTAGGTGCCCAATTATTGGGGCCAGCCAGTGTTTGTTCCACACACCACCAATATTCTTCCTCTGTTTCACCCTTCCAGGCAAATACAGGAATACCTTTAGCTGCAATAGCAGCAGCTGCATGGTCTTGAGTGGAAAATATATTACAAGAAGACCAGCGAACTTCAGCCCCCAAAGCAACCAAAGTTTCAATAAGCACCGCTGTTTGAATGGTCATATGCAAACAACCTGCAATACGAGCGCCTTTCAAGGGCTTTGTTGCACCAAACTCTTCACGTAAAGCCATTAAACCTGGCATTTCCGTCTCTGCTATAGCAATTTCTTTGCGTCCCCAAGACGCCAGCGCCATATCTGCAACTTTATAATCATGGATCATATTGCCTTTTGCTCCTACTTTATCGACTAATTCCATCACAGCCTCCTCATAATGCTTTACGTAATTCAGCTACTTTATCTAAACGTTCCCAAGGAAAAGTTTCACGCCCATAATGGCCATAAGTTGCTGTTTGTCTATAGATTGGCCGAAGTAAATCATGATATTCAATAATACCTTGTGGGGTTAAATCAAAATGGGTATTGACTAATTCAATGATTTCACTATCTTTTAATCGTCCTGTACCAAATGTTTCAACAAAAATGGATGTAGGTTCGGCAACGCCAATAGCGTAAGAAATTTGTAATTCACACTTATCGGCTAAACCTGCAGCTACTATATTTTTAGCAACATGCCGTGCTGCATAAGCTGCTGAACGATCAACTTTTGAAGGATCTTTACCGGAGAAACATCCTCCTCCATGTCTAGCCATACCACCATAAGTGTCCACTATAATTTTACGTCCCGTTAATCCACAATCGCCTAAAGGACCGCCAATAACAAAACGGCCTGTCGGATTGATGAAATAACGAGTTTTTCGCGTTAGCCACTCCGTAGGTAGCGTCGTGCTAATCACTTCTTCACGCACTGCTTCAATTAAATCATTATGGCTAATTTCAGCTGCATGTTGGGTTGAAAAGACAACCGTATCTACTTCAACAGGTATCCCATGCTCATATTTTAAGGTTAATTGGCACTTAGCATCTGGCCGTAACCAAGGTAAAGCCCCTGATTTACGTAAATAAGCTTGTTTCTCCATCAGTCGATGGGCATAGGCAATAGGTGCTGGCATATAAACGTCTGTCTCACGGCTTGCATAACCAAACATTAAACCTTGATCTCCAGCACCAAGAATTTTAGTTTCCTTATTATCTACGCCTTGAGCGATGTCTGGGGATTGTTTCCCAATTGCGGAGAGCACTGCACATGATTCCCAGTCAAATCCCATTTGCGAGCTGTTATAACCTATATCTTTAATTACTTGTCGTGTAACTGCCTCTACATCTACCCATGCTTTAGTAGTAATTTCACCACCAACCAATACCATACCTGTTTTAACAAAAACCTCGCATGCTACCCTTGCGGTTGGATCTTGCATTAAAATAGCATCTAGAATTGCATCAGAAATTTGATCAGCTATCTTGTCCGGATGTCCTTCGGAAACAGATTCTGAAGTAAAGACATGACTTTCATTCATTGTTAATCCTCTTTAAATATGTATTTGTATCTCATTGGCTTCTCAGATCCCTACCCACATTTCACAGATTATGCATCGAGCCTTGATGAAAAATGGACAGTTTCTTTCATTTCATTAACTGTATAAACTCATTAAATACTATTTCTATATCATGTGGTCCTGGGCTTGCCTCTGGATGTCCTTGGAAGCCTAAAGCAGGCTTCTCTTTATGTCTAATGCCTTGTAACGTATTATCGAATAAAGAGCGATGAGTAATAGCAAGACAATCCGGCAAACTTTCTTCATCCACCGCAAAACCATGATTTTGGCTGGTTATAAAAACACGTTTTTTACCTTCAGTTTCAATAACGGGATGATTTGCGCCATGATGACCGAACTTCATTTTTTTAGTCACACCACCACATGCTAAAGCCAAGATTTGAAAACCCAAACAGATACCAAATAAGGGTATATTGTGTACTAAAAATTCTTGAGTTGCGCGAATAGCATAATCACACGCTTGTGGATCTCCAGGACCATTCGATAAAAATATACCATTAGGATTCATTGCCAAAACTTCCGCTGCTGAGGTCTTAGCCGGCACTAAAGTCAAATGACAGCCTTTGTCATATAAGATACGTAAAATATTGTGCTTCACGCCAAAATCATAAGCTACTACATGAAATTGTTGTGGTTGAGAGTTTTTCCCCCATTCACCCAAACCAACATGCCAGCGCTCTATTGTTTTTCTGGAAACTTCCAGTGCTAAATCCACACCTTGTAATCCAGAAAAAGATTTTGCTTTTGCCAAAACCAATTCAGGATTTTCAACATCAGTACTGATACAAGCGCCTAATGCCCCCTTTTCACGCAAACGTAAGGTCAAATCACGAGTATCAATATCAGCAATTCCAACCACCCCATTTTTTTTGAGCCATTCTTGTAGTGATTGTTCGGCACGATAATTACTCTGAATTATTGAAGCATTACGGATGACTAAACCTGAAGCCCAAACTTTGTTAGATTCCATATCCTCATGATTGCATCCTGTATTTCCGACATGTGCAGTGGTTAAAGTGATGATTTGTCGTGCATATGAAGGATCAGTAAGCATTTCTTGGTAACCAGTTAGCGAGGTATTAAAAACCAACTCGCCAACACAATCACCTGACGCTCCTATTGAAATGCCTTTATAAATAGTGCCGTCGGCTAATGCTAAAATTGCTGGTTGGTTCATCATGGATCTACTCTAAGTTGTTTATAATGATTTTTAATTTCAGCCTGAATGACACATTCCATCATCAAAATGATGCGAATCACTCAAGCTCAAAAAATGCACATAAAGATAAATGCCAGCAATTGTAACTTACTTATTTTAAAATTTCATGTCTTCAAAGAATTTTTTCACACCAGCAAACCAGGAATTAGATCGCGGAGAATGATTTGCTTTAGCATTTTCAAGTGATTCATGGAATTTTGTTAATAAATCTTTTTGCTCACGGGATAAATTAACGGGAGTTTCTACAACTACTTTACATAGCAAATCGCCTTGACCATGCCCCCGCACAGATTTCATTCCTTTGCCTCTTAAACGAAATACTTTGCTTGTTTGAGTTTCTTCAGGAATCTTGAGCGTGACTCGTCCTTCAAGAGTAGGAACTTCTATAGAACCCCCCAAAGCTGCAGTAATAAAACTTATGGGCACTTCACAATGCAAATCATTTTCATGTCGTTCAAATATGGCATGTTTTTTAATGCTAACCTGGACATACAGATCACCAGGCCCCCCCCCATGCACTCCTGCTTCACCTTCACCGCTTAATCGTACTCTATCACCATTATCAACACCTGGTGGAATTTTGACGGTGAGTTTTTTACTTTCACGTATTCGTCCTTGACCATGACAACTTGAGCATGGATCAGAAATTATTTTCCCTTCTCCATGACAATGCGGACACGTTTGTTGAATAGAGAAAAATCCTTGTTGAATCCTTACCTGCCCTATTCCGTTACATGTTTCGCATGTTTTTGGTTGAGTTCCTGCTTTTGCACCAGAACCACTGCACACGGTACACGTGCCATGTCTTGGTACCGTAATTTGTACTTCTTTACCTAAAGCAGCTTCTTCAAGAGTTAATTGCACATTAAATTGCAAATCAGCACCACGTTGGCCACGTGATTGTCGGCCAGCGCCACGTCCACCTGAAAAAATATTTTCAAAAATATCTTCGAAAACATCACCAAAACCACCAAATCCTCCACCTCCAAAGCCGCCAGGACCACCTCGCATAGAAGGATCAACACCTGCATGACCGAATTGGTCATAAGCAGCCCGTTTTTGTGGATCGGATAAAATGCTGTAAGCGCTTTGAATTTCTTTAAATTTTTCTTCTGCTTCAGAATCGCCAGGATTACGATCTGGGTGATACTTCATTGCCAACTTGCGATATGCTTTTTTAATTTCAGCATCACTGGCAGTTCGACTTACATCTAAAAGTTCATAATAATCCCGCTTTTCCATAACCACTCACAAAATTTAAAATTAATAGGCTTCATAGTCCGGATTTTTCTAACAGTATGAAACATTAAGTCTCTATCATTATGTCAAATTCATTCCCACGCAAAAAAACGGGACCCATTTATAAATGTTAGCACAATGTACTATAGAAAATAGGGCTTCCTCTCACTACCGTTGACTTAAGGAATCTATACTTTATTTCGACATCCTGCGGGTTGTCCGCGAGATCCATCACCATCATTGCATCCTGCAAATACGTCGGGATGTCGACTGACAGTGTGTCTCTTAAGTCATTAGCAGTGCTCTGCCTGCACAGAAAAATTATTACTCTTGAACATAATGACCACAACAATAACGTAACCCAGGAAATGAGTATTCATTTCTCAAGTTACGTTTTGCTTCACCGAGGCTAGAATACCCAGGCTATCATATATTACGATAGAACCAATTATTTCTTATCGTCTTTTACTTCCTCGAACTCAGCATCAACAACACTTTCATCCGTCTTAGCTGATTCATGTGTTTGTGCCTGTTCCTGGTGTGCTTGCCCCTGCCCTGCTTGTCCTTCAGATGCCTTTTTAGCATAAACTCGCTCAGCCATTTTTGCAGATGCATCACTTAACACTTTCAATTTGTCTTCAATTTGTGCTTTATCACTACCTTGAATTGCTTCTTTTAATTCAGCAATAGCTGTTTCTATACCTTTTTTCTCATCATCGGTCAGATCTGTTGCCAGATCTTTCATAGATTTTTCACAGCTGTGAATTAAGCTATCTGCCTGATTACGAAGATCAGCCATTTCCTTAAATTTCTTATCTTCTTCTGCATGTGATTTAGCATCTTTAACCATAGCTTCAACTTCTTCATCACTCAAACCACTGGAAGCCTTAATTACAATTGATTGCGCTTTACCTGTAGCTTTGTCTTTAGCAGAAACATTAAGAATACCATTGGCATCAATATCAAAAGTAACTTCGATTTGAGGAACGCCGCGTGGTGCAGAGGGAATATCACTTAAATCAAATCGTCCCAAAGATTTATTCGCTGATGCTTGCTCTCTTTCCCCTTGCAGCACGTGCACAGTAACCGCTGTCTGATTATCATCTGCTGTAGAGAAGACCTGTGCTGTTTTGGTTGGAATAGTCGTATTTTTTTCAATGAGCTTCGTCATTATTCCACCCATTGTTTCAATACCTAAAGATAAAGGCGTAACATCAAGCAAGAGAATATCTTTCACTTCTCCAGATAATACCGCAGCTTGAATAGCAGCACCAACAGCAACTGCTTCATCAGGATTCACATCTTTACGTGGCTCTTTGCCAAAAAATTCTTCTACTGTCTTTTGAACTAAAGGCATACGTGTTTGACCACCAACCAAAATGACTTCATTGATTTGTGATACAGTTAAGCCCGCATCTTTTAGCGCCGTCTTACAAGGTTCTATTGTACGCTCAACCAATTTCTCTACTAAAGATTCCAATTTAGCGCGAGTCAATTTGATATTTAAATGTTTAGGTCCGGAAGCATCTGCCGTAATATAAGGCAAATTAACATCCGTTTGCTGTGCCGAAGAAAGTTCAATTTTAGCTTTTTCAGCAGCATCTTTAAGCCGTTGCAATGCTAATGGATCATTGTGTAAATCAATACCGGAATCCTTTTTGAATTCAGAAGCGAGGTAATCAATCAATGCCAAGTCAAAATCCTCACCCCCTAAGAAAGTATCACCATTGGTGGCTAATACTTCAAATTGGTGTTCTCCATCCACTTCAGCAATTTCAATAATAGAAATATCAAAAGTACCACCACCAAGGTCATATACCGCAATGACTGAATCACCGCGTTTTTTGTCCATGCCATAAGCAAGGGCTGCAGCAGTAGGCTCGTTAATGATACGTTTTACTTCAAGACCCGCGATGCGACCTGCATCTTTTGTAGCTTGTCGTTGAGAATCGTTGAAGTATGCAGGTACGGTAATTACTGCTTCTTTTACTTCTTCACCTAGATAATCTTCTGCAGTCTTTTTCATCTTACGTAATACTTCAGCAGAGATTTGAGGCGGTGCTTTATCCTGATTTTTCACACGAACCCAAGCATCACCGTTATCCGCTTTGATAATCTTGTAAGGCACCATTTTAATATCTTTTTGGACAATCGCATCATCAAATCGACGACCAATTAATCGTTTAATTGCAAACAAGGTGCTGTCTGGATTAGTCACTGCTTGACGTTTTGCAGATTGTCCAACCAATACTTCACCATCGTCTGTAAAAGCGACAATGGAAGGAGTAGTACGGTGACCTTCACTGTTTTCAATTACCTTAGGTTTATCACCTTCCATTACAGCAACACATGAGTTGGTGGTACCCAAGTCTATTCCTATAATCTTTGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP025491|2540858:2550329|2540858_2542541_-|AUH73690.1|protease|DBSCAN-SWA MLKLGILSLSLLSIAHNAFAAPANDAVRVIIKYKEQITSVSSLKSQIKQITQLPVKQINPMANGAYLLILDTTNGSLSKEIDNEDTTSLVLDRLRKNPQVLYAVKDRVSYFKPVPDPEILDAGSLLSHEIQWDEFSRPAGIMLESKPGSRDGAWFYTTGLSKEPVVVAVLDTGIALNENLINNLVKDDAGNIWGWNFAGNNNNLMDETRSYHGTHVAGTIGGYGHVMSGMGEDLKILPLKIPGANGMFYESSVINAIYWAVGGDVPGVPKNIHPAKILNMSFGVDKGPNQEIDYCDEALQEAVFFAREHGAVLAVAAGNDNVWEHFNAPAICNGTIKVASTGPEGLRSYFSNYGPSVTLAAPGGDKRYGLWGGILSTVNPGGGYGGSGFDFYQGTSMATPHVAGVAGLILAASNKALSSEQIEQLLYITTHDFGVSSDSNKSCVGKKPCGHGILDAENAVKAAAAGYDLLFSSPKTKSLAMKNCGKNSLTPGKSRVVIDGVTWVLNNAACETLDSFQKPHIEQTKNGAIIAHYGSISYHLDQSAYKECQVIGYDGVGCYL >CP025491|2540858:2550329|2546794_2547940_-|AUH73693.1|DBSCAN-SWA MEKRDYYELLDVSRTASDAEIKKAYRKLAMKYHPDRNPGDSEAEEKFKEIQSAYSILSDPQKRAAYDQFGHAGVDPSMRGGPGGFGGGGFGGFGDVFEDIFENIFSGGRGAGRQSRGQRGADLQFNVQLTLEEAALGKEVQITVPRHGTCTVCSGSGAKAGTQPKTCETCNGIGQVRIQQGFFSIQQTCPHCHGEGKIISDPCSSCHGQGRIRESKKLTVKIPPGVDNGDRVRLSGEGEAGVHGGGPGDLYVQVSIKKHAIFERHENDLHCEVPISFITAALGGSIEVPTLEGRVTLKIPEETQTSKVFRLRGKGMKSVRGHGQGDLLCKVVVETPVNLSREQKDLLTKFHESLENAKANHSPRSNSWFAGVKKFFEDMKF >CP025491|2540858:2550329|2548385_2550329_-|AUH73694.1|DBSCAN-SWA MAKIIGIDLGTTNSCVAVMEGDKPKVIENSEGHRTTPSIVAFTDDGEVLVGQSAKRQAVTNPDSTLFAIKRLIGRRFDDAIVQKDIKMVPYKIIKADNGDAWVRVKNQDKAPPQISAEVLRKMKKTAEDYLGEEVKEAVITVPAYFNDSQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGMDKKRGDSVIAVYDLGGGTFDISIIEIAEVDGEHQFEVLATNGDTFLGGEDFDLALIDYLASEFKKDSGIDLHNDPLALQRLKDAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADASGPKHLNIKLTRAKLESLVEKLVERTIEPCKTALKDAGLTVSQINEVILVGGQTRMPLVQKTVEEFFGKEPRKDVNPDEAVAVGAAIQAAVLSGEVKDILLLDVTPLSLGIETMGGIMTKLIEKNTTIPTKTAQVFSTADDNQTAVTVHVLQGEREQASANKSLGRFDLSDIPSAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAKDKATGKAQSIVIKASSGLSDEEVEAMVKDAKSHAEEDKKFKEMADLRNQADSLIHSCEKSMKDLATDLTDDEKKGIETAIAELKEAIQGSDKAQIEDKLKVLSDASAKMAERVYAKKASEGQAGQGQAHQEQAQTHESAKTDESVVDAEFEEVKDDKK >CP025491|2540858:2550329|2544291_2545440_-|AUH73692.1|DBSCAN-SWA MNESHVFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDAILMQDPTARVACEVFVKTGMVLVGGEITTKAWVDVEAVTRQVIKDIGYNSSQMGFDWESCAVLSAIGKQSPDIAQGVDNKETKILGAGDQGLMFGYASRETDVYMPAPIAYAHRLMEKQAYLRKSGALPWLRPDAKCQLTLKYEHGIPVEVDTVVFSTQHAAEISHNDLIEAVREEVISTTLPTEWLTRKTRYFINPTGRFVIGGPLGDCGLTGRKIIVDTYGGMARHGGGCFSGKDPSKVDRSAAYAARHVAKNIVAAGLADKCELQISYAIGVAEPTSIFVETFGTGRLKDSEIIELVNTHFDLTPQGIIEYHDLLRPIYRQTATYGHYGRETFPWERLDKVAELRKAL >CP025491|2540858:2550329|2542955_2544281_-|AUH73691.1|DBSCAN-SWA