Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014172 | Clostridium botulinum strain B609 plasmid pRSJ22_1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP014173 | Clostridium botulinum strain B609 plasmid pRSJ22_2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 4 | 0 |
CP014174 | Clostridium botulinum strain B609 chromosome, complete genome | 6 crisprs | DEDDh,csa3,DinG,WYL,cas3,csx1,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,casR | 0 | 2 | 11 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 6121
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP014173|0:6121|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP014173|0:6121|1054_1300_-|AUN19942.1|DBSCAN-SWA MNNYIEQRVLNVADYFLDTNCTVRNAAKKFGYSKSTIHLDVTKRLSMLDTNKAREIEKILAYNESIRHIRGGASTKKKYSK >CP014173|0:6121|4402_4786_+|AUN19948.1|DBSCAN-SWA MKRNEYKKQLGERIKKRRKELGMTLEEVAREANYSKSFLCDVENGRSAMSTANLSLTAQVLKIPMEYLLYEEDLKNNEDTIVQTIEKDGVNYEILLSKFVFPNGLTYSEMEDKIKMLEKLQEIINNK >CP014173|0:6121|1915_2527_-|AUN19945.1|DBSCAN-SWA MSIYKKLAEARVKLQNAGLKKSGKNKFAGYEYFELYDFLPRVNEINAELGICAVVSFDKENATMILTDVEKTDSTITITSPMESATLKGCHAIQNLGAVESYQRRYLYMTAYEIAENDILDGTLGQGDKKGSNKPQEDKKANTSLTDAQLKRLYAIGNNAGMSADKVKNHVKEKFKIEPKFMTKQQYDLMCSGYEQLAKKGDK >CP014173|0:6121|5080_6121_-|AUN19949.1|DBSCAN-SWA MEKIKVEELLFTDEPIVINRKLAKCLGLKEAVIFQQIHYWLKHNEKTKQNFKEGKYWTYNTIKKWHENEFDFLSIRTVERTLQKLEKDGLLISKTFNKMKGDKTKWYTIDYKKLLEVCKKSLSNKEILSSKRSESGKKGAIAKKNKNENTIQPTWQNGGAYNQLGNTIQPTWQNDITNLAEPIPETTTKTSTEITSSSSILKNEFENNICELKKTTNIKFDDYIKKYNGEFILAIIEYCTEINIRSFAGFKKVIDSYIGKNILTREDLFKDIENYRNEKKKNKDNNKNNSKFKLDKFNDFEQRQYDFEDLEEKLLKPLSKHKGELGSEELKRKILSTKNKTSFFDD >CP014173|0:6121|2542_3430_-|AUN19946.1|DBSCAN-SWA MNRKNIKSVLSKKFKEFCESIEDEKVKRAVRKHSIITGGCITSMLLGEEIHDFDIYFTNKETCLKVAEYYVQKFNETHKGTNARVEEKEERIKVFIQSEGVAGDDESEPDLIEYEDYDEMQTNITPDSDLENIPQKPKYRPVYLSSNAITLSDKVQLIIRFYGNAEEIHGNYDFVHCTNYWTSGNNELVLQQEALEAILNKELKYVGSKYPLCSIIRTRKFINRGWKINAGQYLKMCMQLNEFNLKDIKVLEDQLVGVDSGYFAMLIDTLQRKRENDPNFTIENDYVVSIIDKIF >CP014173|0:6121|1299_1617_-|AUN19943.1|DBSCAN-SWA MFIKTLEGQIHEVNIEEVYIKPFYSKENIRCYTLCSNKHNNEIILAEYPDRTIAKHMLHILIHCDGLDIQQEILPYISLKEDLLFSASFKLRQAKEKFKKEQEWE >CP014173|0:6121|3448_3934_-|AUN19947.1|DBSCAN-SWA MAKLYELTQNYNNLLDLVDNPEVPVEMLRESLDNIGEEINTKLENVAKVIKSIEVDAKGLKEEEKRLADRRKSLENRISSLKEYAEKSMRATGKKKIKGKVFTLGIQKNPASVDVVNEDNIPDKYFITEKKLVKKDVLEVLKRGEGVPGVNLIQSESLRIR >CP014173|0:6121|236_1031_-|AUN19941.1|DBSCAN-SWA MKYLIVPSDCDVDELVVYSWLYKHSNQTKENYDGLKKNEVYFSNRIISEYTKLDKMKVNRSLKRLEEKQYIRIMYKSKSKKQPSKCFLSFNSNLKNDTVVDTVCNTVNDTVQSIENTKVVNNSKTVNDTVSVTDSDTKSNNIIYKYNLIYNTWLKADIVKHKNLTVVMKKNIDKILKKYSIDDIVLAINRYCEMYKSEYPYCHYKWTLNEFLTREKGIGYFLDDGDKWINYNEWKQGNSIEIDGLDLETRKLLEERKRAMEGLY >CP014173|0:6121|1768_1915_-|AUN19944.1|DBSCAN-SWA MDKDNKKALIYRLDWVLKYAEEGRLDNIKEEVNNIKNELSTYDLVVPF |
9 | Clostridium_phage(40.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
10358 : 11384
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP014173|10358:11384|DBSCAN-SWA TCTATTTTTGGGATTTAAACAATTCTTTTAATATATTTTCTAAGACAGGTACAACAATACTATTACCGGCCATTTTATACATTTGTGTGTTTGTTTTATCAGTACCTTTGTAAAATTTATTGATTAAAGCATTTTTAACTTTAATATAATCATTTTCCGTGAATCCTGTTGCCTTCCAACATTCGTTTGGTGTTAGTTTCCTTACTTTGTATTCTATAATTCTAGGAATACTATTAGAACCTGTAAGTATAGTAGGACAAACACCTTGTGTTGAAAACACTCTTTTATTCATATCTAACGCATTAGGATCGTTAATTTGACCTACTTTGAAAAGTCCAGTTTTAGTTTGAATATTATCTCCTAAAACTTTTCGGTCTATGTATTTTATAAATTCAGTAATATATTTATTACTGTAGTAATATTTAGTATCTATGCTTTTATCTAAAATACTATTTATAGAATTTAATTCTTCCATAGGCTCTGGAAACTCAAATTTATTAGTATCTATATCTTTCCTAATGCTTACTATAAAAACTCTTTCTCTTGCCTGTGGGGCTCCATAATCTTTCCCATTTAGTATTTTCCAATATGAATTATATCCTAGTTCATCAAGTTCTTTAAGCATCAGTTTAAAGTCCTCTATAAACATTTTACTTACTAGATTTTTAACATTTTCAGCTATAGCATAAGAAGGTTTTTTATCTTTTATTATTCTAAGCGCTTCATATAAAAGACCCGATCTAGTTTCCCCTTTTATAATACCTTTCATCTTCCCGGCTCTAGAAATATCTTGGCATGGGAAACCATATGTTAATAAATCGAAATTTTTTAATGTGTCTGGATTAACTTTAGATATATCACCTAAATTTAAATTCTCATCTACATCATGCAAAATGCTATAAGCATAACTAGCAAACTTGTCAATTTCACAATAATTAACTATTTCATAATCTTGGTTTATATTAGATAAGGCTTTTTCAAAAGCTCCTATTCCACTAAATAAACTTAGTAATTTTATTTTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP014173|10358:11384|10358_11384_-|AUN19954.1|DBSCAN-SWA MKKIKLLSLFSGIGAFEKALSNINQDYEIVNYCEIDKFASYAYSILHDVDENLNLGDISKVNPDTLKNFDLLTYGFPCQDISRAGKMKGIIKGETRSGLLYEALRIIKDKKPSYAIAENVKNLVSKMFIEDFKLMLKELDELGYNSYWKILNGKDYGAPQARERVFIVSIRKDIDTNKFEFPEPMEELNSINSILDKSIDTKYYYSNKYITEFIKYIDRKVLGDNIQTKTGLFKVGQINDPNALDMNKRVFSTQGVCPTILTGSNSIPRIIEYKVRKLTPNECWKATGFTENDYIKVKNALINKFYKGTDKTNTQMYKMAGNSIVVPVLENILKELFKSQK |
1 | Bacillus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_3 |
15269 : 36601
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP014173|15269:36601|DBSCAN-SWA ATTATTCGCCATTGCTTATCACCTCGATATCATTAGAAATGGCTACCTCTTCCTCTCCTATAACTATATTCTTCTCAGTTAGCGGTTCACCGACTTTTCCTATTTCTACTTTAATATCTTCTATTCCCTCTAAATTAGCAGACCCTATTACAGAAAACAATTTAAATAAAGTAACATTTTTCCCTAATCCAAATTCATTGATAGCATTAGATGTTAAATTTTCAATAATCTTATTTCCTTGGATCGGGTAATCTTTGTTAGTTTTTATAGTTATTTTAGCATTAATCTTAATATATTCCGGTCGTGTAATTCCTATCGGGTGAATTTCACCCATACTATCCTTGATACCAATATATTTAGAACCGCAAGCTTGTATTCCTCCAGGCTTCTTGTCAAATATAGCCTGCGCTATCTCTTTATCATCACCGCCGACCACTAGCACTCTGAAGCTTTTTTCTGGTATGCCATTTACAACCTGCATTGTGTCATTCTCTTTTATATGAACACTGGAAACTCCTGTTACCCTTAACACGTTAGCCATAATGCTGTCATATACATTTGTATTTCTAATGCTCACTGAAGCCTTATAACGTTCTCTAAACTCTGTATCACTTTCTTTGTCTTGACCTTTAATAGTATCCTTTTCATTAGTAACTGAAGTAAGCCCTATGATAGGATTAACTATTAGAGTTATTGTACCCGCGGGAGTGTTTCCACTAGCTCCTGCTGTCATAGCCATAACGTCTAATGTGATAGAACCACTTTCTGATATAATTCCTTCCCTTGTAGTTTCAAATACAGCACCGCTTTTAGTTGCTACTTTAAAACCTTTGTAAATAACTGTTCCTTTTTCTCCGTAAAAAGTTTCTTGACCAATAGCTTTACTTGCTTGTTTACGAGCTATTCCAATATACATACCCTTATCTGATAATTGATTACCTTCGGCATATCTGGGCGATGCATTGTAAAAATTTTGTTCTAATATCTCCCATAAATCTGATACAATATACATTATTGGAGCAGTAAAATGCTTTAAAGGGTCTTGGTCTGAGAAGTCAATATTTTCGCCGAAATAATCTTCGGCCTTTAAACGTTTTTCTACTTCTTTGATTAAATCCTGATATGTTTTTCTTTTATATCCCTCTGGGGTGATTCCGAATTTACTCATTTATTTTTATCCCCCCTAACTGTATTTTATCTTCGTATTCTTTATATTTATATCTTACACTAATTAGCGTTTTTCTGTTGATTCTATCATAATCTATTATAATGTCATCAACTTTTGATACTGTATTGTCTTGTAATAAAGCATCAGTTACAGCAAACTTTTTCTTTTCTATAGGTGTATTTTTTAATTTTATATCTAATAATAGTTCTCTATCCATGCCCATAGTAGAATCGAAAAACATTTCTCCTGAAACAATATACAATAATCCAGCTGTTTTCTGTATTTTCTGATCTAATCCATTTACAATAACAGCTCTTTTGCTTACAAATTCTAAGTCACCATTATTAAATTTAAGACTATTCATTTAATCACCTCACATATAAGTTTGTTGATTGTTTATAACTATCACCATCAGCGTAAATAACTGGGTGTGGAGCTCCCGAACCTCCAATTGTCATTTTGGGGGTATCTATATTTATTTCGCCTTTGTCATTTATTGTTATTGAAGCTTTTGTATTCCCTACTCTTATTTCGCCACCGTTTAATGTTTTAAATCCTATTGGTATAGCCATAGCATCATTTAAATTGTGCATACGTTCACTAGCATTGTTTTTAAGTGTAGAACCTAACATTATATTATCTATATCATAGTCTATAACAGTAACTAGTACCCACTGCCCAATCTGCGGCACACCTTGTATTGATAAATTACCGAAACATATATTAATTAATGGTATATTCGGCATCACTGAGAGCGGTTCTTTTGTCTCATTGTCTGTATGCATTATTTCAACGTCTACGGTTTCATCAGGGTTCACCGCATTTATTCTACCCAGTAAAGAACAGACTATTTCTTCTTTTAAATTCTGTTTAATCATTTGAAATGTTCTAACTATTTCTTTCATTAAACTGGTCGCACCTCCAATTTTGTAGTAAAGCTTGAACCATCATGTTCTCCTTTTATAACCATCATATTTCCGTTAAGTGTTAAGCCTCTCATTTGTACTAAGCTATATGGTGCTAATGCATGGTTTAACAAACATTCCACTTTATGCGTAGCGGGATTATCCTCTTCGTCGATAGGTTCTACAGATAATAAACCTTCTCTGCTACCTATTACATATGCCATTTCTGTGTTCTTATGGGCCATTAGTATATTTATAGTGTTATTATGAATGGATAATCTGGACCCGCAATTATTTGCTATTCTATTAATCACATCTAAGCACGTTCCACGGGCAGTATATCCTCTTGGATAATTTTTTTTATTTCTTAATTGCAATACATTCGGCTTAGTTCCACCAGCATAATGCAACACATCCCTTATTATATGTTCCGCACTTGGGTTTCCTTTGTATGTATAATTAATCTTTTTACGTAGCATTTGATTAGGTACATCTAATGTTTTTATAGTTGTAATTTTGTCTAATCCTTCAGGCTTAGTTCTAACAGATACAATAACTCCACTTATGACAACACCTATATCTTCTCCATATCCTGCATTAACTACAATGCTATGACCTCTTACTATATTGTTTAGGCTGTCTTTATTTAAGTTGTACATAATTATTTCACCTTCATTTGGTATGGGTTCTGTATCAAATGATATTTTAAATTCAATGTCAAAGTCTGGGCTAGTGTATCGTCTAGTGCCTATTACAACCTCTATTTTCCTTTGCCAGTAATCACTTAGAATAACATCTCCGCTTCTAGGCATTATTACTCACCTCTTTTATTTCTAGTATTACTATGTCTCCAAATTCATCAAAACCAACCCTTTGAACCGTTTTATCGCATGATGTTGGAATTATATCTACACTAGGAAAATTAGGATCTTTGTTTCCTTCATCATCTACAGCACATTGGAACAACGGTTGATTTAATATAAGTTTTTCGCCAGATACCAGTACTTTATCTTCATGAGAAAGTGACATGGTTATAAAATCAAAGGTTAAATTATATTCAATATCTATAACATAATTTTTACCATCAAACTCCATTTGAAAGGTATACGGCAAATCATTTTTATAAATAGGTATTTCCATATTGTAACCCCTTTCTATTTCTTAGCTTGTTTACCTTTGTTTTTTTTAGCTTCCAACTTAGCCTTTTTAGCTTCTTCTTTAGCTTGCTTTTTTTCTTCTAATTGTTCTTTCAAAGCTTCTATATTAGGAATATTAAGTTTACCAGCATTAATACTTACATATGTCTTTTGGATAATTCCAATTTCCCTGAGTTTAATGGAAAACTCTATTCCATTACCTATGCTGGCAGAATGTGTAAAATCAAAGTTTTCCATTATGCAACTTCGCCAATTATTAACACCGTAATATTTCAATACCGTTCTGTTAACTGAATATCTTCTCAATTGATTTATTGTAGCTTCTGGGTATTCTTTATTGTCAAATATATATCCACTAATTTGTATTCCAATCATGTTCTTTTTTGCGTGATCCGTTATTATGGCACCATCTTCCACATTTCTTTCAGTTATACTATTAGAAAAACTTATTTGTTCCTCTTTTACAACTGTAAGATATACATCACCTAACTTGCATAAATTCGGCATTTTCACACCTCCTAACTAGATTTTAGCATAAAATAAAAAAGCCCTTTGAAAAGGACTTTTTAAGCTATACTTTTGCCAATAATTCAGTTTTCTTTTTACTAAATTCTTCTTCAGTTAATACGCCTAAATCTTTTAATTCTCCTAATTTTTTAATTTTTTCTAATATGTTATCTTGTATATTATCTTGCTTATCAGTAATAGTATTACTTGATATTATGCCAGAATCTCTTCTAGCTTTTAATATATCACTTACCAATACAGTAGCATTTAATGATTCAAATATGATTTTATTTTCTATACCATTTTGATTACAAGTCAATATTAAATAATCGTGATTTTCTACTTTTTTCTTTTTAGCTCCAAATGCATATATACCTAATAAAAATAATCTTGTCATAGTTACATCTTTTTCTATATCTTTTTCATTTTTATATTCTACATTAATTATATCCTGGAATGGAATTGAAAAACCTACAAATTTATATGATTTAACAGAAGGAACAAAAACAATACCTTTTTCATAGATATCTATAGTCCCATGAATTGGAATACCACAATTAAAATCTATATGTCCACCTAGATATGAAGTTTTTGTACTTCTTATTTGACTACCATACTTTTCATTGTCTTTATTGAACTCTGTTAGTTTTAGATTCTTTTTATCTTTGTTTTCTTTTAATTTAGAAAATACCCCCATTTTCTACCTCCTCAAGTCGCTATTTCATCTAAATATTAACATATAAATAAATTCAATACAATATTATCCTATATCTGTATAACTTAATTGCATACTAGTAGTGTTGAATATACTAGCTAGTTCTTCTCTAACTATTTCTGCTACAGCCTTTCCTGTTGCTCTTGGATTGCCACTATCACTTATATTTATATTTATGTTGACATTAGGTGTACTACCTCTATTACCTTGATTAAGTAATCTTCTGGTGGTATTAGCTGGTGTTATCTCGTCCCCCCTATTTAGATTTAATATTTCAGGACCATTTTCTCCAACCAGTGTACGCCCACCAATAGCGTTTTTTGTACCAGTTGCTAATTTTTGAATGATCTTTCCACCTCTACCTGCTGCTGTTACGCTAGTAGAACCCTTTCCTATGCCCTTGGTATCAGGTTTTTTCGGACCCGCGGATGGTGCAAGATGATCTAATTCTGGAATGTTAGGTACATTTACTGATGGTATTTTGTTAATTAAATCTATTAGCATATTTATTTTGCTAATAAAATAATTTATTTTATCTATTACTACAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP014173|15269:36601|19765_22450_-|AUN19968.1|tail|DBSCAN-SWA MAGLKELTYVVSFESKDSALSSVLNKEKQIDSGFEKITQSSTKAANSFSKIAQSSASVGTIVGNIAKASQGMGYQFEKSNEEAKSIKERLIGVAQASLNLNQNFNGVNTQLSSASSHYAKLREEARATAVGQTTMVNELSRATSHYSKLREESNQIKASTASTNSELSKATSYYAKMKEETKQTSTGYSTINNELRKASSYYAKNTEKTTKIKKDVKDLADAYRDTNGKIRYANGDLVKMQELTRAARKEARGLKSETQEVEKNTKGMSGGIGKIAKIAAGAFTVKKVFDLGKAMMTTYAEFEQGMANVHATMGKISNDDYETLRNAAMKAGETTRYSSTQAAEALNYMALAGWDANQSAGALPTVLNLAAAGAMDIQMASDLVTDSMSALGLKFKDLEGFSDQMARTSQKSNTNVQQLGEAILTVGAVAKDAGLDTIGLNTELGILADSGYKGAKGGTALRNVLLNLTSPQKNVADKLKELGVATADSNGKIRPLNSILIDLKKSMSGMTEAQQQQIKALIGGKENVAGLSILLDGAGEKYDTLSAKIKDSNGASKEMADVQNNTVSGALDMLKNKLSNAMIELVNNQNAGEGFKDALVSISNHIPQLLNDLEWFMNKFGEVAQFVVENKDIIVPAIAGIVTSVITMKIIQTVVDLYGKWKKATELMTGAQAALNVVLNLNPIGLVITLVAGLVAGLIVLYNKSETARYYMDLFFNGLKNVGIAALNVVIDKINYFISKINMLIDLINKIPSVNVPNIPELDHLAPSAGPKKPDTKGIGKGSTSVTAAGRGGKIIQKLATGTKNAIGGRTLVGENGPEILNLNRGDEITPANTTRRLLNQGNRGSTPNVNININISDSGNPRATGKAVAEIVREELASIFNTTSMQLSYTDIG 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MKEIVRTFQMIKQNLKEEIVCSLLGRINAVNPDETVDVEIMHTDNETKEPLSVMPNIPLINICFGNLSIQGVPQIGQWVLVTVIDYDIDNIMLGSTLKNNASERMHNLNDAMAIPIGFKTLNGGEIRVGNTKASITINDKGEINIDTPKMTIGGSGAPHPVIYADGDSYKQSTNLYVR >CP014173|15269:36601|34507_34894_-|AUN19992.1|DBSCAN-SWA MKEKLTKIWRLCETKQLSDIFEEYMKSIGIRKYDGRRKNNNNTYMIDGHCTGWNRVQCYYHKDLFKYSEENLLIVLRKRAGNYFIIERKGIRAFEVDYSGIRHYEENLLNEIMKEHKPLFDSLMRLVN >CP014173|15269:36601|28272_28599_-|AUN19979.1|DBSCAN-SWA METLHTKVVPGDIEFNSPTSYKIIHKKTGKITQNINIQKGPVKENGLNGIFIEDLILICINQLEHFQASEFKCKENESTLRHLYDALATTRSRQYERQLRNVQGKNLK >CP014173|15269:36601|23689_24727_-|AUN19972.1|DBSCAN-SWA MADINVKFSDATQVVSKDGFGKVLILDTERDSDYKEYDISRSIIELQKNYDPQTEVFKIANIIASQDPRPNKVAVFGKSLKSSEDKVADLIGELNLLINEHNNWYRLLCTDLDEKTIEGLSSWCEANEKMFYTQFNTAEITVDLTEKNKTVLGFKKERNNERLDAGMIGLALTRIPGSFTFKFKNIKGLTADIIPDSELQAIKSKNMNAYYKKFDVQDLGTAQLDDGKVASGMYIDQVESRDWVKFRIENEIAKLLMTTEKISYDNLGIQMVVAAVNVALNDAAKNKIILKNDDGVPQFSVTYQTLDKIHIDDRKARRLTGIEFLYVEAGAIHEVGVTGSVVLNL >CP014173|15269:36601|23258_23675_-|AUN19971.1|DBSCAN-SWA MIKPYNPELVNLILTHSRGTHYVTGFSNGSEIACERESDKYVKHTGMKGDTTFARSLDKSGTITFSLKHDSPSNKLLYTLSEGDTTFDTQLVDGNDVSKSKAGGTECVIMKPANLTRGSEIAEQEWVIAVPALDMKYE >CP014173|15269:36601|24731_25259_-|AUN19973.1|DBSCAN-SWA MVNIYDIWNTFIKGLNSIDSKYLFIKSNMIHNIPPFPYATVGILTPYIQDKDDMRGTITHSYNGTGITMQSVKEPKMSFSLTFYTDNYESVFKFMQDTANWLQTYGKQYLNENGIIYIESTKWVDKSTILETNYVYKYGFDVVFRVSDVVTMNVDSVETVEINNKTTNEVLTIRR >CP014173|15269:36601|35833_36601_-|AUN19995.1|DBSCAN-SWA MLNIYDKVAKPLERRFKNKIYKLLMEQLKEIIAATNRVLNDTKDSGISKEEAKKKAEEVIKQFKIDEGIQTFMLALLPEWINAGKIGAKLFEQIQLTNSEGTLFAIIKDEYLEWLNTYGGDQIKLINETTKELTREIIEKGLINGDSTSKIIDNLSSKIYDYSKSRAKNIAETEIHNTIMKANAMSGEKSGFKYKTWISSRDSAVRVSHRSLDGETVKIDEPFSNGGMYPGDSRLPAKEVCHCRCVIKYQMSEKD >CP014173|15269:36601|25251_25593_-|AUN19974.1|DBSCAN-SWA MILDSLKKDLKTYSMGEGYYDREKGEYKESKPADICFKGAILPLSEKDLKYLEEGTYSLDDVKLYTDIGIENNSFVTDIKESKHYKIYGVREYNIIDSTFKRYYMKRVEKING >CP014173|15269:36601|29873_30056_-|AUN19982.1|DBSCAN-SWA MKNIFAISLSTLALLLSQYNYIFQRVKNEKYALAYSITTTILEIFVLLLTFTVMARLNSF >CP014173|15269:36601|33370_33646_-|AUN20028.1|DBSCAN-SWA MKNKPEKHKQICEELNKIYKAKNHDYGDSFGETYKKLGIISAVTRITDKVNRLQSLCTKEQKVKDESIKDTLRDLANYSIMTLIEMEADEC >CP014173|15269:36601|33230_33377_-|AUN19989.1|DBSCAN-SWA MLERIKDNIYQWFCESSIIDRLEELLVYNSSETLSKLGMRLFWYRMGD >CP014173|15269:36601|26804_27131_-|AUN19977.1|DBSCAN-SWA MACKDLYDSIKIVEAKTDTAVDTAGFSSITFAVTTTGAATAKLYEGDTEKDLKEVDKDDYLGNAITADGAGVYKVGYRGNKRYVAVKLTGTGTTAIGILGHADLEPAN >CP014173|15269:36601|30736_31123_-|AUN19985.1|DBSCAN-SWA MMNKWVGIGNLTKDIDLKFTEGGTAVANFTIAIRRNFKNNGEYESDFINCVAFKKTAEILGKYTHKGSKIGIAGRIQTRTYDNKEGNKVYITEIVVDEVEFLEKREQKEETSVPVDFEPVKGDGDIPF >CP014173|15269:36601|18495_19005_-|AUN19966.1|DBSCAN-SWA MPNLCKLGDVYLTVVKEEQISFSNSITERNVEDGAIITDHAKKNMIGIQISGYIFDNKEYPEATINQLRRYSVNRTVLKYYGVNNWRSCIMENFDFTHSASIGNGIEFSIKLREIGIIQKTYVSINAGKLNIPNIEALKEQLEEKKQAKEEAKKAKLEAKKNKGKQAKK >CP014173|15269:36601|16428_16800_-|AUN19962.1|DBSCAN-SWA MNSLKFNNGDLEFVSKRAVIVNGLDQKIQKTAGLLYIVSGEMFFDSTMGMDRELLLDIKLKNTPIEKKKFAVTDALLQDNTVSKVDDIIIDYDRINRKTLISVRYKYKEYEDKIQLGGIKINE >CP014173|15269:36601|22647_23010_-|AUN19969.1|DBSCAN-SWA MSMNADFQVILKKENDKGEIVETPLTITSQSMNPARMIDLHCECIGKNGQTLVGTFVERAVEEGLVVSPKNLIEQINETENVIELYAQIMKELAEFSDNPKRYRLAKETSKLKDKQQSNK >CP014173|15269:36601|35432_35672_-|AUN20029.1|DBSCAN-SWA MSRYARFGTLSPLGAADSKYFLNPEQFEIDVKEHQENHRKKEEETKRILTELINQDTWQEDNFKIITKALRELKEEYKL >CP014173|15269:36601|23033_23243_-|AUN19970.1|DBSCAN-SWA MAVDVKEFEIKYLLSHNTIAHECKCIIPVAKFNKEINEIDAFNIFFLNFNKDLFRNQDTKFELVSVKEI >CP014173|15269:36601|31484_31703_-|AUN19986.1|DBSCAN-SWA MDKYKIIIRYNGGNYSEFTTNEESKMQFINILEDKNKNLIELIKNENGIDLYICKNNICCVEVIDNENNMYK >CP014173|15269:36601|30075_30267_-|AUN19983.1|DBSCAN-SWA MQVTMTMEEYKELEGYKQKYISLTRDILPSNHFMMNGVVDEETIRSISEKLRKQLTGLRRPIV >CP014173|15269:36601|35142_35391_-|AUN19994.1|DBSCAN-SWA MKFNVTLDKEQLDEIANITADKVLSTVEYQKNNEEWHEREMKALKLEISKRDSMLVQKDLVIDRLRETLRKTRTEIKELKGE >CP014173|15269:36601|31704_32058_-|AUN19987.1|DBSCAN-SWA MLKKQIVEMVFDEAEEWQEIKEQYERLGYKIIDWNIDYNKKEFYFKSILTENKKVSFEEAIQAYGKDIYCIWKDDDGIEHKSEYCIRSEWVQCITDQNCEYLTPAEIVKGDWYIKEN >CP014173|15269:36601|32061_33228_-|AUN19988.1|DBSCAN-SWA MDIKEIAKEMTREEFLNSEYIKEIDKEGYFIEYKCVDDEFRTKKHECDCENNVPFSCERCWNNAVKDIKFKEKNNMGINKKIETMNSLEDLKEISKEITREEFLKKAINYNRYCPGQINLKDCSNSDDYSCSTTPCYSCWENAIKDIKFKGETCMEFNWDEFKKGEIVIHCDTKEKAINFLGECNLQNIKWADKEYIIPTKCYFGQYESDTCYRFLNSDFICGLTYKSLKFYKSLDLNIIEWEIEKGENMLNDLTTKKLDYDREYDILEIKEFPEETEFISEGKYISKLKDGFLKARYVDDISNSWTKCFLTKEWLNAKFKLVKKDRKVSFEEAMQAFRKEIYCTLDDGKTKVNYYIESKQSLLLDTNNILAITPEEILNGEWYIKED >CP014173|15269:36601|19069_19702_-|AUN19967.1|DBSCAN-SWA MGVFSKLKENKDKKNLKLTEFNKDNEKYGSQIRSTKTSYLGGHIDFNCGIPIHGTIDIYEKGIVFVPSVKSYKFVGFSIPFQDIINVEYKNEKDIEKDVTMTRLFLLGIYAFGAKKKKVENHDYLILTCNQNGIENKIIFESLNATVLVSDILKARRDSGIISSNTITDKQDNIQDNILEKIKKLGELKDLGVLTEEEFSKKKTELLAKV >CP014173|15269:36601|17340_18153_-|AUN19964.1|DBSCAN-SWA MPRSGDVILSDYWQRKIEVVIGTRRYTSPDFDIEFKISFDTEPIPNEGEIIMYNLNKDSLNNIVRGHSIVVNAGYGEDIGVVISGVIVSVRTKPEGLDKITTIKTLDVPNQMLRKKINYTYKGNPSAEHIIRDVLHYAGGTKPNVLQLRNKKNYPRGYTARGTCLDVINRIANNCGSRLSIHNNTINILMAHKNTEMAYVIGSREGLLSVEPIDEEDNPATHKVECLLNHALAPYSLVQMRGLTLNGNMMVIKGEHDGSSFTTKLEVRPV >CP014173|15269:36601|28599_29526_-|AUN19980.1|DBSCAN-SWA MDLEFKGLQIEIKEITKKGIFKGVASPFNNIDYGNDRVLPSVANKNNGKTVPYLWQHTVSEPIGEVKLTSTNTGIDIEGKLYLDTLENGNPTIPNAYKAYTLMKNNKLKNSIGYKTLDYEYVTEGKKTIRNLKDIDIMEVSAVTFPMNPKANITDVKAEKGGNKVDLKEIEEKLNSIMETLKPQQEEKEFSDKIEEMKSLIETKAGAKISKSNKEKLKSTLKAIKELLGEDEEDQDQEEEEEQEDKKAKDKEDDKSKEKDKKDPKSEEEEEKEPNKQKKPKDDKIGLKADEFKALESLYKNIVHKEDK >CP014173|15269:36601|25609_26122_-|AUN19975.1|DBSCAN-SWA MRIKKTVKKDNSKKLKQAIERIEKAKIKIGIFGDSGSDILMVANVNEFGCNINVTPKMRMWLHYNGLHLKATTTSIKIPERSFVRRTAEEKQNKINKLIQDGLNEVFTFQIDVDTFLNRVGQYLADLMKETLTEVSSPPNHSFTIERKGGKSNPLINTGRLRESITFKIE >CP014173|15269:36601|15269_16436_-|AUN19961.1|DBSCAN-SWA MSKFGITPEGYKRKTYQDLIKEVEKRLKAEDYFGENIDFSDQDPLKHFTAPIMYIVSDLWEILEQNFYNASPRYAEGNQLSDKGMYIGIARKQASKAIGQETFYGEKGTVIYKGFKVATKSGAVFETTREGIISESGSITLDVMAMTAGASGNTPAGTITLIVNPIIGLTSVTNEKDTIKGQDKESDTEFRERYKASVSIRNTNVYDSIMANVLRVTGVSSVHIKENDTMQVVNGIPEKSFRVLVVGGDDKEIAQAIFDKKPGGIQACGSKYIGIKDSMGEIHPIGITRPEYIKINAKITIKTNKDYPIQGNKIIENLTSNAINEFGLGKNVTLFKLFSVIGSANLEGIEDIKVEIGKVGEPLTEKNIVIGEEEVAISNDIEVISNGE >CP014173|15269:36601|26118_26724_-|AUN19976.1|DBSCAN-SWA MNLCTLEELKEFLNIEKDNTNQNDNTFKIYIEGISETIIGMIGRDIFAQDYIEKYKGSNSNALILNNYPINVINTVEYVLDGEVLNTVSEEEYDINTKSGILYKDTVWFRTGGSSYMSGKINFPRRHIRVNYNAGYKEVPADLKLLALELIGTQLGIDNSEGNKKGLKSYSISDVRYEWKDEIKLNIQQISIINKYRGQKI >CP014173|15269:36601|33662_33869_-|AUN19990.1|DBSCAN-SWA MCYCNCSFEEATGECKIKNFTGALKQLPHCPCFIGGNIEDTQEEGTYKKLCNTGEIAVLQDEIESKYC >CP014173|15269:36601|34217_34478_-|AUN19991.1|DBSCAN-SWA MKYMENKEFDIKNLFTEPNFSVDPQKYINSYKKLLNDIEGYINNLKVKIQNEEGIAVFGLTSELILAEYQKELIKQCMNSFSFYNK >CP014173|15269:36601|30270_30516_-|AUN19984.1|DBSCAN-SWA MFTEDEVYYDEVAYDDIEEMQVIEEIRIGLMLNEISPYISKKELKEWFANLQMKKKNFCEDITGNDLIEIAKSCGLKIKEC |
37 | Aeribacillus_phage(16.67%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
40483 : 54437
