Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP019833 | Streptococcus agalactiae strain SA346, complete genome | 1 crisprs | cas3,cas5,cas7,cas4,cas2,DinG,cas9,cas1,csn2,csm6,DEDDh | 0 | 0 | 4 | 0 |
1. CP019833
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP019833_1 | 817350-817444 | TypeII |
II-A
Consensus repeat of CP019833_1
|
1 spacers
spacers of CP019833_1
>1.1|817379|37|CP019833|CRISPRCasFinder CCAAAACTTATTCTATTGTTAAATCGTGTGTTGATGA |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019833_1
The CRISPR arrays of CP019833_1 >merge|CP019833|1|817350-817444|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACTTATTCTATTGTTAAATCGTGTGTTGATGAGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCAAATGGTT >CP019833|1|1|817350-817444|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTT CCAAAACTTATTCTATTGTTAAATCGTGTGTTGATGA GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCAAATGGTT
>CP019833.1|AUP34773.1|816583_817249_+|CRISPR-associated-protein-Csn2 MIKINFPILDEPLVLSNATILTVEDVSVYSSLVKHFYQYDVDEHLKLFDDKQKSLKATELMLVTDILGYDVNSAPILKLIHADLESQFNEKPEVKSMVERLAATITELIAFECLENELDLEYDEITILELIKALGVKIETQSDTIFEKCFEIIQVYHYLTKKNFLVFVNSGAYLTKDEVIKLCEYINLTQKSVLFLEPRRLYDLPQYVIDKDYFLIGENMV >CP019833.1|AUP34772.1|816255_816597_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MSYRYMRMILMFDMPTETAEERKAYRKFRKFLLSEGFIMHQFSVYSKLLLNNTANNAMIGRLKVNNPKKGNITLLTVTEKQFARMVYLHGERNTSVANSDSRLVFLGDSYDQD >CP019833.1|AUP34771.1|815389_816259_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAGWRTVVVNTHSKLSYKNNHLIFKDSYQTEMIHLSEIDILIMETTDIVLSTMLIKRLGDENILVIFCDDKRLPTAMLMPYYARHDSSLQLSRQMSWIEDVKADVWTSIIAQKILNQSFYLGECSFFEKSQSIMNLYHDLESFDPSNREGHAARIYFNTLFGNDFSREQDNPINAGLDYGYSLILSMFAREVVKCGCMTQFGLKHANQFNQFNLASDIMEPFRPIVDRIIYENRQSDFVKMKRELFTMFSETYNYNGKEMYLSNIVSDYTKKVIKSLNSDGNGIPEFRI >CP019833.1|AUP34770.1|811275_815388_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas9 MNKPYSIGLDIGTNSVGWSIITDDYKVPAKKMRVLGNTDKEYIKKNLIGALLFDGGNTAADRRLKRTARRRYTRRRNRILYLQEIFAEEMSKVDDSFFHRLEDSFLVEEDKRGSKYPIFATMQEEKDYHEKFPTIYHLRKELADKKEKADLRLVYLALAHIIKFRGHFLIEDDRFDVRNTDIQKQYQAFLEIFDTSFENNHLLSQNVDVEAILTDKISKSAKKDRILAQYPNQKSTGIFAEFLKLIVGNQADFKKHFNLEDKTPLQFAKDSYDEDLENLLGQIGDEFADLFSAAKKLYDSVLLSGILTVTDLSTKAPLSASMIQRYDEHREDLKQLKQFVKASLPEKYQEIFADSSKDGYAGYIEGKTNQEAFYKYLSKLLTKQEDSEYFLEKIKNEDFLRKQRTFDNGSIPHQVHLTELKAIIRRQSEYYPFLKENQDKIEKILTFRIPYYVGPLARGNSDFAWMTRKTDDSIRPWNFEDLVDKEKSAEAFIHRMTNNDLYLPEEKVLPKHSLIYEKFTVYNELTKVRYKNEQGETYFFDSNVKQEIFDGVFKEHRKVSKKQLLDFLAKEFEEFRIVDVTGLDKENKAFNASLGTYHDLKKILDKDFLDNPDNESILEDIVQTITLFEDREMIKKRLENYKDLFTESQLKKLYRRHYTGWGRLSAKLINGIRDRESQKTILDYLISDGRANRNFMQLINDDGLSFKSIISKAQSGSHSDNLKEVVGELAGSPAIKKGILQSLKIVDELVKVMGYEPEQIVVEMARENQTTNQGRRNSRQRYKLLEDGVKNLASDLNGDILKEYPTDNQALQNERLFLYYLQNGRDMYTGEALDIDNLSQYDIDHIVPQAFIKDDSIDNRVLVSSAKNRGKSDDVPSIDIVKARKAFWKKLLDAKLISQRKYDNLTKAERGGLTPDDKAGFIQRQLVETRQITKHVARILDERFNNKVDDNNKPIRKVKIVTLKSNLVSNFRKEFGFYKIREVNNYHHAHDAYLNAVVAKAILTKYPQLEPEFVYGDYPKYNSYKTRKSATEKLFFYSNIMNFFKTKVTLADETVVVKDDIEVNNETGEIAWDKKKHFATVRKVLSYPQVNIVKKTEVQTGGFSKESILAHSNSDKLIPRKTKDIYLDPKKYGGFDSPIVAYSVLVLADIKKGKAQKLKTVKELIGITIMERERFEKNPSAFLESKGYLNIRTDKLIILPKYSLFELENGRRRLLASAGELQKGNELALPTQYMKFLYLASRYNESKGKPEEIEKKQEFVNQHVSYFDDILQLINDFSKRVILADANLEKINKLYSDNKDNTPVDELAKNIINLFTFTSLGAPAAFKFFDKSVDRKRYTSTKEVLDSTLIHQSITGLYETRIDLGKLGED >CP019833.1|AUP34769.1|810244_810901_+|Membrane-protein MKDKLLVVLTWIWIISLATLATIYIAWLIYPIEIQFLKLEKVVYLKAETIYYNFNKLMIYLTHPFISDLNMPSFPSSEDGLKHFADVKYLFTLAHGLFVILTFPVIYFLRRGWKQKSIFLYEGFFKIAIMLPIFIVVCAFLLGFDQFFTLFHEVLFPGDSTWQFNPLTDPVIWILPETFFLHCFIIFLLIYETITIILLIIGRKHLKLRKYKNKMQAL >CP019833.1|AUP34768.1|809484_810255_+|HAD-family-hydrolase MAYKGYLIDLDGTIYKGKSRIPAGERFIEHLQEKGIPYMLVTNNTTRTPESVQEMLRGFNVETPLETIYTATLATVDYMNDMNRGKTAYVIGEEGLKKAIADAGYVEDTKNPAYVVVGLDWNVTYDKLATATLAIQNGALFIGTNPDLNIPTERGLLPGAGSLNALLEAATRIKPVFIGKPNAIIMNKALEILNIPRNQAVMVGDNYLTDIMAGINNDIDTLLVTTGFTTVEEVPDLPIQPSYVLASLDEWTFNEG >CP019833.1|AUP34767.1|808746_809484_+|Acyl-ACP-thioesterase MGLLYRETYEVPFYESDTNHYMKLPQLLALALQISAKQSLKLGIGDDIVFKRYGLVWVVTDYIIDIERLPKHAEKIVIETEAKAHNKLLCYRYFYIYGEDGQKIITISSAFVLMDFKTRKIHPVLDDITSIYQSQRIKKVIRGPKYHPIGDSKVKQYHVRYFDLDMNGHVNNSKYLEWMYDVLDLDFLSSHIPKKIDLKYIKEIQYGTDIKSHWYQDGLVTRHDIIGGDAIHAQARIEWQEKKED >CP019833.1|AUP34766.1|807612_808743_+|Coproporphyrinogen-III-oxidase MLKKPTSAYVHIPFCTQICYYCDFSKVFIKNQPVDAYLQALIREFRSYDITDLRTLYIGGGTPTSISAVQLDYLLTELSRDLNLNTLEEFTIEANPGDLTVDKIEVLQKSAVNRVSLGVQTFNDKHLKRIGRSHNEAQIYSTIDALKTAGFQNISIDLIYALPGQTMDNVRSNVAKALSLNIPHLSLYSLILEHHTVFMNKMRRGKLHLPTEDLEAEMFEYIISEMERNGFEHYEISNFTKPGFESRHNLMYWDNVEYYGVGAGASGYLDGIRYRNRGPIQHYLKGVSEGNARLSEEVLSKNEMMEEELFLGLRKKEGVSIGKFEQKFGTSFEKRYGQIVQELQSDGLLKENNGFIQMTKKGLFLGDTVAEKFIVE >CP019833.1|AUP34765.1|807139_807520_+|Pyrimidine-dimer-DNA-glycosylase MRLWHQDIIELLPRQQLLGQHRECCALRGNGWGRKHETIDYVFRYSPYRLFAYHQLVMEEMMERGYRVSKEWLVAEYRGMKCPRYDTLNPVDLETPIYPEHNQDYLQECLWNLKAKGIDLPINKIK >CP019833.1|AUP34764.1|806743_807115_+|hypothetical-protein MTKEAELLWAKHKYLVLSKSQKIYLDIRQTLKSPNCTVLDVQSLIDQAVLLEESPSQVTNAYMHIWGYFKNKAERQEKEEFLILLEKYRKTGYQRRKLLAFLKQLFAKYPNSYLQNSSIFEEE >CP019833.1|AUP34774.1|818074_818491_+|Nucleoside-diphosphate-kinase MEQTFFMIKPDGVKRGFIGEVISRIERRGFSIDRLEVRHADADILKRHYAELTDRPFFPTLVDYMTSGPVIIGVISGEEVISTWRTMMGSTNPKDALPGTIRGDFAQAPSPNQATCNIVHGSDSPESATREIAIWFNN >CP019833.1|AUP34775.1|818626_820459_+|Elongation-factor-4 MNIEDLKKRQEKIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILEKTETVSSREMQAQLLDSMDLERERGITIKLNAIELNYTAKDGETYIFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNDLEILPVINKIDLPAADPERVRAEVEDVIGLDASEAVLASAKAGIGIEEILEQIVEKVPAPTGEVDAPLQALIFDSVYDAYRGVILQVRIVNGMVKPGDKIQMMSNGKTFDVTEVGIFTPKAVGRDFLATGDVGYIAASIKTVADTRVGDTITLANNPAIEPLHGYKQMNPMVFAGLYPIESNKYNDLREALEKLQLNDASLQFEPETSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNIDLIMTAPSVVYHVNTTDSEMLEVSNPSEFPDPTRVDSIEEPYVKAQIMVPQEFVGAVMELAQRKRGDFVTMDYIDDNRVNVIYQIPLAEIVFDFFDKLKSSTRGYASFDYEISEYRRSQLVKMDILLNGDKVDALSFIVHKEFAYERGKLIVDKLKKIIPRQQFEVPIQAAIGQKIVARSDIKALRKNVLAKCYGGDVSRKRKLLEKQKAGKKRMKAIGSVEVPQEAFLSVLSMDDDDKK >CP019833.1|AUP34776.1|823242_823902_+|Phosphohydrolase MTMVKREDVILNATENMVYHKLKNDPSGHDWFHIVRVRNLAVELAHKEGANTFICQMAALLHDIIDDKICQDSEQASYELTQWLYSQDLAIAEVEHILDILQNISFKAGTGLTMKTLEGQIVQDADRLDAMGAIGIARTMAYSGSKGRLIHDPNLKPRENLTLEEYRNGQDTAIMHFYEKLLKLKDLMNTKQGKMLAQKRHDFLELYLAEFYAEWNGKR >CP019833.1|AUP34777.1|823910_824375_+|GNAT-family-acetyltransferase MIRRAKEKDLPAIAELLQQILVLHHGVRPDIFHTRGSKFSKEQLKEMLIDESKPIFVYESDEGKVVAHLFLQLQEKRDLPRKSFKTLYIDDLCIDEEVRGQQIGQKLMDFARQYAKKHGCYNITLNVWNDNQRAVSFYEKLGFKPQQTQMEEIL >CP019833.1|AUP34778.1|824374_824809_+|Peptide-methionine-sulfoxide-reductase-MsrB MKETQEELRQRIGHTAYQVTQNSATEHAFTGKYDDFFEEGIYVDIVSGEVLFSSLDKFQSGCGWPAFSKPIENRMVTNHQDHSHGMHRIEVRSRQADSHLGHVFNDGPVDAGGLRYCINSAALDFIPYDQMAKRGYGDYLSLFD >CP019833.1|AUP34779.1|824960_827753_+|Haloacid-dehalogenase MASTNNVSDTNTRFAKEELEEVFEELGTTQGGLSDEEVAVRQKKYGLNLLSEVKQESIILLFLKNFTSLMAILLWVGGFVAIVSNSLELGLAIWMVNVINGIFSFIQEYRASQATQALKKMLPSYSRVLRKSSEEKILSEQLVPGDIVLIEEGDRISADGRLIKTTDLQVNQSALTGESNPIYKDSNVENDQSKTLIECDNMVFAGTTVSSGSATMVVTAIGMQTQFGQIADLTQGMKSEKSPLQRELDRLTKQISIISITVGIIFFLAATFFVKEPVSKSFIFALGMIVAFIPEGLLPTVTLSLAMAVQRMAKEHALVKKLSSVETLGATSVICSDKTGTLTQNEMTVNHLWQNGKSYQVTGLGYAPEGQVLFEGDNICFGNSDRGDLEKLIRFAHLCSNAQVLPPNDDRSTYTVLGDPTEACLNVLLEKSGINRQENRKFAPRLKELPFDSVRKRMTTIHSLGGDEKDKKISITKGAPKEILDLSDYVLSDGKVIPLNKEERNKIQLANDTFAKDGLRVLAVSYCDIEGFSKEQWTQENLEQHMVFIGLIAMSDPPREGVREAIDKCHAASIRIIMVTGDYGLTALSIAKNIGIIRNDDAKVISGLELSEMTDSQLKKELSGEVVFARVAPEQKYRVVTILQEMGEVVAVTGDGVNDAPALKKSDIGVAMGVTGTDVAKESADMILTDDHFASIVDAVEEGRAVYQNIKKFLTYIFNSNTPEAVPSAFFLFSKGFIPLPLTVMQILAVDLGTDMLPALGLGVESPETDVMNRPPRRLTDRLLDKGLLIKSFLWYGTIESVLAMGGFFWAHYLRYGNFTFFVANGIPYREATTMTLGAIIFSQIGMVMNSRTSYQSIKTLSIFGNKLINFGIIMEILAFLVLVYVPLFHNLFNTASLGLSHWLYLISCPFIMIGLDEVRKLFSSRKNKR >CP019833.1|AUP34780.1|827752_828796_+|hypothetical-protein MSNIITYLKNNSNLTFDELALNDVDILCLNEFGYISFEKLINTTEMKSVLVCELYHEYLQTMAKSYSFMFTSQRHDLCQLMMTSKRFKNLTLSYYQAEISLEFEKQFAAMVFTIPNIDYHQVVFRGTDANLIGWKEDFKLTYMREISAHRSAIKYLNTILPHFDKVVLSGHSKGGNLALYAAMFTKPDLKAKIDLIWLIDSPGLQKTLLPTTEYKTTKQKCIRLLPEESIVGMMLYSDIEPLIISSNARGILQHDVTTWEIQEPAILKTGTGLSLKSICFEKTFQQWMAELKSQERKLFFDLLFDSFLSSGVSSLDDFNLASRAKMMKAFHSFRELDDDKKGYLTNL >CP019833.1|AUP34781.1|828828_829398_-|Chloramphenicol-acetyltransferase MSTGASYPKYGFSVGKYTYGYQQFFYEGVNLKEIGAFCSIAQNVTITGMNHPTDHITTNPFIYYKSRGFINEDRADLIDEKKNGKVIIGNDVWIGTNVTILPSVTIGNGAIIGAGSVITKDIPDYAVVAGTPAKIIKYRFSEEEITLLNASQWWNWSDEAIKEHISEFSDKKEFFNTLKSIEENKNHKL >CP019833.1|AUP34782.1|830177_830789_+|Membrane-protein MNMKLSKRYRFWQKVIKALGVLALIATLVLVVYLYKLGILNDSNELKDLVHKYEFWGPMIFIVVQIVQIVFPVIPGGVTTVAGFLIFGPTLGFIYNYIGIIIGSVILFWLVKFYGRKFVLLFMDQKTFDKYESKLETSGYEKFFIFCMASPISPADIMVMITGLSNMSIKRFVTIIMITKPISIIGYSYLWIYGGDILKNFLN >CP019833.1|AUP34783.1|830825_831608_-|hypothetical-protein MFGKLLKYELKSVGKWYLTLSAAVLLVSIILGLVLKALDGNFSTDTNSTSAQIFTIILVLLLAMVISGSLLSTFAIIIKRFYSNIFGRQGYLTLTLPVTTNQIICSKLLASLLWSIFNIFIVIIGIILVILPLVGIGQFVVAFPEIYKIISSSNAPLFIAYFFLSYVAGTLLIYLSIAVGQLFTNKRVLMGIVSYCGISLLITFLTLIIDSIFHIDLFNSHANATFSQPVLLYNILVSIVEIAIFYMLTHSIIKYKLNIQ |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
187467 : 199637
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019833|187467:199637|DBSCAN-SWA ATTGAATCCGTTCGGGAAACTCAGAAAAAGATGGGGCTTACTGAAATCTCAATTTCAGACATCCTCCTATTTTCCAGTCGCTCCCTTGTCGGACTTGGTATCTTATATGAATAAACGTATTTTTGTTGAGAAAAAGGCTGACTTTGGCATTAAATCGGCTAGTCTTGTGAAAGAGTTGACGCATAATCTACAACTGACTTCTTTGAAGGATTTGCGTATTGTGCAGGTCTATGATGTCTTCAATTTGGCTGAGGATTTGCTGGCGCGTGCTGAGAAGCATATTTTCTCTGAGCAGGTGACAGACTGTCTTTTGACGGAAACTGAAATCACTGCGGAGCTTGATAAGGTTGCCTTCTTTGCCATTGAGGCGCTTCCTGGTCAATTTGACCAACGTGCTGCTAGTTCGCAAGAAGCTTTGCTATTGCTTGGAAGTGACAGTCAGGTTAAGGTCAATACAGCCCAGCTTTACTTGGTCAATAAGGATATTGCAGAAGCAGAGCTTGAAGCTGTTAAGAACTATCTTTTGAATCCTGTTGATTCACGTTTCAAGGACATCACTTTGCCGCTTGAAGAGCAGGCTTTCTCTGTGTCTGATAAGACGATCCCTAATCTTGATTTCTTTGAAACTTATCAAGCTGACGATTTTGCGACTTATAAGGCAGAGCAGGGCTTGGCTATGGAGGTCGATGATTTTCTCTTCATCCAAGATTATTTCAAATCAATCGGGCGTGTGCCAACTGAGACTGAGTTGAAAGTTTTGGATACGTATTGGTCAGACCACTGTCGTCACACAACCTTTGAAACTGAGCTGAAAAACATTGATTTTTCAGCTTCTAAATTCCAGAAACAATTACAGACGACTTATGACAAATACATTGCCATGAGTGATGAGCTTGGTCGTTCTGAAAAGCCACAGACGCTTATGGATATGGCGACTATCTTTGGTCGTTATGAGCGTGCCAATGGTCGTCTGGACGATATGGAAGTCTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTTGAGATTGAAGTAGATGTTGATGGTGTAAAAGAGCCTTGGCTCCTCATGTTTAAGAATGAGACTCACAATCACCCAACAGAAATTGAGCCATTTGGTGGCGCAGCAACTTGTATCGGTGGTGCCATTCGTGACCCGTTGTCAGGACGTTCATACGTTTATCAGGCTATGCGTATTTCAGGCGCAGGCGATATTACGACTCCGATTGCGGAAACACGTGCTGGTAAATTGCCACAACAGGTTATTTCTAAGACTGCGGCGCACGGCTATTCTTCATATGGTAACCAAATTGGGCTTGCGACAACTTATGTGCGTGAGTACTTCCACCCTGGCTTCGTAGCCAAACGTATGGAGCTTGGAGCTGTGGTTGGTGCTGCACCTAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAGAAGCAGGCGATGTGGTCATCTTGCTCGGTGGTAAAACAGGTCGTGATGGTGTCGGTGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAAACGGTTGAATCTGTGGAAACAGCTGGCGCAGAGGTACAAAAAGGGAATGCCATTGAAGAGCGTAAGATTCAACGTCTTTTCCGTGATGGCAATGTCACTCGTCTTATCAAGAAATCAAATGACTTCGGTGCAGGTGGTGTCTGTGTTGCCATCGGTGAATTGGCTGATGGTCTTGAAATCGATTTGGACAAGGTGCCACTTAAATACCAAGGTCTTAATGGTACTGAAATTGCAATCTCAGAATCTCAAGAGCGTATGTCAATCGTTGTTCGTCCTAGTGATGTGGATACCTTCATCGAAGCCTGCAACAAGGAAAATATCGATGCAGTCGTTGTTGCGACCGTTACTGAAAAACCAAATCTTGTTATGACTTGGAATGGCGAAACCATCGTTGACTTGGAACGCCGTTTCCTTGATACCAACGGTGTCCGTGTCGTTGTTGATGCTAAAGTCGTTGACAAGGACTTGACAGTTCCAGAAGCACGCACAACATCAGCAGAGACACTTGAAGCAGATACGCTTAAGGTCTTGTCTGACCTCAACCATGCTAGCCAAAAAGGTCTCCAAACCATCTTTGACTCATCTGTTGGTCGTTCAACCGTTAACCACCCAATCGGTGGTCGCTACCAAATCACACCGACAGAAAGTTCAGTTCAAAAATTGCCAGTTCAACATGGTGTGACAAGAACAGCCTCTGTTATGGCTCAAGGTTACAATCCTTATATTGCTGAGTGGTCACCTTACCACGGTGCTGCCTATGCTGTCATTGAAGCGACAGCTCGCTTGATAGCAACGGGTGCCGACTGGTCTCGTGCACGCTTCTCTTACCAAGAGTACTTCGAGCGTATGGACAAACAGGCAGAGCGTTTTGGTCAGCCAGTATCAGCTCTTCTTGGTTCTGTTGAGGCTCAGATTCAACTTGGCTTGCCATCAATCGGCGGTAAGGACTCGATGTCTGGTACTTTCGAAGAATTGACAGTGCCACCAACCTTGGTAGCTTTCGGTGTGACAACAGCGGACAGCCGCAAGGTTCTCTCTCCTGAGTTTAAAGCGGCTGGTGAGAATATTTACTACATTCCAGGTCAAGCTATTTCAGAAGATATTGATTTTGACCTTATCAAGGCTAACTTTAACCAGTTTGAAGCTATTCAAGCTCAACATAAGATTACCGCTGCTTCAGCCGTTAAATACGGTGGTGTCCTAGAAAGTCTTGCTCTCATGACTTTTGGTAACCGTATCGGTGCTTCTGTTGAAATTGCAGAGCTTGACAGCAGCTTGACAGCTCAACTCGGAGGCTTTGTCTTTACATCAGTTGAGGAAATCGCTGACGCTGTGAAGATTGGTCAAACTCAGGCAGACTTTACAGTCACTGTCAATGGAAATGACCTCGCTGGTGCTAGCCTCCTAGGAGCCTTCGAAGGTAAATTGGAAGAAGTTTACCCAACAGAATTCGAACAGGCAGACGCTCTTGAAGAAGTTCCTGCTGTGGTATCAGATACCGTCATCAAGGCTAAGGAAGTCATTGAAAAACCAGTGGTTTACATTCCAGTCTTCCCTGGTACTAACTCAGAGTACGATTCAGCTAAGGCTTTTGAACAGGTTGGAGCTAGCGTCAACTTGGTACCATTTGTAACCTTGAATGAGGCTGCTATTGCTGACTCAGTTGACACAATGGTCGCTAATATTGCTAAGGCAAATATCATCTTCTTTGCTGGAGGATTCTCAGCAGCGGATGAACCAGATGGGTCTGCTAAGTTTATCGTCAATATCTTGCTTAACAAGAAGGTTCGCGCAGCTATTGACAGCTTCATCGAAAAAGGTGGCCTTATCATCGGTATCTGTAATGGTTTCCAAGCCCTTGTTAAATCAGGTCTTCTTCCATACGGAAACTTCGAGGAAGCTGGTGAGACAAGTCCAACTCTCTTCTATAACGATGCTAACCAGCACGTTGCAAAGATGGTTGAGACTCGTATCGCAAATACCAACTCACCTTGGTTGGCAGGAGTTGAGGTCGGCGATATTCATGCCATTCCAGTTTCACACGGTGAAGGTAAATTTGTTGTCAGCGCTTCTGAATTTGCAGAGCTAAGAGACAATGGTCAAATCTGGAGCCAATATGTGGACTTTGACGGACAACCATCTATGGATTCTAAATACAATCCAAACAGCTCTGTCAATGCCATCGAAGGGATTACCAGCAAGAATGGTCAAATCATCGGTAAGATGGGGCACTCAGAACGCTGGGAAGACGGCCTCTTCCAAAATATCCCTGGTAACAAAGACCAAGCCTTGTTTGCTAGTGCAGTAAAATATTTTACAGGAAAATAATTTTTTCAAATTTTTTCATAAAACAGATAAGGAAACAAGAGCGAAGCGAGCTTAACTGTATCTTTCTGTCGTAGTGGTATTTGGGAGCCGTTGAGGCTAAGACTCAATGATTAGCTTGAAAATAGCTTGATAGATTTTCTATTTTGATGTTGGCATTGATGACGATAGATCCAAAATTGAGAAAATCATCAAAGCTACTTAAGAAGAGATACAAAAAGAATTAGGAAAAAAGAATGACATACGAAGTAAAATCTCTAAATGAAGAATGTGGTGTATTTGGTATCTGGGGGCATTCTCAGGCAGCTCAAGTCACTTACTTTGGGCTTCACAGTCTTCAACACCGCGGTCAAGAAGGTGCTGGTATTGTTTCGAATGATAATGGGAAACTCTATGGTTATCGAAATGTTGGTCTCCTTTCTGAAGTTTTTAAGAATCAATCTGAATTAGATAATTTAACTGGGAATGCGGCTATTGGACATGTTCGGTATGCTACTGCAGGTTCTGCAGATATTCGCAATATTCAGCCTTTTCTTTATAAATTTCATGACGGGCAATTTGCTTTATGCCATAATGGTAATTTGACAAATGCTATTTCTTTAAGGAAAGAATTAGAAAAGCAAGGTGCAATTTTCAATGCCTCCTCAGATACTGAAATTTTGATGCACTTGATTCGTCGAAGCCATAACCCAAGTTTTATGGGGAAGGTAAAAGAAGCTTTAAGCACTGTAAAGGGAGGCTTCGCCTATCTACTGATGACAGAAGATAAATTAATTGCTGCTCTTGACCCTAATGCCTTTCGTCCTTTGTCAATTGGACAAATGCAAAATGGTGCCTGGGTTATTGCCAGTGAGACCTGTGCTTTTGAGGTGGTAGGCGCAAAATGGGTTAGAGATGTTGAACCTGGCGAAGTTATTCTTATAGACGATAGTGGTGTTCAATGTGATCGTTATACTGATGAAACGCAGTTGGCAATTTGTTCGATGGAATATGTCTATTTTGCAAGGCCGGATTCGACTATACATGGTGTTAATGTTCATACGGCTCGAAAAAATATGGGAAAGCGTCTTGCACAAGAATTTAAACAGGATGCTGATATTGTAATTGGTGTCCCAAATTCGTCCTTATCGGCTGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCCGGATTACCAAATGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019833|187467:199637|187467_191298_+|AUP34203.1|DBSCAN-SWA MNPFGKLRKRWGLLKSQFQTSSYFPVAPLSDLVSYMNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDCLLTETEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLLGSDSQVKVNTAQLYLVNKDIAEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFETYQADDFATYKAEQGLAMEVDDFLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMSDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGNVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSIVVRPSDVDTFIEACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGETIVDLERRFLDTNGVRVVVDAKVVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTRTASVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLIATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSVEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEELTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKANFNQFEAIQAQHKITAASAVKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSVEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLGAFEGKLEEVYPTEFEQADALEEVPAVVSDTVIKAKEVIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEAAIADSVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNKKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNSSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQALFASAVKYFTGK >CP019833|187467:199637|194203_194752_+|AUP34206.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASANGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKAAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLSAYEGRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGIKRK >CP019833|187467:199637|197286_198186_+|AUP34209.1|DBSCAN-SWA MNKWLVKASSLVVLGGMVLSAGSRVLADTYVRPIDNGRITTGFNGYPGHCGVDYAVPTGTIIGAVADGTVKFAGAGANFSWMTDLAGNCVMIQHADGMHSGYAHMSRVVARTGEKVKQGDIIGYVGATGMATGPHLHFEFLPANPNFQNGFHGRINPTSLIANVVTFSGKTQASAPSIKPLQSTPVQNQSSRLKVYRVDELQKVNGVWLVKNNTLTPTGFDWNDNGIPASEIDEVDANGNLTADQVLQKGGYFIFNPKTLKTVEKPIQGTAGLTWAKTRFANGSSVWLRVDNSQELLYK >CP019833|187467:199637|193013_194036_+|AUP34205.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVAHTERAGVMGALGDFGGMFDLSQTGVKEPVLISGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNNPVKLEEVVSGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFAVGVAEKSQLIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVKAALPLIKEVLVNGIAHITGGGFIENVPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADDSVVIK >CP019833|187467:199637|191531_192986_+|AUP34204.