Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP019829 | Streptococcus agalactiae strain SA330, complete genome | 1 crisprs | cas3,cas5,cas7,cas4,cas2,cas9,cas1,csm6,DEDDh | 0 | 0 | 4 | 0 |
1. CP019829
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP019829_1 | 817404-817498 | TypeII |
II-A
Consensus repeat of CP019829_1
|
1 spacers
spacers of CP019829_1
>1.1|817433|37|CP019829|CRISPRCasFinder CCAAAACTTATTCTATTGTTAAATCGTGTGTTGATGA |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019829_1
The CRISPR arrays of CP019829_1 >merge|CP019829|1|817404-817498|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACTTATTCTATTGTTAAATCGTGTGTTGATGAGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCAAATGGTT >CP019829|1|1|817404-817498|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTT CCAAAACTTATTCTATTGTTAAATCGTGTGTTGATGA GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCAAATGGTT
>CP019829.1|AUP27977.1|816310_816652_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MSYRYMRMILMFDMPTETAEERKAYRKFRKFLLSEGFIMHQFSVYSKLLLNNTANNAMIGRLKVNNPKKGNITLLTVTEKQFARMVYLHGERNTSVANSDSRLVFLGDSYDQD >CP019829.1|AUP27976.1|815444_816314_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAGWRTVVVNTHSKLSYKNNHLIFKDSYQTEMIHLSEIDILIMETTDIVLSTMLIKRLGDENILVIFCDDKRLPTAMLMPYYARHDSSLQLSRQMSWIEDVKADVWTSIIAQKILNQSFYLGECSFFEKSQSIMNLYHDLESFDPSNREGHAARIYFNTLFGNDFSREQDNPINAGLDYGYSLILSMFAREVVKCGCMTQFGLKHANQFNQFNLASDIMEPFRPIVDRIIYENRQSDFVKMKRELFTMFSETYNYNGKEMYLSNIVSDYTKKVIKSLNSDGNGIPEFRI >CP019829.1|AUP27975.1|811330_815443_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas9 MNKPYSIGLDIGTNSVGWSIITDDYKVPAKKMRVLGNTDKEYIKKNLIGALLFDGGNTAADRRLKRTARRRYTRRRNRILYLQEIFAEEMSKVDDSFFHRLEDSFLVEEDKRGSKYPIFATMQEEKDYHEKFPTIYHLRKELADKKEKADLRLVYLALAHIIKFRGHFLIEDDRFDVRNTDIQKQYQAFLEIFDTSFENNHLLSQNVDVEAILTDKISKSAKKDRILAQYPNQKSTGIFAEFLKLIVGNQADFKKHFNLEDKTPLQFAKDSYDEDLENLLGQIGDEFADLFSAAKKLYDSVLLSGILTVTDLSTKAPLSASMIQRYDEHREDLKQLKQFVKASLPEKYQEIFADSSKDGYAGYIEGKTNQEAFYKYLSKLLTKQEDSEYFLEKIKNEDFLRKQRTFDNGSIPHQVHLTELKAIIRRQSEYYPFLKENQDKIEKILTFRIPYYVGPLARGNSDFAWMTRKTDDSIRPWNFEDLVDKEKSAEAFIHRMTNNDLYLPEEKVLPKHSLIYEKFTVYNELTKVRYKNEQGETYFFDSNVKQEIFDGVFKEHRKVSKKQLLDFLAKEFEEFRIVDVTGLDKENKAFNASLGTYHDLKKILDKDFLDNPDNESILEDIVQTITLFEDREMIKKRLENYKDLFTESQLKKLYRRHYTGWGRLSAKLINGIRDRESQKTILDYLISDGRANRNFMQLINDDGLSFKSIISKAQSGSHSDNLKEVVGELAGSPAIKKGILQSLKIVDELVKVMGYEPEQIVVEMARENQTTNQGRRNSRQRYKLLEDGVKNLASDLNGDILKEYPTDNQALQNERLFLYYLQNGRDMYTGEALDIDNLSQYDIDHIVPQAFIKDDSIDNRVLVSSAKNRGKSDDVPSIDIVKARKAFWKKLLDAKLISQRKYDNLTKAERGGLTPDDKAGFIQRQLVETRQITKHVARILDERFNNKVDDNNKPIRKVKIVTLKSNLVSNFRKEFGFYKIREVNNYHHAHDAYLNAVVAKAILTKYPQLEPEFVYGDYPKYNSYKTRKSATEKLFFYSNIMNFFKTKVTLADETVVVKDDIEVNNETGEIAWDKKKHFATVRKVLSYPQVNIVKKTEVQTGGFSKESILAHSNSDKLIPRKTKDIYLDPKKYGGFDSPIVAYSVLVLADIKKGKAQKLKTVKELIGITIMERERFEKNPSAFLESKGYLNIRTDKLIILPKYSLFELENGRRRLLASAGELQKGNELALPTQYMKFLYLASRYNESKGKPEEIEKKQEFVNQHVSYFDDILQLINDFSKRVILADANLEKINKLYSDNKDNTPVDELAKNIINLFTFTSLGAPAAFKFFDKSVDRKRYTSTKEVLDSTLIHQSITGLYETRIDLGKLGED >CP019829.1|AUP27974.1|810299_810956_+|Membrane-protein MKDKLLVVLTWIWIISLATLATIYIAWLIYPIEIQFLKLEKVVYLKAETIYYNFNKLMIYLTHPFISDLNMPSFPSSEDGLKHFADVKYLFTLAHGLFVILTFPVIYFLRRGWKQKSIFLYEGFFKIAIMLPIFIVVCAFLLGFDQFFTLFHEVLFPGDSTWQFNPLTDPVIWILPETFFLHCFIIFLLIYETITIILLIIGRKHLKLRKYKNKMQAL >CP019829.1|AUP27973.1|809539_810310_+|HAD-family-hydrolase MAYKGYLIDLDGTIYKGKSRIPAGERFIEHLQEKGIPYMLVTNNTTRTPESVQEMLRGFNVETPLETIYTATLATVDYMNDMNRGKTAYVIGEEGLKKAIADAGYVEDTKNPAYVVVGLDWNVTYDKLATATLAIQNGALFIGTNPDLNIPTERGLLPGAGSLNALLEAATRIKPVFIGKPNAIIMNKALEILNIPRNQAVMVGDNYLTDIMAGINNDIDTLLVTTGFTTVEEVPDLPIQPSYVLASLDEWTFNEG >CP019829.1|AUP27972.1|808800_809391_+|Acyl-ACP-thioesterase MGLLYRETYEVPFYESDTNHYMKLPQLLALALQISAKQSLKLGIGDDIVFKRYGLVWVVTDYIIDIERLPKHAEKIVIETEAKAHNKLLCYRYFYIYGEDGQKIITISSAFVLMDFKTRKIHPVLDDITSIYQSQRIKKVIRGPKYHPIGDSKVKQYHVRYFDLDMNGHVNNSKYLEWMYDVLDLDFLSSHIPKKN >CP019829.1|AUP27971.1|807666_808797_+|Coproporphyrinogen-III-oxidase MLKKPTSAYVHIPFCTQICYYCDFSKVFIKNQPVDAYLQALIREFRSYDITDLRTLYIGGGTPTSISAVQLDYLLTELSRDLNLNTLEEFTIEANPGDLTVDKIEVLQKSAVNRVSLGVQTFNDKHLKRIGRSHNEAQIYSTIDALKTAGFQNISIDLIYALPGQTMDNVRSNVAKALSLNIPHLSLYSLILEHHTVFMNKMRRGKLHLPTEDLEAEMFEYIISEMERNGFEHYEISNFTKPGFESRHNLMYWDNVEYYGVGAGASGYLDGIRYRNRGPIQHYLKGVSEGNARLSEEVLSKNEMMEEELFLGLRKKEGVSIGKFEQKFGTSFEKRYGQIVQELQSDGLLKENNGFIQMTKKGLFLGDTVAEKFIVE >CP019829.1|AUP27970.1|807193_807574_+|Pyrimidine-dimer-DNA-glycosylase MRLWHQDIIELLPRQQLLGQHRECCALRGNGWGRKHETIDYVFRYSPYRLFAYHQLVMEEMMERGYRVSKEWLVAEYRGMKCPRYDTLNPVDLETPIYPEHNQDYLQECLWNLKAKGIDLPINKIK >CP019829.1|AUP27969.1|806797_807169_+|hypothetical-protein MTKEAELLWAKHKYLVLSKSQKIYLDIRQTLKSPNCTVLDVQSLIDQAVLLEESPSQVTNAYMHIWGYFKNKAERQEKEEFLILLEKYRKTGYQRRKLLAFLKQLFAKYPNSYLQNSSIFEEE >CP019829.1|AUP27968.1|805322_806675_+|Phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGEANVELTPELAFKLGRFGGYVLSQHETDRPRVFVARDTRISGEMLESALIAGLLSVGIEVYKLGVLATPGVSYLVRTEKASAGVMISASHNPALDNGIKFFGSDGFKLDDDRELEIEALLDAKEDTLPRPSAQGLGTLVDYPEGLRKYEKFMESTGIDLEGMKVALDTANGAATASARNIFLDLNADISVIGDQPDGLNINDGVGSTHPEQLQSLVRENGSDIGLAFDGDSDRLIAVDENGEIVDGDKIMFIIGKYLSDKGQLAQNTIVTTVMSNLGFHKALDREGIHKAITAVGDRYVVEEMRKSGYNLGGEQSGHVIIMDYNTTGDGQLTAIQLTKVMKETGKKLSELASEVTIYPQKLVNIRVENNMKDKAMEVPAIAEIIAKMEEEMDGNGRILVRPSGTEPLLRVMAEAPTNEAVDYYVATIADVVRTEIGLD >CP019829.1|AUP27979.1|817850_817988_+|hypothetical-protein MVKGLGCSTLYLIISLTALVLLVIAGVSLSLILASLQGKQRRTYP >CP019829.1|AUP27980.1|818128_818545_+|Nucleoside-diphosphate-kinase MEQTFFMIKPDGVKRGFIGEVISRIERRGFSIDRLEVRHADADILKRHYAELTDRPFFPTLVDYMTSGPVIIGVISGEEVISTWRTMMGSTNPKDALPGTIRGDFAQAPSPNQATCNIVHGSDSPESATREIAIWFNN >CP019829.1|AUP27981.1|818680_820513_+|Elongation-factor-4 MNIEDLKKRQEKIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILEKTETVSSREMQAQLLDSMDLERERGITIKLNAIELNYTAKDGETYIFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNDLEILPVINKIDLPAADPERVRAEVEDVIGLDASEAVLASAKAGIGIEEILEQIVEKVPAPTGEVDAPLQALIFDSVYDAYRGVILQVRIVNGMVKPGDKIQMMSNGKTFDVTEVGIFTPKAVGRDFLATGDVGYIAASIKTVADTRVGDTITLANNPAIEPLHGYKQMNPMVFAGLYPIESNKYNDLREALEKLQLNDASLQFEPETSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNIDLIMTAPSVVYHVNTTDSEMLEVSNPSEFPDPTRVDSIEEPYVKAQIMVPQEFVGAVMELAQRKRGDFVTMDYIDDNRVNVIYQIPLAEIVFDFFDKLKSSTRGYASFDYEISEYRRSQLVKMDILLNGDKVDALSFIVHKEFAYERGKLIVDKLKKIIPRQQFEVPIQAAIGQKIVARSDIKALRKNVLAKCYGGDVSRKRKLLEKQKAGKKRMKAIGSVEVPQEAFLSVLSMDDDDKK >CP019829.1|AUP27982.1|823296_823956_+|Phosphohydrolase MTMVKREDVILNATENMVYHKLKNDPSGHDWFHIVRVRNLAVELAHKEGANTFICQMAALLHDIIDDKICQDSEQASYELTQWLYSQDLAIAEVEHILDILQNISFKAGTGLTMKTLEGQIVQDADRLDAMGAIGIARTMAYSGSKGRLIHDPNLKPRENLTLEEYRNGQDTAIMHFYEKLLKLKDLMNTKQGKMLAQKRHDFLELYLAEFYAEWNGKR >CP019829.1|AUP27983.1|823964_824429_+|GNAT-family-acetyltransferase MIRRAKEKDLPAIAELLQQILVLHHGVRPDIFHTRGSKFSKEQLKEMLIDESKPIFVYESDEGKVVAHLFLQLQEKRDLPRKSFKTLYIDDLCIDEEVRGQQIGQKLMDFARQYAKKHGCYNITLNVWNDNQRAVSFYEKLGFKPQQTQMEEIL >CP019829.1|AUP27984.1|824428_824863_+|Peptide-methionine-sulfoxide-reductase-MsrB MKETQEELRQRIGHTAYQVTQNSATEHAFTGKYDDFFEEGIYVDIVSGEVLFSSLDKFQSGCGWPAFSKPIENRMVTNHQDHSHGMHRIEVRSRQADSHLGHVFNDGPVDAGGLRYCINSAALDFIPYDQMAKRGYGDYLSLFD >CP019829.1|AUP27985.1|825014_827807_+|Haloacid-dehalogenase MASTNNVSDTNTRFAKEELEEVFEELGTTQGGLSDEEVAVRQKKYGLNLLSEVKQESIILLFLKNFTSLMAILLWVGGFVAIVSNSLELGLAIWMVNVINGIFSFIQEYRASQATQALKKMLPSYSRVLRKSSEEKILSEQLVPGDIVLIEEGDRISADGRLIKTTDLQVNQSALTGESNPIYKDSNVENDQSKTLIECDNMVFAGTTVSSGSATMVVTAIGMQTQFGQIADLTQGMKSEKSPLQRELDRLTKQISIISITVGIIFFLAATFFVKEPVSKSFIFALGMIVAFIPEGLLPTVTLSLAMAVQRMAKEHALVKKLSSVETLGATSVICSDKTGTLTQNEMTVNHLWQNGKSYQVTGLGYAPEGQVLFEGDNICFGNSDRGDLEKLIRFAHLCSNAQVLPPNDDRSTYTVLGDPTEACLNVLLEKSGINRQENRKFAPRLKELPFDSVRKRMTTIHSLGGDEKDKKISITKGAPKEILDLSDYVLSDGKVIPLNKEERNKIQLANDTFAKDGLRVLAVSYCDIEGFSKEQWTQENLEQHMVFIGLIAMSDPPREGVREAIDKCHAASIRIIMVTGDYGLTALSIAKNIGIIRNDDAKVISGLELSEMTDSQLKKELSGEVVFARVAPEQKYRVVTILQEMGEVVAVTGDGVNDAPALKKSDIGVAMGVTGTDVAKESADMILTDDHFASIVDAVEEGRAVYQNIKKFLTYIFNSNTPEAVPSAFFLFSKGFIPLPLTVMQILAVDLGTDMLPALGLGVESPETDVMNRPPRRLTDRLLDKGLLIKSFLWYGTIESVLAMGGFFWAHYLRYGNFTFFVANGIPYREATTMTLGAIIFSQIGMVMNSRTSYQSIKTLSIFGNKLINFGIIMEILAFLVLVYVPLFHNLFNTASLGLSHWLYLISCPFIMIGLDEVRKLFSSRKNKR >CP019829.1|AUP27986.1|827806_828850_+|hypothetical-protein MSNIITYLKNNSNLTFDELALNDVDILCLNEFGYISFEKLINTTEMKSVLVCELYHEYLQTMAKSYSFMFTSQRHDLCQLMMTSKRFKNLTLSYYQAEISLEFEKQFAAMVFTIPNIDYHQVVFRGTDANLIGWKEDFKLTYMREISAHRSAIKYLNTILPHFDKVVLSGHSKGGNLALYAAMFTKPDLKAKIDLIWLIDSPGLQKTLLPTTEYKTTKQKCIRLLPEESIVGMMLYSDIEPLIISSNARGILQHDVTTWEIQEPAILKTGTGLSLKSICFEKTFQQWMAELKSQERKLFFDLLFDSFLSSGVSSLDDFNLASRAKMMKAFHSFRELDDDKKGYLTNL >CP019829.1|AUP27987.1|828882_829452_-|Chloramphenicol-acetyltransferase MSTGASYPKYGFSVGKYTYGYQQFFYEGVNLKEIGAFCSIAQNVTITGMNHPTDHITTNPFIYYKSRGFINEDRADLIDEKKNGKVIIGNDVWIGTNVTILPSVTIGNGAIIGAGSVITKDIPDYAVVAGTPAKIIKYRFSEEEITLLNASQWWNWSDEAIKEHISEFSDKKEFFNTLKSIEENKNHKL >CP019829.1|AUP27988.1|830231_830843_+|Membrane-protein MNMKLSKRYRFWQKVIKALGVLALIATLVLVVYLYKLGILNDSNELKDLVHKYEFWGPMIFIVVQIVQIVFPVIPGGVTTVAGFLIFGPTLGFIYNYIGIIIGSVILFWLVKFYGRKFVLLFMDQKTFDKYESKLETSGYEKFFIFCMASPISPADIMVMITGLSNMSIKRFVTIIMITKPISIIGYSYLWIYGGDILKNFLN |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
187494 : 199664
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019829|187494:199664|DBSCAN-SWA ATTGAATCCGTTCGGGAAACTCAGAAAAAGATGGGGCTTACTGAAATCTCAATTTCAGACATCCTCCTATTTTCCAGTCGCTCCCTTGTCGGACTTGGTATCTTATATGAATAAACGTATTTTTGTTGAGAAAAAGGCTGACTTTGGCATTAAATCGGCTAGTCTTGTGAAAGAGTTGACGCATAATCTACAACTGACTTCTTTGAAGGATTTGCGTATTGTGCAGGTCTATGATGTCTTCAATTTGGCTGAGGATTTGCTGGCGCGTGCTGAGAAGCATATTTTCTCTGAGCAGGTGACAGACTGTCTTTTGACGGAAACTGAAATCACTGCGGAGCTTGATAAGGTTGCCTTCTTTGCCATTGAGGCGCTTCCTGGTCAATTTGACCAACGTGCTGCTAGTTCGCAAGAAGCTTTGCTATTGCTTGGAAGTGACAGTCAGGTTAAGGTCAATACAGCCCAGCTTTACTTGGTCAATAAGGATATTGCAGAAGCAGAGCTTGAAGCTGTTAAGAACTATCTTTTGAATCCTGTTGATTCACGTTTCAAGGACATCACTTTGCCGCTTGAAGAGCAGGCTTTCTCTGTGTCTGATAAGACGATCCCTAATCTTGATTTCTTTGAAACTTATCAAGCTGACGATTTTGCGACTTATAAGGCAGAGCAGGGCTTGGCTATGGAGGTCGATGATTTTCTCTTCATCCAAGATTATTTCAAATCAATCGGGCGTGTGCCAACTGAGACTGAGTTGAAAGTTTTGGATACGTATTGGTCAGACCACTGTCGTCACACAACCTTTGAAACTGAGCTGAAAAACATTGATTTTTCAGCTTCTAAATTCCAGAAACAATTACAGACGACTTATGACAAATACATTGCCATGAGTGATGAGCTTGGTCGTTCTGAAAAGCCACAGACGCTTATGGATATGGCGACTATCTTTGGTCGTTATGAGCGTGCCAATGGTCGTCTGGACGATATGGAAGTCTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTTGAGATTGAAGTAGATGTTGATGGTGTAAAAGAGCCTTGGCTCCTCATGTTTAAGAATGAGACTCACAATCACCCAACAGAAATTGAGCCATTTGGTGGCGCAGCAACTTGTATCGGTGGTGCCATTCGTGACCCGTTGTCAGGACGTTCATACGTTTATCAGGCTATGCGTATTTCAGGCGCAGGCGATATTACGACTCCGATTGCGGAAACACGTGCTGGTAAATTGCCACAACAGGTTATTTCTAAGACTGCGGCGCACGGCTATTCTTCATATGGTAACCAAATTGGGCTTGCGACAACTTATGTGCGTGAGTACTTCCACCCTGGCTTCGTAGCCAAACGTATGGAGCTTGGAGCTGTGGTTGGTGCTGCACCTAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAGAAGCAGGCGATGTGGTCATCTTGCTCGGTGGTAAAACAGGTCGTGATGGTGTCGGTGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAAACGGTTGAATCTGTGGAAACAGCTGGCGCAGAGGTACAAAAAGGGAATGCCATTGAAGAGCGTAAGATTCAACGTCTTTTCCGTGATGGCAATGTCACTCGTCTTATCAAGAAATCAAATGACTTCGGTGCAGGTGGTGTCTGTGTTGCCATCGGTGAATTGGCTGATGGTCTTGAAATCGATTTGGACAAGGTGCCACTTAAATACCAAGGTCTTAATGGTACTGAAATTGCAATCTCAGAATCTCAAGAGCGTATGTCAATCGTTGTTCGTCCTAGTGATGTGGATACCTTCATCGAAGCCTGCAACAAGGAAAATATCGATGCAGTCGTTGTTGCGACCGTTACTGAAAAACCAAATCTTGTTATGACTTGGAATGGCGAAACCATCGTTGACTTGGAACGCCGTTTCCTTGATACCAACGGTGTCCGTGTCGTTGTTGATGCTAAAGTCGTTGACAAGGACTTGACAGTTCCAGAAGCACGCACAACATCAGCAGAGACACTTGAAGCAGATACGCTTAAGGTCTTGTCTGACCTCAACCATGCTAGCCAAAAAGGTCTCCAAACCATCTTTGACTCATCTGTTGGTCGTTCAACCGTTAACCACCCAATCGGTGGTCGCTACCAAATCACACCGACAGAAAGTTCAGTTCAAAAATTGCCAGTTCAACATGGTGTGACAAGAACAGCCTCTGTTATGGCTCAAGGTTACAATCCTTATATTGCTGAGTGGTCACCTTACCACGGTGCTGCCTATGCTGTCATTGAAGCGACAGCTCGCTTGATAGCAACGGGTGCCGACTGGTCTCGTGCACGCTTCTCTTACCAAGAGTACTTCGAGCGTATGGACAAACAGGCAGAGCGTTTTGGTCAGCCAGTATCAGCTCTTCTTGGTTCTGTTGAGGCTCAGATTCAACTTGGCTTGCCATCAATCGGCGGTAAGGACTCGATGTCTGGTACTTTCGAAGAATTGACAGTGCCACCAACCTTGGTAGCTTTCGGTGTGACAACAGCGGACAGCCGCAAGGTTCTCTCTCCTGAGTTTAAAGCGGCTGGTGAGAATATTTACTACATTCCAGGTCAAGCTATTTCAGAAGATATTGATTTTGACCTTATCAAGGCTAACTTTAACCAGTTTGAAGCTATTCAAGCTCAACATAAGATTACCGCTGCTTCAGCCGTTAAATACGGTGGTGTCCTAGAAAGTCTTGCTCTCATGACTTTTGGTAACCGTATCGGTGCTTCTGTTGAAATTGCAGAGCTTGACAGCAGCTTGACAGCTCAACTCGGAGGCTTTGTCTTTACATCAGTTGAGGAAATCGCTGACGCTGTGAAGATTGGTCAAACTCAGGCAGACTTTACAGTCACTGTCAATGGAAATGACCTCGCTGGTGCTAGCCTCCTAGGAGCCTTCGAAGGTAAATTGGAAGAAGTTTACCCAACAGAATTCGAACAGGCAGACGCTCTTGAAGAAGTTCCTGCTGTGGTATCAGATACCGTCATCAAGGCTAAGGAAGTCATTGAAAAACCAGTGGTTTACATTCCAGTCTTCCCTGGTACTAACTCAGAGTACGATTCAGCTAAGGCTTTTGAACAGGTTGGAGCTAGCGTCAACTTGGTACCATTTGTAACCTTGAATGAGGCTGCTATTGCTGACTCAGTTGACACAATGGTCGCTAATATTGCTAAGGCAAATATCATCTTCTTTGCTGGAGGATTCTCAGCAGCGGATGAACCAGATGGGTCTGCTAAGTTTATCGTCAATATCTTGCTTAACAAGAAGGTTCGCGCAGCTATTGACAGCTTCATCGAAAAAGGTGGCCTTATCATCGGTATCTGTAATGGTTTCCAAGCCCTTGTTAAATCAGGTCTTCTTCCATACGGAAACTTCGAGGAAGCTGGTGAGACAAGTCCAACTCTCTTCTATAACGATGCTAACCAGCACGTTGCAAAGATGGTTGAGACTCGTATCGCAAATACCAACTCACCTTGGTTGGCAGGAGTTGAGGTCGGCGATATTCATGCCATTCCAGTTTCACACGGTGAAGGTAAATTTGTTGTCAGCGCTTCTGAATTTGCAGAGCTAAGAGACAATGGTCAAATCTGGAGCCAATATGTGGACTTTGACGGACAACCATCTATGGATTCTAAATACAATCCAAACAGCTCTGTCAATGCCATCGAAGGGATTACCAGCAAGAATGGTCAAATCATCGGTAAGATGGGGCACTCAGAACGCTGGGAAGACGGCCTCTTCCAAAATATCCCTGGTAACAAAGACCAAGCCTTGTTTGCTAGTGCAGTAAAATATTTTACAGGAAAATAATTTTTTCAAATTTTTTCATAAAACAGATAAGGAAACAAGAGCGAAGCGAGCTTAACTGTATCTTTCTGTCGTAGTGGTATTTGGGAGCCGTTGAGGCTAAGACTCAATGATTAGCTTGAAAATAGCTTGATAGATTTTCTATTTTGATGTTGGCATTGATGACGATAGATCCAAAATTGAGAAAATCATCAAAGCTACTTAAGAAGAGATACAAAAAGAATTAGGAAAAAAGAATGACATACGAAGTAAAATCTCTAAATGAAGAATGTGGTGTATTTGGTATCTGGGGGCATTCTCAGGCAGCTCAAGTCACTTACTTTGGGCTTCACAGTCTTCAACACCGCGGTCAAGAAGGTGCTGGTATTGTTTCGAATGATAATGGGAAACTCTATGGTTATCGAAATGTTGGTCTCCTTTCTGAAGTTTTTAAGAATCAATCTGAATTAGATAATTTAACTGGGAATGCGGCTATTGGACATGTTCGGTATGCTACTGCAGGTTCTGCAGATATTCGCAATATTCAGCCTTTTCTTTATAAATTTCATGACGGGCAATTTGCTTTATGCCATAATGGTAATTTGACAAATGCTATTTCTTTAAGGAAAGAATTAGAAAAGCAAGGTGCAATTTTCAATGCCTCCTCAGATACTGAAATTTTGATGCACTTGATTCGTCGAAGCCATAACCCAAGTTTTATGGGGAAGGTAAAAGAAGCTTTAAGCACTGTAAAGGGAGGCTTCGCCTATCTACTGATGACAGAAGATAAATTAATTGCTGCTCTTGACCCTAATGCCTTTCGTCCTTTGTCAATTGGACAAATGCAAAATGGTGCCTGGGTTATTGCCAGTGAGACCTGTGCTTTTGAGGTGGTAGGCGCAAAATGGGTTAGAGATGTTGAACCTGGCGAAGTTATTCTTATAGACGATAGTGGTGTTCAATGTGATCGTTATACTGATGAAACGCAGTTGGCAATTTGTTCGATGGAATATGTCTATTTTGCAAGGCCGGATTCGACTATACATGGTGTTAATGTTCATACGGCTCGAAAAAATATGGGAAAGCGTCTTGCACAAGAATTTAAACAGGATGCTGATATTGTAATTGGTGTCCCAAATTCGTCCTTATCGGCTGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCCGGATTACCAAATGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019829|187494:199664|193040_194063_+|AUP27408.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVAHTERAGVMGALGDFGGMFDLSQTGVKEPVLISGTDGVGTKLMLAIKYDKYDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNNPVKLEEVVSGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFAVGVAEKSQLIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVKAALPLIKEVLVNGIAHITGGGFIENVPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADDSVVIK >CP019829|187494:199664|194801_195554_+|AUP27410.1|DBSCAN-SWA MKLVKNLEIVESIFGDWDETIIWSCVQGIMGEVFVDSLDQPKSSLAKLGRKSSFGFLAGQPTLFLLEVCSGEDIILVPQHKGWSDLIESTYGQNAHSFKRYATKKDTLFERSRLEKFVTQLPNGFELRAIDEKVYNSCLEKEWSQDLVANYATYQYYKKQGIGYVVYYQGNIIAGASSYSTYKNGIEIEVDTHPDFRRRGLATIVAAQLILTCLDKGIYPSWDAHTRTSLNLAEKLGYEFSHEYIAYEID >CP019829|187494:199664|195573_197121_+|AUP27411.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSEKSGIIDFAKELKNLGWDIISTGGTKVALDDAGVETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDADSHLQAAKDNNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDVTYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTFETRQRLAAKVFRHTAAYDALIAEYFTAQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPTDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKDRPTVVALKHMNPCGIGQADDIETAWDYAYEADPVSIFGGIVVLNREVDAATAEKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAAAGIKAIIQPGGSVRDQESIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH >CP019829|187494:199664|194230_194779_+|AUP27409.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASANGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKAAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLSAYEGRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGIKRK >CP019829|187494:199664|198359_199664_+|AUP27413.1|DBSCAN-SWA MKMNKKVLLTSTMAASLLSVASVQAQETDTTWTARTVSEVKADLVKQDNKSSYTVKYGDTLSVISEAMSIDMNVLAKINNIADINLIYPETTLTVTYDQKSHTATSMKIETPATNAAGQTTATVDLKTNQVSVADQKVSLNTILEGMTPEAATTIVSPMKTYSSAPALKSKEVLAQEQAVSQAAANEQVSPAPVKSITSEVPAAKEEVKPTQTSVSQSTTVSPASVATETPALVAKVAPVRTVAAPRVTSAKVVTPKVETGASPEHISAPAVPVTTTSTATDNKLQATEVKSVPVAQKAPTATPVAQPASTTNAVAAHPENAGLQPHVAAYKEKVASTYGVNEFSTYRAGDPGDHGKGLAVDFIVGTNQALGNEVAQYSTQNMAANNISYVIWQQKFYSNTNSIYGPANTWNAMPDRGGVTANHYDHVHVSFNK >CP019829|187494:199664|191558_193013_+|AUP27407.