Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP015562 | Pasteurella multocida strain USDA-ARS-USMARC-59910 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas14j,DEDDh,cas3,cas8f,cas5f,cas7f,cas6f,cas1,cas3-cas2,DinG | 0 | 0 | 3 | 0 |
1. CP015562
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
524594 : 571997
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP015562|524594:571997|DBSCAN-SWA GATGAAAGCAGAAGCATTATTTGATTTAGATCCTGGTGTGAAAGTGCGCACCCGTTTTGCGCCAAGTCCAACAGGCTATTTACATGTAGGGGGCGCTAGAACGGCACTTTATTCTTGGCTCTATGCAAAACATCACCAAGGCGAATTTGTTTTACGTATTGAAGATACCGACTTAGAGCGCTCAACACCAGAAGCGACTGCCGCCATTTTAGAAGGAATGGCGTGGTTAAATTTAGCTTGGGAATATGGTCCATATTTTCAAACCAAGCGTTTTGATCGTTATAACCAAGTGATTGATCAAATGATCGAACAAGGGTTAGCCTACCGTTGTTATTGTTCAAAAGAACGTTTAGAAGATTTACGCAACACGCAAGAACAGAATAAACAAAAAACCCGCTATGATCGTCATTGTTTAGGTGATCATAAGCACTCACCAGAACAACCGCATGTGGTGCGTTTCAAAAATCCAACGGAAGGCTCCGTGGTGTTTGAAGATGCAGTGCGTGGACGTATTGAGATCAGTAACGCAGAGTTAGATGATTTGATTATTCGCCGTACCGATGGCTCACCAACTTATAATTTCTGTGTGGTGGTGGATGACTGGGATATGGGCATCACGCATGTGGTGCGCGGTGAAGACCATATCAATAATACGCCACGTCAAATTAATATTTTAAAAGCCTTAGGCGCACCCATTCCAACTTACGCCCATGTGTCGATGATTTTAGGTGATGATGGACAAAAATTATCCAAACGTCATGGCGCGGTGAGCGTGATGCAATATCGTGATGATGGTTACTTGCCTGAAGCGTTATTAAATTATTTGGTGCGTTTAGGTTGGGGACATGGCGATCAAGAGATTTTCTCCGTAGAAGAAATGATCAAGTTATTTGAGCTTGAAAGTGTGAGTAAATCAGCCAGTGCGTTTAATACGGAAAAATTATTGTGGTTAAATCATCACTATATACGTGAATTGCCAGCAGAATATGTGGCTAAACATTTAGCATGGCACTATCAGGATCAAGGCATTGATACCTCCAATGGACCTGCATTAGAAGACATCGTAAAAATGTTGGCTGAACGTTGTAAGACACTCAAAGAAATGGCTGCCGCAAGCCGTTATTTCTTCGAAGATTTCGACAGCTTTGATGAAGCCGCAGTGAAAAAACATTTCAAAGCAGCTGCGATTGAACCACTTGAGAAAATCAAAGAAAAATTGACCGCACTTGAAAGCTGGGATTTACACAGTACGCATCAAGCCATTGAACAGACTGCCGCTGAATTAGAATTGGGGATGGGCAAAGTTGGGATGCCATTACGTGTTGCGGTAACTGGTTCTGGTCAATCACCTTCTATGGATGTAACTCTAGTGGGCATTGGCAAGGCACGTACGCTTGTGCGTATTCAAAAAGCGATTGATTTTATTAAAAGTCAAAATGTCTAATATTTAGGCTTCTGTTTAAATATCAGCAATTTGAGGTTGACAGTTTGTGTGGCGGAATTTATTATTACCGCCACGACATTTCTGATGTGGGGATATAGCTCAGTTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCGTCGGTTCGATCCCGATTATCTCCACCACTTTAACACATTGAATATATTAGTTTTTTTAATAAAAAAGCAAGTCTAACAATTTCCATTTAATATCAGCTTGGGCGAGTTTTGGGCGGGAACCTTAAATTCAATCAAGCTGTTTTTCTCCGCAAAATGGTCAAAGTTCGACGTTGTGCGCCGTCTGTTTCATTAACTTTATTGGAAAACTCAATGAGCTTCTCAACATCTGGCGCAGAATAGTGTGTTGTAATGCTTTTGGATTTATGACCAAGTAATGTTTTCCGATCTTCTTCGGTAACTCCCGCAGACCTCAACCTATAACCGAAAGTGTGTTTCAAGTCGTGAACCCTTAAATTGATCATCCCATCATTGGCTTTTGTCTCCGTTTCCTTCTCAAAACGTACGGACGCCCTTATTCTGGCTTTTTTCCATGCTGAATTGTACATTCTTGTAACAGGCTTACCTCGATATGTAAAAACATAAATAGGATGCTTGCCACGCTGTTTTTGTACAACCTCTCTTGTTACATCATTAAGAACAACGAGACGGTCCTCTCTATTCTTAACTCCGCTATTTTTATCACGTCCTCCAAAGTCTTCTGGAATAAGAAATACACTCTTTTTAATTTCTGGAATGTAGATTTCCCAATCCCAACGCAAATTACATACTTCTTGTTCACGTGTGCCTGTATTGACTTTGAAAAGCGCCATACTGCGAAGATGCTCTGGGAGTTCTCCCATCAATATTCTTTGCTCAAACCAAGAAATAGGGTAGGGTTTTCTTCTATCTTCTTTCTCGTTTAGCTTTGAAATGGATGGTGGAATATCAAGCCATGTCATACCGTTTTCATCCCTCCATTTCCTTGCGGAAAGGTTTAAGATTCTAATCACGATCTCAAGCGCAATATTGACGGTCCTATTTTTCACACCGTCTTTTGTCTGCGCCGTGTCTCCGTGTTTTTTTCGGTGTTCAATATATTTCTTTAATGTGCCGTCATGGATATTTCTTAACGTCAATTTACCAATGAACGGCATTAATGATTCAAGCATTATAATAGTCATATCAATACTTGGCTTATTTTCATTTTCAGAAATGTATCTCATGGCTGCTTCAGCAAAAGTGCGGTCCTTTCTGATGCCAAAATTTACTGCTTTGTCGATTTCGGACATCTTTTGTATTAAGATTGCTTCCGCTTCCTTTCTTTCATCCGTGTAACAAGAGCATCGAATTGTTTTACCTCGATATTGCTTGTGGATATACCAGACTCCGTTTCTATTTTTGAGCCCTGTGAGTTTGCGACCCATTTTTTACCTCCATAAGGTCGCTTGTCGCAACCATTATTCTTATCTTTTTCTTTGAATAGATCAATTGAGCCATTCTTTATTTTTTCTATTAATTCATCTAGGTCATTTCTATCAAATGCCCAAATTGGAATGTTTCCACGCTTCTCATAGAAATTATCATAAGCTCGAAGATGTGGCTTATATCTTGTTTTGAATGTGTTTACACTACAACCAAGATACAATGCTGCCTGTTCTTGTTTCATCATTCTTGGAATTATCATCGATACCTCCATTAAAAAAGCCCACACTAAGCGGACTTTGTTTTTTCATATTGCGTGTATGCCACGATAGCTAGAATTTCAACTATCGCAATAATGGATAATGTGATGATCATGTTTATCTCCGAGCATTTTTCATGGCATCAAGCCAAGCTTGGGCGTCTTCTTCGGTAGCAAATAACAAACCTTCCATAATTCTTTGCTTCGTCTGATAATCATAATCGCCATTTTCTTTTTCAGCCACCCAATCAGAAATCGAAACGAAACTACCATCACCATCATAAGCATCAACATCGTTAATGACGATCGTGTAGCATCTTTTATTTTCTTCTGGATATGTAATTGGAGCGGGTAAAGTAAGCGTAACGGTTGGGCGTGGCTCTTCGTACATTCCAATAATATCGTTTGGAGTTATATCATCTGATAATATATTACCTGACGGAAGCCATTCCTCTACCTCAGTAAGACAACCGTTGTGAACAATTCCAACAAGTTTTTTAATTTTAGAATTTTCTTCTATTGTAAATTTTACATACCCTTTTTGGTGGTCTCTGGTTAATATAGGTTCACCAGCTAACGCCTTTTCTAAATCAAACTCTTTCATTTTTAATCCTTAATTTTCAATCTGTTAAATGATGTCTCCGACATTAATGTCGGTAACATGCAATAAAAAACCGCATTTCTGCGGTTTATACTTCCAGTACAACTCTTTTCGACAAGATCCGATTACCAAACTCACCATTCTTTTTTCTCATCCTGCCACTGCATGAAAATACGATTTCATTTTCTGCGATATAGTCGATCACAATTGATAAAACTTTAATTTCAGACTTATTAACATTATCAGCAGTCACAACATCATTAATTTGAATCGGACATAATTCTTTCGCATAGTCCCATTTCATGGTTACGAACTCTCTTTGAGCTTCAATAATTTCTTTTTGCTTTCTAATCAGCGCTTTTGCTTTTTCCAATTTTGCTTTGTTCATAGTTTAACCTCATTCTGTTTTTGGTGGTGGTGGAAGTGGTCGCCAGTGAGTTACGTCATTAAAAATAATCTCACAACCAGTCCCGTCGTAGTTATCAGCCCACCATTCTGTTCCTTCTGAATTGTTGCAATACGCAATACGAATGTAATTTTGCTCCCACTTATAATCTTGCTGACACACTAAAACTCTATCGAATTTCTTCGGTAGCTTATCTTTTACACTAATCCAGCCATCATCTTGCGGAAATTCAACAATCTCTGGCAGTTCAACCATACAATCAATTCCGTCATACAGACCAGACTGCTTTTCCTCTTCGCTTAGCTCTCTAGTTTTAGATTCAGCTTTTCCTAGAATCACACCATATATCGCATGACTTATGCGATCTTCATAACATTGCATATCTTGACCATCAGCACATTGTTGATGAAATTCTTCAGCGCAGTTCAAGCACGCTTTTTTAGCTTCTTCTTCAGTTTTGTGAAATGAAATACTGTTTTCATCATAAATATTTACTGCGAAGTATTTGTTTTCTTTTTCTGTCATAACCCACCTCAATTGTAGCTAGTAAGTAATAGTGTTGGAAAACTTACGCAATCTTCTAATAATTGCTTGCTGACTCGCAACATACTGCCAGTGTTTGACTTTTTTTCTCAAAGAGAAAGGATTAAATCCGAGTTTCATACCATTACCCCTACAAAACGCATAACATTGTTAAATGGTTGTGATTTAAAAGCGTTATCCCATAATTCACCGAATTTGATTTTTAATAATTCTTCGGCAGTTTTCGGTGAGAATTGCGGCACTTTCAAGCATTCGATCGGCTCGATGTTTTTAAGTTGTGGCCACGTGCTCTTGTCTGAAAGAAGCGC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>CP015562|524594:571997|532582_533434_-|AUK33835.1|DBSCAN-SWA MTANLPENIQTALTDRKIDTATWTTLQNSVFPGAKDESILLAIDYCKARKLDILKKPCHIVPMSVKDAKTGQSQWRDVIMPGIYEQRITAFRTGQMAGQDEPIFGETISHLGIEAPEWCKVTVYRFIGGERCAFSHTEYFSEACSTTKDGRINSMWTKRPRGQLAKCAEAGALRKAFPDELGGVITADEVIEEQAPQAEQHKTTVIDTVGIELATPEQVHQLQQLIQLTNTNTLKAFAYYGVNTLEQLPKEKAEHFIRTLNQRLDEQSANVTENYVDEEIPLD >CP015562|524594:571997|539465_539729_-|AUK33846.1|DBSCAN-SWA MSKITKLRDKLYKTPPPTDFTWENLKTLLTSLGFNEVQGNGSRVKFIHDVLDFPIIIHKPHPQNTLKQYSIKQIKEALDELKTLLGE >CP015562|524594:571997|547073_547604_+|AUK33858.1|DBSCAN-SWA