Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP015558 | Pasteurella multocida strain USDA-ARS-USMARC-60494 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas3,cas5f,cas7f,cas6f,cas1,cas3-cas2,DEDDh,DinG,csa3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. CP015558
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
720093 : 781591
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP015558|720093:781591|DBSCAN-SWA CTTACTGTTTACGCCAAGTGGTACCATTTACGTTATCTTCTAATACCACACCCATTTCAGCCAGTTTGTTACGTGCGGCATCCGCACTTGCCCAATCTTTTGCTGCCCGGGCATCATTACGCTGTTTGATTAACGCCTCAATCAGCACGACTTCATCATTGTCTGAACCCGATTGTAAGAATTGCTCTGGATCTTGGTAGAGTAAACCTAATATTCCCGCTAATTCACGTAAGCGGGCTGCAAGCGCATTGGCTTTTAATATATCTTCATTTTTCAGTTTGTTGATTTCACGTGCGATTTCGAATAAGACTGAAATGGCTTTCGGAGTATTGAAATCATCATCCATGGCTTCTCTAAAGGCAGCAAGGTAGTTTTGCCCTTCTGTCGCGACTGCAGTTGGGTCTGTTCCTCGTAATGCCGTATATAAACGTTCTAAAGCACTGTGCGCAAGATTGAGGTTTTCTTCGCTGTAATTTAATTGGCTACGGTAATGTGCTGTCAGTAGAAAGTAACGTACACTTTCTGCGTCATAGAGTGATAATACTTCACGTAATGTAAAGAAATTACCCAGTGATTTGGACATTTTTTCTCGATCAACCATAATCATGCCAGAATGTATCCAATAGTTAACGTAGCGTCCACTATGGGCACAGCAAGACTGTGCAATTTCATTTTCATGGTGAGGGAAGGTTAAATCCGAGCCTCCGCCATGAATATCAAAATGCTCACCTAATTCTTTATGGTTCATGGCAGAACACTCAATATGCCAACCGGGACGACCTTCTCCCCAAGGGGATGACCAACTTGGCTCCCCTGGTTTGGACATTTTCCATAACACAAAATCCATCGGATTTTTTTTGACATTGACAATTTCAACACGAGCGCCTGCTTGGAGCTGTTCTAAATTTTGACGAGAAAGCTTTCCGTATTCTTTAAAACTTTCGACATCAAACATCACATCACCATTAGCGGATACATAAGCATGTTGACGAGCTATCAGCTTTTCAATCATTGCGATAATTTCAGGAATATGGTGGGTTGCACGGGGTTCTACATCTGGACGTAATACATTGAGTGCATCAAAGTCTTTGTGCATTTCTGAAATCATTTTTTCAACAAGTTGATTACATGTCTCATTATTTTCTAATGCCCGTTTGATAATTTTATCGTCCACATCTGTGATGTTACGCACATAAGTTAAGTTATAGCCTAAATACCGAAGATAACGAGCAATCACATCAAAACAAACGAATGTACGCCCGTGTCCTACGTGGCATAAATCATAAACCGTAATACCGCAAACATACATACCCACTTTGTTGGCATGAATGGGTTTAAAGATTTCCTTTTCTCTTGTTAATGTATTAAAAATTTTTAGCATGGATTGGTTCTCTTAAGTGTATAGGAGTGTTATAAATTTAGCATAGCGTATTTGCCATAAACAAAGTTACTTTATAGCATTTAATGCGCTTTTATGAAATAATCGAATGATATAAAACTATTAGAGGAAAACAGATATGATTACATTACACACTAACTTGGGTAACATTAAAATTCAATTAGATCATGAAAAAGCACCGAACACAGCACAAAACTTTGTAAATTACTGTAAAAGTGGATTCTATGATAACACAATTTTTCATCGTGTTATTGATGGATTTATGATCCAAGGTGGTGGTATGGATGAGGCGATGCGTGAGAAAAAGACGAATGCGCCGATCCAAAATGAAGCCAACAATGGTTTAAGTAACAAACGTGGCACAATTGCGATGGCGCGAACATCGGATCCTCATTCTGCGACCGCACAATTTTTTATTAATGTAGCAGATAATACTTTTTTAGATCACCGTTCAAAAGAGTTATTTGGTAAAAAGGTGGTACAAGAGTGGGGCTATGCCGTCTTTGGTGAAGTGGTTGAGGGCATGGATGTAGTAGATAAGATCAAAGGCGTGAAAACCGGAAATAAAGGGTTTCACCAAGATGTACCACAAGAAGCCATCGTGATTACTGCAGTGACCGTTGAATAATCAGTCTCTCCCCTCGTAATTGAGGGGATTCTTTTAGGAGAAGAGAAAATGTTAAGAATAATTACCGCACTTTTGCTTGCTGGTGTTGTTTGTGTTGCTCAAGCAAAGAATGTGGTTTTACATACAAATTATGGCGATATTAAAATGGTGTTAGAAGAGGAGAAAGCGCCCATTAGCACTCAGAATTTTCTACGTTATAGCCAAGCGGGATTTTATAACGGTACGATTTTTCATCGTGTTATTCCCAGTTTTATGATTCAAGCTGGGGGATTTGAGGTTGGGATGAAGCAAAAGAAAACCGATGCGCCTATTACAAATGAGGCGAATAATGGTTTGAAAAATTTGCGCGGTACTGTTGCAATGGCACGGACGTCTGATCCGCATTCTGCCACAGCGCAATTCTTTATTAATACAGTTGACAATGATTTTTTGAATTTTAGTGCAGAAACGCAAAAAGGTTGGGGATATGCGGTTTTTGCTAACGTAGTGGCAGGTATGGACGTGGTTGATCGTATTAGCCAAGTAGATACTGAGCGATCAGGATTTCACCGTGATGTACCAAAAGCGCCAGTGATCATTAAAAGTGTCACTATTGAATAGAGCAAGGCTAGCATCACTTTTATGGGCGCGATAGCGGGTCGTTATTTTGATTATTCAGGGAAAATAACTCTCTAGTTCTAATCCATAAGAATGAATAGAAAACGATATGCCATTTTTTGATACACATATCCATTTAGATTATTTACAGCAAGAAACAGGAGAAACGCTGGCACAATTAGTGGAACAAGCACAACAAGCCAATGTGCAAAAAATGCTAATGGTTGGCGTCTCTTCCGAGCATATTGTGACACTTACACAAATGGCTACTGCGTATCCTGAGTCTTTGTATTACGGCGTCGGGCTTCATCCTTTGTATATTCGGCAGCATACTTACGCTGATTTAGAGAAATTGCAACAGACGTTAGACAAACGACTTTCTAATTGTTGTGCTGTGGCAGAAATTGGTCTAGAAAGAGCGGTACCCGATTTGTTAAATGACGGGCTATGGGAAAAACAATGTGCGTTTCTTGAAGCACAGCTAGCATTGGCAAAGCAGTATGGCTTAGCGGTCAGTTTACATTCACGTAAAGCACATGATCAGCTTGTTCCTTTTTTACGGTATATTTCTTCACCAATGTGTGGTATTATCCACGGATTTTCTGGTAGCTATCAACAAGCTGTTCGTTTTGTTGATCTCGGTTATAAAATCGGAGTAGGCGGGACGATTACGTATTTGCGTGCGAATAAAACTCGTGATGTGATTCGCCGTTTGCCTTTAGATTGCCTTGTATTAGAAACAGATGCGCCTGATATGCCTGTATTTGGCTTTCAAGGACAGGTCAATCGACCGGAGAGAATCGTCAATATTTTTGCTCATTTATGTGAGTTAAGAGCGGAAAGACCAGAAGAAATTAAGCAAGTTATTTGGCAAAATAGCTGTAAGCTGTTTTCAATTTAAAGTTCCTATTTACTCTTTTTATGTTGAGAAGATAACTTATGCTCAAAGCAAGGATGTTACTCTTATTACGCATTTATTTATTACTTTCTGAGCGCGTTGCTTGGGTTTCTAAAGACTTGTCTGATGCACAAGTGGTTAAACCAGCATATCAGCGAAATGCAATGCAAAAGAAACCAAGAAAAGGGTGGGCGATCTTGTCGCGTTCGGCAAGATTTAATCTTATTTTAGGTACGATTCTGTTCATATTAGGTAACCTCCTGATCTTTTGGGTACTCATGTAACTCAGCTGCTAGCATCCATATCGCTTAGTATTGTGTGAAACGATAAATAATCTGATTAGCAGAACCGCGCCATACAAGGCTTGGATCCGCTTTATCCTGTTCAAACTTACCATCAATTAAGACATCAATATAAGGCAGTATTTGCCGTTGTAATGTATCGGCTTTGAGCTCTGCTAAGGTATAACCCGTCCAGACCCAAAGATCTTTATCAGGACATTCGTGTTTGACTCGTTTGACAAAGGGAAGAAGTACCGCCAGATTACGTGGATGGAGCGGATCACCACCTGTTAAGGTTAATCCTTGGCGTTTAATACGGGTATCTTTGAGATCTTGAAGGATTTGTGCTTCCATTTTTTCATCGAATGGAAGGCCAGCACAAAAAGACCAACTTTTTTTGTTGTAGCAACCTCGGCAAGCATGCGTACAGCCACTGACAAAAAGTGTACACCTTGTTCCTTCTCCATTCACGATGTCAGTAGGATAATATTGGACGTAATTCATAGCGGGCTTCACCGTGTTTATTTTCTGTGATACTGACGTCCGTGACATATGGTCAAGGACGTCGAACTGGCTTAGAGATGTTTTACTCTGCGCTTGACTTCTTCTTGTTTACCGGCATTAAATGGTCTGGCATCTGGACTGCCAAGATAGCCACAGACACGTCGGGTCACGGAGACTTTCTCACTGTCATGGTTACCACATTTCGGACAAGTAAACCCTTTACTTGTACATTCAAATTCACCACTGAAACCACATTCATAGCATTCATCAATCGGTGTATTGGTCCCATAGTAAGGCACTCTGTCATAGCTATAATCCCAAACGTCCTCCAATGCTTTAAGGTTATGCTGAACATTTGGGTATTCACCATAGCAAATAAACCCGCCGCTTGCGAACGGTGGATAAGGCAATTCAAAATCTATCTTGTCATAAGGATTGACTTTTTTCTCTACGTCTAAGTGGTAGCTATTGGTATAGTAGCCTTTATCTGTGACACCTTCGATAAGCCCAAATTGCTTAGTATCCAAGCGGCAGAAACGGTCACAAAGGTTTTCACTTGGTGTGGAATATAGGCTGAAAGCATAGCCTGTTTCTTGTTTCCAACGTTGCACGGTCTCGTGTAAATATTCGACGATTTCAATCCCTTTTTGGCGGAGTTGTTCATCATCATAAATATGTTTATCGCCGTAGAGA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MFMPPVFPAHWHVSQPVLIADTFSSLVWKVSLPDGTPAIVKGLKPIEDIADELRGADYLVWRNGRGAVRLLGRENNLMLLEYAGERMLSHIVAEHGDYQATEIAAELMAKLYAASEEPLPSALLPIRDRFAALFQRARDDQNAGCQTDYVHAAIIADQMMSNASELRGLHGDLHHENIMFSSRGWLVIDPVGLVGEVGFGAANMFYDPADRDDLCLDPRRIAQMADAFSRALDVDPRRLLDQAYAYGCLSAAWNADGEEEQRDLAIAAAIKQVRQTSY >CP015558|720093:781591|722825_723617_+|AUK25709.1|DBSCAN-SWA MPFFDTHIHLDYLQQETGETLAQLVEQAQQANVQKMLMVGVSSEHIVTLTQMATAYPESLYYGVGLHPLYIRQHTYADLEKLQQTLDKRLSNCCAVAEIGLERAVPDLLNDGLWEKQCAFLEAQLALAKQYGLAVSLHSRKAHDQLVPFLRYISSPMCGIIHGFSGSYQQAVRFVDLGYKIGVGGTITYLRANKTRDVIRRLPLDCLVLETDAPDMPVFGFQGQVNRPERIVNIFAHLCELRAERPEEIKQVIWQNSCKLFSI >CP015558|720093:781591|721609_722119_+|AUK25708.1|DBSCAN-SWA MITLHTNLGNIKIQLDHEKAPNTAQNFVNYCKSGFYDNTIFHRVIDGFMIQGGGMDEAMREKKTNAPIQNEANNGLSNKRGTIAMARTSDPHSATAQFFINVADNTFLDHRSKELFGKKVVQEWGYAVFGEVVEGMDVVDKIKGVKTGNKGFHQDVPQEAIVITAVTVE >CP015558|720093:781591|776740_778234_+|AUK25751.1|transposase|DBSCAN-SWA MPHVAARTASRDRDTGRYQSHRPEQTLLYQIVDEYYPAFAALMAEQGKELPGYVQREFEEFLQCGRLEHGFLRVRCESCHAEHLVAFSCKRRGFCPSCGARRMAESAALLVDEVLPEQPMRQWVLSFPFQLRFLFASRPEIMGWVLGIVYRVIATHLVKKAGHTHQVAKTGAVTLIQRFGSALNLNVHFHMLFLDGVYVEQSHGSARFRWVKAPTSPELTQLTHTIAHRVGRYLERQGLLERDVENSYLASDAVDDDPMTPLLGHSITYRIAVGSQAGRKVFTLQTLPTSGDPFGDGIGKVAGSSLHAGVAARADERKKLERLCRYISRPAVSEKRLSLTRGGNVRYQLKTPYRDGTTHVIFEPLDFIARLAALVPKPRVNLTRFHGVFAPNSRHRALVTPAKRGRGNKVRVADEPATPAQRRASMTWAQRLKRVFNIDIETCSGCGGAMKVIACIEDPIVIKQILDHLKHKAETSGTRALPESRAPPAELLLGLFD >CP015558|720093:781591|749188_751312_+|AUK25733.1|DBSCAN-SWA