Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP025543 | Spiroplasma monobiae MQ-1 chromosome, complete genome | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. CP025543
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
4584 : 18582
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP025543|4584:18582|DBSCAN-SWA AATGAGTGATATTAAACATGGTCGTATTTTAGAAATCGATATTAAAAATGAAGTAGAAAAAGATTTTCTTGAGTACTCAATGAGTGTTATTGTTAGTCGTGCCCTTCCGGATTTAAAAGATGGATTAAAACCAGTTCATAGAAGAATTATCTATGCAATGAATGATTTAAAGATAACTTCAGATACCCCACATAAAAAATCAGCTCGTATTGTTGGAGAAGTTATTGGTAAATATCACCCACATGGTGATTCATCTGTTTATGAAGCAATGGTAAGAATGTCGCAAGACTTTTCATATAGATATCCTTTAGTAGAGGGTCATGGTAATTTTGGTTCAATCGACGGTGATGGAGCTGCTGCCATGCGTTATACTGAGGCTAGACTTGCCAAAATAACTTCAGTCTTGTTAAAAGATATTGATATGGATACAGTCCCTTTCATTGACAATTATGATGCTTCTGAGAGAGAACCGAAATATTTAACTGGTTACTTCCCTAACCTTTTAGTTAACGGAGCTACAGGTATTGCAGTTGGTATGGCAACAAACATACCACCTCATAATTTAAGAGAAGTTATTCAAGCAATTGTTGCATATATAAAAGATGATCAAATAACTATTGATGATATTTTAAAATACATCAAAGGACCTGATTTCCCTACAGGAGCTTTAATGACAAATGGGAAAAGTATGATTGATGGTTATAAAACCGGTAAAGGTAATTTAATCATAAGATCAAAAATTGATATTGAAGATACTGGCAAAAATCAAAGAATTGTTATTAGTGAAATACCTTATCAAACTAATAAATTGAAAATCGTAGAAAAAATAGCTGAGTTATATAAAAATAAACTTATAAGTGGTATATCAGATATTAGAGATGAATCTAACTATGAAGGGATTAGAATTGTTGTTGAACTACAAAAAAATTCAAATCCTCAGTTAATAATTAAAAAACTATACAAGTATACAAATTTACAATCAAGTTTTGCAATAAACATGTTGTCTTTAAATAATGGAATACCTGTAGTTTTAAATATTAGAGATATTATTAAATTTTACGTAAAGCATCAAATTGAAATCATTGTTAAGAGAAGTCTTTTTGAAAAAAATAAATTGAACGCAAGATTACATATTTTAAATGCGATAAGAATAACTTTAGATCACATTGATGAAATTATAAAAATTATTAAAGAATCAAAAACAACCGAAATAGCAAATCAAAAATTGTTTGATACATTTCAATTTGATGAAAAACAATCTAAGGCAATTTTAGATATGAGGCTTCAAAGACTTGTTGGACTTGAAAGAGAAAAAGTTGAGCTAGATATTAAAAATATTGAAATAAGAATTTCTGAGTTAGAAGAAATTTTATCTTCAAAAGAAAAACAAGATGAACTTCTAATCAAACAACTTGAAGAGATAGCTCAGAAATTTGGAGACGACAGAAGAACAAAAATAATTGAAGAAGACGAAACACAAATTGATGAAGAAGAATTAATTCAAGATTCACAAATGTTAATTACTTTATCTAATGAAGGATATGTTAGAAGATTATCTAATGAAGAATTCAAAACACAAAAACGTGGAGGTAAGGGTGTTATCATTAACAACAATGCTGATGACAATATTGTTATAGCTAAAGTTGGAAAAACAAAAGATGATGTGTTGTTTTTCTCTGATGAAGGAAAAGTTTACAGAATCAAAGGTTACAACATTACTCAATTTTCAAGAAATGCAAGAGGAGTTCCTGTGATTAACTTTATTGGAATAAATTCTTCAGAGAAAGTAACTTCAATTTTATCTTTAAAGGATAAAAAAAATATTTATAAATATTTATTATTTGTGACTCAAAACGGAATTGTTAAAAAAGTTGAAATTGAAGAATTTAGTAGAATTAATAATTTTGGAAAAATTGCAATCAATTTGGATGAAGATGATAAATTAGTTTCTGTTATTCCGACTGTTGGATCAACTGAAATTTTAATAGCATCTCAAAATGGAAAAATTATTAAAGTAAATGAAGATGACTTTAGACCAATGTCAAGATCTTCTCGTGGAGTTAAAGGTATGGGTCTAGATAAAAATGATGTTGTTGTATCTTCATGTTCAAGTTATAAAAACGAATGCGTAGCAACTGTATCAGAAAAAGGAATTGTTAAAAAAACACTTATAAGTGAGTATAACATTTTTGGTAGAGGAGCTAAGGGTGTAGTTGGTATGAAACTAAGTGATAAAACAGGTAAATTTAAATCTGTATTACCAATTAGAGAAACCGATGAAATACTTATGATCTCATCAAAAGGTAAAGCTATAAAAATCGGAGCGCAAGATATAAATTTACAGTCAAGAAACTCCACAGGGGTTATTGGTTTCAATCTTGAAGATGACGAATTAATAACAGCTGCAACACTAGAATGAAATAAAGGTGAATAAGAAATGTTAGACATTAATAAAATTGAAAATGATTTTGACAAGGTTTGTTCAGACTTAGGAAAAAGAAATAAAGATTTCAAAAATGAATTAAATGAAATTGTTGAATTGAATTTACAAAGAAAGAAAATTACTTTTGAAGTTGAAGAACTTAAATCTGAAAAGAATAAAATTTCAAAAGATATTGGAGTGTTAGCTAGAGAAAATAAAAAAGACGAAATTGAAAAATTGAAAAATGCAGTTTCAGAAATAAATATCAAAATTGAAAAGTTAGATTATGAGTTAAAAAACGTAAGTGATAATTTGAATTTAAAATTAAGTTACATCCCAAATATTCCAAATAAAAATATTCCTTTAGGGAAAGATGAAGAAGATAATGTGGAAGTAAAAAAATGAAATTCAGATAATTTAAAAAATGGCGGAGAAGCACATTGAGAAATTGCATCAAAATTGGGATTAGTTGATTTTGAACTTGGAGCAAAATTATCAGGATCTAGATTTGTTGTTTATACAAATAAAGGTGCAAAAATGATAAGAGCGCTTACAGATATTTTAATTAATAGACATACAAACAACGGTTATAAAGAAATGTGATTACCATTAATTGTTAATAAAGAGAATATGTATGGAACAGGGCAACTTCCAAAATTTGAAGAAGATGCTTATAAAGTCGATGATCAATATTTAATCCCCACTTCTGAAGTGCCTTTAACAAATACTGTTAGAGATAAAATTTTAGATAAGAGTGAACTTCCAATGTATTTAACCGCTTTCACACAATGTTTTAGAAAAGAAGCTGGAAGCGCAGGGAGAGATACAAAGGGTCTTATAAGACTACATCAATTTAATAAGGTTGAAATGGTAAAAATAACTGATAGTAAAACTTCATATGAAGAGTTGGATAAGATGTTATTGGATGCAGAGGATTGTTTACAACTATTTAATTTACCTTATAGAGTTGTTGAATTATGTGGAGGAGACATAGGGTTTTCTTCAGCTAAAACATATGATCTAGAAGTTTGATTTCCAAATCAAAATAAATTTAGAGAAATATCCTCATGTTCAAATTGTTTGGATTTTCAAGCTAAAAGAATTATGACAAGATATAAAAATGATGAAGGTAAAAATGAGTATGTTCACACACTAAATGGTTCTGGTTTAGCTATAGATAGATTGTTTGCCGCAATAATGGAGAACTATTATGATGGCGAAAAATTGATCCTTCCAGAAGTTTTAAAACAATACTTTGGAAACCAGGAATTTTTAAAATAATGTTTCACGTGAAACATTATTTTTTTTATAAATTGTTTCACGTGAAACAATTTATAAAAAGCAAAATTACTATAATTTTGCTTAAAAAATGTTATTATATAAATGTCATTGTAAGGGTGACGTTCGAATTTGGTCAGGACCGGAAGGTAGCAGCCATAAGAATCTAGTGCCTTGTACAGTGACTTTTTTTATTTTTTAGGAGAATTTACATGGACAAAATTTACTACACCCTTTTAAAAGAACTTAAGAAATGTAAAAAAAGTAAAGACGTTCCTGTTTCAGCTTTACTTATTAATCAAGAAAATAAAATAGTCGCAAAAGACTTTAATACAAGACAAAAAAAGTACAACTTTACAAATCATGCAGAAGTTGGTGTTATAAATAAGATTTATAAGAAATTCAGAACTAAAAATTTATCAGAATATATTTTAGTTACTTCTTTAAAACCTTGTTTAATGTGTTTGACAATAATAGAAGAGGCAAATATTAAAAAAGTTTTTTATTATTTGGATAATTTGAAATGTAATTATAAAAAATTAAAAACAGATATTTTATTTGAAAAATTTGGAACAATAAACCAACAAAAGGAATTCAATATTCAATTAAAGGAATTCTTTTTAAAATTAAGGAAATAACTAGGTAAAATATTTATGCAAGAGGAGATATGCTATGGAAAATAAGAAATCACTTTATAGAGAATATAGACCAAAAAACTTTGATCAAGTAGCTGGTCATGAAGGAATCAAAGAAATTTTAATATCACAGATTAGTACAAATTCATTTGGGCATGCCCTATTATTTTCGGGTCAAAGAGGAACTGGAAAAACATCTATAGCTAAAATATTTTCTAAAGTAGTTAATTGCCAAAATTTAAATGGTTACAATCCTTGTGATGAATGTATAAGTTGTAAAGAATTTAATAACAACTCTCATTCAGATATTTTTGAAATCGACGCAGCTTCTAATAATGGAGTTGAAGAAATTAGGAATATAAAAGCTAATGTGTCTTTAATGCCAAACTTTTCTAAATTTAAAGTTTATATAATAGATGAAGTTCATATGTTATCTAATTCAGCTTTTAATGCTTTATTAAAAACTTTGGAAGAGCCTCCAAAACACGTTTTGTTTGTTTTGGCAACAACAGAATTTTCAAAAATACCAGCAACAATTATTTCGAGATGTCAGCTATTTAATTTTAAAAGAATTGCCCAAAATTCTTTGGAAAAAAAAGTTAAAGAAATTTGCAACTCTGAAGGTAAGGACATTACACAAGATGCATTAAACGAAATATATTACA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP025543|4584:18582|7020_8286_+|AUM62258.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLDINKIENDFDKVCSDLGKRNKDFKNELNEIVELNLQRKKITFEVEELKSEKNKISKDIGVLARENKKDEIEKLKNAVSEINIKIEKLDYELKNVSDNLNLKLSYIPNIPNKNIPLGKDEEDNVEVKKWNSDNLKNGGEAHWEIASKLGLVDFELGAKLSGSRFVVYTNKGAKMIRALTDILINRHTNNGYKEMWLPLIVNKENMYGTGQLPKFEEDAYKVDDQYLIPTSEVPLTNTVRDKILDKSELPMYLTAFTQCFRKEAGSAGRDTKGLIRLHQFNKVEMVKITDSKTSYEELDKMLLDAEDCLQLFNLPYRVVELCGGDIGFSSAKTYDLEVWFPNQNKFREISSCSNCLDFQAKRIMTRYKNDEGKNEYVHTLNGSGLAIDRLFAAIMENYYDGEKLILPEVLKQYFGNQEFLK >CP025543|4584:18582|12022_12769_+|AUM62263.1|DBSCAN-SWA MKKIEVFKTVNELIKENKFYHSIIISNENQNELNEISTEITRQIYCSSKSFENDSCDWCLKVIKGNNLNTFFIGDGSTKISKEEIKELIIRFSSTGLEENKNKVYIIANGENLSESASNSILKFLEEPPKNTYAIILTNDRNQILSTIKSRCKLFSIENDSEKLELDSQIINLVINKDKSGLLEYLIDFKKMDKNEIIRILKNTFNISLELNMKYLQEMLLDSINEIKNSNYINLILENLFIKIYEVI >CP025543|4584:18582|8495_8921_+|AUM62259.1|tRNA|DBSCAN-SWA 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12 | Bacillus_virus(12.5%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
98462 : 108845
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP025543|98462:108845|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP025543|98462:108845|100720_100984_+|AUM62348.1|DBSCAN-SWA MTSFTATVIDPVGLHARPASVLTKEASKFASEIKIKCGDKEGNLKSIMNVMALAVKTGAEITIEANGEDENEAIEAIEKAMKDNSII >CP025543|98462:108845|98462_100634_+|AUM62347.1|DBSCAN-SWA MIENLLKDLNDEQLDSVITTDVPLRIIAGAGSGKTRVITTKVAYLIEKEKIFPSKILAVTFTNKAAQEMRDRVKKIIPNLDRNPMITTFHSFCVRVLREDCEYIGLSKDFTIIDGADQGKIIRDIIKNLDITSDKTKPEKKILSKISNWKSKQLTWEEAYEETFNIAEKKWAKAYRDYEQYLAEKNYLDFDDLILKVHKLFNENIDVREKWKNRFEYILVDEFQDTNYTQFDLIKWLTGSRNNLTVVGDPDQTIYSWRGAKVNIILNFKDEFKNSRTIMLTENYRSTKPILDIANDFIDNNKNREKKDIFTQKKEGEIVRVKEVASRNFEAKFVSKKIKELIEEQNYKYSDIYVLYRTNAWSQEFEKEFQNQKIPFHLIGGFKFRDRKVIKDVTSLLRVVVFKDDLAMDRIFGFTPKVGAVTASKLKQAAFEFDLNLFDFLTQHQQEVNSISKNLNELINCLIKARKLFEENRSLLELTTMLVKESGYKDRLDLKDKEDIESLQNLEAYYDQMEKYDISYNEGENELNRAVSFLQEEALSSDEDNEVEINKVTLLTIHSAKGLENKVVFIVGLNKDVFPSKMSFYSIESLEEERRAFYVAITRAQEMLFVSYVSGEYSYISSGELGPSRFIQELNPDLYEIEKSIYFHSNTETSSGYKGKPSLESKPSKLEAGVVKGDRINHMVFGIGTVVKVIDKYISVAFVDPKQGVKMIPINSSSWEKME >CP025543|98462:108845|101536_102559_+|AUM62349.1|DBSCAN-SWA MAKKKNQYYYDSLSPIEFALNKFNGRMRSVNWNVMNDDKDLEVWNRATQNFWLPEKVPVSNDLVSWKTLTPEWQELITRTFTGLTLLDTIQATVGDVAQVQNSLTDHEQVVYTNFAFMVAVHARSYGTIFSTLCSSEQIEEAHEWVINCDSLQERAKALIPYYVGNDPLKSKVAAALMPGFLLYGGFYLPFYLSARGKLPNTSDIIRLILRDKVIHNYYSGYKYQRKVEKLSPEKQAEMKKFVFDLLYELIDLENKFLYELYDGFGIAEDAVRFSLYNAGKFLQNLGYESPFTEEETRIEPEIFTQLSARADENHDFFSGNGSSYVMGVTEETSDEDWEF >CP025543|98462:108845|103022_105188_+|AUM62351.1|DBSCAN-SWA MNKDNIKNLSGTNESDEYIKLNARAKLFVPGQDNFKLDIQAAEMYMKEHIEPNMMKFGSTKERIDYLVTNQYYDDQVINKYTIEQIDEITKYAYSFDFKFPSFMGALKFFNAYGLKTFDGKQYLENYEDRVVSNALFLAGGNFEKAKNILKQIILGRFQPATPTFLNAGKKQRGEYVSCYLLRVEDNMESIARAVTTSLQLSKRGGGVALCLTNLREFGAPIKNIENQATGVIPVMKILEDSFSYANQLGQRQGAGAVYLNVHHPDIMSFLDTKRENADEKIRIKSLSLGVVVPDITFELAKENKEMALFSPYDVEKVYGKPFSDISVTKEYENMVNNPKIKKTYINARKLFQAIAELHFESGYPYLLFDDTVNNNNAHPVAGRIVMSNLCSEIVQVSTPSEFNADLSFSKTGEDICCNLGSMNIAKTMESGEEFSEVIYNSILALDHVSRNSDLSSAPSIENGNKNNHAVGLGAMNLHGFLATNHIYYNSPEAVDFTNMFFYTMAFHAFKASNKLAKEFGSFAGFNISKFADGSFFDKYTKCEENKWTPESDTVKNLFDKNNVTIPTQQDWIDLAEEIKKTGLANSHLMAVAPTGSISYLSSCTPSLQPVVAPVEVRKEGKLGRVYVPAYKIDFDNMGYYSLGAYEVGPDPIIDIVAAAQQHVDQAISLTLFMTDQATTRDLNKAYIRAFKKGCASIYYVRVRQEVLEDSENYECDACVI >CP025543|98462:108845|105288_106035_+|AUM62352.1|DBSCAN-SWA MIEIKNISRKLGNFGLENVSFTIKKGSVVAFVGDNGAGKTTTIKALFGELKLDSGEILIDGQDLFKNNNLSKVAFFPDSNNVPLDIRIHEYLQYICAANNMNKERTDLSIDNVYRLLELRPYKDKKIKELSSGWKKKAIMASVLVRSPEYIIFDEPTANVDVESKLYFMEIFKLLSKVGITILITSHIIEELQELANYLVLIKKGQIVYASDFDKSKEHIMDVYKRHMNEPIKDLHVLRDLYNKRNKR >CP025543|98462:108845|102562_103036_+|AUM62350.1|DBSCAN-SWA MHDDVIKISGQDIVRPKGKVFCVYFSSISNNTHRFMDKLDVNDARIPYELDEDLIVDKEYVLITPTYAGGGGDTKGAVPPQVVKFLNNETNRNLCRGVIASGNTNFGDTFAIAGPIISKKLGVPLLYQFELLGTKNDVDTIREILEDFWRGKENEQR >CP025543|98462:108845|106034_108077_+|AUM62353.1|DBSCAN-SWA MKKDLNVVKREESTSNFQKEVKNFFLLYRINLKLSLRDVGSIISGILFASLVTLFFILEFSEIIVAGSADKYGTYKILVYTLGSSTLIFHILLSSLYLFKKQVKDGIASIELRAGFKTWKSYLIRVLIVFSTSLVYIGVSLAITIVLNAMSIGNTKLFFNLHYSQVFFLTFLAFFSTMIMTVVMVMFKTSMATMFAMVYMIAIALAPITASFSYLLFQERDTNYNTNIRIISGSKFYNSFKGNEELFNDDNGFGKSKTTTSINEYVKATLDPLSEYTEDGKSIYDENYKMEGFSLRHSVEMNGASSSVKFENSKASHILTKNLGFGQVYYNYNVFEENGVESKQEYLLEETPIWPLLEAINEAVLKNQDSFSSNNSGEIPTLFIEKSSYYWMNRIDGKNMDIDNLVKELSRQLPEYSGILKFIQNFYNQYRSILADAYYKGRYWSSGSSYKASYNDILDNALIPSSRGVQIDNYYSWKELYTIGNYPNYSDPFNFDEVDAPNKRDRCSLGYKNELAKSHNDEMAKVYKSFPELTILNQLIVSLWRMAMDFDIYRTDELDSSLYEYYNTTVASNTLKTDIFRHFAAMSTGLFSDVLYNDLFNVSNEVFYQGQFYTVTNIFDFENFSYTNREADAAMQPAYKTTKIKTKTLFLIPLAYFVYIVLISPLGYIGYVVFNKKAKL >CP025543|98462:108845|108092_108845_+|AUM62354.1|DBSCAN-SWA MIEIKNITRDLGGFVINQVSFKIKKGSVVAFVGDNGAGKTTTIKALFGELKLEQGEILMDGQNIFEEENLQRIAFFPDSNSVPLNMKVKDYVSYVCAVNGMSKQDAQESASKIFAMLSLEPYINKKIKSLSAGWKKRAIMASVLVRTPEYIVFDEPTANVDVEAKLSFMNILHELSKIGVTILITSHILEELQEVANYVVFIRDGEVVMEKDFDNRTESIAALYKEVMAEKNNKEKLLKEIYNPKERVVI |
8 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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