Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP015559 | Pasteurella multocida strain USDA-ARS-USMARC-60215 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas3,cas14j,DEDDh,DinG,cas3-cas2,cas1,cas6f,cas7f,cas5f,cas8f | 0 | 0 | 3 | 0 |
1. CP015559
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
337672 : 395574
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP015559|337672:395574|DBSCAN-SWA ACTAATCAGGTGTTTGTTGTTGCTCGATATATTGGCGAATAATCGATATTGGTGCACCACCACAACTACCAGCAAAGTAAGACGGTGACCAAAGTTGATTTCCCCATAATTTTTTGCGAATGCTCGGATAGTTTTTCTTTCTAATCATTCGGCTCGAAACGCCTTTTAAACTGTTTACAAGATGAGAAATAGCGACTTTAGGCGGATATTCCACAAGTAGATGAACGTGATCATCTTCACCATCAAATTCCACTAATGTGGCTTCAAAATCAGCACAAATCGTTGCAAAAATTGAGCGTAAGTCGTTCAAAATTGCTTGAGTAAAAACTTCCCTGCGATATTTAGTCACGAAAACTAAATGAACGTGTAAGTTAAAAACAACGTGGCGACCACGTCTAATCTCTGTTTCTTTTTTCATAGGCCAAGTGTAGAATAAGCACAATTTTTGTATTCTAATTCGTGCAATGTTACTACGTAAAGCCTTTAAATTTGAAATCAGACCAAATGGGGAACAAGTTCGCAAAATGAAGCAGTTTTGCGGCTGTTCTCGCTTTGTGTTTAACAAGGCATTGGCGTGGCAAAATGAGCAGTACGAACAAGATAACCATCACAAATTCAGTTATACCAAGCTCGCCAACTTGCTTCCGCAATGGAAAAAAGAATTGGTATGGCTTAAAGATTGCCATTCACAAGTGCTTCAACAGTCGTTAAAAGACCTTGAAAGTGCGTTTAAAAACTTCTTTCAAAAGCGTGCGGATTTGCCCAAATTCAAGAAAAAAGGCGTAAAAGAGAGTTTCCGTTTTCCGCAAGGTTGCAAAATCGAGCAGAAAAACGACCGCTTGTATCTGCCGAAAATCGGTTGGGTGCGTTATCGCAACAGTCGTGAAATTGTTGGGGAAGTAAAAAATGTCACCGTTTCAATGAAATGCGGACGCTTTTTTGTGAGCATTCAAACGGAATTTGAACAGGAAATTCCCACGCATAAAGGCGGAGAAATCGGCATTGATATGGGCATTGCTCGTTTTGCAACCCTTTCCAATGGCGAATTTTTTGAGCCGTTAAATGCGTTTAAAACCCACAAAGGAAAATTGGCAAAACTGCAAAAACAGCTAAAAAATAAAGTGAAGTTCAGTAAAAACTGGCAAAAACTGAAAGATAAAATCGGCAAGTTACATCACAAAATCGCCAACTGCCGAAAAGATTTCCTGCATAAAATCTCAACGCAAATCAGCAAAAACCACGCGATGATCTATGTTGAAGATTTGCAAGTGGCGAATATGTCCAAATCAGCCAAAGGCACAGCGGAAGTACACGGCAAAAATGTGAAACAGAAATCAGGCTTAAACCGAGTGATATTAGACCAGTCTTGGTTTGAATTTAGACGACAACTGGACTACAAAACGCAATGGTTAGGCGGATTTTTGCTAGCAGTTCCTCCACAAAATACCAGTCGTACTTGCCCTTGTTGCAACCATACAGCAAAAGAAAATCGCCAAACACAGGAAAATTTTGAATGCGTAGAATGTGGCTATACGGAAAATGCCGATGTAGTGGGAGCAATGAATGTTCTTACACGTGGGCAAGCAATAGTCCAAGCATAATAAATATCAGGGTAGGACATACCCGAAGCGTCTATGAAGTGAATCTCAATAGAGATCAGCAGTAGAAACCCACCGAGAGTAGCCCACAGCTTGCTGTGGGAGCTAGTAGGAATCCCCTGCCTTTAGGCAGGGGAGGATGTCAATAGTCGTTTTTTACTTGTCCACCAGCAAACATATACGGATTCACAGACTGTCCGTCATGCTGGTAATCTTCTGGTTGTGGCTGCACTAACTGATTTAACACCCAGTCATGCGCACTTTCGCCACGTTCTGGAACTGAGTTCAAGTAAAACGAATTAAAAGAAAGTGCTTTTTTATTTCCATCTTTCGCTTTTTTAGATACATAGCTCGCTGTAGTCGAAGTCACGGAGCTGTTGTTGTAGTCAACGGTAAATGACACTAGCTCGTGATAGCTTGCATTTGCGCCAGTTTGTGAATCTTCAATTGTTTTTTCGATGTATTTCATTGTGTTTTCCTTTTAGTAAAAATAAAGCCCTAGAAATAGGGCTTGAATTATGAGAAAGAGATTGTGCCAGTATCTGATAGGGCGTAGCTTATAATGAGTAAGTTTTTGTCCGGATCGACTGGTGTGACATACTCATTGTCCTGTAAGAACGTACCAACTCTTTCATATTTTTTAGTAAAAGCTTGATTTGCTTTTAATACAAAAGATAGTTCGTCGCCTATTTTTACATATCGATCGACGGGATATGGATCAATTCTGATCGTCGCCGCGTAAATTGGAACGTAAACAGTACCATATCGAGCTCTTTCATCATCATGTTGGTTAACGTAATATACGTATTCAACACTACGTGTCCCTGTCTTAGTCATTGTTGCAACGATTTGCTCAATAACACCACCGCCAATCAGTTTCGTTACTTCCAGCTCACCTTTAAATCGACCAGTCGCACCGTCTAATCTGCCACTGAATACGCCATTTTTGGCTGTTAAATTCCCAGTGCTATCAACAGTAAAGTTTCCATTTCCGATGTCGATACTTCCGCCAGTAAACGAACCGCCATTCACAACACCGCCATTAATATTTGGCGCTGTGATTGTGCTATTCGCTTGAATCTTGTTACCAGTGATTGAATCATCAACGATTAAATCGCCAGCCAAAGCAACTTGTGAACGTCCGTTGTGTGTTGAAATGACAAATGGAGTTTTTAATGCGTTACTGTTCGGATCTGCGATAGCGAACTTATTAGCAAAAATGATAACTTGTGATTCAGCAGTTTGACCGTCCGCACCAAGTGCGATGCCGGCAATCGCTTTACGACCGCCAGCGACAGTTTCAGTTTTCAACGTGTACATTGATTGCACTTTGCCGTCAAGACTAGAGATTGCTTGACTTGACGATGTTATCAATGCTTTTGCGCCAACGATTTCCGCTTTGACTGTGCTAACTTCTTGAGAGAATGCTTTCTCTTTCTCAGCCGTCGTATTTTTAAGCGAAGAGATACTCGCATTTACTTCTGAAAGAGTGCTGTCAACATCTTCGGGGGCTGGCGTCCAGTCCGTTGCGATGTTGCCGAGTTCAAGTTTAGGTTTCTTAATATTGAAAACTGTACCATCTTTTTCATACGTTACAATCTCAACACTTAATCGCGTTTGACCTTCCGATTTTTGATAGTCAAAGACTACTGAGTAACGCTTGTAGTCGCGTGAATCGACTGTTACATAAGCCGATATGTCAGAATGAGTACTGCCGGTATATCGTCTTAATCTAAGATTAAGCTTGCCACTTTTGTTCGATAAAGCGTCAAACGAAAGCACGACTTTACCGTCCTTGACTTCCACCTGATCTTCAATGAGCACTTGACTTAGTGCGACCAATCGACCGTTGGCAGTCAGTATCGCAATGCCGTGATCCGTATCAAGCGTTACACCGCTATTTTTATTCCAACTGTTCAGCGTTCTAGTCTGTTTCAGTAGATTTCTGCCACCAATCTGCAACTGATTAAACTTAGCTTCAAGCGTTTCACTCTTGACTGCAAGCGACTTGTTTTCATTGCTAACCGTTTGCTCAAGTGCTGTGATTTTGGATGTTAAATCTAACTTAGTTGCATTGACTTCATCAGTCCATTCTGACTTTAACTCTTTTCTCGCAAGTGACGCCACTTCATCTTTGCTAGCTTTCGTTTCTTTTAAGTCAGAAATGCCACTAGTATTTTGCGCCACTTTAGAATCGAGCGTTTCTAGTTTTGTAGAGAAAGATTTGTCTTTTTCGCTAGCCGTTTTTTGAATTAGCTGTATTTCACTTTCGCTCAATCCAACTCTAGCAGTTAGACTGTCTAGCTTGTCAGCAGTAGATTTATTCACAGTCGCTTGTGATTGCTTGTGTTGAATAATATCCGCGCTTACTTCCGAGATAGCCACGTCAACATCTTCGGGGGCTGGCGTCCAGTCCGTTGCGATGTTGCCGAGCTCGAGTTTAGGTTTCTTAATATTGAAAACTGTACCATCTTTTTCATACGTTACAATCTCAACACTTAATCGCGTTTGACCTTCCGATTTTTGATAGTCAAAGACTACTGAGTAACGCTTGTAGTCGCGTGAATCGACTGTTACATAAGCCGATATGTCAGAATGAGTACTGCCGGTATATCGTCTTAATCTAAGATTAAGCTTGCCACTTTTGTTCGATAAAGCGTCAAACGAAAGCACGACTTTACCGTCCTTGACTTCCACCTGATCTTCAATGAGCACTTGACTTAGTGCGACCAATCGACCGTTGGCAGTCAGTATCGCAATGCCGTGATCCGTATCAAGCGTTACACCGCTATTTTTATTCCAACTGTTCAGCGTTCTAGTCTGTTTCAGTAGATTTCTGCCACCAATCTGCAACTGATTAAACTTAGCTTCAAGCGTTTCACTCTTGACTGCAAGCGACTTGTTTTCATTGCTAACCGTTTGCTCAAGTGCTGTGATTTTGGATGTTAAATCTAACTTAGTTGCATTGACTTCATCAGTCCATTCTGACTTTAACTCTTTTCTCGCAAGTGACGCCACTTCATCTTTGCTAGCTTTCGTTTCTTTTAAGTCAGAAATGCCACTAGTATTTTGCGCCACTTTAGAATCGAGCGTTTCTAGTTTTGTAGAGAAAGATTTGTCTTTTTCGCTAGCCGTTTTTTGAATTAGCTGTATTTCACTTTCGCTCAATCCAACTCTAGCAGTTAGACTGTCTAGCTTGTCAGCAGTAGATTTATTCACAGTCGCTTGTGATTGCTTGTGTTGAATAATATCCGCGCTTACTTCCGAGATAGCCACGTCAACATCTTCGGGGGCTGGCGTCCAGTCCGTTGCGATGTTGCCGAGTTCAAGTTTAGGTTTCTTAATATTGAAAACTGTACCATCTTTTTCATACGTTACAATCTCAACACTTAATCGCGTTTG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MIETEKKFFSVDVSNDIHIVNLHETLDQAKQSCLDGAVEAHEFADDMCDHEDFALNDLPYAVYGVVLGKADCKEKQLSEEEKEDYGSDLVLEKPEIVEFLQDDGWISVKDRLPSEREDILIYTDRGEIKIAWRDDVFFMSLRDYHLSSVTHWQPLPPIPKTE >CP015559|337672:395574|365380_365635_+|AUK27453.1|DBSCAN-SWA MGILRPNAKEFHNPSREYISRLLSDLQKYISMSEIARRLGVNRSTIYNYMRDETDKRFTICPYAVQYALEEMVEKFKNENENEK >CP015559|337672:395574|378111_378759_+|AUK27474.1|DBSCAN-SWA MTTKTQLSTFLFETHIIRTLSINNEPWFVVADLCKALELSSPTKAILNLDEDEVALNSIQGISKGNDKVNLVSESGMYTLILRCRDAVKKGSVPHRFRKWVTAEVLPQIRKMGKYEVQPQQLTLPEPDLNLTAIQNSEETLALIIQLYSYCFQAHEMQEKLQNTNIAKLMESQIGGQYLYNFKHPLEQVMAKAKKYVHSNTERLALVKAVNNLLN >CP015559|337672:395574|369290_369503_-|AUK27460.1|DBSCAN-SWA MKTEYKCPKCGGELSDLWDGEPVSAFIGEWSDDRFRCEGRVVAVGIMGPQRTKSCGYFGLEDLGIKYQED |
72 | Mannheimia_phage(37.5%) | integrase,head,coat,holin,terminase,tail,transposase | attL 337171:337221|attR 389645:389695 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
746592 : 755950
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP015559|746592:755950|DBSCAN-SWA CATGGCGTTATTAAATGTAGAAAATCTTTCGGTGCATTTTGGTGATGAAAATGCCCCTTTTAAAGCGGTGGATCGCCTCAGTTACACGGTCAATGAAGGTGAAGTATTAGGTATTGTTGGCGAATCAGGTTCAGGAAAATCGGTGAGCTCACTCGCGATTATGGGCCTAATTGATTATCCAGGGCGTGTACAAGCGGAACAATTGCTGTTTAATCAAAGTGATTTACTTGCCTTGACTGAAAAACAAAAGCAGAAAATTGTGGGAGCCGATGTGTCCATGATTTTCCAAGATGCGATGACCAGTTTAAACCCAAGTTATACGGTGGGTTATCAAATTATGGAAGCACTCAAAGTTCATCAAGGTGGGGCTAAAGCATGGCGTAAAGAACGTGCTATCGAATTATTAACCTTAGTGGGCATTCCTGATCCGCGTTCGCGTTTAGATGTGTATCCGCATCAATTATCGGGGGGTATGAGTCAACGTGTGATGATTGCGATGGCGATTGCCTGTAATCCGAAATTATTAATTGCAGATGAACCGACAACTGCGTTAGACGTGACGATTCAAGCACAGATTATTGATTTATTGCTGGAATTACAGCGTAAAGAAAATATGGCGTTAATCCTGATCACCCATGATCTTGCCTTAGTCGCGGAAGCAGCCCACCGCATTATTGTGATGTATGCAGGGCAAGTGGTTGAAGAAGGACGAGCGGAGGAAATTTTTAAATGTCCACGCCATCCATATACTCAAGCGCTATTACGTGCGTTACCAGAATTTGCAGAAGGAAAATCACGTTTACAATCTTTACCGGGGGTTGTGCCGGGGAAATATGATCGCCCAACAGGCTGTTTATTAAATCCACGTTGCCCATACGCCACAGATCGTTGTCGTGAGCAAGAACCAGAAACCCGTTTGGTGAATGGACATCGCGTCAAATGTCATACGCCGTTGAATGCGCAAGGTATGCCAAGTTATACAGAATTTGCAGTGTCATAATAAGAAAGAGAACAATATGCAAGAACTTGAGAGACAAGCACCTTTGTTGGATGCAGTGAATTTGAAAAAATACTATCCCGTTAAAAAAGGGATATTGAGTAAGCCGAAGTTAGTGAAAGCGGTAGATGGGGTTTCATTTACCTTAGAGCGCGGTAAAACATTGGCGATCGTGGGGGAGTCAGGTTGTGGTAAATCTACACTTGGTCGCATGCTAACCATGATTGAAGCCCCAACAGAAGGTGAACTTTTCTATAAAGGACAAAACTTTTTGGAAAATGACACGGCCACACAAAAATTGCGTCGTAAGAAAATTCAAATTGTGTTTCAAAATCCTTATGCTTCTTTAAATCCACGCAAAAAAATTGGCACGATTTTAGAAGAGCCGTTGTTGATCAATACGGATTTGAATGCCAAAGAACGTAAGCAGCAAGTGTTGGAAATGATGGAAAAAGTGGGCTTAAAACCAGAGTTTTACGATCGCTATCCACACATGTTCTCAGGGGGACAACGTCAACGTATCGCGATTGCGCGTGGGTTAATGTTGCGTCCTGATATTGTGGTGGCGGATGAACCGGTTTCTGCGCTTGATGTGTCTGTCCGTGCCCAAGTATTAAACTTGATGATGGATCTGCAAGAAGAAATGGGATTATCTTATGTGTTTATTTCCCACGATCTTTCGGTGGTGGAACACATTGCCGATGAAGTGATGGTTATGTATTTAGGGCGTTGTGTTGAACAAGGTGAAACGAAGGCAATTTTTAACCATCCTCGTCATCCTTACACGCAAGCCTTACTTTCAGCTACACCGCGTTTGGAAGCTGAACATCGTCGCGAAAGAATTAAACTGACAGGTGAGTTGCCGAGTCCATTAAGTCCACCTAAAGGCTGTGCTTTCCATGCTCGTTGTCGTTTTGCTATGGAAAAATGTGCCCTCGAGAAACCAGCTTTAAAACAGTATGAGGATGGCAGCAAGATTGCCTGTTTTATGCTAGATTAATGCAAATAAAAAGCGAACTTTGGTTCGCTTTTTCATGTTCGTGAAAAAAGTGTAAATGGGACCGCTCTTTAGCGGTTTAATTATGTTCTTTTTTCATTAATGACAACAAGAATAACAAACTAGCGCAGATGACCACAGAAGGACCTGCTGCGGTATCGTAGTAAGCGGAAAGTAATAAGCCCAAACTAATTGAAAGCATACTTATAAGAATTGCAATGAACACCATACTCTCTGGGGTTTTGGCAAACCGCCTTGCCGTGGCGGAAGGAATAATCAGGAGTGAGGTGATAATTAAGGCACCAACAAATTTCATACTAAGTGCAATCGTCAGTGCGGTTAAGATCATTAAAATAAAACGCATTTTCTGCACATTTACCCCTTCAACTTGTGCAAGTTCTGGACTGACTGTGGTCGAAAGGAGCGGATGCCAGAAATACAATAATGTCACCAGCACAAATACAACACCTATACCAATCACCACTAAATCCTCATAGTTCATGGCTAATAGATCGCCAAAAAGATAAGCCATTAAATCCACGCGGACATTTTGCAATAAGCCAACGGTGACCACACCCAGCGATAAACAACTGTGCGCAATGATGCCAAGTAATGTATCCACCGAAAATTGTGTTTTCCCTTCTAGCCATACCATGAGGATGGCGAGGATTAACGTCAGCAGCACAATCGAAAGGTAAGGGTTGATATCTAGGAAAATTCCCAATGCCACTCCAAGTAATGCGGAATGAGCAAGTGTATCACCAAAGTAAGCCATTTTTCGCCAGACCACAAAAGCACCGAGTGGTGCTGTAATCAGGGAAAGCAACATACCGGTCAGCCAAGCGGGAAAAAGAATTTCAAACATGATTTATCCTATTCTTTATGAGTACATTGTTGAGATTGGAAATCTGACGTACAGCAAATATCGCCATGTATGTCATGTTTATGGTTGTGTTTATGGGTATATAGTGCGACATTTTTGGCAAATTGGTCACCAAAGAAATGAATAAACGTGGGATCATTTGAAACCGTTTCTGGTGTTCCCGCACAGCAAATATGTTGATTAATACAGAGCACTTCATTGGTATCTGCCATCACAATATTGAGATCGTGAGAAACCATGAGAATGGCACAATTTAATTGTTGCTGTGTTTGTTGAATTAACTGATAAAGTTCTGCTTGCCCATTGATATCGACGCCTTGCGTTGGTTCATCTAATACCAATAAATTTGGTTTATTCAAGATAGCGCGGGCTAAGAGTACCCGTTGCATCTCTCCACCAGATAATTTTTGTAGGCTATTTTTATGTAAGTGACTAATTGACAATAATGACAAAGCGTCTTGGATAGCTTGGCGAGAAATCCCTTTTTTGAGTGATAAAAAGCGTTCAACAGTAATCGGCAGACTATGATCTAAGTGAATTTTTTGCGGCACGTAACCAATACGTAAGTTTTTATGGTAAATAACTTGTCCCGAAGTAGGGGGAAGCAATTTGAGTAATACCTTTAATAAGGTTGATTTTCCGCCACCATTAGGACCGACAATCGTAATGATCGAATTGGGATAAAGGGTTAAATTGATATTTTGTAATGCTTTTTTCTGTTCAAAAACAACATTGATGTTTTTTAATTCAACTAAGGGTAATTTTATAGAATGAATGTGCATTATTTGCTAGACTTGACGGCTTAAAGTTGCAGTAAAAATAGCTTATTTTGATTCGTTTAACAAGTTTATCCAATGAAAATAAGTACGATGAATACAATTTGGGCATTCATATGCCTTTTTTAACATTCCGTTGAATTTTTTATTGTTTGCTTGGTCATAATTAAACGAATTGAGAAACAAAGGAATAGAAGCGTGCGGCACGTTAAATTAGCAAGAGATAGACGAAGAAGAAAATTGCAGATTAAGATCGCAATTTTTTTTAGCATTATTTTATTCATCGTTCTCGTTGTATCGTTGGGAAAAAAAGAAGAAGGGCAAGATTCAAGTGCAGATAGCCAAACACAAACAGAAACTCAAATTGAAAAGCAACCTGCCTTATCTACAGCCACGGTAGAATCGCCTTCTTCGGTACAAGCGGATAGCACCCTTTCTCCTCCCTCATCCGCGGAATCAGTAGAAAAGCAAGCGATAACAGAACATCATACTGAGTCTTCCGCTGTCAGTATGGATGAAAAAAACAGTGACACTCAAGTAGATGCATCGTCACAAGAAACGACAGCAAAACCCGCAGAAAATACACTAGATGCAACGTCTTTTTATGATGATTTAGAAGCAAAAGATGATGAGGTTGATGAAATCAAACCCGATATGCTAGATGAATTGGCAGCCTTTCCTGAACCTGTTCGTCATGCGCTGAGTGATTTGTTTGATGTTATGGATCAGGCAATGCGGATTAAAAATCAGTTCAGCCACACGGTGGTAAAAGGGGATTCCTTAAAAGATGTTTTAGAGTTGTCTGGCTTAGATGCCAGTGTAAGCGAGCGCTTAATTAAAGCCTATCCTGAATTTAAAAACTTAAAGCCGGGTCAGCAATTTTATTGGATCTTAGATAACCAAGGCGAACTCGAATACCTTAATTGGTTGGTTTCAGAGAGAGAAGAAAAAATCTACGAAAAAACAGCAGATGGTCAATATCAGCGTGAAATTTTAAAGAAACAAAGTGTTTGGAAAAAAGAGGTGTTAAAAGGCAGAATTGACGGTTCTTTTAATACCGCATTAAGAACATTAGGTTTAGATATCCGCCAAATTAATCAACTTGCGAATGCATTACAATGGCAAATTAATTTAAAACGGCTAAAAAAAGGCGATAAATTTGCGGTATTAGTGACACGTGAATATATTGAAGGGAAGCTGACGGGACAAGGTAATGTGGATGGAATCCATATTATTTCAGCTGGCAAAAGTTATTATGCGATTCAAGCGAGTAATGGGCGTTATTATAATCGCCAAGGCGAAACGCTAGGCAAAGGTTTTGCTCGTTATCCTTTACAACGTCAGGCTCGCGTTTCTTCTCATTTTAATCCCTATCGACGCCACCCTGTGACTGGGCGTATTGCACCACATAAAGGCGTGGATTTTGCTATGCCCGTTGGTACACCGGTCATTGCACCGGCGGATGGTATTGTGGAAAAAGTCGCGTATCAAGCAAATGGCGCAGGACGTTATATTGTGGTACGACATGGGCGTGAATATCAAACCGTTTATATGCACTTAAGCCGTGCTCTAGTCAAAGCAGGGCAAAATGTTAAACGTGGTCAACGTATTGCTCTTTCGGGAAATACAGGGCGTTCGACAGGACCGCATTTACATTATGAATTTCATATTAATGGTCGCGCGGTTAATCCATTGACTGTGAAATTACCGGGAACAAGTAGTGGTATGGGAACTGCTGAGCGTAAACAATTCTTAGTGAAAGCGAAAGAAATTGAGCGGCAGCTCAGACTATAAAAGACGACGCTTATCGAGATAAAAAAGTGCGGTTAAAAATTCAATATTTTTAACCGCACTTTTTTTGTCATTTGACTAGGTGAACATTGCAGAAATTGATTCTTCGTTACTGATACGACGAATAGCTTCAGCCAACATACCTGAAAGGGTTAATACGCGGACTTTGTTTAATGCTTTAATTTCTGGTGAAAGGGGGATCGTGTCTGTTACTACCACCTCATCTAATGCATCACTGGCAAGATTTTTCGCAGCCGAGCCAGAGAATACTGCGTGAGTCGCATAGGCAAAAACACGTTTAGCCCCGCGTTCTTTTAAGGCTTCAGCCGCTTTACATAATGTCCCACCAGTATCAATCATATCATCCACAAGAATACAATCACGACCTGCAACATCCCCGATAATATGCATGACTTGTGCTACATTGGCACGTGGACGACGTTTATCAATAATTGCCATATCGGTATCATTCAGTAATTTTGCGATAGCGCGGGCACGTACGACGCCTCCAATATCTGGTGAAACGACAATCGGATTTTGCATGTCGATTTTCTTTAACATATCATGCACTAATACAGGTGAACCAAAGACGTTATCAACAGGCACATCAAAAAAACCTTGGATTTGTTCCGCGTGTAAATCACAAGTTAACACGCGATCGACACCTACACTAGAAAGGAAGTCTGCCACGACTTTTGCTGTAATCGGTACACGAGCAGAGCGGACACGACGATCTTGGCGTGCATAACCAAAATAAGGAATTACCGCGGTAATACGACCAGCAGATGCTCGACGTAACGCATCAACCATGACAATCAACTCCATTAGGTTATCGTTTGTTGGGGCACAAGTAGATTGAATAATGAACACATCACTACCACGTACGTTTTCGTTGATCTGAACTTGAATTTCTCCATCACTGAAACGACCAACAGTCGCATCACCTAATGAGAGATATAAACGTTCAGAAATTCGTTTTGCTAGTTCTGGTGTTGCATTACCAGTAAAGAGTTTTATATCAGGCATTGTTAATTGAACCTCGAGGTTTAGATTGTAAAGAAATAAAAATGGTTGAGTAAATTCGTTATTATCGAGCTAGCTGATTTTCGCTAGCATATTATGTAAAGGTGATTTATTTAATCCTTGTGCGACAAAACCAAAATAGTTTTTGGGTATTGTTTGAAATGCGAGTTGTGCACTTTCTTCGTCATTAAATTCGGCAAATACACAAGCGCCGGTGCCTGTTAATCTTGATGGCGCATATTGTAACAATCTGTGGAGTATTTCTTCAACCTCTGGATAATGATTTAACACAACTTTTTCACAATCGTTTGTATATTTTTGATTGAGGAGTTGCTCCAGAGATTGCTTAGGGGTATTACGAATTAAATCTGGATCAGAAAAGACGGTCGCGGTTGATATAGACACATTTGGCTTTAAAACCACATACCATTTCTCTTTTGGCTCACAATAAGTAATTTTTTCACCTACTCCTTCAGCAAATGCCGCGTGACCATGGACAAAAATTGGTACGTCTGCACCGAGCATTAATCCTAGTTTAGCAAGTTGTTTTGTGCTGAGTTGCGTATTCCACAGGTAATTTAATGCGACTAATGCTGTTGCCGCATTAGACGAGCCTCCCCCGAGCCCACTTCCCATCGGTAGAATCTTATCAAGTGTCAGATTGGCGCCTAAAGCACAATTGGTTTTTTGTTGCAGTAATTTTGCTGCGCGATAGACTAAATTATCTTCATTTTTTAGTGAGGGGAGTTCTGGCGTTAGGCAGATTTCGTTATCTTCGCGAACCTCAATATCTAACCAATCACCAAAATCAACAAATTGAAAAAGGGTTTGTAGTTCGTGATAACCATCTTGACGTTTCCCATTAATGTAGAGAAATAAGTTAAGTTTAGCCGGACAAGGGAAACGATATGGTTTTTCTTGTTGTGCTAAAAGTGAGTGAGAAAAATGATAATGTTGCATTAATAAGTCCAGTTATCGATACGAATCTTTAAAGTTTGCCCTTCTGTCTTCAACAAAATATCCTTCGGTAAAGGAAGTGGAAGTTGATGATAGCTTAAGTAATCCGCTGTCCATTGTTGATTATCGATAGGATAGCTAAAGTGGGCGAGTAAGTGATTTTCAGCGACTCGATATTCCCGACTCTCATCAGGCTGTCCTTTTAACCAAAGGGCGAATTGGTCAAGCGGTAAATCCATCCCAACAATCTCTTTCAGTAACCGCTTGGCATCCTGTGCTGAGCGGAGAGGTCCTTTATTATCAGACAGGTGCATAACATTATGACGTACTTCAATAGATAGGGTTGTTGGGCTCAGTGTGGAAGACAAGGTTAGACGGTAGTTGGTTGGATTTTGGTATTGCCAGTCAAAACGAGTAGAAAATCGTTCTTTCTGACTGATATAACCTAACTGACCTTGGTTAGTGTAATCGCGAATCTTCTTAAGTTGAGATAAATGTTGTTGCCACGTGGGATCGGTGTGACTGATATATTTCACATCCGTTGGACGTTCTGTATCCAGGGTACAAGCAAATAAAAAGAAACTTGCAATGATAGGCAAAAGAAAATGTTGTTTTTTCATAACCAATAAAAGTACTCAAAATTGTGATTATTTTACGAGCTTAACACGGATTAGTAAAGCGCGGGAGGATTTCCGCGCGTGTCTGTTTAATCGCGATTATACGACGGCGATTGAGTTCATCACGAATGGCTTGCTGCTGGAAACCTTGTTGGATGATGTCTTGCACGTTGACCTGCAGAGCACTTTGATAAAGTTGCCAGAGAAATTCACGTTGTGGATAGTCAACTTGTTCAAATCCGGTCCTACCACGCGTGTCTGCAATACAGACTAACAAAAGTGCTTTAAAACGTTCCGGCTTACGCCAGACATCTAGACGATTGAATAATTTCAATATTGTCTCCGCACGTAATTCAAAGGCTTTGTGTATGTGCGAATGATATTCACAACAAAGTTCTGCAAAATCTTGAATTGCGTGAGGTAATTTAAAGCGCTGACATAAGCGTCTTGTCGGCATGACACCAGCTTTTTCATGTCCATAATGATGTGGCAATATTTCTTTTGGTGTTAAGGCTTTTCCTAAATCATGACAAATTGCAGCAAAACGTACCGCACTTTTGTCACTGTCCGTGTTTTCTGTCAACAAGACTGCTTGTTGTAGGACCAGCATAGTATGCACAAACGTATCTATTTCTGGATGGTATTTCGCGGGATTGGGGACGCCCTGTAATGCAGCTAATTCAGGAAACAGTACTTGTAATGCGCCCACCTCTTGTAGCGTTTGGAAATACACTTCAGGATGCGGTTCTAATAAGGCTTTTTCTGTTTCTAACCAGACACGTTCTGCGGTTAGGTTTGACAGCTCACCACTTTGTGATAACTGTTGCATCAATTCGCAGGTTTCAGATGCAATAGTGAAGCCAAGAGTATGGTAGCGAGCAGCAAAACGTGCCACACGTAATACGCGTAGCGGATCTTCTGCAAAGGCGGGGGAAACGTGGCGTAAAAGACGTTGTTTTAAATCCGTAAGACCACCATAAAAATCATAGATTTTTCCGTCAAGATCTTGAGCGAGCGCATTGATAGTTAAATCACGTCGACTTAAATCTTGTTCCAAAGAAATTGTAGGTGAAAAATCACAAATGAAGCCAGTATAGCCGCTACCCGCTTTACGTTCTGTTCTAGCGAGAGCATATTCTTCTTTTGTTTGGGGATGCAGAAAAACAGGAAAGTCTTTGCCGACTTGTTGATAGCCTTGTGATAGTAAATCATCTGGCGTTGCACCAACTACGACCCAATCACGATCTTTCACAACAAGATTGAGGAGCTGATCTCGCACAGCACCTCCAACTAAATAGATTTTTATCTTGTTGTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP015559|746592:755950|752113_753061_-|AUK27801.1|DBSCAN-SWA MPDIKLFTGNATPELAKRISERLYLSLGDATVGRFSDGEIQVQINENVRGSDVFIIQSTCAPTNDNLMELIVMVDALRRASAGRITAVIPYFGYARQDRRVRSARVPITAKVVADFLSSVGVDRVLTCDLHAEQIQGFFDVPVDNVFGSPVLVHDMLKKIDMQNPIVVSPDIGGVVRARAIAKLLNDTDMAIIDKRRPRANVAQVMHIIGDVAGRDCILVDDMIDTGGTLCKAAEALKERGAKRVFAYATHAVFSGSAAKNLASDALDEVVVTDTIPLSPEIKALNKVRVLTLSGMLAEAIRRISNEESISAMFT >CP015559|746592:755950|746592_747591_+|AUK27796.1|DBSCAN-SWA MALLNVENLSVHFGDENAPFKAVDRLSYTVNEGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDYPGRVQAEQLLFNQSDLLALTEKQKQKIVGADVSMIFQDAMTSLNPSYTVGYQIMEALKVHQGGAKAWRKERAIELLTLVGIPDPRSRLDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACNPKLLIADEPTTALDVTIQAQIIDLLLELQRKENMALILITHDLALVAEAAHRIIVMYAGQVVEEGRAEEIFKCPRHPYTQALLRALPEFAEGKSRLQSLPGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATDRCREQEPETRLVNGHRVKCHTPLNAQGMPSYTEFAVS >CP015559|746592:755950|750484_752038_+|AUK27800.1|DBSCAN-SWA MQIKIAIFFSIILFIVLVVSLGKKEEGQDSSADSQTQTETQIEKQPALSTATVESPSSVQADSTLSPPSSAESVEKQAITEHHTESSAVSMDEKNSDTQVDASSQETTAKPAENTLDATSFYDDLEAKDDEVDEIKPDMLDELAAFPEPVRHALSDLFDVMDQAMRIKNQFSHTVVKGDSLKDVLELSGLDASVSERLIKAYPEFKNLKPGQQFYWILDNQGELEYLNWLVSEREEKIYEKTADGQYQREILKKQSVWKKEVLKGRIDGSFNTALRTLGLDIRQINQLANALQWQINLKRLKKGDKFAVLVTREYIEGKLTGQGNVDGIHIISAGKSYYAIQASNGRYYNRQGETLGKGFARYPLQRQARVSSHFNPYRRHPVTGRIAPHKGVDFAMPVGTPVIAPADGIVEKVAYQANGAGRYIVVRHGREYQTVYMHLSRALVKAGQNVKRGQRIALSGNTGRSTGPHLHYEFHINGRAVNPLTVKLPGTSSGMGTAERKQFLVKAKEIERQLRL >CP015559|746592:755950|747607_748588_+|AUK27797.1|DBSCAN-SWA MQELERQAPLLDAVNLKKYYPVKKGILSKPKLVKAVDGVSFTLERGKTLAIVGESGCGKSTLGRMLTMIEAPTEGELFYKGQNFLENDTATQKLRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGTILEEPLLINTDLNAKERKQQVLEMMEKVGLKPEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLRPDIVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQEEMGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCVEQGETKAIFNHPRHPYTQALLSATPRLEAEHRRERIKLTGELPSPLSPPKGCAFHARCRFAMEKCALEKPALKQYEDGSKIACFMLD >CP015559|746592:755950|753130_754018_-|AUK27802.1|DBSCAN-SWA MQHYHFSHSLLAQQEKPYRFPCPAKLNLFLYINGKRQDGYHELQTLFQFVDFGDWLDIEVREDNEICLTPELPSLKNEDNLVYRAAKLLQQKTNCALGANLTLDKILPMGSGLGGGSSNAATALVALNYLWNTQLSTKQLAKLGLMLGADVPIFVHGHAAFAEGVGEKITYCEPKEKWYVVLKPNVSISTATVFSDPDLIRNTPKQSLEQLLNQKYTNDCEKVVLNHYPEVEEILHRLLQYAPSRLTGTGACVFAEFNDEESAQLAFQTIPKNYFGFVAQGLNKSPLHNMLAKIS >CP015559|746592:755950|749458_750250_-|AUK27799.1|DBSCAN-SWA MHIHSIKLPLVELKNINVVFEQKKALQNINLTLYPNSIITIVGPNGGGKSTLLKVLLKLLPPTSGQVIYHKNLRIGYVPQKIHLDHSLPITVERFLSLKKGISRQAIQDALSLLSISHLHKNSLQKLSGGEMQRVLLARAILNKPNLLVLDEPTQGVDINGQAELYQLIQQTQQQLNCAILMVSHDLNIVMADTNEVLCINQHICCAGTPETVSNDPTFIHFFGDQFAKNVALYTHKHNHKHDIHGDICCTSDFQSQQCTHKE >CP015559|746592:755950|754017_754635_-|AUK27803.1|DBSCAN-SWA MKKQHFLLPIIASFFLFACTLDTERPTDVKYISHTDPTWQQHLSQLKKIRDYTNQGQLGYISQKERFSTRFDWQYQNPTNYRLTLSSTLSPTTLSIEVRHNVMHLSDNKGPLRSAQDAKRLLKEIVGMDLPLDQFALWLKGQPDESREYRVAENHLLAHFSYPIDNQQWTADYLSYHQLPLPLPKDILLKTEGQTLKIRIDNWTY >CP015559|746592:755950|748664_749450_-|AUK27798.1|DBSCAN-SWA MFEILFPAWLTGMLLSLITAPLGAFVVWRKMAYFGDTLAHSALLGVALGIFLDINPYLSIVLLTLILAILMVWLEGKTQFSVDTLLGIIAHSCLSLGVVTVGLLQNVRVDLMAYLFGDLLAMNYEDLVVIGIGVVFVLVTLLYFWHPLLSTTVSPELAQVEGVNVQKMRFILMILTALTIALSMKFVGALIITSLLIIPSATARRFAKTPESMVFIAILISMLSISLGLLLSAYYDTAAGPSVVICASLLFLLSLMKKEHN >CP015559|746592:755950|754675_755950_-|AUK27804.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNNKIKIYLVGGAVRDQLLNLVVKDRDWVVVGATPDDLLSQGYQQVGKDFPVFLHPQTKEEYALARTERKAGSGYTGFICDFSPTISLEQDLSRRDLTINALAQDLDGKIYDFYGGLTDLKQRLLRHVSPAFAEDPLRVLRVARFAARYHTLGFTIASETCELMQQLSQSGELSNLTAERVWLETEKALLEPHPEVYFQTLQEVGALQVLFPELAALQGVPNPAKYHPEIDTFVHTMLVLQQAVLLTENTDSDKSAVRFAAICHDLGKALTPKEILPHHYGHEKAGVMPTRRLCQRFKLPHAIQDFAELCCEYHSHIHKAFELRAETILKLFNRLDVWRKPERFKALLLVCIADTRGRTGFEQVDYPQREFLWQLYQSALQVNVQDIIQQGFQQQAIRDELNRRRIIAIKQTRAEILPRFTNPC |
9 | Planktothrix_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1719722 : 1822818
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP015559|1719722:1822818|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP015559|1719722:1822818|1742845_1746739_-|AUK28599.1|DBSCAN-SWA 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109 | Mannheimia_phage(42.37%) | integrase,tRNA,terminase,tail,transposase | attL 1776833:1776878|attR 1822923:1822968 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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