MYLFESLNRIIEAYLPPEQIELVKRAYIIARDAHEGQSRSSGEPYITHPVAVASIIAEMRLDHEAVMAALLHDVIEDTPYTEEQLKTEFGASVAEIVEGVSKLDKLKFRTRKEAAAENFRKMILAMTRDIRVVLIKLADRTHNMRTLGSLRPDKRRRIAKETLEIYSPLAHRLGIEHIKNELEDLGFEAMHPQRYAVLQKVIQVARGNRKDMIQRITNEIKGRLEDVGIKARVFGREKHLYAIYQKMKLKDQQFHSIMDIYAFRAVVKDIDTCYRVLGQMHGLYKPRPGRVKDYIAVPKANGYQSLHTSMIGPHGVPVEVQIRTEEMDQMAEMGVAAHWAYKEGGKNDSTTVQIRAQRWLQSLIELQQSVGNSFEFIESVKSEFFPKEIYVFTPKGRIVELPVGATPVDFAYAVHTDIGHSCIAANVDRKSYPLSQALTSGQTVDIITLPNSQPSAGWLNFVVTAKARTNIRNFLKNLRGGEAITLGKRQLTRALAPTKLEDLDKNRVQNLLTELKLATFDDLLMEIGLGNQMSAVIAYRLLGEAIEIDTDGDLTNNKANFEIKSAGGLLTTFAQCCHPIPGDPIVAYTSSGKGLVIHHEACANLKHRKDNPEHYMPVEWEQSDNMIDFEAELRIELINQQGALPNLTTLISSLGSNIQSIWTEEQEGRLYQIVVLLTVKDTKHLANIIRKIKAIPGFVNIERNINQ >CP015558|720093:781591|732751_733432_-|AUK25717.1|DBSCAN-SWA MLLSVLYIIGITAEAITGALAAGREKMDIFGVIIIAAMTAIGGGSVRDVLLGHYPIGWVKNPHYFLIVAGAAVLTVFIVPLIRRFMHYFHTVFLVLDALGLIVFSIIGAQVALDMGYGFTIAVIAAIITGAFGGVLRDLLCNRIPLVFQKELYASIALIATAIYIGLQQLNIDHNLVIIITLISGFIARLLAIYFEWGLPVFDYQEQEMAKKNNDDKLPKKVTWKK >CP015558|720093:781591|766879_767065_-|AUK25743.1|DBSCAN-SWA MNEQNNSWVQEWLNKSAKASERMATDEKFRQEVAKRATNSGQDIQAILAKNIAKYQNQAKD >CP015558|720093:781591|753891_754701_+|AUK25736.1|DBSCAN-SWA MNSPYQPTILFFDSGMGGFSVYKETKQLLPDCHYLYCFDNAFFPYSEKSEEEIIQRTLKICQKIDRTFPLDLIVIACNTASTVVLPALRAHFAIPVVGTVPAIKPAAECSETKHIGLLATKGTVKRAYVADLIAQYARDCTVEKLGSTKLVEIAEQKLHGKAVDLHALKQELAPWQSIQDLDTVVLGCTHFPLIKEEIKWCLPQVRFFVDSGKAIALRVKTLLSKIDIQSKTNEKNLIFCTQFFEDEAQFQKVIHFWGFEQLINLNMKA >CP015558|720093:781591|720093_721473_-|AUK25707.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLKIFNTLTREKEIFKPIHANKVGMYVCGITVYDLCHVGHGRTFVCFDVIARYLRYLGYNLTYVRNITDVDDKIIKRALENNETCNQLVEKMISEMHKDFDALNVLRPDVEPRATHHIPEIIAMIEKLIARQHAYVSANGDVMFDVESFKEYGKLSRQNLEQLQAGARVEIVNVKKNPMDFVLWKMSKPGEPSWSSPWGEGRPGWHIECSAMNHKELGEHFDIHGGGSDLTFPHHENEIAQSCCAHSGRYVNYWIHSGMIMVDREKMSKSLGNFFTLREVLSLYDAESVRYFLLTAHYRSQLNYSEENLNLAHSALERLYTALRGTDPTAVATEGQNYLAAFREAMDDDFNTPKAISVLFEIAREINKLKNEDILKANALAARLRELAGILGLLYQDPEQFLQSGSDNDEVVLIEALIKQRNDARAAKDWASADAARNKLAEMGVVLEDNVNGTTWRKQ >CP015558|720093:781591|751308_753390_+|AUK25734.1|DBSCAN-SWA MTIQFLDAVPLTTLSGVGAAISDKLGRIGIHNLQDLLFHLPIRYEDRTRITPIHDLRPDAYATIEGLVQTCEVQFGKRPILNVSLSDGTSKIMLRFFNFNAGMKNSLQPGARVKAFGEVKRGRFMAEIHHPEYQIIRDNAPLILEETLTPIYSTTEGLKQNSLRKLTDQALAVLENIQIAEILPNEFNPHPFSLKEAIRFLHRPPPDVSLEALEKGTHPAQQRLIFEELLAHNLAMQKVRIGTQQFFAYPLSYQTDLKQRFLAQLPFAPTDAQVRVTQEIEQDLTHPFPMMRLVQGDVGSGKTLVAALAALLAIDNGKQVALMAPTEILAEQHATNFRRWLAPLGIEVGWLAGKVKGKVRQTELEKIRTGQVQMVVGTHALFQDEVEFSDLALVIVDEQHRFGVHQRLMLREKGKQADHYPHQLIMTATPIPRTLAMTVYADLDTSIIDELPPGRTPITTVAISEERRAEVIARVNHACVNEKRQAYWVCTLIDESEVLEAQAAEAIAEDLRKILPHLRIGLVHGRMKPAEKQDIMQAFKQAEIDLLVATTVIEVGVDVPNASLMIIENAERLGLSQLHQLRGRVGRGTTASFCVLMYKPPLGKISQKRLQVLRDTQDGFVISEKDLEIRGPGEVLGTKQTGVAEFKVANLMRDRKMIPTVQYYARRLIVEQPEVATKLIQRWINQREIYTHV >CP015558|720093:781591|773671_773890_+|AUK27091.1|transposase|DBSCAN-SWA MTWAQRLKRVFNIDIETCSGCGGAMKVIACIEDPIVIKQILDHLKHKAETSGTRALPESRAPPAELLLGLFD >CP015558|720093:781591|780826_781591_-|AUK25752.1|integrase|DBSCAN-SWA 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49 | Vibrio_phage(12.5%) | integrase,tRNA,transposase | attL 740426:740440|attR 785177:785191 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1626537 : 1635895
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP015558|1626537:1635895|DBSCAN-SWA GATGAACAACAAGATAAAAATCTATTTAGTTGGAGGTGCTGTGCGAGATCAGCTCCTCAATCTTGTTGTGAAAGATCGTGATTGGGTCGTAGTTGGTGCAACGCCAGATGATTTACTATCACAAGGCTATCAACAAGTCGGCAAAGACTTTCCTGTTTTTCTGCATCCCCAAACAAAAGAAGAATATGCTCTCGCTAGAACAGAACGTAAAGCGGGTAGCGGCTATACTGGCTTCATTTGTGATTTTTCACCTACAATTTCTTTGGAACAAGATTTAAGTCGACGTGATTTAACTATCAATGCGCTCGCTCAAGATCTTGACGGAAAAATCTATGATTTTTATGGTGGTCTTACGGATTTAAAACAACGTCTTTTACGCCACGTTTCCCCCGCCTTTGCAGAAGATCCGCTACGCGTATTACGTGTGGCACGTTTTGCTGCTCGCTACCATACTCTTGGCTTCACTATTGCATCTGAAACCTGCGAATTGATGCAACAGTTATCACAAAGTGGTGAGCTGTCAAACCTAACCGCAGAACGTGTCTGGTTAGAAACAGAAAAAGCCTTATTAGAACCGCATCCTGAAGTGTATTTCCAAACGCTACAAGAGGTGGGCGCATTACAAGTACTGTTTCCTGAATTAGCTGCATTACAGGGCGTCCCCAATCCCGCGAAATACCATCCAGAAATAGATACGTTTGTGCATACTATGCTGGTCCTACAACAAGCAGTCTTGTTGACAGAAAACACGGACAGTGACAAAAGTGCGGTACGTTTTGCTGCAATTTGTCATGATTTAGGAAAAGCCTTAACACCAAAAGAAATATTGCCACATCATTATGGACATGAAAAAGCTGGTGTCATGCCGACAAGACGCTTATGTCAGCGCTTTAAATTACCTCACGCAATTCAAGATTTTGCAGAACTTTGTTGTGAATATCATTCGCACATACACAAAGCCTTTGAATTACGTGCGGAGACAATATTGAAATTATTCAATCGTCTAGATGTCTGGCGTAAGCCGGAACGTTTTAAAGCACTTTTGTTAGTCTGTATTGCAGACACGCGTGGTAGGACCGGATTTGAACAAGTTGACTATCCACAACGTGAATTTCTCTGGCAACTTTATCAAAGTGCTCTGCAGGTCAACGTGCAAGACATCATCCAACAAGGTTTCCAGCAGCAAGCCATTCGTGATGAACTCAATCGCCGTCGTATAATCGCGATTAAACAGACACGCGCGGAAATCCTCCCGCGCTTTACTAATCCGTGTTAAGCTCGTAAAATAATCACAATTTTGAGTACTTTTATTGGTTATGAAAAAACAACATTTTCTTTTGCCTATCATTGCAAGTTTCTTTTTATTTGCTTGTACCCTGGATACAGAACGTCCAACGGATGTGAAATATATCAGTCACACCGATCCCACGTGGCAACAACATTTATCTCAACTTAAGAAGATTCGCGATTACACTAACCAAGGTCAGTTAGGTTATATCAGTCAGAAAGAACGATTTTCTACTCGTTTTGACTGGCAATACCAAAATCCAACCAACTACCGTCTAACCTTGTCTTCCACACTGAGCCCAACAACCCTATCTATTGAAGTACGTCATAATGTTATGCACCTGTCTGATAATAAAGGACCTCTCCGCTCAGCACAGGATGCCAAGCGGTTACTGAAAGAGATTGTTGGGATGGATTTACCGCTTGACCAATTCGCCCTTTGGTTAAAAGGACAGCCTGATGAGAGTCGGGAATATCGAGTCGCTGAAAATCACTTACTCGCCCACTTTAGCTATCCTATCGATAATCAACAATGGACAGCGGATTACTTAAGCTATCATCAACTTCCACTTCCTTTACCGAAGGATATTTTGTTGAAGACAGAAGGGCAAACTTTAAAGATTCGTATCGATAACTGGACTTATTAATGCAACATTATCATTTTTCTCACTCACTTTTAGCACAACAAGAAAAACCATATCGTTTCCCTTGTCCGGCTAAACTTAACTTATTTCTCTACATTAATGGGAAACGTCAAGATGGTTATCACGAACTACAAACCCTTTTTCAATTTGTTGATTTTGGTGATTGGTTAGATATTGAGGTTCGCGAAGATAACGAAATCTGCCTAACGCCAGAACTCCCCTCACTAAAAAATGAAGATAATTTAGTCTATCGCGCAGCAAAATTACTGCAACAAAAAACCAATTGTGCTTTAGGCGCCAATCTGACACTTGATAAGATTCTACCGATGGGAAGTGGGCTCGGGGGAGGCTCGTCTAATGCGGCAACAGCATTAGTCGCATTAAATTACCTGTGGAATACGCAACTCAGCACAAAACAACTTGCTAAACTAGGATTAATGCTCGGTGCAGACGTACCAATTTTTGTCCATGGTCACGCGGCATTTGCTGAAGGAGTAGGTGAAAAAATTACTTATTGTGAGCCAAAAGAGAAATGGTATGTGGTTTTAAAGCCAAATGTGTCTATATCAACCGCGACCGTCTTTTCTGATCCAGATTTAATTCGTAATACCCCTAAGCAATCTCTGGAGCAACTCCTCAATCAAAAATATACAAACGATTGTGAAAAAGTTGTGTTAAATCATTATCCAGAGGTTGAAGAAATACTCCACAGATTGTTACAATATGCGCCATCAAGATTAACAGGCACCGGCGCTTGTGTATTTGCCGAATTTAATGACGAAGAAAGTGCACAACTCGCATTTCAAACAATACCCAAAAACTATTTTGGTTTTGTCGCACAAGGATTAAATAAATCACCTTTACATAATATGCTAGCGAAAATCAGCTAGCTCGATAATAACGAATTTACTCAACCATTTTTATTTCTTTACAATCTAAACCTCGAGGTTCAATTAACAATGCCTGATATAAAACTCTTTACTGGTAATGCAACACCAGAACTAGCAAAACGAATTTCTGAACGTTTATATCTCTCATTAGGTGATGCGACTGTTGGTCGTTTCAGTGATGGAGAAATTCAAGTTCAGATCAACGAAAACGTACGTGGTAGTGATGTGTTCATTATTCAATCTACTTGTGCCCCAACAAACGATAACCTAATGGAGTTGATTGTCATGGTTGATGCGTTACGTCGAGCATCTGCTGGTCGTATTACCGCGGTAATTCCTTATTTTGGTTATGCACGCCAAGATCGTCGTGTCCGCTCTGCTCGTGTACCGATTACAGCAAAAGTCGTGGCAGACTTCCTTTCTAGTGTAGGTGTCGATCGCGTGTTAACTTGTGATTTACACGCGGAACAAATCCAAGGTTTTTTTGATGTGCCTGTTGATAACGTCTTTGGTTCACCTGTATTAGTGCATGATATGTTAAAGAAAATCGACATGCAAAATCCGATTGTCGTTTCACCAGATATTGGAGGCGTCGTACGTGCCCGCGCTATCGCAAAATTACTGAATGATACCGATATGGCAATTATTGATAAACGTCGTCCACGTGCCAATGTAGCACAAGTCATGCATATTATCGGGGATGTTGCAGGTCGTGATTGTATTCTTGTGGATGATATGATTGATACTGGTGGGACATTATGTAAAGCGGCTGAAGCCTTAAAAGAACGCGGGGCTAAACGTGTTTTTGCCTATGCGACTCACGCAGTATTCTCTGGCTCGGCTGCGAAAAATCTTGCCAGTGATGCATTAGATGAGGTGGTAGTAACAGACACGATCCCCCTTTCACCAGAAATTAAAGCATTAAACAAAGTCCGCGTATTAACCCTTTCAGGTATGTTGGCTGAAGCTATTCGTCGTATCAGTAACGAAGAATCAATTTCTGCAATGTTCACCTAGTCAAATGACAAAAAAAGTGCGGTTAAAAATATTGAATTTTTAACCGCACTTTTTTATCTCGATAAGCGTCGTCTTTTATAGTCTGAGCTGCCGCTCAATTTCTTTCGCTTTCACTAAGAATTGTTTACGCTCAGCAGTTCCCATACCACTACTTGTTCCCGGTAATTTCACAGTCAATGGATTAACCGCGCGACCATTAATATGAAATTCATAATGTAAATGCGGTCCTGTCGAACGCCCTGTATTTCCCGAAAGAGCAATACGTTGACCACGTTTAACATTTTGCCCTGCTTTGACTAGAGCACGGCTTAAGTGCATATAAACGGTTTGATATTCACGCCCATGTCGTACCACAATATAACGTCCTGCGCCATTTGCTTGATACGCGACTTTTTCCACAATACCATCCGCCGGTGCAATGACCGGTGTACCAACGGGCATAGCAAAATCCACGCCTTTATGTGGTGCAATACGCCCAGTCACAGGGTGGCGTCGATAGGGATTAAAATGAGAAGAAACGCGAGCCTGACGTTGTAAAGGATAACGAGCAAAACCTTTGCCTAGCGTTTCGCCTTGGCGATTATAATAACGCCCATTACTCGCTTGAATCGCATAATAACTTTTGCCAGCTGAAATAATATGGATTCCATCCACATTACCTTGTCCCGTCAGCTTCCCTTCAATATATTCACGTGTCACTAATACCGCAAATTTATCGCCTTTTTTTAGCCGTTTTAAATTAATTTGCCATTGTAATGCATTCGCAAGTTGATTAATTTGGCGGATATCTAAACCTAATGTTCTTAATGCGGTATTAAAAGAACCGTCAATTCTGCCTTTTAACACCTCTTTTTTCCAAACACTTTGTTTCTTTAAAATTTCACGCTGATATTGACCATCTGCTGTTTTTTCGTAGATTTTTTCTTCTCTCTCTGAAACCAACCAATTAAGGTATTCGAGTTCGCCTTGGTTATCTAAGATCCAATAAAATTGCTGACCCGGCTTTAAGTTTTTAAATTCAGGATAGGCTTTAATTAAGCGCTCGCTTACACTGGCATCTAAGCCAGACAACTCTAAAACATCTTTTAAGGAATCCCCTTTTACCACCGTGTGGCTGAACTGATTTTTAATCCGCATTGCCTGATCCATAACATCAAACAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP015558|1626537:1635895|1630449_1632003_-|AUK26455.1|DBSCAN-SWA MQIKIAIFFSIILFIVLVVSLGKKEEGQDSSADSQTQTETQIEKQPALSTATVESPSSVQADSTLSPPSSAESVEKQAITEHHTESSAVSMDEKNSDTQVDASSQETTAKPAENTLDATSFYDDLEAKDDEVDEIKPDMLDELAAFPEPVRHALSDLFDVMDQAMRIKNQFSHTVVKGDSLKDVLELSGLDASVSERLIKAYPEFKNLKPGQQFYWILDNQGELEYLNWLVSEREEKIYEKTADGQYQREILKKQSVWKKEVLKGRIDGSFNTALRTLGLDIRQINQLANALQWQINLKRLKKGDKFAVLVTREYIEGKLTGQGNVDGIHIISAGKSYYAIQASNGRYYNRQGETLGKGFARYPLQRQARVSSHFNPYRRHPVTGRIAPHKGVDFAMPVGTPVIAPADGIVEKVAYQANGAGRYIVVRHGREYQTVYMHLSRALVKAGQNVKRGQRIALSGNTGRSTGPHLHYEFHINGRAVNPLTVKLPGTSSGMGTAERKQFLVKAKEIERQLRL >CP015558|1626537:1635895|1633899_1634880_-|AUK26458.1|DBSCAN-SWA MQELERQAPLLDAVNLKKYYPVKKGILSKPKLVKAVDGVSFTLERGKTLAIVGESGCGKSTLGRMLTMIEAPTEGELFYKGQNFLENDTATQKLRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGTILEEPLLINTDLNAKERKQQVLEMMEKVGLKPEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLRPDIVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQEEMGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCVEQGETKAIFNHPRHPYTQALLSATPRLEAEHRRERIKLTGELPSPLSPPKGCAFHARCRFAMEKCALEKPALKQYEDGSKIACFMLD >CP015558|1626537:1635895|1632237_1633029_+|AUK26456.1|DBSCAN-SWA MHIHSIKLPLVELKNINVVFEQKKALQNINLTLYPNSIITIVGPNGGGKSTLLKVLLKLLPPTSGQVIYHKNLRIGYVPQKIHLDHSLPITVERFLSLKKGISRQAIQDALSLLSISHLHKNSLQKLSGGEMQRVLLARAILNKPNLLVLDEPTQGVDINGQAELYQLIQQTQQQLNCAILMVSHDLNIVMADTNEVLCINQHICCAGTPETVSNDPTFIHFFGDQFAKNVALYTHKHNHKHDIHGDICCTSDFQSQQCTHKE >CP015558|1626537:1635895|1628469_1629357_+|AUK26453.1|DBSCAN-SWA MQHYHFSHSLLAQQEKPYRFPCPAKLNLFLYINGKRQDGYHELQTLFQFVDFGDWLDIEVREDNEICLTPELPSLKNEDNLVYRAAKLLQQKTNCALGANLTLDKILPMGSGLGGGSSNAATALVALNYLWNTQLSTKQLAKLGLMLGADVPIFVHGHAAFAEGVGEKITYCEPKEKWYVVLKPNVSISTATVFSDPDLIRNTPKQSLEQLLNQKYTNDCEKVVLNHYPEVEEILHRLLQYAPSRLTGTGACVFAEFNDEESAQLAFQTIPKNYFGFVAQGLNKSPLHNMLAKIS >CP015558|1626537:1635895|1626537_1627812_+|AUK26451.