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP014173|40483:54437|DBSCAN-SWA 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MENKLTHKQKAFCDYYIETGNATEAYKMAGYKIYKSAGVEANKTLNNPKIKEYLDKRLKPLDDKRIAKAEEVLEYLTKVMRGEEKDQLGLDASLQDRTKAAELLGKRYRIFTEKTEINGNINQTVQFVNDLDELEE >CP014173|40483:54437|52006_52729_-|AUN20019.1|DBSCAN-SWA MLYLYDPINNTKKEIDYKLLSGITGKSIKNLMSYKSKNKKISNINSYLIDSNTSKEQLCRFMQNEKIKNEIWKQINNSLNYYISNYGRVKRIYKNGKHKILMPYIKHNKWLFVKVNINGSIKETAIHKLVAKHFIENPNKYSCVRHKNQNILDNYAHNLEYIDRKTLGEKTAYMSKAIPVFKIDTTTNEIIDEYESMAQAGRCNFLHRETIRQCIKGKLKTAGGFKWTIDTGILNNKEAI >CP014173|40483:54437|49500_49614_-|AUN20031.1|DBSCAN-SWA MKLYTFVKSQEEQSDFIKIALDFYIKYLENGDKNDKK >CP014173|40483:54437|42680_43085_-|AUN20008.1|DBSCAN-SWA MNFISTEEFLKQPKKVQNIFKNWWKPQAGDLVHDKINIVGVIVPVLCIGDYKSNLDKNKVTPLFQMHQLIEFIEDKTDSIVQTSYCFKENEATKRGYMLHLMQDNGGASSHYHNLGEDLLQAYWLIACRIANNL >CP014173|40483:54437|49991_50363_-|AUN20015.1|DBSCAN-SWA MKRENIIGKSEKDFEELSKRKPSKVGKDVTGNWRVLTISKQCKIEEYILSYYKKNFKNKKEIHGIVNFTTNTTTRIIDLGEFIEIGILEYTKDEEHDAKSLFGGIELKQYWIYKDNGDIEEIK >CP014173|40483:54437|48796_49201_-|AUN20013.1|DBSCAN-SWA MKVCVIYSNAKVEDLKKKQKIKHNFNMELVAKHINADNKLKKQAVFVLGSLFYVQDVVSAAGDLAKIDKAGNTILGIARKIGYWVCIIGCIIDIIRSLMQGDTKSIAKIMMKYALAFAALYIFPWMLDLIRSIF >CP014173|40483:54437|41207_41471_-|AUN20004.1|DBSCAN-SWA MLHFHEYKLLGVYYNVGYSIYASHFRVCTYKRLLCMKCGKVKDIKIQSTLTGGKDLTKAYINSLIKNNILNFIEMDSKTIKEIANQL >CP014173|40483:54437|44193_45438_-|AUN20009.1|terminase|DBSCAN-SWA MAVIKLSKVIGKGYKDFWNCTKRYRVCKGGRGSKKSTTTALNIIYRMMKYPNTNTLIIRKTFASHKDSTYAQLKWAITQLKVNHLWEYTKSPLEIIYKPTGQKILFRGLDDPLKITSITVEVGYLCWCWFEEAYEITNEEDFNKIDMSIRGELPKGLFKQITITFNPWNERHWLKKRFFDSEDDEILAMTTNYKCNEFLGKDDIKIFEKMKETSQRRYSIEGLGNWGIAEGVIFDNWQEKEFDYKDIAKKPGVIATNGLDFGYKADPTAFICLLVDKENKEVYIYDEHYQKGMLNDKIADMIKYKGFAKEQIIADSAEQKSIEEIKRDGIGRIKPARKGKDSIINGIQYLLQYKIYVHPKCQNTQIELYNYVWDKNKEGKQLNKPIDDYNHLLDALRYSMEPLQENKRFRAAWC >CP014173|40483:54437|51370_52003_-|AUN20018.1|DBSCAN-SWA MKVHLLSYTINPVETIYRAFRQCYAKGTARDMEIPSNEEMINFICKWMGKGHESPVEHVSFTFSIEGVSRALTHQLVRHRIANYSQQSQRYVDGYNFEFVTPPTIKKDDTFKFIYDDFMKECWFKYDYLVSNGVPKEDARYVLPNATTSNIVVTMNLRSLRHFYDERSCMRAQWEIRELANKMMVRAKEIIPFADYKAKKCGITCFECES |
23 | Clostridium_phage(30.77%) | terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014174_1 | 1036269-1036361 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of CP014174_1
|
1 spacers
spacers of CP014174_1
>1.1|1036298|35|CP014174|CRISPRCasFinder AAAACAATTCCTCTTGAAGGTTGTTTGTTTTTCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP014174_1
The CRISPR arrays of CP014174_1 >merge|CP014174|1|1036269-1036361|CRISPRCasFinder TTGAACAATAACATGAGATGTATTTAAATAAAACAATTCCTCTTGAAGGTTGTTTGTTTTTCTATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT >CP014174|1|1|1036269-1036361|CRISPRCasFinder TTGAACAATAACATGAGATGTATTTAAAT AAAACAATTCCTCTTGAAGGTTGTTTGTTTTTCTA TTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
>CP014174.1|AUN20913.1|1035489_1036047_+|adenosylcobinamide-kinase/adenosylcobinamide-phosphate-guanyltransferase MSNKNKVVLITGGVRSGKSEFAESLLQKEKSVLYIATAKITDKEMEHRVEKHKERRNSTWKTYEGYKGLGKIIKYYDEKNILLDCVTVMTTNLMFHKEIDYENIKEEELDEILEGIKKEFHDLIISVKEENKNIILVTNEVGYSIVPAYKLGRIFRDFQGIINKFIASLSDEVYLVTCGIPLKIK >CP014174.1|AUN20912.1|1033604_1035212_+|LexA-family-transcriptional-regulator MKLESGQNRIAKSKHLGYGLLRGSKGTGKTTAAIYRGIYLKNQYCMYDKDKVLILSKNEENLNYIKNIYNDAEKTGVQYITLFSYNEDKLHFSSIYKIINKYFWEYIENNNLQYELASEKEKLAIIEECINDIKNEYKNLKYIDIKYSKFFLEEIQWMKDCMYYDLEEYKKADRIGRKTKKGEGPQRIIKNSKIREAVFKIMLLYNEKLKYKNLVDYSDVVSMSLKEASKNKENKFNHIIVDEAQNFTKLELKFIEALGRKNIYSSILFIADKEKNLNPKGWITKGRKLNNLQLGFEFKRFNLNKKIGINVKEEVETYIDDCNLKRKASNINTKNEDVSNVDNSNSEDKGLDKNIKNEWHKDKVNYDMDKFEYVDMKHRRSYEFSRGLGSNEEIIVEDQGSKEEYKEDELTKLPVFNDIAAGEPILMNPCVEGEFNIPKYWVRGMKNCFILKVKGDSMIGANIEDGNHVVIKRQQMAENKDIVAVNLEGSATLKRLLIKKSGAVLMPENKKYKPIEILEEGASIIGIAVGIIKGK >CP014174.1|AUN20911.1|1032980_1033526_+|N-acetyltransferase MGKIKQAKYNINGKTIIIRHAEVQDAEQLINVTKKVNQETDFLLKDPGEVCLTIKEEKEFIQSQIDSQVDLLIVPEVDGRIVGVCSLNGNTNKRIRHSAQFGLAVEKEYCGMGIGKNLMKSGIQWAKENGIFRITLEVDINNYRAISLYLKLGFEIEGTLRNDKMLSDGSYTSGYAMALLL >CP014174.1|AUN20910.1|1030932_1032639_+|hypothetical-protein MDRFSFLKIEWPEIYQIICNVEEKSKEDSNITLIELAQIAELITKYILKENHIEKNTELLDEINLLKDCHNLNADIVDFFYKIIIVSNKAIYEDYSDSIIAKSFLDKMFEILVWFAIEYGKTDYRKVDLSNMIPEDKDIFNKYIKSKSYNYTEKNIENETMIQPFTIENEEFFKEENNDDINRYEQDVFETNEEFHKRIRNHEIFTLGRIFIEKSNINETDEIVAFPFSVYKSIQIKIPIIDMLYIERAEFENLSIEEEEYILFSKLDIINDKICIDINNIYIEVSNNKCKVHAVVLDISYYESYEKYRNIIYSKKPIPIGMIKFNKNKYDINKNEMPVTINYYDWIQKYILNTKAYIEIHRYEAKTLCKENLYYILNGKLDIFDKKLLIREYYIQSKSLNKNFRINLHSSDPMNKLRCLVDKEEILAMNIIGEMYCKEQNYKEAMYWYKKAAEKGNSTSMNKIGVMYYEGKGVEQDYQKAMYWYKKSSQEGNFTAMSNIGSMYYNGQGVTEDYKKAMYWYKKSYKEGNFGVMRDIGSMYYEGKGVIKDYKKAMQCYKKASQIDNFIK >CP014174.1|AUN20909.1|1029979_1030528_+|biotin-transporter-BioY MDKKLKVRDMIYSALFATIIGVSSYIIIPLPISPVPITAQSLAIMLAGCVLTPIQVVLSMVTFLLMGIIGIPVFSGGTAGFGIIVGKTGGYLIGFLVGAIIISLLVHKNKSLVNMLIACFIGGIIVVHILGSAWLGQVTSIGIKKAFLLGSAPFIPGDLIKAVVAVLIGRKLSKEMKRIRTQ >CP014174.1|AUN20908.1|1028596_1029628_+|two-component-sensor-histidine-kinase MMNNKISVKMVVAFSLIVFFIVTSAVVISGLVVVFLSRFNVFTQPNPLILLGWLGIISIMVSTAIAQIIGKKVLSPISDLNKATKEVAKGNFNTRLSENSWTDEIREMAHSFNIMTHELGNIETLRDDFISNVSHEFKTPISAIEGYATLLQDDELSDEERREYIHKILISTKRLSSLSGNILQITELENQKILPLEQKYYLDEQIRQTILLFEYEWTKKNIILDINLDNITYIGSKELLAQVWQNILGNAIKFSHQNGTIQVTLTQTNEEVLITIKDNGIGMSEEVKNRVFEKFYQGDSSHYSDGNGLGLALVKRIIDICEGTIEISSHEAVGTEFTVKLPK >CP014174.1|AUN20907.1|1027928_1028600_+|DNA-binding-response-regulator MFKVLVVEDDPALRKLFCTVLNKNGYKSIEAKDGDSALDILYREYIDLIISDIMMPNMDGYTLTKLIRESNNNVPILMITAKETFSDKQEGFRVGTDDYMVKPIDVNEMILRVGALLRRSQIINERRIVIGETTFLYDFLSVKYNNKELVLPQKEFYLIYKLVSTPNKIFTRQQLMDEIWGIESETDPRTVDVHINRLRDRFKDNKDFNIITIRGLGYKVVKQ >CP014174.1|AUN20906.1|1025408_1027769_-|sulfate-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLQIKDLKKVYTTGEFKQTALDGVSIDFRQSEFVAILGPSGSGKTTLLNMLGGLDQYDSGNMIINGLSTKKFGESDWDTYRNNSVGFIFQSYNLIPHLSIVDNVEMGMTLSGVPKSEKRQKATYVLEKVGLGNHIHKKPNQLSGGQMQRVAIARALANDPEIILADEPTGALDTQTSEQIMDLIKEIAKDKLVIMVTHNPELAEEYADRIVSFSDGKIVSDTNPFVSENNSNDYKPKKTSMNFLTALKLSGNNIVTKKWRTALTAFASSIGIIGVALVLSLSNGFNKQINEFEKDSLSNYPISIEQNSMSLGMSPSSKSKDKEKTEFPNKSMIYPYDSSENAAVHANAISTEYVDYIKKIDSSLINGISYTRNVNMNILKKQDGKVVSMNTSAAAFSTYPSKGDSFETDYLKSYYDVLAGSYPKNEKELVLVVDKYNQVDTNILEALGFSANSKNINFDSMIGTEYKLIYNDDYYTQSGKYFTVNGDTTNLENLYNNKNAVTLKISGIIRIKEDANVSNLSTGIVYSDQLAQDFIENAKNSQIVLAQKEAKYNVMNGNLLTEKTSTTTAAVHPTPSMATNTTSNVETKDDVLASLGATSSPTSISIYPVNFEAKDNITNYLDDWNKKLKEEDHIVYTDMASMITSLTGNIMDGITIVLVAFAGISLVVSMIMIGIIIYISVLERTKEIGVLRALGARKKDITRVFNAETFIIGFCSGGLGIAITYLLTIPVNSILYKFTDLNNVAQLNPLHAIALVITSIVLTMIGGAIPSKMAAKKDPVIALRSE >CP014174.1|AUN20905.1|1023437_1025045_+|cell-shape-determining-protein MKKKIYSSFIVLSLIISMALIYFLMPVFSVKFYSFYIVFIIIALLLSINVSLNKGKESSKIYGIPVILIGLFIVMFIISLPIFRASSYKSLLPTPKYEEFSKNITPIDIKEIPTVNQKYAELLADKKLGEETSLGSKVELGTLTLQNVNGKLYYVAPLVHSGFMKWLLNDSTPGYITVSATDDKDVKLVTKLNGKDIKIRYQPKGFLNDDLKRHIYLKGTMNRGITDLTFELDDKGNPYYTATIYENKVGMSGQKAVGTAIVNPETGEVKKYTVENTPKWVDRIQPQSFVENNLKKWGKYIKGFFNFSGQDKLKTTEGTGVIYNNGKCYYYTGLTSVGKDESSIGFALVDTRTQQTRIFKIAGATETASMKSAEGKVQNLGYTSTFPILINVDNVPTYFTTLNDKNDLTKMFAMISVTDYNIIGTGESITECKSNYIKNLASKGNLINVGSTGKEENITDTIERINSYVVGNSTIYTFILKDHKDKIFNAGISISNELPITKEGDKVNIRYVDTKQDTINITSFDNIEFKQQSIK >CP014174.1|AUN20904.1|1021580_1021790_-|acetyltransferase MDSTAELEKSKNFDERLSIVIDSSREEIVMDGIVPSSTYLAIRLVYNKLIGMIDIRHKLNDYLFQNDIL >CP014174.1|AUN20914.1|1036472_1037237_-|MerR-family-transcriptional-regulator MHYKIKEVADMAGISVRMLHHYDKIGLLDPESVSDAGYRLYSDENLDRLQQILFFKELNFPLQEIKIILDSPNFNKKEALETHKQLLLEKKIRLEKIIQSVDKTISSIEGGIKMNKKEVLGAFDMTEIEEHQKKYSEEVKNKYGNTSAYKESNEKTSKYTKEDWNNIMKDWDIIYKKLANLMDKNPDDKEVQEYIHQFREHISKNFYDCTPEIFRGLGELYVNDERFTANIDKYKTGLSKFLREAINVYCDNIK >CP014174.1|AUN20915.1|1037942_1039424_+|cobyric-acid-synthase-CobQ MAKIMIQGTASSVGKSLIVAALCRIFKQDGYSVCPFKSQNMSLNSYITLDGKEMGRAQVLQAYAAGLEPEAYMNPILLKPTSDKKSQIIVNGKVYGNSTAMEYHNLKIKFKDMLKEQFEKLEEDFDIVVMEGAGSPAEINLRDRDIVNMGMAELVDAPVLLVGDIDKGGVFASLAGTMLLLNEGEKERVKGTIINKFRGDVEILKPGLDMLEDIIHIPCLGVVPYTRLQLEDEDGAVEFNKKAYAPIDIAVIKMPHISNFTDLDALKSEEDVSIRFVTSKEEFKEPDLLIIPGSKNTIEDLLYLRQCGLEERIKEYSREGKIIGICGGYQVLGSKIKDPYKVETDLGEIDGLNLLDMETIFEKEKVTTRVSAKLINEETENIVYGYEIHMGISKYSENIKPLFKIYDKNGEKVDYFDGAINEKGNVMGTYIHGVFDGVVFREKIINELRVKKGLKKKKSQMYEHMREKELDKLADIVRQSLDMEKIYSIIGMK >CP014174.1|AUN20916.1|1039425_1040388_+|cobalamin-biosynthesis-protein MYLNITTNFIDIIIAVFIDWIVGDPYWFPHPVIYIGKLISFLEKKFRARVKNEENLKIYGEVIVMIVCFASFLIPFMILQAFKFNFYIYHGLNILIIWTTLAAKCLHEEAIKIYYALYKENIEEARLKLSYIVGRETKDLIGNEIMRADIETVAENASDGVIAPLFYAIIGGAPLAMMYKGINTMDSMLGYLNDKYRYIGFFPAKVDDIFNFIPARLTGILMCISAPIVGGNPFKSFKIMIRDRKNHKSPNCAYPEGATAAALKIQLGGTNVYFGQVVEKPTIGDKIKELAPIHIKESIKLMYASEALMIVMCTIIFKLF >CP014174.1|AUN20917.1|1040606_1041695_+|aspartate-aminotransferase MHGGDIYTEGILKEKELIDFSSNINPLGLPDSFKDNLQEALNWVQVYPDIQYRNLKRNLIDYLSFSLGYFYKEKVEKPNIKEENLVLGNGAVEIIDLAISNLKSISILVPSFVEYELCAKKWNVQIDYCNLNEDMTYNYENIKKSLEKTEGIILGNPNNPNGSVIDKEKFIYILDYCEKNNKIIILDEAFIEFTGKNSFSFLNLCERYKCIFIIRALTKFFSMPGIRFGYGISFNNEFLNKIREKQNPWNINCFAEIAVKYVLKDEDFIEKSINYIEKEKIFMHENLKKCDLFHSVYSTYSNFVLCKLKDITGDELKNRLLEKGFVLRVCKDFKNLNNNYVRFAIKTRELNQALVNILKEIK >CP014174.1|AUN20918.1|1041968_1042688_+|cobalamin-biosynthesis-protein-CbiM MKKKYLFLLTTALVLALSQSAYAMHIAEGFLPPKWAALYFVLSAPFIVIGVKHIRQKTKKNKDLKMLLAVVAAYAFILSAMKIPSVTGSCSHPTGTGLAAIIFGPFVASVVGVIVLLFQAILLAHGGITTLGANTFSMGIVGPIVSYLIYKGLKNKNQKLAVFLAASLGDLATYTVTSLQLALSFPAKTGGVMAAFAKFATIFSLTQIPLAIIEGLITIMIFEFMMKYSKEELKTLSEV >CP014174.1|AUN20919.1|1042691_1042991_+|cobalt-ABC-transporter-substrate-binding-protein-CbiN MKKQNIIITIVSVVVILASLFIGGARGGEFAGADDQAEGIIEEMNKDYEPWFESIWEPPSGEIESLLFASQAALGAGVIGYYIGKKKNAKNNNASIKNQ >CP014174.1|AUN20920.1|1042953_1043652_+|cobalt-ECF-transporter-T-component-CbiQ MLRTIMLLSKTSKLSNIHPLEKVILSIIPIVILGFTQNYIIVFCNILFFLFMNLISKNNKKIFAKITLEVTAFAAISSITFAFDYGIVYTLTLIFKSVSAGLCLSFFSLTTPIDDMLYCLGKKEYLKDICDIAKGMERFLVVINDEYNILYSSIKSRGGFDTFKLTIRNTGKMAALLFINTLSRWKIIKEGLDSRGYVGYMPYLDRNFDFSYIRFLSILSYIILILLLVIFF >CP014174.1|AUN20921.1|1044060_1044723_+|precorrin-2-dehydrogenase MEWINLQEKYNFIALKSKRIRILIIGGGRAAFIKGKAFLDRGCSLYILAPKFSKDVLDLKTYDNVEFIKNNYDEKYILDKHLVVIATEDEEVNNEIRNNCDALSKLYIDCSDKDKSLCFNSFQRESKTMVLALNNKIGCPKATYFIGEKIKKDLERYDNYIEYVTYIRSITKNNPMKDEIIDFICSNDFHFFFEKGYGNLILSMFYGGMDFEFCNSHTKK >CP014174.1|AUN20922.1|1044691_1045564_+|hydroxymethylbilane-synthase MNFVIATRRSKLAQVQTEIIIDLLNKKHDIECEKLLIETVGDKILEVSLDKIGGKGLFVKDIEVAMLEQRADAAVHSMKDVPYEMPKGFEIIAIPEREDVRDAFISLDNIKFKDLRKGAKIGTSSRRRAAQLKLLRPDLDIVPIRGNVQTRIEKIKKENLDGIILAVAGLKRVNLDHLITDYFDTKEMVPAIGQGALGIEVMEEHPKKDLFKDLDHYNSKICVLAERAFMRELDGDCHSTIGAYASIKDNIMHIIGIFERKNKIIKKEITGTKDQYEKLGISLAEHILKD >CP014174.1|AUN20923.1|1045699_1047160_+|uroporphyrinogen-III-C-methyltransferase MSKVYLIGAGPGDEELITLKAIRALKKCTAVMYDRLANGELLKYLAPNCEIYYCGKEPGCHYKSQDEINKMLVKLAKEGHIVGRIKGGDPYVFGRGGEEALDILEENIEFEVIPGVTSPVSVLNYAGIPITHRGISRGFHIFTAMTKDKLDIDWKSVVNIGGTLVFLMGLGRLELITKGLIENGMDKEGKVAVVMKGTTSKQKKVIGNLENIVEKVKEAKLESPVIIVVGEVVSFSDKLNWYEKKPLFGRNICITRTKEQAKELKVQLLDLGAEVTEINSIEIKNTEDNLKSYLSKLKEYDYIALTSVNAVKIFFDYLIKENIDIRNINAKFAAIGPATSEAIRIRGIMPSIKSKHFVAESLFEEMRKHIQKGDKILVPRSKDARPFLVDALRKEGCTVDEVHIYGTLCGQCTYTERFENADTVLFTSPSTVRNMISMVGIDSIKEKSIIAIGPITARELDKNNIECSICDEYSINGIIDKLLDLN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP014174_2 | 1103478-1103569 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of CP014174_2
|
1 spacers
spacers of CP014174_2
>2.1|1103504|40|CP014174|CRISPRCasFinder CTATACTGATGACCAACAACATTAAACCCTGTTTCCGTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP014174_2
The CRISPR arrays of CP014174_2 >merge|CP014174|2|1103478-1103569|CRISPRCasFinder AACATTAACATGAGATGTATTTCTTTCTATACTGATGACCAACAACATTAAACCCTGTTTCCGTTGAACATTAACATGAGATGTATTTCTTT >CP014174|2|2|1103478-1103569|CRISPRCasFinder AACATTAACATGAGATGTATTTCTTT CTATACTGATGACCAACAACATTAAACCCTGTTTCCGTTG AACATTAACATGAGATGTATTTCTTT
>CP014174.1|AUN20986.1|1102758_1103250_+|hypothetical-protein MKKRNNLIIVCLAVIIIAGSGIVYKNYFTNIDSNSYLSSKDESERSIFCHEDDKSSKNTHSFDFKKFDGKWSLMKFTSSKGNKININDNTKINKGKFYIVILDSQYNIIAKKNESNQNGNINFTTPKDGKYLIRIVGAKASGKFDVSVNSDRNIDISHIDFFD >CP014174.1|AUN20985.1|1102183_1102723_+|signal-peptidase-II MKKSLRVILLVLALVLIDQSIKIYIYNNLMNKEFYIFGSIFGFKPIINTKYSYFNSFGNMGIGLITHIVLNIVMLFLILIIFYFIKERYSNNKIIYCLFVLVCAAAICSLIDKVFWGGSLDFISFKNFFIFYLKDVYISVFEIVTMLCVILNYKKLEAINEKTIYNDFKSYIKLKCFKK >CP014174.1|AUN20984.1|1101945_1102128_+|hypothetical-protein MKDIIIILALIIDVVMLVVGKKTKKYKYVNAIGKVIILVCLAMAVPDFIRGFIDGMTAVQ >CP014174.1|AUN20983.1|1100725_1101580_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFIYDTLENIGIEILHETFLNAFSDYQVKMDLPLFKFQHMLQRRGYVSKVSIGAFNNETLVGFVLNGVRNWDGKLTAYDTGTGIIEAYRKQGITSNMLLNVRRLFQQMGVEQYLLEVIQSNTSALQLYKKQGFKILRDFQCFHLDKNKYNPITTYKVEHVDMINPNDWRELTEFWDFAPSWQNSIDSINAVSDSFIYSIVHLDDNIVGYGVIDKKTGDIPQIAVNKNYRRKGIAKSIITDLMKNTESYNINVINVDGRSKSMKDFLLKLGFECGVSQYEMILKL >CP014174.1|AUN20982.1|1100356_1100680_+|competence-protein-TfoX MASNIEFVEYVCDQISGVGDITYKKMFGDYGVYCNEKIIELICDNQFFLKITKAGKDLLHEAIEAPAYKGAKPSFLIESLDNREYLAKIVSATYKELPMSKPKKTKK >CP014174.1|AUN20981.1|1099410_1100256_+|glyoxal-reductase MQDIKSYTILNNGIKMPWLGFGTYKVENGDTVIQSVKEALKIGYGHIDTASYYGNEEGVGTAIKESRIPREDIFLVSKVWNSEQGYDKTLKSFEDSIKKLGTDYLDLYLIHWPQPLSKETWKALEKLYKEGRVKAIGVSNFLVDHLKWLLEDAEIMPMVNQVEFHPQLIQKDLIEFCSKNNIQLEAWSPLMRGKVFEIELLQDIARKYGKTISQIVLRWDLQMGVVTIPKSINPSRIKENADIFDFEISKEDMDKIQQLDKGLRVGSDPNKVYPCQSISNK >CP014174.1|AUN20980.1|1099056_1099293_+|hypothetical-protein MSRKNSFSCVLVYGKKEIEQFESRRDEFSDYMKEIFNETKHYHDGKWLLIRIQDDKYINELIEMIKIKKKSKKNILHK >CP014174.1|AUN20979.1|1098433_1099027_+|hypothetical-protein MFRFNTKEGKWFFEPKNYLIEEDKVEIITEPNTDFWQRTYYGFRNDNAHVLYVTTDEEYFSFTVKTDFNSTALFDQCGLAIYQNSENWAKACIEFHDNNTSWLGSVVTNHGYSDWATMDIGSSVKSMWYRLSRRGSDYCFENSFDGINFKQMRIFHLFEGAKEINFGLLACSPSKNSFKATFTEMKITDCLWEEHKA >CP014174.1|AUN20978.1|1097837_1098281_+|N-acetyltransferase MEIKIIKENKRSFLDLLLLADEQESMIDKYLNRGEMFALYDGDLKSICVVTNEEEGIYEIKNLATYEKYQGQGYGSRLIKFIFEYYKDNCKTMLVGTGDSPLTIPFYKHCGFKISHRIKNFFIDNYDHPIYESGVQLIDMVYLKKDF >CP014174.1|AUN20977.1|1097346_1097811_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MNIRMYQLEDCREIVELFYNTVHSINSRDYNSAQLDVWAPKEIDIVSWDKSFSQHCSIVAEESDVIIGFGDLDATGYLDRLYVHKDYQGIGVATTIVSELENYAQENHISIVTTNASITAKPFFKKRGYEVVKEQFVERNGQFLKNFIMKKVLR >CP014174.1|AUN20987.1|1103929_1104937_-|adenosine-deaminase MNFKKLPKIELHCHLDGSLRIDTILDIAKKDNIPLPSYNKKELINYVSIMDDCNSLDEYLNKFFIPNKVMQTKENLKRIAFELLEDVAADNVKYIEVRFAPLLHVEKGLNIEEIIESVLAGIKEAEKLYDIKGNLILGCMRNMDIPSAFEVVKKGAKFIGKGVVAIDLCAGEEPHFPGKYIEVLKLAKECGYRITIHAGEAGVGENVLEAINLLNAERIGHGIYIKNCAEAYKLVKEKNIPLEVCPTSNLHTKAFESYETHPFMDFLKDGIKVTINTDNMTVSNTTITKELEMLNKFCGLSIEDYKILYLNAVEASFASPETKEILKSYANEITA >CP014174.1|AUN20988.1|1105830_1107999_+|phage-infection-protein MNRFKNIIKVYKRDIKSLNKNFIAIIIILGVCVLPSLYAWVNIKACWDPYENTSTVPIAVINNDKGTDFGGKELNVGNEMVKKLKSNDKIGWKFTNKKEADMGVIDGTYYASIEIPKDFSADIVSVLSDNPKHPEIIYKVDTKENPVAAKITGMAKNTLINEITTTFITTVNKTVFSSINEIGRNLEKNKNEIIKLKESIISMNRNMDLILAGLESVNTNSKNLNEYLSVVRTTFPEITKGLENINSKSSNTNETINQTNNIFNNSLNNINVILKQAISTNNRVQSVLDNLIVLNNESSSNEANSSIANLIMDIDSANKNIDSMVEFLEKINNTKPNTEVSKFIVSLNNVKGALNEEKQKLLKIQEIASNSSKVNENSINELKRNISNTNKQIESVMNVFNSNTRQELSTIINNFKNSIQDASKLIKAGNGLNTQIENLLATSTKGADLSAKLSKELIDKLTEYKGIIGQLSKKLELVSNDDLIQIISVLQNNPMLMSQTAAYPFNIKEEAVYTIPNYGSAMTPVYSVLALWVGTLILVSLLKTEVVDFEGSENITIRQKYFGKMLTFITLAAMQGFIVAVGNKAILGVYTVSFPLMLAFSVVSSIVFAIITYTLVAIFGKFGNAIAIVFMILQLAGSGGTYPIQVDPLIFRILQPFFPFTYSIGGFREAIGGPLVSSVILDFIMLILMGGIFVLIGFFLKSPLHHKISKFDEDFKASGISE >CP014174.1|AUN20989.1|1108024_1110184_+|phage-infection-protein MKKVFRIFSRDLKNIVKHPAAIIVVLGLCFIPSLYAWINIEACWDPYANTGNLPIAIVNKDEGMMIRGKYTNVGNGIIESLKGNKKMGWVFVDEWQANYGLNEGKYYALIEIPSNFTSGLASLKTTDPQKPNIIYRVNEKSNAIATKITNAAKGSLAKEIQTNFVYTVNKEAFKLLNNTGGQLEKNKSKILGIKSTLELGNKSIGEVKNIIDDASKDSESLKQYFNDTKDKLPLITDQINNLQKATEASKNLVNETERDLNGIAKNINNDMIYRESTNSKINSILTNLKEYNNVSNNSEMIKLVDEASKLCDSINSNIDGTIKSLEIVNILKPNKIIEELINSLKNLQEKVNGEKNKLTELKNKISTSNNNKQNINQVVESILLLNDEINKNMRNTSNIFYNQTTMIIENTAKGLNNRLDTANDILDTTKLVIPQLKALGDFGVGTSDAALKDGKKINNKLAEFKKTINKLEEKTSSLTEDNLDKIINLTQKNPEQMASFISSPINIKEEEIYNTGIFGVGLTPFYTVLAIWVGVLLMSSLISVEAEEFEGEKKLTHLQVYFGKLLLFLSIAIIQGVIVTLGDVFILGIKPASMGLLMVFTIVTAITFTFIIYTLVSIFGNLGKAIAVVIMVFQIAGAGGIYPIQTNPKIFGVLQPLWPFTYAIAGFREAIAGPVRAAVIKNLGALFIFSIGSLLLVVLKKPLHKVTEYMNDKFIETGL >CP014174.1|AUN20990.1|1110657_1110960_-|hypothetical-protein MGKEPSVKSSANLLAIVSLIMSIIVILPILNWLFKITPWQKLEGLPLFFGLLISPFGFILGILSIKIQSNKLGKIGVIINTLLFLLPFIYMTLGVLILGP >CP014174.1|AUN20991.1|1111150_1111906_+|hypothetical-protein MPFTFSHPAIVLPLEEKWNKYFNFTALILGSMSPDFEYFIRFKPMATIGHGLIGFFLYNLPLCFILAYLFHRIIKKPLIAHGPKPIDSWYYNTALKPWRINSLAQVLVFSYSAIIGMITHVFWDSFTHKGGKFVILFEGLRKNIEILNYDIPVYKILQHGSTLLGVIFIILYIYSKRNKRINWKRINRIPATNNKEKISYFTTIFCTALIVLFVYISLLKVNFSIKNVGSFVVTFINGLFIGTIIASVKYR >CP014174.1|AUN20992.1|1112150_1114280_+|DNA-helicase-RecQ MLEDAKNLLKKHFGYNEFRKAQEKVIESILKKEDTVAIMPTGAGKSICYQIPALIFEGVTVVISPLISLMKDQVDSLKEVGIEAAYINSSLNNLEIEERIFNAREGLYKLIYIAPERLESDSFVRSLNNLNIALVAVDEAHCVSQWGHDFRPSYTKISNFIRKLSKRPSVTAFTATATETVRRDILNSLELQNPKVFVTGFDRENLSFSVIKGEDKEKFIFGYLESNIGKVGIIYTSTRKEAESLYNKINKKGYKVGVYHAGLNDEERKKTQEDFSFDNIEIIVATNAFGMGIDKSNVRFVIHHNIPKNMEAYYQEAGRAGRDGEESECILLFSPNDIRLQKYFIDESFLSPERKNNEYNKLRAMVDYCYTSKCLRSYILEYFGEDALEEKCNNCSTCNDNREEKDITLEAQKIFSCVYRMKERFGVNMVADVLRGSKNKKLLSLDLDGLSTYGIMEEFTQKDIVALMNKLIADDYMVTTDDKFPVVRLRQKSYDVLKGKEIVSIKVSKIEKKVKADNELFEILKQLRKTISQEESVPPFMIFPDATLKELSEYMPTKEEDLLKIKGIGERKAKVYGERFIEAITEYMNEKGIDINNMDNYDSAKSNKESKIKTHVLSYNLYKEGKTIKEIAEERNLKAITIQEHLFKCLSEGMEVDLDNFIKKDYEKLILDTIKKVGGTKLKPVKDELPPEVDYMCIKSVWYKYKDII >CP014174.1|AUN20993.1|1114451_1114883_+|ferritin MDELDIINENQLGIAANNEKIKTDLEGQFRAETGEVGLYIAMARVAQRQGFPEIAEVLKVIATEEAEHAARYAELNGKVSDCTKENLQKMLQGEIGSNKMKKSLAVKAKEENIDEVHDFIDEASRDEARHAKMLKGLLDRYFG >CP014174.1|AUN20994.1|1115165_1115711_-|phosphodiesterase MKLFFMSDIHGSAYYLEKALHTFEEEKADYLIILGDELYHGARNPLPKGYDPKKVTEILNSYKDKIIAVRGNCESEVDQMVLNYPIMSDYSIVLYNGKRLFLTHGHIFNKDNMPNISDGDALIYGHTHIPLAEKTNNIFVINPGSITFPKENTPHCYGILSDNLFKIKTLEGNTFKEISLI >CP014174.1|AUN20995.1|1116347_1116731_+|two-component-system-response-regulator MSSSQKNILVIDDSASIRSFVRNILEKANYKVYEACDGEEGIEVYKKCGNIDLVMTDIYMPKKSGLEVVVELQNKYKGTQIIVFSDGGKENFTNDSGVCEALGAAYFIRKDLIKDKLLDLVNIIFSK >CP014174.1|AUN20996.1|1116845_1119320_+|hypothetical-protein MIERNLFNIINKYLPMGSQIIVEEDNNNEPLIIRANLNGYGLGEIIVAYRWQEENYIMVLERYCNQWSVIDNIRGKGYDISYLKVAPITDNAMDNLIIGWRRGAIWSELDILQWTPYGFKRVIDEGIYYSKIEVENMKSVKAMNDKNEIALWLHDTAEAYKVEIYRWSLGKLVKAEDVYPYYFKKVIDFYKTKLQEEPDLPVYWYYLADAQIKGEMYEDALKSIDKALELPKAYPSKKELIKLRDYILYYKKCKNINLYPAPMNTIKGVRWGYINEKGEFVIKPLYNLALEFQCNGLAVVEIDNLYGIIDENQNYIVKHKYGFISDFSEERAIVIDNERFNIINEKGEELIPKTENYSYIGNFKEGRAQYGVIDSNKGYLYGYLDREGRIIIPAQYEYGNDFYEGKAVVRIKENEYALINIKGEILNKYEYASVGNLREGLLSFKKNMGEKYGFIDEDGNVVIKPQFTYAQNFSEGRSVVNVSGNIMNNYGVIDKEGNYIITPKYNDIILLGENRVAVGVAIDKTSPFIGSKYAIADTEGNILTDFIYYGILNYKNGIASAYDDKNTFFIDKEGNKIENLPIVEGSGTLTVENELIKAYVDYKISYFDKEGNLIWEENSVISLNNQYKVIEEKYKPNKDYLVYYPKVQGIGDKALEDEVNNRLKILSEVKPIEENVQLEYNYLGDFKIEFFNKNLLELELDGYNFHFGAAHGMPSKIYTKIDLTTGEFYELKDLFKEDSDYVKVLSDIIGEQIKNNPEYSYIFPDSYNGIKEDQPFYVSQDTLYIYFYPYEIAPYAAGFPTFKIPYKHIIDIINEAGAFWMSFN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014174_4 | 2286356-2286715 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of CP014174_4
