Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026320 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP026315 | Vibrio campbellii strain BoB-90 chromosome 1, complete sequence | 0 crisprs | cas3,csx1,DinG,csa3,DEDDh | 0 | 0 | 10 | 0 |
CP026318 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 3 | 0 |
CP026319 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 3, complete sequence | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP026316 | Vibrio campbellii strain BoB-90 chromosome 2, complete sequence | 0 crisprs | csa3,cas3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
CP026317 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence | 2 crisprs | cas5,cas7,cas6e,cse2gr11,cas8e | 0 | 10 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
679564 : 686255
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP026315|679564:686255|DBSCAN-SWA ATTAGGAATCAATTTCAGATAGTACGTTAATCATTTCAAGTGCGCTTAGTGCAGCCTCTGCACCTTTATTACCAGCCTTGGTTCCTGCGCGTTCAATCGCTTGATCGATAGTATCAACAGTCAGTACGCCAAACGCCACTGGAAGACTGTATTCCAGAGAAACTTGTGCAAGACCCTTGTTACACTCACTACAAACATAGTCAAAGTGTGGTGTACCGCCACGGATTACTGTACCTAGAGATACGATTGCATCGTACTTACCAGTCTTAGCAACACGTTGAGCTACTAGAGGTAGTTCTACGGCACCTGGACAACGAACAACAGTGATGTTGTCTTCGCTTACTTGTCCGTGACGCTTTAGTGTATCGATCGCACCAGATAGTAGGCTTTCGTTAATAAAACTGTTGAAACGAGAAATAACGATAGCAATTTTTGCATTTGGCGCTGGGAAGCCACCCTCGATCACTTTCATAAGCTTTCCTTTAACTCTATTTATAAGTGAAAATTGTTCATCAAGTGAGAATCGCCGGATTCTATCACAAATTTGTGAGCAATATCTAATGGAAATTGGAGACGAATCACGAGTTCCTAGCCTTAACGATGATAAGTACTCGCAAGACTAGGAACCTGTAAGTCAGTTGTTATTCGCAGACGTACTCAACTACGTTCAGGCCAAAACCGCCTAGCGCGTGGTACTTTTTGTTGGTCGAAGAAAGCAGACGCATATCGTGCACGCCTAGGTCAGCAAGAATTTGCGAACCAACGCCTACACGGCGAGAAGTGCCTTGCTTCTTCGCAAGTGTTGGGGCTTCACCTTTATCTTGCGCTTCAAACATCTTAACGCGGTGAACAAGTAGATCGGTTGATTCTTCATTGCCAAGTACAACCAATACACCACCCTCTTCGCCAATGCGCTTCATTGCCTTCTCTAGTGTCCAACTGCGCTCTGCATTGCGGTCACTACGAAGTACATCGGTAAAGACATCTTGTAGGTGGACACGAACCAATGGCGCATCTTCTGTTAGGTCACCTTTGCACATTGCGTAATGCACTTGGTTATCGATAGTGTCTTTGTAAGTCACCAGCGTAAACTCGCCGAACTCCGTTGGTAGTGCGCATTCTGCCACTCGCTCAATGGTCGTTTCTGTGTTGTTGCGGTATTCGATAAGATCCGCAATGGTACCCAGTTTCAAACCGTGCTTTTCAGCGAACACTTCTAAATCTGGGCGGCGCGCCATCGTGCCATCGTCGTTTAGGATCTCAACGATAACCGATGCTGGCTCAAGACCAGCCAGACGAGCTAAATCACAACCAGCCTCAGTGTGGCCTGCACGAGTAAGAACACCGCCATCTTGTGCTGCTAGAGGGAAGATGTGACCCGGTTGTACTAAGTCCGCCGCTTTTGCGTTTGGCGCGACTGCAGCTTGTACAGTGCGAGCGCGGTCAGCTGCAGAAATACCCGTTGTTACACCTTCAGCGGCTTCAATAGAAACCGTAAAATTTGTGGTGTATTGTGCGTTGTTGTCTTGCACCATTGGCGGAAGGCCAAGGCTCTCACAACGAGTTTTTGTCATGGTTAGACAGATTAAGCCACGGCCATGCGTAGCCATAAAGTTGATAGCTTCCGGCGTAATGTGCTCGGCAGCCATGATCAAATCACCTTCATTCTCGCGGTCTTCATCATCCATTAGGATGACCATTTTGCCTGCGCGAATGTCATCAATAATCTCTTGAGGCGTGCTGATAGGCATATTCTGTTTCCCGTTATTCAAAAATTTATTATTGCAGCAGCAATGCGTTTAACGTTTCGTTGAGCTACGTCTACTGGCTTTGGTCAGCAAAGCAGTTTGAAGCCAACCTTTATTAAGTCAATTAACCTTATAACGTTCTGTGATTGTGGTCGGTTTCGTTTAAGCAAAACCATTTTGCTGCAAGAAGTCCATGGTAATTCGTGATTCTTGTGACTCTTCTTTTTGACCTTGTAGCAAACGCTCCATGTAGCGAGCTAACACGTCCACTTCTAGGTTCACTTTACGGCCAACTTGGAACTGATCGATGGTCGTCTCTTCACTAGTGTGAGGAACAATTGTTAATTTAAAACCATTCTTACGTAGGTCGTTGACGGTCAGACTAATGCCATCCACTGTGATAGAGCCTTTTTCTGCCACGTACTTACAAATTTCCGCTGGCATCTCAACCCAGAATTCAATCGCACGGCCGACTTGGTTACGCTCAACAATCACACCCACGCCATCGACGTGACCGGACACAATGTGGCCACCAAAACGAGTGGTCGGTAGCATGGCTTTTTCGAGGTTCACTTTGTCACCAACTTGGTAAGCAGCAAAACCGGTTTTGTTCAGCGTTTCCAGTGACAAATCCGCACTGTAGTAGTGACTACCGAAGTCGACGACTGTCAAACACACACCATTGGTCGCGATACTGTCGCCTAACTTAACGTCAGACATATCCAACTTGCCTACTTCTACCGTTACGGTGATGTCTTCGCCTTTTGGCGTAATAGCAGTCAGCTTGCCAACTGCCTCTACAATTCCTGTAAACATAATGCTTCTTTCTAGCTTTGGTTGCGTTTGACGGTTGCGGTAATGCGAATATCCACACCCACCATTCGAACATCGGTAATAGTTAAATCGATAACTTGGGCCATCTCAGTTAACCCAAGTGCACCAATCAAGCCTCGTCCATCGCTGCCCATCAATTTGGGTGCAAGATAAACAATCAGTTCATCTACAAGGTTAGCTTTGATTAACGAACTCGCGAGCGTCGCTCCTGCCTCGACCCACAAGTGATTGATATGGTATCCGCTTGCGACATTTCTTAGTGTTGCCGCTAAGTCAATTTGGCCGTTTTCATCCAGTTCAGGGGCCATATCGCCACCTTGGCTGACAATGATACGCTCACCGTCAGTATTGAATAGCTTTAGATCATCACTAAGTTGAGACTGGCGATCGAAAATAACGCGCGGAGGCTGACGGACATCCTCTTGGGGATATTGCGTTTGTACGCTTTTTGGCAAATCCTCCCAGCGAACGTTCAATGACGCATTGTCATCAATCACGGTTTTGCTGGTTGAGAGAATCCCACCGCTCAATGCACGATAACGCTGCACATCTTGGCGAGCCTTTGGGGAGGTGATCCATTGACTCTGACCATTACTGAGTGCGCTTTGTCCGTCTAAACTGGCCGCCATTTTCAACTGAATGTATGGCATGCCCGTTTGCATGAATTTGATGAAGCCTTTGTTCAGTTCAATAGCTTCGCTTTCTAACAAGCCGACCTGAACTTCTACTCCTGCATCACGCAGCATTTGAAAACCGCGCCCAGCGACTTTCGGGTTGGGATCTTCCATCGCACAGACAACGCGTGCGACTTTGGCTTTGATGAGCCCTTCAGCACAAGGTGGCGTGCGGCCATAGTGAGAACAAGGCTCCAACGTTACGTAAGCTGTCGCACCTTGGGTTTTATCCCCCGCCATACGCATCGCGTGGACTTCGGCATGAGGCTCGCCTGCACGGTGATGATGACCTTCGCCAACTATCTCACCGTCACGAACAATAACACAGCCTACATTAGGATTCGGAGCCGTCGTATAAATGCCGCGCTTCGCCAGCATGAGCGCACGCGACATCATTTCGAAATCTTGAGAGGTAAATTCTGAAGAGAGAGATTGTTGAGCCATGATTCAATCAGTCTTCTAGGCGAGCAATTTCTTCGCCAAATTCACGGATGTCTTCAAAGCTGCGGTAAACCGATGCGAAACGGATATAAGCGACTTTATCCAGCTCTTTTAATTGGTCCATAACTAGATTACCAATCATCTCGCTAGGTACTTCACGCTCACCAGTGGCACGTAGTTGTGACTTAATCATGCTAATCGCTAGCTCGATAGAATCGGCACTCACTGGACGTTTTTCTAGGGCACGCTGTATACCACCGACCATCTTGTCTTCGTCGAAGGGTTCGCGGTTGCCGTTTGACTTAATCACTTTCGGCATCACCAACTCTGCCGTTTCAAACGTAGTAAAACGTTCGCTACATGCAAGACACTGGCGACGACGACGAACCTGATGGCCGTCAGCGACTAAGCGGGAATCAATTACTTTTGTATCGTTCTCAGAACAAAAAGGACAATGCATATCACCTCCAAATAGCGTGCGATTGGGTTCGTCCCAAAAGCAAGACTAGTGTAGCGGAATTGCTATGTTAGAGAAAACAAAAAGGGGCACTACTGCCCCTTTTTCAATCAATATCAGACGTTTTCTGTTAACTGCGTGCTAGGTAGTTTGCTTTACCAACCCATTTGTAGCTTGTTAGCTCTTCCAAGCCCATAGGACCACGTGCATGCAGTTTCTGAGTGGATACCGCTACTTCTGCACCAAGACCAAACTGAGCACCATCCGTAAAGCGTGTTGCCGCATTGACGTAGACTGCGGCAGAACCCACTGAGTTGATGAACAACTCTGAGTTTTCTAGGCTGTTAGTCATGATCGCATCTGAGTGACTCGCGTTGTGAACACGCATGTGATTGATCGCTTCTTTCACATCAGCAACCACTTTTACACCAAGCGTGTAACTTAGCCATTCCGTATCAAAATCGCCTTCACCCGCATCACGAATTTGCTTTGCTTGCGCCATGAGCGCTTTTGCTTTTGGCTCTGCAACGAAGGTCACTTTGTCGTTCATGCGTTCTACAATCATTGTTAGGAATTGCGCTGCCACTTTTTCATGAACAAGCAGAGTATCTAACGAGTTACATGCTGAAGGACGTTGAACTTTTGAGTTCTCAACAACATTCAATGATTTTTCTAGATCCGCTGATTCATCAACAAAAATGTGGCTAATCCCAAAACCACCAATGATCACTGGAATGGTGCTGTTCTCTTTACACATTTTGTGTAGACCAGCGCCACCACGTGGAATAATCATATCGACGTAATCGTCTAGTTTCAGCAGTTGAGAAACCAACTCGCGGTCTGGCTTTTCAATGTATTGAACAGAAGCCGCCGGCAAGTTCGCTTTCGCTAGCGCAGCTTGAATAACCTTTACCAATTCCATATTAGAAAAGAACGTCTCTTTGCCACCACGAAGGATACTTGCGTTACCTGTTTTTAGACACAGCGCAGCAATATCGATGGTTACATTTGGACGCGCTTCGTAAATCACGCCAACCACACCAAGTGGTACGCGACGACGAGACAGAGACATGCCGTTTTCTAGCACTTTGCTGTCAATCTCGCTGCCCACAGGGTCATTTAGACTGATTACGTTACGCACGTCATTGGCAATGCCTGTTAGACGCTCTTCGTTCAATAGAAGTCGGTCAAGTAGAGCGTCGGTTAGACCCGCTTCGCGGCCCAGTTCGATGTCTTTTGCGTTTGCAGTCAAAATAGTTGCTGCGTTAGCTTCTAGCTCATCAGCAATGATCGCTAGTGCTTGGTTCTTTTGTGCGGTTGACGCTGTCGCCAATTCGAAAGCTGCATCTTTGGCAGCTTTACCCATATTAGTTAAATCCACTTTGCTTCCCTCAATTTCTATTCTTGAATGACGACAAGATCATCGCGATGAATCACTTCTGAGCCGTAGTCATGACCCAAAATAGAGATGATATCTTTACTGTGCTTACCGGCGATTTTCGCGAGGTCTTCACTTGAGTAGGCGCTGATACCACGAGCAACCAGTTTGCCGTGAGAGTTTGTTACGCGCGCCACTTCGCCACGAGCAAAGTCACCGCTCACCTTAATAACGCCTTTTGCAAGCAGGCTGCTACCTTTGCCAACAACCGCATTCACTGCGCCATCGTCGATAATGATGTCACCAGATGCTGCAGGGCCCGCCAAGATCCAGCGTTTACGGTTTTCTAACGCTTCTTCACAAGGAAGGAAACGCGTGCCTTGCGGCTCTGAGCTCAATGAGTCAAAGATAACATTTGGTGCACTACCTGCTGCGATAATCACCTCAATGCCTGCACGTCGAGCGATGTCTGCCGCCTGAAGCTTGGTTGCCATGCCGCCAGTACCTAGCGTTGTACCGCTACCACCCGCAATCTTACGCAAAGTATCATCGATGGTTTTCACTTCTTTGATCAGTTCGGCATTTGGATCTTTACGAGGGTCTGCGGTAAACAAACCTTTTTGATCTGTTAGCAACAGTAATTTGTCTGCACCACACAAAATCCCCACCAAAGCAGACAAGTTATCGTTGTCACCAACTTTGATCTCGTTGGTTGCTACCGCATCGTTTTCGTTCACGATAGGAATAATGTCGTTTGCAACCAGAGCATTGATGGTGTCACGCGCATTTAGGAAACGCTCGCGATCGTCCAAATCCGCGCGAGTTAGCAGCATCTGACCAATTTTGATGCCATAAATGCCAAACAAAGACTCCCATGTTTGAATCAAACGGCTCTGGCCCACAGCAGCAAGCAACTGTTTGCTCGCCATCTCGTTGGGCAGTGCGGGGTATCCAAGATGCTCACGGCCTGCTGCAATCGCACCAGACGAAACCATTACTACTGAATGGCCTTGTTTTTTTAGCTCAGCACATTGACGAGCCAGCTCTACCATATGAGCACGGTTTAACGCCAAAGTGCCGCCTGTCAGCACACTTGTACCCAGTTTCACAACGACGGTCTGTGGTTGCGAAACAACTGCATTCTGTTGATTCGTTGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP026315|679564:686255|680204_681314_-|AUW02846.1|DBSCAN-SWA MPISTPQEIIDDIRAGKMVILMDDEDRENEGDLIMAAEHITPEAINFMATHGRGLICLTMTKTRCESLGLPPMVQDNNAQYTTNFTVSIEAAEGVTTGISAADRARTVQAAVAPNAKAADLVQPGHIFPLAAQDGGVLTRAGHTEAGCDLARLAGLEPASVIVEILNDDGTMARRPDLEVFAEKHGLKLGTIADLIEYRNNTETTIERVAECALPTEFGEFTLVTYKDTIDNQVHYAMCKGDLTEDAPLVRVHLQDVFTDVLRSDRNAERSWTLEKAMKRIGEEGGVLVVLGNEESTDLLVHRVKMFEAQDKGEAPTLAKKQGTSRRVGVGSQILADLGVHDMRLLSSTNKKYHALGGFGLNVVEYVCE >CP026315|679564:686255|683270_683720_-|AUW02849.1|DBSCAN-SWA MHCPFCSENDTKVIDSRLVADGHQVRRRRQCLACSERFTTFETAELVMPKVIKSNGNREPFDEDKMVGGIQRALEKRPVSADSIELAISMIKSQLRATGEREVPSEMIGNLVMDQLKELDKVAYIRFASVYRSFEDIREFGEEIARLED >CP026315|679564:686255|683847_685098_-|AUW02850.1|DBSCAN-SWA MDLTNMGKAAKDAAFELATASTAQKNQALAIIADELEANAATILTANAKDIELGREAGLTDALLDRLLLNEERLTGIANDVRNVISLNDPVGSEIDSKVLENGMSLSRRRVPLGVVGVIYEARPNVTIDIAALCLKTGNASILRGGKETFFSNMELVKVIQAALAKANLPAASVQYIEKPDRELVSQLLKLDDYVDMIIPRGGAGLHKMCKENSTIPVIIGGFGISHIFVDESADLEKSLNVVENSKVQRPSACNSLDTLLVHEKVAAQFLTMIVERMNDKVTFVAEPKAKALMAQAKQIRDAGEGDFDTEWLSYTLGVKVVADVKEAINHMRVHNASHSDAIMTNSLENSELFINSVGSAAVYVNAATRFTDGAQFGLGAEVAVSTQKLHARGPMGLEELTSYKWVGKANYLARS >CP026315|679564:686255|681473_682127_-|AUW02847.1|DBSCAN-SWA MFTGIVEAVGKLTAITPKGEDITVTVEVGKLDMSDVKLGDSIATNGVCLTVVDFGSHYYSADLSLETLNKTGFAAYQVGDKVNLEKAMLPTTRFGGHIVSGHVDGVGVIVERNQVGRAIEFWVEMPAEICKYVAEKGSITVDGISLTVNDLRKNGFKLTIVPHTSEETTIDQFQVGRKVNLEVDVLARYMERLLQGQKEESQESRITMDFLQQNGFA >CP026315|679564:686255|685115_686255_-|AUW02851.1|DBSCAN-SWA MTTNQQNAVVSQPQTVVVKLGTSVLTGGTLALNRAHMVELARQCAELKKQGHSVVMVSSGAIAAGREHLGYPALPNEMASKQLLAAVGQSRLIQTWESLFGIYGIKIGQMLLTRADLDDRERFLNARDTINALVANDIIPIVNENDAVATNEIKVGDNDNLSALVGILCGADKLLLLTDQKGLFTADPRKDPNAELIKEVKTIDDTLRKIAGGSGTTLGTGGMATKLQAADIARRAGIEVIIAAGSAPNVIFDSLSSEPQGTRFLPCEEALENRKRWILAGPAASGDIIIDDGAVNAVVGKGSSLLAKGVIKVSGDFARGEVARVTNSHGKLVARGISAYSSEDLAKIAGKHSKDIISILGHDYGSEVIHRDDLVVIQE >CP026315|679564:686255|679564_680035_-|AUW02845.1|DBSCAN-SWA MKVIEGGFPAPNAKIAIVISRFNSFINESLLSGAIDTLKRHGQVSEDNITVVRCPGAVELPLVAQRVAKTGKYDAIVSLGTVIRGGTPHFDYVCSECNKGLAQVSLEYSLPVAFGVLTVDTIDQAIERAGTKAGNKGAEAALSALEMINVLSEIDS >CP026315|679564:686255|682138_683263_-|AUW02848.1|DBSCAN-SWA MAQQSLSSEFTSQDFEMMSRALMLAKRGIYTTAPNPNVGCVIVRDGEIVGEGHHHRAGEPHAEVHAMRMAGDKTQGATAYVTLEPCSHYGRTPPCAEGLIKAKVARVVCAMEDPNPKVAGRGFQMLRDAGVEVQVGLLESEAIELNKGFIKFMQTGMPYIQLKMAASLDGQSALSNGQSQWITSPKARQDVQRYRALSGGILSTSKTVIDDNASLNVRWEDLPKSVQTQYPQEDVRQPPRVIFDRQSQLSDDLKLFNTDGERIIVSQGGDMAPELDENGQIDLAATLRNVASGYHINHLWVEAGATLASSLIKANLVDELIVYLAPKLMGSDGRGLIGALGLTEMAQVIDLTITDVRMVGVDIRITATVKRNQS |
7 | Staphylococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
770305 : 777377
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP026315|770305:777377|DBSCAN-SWA ATTAACGAGGGCAAATCTCTGACTCTGGGAAGAAAAACTCGATTTCACGAGCCGCTGATTCAGGACTGTCTGAACCATGAACAGAGTTATGACGCATGCTCAGTGCGTAATCAGCACGGATTGTACCGCATGCCGCTTCTTCTGGGTTTGTTTTGCCCATTAGCTCACGGTAACGAGCGATTGCATCTTCACCTTCAAGAACCTGAACCATGATAGGGCCAGATGTCATGAACTCTTTCAGTGCAGGGAAAAAAGGTTTGCCTTCATGTTCTGCGTAAAAACCGCTCGCCTGTTCTTCTGTCAGATGAACCATTTTTGCAGCAACAATACGCAGACCCGCCTTTTCGATACGGTGGTAGATTTCACCAATCAGATTGCGTTCTACAGCGTCAGGCTTAACAATTGAAAACGTTCTTTCTAGAGCCATAAGGTTTCCTTTTTGTACTTGTAATAATAGTTTTATATGAGTGACTTGCGTCTCTCTAAGTTATACCAGTACAGACAGGGTGTCTGCACTGGTAAAAGTGTTATTTTGCGGCTTGTTCGTTCAGGAAACGAGCAAGTGTGCGTACACCCATGCCTGTCGCGCCAGCAGCCCATTTATCAGACGCTGACTTACGGTACGTGCCTGCACAGTCAAAGTGCAACCAACCTTTCTTGTAATCTTCAACAAAGTAAGACAAGAATGCCGCCGCTGTACTTGCGCCTGGCGAGTAATCACCAGAACTGATGTTAGATAGGTCAGCAAAGTTTGATGGCAGCATGCCACGGTGGAAATCAGCAAGAGGCAGTGGCCATAGACCTTCTTTCTCTTGATTTGCCGCCGTTAGCGCTTGATGTGAAAGCTCATCATCAAAGCTCATCAGTGCATGGTAGTCATTACCTAGTGCATTCTTCGCTGCGCCCGTAAGGGTTGCACAGTCAATGATCAGCTTAGGGTTTTGCTCACTAGCGTAGATAAGACCATCAGCAAGAACCAAACGACCTTCTGCGTCAGTGTTCATGATTTCTACTGTCTTACCATTTTTGTAAGTGATGATGTCGCCAAGCTTAAGTGCACGACCCGAAACCATGTTTTCTGCACAGCAAAGGATCAGTTTTACACGCTTGTTAAGGCCGCGAAGAATAGCAAGACCAAGACCGCCGGTAATCGTACCTGAACCGCCCATATCCGCTTTCATTGCTGTCATGAAGTTTGATGGCTTAAGGCTGTAACCGCCTGAATCAAAGGTGATGCCTTTACCCACTAGACACGCAAACACTGGTGCGTTTTCATCACCTGTTGGGTTGTAATCAAGTTGCAGCATTGCTGATGTGCGCTCAGAGCCGCGACCCACTGCATAAATGCCTTCCCAACCCTCTGACAACAGGTCTTTATCTTTAACGATACGAGCCGTTACTGTGCCTTGTGGTGCGATGGATTTGATGAATTCAGCCGCCATGGTTGCCAATTGACGTGGCGCCACTTCTTCAGCTGTTTTGTTGATGATATCGCGAGTAAAGTCCGTAGAAGTGATACGAGCGTGTAGCTCTGCTTGGTCTTGCTCAGATAGCGTAACCCACTCTAGCGTGCCGTGTTTTTTCGGGTTGCGGTAACCTTGGTGGAATGCCCAAATGCTCTCCAAATCCCAGTTATCACCAGCAAGTAAAATTGAACGAATTCCTTGGCCATCGAGTTGACGCGCTGCACGTTGAATCGCACCAAGATCGTGACCTTCACCTAGGTGAATGGTTGCGCCATTCTCAGCGAAAGAAAGCAGTGCTTTGTCGCCCCAATATGGTGCTGCTGGTTCTTGGCTTAGAAATACAGACATCTGTGTAGACATGGTTTCTCCTTGTCTTATAACGGCGTTGCCTACGCCTCTTCTTTTTTAATAACTACCGGATGTTAGCATTATGTAGGGTAAAAATGTCAACTTGATAAAAAAACGGACCTTAAGGTCCGCTTTTTTTAGTGAGAATTGTTAACTCTGCTGCGTTTTACCGCCGAATCGAGCATTAATCCGCTTCGTCCATCCAACACAAGATGACCGCTTCTAGAATCTTTTCATTACAATGGTTTGGCTCATCGTCAAACTCATCCAATTCCATGATCCATTGGTGAAGATCGGTAAAACGTACGGTTTTAGGATCTAAGTCGGGAAACTTGTCACAAAGCTCAATCGCGATATCGCGAGAATCTGTCCATTTCATTGCTCGTCTTCCTTTTGCTTCGCCCCTATATTGGGGAGATAGTATTAGATTAGTGATCTTCCGACGCGTGGTTTAGCGTGTATTTTGGAATCTCAACAACCAAATCTTCATCCGCTACTTTTGCTTGGCAACCAAGACGAGATTCAGGCTCAAGACCCCATGCTTTATCTAGCATGTCATCTTCTAGCTCTTCACTCTCTTCTAGCGAATCAAAGCCTTCACGAATGATCACGTGGCAAGTCGTACATGCACATGACTTTTCACATGCGTGTTCAATACCAATGCCATTTTTTAGCGCTACGTCTAGAACGGTGTCACCAGTGTTTGCTTCCAACACTGCACCCTCTGGGCACAAATCTTCGTGTGGTAATACAATAATCTTAGGCATAACTACTTATCTCTTATATATCATTAACTGACTGACCTGACAGTGCAGCTCGAATCGATTTATCCATACGGCGCGACGCAAAATCTTGGCTTGCTTTGTCGGTGTCTTTGATGCCTTGCTCGATGGCGTCTGCATCTTCGCCGTTGCGCAGTTCAATCAGCGCTTCAATCACTTTAACTAGGTCTTGTTTCTCTTGGTCTGATAGTAGTTCATCACCATCAGCTTGCATCGCTGCAATCAAGCCTTCAATCACACGATCCGCTTCTACGCGCTGCTCAGCCAACGCACGAGCCTGCATATCTTCTTTCGCGTAAGTCATCGAGTCACGCAGCATGTTTGCGACTTCATCATCGCTTAGGCCGTAAGAAGGTTTCACTTGGATTTCAGCCTGAACACCCGTGCTCTTTTCCATCGCGGTGACAGACAATAGACCATCAGCGTCCACTTGGTACGTCACGCGAATGTGCGCAGCACCTGCCGCCATTGGTGGAATGCCTTTCAATGAGAAACGAGCCAATGAGCGGCAGTCATCCACCATTTCACGCTCACCTTGTACGGTGTGAACGCTCATTGCTGTTTGACCATCTTTGAACGTGGTAAATTCTTGCGCGCGGGCCACAGGGATGGTGGTGTTACGTGGAATGATTTTCTCAACCAAACCACCCATGGTTTCAATACCAAGGGACAAAGGAATAACGTCCAGAAGCAACATTTCCGAATCAGGCTTATTGCCCGCTAGGATATCTGCTTGAATACCCGCACCGATTGCAACAACTTCATCTGGGTTAATGCTGGTCAGTGGTGTACGGCCGAAGAATTCGCCTACCATTTCACGTACAAGCAATGTGCGAGTTGAACCGCCAACCATAACCGCTTCAAGTACATCTTCCGCATCCACATCCGCATCTTTCAGTGCACGGCGACAAGACATCAAAGTTTTCTTCACTAGCGGACGAATCAGATCTTCGAACTGCTCGCGAGTCACTGAGCCTTTCCAGCCAAATACATCAACATCAACGCTGTCTTGCTCAGAAAAAGCAATCTTAGTTGCTGTTGCAATGTTCAGTAGTGCACGGTTTTTCTCAGCAGAAAGCGGCGCTTCTAGACCAGCCTGCTCCATTAGGTAATCCGCTAATAGGTGGTCAAAATCATCGCCGCCTAGCGCAGAGTCACCGCCTGTTGCTAATACTTCAAATACACCTTTCGACAAACGTAGGATAGAGATATCGAATGTACCACCACCTAGATCGTAAACCGCAATCACGCCCTCTTGACCAGAGTCTAGACCGTAAGCGATCGCTGCAGCTGTCGGCTCGTTAAGCAGACGCAGTACATGAAGACCCGCCAATTTCGCCGCATCTTTTGTACCAGCACGTTGAGCATCATCAAAGTAAGCAGGAACAGTAATAACCACACCAGCTAACTCGCCACCTAGTGTCTCTTCTGCACGTTTGCCTAGTGATTTAAGAATGTCGGCAGACACTTCAATCGGGTTCTTGTCACCTTGCGCAGTTTGCAGAATAGGCAGACCGTTGTCGCTTTCTTTAAATTGGTAAGGCAAAGATGGGTAGCGAGCTTGAATGTCTTTTAATGAACGACCAATTAGACGTTTTACCGAAATAATGGTGTTTTCTGGTTCTTGCTCTGCTTTTGCTTTGGCCTCGTAACCAACTAACGCCGTATCTTGTGCGTAGTTCACCACAGACGGCAAAATACTGCGGCCTTGGTCGTCTGTCAGTGTTTTTGCGTCGCCGCTGCGAACAGATGCAACCAAAGAGTTGGTGGTACCTAAGTCGATACCCGCTGCTAACTTGTGCTCATGAGGTGCCGAGCTTTGGCCCGGTTCTGCGATTTGAAGTAGTGCCATGATGGGTCCTTGTCGCGCTAACTAGCCGAGGAGTTTATCTTCAACCAGTTCAATTTCGTTCTTTAGCTTGGCAATGAATTTGAGTTTACGAACTCGGTCTGCAGCTTCCGCCCAAAGACCTTGGTCAAGTTCTTGTTCTACACTCGCCAAATGCTGTTTGTACATTTTGCTGACCTTAGAATCGAAGTCAAAAAGCGCTGATTCAGGATCAGAGCTGTCAGCAATGTCTTCCAGTTCTTCACGCAGTTCCATTTGCTCCATTAGGAACATCGGGTCTTGCATGGTTTGTTGCTCACCACGAATTTCTGTGCCGTTTTCTGCCAGAATGTATTCAGCGCGAGAGATAGGATGCTTAAGTACTTGATACGCATCGTTGATTTGCGCTGCTTTTTGGACAGCCATCAAGCGGTCGCGCTCAGAAGCGGTCGCAAAATTGTCTGGGTGGAAGCGTTTTTGTAGTTCTCGGAACTGAGAAGAAAGAAGGCTACCATCCAGCTGAAACTGACTTGGTAGCCCAAATAATTCAAAGTGATTCATTAAGATCGGGTCCTAGTAAAGCCTTCTGGACTCGTTTGCCCAGAAGGACAGTCAATTAGACGTTGAAGCTTTCACCACAACCACATTCACTTTTTGCGTTAGGGTTGTTGAATTCAAAACCTTCATTCAACCCTTCCTTCACGTAATCCAGCTCAGTACCGTCTAGGTATACTAGGCTTTTCTTATCAATGATGATCTTCACATCTGACAGTTCAAACACTTCGTCTTCTTCGTTTAGATCATCAACAAACTCAAGGACGTAAGCCATGCCGGAACAGCCTGTCGTCTTCACTCCAAGACGCAAACCGATACCTTTGCCTCGGTTATCTAGGAATGCTTTTACGCGACTTGCCGCTGATTCTGTCATTGTGATGGCCATACTGCACCTTAGTCTGTCTAAATTACGTTTTGGAATGGGAGCATTTTAAGGGCTCCCATTATATACGGAATAATTATTCCTGGTGTTTTTTCTTGTAGTCAGCAACTGCTGCTTTGATTGCATCTTCCGCTAGGATTGAGCAGTGAACTTTCACTGGTGGAAGCTCTAGCTCTTCTGCAATCTCAGAGTTTTTGATAGATGCCGCTTCGTCGATAGACTTGCCTTTTACCCACTCAGTTACTAGTGAGCTTGAAGCGATTGCACTACCACAACCGTATGTTTTGAATTTCGCGTCTTCAATGATGCCTTCTGGCGTCACTTTGATTTGAAGCTTCATTACGTCACCACAAGCTGGTGCGCCAACCATGCCGCTACCTACTGATGGGTCTTCTTTATCAAACGAACCAACGTTACGTGGGTTCTCGTAGTGATCAATTACTTTTTCGCTGTATGCCATGATAAATTACCTCGAATCCTCTATTCAGTCCGTGAGATTAATGGTGAGCCCATTCAACAGTGCTCAGATCAACCCCTTCCTTGTACATATCCCATAGAGGAGACATGTCGCGTAGCTTAGTCACTGCAACGCGGATTTGTTCAATTGCGTAATCAATTTCTGCTTCAGTCGTGAAACGACCAAATGAGAAACGTACTGAGCTGTGTGCTAATTCGTCGTCTAGACCAAGAGCGCGAAGAACGTAAGATGGCTCTAGGCTCGCTGATGTACAAGCACTACCAGAAGATACTGCTAGGTCTTTCAGTGACATCAGTAGAGATTCGCCTTCTACGAATGCAAAACTCACGTTTAAGTTGTGCGGAACACGCTGCTCTAGGTCACCGTTCACCGTTACAGCTTCTAGATCTTTAACGCCATCTAGAAGACGGTTACGAAGTGCTAGCGCGTGATCGTAATCTTTTTGCATGTCTTCTTTTGCTACGCGGAACGCTTCACCCATACCCACGATTTGGTGAGTTGGAAGTGTGCCCGAGCGGAAGCCACGCTCATGACCGCCACCGTGCATTTGCGCTTCAAGACGGATACGAGGCTTACGACGTACGTAAAGTGCGCCAATACCTTTAGGACCGTATACTTTGTGCGCAGACAGTGAAATTAGGTCAACTTTCATTTCTTGAACGTCGATTGGCAGTTTGCCCGCAGACTGTGCAGCATCCACATGGAACACAATCTTACGTTCACGACATAGCTCGCCAATTGCTGCGATGTCTTGAATGACACCAATCTCGTTATTTACGTGCATGATTGAAACTAGAACAGTGTCTTCACGCATTGCTGCTTGAAGTTTGTTTAGATCAACCAGACCGTTTGATTCTGGCTCTAGGTAAGTCACTTCAAAGCCTTCGCGTTCTAGTTGACGACATGGGTCAAGTACCGCTTTGTGCTCTGTTTTACAAGTGATTACGTGTTTACCCTTTTTAGAGTAAAAATGTGCTGCACCTTTAATAGCAAGGTTGTCAGACTCTGTCGCACCAGATGTGAATACGATTTCGCGAGGATCTGCATTTAGAAGGTCAGCAATTTGCTCACGAGCAGTATCTACAGCTTCTTCTGCCTGCCAGCCGTAACGGTGCGAACGCGAAGCTGGGTTGCCAAATGTGCCATCCATTGTCATGTACTGAACCATTTTTTCAGCAACACGTGGATCTACTGGACATGTAGCGGAATAATCAAGATAAATCGGCAGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP026315|770305:777377|772898_774752_-|AUW02920.1|DBSCAN-SWA MALLQIAEPGQSSAPHEHKLAAGIDLGTTNSLVASVRSGDAKTLTDDQGRSILPSVVNYAQDTALVGYEAKAKAEQEPENTIISVKRLIGRSLKDIQARYPSLPYQFKESDNGLPILQTAQGDKNPIEVSADILKSLGKRAEETLGGELAGVVITVPAYFDDAQRAGTKDAAKLAGLHVLRLLNEPTAAAIAYGLDSGQEGVIAVYDLGGGTFDISILRLSKGVFEVLATGGDSALGGDDFDHLLADYLMEQAGLEAPLSAEKNRALLNIATATKIAFSEQDSVDVDVFGWKGSVTREQFEDLIRPLVKKTLMSCRRALKDADVDAEDVLEAVMVGGSTRTLLVREMVGEFFGRTPLTSINPDEVVAIGAGIQADILAGNKPDSEMLLLDVIPLSLGIETMGGLVEKIIPRNTTIPVARAQEFTTFKDGQTAMSVHTVQGEREMVDDCRSLARFSLKGIPPMAAGAAHIRVTYQVDADGLLSVTAMEKSTGVQAEIQVKPSYGLSDDEVANMLRDSMTYAKEDMQARALAEQRVEADRVIEGLIAAMQADGDELLSDQEKQDLVKVIEALIELRNGEDADAIEQGIKDTDKASQDFASRRMDKSIRAALSGQSVNDI >CP026315|770305:777377|775741_776125_-|AUW02923.1|DBSCAN-SWA MAYSEKVIDHYENPRNVGSFDKEDPSVGSGMVGAPACGDVMKLQIKVTPEGIIEDAKFKTYGCGSAIASSSLVTEWVKGKSIDEAASIKNSEIAEELELPPVKVHCSILAEDAIKAAVADYKKKHQE >CP026315|770305:777377|772302_772497_-|AUW02918.1|DBSCAN-SWA MKWTDSRDIAIELCDKFPDLDPKTVRFTDLHQWIMELDEFDDEPNHCNEKILEAVILCWMDEAD >CP026315|770305:777377|774773_775289_-|AUW02921.1|DBSCAN-SWA MNHFELFGLPSQFQLDGSLLSSQFRELQKRFHPDNFATASERDRLMAVQKAAQINDAYQVLKHPISRAEYILAENGTEIRGEQQTMQDPMFLMEQMELREELEDIADSSDPESALFDFDSKVSKMYKQHLASVEQELDQGLWAEAADRVRKLKFIAKLKNEIELVEDKLLG >CP026315|770305:777377|775344_775668_-|AUW02922.1|DBSCAN-SWA MAITMTESAASRVKAFLDNRGKGIGLRLGVKTTGCSGMAYVLEFVDDLNEEDEVFELSDVKIIIDKKSLVYLDGTELDYVKEGLNEGFEFNNPNAKSECGCGESFNV >CP026315|770305:777377|776162_777377_-|AUW02924.1|DBSCAN-SWA MKLPIYLDYSATCPVDPRVAEKMVQYMTMDGTFGNPASRSHRYGWQAEEAVDTAREQIADLLNADPREIVFTSGATESDNLAIKGAAHFYSKKGKHVITCKTEHKAVLDPCRQLEREGFEVTYLEPESNGLVDLNKLQAAMREDTVLVSIMHVNNEIGVIQDIAAIGELCRERKIVFHVDAAQSAGKLPIDVQEMKVDLISLSAHKVYGPKGIGALYVRRKPRIRLEAQMHGGGHERGFRSGTLPTHQIVGMGEAFRVAKEDMQKDYDHALALRNRLLDGVKDLEAVTVNGDLEQRVPHNLNVSFAFVEGESLLMSLKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGLDDELAHSSVRFSFGRFTTEAEIDYAIEQIRVAVTKLRDMSPLWDMYKEGVDLSTVEWAHH >CP026315|770305:777377|770831_772130_-|AUW02917.1|DBSCAN-SWA MSTQMSVFLSQEPAAPYWGDKALLSFAENGATIHLGEGHDLGAIQRAARQLDGQGIRSILLAGDNWDLESIWAFHQGYRNPKKHGTLEWVTLSEQDQAELHARITSTDFTRDIINKTAEEVAPRQLATMAAEFIKSIAPQGTVTARIVKDKDLLSEGWEGIYAVGRGSERTSAMLQLDYNPTGDENAPVFACLVGKGITFDSGGYSLKPSNFMTAMKADMGGSGTITGGLGLAILRGLNKRVKLILCCAENMVSGRALKLGDIITYKNGKTVEIMNTDAEGRLVLADGLIYASEQNPKLIIDCATLTGAAKNALGNDYHALMSFDDELSHQALTAANQEKEGLWPLPLADFHRGMLPSNFADLSNISSGDYSPGASTAAAFLSYFVEDYKKGWLHFDCAGTYRKSASDKWAAGATGMGVRTLARFLNEQAAK >CP026315|770305:777377|770305_770731_-|AUW02916.1|DBSCAN-SWA MALERTFSIVKPDAVERNLIGEIYHRIEKAGLRIVAAKMVHLTEEQASGFYAEHEGKPFFPALKEFMTSGPIMVQVLEGEDAIARYRELMGKTNPEEAACGTIRADYALSMRHNSVHGSDSPESAAREIEFFFPESEICPR >CP026315|770305:777377|772546_772885_-|AUW02919.1|DBSCAN-SWA MPKIIVLPHEDLCPEGAVLEANTGDTVLDVALKNGIGIEHACEKSCACTTCHVIIREGFDSLEESEELEDDMLDKAWGLEPESRLGCQAKVADEDLVVEIPKYTLNHASEDH |
9 | Megavirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
967652 : 976878
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP026315|967652:976878|DBSCAN-SWA GATGAAAAAGCCATTGCTTGCGTTAACCGTTCTTTCTTTAAGCTTGGGTTCAATCATCACCCCAGTTACCGCAACCGCGGCACTTCCACTTAGTGTGGATGGGGAGCAGTTACCTAGTCTTGCCCCTATGCTCGAAAAAGTCACCCCTGCAGTTGTGAGCATTGCGGTGGAAGGGAAACAAGTGCAAACCAGCCGTATCCCGGAGCAGTTTCAGTTCTTCTTTGGCCCTGAATTCCCAACAGAGCAGACCCGAGAACGCCCATTTAGAGGTTTAGGTTCTGGTGTCATCATTGATGCGAAAAAAGGCCAAATCGTCACAAACTACCACGTGATTAAAGGCGCGGATGAAATTCGTGTCCGCTTGTACGATGGCCGTGAGTATGACGCTGAACTAGTCGGTGGCGATGAGATGTCAGATATCGCGCTGCTTAAACTCGAAAAAGCCAAAGACCTAACACAAATTAAAGTCGCTGATTCAGACTCTCTGCGTGTCGGTGACTTTACTGTGGCGATCGGTAACCCATTTGGTTTAGGCCAAACGGTCACATCCGGTATTGTATCGGCACTTGGTCGAAGCGGCTTGAACGTCGAGAACTTTGAAAACTTCATCCAGACCGATGCCGCAATTAACAGCGGTAACTCAGGCGGCGCTTTGGTTAACCTTAACGGTGAACTGATCGGCATCAACACGGCAATTCTTGGTCCAAATGGCGGTAACGTGGGTATTGGCTTTGCAATTCCGTCCAACATGATGAAGAACTTAACCGATCAGATCTTAGAGTTCGGTGAAGTGAAACGCGGAATGCTCGGTGTTCAAGGGGGCGAAGTGACCTCAGAGCTTGCTGAAGCACTGGGTTATGAGTCAAGCAAAGGCGCTTTCGTCAGCCAAGTGGTACCCGACAGCGCAGCAGATAAAGCAGGCCTGAAAGCAGGTGACGTGATTGTCTCTGTGAACGGTAAAGCGATTGATACCTTCTCTGAGCTTCGTGCAAAAGTCGCAACGCTCGGTGCTGGTAAAAAAATCACACTTGGAGTGATCCGCGATGGTAAGCAAAAATCTTTCGATGTAACGTTAGGTGAATCAACGAATGTGAAAGCGAAAGCGGAAACACTGCATGAAGGCCTAAAAGGTGCAGAGCTAAGTAACACCACGCCAAGTGACAAGATCCAAGGTGTGAAGGTCACTAGCGTGGCGGAGAACTCTCCTGCAGCGCAATACCAGCTAGCACAAGATGACATCATTATTGGTGTGAACCGTAAACGCGTGAAGAACCTAGCAGAACTGCGTGCGATTGTTGAAAAGCACAAAGGTGTGCTGGCAATCAATGTTCAACGTGGTGATCGCACGGTTTACTTGGTGATCCGTTAACTGGGCTAAGTGATAAGCCAATCACACAAACAGAAGCGAAGGAATAGCGTCCGTCATTTAATTCGTGATGACACTCGAATGCTTTGCTTATGTCATGGTTTTTTAAAAGGGCAGGACGATCACGTCTTGCCCTTTTGTTATTTTTAAATGTAATGCTATCCTTCAGTTTTCTATGCCAATTGGGCGCTCAATCATGGAGAGGTTATGCTTAGCTTTTTGTTACGTTCTGTCTTTTTAGGCTTAGCAACTGCCGTCATTGTATTACTCGCCGTTCCATCTTTGCGCAGCAATGTCATCCCAACCGCACTTGTTGATCCACAACCAAGCAACATCGCGTCACTCGAGGTGTCTTTTAACCAAGCGGTAAGAAAGGCAGCGCCCGCGGTAGTGAATATCTACAGCCGTAAGTATGTGGAAAATGACCGCAGCAAGCTTTCAACTCAAGGCTTGGGCTCTGGCGTTATTGTTAGCGGAAAAGGCTACATCATTACTAACTACCACGTAGTGGCTCAAGCTGACCAAATCGTGGTTGCGCTGCAAGATGGTCGCGTCGCTGCAGCTCAATTGGTTGGTACTGATAAGCGTACGGACATTGCGATCCTACGTGTCGAAGGTTCTAACCTTCCTGTTATCCCACTCAATCCAGAATACAAACCTCGAGTTGGTGATGTCGTCCTAGCAATTGGCAACCCGTACAATTTAGGTCAAACCACCACATTCGGTATTATCTCCGCAACTGGTCGTTCGTCTATCAGTGACGGTCGTCAAGCCTTTATCCAAACCGATGCAGCAATCAACGAAGGTAACTCCGGTGGGGCTTTGGTCAACACGCAAGGTGAATTGGTTGGTATCAACACCGCTTCTTTTCAGCAAGCAACCGATCTTGAGACCTACGGCATCTCCTTTGCAATTCCAGCCCCTCTAGCAAACAAGATCATGCAGAAAATCATCGCAGATGGTCGTGTAATCCGAGGCTACATTGGTATTGATGGGCAAGATATTAATGCGGTAACTGCTCGCTTGTTAGGTAACGAACACATTGGTGGCATCGTGGTGTTAGGCATTGACCCGAATGGTCCTGCGAGTGATGCTGGTTTTGAGAAACAAGACATCATCATCAGTATTAACGGTACGAAAGTTCAAGGAAGGCAAAGCGTGATGGACATCGTCACTGACTTACGTCCGGGCACCTCCGTCGATGTTGGCATTATCCGCAAGGGTAAAGAAATGAACTTAAAAGTCACCATCGCCGAAGAGTAAGCGCTCCATAAAACCCGCATTCTAATCGCCTAGCGCGAAGAATAAGATCAAGTCTCCAACCATGAGGAGATTTGGAATGGGAAAACGACACACTAATCAAGAATGGCAAACGCTCATCGAGCAGTCTGAATCGAGTTCATTGTCAACGCTTGCTTTTTGTAAGCTTAATGAACTCAATCCCTCGACGTTTTATGCTAAGCGTCAGCAACTCAAAAAAGCAGATGTCTCTCAAGGCTTTGTACGGGCAGAGGTCGTCGAAAAGACAACGAAATATCAAGCTCAAATAGCCACCGCTAACATGACACCTCTCATCAATGATGTGGAATTGAGCATTCCTCAAGGTACGCCCGCTGCCTACCTGGCAGAACTCATTGGAGCCTTGTCATGAAACATATGCTCAGCGCACCAGAGATTTATCTGTATCGTGAGAGTGTCGATTTTAGAAAGTCCATCAATGGCCTCGCGGCGATTATCGAAAATGACACCGATTTACCCTTGGGAAGCGGCGCACTGTTCCTGTTCACCAATAAACAGCGCGACAAAATCAAAGTGCTGTACTGGGATAAAACGGGCTTTGCACTTTGGTATAAACGCCTTGAAAAAGCCAAGTATAAATGGCCTGCAAAAGAGAAAAATGAAGTGTTTACCCTGACTCAATTCGAGCTTGATAGACTGCTTTCTGGCTTCACGATTATCGGCCATAAACCCGTTCAAATAAACGATTTTACAATGACTTAATCGATAATAAAGCCTTATCTACCAAGCGTTAACGGCATGATTTTAGTATAATAAATGCCATGAAAAAGACGCCAGTTATCAACCCAGAAAGTCAAGATGTTGCCGAGCTACAAGCGATGGTAAAAACGCTGTTGGCGTCAGAAAGCCAATGGAAACAAGAGCGTCAATCTCTGCTTGAGCAACTCAAACTTGCTTTCGACCGTCAGTTCGCGAAACGCTCCGAGGCGCTAAAGCCTTACGATGAATCTCAAGGTGACCTCTTCAACGAAGTGGAATGTGAAGCCGCTAAGGAAGAAGAGGTTGAAGTGGTCACGACGACCACCACAACGAAGAAGCGTGGTAAACGCAAGCCACTTCCAAAGACTTTGCCTCGTGAGGTTATCGAACTCGATTTAGACGACCATGAAAAGCAGTGCGCTTGCTGCCAACATAGTCTGCATAAAATCGGTGAAGACCGCAGTGAGAAACTTGAGTTCTCACCAGCTGTGCTCAAAGTGCTGGAATATGTTCGTCCTAAGTATGCTTGTCGTCAGTGCGAGCAAACTGAAGACAAAAGCCACATCGTTCAAAAGCCAGCACCCCAGAGCATCATCCCTAAAAGCTTCGCGACAGAAAGCTTGTTGGCCAACATCATCCTTGGTAAATATCAATACGCAATGCCACTATACCGCCAAGAGTCGCTGTTTACCCAGTCAGGTATCGAGCTATCACGAAGCACGATGGCAAGGTGGGTTATCCAAGTCAGTGAGAAGTTCAAACCCCTCTATGCCGCCTTAAAAGAGCATCTACTTCAACAAGTGGTGGTTCAGGCGGATGAAACGCCGCTCAATGTCCTCAAAGAAGATAAACAGTGTTATATGTGGCTCTACTGCTCGGGCGCAGACTCGCCCGACGCTGCACTGCCGAATGTAAAGAATATCGCCTTGTACGACTATCAAAACAGTCGCGCGAGGGCATGCCCTGTTGCCTTCTTGGGGGATTACAGTGGTTATCTGCAAACCGATGGCTATGGTGCCTATGATGGTCTTCATCACGTAACCAATGTTGGTTGCTTGGCGCATGCACGGCGTAAGTTCATGGATGCTAAGAAGCTTCAAGGTAAAGGTAAGTCAGGCAAAGCAGATAAAGCGCTGGCCAAAATCCAGAAGCTCTATGGGATAGAGTCGCGCTTAAAAGGTGCGACTGTCGAAACACGAAAAGCAGAACGTCAACAGCATGCCAAGCCGATACTGGATGAGCTGCACGACTGGATGACGTCTCAACAAGTAATAAGCTCTAGTCCATTAGGAAAAGCGCTTAAGTATACGCTCGGCCAATGGCCGAAACTTATCCGCTATATCGATGACGGTCATTTATCTATCGATAATAATCGTGCTGAACGCGCCATTAAACCGCTGGTCATTGGCAGAAAAAATTGGCTCTTCTCAAACACACCAAATGGTGCTGATGCGAGCGCGATGCTTTACAGCATCGTCGAGACAGCGAAAGCCAACGGCCTTATCCTCTACGACTACATGGTCAAGTGCATGAAAGAGCTCGCGAAAGCTGAGCCTGATATCGATGCGCTCCTACCTTGGAACTTCAAACATTAACAACACCGCCCCGTGGGTTCATGGGGCGCATACGCCGAAGACAAACAAGAAGCATAAAAAAATCCCAGCCATTGGCTGGGATTTTTATTTGTGCGTTATTCGCTATCGCTTGGCTCTTCTGAAACCTCAGGACTTCCGCCCATCTCAATTTCAATTCGTGTTACGCGTTGTAAACCACGTGGTAGTAAGCTGCCTCGACGTCCGCGTTCACCACGGAAGTTCTCAAGGTCAGCAGGTTTCAAGCCTAGTTTACGCTTACCTGCATACAAGGTTAGAGACGCGCCTTGTGGCAGAGCCATCAAGTGAGAAAGCACCTCTTCACGCTCTTTCGCCTTCGCCGCTGGAATGTTGATGATCTTGTTACCCTTACCTTTCGCCAATTGCGGTAGGTCTTTAATTGGGAACAACAACATACGACCTTGGTTGGTAATCGCTAAAATTTCATCCGAATCCAAATCAGCAATCGTCTTCGGTGTCATCACCTCAGAGTTGGCCGGTAACGTCACCAATGCTTTACCGCTGCGGTTCTTCGATAACAAGTCTGAGCCTTTACATACAAAGCCGTAACCCGCATCAGAACCCACCAGCCATAATTGCTCTTCTTCACCCATGATCACTTGGCGAATATTGCTGCCCGCAGTGATATTCAAGCGACCAGTAATCGGTTCACCTTGGCTTCGTGCTGACGGTAGTGAATGCGACTCAAGTGAGTAGCTTCGGCCATCACTGCCAAAGAATACCGCTTGCTGGTTACTCTTACCGCGCGCGTGCGCTAGGTATTTATCGCCAGACTTGTAGCTCAAGCCTTCTGCATCCACATCGTGACCTTTCGCGTGACGAATCCAACCTTTCTCAGAAAGCACAACCGTGATTGGCTCGCTTGGTACTAGGTCGCGTTCAGTCAGCGCTTTTGCTTCTGCACGTTCAACCATTGGAGAACGACGATCATCGCCGTACTTCTCAGCATCTGCTTTGATTTCTTTCTTCAGTAGAGTGTTCAGACGACGCTCAGAACCTAGCAGCTGTTCTAGCTTCTCACGCTCTTTTTCTAGCTCGTCTTGCTCACCACGGATCTTCATCTCTTCTAGTTTGGCTAGGTGACGAAGTTTAGTATCTAGAATCGCATCCGCTTGGATATCGGTAATGCCAAAGCGTTCCATCAGCACTGCTTTTGGATCGTCTTCAGTACGAATGATCTCAATCACTTCATCTAGGTTTAGGTAAGCAACCAACAAACCTTCCAAGATGTGTAGACGAGCCATGACTTTGTCTAGGCGGTGTTGTAGACGGCGACGTACAGTCGTGCGACGGAACTCGATCCACTCAGACAGAATTTGTACCAGACCTTTAACTTGAGGACGGTTATCCAAACCAATCATGTTCAAGTTAACACGGTAGCTGCGCTCAAGATCCGTTGAAGCGAACAGGTGGTTCATCAACAGATCGCAATCTACGCGGTTTGACTTTGGAACCACAACGATACGCGTTGGGTTCTCGTGATCCGATTCATCGCGAAGGTCGTCAACCATTGGCAGCTTCTTAGCGCGCATTTGGTTTGCGATTTGCTCAAGCAGTTTCGCACCTGATACTTGGTGTGGCAGAGAAGTGATAACGATATCTGAGCCTTCTTTGTGCCATACCGCGCGCATCTTGATGCTGCCGCGACCGTTACGGTAAATCTTCTCGATATCCGCTTGCGGCGAAATGATTTCTGCTTCTGTCGGGTAGTCTGGGCCTTTAACGAACTGCATCACATCTGGCAGTTCCGCTTTCGGGTTGTCGATCAAATGGATGGTTGCATCCGCCACTTCACGAACGTTGTGAGGCGGAATATCTGTCGCCATACCAACCGCGATACCAGTAACACCGTTTAGCAGGATATGAGGCAGACGTGCTGGCAACATTTGTGGCTCTTTCATTGTGCCATCAAAGTTAGGTTGCCATTCAACCGTACCCTGACCTAATTCGCCCAGCAGTACTTCGGCAAACTTAGACAGTTTTGCTTCGGTATAACGCATTGCCGCGAATGATTTCGGATCGTCTGGCGCACCCCAGTTACCTTGACCGTCAACCAATGGGTAACGGTAAGAGAATGGCTGTGCCATCAATACCATCGCTTCGTAACATGCAGAGTCACCGTGCGGGTGGTATTTACCCAACACGTCACCAACGGTACGTGCAGATTTTTTGTATTTTGCTGATGCCGAAAGACCAAGTTCCGACATTGCGTAAATGATGCGTCGTTGAACCGGTTTCAAACCATCGCCAATGTATGGCAATGCGCGGTCCATAATTACGTACATCGAGTAGTTCAGATAAGCGTCTTCGGTGAACTTGCGCATAGGCAACTGTTCAACGCCATCGTAAGTAATTTCTGTAGACATCCGTTAAACCTCTGCCATATCGCCGTTGTTTTGTAGCCAAGAACGACGATCATCTGCTCGTTTCTTACCAAGCAGCATGTCCATCATTTCCATGGTCGCCGCCGAGTCATCAATGGTTAACTGAACCAGGCGACGCGTGTTTGGATCCATGGTTGTTTCGCGCAACTGAAGTGGGTTCATCTCACCCAGACCTTTGAATCGTTGCACGTTGATTTTGGCTTTCTTCTTCGACAAGCGCTCTAGTACACCATCTTTTTCGTCATCGTCTAGGGCATAGAATACTTCTTTGCCACAGTCGATACGGTACAGAGGCGGCATCGCTACGTAGATATGACCGGCTTCAACCAGCGCGCGGAAGTGACGTGTGAACAGTGCGCACAATAGTGTTGCGATGTGTAAACCATCCGAGTCCGCATCGGCAAGGATACAGATCTTACCGTAACGCAGGCTGTCTAGGTTGTCGCTGTCTGGGTCAATACCCAAAGCAACTGAGATGTCGTGCACCTCTTGAGATGCAAGCACTTGGTCTGCAGAGACCTCCCACGTATTCAGGATCTTACCGCGCAGTGGCATCACCGCTTGGAACTCACGATCACGTGCTTGTTTAGCAGAACCACCCGCCGAGTCACCCTCTACGAAGAAGATTTCGGTGCGGTTAAGGTCTTGTACAGAACAGTCGGTCAGTTTACCTGGTAGTGCAGGACCTGATGCGACCTTCTTACGTACAACCTTTTTGCTCGCGCGCATACGACGGTGTGCGTTAGCGATACACACTTCCGCTAACTGTTCAGCCAGCTGCGGCTTTTCGTTCAACCAAAGGCTGAATGCGTCTTTTACGACACCAGAGACAAAGGCAGCCGTCTGACGAGAAGACAGACGCTCTTTGGTCTGACCGGCAAATTGCGGATCTTGAATCTTAACTGACAGAACGTAAGAACAGCGGTCGAAAACGTCATCACCCGTTAGCTTCACGCCACGAGGCAATAAGTTACGGAATTCACAGAACTCACGCATTGCATCAAGCAAGCCTTGGCGTAGACCGTTTACGTGTGTACCACCTTGTGCGGTTGGGATAAGGTTCACGTAGCTCTCCGTGATCATCTCGCCGCCTTCAGGCTGCCAGATTACCGCCCAGTTTGCCGCTTCAGTTTCTGCTGAGAACTCACCAGTAAATGGTTCTTCAGGGAGAACTGGATAACCTTTCACACCTTCCGCTAGATAGTCTTTAAGACCATCTTCGTAGTGCCATTTGTAGTCTTTGTTGTTTACTTTATCGGTAAACGTAATCTCTAGACCCGGGCAAAGTACTGCTTTCGCACGTAGGTTATTCACCAAACGTGTTACCGAGAAGTTTGCAGAATCAAAGTACTTTGCATCTGGCCAGAAGTGTACACTGGTACCACGGTTGCGACGGCCACATGTACCCGTAACCGTTAGGTCAGAAACCTTATCACCGTGTTCAAAAGCAATCTCATACACTTGACCGTCACGACGGACCGTCACTTCAACGCGCTTGGACAACGCGTTTACTACTGAGATACCTACACCGTGTAGACCACCAGAGAATTGGTAGTTCTTATTAGAGAATTTACCACCTGCGTGAAGCTTACATAGGATCAGTTCAACACCTGATACCTTCTCTTCTGGGTGGATATCAACAGGCATGCCTCGACCATCATCGATCACTTCTAGTGATTGGTCAGCATGTAGGATGACTTGTACTTTTGAGGCATGTCCGGCTAGCGCTTCATCGACACTGTTATCGATAACTTCTTGGCCCAAGTGGTTTGGGCGCGCTGTATCCGTATACATCCCTGGTCGGCGACGTACTGGCTCTAAGCCATTCAGTACTTCAATGGCACCAGCATTATATTGTTCAGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP026315|967652:976878|974997_976878_-|AUW03088.1|DBSCAN-SWA MTEQYNAGAIEVLNGLEPVRRRPGMYTDTARPNHLGQEVIDNSVDEALAGHASKVQVILHADQSLEVIDDGRGMPVDIHPEEKVSGVELILCKLHAGGKFSNKNYQFSGGLHGVGISVVNALSKRVEVTVRRDGQVYEIAFEHGDKVSDLTVTGTCGRRNRGTSVHFWPDAKYFDSANFSVTRLVNNLRAKAVLCPGLEITFTDKVNNKDYKWHYEDGLKDYLAEGVKGYPVLPEEPFTGEFSAETEAANWAVIWQPEGGEMITESYVNLIPTAQGGTHVNGLRQGLLDAMREFCEFRNLLPRGVKLTGDDVFDRCSYVLSVKIQDPQFAGQTKERLSSRQTAAFVSGVVKDAFSLWLNEKPQLAEQLAEVCIANAHRRMRASKKVVRKKVASGPALPGKLTDCSVQDLNRTEIFFVEGDSAGGSAKQARDREFQAVMPLRGKILNTWEVSADQVLASQEVHDISVALGIDPDSDNLDSLRYGKICILADADSDGLHIATLLCALFTRHFRALVEAGHIYVAMPPLYRIDCGKEVFYALDDDEKDGVLERLSKKKAKINVQRFKGLGEMNPLQLRETTMDPNTRRLVQLTIDDSAATMEMMDMLLGKKRADDRRSWLQNNGDMAEV >CP026315|967652:976878|971077_972610_+|AUW03086.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKTPVINPESQDVAELQAMVKTLLASESQWKQERQSLLEQLKLAFDRQFAKRSEALKPYDESQGDLFNEVECEAAKEEEVEVVTTTTTTKKRGKRKPLPKTLPREVIELDLDDHEKQCACCQHSLHKIGEDRSEKLEFSPAVLKVLEYVRPKYACRQCEQTEDKSHIVQKPAPQSIIPKSFATESLLANIILGKYQYAMPLYRQESLFTQSGIELSRSTMARWVIQVSEKFKPLYAALKEHLLQQVVVQADETPLNVLKEDKQCYMWLYCSGADSPDAALPNVKNIALYDYQNSRARACPVAFLGDYSGYLQTDGYGAYDGLHHVTNVGCLAHARRKFMDAKKLQGKGKSGKADKALAKIQKLYGIESRLKGATVETRKAERQQHAKPILDELHDWMTSQQVISSSPLGKALKYTLGQWPKLIRYIDDGHLSIDNNRAERAIKPLVIGRKNWLFSNTPNGADASAMLYSIVETAKANGLILYDYMVKCMKELAKAEPDIDALLPWNFKH >CP026315|967652:976878|969224_970280_+|AUW03083.1|DBSCAN-SWA MLSFLLRSVFLGLATAVIVLLAVPSLRSNVIPTALVDPQPSNIASLEVSFNQAVRKAAPAVVNIYSRKYVENDRSKLSTQGLGSGVIVSGKGYIITNYHVVAQADQIVVALQDGRVAAAQLVGTDKRTDIAILRVEGSNLPVIPLNPEYKPRVGDVVLAIGNPYNLGQTTTFGIISATGRSSISDGRQAFIQTDAAINEGNSGGALVNTQGELVGINTASFQQATDLETYGISFAIPAPLANKIMQKIIADGRVIRGYIGIDGQDINAVTARLLGNEHIGGIVVLGIDPNGPASDAGFEKQDIIISINGTKVQGRQSVMDIVTDLRPGTSVDVGIIRKGKEMNLKVTIAEE >CP026315|967652:976878|970664_971018_+|AUW03085.1|DBSCAN-SWA MKHMLSAPEIYLYRESVDFRKSINGLAAIIENDTDLPLGSGALFLFTNKQRDKIKVLYWDKTGFALWYKRLEKAKYKWPAKEKNEVFTLTQFELDRLLSGFTIIGHKPVQINDFTMT >CP026315|967652:976878|970356_970668_+|AUW03084.1|DBSCAN-SWA MGKRHTNQEWQTLIEQSESSSLSTLAFCKLNELNPSTFYAKRQQLKKADVSQGFVRAEVVEKTTKYQAQIATANMTPLINDVELSIPQGTPAAYLAELIGALS >CP026315|967652:976878|967652_969020_+|AUW03082.1|protease|DBSCAN-SWA MKKPLLALTVLSLSLGSIITPVTATAALPLSVDGEQLPSLAPMLEKVTPAVVSIAVEGKQVQTSRIPEQFQFFFGPEFPTEQTRERPFRGLGSGVIIDAKKGQIVTNYHVIKGADEIRVRLYDGREYDAELVGGDEMSDIALLKLEKAKDLTQIKVADSDSLRVGDFTVAIGNPFGLGQTVTSGIVSALGRSGLNVENFENFIQTDAAINSGNSGGALVNLNGELIGINTAILGPNGGNVGIGFAIPSNMMKNLTDQILEFGEVKRGMLGVQGGEVTSELAEALGYESSKGAFVSQVVPDSAADKAGLKAGDVIVSVNGKAIDTFSELRAKVATLGAGKKITLGVIRDGKQKSFDVTLGESTNVKAKAETLHEGLKGAELSNTTPSDKIQGVKVTSVAENSPAAQYQLAQDDIIIGVNRKRVKNLAELRAIVEKHKGVLAINVQRGDRTVYLVIR >CP026315|967652:976878|972705_974994_-|AUW03087.1|DBSCAN-SWA MSTEITYDGVEQLPMRKFTEDAYLNYSMYVIMDRALPYIGDGLKPVQRRIIYAMSELGLSASAKYKKSARTVGDVLGKYHPHGDSACYEAMVLMAQPFSYRYPLVDGQGNWGAPDDPKSFAAMRYTEAKLSKFAEVLLGELGQGTVEWQPNFDGTMKEPQMLPARLPHILLNGVTGIAVGMATDIPPHNVREVADATIHLIDNPKAELPDVMQFVKGPDYPTEAEIISPQADIEKIYRNGRGSIKMRAVWHKEGSDIVITSLPHQVSGAKLLEQIANQMRAKKLPMVDDLRDESDHENPTRIVVVPKSNRVDCDLLMNHLFASTDLERSYRVNLNMIGLDNRPQVKGLVQILSEWIEFRRTTVRRRLQHRLDKVMARLHILEGLLVAYLNLDEVIEIIRTEDDPKAVLMERFGITDIQADAILDTKLRHLAKLEEMKIRGEQDELEKEREKLEQLLGSERRLNTLLKKEIKADAEKYGDDRRSPMVERAEAKALTERDLVPSEPITVVLSEKGWIRHAKGHDVDAEGLSYKSGDKYLAHARGKSNQQAVFFGSDGRSYSLESHSLPSARSQGEPITGRLNITAGSNIRQVIMGEEEQLWLVGSDAGYGFVCKGSDLLSKNRSGKALVTLPANSEVMTPKTIADLDSDEILAITNQGRMLLFPIKDLPQLAKGKGNKIINIPAAKAKEREEVLSHLMALPQGASLTLYAGKRKLGLKPADLENFRGERGRRGSLLPRGLQRVTRIEIEMGGSPEVSEEPSDSE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1822540 : 1881778
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP026315|1822540:1881778|DBSCAN-SWA CATGACTCATTCTTGCAGGCTCTCTGTAGCACCAATGTTGGATTGGACGGATCGTCATTGTCGCTACTTCCATCGCTTAATGACCAAAGAAACCCTGTTGTATACCGAAATGGTGACTACAGGCGCGATCATTCATGGAAAAGGGGATTTCCTGGCTTATAACGAAGAAGAGCATCCGTTAGCCCTTCAGCTTGGTGGTTCTAACCCGGCAGATTTGGCAACGTGTGCCAAGCTAGCACAGGAGCGCGGCTACGATGAGATTAACCTAAACGTGGGTTGTCCGTCGGATCGTGTTCAAAATGGTCGCTTCGGTGCATGTTTAATGGCAGAGCCTCAATTGGTAGCCGACTGCGTTGCGGCGATGAAAGACGTGGTAGACGTGCCTGTTACTGTGAAAACACGTATCGGCATCGATGACCAAGACTCTTATGAGTTCCTAACCGATTTCGTATCTATTGTTTCTGAGAAGGGTGGCTGTGAGCAGTTCACTATCCACGCACGTAAAGCATGGTTAAGTGGTCTAAGCCCTAAAGAGAACCGTGAGATCCCACCATTGGATTACCCACGCGCTTACCAACTGAAGAAAGATTTCTCACACTTAACGATTGCGATTAACGGTGGTGTGAAATCATTAGAAGAAGCGAAAGAGCATCTACAATACCTAGATGGTGTGATGATCGGTCGAGAAGCGTACCAAAGCCCTTATTTGTTGGCATCTGCTGACCAAGAACTGTTTGGTTCAAACACGCCAGTGAAAAAGCGCAGCGAAATTGTTGAAGAGATGTACCCGTACATTGAAGCGCAATTGGCAAAAGGGGCTTACCTAGGTCACATCACACGCCACATGCTGGGTCTGTTCCAAAGCATGCCGGGTGCTCGTCAATGGCGTCGTCACATCAGTGAAAACGCGCACAAACCGGGTTCTGGCCTAGAAGTGCTGCAAGACGCACTAGCGAAGATCCCAAAAGAATTGAATGTGTAAATTTCACCAGTGGTTGGTGAAAATGACCAAATGACAAATGATAAAGCCAGAGTGTGGAAATGCCTCTGGCTTTATTTTTGTCTAAATATCATTGGTTTATGCTGTTTTTTGTAAGTTGGTATGGAACCTGCTCTAGTAAAACTAAAACAAAGGAGAAGTGATTATGTTGGAGCTGATCTTTATTTTAGTTTTCACAGCAACCCTGTTGGTAACCGGTATTACCATGGTGACCGTATTTGCCGCGACAGGTATCGCATTGGTTGTGATGTTCTTGTTGGGTATGGTGGGCGTAGTATTAAAACTATTGCCTTGGTTGATAGTCATTGCATTAGGTATATGGTTTTTTAAAAACTTCGTCGCTCAGCCTCGTTATAAGTAACGGATTGTAGAGATTTAGTTGATGGCGGGCTGTGAGAGTATGTTAGTATTTCTCACATGCCCCTTAATGTTGAAATCAGCTATCTCGGAGTAAAAATTACATGACATATAAAGCGACCATCGCTTTAGCGACACTATCGTTGGCAGCGTCTAACCCTTGTTTTGCAGAGCAAGAGTCTTCTTTCACTACCAAGGTTGGTGCGGAAGTTTGGGTAGCGGATACCAAAGTGAATGAAGTAAGAAGAGATAGCGACACAACGGGTTCTTATTATGCTGCGATAGAGCATGACGTAAAGTACGTTCCCAATGCGCGCCTTCGTTACTCAAGTGTTGATGCGGATTACATGGGTTTCGACAAACTTGATCTCACTCTTTACTACCAAATTCTTGAACACGACTTGATGCATTTTGATGCGGGTCTGACCTTTAGTAATTTGAGCGATACAAAATACGTAGACGCAGGCACTAATGCTCGCACTGAAGACTTTGATGAGCTGATTTGGGCTTGGTACGGCTATGCAGAAATCACAGTGCCAAACACAAACTTTGATGTGATTGGTGAAATGAACTTCGGCGATAACAAAGGCATTAAGAGTACCGACCTAATGGCTGGTGTTCAGTACCGAATTCCTTTCCAAGAGTCTGAGTTAACATTCCGTGGTGGCTACCGTGTGATTGATTTAGAGTCTGAAGAATTCTTGTCGAACCTAGGTAAAGAGTTCATTTTTGCAGACGGCTTCTTTGTTGGTGCTCAGTTTTCTTTCTAAGCACTCTGCATTCATTCCTTCCTTTAAAACGTCGCTTTATAAGCGGCGTTTTTTTATATCACTTCATTATATTAAATCGAATTTCTCGCCCAAGTTTCAGTCTTCGACCATGCTTATTTAGAGCAATGTAGAAAAGTTGGAGCAGGGATTGCGATGACAATAAATGAATTACGACATCTATTTCGTGACAACCAGCTAGTAGAAGCCATCATCGAGCCTTCAATTCAAGAGGGAGGATGGGTTGTTGAGTTTCGCCATGCCCGTGGAGGGTTTGTTTGTCTCACAGACAGTCATGGGGAAGAGTGCCTGTATGATGACCTCGATACGGCATCAAAATCCGCGTTGGCGGTTGGCTTTCAACAAGTTCGTATTGAGGATCGCTGAGCACTAGGTCCAGCGTTCTTACTTCCAAAAAGTTATAAAACATTCTCTTCTATTCTTTCTTGTTATTAGAGAGAGTGGTTAATCTAACGTCACGCAATGAATAGGGATGTCGTGACAATGTCTTTTCAACAGAATGAATATTCTCACAAGAAAGTGTCGGAAGATAATAATGGGCAGGGTGGTAATCCACCAATCGCAAGCCCACTAAATGACCAGCAATTTAACTCACTCCAGCAAACTGTCTCAGAGTTGTCTTCACAGCAACTTGCATGGGTCAGCGGTTACTTCTGGGGACTCGCTCAAAACCAACCAAGCGCGGCGGCTGCAACACCAATCGCACAAGCGGCTGCTGCAGTAGCTGCAAAGCCAGCAGGCAAGCTGAGCATCATTTTTGCTTCTCAAACCGGTAATGCGAAAGGCGTTGCTGAAGCACTAGAGCAAGAAGCTAAAGCTGAAGGTATTGCGGTAGAGCTGTTTGATGCCAGCGATTACAAAGGAAAGAACCTTGCGAAAGAGACCCACGTGATCATTGTGGCGTCGACCAACGGTGAAGGTGAAGCGCCGGATAATGCCATTGAACTGCATGAGTTCCTTCAATCTAAGAAAGCACCAAAGTTACCAAACCTGCAATACGCCGTGATTGCGCTGGGTGATTCTAGTTACGAGTTCTTCTGCCAAACGGGCAAAGACTTTGATAGTTACTTGTCTAAGTTAGGCGCAACAGCCTTCATCGATCGCATTGATTGTGATGTGGATTATGAAGCGCCGGCTGCTGAATGGCGTAAGCAAGCGCTTGAACAAGTAAAAGAAGCCCTTTCTTCAGGTAATGAAGCAGAAGTCGTTCAACTACCTGTTGGTCAAGCCGCTCCAGGACATTCTGCTTATAACAAGCAAAACCCATATACCGCAACATTACTGACTAGCCAGAAAATCACGGGCCGTGATTCAGGTAAAGACGTTCGCCATGTAGAGATTGATCTTGAAGAGTCGGGTTTGACCTATCAGCCAGGTGATGCGCTAGGTGTTTGGTTCGACAATAGTTCAGAATTAGCCAACGCTATCTTAGCTAAGGCTGGTCTCTCTGGTGTAGAAAGTGTTGAAGTGGATGGCGAAAGCCTTTCTATTCACAGTGCATTGGTTAGCAAGTACGAAATCACCGCATCAAACCCTCAGTTTGTCACTAAATTCGCAGAGTTATCTGGTAGTAAGAAACTACAAAAGCTAGTGGAAGATAAAGACAAGCTTCGTGAGTACGCTGCAAATACCCAAGTTGTAGATGTACTTGCAGAGAAGAAGACCAAGCTAAGTGCAGAAGAATTGGTTGGTTTGCTTCGTCGATTGACACCTCGTCTATATTCTATCGCTTCGAGTCAAACGGAAGTCGATGAAGAAGTTCATCTAACCGTAGGCTTGGTTGAATACGACAAAGGTGATGAGAAGCGCTACGGCGGAGCATCAAGTTTCCTCTCTCAACGTCTAGAAGAAGGCGGTGAAGTGAAGGTGTTTGTTGAGCACAACAATAACTTCAAACTGCCACAAGATGACAACACTCCAATCATCATGGTTGGTCCTGGTACCGGTATTGCGCCTTTCCGCAGCTTTATTCAGGAGCGTGATAACCGTGACGCGGAAGGCAAGAACTGGTTGTTCTTTGGTGACCGTACCTTTACTCAAGATTTCCTTTACCAAGTGGAATGGCAGAAGTACCTCAAGTCAGGTTTGCTGACTCGCCTTGATGTTGCGTTTAGCCGTGACCAAGCAGAGAAGGTTTATGTTCAACATCGCATCCTAGAAAACGCTGAACAAGTTTGGCAATGGATTCAAGATGGTGCCTACATCTATGTATGTGGTGATGCCACTCGTATGGCAAAAGATGTTCACGATGCGCTGGTATTTGTAGCCGAGCAACAAGGCAAGCTATCTCGTGAAGAAGCCGAAGCATTTATCAACGATCTACGTAAAGCGAAACGTTACCAAAGGGATGTGTACTAATGAGCGCGAATCAACAATCAAACAGCCAAGAAGTATTAGGTGAGGTGCTTGGTCCACTCTCGGATAACGAGCGCCTTAAAAGAGAAAGTAATTTACTGCGTGGAACGATTGAACAAGATCTGCAAGACCGCATTACTGGTGGCTTTACTGCAGACAACTTCCAATTGATTCGTTTTCACGGAATGTACCAGCAAGATGACCGCGATATCCGTAACGAGCGTGCTAAACAAAAGTTGGAGCCGCTGCACAATGTCATGCTTCGCGCACGCATGCCGGGTGGCATCATTACACCAAAGCAATGGCTAGCGATCGACAAGTTTGCAACCGAGCATTCTCTATATGGAAGTATTCGTCTTACTACTCGTCAAACGTTCCAGTTCCATGGCGTGCTAAAGCCAAATATCAAGTTGATGCACCAAACGCTAAACAGCATTGGTATTGATTCGATTGCAACTGCGGGTGATGTTAACCGTAACGTGTTGTGTACCACTAACCCT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37 | Leptospira_phage(22.22%) | integrase,transposase,tRNA | attL 1849191:1849205|attR 1870507:1870521 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2044755 : 2062225
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP026315|2044755:2062225|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP026315|2044755:2062225|2057085_2057568_+|AUW04003.1|DBSCAN-SWA MERATKLSADLGALLAKHGHVLTTAESCTGGGVATVITDIAGSSAWLDRAFVTYSNEAKMEMLGVQASTLDAHGAVSEPVVIEMVQGAIRNSNATIGVSISGIAGPGGGSEEKPVGTVCFAFADNQSWQQAETMHFTGDRAQVRKKAVEHALTQLHQHLL >CP026315|2044755:2062225|2057768_2058812_+|AUW04004.1|DBSCAN-SWA MDENKQKALAAALGQIEKQFGKGSIMRLGDNRAMDVETISTGSLSLDIALGAGGLPMGRIVEIYGPESSGKTTLTLELIAAAQREGKTCAFIDAEHALDPVYAKKLGVDIDALLVSQPDTGEQALEICDALARSGAIDVMVVDSVAALTPKAEIEGEMGDSHMGLQARMLSQAMRKLTGNLKQSNCMCIFINQIRMKIGVMFGNPETTTGGNALKFYASVRLDIRRTGAIKEGDEVVGNETRIKVVKNKIAAPFKEANTQIMYGQGFNREGELIDLGVKHKLVEKAGAWYSYQGDKIGQGKANACNYLRENPEIGKTIDTKLREMLLSPALPEAPESGEKSEQEEEF >CP026315|2044755:2062225|2044755_2046396_+|AUW03992.1|DBSCAN-SWA MTTNYIFVTGGVVSSLGKGIAAASLAAILEARGLKVTMMKLDPYINVDPGTMSPTQHGEVFVTEDGAETDLDLGHYERFIRTKMTKRNNFTAGRVYADVLRKERRGDYLGATIQVIPHITNAIKDRVIAGSEGHDVAIVEVGGTVGDIESLPFMEAIRQLAVELGRERAMFMHLTLVPYLAAAGEVKTKPTQHSVKELLSIGIQPDILVCRSDRMIPANERKKIALFCNVQEKAVISMKDVDSIYKIPQLVKSQGLDDLVCARFGINAPEADLSEWEQVIYEEANPTGEVTIGMVGKYIELPDAYKSVNEALKHAGLKNRLNVTIKYVDSQDVETKGVEVLEGLDAILVPGGFGDRGIEGKIRAAQYARENKVPYLGICLGMQVALIEYARNVAGMEGAHSTEFNKDTKYPVVGLITEWVDGEGKVEERTETSDLGGTMRLGSQLCHLEKGTKARELYGNATIHERHRHRYEVNNNLRPQIEKAGLKVSGLSADKKLVEMIENPAHPWFVAAQFHPEFTSTPRDGHPLFAGFVKAAGQNARGEFEK >CP026315|2044755:2062225|2052359_2053283_+|AUW04000.1|DBSCAN-SWA MKKLLHRFGISCLLAAGLVGCAAHSPAPVSSLNKDYSAVERGSYRGSYYEVKKGDTLYFIAYVTDKNVNDLVRYNELSAPYTIFPGQKLKLWAPKYVAPKYGHKVEPVVAPVVAAKPAPVTKTSTASKSSNSSKSSTQQPKPTTTQVAQKQPPKKVEQSKPKEYVGSKGNQNVKPKPPVTTAKNDKVSKWLWPTKGRVIKNFSAGEQGNKGIDIAGQRGQPIVSTAAGTVVYSGNALRGYGNLIIVKHNDNYLSAYAHNDRLLVSEGQSVKSGQKIATMGSSGSKSVKLHFEIRYQGKSVNPKRYLP >CP026315|2044755:2062225|2054438_2057000_-|AUW04002.1|DBSCAN-SWA MKAEQKHTPMMQQYLKLKAENPEILLFYRMGDFYELFYDDAKRASQLLDISLTKRGASAGEPIPMAGVPFHAVEGYLAKLVQLGESVAICEQIGDPATSKGPVERKVVRIVTPGTVTDEALLSERIDNLIASIYHHNGKFGYATLDVTSGRFQLVEPETEEAMAAELQRTAPRELLFPEDFEPVHLMSNRNGNRRRPIWEFELDTAKQQLNQQFGTRDLVGFGVEHASLGLCAAGCLIQYVKDTQRTALPHIRSLTFDRQDHSVILDAATRRNLELTQNLSGGTDNTLAEVLDHCATPMGSRMLKRWLHQPMRCVDTLNNRLDAIGEIKDQSLFTDIQPIFKQIGDIERILARLALRSARPRDMARLRHAMQQLPELEAVTSSLAHPYLKKLAQFAAPLDEVCDLLERAIKENPPVVIREGGVIAEGYNAELDEWRKLADGATEYLEKLEADERERHGIDTLKVGYNAVHGFFIQVSRGQSHLVPPHYVRRQTLKNAERYIIPELKEHEDKVLNSKSKALAVEKKLWEELFDLLMPNLEKMQNLASAISQLDVLQNLAERADSLDYCRPTLDKEAGISIQAGRHPVVEQVTSEPFIANPIELSSNRKMLIITGPNMGGKSTYMRQTALIALMAHIGSYVPAESAHIGSLDRIFTRIGASDDLASGRSTFMVEMTETANILHNATKNSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAWASAEWLATQIGAMTLFATHYFELTELPNLLPNLANVHLDAVEHGDSIAFMHAVQEGAASKSYGLAVAGLAGVPKPVIKNARNKLSQLEQLGQGNDSARPSTVDVANQLSLIPEPSDVEQALSNIDPDDLTPRQALEELYRLKKML >CP026315|2044755:2062225|2053363_2054350_+|AUW04001.1|DBSCAN-SWA MSISNTVTKVEEFEYDNASTEGIANNELEKTSNRTKTAAREEFDASSKSLDATQLYLGEIGFSPLLTAEEEVLYARRALRGDEAARKRMIESNLRLVVKISRRYSNRGLALLDLIEEGNLGLIRAVEKFDPERGFRFSTYATWWIRQTIERALMNQTRTIRLPIHVVKELNIYLRTARELSQKLDHEPTAEEIAAQLDIPVEDVSKMLRLNERISSVDTPIGGDGEKALLDIIPDANNSDPEVSTQDDDIKSSLIHWLEELNPKQKEVLARRFGLLGYEPSTLEEVGREIGLTRERVRQIQVEGLRRLREILIKQGLNMENLFNVEDD >CP026315|2044755:2062225|2046474_2047776_+|AUW03993.1|DBSCAN-SWA MSKIVKVLGREIIDSRGNPTVEAEVHLEGGFVGMAAAPSGASTGSREALELRDGDKARFLGKGVLKAVEAVNGAIAEALVGKDAKDQAAIDAVMIELDGTENKSKFGANAILAVSLANAKAAAAAKGMPLYEHIAELNGTAGQFSMPLPMMNIINGGEHADNNVDIQEFMIQPVGAKTLKEGLRIGAEVFHNLAKVLKSKGYSTAVGDEGGFAPNLKSNAEALEVIAEAVAAAGYELGKDVTLAMDCAASEFFDKEAGIYNMKGEGKTFTSEEFNHYLAELANQFPIVSIEDGLDESDWAGFKHQTELLGDKLQLVGDDLFVTNTKILAEGIEKGVANSILIKFNQIGSLTETLAAIKMAKDAGYTAVISHRSGETEDATIADLAVGTAAGQIKTGSMSRSDRVAKYNQLIRIEEALGERAPFNGLKEVKGQA >CP026315|2044755:2062225|2059627_2062225_+|AUW04006.1|tRNA|DBSCAN-SWA 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MTNPHADRLIAFLISSGISDQRVLDAIYRLPRESFVSQAMMHQAYDNNALPIGQGQTISQPYIVAKMTELLDLKSDSNVLEIGTGSGYQTAVLAQIVDHVYSVERIKSLQWDAKRRLKQLDIYNVSTKHGDGWLGWEAKGPFDAIIVTAAAESVPQALLSQLKEGGKMIIPVGEEEQQLLKIERQGEQYLSTVVEMVRFVPLVAGDLA >CP026315|2044755:2062225|2049899_2050943_+|AUW03997.