Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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CP018889 | Beggiatoa leptomitoformis strain D-401 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas10,DEDDh,cas3,csa3,RT | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
122065 : 179030
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP018889|122065:179030|DBSCAN-SWA 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40 | Bacillus_virus(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1463333 : 1505152
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP018889|1463333:1505152|DBSCAN-SWA 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36 | Bacillus_virus(16.67%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1903400 : 1940700
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP018889|1903400:1940700|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP018889|1903400:1940700|1904760_1904964_+|AUI68653.1|DBSCAN-SWA MQTGTVKWFNESKGFGFLAPDDGGKDVFVHFSTIQSGGFKTLKEGQAVQFEAQMGPKGLQTSVCIPL >CP018889|1903400:1940700|1921185_1922328_+|AUI68663.1|DBSCAN-SWA MKTTTTLTLVSPSPLTQRSLLVHRYGMVGARPKAYLHAGLHADELPGLLVLHHLQQLLDNAAENGEIIGEIVLVPVANPIGLGQYLNGHLVGRFDFEIGKNFNRDYPDLTEAVLAIVEPQLTNSATQNVQCIRSALQQQLQIQSNDTEPEALKKALLRLSIDADEVLDLHCDGEALVHLYVSKHHVEQGMTLGAQLGAKTILVEDNVGGDSFDEANAGIWWKLRDRLPDTFPIPLACFSTTIELRGRADVDDTLARSDALNLFRYLQRRGIIAGKPEPLPALLCKPTPLEGADVLKAPLAGILAYHKALGEYVHAGEVVADVVNITASSPEQSRIPVISQTDGVIFARRLEKLVRPGESFCKIAGTHKLAHRKYGKLLGN >CP018889|1903400:1940700|1903400_1903607_+|AUI68648.1|DBSCAN-SWA MQTGTIKWFDKTRGYGFIAPEDGSRDVLIHYSSIREEGFQSLNEGQKVEFESQLGPKGPQATVCVPYS >CP018889|1903400:1940700|1934370_1934763_-|AUI68672.1|transposase|DBSCAN-SWA MWSFVGQRRQKVWVWLALDRDSREVVGIAFGKRDVEGAQALWNSLPAVYRQCAVCYTDFWEAYQKVLPSKRHQAVGKETGLTNHIERFNNTLRQRVSRLVRKTLSFSKKIENHIGATIFFINDYNKSLLL 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>CP018889|1903400:1940700|1926126_1927113_+|AUI68665.1|DBSCAN-SWA MKIQIVAILVGLLSSIQPIHASDAIIVYSARMAHLIKPLFDAYTKKTGVSIKFISAKEEELLERLVIEGENTPADLLLTVDVGNLWLATEKQVLRPIDSATLEKNIPAHLRDPEKRWFGLSVRARPIMYNTEKIKPEELKDYADLANPKWQGKLCLRTAKKVYNQSLVAMFIARDGVEKTRAVLMGWVNNLALPVLSSDTQVIESIANGQCEVGIANTYYLGRLQHDNPNLPVAIHWHDGVHINISGAGVTKYAKHPDLAIQLLEWLSSMEAQDQFAELNFEYPANPQVKLSAIVEKWGSFTADTLHVSEAGRLQLEATHLMEQVGYR >CP018889|1903400:1940700|1935685_1935952_-|AUI68674.1|DBSCAN-SWA MLTCPSCKATHIVKYGKTRTGTQNYKCRECGRRFVEQPTKKYISQETWAQVDKLLKEKLSLRGIARVTGISGTWLQHYVNGLYAQQRL |
35 | Morganella_phage(63.64%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_4 |
3545988 : 3553493