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHSQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNPSFMGKVKEALSTVKGGFAYLLMTEDKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVIASETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDSGVQCDRYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIASPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHAVDEVCDIIGADSLTYLSIDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >CP019833|187467:199637|194774_195527_+|AUP34207.1|DBSCAN-SWA MKLVKNLEIVESIFGDWDETIIWSCVQGIMGEVFVDSLDQPKSSLAKLGRKSSFGFLAGQPTLFLLEVCSGEDIILVPQHKGWSDLIESTYGQNAHSFKRYATKKDTLFERSRLEKFVTQLPNGFELRAIDEKVYNSCLEKEWSQDLVANYATYQYYKKQGIGYVVYYQGNIIAGASSYSTYKNGIEIEVDTHPDFRRRGLATIVAAQLILTCLDKGIYPSWDAHTRTSLNLAEKLGYEFSHEYIAYEID >CP019833|187467:199637|198332_199637_+|AUP34210.1|DBSCAN-SWA MKMNKKVLLTSTMAASLLSVASVQAQETDTTWTARTVSEVKADLVKQDNKSSYTVKYGDTLSVISEAMSIDMNVLAKINNIADINLIYPETTLTVTYDQKSHTATSMKIETPATNAAGQTTATVDLKTNQVSVADQKVSLNTILEGMTPEAATTIVSPMKTYSSAPALKSKEVLAQEQAVSQAAANEQVSPAPVKSITSEVPAAKEEVKPTQTSVSQSTTVSPASVATETPALVAKVAPVRTVAAPRVTSAKVVTPKVETGASPEHISAPAVPVTTTSTATDNKLQATEVKSVPVAQKAPTATPVAQPASTTNAVAAHPENAGLQPHVAAYKEKVASTYGVNEFSTYRAGDPGDHGKGLAVDFIVGTNQALGNEVAQYSTQNMAANNISYVIWQQKFYSNTNSIYGPANTWNAMPDRGGVTANHYDHVHVSFNK >CP019833|187467:199637|195546_197094_+|AUP34208.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSEKSGIIDFAKELKNLGWDIISTGGTKVALDDAGVETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDADSHLQAAKDNNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDVTYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTFETRQRLAAKVFRHTAAYDALIAEYFTAQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPTDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKDRPTVVALKHMNPCGIGQADDIETAWDYAYEADPVSIFGGIVVLNREVDAATAEKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAAAGIKAIIQPGGSVRDQESIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_2 |
944379 : 954231
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019833|944379:954231|DBSCAN-SWA AATGACTTACACAGAAAATTTTCAAAAATGGTTAGATTTTGAGCAGCTTCCTGACTATCTTCGTCAAGAATTACTATCAATGGATGAAAAAACAAAAGAAGATGCTTTTTACACAAACTTAGAATTTGGTACTGCTGGTATGCGTGGTTATATTGGTGCTGGTACAAATCGTATTAATATTTATGTTGTCCGTCAAGCAACCGAAGGATTGGCAAAATTAATCGAAACTAAGGGAGAGGACGCTAAAAAACGTGGTGTAGCCATTGCTTATGATTCACGCCACTTCTCTCCAGAATTTGCTTTTGAGTCTGCACAGGTCTTGGCACAGCATGGAATTAAATCTTACGTATTTGAAGCTCTTCGTCCAACACCAGAACTCTCTTTTGCTGTTCGCCATTTAAATGCCTATGCTGGTATTATGGTTACTGCAAGCCACAATCCAGCACCTTTCAATGGTTATAAAGTCTATGGACAAGACGGAGGTCAACTACCACCAGCTGATGCTGATGCACTAACAGACTTTATCCGTGCTATTGAAAATCCATTTGCAGTTGAACTTGCTGATTTAGATGAAAGCAAATCAGCGGGTCTTATTCAAGTTATCGGTGAAGATGTTGATATTGAATATCTTAGAGAGGTTAAAGATGTTAATATCAATCAAGATTTAATCAATAACTTTGGAAAAGACATGAAAATTGTCTATACTCCTCTCCACGGAACTGGTGAGATGTTGACACGCCGTGCCCTTGCTCAAGTCGGTTTTGAATCTGTTGTTGTAGTAGAATCACAAGCTAAGGCAGATCCAGACTTTTCTACTGTCAAATCTCCTAACCCTGAAAGCCAAGCTGCCTTTGCTCTTGCTGAAGAACTCGGACGAGAAGTTGATGCAGATGTCTTAGTAGCTACTGATCCTGATGCAGACCGCCTAGGCGTTGAAATTCGCCAACCAGATGGTTCTTATAAAAACCTTTCTGGAAATCAAATTGGAGCGATTATTGCGAAATACATCCTGGAAGCTCATAAAACAGCAGGAACACTTCCAGAAAATGCTGCTCTCGCTAAATCAATCGTATCAACAGAATTAGTAACAAAAATTGCCGAAAGTTATGGCGCTACAATGTTTAACGTTTTAACTGGATTCAAATTCATCGCTGAGAAAATTCAAGAGTTTGAAGAAAAACATAACCACACCTATATGTTTGGTTTTGAGGAAAGCTTCGGATACCTTATTAAACCATTTGTCCGTGATAAAGACGCTATTCAAGCAGTTCTTTTGGTTGCTGAGATCGCAGCTTATTACCGTTCGCGTGGATTAACACTTGCAGATGGTATTGATGAAATTTACAAAGAATATGGTTTTTTTGCTGAAAAAACGATTTCAGTAACACTTTCAGGTGTAGATGGAGCTGCTGAAATTAAGAAGATTATGGACAAATTCCGTGAAAATGGTCCAAAACAATTTAACAATACTGATATTGTATTATTAGAAGATTTCCAAAAACAAACCGCTACTAAAAATGATGGAACAATATCTAACTTAACAACTCCTCCAAGTAATGTTTTGAAGTACACATTAGCTGATGATTCATGGATTGCAGTTCGCCCTTCAGGAACTGAACCAAAAATCAAGTTCTATATTGCCACGGTCGGTAATGATTTAGCAGATGCAGAAACAAAAATCGCCAATATTGAAAAAGAGATTACAACATTTGTAAATTAATAAAAAAAGCTAGGAAGGCACTGCACCCCATTAGTGGGACAGAAGAAAAACACTCTTATGAAGCCAATTTCCTGAATTGAACAGGAGATTGGTTTTTTAAATGACGTTGAATTCTAGTTTCATTATAAAATGTAATGTAATTTTTAACAATATTTGTTATACTATCTTTGTTGTATTTTCTCCTATCATGGAGATAAAAGGTTTCAGTCTTTAGGACGGAGTGAAACCATTCAATACAGGCGTTATCTGCAGGTGTTCCTTTTCGGGACATTGAGCGGATAATGCCTTTTTCCGTGCAAGCTTGATAGTAAGCCTTAGAAGTATACACTGAGCCTTGATCGCTGTGTAAGACTGCCCCTTTAGGTAATTTTAACTGATTAAGGGTGTCTATTACAAAATCTGTGTCCTGACAATCTGAGATAGTATAAGCTAAAATCTCTCGGTTATAGAGGTCCATAATTGAAGAGAGATACAATTTACAGTTACCGAAATATAGATAAGTAATATCTGTTACAAGCTTTTCCAATGGCTTATCGGCATGGAAATCCCGATTCAATTTGTTATCTGTTAAATAATAAGTTTTACCAAGATTGGGCGATTTCTTTGGACGTGTCCGACAAAGCCAACCATTGTCTTTCATGATACGATAGACTTTCTTTGCATTAACAGTCAATTCGTGGATCTTTTTGAGCAATCGTGTAATGGTACGATATCCATAAATAAAGTGATTCTCCATGCAGAGCTGTTCAATTAATTCAATGACTTCATCTGTTTCTTGTGGTTTCTCGTACTTCTTTTTCCAACGATAATAGGTCGATCGCTTAACATCAAAACAGTCTAGAATGACAGAAATCGGGTAGTTGTTTTTATAGTCTTCCACAAGCTTGATAAGACTTACTTTATCGATTTCCTTATCAAGCCTCGATACTTTTTTAAGAGGTCAACCTGTAATTGTAACTGTTCCACTTCAGACAGATGTTCCAAGCCTTTACCATAGGTATATTGCTTGCCAACACCTTGATGGAAACGATAAAGTTCCTCATTTTCGTGCCATTTTACCCAAGTATAGATTTGACTATCATTCTTGATACCTAGAGTCTCCATAATAAATCTGTTAGACTTGCCTGCTTTTTTCATCTCGATGCAGGCCAACTTCGTTTCCCATGAATATGCTTTTTTAACCATAATAAAACACTCCTGATTCTATTTTACTAGAATTCTCCAGGAGTGTTTTTCTTGTGTCTCACTTTAGGGAGACAGTGCCGAACTTACTCCTAGCTTTTTTTATATCTATCTAACGATGTTCTATTATTTTCAATCATGAAATATAACTGCAATTAACTTCACGATCAAATAATAGAGCAGACTTACAATTAACCACATTATCCCAATAACTGCAACTAAACCTATTAAAACAGATAATACCGTATTCTTAGTTGCTAGTTGGTTACTGATAAACCATGAAACTGCAAAAATAAATATCAGTAATAATAGTTGAAGCCTTTTTTTCATATAATTCCTCTTACTACTTTTGTGCATTTTGCATTTGATAATAAATACCTTTTTGAGCCATTAATTCAGAGTGGTTACCCACTTCTACAATTTCACCAGATACCATAACTAAAATAATATCTGCTGTTTGAATGGTAGATAAGCGATGTGCAATAATAAAGCTTGTTCTCCCCTTCATCAACATTTGGAATGCTTCTTGAAATAGACGATGTCGCCTCATCTAATATCAATATTCTAGGTAATTTAAGAAAAATACGAGCAATTGTCAATAGCTGACATTGCCCCTGTGATAACGAATCTCCAGCATCTTCTAAATACGTATCATATCCATTCGGTAATTGTTTGATAAAGAAATCTGCATTAGCTGCTTTTGCAGCCTCTATCACTTCTTCACGGCTAGCTTTAGGATTGGCATATGCAATGTTATCGTGAATCGTAGCACTTTTTAACCACGTTTCTTGTAATACCATTCCAATTTCTTGCCTTAATTGTGATGGCTCATAATCAGTAATAGGCTTACCATCTAAAAGGATATTTCCCCCGTCAACTTCATAGAAACGCATTAATAAATTGATTAAAGTAGACTTCCCAGCACCTGTTGGTCCTACAATAGCGACCTTAGCTCCTGCTGGAATGTGTAAATTAATACCATTCAATAGTGGTTTTGATTTATTATAACCAAAAACAATGTTTTTAAAATCGATTTGACCTTTGACCGTTGATGAATCAAGTTTTTCTGTACCTGTTATATTTGGTGACGATTCTTCTAAAATAGAGTAAAGGCGTTCTGCACAAGCCAGAGTACTTTGCATCTCAGACAGGACGGAAGAGATGTCATTAAATGGCTTAGTATATTGATTGACATAATTTAAGAAAGTGATTAATTGACCAACACTAAAAGCCCCTGACATAATACGAAGGGCACCAATCCCTGCTAAGAAGCCATAAATCAAACTATTGATAATTGCTCCGTATCGGTAGTCACACGACTAATCAAGTCACCTATGCCACGTTTATCAAGGTAAGCTATAGGCAATAGATTCAACTTTTCCATTACAACCTTTCTTAAAGAAGCAACATAATGAAAAATTAAGCGGTTATAGAGCAGAGGATTAATCCATTGAATAATAGTATTTGCTAAAATAACTGCAATCATCTTCCACATTATAGGTAACAATAATATCATAGAATGAGGCGATAATACAACGTCTACCGCTTGTCCAATTAGAACAGGCAAATAAACAGTGAGGCAAACTTGTACAACCGTCCCTAATAATGCCATTCCTACTAAGCTTTTTTTAGAAAGAAGATCTTGAACAAGCTTTTTTTGTATCTTTTTAGGATGACTTGCTTTCATTTACTCCTCCTCCTTAAAATTTTGTGAATGGTAAATGGACTTATAAACTTTGTTATGAGCTAATAAAGATTGATGATTATCAAAACCAACTTGTTTCCCCTTATCAAGGAGTAAGATTCTATCTGCATTTTGTATACTATTAATTCTCTGTGATACAATAATAAGATTAGTTTGGTTGAAATGTTTAGTTATAGCTTTAAATAAACGAGCTTCTGTTAAATAATCCAATGCAGATGTTGCATCGTCTAAAATCAAAAATGGTATCTTATCTTGAACTAAAGCTCTTGCAATCGTCAACCTTTGCCTTTGACCACCAGAGAAATTCCTACCAAAACTCTCTACAGAGGCATCAAGTTGACCATCTTTTTCTTTTACAAAATCACTAGCTTGTGCTATTTCTAAAGCAGTCCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019833|944379:954231|950700_951303_-|AUP34893.1|DBSCAN-SWA MFKFLKRLIALIIIIFIGYRLVIIHENVKKVLQYHDLVQNTLAENGSEANVHLVLSMIYTETKGDAIDVMQSSESISGTTNSITDSHTSIKHGVTLLSQNISQAKKAKVDVWTAVQAYNFGSSYIDYVADHGGENSIELAKNYSKNVVAPSLGNYNGDTYFYYHPLALISGGKLYKNGGNIYYSREVQFNLYLIKIMELF >CP019833|944379:954231|952286_953543_-|AUP34895.1|DBSCAN-SWA MIFDKDNFKEFDQELWQAIHDEEIRQQNNIELIASENVVSKAVMAAQGSVLTNKYAEGYPSHRYYGGTDCVDVVESLAIERAKTLFNAEFANVQPHSGSQANAAAYMALIEPGDTVLGMDLAAGGHLTHGASVSFSGKTYHFVSYSVDPKTEMLDYDNILKIAQETQPKLIVAGASAYSRIIDFEKFRQIADAVDAYLMVDMAHIAGLVASGHHPSPISYAHVTTTTTHKTLRGPRGGLILTNDEAIAKKINSAVFPGLQGGPLEHVIAAKAVALKEALDPSFKIYGEDIIKNAQAMAKVFKEDDDFHLISDGTDNHLFLVDVTKVIENGKKAQNVLEEVNITLNKNSIPFERLSPFKTSGIRIGTPAITSRGMGVEESRRIAELMIKALKNHENQDVLTEVRQEIKSLTDAFPLYEN >CP019833|944379:954231|944379_946098_+|AUP34888.1|DBSCAN-SWA MTYTENFQKWLDFEQLPDYLRQELLSMDEKTKEDAFYTNLEFGTAGMRGYIGAGTNRINIYVVRQATEGLAKLIETKGEDAKKRGVAIAYDSRHFSPEFAFESAQVLAQHGIKSYVFEALRPTPELSFAVRHLNAYAGIMVTASHNPAPFNGYKVYGQDGGQLPPADADALTDFIRAIENPFAVELADLDESKSAGLIQVIGEDVDIEYLREVKDVNINQDLINNFGKDMKIVYTPLHGTGEMLTRRALAQVGFESVVVVESQAKADPDFSTVKSPNPESQAAFALAEELGREVDADVLVATDPDADRLGVEIRQPDGSYKNLSGNQIGAIIAKYILEAHKTAGTLPENAALAKSIVSTELVTKIAESYGATMFNVLTGFKFIAEKIQEFEEKHNHTYMFGFEESFGYLIKPFVRDKDAIQAVLLVAEIAAYYRSRGLTLADGIDEIYKEYGFFAEKTISVTLSGVDGAAEIKKIMDKFRENGPKQFNNTDIVLLEDFQKQTATKNDGTISNLTTPPSNVLKYTLADDSWIAVRPSGTEPKIKFYIATVGNDLADAETKIANIEKEITTFVN >CP019833|944379:954231|951445_952282_-|AUP34894.1|DBSCAN-SWA MMDFYIKQIIIHQFSPNDTELVLSDTPLTLTPRIDDYFRKKLSKVFSDEAKRGYFGEDNVFMSHLQDDLYVSSCQIAQLWKEEFVISEDQKTNDLVFIQFDKDGMEHFAFLRISLKEQFAHVSENQEQPITITQNNLPSAAQTPDEALVVNKSSKQYYLIEKRIKHNGSFANYFSENLLQVEPEQSVKKSIKMVEQTAQKIAENFNKDDFSFQSKMKSAIYKNLEEEQELSPEKLADQLFDDNLTARLTFVDELKDAIPGPVQVSDIDHSRQIKKLEN >CP019833|944379:954231|947412_947610_-|AUP34891.1|DBSCAN-SWA MKKRLQLLLLIFIFAVSWFISNQLATKNTVLSVLIGLVAVIGIMWLIVSLLYYLIVKLIAVIFHD >CP019833|944379:954231|946153_946978_-|AUP34889.1|DBSCAN-SWA MEDYKNNYPISVILDCFDVKRSTYYRWKKKYEKPQETDEVIELIEQLCMENHFIYGYRTITRLLKKIHELTVNAKKVYRIMKDNGWLCRTRPKKSPNLGKTYYLTDNKLNRDFHADKPLEKLVTDITYLYFGNCKLYLSSIMDLYNREILAYTISDCQDTDFVIDTLNQLKLPKGAVLHSDQGSVYTSKAYYQACTEKGIIRSMSRKGTPADNACIEWFHSVLKTETFYLHDRRKYNKDSITNIVKNYITFYNETRIQRHLKNQSPVQFRKLAS >CP019833|944379:954231|953634_954231_-|AUP34896.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNDLGQILEDHGAVIMPTETVYGIFAKALSEEAVNHVYELKKRPRDKAMNLNICDFETVLKYSKNQPTYLKQLYDAFLPGPLTIILEASQEVPHWINSGLSSVGFRMPKHPVTLDMIANHGPLIGPSANISGCDSGRVFSEIQKQFNHQVLGIEDDKALTGVDSTIIDLSGDRVKILRQGAITQEVLTATISELIFEN >CP019833|944379:954231|946992_947283_-|AUP34890.1|DBSCAN-SWA MVKKAYSWETKLACIEMKKAGKSNRFIMETLGIKNDSQIYTWVKWHENEELYRFHQGVGKQYTYGKGLEHLSEVEQLQLQVDLLKKYRGLIRKSIK >CP019833|944379:954231|948967_950689_-|AUP34892.1|DBSCAN-SWA MKRLTYYFKGYIKETIFGPLFKLLEASFELLVPIVIAKMIDETIPRGDRSSLLLQIGLIFFLAAVGVVVAITAQYYSSKAAVGYTRQLTEDLYQKVMSLGKKDRDELGTASLITRLTADTFQIQTGLNQFLRLFLRAPIIVFGAIIMAFSISPSLTIWFLVMVVTLFIIVFVMSRLLNPIYLKIRTSTDYLVKLTRQQLQGVRVIRAFNQVDRESEAFNDINYHYTNLQLKAGRLSSLVTPLTFLVVNITLVVIIWRGNLNIANHLLSQGMLVALINYLLQILVELLKMTMLVTSLNQSYISAKRIIAVFERPSEIIDDKLEPKYSNKALEVQEIAFSYPNSSEKALSDITFSMNVGETLGIIGGTGSGKSTLVNLLLHIYKVQEGDIDIYHQGKSPDTISNWRTLVRVVPQNAQLFKGTIRSNLSLGLGKVSEEKLWTALEIAQASDFVKEKDGQLDASVESFGRNFSGGQRQRLTIARALVQDKIPFLILDDATSALDYLTEARLFKAITKHFNQTNLIIVSQRINSIQNADRILLLDKGKQVGFDNHQSLLAHNKVYKSIYHSQNFKEEE |
9 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1349372 : 1360054
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019833|1349372:1360054|DBSCAN-SWA