MKHVKKITACSVAMIIAVVMSDHSTEIRTSERGLEIIGNAEGCAREPYRCPADVLTVGIGSTELSGLPIERKRYSDEEIAKRWVNDIKVAEKCVNNWASGKNLPQSTFEAAVSITFNVGCSKLKYSTLFKHAKNGDIQAMCDQFPRWKYANGKVLRGLEIRRQKERELCLADLHKS >CP015562|524594:571997|535548_536184_-|AUK33840.1|DBSCAN-SWA 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>CP015562|524594:571997|536645_537179_-|AUK33841.1|DBSCAN-SWA MNLPDDYFLDTDDEMLEYLEKQALQSYDDVKKSNENNREKAYRLLNHLLLGIGSISLLLINSIEKIHPIIIVNAILLMAGWTLSAFILTHYVLLSKIRQMGTNIPQNLYNESFKNSQDKNKLGILRRYELHNINQAILYLLNTNAIYRKYTDIAIMIAIGLPILLMVISSSLLHYLP |
64 | Mannheimia_phage(51.06%) | tRNA,transposase,integrase,terminase,tail | attL 526156:526201|attR 572419:572464 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1593354 : 1602712
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP015562|1593354:1602712|DBSCAN-SWA GATGAACAACAAGATAAAAATCTATTTAGTTGGAGGTGCTGTGCGAGATCAGCTCCTCAATCTTGTTGTGAAAGATCGTGATTGGGTCGTAGTTGGTGCAACGCCAGATGATTTACTATCACAAGGCTATCAACAAGTCGGCAAAGACTTTCCTGTTTTTCTGCATCCCCAAACAAAAGAAGAATATGCTCTCGCTAGAACAGAACGTAAAGCGGGTAGCGGCTATACTGGCTTCATTTGTGATTTTTCACCTACAATTTCTTTGGAACAAGATTTAAGTCGACGTGATTTAACTATCAATGCGCTCGCTCAAGATCTTGACGGAAAAATCTATGATTTTTATGGTGGTCTTACGGATTTAAAACAACGTCTTTTACGCCACGTTTCCCCCGCCTTTGCAGAAGATCCGCTACGCGTATTACGTGTGGCACGTTTTGCTGCTCGCTACCATACTCTTGGCTTCACTATTGCATCTGAAACCTGCGAATTGATGCAACAGTTATCACAAAGTGGTGAGCTGTCAAACCTAACCGCAGAACGTGTCTGGTTAGAAACAGAAAAAGCCTTATTAGAACCGCATCCTGAAGTGTATTTCCAAACGCTACAAGAGGTGGGCGCATTACAAGTACTGTTTCCTGAATTAGCTGCATTACAGGGCGTCCCCAATCCCGCGAAATACCATCCAGAAATAGATACGTTTGTGCATACTATGCTGGTCCTACAACAAGCAGTCTTGTTGACAGAAAACACGGACAGTGACAAAAGTGCGGTACGTTTTGCTGCAATTTGTCATGATTTAGGAAAAGCCTTAACACCAAAAGAAATATTGCCACATCATTATGGACATGAAAAAGCTGGTGTCATGCCGACAAGACGCTTATGTCAGCGCTTTAAATTACCTCACGCAATTCAAGATTTTGCAGAACTTTGTTGTGAATATCATTCGCACATACACAAAGCCTTTGAATTACGTGCGGAGACAATATTGAAATTATTCAATCGTCTAGATGTCTGGCGTAAGCCGGAACGTTTTAAAGCACTTTTGTTAGTCTGTATTGCAGACACGCGTGGTAGGACCGGATTTGAACAAGTTGACTATCCACAACGTGAATTTCTCTGGCAACTTTATCAAAGTGCTCTGCAGGTCAACGTGCAAGACATCATCCAACAAGGTTTCCAGCAGCAAGCCATTCGTGATGAACTCAATCGCCGTCGTATAATCGCGATTAAACAGACACGCGCGGAAATCCTCCCGCGCTTTACTAATCCGTGTTAAGCTCGTAAAATAATCACAATTTTGAGTACTTTTATTGGTTATGAAAAAACAACATTTTCTTTTGCCTATCATTGCAAGTTTCTTTTTATTTGCTTGTACCCTGGATACAGAACGTCCAACGGATGTGAAATATATCAGTCACACCGATCCCACGTGGCAACAACATTTATCTCAACTTAAGAAGATTCGCGATTACACTAACCAAGGTCAGTTAGGTTATATCAGTCAGAAAGAACGATTTTCTACTCGTTTTGACTGGCAATACCAAAATCCAACCAACTACCGTCTAACCTTGTCTTCCACACTGAGCCCAACAACCCTATCTATTGAAGTACGTCATAATGTTATGCACCTGTCTGATAATAAAGGACCTCTCCGCTCAGCACAGGATGCCAAGCGGTTACTGAAAGAGATTGTTGGGATGGATTTACCGCTTGACCAATTCGCCCTTTGGTTAAAAGGACAGCCTGATGAGAGTCGGGAATATCGAGTCGCTGAAAATCACTTACTCGCCCACTTTAGCTATCCTATCGATAATCAACAATGGACAGCGGATTACTTAAGCTATCATCAACTTCCACTTCCTTTACCGAAGGATATTTTGTTGAAGACAGAAGGGCAAACTTTAAAGATTCGTATCGATAACTGGACTTATTAATGCAACATTATCATTTTTCTCACTCACTTTTAGCACAACAAGAAAAACCATATCGTTTCCCTTGTCCGGCTAAACTTAACTTATTTCTCTACATTAATGGGAAACGTCAAGATGGTTATCACGAACTACAAACCCTTTTTCAATTTGTTGATTTTGGTGATTGGTTAGATATTGAGGTTCGCGAAGATAACGAAATCTGCCTAACGCCAGAACTCCCCTCACTAAAAAATGAAGATAATTTAGTCTATCGCGCAGCAAAATTACTGCAACAAAAAACCAATTGTGCTTTAGGCGCCAATCTGACACTTGATAAGATTCTACCGATGGGAAGTGGGCTCGGGGGAGGCTCGTCTAATGCGGCAACAGCATTAGTCGCATTAAATTACCTGTGGAATACGCAACTCAGCACAAAACAACTTGCTAAACTAGGATTAATGCTCGGTGCAGACGTACCAATTTTTGTCCATGGTCACGCGGCATTTGCTGAAGGAGTAGGTGAAAAAATTACTTATTGTGAGCCAAAAGAGAAATGGTATGTGGTTTTAAAGCCAAATGTGTCTATATCAACCGCGACCGTCTTTTCTGATCCAGATTTAATTCGTAATACCCCTAAGCAATCTCTGGAGCAACTCCTCAATCAAAAATATACAAACGATTGTGAAAAAGTTGTGTTAAATCATTATCCAGAGGTTGAAGAAATACTCCACAGATTGTTACAATATGCGCCATCAAGATTAACAGGCACCGGCGCTTGTGTATTTGCCGAATTTAATGACGAAGAAAGTGCACAACTCGCATTTCAAACAATACCCAAAAACTATTTTGGTTTTGTCGCACAAGGATTAAATAAATCACCTTTACATAATATGCTAGCGAAAATCAGCTAGCTCGATAATAACGAATTTACTCAACCATTTTTATTTCTTTACAATCTAAACCTCGAGGTTCAATTAACAATGCCTGATATAAAACTCTTTACTGGTAATGCAACACCAGAACTAGCAAAACGAATTTCTGAACGTTTATATCTCTCATTAGGTGATGCGACTGTTGGTCGTTTCAGTGATGGAGAAATTCAAGTTCAGATCAACGAAAACGTACGTGGTAGTGATGTGTTCATTATTCAATCTACTTGTGCCCCAACAAACGATAACCTAATGGAGTTGATTGTCATGGTTGATGCGTTACGTCGAGCATCTGCTGGTCGTATTACCGCGGTAATTCCTTATTTTGGTTATGCACGCCAAGATCGTCGTGTCCGCTCTGCTCGTGTACCGATTACAGCAAAAGTCGTGGCAGACTTCCTTTCTAGTGTAGGTGTCGATCGCGTGTTAACTTGTGATTTACACGCGGAACAAATCCAAGGTTTTTTTGATGTGCCTGTTGATAACGTCTTTGGTTCACCTGTATTAGTGCATGATATGTTAAAGAAAATCGACATGCAAAATCCGATTGTCGTTTCACCAGATATTGGAGGCGTCGTACGTGCCCGCGCTATCGCAAAATTACTGAATGATACCGATATGGCAATTATTGATAAACGTCGTCCACGTGCCAATGTAGCACAAGTCATGCATATTATCGGGGATGTTGCAGGTCGTGATTGTATTCTTGTGGATGATATGATTGATACTGGTGGGACATTATGTAAAGCGGCTGAAGCCTTAAAAGAACGCGGGGCTAAACGTGTTTTTGCCTATGCGACTCACGCAGTATTCTCTGGCTCGGCTGCGAAAAATCTTGCCAGTGATGCATTAGATGAGGTGGTAGTAACAGACACGATCCCCCTTTCACCAGAAATTAAAGCATTAAACAAAGTCCGCGTATTAACCCTTTCAGGTATGTTGGCTGAAGCTATTCGTCGTATCAGTAACGAAGAATCAATTTCTGCAATGTTCACCTAGTCAAATGACAAAAAAAGTGCGGTTAAAAATATTGAATTTTTAACCGCACTTTTTTATCTCGATAAGCGTCGTCTTTTATAGTCTGAGCTGCCGCTCAATTTCTTTCGCTTTCACTAAGAATTGTTTACGCTCAGCAGTTCCCATACCACTACTTGTTCCCGGTAATTTCACAGTCAATGGATTAACCGCGCGACCATTAATATGAAATTCATAATGTAAATGCGGTCCTGTCGAACGCCCTGTATTTCCCGAAAGAGCAATACGTTGACCACGTTTAACATTTTGCCCTGCTTTGACTAGAGCACGGCTTAAGTGCATATAAACGGTTTGATATTCACGCCCATGTCGTACCACAATATAACGTCCTGCGCCATTTGCTTGATACGCGACTTTTTCCACAATACCATCCGCCGGTGCAATGACCGGTGTACCAACGGGCATAGCAAAATCCACGCCTTTATGTGGTGCAATACGCCCAGTCACAGGGTGGCGTCGATAGGGATTAAAATGAGAAGAAACGCGAGCCTGACGTTGTAAAGGATAACGAGCAAAACCTTTGCCTAGCGTTTCGCCTTGGCGATTATAATAACGCCCATTACTCGCTTGAATCGCATAATAACTTTTGCCAGCTGAAATAATATGGATTCCATCCACATTACCTTGTCCCGTCAGCTTCCCTTCAATATATTCACGTGTCACTAATACCGCAAATTTATCGCCTTTTTTTAGCCGTTTTAAATTAATTTGCCATTGTAATGCATTCGCAAGTTGATTAATTTGGCGGATATCTAAACCTAATGTTCTTAATGCGGTATTAAAAGAACCGTCAATTCTGCCTTTTAACACCTCTTTTTTCCAAACACTTTGTTTCTTTAAAATTTCACGCTGATATTGACCATCTGCTGTTTTTTCGTAGATTTTTTCTTCTCTCTCTGAAACCAACCAATTAAGGTATTCGAGTTCGCCTTGGTTATCTAAGATCCAATAAAATTGCTGACCCGGCTTTAAGTTTTTAAATTCAGGATAGGCTTTAATTAAGCGCTCGCTTACACTGGCATCTAAGCCAGACAACTCTAAAACATCTTTTAAGGAATCCCCTTTTACCACCGTGTGGCTGAACTGATTTTTAATCCGCATTGCCTGATCCATAACATCAAACAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP015562|1593354:1602712|1600716_1601697_-|AUK34711.1|DBSCAN-SWA