Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP015572 | Pasteurella multocida strain USDA-ARS-USMARC-60381 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas3,cas14j,DEDDh,DinG,cas3-cas2,cas1,cas6f,cas7f,cas5f,cas8f | 0 | 0 | 3 | 0 |
1. CP015572
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
338131 : 396033
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP015572|338131:396033|DBSCAN-SWA ACTAATCAGGTGTTTGTTGTTGCTCGATATATTGGCGAATAATCGATATTGGTGCACCACCACAACTACCAGCAAAGTAAGACGGTGACCAAAGTTGATTTCCCCATAATTTTTTGCGAATGCTCGGATAGTTTTTCTTTCTAATCATTCGGCTCGAAACGCCTTTTAAACTGTTTACAAGATGAGAAATAGCGACTTTAGGCGGATATTCCACAAGTAGATGAACGTGATCATCTTCACCATCAAATTCCACTAATGTGGCTTCAAAATCAGCACAAATCGTTGCAAAAATTGAGCGTAAGTCGTTCAAAATTGCTTGAGTAAAAACTTCCCTGCGATATTTAGTCACGAAAACTAAATGAACGTGTAAGTTAAAAACAACGTGGCGACCACGTCTAATCTCTGTTTCTTTTTTCATAGGCCAAGTGTAGAATAAGCACAATTTTTGTATTCTAATTCGTGCAATGTTACTACGTAAAGCCTTTAAATTTGAAATCAGACCAAATGGGGAACAAGTTCGCAAAATGAAGCAGTTTTGCGGCTGTTCTCGCTTTGTGTTTAACAAGGCATTGGCGTGGCAAAATGAGCAGTACGAACAAGATAACCATCACAAATTCAGTTATACCAAGCTCGCCAACTTGCTTCCGCAATGGAAAAAAGAATTGGTATGGCTTAAAGATTGCCATTCACAAGTGCTTCAACAGTCGTTAAAAGACCTTGAAAGTGCGTTTAAAAACTTCTTTCAAAAGCGTGCGGATTTGCCCAAATTCAAGAAAAAAGGCGTAAAAGAGAGTTTCCGTTTTCCGCAAGGTTGCAAAATCGAGCAGAAAAACGACCGCTTGTATCTGCCGAAAATCGGTTGGGTGCGTTATCGCAACAGTCGTGAAATTGTTGGGGAAGTAAAAAATGTCACCGTTTCAATGAAATGCGGACGCTTTTTTGTGAGCATTCAAACGGAATTTGAACAGGAAATTCCCACGCATAAAGGCGGAGAAATCGGCATTGATATGGGCATTGCTCGTTTTGCAACCCTTTCCAATGGCGAATTTTTTGAGCCGTTAAATGCGTTTAAAACCCACAAAGGAAAATTGGCAAAACTGCAAAAACAGCTAAAAAATAAAGTGAAGTTCAGTAAAAACTGGCAAAAACTGAAAGATAAAATCGGCAAGTTACATCACAAAATCGCCAACTGCCGAAAAGATTTCCTGCATAAAATCTCAACGCAAATCAGCAAAAACCACGCGATGATCTATGTTGAAGATTTGCAAGTGGCGAATATGTCCAAATCAGCCAAAGGCACAGCGGAAGTACACGGCAAAAATGTGAAACAGAAATCAGGCTTAAACCGAGTGATATTAGACCAGTCTTGGTTTGAATTTAGACGACAACTGGACTACAAAACGCAATGGTTAGGCGGATTTTTGCTAGCAGTTCCTCCACAAAATACCAGTCGTACTTGCCCTTGTTGCAACCATACAGCAAAAGAAAATCGCCAAACACAGGAAAATTTTGAATGCGTAGAATGTGGCTATACGGAAAATGCCGATGTAGTGGGAGCAATGAATGTTCTTACACGTGGGCAAGCAATAGTCCAAGCATAATAAATATCAGGGTAGGACATACCCGAAGCGTCTATGAAGTGAATCTCAATAGAGATCAGCAGTAGAAACCCACCGAGAGTAGCCCACAGCTTGCTGTGGGAGCTAGTAGGAATCCCCTGCCTTTAGGCAGGGGAGGATGTCAATAGTCGTTTTTTACTTGTCCACCAGCAAACATATACGGATTCACAGACTGTCCGTCATGCTGGTAATCTTCTGGTTGTGGCTGCACTAACTGATTTAACACCCAGTCATGCGCACTTTCGCCACGTTCTGGAACTGAGTTCAAGTAAAACGAATTAAAAGAAAGTGCTTTTTTATTTCCATCTTTCGCTTTTTTAGATACATAGCTCGCTGTAGTCGAAGTCACGGAGCTGTTGTTGTAGTCAACGGTAAATGACACTAGCTCGTGATAGCTTGCATTTGCGCCAGTTTGTGAATCTTCAATTGTTTTTTCGATGTATTTCATTGTGTTTTCCTTTTAGTAAAAATAAAGCCCTAGAAATAGGGCTTGAATTATGAGAAAGAGATTGTGCCAGTATCTGATAGGGCGTAGCTTATAATGAGTAAGTTTTTGTCCGGATCGACTGGTGTGACATACTCATTGTCCTGTAAGAACGTACCAACTCTTTCATATTTTTTAGTAAAAGCTTGATTTGCTTTTAATACAAAAGATAGTTCGTCGCCTATTTTTACATATCGATCGACGGGATATGGATCAATTCTGATCGTCGCCGCGTAAATTGGAACGTAAACAGTACCATATCGAGCTCTTTCATCATCATGTTGGTTAACGTAATATACGTATTCAACACTACGTGTCCCTGTCTTAGTCATTGTTGCAACGATTTGCTCAATAACACCACCGCCAATCAGTTTCGTTACTTCCAGCTCACCTTTAAATCGACCAGTCGCACCGTCTAATCTGCCACTGAATACGCCATTTTTGGCTGTTAAATTCCCAGTGCTATCAACAGTAAAGTTTCCATTTCCGATGTCGATACTTCCGCCAGTAAACGAACCGCCATTCACAACACCGCCATTAATATTTGGCGCTGTGATTGTGCTATTCGCTTGAATCTTGTTACCAGTGATTGAATCATCAACGATTAAATCGCCAGCCAAAGCAACTTGTGAACGTCCGTTGTGTGTTGAAATGACAAATGGAGTTTTTAATGCGTTACTGTTCGGATCTGCGATAGCGAACTTATTAGCAAAAATGATAACTTGTGATTCAGCAGTTTGACCGTCCGCACCAAGTGCGATGCCGGCAATCGCTTTACGACCGCCAGCGACAGTTTCAGTTTTCAACGTGTACATTGATTGCACTTTGCCGTCAAGACTAGAGATTGCTTGACTTGACGATGTTATCAATGCTTTTGCGCCAACGATTTCCGCTTTGACTGTGCTAACTTCTTGAGAGAATGCTTTCTCTTTCTCAGCCGTCGTATTTTTAAGCGAAGAGATACTCGCATTTACTTCTGAAAGAGTGCTGTCAACATCTTCGGGGGCTGGCGTCCAGTCCGTTGCGATGTTGCCGAGTTCAAGTTTAGGTTTCTTAATATTGAAAACTGTACCATCTTTTTCATACGTTACAATCTCAACACTTAATCGCGTTTGACCTTCCGATTTTTGATAGTCAAAGACTACTGAGTAACGCTTGTAGTCGCGTGAATCGACTGTTACATAAGCCGATATGTCAGAATGAGTACTGCCGGTATATCGTCTTAATCTAAGATTAAGCTTGCCACTTTTGTTCGATAAAGCGTCAAACGAAAGCACGACTTTACCGTCCTTGACTTCCACCTGATCTTCAATGAGCACTTGACTTAGTGCGACCAATCGACCGTTGGCAGTCAGTATCGCAATGCCGTGATCCGTATCAAGCGTTACACCGCTATTTTTATTCCAACTGTTCAGCGTTCTAGTCTGTTTCAGTAGATTTCTGCCACCAATCTGCAACTGATTAAACTTAGCTTCAAGCGTTTCACTCTTGACTGCAAGCGACTTGTTTTCATTGCTAACCGTTTGCTCAAGTGCTGTGATTTTGGATGTTAAATCTAACTTAGTTGCATTGACTTCATCAGTCCATTCTGACTTTAACTCTTTTCTCGCAAGTGACGCCACTTCATCTTTGCTAGCTTTCGTTTCTTTTAAGTCAGAAATGCCACTAGTATTTTGCGCCACTTTAGAATCGAGCGTTTCTAGTTTTGTAGAGAAAGATTTGTCTTTTTCGCTAGCCGTTTTTTGAATTAGCTGTATTTCACTTTCGCTCAATCCAACTCTAGCAGTTAGACTGTCTAGCTTGTCAGCAGTAGATTTATTCACAGTCGCTTGTGATTGCTTGTGTTGAATAATATCCGCGCTTACTTCCGAGATAGCCACGTCAACATCTTCGGGGGCTGGCGTCCAGTCCGTTGCGATGTTGCCGAGCTCGAGTTTAGGTTTCTTAATATTGAAAACTGTACCATCTTTTTCATACGTTACAATCTCAACACTTAATCGCGTTTGACCTTCCGATTTTTGATAGTCAAAGACTACTGAGTAACGCTTGTAGTCGCGTGAATCGACTGTTACATAAGCCGATATGTCAGAATGAGTACTGCCGGTATATCGTCTTAATCTAAGATTAAGCTTGCCACTTTTGTTCGATAAAGCGTCAAACGAAAGCACGACTTTACCGTCCTTGACTTCCACCTGATCTTCAATGAGCACTTGACTTAGTGCGACCAATCGACCGTTGGCAGTCAGTATCGCAATGCCGTGATCCGTATCAAGCGTTACACCGCTATTTTTATTCCAACTGTTCAGCGTTCTAGTCTGTTTCAGTAGATTTCTGCCACCAATCTGCAACTGATTAAACTTAGCTTCAAGCGTTTCACTCTTGACTGCAAGCGACTTGTTTTCATTGCTAACCGTTTGCTCAAGTGCTGTGATTTTGGATGTTAAATCTAACTTAGTTGCATTGACTTCATCAGTCCATTCTGACTTTAACTCTTTTCTCGCAAGTGACGCCACTTCATCTTTGCTAGCTTTCGTTTCTTTTAAGTCAGAAATGCCACTAGTATTTTGCGCCACTTTAGAATCGAGCGTTTCTAGTTTTGTAGAGAAAGATTTGTCTTTTTCGCTAGCCGTTTTTTGAATTAGCTGTATTTCACTTTCGCTCAATCCAACTCTAGCAGTTAGACTGTCTAGCTTGTCAGCAGTAGATTTATTCACAGTCGCTTGTGATTGCTTGTGTTGAATAATATCCGCGCTTACTTCCGAGATAGCCACGTCAACATCTTCGGGGGCTGGCGTCCAGTCCGTTGCGATGTTGCCGAGTTCAAGTTTAGGTTTCTTAATATTGAAAACTGTACCATCTTTTTCATACGTTACAATCTCAACACTTAATCGCGTTTG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>CP015572|338131:396033|387677_387899_+|AUK55329.1|DBSCAN-SWA