TATGAAACTCATTTCATGGAATATTGATTCCCTCAATGCGGCATTAACAAGTGAATCAACACGTGCTTTAATGTCACGCCAAGTTATTGATACTTTAGTTGCTGAAGATGCCGACATCATTGCGATTCAAGAAACTAAACTGTCTGCCAAAGGGCCTACTAAAAAACATTTGGAAGTACTTGAAACTTACTTCCCAGCATATGATTTGGTTTGGCGATCATCAGTCGAACCTGCTCGTAAGGGCTATGCTGGTACAATGTTTTTATATCGTAAAGGGTTAAATCCTATTGTTAGCTTCCCTGAAATCGATGCTCCTACTACAATGGATAATGAAGGTCGCATTATTACTCTCGAATTGGAAAACTGCTATATCACACAGGTCTATACTCCAAATGCAGGTGATGGCCTAAAGCGCTTAGCTGACCGTCAAATATGGGATATTAAATATGCTGAGTATTTAGCAACATTGGATAGTCAAAAACCTGTTCTAGCAACAGGTGACTATAACGTAGCCCACAAGGAAATAGACCTAGCTAATCCTAGCAGTAATCGTCGTTCTGCTGGATTCACAGATGAAGAGCGCCAAGGCTTTACAAATCTACTAGCTAAAGGTTTTACAGATACTTTTCGTTACCTTCATGGCGATGTTCCAAATGTTTATAGCTGGTGGGCACAACGAAGTCGTACATCCAAAATCAACAATACAGGGTGGAGAATTGATTATTGGCTAACAAGTAACCGTGTCGCAGATAAAATTACCAAGTCAGAAATGATTCATTCTGGTGATCGTCAAGATCATACACCAATTATTTTGGAGATTGAACTATAAACCAAAAAAGATGATTGAGTTATAACTCAATCATCTTTTTATACTAAGTTGAGGTCTTTATACTTAGTACGGTAGCCAATCTGAAGAATTTTATTATCTTTAACTAGCAATGGACGCTTAATAAGCATCCCATCCGATGCCAATAAGTCCAAAGCTTGGTCAAGAGTTAAATCATCAAATTTATCTTTTAAGCCTAATTCTCTGTAAGAATTTCCTGAAGTATTGAAAAACTTTTTAAGGTCATAAGGCGAATTCTCTAACAATTCTTTTAATAACGAAGCTTTGGGAGGATTGCTTTTTATATCAATAGCTTCAAAAGTTAAGCCGAGTTCAGTTAACTCTTTTTTTGCTGAACGACAAGTGGTACATTTGGGGTATTCATAAAACGTATACATATTATTTCTCCTTTTCGTATTCTAATAACCAAGATTTTCTTTCTAAGCCACCAGCATAACCAGTTAATTGACCATATCTTCCTAAAACACGGTGACAAGGTATGATTAGAGAAATAGGATTTTTACCTATTGCTCCTCCAACAGCCTGTGCAGATTGACAATTTAGCTCTTTCGCTAATTCTCCATAAGTTTTTGTATCTCCAAAAGGGATTTTCTGTAATTCCTGCCATACTCTCATCTGAAATGCTGTCCCTCTCAATGATAATGGAATACTAGGTAAATTTTGCTGTGAAAAATAAGCATCTAACCACTTCTTACCAAGTAAAGTATAGGAATTTGACATATTAACAATTTCCTCTTGGTTGACTGCTAGCATATCATATTTTTGCCCAACAAAATAAAGCCCTGATAAACCTAGATTGTCTGCTAGAAGGCGAATTTCTCCAAGAGGGGACTGATAGAATTCTTGATATAACATATGATAAGCATAACTTAAAAAGCCATGAAAAGCAATTCATGACTTTTTTTAGTTCTTTATTGTTGTTTTGCAATTAAACGTACACGGACGATATTCTCATCACCTTCAAATTCTTCAATTAAAGTAGAAATCTTGTTATTATCCGTTTCATCTAAATCTATTAGTGTGTAGGCGTAGTCACCCTTTGAACGGTTAATAATGTTATCAATATTTATACCTAACTCTGATACAGCAGTTGAAATTTTAGCCACAATGTTAGGAACATTCTTGTTAATTAAAGTAATACGAAATGGTGCGGTTTGAATTTGATGTACATTGGGGAAATTAACTGAATTAGTGATTTCTCCTGTCTCCATAAAACAACGAATGGTTTGACTTGCCATAATAGCACAATTTAGCTCTGCCTCATCTGTTGATCCGCCTACATGAGGAAAGACTGTAATTCCTTTTTGGTTTAATAATTCTTTGTCTCCAAAATCAGTAATATAGCGCTTGACAACACCAGTTTCTATCGCTTCAAATAGCTCTTGGTTATTGACTAATTCTGCACGAGCAAAGTTGATAATCGTCGTTCCTTTTTTCATGATTGAAAAAGCTTCCGCATCAAAAGTATGCTTAGTTTCATTTGTTAAGGGAACATGAATTGTGATATAGTCACAAGTTTCAAAAATATCCTTAATCTCTTTAACCCTTTGAACATGGCTTGAAATATTCCAAGCTGTTTCAATTGAAACATAGGGATCATAACCAAGAACTGTCATTCCTAAGCGTCTAGCATCATTCGCAATTCTAGCTCCAATGGCACCAAGGCCGATAACTCCCAATTTTTTTCCTGCAATTTCATTACCAGCAAAAGCTTTCTTTCCTGCTTCAATTTGTTTGGGAATATCTGTTCCAGTTAGAGTATTAACCCATCGGTTAGCTCCTAAATAATCACGAGCTGAAAGTAATAAGGCAGCAATGACCGCTTCTTTTACAGCATTAGCATTTGCACCTGGGGTATTAAAGACGACTATTCCCTGTGCACTTGCCTCTTCAATAGGAATATTATTTGTTCCTGCACCCGCCCTAGCAATAGCTTTGAGGTTACTTGGGAAATCTTGATTATGCAAATTTTGACTACGAATAATATAGGCATCAGGATTTTCTGACATATCCCCATCAATCTGGAAACGATTCCCTAACTCTTGTAAACCAATTTGATTAATATTATTAAATGTTTTGACACTAAAAACCATTCTTTTTCACTAAGGTTATCTCTTTAGTCATCATTGACTAAAATAACCCCTTTCTTTTTTTCTTACATGGGATTTCTTTCATCAATCTCACGATAGATGCTCGTTTCTCCCTTTTCTTTTATCTTCTGATAAGCCAATCGTACCCCATCTAGAGGTACTTTACCACAATATTGATAGCCTAATTTATTTAGAATATGCTGCATAGTGACATTTTTTTCATGAGTATCGCAACGAAAATCAGGTCCTTTGTGACCTTCAATTAACCCTTGAAGGAATGTCTGTGCTAGTCCTCTACCACGAAATTGATTTGAGATAGCAATACGATGAAATGTAAGATAGCGATGGTTATCATGGAGCCATTTTCCCTCATAAATAGCATCATAAACCTCTTCATGACCATCAATGACAGCCGCATAAGTCGCTAGCATCCCATCTTCAATACCAACCCAAGCATAACCGTTCAAGATATCATCAATAATATCGTTACGATTAGGGTATCCATCTTCTTTTTGCCATTGATCACTTCCTGTTTTAGCAATTTCGGCACGCGCTTCCTCAATAAGAAGCATAATTTGGTCAATTTCATTTGGAAAAGCTAATCTGATTTGCATTATATTACCCACTTTTATATATTATAGACTATAATAACGGTTTAATTTTCTTTCGTGATAACATTTACTATGCATTTTCTGCTTCAAATGTTTTCATAAAATCAATTAATTCGATGACACCTTGTTTAGGAAAGGCATTATAAAGGCTAGCCCTCATACCACCTACCGAACGATGCCCTTTAATATTTTTAAATCCACGTTCTGTCGCTTCCTTTACAAATTTTTCATCTAAATCTTTATTAATAGTTATGAAAGGAATGTTACATAGAGAACGACTCTTTTTATCTCTGACAGGATTACTATAAAATTCTGAGGAATCAATATAATCATAGAGAAGTCCTGATTTTTCACGGTTAGCTTTTTCCATAGCATCAACACCACCTAGACTTTTCACCCATTCAAAGACTAATTTAGCAATGTAAATACTGTAAGCAGGCGGCGTATTATAAAGAGAACCAGCATCTGACTGAATCTTATAATCCAACATTGATGATAAAGTTGGTTCCTCATTAATCATATCTTCACGGATAATAACTACCATTACACCAGCAGGTCCAATATTTTTTTGAGCTCCTGCATAAATCATTGCAAAATCTTCTACTTTATATTTTACAGCTAAGATATTAGAAGACATATCCGCAATAACAGGCACTCCATTAGTTTTAGGAGTATCATAAAGCGATGTTCCTTCAATGGTATTATTTGTTGTCACATGAACATAGGCAGCTTCAGGATCAATCTCTTTTTCATCAAACTCTGGAATATAATCATAAACTGATTCTTCTGATGAGGCTAATAGAATTGGTTCAAAAGGAATTGTTTTTGATAGTTTTACAGCCTCTGTATAAGCTTTTTTCCCCCACGAACCAGCAACATGATAGTAAGCTTTACGCCCTCTGGCAATATTCAAGGGAATCATACTAAACTGTAAGGATGCACCACCTTGTAAAAAGATTACTTTATAATTATCCGGAATTCCCATCAAATCTCTTAAGTAACGCTCAGCACCTTTGATAATATCATCAAACTCTTTGGAGCGGTGCGATACCTCCAAAACACTCATACTGGACCCTTGATAATTAAGGAGTTCAGATTGGGCTTTTACAAGCACTGGTTTTGGTAAGACTGCAGGACCTGCAGAAAAATTATAAATTGTCATATAACACCTCCATATAATAGTGTAAGATTATAGCACAGTATTTTGAATATTGTAAAGATTTTTTTGATTAATTTTGCTTTTTATTCGTGATATAATGGTAAAGGCGAACAATCAAGTTTAAAGGAGTAATTTATGATTTTGAGGGAATTTTGTGCAGAGAATTTAACAGACTTAACCAGATTAGATAAAGCTATTATTTCACGTGTCGAGCTTTGTGATAACCTTGCTGCTGGAGGCACTACTCCTAGCTACGGTGTTATCAAAGAAGCTAATCAATATTTACATGAAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019833|1349372:1360054|1359289_1360054_-|AUP35284.1|DBSCAN-SWA MALLEVKNLSKHFGGLTAVGDVSMKLHKGELIGLIGPNGAGKTTLFNLLTGVYLPSKGTISLDDKILNGRKPAKIASLGLGRTFQNIRLFKNMTVLDNVLVGLSNHHLSHSIASFLRLPKYYHSEKALRKKALELLEIFGLKAYQDALAKNLPYGKQRRLEIVRALATEPKILFLDEPAAGMNPQETAELTQLISQIKNDFDITIMLIEHDMNLVMQVTERIYVLEYGRLIAHGTPEEIKNNKRVIEAYLGSEV >CP019833|1349372:1360054|1352373_1352922_-|AUP35275.1|DBSCAN-SWA MQIRLAFPNEIDQIMLLIEEARAEIAKTGSDQWQKEDGYPNRNDIIDDILNGYAWVGIEDGMLATYAAVIDGHEEVYDAIYEGKWLHDNHRYLTFHRIAISNQFRGRGLAQTFLQGLIEGHKGPDFRCDTHEKNVTMQHILNKLGYQYCGKVPLDGVRLAYQKIKEKGETSIYREIDERNPM >CP019833|1349372:1360054|1350238_1350595_-|AUP35272.1|DBSCAN-SWA MYTFYEYPKCTTCRSAKKELTELGLTFEAIDIKSNPPKASLLKELLENSPYDLKKFFNTSGNSYRELGLKDKFDDLTLDQALDLLASDGMLIKRPLLVKDNKILQIGYRTKYKDLNLV >CP019833|1349372:1360054|1355069_1355933_-|AUP35278.