Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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CP025778 | Francisella tularensis strain 12T0050_FLI chromosome, complete genome | 0 crisprs | csa3,DEDDh,RT,cas4,cas2 | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
67523 : 75338
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP025778|67523:75338|DBSCAN-SWA TATGAAAAATATCAGAAACTTTTCGATAATTGCGCATATTGACCATGGTAAGTCTACTCTTTCAGACAGGTTTATACAAGTCTGTAATGGTCTAAGTGAGCGTGAAATGAAAGAGCAGGTTCTTGATTCTATGGATATAGAAAGAGAGCGTGGGATTACGATTAAGGCGCAATCTGTGACGCTTGACTATACAGCTAGAGATGGACAAACATATCAGCTTAATTTCATTGATACACCAGGACACGTTGATTTCTCTTATGAGGTGTCGCGCTCATTAGCAGCTTGTGAAGGAGCTTTACTTGTAGTAGATGCCGCTCAAGGCGTAGAAGCCCAGACAGTAGCAAACTGTTATACTGCCATTGAGCAGAATTTAGAGGTTATACCTATATTAAATAAAATTGATTTACCTTTTGCAGAGCCGGATAGAGTAGCTCAAGAAATTGAAGAAATAATCGGTATTGATGCTACAGGGGCTACTACATGCAGCGCTAAGATAGGTATTGGTGTAGAAGATGTTTTAGAAACTATTGTTGCTAAAGTTCCAGCTCCTGAAGGTGATGTTAATGCAAAGCTGCAAGCTTTGATTATAGATTCATGGTTTGATAACTATCTTGGCGTGGTTTCACTTGTCAGAGTCAAAAATGGTACCATAAAGAAAGGTGAAAAGTTCAAGGTTATGTCAACAGGAGTTGCTTACCAGGTTGATAGACTCGGAGTATTTACGCCGAAAATGAAAGACCTAGATCATCTCAAAGCAGGAGAGGTCGGTTTTATCGTTGCTGGGATTAAGGATATTCATGGTGCACCAGTTGGTGATACGCTCACTCATGCACATAACCCAACAGATAAGCCTGTACCTGGATTTAAAAAGGTTCAACCTCAAGTTTATGCAGGGATGTTTACTATAAGTTCTGACGATTATCCTGATTTTAGAGAAGCTCTCGAAAAGTTAAGTTTAAATGATGCGTCACTATTTTTTGAGCCAGAGGTATCACAAGCTTTAGGTTTTGGCTTTAGATGTGGTTTCTTGGGTATGCTACACATGGAGATTATTCAAGAGAGATTAGAAAGAGAGTATAACCTTGATTTAATCACTTCTGCACCAACAGTTGTTTATAAAGCTATTAAGAAAGATGGTGAAATTATCGAAGTTGATAATCTATCTAAACTACCAGAGCCAGGAGCGATAGCTGAGATACAAGAGCCAATTGTAAGGGCAAATATTCTTGTACCAAAAGATTATGTTGGTAGTGTAATTACTATCTGTATTGAAAAAAGAGGTGTACAGGTTGATCTTAATTATGTGGGGAATCAAGTTTCTATAACTTATGACCTACCAATGATTGAAGTTGTGTCTGATTTCTTTGATACTCTTAAATCTGTAACGAAAGGTTATGGATCATTAGATTATGAGTTGATTCGTTATGAGCCAGCGAATATGGTGTGTCTAGATGTGCTCATAAATGGCGATAAGGTTGATGCATTAGCAAGTATTGTGCATAAAGATCAGGCTAAATACAAAGGTAGAGAACTAGTTGAGCGTCTCAAAGAGTTGATTCCTAGACAAATGTTTGAGGTCGCAATTCAAGCAGCTATAGGTGGAACTATCGTTGCAAGAAGTACAGTTAAAGCATTGCGTAAGAACGTTTTAGCGAAATGCTATGGTGGTGACGTTTCACGTAAGAAAAAACTATTAGAGAAGCAAAAAGAGGGTAAAAAGAGAATGAAGAATATTGGCTCTGTTGAAATTCCTCAAGAAGCTTTTTTATCAGTGCTTAAAAAATAAAATTATAGTTATTATGGAAAATAAAAAAGTAATAGTAGGTATCTCAGGAGGTGTGGACTCATCAGTTTCAGCTTTGCTCTTGAAACAGCAAGGTTATGATGTAACAGGTGTTTTTATGAAAAACTGGGAAGAAGATGATACAGATGAGTTTTGCTCAGCGGAGCAAGATATCGCTGATGCTCAAGCTGTTTGTGACTCTATAGGGATACCTTTCAAAAAGATTAATTTTACCGCTGAATACTGGGATAATGTTTTTGAGCATTTTCTAATAGAGTATAAAGCTGGCAGAACACCTAATCCTGATATCTTATGCAATAAGGAAATCAAATTTAAAGCCTTTCTGAGCTATGTACATCTTTTAGGCGGTGATTATATTGCTACAGGACATTATGCTCAAACAAGACTAGCCGCTGATGGTTCAGTACAGTTAGTCAAAGGACTTGATGATAATAAGGATCAAACATATTTTTTATATACTCTAGGTCAAGAGCAACTTAGACAGACGATATTTCCTATAGGCAACATTGAAAAATCTAAAGTGCGTGAAATTGCCAAAGAAAATAATCTTGTAACATTTGATAAAAAAGATAGTACTGGTATCTGCTTCATAGGTGAGCGTAAGTTTAAAGAATTTTTGTCTAAGTATTTGCCTGCTCAAAAAGGTGAAATCCATGATGAAAATGGTATCAAGATCGGTATGCATGATGGATTGATGTATTATACAATTGGTCAAAGACAGGGGCTTGGTATAGGTGGTGTAAAAGATCGCCCTGAGGTACCTTGGTTTGCAGCTAAAAAAGATTTAGAAAACAATGTCTTGATTGCTGTGCAAGGTCATGATCATCCATTACTATTTAAGCAGTCACTACAAGCTATCGAGCTAAGTTGGGTTGCAGGTATGGCTCCGGCAGATAAATTTAGATGTGCAGCAAAAGTCCGCTATAGACAAAAAGATCAGTCTTGTGAAGTCGAAGTAAATCAAGATGGTTCAGTTAATGTAACTTTTGATCAGCCACAAAGAGCAATCACACCAGGACAGTCAGTAGTATTTTATATTGATGATGTTTGCTTAGGTGGGGGAGTAATTATTTAGAATTACTCTTATTTAATTTCTATTTATTGTCACTTGCTAGAGTTGTTTTTGGAGTATCATTGCTATCAACTTGAGTGGTTGAAGCAGTTTTTGTGGCTGTTTGTATTGTACTACCACTACTTTCTTGATTGATAGGCTTTTTCGCTATAGTACTAATACTACTACCACTTGCTAGTGTGGTTTCTTTGTCTTCGCGTTGCTCATCTGCCTTAGTTATTAGATCGTTATCTAGCGCTGCGACACTACTTGCAACTTCTTGGTGAGTGTATCCTGTATCTTTTTTATCGCTGTCGACAACATCTTTAAGATAGTCATCAACTTTCTTTTTGACATTTGTTTGACTCTTCATAACATCTCTCTGCATGAATTGAGCTTCATGGACAGCGTCAATAGTCATATGTGTATATAAGTATTCTGGATCAATAATAAATGGTCTAAGCTCGGTACTATACTCTTTCTCTAAGCCAGGAAAATAAACAGTATAAGCAACTTTTATACGTTTTTTACCTTCTTTATCATTAACAACCATTGCTACAAGATTTGAATCTATTTCATATTCTTTTCTAACAAGGTGATATTGTTGCTTTCTATCAAGGACAATCTGCTTAACTGGAGTTGCAAAAACTTTTTTAGTTTTAATTGGTTTATTAACCGTGGTAACCCCAGCTTTTCGTAACTCTTCAATAGCGTAGTTTCCATAGTCGTCCTTAGCAAGTCTAACATCTATTTCAATCATCTTAGCTAAAACATATTCTCTAAATTCACGAGCTTGTTTTAATGTAAATGCAAGACAAGTACCTGTATCATCTTTCTGAAAACAACCATTTCTCTTATCAATTAGCACAAAAAGTTTTTGTGTCTTATCGTAATAGAGCTGATAGTCAGGAGAGTTCTCACCATGACCTAGATAAACAAACTGGTCGTTAGATAGCATACCACATGATGCTATAATTACGCTTAGTAATAATATTAATAATGTTTTTTTGAATATATTGCGCATACTAAATTCCATGATTTAATAACAATTACAGGAGATAATTTTTGCGTAATGCTGCTAAAAAGTAAAGTATTGATTATACAAAATAATCAAAAATTAACTCTTAGCATTTTCTTGCATTAGTTTTTTATACTTTTTCTCTATCATTTTGCGCTTTAGTGAACCAAGATGGTCAAAGAAAGTTATACCATTAAGATGATCTATCTCATGTTGGATGCATCTAGCTAAAAATCCATCTTTTTCAACTTCAATCTCTTCTCCAAATTCATTAAGTGCCTTTATTTTGACTACAGTGGCCCTATTTACCTTTGCGGAAACACCAGGAAAAGAAAGACAGCCCTCTTCATCAATTATTTTACCGTTTTGTTCAATTATTTCAGGGTTAATGATAGTGATTATTTCAGGGTTTTGCTCTTCTAAGTTATCATACATGATAAAGAATCTTTTTTTGATACCAACTTGTATTGCTGCTAAACCCACGCCATTTGCTTCTAGCATTAGCTCATGCATTTCAGCAATAGTTGCACGTAAATCATCATTGATTTCATCTTTTGTAACTTCTTTAGCAACCTCTTTTAAAACTGGGTGAGGGTACTTTAGAATTTCTAAAGACATATTCATACTCCTTGTTCTAAAATATCTTTTTTCATCTTTGCCATCGTTATGGCAGCTTGGATAGAGTATTTACCTTTATGACCTTTTTTGCCACCGACTCTTTCTAAGGCTTGCTCTTTGTTGTGTGTGGTTAATATACCAAAAATTACTGGTAAATTATATTGGTGCATGACTTTTTGTGTACCATAACTTACCTGATCGCAAACATAATCATAGTGATCTGTCTCGCCTCGGATTACGCAACCTAGTAATACTATTGCATCAAACTCTTTAGTTTCTGCTAGGAGCTTTGCTGCATATGGAAGTTCAACTGCTCCAGTAACTTTTTTGATACAAATTTGACTATCTTTTAAGCCTTGAGCATATGCTTCTTCTAATGCACCCTCAAGCATTTTATCAGTTATCAAAGAGTTAAATTCACTTACAACGATTGCTAATTTTCTCATAATTTATACCTATATTCCTTTAATTGTATGTTTTGCTTTAATTTTTTTAGTTATCAAGTAGTTTCTATTGTGAGAGTTTACAAATGCCTCACAATATACTGGTTGTGTTTCTATATCAACGTTTCTAAGAGCAGCTAGCTTTTCAGGATTATTAGATATTAATCGGCAGCGGTTGACATTGTTATATTTTAGGACTTGTATAGCTAGATCGTATTTTCTTGCGTCAGCGGGTAAGCCAAGAGCTAAATTAGCTTCAAGAGTGTCCATATTTTCATTCATCTGCAAATTATAGGCTTTAAGCTTATTTGTTAAACCAATACCTCTACCTTCTTGGTCAAGATATATAAAAAAGCCACCCTCTTCGCTAATCATTTCAATTCCTTTATGTAATTGATCTTGGCAGTCACAGCGTAGCGAGCCAAAAATATCTCCTGTTATGCAAGATGAATGCATTCTTACTAAAGGATTATTACCAGAATAAGGTTTAGATAAAACAACAACTTCATCACCACTAAAGTTATCTTTATACACACTCATTTCCAATTCGCCAATTTTCTTGAATGGTATAGTAGAGCTTGCCATTTTCGTGACAAAAATTTCAGTTGCTAAACGATATTGGTAAAGCTCTGCAATAGTTAAAAGAGGCAGATCGTGCTTTTTAGCAAATGCTTCTAGTTCAGCAGCTTTCATCATGGTGCCATCTTTATTCATTAGCTCACATAGAACTCCAGCGCTATTAAAACCACTTAGTTTCATAAGATCAACAGTTGCCTCAGTATGACCATTTCTACCAAGTACGCCTTTATCATTGGCTATAAGAGGGAATATATGTCCAGGTCTAGCTAATTCTTCTGCTTTAGCATCAGCTTTTGATGCAACTTGAATAGTATGTGCTCTATCCTTTGCTGATACTCCTGTAGTTACCCCTTCTTTAGCCTCTATAGTTACAGTAAAAGGAGTTGTAAAAGTACTATTGTTTTGGTCAGCAGCTACCATTGGCGTTAGATTTAATTCTCGTGCTTTCTTTGAGTCCATTGCCAAACAAATGATGCCACTTGTATGCTCAAGCATAAATGTGATATTTTCTTCTGTGGCTTTTTGACCCGGTAGAATTAGATCACCCTCATTTTCTCTATCATAATCATCAAGTACAACTACGGGTTTGCCTTGCTTAAGAGCTTCTATGGCATTCTCAACATTATTTTTTATTTGCTCAAACATTTTCTTTAAATCCTTGTATATATTTATAGATATATTTACCTGTTGCATCAGCTTCAAGATTTACCATAGAACCATTACTATAGTTTTTTGCGATAGTAACTTCAATGGTGTGAGGTATCAAAGTTACAGTAAATGAATCTTTGAGTACATTTATTACAGTTATACTCATACCATCTATGGTTACAAAACCTTTCTTTATTAAGTATTTTAGAAATTCTCTAGAAGCAGAAATTTCAATTAACCATGCACCACCGACATTTTGAATACTTTTGATTTGCCCTGGTTCATCAATATGACCTTGTACCATATGCCCACCAATATGATCACCATAGCGCATTGCAAGTTCGATATTTACTAGTTGGTTCTCCTTAAGAGTATCAAGATTAGTTTTTTTAAGTGTCTCTGGTACTGCATCAAAATTAGCTGTTAAGTTTTGCTTATCAAGTTTTGTAACAGTAAGACAGGTACCATTAATCGCAACACTATCACCAATGCTACATTGAAGACTATTATCAAATTTGATACAAAAAGTTTTTAGACTATCTTTAGTTGTTATTTTTTTAATTGTTCCTAGTTGCTGAACTATGCCACTAAACATTAGAATTTTCCTTAAAACAAGAGTTTATTATTATATCCTCTCTTACAGAGATTTGATTGAAGCTTAGCTGCTGTTTGGGGTTATAATCAGCTATTATTACCGGAGCTAAGTATGTATAAAATTCATTAACAAGTTTTTGATTAATAAAACTATTTAGGGTTTTATTACCACCTTCAACAAGAAGACTAGTTATTCCAATCTTACCCATCTTCTCAAGTAAGGTATCTAAACAAACCTGATGTTGACTTTGTGGTAATAGCCAATATTCAATGCCAAGTTGGTTAAGCTTGGTTGCTACTCGTGCAGAGATCTTTGAACAAACAAAAATCGTTTTGGCATGCCTTTGATCTAAAACTCGCCAATTATGATTTATTGTTGTCAGATGATTAGCAAGTATAAATCTAGTTGAATGTTTTATTTTATTGATATTTATTCTTACATCAAGACTTGGATTGTCATCAATTAGAGTTTGCTTGCCAATTAAGATAGCGTCACAAATATTGCGCAATTCATGAGTATTTACGAATGCTTGATGTGAGCTTATTTTTTTTGAGTCACCATCATTAACAGCTATTTTACCATCTAATGACATAGCCCATTTTGCATAAACAAAAGGTTTTTTGGTTGTTTGATAATGAAAAAATATTTTATTTAACTCTTGTGCTTGTTTCTCTAGTAAGCCTACTTCGACTGTTATACCAGCATTTTTGAGTCTTTCGACGCCTTTGCCAGCAACTTTAGGGTTTGGATCAAGAGTAGCAATAATTACTTTTTTTATCCCAGCTTTGATTATGGTATCAGTACAGGGAGGAGTTCTTCCACAGTGACAGCATGGTTCTAGTGTTACGTATGCTGTAGCTCCTTTTGCTTTATCAACCGCTTTTGTCAGTGCGTGAACCTCTGCATGCGCTTCTCCTACAGTTTCATGCCAACCTTCCGAGATAATTGCACCATTTTTTACTATTATGCAACCAACCATTGGATTAGGTGATACTGTAAGTCTACCTCTATTTGCTAGAGTAAGTGCTTGTTGCATATAATATTTATCGATATTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP025778|67523:75338|71494_72019_-|AUP74658.1|DBSCAN-SWA MNMSLEILKYPHPVLKEVAKEVTKDEINDDLRATIAEMHELMLEANGVGLAAIQVGIKKRFFIMYDNLEEQNPEIITIINPEIIEQNGKIIDEEGCLSFPGVSAKVNRATVVKIKALNEFGEEIEVEKDGFLARCIQHEIDHLNGITFFDHLGSLKRKMIEKKYKKLMQENAKS >CP025778|67523:75338|74270_75338_-|AUP74662.1|DBSCAN-SWA MKNIDKYYMQQALTLANRGRLTVSPNPMVGCIIVKNGAIISEGWHETVGEAHAEVHALTKAVDKAKGATAYVTLEPCCHCGRTPPCTDTIIKAGIKKVIIATLDPNPKVAGKGVERLKNAGITVEVGLLEKQAQELNKIFFHYQTTKKPFVYAKWAMSLDGKIAVNDGDSKKISSHQAFVNTHELRNICDAILIGKQTLIDDNPSLDVRININKIKHSTRFILANHLTTINHNWRVLDQRHAKTIFVCSKISARVATKLNQLGIEYWLLPQSQHQVCLDTLLEKMGKIGITSLLVEGGNKTLNSFINQKLVNEFYTYLAPVIIADYNPKQQLSFNQISVREDIIINSCFKENSNV >CP025778|67523:75338|69255_70401_+|AUP74656.1|tRNA|DBSCAN-SWA MALLKFLKKLFYQCLKNKIIVIMENKKVIVGISGGVDSSVSALLLKQQGYDVTGVFMKNWEEDDTDEFCSAEQDIADAQAVCDSIGIPFKKINFTAEYWDNVFEHFLIEYKAGRTPNPDILCNKEIKFKAFLSYVHLLGGDYIATGHYAQTRLAADGSVQLVKGLDDNKDQTYFLYTLGQEQLRQTIFPIGNIEKSKVREIAKENNLVTFDKKDSTGICFIGERKFKEFLSKYLPAQKGEIHDENGIKIGMHDGLMYYTIGQRQGLGIGGVKDRPEVPWFAAKKDLENNVLIAVQGHDHPLLFKQSLQAIELSWVAGMAPADKFRCAAKVRYRQKDQSCEVEVNQDGSVNVTFDQPQRAITPGQSVVFYIDDVCLGGGVII >CP025778|67523:75338|70420_71413_-|AUP74657.1|DBSCAN-SWA MEFSMRNIFKKTLLILLLSVIIASCGMLSNDQFVYLGHGENSPDYQLYYDKTQKLFVLIDKRNGCFQKDDTGTCLAFTLKQAREFREYVLAKMIEIDVRLAKDDYGNYAIEELRKAGVTTVNKPIKTKKVFATPVKQIVLDRKQQYHLVRKEYEIDSNLVAMVVNDKEGKKRIKVAYTVYFPGLEKEYSTELRPFIIDPEYLYTHMTIDAVHEAQFMQRDVMKSQTNVKKKVDDYLKDVVDSDKKDTGYTHQEVASSVAALDNDLITKADEQREDKETTLASGSSISTIAKKPINQESSGSTIQTATKTASTTQVDSNDTPKTTLASDNK >CP025778|67523:75338|72468_73680_-|AUP74660.1|DBSCAN-SWA MFEQIKNNVENAIEALKQGKPVVVLDDYDRENEGDLILPGQKATEENITFMLEHTSGIICLAMDSKKARELNLTPMVAADQNNSTFTTPFTVTIEAKEGVTTGVSAKDRAHTIQVASKADAKAEELARPGHIFPLIANDKGVLGRNGHTEATVDLMKLSGFNSAGVLCELMNKDGTMMKAAELEAFAKKHDLPLLTIAELYQYRLATEIFVTKMASSTIPFKKIGELEMSVYKDNFSGDEVVVLSKPYSGNNPLVRMHSSCITGDIFGSLRCDCQDQLHKGIEMISEEGGFFIYLDQEGRGIGLTNKLKAYNLQMNENMDTLEANLALGLPADARKYDLAIQVLKYNNVNRCRLISNNPEKLAALRNVDIETQPVYCEAFVNSHNRNYLITKKIKAKHTIKGI >CP025778|67523:75338|67523_69308_+|AUP74655.1|DBSCAN-SWA MKNIRNFSIIAHIDHGKSTLSDRFIQVCNGLSEREMKEQVLDSMDIERERGITIKAQSVTLDYTARDGQTYQLNFIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDAAQGVEAQTVANCYTAIEQNLEVIPILNKIDLPFAEPDRVAQEIEEIIGIDATGATTCSAKIGIGVEDVLETIVAKVPAPEGDVNAKLQALIIDSWFDNYLGVVSLVRVKNGTIKKGEKFKVMSTGVAYQVDRLGVFTPKMKDLDHLKAGEVGFIVAGIKDIHGAPVGDTLTHAHNPTDKPVPGFKKVQPQVYAGMFTISSDDYPDFREALEKLSLNDASLFFEPEVSQALGFGFRCGFLGMLHMEIIQERLEREYNLDLITSAPTVVYKAIKKDGEIIEVDNLSKLPEPGAIAEIQEPIVRANILVPKDYVGSVITICIEKRGVQVDLNYVGNQVSITYDLPMIEVVSDFFDTLKSVTKGYGSLDYELIRYEPANMVCLDVLINGDKVDALASIVHKDQAKYKGRELVERLKELIPRQMFEVAIQAAIGGTIVARSTVKALRKNVLAKCYGGDVSRKKKLLEKQKEGKKRMKNIGSVEIPQEAFLSVLKK >CP025778|67523:75338|73672_74278_-|AUP74661.1|DBSCAN-SWA MFSGIVQQLGTIKKITTKDSLKTFCIKFDNSLQCSIGDSVAINGTCLTVTKLDKQNLTANFDAVPETLKKTNLDTLKENQLVNIELAMRYGDHIGGHMVQGHIDEPGQIKSIQNVGGAWLIEISASREFLKYLIKKGFVTIDGMSITVINVLKDSFTVTLIPHTIEVTIAKNYSNGSMVNLEADATGKYIYKYIQGFKENV >CP025778|67523:75338|72015_72459_-|AUP74659.1|DBSCAN-SWA MRKLAIVVSEFNSLITDKMLEGALEEAYAQGLKDSQICIKKVTGAVELPYAAKLLAETKEFDAIVLLGCVIRGETDHYDYVCDQVSYGTQKVMHQYNLPVIFGILTTHNKEQALERVGGKKGHKGKYSIQAAITMAKMKKDILEQGV |
8 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
871389 : 939747
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP025778|871389:939747|DBSCAN-SWA AATGATAACTAATAATCTAGTTCCTACCGTAATTGAAAAAACAGCTGGCGGTGAGAGAGCCTTTGATATTTATTCAAGACTACTTAAAGAGCGTATAGTTTTTTTGAATGGTGAGGTAAATGATCACTCAGCTAATCTTGTGATTGCGCAACTATTGTTTCTAGAGTCAGAAGACCCAGATAAAGATATTTATTTTTATATAAATTCTCCTGGTGGGATGGTTACAGCTGGCATGGGTGTTTATGATACTATGCAGTTTATCAAACCTGATGTAAGTACTATATGTATTGGTTTGGCTGCGAGTATGGGATCACTTTTGTTAGCAGGTGGTGCTAAAGGTAAAAGATATAGTCTACCAAGCTCGCAAATTATGATTCATCAGCCTTTAGGTGGCTTTAGAGGTCAAGCATCTGATATTGAAATTCATGCAAAAAATATTTTACGTATCAAAGATAGACTAAATAAAGTTTTAGCTCATCATACAGGTCAGGATTTAGAAACTATTGTTAAAGATACTGATAGAGATAATTTTATGATGGCTGATGAAGCTAAAGCGTATGGTCTGATTGATCATGTGATTGAATCTCGTGAAGCAATTATTAAATAATTAAAGGAAGTCAACTTACTAAAATGGCTAAAATTCTATATTGTTCTTTTTGTGGTAAATCACAACAAGAAGTCAAAAATATTATCTCAGGAAGAGATGGTAATATTTGTAACGAATGTGTAAGTAAATGTGCCGAAAAAATTCGTAGTACTGGTAGTACTAGTGCTGAAGATATCTCATTTGAAAAATTACCAAAGCCAGTTGAAATCAAAAAATACTTAGATGATTATATTATCGGTCAAGATAATGCTAAAAAAGTGTTATCAGTAGCTGTATACAATCATTATAAAAGAATTACATCTAACCTAACAAAAGATGATGATACTGAGCTTAAAAAAAGTAACGTGCTGTTAATTGGTCCAACGGGATCAGGTAAGACATTATTTGCCCAGACTTTAGCAAAGTTGTTAAATGTTCCTTTTGCTATAGCAGATGCCACTACTCTTACTGAGGCTGGTTATGTTGGTGATGATGTTGAAAATATAATTGTTCGACTTTTGCAAAATGCTGATTTTGATGTTGCTAAAGCACAAAAGGGTATTATTTATATTGATGAGATAGATAAAATCGCACGCAAATCAGAAAGTACGTCAATAACTCGTGATGTTTCTGGTGAGGGTGTGCAGCAGGCATTATTAAAACTTATTGAGGGTACAGTGTCTTCTGTGCCTCCTAAAGGCGGCAGAAAGCATCCTAATCAAGATATGATTCAAGTGGATACTTCAGATATATTATTTATTTGTGGTGGAGCATTTGCTGGTATCGAGAAGGTTATAAAGCACAGAATGGATAAGGTCAGTATTGGGTTTAATGCTGATGTTATTCAACAAAAAAATAGCTTAGATAGCGATAAACTTATGCAAAAGATTGAAAGTGAAGATTTGACTAGATTTGGGCTTATTCCAGAATTGATTGGTCGTTTGCCAATAGTTACAGTTCTAAATGAACTTAAAGAAGAAGATTTAGTTAGAATCCTTACAGAACCTAAAAATGCTTTAATTAAACAGTATATTAAGCTGTTTAAGTTTGATAATGTTAATATTGAGTTTACCGATCAAGCTCTTGTTGAGATAGCTAAAAAAGCAATAACTAAAAAGACAGGCGCGAGAGGTCTAAGAACTATTTTAGAAAATGTACTTCTTGAAGTGATGTTTCATATACCTTCATCTGAAGATATTGAAAAAGTTATTATCAATGACAAAGTAATTCTAGAGCAGCAAGAACCAATCTTAGCGATAAAAACACAACAGCAAAAACAATTAAAAGATATAATCTAATAATTTACAGGAGGATGTAAGTTTATGTCAGAACCCCTAAATGTCGTTCCTGTTATTCCTTTAAGAGATGTTGTTATTTATCCATCGATGACTCTACCACTTAATGTTGGGCGTAAAAAGTCAATAGAGGCAGTTAAACAGGCATCAAATAATTATAATAACTATATTTTATTAGCTACACAAAAAAATGGTTCGAGTGGCGGTGATGTTGTAGAAAATATATATGATATTGCAACTCTTGCTAAAGTTGTTCAGATAATGAAACTTCCTGATGGTAGTCTGAAAATAATAGTCGAGGGTATTGCTAAAAGACTAGTAGCTAAGTATGAAGATATTGATGGTTGTATCTATGCAAATTTAGATAGTTTACATATTGATGATAACTATGATCCCAGCCAAGTTGATAAAGAACTAAAAGCTATTTTACTATCAGTTTCTGATTCGCTTAAAAGATTTGTTGATATCAGTGGTAGAGTTTCGAAAGAATCATTAGCTACATTGATAAATACGGAAGAGCCACATAAATTTATTTATGAAATAGCTACTATACTTAATACAGAAATAGCTAAAAAACAAAAAATCCTTGAGGCAACGGATATAAAAAATAAAGCCTTGCTACTACTTTCATATCTTTATGAAGAGCTAGAGATACTAGAGCTAGAAGCTAAGATCAAAGATAGAGTCAAAGCTCAAGTTGATAAGAATCAGCGTGAATACTATCTAAATGAGCAAGTCAAAGCGATATATAAAGAGCTTGGTGAAGCTGATGAAGAATCAGAAGTATCTGTTTTGAAAAAAAGGATTGAGCATACTAAGATGTCTAAAGAGGCAAAAGAGAAATGCTTAAAAGAGCTCAAGAAACTTAAGGCTATGCCGCCTTCTTCATCAGAATCAGCTGTTTCGAGAAACTATATTGAAACTATACTTTCTCTACCATGGGGTAAGAGGGCAAAAGTTAAAAGAGATATTAATCTTGCTGAGAAAGTTTTAGAAAAAGATCATTACGGTATCAAAAAAGTTAAAGAAAGGATCCTTGAGCATTTAGCTGTTCAGATTAAAAGAGACAGTAATACTAAAGCACCAATTCTGTGCTTAGTAGGACCTCCAGGAGTAGGTAAAACATCTATAGGACAGTCGATTGCTAGAGCAACAGGGCGTGAGTATGTGCGTATGGCTTTAGGTGGTGTACGTGATGAGTCTGAGATTAGGGGACATCGTCGTACATACATAGGTTCTATGCCTGGTCAAATTATCCAAAAGATAATTAAATCAAAGACAGAGAATCCACTTTTCTTATTAGACGAGATTGATAAAATTTCTTCTGATTTCCGTGGTGATCCATCTGCCGCGCTCTTAGAAGTACTTGATCCAGAGCAAAATAGTACATTTAACGATCATTACCTTGAGATAGACTATGATTTATCAAAGGTAATGTTTGTTGCTACAGCAAATTCCTTAGATATAGATCCAGCATTACGTGATAGATTAGAGATTATCAACTTATCAGGCTATACCGAAATAGAGAAGCAAGCTATCGCAAAACAGTATTTAATACCTAAAGCATTAGAAAATAATGGTTTGACTAAGGATGAAATTAATTTCACACCAAAAGCTATCCTTGATATTATCAGATATTATACAAGAGAGGCTGGTGTAAGAAATCTTCAGCAAAAAATAGATGGTGTTTGCCGTAAAGCAGTTAAAAATCTCTTAAAGGATTCAAATACTGGCAAAATTTCGATTACACAAAAAAATCTCGAAGATTATCTTGGTGTACATCAGTATGATTATGGTGTTAAAAATGCTAAAGCAAAAGTAGGTCAAGTAACAGGTTTAGCTTGGACATCAGTTGGTGGAGAGCTTTTGACTATAGAAGCTCTAGCAATGCCAGGAAAAGGTAAAGTTAAATATACTGGTAGTCTTGGTGATGTAATGAAAGAATCTATAGATGCTGCTTTTAGTGTGGTACGCTCAATGTCAAAAGACTATAAGTTAGAAGATGATTTCTATGAGAAAAAAGATATACATATTCATGTCCCTGAAGGAGCTACACCAAAAGATGGTCCAAGTGCTGGTATTGCGATGACAACGGCTTTAGTTTCTGTATATACAAACAAACCAGTTAGAAATGATGTGGCAATGACAGGTGAGGTGACACTCCGTGGTGAAGTGCTAGCTATAGGCGGTTTAAAAGAAAAGCTTTTGGCAGCATTAAGAGGTGGAATTAAGGAGGTTTTGATCCCAAAACAGAATGTTAAAAATTTAGCCGATGTTGATAAAGAAATCCTGGAAAAACTCGAAATAACCCCTGTAAGTAGCATAAAAGAGGTTTTAGAGAGAGTTTTTTGATATTTAACTGTTGAAACACTGCATTTTTAGTGTTATAAAGTTAACTGACACTTGTCAATTGTATAAAAATAAAGGAGTTTAAAAACATGAACAAGAGTGAATTAGTAAGTGCTATAGCTAAAGAAGCAGATGTTACTAAAGAAGTTGCTAGCAACACTCTAGATGCTACTATTGCGGCAGTAACTAAAGCTTTAAAAAATGGTGATAGCGTAACTCTAGTAGGTTTTGGTACTTTTCAGGTAAAAGAAAGAAGTCCTAGAGAGGGTAGAAACCCAAAGACTGGTGAAACTATTAAGATCCCTGCTTCTAAAGTTCCTAGCTTTAAAGCTAGTAAGGGTCTTAAAGACGCTGTAAAATAATAAAAAGTTACAAAAAAGTAATTTTTTTAAAGGCATGCTTAACAGTATGCCTTTTTTTTATCTATAATATTTACAAGTTAATTAAATTACTCATTAATTAAGGTCAATAAAAATGTTACAGTCTTTTAATGATAGACTCAAAGGTCCTTTTACATGGATTGTGGTTATCTCGATAAGCTTTATTTTTGTAATTTCTGGAATGACATTCTTTTTTACAAATATTGGTAGTAGTAGAGCATATGTTGCTAAAGTTGGTGATAATGAAATAAGCTCACAACAATTCCAACAATATGTTCAAAGTGCTACTACAGAAGAACAAAAGAGAGCTATTTTATCTCAAATGATAGATCAGTATTTGATATTAGCCGATGCACAACGCCATGATATTGTAGTGTCAAAACTAGCGCT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58 | Agrobacterium_phage(11.11%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1529224 : 1611280
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP025778|1529224:1611280|DBSCAN-SWA 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59 | Phaeocystis_globosa_virus(29.41%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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