Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019800 | Streptococcus agalactiae strain SA30, complete genome | 1 crisprs | cas3,cas5,cas7,cas4,cas2,DinG,cas9,cas1,csn2,csm6,DEDDh | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019800_1 | 817247-817341 | TypeII |
II-A
Consensus repeat of CP019800_1
|
1 spacers
spacers of CP019800_1
>1.1|817276|37|CP019800|CRISPRCasFinder CCAAAACTTATTCTATTGTTAAATCGTGTGTTGATGA |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019800_1
The CRISPR arrays of CP019800_1 >merge|CP019800|1|817247-817341|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACTTATTCTATTGTTAAATCGTGTGTTGATGAGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCAAATGGTT >CP019800|1|1|817247-817341|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTT CCAAAACTTATTCTATTGTTAAATCGTGTGTTGATGA GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCAAATGGTT
>CP019800.1|AUO80366.1|816480_817146_+|CRISPR-associated-protein-Csn2 MIKINFPILDEPLVLSNATILTVEDVSVYSSLVKHFYQYDVDEHLKLFDDKQKSLKATELMLVTDILGYDVNSAPILKLIHADLESQFNEKPEVKSMVERLAATITELIAFECLENELDLEYDEITILELIKALGVKIETQSDTIFEKCFEIIQVYHYLTKKNFLVFVNSGAYLTKDEVIKLCEYINLTQKSVLFLEPRRLYDLPQYVIDKDYFLIGENMV >CP019800.1|AUO80365.1|816152_816494_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MSYRYMRMILMFDMPTETAEERKAYRKFRKFLLSEGFIMHQFSVYSKLLLNNTANNAMIGRLKVNNPKKGNITLLTVTEKQFARMVYLHGERNTSVANSDSRLVFLGDSYDQD >CP019800.1|AUO80364.1|815286_816156_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAGWRTVVVNTHSKLSYKNNHLIFKDSYQTEMIHLSEIDILIMETTDIVLSTMLIKRLGDENILVIFCDDKRLPTAMLMPYYARHDSSLQLSRQMSWIEDVKADVWTSIIAQKILNQSFYLGECSFFEKSQSIMNLYHDLESFDPSNREGHAARIYFNTLFGNDFSREQDNPINAGLDYGYSLILSMFAREVVKCGCMTQFGLKHANQFNQFNLASDIMEPFRPIVDRIIYENRQSDFVKMKRELFTMFSETYNYNGKEMYLSNIVSDYTKKVIKSLNSDGNGIPEFRI >CP019800.1|AUO80363.1|811172_815285_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas9 MNKPYSIGLDIGTNSVGWSIITDDYKVPAKKMRVLGNTDKEYIKKNLIGALLFDGGNTAADRRLKRTARRRYTRRRNRILYLQEIFAEEMSKVDDSFFHRLEDSFLVEEDKRGSKYPIFATMQEEKDYHEKFPTIYHLRKELADKKEKADLRLVYLALAHIIKFRGHFLIEDDRFDVRNTDIQKQYQAFLEIFDTSFENNHLLSQNVDVEAILTDKISKSAKKDRILAQYPNQKSTGIFAEFLKLIVGNQADFKKHFNLEDKTPLQFAKDSYDEDLENLLGQIGDEFADLFSAAKKLYDSVLLSGILTVTDLSTKAPLSASMIQRYDEHREDLKQLKQFVKASLPEKYQEIFADSSKDGYAGYIEGKTNQEAFYKYLSKLLTKQEDSEYFLEKIKNEDFLRKQRTFDNGSIPHQVHLTELKAIIRRQSEYYPFLKENQDKIEKILTFRIPYYVGPLARGNSDFAWMTRKTDDSIRPWNFEDLVDKEKSAEAFIHRMTNNDLYLPEEKVLPKHSLIYEKFTVYNELTKVRYKNEQGETYFFDSNVKQEIFDGVFKEHRKVSKKQLLDFLAKEFEEFRIVDVTGLDKENKAFNASLGTYHDLKKILDKDFLDNPDNESILEDIVQTITLFEDREMIKKRLENYKDLFTESQLKKLYRRHYTGWGRLSAKLINGIRDRESQKTILDYLISDGRANRNFMQLINDDGLSFKSIISKAQSGSHSDNLKEVVGELAGSPAIKKGILQSLKIVDELVKVMGYEPEQIVVEMARENQTTNQGRRNSRQRYKLLEDGVKNLASDLNGDILKEYPTDNQALQNERLFLYYLQNGRDMYTGEALDIDNLSQYDIDHIVPQAFIKDDSIDNRVLVSSAKNRGKSDDVPSIDIVKARKAFWKKLLDAKLISQRKYDNLTKAERGGLTPDDKAGFIQRQLVETRQITKHVARILDERFNNKVDDNNKPIRKVKIVTLKSNLVSNFRKEFGFYKIREVNNYHHAHDAYLNAVVAKAILTKYPQLEPEFVYGDYPKYNSYKTRKSATEKLFFYSNIMNFFKTKVTLADETVVVKDDIEVNNETGEIAWDKKKHFATVRKVLSYPQVNIVKKTEVQTGGFSKESILAHSNSDKLIPRKTKDIYLDPKKYGGFDSPIVAYSVLVLADIKKGKAQKLKTVKELIGITIMERERFEKNPSAFLESKGYLNIRTDKLIILPKYSLFELENGRRRLLASAGELQKGNELALPTQYMKFLYLASRYNESKGKPEEIEKKQEFVNQHVSYFDDILQLINDFSKRVILADANLEKINKLYSDNKDNTPVDELAKNIINLFTFTSLGAPAAFKFFDKSVDRKRYTSTKEVLDSTLIHQSITGLYETRIDLGKLGED >CP019800.1|AUO80362.1|810143_810710_+|Membrane-protein MKDKLLVVLTWIWIISLATLATIYIAWLIYPIEIQFLKLEKVVYLKAETIYYNFNKLMIYLTHPFISDLNMPSFPSSEDGLKHFADVKYLFTLAHGLFVILTFPVIYFLRRGWKQKSIFLYEGFFKIAIMLPIFIVVCAFLLGFDQFFTLFHEVLFPGDSTWQFNPLTDPVIWILPETFFLHCFIIFC >CP019800.1|AUO80361.1|809383_810154_+|HAD-family-hydrolase MAYKGYLIDLDGTIYKGKSRIPAGERFIEHLQEKGIPYMLVTNNTTRTPESVQEMLRGFNVETPLETIYTATLATVDYMNDMNRGKTAYVIGEEGLKKAIADAGYVEDTKNPAYVVVGLDWNVTYDKLATATLAIQNGALFIGTNPDLNIPTERGLLPGAGSLNALLEAATRIKPVFIGKPNAIIMNKALEILNIPRNQAVMVGDNYLTDIMAGINNDIDTLLVTTGFTTVEEVPDLPIQPSYVLASLDEWTFNEG >CP019800.1|AUO80360.1|808645_809383_+|Acyl-ACP-thioesterase MGLLYRETYEVPFYESDTNHYMKLPQLLALALQISAKQSLKLGIGDDIVFKRYGLVWVVTDYIIDIERLPKHAEKIVIETEAKAHNKLLCYRYFYIYGEDGQKIITISSAFVLMDFKTRKIHPVLDDITSIYQSQRIKKVIRGPKYHPIGDSKVKQYHVRYFDLDMNGHVNNSKYLEWMYDVLDLDFLSSHIPKKIDLKYIKEIQYGTDIKSHWYQDGLVTRHDIIGGDAIHAQARIEWQEKKED >CP019800.1|AUO80359.1|807511_808642_+|Coproporphyrinogen-III-oxidase MLKKPTSAYVHIPFCTQICYYCDFSKVFIKNQPVDAYLQALIREFRSYDITDLRTLYIGGGTPTSISAVQLDYLLTELSRDLNLNTLEEFTIEANPGDLTVDKIEVLQKSAVNRVSLGVQTFNDKHLKRIGRSHNEAQIYSTIDALKTAGFQNISIDLIYALPGQTMDNVRSNVAKALSLNIPHLSLYSLILEHHTVFMNKMRRGKLHLPTEDLEAEMFEYIISEMERNGFEHYEISNFTKPGFESRHNLMYWDNVEYYGVGAGASGYLDGIRYRNRGPIQHYLKGVSEGNARLSEEVLSKNEMMEEELFLGLRKKEGVSIGKFEQKFGTSFEKRYGQIVQELQSDGLLKENNGFIQMTKKGLFLGDTVAEKFIVE >CP019800.1|AUO80358.1|807038_807419_+|Pyrimidine-dimer-DNA-glycosylase MRLWHQDIIELLPRQQLLGQHRECCALRGNGWGRKHETIDYVFRYSPYRLFAYHQLVMEEMMERGYRVSKEWLVAEYRGMKCPRYDTLNPVDLETPIYPEHNQDYLQECLWNLKAKGIDLPINKIK >CP019800.1|AUO80357.1|806642_807014_+|hypothetical-protein MTKEAELLWAKHKYLVLSKSQKIYLDIRQTLKSPNCTVLDVQSLIDQAVLLEESPSQVTNAYMHIWGYFKNKAERQEKEEFLILLEKYRKTGYQRRKLLAFLKQLFAKYPNSYLQNSSIFEEE >CP019800.1|AUO80367.1|817669_817831_+|hypothetical-protein MKDYNSNLMVKGLGCSTLYLIISLTALVLLVIAGVSLSLILASLQGKQRRTYP >CP019800.1|AUO80368.1|817971_818388_+|Nucleoside-diphosphate-kinase MEQTFFMIKPDGVKRGFIGEVISRIERRGFSIDRLEVRHADADILKRHYAELTDRPFFPTLVDYMTSGPVIIGVISGEEVISTWRTMMGSTNPKDALPGTIRGDFAQAPSPNQATCNIVHGSDSPESATREIAIWFNN >CP019800.1|AUO80369.1|818523_820356_+|Elongation-factor-4 MNIEDLKKRQEKIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILEKTETVSSREMQAQLLDSMDLERERGITIKLNAIELNYTAKDGETYIFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNDLEILPVINKIDLPAADPERVRAEVEDVIGLDASEAVLASAKAGIGIEEILEQIVEKVPAPTGEVDAPLQALIFDSVYDAYRGVILQVRIVNGMVKPGDKIQMMSNGKTFDVTEVGIFTPKAVGRDFLATGDVGYIAASIKTVADTRVGDTITLANNPAIEPLHGYKQMNPMVFAGLYPIESNKYNDLREALEKLQLNDASLQFEPETSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNIDLIMTAPSVVYHVNTTDSEMLEVSNPSEFPDPTRVDSIEEPYVKAQIMVPQEFVGAVMELAQRKRGDFVTMDYIDDNRVNVIYQIPLAEIVFDFFDKLKSSTRGYASFDYEISEYRRSQLVKMDILLNGDKVDALSFIVHKEFAYERGKLIVDKLKKIIPRQQFEVPIQAAIGQKIVARSDIKALRKNVLAKCYGGDVSRKRKLLEKQKAGKKRMKAIGSVEVPQEAFLSVLSMDDDDKK >CP019800.1|AUO80370.1|823137_823797_+|Phosphohydrolase MTMVKREDVILNATENMVYHKLKNDPSGHDWFHIVRVRNLAVELAHKEGANTFICQMAALLHDIIDDKICQDSEQASYELTQWLYSQDLAIAEVEHILDILQNISFKAGTGLTMKTLEGQIVQDADRLDAMGAIGIARTMAYSGSKGRLIHDPNLKPRENLTLEEYRNGQDTAIMHFYEKLLKLKDLMNTKQGKMLAQKRHDFLELYLAEFYAEWNGKR >CP019800.1|AUO80371.1|825090_827646_+|Haloacid-dehalogenase MAIVSNSLELGLAIWMVNVINGIFSFIQEYRASQATQALKKMLPSYSRVLRKSSEEKILSEQLVPGDIVLIEEGDRISADGRLIKTTDLQVNQSALTGESNPIYKDSNVENDQSKTLIECDNMVFAGTTVSSGSATMVVTAIGMQTQFGQIADLTQGMKSEKSPLQRELDRLTKQISIISITVGIIFFLAATFFVKEPVSKSFIFALGMIVAFIPEGLLPTVTLSLAMAVQRMAKEHALVKKLSSVETLGATSVICSDKTGTLTQNEMTVNHLWQNGKSYQVTGLGYAPEGQVLFEGDNICFGNSDRGDLEKLIRFAHLCSNAQVLPPNDDRSTYTVLGDPTEACLNVLLEKSGINRQENRKFAPRLKELPFDSVRKRMTTIHSLGGDEKDKKISITKGAPKEILDLSDYVLSDGKVIPLNKEERNKIQLANDTFAKDGLRVLAVSYCDIEGFSKEQWTQENLEQHMVFIGLIAMSDPPREGVREAIDKCHAASIRIIMVTGDYGLTALSIAKNIGIIRNDDAKVISGLELSEMTDSQLKKELSGEVVFARVAPEQKYRVVTILQEMGEVVAVTGDGVNDAPALKKSDIGVAMGVTGTDVAKESADMILTDDHFASIVDAVEEGRAVYQNIKKFLTYIFNSNTPEAVPSAFFLFSKGFIPLPLTVMQILAVDLGTDMLPALGLGVESPETDVMNRPPRRLTDRLLDKGLLIKSFLWYGTIESVLAMGGFFWAHYLRYGNFTFFVANGIPYREATTMTLGAIIFSQIGMVMNSRTSYQSIKTLSIFGNKLINFGIIMEILAFLVLVYVPLFHNLFNTASLGLSHWLYLISCPFIMIGLDEVRKLFSSRKNKR >CP019800.1|AUO80372.1|827645_828689_+|hypothetical-protein MSNIITYLKNNSNLTFDELALNDVDILCLNEFGYISFEKLINTTEMKSVLVCELYHEYLQTMAKSYSFMFTSQRHDLCQLMMTSKRFKNLTLSYYQAEISLEFEKQFAAMVFTIPNIDYHQVVFRGTDANLIGWKEDFKLTYMREISAHRSAIKYLNTILPHFDKVVLSGHSKGGNLALYAAMFTKPDLKAKIDLIWLIDSPGLQKTLLPTTEYKTTKQKCIRLLPEESIVGMMLYSDIEPLIISSNARGILQHDVTTWEIQEPAILKTGTGLSLKSICFEKTFQQWMAELKSQERKLFFDLLFDSFLSSGVSSLDDFNLASRAKMMKAFHSFRELDDDKKGYLTNL >CP019800.1|AUO80373.1|828721_829291_-|Chloramphenicol-acetyltransferase MSTGASYPKYGFSVGKYTYGYQQFFYEGVNLKEIGAFCSIAQNVTITGMNHPTDHITTNPFIYYKSRGFINEDRADLIDEKKNGKVIIGNDVWIGTNVTILPSVTIGNGAIIGAGSVITKDIPDYAVVAGTPAKIIKYRFSEEEITLLNASQWWNWSDEAIKEHISEFSDKKEFFNTLKSIEENKNHKL >CP019800.1|AUO80374.1|830070_830682_+|Membrane-protein MNMKLSKRYRFWQKVIKALGVLALIATLVLVVYLYKLGILNDSNELKDLVHKYEFWGPMIFIVVQIVQIVFPVIPGGVTTVAGFLIFGPTLGFIYNYIGIIIGSVILFWLVKFYGRKFVLLFMDQKTFDKYESKLETSGYEKFFIFCMASPISPADIMVMITGLSNMSIKRFVTIIMITKPISIIGYSYLWIYGGDILKNFLN >CP019800.1|AUO80375.1|831513_832212_-|ABC-transporter,-ATP-binding-protein MTQLLQLHHVTKKYHKHTAVNDVTVSIPTGKIIGLLGPNGSGKTTIIKMINGLLQPDKGDIVIDGYRPSVETKKIISYLPDTSYLQENMKIKDVVTLFEDFYNDFDSKVAYQLFEDLNLNPKERLKNLSKGNKEKVQLILVMSRKARLYILDEPIGGVDPAARDYILKTIISNYSNDASVLISTHLISDIEPILDEVIFLKEGEIDLQGNADDLREEHNCSIDALFRERFKK >CP019800.1|AUO80376.1|832212_832581_-|GntR-family-transcriptional-regulator MAWEFNEKSPIYSQIAEHIKMQIVSQEIKSGDQLPTVRELAQEAGVNPNTMQRSFTELEREGMVFSQRTSGRFVTEDNLLIGKIRQQVAKAELATFVNNMKKIGYKLDEITVALDHFIKEIN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
187450 : 199619
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019800|187450:199619|DBSCAN-SWA ATTGAATCCGTTCGGGAAACTCAGAAAAAGATGGGGCTTACTGAAATCTCAATTTCAGACATCCTCCTATTTTCCAGTCGCTCCCTTGTCGGACTTGGTATCTTATATGAATAAACGTATTTTTGTTGAGAAAAAGGCTGACTTTGGCATTAAATCGGCTAGTCTTGTGAAAGAGTTGACGCATAATCTACAACTGACTTCTTTGAAGGATTTGCGTATTGTGCAGGTCTATGATGTCTTCAATTTGGCTGAGGATTTGCTGGCGCGTGCTGAGAAGCATATTTTCTCTGAGCAGGTGACAGACTGTCTTTTGACGGAAACTGAAATCACTGCGGAGCTTGATAAGGTTGCCTTCTTTGCCATTGAGGCGCTTCCTGGTCAATTTGACCAACGTGCTGCTAGTTCGCAAGAAGCTTTGCTATTGCTTGGAAGTGACAGTCAGGTTAAGGTCAATACAGCCCAGCTTTACTTGGTCAATAAGGATATTGCAGAAGCAGAGCTTGAAGCTGTTAAGAACTATCTTTTGAATCCTGTTGATTCACGTTTCAAGGACATCACTTTGCCGCTTGAAGAGCAGGCTTTCTCTGTGTCTGATAAGACGATCCCTAATCTTGATTTCTTTGAAACTTATCAAGCTGACGATTTTGCGACTTATAAGGCAGAGCAGGGCTTGGCTATGGAGGTCGATGATTTTCTCTTCATCCAAGATTATTTCAAATCAATCGGGCGTGTGCCAACTGAGACTGAGTTGAAAGTTTTGGATACGTATTGGTCAGACCACTGTCGTCACACAACCTTTGAAACTGAGCTGAAAAACATTGATTTTTCAGCTTCTAAATTCCAGAAACAATTACAGACGACTTATGACAAATACATTGCCATGAGTGATGAGCTTGGTCGTTCTGAAAAGCCACAGACGCTTATGGATATGGCGACTATCTTTGGTCGTTATGAGCGTGCCAATGGTCGTCTGGACGATATGGAAGTCTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTTGAGATTGAAGTAGATGTTGATGGTGTAAAAGAGCCTTGGCTCCTCATGTTTAAGAATGAGACTCACAATCACCCAACAGAAATTGAGCCATTTGGTGGCGCAGCAACTTGTATCGGTGGTGCCATTCGTGACCCGTTGTCAGGACGTTCATACGTTTATCAGGCTATGCGTATTTCAGGCGCAGGCGATATTACGACTCCGATTGCGGAAACACGTGCTGGTAAATTGCCACAACAGGTTATTTCTAAGACTGCGGCGCACGGCTATTCTTCATATGGTAACCAAATTGGGCTTGCGACAACTTATGTGCGTGAGTACTTCCACCCTGGCTTCGTAGCCAAACGTATGGAGCTTGGAGCTGTGGTTGGTGCTGCACCTAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAGAAGCAGGCGATGTGGTCATCTTGCTCGGTGGTAAAACAGGTCGTGATGGTGTCGGTGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAAACGGTTGAATCTGTGGAAACAGCTGGCGCAGAGGTACAAAAAGGGAATGCCATTGAAGAGCGTAAGATTCAACGTCTTTTCCGTGATGGCAATGTCACTCGTCTTATCAAGAAATCAAATGACTTCGGTGCAGGTGGTGTCTGTGTTGCCATCGGTGAATTGGCTGATGGTCTTGAAATCGATTTGGACAAGGTGCCACTTAAATACCAAGGTCTTAATGGTACTGAAATTGCAATCTCAGAATCTCAAGAGCGTATGTCAATCGTTGTTCGTCCTAGTGATGTGGATACCTTCATCGAAGCCTGCAACAAGGAAAATATCGATGCAGTCGTTGTTGCGACCGTTACTGAAAAACCAAATCTTGTTATGACTTGGAATGGCGAAACCATCGTTGACTTGGAACGCCGTTTCCTTGATACCAACGGTGTCCGTGTCGTTGTTGATGCTAAAGTCGTTGACAAGGACTTGACAGTTCCAGAAGCACGCACAACATCAGCAGAGACACTTGAAGCAGATACGCTTAAGGTCTTGTCTGACCTCAACCATGCTAGCCAAAAAGGTCTCCAAACCATCTTTGACTCATCTGTTGGTCGTTCAACCGTTAACCACCCAATCGGTGGTCGCTACCAAATCACACCGACAGAAAGTTCAGTTCAAAAATTGCCAGTTCAACATGGTGTGACAAGAACAGCCTCTGTTATGGCTCAAGGTTACAATCCTTATATTGCTGAGTGGTCACCTTACCACGGTGCTGCCTATGCTGTCATTGAAGCGACAGCTCGCTTGATAGCAACGGGTGCCGACTGGTCTCGTGCACGCTTCTCTTACCAAGAGTACTTCGAGCGTATGGACAAACAGGCAGAGCGTTTTGGTCAGCCAGTATCAGCTCTTCTTGGTTCTGTTGAGGCTCAGATTCAACTTGGCTTGCCATCAATCGGCGGTAAGGACTCGATGTCTGGTACTTTCGAAGAATTGACAGTGCCACCAACCTTGGTAGCTTTCGGTGTGACAACAGCGGACAGCCGCAAGGTTCTCTCTCCTGAGTTTAAAGCGGCTGGTGAGAATATTTACTACATTCCAGGTCAAGCTATTTCAGAAGATATTGATTTTGACCTTATCAAGGCTAACTTTAACCAGTTTGAAGCTATTCAAGCTCAACATAAGATTACCGCTGCTTCAGCCGTTAAATACGGTGGTGTCCTAGAAAGTCTTGCTCTCATGACTTTTGGTAACCGTATCGGTGCTTCTGTTGAAATTGCAGAGCTTGACAGCAGCTTGACAGCTCAACTCGGAGGCTTTGTCTTTACATCAGTTGAGGAAATCGCTGACGCTGTGAAGATTGGTCAAACTCAGGCAGACTTTACAGTCACTGTCAATGGAAATGACCTCGCTGGTGCTAGCCTCCTAGGAGCCTTCGAAGGTAAATTGGAAGAAGTTTACCCAACAGAATTCGAACAGGCAGACGCTCTTGAAGAAGTTCCTGCTGTGGTATCAGATACCGTCATCAAGGCTAAGGAAGTCATTGAAAAACCAGTGGTTTACATTCCAGTCTTCCCTGGTACTAACTCAGAGTACGATTCAGCTAAGGCTTTTGAACAGGTTGGAGCTAGCGTCAACTTGGTACCATTTGTAACCTTGAATGAGGCTGCTATTGCTGACTCAGTTGACACAATGGTCGCTAATATTGCTAAGGCAAATATCATCTTCTTTGCTGGAGGATTCTCAGCAGCGGATGAACCAGATGGGTCTGCTAAGTTTATCGTCAATATCTTGCTTAACAAGAAGGTTCGCGCAGCTATTGACAGCTTCATCGAAAAAGGTGGCCTTATCATCGGTATCTGTAATGGTTTCCAAGCCCTTGTTAAATCAGGTCTTCTTCCATACGGAAACTTCGAGGAAGCTGGTGAGACAAGTCCAACTCTCTTCTATAACGATGCTAACCAGCACGTTGCAAAGATGGTTGAGACTCGTATCGCAAATACCAACTCACCTTGGTTGGCAGGAGTTGAGGTCGGCGATATTCATGCCATTCCAGTTTCACACGGTGAAGGTAAATTTGTTGTCAGCGCTTCTGAATTTGCAGAGCTAAGAGACAATGGTCAAATCTGGAGCCAATATGTGGACTTTGACGGACAACCATCTATGGATTCTAAATACAATCCAAACAGCTCTGTCAATGCCATCGAAGGGATTACCAGCAAGAATGGTCAAATCATCGGTAAGATGGGGCACTCAGAACGCTGGGAAGACGGCCTCTTCCAAAATATCCCTGGTAACAAAGACCAAGCCTTGTTTGCTAGTGCAGTAAAATATTTTACAGGAAAATAATTTTTTCAAATTTTTTCATAAAACAGATAAGGAAACAAGAGCGAAGCGAGCTTAACTGTATCTTTCTGTCGTAGTGGTATTTGGGAGCCGTTGAGGCTAAGACTCAATGATTAGCTTGAAAATAGCTTGATAGATTTTCTATTTTGATGTTGGCATTGATGACGATAGATCCAAAATTGAGAAAATCATCAAAGCTACTTAAGAAGAGATACAAAAAGAATTAGGAAAAAAGAATGACATACGAAGTAAAATCTCTAAATGAAGAATGTGGTGTATTTGGTATCTGGGGGCATTCTCAGGCAGCTCAAGTCACTTACTTTGGGCTTCACAGTCTTCAACACCGCGGTCAAGAAGGTGCTGGTATTGTTTCGAATGATAATGGGAAACTCTATGGTTATCGAAATGTTGGTCTCCTTTCTGAAGTTTTTAAGAATCAATCTGAATTAGATAATTTAACTGGGAATGCGGCTATTGGACATGTTCGGTATGCTACTGCAGGTTCTGCAGATATTCGCAATATTCAGCCTTTTCTTTATAAATTTCATGACGGGCAATTTGCTTTATGCCATAATGGTAATTTGACAAATGCTATTTCTTTAAGGAAAGAATTAGAAAAGCAAGGTGCAATTTTCAATGCCTCCTCAGATACTGAAATTTTGATGCACTTGATTCGTCGAAGCCATAACCCAAGTTTTATGGGGAAGGTAAAAGAAGCTTTAAGCACTGTAAAGGGAGGCTTCGCCTATCTACTGATGACAGAAGATAAATTAATTGCTGCTCTTGACCCTAATGCCTTTCGTCCTTTGTCAATTGGACAAATGCAAAATGGTGCCTGGGTTATTGCCAGTGAGACCTGTGCTTTTGAGGTGGTAGGCGCAAAATGGGTTAGAGATGTTGAACCTGGCGAAGTTATTCTTATAGACGATAGTGGTGTTCAATGTGATCGTTATACTGATGAAACGCAGTTGGCAATTTGTTCGATGGAATATGTCTATTTTGCAAGGCCGGATTCGACTATACATGGTGTTAATGTTCATACGGCTCGAAAAAATATGGGAAAGCGTCTTGCACAAGAATTTAAACAGGATGCTGATATTGTAATTGGTGTCCCAAATTCGTCCTTATCGGCTGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCCGGATTACCAAATGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019800|187450:199619|197268_198168_+|AUO79824.1|DBSCAN-SWA MNKWLVKASSLVVLGGMVLSAGSRVLADTYVRPIDNGRITTGFNGYPGHCGVDYAVPTGTIIGAVADGTVKFAGAGANFSWMTDLAGNCVMIQHADGMHSGYAHMSRVVARTGEKVKQGDIIGYVGATGMATGPHLHFEFLPANPNFQNGFHGRINPTSLIANVVTFSGKTQASAPSIKPLQSTPVQNQSSRLKVYRVDELQKVNGVWLVKNNTLTPTGFDWNDNGIPASEIDEVDANGNLTADQVLQKGGYFIFNPKTLKTVEKPIQGTAGLTWAKTRFANGSSVWLRVDNSQELLYK >CP019800|187450:199619|195529_197077_+|AUO79823.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSEKSGIIDFAKELKNLGWDIISTGGTKVALDDAGVETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDADSHLQAAKDNNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDVTYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTFETRQRLAAKVFRHTAAYDALIAEYFTAQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPTDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKDRPTVVALKHMNPCGIGQADDIETAWDYAYEADPVSIFGGIVVLNREVDAATAEKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAAAGIKAIIQPGGSVRDQESIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH >CP019800|187450:199619|192996_194019_+|AUO79820.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVAHTERAGVMGALGDFGGMFDLSQTGVKEPVLISGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNNPVKLEEVVSGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFAVGVAEKSQLIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVKAALPLIKEVLVNGIAHITGGGFIENVPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADDSVVIK >CP019800|187450:199619|191514_192969_+|AUO79819.