Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016495 | Lactobacillus pentosus strain BGM48 plasmid pBGM48-4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP016493 | Lactobacillus pentosus strain BGM48 plasmid pBGM48-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP016496 | Lactobacillus pentosus strain BGM48 plasmid pBGM48-5, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP016492 | Lactobacillus pentosus strain BGM48 plasmid pBGM48-1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP016491 | Lactobacillus pentosus strain BGM48 chromosome, complete genome | 5 crisprs | cas9,cas1,cas2,csn2,csa3,DinG,cas3,DEDDh,cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e,WYL | 0 | 23 | 11 | 0 |
CP016494 | Lactobacillus pentosus strain BGM48 plasmid pBGM48-3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016491_1 | 123447-124178 | TypeII |
NA
Consensus repeat of CP016491_1
|
10 spacers
spacers of CP016491_1
>1.1|123483|30|CP016491|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATCTAAGTCATGTCGCGGGGTGGTTTTTC >1.2|123549|30|CP016491|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTACAATTGTAATCAGGGTACGCGCCGT >1.3|123615|30|CP016491|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATTATTTGCAAAGTGGCTGGTGTAGACC >1.4|123681|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT ACGGCTTTAAGCTTGTGCTCGTGGACGTAT >1.5|123747|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTTATGTACCAGCGATTACAGCCGTTAAT >1.6|123813|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGACGGTAGTAAAAACACCGGTACTTGCA >1.7|123879|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGGTGTTCGTTAACGACGGGCGCCGCGTTC >1.8|123945|71|CP016491|CRISPRCasFinder TTTGACGCTGTAATATATTCATCTATAAACAGGTTTAGAACCCTTGCTGACGGTAAACAGCGCACCAGATA >1.9|124052|30|CP016491|CRISPRCasFinder TTTACCTGCCGTATACGCCTGATACTCCAT >1.10|124118|25|CP016491|CRISPRCasFinder AGGATCGTTTCGACCTGTCATCCGG >1.11|123945|26|CP016491|PILER-CR TTTGACGCTGTAATATATTCATCTAT >1.12|124007|30|CP016491|PILER-CR CCTTGCTGACGGTAAACAGCGCACCAGATA |
csn2,cas2,cas1,cas9,csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016491_1
The CRISPR arrays of CP016491_1 >merge|CP016491|1|123447-124178|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACGATCTAAGTCATGTCGCGGGGTGGTTTTTCGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACATTTACAATTGTAATCAGGGTACGCGCCGTGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACTAATTATTTGCAAAGTGGCTGGTGTAGACCGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACACGGCTTTAAGCTTGTGCTCGTGGACGTATGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACACTTATGTACCAGCGATTACAGCCGTTAATGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACTTGACGGTAGTAAAAACACCGGTACTTGCAGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACCGGTGTTCGTTAACGACGGGCGCCGCGTTCGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACTTTGACGCTGTAATATATTCATCTATAAACAGGTTTAGAACCCTTGCTGACGGTAAACAGCGCACCAGATAGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACTTTACCTGCCGTATACGCCTGATACTCCATGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAGCAAGTTTAGAACAGGATCGTTTCGACCTGTCATCCGGGTCTCGGACAGTGGTCATTTTAAGCAGTTGTAGAAT >CP016491|1|1|123447-123680|PILER-CR GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC GATCTAAGTCATGTCGCGGGGTGGTTTTTC GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC ATTTACAATTGTAATCAGGGTACGCGCCGT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC TAATTATTTGCAAAGTGGCTGGTGTAGACC GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACACGGCTTTAAGCTTGTGCTCGTGGACGTATGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC ACTTATGTACCAGCGATTACAGCCGTTAAT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC TTGACGGTAGTAAAAACACCGGTACTTGCA GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC CGGTGTTCGTTAACGACGGGCGCCGCGTTC GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC TTTGACGCTGTAATATATTCATCTAT AAACAGGTTTAGAACCCTTGCTGACGGTAAACAGCG CACCAGATAGTCTTGAATAGTAGTCATATC >CP016491|1|1|123447-124178|CRISPRCasFinder GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC GATCTAAGTCATGTCGCGGGGTGGTTTTTC GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC ATTTACAATTGTAATCAGGGTACGCGCCGT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC TAATTATTTGCAAAGTGGCTGGTGTAGACC GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC ACGGCTTTAAGCTTGTGCTCGTGGACGTAT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC ACTTATGTACCAGCGATTACAGCCGTTAAT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC TTGACGGTAGTAAAAACACCGGTACTTGCA GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC CGGTGTTCGTTAACGACGGGCGCCGCGTTC GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC TTTGACGCTGTAATATATTCATCTATAAACAGGTTTAGAACCCTTGCTGACGGTAAACAGCGCACCAGATA GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC TTTACCTGCCGTATACGCCTGATACTCCAT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAGCAAGTTTAGAAC AGGATCGTTTCGACCTGTCATCCGG GTCTCGGACAGTGGTCATTTTAAGCAGTTGTAGAAT >CP016491|1|1|123447-123944|CRT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC GATCTAAGTCATGTCGCGGGGTGGTTTTTC GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC ATTTACAATTGTAATCAGGGTACGCGCCGT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC TAATTATTTGCAAAGTGGCTGGTGTAGACC GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC ACGGCTTTAAGCTTGTGCTCGTGGACGTAT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC ACTTATGTACCAGCGATTACAGCCGTTAAT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC TTGACGGTAGTAAAAACACCGGTACTTGCA GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC CGGTGTTCGTTAACGACGGGCGCCGCGTTC GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC >CP016491|1|2|123711-124051|PILER-CR GATCTAAGTCATGTCGCGGGGTGGTTTTTC GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC ATTTACAATTGTAATCAGGGTACGCGCCGT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC TAATTATTTGCAAAGTGGCTGGTGTAGACC GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACACGGCTTTAAGCTTGTGCTCGTGGACGTATGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC ACTTATGTACCAGCGATTACAGCCGTTAAT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC TTGACGGTAGTAAAAACACCGGTACTTGCA GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC CGGTGTTCGTTAACGACGGGCGCCGCGTTC GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC TTTGACGCTGTAATATATTCATCTAT AAACAGGTTTAGAACCCTTGCTGACGGTAAACAGCG CACCAGATAGTCTTGAATAGTAGTCATATC AAACAGGTTTAGAAC
>CP016491.1|AUI77283.1|122744_123422_+|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MNLTYYPFPPFKINTGQVNILDIGNSQMYADICQGFRDRTDDLRVSNDNLELQTMSSQCSWYGDLMLSVDLNRLFMKKIQTQIIKLMADEQQVAVLDQSRAMIAKVMEASFLLDLPLDVEEAPGLDQALKFAGIHFPTDLTHNPSAVLEALVQTHVELGLKQCPVMTNVSHYLNPEQWAVFEQQVADLDITVIIIEYSETNRMEKFKNCCYYYVDEDLADWRDMN >CP016491.1|AUI77282.1|122442_122748_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLIVMFDVPMDTSDQRRAYRHFHKALIREGFLMMQYSTYVRVCVNKKAAEFVEKRIAPLAPKGGKVQTMTVTEKQYQAMHYIQGAPSTDVLNSAERTIVI >CP016491.1|AUI77281.1|121559_122465_+|subtype-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRNVIITQHAKVSYSMNRIIVQTSTDKHVIPVSDIQLLLVGTTQAVITSAALCALAEAHVKVIFTDHQGEPISEVNDYYPTRRTAKLVRQQVAWPESRIAKLWTKNIGSKILNQIQVVDFVGGNVQPLVDELDKLELNDVTNREAVVANKYFSLLFGEDFYRRDFSSINAALNYGYAILLSMVNREIVMNGYLTCIGIHHENNENEFNLGSDLMEPFRPIVDQWVSQQRFDEFTPDIKIGLVSLLDLEIGFNGHQTIVSHAITTYVADCLHYLSSETEELKIEVKLPDEVSSHAINSHV >CP016491.1|AUI77280.1|117289_121366_+|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MNEPYGVGLDIGTNSVGWTVVDMNGRVRKVKGKTALGARLFKEGATAEDRRGFRTTRRRLKRVKWRLRLLREFFDQPISKIDPNFFARRKYSDISPRDPNYNGLAKTLFNDRTDQEFYHDYPTIYHLRDKLMTSDRKFDIREIYLAIHHIVKYRGNFLRTGPASQYGSASLHLATSFQKLNDLFTQSEETLNLKLVTDEAQLQQIQQILVRTDLSRSDQQTQILPLMAVLTGASAAEKRRQKDFAKELANALVGLKAKLNVVTLTNVDTTVVKDWTFTLEESQDKLPEIEEQLSEVGQQIMDEVIQLYASVNLAQLIPAGKRFSQHMVEKYKHHEKNLKLLKEYIHSQSDSKRGREIRATYDRYIDGVKSKPVTQEMFYKDLMKYVEADATSNHLAAEIKAEIDSEQFMPKLRTKQNGSIPYQVQQYELDQIISHQKKYYPWLGEENPVAERRGKFPYKLDELVGFRVPYYVGPLITKEDQQATSGAGFAWMVRKAEGPITPWNFDQKVDRIASATAFIQRMQTTDIYLIGEDVLPARSLIYQRFMVLNELNNMRVEDQQLAPRQKQRLYNQVFKQHQHVSVKNIQQNLMDAGEYRETPKITGLADPKGFNSSLSTYHDFKKILPEAIADEHKRADIEKIILWSTTFEDSAIFKQKLEEVAWLTDAQRKQLSGLRYRGWGQLSHKLLTAFRDDNGRSIMDGLWETSDNFMQLRKQPAIETQIKEANQANLTDADIQDTINELYTSPQNKKAIREVMLVLDDIKNAMHGQTPSWIFIEAARGGGVAGRRTQSRSKQIVEAYKSTAKEIVSEKVQHELNEKIKAKADFNTRLVLYFLQNGRDLYTNETINIDRLSEYDIDHILPQSLVKDDSLDNRVLTSARINREKNDTFASEKFGRKMGAQWRELHWNGLMTQRKLNHLLMRPDEISKYATGFINRQLVETRQVIKLVEELISSEYPAASIVAVKANLTHQFRQTFNFPKLREVNDYHHAFDASLTAFIGTYLLKQYPKLERFFVYGKFAKQPVNLTRFNVIRKLAVAEEPIANIETGEILWDKTVDIKYFEKLYNYKRLLVTHEVRENYGAMFDQTIFKATDSRKRLIQKKKGFATETYGGYTGRTLAYLTIVKVVTNKDTQYQVVGIPTTMVTQIQQLEASGLTSKQAVTKAIGAMINENNKKLQSYEVLLPKVRFEQVVRDEVKGHIHRFALGTDTYYHNIQELYLPLTIQRAFLGKRNDTDIQTEQNLLTVFETTLAQVNRYFPLYEMNKFKQILNSAQEKFAALPTKNKTVKNKFVIGKDGVLNNLFIGLHANASFGNLKVLGAKTSFGQLQVPGGLKLTDQAEIIYQSPTGLFERKVALKDL >CP016491.1|AUI77279.1|116264_117047_+|alpha/beta-hydrolase MHFITSDYVQLNYTDQGSGQPIVILTGFGGSKDIWHAQIPVLVQAGYRVINLDGRCQGLSEHTVKGLRMSRRAVDAHELIEKLQLKQPILLGNSMGAATWFAYVSLYGDTGIKALIDVDQSPKMINTPDWPYGFKSVQWVDFPDYFRMPLGHSTFKHIDDDTYARVTAVEEQAPFDGKLMFPLLVNHAVQDWRDIVRQLTVPFLIISGEKSPFFDSDFAAVTAKMAPLGQSVVIPDAGHIVMAEQSAAFNEALLAFLKTL >CP016491.1|AUI77278.1|115529_116240_+|hypothetical-protein MVKQGRYAGVSKQKRLRQLKQRHQAQEQRAIRPGAVGEFLQVRYHLTQAGQQRPVMRQTMQRFMSRWLANAQDLLDEDEQTTWSMTALTKQAMQQFNRQLPWQGYALLDQEMPHWTAFLTKEVPAVPLQERISLVEPLTAETWRACLTEQLAVNTMLAMTHNNRQQLQQVQTDQIQSLQTSIQTANGVDWEKVAQLLGPTVTEPDPLTSTMMDNKTKQWLERLNKLTPAKFNTDVE >CP016491.1|AUI77277.1|113899_115264_+|amino-acid-permease MQRKLSTGQMQMIALGGTIGVGLFMGSSSTIKWTGPSVLIAYIVSGAFLYLIMRALGEMLYVDPNTGSFAKFASEYIHPVFGYLTAWSNIFQFVVVGMSEMIALGGYCRYWWPNLPDWIPGLIAIVFLCAANLISVKMFGTLETWFSLIKVITIILMIIAGLGLIIFGIGNHGQPIGISNLWTHGGFFTGGVKGFVFALAIVLASYQGIELIGVTAGEAENPQSTIVKAIRSTVARILIFYVGAIFVIVSIYPWNQLSQIGSPFVQTFAKIGITAAASIINFVVITASLSGTNSGIYSASRMTYTLAESHQLPKKMTLLNRHGVPFYSVIAIATGILIGVVLNVVLPMFFKDAGEIFVMVYSSSVLPGMVPWVVILVSQIAFRKQNAAKMKNHPFKMPFSPYSNYLTLAFLALTLLFMFINPETRYSILVGVVFLIVMTLIYFRKYAGNKEDNL >CP016491.1|AUI77276.1|113197_113662_-|ADP-ribose-pyrophosphatase MANYIKEIRALVGHKPIILNTAAGILVNDQQQVLLNLRTDTHNWSLPGGYLEYGETYAAACVREYKEDSGIDVEIVDRIAIFDKGETAYPNGDVAQTISALFLVKPVGGQALTHATDETLKLDYFDFDNLPPLLNQQNADMIHAGQQYLQTHPQ >CP016491.1|AUI77275.1|111245_112838_+|DNA-binding-protein MKQIEMGMRITTNQQQTYRVIAVVNQGQQILARPIEPETAPVEVIAITDIVQITEQKPAKATGLALDTVAVVGQRYIDNIIPVLAELEVGLPVLLQRESNNQYDDNAISVWTCQHEKLGYIARYQNQPYAALMDQGQLLYGTVTELDKKQQHLSVMVWRTTTGESSVEAMQARQQLTTQSTSLGAMPKHLLQTPLGTLVVLCNGRPINYQRVPLSPWLTPDDALQVTKRYLITPDWSQVPANSLVTCQVTATADVVQRWQDDRISAAVLTNASSFYVVGLSAQARTDLNDNLVDDGSQAAVIYRVGQLKAHEQAGFMVSWAPFGDPRVQPALKLALQFTSQPVVPYQPKTPSQTHATFTQQELAAILVSALPNYQGGQRLEPSVTAITVEKIRQTLGDQAYHALANYQQYVQLAATSTEDVDETLLQALIHAVVYHEITTMHYYQPTVGMVDHVIYPLQLFSTATKDDESQLIGCLAFYNYAMFEIQQVPLTAIARIAIIADPEHPQMTPTTESPDWLRIFLRGWNDDVE >CP016491.1|AUI77274.1|110529_110874_+|HxlR-family-transcriptional-regulator MHTRKIFDCQAGCPVESTLQVIAGKWKSVILYHLLTSGVCRFSELQKRMPDCSRRMLALQLQELEHDQLISKRVYPVIPPKTEYRLTDFGLTLKPVVMEMEKWGRLYNARKVAD >CP016491.1|AUI77284.1|124289_127034_-|magnesium-transporting-ATPase MINDDNNQSLSANNEAQNDSQNPPDADNLWQLDESALANKYATDPENGLSTAEAAARLQHNGRNELETKRTSRFVQFIKQFNNSIIYILAAAAVLTFFMHHYSDSIVIGLVIIANAIIGYVQERQAGNALERIREMLISKNFVIRDGKKLEIDARELVVGDLVNLEAGDAVPADMRLISADNFNVQESVLTGETNPVEKQEEPMTDTSLALADRKNMVYASTAVTSGSAVGIVTATAADTEIGHIQQSVSDVKETTTPLMRNLNSLGVGLSIAIVVAAVLLFLLGMVMDTYSLPTLLIAVITMVVGSMPEGLPASTSVVLAMGTRQMTKKNVIVKSLPAVETLGAVDIVNTDKTGTLTKNEMTVTKVVTPEHTFDVTGVGYDDNGGVNFDGHLKLNGQKVDWHQDKAMEWLVKIAGQTTDAELHFENNRWELTGEPTDGALTTLFRKMTGHDPEVDEIESLPFDSAFRFSARLADLNGQCLLMVKGSPATVLRLTDQANQTAYWDNAMDDLTADGLRVVALAYQVVDDDVTDIDPKAISGLHLAGFVGIIDPPREEAATAIAELRQAGVDVKMITGDHPDTAMAIANKLNLAANVKAITGPEIDAMDDQQLQEHIDDYNVFARATPNNKLRIVRAQQANNHVVSMTGDGVNDAPALKQADIGVAMGIKGTEVAKESADMVLADDDFADIVAAVREGRHVFDNIRKTIRFLLPTSFAEGLVVIISILMGHELPLYPTQLLWINMVSALTIQFAFIFEPPEAGIMARGPRNVKSGLLSKLDYFEIGYVSFLISGLGIFAYDYLTALGLPNVVGSTMSLNIIIFGKIFYLFNLRNDHPVISKYFFQNKMAFYIIGILILLQLGIIYLPFMQSVFHTTSINFWYGWGIPIVCGIVVLIVTEIGKFIRFRRMGKDRVLD >CP016491.1|AUI77285.1|127484_127679_-|PspC-domain-containing-protein MKINIHRSATNRVLAGVIGGIAEHFNWNANITRLVFVLLAISPMFPGIIAYLILWLLMKDPVES >CP016491.1|AUI77286.1|127743_128346_-|NADPH-dependent-FMN-reductase MVKIGIILGSTRTQSNGRSLFNYLKRNLDQWQTDEAITTAFLDLAHYQLPFFDESEPPMANPHRQLPANQQQWLDDMAAMDGYIILTPEYNHAMPAGLKNALDFLAFEGLRKPVKLISYSDNMRGGQFGAAALVPVLQRLGMVVLPKPTPVGNVPQTLQTDGQVIPDAPLASRYESGLQRAVGEIAYYTTVLTQHPFLTD >CP016491.1|AUI77287.1|128458_128929_+|MarR-family-transcriptional-regulator MAMLIDQLMSELNQFIAQDSVDDQEKQWAMRQTTDPQLQAVLKQLSTTDIKMIAVLGQVGASRAKALPAPTGLSQATISRGLTKLARLGLAVKYRDLTNNKEVLVRLTPTGQQVAQLHTQLDAAIAQQAQAIADDYSDAELARFVTLMKRIREIKI >CP016491.1|AUI77288.1|129073_129496_+|heat-shock-protein MANTLMNRNDFGMMDPFERLARSFWTPFENMDQVLKTDISETDDQYQVKVDVPGIDKQDVKLDYRDNVLSIKVQKDSFVDHEDEQQNVVMNERHTGTLQRQYMLPNVAADKISASQADGVLTITLPKTQASDDNGTIEIQ >CP016491.1|AUI77289.1|129824_131057_+|multidrug-transporter MDDAERERGPWHRNLIVLWFCTFVAGMAFSEIMPFLSLFVSQLGDFTKAQVTFYSGLAFAADYAISAISAPLWGIIADKKGRKIMLLRASFGMAVAMGLMGLVTNVWQLIALRALQGVFAGFISNAQALVASQAPRKYSGRALSTLITGAVSGQLFGPVIGGFLAQLFSIRNTFFITAGLLLVAFLLSLFFVQEHFKPVEHHRNPGDSRNPLAAFQNPRLIIMMLCSTAIVQFGNASIAPIISLYVRELMHYKGPITVVAGIIAALPGISNIFSAPRLGRYGDHHGSGKVLLFGYIFAVIMYFPQGIVTSVVALGILRFAIGISDGALYPEIQTVLTKNTPVNLTSTIFSYNQSFQAIGNMLGALLGGLVAGWFNYNAVFIMTALLLLINLVLILWLVPGIWKTGDRVAS >CP016491.1|AUI77290.1|131294_131594_+|transcriptional-regulator MDIEINQQNQEDQQRVAIFKALADDNRLRIIRVLYQAQREMTCGEVGAQLSISKSTVSYHFKALRLVGLTNTRREAQTKYLSLQRATFDHFLPGFLDSL >CP016491.1|AUI77291.1|131654_132845_+|MFS-transporter MTTTHQHSRYLTLGMILAATNMRLPITMMPGLISSLKRTLGLPSSMAGLLTTIPLLTFAVMSPLIAHWGRRFGNELTIYVMLIFLALGSYLRVIPTIAALFIGTLLVGIGADGGNVLIPAIIKDNFPTKIPLATSQYTLSMLLVGSLGTGISGVLAAHWSLPATMAVLSVIGLINLVVWLPNLKYNHREPVATNDEQDSTVVTHGSVWGRPLAWVVTAFFGLQALVYYSLLTWLPTVFTAHGFSTIVAGNLVTIMQLSGLPMSFIVPTSSGKRRGVLAMIWVVGVGFIAGIGGILMSGTSFGWSALWCILLGLGSGAAFSLAVVFFTQKTTNGFETADLSGMAQSAGYLLAAIGPVLFGWLGGQLGWAPVLWLAIGFSALLALAGSIIFRHDSIYD >CP016491.1|AUI77292.1|133181_134030_+|2,5-diketo-D-gluconic-acid-reductase MAILTSTYQLANGVQIPKVAFGTWQIPGGDTAYQAVRAALKAGYRHIDTALAYRNEASVGKAIRDSGIPREQIFVTTKLPAETKSYQGALADFDESLKNLGLDYVDLYLVHAPWPWSQVGRVYDEANLEVWQAMEAIYDSGRAKAIGVSNFAVRDLKNVLKQATVAPMVNQIQYYLGFTEPKITQFSEDHDMLVEAYSPLATGGVLDNPQVQAYADKYGVSVAQLALRFVLQNGVLPLPKAVTPAHITANTQLDFTISDADMAALNALPDAAGAYMHNPTQG >CP016491.1|AUI77293.1|134114_134987_+|aldo/keto-reductase MTTINAANAGTYAFDDQFKVNRLGYGVMQLTGPGTWGPYADPENGVKVIKKALEYGVNFFDTADSYGPWYADRYLAAGLKDAANRDKIFISDKVGQTRQGPNVWTPHGEPHYLRQQVEVSMMTLGLDHEDLVFLHRIDSHFSIAEQVGELKKMQDEGKIKHIGLSQVTVEQIKEAQKVAKIDAIENLYNVSDHRDDDVVDYAASQNMAFLPWFPLATGELAQPGSALSTMAQKYQVSPAQIALAWLLKRSDNILPIPGTSSIEHLQDNVAAANVELSTADFNGLSQLSNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016491_2 | 379286-379364 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP016491_2
|
1 spacers
spacers of CP016491_2
>2.1|379311|29|CP016491|CRISPRCasFinder TGGGTAGCCAGTGAAGCTAATACAATCAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016491_2
The CRISPR arrays of CP016491_2 >merge|CP016491|2|379286-379364|CRISPRCasFinder ATGACAAGAGCGTATCAAGCTTTAGTGGGTAGCCAGTGAAGCTAATACAATCAGATGATAAGAGCGTATCAAGCTTTAG >CP016491|2|2|379286-379364|CRISPRCasFinder ATGACAAGAGCGTATCAAGCTTTAG TGGGTAGCCAGTGAAGCTAATACAATCAG ATGATAAGAGCGTATCAAGCTTTAG
>CP016491.1|AUI77490.1|378595_379204_+|acetyl-CoA-carboxylase-biotin-carboxyl-carrier-protein-subunit MELDKIYQLMDKFEQSSLTSFEYRDQDFEIQMGKKGHNNKATTASSEPAPLPNQPVIDPTPVTPTPIANASAASVVEPTPTATVTSTAAATPTSIAPESTPEPEPAPTPEPAPVQVDPKECVTAPVVGIYYPAHSSEEAPYVKLGDHVSVGQQVGLIQAMQMMRPVVAKQAGTVKAFLVKNGEEVNFGQPLIQLIPDTPDDI >CP016491.1|AUI77489.1|377517_377988_+|Rrf2-family-transcriptional-regulator MKLDFSVAVHSILYLDAHRDSKVASRELAQSLHLNPVMIRNILSVLHKHGYLTGTVGKNGGYQLDLPLVEMNLGDLYDLTIPPTISYARFITGPSKTDEQASQSPIAANISETLTDLFTVADRQYRAYYHQFTMADLQQDLKQHGLFLKREHDSES >CP016491.1|AUI77488.1|376210_377407_-|DNA-replication-initiation-protein MSSTISAATFKLNEQAALSPAQQSLEQQLLTFIRSHRHQDQSSLFVIHGDAGTGKSAVLAAAFGRLQALSRSTTANDLQATQNYLVVNHNEMLKIYKRLAGDDPDLRKKDFQKPTPLINRLTKTHQRADVIFIDEAHLLLTQPDRYNRFDGHNQLTELIKHAHVVVLVFDTRQVLKLKSYWHTNDLEPFLAHYPHASYNLDEQFRVTGGPAVVNWIDHFTHGQLLEKPATPDFDLRFFDDGQPMYDLIRQQDHRFGLARMVATADFPYVVNHGTWYVTAGQLKLPWDKVNLTDDPWALRPETLNEVGSIYTIQGFDLNYAGVILGPSVGYDAVHDRIIVRPERYEDQEAFKQRADLGDLEPLKQQIIFNSINVLMKRGRYGLYIYAVDPALRERLLAL >CP016491.1|AUI77487.1|375670_376180_-|hypothetical-protein MQLSIPTTDGALAATYSKQAAPAQIYKGHPIISFPVDISDVPAGTHSLAFTFVDHDAIPVGGFTWIHWIAANLPATTTHIPENASQTGAIPMVQGNNSTAGGYVHETDPKVSQHYVGPYPPDKDHRYSFKLFALDTELDLQPGYWLNEFHDAIAGHVLATAKTTVIGRV >CP016491.1|AUI77486.1|375059_375428_+|hypothetical-protein MHIAATIMALVVAVEHLFILWLEMFNADSELASKSFGIPRQTLQSPAVQLLFKNQGLYNGFLAVGILYSLFVIPAVASAGATLFFLACVMVAAVYGSITVSQAIVVIQGLPALIAFILMYFA >CP016491.1|AUI77485.1|373260_374766_+|copper-oxidase MAKKVYTDYFFDEPAYNTHDGGYIPLVTPKVDPQPLAIPPLLQPDRQTDTDDYYTVTAQESETQFLPGKKTKTWGYNAGFLGQTIVFRNGKQTHIDLQNKLPELTTFHWHGLNVPGPITDGGCHAPVYPGQTNHIDFKVHQPAATTWLHAHPCPSTATQVWKGLATMVIIKDDVEDQLPLPRNYGVDDIPMVLQDREFHEDNQFDYRADYDPDGVQGHTALVNGTVNPYFDVTTQRVRLRILDGSNRREWRLHFNDDLEFAQVGSDGGILPAPVYMTKVMMTCAERDEIVVDFGKYQPGDEVTLMTDDTPLCRFRIKAFEPDDTTLPDHLVDIPDEAPTADLPVRKITMDGMDDEVALNGKKFDMERIDARQKVGDVAIWEIRNTNSTENGMVHPFHVHGTQFTVLSRNGGPVYPNEHGLKDTVGVNPGETVRIKVKFELTGVYMYHCHIIEHEDGGMMAQIESYDPEHPQTYHLMDMDTLRNAFAEEQGVKPEDVWMPGM >CP016491.1|AUI77484.1|372246_372915_+|ribose-5-phosphate-isomerase-A MTIKQAIVQQALTLIKPQMVVGFGGGTTVGELVKEAANLVNDITVVTPSPTTRQLATVLGYTVVDTAYCDRVDIAFDGCDQLDHHGNALKSGGGIHANEKIIASLADEYWLLTMQDRLVDQFDIKTPLVLEVLPGALSLVMRSVSDLGGQATIRTAENRDGFTLTDSGNLLIDCHFPTYANLPTLNTALATLAGVVETSYFDRLVTNAWLGDAATNTVRALF >CP016491.1|AUI77483.1|371489_372053_-|peptidase-M10 MKRKYRAKLGLTTLTIIVGIGLTPIANAKSIATPISRSRWPHAQVTYVIQASASERRVYQAAIRAWNATGQFKFVQGTTAHHQVTLETSNATTGQYYRLAGITFSTGYPNGYYTKAQVYLLTRNFTRYHYSYSDQVHVAEHELGHTIGLEHSRDRHSVMLADNRYNGISSADSTAVRLRYRLPVGRL >CP016491.1|AUI77482.1|370692_370962_+|hypothetical-protein MRRQLTNRQRWLVIIVATILGVGCALLGQWGQLLGVVAAALALMLLTSGCLTFCHHRGWQPGSGMLLALAMATGYVIIILGSYGYLLRS >CP016491.1|AUI77481.1|369630_370590_+|L-lactate-dehydrogenase MRKYAIIGVGHVGATIAYTLVCKGIADELILIDTNVGKARAEQLDLQDAQARLDSRTIIKINDYHELDDTDILFVTSGNIHALDHASGNRWAEFEYTKQIVQDIAPKVKATKFDGVVIDTMNPCDAITHYFQRATGLSRQQVFGTGTFLDTARMQKVVAEAFDCDPKNISGYVYGEHGESQFSAWSTVQVNGIPITSLVDKYHLDLDALEAAARHGGWAVHSGKGYTSFAIATCAVKLSEAVFANARLACPVSAYSETFGTYVGQPAIIGRDGVESVTTLALTEDEQAKFRNSADTIIEKFHAFDDVLSEQSVQKRQQA >CP016491.1|AUI77491.1|379466_380387_-|ribonucleoside-hydrolase-RihC MSTKIIMDTDPGIDDAAAITIALNHPDLDLQLITTVAGNVTVDKTTLNALKLTRFFNSDVPVAGGAPQPLIKPFEDAVRIHGVSGMPGYDFPTDLADPLPETAVEALRDYIMAAEQPITLVPTGAYTNIALLFKTYPEVLPHIKEIVAMGGALGKGNMTSAAEFNVFTDPHAAEIMYQSGVPITMVGLDVTMKALLTRESIEQLPAFGKTGEMLHALFGHYNDRNQTGVAMHDVNTLFYLLHPEAFTTEAMWIDVQTDGPANGETVGDIRGAYHDGKTNANVCVDIDAAAFNKWFLATVKAIDEQL >CP016491.1|AUI77492.1|380523_381435_+|short-chain-dehydrogenase/reductase MSQPRVILITGASSGIGKATALKLQAQGNIVYGAARRIEKMTDLAAAGVHVLKVDVTDEATLIAAVKTIQVEQGRIDVLINNAGYGSYGALEDVPVTEGEYQFKVNVFGVMRLTQLVLPLMRAQHCGRIINVSSIGGKIYQPLSAWYMGTKHAIEGMSDSLRMEVAPFGIDVVIIEPGGIKTEWAGIAEKKLLAVSGETAYRDQAIKVGAMLSLFDQFASNPGVIAKLMVRAVNDVKPKTRYHAGMGASLSLTGRRWLSDRQFDRMMTSAVNGAAKLSKVTRRKDRRAGSRHYQHGNSTNETN >CP016491.1|AUI77493.1|381492_381939_-|ribonuclease-H MTTIHLYLASTMHQATPITATTPAAWVVILRYADHQKALNDAGYGHTETQLTLSALIEALTTLKRHDLPVHVHTTTEIVATIISEQRYLTWRQNDWQLPDDEQDNLTQWQQLVPLIEAYPDLQVTYHPVDDPTMTTAATTLTAVMTKL >CP016491.1|AUI77494.1|382778_383006_+|hypothetical-protein MKLRSGFLREFKSMSALFQRCQPAPEVGLGRASADEQESSNDMFQLHMKPQKLQSVAILGAYYYDFGRSMLRLNT >CP016491.1|AUI77495.1|383053_384580_+|glycine/betaine-ABC-transporter-permease MQTLIQTFMDRRSDLLTALWQHLGISLAALVIAMVIAIPLAIWVVRRPRWAEGLLQLTSVLQTIPSLALLGLLIPLVGIGTVPAVIALVIYALLPIFQNTYLGISEIDASIEEAADAFGMSRMRKLFKVELPIALPQIIAGIRTALVLIIGTATLAALIGAGGLGTFIMLGIDRNDTSLLLIGAISSALLAILLSALVRWFQTAKPRHALIVFVGILALLGGGGAYSVYANRVETITIAGKLGSEPDILINMYKQLIEAEDDHIHVTLKPNFGKTTFLFSALKNNQIDIYPEFTGSVLETLVKGNNPASQTANQTYQLAKKRLAKQEQMTYLKPMQYNNTYALAVTKKFQQEHHLKTISDLTQVESILKPGMTLEFIDRDDGLKGIKKTYGLDVTAKSMEPALRYEAISKGKINLVDAYATDSELRQYNLALLKDDKHFFPTYQGAPLMKTSFANKHPKVVQALNKLAGKISETDMQEMNYEVNVKKKSASTVAHNYLVKHGLLKEGR >CP016491.1|AUI77496.1|384579_385551_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTTAIEFQHVQKDFNGQTVIPDLNLTVDQGELFVLVGTSGSGKTTSLKMINRLEPLTAGKILVNGADTTTVPVRDLRWQMGYVLQQIALFPTMTVAQNIAVIPEMKGTAKKTINQTIDELLTEVGLDPQEYRDRMPSELSGGEQQRIGILRAIAAQPDIVLMDEPFSALDPISRQQLQDLVLGLHARYHNTIVFVTHDMNEALKLGDRIGVMQHGQLVQVDTPTALAQHPVNDFVRDFFGASRAKNVYDVYVGRVGLVQGYLKTAPDVADGRIQSLDIQATLRTAFTAFTDHDYLAVTEDDHVVGYLDRQRVVAYLSQHEEVS >CP016491.1|AUI77497.1|385647_386979_+|glutathione-reductase MTEQYDVVVIGGGPAGNAMASGLQAQGKSVLIVEADLWGGTCPNRGCDPKKILLSAVEAQQAAQHLQHQGLTGTPTIDWPALMAHKRGYTDGINDGTLKGLQHQGIATLHGQAHFQNDGQLAVGDQVVSATDYVIATGQRPAILPITGQEYFKTSTDFLDLDEMPKRVTFVGGGYVGFELAAIANAAGADVHVIHHNDRPLKAFDADLVQDLMAAMTADGVTFDLNTDLQAIEQTDAGLRLTAPDFELTTDLVISSAGRIPNADQLGLENVGVTFNRHGIQVNDRLQTANPHIYAIGDVSDTPVPKLTPVAGYEARYLVQQLTHPEAAITYPVIPTQVFAAPKLAQVGLSATDAADQPDKYRVNTLDMTKWFSYYRFGAQQAQAKVIIDQTSGQVVGATLLSDVADEMINYLTLLIEKHVTLAQLQQLVLAYPTPASDLQYLY >CP016491.1|AUI77498.1|388412_389930_+|glycerol-kinase MTDKYIMAIDEGTTSTRAIIFDHAGHKVADSQREFPQYFPQPGWVEHNANEIWNAVLSTIANAFIESGIKPAQISGIGITNQRETTIVWDKKTGLPIHNAIVWQSRQTAPIAEQLVKDGHGDLIHKHTGLVTDAYFSATKIRWILDHVKGAQERAEKGELLFGTIDTWLVWKLTGGATHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDSEILQLLNIPAAMLPEVRTNSEIYGKTKDYHFFGSEVPISGMAGDQQAALFGQLAFEPGTVKNTYGTGAFIVMNTGEQPQLSDNNLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGIRLVESAPDSERAARESHNENEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGSVFGLTRGTTREDFIKATLQALAYQTRDVIETMKKDSGIEIPVLKVDGGAARNDWLMQFQADILDTQIMRAANLETTALGAAFLAGLSVGYWKDLDELKASYKPGTSFKPEMGAAERTNLYDGWQAAVKATQVFKHIPYHAAK >CP016491.1|AUI77499.1|389944_391774_+|alpha-glycerophosphate-oxidase MAFSATTRQQNIERLQNETLDLLVIGGGITGAGVAIQATAMNMKTGLIDMQDFAEGTSSRSTKLVHGGIRYLKTFDVGVVADTVKERAVVQGIAPHIPKPDPMLLPIYNETGATFDLFSVKVAMDLYDKLAEVKDPKFTNYTLSKEEVLQREPQLSPKNLVGGGVYLDFRNNDARLVIENIKKAHENGGIMASHVKATGLLHDDDGHINGITAEDLFTGETFEIHARVVINTTGPWSDTIRKMDHGETYQSQMRPTKGVHLVVDAEKLPVPQPTYFDSGDQDGRMIFVVPRENKTYFGTTDTDYHGDLEHPTVTQEDVDYLLEIVNRRYPTAKITLDDIEASWAGLRPLIAANGSSDYNGGNSGKISDKSFKEVIKVVDQFENQEASREDVESVLNDLESSLAEDKLSPSAVSRGSSLTSSPDGLLTLAGGKITDYRKMAAGAMALVAKILADKFDAHFNEINSKNLPVSGGDIDPHNVDATIAFYAKQGTDNGLTNDEALRIANMYGSNAARVFSLIGKVEPTHGLSLAETISLRYALDEEMTLTPVDYLLRRTNHLLFMRDTLDDLKDGVIATMADYLGWDAATTKEQTDRLNQTIAESDLTALKQG >CP016491.1|AUI77500.1|391791_392511_+|aquaporin MKDPLALQLLGEFLGTFILILLGDGVVAGVTLNKSKAQNAGWVAITLGWGFAVTMGVYASSFMSPAHLNPAVSLGMAVAGKFPWAYVLPYSAAQIAGGIVGGLAVWLHYYPHWQATKDAGAILGIFSTGPGIRQYFWNFISEVIGTFVLVFGLLAFTKGQFTAGLNPIVVGILIIAIGLSLGGTTGYAINPARDLGPRIAHAVLPIANKGTSDWAYSWVPIAGPLVGGALGALLFNVLP |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016491_4 | 2130580-2131090 | TypeI-E |