MSNINSFRSLSIDTIDEINKLTEQAKSLIQIVLNDGNDLSCGFASSQQVITGTLWAALDLVSQTDHHISNAKQ >CP015572|338131:396033|359032_360634_-|AUK57015.1|head|DBSCAN-SWA MSIDEQIEHLLTDHKILLFRYDASLRREIVKRLNKLQKQMLSRISAVGLENASKRDVAKLLGEIKELIKSYYVEMYSFTDGELQSLLPIEALAIMEIYNQSVKFDLFNKVPDYKLKANKTAQIVAGSPLSDWFDKQGGDLSFKFSGLIRQGILDGKATSRIITEVNELMVHSRRSAETLVRTAVMKVNDEAHKLLRDENMDIIKGEQHISTLDTRTSEVCRARDGLVWDLNQKPVGDHKVPYQRPPLHPNCRSTLRLIMKSWRELGFDVDEIPESTRASMDGQVKANITYEDWLKNKTKAQQDEILGKGKADLWRNGVITFRDMLDQSGRPLTLKELREQFKLGGVESAVNAVYKRASELEPAFTNDMLSIVKQSNGYLDGLDYRLKSIDSITRKVQTDIIKTGITEGESLSKITDIVRYTTIFESKNFTQNYFRMQEILTEKGYNVTRVKNTWRKGAVYKGINTIVEKDGVKFEMQYHTRQSFELKNGKLHELYEKARILNISSEELKRLNEKMKDLSNQLETPVNIGKIRN >CP015572|338131:396033|370035_370494_-|AUK55301.1|DBSCAN-SWA MEIKNQFLLRSEQVRLNAIEFIKTLPLPKIVKDEKGNEIETNPLVIDIKPRTRNLEQNAKFHAMCQDVANQLEFMGRKLTMEQWKVLFISGHAMATNEKADVVPGLEGEFVNIRESSAKMSVKRMASLIEYVTAYGISHGVRFNDRYGFWGK |
72 | Mannheimia_phage(37.5%) | integrase,holin,coat,terminase,head,transposase,tail | attL 337630:337680|attR 390104:390154 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
747052 : 756410
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP015572|747052:756410|DBSCAN-SWA CATGGCGTTATTAAATGTAGAAAATCTTTCGGTGCATTTTGGTGATGAAAATGCCCCTTTTAAAGCGGTGGATCGCCTCAGTTACACGGTCAATGAAGGTGAAGTATTAGGTATTGTTGGCGAATCAGGTTCAGGAAAATCGGTGAGCTCACTCGCGATTATGGGCCTAATTGATTATCCAGGGCGTGTACAAGCGGAACAATTGCTGTTTAATCAAAGTGATTTACTTGCCTTGACTGAAAAACAAAAGCAGAAAATTGTGGGAGCCGATGTGTCCATGATTTTCCAAGATGCGATGACCAGTTTAAACCCAAGTTATACGGTGGGTTATCAAATTATGGAAGCACTCAAAGTTCATCAAGGTGGGGCTAAAGCATGGCGTAAAGAACGTGCTATCGAATTATTAACCTTAGTGGGCATTCCTGATCCGCGTTCGCGTTTAGATGTGTATCCGCATCAATTATCGGGGGGTATGAGTCAACGTGTGATGATTGCGATGGCGATTGCCTGTAATCCGAAATTATTAATTGCAGATGAACCGACAACTGCGTTAGACGTGACGATTCAAGCACAGATTATTGATTTATTGCTGGAATTACAGCGTAAAGAAAATATGGCGTTAATCCTGATCACCCATGATCTTGCCTTAGTCGCGGAAGCAGCCCACCGCATTATTGTGATGTATGCAGGGCAAGTGGTTGAAGAAGGACGAGCGGAGGAAATTTTTAAATGTCCACGCCATCCATATACTCAAGCGCTATTACGTGCGTTACCAGAATTTGCAGAAGGAAAATCACGTTTACAATCTTTACCGGGGGTTGTGCCGGGGAAATATGATCGCCCAACAGGCTGTTTATTAAATCCACGTTGCCCATACGCCACAGATCGTTGTCGTGAGCAAGAACCAGAAACCCGTTTGGTGAATGGACATCGCGTCAAATGTCATACGCCGTTGAATGCGCAAGGTATGCCAAGTTATACAGAATTTGCAGTGTCATAATAAGAAAGAGAACAATATGCAAGAACTTGAGAGACAAGCACCTTTGTTGGATGCAGTGAATTTGAAAAAATACTATCCCGTTAAAAAAGGGATATTGAGTAAGCCGAAGTTAGTGAAAGCGGTAGATGGGGTTTCATTTACCTTAGAGCGCGGTAAAACATTGGCGATCGTGGGGGAGTCAGGTTGTGGTAAATCTACACTTGGTCGCATGCTAACCATGATTGAAGCCCCAACAGAAGGTGAACTTTTCTATAAAGGACAAAACTTTTTGGAAAATGACACGGCCACACAAAAATTGCGTCGTAAGAAAATTCAAATTGTGTTTCAAAATCCTTATGCTTCTTTAAATCCACGCAAAAAAATTGGCACGATTTTAGAAGAGCCGTTGTTGATCAATACGGATTTGAATGCCAAAGAACGTAAGCAGCAAGTGTTGGAAATGATGGAAAAAGTGGGCTTAAAACCAGAGTTTTACGATCGCTATCCACACATGTTCTCAGGGGGACAACGTCAACGTATCGCGATTGCGCGTGGGTTAATGTTGCGTCCTGATATTGTGGTGGCGGATGAACCGGTTTCTGCGCTTGATGTGTCTGTCCGTGCCCAAGTATTAAACTTGATGATGGATCTGCAAGAAGAAATGGGATTATCTTATGTGTTTATTTCCCACGATCTTTCGGTGGTGGAACACATTGCCGATGAAGTGATGGTTATGTATTTAGGGCGTTGTGTTGAACAAGGTGAAACGAAGGCAATTTTTAACCATCCTCGTCATCCTTACACGCAAGCCTTACTTTCAGCTACACCGCGTTTGGAAGCTGAACATCGTCGCGAAAGAATTAAACTGACAGGTGAGTTGCCGAGTCCATTAAGTCCACCTAAAGGCTGTGCTTTCCATGCTCGTTGTCGTTTTGCTATGGAAAAATGTGCCCTCGAGAAACCAGCTTTAAAACAGTATGAGGATGGCAGCAAGATTGCCTGTTTTATGCTAGATTAATGCAAATAAAAAGCGAACTTTGGTTCGCTTTTTCATGTTCGTGAAAAAAGTGTAAATGGGACCGCTCTTTAGCGGTTTAATTATGTTCTTTTTTCATTAATGACAACAAGAATAACAAACTAGCGCAGATGACCACAGAAGGACCTGCTGCGGTATCGTAGTAAGCGGAAAGTAATAAGCCCAAACTAATTGAAAGCATACTTATAAGAATTGCAATGAACACCATACTCTCTGGGGTTTTGGCAAACCGCCTTGCCGTGGCGGAAGGAATAATCAGGAGTGAGGTGATAATTAAGGCACCAACAAATTTCATACTAAGTGCAATCGTCAGTGCGGTTAAGATCATTAAAATAAAACGCATTTTCTGCACATTTACCCCTTCAACTTGTGCAAGTTCTGGACTGACTGTGGTCGAAAGGAGCGGATGCCAGAAATACAATAATGTCACCAGCACAAATACAACACCTATACCAATCACCACTAAATCCTCATAGTTCATGGCTAATAGATCGCCAAAAAGATAAGCCATTAAATCCACGCGGACATTTTGCAATAAGCCAACGGTGACCACACCCAGCGATAAACAACTGTGCGCAATGATGCCAAGTAATGTATCCACCGAAAATTGTGTTTTCCCTTCTAGCCATACCATGAGGATGGCGAGGATTAACGTCAGCAGCACAATCGAAAGGTAAGGGTTGATATCTAGGAAAATTCCCAATGCCACTCCAAGTAATGCGGAATGAGCAAGTGTATCACCAAAGTAAGCCATTTTTCGCCAGACCACAAAAGCACCGAGTGGTGCTGTAATCAGGGAAAGCAACATACCGGTCAGCCAAGCGGGAAAAAGAATTTCAAACATGATTTATCCTATTCTTTATGAGTACATTGTTGAGATTGGAAATCTGACGTACAGCAAATATCGCCATGTATGTCATGTTTATGGTTGTGTTTATGGGTATATAGTGCGACATTTTTGGCAAATTGGTCACCAAAGAAATGAATAAACGTGGGATCATTTGAAACCGTTTCTGGTGTTCCCGCACAGCAAATATGTTGATTAATACAGAGCACTTCATTGGTATCTGCCATCACAATATTGAGATCGTGAGAAACCATGAGAATGGCACAATTTAATTGTTGCTGTGTTTGTTGAATTAACTGATAAAGTTCTGCTTGCCCATTGATATCGACGCCTTGCGTTGGTTCATCTAATACCAATAAATTTGGTTTATTCAAGATAGCGCGGGCTAAGAGTACCCGTTGCATCTCTCCACCAGATAATTTTTGTAGGCTATTTTTATGTAAGTGACTAATTGACAATAATGACAAAGCGTCTTGGATAGCTTGGCGAGAAATCCCTTTTTTGAGTGATAAAAAGCGTTCAACAGTAATCGGCAGACTATGATCTAAGTGAATTTTTTGCGGCACGTAACCAATACGTAAGTTTTTATGGTAAATAACTTGTCCCGAAGTAGGGGGAAGCAATTTGAGTAATACCTTTAATAAGGTTGATTTTCCGCCACCATTAGGACCGACAATCGTAATGATCGAATTGGGATAAAGGGTTAAATTGATATTTTGTAATGCTTTTTTCTGTTCAAAAACAACATTGATGTTTTTTAATTCAACTAAGGGTAATTTTATAGAATGAATGTGCATTATTTGCTAGACTTGACGGCTTAAAGTTGCAGTAAAAATAGCTTATTTTGATTCGTTTAACAAGTTTATCCAATGAAAATAAGTACGATGAATACAATTTGGGCATTCATATGCCTTTTTTAACATTCCGTTGAATTTTTTATTGTTTGCTTGGTCATAATTAAACGAATTGAGAAACAAAGGAATAGAAGCGTGCGGCACGTTAAATTAGCAAGAGATAGACGAAGAAGAAAATTGCAGATTAAGATCGCAATTTTTTTTAGCATTATTTTATTCATCGTTCTCGTTGTATCGTTGGGAAAAAAAGAAGAAGGGCAAGATTCAAGTGCAGATAGCCAAACACAAACAGAAACTCAAATTGAAAAGCAACCTGCCTTATCTACAGCCACGGTAGAATCGCCTTCTTCGGTACAAGCGGATAGCACCCTTTCTCCTCCCTCATCCGCGGAATCAGTAGAAAAGCAAGCGATAACAGAACATCATACTGAGTCTTCCGCTGTCAGTATGGATGAAAAAAACAGTGACACTCAAGTAGATGCATCGTCACAAGAAACGACAGCAAAACCCGCAGAAAATACACTAGATGCAACGTCTTTTTATGATGATTTAGAAGCAAAAGATGATGAGGTTGATGAAATCAAACCCGATATGCTAGATGAATTGGCAGCCTTTCCTGAACCTGTTCGTCATGCGCTGAGTGATTTGTTTGATGTTATGGATCAGGCAATGCGGATTAAAAATCAGTTCAGCCACACGGTGGTAAAAGGGGATTCCTTAAAAGATGTTTTAGAGTTGTCTGGCTTAGATGCCAGTGTAAGCGAGCGCTTAATTAAAGCCTATCCTGAATTTAAAAACTTAAAGCCGGGTCAGCAATTTTATTGGATCTTAGATAACCAAGGCGAACTCGAATACCTTAATTGGTTGGTTTCAGAGAGAGAAGAAAAAATCTACGAAAAAACAGCAGATGGTCAATATCAGCGTGAAATTTTAAAGAAACAAAGTGTTTGGAAAAAAGAGGTGTTAAAAGGCAGAATTGACGGTTCTTTTAATACCGCATTAAGAACATTAGGTTTAGATATCCGCCAAATTAATCAACTTGCGAATGCATTACAATGGCAAATTAATTTAAAACGGCTAAAAAAAGGCGATAAATTTGCGGTATTAGTGACACGTGAATATATTGAAGGGAAGCTGACGGGACAAGGTAATGTGGATGGAATCCATATTATTTCAGCTGGCAAAAGTTATTATGCGATTCAAGCGAGTAATGGGCGTTATTATAATCGCCAAGGCGAAACGCTAGGCAAAGGTTTTGCTCGTTATCCTTTACAACGTCAGGCTCGCGTTTCTTCTCATTTTAATCCCTATCGACGCCACCCTGTGACTGGGCGTATTGCACCACATAAAGGCGTGGATTTTGCTATGCCCGTTGGTACACCGGTCATTGCACCGGCGGATGGTATTGTGGAAAAAGTCGCGTATCAAGCAAATGGCGCAGGACGTTATATTGTGGTACGACATGGGCGTGAATATCAAACCGTTTATATGCACTTAAGCCGTGCTCTAGTCAAAGCAGGGCAAAATGTTAAACGTGGTCAACGTATTGCTCTTTCGGGAAATACAGGGCGTTCGACAGGACCGCATTTACATTATGAATTTCATATTAATGGTCGCGCGGTTAATCCATTGACTGTGAAATTACCGGGAACAAGTAGTGGTATGGGAACTGCTGAGCGTAAACAATTCTTAGTGAAAGCGAAAGAAATTGAGCGGCAGCTCAGACTATAAAAGACGACGCTTATCGAGATAAAAAAGTGCGGTTAAAAATTCAATATTTTTAACCGCACTTTTTTTGTCATTTGACTAGGTGAACATTGCAGAAATTGATTCTTCGTTACTGATACGACGAATAGCTTCAGCCAACATACCTGAAAGGGTTAATACGCGGACTTTGTTTAATGCTTTAATTTCTGGTGAAAGGGGGATCGTGTCTGTTACTACCACCTCATCTAATGCATCACTGGCAAGATTTTTCGCAGCCGAGCCAGAGAATACTGCGTGAGTCGCATAGGCAAAAACACGTTTAGCCCCGCGTTCTTTTAAGGCTTCAGCCGCTTTACATAATGTCCCACCAGTATCAATCATATCATCCACAAGAATACAATCACGACCTGCAACATCCCCGATAATATGCATGACTTGTGCTACATTGGCACGTGGACGACGTTTATCAATAATTGCCATATCGGTATCATTCAGTAATTTTGCGATAGCGCGGGCACGTACGACGCCTCCAATATCTGGTGAAACGACAATCGGATTTTGCATGTCGATTTTCTTTAACATATCATGCACTAATACAGGTGAACCAAAGACGTTATCAACAGGCACATCAAAAAAACCTTGGATTTGTTCCGCGTGTAAATCACAAGTTAACACGCGATCGACACCTACACTAGAAAGGAAGTCTGCCACGACTTTTGCTGTAATCGGTACACGAGCAGAGCGGACACGACGATCTTGGCGTGCATAACCAAAATAAGGAATTACCGCGGTAATACGACCAGCAGATGCTCGACGTAACGCATCAACCATGACAATCAACTCCATTAGGTTATCGTTTGTTGGGGCACAAGTAGATTGAATAATGAACACATCACTACCACGTACGTTTTCGTTGATCTGAACTTGAATTTCTCCATCACTGAAACGACCAACAGTCGCATCACCTAATGAGAGATATAAACGTTCAGAAATTCGTTTTGCTAGTTCTGGTGTTGCATTACCAGTAAAGAGTTTTATATCAGGCATTGTTAATTGAACCTCGAGGTTTAGATTGTAAAGAAATAAAAATGGTTGAGTAAATTCGTTATTATCGAGCTAGCTGATTTTCGCTAGCATATTATGTAAAGGTGATTTATTTAATCCTTGTGCGACAAAACCAAAATAGTTTTTGGGTATTGTTTGAAATGCGAGTTGTGCACTTTCTTCGTCATTAAATTCGGCAAATACACAAGCGCCGGTGCCTGTTAATCTTGATGGCGCATATTGTAACAATCTGTGGAGTATTTCTTCAACCTCTGGATAATGATTTAACACAACTTTTTCACAATCGTTTGTATATTTTTGATTGAGGAGTTGCTCCAGAGATTGCTTAGGGGTATTACGAATTAAATCTGGATCAGAAAAGACGGTCGCGGTTGATATAGACACATTTGGCTTTAAAACCACATACCATTTCTCTTTTGGCTCACAATAAGTAATTTTTTCACCTACTCCTTCAGCAAATGCCGCGTGACCATGGACAAAAATTGGTACGTCTGCACCGAGCATTAATCCTAGTTTAGCAAGTTGTTTTGTGCTGAGTTGCGTATTCCACAGGTAATTTAATGCGACTAATGCTGTTGCCGCATTAGACGAGCCTCCCCCGAGCCCACTTCCCATCGGTAGAATCTTATCAAGTGTCAGATTGGCGCCTAAAGCACAATTGGTTTTTTGTTGCAGTAATTTTGCTGCGCGATAGACTAAATTATCTTCATTTTTTAGTGAGGGGAGTTCTGGCGTTAGGCAGATTTCGTTATCTTCGCGAACCTCAATATCTAACCAATCACCAAAATCAACAAATTGAAAAAGGGTTTGTAGTTCGTGATAACCATCTTGACGTTTCCCATTAATGTAGAGAAATAAGTTAAGTTTAGCCGGACAAGGGAAACGATATGGTTTTTCTTGTTGTGCTAAAAGTGAGTGAGAAAAATGATAATGTTGCATTAATAAGTCCAGTTATCGATACGAATCTTTAAAGTTTGCCCTTCTGTCTTCAACAAAATATCCTTCGGTAAAGGAAGTGGAAGTTGATGATAGCTTAAGTAATCCGCTGTCCATTGTTGATTATCGATAGGATAGCTAAAGTGGGCGAGTAAGTGATTTTCAGCGACTCGATATTCCCGACTCTCATCAGGCTGTCCTTTTAACCAAAGGGCGAATTGGTCAAGCGGTAAATCCATCCCAACAATCTCTTTCAGTAACCGCTTGGCATCCTGTGCTGAGCGGAGAGGTCCTTTATTATCAGACAGGTGCATAACATTATGACGTACTTCAATAGATAGGGTTGTTGGGCTCAGTGTGGAAGACAAGGTTAGACGGTAGTTGGTTGGATTTTGGTATTGCCAGTCAAAACGAGTAGAAAATCGTTCTTTCTGACTGATATAACCTAACTGACCTTGGTTAGTGTAATCGCGAATCTTCTTAAGTTGAGATAAATGTTGTTGCCACGTGGGATCGGTGTGACTGATATATTTCACATCCGTTGGACGTTCTGTATCCAGGGTACAAGCAAATAAAAAGAAACTTGCAATGATAGGCAAAAGAAAATGTTGTTTTTTCATAACCAATAAAAGTACTCAAAATTGTGATTATTTTACGAGCTTAACACGGATTAGTAAAGCGCGGGAGGATTTCCGCGCGTGTCTGTTTAATCGCGATTATACGACGGCGATTGAGTTCATCACGAATGGCTTGCTGCTGGAAACCTTGTTGGATGATGTCTTGCACGTTGACCTGCAGAGCACTTTGATAAAGTTGCCAGAGAAATTCACGTTGTGGATAGTCAACTTGTTCAAATCCGGTCCTACCACGCGTGTCTGCAATACAGACTAACAAAAGTGCTTTAAAACGTTCCGGCTTACGCCAGACATCTAGACGATTGAATAATTTCAATATTGTCTCCGCACGTAATTCAAAGGCTTTGTGTATGTGCGAATGATATTCACAACAAAGTTCTGCAAAATCTTGAATTGCGTGAGGTAATTTAAAGCGCTGACATAAGCGTCTTGTCGGCATGACACCAGCTTTTTCATGTCCATAATGATGTGGCAATATTTCTTTTGGTGTTAAGGCTTTTCCTAAATCATGACAAATTGCAGCAAAACGTACCGCACTTTTGTCACTGTCCGTGTTTTCTGTCAACAAGACTGCTTGTTGTAGGACCAGCATAGTATGCACAAACGTATCTATTTCTGGATGGTATTTCGCGGGATTGGGGACGCCCTGTAATGCAGCTAATTCAGGAAACAGTACTTGTAATGCGCCCACCTCTTGTAGCGTTTGGAAATACACTTCAGGATGCGGTTCTAATAAGGCTTTTTCTGTTTCTAACCAGACACGTTCTGCGGTTAGGTTTGACAGCTCACCACTTTGTGATAACTGTTGCATCAATTCGCAGGTTTCAGATGCAATAGTGAAGCCAAGAGTATGGTAGCGAGCAGCAAAACGTGCCACACGTAATACGCGTAGCGGATCTTCTGCAAAGGCGGGGGAAACGTGGCGTAAAAGACGTTGTTTTAAATCCGTAAGACCACCATAAAAATCATAGATTTTTCCGTCAAGATCTTGAGCGAGCGCATTGATAGTTAAATCACGTCGACTTAAATCTTGTTCCAAAGAAATTGTAGGTGAAAAATCACAAATGAAGCCAGTATAGCCGCTACCCGCTTTACGTTCTGTTCTAGCGAGAGCATATTCTTCTTTTGTTTGGGGATGCAGAAAAACAGGAAAGTCTTTGCCGACTTGTTGATAGCCTTGTGATAGTAAATCATCTGGCGTTGCACCAACTACGACCCAATCACGATCTTTCACAACAAGATTGAGGAGCTGATCTCGCACAGCACCTCCAACTAAATAGATTTTTATCTTGTTGTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP015572|747052:756410|749918_750710_-|AUK55637.1|DBSCAN-SWA MHIHSIKLPLVELKNINVVFEQKKALQNINLTLYPNSIITIVGPNGGGKSTLLKVLLKLLPPTSGQVIYHKNLRIGYVPQKIHLDHSLPITVERFLSLKKGISRQAIQDALSLLSISHLHKNSLQKLSGGEMQRVLLARAILNKPNLLVLDEPTQGVDINGQAELYQLIQQTQQQLNCAILMVSHDLNIVMADTNEVLCINQHICCAGTPETVSNDPTFIHFFGDQFAKNVALYTHKHNHKHDIHGDICCTSDFQSQQCTHKE >CP015572|747052:756410|748067_749048_+|AUK55635.1|DBSCAN-SWA MQELERQAPLLDAVNLKKYYPVKKGILSKPKLVKAVDGVSFTLERGKTLAIVGESGCGKSTLGRMLTMIEAPTEGELFYKGQNFLENDTATQKLRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGTILEEPLLINTDLNAKERKQQVLEMMEKVGLKPEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLRPDIVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQEEMGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCVEQGETKAIFNHPRHPYTQALLSATPRLEAEHRRERIKLTGELPSPLSPPKGCAFHARCRFAMEKCALEKPALKQYEDGSKIACFMLD >CP015572|747052:756410|753590_754478_-|AUK55640.1|DBSCAN-SWA MQHYHFSHSLLAQQEKPYRFPCPAKLNLFLYINGKRQDGYHELQTLFQFVDFGDWLDIEVREDNEICLTPELPSLKNEDNLVYRAAKLLQQKTNCALGANLTLDKILPMGSGLGGGSSNAATALVALNYLWNTQLSTKQLAKLGLMLGADVPIFVHGHAAFAEGVGEKITYCEPKEKWYVVLKPNVSISTATVFSDPDLIRNTPKQSLEQLLNQKYTNDCEKVVLNHYPEVEEILHRLLQYAPSRLTGTGACVFAEFNDEESAQLAFQTIPKNYFGFVAQGLNKSPLHNMLAKIS >CP015572|747052:756410|749124_749910_-|AUK55636.1|DBSCAN-SWA MFEILFPAWLTGMLLSLITAPLGAFVVWRKMAYFGDTLAHSALLGVALGIFLDINPYLSIVLLTLILAILMVWLEGKTQFSVDTLLGIIAHSCLSLGVVTVGLLQNVRVDLMAYLFGDLLAMNYEDLVVIGIGVVFVLVTLLYFWHPLLSTTVSPELAQVEGVNVQKMRFILMILTALTIALSMKFVGALIITSLLIIPSATARRFAKTPESMVFIAILISMLSISLGLLLSAYYDTAAGPSVVICASLLFLLSLMKKEHN >CP015572|747052:756410|750944_752498_+|AUK55638.1|DBSCAN-SWA MQIKIAIFFSIILFIVLVVSLGKKEEGQDSSADSQTQTETQIEKQPALSTATVESPSSVQADSTLSPPSSAESVEKQAITEHHTESSAVSMDEKNSDTQVDASSQETTAKPAENTLDATSFYDDLEAKDDEVDEIKPDMLDELAAFPEPVRHALSDLFDVMDQAMRIKNQFSHTVVKGDSLKDVLELSGLDASVSERLIKAYPEFKNLKPGQQFYWILDNQGELEYLNWLVSEREEKIYEKTADGQYQREILKKQSVWKKEVLKGRIDGSFNTALRTLGLDIRQINQLANALQWQINLKRLKKGDKFAVLVTREYIEGKLTGQGNVDGIHIISAGKSYYAIQASNGRYYNRQGETLGKGFARYPLQRQARVSSHFNPYRRHPVTGRIAPHKGVDFAMPVGTPVIAPADGIVEKVAYQANGAGRYIVVRHGREYQTVYMHLSRALVKAGQNVKRGQRIALSGNTGRSTGPHLHYEFHINGRAVNPLTVKLPGTSSGMGTAERKQFLVKAKEIERQLRL >CP015572|747052:756410|747052_748051_+|AUK55634.1|DBSCAN-SWA