Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021850 | Pseudoclostridium thermosuccinogenes strain DSM 5807 chromosome, complete genome | 9 crisprs | WYL,csa3,cas3,DEDDh,RT,csm6,cas6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,Cas14u_CAS-V,cas8a4,DinG | 0 | 4 | 12 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021850_1 | 217140-217227 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP021850_1
|
1 spacers
spacers of CP021850_1
>1.1|217169|30|CP021850|CRISPRCasFinder GTTCTTTAGGGCTTGGGATGTGTCTGTAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP021850_1
The CRISPR arrays of CP021850_1 >merge|CP021850|1|217140-217227|CRISPRCasFinder AGGAAAAGGGACACGCCCCTACAAGATGTGTTCTTTAGGGCTTGGGATGTGTCTGTAATAGGAAAAGGGACACGTCCCTACAAGATGT >CP021850|1|1|217140-217227|CRISPRCasFinder AGGAAAAGGGACACGCCCCTACAAGATGT GTTCTTTAGGGCTTGGGATGTGTCTGTAAT AGGAAAAGGGACACGTCCCTACAAGATGT
>CP021850.1|AUS95140.1|216461_216914_+|hypothetical-protein MKIADMLNNPTGIASAQGRDDRRISGSKVSEFQSRLLSIEEKNYDEKLRTLADQIFAQGEKLGERIDIRELKVYKRLVSEFLREAVGGSHRFSKESFLDRRGRYKVFATIKKINHELDELTKDVLKEEKDNIRILQRLDDIRGMILDIMM >CP021850.1|AUS95139.1|215697_216318_+|dTMP-kinase MDRGIFITVEGTDGSGKTTQIRLMEEYLREKGYDVVIARDPGGTDISEKIREIILDPGNGEMAKVTEMLLYASARAQLVSEVIKPAVESGKVVICDRFVDSSYVYQGYGRGISLKTIEDVNRVAMDGVIPDITFFFDISPEIALKRRFASTEADRIENEKMAFHMKVYEGYKSLASRFPERIKTIDATRGVMEIAEDVRRWLDEIV >CP021850.1|AUS95138.1|212454_213627_+|NAD-dependent-malic-enzyme MDIREESLKCHGEWKGKIEVISKVPVENKRDLSLAYTPGVAEPCLAISKDVNRSYELTRRWNLVAVVTDGTAVLGLGDIGPEAGMPVMEGKCVLFKSFGDVDAFPLCIKSKDVDEIVKTVKLISGSFGGVNLEDISAPRCFEIEKRLKEECDIPIFHDDQHGTAVVTLAAMLNALKLAKKNIEDIEVVVNGSGAAGIAITKLLMSMGLKKVILCDTKGAIYEGREGLNPIKEEMAKISNLEKKKGTLKDVIVGADVFIGVSGPGVLTKEMVKSMAKDPMIFAMANPVPEIMPDEAKEAGALVVGTGRSDFANQINNVLAFPGIFRGALDVRASDINDEMKIAAAKAIASLISDEELNPEYVIPAPFDPRVAKAVAAAVAQAARDTGVARI >CP021850.1|AUS95137.1|211487_212264_+|pantothenate-kinase MILGIDVGNTNIALGVYQGRKLLHHWRFAADRNRTSDEIGMMMISLFNIAKLDYEQIEAVIIASVVPPMMYSLEHAIRKYLKKKAMVVGPGTKTGINIKYENPREVGADKIANAVAVYELYGGPAIIVDFGTATTFCALSSKGEYLGGVICPGIKISSEALFQKAAKLTKIELVKPESVLGRNIVSSMQSGIYYGYVGQVDYIVEKLKAELNEDNIKVIATGGMARLIAGESRTIDEVNGFLTLEGLRIIYERNRERY >CP021850.1|AUS95136.1|210927_211305_+|hypothetical-protein MNNQKEEIQNKEVQSKKEDTRSRKEDFQKRHKSRVNNLQTLQGGNQPRKNGSEQPTNRERSFGKNHTRDNAYPGRNNHQYQAPPAKHTAKAKAVETIDDIRMDIGRIEKEIELEIKEIRSLRLGI >CP021850.1|AUS95135.1|209763_210795_+|biotin--[acetyl-CoA-carboxylase]-ligase MSDMKEKVLQALKENTQEYVSGEALSELMGVSRTAVWKYISELKKEGYVIESSPKKGYRIMPVYDMLNEYEIRWGLKTKIIGRDIRYFNEIDSTNNYAKKIAYEGCDEGTVVVADCQTAGRGRLGRAWDSAGGKGIWMSVVLKPSIAPENVQIITLAASVAVARAIAGTCGIRTGIKWPNDIVLDGKKVCGILTEMNSEMERVNFLVLGIGINVNHEEGDFPDEIKDRATSLKCYADSGREASKKEGHGSVFPRSQIIGRILLELEEMYSKINKGFTDEIIDEWRSYSATLGRKVKITGRDGEYEGTAKDVTRDGKLVVDCTDGITREVVSGEVSVRGLMGYV >CP021850.1|AUS95134.1|208508_209021_+|2-amino-4-hydroxy-6--hydroxymethyldihydropteridine-diphosphokinase MAHKAYIALGSNLGDREGHLTGALQYISGITGTRILSISNIYETDPVGYTEQGKFLNMVVLVGTSLSPLRLLDELQKMEQEFKRSREIRWGPRTLDADILLYDDIKLDDPRLVIPHPRMLERAFVLIPLKDVNPGFMVGEKTLEDMIQECCDKDGVKLYKKMDNGVGFCG >CP021850.1|AUS95133.1|208144_208519_+|dihydroneopterin-aldolase MAIDKITLKNMKFFAYHGVYEKERLEGQNFFIDVEMYLDLRKPGVTDNLEDTINYSDVYKLVQKITQGNSFKLIEKLAESISGEILSTFTRIETVKVRVRKPQAPIGGVLDWAEVEVERSAHGA >CP021850.1|AUS95132.1|206900_208082_+|dihydropteroate-synthase MVNARLLYIEKIGEAKEEVRKIGADAASISWLAPKAVHMTIKLENVSSFAANIIKQEMLGLGGDAAVNKGCADCSVEKTGVLLMGTYSQISRLVYKLSLHSAGLKGIGEEIRQVISAVDQGKPKYFECGKHKLEIGEKTYIMGILNVTPDSFSDGGKYNSIEAAVRRAKEMVEDGAEIIDVGGESTRPGYTPVDASEEINRVVPVIDILSKELNVPISVDTSKAATAEKALKAGAHIINDVWGLQRDPAMAEVASRFGAGVILMHNGNEVVRGDVMEEILRFLRKSIEIAEKAGISRECLCVDPGIGFAKTLEQNLETMRRLKELNSLNLPVLLGTSRKSLIGNVLELPVNERLEGTAATVTLGIANGADIVRVHDVREMSRVVRMTDAMVRV >CP021850.1|AUS95131.1|205044_206424_-|hypothetical-protein MVNLFKLSTDELKALVEYKEVLENEDKRFPKNTWYYEKYQLSGIKTKCRIYTRYCLENLAHIEVTDLPKYNLKEIKNILIEHKLFGMVQQVFNHDILALLKNAYPEEFKNRTLREWMWSKHGIWNDDNAVIEAVQYMVRNEGIRRVEDIPTLDWKKRLLKYGIYNVLSRFNWSIFALFDFVYPGRFHPTDFKYKVKWAASESLDNAFYHMHTTFKKKRYTLDDILLLNSSDFRKLGLAGMLAALFDSSVLKAKEYYLYKTIDDPEHKSELIKDIKNLADKKRDQKIAERLKQVAKGKYIYNLRTHITLYNFIKRHAKSKNMSISDFVASYGFIYKTAKKDAGEIDKDEVYRLRKQGLTYVQIAQKLCSNPTTITKLCNKYFGGDPLIPRPLEDYITVQELMNKYHVDHKTVMKLVYENGFENHTTIRFRYLKKSEIEPALKQYISSSKHHQFMVNRYAN >CP021850.1|AUS98626.1|217279_218263_+|DNA-polymerase-III-subunit-delta' MGFDDIIGQTEIVNTLKRAVKNDHAGHAYVFSGPEGIGKGMMAEAFARQLLCLDADAPERCEGCTACRLLDEGTNPDFIVIRPSGSSIGIDEIRGIQSDIIIKPLYSRRKVYVIVNADLMTVQAQNCLLKILEEPPRYAVIILTVSNYNALLETIRSRTIRYNFKRNSIEEVTGLLRERFGSSLKGIDFIAAYSGGIIGTALKLAESEEFISLRDRTIDMVFRIANSGLDAIFDIYDFFDENKDNINTVLDIMQMVYRDIMLLKTNQKENMLINYDKKDIILSNADAFTVQKLIRNIELVEQTYRNLKYNANFQLSIEAMLMKLQED >CP021850.1|AUS95141.1|218268_219150_+|stage-0-sporulation-protein MVKVVGVRFKEAGKVYYFDPGDLEIELYSNVIVETARGIEFGQVVVANREVPEEEIVAPLKKVIRIATEEDKQHAARNDEKEKEAFEICLQKIRAHNLDMKLIDVEYTFDNNKILFYFTAEGRVDFRELVKDLASVFKTRIELRQIGVRDESKMMGGLGICGRVLCCKSFLGEFQPVSIKMAKEQGLSLNPAKISGACGRLMCCLKYEQEAYEDLLTRVPKVGAIVDTPEGQGTVEEVSLLKEEVKVKLDKVNETELKIYKASEVKVIKEASATNDDTDDLDIDLEDLKELED >CP021850.1|AUS95142.1|219437_219608_+|ferredoxin MAYFITDDCISCGACEAECPVSCISAGDSKYVIDEDACIECGACANVCPVDAPQQK >CP021850.1|AUS98627.1|219741_220518_+|SAM-dependent-methyltransferase MQVRIYDNERVDDLQYKGLKLIQKKDGFCFGVDAVLLANFADVKRGAEVIDLGTGTGIIPVLIAGKTEARHVTGLEIQEEMAEMASRSVSMNGLEERVKIVCGDIRNHSRLFGSSTFDVVVTNPPYMNQGGGLINLSDTKAIARHEILCTLEDVISAASKLLKPGGQMAMVHRPERLVDILCLMRNYKIEPKYIRFVHPSPYKKANLLLIKGSKGGRPQLKMMDPLYIYDEKGNYSEEINRIYCRGMENSWGDGKHGN >CP021850.1|AUS95143.1|220507_221368_+|16S-rRNA-(cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase MEIKTDSAEKGMLYLVSTPIGNLEDITLRALRILKEVDLVAAEDTRQTLKLLNHFEIKKPLVSYYEHNKIEKGNQLIRQMLEGKNIALVSDAGTPGISDPGEDLVRLAIENGIEVTAVPGPVAAVTGLITSGLPTGRFVFEGFLPMNKRVRKEHLKNLVGETRTIIFYEAPHKLIYTLKDLYEVLGNRRIVLARELTKRFEEKLRMTLEEAIRKYEEESPKGEFVLILEGASEEELKQQQRNKWEDMGIAEHVEMYMEQGMSKKEAMKKAAEDRGISKRDIYNSLL >CP021850.1|AUS95144.1|221508_221748_-|AbrB-family-transcriptional-regulator MKSTGIVRKVDELGRVVLPIELRRTLDIAEKDALEIYVDGSTIILKKYEPACIFCGDAKDVTVYKGKNICPNCMKELKK >CP021850.1|AUS98628.1|222345_222939_+|nucleoside-recognition-protein MLNYVWMGMLVIGFFVGILNGRVEEVTKAAINSAGKAVELGIGLLGIMCLWTGLMNIAEKSGMMQYISRALKPVLKFLFPDIPEKHPAMGAIVMNLAANFLGLGNAATPLGLKAMSELQKLNRHKDTATDSMCMFLVLNTAAIQLIPATVIAIRTKFNSQNPEEIIGTVWIASICATIAGIIAAKVLSAVRSKGRRA >CP021850.1|AUS95145.1|222946_223480_+|spore-maturation-protein MEAVKIVSSYAIPGIFLVILGVGVYRDVKVFDVFVDGAKEGVATVVRIIPSLVGLMVAVGVFRASGALDLLIYATRPVASFLGIPSEAMPLAFMRPISGSASLALVSDIIEANGPDSFVGRVVSTMMGSTETIFYTLTVYFGSVGIKNIRYTLVAALIADTVSIIASVLACWMVFGM >CP021850.1|AUS95146.1|223495_224437_-|hypothetical-protein MSVDYANIILSVKIKIAYCNKILEICKNRTKGWIMAESFIFDIPPWPEYLISSYRHFNEGEKHVTRICKDFVLIFMLERELYFTEDNCHIEVKPGQWYMQIPGLKQEGLKGSPAPKYYYIHFKASGQAGPSKESMLQSRIEFKGKPATLSLPIRGNFDPQFFKPMFEQLEHFSKRSPSDILGKQAVFLNILNCLTDTARPNTDHIQSIINQMMEYLAKNYNKPVTCKELSDRFHFTEDYLTRKMKQYAGITPWQYLQHLRIEKAKELLANTDYTLSSIAGSIGYGDLSVFYKAFKKQTGMAPGEWRMKKRGLY >CP021850.1|AUS95147.1|224480_226355_+|hypothetical-protein MKSALRKPAFTFLKTEEIRPEGWLLNQLKIQAAGLSGNLDKFWRDIKDSKWIGGSADGWERVPYWLDGFIPLAWLLDDEDMKARANKYINYILDHQQPDGWLCPVSDSNRSTYDMWAYFLILKVLVVYHDATGDQRIENAVRKALIALDRHIDNNTLFGWGQMRWFECLIPLLWLYDRTGEEWLINLASKIHSQGFDWQSFFKIWPYRKPDPKGRWSQMSHVVNNAMMLKSGALLWRFTGSQDDLQSAENMVSLLDEYHGMVTGVFSGDECLNGKSPIQGTELCAVAEYMYSLEHLLSITGCSAWGDRLEKITFNALPATFSPDMWTHQYDQQVNQIECSYQENPVFGTNGGYSNTFGLEPNFGCCTANLNQAWPKFAHSTFMRSDDGLVAAVYAPCTVNTKIKDANVSVTLETGYPFRDTLKFKVVTDREVDFALHLRIPEWACDAVIELDDSSISPQKGAFYKLSRRWSGETVFTLRLPMKPQLVQRPNDLYAVTRGPLVYSLAIGERWVRINEDVPGHEFPHCDYEIYPTTPWNYGFYLSKTDPESGLVFEEHPIGDCPFSPEGAPVSVRVPGRKVDWSKEGNSAAPFPAMSWIADETETLKLIPYGCTNLRLTELPWIKY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021850_2 | 2164572-2164736 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of CP021850_2
|
2 spacers
spacers of CP021850_2
>2.1|2164604|34|CP021850|CRISPRCasFinder AAGAATATGAAGCACATGTCAAGAAAGCAGAAAT >2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder ACGATAAATCCATTTTTAGATATGAAAAAGACCT |
cas6,csm6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP021850_2
The CRISPR arrays of CP021850_2 >merge|CP021850|2|2164572-2164736|CRISPRCasFinder ATCACCGTCCCCTTACGGGTGTTGGTTGTTATAAGAATATGAAGCACATGTCAAGAAAGCAGAAATCTTGCCGTCCCCTCACGGGTACAGGTTGCTACACGATAAATCCATTTTTAGATATGAAAAAGACCTACTGCCGTCCCCTTGCGGGTATGGGTTGCTTTA >CP021850|2|2|2164572-2164736|CRISPRCasFinder ATCACCGTCCCCTTACGGGTGTTGGTTGTTAT AAGAATATGAAGCACATGTCAAGAAAGCAGAAAT CTTGCCGTCCCCTCACGGGTACAGGTTGCTAC ACGATAAATCCATTTTTAGATATGAAAAAGACCT ACTGCCGTCCCCTTGCGGGTATGGGTTGCTTTA
>CP021850.1|AUS96647.1|2163176_2163971_-|hypothetical-protein MFHYPYENRKEDKMLQRITLKLTYKGEAKASYNWGSMMHGVLMELLPADAAEAFHENSLRPFSQYVLPLGESIIEWNIGLWGDGISDVVAKAILPVNTLEIKHKGILLNVCSSERQNLSERDFMARFFETENPCRKYELEFLTPCTHKSAGKHVLFPTTDLMVQSLCMRFNAYSQEYSLDDPEAMKQIAENMRIVKYSLHSAQYHLDGTKVTGYAGRIVLYISGPEQLVRLAGMLLSFSEYSGIGVKTSLGMGGCRIRPILKEI >CP021850.1|AUS96646.1|2161789_2163139_-|hypothetical-protein MSEYVLFSPLGMSDPTRGCRDGAFIHICRKYRPKKAYLYMSKEICEYDELDNRYEKYLSLLCEKLDFKCDVKKIKRPDLVKVNDFEAFYGDFSKIMESISSENPGCDILINLSSGTAQMKSALLVLGTLFPKPLTMVQVSTPSQKSNDTKPVGKDYDIYLEWELNEDNYEDYSDEDKYRCFVSKSENLNARIMYETVGKHILAYDYKAALTVAENIKDFMDTRALNLINAGFRRLILDLGNAERFAENAGYDLLPINEKRYNEKEKVVFEYILTLKIKREKGEIADFVRAVSPVLTDMFEIYLKNKCNIDIESYYLKDPYGRYAPKLSRNLLPADIIQILDSTYASRGGYRDTEPCAANLSPIVAAKGDAKAGGIAVKLRSFEGRVRNIAAHEIVVVTEKWIKERSGFNTGEVLKMLMDFFSCCIDIPQNTWNSYEQLNKTILEIPLLK >CP021850.1|AUS96645.1|2161191_2161566_-|permease MDKKAGVIKRYFKYALIGLVTGTANGLFGSGGGTIAVPAMVLLLGVEDHKAHATAISIILPLTLISAFFYVKNNFVDWALTIKVTLGGIAGGYIGAKLLNICPARVLRRIFAAFMIAAALRMIL >CP021850.1|AUS96644.1|2160742_2161123_-|permease MILFLIGMASGIISGMGIGGGTILIPALVIFIGVDQHIAQSVNLLFFIPTAVVALFIHFKNKRVNLKMAIPIVAFGLIGAFFGSKMAIGLSGTDLKKWFGFFLLAMGIYEMFRKDKAMERRQKNSG >CP021850.1|AUS98751.1|2158933_2160214_-|diaminopimelate-decarboxylase MEVEILKNYFTEQTNFFKGISPFEIIKEYGSPLYVYNESILRQRCREMKNFITYPNFSVNYSTKANSNLELLKIVREEGLNADAMSPGEIYVLLAAGFKPEQIFYISNNVSAEEMKYAIEKGIILSADSLSQLELYGKLNPGGKVAVRFNPGVGAGHHEKVVTAGKKTKFGVNMDYISEVKEILKRYDLKLVGINQHIGSLFMEGKPYIEGVKSLLDIAKQFDDLEFVDLGGGFGIPYRKQEGQERLELKEFGSKLDQVLKDWIREYGKDITFKIEPGRYIVAECSVLLGTVHSIKNNYGVTYAGTDIGFNVLARPVMYDSHHDIEVYREGKLLKSTESDKPVYVVGNICESGDILAKDRMLPELKEGDILGIMDAGAYGYSMSSNYNNRLRPAEVLIRENGSISLIRRRDTLEDLMRNFDVDSGA >CP021850.1|AUS96643.1|2157388_2158456_-|aminotransferase MHKRLFIPGPVEVREDILKKMSTPMIGHRSKDASKLQKSISGKMKKLMYTDNEILLSTSSGSGLMEGAIRSCTVKRAAVFSIGAFGDRWYKMAVCNGVQADKISSEPGQPTLPEMVDKTLATGKYDLITITHNETATGVMNPVEEIAEVMKKYPDVVYCLDAVSSLGGTKIEVDKLGVDICITSSQKCLGLPPGLSICSISQKALDAAKKVEFRGLYFDLLELYEYIKKKDYQYPSTPSLSHMFALDYQLDRIFEEGLENRFERHRKMAEYVRQWAKERFALFADERYASNTVTAVKNTRNIDVSELNKKLGEVGYVISNGYGQLKDITFRIAHMADTTLDEIKGLIESIDKIIM >CP021850.1|AUS96642.1|2155628_2157233_-|phosphoglycerate-dehydrogenase MRIIITERIADEGINYLKENGFEVDTRYGISSDELLGIIGDYDAIIVRSVTKVNEELLEAAKNLKVVGRAGNGIDNIDVGACTKRGIIVVNTPESNIMAAAELAVALAFAIFRNLPQVHVAVRNKDFRRNRFIGNELDGKTAGIIGLGRIGSIVARKLKGCNMRVVAYDPYITDDRFKMLGVEKCETLEELLKQSDLITLHTPKTSETYGMIGEKELNMCKRGVRIVNAARGGLVNEKALYDALKDGRVTAAALDVLDPEPSYDKKPEEQDYTNPLLELDNVMVTPHLGASTQEANYNVGTAITELVAGALKGEMVAAVNMPPMHTKDLSELRPYLNLAEMLGKIYYQAEKETVQQIEVIYRGDLADKETKVISLSVLKGFLDPINKEKVNYVNAELMLKNMGVEFKESKSTNLDKYTNLITVKFTTKKKELSVSGTVFAKEEIRIVDFFGYKLDFEPTPYVLAIQNVDKPGIIGQIGTILGADNINIAAMQWSRNRRGEKAVAFVSVDAEVSEEIMRLLKNIDGVLKVSMLKF >CP021850.1|AUS96641.1|2154322_2155261_-|hypothetical-protein MKSNSEMILSVCKDIPNHESFIRIEAINKGVSGDDKYYVETAQGQRYLLRISSIEFYKRKKAMYDMMGRAASLGVSMSAPVDFGICNSGKNVYQLLTWCDGETADVLLPKLSHAEQYELGIKAGQNLRRIHSIPAPEGLEDWYDRFVSINDERLKAFFNCGVHINGSEAILAFYKENRHLLLGRPQCFIHGDYHNDNLIISPNRDVVVVDWDLIDSLYGDPWSEFNRILLANLVPHFTTGQIHGYFNGEPPEEFWRILALYLSTGALVLVSWAVYVEPSYRDESIQTAINIMNWFDEMRNPVPNWYLREFTP >CP021850.1|AUS96640.1|2152409_2153771_+|hypothetical-protein MKESNKFQNKIGVHVPSLLLPAKNVDMCKWSVVACDQYTSQPDYWKEVEKIVGSNPSTLHLIFPEVYLGKGDDDERIDKINHCMEEYIKNGTLVEHEPALIYVERKTSHTESRKGLIIAVDLECYDYEKGSCTLIRATEGTVLDRLPPRIKIRQNAPIELPHIMLLIDDPDKTVIEPLSEKLDKFEKIYDFDLMMNGGHIKGYKIDDEDTIKSILDALEKLTDPDNFRSRYELDSCRDVLLFAAGDGNHSLATAKACWESLKTGLSPEERENHPARFALVELVNVHDEGLVFEPIHRVVFNVDVNNMLEKLTEYFTGTSKAYWIDCSSEEQAFEEAKKFPGQPDKHVIPFTSKDIKGLIVVENPVHNIEVGTLQSFLDEYLKDHASARIDYIHGYDVVERLGSMDSNIGFYLPPMDKKDLFKTVILDGVLPRKTFSMGEAEEKRFYLECRKIR >CP021850.1|AUS96639.1|2151683_2152217_-|photosystem-reaction-center-subunit-H MHKYSEVVGLPVICVDTGKKVGLVKDIIFCPGSKEIKAFIIERSSYEIKRKLVLPEDVLNIGHDAVIINSASNLKNLKDMEKKGELRDKGEVLGLRVYTVNGEDLGVVKDILFDCDSGLIEGVEISDGLLQDIVKGRNIIPLFGKVEFSSENILIGKEALEEMTGTGGGLKKRFLEE >CP021850.1|AUS96648.1|2165505_2166651_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MRYGHLERVELVLRTLSPVFIGSGEKLTKKEYIYDKNDRVIYMLNLAKLVEYLSRRKLEGAYERFLLSPNKNDLQAFLYENGVSKKDYKLFTSYAIDAGEVAASEKFHGVLMFIKGSDGKPYIPGSSLKGAIRTAIGSKLMEKGNYDKEILKIEESSKVFKSQKTYVSGEAKNLESRLFCKLGITDPRKPGKIKWNSILNDFMKGISISDSLPIDLENLTLCGKHDRKPDGKSKQLPIYRECLAPDTEARFVMTLDRTIMDKVGIDLDFIQDALQRFSKKHFENFEKYYRKLPEDAEDKSTSGVKIILGGGAGYVSKTLTYPLIRERERSVKLVSDMMAKLFRIHKHEKDLKVYKVSPHILKTTMYKGKYYQMGKCELMFR >CP021850.1|AUS96649.1|2166647_2167589_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MGYSLYRLEFTTGLHIGVDRGGQSLDDGRMTIHSDTLFSALCCECAKRGDIDRLYELFYTGEITTSDCLPYKGNEYYFPRPILHTGKAQREGRPEARKALKSVEYIPVSLFDAFLKDYANKEVDTDRLKCNFGGLTSYTRVAMKGQPQPQLYQVAFWRFASGCGLYVIVRYKDESSLLFFEEVLTALGLSGVGGKQSSGLGKFNVMKSSLPEKMEELLEDDRADYHMLLGTALPEEGALDDILSESWYATLRRGGFVRSETYSKAQLKKKTIYMLAPGSCIKKRFDGGMFDLSDGGTHPVWRCGKTLFAGVRL >CP021850.1|AUS96650.1|2167563_2168259_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MYGKIAINCKMTVLTGMHIGGSSMFSAIGAVDSVVIRDPWTGEPMVPGSSLKGKMRTLLAKEIRNDYVMQDFSDDPDIIKRLFGTTGNKNTGEKPKGARLQFADAFLTNAEHLKKRGGMTEIKFENVINRYTSIANPRQIERVVRGAEFAIKMVYDMEKPEEIREDFESIAKALKLLSMDYLGGHGTRGYGRVKFSDFDIKVMNGQCNEDTNELLNILKGVEDYGIFSLQA >CP021850.1|AUS98752.1|2168288_2168768_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MKDALKKAGYSEPDNRNKKAEAKHSTSKGFDAFEKLHEDYTDRAERVIIELQNKLGKNYKDFTTSKIRNILAMVSDIYNDVLTEQDEVLNDEIRGKIAYLKVRLIYECGREPNIVKPFVELAGLLDIISGIGYSRQRFIDFEHYMEALVAYHRFHEGKD >CP021850.1|AUS96651.1|2168780_2171198_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MLNKAAYITTVGGLLHDFGKVLHRSGAADGRSHSISGADYIKGFTSDKDIIDCIRFHHRKEIDSALLSDESPAYIVYIADHISSGADRKGIEGEANTGYDQERMLESVYNLLSNRKGKAVYAPGMIKNTINYPGEGIKAAATEYPRLLSGFTDGLSDICFEPEYINSLLELCEKYLSYIPASTDSGQVCDISLFDHSKITAALASCIALYLEEGNRLNYRKELYERESDFCSEKAFCLFSVDISGIQKFIYTISSKGALKGLRSRSFYLEILLENIADEILNACGVSRSNLLYTGGGHAYLLLPNTGKVLTTVKESFSNINRRLLEKFETELYIAYGIKACSANELMSRTGNPESYVNLFRSVSSQISAMKLRRYSAEDIRFLNSVGIDREGRECAVCGTSSVRLSERNGSIMCGMCSSLSDISGGLIKENVVFAVLREEPNNACLPVFSADGSSLYLKPMTADAVREMLREAPEKVVRIYSKNAYSTGIPHSIKLWMGDYAAKSAEGALKTFSELAQDSQGINRIAVLRADVDNLGAAFVSGFMREKDPENKYKYMTISRTTTLSRSLSLFFKYHINYLMENPEFSLTDKEGKRNVVIVYSGGDDLFIVGAWDEVFSAAVDIRRAFNRYTDRALTLSAGLAVFDEKYPISLMAEETAELEERAKDNKYEGGSKNSVSLFGLESEKGQLTDKHTYNWDTFESKVIGEKYKAIKALYEAGGDYGNTYFYNILYFLRESENEKVNVARLAYLLARREPDKKAADKLKQAYSSFSANVYKWALAPEDRKQLITALIIFMCTLRDEKED >CP021850.1|AUS96652.1|2171392_2172019_-|hypothetical-protein MTIIGFFAGSLMFSYFIPKWFLGIDIRENTEDGNPGSTNAIKSAGVHIGLLCMFLDILKAFIPIYISINYLNISGLYLVPVIAAPSAGHAFSPFMGFKGGKAVSTLYGSLLGILGISRAVFFIAALMVLFKTLIVIKPDSAMVTVSLISANAAVLYYEPLYEVKIAVTLICLIVSYKILKNPNKGDIVVSIWNLHIIFDEGKVKVRHI >CP021850.1|AUS96653.1|2172021_2173149_-|hypothetical-protein MKALILSTKTGQGHNSASMAIASCLENEGWEAIVSDVLKSGKRNVSAPVSALYDNIVLHMPALFGMLYRAGELVSSSKRHSPIYYLNSIYSGKLLDKIKSTEPQIIICPHIFSAQAITRLYEKHELSTPSVGILTDYTCSPFWEETRLDAYVIPAPQLIDEFAYKGIPREKLYPLGIPVNSCFKKTHDKAEARRLFGITADKVFTVMGGSMGYGYIRELSTLLARKMPKAQVVAVCGNNEKLFKSFTGISNIIPFQFIDNIDILMDATDVLLTKPGGLSSTEALSKRLPVVLTCPIPGGEERNADFLSSIGVAEYAKTPESAVEKAIELVFDMRKRKKMIEAQEKYINRDADRDIAKLIIKLSEKAGGRQMCKAV >CP021850.1|AUS96654.1|2173397_2175692_-|single-stranded-DNA-specific-exonuclease-RecJ MKIDVNILNENTHIPDEIIEAADGDELIARIFFNRGYKDPDTIRQMLCEDLYTPVQPEEFPRMDKAVARIAKAIETGEKIAVYGDYDVDGVTSTALLVQCLTWYSSSVIYHVPDRFTEGYGMNEDVIRSMAKDGVSLIITCDCGISNINEIKTAKDLGMDVVITDHHNPDVLPEADVILNPKLLGEGHKARNLSGCGMAYFLALALLEQYGESEKAEAFLDLLAMSLIADVVSLNGENRYLLKKALPKLFGTKRTGLKALLEIAEKDSKLQSEEDVAFQLAPRINAAGRMESARLPVELLLCSDAQKAMEMALKIDHLNRERKRIQQEMVDEAIEQVENRKKNKSILVLFSEFWHHGIIGIAAGKVCETYRKPAILFSLKEDGTTVTGSARSTEEVNIYELIKACSSKLLKFGGHSQAAGLSLKREDLEEFTREIEELAEREYFIKDEIKVNADMELTLDNIDEELYGRILKAGPYGEGFEAPCFITRGATVASDRKTAKRHHIMVLADGHGNRLPAVKWFGEDEDLSGKLFDIVYKIGRNTYRGNDEIQLTISHLLPVEGTPEAVFEGEFIDGRGMDIKTLLKDFEEAVFFYEGLRLKCPVDNTVDRYDLRTSKKVETLVFLSTPVNASVFREVIALARPRKVVLSFAVTQDYTFKGFMTNLMGLVKHIINKQGGRSSLEQLALMLCVEDNIMRAALKYLRTIAPVEFLENSEDEIYIYGVKERSTANNIAVEKNIKNALMEKNAYQQFLMKLDVKSFGQYLK >CP021850.1|AUS96655.1|2175697_2176522_-|hypothetical-protein MDRDLRLADHFLYTQHSLATFDNCPLKFKKRYLENLKWDSFPDEATRKSIEAGNNFHLLAYRYFMGIETAPVEALEKYPELSRWMESLMKRFNINPEFKYLPEYKLRMSSGEMKLEANFDLLIVKHDHIEIWDWKTHGGRGKVSAAAIGKKLRSSLQTMVYMYALKEQSRLVAGEEIKASNISMHYWQPEPAMTLAEIKYSDALHEHFGNIIREKIRNILNYDFNSFDKDMYSKHCRVCEFNWFCNNERVDFSAMQEDEDIMLELDWERAEEVY >CP021850.1|AUS96656.1|2176506_2178759_-|DNA-helicase-UvrD MGLRKGQKELVEQYRGGFCAVPAIPGGGKTHCLSIWAAEMIAQGLHKPGKILIVTYMNSAVNNFRQRIAKELARRGISGNKDYVVSTIHSLCLKIVKEKPDLISTNEEFEIIDEVTKFHLISSAVDEWRRKNEDIFRYYLEESNLSANKLSENYKKWNDRLCGVVLGAIGDFKSHGMKPLQARESCRKLPETSLLKHAADIYAIYDKKLKMSGFLDFDDMLYNAKELLTMDSSLLEKYRKKFTFVCEDEAQDSNLIQSEILTLIADGNLLRVGDSNQAICGSFSNSDFTLFKSFCEKPETVVYRITQSSRNTREIIDLANYFVKLVREEHPVPECRESLLPQFIEPVDPHDERQNPVTTEYGIKAQIYGSWDEEVNSVVTEVIRMVKRHPDKTISVLVPNSYKMRDIVRCLEDKNIPFEQLDNTSDERNRTIKVLGRIIDFIAEPENGEKFGAMMNECFLRDKYEDEMPESEFNPDMHGKESQREMLTAFLRKYPVEKLLYPAAGEIDIREIPPELLKSKIWRDFTDKLETVRGFLEFPTTVVEKLILYISEKLNFGREERAIAQKVAGDVRYLMNQNPRWRLSDLALELLSPKNMFNFFAGIVWELKGYEPKPGVVTVATYHKSKGMEWDIVFLTGLNYADFPVYLTDKFVGEYWFLKQEYKNPQALVKADLEKILGAGTGEDSILKSKIETISERARLLYVGITRAREYLYLSGFHANQGKWNENLPSKYLLDIKKHIEEVGAKWTGI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021850_3 | 2164834-2165331 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of CP021850_3
|
7 spacers
spacers of CP021850_3
>3.1|2164866|35|CP021850|CRISPRCasFinder ATTTATGGCGATACTATTGAAATCGAAGGAGGGCA >3.2|2164933|35|CP021850|CRISPRCasFinder TTTGAGGATTATCCAGAAGAATATGTAAAGCAGGT >3.3|2165000|35|CP021850|CRISPRCasFinder TTTATAATTAAGTCTAATGTATCATTTCCACCATC >3.4|2165067|34|CP021850|CRISPRCasFinder TCAAGCCGCTGACACTCAACGACCTGGCAATAGC >3.5|2165133|34|CP021850|CRISPRCasFinder TATTGTGAAAGCACAAAAGAAGAATGTTTGAAAA >3.6|2165199|34|CP021850|CRISPRCasFinder TAAAAAGGCCCGTATACTCCGCATAGGTAGAGAC >3.7|2165265|34|CP021850|CRISPRCasFinder AACCAAACGGCCAAGTAAAAGCAGAGTGGTTGGA >3.8|2164867|38|CP021850|CRT TTTATGGCGATACTATTGAAATCGAAGGAGGGCAGTTA >3.9|2164934|38|CP021850|CRT TTGAGGATTATCCAGAAGAATATGTAAAGCAGGTGTTA >3.10|2165001|38|CP021850|CRT TTATAATTAAGTCTAATGTATCATTTCCACCATCGTTG >3.11|2165068|37|CP021850|CRT CAAGCCGCTGACACTCAACGACCTGGCAATAGCGTTG >3.12|2165134|37|CP021850|CRT ATTGTGAAAGCACAAAAGAAGAATGTTTGAAAAGTTG >3.13|2165200|37|CP021850|CRT AAAAAGGCCCGTATACTCCGCATAGGTAGAGACGTTG >3.14|2165266|37|CP021850|CRT ACCAAACGGCCAAGTAAAAGCAGAGTGGTTGGAGTTG >3.15|2165068|33|CP021850|PILER-CR CAAGCCGCTGACACTCAACGACCTGGCAATAGC >3.16|2165134|33|CP021850|PILER-CR ATTGTGAAAGCACAAAAGAAGAATGTTTGAAAA >3.17|2165200|33|CP021850|PILER-CR AAAAAGGCCCGTATACTCCGCATAGGTAGAGAC >3.18|2165266|33|CP021850|PILER-CR ACCAAACGGCCAAGTAAAAGCAGAGTGGTTGGA |
cas6,csm6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP021850_3
The CRISPR arrays of CP021850_3 >merge|CP021850|3|2164834-2165331|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTACCGTCCCCTCGTGGGTGCGAGTTGTTACATTTATGGCGATACTATTGAAATCGAAGGAGGGCAGTTACCGTCCCCTCACGGGTGCAGATTGTTATTTTGAGGATTATCCAGAAGAATATGTAAAGCAGGTGTTACCGTCCCCTCGTGGGTGCGAATTGTTACTTTATAATTAAGTCTAATGTATCATTTCCACCATCGTTGCCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTACTCAAGCCGCTGACACTCAACGACCTGGCAATAGCGTTGCCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTACTATTGTGAAAGCACAAAAGAAGAATGTTTGAAAAGTTGCCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTACTAAAAAGGCCCGTATACTCCGCATAGGTAGAGACGTTGCCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTACAACCAAACGGCCAAGTAAAAGCAGAGTGGTTGGAGTTGCCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTACT >CP021850|3|3|2164834-2165330|CRISPRCasFinder GTTACCGTCCCCTCGTGGGTGCGAGTTGTTAC ATTTATGGCGATACTATTGAAATCGAAGGAGGGCA GTTACCGTCCCCTCACGGGTGCAGATTGTTAT TTTGAGGATTATCCAGAAGAATATGTAAAGCAGGT GTTACCGTCCCCTCGTGGGTGCGAATTGTTAC TTTATAATTAAGTCTAATGTATCATTTCCACCATC GTTGCCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTAC TCAAGCCGCTGACACTCAACGACCTGGCAATAGC GTTGCCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTAC TATTGTGAAAGCACAAAAGAAGAATGTTTGAAAA GTTGCCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTAC TAAAAAGGCCCGTATACTCCGCATAGGTAGAGAC GTTGCCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTAC AACCAAACGGCCAAGTAAAAGCAGAGTGGTTGGA GTTGCCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTAC >CP021850|3|1|2164838-2165331|CRT CCGTCCCCTCGTGGGTGCGAGTTGTTACA TTTATGGCGATACTATTGAAATCGAAGGAGGGCAGTTA CCGTCCCCTCACGGGTGCAGATTGTTATT TTGAGGATTATCCAGAAGAATATGTAAAGCAGGTGTTA CCGTCCCCTCGTGGGTGCGAATTGTTACT TTATAATTAAGTCTAATGTATCATTTCCACCATCGTTG CCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTACT CAAGCCGCTGACACTCAACGACCTGGCAATAGCGTTG CCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTACT ATTGTGAAAGCACAAAAGAAGAATGTTTGAAAAGTTG CCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTACT AAAAAGGCCCGTATACTCCGCATAGGTAGAGACGTTG CCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTACA ACCAAACGGCCAAGTAAAAGCAGAGTGGTTGGAGTTG CCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTACT >CP021850|3|1|2165035-2165331|PILER-CR GTTGCCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTACT CAAGCCGCTGACACTCAACGACCTGGCAATAGC GTTGCCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTACT ATTGTGAAAGCACAAAAGAAGAATGTTTGAAAA GTTGCCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTACT AAAAAGGCCCGTATACTCCGCATAGGTAGAGAC GTTGCCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTACA ACCAAACGGCCAAGTAAAAGCAGAGTGGTTGGA GTTGCCGTCCCCTCGCGGGTGCAAGTTGTTACT