NA
Consensus repeat of CP016491_4
|
8 spacers
spacers of CP016491_4
>4.1|2130611|30|CP016491|PILER-CR TATGGACACTGTGCTATCGCTGCCACAACA >4.2|2130672|30|CP016491|PILER-CR ATGTGCCCATCTACTACTTGATAAGTTCTC >4.3|2130610|31|CP016491|CRISPRCasFinder TTATGGACACTGTGCTATCGCTGCCACAACA >4.4|2130671|31|CP016491|CRISPRCasFinder GATGTGCCCATCTACTACTTGATAAGTTCTC >4.5|2130732|31|CP016491|CRISPRCasFinder GTTCATTTTGCTCGATATTTTTCGTTGGTTT >4.6|2130793|33|CP016491|CRISPRCasFinder TAACGAAACCGTATTCTGCTGATTTGTCCTGGC >4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder TAACACGCCGGTAGTCCCGTTTTTGAGGGATT >4.8|2130918|31|CP016491|CRISPRCasFinder ATGACTGCGCACTATACTGAGTCAGTGCGAC >4.9|2130979|31|CP016491|CRISPRCasFinder AGGGGCACTCTCGTGAGAAGTGTAGACGCTA >4.10|2131040|21|CP016491|CRISPRCasFinder CGCTGAATCGATATCCGCCAT >4.11|2130609|33|CP016491|CRT CTTATGGACACTGTGCTATCGCTGCCACAACAT >4.12|2130670|33|CP016491|CRT CGATGTGCCCATCTACTACTTGATAAGTTCTCG >4.13|2130731|33|CP016491|CRT CGTTCATTTTGCTCGATATTTTTCGTTGGTTTT >4.14|2130792|35|CP016491|CRT TTAACGAAACCGTATTCTGCTGATTTGTCCTGGCA >4.15|2130855|34|CP016491|CRT TTAACACGCCGGTAGTCCCGTTTTTGAGGGATTG >4.16|2130917|33|CP016491|CRT CATGACTGCGCACTATACTGAGTCAGTGCGACT |
cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e,DEDDh,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016491_4
The CRISPR arrays of CP016491_4 >merge|CP016491|4|2130580-2131090|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTATTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCCTTATGGACACTGTGCTATCGCTGCCACAACATCTATTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCCGATGTGCCCATCTACTACTTGATAAGTTCTCGCTATTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCCGTTCATTTTGCTCGATATTTTTCGTTGGTTTTCTATTACCCGTGTATACGAGGGTGACCCTTAACGAAACCGTATTCTGCTGATTTGTCCTGGCACTGTTCCCCGTATATACGGGGGTGATCCTTAACACGCCGGTAGTCCCGTTTTTGAGGGATTGCTGTTCCCCGTGTATATGGGGCTGATCCCATGACTGCGCACTATACTGAGTCAGTGCGACTCTTTTCCCTGTGTATACGGAAGTGATTCGAGGGGCACTCTCGTGAGAAGTGTAGACGCTAGCTGTTCTTCGTGTATGCGGAGGTCATCCTCGCTGAATCGATATCCGCCATTTTATTCCCCGTATATACGGGGGCAGTCTT >CP016491|4|3|2130580-2130732|PILER-CR TCTATTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCCT TATGGACACTGTGCTATCGCTGCCACAACA TCTATTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCCG ATGTGCCCATCTACTACTTGATAAGTTCTC GCTATTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCCG >CP016491|4|4|2130580-2131090|CRISPRCasFinder TCTATTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCC TTATGGACACTGTGCTATCGCTGCCACAACA TCTATTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCC GATGTGCCCATCTACTACTTGATAAGTTCTC GCTATTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCC GTTCATTTTGCTCGATATTTTTCGTTGGTTT TCTATTACCCGTGTATACGAGGGTGACCCT TAACGAAACCGTATTCTGCTGATTTGTCCTGGC ACTGTTCCCCGTATATACGGGGGTGATCCT TAACACGCCGGTAGTCCCGTTTTTGAGGGATT GCTGTTCCCCGTGTATATGGGGCTGATCCC ATGACTGCGCACTATACTGAGTCAGTGCGAC TCTTTTCCCTGTGTATACGGAAGTGATTCG AGGGGCACTCTCGTGAGAAGTGTAGACGCTA GCTGTTCTTCGTGTATGCGGAGGTCATCCT CGCTGAATCGATATCCGCCAT TTTATTCCCCGTATATACGGGGGCAGTCTT >CP016491|4|2|2130581-2130977|CRT CTATTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CTTATGGACACTGTGCTATCGCTGCCACAACAT CTATTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CGATGTGCCCATCTACTACTTGATAAGTTCTCG CTATTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CGTTCATTTTGCTCGATATTTTTCGTTGGTTTT CTATTACCCGTGTATACGAGGGTGACCC TTAACGAAACCGTATTCTGCTGATTTGTCCTGGCA CTGTTCCCCGTATATACGGGGGTGATCC TTAACACGCCGGTAGTCCCGTTTTTGAGGGATTG CTGTTCCCCGTGTATATGGGGCTGATCC CATGACTGCGCACTATACTGAGTCAGTGCGACT CTTTTCCCTGTGTATACGGAAGTGATTC
>CP016491.1|AUI78950.1|2127301_2130052_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MTEFSRLAQSLWAKKRSSDGQRLWLPLIVHLKDCENTINWLFNHWLSDGQRQQLAAATSEEDVQKLVKFLGFIHDCGKATPAFQMKPAYNGDNQLDQILVEQLMRSGFKDLDVLNLSSAQRSPHALAGEAILTAYGVDSTVGAIVGGHHGKPESEPPVHQIRDYTANYFQSDNRPELQVEWQQVQRELVEYGLHSAGYQSAAEIPAINQPEAVILTGLLIMADWLASSEYFNEDTSKPLFPLVTTAQSVETIDVQTRFQRAIMTWRLDDEWVPAPLSRDSDPYQLRWGFHARPVQEAITRALGATTDPGMAIIEAPMGLGKTEIALIAVEQLARMTGRDGVYMGLPTQATTNAMFARVNDWLASVADEQEAHLSIKLMHGKSQFNRTYTALPNASNVNSTDEHHGAVTLNSWFSGKKSILTKFTVGTIDNLLLMGLKQKHLFLRHLGFSGKVVVIDEVHAYDAYMNAYLLRAIEWLGAYHVPIVILSATLPKIKRNQLLKAYLKGKYGRKFHQLLKLAPTGWEDTQAYPLLSVLDGPEIKQVTHFEGQSDQAPLTLAVERTNQDDEDLIVSLLAQLDAGGVAGIIVNTVKRAQALAALIPADVPLMVLHSAFLAPDRAQQEEKLQAAIGKHGQRPAKLVVIGTQVLEQSLDIDFDVLYTDIAPIDLILQRAGRLHRHQTIIRPKQFQQPQLKVMGIKSFGDYGDDDNEKVYEKYLLMKTDHFLPDKIQLPGDISTLVQCVYDAATDAEVPEIEPAAEKFETDLKAEQQKAVVFQVKAPQLKQGITLHGWLNRDHTDVVNDQQASAAVRDIQETLEVILVQHTTDGDFLLDGRKLAEVASAEIAQQTLRIPAVITPNITAAITELEDLTRPYHLRWQDDVWLNGALVLPLDQNLTATFNGWQVSYSPQLGLSYSKEE >CP016491.1|AUI78949.1|2125545_2127297_-|CRISPR-associated-protein MEKTFNLTTEPWIEVIDAQTNQQVSVSLIELFQNAQNYRQLAGDMRAQDLAVLRLLLAILTTVYTRYDADNQGYEWLTIADDFKVVSVDEDYDSDEIHDDLKQTWQDLYEGGQFTTIVTNYLKQYANRFDLFGDQPFYQVTASEYDAVVPENKSVAHGQKTGKPTGLVAIRQMNRRISESGNSVALFAPKVNETKNDLTHAELARWLIMYQNYTGVTDKTKIKSDETFSNGAGWLYQLNPVYANGRSLFEILMLNLILVPMDEDVRYPVQRPVWEYTGLADYLKERRRKLVPDNLAALYTTWSRLLHIEWDDQQRPLIFTAGIPMFDNVGALIEPMTLWRQDKKTSQFKPAVASIKYTGKAMWRNFGQYVNVNRRDDIHEAGIVTWLHYLKAQGLVPDEQQLWLASTALLNDGNMSSQMPATEVYDDMQIQADVLFDESSAEYWPVRIEDAINITQKIGDGYYRFAATIGQIRNIDAKQFGQRHSAQFYAELNRPFKAWLASLTGNDDREAKINEWKQTLQAITLQAANMMMATSSSRDVRGIVDHDKNNVPRQINVFTANNQLRRLVFTQLKGKQVKVAHEK >CP016491.1|AUI78948.1|2124944_2125556_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MKNKIQKVTASIIRQLYNHGNLNKGVLASVRHATVLNSPQAQALWPIMMAELDDEMLSRDGRPTAAEVAVYTAVRFYAIQQQGSEVLVYDPAISQKDDAEKGIPLFQALAKLRRNEETRVALDRRMQPLLATTNVASAINALTHLVSMLKAANQQQKIDYARLAQDIYWLQQSYERASQVRLQWGQQYYRPQDATEKPEGKKN >CP016491.1|AUI78947.1|2123865_2124945_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MTTNNLYLDIHVIQTVPSSNINRDDTGAPKTALYGGVSRSRVSSQSWKRAVRQSFQDDTVTVGYRTKTAAQLLKDALQKLTPDLSDDDAWKQVNEVFKAASVKLDKNEKTSALLMVSPGQIDQLAQYVKDNADGELDKKAIKAVLKGNQSIDLALFGRMVADNPELNVEAAAQVAHAISTHEVVPEFDYFTALDDLQPDDTTGAAMLGTLEFNSATLYRYANINMNDLIANLGEAAAVDGAREFVKAFVLSMPTGKQNTFANKTLPSYVMLTLRTDTPVNLVSGFEDPVTSKQGYVKQSIEKLNAAYKQTLQFVEKPLLNVALGADASAIAVPAENLTDLLGQVTTELTKVVKDENGND >CP016491.1|AUI78946.1|2123159_2123885_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MKTVTIRLTAPLQSYGDEANFDRRTSYDYPSKSAIVGLIAAALGYRRTDSRIQTLNQLDYAVRIDQPAEPLTDFQIVEWKRGKRKLTYRDYLQDAVFLAAVGSEDDALIDKIDWALHHPRFQLSLGRRANVPAGPLMTEIALGSNPAQVLQFLSWHASRFYMKKTKSPTFVAELIADAALLPNHRSSMVKDNVITFDQRERQYGFRTVAVDRVSLENPYHPDSTAETDHDMMTFLWKEDQR >CP016491.1|AUI78945.1|2122491_2123160_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRVEIDRDNRYKTRDLTHLGAYHNWVEQSFPEEIENNQRGRHLWRIDRLNGKDYLLVLSADRPKLEQLGQYGVEGTAMTKSYDTWLDHIEAGMVLRFRLTANPTHSIIEPNHPKGRVVPHVTIEQQKQWLADRALRAGFELVTRADTAADETEKLAFDVVSHDWPTLHRRKGRSVRLSRVTFEGVLRVQDADTFKQTLTKGLGREKAFVMGLMTVIPTE >CP016491.1|AUI78944.1|2121023_2122337_+|glycosyl-transferase MEIMQTLKPFESIWNFVLLLLVSYPILGAFAWFIGVLCYQLVYRHRHKDDVEFKELAPAEQPFITIMIPAHNEEVMIEHTINYLMNNLNYQNYEVLVTDDGSTDETPAILERLQTVYDNLRVITIKKNQGKAHAFNVGVSFARGEFILSNDADSIPEPDALWKYMSYFMGEEHANTAAVTANMDVQNRSTLIAKSQTVEFSSIVGVIKRSQVSALGNMYAYSGANTMYRRDALIDVGLFRQDRATEDISIAWDHQLNGWTTVFSPDILFYMNVPENLDALYHQRKRWAKGGTEVLLTNFKRVASHPGKYLKQWAFITDQTLSIIWSLFFFVSTLIFLISLVTFFFTGNYERVYHMFCMAFIFVTFEMFAGVLQLLSALIVDDRGRKFKYLIFMPLYMLIYWQVNALALVTTLIPAVKTILGYGSGTWVSPVRKHHTE >CP016491.1|AUI78943.1|2120546_2121020_+|hypothetical-protein MEKKDVMKQYVTDKYFSKGHWWTKIWQTIVAWICVAVPVYWTISSTLLANNPRFIHAWKYEEGKTLFYFFDRFFIFAFILIAIIVIISTIHNNHRVKQHISKERQYDEERLDVRKRRLNNFYTQRFGQATFRQHVKHYTVDPEQNLDVNEIHKLYED >CP016491.1|AUI78942.1|2119839_2120064_-|hypothetical-protein MSTHWQRISTSHPTNLVTIDVSALPTEPQASANRSIHLQQTDTFIFRTLSLYGWIFVAYFQKTNYYIMMTKISS >CP016491.1|AUI78941.1|2119186_2119717_-|HAD-family-hydrolase MINQFKPTWMIPAIYNVTPAQLRAQGIKAVFTDLDNTLIAWDNPDGTPELKKWLHALQDAGIPLVVVSNNSEARIAKALEQLDLPFVSRSLKPLPIGLNKARHDLGLHKNEVVMVGDQYITDMWSAHLAGVPSILVKPIVTTDAWNTRINRFFERFIKLRLAHVYPEMHFQEDLNK >CP016491.1|AUI78951.1|2131301_2132201_-|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MIVITLTKVPNALRGDLTKWYQEIQTGVYVGSVSARIRDSLWLRIVKNIGRGEATMVYNANNELGYQFKTTRRDHQVVDYDGIPLMMHLNAAPQAEEHGYSDAAKFHKARVMSQKAQQKRSQPSRKNNKPMVAVDLETTGLDPSKDVIISIGAVKATTDGQASEFSRLISVTESIPEKISTLTGLTNDMLAKQGVPIVEALSGLNTFIGDCAIVGYNFHFDEAFLKQAFISNNLEALRSQTIDLMPIVKRTNAFLDNYRLATVLSAYEIENLKPHHALEDARATLALAQALNKLERLKI >CP016491.1|AUI78952.1|2132197_2133151_-|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MEKQSGAKKPELSELGRVRDRLTFLYLEHAKLDRQDSAIRVSDARGIVFVPAAIISVLMLGPGVDVTHRAMELMGDAGMAVVWVGERGVRQYAHGRALNHSSLLLEAQAKLFSNQRSRLAVARKMYQMRFPNDDVSGLSMQAQRGKEGARVRQVYRLQSERTGVKWTRRDYNPDDFEASSPINQALTAAHQALYGLSYSVIMAMGASAGLGFVHTGHDLSFVYDFADLYKAEFSIPVAFNTVAALTEDDNISRNTRLAMRDAFVDGKLLGRMVSDLKAILGVSDDQTEISNLSLWDDRLGLQEFGVQYHEIKVGETQ >CP016491.1|AUI78953.1|2134126_2134543_+|hypothetical-protein MMVEIIAHVLIPTNRGFLILQRTRKEYGNKNVYPGYWDIPGGLAINNEIPRETAIRECMEETGLKVKISRIIWEDSVLDTAKMRVFTTLVYLAHEISADQKIYLNREEHSEFIFVNSRQTLNKVKVVPYLEKVLLQFL >CP016491.1|AUI78954.1|2134874_2135231_-|50S-ribosomal-protein-L20 MARVKGGTVTRKRRKRILKLAKGYRGAKHIQFKVAKDQVMKSYQYAFRDRRRRKSDFRRLWIARINAAARINDISYSQLMHGLKVANVDVNRKMLADLAVNDADAFKALVDTAKKALA >CP016491.1|AUI78955.1|2135267_2135462_-|50S-ribosomal-protein-L35 MPKQKTNRAAAKRFKVTAKGKIKSANAFTSHRFHGKTKKQRRQLRGTAIIEKPMVKTYHKLLQK >CP016491.1|AUI78956.1|2135483_2135984_-|translation-initiation-factor-IF-3 MVNDGIRAREVRLIASDGEQLGVKSRQEAMQIAEDASLDLVLVAPKAKPPVARIMDYGKYRFEQQKKEREARKKQKVVSIKEVRLSPAIDTNDFNTKLKHAEKFLSKGDKVRVSIRFKGRAITHKDIGRQVLNRMIEATKEFSTVEAYPKMDGRSMFLVLAPKTDK >CP016491.1|AUI78957.1|2136226_2138191_-|threonine--tRNA-ligase MASINVKFPDGAVKQFDAGVTTEAIAKSISPSLAKRSVAGKFNDQIVDYRQPLTTDGSIEIIAADSEDGLNVLRQTAAQVLANAVKQLFPSIHFGSGEGNANGFFFDTDNPDEDGKQVSEDDLEAISDKMAAIIKQDLPIEREVLSKADALALVGDNPYQQDLVNERAAENDDQVVVYKQGDFVDLSDGAQLASTGKVKVFKLLSVAGAYWQGKSSNPMLQRIYGTAFLKQKDLDADLKRRQEARERDHRVIGNELDLFFVDPKVGNGLPYWMPNGATIRRQIERYIIDKEVANGYQHVYTPVLANLDVYKQSGHWDHYREDMFPPMDMGDGEQLELRPMNCPSHIQIYNHHIRSYRELPLRIAELGMMHRYEKSGALTGLSRVREMTLNDGHTFVALDQIEEEFKKILSLMVEVYEDFDISDYRFRLSYRDPENTEKYFDDDAMWERSQKMLKSAMDDMGLDYFEAEGEAAFYGPKLDVQTKTALGGEETLSTIQLDFLLPERFDLKYVGADGEEHRPVMIHRGLVSTMERFVAYLTEMYKGAFPTWLAPKQVTIIPVNNGAHGAYAETVRRRLAAEGVRVSIDDRNEKMGYKIRESQTKKVPYLLVVGDQEVANGSVSVRKYGEERTESEAVDMFIGAITQEIKRYSRGASK >CP016491.1|AUI78958.1|2138523_2139459_-|primosomal-protein-DnaI MENISETLRTLMNRKNLNHRYEALMTTVYHDPDVRQFLAAHQDELSADALERSGAKLYEFCEEKRKLARHEPTQAPGYQPTLVMSNHLIDIAYQPTPQLQEQQAARALQQRVRSISMPKSIQTADLKSYDQDGDRATALVAALDFIDAYTQAPKRFHRGLYLYGSFGVGKTYLLGGMANELAARGFNTTLIHFPSFAVEMKRSISNNTSADKVDAIKRAPILMIDDIGADASSTWIRDDVLGVILEYRMQEELPTCFSSNFSMQELQDGYLTISQKGDEEPVKAQRIMQRVRYLASEIEMVGRNRRLNPDG >CP016491.1|AUI80229.1|2139462_2140899_-|helicase-DnaB MPNEEPLTPKSGLVVPQAPALSAAQQAVLAELYLPLIGPLAYSLYAALRSLQSSENELSNRRSHAELLGILNADLPTVLAARRKLEATGLLRSYYQQDELGTLYIYRLQAPQLALQFFADDLLSVLLLDTVGELRYQQLASDFATQPVDLTAAKDVTANILEVFHVDGHKVTTTPRPVQQVRAQLAANEPAEDQSPVLSDDDFDWQLLGQILKQNYVDLKQVASSRQLIVTESRVYGISEIEMAKLISEVASLTTGQFDENQLKLLIARRYERPTTPTRTTTNEATTDKSTKLTTTAANSSKATRQPASTAQLSKAEQQLVDVAKQAAPYDFLAAVKAEKHGFVTSGENRLVHDLISRGVLPNSVINIVIYYLLQNRELAALNRSLIETVANDWQQHGVNTPEAALAYLKQRQRPKTSAPRRKSNARPTRKEVMPKWAQKQQTGEAQPDKPNKQLSAEQRQQLAARLAKLETNSEKED >CP016491.1|AUI78959.1|2140920_2141436_-|transcriptional-regulator-NrdR MQCPHCHHNGSRVVDSRPTDDGRVIRRRRECENCGFRFTTFERVEATPLLVIKKNGAREEFNREKVLRGIIRSAEKRPVSMETMTGVVDDVENKVRSLGENEISSQVIGEYVMEQLADIDEISYIRFASVYRQFKDMHVFLNELQDMMERDKVKLAKPSAKTEHAPKRKKD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016491_5 | 2133708-2134098 | TypeI-E |
NA:I-C,I-E,II-B
Consensus repeat of CP016491_5
|
6 spacers
spacers of CP016491_5
>5.1|2133737|32|CP016491|PILER-CR AATTTACGCTATCTAAGTTTATCAAACAAAAT >5.2|2133798|32|CP016491|PILER-CR GTGAGAACAGTTCACCACTCCATGAATCCCAC >5.3|2133859|32|CP016491|PILER-CR GTGGCAAACAACTGGACGCTAGCCTTGGGTGT >5.4|2133733|36|CP016491|CRISPRCasFinder TCCTAATTTACGCTATCTAAGTTTATCAAACAAAAT >5.5|2133794|36|CP016491|CRISPRCasFinder TCCCGTGAGAACAGTTCACCACTCCATGAATCCCAC >5.6|2133855|36|CP016491|CRISPRCasFinder TCCTGTGGCAAACAACTGGACGCTAGCCTTGGGTGT >5.7|2133916|36|CP016491|CRISPRCasFinder ACCTCGTTTCATCAAATTTGTCTCTGGGAGGGTTTA >5.8|2133977|36|CP016491|CRISPRCasFinder ACCCCATATTGATTCAAGTAAGGTACGTCAAGCTAC >5.9|2134038|36|CP016491|CRISPRCasFinder ACCCGAGCTACTGAGGAACTGGAGGAGAAACTAGAT >5.10|2133736|33|CP016491|CRT TAATTTACGCTATCTAAGTTTATCAAACAAAAT >5.11|2133797|33|CP016491|CRT CGTGAGAACAGTTCACCACTCCATGAATCCCAC >5.12|2133858|33|CP016491|CRT TGTGGCAAACAACTGGACGCTAGCCTTGGGTGT >5.13|2133919|33|CP016491|CRT TCGTTTCATCAAATTTGTCTCTGGGAGGGTTTA >5.14|2133980|33|CP016491|CRT CCATATTGATTCAAGTAAGGTACGTCAAGCTAC |
cas1,DEDDh,cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016491_5
The CRISPR arrays of CP016491_5 >merge|CP016491|5|2133708-2134098|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCCTAATTTACGCTATCTAAGTTTATCAAACAAAATCTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCCCGTGAGAACAGTTCACCACTCCATGAATCCCACCTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCCTGTGGCAAACAACTGGACGCTAGCCTTGGGTGTCTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGAACCTCGTTTCATCAAATTTGTCTCTGGGAGGGTTTACTATTCCCCGTGCATACGGGGGTGAACCCCATATTGATTCAAGTAAGGTACGTCAAGCTACCTATTCCCCGTGTCTACGGGGGTGAACCCGAGCTACTGAGGAACTGGAGGAGAAACTAGATTTGTTCCCCACATATACGGGAGTGA >CP016491|5|4|2133708-2133919|PILER-CR CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCCT AATTTACGCTATCTAAGTTTATCAAACAAAAT CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCCC GTGAGAACAGTTCACCACTCCATGAATCCCAC CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCCT GTGGCAAACAACTGGACGCTAGCCTTGGGTGT CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGAACCT >CP016491|5|5|2133708-2134098|CRISPRCasFinder CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGA TCCTAATTTACGCTATCTAAGTTTATCAAACAAAAT CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGA TCCCGTGAGAACAGTTCACCACTCCATGAATCCCAC CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGA TCCTGTGGCAAACAACTGGACGCTAGCCTTGGGTGT CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGA ACCTCGTTTCATCAAATTTGTCTCTGGGAGGGTTTA CTATTCCCCGTGCATACGGGGGTGA ACCCCATATTGATTCAAGTAAGGTACGTCAAGCTAC CTATTCCCCGTGTCTACGGGGGTGA ACCCGAGCTACTGAGGAACTGGAGGAGAAACTAGAT TTGTTCCCCACATATACGGGAGTGA >CP016491|5|3|2133708-2134040|CRT CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCC TAATTTACGCTATCTAAGTTTATCAAACAAAAT CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCC CGTGAGAACAGTTCACCACTCCATGAATCCCAC CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCC TGTGGCAAACAACTGGACGCTAGCCTTGGGTGT CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGAACC TCGTTTCATCAAATTTGTCTCTGGGAGGGTTTA CTATTCCCCGTGCATACGGGGGTGAACC CCATATTGATTCAAGTAAGGTACGTCAAGCTAC CTATTCCCCGTGTCTACGGGGGTGAACC
>CP016491.1|AUI78952.1|2132197_2133151_-|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MEKQSGAKKPELSELGRVRDRLTFLYLEHAKLDRQDSAIRVSDARGIVFVPAAIISVLMLGPGVDVTHRAMELMGDAGMAVVWVGERGVRQYAHGRALNHSSLLLEAQAKLFSNQRSRLAVARKMYQMRFPNDDVSGLSMQAQRGKEGARVRQVYRLQSERTGVKWTRRDYNPDDFEASSPINQALTAAHQALYGLSYSVIMAMGASAGLGFVHTGHDLSFVYDFADLYKAEFSIPVAFNTVAALTEDDNISRNTRLAMRDAFVDGKLLGRMVSDLKAILGVSDDQTEISNLSLWDDRLGLQEFGVQYHEIKVGETQ >CP016491.1|AUI78951.1|2131301_2132201_-|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MIVITLTKVPNALRGDLTKWYQEIQTGVYVGSVSARIRDSLWLRIVKNIGRGEATMVYNANNELGYQFKTTRRDHQVVDYDGIPLMMHLNAAPQAEEHGYSDAAKFHKARVMSQKAQQKRSQPSRKNNKPMVAVDLETTGLDPSKDVIISIGAVKATTDGQASEFSRLISVTESIPEKISTLTGLTNDMLAKQGVPIVEALSGLNTFIGDCAIVGYNFHFDEAFLKQAFISNNLEALRSQTIDLMPIVKRTNAFLDNYRLATVLSAYEIENLKPHHALEDARATLALAQALNKLERLKI >CP016491.1|AUI78950.1|2127301_2130052_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MTEFSRLAQSLWAKKRSSDGQRLWLPLIVHLKDCENTINWLFNHWLSDGQRQQLAAATSEEDVQKLVKFLGFIHDCGKATPAFQMKPAYNGDNQLDQILVEQLMRSGFKDLDVLNLSSAQRSPHALAGEAILTAYGVDSTVGAIVGGHHGKPESEPPVHQIRDYTANYFQSDNRPELQVEWQQVQRELVEYGLHSAGYQSAAEIPAINQPEAVILTGLLIMADWLASSEYFNEDTSKPLFPLVTTAQSVETIDVQTRFQRAIMTWRLDDEWVPAPLSRDSDPYQLRWGFHARPVQEAITRALGATTDPGMAIIEAPMGLGKTEIALIAVEQLARMTGRDGVYMGLPTQATTNAMFARVNDWLASVADEQEAHLSIKLMHGKSQFNRTYTALPNASNVNSTDEHHGAVTLNSWFSGKKSILTKFTVGTIDNLLLMGLKQKHLFLRHLGFSGKVVVIDEVHAYDAYMNAYLLRAIEWLGAYHVPIVILSATLPKIKRNQLLKAYLKGKYGRKFHQLLKLAPTGWEDTQAYPLLSVLDGPEIKQVTHFEGQSDQAPLTLAVERTNQDDEDLIVSLLAQLDAGGVAGIIVNTVKRAQALAALIPADVPLMVLHSAFLAPDRAQQEEKLQAAIGKHGQRPAKLVVIGTQVLEQSLDIDFDVLYTDIAPIDLILQRAGRLHRHQTIIRPKQFQQPQLKVMGIKSFGDYGDDDNEKVYEKYLLMKTDHFLPDKIQLPGDISTLVQCVYDAATDAEVPEIEPAAEKFETDLKAEQQKAVVFQVKAPQLKQGITLHGWLNRDHTDVVNDQQASAAVRDIQETLEVILVQHTTDGDFLLDGRKLAEVASAEIAQQTLRIPAVITPNITAAITELEDLTRPYHLRWQDDVWLNGALVLPLDQNLTATFNGWQVSYSPQLGLSYSKEE >CP016491.1|AUI78949.1|2125545_2127297_-|CRISPR-associated-protein MEKTFNLTTEPWIEVIDAQTNQQVSVSLIELFQNAQNYRQLAGDMRAQDLAVLRLLLAILTTVYTRYDADNQGYEWLTIADDFKVVSVDEDYDSDEIHDDLKQTWQDLYEGGQFTTIVTNYLKQYANRFDLFGDQPFYQVTASEYDAVVPENKSVAHGQKTGKPTGLVAIRQMNRRISESGNSVALFAPKVNETKNDLTHAELARWLIMYQNYTGVTDKTKIKSDETFSNGAGWLYQLNPVYANGRSLFEILMLNLILVPMDEDVRYPVQRPVWEYTGLADYLKERRRKLVPDNLAALYTTWSRLLHIEWDDQQRPLIFTAGIPMFDNVGALIEPMTLWRQDKKTSQFKPAVASIKYTGKAMWRNFGQYVNVNRRDDIHEAGIVTWLHYLKAQGLVPDEQQLWLASTALLNDGNMSSQMPATEVYDDMQIQADVLFDESSAEYWPVRIEDAINITQKIGDGYYRFAATIGQIRNIDAKQFGQRHSAQFYAELNRPFKAWLASLTGNDDREAKINEWKQTLQAITLQAANMMMATSSSRDVRGIVDHDKNNVPRQINVFTANNQLRRLVFTQLKGKQVKVAHEK >CP016491.1|AUI78948.1|2124944_2125556_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MKNKIQKVTASIIRQLYNHGNLNKGVLASVRHATVLNSPQAQALWPIMMAELDDEMLSRDGRPTAAEVAVYTAVRFYAIQQQGSEVLVYDPAISQKDDAEKGIPLFQALAKLRRNEETRVALDRRMQPLLATTNVASAINALTHLVSMLKAANQQQKIDYARLAQDIYWLQQSYERASQVRLQWGQQYYRPQDATEKPEGKKN >CP016491.1|AUI78947.1|2123865_2124945_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MTTNNLYLDIHVIQTVPSSNINRDDTGAPKTALYGGVSRSRVSSQSWKRAVRQSFQDDTVTVGYRTKTAAQLLKDALQKLTPDLSDDDAWKQVNEVFKAASVKLDKNEKTSALLMVSPGQIDQLAQYVKDNADGELDKKAIKAVLKGNQSIDLALFGRMVADNPELNVEAAAQVAHAISTHEVVPEFDYFTALDDLQPDDTTGAAMLGTLEFNSATLYRYANINMNDLIANLGEAAAVDGAREFVKAFVLSMPTGKQNTFANKTLPSYVMLTLRTDTPVNLVSGFEDPVTSKQGYVKQSIEKLNAAYKQTLQFVEKPLLNVALGADASAIAVPAENLTDLLGQVTTELTKVVKDENGND >CP016491.1|AUI78946.1|2123159_2123885_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MKTVTIRLTAPLQSYGDEANFDRRTSYDYPSKSAIVGLIAAALGYRRTDSRIQTLNQLDYAVRIDQPAEPLTDFQIVEWKRGKRKLTYRDYLQDAVFLAAVGSEDDALIDKIDWALHHPRFQLSLGRRANVPAGPLMTEIALGSNPAQVLQFLSWHASRFYMKKTKSPTFVAELIADAALLPNHRSSMVKDNVITFDQRERQYGFRTVAVDRVSLENPYHPDSTAETDHDMMTFLWKEDQR >CP016491.1|AUI78945.1|2122491_2123160_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRVEIDRDNRYKTRDLTHLGAYHNWVEQSFPEEIENNQRGRHLWRIDRLNGKDYLLVLSADRPKLEQLGQYGVEGTAMTKSYDTWLDHIEAGMVLRFRLTANPTHSIIEPNHPKGRVVPHVTIEQQKQWLADRALRAGFELVTRADTAADETEKLAFDVVSHDWPTLHRRKGRSVRLSRVTFEGVLRVQDADTFKQTLTKGLGREKAFVMGLMTVIPTE >CP016491.1|AUI78944.1|2121023_2122337_+|glycosyl-transferase MEIMQTLKPFESIWNFVLLLLVSYPILGAFAWFIGVLCYQLVYRHRHKDDVEFKELAPAEQPFITIMIPAHNEEVMIEHTINYLMNNLNYQNYEVLVTDDGSTDETPAILERLQTVYDNLRVITIKKNQGKAHAFNVGVSFARGEFILSNDADSIPEPDALWKYMSYFMGEEHANTAAVTANMDVQNRSTLIAKSQTVEFSSIVGVIKRSQVSALGNMYAYSGANTMYRRDALIDVGLFRQDRATEDISIAWDHQLNGWTTVFSPDILFYMNVPENLDALYHQRKRWAKGGTEVLLTNFKRVASHPGKYLKQWAFITDQTLSIIWSLFFFVSTLIFLISLVTFFFTGNYERVYHMFCMAFIFVTFEMFAGVLQLLSALIVDDRGRKFKYLIFMPLYMLIYWQVNALALVTTLIPAVKTILGYGSGTWVSPVRKHHTE >CP016491.1|AUI78943.1|2120546_2121020_+|hypothetical-protein MEKKDVMKQYVTDKYFSKGHWWTKIWQTIVAWICVAVPVYWTISSTLLANNPRFIHAWKYEEGKTLFYFFDRFFIFAFILIAIIVIISTIHNNHRVKQHISKERQYDEERLDVRKRRLNNFYTQRFGQATFRQHVKHYTVDPEQNLDVNEIHKLYED >CP016491.1|AUI78953.1|2134126_2134543_+|hypothetical-protein MMVEIIAHVLIPTNRGFLILQRTRKEYGNKNVYPGYWDIPGGLAINNEIPRETAIRECMEETGLKVKISRIIWEDSVLDTAKMRVFTTLVYLAHEISADQKIYLNREEHSEFIFVNSRQTLNKVKVVPYLEKVLLQFL >CP016491.1|AUI78954.1|2134874_2135231_-|50S-ribosomal-protein-L20 MARVKGGTVTRKRRKRILKLAKGYRGAKHIQFKVAKDQVMKSYQYAFRDRRRRKSDFRRLWIARINAAARINDISYSQLMHGLKVANVDVNRKMLADLAVNDADAFKALVDTAKKALA >CP016491.1|AUI78955.1|2135267_2135462_-|50S-ribosomal-protein-L35 MPKQKTNRAAAKRFKVTAKGKIKSANAFTSHRFHGKTKKQRRQLRGTAIIEKPMVKTYHKLLQK >CP016491.1|AUI78956.1|2135483_2135984_-|translation-initiation-factor-IF-3 MVNDGIRAREVRLIASDGEQLGVKSRQEAMQIAEDASLDLVLVAPKAKPPVARIMDYGKYRFEQQKKEREARKKQKVVSIKEVRLSPAIDTNDFNTKLKHAEKFLSKGDKVRVSIRFKGRAITHKDIGRQVLNRMIEATKEFSTVEAYPKMDGRSMFLVLAPKTDK >CP016491.1|AUI78957.1|2136226_2138191_-|threonine--tRNA-ligase MASINVKFPDGAVKQFDAGVTTEAIAKSISPSLAKRSVAGKFNDQIVDYRQPLTTDGSIEIIAADSEDGLNVLRQTAAQVLANAVKQLFPSIHFGSGEGNANGFFFDTDNPDEDGKQVSEDDLEAISDKMAAIIKQDLPIEREVLSKADALALVGDNPYQQDLVNERAAENDDQVVVYKQGDFVDLSDGAQLASTGKVKVFKLLSVAGAYWQGKSSNPMLQRIYGTAFLKQKDLDADLKRRQEARERDHRVIGNELDLFFVDPKVGNGLPYWMPNGATIRRQIERYIIDKEVANGYQHVYTPVLANLDVYKQSGHWDHYREDMFPPMDMGDGEQLELRPMNCPSHIQIYNHHIRSYRELPLRIAELGMMHRYEKSGALTGLSRVREMTLNDGHTFVALDQIEEEFKKILSLMVEVYEDFDISDYRFRLSYRDPENTEKYFDDDAMWERSQKMLKSAMDDMGLDYFEAEGEAAFYGPKLDVQTKTALGGEETLSTIQLDFLLPERFDLKYVGADGEEHRPVMIHRGLVSTMERFVAYLTEMYKGAFPTWLAPKQVTIIPVNNGAHGAYAETVRRRLAAEGVRVSIDDRNEKMGYKIRESQTKKVPYLLVVGDQEVANGSVSVRKYGEERTESEAVDMFIGAITQEIKRYSRGASK >CP016491.1|AUI78958.1|2138523_2139459_-|primosomal-protein-DnaI MENISETLRTLMNRKNLNHRYEALMTTVYHDPDVRQFLAAHQDELSADALERSGAKLYEFCEEKRKLARHEPTQAPGYQPTLVMSNHLIDIAYQPTPQLQEQQAARALQQRVRSISMPKSIQTADLKSYDQDGDRATALVAALDFIDAYTQAPKRFHRGLYLYGSFGVGKTYLLGGMANELAARGFNTTLIHFPSFAVEMKRSISNNTSADKVDAIKRAPILMIDDIGADASSTWIRDDVLGVILEYRMQEELPTCFSSNFSMQELQDGYLTISQKGDEEPVKAQRIMQRVRYLASEIEMVGRNRRLNPDG >CP016491.1|AUI80229.1|2139462_2140899_-|helicase-DnaB MPNEEPLTPKSGLVVPQAPALSAAQQAVLAELYLPLIGPLAYSLYAALRSLQSSENELSNRRSHAELLGILNADLPTVLAARRKLEATGLLRSYYQQDELGTLYIYRLQAPQLALQFFADDLLSVLLLDTVGELRYQQLASDFATQPVDLTAAKDVTANILEVFHVDGHKVTTTPRPVQQVRAQLAANEPAEDQSPVLSDDDFDWQLLGQILKQNYVDLKQVASSRQLIVTESRVYGISEIEMAKLISEVASLTTGQFDENQLKLLIARRYERPTTPTRTTTNEATTDKSTKLTTTAANSSKATRQPASTAQLSKAEQQLVDVAKQAAPYDFLAAVKAEKHGFVTSGENRLVHDLISRGVLPNSVINIVIYYLLQNRELAALNRSLIETVANDWQQHGVNTPEAALAYLKQRQRPKTSAPRRKSNARPTRKEVMPKWAQKQQTGEAQPDKPNKQLSAEQRQQLAARLAKLETNSEKED >CP016491.1|AUI78959.1|2140920_2141436_-|transcriptional-regulator-NrdR MQCPHCHHNGSRVVDSRPTDDGRVIRRRRECENCGFRFTTFERVEATPLLVIKKNGAREEFNREKVLRGIIRSAEKRPVSMETMTGVVDDVENKVRSLGENEISSQVIGEYVMEQLADIDEISYIRFASVYRQFKDMHVFLNELQDMMERDKVKLAKPSAKTEHAPKRKKD >CP016491.1|AUI78960.1|2141475_2142069_-|dephospho-CoA-kinase MTKLIGLTGGIATGKSTVSKLLAQYLPIVDADKIAWAVEGPGQPTTQKIAAKFGPDALLADGSLNRPWLGQLVFNDSAALQDLTAITSLPIQYAMFEAIVAAGQSNPTAIILDVPLLYESGWQNVCDQVVVVTAPPAVVLKRLMARNQLSKQAAQARIASQLPLAQKAAWADVVIDNGSTVDKTEAAVLKWLETMTV >CP016491.1|AUI78961.1|2142078_2142903_-|DNA-formamidopyrimidine-glycosylase MPELPEVETVRRGLNRLVKGATIADIDVYWPKIINNDVALFKERLINQTIQTIDRRGKYLLFRFSNGLTMVSHLRMEGKYNVVPRGEARDKHTHVVFHLTDDRDLLYNDTRKFGRMTLVPTGEELSVAGLRTIGPEPVADQLTLAYLTATLEHSKKMIKPLLLDQSKIAGIGNIYADETLWMSKIHPMRPANSLTADEIATLRDNIITEMALAIKGHGTTVHSFSTAFGEAGQFQNHLHVYGREGEPCERCGTMIEKIKVAQRGTHFCPLEQRL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016491_6 | 2406288-2407047 | Orphan |