|
5 spacers
spacers of CP014174_4
>4.1|2286386|35|CP014174|CRISPRCasFinder,CRT CTACCAGAAAAGATACAACAGGCAATAAGAAGCCA >4.2|2286451|36|CP014174|CRISPRCasFinder,CRT CTTTGGTCTTGTAGCTGGTGTAACTGTTTTAACATT >4.3|2286517|37|CP014174|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGACACAATACTCTCCAGCGGGAATGGCACTAATAAA >4.4|2286584|35|CP014174|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAATCATCTTTATGAGTATTAGATCCATAAATTT >4.5|2286649|36|CP014174|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCTTAAATATCCAGGTGCATAATTATTTTTCATCA |
csx1,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP014174_4
The CRISPR arrays of CP014174_4 >merge|CP014174|4|2286356-2286715|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTAAATACATCCTATCTTAGTGCTCAATCTACCAGAAAAGATACAACAGGCAATAAGAAGCCAATTTAAATACATCCCATGTTACTATTCAACCTTTGGTCTTGTAGCTGGTGTAACTGTTTTAACATTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATGGACACAATACTCTCCAGCGGGAATGGCACTAATAAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATAAAATCATCTTTATGAGTATTAGATCCATAAATTTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATTTCTTAAATATCCAGGTGCATAATTATTTTTCATCAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATC >CP014174|4|4|2286356-2286715|CRISPRCasFinder GTTTAAATACATCCTATCTTAGTGCTCAAT CTACCAGAAAAGATACAACAGGCAATAAGAAGCCA ATTTAAATACATCCCATGTTACTATTCAAC CTTTGGTCTTGTAGCTGGTGTAACTGTTTTAACATT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT GGACACAATACTCTCCAGCGGGAATGGCACTAATAAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT AAAATCATCTTTATGAGTATTAGATCCATAAATTT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT TTCTTAAATATCCAGGTGCATAATTATTTTTCATCA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATC >CP014174|4|1|2286356-2286714|CRT GTTTAAATACATCCTATCTTAGTGCTCAAT CTACCAGAAAAGATACAACAGGCAATAAGAAGCCA ATTTAAATACATCCCATGTTACTATTCAAC CTTTGGTCTTGTAGCTGGTGTAACTGTTTTAACATT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT GGACACAATACTCTCCAGCGGGAATGGCACTAATAAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT AAAATCATCTTTATGAGTATTAGATCCATAAATTT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT TTCTTAAATATCCAGGTGCATAATTATTTTTCATCA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT >CP014174|4|1|2286487-2286714|PILER-CR ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT GGACACAATACTCTCCAGCGGGAATGGCACTAATAAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT AAAATCATCTTTATGAGTATTAGATCCATAAATTT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT TTCTTAAATATCCAGGTGCATAATTATTTTTCATCA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT
>CP014174.1|AUN22001.1|2285734_2286223_+|50S-ribosomal-protein-L7ae MISKKIIAFIAMTIMMISLLIGCSNNTMDKVYNDNIKIASVYDTFGLDKSDEIIESGIYKGKLKLSGSGTIWTYESSSDFDLKVPYILSVKSGKAKIVLISPDNTVVNLVENTDKATMKGTTSLTLPIKKGNNRIKLVGYKKADIDIELHIEKGTFEKISFN >CP014174.1|AUN22000.1|2284313_2284907_-|acyl-phosphate-glycerol-3-phosphate-acyltransferase MIIIITSIISFLLGSIPTGYFITKKTCGIDIRTKGSGNIGSTNVKRIVGTKISIITQTIDVLKGIIPVVLGISLSKIVKLPVSIDTYLSIIAIAAILGHDYTPFLKFKGGKGVNTTLGVFIFIAPIPTLTGLAVYFILGLFIRIVSIRSISIGITIPIMCIITKLPIQIIISTTIACILMIIRHKDNLVRLIRGEEK >CP014174.1|AUN21999.1|2283227_2283974_-|transpeptidase-transglycosylase MDKFRNMKKSHIALLVIMYMVLMGSLPRFTGWATIFSAIAVGGYFLKNKKDLKELTRKKKNFIFAGIIILAIIGSFNVAVGNNIQNEKLLAEKSKQEQQIKKEQEEKKLAEEQKRIQEEEARKKAEEEKRKQEEEAKKKTEEEAKKKALEEQKKQEELKRKQEEENKVKAENEQAQAAFAQSTGKGDSNSQSNESQNADDNQNYTVYKTRTGSKYHSSGCRYLKKSCYETTVSQARNEGLTPCRVCNP >CP014174.1|AUN21998.1|2282488_2282890_-|hypothetical-protein MNILISTCNIGIPVLMIFIGILYKCNLYKKIDKTLDLIVPIAMFFTGFSERDREHLYKNTNKLALVNRKCSLIWSISGVCTLLLTIISLILNKSDIYNTSVILLEPEFLILVIVFITVEYVLKRNFYKKIQQS >CP014174.1|AUN21997.1|2281536_2282253_-|transaldolase MKYNDLKIKIFADGADLNGMLDAYNKGIVKGFTTNPSLMKKAGITDYKEFAKEVLAKIKDMPVSFEVFSDDLETMEKEAEVLGNLGENVYIKIPVTNTKGESTAPLIKKLSEKGYHLNVTAIFTIDQVKEVVGALKSGVDSIVSVFAGRIADTGEDPVKIMKEASKICKTKEGVELLWASCREFYSIVEADKCGCEIITVTNDVLKKMPNMGKDLKEYSIETVRGFYKDASSLGFSIL >CP014174.1|AUN21996.1|2281075_2281513_-|PTS-maltose-transporter-subunit-IIBC MLKNYINDQVVEVNVEVKNWEEAVRLGGKLLEEDGAVEHSYIDAMVDTVKNMGPYIVIAPGIAMPHARPEAGAKNIRIGLLKLKNPVNFGNEEHDPVDMVIFLCAVDNKAHIEVLGELVQLIEDDDFLKIVRNASTKKEILDYIK >CP014174.1|AUN21995.1|2280762_2281047_-|PTS-maltose-transporter-subunit-IIBC MNILTVCGNGIGSSLMLAMKIEEICKENGIAANVESTDFNSAQGKKADLIVTVKELAEQFEGRDVAVVRSYINKKKITEDVLEIIKQKDEELKK >CP014174.1|AUN21994.1|2279385_2280750_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MLGLLQFLRDVLKQPALLMGIMALVGLVALKKPGHKVLTGTLKPILGYLMLGAGADFIVANLEPLGGMIQTGFNITGVVPNNEAIVAVAQKVLGVETMSILVVGLLINLVIARFTKYKYVFLTGHHSFFMACLLSAVLGTSGMKGTELILFGGFLLGAWSAISPAIGQKYTLKVTDGDEIAMGHFGSLAYYVSAWVGSKVGKPEESTENIEIPEKWGFLRDTTISTAITMMVFYIVAAVAAGPEYVSKLSDGMSPILFAIMSSLKFAVGVTIVYNGVRMILGDLIPAFQGIATKIIPDAIPAVDCAVFFPYAPTAVIIGFVSSFIGGIIGMVLLGVAGGVLIIPGLVPHFFCGSTAGIFGNATGGKKGAVIGSFVNGLLITFAPALLLPVLSTLGFKNTTFGDFDFGVLGIIIGKTSNLAGKTGIIIIAMLMLVALIVPNFIKTKSKALNNIEE >CP014174.1|AUN21993.1|2277080_2279174_-|sugar-transporter MLNKRCSNILQMIVNNEKPITIKEISKKVNKSPRTVRYDLDKIDDYLTEIEFPKLERKSNLGISLDLKDEEIKKLFKIIGKINNYDYVLSQKERVFYIIYELLNKSEFATINMLSDRMMVSRSTIINDLIEVKKWLSENKITLESSKGQGIKILGRERDLRRAAVKLFFQSMDSINFFNVTTLKLFNDIDIDFIRNTIKIAEEQMETSFSDDAFNNLVIHIAIAIKRIELSKDIIMDSEELKNLRKTAEYVIASGIAKMLEDRFKISIPEDEIGYITIHILGSNTSTLENIVKDDWIYLHLIVFKLIENVENITGINFSKDNKLFDSLAQHIRPAIYRLKHDIKVKNPLIEEIKEKYSYIFESIEEGVKFIEEDIGDSVNQEEIGYLTLHFMASIERSKNKKHRKPNVLIVCATGIGTSKFISNKLKSIFDINIIDTISSHTMEKILKYNKNIDLIVTTIPLKVKGIKCIEVNTFLTEKNISELGLYFAKFIRNNSEECNGSCKYEERDKVQEILNIVKENCTIHDYYKLRNKLALYLNIKDPTLTEDHKPSLKELLKPDFIKLNEEAENWEDAVRKSGEILMNNGCVKESYIDAMVNTVKNMGPYIVIAPGIAMPHAAPEDGVLKTGISMLTLKDPISFGNSEHDPVSVIISICSIDKVNHMKALKELMSIMDQEDFISKVKNIKASSEIDSILYS >CP014174.1|AUN21992.1|2276401_2276755_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MIIWGWGKVTKKIIGAVFERTCNYCNTDEVWNLCVVRTWFTLFFIPIIPYKKQYCIACPKCWSYIELTQEEFEKIKIDITSSSNNINEKVVTDNIKYAGKTETQINYLKQMEEYSNK >CP014174.1|AUN22002.1|2287502_2288192_-|hypothetical-protein MHYYQLKIRVKLENNINYIQAPYLIGTFINNCMLKNDMLKNIHKKKIYKYVYDSFFPIEKDGIYKREKYYNIQLRTINLNLINKLAIALYNHKFNGIKTVNIDLEVMEPTKINQLYTLKPSIVTITGQPWIKNKHSIDVLIGNLNANLEKKYKQIFNEELENNKSFIKKIKVVNNIPIKYEYKNIILLGNKFEIIVNEDEVSQRKATIALGMGLGEKGSSLGAGFCIYR >CP014174.1|AUN22003.1|2288208_2289690_-|hypothetical-protein MDNVLIINLGNSDIEKEGNKIEFGEFREKTKKIYEQLEGANKEEKQEIFKYLDFPIIKAIIDKVDGELKNEKLDKVILAYTNQKFNNNKDTVYLYEILKQKKHLVNNLETDNQDIWEKRLKETNFKQSYNIDFDPSDIDRMYNFYAEEINELNNKKIKKLFFSITGGASAMNFALLINAIEKFSGQLIPCYLSRGKKVAYKVNIAKNLRKQILKRDIKILINNKDYFAAIKMLENLEDGIVDDMSKLELKNIILALKYAEARIQFNFDKCKEYGEKCLDNTAEYREEFSQAVKDILIEKDDYINRLVELKNNAIYLYKKGSYTDFLGRVYRFQEAVYEHILGQYDLIIEKSNGVKINKEILKSRYSDKKEILDNIKIAGNKLEYEKNLTVDAMSKIISTLIDNDDVRNIVNRMEEIKDVKQLRNKSILAHGFEGISKEKIQGKLNCEEKDISKLLEEVMCKILVLFKIGTIEDMFYCENSRYDCILIEMIEKL >CP014174.1|AUN22004.1|2289692_2290784_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MNYDKIILNLKGQVLTPVHIGCGKKYSPYLDIIKNENKITVLDEEKIIEKLVLNDEIFEEYINILKNKSPNAIEKYNIINILKNNKIEIGEVKKYDLICGNSFNNLIDVNQSIKTKGIPYIPGSSIKGSIRTALIYNKLLKNGIDFGKIKEISNLKNKYYCYLGQDIFRQNDKLIYDDMMKNLLVRDTDIISNNKVKVYLCRAVNLYESIKNGNISTSVKSLNECIEEYTDFTFSIIIKNSLISKEELYNNINSFYEKILLKEIQEIEKLKLNIINSQYKLLLNEINEFRKYNNGFILRIGGMKGIFSNTIDSILSKKELEDIRNAHKNKRKKTGEFPTTKWCVMDEYENIKTTLGWIKIMEE >CP014174.1|AUN22005.1|2290773_2291829_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MKKVILKIDNETKFHIGNGQEILEYIPSDKLYSAIINSLALTYSKYELNKLIEIINEKLQISSAFMGIKIKNKNKGIEKSIDFLPRPYMYIGNNNIISTQLLNRKKFKKINYVSNNVFLDFNKHYDSKKNFINYDFQQGYIIGEKYYVTDREINFLSEDEKKYLEKYKPIINESVQRNYINRFSKESIGTYYDNFKVIVQEKYKDMQLIPYFYFYIKGDLEIDKIMYAIIEGGIGGKRSLGAGTIKDISIEECDDFKENGERFINISMIYPDKQELNYIESYALENRNGYIYSQGPTDLKKPWIRMIKEGGVFTKRIKGNINDINVKDIDYPIYTYGKAFFITLGGNLDEL >CP014174.1|AUN22006.1|2291830_2292580_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 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CP014174_6 | 2287380-2287475 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of CP014174_6
|
1 spacers
spacers of CP014174_6
>6.1|2287410|36|CP014174|CRISPRCasFinder CAAAGAATATGTAAGCATTTAAGGAAGTTAAGAAAA |
csx1,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP014174_6
The CRISPR arrays of CP014174_6 >merge|CP014174|6|2287380-2287475|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCCTATGTTAATATTCAATCAAAGAATATGTAAGCATTTAAGGAAGTTAAGAAAAATTTAAATACATCCCATATTAAGGTTCAAC >CP014174|6|6|2287380-2287475|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCCTATGTTAATATTCAAT CAAAGAATATGTAAGCATTTAAGGAAGTTAAGAAAA ATTTAAATACATCCCATATTAAGGTTCAAC
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP014174_5
The CRISPR arrays of CP014174_5 >merge|CP014174|5|2286968-2287127|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAACTAATACAAAAATTAGATCCAGGAATGAAATTATTAATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCGACATACTGAAAAGGGTAAGAAAATTGATTATATGCTATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCGACC >CP014174|5|5|2286968-2287127|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC TAATACAAAAATTAGATCCAGGAATGAAATTATTA ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCGAC ATACTGAAAAGGGTAAGAAAATTGATTATATGCT ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCGACC
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MNILISTCNIGIPVLMIFIGILYKCNLYKKIDKTLDLIVPIAMFFTGFSERDREHLYKNTNKLALVNRKCSLIWSISGVCTLLLTIISLILNKSDIYNTSVILLEPEFLILVIVFITVEYVLKRNFYKKIQQS >CP014174.1|AUN21997.1|2281536_2282253_-|transaldolase MKYNDLKIKIFADGADLNGMLDAYNKGIVKGFTTNPSLMKKAGITDYKEFAKEVLAKIKDMPVSFEVFSDDLETMEKEAEVLGNLGENVYIKIPVTNTKGESTAPLIKKLSEKGYHLNVTAIFTIDQVKEVVGALKSGVDSIVSVFAGRIADTGEDPVKIMKEASKICKTKEGVELLWASCREFYSIVEADKCGCEIITVTNDVLKKMPNMGKDLKEYSIETVRGFYKDASSLGFSIL >CP014174.1|AUN21996.1|2281075_2281513_-|PTS-maltose-transporter-subunit-IIBC MLKNYINDQVVEVNVEVKNWEEAVRLGGKLLEEDGAVEHSYIDAMVDTVKNMGPYIVIAPGIAMPHARPEAGAKNIRIGLLKLKNPVNFGNEEHDPVDMVIFLCAVDNKAHIEVLGELVQLIEDDDFLKIVRNASTKKEILDYIK >CP014174.1|AUN21995.1|2280762_2281047_-|PTS-maltose-transporter-subunit-IIBC MNILTVCGNGIGSSLMLAMKIEEICKENGIAANVESTDFNSAQGKKADLIVTVKELAEQFEGRDVAVVRSYINKKKITEDVLEIIKQKDEELKK >CP014174.1|AUN21994.1|2279385_2280750_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC 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MLNKRCSNILQMIVNNEKPITIKEISKKVNKSPRTVRYDLDKIDDYLTEIEFPKLERKSNLGISLDLKDEEIKKLFKIIGKINNYDYVLSQKERVFYIIYELLNKSEFATINMLSDRMMVSRSTIINDLIEVKKWLSENKITLESSKGQGIKILGRERDLRRAAVKLFFQSMDSINFFNVTTLKLFNDIDIDFIRNTIKIAEEQMETSFSDDAFNNLVIHIAIAIKRIELSKDIIMDSEELKNLRKTAEYVIASGIAKMLEDRFKISIPEDEIGYITIHILGSNTSTLENIVKDDWIYLHLIVFKLIENVENITGINFSKDNKLFDSLAQHIRPAIYRLKHDIKVKNPLIEEIKEKYSYIFESIEEGVKFIEEDIGDSVNQEEIGYLTLHFMASIERSKNKKHRKPNVLIVCATGIGTSKFISNKLKSIFDINIIDTISSHTMEKILKYNKNIDLIVTTIPLKVKGIKCIEVNTFLTEKNISELGLYFAKFIRNNSEECNGSCKYEERDKVQEILNIVKENCTIHDYYKLRNKLALYLNIKDPTLTEDHKPSLKELLKPDFIKLNEEAENWEDAVRKSGEILMNNGCVKESYIDAMVNTVKNMGPYIVIAPGIAMPHAAPEDGVLKTGISMLTLKDPISFGNSEHDPVSVIISICSIDKVNHMKALKELMSIMDQEDFISKVKNIKASSEIDSILYS >CP014174.1|AUN21992.1|2276401_2276755_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MIIWGWGKVTKKIIGAVFERTCNYCNTDEVWNLCVVRTWFTLFFIPIIPYKKQYCIACPKCWSYIELTQEEFEKIKIDITSSSNNINEKVVTDNIKYAGKTETQINYLKQMEEYSNK >CP014174.1|AUN22002.1|2287502_2288192_-|hypothetical-protein MHYYQLKIRVKLENNINYIQAPYLIGTFINNCMLKNDMLKNIHKKKIYKYVYDSFFPIEKDGIYKREKYYNIQLRTINLNLINKLAIALYNHKFNGIKTVNIDLEVMEPTKINQLYTLKPSIVTITGQPWIKNKHSIDVLIGNLNANLEKKYKQIFNEELENNKSFIKKIKVVNNIPIKYEYKNIILLGNKFEIIVNEDEVSQRKATIALGMGLGEKGSSLGAGFCIYR >CP014174.1|AUN22003.1|2288208_2289690_-|hypothetical-protein MDNVLIINLGNSDIEKEGNKIEFGEFREKTKKIYEQLEGANKEEKQEIFKYLDFPIIKAIIDKVDGELKNEKLDKVILAYTNQKFNNNKDTVYLYEILKQKKHLVNNLETDNQDIWEKRLKETNFKQSYNIDFDPSDIDRMYNFYAEEINELNNKKIKKLFFSITGGASAMNFALLINAIEKFSGQLIPCYLSRGKKVAYKVNIAKNLRKQILKRDIKILINNKDYFAAIKMLENLEDGIVDDMSKLELKNIILALKYAEARIQFNFDKCKEYGEKCLDNTAEYREEFSQAVKDILIEKDDYINRLVELKNNAIYLYKKGSYTDFLGRVYRFQEAVYEHILGQYDLIIEKSNGVKINKEILKSRYSDKKEILDNIKIAGNKLEYEKNLTVDAMSKIISTLIDNDDVRNIVNRMEEIKDVKQLRNKSILAHGFEGISKEKIQGKLNCEEKDISKLLEEVMCKILVLFKIGTIEDMFYCENSRYDCILIEMIEKL >CP014174.1|AUN22004.1|2289692_2290784_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MNYDKIILNLKGQVLTPVHIGCGKKYSPYLDIIKNENKITVLDEEKIIEKLVLNDEIFEEYINILKNKSPNAIEKYNIINILKNNKIEIGEVKKYDLICGNSFNNLIDVNQSIKTKGIPYIPGSSIKGSIRTALIYNKLLKNGIDFGKIKEISNLKNKYYCYLGQDIFRQNDKLIYDDMMKNLLVRDTDIISNNKVKVYLCRAVNLYESIKNGNISTSVKSLNECIEEYTDFTFSIIIKNSLISKEELYNNINSFYEKILLKEIQEIEKLKLNIINSQYKLLLNEINEFRKYNNGFILRIGGMKGIFSNTIDSILSKKELEDIRNAHKNKRKKTGEFPTTKWCVMDEYENIKTTLGWIKIMEE >CP014174.1|AUN22005.1|2290773_2291829_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MKKVILKIDNETKFHIGNGQEILEYIPSDKLYSAIINSLALTYSKYELNKLIEIINEKLQISSAFMGIKIKNKNKGIEKSIDFLPRPYMYIGNNNIISTQLLNRKKFKKINYVSNNVFLDFNKHYDSKKNFINYDFQQGYIIGEKYYVTDREINFLSEDEKKYLEKYKPIINESVQRNYINRFSKESIGTYYDNFKVIVQEKYKDMQLIPYFYFYIKGDLEIDKIMYAIIEGGIGGKRSLGAGTIKDISIEECDDFKENGERFINISMIYPDKQELNYIESYALENRNGYIYSQGPTDLKKPWIRMIKEGGVFTKRIKGNINDINVKDIDYPIYTYGKAFFITLGGNLDEL >CP014174.1|AUN22006.1|2291830_2292580_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MNLLMGKIFIDGDIILKTGLRIGGGNNSIEIGGIDNNVIKNHRGEPYIPGSSLKGKLRSLLEISTNRLKDGRPCNCGECSICSIFGVGANENKQNLPTRIIVRDAFLNEDIKKQMYEKQGQFKRLELNYTESKYENTIDRLNSKATPRLIERVPEGASFRLQIIYSVFNNKDIDNFNDLIKGMKLLEDDYLGSNGSRGYGQVEFDNLNIKIKVIKDYKTKEVLNKSSLTDIDSVCLKEKLNELIEIKGV >CP014174.1|AUN22007.1|2292592_2292991_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MEKDYKTDKFREYEEYFKKNVLTLDKINYDQFIEKSKDYSRLLKNNGLTTSMIRKIYNEILKANEAIDLKRLRPILAYTYGRNRVKGLQSLFYTLDDLLKRLNLKTNYLEIENVKEFLEVIIAYMKFYGDRY >CP014174.1|AUN22008.1|2293009_2295160_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MHICYKSLLYSFLRYVESIDKAMYKENAFKLKDKLLNPILQESYELVTKNIKKKKCKDGTFRLMNIFSNINDSKRKKFNLLKEIDINRYDNILKENGEEIDKAYCINYVKSIIKKLLQNDNEKIYFLMSKYCSNVPFINSKNCDISLFDIAKVTAAIATCKEKNKEEYILIKGDFSGIQSFIFKTSSDGALKTLKGRSVYLTLLQEICAKYIVKELGLSLCNILYSGGGNFYILASKSDENKIKLLRKQLSKLILKAYNGEIYLALGYLSFKEEDFKNFNILWKNIGEEVGFLKSKRWSELNLKESFNEIFGPLDLGGRREHSCRLCGCINKNLKEGMCDLCISFKDFSMEMKKANFYCEKIIPKADISLHNNVKDIFHELGFEIKFSDKPLKGFKNYIINSCDFEAYDGFIFKSVKLSDESLDYMVQKQKGNNKVGVIKLDIDNLGKLFINGLGNEGSISKIISLSRNISMFFEGYIENILYKSKRLDKLKEYLKTSDWEKRVTIIFSGGDDTFIIGRYEEILEFALLIREVFEEFVGGEQLTFSAGIGIFDYNYPVINIAEDTERCLELAKNHIEGNEIYAKKNKVCIMGQVFTWNEFLEIIKLKNLIEEIYLLSSKKSIFEKINKSTLGFKAVVEGGKRLNYIKLHRLAYYLRDLNNASNKNLKNKVEELIEFYEELCLKAFMGNNKKNYNINNIMIIPVASKLAQYNYRIIN >CP014174.1|AUN22009.1|2295491_2295986_-|hypothetical-protein MILAIECFIACVLFTLMILPSLYKEPMKHIMSYPTEIRKRVESLPQYKDAIQKKEKKHLTVKIIAVFMFAIIFAVVAYFSGAKSFSKAYIHVFTLFFVVNIYDMIVLDIGLFCHSKKTRIPGTEDMDKEYRNPWHHIKGAGIGTIIGAVVALLSGGMVHFISII >CP014174.1|AUN22010.1|2296028_2296643_-|galactoside-O-acetyltransferase MNQKDRMLAGLPYKACLDGLPEERMANKKKIYEYNHCFPDEHEKIHKLIRDILGKAGADVHIESPFYCDYGKNIQVGDNFFANYNCTILDVGKVIIGNNVQFAPNVSLYTAGHPIHPDSRNSGYEYGIGITIGDNVWLGGNVVVNPGVHIGNNVVIGSGSVVTKDIPDNVIAIGNPCKVIREITEEDRKYYYKNYEFDVDDYKE >CP014174.1|AUN22011.1|2296966_2297320_+|peptidase-M24 MHLFINKNKLSDEIKSSLKKNAALFIHPYNKIYKEVKKFTNSDVVLVHPDRINYELYNNIDKEVITEISSSNKLDAFPAEQGRFICPSFEPISSFGEHVTIVTCIFLMENSFMVVTV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014174_7 | 2301817-2301911 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of CP014174_7
|
1 spacers
spacers of CP014174_7
>7.1|2301846|37|CP014174|CRISPRCasFinder CAATTTTAAGGTGAACTTATACTTTGGACTGTATTAT |
cas10,csm2gr11,csm3gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP014174_7
The CRISPR arrays of CP014174_7 >merge|CP014174|7|2301817-2301911|CRISPRCasFinder TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACCCAATTTTAAGGTGAACTTATACTTTGGACTGTATTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACC >CP014174|7|7|2301817-2301911|CRISPRCasFinder TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACC CAATTTTAAGGTGAACTTATACTTTGGACTGTATTAT TTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACC