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHSQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNPSFMGKVKEALSTVKGGFAYLLMTEDKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVIASETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDSGVQCDRYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIASPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHAVDEVCDIIGADSLTYLSIDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >CP019800|187450:199619|198314_199619_+|AUO79825.1|DBSCAN-SWA MKMNKKVLLTSTMAASLLSVASVQAQETDTTWTARTVSEVKADLVKQDNKSSYTVKYGDTLSVISEAMSIDMNVLAKINNIADINLIYPETTLTVTYDQKSHTATSMKIETPATNAAGQTTATVDLKTNQVSVADQKVSLNTILEGMTPEAATTIVSPMKTYSSAPALKSKEVLAQEQAVSQAAANEQVSPAPVKSITSEVPAAKEEVKPTQTSVSQSTTVSPASVATETPALVAKVAPVRTVAAPRVTSAKVVTPKVETGASPEHISAPAVPVTTTSTATDNKLQATEVKSVPVAQKAPTATPVAQPASTTNAVAAHPENAGLQPHVAAYKEKVASTYGVNEFSTYRAGDPGDHGKGLAVDFIVGTNQALGNEVAQYSTQNMAANNISYVIWQQKFYSNTNSIYGPANTWNAMPDRGGVTANHYDHVHVSFNK >CP019800|187450:199619|194757_195510_+|AUO79822.1|DBSCAN-SWA MKLVKNLEIVESIFGDWDETIIWSCVQGIMGEVFVDSLDQPKSSLAKLGRKSSFGFLAGQPTLFLLEVCSGEDIILVPQHKGWSDLIESTYGQNAHSFKRYATKKDTLFERSRLEKFVTQLPNGFELRAIDEKVYNSCLEKEWSQDLVANYATYQYYKKQGIGYVVYYQGNIIAGASSYSTYKNGIEIEVDTHPDFRRRGLATIVAAQLILTCLDKGIYPSWDAHTRTSLNLAEKLGYEFSHEYIAYEID >CP019800|187450:199619|187450_191281_+|AUO79818.1|DBSCAN-SWA MNPFGKLRKRWGLLKSQFQTSSYFPVAPLSDLVSYMNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDCLLTETEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLLGSDSQVKVNTAQLYLVNKDIAEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFETYQADDFATYKAEQGLAMEVDDFLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMSDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGNVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSIVVRPSDVDTFIEACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGETIVDLERRFLDTNGVRVVVDAKVVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTRTASVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLIATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSVEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEELTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKANFNQFEAIQAQHKITAASAVKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSVEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLGAFEGKLEEVYPTEFEQADALEEVPAVVSDTVIKAKEVIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEAAIADSVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNKKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNSSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQALFASAVKYFTGK >CP019800|187450:199619|194186_194735_+|AUO79821.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASANGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKAAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLSAYEGRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGIKRK |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
944250 : 954102
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019800|944250:954102|DBSCAN-SWA AATGACTTACACAGAAAATTTTCAAAAATGGTTAGATTTTGAGCAGCTTCCTGACTATCTTCGTCAAGAATTACTATCAATGGATGAAAAAACAAAAGAAGATGCTTTTTACACAAACTTAGAATTTGGTACTGCTGGTATGCGTGGTTATATTGGTGCTGGTACAAATCGTATTAATATTTATGTTGTCCGTCAAGCAACCGAAGGATTGGCAAAATTAATCGAAACTAAGGGAGAGGACGCTAAAAAACGTGGTGTAGCCATTGCTTATGATTCACGCCACTTCTCTCCAGAATTTGCTTTTGAGTCTGCACAGGTCTTGGCACAGCATGGAATTAAATCTTACGTATTTGAAGCTCTTCGTCCAACACCAGAACTCTCTTTTGCTGTTCGCCATTTAAATGCCTATGCTGGTATTATGGTTACTGCAAGCCACAATCCAGCACCTTTCAATGGTTATAAAGTCTATGGACAAGACGGAGGTCAACTACCACCAGCTGATGCTGATGCACTAACAGACTTTATCCGTGCTATTGAAAATCCATTTGCAGTTGAACTTGCTGATTTAGATGAAAGCAAATCAGCGGGTCTTATTCAAGTTATCGGTGAAGATGTTGATATTGAATATCTTAGAGAGGTTAAAGATGTTAATATCAATCAAGATTTAATCAATAACTTTGGAAAAGACATGAAAATTGTCTATACTCCTCTCCACGGAACTGGTGAGATGTTGACACGCCGTGCCCTTGCTCAAGTCGGTTTTGAATCTGTTGTTGTAGTAGAATCACAAGCTAAGGCAGATCCAGACTTTTCTACTGTCAAATCTCCTAACCCTGAAAGCCAAGCTGCCTTTGCTCTTGCTGAAGAACTCGGACGAGAAGTTGATGCAGATGTCTTAGTAGCTACTGATCCTGATGCAGACCGCCTAGGCGTTGAAATTCGCCAACCAGATGGTTCTTATAAAAACCTTTCTGGAAATCAAATTGGAGCGATTATTGCGAAATACATCCTGGAAGCTCATAAAACAGCAGGAACACTTCCAGAAAATGCTGCTCTCGCTAAATCAATCGTATCAACAGAATTAGTAACAAAAATTGCCGAAAGTTATGGCGCTACAATGTTTAACGTTTTAACTGGATTCAAATTCATCGCTGAGAAAATTCAAGAGTTTGAAGAAAAACATAACCACACCTATATGTTTGGTTTTGAGGAAAGCTTCGGATACCTTATTAAACCATTTGTCCGTGATAAAGACGCTATTCAAGCAGTTCTTTTGGTTGCTGAGATCGCAGCTTATTACCGTTCGCGTGGATTAACACTTGCAGATGGTATTGATGAAATTTACAAAGAATATGGTTTTTTTGCTGAAAAAACGATTTCAGTAACACTTTCAGGTGTAGATGGAGCTGCTGAAATTAAGAAGATTATGGACAAATTCCGTGAAAATGGTCCAAAACAATTTAACAATACTGATATTGTATTATTAGAAGATTTCCAAAAACAAACCGCTACTAAAAATGATGGAACAATATCTAACTTAACAACTCCTCCAAGTAATGTTTTGAAGTACACATTAGCTGATGATTCATGGATTGCAGTTCGCCCTTCAGGAACTGAACCAAAAATCAAGTTCTATATTGCCACGGTCGGTAATGATTTAGCAGATGCAGAAACAAAAATCGCCAATATTGAAAAAGAGATTACAACATTTGTAAATTAATAAAAAAAGCTAGGAAGGCACTGCACCCCATTAGTGGGACAGAAGAAAAACACTCTTATGAAGCCAATTTCCTGAATTGAACAGGAGATTGGTTTTTTAAATGACGTTGAATTCTAGTTTCATTATAAAATGTAATGTAATTTTTAACAATATTTGTTATACTATCTTTGTTGTATTTTCTCCTATCATGGAGATAAAAGGTTTCAGTCTTTAGGACGGAGTGAAACCATTCAATACAGGCGTTATCTGCAGGTGTTCCTTTTCGGGACATTGAGCGGATAATGCCTTTTTCCGTGCAAGCTTGATAGTAAGCCTTAGAAGTATACACTGAGCCTTGATCGCTGTGTAAGACTGCCCCTTTAGGTAATTTTAACTGATTAAGGGTGTCTATTACAAAATCTGTGTCCTGACAATCTGAGATAGTATAAGCTAAAATCTCTCGGTTATAGAGGTCCATAATTGAAGAGAGATACAATTTACAGTTACCGAAATATAGATAAGTAATATCTGTTACAAGCTTTTCCAATGGCTTATCGGCATGGAAATCCCGATTCAATTTGTTATCTGTTAAATAATAAGTTTTACCAAGATTGGGCGATTTCTTTGGACGTGTCCGACAAAGCCAACCATTGTCTTTCATGATACGATAGACTTTCTTTGCATTAACAGTCAATTCGTGGATCTTTTTGAGCAATCGTGTAATGGTACGATATCCATAAATAAAGTGATTCTCCATGCAGAGCTGTTCAATTAATTCAATGACTTCATCTGTTTCTTGTGGTTTCTCGTACTTCTTTTTCCAACGATAATAGGTCGATCGCTTAACATCAAAACAGTCTAGAATGACAGAAATCGGGTAGTTGTTTTTATAGTCTTCCACAAGCTTGATAAGACTTACTTTATCGATTTCCTTATCAAGCCTCGATACTTTTTTAAGAGGTCAACCTGTAATTGTAACTGTTCCACTTCAGACAGATGTTCCAAGCCTTTACCATAGGTATATTGCTTGCCAACACCTTGATGGAAACGATAAAGTTCCTCATTTTCGTGCCATTTTACCCAAGTATAGATTTGACTATCATTCTTGATACCTAGAGTCTCCATAATAAATCTGTTAGACTTGCCTGCTTTTTTCATCTCGATGCAGGCCAACTTCGTTTCCCATGAATATGCTTTTTTAACCATAATAAAACACTCCTGATTCTATTTTACTAGAATTCTCCAGGAGTGTTTTTCTTGTGTCTCACTTTAGGGAGACAGTGCCGAACTTACTCCTAGCTTTTTTTATATCTATCTAACGATGTTCTATTATTTTCAATCATGAAATATAACTGCAATTAACTTCACGATCAAATAATAGAGCAGACTTACAATTAACCACATTATCCCAATAACTGCAACTAAACCTATTAAAACAGATAATACCGTATTCTTAGTTGCTAGTTGGTTACTGATAAACCATGAAACTGCAAAAATAAATATCAGTAATAATAGTTGAAGCCTTTTTTTCATATAATTCCTCTTACTACTTTTGTGCATTTTGCATTTGATAATAAATACCTTTTTGAGCCATTAATTCAGAGTGGTTACCCACTTCTACAATTTCACCAGATACCATAACTAAAATAATATCTGCTGTTTGAATGGTAGATAAGCGATGTGCAATAATAAAGCTTGTTCTCCCCTTCATCAACATTTGGAATGCTTCTTGAAATAGACGATGTCGCCTCATCTAATATCAATATTCTAGGTAATTTAAGAAAAATACGAGCAATTGTCAATAGCTGACATTGCCCCTGTGATAACGAATCTCCAGCATCTTCTAAATACGTATCATATCCATTCGGTAATTGTTTGATAAAGAAATCTGCATTAGCTGCTTTTGCAGCCTCTATCACTTCTTCACGGCTAGCTTTAGGATTGGCATATGCAATGTTATCGTGAATCGTAGCACTTTTTAACCACGTTTCTTGTAATACCATTCCAATTTCTTGCCTTAATTGTGATGGCTCATAATCAGTAATAGGCTTACCATCTAAAAGGATATTTCCCCCGTCAACTTCATAGAAACGCATTAATAAATTGATTAAAGTAGACTTCCCAGCACCTGTTGGTCCTACAATAGCGACCTTAGCTCCTGCTGGAATGTGTAAATTAATACCATTCAATAGTGGTTTTGATTTATTATAACCAAAAACAATGTTTTTAAAATCGATTTGACCTTTGACCGTTGATGAATCAAGTTTTTCTGTACCTGTTATATTTGGTGACGATTCTTCTAAAATAGAGTAAAGGCGTTCTGCACAAGCCAGAGTACTTTGCATCTCAGACAGGACGGAAGAGATGTCATTAAATGGCTTAGTATATTGATTGACATAATTTAAGAAAGTGATTAATTGACCAACACTAAAAGCCCCTGACATAATACGAAGGGCACCAATCCCTGCTAAGAAGCCATAAATCAAACTATTGATAATTGCTCCGTATCGGTAGTCACACGACTAATCAAGTCACCTATGCCACGTTTATCAAGGTAAGCTATAGGCAATAGATTCAACTTTTCCATTACAACCTTTCTTAAAGAAGCAACATAATGAAAAATTAAGCGGTTATAGAGCAGAGGATTAATCCATTGAATAATAGTATTTGCTAAAATAACTGCAATCATCTTCCACATTATAGGTAACAATAATATCATAGAATGAGGCGATAATACAACGTCTACCGCTTGTCCAATTAGAACAGGCAAATAAACAGTGAGGCAAACTTGTACAACCGTCCCTAATAATGCCATTCCTACTAAGCTTTTTTTAGAAAGAAGATCTTGAACAAGCTTTTTTTGTATCTTTTTAGGATGACTTGCTTTCATTTACTCCTCCTCCTTAAAATTTTGTGAATGGTAAATGGACTTATAAACTTTGTTATGAGCTAATAAAGATTGATGATTATCAAAACCAACTTGTTTCCCCTTATCAAGGAGTAAGATTCTATCTGCATTTTGTATACTATTAATTCTCTGTGATACAATAATAAGATTAGTTTGGTTGAAATGTTTAGTTATAGCTTTAAATAAACGAGCTTCTGTTAAATAATCCAATGCAGATGTTGCATCGTCTAAAATCAAAAATGGTATCTTATCTTGAACTAAAGCTCTTGCAATCGTCAACCTTTGCCTTTGACCACCAGAGAAATTCCTACCAAAACTCTCTACAGAGGCATCAAGTTGACCATCTTTTTCTTTTACAAAATCACTAGCTTGTGCTATTTCTAAAGCAGTCCAAAGTTTTTCCTCACTAACTTTACCAAGTCCCAAAGAAAGGTTAGAACGAATAGTTCCTTTAAACAACTGAGCATTTTGAGGAACAACTCTTACCAGGGTACGCCAATTTGAAATTGTATCTGGACTTTTTCCCTGATGATATATATCAATATCCCCTTCTTGCACTTTATAAATATGAAGCAGTAAATTAACCAAGGTTGATTTCCCAGAGCCAGTTCCACCAATTATCCCTAAAGTTTCTCCTACATTCATAGAAAAAGTAATATCAGATAAAGCTTTTTCAGAGGAGTTTGGATAAGAAAATGCTATTTCTTGCACTTCTAAAGCCTTATTCGAATATTTTGGCTCAAGTTTGTCATCAATTATTTCAGACGGTCTTTCAAAAACGGCTATAATTCGCTTAGCACTGATATAACTTTGGTTCAGTGATGTCACCAACATTGTCATTTTTAACAATTCAACAAGAATTTGCAATAAGTAATTAATTAAAGCAACCAACATTCCTTGTGATAAAAGATGATTAGCTATATTTAAATTACCACGCCAAATAATCACAACCAAAGTGATATTAACAACTAGAAATGTTAGAGGCGTTACTAAACTAGAAAGCCTACCTGCTTTTAATTGTAAATTCGTATAATGATAATTGATATCATTAAATGCTTCACTCTCTCTATCTACTTGATTAAAGGCACGGATAACTCGTACACCTTGAAGTTGTTGCCTAGTCAACTTTACCAAATAATCGGTTGAAGTTCTGATTTTAAGGTAAATAGGATTTAATAGTCGAGACATTACAAAAACAATGATAAATAACGTGACAACCATTACCAAGAACCAAATAGTCAATGAGGGGCTAATGGAAAAAGCCATAATTATGGCACCAAAAACAATAATCGGAGCCCTCAAAAATAAACGTAAAAATTGATTTAAACCAGTTTGGATTTGAAATGTATCAGCAGTCAAACGAGTAATCAAACTAGCAGTTCCCAATTCATCTCTGTCTTTTTTACCCAGTGACATGACTTTTTGATAGAGATCCTCTGTCAATTGTCTCGTATAACCAACTGCAGCTTTTGAAGAATAATATTGAGCAGTTATCGCTACTACAACACCCACCGCAGCCAAAAAGAAAATCAATCCAATTTGCAACAGTAAACTACTTCTATCCCCTCGTGGAATGGTCTCGTCAATCATTTTTGCAATAACGATTGGTACCAAAAGTTCAAAAGAGGCTTCTAATAATTTGAAAAGGGGTCCAAAGATAGTTTCTTTGATATACCCCTTAAAATAATAAGTTAGTCTTTTCATACTTACCCTTCTTAAAACAACTCCATTATTTTTATCAAATAAAGGTTGAATTGAACTTCACGTGAGTAGTAAATATTACCACCATTTTTATAGAGCTTCCCTCCTGAAATTAAGGCGAGAGGATGATAGTAAAAGTAAGTGTCCCCGTTATAATTTCCTAGGCTGGGAGCTACAACATTTTTAGAGTAATTTTTGGCCAACTCAATGGAATTTTCACCCCCATGATCCGCTACATAATCAATATAAGAAGAACCAAAATTATATGCTTGGACAGCAGTCCATACATCAACCTTAGCTTTTTTAGCTTGACTTATATTTTGTGACAACAGAGTGACGCCATGTTTAATACTGGTGTGACTATCCGTAATACTGTTCGTAGTTCCACTGATACTTTCACTTGATTGCATCACATCTATAGCATCTCCCTTAGTTTCAGTATAAATCATAGATAATACTAAGTGCACATTAGCCTCTGAACCATTCTCTGCAAGAGTATTCTGCACTAAATCATGATATTGAAGCACTTTTTTAACATTTTCATGGATGATAACCAGACGGTACCCAATGAAAATAATAATAATTAATGCTATCAAACGTTTTAAAAATTTAAACATATTATTTATTTTGAATATCCTGTATGTTTTTGATTAGTATTGAGTATGTACCATCAGGGTTTTGGATAAATTCAACTGATTCGGCATCTTGGTAGACATTGTTGGGTACAATCAATTCAATACCATTTGAAAGAGATAGCTTCTAATTCTCTAACTTCTTAATTTGACGGGAATGATCAATATCACTTACTTGAACAGGTCCAGGTATTGCGTCTTTCAATTCATCAACAAAAGTCAGCCTGGCTGTTAAATTATCATCAAATAATTGATCTGCTAATTTTTCTGGAGACAATTCTTGCTCTTCTTCTAAATTCTTATAAATAGCCGATTTCATTTTTGATTGGAAAGAAAAATCATCTTTGTTGAAATTTTCAGCAATTTTTTGAGCTGTCTGTTCAACCATTTTGATAGATTTTTTAACAGACTGTTCTGGTTCTACTTGTAATAAATTTTCAGAAAAATAATTAGCAAATGAACCATTGTGTTTGATACGCTTTTCAATTAAATAGTATTGCTTTGATGACTTGTTAACAACCAAAGCTTCATCTGGAGTTTGAGCAGCACTTGGAAGGTTATTCTGTGTTATTGTAATTGGCTGCTCTTGATTTTCAGAAACATGAGCAAATTGTTCCTTTAATGAGATTCGAAGGAAAGCAAAATGTTCCATTCCATCCTTGTCAAATTGAATAAAAACTAAGTCATTCGTTTTTTGATCTTCCGATATGACAAACTCTTCTTTCCAAAGTTGCGCAATTTGACAGGAAGAAACATATAAATCATCTTGTAAATGACTCATAAATACATTATCCTCTCCAAAATAGCCACGCTTAGCTTCATCAGAAAAAACTTTACTTAATTTTTTACGAAAGTAGTCATCAATCCTTGGAGTTAGGGTTAACGGAGTATCTGATAGCACTAACTCTGTGTCGTTAGGAGAAAACTGATGTATAATAATCTGTTTGATATAAAAATCCATCATAACATTAATTCTCATACAAGGGGAAAGCGTCCGTTAATGATTTAATTTCTTGACGAACTTCTGTGAGGACATCTTGATTTTCATGATTTTTGAGTGCCTTAATCATTAATTCAGCGATTCTTCGAGATTCTTCAACTCCCATTCCTCGACTAGTAATCGCTGGAGTACCAATTCGAATACCTGATGTTTTAAATGGTGATAGTCGCTCAAACGGTATAGAGTTCTTGTTAAGGGTGATATTGACTTCTTCAAGAACATTTTGTGCCTTTTTGCCATTCTCAATAACTTTTGTGACGTCTACTAAGAACAAATGATTATCAGTACCATCAGAAATCAAATGAAAGTCATCATCTTCTTTAAAAACTTTAGCCATGGCTTGAGCATTTTTAATAATATCCTCACCGTATATTTTAAAGGAAGGATCTAGGGCTTCTTTCAAAGCTACAGCTTTTGCAGCAATTACATGTTCTAATGGTCCACCTTGGAGTCCTGGAAAGACTGCAGAATTAATTTTTTTAGCAATTGCTTCATCATTGGTTAAAATCAAACCACCTCTAGGTCCACGTAGAGTCTTATGGGTTGTCGTTGTCGTTACATGAGCATAAGAAATAGGACTAGGGTGATGACCAGAAGCAACTAAACCTGCAATGTGAGCCATATCAACCATTAAGTAAGCATCTACTGCGTCTGCTATTTGACGAAATTTTTCAAAATCAATAATGCGAGAATAGGCCGACGCCCCTGCAACAATTAATTTAGGTTGCGTTTCCTGTGCTATTTTCAAAATGTTATCATAGTCTAGCATCTCCGTCTTAGGATCAACAGAGTAAGAAACAAAATGATAAGTTTTTCCTGAGAAGCTAACTGAAGCGCCATGTGTTAAGTGCCCACCTGCTGCTAAGTCCATCCCTAAGACAGTATCTCCTGGCTCGATTAAAGCCATGTAAGCTGCTGCATTAGCCTGACTACCAGAATGTGGTTGAACATTAGCAAACTCAGCATTAAATAACGTCTTAGCTCGTTCTATAGCTAAACTTTCAACTACATCAACACAATCTGTTCCTCCATAATAACGATGACTAGGATACCCTTCGGCATATTTATTTGTCAAAACAGAACCTTGTGCTGCCATAACAGCTTTTGAAACAACGTTCTCTGATGCAATTAATTCAATATTATTTTGTTGGCGAATTTCCTCATCATGAATAGCCTGCCAAAGTTCTTGGTCAAATTCTTTAAAATTGTCTTTATCAAAAATCATTTTTTACTCCTTAAGCTCGTTATAACTTTTAAATAATGGTTTCAATCATTATATTTATCACATTTTTACTATTAGTTGCAAGATGATTAAATTAATTTTCAAAAATTAATTCAGATATCGTAGCCGTTAGTACCTCTTGCGTGATTGCACCTTGCCTTAAAATCTTAACTCTATCACCAGACAAATCAATAATAGTAGAATCCACACCTGTCAATGCTTTATCATCTTCAATACCTAAAACTTGATGATTAAACTGTTTTTGAATTTCTGAGAATACACGACCACTATCACATCCAGAAATATTAGCAGAAGGACCAATCAATGGACCATGGTTAGCAATCATATCAAGGGTTACAGGGTGCTTAGGCATCCGAAATCCTACGCTTGATAACCCAGAATTGATCCAATGCGGAACTTCTTGTGAAGCTTCCAAAATAATGGTTAGCGGTCCTGGTAAAAAGGCATCGTACAATTGCTTCAAATAGGTCGGTTGATTTTTAGAATATTTTAAAACAGTCTCAAAATCACATATATTTAAGTTCATAGCCTTATCACGAGGCCTTTTTTTAAGCTCATAGACGTGGTTCACAGCTTCTTCACTCAAAGCTTTGGCAAAGATTCCGTAGACTGTTTCTGTTGGCATAATAACTGCGCCATGATCCTCTAAAATCTGTCCCAAATCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019800|944250:954102|953505_954102_-|AUO80477.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNDLGQILEDHGAVIMPTETVYGIFAKALSEEAVNHVYELKKRPRDKAMNLNICDFETVLKYSKNQPTYLKQLYDAFLPGPLTIILEASQEVPHWINSGLSSVGFRMPKHPVTLDMIANHGPLIGPSANISGCDSGRVFSEIQKQFNHQVLGIEDDKALTGVDSTIIDLSGDRVKILRQGAITQEVLTATISELIFEN >CP019800|944250:954102|952157_953414_-|AUO80476.1|DBSCAN-SWA MIFDKDNFKEFDQELWQAIHDEEIRQQNNIELIASENVVSKAVMAAQGSVLTNKYAEGYPSHRYYGGTDCVDVVESLAIERAKTLFNAEFANVQPHSGSQANAAAYMALIEPGDTVLGMDLAAGGHLTHGASVSFSGKTYHFVSYSVDPKTEMLDYDNILKIAQETQPKLIVAGASAYSRIIDFEKFRQIADAVDAYLMVDMAHIAGLVASGHHPSPISYAHVTTTTTHKTLRGPRGGLILTNDEAIAKKINSAVFPGLQGGPLEHVIAAKAVALKEALDPSFKIYGEDIIKNAQAMAKVFKEDDDFHLISDGTDNHLFLVDVTKVIENGKKAQNVLEEVNITLNKNSIPFERLSPFKTSGIRIGTPAITSRGMGVEESRRIAELMIKALKNHENQDVLTEVRQEIKSLTDAFPLYEN >CP019800|944250:954102|947283_947481_-|AUO80473.1|DBSCAN-SWA MKKRLQLLLLIFIFAVSWFISNQLATKNTVLSVLIGLVAVIGIMWLIVSLLYYLIVKLIAVIFHD >CP019800|944250:954102|950571_951174_-|AUO80475.1|DBSCAN-SWA MFKFLKRLIALIIIIFIGYRLVIIHENVKKVLQYHDLVQNTLAENGSEANVHLVLSMIYTETKGDAIDVMQSSESISGTTNSITDSHTSIKHGVTLLSQNISQAKKAKVDVWTAVQAYNFGSSYIDYVADHGGENSIELAKNYSKNVVAPSLGNYNGDTYFYYHPLALISGGKLYKNGGNIYYSREVQFNLYLIKIMELF >CP019800|944250:954102|946024_946849_-|AUO80471.1|DBSCAN-SWA MEDYKNNYPISVILDCFDVKRSTYYRWKKKYEKPQETDEVIELIEQLCMENHFIYGYRTITRLLKKIHELTVNAKKVYRIMKDNGWLCRTRPKKSPNLGKTYYLTDNKLNRDFHADKPLEKLVTDITYLYFGNCKLYLSSIMDLYNREILAYTISDCQDTDFVIDTLNQLKLPKGAVLHSDQGSVYTSKAYYQACTEKGIIRSMSRKGTPADNACIEWFHSVLKTETFYLHDRRKYNKDSITNIVKNYITFYNETRIQRHLKNQSPVQFRKLAS >CP019800|944250:954102|944250_945969_+|AUO80470.1|DBSCAN-SWA MTYTENFQKWLDFEQLPDYLRQELLSMDEKTKEDAFYTNLEFGTAGMRGYIGAGTNRINIYVVRQATEGLAKLIETKGEDAKKRGVAIAYDSRHFSPEFAFESAQVLAQHGIKSYVFEALRPTPELSFAVRHLNAYAGIMVTASHNPAPFNGYKVYGQDGGQLPPADADALTDFIRAIENPFAVELADLDESKSAGLIQVIGEDVDIEYLREVKDVNINQDLINNFGKDMKIVYTPLHGTGEMLTRRALAQVGFESVVVVESQAKADPDFSTVKSPNPESQAAFALAEELGREVDADVLVATDPDADRLGVEIRQPDGSYKNLSGNQIGAIIAKYILEAHKTAGTLPENAALAKSIVSTELVTKIAESYGATMFNVLTGFKFIAEKIQEFEEKHNHTYMFGFEESFGYLIKPFVRDKDAIQAVLLVAEIAAYYRSRGLTLADGIDEIYKEYGFFAEKTISVTLSGVDGAAEIKKIMDKFRENGPKQFNNTDIVLLEDFQKQTATKNDGTISNLTTPPSNVLKYTLADDSWIAVRPSGTEPKIKFYIATVGNDLADAETKIANIEKEITTFVN >CP019800|944250:954102|946863_947154_-|AUO80472.1|DBSCAN-SWA MVKKAYSWETKLACIEMKKAGKSNRFIMETLGIKNDSQIYTWVKWHENEELYRFHQGVGKQYTYGKGLEHLSEVEQLQLQVDLLKKYRGLIRKSIK >CP019800|944250:954102|948838_950560_-|AUO80474.1|DBSCAN-SWA MKRLTYYFKGYIKETIFGPLFKLLEASFELLVPIVIAKMIDETIPRGDRSSLLLQIGLIFFLAAVGVVVAITAQYYSSKAAVGYTRQLTEDLYQKVMSLGKKDRDELGTASLITRLTADTFQIQTGLNQFLRLFLRAPIIVFGAIIMAFSISPSLTIWFLVMVVTLFIIVFVMSRLLNPIYLKIRTSTDYLVKLTRQQLQGVRVIRAFNQVDRESEAFNDINYHYTNLQLKAGRLSSLVTPLTFLVVNITLVVIIWRGNLNIANHLLSQGMLVALINYLLQILVELLKMTMLVTSLNQSYISAKRIIAVFERPSEIIDDKLEPKYSNKALEVQEIAFSYPNSSEKALSDITFSMNVGETLGIIGGTGSGKSTLVNLLLHIYKVQEGDIDIYHQGKSPDTISNWRTLVRVVPQNAQLFKGTIRSNLSLGLGKVSEEKLWTALEIAQASDFVKEKDGQLDASVESFGRNFSGGQRQRLTIARALVQDKIPFLILDDATSALDYLTEARLFKAITKHFNQTNLIIVSQRINSIQNADRILLLDKGKQVGFDNHQSLLAHNKVYKSIYHSQNFKEEE |