NA:I-C,I-E,II-B
Consensus repeat of CP016491_6
|
12 spacers
spacers of CP016491_6
>6.1|2406316|33|CP016491|PILER-CR,CRT CCATGGCTAGGCCCCCTCATAGAATTTCGTGTT >6.2|2406377|33|CP016491|PILER-CR,CRT TAAGATGATCGAGTATTACCAAACCAGTCACAT >6.3|2406438|33|CP016491|PILER-CR,CRT TTAATCCCGCCGCGTCTTCGACCTTCATGTCGG >6.4|2406499|33|CP016491|PILER-CR,CRT CGTTTGCCAGGCTTTACTGGAGTCGTTCAATTC >6.5|2406560|33|CP016491|PILER-CR,CRT CACGTTTAAACTTGAGCGCGTCGCGATTCTTGA >6.6|2406621|33|CP016491|PILER-CR,CRT CTGTATGGGGTCAGGTAGTACGGGTGTCAGCTG >6.7|2406682|33|CP016491|PILER-CR,CRT CTAATTCACGATTCTGGTCGCTGTGGTCAAGTA >6.8|2406743|33|CP016491|PILER-CR,CRT TAGATAGCTTGCATGAGTGTGCCGTAGTCCGTG >6.9|2406804|33|CP016491|PILER-CR,CRT TGTTCCGTCCTTGTCGTTGCCGTGCGTGCCATC >6.10|2406865|33|CP016491|PILER-CR,CRT TTATACCATACACCGAAAATGTGAAATAATAAT >6.11|2406317|32|CP016491|CRISPRCasFinder CATGGCTAGGCCCCCTCATAGAATTTCGTGTT >6.12|2406378|32|CP016491|CRISPRCasFinder AAGATGATCGAGTATTACCAAACCAGTCACAT >6.13|2406439|32|CP016491|CRISPRCasFinder TAATCCCGCCGCGTCTTCGACCTTCATGTCGG >6.14|2406500|32|CP016491|CRISPRCasFinder GTTTGCCAGGCTTTACTGGAGTCGTTCAATTC >6.15|2406561|32|CP016491|CRISPRCasFinder ACGTTTAAACTTGAGCGCGTCGCGATTCTTGA >6.16|2406622|32|CP016491|CRISPRCasFinder TGTATGGGGTCAGGTAGTACGGGTGTCAGCTG >6.17|2406683|32|CP016491|CRISPRCasFinder TAATTCACGATTCTGGTCGCTGTGGTCAAGTA >6.18|2406744|32|CP016491|CRISPRCasFinder AGATAGCTTGCATGAGTGTGCCGTAGTCCGTG >6.19|2406805|32|CP016491|CRISPRCasFinder GTTCCGTCCTTGTCGTTGCCGTGCGTGCCATC >6.20|2406866|32|CP016491|CRISPRCasFinder TATACCATACACCGAAAATGTGAAATAATAAT >6.21|2406927|32|CP016491|CRISPRCasFinder AATCCAGCTCCAATTGGTTGGACGTTAAATGC >6.22|2406988|31|CP016491|CRISPRCasFinder TGCCGGACTGCTCAACGGTCATAATGCTACG >6.23|2406926|33|CP016491|CRT TAATCCAGCTCCAATTGGTTGGACGTTAAATGC >6.24|2406987|32|CP016491|CRT GTGCCGGACTGCTCAACGGTCATAATGCTACG |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP016491_6
The CRISPR arrays of CP016491_6 >merge|CP016491|6|2406288-2407047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCCCATGGCTAGGCCCCCTCATAGAATTTCGTGTTCTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCTAAGATGATCGAGTATTACCAAACCAGTCACATCTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCTTAATCCCGCCGCGTCTTCGACCTTCATGTCGGCTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCCGTTTGCCAGGCTTTACTGGAGTCGTTCAATTCCTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCCACGTTTAAACTTGAGCGCGTCGCGATTCTTGACTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCCTGTATGGGGTCAGGTAGTACGGGTGTCAGCTGCTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCCTAATTCACGATTCTGGTCGCTGTGGTCAAGTACTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCCTAGATAGCTTGCATGAGTGTGCCGTAGTCCGTGCTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCCTGTTCCGTCCTTGTCGTTGCCGTGCGTGCCATCCTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCCTTATACCATACACCGAAAATGTGAAATAATAATCTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTAATCCTAATCCAGCTCCAATTGGTTGGACGTTAAATGCCTGTTTCCCGTGTATGCGGGGTGATCCCGTGCCGGACTGCTCAACGGTCATAATGCTACGCTGTTCCCCGTATATGCGGGGGTAATCCA >CP016491|6|5|2406288-2406925|PILER-CR CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CCATGGCTAGGCCCCCTCATAGAATTTCGTGTT CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC TAAGATGATCGAGTATTACCAAACCAGTCACAT CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC TTAATCCCGCCGCGTCTTCGACCTTCATGTCGG CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CGTTTGCCAGGCTTTACTGGAGTCGTTCAATTC CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CACGTTTAAACTTGAGCGCGTCGCGATTCTTGA CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CTGTATGGGGTCAGGTAGTACGGGTGTCAGCTG CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CTAATTCACGATTCTGGTCGCTGTGGTCAAGTA CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCC TAGATAGCTTGCATGAGTGTGCCGTAGTCCGTG CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCC TGTTCCGTCCTTGTCGTTGCCGTGCGTGCCATC CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCC TTATACCATACACCGAAAATGTGAAATAATAAT CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTAATCC >CP016491|6|6|2406288-2407047|CRISPRCasFinder CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCC CATGGCTAGGCCCCCTCATAGAATTTCGTGTT CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCT AAGATGATCGAGTATTACCAAACCAGTCACAT CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCT TAATCCCGCCGCGTCTTCGACCTTCATGTCGG CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCC GTTTGCCAGGCTTTACTGGAGTCGTTCAATTC CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCC ACGTTTAAACTTGAGCGCGTCGCGATTCTTGA CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCC TGTATGGGGTCAGGTAGTACGGGTGTCAGCTG CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCCC TAATTCACGATTCTGGTCGCTGTGGTCAAGTA CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCCT AGATAGCTTGCATGAGTGTGCCGTAGTCCGTG CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCCT GTTCCGTCCTTGTCGTTGCCGTGCGTGCCATC CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCCT TATACCATACACCGAAAATGTGAAATAATAAT CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTAATCCT AATCCAGCTCCAATTGGTTGGACGTTAAATGC CTGTTTCCCGTGTATGCGGGGTGATCCCG TGCCGGACTGCTCAACGGTCATAATGCTACG CTGTTCCCCGTATATGCGGGGGTAATCCA >CP016491|6|4|2406288-2407046|CRT CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CCATGGCTAGGCCCCCTCATAGAATTTCGTGTT CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC TAAGATGATCGAGTATTACCAAACCAGTCACAT CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC TTAATCCCGCCGCGTCTTCGACCTTCATGTCGG CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CGTTTGCCAGGCTTTACTGGAGTCGTTCAATTC CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CACGTTTAAACTTGAGCGCGTCGCGATTCTTGA CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CTGTATGGGGTCAGGTAGTACGGGTGTCAGCTG CTGTTCCCCGTGTATGCGGGGGTGATCC CTAATTCACGATTCTGGTCGCTGTGGTCAAGTA CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCC TAGATAGCTTGCATGAGTGTGCCGTAGTCCGTG CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCC TGTTCCGTCCTTGTCGTTGCCGTGCGTGCCATC CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTGATCC TTATACCATACACCGAAAATGTGAAATAATAAT CTGTTCCCCGCGTATGCGGGGGTAATCC TAATCCAGCTCCAATTGGTTGGACGTTAAATGC CTGTTTCCCGTGTATGCGGGGTGATCCC GTGCCGGACTGCTCAACGGTCATAATGCTACG CTGTTCCCCGTATATGCGGGGGTAATCC
>CP016491.1|AUI79171.1|2405363_2405921_+|adenine-phosphoribosyltransferase MQQYQLRLGPLTRQLPLIQIAPNTRIASFVLLGDAELTQYAAQQLAQRLTHTPFDYLVTMESKGIPLAQALSQLTHHPRFIVLRKSVKPYMTHPHTIAVTAITTNTPQQLVLDDADATLLRGKRVVIVDDVISTGGSLEAANRLLQQVGAQVVAQTAILAEGAAGTRTDIGFLAKLPLFDGNNSE >CP016491.1|AUI79170.1|2404516_2405038_-|hypothetical-protein MSTVADFYLHDRPTLLFSLHPEPTQAIIDGSKLLEYRRRFFSEPFQAFVYTSGPNGGIRLYLRCDKGLQLPPDQLALVGALIQHDSPDVTAAYFKCAAQGVALPITAFTTLPNIPLDQLRQQFSNFVAPRSYVFLDRPARQAQLDWLLQQPCQPLQLIDWTRRYAALATLLAR >CP016491.1|AUI79169.1|2403798_2404317_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MYFKRATLDDLDQIIDILSDGRNQLAEAGVNQWQGDYPSRKQITADIMQGSAYLFNADDNATVGAVAVVPSPDETYDTANANWLNTTDPYVVIHRVAIHSSHAGHGYATQLFEKIIAHIAAEHPEIKSIRIDTHADNLAMQHLIAKMNFERVGDMVGVYHVDDVCYVYEKLL >CP016491.1|AUI79168.1|2402847_2403684_+|metallophosphoesterase MVKIAVLSDVHGNATALEAVLADARAQRVDEYWTVGDMTVRGPESERVLSLLDTVAPTAYVLGNHEENYQKVLTANPNTFTKPKQVMATVLTAFDRRQLSSEHFERCLNLPMTVTKQVGPLTIRLQHVLPTVASGHALAPTASQANFDEATTGDVDIVIYAHTHTPIMRYGTGGKLILNAGTVGLPTALNPNLRQPRASYLVLTIDASGLQQIDYRSVDFDREQAITIAHQAHLPYVEFYEQTLRTNAYQYAPSAVAAYNTQHDMAQEARKILLENRR >CP016491.1|AUI79167.1|2401583_2402456_-|transcriptional-regulator MATSFQHEIVTRTQPLSAWIHYHDQHAPSEIAAHWHQGIELSYTISGHIDDFTINGQHFRTSAGQLLVVNSQLIHSIHTHNTPESRALSVIYPYDYVRRLYPKIETEIIAVNDPHQFTSAQQAMYLNLQGHFDQLYLALQRPSAVTNLRLEAETVQILAELLTYFTSAKASTGVMYGKDALAVERIQKISTYVAQHYTEPISLTDVAQQINVTKEYLTRFFKKQMAMTVGQYVNLVRAQHAYEDLLGERGNLTTIASMNGFASTRALNRAFQTVYHQSAAEIYKTKHTWD >CP016491.1|AUI79166.1|2400403_2401294_-|lipase MTEKDLKQAIIELRTAFKTNDDARDAGLPREVAGVERLDDLSYGPDPKWHLLDLYRPTDASRPLPVIINIHGGGWCYGTKETYQFYGLNWAQRGFAFVNPNYRLAPDAVFPDELDDVDRYIHWVADHADEYGLDRNNVFLLGDSAGGQMAEQYAAILTNPDYRDLFGYQLTDLHFRAVVLNSAAAFPLDEGMVTGAVAAYFTPEAIQKQRNQIEAERYIQANYLPTFICTATEDFIRNNSAKLDGFLTAKGIEHVFKMYGDEKHPRGHVFLVSQKDDIAKQATDAEMAFLNAHLSK >CP016491.1|AUI79165.1|2399176_2400391_-|MFS-transporter MRAKQDRFIFKASLLSISLFLMMAPQIASALPLMYHAFKGVQAAGVQTLSTIPNFGIVAGLLISPFMVRWFHEKATIIIGLLVTLIAGTFPMYASAYVPILISRFLIGLGIGLFNSLAVSLIPQFYKRDEDELARMIGYQNVMGSVGAAIASFLVSYLVTISWHAAFAIYLLVIPVLILFALFVPLPHTAAPRQTSQTATKAGGNHQINRPVVVISILMFLVFTFYMPFSYELPSLIVNEGLGNASTAALIAGLSTLVSIPIGASFGFFFKRLHDRIFPLGFVLVAAGFLLIAVATNIIFLFIAVVILGFGFGLGVPYLYNWLDWAAPEQSLNLATTIVLVLVNIGCFVSPTIMDALASAVGHGTPRGMMVLSGVAFICIAIYAVGHYLHVHRTQANVAGDSRD >CP016491.1|AUI79164.1|2398281_2399223_-|sugar-kinase MCIAPKQTWRVIHVTNQYLCFDIGGTNLKAGLLDTNGGQIQPATSVPMAQDLDAFWQQLFTIADQYVGQIAGIAVSVPGQVDPQTGIVYHGGALPFLDQCPLQQTLAMRYQLPVAVENDGKAAALAENWRGSLQGCQNGLVLVLGTGVGGGLIIHNQLYRGSHFQAGELSLMLAASTSAPIKITGQTGSAVSMISAIAHELQLPDEHDGRQVFAALTAGDPKALEMFNAYGRQVAQIILNVQAVMDLNVVAIGGGISAQPSVVPMIQRQYDELLEQLPMIRETLSQPRIVAAKFHNEANLVGALAALLGMATV >CP016491.1|AUI79163.1|2396613_2397939_+|divalent-metal-cation-transporter MQPRSRQSLEEINQSVAVPDVHQTAFWRKFLAYSGPGALVAVGYMDPGNWLTSLAGGGQFQYRLLTVLALAIIVAMFMQALAIKLGVVARQDLAQAIAAKLPRPIRYALWILNEVAMMATDMTGVIGTAIALKLLFGLPLLAGILLTIADVLVVLLFLRFGIRRVEFLVLAAIISVGIIFGLEVGRAHVQVGQVMLGLVPNSLIIKNHTALVLSLGILGATIMPHNLYLHSSLAQSRRYDYHDPLQVNEALRFANWDSTVHLIAAFLINALLLVLGGTLFFGHTTALASLQAVFNGLKNPAIVGALASPFMSWLFALALLITGLISSITSTLAGQIVMEGYLHIRLPLWQRRLLTRAVTLIPILIIGFMVGFSDAAFENLIIYAQVALSVALPFTLLPLVALTNNRQLMGAHVNRPAVTWLGYGLAGIITILNIYLVYSLF >CP016491.1|AUI79162.1|2395667_2396627_+|ferrochelatase MHPGLLLVNLGSPASPTTQDVKTYLQEFLSDPSVIEMPDALWQPLLRGIILPTRSWRSATFYQDSWLPAGSPLIVYSEKICEQVQADLPDWDVRLAMTYGQPDIGETLQAMVADGCEQPIVLPLFPQYTQSTHGGIHRQVEATGLPHTFIDHFYDNATYIQLLAAKVWESYQQHDFDAVIFSYHSIPTAMVRHGDPYQKECEATTAAVLAQLPELPADKVVTAYQSKFGPMPWLKPYLRNELMQLVELGKRNVLIATPSFVVDCLETLEEDYVQNYQTFKSSGGDRFELVPPMNTDPQFSQLLADLAVQKWEARAHATT >CP016491.1|AUI79172.1|2407544_2408786_+|hypothetical-protein MKKVTVFLVIIFAIAISIQYWWALSLVAGISLTIFGIIRAKKDKQRKSRQSIYQVDKHGQQPSIGKDISLHGGSDESQDIDDEDTELKNAEPHHSHRDKLNNSVTSDKSVNSNLNKPTSIEEEKSTMRASTRQAPNIHKLRRKLTNFVVVDIETTGFNRFEETIIQISALKFKKDQLIDDFNCYINPHRKLQQKISSLTGLTDEKLKNAPDLNYALDKFTHFVADFPLVGHNIMGFDLPFLIEKGFYLPDIEALDTLPLSRRKLPELKDKKLPTLKKYFGVVNRSHNALNDCRTTAIVYQRLRDDKLDEVEPDYSKIPKSIAGIRFCITGKFDEESRDDLIDEIKQHGGRYTKSVSGLTNYLLKGTQTSQNLIDGVHSNSELKMLENVKNGKEAKIIGLSEFHTLIATGNAKQ >CP016491.1|AUI79173.1|2408805_2409027_+|hypothetical-protein MLLLLAVLFCMFTYKFFTKWIWVILPFALAIDGLLWIHAHQLLFWIVFSVALITYNLIYRHQHSGRDPFYNKK >CP016491.1|AUI79174.1|2416658_2418764_-|glycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase MPKFIKNTVGKVNTTLGFYLLTVVLFWLKTYIAYKSEFTLGVKGPVQEFILFLNPFPTAIVLLGIALYFRGRLKYWIMMIIDAIQTTWLFANILYYREFSDFMSAGVIKSSGAASNNLGKSLGQIIHGTDFLVYADVVLLILLLAFKVIRIDPRPFKIRYAATLTMIGVALFAVDLGMSEHDRSDLLTRTFDNNYIVKYLGLNTYAGYSFYQTEKESATRAQASSSDMKSVLAYLKKNQAGENVKYFGKAKGKNVFVIHLESFQQFLIDYKVDGKEVTPNLNKFYHDKSTLSFDNFYHQVAQGKTSDAEMMMENSLFGLPTGSAMTQYGTSNTFQAAPAILAQKGYTTAAFHGDVASFWNRDNAYKSWGYDYFFYSSYYKEKADYNIGYGLKDKIFFKDSVKYLEQLPQPFYAKLITLTNHYPYELDKKNQSIDKTKTGDSTVDGYVQTAHYLDQAFAEFISYLKKAGLYKNSMIVLYGDHYGISNNHKAAIAQLLGKKSVTSFDLAQFQKVPFMIHSEGIKGGVNHTYGGEIDALPTIFDLLGIKNKGYIQFGTDLLSKQHNQTVAFRNGDFVSPTYTKISGTVYDSKTGKKLTNMTTKQKDTVKQMQNHVTTELSLSDRVIQGDLLRFYTPKGFKKVDKSKYSYKITKTLKSLKEIQAEKNTSLLSKRKGKSSESLYKTDAPELSSSSDSSSSSSSSSD >CP016491.1|AUI79175.1|2418920_2419157_-|hypothetical-protein MDKSELSAILKRLEAMRTTDATEVQSRRFEKEGVQRGQVAYDPATSTYTLQEFNPDQTFEFDNIDLVAIELYDLLTDN >CP016491.1|AUI79176.1|2419349_2420537_+|aromatic-amino-acid-aminotransferase MTLFRDDLNETISQIQVSTIRQFDEEVRAIPDMVKLTLGEPDFNTPEHVKAAAKKAIDDNFSHYTGMAGLLELRQAAANFQATKYGVHYDAEDQVLVTVGATEAIATALTTICNPGDAIIVPSPIFPAYIPIIQEAHARPLFMDTGVNDFIITPKMVDDFIAAHPDEHFKGIILNYPNNPTGVTYVADEVKALAECFQRHNLWVVSDEIYSELTYGSDHVSIAKYIPDEVVLINGLSKSHAMTGWRIGFLFASKEMTAQLKKVHQYYVTAATTIAQKAGVEALTNGIDDALPMRKEYQTRRDFVYQTMSKLGFKIARPTGAFYIFAKIPAGFEQDSMAFCKDLARKNQLAIIPGTGFGAEGEGYVRLSYAASMEKLQLAMDRLTAYMQTPANRVD >CP016491.1|AUI79177.1|2420651_2421893_-|D-alanyl-D-alanine-carboxypeptidase MLKLIKHRLATGLVLAAGMVGLLMGTPAVHAANKADEVKAAYIMDAKSGQVVYAQNADQKLPIASLSKLMTLYLVESAIQRGQIKWTDTVPIDKNVRKMATSATLSVMPMPAKEHFTVKELFAATLVGSSNSGAIALGEYVAGSNAKFIKLMNQQAAKWQLDAHFISASGLDNTDLTNYDLKIAGTGEQGQNMVSARAVTTIARHLINDYPDVIKVTDQRSVKIHKYTVPTSVQILKGEKYYDYRVPVDGLKTGYTNQAGACLVATFRQNGRRMIATTLGGAWKFTANNNLRLMLKQSERYQQVAPKTIQYQIPGTTTKLQLETDSQTTMWQNTDHPMTQTKIELWPLHRTKPNYLAAGTAVLKLRLTDPLSGTVHNVIYRTPKALTMLGPVQWATQVKKSTTVSAAAFAMAK >CP016491.1|AUI79178.1|2421963_2423013_-|hypothetical-protein MTRKNIWSLLIMVALGVGISWYSLRNVKLSNLMDDIVTLNWWWLLVALGCVGLYFGLEAVVVQKFVRHRYRHYTFRNALRVPLAEQLFNGITPFSSGGQPAQIFVMAQSGIDAGRASSVALMKFVVFQAMVVLNFLFSMLIGFHYLAEKLSYLSLYVLLGFLIHFGVIVGLLLVMYWYNFTKRAVKIVLIPVGWFMKAERFAKFEQNISDKIDSFYEESLRMTKDWRMLLEVSIVTFLQLFFYYLIPYFIMRAMGVDDVNLIMVTSLNVLIFLVTSLFPIPGGAGGAEFGFTALFAKFIPTHSKLILAMLIWRILTYYLGLFLGMIAMAMHPEKAEEIPLTEDSQETEL >CP016491.1|AUI79179.1|2423016_2424039_-|glycosyltransferase MLDITMFSKADSVKGQGVGSAYLELMRLLQTHWQDEFNIKVNRYGRSAISHYHTVNPMFYLSTFMPNRGRKIGYVHFLPETLEGSLKLPRPFQVIFNRYLISFYKRMDHIVVVNPTFIPKLEAYHIKRADVTYIPNFVSKREFYEMTKSKQLRLRQQYGYDQHKFMIIGTGQIQDRKGVPDFITLAKRNPDIQFVWAGGFSFGRITDGYQDLKQVVDNPPANLSFPGIVAREKLVDYYNMADLFLLPSYNELFPMSVLEAFSCGTPVLLRDLDLYRAIIDGYYQAATDVDDMQKQIDHLRNNPAGMQFLHDKAVLAAQDYSEERLASVWHDFYLQQAKEG >CP016491.1|AUI79180.1|2424091_2425270_-|1,2-diacylglycerol-3-glucosyltransferase MNIGIFTDTYYPQVSGVATSIKVLRNQLERAGHQVYIFTTTDPHVDKNIYERNIFRFTSIPFVSFTDRRIAVRGLFKAYQVAKDLGLDIVHTQTEFSMGMIGKFVAKQLKVPCIHTYHTMYEDYLHYIANGKLLKPYHVKEATRAYCYHLNGIVAPSDRVAKTLTGYGVKAPIRIIPTGIDINQYEQQSTADYRKQLGYQPDTPVLLSLSRLAYEKNIHEVIAALPAILDQVPAAQLLIVGDGPARETLENQVEAAGLSDHVQFTGEIDNDAVYNYYQMADLFVSASNSESQGLTYIEAMAAGLKTVVASSPYTDQLLDDPSLGTTFTSEAGLVKDVVRYLQHPTTFDDPKPRQKKLYQISAEYFGKQVINYYQDVQLAYSESTDKSANISN >CP016491.1|AUI79181.1|2426928_2428659_-|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MAEKVLKGIAASDGIAIAKAYMLVDPDLSFEKTTVSDTDAEVARLHDAFDASKAELKVIKDKAVENLGEEEAEVFEAHITILSDPEMLGQIEGKIKDDKVNAEEALKEVTDTFISMFEAMTDNAYMQERAGDIRDVTKRVLSHLLGVTLPSPALIDSEVIVVAHDLTPSDTAQLDRKYVKGFITDIGGRTSHSAIMSRTLEIPAVVGSESATADIKAGDTVVLDGINGDALVEPTDAEVTDYEQKAKDFVAQKAEWAKLKNEATVSKDGKHFELASNIGTPDDMDGVLDAGSEAIGLFRSEFLYMNSSELPDEETQFQAYKKVVEGMNGKPVIVRTMDIGGDKELPYLPLPDEMNPFLGYRAIRISLDRDDIFRTQLRALLRASHYGQLRIMFPMIATLDEFRKAKAIFEEEKAKLVAAGTPVADDIKLGIMIEIPAAAILADQFAKEVDFFSIGTNDLIQYSFAADRGNEQVSYLYQPYNPSLLRLIKHVIDAAHANGRFTGMCGEVAGDQIAVPLLMGLGLDEFSMSSTSVLKTRSLMKKLDTKEMAKLADKALNECVTNEEVKELVEKNVFDK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP016491_1 | 1.3|123615|30|CP016491|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 123615-123644 | 30 | NZ_CP018210 | Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_1, complete sequence | 31295-31324 | 2 | 0.933 |
CP016491_1 | 1.9|124052|30|CP016491|CRISPRCasFinder | 124052-124081 | 30 | NC_004305 | Lactobacillus phage phig1e, complete genome | 38050-38079 | 2 | 0.933 |
CP016491_1 | 1.9|124052|30|CP016491|CRISPRCasFinder | 124052-124081 | 30 | X98106 | Lactobacillus bacteriophage phig1e complete genomic DNA | 38050-38079 | 2 | 0.933 |
CP016491_1 | 1.3|123615|30|CP016491|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 123615-123644 | 30 | MG788324 | Lactobacillus phage PM411, complete genome | 37023-37052 | 3 | 0.9 |
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CP016491_5 | 5.9|2134038|36|CP016491|CRISPRCasFinder | 2134038-2134073 | 36 | NZ_CP032362 | Lactobacillus plantarum strain ZFM55 plasmid unnamed3, complete sequence | 42176-42211 | 3 | 0.917 |
CP016491_5 | 5.9|2134038|36|CP016491|CRISPRCasFinder | 2134038-2134073 | 36 | NZ_CP018328 | Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain TS12 plasmid pLP12-4, complete sequence | 7709-7744 | 3 | 0.917 |
CP016491_5 | 5.9|2134038|36|CP016491|CRISPRCasFinder | 2134038-2134073 | 36 | NZ_CP018328 | Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain TS12 plasmid pLP12-4, complete sequence | 23503-23538 | 3 | 0.917 |
CP016491_5 | 5.9|2134038|36|CP016491|CRISPRCasFinder | 2134038-2134073 | 36 | NZ_CP032647 | Lactobacillus plantarum strain ZFM9 plasmid unnamed5, complete sequence | 12703-12738 | 3 | 0.917 |
CP016491_1 | 1.11|123945|26|CP016491|PILER-CR | 123945-123970 | 26 | LR215718 | Staphylococcus phage Stab20 genome assembly, chromosome: I | 97379-97404 | 4 | 0.846 |
CP016491_5 | 5.9|2134038|36|CP016491|CRISPRCasFinder | 2134038-2134073 | 36 | NZ_CP025733 | Lactobacillus plantarum strain B21 plasmid pB21AG02, complete sequence | 3146-3181 | 4 | 0.889 |
CP016491_5 | 5.9|2134038|36|CP016491|CRISPRCasFinder | 2134038-2134073 | 36 | NZ_MH544243 | Lactobacillus plantarum strain PC518 plasmid pLP60, complete sequence | 3146-3181 | 4 | 0.889 |
CP016491_1 | 1.5|123747|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 123747-123776 | 30 | NZ_CP053953 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_798 plasmid unnamed2, complete sequence | 197403-197432 | 6 | 0.8 |
CP016491_1 | 1.5|123747|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 123747-123776 | 30 | NZ_CP045608 | Bacillus cereus strain SB1 plasmid p2, complete sequence | 161404-161433 | 6 | 0.8 |
CP016491_1 | 1.5|123747|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 123747-123776 | 30 | NZ_CP053950 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed2, complete sequence | 91650-91679 | 6 | 0.8 |
CP016491_6 | 6.15|2406561|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406561-2406592 | 32 | NZ_CP040097 | Pantoea sp. SO10 plasmid unnamed2, complete sequence | 29263-29294 | 6 | 0.812 |
CP016491_4 | 4.2|2130672|30|CP016491|PILER-CR | 2130672-2130701 | 30 | NZ_LR215005 | Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 9 | 83709-83738 | 7 | 0.767 |
CP016491_5 | 5.1|2133737|32|CP016491|PILER-CR | 2133737-2133768 | 32 | KY744230 | Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 10, partial genome | 3194-3225 | 7 | 0.781 |
CP016491_5 | 5.1|2133737|32|CP016491|PILER-CR | 2133737-2133768 | 32 | KY926699 | Lactococcus phage PLgY-30, complete genome | 24612-24643 | 7 | 0.781 |
CP016491_5 | 5.1|2133737|32|CP016491|PILER-CR | 2133737-2133768 | 32 | KY888143 | Lactococcus phage PLgW-1, complete genome | 25434-25465 | 7 | 0.781 |
CP016491_5 | 5.1|2133737|32|CP016491|PILER-CR | 2133737-2133768 | 32 | KY926698 | Lactococcus phage PLgY-16, complete genome | 24670-24701 | 7 | 0.781 |
CP016491_6 | 6.5|2406560|33|CP016491|PILER-CR,CRT | 2406560-2406592 | 33 | NZ_CP040097 | Pantoea sp. SO10 plasmid unnamed2, complete sequence | 29263-29295 | 7 | 0.788 |
CP016491_6 | 6.13|2406439|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406439-2406470 | 32 | NZ_CP006990 | Rhizobium sp. IE4771 plasmid pRetIE4771d, complete sequence | 410662-410693 | 7 | 0.781 |
CP016491_6 | 6.15|2406561|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406561-2406592 | 32 | NC_016591 | Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_2p, complete sequence | 8070-8101 | 7 | 0.781 |
CP016491_1 | 1.4|123681|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT | 123681-123710 | 30 | NZ_CP045339 | Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_a, complete sequence | 518631-518660 | 8 | 0.733 |
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CP016491_1 | 1.7|123879|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 123879-123908 | 30 | NZ_CP033583 | Streptomyces sp. ADI95-16 plasmid pADI95-16b, complete sequence | 205625-205654 | 8 | 0.733 |
CP016491_1 | 1.7|123879|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 123879-123908 | 30 | NZ_CP016619 | Microvirga ossetica strain V5/3m plasmid unnamed2, complete sequence | 575420-575449 | 8 | 0.733 |
CP016491_1 | 1.9|124052|30|CP016491|CRISPRCasFinder | 124052-124081 | 30 | NC_005250 | Vibrio anguillarum 775 plasmid pJM1, complete sequence | 6763-6792 | 8 | 0.733 |
CP016491_1 | 1.9|124052|30|CP016491|CRISPRCasFinder | 124052-124081 | 30 | NZ_LK021128 | Vibrio anguillarum strain NB10 plasmid p67vangNB10, complete sequence | 34478-34507 | 8 | 0.733 |
CP016491_1 | 1.9|124052|30|CP016491|CRISPRCasFinder | 124052-124081 | 30 | NC_022225 | Vibrio anguillarum M3 plasmid unnamed, complete sequence | 30405-30434 | 8 | 0.733 |
CP016491_1 | 1.9|124052|30|CP016491|CRISPRCasFinder | 124052-124081 | 30 | NZ_CP023210 | Vibrio anguillarum strain ATCC-68554 plasmid p65, complete sequence | 34817-34846 | 8 | 0.733 |
CP016491_1 | 1.9|124052|30|CP016491|CRISPRCasFinder | 124052-124081 | 30 | NZ_CP020532 | Vibrio anguillarum strain 425 plasmid pEIB1, complete sequence | 38808-38837 | 8 | 0.733 |
CP016491_2 | 2.1|379311|29|CP016491|CRISPRCasFinder | 379311-379339 | 29 | NZ_CP013691 | Myroides odoratimimus strain PR63039 plasmid p63039, complete sequence | 70648-70676 | 8 | 0.724 |
CP016491_4 | 4.4|2130671|31|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130671-2130701 | 31 | NZ_LR215005 | Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 9 | 83709-83739 | 8 | 0.742 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_LR213454 | Shigella flexneri strain AUSMDU00008355 isolate AUSMDU00008355 plasmid 3 | 45729-45760 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_KU295131 | Escherichia coli strain BK28009 plasmid pBK28009, complete sequence | 34822-34853 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_KM023153 | Escherichia coli strain PGR46 plasmid pPGRT46, complete sequence | 19900-19931 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_KY848295 | Shigella flexneri Y strain RC960 plasmid pRC960-1, complete sequence | 29653-29684 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP025845 | Escherichia coli strain 720632 plasmid p720632_72, complete sequence | 38578-38609 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_LT882487 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi isolate 4714STDY6831631 plasmid 2 | 54863-54894 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP046430 | Salmonella enterica strain R19.2839 plasmid pR19.2839_83k, complete sequence | 64797-64828 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP040574 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain WGS1146 plasmid unnamed, complete sequence | 65930-65961 | 8 | 0.75 |