>CP014174.1|AUN22015.1|2301099_2301621_+|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKVLIPLIIILSLNLVGCGMNSEKKSKENIKNSSKVETYDLIKYKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANEYSAGFILQTSKEPYEITVNYKANENLGEENYNKFWKGNKVEKLLEKNAAVLLSLIPNAEIIKFNVENIGKESYKYDRKNLEQKYGNLKNLFKDNDSLNKFLNN >CP014174.1|AUN22014.1|2299908_2300799_-|AraC-family-transcriptional-regulator MNYRKDIENCIDYIEEHIKEPLTLKEITQEIGYSSYHFCRVFSFLKGMPLMEYVRKRRLSLSTIDLLEGQKIIDVAFKWGFETPSSFARAFRKEFGCSPSQYIKKMKSYYKSEGILTVGNFMIDPYIIKKEAFKVAGYGIKTNVADSKYTKDVASFWSNYNGENLESKLYKILSPLKHGEVGLCIPCSDSGDITYLLGVIVEDFSKVTSDMITVEVPKAQYAVFTTNPVNTVDNKDQREFAKIIKESWKYIFDEWFKNNDYEYDEEKLDFEFYDERCHLRPDTVMDIYVPIKKLER >CP014174.1|AUN22013.1|2299161_2299902_-|SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEIKILEPLCGSGRFLVPFLERGFNITGFDMSEEMLKELYKKAPKAKVFQSSIEEFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIPDREEYLENCHVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGDNLLGKEEMDFRIKLYDSGELEELILKAGFKGSHVFSDFNRRESIDRNTEIFLYKCYI >CP014174.1|AUN22012.1|2297652_2299059_+|MFS-transporter MSEKKQKHPIGLWLVNISIALQSYAAYAVVSILILFLTADVSKNGLGLSVSKAAAIIGLYQGINYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLILGCFLTACGYLALFFAKPNIGSVWLGLIILIVAGAFFKAQISSLVGELYGKNELSKKDAAYSIFYMFINIGAFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCTLIMIFIGIFIWIVSPKWLGEIGKYPVSKDKKTSTESVSTKSTEKAKAQPLTQLEKNRIKAMIVMFVFVIIFWSAWDQTATSFSLLANKLVNRTIGGFTMPVPWLTSINAIFCVVLSPIIANIWLKLGNSKKGDLSVPTKMGLGMILTGIAFLTLILGISTLGGVLDGSKQMNILFIIVAYFLLTVGELCLSPIGMAMFNKLAPAKYGSLAMGAWYLSFFFSSIISGKLAGFTDTLGYTQIFGLISGIVIVFGVILILLRNGLLKLMSLDELDK >CP014174.1|AUN22011.1|2296966_2297320_+|peptidase-M24 MHLFINKNKLSDEIKSSLKKNAALFIHPYNKIYKEVKKFTNSDVVLVHPDRINYELYNNIDKEVITEISSSNKLDAFPAEQGRFICPSFEPISSFGEHVTIVTCIFLMENSFMVVTV >CP014174.1|AUN22010.1|2296028_2296643_-|galactoside-O-acetyltransferase MNQKDRMLAGLPYKACLDGLPEERMANKKKIYEYNHCFPDEHEKIHKLIRDILGKAGADVHIESPFYCDYGKNIQVGDNFFANYNCTILDVGKVIIGNNVQFAPNVSLYTAGHPIHPDSRNSGYEYGIGITIGDNVWLGGNVVVNPGVHIGNNVVIGSGSVVTKDIPDNVIAIGNPCKVIREITEEDRKYYYKNYEFDVDDYKE >CP014174.1|AUN22009.1|2295491_2295986_-|hypothetical-protein MILAIECFIACVLFTLMILPSLYKEPMKHIMSYPTEIRKRVESLPQYKDAIQKKEKKHLTVKIIAVFMFAIIFAVVAYFSGAKSFSKAYIHVFTLFFVVNIYDMIVLDIGLFCHSKKTRIPGTEDMDKEYRNPWHHIKGAGIGTIIGAVVALLSGGMVHFISII >CP014174.1|AUN22008.1|2293009_2295160_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MHICYKSLLYSFLRYVESIDKAMYKENAFKLKDKLLNPILQESYELVTKNIKKKKCKDGTFRLMNIFSNINDSKRKKFNLLKEIDINRYDNILKENGEEIDKAYCINYVKSIIKKLLQNDNEKIYFLMSKYCSNVPFINSKNCDISLFDIAKVTAAIATCKEKNKEEYILIKGDFSGIQSFIFKTSSDGALKTLKGRSVYLTLLQEICAKYIVKELGLSLCNILYSGGGNFYILASKSDENKIKLLRKQLSKLILKAYNGEIYLALGYLSFKEEDFKNFNILWKNIGEEVGFLKSKRWSELNLKESFNEIFGPLDLGGRREHSCRLCGCINKNLKEGMCDLCISFKDFSMEMKKANFYCEKIIPKADISLHNNVKDIFHELGFEIKFSDKPLKGFKNYIINSCDFEAYDGFIFKSVKLSDESLDYMVQKQKGNNKVGVIKLDIDNLGKLFINGLGNEGSISKIISLSRNISMFFEGYIENILYKSKRLDKLKEYLKTSDWEKRVTIIFSGGDDTFIIGRYEEILEFALLIREVFEEFVGGEQLTFSAGIGIFDYNYPVINIAEDTERCLELAKNHIEGNEIYAKKNKVCIMGQVFTWNEFLEIIKLKNLIEEIYLLSSKKSIFEKINKSTLGFKAVVEGGKRLNYIKLHRLAYYLRDLNNASNKNLKNKVEELIEFYEELCLKAFMGNNKKNYNINNIMIIPVASKLAQYNYRIIN >CP014174.1|AUN22007.1|2292592_2292991_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MEKDYKTDKFREYEEYFKKNVLTLDKINYDQFIEKSKDYSRLLKNNGLTTSMIRKIYNEILKANEAIDLKRLRPILAYTYGRNRVKGLQSLFYTLDDLLKRLNLKTNYLEIENVKEFLEVIIAYMKFYGDRY >CP014174.1|AUN22006.1|2291830_2292580_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MNLLMGKIFIDGDIILKTGLRIGGGNNSIEIGGIDNNVIKNHRGEPYIPGSSLKGKLRSLLEISTNRLKDGRPCNCGECSICSIFGVGANENKQNLPTRIIVRDAFLNEDIKKQMYEKQGQFKRLELNYTESKYENTIDRLNSKATPRLIERVPEGASFRLQIIYSVFNNKDIDNFNDLIKGMKLLEDDYLGSNGSRGYGQVEFDNLNIKIKVIKDYKTKEVLNKSSLTDIDSVCLKEKLNELIEIKGV >CP014174.1|AUN22016.1|2302202_2304200_-|2-enoate-reductase MKDKYKVLYDPIKIGKLEIKNRYVLAPMGPGGMCNADGSFNKRGIEFYVERAKGGTGLIMTGVTMVENNIEKCALPSMPCPTINPLNFITTGNEMTERVHAYGAKIFLQLSAGFGRVSIPSIVGKVAVAPSKIPHRFLPGVTCRELTTEEVKEYVKAFGESAEIAKKAGFDGVEIHAVHEGYLLDQFAISFFNHRTDEYGESLENRLRFACEVVQEIKKRCGQDFPVSLRYSIKSFIKDWCKGGLPDEEFEEKGRDIPEGIEAAKILVAAGYDALNGDVGSYDSWYWSHPPMYQKKGLYLPYNEILKKVVDVPIITAGRMEDPELSSDAILSGKTDMIALGRPLLADAEIPNKIFEDKYDKVRPCLSCQEGCMGRLQNFATVSCAVNPACGREKEYGLKKAEQIKKVLVVGGGVAGMEAARVAAVRGHKVTLIEKNGYLGGNIVPGGIPDFKDDDRALVKWYEGILKDLGVEIKLNVDASKENIKEFGADEVLLATGSSPRTLTIEGADKVYSAEDVLMERKNVGEKVIVIGGGLVGCETALWLKQQGKEVTIVEMQNDILQVGGPLCHANHDMLVDLIKFNKIDVKTSSYISKKTDEGFVLNTNGEESIINADSAVVAIGYLSEKDLYSEVRFDIPNARLIGDANKVQNIMYAIWSAYEVAKNI >CP014174.1|AUN22017.1|2304296_2305094_-|MerR-family-transcriptional-regulator MRYSITDLAEILGCTTSAIHYFEKEHLIEVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEKRETMYQLEALKRAQYYMNLADAIEEHLVSIRRIEELLNKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQKIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGMSNFGYLVKTKKREELELPLGLHAKELKSTSCIHTIVMADEDFTQQPQKVFKKASEFVIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKM >CP014174.1|AUN22018.1|2305141_2305435_-|hypothetical-protein MNFFTLNILIGAMAFIINKINNMSQDIDPFEAFNDIEENLDEIDNEKVTNFVNGLINASMSNPSIGYFFMFLVYMTPILNLLLLIKGIVNYFNREAG >CP014174.1|AUN22019.1|2305609_2306059_-|transcriptional-regulator MKLDEIDVLILQELQKDSRLSIRELSKRINLSPPSVTERVRRLEDDGVIEKYTIKINKKKLGLSIDCIVKVTMKNGQYEKFKIFIKEYKRSEWCYRIAGDGCFLVKLLVKSLNDIEEFINDISSYAITETIIAFSEVTINNGINKFLGE >CP014174.1|AUN22020.1|2306197_2306614_+|alkylhydroperoxidase MAKITFSQEGLTPFQQLLGHNKYIMEKWTSLEECFFNSNTFTHELKEEVRRTLAFNNGCQYCMSKGKPSNEITNSKILIATKIADIISKNQLIDNECFNRLKNEFSDNEVSELLALICFITASQKFGALLDLQPSCSI >CP014174.1|AUN22021.1|2306925_2307846_-|phenazine-biosynthesis-protein-PhzF MRKFEYTLVDVFTNQVFGGNQLAVFKDAEKLSSEEMQSIARELNFSETTFVTDIGPNHKKLRIFTPKTELPMAGHPTIGTAFVLADEGVIETREGINKLIFEEGVGEIAVSIHVEGGRIRSIEMEQPMPVFGRVFGDIRTAAELLSLDIADIDTTSPIQTVSTGVPFLYIPLKSLDGISKIKLRLDTWEKFFSASEDTKHIFAFTRETLHAGSTIHSRMFAPAMGIVEDPATGGASGPLGAYLVEHGLVAHGYDGKYMIINEQGIEMGRPSFINITVSKTYNNFSEIKIGGTCVKFGAGVIELPTL >CP014174.1|AUN22022.1|2308169_2309663_+|GntR-family-transcriptional-regulator MNIKIDKNSLITITQQLVHYFSDRIMSEFIKAGQKLPSIRNLAKELGISPMTIIKAYNNLEQNGLVTTIQGKGTYVNERNSTVKSNNITEKDSFQWQMSVPDYLSRSQFRYNPNLSYSNDYYNLSVASLNHKLLPTKTILKDSLSLIQNDIKLLSQYPPAQGDYEFRNIMSQYLRSKEIATSPENILVTSGSQQGISLIASTFIGPGDIVVMETPTYPGAIDLFKCRGAVILTVPVDSEGMRTDILMNLCDKHSPKLIYTIPNFHNPTGYSMSSNRKAELLDIARYNDILIVEDDPWNEISYKREKIKSIKSMDTDGHVVYIKSLSKILGPSYRLAVIISESSILSRLIAAKSNHDLGTSVLIQKTIINFIQSNKITYYIENLNKQLVKRRDKVISLLKSHAPSGMKWAIPEGGINIWVTLPKNFNVEKLLSYSITTKNISFLPGTICYPNEVEFNNLRICFTYLDEEFIEDTIIELCNLIKLLYTTKNITDYRPII >CP014174.1|AUN22023.1|2310521_2310977_+|hypothetical-protein MSKLNPEKLSVEFRDGVTGTEPILGRRYTLTHSDITAELFLTIGLTYAYDKIDVMRDEVLGEWIEKEKNYLFHVYLHVDGNNPIVTGVRNHIFRRELHLALEAIRYGDRKFFISHPKLDNSPVIVHFISSYPSFDRIEKWGTFSDYSLKKR >CP014174.1|AUN22024.1|2311056_2311524_-|transcriptional-regulator MSLGEKLLYLRKKEGLSQEDVAEKLSVSRQTVSKWETDQTVPELNKAKLLSELYNVSYDYLISENYISGDVTGIEMIVDEIDWTGAWSKKYSILASYPGIKGINTYSEKISELYDSFKNDFGFNDTDTVLVLKDILYQKYKMEKKKKVDNSKEKI >CP014174.1|AUN22025.1|2311691_2312738_-|esterase MEVNGVKKVIKVVSVILVILVIAGFFIIKNLTETKDGKLNMYVAANLQLYKILNPKSLNNKSIEETRGALNKQSTRWSNKPIPFSNIKNLDIKMNNEKIPVRIYTPEKGSNFPIIIYSHGGFWIGGNVDTIDGVCRKLSQNTKAIVISVNYRLAPENPFPAGLNDVYNVLQWTYKNGKSINGDEKHIAVVGDSAGGNLSAAVSSMSRDKNGPSITCQVLIYPSTNIFKLNSKSWSHFSNSFNVSTEDMEKYISIYAPKKEDRKSPYASPLLSKDLRKLPDTLVVTAEIDPLRDEGEAYANKLKESGVKAEVTRYKGITHGFITMDKITNKADEALNQISLYIQKEFQK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NZ_CP013700 | Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence | 84483-84517 | 2 | 0.943 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NZ_CP013710 | Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence | 28409-28443 | 2 | 0.943 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NZ_CP014152 | Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence | 9866-9900 | 2 | 0.943 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NZ_CP006909 | Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence | 5036-5070 | 3 | 0.914 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NC_010418 | Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence | 79434-79468 | 3 | 0.914 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NC_010379 | Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence | 102786-102820 | 3 | 0.914 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 79772-79806 | 4 | 0.886 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 200531-200565 | 4 | 0.886 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NC_010418 | Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence | 83392-83426 | 4 | 0.886 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NC_010418 | Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence | 205022-205056 | 5 | 0.857 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NZ_CP013710 | Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence | 29200-29234 | 6 | 0.829 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NZ_CP014152 | Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence | 9075-9109 | 6 | 0.829 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NC_010418 | Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence | 169943-169977 | 6 | 0.829 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NC_012654 | Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence | 146329-146363 | 6 | 0.829 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NZ_CP031095 | Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence | 235820-235854 | 6 | 0.829 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NC_010379 | Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence | 37038-37072 | 6 | 0.829 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NZ_CP013684 | Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence | 88444-88478 | 7 | 0.8 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NZ_CP013700 | Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence | 168896-168930 | 8 | 0.771 |
CP014174_5 | 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder | 2286998-2287032 | 35 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 249579-249613 | 8 | 0.771 |
CP014174_3 | 3.2|1884908|40|CP014174|CRISPRCasFinder | 1884908-1884947 | 40 | NC_018689 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence | 417214-417253 | 11 | 0.725 |
1. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013700 (Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
taatacaaaaattagatccaggaatgaaattatta CRISPR spacer caatacaaaaattagatccaggaatgaaataatta Protospacer .***************************** ****
2. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013710 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
taatacaaaaattagatccaggaatgaaattatta CRISPR spacer taattcaaaaattatatccaggaatgaaattatta Protospacer **** ********* ********************
3. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014152 (Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
taatacaaaaattagatccaggaatgaaattatta CRISPR spacer taattcaaaaattatatccaggaatgaaattatta Protospacer **** ********* ********************
4. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
taatacaaaaattagatccaggaatgaaattatta CRISPR spacer caatacaaaaattagatccaggaatgaaattaatg Protospacer .******************************* *.
5. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
taatacaaaaattagatccaggaa-tgaaattatta CRISPR spacer taatacaagaataagatccaggaattgaaattatt- Protospacer ********.*** *********** **********
6. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
taatacaaaaattagatccaggaa-tgaaattatta CRISPR spacer taatacaagaataagatccaggaattgaaattatt- Protospacer ********.*** *********** **********
7. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
taatacaaaaattagatccaggaatgaaattatta CRISPR spacer caatccaaaaattagatccaggaataaaattattg Protospacer .*** ********************.********.
8. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
taatacaaaaattagatccaggaatgaaattatta CRISPR spacer gacttcaaaaattatatccaggaatgaaattatta Protospacer * * ********* ********************
9. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
taatacaaaaattagatccaggaatgaaattatta CRISPR spacer taatacaaatattagatccaggaatgaaataaatg Protospacer ********* ******************** * *.
10. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
taatacaaaaattagatccaggaatgaaattatta CRISPR spacer cagtccaaagattatatccaggaatgaaattatta Protospacer .*.* ****.**** ********************
11. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013710 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
taatacaaaaattagatccaggaatgaaat-tatta CRISPR spacer tctttcaaatagtagatccaggaatgaaatatatt- Protospacer * * **** * ****************** ****
12. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014152 (Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
taatacaaaaattagatccaggaatgaaat-tatta CRISPR spacer tctttcaaatagtagatccaggaatgaaatatatt- Protospacer * * **** * ****************** ****
13. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
taatacaaaaattagatccaggaatgaaat-tatta CRISPR spacer tctttcaaatagtagatccaggaatgaaatatatt- Protospacer * * **** * ****************** ****
14. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NC_012654 (Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
taatacaaaaattagatccaggaatgaaat-tatta CRISPR spacer tctttcaaatagtagatccaggaatgaaatatatt- Protospacer * * **** * ****************** ****
15. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031095 (Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
taatacaaaaattagatccaggaatgaaat-tatta CRISPR spacer tctttcaaatagtagatccaggaatgaaatatatt- Protospacer * * **** * ****************** ****
16. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
taatacaaaaattagatccaggaatgaaat-tatta CRISPR spacer tctttcaaatagtagatccaggaatgaaatatatt- Protospacer * * **** * ****************** ****
17. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
taatacaaaaattagatccaggaatgaaattatta CRISPR spacer caattcaaaaattagatccagaaatgaaatgaaag Protospacer .*** ****************.******** * .
18. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013700 (Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
taatacaaaaattagatccaggaatgaaattatta CRISPR spacer tctttcaaaaattaaatccaggaatgaaatgaagg Protospacer * * *********.*************** * .
19. spacer 5.1|2286998|35|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
taatacaaaaattagatccaggaatgaaattatta CRISPR spacer tctttcaaaaattaaatccaggaatgaaatgaagg Protospacer * * *********.*************** * .
20. spacer 3.2|1884908|40|CP014174|CRISPRCasFinder matches to NC_018689 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.725
tatttaaaggatttaaactta---catcatttagatctaagag CRISPR spacer tatttaaaggatttaaacttagttcattacataggttatc--- Protospacer ********************* ***.*. ***.*.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
574172 : 583588
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP014174|574172:583588|DBSCAN-SWA CATGATTATAAAAAAGAAATTGCTTTTAAAAGGCTTACATTGTGCCAATTGTGCAACAAAAATAGAACGAGCCGTGCAAAAGCTAAATATAATAGAGGAAGCTAACTATAATTTTAATAATTCAACTTTAATTATTAACTTAGAAGAAACTCATAAAGATAGCATTATAAAAACAATACAAGAAATAGTAGATAGAATAGAACCCGGGGTAAAGGTAGTAGATAAAGAAAATTTAAAAAGAACGGTAGTGCATGCCCCTGTTAAAAATAGTAGTAATTTAAAGATGCAGAATAATAAAGAGGAAAATTTAAAATTAGATAAAAAAGAAAATAGTTATGAGCATAATCATGATCATAGTCATGGACACAGTCATGATGGAGAAGATAGTGACGAGTTAGAAAAGAAGACTCTTATAAGAATTATTTCAGGAGTGGTTTTATTAATTTTAGCTACCGTATTGAAATCTAAAGAAACTTTGTCTATAGGTCTATATTTAACTTCATATGTATTAATTGGAGGTAAGGTAATATTAAGTTCTATAAGAAATATATCTAAAGGACAAGTATTTGATGAAAACTTTTTAATGGCTGTTGCAACTGTAGCGGCTATAGGAGTAAAACAGTATCCAGAAGCAGTAGCGGTTATGCTATTTTATGAAGTAGGGGAGTTCTTACAAGATAAAGCTGTTAATAAATCTAGAAAATCTATAACAGCACTTATGAATATAAGACCTGACTATGCCAATTTAGTTAAGGGTGAAGATATAGAAGTAGTTTCTCCAGAAGATATTAATATAGATGATATTATAATGGTAAAACCAGGAGAAAAAATTCCTCTAGATGGTATAGTTGTAGAAGGACAATCTTCTGTAGATACATCAGCTATAACAGGTGAATCTTTAATAAGTGAAGTTTCAAAAGATAGTAATGTATTAAGTGGATATATAAACAAAAATGGTGTTATAAAAATAAAAGTTACAAAAACCTTTGGAGAATCTACAGTGTCCAAAATATTGGAATTAACAGAAAACGCATCAGCTACTAAGGCAAATACAGAAAAATTTATAACAAAGTTCGCCAGATATTATACTCCTGTAGTTGTTTTTGCTGCTTTAGCTTTAGCAGTAATTCCTACACTAATACTAAAAGATCCAGATATATCTAAATGGATTTATAGAGCAGCTGTATTTTTAGTAGTATCTTGTCCATGTGCTTTAGTAATATCAATACCTTTAAGCTTCTTTGCTGGTATTGGAGGGGCATCTAAAAAAGGTGTTTTAATAAAAACAGGAACAGCATTAGAAGCTCTAAATGATGCAGATACAATAGTATTTGATAAAACAGGAACTCTAACTAAAGGTGTGTTTAAAGTATCAAAAATTGATTCAGAAGAAGGAGTAAATACAGAAGAATTAATAGAATATGCTGCTTATGTAGAAAGTTATTCTAATCACCCTATCGCAAAATCTATACTAAAGTATTATGAAAAAACCATAGATAATAAAAGAATAGAAGGTTATGAAGAAATAGTTGCAAGAGGTGTAACTGCTTATATTGATGGCAAAAAAGTTTATGCTGGTAACAATAAATTAATGGAAGAATTAAATATTAACTATAAAAAAGCTCAAGAGGATGGAGTAATCCTTTATATAGCATTAGAAGATAAGTATATAGGTTATATAGTTATAAACGACGAAATAAAGAAAGATTCAAAAGAAACAATAAAATCATTAAAAGATATAGGTATAAAAAAAGCAGCTATGCTTACAGGAGATAGAAAATCTACAGCTAATAATATAGGGACTTTTCTAGGAATGGATGAAATATACTCAGAACTTTTACCACAGGAAAAGGTAGAAAAGATGCAATCCTTAAAGTCCAAAACATCTAAAGATGGGAAAATTGTTTTCGTAGGGGATGGAGTAAATGATGCTCCAGTATTAGCTATGTCAGATATAGGGGTATCCATGGGAGGCTTAGGATCTGATGCAGCCATAGAAGCATCTGATTTAGTTTTAATGTCTGATGAACCATCAAAATTAGTAGATGCCATAAAAATAGCTAGAAAAACTCATAAAATAGTATGGCAAAATATAATTATAGTTTTAATAATCAAGTTTGCAGTATTAGCTCTAGCTGTAATGGGAAAAAGTACTATGTGGATGGCTGTTTTTGCCGATGTGGGTGTGGCTTTAATAGCAGTAATAAATGCATTAAGAATACTAAAATAAGAATTTACTAAAATAAGAACTTTCTAAAGAAGAATAGGAACGAATAATTTTAAAGAAAAATATTTAATTATATTTATATAGTTTTAGTTAAGTAGTTTTAGATTCAGATGGAGTTTGCTTAGAACAATTATTTTTCTCCATCTGAACATTATTATTTATCAGAGAGTAATAAATATAGAAGATTAATTTTTATGAAAGTATAAAAAATTATCAAATTGTATAAACAAAGTATACTTATGAGAAATTATAAGATGAGCATTAGGTACTTCTATATATTCTTCAATAAATGTTATGTAAAAATAAAAGATTTAATAATTTAATAAAAAAATTAAAAACAAAAGAAAATATTTCTAAAAAATATTGACTTAAAATTTAGGCTGTAATATAATTATATATGTTCAAAGAAAATAAATAATTGAGGCTTCTTGGTCAAGCGGTTAAGACGCCACCCTCTCACGGTGGAATCAGGGGTTCGACTCCCCTAGGAGCTACCAGATTTGAAGAAATGCTGTAAACAGTGATGTTTACAGCATTTCTTATTTAGAAGTGAAAATGGAAAATTAATATTTTCCCACACTAGAAAAATACAAATATAAACTTCCTTTCTAATCAAATTTCCATTGGCATCCCCCAATAATTTAAATAGTTTGTTAAAGGCTAAAGAAAAAGCTTTACCAAAAGGATTTAATGAAGCTAGATTTTTACAAAATTGCATGACAATATTAAAAGATACTAAAAATATAGAAAAATGTAATGAAGTTAGTGTAGTAAGAACAATGCTTAAAGGAGTATTTCTAGGTTTAGACTTCTTTAATAAGGAATGTTATGCAATACCAGTTTATTTAAATCTTTTTTAGAAGAATATAATGGATGTGAAGCTAGGATGATGGCAGTATTAAATGTATCCATGAAAATATAAAGAGTTAAAAAAGTATGAAAGGTGAATTAGAGTTTATTAGATGTGGTAAATATGATTATTGCAAGATTACTAAAGAATTAAAAGAAATTATACACTATAAAAAATTATAAGAGGGGTAATAAAGTGGCAGGTACAACCTCATATATGGATAAAGAAACAAGAGTAAATATTTAAGAGGATGATGATTTTTTTGTTAAAATTGACAAGTTATTTGATGAATATGCTTTAAGTATTATTGGAAGAAGAGAAGTTCTTCAAAAAGTATATGATGTTCTACCAAGTAATTTATTTGATTGTCCAATCTATAGTGAACTAGAAGAACAATTAATAAATAAGGAGTTGCTTTTATAAGAAGCATAAAGTCAAATTGAATGTTTAAAAGATATAATAGATTTTTTAAAAAGATAACACTACCGTAGTAGAAATTAATATGGCAAGATAAGTGAAAGCCTGGATAAGTTTATATAGAAGTATACAAGAGCATTGGTTATAGCAAGAGAAGCTTTTTTCAAAAAGACAGGCATGACTGAATATTATTTTCTTAGAGAATGAATTGATAATTGGTGCAAGAGATAGCTTCATAACATCACCAAAAAAGTTGATCCAAAAATGGGGATGGGGTTATAAAAGGACCAGAAGATTTTTAAAAAGAAGCGTTATGTAATACTATATTTGGATTAAAAGATTTAAAATAGGTAATACTACATTTACATTAAAAGACTTAAAACAAGTGGTATAGGAACTAGTACAAGCGGAAGAAGTTATAGAGAAATTAAAATAAATTACAGGATTTATATCCCTGATGATAAGGAGGAAATATGACACCGATAGAAATAATGGAAAAGATAGGGGCATGTCAACGGGGGCTGACGAAAGGGAATATAGAATTAAAAGCTTTAGGAGTGAAGAAGGCTAGAGCAGAACATGACTATAGGATAGCTCTAAGAAAAGAGATTTTAAGATTAAGACAGTTAGAGAATCAGCCAGCAACAATAATAAATGACTTAGCTAAAGGAAAAGAAGATATTGCAAAATTAAGACTTGAAAGGGATATAGCAGAAACTAATTACAGTGTATATATAGAAAGTATGAGGAATTTAAGATTAGAGATTGAGGCGTATAGAAGTTTTCTCACATGGGAACGTGTAGAACTTAAAAATACGTAATGTTAAAATTATGATGAACTAAAGAGAGGTAAAGAAGACCTCTTCTTTTCTGATGTAAATTATTATTGATTGCTTAACTCTGATTTTATTTAATTTATCTGCTATTGTTTCATGTGCACCAATAAGATGAGGAAGATTTTGTAATTCTAGTGAGTTTAAATTTGACATAAAATCACCTCTTTAATAATTAGTTCAATAATATTATTGGAAAGAGAATTAAAAATTATACAGTGATGTTTAATACTTAAATATAAAGTTGAGTGAGCTCATGGCAAAATTCAAATATTGAACTAAGATAAAAGATAAGCTTGTATTAGCTGAAGAAAGGGCAAGAAATGAAGTAAGTAATGGACAAATAACAAAGAATCTAGGGATAGATAAGGGTATATTTTATAAATATAAAAAGCAAGTATATAGGATTTTTTATATCTTAGAAAGGGGGAAGGAGATAATGATGATAGATTTTGGAATTAAAGATTCACTTTTAAAAAGAACATTAGAATATAAGTATAAGGAAGTAACCAAGGAATTAGTATAAGATCATAGGACTAAATTGTATACATATATAATAACTTTGATCATTATTAAATATGTATAATAAATAATAAATATATCAGTAACATAATGTTGTTTGTGAACATATTATATTAAGTAATATAGATTAGAAATATTTTGGAGGGTAACT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP014174|574172:583588|580939_582316_+|AUN20508.1|DBSCAN-SWA