MQELERQAPLLDAVNLKKYYPVKKGILSKPKLVKAVDGVSFTLERGKTLAIVGESGCGKSTLGRMLTMIEAPTEGELFYKGQNFLENDTATQKLRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGTILEEPLLINTDLNAKERKQQVLEMMEKVGLKPEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLRPDIVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQEEMGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCVEQGETKAIFNHPRHPYTQALLSATPRLEAEHRRERIKLTGELPSPLSPPKGCAFHARCRFAMEKCALEKPALKQYEDGSKIACFMLD >CP015562|1593354:1602712|1593354_1594629_+|AUK34704.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNNKIKIYLVGGAVRDQLLNLVVKDRDWVVVGATPDDLLSQGYQQVGKDFPVFLHPQTKEEYALARTERKAGSGYTGFICDFSPTISLEQDLSRRDLTINALAQDLDGKIYDFYGGLTDLKQRLLRHVSPAFAEDPLRVLRVARFAARYHTLGFTIASETCELMQQLSQSGELSNLTAERVWLETEKALLEPHPEVYFQTLQEVGALQVLFPELAALQGVPNPAKYHPEIDTFVHTMLVLQQAVLLTENTDSDKSAVRFAAICHDLGKALTPKEILPHHYGHEKAGVMPTRRLCQRFKLPHAIQDFAELCCEYHSHIHKAFELRAETILKLFNRLDVWRKPERFKALLLVCIADTRGRTGFEQVDYPQREFLWQLYQSALQVNVQDIIQQGFQQQAIRDELNRRRIIAIKQTRAEILPRFTNPC >CP015562|1593354:1602712|1594669_1595287_+|AUK34705.1|DBSCAN-SWA MKKQHFLLPIIASFFLFACTLDTERPTDVKYISHTDPTWQQHLSQLKKIRDYTNQGQLGYISQKERFSTRFDWQYQNPTNYRLTLSSTLSPTTLSIEVRHNVMHLSDNKGPLRSAQDAKRLLKEIVGMDLPLDQFALWLKGQPDESREYRVAENHLLAHFSYPIDNQQWTADYLSYHQLPLPLPKDILLKTEGQTLKIRIDNWTY >CP015562|1593354:1602712|1597266_1598820_-|AUK34708.1|DBSCAN-SWA MQIKIAIFFSIILFIVLVVSLGKKEEGQDSSADSQTQTETQIEKQPALSTATVESPSSVQADSTLSPPSSAESVEKQAITEHHTESSAVSMDEKNSDTQVDASSQETTAKPAENTLDATSFYDDLEAKDDEVDEIKPDMLDELAAFPEPVRHALSDLFDVMDQAMRIKNQFSHTVVKGDSLKDVLELSGLDASVSERLIKAYPEFKNLKPGQQFYWILDNQGELEYLNWLVSEREEKIYEKTADGQYQREILKKQSVWKKEVLKGRIDGSFNTALRTLGLDIRQINQLANALQWQINLKRLKKGDKFAVLVTREYIEGKLTGQGNVDGIHIISAGKSYYAIQASNGRYYNRQGETLGKGFARYPLQRQARVSSHFNPYRRHPVTGRIAPHKGVDFAMPVGTPVIAPADGIVEKVAYQANGAGRYIVVRHGREYQTVYMHLSRALVKAGQNVKRGQRIALSGNTGRSTGPHLHYEFHINGRAVNPLTVKLPGTSSGMGTAERKQFLVKAKEIERQLRL >CP015562|1593354:1602712|1595286_1596174_+|AUK34706.1|DBSCAN-SWA MQHYHFSHSLLAQQEKPYRFPCPAKLNLFLYINGKRQDGYHELQTLFQFVDFGDWLDIEVREDNEICLTPELPSLKNEDNLVYRAAKLLQQKTNCALGANLTLDKILPMGSGLGGGSSNAATALVALNYLWNTQLSTKQLAKLGLMLGADVPIFVHGHAAFAEGVGEKITYCEPKEKWYVVLKPNVSISTATVFSDPDLIRNTPKQSLEQLLNQKYTNDCEKVVLNHYPEVEEILHRLLQYAPSRLTGTGACVFAEFNDEESAQLAFQTIPKNYFGFVAQGLNKSPLHNMLAKIS >CP015562|1593354:1602712|1596243_1597191_+|AUK34707.1|DBSCAN-SWA MPDIKLFTGNATPELAKRISERLYLSLGDATVGRFSDGEIQVQINENVRGSDVFIIQSTCAPTNDNLMELIVMVDALRRASAGRITAVIPYFGYARQDRRVRSARVPITAKVVADFLSSVGVDRVLTCDLHAEQIQGFFDVPVDNVFGSPVLVHDMLKKIDMQNPIVVSPDIGGVVRARAIAKLLNDTDMAIIDKRRPRANVAQVMHIIGDVAGRDCILVDDMIDTGGTLCKAAEALKERGAKRVFAYATHAVFSGSAAKNLASDALDEVVVTDTIPLSPEIKALNKVRVLTLSGMLAEAIRRISNEESISAMFT >CP015562|1593354:1602712|1599054_1599846_+|AUK34709.1|DBSCAN-SWA MHIHSIKLPLVELKNINVVFEQKKALQNINLTLYPNSIITIVGPNGGGKSTLLKVLLKLLPPTSGQVIYHKNLRIGYVPQKIHLDHSLPITVERFLSLKKGISRQAIQDALSLLSISHLHKNSLQKLSGGEMQRVLLARAILNKPNLLVLDEPTQGVDINGQAELYQLIQQTQQQLNCAILMVSHDLNIVMADTNEVLCINQHICCAGTPETVSNDPTFIHFFGDQFAKNVALYTHKHNHKHDIHGDICCTSDFQSQQCTHKE >CP015562|1593354:1602712|1599854_1600640_+|AUK34710.1|DBSCAN-SWA MFEILFPAWLTGMLLSLITAPLGAFVVWRKMAYFGDTLAHSALLGVALGIFLDINPYLSIVLLTLILAILMVWLEGKTQFSVDTLLGIIAHSCLSLGVVTVGLLQNVRVDLMAYLFGDLLAMNYEDLVVIGIGVVFVLVTLLYFWHPLLSTTVSPELAQVEGVNVQKMRFILMILTALTIALSMKFVGALIITSLLIIPSATARRFAKTPESMVFIAILISMLSISLGLLLSAYYDTAAGPSVVICASLLFLLSLMKKEHN >CP015562|1593354:1602712|1601713_1602712_-|AUK34712.1|DBSCAN-SWA MALLNVENLSVHFGDENAPFKAVDRLSYTVNEGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDYPGRVQAEQLLFNQSDLLALTEKQKQKIVGADVSMIFQDAMTSLNPSYTVGYQIMEALKVHQGGAKAWRKERAIELLTLVGIPDPRSRLDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACNPKLLIADEPTTALDVTIQAQIIDLLLELQRKENMALILITHDLALVAEAAHRIIVMYAGQVVEEGRAEEIFKCPRHPYTQALLRALPEFAEGKSRLQSLPGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATDRCREQEPETRLVNGHRVKCHTPLNAQGMPSYTEFAVS |
9 | Sinorhizobium_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1953735 : 2011673
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP015562|1953735:2011673|DBSCAN-SWA 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72 | Mannheimia_phage(37.5%) | tail,holin,transposase,coat,integrase,terminase,head | attL 1959615:1959665|attR 2012125:2012175 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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