Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019818 | Streptococcus agalactiae strain SA184, complete genome | 1 crisprs | cas3,cas5,cas7,cas4,cas2,cas9,cas1,csn2,csm6,DEDDh | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019818_1 | 817459-817553 | TypeII |
II-A
Consensus repeat of CP019818_1
|
1 spacers
spacers of CP019818_1
>1.1|817488|37|CP019818|CRISPRCasFinder CCAAAACTTATTCTATTGTTAAATCGTGTGTTGATGA |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019818_1
The CRISPR arrays of CP019818_1 >merge|CP019818|1|817459-817553|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACTTATTCTATTGTTAAATCGTGTGTTGATGAGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCAAATGGTT >CP019818|1|1|817459-817553|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTT CCAAAACTTATTCTATTGTTAAATCGTGTGTTGATGA GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCAAATGGTT
>CP019818.1|AUP09662.1|816692_817358_+|CRISPR-associated-protein-Csn2 MIKINFPILDEPLVLSNATILTVEDVSVYSSLVKHFYQYDVDEHLKLFDDKQKSLKATELMLVTDILGYDVNSAPILKLIHADLESQFNEKPEVKSMVERLAATITELIAFECLENELDLEYDEITILELIKALGVKIETQSDTIFEKCFEIIQVYHYLTKKNFLVFVNSGAYLTKDEVIKLCEYINLTQKSVLFLEPRRLYDLPQYVIDKDYFLIGENMV >CP019818.1|AUP09661.1|816364_816706_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MSYRYMRMILMFDMPTETAEERKAYRKFRKFLLSEGFIMHQFSVYSKLLLNNTANNAMIGRLKVNNPKKGNITLLTVTEKQFARMVYLHGERNTSVANSDSRLVFLGDSYDQD >CP019818.1|AUP09660.1|815498_816368_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAGWRTVVVNTHSKLSYKNNHLIFKDSYQTEMIHLSEIDILIMETTDIVLSTMLIKRLGDENILVIFCDDKRLPTAMLMPYYARHDSSLQLSRQMSWIEDVKADVWTSIIAQKILNQSFYLGECSFFEKSQSIMNLYHDLESFDPSNREGHAARIYFNTLFGNDFSREQDNPINAGLDYGYSLILSMFAREVVKCGCMTQFGLKHANQFNQFNLASDIMEPFRPIVDRIIYENRQSDFVKMKRELFTMFSETYNYNGKEMYLSNIVSDYTKKVIKSLNSDGNGIPEFRI >CP019818.1|AUP09659.1|811384_815497_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas9 MNKPYSIGLDIGTNSVGWSIITDDYKVPAKKMRVLGNTDKEYIKKNLIGALLFDGGNTAADRRLKRTARRRYTRRRNRILYLQEIFAEEMSKVDDSFFHRLEDSFLVEEDKRGSKYPIFATMQEEKDYHEKFPTIYHLRKELADKKEKADLRLVYLALAHIIKFRGHFLIEDDRFDVRNTDIQKQYQAFLEIFDTSFENNHLLSQNVDVEAILTDKISKSAKKDRILAQYPNQKSTGIFAEFLKLIVGNQADFKKHFNLEDKTPLQFAKDSYDEDLENLLGQIGDEFADLFSAAKKLYDSVLLSGILTVTDLSTKAPLSASMIQRYDEHREDLKQLKQFVKASLPEKYQEIFADSSKDGYAGYIEGKTNQEAFYKYLSKLLTKQEDSEYFLEKIKNEDFLRKQRTFDNGSIPHQVHLTELKAIIRRQSEYYPFLKENQDKIEKILTFRIPYYVGPLARGNSDFAWMTRKTDDSIRPWNFEDLVDKEKSAEAFIHRMTNNDLYLPEEKVLPKHSLIYEKFTVYNELTKVRYKNEQGETYFFDSNVKQEIFDGVFKEHRKVSKKQLLDFLAKEFEEFRIVDVTGLDKENKAFNASLGTYHDLKKILDKDFLDNPDNESILEDIVQTITLFEDREMIKKRLENYKDLFTESQLKKLYRRHYTGWGRLSAKLINGIRDRESQKTILDYLISDGRANRNFMQLINDDGLSFKSIISKAQSGSHSDNLKEVVGELAGSPAIKKGILQSLKIVDELVKVMGYEPEQIVVEMARENQTTNQGRRNSRQRYKLLEDGVKNLASDLNGDILKEYPTDNQALQNERLFLYYLQNGRDMYTGEALDIDNLSQYDIDHIVPQAFIKDDSIDNRVLVSSAKNRGKSDDVPSIDIVKARKAFWKKLLDAKLISQRKYDNLTKAERGGLTPDDKAGFIQRQLVETRQITKHVARILDERFNNKVDDNNKPIRKVKIVTLKSNLVSNFRKEFGFYKIREVNNYHHAHDAYLNAVVAKAILTKYPQLEPEFVYGDYPKYNSYKTRKSATEKLFFYSNIMNFFKTKVTLADETVVVKDDIEVNNETGEIAWDKKKHFATVRKVLSYPQVNIVKKTEVQTGGFSKESILAHSNSDKLIPRKTKDIYLDPKKYGGFDSPIVAYSVLVLADIKKGKAQKLKTVKELIGITIMERERFEKNPSAFLESKGYLNIRTDKLIILPKYSLFELENGRRRLLASAGELQKGNELALPTQYMKFLYLASRYNESKGKPEEIEKKQEFVNQHVSYFDDILQLINDFSKRVILADANLEKINKLYSDNKDNTPVDELAKNIINLFTFTSLGAPAAFKFFDKSVDRKRYTSTKEVLDSTLIHQSITGLYETRIDLGKLGED >CP019818.1|AUP09658.1|810354_810921_+|Membrane-protein MKDKLLVVLTWIWIISLATLATIYIAWLIYPIEIQFLKLEKVVYLKAETIYYNFNKLMIYLTHPFISDLNMPSFPSSEDGLKHFADVKYLFTLAHGLFVILTFPVIYFLRRGWKQKSIFLYEGFFKIAIMLPIFIVVCAFLLGFDQFFTLFHEVLFPGDSTWQFNPLTDPVIWILPETFFLHCFIIFC >CP019818.1|AUP09657.1|809594_810365_+|HAD-family-hydrolase MAYKGYLIDLDGTIYKGKSRIPAGERFIEHLQEKGIPYMLVTNNTTRTPESVQEMLRGFNVETPLETIYTATLATVDYMNDMNRGKTAYVIGEEGLKKAIADAGYVEDTKNPAYVVVGLDWNVTYDKLATATLAIQNGALFIGTNPDLNIPTERGLLPGAGSLNALLEAATRIKPVFIGKPNAIIMNKALEILNIPRNQAVMVGDNYLTDIMAGINNDIDTLLVTTGFTTVEEVPDLPIQPSYVLASLDEWTFNEG >CP019818.1|AUP09656.1|808857_809625_+|Acyl-ACP-thioesterase MGLLYRETYEVPFYESDTNHYMKLPQLLALALQISAKQSLKLGIGDDIVFKRYGLVWVVTDYIIDIERLPKHAEKIVIETEAKAHNKLLCYRYFYIYGEDGQKIITISSAFVLMDFKTRKIHPVLDDITSIYQSQRIKKVIRGPKYHPIGDSKVKQYHVRYFDLDMNGHVNNSKYLEWMYDVLDLDFLSSHIPKKIDLKYIKEIQYGTDIKSHWYQDGLVTRHDIIGGDAIHAQARIEWQEKRRIKWLIKDILLI >CP019818.1|AUP09655.1|807723_808854_+|Coproporphyrinogen-III-oxidase MLKKPTSAYVHIPFCTQICYYCDFSKVFIKNQPVDAYLQALIREFRSYDITDLRTLYIGGGTPTSISAVQLDYLLTELSRDLNLNTLEEFTIEANPGDLTVDKIEVLQKSAVNRVSLGVQTFNDKHLKRIGRSHNEAQIYSTIDALKTAGFQNISIDLIYALPGQTMDNVRSNVAKALSLNIPHLSLYSLILEHHTVFMNKMRRGKLHLPTEDLEAEMFEYIISEMERNGFEHYEISNFTKPGFESRHNLMYWDNVEYYGVGAGASGYLDGIRYRNRGPIQHYLKGVSEGNARLSEEVLSKNEMMEEELFLGLRKKEGVSIGKFEQKFGTSFEKRYGQIVQELQSDGLLKENNGFIQMTKKGLFLGDTVAEKFIVE >CP019818.1|AUP09654.1|807250_807631_+|Pyrimidine-dimer-DNA-glycosylase MRLWHQDIIELLPRQQLLGQHRECCALRGNGWGRKHETIDYVFRYSPYRLFAYHQLVMEEMMERGYRVSKEWLVAEYRGMKCPRYDTLNPVDLETPIYPEHNQDYLQECLWNLKAKGIDLPINKIK >CP019818.1|AUP09653.1|806854_807226_+|hypothetical-protein MTKEAELLWAKHKYLVLSKSQKIYLDIRQTLKSPNCTVLDVQSLIDQAVLLEESPSQVTNAYMHIWGYFKNKAERQEKEEFLILLEKYRKTGYQRRKLLAFLKQLFAKYPNSYLQNSSIFEEE >CP019818.1|AUP09664.1|817881_818043_+|hypothetical-protein MKDYNSNLMVKGLGCSTLYLIISLTALVLLVIAGVSLSLILASLQGKQRRTYP >CP019818.1|AUP09665.1|818183_818600_+|Nucleoside-diphosphate-kinase MEQTFFMIKPDGVKRGFIGEVISRIERRGFSIDRLEVRHADADILKRHYAELTDRPFFPTLVDYMTSGPVIIGVISGEEVISTWRTMMGSTNPKDALPGTIRGDFAQAPSPNQATCNIVHGSDSPESATREIAIWFNN >CP019818.1|AUP09666.1|818735_820568_+|Elongation-factor-4 MNIEDLKKRQEKIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILEKTETVSSREMQAQLLDSMDLERERGITIKLNAIELNYTAKDGETYIFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNDLEILPVINKIDLPAADPERVRAEVEDVIGLDASEAVLASAKAGIGIEEILEQIVEKVPAPTGEVDAPLQALIFDSVYDAYRGVILQVRIVNGMVKPGDKIQMMSNGKTFDVTEVGIFTPKAVGRDFLATGDVGYIAASIKTVADTRVGDTITLANNPAIEPLHGYKQMNPMVFAGLYPIESNKYNDLREALEKLQLNDASLQFEPETSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNIDLIMTAPSVVYHVNTTDSEMLEVSNPSEFPDPTRVDSIEEPYVKAQIMVPQEFVGAVMELAQRKRGDFVTMDYIDDNRVNVIYQIPLAEIVFDFFDKLKSSTRGYASFDYEISEYRRSQLVKMDILLNGDKVDALSFIVHKEFAYERGKLIVDKLKKIIPRQQFEVPIQAAIGQKIVARSDIKALRKNVLAKCYGGDVSRKRKLLEKQKAGKKRMKAIGSVEVPQEAFLSVLSMDDDDKK >CP019818.1|AUP09667.1|823349_824009_+|Phosphohydrolase MTMVKREDVILNATENMVYHKLKNDPSGHDWFHIVRVRNLAVELAHKEGANTFICQMAALLHDIIDDKICQDSEQASYELTQWLYSQDLAIAEVEHILDILQNISFKAGTGLTMKTLEGQIVQDADRLDAMGAIGIARTMAYSGSKGRLIHDPNLKPRENLTLEEYRNGQDTAIMHFYEKLLKLKDLMNTKQGKMLAQKRHDFLELYLAEFYAEWNGKR >CP019818.1|AUP09668.1|824017_824482_+|GNAT-family-acetyltransferase MIRRAKEKDLPAIAELLQQILVLHHGVRPDIFHTRGSKFSKEQLKEMLIDESKPIFVYESDEGKVVAHLFLQLQEKRDLPRKSFKTLYIDDLCIDEEVRGQQIGQKLMDFARQYAKKHGCYNITLNVWNDNQRAVSFYEKLGFKPQQTQMEEIL >CP019818.1|AUP09669.1|824481_824916_+|Peptide-methionine-sulfoxide-reductase-MsrB MKETQEELRQRIGHTAYQVTQNSATEHAFTGKYDDFFEEGIYVDIVSGEVLFSSLDKFQSGCGWPAFSKPIENRMVTNHQDHSHGMHRIEVRSRQADSHLGHVFNDGPVDAGGLRYCINSAALDFIPYDQMAKRGYGDYLSLFD >CP019818.1|AUP09670.1|825067_827860_+|Haloacid-dehalogenase MASTNNVSDTNTRFAKEELEEVFEELGTTQGGLSDEEVAVRQKKYGLNLLSEVKQESIILLFLKNFTSLMAILLWVGGFVAIVSNSLELGLAIWMVNVINGIFSFIQEYRASQATQALKKMLPSYSRVLRKSSEEKILSEQLVPGDIVLIEEGDRISADGRLIKTTDLQVNQSALTGESNPIYKDSNVENDQSKTLIECDNMVFAGTTVSSGSATMVVTAIGMQTQFGQIADLTQGMKSEKSPLQRELDRLTKQISIISITVGIIFFLAATFFVKEPVSKSFIFALGMIVAFIPEGLLPTVTLSLAMAVQRMAKEHALVKKLSSVETLGATSVICSDKTGTLTQNEMTVNHLWQNGKSYQVTGLGYAPEGQVLFEGDNICFGNSDRGDLEKLIRFAHLCSNAQVLPPNDDRSTYTVLGDPTEACLNVLLEKSGINRQENRKFAPRLKELPFDSVRKRMTTIHSLGGDEKDKKISITKGAPKEILDLSDYVLSDGKVIPLNKEERNKIQLANDTFAKDGLRVLAVSYCDIEGFSKEQWTQENLEQHMVFIGLIAMSDPPREGVREAIDKCHAASIRIIMVTGDYGLTALSIAKNIGIIRNDDAKVISGLELSEMTDSQLKKELSGEVVFARVAPEQKYRVVTILQEMGEVVAVTGDGVNDAPALKKSDIGVAMGVTGTDVAKESADMILTDDHFASIVDAVEEGRAVYQNIKKFLTYIFNSNTPEAVPSAFFLFSKGFIPLPLTVMQILAVDLGTDMLPALGLGVESPETDVMNRPPRRLTDRLLDKGLLIKSFLWYGTIESVLAMGGFFWAHYLRYGNFTFFVANGIPYREATTMTLGAIIFSQIGMVMNSRTSYQSIKTLSIFGNKLINFGIIMEILAFLVLVYVPLFHNLFNTASLGLSHWLYLISCPFIMIGLDEVRKLFSSRKNKR >CP019818.1|AUP09671.1|827859_828903_+|hypothetical-protein MSNIITYLKNNSNLTFDELALNDVDILCLNEFGYISFEKLINTTEMKSVLVCELYHEYLQTMAKSYSFMFTSQRHDLCQLMMTSKRFKNLTLSYYQAEISLEFEKQFAAMVFTIPNIDYHQVVFRGTDANLIGWKEDFKLTYMREISAHRSAIKYLNTILPHFDKVVLSGHSKGGNLALYAAMFTKPDLKAKIDLIWLIDSPGLQKTLLPTTEYKTTKQKCIRLLPEESIVGMMLYSDIEPLIISSNARGILQHDVTTWEIQEPAILKTGTGLSLKSICFEKTFQQWMAELKSQERKLFFDLLFDSFLSSGVSSLDDFNLASRAKMMKAFHSFRELDDDKKGYLTNL >CP019818.1|AUP09672.1|828935_829505_-|Chloramphenicol-acetyltransferase MSTGASYPKYGFSVGKYTYGYQQFFYEGVNLKEIGAFCSIAQNVTITGMNHPTDHITTNPFIYYKSRGFINEDRADLIDEKKNGKVIIGNDVWIGTNVTILPSVTIGNGAIIGAGSVITKDIPDYAVVAGTPAKIIKYRFSEEEITLLNASQWWNWSDEAIKEHISEFSDKKEFFNTLKSIEENKNHKL >CP019818.1|AUP09673.1|830931_831714_-|hypothetical-protein MFGKLLKYELKSVGKWYLTLSAAVLLVSIILGLVLKALDGNFSTDTNSTSAQIFTIILVLLLAMVISGSLLSTFAIIIKRFYSNIFGRQGYLTLTLPVTTNQIICSKLLASLLWSIFNIFIVIIGIILVILPLVGIGQFVVAFPEIYKIISSSNAPLFIAYFFLSYVAGTLLIYLSIAVGQLFTNKRVLMGIVSYCGISLLITFLTLIIDSIFHIDLFNSHANATFSQPVLLYNILVSIVEIAIFYMLTHSIIKYKLNIQ |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
187551 : 199657
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019818|187551:199657|DBSCAN-SWA TATGAATAAACGTATTTTTGTTGAGAAAAAGGCTGACTTTGGCATTAAATCGGCTAGTCTTGTGAAAGAGTTGACGCATAATCTACAACTGACTTCTTTGAAGGATTTGCGTATTGTGCAGGTCTATGATGTCTTCAATTTGGCTGAGGATTTGCTGGCGCGTGCTGAGAAGCATATTTTCTCTGAGCAGGTGACAGACTGTCTTTTGACGGAAACTGAAATCACTGCGGAGCTTGATAAGGTTGCCTTCTTTGCCATTGAGGCGCTTCCTGGTCAATTTGACCAACGTGCTGCTAGTTCGCAAGAAGCTTTGCTATTGCTTGGAAGTGACAGTCAGGTTAAGGTCAATACAGCCCAGCTTTACTTGGTCAATAAGGATATTGCAGAAGCAGAGCTTGAAGCTGTTAAGAACTATCTTTTGAATCCTGTTGATTCACGTTTCAAGGACATCACTTTGCCGCTTGAAGAGCAGGCTTTCTCTGTGTCTGATAAGACGATCCCTAATCTTGATTTCTTTGAAACTTATCAAGCTGACGATTTTGCGACTTATAAGGCAGAGCAGGGCTTGGCTATGGAGGTCGATGATTTTCTCTTCATCCAAGATTATTTCAAATCAATCGGGCGTGTGCCAACTGAGACTGAGTTGAAAGTTTTGGATACGTATTGGTCAGACCACTGTCGTCACACAACCTTTGAAACTGAGCTGAAAAACATTGATTTTTCAGCTTCTAAATTCCAGAAACAATTACAGACGACTTATGACAAATACATTGCCATGAGTGATGAGCTTGGTCGTTCTGAAAAGCCACAGACGCTTATGGATATGGCGACTATCTTTGGTCGTTATGAGCGTGCCAATGGTCGTCTGGACGATATGGAAGTCTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTTGAGATTGAAGTAGATGTTGATGGTGTAAAAGAGCCTTGGCTCCTCATGTTTAAGAATGAGACTCACAATCACCCAACAGAAATTGAGCCATTTGGTGGCGCAGCAACTTGTATCGGTGGTGCCATTCGTGACCCGTTGTCAGGACGTTCATACGTTTATCAGGCTATGCGTATTTCAGGCGCAGGCGATATTACGACTCCGATTGCGGAAACACGTGCTGGTAAATTGCCACAACAGGTTATTTCTAAGACTGCGGCGCACGGCTATTCTTCATATGGTAACCAAATTGGGCTTGCGACAACTTATGTGCGTGAGTACTTCCACCCTGGCTTCGTAGCCAAACGTATGGAGCTTGGAGCTGTGGTTGGTGCTGCACCTAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAGAAGCAGGCGATGTGGTCATCTTGCTCGGTGGTAAAACAGGTCGTGATGGTGTCGGTGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAAACGGTTGAATCTGTGGAAACAGCTGGCGCAGAGGTACAAAAAGGGAATGCCATTGAAGAGCGTAAGATTCAACGTCTTTTCCGTGATGGCAATGTCACTCGTCTTATCAAGAAATCAAATGACTTCGGTGCAGGTGGTGTCTGTGTTGCCATCGGTGAATTGGCTGATGGTCTTGAAATCGATTTGGACAAGGTGCCACTTAAATACCAAGGTCTTAATGGTACTGAAATTGCAATCTCAGAATCTCAAGAGCGTATGTCAATCGTTGTTCGTCCTAGTGATGTGGATACCTTCATCGAAGCCTGCAACAAGGAAAATATCGATGCAGTCGTTGTTGCGACCGTTACTGAAAAACCAAATCTTGTTATGACTTGGAATGGCGAAACCATCGTTGACTTGGAACGCCGTTTCCTTGATACCAACGGTGTCCGTGTCGTTGTTGATGCTAAAGTCGTTGACAAGGACTTGACAGTTCCAGAAGCACGCACAACATCAGCAGAGACACTTGAAGCAGATACGCTTAAGGTCTTGTCTGACCTCAACCATGCTAGCCAAAAAGGTCTCCAAACCATCTTTGACTCATCTGTTGGTCGTTCAACCGTTAACCACCCAATCGGTGGTCGCTACCAAATCACACCGACAGAAAGTTCAGTTCAAAAATTGCCAGTTCAACATGGTGTGACAAGAACAGCCTCTGTTATGGCTCAAGGTTACAATCCTTATATTGCTGAGTGGTCACCTTACCACGGTGCTGCCTATGCTGTCATTGAAGCGACAGCTCGCTTGATAGCAACGGGTGCCGACTGGTCTCGTGCACGCTTCTCTTACCAAGAGTACTTCGAGCGTATGGACAAACAGGCAGAGCGTTTTGGTCAGCCAGTATCAGCTCTTCTTGGTTCTGTTGAGGCTCAGATTCAACTTGGCTTGCCATCAATCGGCGGTAAGGACTCGATGTCTGGTACTTTCGAAGAATTGACAGTGCCACCAACCTTGGTAGCTTTCGGTGTGACAACAGCGGACAGCCGCAAGGTTCTCTCTCCTGAGTTTAAAGCGGCTGGTGAGAATATTTACTACATTCCAGGTCAAGCTATTTCAGAAGATATTGATTTTGACCTTATCAAGGCTAACTTTAACCAGTTTGAAGCTATTCAAGCTCAACATAAGATTACCGCTGCTTCAGCCGTTAAATACGGTGGTGTCCTAGAAAGTCTTGCTCTCATGACTTTTGGTAACCGTATCGGTGCTTCTGTTGAAATTGCAGAGCTTGACAGCAGCTTGACAGCTCAACTCGGAGGCTTTGTCTTTACATCAGTTGAGGAAATCGCTGACGCTGTGAAGATTGGTCAAACTCAGGCAGACTTTACAGTCACTGTCAATGGAAATGACCTCGCTGGTGCTAGCCTCCTAGGAGCCTTCGAAGGTAAATTGGAAGAAGTTTACCCAACAGAATTCGAACAGGCAGACGCTCTTGAAGAAGTTCCTGCTGTGGTATCAGATACCGTCATCAAGGCTAAGGAAGTCATTGAAAAACCAGTGGTTTACATTCCAGTCTTCCCTGGTACTAACTCAGAGTACGATTCAGCTAAGGCTTTTGAACAGGTTGGAGCTAGCGTCAACTTGGTACCATTTGTAACCTTGAATGAGGCTGCTATTGCTGACTCAGTTGACACAATGGTCGCTAATATTGCTAAGGCAAATATCATCTTCTTTGCTGGAGGATTCTCAGCAGCGGATGAACCAGATGGGTCTGCTAAGTTTATCGTCAATATCTTGCTTAACAAGAAGGTTCGCGCAGCTATTGACAGCTTCATCGAAAAAGGTGGCCTTATCATCGGTATCTGTAATGGTTTCCAAGCCCTTGTTAAATCAGGTCTTCTTCCATACGGAAACTTCGAGGAAGCTGGTGAGACAAGTCCAACTCTCTTCTATAACGATGCTAACCAGCACGTTGCAAAGATGGTTGAGACTCGTATCGCAAATACCAACTCACCTTGGTTGGCAGGAGTTGAGGTCGGCGATATTCATGCCATTCCAGTTTCACACGGTGAAGGTAAATTTGTTGTCAGCGCTTCTGAATTTGCAGAGCTAAGAGACAATGGTCAAATCTGGAGCCAATATGTGGACTTTGACGGACAACCATCTATGGATTCTAAATACAATCCAAACAGCTCTGTCAATGCCATCGAAGGGATTACCAGCAAGAATGGTCAAATCATCGGTAAGATGGGGCACTCAGAACGCTGGGAAGACGGCCTCTTCCAAAATATCCCTGGTAACAAAGACCAAGCCTTGTTTGCTAGTGCAGTAAAATATTTTACAGGAAAATAATTTTTTCAAATTTTTTCATAAAACAGATAAGGAAACAAGAGCGAAGCGAGCTTAACTGTATCTTTCTGTCGTAGTGGTATTTGGGAGCCGTTGAGGCTAAGACTCAATGATTAGCTTGAAAATAGCTTGATAGATTTTCTATTTTGATGTTGGCATTGATGACGATAGATCCAAAATTGAGAAAATCATCAAAGCTACTTAAGAAGAGATACAAAAAGAATTAGGAAAAAAGAATGACATACGAAGTAAAATCTCTAAATGAAGAATGTGGTGTATTTGGTATCTGGGGGCATTCTCAGGCAGCTCAAGTCACTTACTTTGGGCTTCACAGTCTTCAACACCGCGGTCAAGAAGGTGCTGGTATTGTTTCGAATGATAATGGGAAACTCTATGGTTATCGAAATGTTGGTCTCCTTTCTGAAGTTTTTAAGAATCAATCTGAATTAGATAATTTAACTGGGAATGCGGCTATTGGACATGTTCGGTATGCTACTGCAGGTTCTGCAGATATTCGCAATATTCAGCCTTTTCTTTATAAATTTCATGACGGGCAATTTGCTTTATGCCATAATGGTAATTTGACAAATGCTATTTCTTTAAGGAAAGAATTAGAAAAGCAAGGTGCAATTTTCAATGCCTCCTCAGATACTGAAATTTTGATGCACTTGATTCGTCGAAGCCATAACCCAAGTTTTATGGGGAAGGTAAAAGAAGCTTTAAGCACTGTAAAGGGAGGCTTCGCCTATCTACTGATGACAGAAGATAAATTAATTGCTGCTCTTGACCCTAATGCCTTTCGTCCTTTGTCAATTGGACAAATGCAAAATGGTGCCTGGGTTATTGCCAGTGAGACCTGTGCTTTTGAGGTGGTAGGCGCAAAATGGGTTAGAGATGTTGAACCTGGCGAAGTTATTCTTATAGACGATAGTGGTGTTCAATGTGATCGTTATACTGATGAAACGCAGTTGGCAATTTGTTCGATGGAATATGTCTATTTTGCAAGGCCGGATTCGACTATACATGGTGTTAATGTTCATACGGCTCGAAAAAATATGGGAAAGCGTCTTGCACAAGAATTTAAACAGGATGCTGATATTGTAATTGGTGTCCCAAATTCGTCCTTATCGGCTGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCCGGATTACCAAATGAGATGGGTCTTGTAAAAAATCAGTATACGCAGCGAACCTTTATTCAACCGACACAAGAATTAAGGGAACAAGGTGTTCGTATGAAACTATCAGCGGTATCTGGTGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019818|187551:199657|195525_197073_+|AUP09112.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSEKSGIIDFAKELKNLGWDIISTGGTKVALDDAGVETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDADSHLQAAKDNNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDVTYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTFETRQRLAAKVFRHTAAYDALIAEYFTAQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPTDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKDRPTVVALKHMNPCGIGQADDIETAWDYAYEADPVSIFGGIVVLNREVDAATAEKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAAAGIKAIIQPGGSVRDQESIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH >CP019818|187551:199657|197264_198164_+|AUP09113.1|DBSCAN-SWA MNKWLVKASSLVVLGGMVLSAGSRVLADTYVRPIDNGRITTGFNGYPGHCGVDYAVPTGTIIGAVADGTVKFAGAGANFSWMTDLAGNCVMIQHADGMHSGYAHMSRVVARTGEKVKQGDIIGYVGATGMATGPHLHFEFLPANPNFQNGFHGRINPTSLIANVVTFSGKTQASAPSIKPLQSTPVQNQSSRLKVYRVDELQKVNGVWLVKNNTLTPTGFDWNDNGIPASEIDEVDANGNLTADQVLQKGGYFIFNPKTLKTVEKPIQGTAGLTWAKTRFANGSSVWLRVDNSQELLYK >CP019818|187551:199657|194182_194731_+|AUP09110.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASANGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKAAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLSAYEGRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGIKRK >CP019818|187551:199657|192992_194015_+|AUP09109.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVAHTERAGVMGALGDFGGMFDLSQTGVKEPVLISGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNNPVKLEEVVSGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFAVGVAEKSQLIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVKAALPLIKEVLVNGIAHITGGGFIENVPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADDSVVIK >CP019818|187551:199657|198310_199657_+|AUP09114.1|DBSCAN-SWA MKMNKKVLLTSTMAASLLSVASVQAQETDTTWTARTVSEVKADLVKQDNKSSYTVKYGDTLSVISEAMSIDMNVLAKINNIADINLIYPETTLTVTYDQKSHTATSMKIETPATNAAGQTTATVDLKTNQVSVADQKVSLNTILEGMTPEAATTIVSPMKTYSSAPALKSKEVLAQEQAVSQAAANEQVSPAPVKSITSEVPAAKEEVKPTQTSVSQSTTVSPASVATETPALVAKVAPVRTVAAPRVTSAKVVTPKVETGASPEHISAPAVPVTTTSTATDNKLQATEVKSVPVAQKAPTATPVAQPASTTNAVAAHPENAGLQPHVAAYKEKVASTYGVNEFSTYRAGDPGDHGKGLAVDFIVGTNQALGNEVAQYSTQNMAANNISYVIWQQKFYSNTNSIYGPANTWNAMPDRGGVTANHYDHVHVSFNNNIKKEAIWLLFYMP >CP019818|187551:199657|194753_195506_+|AUP09111.1|DBSCAN-SWA MKLVKNLEIVESIFGDWDETIIWSCVQGIMGEVFVDSLDQPKSSLAKLGRKSSFGFLAGQPTLFLLEVCSGEDIILVPQHKGWSDLIESTYGQNAHSFKRYATKKDTLFERSRLEKFVTQLPNGFELRAIDEKVYNSCLEKEWSQDLVANYATYQYYKKQGIGYVVYYQGNIIAGASSYSTYKNGIEIEVDTHPDFRRRGLATIVAAQLILTCLDKGIYPSWDAHTRTSLNLAEKLGYEFSHEYIAYEID >CP019818|187551:199657|187551_191277_+|AUP09107.1|DBSCAN-SWA MNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDCLLTETEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLLGSDSQVKVNTAQLYLVNKDIAEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFETYQADDFATYKAEQGLAMEVDDFLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMSDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGNVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSIVVRPSDVDTFIEACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGETIVDLERRFLDTNGVRVVVDAKVVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTRTASVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLIATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSVEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEELTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKANFNQFEAIQAQHKITAASAVKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSVEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLGAFEGKLEEVYPTEFEQADALEEVPAVVSDTVIKAKEVIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEAAIADSVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNKKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNSSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQALFASAVKYFTGK >CP019818|187551:199657|191510_192965_+|AUP09108.