MELVDKVGAKGNMIHDYKVADMALASWGRKEIAIAETEMPGLMALREEFGATKPLKGARIAGCLHMTIQTAVLIETLVALGAEVRWSSCNIFSTQDHAAAAIAAKGIPVFAWKGETEEEYWWCVEQTLAGPNNWAPNLLLDDGGDLTQIIHQKYPQLLPDIKGVSEETTTGVARLYEMAKHGELSIPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLLDGLKRATDVMVAGKVALILGYGDVGKGCAQALRGQGAIVLIAEIDPICALQAAMEGYRVVTLDDVAEQVDIVVTATGNYHVVTHEHMKRMRNQAILCNIGHFDSEIDVQSLKKYQWENIKPQVDHVIFPDGKRIILLAEGRLVNLGCATGHPSFVMSASFSNQVLAQIELFKNAAQYEKQVYVLPKLLDEKVARLHLDRIGVKLTRLTDEQAQYLGVEINGPFKPDHYRY >CP025491|2540858:2550329|2545546_2546659_-|AYK03052.1|DBSCAN-SWA MMNQPAILALADGTIYKGISIGASGDCVGELVFNTSLTGYQEMLTDPSYARQIITLTTAHVGNTGCNHEDMESNKVWASGLVIRNASIIQSNYRAEQSLQEWLKKNGVVGIADIDTRDLTLRLREKGALGACISTDVENPELVLAKAKSFSGLQGVDLALEVSRKTIERWHVGLGEWGKNSQPQQFHVVAYDFGVKHNILRILYDKGCHLTLVPAKTSAAEVLAMNPNGIFLSNGPGDPQACDYAIRATQEFLVHNIPLFGICLGFQILALACGGVTKKMKFGHHGANHPVIETEGKKRVFITSQNHGFAVDEESLPDCLAITHRSLFDNTLQGIRHKEKPALGFQGHPEASPGPHDIEIVFNEFIQLMK |
6 | Bacillus_phage(16.67%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
86044 : 95086
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP025493|86044:95086|DBSCAN-SWA ATCATTGAAACATACTCTCCAGTAATAAAGAGTTTAAAGAGTTCACCAAATCTTGTGGTGTACCAAAACAAAACATTTTTTGCGTCCATAATGGGATTATTTTTTTACTCATTTGTAACATTGATTTATAGGTTGATGAGAGATAAAATTCATTATTTTCTCGTACATTAGCTTGAATGTTCTTCGCGGTGATTTCTAAAAGGTCAGATGTATTTTTAAAAAAATAGGTACCTGTAGTTGCATAATCAGAAATAACTTTTTTCTCTTGGACATCAATAATGTATTGTTGATTTGAATCAAGCTTGGCATAACTCCAACGCTCTTCTTGGGAATTAAATAAAACAATAGCACCATCTATATTTTGCTGAACTAAATGATCCCAATTAAAATTTTCTTTAATATAAGTATCGCAATTATGAATAAGGGTAGGTTCGTTTAGATCTAAATATTCACTACAGTACAATAAAGTTTCTGCTTGACCTTCAGTTTCGTGTTTTAATATAACGAGAGCAAGAGGTAAATCCTCGTAGTTCGTCTCAATATCATCTTTTAAAGTATCAACATATTCATTTTCACGAATAATAAAAATTAATTTTTTTGCGAAAGTTAAGGGGAGACAATCTACAGCTCGTCGATACATTGGTTTATGCCCTACATTGATTAATGGTTTTGGCAAGGTAAAACCACTTTGCGCAAAACGAGAGCCAAGTCCTGCCATAGGTATTACAATATTCACACTGCCTCCTGTTATAATAAGTTTTTCATAATAATGTCACCTACCTTCTCCCAGGACCCTTCAAATTTTAACGCCTTATCATCAATATAAAGATCAGCATAAGGCTTACCAAACCATATCTCATCATATTCAAAATGATGTTCTTTTAACCATTCAAGTAATGTATGTCCTTCACGGGCTATAACTTGTCCAATATTGGATTCACAAGTTTTCATATGTCTGGCCGTATTTAAAATGATATAGTTACCATTTTCTCTTAATTCTTTAATTTTTTGGGCAGCTCCTGGTAAGGGTAAAACATTTTTATAAGTTTGATTTGCTTCACGTAAGGTACAAATTGTTCCATCAATATCAATGCATATGCGCATAGTGGCCCTCTATAACTTGATTTAAGATGATGATTCCAATTAAATAAAGAATTTTTTGGCGTTGAATATTTTCATAATGCAAACTGGCCATACTTAAAAATAGCGATGCTTCAATTAAATAAAGAAATTCTAAAGTTATATTTTTTTCTATTAAAATTTCTTTATAAAATTCTTCCAATTGGTCGAGTAATAAAGAGGTCGGAATTTCAAAATAGAAGCACTCTGAATCGCATTCATTTAATGTGAATAAATCATTTACTATAAAATCGTAGCGACTGTGCACACAATGGAGTAATTTTGCATAATCATATAAATTATGGCCATAAATTCCTTCATGTATAAAAGAACCGCGTGGATCAATTAATTTAATTGTTTGTTTGGTAGGAGAGTATAAAATATTACTAAAACAAAAATCGCCATGGATTATACTAATAGAATGATGTTTCGCAGTATGTTGTTGTATTAACTGAGAGAAACTATTTTCTATTAAGCTAAAATTTTTATATTTAATTCCGTTTATAGTTAAATAGGATTTCGACAAGATATTTTTAAAATCATTAATTTTACCGAGATCGTAGATACGTTCTTTAGTTTTTTTAATATAAAAATTAGCAACATCTACACTGGTGATATCCATTTTAGACGGCTTTATCTTATGAAATTTATCCATTAATCTAATAAGATCGCCTAAAATATTTTTACATTCAGCAAAAGATATTTCTTGATTTAAAATTAACTCTTCCAGTGATTTATATGGAATATATTGGAGCTTATAAGTGGAGTAATCTTTTTGATAATTAACTAATTTTGGAAAAAAACTCCGTAGTTCTTTGGGTAAAAATAGGTAATATAAAATTTCACTTTTTAACTTCTCAATATTATTTGAAGATTTAGTAAATATATTATTTATTTTATCAACTGCCACAGAATTAAAAGCGCGTACTTGCATCGAAATCTCCTTTTCTAAAACCAAATACTTATCTAATGGGCATAATTCATTAAGATAATGAAATAAATCTTTTTGTATGCCACAAATGCTACCAATCCCTCTAAATGCCCCTTTAAAAAAAATAAAAATCTGTATAAGAAGCCTAGGTGGTCATCTCTAATATTTCTATTAAGGAATTTATTTAATATTTAAGGAAAATACCTATAATACAATGTCAAGCATTAAACAGATTTGAGAACAGGTGATTTTTCAGGCTAATTTTTTTATCTTTGGCGAATATTATAATGTTGCGCTTTATTCTAGGGCCTCCATTTCTTGTAAAGGAAGAAAACACCCGGATGAGCATTCCTCTTTAAATAATTAAAAGTTCGGGATTTATTTAACAGATTACATTCATCATGAAAATGGAGGGACAATTCAGCTAAATAATCCTAAGGTTTCATGAGTACTATCCTTATGAATAAACTTTGACATATAAAACTTCAAATTTCGCTTTTATTAACTACTGATTAGAGCAGAATTTATAAAAAACCTAATATTGATCTAGTCGTAAAGATTGCTTCGTGACCCAAAAATCGGGCTTGGGGAGCAATGGAACAGCCAACCGACTTAAGGCTTTTCTGTTGTTCTTAATGGCCTTAACTCACCACGTTTTACCTCATCTGGCATGGCAAAGGAATATCGTCCGAGCATATTAATATGACCATATCCATATGCGGACAGTCTGGCTACATCTTCATCGTATACGGGGAAGCCTTCTTGTCGTAATTGATTAATGGCAGCATCCATGTAAATAGTGTTCCAAAGTGTAATGATATTTAAAACCAGTCCAAGGGCACCTAACTGATCTTCTTGCCCTGCACGATACCGCTGATGAAGTTCTCCTCGCTTACCATGAAAAACAGAACGACCTAAACTGTGTCTGCCTTCGCCCAAATTTAGTTGTACCAAAGTCTGACGACGGAATGACTCATCATGAAGATAATTGAGCATGTGGATAGTTTTGTCAATTCGCCCAATTTCGGCAATTGCTTTGGCTAAACGAGTTGGTTTATCAGCAACTTGAAGAGTGCGCATAATGCCTTCTGCGGGAACTCTCCCGAGTTTTAATGAAGCCAATAAACGTAAAATATCATCCCACTCAGGAGGAACAAGATTTATATTTATACGACTTTTTGCAAGTACATTGAGCTTTCCATAATCAGCCAACGGATCAATCCGCCAGAATCTAGCACCACCCATATCAGCCAATCGCGGACTGAAACGAAGTCCCAACAAACGAAACAGTCCAAATACAATATCACTGTATGCGCCTGCATCTGTCATGATCCGCGTTGGCTGTAATTCCGTCTGTTGCTCAAGAACAACGCCTAACAATATTAGGCTATCACGTAAAGTGCCAGGTACTGTTACAGCATTTAAGCCAGTTCGTTGATTAGAGATTAGATTGTACCAAGTGACACCACGACCTGATTTAAAATATTTTGGATTTGGAGCAGCGTGCACTGTTCTAACCGGTACAACGAAGCGCATGCCATCAGCCGATGCAATATCGCCTCCGCCCCATTTCTTAGCTAATGGAATTTGATTTTGAGCAGAAACTAAAATGGCATTGACCGCCATTATCGTTTCATTTCGAATATAATTTTGATCAACCCATACCAATCTATCTCTTTTTAAAGCAGGTATGTCCTCACGAACAAACGGTTCTCGTCCAGTATTGCAAGCGTCTGCTAGCAATTCAGCACATAAACTGATTAATAGATCCTCAGCACGCGCACTTCCTTCATTGATGTGGGTAAATCCATCCGCAAATCCAGTACGTGTGGCTATCTCAAGTACCATCTCGGGTAAATCGACACGTGGTAATTTGGCTTTTACAGCAGCTCTCAATGCTTTTAATGATGGAGGCTCATCAAGTGCATCAAGCTGAGTTAGAATCAGCTCCTCATTACCCTTAACTGTTTCAAATCGAACAGCAGGGTTATTATCAATATTTGCAGCAACTAACCGATACACTTGATGTAGTTCATCTGTAAGGCTTGTTATGGCTAACATTGGGTCAATTGTTAAATTTAATGAGCGGCAAATCATAGGACGTATTGCCTCCCACTCTGAGCCAGAATAAAGATTGGCTCTTGGATCAGCATACCGCCAACTCGGACTTATGAACACATCCCTATGTTTCAGTGCCGATTGCAATTTATCAAGAACACAAAATATATATGCTGTTCGGTCAATTGTAGTTCTATTGCTATCCCGGCCAGTTATTGATGTTATTAATGCAAGCTCTTTATTATTTGCGTTTTTTTGAACTTCCTTCATGTTTAAAATGGATTTTTTCAATTTCTCAACTTGAGATTGTTTTTTCTCTGGTACAACGATTTCCTTAATTTTTTTATTGATAAGGTCAGCATATAAAAGTTTATCGTTATGCAAAATGATACCATCTTGGGTTTTTACAAGTTTCTTTATGACGCGATAAGTGGGTCGTGGTTCGTCTTGTGGCCAATTGATAACGCTACATTCATTTTTAATAACAATATTACGTTTCCATGATGTTCCAATAATCTCCATTGGCGGTTCATCCGTTTGTTTTCCCTTTAACCATTCAAGACTGGCAAGAAGAGGTTTTCCCGCTTGATTACTATCAAAATTTATTACTCGAAGGAGCGAAGGTAAAAATTTCTGAACTGTTTTTTCCTTTTGTTCAAGCTCATGATAAAACACATTACTTGGCGGCCTGATTAAGGCAGTGGCATTTTCAACTGCAGATACAAGCGCTTCATGACCTACTGTTGTATAAATTGTGTCCCGAATTTCATGATCACATAATTCTGTATTCAGTAGTAATTTACATGCATCGACCAATGTGGCTGTAGCTTGATCGAGATCTTTAAGAGTTCGCAGTCGTGTATTTTTATTTTCTTGCTTGGCCTTTGAGAAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP025493|86044:95086|93178_95086_-|AYK03146.1|DBSCAN-SWA MGCSTCPSHKEPMPKLWHNPKVITAAIAGILLTIGFVGSYLTLPRIIANGFYIGAVLIGGYYFAREAIEEFFKEHEIGIEFLMSTAAIVAGVMGQWAESATLVFLYSISEAAEGYAGERARHAIRVLMELAPKSALVRRNNSEFLIPLEDIQIGDEFIVRPGESIATDGEVISGHSSVNQAPITGESIPVEKFVGNKVFSATINGEGTLTIRATKKFAENTLSRIIFLVEKAQDKKGRSQRFIERFGNLYSPFVLLAGVLIATLPPLFGLHWQEWVLRATVFIVAAAPCALVISIPITLVAALGTASRNGILLKGGIYLEKLVQIKVIALDKTGTLTQGQPKVTDIISLNNYTQNQILNVAATLESRSQHPLAHAILQQAKAESVAYKPVEHFKSLTGSGVQGFINGEQFYIGNPKLFIDMGLLVETVIQEINKLQTVGKTVVLVGTDKEILGLIAITDPLRSTARQMVSSLKLMGIERVVMLTGDNSITAASIGVQAGVDEVFSDLSPEDKTRKIEELERRYGKVMMVGDGVNDAPALAAAHVGVAMGAAGTDVALETADVALMGDNLLKLPYLIEFSHRTWNIILQNLGLSIIVISSLIVGAVTGYFTLPIAVLAHEISELIVIASGLRMLKS >CP025493|86044:95086|92119_92668_+|AYK03144.1|DBSCAN-SWA MKIGYARVSTTDQNLELQLVALKEAGCKRIYQEKISGAKRDRPELQRLLDQLRPEDVVVVWKLDRLARSTQHLLELIDCIRTTEASFCSLSEPWADTTSHAGKMIMTVFAGIAEFERDLIRERTGAGRAAAKQRGVRFGRPEKMNKEQKSLAKRLLQEDKSVSEIAKTFNVHKATIYRLQQE >CP025493|86044:95086|88705_91963_-|AYK03143.1|transposase|DBSCAN-SWA