8 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1349203 : 1359884
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019800|1349203:1359884|DBSCAN-SWA TATGAAACTCATTTCATGGAATATTGATTCCCTCAATGCGGCATTAACAAGTGAATCAACACGTGCTTTAATGTCACGCCAAGTTATTGATACTTTAGTTGCTGAAGATGCCGACATCATTGCGATTCAAGAAACTAAACTGTCTGCCAAAGGGCCTACTAAAAAACATTTGGAAGTACTTGAAACTTACTTCCCAGCATATGATTTGGTTTGGCGATCATCAGTCGAACCTGCTCGTAAGGGCTATGCTGGTACAATGTTTTTATATCGTAAAGGGTTAAATCCTATTGTTAGCTTCCCTGAAATCGATGCTCCTACTACAATGGATAATGAAGGTCGCATTATTACTCTCGAATTGGAAAACTGCTATATCACACAGGTCTATACTCCAAATGCAGGTGATGGCCTAAAGCGCTTAGCTGACCGTCAAATATGGGATATTAAATATGCTGAGTATTTAGCAACATTGGATAGTCAAAAACCTGTTCTAGCAACAGGTGACTATAACGTAGCCCACAAGGAAATAGACCTAGCTAATCCTAGCAGTAATCGTCGTTCTGCTGGATTCACAGATGAAGAGCGCCAAGGCTTTACAAATCTACTAGCTAAAGGTTTTACAGATACTTTTCGTTACCTTCATGGCGATGTTCCAAATGTTTATAGCTGGTGGGCACAACGAAGTCGTACATCCAAAATCAACAATACAGGGTGGAGAATTGATTATTGGCTAACAAGTAACCGTGTCGCAGATAAAATTACCAAGTCAGAAATGATTCATTCTGGTGATCGTCAAGATCATACACCAATTATTTTGGAGATTGAACTATAAACCAAAAAAGATGATTGAGTTATAACTCAATCATCTTTTTATACTAAGTTGAGGTCTTTATACTTAGTACGGTAGCCAATCTGAAGAATTTTATTATCTTTAACTAGCAATGGACGCTTAATAAGCATCCCATCCGATGCCAATAAGTCCAAAGCTTGGTCAAGAGTTAAATCATCAAATTTATCTTTTAAGCCTAATTCTCTGTAAGAATTTCCTGAAGTATTGAAAAACTTTTTAAGGTCATAAGGCGAATTCTCTAACAATTCTTTTAATAACGAAGCTTTGGGAGGATTGCTTTTTATATCAATAGCTTCAAAAGTTAAGCCGAGTTCAGTTAACTCTTTTTTTGCTGAACGACAAGTGGTACATTTGGGGTATTCATAAAACGTATACATATTATTTCTCCTTTTCGTATTCTAATAACCAAGATTTTCTTTCTAAGCCACCAGCATAACCAGTTAATTGACCATATCTTCCTAAAACACGGTGACAAGGTATGATTAGAGAAATAGGATTTTTACCTATTGCTCCTCCAACAGCCTGTGCAGATTGACAATTTAGCTCTTTCGCTAATTCTCCATAAGTTTTTGTATCTCCAAAAGGGATTTTCTGTAATTCCTGCCATACTCTCATCTGAAATGCTGTCCCTCTCAATGATAATGGAATACTAGGTAAATTTTGCTGTGAAAAATAAGCATCTAACCACTTCTTACCAAGTAAAGTATAGGAATTTGACATATTAACAATTTCCTCTTGGTTGACTGCTAGCATATCATATTTTTGCCCAACAAAATAAAGCCCTGATAAACCTAGATTGTCTGCTAGAAGGCGAATTTCTCCAAGAGGGGACTGATAGAATTCTTGATATAACATATGATAAGCATAACTTAAAAAGCCATGAAAAGCAATTCATGACTTTTTTTTAGTTCTTTATTGTTGTTTTGCAATTAAACGTACACGGACGATATTCTCATCACCTTCAAATTCTTCAATTAAAGTAGAAATCTTGTTATTATCCGTTTCATCTAAATCTATTAGTGTGTAGGCGTAGTCACCCTTTGAACGGTTAATAATGTTATCAATATTTATACCTAACTCTGATACAGCAGTTGAAATTTTAGCCACAATGTTAGGAACATTCTTGTTAATTAAAGTAATACGAAATGGTGCGGTTTGAATTTGATGTACATTGGGGAAATTAACTGAATTAGTGATTTCTCCTGTCTCCATAAAACAACGAATGGTTTGACTTGCCATAATAGCACAATTTAGCTCTGCCTCATCTGTTGATCCGCCTACATGAGGAAAGACTGTAATTCCTTTTTGGTTTAATAATTCTTTGTCTCCAAAATCAGTAATATAGCGCTTGACAACACCAGTTTCTATCGCTTCAAATAGCTCTTGGTTATTGACTAATTCTGCACGAGCAAAGTTGATAATCGTCGTTCCTTTTTTCATGATTGAAAAAGCTTCCGCATCAAAAGTATGCTTAGTTTCATTTGTTAAGGGAACATGAATTGTGATATAGTCACAAGTTTCAAAAATATCCTTAATCTCTTTAACCCTTTGAACATGGCTTGAAATATTCCAAGCTGTTTCAATTGAAACATAGGGATCATAACCAAGAACTGTCATTCCTAAGCGTCTAGCATCATTCGCAATTCTAGCTCCAATGGCACCAAGGCCGATAACTCCCAATTTTTTTCCTGCAATTTCATTACCAGCAAAAGCTTTCTTTCCTGCTTCAATTTGTTTGGGAATATCTGTTCCAGTTAGAGTATTAACCCATCGGTTAGCTCCTAAATAATCACGAGCTGAAAGTAATAAGGCAGCAATGACCGCTTCTTTTACAGCATTAGCATTTGCACCTGGGGTATTAAAGACGACTATTCCCTGTGCACTTGCCTCTTCAATAGGAATATTATTTGTTCCTGCACCCGCCCTAGCAATAGCTTTGAGGTTACTTGGGAAATCTTGATTATGCAAATTTTGACTACGAATAATATAGGCATCAGGATTTTCTGACATATCCCCATCAATCTGGAAACGATTCCCTAACTCTTGTAAACCAATTTGATTAATATTATTAAATGTTTTGACACTAAAAACCATTCTTTTTCACTAAGGTTATCTCTTTAGTCATCATTGACTAAAATAACCCCTTTCTTTTTTTCTTACATGGGATTTCTTTCATCAATCTCACGATAGATGCTCGTTTCTCCCTTTTCTTTTATCTTCTGATAAGCCAATCGTACCCCATCTAGAGGTACTTTACCACAATATTGATAGCCTAATTTATTTAGAATATGCTGCATAGTGACATTTTTTTCATGAGTATCGCAACGAAAATCAGGTCCTTTGTGACCTTCAATTAACCCTTGAAGGAATGTCTGTGCTAGTCCTCTACCACGAAATTGATTTGAGATAGCAATACGATGAAATGTAAGATAGCGATGGTTATCATGGAGCCATTTTCCCTCATAAATAGCATCATAAACCTCTTCATGACCATCAATGACAGCCGCATAAGTCGCTAGCATCCCATCTTCAATACCAACCCAAGCATAACCGTTCAAGATATCATCAATAATATCGTTACGATTAGGGTATCCATCTTCTTTTTGCCATTGATCACTTCCTGTTTTAGCAATTTCGGCACGCGCTTCCTCAATAAGAAGCATAATTTGGTCAATTTCATTTGGAAAAGCTAATCTGATTTGCATTATATTACCCACTTTTATATATTATAGACTATAATAACGGTTTAATTTTCTTTCGTGATAACATTTACTATGCATTTTCTGCTTCAAATGTTTTCATAAAATCAATTAATTCGATGACACCTTGTTTAGGAAAGGCATTATAAAGGCTAGCCCTCATACCACCTACCGAACGATGCCCTTTAATATTTTTAAATCCACGTTCTGTCGCTTCCTTTACAAATTTTTCATCTAAATCTTTATTAATAGTTATGAAAGGAATGTTACATAGAGAACGACTCTTTTTATCTCTGACAGGATTACTATAAAATTCTGAGGAATCAATATAATCATAGAGAAGTCCTGATTTTTCACGGTTAGCTTTTTCCATAGCATCAACACCACCTAGACTTTTCACCCATTCAAAGACTAATTTAGCAATGTAAATACTGTAAGCAGGCGGCGTATTATAAAGAGAACCAGCATCTGACTGAATCTTATAATCCAACATTGATGATAAAGTTGGTTCCTCATTAATCATATCTTCACGGATAATAACTACCATTACACCAGCAGGTCCAATATTTTTTTGAGCTCCTGCATAAATCATTGCAAAATCTTCTACTTTATATTTTACAGCTAAGATATTAGAAGACATATCCGCAATAACAGGCACTCCATTAGTTTTAGGAGTATCATAAAGCGATGTTCCTTCAATGGTATTATTTGTTGTCACATGAACATAGGCAGCTTCAGGATCAATCTCTTTTTCATCAAACTCTGGAATATAATCATAAACTGATTCTTCTGATGAGGCTAATAGAATTGGTTCAAAAGGAATTGTTTTTGATAGTTTTACAGCCTCTGTATAAGCTTTTTTCCCCCACGAACCAGCAACATGATAGTAAGCTTTACGCCCTCTGGCAATATTCAAGGGAATCATACTAAACTGTAAGGATGCACCACCTTGTAAAAAGATTACTTTATAATTATCCGGAATTCCCATCAAATCTCTTAAGTAACGCTCAGCACCTTTGATAATATCATCAAACTCTTTGGAGCGGTGCGATACCTCCAAAACACTCATACTGGACCCTTGATAATTAAGGAGTTCAGATTGGGCTTTTACAAGCACTGGTTTTGGTAAGACTGCAGGACCTGCAGAAAAATTATAAATTGTCATATAACACCTCCATATAATAGTGTAAGATTATAGCACAGTATTTTGAATATTGTAAAGATTTTTTTGATTAATTTTGCTTTTTATTCGTGATATAATGGTAAAGGCGAACAATCAAGTTTAAAGGAGTAATTTATGATTTTGAGGGAATTTTGTGCAGAGAATTTAACAGACTTAACCAGATTAGATAAAGCTATTATTTCACGTGTCGAGCTTTGTGATAACCTTGCTGCTGGAGGCACTACTCCTAGCTACGGTGTTATCAAAGAAGCTAATCAATATTTACATGAAA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CATATTCCAATACATAAATTCTCTCTGTTACTTGCATAACCAAGTTCATATCATGTTCAATCAGCATAATAGTAATATCAAAATCATTCTTTATTTGACTAATTAACTGCGTCAATTCTGCAGTTTCTTGAGGATTCATTCCTGCTGCGGGCTCATCCAAAAACAATATTTTCGGTTCTGTTGCTAAAGCACGAACAATTTCTAAACGCCGTTGTTTTCCATAAGGGAGGTTCTTAGCAAGAGCATCTTGATATGCTTTCAAACCAAAAATCTCTAATAGCTCTAGGGCCTTTTTCCTTAAGGCTTTTTCACTATGATAGTATTTGGGTAATCGTAAAAAACTAGCAATAGAATGTGATAAGTGATGATTACTGAGTCCTACTAGTACATTATCTAAAACAGTCATATTTTTAAAAAGTCGGATATTTTGAAAAGTTCTACCTAAACCTAAAGAAGCTATTTTAGCTGGTTTCCTCCCATTTAATATCTTATCATCAAGTGATATTGTCCCTTTACTAGGAAGGTATACTCCTGTTAAGAGATTAAAAAGCGTTGTCTTACCCGCACCGTTGGGGCCGATTAAGCCAATTAATTCACCTTTATGTAATTTCATCGAAACATCACCTACAGCAGTTAGGCCACCGAAATGTTTACTTAAATTTTTTACTTCAAGAAGTGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019800|1349203:1359884|1357732_1358290_-|AUO80830.1|DBSCAN-SWA MPVVENDQLVGLVTEGTMAEAQPSKATSLSIYEMNYLLNKTKIRDIMIKDIVTVSQYASLEDAIYLMMSRKIGVLPVVDNGQLYGIVTDRDVFKAFLEIAGYGQEGYRLVILADEGIGVLSKVLNRLSSANLSVKRLVIIERKAGKKAVEIQLEGYADKDVLKQELVFDDVIVETLEKTVKKPLS >CP019800|1349203:1359884|1350069_1350426_-|AUO80820.1|DBSCAN-SWA MYTFYEYPKCTTCRSAKKELTELGLTFEAIDIKSNPPKASLLKELLENSPYDLKKFFNTSGNSYRELGLKDKFDDLTLDQALDLLASDGMLIKRPLLVKDNKILQIGYRTKYKDLNLV >CP019800|1349203:1359884|1357008_1357644_-|AUO80829.1|DBSCAN-SWA MKKGLMISFEGPDGAGKTTVLEAVLPLLREKLSQDILTTREPGGVTISEEIRHIILDVKHTQMDKKTELLLYMAARRQHLVEKVLPALEEGKIVLMDRFIDSSVAYQGSGRGLDKSHIKWLNDYATDSHKPDLTLYFDVPSEVGLERIQKSVQREVNRLDLEQLDMHQRVRQGYLELADSEPNRIVTIDASQQLDEVIAETFSIILDRINQ >CP019800|1349203:1359884|1350427_1350904_-|AUO80821.1|DBSCAN-SWA MLYQEFYQSPLGEIRLLADNLGLSGLYFVGQKYDMLAVNQEEIVNMSNSYTLLGKKWLDAYFSQQNLPSIPLSLRGTAFQMRVWQELQKIPFGDTKTYGELAKELNCQSAQAVGGAIGKNPISLIIPCHRVLGRYGQLTGYAGGLERKSWLLEYEKEK >CP019800|1349203:1359884|1354901_1355765_-|AUO80826.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKSNTHYGTLYLVPTPIGNLDDMTFRAIRILREVDFICAEDTRNTGLLLKHFDITTKQISFHEHNAYDKISGLIDLLKEGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIEGDIPVVSIPGASAGITALIASGLAPQPHIFYGFLPRKKGQQITFFETKKDYPETQIFYESPFRVSDTLKHMKEIYGDRQVVLVRELTKLYEEYQRGTISQLLWHIEKVPLKGECLIIVDGKRDTERVKDSSQQDPLVLVKEYIANGDKTNQAIKKVAKELNLNRQELYASFHDL >CP019800|1349203:1359884|1358409_1359120_-|AUO80831.1|DBSCAN-SWA MTMLKVENLSIHYGVIQAVNDVSFEVNQGEVVTLIGANGAGKTSILRTISGLVRPSQGSISFLGKPIHKLAARKIVGNGLAQVPEGRHVFSSLPVMENLEMGAFLQKDREQNQKMLKKVFDRFPRLEERKNQDAATLSGGEQQMLAMGRALMSRPKLLLLDEPSMGLAPIFIQEIFNIIEDIKKQGTTVLLVEQNANKALTIADKAYVLETGKVVLSGTGKELLVSDQVRKAYLGG >CP019800|1349203:1359884|1354045_1354681_+|AUO80825.1|DBSCAN-SWA MILREFCAENLTDLTRLDKAIISRVELCDNLAAGGTTPSYGVIKEANQYLHEKGISVAVMIRPRGGNFVYNDLELRIMEEDILRAVELESDALVLGILTSNNHIDTEAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDVIPKSDQKKSIDQLVALGFTRILLHGSSNGEPIIENIKHIKALVEYANNRIEIMVGGGVTAENYQYICQETGVKQAHGTRITQ >CP019800|1349203:1359884|1355770_1356097_-|AUO80827.1|DBSCAN-SWA MDKKDLFDAFDDFSQNLLVGLSEIETMKKQIQKLLEENTVLRIENGKLRERLSVIEAETETAVKNSKQGRELLEGIYNDGFHICNTFYGQRRENDEECAFCIELLYRD >CP019800|1349203:1359884|1356126_1356879_-|AUO80828.1|DBSCAN-SWA MALYLAQSQFCEKRQSGLPCQECRACRLIANGEFSDVKIIEPQGQLIKTETIKELTKDFSRSGFEGKSQVLIIKDCEKMHVNAANSLLKFIEEPQSSSYVILLTNDENNVLPTIKSRTQIFRFPKQLDMLVHQAEQAGLLKSQASLLAQVADDPKHLEILLTNKKLLDYLNLSQQFVTTLAKDRQTAYLEVSRLTSQVVDKNDQAFVFQWLTIMLAKEGQLYDLENTYRAQQMWKSNVSFQNSLEYMVLS >CP019800|1349203:1359884|1349203_1350031_+|AUO80819.1|DBSCAN-SWA MKLISWNIDSLNAALTSESTRALMSRQVIDTLVAEDADIIAIQETKLSAKGPTKKHLEVLETYFPAYDLVWRSSVEPARKGYAGTMFLYRKGLNPIVSFPEIDAPTTMDNEGRIITLELENCYITQVYTPNAGDGLKRLADRQIWDIKYAEYLATLDSQKPVLATGDYNVAHKEIDLANPSSNRRSAGFTDEERQGFTNLLAKGFTDTFRYLHGDVPNVYSWWAQRSRTSKINNTGWRIDYWLTSNRVADKITKSEMIHSGDRQDHTPIILEIEL >CP019800|1349203:1359884|1352205_1352754_-|AUO80823.1|DBSCAN-SWA MQIRLAFPNEIDQIMLLIEEARAEIAKTGSDQWQKEDGYPNRNDIIDDILNGYAWVGIEDGMLATYAAVIDGHEEVYDAIYEGKWLHDNHRYLTFHRIAISNQFRGRGLAQTFLQGLIEGHKGPDFRCDTHEKNVTMQHILNKLGYQYCGKVPLDGVRLAYQKIKEKGETSIYREIDERNPM >CP019800|1349203:1359884|1359119_1359884_-|AUO80832.1|DBSCAN-SWA MALLEVKNLSKHFGGLTAVGDVSMKLHKGELIGLIGPNGAGKTTLFNLLTGVYLPSKGTISLDDKILNGRKPAKIASLGLGRTFQNIRLFKNMTVLDNVLVGLSNHHLSHSIASFLRLPKYYHSEKALRKKALELLEIFGLKAYQDALAKNLPYGKQRRLEIVRALATEPKILFLDEPAAGMNPQETAELTQLISQIKNDFDITIMLIEHDMNLVMQVTERIYVLEYGRLIAHGTPEEIKNNKRVIEAYLGSEV >CP019800|1349203:1359884|1352821_1353913_-|AUO80824.1|DBSCAN-SWA MTIYNFSAGPAVLPKPVLVKAQSELLNYQGSSMSVLEVSHRSKEFDDIIKGAERYLRDLMGIPDNYKVIFLQGGASLQFSMIPLNIARGRKAYYHVAGSWGKKAYTEAVKLSKTIPFEPILLASSEESVYDYIPEFDEKEIDPEAAYVHVTTNNTIEGTSLYDTPKTNGVPVIADMSSNILAVKYKVEDFAMIYAGAQKNIGPAGVMVVIIREDMINEEPTLSSMLDYKIQSDAGSLYNTPPAYSIYIAKLVFEWVKSLGGVDAMEKANREKSGLLYDYIDSSEFYSNPVRDKKSRSLCNIPFITINKDLDEKFVKEATERGFKNIKGHRSVGGMRASLYNAFPKQGVIELIDFMKTFEAENA >CP019800|1349203:1359884|1350961_1352143_-|AUO80822.1|DBSCAN-SWA MVFSVKTFNNINQIGLQELGNRFQIDGDMSENPDAYIIRSQNLHNQDFPSNLKAIARAGAGTNNIPIEEASAQGIVVFNTPGANANAVKEAVIAALLLSARDYLGANRWVNTLTGTDIPKQIEAGKKAFAGNEIAGKKLGVIGLGAIGARIANDARRLGMTVLGYDPYVSIETAWNISSHVQRVKEIKDIFETCDYITIHVPLTNETKHTFDAEAFSIMKKGTTIINFARAELVNNQELFEAIETGVVKRYITDFGDKELLNQKGITVFPHVGGSTDEAELNCAIMASQTIRCFMETGEITNSVNFPNVHQIQTAPFRITLINKNVPNIVAKISTAVSELGINIDNIINRSKGDYAYTLIDLDETDNNKISTLIEEFEGDENIVRVRLIAKQQ |
14 | Streptococcus_phage(84.62%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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