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNNKIKIYLVGGAVRDQLLNLVVKDRDWVVVGATPDDLLSQGYQQVGKDFPVFLHPQTKEEYALARTERKAGSGYTGFICDFSPTISLEQDLSRRDLTINALAQDLDGKIYDFYGGLTDLKQRLLRHVSPAFAEDPLRVLRVARFAARYHTLGFTIASETCELMQQLSQSGELSNLTAERVWLETEKALLEPHPEVYFQTLQEVGALQVLFPELAALQGVPNPAKYHPEIDTFVHTMLVLQQAVLLTENTDSDKSAVRFAAICHDLGKALTPKEILPHHYGHEKAGVMPTRRLCQRFKLPHAIQDFAELCCEYHSHIHKAFELRAETILKLFNRLDVWRKPERFKALLLVCIADTRGRTGFEQVDYPQREFLWQLYQSALQVNVQDIIQQGFQQQAIRDELNRRRIIAIKQTRAEILPRFTNPC >CP015558|1626537:1635895|1633037_1633823_+|AUK26457.1|DBSCAN-SWA MFEILFPAWLTGMLLSLITAPLGAFVVWRKMAYFGDTLAHSALLGVALGIFLDINPYLSIVLLTLILAILMVWLEGKTQFSVDTLLGIIAHSCLSLGVVTVGLLQNVRVDLMAYLFGDLLAMNYEDLVVIGIGVVFVLVTLLYFWHPLLSTTVSPELAQVEGVNVQKMRFILMILTALTIALSMKFVGALIITSLLIIPSATARRFAKTPESMVFIAILISMLSISLGLLLSAYYDTAAGPSVVICASLLFLLSLMKKEHN >CP015558|1626537:1635895|1629426_1630374_+|AUK26454.1|DBSCAN-SWA MPDIKLFTGNATPELAKRISERLYLSLGDATVGRFSDGEIQVQINENVRGSDVFIIQSTCAPTNDNLMELIVMVDALRRASAGRITAVIPYFGYARQDRRVRSARVPITAKVVADFLSSVGVDRVLTCDLHAEQIQGFFDVPVDNVFGSPVLVHDMLKKIDMQNPIVVSPDIGGVVRARAIAKLLNDTDMAIIDKRRPRANVAQVMHIIGDVAGRDCILVDDMIDTGGTLCKAAEALKERGAKRVFAYATHAVFSGSAAKNLASDALDEVVVTDTIPLSPEIKALNKVRVLTLSGMLAEAIRRISNEESISAMFT >CP015558|1626537:1635895|1634896_1635895_-|AUK26459.1|DBSCAN-SWA MALLNVENLSVHFGDENAPFKAVDRLSYTVNEGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDYPGRVQAEQLLFNQSDLLALTEKQKQKIVGADVSMIFQDAMTSLNPSYTVGYQIMEALKVHQGGAKAWRKERAIELLTLVGIPDPRSRLDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACNPKLLIADEPTTALDVTIQAQIIDLLLELQRKENMALILITHDLALVAEAAHRIIVMYAGQVVEEGRAEEIFKCPRHPYTQALLRALPEFAEGKSRLQSLPGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATDRCREQEPETRLVNGHRVKCHTPLNAQGMPSYTEFAVS >CP015558|1626537:1635895|1627852_1628470_+|AUK26452.1|DBSCAN-SWA MKKQHFLLPIIASFFLFACTLDTERPTDVKYISHTDPTWQQHLSQLKKIRDYTNQGQLGYISQKERFSTRFDWQYQNPTNYRLTLSSTLSPTTLSIEVRHNVMHLSDNKGPLRSAQDAKRLLKEIVGMDLPLDQFALWLKGQPDESREYRVAENHLLAHFSYPIDNQQWTADYLSYHQLPLPLPKDILLKTEGQTLKIRIDNWTY |
9 | Sinorhizobium_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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