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKSNTHYGTLYLVPTPIGNLDDMTFRAIRILREVDFICAEDTRNTGLLLKHFDITTKQISFHEHNAYDKISGLIDLLKEGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIEGDIPVVSIPGASAGITALIASGLAPQPHIFYGFLPRKKGQQITFFETKKDYPETQIFYESPFRVSDTLKHMKEIYGDRQVVLVRELTKLYEEYQRGTISQLLWHIEKVPLKGECLIIVDGKRDTERVKDSSQQDPLVLVKEYIANGDKTNQAIKKVAKELNLNRQELYASFHDL >CP019833|1349372:1360054|1355938_1356265_-|AUP35279.1|DBSCAN-SWA MDKKDLFDAFDDFSQNLLVGLSEIETMKKQIQKLLEENTVLRIENGKLRERLSVIEAETETAVKNSKQGRELLEGIYNDGFHICNTFYGQRRENDEECAFCIELLYRD >CP019833|1349372:1360054|1350596_1351073_-|AUP35273.1|DBSCAN-SWA MLYQEFYQSPLGEIRLLADNLGLSGLYFVGQKYDMLAVNQEEIVNMSNSYTLLGKKWLDAYFSQQNLPSIPLSLRGTAFQMRVWQELQKIPFGDTKTYGELAKELNCQSAQAVGGAIGKNPISLIIPCHRVLGRYGQLTGYAGGLERKSWLLEYEKEK >CP019833|1349372:1360054|1351129_1352311_-|AUP35274.1|DBSCAN-SWA MVFSVKTFNNINQIGLQELGNRFQIDGDMSENPDAYIIRSQNLHNQDFPSNLKAIARAGAGTNNIPIEEASAQGIVVFNTPGANANAVKEAVIAALLLSARDYLGANRWVNTLTGTDIPKQIEAGKKAFAGNEIAGKKLGVIGLGAIGARIANDARRLGMTVLGYDPYVSIETAWNISSHVQRVKEIKDIFETCDYITIHVPLTNETKHTFDAEAFSIMKKGTTIINFARAELVNNQELFEAIETGVVKRYITDFGDKELLNQKGITVFPHVGGSTDEAELNCAIMASQTIRCFMETGEITNSVNFPNVHQIQTAPFRITLINKNVPNIVAKISTAVSELGINIDNIINRSKGDYAYTLIDLDETDNNKISTLIEEFEGDENIVRVRLIAKQQ >CP019833|1349372:1360054|1356294_1357158_-|AUP35280.1|DBSCAN-SWA MDLKRTQPKLLEKFNTILQSDRMSHAYLFSGNFASLDMALYLAQSQFCEKRQSGLPCQECRACRLIANGEFSDVKIIEPQGQLIKTETIKELTKDFSRSGFEGKSQVLIIKDCEKMHVNAANSLLKFIEEPQSSSYVILLTNDENNVLPTIKSRTQIFRFPKQLDMLVHQAEQAGLLKSQASLLAQVADDPKHLEILLTNKKLLDYLNLSQQFVTTLAKDRQTAYLEVSRLTSQVVDKNDQAFVFQWLTIMLAKEGQLYDLENTYRAQQMWKSNVSFQNSLEYMVLS >CP019833|1349372:1360054|1354213_1354849_+|AUP35277.1|DBSCAN-SWA MILREFCAENLTDLTRLDKAIISRVELCDNLAAGGTTPSYGVIKEANQYLHEKGISVAVMIRPRGGNFVYNDLELRIMEEDILRAVELESDALVLGILTSNNHIDTEAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDVIPKSDQKKSIDQLVALGFTRILLHGSSNGEPIIENIKHIKALVEYANNRIEIMVGGGVTAENYQYICQETGVKQAHGTRITQ >CP019833|1349372:1360054|1357177_1357813_-|AUP35281.1|DBSCAN-SWA MKKGLMISFEGPDGAGKTTVLEAVLPLLREKLSQDILTTREPGGVTISEEIRHIILDVKHTQMDKKTELLLYMAARRQHLVEKVLPALEEGKIVLMDRFIDSSVAYQGSGRGLDKSHIKWLNDYATDSHKPDLTLYFDVPSEVGLERIQKSVQREVNRLDLEQLDMHQRVRQGYLELADSEPNRIVTIDASQQLDEVIAETFSIILDRINQ >CP019833|1349372:1360054|1358579_1359290_-|AUP35283.1|DBSCAN-SWA MTMLKVENLSIHYGVIQAVNDVSFEVNQGEVVTLIGANGAGKTSILRTISGLVRPSQGSISFLGKPIHKLAARKIVGNGLAQVPEGRHVFSSLPVMENLEMGAFLQKDREQNQKMLKKVFDRFPRLEERKNQDAATLSGGEQQMLAMGRALMSRPKLLLLDEPSMGLAPIFIQEIFNIIEDIKKQGTTVLLVEQNANKALTIADKAYVLETGKVVLSGTGKELLVSDQVRKAYLGG >CP019833|1349372:1360054|1357901_1358561_-|AUP35282.1|DBSCAN-SWA MPVKDFMTKKLVYVSPDTTVAEAADLLREHHLRRLPVVENDQLVGLVTEGTMAEAQPSKATSLSIYEMNYLLNKTKIRDIMIKDIVTVSQYASLEDAIYLMMSRKIGVLPVVDNGQLYGIVTDRDVFKAFLEIAGYGQEGYRLVILADEGIGVLSKVLNRLSSANLSVKRLVIIERKAGKKAVEIQLEGYADKDVLKQELVFDDVIVETLEKTVKKPLS >CP019833|1349372:1360054|1349372_1350200_+|AUP35271.1|DBSCAN-SWA MKLISWNIDSLNAALTSESTRALMSRQVIDTLVAEDADIIAIQETKLSAKGPTKKHLEVLETYFPAYDLVWRSSVEPARKGYAGTMFLYRKGLNPIVSFPEIDAPTTMDNEGRIITLELENCYITQVYTPNAGDGLKRLADRQIWDIKYAEYLATLDSQKPVLATGDYNVAHKEIDLANPSSNRRSAGFTDEERQGFTNLLAKGFTDTFRYLHGDVPNVYSWWAQRSRTSKINNTGWRIDYWLTSNRVADKITKSEMIHSGDRQDHTPIILEIEL >CP019833|1349372:1360054|1352989_1354081_-|AUP35276.1|DBSCAN-SWA MTIYNFSAGPAVLPKPVLVKAQSELLNYQGSSMSVLEVSHRSKEFDDIIKGAERYLRDLMGIPDNYKVIFLQGGASLQFSMIPLNIARGRKAYYHVAGSWGKKAYTEAVKLSKTIPFEPILLASSEESVYDYIPEFDEKEIDPEAAYVHVTTNNTIEGTSLYDTPKTNGVPVIADMSSNILAVKYKVEDFAMIYAGAQKNIGPAGVMVVIIREDMINEEPTLSSMLDYKIQSDAGSLYNTPPAYSIYIAKLVFEWVKSLGGVDAMEKANREKSGLLYDYIDSSEFYSNPVRDKKSRSLCNIPFITINKDLDEKFVKEATERGFKNIKGHRSVGGMRASLYNAFPKQGVIELIDFMKTFEAENA |
14 | Streptococcus_phage(84.62%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1811413 : 1818617
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP019833|1811413:1818617|DBSCAN-SWA ACTAGTAACCCCAAGCTGATAAACCTTGAGCACGATAAGCTTTAATAGCTGAATTAACTTGATCCTGAACTGTAGCTGTTGAACCCCAACCTGGCATCGTTTGGAAAAGTCCTGAAGCTCCTGAGGCATTAGCAACATTAGGATTACCATTTGATTCACGGGCAATAATATGTTCCCAAGTAGACTGAGGGACTCCTGTTGCAGCAGCCATTTGTGCTGCAGCTGCTGAGCCAATAGCCCCTGCAGTATTTCCATTACTCAATACTTGGCCACTCGTCTGGTGTTGAGCAGGTCTATAAGTTGTCTCAGTAACAGCATAAGCTTGTTGTGCCTGACTGGTAGCAGGGGTGTTTTCTGTTACAACTGCTTGTTCTACAGCTGCCTCTTCACTCGCAGTAACTTGTTGCTGAGAATTAGCTTCTGTAGATTGAGAACTTGATTTTGGGGCTTCATTAGATGCCTGAGAAGGTTTTGGAGCCTGTTTTACATCTTCTACTTTTGATTTAGATGTCGCCTTAGTCATTTTTGATTTTTTGGCTACGCGAACTTTATCTGCTTTTGACAAAGATTCAGTAGTAACTTGTGAACTTTTAAAGATGACCGTTACAGCCAAAATACATGAAAAAAGGGCTACTAAAGTGATAGCTCCATAAGCTAAATGTTGTTTTTTTACATTCAATTTTGATAATTTTCTTCTTTTATTCATGTTACCTATATTATACTTTATTTGTTACCTTGCAATTGAATAGATGTTAAAAATATTACAAAGAGATTTAATTTTAAGTAAATCTCTTTGTTTTATCAACTTTTATTAATACCAGCCGTTACTATTCCAAAATGATAGCGCTGCCGACCAAGATCCGTAACGAGAAGCCACATAATTGTCCGCTACTTTTTCTTGATTTTCAGGAGATAAGTCGCCATTTAGGTAAGATTGAGACAGTTGATATCTTCCATAATATTGTCCATTCTGTGCAGTATAACTACCATTTGATTCACGACGAGCTATTTCTTCTTTTGCAGCTGAATCACTTGAACTCAAATTTGATGAAGAATTCATTGAATTTTCAATTGTTGGTTGAGATTTTGCTTCTGCTTGACTAGTTGTAGAATTATCCAATTTTAAAACATCACCTATACTGATGACATCAGCGTTACTGATACTATTGAGAGACACTAACTCTTGTACCGTAGTTTTATGATTTTTAGCAATAGCTGATAAGGTATCACCTGATTTCACGGTATAAGATGCTGCGCTTACTGAAAGTGGTAAAGCTAATGAAGCACCCACTAAAAGACCTGCCACTCCTAATTTAAATGGTTTTGATTTTTTAACCGAGGTTATTGACATAATATATGCTCTCTTTCATTAATTGATACGCGTACTATCATACCTTGTAAATATTACTAATTGTTTTGCCTTAGATGAAATTTATTACAAATAAATTGTAAATTAATAAAGAAAAGGCCTCCAAAAAACAATTTTTAGTTTTCTTTAAGTAAAGTTGTTGAGCTTTTCACATTATATAAATGAAAAGGCTAAGACCATAAACTGACCTTAACCTTTTAATTTTTTAATAGAAACAAACTCAAACCCAATAATAACATAAGTAATATACTAAAAGTATCCCGAACAGTCCACTTCAATAAACGGTACTTACTACGATTGGCTCCGCCTTGATAACCTCTTGCTTCCATAGCAATTGCCAACGCATCTGCTCTTTTAAAACTAGAAGCAAATAATGGAATCAAAATAGGGATAATGGACTTAACCTTATGAATTAGGTTTTCCTCTCCAAAATCAACTCCACGAGCTCTTTGAGCATTCATGATACGTGTTGTATCATCCATTAAAGTAGGAACGAAACGTAAGCTAAGGGATAACATCAAACCAATCTCGTGTGCTGGTACTCTCAGTACTTCCAATGGTTTTAACAAAGATTCAACAGCATCTGCTAAACTTAACGGAGTAGTAGTTAAGGTAAGTAATGTCGAAAAGAAGATAATTAAAACAAATCTCATAAAAATAAGTGCTGCTTGTTGTAACCCAAGGCTAGTGATGCTAAAAATCCAAAACGAGAAGATAACCTGCCCGCCTTGTGCAAACAGCATCTGGAACAGGGTTGTAAATAAAATAATACCAACCATCGGTTTAATACCATTGAAAAAATAGGAAAATTTTATCTGAGATAAACCCACAATAACCAACGTAAAAATGAATACGATCACATTTGTCACTACATTATTTGCCCAAAAAACAATAATGATAAAAAGCAACATGGCTAGTAACTTACTTCGAGGATCTAATTTATGAATGAGAGAATTACCTGGTATGTAACGTCCCAAAATCAATTTATCCATGCTTAATAGCCTCCACAAATTCGTTAATAGTAATTGGTAAACTAGGTAAATTTAATCCCTTATGAGATAGTCTTTGAGCAAACTTGGTGATTTTGGGAACTCCTAATTGTTTACTTTCTAGAAGTTCTACTTCTTGAAAAATCTGTTTTGGTTGTCCTGATAGGGTTACTTTCCCTGCTTCTAAAACATACACATAGTCAGTATAATCCGCTACATCGTCCATTAAGTGAGTCACTAAGACGATGGTCATTCCTTTTTTATGAAGATTTTTAAAAAGAGTCATTAATTCTTTTCTTCCCTTAGGATCAAGTCCAGCAGTTGGCTCATCTAGTACTAGTACTTTGGGTTCCATCGCTAAAATACCAGCTATAGCAACCCGCCTCATCTGCCCTCCAGAAAGTTCAAATGGATTTTTATCGAATAAATCCTCACTAATACCAACTAACCTTAATTTTTCTTCAGCCAGCCTTTCAGCTTCAATCTGAGAAATACCAAAATTTTGTGGTCCAAAAGCAACATCCTTTAAAACTGTCTCTTCAAAAAGCTGACTTTCTGGAAATTGAAAAACTAAACCAACTTTTTGCCTTATAAATTTGATTTCTTTGTTCTTGTCCCCTGCTTTAATAGAAAAATCATCGACAATTACCTCACCTTTTGTAGGAATATGTAAACCATTCAAAAGTTGCATAATAGTTGATTTTCCAGAACCTGTGTGCCCAATGAACGCGGTATAGGAAGCATCTTCAATTTTCAGATTGACGTCAAAAAGGGCACGCCCTTCAAAAGGAGTGCCGGCTTGATAGGTATAACTTACATTTTTAAATTCAATTCCCATAATTGTTCTTCTAATTCCTTCTCTGTAAGATACTCTGTCCCTATATCAAGACCATTAGCAGCCAGTGCTGCCATTAACCTACTTGTAAAGGGAACATCTAAACCTAAACTAATCAAATGATTTCCACGACCAAATAACGCTTTTGGAGTGGATGTTGACTCAACTTTACCATTTTTCATAACGATGACACGATCACTCAATGCAACTTCATCTAAGTCATGTGTAATTGAAATAACAGTAAGATTATATTTTTGACGAATAGCTCGTATCGTTCTTATCAGTTCCAATCGTCCCTCAGGATCAAGCATACTAGTCGCCTCATCCAAGATGATAACTTGTGGACGCATAGCTACAGCTCCTGCAATGGCTACACGCTGCTTTTGTCCTCCAGATAAACGTGCAGGCTCCCTCATTTTAAATTCAGACATTCCTACCAAATCAAGTGCTTGGTCCACTCTTTCTTTCATGTCTTTCAAAGAAATACCTTTATTTTCCAAACCAAAGGCAACGTCATCTTCAACAGTTGCCCCTACAAATTGGTTATCTGGATTTTGAAATACCATGCCAATCTTGTGACGTAACTCCCAGACATTATCTTCGGTTAACTCTTGTCCATCAATGATAATCTGGCCAGACTCCGCCTCTAAAAGCCCATCTATTAAACGAACAGTAGTGGATTTCCCAGAACCATTATGACCAATAATAGATAGCCATTCTCCTTGTTTCACATGAAACGATACATTCTCCAATTGATAATGTGTTTGATTACTATCATATTTAAAAAAGAGATTATTAACGGTAATAATATTTGTCATTATTTAAAAGTATCCTTAAATAAGAAGCCTGCACCTTTAAAATAGTCGTAGCCTGAATACAAGGTAAAGAATAAAGCAATGTATAACATGATGTTACCAAGTGTCATCCAATGTACTAACAAAAAAATAACTGCAAACATTTGAGTAGCCGTCTTTATTTTCCCTGGCATAGCTGCCGCAAGTACTGTTCCACCTGTTTCAACTAAAAGTAAACGCAAACCTGTAACTGCTAGCTCTCTACAAATGATAATAGCTGAAACCCAAGCCGGTGCTAAGTCTAGTCCAACTAACATAATAAAAGCACTCATAACTAGCATTTTATCAGCTAATGGATCTGCAAATTTCCCAAAATTTGTTACTACTTGCCATTTACGTGCTAGATAACCGTCTAGGTAATCGGTCAAGCTTGCAATAGCAAATACAATAGCTGCAACAATATGCCAAGTTGTACTTGTTGTTACTGAAGTTAATACTATAAATAACGGAATCATTAAAATTCTGACTACAGTTAATAGATTCGGAATATTTTCTTTCTTCACCATAAATTCTCCTTTTGGAAACATAGTATTCCTATATTATGTTATTTCAAAACTAGTAAAAGACTTTTGACATACCAACTTTATAGATGTCTAAGCTTCCTTATTATATCAAAATTTCAGATTATTTACGAAGATTTTGGAAAAATAACGAAGTCAGATGTGTCAGCGTTATCTAAGAAATCCTTACCAATCGTAATGACATCTTCCAAGTCTAATTCTTCAACGATAGATGGCAAATCCAAATACATCGTTTTTCCATCATATAAATAGGTGACGAATTGCATTGCGAGATTTTCAATAGAATCTAAGCCCCTTAAAAAATCGCCATAGAGCTCTCTCTTAACGTTTTGTAAGTGGCTTTCGGTAAGATCAGATGATTGCAAAGCATTTTTTAGCAATAACCTCAACTGAGTTGAAAAAGCAATTGGCTCTGTCGTATCTAAAGAAATA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP019833|1811413:1818617|1815422_1815986_-|AUP35713.1|DBSCAN-SWA MFPKGEFMVKKENIPNLLTVVRILMIPLFIVLTSVTTSTTWHIVAAIVFAIASLTDYLDGYLARKWQVVTNFGKFADPLADKMLVMSAFIMLVGLDLAPAWVSAIIICRELAVTGLRLLLVETGGTVLAAAMPGKIKTATQMFAVIFLLVHWMTLGNIMLYIALFFTLYSGYDYFKGAGFLFKDTFK >CP019833|1811413:1818617|1814583_1815423_-|AUP35712.1|DBSCAN-SWA MTNIITVNNLFFKYDSNQTHYQLENVSFHVKQGEWLSIIGHNGSGKSTTVRLIDGLLEAESGQIIIDGQELTEDNVWELRHKIGMVFQNPDNQFVGATVEDDVAFGLENKGISLKDMKERVDQALDLVGMSEFKMREPARLSGGQKQRVAIAGAVAMRPQVIILDEATSMLDPEGRLELIRTIRAIRQKYNLTVISITHDLDEVALSDRVIVMKNGKVESTSTPKALFGRGNHLISLGLDVPFTSRLMAALAANGLDIGTEYLTEKELEEQLWELNLKM >CP019833|1811413:1818617|1812223_1812763_-|AUP35709.1|DBSCAN-SWA MSITSVKKSKPFKLGVAGLLVGASLALPLSVSAASYTVKSGDTLSAIAKNHKTTVQELVSLNSISNADVISIGDVLKLDNSTTSQAEAKSQPTIENSMNSSSNLSSSDSAAKEEIARRESNGSYTAQNGQYYGRYQLSQSYLNGDLSPENQEKVADNYVASRYGSWSAALSFWNSNGWY >CP019833|1811413:1818617|1812978_1813773_-|AUP35710.1|DBSCAN-SWA MDKLILGRYIPGNSLIHKLDPRSKLLAMLLFIIIVFWANNVVTNVIVFIFTLVIVGLSQIKFSYFFNGIKPMVGIILFTTLFQMLFAQGGQVIFSFWIFSITSLGLQQAALIFMRFVLIIFFSTLLTLTTTPLSLADAVESLLKPLEVLRVPAHEIGLMLSLSLRFVPTLMDDTTRIMNAQRARGVDFGEENLIHKVKSIIPILIPLFASSFKRADALAIAMEARGYQGGANRSKYRLLKWTVRDTFSILLMLLLGLSLFLLKN >CP019833|1811413:1818617|1813765_1814608_-|AUP35711.1|DBSCAN-SWA MGIEFKNVSYTYQAGTPFEGRALFDVNLKIEDASYTAFIGHTGSGKSTIMQLLNGLHIPTKGEVIVDDFSIKAGDKNKEIKFIRQKVGLVFQFPESQLFEETVLKDVAFGPQNFGISQIEAERLAEEKLRLVGISEDLFDKNPFELSGGQMRRVAIAGILAMEPKVLVLDEPTAGLDPKGRKELMTLFKNLHKKGMTIVLVTHLMDDVADYTDYVYVLEAGKVTLSGQPKQIFQEVELLESKQLGVPKITKFAQRLSHKGLNLPSLPITINEFVEAIKHG >CP019833|1811413:1818617|1817372_1818617_-|AUP35715.1|DBSCAN-SWA MKIVEGVSLHLIKNQQFKTNHLTFRFSGDFNNKTVARRSLVAQMLVTANAKYPKVQEFREKLASLYGASLSTKISTKGLVHIVDIDIVFVKNTFTLEQENIVEQIITFLEDMLFSPLISLEQYQTSIFDTEKKNLIQYLEADIEDNFYSSDLALKSLFYNNKTLRLPKYGTASLVESENSFTAYQEFQKMLKEDQLDIFVVGDFDDYRMIQAFNRMAFEPRHKVLAFDYTQTYENITRSQVEDKDVNQSIMQLAYHLPITYKDEDYFALIVFNGLFGAFAHSLLFTEIREKQGLAYTIGSQFNSFTGLFTIYAGIDKENRERFLKLINKQFNNIKMGRFSSTLLKQTKDILKMNYVLASDNPKVIVDHIYHEHYLDQFHTSALFIDKVDDVTKSDIVSVATKLKLQAFYFLEGN >CP019833|1811413:1818617|1811413_1812118_-|AUP35708.1|DBSCAN-SWA MNKRRKLSKLNVKKQHLAYGAITLVALFSCILAVTVIFKSSQVTTESLSKADKVRVAKKSKMTKATSKSKVEDVKQAPKPSQASNEAPKSSSQSTEANSQQQVTASEEAAVEQAVVTENTPATSQAQQAYAVTETTYRPAQHQTSGQVLSNGNTAGAIGSAAAAQMAAATGVPQSTWEHIIARESNGNPNVANASGASGLFQTMPGWGSTATVQDQVNSAIKAYRAQGLSAWGY >CP019833|1811413:1818617|1816087_1817371_-|AUP35714.1|DBSCAN-SWA MTVNKITYQNLQEEVYKLTLESGLNVYLIPKPSFKETVGVLTANFGSLHTRYTRNGCVEHYPAGIAHFLEHKLFELDKGQDAATQFTKYGAESNAFTTFDKTSFYFSTISHITNCLDILLDFVLTTNFTEESITKEKDIIKQEIEMYQDDPEYRLYQGVLSNLYPNSPLAFDIAGDYQSISQITLTDLQENHKDFYQLSNMNLVLVGQFSPQEIITYLQKKSHFTSYSQNIDRDSISLEPVIKNNSCHMTVTKPKLAIGYRKSNHMIHGSYLKEKIGLQLFFAMLLGWTSTINQDWYESGQIDDSFDIEIEVHPDFECVIISLDTTEPIAFSTQLRLLLKNALQSSDLTESHLQNVKRELYGDFLRGLDSIENLAMQFVTYLYDGKTMYLDLPSIVEELDLEDVITIGKDFLDNADTSDFVIFPKSS |
8 | uncultured_Caudovirales_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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