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHSQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNPSFMGKVKEALSTVKGGFAYLLMTEDKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVIASETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDSGVQCDRYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIASPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHAVDEVCDIIGADSLTYLSIDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
944463 : 954315
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019818|944463:954315|DBSCAN-SWA AATGACTTACACAGAAAATTTTCAAAAATGGTTAGATTTTGAGCAGCTTCCTGACTATCTTCGTCAAGAATTACTATCAATGGATGAAAAAACAAAAGAAGATGCTTTTTACACAAACTTAGAATTTGGTACTGCTGGTATGCGTGGTTATATTGGTGCTGGTACAAATCGTATTAATATTTATGTTGTCCGTCAAGCAACCGAAGGATTGGCAAAATTAATCGAAACTAAGGGAGAGGACGCTAAAAAACGTGGTGTAGCCATTGCTTATGATTCACGCCACTTCTCTCCAGAATTTGCTTTTGAGTCTGCACAGGTCTTGGCACAGCATGGAATTAAATCTTACGTATTTGAAGCTCTTCGTCCAACACCAGAACTCTCTTTTGCTGTTCGCCATTTAAATGCCTATGCTGGTATTATGGTTACTGCAAGCCACAATCCAGCACCTTTCAATGGTTATAAAGTCTATGGACAAGACGGAGGTCAACTACCACCAGCTGATGCTGATGCACTAACAGACTTTATCCGTGCTATTGAAAATCCATTTGCAGTTGAACTTGCTGATTTAGATGAAAGCAAATCAGCGGGTCTTATTCAAGTTATCGGTGAAGATGTTGATATTGAATATCTTAGAGAGGTTAAAGATGTTAATATCAATCAAGATTTAATCAATAACTTTGGAAAAGACATGAAAATTGTCTATACTCCTCTCCACGGAACTGGTGAGATGTTGACACGCCGTGCCCTTGCTCAAGTCGGTTTTGAATCTGTTGTTGTAGTAGAATCACAAGCTAAGGCAGATCCAGACTTTTCTACTGTCAAATCTCCTAACCCTGAAAGCCAAGCTGCCTTTGCTCTTGCTGAAGAACTCGGACGAGAAGTTGATGCAGATGTCTTAGTAGCTACTGATCCTGATGCAGACCGCCTAGGCGTTGAAATTCGCCAACCAGATGGTTCTTATAAAAACCTTTCTGGAAATCAAATTGGAGCGATTATTGCGAAATACATCCTGGAAGCTCATAAAACAGCAGGAACACTTCCAGAAAATGCTGCTCTCGCTAAATCAATCGTATCAACAGAATTAGTAACAAAAATTGCCGAAAGTTATGGCGCTACAATGTTTAACGTTTTAACTGGATTCAAATTCATCGCTGAGAAAATTCAAGAGTTTGAAGAAAAACATAACCACACCTATATGTTTGGTTTTGAGGAAAGCTTCGGATACCTTATTAAACCATTTGTCCGTGATAAAGACGCTATTCAAGCAGTTCTTTTGGTTGCTGAGATCGCAGCTTATTACCGTTCGCGTGGATTAACACTTGCAGATGGTATTGATGAAATTTACAAAGAATATGGTTTTTTTGCTGAAAAAACGATTTCAGTAACACTTTCAGGTGTAGATGGAGCTGCTGAAATTAAGAAGATTATGGACAAATTCCGTGAAAATGGTCCAAAACAATTTAACAATACTGATATTGTATTATTAGAAGATTTCCAAAAACAAACCGCTACTAAAAATGATGGAACAATATCTAACTTAACAACTCCTCCAAGTAATGTTTTGAAGTACACATTAGCTGATGATTCATGGATTGCAGTTCGCCCTTCAGGAACTGAACCAAAAATCAAGTTCTATATTGCCACGGTCGGTAATGATTTAGCAGATGCAGAAACAAAAATCGCCAATATTGAAAAAGAGATTACAACATTTGTAAATTAATAAAAAAAGCTAGGAAGGCACTGCACCCCATTAGTGGGACAGAAGAAAAACACTCTTATGAAGCCAATTTCCTGAATTGAACAGGAGATTGGTTTTTTAAATGACGTTGAATTCTAGTTTCATTATAAAATGTAATGTAATTTTTAACAATATTTGTTATACTATCTTTGTTGTATTTTCTCCTATCATGGAGATAAAAGGTTTCAGTCTTTAGGACGGAGTGAAACCATTCAATACAGGCGTTATCTGCAGGTGTTCCTTTTCGGGACATTGAGCGGATAATGCCTTTTTCCGTGCAAGCTTGATAGTAAGCCTTAGAAGTATACACTGAGCCTTGATCGCTGTGTAAGACTGCCCCTTTAGGTAATTTTAACTGATTAAGGGTGTCTATTACAAAATCTGTGTCCTGACAATCTGAGATAGTATAAGCTAAAATCTCTCGGTTATAGAGGTCCATAATTGAAGAGAGATACAATTTACAGTTACCGAAATATAGATAAGTAATATCTGTTACAAGCTTTTCCAATGGCTTATCGGCATGGAAATCCCGATTCAATTTGTTATCTGTTAAATAATAAGTTTTACCAAGATTGGGCGATTTCTTTGGACGTGTCCGACAAAGCCAACCATTGTCTTTCATGATACGATAGACTTTCTTTGCATTAACAGTCAATTCGTGGATCTTTTTGAGCAATCGTGTAATGGTACGATATCCATAAATAAAGTGATTCTCCATGCAGAGCTGTTCAATTAATTCAATGACTTCATCTGTTTCTTGTGGTTTCTCGTACTTCTTTTTCCAACGATAATAGGTCGATCGCTTAACATCAAAACAGTCTAGAATGACAGAAATCGGGTAGTTGTTTTTATAGTCTTCCACAAGCTTGATAAGACTTACTTTATCGATTTCCTTATCAAGCCTCGATACTTTTTTAAGAGGTCAACCTGTAATTGTAACTGTTCCACTTCAGACAGATGTTCCAAGCCTTTACCATAGGTATATTGCTTGCCAACACCTTGATGGAAACGATAAAGTTCCTCATTTTCGTGCCATTTTACCCAAGTATAGATTTGACTATCATTCTTGATACCTAGAGTCTCCATAATAAATCTGTTAGACTTGCCTGCTTTTTTCATCTCGATGCAGGCCAACTTCGTTTCCCATGAATATGCTTTTTTAACCATAATAAAACACTCCTGATTCTATTTTACTAGAATTCTCCAGGAGTGTTTTTCTTGTGTCTCACTTTAGGGAGACAGTGCCGAACTTACTCCTAGCTTTTTTTATATCTATCTAACGATGTTCTATTATTTTCAATCATGAAATATAACTGCAATTAACTTCACGATCAAATAATAGAGCAGACTTACAATTAACCACATTATCCCAATAACTGCAACTAAACCTATTAAAACAGATAATACCGTATTCTTAGTTGCTAGTTGGTTACTGATAAACCATGAAACTGCAAAAATAAATATCAGTAATAATAGTTGAAGCCTTTTTTTCATATAATTCCTCTTACTACTTTTGTGCATTTTGCATTTGATAATAAATACCTTTTTGAGCCATTAATTCAGAGTGGTTACCCACTTCTACAATTTCACCAGATACCATAACTAAAATAATATCTGCTGTTTGAATGGTAGATAAGCGATGTGCAATAATAAAGCTTGTTCTCCCCTTCATCAACATTTGGAATGCTTCTTGAAATAGACGATGTCGCCTCATCTAATATCAATATTCTAGGTAATTTAAGAAAAATACGAGCAATTGTCAATAGCTGACATTGCCCCTGTGATAACGAATCTCCAGCATCTTCTAAATACGTATCATATCCATTCGGTAATTGTTTGATAAAGAAATCTGCATTAGCTGCTTTTGCAGCCTCTATCACTTCTTCACGGCTAGCTTTAGGATTGGCATATGCAATGTTATCGTGAATCGTAGCACTTTTTAACCACGTTTCTTGTAATACCATTCCAATTTCTTGCCTTAATTGTGATGGCTCATAATCAGTAATAGGCTTACCATCTAAAAGGATATTTCCCCCGTCAACTTCATAGAAACGCATTAATAAATTGATTAAAGTAGACTTCCCAGCACCTGTTGGTCCTACAATAGCGACCTTAGCTCCTGCTGGAATGTGTAAATTAATACCATTCAATAGTGGTTTTGATTTATTATAACCAAAAACAATGTTTTTAAAATCGATTTGACCTTTGACCGTTGATGAATCAAGTTTTTCTGTACCTGTTATATTTGGTGACGATTCTTCTAAAATAGAGTAAAGGCGTTCTGCACAAGCCAGAGTACTTTGCATCTCAGACAGGACGGAAGAGATGTCATTAAATGGCTTAGTATATTGATTGACATAATTTAAGAAAGTGATTAATTGACCAACACTAAAAGCCCCTGACATAATACGAAGGGCACCAATCCCTGCTAAGAAGCCATAAATCAAACTATTGATAATTGCTCCGTATCGGTAGTCACACGACTAATCAAGTCACCTATGCCACGTTTATCAAGGTAAGCTATAGGCAATAGATTCAACTTTTCCATTACAACCTTTCTTAAAGAAGCAACATAATGAAAAATTAAGCGGTTATAGAGCAGAGGATTAATCCATTGAATAATAGTATTTGCTAAAATAACTGCAATCATCTTCCACATTATAGGTAACAATAATATCATAGAATGAGGCGATAATACAACGTCTACCGCTTGTCCAATTAGAACAGGCAAATAAACAGTGAGGCAAACTTGTACAACCGTCCCTAATAATGCCATTCCTACTAAGCTTTTTTTAGAAAGAAGATCTTGAACAAGCTTTTTTTGTATCTTTTTAGGATGACTTGCTTTCATTTACTCCTCCTCCTTAAAATTTTGTGAATGGTAAATGGACTTATAAACTTTGTTATGAGCTAATAAAGATTGATGATTATCAAAACCAACTTGTTTCCCCTTATCAAGGAGTAAGATTCTATCTGCATTTTGTATACTATTAATTCTCTGTGATACAATAATAAGATTAGTTTGGTTGAAATGTTTAGTTATAGCTTTAAATAAACGAGCTTCTGTTAAATAATCCAATGCAGATGTTGCATCGTCTAAAATCAAAAATGGTATCTTATCTTGAACTAAAGCTCTTGCAATCGTCAACCTTTGCCTTTGACCACCAGAGAAATTCCTACCAAAACTCTCTACAGAGGCATCAAGTTGACCATCTTTTTCTTTTACAAAATCACTAGCTTGTGCTATTTCTAAAGCAGTCCAAAGTTTTTCCTCACTAACTTTACCAAGTCCCAAAGAAAGGTTAGAACGAATAGTTCCTTTAAACAACTGAGCATTTTGAGGAACAACTCTTACCAGGGTACGCCAATTTGAAATTGTATCTGGACTTTTTCCCTGATGATATATATCAATATCCCCTTCTTGCACTTTATAAATATGAAGCAGTAAATTAACCAAGGTTGATTTCCCAGAGCCAGTTCCACCAATTATCCCTAAAGTTTCTCCTACATTCATAGAAAAAGTAATATCAGATAAAGCTTTTTCAGAGGAGTTTGGATAAGAAAATGCTATTTCTTGCACTTCTAAAGCCTTATTCGAATATTTTGGCTCAAGTTTGTCATCAATTATTTCAGACGGTCTTTCAAAAACGGCTATAATTCGCTTAGCACTGATATAACTTTGGTTCAGTGATGTCACCAACATTGTCATTTTTAACAATTCAACAAGAATTTGCAATAAGTAATTAATTAAAGCAACCAACATTCCTTGTGATAAAAGATGATTAGCTATATTTAAATTACCACGCCAAATAATCACAACCAAAGTGATATTAACAACTAGAAATGTTAGAGGCGTTACTAAACTAGAAAGCCTACCTGCTTTTAATTGTAAATTCGTATAATGATAATTGATATCATTAAATGCTTCACTCTCTCTATCTACTTGATTAAAGGCACGGATAACTCGTACACCTTGAAGTTGTTGCCTAGTCAACTTTACCAAATAATCGGTTGAAGTTCTGATTTTAAGGTAAATAGGATTTAATAGTCGAGACATTACAAAAACAATGATAAATAACGTGACAACCATTACCAAGAACCAAATAGTCAATGAGGGGCTAATGGAAAAAGCCATAATTATGGCACCAAAAACAATAATCGGAGCCCTCAAAAATAAACGTAAAAATTGATTTAAACCAGTTTGGATTTGAAATGTATCAGCAGTCAAACGAGTAATCAAACTAGCAGTTCCCAATTCATCTCTGTCTTTTTTACCCAGTGACATGACTTTTTGATAGAGATCCTCTGTCAATTGTCTCGTATAACCAACTGCAGCTTTTGAAGAATAATATTGAGCAGTTATCGCTACTACAACACCCACCGCAGCCAAAAAGAAAATCAATCCAATTTGCAACAGTAAACTACTTCTATCCCCTCGTGGAATGGTCTCGTCAATCATTTTTGCAATAACGATTGGTACCAAAAGTTCAAAAGAGGCTTCTAATAATTTGAAAAGGGGTCCAAAGATAGTTTCTTTGATATACCCCTTAAAATAATAAGTTAGTCTTTTCATACTTACCCTTCTTAAAACAACTCCATTATTTTTATCAAATAAAGGTTGAATTGAACTTCACGTGAGTAGTAAATATTACCACCATTTTTATAGAGCTTCCCTCCTGAAATTAAGGCGAGAGGATGATAGTAAAAGTAAGTGTCCCCGTTATAATTTCCTAGGCTGGGAGCTACAACATTTTTAGAGTAATTTTTGGCCAACTCAATGGAATTTTCACCCCCATGATCCGCTACATAATCAATATAAGAAGAACCAAAATTATATGCTTGGACAGCAGTCCATACATCAACCTTAGCTTTTTTAGCTTGACTTATATTTTGTGACAACAGAGTGACGCCATGTTTAATACTGGTGTGACTATCCGTAATACTGTTCGTAGTTCCACTGATACTTTCACTTGATTGCATCACATCTATAGCATCTCCCTTAGTTTCAGTATAAATCATAGATAATACTAAGTGCACATTAGCCTCTGAACCATTCTCTGCAAGAGTATTCTGCACTAAATCATGATATTGAAGCACTTTTTTAACATTTTCATGGATGATAACCAGACGGTACCCAATGAAAATAATAATAATTAATGCTATCAAACGTTTTTAAAAATTTAAACATATTATTTATTTTGAATATCCTGTATGTTTTTGATTAGTATTGAGTATGTACCATCAGGGTTTTGGATAAATTCAACTGATTCGGCATCTTGGTAGACATTGTTGGGTACAATCAATTCAATACCATTTGAAAGAGATAGCTTCTAATTCTCTAACTTCTTAATTTGACGGGAATGATCAATATCACTTACTTGAACAGGTCCAGGTATTGCGTCTTTCAATTCATCAACAAAAGTCAGCCTGGCTGTTAAATTATCATCAAATAATTGATCTGCTAATTTTTCTGGAGACAATTCTTGCTCTTCTTCTAAATTCTTATAAATAGCCGATTTCATTTTTGATTGGAAAGAAAAATCATCTTTGTTGAAATTTTCAGCAATTTTTTGAGCTGTCTGTTCAACCATTTTGATAGATTTTTTAACAGACTGTTCTGGTTCTACTTGTAATAAATTTTCAGAAAAATAATTAGCAAATGAACCATTGTGTTTGATACGCTTTTCAATTAAATAGTATTGCTTTGATGACTTGTTAACAACCAAAGCTTCATCTGGAGTTTGAGCAGCACTTGGAAGGTTATTCTGTGTTATTGTAATTGGCTGCTCTTGATTTTCAGAAACATGAGCAAATTGTTCCTTTAATGAGATTCGAAGGAAAGCAAAATGTTCCATTCCATCCTTGTCAAATTGAATAAAAACTAAGTCATTCGTTTTTTGATCTTCCGATATGACAAACTCTTCTTTCCAAAGTTGCGCAATTTGACAGGAAGAAACATATAAATCATCTTGTAAATGACTCATAAATACATTATCCTCTCCAAAATAGCCACGCTTAGCTTCATCAGAAAAAACTTTACTTAATTTTTTACGAAAGTAGTCATCAATCCTTGGAGTTAGGGTTAACGGAGTATCTGATAGCACTAACTCTGTGTCGTTAGGAGAAAACTGATGTATAATAATCTGTTTGATATAAAAATCCATCATAACATTAATTCTCATACAAGGGGAAAGCGTCCGTTAATGATTTAATTTCTTGACGAACTTCTGTGAGGACATCTTGATTTTCATGATTTTTGAGTGCCTTAATCATTAATTCAGCGATTCTTCGAGATTCTTCAACTCCCATTCCTCGACTAGTAATCGCTGGAGTACCAATTCGAATACCTGATGTTTTAAATGGTGATAGTCGCTCAAACGGTATAGAGTTCTTGTTAAGGGTGATATTGACTTCTTCAAGAACATTTTGTGCCTTTTTGCCATTCTCAATAACTTTTGTGACGTCTACTAAGAACAAATGATTATCAGTACCATCAGAAATCAAATGAAAGTCATCATCTTCTTTAAAAACTTTAGCCATGGCTTGAGCATTTTTAATAATATCCTCACCGTATATTTTAAAGGAAGGATCTAGGGCTTCTTTCAAAGCTACAGCTTTTGCAGCAATTACATGTTCTAATGGTCCACCTTGGAGTCCTGGAAAGACTGCAGAATTAATTTTTTAGCAATTGCTTCATCATTGGTTAAAATCAAACCACCTCTAGGTCCACGTAGAGTCTTATGGGTTGTCGTTGTCGTTACATGAGCATAAGAAATAGGACTAGGGTGATGACCAGAAGCAACTAAACCTGCAATGTGAGCCATATCAACCATTAAGTAAGCATCTACTGCGTCTGCTATTTGACGAAATTTTTCAAAATCAATAATGCGAGAATAGGCCGACGCCCCTGCAACAATTAATTTAGGTTGCGTTTCCTGTGCTATTTTCAAAATGTTATCATAGTCTAGCATCTCCGTCTTAGGATCAACAGAGTAAGAAACAAAATGATAAGTTTTTCCTGAGAAGCTAACTGAAGCGCCATGTGTTAAGTGCCCACCTGCTGCTAAGTCCATCCCTAAGACAGTATCTCCTGGCTCGATTAAAGCCATGTAAGCTGCTGCATTAGCCTGACTACCAGAATGTGGTTGAACATTAGCAAACTCAGCATTAAATAACGTCTTAGCTCGTTCTATAGCTAAACTTTCAACTACATCAACACAATCTGTTCCTCCATAATAACGATGACTAGGATACCCTTCGGCATATTTATTTGTCAAAACAGAACCTTGTGCTGCCATAACAGCTTTTGAAACAACGTTCTCTGATGCAATTAATTCAATATTATTTTGTTGGCGAATTTCCTCATCATGAATAGCCTGCCAAAGTTCTTGGTCAAATTCTTTAAAATTGTCTTTATCAAAAATCATTTTTTACTCCTTAAGCTCGTTATAACTTTTAAATAATGGTTTCAATCATTATATTTATCACATTTTTACTATTAGTTGCAAGATGATTAAATTAATTTTCAAAAATTAATTCAGATATCGTAGCCGTTAGTACCTCTTGCGTGATTGCACCTTGCCTTAAAATCTTAACTCTATCACCAGACAAATCAATAATAGTAGAATCCACACCTGTCAATGCTTTATCATCTTCAATACCTAAAACTTGATGATTAAACTGTTTTTGAATTTCTGAGAATACACGACCACTATCACATCCAGAAATATTAGCAGAAGGACCAATCAATGGACCATGGTTAGCAATCATATCAAGGGTTACAGGGTGCTTAGGCATCCGAAATCCTACGCTTGATAACCCAGAATTGATCCAATGCGGAACTTCTTGTGAAGCTTCCAAAATAATGGTTAGCGGTCCTGGTAAAAAGGCATCGTACAATTGCTTCAAATAGGTCGGTTGATTTTTAGAATATTTTAAAACAGTCTCAAAATCACATATATTTAAGTTCATAGCCTTATCACGAGGCCTTTTTTTAAGCTCATAGACGTGGTTCACAGCTTCTTCACTCAAAGCTTTGGCAAAGATTCCGTAGACTGTTTCTGTTGGCATAATAACTGCGCCATGATCCTCTAAAATCTGTCCCAAATCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019818|944463:954315|951530_952367_-|AUP09773.1|DBSCAN-SWA MMDFYIKQIIIHQFSPNDTELVLSDTPLTLTPRIDDYFRKKLSKVFSDEAKRGYFGEDNVFMSHLQDDLYVSSCQIAQLWKEEFVISEDQKTNDLVFIQFDKDGMEHFAFLRISLKEQFAHVSENQEQPITITQNNLPSAAQTPDEALVVNKSSKQYYLIEKRIKHNGSFANYFSENLLQVEPEQSVKKSIKMVEQTAQKIAENFNKDDFSFQSKMKSAIYKNLEEEQELSPEKLADQLFDDNLTARLTFVDELKDAIPGPVQVSDIDHSRQIKKLEN >CP019818|944463:954315|946237_947062_-|AUP09768.1|DBSCAN-SWA