>CP021850.1|AUS96647.1|2163176_2163971_-|hypothetical-protein MFHYPYENRKEDKMLQRITLKLTYKGEAKASYNWGSMMHGVLMELLPADAAEAFHENSLRPFSQYVLPLGESIIEWNIGLWGDGISDVVAKAILPVNTLEIKHKGILLNVCSSERQNLSERDFMARFFETENPCRKYELEFLTPCTHKSAGKHVLFPTTDLMVQSLCMRFNAYSQEYSLDDPEAMKQIAENMRIVKYSLHSAQYHLDGTKVTGYAGRIVLYISGPEQLVRLAGMLLSFSEYSGIGVKTSLGMGGCRIRPILKEI >CP021850.1|AUS96646.1|2161789_2163139_-|hypothetical-protein MSEYVLFSPLGMSDPTRGCRDGAFIHICRKYRPKKAYLYMSKEICEYDELDNRYEKYLSLLCEKLDFKCDVKKIKRPDLVKVNDFEAFYGDFSKIMESISSENPGCDILINLSSGTAQMKSALLVLGTLFPKPLTMVQVSTPSQKSNDTKPVGKDYDIYLEWELNEDNYEDYSDEDKYRCFVSKSENLNARIMYETVGKHILAYDYKAALTVAENIKDFMDTRALNLINAGFRRLILDLGNAERFAENAGYDLLPINEKRYNEKEKVVFEYILTLKIKREKGEIADFVRAVSPVLTDMFEIYLKNKCNIDIESYYLKDPYGRYAPKLSRNLLPADIIQILDSTYASRGGYRDTEPCAANLSPIVAAKGDAKAGGIAVKLRSFEGRVRNIAAHEIVVVTEKWIKERSGFNTGEVLKMLMDFFSCCIDIPQNTWNSYEQLNKTILEIPLLK >CP021850.1|AUS96645.1|2161191_2161566_-|permease MDKKAGVIKRYFKYALIGLVTGTANGLFGSGGGTIAVPAMVLLLGVEDHKAHATAISIILPLTLISAFFYVKNNFVDWALTIKVTLGGIAGGYIGAKLLNICPARVLRRIFAAFMIAAALRMIL >CP021850.1|AUS96644.1|2160742_2161123_-|permease MILFLIGMASGIISGMGIGGGTILIPALVIFIGVDQHIAQSVNLLFFIPTAVVALFIHFKNKRVNLKMAIPIVAFGLIGAFFGSKMAIGLSGTDLKKWFGFFLLAMGIYEMFRKDKAMERRQKNSG >CP021850.1|AUS98751.1|2158933_2160214_-|diaminopimelate-decarboxylase MEVEILKNYFTEQTNFFKGISPFEIIKEYGSPLYVYNESILRQRCREMKNFITYPNFSVNYSTKANSNLELLKIVREEGLNADAMSPGEIYVLLAAGFKPEQIFYISNNVSAEEMKYAIEKGIILSADSLSQLELYGKLNPGGKVAVRFNPGVGAGHHEKVVTAGKKTKFGVNMDYISEVKEILKRYDLKLVGINQHIGSLFMEGKPYIEGVKSLLDIAKQFDDLEFVDLGGGFGIPYRKQEGQERLELKEFGSKLDQVLKDWIREYGKDITFKIEPGRYIVAECSVLLGTVHSIKNNYGVTYAGTDIGFNVLARPVMYDSHHDIEVYREGKLLKSTESDKPVYVVGNICESGDILAKDRMLPELKEGDILGIMDAGAYGYSMSSNYNNRLRPAEVLIRENGSISLIRRRDTLEDLMRNFDVDSGA >CP021850.1|AUS96643.1|2157388_2158456_-|aminotransferase MHKRLFIPGPVEVREDILKKMSTPMIGHRSKDASKLQKSISGKMKKLMYTDNEILLSTSSGSGLMEGAIRSCTVKRAAVFSIGAFGDRWYKMAVCNGVQADKISSEPGQPTLPEMVDKTLATGKYDLITITHNETATGVMNPVEEIAEVMKKYPDVVYCLDAVSSLGGTKIEVDKLGVDICITSSQKCLGLPPGLSICSISQKALDAAKKVEFRGLYFDLLELYEYIKKKDYQYPSTPSLSHMFALDYQLDRIFEEGLENRFERHRKMAEYVRQWAKERFALFADERYASNTVTAVKNTRNIDVSELNKKLGEVGYVISNGYGQLKDITFRIAHMADTTLDEIKGLIESIDKIIM >CP021850.1|AUS96642.1|2155628_2157233_-|phosphoglycerate-dehydrogenase MRIIITERIADEGINYLKENGFEVDTRYGISSDELLGIIGDYDAIIVRSVTKVNEELLEAAKNLKVVGRAGNGIDNIDVGACTKRGIIVVNTPESNIMAAAELAVALAFAIFRNLPQVHVAVRNKDFRRNRFIGNELDGKTAGIIGLGRIGSIVARKLKGCNMRVVAYDPYITDDRFKMLGVEKCETLEELLKQSDLITLHTPKTSETYGMIGEKELNMCKRGVRIVNAARGGLVNEKALYDALKDGRVTAAALDVLDPEPSYDKKPEEQDYTNPLLELDNVMVTPHLGASTQEANYNVGTAITELVAGALKGEMVAAVNMPPMHTKDLSELRPYLNLAEMLGKIYYQAEKETVQQIEVIYRGDLADKETKVISLSVLKGFLDPINKEKVNYVNAELMLKNMGVEFKESKSTNLDKYTNLITVKFTTKKKELSVSGTVFAKEEIRIVDFFGYKLDFEPTPYVLAIQNVDKPGIIGQIGTILGADNINIAAMQWSRNRRGEKAVAFVSVDAEVSEEIMRLLKNIDGVLKVSMLKF >CP021850.1|AUS96641.1|2154322_2155261_-|hypothetical-protein MKSNSEMILSVCKDIPNHESFIRIEAINKGVSGDDKYYVETAQGQRYLLRISSIEFYKRKKAMYDMMGRAASLGVSMSAPVDFGICNSGKNVYQLLTWCDGETADVLLPKLSHAEQYELGIKAGQNLRRIHSIPAPEGLEDWYDRFVSINDERLKAFFNCGVHINGSEAILAFYKENRHLLLGRPQCFIHGDYHNDNLIISPNRDVVVVDWDLIDSLYGDPWSEFNRILLANLVPHFTTGQIHGYFNGEPPEEFWRILALYLSTGALVLVSWAVYVEPSYRDESIQTAINIMNWFDEMRNPVPNWYLREFTP >CP021850.1|AUS96640.1|2152409_2153771_+|hypothetical-protein MKESNKFQNKIGVHVPSLLLPAKNVDMCKWSVVACDQYTSQPDYWKEVEKIVGSNPSTLHLIFPEVYLGKGDDDERIDKINHCMEEYIKNGTLVEHEPALIYVERKTSHTESRKGLIIAVDLECYDYEKGSCTLIRATEGTVLDRLPPRIKIRQNAPIELPHIMLLIDDPDKTVIEPLSEKLDKFEKIYDFDLMMNGGHIKGYKIDDEDTIKSILDALEKLTDPDNFRSRYELDSCRDVLLFAAGDGNHSLATAKACWESLKTGLSPEERENHPARFALVELVNVHDEGLVFEPIHRVVFNVDVNNMLEKLTEYFTGTSKAYWIDCSSEEQAFEEAKKFPGQPDKHVIPFTSKDIKGLIVVENPVHNIEVGTLQSFLDEYLKDHASARIDYIHGYDVVERLGSMDSNIGFYLPPMDKKDLFKTVILDGVLPRKTFSMGEAEEKRFYLECRKIR >CP021850.1|AUS96639.1|2151683_2152217_-|photosystem-reaction-center-subunit-H MHKYSEVVGLPVICVDTGKKVGLVKDIIFCPGSKEIKAFIIERSSYEIKRKLVLPEDVLNIGHDAVIINSASNLKNLKDMEKKGELRDKGEVLGLRVYTVNGEDLGVVKDILFDCDSGLIEGVEISDGLLQDIVKGRNIIPLFGKVEFSSENILIGKEALEEMTGTGGGLKKRFLEE >CP021850.1|AUS96648.1|2165505_2166651_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MRYGHLERVELVLRTLSPVFIGSGEKLTKKEYIYDKNDRVIYMLNLAKLVEYLSRRKLEGAYERFLLSPNKNDLQAFLYENGVSKKDYKLFTSYAIDAGEVAASEKFHGVLMFIKGSDGKPYIPGSSLKGAIRTAIGSKLMEKGNYDKEILKIEESSKVFKSQKTYVSGEAKNLESRLFCKLGITDPRKPGKIKWNSILNDFMKGISISDSLPIDLENLTLCGKHDRKPDGKSKQLPIYRECLAPDTEARFVMTLDRTIMDKVGIDLDFIQDALQRFSKKHFENFEKYYRKLPEDAEDKSTSGVKIILGGGAGYVSKTLTYPLIRERERSVKLVSDMMAKLFRIHKHEKDLKVYKVSPHILKTTMYKGKYYQMGKCELMFR >CP021850.1|AUS96649.1|2166647_2167589_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MGYSLYRLEFTTGLHIGVDRGGQSLDDGRMTIHSDTLFSALCCECAKRGDIDRLYELFYTGEITTSDCLPYKGNEYYFPRPILHTGKAQREGRPEARKALKSVEYIPVSLFDAFLKDYANKEVDTDRLKCNFGGLTSYTRVAMKGQPQPQLYQVAFWRFASGCGLYVIVRYKDESSLLFFEEVLTALGLSGVGGKQSSGLGKFNVMKSSLPEKMEELLEDDRADYHMLLGTALPEEGALDDILSESWYATLRRGGFVRSETYSKAQLKKKTIYMLAPGSCIKKRFDGGMFDLSDGGTHPVWRCGKTLFAGVRL >CP021850.1|AUS96650.1|2167563_2168259_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MYGKIAINCKMTVLTGMHIGGSSMFSAIGAVDSVVIRDPWTGEPMVPGSSLKGKMRTLLAKEIRNDYVMQDFSDDPDIIKRLFGTTGNKNTGEKPKGARLQFADAFLTNAEHLKKRGGMTEIKFENVINRYTSIANPRQIERVVRGAEFAIKMVYDMEKPEEIREDFESIAKALKLLSMDYLGGHGTRGYGRVKFSDFDIKVMNGQCNEDTNELLNILKGVEDYGIFSLQA >CP021850.1|AUS98752.1|2168288_2168768_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MKDALKKAGYSEPDNRNKKAEAKHSTSKGFDAFEKLHEDYTDRAERVIIELQNKLGKNYKDFTTSKIRNILAMVSDIYNDVLTEQDEVLNDEIRGKIAYLKVRLIYECGREPNIVKPFVELAGLLDIISGIGYSRQRFIDFEHYMEALVAYHRFHEGKD >CP021850.1|AUS96651.1|2168780_2171198_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MLNKAAYITTVGGLLHDFGKVLHRSGAADGRSHSISGADYIKGFTSDKDIIDCIRFHHRKEIDSALLSDESPAYIVYIADHISSGADRKGIEGEANTGYDQERMLESVYNLLSNRKGKAVYAPGMIKNTINYPGEGIKAAATEYPRLLSGFTDGLSDICFEPEYINSLLELCEKYLSYIPASTDSGQVCDISLFDHSKITAALASCIALYLEEGNRLNYRKELYERESDFCSEKAFCLFSVDISGIQKFIYTISSKGALKGLRSRSFYLEILLENIADEILNACGVSRSNLLYTGGGHAYLLLPNTGKVLTTVKESFSNINRRLLEKFETELYIAYGIKACSANELMSRTGNPESYVNLFRSVSSQISAMKLRRYSAEDIRFLNSVGIDREGRECAVCGTSSVRLSERNGSIMCGMCSSLSDISGGLIKENVVFAVLREEPNNACLPVFSADGSSLYLKPMTADAVREMLREAPEKVVRIYSKNAYSTGIPHSIKLWMGDYAAKSAEGALKTFSELAQDSQGINRIAVLRADVDNLGAAFVSGFMREKDPENKYKYMTISRTTTLSRSLSLFFKYHINYLMENPEFSLTDKEGKRNVVIVYSGGDDLFIVGAWDEVFSAAVDIRRAFNRYTDRALTLSAGLAVFDEKYPISLMAEETAELEERAKDNKYEGGSKNSVSLFGLESEKGQLTDKHTYNWDTFESKVIGEKYKAIKALYEAGGDYGNTYFYNILYFLRESENEKVNVARLAYLLARREPDKKAADKLKQAYSSFSANVYKWALAPEDRKQLITALIIFMCTLRDEKED >CP021850.1|AUS96652.1|2171392_2172019_-|hypothetical-protein MTIIGFFAGSLMFSYFIPKWFLGIDIRENTEDGNPGSTNAIKSAGVHIGLLCMFLDILKAFIPIYISINYLNISGLYLVPVIAAPSAGHAFSPFMGFKGGKAVSTLYGSLLGILGISRAVFFIAALMVLFKTLIVIKPDSAMVTVSLISANAAVLYYEPLYEVKIAVTLICLIVSYKILKNPNKGDIVVSIWNLHIIFDEGKVKVRHI >CP021850.1|AUS96653.1|2172021_2173149_-|hypothetical-protein MKALILSTKTGQGHNSASMAIASCLENEGWEAIVSDVLKSGKRNVSAPVSALYDNIVLHMPALFGMLYRAGELVSSSKRHSPIYYLNSIYSGKLLDKIKSTEPQIIICPHIFSAQAITRLYEKHELSTPSVGILTDYTCSPFWEETRLDAYVIPAPQLIDEFAYKGIPREKLYPLGIPVNSCFKKTHDKAEARRLFGITADKVFTVMGGSMGYGYIRELSTLLARKMPKAQVVAVCGNNEKLFKSFTGISNIIPFQFIDNIDILMDATDVLLTKPGGLSSTEALSKRLPVVLTCPIPGGEERNADFLSSIGVAEYAKTPESAVEKAIELVFDMRKRKKMIEAQEKYINRDADRDIAKLIIKLSEKAGGRQMCKAV >CP021850.1|AUS96654.1|2173397_2175692_-|single-stranded-DNA-specific-exonuclease-RecJ MKIDVNILNENTHIPDEIIEAADGDELIARIFFNRGYKDPDTIRQMLCEDLYTPVQPEEFPRMDKAVARIAKAIETGEKIAVYGDYDVDGVTSTALLVQCLTWYSSSVIYHVPDRFTEGYGMNEDVIRSMAKDGVSLIITCDCGISNINEIKTAKDLGMDVVITDHHNPDVLPEADVILNPKLLGEGHKARNLSGCGMAYFLALALLEQYGESEKAEAFLDLLAMSLIADVVSLNGENRYLLKKALPKLFGTKRTGLKALLEIAEKDSKLQSEEDVAFQLAPRINAAGRMESARLPVELLLCSDAQKAMEMALKIDHLNRERKRIQQEMVDEAIEQVENRKKNKSILVLFSEFWHHGIIGIAAGKVCETYRKPAILFSLKEDGTTVTGSARSTEEVNIYELIKACSSKLLKFGGHSQAAGLSLKREDLEEFTREIEELAEREYFIKDEIKVNADMELTLDNIDEELYGRILKAGPYGEGFEAPCFITRGATVASDRKTAKRHHIMVLADGHGNRLPAVKWFGEDEDLSGKLFDIVYKIGRNTYRGNDEIQLTISHLLPVEGTPEAVFEGEFIDGRGMDIKTLLKDFEEAVFFYEGLRLKCPVDNTVDRYDLRTSKKVETLVFLSTPVNASVFREVIALARPRKVVLSFAVTQDYTFKGFMTNLMGLVKHIINKQGGRSSLEQLALMLCVEDNIMRAALKYLRTIAPVEFLENSEDEIYIYGVKERSTANNIAVEKNIKNALMEKNAYQQFLMKLDVKSFGQYLK >CP021850.1|AUS96655.1|2175697_2176522_-|hypothetical-protein MDRDLRLADHFLYTQHSLATFDNCPLKFKKRYLENLKWDSFPDEATRKSIEAGNNFHLLAYRYFMGIETAPVEALEKYPELSRWMESLMKRFNINPEFKYLPEYKLRMSSGEMKLEANFDLLIVKHDHIEIWDWKTHGGRGKVSAAAIGKKLRSSLQTMVYMYALKEQSRLVAGEEIKASNISMHYWQPEPAMTLAEIKYSDALHEHFGNIIREKIRNILNYDFNSFDKDMYSKHCRVCEFNWFCNNERVDFSAMQEDEDIMLELDWERAEEVY >CP021850.1|AUS96656.1|2176506_2178759_-|DNA-helicase-UvrD MGLRKGQKELVEQYRGGFCAVPAIPGGGKTHCLSIWAAEMIAQGLHKPGKILIVTYMNSAVNNFRQRIAKELARRGISGNKDYVVSTIHSLCLKIVKEKPDLISTNEEFEIIDEVTKFHLISSAVDEWRRKNEDIFRYYLEESNLSANKLSENYKKWNDRLCGVVLGAIGDFKSHGMKPLQARESCRKLPETSLLKHAADIYAIYDKKLKMSGFLDFDDMLYNAKELLTMDSSLLEKYRKKFTFVCEDEAQDSNLIQSEILTLIADGNLLRVGDSNQAICGSFSNSDFTLFKSFCEKPETVVYRITQSSRNTREIIDLANYFVKLVREEHPVPECRESLLPQFIEPVDPHDERQNPVTTEYGIKAQIYGSWDEEVNSVVTEVIRMVKRHPDKTISVLVPNSYKMRDIVRCLEDKNIPFEQLDNTSDERNRTIKVLGRIIDFIAEPENGEKFGAMMNECFLRDKYEDEMPESEFNPDMHGKESQREMLTAFLRKYPVEKLLYPAAGEIDIREIPPELLKSKIWRDFTDKLETVRGFLEFPTTVVEKLILYISEKLNFGREERAIAQKVAGDVRYLMNQNPRWRLSDLALELLSPKNMFNFFAGIVWELKGYEPKPGVVTVATYHKSKGMEWDIVFLTGLNYADFPVYLTDKFVGEYWFLKQEYKNPQALVKADLEKILGAGTGEDSILKSKIETISERARLLYVGITRAREYLYLSGFHANQGKWNENLPSKYLLDIKKHIEEVGAKWTGI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021850_4 | 2584320-2584495 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of CP021850_4
|
2 spacers
spacers of CP021850_4
>4.1|2584356|31|CP021850|PILER-CR ATAGAGTTCCCGGTTTTTATAGAAGTCCATT >4.2|2584423|37|CP021850|PILER-CR ACAGCATGTATATCATCTGCTTCTCTGATGTTTTTGA >4.3|2584355|35|CP021850|CRISPRCasFinder GATAGAGTTCCCGGTTTTTATAGAAGTCCATTTAT >4.4|2584422|41|CP021850|CRISPRCasFinder TACAGCATGTATATCATCTGCTTCTCTGATGTTTTTGAACC |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP021850_4
The CRISPR arrays of CP021850_4 >merge|CP021850|4|2584320-2584495|PILER-CR,CRISPRCasFinder TACGTTTCAATCCACGCACCCGTGCAGGGTGCGACGATAGAGTTCCCGGTTTTTATAGAAGTCCATTTATGTTTCAATCCACGCACCCGTGCAGGGTGCGACTACAGCATGTATATCATCTGCTTCTCTGATGTTTTTGAACCGTTTCAATCCACGCACCCGTGCAGGGTGCGACT >CP021850|4|2|2584320-2584495|PILER-CR TACGTTTCAATCCACGCACCCGTGCAGGGTGCGACG ATAGAGTTCCCGGTTTTTATAGAAGTCCATT TATGTTTCAATCCACGCACCCGTGCAGGGTGCGACT ACAGCATGTATATCATCTGCTTCTCTGATGTTTTTGA ACCGTTTCAATCCACGCACCCGTGCAGGGTGCGACT >CP021850|4|4|2584323-2584494|CRISPRCasFinder GTTTCAATCCACGCACCCGTGCAGGGTGCGAC GATAGAGTTCCCGGTTTTTATAGAAGTCCATTTAT GTTTCAATCCACGCACCCGTGCAGGGTGCGAC TACAGCATGTATATCATCTGCTTCTCTGATGTTTTTGAACC GTTTCAATCCACGCACCCGTGCAGGGTGCGAC
>CP021850.1|AUS96942.1|2583873_2584149_-|hypothetical-protein MSKVYEFEAEIKKVPDIDGAYIEIPFDVKAKFGKGRVSVTATFDGEVYHGMLVRMKTPCHIIGIRKDIRAKINKQPGDKVFVTIREREVKK >CP021850.1|AUS96941.1|2583013_2583862_-|methyltransferase-type-11 MERKSLFQCPVCKKALVQGEKEYRCNKGHSFDISRKGYVNLLLPNHKGSGNPGDSKEMLQSRRDFLNKGYYEGFSDRLNALSSHYIPNDDANGISILDAGCGEGYYISRLKNSLWASGMEKTDIYGIDVSKAAINLASGRDKAIRFAVASTYHLPLLDRCLDGILCIFSPRDEKEFLRVLKPKGKLIVAAPGPKHLYSFKKELYENPEYIGQKGTVGEGFSVLECVNISYGISLESTQDIMNLLSMTPYTRHTDQDAVEKLKRLNALETEVDINIIVYQKLR >CP021850.1|AUS96940.1|2582715_2582904_+|hypothetical-protein MADKTLVCKDCNSEFIFTEGEQEFYKEKGFENEPQRCPDCRRARKQQRNNNNSRNRSFGNRW >CP021850.1|AUS96939.1|2580373_2582185_-|phosphoenolpyruvate-carboxykinase-(GTP) MNLNEPRTTNKELLAWVKEMADMCQPDNIYWCDGSQEENDRLLQEMVDSGMAIRLNQEKRPGCYLFRSHPSDVARVEDRTFIASKTKEDAGPTNNWIDPVELKKTMTELYTGCMKGRTMYVIPFSMGPIGSPASKIGVELTDSPYVVVNMRIMTRMGQAVLDALGDGEFVKCLHSVGAPLEKGQKDSSWPCAPMEKKYISHFPEERTIWSYGSGYGGNALLGKKCFALRIASVQARDEGWLAEHMLILRITDPNGNKTYIAGAFPSACGKTNLAMLVPTIPGWKVETIGDDIAWMKFGKDGRLYAINPEAGFFGVAPGTSSESNPNAMHSIEKNTIFTNVALTDDGDVWWEGIGYDAPDHLIDWRGNDWTPGSETPAAHPNARFTAPAGQCPVIAPEWEDPQGVPISAILIGGRRPSTIPLVHQSFDWNHGVFMGSIMGSEITAATISKDIGQVRRDPFAMLPFCGYNISDYLQHWLNIGTKTDADKLPKIFYVNWFRKDANGKWLWPGFGENSRVLKWIVERVNGVGKAVSTAIGYMPTPDAIDVEGLKVSKEDMEELLKVNKDEWLKEVASIREHYAKFGDRLPKELVAQLDALEKRLNEM >CP021850.1|AUS96938.1|2579994_2580240_+|hypothetical-protein MDKLNYCLDCKRIFTQKETCEYCSSVNIRELAKNAPVNVIGSKLKGRVLNAKQGMVQVLFTEQGNTKTIREYEPSKIRKVL >CP021850.1|AUS96937.1|2579076_2579343_-|transcriptional-regulator MDCNDKKQVMNLIKTARGQMDGILKMLEEDRYCVDISKQILSVQALLKKANLKIIDQHIKHCVKQAFTEGNGDEKVNEVMELIDKYAK >CP021850.1|AUS96936.1|2576493_2578953_-|copper-translocating-P-type-ATPase MKKETLNITGMTCASCVKAVERSVKRLGNINSADVNLATEKLVVEFDESQVTLDEIKEAVKKAGYGVEEEKNDILRDVTIPISGMTCASCAKAVERAIKKLPGIREVSVNYATEKARVLYDPGSTRISEIKNAVSKAGYKPMEVEAGEQVDRERERREKERKTLWTKFLVAVIFTAPLLYISMGHMMGLPMPDFIMPEMHPLNFGLVQLILVIPVMISGYRFYTVGFSRLFKGEPNMDSLIAVGTSAAFLYGIYAIVQIINGNTEYAQDLYFETAGVIIALIMLGKYLEAITKGKTSEAIKKLMGLSPKTATVIHDGKEMVIPIEEVEVGDIILVKPGEKIPVDGEVIEGRTSVDESMLTGESIPVEKYAGSKVVGASINKNGTIRFKATKVGKDTTLAQIIKLVEDAQGSKAPIAKLADIIAGYFVPVVIAIAVLAGVAWYISGESLIFSLTIFISVLVIACPCALGLATPTAIMVGTGKGAEYGVLIKGGEALETAHRIKTIVFDKTGTITEGKPKVTDIITAEGMDEAELLRLSASAERGSEHPLGEAIVNEAKDKKMDLLEVESFEAIPGQGIEVVIKGRKMLLGNKKLMDSRNIEITLQKESDRLAGEGKTPMFVAIDNKLAGIIAVADVMKPSSKRAIEKLHEMGIEVAMITGDNRRTAEAIAKQAGIDRVLAEVLPQDKAKEVQKLQAEGKKVAMVGDGINDAPALAQADIGIAIGSGTDVAMESADIVLMRSDLMDVPAAIELSRRTIRNIKQNLFWAFGYNTAGIPIAAGVLHIFGGPLLSPMIAAAAMAFSSVSVLTNALRLKRFKPLH >CP021850.1|AUS96935.1|2576039_2576249_-|heavy-metal-transport/detoxification-protein MTKKVFIEGMSCKHCVMHVEEALKEVSGIKEVKVSLEGKVAEIELEHDVDDEKIKAAVADAGYEVTAIQ >CP021850.1|AUS96934.1|2573288_2575028_-|hypothetical-protein MQMTLRKPLNSIYFKILVVYLITILPIYALFVIFQIRISKDINNERSEVITNYTNRSITFIENELARVYNTQQIMAANNFEITMLHRGYNKINAYQLGKLVQSINDNLWSIKKSSSLVDSVKLYIPAIQREVSTISYFDVISENMAENLYLNTMDTQQGSVAYADKQMLLCHYNTFTGKDTLPEYMICVQLSEKSIRSMLGAASDDVFWIIHNQDFQMSNDPNPNNAQVLIESSKKYDMIDNEIITDVIDIDSVKYIVSYVKSPVLNCLISYYTPLSEIMVHMQSYINIVLIIGICTLVGGLVLAFYLYSMLKVPLNHLLDAFRQMEKGNLDMEIHYRSNNEFGTVFKFFNKMLTQLNSMINQVYLAQINLKKAQLRQLQAQINPHFLYNSFGILTHSIMRNDNEVALSMANNLSSYFKYITKNIDEDTTLGKEFEFAQTYLNIQKIRFQNKIHIEFKPIVEPYSDIKVPRMILQPLIENCYKHGLKNTEYSGRVSLTWYTEDNNLFIEVKDNGCGINASELEKLKKYLDEGTFSEHDGLQNVNQRLKLKYGSEYGLHVESVENEYFKVTVTIPVLKGA >CP021850.1|AUS96933.1|2571673_2573284_-|hypothetical-protein MYNLLIVDDEPIITDSYFEYLSDKYANMLNIQKAYTPSEALQKAHNRVDILITDITMPRMDGYTLQKKICQIWPKCNVIFLTGNEEVHFAQNAIRQASFVDYVLKNEHFDVLAKAVNKAIEKIESSIRADEVFLRMQKNIQLALPMLRKEFFMDVINGKITDQQAINKKLNQYSIELNAENPVILLGAVIKEDKGRDCQLGQSDNNLSVLAVDSVLSEHLKHTHKHYCVNMDGGFVLWFIQKAREDMMDIYQGDSFQYVLSLLDIIQDSCSKILKSDVSFVIADNQCSWDELQYKFFAIKRAIHRHHNLNESILIAENSFELQDEISSEEQYKQFLQEIEHSLLCNDRERVFKAIDKLDKILGNVDLVGFHYKISAIYIKCLEAIAAPFDVYKEICSVLFSVDISNISGENLILTYKQITETLFAQSIEYNNAVTDMIKQVEEYIDNNLSGDLSLTAISSMVNYSPTYFSKLFKKVTGENFSDYILAKRLKKAQELLCETNMKVGDIAKMVGYESVPYFIKSFKRLLGRTPNDYRN >CP021850.1|AUS96943.1|2584667_2584958_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMVLITYDVDTTTYGGQRRLYKVAKTCVNYGQRVQESVFECVLEPHQYIELKAKLEKLMDIERDSIRFYNLGSNWKRRVEHLGAKKPYDPEGVIIT >CP021850.1|AUS96944.1|2584969_2586001_-|subtype-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKLLNTLYVTSPNSYLTRDGDNIVIKEEDKEKLRIPAHNLESVICFNYAGASPSLMSLCAEKGISLSFLSPSGYFYARVTGKVNGNVLLRRKQYRVADNLMESSAFAKNFIIGKVYNSRAILQRALREYKNMESSGELQRASDYLNFQLMRLDNSENLETVRGIEGESAHIYFSCFNHLIINQKESFLFSERNRRPPLDNVNALLSFLYTLLMHDVQAALETVGLDPYVGFLHRDRPGRASLALDLMEELRPYLADRMTLSLINKRQVDSKGFVSKESGAVIMDDDTRKVVITAWQKRKQEEIMHPYINEKIPVGLLPYVQAMLLARTLRGEIDEYPPFLIK >CP021850.1|AUS96945.1|2586027_2586717_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MYTEEELLALSGIQHIAFCPRQWALIHVECQWAENARTTEGRLMHERADNPFIQESRGNIVVARSVPLVSYEIGLYGVADVVEFIKTEVDGKGVALKYYDGVWVPHPVEYKKGRPKPDERDIVQLCAQAICLEEMYGIRIDRGSLYYGETRHRELVDFDGKIRKKVKELSLKMHELFTEGHTPQPYYSKHCRQCSLYDLCMPTLTKKKTTVKQYLYKAMHEETDTHTHL >CP021850.1|AUS96946.1|2586723_2587605_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MFNKNNPIANRYEFVLLFDVENGNPNGDPDAGNMPRIDPETGLGLVTDVCLKRKIRNYVSIAKGSEDGYDIYVQEGAVLNEQHLKAYKAVGIEPDTKNKRLPSDKDKAEQIIDFMCKHFYDIRTFGAVMTTEVNCGQLRGPVQINFARSIDPVVQQEVTITRMAVTNIKDMEKERSMGRKYIIPYGLYRVEGFVSANFAKKTGFSSSDLELLWEALINMFDHDRSAARGKMESRKLFIFQHSSMLGNAPAHKLFDCIKVNRVDPSTPPRFFTDYEVVVEKESIPDGVTLIERL >CP021850.1|AUS96947.1|2587606_2589379_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MILQSLYNFYHVLLDDPDCEIAPPGYSAAKVSFSLILSHEGELLDVRDLRISNGKKALPRTLIVPEQPKRTSGTLPFFLCDNAGYVLGLDEKRGKVKYDAFCDFQKQILASCPSIEAHAVIKFLDTWDVEKASVHSIIKDLYKDIKNANLVFQLDGSYSYVHDVPEIKAVWERYLLGKTAEYEAICLVTGKKAKIANIHPSIKGVFGAQSSGAALVSFNIPSFKSFGKDQSYNAPVSEEAAFGYTTALNYLLADPKHRLSIIDTTTVFWAEKPGSLEEEIFSYLLNPPMFEEEEKDKNAMVRDQKTRQLLEDTLKRVSMGLPIKNWIANIDGDMHFYILGLSPNNARLAVRFWHMDTLNGFAEKIGQHYADLKIEGLKHDAIPVWMILKETAVRRELKNVSPILEGGIMRAILTGDLYPQTLYTSIINRIRSDHEINSIRAAIIKACLLRKAKKYRKVETISEEVLPMSLNARNGETARNLGALFAILEKIQQNANPGINATIKERYFNSASATPSTVFPQLMRLSNHHLAKLETGSRIYWENKVMENISQIENFPARLTLEEQGLFMLGYYHQRENFFNRKNEEKREDD >CP021850.1|AUS96948.1|2589375_2590038_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MGFGIAIKVQGPYALFCRPEMKAERVSYDVITPSAARAIIEACYFKPAIRWIIDRIHVMNEIRFDNVRRNEVENVISVRNVMAAFNGKPSDLHQYASLERQQRASLLLRDVSYVIEAHFEMTDRAGPDDTEEKHYNIAVRRLRKGQCYYQPYLGCREFSAKVELLEGDIPASFYTGTEKDLGWMLWDIDYSNDKKPLFFRPVMKNGIIEVPDLLKKGGMS >CP021850.1|AUS96949.1|2590431_2592636_-|hypothetical-protein MYYAHTKVGLPEDEWQKLSDHLTGTSELAGKKASKFNGEEYGKVAGLLHDAGKYSIEFQKRLRGSKVPVDHSTAGAKEAFEKYGLPGLILAYVVAGHHTGMPDWIDPGSSSSLSERIENADLPDYKEFHKEISLTDKLPPLPIKIHGRDREEIRKSTGFSLSFFTRMLYSCLVDADYRDTERFIDPQKSKNRDLKINLSQLLQNLDTYMEAKCSKSSEGYINRKRNEIRIACIEKSSLPKGMFSLKVPTGGGKTLSSLEFAIRHAICHNMDRVIYAIPYTSIIEQNAQVFREALGEEFVLEHHSNFLFDRDEDDLNYEDNPLRLAAEDWNIPVVVTTNVQFFESLFSNRSSRCRKLHNLCNSVIVLDEAQMIPIEFLKPCLAAICELIRNYGCSVVLCTATQPDINDFLPVDMKPREIIHNADELFRSLKRVKTSYVGRMTDEELSTKLKDCRQVLCIVNTKSRASQIYDLINDGEGIYHLSTFMCPIHRNKKLNEIKECLKASKQNSNLPCRVVSTQLVEAGVDLDFPTVYREIAGIDSINQAAGRCNREGRLEWGRVFVFEPEKLLASDSFLARAASIGRSVLRKYDDPMLLEAIKEYFRCLYHQDENLLDKHRIIEALSECGMSLQFPFATIARLFRLISNNQVSLIIPYDERCRKMLSDAQWLDKPEKLARKLQPYVVPLEVYQFKDLEKNNLIETVAGVFYVLSDMKFYDDNKGLILPKGTVEQDILIY >CP021850.1|AUS96950.1|2592959_2593895_-|hypothetical-protein MKFDAEPMSILDKSMKWLCSGKKIHISIHDASGVFQSNPDLKLHPIYKVHYNDFCNKAKTTCAGLRFCLRCKACSIRKAFSVNEMYVGRCYLGITEIVKPVVLNGRKICVIYLGNMTEEEKLPSIKGMIHKACGITGVKENLLLDALEGTEKVGKQDIEQYKEIVEVVSHLIRQTLLNYMKRDRTEEMLITAAGSGKHWIIDAVENYIRAYYDRDLKLSYLSKLYFVNPDYLCRLFRKETGKNFSEYVNDIRIEKSKQLLTGSDDAIMNIALQVGYNNVTYFNRVFRKQTGISPGEYRKVLKSHGNGDTVL >CP021850.1|AUS96951.1|2594290_2595055_-|MerR-family-transcriptional-regulator MEYTVQKLGKMAGISTRTLRYYDEIGILKPARINSSGYRIYGQSEVDRLQQILFYRELGVSLDSIKDIMSSPSFDSLAALKEHREKLLEKRKQLDALIANVEKTIAASEGRIIMSDMEKFEGFKQKLLDENEKKYGKEIREKYGEEQVAKSYEKFKNMTQEQYEEVQKLGEDVMTTLKEAFKTGDPAGELAQKAADLHRQWLCYFWPNYTKEAHAGVAQMYVDDERFTQYYDKEQPGLAKFLRDAVLIYTGMNK >CP021850.1|AUS96952.1|2595397_2596663_+|hypothetical-protein MSGNKKYDLIVAGGGLSGVAAAVAAAREGVKVLLIEKNGYLGGMATAGLVNPFMPYCERSENGGYNWNKIVNEGLFKEILRRLDELEGLHKNRQTFNEEIMKLVLDRMILEHKIDILLHSFISSVEKQGARLKAVTVTSKSGTASYEGSYFVDATGDADLSTLAGCEYRIGRDSDHLCQPMTLCFRLANVDTSKYDRNFVNKKFNEMKQKGLIKNPREDVLTFAHVVDDVMHFNSTRVVGKSGVKAEDLTQAEIEAREQVYELYRFMKDNILGFENCQLLMSAPEIGVRESRRIVGEYTITQEDLLNTVKFEDSIARGTYPVDIHNPSGSGTVIQHIPAGDYYTIPYRALLPKGMDNLIVAGRPISSTHEAHSAYRVMPICTCIGEGAGTAASIAVKRNLAFRDVDYKEIQSLLDSHGALY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021850_5 | 3300780-3300856 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP021850_5
|
1 spacers
spacers of CP021850_5
>5.1|3300804|29|CP021850|CRISPRCasFinder AATCTCCATTAACCTTAGTGCAATCAATA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP021850_5
The CRISPR arrays of CP021850_5 >merge|CP021850|5|3300780-3300856|CRISPRCasFinder TCTCACTCCAAAAGTCAACGCTTTAATCTCCATTAACCTTAGTGCAATCAATATCTCACTCCAAAAGTCAAACGCTT >CP021850|5|5|3300780-3300856|CRISPRCasFinder TCTCACTCCAAAAGTCAACGCTTT AATCTCCATTAACCTTAGTGCAATCAATA TCTCACTCCAAAAGTCAAACGCTT