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSDILSSLAYLTGKPVASAKIKAQPEHFQVREDLGFAFTGEGEHLMVRIRKTGENTSFVANELAKACGVKSKDVSWAGLKDRHAVTEQWLSVHLPKGETPDFSAFLAQYPSIEILATDRHNKKLRPGDLVGNEFVVTLSEVTDVADVEQRLEKVKQVGVPNYFGSQRFGNDGNNLEEARRWGRENVRTRNQNKRSMYLSAARSWIFNRIVSARLENGVFDKFIDGDVVQTASGTQLVDASNMAALQAQFAQGEVAITAALAGDNALPTQADALTLEQPFLDEEPDLMALIRGNRMRHDRRDIALKPQDLAWTVDGNNITMTFSLDAGSFATSIVRELVIEEKVEREY >CP026315|2044755:2062225|2059017_2059485_+|AUW04005.1|DBSCAN-SWA MYQKRQAPTLSSKEAAIQLLSRRDHGQYELYQKLALKGYEEADIEAAINFCLDHNYLDDLRYAKSQVRQHVYKGHGERRIRQELNQKRVAESIIDMAMAEEPQDWFELARMAAEKKFKGIKAKDQKEYAKQVRFLQYRGYSFDQISYALSFEDED >CP026315|2044755:2062225|2050942_2051719_+|AUW03998.1|DBSCAN-SWA MEMDSHNAKPLRILLSNDDGVHAQGIHALADELRSIAEVTIVAPDRNRSGASNSLTLEQPLRVTEIAPKTFSVQGTPTDCVHFALNELMKDDLPDLVLSGINHGANLGDDVLYSGTVAAAMEGHFLGVQAIAFSLVGKQHFESAAKIARQLVEQHLIRPIPTNRLLNVNVPDLPFEDLGEIEVTRLGARHHAENMIKQKDPRGHDIYWLGPPGKEQDAGIGTDFYAIEHGFVSITPLQVDLTAHESLRAMDSWLKEEN >CP026315|2044755:2062225|2048369_2048651_+|AUW03994.1|DBSCAN-SWA MRIFVIALTLLFGWLQYTLWFGKNGVSDYYTVEDEIEVQQQVNSKLQARNNEMFAEIDDLRQGLDAIEERARHELGLVKDGETFYRIVDEEEH >CP026315|2044755:2062225|2048652_2049363_+|AUW03995.1|DBSCAN-SWA MLETNTPTHIAIVPAAGVGSRMKADRPKQYLLIDGKAVLEHTVEKLLSHPKISKVVVAITDGDPYYPELSIAQHPDVIRVAGGKERADSVLSGLNYVSTHLESEWVLVHDAARPCVLTSDIDRLIDVCSAHPTGGILASPVRDTMKRANAAQDIDHTVDREALWHALTPQMFKTQQLTQALADALEQGATITDEASALEWLGEKPALVQGNANNIKITQPEDLALAEFYLSRERGE >CP026315|2044755:2062225|2049377_2049854_+|AUW03996.1|DBSCAN-SWA MIRIGHGFDVHKFGGEGPVIIGGVAIPYEQGLIAHSDGDVALHALTDALLGAIAAGDIGRHFPDTDDKWKGADSRELLKEVYRRVKEQGYRLGNADVTIMAQAPKMAPHIDAMCAAIAEDLETDISNINVKATTTERLGFTGRKEGIATEAVVLLFKQ |
15 | uncultured_Mediterranean_phage(18.18%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2684058 : 2753662
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP026315|2684058:2753662|DBSCAN-SWA AATGAGTTCAACACAATACCTAATCTCTGATGCCCTTTGGGCGAAAATTGAGCCTTTGTTGCCTATCCACAAGACTAATCACCCTCTCGGGACACATCGAAAGAGGGTCGATAATCGCGATGCAATGAATGGAATTCTTTTTGTTCTCAGAACGGGTTGTCAGTGGAACGCCCTTAACGCAACGGGTATTTGTACCTCTAGCTCTGCACATCGTCGCTTTCAAGAGTGGCGGGATGCTGGTGTCTTTGAGCGATTTTGGCAAAATGGCCTGATTTACGAAGGTGTTGATTGGCGTTCTATATCAATGGATGGCTGCCAAACGAAAGCGCCTTTAGCAGGCTCAAAAAAACAGGTAAAAACCCAACAGACAGAGCGAAGCAAGGCGTAAAACGCAGTTTGCTTACCGACGCAAATGGATTGCCACTTGCCGTTGTCAGTGATGGTGCGAACGTCCACGATATCAAGCTGGTACTTCAAACATTAAATGCACTGGAGTGTTATCGTCCACCTCTGAAAGTGCCCTTGTATCTAGACAAAGGTTATACAGGTCAGTGGTTACATGATGAACTGGTTGCTTTGAACTACATTCCCCATGTTCAATCACGTGCTGAAGAGGCTGCGAGCTTGAAACAATCGGATGATTTTAAGGCTCATCGTTGGGTTGTGGAGCGAACTCATAGCTGGCTAAACCGTTATCGTAGATTGCTTGTTCGTTGGGAGAAGAAAATCGAAAACTACGAGGCCATGTTGCATTTTGCTTGTGGCCTCATTGTTTGGAATAAATCCCTTTTGGGATAGGCTCTAAGGCTTTATTGTACTGCTTCCAGTTAGTTGTTTTGTAACGAGGTTTAGGCATAAGGTTACGACGATTGATAGGTGTAGGCAATCAGATCGTAGCTTCCTGATTTAGTTCCGACGATTTAAGCAACAAAGTCGTTAACAAATAATGTAAATTATGGTTTCAACAAATAATGCTTATTGTCATTTCAAATATTTTTTTGATATATTTGAAATGTAGATAAGGTTAATATTATTTATATGAGATTTTTTACTTAAAAGGCATTTGTTATGAAAAAACTAACACAAGCTACTAAAAAGCAAGTTAAAGGTGGTTTCTCTGGTCACTACGACGCGAACGGCAACCTAATTCACCACGGTTCTTGCGCAAGCGGCTGTTAATATCAATCAGTAACTAATTTAAAAAGGCAACTTCGGTTGCCTTTTTGTTTCTTAAAATCTAGAAAAAATATTTAAATGAATGATTCAAATATAAAAAAAATAATTTATGTATTTGTTTTTCTATTCCTTATGTCGATTTTCTTTGCAACCAAAATAAAATTCAATGAAAAGGTAGAACTAAAGGGTGTAATATCTTACGAGAGTGAAGTTGTGATACGAGCACCGTTTGATGGATATATAAAAGACAAGTTTTATGATATGAACGATACTGTGGTCACTGGCGTTCCTATCTTATCAATATACTCAGTTGATTCACTCAATACTGATAATAATGGTAACTCAGATATAGATGCAAAAATAAAAAGTATCCAACGTCAAGTATTAGATAACGAAAAGTCTTATGATGTTACCAAAAACATAATCACAAACAATATCAACAAAGTAAAAAGAAATATAGAAAACGAGCAGGACAGTAAAGAACAGCTTGAGATAATTCAAAATCTAAACAAGGAAGTTCTTGATATTAAGAGTGCTCGTATCGATAAAGACAAAAAGCTTCTACTGTCAGGAACACTCAGTCATAAAGATTATGAAGATCGTCTGTCTGATTTACTTATGGTGAGAAATAAATTCATCGAGTCTCAAATTAGTCTAAGCAATTCATTGAACAAACTAGATAACTTGAACTTAGAGTTAATAGATCTAAAACATCAAATGGAAGAGTTAGAACTTGCTTATGCGACCGATAAAGAAGTTTTAAATGAACAGCTAGTTATCGCGAATAAGACTAAAGAGCTTATCCTAAAATCCCCACAAGACGGAACACTTGTTGATTCAAAATTTAATGTCACTAAGCAATTCAACAAAGGTGATATTCTAGCTAGAGTTGTTTCAAAAGATATGGTGGTTAAGCTACTGCTCGAAAGTGATTCTCAAGCAATAATTGCTGAAGGTGATTCGATTGAAGTTTCAGTACTGTCTCTTCCATATGACACTTACGGATTCTTACAAGGCACGATTTTGAAGATCCGAGATATAAGTACTGGTTCCAACAAAAATACACATGAAGTTGAAGTTGCAATCGATTTTAACGGCAAGATTTCCAAAGAGATACTTATGAACGGTATGGGTGTTACTGGTTACGTAAACGCTGAAAGCACATCTATCTTGCGTTTACTACTACTTCCTCTTATTAACTCAGCTGACAAGAACTTCGAGACAACGCTATGAAAATTATAATGCAAGATGAGATGTCAGAATGTGGATTAGCATGTGTCGCTATGATTGCCACTCATCATGATGTATCAACTACCTTACCTGAACTTCGTCGACACTACACCGTTGACCGTACCGGATTATCCCTGTACGACCTAGAATGTATCTTCTCTGATCTAGACATCGTAGCATGTAGTTATGAACTTACATACGAGCACATAGGTGAGCTTGCACTACCAGCAATAATCCAATGGACTCACAATCATTACGTAGTTCTTTCCAAGGTGACCAAAGACCATATCGAGGTCTACGACCCAGCTGTTGGTAAAAAACGATATTCTACTGATCTTGCTAGTAAAATGTTTAGTGGCTATGCAGTTAACGTCGAGGAAATTCGTAACTCTGGTAATAAGAAATCAGAAACATCAGATAATAGTATATTCAAAAAAGCTGTTTCTATTAAAGGTGTCAAATCTTGGCTGTGTTTATTTTCAGTGATGAGTTGTTTAATTCAAGTATTCGCATTGATGACACCAAAGTTCATAGCACTATCGATAGATAAGGTTTTATCGGTAAATGATTATGACCTGATGTACATTTTGGCTTTTGGATTCTTGTTGATTTATGTATTTGACTTCTTATCTCAGCTTTTAAACAACGAAGTTAAAAAGCGTGTATCATATTATATAAGTAAGCTTTTATCAGTTTCTGCTTATAAAAATCTTTCAAATCAAGAGTTGAAATATTTCCAATCAAGAAATTTATCTGACATAACAAAGAGACTATCTGTTATTTCCGAATATGGAAGATACATGGTGTCATCATATGTCACAACAGCAATCAGTCTTAGCTTTGCTGTTGTGTTTGCTTCGTTGGTAGCGTTGATTGATGTTCAAGCATTCTTTGCTATGTTAGTAGTTGCTCTTATTTTCTTTAGTACTCGTATGGTTTACATCTACAAGCTAGATAAACTGTATTCAGACCAAACTGCATATGATAATAACAGAAACGAAGTAATAAGAGAGAAGTTCAACAAAATAAAGTCTAACAAAATATCTCGCACTGAACACGTATCTGTTAAAGATGCTATTAAGTTCAACAATAAGTATATAAAGAGCTCATTGCAGGGTTCAAAAATAATGGATGACGGTCAAGCGTTTTATTCTTTATGTAATAACATCTGTACGATAGCAATCACGATGTTATTTACTATGAACTTTTTAGAGGGTACTAAAGAAGTATCAGAGATAAGTGAAGATGATTTATATTCAATTGGTAACTTCTTTGTTTTGTTTTTCTACAAAGAATTTTTCTTCAGAAACGTCTCATCGTCTGTGGAATCGATTCTTACTGTCTTTAAGAACAAATCAGAGATTGAACTAGCATCAGGTATTCTTTTCGAGCAAGGTGAAATCCTAACATCTAAGGTTGCATTAGATAAGTCTAAAATAATAGAATCGATTGAGATCAGCAATGGTCATTTGTCATATTCTAGTTTTGGTGACCCTGTATTCACCAATTTAGCACTGAAGTTATGTCGACATGATAAAGTCGCAATCGTGGGTAAATCTGGTTCTGGTAAGACTTCATTACTGAATGTGTTGTCGTCATTAACCCCGCTTAACAGCGGTAGTTTCATTGTAAACAATACAACCCTAGACAAGTTCGGTTTGATTGATTATCGCAAGTCTCTGGGTGTTTACTTCTCGGAAGAAGAAGTGAAAAACAAAACAGTCCTTAAGAATATAACTGAGGACGAAAACTATGATGAAGATTATCTGTATTACGTACTGGATAAAGTAGGGCTGGTTAATGAGATCAACGCTATGCATTCAGGATTGAATACGCTTCTTGGTCAAGGTGGTGTTCAACTTTCTAGCGGTCAGAAGCAGCGATTGATGATAGCAAAAGAGTTGTACAAGCGTCCTTCAGTTCTTCTTCTTGATGAACCGACGTCGCACCTAGATACACCTAACTCGCTAAAAATTGCAAATGTAATTAATGAGTTTGATGGTATCTGTTTGGTTATTACGCACGATAACGAGCTGATAAGTAAGATTGACAAGGTGTACCAATTTGGAGATATCACAAATGCATGATCTTGCAACGATGTTAAAAGTCAAAGGTTTGATGGTGTCGGAGCTGACGATTCAGATCTTACGAATCATGACCAACTTCTATAACAAGAGTAGGGAAGACGACTTTGCGTCTGGGTGCAAGACAATCGGAGCACGCGGTGTTGATATGAAATCGTGGATGCATCACCGAAAACGCATCAGAATTGAGCAGTTGGATCTAGACTGCAGTGCTGAACACTTTATCAACAAAGCTAATAAGTTTGTTTGGGAAAGACCCTTACCCGACGTAAAGGTGTATCTTGGGACTCATACAGGGTGTCACTATAATGTGATCGCGTCTATTGTAATGCAGCATACTGAGCATACTCAGTTTTTCATTCCTATAATGGACAACCTTACAAGTTCGAGAGAAGAGAAAAACTTAAAGCGGATGGAAATCTTCGGTCATACTATTGAGATCGGTAGTAGCAATGACCCTAAGTTCATTTTCAAAATGATAAAAGCTTGTAGAAGATCTGCTAACGCTAA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59 | Bacillus_phage(20.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2913061 : 2939689
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP026315|2913061:2939689|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP026315|2913061:2939689|2920840_2921308_+|AUW04734.1|DBSCAN-SWA MSASDYIKEVRSKIGTMPLLIPCVAGVILNENKELLLQQKSDGTWSLPAGMIEPQESPVQALIREVREETGLAVKVDRLLGVFGGEGFGFTYPNGDQVEYTVIMFKCVVESCSQSALDDETVCLKWFSKGNMPRLELPYPLDCLFAENDSAYFVG >CP026315|2913061:2939689|2926318_2927170_+|AUW04742.1|transposase|DBSCAN-SWA MKYEFIESYVGEYSISLMCRTLEVSRGGYYKWCHHTPSERSKRRERFEQLVMCTFAQYRARYGSVRIAEELNETGYACCVNYVADIMKEKGIRARNGKGFKYSKDVAAMTNVADNLLRRDFESETPNQKWVTDITYIWVKSRWLFLATVMDLHSRRIVGWSLGTTMTVELITNALKMAFESRKPPKGVIIHSDRGVQYRAYKYQDFMRKHGGVPSMSRQGNCWDNAVMESFYSRLKVELIYAEDYQTVEEARMGIFEYIEVFYNRRRRHSALGHVSPVEYESM >CP026315|2913061:2939689|2923121_2923211_+|AUW05421.1|DBSCAN-SWA MRNAWHFYYALTLVIKVVCGGFGIALLTP >CP026315|2913061:2939689|2929036_2929147_+|AUW04746.1|DBSCAN-SWA MTNCLRVIRNAWHFYYALVLVCKVVCGGFGIALLTP >CP026315|2913061:2939689|2916244_2917129_+|AUW04727.1|DBSCAN-SWA MPDTLYIIGNGFDLHHGMQTSYESFKLYLQRKHGLVFDTVEKFLSIDEKWSDFEEALGNLDVDLLEDDASNYLPSYGDDDWSESGHHDYQYELTKNVEALSSELYECFCEWINTVDVPNNPTLLNLTLHARFLTFNYTQTLTELYNIPKSNVLHIHGSIDEPANEIVLGHGWAPEDRTQLTTYIDENTDTRIASGYQVVDEYFSHTYKSTSSVLRKNERFFASLSGLRNIYILGHSMSSVDLEYFRVIASQVKFDTNWYISFYKLEDKISLSQAAMELGLSESNVHFIKMEEIK >CP026315|2913061:2939689|2931375_2931693_-|AUW04749.1|DBSCAN-SWA MSQFTLYKNNDKSTASAYPYFVDVQSELLDSLNTRLVIPLTPIELLEKKAPSHLCPTIHIDEGDFVILTQQMASVPTKILTTPVNELSTFRNEIIAAIDFLITGI >CP026315|2913061:2939689|2918268_2918379_+|AUW05417.1|DBSCAN-SWA MTNCSRGIRNAWDFHYALNLVIKVVCGGFCIALLTP >CP026315|2913061:2939689|2925821_2925932_+|AUW04741.1|DBSCAN-SWA MTNCSRVIRHAWHFYYALGLVVKVVCGGIGIAYLTP >CP026315|2913061:2939689|2935756_2935909_+|AUW04758.1|DBSCAN-SWA MRLTNCSRVIRNAWHFQHALRLVFKVVCGGFGIALLSKRPMNPRGELANV >CP026315|2913061:2939689|2937487_2937841_-|AUW04760.1|DBSCAN-SWA MKRMLSAPEIYLYRESVDFRKSINGLAAIIESDTDLLLGSGALFLFTNKQRDKIKVLYWDKTGFALWYKRLEKAKYKWPTKEKNEVFTLTQFELDRLLSGFTIIGHKPVRINDFTMT 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>CP026315|2913061:2939689|2920723_2920813_+|AUW05420.1|DBSCAN-SWA MRNAWHFYYALNLVVKVVCGGFGIALLTP |
51 | Leptospira_phage(57.14%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2944182 : 2975879
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP026315|2944182:2975879|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP026315|2944182:2975879|2952309_2952630_+|AUW04782.1|DBSCAN-SWA MIRIIKKVVLTSTLIVLAACSSMSGANKYDGIYYHEDDQSHYLNLKDNGKFELLEKGKHTVGYYKVRAGMLHLYKDSRCFAEGLFKEDYLLDPDKTKWIKSKVVNK >CP026315|2944182:2975879|2967840_2968329_+|AUW04801.1|DBSCAN-SWA MRIALTFFLMVFSIISNAGQSVEDKLFTDLNNSIDALGSRIAVCSKISTKNKPDEETLKFAKQRLKELTPVLAHINYLAIERCSFSEKKELAYSMLIAKNNAKRQSTLELVKATEKMTFPFNTESQAKFDALSGEIKTFLTNSSFFSKPFDVLAFYESVADM >CP026315|2944182:2975879|2957717_2958302_+|AUW04788.1|DBSCAN-SWA MAFNELIGQLGAVIAVVVNLAVLSVSYNKINSFRGEQAKELHSRFTVVKELSKDIDANYAELLIILSGLTRASLSKDEIHWFITEPRAFLKLEAYGKLYGRYCQIDLEKREFSLTEKVNTVKKRVIERIKIVTFCVLIMSTITTIWYFVVSGFESVKAVYLALGFWCAYLLLILWGAQMLLSALSKAKELSGKP >CP026315|2944182:2975879|2947570_2948035_+|AUW04777.1|DBSCAN-SWA MYIWNIKSLKEQIRSGRLTEKDRFIYMFLTLIFTALGIELALRFPIESGNVWDTISSVSSVLIPMLGTFLAYKANGADSGTDFLGRYFSISFVVAVRFFALLIPMSALLFAYYMLVIPENPALESTALDTLPFIVWQGLLYYQIVKHVGAVKHS >CP026315|2944182:2975879|2953973_2954291_+|AUW04785.1|DBSCAN-SWA MAKRRSNQEWQALLEQYESSNITQRVFCEQHGLSLSTFFAKRRQLQTAIQPTPVEFVRAEVVEKTTKYQAQIATANMTLLVNDVELSIPQGTPAAYLAELIGALS >CP026315|2944182:2975879|2970671_2971190_+|AUW04805.1|DBSCAN-SWA MANIIYLNSGRDSVRVSDYSKKVLRDIMASVGLKKIMITSTARTANDQARIMLGNIEKYGVEHQKKLYGRYGDQIIDFYSTLKSSGKSRPEILNRMASKVNEIGPRKVSRHAGDYSKLNVIDIGPSIIPIPLRENFENAVRADSRVAKFLVPPKDPAYHLEIPQYSVGQSND >CP026315|2944182:2975879|2971182_2971599_+|AUW04806.1|DBSCAN-SWA MTRLWAILVILLFSLNVSANECVFDSHPVQTDNFNLENVQYYDLDSNNSEVKGILSNGNLFSVKYWSCNSFGIQATLFVGPFNIDKNVGLYIDQIAKLTLDTVDYERVNEMLLTRSFILTEQVVNVSLRTYLNRCCLS >CP026315|2944182:2975879|2971624_2972420_+|AUW04807.1|transposase|DBSCAN-SWA MSSTQYLISDALWAKIEPLLPIHKTNHPLGTHRKRVDNRDAMNGILFVLRTGCQWNALNATGICTSSSAHRRFQEWRDAGVFERFWQNGLIYEGVDWRSISMDGCQTKAPLAGKKTGKNPTDRAKQGVKRSLLTDANGLPLAVVSDGANVHDIKLVLQTLNALECYRPPLKVPLYLDKGYTGQWLHDELVALNYIPHVQSRAEEAASLKQSDDFKAHRWVVERTHSWLNRYRRLLVRWEKKIENYEAMLHFACGLIVWNKSLLG >CP026315|2944182:2975879|2974664_2974937_+|AUW04810.1|DBSCAN-SWA MSAEEIMNLAKKKQFEKAYFVGKRYLEKSPNNVEVVEALKVVSSDLRSRCMDLAYKKADNTSAYFKVASLLEKVNQLTNQDLYGNVIFPG >CP026315|2944182:2975879|2951811_2952138_+|AUW04781.1|DBSCAN-SWA MSLSIEEKQDLKSFLVNVYGPQARNWAINDEMFNLTYKMLSESGKCSDLMDLVPRPISVGENPAKWLSKQVRSMILRKLKGRKGHYAVCVKTSAIKMKTNFLMIDAGL >CP026315|2944182:2975879|2968702_2969746_-|AUW04803.1|transposase|DBSCAN-SWA MLRIMKITLTPQQKLQLEQTHDSTRDGRVRDRIKAVLLASEGWSQTMIAQALRIHESTVARHLSDYVLSEKLKPENGGSQSKLSATQTMQLIEHLTEKTYSHTHQIVAYVKETFGLDYTVSGMNKWLHHNGFSYKQPKGVPHKFDEAKQQAFIEAYEALKASCGEDESIVFIDAVHPTLSTKISHGWIRTGQDKVIETTGNRSRLNIIGALNLSDIGATIVHDYENINSETIVRFFCKLRESYPLTHKLHIILDGAGYHRSDLVKDAAFVLNIELHYLPPYSPNLNPIERLWKVMNEKSRNNVYFKRKRDFKEAIDQFFAVTLPEIAGSLASRINDNFQILKPASSS >CP026315|2944182:2975879|2965454_2965592_+|AUW04797.1|DBSCAN-SWA MGKYTLGQLANKLFRGIRNAWHFHYALVLVFKVVCSGFGIALLTP >CP026315|2944182:2975879|2970444_2970561_+|AUW05435.1|DBSCAN-SWA