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP018889|3545988:3553493|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP018889|3545988:3553493|3549936_3550551_-|AUI69926.1|DBSCAN-SWA MASLQLYALIPQTHVLGPFTRFALWVQGCPFRCHDCMTPDALRVDGGTSVEITELAQQILNTPTIEGITLSGGEPFAQSAELLELIHQIKRVKSLGIIVYSGYTLEQLQKMAKKHPAVAGLLDQIDVLIDGLYIAEQNDGLSLRGSKNQQIHALTPRYAALIAEYYAQSQRAVEMHLLADTVMLVGIPGINLLSTWQTQIKKQS >CP018889|3545988:3553493|3546950_3548804_+|AUI69924.1|DBSCAN-SWA MCGIAGFIGTGTIADLRSLTHRLQHRGPDAEGLWHEQTVFLGHRRLAIVDLSGGQQPMLTSDKDLVIVFNGEIYNHIALRQQLQCKGHVFVTDHSDTEVLLHGYREWGTELPNKLNGMWSFVLYDRKQQVIFCSRDRFGEKPFFYTCQKDLFVFASELQAITAHPAVTPTLFPLALQKYFAYGYIPAPHTLYKNIYKLPAGHSLIYNLQTQHCNIQKYWDFVLEPFTTIPSNPDIVWAEQLRELLDNAVKIRLMADVPLGIFLSGGVDSSAVAAFARRHVDRDKLNTFSIGFTEADFDESKYAQQVASYLGTQHHLDVLSLDKAQTLLPSIIDKLDEPMGDSSLLPTYLLCRFARQTVTVALGGDGSDELFAGYDPFRALRWATLYQKFIPKPLHQGIRLLFARLPVSHRNMSVDFKIKRTLRGLSYPPSLWSPVWMATLDPQELNDLFQEPIDLENLYSEAIIQWDACQQDNLVDKTLQFYTKLYLQDDILVKLDRASMMVSLEGRCPFLDIDLVNFIRQIPSDYKFRHGQTKYLLKKALEGILPNEILYRSKKGFGVPIGKWLAQGKLTIPTTFPLLHSPFIQEKIHEHRCNTVDNRAFLWNLSLLSRWSESKSF >CP018889|3545988:3553493|3545988_3546948_+|AUI69923.1|DBSCAN-SWA MHSLSLIIPVYNEAENIPLLQEKIAKTLAQLSYPYEIIYVDDGSQDQSFAVLTALAQNNAFIKVIQFTCNHGQTAAIAAGIDHATGDVIIFMDADLQNDPADIPMILNKLDEGYDLVSGWRANRQDAWLTRTLPSNMANWLISKVTGVRLHDYGCTLKAYRKEVLQGYRLYGEMHRFLPAYAAQVGARIAEIPVNHNPRRFGQSKYGLERIFKVILDLFTVKFLSKYGQKPIYLFGSIGAGFIVGSFLLLIYLLLDKFFYAQSLVTSPLLLMSAMFFIVGVQSIFFGLIGELLMRTYYESQDKPTYSIRTRFNITADKP >CP018889|3545988:3553493|3550722_3552201_+|AUI69927.1|DBSCAN-SWA MTPYKRLVDGIKKILKSFEPSEVQPQTALSSIIDTQKPVPLRISRAEHALSRKNISKSALKVLYQLQSAGFQAYIVGGGVRDVLLGKQPKDFDIVTNALPEQVKNVFRNCRLIGRRFVLAHVYFGQEIVEVATFRASHGGKVNGNERVIEDGRIVRDNVYGTTVDEDANRRDFTFNALYYDINDFAILDYANGMADLQAGIVRLIGDPMLRYQEDPVRMLRAVRFAAKLGFTIENYTAEPIPQLGGLLADVPSARLHDEVLKLFLSGHGLKSFRYLRQYGLFEHLFRQTHECILENPNVLTMVEQVLKNTDERVAKQQSVNPAFLFAALLWSPILKVLPFHREEGASEQDCLINAMQRVMNKQVKQVAIPKRISVIMQEIWLMQPRLLQRKNKRKRLLLMEHPRFRAAYDFLLLRAFLDAEAREGAEWWTQALTTEVVARVPEENTPVIAEIEETLIISTPPTHPAIHKQPHHNRRKRRPYRRRNDASQSES >CP018889|3545988:3553493|3552210_3552699_+|AUI69928.1|DBSCAN-SWA MVNSIAYIGLGSNLAEPVKQIHQAFQSLATLPQTQLRKQSGLYQSKPLANMLQPDYINAVAVLETQLPPYILLEHLQAIENQQGRVRGERWGARTLDLDILLYDALQSTDPRLCLPHIGLTQRAFVLYPLYECEPALILPDGTPLEILLQHCPMDGLYRIEN >CP018889|3545988:3553493|3552698_3553493_+|AUI69929.1|DBSCAN-SWA MPRLSLNHFRKLKRQGEKFASLTAYDASFAHLIEEAGIELVLVGDSLGMVIQGHESTLPVSIEEMIYHAQQVHRGSDNMLLMVDMPFMSYATPDTALHNAARLMREGYAQVVKLEGGNWLVDTVKLLTERGIPVCAHLGLMPQSVHQLGGYVVQGRANSDAERLRQDALALQAAGASMLLVECIPGKLAAEITQALHIPVIGIGAGAECDGQILVLYDMLGLTVKPPSFSKNFLTEQYSIQAAVQAYTQAVKSKAFPTIEQTFT >CP018889|3545988:3553493|3548809_3549940_+|AUI69925.1|DBSCAN-SWA MNLLLINYEFPPIGGGAATATWNTAHELAKQGHQVTVLTSCFQELRGWSEEQGVFIYRCLAFRHQVSRSSLFEQFSFVLSAMMVLPRLLKKQNIQGIIVYFSIPCGPLGLWAKLLYKTPYIVSLRGGDVPGLEPRIMWIHRILQPLRRVILKQAIAIVANSIGLQQVAQKADPFQTQIIANGVDTHFFFPIPHENPIFQFLFVGRFQEQKNLFFLLKQLKKLRDTTTLAFCCHLVGDGYQKTALQAYAQQLQLDDVLIWHGWLDKTILRACYQQADCLLSFSLYEGMPNVLLEAMASGLAIVASQVTGHESVVRHGETGYLLALQNNDEIQTTLKYLITNRQQTKVLGDAGRQWVMEHFSWEQVAKQYVQLFVNKS |
7 | Salmonella_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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