MKLTYVLDTNVILYSPGAIFSFADNDVVIPEVVLEELDSFKKNNYDLGANARHAARIIDKLRKDGSLIDGIVLPGGGTLRVEMNHYDVKLPPSWDKNKPDNRIIQVCKGLKEKGEEVVLITKDTFERIKADTINIDVEDFYEKVVPEYESQYKGRCDAFASHSTLESFYKNKYMDVESLFFYSEEKNDYYKADININEFILIKSMENPKQTALGRYNGEKVVPLFYKDVKPLGISPRNIGQKFMLEAFLTDSKNAPLVIVKGPAGTAKTLFSLATGLHKVMEEGEDGYRKILICRPNVTMDEDIGFLPGTEEEKIMPFMRPIFDNLEILVDSDEKERYKNEKELYDKIKELFDRRIITTEAVAYLRGRSIVKNWVIIDEAQNLTPKQVKAVITRVGQGTKLILVGDPDQIDQPFLDSRSNGLCYASEKMKGSKLCYQVTLKDHECERSPLAYEGAKRL >CP014174|574172:583588|582583_583588_+|AUN20509.1|DBSCAN-SWA MENKEKKSKNKKFSFKIFLYFIIFELFFTAATAPFIIFHGPFKNVKKTMVGAAMTTLKHQYIAKTFLSDAKIKEILGEDSIQTIKQDKNSVLKFENKHDSTIERYDISYGKKFKGYMLVVHDPSRVKVGYSSKLPVQGELTSQIARNKRAVAAINAGGFTDKSANSKWTGTGGNVEGVIISKGEVKYNSNKQGEFTGDVAAITKKGALVVGKHSIQELKDLNVQEAITFGPALVVKGQGTITSGDGGWGMAPRTAIGQREDGAILMLVIDGRQASSLGATLKDVQDIMLQYDAYTATNLDGGSSTTMYHEGEVINNPANSLGERSVPSILYVEP >CP014174|574172:583588|578138_578486_+|AUN20505.1|DBSCAN-SWA MTPIEIMEKIGACQRGLTKGNIELKALGVKKARAEHDYRIALRKEILRLRQLENQPATIINDLAKGKEDIAKLRLERDIAETNYSVYIESMRNLRLEIEAYRSFLTWERVELKNT >CP014174|574172:583588|577048_577258_+|AUN20504.1|DBSCAN-SWA MLKAKEKALPKGFNEARFLQNCMTILKDTKNIEKCNEVSVVRTMLKGVFLGLDFFNKECYAIPVYLNLF >CP014174|574172:583588|579171_579981_+|AUN20507.1|DBSCAN-SWA MKISNIKEITLFEHHFWLQILGDHSRFILNSLSPKEKSFIEEANRFKNLFDNLLKKSKQSLSEEELFALNNHAYNAAMKIREFKLDIIDRQITDKIVISLPPTFINHMVNEVDEYIFILTKLMKGNVSNIGPIHLHLLWLPDGAGHASNIASSLDITEKELIKKSNQYSKKFNNLYLRTIEYNGYTRTGICDFPALDSLNNNADETMSCFKEFLNELKKGVIEKKILGTIVPLVPDHMFREECYYLTKLSMVSNIKKPECDPTKSRVES >CP014174|574172:583588|574172_576401_+|AUN20503.1|DBSCAN-SWA MIIKKKLLLKGLHCANCATKIERAVQKLNIIEEANYNFNNSTLIINLEETHKDSIIKTIQEIVDRIEPGVKVVDKENLKRTVVHAPVKNSSNLKMQNNKEENLKLDKKENSYEHNHDHSHGHSHDGEDSDELEKKTLIRIISGVVLLILATVLKSKETLSIGLYLTSYVLIGGKVILSSIRNISKGQVFDENFLMAVATVAAIGVKQYPEAVAVMLFYEVGEFLQDKAVNKSRKSITALMNIRPDYANLVKGEDIEVVSPEDINIDDIIMVKPGEKIPLDGIVVEGQSSVDTSAITGESLISEVSKDSNVLSGYINKNGVIKIKVTKTFGESTVSKILELTENASATKANTEKFITKFARYYTPVVVFAALALAVIPTLILKDPDISKWIYRAAVFLVVSCPCALVISIPLSFFAGIGGASKKGVLIKTGTALEALNDADTIVFDKTGTLTKGVFKVSKIDSEEGVNTEELIEYAAYVESYSNHPIAKSILKYYEKTIDNKRIEGYEEIVARGVTAYIDGKKVYAGNNKLMEELNINYKKAQEDGVILYIALEDKYIGYIVINDEIKKDSKETIKSLKDIGIKKAAMLTGDRKSTANNIGTFLGMDEIYSELLPQEKVEKMQSLKSKTSKDGKIVFVGDGVNDAPVLAMSDIGVSMGGLGSDAAIEASDLVLMSDEPSKLVDAIKIARKTHKIVWQNIIIVLIIKFAVLALAVMGKSTMWMAVFADVGVALIAVINALRILK >CP014174|574172:583588|580402_580564_-|AUN23635.1|DBSCAN-SWA MTILADEPTGSLDEENSYKIIGLLKLLNKKGKTIVIVTYDKNIANECNRIINI >CP014174|574172:583588|578504_578654_-|AUN20506.1|DBSCAN-SWA MSNLNSLELQNLPHLIGAHETIADKLNKIRVKQSIIIYIRKEEVFFTSL |
8 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
919573 : 931274
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP014174|919573:931274|DBSCAN-SWA ATTAATTAGTAATATCTATATGCAATCTTATATTATAGTTATTTAATTCTGTAACTTCTACTTTTAATATATAAATTGCACCATTTAATAAACGTATTGACTTGGTACTATTTAAGAGATTTAAATTTTGTTGTATATTAATTAAATTATAGCCGTCAATAGTTTCAGTGACTCTAAATAAAGTACCTATTCCTTGGTTATAACTAGTATAAAGCCTAATGTTAGATGTATCTTTATTATTAAAGTTACCAGGTATTGTAAATTCATATGAAATATAGTCATGGACATCAGGGCTTTGTCTTGTATAGTAATGTGCACCTGTTGAATTAAGATTATCTATTATATTAACTGAAGAATTCATTAAATTTCGGAGATCCCCTTCTTCTCTCTTGAATTTTATTTGATTTTCTATATTAGAAGAAGTTTGTGGTACTCTAATGTAGTAATTTTTATCCTTATTAAGCAAAACAACTAAATAACTTTTAGCATTAGGACTGTCAAACCCAGTAATATAATTTATTGCTTTAATATCATCATCACATAAATTCCCAGATTGGAAATTTCTATTACCAGAACCTATCGCTTCATATATTTTTAATGATGGTAGATTATTTTGAGCATTAATTTTATAAATTCCTGTAGTATTTACTGTAAATAATATATAAAATGGATTATTATTTACAATACCCGGAATGTTATATGTGTAATTATCTGAAATAGCAGTATTTATTTCTTGTATATTTTCAGATGGGTCTATGACACCTACTACGATTTCTTCCTCGGGGCCATTCTGTATAAATCCATCTTCAGCCACTTGCGTTTTAACTACTTCAGATTCAGGTGAAGGAGCATTAGTTACTTCACAATATCCTAAGGAAGGAAGGTAATACTCAGCTTTATTAACAATACTTCCATTTTGATAGTCTATTAATTCATACTTTTCATAGGTATTATAAGCCTTTATGCATATATTTTTATTTGAAGGAGCTTCTTCTACAAATTTAAATAACGATGTTGATGTATTAAATAATTGTACATTGAAAGCGTCTTTAAGTCTTTCTTCAGTATATTGTTGTGAGAATTTTGCATCATTACTTGTGGTGAATAATGGCCTAGTTGTATTTCTTAATCGAGGTTGTATAATACTTCCTGATGAACCTGCTTCGATTAATAATGTACCTATCAAATCTTTATCATTTGTTCTTATATATCCATCACCCTTATTAATAACATATAGTCCATTACTATAAGGCAATACTCGTTGTGTGCTACTAACTTTAGAATTAAAAATATTGTTAGTTGGTATATTTTTAGTAGTTTCTAAAATTTTTTTATATAGGAATTGTTCATTTAAAATGCACTTATCATTAGTTAAAAAGTAAAAATCTTTATTTATTTTTTCCCCTGGATTAAATTCTATAGACTTAACATATCCAAGAGATGGAACATATAAAACTGCTCTTTCTATAATTTCATGTTGCAAGACTTTTATTATTTCATATCTAATGTAGGTATATTGTAAATACATATATAAGTTTTTATTTGAGGGAGCGGTTTTACTAAATTCAAATCCTATTGGAATTTGATTAGCTTCAGTAAAGTTAGCAAATACAGTTTGTATATTATTTTTTATATATTCTTCATTGAAGGATGGTGTTGGATAATAATATGGTATCGCATTATCATTTACACGTAGGTCCCCAACTATTCCTGTTGATCCATTACTAATTACACTTCCACCTAGTATTTGATTTTGTCTAGATAATATCCATCCATCCCCTCTGCTAACTACATAATTACCATCAGCTAAATCAATAGTATCACTATAGTTTATAACTTTTTCTTGTATATGATTATAAATTTTTTTTATAGATGAATTCATACACTTTTCTCCTTTATATTTTTTCAAGTTTGAACATTTGATTTGAATTGTATATATCAAAATTAGGTAGTAGGAGTAGTGGCTGACTTAAAATATTTTCATTAGTATCATAAATGTCCCAGGCATAATCTAATTCATTCACTTTATTTAAACTTAACATAATATAAGTATTTACAGCGATTTTAATAGGAAACCAGTAGCATCTATTGGATAATGAATCTAAAGAAATAAATCCAAAGTTATCGTAACTTAAATACTTATTTGGTTCTGCTACATTAGAGATTTTAAAGCATCTATTTTCAGCCATATATTCTACATTCCATTTTTGATTATTTGCAGAAGATTCATTTGAAAATGTTAATGATTTCGATACAGGATTTAAATATAAAGAATCAGAAAAGATAGATTTTATATTGTAATTACCATTAGGTAGAAAAGTTCTTTCAACTGACATATAATTCACCTCTTTATAAATTAGATGATAGTACTCATATTGAGTCTTTGTTGATATTAATTTTATAGGTCACTCATAGTCCATATCTGATTATTACCTCCATTAGAATTAAATACTTGAATAGCAGTTCCGTCTGCTGTTTGGCCGTCATATAAATCTAGAACTTTAGTTTTATCGCGTAGATTAGTAATTGTATATCTGTCATAATTATCTGAAACAGGATTTATAAGCCAATATTGGGCATCATTATTTTGCGCACTAGAAGAAACTCTTACAGTATTACCATCTGAAAAAATCCATGTTAGAACTCCGTTTGAAAGTATTGTATTAAAAAACTGGTATGCTGCTTTTTCTTCATTATATATAATTGTCCATTTTTGATTGCGATCATTGTTCCAAGTATATAAATTAACAGCTAGATTTGTCACAGACACTTGTTGTACAACTTTATTAGCAGCTAATATTGGACTTATTTTACATGTGAAATTGTTAAGATCTGATATTATATAATCTTCTATGATAAATTTTATATAACTTGAATTATTAAGTGTGCTAAGTTTCAAATTATGAGCTACGGTATCGGCATATAATACTAAGTTAGGGTTTTTATAACTTGCAATAATAAATGAATTGTTACCAATGTCTTTTAATAATAACCAATATTGATTATCTGCATTTGAATCTTGTTGCGCTGATATATTATGTGTTGGTGCATTCCATGTTAAAACTAAATTAGTATTATGGATATTCATACTTTTTATTTTATAAGCAGCTTTATTAGAATCATATATAAGTCTCCATCTTTCAAGGTAATTTCTAGTTTGTAGAAATAAGCTAACGTTACTGGTACCGGCAGCTTGATAAAAAAATAAATTAGTATCGGCCTTACAGGAGATGGTAACGATTTTGTCATTTAATGAATTTTGGATTATTGAATGGTGTTCCATTATGATTCCTCCTTTATTTAATAATTAATCTTACATATAACATATAACATAATCAAATTATTTTTTGTAAACCTAAAATTTAAATATATCAAATTTTTATTAGTATGTTTACATAATTGATTATGGATATTTCGTAAAAATGGCTTATTAAAAATTTAAAGTCAATTAGTCCATTTATAGTATAATAAAACAATAATATGTATATTATGGAAGGATAGTGGTGAATATGAATAAGTTGTTTTTACAAATTAAAATGTTAAAAAATGACAATAGGGAGTTTCAAGAAATTTTTAAGCATTTTGAAAAAACTATAAATATATTTACTAGAAAATATAATATATATGATAATTACAATGATATTTTGTACCATTTATGGTATACACTTAAAAAAGTTGATTTGAGCAATTTCAATACACAAAATGATTTAGAGAGATATATTAGTAGGACTTTAAAAAGATATTGCTTAGATATTTGCAATAAAAGAAAGATTGATAAGAAAATAATATATAATTCAGAAATTGTAGATAAGAAATTAAGCTTAATAGCAAATAGTTATTCAAGTTATTCAGAATTTGAATTTAATGATTTAATATCCATATTACCTGATGATCAAAAGAAAATTATATATATGAAATTTGTTGAAGATATTAAGGAGATAGATATAGCTAAAAAACTTAATATAAGTCGTCAATCTGTATATAAAAATAAAATACTGGCTTTAGAGAGATTAGAACCCATATTGAAAAAATTAATTAATATGTAGTTTATATTTTTTAAAAATTTTAGGTTTACAAAAAATAGTGTGGCTATGTTATATATAAATGATAACAATATACTGAAAAATATATCCAAAATTTAAGGGGGCGTGTATAGTAAATAATTAAAAGTATGTGCGTTGAAATAAATTTAGGAGAGTGGTTAGATATGAATATAAATGACAACTTAAGTATAAATTCCCCGGTAGATAATAAAAATGTTGTAGTAGTTAGAGCTAGAAAAACTGATACGTTTTTTAAGGCTTTTAAGGTTGCTCCTAATATTTGGGTGGCGCCAGAGAGATATTATGGCGAATCTTTGAGTATAGATGAAGAATATAAAGTTGATGGGGGAATATATGATTCTAATTTTCTTTCACAAGATAGTGAAAAAGATAAGTTTTTACAAGCTATTATTACTTTGTTAAAAAGAATTAATAGTACTAACGCCGGGGAAAAATTATTATCCTTGATTTCTACAGCTATTCCATTTCCTTATGGATATATAGGTGGAGGGTATTATGCACCTAATATGATTACTTTTGGATCAGCACCAAAATCTAATAAAAAATTGAATTCTTTAATTTCAAGTACTATTCCATTTCCTTATGCAGGATATAGAGAAACAAATTATCTTTCATCTGAAGATAATAAAAGTTTCTATGCATCTAATATAGTTATTTTTGGTCCAGGAGCAAACATAGTAGAAAACAATACTGTTTTTTATAAAAAGGAAGATGCAGAAAATGGTATGGGAACAATGACTGAAATATGGTTCCAACCATTTCTAACCTATAAATATGACCAATTTTATATTGATCCTGCAATAGAATTAATGAAATGTTTAATAAAATCTCTTTATTTCTTATATGGGATAAAACCAAGTGATGATTTAGTTGTTCCATATAGATTAAGAAATGAATTAGAGAATATAGAATACTCACAGTTGGATATAGTTGATT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP014174|919573:931274|923779_927373_+|AUN23639.1|DBSCAN-SWA MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTFFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGGGYYAPNMITFGSAPKSNKKLNSLISSTIPFPYAGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDQFYIDPAIELMKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVVPYRLRNELENIEYSQLDIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFIDNYFSNAKKMFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFNIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNENNVLLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRAYEYHFNNSNDSSLDNVNVGVIDNIPEIIDVNPYRKNCDPFTPVYNITETKEINTTIPFSVNYLQAQNANNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLAYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKEYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGPISLINKKENLSMPIIEIYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYLKNILYFKKVYFNFLDQWWTEYYSQYFDLICMAKQSILAQEKLIKQIIQNKLQDLSKADISMDKLNLMNLATEKTFIDLSNESQIAINNINDFLNKSAICVFDTNIYPKFISFMEQCINSVNSNVTAFIQKCTNITEDEKLQLIKLNTFMNIDFEFFDIQSIKDLITSETDLIKEEKESDYNLFLFTLQEDNNKVIEDISGKNTLVKYSDSISLVYGVNGDALYLKEPDESVSFSNKAFENGLTNSFSICFWLRNLGEDIITSKLIENKADNCGWEIYFQNNGLVFSIVDCNGNEENIYLSDVISKNWYYISISIDRLRNQLLIFINDKLIANQSIEQILNIYSSNTISLVNGNNPIYVEGLSILNRSITSEEVVNNYFSYLNNSYIRDISGERLEYNKTYELYNYVFPENSLYEVTENNNIYLSIKDTNNLNIQGAKFKLINIDTNKQYVQKWDEGVVYLLGDEEKYVDISSENNRIQLVSSKDTAKRIIFNNDIFRPNCLTFAYNNKYLSLSFRDRNYNWMICNNNDNIPKAAHLWALKGI >CP014174|919573:931274|921467_921908_-|AUN20816.1|DBSCAN-SWA MSVERTFLPNGNYNIKSIFSDSLYLNPVSKSLTFSNESSANNQKWNVEYMAENRCFKISNVAEPNKYLSYDNFGFISLDSLSNRCYWFPIKIAVNTYIMLSLNKVNELDYAWDIYDTNENILSQPLLLLPNFDIYNSNQMFKLEKI >CP014174|919573:931274|923081_923618_+|AUN23638.1|DBSCAN-SWA MNKLFLQIKMLKNDNREFQEIFKHFEKTINIFTRKYNIYDNYNDILYHLWYTLKKVDLSNFNTQNDLERYISRTLKRYCLDICNKRKIDKKIIYNSEIVDKKLSLIANSYSSYSEFEFNDLISILPDDQKKIIYMKFVEDIKEIDIAKKLNISRQSVYKNKILALERLEPILKKLINM >CP014174|919573:931274|919573_921454_-|AUN20815.1|DBSCAN-SWA MNSSIKKIYNHIQEKVINYSDTIDLADGNYVVSRGDGWILSRQNQILGGSVISNGSTGIVGDLRVNDNAIPYYYPTPSFNEEYIKNNIQTVFANFTEANQIPIGFEFSKTAPSNKNLYMYLQYTYIRYEIIKVLQHEIIERAVLYVPSLGYVKSIEFNPGEKINKDFYFLTNDKCILNEQFLYKKILETTKNIPTNNIFNSKVSSTQRVLPYSNGLYVINKGDGYIRTNDKDLIGTLLIEAGSSGSIIQPRLRNTTRPLFTTSNDAKFSQQYTEERLKDAFNVQLFNTSTSLFKFVEEAPSNKNICIKAYNTYEKYELIDYQNGSIVNKAEYYLPSLGYCEVTNAPSPESEVVKTQVAEDGFIQNGPEEEIVVGVIDPSENIQEINTAISDNYTYNIPGIVNNNPFYILFTVNTTGIYKINAQNNLPSLKIYEAIGSGNRNFQSGNLCDDDIKAINYITGFDSPNAKSYLVVLLNKDKNYYIRVPQTSSNIENQIKFKREEGDLRNLMNSSVNIIDNLNSTGAHYYTRQSPDVHDYISYEFTIPGNFNNKDTSNIRLYTSYNQGIGTLFRVTETIDGYNLINIQQNLNLLNSTKSIRLLNGAIYILKVEVTELNNYNIRLHIDITN >CP014174|919573:931274|927398_931274_+|AUN20818.1|DBSCAN-SWA MPVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVLLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKNMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVRAPGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIKYDTQRNYIENRSSIDELILDTNLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVDDFVIEANKSSTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRYEKWIDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYKYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINECSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVDKHLKTIIPFDLSMYTNNTILIEIFNKYNSEILNNIILNLRYRDNNLIDLSGYGANVEVYDEVELNDKNQFKLTSSTNSEIRVTQNQNIIFNSMFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCIKNNSGWKISIRGNRIIWTLTDINGKTKSVFFEYSIREDISDYINRWFFVTITNNSDNAKIYINGKLESNIDIKDIGEVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIKEIYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSSVGEILTRSKYNQNSNYINYRNLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNSNREWRVYAYKDFKEEEKKLFLANIYDSNEFYKTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVLKDYKNYFCISKWYLKEVKRKPYNPNLGCNWQFIPKDEGWIE >CP014174|919573:931274|921970_922855_-|AUN20817.1|DBSCAN-SWA MEHHSIIQNSLNDKIVTISCKADTNLFFYQAAGTSNVSLFLQTRNYLERWRLIYDSNKAAYKIKSMNIHNTNLVLTWNAPTHNISAQQDSNADNQYWLLLKDIGNNSFIIASYKNPNLVLYADTVAHNLKLSTLNNSSYIKFIIEDYIISDLNNFTCKISPILAANKVVQQVSVTNLAVNLYTWNNDRNQKWTIIYNEEKAAYQFFNTILSNGVLTWIFSDGNTVRVSSSAQNNDAQYWLINPVSDNYDRYTITNLRDKTKVLDLYDGQTADGTAIQVFNSNGGNNQIWTMSDL |
6 | Clostridium_botulinum_D_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1715046 : 1722112
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP014174|1715046:1722112|DBSCAN-SWA ACTATGTCATATTTGAATATATATCATTAATTTTTTTACATTTATCCTTTATAATTTCTCTAATATGATTGGGTTCAAGTACTTCCACACATTCTCCGTAACTTAATATCATGGAATATATCCAGTCATCTTCTAATAAATATGTATCTACAATTACACTACCATCTTCTTGAAACTTTATTTCATCTTTATCAAAACAATCGTCTATTCTATATCTAACTCTTTCAGAAAACTTTAATACAACTCTTGTAGGTACTTGTTCACTCTCACTAATATTTATATATTCTTTATAGGAAATTCTATTTTCATTAATTTTTTCATGTGGAACAGTTAAATTTTCCATTCTTGATAATTTGAAAAGTCGGTAATCATTTTTTAATTTGCAAAAGGAAAATAAATACCATGAAAAACCTTTAAAAACAAGAGTTAATGGCTCTATCTCCCTCCAATTATATTCACCTTTTGAGTTTCTATAATCAAAGGCTATACAGTTTTTGTTATCTACAGCATCATATATAATTTTGTATTTTAAGTTTTCTTCTTCACATTTTTTAAAGCCCCAAGGTAATGTATCTATACACATTTGCTCAAAATGTAAATCAAATACTTCTTTTTTTTCTTTAGGAACAATATTTTTTACCTTTTCAATGGCCATTTCAACATTTTTATTATCTAAAAATTTATTCATATTTTTTAGAGCTTCTATAATTGAAATCATATCTTCTAATGTTAAAAGTTGATGATTGATTTTATAGTTATCTATAATATAAAATCCTCCATTATTTCCAATTTGAGAAACTATAGGAATTCCAGCAAGATTAATTGCTTCAATATCTCTATAAATTGTTCTTACAGAAACCTCAAATTTTTCAGCTAATTCTGATGCAGATATTTTTTCTCTATTTAAAAGCATTACAACAATTGCCAATAATCTATTAATTTTCATGAATCTATAAACCCCCCATAATTTGAAATGACTATTTTATTATATCAAATTAATAACTTGTAAGATTGGTTAGAGAGAAATTGTTGAGGGAATTGCATAAGAAAGTTTTAAAAGAATAAATTCCAATATGGTATTTTTTGGGTTATCTATGGGTATGAACTTGACTTAACAAATGTACTATAGTAAACTTATATCGTAAAAAAGAATAAAGACAGTTCGTAACCATCCTGTCTATAAATAAAACTAGGACGTAGCTACCGCCTTAGGTAGTTTTTTTGTTGATGGGCATTTAATGCCCTTTTTTATTTGCAAAAAATTTACAAATAGGATTTTTGTTTTAGGTGAAATTTTTAATTTATATAAAGTTTAGAAATTGTTATTCAAGGACGCAGAGGTCTTATCCAATAAATTTTTTAACTTAAATATAACAGTAACAGTATAAGGCTGTTTTTTATAAAGATTGTCCAAATATAACTTAAAAACCTTACAATGTAGGAAACTTCAAATAGTTGTAAAATATCCTAATAAATAATAATTTATCATAACCATTATAACTGTTTAATGTTTTCAAGTCTAAGTGAGTGTAATAGATTGAAAAATCTATAGCACAAGGAGGAATGAAAATGAAAAAAATAGGACTAACAACTACAGTGCCAGTGGAAGTTATTGTTGCAGCAGGATATAAACCAGTAGATTTAAATAATATGTTTATAACTTCAGAGAATTATTTAAAATATATAGACATAGCTGAAAGAGACGGTTTCCCCAAAAGCTTATGTGCTTGGATAAAGGGGATTTATGGAGCATGTCTAGAAAATAATATTAAAGAAATAGTTGGAGTTATGGAGGGGGATTGTTCTAACACTAAAGCCCTCATTGAGGTTTTTAAACTAAGAGGAATAAAAATTTATCCATTTTCATTTCCCCATAGCCATAGTTTAAAGGATGTAGAAATTGAAATAAGAAAGTTCATGGATATCTTCAATGTTAACGAGGATAAGGTAGAACAGGTTAGAAAAAGATTAAATAGAGTTAGGAAGCTAGCAAAAAAAATAGATGAAATGACTTATATAGATAATAAGGTTAATGGTTTTGAAAACCACCTATATCAGGTGAGCTTAAGTGACTTTAATGGAAACATAGATGAATTTGAAGAACACCTTAAAAAAGTCATTGAGGGTATGGAGAAAAGAGAGCCAATAAATAAAAAATTAAGATTAGGCTATATAGGAGTTCCTCCAATGATTGGAGATATATATGAGTTTAGTGAAAAATTAAATGCTCATTTTGTATATAACGAAGTTCAAAGAGAATTTGCTTTTCCTAGGGGGATAGAAGCTGCAAATATATTTGAACAGTATTATAATTACACCTATCCTTATGATAATGAGTTTAGAATTAAGGAGTTGAAAAAGCAAATAGAAAAGAGAAAGATAGATGCTATAATTCACTACACTCAGGCTTTTTGCCATAGAGCTGTTGAAGATATAGTATTAAAAGAAGAATTAAATATTCCTATATTAAATATTGAAGGTGATAAGTTAAATACATTAGATGCAAGAACTAAACTAAGATTAGAAGCCTTTCTGGATATGTTGCTGGACTTAAAGCAGAAGTAATAGGTGATCTAGTAAGAATTTTTATCTTAATATATTGTTGGATTTAAAGCAAAAGTAATAGACGGTATATAAAAGAAGTTCATGTTTTCTTTATATTTAGCGAAGGAGGGGAATTAATGAGATTGTTAGGAATAGACCTTGGAAGTAGAGAAGTTAAGATTGTTTTAATGGAAAACAATATTATAGTTCAAAAGAAAAAAGTAAGTACCATGAAATTTTATAGAGATTACTGTAGCTTTCATGGCAAGATTGTAGTAGATTTAGAAAAACTTAATATAGAAGGAATAGATAAAGCGATATCAACGGGTTATGGAAAAAATAATACGGATTTAGAATTTTTTACACCTATAAATGAGATAAAAGCCCATGTTTATGGTGGGATCTATCAAAGTAATTTAAAGGATTTTATACTTTTAGATGTAGGTGGTCAGGACGTTAAGGTGGTAAAGGTAGAAAAGGGTGTTGCAACAGATTTGGAGCTTAATGAAAAATGTGCTGCTTCCTGTGGAAGATACTTGGAAAATATGGCAAATGTACTTGAAATATCCCTAGATGAAATGAGTCAGTACTCGGAAAATCCCGTGGATTTAAATTCCACCTGTGCAGTATTTTCTGAATCAGAATTAATTGGAAAAATAGCCGAAGGGGTACACATAGAAAGGTTATGTGCTGGGGTTAATTACTCTTTGTATAAAAGGCTACAACCTCTTTTAAGTAAGTTTAGGGGGAAGAAATTAGTTATAACCGGTGGTGTTGCAAATAACCATTCAATAAAAAAATATTTAAATAATGATTATGAAGAAATAGTATCCGTAAAAGATCCTCAGTTTAATGGGGCTATTGGATGTTGCTATTACGGAAGCAAATTTTTAAAATAAACTTAGGAGGAAAAAACATGTATACTTTAAAAGTAGAACATAATTTTGATAGTGCTCATTTTCTTGCAGGTTATGAAGGTAAATGTGGAAATATTCATGGACACAGATGGAAGGTTGAAATTCAGGTTCAGGCAGAATCATTAGTACAAGGCGGTCAACTTGACGGGATGATAATAGACTTTGGAGACTTAAAAAAAGATGTTAAATCTATGGTAGATTATTATGATCATGCACTTATAATAGAGAAAGGAACTATGAGGGGGCAATCATTAAGCTCATTAAAGGAGGATGGATTTCGTATAATAGAAGTTAATTTTAGACCAACAGCGGAAAATTTTGCAGCTTTTCTCTATAAAATTATGAAGGATAGAGGATATAATGTAAAAAGTACTACAGTTTATGAAACACCTAATAATAGTGCTACCTATGAAGAAAGTGGGGTAATTTAGAATGGATTTTAAGGTGGTTGAAAGGTTTGTAAGCATAAATGGAGAAGGAAGGCGTTGTGGACAACTGGCTATATTCATAAGATTCGCGGGTTGTAATTTAAACTGTAGCTATTGTGATACACTTTGGGCAAATGAAAAGGATGTACCCTATGAAGTATTAAGTTCCAAAGATATATATGAATATATTAAGTCCAAAGAGGTTAAAAATGTAACTTTAACAGGAGGAGAACCTCTTTTGCAAAAGGGAATAATGGAGTTATTAAAACTTTTGTCTAAGGATAAAGAGCTTTATGTGGAAATTGAGACAAATGGCAGCATATTATTAGATGAATTTTTGAATATAGAAAATTCACCAAGCTTTACTATGGATTATAAACTTCCTTTAAGCAATATGGAAAATAAAATGGCATTAGATAACTTTAAATATTTAACTAAGAAGGATACAGTAAAATTTGTATCAGGTAGTATAGAGGATTTAGAAAAAGCTAGAGAAATAATAAATAAGTATAACTTAGTAGATAAAACTAATGTGTATATAAGTCCTGTTTTTGGAAAAATTAATTTAGATACTATTGTAGAATTTATGAAAAATAATAGAATGAATGGAGTTAATTTACAACTGCAGCTTCACAAGATTATATGGGAGCCTAGTAAGAGAGGAGTATAGCATATGGCAATTGATGTTAAAGCAATTGAAGAACACATAAGGGGAATTTTGATAGCTTTAGGAGACAACCCAGAAAGAGAAGGTCTAAAGAACACACCAAAACGTGTAGCTAAAATGTATGAAGAAGTATTCAAAGGTATGTGTTATAGCAATGATGAAATTGCAGAAATGTTTAATGTAACCTTTGAAGATGATTTATGTATAAATGATAATGAAAATGACATGGTTTTTATGAAGGAAATAGAAATATTTAGTCATTGTGAACATCATTTAGCACTTATGTACAATATGAAAGTAGCCATAGCATATATACCTAAGAAAAAAATTATTGGTTTAAGCAAAATAGCACGAATAGCAGATATGGTAGGACGTAGACTACAGCTTCAAGAGAGGATTGGAAGTGATATAGCAGAAATACTTCAGAAGATAACTGACTCAGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP014174|1715046:1722112|1719607_1720198_+|AUN21530.1|DBSCAN-SWA MAIDVKAIEEHIRGILIALGDNPEREGLKNTPKRVAKMYEEVFKGMCYSNDEIAEMFNVTFEDDLCINDNENDMVFMKEIEIFSHCEHHLALMYNMKVAIAYIPKKKIIGLSKIARIADMVGRRLQLQERIGSDIAEILQKITDSEDVAVIIEGEHGCMTTRGIKKPGTKTITTTLRGKFNTDPIVSNKLMMLYTK >CP014174|1715046:1722112|1715046_1715991_-|AUN21525.1|DBSCAN-SWA MKINRLLAIVVMLLNREKISASELAEKFEVSVRTIYRDIEAINLAGIPIVSQIGNNGGFYIIDNYKINHQLLTLEDMISIIEALKNMNKFLDNKNVEMAIEKVKNIVPKEKKEVFDLHFEQMCIDTLPWGFKKCEEENLKYKIIYDAVDNKNCIAFDYRNSKGEYNWREIEPLTLVFKGFSWYLFSFCKLKNDYRLFKLSRMENLTVPHEKINENRISYKEYINISESEQVPTRVVLKFSERVRYRIDDCFDKDEIKFQEDGSVIVDTYLLEDDWIYSMILSYGECVEVLEPNHIREIIKDKCKKINDIYSNMT >CP014174|1715046:1722112|1716614_1717610_+|AUN21526.1|DBSCAN-SWA MKKIGLTTTVPVEVIVAAGYKPVDLNNMFITSENYLKYIDIAERDGFPKSLCAWIKGIYGACLENNIKEIVGVMEGDCSNTKALIEVFKLRGIKIYPFSFPHSHSLKDVEIEIRKFMDIFNVNEDKVEQVRKRLNRVRKLAKKIDEMTYIDNKVNGFENHLYQVSLSDFNGNIDEFEEHLKKVIEGMEKREPINKKLRLGYIGVPPMIGDIYEFSEKLNAHFVYNEVQREFAFPRGIEAANIFEQYYNYTYPYDNEFRIKELKKQIEKRKIDAIIHYTQAFCHRAVEDIVLKEELNIPILNIEGDKLNTLDARTKLRLEAFLDMLLDLKQK >CP014174|1715046:1722112|1717726_1718488_+|AUN21527.1|DBSCAN-SWA MRLLGIDLGSREVKIVLMENNIIVQKKKVSTMKFYRDYCSFHGKIVVDLEKLNIEGIDKAISTGYGKNNTDLEFFTPINEIKAHVYGGIYQSNLKDFILLDVGGQDVKVVKVEKGVATDLELNEKCAASCGRYLENMANVLEISLDEMSQYSENPVDLNSTCAVFSESELIGKIAEGVHIERLCAGVNYSLYKRLQPLLSKFRGKKLVITGGVANNHSIKKYLNNDYEEIVSVKDPQFNGAIGCCYYGSKFLK >CP014174|1715046:1722112|1718505_1718937_+|AUN21528.1|DBSCAN-SWA MYTLKVEHNFDSAHFLAGYEGKCGNIHGHRWKVEIQVQAESLVQGGQLDGMIIDFGDLKKDVKSMVDYYDHALIIEKGTMRGQSLSSLKEDGFRIIEVNFRPTAENFAAFLYKIMKDRGYNVKSTTVYETPNNSATYEESGVI >CP014174|1715046:1722112|1718938_1719604_+|AUN21529.1|DBSCAN-SWA MDFKVVERFVSINGEGRRCGQLAIFIRFAGCNLNCSYCDTLWANEKDVPYEVLSSKDIYEYIKSKEVKNVTLTGGEPLLQKGIMELLKLLSKDKELYVEIETNGSILLDEFLNIENSPSFTMDYKLPLSNMENKMALDNFKYLTKKDTVKFVSGSIEDLEKAREIINKYNLVDKTNVYISPVFGKINLDTIVEFMKNNRMNGVNLQLQLHKIIWEPSKRGV >CP014174|1715046:1722112|1721155_1722112_+|AUN21532.1|DBSCAN-SWA MINIFSKKDSEKDNKNDTIEQEVIVEEKHEVETIDTMKFLKEMTIQIEGIIQQHNKVNGEHEVLEKLAKQIENHMVTVSNLTERTNESTDKLFSQGESLLEITKDTVNKSLEGKKSIEGMVKVIENLDIETKDTYENINALGEKLKEIGEIAQLISGIASKTNLLALNAAIEAARAGEQGKGFAVVADEVRKLAEMTGESSSNITNLISGIDSQTENVLNSVEKSTLVVTEGVKSSKGALEKIEEVLDSFNRVEDDTDSLIKTINTQKEDISKIFNGINGVDKILTETNEQIIKHIDEAHKVDEKLEKSVYHIAQYVK >CP014174|1715046:1722112|1720381_1721041_+|AUN21531.1|DBSCAN-SWA MNKEKAIVVFSGGQDSTTCLFWAKKKYKEVIAVSFDYNQKHKLELDCAKDICKKYNIEHHILDLNLLNQLAPNSLTRQDITVDKSAPKEGVPNSFVDGRNLLFLSFVAVFAKQKGINTIITGVSQSDFSGYPDCRDVFIKSLNVTLNLAMDYEFEIITPLMWINKAETWKMAYDLGVLDIVKEETLTCYNGIKADGCGECPACKLRKKGYWEFEKEYLK |
8 | uncultured_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2421418 : 2446357
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP014174|2421418:2446357|DBSCAN-SWA TCTATTGTGTAACAACTTCTTCTGTAGTATCTTCTACATTTAATCCTTGGTTTCCTAAATCTTCTTTTTCAGCTGGATTAACTGTAGCCATTAATTCACTATACTGTTCTAAATTAATCTGGTTAAAAGTATAAAATACATTTAGTTTATTATTCATGTCCTCTTTTTCATAGTAATTATTATTAATTAAATTTTTTAATAAATCATATAGTATCATAATATCATTTCCTTTCTATTTTATATTATTTAACACTTCTTTATATTTTAAATTAACTACTTCTGATTGTGCTTTTAACAATTCTTTTTTTAGTTTTTCTTCTTCTGTTTCTATATGTGGAATATCTTCTGTTATTAATTTATGTGGTGTAACTGTTACATCTATGCCTTTAATTATTTTATCATTAAATTCTCCAAATTCAGTAATTATATAAGGTAATCCATCTGGTGGTGTATGTGGAGGAATACATCCCTCTGCATCACCAGTATTAACCCATACTTTACCTGAGTTATCATATATAATTAAGCTCCCTCTTTTCATATAATCATCTCCTCTCTATTCATATGCATACCAATTTACTTTATCGAACATATATCGTTCTGCTGTGCTAGTCCCTTTTTCTACACGTACACTATAACGCATAATATGAAGAGATGTATAAATTGTATTACCAATGGAATTTATTTTCTCAATACTATACTCACGATCATAAGCAATATCGCTACTGTATCCGCTTTTCGTTTTAAATGTAATTTTTACTTGTAATAATTCATTATAAATATATAATTCTATTCTTGGTTCTGAGTACCTATCATCAGAGCGAAAATAATCGTCTGGGTTTTTTCGTGGGGTTATTCCTATTGTTGTTAAAATCACGATAGATGGCTTAAATCCACAATTTGTATTTACGCTTGCAGAAGATAAAGGATAATTTGATTCCATAAATATTCCTACTTCAGGACCATAATAGTTAACATTTGCTGTACCCTGTGCCCATTTTTTACCTGTGCTAATTTTACTAATGTTTTTTATAATATCTTCCCATTTGCTTTCTTTTGTAATCTGTAGACTTTTATCTAATTGCAATAATGCGTCTACAGTATTAATTTTTACATTATTGCCAGAAGTAAAAACCTCATTAATTGCACTTACTAAATTTGTTTTATTGGTAGTTTTTAAGTTATCTTTATTACCTGTTAGTGTCGTAATATCAGCCAATTGTGTCTCAACTGTTTGTCCGTTTTCTGTTTTTATATCTTCTGCAGTTAGCTCTATATCTCCAGTTTTCTTATTTACAGAAGTTACTGGAATATCTATATTATTAATATCCTCTTGCAGTTGTATTACATCTTTAGCTAATTTAGCCGCTACATCACCATCTAATTTATTTTTTATAGTATTGAACCATACCTGGAACTCATCCGCCCATGCCTGTGTATTAATGTTGTACCATTCATCAAATGCTTCTTTCTTTTCTTTAGTCCATTCAGCAATATCTTTATCATAAGCTTCCTTGGTTTTACTATACCAACTTTGAAATTGCCTAAAAATTTCTGTAGTATCTACCTGATCTACTACACCATGAACTATTCCGCATAGCTCTTTATTTAATCTCAAGTCTGTTATATTGCTTTGTATTATAGATATTACTCCTGCTCTTACATAAATATCCGCAAGTCCTAATTCATACACGTCAGCATTTCTAGACAATTCTGGTGTTTTAGGTTCGCTAGCAAATTGACCTTTTTTAACTGCAGCTCTTATTTCTCTTTTTTCAATATCATATCGTAGGACTACTCTATCTATTCTATCTAATACACCATCTGCAACATCTATAGGCAACATTAATTCATCTGTGTTTATATATATGAATCCATTTATCCATGCCTTACCTGGTTTAATAATTACATTCATCCTGTCTGTCTCTATTACTTGTAATTGTTTAGCAGGATTAGGGAAAACACCATTACCTATAAATGTAGCAAAATACCCTGCAAAAGTTTCTGCTTTATATATCCTATCCCATGTATCACCTACTTTCATGGCATTAAAAAATCCACTCTTTTCCATTATCTCACTTCCTTTTTAGATACTTTCTTTATTTTATCTATAATAGTAGGAATGCTATCTCCAAATATACATTCTAAATTGAAGCCATTCGTTTCATATATCTCCTTAATTTCTGTAACCCTGCTATTAAGAGTTATACCCCATTTTTTATCTTGGACAGTAATAACATCTCCTAAATCCCAGTCCTGACCATAAATAAAAGCTCCATAAGGAATTACTTGTGCTTCAAATGTTTCCACTATTTTATATTCTTGTAATCTTTGTTTGCCCATAGTTGTAAGTTCTGTAATATTATCAGCCTGACTACAATCTATAAAAGTTTCCTTCCTGTACCAACCTTTAATGTTTCCTACTTGTTGTATTAATCTTTTTTCATCTTCTCCCTTCCCCCCAACATAAGCCACGTTTTTATAACTTAACAAACTTTTTAGAAAATGCTTATTTCTAATATTTTCAAAATCCATACTGAAAATCACTGGAGGATTTTCTTCCTGATCTGCAGTAAGATTTCTTCCTTCTATGACATCAAATATAAAATTATTATTAGAAGTGTCTAATGTTATATTCCAACCTAAATTACTATATTCAGCTATCTCTTGTATCTTATCTGCCAGGTTTTCATAACGAGTACGCCAAGCATCTTGTTTTCCTCTTTGTTTGTCTTTAGCAATAATTAAATTAGGAATAACTCTATCTTTATCTACTGGATTTACAGCATTATTATTTATAAATTGTTTTATTATAGTTTCTTGTTGGCCTGTTGCACTATCGTATCCTCGTCCTATTAGTGGTAGTGTCATTCTATCTTTAATTTTCCCTTTTAAAGTAGGTCCTTTAATAACTAACTGCTGTTTACCATCTTCACTCATAGATTTATCTATATGTTCAATTATCCCTACCTTATTAAAATAAACTCCTAAGAGGATTAAATTGTCTTCTTGGAGTTTATCAGTATTTTGTTTATCCAAATTCATGTGTAATTCAAATTCCCCAACTTTAAAAAAACGTCTAATAAAAATTAGACTCTCATAGTTATCAATTTCACCAAGTAAATTGAAATCTTTATCTATAATTCTTATTGGTATATTATTCATAATCTACACTCCTATATATAAAGGTTTATAGTATAAAGCCATTTCCAAGTTATCTAATCCTTTCTCAGCATCATATCTAAATAAATTATCTCCTGGGGCCAATTGAAGGAATGTAGAATTTAAATCTATATAATAAAATACATTTTGTCTTACACCATTGCTTCTTATCATTTCAACCCTTTTATTTCCGAAGTCAGTATTAACTACAAGTTTATCTCCGGCATTTAGTGTTCTTTTAATTTTTATATATTTTCTGGTATATACATCAAACAGGCTTGGATTAACAACTGTTGCAAGCGCTTTAAATTCTATACGCATACCACATTCTACATCTCCACGATTTTTAGCATTTACAATAAGATTACTTACCCTATGCCCCATAATAATTCCTTCTGGGGGAATAATTAAAGGAAAATGAAAATCCCCAACCCATAAAGCTATTTCTTCTTTTTCTTCTATCAAATCCATCCATAAAGGATTAGGACAATAAAACTGTATTAGAAATTCTTGCATATCATCTATTTGTTCTCTAAATGTTGGAGAACTATCTACAATACAATTTATAACATGCTCACTAGCATTATTGATATAGGTAAGAGTAGCATTTATCTTAGGATTAAATATACTACAAAGCTTTTGCCTCTTTCTATACATATCTTCTACAGTATCTCCTACTATAGCTCCCTCTATTGGTAAAATTCTTTCATCTAAAAAAGTTCCATGGTGTGTCTTACCATCCTGTCCAGGAGATTTACTTGTCAATATTGTTGTTTTAGGACTTCCTATCTCAATTTTAGTTAAAATAAAAGGAGTAGAGTTACCTAATTCTATACTCTGTCCCCTTTCATTTTTAAATATAATTTTTTGCAACTTTTACTCCTCCTTAAGATGTACTAAAGTTTAAATTCCTTATCATTACTTCATTCTTTCTCATCATTTCACTTGGAGATAGTGCTCTAGGGCTATTAAAAGTAAAACTATTGTGGTTTACTACACTCCTACTATTATCAATACTAGTTGAACTTGCATTACTAGAGTATTGCTGAATTGAATTTATCGCAGAAGATCGAGTAGCCATTGAATTTAAAGCTGAATTTCTAGCAACCTCAAAACTTTCCTGTATACTAGCTATCATGTCCTTAAGTTCCTCTATTTTAGGCTTAAAGCCCTCTACAAGTTTTTCTCCAAGACTTTGTCCTGCTTGTTGATAAGCTTCCTCATAAGAATGTAACAATTCAATAATTTCCTTTTGATTGTTGTCCATTATAATTCTTTCGGCTTCAGCCTGGAGTGCTGCATCATTAGTTTTTTTAGCACAGAAACTTCTATAATCATCAAGTTGTTTTTCTAAACTTTGTCTATTGCTTTCATATATAGAATTAATATTTTTTAATTCATTTTCTTTTTCTTTCTGTAGCTGCTCTTTTTGTTCTTCTAGTTGTTCTTTATGAATCCTTTTCTCTCTCTCTTTAAGAAGATTATTAAGTTCCTTCTGGATTTCAATTTTGTTAAATTCATTATGTTCATATTCTAATGCTGTCTCAAGCTGATTTATTTTTTTTAGTTCTTCTGCATTCTTATCAGCTTTATCTTCTTCTACAAGTTGTTTATCTATAGCTTCAATCTTAGAATCATAAAAGCTCTCTATTCTTTTTATAGATTCATCTTTCCATCTATCTAAATTTTTAAGCTCATTATTTATGTGATCTTCTTGTGCCTTTAGCTCATCTTCGTATCGTTGCTTTAATGCTGACTTAATTCTATCAACCATATTATTAATACTATCAGATACTTTTTTATCTGCTTCTTTTTGAGCATCTATAATCTTTTGTTTTGTA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MANLKEIIGEELFKKLPEEKQKEYKDKDFEDVSNGSFIPKTRFDQVNEQAKEYKKQVGERDTQLKEVKEQYKDVDGLKEKVEQLELDNKTQKETYEKQLSDIAFNNALEKGLGAFNIKDKRLIMALIDREKLKVDGDTVIGLKEQIEPLKQSHDFLFEKEVKGTGAFNTGGNNDPESNKTNFASELGKQRAENMKAKSLTDFAK >CP014174|2421418:2446357|2431402_2432014_-|AUN22132.1|DBSCAN-SWA MKKIFNKISLLFIFMFVVSLTLVGCAPKENPEETLNKYYENIKSGNAGEAYEALCEQSKKDFTEEDFTKWRNTEKEVCELKETKIEKVNEFKGSLENIEFKNIVEFNATEKVKDLYENKEVEQKHKMYVVNDNGKWKIYLNKKLIKQLTSNDLTQLARMYMYGTGNKTKDLNKAISLLEEAIKLNPNNEEAKSALPYLKASGH |
31 | Clostridium_phage(55.0%) | terminase,tail,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2451072 : 2464924
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP014174|2451072:2464924|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP014174|2451072:2464924|2451072_2451495_-|AUN22168.1|DBSCAN-SWA MNRSKYGAKKIVIDGITFDSKDEGKYYEYLKKLKSQEKILNFELQPKYELQPGFKKNGKTYRAITYAPDFLIYHLDGTEELIDVKGMSTQQGEMRRKMFDYKYPDLKLTWVARSLKYSSIGWIEYDKLKKIRRENKKCKR >CP014174|2451072:2464924|2452614_2452791_-|AUN22172.1|DBSCAN-SWA MDVKTLLPIMRKYEKCPKCGNNKIGNGEGGIIIEDDTYTRTCKCGFKITINEDGKEQR >CP014174|2451072:2464924|2456480_2456681_-|AUN22178.1|DBSCAN-SWA MKRREVLYHIDLMLERNIGEDKKALNVAKKSILKEYRFKFWANVILLIATVIMFGSFAVMYYFIYR >CP014174|2451072:2464924|2451746_2452334_-|AUN22170.1|DBSCAN-SWA MAYQYTKEQIKFITKNVKGRSNRELTEMFNNNFGLDLKISQIKSFKKNHKLDSGLDGRFKPGHIPFNKGIKGVYAKGCEKTWFKKGSTPINHRPVGSERITVDGYTEIKVEEPNKWRLKQQLIWEKYNGPVPKGYVVIFGDGNQHNFNPDNIILVSRQQLLILNRNKLIQKDADLTRTAIIIADLHQKISQRKAK >CP014174|2451072:2464924|2459215_2459425_-|AUN22182.1|DBSCAN-SWA MEDIKVTVTQEKREETIDKILDLVEKEFKGIDVTAVFTKKLLEDTVRTLENRCMETSLRFINKGVNEGH >CP014174|2451072:2464924|2461869_2463207_+|AUN23676.1|DBSCAN-SWA 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22 | Clostridium_phage(20.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2510552 : 2517844
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP014174|2510552:2517844|DBSCAN-SWA 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TGTATAACATCCAATTCCTTTATGAATTCTAATAGCTTCAGCGATTTCTTTATCTTCTCCGCCCTCTGCTACTACTGTAATTGAATGTGGCGGTAATCCTAATTGATCTATTTGATTTGTATCATTTTCATATACTCTAGATCTTTTTACTTTCTTGACCTGTGCTACTGCTCCGCTGGTTCCCTCTAATATAGTTAAACTGGCTTGGGCAGTGCTTTGGCTTTGTCTTTTTCTTAGTTTAGGGTCCTCTTCTACATAGGCACCCAGTTCAGCATTTACTTCATTATAAACGCCATTCCAACCAAAGGTTGGATTGTATATCTCTGTTATATCTCCTGGGTTTGCAACTATAGGACCAGGTATTTGACATACAGCCATAACTTCTATTTGTCCACTTTCTGGTATGGTAACTGTATAAGGTAAATTCCATTTTATATTACCTTTGTCTGTAACTATGCCATTTTTAATAGTAGTATTTTTTACCCCACTAATAATTACTGGACATTTACTATAATCTTTTGCTTTTCTTTTTATCCCATTTATTTTTACTATGCTATCTAGTCCTGTACCTATTGCTGTATTAGGTGCTCTATTATTATAAACAGATTGGGATATTTGGAAAGCATCATATATTTTCTCTGAAACAGTTGCAATCCATTGATAATCCTGGCTATCTTCTCCAAGATATATATCTTGGCCAAAGATTAATCTTGCATCTTCTATAAGTCTATCTCTTACATCAATATAAGTGGGCATGTGAAATCCACTTCTATCAATAAATGGGCTAAAATAGGGCATTGACATTTCCTCCTTTTTAATATAATGTATCCATATAAGTTGCAACATACAAATTACATGGAGGTTTTTTATGATTGAATATAAAACAAGAACTATCTATTATGCAATCTTTAACGGAATTACTTATTACAAGCAATCAGATGGATATTATAGAACTAATAAAAAAGGATGTATTCCAGCTTTACATCATGCAGTATGGGAATTTCATGGTAATAAAATAATTAAAGGTTATGATATCCACCATAAGGATTTTGATAAAGATAATAATGATATTGAAAACTTACAACAATTATCGCATGAAGAACACGCTAAAATTCATTATGAGCATAATGATGTAATACATAGAAGATGTAAAAAATGTGGGAATGAATTCACTACAGGTAATACAATTAATCCATCTTCTATGTGTGATTCATGTAAAGAGCTACAGCTAAAAAACTATAAATATAAGTGGACTCAGGAAAATAGAGAAAAATTAAATAAAAACTTTTTAGAAAAATATCATTCAGACAAATATCGAGAAATAAGAATATGTGAATTATGTGGGAAGGAATTTTCCACATATAAATATGGTCCACAAAAACTTTGTTCTCGTAGCTGTGCTGCAAAATCAAAATATAAAAAATAACTATTTTAAAAATTCATCCCAATAAGGACATCTCCATATTGGGATATTATTACACAACTAAATGAATAGTTTCTATTTTCAATTTTACTTTCAAATTTCTTTATACTAATAACTCCTTGAGTTTTTGATATTCTTTCTTTAATTATGTTATCAACTATAATTTTATTGTCCATACTTGCTGAATTACCTAATATATCTTGAAAAAGTGGTAAACCTTCTTCTTTATTTTCCCACCATTCTTCTTTTAATAATAAAAGACGTGTCTTTACTGCTTGAGATACCGCATAGGTACCATAGGTTATATTCTGTTGGCCTTTGCCAAAAGAATAATCACCGTTTCCATCTAGTATCCTATATCTCACGAGTTAACACATCCTTTCCATTAAACTTAAACTTTGATGTATTTACATTAATTTCCCCCGGTTTAATGTCTATAGATGAAGTACCATCTATAGTTCTTAATTGACATGAATTTGTTGAATAATTTTCTATTTTATTTGGTTGGCTCCATGTTCCTAAAATAGCAAAACCATCACTTAAATCATGTCTTCTCTTTTCTATTTGGTTTTGAATACCTCCATAAGTAAACCATGCATCTATGCACATGTCTGAAAATATAATCAGACATTCATCTCCTTGCTTTACTGGCATTGTAAGACAATATTCTCCTGCTCTAGGAATAATTATAGGTACATCTAATAACAGTGGTAGGTTAGCCCACTCCTTTGTAAAATCTGGTTTAGTTATATGCTCTCTTAATGCAAGTTGTACAGTTACTGTTTGTGTTTCAGAATCAAAGCTTTGAATAATTCCAGGACAGGCAACTCTTAAAACATTTTTCCATGAATCCCCCATACTTCTAAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP014174|2510552:2517844|2512325_2512403_-|AUN23682.1|DBSCAN-SWA MEEATKWGCITKKEFKEITNKDYKE >CP014174|2510552:2517844|2516419_2516977_+|AUN22240.1|DBSCAN-SWA MIEYKTRTIYYAIFNGITYYKQSDGYYRTNKKGCIPALHHAVWEFHGNKIIKGYDIHHKDFDKDNNDIENLQQLSHEEHAKIHYEHNDVIHRRCKKCGNEFTTGNTINPSSMCDSCKELQLKNYKYKWTQENREKLNKNFLEKYHSDKYREIRICELCGKEFSTYKYGPQKLCSRSCAAKSKYKK >CP014174|2510552:2517844|2517328_2517844_-|AUN23683.1|DBSCAN-SWA MFRSMGDSWKNVLRVACPGIIQSFDSETQTVTVQLALREHITKPDFTKEWANLPLLLDVPIIIPRAGEYCLTMPVKQGDECLIIFSDMCIDAWFTYGGIQNQIEKRRHDLSDGFAILGTWSQPNKIENYSTNSCQLRTIDGTSSIDIKPGEINVNTSKFKFNGKDVLTREI >CP014174|2510552:2517844|2511888_2512215_-|AUN22236.1|DBSCAN-SWA MNDCKDCIQINNIEDKIKAVWHQIEESKAQRKEFEKRITDLEISKGETKEKFDRIFTAIEAIEKNIEKIADSIEKIQSKSSKTYENLKYEVIKYIVIAGLAAAVAKFI >CP014174|2510552:2517844|2512462_2512864_-|AUN22237.1|DBSCAN-SWA MYIKIIDNLKIYKGMMTNYIYDNLDINKGYFILNQDETLCICEYDGDIDKNKNPNTIEISKDEYNNILNEINTTIKENQKDISQNTDAEKEQLIKTVNNLSVENQKKDFMLKELASTVNTLNLKIQKLEGGSI >CP014174|2510552:2517844|2516982_2517339_-|AUN22241.1|DBSCAN-SWA MRYRILDGNGDYSFGKGQQNITYGTYAVSQAVKTRLLLLKEEWWENKEEGLPLFQDILGNSASMDNKIIVDNIIKERISKTQGVISIKKFESKIENRNYSFSCVIISQYGDVLIGMNF >CP014174|2510552:2517844|2515179_2516349_-|AUN22239.1|DBSCAN-SWA MPYFSPFIDRSGFHMPTYIDVRDRLIEDARLIFGQDIYLGEDSQDYQWIATVSEKIYDAFQISQSVYNNRAPNTAIGTGLDSIVKINGIKRKAKDYSKCPVIISGVKNTTIKNGIVTDKGNIKWNLPYTVTIPESGQIEVMAVCQIPGPIVANPGDITEIYNPTFGWNGVYNEVNAELGAYVEEDPKLRKRQSQSTAQASLTILEGTSGAVAQVKKVKRSRVYENDTNQIDQLGLPPHSITVVAEGGEDKEIAEAIRIHKGIGCYTNGDVSIKIKGIEGPPIRFFRPTYIDIEVTINIKPLSGYTTETTESIKKNLQTYLNSMEIGANLSLSSLWGAALQAMPNLMDPMFSITGITAARVEEEQKPDDIELKFNEVCRGNINYITANII >CP014174|2510552:2517844|2510552_2511575_-|AUN22235.1|DBSCAN-SWA MAKGIDISMHNGTVNFSAVKSSGCNIVIIKATEGVDYVDPCLNQHYNGAKAQGLNIGFYHFMSEKTDPAQQAVDFWNAIKSKQFNIIPTLDIETNSMDRSAEAISDRCIEFLEKFKSLSGYNCLIYTGGYFGRDNLDSRVKKYSGWIAHYGVNSPMATGFTVVGHQYTEDGRINGVNTRVDLNNFENGIFIGKATNAIETREMKIQNMLVTIGYPIGSSGVDGVIGNGTITAIKAFQKDCNLTVTGSVDTKTWNKLEQEYNKKLGIKPNNKEDFDMDKVILYFGPLDALSAVLVSQKHQCPMMLKKDFEDKKLKAKEIIIIGGKPGTDRYDSFKDAAKLL >CP014174|2510552:2517844|2514496_2515168_-|AUN22238.1|DBSCAN-SWA MAIEKYVDNITSQHRDKPKFIAWLSSNLTILDHAYLAAKSIDINFDLDYAIGKQLDTLGTIIGRQRILTFQPLNGHDPVLDDETYRLVLKAKVAMNMWDGTIPQMYEIWDNIFKDIGLELQDNQDMSFNAYITGYVNQIRQDLIQHGYIVPKPEGVRVNYIGKSIVGFKPYSGMIVSMAKSETINMSYNPKELINFKQNPYFIVQGITKSTIEMKGVEEVGSI >CP014174|2510552:2517844|2511610_2511871_-|AUN23681.1|DBSCAN-SWA MNLMDYIIDQALILIPALYVLGIMLKQTSKIKDWTIPWILLVVGIIGSISLMGLNPNAIIQGILATGAAVYTNQLIKQSTEKKEQV |
10 | Clostridium_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2539799 : 2557171
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP014174|2539799:2557171|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP014174|2539799:2557171|2552862_2553225_+|AUN22287.1|DBSCAN-SWA MKLNYDLIRDLLLVVEDISDGSINYPVENIQNDYLSNYELKTIKYHVKQLAQGGIVEVPSSSIYSIIDLTWYGHQYLANIRDNTIWSKTKEYIKPFGTVTLDIISEVAKLFILNKLHLNP >CP014174|2539799:2557171|2540850_2541177_-|AUN22270.1|DBSCAN-SWA MPFHKIDPEEEIRKAIKKNPELAKEIEKADAEYRELKSRKENTDKEIKKSIEYFNGYGSPYDELVISTLEKQVPKKVIRTKTISQACPVCKSAVNWKYCSNCGQRLTY >CP014174|2539799:2557171|2542882_2543203_-|AUN22273.1|DBSCAN-SWA MYGGEKLRSKVVKIILSCTILLSFIGFHIYTHSTIERVIRKDLFLKGYFKEAFKTEISELPIPDKQYGTLYICNNPAIGPDYYDIDYKYIYFGKVKYWYINGAGGG >CP014174|2539799:2557171|2547162_2547402_-|AUN22280.1|DBSCAN-SWA MKNIGIVRKVDELGRIVIPKELRRTLNLEEGDGLEIYTEGDQIILKKYEPCCIFCGEAKEVINFKGKNICKKCMRELKK >CP014174|2539799:2557171|2555251_2555629_+|AUN22290.1|DBSCAN-SWA MSISILGLNIKRIREEKGISAYRLAKDANVGVSTISQIETGKRQSLNSKTAEKIATTLGVSVDELMTTETDVEYVVTDIEQTIKLILSSDELVLDDIELNDTEKLQIESALNATFAMIRNQRNRR >CP014174|2539799:2557171|2552096_2552453_-|AUN22285.1|DBSCAN-SWA MKQAITGYITALINVYVGNEYPQSNLLHFNNNKFIIKDLNDLLDYVADLKEEENKSNEVLNIFNEIVMENKTLNKTVKDLEESCQYMCDIEKNQLEKMELLKAENEDLKAKLLKKGEI >CP014174|2539799:2557171|2555632_2557171_+|AUN22291.1|DBSCAN-SWA MKRIAIYSRKSRETDTGESIKNQIDMCKTYFDRTNEDCSFEVFQDEGFSGGNTNRPSFQRMLELAKHKQFDVIAVYKVDRIARNIVDFVNTFNELEEHDVKLVSITEGFDPSTPIGKMMMMLLASFAEMERMNTAERVKDNMKGLAKIGRWSGGTPPTGYKSKTITVNGKKETYLELIPEKKQLIISIFEKASDGYTTYQIGEMFSMSPKTISNIIINPTYVKSDELSANYLKSIGYDVFCELNGNGYLAYNRRPKKKGKKLFNAKGMFVSVSLHEAPIDSKTWIKANNNLKDRATEAKPRISNNSFLAHLVKCSCGSGMYIHTGHKKKDGTKNTYFVCSKKKSKNKCASKWLRIDVVEAEVLNTLKKVSSNPKILDVYLKKKNNSVNYVESIKNIKKQINKNTEAINALTDKLVLLEGASIDIVSKKINSIANENTKLNTQLLEIERKKMFLEVDGENLKLLISNMSKFLARFDRIDINEKQNFIKTIIKEVIWDSISNDGEDEITIEFLE >CP014174|2539799:2557171|2547454_2548330_-|AUN22281.1|DBSCAN-SWA MAEGKEKGWISLYRAMEDGWLWEDKPFARGQAWIDLLLQANHKDKKTFSKGELVIVKRGSFLTSDQLLADRWGWSRKKVRTFLEVLVKEQMIELKRSPKGTSLTLVNWDLYQGLGTTEEQQKIQQRDNRRTAEGTTEEQQKNTNNNDNNVNNVNNVNNDNNVNNSSSTTPNYIEFFNNNFHLISSYEAEILNSFEEDGLDPGVVQLALEKAIENGARNIKYVKSILRSWLEKNIKTVEAVRAEQQQFKRQKKDKNIKTVIHKKEDKFNDCEQRNYSKEQLNDLEKKLLGWS >CP014174|2539799:2557171|2546003_2546630_-|AUN22278.1|DBSCAN-SWA MAGRTTGSKNKVLHIWSKEEKEYLKQITPGHHYKEIQNFINKKFDLNLTLGQIKGAISRYKLNTGFTGQFKEGNVPANKGIKGVYAKGCEKTWFKKGSTPINHRPVGSERITVDGYTEIKVAEPNKWRLKQQVIWEKYNGNIPKGHSILFGDGNKRNFDIDNLILVSRQQLLIMNRNKLIKTDADLTKTGLIIADIYQKIGQRKTNAK >CP014174|2539799:2557171|2545484_2545877_-|AUN22277.1|DBSCAN-SWA MEKMINLETFADGALAEKINMALKEVLENIADPNTDYKTKRKLTVDMTFASGEDRELTEVSIVAKPKLAPTKPLAAKIVIGTDGKGGILASEYKKQIPGQSTMRVDEETGEVLTTAEEKEVDLKGIKLVK >CP014174|2539799:2557171|2541191_2542187_-|AUN22271.1|integrase|DBSCAN-SWA MYSSSSKEEVVIKLVGKLSLEFPEIDQRKVRTIAEEVLYKYRVLPEETGLVTSDIEEKLQIYLASKKLDGLSLKTLKNYQYNLAIFADHLRKPLGTITTMDLRMFLAVRCKNMKATSVNGQISILKSFFGWLHDEEYIPKNPAKKLKQTKEPKRLRHAMTEEEVELLRQASKTDREKALVEFLISTGCRLSEVVGVNKDDLNWHEMSLNVIGKGNKERKVYFSTKAKILLKKYLLTRKDDNEALFVTSKRPHGRLGGRSVQREIKKIANRAGLNKSVYPHLFRHSFATCKINSGMPLPVLQHIMGHESPSTTQVYAQLSEENIKYEYKKIS >CP014174|2539799:2557171|2539799_2540321_-|AUN22267.1|DBSCAN-SWA MLEKDIFKKTEGRLYRYFKTLQQIKCFNLECEELEKQKDRIRKDIRETNVFIEEESRAITYEERVQTSSKKFSYAENEIIKGIENLEKEWIYVRRKLLKRKAKIRELERQIVPLKYNISMLSEESKKFIEWKYSQCKSVEWIANQMYGGARATAYRKREELVKSLIIWNNFYL >CP014174|2539799:2557171|2542245_2542509_-|AUN22272.1|DBSCAN-SWA MFFYNENIDFEVAVIIDKLEEIKCVHENRYVQVPNRAIKVTLYNANVQVGEFKIYNEFLTLEEIKVRIKDYIQAKELTKPKYWEFKY >CP014174|2539799:2557171|2554773_2554980_-|AUN22289.1|DBSCAN-SWA MNNLKKILKHKKISPYRLAKLAGIGQATVHGLVNNNREPRISTAQKISNILDCSIEEIFFEEEKRNEI >CP014174|2539799:2557171|2553207_2553504_-|AUN22288.1|DBSCAN-SWA MNPFRISKNNIKAFIDSGNYELTGLLETGEITIAIVSDLERDTLKKVMKSSNINKEQIIEELNNLTDNRTNEILEIYKQLSANDTLNICKKNGLRIKV >CP014174|2539799:2557171|2543386_2543734_-|AUN22274.1|DBSCAN-SWA MTPIEIMQKIETCQQALTRGNTELKTLGIKKSRAEHDYKVALRKEILRLRQLEKQPATLINDLAKGKEEIAKLRLNRDIAETNYSVCIEAMRNLRLELEAYRSFLTWERVELKNT >CP014174|2539799:2557171|2540331_2540574_-|AUN22268.1|DBSCAN-SWA MNSTLDEFDLAGIELTEEKKIQFRKFDRDMDRIITLLGEFHKDKLSELAALARKLGENKPFGGRENKSRTKMWGKNGFYE >CP014174|2539799:2557171|2550149_2552096_-|AUN22284.1|DBSCAN-SWA MAKQIILNSLKLKNFKGIKDLTIDFSNITNIFGENATGKTTINDAFTWLLFDKDSKDRTSFEIKTLDSNNNVIHGLEHEVTGVLNVDDKSITLSKIYKEKWTKRRGEAEKQLTGHETIYSIDEVPVKKKEYQETINSIIDENLFKLITNPLYFSINMKWQDRRTVLLDIIGDITTEKIVNYKDDLKPLLELLGDKDIDTLKKSVQARKRKLNEEIKSIPYRVDECNNSIKEVDLEALEFRKRGIVSGIKSLEEQLLDSSKVNEEVLKEKDKLYSLKSKLRDMEYKASMEADKPKRKFENKLNDLRMDIKQIEYTLNSFEREKQDIENNMNHYTSLRDETREKWFEENKRVFEFDESNCICPTCKRPLDTEDIENKKHQLEENFNSNKAKILKDIQDKGKSYKNLLEKYKETLDKTINNLEASSRDLEKLKAAEIELQEQIKNYMPKDSLMSNKEYEDLKAKISELEAKLQQSTTANSQSQELKERKSKLEIELEEVNKDLSYKEQNEKLKNRIQELQEQEKKIAQQIAILEGQEYLCEEFIKTKVELLESSINSKFKYVSFKLFDTQVNGGLNETCEALINGVPFSNANTASQINAGLDIINALSEHYSVQAPIFIDNRESINNLIDINSQIINLIVSKDKNLRVEVM >CP014174|2539799:2557171|2544744_2545458_-|AUN22276.1|DBSCAN-SWA MINKEALEYLVNLGEKRDPIIQLDQGTFSTKGLDRVTGPLADTLTVSTLTGLVDYIKTNTDRLQSELLIQVKSHDDVRLYSPLNEDREREMYIKAVAILPNNIYYDRFMGTEEFNIMLQSSFVDVGDKEVLLKYTGLIKDEAVKSTGDDGVSQAVTIKTGVASVGQAVVPNPVTLAPYRTFPEIEQPLSKFIFRMQQGPKAAIFEADGGAWRNEAMRRIKAYLEEELKEMENINIIS >CP014174|2539799:2557171|2552614_2552797_-|AUN22286.1|DBSCAN-SWA MFKKLLEERGINLTKAEFAIICEITTDNIKFNRINFNKRTSLNYVLYIAARSSDIFKRCA >CP014174|2539799:2557171|2549221_2550148_-|AUN22283.1|DBSCAN-SWA MADKNTTAITLAKEEALNQVAAKISELKKNNEIVFPKNYSVANAVNSAWLMLQDVQDKSKKPALEVCTKNSIIGSLYDMCLQGLTPAKKQCYFVVYGNQLQLMRSYMGTVAVTKRLKGIKDIKAYCIYEDDEFEQKYDVDTATLKINKFNPKFENIDISKIKGAFAVVLGDNGPIHTEVMNINQIKNAWNQGYAKGGSGAHKNFTDEMAKKTVINRACKMFANTSDDSDLLIEAFNNTDKTYDEKDLVNNVEYEVKEEIKEKANSKPLNLNPQTEEPMKEIEIVEAEKVEVKQMEESPNQMTLEGPGF >CP014174|2539799:2557171|2540570_2540762_-|AUN22269.1|DBSCAN-SWA MEAWRKKLDKFLDGDLKLFEEDYKITYPCVLKRNKKRIKAKIDMDHGIVYNLNGKEIRKVKAV >CP014174|2539799:2557171|2546635_2546869_-|AUN22279.1|DBSCAN-SWA MKNTLGDLNNHLFMQLERLNDEDIEGEELKEEITRAKAVTGIASQIVSNANVILQAKKLQAETLERDNTEMPKMLEG >CP014174|2539799:2557171|2544317_2544680_-|AUN22275.1|DBSCAN-SWA MEEYKHCEVCGRLYPEKHHIVFKSQGGLDFFLNFKYLCVEHHKGKNSPHMCKKIDLEYKKELQAKLKNKLIQDYYTENELIKILELNRRQVKKMCRKFLLYKGGYKTEDIIRRLMGGKLY >CP014174|2539799:2557171|2543736_2544072_-|AUN23686.1|DBSCAN-SWA MKKKQKYKNKGTWIDGVFFRSQLEAKRYCQLKLLFHAGEIAGFVLQPQFVLQEGNGENRAITYSADFLVLNKDGTYIVEDTKGYESEQWKRTYKQFKLRYPGIDLKILKEV >CP014174|2539799:2557171|2548503_2549220_-|AUN22282.1|DBSCAN-SWA MKLKVLGSGSAGNCYLLQGENETLIIECGLSYKTILKGLNFNLGNVVGCLVSHEHKDHSKAVQDLIKNGIDVYSSKGTFEAIEVKGHRTNIIESEKSFKIGEFVVLPFKTQHDAAEPLGFLIYQKEIGNLLFITDSYYCQYKFQDVDHILIECNYSNEILEEKELPKTLKNRIIKSHFELENVKEFLKATDLKETKEILLIHLSDGNSNATQFHKEIERLTGKPTYIADKGLELEMEV >CP014174|2539799:2557171|2553517_2554267_-|AUN23687.1|DBSCAN-SWA MEVVLEIDEEGRTTARKLYNFLELAKGQFSRWAKTNILENSFAIEGEDYKGFDIVVEGNITKDYKLSASFAKKLAMGTHNFKGEAAKDYFIKVEEKLKQKIVDTSNLSPELQMFNNLFKALATTELEQQQIKAEVKETKEEVQAIRDVVEIIPSKSWRSETNRLITKICFKLKDYQKPKEEVYKALQERAGCDLKIRLKNMRARLALQGVTKSKLDELNYLDVIEQDKKLIEIYTAIVKDMAIKHGIKA |
27 | Clostridium_phage(47.37%) | integrase | attL 2535539:2535557|attR 2557903:2557921 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2734365 : 2806690
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP014174|2734365:2806690|DBSCAN-SWA ACTATTTAACTAAACTTTCAACTACAGTTTCTACTGTTTTTATAGCATCTTCTAATTTATTTGGATCTTTACCTCCTGCCTGTGCCATGTCTGGTCTTCCACCACCACCACCACCGGCTATAGTTGCAACCTCTTTAATTATTTTTCCACAATGCACTCCTTTAGCCACTGTATCCTTAGTTGCCATAGCAACAAATAAAACTTTACCTTTATAGTTACTTCCTAGAACAACTACTCCACTTTGCATATTATCTCTTATTTTATCGCCTAAATCTCTTAGGGCATTCCCATCTATATCCTTTACTGCAGCTGATGCTACTTTGACACCTTTTATTTCTTTTATGTTATCTAATATTTCATCTTCTGCACCACTTGCTAATTTTAATTTTAAAGCTTCTATTTCCTTTTCCTTTTCTTTCATTTCTAGAACTTGATGATTTAATTTATTTAATAATTCCTTTTCGTTACATTTTAATATTTGAGCTGCTTCTTTTAATATGTTATTTTTATGATCTACATATTCCATAGCTTTAAAAGCCGTTACTGCCTCTATTCTTCTTATGCCAGCTGCAACCCCTGCCTCGGAAACTATTTTAAATATTCCAATCTGGCCACTATTACTTACATGAGTTCCACCACATAATTCTTTACTAAAATCTCCTACAGAAACTACTCTAACATCATCCTTATATTTATTATCGAATAATGCAATAGCCCCCTGCTGTTTTGCTTCTTCTATATTCATTACTTTAGTATTTACAGCATTGGCTTTCATTATCTCTTTATTTACTATCTTCTCTACTTCTTTTAATTCATCCTCTGATACTGCTTCAAAATGACTAAAGTCAAATCTTAGTCTTTCATCATCCACATAAGAACCTGATTGTTGTACATGATCTCCTACCACTTTTATTAAAGCAGCATGTAGTATATGGGTTGCTGTATGATTTTTTCTTATATTATTTCTTCTTTCTTCATTTACTTTTAATATAACTTGATCTTCTAAAGCAACTTTTCCATCTAAAATTTTTACAAAATGAAGTATTTTACCTGATATGTTCTTTTTACAATCTATAACCTCTGCTTTAAAATTATCGTTATATATAATACCTGTATCTCCTATTTGACCACCCATTTCTGCATAAAATGGAGTATTATAAGTTACTATTACCCCTTCATTTCCTTTTTCCATTTCATTTTTGAACTCTTCATCTTTTATAATCACAGCCACTTTTGATTTTACTTCTAGTTTATCGTAACCTTCAAAGTCTGTATTTATATTTAGATCTATTTTATTTAATATAGTATCCTCTGCCCCCATATAATTAGTTTCTTCTCTAGCGGATCTAGCTCTTTCTCTTTGCTCCTTCATTTCTTTGTTGAAACCTTCTTTATCTATACTTATACCTTCCTCTTCTAATATTTCTTCTGTTAATTCTACTGGGAATCCATAAGTATCATATAGTTTGAAAGCTTTATCTCCTGAAAGGATCTTATAATTATTATTCTTAACTTCTTTTATATAATCATTTAATATTTGCATTCCAGCATCTATAGTTTCATCAAATCTTTCTTCTTCTAATTTTATAATTTTCTTTATATATTCTCTTTTTTCTTCTAATTCCGGATAATTTTTATAGCAATTTTCTATAACTATGTCTGTTAAGTTATGTAGAAATGTATTGTTTATTCCTAAAGTTTTTCCATGTCTTGCAGCTCTTCTTAAAAGTCTTCTAAGAACATATCCTCTTCCTTCATTAGAAGGTAATATACCATCGCTTATCATAAAAGTAATACTTCTTATGTGATCTGTTATTATTCTTATAGATATATCTTTTACTCTATCTTCTTTGTAATTAGCTCCTGAAAGTTTACACACCTTATCTAATACAGCTTTTATTGTATCCACTTCAAATATAGTATCCACATTTTGCATTATAGTAGCCATTCTTTCAAGCCCCATACCTGTATCTATATTAGGATTAGCTAATTTATTATAATTTCCTTCTTCATCTTTATCAAATTGAGTAAATACTAAGTTCCAAAATTCTACTATTTTATCCTCATCACTAGCTTTTACAAATTCCTCTGAAGTTTTAACCTCTCCTGCTCCCCTATCAAAGTGAATTTCTGAACAAGGTCCACAAGGTCCTAATCCATGTTCCCAAAAATTATCTTCTTTTCCTAATCTAAATATTCTTTTAGGATCCATATCTGTTTTATTTACCCATATGTCTAAAGCTTCATCATCATCCTCATATATAGTCACATACAATTTGTTTTTAGGTAATTTTAAAACCTCTGTAGTAAATTCCCAAGCCCAAGGAATAACTTCTTCTTTAAAATAATCCCCAAAGGAAAAATTTCCCATCATTTCAAAGAAAGTACCATGTCTTGAAGTTTTACCTACATTTTCAATATCTCCAGTTCTTACACATTTTTGACAAGTAGTGACCCTTTTATTTGGTGGAACTTGAAGCCCTGTAAAATAAGGCTTTAAAGGGGCCATTCCTGCATTTATTAAAAGTAAACTTTTATCATTTTTAGGCACTAAAGAAAAGCTCGGCAATCTTAAATGTGCTTTACTTTCAAAAAACTTTAGATATTCTTCCCTTATTTCATTTAAACCCATTCTTTCCATGGTTTATCTCTCCTTTATTCTCATATTTTTATAATAAAAAAAACCTTCAATCCCTAAAAGGGACGAAAGTTATATTCCGCGGTACCACCCTAATTTAAATACAAAAACTGTATTCACAACTCCTGCAGCATAGCTCCTAAACAGCCTTCAGTACAAACTTTAGGAAGTTTTCACCAACCACTTCCTCTCTATATAAAGTTACTTTACTTACTCCTTTTAATCATCACTATATATATATATATTTAATATTATCATGCTCAAATTATAAATAAAAATTACCATTATGTCAAGATATGCAAAAATTTATCCGATGACTATCCGCTCTAATACTCCCATCGCACTCTGTGAAAGCGATTCGCACCAAATCGAAGATTTGGACTCTCTGCTTTTCTTCAAAGTGGGAGTAAAGAGCGGCTACGTCCCTGGATAACGATTCCTAAGCTTTAGTGGGAGTAAAAACTCCCTCTGAAGCCAAGAACTCTGCTTATCCTATGATTCATTTAAAACAAATAATAGTTTAAATCTTCATATATAATTTTCATTATAACCCCTATAGGTATAGCTAAAACCATTCCCGCAAAGCCATATATTTTCCCTCCTATTAAAAGGAGTAATATAACTGTTAAGGGATGCATATCTACACTATCTCCTGTAATTTTAGGAGACAGTATATCACCTTCTATTTGTTGTATAAAGTATAATAAAATCAAAGCCCACAAAGCTGTTTTAGGCGATTTTGTAAAGGCTATTAATATAGCTGGCAAGGATCCTATAACCGGCCCAAAATAAGGTATTATATTAAAAAATCCATTTATCAAGGATAATAATATAGGTAATTTTATACCTAAGCCTATTAAAACTAAAAAAGTAAGTATTGTTATTATTAAACATAATATTATTTGACTTATAATATATCTTGCTAAAATTTTATCTATATCCTCAAGTACGTTTTTTACCATCCCTCTTATCTTAACAGGAAAAATTATAAAAAATTTTTGTATTATTTTATCCCCTGCGGCTAAAAAGTAATATACTATTATGGGAATAACTGCATAATCTAATATATTTTCTCCTAAACCTACAAATTTATTTAAAATATTTTCTCCAATTGATACTGTATAATTTTCAATTTTTCCATTTACTTTATTTAAAATCCCTCCTAAAATTTTATTATTATTTAATAAATTTATTTTATTATATATATAATCTATATATTTTTGAATATATCCTACAGAACTTGTTATATTGTACCCTTCTTTTATTATTGCAGGTATTATAGAAATAATAAAGACTCCTATGATCATTATTAATGTAACAACTAAAAGTAATGCAGAAAATTTCTCATTTATACCTTTTTGTTTTAAAAATGTATGTATAGGTTTTAGTACATAATATATAACAAAAGATATAAAAAACAAGGAAAGTATATCTCTTACTATGGTATTTTTTATAAGTATAATAAAAAATACTAGGAATACTAATATAAAAAATAATAGTTTACAGTACAAATTTTTGTAATATTTTCTCATTATCTCTTGCTCCTATGTATTCATTTTGTTTTTAACCATAATTTTAAAATCTAAATTTCTACTTCTATAATTAAAGTAAAGTAGATTTCTTTCTCCTAATATTATTTCATTAGGACTTATTATTTTTTTCCCTTTTATAAAATTATTTAAAAATCCCATAGATATTATAATAGCAACTATTCTAAAATTACCTTCATTTATTATTATATCTTCAATAACTCCCATTAAAACGCCCTCTATATCTATAACCTCTAAATGCTTTATATCATTAAAACTTAAATACTTTCCCCTTTCTAGTTTTTTTACCACCATATTTTTATTTATTGATATTATATCCTCTATAAGCACTATATTATTTTTATTTAATATTTTATAAGAGCTCACACAAAAACCTATAATTCTTTCTTCATTAAAATCTACTAATATATCCTTTATAAAACCTACTTTTTTACCATTACTATAATATACATTCATATATTTAAAATATTTACTTCTATACATCTTTACCTCACTTTATATTAATATTTTAAAATTGAAAAACTCCTAAAACTTATAGTCCAATTACCACCATCTTACCTTTAGTTTTATCAAAAAAATAAAAAATACCCTCTCTAATGAGGGTATTTTTTAAATATCTTATATAAAAATAATTTATTATATTCTGCAGCAATCTACAGATCTATTAATGGCCGTGTACATGTTCGTGAATATGTTCAGAATGAGTCTTCATTTTCCATGCTTCTAAACCTTGAGATACTCTATATTCATTTATTGCTTTGTGTATAGCTTCTTCTGCAAGTACAGAACAATGCATTTTTACTGGTGGTAAT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>CP014174|2734365:2806690|2752169_2752823_+|AUN22471.1|DBSCAN-SWA MFDFPCFDENKVKFRKSDETSHIRILHATPDAPAVDIYINNNLISKGLSYKGFTEYMPLISRVYNIKVFPTDKKDVPVINKNIFIPPNSIYTIAATNFLKNIALFPILDKKLDNKNPNKAYVRFVHLSPNAPKLDFYMNGKEIFNNIDYKNITNYSSVDPKNYTLSLKIANTENTILTSPNANLKSDKYYTVYAVGLANGKPSLQVLIPLDGNSYIR >CP014174|2734365:2806690|2778163_2778640_+|AUN22493.1|DBSCAN-SWA MKKFLKLIFLISICCFLLTSCNIVFPIDGLKGKKSSNFYYTNLLAKDMTLEKEYKVTILETNFYKGLEINKKDKELIKHFITLLKKENFKTLEKKSESKPLYKIFFTFEKDKYIINVYNKQYISVYPFDGNFPMDYIDMSNIPEAYNLYNLCNFLFNK >CP014174|2734365:2806690|2788509_2789097_-|AUN22499.1|DBSCAN-SWA MKKNFKLIIGGLIIFIVGYFIGDATAINRIKKQIGQGAEKQVSSTKEEVREEKKDIKFGEQSPVGNLGAKILEAKESTAISNESGKSTPSGKFIVIKLELKNNGEEATEYNTNEFALKKDKTVYEVDDNAFEALGQLNSQETIYNKNSSFIGAYDKFNSGITKNTYIAFDVPKETKIEDLKLITKHNKGIQFNLK >CP014174|2734365:2806690|2750458_2751793_-|AUN22470.1|DBSCAN-SWA MDLLKIVEGFNNILWSYILMFFLFGAGIFFTFNLRFVQVRKFKAMFKQVFSKNQDRDSGITSFQALATAVAAQVGTGNLAGAATAIAAGGPGAIFWMWVSAFFGMGTIFSEAILAQKYKVKKDNGEVLGGPAYYIRDGFGSKKLAGFFAFSMMVSACLTGDMVQSNSIGISINKAFGVPNIVVGIIVAILTALIVLGGIQRIASVTEKLVPIMALFFIIGSLIIIGINYDNIGPAFKMIFLGAFNPKAATGGLIGVSVREAMRYGISRGLFSNEAGMGSTPHAHAVADVKHPAQQGLVAMFGLFIDTFVVLTCTAMVILTTGALDGKTTGIELTQQAFINGFGHFGNIFVAVSLFFFAFSTIIGWYFFGLLNVKFIFGDKGTRPYVVLFLVALVVGTILDVPLVWQLADTFNGFMVIPNLIALIALAKLVKKELKDYENNFSIK |
66 | Clostridium_phage(64.29%) | portal,bacteriocin,capsid,tRNA,head,terminase,tail,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3152595 : 3162079
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP014174|3152595:3162079|DBSCAN-SWA TCTAGTGTTTAAAATGTCTTATTCCTGTAAATACCATAGAAATCCCTTTTTCATTACATACCTTTATAGATTCTTCATCTCTTATAGAACCGCCTGGTTGAATTATAGCTTTTATTCCCCATTTTGCAGCTTCTTCTGCTACATCTCCAAATGGGAAAAAAGCATCTGAAGCTAAAACTACGCCATCTCCAGCTCTATCTAACGCTTCCTTTGCTGCCCATATTCTATTTACTTGGCCTCCCCCAATACCTTTTGCCATACCATCTTTAACTACTACAATAGCGTTGGATTTCACATATTTAACTACTTTCATACCAAATATAAGATCTTTCATTTCTTGCTCTGTTGGAGATTTTTCTGTAACTACTTTTGTATCTTCTAATAATTTATTATCACTCTTTTGTACTAATATTCCTCCATCTACCTTTGCCATATCTTTTCCTTCTGTAGATTTTTCTTCACATTTTATAACCCTTAAATTTTTCTTGTTTTTTAAGACTTCTAAAGCATCTTCATCAAAATCTGGTGCTACAACTATTTCTAAAAATATTTTTGCAAGATTTTCTGCTGTTTCCTTATCTACTTTTCTATTAAAAGCAACTATGCCACCAAATATAGATATAGGATCACATTCATAGGCCTTAGTATAAGCTTCCTGTACAGTATCCCCTATAGCCACACCACAAGGTGTATTATGTTTTAATGCACAACAAGCCACCTCTTCAAATTCACAAACGGTTTTCCACGCTATATCCATATCCTTTATATTATTGTAGGATAATTCTTTTCCATTTAACTTTTCAAAATTTTTCATAGGATATTTTCCAACAGTAGATGTGTAATAAGCTGCTGTTTGATGAGGATTTTCTCCATATCTTAAATCCATGTTCTTTTTATAGGATAGAGTTAAATATTCTGGATATTCCTCTTCTAATAAGAAATTACTTATAGCTGCATCATAGGCTGACATTAGATTGAAAACTTTTCCTGCTAATTTTTTTCTAGTTTGTATATTAACCTGATTATTTTCTTTTATCTCATTTATGACATTTTCATAATCCTTAGTATCTGTTAGTACTACTACATCTTTAAAATTTTTAGCTGCTGCTCTTATCATAGTAGGTCCACCAATGTCTATAAACTCTACTTTTTCATCAAAACTTAAATTTTCTTCTACTTTATTAAAGAAAGGATATAAATTCACTACTACCATATCTATAGGGTTTATGCCCTTTTCTTCTATTACCTTCATATGCTCTTCATTATCTCTTATAGCTAATATGCCTCCATGAATTAAAGGATTTAATGTTTTTACTCTTCCATCTAACATTTCTGGGAAACCTGTTACCTCTTCTATATCTATTACTTTTACTCCATTTTCTTTTAAATGTTTATAAGTTCCACCTGTAGATATTATTTCTACATCTCTACTTTCTAAAAACTTTGCCAAATCTAAAATTCCTGTTTTATCAAATACACTTATTAATGCTCTTTTTATCACTTAAACTCCCCCAGTTTCAATATTTTTTATTATCTTATTTATCTGTCATAAGTAACTGCCACCAATATACCTTCTTTCAAAGAAAACATATAAGTGGCACTATTTCAATTTACAAACTACAATTTTTTATATTTCAATAAATTTAATCTACTCTAAACACATTTTTCTATTAGTTTCATTTATATTAATAGTAATTTTTTCATTATTATAAATTTAGTATGTTTTAATAAAAACTTTTCTTCCTTGTAATTTTACTTTTTCTTCACTTATAAGTTTTATAGCTTCTGGTAATGCCTCATGTTCTTTTTCTAGAACTCTTTTTTGCAATATTTCTGCTGTATCTTCTGCAAAAACTGGTACAGATTTTTGTATTATTATAGGTCCACTGTCCGTACTCTCATCTACAAAATGAACAGTGCACCCAGATACTTTTACTCCGTATTCTAATGCTTTTTGGTGCACTTTTATACCATACATTCCATCTCCGCAAAAGCTTGGTATTAATGAAGGATGTATGTTTATTATCTTATTTTCAAATTTATTTACCAAATCCCCATTTAATATAGAAAGCCATCCTGCTAAAACTATTAAATCTACGTTTCCATATAAACACTCACATATTTTATTAGACAGATTGCTTTTATATATTTTTCTATCTAGAGTTAAAGTTTTAATTCCCTTTTTTTCTGCTCTTTCTATACCATAAATATTAGATCTATCCCCTATAACCATTTCTATCTTGCAATTTTTTATATATCCCTCTTCTATTTTATCTATTATAGATTGAAGATTGCTTCCTCCCCCTGAAACAAGTACTGCAATTTTAAACATCTTATTCTCCTTTAATTTAAAGAAAATTTTTCATATATACTCTATAAATAATTAATTCCCCAATCAATTATTTTAAAGATCTAACCTATGAACTAATTTTTATTATAAATTTATTTAATGCCTTTTTTTAAATTAGTTCAACAGACTTATCTCCTTTTTTAACATATCCTATTTTATAACCCTTTTCTCCCATTTCTATCAGGTCTTTTATTATATTTTCCCCATCTTTTTCATTTACACATAATACAAAACCAATCCCCATATTAAAAGTATTGTACATATGATCTTCTTCTATCCCTAAACTTATTAGATGGCTAAATATATTTGGTAATGGATAAGATTTTTTATTTATAACTGCTGTAAAATCCTCTTTAAACATTCTAGGAATATTTTCATAAAAACCTCCTCCAGTTACATGAGCCATACCTTTTATATTATATTTTTCTAAAAGTTTCATTACAGGTTTTACATATATTTTTGTAGGAGTTAAAAGAGTATTTCCTATTTTATTTCCTTCAAAATCTTTATGCAAATCTTCTACTAATTTTCTAATAAGAGAATATCCGTTGCTATGAGGTCCTGAAGATGCTATACCTATTAATATATCCCCATCTTCTATTTTACTTCCATCTATTATTTCATCTTTTTCTGCTATACCTACAGCAAAACCAGCTATATCATATTCCCCATCTCTATAAAAGCCTGGCATTTCTGCTGTTTCTCCACCTATTAGAGCACATTCACTTTGGATACAACCATTGCTAACCCCTTCTACAAGCTGAGCTGCAACTTCTGCTTCCAATTTCCCACAAGCTATATAATCTAAGAAAAATAACGGCTTAGCACCATGACATAATATATCATTTATGCACATAGCTACGCAGTCTATTCCCACTGTATTATATTTTTTCATTCTAAAGGCTATATCTAATTTAGTTCCAACTCCGTCAGTTCCTGATACTAATACGGGATTTTTATATTTAGGAAGTTCAAACATTCCTGCAAAACTTCCTAAATTATTTAATACTCCCTTTGTAAATGTCTTTGAAGCATGTTTTTTTATAAGATCTACTGATTTATAACCTTCCTCTATATTAACCCCAGCTTCTTTATAAGATACCATGAATAACATTCCCTTCTTTACATTATTAGTTATTCTCAAAATTTAAAAAACTTAAATTCCCTATTCCAAACTATCTTTAGGCATTTCTATAGGTGCAGATATAGGATATACGCCATTAAAACATCCCAAGCAAAAACCTTTATCTTTATTAAGTGTTTCTACTAAGTCTTCCATACTTATATAAGCTAGACTATCTGCTCCTATTTTTTCTCTTATTTCTTCTACTTCTGAGTGAGCACCTATTAAATCTTTTCTATAAGGAGTATCTATTCCAAAATAGCAAGGATATTTAACCACTGGAGATGATACTCTAAAATGAACTTCCTTAGCTCCAGCTTTTCTTAATATTTGTACTAATCTTTTACTAGTAGTTCCTCTTACTATGGAATCATCTATTATTACTACTCTTTTTCCTTCTACATTTATTTTAAGTGGATTTAATTTTACAGATACAGCTTTTTCTCTTAATTCTTGAGAAGGTGCTATAAAAGTTCTTCCCACATATTTATTTTTTATAAATCCTATACCATAAGGTATTCCTGAAGCTTCAGCATATCCTACCGTAGCTGGTATACCTGAGTCTGGGACTCCTATAACTATATCTGCCTCTACTGGGTATTCTTCATAAAGTTTTCTTCCCGCTCTAACCCTTGATTCATAAACATTTATACCATCCATAGTACTATCTGGTCTTGCAAAATATATATATTCAAAAGCACAGGTATGACATCTTGTTTTTTCTGTAAACTTAATTGAATTTATTCCACTTTCGTCTATAATAACTATTTCTCCAGGCTCTATATCCCTTATAAACTCTCCACCTACGCAATCAAAAGCACAACTTTCCGAGCTTAATAAATAATCATCCCCAATTTTTCCTAGGCACATAGGCCTTATACCATGAGGATCACGTGCTCCTATTAACTTATCTTCTGTAAGTATAACGATAGCATAGGAACCTTTAATTGCTTGTATTGCATCTACTACTGCTTTATCTATACCTTTTTTAGCGCTTCTTGCTATTAAGTTTAATAATACCTCTGTGTCTATAGAAGTTTGAAAAATACATCCGCCATCTTCTAAAAGTTCTCTTATAACTGCTGCATTAACTAAATTACCATTATGAGCTATAGCAATAGAACCTAACTTATAAGTACCTACTATAGGTTGTGCATTATCTGATTTACTCGCTCCTGTAGTTGAATATCTAACATGTCCTATAGCAGAATTTCCTATTAATCCTTCTATAGTTTCTTTGCTAAAAACATCCGATACAAGACCCATACCCTTATGATATTTAAATTTTTCTCCATCAGATACTACTATTCCTGCACTTTCTTGTCCCCTATGTTGAAGAGCATATAATCCGTAATAAGTTATTTCTGCTGACTTTGATTCATTATCTTTAGAAAATACTCCAAATACCCCACATTCTTCTTTAAACTTATCTCCTTCTAAATCAAAGGGCATATTTTCATTTAAATCATCTAACATATAGCACATACTCATTTTTACTCCCCACTTATTTTCTATTTTAAAAATTTAATCTTCTCTTAGATTATTTCCAGCTGCTGTAAAAATAATTTTAAACTATAACAATCTATTTATTGACTCTTTTTAATATTTCCATATAAGCTTCTTTTACATTTCCCATGTCTCTTCTAAATCTATCTTTATCTAACTTTTCTCCTGTGCTTTTATCCCATAATCTACAAGTATCTGGGGATATTTCATCTGCTAAAAGGAGCTCACCATTAAATCTTCCTATTTCTATTTTAAAATCAACTAGATTTATTCCTTGCTCATCAAAGAATTCTTTTAATGTATTATTTACTTTTTCTGCTATAGAATACATTTCTTTTAGTTCTTCAAAGGTTGTAAGTCCTATAGCCACTGCATGATAGTCATTTATAAGAGGGTCATTTAAATCATCATTTTTATAACTTATTTCAAATACAGTAGTATCTAATTTTCTTCCTTCTGAAAGACCTAATCTTTTTGCCATACTTCCTGCTGCTATATTTCTAACTATAACTTCTAGTGGAACTATTTCTACTTTTTTGCAAAGCTGTTCTCTTTCATTTATCTTTTCTATAAAATGTGTTTTTACGCCCTTTTTTTCTAAAAGTTCAAATAACATTGCCGTTATAGAGTTATTCATAACTCCCTTATCTTCAATAGTTCCTTTCTTTTCCCCATTAAAAGCTGTGGCATCATCCTTATAATACACAACAACTGTATCCTTATCATCCGTTCTGAATATTTTTTTAGCCTTTCCTTCATATAACATATCCTTCTTTTCCATTATAACTCCACTCCCTCTTTGTTATCATTTATAAATTTTTCTTTCATATCTTTTCTATATTCTATAAGTTTTTCTTTTAACTTTTCATACTTTAAAGATAATATTTGTACCGCAAGCATTCCTGCGTTATAACTATTATTTATACCCACTGTAGCTACAGGTATAGATTTAGGCATTTGAACTATAGATAAAAGTGAATCCATTCCTCCAACTGCGGCTTCTATAGGCACTCCTATAACCGGAAGAACCGTATGAGAAGCTATAACCCCAGGTAAATGTGCTGCAAGACCTGCCCCAGCAATTATACATTCATAACCTTCCTTTTCTAAATCTTCAATTGTTTCCATCAACTTTTCTGGTACTCTGTGCGCTGAAAGTATGTAAGCTTTATATTCTATACTAAACTCTTTTAAAGCTTTAGCCGCTCCCTTCATTTTATCAGTATCAGATTTACTTCCAAAAATAATAGCTACTTTCATGTACTAGACCTCCTTATATTTAAATATATAAAAAATTCCGCTAAGATTTCTATGGAGAATCCTAAAGCGGAACTTAAGCGCACTGCAAAAGCATAGCTAAGATTCATCCATAGACAGGGAATTTATGGTTCCCTCGTAGAGACTCTCAAACCTTATTATTGAGATTATATGGATGATATATTCATTTGTTTTATGTACTCATGGTAACATATAATTCTTAATAAATCAACATACTTTTATAAAAACATTCGTATTTTATTGGTATTTTATTTATTTTTTCATAATATTATTCGTAATGTAACGAACAATTAGTTAGGTGAAAAATTCACTGAAATATATATTATATTGTAATAGAAATAATTTATAATAGAAATTTATTTCTGAAAATAAAATAGATTTAATTTTCAGATATCAAGCAAAATAATATATGGTAATAAACATATGAATAAGCTTTAACATTTTCTAATCTTTTTAAATCGAGAGCTTTTGTTATTAATCAAAGAATGAAGGTAAAAAACCGATGGCCAAGCCACACATAGCTTTTCCACCGGGTAAAAAATTTTTAATGAAAAAATTTGAGATTCCTAGTCAAGTAAGTTATCTATCTATACATGTATTTTTTATATTTGCATGGTTAAAATTAAATCTATTTTAAAATATTACTATCTAAGATAATTATTTTTTTCTTCTATAAGCAGTATCCTCAAGTGGAAGCTTTTTTCTAAAGTTTCCATCAAATTTATAGTAAGCACCTTGAGCTGCTGGGGCTGTTGGTATGGTTGTAATTTCTCCTATTCCTTTTGCACCATAAGCTAAATCATTAGTATTCTTTTCAATTATTGTTGTTTCAATTTCTGGTATATCAGTAGCTCTAAACAAACCTAATGTGCCAAACTTAGCAGTTGGGATAGATTTATTTAATGGATAATCTTCTGTAAATGCATACCCAAGTCCCATAACTATTCCACCTTCAATTTGTCCTTCTACATTAGTTAAATTTATAGCTTTTCCCACATCATGTGCTGCAACTACTCTTTCTACTTTTCCATCATCATCAAGAATAACAACTTGTGTTGCATAGCCATAAGCCACGTGACTTACTGGATTCTTTTTATCAGAATTAATAGGATCTGTAATACTTTGATATTCCCCATAAAATTCTTCACCTTCACACTCTTCTAATGATGTAGTTAATAATTTTTCCTTAAGCTTTAATGATGCCATTCTTGTGGCTTCTCCAGTAAATACTGTTTGTCTTGATGCTGTAGTTGTCCCTGAATCTGGTGCAAATTTTGTATCTGGTAAATCTAAAATTATCTGTTCTGGTAATAAACCTATTGTTTCACATATTATTTGTGTAAGAATTGTTCCAAGACCTTGACCTATGCAAGCTGCACTAGTTCTTATATGAACCTTTCCATCTATTACTATTAAGTTACATCTTCCAATATCCGGTATTCCAACACCAACTCCTGAATTTTTCATACAACAGGCTATTCCTGCACATTTACTCTTTTTATATACATCTTTCACAGCTAATATAGTTTCTTTAATTGCAGTTCCTTTATCAGCAATTTGTCCATTAGGTAGTGCATCTCCAGGTTCTACTGCGTTTTTAAATCTTATTTCCCAAGGAGATATACCAACTTTTTCAGCTAAAAGATTTAAGTTGCACTCTGATCCAAAAACTGATTGTGTTACTCCAAATCCCCTAAAAGCTCCTCCTGGGGGATTGTTAGTATATACAGCGGTACCTTTTATTTTCACATTAGGACATTTATATGGGCCAGCTGCATGAGTACAAGCTCTTTGGAGTACAGGTCCTCCTAATGATGCATAGGCACCAGTATCTGATATAATATCTGCTTTAAAAGCAGTTAAATTTCCTTTTTCATCACATGCAGTAGTAATTGTCATTTCCATAGCATGTCTTTTAGGATGAATCTTTATACTTGCCTTACGACTTAAAGTTATTTTAACGGGCTTTTTAATAGTCCATGCAAGAAGAGCGGCATGATGTTGTACACTCATATCTTCTTTTCCACCAAAGCCTCCACCCACATATTTGCTAATAGTCCTTACTTTTTCTTTAGGAAGCCCTAAAAGCTCAGAAATCTCTCTCTGCTCATCATATATACCTTGGCTTCCTGTATAAATAATAACTCCATCCCCATCTGGCATAGCTAAAGCACTTTCAGGCTCTAAAAAAGCATGTTCAGTAAAGGGAGTAGAATAATGATTAGTAACCACATACTTAGAATTGGCTATTGCCTCATCTACATCTCCTCTATTAACTTTTTCCACTGTTAAAATATTTCCCTTAGGATGAATTTTAGGAGCATCTTCAGCTATTGCAATATTAGGATTAGAAATAGGTTCTAATTCTTCATATTCTACCTTTATTAAATTAAGTATTTCTTTTAAAGCCTTCTTGCTTTTTGCTGCCACTAAAGCCACTGCATCACCAACATACCTTGTTTCTTCTCCTACGGCTATCATTGCTGGCCAATCCTTTACAATATGTCCTATAAGCCTATTTCCTGGGACATCTTCTGCTGTAAGAATAGCTTCAACTTCTGGATGTTTTAAAGCTACACTTATATCAATGCTTTTTACTAAAGCTCTAGGATATTTTGATCTTAAAGCAGAACCATAAACCATTCCTTCTATCTTCATGTCATCTACATATTTTCCTATACCTAAAATTTTATCTTTTGCATCTATTCTTGGAATATTTTCACCTATTTTCCCTTTATATTCTTTCGCAAATGGAAGTTTACCATTTCTAAATGCCCCTGCTGCCATTTCAATGGCTTTTATTATTTTCACATATCCAGTACATCTACATACATTTCCTCTAATAGCAGTTTTAATTTCTTTCTTATTTGGATTTAGATTTTTATCTAAAAGTGCCTTTGCACTTATTATCATCCCTGGAATACAATATCCACACTGTACTGCTCCAGCTTTAGAAAAAGCCCAAGTAAAAACATCCTTTTCAAATTCTGTTAACCCCTCTACAGTCTTAACATCTTTTCCATTCACCTTTGCAGTTGTACATATACAGGCTCTAAGCGCCTTACCATTAACAAGTATCATACAGGCTCCACAGGCTCCTTCTGCACACCCATTTTTTACTGAAGTTAAATCCTCATTATCCCTCAAATATTCAAGTAAATTAATATCCTCTGAAACAGATACATTTCTTTCATTTAATATAAATTCATACACATTTATTACCCCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP014174|3152595:3162079|3157649_3158354_-|AUN22819.1|DBSCAN-SWA