MCLTKHLSVIPNAWHFYYALRLVFKVACGGIGIALLTP >CP026315|2944182:2975879|2947067_2947427_+|AUW04775.1|DBSCAN-SWA MEYHYTNNDRLMQLNDLKGRLTLLIAHLQLNHNDAKIISIYECALFDVDELICNGFNQNQLSNVSDSIPDLFNRHKDWVPPLEAGSDGKLSEPQWFLALENYLQPVLKSARKLKELGAR >CP026315|2944182:2975879|2954941_2956180_-|AUW04787.1|transposase|DBSCAN-SWA MTDNTVVSLNTPQDPLTELIRQGARDLIAQAVEAELQQLLAQHQNVMVDGKQAIVRNGFLPERTLQTGVGDVEVQIPKVRDRSGHGVKFNSNLIPPYLKRTKSVATLLPLLYLKGISTGDMLPALESLLGKDAKGLSANSICRLKERWYAEYEQWRKRDLGRRRYVYIWADGVYCHVRMDDKLCLLVIIGVDDTGRKEVLGVLDGHRESEASWTELIEQLRAQGLQLAPKLAIGDGALGFWKAVAKCWPQTTQQRCWVHKTANVLNKVPKSVQPRMKEALQDIWMAETRDDAYHAFSTFQKRFEAKYPKATDCLVKDKAEMLTFYDYPAEHWIHIRTTNPIESMFATVRLRTNKTKNCGNRKTTLMMAYKLMRSAETKWRRLRGFALLADVVKDVRFINGVKEMETHQQATA >CP026315|2944182:2975879|2952780_2953377_+|AUW04783.1|DBSCAN-SWA MDKNTENWRQYYEKALSRPHSKRTEFAVRLNESNLKVATDCGCGTGSDIDYLSGQNYKVFGFDVNPDSITICNDRFGSNPQINIEQSSFESFRYPKSGVVIANNSLFFAVPTVFSTIWHNIESSLVVGGVFAGDFMGYKDSWASGFRVPTSPFTESEIRAMLTNFDIVSWSERDEVGQTTIGATKHWHIYSVVAVKRT >CP026315|2944182:2975879|2945578_2945704_+|AUW05430.1|DBSCAN-SWA MCEICITNCSRVIWHAWHFYYALVLVFRVVCGGFGIALLTP >CP026315|2944182:2975879|2974338_2974548_+|AUW05436.1|DBSCAN-SWA MAGGLLGAVFVILAAYLIGSLFGPLYNSEDESARNFKLFLLILVGGIGAGALLVHRCKSKHNKAFKSDS >CP026315|2944182:2975879|2944182_2945034_+|AUW04771.1|transposase|DBSCAN-SWA MKYEFIESYVGEYSISLMCRTLEVSRGGYYKWCHHTPSERSKRRERFEQLVMCTFAQYRARYGSVRIAEELNETGYACCVNYVADIMKEKGIRARNGKGFKYSKDVAAMTNVADNLLRRDFESETPNQKWVTDITYIWVKSRWLFLATVMDLHSRRIVGWSLGTTMTVELITNALKMAFESRKPPKGVIIHSDRGVQYRAYKYQDFMRKHGGVPSMSRQGNCWDNAVMESFYSRLKVELIYAEDYQTVEEARMGIFEYIEVFYNRRRRHSALGHVSPVEYESM >CP026315|2944182:2975879|2954287_2954641_+|AUW04786.1|DBSCAN-SWA MKRMLSAPEIYLYRESVDFRKSINGLAAIIESDTDLLLGSGALFLFTNKQRDKIKVLYWDKTGFALWYKRLEKAKYKWPTKEKNEVFTLTQFELDRLLSGFTIIGHKPVRINDFTMT >CP026315|2944182:2975879|2951165_2951483_-|AUW04780.1|DBSCAN-SWA MAKRRSNQEWQALLEQYESSNITQRVFCEQHGLSLSTFFAKRRQLQTAIQPTPVEFVRAEVVEKTTKYQAQIATANMTLLVNDVELSIPQGTPAAYLAELIGALS >CP026315|2944182:2975879|2960532_2960646_+|AUW04791.1|DBSCAN-SWA MLTNCLRVIRNAWHFHYALRLVFKVVCGGFGIALLTP >CP026315|2944182:2975879|2965618_2965921_+|AUW04798.1|DBSCAN-SWA MSSCKKLFECVRPDFICSLIATRTEEQGVLKLNLRSQNENVELYGFEDLADSVSDLLSSKRVTISEELGTYKEFGTIRIECWVNESYSEYWCDRANVEQT >CP026315|2944182:2975879|2964871_2965486_+|AUW05434.1|DBSCAN-SWA MSSKGIDYDFPNTNRNGSHDQNEIQALKNCFESKIPLFVISKASNQKLRNVHIGLVQTFDEINAKAFIRFVAQDKLFPTANETIKESQAEYKVTFENEVNESLDDSSENRQRRLASRSTKPKVVYRLVQDYRRDPDVVAEALYRAEGFCEKCKEKAPFIKRSNGEPYLEVHHIIPLSQGGLDSLENVISLCPNCHREIHFGPAG >CP026315|2944182:2975879|2965917_2966028_+|AUW04799.1|DBSCAN-SWA MTNCLRVIRNAWHCYHASVFVFKVVCRGLGIALLTP >CP026315|2944182:2975879|2946376_2946469_+|AUW04773.1|DBSCAN-SWA MIRNAWHFYYALVLVFKVVCGSFSIALLTP >CP026315|2944182:2975879|2953514_2953814_+|AUW04784.1|DBSCAN-SWA MNMTDIIEYISYLIAGIIIAPFGFMLFKEFIGKDRKTVTDEVKSTVGDESRKFLGGRYGDAVVGQFVEFKLIIAIGLPLVLFLGISSLVNSLLKVLFNL >CP026315|2944182:2975879|2961501_2962284_+|AUW04794.1|DBSCAN-SWA MSVFISPRLKVERACKHIQELESITFPLSKELYEIKVEAEFAFPRPDAIGMSLVYRPTQPIAETLGLIIGDVISNFRAALDHLVSGIVREVDSTKRPYFPMSDSREELSKNRFLPILDAALPGASELLLGKLRPEGGGYELYWLFHSMDNDSKHNIILPTVSAVNIQNINLTSGGMTMTNYGVGGDATKQINLLRTGGEPIRIQNTFDVSVELSFPSESIFPNLPVIRTLQKIGEIVTLTINEFEKLYTTNKTDKVKELA >CP026315|2944182:2975879|2961333_2961462_+|AUW05433.1|DBSCAN-SWA MCAKCKLTNCSRGIRNAWHFYYALVLVFRVVCGGFGIALLTP >CP026315|2944182:2975879|2973764_2974298_+|AUW04809.1|DBSCAN-SWA MLGFSFYSLIMRSAMIKFDDLWEAHATVSGVDYPCVVNNELAFSNQCAIRVGNALVKCGYDTSKLIGAEHCWHHAKSEGHILRAQQLANALKRNMPSEFSADKSIPIKDFKKHISGQKGIIFFKDYWPRNSDPIDNPTGDHIDLWNGSQLTDWSSWIRVTTGLSIEGAGRTLKNLRK >CP026315|2944182:2975879|2962438_2963413_+|AUW04795.1|DBSCAN-SWA MLVLNEHTILDSLVRELKDLGYPEGALRREVPIAMANGMKGYIDLTIIDQDSNEVIAIFEVKRRSEYIHGAAQQIIRYAKALPKSILCYAYVRDNEGIEIAQVNQDDGFITLVDSLPTYDSLKSTYFALNKIKKKAESLFQKTNSAKKWSSIVAGATSALTLGITASMTVGLFTSEQKSLTQAELTNKVIMLEEQSKKQQSNYEDILVAIEGTNASIKSLTSVPEDHGWKIEASKIQNELDNLQGKLKALEDALTVNPAKALSMPILRKDLDNTEKSLRSELLQTRSEIDRMYDQNKWFIGLMFTIALSVLGIAISSFFNRNDT >CP026315|2944182:2975879|2950815_2951169_-|AUW04779.1|DBSCAN-SWA MKRMLSAPEIYLYRESVDFRKSINGLAAIIESDTDLLLGSGALFLFTNKQRDKIKVLYWDKTGFALWYKRLEKAKYKWPTKEKNEVFTLTQFELDRLLSGFTIIGHKPVRINDFTMT >CP026315|2944182:2975879|2970031_2970439_+|AUW04804.1|DBSCAN-SWA MERFSWLPNNPSWSVERILIKSAKWFRNVSCTIVFVISFPVTSSDNVVESDYQLLSSQYNEYYQKGKYKEAFQISIKQLNMDPSDSVAFLRLALSVRGSCNLVKPYFSQFGSMNQFREVTLLAKGVILKECAINL >CP026315|2944182:2975879|2975083_2975879_+|AUW04811.1|transposase|DBSCAN-SWA MSSTQYLISDALWAKIEPLLPIHKTNHPLGTHRKRVDNRDAMNGILFVLRTGCQWNALNATGICTSSSAHRRFQEWRDAGVFERFWQNGLIYEGVDWRSISMDGCQTKAPLAGKKTGKNPTDRAKQGVKRSLLTDANGLPLAVVSDGANVHDIKLVLQTLNALECYRPPLKVPLYLDKGYTGQWLHDELVALNYIPHVQSRAEEAASLKQSDDFKAHRWVVERTHSWLNRYRRLLVRWEKKIENYEAMLHFACGLIVWNKSLLG >CP026315|2944182:2975879|2945084_2945597_+|AUW05431.1|DBSCAN-SWA MNSYTSECKRLSINARAAIGLLVFERFCVLHGLEFHDNQEFLEHLWDWFLVDGPDEFEPWESKRPTLVNCGLGDELPEDLRHSLAQNGIGESQFRTIVSGVTDILWGSFWGAVENEQSMAALESVISASGIEQLPVLTPFKFSLFSQNDGWSDKITPQDLEFWRTCAKYA >CP026315|2944182:2975879|2958419_2959658_-|AUW04789.1|transposase|DBSCAN-SWA MTDNTVVSLNTPQDPLTELIRQGARDLIAQAVEAELQQLLAQHQNVMVDGKQAIVRNGFLPERTLQTGVGDVEVQIPKVRDRSGHGVKFNSNLIPPYLKRTKSVATLLPLLYLKGISTGDMLPALESLLGKDAKGLSANSICRLKERWYAEYEQWRKRDLGRRRYVYIWADGVYCHVRMDDKLCLLVIIGVDDTGRKEVLGVLDGHRESEASWTELIEQLRAQGLQLAPKLAIGDGALGFWKAVAKCWPQTTQQRCWVHKTANVLNKVPKSVQPRMKEALQDIWMAETRDDAYHAFSTFQKRFEAKYPKATDCLVKDKAEMLTFYDYPAEHWIHIRTTNPIESMFATVRLRTNKTKNCGNRKTTLMMAYKLMRSAETKWRRLRGFALLADVVKDVRFINGVKEMETHQQATA >CP026315|2944182:2975879|2949226_2950756_-|AUW04778.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKTPNINPESQDIAELQAMVKALMASENRLKQERQSLLEQLKLAFERQFAKRSEALKPYDESQGDLFNEVECEATKEEEVEVTTTTTTKKRGKRKPLPKTLPREVIELDLDDHEKQCACCKHSLHKIGEDRSEKLEFSPAVLKVLEYVRPKYACRQCEQTEDKNRIVQKPAPQSIIPKSFATESLLANIILGKYQYAMPLYRQESLFTQSGIELSRTTMARWVIQVSEKFKPLYAALKEHLLQQVVVQADETPLNVLKEDKQCYMWLYCSGADSPDAALPDVKNIALYDYQNSRARACPVAFLGDYSGYLQTDGYGAYDGLHQVTNVGCLAHARRKFMEAKKLQGKGKSGKADKALAKIQKLYGIESRLKGATVETRKAERQLHAKPILDELHEWMTTQKVISSSPLGKAIKYTLGQWPKLIRYIDDGHLSIDNNRAERAIKPLVIGRKNWLFSNTPNGADASAMLYSIVETAKANGLILYDYMVKCMKELAKAEPDVDALLPWNFKH >CP026315|2944182:2975879|2947348_2947543_+|AUW04776.1|DBSCAN-SWA MVFSARELSSTCSKKCKETKGVGCAIIHLTNCSRGIRNAWHFYYALVLVFKVACGGIGIALLTP >CP026315|2944182:2975879|2966624_2967119_+|AUW04800.1|DBSCAN-SWA MLKNVVILIFLMFSSSVIASTPRKELNLLWMKNNYFVIQEHLESDESKIVVPTINTLGEIWVHRDGAVSGEVSLLLLVALTHHTYIALAVLSSEPDSFSKWLNELQGIVFTDFNGGEVEQLSHAKEDLVRALSLYMNSNPQVALAPYGESLLERLEGISIRSVD >CP026315|2944182:2975879|2963438_2964407_-|AUW04796.1|transposase|DBSCAN-SWA MKYTHLTENERYMISALRKQGISTAKIAKQLGRHKATIYREIERNSRYNKHFKRYSYQAWRAQQMARNRLRRSRRNKRYSEIDFRLPEALLRLDWSPDQIVGYLRVRGYPTMSHELIYQHIWNDKTLGGTLWKHLRQSTKKRRKRYNSKDSRGRLAAKRHITERPAKAEHRKEPGHWEIDTVVGRGTKHCIVTLVDRMTGYTFIGQMDDRTSESLNVRMSKIMTRSDLPFKTITADNGTEFHGYAQLEKHHNCLFYFANPYHSWERGTNENTNGLIRQYLPKRTSMSHVTQKLCNEIAHKLNTRPRKRLGYRTPTEYIHAHL >CP026315|2944182:2975879|2946505_2946931_+|AUW04774.1|DBSCAN-SWA MSEKYMLRALEVSRKALPDCVPNPPVGCVLVKDNLIVSEGFTQAIGGNHAEAEALNAYEGSMDEVTAYVTLEPCSFVGRTPACADTLVKSGIKYVVVALVDPDERNSGKGISILKQNGIEVEVGLCEEQVACFLKSYLGKS >CP026315|2944182:2975879|2959840_2960512_+|AUW04790.1|DBSCAN-SWA MKELLLLSVSLFGANVLAQEKIDFDSSYQEIVLNGHTIIEAIHGDLNGDSRDDIVLMIQGTDQNKIVTDELRGQLDLNRRGIIVALRNNNKYDVVVENDNCFFSDDEDGGVYMVPYIEISIKKGNLYIHFAHGRYGYWRYNFRYQDSDLELIGYDESANRGPRVEEVTSINYLTKKMLTKENVNELDDYDPIFKEEWLTFVLEHRFKLSQISDFTEFGDGVRN >CP026315|2944182:2975879|2972623_2973034_+|AUW04808.1|DBSCAN-SWA MYSSILILLYGLLVSLGAVSGTCTQGDDERFYASIMSGSVLFIVIMLRLLRENRGSKFIWITPLTALLVAMSVTYFWAPFVIETTFEGHHLCGKEFDSHLVESDVWSRSIPTLHIVFSLAIFMLSFWKLIRSKTGK >CP026315|2944182:2975879|2945735_2946362_+|AUW04772.1|DBSCAN-SWA MSVYKEELGFPLFHGTSSIFLDSINQSGLGGENVSKKFEINAMFSQVVDAFNSKYKDCSWWVGEGFICEKMVRQEVTNGGFNFRYGGVYLTPSLKTAKNYATSKKYGSELISYFIRSYEELFKLDPMLADKIFPIAHPLRQLIALNPVPVVLEVVGITKDCLVTEQGMPIEEQLELMRQFPEEMWQQFNFESTKPISWENIKQIDLNG >CP026315|2944182:2975879|2961016_2961259_-|AUW04793.1|DBSCAN-SWA MHTLTANDAKRNFGELLLSAQREPVKISKNSKDTVVVMSIRDFEELEAMKVEYLKHCFKSAKEDLNNGNTVDGESFLNSL >CP026315|2944182:2975879|2960709_2961009_-|AUW04792.1|DBSCAN-SWA MQKNKYKLSNLAQSHLRKVKNYTVENFSELQWRNYKDTLLSGFQMLADNPGLGRSCDEIYPNGFYFPIGKHTAYFTKEDDFILVVAVLGQSQLPQNHLK >CP026315|2944182:2975879|2968315_2968447_+|AUW04802.1|DBSCAN-SWA MLTCKCCITKHLRVIRRAWHFYYALVLVVKVVCGSFGIACLTP >CP026315|2944182:2975879|2948537_2948654_+|AUW05432.1|DBSCAN-SWA MGITICLRVIRNAWHFCYALRFVFKVVCGSFGIALLTP |
48 | Leptospira_phage(37.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3097253 : 3165365
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP026315|3097253:3165365|DBSCAN-SWA 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52 | Tupanvirus(20.0%) | protease,transposase,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3383377 : 3457174
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP026315|3383377:3457174|DBSCAN-SWA 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54 | Tupanvirus(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
6187 : 31789
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP026320|6187:31789|DBSCAN-SWA 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41 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 2007
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP026318|0:2007|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP026318|0:2007|697_1207_+|AUW07520.1|DBSCAN-SWA MAADFNREKLLVKKMVHTYFQHQWQFRLEIEEQPLDFEIFIKDVTYGPIELEYEPVKVGVNQLQFPTGVMPVSISMTVRDHDDERIHKWFAEWTSKVANGDGTVNPPFNPETKWIRDWKKYTLLHKGTGFEEVLSETYPVAPVQLGDVTQSYSEHSFKEFPLTVIQFRS >CP026318|0:2007|351_708_+|AUW07519.1|DBSCAN-SWA MRHNDVSIGTPLYFYQITPEGPLVGEWLTCTVTGEHEQVWLVSYENRVYAVDKTTLVSERTAFYTQKATENEPKGRYALSESLRQFFMANRHHNMPYPLIRQMYDVVNNHITGAADGS >CP026318|0:2007|1209_2007_+|AUW07521.1|DBSCAN-SWA MFAPFSLPSKPIKQVLIREATTAETLDFCDVLPEHEEALTTKFLNTIQDKEAFSDCLGWTAEDRRLALFWYWIHTTEDTFVSLDYDCPHCKQPHTHEFDMRDLAEGYQEISGLASRDLTFEGRKLVISPLTGSHMEELENMRLALMVEKEGSPAAVRKQAEIRFHKLKSALYMADDHEKSAYKRDANLNNWLRELPETKYQTLQVLVNDALASMVHGLPSKVMDDGKIMLRSPSHICPTIKTKENKEVTTELLLPFRNYSRIPRV |
3 | Escherichia_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
5201 : 50035
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP026318|5201:50035|DBSCAN-SWA AATGAGCAATCTTGAAAACAAGGCAGAAGCACGCGCTTCCTTTACCGACATTATCCGCAAAAAGCCGGTATTAGAACCATTGGCAGATAGTCAGGTAATGCAGGGGATAAACACCTTCCAAAACCTCGCCTTGGAATATGCCATCCATAAACTCGAACGGGCGGTCCAAGAGGGGTATTTGAGTACTGCCTATAATCGCAGTTCAATTCTAGCGCTTGCTGAAGACCGACAGTACCTACCTCGTAAGGCTGCCCCTAGCCGTGGACAGATCCGTATCAGAAACAAACAGAGCCGAGATCGCAGCGTCATGGCGCATTTCCCTATTGTTTCTGAAGATCAGGTTTACTACATGATTAACGAAAGTGTTCGTGTGGCAGCTGGTGGAGAGGTCGTTGTTGAAGGCTCTCAAGTTAAGCAGCATGAACTATCGTTCGTTGTGGAGAAAGAGCAACCCTTCTTAGAGTTTGAGTTTGGGCGCTCTATCAGTGTTAACCTGCATAAGTTCAGAGTATTTGTTGATATGGGAAGTGGCTATGAAGAATGGCTACCTACCAATCGCTTTCGCAACGCTCGCGCTGATAAAGTGTTTGATGAGTTTTACTCGCATACCGATCAGGTAGGGATCCGATTTGGCAACAATATTTTCGGACTTATCCCAGCAAAAGACTCAAAAGTAAAAGTTGAGCTATGGCTAACTGAAGGTGACAAAAAGTTAATGCCAAACCAACCACTGACGCCAGTGGATGATGACGCAGAAGACATCGAATTTGAAACTGCCTCCGTCTTTACTGGTGGCGCTGCCAGAGAAGAAACAGATGAGCTACGCCGTAATGCGCTTTATTACCCGCTCTATGACGACAACCATGTTTGGGATGATGATTACCTGTTCTTTATTAAGCGCCACTTTCCTGAAGTGATTTGGGGTAATGTATGGGGAGAGGCAGAGCAAGAGAAAATGGATGGTCAACTAAAGCTGGAGAACGTCAATAAGATCTTTCTTTGTGTTTATGCGCCGAACAATGACGCTATCGGTACCGAGATTGCTGCATACATGAAAGAGAACATTCCCCAATTTAACCGCCGTTACCAGAATGTCCCTGTAGATGCTCAGGCATTTACTGCCAAGATCACTGGCAAGCTTTTACGCAGCGTTACGCTAACCGATGCCGAGAAGTTAATCAGCGATACTCTTTGGAACAACTACGGAAAAGACGCTTCAAAGCGAAAGGCAAAAGCCCTCAAACGCGATCTTTACCGTCTGATGAATAACTTAAACATCTTTGAGAGTGAAGATGACATTGATATTGAAATTCTAGGTAAAGCAGAGCCAGAAAACCTCAAGCAAATGATATACATCAATCTTGAAGCTTCCATGGGGATGCTTGACATAGATTACACAAATAACGCTAAGTTAAGTATTTACTAGATACTGATGTAACACCTAACAAATACTCGCCATAGGTAAAAAATCTTTTTGTCGTGGCGGGTTCTTGCCTTAAACCGTACCCTCATTCGAGATTTAGAGTGAGGTTTTCCTGTGGCTGAAAAATGGTTAGTTGAGCGTCTTACAAAGAGCAAACAAGGCTCTCCCCAATGGGTAGCGCTTGCTGAAGCATTGGAAGAATACTGGGATACCTATTTTTTCAGTGAACTCCAAACATTTGAAGATAGTAAAAACATCTTCACTGCCAACGATGAACATCTAAATAAGAAAATTGCCGAGTTTGGTGATTATTTTGATACTGCCTTACCCATCGACTCTTCAGGTAAGCGGCTGTCTATTTCTTGGCAGCGAGCCAACATTCATGAAAAAGACACTATCGTTCCTTTCGTGAATGCCTTGTGCGTGAACTTCGCAGGGCTTGGTGTGACATGGGAACCTCTCTACTCCAACCGCAGTCAAGCGTATACCTTAGACAATCTATATACAGAGCAAGAGATCCAACTAAAACAGTGGGAGCTAGATGATTTCTGGATGACCTCTCGGGGCAAGATTGCAGTTGATCTCACACACCTTCATCAATTGGGCATGGCTAAAGAAACTTTTATTGCCATAGCTCAACGAGAAATTGAACGATTACGCCCCTCTCATATCGTGTATGACGGTGAATATTTCATTCTAACCATCAATTTCAACTATGAGCCGTTGGGTTATCACGTTAAGCGCCAGACCATAGCCGAAAAAGGCGGCTGTATGTTCTACCGCTTAACGGCTTCTTTTGATGAGCGACCAGCTGACGTACCTTGGTTAGATGAAAGCCCTTTATATGTCGAGCATGTTCGTGGAGTAACAACCAGCCAAGTTGACTTTTCTCTGGGTAATATTTCATGGTCCCTTGATTTGTTCGTTGATTTGGGTGATCGCCGTGTACCACTTGCGGGGAAAGAAGGCGACGTAATCGGGGCGTTGCAGGAAATATCAACGATTGAGCGTTCTGTTCCTATTGAGCATGGGTTTATGCCTATGGATGGTGGTGCTCTATCAGCCGTCCGTTATCCATGCTTGACGTTCAATATGCACTATCAATTTGATGCGATGCCAGCAGACAGCGTTCCAACAAACGATCCTTTACACGGGCAAAGTCGAATGACGATTAGACCTGTCTGGATGAGTTATCAACTGGGGGCGGATTGGTCCCTTGATTTGTTTGTGAAGACACAAGACGGCACTGCAGCATTATCTGGAAAGGAAGGCGATAAACTTCCGCCATTTAAGCAGCATCGAATCCAGTTACGCTCATTTCAAATGGAAGTGAGCCAGCATGGCTGTATTCAAACGAAGCAAACGCAGTCATCTTGTTCCATCGCTTACAGCGCTCGAGAGTACCCCTCTTTGCCTTTTGAGTTAAAGCAACCAACAGAGATAAACCAAAATCCATGGCTGGGGTTTGACGAAATCCCAGCTGATTTCGCACCGTTAGACACACCACTTTGGAATTAGCGCTATGTCGACAAACCAACCATGGCAGATTGCAGAGCTACTGCCTCGTTTTTACGAAAAAAATGCTCTCTCAATTGCAGGACTGGCGAAACAGTTCAAGATCGTTAAATTTAAGTTTGGTCATGATCCGTTGCTGGTGGATGACAGCAAAACCCCGCCAGCACTCTCACCATTCAATGCAGCAGAAAACGACATCAAAAACGTTTTCTTTGAAGGGACCATTAATCCTGCAGAAGATGTTGTTTGGGCTAATGGGCGATTACTATTCCGCTGTATCATGCCTGAAAATACCTTATCAGAGCCGAAGCAATACAGCCAAACCGGCTTATATGACGATGACGGGGATCTGGTTGCCGTCAGTATTGATTTGCCAGATTGGGTAACACCTGAAGAGGGCATTAACACACACCCATACGTTAACTTCCCTATTTCCGGAGAGTAATGGATGAATACATACCCACAACAGCCAATGGACGACTTGAGAGTAGATACAGCATGGCGTGAAAACTTCTCGGGTGCGTCCATGAACCAAAAGTTACAGGGGTTACTACCTAAAGGGGTTTACTCTGGCTTTTCGGTCAAACCAAAGACGGGGCTAACCGTCGAAGTCTCAGGAAGTGATCAGAATATTGCGGTTCTTGAAGTCGGCACTTATTCACTGACAGCAAGAATGCCAAACAATGTTACCAAGCAGGTAACATTGACTGCAGGTAAAACGCAATATGTGGTGCTCGAAGCACAATATGCACTTCACCAAGCGTCTTCTGTCGGTATTTACGTTCGAGATAGCGTGCCGAGTAACGCTATCATGTTGGCTAAGATTACGCTTCCGTCAGGGGCAACATCTGTCCCTGTAGACAGCATTGAGCAAGCATTGCCATCTAAACCAGTTTCAGCCTCAGATTATGCAGAGCTGGCAGCGTATACCATCGACAATGGGCGCCGAACACTAGAACTGCAAGAAGAAGTAAACCAGCTCAAAAAGCACCTTGGTCTGTAATCCTCCTATTTACTCTCTCACGCGAGGGAGTAAATTTTCCTGTTGATGCGATCCTACCCCCTGCGCTCTACCATCGAACTGTTAACAACACAATCACAGTGTGGAGCGTTCCCGTGAGTTACTTATCTTTCGATTATGCCCAATTCAATGAAAAGGGACTAAAGAAGGTCATTGATGAATTTAAACGTCAAGATCTCCAAGTCACAAGCGTTGAAGCGGACAACAAAGCCAAACGACAGTCTGGAGTGCAGACTAAAAAAGCCACTCTTCATTTTGCCGATGGTCAGAAGCTCATGCTTCAGGCAACCGCGCAAGGGGCTATTTTCCAAGTACGCCTCAATACAAGAGTGATCCCAATCAAGCATGTTGACGATCTAAAAAAAGCCGTTGCAGAAATTGCCGGCAAGGTCAGTGCAAACAGCAAGCAGTTTCAACAGACATTAAAAAAACGAGCAGCCAGAGCCAGCAGTACGAGTAAAGACTCATCAAGCCGAGCTAAAACATCACTTAAAGCCCAGATAGCACTGGCAAACGCTGATAAGCAAGATTTGGAAGCTTCAGTTACTGAGAAACGAAAGCAAAAGCAGGCATTAGAAGACGGTTTGCCAGCTAAAGAGCAAAGAAAGTCAGATATCAGCACCCACATTAACCAAGAATATTCTGTTTCAGAGCAACTAGAAGCGGAGCTAAAACAGCTAGAGGAGTCCGCAGCATGAACCCAGTGAAAGGATTAAAAGTTTTTGCCATGCCGGACCCACTGGCAAAAGGCTTTACTCGCTCTCAAATCAAAGAAGCAATGTATCAGCTAACCGCAGATCCAGAGCAAGAAGCGTTAATGTTTGAGGTTGAGCCTTTGTCAGTCATGGATGCTGCGTATGTTGAGGGGGAACTCGTTGGCAAGCATGATGGTTTTATTCTGGATGCGGTGACAACCAGTTATGCCTCATTCCCTCGCACAATGAAAGCGTTGGCTAGAGCACTAAACCGAGCCTTATCAAGCAGCAATATTACTGTGACAGATCATGAAGTCGGTGAGCCAAAGAAAAACAACCTCTTCGC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50 | Vibrio_phage(40.91%) | integrase | attL 23047:23061|attR 53426:53440 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