>CP021850.1|AUS97540.1|3299701_3300631_-|sugar-ABC-transporter-permease MLLTYGTAQTDKGIKAVKRHKLGRYQAIMGYLFIAPSVVLYIIFTGIPIISAFYLSFTNYDVLSTAKWVGLKNYKKLLDDEIFITSLLNILFYVVMYVPLMVVCSLLIALLLNRKLPGTNLFRTIYYIPGLTSSIAAATVWMWILNPEYGLLNQILSYVGITGPAWLANTSTAMISIVIVTLWQGIGGNMVIYMAGLQGIPATLYESAKLDGANKWQLFFYITLPGLRPTTFFIFIMSMIGSFQLFDQAFAMTQGGPGYATTTPVYLIYNEGFNQLNMGYASAMAFALFVIILVFSIINFRLNSSEQEE >CP021850.1|AUS97539.1|3298816_3299698_-|ABC-transporter-permease MHRESVGKKYMEGILYYILLIPIAIIMILPFYWSLITSFKYNEDIFAIPIIWIPNRITLQHYIDAFTTVPYARYFANSFYLASLGVISNLFFGSLGGYAFAKLRFKGRNLIFRILLSSFMVPGIVTMIPQFLVVKNFPLVGGNDILGKGGTGLLNTYWAIVLPGAAGAFAVFFMRQFFVTLPTELAEASRIEGAGEFRIFWSIYMPLTKPALAALAIFTFQAGWNNFLWPMIVLNDPQKATIQMGLQAFSYNRNTEYGAMMAGSLIAIIPILVLFVFAQKYFIKGIAFSGMKV >CP021850.1|AUS97538.1|3297544_3298813_-|hypothetical-protein MLRRDQMKKATFLIFLLSSLMLSGCTNKTSTEKISTDKVSTDKTSIDKVSADSANNINNPREKEDETVMENMQITYQKKAESLYEKILELYSVEGTNLFLENYPPKPEDNAVSYLWPYSAMFSAANAIIKLPGNKEKYIDSYEKILAGLEHYYDDIRKPAAYEAYPGEFGGSDRYYDDNMWLGLDFIEAYRTFGDKKYLEKAERIFEFVKSGWTDELGGGIYWCEQKKESKNTCSNGPAAILALMLYEETQKEEYYEWGLKIYNWTKDNLQSPSGVYWDNIDLKGNIDKATYTYNSGTMLHASVLLYNITKEDKYLLEAQKVAKASLEHFTEKKQDICFYPANNPWFTDILYRGYIELYKVDGNPRYINSIIDNIDYAWENAKDENGLLESDWSGVVKNRNKPLLDVSCMVEMYARTALLRD >CP021850.1|AUS97537.1|3295562_3297503_-|hypothetical-protein MLKGVKGKRLFAMALIFNFLFSSVVFFADSSNVHAFTAANAETAMEDFLNVFYDPVKKYFYTNSDRQIHEHAAGPENGLYTDYWWEAQIWQTIMDAYERTNDPKYLNLIHDIYDGFNSAYPNWESNPFNDDIAWWALGSIRAYEITGDTRYKTRAKEMFDHIWQSWSSDFGGGIWWNTINFLPQKNVATNATAAIIAVRLYNAYNDPSYLSKAHDLYNWLENTLYAGNGYVYDQYRQGEGLIDWEFTYNFGGFAGASLELYKVTGNSRYLTNATDCVDWVFNNMTVDGTTLLYEGIDDVPAFKMIFMRNVKRLVYEANQTQYLKFLQDNATQAWNHRRTSDGIIGPDWSLTPDSGYIQSIAAAAGVDILFLSDPDNFTGVVVGSGTYEAENARRFNVPVEDNDYERPGYSGRSYVAGWNQNGSSVLFPVNVQSNGIYAITFRYSAAAGNAVRKLTVNGVSMGNVAFTQTSSWSDWSSVSVYVPLIQGTNKVELIFDSSSGSTNYLNLDKITVAEASGRIYEAESAVLHNLSTESTYGDYSGSGYIAGWNSNGQWVDFNVNVDTAGYYNLIFRYAAGAGNASRYLYVNGTGVVDNQAFSATGSWSNYSIVTVSNVYLHSGSNTISLIFNSSKGSTNWLNLDYLQIVQ >CP021850.1|AUS97536.1|3294440_3295499_-|glycosyl-hydrolase MRIDWATRAQTAQEELKYNFWNEELGIMNQTCPGENISKDNLIYWWHAHVIDALMDGYERTKDFGYIELIDTIIANVKRINGNTLLHNYYDDMEWMALALLRVYDATKNEFYKEQVLILWESIKTAWNDHMGGGMAWKKDQLDYKNTPANAPASILASRLYQRFNRPDDFKWAHKIYNWNKDNLMDPNTGFVWDGINRLGDGKIDYDWEYTYCQGVFIGAGIELYRITGDIMYINDAVRTAEFALKRFIDAESGMLPDEGKDDCGLFKGIFVRYLCELVKMRPDMLNIRKMLIHNATVMWESGRNERGLISRGWKGKVEPVVQLCAQLSGLMLLEMVALLDPDPGILTVESV >CP021850.1|AUS97535.1|3292013_3293921_-|threonine--tRNA-ligase MIKVMLKDGSSKEFNEGIAIKEVAESISAGLARVALAGEVDGEVKDLNYKLEKDCKLNLLTWDDEGGKRAYRHTTSHIMAQAVKRLYPNVKLAIGPSIDNGFYYDFDTDKPFSVEELEAIEKEMAKIIKEDYPLERFTLPRDEAIRYMEERNEPYKVELIRDLPEGEEISFYKQGEFVDLCAGPHLPSTGKVKAFKLLSVAGAYWRGDEKNKMLQRIYGTAFSKKSELDEYLLRLEEAKKRDHRKLGKELDLFDILEEGPGFPFFMPKGMVLRNVLEEYWREEHRKRGYQEIKTPIILNEDLWHRSGHWDHYKENMYFTKIDEGNFAIKPMNCPGGMLVYKRRLHSYRDLPQRMAELGLVHRHELSGALHGLMRVRCFTQDDAHIFMTPDQIRDEVLAVIELIDDFYKVFGFKYHVELSTRPENSMGSDEDWEMATDALKNALEAKNMDYKVNEGDGAFYGPKIDFHLEDSLGRTWQCGTIQLDFQMPERFDLTYVGADGEKHRPVMIHRVVFGSIERFIAILTEHFAGAFPVWLSPVQVKILALVEKHHPYVLELKRAMEEKGIRVEVDLRNEKIGYKIREAQMEKVPYMLVIGDQETENRTVAVRSRKEGQLGSMKVEEFISKVLDEIKSKAM >CP021850.1|AUS97534.1|3288975_3291306_+|sulfate-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLALKNIKKSYTTGSFTQVALNGINLNFRENEFVAILGPSGSGKTTCLNVIGGLDRYDSGDLVINGKSTKSFKDVDWDAYRNNSIGFIFQSYNLITHLNIIDNVEMGMTLSGVSAGAKRKKAMEVLERVGLKEHMHKKPNQLSGGQMQRVAIARALANDPDIILADEPTGALDSTTSKQIMDLIKEIAKDKLVIMVTHNPEIARTYADRIIEFKDGEVVSDSRPLPDVEISPNYKLKKTKMSFFTALKLSANNIRTKKGRTFLTAFASSIGIIGIALILSLSNGFDKKIAEYESETLSNFPIMISQSAAEIDADMLKERQSAMMGATDEDAYPDEKVVYPTEPIIEKITHTNILTDEYMEHIENIDPELVSGISYTRMLKINLLKKQDDKATIINADSMSFTSYPKSLGGDNTRYLELNYDVLAGSYPKGMNDVVLIVDNKNQIDKTILQNFGLEYESDSIPFEDIIGYEFRAILNNDFYKANDSFFMINGDPTNLIDLYNNENAIPLKVVGILRPKEHIKIPLLPEGFAYSDELAEFIIKDAANSEIVLKQKDSEFNVLTGAPFDESDLDFNGVSSKEAVLSVLGANDTPYMISIYPASFSAKDDILTYLDKYNEGKSETDKVVYTDLAGKVTELSGGIMDAITIVLIAFSSISLVVSLIMVGIITYISVLERTREIGVLRSLGARKKDITRVFNAETFIIGLCSGVMGIVIARLLIFPINSIIKRMTTLPNVAQLNPVHAAALVLLSLALTVLGGTIPAKIAARKDPVEALRAE >CP021850.1|AUS97533.1|3288338_3288989_+|hypothetical-protein MHEGGDGLPKETFYNLPQEKRDRIIAAIKKELARAPFEEISINKIIQDAGISRGSFYMYFEDKKDMLHCIFSDFRDRLLATIEESARQNDGDLFSIFSDILKFTAEFGTKKENIDFCMNVFARQRLQSDILLKFANRRRRSDFSDWFGRYANTRKLNLHKPEDLYSMIDILATITKKAIADIFLSIEDKDSILEEYNNKINILKRGMLKESNNACT >CP021850.1|AUS97532.1|3286395_3287919_+|glycosyl-hydrolase MDRKHNSLILRIIAGAVLFLSFSGILYINNIFPNKNTDKKVNSGAKSGTEANEGHEIIGNVDCWLTTTNQANLLSPQAPILPGEEIPADGNGIMRTITVSPDATYQMMDGFGASFTDASAWLVYNELDEPSRKDLMTKLFSYEDGIGISFLRQPMGASDFAHRLYTYDDVPAGTEDYELEHFSIEHDRQYIIPCIKDALELNPMLKVMASPWSPPAWMKTSGHLIGGSLRKEAYDAYARYFVKFIKAYEEEGIPIYAVTPQNEPLYVPTEYTGMKMEPYAQAEFINNHLGPEFEKNGLNTKILVYDHNWDNVTYAMEVLQKAGKYVAGSAWHCYGGSHDAMSVVYKKFPDKGIWFTEASGGQWVPPFNDAFADQMMHVIRSTRNYSKTVAWWNIALDQNNGPTVLKNSICRGIVTIDTSTGEVTYNVDYYTLGHISKFVKPGAYRIDSDNYMNDVESVAFKNPDGSIVLIVSNRTTKDKTLDVKYGNSSFSYKLPGKAAATFKWKGE >CP021850.1|AUS97531.1|3284773_3286225_-|hypothetical-protein MKSTRKIAAFVLVAVMAMMLLTTGCSGSKADPTKTSGTVVYATYNWDVERAQKMVEGFNQIYPNISVEIVGFEGNLNDYLTTQAASNSLPDVTWGWENLNYPISQGWLYPLDEFLKKDDEAEYLPKSAMDSYKFLDKTYAVPYDVQFSAVLVNLDLVEQLNMDAPSYEWTVDEFKEYATKATTDKYSGINHLWDFDVMMAGVMSKNLAQLAFDQKEGKFKFTEGSWEKALALQKELKAVPGLVSDDLKNQELRDAGKEDDYQKKFGKDADALRESKVLMGFHGTWDMSWIKTMNYRFDMYPLPKDPEMGYRQAVHYNHAFMMSNAKYPEAAFQFLKWISYGKDGTLTRFDIYKNLVDADGNPAPDYYIPATTHPDVVKAFEAIEIVPEGVKYLYKNIDKTFRGDFYKFVPGWDKVWNEIILPKNEEIRQNKVQASAVAAELEDKANEALSEARSEFEKQLQEVQKNFSELRKKIEQELKSQSK >CP021850.1|AUS97541.1|3301446_3302802_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKTKVLKTLSLLLALCLALSLVACGSKNADSKDDSAKTQEQTSAGGTEKTDKTDKAEKKEPVEIIYWGDWAGEGQKQFEAMLEEFNKSQDRIVAKYVVTQDMITKFLTASASGQSPDIMFWDRWRTCLYAPKGVLEPIDDFMQRDNVNKEDFYQEALRELSYGGKTYGLPLTVDCRALFYNKKLFAEKGLNPPKTWDELREAAIKLTEWDGDKLVRAGFSLSDVGLFSMWIRQAGGDMVTEDGKKTAFNSPEGLMVLNFWDRLLNEDKVYKVGFESGLGNDVDAFATGKVAMTYTGPWMLSTYKEYGKDLEFGIVPPPAGPNGHKGGMIGGFGLVIPSAAKHKEEAWELMKWWLAVPENAAMYGKMSLNIPGSRIAAQDEFFSAEDSLYKPFVETFEFAKIRPPFEQYSNMEVKALIPQLQLFVEGKLTAEQALQKAQEMGDKILAETSEE >CP021850.1|AUS97542.1|3303653_3304781_-|GntR-family-transcriptional-regulator MNGTNGHLYEIIYNHVINEIKSGKYEKGDRLPTEKELTEKFNVSRITTKKALELLAEEGIVKRIRGKGSYITKDFKETTDKTNEGCVKSGSLIGFVLPDYSDGYATELFKGIEEEATKHDLYIVHRRTFGLQDLEEKVMDGLVNLGVKGIIIMPVHGENYNPKVLRLVLDGFPVVFVDRYLKGIPSPCVCTDNIASSKMAVDYLLKLGHRYISFVSPPSIDTSTIEERMEGFIKSHAENGVPVESSLHLMGIKSTIPGMNTEENIAKDIEKIMDHLKRNPQITCLFATEYNIALLCRKAVLTLGKKVPDDISIICFDEPRSYTGDYLFTHVRQKEREMGAIAVQLIQKQIENGDYNKKVFLESELIIGQTTKKIT >CP021850.1|AUS97543.1|3305464_3306484_-|hypothetical-protein MKQNMKRNITLTITLAVIITTISACSFMKGKESDAPQDTDLPASTTQTSTSDTAPDESNTTGENKITLSLYFANEDKSAVVKEMREVAVEDGDMVRAAIEALIEGPSEKNLKRSMPENTRLIESSIDGDTVIVNFSKEFLNANGMAEVIARASLVNTLTDMEGIRKVKILVEGEALIGPSGLPFGELERFELDAQGQPVEGETRAVTLYYGNAEGEALIAEKREAYIYKDEPIEAEVFYELTKAPITRGLNPTIPEGTRVLSVETKDGICHLNLSKEFLENSTGGSAGELMTIYSIVNTLTELPGIEKVQFLIEGEIRETYIHMELGEPIERNEDAIAE >CP021850.1|AUS97544.1|3306575_3307403_-|hypothetical-protein MLINLFGREIYIKKSLVVIAALVLLAAALAIGYAVNSSGADIIIKNDDDFSMAWEESKGTSDIPTTDRKPEAANQKAESEGGQNVAEPEAEVEEIKVYVVGCVKNEGIVTLKKGQLIDDAIKAAGGATEDADIKNINLVYELTENVMLRIRSVKESQETSQGSSNNNAGAQSKSGAKSSENEGAAGSGIEIIKDSGGAVVIGNKGSSGISGGKININTATLEELDTLPGIGAATAQKIIDYRQKNGKFKKISDIMQVSGIGASKFDKIKDIITVD >CP021850.1|AUS97545.1|3307733_3309050_+|hypothetical-protein MRKIFSVLLAISVLSACISNVHAEELNIDAPSYILIDPETGRSLAEKEPDEKMYPASTTKIMTAIIALEQGDLNQMATASAKAIDLEYGSMHIGIMQGEQIVLEDLLNAMMVRSANDAANIIAENVGASYDDFIEQMNKKARELGATNTHFVNPHGMHNDDHYTTVCDMATIARYAMSIDKFREIVKKPYYDMKPTNKHEEWDRLYTINRFLTNLQEYKSDYFTPIGIKSGYTSQAGNTLVSAAVNDSGMELIAVVFGAKGSNNNSDVYDFSKELLEYGFKNFSRKKLLKSNQLVESVNVEDATDNPSLDLVAESDISAILPSDQDLSLLEKNIVLISPTISAPVSKGDVLGYVEFRQDGVLLGKTNIVASRSIDKSTKAIEKFSEEVASARPRLKNFLIGTATALVAFLLLRIILRRISRARFSSRYSTKSRKHYRN >CP021850.1|AUS97546.1|3309270_3310989_+|AMP-dependent-synthetase MTSEPRYSVRPIRNLKDMLAQSVRLYGENNAFLLKDDNNNYRGVKYKEYNSDIEGLGTALINLGLKDKYIAVIGENRYEWTVSYLAVVNGTGVVVPLDKDLPLQELQNLLERSGASAVIFSGKLENEFRKVQASVPSVKYFINMDSEEDDGSFLSYRRLIEKGKQLVQAGDTSFIDAEIDDEAMSILLFTSGTTDLAKGVMLSHKNICSNIMAVCSSLYIDDKDSALSILPLHHTYECTCGFLVMIYNGCTISFIEGLRHIVKNMQETKPSIIMAVPLILEGMYKKIWDKVSKNPVHKYKLKAAVAISDFLYHVLKIDIRKKLFKQIHDNFGGRLRLVISGAAAIDPKALKGLRSFGLNVLQGYGLTECSPIVTVNREEAHINSSIGLPLPGVEVQLADIGPDGVGELIVKGDNVMLGYFKNEAATQKVMKDGWFYTGDLGRLDEKGFFYITGRKKNVIVTKNGKNIFPEEVETYLNRSPYIQESLVWGKYDQITGETFVNAQIYPDLEAIKQKLKTNEVSQEDIHRIISAEIKAVNHSMPLYKHVRGFTIRENEFAKTTTKKIKRYAEKVG >CP021850.1|AUS97547.1|3311228_3311891_-|hypothetical-protein MVHKNQKPYINVLIFDFDGVIIDSRDDIAGAVEYSLKHFGRPPLPRDEIISYIGWGADNLIRSCFKGCDDEVIREAISFYKKYYLDNSVKETKLYKNVEETLDFFKGKKIALVTNKPEDISLSILDKLGVADRFNIVIGPESLKKLKPDPEGILKVLDAFGEDPKKTIMIGDTYTDVEAGKAAGTYTCGVTYGIGSTEDLLKASPDYIVDDIIKLTDIII >CP021850.1|AUS97548.1|3311920_3312259_-|ribosome-silencing-factor MDSKKLVDMVVDALQDKKAKEINIINIENISILADYFVICSGTSSTHLKALADSVEEKAAEAGYTMLHKEGYNSFRWILLDYGEVVVHIFHDEDRKFYNLERLWSDGIITYK >CP021850.1|AUS97549.1|3312402_3312978_-|phosphohydrolase MTIDEIKRELKKILKPGRFNHTIGVMNTSVKLAQTYGADESKAAMAGLLHDCAREIKGEVLFELCERYHIPVDDVCRTQPELLHGPLGSKLAEEVYGVSDREVLDAVCYHTTGRENMSLLEKIVFVADIIEPSRNFKGVDEIRKDAFVDLDKAVLAALDGSIRYVLSKGALLHIDTVNSRNYLINEINKRW >CP021850.1|AUS97550.1|3313141_3313768_-|nicotinic-acid-mononucleotide-adenylyltransferase MAEKHKRIGISGGTFDPVHHGHLIAAETIREEFQLDEIIFIPVGLTPHKNISRVTDAEHRYNMTRLAVETNPYFRVSRMEIDRQGYTYTVDTLSQLKQEYGWDVQLFFIVGADVIRDLLTWRQYEKVFQMCEFIATLRPGFEEKDFTHEIDNLKNRYGARIHIAKMPLIDISSTTIRSKVGNNKSIKYLVPEKVEQYIMEHGLYKDFA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021850_6 | 4336573-4336869 | Unclear |
I-A,II-B,III-A
Consensus repeat of CP021850_6
|
4 spacers
spacers of CP021850_6
>6.1|4336603|37|CP021850|CRT CTTCTGAATTAATTGACGTTTCAACAGATACTATGAT >6.2|4336670|36|CP021850|CRT,CRISPRCasFinder CCACTGTATCGATGCAGATATTTACAAAAATGATGA >6.3|4336736|36|CP021850|CRT,CRISPRCasFinder GGTTAAGCTATGTGTCCTTCCCGAAAGTGTTTACGC >6.4|4336802|37|CP021850|CRT,CRISPRCasFinder ATTGCCATTTATATCACATCCTCAGAAATATCTTCAT >6.5|4336750|20|CP021850|PILER-CR GTTAAGCTATGTGTCCTTCC >6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR TTGCCATTTATATCACATCCT |
cas5,cas7,cas8a4,cas3,cas6,cas2,cas1,cas4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP021850_6
The CRISPR arrays of CP021850_6 >merge|CP021850|6|4336573-4336869|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR TGCTTTATTACAATGTGGTAAGAGTAAAGCCTTCTGAATTAATTGACGTTTCAACAGATACTATGATGTTTCAATTCCAATATGGCACGATTAAAGCCCACTGTATCGATGCAGATATTTACAAAAATGATGAGTTTCAATTCCAACATGGTACGATTAAAGCGGTTAAGCTATGTGTCCTTCCCGAAAGTGTTTACGCGTTTCAATTCCAACATGGTACGATTAAAGCATTGCCATTTATATCACATCCTCAGAAATATCTTCATGTTTCAATTCCAACATGGTACGATTAAAGCA >CP021850|6|2|4336573-4336868|CRT TGCTTTATTACAATGTGGTAAGAGTAAAGC CTTCTGAATTAATTGACGTTTCAACAGATACTATGAT GTTTCAATTCCAATATGGCACGATTAAAGC CCACTGTATCGATGCAGATATTTACAAAAATGATGA GTTTCAATTCCAACATGGTACGATTAAAGC GGTTAAGCTATGTGTCCTTCCCGAAAGTGTTTACGC GTTTCAATTCCAACATGGTACGATTAAAGC ATTGCCATTTATATCACATCCTCAGAAATATCTTCAT GTTTCAATTCCAACATGGTACGATTAAAGC >CP021850|6|6|4336640-4336868|CRISPRCasFinder GTTTCAATTCCAATATGGCACGATTAAAGC CCACTGTATCGATGCAGATATTTACAAAAATGATGA GTTTCAATTCCAACATGGTACGATTAAAGC GGTTAAGCTATGTGTCCTTCCCGAAAGTGTTTACGC GTTTCAATTCCAACATGGTACGATTAAAGC ATTGCCATTTATATCACATCCTCAGAAATATCTTCAT GTTTCAATTCCAACATGGTACGATTAAAGC >CP021850|6|3|4336704-4336869|PILER-CR GAGTTTCAATTCCAACATGGTACGATTAAAGCGGTTAAGCTATGTG TCCTTCCCGAAAGTGTTTAC GCGTTTCAATTCCAACATGGTACGATTAAAGCATTGCCATTTATAT CACATCCTCAGAAATATCTTC ATGTTTCAATTCCAACATGGTACGATTAAAGCA
>CP021850.1|AUS98893.1|4335592_4336360_-|spermidine/putrescine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MEYIVEINGLGMKYQSLNGEINAIENIDLSVKKGEFISIVGPSGCGKSTLLSIICGLLTPTSGHVLINGKSLRGPSSDVGYMPQKDHLFDWRTILQNVLLGLEIRKIMTDENKQYALNLLKTYGLYEFKDKYPYQLSGGMRQRAALIRTLATKPEILLLDEAFSALDYQTRLAVTDDIYKIIKKENKTAILVTHDISESISMADRVIVLTSRPARVKNIHEIKFDCENRSPLSCREAPEFRYYFNAIWKELDIHV >CP021850.1|AUS98338.1|4334781_4335600_-|sulfonate-ABC-transporter-permease MSDSIRNEISKERKEYLRKLKLRKTAILTTQIALLVLFFISWEIAANLKLIDPFITSQPSRMVKTFQNLYKGGELFQHVGITCLETIVGFLLGTITGTVIAIILWWSEFLSRVLEPYLVVLNSLPKVALGPIIIVWMGAGPGSIIVMALAISLIVTIMEVLNGFLTVDQDKIKLVQTFGANRLQILTKVVIPANFGTIINSLKINVGLSWVGVIMGEFLVSKAGLGYLIIYGGQVFQLDLVMTSVIILAIAATLMYQGVAYLEKLLVKNNGH >CP021850.1|AUS98337.1|4333620_4334619_-|hypothetical-protein MKKIIALLLVIAVGFSFVLAGCKEEGPKKVRLSEVTRSVFYAPQYVALSKGFFKEEGLEIELSTGQGADKVMTAVLSNQVDIGFSGPEAAIYVYNEGKEDYPIVFAQLTNRDGSFLVGKDPDPDFDWSHVKGKTIIGGRKGGVPNMTLEYVLKKHGIMPGTDVNVDTSIQFSVMAGAFTGTDAEYVALFEPTASLVEKEGKGYVLTSIGKDSGEISYTAYYAKKSYIDKNKDTIQKFTNAIYKGQLWVKEHTPEEVAEAIQSFFPDTDLDLLKMVTKRYKEIEAWNTDPILKKASFDLLQEVMQTAGELDETVPYEKLSDTSFAEKAIKDIK >CP021850.1|AUS98336.1|4332631_4333462_+|hypothetical-protein MKYLKMSAFILLYMAVYFIISNYIGFVFGIFYMIKEIIVNPDVFLYGSPDAFMDTFVKNSVWFMAIAALVSFPIYAFILWLRKQNIFRVCGFSGISVKDMAITALMGISLNFVIEYLVAISSLNDLSPSVQQMFSQIFDGNSFVVILIAIGIVGPFIEEVIFRGLILNELRRNIPLTAAVIIQAVLFGAYHMNLTQGIYATLLGIILAQACIKMKSIWAPILIHMLFNSTSVVLAKLIDPYILMTYQYFILAGSVILLVFTSILAWRGKKSIVNIY >CP021850.1|AUS98335.1|4331560_4332592_+|peptidase-M42 MNGYIDYAVQQVINLCNIPSPTGFTKRVQNYLVEEFVNLGYKPVLTNKGSVLVDLGGNGDVLVLAAHVDTLGAMVRAIKDNGRIRISKIGGYPGNYIETENCIVHTRTGKEYSGTIQLVNPAVHVNKDVSDTKRDDSNMEVVLDEKVKSKEDVLKLEINTGDFISFDPRTVYTASGFIKSRHLDDKASAGVLIALAKYIKDTAPQLHRKVYLLFTTYEEVGHGGCSGLPDNVKEMISVDMGAVGDDLQADEFKVSICAKDSQGPYDYDITTRLIELAKKNNLNYAVDIYPYYGSDVDAALSAGYDLKHGLIGPGVSASHGYERTHREGIGNTLSLLKEYVESP >CP021850.1|AUS98334.1|4329123_4331310_-|hypothetical-protein MKRYVAMFLTLAMLFVSLMPMQAFAESDKGLEAAIKGVKSKIDIPEDFIFSKNYDVYTQQDGKKIWYLRWESKDDLGGSIMVSADEKGTIYSYEHYKPYNYSDRKKLPKISKDDALKAAKAFVKKVNPEAAANVKLEDENQLLYMSSDYYFTFYRTEKGFPLYENNIGITVDRDSGEVRYYYYNWNDGLVFPDSSKAIAPEAAQKAFKEKMGLKLVYKYSYDYENEKINIFPAYVPVYDSMYAIDALTGEMIQTGYYYVFAGGMGATADMALKSVAEVEQVVLSPEELEAAEEASKLISKDDAEKVARGLSVLGLTDEYKLTNAWLSRAWPNRKDFLWSLSFAKEDKDGRDYRYVNVSINAETKEIMNFYTSMPYDAKAQAKYDEDDAKAAAEKFLKEFKPDLFEQTKYEGSNGRGIVIPLAEDGKEEKPLQYSLVYTRMVNGIPFPDNSLRVGYDAVNGRIYSFDMTWFDEKFPAVKDNVTPDKAYETLFKNLGLELQYKFVYNNNNSLYEKVIYAPDYNNVEVKLVYALNTRKPWIFDPETGAILNHDGKPYEEVKVAEYSDIDGHYAEDEIKILAAYGISLDGNEFRPNDSITQKDFLTLLSKTLQDYYVPVSERGGDKETDALYSYMMRQGIVREGEKAPNAVLTREDSVKFIIRALKYDKVADIKGIYKSIFKDEDEINPDLIGYISIAQGLNIISGYDGYFNPKGELTRAQAAIIIYKYLQV >CP021850.1|AUS98333.1|4328056_4328680_-|hypothetical-protein MLIDTNITIAYKCYFCGTYEFFNISVFELPDKRELKLKCRCGKCSAVILKDSPKKYALRVGCIACGREHTYNVSRREMVSKSIEVFNCPITGIQQCFVGNDHEVRKKVDGVEEELDELVDMLGYESYFKNTQVAFDSLNKIHDIAEKGNLYCTCGNRDIELFLFTEKILLKCSICGRSIEIGTGSNEDLKKLLSSNQILLGCEESKA >CP021850.1|AUS98332.1|4325753_4327748_-|transcription-termination-factor-Rho MEDINLKGKTLEDLRYIAKMMNIKNISRLKKDELIEKILEEGRKTENVDNKSNIEQEQPQEAVPEVVVKRRRRTAASKAEKADIPVEEQQEAAKQDPGSIESGREADKVEAAEVKEEIKEEVKDEDKQKPSEALEEAGTVKKTRRGRPSKKAAKEEKTEPEKAEEESPKDTSKADLEIKEPVEERASEQTAAEAPVAEQIEIQMPEAGQTEDVKAETEQREGEQAKAEPQTRERVRREKTAQTAETKTENKLAAEPEKEAEKSEKIVERQQEQRREGLVAYPTPIYEKIESDDPVEGVLEVLPDGYGFLRSDNYLSGSRDVYVSPSQIRRFGLKTGDKVKGKGRIPKEGEKFQALLYVQSVNGDPPEVASKRVPFEHLTPIYPDQRITLETTPRELSTRLIDLIAPIGKGQRGMIVSPPKAGKTILLKKIANAITANYPEIELIVLLIDERPEEVTDMQRNIKGDVLYSTFDEVPEHHIKVAEMVLERAQRLVEQKKDVVILLDSITRLARAYNLTIPPTGRTLSGGLDPGALHKPKKFFGAARNIENGGSLTIMATALIETGSRMDDVIFEEFKGTGNMELHLDRRLSEKRIFPAIDINRSGTRREELLLSQKELESIWAIRKAMSNMGTAEVTEMLINRLMQTKTNEEFINGINLAFLEKEK >CP021850.1|AUS98331.1|4325429_4325639_-|50S-ribosomal-protein-L31 MKEGIHPQYGEAVVKCACGETFVTGSTKKNLHVEICSKCHPFFTGKQKFVDTSGRVEKFKKKFGIEDKE >CP021850.1|AUS98330.1|4324199_4325111_-|hypothetical-protein MKKTSIGGQALIEGILMLGPENAAIAVRKPDGEIVIDKKPLPKKNWLSKVPVVRGVVNFVKQIVFGMKALMYSAEFYDVEEEQVKPSKFEKFIEKLLGNKFKDAAIYAAVVVAIAFSVGLFVLLPNFLATLIGFKNPVAYNLFEGVVRIVIFFLYLKLASMMKDIQRVWEYHGAEHKTIHCYEHGEELTVENVSKYSTKHPRCGTSFMFLVMIVSILVFSVVPLGNIWFNVLTRLALVPLVAGLSYEVLKFAGRSEWKIMKIINAPGMLFQIFTTREPDAKQIEVAIAAFNNVLVPDKDADNW >CP021850.1|AUS98340.1|4337354_4338860_+|IS21-family-transposase MLTMADIKYIKDLSDKKGLSLREISRITGFNFRTVQKYVDKDDWSKPLTRKKNSKSVLDSFAKTIDEWLEADLKAPRKQRHTAKRIYNRLSKLYKDEFTVSYRTVARYVAEKKRKLYGSNESYIPLYHPAGEAQLDFGMAEFVENGIRYEGCYVAMSFPYSNGGYIQAYKGTNIECLLQGMQNIFNHMGRVPTCIWFDNDKAVVKKILTNGEREVTDAFNRFRLHYGFESNFCNPDSGHEKGHVENKVGYSRRNMLVPVPEFKDLQEFNKNLLIECDEDMHRKHYLKDILIKTLFEQDKKAMKPLPKAEYEIYRLEKVKSDKYGKVNFENRKYSASPEHAQRELFVKANAFNVWILDDQYQVVQWHNRLYGKQKESMKWEPYLVLMSNRPNAIKYTGFFQQLPQTLQEYLSGCDYEQKKATLRMLKKMVANSELETAVDAFNYCVQKGIQDLDSIWARYYSMVFANAPIPDIVVKDEIPCLSYEVNNSIYDDLLERGLPHA >CP021850.1|AUS98341.1|4338852_4339578_+|ATP-binding-protein MHELIAAYCNTLKLGSRIAKNYSQIEAETHEEFLAKLLAMEIEARELNRKNALLKQAQFDVLKTFGDFRFEKMSIPNTIDVEAIKTASFVDKKENLILYGSVGLGKTHLATAMGVEACNRGKRVRFFRTSSLVNQLLDAKAEGSLKRFMKQLNKADLIICDEWGFIPFEKEGAQLLFQVISDCYERKSLIITTNLEFSKWNSIFYDEKLTSAIIDRIIHHSHLIVFEGSSNRLENSLMKVR >CP021850.1|AUS98342.1|4340740_4341427_-|hypothetical-protein MWLEITYRPVSLFSLRRSDATNPAAKSLLCPSPYSIKMALLNSIITFGSVEEAIERFNTIKSFNIQFKLPKYICANNCFIKIQKEPHSDKKKKNPDIAFDSTVGFREFIYYNGDIAIAVAVDEKLVDYYVDKFKRINYFGKRGCFFQFIKAERIEELDEQYSGYFDETSLIARNDRMIIRMDDFHNKAKFDNVNTYSTQKAMRLEKLYYLNYKMVKANKNYTLYERSC >CP021850.1|AUS98894.1|4341429_4342425_-|CRISPR-associated-protein MKISSISISGKITLDMHSLNNEGGEGNQILTRQVTIVDDKGKIHTVNAISGDMLKHVQTEHLYNIAVEKGLPLCNACTTFNSNRISGDRVFSEESKGKDQQTVMDLLLEKCVIDDMQGILVTNNNSNLPRKSCSEYGWLIGLPDKTTTENYFHVKLVPNAGSKSEGEDESSNQGQNIFHRPANSGEYALVCNLDIYRIGYNEITRTYSIDDNDRLERYKALLESTLYTFLKTKGAMRNTQNPHVVNFEGVLAISKNATPAPLISAINPDYKEEIERIADALNSLDIKEEPENNEKNIVLRRFNSLSEFADAMKDLINEGEPYKVKESRQEG >CP021850.1|AUS98343.1|4342438_4344265_-|hypothetical-protein MYQDKYYVLKDSGTYSNMLEAYGLALLLSRLLRQERSVDIIDRGVYYEISLKRPITEEMVGNCRYIDLFRYIKTKGDDADIPDSIDYEFEANRAKLFNEERKEQSLKLKEARSKLDKKAYKAYSLKLKQQLDNSENKPRDDWDILQALNPSKLKALDTYKTVFQNVYNNKSNYKEIVKHVLMLYASPFQNQDEVEKSLKKLIRSGELRDIVEVNAVQAVNPDKVKGAASTKANSISPGPIKAFWLREYVKLAGMFSGMIVKDIKIGPKKWDAKIYVLDLKNMNYSMHTSVYKNLKPIVTGMTAVRLDITMLLLLCKTLIEHSENYIDEELSKRKHADSYVSGLYTVYLKNMGKAYSPTNISYLETPDFIAFNNKEEAGKWINIIDDHLDVIKNIRISASKSDETNSILKMLQNYRQFISGSNIEYFFDFIVEYSEFLMSKISKEEYYVRPFSLSCMEVFLKEMNYGEILKNQGFCNIAKAIRNSTISAQYAKDKDDGIKYEIRYGMALDLKRKAPYKDQFIQYLSDFIASYNAEAARVAEKHPELKGTHKLRATIKTQDLEDIIELIDKYDDCTTIAKLLCAYGYSLERKELDDQMSKVSEEDDVDDE >CP021850.1|AUS98344.1|4344277_4346614_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MLDERKIRDYFYNITEFEPYNFQVDMCRKVLNGEDVVMQAPTGCGKTWASVVPFIIAKKENIPFPAKLIYSLPLRVLANSLYKDVKEKLIKYDPSIKVTIQTGETPEDPYFEGDIIFTTVDQSLSSALLIPFALPNRQCNINAGAFVSSYHVFDEFHLLDWERSLSTTINLLRMFKNTARFCLMTATLSNEMVDRICTFLNAGRVSVSPDEYAKLQCNVNKYRIVHTYNRELKADDVISKHKKRTIVLCNTVERAQSLFLELKEKIKGNERFSNTSLICLHSRFYQKDRMQKEDDIKRLFSKESDSDAILISTQVVEVGIDITCDTMHTEISEINSFLQRIGRAARYGGEEADIYVYDIDKEKGTYLPYNKDISQKTLNELNEVQGKNMDFYLGQEIINKVLTQRELEIYETIRSGDRDLRIKDCWIKPERKWATDLIRKIENFNVVISSNPYEIRNPYFVDSVSINKHSLISKLKKIDKEDEEDWIIKKIEEDSFGLDDENDFSYTTVGVDEDILFSYDRIIVNPKYVFYDEDIGLNFEKTGETQLVELEKVCDDKVYSMRLESYREHVQKMIQVYQKLLRPQVINTLNSIWERNKVDVSIDEIINFMIILHDYGKLNLAWQKKAHEWQAKKAPAPKDMILAHTDWDEGDEKTRLPNHAGIGALVCYAIAPETICDEIVIAMVSSIARHHSPMNDSCESYFVPESSVEEIFELIKTYCPSLYNDIDKRNKYLFKNTYNQSLESYMVTFSDVNESMDTILYFIFSRILRLCDQKACEQ >CP021850.1|AUS98345.1|4346603_4347362_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRIKLTLDSIGKQTIDLNYNYALSSMIYNLIRESDSKYSTFLHEKGYEINNKHYKLFTFSQLKPEKYEINGSCMSIQGKVVLYITSPMKEFILSLVKTVTGYPEIRIDKVMFRVINIEVMAEPKFSRCMKFMCLSPITISTAFLKENARLKRQDLYIEDKRFTENLRANIISKYEILHGKKPEDTEFEVKFTDVDKYKKGKLIDYKGIKIKGYLAPFEVCGNPELIATAYECGVGDRNSLGMGMIEVVRDVG >CP021850.1|AUS98346.1|4349380_4349644_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYALIVYDVKEKRVAKVLKFLRSYLNWIQNSVFEGEVTEAQMLKIKNHLREIIDEDEDSVIIFTSREKRWLSKSIMGREKNSTDNFI >CP021850.1|AUS98347.1|4349647_4350637_-|subtype-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKRNYYILKSGRLKRKDNTIYFENDEGKKVIPVNDIENIYVYGEVDFNSKAVNFLSQNNIPMHLFNYYGYYAGTFYPREQLNSGYMIVKQVENYLKYDQRVYIAREMIYSASYNIVKNLKHYVSKKPVLQEHIEKIEAIRDQFVTAFDIGTIMGLEGSIRNIYYDAFPVITDNRFEFEERVKRPPDNPMNSLMSFGNSLMYTAVLGEIYNTQLNPTISYLHEPGERRFSLSLDISEIFKPIIVDRIIFKLINNNMITEDHFLKELNYCYLNDKGKQIFLKEFDEKMNSVIEHRNLEKNVSYRTLIRLELYKLIKHLTGDQSYEGFKMWW >CP021850.1|AUS98348.1|4350648_4351158_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDLFGNSVKITGVEINYLYVCPRKLWFFTHGISMEQNSVRVEIGKETHDNSLNRKRTEILIDNTIRLDYVDKELAVHEIKLTKAMDMASKYQLLYYLYYLNKKGIDCKKGVIHYPKTRKTEIIEITQSDKEELEKAIEEIVRIKKLERPPKMIKERKCKSCSYLELCFC |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021850_7 | 4339806-4340297 | Unclear |
I-A,II-B,III-A
Consensus repeat of CP021850_7
|
7 spacers
spacers of CP021850_7
>7.1|4339836|37|CP021850|CRISPRCasFinder,CRT GATGGAGAAAGGATACCCATTGAGTTATCAAAAGTTA >7.2|4339903|35|CP021850|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTGAACACACGAGAGAGGAACGCACGACGACAAG >7.3|4339968|35|CP021850|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATATCCAACAATTGCTTTTCTTCTTGATATACAG >7.4|4340033|35|CP021850|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATTCCGGCACACAGTCCAAGCATAAGATTAACAA >7.5|4340098|37|CP021850|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGTTGGGCAGGGTAATTACTGATGATGTGGCTTCTTG >7.6|4340165|36|CP021850|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATAGTAACCCTGTGTTAACTTTCAGGGTGGTTAGG >7.7|4340231|37|CP021850|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATCGGATATAAGAAATAATAGAAAAGAAAAATCAAA |
cas5,cas7,cas8a4,cas3,cas6,cas2,cas1,cas4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP021850_7
The CRISPR arrays of CP021850_7 >merge|CP021850|7|4339806-4340297|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACGCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAACGATGGAGAAAGGATACCCATTGAGTTATCAAAAGTTACTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAACCTTGAACACACGAGAGAGGAACGCACGACGACAAGCTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAACTATATCCAACAATTGCTTTTCTTCTTGATATACAGCTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAACGATTCCGGCACACAGTCCAAGCATAAGATTAACAACTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAACGGTTGGGCAGGGTAATTACTGATGATGTGGCTTCTTGCTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAACAATAGTAACCCTGTGTTAACTTTCAGGGTGGTTAGGCTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAACTATCGGATATAAGAAATAATAGAAAAGAAAAATCAAACTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC >CP021850|7|7|4339806-4340297|CRISPRCasFinder AACGCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC GATGGAGAAAGGATACCCATTGAGTTATCAAAAGTTA CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC CTTGAACACACGAGAGAGGAACGCACGACGACAAG CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC TATATCCAACAATTGCTTTTCTTCTTGATATACAG CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC GATTCCGGCACACAGTCCAAGCATAAGATTAACAA CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC GGTTGGGCAGGGTAATTACTGATGATGTGGCTTCTTG CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC AATAGTAACCCTGTGTTAACTTTCAGGGTGGTTAGG CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC TATCGGATATAAGAAATAATAGAAAAGAAAAATCAAA CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC >CP021850|7|3|4339806-4340297|CRT AACGCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC GATGGAGAAAGGATACCCATTGAGTTATCAAAAGTTA CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC CTTGAACACACGAGAGAGGAACGCACGACGACAAG CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC TATATCCAACAATTGCTTTTCTTCTTGATATACAG CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC GATTCCGGCACACAGTCCAAGCATAAGATTAACAA CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC GGTTGGGCAGGGTAATTACTGATGATGTGGCTTCTTG CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC AATAGTAACCCTGTGTTAACTTTCAGGGTGGTTAGG CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC TATCGGATATAAGAAATAATAGAAAAGAAAAATCAAA CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC >CP021850|7|4|4339873-4340297|PILER-CR CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC CTTGAACACACGAGAGAGGAACGCACGACGACAAG CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC TATATCCAACAATTGCTTTTCTTCTTGATATACAG CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC GATTCCGGCACACAGTCCAAGCATAAGATTAACAA CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC GGTTGGGCAGGGTAATTACTGATGATGTGGCTTCTTG CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC AATAGTAACCCTGTGTTAACTTTCAGGGTGGTTAGG CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC TATCGGATATAAGAAATAATAGAAAAGAAAAATCAAA CTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC
>CP021850.1|AUS98341.1|4338852_4339578_+|ATP-binding-protein MHELIAAYCNTLKLGSRIAKNYSQIEAETHEEFLAKLLAMEIEARELNRKNALLKQAQFDVLKTFGDFRFEKMSIPNTIDVEAIKTASFVDKKENLILYGSVGLGKTHLATAMGVEACNRGKRVRFFRTSSLVNQLLDAKAEGSLKRFMKQLNKADLIICDEWGFIPFEKEGAQLLFQVISDCYERKSLIITTNLEFSKWNSIFYDEKLTSAIIDRIIHHSHLIVFEGSSNRLENSLMKVR >CP021850.1|AUS98340.1|4337354_4338860_+|IS21-family-transposase MLTMADIKYIKDLSDKKGLSLREISRITGFNFRTVQKYVDKDDWSKPLTRKKNSKSVLDSFAKTIDEWLEADLKAPRKQRHTAKRIYNRLSKLYKDEFTVSYRTVARYVAEKKRKLYGSNESYIPLYHPAGEAQLDFGMAEFVENGIRYEGCYVAMSFPYSNGGYIQAYKGTNIECLLQGMQNIFNHMGRVPTCIWFDNDKAVVKKILTNGEREVTDAFNRFRLHYGFESNFCNPDSGHEKGHVENKVGYSRRNMLVPVPEFKDLQEFNKNLLIECDEDMHRKHYLKDILIKTLFEQDKKAMKPLPKAEYEIYRLEKVKSDKYGKVNFENRKYSASPEHAQRELFVKANAFNVWILDDQYQVVQWHNRLYGKQKESMKWEPYLVLMSNRPNAIKYTGFFQQLPQTLQEYLSGCDYEQKKATLRMLKKMVANSELETAVDAFNYCVQKGIQDLDSIWARYYSMVFANAPIPDIVVKDEIPCLSYEVNNSIYDDLLERGLPHA >CP021850.1|AUS98339.1|4336571_4336865_+|hypothetical-protein MLYYNVVRVKPSELIDVSTDTMMFQFQYGTIKAHCIDADIYKNDEFQFQHGTIKAVKLCVLPESVYAFQFQHGTIKALPFISHPQKYLHVSIPTWYD >CP021850.1|AUS98893.1|4335592_4336360_-|spermidine/putrescine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MEYIVEINGLGMKYQSLNGEINAIENIDLSVKKGEFISIVGPSGCGKSTLLSIICGLLTPTSGHVLINGKSLRGPSSDVGYMPQKDHLFDWRTILQNVLLGLEIRKIMTDENKQYALNLLKTYGLYEFKDKYPYQLSGGMRQRAALIRTLATKPEILLLDEAFSALDYQTRLAVTDDIYKIIKKENKTAILVTHDISESISMADRVIVLTSRPARVKNIHEIKFDCENRSPLSCREAPEFRYYFNAIWKELDIHV >CP021850.1|AUS98338.1|4334781_4335600_-|sulfonate-ABC-transporter-permease MSDSIRNEISKERKEYLRKLKLRKTAILTTQIALLVLFFISWEIAANLKLIDPFITSQPSRMVKTFQNLYKGGELFQHVGITCLETIVGFLLGTITGTVIAIILWWSEFLSRVLEPYLVVLNSLPKVALGPIIIVWMGAGPGSIIVMALAISLIVTIMEVLNGFLTVDQDKIKLVQTFGANRLQILTKVVIPANFGTIINSLKINVGLSWVGVIMGEFLVSKAGLGYLIIYGGQVFQLDLVMTSVIILAIAATLMYQGVAYLEKLLVKNNGH >CP021850.1|AUS98337.1|4333620_4334619_-|hypothetical-protein MKKIIALLLVIAVGFSFVLAGCKEEGPKKVRLSEVTRSVFYAPQYVALSKGFFKEEGLEIELSTGQGADKVMTAVLSNQVDIGFSGPEAAIYVYNEGKEDYPIVFAQLTNRDGSFLVGKDPDPDFDWSHVKGKTIIGGRKGGVPNMTLEYVLKKHGIMPGTDVNVDTSIQFSVMAGAFTGTDAEYVALFEPTASLVEKEGKGYVLTSIGKDSGEISYTAYYAKKSYIDKNKDTIQKFTNAIYKGQLWVKEHTPEEVAEAIQSFFPDTDLDLLKMVTKRYKEIEAWNTDPILKKASFDLLQEVMQTAGELDETVPYEKLSDTSFAEKAIKDIK >CP021850.1|AUS98336.1|4332631_4333462_+|hypothetical-protein MKYLKMSAFILLYMAVYFIISNYIGFVFGIFYMIKEIIVNPDVFLYGSPDAFMDTFVKNSVWFMAIAALVSFPIYAFILWLRKQNIFRVCGFSGISVKDMAITALMGISLNFVIEYLVAISSLNDLSPSVQQMFSQIFDGNSFVVILIAIGIVGPFIEEVIFRGLILNELRRNIPLTAAVIIQAVLFGAYHMNLTQGIYATLLGIILAQACIKMKSIWAPILIHMLFNSTSVVLAKLIDPYILMTYQYFILAGSVILLVFTSILAWRGKKSIVNIY >CP021850.1|AUS98335.1|4331560_4332592_+|peptidase-M42 MNGYIDYAVQQVINLCNIPSPTGFTKRVQNYLVEEFVNLGYKPVLTNKGSVLVDLGGNGDVLVLAAHVDTLGAMVRAIKDNGRIRISKIGGYPGNYIETENCIVHTRTGKEYSGTIQLVNPAVHVNKDVSDTKRDDSNMEVVLDEKVKSKEDVLKLEINTGDFISFDPRTVYTASGFIKSRHLDDKASAGVLIALAKYIKDTAPQLHRKVYLLFTTYEEVGHGGCSGLPDNVKEMISVDMGAVGDDLQADEFKVSICAKDSQGPYDYDITTRLIELAKKNNLNYAVDIYPYYGSDVDAALSAGYDLKHGLIGPGVSASHGYERTHREGIGNTLSLLKEYVESP >CP021850.1|AUS98334.1|4329123_4331310_-|hypothetical-protein MKRYVAMFLTLAMLFVSLMPMQAFAESDKGLEAAIKGVKSKIDIPEDFIFSKNYDVYTQQDGKKIWYLRWESKDDLGGSIMVSADEKGTIYSYEHYKPYNYSDRKKLPKISKDDALKAAKAFVKKVNPEAAANVKLEDENQLLYMSSDYYFTFYRTEKGFPLYENNIGITVDRDSGEVRYYYYNWNDGLVFPDSSKAIAPEAAQKAFKEKMGLKLVYKYSYDYENEKINIFPAYVPVYDSMYAIDALTGEMIQTGYYYVFAGGMGATADMALKSVAEVEQVVLSPEELEAAEEASKLISKDDAEKVARGLSVLGLTDEYKLTNAWLSRAWPNRKDFLWSLSFAKEDKDGRDYRYVNVSINAETKEIMNFYTSMPYDAKAQAKYDEDDAKAAAEKFLKEFKPDLFEQTKYEGSNGRGIVIPLAEDGKEEKPLQYSLVYTRMVNGIPFPDNSLRVGYDAVNGRIYSFDMTWFDEKFPAVKDNVTPDKAYETLFKNLGLELQYKFVYNNNNSLYEKVIYAPDYNNVEVKLVYALNTRKPWIFDPETGAILNHDGKPYEEVKVAEYSDIDGHYAEDEIKILAAYGISLDGNEFRPNDSITQKDFLTLLSKTLQDYYVPVSERGGDKETDALYSYMMRQGIVREGEKAPNAVLTREDSVKFIIRALKYDKVADIKGIYKSIFKDEDEINPDLIGYISIAQGLNIISGYDGYFNPKGELTRAQAAIIIYKYLQV >CP021850.1|AUS98333.1|4328056_4328680_-|hypothetical-protein MLIDTNITIAYKCYFCGTYEFFNISVFELPDKRELKLKCRCGKCSAVILKDSPKKYALRVGCIACGREHTYNVSRREMVSKSIEVFNCPITGIQQCFVGNDHEVRKKVDGVEEELDELVDMLGYESYFKNTQVAFDSLNKIHDIAEKGNLYCTCGNRDIELFLFTEKILLKCSICGRSIEIGTGSNEDLKKLLSSNQILLGCEESKA >CP021850.1|AUS98342.1|4340740_4341427_-|hypothetical-protein MWLEITYRPVSLFSLRRSDATNPAAKSLLCPSPYSIKMALLNSIITFGSVEEAIERFNTIKSFNIQFKLPKYICANNCFIKIQKEPHSDKKKKNPDIAFDSTVGFREFIYYNGDIAIAVAVDEKLVDYYVDKFKRINYFGKRGCFFQFIKAERIEELDEQYSGYFDETSLIARNDRMIIRMDDFHNKAKFDNVNTYSTQKAMRLEKLYYLNYKMVKANKNYTLYERSC >CP021850.1|AUS98894.1|4341429_4342425_-|CRISPR-associated-protein MKISSISISGKITLDMHSLNNEGGEGNQILTRQVTIVDDKGKIHTVNAISGDMLKHVQTEHLYNIAVEKGLPLCNACTTFNSNRISGDRVFSEESKGKDQQTVMDLLLEKCVIDDMQGILVTNNNSNLPRKSCSEYGWLIGLPDKTTTENYFHVKLVPNAGSKSEGEDESSNQGQNIFHRPANSGEYALVCNLDIYRIGYNEITRTYSIDDNDRLERYKALLESTLYTFLKTKGAMRNTQNPHVVNFEGVLAISKNATPAPLISAINPDYKEEIERIADALNSLDIKEEPENNEKNIVLRRFNSLSEFADAMKDLINEGEPYKVKESRQEG >CP021850.1|AUS98343.1|4342438_4344265_-|hypothetical-protein MYQDKYYVLKDSGTYSNMLEAYGLALLLSRLLRQERSVDIIDRGVYYEISLKRPITEEMVGNCRYIDLFRYIKTKGDDADIPDSIDYEFEANRAKLFNEERKEQSLKLKEARSKLDKKAYKAYSLKLKQQLDNSENKPRDDWDILQALNPSKLKALDTYKTVFQNVYNNKSNYKEIVKHVLMLYASPFQNQDEVEKSLKKLIRSGELRDIVEVNAVQAVNPDKVKGAASTKANSISPGPIKAFWLREYVKLAGMFSGMIVKDIKIGPKKWDAKIYVLDLKNMNYSMHTSVYKNLKPIVTGMTAVRLDITMLLLLCKTLIEHSENYIDEELSKRKHADSYVSGLYTVYLKNMGKAYSPTNISYLETPDFIAFNNKEEAGKWINIIDDHLDVIKNIRISASKSDETNSILKMLQNYRQFISGSNIEYFFDFIVEYSEFLMSKISKEEYYVRPFSLSCMEVFLKEMNYGEILKNQGFCNIAKAIRNSTISAQYAKDKDDGIKYEIRYGMALDLKRKAPYKDQFIQYLSDFIASYNAEAARVAEKHPELKGTHKLRATIKTQDLEDIIELIDKYDDCTTIAKLLCAYGYSLERKELDDQMSKVSEEDDVDDE >CP021850.1|AUS98344.1|4344277_4346614_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MLDERKIRDYFYNITEFEPYNFQVDMCRKVLNGEDVVMQAPTGCGKTWASVVPFIIAKKENIPFPAKLIYSLPLRVLANSLYKDVKEKLIKYDPSIKVTIQTGETPEDPYFEGDIIFTTVDQSLSSALLIPFALPNRQCNINAGAFVSSYHVFDEFHLLDWERSLSTTINLLRMFKNTARFCLMTATLSNEMVDRICTFLNAGRVSVSPDEYAKLQCNVNKYRIVHTYNRELKADDVISKHKKRTIVLCNTVERAQSLFLELKEKIKGNERFSNTSLICLHSRFYQKDRMQKEDDIKRLFSKESDSDAILISTQVVEVGIDITCDTMHTEISEINSFLQRIGRAARYGGEEADIYVYDIDKEKGTYLPYNKDISQKTLNELNEVQGKNMDFYLGQEIINKVLTQRELEIYETIRSGDRDLRIKDCWIKPERKWATDLIRKIENFNVVISSNPYEIRNPYFVDSVSINKHSLISKLKKIDKEDEEDWIIKKIEEDSFGLDDENDFSYTTVGVDEDILFSYDRIIVNPKYVFYDEDIGLNFEKTGETQLVELEKVCDDKVYSMRLESYREHVQKMIQVYQKLLRPQVINTLNSIWERNKVDVSIDEIINFMIILHDYGKLNLAWQKKAHEWQAKKAPAPKDMILAHTDWDEGDEKTRLPNHAGIGALVCYAIAPETICDEIVIAMVSSIARHHSPMNDSCESYFVPESSVEEIFELIKTYCPSLYNDIDKRNKYLFKNTYNQSLESYMVTFSDVNESMDTILYFIFSRILRLCDQKACEQ >CP021850.1|AUS98345.1|4346603_4347362_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRIKLTLDSIGKQTIDLNYNYALSSMIYNLIRESDSKYSTFLHEKGYEINNKHYKLFTFSQLKPEKYEINGSCMSIQGKVVLYITSPMKEFILSLVKTVTGYPEIRIDKVMFRVINIEVMAEPKFSRCMKFMCLSPITISTAFLKENARLKRQDLYIEDKRFTENLRANIISKYEILHGKKPEDTEFEVKFTDVDKYKKGKLIDYKGIKIKGYLAPFEVCGNPELIATAYECGVGDRNSLGMGMIEVVRDVG >CP021850.1|AUS98346.1|4349380_4349644_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYALIVYDVKEKRVAKVLKFLRSYLNWIQNSVFEGEVTEAQMLKIKNHLREIIDEDEDSVIIFTSREKRWLSKSIMGREKNSTDNFI >CP021850.1|AUS98347.1|4349647_4350637_-|subtype-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKRNYYILKSGRLKRKDNTIYFENDEGKKVIPVNDIENIYVYGEVDFNSKAVNFLSQNNIPMHLFNYYGYYAGTFYPREQLNSGYMIVKQVENYLKYDQRVYIAREMIYSASYNIVKNLKHYVSKKPVLQEHIEKIEAIRDQFVTAFDIGTIMGLEGSIRNIYYDAFPVITDNRFEFEERVKRPPDNPMNSLMSFGNSLMYTAVLGEIYNTQLNPTISYLHEPGERRFSLSLDISEIFKPIIVDRIIFKLINNNMITEDHFLKELNYCYLNDKGKQIFLKEFDEKMNSVIEHRNLEKNVSYRTLIRLELYKLIKHLTGDQSYEGFKMWW >CP021850.1|AUS98348.1|4350648_4351158_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDLFGNSVKITGVEINYLYVCPRKLWFFTHGISMEQNSVRVEIGKETHDNSLNRKRTEILIDNTIRLDYVDKELAVHEIKLTKAMDMASKYQLLYYLYYLNKKGIDCKKGVIHYPKTRKTEIIEITQSDKEELEKAIEEIVRIKKLERPPKMIKERKCKSCSYLELCFC >CP021850.1|AUS98349.1|4351844_4352645_-|methyltetrahydrofolate--corrinoid-methyltransferase MIIIGEKLNSTLKSIRPAMESYDAAAIQELAKKQYEAGAMYIDVNAGMFHEEEPERLEWLINTVQEVLDAPFSIDSPNPVAIERALKANKNSKPIINSITDEKERFNSIMPLAIEYKTGIIALCMDDNGMPETTKDRVVIAERLIEKLTKEGMDLSDIYIDPMVRPVGTGSHYGTVAIETIRQVKKEFPGVHIACGLSNISFGIPARKLMNQAFLIAAMAAGMDGAILDPLDKKLMSFVYAGEALLGIDEFCMNYLTKFREGALEV >CP021850.1|AUS98350.1|4352699_4353563_-|bifunctional-5,10-methylene-tetrahydrofolate-dehydrogenase/5,10-methylene-tetrahydrofolate-cyclohydrolase MAEILKGKDVIASMKERMLKQVEELQSHGVTPCLAIVRLGAKADDLAYEKGAVKRCEGLGIKCVVMEYDESISQKELEDEIRKLNEDTGIHGILVFRPLPKHIDENAIKYVISPDKDVDCFSPVNVAKVFEGDDNGFAPCTPEAVMEMLEHYGVDVSGKRVVVIGRSLVVGKPLSMLLLRKNATVTICHTKTRDLGGTARTADILIAAAGKARMITKEFVSPGQIVIDVGINMDKDGNLCGDVDYDNVEKTVAMITPVPGGVGTVTTSILAKHVLAAAWRLSGVMGS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021850_9 | 4351331-4351493 | Unclear |
I-A,II-B,III-A
Consensus repeat of CP021850_9
|
2 spacers
spacers of CP021850_9
>9.1|4351369|30|CP021850|PILER-CR GTAAAACCTGCCCTATTAAAAGATACCTCC >9.2|4351437|29|CP021850|PILER-CR GTAACAACGTATCAACAAGGGCAACCAAA >9.3|4351359|37|CP021850|CRISPRCasFinder GTAAAACCTGCCCTATTAAAAGATACCTCCATTAGTT >9.4|4351424|39|CP021850|CRISPRCasFinder CCGGTAACAACGTATCAACAAGGGCAACCAAAATAAGTT |
cas4,cas1,cas2,cas6,cas3,cas8a4,cas7,cas5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP021850_9
The CRISPR arrays of CP021850_9 >merge|CP021850|9|4351331-4351493|PILER-CR,CRISPRCasFinder TCAATTCCAATATGGTACGATTAAAACTGTAAAACCTGCCCTATTAAAAGATACCTCCATTAGTTTCAATTCCAATATGGTACGATTAAAACTCCGGTAACAACGTATCAACAAGGGCAACCAAAATAAGTTTCAATTCCAATATGGTACGATTAAAACACCG >CP021850|9|6|4351331-4351493|PILER-CR TCAATTCCAATATGGTACGATTAAAACTGTAAAACCTG CCCTATTAAAAGATACCTCCATTAGTTTCA ATTCCAATATGGTACGATTAAAACTCCGGTAACAACGT ATCAACAAGGGCAACCAAAATAAGTTTCA ATTCCAATATGGTACGATTAAAACACCG >CP021850|9|9|4351331-4351490|CRISPRCasFinder TCAATTCCAATATGGTACGATTAAAACT GTAAAACCTGCCCTATTAAAAGATACCTCCATTAGTT TCAATTCCAATATGGTACGATTAAAACT CCGGTAACAACGTATCAACAAGGGCAACCAAAATAAGTT TCAATTCCAATATGGTACGATTAAAACA
>CP021850.1|AUS98348.1|4350648_4351158_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDLFGNSVKITGVEINYLYVCPRKLWFFTHGISMEQNSVRVEIGKETHDNSLNRKRTEILIDNTIRLDYVDKELAVHEIKLTKAMDMASKYQLLYYLYYLNKKGIDCKKGVIHYPKTRKTEIIEITQSDKEELEKAIEEIVRIKKLERPPKMIKERKCKSCSYLELCFC >CP021850.1|AUS98347.1|4349647_4350637_-|subtype-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKRNYYILKSGRLKRKDNTIYFENDEGKKVIPVNDIENIYVYGEVDFNSKAVNFLSQNNIPMHLFNYYGYYAGTFYPREQLNSGYMIVKQVENYLKYDQRVYIAREMIYSASYNIVKNLKHYVSKKPVLQEHIEKIEAIRDQFVTAFDIGTIMGLEGSIRNIYYDAFPVITDNRFEFEERVKRPPDNPMNSLMSFGNSLMYTAVLGEIYNTQLNPTISYLHEPGERRFSLSLDISEIFKPIIVDRIIFKLINNNMITEDHFLKELNYCYLNDKGKQIFLKEFDEKMNSVIEHRNLEKNVSYRTLIRLELYKLIKHLTGDQSYEGFKMWW >CP021850.1|AUS98346.1|4349380_4349644_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYALIVYDVKEKRVAKVLKFLRSYLNWIQNSVFEGEVTEAQMLKIKNHLREIIDEDEDSVIIFTSREKRWLSKSIMGREKNSTDNFI >CP021850.1|AUS98345.1|4346603_4347362_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRIKLTLDSIGKQTIDLNYNYALSSMIYNLIRESDSKYSTFLHEKGYEINNKHYKLFTFSQLKPEKYEINGSCMSIQGKVVLYITSPMKEFILSLVKTVTGYPEIRIDKVMFRVINIEVMAEPKFSRCMKFMCLSPITISTAFLKENARLKRQDLYIEDKRFTENLRANIISKYEILHGKKPEDTEFEVKFTDVDKYKKGKLIDYKGIKIKGYLAPFEVCGNPELIATAYECGVGDRNSLGMGMIEVVRDVG >CP021850.1|AUS98344.1|4344277_4346614_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MLDERKIRDYFYNITEFEPYNFQVDMCRKVLNGEDVVMQAPTGCGKTWASVVPFIIAKKENIPFPAKLIYSLPLRVLANSLYKDVKEKLIKYDPSIKVTIQTGETPEDPYFEGDIIFTTVDQSLSSALLIPFALPNRQCNINAGAFVSSYHVFDEFHLLDWERSLSTTINLLRMFKNTARFCLMTATLSNEMVDRICTFLNAGRVSVSPDEYAKLQCNVNKYRIVHTYNRELKADDVISKHKKRTIVLCNTVERAQSLFLELKEKIKGNERFSNTSLICLHSRFYQKDRMQKEDDIKRLFSKESDSDAILISTQVVEVGIDITCDTMHTEISEINSFLQRIGRAARYGGEEADIYVYDIDKEKGTYLPYNKDISQKTLNELNEVQGKNMDFYLGQEIINKVLTQRELEIYETIRSGDRDLRIKDCWIKPERKWATDLIRKIENFNVVISSNPYEIRNPYFVDSVSINKHSLISKLKKIDKEDEEDWIIKKIEEDSFGLDDENDFSYTTVGVDEDILFSYDRIIVNPKYVFYDEDIGLNFEKTGETQLVELEKVCDDKVYSMRLESYREHVQKMIQVYQKLLRPQVINTLNSIWERNKVDVSIDEIINFMIILHDYGKLNLAWQKKAHEWQAKKAPAPKDMILAHTDWDEGDEKTRLPNHAGIGALVCYAIAPETICDEIVIAMVSSIARHHSPMNDSCESYFVPESSVEEIFELIKTYCPSLYNDIDKRNKYLFKNTYNQSLESYMVTFSDVNESMDTILYFIFSRILRLCDQKACEQ >CP021850.1|AUS98343.1|4342438_4344265_-|hypothetical-protein MYQDKYYVLKDSGTYSNMLEAYGLALLLSRLLRQERSVDIIDRGVYYEISLKRPITEEMVGNCRYIDLFRYIKTKGDDADIPDSIDYEFEANRAKLFNEERKEQSLKLKEARSKLDKKAYKAYSLKLKQQLDNSENKPRDDWDILQALNPSKLKALDTYKTVFQNVYNNKSNYKEIVKHVLMLYASPFQNQDEVEKSLKKLIRSGELRDIVEVNAVQAVNPDKVKGAASTKANSISPGPIKAFWLREYVKLAGMFSGMIVKDIKIGPKKWDAKIYVLDLKNMNYSMHTSVYKNLKPIVTGMTAVRLDITMLLLLCKTLIEHSENYIDEELSKRKHADSYVSGLYTVYLKNMGKAYSPTNISYLETPDFIAFNNKEEAGKWINIIDDHLDVIKNIRISASKSDETNSILKMLQNYRQFISGSNIEYFFDFIVEYSEFLMSKISKEEYYVRPFSLSCMEVFLKEMNYGEILKNQGFCNIAKAIRNSTISAQYAKDKDDGIKYEIRYGMALDLKRKAPYKDQFIQYLSDFIASYNAEAARVAEKHPELKGTHKLRATIKTQDLEDIIELIDKYDDCTTIAKLLCAYGYSLERKELDDQMSKVSEEDDVDDE >CP021850.1|AUS98894.1|4341429_4342425_-|CRISPR-associated-protein MKISSISISGKITLDMHSLNNEGGEGNQILTRQVTIVDDKGKIHTVNAISGDMLKHVQTEHLYNIAVEKGLPLCNACTTFNSNRISGDRVFSEESKGKDQQTVMDLLLEKCVIDDMQGILVTNNNSNLPRKSCSEYGWLIGLPDKTTTENYFHVKLVPNAGSKSEGEDESSNQGQNIFHRPANSGEYALVCNLDIYRIGYNEITRTYSIDDNDRLERYKALLESTLYTFLKTKGAMRNTQNPHVVNFEGVLAISKNATPAPLISAINPDYKEEIERIADALNSLDIKEEPENNEKNIVLRRFNSLSEFADAMKDLINEGEPYKVKESRQEG >CP021850.1|AUS98342.1|4340740_4341427_-|hypothetical-protein MWLEITYRPVSLFSLRRSDATNPAAKSLLCPSPYSIKMALLNSIITFGSVEEAIERFNTIKSFNIQFKLPKYICANNCFIKIQKEPHSDKKKKNPDIAFDSTVGFREFIYYNGDIAIAVAVDEKLVDYYVDKFKRINYFGKRGCFFQFIKAERIEELDEQYSGYFDETSLIARNDRMIIRMDDFHNKAKFDNVNTYSTQKAMRLEKLYYLNYKMVKANKNYTLYERSC >CP021850.1|AUS98341.1|4338852_4339578_+|ATP-binding-protein MHELIAAYCNTLKLGSRIAKNYSQIEAETHEEFLAKLLAMEIEARELNRKNALLKQAQFDVLKTFGDFRFEKMSIPNTIDVEAIKTASFVDKKENLILYGSVGLGKTHLATAMGVEACNRGKRVRFFRTSSLVNQLLDAKAEGSLKRFMKQLNKADLIICDEWGFIPFEKEGAQLLFQVISDCYERKSLIITTNLEFSKWNSIFYDEKLTSAIIDRIIHHSHLIVFEGSSNRLENSLMKVR >CP021850.1|AUS98340.1|4337354_4338860_+|IS21-family-transposase MLTMADIKYIKDLSDKKGLSLREISRITGFNFRTVQKYVDKDDWSKPLTRKKNSKSVLDSFAKTIDEWLEADLKAPRKQRHTAKRIYNRLSKLYKDEFTVSYRTVARYVAEKKRKLYGSNESYIPLYHPAGEAQLDFGMAEFVENGIRYEGCYVAMSFPYSNGGYIQAYKGTNIECLLQGMQNIFNHMGRVPTCIWFDNDKAVVKKILTNGEREVTDAFNRFRLHYGFESNFCNPDSGHEKGHVENKVGYSRRNMLVPVPEFKDLQEFNKNLLIECDEDMHRKHYLKDILIKTLFEQDKKAMKPLPKAEYEIYRLEKVKSDKYGKVNFENRKYSASPEHAQRELFVKANAFNVWILDDQYQVVQWHNRLYGKQKESMKWEPYLVLMSNRPNAIKYTGFFQQLPQTLQEYLSGCDYEQKKATLRMLKKMVANSELETAVDAFNYCVQKGIQDLDSIWARYYSMVFANAPIPDIVVKDEIPCLSYEVNNSIYDDLLERGLPHA >CP021850.1|AUS98349.1|4351844_4352645_-|methyltetrahydrofolate--corrinoid-methyltransferase MIIIGEKLNSTLKSIRPAMESYDAAAIQELAKKQYEAGAMYIDVNAGMFHEEEPERLEWLINTVQEVLDAPFSIDSPNPVAIERALKANKNSKPIINSITDEKERFNSIMPLAIEYKTGIIALCMDDNGMPETTKDRVVIAERLIEKLTKEGMDLSDIYIDPMVRPVGTGSHYGTVAIETIRQVKKEFPGVHIACGLSNISFGIPARKLMNQAFLIAAMAAGMDGAILDPLDKKLMSFVYAGEALLGIDEFCMNYLTKFREGALEV >CP021850.1|AUS98350.1|4352699_4353563_-|bifunctional-5,10-methylene-tetrahydrofolate-dehydrogenase/5,10-methylene-tetrahydrofolate-cyclohydrolase MAEILKGKDVIASMKERMLKQVEELQSHGVTPCLAIVRLGAKADDLAYEKGAVKRCEGLGIKCVVMEYDESISQKELEDEIRKLNEDTGIHGILVFRPLPKHIDENAIKYVISPDKDVDCFSPVNVAKVFEGDDNGFAPCTPEAVMEMLEHYGVDVSGKRVVVIGRSLVVGKPLSMLLLRKNATVTICHTKTRDLGGTARTADILIAAAGKARMITKEFVSPGQIVIDVGINMDKDGNLCGDVDYDNVEKTVAMITPVPGGVGTVTTSILAKHVLAAAWRLSGVMGS >CP021850.1|AUS98351.1|4353898_4354531_-|sugar-ABC-transporter-substrate-binding-protein MVYIEYSCKEFTDALASGAPVPGGGGASALVGALGTALGSMVGNLTLGKKKYESVQDDIKAILEKAQLLKEQLLSLVDKDAEVFEPLSKAYGLPKNTEEEKRKRDEIMENALRMACSVPVEIMEKAMEAIALHEELATKGSRIAISDVGVGVLLCKSALMGASLNVFINTKLMKDRQYADEINSRVDEMLKSGIKRADAVYMEVESGLRK >CP021850.1|AUS98352.1|4354864_4356544_-|formate--tetrahydrofolate-ligase MGFKGDIEIAQSTEMKPIEEIAASIGIDRENLELYGNYKAKVNYNILEKLSDRKDGKLILVTAITPTPAGEGKTTTTVGLGDALKKIGKKVVIALREPSLGPVFGVKGGAAGGGYAQVVPMEDINLHFTGDMHAIGAANNLLAAMIDNHIYQGNQLGIDPRRITWKRCVDMNDRQLRFIVDGLNGKANGMPREDGFDITVASEVMAILCLSKNIDDLKEKLRSIVIGYTRDDKPVTAGQLKAEGAMAALLKDALKPNLVQTLEHTPAFVHGGPFANIAHGCNSIMATKMALKFGDYVVTEAGFGADLGAEKFLDIKCRIAGLKPSAVVIVATVRALKHHGGAEKSQLSVENLEALEKGIPNLLKHIENITVKFGLPAVVAINRFPTDTEAELKLIEEKCKQYGANVALSEVWAKGGEGGIELAKEVVRLADEGKSNFKFIYGDEMPIKEKIEAVVREVYGGDGVDFLPAAAKEISKLEEMGFGHLPVCMAKTQYSLSDDPKKLGWPKNFRVTVRNVKVSAGAGFVVVLTGDIMTMPGLPKVPAAESIDVDSTGRISGLF >CP021850.1|AUS98353.1|4356768_4357614_-|FdhC-protein MNNFYLSPSEITERYVDTGCMKSNLPPLKLLLLGILAGAFIAFASEGSNMAIHTITSAGLAKTLAGALFSTGLMMVVITGAELFTGNTLIIVSCLEGRARWGGLLKNWFFVYTGNFIGAVIVVVFILLSGQFNFSSGMLGGYTIKTAVYKVSLPFAGAFFMGLLGNWLVCMAVWMASAAKDVTGKLLSIFFPIWLFVTSGFEHSIANMYYIPAGILAKSNQTWLDAAISMGVAAKDLEALNWSSFVLKNLIPVTLGNIVGGSIFVGVTYWLSYLYKAKKKA >CP021850.1|AUS98354.1|4357951_4359478_-|xylulokinase MNYLIGIDIGTSSTKTVLFDENYNVVSSASQEYPLYQPQNGWAEQKPEDWYNAVMDTLKRVIKESGVPGESILGIGLSGQMHGLVMLDENNEVIRPAIIWCDQRTAKECEEITERVGAKRLIEITANPALTGFTASKILWVRNNEPENYARCRHILLPKDYIRFMLTGEFATEVSDASGMQLLDIPNRCWSDEVLEKLEIDKSMLGKVYESPEVTGHITQKVAEETGLSVKTIVVGGAGDNAAAAVGTGIVRDGRAFTTIGTSGVVYAHSSRITIDPKGRVHTFCCAVPGCWHVMGVTQGAGLSLKWFRDNFCQDYIDEAKRQGVDPYYLMDKDAESVPIGSNKLVFLPYLMGERTPHLDPDCRGVFFGLSAIHTKKDMIRAVMEGVSYSLKNCSDILKEMGIAVGEMMACGGGGTSKLWRQMLADLYGCEVKMVSSKEGPALGAAILAGVGAGLFDSVEQACDRVIKVDKVCGPIDENSRKYEKFYEIYNSLYGDLKAEFAKLAKLS >CP021850.1|AUS98355.1|4359653_4360688_-|LacI-family-transcriptional-regulator MAVTIKKIAELCGVSRGTVDRVLNNRGKVKPETEALIRRVAEQLDYKPNIAGKALAARKKSFVIGVIVASEGNPFFDDVLKGIHQAENELHDYGVKIIIKTMKGYDIQRQLKLIEELEGGIHALILNSISDAEIAAKIDELTDKGIPVITLNTDIENSKRLCYVGCDYVKGGETACGMLGLLTGGRAKVGVITGSVKILGHNQRVQGFRNVIKRRYPGIEVVDFAESNDDDIIAFEATKKMLLEHKEIDALFIAAAGAYGVCRAVISLGLENKITIVCFDDVPSTVEMMEKGLIKATICQQPFLQGNKSVHIAYDYLVSGARPHNDQFIVENKIKILENLYQTP >CP021850.1|AUS98356.1|4361020_4362523_+|fucose-isomerase MKRGIRLNNIPEVKLGIIAVSRDCFVIELSERRRAAIVKSYTDMGGSIFEAKTTVENENDMLKAVEEVKKAGCNALVVFLGNFGPETPETLIAKNFDGPVMYVAAAEESGDDLINGRGDAYCGMLNCSYNLGLRKIPAVIPSYPVGTAEDIAKMIDEFVPVARALIGLSKLKVISFGPRPQDFFACNAPIKPLYDIGVEIQENSELDLLVAYRAHKDDPRIPSVVEDMAAELGLGNQYPELLPRMAQYELTLLDWAEQNKGSREYVVFANKCWPAFPKEFGFEPCYVNSRLASKGCPVSCEVDIYGAVSEYIGACVTNDAVTLLDINNSVPKDIYEADIKGKYNYTLKDVFMGFHCGNTPLCKLSKGAIKYQLIQNRLLENGGEPDFTRGTLEGDIAPGKITFFRLQSTPDTKLQAYIAQGEVLPVATRSFGGIGVFAIPEMGRFYRYVLIAKRYPHHGAVAFSHCGKALHTIFSYLGVDDISFNQPKGMLYKNENPFDA >CP021850.1|AUS98357.1|4363467_4363710_-|hypothetical-protein MKAFGKLLMQKGNLINNVQKQQNAFPKERYYCAFDKRFQFIIKYVIGNTAHNVTQISCKKGLTLSRGACYYIHAVEISSV >CP021850.1|AUS98358.1|4363879_4364437_+|hypothetical-protein MANKVDRILESIKTITGTDSYNSIIADCGVLDSKATPNKQAKYVKKIIDKINETQGEEAVEKIMKPCGYQCISDSIIDKAKKLYEKSSSIDDFLQLLNGQHIGGGQLHTKDGKIIGIYNTCYCGLAKNAKGMSPVYCYCSTGWFERLFSSIFGDSVKVKKYKQFWMARISAYLKLVISANICVSK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021850_8 | 4348688-4349236 | Unclear |
I-A,II-B,III-A
Consensus repeat of CP021850_8
|
8 spacers
spacers of CP021850_8
>8.1|4348718|36|CP021850|CRISPRCasFinder GAAAGAAAATAACTTTAAAAGATATGATAAAATAAG >8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder AATACATAGTTAATAATTAAAATA >8.3|4348838|36|CP021850|CRISPRCasFinder TTATTTTATCATATTTTATGTTGTGTGCATAGGTAT >8.4|4348904|37|CP021850|CRISPRCasFinder TTGTAAAAATAGCCCGGATTATCCGGGCTTATTTTTT >8.5|4348971|37|CP021850|CRISPRCasFinder,CRT AAGCATATTTTAATGACGTAATTAAGCTTGTCGTTGA >8.6|4349038|37|CP021850|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATGTCTTTTAACCTCACCATCTTTATTTATCTTCAT >8.7|4349105|36|CP021850|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGATTATAAGATAAAACTTTTACTTTAACTTAAAG >8.8|4349171|36|CP021850|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAATTCTACTAATTCACCCTCAGCAACTATTTCCAT |
cas6,cas3,cas8a4,cas7,cas5,cas2,cas1,cas4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP021850_8
The CRISPR arrays of CP021850_8 >merge|CP021850|8|4348688-4349236|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTCGACTCCATCTTGGTATGATTAGAACGAAAGAAAATAACTTTAAAAGATATGATAAAATAAGGTTTTAATTCCAATATGGTTCGATTAAAACAATACATAGTTAATAATTAAAATAATTTCAGTTCCAATTTGGTACGATTAAAATTTATTTTATCATATTTTATGTTGTGTGCATAGGTATGTTTCAATTTCAGCATGGTACTGTAAAACTTTGTAAAAATAGCCCGGATTATCCGGGCTTATTTTTTGTTGCAATTCCAATATGGTAAGATTAAAGCAAGCATATTTTAATGACGTAATTAAGCTTGTCGTTGAGTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAACTATGTCTTTTAACCTCACCATCTTTATTTATCTTCATGTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAACGAGATTATAAGATAAAACTTTTACTTTAACTTAAAGGTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAACCAATTCTACTAATTCACCCTCAGCAACTATTTCCATGTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC >CP021850|8|8|4348688-4349236|CRISPRCasFinder ATTTCGACTCCATCTTGGTATGATTAGAAC GAAAGAAAATAACTTTAAAAGATATGATAAAATAAG GTTTTAATTCCAATATGGTTCGATTAAAAC AATACATAGTTAATAATTAAAATA ATTTCAGTTCCAATTTGGTACGATTAAAAT TTATTTTATCATATTTTATGTTGTGTGCATAGGTAT GTTTCAATTTCAGCATGGTACTGTAAAACT TTGTAAAAATAGCCCGGATTATCCGGGCTTATTTTTT GTTGCAATTCCAATATGGTAAGATTAAAGC AAGCATATTTTAATGACGTAATTAAGCTTGTCGTTGA GTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC TATGTCTTTTAACCTCACCATCTTTATTTATCTTCAT GTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC GAGATTATAAGATAAAACTTTTACTTTAACTTAAAG GTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC CAATTCTACTAATTCACCCTCAGCAACTATTTCCAT GTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC >CP021850|8|4|4348941-4349236|CRT GTTGCAATTCCAATATGGTAAGATTAAAGC AAGCATATTTTAATGACGTAATTAAGCTTGTCGTTGA GTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC TATGTCTTTTAACCTCACCATCTTTATTTATCTTCAT GTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC GAGATTATAAGATAAAACTTTTACTTTAACTTAAAG GTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC CAATTCTACTAATTCACCCTCAGCAACTATTTCCAT GTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC >CP021850|8|5|4349008-4349236|PILER-CR GTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC TATGTCTTTTAACCTCACCATCTTTATTTATCTTCAT GTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC GAGATTATAAGATAAAACTTTTACTTTAACTTAAAG GTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC CAATTCTACTAATTCACCCTCAGCAACTATTTCCAT GTTTCAATTCCAACTTGGTACGATTAAAAC