MALLNVENLSVHFGDENAPFKAVDRLSYTVNEGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDYPGRVQAEQLLFNQSDLLALTEKQKQKIVGADVSMIFQDAMTSLNPSYTVGYQIMEALKVHQGGAKAWRKERAIELLTLVGIPDPRSRLDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACNPKLLIADEPTTALDVTIQAQIIDLLLELQRKENMALILITHDLALVAEAAHRIIVMYAGQVVEEGRAEEIFKCPRHPYTQALLRALPEFAEGKSRLQSLPGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATDRCREQEPETRLVNGHRVKCHTPLNAQGMPSYTEFAVS >CP015572|747052:756410|752573_753521_-|AUK55639.1|DBSCAN-SWA MPDIKLFTGNATPELAKRISERLYLSLGDATVGRFSDGEIQVQINENVRGSDVFIIQSTCAPTNDNLMELIVMVDALRRASAGRITAVIPYFGYARQDRRVRSARVPITAKVVADFLSSVGVDRVLTCDLHAEQIQGFFDVPVDNVFGSPVLVHDMLKKIDMQNPIVVSPDIGGVVRARAIAKLLNDTDMAIIDKRRPRANVAQVMHIIGDVAGRDCILVDDMIDTGGTLCKAAEALKERGAKRVFAYATHAVFSGSAAKNLASDALDEVVVTDTIPLSPEIKALNKVRVLTLSGMLAEAIRRISNEESISAMFT >CP015572|747052:756410|755135_756410_-|AUK55642.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNNKIKIYLVGGAVRDQLLNLVVKDRDWVVVGATPDDLLSQGYQQVGKDFPVFLHPQTKEEYALARTERKAGSGYTGFICDFSPTISLEQDLSRRDLTINALAQDLDGKIYDFYGGLTDLKQRLLRHVSPAFAEDPLRVLRVARFAARYHTLGFTIASETCELMQQLSQSGELSNLTAERVWLETEKALLEPHPEVYFQTLQEVGALQVLFPELAALQGVPNPAKYHPEIDTFVHTMLVLQQAVLLTENTDSDKSAVRFAAICHDLGKALTPKEILPHHYGHEKAGVMPTRRLCQRFKLPHAIQDFAELCCEYHSHIHKAFELRAETILKLFNRLDVWRKPERFKALLLVCIADTRGRTGFEQVDYPQREFLWQLYQSALQVNVQDIIQQGFQQQAIRDELNRRRIIAIKQTRAEILPRFTNPC >CP015572|747052:756410|754477_755095_-|AUK55641.1|DBSCAN-SWA MKKQHFLLPIIASFFLFACTLDTERPTDVKYISHTDPTWQQHLSQLKKIRDYTNQGQLGYISQKERFSTRFDWQYQNPTNYRLTLSSTLSPTTLSIEVRHNVMHLSDNKGPLRSAQDAKRLLKEIVGMDLPLDQFALWLKGQPDESREYRVAENHLLAHFSYPIDNQQWTADYLSYHQLPLPLPKDILLKTEGQTLKIRIDNWTY |
9 | Planktothrix_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1720181 : 1823277
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP015572|1720181:1823277|DBSCAN-SWA 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>CP015572|1720181:1823277|1786992_1787322_-|AUK56472.1|DBSCAN-SWA MERFNFNVEMNYDVQHEPLVNQVQFGDNYSQRTSKGINSDLCKYSNLRIICDADVKHQIDTFLKSHGGHKSFLWRSKTENRDVKVFCPSWSYRENGAVFEFTLNFIETL >CP015572|1720181:1823277|1809859_1810123_+|AUK56503.1|DBSCAN-SWA MSKITKLRDKLYKTPPPTDFTWENLKTLLTSLGFNEVQGNGSRVKFIHDVLDFPIIIHKPHPQNTLKQYSIKQIKEALDELKTLLGE >CP015572|1720181:1823277|1753212_1753674_-|AUK56444.1|DBSCAN-SWA MDIRKIKKLIELVEESGIMELEISEGEESVRINRGSAAPSAVQYSLPVQAAPAPVAAPTAPAVSAPAAPVNAEEVSGHFIRSPMVGTFYRSPSPEAKPFVEIGQAVKVGDALCIVEAMKMMNRIEADKAGVVKAILVNDGEAVEFDQKLIIIE |
109 | Mannheimia_phage(42.37%) | tRNA,integrase,terminase,transposase,tail | attL 1777292:1777337|attR 1823382:1823427 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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