55414 : 74019
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP026318|55414:74019|DBSCAN-SWA 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>CP026318|55414:74019|68492_70094_+|AUW07596.1|DBSCAN-SWA MGTPSTEQAYREQVAKINDNASQLAQHIIHPQMENGEIITDSAARNEAIVQSLNGSIFDNAGEMSSMIAGSAANAVRHYHAMHGEMPSAELMSSMHNSISNMLDPNTDNPHLKAILDSAGDGSMSASEGIIQRNRMVALVVPVQLMMITNDMVTHIPANYNKSEIFRINRVAGSTFGDLTEGDLIDVDFNGQYSSMDQRHLIGNGDGTEVNFNFDIASVSKTMPFVKGKVRILVDRMPVGGDDGKGGIFGKFVDADSDTVTFTGTVNYQTGVIALKFSKAPKTGIEIHTIADISIEKDPSLIPTVEHEMVSYELFPHESALVSSNSIQSQFTGKREYNIDIAGMQLATARNLMAADKDRKRLNDIYFYAKGEKTFDLTIPSGLSYRQHYEMIQTILLAISTELMNRTKRSGLVGLVAGREASRVLKSLGAPHMVYAPNYRQLPQPHYVGTVFGYKFKEDPHMPDPWKILCYAKGREHGDAGYVAGDAISAINYAHSIGRNLKHENTLYELAYRDLHPHNGRDWFMWLRVIPKA >CP026318|55414:74019|73518_74019_+|AUW07601.1|DBSCAN-SWA MAVPNAKGNVDLLRQAHKKNVALGERAVASDFIVRIKEYPEISALVRTAQLPEEKRGEPVEDQGQYGQGFRQYGATKRDGDMAAQIVEIKRGDVLKTIAKIVDNKEYVTIEVVLHGEDMEEKGYRLEDTMIAADPADLDVENRTGTVRIPVNFLYNWFERIGGYAG >CP026318|55414:74019|57393_57681_+|AUW07580.1|DBSCAN-SWA MSDSIVQLSNVFGVLKEKLPTIENEFDPLELEVEEREGIVVDYIINKAGNGYVLVIDDRDLTPELVTLEFESSDAIITYFEKGQRKPMVLDSVEN >CP026318|55414:74019|56652_57066_+|AUW07579.1|DBSCAN-SWA MNATFEESMLNDCLVQLQEQFPKYSKLDQMKILESIRSLVVEPKTIAKARPLEDVLADIREAIEDGGRARTFFTTAFSNWYRRTETPRIAHLHDYVNLDYKNRHLFQEMMGLRDSGRFDDEALYQFEQYCLSFLDKE >CP026318|55414:74019|61485_62664_+|AUW07588.1|DBSCAN-SWA MKQPEMTKNVRSQDKDFNERRRNQKAERQYARRTLSPSAIREAIRTGELPLYHSVLLGSKKGGDPFTIDDMRAFDKARKSTSKKWGRTRGAPLDQLIVASRKIDVQRANTEIKVARLYKVRGDLLHFNVTASGKHGEDSYQVRIRLENWMEELTQTQRSWTAAIKRICLGNVSIDCQCGRYQFWYRYVATAGNFAIAPYEKDFPKIRNPQLTGCCCKHQLKALGALKSPTIQAQLAKQLQAQAEKEGFAGENTDSFLTKEDREQLERARPRDVDKAAAMQVINKMKQAKRVFKRQIKDPKYIKKLEKEVAELRKQLGKQQAKVSTSKAKAKKAIEQCQKQAQSANRDQLKALLRSELDRAKMYGADRDSAVKVFAKMNKVPLADAQKLAKDL >CP026318|55414:74019|64326_64524_+|AUW07591.1|DBSCAN-SWA MATPPKRYGELATEQQVANAKQEAQTGMVSSLEFEQFKQDLMTAVNAITKQNNDSADRLSGKTNA >CP026318|55414:74019|65250_65436_+|AUW07606.1|DBSCAN-SWA MSDIRQRRDVLMTQTDWTQIPDAPLSPEKKEEFAAYRQALRDIPQVYNNPDDVIWPQKPTV >CP026318|55414:74019|72189_72861_+|AUW07599.1|DBSCAN-SWA MYGTGYPFGGSDPVFDSAGVMPAAKKPQSNEYTIPDQILDDASNDLGEKQIRANAMAAALTWLEDNDASYSNFEAIVAGLADLDEDGEVTEPEEELFNEILTMAADSLVELGANAANVESFIDSESEEAGEKLHTYLNDKLSENEKSDDELITEYAVKAKLVLDATQRVVRNGKVKVIKKPLKKKRLSSAQKAALKKARRKANNSGARRKRAKSMKARRQRNM >CP026318|55414:74019|68029_68239_+|AUW07595.1|DBSCAN-SWA MALKGQESTMAENIMDALEAAGFKPRAQEAVGAKFWTAVSKGIIDTIVSESEVEVKGGGSYGGEMAKIK >CP026318|55414:74019|65508_66240_+|AUW07593.1|DBSCAN-SWA MTEITEKNDITDFYPVDVAFGGHIVDALASLDPESCPHHVKAFLQRDSKQQVFRGDYDSPKAFIQAIRQFQKQTGSDGERKFNAARLPLINYYRPIGFRSASAEYAQFVESVTGWDDALLKKTNISISYLELTYRIVFMANDKASVERLVLAWHMHIARRRAGGHRFNVTYSLFGEDIDLPITIEDSQTIEANNLSHNYADGRLYAVDVEHTVNAPILYGKGVGHISPIRWMVEFRPLEEVFV >CP026318|55414:74019|57983_58331_+|AUW07582.1|DBSCAN-SWA MDKLEQLGQQLATAMKQAEHANVGTIGSVHHKISPLAYELAKNTNPYLTLLKENHERFKHEHGRPAEYVFMPLEMLMSLVGDLPQMEQKLFWLSDTKKIEEMIVKLTDDGTLRFY >CP026318|55414:74019|70625_72179_+|AUW07598.1|DBSCAN-SWA MSGMISQFITEAAGIAVLPPIDNNYTTGGGDVAVGACVVIAPKGPVGKVITATAEDWEDLLGRPLPMNQGTKAEGLRQLKDALDDLQYCHVIRVVADDAKYPSIALPTAAEGAAVKSSHAYGTSLSLANGHWLAVYPVDGDPSTKRRMVISDVDSATKRFTLSFQEQISGVWQSIQGESYVVGVSVDDVDDSGLTAYLPNVLEERASRFRAEIATTVDFSVVKASEEAFEGGTNGGDPTLDNWKAAWDLLKTDDIDFNLCFAAGNYEPAAIAHMITIADGRLAQFRFDVPPWLTEVAAKQWLADANLESYQASCFHYPYKATDEWYGGKSVWGLSGAATAAKAKCFATPTGHAAVKGAHFTAAGEKRGTINRRGIEPLHLTGKLQPTELVKARINPVAKGKVINDCLNIWHKNNYLRFEHTTAILNDLCHEFLQAAAVVQFEPDGFVLENLQELADKICKKRYEAGAFVEPRNPNKDGKNPYRITLKQVEIDYWHIEVAYAQTGVARRIAIQPRLMA |
25 | Escherichia_phage(54.55%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026317_1 | 27529-28091 | TypeI-E |
NA
Consensus repeat of CP026317_1
|
9 spacers
spacers of CP026317_1
>1.1|27558|30|CP026317|CRISPRCasFinder TCATTCAGCAACCAACTTCATTACGTCTGA >1.2|27617|32|CP026317|CRISPRCasFinder AGAATACACATCTCTTTTATCATACCACTATT >1.3|27678|33|CP026317|CRISPRCasFinder ATTTGCTGCGTAACATTGAACTGTCTTGTAGGA >1.4|27740|31|CP026317|CRISPRCasFinder TAATTTTTAATCTGGAATGTCTTTAACCTTG >1.5|27800|19|CP026317|CRISPRCasFinder TCTCGGCAATAACAATGTT >1.6|27848|32|CP026317|CRISPRCasFinder AATGCTGAGGTTGGTAAATTGCCATTTCAATC >1.7|27909|32|CP026317|CRISPRCasFinder GTGGTTGTAACGAATCTGAACCTTTTGATTCT >1.8|27970|32|CP026317|CRISPRCasFinder CATGAGTCTACGTGACCGATTTGCATCCACTG >1.9|28031|32|CP026317|CRISPRCasFinder CTCTGTCCGTTGAGCATCCACTGCAGTCTTCC |
cas5,cas7,cas6e,cse2gr11,cas8e |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP026317_1
The CRISPR arrays of CP026317_1 >merge|CP026317|1|27529-28091|CRISPRCasFinder GTAAACATCCACGCTAGTGTGGAAAAGACTCATTCAGCAACCAACTTCATTACGTCTGAAGAAACATCCACGCTTGCGTGGAAAATACAGAATACACATCTCTTTTATCATACCACTATTGGAAACATCCACGATTTCCGTGGAAAATAATTTGCTGCGTAACATTGAACTGTCTTGTAGGAAGAAACATCCACGCTTGCGTGGAAAAGACTAATTTTTAATCTGGAATGTCTTTAACCTTGAGAAACATCCACGGTTACGTGGAAAAGACTCTCGGCAATAACAATGTTAGAAACATCCACGATTACGTGGAAAATACAATGCTGAGGTTGGTAAATTGCCATTTCAATCAGAAACATCCACGACTACGTGGAAAATACGTGGTTGTAACGAATCTGAACCTTTTGATTCTGGAAACATCCACGCGAGCGTGGGAAATACCATGAGTCTACGTGACCGATTTGCATCCACTGAGAAACATCCACGACTACGTGGGAAATACCTCTGTCCGTTGAGCATCCACTGCAGTCTTCCAGAAACATCCACGATTACGTGGGAAATAC >CP026317|1|1|27529-28091|CRISPRCasFinder GTAAACATCCACGCTAGTGTGGAAAAGAC TCATTCAGCAACCAACTTCATTACGTCTGA AGAAACATCCACGCTTGCGTGGAAAATAC AGAATACACATCTCTTTTATCATACCACTATT GGAAACATCCACGATTTCCGTGGAAAATA ATTTGCTGCGTAACATTGAACTGTCTTGTAGGA AGAAACATCCACGCTTGCGTGGAAAAGAC TAATTTTTAATCTGGAATGTCTTTAACCTTG AGAAACATCCACGGTTACGTGGAAAAGAC TCTCGGCAATAACAATGTT AGAAACATCCACGATTACGTGGAAAATAC AATGCTGAGGTTGGTAAATTGCCATTTCAATC AGAAACATCCACGACTACGTGGAAAATAC GTGGTTGTAACGAATCTGAACCTTTTGATTCT GGAAACATCCACGCGAGCGTGGGAAATAC CATGAGTCTACGTGACCGATTTGCATCCACTG AGAAACATCCACGACTACGTGGGAAATAC CTCTGTCCGTTGAGCATCCACTGCAGTCTTCC AGAAACATCCACGATTACGTGGGAAATAC
>CP026317.1|AUW07370.1|27051_27498_+|hypothetical-protein MENFMFLSFCGVWFYLAQNMYKESIISFGVLVFCMILLVKSRRKKFKKPEGKIYVIYPKSNKWICKVGLTKRDAHRRVAELNDQCYFGKSDWNVYKTYEVSDIKQAEDDCHSILLRHQLIGKKNEKEVFSLHPFIAVMKIRNTLKIYR >CP026317.1|AUW07369.1|26443_26962_+|hypothetical-protein MIVLVTPIMVAFLGVSFISMIDGHELLFYVSLASFFVCLMVTTLNLKFIPKLIVMSLLIFSLILLIIFSIKSGVMKPSTIYWLVPIPLFDFSCTLLKRFLDNTDKDNIIVSLKKFGFSDHVSGVILGVMSLVYMSVGVIGDSVDADPTLMGLALCIAFMVHWCVVDDLRLKD >CP026317.1|AUW07368.1|23860_25237_-|hypothetical-protein MIEPLLTFLFGILLILAIIAANGYFVAQEFAYMAVDRTRLVTFAASGDAAAKRALSVTNRTSFMLSGAQLGITVTGLVLGFVAEPLVGRSIGVLLQNFGIELEIGIAIGTVATLVIAMVVQMILGELYPKNLAIANAEPMSRMLSRSTLIYMSVFGWFISFFDKSANLLLRAVRIEPVHDLDVSASEGDLHHIIANSRNSGDLPVELSFMMDRILDFPERDVEHAMVPRSQVDWVVPETTLTELLSLMAQAHTRYPVINDDDAPVGVVHLADVLKKIETGHADATVSSVMRPATVLPTLMRLPDALDQLVTSTNQLACVIDEYGGFAGVLTIEDLAMEIVGEITDEHDMDNSNAVVAESDKVWLMTGDVHLDEVKRAIGYDLPRRDVETIAGMLIAEKGALPTNGEMITVALPIDPSELASGEPLLRHLEVSVLRIERHVPTEVRVKLVEKSILEKKK >CP026317.1|AUW07367.1|22847_23864_-|hypothetical-protein MNDPLIVFIITFALIVLSGIFVIIEFALLGARRHRLEEIAVESRSARAALRGMNDLTLMLAGAQLGITFCTFALGAVTKPAVDQWVGPVFISMGMSEWLADGASFGFALFVVTFLHLVVGEMAPKSWSIAHPEKSALAIGIVARAYVWPLRPLLNWINSIANRLVKASGVEPVESAAVGGQDIDTIRHLVEHSGKVGTLQPKIQKQLSGLIDLSSIQIDSLVTEGQVMAHVDKNATVADVRAAAMESGHLRILVFGKSGLKPLVVHVRDTLLEPSERPAREVARNAYVLDSKTPVYEALVRMREASVQLAVVSKDEKMVGIVTLADILKRVLPPTSLN >CP026317.1|AUW07366.1|20948_22478_+|IS66-family-transposase MKKTPNINPESQDIAELQAMVKALMASENRLKQERQSLLEQLKLAFERQFAKRSEALKPYDESQGDLFNEVECEATKEEEVEVTTTTTTKKRGKRKPLPKTLPREVIELDLDDHEKQCACCKHSLHKIGEDRSEKLEFSPAVLKVLEYVRPKYACRQCEQTEDKNRIVQKPAPQSIIPKSFATESLLANIILGKYQYAMPLYRQESLFTQSGIELSRTTMARWVIQVSEKFKPLYAALKEHLLQQVVVQADETPLNVLKEDKQCYMWLYCSGADSPDAALPDVKNIALYDYQNSRARACPVAFLGDYSGYLQTDGYGAYDGLHQVTNVGCLAHARRKFMEAKKLQGKGKSGKADKALAKIQKLYGIESRLKGATVETRKAERQLHAKPILDELHEWMTTQKVISSSPLGKAIKYTLGQWPKLIRYIDDGHLSIDNNRAERAIKPLVIGRKNWLFSNTPNGADASAMLYSIVETAKANGLILYDYMVKCMKELAKAEPDVDALLPWNFKH >CP026317.1|AUW07365.1|20535_20889_+|IS66-family-insertion-sequence-hypothetical-protein MKRMLSAPEIYLYRESVDFRKSINGLAAIIESDTDLLLGSGALFLFTNKQRDKIKVLYWDKTGFALWYKRLEKAKYKWPTKEKNEVFTLTQFELDRLLSGFTIIGHKPVRINDFTMT >CP026317.1|AUW07364.1|19024_20269_+|IS91-family-transposase MVQYSSRRRRHTPNEFVPRATKLLFEKDNAWEKVLWKHAQTFSLWQITCVERMLACGSNMMGAKHYDCGTPNCPHTKVICQSCKTKACSSCGTKSTEQWISTQLDVMPDCEHQHITFTMPSELWPIFEANPKLLNDLFSLAADTLLKWAKKYGLEVGIFGALHTYGRGLNWHPHIHLSVTRGGLDKHNIWRPIYFKKKHVEYHWRRCLIGLLRRKYSELNLSTLSTNHIQDSRQWHFFLERQYQRYWNIHFAQKTQELKQTVNYLGRYLKRPPISASRLRHYSGGTVVFKYLDHRDGKYKTKTLTQEEMILRYVSHLPQHHFKMVRYYGFLSNRKRGRLLPLVYLALGEKSPKQAEPLTYAKQYKGFTGNDPYQCVLCGSRMVFTGFRAGSKNRELLDNRRMSMRESRRLGVPA >CP026317.1|AUW07363.1|18700_19006_+|hypothetical-protein MKKVKLGFYDVKFGSVALCHGVSLVVTHDKSTLRELAPVNKGHVYQTVYLHHVLDGLALGAEYDFDTPAFNVLKEHIELNEFSHHALDEAEPTFHRVKLAN >CP026317.1|AUW07362.1|18050_18575_-|hypothetical-protein MVMYKHSSAMKFVASLQEEDKKNNQYQYIVASFLIERLIFSRFGRPLHLTMYSVSDHCIHRIMHRLDCIDCNECLDIVTLDVARIMLYMDSVSEPSDFKSLKIRTSTGVYVMCKFDNSLTVGHDKTISESIDYAMVTFDPDLLKEVVVDVDLSFVSESIIKMLHKTHPATLKIT >CP026317.1|AUW07361.1|17469_18000_-|hypothetical-protein MKVICLIGSKGGVGKSTLVNYIAWVLRTVYKKKVSVCNLDFQNHVQVVNHDDADFLIFDTVGAYAERTTNLLNKLKNDPNATVICPMGTGINDRKEYRFTVDQMMKYGLLDKTTFVMNKARQGSKSLADSRSLLKEMDVKVSVASVSILEDYAQERYTSRTKNEISRVLNEILGRL >CP026317.1|AUW07371.1|28434_28821_-|hypothetical-protein MKSNFAFRNTPPEPTVDVPLGSGKIEIETQKIYQIKVEPTMVSHLGNKAITDEIRWHATNEEMTTNFLMTTGAGTLETYRIAPDSDNLTSVRFYPRIYTSSVNSVSDVLNAYGSVRSEIDLTVTCIPE >CP026317.1|AUW07372.1|28964_29270_+|hypothetical-protein MKKVKLGFYDVKFGSVALCHGVSLVVTHDKSTLRELAPVNKGHVYQTVYLHHVLDGLALGAEYDFDTPAFNVLKEHIELNEFSHHALDEAEPTFHRVKLAN >CP026317.1|AUW07373.1|29288_30533_+|IS91-family-transposase MVQYSSRRRRHTPNEFVPRATKLLFEKDNAWEKVLWKHAQTFSLWQITCVERMLACGSNMMGAKHYDCGTPNCPHTKVICQSCKTKACSSCGTKSTEQWISTQLDVMPDCEHQHITFTMPSELWPIFEANPKLLNDLFSLAADTLLKWAKKYGLEVGIFGALHTYGRGLNWHPHIHLSVTRGGLDKHNIWRPIYFKKKHVEYHWRRCLIGLLRRKYSELNLSTLSTNHIQDSRQWHFFLERQYQRYWNIHFAQKTQELKQTVNYLGRYLKRPPISASRLRHYSGGTVVFKYLDHRDGKYKTKTLTQEEMILRYVSHLPQHHFKMVRYYGFLSNRKRGRLLPLVYLALGEKSPKQAEPLTYAKQYKGFTGNDPYQCVLCGSRMVFTGFRAGSKNRELLDNRRMSMRESRRLGVPA >CP026317.1|AUW07374.1|30944_31331_-|hypothetical-protein MKRLVLISLLLSANAFAGINQSVRSNDLDCFVDVDDPFEMYVEGVNSQYNSDNDDHNNYWNNNYRDDKQVRIGIKYKFGSGIKPIDCDSLFQVELRKKEIELERLRSALENMKALDSLQSLGNELPAL >CP026317.1|AUW07375.1|31327_31585_-|hypothetical-protein MCYQFEQDGKELTPLQVCLDGKEQRELDFDVIVEPDVKKEFTFCSLSGFIGDSSRVRSRMCTEVSMLYAKTLIEKRQKQLEELRK >CP026317.1|AUW07376.1|32350_33052_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MSNPYVLMWLESPIQSWGYDSRFGRRDTLLFPTKSGVLGIICNALGREGEQSDFLSEFIELDIQVYAFPRSVDGMIKNLPMLKDFHMVGSGYDDKDPWELLHIPKTSEGKKVVGGGSKMTYRYYLQDMAFAVLLEIPSKRVSEIIESLQFPVYDLCLGRKCCVPTEFVYQGVFDVADEGVSVATKLATSKSRKLHFVVTEGGGEGEQLTISDVPIRFGSYKQYQDRIVTIRYE >CP026317.1|AUW07377.1|33048_34080_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MKTTRIEFHILQSFPVTCLNRDDIGSPKSAIVGGVPRARVSSQCWKRQVRMSMRDFGIKIGTRTKKIEKLMNGACLSLDAEIKEAQLCADVIAKELSSETLVFISDTECKAFAEYAKSLNFDHTKIKSKELGKISKKVINPAIDALDIALFGRMVAKSSEMDVQAACSFNHAISTHKAVNEIEFFTALDDIRMDGEQGSGHMGSIEFNSATYYRYISLDIGRLAASMNPNDVKTAIEAFTKALFVAVPNARQTTQSGASPWEYAKVLVRKGQGLQVPFEVPVQCENGSYLKPSIDAMNKYLDDKEALFGSIFGKLGCYEWGVDTSYNIDSLINDLKTHVTYNL >CP026317.1|AUW07378.1|34091_34721_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MQLYASVLKIDRKSFKELRIKDTYSLHRVVYNLFECVDNETSRCIQWVDMGGDFHSRDVLIFSDKIPRSSIDGAGTVVTKEIPLQFLGYDFYRFEIVVNPSYRPMKRGSELNGNRTKIVPIKGRENIEKWFIEKSVKCGFECSAIQVESVVVDKFNAKSSVTIQKVKIVGQLKVTDRDQFIKTVASGIGRAKGFGCGLLQVTPIIESLF >CP026317.1|AUW07379.1|34720_35350_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MCRRYTTSYVQTIHRDKCKLGQNVDLTHGNTLRDRMTKYERCYSFVDYVKLNCRTNKRFASSLNHADYQSGTESNIWDLLCRFDVDIENDNERIPFILIGAAIARGDNHNIHTLPLGRAIYKSFPNGDEQGSARLRRLISCDTTEEVCNVLRPLLGLLQSKIKISINYAELLCQLIEYSNNPESVRMIWTNDFYRFRPEEESSSQKGEA >CP026317.1|AUW07380.1|35231_36767_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MNHFNLIEESWIPVAGVGLVSLRDVFNDHTLKSLGGTPIEKIALTKLLVAIAQSAYTPEDFCEWSSLGSSGLSSKCLSYLEYNKNRFYLYGDNPFLQFHEVKDIARYSTKGKKEKLLPYGALIPEVATGNTTRLTGYNIERSLTDGQKALILITQLSMCFSGKKADNSIVLTEGYEGKSNDKGKPSTPRSGTGIAHMGLLHSFAHGSSLQETIWLNVFTNQDIQETNMFQLGVGVAPWEQMPKGEDCAVARRLKSTLMGRLVPMCRFMYLEKNGVYITEGIHHLTHKDHMFDPSITVKPTCKTRSELKVVWTDPDRKPWRQLPSMLGFLSGSPDMCYQLKFAFDKAKRANRLISVWSGGAQVSANAGEQYLSGGNDTVETIMSIPYESHNHMGFIKYTNEIKELDAISKRLYGCVLGYASEFNKDGKDIALNATMMFWEACGHNAQLLIDSCFDETSESYEKIYQLRKVFFDNVQTIYDILCANHSSRQMQAWSKCRPNAWKYLERSYDEI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026317_2 | 107107-107217 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP026317_2