MPVSFLSPVQCDNYAKYPTDLPPDIVDSLFFLDDQDMEWIANKRGDFSRLGYALQLTTVRFIGAFISDLNQIPRVVIERVAIQIKVNDPESCISMYMKSEQRWRHAVEIRARYGYIEFAEKGSRYRLGRILCALCWTGTDRPGVLFDHAVGWLSTNKILLPGITVLERFVAEIRSRMESRLWRMLIKNLSASQQEKLNDLLVVEDDEHLSLLDKLRKGPVSISSTALVQALKRVESARNISVELPLYRIPACKIATLARFANTAKITAINRLPFERKMATLVAFANHFESDSQDDSLDVLSMVLRDLFSKAKQENKNTRLRTLKDLDQATATLVDACKLLLNTELCDHEIRDTIYTTVGHEALVSAVENATALIRPPSNVFYHELEQKEKTVQKFLPSLLRVINFDSNQAGKPLLASLEWLKGKQTDEPPMEIIGTSWKRNIVIKNECSVINWPQDEPRPTYRVIKKLVKTQDGIILHNDKLLYADLINKKIKEIVVPEKKQSQVEKLKKSILNMKEVQKNANNKELALITSITGRDSNRTTIDRTAYIFCVLDKLQSALKHRDVFISPSWRYADPRANLYSGSEWEAIRPMICRSLNLTIDPMLAITSLTDELHQVYRLVAANIDNNPAVRFETVKGNEELILTQLDALDEPPSLKALRAAVKAKLPRVDLPEMVLEIATRTGFADGFTHINEGSARAEDLLISLCAELLADACNTGREPFVREDIPALKRDRLVWVDQNYIRNETIMAVNAILVSAQNQIPLAKKWGGGDIASADGMRFVVPVRTVHAAPNPKYFKSGRGVTWYNLISNQRTGLNAVTVPGTLRDSLILLGVVLEQQTELQPTRIMTDAGAYSDIVFGLFRLLGLRFSPRLADMGGARFWRIDPLADYGKLNVLAKSRININLVPPEWDDILRLLASLKLGRVPAEGIMRTLQVADKPTRLAKAIAEIGRIDKTIHMLNYLHDESFRRQTLVQLNLGEGRHSLGRSVFHGKRGELHQRYRAGQEDQLGALGLVLNIITLWNTIYMDAAINQLRQEGFPVYDEDVARLSAYGYGHINMLGRYSFAMPDEVKRGELRPLRTTEKP >CP025493|86044:95086|87130_88096_-|AUH74274.1|DBSCAN-SWA MQVRAFNSVAVDKINNIFTKSSNNIEKLKSEILYYLFLPKELRSFFPKLVNYQKDYSTYKLQYIPYKSLEELILNQEISFAECKNILGDLIRLMDKFHKIKPSKMDITSVDVANFYIKKTKERIYDLGKINDFKNILSKSYLTINGIKYKNFSLIENSFSQLIQQHTAKHHSISIIHGDFCFSNILYSPTKQTIKLIDPRGSFIHEGIYGHNLYDYAKLLHCVHSRYDFIVNDLFTLNECDSECFYFEIPTSLLLDQLEEFYKEILIEKNITLEFLYLIEASLFLSMASLHYENIQRQKILYLIGIIILNQVIEGHYAHMH >CP025493|86044:95086|86790_87147_-|AUH74275.1|DBSCAN-SWA MRICIDIDGTICTLREANQTYKNVLPLPGAAQKIKELRENGNYIILNTARHMKTCESNIGQVIAREGHTLLEWLKEHHFEYDEIWFGKPYADLYIDDKALKFEGSWEKVGDIIMKNLL >CP025493|86044:95086|86044_86779_-|AUH74276.1|DBSCAN-SWA MNIVIPMAGLGSRFAQSGFTLPKPLINVGHKPMYRRAVDCLPLTFAKKLIFIIRENEYVDTLKDDIETNYEDLPLALVILKHETEGQAETLLYCSEYLDLNEPTLIHNCDTYIKENFNWDHLVQQNIDGAIVLFNSQEERWSYAKLDSNQQYIIDVQEKKVISDYATTGTYFFKNTSDLLEITAKNIQANVRENNEFYLSSTYKSMLQMSKKIIPLWTQKMFCFGTPQDLVNSLNSLLLESMFQ >CP025493|86044:95086|92767_93163_+|AYK03145.1|DBSCAN-SWA MINIKYGFGKEVLYSFDDAIKKVTEELQKEGFGVLTNIDVSATLKKKLNKDMPPYQILGACNPQFAHHALEKEPSIGLLLPCNVVVRQDDIGKVHIEFMDPKSVLELVGNPEINLVAGEVRQKLERVLSAL |
7 | Synechococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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