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHSQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNPSFMGKVKEALSTVKGGFAYLLMTEDKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVIASETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDSGVQCDRYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIASPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHAVDEVCDIIGADSLTYLSIDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >CP019829|187494:199664|187494_191325_+|AUP27406.1|DBSCAN-SWA MNPFGKLRKRWGLLKSQFQTSSYFPVAPLSDLVSYMNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDCLLTETEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLLGSDSQVKVNTAQLYLVNKDIAEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFETYQADDFATYKAEQGLAMEVDDFLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMSDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGNVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSIVVRPSDVDTFIEACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGETIVDLERRFLDTNGVRVVVDAKVVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTRTASVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLIATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSVEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEELTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKANFNQFEAIQAQHKITAASAVKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSVEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLGAFEGKLEEVYPTEFEQADALEEVPAVVSDTVIKAKEVIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEAAIADSVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNKKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNSSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQALFASAVKYFTGK >CP019829|187494:199664|197313_198213_+|AUP27412.1|DBSCAN-SWA MNKWLVKASSLVVLGGMVLSAGSRVLADTYVRPIDNGRITTGFNGYPGHCGVDYAVPTGTIIGAVADGTVKFAGAGANFSWMTDLAGNCVMIQHADGMHSGYAHMSRVVARTGEKVKQGDIIGYVGATGMATGPHLHFEFLPANPNFQNGFHGRINPTSLIANVVTFSGKTQASAPSIKPLQSTPVQNQSSRLKVYRVDELQKVNGVWLVKNNTLTPTGFDWNDNGIPASEIDEVDANGNLTADQVLQKGGYFIFNPKTLKTVEKPIQGTAGLTWAKTRFANGSSVWLRVDNSQELLYK |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
944444 : 954296
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019829|944444:954296|DBSCAN-SWA AATGACTTACACAGAAAATTTTCAAAAATGGTTAGATTTTGAGCAGCTTCCTGACTATCTTCGTCAAGAATTACTATCAATGGATGAAAAAACAAAAGAAGATGCTTTTTACACAAACTTAGAATTTGGTACTGCTGGTATGCGTGGTTATATTGGTGCTGGTACAAATCGTATTAATATTTATGTTGTCCGTCAAGCAACCGAAGGATTGGCAAAATTAATCGAAACTAAGGGAGAGGACGCTAAAAAACGTGGTGTAGCCATTGCTTATGATTCACGCCACTTCTCTCCAGAATTTGCTTTTGAGTCTGCACAGGTCTTGGCACAGCATGGAATTAAATCTTACGTATTTGAAGCTCTTCGTCCAACACCAGAACTCTCTTTTGCTGTTCGCCATTTAAATGCCTATGCTGGTATTATGGTTACTGCAAGCCACAATCCAGCACCTTTCAATGGTTATAAAGTCTATGGACAAGACGGAGGTCAACTACCACCAGCTGATGCTGATGCACTAACAGACTTTATCCGTGCTATTGAAAATCCATTTGCAGTTGAACTTGCTGATTTAGATGAAAGCAAATCAGCGGGTCTTATTCAAGTTATCGGTGAAGATGTTGATATTGAATATCTTAGAGAGGTTAAAGATGTTAATATCAATCAAGATTTAATCAATAACTTTGGAAAAGACATGAAAATTGTCTATACTCCTCTCCACGGAACTGGTGAGATGTTGACACGCCGTGCCCTTGCTCAAGTCGGTTTTGAATCTGTTGTTGTAGTAGAATCACAAGCTAAGGCAGATCCAGACTTTTCTACTGTCAAATCTCCTAACCCTGAAAGCCAAGCTGCCTTTGCTCTTGCTGAAGAACTCGGACGAGAAGTTGATGCAGATGTCTTAGTAGCTACTGATCCTGATGCAGACCGCCTAGGCGTTGAAATTCGCCAACCAGATGGTTCTTATAAAAACCTTTCTGGAAATCAAATTGGAGCGATTATTGCGAAATACATCCTGGAAGCTCATAAAACAGCAGGAACACTTCCAGAAAATGCTGCTCTCGCTAAATCAATCGTATCAACAGAATTAGTAACAAAAATTGCCGAAAGTTATGGCGCTACAATGTTTAACGTTTTAACTGGATTCAAATTCATCGCTGAGAAAATTCAAGAGTTTGAAGAAAAACATAACCACACCTATATGTTTGGTTTTGAGGAAAGCTTCGGATACCTTATTAAACCATTTGTCCGTGATAAAGACGCTATTCAAGCAGTTCTTTTGGTTGCTGAGATCGCAGCTTATTACCGTTCGCGTGGATTAACACTTGCAGATGGTATTGATGAAATTTACAAAGAATATGGTTTTTTTGCTGAAAAAACGATTTCAGTAACACTTTCAGGTGTAGATGGAGCTGCTGAAATTAAGAAGATTATGGACAAATTCCGTGAAAATGGTCCAAAACAATTTAACAATACTGATATTGTATTATTAGAAGATTTCCAAAAACAAACCGCTACTAAAAATGATGGAACAATATCTAACTTAACAACTCCTCCAAGTAATGTTTTGAAGTACACATTAGCTGATGATTCATGGATTGCAGTTCGCCCTTCAGGAACTGAACCAAAAATCAAGTTCTATATTGCCACGGTCGGTAATGATTTAGCAGATGCAGAAACAAAAATCGCCAATATTGAAAAAGAGATTACAACATTTGTAAATTAATAAAAAAAGCTAGGAAGGCACTGCACCCCATTAGTGGGACAGAAGAAAAACACTCTTATGAAGCCAATTTCCTGAATTGAACAGGAGATTGGTTTTTTAAATGACGTTGAATTCTAGTTTCATTATAAAATGTAATGTAATTTTTAACAATATTTGTTATACTATCTTTGTTGTATTTTCTCCTATCATGGAGATAAAAGGTTTCAGTCTTTAGGACGGAGTGAAACCATTCAATACAGGCGTTATCTGCAGGTGTTCCTTTTCGGGACATTGAGCGGATAATGCCTTTTTCCGTGCAAGCTTGATAGTAAGCCTTAGAAGTATACACTGAGCCTTGATCGCTGTGTAAGACTGCCCCTTTAGGTAATTTTAACTGATTAAGGGTGTCTATTACAAAATCTGTGTCCTGACAATCTGAGATAGTATAAGCTAAAATCTCTCGGTTATAGAGGTCCATAATTGAAGAGAGATACAATTTACAGTTACCGAAATATAGATAAGTAATATCTGTTACAAGCTTTTCCAATGGCTTATCGGCATGGAAATCCCGATTCAATTTGTTATCTGTTAAATAATAAGTTTTACCAAGATTGGGCGATTTCTTTGGACGTGTCCGACAAAGCCAACCATTGTCTTTCATGATACGATAGACTTTCTTTGCATTAACAGTCAATTCGTGGATCTTTTTGAGCAATCGTGTAATGGTACGATATCCATAAATAAAGTGATTCTCCATGCAGAGCTGTTCAATTAATTCAATGACTTCATCTGTTTCTTGTGGTTTCTCGTACTTCTTTTTCCAACGATAATAGGTCGATCGCTTAACATCAAAACAGTCTAGAATGACAGAAATCGGGTAGTTGTTTTTATAGTCTTCCACAAGCTTGATAAGACTTACTTTATCGATTTCCTTATCAAGCCTCGATACTTTTTTAAGAGGTCAACCTGTAATTGTAACTGTTCCACTTCAGACAGATGTTCCAAGCCTTTACCATAGGTATATTGCTTGCCAACACCTTGATGGAAACGATAAAGTTCCTCATTTTCGTGCCATTTTACCCAAGTATAGATTTGACTATCATTCTTGATACCTAGAGTCTCCATAATAAATCTGTTAGACTTGCCTGCTTTTTTCATCTCGATGCAGGCCAACTTCGTTTCCCATGAATATGCTTTTTTAACCATAATAAAACACTCCTGATTCTATTTTACTAGAATTCTCCAGGAGTGTTTTTCTTGTGTCTCACTTTAGGGAGACAGTGCCGAACTTACTCCTAGCTTTTTTTATATCTATCTAACGATGTTCTATTATTTTCAATCATGAAATATAACTGCAATTAACTTCACGATCAAATAATAGAGCAGACTTACAATTAACCACATTATCCCAATAACTGCAACTAAACCTATTAAAACAGATAATACCGTATTCTTAGTTGCTAGTTGGTTACTGATAAACCATGAAACTGCAAAAATAAATATCAGTAATAATAGTTGAAGCCTTTTTTTCATATAATTCCTCTTACTACTTTTGTGCATTTTGCATTTGATAATAAATACCTTTTTGAGCCATTAATTCAGAGTGGTTACCCACTTCTACAATTTCACCAGATACCATAACTAAAATAATATCTGCTGTTTGAATGGTAGATAAGCGATGTGCAATAATAAAGCTTGTTCTCCCCTTCATCAACATTTGGAATGCTTCTTGAAATAGACGATGTCGCCTCATCTAATATCAATATTCTAGGTAATTTAAGAAAAATACGAGCAATTGTCAATAGCTGACATTGCCCCTGTGATAACGAATCTCCAGCATCTTCTAAATACGTATCATATCCATTCGGTAATTGTTTGATAAAGAAATCTGCATTAGCTGCTTTTGCAGCCTCTATCACTTCTTCACGGCTAGCTTTAGGATTGGCATATGCAATGTTATCGTGAATCGTAGCACTTTTTAACCACGTTTCTTGTAATACCATTCCAATTTCTTGCCTTAATTGTGATGGCTCATAATCAGTAATAGGCTTACCATCTAAAAGGATATTTCCCCCGTCAACTTCATAGAAACGCATTAATAAATTGATTAAAGTAGACTTCCCAGCACCTGTTGGTCCTACAATAGCGACCTTAGCTCCTGCTGGAATGTGTAAATTAATACCATTCAATAGTGGTTTTGATTTATTATAACCAAAAACAATGTTTTTAAAATCGATTTGACCTTTGACCGTTGATGAATCAAGTTTTTCTGTACCTGTTATATTTGGTGACGATTCTTCTAAAATAGAGTAAAGGCGTTCTGCACAAGCCAGAGTACTTTGCATCTCAGACAGGACGGAAGAGATGTCATTAAATGGCTTAGTATATTGATTGACATAATTTAAGAAAGTGATTAATTGACCAACACTAAAAGCCCCTGACATAATACGAAGGGCACCAATCCCTGCTAAGAAGCCATAAATCAAACTATTGATAATTGCTCCGTATCGGTAGTCACACGACTAATCAAGTCACCTATGCCACGTTTATCAAGGTAAGCTATAGGCAATAGATTCAACTTTTCCATTACAACCTTTCTTAAAGAAGCAACATAATGAAAAATTAAGCGGTTATAGAGCAGAGGATTAATCCATTGAATAATAGTATTTGCTAAAATAACTGCAATCATCTTCCACATTATAGGTAACAATAATATCATAGAATGAGGCGATAATACAACGTCTACCGCTTGTCCAATTAGAACAGGCAAATAAACAGTGAGGCAAACTTGTACAACCGTCCCTAATAATGCCATTCCTACTAAGCTTTTTTTAGAAAGAAGATCTTGAACAAGCTTTTTTTGTATCTTTTTAGGATGACTTGCTTTCATTTACTCCTCCTCCTTAAAATTTTGTGAATGGTAAATGGACTTATAAACTTTGTTATGAGCTAATAAAGATTGATGATTATCAAAACCAACTTGTTTCCCCTTATCAAGGAGTAAGATTCTATCTGCATTTTGTATACTATTAATTCTCTGTGATACAATAATAAGATTAGTTTGGTTGAAATGTTTAGTTATAGCTTTAAATAAACGAGCTTCTGTTAAATAATCCAATGCAGATGTTGCATCGTCTAAAATCAAAAATGGTATCTTATCTTGAACTAAAGCTCTTGCAATCGTCAACCTTTGCCTTTGACCACCAGAGAAATTCCTACCAAAACTCTCTACAGAGGCATCAAGTTGACCATCTTTTTCTTTTACAAAATCACTAGCTTGTGCTATTTCTAAAGCAGTCCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019829|944444:954296|944444_946163_+|AUP28090.1|DBSCAN-SWA MTYTENFQKWLDFEQLPDYLRQELLSMDEKTKEDAFYTNLEFGTAGMRGYIGAGTNRINIYVVRQATEGLAKLIETKGEDAKKRGVAIAYDSRHFSPEFAFESAQVLAQHGIKSYVFEALRPTPELSFAVRHLNAYAGIMVTASHNPAPFNGYKVYGQDGGQLPPADADALTDFIRAIENPFAVELADLDESKSAGLIQVIGEDVDIEYLREVKDVNINQDLINNFGKDMKIVYTPLHGTGEMLTRRALAQVGFESVVVVESQAKADPDFSTVKSPNPESQAAFALAEELGREVDADVLVATDPDADRLGVEIRQPDGSYKNLSGNQIGAIIAKYILEAHKTAGTLPENAALAKSIVSTELVTKIAESYGATMFNVLTGFKFIAEKIQEFEEKHNHTYMFGFEESFGYLIKPFVRDKDAIQAVLLVAEIAAYYRSRGLTLADGIDEIYKEYGFFAEKTISVTLSGVDGAAEIKKIMDKFRENGPKQFNNTDIVLLEDFQKQTATKNDGTISNLTTPPSNVLKYTLADDSWIAVRPSGTEPKIKFYIATVGNDLADAETKIANIEKEITTFVN >CP019829|944444:954296|947057_947348_-|AUP28092.1|DBSCAN-SWA MVKKAYSWETKLACIEMKKAGKSNRFIMETLGIKNDSQIYTWVKWHENEELYRFHQGVGKQYTYGKGLEHLSEVEQLQLQVDLLKKYRGLIRKSIK >CP019829|944444:954296|947477_947675_-|AUP28093.1|DBSCAN-SWA MKKRLQLLLLIFIFAVSWFISNQLATKNTVLSVLIGLVAVIGIMWLIVSLLYYLIVKLIAVIFHD >CP019829|944444:954296|951510_952347_-|AUP28096.1|DBSCAN-SWA MMDFYIKQIIIHQFSPNDTELVLSDTPLTLTPRIDDYFRKKLSKVFSDEAKRGYFGEDNVFMSHLQDDLYVSSCQIAQLWKEEFVISEDQKTNDLVFIQFDKDGMEHFAFLRISLKEQFAHVSENQEQPITITQNNLPSAAQTPDEALVVNKSSKQYYLIEKRIKHNGSFANYFSENLLQVEPEQSVKKSIKMVEQTAQKIAENFNKDDFSFQSKMKSAIYKNLEEEQELSPEKLADQLFDDNLTARLTFVDELKDAIPGPVQVSDIDHSRQIKKLEN >CP019829|944444:954296|952351_953608_-|AUP28097.1|DBSCAN-SWA MIFDKDNFKEFDQELWQAIHDEEIRQQNNIELIASENVVSKAVMAAQGSVLTNKYAEGYPSHRYYGGTDCVDVVESLAIERAKTLFNAEFANVQPHSGSQANAAAYMALIEPGDTVLGMDLAAGGHLTHGASVSFSGKTYHFVSYSVDPKTEMLDYDNILKIAQETQPKLIVAGASAYSRIIDFEKFRQIADAVDAYLMVDMAHIAGLVASGHHPSPISYAHVTTTTTHKTLRGPRGGLILTNDEAIAKKINSAVFPGLQGGPLEHVIAAKAVALKEALDPSFKIYGEDIIKNAQAMAKVFKEDDDFHLISDGTDNHLFLVDVTKVIENGKKAQNVLEEVNITLNKNSIPFERLSPFKTSGIRIGTPAITSRGMGVEESRRIAELMIKALKNHENQDVLTEVRQEIKSLTDAFPLYEN >CP019829|944444:954296|950765_951368_-|AUP28095.1|DBSCAN-SWA MFKFLKRLIALIIIIFIGYRLVIIHENVKKVLQYHDLVQNTLAENGSEANVHLVLSMIYTETKGDAIDVMQSSESISGTTNSITDSHTSIKHGVTLLSQNISQAKKAKVDVWTAVQAYNFGSSYIDYVADHGGENSIELAKNYSKNVVAPSLGNYNGDTYFYYHPLALISGGKLYKNGGNIYYSREVQFNLYLIKIMELF >CP019829|944444:954296|953699_954296_-|AUP28098.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNDLGQILEDHGAVIMPTETVYGIFAKALSEEAVNHVYELKKRPRDKAMNLNICDFETVLKYSKNQPTYLKQLYDAFLPGPLTIILEASQEVPHWINSGLSSVGFRMPKHPVTLDMIANHGPLIGPSANISGCDSGRVFSEIQKQFNHQVLGIEDDKALTGVDSTIIDLSGDRVKILRQGAITQEVLTATISELIFEN >CP019829|944444:954296|949032_950754_-|AUP28094.1|DBSCAN-SWA MKRLTYYFKGYIKETIFGPLFKLLEASFELLVPIVIAKMIDETIPRGDRSSLLLQIGLIFFLAAVGVVVAITAQYYSSKAAVGYTRQLTEDLYQKVMSLGKKDRDELGTASLITRLTADTFQIQTGLNQFLRLFLRAPIIVFGAIIMAFSISPSLTIWFLVMVVTLFIIVFVMSRLLNPIYLKIRTSTDYLVKLTRQQLQGVRVIRAFNQVDRESEAFNDINYHYTNLQLKAGRLSSLVTPLTFLVVNITLVVIIWRGNLNIANHLLSQGMLVALINYLLQILVELLKMTMLVTSLNQSYISAKRIIAVFERPSEIIDDKLEPKYSNKALEVQEIAFSYPNSSEKALSDITFSMNVGETLGIIGGTGSGKSTLVNLLLHIYKVQEGDIDIYHQGKSPDTISNWRTLVRVVPQNAQLFKGTIRSNLSLGLGKVSEEKLWTALEIAQASDFVKEKDGQLDASVESFGRNFSGGQRQRLTIARALVQDKIPFLILDDATSALDYLTEARLFKAITKHFNQTNLIIVSQRINSIQNADRILLLDKGKQVGFDNHQSLLAHNKVYKSIYHSQNFKEEE >CP019829|944444:954296|946218_947043_-|AUP28091.1|DBSCAN-SWA MEDYKNNYPISVILDCFDVKRSTYYRWKKKYEKPQETDEVIELIEQLCMENHFIYGYRTITRLLKKIHELTVNAKKVYRIMKDNGWLCRTRPKKSPNLGKTYYLTDNKLNRDFHADKPLEKLVTDITYLYFGNCKLYLSSIMDLYNREILAYTISDCQDTDFVIDTLNQLKLPKGAVLHSDQGSVYTSKAYYQACTEKGIIRSMSRKGTPADNACIEWFHSVLKTETFYLHDRRKYNKDSITNIVKNYITFYNETRIQRHLKNQSPVQFRKLAS |
9 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1349447 : 1360130
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019829|1349447:1360130|DBSCAN-SWA TATGAAACTCATTTCATGGAATATTGATTCCCTCAATGCGGCATTAACAAGTGAATCAACACGTGCTTTAATGTCACGCCAAGTTATTGATACTTTAGTTGCTGAAGATGCCGACATCATTGCGATTCAAGAAACTAAACTGTCTGCCAAAGGGCCTACTAAAAAACATTTGGAAGTACTTGAAACTTACTTCCCAGCATATGATTTGGTTTGGCGATCATCAGTCGAACCTGCTCGTAAGGGCTATGCTGGTACAATGTTTTTATATCGTAAAGGGTTAAATCCTATTGTTAGCTTCCCTGAAATCGATGCTCCTACTACAATGGATAATGAAGGTCGCATTATTACTCTCGAATTGGAAAACTGCTATATCACACAGGTCTATACTCCAAATGCAGGTGATGGCCTAAAGCGCTTAGCTGACCGTCAAATATGGGATATTAAATATGCTGAGTATTTAGCAACATTGGATAGTCAAAAACCTGTTCTAGCAACAGGTGACTATAACGTAGCCCACAAGGAAATAGACCTAGCTAATCCTAGCAGTAATCGTCGTTCTGCTGGATTCACAGATGAAGAGCGCCAAGGCTTTACAAATCTACTAGCTAAAGGTTTTACAGATACTTTTCGTTACCTTCATGGCGATGTTCCAAATGTTTATAGCTGGTGGGCACAACGAAGTCGTACATCCAAAATCAACAATACAGGGTGGAGAATTGATTATTGGCTAACAAGTAACCGTGTCGCAGATAAAATTACCAAGTCAGAAATGATTCATTCTGGTGATCGTCAAGATCATACACCAATTATTTTGGAGATTGAACTATAAACCAAAAAAGATGATTGAGTTATAACTCAATCATCTTTTTATACTAAGTTGAGGTCTTTATACTTAGTACGGTAGCCAATCTGAAGAATTTTATTATCTTTAACTAGCAATGGACGCTTAATAAGCATCCCATCCGATGCCAATAAGTCCAAAGCTTGGTCAAGAGTTAAATCATCAAATTTATCTTTTAAGCCTAATTCTCTGTAAGAATTTCCTGAAGTATTGAAAAACTTTTTAAGGTCATAAGGCGAATTCTCTAACAATTCTTTTAATAACGAAGCTTTGGGAGGATTGCTTTTTATATCAATAGCTTCAAAAGTTAAGCCGAGTTCAGTTAACTCTTTTTTTGCTGAACGACAAGTGGTACATTTGGGGTATTCATAAAACGTATACATATTATTTCTCCTTTTCGTATTCTAATAACCAAGATTTTCTTTCTAAGCCACCAGCATAACCAGTTAATTGACCATATCTTCCTAAAACACGGTGACAAGGTATGATTAGAGAAATAGGATTTTTACCTATTGCTCCTCCAACAGCCTGTGCAGATTGACAATTTAGCTCTTTCGCTAATTCTCCATAAGTTTTTGTATCTCCAAAAGGGATTTTCTGTAATTCCTGCCATACTCTCATCTGAAATGCTGTCCCTCTCAATGATAATGGAATACTAGGTAAATTTTGCTGTGAAAAATAAGCATCTAACCACTTCTTACCAAGTAAAGTATAGGAATTTGACATATTAACAATTTCCTCTTGGTTGACTGCTAGCATATCATATTTTTGCCCAACAAAATAAAGCCCTGATAAACCTAGATTGTCTGCTAGAAGGCGAATTTCTCCAAGAGGGGACTGATAGAATTCTTGATATAACATATGATAAGCATAACTTAAAAAGCCATGAAAAGCAATTCATGACTTTTTTTTAGTTCTTTATTGTTGTTTTGCAATTAAACGTACACGGACGATATTCTCATCACCTTCAAATTCTTCAATTAAAGTAGAAATCTTGTTATTATCCGTTTCATCTAAATCTATTAGTGTGTAGGCGTAGTCACCCTTTGAACGGTTAATAATGTTATCAATATTTATACCTAACTCTGATACAGCAGTTGAAATTTTAGCCACAATGTTAGGAACATTCTTGTTAATTAAAGTAATACGAAATGGTGCGGTTTGAATTTGATGTACATTGGGGAAATTAACTGAATTAGTGATTTCTCCTGTCTCCATAAAACAACGAATGGTTTGACTTGCCATAATAGCACAATTTAGCTCTGCCTCATCTGTTGATCCGCCTACATGAGGAAAGACTGTAATTCCTTTTTGGTTTAATAATTCTTTGTCTCCAAAATCAGTAATATAGCGCTTGACAACACCAGTTTCTATCGCTTCAAATAGCTCTTGGTTATTGACTAATTCTGCACGAGCAAAGTTGATAATCGTCGTTCCTTTTTTCATGATTGAAAAAGCTTCCGCATCAAAAGTATGCTTAGTTTCATTTGTTAAGGGAACATGAATTGTGATATAGTCACAAGTTTCAAAAATATCCTTAATCTCTTTAACCCTTTGAACATGGCTTGAAATATTCCAAGCTGTTTCAATTGAAACATAGGGATCATAACCAAGAACTGTCATTCCTAAGCGTCTAGCATCATTCGCAATTCTAGCTCCAATGGCACCAAGGCCGATAACTCCCAATTTTTTTCCTGCAATTTCATTACCAGCAAAAGCTTTCTTTCCTGCTTCAATTTGTTTGGGAATATCTGTTCCAGTTAGAGTATTAACCCATCGGTTAGCTCCTAAATAATCACGAGCTGAAAGTAATAAGGCAGCAATGACCGCTTCTTTTACAGCATTAGCATTTGCACCTGGGGTATTAAAGACGACTATTCCCTGTGCACTTGCCTCTTCAATAGGAATATTATTTGTTCCTGCACCCGCCCTAGCAATAGCTTTGAGGTTACTTGGGAAATCTTGATTATGCAAATTTTGACTACGAATAATATAGGCATCAGGATTTTCTGACATATCCCCATCAATCTGGAAACGATTCCCTAACTCTTGTAAACCAATTTGATTAATATTATTAAATGTTTTGACACTAAAAACCATTCTTTTTCACTAAGGTTATCTCTTTAGTCATCATTGACTAAAATAACCCCTTTCTTTTTTTCTTACATGGGATTTCTTTCATCAATCTCACGATAGATGCTCGTTTCTCCCTTTTCTTTTATCTTCTGATAAGCCAATCGTACCCCATCTAGAGGTACTTTACCACAATATTGATAGCCTAATTTATTTAGAATATGCTGCATAGTGACATTTTTTTCATGAGTATCGCAACGAAAATCAGGTCCTTTGTGACCTTCAATTAACCCTTGAAGGAATGTCTGTGCTAGTCCTCTACCACGAAATTGATTTGAGATAGCAATACGATGAAATGTAAGATAGCGATGGTTATCATGGAGCCATTTTCCCTCATAAATAGCATCATAAACCTCTTCATGACCATCAATGACAGCCGCATAAGTCGCTAGCATCCCATCTTCAATACCAACCCAAGCATAACCGTTCAAGATATCATCAATAATATCGTTACGATTAGGGTATCCATCTTCTTTTTGCCATTGATCACTTCCTGTTTTAGCAATTTCGGCACGCGCTTCCTCAATAAGAAGCATAATTTGGTCAATTTCATTTGGAAAAGCTAATCTGATTTGCATTATATTACCCACTTTTATATATTATAGACTATAATAACGGTTTAATTTTCTTTCGTGATAACATTTACTATGCATTTTCTGCTTCAAATGTTTTCATAAAATCAATTAATTCGATGACACCTTGTTTAGGAAAGGCATTATAAAGGCTAGCCCTCATACCACCTACCGAACGATGCCCTTTAATATTTTTAAATCCACGTTCTGTCGCTTCCTTTACAAATTTTTCATCTAAATCTTTATTAATAGTTATGAAAGGAATGTTACATAGAGAACGACTCTTTTTATCTCTGACAGGATTACTATAAAATTCTGAGGAATCAATATAATCATAGAGAAGTCCTGATTTTTCACGGTTAGCTTTTTCCATAGCATCAACACCACCTAGACTTTTCACCCATTCAAAGACTAATTTAGCAATGTAAATACTGTAAGCAGGCGGCGTATTATAAAGAGAACCAGCATCTGACTGAATCTTATAATCCAACATTGATGATAAAGTTGGTTCCTCATTAATCATATCTTCACGGATAATAACTACCATTACACCAGCAGGTCCAATATTTTTTTGAGCTCCTGCATAAATCATTGCAAAATCTTCTACTTTATATTTTACAGCTAAGATATTAGAAGACATATCCGCAATAACAGGCACTCCATTAGTTTTAGGAGTATCATAAAGCGATGTTCCTTCAATGGTATTATTTGTTGTCACATGAACATAGGCAGCTTCAGGATCAATCTCTTTTTCATCAAACTCTGGAATATAATCATAAACTGATTCTTCTGATGAGGCTAATAGAATTGGTTCAAAAGGAATTGTTTTTGATAGTTTTACAGCCTCTGTATAAGCTTTTTTCCCCCACGAACCAGCAACATGATAGTAAGCTTTACGCCCTCTGGCAATATTCAAGGGAATCATACTAAACTGTAAGGATGCACCACCTTGTAAAAAGATTACTTTATAATTATCCGGAATTCCCATCAAATCTCTTAAGTAACGCTCAGCACCTTTGATAATATCATCAAACTCTTTGGAGCGGTGCGATACCTCCAAAACACTCATACTGGACCCTTGATAATTAAGGAGTTCAGATTGGGCTTTTACAAGCACTGGTTTTGGTAAGACTGCAGGACCTGCAGAAAAATTATAAATTGTCATATAACACCTCCATATAATAGTGTAAGATTATAGCACAGTATTTTGAATATTGTAAAGATTTTTTTGATTAATTTTGCTTTTTATTCGTGATATAATGGTAAAGGCGAACAATCAAGTTTAAAGGAGTAATTTATGATTTTGAGGGAATTTTGTGCAGAGAATTTAACAGACTTAACCAGATTAGATAAAGCTATTATTTCACGTGTCGAGCTTTGTGATAACCTTGCTGCTGGAGGCACTACTCCTAGCTACGGTGTTATCAAAGAAGCTAATCAATATTTACATGAAA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ACCATATTCCAATACATAAATTCTCTCTGTTACTTGCATAACCAAGTTCATATCATGTTCAATCAGCATAATAGTAATATCAAAATCATTCTTTATTTGACTAATTAACTGCGTCAATTCTGCAGTTTCTTGAGGATTCATTCCTGCTGCGGGCTCATCCAAAAACAATATTTTCGGTTCTGTTGCTAAAGCACGAACAATTTCTAAACGCCGTTGTTTTCCATAAGGGAGGTTCTTAGCAAGAGCATCTTGATATGCTTTCAAACCAAAAATCTCTAATAGCTCTAGGGCCTTTTTCCTTAAGGCTTTTTCACTATGATAGTATTTGGGTAATCGTAAAAAACTAGCAATAGAATGTGATAAGTGATGATTACTGAGTCCTACTAGTACATTATCTAAAACAGTCATATTTTTAAAAAGTCGGATATTTTGAAAAGTTCTACCTAAACCTAAAGAAGCTATTTTAGCTGGTTTCCTCCCATTTAATATCTTATCATCAAGTGATATTGTCCCTTTACTAGGAAGGTATACTCCTGTTAAGAGATTAAAAAGCGTTGTCTTACCCGCACCGTTGGGGCCGATTAAGCCAATTAATTCACCTTTATGTAATTTCATCGAAACATCACCTACAGCAGTTAGGCCACCGAAATGTTTACTTAAATTTTTTACTTCAAGAAGTGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019829|1349447:1360130|1355145_1355925_-|AUP28477.1|DBSCAN-SWA MTFRAIRILREVDFICAEDTRNTGLLLKHFDITTKQISFHEHNAYDKISGLIDLLKEGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIEGDIPVVSIPGASAGITALIASGLAPQPHIFYGFLPRKKGQQITFFETKKDYPETQIFYESPFRVSDTLKHMKEIYGDRQVVLVRELTKLYEEYQRGTISQLLWHIEKVPLKGECLIIVDGKRDTERVKDSSQQDPLVLVKEYIANGDKTNQAIKKVAKELNLNRQELYASFHDL >CP019829|1349447:1360130|1350313_1350670_-|AUP28471.1|DBSCAN-SWA MYTFYEYPKCTTCRSAKKELTELGLTFEAIDIKSNPPKASLLKELLENSPYDLKKFFNTSGNSYRELGLKDKFDDLTLDQALDLLASDGMLIKRPLLVKDNKILQIGYRTKYKDLNLV >CP019829|1349447:1360130|1357253_1357889_-|AUP28480.1|DBSCAN-SWA MKKGLMISFEGPDGAGKTTVLEAVLPLLREKLSQDILTTREPGGVTISEEIRHIILDVKHTQMDKKTELLLYMAARRQHLVEKVLPALEEGKIVLMDRFIDSSVAYQGSGRGLDKSHIKWLNDYATDSHKPDLTLYFDVPSEVGLERIQKSVQREVNRLDLEQLDMHQRVRQGYLELADSEPNRIVTIDASQQLDEVIAETFSIILDRINQ >CP019829|1349447:1360130|1359365_1360130_-|AUP28483.1|DBSCAN-SWA MALLEVKNLSKHFGGLTAVGDVSMKLHKGELIGLIGPNGAGKTTLFNLLTGVYLPSKGTISLDDKILNGRKPAKIASLGLGRTFQNIRLFKNMTVLDNVLVGLSNHHLSHSIASFLRLPKYYHSEKALRKKALELLEIFGLKAYQDALAKNLPYGKQRRLEIVRALATEPKILFLDEPAAGMNPQETAELTQLISQIKNDFDITIMLIEHDMNLVMQVTERIYVLEYGRLIAHGTPEEIKNNKRVIEAYLGSEV >CP019829|1349447:1360130|1356370_1357234_-|AUP28479.1|DBSCAN-SWA MDLKRTQPKLLEKFNTILQSDRMSHAYLFSGNFASLDMALYLAQSQFCEKRQSGLPCQECRACRLIANGEFSDVKIIEPQGQLIKTETIKELTKDFSRSGFEGKSQVLIIKDCEKMHVNAANSLLKFIEEPQSSSYVILLTNDENNVLPTIKSRTQIFRFPKQLDMLVHQAEQAGLLKSQASLLAQVADDPKHLEILLTNKKLLDYLNLSQQFVTTLAKDRQTAYLEVSRLTSQVVDKNDQAFVFQWLTIMLAKEGQLYDLENTYRAQQMWKSNVSFQNSLEYMVLS >CP019829|1349447:1360130|1354289_1354925_+|AUP28476.1|DBSCAN-SWA MILREFCAENLTDLTRLDKAIISRVELCDNLAAGGTTPSYGVIKEANQYLHEKGISVAVMIRPRGGNFVYNDLELRIMEEDILRAVELESDALVLGILTSNNHIDTEAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDVIPKSDQKKSIDQLVALGFTRILLHGSSNGEPIIENIKHIKALVEYANNRIEIMVGGGVTAENYQYICQETGVKQAHGTRITQ >CP019829|1349447:1360130|1352449_1352998_-|AUP28474.1|DBSCAN-SWA MQIRLAFPNEIDQIMLLIEEARAEIAKTGSDQWQKEDGYPNRNDIIDDILNGYAWVGIEDGMLATYAAVIDGHEEVYDAIYEGKWLHDNHRYLTFHRIAISNQFRGRGLAQTFLQGLIEGHKGPDFRCDTHEKNVTMQHILNKLGYQYCGKVPLDGVRLAYQKIKEKGETSIYREIDERNPM >CP019829|1349447:1360130|1353065_1354157_-|AUP28475.1|DBSCAN-SWA MTIYNFSAGPAVLPKPVLVKAQSELLNYQGSSMSVLEVSHRSKEFDDIIKGAERYLRDLMGIPDNYKVIFLQGGASLQFSMIPLNIARGRKAYYHVAGSWGKKAYTEAVKLSKTIPFEPILLASSEESVYDYIPEFDEKEIDPEAAYVHVTTNNTIEGTSLYDTPKTNGVPVIADMSSNILAVKYKVEDFAMIYAGAQKNIGPAGVMVVIIREDMINEEPTLSSMLDYKIQSDAGSLYNTPPAYSIYIAKLVFEWVKSLGGVDAMEKANREKSGLLYDYIDSSEFYSNPVRDKKSRSLCNIPFITINKDLDEKFVKEATERGFKNIKGHRSVGGMRASLYNAFPKQGVIELIDFMKTFEAENA >CP019829|1349447:1360130|1349447_1350275_+|AUP28470.1|DBSCAN-SWA MKLISWNIDSLNAALTSESTRALMSRQVIDTLVAEDADIIAIQETKLSAKGPTKKHLEVLETYFPAYDLVWRSSVEPARKGYAGTMFLYRKGLNPIVSFPEIDAPTTMDNEGRIITLELENCYITQVYTPNAGDGLKRLADRQIWDIKYAEYLATLDSQKPVLATGDYNVAHKEIDLANPSSNRRSAGFTDEERQGFTNLLAKGFTDTFRYLHGDVPNVYSWWAQRSRTSKINNTGWRIDYWLTSNRVADKITKSEMIHSGDRQDHTPIILEIEL >CP019829|1349447:1360130|1357977_1358637_-|AUP28481.1|DBSCAN-SWA MPVKDFMTKKLVYVSPDTTVAEAADLLREHHLRRLPVVENDQLVGLVTEGTMAEAQPSKATSLSIYEMNYLLNKTKIRDIMIKDIVTVSQYASLEDAIYLMMSRKIGVLPVVDNGQLYGIVTDRDVFKAFLEIAGYGQEGYRLVILADEGIGVLSKVLNRLSSANLSVKRLVIIERKAGKKAVEIQLEGYADKDVLKQELVFDDVIVETLEKTVKKPLS >CP019829|1349447:1360130|1351205_1352387_-|AUP28473.1|DBSCAN-SWA MVFSVKTFNNINQIGLQELGNRFQIDGDMSENPDAYIIRSQNLHNQDFPSNLKAIARAGAGTNNIPIEEASAQGIVVFNTPGANANAVKEAVIAALLLSARDYLGANRWVNTLTGTDIPKQIEAGKKAFAGNEIAGKKLGVIGLGAIGARIANDARRLGMTVLGYDPYVSIETAWNISSHVQRVKEIKDIFETCDYITIHVPLTNETKHTFDAEAFSIMKKGTTIINFARAELVNNQELFEAIETGVVKRYITDFGDKELLNQKGITVFPHVGGSTDEAELNCAIMASQTIRCFMETGEITNSVNFPNVHQIQTAPFRITLINKNVPNIVAKISTAVSELGINIDNIINRSKGDYAYTLIDLDETDNNKISTLIEEFEGDENIVRVRLIAKQQ >CP019829|1349447:1360130|1358655_1359366_-|AUP28482.1|DBSCAN-SWA MTMLKVENLSIHYGVIQAVNDVSFEVNQGEVVTLIGANGAGKTSILRTISGLVRPSQGSISFLGKPIHKLAARKIVGNGLAQVPEGRHVFSSLPVMENLEMGAFLQKDREQNQKMLKKVFDRFPRLEERKNQDAATLSGGEQQMLAMGRALMSRPKLLLLDEPSMGLAPIFIQEIFNIIEDIKKQGTTVLLVEQNANKALTIADKAYVLETGKVVLSGTGKELLVSDQVRKAYLGG >CP019829|1349447:1360130|1356013_1356325_-|AUP28478.1|DBSCAN-SWA MFDAFDDFSQNLLVGLSEIETMKKQIQKLLEENTVLRIENGKLRERLSVIEAETETAVKNSKQGRELLEGIYNDGFHICNTFYGQRRENDEECAFCIELLYRD >CP019829|1349447:1360130|1350671_1351148_-|AUP28472.1|DBSCAN-SWA MLYQEFYQSPLGEIRLLADNLGLSGLYFVGQKYDMLAVNQEEIVNMSNSYTLLGKKWLDAYFSQQNLPSIPLSLRGTAFQMRVWQELQKIPFGDTKTYGELAKELNCQSAQAVGGAIGKNPISLIIPCHRVLGRYGQLTGYAGGLERKSWLLEYEKEK |
14 | Streptococcus_phage(84.62%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1811508 : 1818713
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP019829|1811508:1818713|DBSCAN-SWA ACTAGTAACCCCAAGCTGATAAACCTTGAGCACGATAAGCTTTAATAGCTGAATTAACTTGATCCTGAACTGTAGCTGTTGAACCCCAACCTGGCATCGTTTGGAAAAGTCCTGAAGCTCCTGAGGCATTAGCAACATTAGGATTACCATTTGATTCACGGGCAATAATATGTTCCCAAGTAGACTGAGGGACTCCTGTTGCAGCAGCCATTTGTGCTGCAGCTGCTGAGCCAATAGCCCCTGCAGTATTTCCATTACTCAATACTTGGCCACTCGTCTGGTGTTGAGCAGGTCTATAAGTTGTCTCAGTAACAGCATAAGCTTGTTGTGCCTGACTGGTAGCAGGGGTGTTTTCTGTTACAACTGCTTGTTCTACAGCTGCCTCTTCACTCGCAGTAACTTGTTGCTGAGAATTAGCTTCTGTAGATTGAGAACTTGATTTTGGGGCTTCATTAGATGCCTGAGAAGGTTTTGGAGCCTGTTTTACATCTTCTACTTTTGATTTAGATGTCGCCTTAGTCATTTTTGATTTTTTGGCTACGCGAACTTTATCTGCTTTTGACAAAGATTCAGTAGTAACTTGTGAACTTTTAAAGATGACCGTTACAGCCAAAATACATGAAAAAAGGGCTACTAAAGTGATAGCTCCATAAGCTAAATGTTGTTTTTTTACATTCAATTTTGATAATTTTCTTCTTTTATTCATGTTACCTATATTATACTTTATTTGTTACCTTGCAATTGAATAGATGTTAAAAATATTACAAAGAGATTTAATTTTAAGTAAATCTCTTTGTTTTATCAACTTTTATTAATACCAGCCGTTACTATTCCAAAATGATAGCGCTGCCGACCAAGATCCGTAACGAGAAGCCACATAATTGTCCGCTACTTTTTCTTGATTTTCAGGAGATAAGTCGCCATTTAGGTAAGATTGAGACAGTTGATATCTTCCATAATATTGTCCATTCTGTGCAGTATAACTACCATTTGATTCACGACGAGCTATTTCTTCTTTTGCAGCTGAATCACTTGAACTCAAATTTGATGAAGAATTCATTGAATTTTCAATTGTTGGTTGAGATTTTGCTTCTGCTTGACTAGTTGTAGAATTATCCAATTTTAAAACATCACCTATACTGATGACATCAGCGTTACTGATACTATTGAGAGACACTAACTCTTGTACCGTAGTTTTATGATTTTTAGCAATAGCTGATAAGGTATCACCTGATTTCACGGTATAAGATGCTGCGCTTACTGAAAGTGGTAAAGCTAATGAAGCACCCACTAAAAGACCTGCCACTCCTAATTTAAATGGTTTTGATTTTTTAACCGAGGTTATTGACATAATATATGCTCTCTTTCATTAATTGATACGCGTACTATCATACCTTGTAAATATTACTAATTGTTTTGCCTTAGATGAAATTTATTACAAATAAATTGTAAATTAATAAAGAAAAGGCCTCCAAAAAACAATTTTTAGTTTTCTTTAAGTAAAGTTGTTGAGCTTTTCACATTATATAAATGAAAAGGCTAAGACCATAAACTGACCTTAACCTTTTAATTTTTTAATAGAAACAAACTCAAACCCAATAATAACATAAGTAATATACTAAAAGTATCCCGAACAGTCCACTTCAATAAACGGTACTTACTACGATTGGCTCCGCCTTGATAACCTCTTGCTTCCATAGCAATTGCCAACGCATCTGCTCTTTTAAAACTAGAAGCAAATAATGGAATCAAAATAGGGATAATGGACTTAACCTTATGAATTAGGTTTTCCTCTCCAAAATCAACTCCACGAGCTCTTTGAGCATTCATGATACGTGTTGTATCATCCATTAAAGTAGGAACGAAACGTAAGCTAAGGGATAACATCAAACCAATCTCGTGTGCTGGTACTCTCAGTACTTCCAATGGTTTTAACAAAGATTCAACAGCATCTGCTAAACTTAACGGAGTAGTAGTTAAGGTAAGTAATGTCGAAAAGAAGATAATTAAAACAAATCTCATAAAAATAAGTGCTGCTTGTTGTAACCCAAGGCTAGTGATGCTAAAAATCCAAAACGAGAAGATAACCTGCCCGCCTTGTGCAAACAGCATCTGGAACAGGGTTGTAAATAAAATAATACCAACCATCGGTTTAATACCATTGAAAAAATAGGAAAATTTTATCTGAGATAAACCCACAATAACCAACGTAAAAATGAATACGATCACATTTGTCACTACATTATTTGCCCAAAAAACAATAATGATAAAAAGCAACATGGCTAGTAACTTACTTCGAGGATCTAATTTATGAATGAGAGAATTACCTGGTATGTAACGTCCCAAAATCAATTTATCCATGCTTAATAGCCTCCACAAATTCGTTAATAGTAATTGGTAAACTAGGTAAATTTAATCCCTTATGAGATAGTCTTTGAGCAAACTTGGTGATTTTGGGAACTCCTAATTGTTTACTTTCTAGAAGTTCTACTTCTTGAAAAATCTGTTTTGGTTGTCCTGATAGGGTTACTTTCCCTGCTTCTAAAACATACACATAGTCAGTATAATCCGCTACATCGTCCATTAAGTGAGTCACTAAGACGATGGTCATTCCTTTTTTATGAAGATTTTTAAAAAGAGTCATTAATTCTTTTCTTCCCTTAGGATCAAGTCCAGCAGTTGGCTCATCTAGTACTAGTACTTTGGGTTCCATCGCTAAAATACCAGCTATAGCAACCCGCCTCATCTGCCCTCCAGAAAGTTCAAATGGATTTTTATCGAATAAATCCTCACTAATACCAACTAACCTTAATTTTTCTTCAGCCAGCCTTTCAGCTTCAATCTGAGAAATACCAAAATTTTGTGGTCCAAAAGCAACATCCTTTAAAACTGTCTCTTCAAAAAGCTGACTTTCTGGAAATTGAAAAACTAAACCAACTTTTTGCCTTATAAATTTGATTTCTTTGTTCTTGTCCCCTGCTTTAATAGAAAAATCATCGACAATTACCTCACCTTTTGTAGGAATATGTAAACCATTCAAAAGTTGCATAATAGTTGATTTTCCAGAACCTGTGTGCCCAATGAACGCGGTATAGGAAGCATCTTCAATTTTCAGATTGACGTCAAAAAGGGCACGCCCTTCAAAAGGAGTGCCGGCTTGATAGGTATAACTTACATTTTTAAATTCAATTCCCATAATTGTTCTTCTAATTCCTTCTCTGTAAGATACTCTGTCCCTATATCAAGACCATTAGCAGCCAGTGCTGCCATTAACCTACTTGTAAAGGGAACATCTAAACCTAAACTAATCAAATGATTTCCACGACCAAATAACGCTTTTGGAGTGGATGTTGACTCAACTTTACCATTTTTCATAACGATGACACGATCACTCAATGCAACTTCATCTAAGTCATGTGTAATTGAAATAACAGTAAGATTATATTTTTGACGAATAGCTCGTATCGTTCTTATCAGTTCCAATCGTCCCTCAGGATCAAGCATACTAGTCGCCTCATCCAAGATGATAACTTGTGGACGCATAGCTACAGCTCCTGCAATGGCTACACGCTGCTTTTGTCCTCCAGATAAACGTGCAGGCTCCCTCATTTTAAATTCAGACATTCCTACCAAATCAAGTGCTTGGTCCACTCTTTCTTTCATGTCTTTCAAAGAAATACCTTTATTTTCCAAACCAAAGGCAACGTCATCTTCAACAGTTGCCCCTACAAATTGGTTATCTGGATTTTGAAATACCATGCCAATCTTGTGACGTAACTCCCAGACATTATCTTCGGTTAACTCTTGTCCATCAATGATAATCTGGCCAGACTCCGCCTCTAAAAGCCCATCTATTAAACGAACAGTAGTGGATTTCCCAGAACCATTATGACCAATAATAGATAGCCATTCTCCTTGTTTCACATGAAACGATACATTCTCCAATTGATAATGTGTTTGATTACTATCATATTTAAAAAAGAGATTATTAACGGTAATAATATTTGTCATTATTTAAAAGTATCCTTAAATAAGAAGCCTGCACCTTTAAAATAGTCGTAGCCTGAATACAAGGTAAAGAATAAAGCAATGTATAACATGATGTTACCAAGTGTCATCCAATGTACTAACAAAAAAAATAACTGCAAACATTTGAGTAGCCGTCTTTATTTTCCCTGGCATAGCTGCCGCAAGTACTGTTCCACCTGTTTCAACTAAAAGTAAACGCAAACCTGTAACTGCTAGCTCTCTACAAATGATAATAGCTGAAACCCAAGCCGGTGCTAAGTCTAGTCCAACTAACATAATAAAAGCACTCATAACTAGCATTTTATCAGCTAATGGATCTGCAAATTTCCCAAAATTTGTTACTACTTGCCATTTACGTGCTAGATAACCGTCTAGGTAATCGGTCAAGCTTGCAATAGCAAATACAATAGCTGCAACAATATGCCAAGTTGTACTTGTTGTTACTGAAGTTAATACTATAAATAACGGAATCATTAAAATTCTGACTACAGTTAATAGATTCGGAATATTTTCTTTCTTCACCATAAATTCTCCTTTTGGAAACATAGTATTCCTATATTATGTTATTTCAAAACTAGTAAAAGACTTTTGACATACCAACTTTATAGATGTCTAAGCTTCCTTATTATATCAAAATTTCAGATTATTTACGAAGATTTTGGAAAAATAACGAAGTCAGATGTGTCAGCGTTATCTAAGAAATCCTTACCAATCGTAATGACATCTTCCAAGTCTAATTCTTCAACGATAGATGGCAAATCCAAATACATCGTTTTTCCATCATATAAATAGGTGACGAATTGCATTGCGAGATTTTCAATAGAATCTAAGCCCCTTAAAAAATCGCCATAGAGCTCTCTCTTAACGTTTTGTAAGTGGCTTTCGGTAAGATCAGATGATTGCAAAGCATTTTTTAGCAATAACCTCAACTGAGTTGAAAAAGCAATTGGCTCTGTCGTATCTAAAGAAAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP019829|1811508:1818713|1817468_1818713_-|AUP28913.1|DBSCAN-SWA MKIVEGVSLHLIKNQQFKTNHLTFRFSGDFNNKTVARRSLVAQMLVTANAKYPKVQEFREKLASLYGASLSTKISTKGLVHIVDIDIVFVKNTFTLEQENIVEQIITFLEDMLFSPLISLEQYQTSIFDTEKKNLIQYLEADIEDNFYSSDLALKSLFYNNKTLRLPKYGTASLVESENSFTAYQEFQKMLKEDQLDIFVVGDFDDYRMIQAFNRMAFEPRHKVLAFDYTQTYENITRSQVEDKDVNQSIMQLAYHLPITYKDEDYFALIVFNGLFGAFAHSLLFTEIREKQGLAYTIGSQFNSFTGLFTIYAGIDKENRERFLKLINKQFNNIKMGRFSSTLLKQTKDILKMNYVLASDNPKVIVDHIYHEHYLDQFHTSALFIDKVDDVTKSDIVSVATKLKLQAFYFLEGN >CP019829|1811508:1818713|1811508_1812213_-|AUP28906.1|DBSCAN-SWA MNKRRKLSKLNVKKQHLAYGAITLVALFSCILAVTVIFKSSQVTTESLSKADKVRVAKKSKMTKATSKSKVEDVKQAPKPSQASNEAPKSSSQSTEANSQQQVTASEEAAVEQAVVTENTPATSQAQQAYAVTETTYRPAQHQTSGQVLSNGNTAGAIGSAAAAQMAAATGVPQSTWEHIIARESNGNPNVANASGASGLFQTMPGWGSTATVQDQVNSAIKAYRAQGLSAWGY >CP019829|1811508:1818713|1813860_1814703_-|AUP28909.1|DBSCAN-SWA MGIEFKNVSYTYQAGTPFEGRALFDVNLKIEDASYTAFIGHTGSGKSTIMQLLNGLHIPTKGEVIVDDFSIKAGDKNKEIKFIRQKVGLVFQFPESQLFEETVLKDVAFGPQNFGISQIEAERLAEEKLRLVGISEDLFDKNPFELSGGQMRRVAIAGILAMEPKVLVLDEPTAGLDPKGRKELMTLFKNLHKKGMTIVLVTHLMDDVADYTDYVYVLEAGKVTLSGQPKQIFQEVELLESKQLGVPKITKFAQRLSHKGLNLPSLPITINEFVEAIKHG >CP019829|1811508:1818713|1812318_1812858_-|AUP28907.1|DBSCAN-SWA MSITSVKKSKPFKLGVAGLLVGASLALPLSVSAASYTVKSGDTLSAIAKNHKTTVQELVSLNSISNADVISIGDVLKLDNSTTSQAEAKSQPTIENSMNSSSNLSSSDSAAKEEIARRESNGSYTAQNGQYYGRYQLSQSYLNGDLSPENQEKVADNYVASRYGSWSAALSFWNSNGWY >CP019829|1811508:1818713|1814678_1815518_-|AUP28910.1|DBSCAN-SWA MTNIITVNNLFFKYDSNQTHYQLENVSFHVKQGEWLSIIGHNGSGKSTTVRLIDGLLEAESGQIIIDGQELTEDNVWELRHKIGMVFQNPDNQFVGATVEDDVAFGLENKGISLKDMKERVDQALDLVGMSEFKMREPARLSGGQKQRVAIAGAVAMRPQVIILDEATSMLDPEGRLELIRTIRAIRQKYNLTVISITHDLDEVALSDRVIVMKNGKVESTSTPKALFGRGNHLISLGLDVPFTSRLMAALAANGLDIGTEYLTEKELEEQLWELNLKM >CP019829|1811508:1818713|1816183_1817467_-|AUP28912.1|DBSCAN-SWA MTVNKITYQNLQEEVYKLTLESGLNVYLIPKPSFKETVGVLTANFGSLHTRYTRNGCVEHYPAGIAHFLEHKLFELDKGQDAATQFTKYGAESNAFTTFDKTSFYFSTISHITNCLDILLDFVLTTNFTEESITKEKDIIKQEIEMYQDDPEYRLYQGVLSNLYPNSPLAFDIAGDYQSISQITLTDLQENHKDFYQLSNMNLVLVGQFSPQEIITYLQKKSHFTSYSQNIDRDSISLEPVIKNNSCHMTVTKPKLAIGYRKSNHMIHGSYLKEKIGLQLFFAMLLGWTSTINQDWYESGQIDDSFDIEIEVHPDFECVIISLDTTEPIAFSTQLRLLLKNALQSSDLTESHLQNVKRELYGDFLRGLDSIENLAMQFVTYLYDGKTMYLDLPSIVEELDLEDVITIGKDFLDNADTSDFVIFPKSS >CP019829|1811508:1818713|1815611_1816082_-|AUP28911.1|DBSCAN-SWA MFPKGEFMVKKENIPNLLTVVRILMIPLFIVLTSVTTSTTWHIVAAIVFAIASLTDYLDGYLARKWQVVTNFGKFADPLADKMLVMSAFIMLVGLDLAPAWVSAIIICRELAVTGLRLLLVETGGTVLAAAMPGKIKTATQMFAVIFFVSTLDDTW >CP019829|1811508:1818713|1813073_1813868_-|AUP28908.1|DBSCAN-SWA MDKLILGRYIPGNSLIHKLDPRSKLLAMLLFIIIVFWANNVVTNVIVFIFTLVIVGLSQIKFSYFFNGIKPMVGIILFTTLFQMLFAQGGQVIFSFWIFSITSLGLQQAALIFMRFVLIIFFSTLLTLTTTPLSLADAVESLLKPLEVLRVPAHEIGLMLSLSLRFVPTLMDDTTRIMNAQRARGVDFGEENLIHKVKSIIPILIPLFASSFKRADALAIAMEARGYQGGANRSKYRLLKWTVRDTFSILLMLLLGLSLFLLKN |
8 | uncultured_Caudovirales_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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