|
1 spacers
spacers of CP026317_2
>2.1|107149|27|CP026317|CRISPRCasFinder CTAGGTTCGTTACTATCCTTTGACTGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP026317_2
The CRISPR arrays of CP026317_2 >merge|CP026317|2|107107-107217|CRISPRCasFinder AAAACAAGATTTTACACGAGACATGGAAAAACTGGGGTTTGGCTAGGTTCGTTACTATCCTTTGACTGAAAAACAGGATTTTACACGAGACATGGAAAAACTGGGGTTTGG >CP026317|2|2|107107-107217|CRISPRCasFinder AAAACAAGATTTTACACGAGACATGGAAAAACTGGGGTTTGG CTAGGTTCGTTACTATCCTTTGACTGA AAAACAGGATTTTACACGAGACATGGAAAAACTGGGGTTTGG
>CP026317.1|AUW07449.1|106668_106974_-|hypothetical-protein MKKVKLGFYDVKFGSVALCHGVSLVVTHDKSTLRELAPVNKGHVYQTVYLHHVLDGLALGAEYDFDTPAFNVLKEHIELNEFSHHALDEAEPTFHRVKLAN >CP026317.1|AUW07448.1|105405_106650_-|IS91-family-transposase MVQYSSRRRRHTPNEFVPRATKLLFEKDNAWEKVLWKHAQTFSLWQITCVERMLACGSNMMGAKHYDCGTPNCPHTKVICQSCKTKACSSCGTKSTEQWISTQLDVMPDCEHQHITFTMPSELWPIFEANPKLLNDLFSLAADTLLKWAKKYGLEVGIFGALHTYGRGLNWHPHIHLSVTRGGLDKHNIWRPIYFKKKHVEYHWRRCLIGLLRRKYSELNLSTLSTNHIQDSRQWHFFLERQYQRYWNIHFAQKTQELKQTVNYLGRYLKRPPISASRLRHYSGGTVVFKYLDHRDGKYKTKTLTQEEMILRYVSHLPQHHFKMVRYYGFLSNRKRGRLLPLVYLALGEKSPKQAEPLTYAKQYKGFTGNDPYQCVLCGSRMVFTGFRAGSKNRELLDNRRMSMRESRRLGVPA >CP026317.1|AUW07447.1|103679_105212_-|IS66-family-transposase MKKTPVINPESQDVAELQAMVKTLLASESQWKQERQSLLEQLKLAFDRQFAKRSEALKPYDESQGDLFNEVECEAAKEEEVEVVTTTTTTKKRGKRKPLPKTLPREVIELDLDDHEKQCACCQHSLHKIGEDRSEKLEFSPAVLKVLEYVRPKYACRQCEQTEDKSHIVQKPAPQSIIPKSFATESLLANIILGKYQYAMPLYRQESLFTQSGIELSRSTMARWVIQVSEKFKPLYAALKEHLLQQVVVQADETPLNVLKEDKQCYMWLYCSGADSPDAALPNVKNIALYDYQNSRARACPVAFLGDYSGYLQTDGYGAYDGLHHVTNVGCLAHARRKFMDAKKLQGKGKSGKADKALAKIQKLYGIESRLKGATVETRKAERQQHAKPILDELHDWMTSQQVISSSPLGKALKYTLGQWPKLIRYIDDGHLSIDNNRAERAIKPLVIGRKNWLFSNTPNGADASAMLYSIVETAKANGLILYDYMVKCMKELAKAEPDIDALLPWNFKH >CP026317.1|AUW07446.1|103201_103627_+|hypothetical-protein MSVKCIKNYGFEHQGLSQVIPFFIVDDVIVNYAFVCDDKSFKTPVGKIKKACLMSILNAEYVSVFVPNGSFDDMKKTIRDEFTKTHKGGVAKLAILFEIQSTGAASDSTFYEGLGIVPNEAEYITFEQSGLKSSGHPFRCF >CP026317.1|AUW07445.1|101897_102866_-|hypothetical-protein MNHLNVEVIDKASIDDGSSAIKAAFDKGDGVKTHSFESRVIRNALPDNKTVTGFSASSYEINGEKYAVVEDSDGIVPTTTVTYQTSEVNRVLVHHMLKQIGMTGKVSVLVTLPVDQFLNSDGSRNQQLIEAKIANIKGEITYLDGTKPAEIVSVIVVPEGVPAYQYACSELSLGGESNIGRYFVIDIGGTTTDILDIKNGQIVSSGSLPIGALEMIESFKGVIKNRLGFRSVPDSDALEGILTGRTLHNDFSSEAKIEIEKFNKRLSDHVLTDGQYVKYTNVIYSGGGANLVEPEMHNAVKTSNPRFDNALGGLQILQSIGD >CP026317.1|AUW07444.1|101483_101894_-|hypothetical-protein MANAKSVQIRLREDFPLEKKIIEYLAKIGGRSGLEKQIFVRAMTEHMAENPLDDDIGYAPKNKTKDEKVFKVKPEESKEVVSVEERREPLQEQSSSEGYSSYFGDTQVNPEKVDTQPTPKITPKLTDVASFMYAKG >CP026317.1|AUW07443.1|101200_101497_-|hypothetical-protein MLKVKSKRPHRKDLITMRSFLYPLIPRFIMIQNYIDLFIHFLDNFELYLAFATYKSVIGGLESGRMFFTLLYAAFCFQTGKIIGILIRQPQRNNNNHQ >CP026317.1|AUW07442.1|100820_101030_-|hypothetical-protein MYSADKIEFNKVIYDYTVLVESGATPYVHSKLTKQHLTGLLSNNLALESIYIALMFSKIAILRIEQGRY >CP026317.1|AUW07441.1|100440_100746_-|hypothetical-protein MKKVKLGFYDVKFGSVALCHGVSLVVTHDKSTLRELAPVNKGHVYQTVYLHHVLDGLALGAEYDFDTPAFNVLKEHIELNEFSHHALDEAEPTFHRVKLAN >CP026317.1|AUW07440.1|99177_100422_-|IS91-family-transposase MVQYSSRRRRHTPNEFVPRATKLLFEKDNAWEKVLWKHAQTFSLWQITCVERMLACGSNMMGAKHYDCGTPNCPHTKVICQSCKTKACSSCGTKSTEQWISTQLDVMPDCEHQHITFTMPSELWPIFEANPKLLNDLFSLAADTLLKWAKKYGLEVGIFGALHTYGRGLNWHPHIHLSVTRGGLDKHNIWRPIYFKKKHVEYHWRRCLIGLLRRKYSELNLSTLSTNHIQDSRQWHFFLERQYQRYWNIHFAQKTQELKQTVNYLGRYLKRPPISASRLRHYSGGTVVFKYLDHRDGKYKTKTLTQEEMILRYVSHLPQHHFKMVRYYGFLSNRKRGRLLPLVYLALGEKSPKQAEPLTYAKQYKGFTGNDPYQCVLCGSRMVFTGFRAGSKNRELLDNRRMSMRESRRLGVPA >CP026317.1|AUW07512.1|107510_108491_+|IS5/IS1182-family-transposase MPNKYNQRKRRHFSKPKFRTRNWRQYNQSLKDRGSIDIWLSKEILDEWQFDKRHYDGTGSTVKYPDKTIEACHHLRMVFKQPLRQAQGFIGSLLKMLGRKNLQCPDYSVLSRRLGDLGLVTPRFKQLDIIDKDIVAIAIDSTGLKLYGKDEWHQEKHNIDAKRSWKKAHFVVRNNHIIESAVMTGKDVMDDQVVGDLCQQIIADVKHITADKMYDTNAVYSTLEECFPNADIVIPPKDNSFADEHHNKKRMQNLVSCTALGVMGWQKKRDYGRRNVSETAMQRYKKIIGNRLYSRKSSNQAQEMLIGCSILNRFTQLGMPNSYRVA >CP026317.1|AUW07450.1|108510_108879_-|hypothetical-protein MMIPDEIIKKAESGDVESQYNLAWLYDEENNIDEAKKWFEAASNNGHKESQYNLGLLFEELDQLPEAKKWFLEAANQNCSDAQFKLGCLAELEADIESAKNWYKLSAGQGDFDAERLCCNTK >CP026317.1|AUW07451.1|109077_109407_-|hypothetical-protein MITKESCLINHIKTNHPTLLSLTSFPLRIINNQNHADYFDAVVWFDDENYLTISMSTLRDEWMNSTFTVVVHGEFCRSAMEGGKHVTCLGLSSLDRRLNRFTDIATKLN >CP026317.1|AUW07452.1|109473_110082_-|hypothetical-protein MIKITEYFEDFDSAMFHLKSQLNGVVNRGVDTNGNECFVWTGEVDIYYLASKIRSLLSSRDPITEQDKMRFANIGISTLSKPKVSKSGITYLQCNDIISKNIDEAQYKVKRYNQLGLHGDGWRIPTFREIQELDLVFGTWWCTDEHEEVNVYTLDREYGVAFDVETKAVVAIKFQDSKHINGTSNFEGGGYNYSPRVILVRN >CP026317.1|AUW07453.1|110125_110389_-|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin MSSRLLSWTNEAWDDYLYWQSQDKKTLKRVNKLISDAKRSPFEGIGKPEPLRENLSGFWSRRIDDVNRLVYAVNDESLTIISCRYHY >CP026317.1|AUW07454.1|110381_110636_-|type-II-toxin-antitoxin-system-prevent-host-death-family-antitoxin MRIVSFTEARNNLKTILDTVVDDADTTVITRRDSEDAVVMSLDYYNSLMETVHLLRSPNNAEHLNRSIEQYRSGHTTARDLIDE >CP026317.1|AUW07455.1|110949_111165_+|hypothetical-protein MKKDILLTNLILLSTVAVSSTLESSEQRCYKFSDEEKLLFLESSTPPLSNDSNALFPDLQLVYIDPVIFKF >CP026317.1|AUW07456.1|111517_111970_+|hypothetical-protein MIRHHNTSNYSNDEYLFHHYVVLKYYKTLYQYAYCLCGSFETAEGLVIRTYAKAVHSISEKESSNYKVLLITILIKENDEFLLKNKNTPIRVNNNETYNKIMTLDNKYRAPLLLQVIAECNHDEISKILDIEHSEVKELIIYARSKLGGF >CP026317.1|AUW07513.1|112351_113332_+|IS5/IS1182-family-transposase MPNKYNQRKRRHFSKPKFRTRNWRQYNQSLKDRGSIDIWLSKEILDEWQFDKRHYDGTGSTVKYPDKTIEACHHLRMVFKQPLRQAQGFIGSLLKMLGRKNLQCPDYSVLSRRLGDLGLVTPRFKQLDIIDKDIVAIAIDSTGLKLYGKDEWHQEKHNIDAKRSWKKAHFVVRNNHIIESAVMTGKDVMDDQVVGDLCQQIIADVKHITADKMYDTNAVYSTLEECFPNADIVIPPKDNSFADEHHNKKRMQNLVSCTALGVMGWQKKRDYGRRNVSETAMQRYKKIIGNRLYSRKSSNQAQEMLIGCSILNRFTQLGMPNSYRVA >CP026317.1|AUW07457.1|114731_119501_-|hypothetical-protein MKRLLLPLCLSIAGCNDYEEYITENNHAPTIEALSTIKAVAGKTTKVSVTASDKDGDTLTYSLVSNPSWVSIQDNIISIAPSSANAGNHVFKVKVSDGVLTAEVDAALVVNLPMTPVDPDLVNHAPTIEALSTIKAVAGKTTKVSVTASDKDGDTLTYSLVSNPSWVSIQDNIISIAPSSANAGNHVFKVKVSDGVLTAEVDAALVVNLPMTPVDPDLVNHAPTIEALSTIKAVAGKTTKVSVTASDKDGDTLTYSLVSNPSWVSIQDNIISIAPSSANAGNHVFKVKVSDGVLTAEVDAALVVNLPMTPVDPDLVNHAPTIEALSTIKAVAGKTTKVSVTASDKDGDTLTYSLVNNPSWVSIQDNIISIAPSSANAGNHVFKVKVSDGVLTAEVDAALVVNLPMTPVDPDLVNHAPTIEALSTIKAVAGKTTKVSVTASDKDGDTLTYSLVSNPSWVSIQDNIISIAPSSANAGNHVFKVKVSDGVLTAEVDAALVVNLPMTPVDPDLVNHAPTIEALSTIKAVAGKTTKVSVTASDKDGDTLTYSLVNNPSWVSIQDNIISIAPSSANAGNHVFKVKVSDGVLTAEVDAALVVNLPMTPVDPDLVNHAPTIEALSTIKAVAGKTTKVSVTASDKDGDTLTYSLVNNPSWVSIQDNIISIAPSSANAGNHVFKVKVSDGVLTAEVDAALVVNLPMTPVDPDLVNHAPTIEALSTIKAVAGKTTKVSVTASDKDGDTLTYSLVNNPSWVSIQDNIISMTPSPLDEGVAEFLVIVSDGMLSTRRKVIVDVFVETIVLSATKNSENKRNVELAWEAKPRKHEYQIYRNETLIDKVSSESYDDVMPLSTTSYSYKIKACDADNHCEIESNVKQLRAEPDKIFVKVQGLDTTVESNKAVLQFYYRSTSKLWVSANFSFNKNETRHIIDLGFDTRYMKRMSLQPINGQICSTDKLNVAQFSNGNDVHAVYSCQTAATLVAEMTTVTIQKGSINQVGSPLILSRQSDGANMTSNDYIYESSNPSVVNVNKQGLLSGVSVGESTITVTANPDNYGEQASTSYKVIVDESTHYIMNKMDFGQQLLLPQNNEHQVITAGVEFLVRGFPVALDISNTKKPNLTFIAEVDGIIREYQVFCPEQLPLSISDDTNYTLSDSCYAYIQPDAVSKGGSYYFKDLDSDAKFFISPSINKPSHLKLVIVPLVVNEVAPIIPDLELIKARILETMPIKSVDISIRAPYVYSEPMATHDLGAFLSTVNNIRQREDNSGTHYMGILTGVCGVNGLAYIGSWHSAVIKDERCGGVNAINVSLIHELGHNLSLKHAPCGGASGADSFWTKDPQPWVGARNGAMSDAPIFSLKAQEILIPGSLTTKADIMGYCGGWHFSEYNHRKMALYIENNDVYNIKPDIGMVRSNSKNLVTIVSGKIVNGVVYFDPTSVSTSTRPQEIYQGEYELIVSSDYRYKFDVVKDSNEDILHFNVEIPYTETISSLAIEKNSISYGTKVNVYQRHQMLVNAEVNVSAGHLFVKWDNTDYPWLTAMISNESGSNMLLEEKNTRGYLDAEIPKYFDDNVVTLIFSNGLDTNIQQYCRKDLKYEECN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026317_1 | 1.1|27558|30|CP026317|CRISPRCasFinder | 27558-27587 | 30 | NZ_CP026317 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence | 27558-27587 | 0 | 1.0 |
CP026317_1 | 1.2|27617|32|CP026317|CRISPRCasFinder | 27617-27648 | 32 | NZ_CP026317 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence | 27617-27648 | 0 | 1.0 |
CP026317_1 | 1.3|27678|33|CP026317|CRISPRCasFinder | 27678-27710 | 33 | NZ_CP026317 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence | 27678-27710 | 0 | 1.0 |
CP026317_1 | 1.4|27740|31|CP026317|CRISPRCasFinder | 27740-27770 | 31 | NZ_CP026317 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence | 27740-27770 | 0 | 1.0 |
CP026317_1 | 1.5|27800|19|CP026317|CRISPRCasFinder | 27800-27818 | 19 | NZ_CP026317 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence | 27800-27818 | 0 | 1.0 |
CP026317_1 | 1.6|27848|32|CP026317|CRISPRCasFinder | 27848-27879 | 32 | NZ_CP026317 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence | 27848-27879 | 0 | 1.0 |
CP026317_1 | 1.7|27909|32|CP026317|CRISPRCasFinder | 27909-27940 | 32 | NZ_CP026317 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence | 27909-27940 | 0 | 1.0 |
CP026317_1 | 1.8|27970|32|CP026317|CRISPRCasFinder | 27970-28001 | 32 | NZ_CP026317 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence | 27970-28001 | 0 | 1.0 |
CP026317_1 | 1.9|28031|32|CP026317|CRISPRCasFinder | 28031-28062 | 32 | NZ_CP026317 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence | 28031-28062 | 0 | 1.0 |
CP026317_2 | 2.1|107149|27|CP026317|CRISPRCasFinder | 107149-107175 | 27 | NZ_CP026317 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence | 107149-107175 | 0 | 1.0 |
CP026317_1 | 1.4|27740|31|CP026317|CRISPRCasFinder | 27740-27770 | 31 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 289611-289641 | 6 | 0.806 |
CP026317_1 | 1.7|27909|32|CP026317|CRISPRCasFinder | 27909-27940 | 32 | NZ_CP016481 | Synechococcus sp. PCC 7117 plasmid unnamed4, complete sequence | 37105-37136 | 8 | 0.75 |
CP026317_1 | 1.2|27617|32|CP026317|CRISPRCasFinder | 27617-27648 | 32 | NZ_CP040241 | Campylobacter coli strain S9 plasmid pCcS9_2, complete sequence | 1220-1251 | 9 | 0.719 |
CP026317_1 | 1.8|27970|32|CP026317|CRISPRCasFinder | 27970-28001 | 32 | NZ_CP017589 | Pantoea stewartii subsp. stewartii DC283 plasmid pDSJ08, complete sequence | 3257-3288 | 9 | 0.719 |
1. spacer 1.1|27558|30|CP026317|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026317 (Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcattcagcaaccaacttcattacgtctga CRISPR spacer tcattcagcaaccaacttcattacgtctga Protospacer ******************************
2. spacer 1.2|27617|32|CP026317|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026317 (Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agaatacacatctcttttatcataccactatt CRISPR spacer agaatacacatctcttttatcataccactatt Protospacer ********************************
3. spacer 1.3|27678|33|CP026317|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026317 (Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atttgctgcgtaacattgaactgtcttgtagga CRISPR spacer atttgctgcgtaacattgaactgtcttgtagga Protospacer *********************************
4. spacer 1.4|27740|31|CP026317|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026317 (Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taatttttaatctggaatgtctttaaccttg CRISPR spacer taatttttaatctggaatgtctttaaccttg Protospacer *******************************
5. spacer 1.5|27800|19|CP026317|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026317 (Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tctcggcaataacaatgtt CRISPR spacer tctcggcaataacaatgtt Protospacer *******************
6. spacer 1.6|27848|32|CP026317|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026317 (Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatgctgaggttggtaaattgccatttcaatc CRISPR spacer aatgctgaggttggtaaattgccatttcaatc Protospacer ********************************
7. spacer 1.7|27909|32|CP026317|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026317 (Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtggttgtaacgaatctgaaccttttgattct CRISPR spacer gtggttgtaacgaatctgaaccttttgattct Protospacer ********************************
8. spacer 1.8|27970|32|CP026317|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026317 (Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
catgagtctacgtgaccgatttgcatccactg CRISPR spacer catgagtctacgtgaccgatttgcatccactg Protospacer ********************************
9. spacer 1.9|28031|32|CP026317|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026317 (Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctctgtccgttgagcatccactgcagtcttcc CRISPR spacer ctctgtccgttgagcatccactgcagtcttcc Protospacer ********************************
10. spacer 2.1|107149|27|CP026317|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026317 (Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaggttcgttactatcctttgactga CRISPR spacer ctaggttcgttactatcctttgactga Protospacer ***************************
11. spacer 1.4|27740|31|CP026317|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
taatttttaatctggaatgtctt-taaccttg CRISPR spacer taattttgaatcgggaatgtcttattatttt- Protospacer ******* **** ********** * *..**
12. spacer 1.7|27909|32|CP026317|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016481 (Synechococcus sp. PCC 7117 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
gtggttgtaacgaatctgaaccttttgattct CRISPR spacer atattattaacgaatctgaagctttagattcg Protospacer .*. * ************* **** *****
13. spacer 1.2|27617|32|CP026317|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040241 (Campylobacter coli strain S9 plasmid pCcS9_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agaatacacatctcttttatcataccactatt CRISPR spacer gaattcagtatcttttttatcataccacaatt Protospacer ..* * ..****.************** ***
14. spacer 1.8|27970|32|CP026317|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017589 (Pantoea stewartii subsp. stewartii DC283 plasmid pDSJ08, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
catgagtctacgtgaccgatttgcatccactg CRISPR spacer ttaaagtctacgtgacggatttgtatccagaa Protospacer . .************ ******.***** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
15073 : 63279