>CP021850.1|AUS98345.1|4346603_4347362_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRIKLTLDSIGKQTIDLNYNYALSSMIYNLIRESDSKYSTFLHEKGYEINNKHYKLFTFSQLKPEKYEINGSCMSIQGKVVLYITSPMKEFILSLVKTVTGYPEIRIDKVMFRVINIEVMAEPKFSRCMKFMCLSPITISTAFLKENARLKRQDLYIEDKRFTENLRANIISKYEILHGKKPEDTEFEVKFTDVDKYKKGKLIDYKGIKIKGYLAPFEVCGNPELIATAYECGVGDRNSLGMGMIEVVRDVG >CP021850.1|AUS98344.1|4344277_4346614_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MLDERKIRDYFYNITEFEPYNFQVDMCRKVLNGEDVVMQAPTGCGKTWASVVPFIIAKKENIPFPAKLIYSLPLRVLANSLYKDVKEKLIKYDPSIKVTIQTGETPEDPYFEGDIIFTTVDQSLSSALLIPFALPNRQCNINAGAFVSSYHVFDEFHLLDWERSLSTTINLLRMFKNTARFCLMTATLSNEMVDRICTFLNAGRVSVSPDEYAKLQCNVNKYRIVHTYNRELKADDVISKHKKRTIVLCNTVERAQSLFLELKEKIKGNERFSNTSLICLHSRFYQKDRMQKEDDIKRLFSKESDSDAILISTQVVEVGIDITCDTMHTEISEINSFLQRIGRAARYGGEEADIYVYDIDKEKGTYLPYNKDISQKTLNELNEVQGKNMDFYLGQEIINKVLTQRELEIYETIRSGDRDLRIKDCWIKPERKWATDLIRKIENFNVVISSNPYEIRNPYFVDSVSINKHSLISKLKKIDKEDEEDWIIKKIEEDSFGLDDENDFSYTTVGVDEDILFSYDRIIVNPKYVFYDEDIGLNFEKTGETQLVELEKVCDDKVYSMRLESYREHVQKMIQVYQKLLRPQVINTLNSIWERNKVDVSIDEIINFMIILHDYGKLNLAWQKKAHEWQAKKAPAPKDMILAHTDWDEGDEKTRLPNHAGIGALVCYAIAPETICDEIVIAMVSSIARHHSPMNDSCESYFVPESSVEEIFELIKTYCPSLYNDIDKRNKYLFKNTYNQSLESYMVTFSDVNESMDTILYFIFSRILRLCDQKACEQ >CP021850.1|AUS98343.1|4342438_4344265_-|hypothetical-protein MYQDKYYVLKDSGTYSNMLEAYGLALLLSRLLRQERSVDIIDRGVYYEISLKRPITEEMVGNCRYIDLFRYIKTKGDDADIPDSIDYEFEANRAKLFNEERKEQSLKLKEARSKLDKKAYKAYSLKLKQQLDNSENKPRDDWDILQALNPSKLKALDTYKTVFQNVYNNKSNYKEIVKHVLMLYASPFQNQDEVEKSLKKLIRSGELRDIVEVNAVQAVNPDKVKGAASTKANSISPGPIKAFWLREYVKLAGMFSGMIVKDIKIGPKKWDAKIYVLDLKNMNYSMHTSVYKNLKPIVTGMTAVRLDITMLLLLCKTLIEHSENYIDEELSKRKHADSYVSGLYTVYLKNMGKAYSPTNISYLETPDFIAFNNKEEAGKWINIIDDHLDVIKNIRISASKSDETNSILKMLQNYRQFISGSNIEYFFDFIVEYSEFLMSKISKEEYYVRPFSLSCMEVFLKEMNYGEILKNQGFCNIAKAIRNSTISAQYAKDKDDGIKYEIRYGMALDLKRKAPYKDQFIQYLSDFIASYNAEAARVAEKHPELKGTHKLRATIKTQDLEDIIELIDKYDDCTTIAKLLCAYGYSLERKELDDQMSKVSEEDDVDDE >CP021850.1|AUS98894.1|4341429_4342425_-|CRISPR-associated-protein MKISSISISGKITLDMHSLNNEGGEGNQILTRQVTIVDDKGKIHTVNAISGDMLKHVQTEHLYNIAVEKGLPLCNACTTFNSNRISGDRVFSEESKGKDQQTVMDLLLEKCVIDDMQGILVTNNNSNLPRKSCSEYGWLIGLPDKTTTENYFHVKLVPNAGSKSEGEDESSNQGQNIFHRPANSGEYALVCNLDIYRIGYNEITRTYSIDDNDRLERYKALLESTLYTFLKTKGAMRNTQNPHVVNFEGVLAISKNATPAPLISAINPDYKEEIERIADALNSLDIKEEPENNEKNIVLRRFNSLSEFADAMKDLINEGEPYKVKESRQEG >CP021850.1|AUS98342.1|4340740_4341427_-|hypothetical-protein MWLEITYRPVSLFSLRRSDATNPAAKSLLCPSPYSIKMALLNSIITFGSVEEAIERFNTIKSFNIQFKLPKYICANNCFIKIQKEPHSDKKKKNPDIAFDSTVGFREFIYYNGDIAIAVAVDEKLVDYYVDKFKRINYFGKRGCFFQFIKAERIEELDEQYSGYFDETSLIARNDRMIIRMDDFHNKAKFDNVNTYSTQKAMRLEKLYYLNYKMVKANKNYTLYERSC >CP021850.1|AUS98341.1|4338852_4339578_+|ATP-binding-protein MHELIAAYCNTLKLGSRIAKNYSQIEAETHEEFLAKLLAMEIEARELNRKNALLKQAQFDVLKTFGDFRFEKMSIPNTIDVEAIKTASFVDKKENLILYGSVGLGKTHLATAMGVEACNRGKRVRFFRTSSLVNQLLDAKAEGSLKRFMKQLNKADLIICDEWGFIPFEKEGAQLLFQVISDCYERKSLIITTNLEFSKWNSIFYDEKLTSAIIDRIIHHSHLIVFEGSSNRLENSLMKVR >CP021850.1|AUS98340.1|4337354_4338860_+|IS21-family-transposase MLTMADIKYIKDLSDKKGLSLREISRITGFNFRTVQKYVDKDDWSKPLTRKKNSKSVLDSFAKTIDEWLEADLKAPRKQRHTAKRIYNRLSKLYKDEFTVSYRTVARYVAEKKRKLYGSNESYIPLYHPAGEAQLDFGMAEFVENGIRYEGCYVAMSFPYSNGGYIQAYKGTNIECLLQGMQNIFNHMGRVPTCIWFDNDKAVVKKILTNGEREVTDAFNRFRLHYGFESNFCNPDSGHEKGHVENKVGYSRRNMLVPVPEFKDLQEFNKNLLIECDEDMHRKHYLKDILIKTLFEQDKKAMKPLPKAEYEIYRLEKVKSDKYGKVNFENRKYSASPEHAQRELFVKANAFNVWILDDQYQVVQWHNRLYGKQKESMKWEPYLVLMSNRPNAIKYTGFFQQLPQTLQEYLSGCDYEQKKATLRMLKKMVANSELETAVDAFNYCVQKGIQDLDSIWARYYSMVFANAPIPDIVVKDEIPCLSYEVNNSIYDDLLERGLPHA >CP021850.1|AUS98339.1|4336571_4336865_+|hypothetical-protein MLYYNVVRVKPSELIDVSTDTMMFQFQYGTIKAHCIDADIYKNDEFQFQHGTIKAVKLCVLPESVYAFQFQHGTIKALPFISHPQKYLHVSIPTWYD >CP021850.1|AUS98893.1|4335592_4336360_-|spermidine/putrescine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MEYIVEINGLGMKYQSLNGEINAIENIDLSVKKGEFISIVGPSGCGKSTLLSIICGLLTPTSGHVLINGKSLRGPSSDVGYMPQKDHLFDWRTILQNVLLGLEIRKIMTDENKQYALNLLKTYGLYEFKDKYPYQLSGGMRQRAALIRTLATKPEILLLDEAFSALDYQTRLAVTDDIYKIIKKENKTAILVTHDISESISMADRVIVLTSRPARVKNIHEIKFDCENRSPLSCREAPEFRYYFNAIWKELDIHV >CP021850.1|AUS98338.1|4334781_4335600_-|sulfonate-ABC-transporter-permease MSDSIRNEISKERKEYLRKLKLRKTAILTTQIALLVLFFISWEIAANLKLIDPFITSQPSRMVKTFQNLYKGGELFQHVGITCLETIVGFLLGTITGTVIAIILWWSEFLSRVLEPYLVVLNSLPKVALGPIIIVWMGAGPGSIIVMALAISLIVTIMEVLNGFLTVDQDKIKLVQTFGANRLQILTKVVIPANFGTIINSLKINVGLSWVGVIMGEFLVSKAGLGYLIIYGGQVFQLDLVMTSVIILAIAATLMYQGVAYLEKLLVKNNGH >CP021850.1|AUS98346.1|4349380_4349644_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYALIVYDVKEKRVAKVLKFLRSYLNWIQNSVFEGEVTEAQMLKIKNHLREIIDEDEDSVIIFTSREKRWLSKSIMGREKNSTDNFI >CP021850.1|AUS98347.1|4349647_4350637_-|subtype-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKRNYYILKSGRLKRKDNTIYFENDEGKKVIPVNDIENIYVYGEVDFNSKAVNFLSQNNIPMHLFNYYGYYAGTFYPREQLNSGYMIVKQVENYLKYDQRVYIAREMIYSASYNIVKNLKHYVSKKPVLQEHIEKIEAIRDQFVTAFDIGTIMGLEGSIRNIYYDAFPVITDNRFEFEERVKRPPDNPMNSLMSFGNSLMYTAVLGEIYNTQLNPTISYLHEPGERRFSLSLDISEIFKPIIVDRIIFKLINNNMITEDHFLKELNYCYLNDKGKQIFLKEFDEKMNSVIEHRNLEKNVSYRTLIRLELYKLIKHLTGDQSYEGFKMWW >CP021850.1|AUS98348.1|4350648_4351158_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDLFGNSVKITGVEINYLYVCPRKLWFFTHGISMEQNSVRVEIGKETHDNSLNRKRTEILIDNTIRLDYVDKELAVHEIKLTKAMDMASKYQLLYYLYYLNKKGIDCKKGVIHYPKTRKTEIIEITQSDKEELEKAIEEIVRIKKLERPPKMIKERKCKSCSYLELCFC >CP021850.1|AUS98349.1|4351844_4352645_-|methyltetrahydrofolate--corrinoid-methyltransferase MIIIGEKLNSTLKSIRPAMESYDAAAIQELAKKQYEAGAMYIDVNAGMFHEEEPERLEWLINTVQEVLDAPFSIDSPNPVAIERALKANKNSKPIINSITDEKERFNSIMPLAIEYKTGIIALCMDDNGMPETTKDRVVIAERLIEKLTKEGMDLSDIYIDPMVRPVGTGSHYGTVAIETIRQVKKEFPGVHIACGLSNISFGIPARKLMNQAFLIAAMAAGMDGAILDPLDKKLMSFVYAGEALLGIDEFCMNYLTKFREGALEV >CP021850.1|AUS98350.1|4352699_4353563_-|bifunctional-5,10-methylene-tetrahydrofolate-dehydrogenase/5,10-methylene-tetrahydrofolate-cyclohydrolase MAEILKGKDVIASMKERMLKQVEELQSHGVTPCLAIVRLGAKADDLAYEKGAVKRCEGLGIKCVVMEYDESISQKELEDEIRKLNEDTGIHGILVFRPLPKHIDENAIKYVISPDKDVDCFSPVNVAKVFEGDDNGFAPCTPEAVMEMLEHYGVDVSGKRVVVIGRSLVVGKPLSMLLLRKNATVTICHTKTRDLGGTARTADILIAAAGKARMITKEFVSPGQIVIDVGINMDKDGNLCGDVDYDNVEKTVAMITPVPGGVGTVTTSILAKHVLAAAWRLSGVMGS >CP021850.1|AUS98351.1|4353898_4354531_-|sugar-ABC-transporter-substrate-binding-protein MVYIEYSCKEFTDALASGAPVPGGGGASALVGALGTALGSMVGNLTLGKKKYESVQDDIKAILEKAQLLKEQLLSLVDKDAEVFEPLSKAYGLPKNTEEEKRKRDEIMENALRMACSVPVEIMEKAMEAIALHEELATKGSRIAISDVGVGVLLCKSALMGASLNVFINTKLMKDRQYADEINSRVDEMLKSGIKRADAVYMEVESGLRK >CP021850.1|AUS98352.1|4354864_4356544_-|formate--tetrahydrofolate-ligase MGFKGDIEIAQSTEMKPIEEIAASIGIDRENLELYGNYKAKVNYNILEKLSDRKDGKLILVTAITPTPAGEGKTTTTVGLGDALKKIGKKVVIALREPSLGPVFGVKGGAAGGGYAQVVPMEDINLHFTGDMHAIGAANNLLAAMIDNHIYQGNQLGIDPRRITWKRCVDMNDRQLRFIVDGLNGKANGMPREDGFDITVASEVMAILCLSKNIDDLKEKLRSIVIGYTRDDKPVTAGQLKAEGAMAALLKDALKPNLVQTLEHTPAFVHGGPFANIAHGCNSIMATKMALKFGDYVVTEAGFGADLGAEKFLDIKCRIAGLKPSAVVIVATVRALKHHGGAEKSQLSVENLEALEKGIPNLLKHIENITVKFGLPAVVAINRFPTDTEAELKLIEEKCKQYGANVALSEVWAKGGEGGIELAKEVVRLADEGKSNFKFIYGDEMPIKEKIEAVVREVYGGDGVDFLPAAAKEISKLEEMGFGHLPVCMAKTQYSLSDDPKKLGWPKNFRVTVRNVKVSAGAGFVVVLTGDIMTMPGLPKVPAAESIDVDSTGRISGLF >CP021850.1|AUS98353.1|4356768_4357614_-|FdhC-protein MNNFYLSPSEITERYVDTGCMKSNLPPLKLLLLGILAGAFIAFASEGSNMAIHTITSAGLAKTLAGALFSTGLMMVVITGAELFTGNTLIIVSCLEGRARWGGLLKNWFFVYTGNFIGAVIVVVFILLSGQFNFSSGMLGGYTIKTAVYKVSLPFAGAFFMGLLGNWLVCMAVWMASAAKDVTGKLLSIFFPIWLFVTSGFEHSIANMYYIPAGILAKSNQTWLDAAISMGVAAKDLEALNWSSFVLKNLIPVTLGNIVGGSIFVGVTYWLSYLYKAKKKA >CP021850.1|AUS98354.1|4357951_4359478_-|xylulokinase MNYLIGIDIGTSSTKTVLFDENYNVVSSASQEYPLYQPQNGWAEQKPEDWYNAVMDTLKRVIKESGVPGESILGIGLSGQMHGLVMLDENNEVIRPAIIWCDQRTAKECEEITERVGAKRLIEITANPALTGFTASKILWVRNNEPENYARCRHILLPKDYIRFMLTGEFATEVSDASGMQLLDIPNRCWSDEVLEKLEIDKSMLGKVYESPEVTGHITQKVAEETGLSVKTIVVGGAGDNAAAAVGTGIVRDGRAFTTIGTSGVVYAHSSRITIDPKGRVHTFCCAVPGCWHVMGVTQGAGLSLKWFRDNFCQDYIDEAKRQGVDPYYLMDKDAESVPIGSNKLVFLPYLMGERTPHLDPDCRGVFFGLSAIHTKKDMIRAVMEGVSYSLKNCSDILKEMGIAVGEMMACGGGGTSKLWRQMLADLYGCEVKMVSSKEGPALGAAILAGVGAGLFDSVEQACDRVIKVDKVCGPIDENSRKYEKFYEIYNSLYGDLKAEFAKLAKLS >CP021850.1|AUS98355.1|4359653_4360688_-|LacI-family-transcriptional-regulator MAVTIKKIAELCGVSRGTVDRVLNNRGKVKPETEALIRRVAEQLDYKPNIAGKALAARKKSFVIGVIVASEGNPFFDDVLKGIHQAENELHDYGVKIIIKTMKGYDIQRQLKLIEELEGGIHALILNSISDAEIAAKIDELTDKGIPVITLNTDIENSKRLCYVGCDYVKGGETACGMLGLLTGGRAKVGVITGSVKILGHNQRVQGFRNVIKRRYPGIEVVDFAESNDDDIIAFEATKKMLLEHKEIDALFIAAAGAYGVCRAVISLGLENKITIVCFDDVPSTVEMMEKGLIKATICQQPFLQGNKSVHIAYDYLVSGARPHNDQFIVENKIKILENLYQTP |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021850_6 | 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR | 4336816-4336836 | 21 | NZ_CP053971 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed3, complete sequence | 34797-34817 | 1 | 0.952 |
CP021850_6 | 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR | 4336816-4336836 | 21 | NC_010180 | Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence | 2734-2754 | 1 | 0.952 |
CP021850_6 | 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR | 4336816-4336836 | 21 | NZ_CP039724 | Bacillus thuringiensis strain BT-59 plasmid p3, complete sequence | 92656-92676 | 1 | 0.952 |
CP021850_6 | 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR | 4336816-4336836 | 21 | NZ_CP013278 | Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain AM65-52 plasmid pAM65-52-3-235K, complete sequence | 40658-40678 | 1 | 0.952 |
CP021850_6 | 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR | 4336816-4336836 | 21 | NC_018509 | Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-2, complete sequence | 34542-34562 | 1 | 0.952 |
CP021850_6 | 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR | 4336816-4336836 | 21 | NZ_CP051859 | Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain BGSC 4Q7rifR plasmid pBtic235, complete sequence | 147186-147206 | 1 | 0.952 |
CP021850_6 | 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR | 4336816-4336836 | 21 | NZ_CP009347 | Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 3, complete sequence | 185942-185962 | 1 | 0.952 |
CP021850_6 | 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR | 4336816-4336836 | 21 | NZ_CP045025 | Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p3, complete sequence | 40658-40678 | 1 | 0.952 |
CP021850_8 | 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder | 4348784-4348807 | 24 | NZ_CP015323 | Bacillus filamentosus strain Hbe603 plasmid pBEH1, complete sequence | 29006-29029 | 3 | 0.875 |
CP021850_8 | 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder | 4348784-4348807 | 24 | NC_011996 | Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL2, complete sequence | 35403-35426 | 3 | 0.875 |
CP021850_8 | 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder | 4348784-4348807 | 24 | NC_019526 | Enterobacteria phage vB_KleM-RaK2, complete genome | 284441-284464 | 3 | 0.875 |
CP021850_8 | 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder | 4348784-4348807 | 24 | MT682713 | Escherichia phage vB_EcoM_Ozark, complete genome | 64392-64415 | 3 | 0.875 |
CP021850_8 | 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder | 4348784-4348807 | 24 | AB897757 | Klebsiella phage K64-1 DNA, complete genome | 284248-284271 | 3 | 0.875 |
CP021850_8 | 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder | 4348784-4348807 | 24 | MK448517 | Streptococcus satellite phage Javan495, complete genome | 1143-1166 | 3 | 0.875 |
CP021850_8 | 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder | 4348784-4348807 | 24 | MK327942 | Escherichia phage vB_EcoM_G50, complete genome | 63394-63417 | 3 | 0.875 |
CP021850_8 | 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder | 4348784-4348807 | 24 | NZ_LR134418 | Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 9 | 441873-441896 | 4 | 0.833 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | NC_025440 | Listeria phage WIL-1, complete genome | 59695-59728 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | NC_047872 | Listeria phage LMTA-94, complete genome | 26510-26543 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | KJ591605 | Listeria phage LMTA-57, complete genome | 36274-36307 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | KJ535721 | Listeria phage List-36, complete genome | 21462-21495 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | MT438761 | Listeria virus P61, complete genome | 118236-118269 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | MT668624 | Listeria phage LP-Mix_6.2, complete genome | 108353-108386 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | MT178766 | Listeria virus P100plus, complete genome | 73417-73450 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | DQ003638 | Listeria phage A511, complete genome | 106998-107031 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | MT178767 | Listeria virus P200, complete genome | 73418-73451 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | DQ004855 | Listeria bacteriophage P100, complete genome | 73413-73446 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | KJ591604 | Listeria phage LMTA-148, complete genome | 117231-117264 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | MN128594 | Listeria phage LP-066, complete genome | 107939-107972 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | NC_042048 | Listeria phage LMTA-34, complete genome | 121412-121445 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | NC_041862 | Listeria phage LP-064, complete genome | 116399-116432 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | KJ094030 | Listeria phage LP-083-2, complete genome | 113105-113138 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | JX126918 | Listeria phage LP-125, complete genome | 116401-116434 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | NC_024360 | Listeria phage LMSP-25, complete genome | 121412-121445 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | JQ797329 | Listeria phage vB_LmoM_AG20, complete genome | 106337-106370 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | KJ094031 | Listeria phage LP-124, complete genome | 75220-75253 | 7 | 0.794 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | NZ_CP032530 | Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_2, complete sequence | 82678-82711 | 8 | 0.765 |
CP021850_2 | 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder | 2164670-2164703 | 34 | NZ_CP032532 | Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_4, complete sequence | 73483-73516 | 8 | 0.765 |
CP021850_7 | 7.7|4340231|37|CP021850|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4340231-4340267 | 37 | MN693809 | Marine virus AFVG_250M1103, complete genome | 40272-40308 | 11 | 0.703 |
1. spacer 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR matches to NZ_CP053971 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.952
ttgccatttatatcacatcct CRISPR spacer ttgccatttatataacatcct Protospacer ************* *******
2. spacer 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR matches to NC_010180 (Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.952
ttgccatttatatcacatcct CRISPR spacer ttgccatttatataacatcct Protospacer ************* *******
3. spacer 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR matches to NZ_CP039724 (Bacillus thuringiensis strain BT-59 plasmid p3, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.952
ttgccatttatatcacatcct CRISPR spacer ttgccatttatataacatcct Protospacer ************* *******
4. spacer 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR matches to NZ_CP013278 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain AM65-52 plasmid pAM65-52-3-235K, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.952
ttgccatttatatcacatcct CRISPR spacer ttgccatttatataacatcct Protospacer ************* *******
5. spacer 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR matches to NC_018509 (Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.952
ttgccatttatatcacatcct CRISPR spacer ttgccatttatataacatcct Protospacer ************* *******
6. spacer 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR matches to NZ_CP051859 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain BGSC 4Q7rifR plasmid pBtic235, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.952
ttgccatttatatcacatcct CRISPR spacer ttgccatttatataacatcct Protospacer ************* *******
7. spacer 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR matches to NZ_CP009347 (Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.952
ttgccatttatatcacatcct CRISPR spacer ttgccatttatataacatcct Protospacer ************* *******
8. spacer 6.6|4336816|21|CP021850|PILER-CR matches to NZ_CP045025 (Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p3, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.952
ttgccatttatatcacatcct CRISPR spacer ttgccatttatataacatcct Protospacer ************* *******
9. spacer 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015323 (Bacillus filamentosus strain Hbe603 plasmid pBEH1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
aatacatagttaataattaaaata CRISPR spacer agtacatagttaataattaaaaat Protospacer *.********************
10. spacer 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder matches to NC_011996 (Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
aatacatagttaataattaaaata CRISPR spacer tatacatagttaataattgacata Protospacer *****************.* ***
11. spacer 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder matches to NC_019526 (Enterobacteria phage vB_KleM-RaK2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
aatacatagttaataattaaaata CRISPR spacer aatacatagtgaatagttaaaatg Protospacer ********** ****.*******.
12. spacer 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder matches to MT682713 (Escherichia phage vB_EcoM_Ozark, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
aatacatagttaataattaaaata CRISPR spacer tattcatagttactaattaaaata Protospacer ** ******** ***********
13. spacer 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder matches to AB897757 (Klebsiella phage K64-1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
aatacatagttaataattaaaata CRISPR spacer aatacatagtgaatagttaaaatg Protospacer ********** ****.*******.
14. spacer 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder matches to MK448517 (Streptococcus satellite phage Javan495, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
aatacatagttaataattaaaata CRISPR spacer aatatatggttaataattaaaatg Protospacer ****.**.***************.
15. spacer 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder matches to MK327942 (Escherichia phage vB_EcoM_G50, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
aatacatagttaataattaaaata CRISPR spacer tattcatagttactaattaaaata Protospacer ** ******** ***********
16. spacer 8.2|4348784|24|CP021850|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134418 (Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 9) position: , mismatch: 4, identity: 0.833
aatacatagttaataattaaaata CRISPR spacer aatacataattaataattaaacac Protospacer ********.************
17. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to NC_025440 (Listeria phage WIL-1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
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18. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to NC_047872 (Listeria phage LMTA-94, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
acgataaatccatttttagatatgaaaaagacct CRISPR spacer aagttaaatccatttctagatattaaaaaaagat Protospacer * * ***********.******* *****.* *
19. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to KJ591605 (Listeria phage LMTA-57, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
acgataaatccatttttagatatgaaaaagacct CRISPR spacer aagttaaatccatttctagatattaaaaaaagat Protospacer * * ***********.******* *****.* *
20. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to KJ535721 (Listeria phage List-36, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
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21. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to MT438761 (Listeria virus P61, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
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22. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to MT668624 (Listeria phage LP-Mix_6.2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
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23. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to MT178766 (Listeria virus P100plus, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
acgataaatccatttttagatatgaaaaagacct CRISPR spacer aagttaaatccatttctagatattaaaaaaagat Protospacer * * ***********.******* *****.* *
24. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to DQ003638 (Listeria phage A511, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
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25. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to MT178767 (Listeria virus P200, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
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26. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to DQ004855 (Listeria bacteriophage P100, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
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27. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to KJ591604 (Listeria phage LMTA-148, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
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28. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to MN128594 (Listeria phage LP-066, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
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29. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to NC_042048 (Listeria phage LMTA-34, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
acgataaatccatttttagatatgaaaaagacct CRISPR spacer aagttaaatccatttctagatattaaaaaaagat Protospacer * * ***********.******* *****.* *
30. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to NC_041862 (Listeria phage LP-064, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
acgataaatccatttttagatatgaaaaagacct CRISPR spacer aagttaaatccatttctagatattaaaaaaagat Protospacer * * ***********.******* *****.* *
31. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to KJ094030 (Listeria phage LP-083-2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
acgataaatccatttttagatatgaaaaagacct CRISPR spacer aagttaaatccatttctagatattaaaaaaagat Protospacer * * ***********.******* *****.* *
32. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to JX126918 (Listeria phage LP-125, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
acgataaatccatttttagatatgaaaaagacct CRISPR spacer aagttaaatccatttctagatattaaaaaaagat Protospacer * * ***********.******* *****.* *
33. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to NC_024360 (Listeria phage LMSP-25, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
acgataaatccatttttagatatgaaaaagacct CRISPR spacer aagttaaatccatttctagatattaaaaaaagat Protospacer * * ***********.******* *****.* *
34. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to JQ797329 (Listeria phage vB_LmoM_AG20, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
acgataaatccatttttagatatgaaaaagacct CRISPR spacer aagttaaatccatttctagatattaaaaaaagat Protospacer * * ***********.******* *****.* *
35. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to KJ094031 (Listeria phage LP-124, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
acgataaatccatttttagatatgaaaaagacct CRISPR spacer aagttaaatccatttctagatattaaaaaaagat Protospacer * * ***********.******* *****.* *
36. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032530 (Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
acgataaatccatttttagatatgaa---aaagacct CRISPR spacer acgataaatccattattagttatgtattgggaga--- Protospacer ************** **** **** * ..***
37. spacer 2.2|2164670|34|CP021850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032532 (Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
acgataaatccatttttagatatgaa---aaagacct CRISPR spacer acgataaatccattattagttatgtattgggaga--- Protospacer ************** **** **** * ..***
38. spacer 7.7|4340231|37|CP021850|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693809 (Marine virus AFVG_250M1103, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
tatcggatataagaaataatagaaaagaaaaatcaaa CRISPR spacer aatacaatataataaataatagaaaataaaaaagggg Protospacer ** .****** ************* ***** ...
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
80811 : 92802
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP021850|80811:92802|DBSCAN-SWA 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AATTGCCTTGACGGAGGTGGTATAGCATGAATCTGATGGATCTGCTGCCTGACTATTATAAAGGCAATCTTACGATGGAAGAGCTGCAGGATATTTTAAGCGCAGATATGGACAATCTGGCAACGGCCTTCGATAAGACGATAAACCAGTGCTTTGTGAACACTGCTACTGACCTATTGAGCCGGTATGAAAAGATTTTCGGGCTTCAAGTTGATGTCAATAAACCCGATGAGTTCCGACGTGAACGCATCCGGGCAAAGATTAGGGGTACCGGAACGGTAACAAAGCAGATGATAAAGGATGTGGCGAGCTCTTATTCCAATGGTGAAGTGGAGGTAATAGAAGACCCTTCTAATTACAGCTTTAAAATAAAGTTTATTGGCACAAAGGGAATTCCTGCGAATATGACCGACCTGACATTGACCATTCAGGAAATCAAACCAGCTCACTTAGCTTTTGAATTTGAATTTACTTATAATACCTGGAAGGATGTTGAGGGTATGACCTGGAGTGAGGCAAGTACTTATACATGGAATGAATTAAGAGTGAGGTGATTATATGGCTGAATATACAAATAATTATAATTTGGAGAAGCAGCAAGCGAATGAATATATCAGCATCGAGGGAATAAATGATAACTTTGATATAATTGATGCTCAAATGAAAAGCAATGAGGAAGCAGCTTCTAAGGTGCAAACAGACCTCAATGAGCACATGAAAGACAATATGAAGCATATAGTCTACGCTGTAGCAAGCGGTACAAATACTTATACGGCTGCAATCAATGGTATTACATCGCTTGTTGAAGGGATGAGCATTAAAATCAAGTTCCCCAATGCAAACACAGGAGCAAGTACCCTTAATATTAACGGTCTGGGAGCAAAAGAAATACGTAAGAGCAATGGAAATGCTTTGTCCAGTGGAAACATAAAGGCAGGACAGATATGCCATCTGGTTTACACTGGTTCGGTTTTTCAGTTATTGGGTGAAGGGGGTGAGTATGGAACAGCCACATCCGATAAAGTATTAGCTGGTTATACTATAGGGACAGAAAGTGGAGTTATGGAAGGTACGATGCCCAATAATGGACCTGCTGCAGCAGATACAATCAACCTTACGAACCAAAACCAGGAGTATACTATTGCACAAGGGTATCATTCCGGATTACGCAAAATAAAGGCTGCAATTAGTGGATTGGCAGCAAATGTAATAAAAGCTGGCACCACGGTGGGTGGTATAGTAGGTACATTTACATCAGATGCGAATGCAGCAGCAGGTCATATATTGTCTGGAATGACAGCGTATGTCAATGGTAATAAGATTACAGGCAATATTCCAAGCAAAGGTGCGGCAACATATACACCGGGAACAACCAATCAGACTATTGCAGCTGGACAGTATTTATCAGGAACTCAAACTATTATAGGCGATGCTAATTTAGTAGCTGCAAATATAAAAAGTGGTATTTCTATATTTGGAGTTACAGGCTCTTATCAAACTCCTGTAATAAAAAGCATACAAAGAGGTTCATACACCTTTGATGATACAACTTCTTCTGTAAATATAACTATATCTGCAGTAGATTTAAATGCAGCCATTGTATTGTTTTCTCATAAGTATATAAGTGGAATAACAACGCCTTATAATGTACTTATTTGGGCAAGACTTACTAGCCCGACTACACTTGAATTAGCAAGGGCGCAAGCACAAGGTCAACAACAAGTGGAATGGCAAGTAGTTGAGTTTAATAATGTAAAAAGCGTACAAAGAGGTACTGTAAATATGAATTCATCTGCTACGGTTACTATAAATGCAGTTGATTTGAGTAAATCGTTGTGTTTTGCATCTTTTAAAGATTCAGGGTCGGGAGGTGATATGAGTAATGCATTTGTGGCAATTAAATTTAATAGTACAACTCAATTGTCGTTAAGCGCATACGCCACAATTTCTAATACACGAAGTGTGCATTGGCAAGTAATAGAATTTAAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP021850|80811:92802|88249_89194_+|AUS95043.1|DBSCAN-SWA MSMEFLVKVDNNVYEISGLVTSISYSDRLNDGCSKLEFSYVGDILKVKNGSVISFKYDNVGIFYGYVFKHGQNKRKEITVTAYDQLRYCKAKDTIVVRGDSVTSLVKKMCNYFGLKTGALTNTGYTLATSIQDDKTWLDIIYSGIDDTLTNTGRWYSLRDEFGSIALRDLVDLQLNLVLGDESLVYDYKYDKSIDDEFYNQIKIVSDNESTGKRDVYITKDSGSIAKYGLLQYFEVLNKNANPSQAKSKADMLLKLYNREVETISLDCLGDTSVRAGSSFYGRIGDIELNRRLIVRSVTHKFLPVHTMSLEVAI >CP021850|80811:92802|87593_88253_+|AUS95042.1|DBSCAN-SWA MYAIFFDKDNITYRLPVNPEQIEITSTQAIERYEILKSGQVAIPTHMELKEYSFECELPHTVTHYTETSRGFKNADYYLRLFEQWRKNLEPVRFIACNGMGDDINSLVLIEDLRITEKAGEEGDKYVSFSLLEYVDLEKQIIPKPADQLLPGVIKEEPPKGGNPKHNGTYTVVRGDSLWAIAKKFYGDGSLYTKIVEANRDKIKNPSLIYPGQKLVIPE >CP021850|80811:92802|89827_90835_+|AUS98616.1|plate|DBSCAN-SWA MTYENILKDMLSRVTSDVDKREGSVIFDALAPCAYKLAETYFKLNNFIDLVSADTAVGEYLDRVVADYGIKRKAATYAVRKVEATAPVDIGTRWGLKDTTYVITEKMSDTEYKAKCEQLGSIGNQYSGLLDNIDNVPDVAAALTDIIISGEDEETDDSLRARFYNQIRTPSTSGNADHYRKWAMEVAGCGDAKVLPLWNGNGTVKVLVVDENMAVDEALPAAVAAHIETVRPIGAAVTVESPQEKVISISAGVVLDGSKTLNDVYNSFSKAFSEYLKDIVFKNYSISYARIGSLLLSTDGVADYVNLLVNGGAANITIGETEVPVAGTIALTEVV >CP021850|80811:92802|89190_89424_+|AUS95044.1|DBSCAN-SWA MINEIKTIVQNYLNNAKLCSIMLGTVTDDGIKVSDKLVIPKELVVGNLKNSVLVGQKVRLLRNHGGQQFYILEVVAE >CP021850|80811:92802|83375_84419_+|AUS95038.1|tail|DBSCAN-SWA MSGTWNSQNKILPGAYINFLTNAPLSITPGDRGIVVLLQEMGAGAFRDMYTVTASENDYPDGIADEDKLLANEALKGARTVIVYNLGTAHTDDTITTALSDLKTVAFNTLAYPYDGAAYEANKAAIAAWIKSMREDEGVKIQGVLANYAADSEAIINVTHGVKLSDGTELSPAQTTAWVAGITAGANINESNTGRKYDGAIDVVPRMTKTEMEAAITAGQFIFKVDTAQNVTAVYDINSLTTSAPEKGAQFKKNRAIRTIDGINNDIVEIFESNYKGKLNNNADGRSLLRASLIEYFNELQRLQAIQNFTPEDVTVEAGSDTDAVVINCYIQLVDSAEKFYITVNLS >CP021850|80811:92802|85563_87594_+|AUS95041.1|DBSCAN-SWA MVTLKAMLLQIEGWNEAIEIFNRKIEVTAQKMLKASGEADQLDDKLKSAGASAGIISKALDSLKNPSFIIDKVVEGMKIMDQFTNAATKLKYINSDLKTQAELQDKVFAAANRSRSAYSDMVDVIAKLKPITEKQFLSNDELIAFAELVQKGFRISGAGTEEQSSAMSQLINSMAAGGLQGGEFESIMKDAPVIADAIAEYTGKSKDELKKLSAEGLITADIIKNAIFYSADDINSRFDAMSSEAELIPMTFADVWNRVKNSALQAFSGVMESISKLINNKAFTSLLGMVTGALNVIVFPLDKILKAISYIGDVISYLWPIIEPILTAVGSALLFWTTTQIPLLTSKISLMVMELWSAVRPILAQAAAWAMANMPILLLGAMIGLLIYAILKYGDCVIEVVGVIGGVIGGIVAVLLNVGRTIVNILISLAEFIKNVFKNPVYSINRLFVNLAISILDLIQSIAKAIDKVFGTSLADGLQSFKNFLNNQLSIRVGPKPEDYTEEEKHNMLDIVDTVNFGYDIGKKAGTTSVQELSGQLRSLFSHDGSISIPHYDTFDGFETPMDPLTVANFDYNMDTISMPNYDPFKGFGTPMDPLIVEGVGPGGKVEVDMSDEDMKYLRDIAERDYINKFSTATLAPSISVSFGDVHETADADKLAGRIQKILAEEIAMAAEGVYA >CP021850|80811:92802|90836_91364_+|AUS95046.1|DBSCAN-SWA MNLMDLLPDYYKGNLTMEELQDILSADMDNLATAFDKTINQCFVNTATDLLSRYEKIFGLQVDVNKPDEFRRERIRAKIRGTGTVTKQMIKDVASSYSNGEVEVIEDPSNYSFKIKFIGTKGIPANMTDLTLTIQEIKPAHLAFEFEFTYNTWKDVEGMTWSEASTYTWNELRVR >CP021850|80811:92802|89420_89816_+|AUS95045.1|DBSCAN-SWA MIPQGFIDFDLIAAKTAGTTRTYKLSGNRIQGFADGLEALEQAIYKVLNTEKYEYPIYSFSYGIELENLIGKDPLYVQVELKRRILECLLKDERIQGVDNFKFETSGDRLFCVFDVISTYGKITVTKGVEI >CP021850|80811:92802|84436_84913_+|AUS95039.1|portal|DBSCAN-SWA MADNYIRLSDTISSHEGKAYITINGVNRELFEVSALSAQIDMIVQEKRMLGHRMTQHKVVGASGTGSLTMYFMNSEMLKQAIQYIRTGNYRGLKLQVKNEDPQSTVGKQEVVLLNVILNSIPAAILDDGSDDPITFDTDFTFDDIESLHSFKLPENYR >CP021850|80811:92802|91368_92802_+|AUS95047.1|DBSCAN-SWA MAEYTNNYNLEKQQANEYISIEGINDNFDIIDAQMKSNEEAASKVQTDLNEHMKDNMKHIVYAVASGTNTYTAAINGITSLVEGMSIKIKFPNANTGASTLNINGLGAKEIRKSNGNALSSGNIKAGQICHLVYTGSVFQLLGEGGEYGTATSDKVLAGYTIGTESGVMEGTMPNNGPAAADTINLTNQNQEYTIAQGYHSGLRKIKAAISGLAANVIKAGTTVGGIVGTFTSDANAAAGHILSGMTAYVNGNKITGNIPSKGAATYTPGTTNQTIAAGQYLSGTQTIIGDANLVAANIKSGISIFGVTGSYQTPVIKSIQRGSYTFDDTTSSVNITISAVDLNAAIVLFSHKYISGITTPYNVLIWARLTSPTTLELARAQAQGQQQVEWQVVEFNNVKSVQRGTVNMNSSATVTINAVDLSKSLCFASFKDSGSGGDMSNAFVAIKFNSTTQLSLSAYATISNTRSVHWQVIEFK >CP021850|80811:92802|82078_82615_+|AUS95036.1|DBSCAN-SWA MITKEELNAITQNLDKQVKKAVEKFLYTNGLVEDYQRDYFKDTEKLLYAYPDLKLKVEQDMEDLKSGVLAMKVNRSKDIIRLSANSGSWKPEEYVQEEIIRSRKASMERTRLQVQRIDRALETIKDDQYYDIIPMRYFDRIKIEEIADRLVCDESTVRRNKNRLVNKIKIVLFGADAL >CP021850|80811:92802|80811_81291_-|AUS95034.1|DBSCAN-SWA MEELENEAFKSRINVQRAELPESISGLYYDDGTNQPLIALNECLKTKSEQTCVLAEELGHYYTSCGNLLTDPSVSKAIIQKQETKAKRWAFSRLVSLKNIIKAYEAGCNNLYEMAEYLSVTQDFLEKAFASYNSIYGKFKKRGNYIIYFDPPGIFKNIK >CP021850|80811:92802|84965_85370_+|AUS95040.1|portal|DBSCAN-SWA MSSLKAFLNPIKVENKEVIVSNRFQEDGKPVPFVIRPITQKENEELIRKYTKKDKKGQETFNRTEYIHALTASAVVFPDLKNAELQKSYGVLGEAELLKTMLYVGEFAELAKEVQALSGLDVDINEDIEEVKNE >CP021850|80811:92802|82950_83361_+|AUS95037.1|DBSCAN-SWA MISIIKQDIADKLTEIYPDGYTVYDEYMPQDFEKPSFLIVSTGQSYSKRMNNKYSGKVSFDVAYFSDKDATEVKKDCLDKQMSLLRAFSSMNAFHAQNMQANITDNILHVTFDVRYWEIKEKTSTMMQTQQTNTYL >CP021850|80811:92802|81305_81638_-|AUS95035.1|DBSCAN-SWA MSILEIIQDLCAKKGINPSKLEMELGFGKGAIYKWDKNSPSVDKIQKVADYFNVSTDYLLGRTEIKDTSGIKTLAAHRLDGYDKPLTDDEVIAVNAFLEAYRKGKQSKKD |
15 | Clostridium_phage(33.33%) | tail,portal,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
153078 : 161238
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP021850|153078:161238|DBSCAN-SWA TATGATAGATGTAGGCTTCTGGAGCAATAAAAAAGTATTAGTGACAGGACATACAGGGTTTAAAGGCTCATGGTTGAGTATATGGCTTTATTCTATGGGTGCCAAAGTAATGGGATATTCATTAGAACCACCTACAGAACCAAGCCTTTATAAAATATGCAGAGTAGATGAACTAGTTGTTTCGCATATTGGAGATATTCGTGATAAGGAATCTCTAATTACCTATTTTATGTCATTTAGACCAGAAATCGTCATACACATGGCAGCTCAACCAATAGTACGTGAGTCCTATAAAAATCCGGTTGGTACATATGAAATAAATGTTATGGGGACAGTTAACCTGTTGGAAGCTGTTAGAATGAGTCCAGGAGTTAAAGCCGTAATTAATGTTACAACAGATAAATGCTATGAAAATAAGGAATGGGTTTGGGGATACAGAGAATTAGACCAGCTTGGCGGGTACGATCCTTACTCAAATAGCAAAGCTTGTTCCGAGCTTATAACCGAATCATATAGAAGTTCGTTTTTTAACCCAAATGAATACGATACTCATGGAGTGGCTATAGCAACAGCGAGAGCTGGAAATGTTATTGGTGGAGGGGACTGGGCGACAGACAGGCTTATACCAGATTGTATCAAAGCATTGCTTAGTAATAATGAAATCTTAGTAAGAAACCCTAACTCTGTTAGGCCATGGCAGCATGTACTAGAGCCCCTTTCTGGATATCTAATTTTGGCACAGAAGCTTTTTGAACAAGGACCAGAATACTCAGGAGCTTGGAATTTTGGACCGGAGTTTCCTGATGCCAGACCGGTAAGCTGGATCGTAAGTGAATTGTGTAGACTTTGGGGCAAAAATGCGACTTTCAGAATAGACAAAAGCAAGCAACCTCATGAAGCAAATTATCTTAGGCTGGATTGTTCCAAAGCTAAGCAAATGCTTGGGTGGAGCCCAAGATGGGATATTGAAACTGCGTTGAAAAAAGTCGTAGATTGGACACTAGAATATAAAGATGGATTAGATCCAAGGGAATCCTGCATTAGACAGATTAATGAGTACTTAAATACTTAAGACGGAGTGTGATAGCTTATATGGAAAACTCATTAGATAAAGAGAAAGCACTTAGAGAGAAAGTAATTAATGCTGCAATTGAGCATTATAAGGTAATGCATGGTCAAAACAAAGGTAGATTTACCCCTGGTGATCGCATCTCCTATGCAGGAAGAGTTTTTGATGAAAAAGAAATATCATACTTGATAGATGCTTCATTGGAATTTTGGCTGACTTCAGGTAAGTATGCTGATATGTTTGAAAGGAAATTCGCAGAATTCCTGGGTGTAAATTATTGTTCCTTAGTGAATTCAGGTTCTTCTGCCAACTTGCTTGCTTTTATGGCATTAACATCTCCGGAACTAGAAGCAAGAGCCATAAAACGAGGGGATGAGGTTATTACTGTTGCAGCAGGTTTTCCAACTACAGTAGCGCCTATAATACAGTACGGAGCAGTTCCAGTGTTTATCGATGTTACTATTCCAGAATGTAATATTGACTGTTCGTTACTTGAGAAAGCATTGTCATCAAAAACAAAAGCAGTCATGCTTGCTCATACTCTTGGTAATCCTTTTGATCTTGAAGCTTTGAGAAACTTTTGTGACAGACATGGATTATGGCTTATAGAAGATAATTGTGACGCCCTTGGAACTAAGTATTATTATAATGATTGCTGGAGATATACAGGTACAATTGGTGATATTGGCACTTCAAGTTTTTATCCTCCTCATCACATAACTATGGGTGAGGGAGGGGCAGTTTATACTAATAATTTAAGATTAAAGAGAATAATTGATTCTCTTAGAGATTGGGGAAGAGATTGCTGGTGCCAATCGGGATATGATAATACATGCAATAAAAGATTCAGTCAGCAATTTGGTGAGCTACCGTATGGATATGATCACAAATATGTATATTCACATTTTGGTTATAATCTGAAAGTAACCGATATGCAGGCTGCAATTGGTTGTGCTCAGTTAGAAAAACTCCCAGCATTTATTGCAGCTCGAAAACACAACTGGAAAATTTTGAGATCTGGTTTAGACGGTTTTAGTGACAAGTTTATATTGCCAAAGGCAGCAAAAAATTCTGATCCCAGTTGGTTCGGATTTTTGATTATGGTTAAAGAGGATGCAGGATTTACAAGAGATGAATTTGTTGATTATTTAGAAAGCAATAATATTCAGACAAGGATGTTATTTGCTGGTAATCTTATTAAGCATCCTTGTTTTAATGAAATGAGAAACACAGGAGAAGGTTATAGAGTGGTTGGTAAACTTACTAATACTGACAGAATAATGAATCAATCTTTATGGATTGGCGTATATCCAGGTATGACACATCAAATGCTTGAGTATATTATCTCTAAAATTACTGACTATGTGAGGAGATATAGGTGAATGCAATTTTAGTAGAAGACTTTAAAATCATAAATAAATATATCGACAAGTCAGCATTAATGAATAGTAAATGGTTTATAACAGGCTCTACGGGAATGTTGGGCTCATATTTTGTATCATTTCTCAGTTGGTTAAATGAAAATGAGCTGAATAATTCACTTACAATGACGCTGACGCATAGAAGTAAATCGATAAAAGATGATGCAAATATAGGTTACCTGACGAACAAAAAATATATTAATTTTGTGCAAGTTGATTTAAGTTCTGAGTTCGAAGCAATAAAGTATCATGGTGAGTATGACTATGTTGTACACGCAGCATCGAACGCTGCTCCAAGAATATATCTCGAAGATCCTGTAGGCACAATAAATACAAATGTGAGAGCAACACAAATATTGCTTGAAAGTCTTAAGAAATCTAAAAAACTTAAGGCATTTATGTATGTAAGCTCAGGAGAAGTATATGGTAACCCTCCAATGGAAGCAGTGCCTACTCCTGAAAGCTATATAGGTGTGACAGATAATCTTTCAAATAGATCATGTTATGTCGAATCAAAGAGATTTGCAGAAACAATCTGCTGGAATTATTATAAACATTATGGAATGCCTGTGAGGATTATAAGACCTGTACATCTATATGGTCCAGGTTTCAGAGAAAACGATAGCAGAGTTTGGGCTGATTTTATTATGAAAGCAGTGAATGCTAGGGACATAGAAATATTGGGAGATGGGCTTTCACGAAGAGGTTTCTGCTACTTAGCGGATGCTGTTGTACAAATATTACTGGTTTTGTTACATGGAGAAAACGGGGAAGTATATAATATTGGAAGTGATAAGCACATATCAATCAAAGAGTTAGCTGATGTTATTGCATCTTTGACTAATGATACAGTTAGTGTAAAGATAAAAAACGATCTGCCGGACTATTTAAAAGGGAGTCCTCAGATATCATGTCCATCGGTAGAAAAAGTTAGTTCTCTTTCAAAATTACATTATACTACTATAAAAACAGGGTTAGATAGAACAATGAAATGGTATAATATCAAGTTAAAAGGAGAATACGATGAGTGAGAATTATTTTAATCTTATTAGTGAATGCAGGTCATGTAGGAGTAAAAATATTATAGAAATGTATAAGACTGAATACATACCAGTTGCGGGTATTTATTATGATGAGGGTTCTAAACCTCTTAATATTAAGTCACCAATGACTTTGCTATTTTGCGAAGACTGTGGGCTAGTGCAGCTCAAAGAGACTATTAGTTCTAATATATACAGCGACTATAATTTTAGTGGAAATACTATGAATTCGTATAAGAACCATTTGGAAAAGATAGCCGGGCTAATTGTTGACGAATGGAATATTAAGAATAAGCATGTATTTGAAGTAGGTGCAAGTGATGGAGCATTGCTTAAATATATAGCAGACAAAGGAAACAATAAAGTTGCAGGAGTAGAGCCCTCAAAAAAGCTTTGTGATTATGCACATAGCTTAGGTATAGATCTCAAGAATGATTATTTTAATGGAGATTATATAAGGAGAAATCCTGAAGAGAAATATGATTGTGTAGTAGTTAGACATGTAATGGAGCATATTGATGATTTAAATGATATAGCGGATTCCTTACGCAAAATACTAAATGAAGATGGACTGCTTGTAGTAGAAGTGCCTGACGTTGAGGCTATATTAACCAATAATCTTTATTCAAATATATTTCACGAGCATTTGAACTACTTTTCGCAAGTGTCAATTAACAGGTTATTTGCAAGATATGGATTTAAGTCTGTTTATGAAACAAAAGTTAATATCCATGGAGGCTCCTTACTCGTATTTTATAAACTAAGACAATTAGATGAAATAAGCAATATTAGTAAAGAATTCCGTAATAAGCTTAAAAGTTTTGCTGAGAATATTAGCAAGTACTATTCTCGAATTAATAGGCTTATATTGGATTTGTCCAGAGAAAATAAGATTATCCATGGGTATGGAGCATCTCACAGAACTTTCATTTTGCTTGGTAATGCTCATTTGCACGACTGTATACCTATTATATATGACAGTAATCCTTTCCTAGATAATAGAAGACTTAATGGCTTTCATTCATTGGTCATGAACCCTGATACCATAGTAAACAATAATCCTGATACTATTGTGGTTTTTGCAACTTCATATGAAAGCGAAATAGTAAAGGATTTAAGAGAAAAATATCACTATGATAAGCAGATAATATCCTTAAGATTTGAGGCGGATGAATCTAATGATTACAAAAGAGATTAGGAAATCCATATTGCAAATGGTGTATAGATCAAAATCATCTCATATTGGGAGTTGTCTTTCTATAGTTGAAATTCTATATGTATTATACTTCAAAGTTATGCGCATAGATCCTGCTCATCCAGACAATGAGAGCAGAGATAAATTCATTTTAAGCAAAGGTCATGCAAGTGCAGCATTATACGCTACACTTGCTGAAAAAGGTTTTTTCCAAAAACAATTATTGGAGCGATTTTATGTAGATTATGGTTTGCTTCCGGGACATGTAGATATGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP021850|153078:161238|159556_160375_+|AUS95098.1|DBSCAN-SWA MDDKLNSKEFISTNIEGTYTLLEAAKKAWLENDIWAEGKKFVQVSTDEVYGSLGETGYFTETTPLDPRNPYSASKASADMLVKSYYDTYGMPINITRCSNNYGPYQFPEKLIPLMINNCLNGKDLPIYGDGKNIRDWIYVKDHCRAIDLVVNNGQIGEIYNIGGKSEKTNIEIVKTIINTLKDLLEDGDECKSSLGENRIRYVKDRKGHDRRYAIDPSKIKAQLGWEPETSFEEGIIATIKWYLENSKWLNEVTSGEYEKYYSKMYPNRERE >CP021850|153078:161238|157776_158568_+|AUS95096.1|DBSCAN-SWA MNLMITKEIRKSILQMVYRSKSSHIGSCLSIVEILYVLYFKVMRIDPAHPDNESRDKFILSKGHASAALYATLAEKGFFQKQLLERFYVDYGLLPGHVDMKAVPGIEASSGSLGHGLSIGIGMAIANKLSNNPGHIYVLLGDGECNEGSIWEGVMIAPMLKLDNLTVIIDLNKLQGYGRSDEIINQSNIIERWKAFGWDTYDIDGHDTEEIEVALKYYHSMPKVIVANTIKGKGISFMENKLEWHYKSPNTEEYQKALAELGD >CP021850|153078:161238|158569_159493_+|AUS95097.1|DBSCAN-SWA MRNAFVRCLMKQAKKDDRIFVITPDLGYSVFDTFAEEFPDKFLNVGIAEQNAIGIASGLALSGRLVYVYSIIPFMTMRCYEQIRVDVAYMNTNVRIVGVGAGLSYGSAGATHHAIEDIAIMRVLPNMTVCCPGDPLEVEWVMNKSVMYNGPMYIRLGKSGESNIHQQKIGCEFGKAIPLLKGDTLAILTTSNMLEIGFELSKRLREVGLSIELASMPVVKPLDVEYIMQLVERDLSIVTLEEHSIIGGFGSAVAEVIAELNCKVKFKRIAIKDCYSHCVGGHRVLREHFGLCTDKIFCELIGFLADK >CP021850|153078:161238|160380_161238_+|AUS95099.1|DBSCAN-SWA MRGIILAGGSGTRLYPITKPISKQIVPIYDKPMIYYPLSVLMLANIREILIISTPRDLPLYKELFGDGSQLGMSFSYEAQAQPNGIAEAFIVGEKFIGNDSVALILGDNVFYGHGFSGILQEISLLREGACIFGYYVNNPKAYGVVEFDEEGHVLSIEEKPEKPKSNYAVPGLYFYDNNVVQIARNLKPSPRGELEITDVNREYLRRGCLNMQILGRGFAWLDTGTHDSLLEASNFVQTVQKRQGLYVACIEEIAYRNRFITKEQLHTLAKPLIKTEYGQYLMRL >CP021850|153078:161238|156590_157805_+|AUS95095.1|DBSCAN-SWA MSENYFNLISECRSCRSKNIIEMYKTEYIPVAGIYYDEGSKPLNIKSPMTLLFCEDCGLVQLKETISSNIYSDYNFSGNTMNSYKNHLEKIAGLIVDEWNIKNKHVFEVGASDGALLKYIADKGNNKVAGVEPSKKLCDYAHSLGIDLKNDYFNGDYIRRNPEEKYDCVVVRHVMEHIDDLNDIADSLRKILNEDGLLVVEVPDVEAILTNNLYSNIFHEHLNYFSQVSINRLFARYGFKSVYETKVNIHGGSLLVFYKLRQLDEISNISKEFRNKLKSFAENISKYYSRINRLILDLSRENKIIHGYGASHRTFILLGNAHLHDCIPIIYDSNPFLDNRRLNGFHSLVMNPDTIVNNNPDTIVVFATSYESEIVKDLREKYHYDKQIISLRFEADESNDYKRD >CP021850|153078:161238|154169_155528_+|AUS95093.1|DBSCAN-SWA MENSLDKEKALREKVINAAIEHYKVMHGQNKGRFTPGDRISYAGRVFDEKEISYLIDASLEFWLTSGKYADMFERKFAEFLGVNYCSLVNSGSSANLLAFMALTSPELEARAIKRGDEVITVAAGFPTTVAPIIQYGAVPVFIDVTIPECNIDCSLLEKALSSKTKAVMLAHTLGNPFDLEALRNFCDRHGLWLIEDNCDALGTKYYYNDCWRYTGTIGDIGTSSFYPPHHITMGEGGAVYTNNLRLKRIIDSLRDWGRDCWCQSGYDNTCNKRFSQQFGELPYGYDHKYVYSHFGYNLKVTDMQAAIGCAQLEKLPAFIAARKHNWKILRSGLDGFSDKFILPKAAKNSDPSWFGFLIMVKEDAGFTRDEFVDYLESNNIQTRMLFAGNLIKHPCFNEMRNTGEGYRVVGKLTNTDRIMNQSLWIGVYPGMTHQMLEYIISKITDYVRRYR >CP021850|153078:161238|155524_156598_+|AUS95094.1|DBSCAN-SWA MNAILVEDFKIINKYIDKSALMNSKWFITGSTGMLGSYFVSFLSWLNENELNNSLTMTLTHRSKSIKDDANIGYLTNKKYINFVQVDLSSEFEAIKYHGEYDYVVHAASNAAPRIYLEDPVGTINTNVRATQILLESLKKSKKLKAFMYVSSGEVYGNPPMEAVPTPESYIGVTDNLSNRSCYVESKRFAETICWNYYKHYGMPVRIIRPVHLYGPGFRENDSRVWADFIMKAVNARDIEILGDGLSRRGFCYLADAVVQILLVLLHGENGEVYNIGSDKHISIKELADVIASLTNDTVSVKIKNDLPDYLKGSPQISCPSVEKVSSLSKLHYTTIKTGLDRTMKWYNIKLKGEYDE >CP021850|153078:161238|153078_154149_+|AUS95092.1|DBSCAN-SWA MIDVGFWSNKKVLVTGHTGFKGSWLSIWLYSMGAKVMGYSLEPPTEPSLYKICRVDELVVSHIGDIRDKESLITYFMSFRPEIVIHMAAQPIVRESYKNPVGTYEINVMGTVNLLEAVRMSPGVKAVINVTTDKCYENKEWVWGYRELDQLGGYDPYSNSKACSELITESYRSSFFNPNEYDTHGVAIATARAGNVIGGGDWATDRLIPDCIKALLSNNEILVRNPNSVRPWQHVLEPLSGYLILAQKLFEQGPEYSGAWNFGPEFPDARPVSWIVSELCRLWGKNATFRIDKSKQPHEANYLRLDCSKAKQMLGWSPRWDIETALKKVVDWTLEYKDGLDPRESCIRQINEYLNT |
8 | Micromonas_pusilla_virus(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
270916 : 278042
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP021850|270916:278042|DBSCAN-SWA AATGAGGTACGATTATTTAATAGTTGGTGCTGGAATATTCGGTAGTATATTTGCTCATGAAGCAAATAAGCGTGGAAAGAAATGTTTAGTAATTGATAAACGAAACCATGTTGGTGGTAATATCTTTACTGAGAATATTAAAGGTATTAATGTTCATAAATATGGTGCACATATTTTTCATACAGACAATAAAAGAGTTTGGGATTATATGAATAATTTTGCTGAGTTTAATAGGTATACTAACTCTCCGATTGCTATTTATGAAGATGAACTTTATAACTTGCCGTTTAATATGAATACGTTTTATAAGATGTGGGGCGTAAAAACACCTGCTGAAGCTAAAGCAAAAATAGAAAAGCAGATTGCAGAAGCTAATATTTCAGTACCAAAAAATTTGGAAGAACAAGCTATAAGTTTGGTTGGCAGGGATATTTATGAAAAATTGATAAAAGGATATACAGAAAAACAATGGGGTATGAAAGCGACAGAGTTACCTCCCTTTATAATTAAAAGATTACCAGTTCGTTTTACTTACGATAACAATTATTTTAATGATAAATTTCAGGGTATTCCAATTGGAGGATACACACAGATTATTGAAAAGATGCTTAAAGGTATAGATGTAAAATTAAATACTGACTTTTTTATATATAGAGATGAATTAGAATCACAGGCAGACAAGGTGCTATTTACTGGTATGATAGATGAATTCTACAATTATTGTTATGGAGAGTTAGAATATAGGAGTTTAAGGTTTGAGCATGAGATACTTGATATGGAAAACTATCAAGGTAATGCTGTAGTAAACTATACAGAGTACGAAGTGCCATATACTCGTATAATTGAACATAAACATTTTGAGTATGGAACACAACCTAAAACTGTAATTACTAAAGAATATCCGGTAAAATGGAAAAAAGGTGATGAACCTTACTATCCAATAAATAATGATAAGAATAATTTAATATATTCAAAATACAAGGAACTTGCTAATAAAGAAACTAAATATATTTTTGGTGGTAGATTAGCAGAATATAAGTATTATGATATGGATCAAGTAATAGAGCGCGCATTATATATGGTTGAAAAAGAAATTTAAAGAATGAAATATTGATAATAACTGAATGGGGGGTGCGGACATAAAGTTGGACACTATTGAGATTCGGGAAGGAGTAACAATACGTGTATTCAAAATATCAGCGAAAAAAGGCATTGCAACTTTATGATCAATGTAAATCTGTAAGTAAGGTTATTCAACAACTGGGATATCCAACTCGAAAAAGACTGTATGATTGGATTGCCGAGCGTAATTCCCTGCCAAGCAGAAAAGCTCCCAGACAAAAATATAACAATACTCCTGAACATCCTAGACATCCACCACTTGAACTTAAGCTTGAAGCAATTAAGCGTTGCTTTGAAATGGGAGAGAATGTACAATTAGTATCAGAAGAAATTGGATATAGCAGAGCCAGTATCTATACGTGGCGAAAAAAGTATATCCTGAAAGGAGCTGCTGGACTTATGAATACCAGTGACAACCCCCGTGGTAAATTGCCCCCAGGAGATACAGTCTCTTTCAAAGAGGTTGAACAGTTGAAAGCTCAGATACTGGATATGCAGTTAGAAATAGATATCCTAAAGGAGACACTAGATGTCTTAAAAAAAGACCCAGGCGCCGATATAACAGTTCTCAAGAATCGGGAGAAGGCAGTGATTATCGGTGTCCTGAAAGATAAGTATTCACTGCCATTGCTTCTACATAAACTTAATCTGCCAAAAAGCAGTTATTATTATCAATGTAATCGGATGAAGTGTTCCGATAAATATGCAACATTACGTACTCGTATTATAGAATTATTCAATAAAACCACGGAGAGATATGGATATCGAAGAATTTATGCATTATTAGTCAAAGAAGGCATTCGTGTATCGGAAAAGGTAGTAAGAAAAACCATGCCTGAAGATAAGTTGATAGTGCGAGACAAACGCAGAAATAAATACAATTCATATAAAGGTGATATTTCACCTGAGGTTCCCAATATCGTTAAACGTGATTTTCATGCTGATGCACCAAATAAAAAGTGGCTTACTGATATAACAGAGTTCGCTATTCCAGCCGGAAAGGTATATCTGTCACCTATAGTAGATTGTTTTGACGGAATGCTTCCTGCATGGAGAATAAGCACAACACCGGATGCCCAACTAGTCAACAGTATGTTAGATGATGCAATAAGTACCCTTAATAATAATGAACATCCAATCATCCATACAGATCAAGGTTGCCATTATCGATGGCCGGGCTGGATATCTAGAATGGATAATGCAGGCCTATGCAGATCCATGTCAAAGAAAGGATGTTCACCAGATAATTCAGCTTGTGAAGGATTTTTTGGAAGATTGAAAAATGAAATATTTTACAATCGTAATTGGGCAGGTGTAACTATAGAACAATTTATAGGAATCCTTAATGATTATCTTATATGGTATAATGAAACTAGAATTAAAATATCACTTGGAAATATGAGTCCATTGGAGTACCGACGAAGTCTTGGATTAGCCTCTTAAGCTGTCCAAGAAAACGTCCGCACCCCCAGATAAGTGCCTGGGACTCTTAGATGCAATAAATGAGGTTTATCCAGATGCAAAGTATCAGCGTTGTACCGTTCATTTCTATCGAAATGTATTTACAGTTACCCCACGTTCCAAGATAAAAGAGGTAGCCGTAATGCTGAAAGCCATTCATGCGCAAGAGAATAAAGAGGCAGCAAGGCAAAAGGCACAGAGTGTGGTTAAGAAACTACGAGAAATGAAACTTAAAGAAGCAGCTGATAAGGTAGAAAGGGGCATCGAGGAAACGCTGGCTTACATGGATTTCCCCTATGCCCATTGGCAAAAATTGCGGAGTAATAATGTTATTGAACGACTTAATCGAGAGATCAGGCGCAGGACAAGGGTTGTAGGAACCTTCCCTGATGGAAACTCAGCCTTAATGTTAGTTTGTGCAAGGTTACGCTATGTTGCAAGCAAGGACTGGGGAACTAAGCGCTACATGAGCATGAAACACCTTGAGGAAATAAACATTGATGAATCACTAATGACAGTTAGTTAGCAGCTGGCTACCAAACGGAATGAATTTGCGAAAAAATCTTGACGGTACCAAGAAGTTTTTAATGAGAAAAGAATGGTAGAAGTTTACAGATTAATATGAGGGGAATATTATATATTGAAAAAGTTACAATTTATCTTATTGATTTGCGTGACATACTTATTGATAAGTTAGTGCTATTTATTTTAGAGAAAATCTCCATTATAACAAATCGAATTTCCCAAAGTGAGTGAGAAGTTAAACTTAAAACAAACTTGTGGGGAAAGATGTGAAGCATTCCATGAATTTTCCGCCACGCTATTTAATGAGAGTTTATCAAATGAGTTTGAAGTAATAATCATGTTGAGTTACTATATTTTAATATTTTGCATTTATGTAATTTAAGTTCTGAATCCTTAAGGAAATACGTTTTGTAAAAGTGGCAAATCAGAAGTACAATTTTGGAAATTTATTATACAGTAGTAAACGCACCATTATAAATTAATTATGAGCAAATAGGTGATAAATATGAAAGGTATCATATTAGCCGGTGGTAGCGGAACGCGCCTCTACCCACTTACAAAAGTAACATCAAAGCAATTGCTGCCTGTGTACGACAAGCCAATGATTTACTACCCTATGAGCATATTAATGGAAGCAGAGATCCAGGATATATTAATCATATCCACGCCTGAAGATACACCAAGATTTGAGGAATTGCTGGGTGACGGAAGCCAGTTTGGCATAAACTTGTCCTATGCAGTGCAGCCTTCACCGGACGGCTTGGCTCAGGCCTTTATCATAGGAGAGGATTTCATAGGTTCTGATTCTGTAGCAATGATTTTGGGAGACAATATATTCCACGGTCATGGATTGAAAAAGCGTCTGGTGGCAGCAGCGAACAAGAGGACAGGAGCGACCATATTCGGATATTATGTAGATGATCCGGAACGTTTTGGGGTAGTGGAGTTTGATGAGGAAGGCAGAGCTATATCTATTGAGGAGAAACCAAAAGTGCCAAAATCCAATTATGCAGTAACCGGCCTTTATTTCTATGATAACCGGGTGGTGGAATATGCAAAGAGCCTTAAACCTTCTGCCCGTGGAGAGTTGGAGATTACCGATTTAAACCGCATTTACCTGGAGGCTGGCGAGCTGGATGTAATACTTTTGGGACAGGGCTTTACCTGGCTGGATACCGGAACCCACGAATCCCTTGCAGATGCGACCAATTTTGTAAGGGAAATTGAGACCCACTCCCATCGAAAGATAGCATGCCTGGAGGAAATCGCTTACCTAAATGGTTGGATTACTAAAGAACAGGTAATGGAAGCGTATGAGGAGTATAAAAAGAATCAGTATGGGCAGTATCTAAAAGATGTAGTGGATGGTAAGTTTATTGACAAGAATTTAATGTATAATAAATACTTACGTGCTGTATATAGAAAAGAGAGGAAGAAGTATGAAAGCTATAAAAACAGAATTGGAGGAAGTATTAGTAATAGAGCTTGACTGTTATGGCGATAACAGGGGATGGTTCATGGAATGCTATAACCAGGATAAGTTCCATAAGCTGGGTATTGATACAGTGTTTGTTCAGGACAACCACTCCATGTCGGCTGTAAAAGGGACTCTTAGGGGACTGCATTTTCAGAATAACCCCATGGCTCAGGCAAAGTTGGTAAGATGCACAAAAGGTGCAATACTGGATGTTGCTGTGGACATCAGAAAGAATAGCCCTACGTATAAAAAATGGGTGGCTGTCGAGCTGACGGAGGAAAATAAGAAGATGCTTTATATACCGAGGGGCTTCGCCCATGGGTTCCTTACTTTGACTGACAATGTGGAGGTTCAGTACAAGGTGGACAACCTTTATTCCAAAGAGCATGACAGAAGCATTCGTTACGATGATCCTACCATAGGAGTGAATTGGGGAGATATCGAACCTATTTTATCCGATAAAGATAGAAATGCTCCATTATTGGATGACAGTGATGCAAACTTTATATTTGAGTAATTGCATTGGAGGATATTGATATGAAAATTCTAATCACTGGCGGTGCCGGGTTCATTGGCGGCAACTTCGTCCATTACATTTTAAACAAGTATCCTGATTACAAAATCCTGTGCCTGGACAAGCTGACTTATGCCGGCAATCTGGAAACCCTGAAGCCTGTAATGGACAATCCTAATTTCAAATTCATAAAAGGTGACATTTCAGACCGGGAATTTATATATGAATTGTTTTCGGAAGAAAAACCCGACATGGTTGTAAATTTTGCAGCGGAGAGCCATGTAGACCGATCCATAGAGGATCCTGGGATATTCCTTAAAACCAATGTGATTGGTACAGGGGTGCTTATGGATGCCTGCCGGAAGTTTGGCATAAAAAGGTACCATCAGGTTTCCACCGATGAGGTGTACGGAGATCTTCCCCTAGAAAGGCCTGACCTTTTCTTTACTGAGGAGACTCCCATTCATGCATCAAGCCCCTACTCAGCGTCAAAAGCATCGGCAGATCTGCTGGTGCAGGCTTACTACCGCACCTACAAGCTGCCGGTTACTATATCCCGCTGCAGCAATAACTACGGGCCATACCATTTTCCTGAGAAGCTTATACCACTAATCATTACCCGTGCTCTGGCTGATGAAGAGCTGCCTGTCTATGGAACCGGAGAAAATGTCCGGGATTGGCTGTATGTAGAAGACCACTGCTCGGCCATCGACCTCATCCTTCATAAGGGAAGAGAGGGAGAGGTATATAATATAGGCGGGCATAATGAACGCACCAATCTCCAAGTGGTAAAGACCATCTTGAAAGAGTTAGGCAAGCCGGAAAGCCTGATCAGATTCGTGGCAGATCGCCCGGGGCATGACCGGCGTTACGCCATTGACCCGACCAAGATTCATAATGAACTGGGATGGCTGCCAGCCACCACTTTTGATGAAGGCATCAAAAAGACAATAAAATGGTATCTGGACAACAGGGAATGGTGGCAGCATATTTTAAGCGGCGAGTATAAAGATTATTTTAACAAAATGTATGGAAACAGACTGGCTGAAAGCTAGGTTTAGAGCGGCTTTCAATTAGCCCTGCCTTGTTATTCAGGTATCACATTGGAAGCAATTGCCGGAGGTTATTGCTTACCAGTGTGGCAAAGAGGTAGTTTTTAGGAGGTAAACGATGAAAGTACTGGTAACCGGTGTTAAAGGTCAGCTAGGCTATGATGTAGTGCTGGAATGTAAAAAACGGAATATTGAAGCCATCGGAGTCGAGATTGACGAAATGGATATCACCGATAAGGCAGCAGTGGAAAAAGTGATCACCGAAGCGCAGGTGGATGCTGTGATACATTGTGCGGCTTACACTGCAGTTGATGCGGCGGAGGACAATGTGGATCTGTGCCGCAGAGTAAATGCCGATGGTACGAAAAATATAGCAGAGGTATGCAAAAGGCTGGATATAAAGATGATGTACTTTTCCACCGACTATGTTTTTGACGGCCACGGCGAGAGACCATGGCAGCCGGAGGATGAGAGAAAGCCTCTTAATGTCTATGGACAGACGAAATATGAAGGGGAGCTTGCCGTGGAAGAATTGCTGCAGAAATATTTTATCCTGCGCATCTCCTGGGTGTTTGGTGTAAACGGAAAGAATTTCGTTAAGACAATGCTGCGTCTGGGTAAAGAAAAAGGGGCAGTCAGCGTTGTTAATGACCAGATAGGTTCACCCACTTATACCGCTGACCTAGCAAGGCTGGTGGTGGACATGATCCAGACTGACAAGTACGGAATATATCATGCAACCAATGAGGGTTTCTGCAGCTGGTACGAATTTGCCTGTGAGATATTCAAGCAGGCTGGAATGATGGATGTGAAGGTAACTCCTGTGGACAGTACAGCTTTTCCTGTAAAAGCTCTAAGACCTAAAAACAGCCGGATGAGCAAGGATAAGCTGGACGCTAATGGTTTTAAAAGGCTCCCCATCTGGCAGGACGCGCTCCAGCGGTATTTGAAGGAGATTGGGTGTAATGAAATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP021850|270916:278042|274528_275512_+|AUS95185.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPLTKVTSKQLLPVYDKPMIYYPMSILMEAEIQDILIISTPEDTPRFEELLGDGSQFGINLSYAVQPSPDGLAQAFIIGEDFIGSDSVAMILGDNIFHGHGLKKRLVAAANKRTGATIFGYYVDDPERFGVVEFDEEGRAISIEEKPKVPKSNYAVTGLYFYDNRVVEYAKSLKPSARGELEITDLNRIYLEAGELDVILLGQGFTWLDTGTHESLADATNFVREIETHSHRKIACLEEIAYLNGWITKEQVMEAYEEYKKNQYGQYLKDVVDGKFIDKNLMYNKYLRAVYRKERKKYESYKNRIGGSISNRA >CP021850|270916:278042|275462_276017_+|AUS95186.1|DBSCAN-SWA MKAIKTELEEVLVIELDCYGDNRGWFMECYNQDKFHKLGIDTVFVQDNHSMSAVKGTLRGLHFQNNPMAQAKLVRCTKGAILDVAVDIRKNSPTYKKWVAVELTEENKKMLYIPRGFAHGFLTLTDNVEVQYKVDNLYSKEHDRSIRYDDPTIGVNWGDIEPILSDKDRNAPLLDDSDANFIFE >CP021850|270916:278042|272097_273480_+|AUS95184.1|transposase|DBSCAN-SWA MYSKYQRKKALQLYDQCKSVSKVIQQLGYPTRKRLYDWIAERNSLPSRKAPRQKYNNTPEHPRHPPLELKLEAIKRCFEMGENVQLVSEEIGYSRASIYTWRKKYILKGAAGLMNTSDNPRGKLPPGDTVSFKEVEQLKAQILDMQLEIDILKETLDVLKKDPGADITVLKNREKAVIIGVLKDKYSLPLLLHKLNLPKSSYYYQCNRMKCSDKYATLRTRIIELFNKTTERYGYRRIYALLVKEGIRVSEKVVRKTMPEDKLIVRDKRRNKYNSYKGDISPEVPNIVKRDFHADAPNKKWLTDITEFAIPAGKVYLSPIVDCFDGMLPAWRISTTPDAQLVNSMLDDAISTLNNNEHPIIHTDQGCHYRWPGWISRMDNAGLCRSMSKKGCSPDNSACEGFFGRLKNEIFYNRNWAGVTIEQFIGILNDYLIWYNETRIKISLGNMSPLEYRRSLGLAS >CP021850|270916:278042|270916_272014_+|AUS95183.1|DBSCAN-SWA MRYDYLIVGAGIFGSIFAHEANKRGKKCLVIDKRNHVGGNIFTENIKGINVHKYGAHIFHTDNKRVWDYMNNFAEFNRYTNSPIAIYEDELYNLPFNMNTFYKMWGVKTPAEAKAKIEKQIAEANISVPKNLEEQAISLVGRDIYEKLIKGYTEKQWGMKATELPPFIIKRLPVRFTYDNNYFNDKFQGIPIGGYTQIIEKMLKGIDVKLNTDFFIYRDELESQADKVLFTGMIDEFYNYCYGELEYRSLRFEHEILDMENYQGNAVVNYTEYEVPYTRIIEHKHFEYGTQPKTVITKEYPVKWKKGDEPYYPINNDKNNLIYSKYKELANKETKYIFGGRLAEYKYYDMDQVIERALYMVEKEI >CP021850|270916:278042|277184_278042_+|AUS95188.1|DBSCAN-SWA MKVLVTGVKGQLGYDVVLECKKRNIEAIGVEIDEMDITDKAAVEKVITEAQVDAVIHCAAYTAVDAAEDNVDLCRRVNADGTKNIAEVCKRLDIKMMYFSTDYVFDGHGERPWQPEDERKPLNVYGQTKYEGELAVEELLQKYFILRISWVFGVNGKNFVKTMLRLGKEKGAVSVVNDQIGSPTYTADLARLVVDMIQTDKYGIYHATNEGFCSWYEFACEIFKQAGMMDVKVTPVDSTAFPVKALRPKNSRMSKDKLDANGFKRLPIWQDALQRYLKEIGCNEI >CP021850|270916:278042|276037_277069_+|AUS95187.1|DBSCAN-SWA MKILITGGAGFIGGNFVHYILNKYPDYKILCLDKLTYAGNLETLKPVMDNPNFKFIKGDISDREFIYELFSEEKPDMVVNFAAESHVDRSIEDPGIFLKTNVIGTGVLMDACRKFGIKRYHQVSTDEVYGDLPLERPDLFFTEETPIHASSPYSASKASADLLVQAYYRTYKLPVTISRCSNNYGPYHFPEKLIPLIITRALADEELPVYGTGENVRDWLYVEDHCSAIDLILHKGREGEVYNIGGHNERTNLQVVKTILKELGKPESLIRFVADRPGHDRRYAIDPTKIHNELGWLPATTFDEGIKKTIKWYLDNREWWQHILSGEYKDYFNKMYGNRLAES |
6 | Enterobacteria_phage(66.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
328318 : 353504
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP021850|328318:353504|DBSCAN-SWA TATGAAAATATATAATACCCTTACCAGACGCAAGGAAGAATTGAAACCAATTACAGACAACGAGCTGAGGATATATTCATGCGGTCCTACGGTTTATAACTATGCCCATATAGGAAATCTCAGGACTTATGTTTTTATGGACATTTTAAGGAGAGTATTGAAATATAACGGATTCAAGCTAAAGCATGTGATGAACATAACCGATGTAGGACATCTGGTATCCGATGCCGATGAGGGCGAAGACAAGATGATGAAGACGGCAAAAGAGCAGCAAAAATCGCCTTGGGAGATTGCGGAATACTATACCGGCGTTTTTTTCAGAGATATAGCTGCTCTGAATATTGAAAAGCCTGAGATTATTGCAAAAGCCACAGAGCATATTGATGAAATGATTGAGTTTGTGCAGGGCCTGGTGGAAAAGGGCTATGGTTATGAGACCAGTGACGGGATATATTTCGATATTTCAAAGCTCCCGGACTACGGAAAACTGTCGGGCATTGACCTGGAGGGCCAAATGGCCGGCGCCAGGGTGGAGGTTAATGATGAAAAAAGGCACCCGGCGGATTTTGCACTGTGGAAGAAGGCACCGAAGGAGCACATCATGCAGTGGCCAAGCCCATGGGGCATGGGATATCCGGGATGGCACATAGAATGCTCCGCCATGGGCAGAAAGTATCTGGGGGATACTTTTGACATACATACCGGAGGTGTCGACCATATACCGGTACATCATGAAAATGAAATCGCCCAGTCGGAAGCCCTGCTGGGACATCCGGCGGTGAAATATTGGATGCATGGGGAATTCCTGCTGGTGGACAATGGCAAAATGTCCAAAAGCCTCGGGAATACTTATACAATAGAAGACTTAAAGGCCAGGGGATTAAACCCTCTTGCTTTCAGATACTTGTGCCTGAATGCCCATTACAGGAACAAGCTGAATTTCACATGGGATGCGATACAATCGGCCCAGGTATCCCTGGACAGGCTGCTTGAAGGAGCTCTTGCCCACAAAAATGGCACGGCTTCTGTTGATGCGGAGCTGATCGCAAAATTCCGCCAGGACTTTGAAGAGGCGATAAATGACGACCTGAATATACCCAGAGCCCTTGGTATTGTATGGAATGTAGTGCGGTACCATGAAAAATCCAAGGATTTGTTTGATCTCCTCGTGCTTATGGATTCGATACTGGGACTGAATATAGATAAGGTGCAGCCCAAAGAGGAAAAGCAGGAAGAAATCGATCCAGAAATCGAGGAATTGATACGGCAAAGGCAGCAGGCCAGAAAGGAAAAGAACTGGAAGCTGGCTGATGAGATCCGGGACAAGCTTAAAGAAATGGGAATACTGCTTAAGGATACCCCGGAAGGTGTTAAGTGGGAGAAGATATAATACAGCAAATTTGATTGTTCAGCCCTTTCAAGACCTGGATGGGGATATGTGACAATAGTTAGATATTTGCTGTTGTCGCTTGTTGGAGCTGTCCGAAGAGCATGGATTTCCAGCTTTCCCTGGAAAAAGTGAAATGCCATTGGAGTTATGGAGAATTAATCGGATATGGTGATTATCCGTTGATTATCTGTGTAAAATAAAAGGGGAGAATAACCGGGCATTGGCTCGCCAGATTTCCATGGACTTGATTTGGGCTGGGACTGGGTTTCAGGTGTTACATGAGCCTGGTTTAGGTCCTAAGCCTGGGTCAAGCTTCAGGTGTTTTACGGGCCTGTTTTAGGTTTCAAGCTTGGGCCTAGCTTCGGGTATTTCACATGCCTGGCTTAGCATTTTAAGTTTAGGTTGAGCTTCAGACATTCCGTAAGCCTGAATCAGATCTTAAGCCTGGAACGAGCTTAATGCTGTTCCGCAAGTTTGAGATAGGTTATAAATTTGGACTATATTTGATTTAACTTTGATTTAATTAAAATTTTGAATAATATAATTTGTTTTGCTTTTAGGTACCACATGGAAAGCAAATATTGAAAAGCTTGCCCAACCCGAAGTGTGGTTTTGACCCACAAAAAGCTAAGTTCTTACGGCTTCGACAAGCGGATTAAGCAACGCATAGAGAAGTCGAGGATGATTGGAAGTCATTGCTATCCAATGTGGCAATGCAGTGCTTAGCCGGAATAAGGCTTGATGCAGATTTTGGATATTTTAATCTATTGAAAATAAGGTGCTTTGTATTGGAAGAAGTGTTTAAAGAGGTTATAAAGGAATTTAACAAAGAAATTACGGACAAAAAGGATCCGTCCCAGATAAATCCGCTGGTGCTGGCCTATATCGGTGACGCAGTTTATGAGCTGTATATAAGGGCACTCCTGGTGTCCAGGAGCAATGCCCATGTCCATAAACTGCATGTAGATTCAATAAAGTTTGTAAAGGCTAAAGCCCAATCGGACATATTGCACAGGATAATGGGGAATCTTACGGAGGAAGAGCAGGATATTGTGAGGAGAGGCAGAAATGCCAAATCCGGTACTATTCCTAAAAATGCCGATGTGACAGAGTATAAGTATGCAACGGGTTTTGAGTCTCTCATAGGCTATCTGTACCTCACCCATGCCTATGACCGTTTGGTGGAGGTTTTAAAAATGGCTGTTTCTGAAGATGCAGCCCAGAGCTAACCTGGATTTTGGTATGGTGGCGAGCATGTACCGGAACCAATTTAAAATAACACGAAGGCAGGTTGTGACAGATGTTGGCTAATAAAAAGAAGGGTAATAGAAGAGCAGATGGCAGCAGATTTGATGGTAAAAAATCTGATGATAAAAGATATGACAGCGAAAAGGCTCAATATAAATCAAAACATAAAGACTCGGATGATTTCAGGGATGGTACCGGCCGCTATGAGCCTTCCCCTGAGGAAGCTGCCGAAAGAATAGAGGGCAGAAATCCTGTGATAGAGGCTATCAGAGCGGATAGGGCAATCAATAAAATTTTCGTATCCAAAGGCGAAAAGGAAGGATCAATAAAATATATCATAGCGCTGGCAAGGGAAAAGGGTATAGTGGTGCAGGAGGTGGACAGATCCAAACTGGACACCCTGTCCATAACCAGAGCTCATCAGGGAGTCATTGCTTTTGCAGCGGCCAAGGAATACGTGGATGTGGATTATATACTGGAAGCTGCTGCTTCCGCCGGAGAAGCACCGTTTATAATAATTCTGGATGAAATCACCGATCCCAACAATTTTGGTTCAATATTGAGAACGGCAGATGCGGCAGGTGCTCATGGGGTAATCATACCCAAGAGGAGGGCTATTGGCCTTACGGCTACGGTATCAAAAGCGTCAGCCGGAGCGGCTGAATATGTTCCTGTAGCTAGGGTTACAAATCTTGGACAGACGATAGATTACCTCAAGAAAAACGGTGTCTGGATCGTAGGGACGGACTTGACCGGTGAGAAGCCTTTCTACGACAGCGATTTGAAAGGACCGATCGCCCTTGTGATAGGCAGCGAAGGAGAAGGCATGGGAAGGCTCGTCAAGGAAAAGTGCGATTTTATCGTAAATATCCCTATGAAAGGCCATGTGTCCTCACTAAATGCTGGTGTTGCGGCAGCAATTGTCATGTATGAGATATTAAAACAGCGTAACAAATAATGTAACTAAGACGACAGGTTTAAACAGCAATATCTGTTCGTTGATGGTTCTTTGCAGAGCCGGTTGAAAATAACCGAATGTTTTGAAAACATTTTGTTATAATCTGATTTGATGCTCTAAAAACAGGATAATTTCAACCAACAGTGGCAAGGACCTGTCTATGGCTATTAGCGCAGGGAAAGGCGTATCCATATCTTAAAAAAAGACACCCTGGAAGACTGAAGGGATAAACCCTGCTGGATGATGTGCAGCTAACCGGGGGATTCAATTAGAAAATATTATAATCGCATCCTATGCCCATATGTTTAAAAACGGGCAGGGAATCAGAAATCTATGATTTTTTGAGAAATATATATTCAAAAGAAAAGGAAACTGCCGATAAATATATAAAGGCTTGTTTACCATAATTTTTTTCTATTCATAGGGCAGCTGGTACAGAGTCAGATTGAAGGTCTCCGACCATTTTGAACAGGGGTTTGTATAATTGGCCAGTGATAGGACAAGAATGCCTCCGATGGGACTGAGGCATGAAATATAAAGATTATCAGGATTGTTAAAGAAGCAATGGATAAATAGTTGCAAAAAAGGAATCCTATTATGTCAAATGCCACGCTGATTTGTTCGAAATTTTAGGGAAAAATTGGAATGAAAAGTTTTAATTGACATAATAGCGTGTTTTTCTTATAATTATTAATATGTGACCTTTCTGACTTGTTATCAGCTCATATTATGTCATTGCTTATGTAAACAAGCAATATAAAATATAGGTTATGCACTTAATGCAGGGGGGCGTTATCTTGAATTCGAATACACGTATAGGTGTAGTTGGATCTTACAGTACTATGCTTGATGAAGAAATCATAGAAGAAGCACAGGCTGGTGACATTGGAGCCCTTGAATATTTAATCAACAAGTATAAGGGCTTTGTACGTGCCAAGGCTAGAACCTATTTCCTTATTGGCGCTGACAGGGAGGATATTATCCAGGAAGGAATGATAGGACTTTTTAAGGCAATAAGGGATTATAGAGAGGACAAGCTGTCATCATTTCGCGCCTTTGCAGAGATTTGCATTACGCGTCAGATTATTACCGCAATAAAGACGGCCACCAGGCAAAAGCACATTCCTCTGAATTCCTATGTTTCTTTGAACAAGCCTATCTTTGATGAAGAATCCGACCGCACGCTTATGGACGTAATAAGTGAAGAAAGCATAACCGATCCGGAAGAGATGATAATAAACCGTGAGGAATTTGCAGGTATTGAAGATAAAATGGGTGAAATTCTCAGCGATCTCGAATGGGAGGTTTTGTCCTTGTATTTGCAAGGCAAGTCCTATCAGGAGATAGCCGAAGAATTGGACAGGCATGTAAAATCGATTGACAACGCCCTACAGCGAGTAAAAC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22 | Leptospira_phage(44.44%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
600374 : 658744
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP021850|600374:658744|DBSCAN-SWA 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MSKTPEELLEKGFEEYIEEHLLKNGYVKGSPDDYNKEYALDTKLLFEFLENTQPKKMDKLRQIHKDQYEFKILKRLNTELNNRGMIDVLRHGIKDYGVYLDLAYFKPASKLNNEMVKLYEKNRISVTRQVHYSTKNENSIDMLICVNGLPVVVLELKNAFTGQTYEDAIIQYKKDRSPNELLFQFKKRAIVFFAVDTSEAYMTTRLSGDKTSFLPFNKGCDGGKGNPDNPDGLKTAYLWEEILQKDSLMDILKKFVFIQTEEKKDMDGNTYTSETVIFPRYHQLDAVRKLEADAREKGVGTNYLVQHSAGSGKTNSISWLAHRLANLHDDEDMPVFDSVIVITDRRVLDRQLQDSIYQLEHKHGVVQKIDKDSNQLADALKSGTRIIISTLQKFPFIIEKVGELQSRKYAVIIDEAHSSSAGENMASLREVLSVSTLEEAAKLDEELEGKEYDPEEEILKTIKKRGKQPNISFFAFTATPKAKTLEMFGTMGEDGLPHPFHLYSMRQAIEEGFILDVMQNYVTYETYFKLAKKIEDDPTFDRAKATKALTRYVSLHPHNIAQKTEIMVEHFRSVTRHKIGGRAKAMVVTSSRLHAVRYKHAFDEYIKKKGYKDMKTLVAFSGTVKDGDVDYKESDMNGFKESELPERFATDEYQVLLVAEKYQTGFDQPLLHTMYVDKKLSGVKAVQTLSRLNRTCAGKADTFVLDFVNKAEDIQEAFKPYYQATIVEEVTEPNLLYDIETMLNSYGVYLKEELDKFAYIYFKPKDKKTSKDRVIINHLIDMAVERFKKLDEQRKQDFSSQATKYIRLYSFILQITPFEDVELHKLYVYLTYLLKKLPKKKGSNVHLADEIALEYYTTKKTFEGSISLSSDDENVPVTPVKFAGTGVKEEQEEYLSSIIERLNKRFGTDFTKADQLSVEQIKEDFASDEDLVQKAKTNTIDDFRLAFEKVFINKVIDRMDQNQAFFTRVLDDEQFKNALMEYMLVETYAKLKNVAS >CP021850|600374:658744|623203_623488_+|AUS95461.1|DBSCAN-SWA MNIQVLKVAGNSSVNSVSDKIIQHAVNDGIVHVDCIGVKATYTAVRAIILATEYLVKEGYKFNLRPYYTEVDVQDNDKMVQKTAIRWTIVAKKK >CP021850|600374:658744|615967_617833_-|AUS95454.1|DBSCAN-SWA MNRSIDSIIAKKISHDVGVLVFQYLNDIEPLIQQSLTAAKLKDYYRLKGKYNKGRFVCPFHPGADNPTSLSLNDNKRNFHCNACGKSGTYLEFIMYMQNFSGRNSLNEAKIFAANNFAGLNLGFNSIADFEQKLKDKILERYHKTNSLRYTDYCNIWLLPERYFSYTAESQGRQCQGEEQQIKPSFKVSPSNSTNKPGFILEALDLEMTIRHHKAQNIIDNGITDYDKAIQDAKNSKLINDFTQNADKLNSVDKLSDFMSKKYNIDIDTALRYGLIYFDKDSQKQLYYSDFFMLNDRVLFPVQDHETGIVVGYQCRQTDLNAPKQYKYLNVTDYQDNLTANKNGTAFRNFVPFKPGNFLFNLYELKNKCINALWITEGIADAIKLSCMGYDAVSPGQANLTDFHIYLIDKYCGKDVVINLFFDNDDHKVGQSKSIAAAYRLWQFGFRNIRIISTFKELGKDITDCSVKLRDDNMLRLLISLWEKQAYSFTPASNEDLNTLLKTGLYTENEIMCIDPRDINQMTNFAEAIVKHIDLKDMTYQQLAVLKKLCCFREEEIKILFNLSTKDYHDMQDTDETETAIKENGNINAGNAQEERNAGENLINISKAQLFHLKKRFNLDL |
57 | Liberibacter_phage(15.38%) | transposase,integrase | attL 614543:614602|attR 664107:665535 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2918689 : 2968708
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP021850|2918689:2968708|DBSCAN-SWA 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49 | Leptospira_phage(35.71%) | tail,transposase,head,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2981229 : 3036255
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP021850|2981229:3036255|DBSCAN-SWA TATGGAAAACACAGTGAAATCAACGGTTACAATAGAAAAACTCCAAACAGAAATTGAAATATTGAAGCAGGAAAAAGCCGAGCTTGAAGCAAAACTCAAATGGTTTGAAGAACAATTCCGGCTGCATCAGCATAAGCTTTTTGGGCGTTCAAGTGAAAAGACGGAAGTCCCTGAACAGCTAAATCTTTTCAACGAGGCGGAATCAGAAGCCAAGCCTGCAGTTCCCGAACCAACATTAGAGGAAATTACATATAAACGTCGTAAAAAGCAGGGGCACAGAGAAGAAATGCTTAAAGACATTCCTGTAGAGACCATAGAGTATCGCTTGCCTGAAGAAGAGCAGGTTTGTGATTGCTGTGGCGGCAAACTGCATGAAATGAGCAAGGAAGTAAGGCGGGAAATAGAAATTATTCCGGCTCAGGTGCGTGTAAAGGAACATGTGCAGTATGTATATGGCTGCCGTAATTGCGAGAAGAATGAAATATCTACACCGATAGTAACAGCCCCAATGCCAAAGCCGGCACTTCCTGGAAGCCTGGCTTCGGCATCCGCCATAGCTCATGTAATGACGGAGAAATTTGTAAAAGGGCTTCCTCTTTATCGTCAAGAGCAGGACTGGGAGAGGATGGGGATTGAAATATCCAGGCAAACCATGGCGAACTGGATGATACAAAGCTCCGACAGGTGGCTGCGGCCGATATATGAACGAATGCGGGAACACTTGCAGCAAAGGGACATCCTCCATTCCGATGATACTACCCTCCAAGTACTCAAGGAACCCGGGCGAGCCGCAGATTCAACCTCCTACATGTGGCTATACCGGACCGGCCGGGAAGGGCCTCCGATTATTCTTTATGACTACCAAACTACCAGGGCTGGCAAACATCCTAAAAAATTTCTTGAAGGATTCAAAGGTTACCTTCATACGGATGGGTATGATGGTTATAGTGGCATGCCCGGAATCATCCAGGTTGGTTGCTGGGCACATGCAAGGCGTTATTTTGTCGACGCCTTAAAAGCCATGCCTCCAAAAAAAGATGACAAGCCCACAGTAACAGAAGAAGGTTTGGCATTTTGCAATAACTTGTTTGAGATAGAAAAAATGCTTCATGATGTTACACCGGAAGAAAGATATGAGGGCCGATTGAAACACAGCCGACCAGTGCTTGATAAATTCAAGGAATGGCTCAAATACTGGAGTCCAAGAGTAACTCCCAAAAGTTCATTAGGAAAAGCAATCCAATACTGCCGGAACCAGTGGGACAAGCTGGAGGCCTTTATGCTGGACGGCAGGCTAGAGATTGATAACAACCGAAGTGAACGGTCGATAAAGCCTTTTGTAATCGGGAGGAAGAATTGGCTGTTTAGCAACACGCCTAAAGGAGCCAATGCCAGCGCAACAATTTACAGTATTGTGGAGACGGCAAAAGAGAATGGGTTGAACCCGTTTGAATATCTTACTTATCTCTTTGAACGTCTACCGAATATAAATATCAAGGATCAACATGCATTAGACACCTTGTTGCCATGGTCAGCAAATCTTCCGGGTCATTGCAAAGTGCCCAATAAATAATATATATTATGCCCCTGCTAAATCAAAGGTGGGGGCTATTTGACGCTTACTTTGTTCAAATTGCACAGCTTCTTCGTACGTATGAAGATATTTGAATATTTCATCGTTATTGTGAACTATGCCATGTTTCTCTCATTCGTGATGAAATATCTCCATCAGTTTTTCGTTATTATCACTTTTCAGTTCATAGCTAAAGCCGTATTTTTTATGATAAATTTGCCTTAAGCCCGGAAAGTGCTCATCAAGTTTTTATAAAAGTATTCTCTGCTTCCCTCTCTCAAAGTTAATCCCATTCCAAAGCAAATTATTCCAATCACTTCAGCATCAATGCAATAATCAAGTATGCCTTTAAGATTTTCCTCCGTATCATTTATAAATGGTAAAATTGGATCAAGCCATACTATAGTGGGAATCCCATTGTCCCTCATTTTTTTCAGAACTTCGTAACGCTTTTTAGTTGTGCATACTGCAGGCTCAATTAATTTGCACAGGTTCTCATCATATGTTGTCATAGTCATCTGAACAACGCATTTCGATTTGTTATTTATGCTTTTTAATAAATCCAAATCCCTTAGTATTCTGTCTGATTTGGTCTGAATACTTAGTCCGAATCCATACCTGTCAATAATTTCAAGGCACTTCCGTGTATGGTTGAGCTCTGTTTCAATATGCATGTATGGGTCGCACATGGAACCAGTTCCTATCATGCATTTTTTGCGTTTTTTCCTGAGGGCATTTTCCAGAAGCTCAGGAGCATTTACCTTAACCTCTATATCCTCAAAATCATGCTCCATCTTATAGCACTTGCTTCTACTATCGCAATAGATGCAGCCATGGGTGCAGCCACGATATACATTCATTCCGTTATTGGCAGATAAAATTGTCTTTACCTCTTTGTAGTGCATATTGCCCATCCTCACTGCTTTTCGTATAATTCCAAAAGCTTTCTTGCCCTATCGGTAATAATGTTCATGATATGCTGGGGCTCCAAAACCTTCACATAACTGCCGAATGATAGTAAATGCCCGTAAACCCATTCATCTACAATTATACCGCATTAATATGACAACAGATAGTCATATTTGGAAACTTTACCTGCCTATTGCTTACAGTTCACACCCGCACCGGCAAAAAGCAAAAAGAAACGCCTGTAGACCCTTGATACTGTTCCATTTAGGTCATTACCTGCTAATAGTTTTCTGCATACTCCCTGCCATCTTACAAATGCATAGGTACCGTCAAGATTTTTTCGCAAAATCAATTACCGGTTGGTAAGCATTGATTAGCCGACAGTCATTAATGAATCATCCATGTCGAATTCTTCAAGGTGTTTCATGCTCATGTAGCGCTTAGTTCCCCAGTCCTTGCTTGCAACATAGCGTAACCTTGCACAAACTAACATTAAGGCTGAGTTTCCATCAGGGAAGGTTCCTACAACCCTTGTCCTGCGCCTGATCTCTCGATTAAGTCGTTCAATAACATTATTACTCCGCAATTTTTGCCAATGGGCATAGGGGAAATCCATGTAAGCCAGCGTTTCCTCGATGCCCCTTTCTATCTTATCAGCTGCTTCTTTAAGTTTCATTTCTCGTAGTTTCTTAACCACACTCTGTGCCTTTTGCCTTGCTGCTTCTTTATTCTCTTGCGCATGAATGGCTTTCAGCATTACGGCTACCTCTTTTATCTTGGAACTTGGGGTAACTGTAAATACATTTCGATAGAAATGAACGGTACAACGCTGATACTTTGCATCCGGATAAACCTCATTTATTGCCTCTAAGAGTCCCAGGCACTTATCTCCTATGAATAGCTGGACTCCAGTTAGTCCTCGCTCCTTTAAACCTGCAAAAAGGCTAGCCAGCTTGCTTTATCTTCTTTCATTCCTTCAGCGGCACCAATGACTTCTCTGTAGCCTTCTTCGTTTACCGCCATTGCTATGAGAATGGATACATTCTCATATTCGCCACCCCAGTTGCGTTTTAAATAGATTCCATCCAGGTAGACATACGGATATCTATTTTTCAGTGGTCTATTACGCCATGCATCAATATGTACATATACTTTCTTATTTAGTTCACTGATAGTGCCAGGAGAGACTCTTGTCCACCAAAGGGCTTCGGTAATATCCTCGACTCGCCGTACCGATACACCCGCCAAGTACATTTCTATTAGAGCTTCTTCCACTGAACTTTCACTCCGACGGTATCGTTCAATTATTGCTGTTTCAAAGGCTATCCCTTTTAATTTAGGCATCTTTAGCCTCACATTTCCCGATGTTGTGGTCAGATTTCTTTCATAGTGACCGGATCTATAGCCCTGCCTTTCCGAAGTGCGCTCATAGCGTTCTGCTTTAGTTAGTTCTGCCGCCTCTTGCTCCAATAACTGATTAAGAGTTTCCTCAACACTACTGCGAACTAAATCTTTTAATTCCTGCTTTATTACGCCTTCATTTAGTTGTATAATTTTATCTGACATGGTTCGTAACCTCCTTTGGTTGGTTTTTGTGTAGCAACTTAATTCTACCAAACGGTTACGTCCATGTCATTTTTTATTGGACTTTTATGAATTTGCGAAAAATATTATACTTTATCAATGCATACAGAAGCCTTCGATCTACTAAATTTAATAATTAGACCCTCATGCCACTAAAGTAGCACCATCAAATTGATGAAAACGAGCAGCCGTTACGGTATACTATAGACATACGGTGAAGAAGGTCGAACTATCTTGGTGCGTGAGAGCCCGTGGATTAGACTGATTTCAGCTTCCTGCTTGTACCACAAATTGTTGCCCCTTACAGGGAGCACGCAGGGTAGAATAATGAAGTACAGGGAGCTGCGCCGGAATATTACAACCATAGGAGTTGATATTAATGGAAGTAGTATACCAGCGTTGTTGTGGGTTGGATGTCCATAAGGACAAAATTGTTGCATGTGTGATTACTGAAAGCAAGAAAGAGATTCGCAGTTACGGGACAGTAACCGAGTCGTTGATTGAGCTGGTAGATTGGCTGAAAGAAGAGAGCTGTGAGAATGTTGCAATGGAAAGTACAGGATCTTACTGGAAGCCAATATACAATCTACTTGAATTGGAGGAGATACCGGCAATGGTAGTCAATGCCCAGCATATCAAGGCGGTGCCGGGCAGAAAGACGGATGTCAAAGATGCAGAGTGGATAGCGGAGCTTTTAAGGTATGGACTTCTTAAAGGTAGCTATATACCAAACCGGGAGCAACGTGAATTAAAAGAGTATATACGATATAGGCGAAGCATGATAGAAGAACGTGCCCGCGAATTAAACCGGGTACAAAAAGTGCTTGAAGGGGCAAATATTAAGCTTTCATCAGTAGTAAGCAACATAGATGGAGTATCATCAAGAAGAATGCGTGAGGAAATCATAAAAGGTACTGAGGATACAGAAGTGCTT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43 | Leptospira_phage(53.85%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3047742 : 3088758