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CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP024474 | Shigella flexneri 7b strain 94-3007 plasmid unnamed1, complete sequence | 46825-46856 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP026764 | Shigella flexneri strain 04-3145 plasmid unnamed, complete sequence | 20674-20705 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP006642 | Escherichia coli PCN061 plasmid PCN061p6, complete sequence | 121767-121798 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | CP045558 | Citrobacter sp. S39 plasmid pS39-3, complete sequence | 11439-11470 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NC_014725 | Edwardsiella tarda strain CK41 plasmid pCK41, complete sequence | 21876-21907 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | MN086778 | Escherichia coli plasmid p16EC-IncN, complete sequence | 67561-67592 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP040928 | Escherichia coli strain YY76-1 plasmid pYY76-1-1, complete sequence | 127820-127851 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | CP044008 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 2018K-0756 plasmid p2018K-0756, complete sequence | 6183-6214 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP021681 | Escherichia coli strain AR_0162 plasmid tig00003056, complete sequence | 26165-26196 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP026200 | Escherichia coli strain ECONIH6 plasmid pECO-6dfa, complete sequence | 58246-58277 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP012163 | Enterobacter roggenkampii strain 35734 plasmid p35734-109.753kb, complete sequence | 44732-44763 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP045514 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Anatum strain Sal-3948 plasmid p77k, complete sequence | 53668-53699 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_LT904889 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 129-0238-M genome assembly, plasmid: 2 | 61-92 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP040809 | Escherichia fergusonii strain EFCF056 plasmid pEF04, complete sequence | 38127-38158 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP040810 | Escherichia fergusonii strain EFCF056 plasmid pEF05, complete sequence | 61881-61912 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NC_011092 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 plasmid pCVM19633_110, complete sequence | 92646-92677 | 8 | 0.75 |
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CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP036311 | Enterobacter hormaechei strain WCHEH090011 plasmid pCTXM65_090011, complete sequence | 78718-78749 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | CP042900 | Escherichia coli strain CFSAN061763 plasmid pCFSAN061763, complete sequence | 46200-46231 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP009851 | UNVERIFIED_ORG: Enterobacter cloacae strain ECNIH4 plasmid pENT-c88, complete sequence | 24393-24424 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP039328 | Citrobacter portucalensis strain Effluent_1 plasmid unnamed1, complete sequence | 67319-67350 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | CP042902 | Escherichia coli strain CFSAN061762 plasmid pCFSAN061762, complete sequence | 51814-51845 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP018207 | Escherichia coli strain MRSN346647 plasmid pMRSN346647_113.1, complete sequence | 100577-100608 | 8 | 0.75 |
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CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | CP042974 | Escherichia coli strain CFSAN061768 plasmid pCFSAN061768, complete sequence | 116350-116381 | 8 | 0.75 |
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CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP029869 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 343077_215174 plasmid pK91, complete sequence | 33879-33910 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP047573 | Escherichia coli strain 2EC1 plasmid p2EC1-2, complete sequence | 90385-90416 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP029874 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 343077_211171 plasmid pK91, complete sequence | 50878-50909 | 8 | 0.75 |
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CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | MH430882 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar London strain 3-5 plasmid pSa44-CIP, complete sequence | 51163-51194 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP029912 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 343076_249107 plasmid pK91, complete sequence | 33879-33910 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP029963 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 343078_228140 plasmid pK91, complete sequence | 53163-53194 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | MH430881 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar London strain 3-5 plasmid pSa44-CIP-CRO, complete sequence | 119431-119462 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP020344 | Shigella flexneri 1a strain 0439 plasmid unnamed2, complete sequence | 2366-2397 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP021734 | Escherichia coli strain AR_0114 plasmid unitig_2, complete sequence | 77986-78017 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_LT985234 | Escherichia coli strain 557 plasmid RCS32TR557_p, complete sequence | 7372-7403 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | MN604267 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar London strain SAL-19-0623 plasmid pSAL-19-0623_NDM, complete sequence | 137646-137677 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_CP043007 | Citrobacter portucalensis strain WCHCP085039 plasmid p1_085039, complete sequence | 38566-38597 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_MG870194 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar London strain Sa128 plasmid pSa128, complete sequence | 82020-82051 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | NZ_MG773378 | Escherichia coli strain WA8 plasmid pWA8, complete sequence | 19901-19932 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | MG874043 | Salmonella sp. strain Sa63 plasmid pSa63-CIP, complete sequence | 81629-81660 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130856-2130887 | 32 | MG874044 | Salmonella sp. strain Sa76 plasmid pSa76-CIP, complete sequence | 75177-75208 | 8 | 0.75 |
CP016491_4 | 4.8|2130918|31|CP016491|CRISPRCasFinder | 2130918-2130948 | 31 | KT351734 | Pectobacterium carotovorum plasmid Drgb3, complete sequence | 138929-138959 | 8 | 0.742 |
CP016491_5 | 5.1|2133737|32|CP016491|PILER-CR | 2133737-2133768 | 32 | NZ_CP021437 | Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB240, complete sequence | 130265-130296 | 8 | 0.75 |
CP016491_5 | 5.1|2133737|32|CP016491|PILER-CR | 2133737-2133768 | 32 | MH853356 | Streptococcus phage LF2, partial genome | 20192-20223 | 8 | 0.75 |
CP016491_5 | 5.10|2133736|33|CP016491|CRT | 2133736-2133768 | 33 | KY744230 | Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 10, partial genome | 3194-3226 | 8 | 0.758 |
CP016491_6 | 6.3|2406438|33|CP016491|PILER-CR,CRT | 2406438-2406470 | 33 | NZ_CP006990 | Rhizobium sp. IE4771 plasmid pRetIE4771d, complete sequence | 410661-410693 | 8 | 0.758 |
CP016491_6 | 6.14|2406500|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406500-2406531 | 32 | MT773557 | Myoviridae sp. isolate BML_S_1 genomic sequence | 115553-115584 | 8 | 0.75 |
CP016491_6 | 6.15|2406561|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406561-2406592 | 32 | NC_009507 | Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT01, complete sequence | 115618-115649 | 8 | 0.75 |
CP016491_6 | 6.18|2406744|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406744-2406775 | 32 | NZ_CP024940 | Paraburkholderia hospita strain mHSR1 plasmid pmHSR1_P, complete sequence | 346708-346739 | 8 | 0.75 |
CP016491_6 | 6.19|2406805|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406805-2406836 | 32 | NZ_CP017104 | Rhizobium gallicum strain IE4872 plasmid pRgalIE4872c, complete sequence | 425968-425999 | 8 | 0.75 |
CP016491_1 | 1.2|123549|30|CP016491|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 123549-123578 | 30 | NZ_CP014683 | Kozakia baliensis strain NBRC 16680 plasmid pKB16680_2, complete sequence | 64919-64948 | 9 | 0.7 |
CP016491_1 | 1.2|123549|30|CP016491|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 123549-123578 | 30 | NZ_CP014675 | Kozakia baliensis strain DSM 14400 plasmid pKB14400_1, complete sequence | 21455-21484 | 9 | 0.7 |
CP016491_6 | 6.13|2406439|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406439-2406470 | 32 | CP033374 | Lactobacillus fermentum strain DR9 plasmid unnamed3, complete sequence | 8539-8570 | 9 | 0.719 |
CP016491_6 | 6.13|2406439|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406439-2406470 | 32 | NZ_CP029452 | Sinorhizobium fredii CCBAU 25509 plasmid pSF25509b, complete sequence | 1169941-1169972 | 9 | 0.719 |
CP016491_6 | 6.13|2406439|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406439-2406470 | 32 | NC_016655 | Rhodococcus phage REQ1, complete genome | 7945-7976 | 9 | 0.719 |
CP016491_6 | 6.18|2406744|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406744-2406775 | 32 | MN694267 | Marine virus AFVG_250M705, complete genome | 8384-8415 | 9 | 0.719 |
CP016491_6 | 6.18|2406744|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406744-2406775 | 32 | MN582058 | Caudovirales sp. ctOwN3, complete genome | 5660-5691 | 9 | 0.719 |
CP016491_6 | 6.19|2406805|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406805-2406836 | 32 | JQ807233 | Environmental Halophage eHP-12, partial genome | 25030-25061 | 9 | 0.719 |
CP016491_6 | 6.19|2406805|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406805-2406836 | 32 | JQ807237 | Environmental Halophage eHP-16, partial genome | 10261-10292 | 9 | 0.719 |
CP016491_6 | 6.13|2406439|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406439-2406470 | 32 | NZ_CP023071 | Sinorhizobium fredii CCBAU 83666 plasmid pSF83666b, complete sequence | 1178073-1178104 | 10 | 0.688 |
CP016491_6 | 6.13|2406439|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406439-2406470 | 32 | NZ_CP029232 | Sinorhizobium fredii CCBAU 45436 plasmid pSF45436b, complete sequence | 910927-910958 | 10 | 0.688 |
CP016491_6 | 6.19|2406805|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406805-2406836 | 32 | NZ_CP043441 | Cupriavidus campinensis strain MJ1 plasmid unnamed1, complete sequence | 2349836-2349867 | 10 | 0.688 |
CP016491_6 | 6.19|2406805|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406805-2406836 | 32 | NC_048068 | Microbacterium phage OneinaGillian, complete genome | 48152-48183 | 10 | 0.688 |
CP016491_6 | 6.17|2406683|32|CP016491|CRISPRCasFinder | 2406683-2406714 | 32 | NZ_CP011274 | Planctomyces sp. SH-PL62 plasmid pPL62-1, complete sequence | 46275-46306 | 11 | 0.656 |
1. spacer 1.3|123615|30|CP016491|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018210 (Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
taattatttgcaaagtggctggtgtagacc CRISPR spacer caattatttgcaaagtggctggtgtaaacc Protospacer .*************************.***
2. spacer 1.9|124052|30|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NC_004305 (Lactobacillus phage phig1e, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tttacctgccgtatacgcctgatactccat CRISPR spacer tttacctgccgtatactcccgatactccat Protospacer **************** **.**********
3. spacer 1.9|124052|30|CP016491|CRISPRCasFinder matches to X98106 (Lactobacillus bacteriophage phig1e complete genomic DNA) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tttacctgccgtatacgcctgatactccat CRISPR spacer tttacctgccgtatactcccgatactccat Protospacer **************** **.**********
4. spacer 1.3|123615|30|CP016491|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG788324 (Lactobacillus phage PM411, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
taattatttgcaaagtggctggtgtagacc CRISPR spacer caattatttgcaaagtggctggtgtgaacc Protospacer .************************..***
5. spacer 5.9|2134038|36|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032362 (Lactobacillus plantarum strain ZFM55 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
acccgagctactgaggaactggaggagaaactagat CRISPR spacer aagcgagctactgaagaactggaggagaaactagat Protospacer * ***********.*********************
6. spacer 5.9|2134038|36|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032362 (Lactobacillus plantarum strain ZFM55 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
acccgagctactgaggaactggaggagaaactagat CRISPR spacer aagcgagctactgaagaactggaggagaaactagat Protospacer * ***********.*********************
7. spacer 5.9|2134038|36|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018328 (Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain TS12 plasmid pLP12-4, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
acccgagctactgaggaactggaggagaaactagat CRISPR spacer aagcgagctactgaagaactggaggagaaactagat Protospacer * ***********.*********************
8. spacer 5.9|2134038|36|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018328 (Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain TS12 plasmid pLP12-4, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
acccgagctactgaggaactggaggagaaactagat CRISPR spacer aagcgagctactgaagaactggaggagaaactagat Protospacer * ***********.*********************
9. spacer 5.9|2134038|36|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032647 (Lactobacillus plantarum strain ZFM9 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
acccgagctactgaggaactggaggagaaactagat CRISPR spacer aagcgagctactgaagaactggaggagaaactagat Protospacer * ***********.*********************
10. spacer 1.11|123945|26|CP016491|PILER-CR matches to LR215718 (Staphylococcus phage Stab20 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
tttgacgctgtaatatattcatctat CRISPR spacer cttaaagctgtaatatattcatctac Protospacer .**.* *******************.
11. spacer 5.9|2134038|36|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025733 (Lactobacillus plantarum strain B21 plasmid pB21AG02, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
acccgagctactgaggaactggaggagaaactagat CRISPR spacer aagcgagctaccgaggaactggaagagaaactagat Protospacer * ********.***********.************
12. spacer 5.9|2134038|36|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_MH544243 (Lactobacillus plantarum strain PC518 plasmid pLP60, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
acccgagctactgaggaactggaggagaaactagat CRISPR spacer aagcgagctaccgaggaactggaagagaaactagat Protospacer * ********.***********.************
13. spacer 1.5|123747|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP053953 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_798 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
acttatgtaccagcgattacagccgttaat CRISPR spacer atgaacataccagcgattacagcagttaat Protospacer *. *..**************** ******
14. spacer 1.5|123747|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP045608 (Bacillus cereus strain SB1 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
acttatgtaccagcgattacagccgttaat CRISPR spacer atgaacataccagcgattacagcagttaat Protospacer *. *..**************** ******
15. spacer 1.5|123747|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP053950 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
acttatgtaccagcgattacagccgttaat CRISPR spacer atgaacataccagcgattacagcagttaat Protospacer *. *..**************** ******
16. spacer 6.15|2406561|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040097 (Pantoea sp. SO10 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
acgtttaaacttgagcgcgtcgcgattcttga CRISPR spacer acgtttgaacttgagcgcctcgcgtattgtga Protospacer ******.*********** ***** *. ***
17. spacer 4.2|2130672|30|CP016491|PILER-CR matches to NZ_LR215005 (Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 9) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atgtgcccatctactacttgataagttctc CRISPR spacer gtgtcaccatctactacttgataatgtcat Protospacer .*** ****************** ** .
18. spacer 5.1|2133737|32|CP016491|PILER-CR matches to KY744230 (Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 10, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aatttacgctatctaagtttatcaaacaaaat CRISPR spacer attttacgctatctaaatttctcaaacttaga Protospacer * **************.*** ****** *.
19. spacer 5.1|2133737|32|CP016491|PILER-CR matches to KY926699 (Lactococcus phage PLgY-30, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
---aatttacgctatctaagtttatcaaacaaaat CRISPR spacer tgcaatt---attatcaaagtttatcaaagaaaat Protospacer **** ..**** ************ *****
20. spacer 5.1|2133737|32|CP016491|PILER-CR matches to KY888143 (Lactococcus phage PLgW-1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
---aatttacgctatctaagtttatcaaacaaaat CRISPR spacer tgcaatt---attatcaaagtttatcaaagaaaat Protospacer **** ..**** ************ *****
21. spacer 5.1|2133737|32|CP016491|PILER-CR matches to KY926698 (Lactococcus phage PLgY-16, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
---aatttacgctatctaagtttatcaaacaaaat CRISPR spacer tgcaatt---attatcaaagtttatcaaagaaaat Protospacer **** ..**** ************ *****
22. spacer 6.5|2406560|33|CP016491|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP040097 (Pantoea sp. SO10 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
cacgtttaaacttgagcgcgtcgcgattcttga CRISPR spacer gacgtttgaacttgagcgcctcgcgtattgtga Protospacer ******.*********** ***** *. ***
23. spacer 6.13|2406439|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006990 (Rhizobium sp. IE4771 plasmid pRetIE4771d, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
taatcccgccgcgtcttcgaccttcatgtcgg CRISPR spacer gatacgggccgcgtcttcgaccttcagttcgg Protospacer * * ******************* ****
24. spacer 6.15|2406561|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NC_016591 (Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_2p, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
-acgtttaaacttgagcgcgtcgcgattcttga CRISPR spacer cacg-gcggacttgagcgcctcgcgattcttgc Protospacer *** ...********** ************
25. spacer 1.4|123681|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045339 (Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
acggctttaagcttgtgctcgtggacgtat CRISPR spacer ttgcttttcagcttgtgctggtggacgttg Protospacer .* .*** ********** ********
26. spacer 1.7|123879|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP011667 (Streptomyces sp. Mg1 plasmid pSMg1-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cggtgtt----cgttaacgacgggcgccgcgttc CRISPR spacer ----gccaagacgttcacgacgggcgccgcggtc Protospacer *.. **** *************** **
27. spacer 1.7|123879|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP033583 (Streptomyces sp. ADI95-16 plasmid pADI95-16b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cggtgtt----cgttaacgacgggcgccgcgttc CRISPR spacer ----gccaagacgttcacgacgggcgccgcggtc Protospacer *.. **** *************** **
28. spacer 1.7|123879|30|CP016491|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP016619 (Microvirga ossetica strain V5/3m plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cggtgttcgttaacgacgggcgccgcgttc CRISPR spacer gagacatcgtttacgacgggcggcgcgttg Protospacer .* ***** ********** ******
29. spacer 1.9|124052|30|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NC_005250 (Vibrio anguillarum 775 plasmid pJM1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tttacctgccgtatacgcctgatactccat CRISPR spacer tttacctgccgcatacgcctcattggcttg Protospacer ***********.******** ** *.
30. spacer 1.9|124052|30|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_LK021128 (Vibrio anguillarum strain NB10 plasmid p67vangNB10, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tttacctgccgtatacgcctgatactccat CRISPR spacer tttacctgccgcatacgcctcattggcttg Protospacer ***********.******** ** *.
31. spacer 1.9|124052|30|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NC_022225 (Vibrio anguillarum M3 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tttacctgccgtatacgcctgatactccat CRISPR spacer tttacctgccgcatacgcctcattggcttg Protospacer ***********.******** ** *.
32. spacer 1.9|124052|30|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023210 (Vibrio anguillarum strain ATCC-68554 plasmid p65, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tttacctgccgtatacgcctgatactccat CRISPR spacer tttacctgccgcatacgcctcattggcttg Protospacer ***********.******** ** *.
33. spacer 1.9|124052|30|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020532 (Vibrio anguillarum strain 425 plasmid pEIB1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tttacctgccgtatacgcctgatactccat CRISPR spacer tttacctgccgcatacgcctcattggcttg Protospacer ***********.******** ** *.
34. spacer 2.1|379311|29|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013691 (Myroides odoratimimus strain PR63039 plasmid p63039, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
tgggtagccagtgaagctaatacaatcag CRISPR spacer gttttagccattgaagctaatacaatact Protospacer ****** ***************
35. spacer 4.4|2130671|31|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR215005 (Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 9) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gatgtgcccatctactacttgataagttctc CRISPR spacer cgtgtcaccatctactacttgataatgtcat Protospacer .*** ****************** ** .
36. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR213454 (Shigella flexneri strain AUSMDU00008355 isolate AUSMDU00008355 plasmid 3) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
37. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_KU295131 (Escherichia coli strain BK28009 plasmid pBK28009, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
38. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_KM023153 (Escherichia coli strain PGR46 plasmid pPGRT46, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
39. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_KY848295 (Shigella flexneri Y strain RC960 plasmid pRC960-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
40. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025845 (Escherichia coli strain 720632 plasmid p720632_72, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
41. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_LT882487 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi isolate 4714STDY6831631 plasmid 2) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
42. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP046430 (Salmonella enterica strain R19.2839 plasmid pR19.2839_83k, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
43. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040574 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain WGS1146 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
44. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to KY051550 (Escherichia coli plasmid pFZ11, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
45. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024474 (Shigella flexneri 7b strain 94-3007 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
46. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026764 (Shigella flexneri strain 04-3145 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
47. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006642 (Escherichia coli PCN061 plasmid PCN061p6, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
48. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to CP045558 (Citrobacter sp. S39 plasmid pS39-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
49. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NC_014725 (Edwardsiella tarda strain CK41 plasmid pCK41, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
50. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to MN086778 (Escherichia coli plasmid p16EC-IncN, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
51. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040928 (Escherichia coli strain YY76-1 plasmid pYY76-1-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
52. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to CP044008 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 2018K-0756 plasmid p2018K-0756, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
53. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021681 (Escherichia coli strain AR_0162 plasmid tig00003056, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
54. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026200 (Escherichia coli strain ECONIH6 plasmid pECO-6dfa, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
55. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012163 (Enterobacter roggenkampii strain 35734 plasmid p35734-109.753kb, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
56. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045514 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Anatum strain Sal-3948 plasmid p77k, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
57. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_LT904889 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 129-0238-M genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
58. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040809 (Escherichia fergusonii strain EFCF056 plasmid pEF04, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
59. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040810 (Escherichia fergusonii strain EFCF056 plasmid pEF05, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
60. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NC_011092 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 plasmid pCVM19633_110, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
61. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to CP047672 (Edwardsiella piscicida strain CK41 plasmid pCK41, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
62. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to CP047672 (Edwardsiella piscicida strain CK41 plasmid pCK41, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
63. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP036311 (Enterobacter hormaechei strain WCHEH090011 plasmid pCTXM65_090011, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
64. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to CP042900 (Escherichia coli strain CFSAN061763 plasmid pCFSAN061763, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
65. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009851 (UNVERIFIED_ORG: Enterobacter cloacae strain ECNIH4 plasmid pENT-c88, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
66. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039328 (Citrobacter portucalensis strain Effluent_1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
67. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to CP042902 (Escherichia coli strain CFSAN061762 plasmid pCFSAN061762, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
68. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018207 (Escherichia coli strain MRSN346647 plasmid pMRSN346647_113.1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
69. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041112 (Escherichia coli strain ECCTRSRTH03 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
70. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to CP042974 (Escherichia coli strain CFSAN061768 plasmid pCFSAN061768, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
71. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026578 (Escherichia coli strain WCHEC005237 plasmid pQnrS1_005237, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
72. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029860 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 343077_260153 plasmid pK91, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
73. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029869 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 343077_215174 plasmid pK91, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
74. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047573 (Escherichia coli strain 2EC1 plasmid p2EC1-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
75. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029874 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 343077_211171 plasmid pK91, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
76. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029871 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 343077_214135 plasmid pK91, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
77. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to MH430882 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar London strain 3-5 plasmid pSa44-CIP, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
78. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029912 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 343076_249107 plasmid pK91, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
79. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029963 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 343078_228140 plasmid pK91, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
80. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to MH430881 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar London strain 3-5 plasmid pSa44-CIP-CRO, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
81. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020344 (Shigella flexneri 1a strain 0439 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
82. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021734 (Escherichia coli strain AR_0114 plasmid unitig_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
83. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_LT985234 (Escherichia coli strain 557 plasmid RCS32TR557_p, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
84. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to MN604267 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar London strain SAL-19-0623 plasmid pSAL-19-0623_NDM, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
85. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043007 (Citrobacter portucalensis strain WCHCP085039 plasmid p1_085039, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
86. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG870194 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar London strain Sa128 plasmid pSa128, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
87. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG773378 (Escherichia coli strain WA8 plasmid pWA8, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
88. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to MG874043 (Salmonella sp. strain Sa63 plasmid pSa63-CIP, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
89. spacer 4.7|2130856|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to MG874044 (Salmonella sp. strain Sa76 plasmid pSa76-CIP, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taacacgccggtagtcccgtttttgagggatt CRISPR spacer gctcaggccggtattcccgtttttgatgaagt Protospacer ** ******* ************ *.* *
90. spacer 4.8|2130918|31|CP016491|CRISPRCasFinder matches to KT351734 (Pectobacterium carotovorum plasmid Drgb3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
atgactgcgcactatactgagtcagtgcgac CRISPR spacer tcagctccgcacgatactgagtcagtgatac Protospacer ...** ***** ************** **
91. spacer 5.1|2133737|32|CP016491|PILER-CR matches to NZ_CP021437 (Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB240, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aatttacgctatctaagtttatcaaacaaaat CRISPR spacer acaatagaatatctaagtttatctcacaaaat Protospacer * ** . ************** *******
92. spacer 5.1|2133737|32|CP016491|PILER-CR matches to MH853356 (Streptococcus phage LF2, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aatttacgctatctaagtttatcaaacaaaat CRISPR spacer tataggctttatctaagtttagcaaacagaat Protospacer ** .* .************ ******.***
93. spacer 5.10|2133736|33|CP016491|CRT matches to KY744230 (Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 10, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
taatttacgctatctaagtttatcaaacaaaat CRISPR spacer cattttacgctatctaaatttctcaaacttaga Protospacer .* **************.*** ****** *.
94. spacer 6.3|2406438|33|CP016491|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP006990 (Rhizobium sp. IE4771 plasmid pRetIE4771d, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttaatcccgccgcgtcttcgaccttcatgtcgg CRISPR spacer cgatacgggccgcgtcttcgaccttcagttcgg Protospacer . * * ******************* ****
95. spacer 6.14|2406500|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to MT773557 (Myoviridae sp. isolate BML_S_1 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
gtttgccaggctttactggagtcgttcaattc CRISPR spacer gctggccaggatttactggagtagttctacct Protospacer *.* ****** *********** **** *...
96. spacer 6.15|2406561|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NC_009507 (Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
acgtttaaacttgagcgcgtcgcgattcttga CRISPR spacer ccattcctgcttgagggcgtcgcgatccttga Protospacer *.**. .****** **********.*****
97. spacer 6.18|2406744|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024940 (Paraburkholderia hospita strain mHSR1 plasmid pmHSR1_P, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
agatagcttgcatgagtgtgccgtagtccgtg CRISPR spacer gcgtggttcgcgtgagtgtgccgtagcccgtg Protospacer . .*.*.*.**.**************.*****
98. spacer 6.19|2406805|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017104 (Rhizobium gallicum strain IE4872 plasmid pRgalIE4872c, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
gttccgtccttgtcgttgccgtgcgtgccatc CRISPR spacer atcgcggtcttgtcgacgccgtgcgtgccatg Protospacer .*. ** .******* .**************
99. spacer 1.2|123549|30|CP016491|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014683 (Kozakia baliensis strain NBRC 16680 plasmid pKB16680_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
atttacaattgtaatcagggtacgcgccgt CRISPR spacer gagcgcaattttaatcaggatacgcgcccg Protospacer . ..***** ********.********
100. spacer 1.2|123549|30|CP016491|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014675 (Kozakia baliensis strain DSM 14400 plasmid pKB14400_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
atttacaattgtaatcagggtacgcgccgt CRISPR spacer gagcgcaattttaatcaggatacgcgcccg Protospacer . ..***** ********.********
101. spacer 6.13|2406439|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to CP033374 (Lactobacillus fermentum strain DR9 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
taatcccgccgcgtcttcgaccttcatgtcgg CRISPR spacer ttcccggatcgggtcttcgatcttcatgtcgg Protospacer * .* ..** ********.***********
102. spacer 6.13|2406439|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029452 (Sinorhizobium fredii CCBAU 25509 plasmid pSF25509b, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
taatcccgccgcgtcttcgaccttcatgtcgg CRISPR spacer ggcggcctgcgcgtcttcgacccccatgtcgg Protospacer . ** *************..********
103. spacer 6.13|2406439|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NC_016655 (Rhodococcus phage REQ1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
taatcccgccgcgtcttcgacctt-catgtcgg CRISPR spacer tactccggccgcgtcttcgacctcacgcgctc- Protospacer ** *** ****************. *..*..
104. spacer 6.18|2406744|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to MN694267 (Marine virus AFVG_250M705, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agatagcttgcatgagtgtgccgtagtccgtg CRISPR spacer taacggacggcatgagtgggccgtagtccttg Protospacer .*..* . ********* ********** **
105. spacer 6.18|2406744|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to MN582058 (Caudovirales sp. ctOwN3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agatagcttgcatgagtgtgccgtagtccgtg CRISPR spacer ggtatgcttgcttgagtgtgtcgtagtctacg Protospacer .* ****** ********.*******...*
106. spacer 6.19|2406805|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to JQ807233 (Environmental Halophage eHP-12, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gttccgtccttgtcgttgccgtgcgtgccatc CRISPR spacer gcggagagtttgtcgttcccgggcgtgccatc Protospacer *. * .******** *** **********
107. spacer 6.19|2406805|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to JQ807237 (Environmental Halophage eHP-16, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gttccgtccttgtcgttgccgtgcgtgccatc CRISPR spacer gcggagagtttgtcgttcccgggcgtgccatc Protospacer *. * .******** *** **********
108. spacer 6.13|2406439|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023071 (Sinorhizobium fredii CCBAU 83666 plasmid pSF83666b, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
taatcccgccgcgtcttcgaccttcatgtcgg CRISPR spacer ggcggcttgcgcgtcttcgacccccatgtcgg Protospacer . *. *************..********
109. spacer 6.13|2406439|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029232 (Sinorhizobium fredii CCBAU 45436 plasmid pSF45436b, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
taatcccgccgcgtcttcgaccttcatgtcgg CRISPR spacer ggcggcttgcgcgtcttcgacccccatgtcgg Protospacer . *. *************..********
110. spacer 6.19|2406805|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043441 (Cupriavidus campinensis strain MJ1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gttccgtccttgtcgttgccgtgcgtgccatc CRISPR spacer acctcgtcctcgccgttgccgtgcgtggcgcg Protospacer ....******.*.************** *..
111. spacer 6.19|2406805|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NC_048068 (Microbacterium phage OneinaGillian, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gttccgtccttgtcgttgccgtgcgtgccatc CRISPR spacer tcgaccgcctcgtcgttgccgttcgtgccacg Protospacer . * ***.*********** *******.
112. spacer 6.17|2406683|32|CP016491|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011274 (Planctomyces sp. SH-PL62 plasmid pPL62-1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
taattcacgattctggtcgctgtggtcaagta CRISPR spacer gcattcgcgattcttgtcgctgtgggtgtcgg Protospacer ****.******* ********** .. .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
401457 : 464565
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP016491|401457:464565|DBSCAN-SWA TTTGGAGTTCTTGGGGATATTATCTCGGAAAGAAAGCACGTTGGAATTTGAAACACCCATATGTACAGTTTTAGGAGTGTTCAATGTGATTAATAAAAACTTTTTGAAAGATATCAATTTTTGGGTCTGGATGATTGTTCTGATTATTAGTATAAAGACGACAGTAAATATTGACTTGAGCAGCATGGATTGGATTATACAGACCATCTTCACAATTGTCAGTATTGTAGGAATCGTGAATATACTGTTTTTTAAGAGTAATGCCCAAAAATAATTTGATGACAGACTTTTTTTAAATTTAGATTAGCTATGTGAATAATTACAGCTAATCTAGTGTATTAATAGAGTCTATTTCAAGATTTAAAATGGAAACGAGATCTGCTTGAGTAGTTGTATTCATGCAAGTCTCGTTTTTTTTGATGCTGAATCAATTAAAGATGCATAGCTCGTATTGAGAACTATTTTGTAGATATCCACCTGGATGAACAAACAAATCAAAAACAATCCGTGAATCCGGTAATAAAACTCAAATTTCCTCTCATATTTTTCAGTAAGAGTCGTCAAAAGCCGTTATTATTACTGAATTATAGAATGAACTTACTTGCATTCGGAAAAGTAACACTGAAATTTGAAATAGGCGTATACGTAATGTCACGATTTTTAAAATCACATTTTTCCGATGCAAAAATGGATTGTTTGAAATTTGAAAAATATTGTACTGCGTTATTCAATATGAAAAACGTATGGTTATGTAATGATAACTGTTGGTTTTGTCAAGGAGGAAAATAGTTTAGTTTTTTAACGTTATTTTCGACGATGATTCGTTGATTGCAGGCATTGAATAAATCGGATGCAGTGTTAGTATAAGAGCCTCGAGTTGGTATCGATTTACAAATTCAGACGGATTGTCTCCTGCACCAGATATAGCGGTTTTAATACCCATAGGGTCGCCTTTTTTGTGGGTATTGGTCGTGATTGTCGAATATTAAGTGCGAATTTACGTTTGAAGCCAAAAAGTGTACGTTAATAAGAATAACAATATTTCAGATCAAAATTGCTCTATCATGGACATGTGAGGTGATTGTTGTGAAAATTAAGATTAAGCATGTAAAGCAGTGTGAGTAATAACGAAATGCAGAAAATCGCTGGTGGGAAGAGTAGCACGTATTCGTTACAAATGGGATTGGTTGTACGTACGGCAACAAAAATATTTAAAAACTGAAATGGTGAATTGATGTGTTGAGTGTCTACTCTGCTAAGGTGTAAATTGTTCGAATATTGCTAGTTCAAGCTGGTTAATGAGTCACAGCTCTTGAAAAGAATACTGTAAAATGATAGCTTGCTAATAAAGTAAATTAACAAATATTATTTTATATTAGCTAATGAGACGATAAAACACTTTAGGGGGAGTACTGTGATTGAAGTTAGCATTTTGGATGGCATTGCACAATCGTTTTTTATTTATTTTGGGATAATTGTGGTATACAATTTTATTTTTGGTAATACTGGTGTGAAAAACATCGTTTATTCATTGATTTTGTTATTGATATTATCTTTAATAGGAATCTTTTTAGGCGACATTACATCATTTTTCTTAGCCTTAGGAATGATAATTAGAGAAAGACGAAAGCCAAAAATCAATTATTACCATTTAAATGTTTTTTTGATGTTGTTATCAAGTCAAATCGTAGTTTTAGCACTGGCAGCTTATTTCAGTAGGGGATTGTTGTATCTTTTTCTTGACCTTCATCAAATCGCTGATTTATCAACACACAGCCATCTTTTTACTGGAGTTGAGATTGTTACGATGTGCATCATTGATCTTTTAGCGCTTCAATTTGGTCATGTCATGATAAAGCGGTATGCTGGATCGCTAGACATAAGTAATGACGGAGAAGTTAATAAGCATCTATTTACTATATTGTTGGCTGTTTTTGGATCAATCGAGCTGCTACTACTAATTAGTAATTTTCAAGGAGTTACAGCTACAATTCAGTTAACGCTGTTATTAACATTTGTTTTAATGCTTGGTCTCATCAGTTGGCAAGCTTTAGAAACCACAAGAGTGTATATTTTGCAGAAAAAAGTCGCAACTGAGAAGCTCCAAAATGAACAGTTAGATAATTATCTTAAGAGCGTAGAGCACCAGTATTTGGAATTAAGAAAGTTTAAGCACGATTATAAAAATTTAATTGCTAGTTTAAATGCTCAAAATGATATTGGTGAGATTAAGGACTACTTGACTGATTATACAAATAGTAAAGCGTTTAAAATAACTTTAAATGATGGGAGTATCGCACGTATTCAGCATTTAAAAAATGATACATTACGTGGGTTAATCGTCCAAAAGTTTTTTTATGCTAAACAATGTGATGTCAAGCTAAATATTGAAATAGGTGACACTGATTTTTATCTCAGTCATGGGGTTGCTACAGCAATGCGTATCGTGGGTAACTTGTTGGATAATGCAATTGAACAAGCAATATTAATGGCCGATAGAGCGGTGACAGTTGCTTTTAATGTAATTGAAAATACATCGGAAATTTCGATTAGTAATTCTGTTGGTTCAGATTTTGACCAGCACAAGCTCTTTGAGACTGGCTATTCAACCAAGGGCAGCAATCGTGGCTTAGGCCTCGCAAATGTGCAAGAGCTTGTCGAACAGCAGCATGGGTTCTATATGGAAATTGAAAGCACCAAAGGCTATGTCACAATGACTTTGATTATTACGGAGGATAACTAGGTGTTACCGGTTTATATATTAGAAGATAATGAAGCTCAAAGAAGCGAATATACAAGTATCATAAACAATACCATCATGATTGAAGAATATGATATGCAATTGGCAGTAGCAACTGACGATCCGCAAGTTCTGCTGGACAGCATTGTAAGCTCTGAAGAAGGGTTGTTTTTTCTGGATATGGAAATTGGCAGTCAGCCCCAAGCAGGCTTGAATCTCGCAGATGAGATTCGCCATCGATTGCCGTTTGCCCAAATTGTATTCATTACCACTCATGAGGAGTTGTCTTTTTTAACGTTAGAACGGCGCATTGCACCGCTAGATTATATTTTGAAAGAACAAGGTCCAGATACTGTTAAGACGAAAATAGAAGCGGATATTCGTGCAACCATAGATATTCTTAAGTCGGAAGCGGAAGAACACAAGAATATTCTGGGATATAAGATTGGAACGCGCTTTTTTTCAGTCCCTGTCAAAGATGTTATTATGCTAAGTACTAGCAAAGAACGGCCTGGTATCGTGAGATTGACTGCTATAAATAAAGTGGCCGATTTTCCCGGTAATTTAAATAGTTTTGAAGGTAAATATAGTGACTTCTTTAGGTGTGATAAAAGTACATTAGTTAATCTGGATCATTTTCGTAGTTTTGATTACCAGAGAAAAGAGCTAACCATGATAGATGGTATCAAGTGCAGCGTTTCGCATAGAAAATCGCGGGAACTAAATAAAATTTTAAAAGAGGATGAGTAGCCTTCCTGGTTATTCAGAAAAAAGAGTTGTTACTTGTTGGTGGGTTTAAATGTAAAATTTTGCTCGAAAAATCACTGTGAAAAAGCGTTGTAATGCATGAAAATTATAGAGATTAATATGTCTATATTGAATGGGTAGGCAACATCCAATATGGAACTGATAACTGTCGATTGTATTCAAAGGGGATATTAGATATGACCAAAAAAATCAGTATTGGACTGTGTGTATTTTTATTCGTGTTTATGGTGGTAACTTGGATTGTCTATCGAGAACTGCCATCTGAACTGGATGTATTATTATTTTTTATTATCTTAGCAGACAGTCTCAGGTTAACATTCAATGGCAAGAGCGTTCAGAAATAGCCGATAAAAACCATACTTTGTTTGTAGGCAGTAAATGCTGCAACTGATCGTGCGACTTTATGTTTATTGCAAAAGAGTGTCTCAAGCTTCTCAAAAACCGAGAAGTTTGGGACACTCTTTTTGTATTGGAAATAATCTGAAAAGCATCAACCAATACGGTCAGCTATTTACTGCTTACACGGAATCGCCCTGTCCTTAACAATTAAATCGGGCAATTGTCAGCAACGGTTGTAAAATGTTGGAAAATACCGATTAGAAAATGTCGGTTTTCCAACATTTTTTTACGGTAAAATAAACGCATCTCAAATTTGGAGGAACTGAAATGCGTTTAGATGTTGAGCAGTGTGTCCAGCAATATATTATGAACAAAATAAAGCCCAACTTCGCTGAAATTGGTCGGCGATACGGTGTTGATCCACGAACGGTAAAAAGATACTACAATTTAGGGCTTACGCCCCCAGATGAGCAGCCACAACCCTTACGGCGGCCGAGTAAACTTGACGATTATCGAAAAACGATTGAAGAAAAGGTTCTAGAAGGCTGTTCGGCAACGGCAATTTATTATTTTATCAAAGAACGTGGCTATCAAGGAAAGCAAAGTATTCTCAGAGACTATTGTCGAACCATCAGAAAAGCCGCAACGAAAAAAGCCACTATCCGGATTGAAACCTCGCCAGGGCTTTCAGCCCAGGTTGATTGGAAAGAAGATTTAACGTTAGTTTCTCGGCATGGAGAGATTGTCAAAGGCAACATCTTCTTATATGTTTTAGGGTACTCGCGAATGAAATACATGCAATTTACCTTCAGTCGCAGCCAAATTACCTTTTTTGATTGCTTAACTAATGCCTTTTGGGCAACCGGGGGTGTGCCGAAAGAAATCTGGTTTGACAACCAAAAGGTTGTCGTCGATCATCATAAAAGTAATTTTGGTAAGCCGGTATTTAATGAAACCTTCGTTGAATACGCTAAGGACGCTGGTTTCAAGCCAATTGCTTGTCGACCGTTTCGGCCACAAACCAAAGGAAAGGTTGAGGCGCTGGCCAGAACTACTCAGCGAATCAAAGTTTACAACCACGAGTTTGAAGAGCCGCTAGACTTAGCCGAGATCGTCCATTTGACGTGTGATCAGCTGAATCATGAGAAGTCTC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MIKTFANKVTQKVFQQEFAKTLPPTVQRVALRKLLMIDHAETINDLRMPPANHLEKLSQDRLGQYSIRINNQYRICFTIQNGNEFYDVEIVDYHRG |
52 | Lactococcus_phage(20.0%) | tRNA,integrase,bacteriocin,transposase | attL 408438:408456|attR 433473:433491 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
932834 : 941345
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP016491|932834:941345|DBSCAN-SWA 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GCCGTCTACGTGCTCGGAACGACCGCCGCTGATTTTAACGGTAGTGAATTGCAAAAGATGCTAACTGGAACGATCAAAGGCGAGCTGTTCGACTTTGACCTGGTCACTGAGAATCGCAACCAGCGCTTGTTGTTGACGGCCATCCAAAAGGGCTTAGTTGCCAGTGCCCACGATGTCTCAGAAGGGGGCTTGATCGTCACCATTGCGGAATCTTGCTTTGGCCAGAATCTGGGGGTCGATTTAACGAGTAGTGAACCGGCAGCCAACTTCTTTGCCGAAACGCAATCGCGCTTTGTGATTTCAGTGACGCCTGATAATCAAGCGGCGTTTGAACAATTAATGGAACCCTACGTCACGTATCTTGGGAAAACGACGGACGCTGACCGGCTACTGGTCAAGACGGCCGACCAAGCATTTGATTTGAAAGTTAGTTTTGCCAAACAGTTGTGGGAAGGGGCTTTACCATGCCTACTGAAGTAAAAAGTTTGAATGAAGAGTGTGGGGTCTTCGGTGTTTGGGGTTCACCAGATGCCGCCCAGCTCACGTATTTTGGCCTCCACGCCTTGCAACATCGTGGTCAGGAAGGTGCCGGCATTACGGCTAATGACCATGGCAAGTTACGTACAGAGCGGGGCCTCGGATTATTAGCGGATGTTTTCCGTGATCCGCGGCGCCTCGAACAGTTGACCGGACAAGCTGCTGTGGGCCACGTCCGTTACGCGACGGCCGGCAATCACGGATTAGAAAACATTCAGCCGCTGAGTTTTAATTTTAGTGATTCGCAGTTTGCACTTGCCCATAACGGTAATTTGACGAATGCGGTCACGTTGCGGCGGAACTTGGAACAAAACGGCGCAATTTTTCACGCTAGCTCTGACAGTGAGATTCTAATGCATTTGATTCGACGCAGTCCCGCAGCAACTTTGACCGAACAAGTCAAGGATGCGCTACGTCAGATTCATGGGGGCTTTGCCTACTTACTCTTGACTAACGATCGTTTGATTGCGGCACTCGACCCGAATGGTTTGCGGCCGTTGGTAGTTGGACAACTGCCAACCGGGGGCTACGTGGTTTGTAGTGAAACATGCGCGTTAGATACGATTGGGGCAACTTTCGTGCAGGATGTGCAACCTGGTGAACTCCTGACGATTGACGATAATGGCCTCACCATCGACCATTACACGACCGATACGCAGTTAGCGATTTGCTCGATGGAATTTATTTATTTTGCGCGTCCGGATTCCGATATTCACGGCGTCAACGTGCATTCCGCCCGCAAGCGAATGGGGGCTCGCCTGGCAGCGGAACAGCCCGTCGACGCGGACATTGTCGTCGGGGTGCCGAACTCGTCACTATCGGCCGCAACCGGTTACGCAGAAGCGAGTGGTTTACCTTATGAAATGGGCCTGATCAAGAATCAATATTCAGCGCGGACGTTTATTCAGCCGACCCAAGCGTTGCGTGAACAAGGCGTGCGGATGAAACTCTCGGCGGTTAAAGGGGTCGTCGCGGGCAAACGGGTCGTCTTGATCGACGATTCGATCGTTCGTGGCACAACGAGTCGCCGTATCGTTAAATTATTGAAAGACGCCGGTGCCAAGTCAGTCCACTTGCGGATTGCGTCACCGCCATTACGCTACCCATGTTTTTATGGCATCGATATTCAGTCGACCAACGAACTGATTGCGGCTCAACAGACGATCAATCAAATGTGTACGACGTTTGGTGCGGATTCCCTGGGCTTTCTAAGCGAACAGGGTGTGATCGATGCCGTGGGGTTGGACACGACTGAACCATACGGTGGGCTGTGCATGGCCTACTTCAATGGCGATTATCCAACGGCATTGTATGATTACCAAGCCGAATATGATGCGGAGATTGCGCAATTACAAGCCAATCATGAAGGGGTGATCAAGTGAGTGATGCGTATAAGCGCGCTGGTGTGGATATTAACGCGGGCTATGAAGTCTTAAAGACGGTCAAGCGAATGAGTGGGAATGCACAATTGGGGGCTTTTGGGGGCTTATTCCCGTTAGATGCGAAGACAACTGGCAATGAACCAGTGCTGGTTGGGGGCACGGATGGCGTTGGGACCAAGTTACTAGTGGCGATTGCTGCTAATCAGCATACGACGATCGGTATTGACTTGGTGGCAATGTGCGTAAACGATATTTTGGCACAGGGCGCCACGCCGCAGTTCTTCTTGGACTATTTAGGCCTGGGACATACCGACCAGGCGCGCGTCAAAGCGATTCTTTCAGGCGTTGTCACGGGGTGTCAGCAGGCGCATACCGCACTAATTGGGGGCGAAACCGCTGAGATGCCGGACATGTATGGCGAACAACACTACGACTTAGCGGGTTTTGCAGTCGGTGTCGCTAATCGCGCGGACTTGTTGTCACCGACGAATGTCACAGCTGGCGACGTGTTGATTGGGTTACCATCCAACGGTTTGCATTCCAATGGTTTCAGCCTGGTCCGTGACATCTTATTCAAACAGCATGACTATCAACTGACGACGGTCTTTGAAGAATTGGGACATGATTTGCAGACTGAACTACTACGGCCAACCACGATTTATGTCGATGCTGTTCAACCGTTATTGCAGCAAAAACTCATCGCAAGTATTGCGCACATCACGGGTGGTGGCTTGATTGAAAACGTGGCGCGGGCGTTACCAGCAGGCTTGAGTGCCCACTTGAAACAAGAGACATGGCCGGTTCCACCAATCATGCCGTTACTGGCGAAATTAGGCGACTTGACGACATCAGATTTGCGGTCGACCTTTAATTTGGGACTTGGGATGGTGCTTATCGTTCATCCCGAACAGGTGAATGCCGTGACGGCGAACTTGACGGCTAACCACCAAGCCTACTATCAGGTTGGAACGGTTCAAGCAGGGGATACTCCGGTCGTTTTCGAGGAGGCTAAGCATGCTTAAACAGATTGCTGTCTTCGCTTCTGGCAACGGCACGAATTTCGTCGCCCTACATCAAGCGATTGCTGCGAGACAACTACCGGCAACGATTGCGTTACTCGTTTGTGACCAAGCGCAGGCACCGGTGATTGCCAAGGCGCGTGCGTTGCAAGTGCCAGTCCTCATCGTTGATTTTCATGACTATGCGAATAAGGCTGCAGCTGAGGAAATTATCCTCACGGCACTGCAAGCGCGCCAAATCGACGCGGTTTTACTGGCCGGTTACATGCGGATTATCGGCTCGACCCTATTGACCGCGTATCCGCATAAAATTATTAATCTTCACCCAGCGTTACTGCCTAAATTTCCTGGTCGTCATGGCATTGAAGACGCCTTTGCAGCCGGTGTCAGTGAGACTGGTGTGACGATTCATTATATTGATGCGGGCATCGATACCGGTCAAATCATCGCACAACGGACAGTTCCCGTTAAAAGTGATGATACGTTAGCGACTTTGGCAACTAGAATCCATGATTGTGAGCACCAATTTTATCCAGACGTTCTACAGACACTCATTAATGAAGGAGCAATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP016491|932834:941345|932834_933317_+|AUI77942.1|DBSCAN-SWA MAKVGLVMGSISDWPTMQLAAERLTAMGVSYERHVISAHRMPQTLQTYGEQAAERGLQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTVLPVIGVPIKTKALNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGEAGAKNAALMAAQIIGLREPAVQQAISDFRDKQRQEAEQSERQF >CP016491|932834:941345|934433_935165_+|AUI77944.1|DBSCAN-SWA MTAAIEKETLLYTGKAKEMYTTNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRISSLIFKDLAAHGIPNHFIDQPTDYVQLVKRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVAHLTKFPEPVLEFFYKSDALDDPFINDSQIHALNIATPEVVAEIKRQALQVNQRLTTIFAAMGVQLVDFKIEFGLTAAGDVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKNLGDLTSVYQEVLARLATVEED >CP016491|932834:941345|936093_938313_+|AUI77946.1|DBSCAN-SWA MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQMLTDDVLGRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDSSYQKNPLVNAMCVGILNQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHDHADVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLTLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTDGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYQREKKRPTRLNHQSHHQFMPRIVDATGTLKKMLQQPTIASKAVLYNTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAITTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQRDITTSDFKHAGDAVYVLGTTAADFNGSELQKMLTGTIKGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLIVTIAESCFGQNLGVDLTSSEPAANFFAETQSRFVISVTPDNQAAFEQLMEPYVTYLGKTTDADRLLVKTADQAFDLKVSFAKQLWEGALPCLLK >CP016491|932834:941345|935166_935421_+|AUI77945.1|DBSCAN-SWA MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVADVELGKYFEVKLEADERPIEPEVDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL >CP016491|932834:941345|938297_939752_+|AUI77947.1|DBSCAN-SWA MPTEVKSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLRTERGLGLLADVFRDPRRLEQLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRNLEQNGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQIHGGFAYLLLTNDRLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDNGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGARLAAEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSARTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTINQMCTTFGADSLGFLSEQGVIDAVGLDTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK >CP016491|932834:941345|940766_941345_+|AUI77949.1|DBSCAN-SWA MLKQIAVFASGNGTNFVALHQAIAARQLPATIALLVCDQAQAPVIAKARALQVPVLIVDFHDYANKAAAEEIILTALQARQIDAVLLAGYMRIIGSTLLTAYPHKIINLHPALLPKFPGRHGIEDAFAAGVSETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRTVPVKSDDTLATLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI >CP016491|932834:941345|933300_934431_+|AUI77943.1|DBSCAN-SWA MNASFKQPILPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYQVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDEAALLDLARRSDVLTYEFENVDETALKAAQAYAQLPQGTELLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTPFAPVNDRQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQADLASTTITPEAEALLAHPCILEARQEFQTEVSMMVTRSAADVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQASVHAAARKIAVSIAEALELRGVLGIEFFVLPDDTLIVNELAPRPHNSGHYTIEPCNISQFEAHIRSICGLPIPAVVQTSPAVMRNLLGDDLTLARQQLINHPEWHFHDYGKAAIKSQRKMGHVTVLNHNIDAALASVSILKGEQ >CP016491|932834:941345|939748_940774_+|AUI77948.1|DBSCAN-SWA MSDAYKRAGVDINAGYEVLKTVKRMSGNAQLGAFGGLFPLDAKTTGNEPVLVGGTDGVGTKLLVAIAANQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQARVKAILSGVVTGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGEQHYDLAGFAVGVANRADLLSPTNVTAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFEELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLIASIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLKQETWPVPPIMPLLAKLGDLTTSDLRSTFNLGLGMVLIVHPEQVNAVTANLTANHQAYYQVGTVQAGDTPVVFEEAKHA >CP016491|932834:941345|935423_936101_+|AUI80171.1|DBSCAN-SWA MKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDVLKVSADLIPATATSLADYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMAAVIEFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQSNRSAKFICQDSTLKIVNGDTAFTRAYGATTEITLPIAHGEGNYYCDEDTLAQLRANHQIVFEYVDNPNGSTANIAGITNQAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGLFQSIIASQEEVAHA |
9 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1188682 : 1218297
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP016491|1188682:1218297|DBSCAN-SWA TTTAAAAATCCTTATTGAGCAATTCAAGTGCTTTTTTATTTGATTCACCATTTTCTTCCTCAATAAGATGGACGTAAGTGTTAACTGTTGTTTCCAATTTTTGATGTCGCAAGCGCTGTTGAACATAAGGAAGTGATTCGTGGTTCATAATGAGCACGGAAGCATGAGTATGTCGCATTGCGTGTGTAGTAACAACTTTTATCCCAAGACGCCTGCAAATACGTGCCAATTCCTCGTTCGCTGTCCCATTGCCTTCAATTTTACCAAGTTTCGACCAAAACACAAGATTTTTAGGGTTTTTGATTCTGTGCATCTTAAGCCAATCACTCTGTACATGCTTGTAGTCTAGCAGATAGTCACAGTAGCCACTAGGGATAGAGACGTCCCCATCGGCTTTACCGTTGCCTTTTGTTGGTCCAAAATCGCGGCGTCGCTCAACCCACTGTTGTTTAATGTGGACAATACCACGAACAAGATCAAGGTTATTCCAAGTCATACCAGCGGCTTCTTCAAAGCGGGCACCAGTTTCAAGCTGAAAAAGAAGCATTAGCATTGTCATGTGGCTATAGTCGGCCGTTTTAATCAAATATTTACGCAGCTTGTTGTATTCCTTTAAGCTTAGAAATTTATCTTCTACTGGCTTCGGAGGGCGCCCAGTGACATGCGCTTTATAGGCAAAATCACGTTGAAGGATGCCATCGGCTACTGCGTCTCTGATAGCTGAGTGAATTTGCTGGTGAAGTTTTTTAGCAGTAGCAATGCCGCGTGTTTTTCCAAATTCGTTCAAAAACTTCTGGTAGTCTGCTCGCGTGATGGCTGTTAAAGGCTTGTCATTGAAGTACTTTGCAACATGGTTATAATTTCCTAAATAAATCTCGTGTGTATGCCGACTGACACCATCTGTTTTATAAATTTTGATCCAGTCAAAAAGATAATCTTTGAATGATTCGGTGCTCCGTGACAAATCGGCGCCATCAATGAGTGCGCTTTTTGTCTTTGTTTCCCATTCAGAAGCTTCGCCCTTTCGCTTGAAGGACTGGCTTGCAATGCGGTATTTGCCTTGTTTGTCTTTATAGCTGACTCGTGCTTGCCAGCGTCCGCTCGCTAACTTTGTTACTGACATGTTTTATCCCTCCAAATCGGAAATAGCAACTGGCTGAAATTTCCAAACGTATGTTCTTTTATGTGCTAAAATAAAAGCACCAAAGTAGTAAAGTGCTGTTTATTTTATATATGATATGTGTAATCATATATAAGTGGAAGAAAGGAAGTGAAGGTTATGAAGAAGGTAGTAGCATATCTTATGTTAACGTCAATGGAGTCGACATTCATTGCATTAATACTGTGGCCGCTAATTCATAGCTATATTCCCTTTGCCATTTGGATATTTTCCATTCTTGTTATTCCAATGTTTATTTCTCTGGTTCCTGATCATTCTCTGGCTTTTCCTTCGATTTTAGGTTTTCGTGTGAAATTACGGTTCCAACATCCTTGATCTGAGGTTTGATATTCTTCACTTCATCAGGAACATTTTTTGTTCCTTGTTTGAGACGTTTAAGTTTGGCCTTCTTTTGTATGTGCGAGATTCGGTAATCATCCCACCAATTTAGAATGCCTTTTTTCTTCCCCTCTTTCCCAATTACTAAAGAGATTAAAGTAACAATTCCACCAAAAGTAATTACTTGATTTCCTCCAAGACTAGCTACTGTATGAATGATGTTGATAATTGCTTGTATGTTTTCCTGACCAGTTATAAATCCTAAGGTGCCCGGACAATGAACGTCTGCTTGTAGTTCTACTTGGTGTAAATAATTAGACTGTTCGTCTTTTGCCATTTCGACAATACCTTGCCAATTTGCAAGAGTTAAATCGTCTTCTAATGTGGTGTAGACGGTTAAATGAATTTTTTTATGTTTTTGAAAAAGAGGAAATATTAACGGATCAATGTATTCCGCGTAACTTGAAATGTTAAAAATTGCTTGATGTGCAGACAAAATCCAATAAAGTTCGTCGGGGAGTGATGATCTGTGTATTGTTTTCATCCATGTAACGTTTCGCCGTTTTAGATTTTGATCGACTTTATATTGAATTCCATTGGGTCCGGAGTTTTCTTTTTTTGTTCTTAATTTTGATTTATCAGCATCAAATGGATCTCCTGTAATAACACCTATTGCAAAATAATCAGAACTTTTACCAGGCGTAAGAACAACATCTCCGATTTTCATGTTATTAATAAATTCAAAACATTGAGACGAGGCAATCGTCTGCCAATGTTTTGTTTGATGAGGATAAGAATCAATGTACATTTGATGGATATCTGGTTTTTTTAGACCATCTTTGGGGCTATCATCGGAGTGGATTGACTCGATAGTTACCTGATTATGTGCAATCGAAATGAAAGAATTTTCAATGTAGTCATCTAGATATTTTCCACCATCAGCACGAACTAACCAGTAACTTGTGTCATCTGGAATTGTTAAAATTTCAAAAGTGTCTTTATTATTCATACTTTAATCCCCGCATTAGTATATACAATATTAATTTGATTTTTGTTAAAATAATTTTTTTTATTAAGCGAGTGACGGGAATCGGACCCGCGACTACAGCTTGGAAGGCTGTCGTTTTACCACTAAACTACACTCGCATGAATGGACCTTGTTGGACTCGAACCAACGACCGGACGGTTATGAGCCGTCTGCTCTAACCAACTGAGCTAAAGGTCCAATGAAAATTTAAATGCGAGCGGCAGGAGTCGAACCTGCATTGGAAGGTAGGTTATGCTTGAATTAAAGGAACCGTTCTACCGTTGAACTACGCTCGCGTGAAGTCAGCTAGGGCTGACTATCATTTACTGAGTTCATAATTATTTTTGCAATAGCCGTGTTTTCAAATCATCTTTTACTTCTGTAAGCATACGGTCATATTCTTCTGTTGAATATGAATCTTTTTTTAGATATAACATGGATTCTGAGTTCATAAATGTCTGTATATCTTTCTTCATCGTGGCAATTAGCTCGTATTTTGAAATTTCATTATCCATAGCATTAAGCCTTCTTTCTGGTTAAAGCGAGCGGCAGGAGTCGAACCTACATCTGAAAGTATCTAGTTAGCAATTCATAGGAGTACTGTTCTACCGTTGAACTACGCTCGCGTGAAAGCCCCGACGAGGGCTTGGACTTGTTATGGTCTTGCGTATTGATTGCCCCGTGGTGCTGGCTTGGCACCAGAATTATCAGCAGCACTCTGGGTCATATATTGGTAATTACCTGGATTTTTAACGCTCGTGTAGTACTTATTGGAGTCTGATACAAAAACCATACCAGAAGCAGCAGTAGTCCAACCACCATTTTGTGTATAGGAAGCATTGTCTGTTTTACTTGTTTCGCTCGCTTTTTTAGCTGATGACGAGCTAGCAACTAATGATTCTGAACTGGCTTTAGCTATTGAAGAGCTTTCTGCCTCAGACTGCTTTTTGCTTGATTCGGATTCAGAACTAGCCATACTCTCTGAATTCTCTTTGGATTCAGACTTGGAGGCAGCAATACTTTCAGATTCTTCTTTGCTACTTGATAGGGCGCTTTCAGATGACTCCTTCTCCTTAATAGAGTTAGCTTTACTGATACTAGCCTTTCTTTTCGATGCATCTTTTGCTGAACTTTTCTTTGCTTTGCTACTTGAGGCTGTATCTGACTGTGATGTACTCGATCTTGCTGTGCCAGAAGGGGCGGCCCAAACCGTTAATGCTAAGAATAGGATTGTTAGTCCTACTGAGATTAAGGTGTATTTTTTGTATGGACGATTAACACCTGTTTTTGTGAAATGATGAATTCCCCCACGAATTGAAAAGTAAGCTAACGCAATTAAAGATACAAGAAACATAAATGTAAAAAATATATCCAAAGTAATCCCTCCAAAATATGTTATTCCCCAATAACAATAATTCCCCGAATTATAAGTAGTCCCAACTCCTAGCTTTTAATGACATCCTGACTGGTCAATGTGAGTGGCAGGAGTTGAACCCGCATGGCAATAAGAAATAAAGGAAGGGTATCCCATAAGAAGTTGCCGTTCTGCCGTTGAACTACACCCACGTTTGTAATCAATTAGTGATGAAGCTTTTTATAGAGAAAATATGCAACTAATGCTGATATAATTACCATAAATAATAGCTCAGTGCTCCACTTAATAGAGGACAGGCTTTTTAAAAAATAAGTTAAAGAATTGAACATTGGTGATTCTCCTGTGTTTGATTGAGTTAAGAATCTCTATGCGAGCGGCAGGAGTCGAACCTGCATCAATATAGGATGTGAGACCTATGAGAAGTGTGCAAATAATCGTTCTACCGTTGAACTACGCTCGCATGTTAACAGAAGTTTCAATAGATGTTGTAAAAAGTTGTGTACATACCAAACAATCCCACGATGATGGCAACTATTAATTTGAGGGTTATTATAAACATGTTGTAGGGGTTGTTATGATTTGTTTGCAGAAGTGTATCCACAACTAAGTAAAGAGATAGTACTATCAATCCCCAATCTAATAGTTTTGTGATATCAATATTCATAGCTGCCTCCATAATTATTTGCTATTAACGTACAATGCGAGCGGCAGGAGTCGAACCTGCATCTGTTAGTATCTAGTCAGCAATTCAAAGGAGCACCGTTCTACCGTTGAACTACACTCGCGTGAAAGCCCGGTGAGGGGCTTTTGTTTGGTTGTGAGCTTGGCTACTTAATCCCGTATTTTAAGAATTGGGTCTGTAGTTCGCCAGAACTTTTCATTGAATCCGGGGTAGTTTCAAAAGCTTCCTTTTCAGACATCACATGCTGTGTTTTATATAACACTGGAGAAACTCCGTATTTATTTAAAAATCCTGTTAGTGTATGTTCATCCATTGAAATTGATGAGCTGTTAGCTCCCGTAGCACTAGAAGCTGCTGTGGAAGATTCTAATGACTGTGAAGCTGAGGACGCGGCACTTGATGAACTAGCGGCTGTGAT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46 | Lactobacillus_phage(38.71%) | terminase,tail,portal,capsid,integrase | attL 1187053:1187068|attR 1226478:1226493 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1224075 : 1235493
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP016491|1224075:1235493|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP016491|1224075:1235493|1230886_1232002_+|AUI80185.1|DBSCAN-SWA MAFLMVNVTSQAARMDMVDVSNNNGYMSTAEYTSMRNEFGVKALTVKVSEGTTFKDGYAASNIANGQAAGLYVNGYHFAHYKTKAQAIAEADFAGQAAKAAGLPVGAVLATDVESAEEQGILSQATNDRNNAAFMKEIQKFGYRTDIYTSGSWANNKMTVKGKTGWIASYPYVVSGKNWYSTNHAWQWSSTAKFRISYGGFDVSQLNSNYYTAGQKSTVKPTNKGAVKANNQKANKNVSKPAASAKWVKEKKTYTLKTAVKLHTSTSTSSNTIAILPAGTTVKTDQAIIKGGYRWVRQPRFNGYGYLATGPASNTLEYVKSGATHTYYTVKYGDSWWTIAQRNGLSMTTLASQNGKSIYTTIYPSQRLVVR >CP016491|1224075:1235493|1233667_1234348_+|AUI78196.1|DBSCAN-SWA MTKIPYFSESNKSAQKLVQTLFTPTQQRLVVGIIAAGYQTEKHFVSVNAPEWLQMDRAQKLYPELKNMAVEFSLRRACDQKIIPFSYEIGTIEKNKNKFLKLINNEKQVILTINQTPSDRRASRHAKFRADLFDQCDNRFVLFDDEARSQDSVYLELNHGYQSDQPSFTILGKPDSTGLWEARLNLQNNLQVLSSNEEKDIKTTAKEVASFSMDEFRQYQEFKTEG >CP016491|1224075:1235493|1232285_1232663_+|AUI78195.1|holin|DBSCAN-SWA MKKISFKNIDGSLNGKLIAGIISLLIVLIQQVFAMFGIKFTGDWSSIIAVVNTVLTILGMLGVITDVQTVTAPTVKSDEESQVEATANAVADEAQTPTSTVAAVNSSAASNTEMASESASQASQK >CP016491|1224075:1235493|1224452_1229819_+|AUI78191.1|DBSCAN-SWA MIKQSDLALAAWKATERTLDAVVTINKIDYKTTDIASISYDAGGYTGDTFGIGSNYENSVTIKFSHLIEGLKPGMTVWPKIGIKTSNGYEYSSLGLFIVSDDIQMDRNNDETTIKAYDQMCLLEGTYTSKLTYPAKMTSVIAEIANLAGVLLNTTDISRLPVQVNLPSAITGQTYRNAIGMIAQFYAGFATFDRDGKLTIRTITEPDYTLDPSQYEQGGLTKNEAPYKIGGIQCEVTTTTTDSTGQSTETTNTLQVGAASGSQIKLTNNLMTMDRLASIWQQLQSLTFYPFSLNWFGNPAIEAGDWLTLQDTKGNKFNVPNNGYTMTFDGSLSAVSKADQTSTSSSSYAWRGELSQYVADLGGRQGASGNYIYGTDTTEPPYGAKFNDIWYKQNGNKVELWTYERQADGTGKWVLTVSDATGEEVKAKVDQVELEAKASTDAAKAASDKTDQLAAKYDDTNSLANQAMDKAVSAQSDASSAVAKANSTASEFGKVDQKADSALASALNAQSNASAAVKQASSAAADSKDAKQIAGAVSQNYKTLTDGSTMTIAELQNGLAAKLTKTDLDGYATQTWTQTQIKMTADGINGTISSVKGTVDGHTTSINDLKADSSSFKSQFTTVNDTLGKHTTDIGSLQTTSKELTTGFNTLTTDNTTNKNDISQLKQTATEVSSTLETVQTQVQNSSVGTNLFSQSTATGGYVDASYGNINPPSTTTNENVSDYISVGASSNYTFQMWGTTPSGAYYWYGIGLYDSDKKFISRMSNVGRTYSSDTEEYVSKTLTTTSTTAYVRVSFRKYNNYKVKLEKGSVATDYSVNPEDTATVTAMSKLSQTVDGMKSDISKKIEQKDLNGYATQTWTQTQIKTTADGINGTISSVKSTVDGHTTSINNLQADSNGFKAQFTTVNDTLGKQSTDIGTLQATAKSLSANFNSLNNDNDTNKHNIGQLQASANTFNSTLLTVQQKVEDGLISTNIFRSANDFSRSYWTDALGYTFTTLQSESRYHDSLIHYQGQGKTPAPYSTIAKQTITDGAMAADTWYTLSFYARGAGDNNTVGKFGVYFYGNGSDQSMSNSDGVEVLATSDTHCIITLTPYFRRYVITFHTPKDFSGGHSFWARNDLDLNDGSLYCDFWHPKLELGKVASDFSVNPADTATISALSSISQTVDAIQTTVRGKVDNDTYQSKMTQLDNQITTKVSQGDITNENILPYSGYWSDLTGWTLMSWGAADRNLNLIHHNFYHNAVDATLCVGTAMADTAAAGSTKFNVIPNTTYTMTFLGFASSNVKGTNVYVLGRTFASTKDYDYVHVVQANLIMSPSGINKYTATFTTNSDETQAYVRLDNQGSTNGQSSGAYFAELKIERGTVSTPYTRVSSSEVQITSDNINLKVSKDGVINAINISTDGTQIYGNKLHITAATYIDNAVIKDAMIADLSASKLTAGTINAAHINVINLNANNITTGTINGSNLSINLNTGNVQFQAGRIHSADNAIDININNRYISVANDVNRVMLKNGEMQFVEPTTYDTSSNPYLRISNTFGGQSAEGAAFIGRRYAVLTNSSNATGNEMFDIGLGTEKFSGIATGYGTGYLNSGWHMTKVGGAERGVVISGGKATSYNRYWSASPSIMVGATSTSTHSGGMNGPNIIMDCNYLYNFSTWVQTSSHAANVYVADDGAIVRASSASKYKTNIERSFDTGMGERILEIPTAHWFDKAEVRKKTLDPQAPDPRRYFGMIADDLDDAGLTELVEYNDKGEVEGLMYDRIALTIIPIVRNYRDRITKLESEIKQLKEG >CP016491|1224075:1235493|1234353_1235493_+|AUI78197.1|DBSCAN-SWA MSAIESGRFSSKKLRFFRDLKGESLKQVSDDVGYSVTTLSKWEKGRSIPDFSGIMSLSKHFNVDHHFFLSRVDVPEFDGPVFFRKAAVLPKRKVTQAQSKEKGFAIVDGLLTEILNLPTYAEPSYANKSKDFEILSYETIDRIADNVRSQFNLGDGPIANMTLIVERMGIRVKFSDLESEKIDAVTGNIMSRPYILLNSRRLSSVRLRFNLAHELGHILLHAHYPSNIINSSSNLKTIESEANHFAGALLMPDYGISLDMIRTNMSYIIELKKHWKVAIQALVYRGNEMGLISDSQALFLRQTIYRNKWRINEPLDDEIPIERPSYIQSAIKFSNDNSNYSLKEISRATGLSIAEVNYWLINEKMSSLDDKQESGLRLL >CP016491|1224075:1235493|1230273_1230708_+|AUI78193.1|DBSCAN-SWA MNLLNTSISYNIDGTGNTSSVIAGLRGEVEGRVTITANVTIYPTDLAKDETFDDLTKKELSKRAVDKIPSVIDSLIAVNGGWSFTAGKISSVSTQFNQSETGTYVNVNVTATESDFSDKKLDDVTMSEAQSVLQSILKNELPTS >CP016491|1224075:1235493|1224075_1224438_+|AUI78190.1|DBSCAN-SWA MTYSLKIGGTVVKAPQSLEVAIQDIDAKASRDANGLLHRDRVAIKRKLTVKWGPLTLAENSTILKAVSGQFFSCSYLDPQEGAVVTKTFYVGDRTAPTYTLNPLTSDYIWQNVSMDFIEQ >CP016491|1224075:1235493|1232002_1232299_+|AUI78194.1|DBSCAN-SWA MHTLLGLGWDEWGSIVAIVTSICILANWILNKTVRIPLNDLGKRLSRFTDESLKVRQQNAEAMNAIENRVIKVEGRLDGHDMEFKHLYEKEAKRNEKN >CP016491|1224075:1235493|1229821_1230277_+|AUI78192.1|DBSCAN-SWA MSKTSVQLGFKNGELVNVYQALQGYKLKGRASLGRTWLGKRLADANKQFNEDRTATQKVYFKTDDDGEFVYQADKKTLILKDDYTMDEAQSNFDQLINEVINIDVSQYSERMKALYQSLADYPYELDGQTAEVYAVLFDELEKAFGKGEQQ |
9 | Lactobacillus_phage(57.14%) | holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1555393 : 1643579