MEDYKNNYPISVILDCFDVKRSTYYRWKKKYEKPQETDEVIELIEQLCMENHFIYGYRTITRLLKKIHELTVNAKKVYRIMKDNGWLCRTRPKKSPNLGKTYYLTDNKLNRDFHADKPLEKLVTDITYLYFGNCKLYLSSIMDLYNREILAYTISDCQDTDFVIDTLNQLKLPKGAVLHSDQGSVYTSKAYYQACTEKGIIRSMSRKGTPADNACIEWFHSVLKTETFYLHDRRKYNKDSITNIVKNYITFYNETRIQRHLKNQSPVQFRKLAS >CP019818|944463:954315|947076_947367_-|AUP09769.1|DBSCAN-SWA MVKKAYSWETKLACIEMKKAGKSNRFIMETLGIKNDSQIYTWVKWHENEELYRFHQGVGKQYTYGKGLEHLSEVEQLQLQVDLLKKYRGLIRKSIK >CP019818|944463:954315|949051_950773_-|AUP09771.1|DBSCAN-SWA MKRLTYYFKGYIKETIFGPLFKLLEASFELLVPIVIAKMIDETIPRGDRSSLLLQIGLIFFLAAVGVVVAITAQYYSSKAAVGYTRQLTEDLYQKVMSLGKKDRDELGTASLITRLTADTFQIQTGLNQFLRLFLRAPIIVFGAIIMAFSISPSLTIWFLVMVVTLFIIVFVMSRLLNPIYLKIRTSTDYLVKLTRQQLQGVRVIRAFNQVDRESEAFNDINYHYTNLQLKAGRLSSLVTPLTFLVVNITLVVIIWRGNLNIANHLLSQGMLVALINYLLQILVELLKMTMLVTSLNQSYISAKRIIAVFERPSEIIDDKLEPKYSNKALEVQEIAFSYPNSSEKALSDITFSMNVGETLGIIGGTGSGKSTLVNLLLHIYKVQEGDIDIYHQGKSPDTISNWRTLVRVVPQNAQLFKGTIRSNLSLGLGKVSEEKLWTALEIAQASDFVKEKDGQLDASVESFGRNFSGGQRQRLTIARALVQDKIPFLILDDATSALDYLTEARLFKAITKHFNQTNLIIVSQRINSIQNADRILLLDKGKQVGFDNHQSLLAHNKVYKSIYHSQNFKEEE >CP019818|944463:954315|950784_951366_-|AUP09772.1|DBSCAN-SWA MIALIIIIFIGYRLVIIHENVKKVLQYHDLVQNTLAENGSEANVHLVLSMIYTETKGDAIDVMQSSESISGTTNSITDSHTSIKHGVTLLSQNISQAKKAKVDVWTAVQAYNFGSSYIDYVADHGGENSIELAKNYSKNVVAPSLGNYNGDTYFYYHPLALISGGKLYKNGGNIYYSREVQFNLYLIKIMELF >CP019818|944463:954315|947496_947694_-|AUP09770.1|DBSCAN-SWA MKKRLQLLLLIFIFAVSWFISNQLATKNTVLSVLIGLVAVIGIMWLIVSLLYYLIVKLIAVIFHD >CP019818|944463:954315|944463_946182_+|AUP09767.1|DBSCAN-SWA MTYTENFQKWLDFEQLPDYLRQELLSMDEKTKEDAFYTNLEFGTAGMRGYIGAGTNRINIYVVRQATEGLAKLIETKGEDAKKRGVAIAYDSRHFSPEFAFESAQVLAQHGIKSYVFEALRPTPELSFAVRHLNAYAGIMVTASHNPAPFNGYKVYGQDGGQLPPADADALTDFIRAIENPFAVELADLDESKSAGLIQVIGEDVDIEYLREVKDVNINQDLINNFGKDMKIVYTPLHGTGEMLTRRALAQVGFESVVVVESQAKADPDFSTVKSPNPESQAAFALAEELGREVDADVLVATDPDADRLGVEIRQPDGSYKNLSGNQIGAIIAKYILEAHKTAGTLPENAALAKSIVSTELVTKIAESYGATMFNVLTGFKFIAEKIQEFEEKHNHTYMFGFEESFGYLIKPFVRDKDAIQAVLLVAEIAAYYRSRGLTLADGIDEIYKEYGFFAEKTISVTLSGVDGAAEIKKIMDKFRENGPKQFNNTDIVLLEDFQKQTATKNDGTISNLTTPPSNVLKYTLADDSWIAVRPSGTEPKIKFYIATVGNDLADAETKIANIEKEITTFVN >CP019818|944463:954315|953718_954315_-|AUP09774.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNDLGQILEDHGAVIMPTETVYGIFAKALSEEAVNHVYELKKRPRDKAMNLNICDFETVLKYSKNQPTYLKQLYDAFLPGPLTIILEASQEVPHWINSGLSSVGFRMPKHPVTLDMIANHGPLIGPSANISGCDSGRVFSEIQKQFNHQVLGIEDDKALTGVDSTIIDLSGDRVKILRQGAITQEVLTATISELIFEN |
8 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1349389 : 1360067
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019818|1349389:1360067|DBSCAN-SWA TATGAAACTCATTTCATGGAATATTGATTCCCTCAATGCGGCATTAACAAGTGAATCAACACGTGCTTTAATGTCACGCCAAGTTATTGATACTTTAGTTGCTGAAGATGCCGACATCATTGCGATTCAAGAAACTAAACTGTCTGCCAAAGGGCCTACTAAAAAACATTTGGAAGTACTTGAAACTTACTTCCCAGCATATGATTTGGTTTGGCGATCATCAGTCGAACCTGCTCGTAAGGGCTATGCTGGTACAATGTTTTTATATCGTAAAGGGTTAAATCCTATTGTTAGCTTCCCTGAAATCGATGCTCCTACTACAATGGATAATGAAGGTCGCATTATTACTCTCGAATTGGAAAACTGCTATATCACACAGGTCTATACTCCAAATGCAGGTGATGGCCTAAAGCGCTTAGCTGACCGTCAAATATGGGATATTAAATATGCTGAGTATTTAGCAACATTGGATAGTCAAAAACTGTTCTAGCAACAGGTGACTATAACGTAGCCCACAAGGAAATAGACCTAGCTAATCCTAGCAGTAATCGTCGTTCTGCTGGATTCACAGATGAAGAGCGCCAAGGCTTTACAAATCTACTAGCTAAAGGTTTTACAGATACTTTTCGTTACCTTCATGGCGATGTTCCAAATGTTTATAGCTGGTGGGCACAACGAAGTCGTACATCCAAAATCAACAATACAGGGTGGAGAATTGATTATTGGCTAACAAGTAACCGTGTCGCAGATAAAATTACCAAGTCAGAAATGATTCATTCTGGTGATCGTCAAGATCATACACCAATTATTTTGGAGATTGAACTATAAACCAAAAAAGATGATTGAGTTATAACTCAATCATCTTTTTATACTAAGTTGAGGTCTTTATACTTAGTACGGTAGCCAATCTGAAGAATTTTATTATCTTTAACTAGCAATGGACGCTTAATAAGCATCCCATCCGATGCCAATAAGTCCAAAGCTTGGTCAAGAGTTAAATCATCAAATTTATCTTTTAAGCCTAATTCTCTGTAAGAATTTCCTGAAGTATTGAAAAACTTTTTAAGGTCATAAGGCGAATTCTCTAACAATTCTTTTAATAACGAAGCTTTGGGAGGATTGCTTTTTATATCAATAGCTTCAAAAGTTAAGCCGAGTTCAGTTAACTCTTTTTTGCTGAACGACAAGTGGTACATTTGGGGTATTCATAAAACGTATACATATTATTTCTCCTTTTCGTATTCTAATAACCAAGATTTTCTTTCTAAGCCACCAGCATAACCAGTTAATTGACCATATCTTCCTAAAACACGGTGACAAGGTATGATTAGAGAAATAGGATTTTTACCTATTGCTCCTCCAACAGCCTGTGCAGATTGACAATTTAGCTCTTTCGCTAATTCTCCATAAGTTTTTGTATCTCCAAAAGGGATTTTCTGTAATTCCTGCCATACTCTCATCTGAAATGCTGTCCCTCTCAATGATAATGGAATACTAGGTAAATTTTGCTGTGAAAAATAAGCATCTAACCACTTCTTACCAAGTAAAGTATAGGAATTTGACATATTAACAATTTCCTCTTGGTTGACTGCTAGCATATCATATTTTTGCCCAACAAAATAAAGCCCTGATAAACCTAGATTGTCTGCTAGAAGGCGAATTTCTCCAAGAGGGGACTGATAGAATTCTTGATATAACATATGATAAGCATAACTTAAAAAGCCATGAAAAGCAATTCATGACTTTTTTTAGTTCTTTATTGTTGTTTTGCAATTAAACGTACACGGACGATATTCTCATCACCTTCAAATTCTTCAATTAAAGTAGAAATCTTGTTATTATCCGTTTCATCTAAATCTATTAGTGTGTAGGCGTAGTCACCCTTTGAACGGTTAATAATGTTATCAATATTTATACCTAACTCTGATACAGCAGTTGAAATTTTAGCCACAATGTTAGGAACATTCTTGTTAATTAAAGTAATACGAAATGGTGCGGTTTGAATTTGATGTACATTGGGGAAATTAACTGAATTAGTGATTTCTCCTGTCTCCATAAAACAACGAATGGTTTGACTTGCCATAATAGCACAATTTAGCTCTGCCTCATCTGTTGATCCGCCTACATGAGGAAAGACTGTAATTCCTTTTTGGTTTAATAATTCTTTGTCTCCAAAATCAGTAATATAGCGCTTGACAACACCAGTTTCTATCGCTTCAAATAGCTCTTGGTTATTGACTAATTCTGCACGAGCAAAGTTGATAATCGTCGTTCCTTTTTTCATGATTGAAAAAGCTTCCGCATCAAAAGTATGCTTAGTTTCATTTGTTAAGGGAACATGAATTGTGATATAGTCACAAGTTTCAAAAATATCCTTAATCTCTTTAACCCTTTGAACATGGCTTGAAATATTCCAAGCTGTTTCAATTGAAACATAGGGATCATAACCAAGAACTGTCATTCCTAAGCGTCTAGCATCATTCGCAATTCTAGCTCCAATGGCACCAAGGCCGATAACTCCCAATTTTTTTCCTGCAATTTCATTACCAGCAAAAGCTTTCTTTCCTGCTTCAATTTGTTTGGGAATATCTGTTCCAGTTAGAGTATTAACCCATCGGTTAGCTCCTAAATAATCACGAGCTGAAAGTAATAAGGCAGCAATGACCGCTTCTTTTACAGCATTAGCATTTGCACCTGGGGTATTAAAGACGACTATTCCCTGTGCACTTGCCTCTTCAATAGGAATATTATTTGTTCCTGCACCCGCCCTAGCAATAGCTTTGAGGTTACTTGGGAAATCTTGATTATGCAAATTTTGACTACGAATAATATAGGCATCAGGATTTTCTGACATATCCCCATCAATCTGGAAACGATTCCCTAACTCTTGTAAACCAATTTGATTAATATTATTAAATGTTTTGACACTAAAAACCATTCTTTTTCACTAAGGTTATCTCTTTAGTCATCATTGACTAAAATAACCCCTTTCTTTTTTCTTACATGGGATTTCTTTCATCAATCTCACGATAGATGCTCGTTTCTCCCTTTTCTTTTATCTTCTGATAAGCCAATCGTACCCCATCTAGAGGTACTTTACCACAATATTGATAGCCTAATTTATTTAGAATATGCTGCATAGTGACATTTTTTTCATGAGTATCGCAACGAAAATCAGGTCCTTTGTGACCTTCAATTAACCCTTGAAGGAATGTCTGTGCTAGTCCTCTACCACGAAATTGATTTGAGATAGCAATACGATGAAATGTAAGATAGCGATGGTTATCATGGAGCCATTTTCCCTCATAAATAGCATCATAAACCTCTTCATGACCATCAATGACAGCCGCATAAGTCGCTAGCATCCCATCTTCAATACCAACCCAAGCATAACCGTTCAAGATATCATCAATAATATCGTTACGATTAGGGTATCCATCTTCTTTTTGCCATTGATCACTTCCTGTTTTAGCAATTTCGGCACGCGCTTCCTCAATAAGAAGCATAATTTGGTCAATTTCATTTGGAAAAGCTAATCTGATTTGCATTATATTACCCACTTTTATATATTATAGACTATAATAACGGTTTAATTTTCTTTCGTGATAACATTTACTATGCATTTTCTGCTTCAAATGTTTTCATAAAATCAATTAATTCGATGACACCTTGTTTAGGAAAGGCATTATAAAGGCTAGCCCTCATACCACCTACCGAACGATGCCCTTTAATATTTTTAAATCCACGTTCTGTCGCTTCCTTTACAAATTTTTCATCTAAATCTTTATTAATAGTTATGAAAGGAATGTTACATAGAGAACGACTCTTTTTATCTCTGACAGGATTACTATAAAATTCTGAGGAATCAATATAATCATAGAGAAGTCCTGATTTTTCACGGTTAGCTTTTTCCATAGCATCAACACCACCTAGACTTTTCACCCATTCAAAGACTAATTTAGCAATGTAAATACTGTAAGCAGGCGGCGTATTATAAAGAGAACCAGCATCTGACTGAATCTTATAATCCAACATTGATGATAAAGTTGGTTCCTCATTAATCATATCTTCACGGATAATAACTACCATTACACCAGCAGGTCCAATATTTTTTTGAGCTCCTGCATAAATCATTGCAAAATCTTCTACTTTATATTTTACAGCTAAGATATTAGAAGACATATCCGCAATAACAGGCACTCCATTAGTTTTAGGAGTATCATAAAGCGATGTTCCTTCAATGGTATTATTTGTTGTCACATGAACATAGGCAGCTTCAGGATCAATCTCTTTTTCATCAAACTCTGGAATATAATCATAAACTGATTCTTCTGATGAGGCTAATAGAATTGGTTCAAAAGGAATTGTTTTTGATAGTTTTACAGCCTCTGTATAAGCTTTTTTCCCCCACGAACCAGCAACATGATAGTAAGCTTTACGCCCTCTGGCAATATTCAAGGGAATCATACTAAACTGTAAGGATGCACCACCTTGTAAAAAGATTACTTTATAATTATCCGGAATTCCCATCAAATCTCTTAAGTAACGCTCAGCACCTTTGATAATATCATCAAACTCTTTGGAGCGGTGCGATACCTCCAAAACACTCATACTGGACCCTTGATAATTAAGGAGTTCAGATTGGGCTTTTACAAGCACTGGTTTTGGTAAGACTGCAGGACCTGCAGAAAAATTATAAATTGTCATATAACACCTCCATATAATAGTGTAAGATTATAGCACAGTATTTTGAATATTGTAAAGATTTTTTTGATTAATTTTGCTTTTTATTCGTGATATAATGGTAAAGGCGAACAATCAAGTTTAAAGGAGTAATTTATGATTTTGAGGGAATTTTGTGCAGAGAATTTAACAGACTTAACCAGATTAGATAAAGCTATTATTTCACGTGTCGAGCTTTGTGATAACCTTGCTGCTGGAGGCACTACTCCTAGCTACGGTGTTATCAAAGAAGCTAATCAATATTTACATGAAAAAGGTATTAGTGTCGCTGTTATGATTCGTCCCCGTGGAGGAAATTTTGTATACAATGATTTAGAATTACGTATTATGGAAGAGGATATCCTACGTGCTGTTGAGTTAGAATCAGATGCTCTTGTTTTGGGAATATTAACTTCAAATAATCATATTGATACTGAAGCCATTGAACAACTTCTACCTGCTACCCAAGGTTTGCCACTTGTTTTTCATATGGCATTTGATGTTATCCCGAAATCTGACCAAAAAAAATCAATAGATCAATTAGTTGCTTTAGGCTTTACAAGGATTCTCCTACATGGTTCATCTAATGGCGAACCAATTATAGAAAATATCAAACATATCAAAGCATTAGTTGAATATGCTAATAATCGTATTGAAATTATGGTTGGCGGCGGTGTGACTGCTGAAAACTATCAATATATTTGCCAAGAAACTGGGGTTAAACAAGCCCATGGTACTAGAATAACTCAATAAAAAATTCGAAACAGGGCTATAAGTTTCTTTAGTATATTTACTACTAAGTTCTTTCATGTTTTGTAAAACCTGAAAGAACCGGAATAAGAGCATACCATCTTTTATAACCTGCTCTCAGAAATAAAATCCAATTTGTAATGGTATTCAAAAGAGCTGAAATTAAAAATCTTAAGGAAATTGGAAGCACCTTACTTCTTTATTCCAATAGCTAAATCGGAGATTATAAATCATGGAAACTAGCATAGAGTTCTTGTCTATTGAGATTAAGTTCTTTTGCTACTTTTTTATCGCTTGATTAGTTTTATCACCATTAGCGATATATTCTTTTACTAATACTAGTGGATCTTGTTGGCTACTGTCTTTCACTCGCTCAGTATCTCTCTTACCATCAACAATAATTAAGCATTCACCTTTGAGAGGGACTTTTTCAATATGCCATAAAAGTTGACTAATGGTTCCTCTTTGATACTCTTCATAGAGTTTCGTCAATTCGCGTACTAAAACAACTTGGCGATCTCCGTAAATCTCTTTCATGTGTTTTAGCGTATCAGAGACTCGAAACGGTGACTCATAAAAGATTTGTGTTTCAGGGTAATCTTTCTTTGTTTCAAAAAAAGTTATTTGTTGACCTTTCTTACGCGGTAAGAAGCCATAAAAAATATGAGGTTGTGGAGCTAAACCTGAAGCGATGAGAGCAGTAATACCAGCGCTAGCTCCTGGTATAGATACGACCGGGATATCCCCTTCAATAGCAGCCTTGACAAGGTCATGTCCTGGGTCAGAAATAGAGGGCATTCCTGCATCAGATACTTGGGCTAAAGATCTCCCTTCTTTTAACAAATCAATTAACCCAGAGATTTTATCGTAAGCATTGTGTTCGTGAAAACTAATTTGTTTAGTAGTAATATCAAAGTGCTTGAGTAAAAGTCCCGTATTTCGTGTATCCTCTGCACAAATAAAATCAACTTCTCTTAAAATCCTAATGGCACGAAAAGTCATATCATCTAGATTACCAATTGGAGTTGGGACTAGATAGAGTGTCCCGTAATGTGTATTTGATTTAAAACTTTTTTGAACTTGCATTTCCATCAATCTCTATATAATAATTCAATACAAAAAGCACATTCTTCGTCATTTTCACGACGTTGACCATAGAAAGTATTACAAATGTGAAAGCCATCATTGTAAATTCCTTCGAGTAGTTCTCTTCCTTGTTTAGAATTTTTAACTGCTGTTTCTGTTTCTGCTTCAATAACGCTCAGACGCTCACGAAGTTTACCATTTTCAATGCGTAGAACAGTATTCTCCTCCAATAATTTTTGGATTTGTTTTTTCATAGTCTCAATTTCAGACAACCCAACTAATAAATTTTGTGAAAAATCATCAAAGGCATCAAACAAGTCTTTTTTATCCATTCACTCTTCCTCTCTGCGCGTATTATTTTCTAAGAAAGCACCATATATTCTAAACTATTTTGAAAACTAACATTGCTCTTCCACATTTGCTGAGCTCTATAAGTATTTTCTAAATCATAAAGTTGGCCTTCTTTAGCCAGCATTATTGTCAGCCATTGAAAAACAAATGCCTGATCATTTTTATCTACAACTTGCGATGTCAAGCGAGATACTTCTAAATAAGCAGTTTGCCTATCTTTTGCCAAAGTCGTCACAAACTGTTGACTTAAATTCAAGTAATCTAATAACTTTTTGTTAGTCAACAATATTTCTAAATGTTTAGGATCGTCTGCTACTTGAGCTAATAAGCTAGCTTGTGATTTTAGCAATCCTGCTTGTTCAGCTTGATGAACCAACATGTCCAATTGTTTTGGAAAACGAAAAATTTGCGTTCTACTCTTAATTGTTGGCAAAACATTGTTTTCATCATTAGTCAATAAGATTACATAAGATGAACTTTGAGGTTCTTCAATAAATTTCAAAAGGCTGTTGGCTGCATTGACATGCATTTTTTCGCAATCTTTGATGATAAGGACCTGTGATTTCCCTTCGAAACCTGATCTTGAAAAATCTTTAGTCAGCTCTTTTATAGTCTCTGTCTTAATAAGTTGCCCCTGTGGTTCTATGATTTTAACATCTGAAAATTCCCCATTAGCGATTAAACGACAGGCTCTACACTCTTGACATGGTAAACCACTCTGGCGCTTTTCACAGAACTGACTTTGTGCTAAATAAAGTGCCATATCTAGACTTGCAAAATTTCCCGAAAAAAGATAGGCATGACTCATCCTATCTGACTGTAAAATAGTATTAAACTTTTCCAGCAATTTGGGTTGTGTTCGCTTTAAATCCATGACCTTTGTACTTCCTGATTCATTGGTTGATACGATCTAAAATAATAGAGAATGTCTCAGCTATTACTTCATCTAGCTGTTGGGAGGCATCAATCGTCACAATGCGGTTTGGCTCCGAATCCGCCAATTCAAGGTAACCTTGACGGACGCGTTGATGCATATCTAATTGCTCGAGATCTAGACGATTTACCTCCCTTTGAACACTTTTTTGAATACGCTCTAAACCTACCTCAGAAGGAACATCAAAATATAAAGTTAAATCAGGTTTATGACTATCAGTCGCATAGTCATTAAGCCATTTTATATGTGACTTATCTAATCCTCTTCCTGATCCCTGATAGGCAACAGAACTATCAATAAAACGATCCATTAGGACTATTTTCCCTTCTTCTAGAGCTGGGAGTACCTTTTCCACTAGATGTTGGCGTCGAGCAGCCATGTAAAGCAATAGCTCTGTTTTTTTATCCATTTGTGTGTGTTTAACATCTAAAATAATATGACGAATTTCTTCTGAAATAGTTACGCCACCAGGCTCTCTGGTGGTGAGAATATCTTGTGATAATTTTTCTCTGAGCAAGGGTAAAACAGCTTCTAAAACGGTTGTTTTACCCGCACCATCTGGGCCCTCAAAAGAAATCATTAGTCCTTTTTTCATGGTACATCCTTTATTTATAATTACTACCATTCTATCAAAATTTATCAAAAAAAGACACCCACAACTTGATTGTGCATGTCTGATATTTTTAAGAAAGTGGTTTTTTCACGGTCTTTTCTAAAGTTTCCACAATAACATCATCAAATACTAGTTCTTGTTTTAAAACATCCTTGTCAGCGTATCCTTCTAGTTGTATCTCGACCGCTTTCTTACCTGCTTTTCGTTCAATAATGACTAAACGTTTAACACTTAAATTTGCACTAGAAAGACGATTTAGGACTTTTGATAGTACCCCTATCCCCTCATCAGCTAATATAACCAAGCGATAACCTTCTTGACCATACCCCGCAATTTCAAGGAAGGCTTTAAAAACATCCCTATCCGTGACAATCCCATAAAGTTGTCCATTATCAACTACTGGTAAAACACCGATCTTTCGAGACATCATCAAATAAATAGCGTCCTCAAGGCTAGCATACTGTGAAACAGTCACAATATCTTTAATCATAATATCTCGAATTTTTGTCTTATTAAGAAGATAGTTCATCTCATATATAGAAAGACTGGTTGCTTTAGAAGGTTGTGCTTCTGCCATTGTCCCTTCTGTCACTAACCCCACTAGCTGATCATTTTCAACAACTGGCAAACGCCTTAAGTGGTGTTCTCTCAATAAATCAGCAGCTTCTGCAACTGTAGTGTCTGGAGAGACATAAACTAATTTTTTTGTCATAAAATCTTTCACTGGCATACCTGACTCCTCTAAATATTATCCACCTAAGTAAGCTTTACGAACTTGATCTGAAACTAGTAATTCCTTACCTGTCCCTGATAAAACAACCTTCCCAGTCTCTAGAACATATGCTTTATCAGCAATCGTCAGAGCTTTATTTGCATTTTGTTCAACTAAAAGAACTGTAGTCCCTTGTTTTTTGATGTCTTCAATGATATTAAAAATTTCTTGAATAAAAATTGGAGCTAGGCCCATTGACGGTTCATCTAAAAGTAATAATTTAGGACGACTCATCAATGCACGCCCCATAGCGAGCATTTGCTGCTCACCACCTGATAAGGTTGCTGCATCTTGGTTTTTACGTTCTTCTAAGCGAGGAAAACGATCAAACACTTTTTTTAACATTTTTTGATTTTGTTCACGATCCTTTTGAAGAAAGGCTCCCATTTCTAAATTTTCCATAACAGGCAAACTTGAGAAAACGTGGCGCCCTTCTGGAACCTGAGCTAAACCATTGCCAACAATTTTTCTAGCTGCTAACTTATGTATAGGTTTCCCCAAAAAAGAAATAGAACCCTGACTTGGTCTTACTAAACCAGAAATTGTCCTCAAAATTGATGTCTTTCCTGCACCATTGGCTCCAATTAAGGTTACAACCTCACCTTGGTTAACTTCAAACGAGACATCATTCACCGCTTGAATAACACCATAGTGAATAGATAGATTTTCTACTTTCAACATGGTCATTATACCTCACTCCCCAAGTATGCTTCTATAACACGTTTATTATTTTTAATTTCTTCAGGTGTCCCGTGAGCAATCAGACGACCATATTCCAATACATAAATTCTCTCTGTTACTTGCATAACCAAGTTCATATCATGTTCAATCAGCATAATAGTAATATCAAAATCATTCTTTATTTGACTAATTAACTGCGTCAATTCTGCAGTTTCTTGAGGATTCATTCCTGCTGCGGGCTCATCCAAAAACAATATTTTCGGTTCTGTTGCTAAAGCACGAACAATTTCTAAACGCCGTTGTTTTCCATAAGGGAGGTTCTTAGCAAGAGCATCTTGATATGCTTTCAAACCAAAAATCTCTAATAGCTCTAGGGCCTTTTTCCTTAAGGCTTTTTCACTATGATAGTATTTGGGTAATCGTAAAAAACTAGCAATAGAATGTGATAAGTGATGATTACTGAGTCCTACTAGTACATTATCTAAAACAGTCATATTTTTAAAAAGTCGGATATTTTGAAAAGTTCTACCTAAACCTAAAGAAGCTATTTTAGCTGGTTTCCTCCCATTTAATATCTTATCATCAAGTGATATTGTCCCTTTACTAGGAAGGTATACTCCTGTTAAGAGATTAAAAAGCGTTGTCTTACCCGCACCGTTGGGGCCGATTAAGCCAATTAATTCACCTTTATGTAATTTCATCGAAACATCACCTACAGCAGTTAGGCCACCGAAATGTTTACTTAAATTTTTTACTTCAAGAAGTGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019818|1349389:1360067|1349389_1349878_+|AUP10115.1|DBSCAN-SWA MKLISWNIDSLNAALTSESTRALMSRQVIDTLVAEDADIIAIQETKLSAKGPTKKHLEVLETYFPAYDLVWRSSVEPARKGYAGTMFLYRKGLNPIVSFPEIDAPTTMDNEGRIITLELENCYITQVYTPNAGDGLKRLADRQIWDIKYAEYLATLDSQKLF >CP019818|1349389:1360067|1355951_1356278_-|AUP10122.1|DBSCAN-SWA MDKKDLFDAFDDFSQNLLVGLSEIETMKKQIQKLLEENTVLRIENGKLRERLSVIEAETETAVKNSKQGRELLEGIYNDGFHICNTFYGQRRENDEECAFCIELLYRD >CP019818|1349389:1360067|1351144_1352326_-|AUP10117.1|DBSCAN-SWA MVFSVKTFNNINQIGLQELGNRFQIDGDMSENPDAYIIRSQNLHNQDFPSNLKAIARAGAGTNNIPIEEASAQGIVVFNTPGANANAVKEAVIAALLLSARDYLGANRWVNTLTGTDIPKQIEAGKKAFAGNEIAGKKLGVIGLGAIGARIANDARRLGMTVLGYDPYVSIETAWNISSHVQRVKEIKDIFETCDYITIHVPLTNETKHTFDAEAFSIMKKGTTIINFARAELVNNQELFEAIETGVVKRYITDFGDKELLNQKGITVFPHVGGSTDEAELNCAIMASQTIRCFMETGEITNSVNFPNVHQIQTAPFRITLINKNVPNIVAKISTAVSELGINIDNIINRSKGDYAYTLIDLDETDNNKISTLIEEFEGDENIVRVRLIAKQQ >CP019818|1349389:1360067|1358592_1359303_-|AUP10126.1|DBSCAN-SWA MTMLKVENLSIHYGVIQAVNDVSFEVNQGEVVTLIGANGAGKTSILRTISGLVRPSQGSISFLGKPIHKLAARKIVGNGLAQVPEGRHVFSSLPVMENLEMGAFLQKDREQNQKMLKKVFDRFPRLEERKNQDAATLSGGEQQMLAMGRALMSRPKLLLLDEPSMGLAPIFIQEIFNIIEDIKKQGTTVLLVEQNANKALTIADKAYVLETGKVVLSGTGKELLVSDQVRKAYLGG >CP019818|1349389:1360067|1350611_1351088_-|AUP10116.1|DBSCAN-SWA MLYQEFYQSPLGEIRLLADNLGLSGLYFVGQKYDMLAVNQEEIVNMSNSYTLLGKKWLDAYFSQQNLPSIPLSLRGTAFQMRVWQELQKIPFGDTKTYGELAKELNCQSAQAVGGAIGKNPISLIIPCHRVLGRYGQLTGYAGGLERKSWLLEYEKEK >CP019818|1349389:1360067|1352387_1352936_-|AUP10118.1|DBSCAN-SWA MQIRLAFPNEIDQIMLLIEEARAEIAKTGSDQWQKEDGYPNRNDIIDDILNGYAWVGIEDGMLATYAAVIDGHEEVYDAIYEGKWLHDNHRYLTFHRIAISNQFRGRGLAQTFLQGLIEGHKGPDFRCDTHEKNVTMQHILNKLGYQYCGKVPLDGVRLAYQKIKEKGETSIYREIDERNPM >CP019818|1349389:1360067|1359302_1360067_-|AUP10127.1|DBSCAN-SWA MALLEVKNLSKHFGGLTAVGDVSMKLHKGELIGLIGPNGAGKTTLFNLLTGVYLPSKGTISLDDKILNGRKPAKIASLGLGRTFQNIRLFKNMTVLDNVLVGLSNHHLSHSIASFLRLPKYYHSEKALRKKALELLEIFGLKAYQDALAKNLPYGKQRRLEIVRALATEPKILFLDEPAAGMNPQETAELTQLISQIKNDFDITIMLIEHDMNLVMQVTERIYVLEYGRLIAHGTPEEIKNNKRVIEAYLGSEV >CP019818|1349389:1360067|1354227_1354863_+|AUP10120.1|DBSCAN-SWA MILREFCAENLTDLTRLDKAIISRVELCDNLAAGGTTPSYGVIKEANQYLHEKGISVAVMIRPRGGNFVYNDLELRIMEEDILRAVELESDALVLGILTSNNHIDTEAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDVIPKSDQKKSIDQLVALGFTRILLHGSSNGEPIIENIKHIKALVEYANNRIEIMVGGGVTAENYQYICQETGVKQAHGTRITQ >CP019818|1349389:1360067|1355139_1355946_-|AUP10121.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKSNTHYGTLYLVPTPIGNLDDMTFRAIRILREVDFICAEDTRNTGLLLKHFDITTKQISFHEHNAYDKISGLIDLLKEGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIEGDIPVVSIPGASAGITALIASGLAPQPHIFYGFLPRKKGQQITFFETKKDYPETQIFYESPFRVSDTLKHMKEIYGDRQVVLVRELTKLYEEYQRGTISQLLWHIEKVPLKGECLIIVDGKRDTERVKDSSQQDPLVLVKEYIANGDKTNQAIKK >CP019818|1349389:1360067|1353003_1354095_-|AUP10119.1|DBSCAN-SWA MTIYNFSAGPAVLPKPVLVKAQSELLNYQGSSMSVLEVSHRSKEFDDIIKGAERYLRDLMGIPDNYKVIFLQGGASLQFSMIPLNIARGRKAYYHVAGSWGKKAYTEAVKLSKTIPFEPILLASSEESVYDYIPEFDEKEIDPEAAYVHVTTNNTIEGTSLYDTPKTNGVPVIADMSSNILAVKYKVEDFAMIYAGAQKNIGPAGVMVVIIREDMINEEPTLSSMLDYKIQSDAGSLYNTPPAYSIYIAKLVFEWVKSLGGVDAMEKANREKSGLLYDYIDSSEFYSNPVRDKKSRSLCNIPFITINKDLDEKFVKEATERGFKNIKGHRSVGGMRASLYNAFPKQGVIELIDFMKTFEAENA >CP019818|1349389:1360067|1357190_1357826_-|AUP10124.1|DBSCAN-SWA MKKGLMISFEGPDGAGKTTVLEAVLPLLREKLSQDILTTREPGGVTISEEIRHIILDVKHTQMDKKTELLLYMAARRQHLVEKVLPALEEGKIVLMDRFIDSSVAYQGSGRGLDKSHIKWLNDYATDSHKPDLTLYFDVPSEVGLERIQKSVQREVNRLDLEQLDMHQRVRQGYLELADSEPNRIVTIDASQQLDEVIAETFSIILDRINQ >CP019818|1349389:1360067|1357914_1358574_-|AUP10125.1|DBSCAN-SWA MPVKDFMTKKLVYVSPDTTVAEAADLLREHHLRRLPVVENDQLVGLVTEGTMAEAQPSKATSLSIYEMNYLLNKTKIRDIMIKDIVTVSQYASLEDAIYLMMSRKIGVLPVVDNGQLYGIVTDRDVFKAFLEIAGYGQEGYRLVILADEGIGVLSKVLNRLSSANLSVKRLVIIERKAGKKAVEIQLEGYADKDVLKQELVFDDVIVETLEKTVKKPLS >CP019818|1349389:1360067|1356307_1357171_-|AUP10123.1|DBSCAN-SWA MDLKRTQPKLLEKFNTILQSDRMSHAYLFSGNFASLDMALYLAQSQFCEKRQSGLPCQECRACRLIANGEFSDVKIIEPQGQLIKTETIKELTKDFSRSGFEGKSQVLIIKDCEKMHVNAANSLLKFIEEPQSSSYVILLTNDENNVLPTIKSRTQIFRFPKQLDMLVHQAEQAGLLKSQASLLAQVADDPKHLEILLTNKKLLDYLNLSQQFVTTLAKDRQTAYLEVSRLTSQVVDKNDQAFVFQWLTIMLAKEGQLYDLENTYRAQQMWKSNVSFQNSLEYMVLS |
13 | Streptococcus_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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