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP021850|3047742:3088758|DBSCAN-SWA 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>CP021850|3047742:3088758|3065359_3065956_-|AUS97340.1|tail|DBSCAN-SWA MATIGLDRLYYAKITENENGEETYDTPVPLAKAITAELSVELAEATLYADDGAAEVVKEFQSGTLTLGVADIGVDAAEVLTGATLDDNKVLISTSEDGGAPVAIGFRAKKANGKYRYFWLYRVKFGIPATNLQTKGDSITFSTPTIEGTVMRRNKPDGQGKHPWKAEVSEDDPGVLPETIAGWYTEVYEPVFAVGGGS |
47 | Erysipelothrix_phage(77.14%) | tail,holin,terminase,transposase,portal,head,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3315520 : 3322876
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP021850|3315520:3322876|DBSCAN-SWA 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6 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3486173 : 3493355
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP021850|3486173:3493355|DBSCAN-SWA AATCGATGTTCCTCAAGATCTAGAAAGTACATTTGAACCTAAAATCGTTAAGAAGCGTCAAAAGGACATTTCCAATATAGATGCCATGTATGCCAAGGGGCTTACAACACGGCAAATATCCGATCAGATTAAAGAAATATATGAATTTGAAGTTAGTGAAGACATGGTTTCAGATATCACAAGCAAACTTTTACCTGAGATAGAAGAATGGCAGCAAAGACCCCTATCCAGCATATATCCGATAATATTTATTGACGCAGTTCATTTTTCAGTAAGAGATAACAACGTCATCAAAAAACTTGCTGCTTACATTATACTTGGCATTAATCAAGATGGACAAAAGGAAGTCTTAAGCATTAACATAGGTCAAAATGAGAGCAGCAAATACTGGCTTAGTGTACTTAATGAGCTAAAAAATCGCGAAGTAAAAGACATACTAATTCTATGCGCTGATGGGCTTAGTGGCATCAAAGAATCCATAGCGGTAGCTTTCCCTAATACTGAATATCAACGCTGTATAGTTCATCAGGTCAGAAACACCCTGAAATACGTTGCGGACAAGGACAAAAAGGAGTTTGCAGCTGATTTGAAGACAATCTACCACGCGCCTACTGAGGAAACCGGATATGAGCGTATGTTAAAAATAACAGATAAATGGCAGGATCGTTATCCAAATGCTATGAAAAGTTGGGAGGCAAGCTGGGATGTCATATGATATGAACCCAAAATGTTAGACAAAATAATATGGAGAATGGAGGAAATGAGGATGAAGTATACATCAGAATTAAAGAAAGAGGCTGTCCGATTAGTCTTATAAGAAAATAATACTGTCATAGCTGTAGCGAATGTGCTGCAAATAAGTGATTCTTCTATAACATTTTGGGTGAGATTAGTTAATGAACATGGATACGAAATTTTAAATAAAAAGCCATCCAGGAATTATAGTGGTGATTTCAAAGTTAATGCGGTAGAATATATGCATAAACACCATTTGTCATTATGTGAGGCAGCTCCTGTCTTTGGTATCCCTACAACTAGTATTCTTGGTAAATGGGAAAAAATATATTATGAGAAAGGACCGCAGGGCTTAAGGGAATGGAAGCCTTGCAGGAAACCCAAAATGAATAAAGACCGCATTAATAATCCTCAAAATATCGAACCTACGTTAGAAAAAAATCTTATCGCTGAAGTAAAGCAGCTGCGTATGGAGAATGAATTCCTAAAAAAACTCAATGCCTTAGTTCTGGAACGCATAAAGCGAGAAAGTGCGAAATAATTAATGTCATCAGTGAACTAAGGCAGAGTTACGATTTGATGGCGTTATTGAAGTTGGCTGGGATAGCAAGAAGTACATACTATTATTATCAAAAACGTATGAAGCAGCCGAGTAAATATGAAAGTATTAGAGCAGAAATAAAGCGCATTTATGCCGAAAATCAGAGAAGATATGGATATCGCAGAATCTGCATCGAGTTAAAGAATAGGGGTATCCAAATAAATCATAAAACGGTATTACGCTTGATGAAGGAGCTTGGTTTGCGTGCTATAAAAAATAAGAAAAAGTATAAATCATATAAAGGAGAAGTTGGACATATAGCTCCTAATATAATTAACCGGGACTTTAATGCGAGTTCTCCAAATCAAAAATGGGCAACTGACATAACAGAATTCAGAATACCTGCTGGTAAACTATATCTTTCACCAACAATAGATTTATATAATGGAGAAATAGTCAGTTATAGTATTTCAAGAAATCCGAATTTTAAGCAAACTATGGAAATGCTCGATAAAGCATTTATCAAAATTCCAAAAAATACAAATCTGATTTTGCACTCGGATCAAGGATGGCAATACCAACAGGTTCGTTATCAAGAACGATTGAGGGAAAAGGGAATTACACAAAGCATGTCAAGGGAAGGAAATTGTTTGGATAATGCTGTGATGGAAAATTTCTTCAGTTTATTAAAGAATGAAGTTTTTTATGGGAATGAGAGCAAGTTTTCCACATTGAGCGACTTAAAGATTGTGTTGGAGGAACACATAGATTAATATAACAATAGAAGAATTAAAAACCGGCTTAAAGTTGTCGCCGGTACAATATAGACTTAAAATGGGAGCATAATTAAAGTCTAACATTTAGGGCTCATATCAATATGTCCAATCTTTAAGTTTTCGTCAGATGTGCGCAAAGTAATATACACACAACCAATTCCATAGAAAGTCCTAATAGTACTTACCGCCGTTTAAACCGTCAAAGAAGCGTATTTCCGAGTGATAGGTAGTGTCCTAAGTTTTGTGTAAACTCAAGGATAATATATTTTTTGGTGTTGGGATGCCAGATTTTTTGGTATCCCAGTTGTTTTAACTCTATCATTCGCTTATATTTTAGTCAATACATATTTGTGATTTCTGATTAGATTACGGAATCCTGAAAAGGCTTTTATGCCGCGAAAGCCTCTTGATAATGAGTAAAGCGGCATGTTAGGCTATCAGCCAGGCATCTTCCATGCTGCAGAGGAGTACTCCCTTGTTCAGAATGGGTGGTGCCTGCAGATGCCTTGTAACATGCCAGCAAAGGCTCATTGTCAAGAGGATCGTGGAATAAATGCCCGTAGCTTTATATGTCTTTTTCTGATATCCGCCCGTCAAAATAAATCATAAGCTGATCAAGAATGGTACCCCAACCTTGGTAAGCGCTTAATATAAGTGCGCATAGAAGTTTATCCGTCCATATGAGATAATCCATCCAAAAGTCTTTAGACTTTTTCGAGTTTTTCGACTCTGACTAAAAAGTCTAGAATCTCTAAGGAGGCTATCTCAATATGGATAAAATCACAAATGCCAAAACTGAATTCCGACTCAAGCAGTGGAGCAAGATTATCCAAGCCTGCCAAACCAGTGGAATGACAGTTGTCAGTTGGTGCAGCCAGAACAATGTAAAAATTAAATCGTACTACTACTGGCTGCGAAGAATCCGCACCTTGGCGTGTGAGACCGGATCACTTGTACCTCAGAAACCGGAACAAGAAATTGTCCCAGTACCATTTCACCAGACAAAGGTATCTGCAGCAGTCACAATCCACTTGCCTTCTTTTTGTGTTGATATACATGACGGAACTTCCAGAGAAACCATCGAGGCAGTTCTGTCGGCATTGAAAAGCATATGTTAGGCGATATTACAAGGGCAGAAGATATCTACATTGTCTGCGGGTACTCAGACATGAGAAAGTCAATTGATGGATTAGCGGCTATTATCAAAGAGACATTTGGCATGGATCCCTTTTCTCCGAGCCTGTTCCTCTTCTGTGGGAGACGTCGTGATCGTCTCAAAGCTCTCTTCTGGGAAGGAGACGGTTTTGTACTGCTATATAAGCGTCTTGAGAATGGGAACTTTAAATGGCCCCGTACACCGGAGCAAGCAAGACGGCTTACCCAGCAGGAATTCCGGTGGCTGATGGAGGGTCTGACGATAGATCAACCCAAAGCAATACGAAAAGCAAGAACAGGCGAAATCTACTGATAAAAAAGTGCGTAAAAGTATTGATTTTACAGCATTTAAGCTGGATTTTTCAGGTGAAATATGGTACAATTATCTTATGCAAAAGATAAATTTTACAGGGCTTACGCCAGAACAAATTGAATATGTTTCCACTCTGGAAAAAATAGTGGAAAACCAGCAAATCCGTATCAACCAGCTTACAGAGCTTCTTATCAAATCCCAAAAAGCTCTATACGGCCAATCCAGCGAAAAGCGTCGTTATGTTTTAGGAGAAGACAACGATCAAATCTCACTTTTCAACGAAGCAGAGGTCGAAGCGAACAACAAAGCAGAAGAACCTACCGTACAGACAATTGTGGCTGCCCATACCAGAAAACCTAAAAGAACAAAGGAAGAACTGGCACAGACAGTTCCTGTAGTGGAGGTTGTTTGTGACCTTGACGAGGACAAGCGCTCTTGCGGTATTTGCCAGGCTGACCTTAGATATCTGGGCAAGGAGCATGTCAGGGATGAACTTGAGATTATCCCTGCCCAAGTAAGAGTATTGAGATACATTCGTTTTAATTATGTGTGTACCGTCTGCGAGAAGGAAACCGGAGATGCCAACATTGTCAAAGCGCCGGTTCCAGCCCCGGTCATGAAACGCAGCCTTGCTTCTGCCTCAACAGTTGCTTATGTTATGTATCAGAAATATGCCAACGGAATGCCTTTATACCGGCAGGAGAAAGACTGGGCAAATCAGGGGGTGACACTTTCCAGAGCCACCCTGGCAAACTGGATCATACGTCCAAGCCATGAATGGCTTGAACCAATGTACAATGCCATTCATAAGCACTTGATTTCCGAACCCCTGATTCATGCAGACGAAACTGTACTGCAGGTATTAAAAGAACCGGGACGGAAAGCAACGACAGAATCGCGGATGTGGGTCTACACTTCCGGGCGAAGTCCAACCCCGGCTGTTTTATTTGAATACCAACCGACACGATCCGGCCAGCATGCCCGAAGATTTCTTGAGGGTTTTTCGGGTTACCTTCAGACAGATGGCTATAGTGGCTACAATGCAGTGCCTGATGTTATACATTGTGGATGTTGGGCTCATTTACAACGCAAATTCGAAGAAGCAATTCCCCAGGGGGCTGACACTAAGACTTCCAAGGCGGCTATCGGATATGATTATTGTAACCGTCTGTTTGCCATGGACAAGAAATGGGAGGAACTATCCGCTGAAAGGCGGTATGAAGAACGACTTAAAAATATGAAACCCCTTCTTGATGAGTTCTGGGAATGGGTGCAACAACTAAATCCGCTGCCAAACTCCAATCTGGGGAAAGCGATCACATATGCATTGAATCAAAAGGAATCATTGAATCGTTTCCTGTTGGATGGACGAATCGAGCTTTCCAACAATCGAGCCGAAAATGCCATTCGTCCGTATGTCACAGGCAGGAAGAACTGGCTGTTTGCCGACACAACTCGCGGAGCCAAGGCCAGTGCTATT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP021850|3486173:3493355|3486173_3486887_+|AUS97688.1|DBSCAN-SWA MDVPQDLESTFEPKIVKKRQKDISNIDAMYAKGLTTRQISDQIKEIYEFEVSEDMVSDITSKLLPEIEEWQQRPLSSIYPIIFIDAVHFSVRDNNVIKKLAAYIILGINQDGQKEVLSINIGQNESSKYWLSVLNELKNREVKDILILCADGLSGIKESIAVAFPNTEYQRCIVHQVRNTLKYVADKDKKEFAADLKTIYHAPTEETGYERMLKITDKWQDRYPNAMKSWEASWDVI >CP021850|3486173:3493355|3491386_3492541_-|AUS97693.1|transposase|DBSCAN-SWA MFPLKQEDYFSDELLDQLIKEYNIKDTDDIKNMLKDLMGSTIQRMLNSELDEELDYEKYDVQNKETDNSRNGYSKKTVRSEYGEIELDIPRDRNGEFEPQIVKKNQTEIKGIEGQIISMYAKGMSNRDIETHLQELYGIEVSPTLISRITDKILPEIKEWQSRMLKSVYPIVFMDAIHYSVRKDGIVVKKAVYIAIGIDLESQKDILGMWIGEAESSKFWLSIMNEIKNRGVRDILITSVDGLNGFSEVIRAVFPMTEIQRCIVHQIRNSTKFISYKDLRSFTADLKPIYKAATEALALQELDAFESKWGSKYPNAVRSWRNNWEELSVFFKYPREIRKIIYTTNAIENFNRQLRKVTKTKSAYPSDDALIKALYLAVRDITKK >CP021850|3486173:3493355|3492629_3493355_-|AUS97694.1|DBSCAN-SWA MHELIAAYCNTLKLGSRIAKNYSQIEAETHEEFLAKLLAMEIEARELNRKNALLKQAQFDVLKTFGDFRFEKMSIPNTIDVEAIKTASFVDKKENLILYGSVGLGKTHLATAMGVEACNRGKRVRFFRTSSLVNQLLDAKAEGSLKRFMKQLNKADLIICDEWGFIPFEKEGAQLLFQVISDCYERKSLIITTNLEFSKWNSIFYDEKLTSAIIDRIIHHSHLIVFEGSSNRLENSLMKVR >CP021850|3486173:3493355|3488994_3489342_+|AUS97691.1|DBSCAN-SWA MDKITNAKTEFRLKQWSKIIQACQTSGMTVVSWCSQNNVKIKSYYYWLRRIRTLACETGSLVPQKPEQEIVPVPFHQTKVSAAVTIHLPSFCVDIHDGTSRETIEAVLSALKSIC >CP021850|3486173:3493355|3487019_3487448_+|AUS97689.1|DBSCAN-SWA MLQISDSSITFWVRLVNEHGYEILNKKPSRNYSGDFKVNAVEYMHKHHLSLCEAAPVFGIPTTSILGKWEKIYYEKGPQGLREWKPCRKPKMNKDRINNPQNIEPTLEKNLIAEVKQLRMENEFLKKLNALVLERIKRESAK >CP021850|3486173:3493355|3489335_3489692_+|AUS97692.1|DBSCAN-SWA MLGDITRAEDIYIVCGYSDMRKSIDGLAAIIKETFGMDPFSPSLFLFCGRRRDRLKALFWEGDGFVLLYKRLENGNFKWPRTPEQARRLTQQEFRWLMEGLTIDQPKAIRKARTGEIY >CP021850|3486173:3493355|3489768_3491352_+|AUS98851.1|transposase|DBSCAN-SWA MQKINFTGLTPEQIEYVSTLEKIVENQQIRINQLTELLIKSQKALYGQSSEKRRYVLGEDNDQISLFNEAEVEANNKAEEPTVQTIVAAHTRKPKRTKEELAQTVPVVEVVCDLDEDKRSCGICQADLRYLGKEHVRDELEIIPAQVRVLRYIRFNYVCTVCEKETGDANIVKAPVPAPVMKRSLASASTVAYVMYQKYANGMPLYRQEKDWANQGVTLSRATLANWIIRPSHEWLEPMYNAIHKHLISEPLIHADETVLQVLKEPGRKATTESRMWVYTSGRSPTPAVLFEYQPTRSGQHARRFLEGFSGYLQTDGYSGYNAVPDVIHCGCWAHLQRKFEEAIPQGADTKTSKAAIGYDYCNRLFAMDKKWEELSAERRYEERLKNMKPLLDEFWEWVQQLNPLPNSNLGKAITYALNQKESLNRFLLDGRIELSNNRAENAIRPYVTGRKNWLFADTTRGAKASAIVYSMIETAKANQLNPYMYLVHLLTNLPSLKELTHESLTPYLPWSPELPSWCRNDSYKAP >CP021850|3486173:3493355|3487486_3488221_+|AUS97690.1|DBSCAN-SWA MALLKLAGIARSTYYYYQKRMKQPSKYESIRAEIKRIYAENQRRYGYRRICIELKNRGIQINHKTVLRLMKELGLRAIKNKKKYKSYKGEVGHIAPNIINRDFNASSPNQKWATDITEFRIPAGKLYLSPTIDLYNGEIVSYSISRNPNFKQTMEMLDKAFIKIPKNTNLILHSDQGWQYQQVRYQERLREKGITQSMSREGNCLDNAVMENFFSLLKNEVFYGNESKFSTLSDLKIVLEEHID |
8 | uncultured_virus(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3988397 : 4051175
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP021850|3988397:4051175|DBSCAN-SWA ATCATCTTTCCCCCAGCTTCAAACCTGGTATTGCATTGAGGTCCAACTCCGAAGCGCTGCCGCTCCTGTATTCATAATATGCGGCACAAGCTATCATTGCAGCATTATCCGTGCACAGCACAGGTTTCGGGTAGCGCACGCTAAATCCGTATTCCTCTGCAGCAGCTTTCAGTCCGCTTCTCAAGGCTGAATTGGCTGCTACGCCCCCTGCCAGGGCAATATTCTTTACCCCTTTTTGCTTGCCTGCTTCGATTACATTCCTGACCAGGACATCAACAACCGCCTGCTGAAAGCTTGCGGCCACGTCCTCTACAATGATCTTTTCGCCTTTTTGCTCGGCTGTATTAAGATAATTCAATACTGCTGTCTTCAAGCCGCTAAAGCTGAAATCCAGGCTACCGTCCTCAAACAGCACCCTTGGAAAAGCGATGGCGTTTTTGTTTCCGGATTTTGCAGCTTTATCAATGAGCGGACCTCCCGGATATCCAAGGCCTATAGCTCTGGCTACCTTGTCGAAAGCTTCCCCGGCTGCATCATCCCTTGTCTGCCCCATGATTTCAAATTTATTATAATCCCCTACATAGACAATATGGCTGTGTCCTCCCGACGCCACAAGGCATACGAAAGGAGGCTCCAGATCCGGGTATTCCAGGTAGTTGGCCGCTATGTGCCCCTCAATATGGTGGACACCTACAAAAGGCTTATTGGCAGCAAAAGCCAGCGCCTTTGCTGCAGACAACCCGACCAGCAGAGCCCCCACCAGTCCCGGGCCATATGTAACTCCTATAACGTCCACATCTTCCAGCTTTATCCTCGCTTCCTCCAATGCCTGGTCAATCACAGGGATGACCAGCTCAACATGCTTACGGGAAGCAACCTCCGGTACTACTCCTCCGAACTTCTGATGTATGTCTATCTGAGATGATATCACATTGGATAAAACCTCCCTGCCGTTTCTTACCACGGCAGCAGCGGTTTCATCACAGCTCGATTCAACTCCCAGTACTATGATATCTTTCAATACTCCGCACCTACTTCATTAGTTTTAAAACAGCATCAAAACAGCTTTCCAAAATATTTGCCGCTGACCAGCTGCTCTATAATTATTATAATGCCTAAAGCAAATACATAATATGAAAAGACCTTTAAGCTTGTTTTGGAAAATACCTTCAGCATGAATCTAACCGACAGGTATCCGGACACCGCTGCCGTCAGCATTCCTATAACAAGCGGTAATACGTCCACACTTAAGGACCCTGCTTTTACCGTATCGTACACGTCCAGCACCGCAGCACCCAATATGGCAGGTATGGACATCAGGAATGAGAATTTCAGCGCAAACTCTCGGTTTAATCCCCGGGACAAGGCTCCGGCCAGAGTCAATCCTGAACGGGAAACCGCGGGAAGGATCGCTAAGCCCTGGGCAACACCCACAACGGTCGCATCCGTGTAGGTCATTTCCTTCAAACCTTTGTTTCTGCTTCTGACGCTCTCCGCATACCAGAGCACCAATCCTGTAATCAAAAACTCGAAGCCTAAGGTTACAGCTGAATTGAAAATCGAATCAAAAAAATCCTTGAGTAAAACTCCTATAAGAGCTGTAGGAATCGTTCCCACCACAATAAGCAGAGGAAGTTTTGAAAACGGCCTTTTCAATATCTCTATTATATCCTTCCACAATACCGCACAAACAGCCACAAGAGTGGCAAAGTGCACAGCTACATCAAAAGTGATCACGTCATGGAGACCAAACAGTCTTTGAAAAATCACAAGATGTCCGGAACTGCTAATGGGCAGAAACTCCGTAAGCCCCTGCACCAGACCCAATATAAATGCTTCTAAAGAATTCAAAATTATTTCTCCCCTTAAACTAAAATTAATATATATAAAAAAATATGCTTTCAAGACCGGCATTTATACGGTGCCAACTATTATATAATATTATTTTTCCATAGTTTTGTAAATAGCCTATGAATTAAAGGCGGATTTGGTGTGTCCCAAACCCGCCTTTATGTCCCGGACGCTGTCAGTACGTTCACTGTCTGGTTTTGTTGTATAGGTACCTCTTTTACCGGCTCCTGTTTCTTGTGGAATACGATTTCCATCACCTGATTTATATCTTCCACCGGAATTACATCTATCCCTATATCTTTAAACAGCTCCTGCCAGTTCTCAGCTGGTATCAGCACTTTTTTAATCCCCGCAGTCTTGGCTGCCTCCACTTTCGCTACCACTCCTCCGACAGGCTTGACTTTTCCGCGTATTGATATTTCACCCGTCATGGCAATATCGCTGCTTATCGGCATTCCGGTTATGGCAGAGTATATGGCCACCGCCATCGCGACACCTGCCGACGGTCCATCGATAGGTACACCGCCGGGGAAATTCAGGTGTATCTCATAGTCCCTGCACCTTATGTTCAGTATTCTCTCCAGGACGGTGATGACATTCTCCACGGAAGATCTGGCGGAACTGGTTCTTTTATATTTGTGCCCCTTCCCTTCCATCTCTTCTTCTTCCACAATACCTGTGATTTTTATATTGCCCTTGCCGCTTTCCGATTTTACAGCCGATACTTCTATATCTATCACCACGCCGGTGCTGTTCCCAAACACCGCCATTCCGTTAACACATCCTACCTGTTCTCCAGCGACTATCTTTTTCTCTATCCTCGGGCTGTAATGTCCGAATTCGATTACCCACTCTATATCTTTTCTTGTTATCAGCGTCCTGCCTTCAACCTGAGCCACGCCCGCTGCTATTTGTATTATGTTTACCGCATCCCTTCCATTTTGCGCATACTTGGAAATCAGCTCATCAATTCCTTCTTCGGTCTGGAAACCTCCTTTGGCTGCAGCATTCCGAGCAATCTGCGCTATCTCCGGCGGAGTCAGCGGCCTGAAATATATCTCCTGACACCTTGATCTTATGGCAGGAGGTATCTCATCGGCTGTTCTCGTAGTCGCTCCTACAAGACGGAAATCCGCAGGAAGACCTTTCTGGAATATCTCATGGATATGCTGGGGTATGTTGCTGTCTTCCGAACTGTAATAAGCGCTTTCCAGGAAAACCTTCCTGTCTTCCAGCACCTTTAAAAGCTTGTTCATCTGTATGGGATGCAGCTCTCCGATCTCGTCTATAAACAATATGCCGCCATGAGCCTTTGTAACAGCCCCTGGCTTTGGCTGCGGTATCCCTGCCACACCGTAAGCTCCGGCGCCCTGGTATATTGGATCGTGCACCGACCCCATCAAAGGGTCCGCAATCCCTCTTTCATCAAATCTTAAAGTGGTGGCATCCAGTTCTACAAACTTGGCATCTTTTCTGAAAGGAGAAATCGGGTTCTGCTTCGCTTCTTCCAGAATGACTCTTGCCGCTGCGGTTTTTCCCACGCCCGGAGGTCCATATATGATTACATGCTGAGGATTGGGACCACAAAGCGCGGCTCTTAATGCCTTGATTCCCTGTTCTTGACCCACTATATCCTTGAGGCTTGCAGGTCTTGTTTTCTCGGACAAAGGCTCCGTCAGTCTTATTTCCCTCAAACGCCTGAGTTTTTCCAGCTCCTTTTTTGCCTCCCTGTCTATAGCGGTTTTATTTCCCTGTTGTGATTTCAGGAGATTTAAAAAGTATATACCTATAATAATTGTAAAAAAGAATTGTATGATGAAAAGAGTGCTTGTTAGCATAACCTTCCTCCTTATTAAATCAAGCTGTCCGATAAATGGCACCGGCTGTCATGGATGCCGCACTAAAACAAGGATCAAAATTGGTGGCCTTGCATACATTTATTATTTACTATGATATTTTTTTTATCCTGTGGGATTACAAATGTAAATTTTACTAAACCATGGAACTGCCTGCATAACATGGCAGACGCGGTGGCAGGCGAAATGCAAAAACAGCAGGAAGTTTTATCTTCCTGCTGTTTTTATCCTGTTGGTTACTAAACTTATCGACTATATAAGGCTTCTTTTAATAACGCCGGTTATAATCCGTCATTTTCTGTTACGAAACTGATTCCTTTTTAGTCCTGGGCTTTTTTCCCGCTGTCTTCTTCAAGCTTTTTTTATTTTCATTTATTATTAATTCCGGCTGTTTTCCATTTAGCACCGTATCCTTGCTGATTATGCACTTCTCCACATTAACTGTAGATGGTATTTCATACATTACATCCAGCATGATTTCCTCAATTATTGCTCTCAACCCTCTGGCTCCGGTATTCCTTTCTATAGCTTTTTCAGCAATGCACTCCAGGGCCTCATCCTCAAACTCCAGTATCACATCATCCATCTCGAACAATTTCTTGTATTGCTTTACCAGAGCATTTTTGGGCTCAGTGAGTATCTGGACTAATGCCTGTTTGTCCAGTGAATGCAGAGTTGCTATTATGGGAAGCCTGCCCACAAATTCGGGAATCAGCCCGAATTTCAGCAAATCCTGCGGGAGTATATGCTTTAAGATCTCGCCAACATCCTTTTCCTTGGAACTCTCGATCTTGGCTCCAAAGCCTATGGACTTTTTGCCTATACGGTTTTGTATGATCTTCTCTATGCCGTCAAAAGCCCCACCGCATATAAACAGTATGTTGGTAGTGTCAATCTGTATGAACTCCTGATGCGGGTGCTTTCTCCCACCCTGGGGTGGTACCGAAGCAACAGTTCCTTCAAGGATCTTCAGCAAAGCTTGTTGCACACCTTCACCGCTCACATCTCGGGTTATGGATGGATTTTCGGATTTTCTGGCTATTTTGTCTATTTCATCGATGTATATAATTCCCTTTTCAGCTCTCTCAATATCATAATCAGCAGCCTGAATCAGCTTCAGGAGGATATTCTCCACGTCTTCTCCCACATATCCCGCTTCAGTAAGGGAAGTCGCGTCTGCTATCGCAAAGGGAACGTTTAAAATTCTTGCAAGAGTCTGAGCGAGCAAAGTTTTTCCTGAACCTGTCGGTCCAAGCATCACGATATTACTCTTTTGGAGTTCTACCTCTCCAG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MKDIIVLGVESSCDETAAAVVRNGREVLSNVISSQIDIHQKFGGVVPEVASRKHVELVIPVIDQALEEARIKLEDVDVIGVTYGPGLVGALLVGLSAAKALAFAANKPFVGVHHIEGHIAANYLEYPDLEPPFVCLVASGGHSHIVYVGDYNKFEIMGQTRDDAAGEAFDKVARAIGLGYPGGPLIDKAAKSGNKNAIAFPRVLFEDGSLDFSFSGLKTAVLNYLNTAEQKGEKIIVEDVAASFQQAVVDVLVRNVIEAGKQKGVKNIALAGGVAANSALRSGLKAAAEEYGFSVRYPKPVLCTDNAAMIACAAYYEYRSGSASELDLNAIPGLKLGER >CP021850|3988397:4051175|4005454_4005916_-|AUS98075.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKEFKTLTERETAELGRKLGGILKPGDIVCLNGDLGAGKTAFTKGIAEALGVEGYITSPTFTIVNEYHGFKPLYHFDVYRIADPEEMYEIGFEEYLNGDGIVVIEWSDLISEIIPPRHVRVEIRKTPEDLNARLIRVEFIGEDFEGYESKLEI |
54 | Moraxella_phage(30.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
4194474 : 4205728
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP021850|4194474:4205728|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP021850|4194474:4205728|4200263_4202567_+|AUS98238.1|DBSCAN-SWA MPQMLKDMPQFCCWKYEERSGRKTKVPYNPVTGKRAKADKRSTFKDFSSAIATISDYDGIGFLVGNDICVIDLDDCFDSSGNLKPVDQNVVEAFSGCYMEHSPSEKGLHIFFKSTGFNFDKTKYYINNRKLGVEVYVAGATNRFVTVTGNVYANGDIAEKSNELQMILDKYMLRPTPVKQLLDTESQSYLSDKSVIEKALKSANGERFKALWQGDTSGYASASEADLALCGMLAFWCGRDIGQMDRLFRQSGLMRDKWNRPQSGSTYGMITIEKAIANATEIYKPGGKRSSATEDFGECSLADFKPESNGRYPWTDIGASRLFADYYKSFARFVPERKMWFCYENGIWIPDVGNLKVMEMCKSLANQLLTYALTIQDEHQRKAYIDYCRKWQSRRYRETVLKDAQSVYPISMAEFDQDPQVLNCSNGTLFLTSMDFQPHNSEDRLTKISGVKFDPEAKRERWDRFIHEIMSGDEEKAKFLQKAFGYSISGDTRYECLFVLYGATTRNGKGTLCESILKVLGSYGCTARPETISLKKNNNSSSPSEDIARLAGVRFVNISEPSRGLVLNAAQVKSMTGGDTINARFLHENSFDFSPKFKLYINTNYLPVITDMTLFSSGRVVIIPFERHFDESEQDKNLKREFAKAKNQSAILNWLIEGYQLLKKEGLTLPDSVKTATEAYKRDSDKIALFFEDALEESPNSEVRTSEVYARYQRWCSANGCYSENARNFKQALTAIARVERKRPRSGGGMTTMLIGYKLTEEEFFLI >CP021850|4194474:4205728|4202840_4203740_+|AUS98239.1|capsid|DBSCAN-SWA MATSTTYNRAFWNVMKGKEENNRNLSEGFDNAGAYVAPDEFREGFNTALAKENIFRRFATVINLSSAEGKIQAVSSTGTADWVEDGDPIPESVDTFTQFLVKSYKLASLVKLNRSFVTDMNFNLEKYLMGDFAKRFGKAEENALLNGNGTAQPTGILTADADVTTADNSTISFDEIISLYFSLKDEYRNNAVFIMHDNTAMLLRTLKDTSGSYLWNSSDNTIFGKPVVTSPYMPTVSAGAKSIVFGDLSYYWLIERQPITIKKLSELYALQGQIGFSAYERLDGKLIQPDALKILQIKA >CP021850|4194474:4205728|4197449_4199399_-|AUS98236.1|DBSCAN-SWA MIKDIMNANDSATPNSREMAVLKENFPSCFKADGSFDIERFKEFLSDKIAVTGEGYELKFLGKNYARLLASIDTTTVVVPDEEHNSKPENMNSENIYISGDNLDALKHLLKSYSRKVKMIYIDPPYNTGTDGFVYNDNFKFTVEELSEKLSISEEQAQRILDLTKRGSASHSAWLMFMYSRLLLARDLLTTDGVIFISIDDNEQSNLKLLCDEVFGEQNFVEQIIWRKKSGGGQQDDYFVTEHDYIVCIARDKVYFSLNEKTITKSSNSYNKVDPDTKKKFKQIKLAKWGSAAHKEDRPTMYFPIIDPDGNDNYPIAPDGRPGRWRYGKASIERLIAENKIIFEKINGEWVAYEKEYEPTEDDISILKERSIFYDLVENTSGAKELTELFGTKDVFDNPKPTDLLLHLSLLVFGEGERGIILDFFSGSASTAHAAIRLNVEYNRNIRFICIQIPDKLDSENSSQIKAFNFLIENDLPTTLDYIGMERIIRAAKAIKEEFPDTTSDLGFKHYTLVEPASDTLDKLEKFDPTENKLFADKDILSDFGKPTVLATWLVRDGYGLTADAEELNFAGYNGYYIGKHLYLIDPELSNKAIEAIVVKYETDGSFNPENVVLFGYSFTWTEMEALKINLKRLKDTEKNLRINFDIRY >CP021850|4194474:4205728|4194474_4197435_-|AUS98235.1|DBSCAN-SWA MELILQRGLPHQQKAVDAISAALNGVQIASPVQFYENPSISLSDPKLAANIREIQKNIPAEYRSSMPIGDCLNIDIKMETGTGKTYVYTHTIYELHKRYGLNKFVIAVPSLAIKAGTAQFLRDEYVKRHFSDVCGYGTEIEVGVLEAPKNKKKGRSYFPSVVSDFVKGSCQNTKKIYVLLVNMQLLVVRSNGMLSRDDYDYGVEGFYRPLDAIRATNPVVIIDEPHRFSRDQKAFNVIVDEIKPQCIIRFGATFPETTSGRGKNKITVKDYQNLLYDLNACESFNQNLIKGVTKEHFEPVSKREEKVKITSITSKDSVTFQYKKRDESTKTFTLKTGDSLSIINEAFEGITVHAIGKSTVEFSNGIQKSTGEELDVDIYMTSYQEQMMRLALERHFETEKTNFCGRNFKIKTLALFFIDDISSYRPNEEGKTPYLLQAFERLLKERIESVLSTLSEHDTEYRAYLEASLADISSCHAGYFSQDNSDSDEDIAKEVETILHGKKHLLSFKNKDGSYNTLRFLFSKWTLKEGWDNPNVFTIAKLRSSGSENSKLQEVGRGLRLPVDENGNRISNEEFQLNYIVDFTEADFANRLIDQINGEIPQASSISEERLEQVAKKLGMTSDELFDALYDKHYIDRRLNIKPDTRDAFFAEYPDFATGLSSGKVKDRNVAKPRPVKIRKAVYSEIRELWEAINQRYLLFYDDDLDADMAKVVLSLLEKPGVFTDVVMTSSRDMVKSDGSQMMIVSDTGAQYIVSKPIPYNEFLKRITNATNIPIKVLHEALCEYVKRNGTINPERINENSVSMFIQQFHDWRSNNLQGRFHYAKSNTPVGATALTYSDGSPREDIAQGRIGTKIVPGTPSEKYLYDAFAYDSPLEQKNIMSDIEEVIVYGKIPRSSIAIPTITGGMYSPDFMYVVRRASGEKELNIVVETKDVENKSDLRGTEKAKIDCARVFFDMLSKDGYTVYFRDQLNNKQMAQIIKEVLAE >CP021850|4194474:4205728|4199391_4199631_-|AUS98237.1|DBSCAN-SWA MAIHYNKLWKLLIDKNMKKKDLQRLSGVSSATITKLGRNENVNTEILQKICTALECDICDILEFVPDKIEKGKVNDNND >CP021850|4194474:4205728|4204075_4205728_+|AUS98241.1|DBSCAN-SWA MNRQSTFGTIRKSKLAFEEAKITALYCRLSRDDELAGDSNSIVNQKAILKKYAEDNGFRNIEFYVDDGVSGTTFDRPDFNRMIADVESGRIGTIIIKDMSRFGRDYLKVGYYTEIMFPEADVRFIAINNGIDSANQADSDFTPFLNIINEWYAKDTSKKIRAVFKSKGQSGKPLCTNPPYGYIKDPEDKLHWIIDEKAAEVVRDIFRLCMAGFGPTQIAKQLEKRCIDTPTVHLRKMGINTPARPPENPYAWSARTVADILAKMEYLGHTVNFKTSKKSYKSKVKIMNNPEEWLVFKNTHEAIIDEGTWETVQKIRDGKRRPSRLGEMGMLSGMMFCADCGAKLYQVRGKGWTHDKEYFVCATYRKKKGMCSSHQIRNVVVEQLLIEDLRRVTSFAKDHEQEFIRIVMNSSEKELAKELRQSQKEYEQAQSRIADIDKIIRKLYEDNVMGKIPEERFYKMSAEYEAEQKALEERITKLKHTIDTANEQSLNTDRFLALVKKYTEITELDAEIIREFIDKIIVFKAEKVDGRRTQRIQIFYNCIGAIDLPK >CP021850|4194474:4205728|4203814_4204018_+|AUS98240.1|DBSCAN-SWA MENPINSRTTKSDIGGTVYVVESRISDSAKESAYSKLKRLITVNAKSLSKLSDSSYKPTEINSTSSR |
7 | Erysipelothrix_phage(33.33%) | capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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