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP016491|1555393:1643579|DBSCAN-SWA 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92 | Lactobacillus_phage(78.0%) | tRNA,terminase,holin,transposase,tail,portal,protease,capsid,integrase,head | attL 1550630:1550648|attR 1639889:1639907 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2236090 : 2245345
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP016491|2236090:2245345|DBSCAN-SWA TTCATACGTGCACCCGCTGTGAATCGAGCAATGCTGGCTGTTGGGTGACGGTATAATCATCGGTCTCAATAATATACCGTGGCCGGTGTTTGACCTCCGCAAAAATTTTGCCGACATATTCACCAACCACACTGATTCCAATTAATTGCATGCCGCCTAAGAACCACAAACTCGTCATCAGTGAAGACCAGCCGCTAATGGCCGTTCCCAGCACCCCTTGAATAACCGCATACACCATCATCAGTAAGCTACCGCTACTGATCAACACGCCTAGCATCAAAATCAACTTGATGGGCGCAATGGAAAACGACGTGATACCGTCAAACGCAAACGCCAGCATTTTGCGCAGTGGATACTTAGAAACCCCCGCAAACCGTGGGCGCCGGCGATAATAAAGTTTGGTCGTCGGAAAACCGAGTTGTGGCACAATGCCCCGTAAAAACAAATTAGTTTCCTGATAGCTAAGCAGTGCCCGCACCGCCCGCTGACTCAACAAACGGAAATCGGCGTGGTCGGGCACCAGCTGGACACCGATGCGATTCATCAAGCCGTAAAAGCGTTCAGCCGTCCACCGTTTGAAACGGGAATCACTACTGCGGTCATTGCGAACGCCTAAGACGACATCATTACCAGCATGAAACCGCGCGACCATTTCCGGAATCACTTGCGGATCATCTTGCAAATCCGCGTCAATAGTAATCATCATGTCAGAAGTTGGACAGGCCGTTTTCATCCCGGCCATCAACGCATTCTGATGGCCAAAATTACGACTGAACTTAATCCCCGTCACGACTGGTAATTGCGTTTCGAGTTCTTTGATCAAAGCCCAAGTTGCATCCTGACTGCCATCATCTACAAACAGTAATTTACTTTCTGAATTGACTTGTTTATGCTGAATCAGCCCCATCAGAATCTCTGCCAAAACGTGCGCTGATTTGGGCAAAACCGCTTCCTCATTGTAACAAGGTACAATAATCGTTAACCGTGGACTTCGCATGCTAATTCCCCCAATATTACTTTGCTTATTTCCTAACATCACTAATCAAATATTCGGCAACGATATCCTCGCCAACGACACTAACTGCCACCGATTTCACAAACTCGAGGACACCGTGCTTGAACCCAGGTGACTGATTATTTGTGTATCCCCAAATACACTGACTTCATTGATGATACTCGCCCGGCAACCGGTCTGGTATCAGATTTAACAACCACGAACGATACTTCTAGCTACCACCGTGTTGACTGTCATCGCTATTAATCATGCGAATTTTGAGTATGAATTCACGCCATCAAAGATGAGATTGACCTGCTGATAATGCTGACTACCATTCACGGTTGATAGTTCAGATTGATGGTACCAATATCCAATCGGTAATTCAAATAAACCAGCAATCTTCAGGCCGTACATTAACAAATTATCCGAACATAGTGGCTCACTAAGAACTAAATCTACCAATTTTGCATGGTTACTAATGGAACTCATCTGGCGCATTTTGAACAAAAAAATGACGCTTACTTGCAATTCAATCTGCAAGTAAGCGCCATATCTTCAGTTCATTTGATGATTTACCAATGCGCGCCAATCGTCTGTTGCCAGGTGAAGTACTTGGTGCCCTTCGTCAAGGCTTCAAACTGTGCGGTCGTCAAGTTCAGCCAGTCTAAATCACTGGTGGCTAATTGTAACGGATCAGTTAAGTGGAGTTGATAGTCTTTAATCCACGCAATCAGTGGCGCAATCACTGCCAGATCAGTGTTTAACAGTTGATAGCTAGCGCTGGGTGTCATCAGCGTCGCCGCCAATGTATAGCGCGCCTTCATCCGCACGCCGTTGCCTAACTGCCGCACGATTGACCGGTATAGCCCCAGTTGGACGTCCGTAATCGTGGCTGACGTCGGTGCAAGCGTCTGAAACACCTGGCCACGTTCGTCTGCCAAACTCAGCCGACTCGGCGTGATCGTCAAGCGCCCGTGTGCAGCTGCGCCTTCGTTTAACGCCTTGAGGATAAAAGGCGTCTTCTTACGCGCAGTAGAATATTTATGGTCATTTAACACGATCGTCATGTAGGCTGGCTGATGGGTAATATTGCCGGCGATATTCGTGACCGCAACTGGCATTGGTTTTTGCATGTGATAATCTCCCCCGTTCAATTCGGTACTTCTAGGTCGATTATACACTAACGCCTGGCCGTTGTTGCAGGTGATTACATACGCTGGTAAGACTCAACTATTCCGTCACTGCAGTCTCGTGGTCAGCAAGTGCATTTGCGGCTGCGATTCGACCGAATGTAAAGATATCGCTAAGTGAATTACCACCCAAGCGGTTACCAGCGTGAATCCCACCGGCAACTTCACCGGCTGCATATAGCCCATCGATTGGTTGACCTTGGTGATCAAGAACGTGTGCACCGGTATCAATCTTCAAGCCACCCATCGTATGATGCGTCGCAGGCTTCCGTGGAGTCGCATAGAATGGCGCAACTTCCACTTTCAAATCAAAAGCAGTCTTGTGGAACTCTGGATCTGAACCCGCATCAACATAATGGTTGTAATCGCTGATCGTCTTCGTTAACACATCAGGGTCGACCTTAATCTGTTCAGCTAGTTCAGCCAACGTGTTTGCCCGGAATAGCGTCCCGTCGGCAACTTGTTGGTCAATCTTAGCTTGACTCGTGTTGTAAGCAGTCTTCTTAATGGCCTCATCCGCAATCAAGTAGAACAAGCTCCCGTTATCGATGGCGGCTTGCGTCAATTCATCACGACTACCGTATTCATTCACGAATCGTTTACCTTGTTGGTTGACCATCACAAAGTTAGCCGGTGGCACTTGCAGTCCGGTGAACAGTTCACCAGTATTCGGGTCAGAAACGGGCATCATTTGTGAAAAGCCCATGCCGACCAGGTCCGCACCAACGCTCGTCCCTAAACGAATCCCGTCACCGGTCATGGCTGGTGAGTTGGTCGTTTTGACATCATCGTCGATGGCTGTCCAGTAGGTATTGTACTTTTGTAACATTTTAGTATTGGCCGCAAAACCACCTGAAGCGAGAATCACCGCATCTGCATGCACGATGACCTGTTCGTGGTCAGCGTTGGTCGCGACGACCCCGCGGACTTGACCATCCGTCACTAACAGTTTCTGAACGGGCGTTTCCGTCATGATCGTCCCACCTTGTTTTTCAACGAAGGCTTTCAAGGTTTGAATATAGGCAAAACCGAGGTCGCCCATCGGTTTATGACCACGCCGCCAGATTGCACCGACCGGCATCGTGACCTGCGTTTCATCAAATTTGACGCCAATTGATTTGAGCCATTTGACCGAATCCAGTGCATTATCAGTCAATTCTTTGACCAAATCATACTGACCATAAATTTGTTGGCCATTCAAATCGGTCCGCTTCCCACCCAGGTAAGTCTGAATGCGGTGTAGCAGTGTGGAATCAAACAAGGTCCCTGTCTGGTCGGCATTATCCGCTAAGTACGTCTTGATTTGTTGCTTGAGCGTGCGGAAATCGGCCCGATATTCAGGCGCAATTTGGGCTTCATCCAGCTCAGTCAATTCTTGTAACGACTGTTTTTCACCGGGTAGAGCAGCAAATTGCCGTTGCCAGTCTGGGTCAGCGGCGTTCATTGGTCCACCTGCTCGAACGGTGTTACCACCAACTGCTGGAAACTTCTCCAAAACAAGTGCTTGATGACCAGCTTGCAAGACCTTGGCCGCGGCCGTCAAACCAGCGCCACCCGCACCAACGACGACCACATCCGTCGTGACTTCGGTAACTTTGGGCTTAGCTGCGGCTTTAGTCGCGCGGCGTTTCTTCAATTCATCAGGATTAGCACCCGCTTCTTTGACGGCGCGAGCCACCCCATCGATCACCCCATGACTAGTAATCGAAGCACCAGAAATTGCATCGACTGCCAACGTTTGACCGTCGATAATTTCCTTAGGAATCCGTTCGAAGGCCACATCCGCGATCCCCTTAGTTTCACTACTAGTATCGATTTCGATGTCTTCGATTCGGTCTGCCGACAACGTGACCCGCATTGGTAATTCGCCATTATGGCCAGTCGCGGTCACTTCATACGTCCCAGGATTAAAACTCAGGGCTTCCGGCGCGTTCATTTCAGCCACGATTTCCGCAAATTTTTGGAACTTGGCAAAACAGCTATCCAAGAAGTCAATCGTCCCTTGAACCTTTAAATTCCCCTGGTCATCAAACGCGGTTTGGGCGCGACCTAACAGAAATTCAGAACCTGGCATGACACTGGCATTAACGCCGGGTGCATCAAGCACTTGGCGCAAATGTAACTGGGCACGGGATGAGCCCTGGACACTATAGGAAGCGCCAACGATCATGACTGCTTGCCCGTCAAAGGGATGAATTTTGAACGATAACCATTCAATAATGCTCTTAAGCGCTGAAGGGATCGAATGATTGTGTTCGGGAGAGGCGATAATCACCCCATCCGCTGCTTCGATTTTGGTGGCAAACTGCTGAATAACGTCACTATCCGTTTGGTCATTGGACTCATCAAACATCGGCACGTCCGTCAGTTCGAGAATCTCAATTTCGGCTTGATCTGCAAAGTGCCGTTGCATGAATTCTAGTAACATCCGATTATATGAGTGGCGGGCATTCGTCCCCACAATTCCAACAAATTTCATTTGGCTATTCCTCCCCAGTGACTTGTTTCCATGAAAATTGCTTACTCTTTTCAAAAAATTGACTGGACGGCATAATCTTGTTCGTCAAATCGACAAAATCGACAAATTCAGCAAACGCGTTGTCCAGTTCTTGCACTTTGTCTGGATACGTCAAATTACCTTGGTCATCGAAGGCTTGCAAGGACCGACCGAGCAAGTATTCAACGTTCGGCATGACCAGCGCTTTTAATTCGGGCGCTTCTAAGATTTGTCGTAAATGAGCTTGCGCACGTGACGTTCCCAGTGAACCATTCGAAGCACCGACGATCATGACCGGCTTATTGATCAGGGGTCGTGTCGTGTATGACAACCATTCAATCGCACTCTTCAGCACTGCGGGAATCGAATGATCATATTCGGGCGTGGCAAAAATCACCCCGTCCGCCGCGTTAATTTTATCAGACAGCTGTTGCACTGCGCTTGGTGCGGGCCGGTCATCCGGTTCGTTAAACGCAGGTAAATCTTTTATTTCACAAATTTCAATCGTGGCTTGTTGTTCAAAATGACGTTGCATGTATTGCAATAACTGACGGTTCGTTGATTGGGTCGCATTAGTGCCGACAATCCCGACAAACTTCATAATATCAGTTCCTTCCATCGTAACTTGTAAGTGGCATTTTATCCGGTCATTGGCTCCAATCAGGTGAGACTGACCGGTCGCTTATACTGATTAGTTTAAATGAAAGCGTCACGCTTGTGAAATATTTATTTATCTATCGCGTTATAACAAATTTACTATAACCGACATTCGCGGTAAACTTAAGACACCTTAGACGCCCCTTTTAGTCAGCCACACGTCCTGAAAAACACCATCAGTGACGGTGCGGGCTGCAATCGGCGTCCTCATTTTTTCGAAAGGAAGGTGTCCATTTGCCAAAAACTGACTCCAGTGAGATGCGCCGCTTTTTGGACGTCCTCTTAAAACATGGCAACTTTACCCGGGCTGCCCGCGACCTATACATCTCTCAGCCTTATCTGACTCAAAGTATTCGAAACGTTGAAAAAACACTCGGTGTCAAAATCATTAACCGTGATGTCAGTCCACTTCGACTAACGCCAGCCGGTCGGACCTACTACCAGTATTTGACGGCGTTGGAAAACGACAAGGCCGCCTTTACCAAGCAACTACGCCAATATACGCATGCGGACCAAGTGGTGCTACGATTGGGCATCTTACCAAGCCTGGGGAACTACTTGCTGCCGTTGTTTTTGCCCGCTTTTCTGAAGGCGCACCCCACCACGAAGATTGAATTAACCGAGGATATTTTGGCCCGCAACGAGCAACGGGTGTTACGGGGTGAACTCGACTTTTTGATTGGTCAAAATCCAGAGACGATTGCCCCCGGTTTAGATAGCTTCGACCGCGGCCGCGATGGCTATTACGCCATTATTCCCAACACGGTCACTTGGTATCAACCGCATCAGGCCTATTTAAATCCCGGCGCACTCACGACCCAGGACTTGCTACAAGCCCCACTCGTGCTCTCGCCTCACGGTTCTTCAATTCGGCGCCAAGTTGATTATTTGCTGCAAAAATACAACGTGTCGCCCAATATCGTCATTGAAAGCACCAGTACGGCCACCATCACGAAGCTCGCCACAGCCGGACTGGGCGTGACGTTTCTCCCAGACAGCGTGCACACCCGTCCGGACCCCAAACGTTACAATCTGCTCCCGTTACCGCAAGACTTGCTGTCGCTGAATTACTTTATCGCATACCCATCAGGCCACCAGCTCAACAAGGTGGAAAAAGACTTGGTCACGATATTCTTAACACAACTCGAAGCGGATCTGGCACAGTCGTCGACGATTCCATAGGCGCCACGATTGCTCTGATCTAGTTGATGGCCGTGGGTTGGACGAGTAACAACTTTAAATAATCACCTGAACTGTGAATCAATTAAATACGAGTTAAAAACGAGTTAGCACGGCATTTAGGAGTCAACTGCCGGATAACTCGTTTTTGATTTTAATAAGCAGAGACTTGCTCAACTAACATGACGTTCTGATTGCAACTCACGGTTACCAGATTTACACTTTAAATGACCTCAATTCGATCAAAAGAACACTTTAAGTGATGGTGTTTCAAACCAGGCCCCATCCCTTCTGATCAGTGGTCAGGTGGTCATCATCACCGTCTAAATCTTTCGGCCAACTAAATTATCCGACTAAACGAGGCGCCAAACATGAAACGTAAACTTTTCCAGGTTATTGGGACCCTACTAGCTTGTATGGGCGTTATGATGTTAACCGCGAGTCAGCGCTTGTCGCCCCACTTTGACGCCCGACCCGCAATCGCTGCGATGACGCGTCGGGGGATCATCAATGACCGAGCGAGTTGGCAAACCATCTGCACACAAACTGACAACGGGCGCCAAATTACCTCGGTCACACAATTGAGCCGCTTGCTTCAACGCGCAAATCGGCATTCGTTCGCTGTTAGCAACATCAAGCAGGTCGAGCACCATCAATTACCGCGTCTCGTCACGGATCATCGGTTGAAACTCATCAACGTGCCGGGCTTCTTTAGTCAGCGTCGAGCCATCCAAAAACAATATTGGCAACGCCTACAAACCCTGCTGAAACAAGCCAGTCCCGCATCTCAACTAATTTTGAACTTTGCCAGCAATACAGGTGGCCTAGCGGAACCGATGATTGCCGGCCTGGCCGCGATTATCCCCGATGGTACGCTCTACACCGGTCTCGACAATCACGGCCGAGCCTTTCCACGAACCCTTCACCGCGGGCACTTATCTGATAATTTGGGGCAAGAAGCTCTGACGTTTCAACCACCTAAGCGGCTTTATTTTAAACACATTACCGTCATTGTCGGCGAACAGACCGCCAGCGCCGCTGAAATCACGATTATGGCGTTGAAACGTAACCCTCACGTGACATTAGTCGGACATCCGACTGCCGGCTATACGAGTCTGAACAGTGGCGTCTACCTGAATACCGGGGCCGCTGCCGTTTTGACAATCCGCACCCTCAAATCGACCGTCAAAATTCATGGTCAGCAATTCTTTAATAATCAGCCACTCATCCCCGATGTGACCACGCTTTACCAGCCACTAGCCCCTGCTCAGACTGGCCATCACCGGCAGTCAGCGCATTTGGATCCCGATTTCATCTCGGAATTACAAACGATTGTTCGCACTCCAGGCGACTAGTATGTAGCACGCTTCGTTCGCATGATTTTGACAGCTGAACGGTTGTCTGTTCTCAGTCATCAAATCGCGCTACTATTGTGATTGCAGCCGCCAATGCCTGTTGTTCGTTTCTATGCCGCCAGAACACGCCACTTCATTGAAAGCAATTAAAAAAGACCGCAGCCCCAGCCTAATTGCCGAGTCCGCGGTCACCGATATACATCAGTCATTAATAAGAACTACTCTAAAAAATCAACCGGCGAATTTGCCGCCAGCCCCAGATTCCAATGGTAATCACAATCGCGGTGATCAACCACGCCACTAAAACGATACCGATACTGACCATCGCACCTAATGCTTGATTGGACATGCCAACAGCGGCTAAGCCTGGGACGCTTTCAGGCCGAAACATCCCATACGCGATTAAGCGTACCGCAATCAAAACCGTGCTGTAGCTCGCGCCCAATTTCCAGGCTGGCTGTTCTTGCGACTCGTCATCATCGTCTTCATCATTGAATTCAGCATCAAAATGCCGCGCCCATTGTTCAGTGTTCGCCGGTTGTGCTAAATCCCAATGTTGCCATGCATAGACCCAATTTTGCTCAGTCTCTTCGTTGAGTTTGCCATCGAGTGTTCGCTGCGTCAGCTTGTTTTGCAGCGTCACCTTCGCTGTCAGGTCACCATCCCATTCTGCTTGGTCCAACAATTGCAAGGCTAGTGAGAGTCCTTCCACGAGTGTAATGGCCTGGGGATCAACATCGCTAGCGTCCACGATTTGTTGCCATTGTGCATCCAATTCAGCGTCCCCCGACACCTGCCACGACTCTAAGGCGTTTAGCAAAGAATAAATATCAAACGGATCATCTTTCAAGTTATACCGCGAGATGAATACCCACACGACTGCCCGTAACTGACGCATCGTCAAGGTCTGAGGCGCACCCTCGGGATGCATGCTTTGACGATGTCGTTGCCAAATCTGCCACCCGGCGCCGGTCACCTGAACAGCCGCGCGAGTCCCAAGTAAGCGCAAGTACTCATCATTGGCTTGTCTTTGCAAAAAGGCATTCATCGCCGCATAGGCTTGCACATTTTCTAATTGGCGTTCAGGACGGACCGCCGTTGGCAAGACGACTTCCGATGCGTCATCGGTTGTTACTGAAGTATTCTCAACGTCCGACGTCGGCTTGAGCACTTCAGTGACCGCCCGTTGCCAGTCGGCCCAATAGGCATCATCTTCACTCGGAGTGCCAACCGCTCCCGCCTGCATCTGATTCAGCAGATCCTCGACAGATTCATTCATTTCATCCAAGTCATACTCGTCTTCTAGGCCAAGATAATCATCATTCACCCAGCTGTCGGCCAGCCAGTAAAACGTCGTTAAATAGGCTTCGTGTTCAGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP016491|2236090:2245345|2237658_2238219_-|AUI79042.1|DBSCAN-SWA MQKPMPVAVTNIAGNITHQPAYMTIVLNDHKYSTARKKTPFILKALNEGAAAHGRLTITPSRLSLADERGQVFQTLAPTSATITDVQLGLYRSIVRQLGNGVRMKARYTLAATLMTPSASYQLLNTDLAVIAPLIAWIKDYQLHLTDPLQLATSDLDWLNLTTAQFEALTKGTKYFTWQQTIGAHW >CP016491|2236090:2245345|2236090_2237086_-|AUI79040.1|DBSCAN-SWA MRSPRLTIIVPCYNEEAVLPKSAHVLAEILMGLIQHKQVNSESKLLFVDDGSQDATWALIKELETQLPVVTGIKFSRNFGHQNALMAGMKTACPTSDMMITIDADLQDDPQVIPEMVARFHAGNDVVLGVRNDRSSDSRFKRWTAERFYGLMNRIGVQLVPDHADFRLLSQRAVRALLSYQETNLFLRGIVPQLGFPTTKLYYRRRPRFAGVSKYPLRKMLAFAFDGITSFSIAPIKLILMLGVLISSGSLLMMVYAVIQGVLGTAISGWSSLMTSLWFLGGMQLIGISVVGEYVGKIFAEVKHRPRYIIETDDYTVTQQPALLDSQRVHV >CP016491|2236090:2245345|2244187_2245345_-|AUI80233.1|DBSCAN-SWA MTEHEAYLTTFYWLADSWVNDDYLGLEDEYDLDEMNESVEDLLNQMQAGAVGTPSEDDAYWADWQRAVTEVLKPTSDVENTSVTTDDASEVVLPTAVRPERQLENVQAYAAMNAFLQRQANDEYLRLLGTRAAVQVTGAGWQIWQRHRQSMHPEGAPQTLTMRQLRAVVWVFISRYNLKDDPFDIYSLLNALESWQVSGDAELDAQWQQIVDASDVDPQAITLVEGLSLALQLLDQAEWDGDLTAKVTLQNKLTQRTLDGKLNEETEQNWVYAWQHWDLAQPANTEQWARHFDAEFNDEDDDDESQEQPAWKLGASYSTVLIAVRLIAYGMFRPESVPGLAAVGMSNQALGAMVSIGIVLVAWLITAIVITIGIWGWRQIRRLIF >CP016491|2236090:2245345|2243037_2243964_+|AUI80232.1|DBSCAN-SWA MLTASQRLSPHFDARPAIAAMTRRGIINDRASWQTICTQTDNGRQITSVTQLSRLLQRANRHSFAVSNIKQVEHHQLPRLVTDHRLKLINVPGFFSQRRAIQKQYWQRLQTLLKQASPASQLILNFASNTGGLAEPMIAGLAAIIPDGTLYTGLDNHGRAFPRTLHRGHLSDNLGQEALTFQPPKRLYFKHITVIVGEQTASAAEITIMALKRNPHVTLVGHPTAGYTSLNSGVYLNTGAAAVLTIRTLKSTVKIHGQQFFNNQPLIPDVTTLYQPLAPAQTGHHRQSAHLDPDFISELQTIVRTPGD >CP016491|2236090:2245345|2237350_2237626_-|AUI79041.1|DBSCAN-SWA MQIELQVSVIFLFKMRQMSSISNHAKLVDLVLSEPLCSDNLLMYGLKIAGLFELPIGYWYHQSELSTVNGSQHYQQVNLIFDGVNSYSKFA >CP016491|2236090:2245345|2241664_2242612_+|AUI79045.1|DBSCAN-SWA MPKTDSSEMRRFLDVLLKHGNFTRAARDLYISQPYLTQSIRNVEKTLGVKIINRDVSPLRLTPAGRTYYQYLTALENDKAAFTKQLRQYTHADQVVLRLGILPSLGNYLLPLFLPAFLKAHPTTKIELTEDILARNEQRVLRGELDFLIGQNPETIAPGLDSFDRGRDGYYAIIPNTVTWYQPHQAYLNPGALTTQDLLQAPLVLSPHGSSIRRQVDYLLQKYNVSPNIVIESTSTATITKLATAGLGVTFLPDSVHTRPDPKRYNLLPLPQDLLSLNYFIAYPSGHQLNKVEKDLVTIFLTQLEADLAQSSTIP >CP016491|2236090:2245345|2238316_2240755_-|AUI79043.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNARHSYNRMLLEFMQRHFADQAEIEILELTDVPMFDESNDQTDSDVIQQFATKIEAADGVIIASPEHNHSIPSALKSIIEWLSFKIHPFDGQAVMIVGASYSVQGSSRAQLHLRQVLDAPGVNASVMPGSEFLLGRAQTAFDDQGNLKVQGTIDFLDSCFAKFQKFAEIVAEMNAPEALSFNPGTYEVTATGHNGELPMRVTLSADRIEDIEIDTSSETKGIADVAFERIPKEIIDGQTLAVDAISGASITSHGVIDGVARAVKEAGANPDELKKRRATKAAAKPKVTEVTTDVVVVGAGGAGLTAAAKVLQAGHQALVLEKFPAVGGNTVRAGGPMNAADPDWQRQFAALPGEKQSLQELTELDEAQIAPEYRADFRTLKQQIKTYLADNADQTGTLFDSTLLHRIQTYLGGKRTDLNGQQIYGQYDLVKELTDNALDSVKWLKSIGVKFDETQVTMPVGAIWRRGHKPMGDLGFAYIQTLKAFVEKQGGTIMTETPVQKLLVTDGQVRGVVATNADHEQVIVHADAVILASGGFAANTKMLQKYNTYWTAIDDDVKTTNSPAMTGDGIRLGTSVGADLVGMGFSQMMPVSDPNTGELFTGLQVPPANFVMVNQQGKRFVNEYGSRDELTQAAIDNGSLFYLIADEAIKKTAYNTSQAKIDQQVADGTLFRANTLAELAEQIKVDPDVLTKTISDYNHYVDAGSDPEFHKTAFDLKVEVAPFYATPRKPATHHTMGGLKIDTGAHVLDHQGQPIDGLYAAGEVAGGIHAGNRLGGNSLSDIFTFGRIAAANALADHETAVTE >CP016491|2236090:2245345|2240759_2241374_-|AUI79044.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNATQSTNRQLLQYMQRHFEQQATIEICEIKDLPAFNEPDDRPAPSAVQQLSDKINAADGVIFATPEYDHSIPAVLKSAIEWLSYTTRPLINKPVMIVGASNGSLGTSRAQAHLRQILEAPELKALVMPNVEYLLGRSLQAFDDQGNLTYPDKVQELDNAFAEFVDFVDLTNKIMPSSQFFEKSKQFSWKQVTGEE |
8 | Lactobacillus_phage(85.71%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2265527 : 2372992
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP016491|2265527:2372992|DBSCAN-SWA 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88 | Lactobacillus_phage(78.57%) | tRNA,terminase,holin,transposase,tail,portal,protease,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2917334 : 2956084
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP016491|2917334:2956084|DBSCAN-SWA 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37 | Bacillus_phage(36.36%) | integrase,protease,transposase | attL 2911657:2911672|attR 2935640:2935655 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2968930 : 2977681
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP016491|2968930:2977681|DBSCAN-SWA TTTAGTGACGATCGTCGTAGCCGTTTGGATGCTTTTGAGTCCAAGCCCAAGCCGTTTTGATGATGTCATTGACGTTATCATAGTTTGGCTTCCAGCCGAGTACTTCGCGCGCCTTGTCGCTGGCTGCCACGAGTGAGTCGGGATCACCAGGACGACGTGGGGCTAAAGTTGCGGGAATTGGTTGGCCGGTCACTTCCCGGGCTGCAGCTAACATTTGCTTGTTTGAGAAACCAGTTGAAGAACCGAGGTTGAAGGCGTTACTTTCGTTACCCGCAGCCAAGTACTTCAGGGCCAAGATGTGGGCATCCGCCAAGTCGATGACGTGGACATAGTCGCGGACATTGGTCCCATCTGGCGTGTTATAGTCATCACCGAAGATTTTCAGCTCATCGCGTTTACCTTGAGCCACTTGTAAGATAATTGGCACCAAGTGTGTTTCTGGGCCATGGTCTTCACCAATACTGCCATCGGGCTTAGCACCCGCAACGTTAAAGTAACGTAAGGCAACGAATTTGATACCATAAGCAACATCCGCCCAGTGCATGATTTGTTCCATCATTAACTTACTTGCACCGTATGGGTTGATTGGCAATTGCGGGTCAGTTTCCTTAATTGGAATCTGTTCCGGTGTGCCATAAGTGGCCGCCGTAGATGAGAAGACGATCTGCTTCACATCATGTGCTTGCATCGCTTCTAGCAACGTAATCATTCCGCCCGTATTGTTGTCAAAGTACTTCAATGGTTTTGACATTGATTCAGGTACGATTGAGAAGGCTGCGAAGTGTACGACCGCCGTGATCGATTCGGTATCAAAAACGTGGTTTAAAAAGTCTGCATCCCGTAAATCACCTTGATAAAACTTGGCAGCTGAATTGACCGCTGCTCGGTGTCCAGTCACCAAATTATCGACAACGACCACGTCGGTACCGTGTTCAACTAACCGGTCGACCATATGAGAACCAATATAACCGGCTCCCCCTAAAACTAAAATTGACATAATGAACCTCCCCTGTATGGATGTTTTAATCATAGCATACTGTCACGTTAATAACTGCACGAAAAACGTGCTTTCTAATTGACCGAACAATCGGCCTTCAATTGAACTGAGGCCAATCACAAGACGCGACAATTAGTCGATTGGTGCGGGTAACGTCCGCCACTGAATCGTCACTTCGCAACATTTTTCGTCCCCGACTTCAATTAAATGACTGGTCGTCACTTGGTCCGCTTGTTCGCCGGATAAAATGTTGGCGTGCGCCATCACCGTCTGGCCGTACTTCACTTCATTTTCGTAACGCACATCAATATGCACTAAGTCGTGTTGCAACAAGAAATCTGCCGGCAACGTATCGACCAGCCAATCAAAGTAATGTGCGTTATTCACGTGCCGGTTCGGGTCAATGTCAAAGAAACGCACGTGGTAAGGCTTAGTAATGGTATCCGCCGTCTTTTCAAAGCTAATCGGACGTGGCAAGCGTGGAATCCGTTTGACCGCCTCGGACTGATAAGGTGCGACCAGTTCCGGCATAATTTTGACAATTCGCCGGGTCTTCTGACTCATCAATACCCAAATACTCGTGATGTACGCCAACTGTTGGCCATCCGCATCCCGAATCCAAAATTCGCGATAAGCAAAGTAGGGATTGTAAGCACTGCCCCGCACCGCGATGGTTACGACCTCATCTTGGCGAGGCATCCGGGTAATGTCCATGGCATACTGGGTGACGACCCAGCCGACTCCATGACCCTGCACAAAATCCGTGGTCAGCCCCAGCGCGTCACTCTGATCTTCGGAAGCTAGGACGGCGATGTCAATCAAGGTCGTCAACGTCGCACGACCCGTTCGGTCACATTCATAGTAAGTAATCCGGTGCTGTTCACTGTAAAGACTCGCAGTTGCGCCTAAAGTTGCCATTAATTAAGACTCCTCATCGTTAGGTTTTAGTTCGTGAAATTGATTATAGACCGTCTGCCGAGCTAAATTGCGGCGTTTGGCAATCGTTTTGATAGCGGCGTTGGGCTTGTCACCGGCTGCAATCAATGCCTCGACTTGGGCCTTGATTGGCAGTTGTGCTAACTCATCCGTAGCGGCCGGTTCGTCCGTATTCGGATTACCGCCAAGCAGGAGGACAAATTCCCCCTTTAGCTGGTGGTCCTGTGCCCAGGCGACCATCTCCGTTAAGGTGCCCCGCGCGAATTCCTCGTAGCGTTTCGTCAGCTCACGACAGGCGACGATTGGCCGACTGCCCTCACAAACAGTTGCCAGTAAGGCCAAGGTCTTCGCCACTCGGAATGGAGACTCGTACAGTACGACCGTCTCATGACGTTGCGCTAATTGCGCCAAGTCAGCCTTTTGCTCATTCTTTTTGCGTGGTAAGAAGCCGTAGAAATAAAACGGCTGGGGAACGAGTCCAGAGGCAATCAACGCAGTCAAACCCGCATTCGCTCCGGGCAATGGGACGACTGGAATATTGGCTTGAATACAAGCCGCCACTAACTCCTTGCCCGGATCACTGATCGACGGCATCCCAGCGTCACTGACTTGCGCCAGGTTCACGCCCGCGTGTAACTTTTCCACCAGTTGGGGAATCCGTTCTTGCGTGTTGTGTTCATGGAAACTAATTTGTTTCGTTGTAATTTCAAAATGATTCAATAATTTTTGCGTATTGCGCGTATCTTCTGCGGCAATCAAATCGACCGTTTTGAGCGTTTCGACTGCGCGATAGGTCATATCTTGTAAATTACCGATGGGTGTAGGGACCAAATATAACGTCCCGACGCCGGCATGTGCCGCAAAGCTTTGTTGTGTTTGCAAAGTATCCTCCTAACTCTTCTCGTCATTGCCTGTCTACTGACTTAATTTCGGTCGCCAGAAGCACAAAAAGCCTGGGATTGCCCCAGACTCTAATGACTATGCACGTTCGCGTTCACCATAAATGACTTCTAGGCAGAAAACACAGGATTCGTCATCATCACGTCGTTTGCCATAGAATTGGTTGCAAACATGAAACCCTTCATCGTACAACTTTTCTAGGTTCTGGCGTGACTTTGAGAGCGTGGTCGTGCTGGTTGTTTTTTTCGGCAATTCGTTTTCAATCTCGACCATGTGTTCACGTAAATGTTCATTTTCAATGACCAATTCCGCATTCTTTTCTAACACTGTCGTCATATCTGCGCGTAATTTGGCCATTTTGTCTAGCATTTGTTGCATCTGTTGTTCCATATCACCGAAACTATCGTATAAATCACGCTTATCCACGCGCTCACCCTCGTTTTCCTTTAATTAAGCGTTTGTTTGAAAAATCGGCCATAACTTTAAGGTTAGGCCCTCTAAGACATTCTGAAAACTAATATTGCTAGCTAACTGTCGCTTTGCAGTTAGGGCTAGCTCAGTCGCCGCAATCAACTGGTCATCACTCAACCGAGTCGTTAATGCCGTCAATTCCTGCTGGTACTGACCAAACGTCAATGCGGTCGTTGCCACTTGAAAATGTAGTTGTAATAAATCCTGAAACAGCGCGGCGATCAAATCTAGCATCACCAGCTGATGGTCGGCATCCTTCGCTAATCCGACCAGGTTGACTTGCACTGCCGCAAAGCTGCGCGAATCACCCTTAACCGCCTGTTCAAACCACCGCCACAAGGCCTGTGATGCTTGTGGCAACCAATCGTCCTCTAGGAGCGCCTGCGCCTGAGTGACGCTACTCGTCAACGAGCGGGCCATCTGGGCTTGATTAGGGGCGATTCCGGCCTGCTCAAACGTCTGTTGCAAAGCTTGGGCGTTGAGTGGTGGAAATTCAATGACCTGCGTCCGGGAGATGATCGTCGGCAGCATCAACTGTTTATTGGTCGTTAGAAGTAGCGCCGTCACGTTGCCGCTCGGTTCCTCGATAAACTTCAACAAACTGTTGGCAGCGCTGGCAGTCATCTTTTCGGCATCACTGATAATAAATAACTTGCGATTACCCTCAACCGCACTCTTAGAGAATTCGGCTTTTAAGTACCGCACTTGGTCCACATGAATCCGTTGCCCTTCAGGCGCGACCGTTACGATGTCTGGGTGCGACCCATTGGCGATGCGGACGCATTCCTCACAGGTACCATCCGGTTCGCCATCGTCAGTCACGTGTAGGCAAAACAACCGTTGCGCGATCCAGTGGGCCAATTCTGGTTGCCCAGCGCCCTCCATGCCCGCAAACAAATACGCGTGTGCGAGATGGTTCTGGGCAATAATGTGTTTAAATGCCGCCAACAAACGGGGTTGTTTGGCAGTCAACGTTTGCGCAAATGAATCGGTTGCCATTAATCATCATCCTTCATTAAAGTTAAACGTTAAAATCGACCCATTAAAATTGATGAAATTGTTCGATTGGTAAGACAAAGACCGTGGCCCCGCCGACCTGGACTTCGACTGGATAGGCGGACGCGCCGTCCATCGTCACGTCTAAGTTAACGGGTGGTGTCATGAATTGCTCACGCGCATGACTAGTCTCTTTAATCATCGCCAAAACTTCATCGACGCGTTCGTCTTCAATCCCAATCATAAAGGTGGTGTTTCCTGAACGCAAGAAACCACCAGTCGTTGAAAGCTTTGTTGCGCGGACGTTGGCTTCGATAAATTGGCTGCTTAACCGGTTACTGTCCTTATCTTGGACGATTGCAATAATTAATTTCATTCGCGTTCCCCTCCCTCGGTAGCCATGTAAGTTGGTAACTTCGTCGTCATGATTTGAATGGCTTGCGTGACGACTTCTTCTAATGGTTGACTGGCATCGATGCGCTTAATGCGCTCCGGATGATCAGCCAGTAATTGTAAGTATGCTGCTTGGACACGATGATGAAAGCTGAGGGCTTCTACGTCCAAACGATTGATTTCATTTTGTCGATGTTGTTGAATCCGGTTCAATCCGACCGCGGCGTCAACGTCAAAGTACAACGTTAAGTCCGCCGTTAATCCCTTGGTCGCAAACTGGTTCATGTCATAAACGGCCTGTTCACCGATTTCACGGCCAGCACCTTGATAAGCCACAGAACTGTCGAGATAGCGGTCACATAAGACTAGTTGACCGCGGTCTAATGCGGGTTGAATCGTTTGAACAATGTGTTGCCGGCGCGCGGCCGCATATAATAAAGCCTCCGTGCGGTCATCCATTGCCGTATTGTTACGATCCAAAATAATGTTCCGAATCGCTTCTGAGATTTGATTACCGCCCGGTTCACGCGTCACGACTAAGCGATCCCCTAATTGCGGCTGTAACTGTGCCACAATCGCGTTTAAAGCTGACGTTTTACCGGCACCATCTGGCCCTTCAAAAGTAACTAATTTTCCTGTCAACATTCCCAATCCCATCTATTTTCTTATATGTAGCAATTGTACTTGATTTTGGGAGGCCTGTCTAATCCGGTTACCACTAGTGAGGGTATTTTTTGACCGATTTTTGGGGCGATAGCTACTACCAATTGTGGTTTTGACGATTTATTAAGTTAATTACTGATAGTTAGTAATGCTCAGAGTGCGAGGCTCAGGCGGGTTGGGACTGAGAATTAGCCTAGCTAGAGCGTTAAGTAGTGTATTTCCGCTTGGCGCTCTGGCGTAACAAACCTGAAGTCCCAATCTGCCCCCAACACGTTTCGGCAATATCGCGGGCAACGTGATAGCCATGACTCAAAAATCAAATCACCGCTAACTCAGCAATTTATATGAGTTCACGCTTCAAATCAAATCCATTCAAACTTGCCGTCCTGACAATGACATACTATCAGCTAATAAAAAACGCATTCCACTGACGGGTATCAGCGAAATGCGTTTTTATGTTGGCACGACTTTTTAAGTCGACTACTTATCAATCACCGAGCGCTGAATCGTCTGTCCATGGACTTGCCGTAACCGCGCTTCACGGTAGAGATACAAGTACTTGGCGCGCGCTAACGCAGTCTGAGTGACGAGTTCACTCGTATTGTTGTCGTAGACCGCCTCTTGGTTCTGCTTGGCGCGGTCCCAGTCGACCTTGGCCGCATTCAACGTCGTCAATAATTGTTCATCATACGTTGCTTTGGGGTGCTTGATCTTCTGTTTACGTTTAAACATACTAACACCTCCGAATTACATCTCTTGGCGACCTTCAACCGCCTTAAACAGGGTCATTTCATCCGCATACTGAATATCACTGCCGACCGATAACCCGTGAGCCAGCCGCGTTACTTTGATGCCGGCGGGCTTAACTAGTCGTGAAATATACATCGCAGTGGCTTCACCCTCAGGCGTGGCGTTGGTCGCGATGATGACTTCTTTGATGGCTTCATTTTGCTGGAGCCGTTTCAATAAACTGGCAATGTTGATATCTTCCGGGCCCTTACCGTCGATTGGCGAAAGCACGCCATGCAGCACGTGATACAACCCGTTATATTCCTTGATTTTTTCCATTGCCATGACGTCCTTGGCTTCTTCCACCACCAGCACAGTGCTCTGGTCGCGCGACTTGTCCTTACAAATCACACACGGATCATCTTCAGTGATATTGCCACAAATACTACAAAAATGCAGGTCCCGTTTGGCCGCAATCAGCGACTTAGCGAACTCGGTGACATCATCACCGTTCATATCAATCGTATAGAACGCCAGCCGTGTCGCCGTCTTGCCCCCAATGCCGGGCAACTTCATGTAACTATCGATCAACTTCGCAATTGGTTCTGGATACTGCATGTGCTTACCTCGTTTTTACTGTAATCCCTTAGTATACTTGCCCATCGTGCTCTGTGTCTGGTCATCGACCTTAGTCAGCGCGTCGTTGACTGCGGCTAAGACCAAGTCTTGTAACATGTCGACATCGTCTGGATCAACGGCGTCGGGGTTAATCGTGATATCTTGCATCTTCTTGTCGCCAGTGAAGGTCACTTTGACCATGTCGTCAGGCGCTGACCCGGTAAACGTCTGTTCATTTAGAGCAGCTTGTTCGGCCGTCATTTGTGCCTGCATCTTTTTCATTTGTTTCATCATATTTTGCATATTTCCCATTCCACGCATCATAATTATCAGTTCCTTTCATGGTTAGTCTGGCTGAACCTCGACTAGGTCGCCAAACATGTTCTTCGCTTCTTCAACAACGGGTGCTTTGGCCGGTGCCTGCTTCTCAGGAGTGGCACCCCCTGGCTGATGAGTCGCCAAGTAATCCTTACGAATCTGCGGCCATTGCTCCTTAGGTACACACACGATCTTAGGTGCTTGACCCATCAAGCGGTCCAATCCATTACCGAGTGCATCAATCAGTGTCTGGTCATCGATCGCCTTTTGATAAACGAACGCGTAATCAAAGGCAACTACAACGCCATCCGCACTCGCAGCAACCGGCTGAGCAACGTGCATCAGCGCACGTTGGGTCACACTCAAGATATTCATCAAGTCGGTCCAAACGTCTCTAACCTTCAACAAGTCATTCTTGGTCGCCGCACCCAAAATCGGATAGATTTGGCTAACGTTGACCTTTTTAACAACTGGGCCACTGCTCGTACGCGGTTTCGCTGGCGCAGGTTTAGTATTCCCACCACCTTGCGTTCGCAACGTTTTAACTTCATTTTGCAGTTGTTCAACTTGTTGTGCGAGCTTGTGCACTGTTGGATCTTCTGGATTGACGGCCGCGGTAGTTGTCGCTGGCTGAGCAGTTGCCGTTTGACCATCCAACTGCGCGAGTTTGACCGTCAGAACTTCCAAGTAAACGTCGGGATGCGTCGTGAACCGCATCTGCTGCTGAATATCATTCAGTGTTTTGACCATCTGATACAAGACTTCGGCGTCGATTTCCTTGGCAAAAGCCTCAAACTGTTGATCATCTTCACCCATGGCCACACTGTCGACCATTTCAGGGGCCTGTTGATAGAGTAACACGTCTCGCGTATAACTAATCAAATCTTCGATGAAGCGGTTCGCATCTTTACCTTCTTGTAAGATTTCGCGCATCGTCTCCAAGGCCGGCTTGGTCTCGTGGTGCGTCACCTGCGTCACATAATTGGCAAGTAACTGCTTGGTGACACTCCCCGTGACCATCAACGCATCATCTAAGGTGACCGTATTATCCCCGAAGGAAATCACTTGGTCTAAGATACTCAATGCATCCCGCATCCCACCTTCAGCGGCCGCCGCAATCACACGCAGCGCTTTTTCATCGTAGGTCACGTCTTTTTCATTCAGGATGTAGACCATTCGATCATAACTATCCTTGGCCGTGATCCGCCGAAAGTCAAAACGCTGGGTCCGCGAAATAATCGTTAACGGAATCTTATGTGGTTCGGTAGTGGCTAAAATGAAGATGACGTTTGCCGGCGGTTCTTCCAACGTCTTCAACAGTGCGTTGAACGCCCCGGTCGACAACATGTGGACTTCATCAATAATATAGACTTTATAATCCGCCTGGGTTGGTGCGTACTTGGCCTTATCACGGATATCACGAATTTCTTCGACCCCGTTATTGGAAGCAGCATCGATTTCGATGACATCGTTCAACTGCCCCTTGGTGATCGCCGTACACGTCTCACATTCATTGCACGGCTCCCCGTCAACCAGATGGTGACAGTTGATGGCCTTCGCAAAGATTTTAGCTGCCGACGTCTTCCCAGTTCCCCGGGGACCTGTAAACAGATACGCATGGCTCGTCTGGTGGGTCATAATGGCATTTTTTAACGTCTGGGTAATCATTTGTTGCCCGACGATTTCATCAAAGCGTTGGGGACGCCAAACCCGATATAGTGCCCGATACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP016491|2968930:2977681|2975647_2975953_-|AUI80252.1|DBSCAN-SWA