MEKKDMLYEGKAKKIFRTDDKDTVVVYYKDDATAFNGEKKGTIEDKGVMNNSITAMLFELLEKKGVKTHFIEKINEREQLCKKVEIVPLEVIVRNIAAGSMAKRLGLSEGRKLDTTVFEISYKNDDLNDPLINDYHAVAIGLTTFEELKEMYSIAEKVNNTLKEFFDEQGINLVDFKIEIGRFNGELLLADEISPDTCRLWDKSTGEKLDKDRFRRDMGNVKEAYMEILKRVNK >CP014174|3152595:3162079|3159353_3159488_+|AUN22821.1|DBSCAN-SWA MAKPHIAFPPGKKFLMKKFEIPSQVSYLSIHVFFIFAWLKLNLF >CP014174|3152595:3162079|3159508_3162079_-|AUN22822.1|DBSCAN-SWA MGVINVYEFILNERNVSVSEDINLLEYLRDNEDLTSVKNGCAEGACGACMILVNGKALRACICTTAKVNGKDVKTVEGLTEFEKDVFTWAFSKAGAVQCGYCIPGMIISAKALLDKNLNPNKKEIKTAIRGNVCRCTGYVKIIKAIEMAAGAFRNGKLPFAKEYKGKIGENIPRIDAKDKILGIGKYVDDMKIEGMVYGSALRSKYPRALVKSIDISVALKHPEVEAILTAEDVPGNRLIGHIVKDWPAMIAVGEETRYVGDAVALVAAKSKKALKEILNLIKVEYEELEPISNPNIAIAEDAPKIHPKGNILTVEKVNRGDVDEAIANSKYVVTNHYSTPFTEHAFLEPESALAMPDGDGVIIYTGSQGIYDEQREISELLGLPKEKVRTISKYVGGGFGGKEDMSVQHHAALLAWTIKKPVKITLSRKASIKIHPKRHAMEMTITTACDEKGNLTAFKADIISDTGAYASLGGPVLQRACTHAAGPYKCPNVKIKGTAVYTNNPPGGAFRGFGVTQSVFGSECNLNLLAEKVGISPWEIRFKNAVEPGDALPNGQIADKGTAIKETILAVKDVYKKSKCAGIACCMKNSGVGVGIPDIGRCNLIVIDGKVHIRTSAACIGQGLGTILTQIICETIGLLPEQIILDLPDTKFAPDSGTTTASRQTVFTGEATRMASLKLKEKLLTTSLEECEGEEFYGEYQSITDPINSDKKNPVSHVAYGYATQVVILDDDGKVERVVAAHDVGKAINLTNVEGQIEGGIVMGLGYAFTEDYPLNKSIPTAKFGTLGLFRATDIPEIETTIIEKNTNDLAYGAKGIGEITTIPTAPAAQGAYYKFDGNFRKKLPLEDTAYRRKK >CP014174|3152595:3162079|3154308_3154926_-|AUN22816.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGSNLQSIIDKIEEGYIKNCKIEMVIGDRSNIYGIERAEKKGIKTLTLDRKIYKSNLSNKICECLYGNVDLIVLAGWLSILNGDLVNKFENKIINIHPSLIPSFCGDGMYGIKVHQKALEYGVKVSGCTVHFVDESTDSGPIIIQKSVPVFAEDTAEILQKRVLEKEHEALPEAIKLISEEKVKLQGRKVFIKTY >CP014174|3152595:3162079|3152595_3154095_-|AUN22815.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVFDKTGILDLAKFLESRDVEIISTGGTYKHLKENGVKVIDIEEVTGFPEMLDGRVKTLNPLIHGGILAIRDNEEHMKVIEEKGINPIDMVVVNLYPFFNKVEENLSFDEKVEFIDIGGPTMIRAAAKNFKDVVVLTDTKDYENVINEIKENNQVNIQTRKKLAGKVFNLMSAYDAAISNFLLEEEYPEYLTLSYKKNMDLRYGENPHQTAAYYTSTVGKYPMKNFEKLNGKELSYNNIKDMDIAWKTVCEFEEVACCALKHNTPCGVAIGDTVQEAYTKAYECDPISIFGGIVAFNRKVDKETAENLAKIFLEIVVAPDFDEDALEVLKNKKNLRVIKCEEKSTEGKDMAKVDGGILVQKSDNKLLEDTKVVTEKSPTEQEMKDLIFGMKVVKYVKSNAIVVVKDGMAKGIGGGQVNRIWAAKEALDRAGDGVVLASDAFFPFGDVAEEAAKWGIKAIIQPGGSIRDEESIKVCNEKGISMVFTGIRHFKH >CP014174|3152595:3162079|3155053_3156049_-|AUN22817.1|DBSCAN-SWA MVSYKEAGVNIEEGYKSVDLIKKHASKTFTKGVLNNLGSFAGMFELPKYKNPVLVSGTDGVGTKLDIAFRMKKYNTVGIDCVAMCINDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVAAQLVEGVSNGCIQSECALIGGETAEMPGFYRDGEYDIAGFAVGIAEKDEIIDGSKIEDGDILIGIASSGPHSNGYSLIRKLVEDLHKDFEGNKIGNTLLTPTKIYVKPVMKLLEKYNIKGMAHVTGGGFYENIPRMFKEDFTAVINKKSYPLPNIFSHLISLGIEEDHMYNTFNMGIGFVLCVNEKDGENIIKDLIEMGEKGYKIGYVKKGDKSVELI >CP014174|3152595:3162079|3156109_3157558_-|AUN22818.1|DBSCAN-SWA MSMCYMLDDLNENMPFDLEGDKFKEECGVFGVFSKDNESKSAEITYYGLYALQHRGQESAGIVVSDGEKFKYHKGMGLVSDVFSKETIEGLIGNSAIGHVRYSTTGASKSDNAQPIVGTYKLGSIAIAHNGNLVNAAVIRELLEDGGCIFQTSIDTEVLLNLIARSAKKGIDKAVVDAIQAIKGSYAIVILTEDKLIGARDPHGIRPMCLGKIGDDYLLSSESCAFDCVGGEFIRDIEPGEIVIIDESGINSIKFTEKTRCHTCAFEYIYFARPDSTMDGINVYESRVRAGRKLYEEYPVEADIVIGVPDSGIPATVGYAEASGIPYGIGFIKNKYVGRTFIAPSQELREKAVSVKLNPLKINVEGKRVVIIDDSIVRGTTSKRLVQILRKAGAKEVHFRVSSPVVKYPCYFGIDTPYRKDLIGAHSEVEEIREKIGADSLAYISMEDLVETLNKDKGFCLGCFNGVYPISAPIEMPKDSLE >CP014174|3152595:3162079|3158353_3158833_-|AUN22820.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDTDKMKGAAKALKEFSIEYKAYILSAHRVPEKLMETIEDLEKEGYECIIAGAGLAAHLPGVIASHTVLPVIGVPIEAAVGGMDSLLSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQILSLKYEKLKEKLIEYRKDMKEKFINDNKEGVEL |
8 | Synechococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3302646 : 3330739
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP014174|3302646:3330739|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP014174|3302646:3330739|3322861_3323146_-|AUN22973.1|DBSCAN-SWA MRTPLEILKFNLQEKQYPYFEDKELELLLEINNNDVEKSSYKGCILKAIADDGIEVASVKLQSNRAYWLTLAEHFKEEQKILKNQTSMERVDEH >CP014174|3302646:3330739|3307394_3308174_-|AUN22954.1|DBSCAN-SWA MVKYTENLIPKMTSNSINGITVSASSEYGNGYKAFHAFDRDSKEYWIAGNSISTGWLKIDFGTNNKRAISKYTIKHFNNQIYINSAPRNWTFEGGNDNINWNTLDARNNEINWKLNEQREYTFKNFNKYEYYRLNISRNNGDQYVSIDEIEMMESININKYLIKEKNQYYTINNIEIILSPSQTLDEDNFSNNGFNDIDIITKDLLLSKFKNLEEVKLLVYTDDSEKNKCEMTYNCYPFRPIDKLKKNSHFCNILFNEV >CP014174|3302646:3330739|3302646_3303771_-|AUN22948.1|DBSCAN-SWA MLRFLDAGESHGMALTAIIEGIPSNVDIDIDFINKELKRRQTGYGRGKRMSIEKDKVEIWSGIRENKTTGNPITLIIYNKDYQNWKELTNKEVEDKDKIFVPRPGHGDLVGHIKYNTGDIRNVIERTSARETAIRTAVGAICKYILKLLGIDIRSKIQSIGEIFDENVDIYNDHIYKEIEDSPLRCYNKEVENNMINEIDNCKKEGDTIGGSIYISIKGMPVGIGSYTQWDRKLDALLSYSIMSVQGIKVVEFGEGLDLSKRGSTFNDEIYYDEDNIKRKSNNAGGIEAGVSNGEDIIVKAYMKPIPSIKKTIRTINLKEKTNVENRYERSDVCGVVPASIVLENVCAFEILKEILNTYPCDDFNMLKKYMREM >CP014174|3302646:3330739|3318267_3318702_-|AUN22965.1|DBSCAN-SWA MDLNRIKDFKVDLLYEDRKNTGGVITNYKPPRPAYFRKGIRTVQGYTYFEKNIKSDCIIEFTVAFNIKGENDEETQSNIAKFLDFRKSYSGRFIFVDEFGIQYKGYLQNKFEIDTPIEGDIYYINLELLCNHEASGWVKDNGKV >CP014174|3302646:3330739|3328021_3328171_+|AUN22981.1|DBSCAN-SWA MFNFSGVLSIKKEGEIIYEKKDTFTLNRKKTSCEKSSKDKIQLVQKVNT >CP014174|3302646:3330739|3317195_3318281_-|AUN22964.1|DBSCAN-SWA MAKCKVEFYKKNGYQAFEDGDANKIILEHCLVSVKINRTLTTPTAEATITAQYENLPTAIFAGGTQGVIDNFAQVKIYIEDVLQFTGVIKKYDYNTLDKTIEMTCHDMYYRMLNLCDKELKFYNKTAADIISTVVSDAKCSFQRGGGNNYTVPKLECEIGTMYNDIISNLVETMYARIRANKNGTIILEEQYPAYNESNHEANHHDYVLSVDTNLSSEAASRDSSLMRNILKICCNDKYSIFESKAMTSYLNGERWVDIIDNPLASTPLLKQKVAGYKFLDMWRESTALNVVPVAGIPNIDLGQVVKLVNNQRGNGWYLIVGISTEINADTYVDTLQLQGMRDKTKVYDQCIQIGSGRLKQ >CP014174|3302646:3330739|3304828_3305023_-|AUN22950.1|DBSCAN-SWA MEFLKKFLQIKKIIALLTTIVFCYLSIKGNLSSTEFLSVFTLIIGFYFGQSSARQAVKESKEQE >CP014174|3302646:3330739|3324468_3324789_-|AUN22975.1|DBSCAN-SWA MSIVLVKEIENKVFEEIESFRKENAVLKILLKEYVKKSIDYEKLLKESINLLDKCQEELEFLRVAKNRWTDEVVKHYFTIKDLQKALDIVGKEIMIYELNKNNKEM >CP014174|3302646:3330739|3321719_3322139_-|AUN22970.1|DBSCAN-SWA MSKFNYKVPGDSIQQDLINNAIPETLWQKVYLYLKRLGYNVYAPGQKKNKCTESYVVIRENGVHALVGNISGYKLFDIIVYSPMDQYSTMEFYVENIKEALKKIEDLRPTGNETPSVIDYDVQAYTTSIEYQQFKSLRR >CP014174|3302646:3330739|3310054_3311053_-|AUN22957.1|DBSCAN-SWA MKLIQVKNGLLEAENFFLASSFSDFAGESNVTRDIKAGKLKLISNNKMERKFDYKEFVLEVEKENFSDIKDMDYSMLYLGNGDYIFGIKDLKSNEQNRYWKMLKKDNYIQAYSSNDGKNYTNMGGMEFIDPLTKQGFMKYSDEDFILNNYKVYANPYVTIQNFPENTLCQLYDLDNKLIKTRLFNSDMECKVFIDSKISGYFTFKDRDGKVIYTSDVLQLQYGDMWVFSPYNFEIIYHGNVVTNVSPAMLQDLEELITIKNIGDKDYNNIKIGTETPSNDLIQLSFDGINYADSLTIDSIRQSESKGIYVKITKNAENHNFVVRDFHLVISE >CP014174|3302646:3330739|3329251_3330739_+|AUN22982.1|DBSCAN-SWA MLFNSMHFLLFFPIVTFIYFFIPHKFRYIWLLITSYYFYMSWNPKYALLIGISTIITYLSGILIEKSNKITDKQKSKFFKKLWVFLSLFINLSILFLFKYCNFFTYTLTKIFSLINITIKVPSFDFILPVGISFYTFQALSYTIDVYRGNIKFEKNLGKYALFVSFFPQLVAGPIEKSKDLLNQFNEKHIFDYNRVKNGLVLMLWGFFQKVFISDRLAILVDTVFNNPSNYKGLEIIVASVFFAIEIYRDFSSYSNIARGAAEVMGFDLSLNFKQPYFSKSIQEFWRRWHITLGAWFKDYLYIPLGGNKCSKWRRYFNNMVVFLISGLWHGAAINFIIWGGLHGFYIIIGDMLKPLKEKIINNLKIKTNVFSFKLFQTLFTFILVDFSWIFFRANSFSEAKLLIKNMFYFNPWIFTSGSIYKLGLDQKDFKMSILGILIVFIIDNIARNKDVRVELSNQNIVFRWAIYLSAICFILILGIYGAGYDANQFIYFQF >CP014174|3302646:3330739|3326908_3327118_-|AUN22979.1|DBSCAN-SWA MTTAKKLKAYRCLRGAKQEDIARLIGVSLNTYNFKENGKKSFTLNEAKIISDFFDTTIDELFLKRNGQL >CP014174|3302646:3330739|3308175_3308877_-|AUN22955.1|DBSCAN-SWA MKINTLNAIPVLSNNNNVIHNGYFESFEPYKAFDNIDKTYWVILFNGKSYLGYKFHEPIIISKYRIYSESNSENFFRDWTFEGSNDNLDWVILDKQSGKCQKDFSTIINNTNSYLYYRINISKNNGGSYIGINTFQMYESLKENKFLLKQNNKYYTIKPEFYKNSNCQPIKELEEKKILTKTDFETYGIDDLNSLTKTIDTQDINGIDKGDLGNGKLFEIPFNNDFLSISEVK >CP014174|3302646:3330739|3325635_3326550_-|AUN22977.1|DBSCAN-SWA MYTMDKKESGDMLAEVKWIKITTNMFDDEKIKLIDAMPERDTVHYIWMRLLVQAGKTNSNGYIFLNDNVPYTEEMLSTIFNRPLNSLRFALKVLRDFGMIQIQEDKLIKIANWSKHQNIEGMEKVRQQTRERVAKHRAKKKELLEETKRQSCKNNDNKKNIMLHETLSNGRDIDIEDIDIEIKEDRKSDIRKNLDKINEAYFNTFYRQISATYLNQVLKVMAKEDYTDLLIYALDITKKREQEQGKIKGFKYTMSILESWINKGYKLPQDVKRNEISKKWREGEVYETSRTSFGEDLKKQGIGL >CP014174|3302646:3330739|3318714_3320118_-|AUN22966.1|DBSCAN-SWA MAVNVGEAVAHLTLDTSEFKKALNGAGKDLEIFVHKVEEEKTKIEKLQEALTKKAETFSKIGKSMEKPSAAAQNLLKTGMKNNLAEEAKSKNPKKGPANIAKGNYEKIQKDIQSSIKKVQDSFAQLQTSIVKQLIPIFNNQLVPILNNKLIPIFTKLANKAVELMNSFNKLPNPVKNAIAVMVVSIAGVAKTFTVLSKLVGTINNVIGIFNKLKKAGGIFGVLKTIITSKTLLILVAIAAIGLIVYEVIKHWDQLKKAADDLGKKISNVCKKISGHFDKNIKKWKMKWKAFRTYMHKIGQDIMRGLVSGLKEGIKKVRETIESIANEIKNRFKKMLGINSPSRVFADYGNFIGEGLIQGIDNQENAISNKFKGIANKIKGLGNVRPNFNGLNNMSLSGAYGGTYASPYGLNNMNKSMGLTQDIKMYVTIPNADKEGATKIANEFKQMTESSMKNVMTGLFMNDVLRD >CP014174|3302646:3330739|3313234_3314473_-|AUN22960.1|DBSCAN-SWA MATDNFYFVEGNTSVKNLVKTLATEITQNSGIYKWDLVYPDSINKIGSTGEGSTINLIKDNSKTDKVDTVFTVGSQNDKCIIKATTTYGKEFYVKIDREEADLTKEEKKALIDFNKLHTYYNGNGDSFSRTDAQVLEVMAGASDRWSKSGDYNAYVSAMTKSNSINNIKLQISDKLNADKTDLGISKNIQAEYNYRLAWYRKLQPEIKDFLPVQYWINITKDSINLVLCGDPSADVHPYENYLTSYAYIGALKPVEDSAYTDDKYNFGITVSSDIEPNYSKVYGERTATGVTDVCMIANKIGMPYQPHYPAFYATNPFMDKCNVEGSRYNHKKHQFSDITLVHPVDMERGKMINVLVGDASAINDTDRLAYKKDTEEEEYYKKFKITAPYCFLNNSANINYCVAIRCYKTTK >CP014174|3302646:3330739|3305448_3306258_-|AUN22952.1|DBSCAN-SWA MKKWSNDLTDSLKQENFTSSRFHTGRYHYIPYLAFDNHTASTVYDGFQLHYPNNMDWLKIDFINPVNPSKITIQGNDDQPYLPKKIRVLMSDNDIDYIEINIIDNIKNDNKVTEYVYKNSTKKYRFLKIEFLEFYSTEWLSINQMQFFEAINVNKYLINQNENYYSTNSNFLNLEQPIDNTQLENWYNKYGADDINIIIQNSNNKEFPMSKDENGIWKTDFELDINEVIDSIELIDTDGNNKSIKYNCNDYKILDLCDDQFKLTMCKTK >CP014174|3302646:3330739|3315477_3316827_-|AUN22962.1|DBSCAN-SWA MGLPSYVVNFDELSDLIKDYLQNGVKVDIGNINFSTKDIENLLSEIKDKIQGVDYNDLINALNALGVKLDNLSGNLGISGTQKIYGKMLEIPAVKGQHIIEFKGNGQITGITYSQSSWRFEDNWDLQVGNDKLFESVCTKEYGEHKFLNVFYPINDTVKFIYNNISRTSKVLWVDFNILENSNLPSPTTPTIPTTSEKNYRFLAIGESEYTLQGANNLMGCTYDADNMSNLFKEHKESAKFTKNIVAKNKTKSEALNLIKNTFQDAQDNDISYLFWSGHGTVYEDKFALVAKDNIITVYELQTILDDIKGTKVIFIDTCHSGLAIDKNFAYTLAVVEEKLRSIDKTLNKQGYKVLTASAGSETSGDLSAGYNGNPNPSGAFTWALTQSIKTKKSDKDKNRIVTLEELYQSVLHFYDEFNIKNPYLKITQTAQVYPRNDTSSIFEYKEGA >CP014174|3302646:3330739|3323833_3324355_-|AUN22974.1|DBSCAN-SWA MLDKKLYIKTEERLYRYFRSKKELSKLKNRVKHLSNRIEIIMDKIKNNNVTLEEESRSRTYDEIVQTSSNGTSYAERELIRQIERLEIELGEKIKKKGKVEYKIREIEEEISVMEDNLSSLNEENKKFIELKYGENKSVDWIAVEMFGRARSTAYRKKNELVEHVAQLNNLIV >CP014174|3302646:3330739|3306309_3307308_-|AUN22953.1|DBSCAN-SWA MKKGIMKMPNNYSLNLNGTGYISVDNFPSFGDEYTLKIYICKKYNEFQRWTGVLMRGDSDTSQGIYIQDDNTLCFTNSKSGRVVLDNMKNYNINEWNCITITHNNKTLKYYKNGKLIKILQNLRSINSKEQLFIGYWDKFCKFNGNIAEVAIWNTCLNDKQVLNNYNKKLTGEESNLVAYWRINEGKGDIIYDLSNNRFNGNVINSEWEVTAPAITCNKYLLRQSNNYYSVNNNYIDLGEIDNNEELDNLIDEYGYNDLSILTKELNTKKVPTKLENDYYKSFDINLNDIKDSISLIEENDKKYIEYGCGDYKISDEIKKFNNGKFEVLMKE >CP014174|3302646:3330739|3320193_3320361_-|AUN22967.1|DBSCAN-SWA MTNDYEAFCFDEACVYILNEISKEDAREPKFIDGDRINKANNEDVIQWLNANNRK >CP014174|3302646:3330739|3316841_3317183_-|AUN22963.1|DBSCAN-SWA MAYMGYKNFREPVVYILDQELRKRNFKNQINTNEDSKYIGELPEYPCRIIRDSNNKAYKFIYANGTDMQWQEELIRNAEGKVYRIKTTYPNNTNKTIQLIKDNHGKLETIDYV >CP014174|3302646:3330739|3303911_3304682_-|AUN22949.1|DBSCAN-SWA MLFNLNPGHTLSGGDVGTRGINGLKEEVLTRQLIEEIDKELRERKHRTNICRVDYAPTLQESLNKQVALCNSVDADLNICIHFNTTVGGYGSEVYTYNGKYLIGADRVLKELNKLGFRNRGIKDQPLALTKRTKAKTIYIEVCFIDSAGDVAILNKYGINGIAKAIVNGVLGTSSNVSSKPVEENTSTGWINLDGKTGTICTSSGVNVRENKSTTSGILGTLPNGAKVQLYRKEGEWMHVYYPPHGGYIYSKYIRY >CP014174|3302646:3330739|3305041_3305296_-|AUN22951.1|DBSCAN-SWA MELKVCEEKHKRLEEKINVHDIRLNDHGKRIDKIEQNQSKIDTKIENLCDQLKQLVSVLKWYIGLSVGALVSFFFYAIQHNIFK >CP014174|3302646:3330739|3320827_3321715_-|AUN22969.1|DBSCAN-SWA MTSGKTLVNVVKVNFIDEVTNTKHTIETSNEIDIEPINSKGKRDILRIKNKIYGINETDDIVIGYKLKMKDNLFNIETMALIDGGTIQDNKYCGTEVGIAVERHPFTMEIFTEEKDYSRTTGYVKFVYKHCKGKPAKYKIQDGKFLVSSYEAESIPFRNEKPVEIEFLNKLQENNNGEKPGESTPIEDIGVEGGEVENKNPDVGVSITNRVVWSFSNKINQDDVNLENFIIKRKSDNSRVNGNVTIDDTKKIVTFVPDSLAIDTVYIAEAKEINKLDGSGKTTALSTEFKTIKIR >CP014174|3302646:3330739|3322496_3322862_-|AUN22972.1|DBSCAN-SWA MNNINRAKISKNIYEHLEKKDLLREIKILRIGKNAFEEKLDEMYVCTIRGYYYRNNSNIITTSMEGLEFNNLYNDKLLIIYNDISSKIQKDDYFILDGTKYEIVDTGNIQNLVFDMILNRV >CP014174|3302646:3330739|3308957_3310043_-|AUN22956.1|DBSCAN-SWA MSEFFNVTLDKDIILDDSVISNKTGWSSEKIQKEIIDKRITKFEELEDVDVTNKKNKQLVAYSEETGKFTTIDGIDAGEIVGAGMKQISKMGIVGSAETPRIVNIPVNTVDFKVPRVNVLRYDTENTQDLISVKNEFTNDESNDFIDDRMMTFDGKAHLETNHISDFEVVQDTESFTEYSVNVDKTLFKKIEGFETFEDGVIQKLKTKAIPFDRLLIPKGDMNLSNVDHIDYFRLTANGNNIRIVCSVDSGNTWKTFSGEKWVNVNLTVDDVRKSGMNIATFNAINDVFWNELITTKKIRFAYLFSMDSITDIEEIDKLDLQYDGVGRWKQVKEDLYEVTYASNTLLQVECKFSGDIKINY >CP014174|3302646:3330739|3322144_3322492_-|AUN22971.1|DBSCAN-SWA MREFEVNIDSVIDGLSEFEMQSKTAISGYADIAAKKLEEDAKKNAPWKDQSGKDIETIKGGKQWKGDKCNIYIAGNKDYYPSLELCNDKKYAILKPTIDKLSPQILKGMSNLFGK >CP014174|3302646:3330739|3311324_3313220_-|AUN22959.1|DBSCAN-SWA MPLHKIPLCSFEYVGDNAFSSGIFIYDTTEKVVKTTEKLFYKETMGEIDKIKGDKLFYKEPKDNIEKEKNKYISKKITDIKKEFEKELELRNKEVNKNNTISLDKIKYISINRITSKELDVRKNTDISICYNNKLLVREILQLNKANNLINLSIDRENLQLNKFKSIYTDLIVEKEIFKGESLQNLKLEKYINIEKNIRYYLYRIYCKEIDIDKLKFVEKHGFKSINKNKYRFIDRSNLKEVAKISNKTMLNKDIIIGIDIDTSINNLKILNSKDIDKNYKVILMYNIALKDIEKYRIKNTLNKIAYKEICKDHNKKYFYKDVFKFIDKSINGYLDRQAIRSIFKYNNRYLDREYITNIFKHNEKYLDNSPIINIYKQIERDLLNLSIWQIYRQSNKYLNNEAIRQIYTPNKNKFIKITKRWWWLKPTNPTDRLIVPNKDYIYNNDLLNNLDYEYLRFSNHPIEWGKDWGVDYNIPPMEVSTEIMLDLINILAMIWHKNAQAWLSCTGKESIQFIMELIYDWYTVDTSSPSADYIRAYRWIRWEAEKVYFLNTENGLQAIGLLIANLIDYLKQHHFNLVPIWHNPKAMDIERKFNKVATNGDIMKDLDKLKDKRNYMIEAQNFEKKNIFGR >CP014174|3302646:3330739|3314495_3315476_-|AUN22961.1|DBSCAN-SWA MSLPKYIINFEELTEDLKNHLLSLIDDNIRTNYPEINTNNIQDLLQQLKNLLPSVQYEGLKKKIDAFIYRKIEGIQKVKGILLDIPAIQNDYTEQFKFDKDVYITGLHFNQTGWKKEDKYSLEINKIKIIDNVTTKEIGEHKYFNTFYKVNANTLISFIFHNLSGNSRQTMVDLEYIDGEDSNIPVEPPPGIEDIDNEWDIAVVMNWEENTDADIDLHGEIDGKKVWYGNKSHDGFYLNFDYTSHKTNKNPEIISVKGYKNKKLLISIRNFNGVELKEPVTLEIYQYRTYGNKLLKKFNVNLDTNRDLKDIFIMDLNTLKITNLNK >CP014174|3302646:3330739|3324845_3325694_-|AUN22976.1|DBSCAN-SWA MKQVGQALEKTLKSRELDYNITGENERVEICSVCGEAIEKITYILGLNRYIKGPVMCKCKREALMAKEKEKINKEKQLRLKKIIKNSLIDEKFRNSKFKNWDFTKGNDKMYKIANKYTKKFENMKKESVGLLLYGSPGNGKTYTVACIANFLIEKMLPVICVNADSLLNRIKDTYKKSGKEVEEDILRGLDNADLLIIDDLGTEQDTEWTRTKIYNILDSRYRNGLPLIITTNLSLIELKNRYEKRTYYRILEMCTPILNDGKNIREEKAKEKTEILKELLK >CP014174|3302646:3330739|3327309_3327720_+|AUN22980.1|DBSCAN-SWA MAEIKDRLKCERLRKDLNQTELAKFLNVSKQTVSNWENGNRIPDTLTLSKLADFFNCSVDYILGRSENRNGIISKANIDGSNYEFELDKSIFPNGITREQMINYIKELEDRNKELEKEAEISRKLKEAGFDFNPDK >CP014174|3302646:3330739|3311064_3311319_-|AUN22958.1|DBSCAN-SWA MLTSTIDFKKTRQKMWGILKNKTLAQLPYGHETDKNGSEITSYATNCYEDALEEAHTLLANGIGTKDIQIVEFVPYDYIMQPRV >CP014174|3302646:3330739|3326634_3326868_-|AUN22978.1|DBSCAN-SWA MLRRNPQVAVIKTKEYRRIRNLSISKLSYKSKIARSYITELEEGKYENPGLKVICNLCKILKITPNELIDQELWRWW >CP014174|3302646:3330739|3320395_3320812_-|AUN22968.1|DBSCAN-SWA MDLKVTNIEDLKKAAQDEVIQLPQFSQGIPFNARVKRVSLLNLVRKGVVPNKLLSAAEELFYGKQSSKENVDLAQMTDVMYIMAENALVEPSIEDLKSVGLELTDEQIVALFNYTQEGVSELDSFREESENTECNINK |
35 | Clostridium_phage(80.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3528414 : 3583055
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP014174|3528414:3583055|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP014174|3528414:3583055|3552079_3553129_-|AUN23183.1|DBSCAN-SWA MEYIKEVNINEAVVHILDNNSEEPVLNEYKLRLDDECYKYILKLIDKCLKDECLRYAKFNEEKNVVKEISQEYLNGQNDLLDVSKELARQLFILMKGNDSISSCDLMIVSISTEYGPMLAILKMDYVKNYIHVVDMVENKVGIDIVPEFTGLPASAQKIQKCAFIKPIRENQEFNLMVIDKQKKIKTSEEYGSNYFINKYLGCNIIENERDSTKAFVQATEKWSKINLNEDAATSEKIIRTVGKLLKEKDTIDIEEVSNDIFGENSDAKLNYEGFIAEQGIKEKIDVDKEWVDKKFKRIRLKIDRDIDLYIDKESYHDDSRFEVKRVGDGSVNIIIKNVYNYMQKISRK >CP014174|3528414:3583055|3546822_3547131_-|AUN23173.1|DBSCAN-SWA MRKELLKAIEQGYVKTFYKSGEWINKRKDIIKRDKNECQRCKDNGGYHRAECVHHIKHLRDRPDLALTDSNLISLCYTCHNEVHPEKLHKNYKPKFRNKERW >CP014174|3528414:3583055|3548132_3548324_-|AUN23176.1|DBSCAN-SWA MEDIKLLKIDYEYLILMPMEEKVLQGYNIEFDYKSLRQCKIYIKTNKELNVKEIKERIWGEIR >CP014174|3528414:3583055|3554947_3555607_-|AUN23721.1|DBSCAN-SWA 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63 | Clostridium_phage(45.16%) | integrase,portal,capsid,tRNA,head,terminase,tail,protease | attL 3557743:3557762|attR 3560445:3560464 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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