MRGMGNMQNMMKQMKKMQAQMTAEQAALNEQTFTGSAPDDMVKVTFTGDKKMQDITINPDAVDPDDVDMLQDLVLAAVNDALTKVDDQTQSTMGKYTKGLQ >CP016491|2968930:2977681|2972212_2973232_-|AUI79628.1|DBSCAN-SWA MATDSFAQTLTAKQPRLLAAFKHIIAQNHLAHAYLFAGMEGAGQPELAHWIAQRLFCLHVTDDGEPDGTCEECVRIANGSHPDIVTVAPEGQRIHVDQVRYLKAEFSKSAVEGNRKLFIISDAEKMTASAANSLLKFIEEPSGNVTALLLTTNKQLMLPTIISRTQVIEFPPLNAQALQQTFEQAGIAPNQAQMARSLTSSVTQAQALLEDDWLPQASQALWRWFEQAVKGDSRSFAAVQVNLVGLAKDADHQLVMLDLIAALFQDLLQLHFQVATTALTFGQYQQELTALTTRLSDDQLIAATELALTAKRQLASNISFQNVLEGLTLKLWPIFQTNA >CP016491|2968930:2977681|2975032_2975632_-|AUI79632.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIAKLIDSYMKLPGIGGKTATRLAFYTIDMNGDDVTEFAKSLIAAKRDLHFCSICGNITEDDPCVICKDKSRDQSTVLVVEEAKDVMAMEKIKEYNGLYHVLHGVLSPIDGKGPEDINIASLLKRLQQNEAIKEVIIATNATPEGEATAMYISRLVKPAGIKVTRLAHGLSVGSDIQYADEMTLFKAVEGRQEM >CP016491|2968930:2977681|2968930_2969926_-|AUI79624.1|DBSCAN-SWA MSILVLGGAGYIGSHMVDRLVEHGTDVVVVDNLVTGHRAAVNSAAKFYQGDLRDADFLNHVFDTESITAVVHFAAFSIVPESMSKPLKYFDNNTGGMITLLEAMQAHDVKQIVFSSTAATYGTPEQIPIKETDPQLPINPYGASKLMMEQIMHWADVAYGIKFVALRYFNVAGAKPDGSIGEDHGPETHLVPIILQVAQGKRDELKIFGDDYNTPDGTNVRDYVHVIDLADAHILALKYLAAGNESNAFNLGSSTGFSNKQMLAAAREVTGQPIPATLAPRRPGDPDSLVAASDKAREVLGWKPNYDNVNDIIKTAWAWTQKHPNGYDDRH >CP016491|2968930:2977681|2974765_2975017_-|AUI79631.1|DBSCAN-SWA MFKRKQKIKHPKATYDEQLLTTLNAAKVDWDRAKQNQEAVYDNNTSELVTQTALARAKYLYLYREARLRQVHGQTIQRSVIDK >CP016491|2968930:2977681|2975977_2977681_-|AUI79633.1|DBSCAN-SWA MYRALYRVWRPQRFDEIVGQQMITQTLKNAIMTHQTSHAYLFTGPRGTGKTSAAKIFAKAINCHHLVDGEPCNECETCTAITKGQLNDVIEIDAASNNGVEEIRDIRDKAKYAPTQADYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPANVIFILATTEPHKIPLTIISRTQRFDFRRITAKDSYDRMVYILNEKDVTYDEKALRVIAAAAEGGMRDALSILDQVISFGDNTVTLDDALMVTGSVTKQLLANYVTQVTHHETKPALETMREILQEGKDANRFIEDLISYTRDVLLYQQAPEMVDSVAMGEDDQQFEAFAKEIDAEVLYQMVKTLNDIQQQMRFTTHPDVYLEVLTVKLAQLDGQTATAQPATTTAAVNPEDPTVHKLAQQVEQLQNEVKTLRTQGGGNTKPAPAKPRTSSGPVVKKVNVSQIYPILGAATKNDLLKVRDVWTDLMNILSVTQRALMHVAQPVAASADGVVVAFDYAFVYQKAIDDQTLIDALGNGLDRLMGQAPKIVCVPKEQWPQIRKDYLATHQPGGATPEKQAPAKAPVVEEAKNMFGDLVEVQPD >CP016491|2968930:2977681|2970847_2971744_-|AUI79626.1|DBSCAN-SWA MQTQQSFAAHAGVGTLYLVPTPIGNLQDMTYRAVETLKTVDLIAAEDTRNTQKLLNHFEITTKQISFHEHNTQERIPQLVEKLHAGVNLAQVSDAGMPSISDPGKELVAACIQANIPVVPLPGANAGLTALIASGLVPQPFYFYGFLPRKKNEQKADLAQLAQRHETVVLYESPFRVAKTLALLATVCEGSRPIVACRELTKRYEEFARGTLTEMVAWAQDHQLKGEFVLLLGGNPNTDEPAATDELAQLPIKAQVEALIAAGDKPNAAIKTIAKRRNLARQTVYNQFHELKPNDEES >CP016491|2968930:2977681|2970058_2970844_-|AUI79625.1|DBSCAN-SWA MATLGATASLYSEQHRITYYECDRTGRATLTTLIDIAVLASEDQSDALGLTTDFVQGHGVGWVVTQYAMDITRMPRQDEVVTIAVRGSAYNPYFAYREFWIRDADGQQLAYITSIWVLMSQKTRRIVKIMPELVAPYQSEAVKRIPRLPRPISFEKTADTITKPYHVRFFDIDPNRHVNNAHYFDWLVDTLPADFLLQHDLVHIDVRYENEVKYGQTVMAHANILSGEQADQVTTSHLIEVGDEKCCEVTIQWRTLPAPID >CP016491|2968930:2977681|2973601_2974267_-|AUI79630.1|DBSCAN-SWA MLTGKLVTFEGPDGAGKTSALNAIVAQLQPQLGDRLVVTREPGGNQISEAIRNIILDRNNTAMDDRTEALLYAAARRQHIVQTIQPALDRGQLVLCDRYLDSSVAYQGAGREIGEQAVYDMNQFATKGLTADLTLYFDVDAAVGLNRIQQHRQNEINRLDVEALSFHHRVQAAYLQLLADHPERIKRIDASQPLEEVVTQAIQIMTTKLPTYMATEGGERE >CP016491|2968930:2977681|2971840_2972188_-|AUI79627.1|DBSCAN-SWA MDKRDLYDSFGDMEQQMQQMLDKMAKLRADMTTVLEKNAELVIENEHLREHMVEIENELPKKTTSTTTLSKSRQNLEKLYDEGFHVCNQFYGKRRDDDESCVFCLEVIYGERERA >CP016491|2968930:2977681|2973275_2973605_-|AUI79629.1|DBSCAN-SWA MKLIIAIVQDKDSNRLSSQFIEANVRATKLSTTGGFLRSGNTTFMIGIEDERVDEVLAMIKETSHAREQFMTPPVNLDVTMDGASAYPVEVQVGGATVFVLPIEQFHQF |
11 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3000775 : 3077213
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP016491|3000775:3077213|DBSCAN-SWA ATTATTCCTTTCTAAACCGCACACCCTGAGGCGTATCTTCTAAAATGATCCCTTGCGCTTTCAAGTCGTCACGAATCTGGTCGGCCTTGGCAAAATCCTTGGCTTGCCGAGCTGCTTCGCGTTCATCGATCAGCGCTTGAATCGCGTCGTCTGCCAAACTGGCATTGGCGGGAGCTGCTAAGGTCACGCCAAACACGCCGGCTAACGCCTCAAGGGTCTCGCTTAATGCCGTCAAGGTGTCACTTTGGACGGTCGTTTTAGCGGCATACACGTTGGCCAATTTGGCTAATTCATAAACTGCTGCGACCCCGTTTTGGACATTAAAATCATCATCCATTGCGGTCACGAAATTATCAGTCAACGTCTTCAGCTGTGCACTGACCGTTTCGTCAGCCCCAGTCGTCGCGTCCTTGAGACGGAACGTTAAATTACGATAAGCATTCCGCAACTTATCCAAATTATTGGCAGCTTCGTCCAGGTTGCCCTGCGTATATTGAATTGGCCGCCGATACTGCGTCGTTGCCATGAAGAAGCGCAGCACTTGGGGATCGACCGTCTTGATGATATCGTGGACCGTCACAAAGTTGCCCAGTGACTTGCTCATTTTTTCATTGTCGTCACCAACCGTCACAAAGCCGTTATGCAGCCAGTAGTTGGCAAACTTCTGCCCAGTCTTGGCTTCACTTTGAGCGATTTCATTCTCGTGATGTGGGAACTCTAAGTCTTGCCCACCACCGTGAATATCAAACGTATCGCCGAGATACTTGGTCGACATCACGGAGCATTCGATATGCCAGCCCGGTCGTCCAGCACCCCATGGGGAATCCCACGAGATCTCACCGGGTTTAGCCGCTTTCCAAAGGGCGAAGTCGATTGGATCTTCTTTACGATCAGTCTCTTCATCCGCCGTATGTTGACTCGCACCAACTTCCAAGTCATCGATTCGTTGATCTGAGAGTTGCCCATAATTCTTGAACTTACGGGCCCGGTAGTAGACATCACCAGCTGATTCGTATGCGTAGCCCTTATCAATCAGGACTTGGACAAACGCAATAATTTCTGGAATATTTTCAGATGCGCGGGGATGAGCCGTCGCCGGTTCAATATTGACCGCCGCAGTATCTTCCATAAAAGCTTGAATGAACCGGTCCGCCACAGCGGGAACCGTGGTATGGTCCTCAGCGGCTCGCTTGATGAGTTTATCATCAACATCCGTAAAGTTAGAGACATAGTCGACGTGGTAGCCCCGGTATTCAAAATACCGCCGAATCGTATCAAAGGCGATTGCGGAGCGGGCATTCCCGATATGAATATAGTTATAAACAGTCGGCCCACAGACATACATCTTCACAACTCCGGGGGTAATTGGTTTAAACGGTTCTTTTTGGCGCGTTAACGTATTAAAAACGCTTAGCATATTGGCGACAACTCCTTTCAATTGAGACGTGTTACTTTACGCGTTGTGTTAGTTATGATTTGGCATTAAAGATGATTAAAACGTGCTAAGTTGGCGTCCTGTTTGTCAGCCGATGCGCTTCCTAGTCCGACTTCCGGGGCCGGCTGACAACGCTGGAACGTAGCCGACGTCGATTTGAACTCACGCAGAAGACCACTGCGCAATTTCAAATACGAGTCTTATTCTAAGCCGGAAGAAAAGCACTTCCAGCTAAGAATAATTTGGCTACTGAGCATTGTCCGCCAGCCCCTCCAGTCGGGAAGCCGCTCGAATGGCAGATGAACGGCCACCTATCCTGGCACAATTGACCACTGAATGTTAAAAGACTGGATCTTTATGCGAACTTTTAATCAGTGTCAATGATTGTTTGTTATATTTAAATGTTGATGAGATGATCTGAAATTCCAGTAACAACTAGTCTTGCGATTAGAACGATTAGTCGATAGAATTGCCATCTGTTAGAAGTTCAGACTTTATCATTTCAGGCAAGCTAGAGAAGACTACAAAAAACTGTCTTACAGTTGACTATCAAAATGACTGTTTACTAAGAACCTACGAACAGTTCATCAAAAGTTGGGACCGAACATGTCTGCCATTCGAATACCATCCCGGCTGGAAGGTATTCTGGGCAAGGCCCAGTGGTGAAATTTCACTTAGCAAGCGTTTTTGGCTTGGTTAGTGAAAGACCAGTATTTAAGACGTGGACTTCGGCTTAAATCTGTGTCCACCACGTTCCGGCCATTGACCAGAATGCCTGGAAGCCGGCCTAGGACGCACCTATCACTGCATGTTTACGGTAACTGGCACTGTTTCCAGCGGGTCTCAGCTGGCAGCACTTGAACTTAATAACTGGCACGTTTTAATCATGATGCATGACAAATTAACTCCCACAATACGTGTTACTTTTGATGATAGTTTACCATGTTTGGATGACAAATGAAAAAGCGCCCCTCATACTGCGGAATCCAATCCCGCCATACAAAAGACACTTTCACGTGCTGCCACGCGAGTCTTACCGACTATCGTTGCACTCATGATGAGCTTCCGACCATCCGGTTATTATCGTGACAATCGCACTAATTTTTAATTGAAACACCTCGGTACACCGCCTGACGACTCACATACCGATTGCGATTGTAGAACCTACTTCGCTAATTCCGCAATCATGGCATCAAGGTGCTTCTTAGTCGTTTCGCGACCAAGTAATTCGATTGTTTCAGGTAATTCTGGCCCGTGCATTTCATGCGAAACGGCGATCCGAATTGGCATGTATAGGGCACGACCCTTGATCTTCGTATCCTTTTGAATACTCTTGATCGTCTTTTGAATGGCCGTCGCTTCGAAAACGTCGATGTTTTCAATGCGTTGACGGAATTCCTTCAAGACTGGCAATGCCGTGTCATTATCAAGTTCTGCCTTGGCTTCATCATTGATATCAGCGGGACCATTGAAGAACAGGTCGGCTAAGTCAACGATTTGTCCGGTATAACTCATTTGGTTCTTGAAGAGGGACACTAACGTCCGCGTCCATTCGATTTGACTCATATCTGGGCGTTGTGGCAACCGACCAGCCTTGATCAACTGACGAATTGACATCGCAAAGACTTCATTGTCATCCGCCTTCTTGATGTATTGGTTGTTGACCCATTCGAGCTTCTTGGCATCAAAAGCAGCTGGTGACTTGCTTAAACGTTTTTCATCATACATCTTAATGAATTCGCGCTTCGTGAACAATTCACTTTCGCCAACTGGTGACCACCCTAAGAGGATAATGAAGTTAAGCATGGCTTCTGGCAAGTAGCCCAATTCACGATATTGTTCGATGAATTGAAGCACCGTTTCATCACGCTTACTCAATTTCTTACCCGTTTCAGTATTGATGATCAAACTCATATGACCGAACTTCGGTGGTTGCCAACCGAAAGCTTCATAAATCATTAATTGCTTAGGCGTGTTAGCCACATGGTCATCACCACGGAAGACGTGACTGATTTCCATCATGTGGTCATCCACAACCACGGCGAAGTTATACGTTGGCATACCATCGCGCTTCTTAATGACAAAGTCGCCACCGACCGTCTTGGATTCAAACGAAACGTTGCCTTTGACCATGTCATCCCAAGCGTACGTTTGGTTTTCTGGGACGTGGAAACGGACCACTGGTTGGATACCAGCTTCCTTAGCAGCCGCAATCTTGGCCTGCTTTTCTTCTTCCGTCATACCAGCAAATTCATAGACGTAGTGTGGCATTTCCTTGCGAGCCTTTTGGGCTTCACGTTGGGCCTGCAATTCTTCTTCCGTCATGTAAGATTCGTACGCTTTACCTTCATCAATTAATTGTTGAATCAACGGATCATAGATTGACTTACGTTCAGATTGACGATAAGGGCCAAAGTCGCCGCCCTTATCTGGACCTTCATCCCAATCAATTCCTAACCAGGTCAAGTTATCCATCTGACTCTTTTCACCGTCTTTAACGTTCCGTTTTAAGTCGGTGTCTTCAATCCGAAGAATAAACTTACCCTTATTATGCCGGGCAAATAAATAGTTAAACAATGCAGTCCGAGCATTACCAATGTGTAAATGGCCAGTTGGACTTGGTGCGTAACGCACACGAATCTTACTCTTTGCCAATGTGATTAACGCCTCTTTCATATTTTTTCATCTTAAATGTTACGCCGCGCTCCAGTTAACACCAGAATACTGCGACTTTCACTTGCTTTTCCAGTTTACCATGTTTACCACTAAAAATTAAGGTTTCAGACCGAACCCGTTGTAAAAACCTCAAAATCATTTGGGTTGGGCCGCTGCTACGGTTGGATTAGTTGTGGTTGATTCGGATGCAATCTAAAAGCAAACTTCAAAGTCAAAAGCTGCCAGCTGAGGTACGCTGGAAAAAGTACGAATTAGCGTAAACTTGCTGTGATAGTTGCGTCCTACGCCGGCTTCCAGCCGAGATGGTATTCGAAAGGCGGATATTTGCGGGCCCAACTTTTGTCGGATTAATCGCTGGTTCTTTGCATACGGTCATTTTGATAGTCGACTGTCAGACTAGTTTCTGATGATAGCAAAACTCCCTTACCCATATTGAACTTTTCAAATTGGCGTTTCACAGAACTTTTCTGAGCTTTCTCTGATCGCCTTAGACAGCCAAACCTCAAATTCTAGACAAAGGTAATTTTATCGACTAAATTCAAGACTAGTGTCCATTGAAATTAGTGAATTATATTCAGTAATCTTCCCAGTACTAAAATGCCATAAAGCATTATCAATATCGATTGAAAGTTTACTCGAAGGACCTGTCTCCTAATATTCAGTGATCAATTGTACCAAGATAGGTGGCCGTTCATCCGCCATTCGAACGGCTTCCCGACTGTAGGGGCTGGCTGACAATGCTCAAGGGCGAAATTCTTCTTGTCCGGGTGGTCTTCCCGGGCTAGAAGAAGACTCGTATTTGAAATTGCGCAGCGCTTTTCTGCGTGAGTTCAAATCGATGTCCGCCCTGTTCCAGCGTTGTCAGCCGGCCCCGGAAGTCGGACTAAGG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80 | Lactobacillus_phage(88.1%) | tRNA,terminase,holin,tail,portal,capsid,integrase,head | attL 3036582:3036597|attR 3077364:3077379 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3256347 : 3266206
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP016491|3256347:3266206|DBSCAN-SWA ACTAGCGTGCAGTCCGACTGATAATTCGGGCTAACCGGTCAGCCATCCGTTCCAGATTGGCCGGTCCTTGTGCCATGGCTTGGTCTAAGGTCATGACTTGGTCAACGATGGGCAAGACGGCAGTGACGCCCTGTTCGGCAAACGTTGCGTTAGTCCCTTTTTGCCGGCCAACGAGGAGATAACACGGTTTGTCAGCTGCCTGAGCCATTTGACTCAACTGAATCGGGACTTTGCCCATAAAGCTCTGGTCGTCGACTTGGCCCTCGCCCGAAATGACCAAATCAGCTTGCGCGACCTTGGCCTTCAACTGGCTCACGTCGGCGAGTAGTTGAAAGCCAGATTGCACCTGAGCGTGTAAGAAATAGCGCAAAGCAAAGCCGATTCCACCCGCTGCACCATCGCCAGCACAGGCGCTTACCTGACCACTCGCAATCGTCATATAGTGCGCCAGGGCCGCATCGTGTGCGTCGATTTGGGCTACGGGCAACCCTTTTTGTGGGCCAAAGATTCTCGCCGCGCCATTGGTCCCAGTCAACGGATTCGTCACATCCGCCGCGCTGATAAACGTCACGTCGGCGAGTTGTGGTAAGACTTGCTGCATATCAATTGTAGCCACTTTGCCTAAATCAGCACCAATCATCGCGAGTTCGTTCCCATCGGCATCTAGGAACCGATAGCCGAGCGCTCGCAAAATGCCGGCACCCCCATCGACTGTCCCGCTACCACCGAGGCCCAGAATAATTTTACGTGCCCCGTGCTTGATTGCGTCCTTGATCAACAGGCCCGTCCCGTAAGTATTCGTGGCTAACGGGGTCAACTCCTCCGTGACAAACTGAATGCCGGATGCAGCGGCGACCTCAATCACAGCTAGTTTTTCAGCCGCAAAATAGCCATACGTGGCTTCCAGCGGCTGTTGGGCTAGGTCGACGGTCTGCGCCGTAATCGACTGACCACCCGCATGATTCGCTAACCAGGCCGCAACCGTTCCTTCACCACCATCCGCGATCGCCACCTGAGTCGTTGCTAATCCGTGTGCTTCAAAACGCCGGGCCACCAGCTGATTGGCCTGAATACTCGTGATGGAATTTTTGAAAGAATCAATGGCAATTAATGCGTGCATTTTATCGTCCCCTATTCAATAACTACTTTCCAGTATAGAGAACCAACGTCTAATCGGCAATTCATATCAGTTGTCAACATTTATGAAAATCGTTAAGCTTAAAGTATCAAATAATTCATATGGAGGACGATAAGTTATGGCAACTCAGTACGATTACGACGTATTATACATTGGTGCGGGCCACGCGACCTTTGATGGCGCGGCCCCACTCGCTAAGACCGGGGTCCGAGTCGGTGTGATTGAAAGTGGTTTAATTGGTGGGACCTGCCCTAATCGCGGGTGTAATGCCAAAATCACGCTCGATGAACCAGTCAAACTCACCCGTGAAGCTGCTCGCTTGAACGACCTGTTAAGTAGTGCGCCGACCATCAACTGGACGGCCAACGTGGCGCATAAACAAGAAATCATCGACCCCTTACCAGCTGGTCTAACCGCTCGCTTGGAAGATGGTGGCGCCAAGATTATTCATGGCCACGCGACGTTCAAAGATAACCACACCGTAATCGTGGATGACGACCAAACGATCACCGCTGAAAAGATCGTGATTGCGACCGGCTTGAAGCCCCACCGTTTGGACATTCCGGGTACTGAATTAGCCCATGACAGCAGCGACTTCATGAACCTCAAGCAGTTGCCGCAAAACCTCGTCATCATTGGGGCCGGCTATATCGGCATGGAATTCGCGACGATTGCCAATGCCGCTGGCGCTAACGTGACAGTGATGCTTCACGGTGACCAAGCGCTCCGCAACTTCTATCAACCTTACGTTGAACAAGTCGTTGCTGACTTAACCGAACGAGGCGTCAAATTCATCAAAAATGCGAACGTTCAAGCGTTCGAACAACAAACCGACCAACTCCAGGTGAGTTATGGTGACCATCAGCAATTAACGGCTGACTGGATTTTAGATGCCACCGGCCGGATTCCGAACTTAGACGGCTTAGGTTTGGACCAAGTCGGCGTCAAATACGACCGCCACGGGGTCTACGTTAACGATTATCTCCAAACCAACATCGATAACATTTACGCGGCCGGTGATGTGCTCGCCAACGACTTGCCAAAGGTCACCCCTGCCGCTTACTTCGAGTCCAAATACTTGATGCGCCTATTCTCTGGTCAGACCACTGACCCCATCGACTATCCGGTCATTCCATCCGTGGTCTTCACCTCACCACGAATCGCTCAAGCCGGGATGAAGATTCCAGACGCGGAAAAAGCTGGTTTGGACGTGGCCGAAAATGATTTAGCCAACTACTGGTATTACCAAGTCTCCCGTGAACCGATCGCCGCTAGCAAACAAGTTCATGACAAGGACGGCCATCTCGTCGGCGTCACTGAAATCAGCGACCAGGCCGAAAACGCAGTCAACGCGCTATTACCAGCCATTGAATATCAATTGGACCGGGACCAAGTCGACCGCTTGATCGGCATCTTTCCAACCATCGGCTATGCCGCATGGCACCGGGCTTAAGATGTTAAAGATTGATTTCACACGATGATTTGAATTGTCTCGTTATCACAGTCTAGGCATAAAATACAGCGATTCAAGGCCAACTGCTTTGAATCGCTTTTTGTTACGTTACACTTACGCATTGTGCTAGTGATTGGTCATGAATCATGATTAAAGCTTGCCAGTTAATTCGGATTACTGTCCGTCAGCATTGTTCGTCCTAGTCCGACTTCCGGGGCCGGCTGACAACGCTGGAACAGGGCGGACATCGATTTGAACTCACGCAGAAACCCACTGCGCAATTTCAAATACGAGTCTTCTTCTAGCCCGGGAACCCCACCCGGACAAGAAGAATTTCGCCCTTGAGCATTGTCAGCCAGCCCCTACAGTCGGGAACCCGCTCGAATGGCGGATGAACGGCCACCTAACTTGGTGCAATTGACCACTGGATATAGGTGACTGGACTTTCAGTAAAACTTCAAATTGGTATCATTAATTCTTTAAGGCAGTTGAACGCTGAGAAGATTACCTGAATATTATTCACTACTTCCAATTACAACTAGCTTGAAATTGTTCAATAAAATTGCCTTCGTTTATAATTCAAGACTTTGTTATCTCAGACGACTAGCGAAAATTCTGACAGGTAATTTCAGTGAAGTTGCTTGTCAAAAACCTTAAACCATGGGTAAGGACATTTAACTATTGTTAGAACCCAGTCTGACAGTTGAATATCAAGATAACCATGTACTAAGGAACCAACGACTAATCCAACCAAAAGTTGAGTCCGCACATGTCTGCCTTTCGAATACCATCCCGGCTGGAAGGCATTCTGTGCAAGGCTCAGTGGTGAAATTTCACTTAGCAAGCGTTCTTTGCTTGGTTAGTGAAAGACCAGTATTTAAGACGCGGACTTCGGCTTAAATCTGTGTCCACCACGTTCCAGCCATTGCACAGAATGCCTGGAAGCCGGTGTAGGACGACGCCACGACTGCAAGTTTACGCTAACTCGCACTGTTTCCAGCGGTTCCAAGCTGGCTGGTTTTGAACTTAAAAACACAGTAACAAAATGCCCCAAAAAGCCCCAGCGAATCATTCGCTGGGGCTTCATTAGTTTTAAATTAATCGTCTAATCCTAATCGTTCGAAAATCTCGTCAACGTGACGTAAGTGATAATGGTAGTCAAAGGCGTCATCGATAGCGGCTTGGTCCAAGTGTTCGCGAATTTCGGCGTTGCCTTCGACGAGTGGCTTGAATTGGAGCTGCTCATCCCAGGACTTAGCCGTTAACGGTTGAACCAGGTCATAGGCACTTTCACGTGACATGCCGGTATCAATCAATTTTAACAAGACGCGTTGACTATAGATCAACCCGTAAGTCGCATCCATATTCTGTTTCATCCGTTCTGGGAAGACCGTCAACGTCTTAATGATCTTGTTGATTCGCGTCAAGATGTAGTCCACCAAGATCGTCGTATCTGGTAAAATGATCCGTTCTGCAGATGAGTGCGAAATGTCGCGTTCATGCCACAGTGGTACGTCTTCGTAAGCCGTCATCATGTGACCACGGATAACGCGTGCCAACCCAGTCACGTTTTCAGAACCGATTGGATTACGCTTATGCGGCATCGCTGAAGACCCCTTTTGTCCTTTATTGAAGAATTCTTCAACTTCATGGGTCTCAGATTTTTGTAAGCCCCGAATCTCGGTCGCGAACACTTCAACGCTGGTTGCAATCAAGGCTAAGCTCGCAATGTATTCCGCGTGTAAGTCACGTGGTAAGACTTGTGTTGAGATTTCTTGTGCGCGCAAGCCGAGTCGTTTGCAGACAAATTCTTCGACAAACGGTGGGATGTTGGCAAACGTCCCCACGGCGCCACTGATTTTACCCGCTTCAACGCCCGCGGCTGCGTGTTCGAAGCGTTCGATATCCCGGTTGATTTCTGAATACCAGCGGGCAATCTTCAAGCCAAAGGTAGTTGGTTCAGCGTGAACACCGTGCGTCCGGCCCATTTCAACCGTATATTTATATTTTTTCGCCTGTTGTGCTAGTGTCGCCCGTAAGTCCTGTAAGTCTTGGCGAATAATCGCATTGGCCTGCTTCAAACGGTACCCCTGAGCAGTGTCGACCACGTCAGTACTTGTCAGGCCATAATGAACCCACTTACGTTCGGCGCCTAATGATTCGGAAACATCACGCGTAAAAGCAACCACATCATGATGCGTTACGGCTTCGATTTCCGCGATCCGATCAACATCAAACTTGGCATTTTCTCGAATTTTAGCAACATCACTTGCCGGAATCTTCCCCAATTCAGCCCAGGCCTCGTCTGCAGCAATCTCTACTTCCAACCACGCTTGATACTGATTTTCTAACGACCATACTTTGCCCATCTCGGGACGCGTATAACGATCAATCATTGCTAATCCTCAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP016491|3256347:3266206|3257602_3258937_+|AUI79872.1|DBSCAN-SWA MATQYDYDVLYIGAGHATFDGAAPLAKTGVRVGVIESGLIGGTCPNRGCNAKITLDEPVKLTREAARLNDLLSSAPTINWTANVAHKQEIIDPLPAGLTARLEDGGAKIIHGHATFKDNHTVIVDDDQTITAEKIVIATGLKPHRLDIPGTELAHDSSDFMNLKQLPQNLVIIGAGYIGMEFATIANAAGANVTVMLHGDQALRNFYQPYVEQVVADLTERGVKFIKNANVQAFEQQTDQLQVSYGDHQQLTADWILDATGRIPNLDGLGLDQVGVKYDRHGVYVNDYLQTNIDNIYAAGDVLANDLPKVTPAAYFESKYLMRLFSGQTTDPIDYPVIPSVVFTSPRIAQAGMKIPDAEKAGLDVAENDLANYWYYQVSREPIAASKQVHDKDGHLVGVTEISDQAENAVNALLPAIEYQLDRDQVDRLIGIFPTIGYAAWHRA >CP016491|3256347:3266206|3260034_3261333_-|AUI79873.1|DBSCAN-SWA MIDRYTRPEMGKVWSLENQYQAWLEVEIAADEAWAELGKIPASDVAKIRENAKFDVDRIAEIEAVTHHDVVAFTRDVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTAQGYRLKQANAIIRQDLQDLRATLAQQAKKYKYTVEMGRTHGVHAEPTTFGLKIARWYSEINRDIERFEHAAAGVEAGKISGAVGTFANIPPFVEEFVCKRLGLRAQEISTQVLPRDLHAEYIASLALIATSVEVFATEIRGLQKSETHEVEEFFNKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMMTAYEDVPLWHERDISHSSAERIILPDTTILVDYILTRINKIIKTLTVFPERMKQNMDATYGLIYSQRVLLKLIDTGMSRESAYDLVQPLTAKSWDEQLQFKPLVEGNAEIREHLDQAAIDDAFDYHYHLRHVDEIFERLGLDD >CP016491|3256347:3266206|3262988_3263960_+|AUI80264.1|DBSCAN-SWA MEIFDYEDIQLIPNKCVINSRSEADTTVELGGRRFKIPVVPANMATVINDDIAKWLATNDYFYIMHRFAPETRRAFIETMHADKLYASISVGVKASEYDFIDDLAANQIVPEYITIDIAHGHADSVIAMIKHIKDVLPASFVIAGNVATPAAVRDLENAGADATKVGVGPGKACITKVKTGFGTGGWQLAAVRWCAKAARKPIIADGGVRTNGDIAKSIRFGATMVMIGSMLAGHQESPGNILKIDGKTYKQYYGSASETQKGEHKNVEGKQMLVPYRGHLADTLNEMQEDLQSSISYAGGRDLKAITKCDYVVVKNSIYNGD >CP016491|3256347:3266206|3256347_3257466_-|AUI79871.1|DBSCAN-SWA MHALIAIDSFKNSITSIQANQLVARRFEAHGLATTQVAIADGGEGTVAAWLANHAGGQSITAQTVDLAQQPLEATYGYFAAEKLAVIEVAAASGIQFVTEELTPLATNTYGTGLLIKDAIKHGARKIILGLGGSGTVDGGAGILRALGYRFLDADGNELAMIGADLGKVATIDMQQVLPQLADVTFISAADVTNPLTGTNGAARIFGPQKGLPVAQIDAHDAALAHYMTIASGQVSACAGDGAAGGIGFALRYFLHAQVQSGFQLLADVSQLKAKVAQADLVISGEGQVDDQSFMGKVPIQLSQMAQAADKPCYLLVGRQKGTNATFAEQGVTAVLPIVDQVMTLDQAMAQGPANLERMADRLARIISRTAR >CP016491|3256347:3266206|3261649_3262939_+|AUI79874.1|DBSCAN-SWA MASVVVVGSQWGDEGKGKITDFLSQEADVVSRYQGGDNAGHTIVFNGQTFKLRLIPSGIFFHDKLAVIGNGVVLNPKSLVEELQYLRDNGVNPDNLRISNRAHVILPYHITLDGAQEKAKAGGKIGTTNKGIGPAYMDKAERIGIRVADLLDKDTFAALLKRNLAEKNQIITKLYDLEPLKFEDIFDDYYAYGQTLKPFVTDTSVVINDALDNGQRVLFEGAQGVMLDIDQGTYPYVTSSNPVAGGVTIGSGVGPSKIDNCVGVLKAYTSRVGDGPFPTELFDEVGDFIRETAHEYGTVTKRPRRIGWFDSVVLRHAKRVSGFTHLSLNCLDVLTGLKTIKVCTAYDLNGETIYHYPASLKELEACKPIYEELPGWDEDITGVKTFEELPTNAQNYLRKLEELVGVKIATFSVGPDREQTNVIDHDIWG >CP016491|3256347:3266206|3265114_3266206_-|AUI79876.1|DBSCAN-SWA MKQQVVLAVDDLSVSFRVRGQDLQAIRHVSLALYDQEILALVGESGSGKSVLTKTFTGMLEDNGRITSGRIMYGDTCLSDLKRDREWDQIRGKGITTIFQDPMTSLDPIKTIGSQIAEVIIKHQQKSPAEAKAQAIELMTRTGIPDAAERYNAYPFEYSGGMRQRIVIAVALACHPRILICDEPTTALDVTIQAQILDLIKQLQREYHFSIIFITHDLGVVAAIADRIAVMYAGQIVELGTCDEIFYDPRHPYTWSLLSALPQLATADSGLYSIPGTPPSLFHDIEGDAFAPRNRYALAADFKQEPPQFDVSPTHWAKTWLLDPRAPKVEKPALIRNLHARLVALTKSEMQISQKTGGPTSDE >CP016491|3256347:3266206|3264177_3265125_-|AUI79875.1|DBSCAN-SWA MTNEKQALLTVKNLEIAFGAGKRRFVAVKDANFDLYPGETLALVGESGSGKTTIGRAILGIIPTAAGTITFHGQPINQGLAAKAHRDVMRKIQMIFQDPAASLNERATIDYIISEGLLNFHLYHSEQDRREQVARMIKAVGLLPEHLSRYPHEFSGGQRQRIGIARALIMRPELVVADEPISALDVSIRAQILNLLKQFQQESQLSYLFIAHDLSVVRFISDRVAVIHNGRILELAPTAELFAHPLHPYTQSLLAAIPIPDPQLARQKQLVAYHEVVHEDPADVPQFSEVVPGHFIYATQTELAAYRTQLAVMRS |
7 | Streptococcus_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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