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP026317|15073:63279|DBSCAN-SWA AATGAGTTCAACACAATACCTAATCTCTGATGCCCTTTGGGCGAAAATTGAGCCTTTGTTGCCTATCCACAAGACTAATCACCCTCTCGGGACACATCGAAAGAGGGTCGATAATCGCGATGCAATGAATGGAATTCTTTTTGTTCTCAGAACGGGTTGTCAGTGGAACGCCCTTAACGCAACGGGTATTTGTACCTCTAGCTCTGCACATCGTCGCTTTCAAGAGTGGCGGGATGCTGGTGTCTTTGAGCGATTTTGGCAAAATGGCCTGATTTACGAAGGTGTTGATTGGCGTTCTATATCAATGGATGGCTGCCAAACGAAAGCGCCTTTAGCAGGCTCAAAAAAACAGGTAAAAACCCAACAGACAGAGCGAAGCAAGGCGTAAAACGCAGTTTGCTTACCGACGCAAATGGATTGCCACTTGCCGTTGTCAGTGATGGTGCGAACGTCCACGATATCAAGCTGGTACTTCAAACATTAAATGCACTGGAGTGTTATCGTCCACCTCTGAAAGTGCCCTTGTATCTAGACAAAGGTTATACAGGTCAGTGGTTACATGATGAACTGGTTGCTTTGAACTACATTCCCCATGTTCAATCACGTGCTGAAGAGGCTGCGAGCTTGAAACAATCGGATGATTTTAAGGCTCATCGTTGGGTTGTGGAGCGAACTCATAGCTGGCTAAACCGTTATCGTAGATTGCTTGTTCGTTGGGAGAAGAAAATCGAAAACTACGAGGCCATGTTGCATTTTGCTTGTGGCCTCATTGTTTGGAATAAATCCCTTTTGGGATAGGCTCTAAGTGACTTTGAAAGTCTGATGTACTTTGTATCTCTAGATACAAGCTTTTCTACGTGCTGTAGAGACTTTAAAATTATTGCATTACATTTAGTATTAGATTTATACAAAAGCAGCCCTTCTGTGAAACTTTTAGGGTCGTAAAACTCCCGAAATTCATCGGTTTCTCGTGCTCGTAAACGAGTTACACTTGCTTCTTTTGGTACGCTAAAAACAGACACCGGTATCGATTTCCCATCAGAACAGAGGACATACCCTTCATCTGATACCAACATGCTGATGTCATTTTCGCTGTTCGAAAGCATGTCGAACGCATTGATAAACTCACTAACATCATCGATATACAGCGAACCGCTCTGAATTTTTATAATGTTTGAAAAGTCGATGGTATCATTTTTCCAGACTTCGTGAAATAGTTTTTCATCTTTACTAGATGTATAGATTAACTTTTCATCTCCACAAACAATCACTGAATTCCCTAGTTCACCCAGTGTTTTAATTATTTCAATTAACTCTCTATTGATTATCATCATTAAGCCTTTTACAGATATTAATTAAGTTCCCTTCACTAAACTTGCACTTTGATTCAAGCGTCCGTAAGTAACTGGATTTTCGATAGTAAATACTTGCAAAAAGGTATTTACATGATAACAACTTCATTAAACACATCACGGAAGCAAATCCCTGCTTCAATCAAACGTCCTATTTGTGACGTGAAAAATAAAAAGATATTAAACTTTGGTTCAGGGAAATATCCTTAATTATCGAAACACCACTTAGAATCATTAGGAGCCAAAGAAGTCATTTGTTATGACCCTTATGCGATTAATGAAATTACTCTAAATGACTTAAATGATGTCAGCATTCATAGCTTTGACGTCATATTTTGCTGCAACGTTTTGAACGTTGTAGAGAACTTAGAAGAAGTAGTGTCTAGTCTTCTTTCTATCAACATGAACCGAGAATCAATCGTAGTCGTACAGATCTACGAGGGAGACAAAAGCGGTATAGGAAAACACACTAGAGACGGTTACCAGAGAAACGCAAGGACAAAAGAGTATTGTCAATGGCTCCCTGAATTTACGACAAAAGGGAATGTGTTGATAAGGCAAAGGTAAGCTTTGCTCGAAAGATTTACTTTATTAATATAACACGATGTTACGAATAGTAAACATAATATTAAAAAAAGATCCACCGAAGTGGATCAAATGTCACTACTCACGAATTACTTGAGTATGTAAGCGTTTTCTTTGACGATCTTAGTACATTCTTCCACTAGAATCGTTCGTATAGACTTCCCGCTCAGTCGTTTTGCTAAGTTCAACACGACTGCTTCTCGTCGATTAACAGTGGAAGTGTTGTTGATGGTTCGTTTTTCATTAAACGGTAGATCATCAAGCATCTTCAGCATGTCTTCGGTATCCATGTTCGATAGATCCCTCGCCCAGTTCTTAGTGATGTTTGCGTTATCACGAGCTTGGTTTCTGTCGACCATTTGCTTATCCCGAGAAGATTGGTCATGTTGGTCTTTAGTCGACAACAACAACTCTTCTCGGTTTGGTGAATTCTTAGTACTAATCTCTTCTGAATAGTCCATTAAAGTCTACCTAAGATCTCATTAAGAACACGACTGATTTCATTCTTTGTTCGGCTTGTGTAACGCTCTTGTGCGTAATCCTCAAGGATACTCACAGAAGCTACAGAAACCTTCACGTCCATCTCTTTAAGCAAGCTACGACTGTCTGCAAGCGATTTAGACCCTTGTCTTGCTTTGTTCATGACAAACGTTGTCTTATCTAGCAAACCATACTTCATCATCTGGTCAACAGTAAAGCGATATTCTTTGCGGTCGTTGATCCCTGTTCCCATAGGACAGATAACCGTAGCATTAGGATCGTTCTTTAACTTGTTAAGAAGATTCGTTGTACGCTCTGCGTATGCACCTACCGTATCAAAGATAAGGAAATCTGCATCATCATGGTTAACGACTTGCACGTGATTCTGGAAATCAAGATTGCAAACGCTAACTTTCTTTTTATAAACCGTACGTAGCACCCACGCAATGTAGTTTACTAACGTAGACTTACCAACCCCTCCCTTGGAGCCAATAAGACAAATAACTTTCATTTAGTTTCTCCTGAGTAGTCAGGAAAAATTATCACCAACATCCATTATAATCAAGTGATTTTTAATGTTGCTGGGTGGGTTTTATGTAACATCTTGATTATCGATTCACTCACAAAACTAAGATCAACGTCCACAACAACTTCTTTCAACAAATCAGGATCAAAAGTAACCATTGCGTAATCGATGCTTTCCGAGATCGTTTTATCGTGACCAACGGTTAGACTGTTGTCGAACTTACACATCACGTAGACCCCAGTAGAGGTTCTTATCTTCAAAGATTTGAAGTCAGAAGGTTCACTTACTGAATCCATGTAAAGCATGATCCTAGCTACATCAAGAGTAACGATATCTAGACATTCATTACAGTCAATGCAATCTAGTCTATGCATGATCCTGTGTATACAGTGGTCACTCACTGAATACATGGTTAAGTGTAAAGGTCGACCGAACCTAGAGAATATTAGTCGTTCGATCAAGAAGGAAGCAACTATGTACTGGTACTGGTTGTTCTTTTTGTCCTCTTCCTGCAGGGATGCAACAAACTTCATAGCAGAAGAATGCTTGTACATCACCATGAAATCCTCTTCAAGATAGCGATACTACGCATCGAGCAAGGGCGCTATTAATTCATTGATATTCTTATCATTCAGAGTACGCTACCCTTTCCCTTCCGAAAATAATTCAACCTGTCAGCACTCTCATGAAAAAAGTAAAACTTGGCTTCTATGACGTAAAATTCGGCTCTGTCGCGCTTTGCCACGGCGTATCCTTGGTTGTCACTCACGATAAAAGCACGTTGCGAGAACTGGCTCCGGTCAACAAAGGTCATGTTTACCAAACCGTTTATTTGCATCATGTACTGGACGGCTTAGCTCTTGGTGCTGAGTATGATTTTGATACACCAGCGTTCAATGTGCTCAAAGAGCACATTGAACTAAATGAGTTTTCGCACCACGCCCTGGATGAAGCCGAGCCCACCTTTCATCGCGTAAAATTGGCCAACTAAGCAGCCCAACGTTTTTACGTGGTTCAATACTCCAGTCGCAGACGCCGCCACACACCAAATGAATTTGTCCCGCGAGCCACAAAACTCCTTTTTGAAAAGGACAACGCGTGGGAAAAGGTACTTTGGAAGCATGCCCAGACCTTCAGTCTCTGGCAAATCACTTGTGTAGAACGAATGCTGGCGTGCGGTAGCAATATGATGGGCGCCAAACACTACGACTGTGGTACTCCAAACTGCCCGCATACAAAAGTCATCTGTCAGAGCTGCAAGACGAAGGCTTGCAGCTCTTGTGGCACCAAATCTACCGAGCAATGGATATCCACTCAGCTTGATGTCATGCCAGACTGTGAGCATCAACATATCACGTTCACCATGCCGAGCGAGCTTTGGCCTATCTTCGAAGCCAATCCGAAACTGCTCAATGACTTGTTCTCATTGGCAGCTGACACACTACTGAAATGGGCGAAGAAGTATGGGCTTGAGGTTGGTATATTCGGTGCGCTCCATACCTACGGTCGCGGTCTCAACTGGCATCCACACATTCACTTATCCGTGACTCGCGGTGGATTAGACAAACACAACATCTGGCGGCCCATCTACTTTAAAAAGAAGCATGTGGAATATCACTGGCGCCGATGTTTAATAGGATTACTCCGACGAAAGTACAGCGAGCTCAATTTATCGACATTGAGCACAAACCACATCCAGGACTCTCGGCAATGGCACTTCTTCTTAGAGCGCCAATATCAACGTTACTGGAACATCCATTTTGCTCAGAAAACGCAAGAGCTAAAACAGACAGTGAATTATCTGGGTCGTTACCTGAAGCGACCACCGATATCCGCATCGAGACTGCGTCATTACAGCGGCGGAACGGTCGTGTTTAAATATCTAGACCATCGAGATGGTAAATACAAAACGAAGACGTTGACGCAAGAAGAGATGATATTACGGTACGTAAGTCATCTCCCACAGCACCATTTTAAAATGGTGCGTTACTACGGTTTTCTGTCGAACAGAAAACGGGGACGGTTACTTCCTCTGGTGTATTTAGCGCTTGGAGAAA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43 | Leptospira_phage(75.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
70633 : 129755
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP026317|70633:129755|DBSCAN-SWA 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56 | Mycobacterium_phage(53.85%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
861558 : 868262
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP026316|861558:868262|DBSCAN-SWA TTTAACATAATATACATAATGCGCACTGAATTGAGGATTCCACTGGGCTTGAAAACGCTACGGCAAATCCTGCACAAGCCATTGAAATACTTGGTAATCCAAGCCCGTTAAACTTTTTTGCAATGCTCGACCATAGCGTTTGCGCTTCGCAAGATTTTGCTTTATCCAAAGCTAGTCCGATAAGTGCCTTTTCTTTATCTTCTCCGACAGCTTCTGCAAGCATAAGTATCTGATTTTCATTGAGATAAGTTCTTCCTTTACGTACCTCTGTAATCATTTGCGGACTTACACCCAAATCGTGAGCGATTTGTTTGTACTGCACATACTTCATTTGCTCTTTATAAGCATCAATGAGTTGGTTTGTGTACATTTTTGATTTTCCTATCCAAGCCACATTGACCTCATTCTAGTCCTTTAACACAAAATTTGCTGTATTGACGGTACATAAAACTCTGTATTTAATCAGCACAGAATTTACTGTACTTGACCACCTTGGTTTGGGCGTTTGCCCTTGACGCTTTCGTCTGGCCTTGGTGGTCACTCCTAACTAGTCAAGGTGGTTTCTATGTCAAAATTCTCTAGCTTAATCGAGGTTAATCCTCATAACCCTTCAATACGTTCTATAGATTTCGGAAATCTTCGTCTTACTCATTTTGGTAATCAAAACGCCTATAGAATCCGAATTTCATTTTGTGATATCGGTGTTCACTACTCACAAGAAACGTATGTGTTACCGAGTCAACTTGAGCATGTTGTTGAAATTGACCAACACGGTGAAGCTTGGGTAGTCCTTCGAGATGTAGACAACCATCAAATTTTTCTATCTGTAGCCTGTCAGCATGCCTATGCATCAATCTGTGAACTTTTCTCAATGCCTGTCAGTGATGCGGTTATTCGCGCCTTTGAGATTGAGGAGCAACTTGCAGTAAAACGTGACGCCGTAACTGAGTCTAACTCAGAGGCATAACCCATGAACGAAGCCCAAACCATCTATTACGATTTGTTGCCTGATTACACGGTTTCTGTGTTGGTCAAAGGCTGTGAAGAATGGGATTTGCTTAAGTCTATGTCTCATCTTGAATCTTGGGCTTCGTCTGAATTTGTCTCTTACGAGTTGGTATCTATTACCAACACCACTTACCAAGAACGCGTTGATTTAGGGGTCTTCGATGACTACTGCAACTAACATCCTTAAGAAATTCGATGAGCAGTCTGTTCATATTGACTACCTATGTTTTACATTTGCAGTCAAGGACTTACGCCATTGTCACAACGCGATTCAACGTCTGCACAAGCATGAGGAATATAAAGGTTTAGCACCTAAATCTCTGTTACAGCGTAACTGTAAAGCACCCAAGTTCCCTGCTCCACCTCAGTTTAATGCGACCATCGCGGGTACTGCTGAAGAGATTGAAGCGTACAACAACGCCTTTGATATCTGTTACCGCAATTACCTAGAAGATTGCCTGCGTATCTTCACGAATCAGGTGCTTGGATTGTCTCTTTCAGCACCTCGTGGCCTTGGCTTTCAGTTCTATTCTGAGTCTATGAAGTTGACCTCACCAGACGGTGAAGACTTCTGTGGTTTCGTGGGTATTGGTGGCAACAATGACACGGTGCATTTCCAAATTAATGGCACTGGTTGTAAGCATGTGTTTGCTCGTCGTGCGCCTTGGTCGCTGCATGATTGGCTAACAAACGTTCTTGGTGTTCAAACACTCGCGCGTGTCGATCTCGCTTACGATGATTACGACGGTATCTTTGATTGTGAATACGCGCGCAAAGCTTGGAATGATGATGCTTTCCGTACTGCTGAGCGTGGCCGTAATCCGGTTCTACATGAAGATATGACGATTGCCAGCATCAAAGACGGCAAGCCTGTCTACACCAAAGAGCAATACTCTGTCGGCTCTCGTACTTCTCGCATCTACTGGCGTATCTACAACAAGGCTCTTGAGCAGAAACTCGCGAACACGGGTTTGGTTTGGTACCGCTCAGAAGTTGAACTTAAAAAATGGAACATCGATGTGCTCTTGAATCCTGCTGGCGCATTCGCGGCCATCAACGACTTCGCAGCGTCGATTTCTACTGCAAAACAATTCAATACAAAACCTGTCCCGACTAAACGTGCGGCGCTCGACCTGTTGGCTTCGGCTCACTGGATGCGTCGCCAGTACGGGAAAATCCTGAACTCTTTAATCGAATTCCATGAGGGCGACATTGAAACCGTTGTCGGCTCGCTCGTCCGTGATGGAACCAAATTCACCTTCCCCGATACCTACGGCAAGTTGGTGACTCACATATTGGAGACCTAACAAATGGCTAAATCTGTTTTTGTCCTAGGCATGGACATCACTTGGAACTCGGCACGTGGTGACAGTGCTCAACTGAACATCTCACGTCCACTACGTGAAATTAACTCGGAGAAATTCAAGCGTCGCACCATCGGCGAATCTGGTGACGTAAACCCGCAATGGGATCAACCTTTGATGATTGATCATGAATACGCCCTGCTCCTTGAGCGCACCGGTGCTTTGGTTCCTCGTCGTGAGTACCAATTGCAACTTGAAATCAATCCAGAAGATCCATTGGCGGGTGCCATCGTGACAGCGCTTATTCCTGTCGACGCAGAAATTAAGAAGCACTTCGAAGCTTCAATGAAGGCTAACTAAGAAATTCTATGTCTATTTGCGTAACGGTTATTGATGGTGTTTTGCAGCAAGCAACTAATGGCAGTTGTGAGCTCATTTTGATGTCAAAAGAACAAGTTACGCAGTTAGTTGATGGTCAATTTGATTGGTCATTACTCGAATTTGACAAGGAACTGTACCAATACGTTTTAGGCCAGTCCCTTGTCACTTTCATCGGCGGTCATGTCTTAGGCCGCGTACTTAAATACTTTGGAAAATAATAGGAAAATCAGCATGAAATACATGAATCAAGTACAGAGCTTTTTCACTAACAAATACACACAAGCGGGTGTGGCAATGTCGCTTTCTGTTCCGGCTTTTGCTGAAGGTAACGCTAACGTTGAAGCCATTAACGGCGCTATCGATGGTGGTAAACAGATGGTGTCTTTGACCACTTCTGGTGTTATCGGTATCGCGGCTCTTGGCTTCGGTTTGGGGATGGTTGTTGCGTGGCTACGTAAATAATGATCCTCTCTATCGCTTTGGCCTCGTTAATATCTCTGTCCTTTTTATACGGGGTCTATACAGGCGTTATATCTGGTTAAGGGGAGCTTAAAGCTCCCTTTTTTCTTCTCAGTAATAAGGTGATTTCATGCGTTTTATAGCTCCCTTCTTATTACTTCTTTCACCGCTGGCCTTTGCTGATGAGTGTCCTGATGGTGAGCAAATGTATCAAGGCCAATGCCGCACCACTTGTGAAATCTTGGCTCAAGACTCTAGCCCTAGGGGTATGCGTTGGGATGGTACGGTTTGGGGTGATGCGCCTACTGGTTACTGTCGTGGCTCTGGCTCATCGGGTTGTGAACTTCGCCGTACAGGGGTAACCATTCAAGTTAATGGTTCAGTTTTCTGGCAAGGTGACTTCAAGTATACAGGTGCATCTTGTTCTAATGTTGGTGAGTACACCGGAGATTCTCCTTGGACCGAACCTGACGATGGTAACTCTGACGGTGGTTCAGGTAATGATTCTGGTGGTGATACTGGAACCGATACTGGTGACGGTTCCGATGGTACTACTGATAACGGTGATGACCTCGATCATGGTGGCGGTGGTAATGGCGGTAACTCTGGTTCTGCTTATCCAGACAGTAGTCATCCAATAAATCACTTGCGCTCTATCCAAGAAAAACAGGTTATCTCTAACAACCTTTTGGATCGGAATACCAATGAAATTATTCAGCTTAATGCTTCCATAACTGACAGGTTGACCGATATTTCCTCTCATTTGAACACCGAGCAAGTCAATACCAATAACTATCGAAACGAGCTCAAGACCAGTGTTCGTGGGATCACTTTCGCGTTCCAAGATGCCAATTCCACGCTCAAAGACTTGCTCCAAACAATGAACTCCATAGACCGAAAGACAACGGGTGGAACGGGTAGCAATGTTGACCTTTCGCCGTTAATTGCGAGTGCCGCTGAAATCGAGAAGCACACATCCGGTACTTACTGGTTCTTAGATGCCATGCGCAAGCAAGTTGATTCGGTTGCAGACAATACTGGAGCAATCAAATACCAAGTCACTCCAATCTTAGAGAACATTGAGCAACGTATGGCGAGTGGCTCTCAAAATACTCGTATCTTTCGTGATGGCATTCGTAGCGATACAAGGAGCATCAAAGCCAACACTAATAACATCAAGAGAGAAGTCATTAACATCAAGAAAGCCGTTCAAGCGAATAAGGAATCAGTCGACGCTGTTAAGACGGCCGTTGAAGATCAAACGGCCTCTTTAGAAGGTGCGCTTAACCAAATCGTAGAAGCAATTGGTAGTGGTGATGGCTCTGACGGTGGTTCCCAAAGCGGAGACAATTCTGATGTTGTTAGCAAGCTTGGAGAACTTCAAGGCTCCACTGAACAACTAGGGGATCAACTAGGTCAATCCTTAGAAGGTATTCAAGATGCGATTAACGGATTGAATGACGGTGGCCTATTCCATGCGCCACCAACTAGCGATGGTTGGTCCCACGGTACAGTTATTGGTGAGGCGGTTGAAGGTCTTGTTGATGACATCGACAAACTCAAAGCAACTCTCAAGGACATGCAATCAACATCCCCTATTAATCTCGGCACAATGAGCTTCAACGATGGCAGTTATTCAGGTGAAACCTTCACTCTTTCACGGGCATCTTGGAATGTAGATGTGCGCTTTAACCTATTCAACACACTCGGCAAGAACACAAGCACCATTCGCAACGTAATCATCTTTGCCGCTATGTTGATGGCTGCTTTTATCATCTTATCGTCGGGACGCAAAGGAAGCTAATATGGATTTCATTTTCGAAGCCTTTCAATACATAGCAAATGTGTTCGGCTCTATCTCTGACTTCTTTAGGTCTATTCCCGACTTAGTAATGGAAATCTTTACCTATGCTTGGTACTGGGGTATCAAACTTTATCTGTCCATCAAAATCTCTATGGTTGAGATGGCCTACGAAATTGCCTCAATGATACTAACAGACTATGAAGTCTATACGGTTCTTAACGCTGCCTTTAACAACCTAGCGCCAGACCTCAGACATGCGGCCTATCAACTTGGTGTAGTTGATGCTATCCGAATCGTTATCGATGGGCTGGCTACCGCCTTTGTTCTTCGAATTATGGGGTGGTGATTATGGCTGTTATCTTTCGTCACGGCTCTAATGGTTCTTACAAGTCTGCTTATGCGACTTGGTTTGAAATCCTCCCTGCACTTCGTGAAGGCCGCTTGGTTGTCACCAATATTGAAGGCTTACGCCCTAAAGAATCTATCGAGAAAATTCTTGGGGAAACCTTTCCGGCCAGTGCCAAGCTTATAAGGATCTTTACGCGATCAAGCGAAGGTGTTCACCTTTGGCAGAACTGGTTTAACTGGATGCCAACGGGTGCATTGGTTGTTATCGATGAGTGCCAGGACTTGTACTGTCCAGAAGCAGGTTTTAAACGTGAGAAGTTCTTAGCTCGTCCGTTCTCAGAGTTCGAAGACATCTTACCAAAGGGCTTTGGTGAGTTGTTTCATTCTCGTTGGCTACCCATTGACCCAGATTCGCTCGATGAGAGTGACTTAGACGATTGTGAGCGTACGCAACTGGACGAGAACAACCGTCTGCTCTACCCGTTCGATTTCTATGGCGCTTTCATGCGTCACCGCAAATATCAATGGGATGTGATCATGCTGACACCGGATTACAGTGCAATCCCAACATGGCTAAAAGGTTGTGCAGGTGAAGCCTACTCACATCGTTCTACGGATACCTTCTTCCGTAAGCGTAAGCCGCGTATCTATAACCATCGCCCTAAAGCAACTAAGACCGACCCGACGACCAAAGCAGACTACGCCAGCTGCAGCAGTAAGAAGATTCCGGTGGATGTGTTCGCTCTGTATCAATCCACAGGTACGGGCGGATTCAATGAAACTAAGTCAGATATCTCGATCTTAAAGTCGCCAAAGTTCCTTCTGGCTATGCTCATTGGTGTGTTGGCCATTCTAAAATTTTTCTGGGATTTGTATGTATTATCTAATAGTGATGTGGATTCGGCTCAAACAGTTCCTGCGCAAGTTGAAACTGCTTCAGCGTCCTCTTTACCTACTTCGCCTACTCTATCAATACCTCAAGCCGATACTGGTTTGGCTCGGTCGGACGCTTCTGGGTTGGATACTAGCAATGCTCATACTCAAGCTAGTCATACGACTGTTCCTAATGGTGTAAATCCGTTCTTTGAGGCACTTCCAATGTACAATGATGCGAAGTCTTTCTATCTCACGGGTATAAACACAGTAGCTAACGCGCATGATTATCTGTTTCGCATCGATAGAGGTAGAGATACCTATTACTTGCGTTCACAGACGTTAGCGAAGTTTGGATATGAGTTTGAGTTAATTGATGAATGCTTAGTGATGGTGAAATCCGACACCATCAACGCACTGCTAACTTGTCCACCAAGCATTAACCTCGACGCGAATGAACCAGAAAAAGAAATTCAGTTGACTGGCGTTCAAAGTGGCGTGGATATCTTCAATTTAAACAAGGGCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP026316|861558:868262|864237_864468_+|AUW06203.1|DBSCAN-SWA MSICVTVIDGVLQQATNGSCELILMSKEQVTQLVDGQFDWSLLEFDKELYQYVLGQSLVTFIGGHVLGRVLKYFGK >CP026316|861558:868262|864839_866513_+|AUW06205.1|DBSCAN-SWA MRFIAPFLLLLSPLAFADECPDGEQMYQGQCRTTCEILAQDSSPRGMRWDGTVWGDAPTGYCRGSGSSGCELRRTGVTIQVNGSVFWQGDFKYTGASCSNVGEYTGDSPWTEPDDGNSDGGSGNDSGGDTGTDTGDGSDGTTDNGDDLDHGGGGNGGNSGSAYPDSSHPINHLRSIQEKQVISNNLLDRNTNEIIQLNASITDRLTDISSHLNTEQVNTNNYRNELKTSVRGITFAFQDANSTLKDLLQTMNSIDRKTTGGTGSNVDLSPLIASAAEIEKHTSGTYWFLDAMRKQVDSVADNTGAIKYQVTPILENIEQRMASGSQNTRIFRDGIRSDTRSIKANTNNIKREVINIKKAVQANKESVDAVKTAVEDQTASLEGALNQIVEAIGSGDGSDGGSQSGDNSDVVSKLGELQGSTEQLGDQLGQSLEGIQDAINGLNDGGLFHAPPTSDGWSHGTVIGEAVEGLVDDIDKLKATLKDMQSTSPINLGTMSFNDGSYSGETFTLSRASWNVDVRFNLFNTLGKNTSTIRNVIIFAAMLMAAFIILSSGRKGS >CP026316|861558:868262|862527_862743_+|AUW06200.1|DBSCAN-SWA MNEAQTIYYDLLPDYTVSVLVKGCEEWDLLKSMSHLESWASSEFVSYELVSITNTTYQERVDLGVFDDYCN >CP026316|861558:868262|863875_864229_+|AUW06202.1|DBSCAN-SWA MAKSVFVLGMDITWNSARGDSAQLNISRPLREINSEKFKRRTIGESGDVNPQWDQPLMIDHEYALLLERTGALVPRREYQLQLEINPEDPLAGAIVTALIPVDAEIKKHFEASMKAN >CP026316|861558:868262|866514_866859_+|AUW06206.1|DBSCAN-SWA MDFIFEAFQYIANVFGSISDFFRSIPDLVMEIFTYAWYWGIKLYLSIKISMVEMAYEIASMILTDYEVYTVLNAAFNNLAPDLRHAAYQLGVVDAIRIVIDGLATAFVLRIMGW >CP026316|861558:868262|862122_862524_+|AUW06199.1|DBSCAN-SWA MSKFSSLIEVNPHNPSIRSIDFGNLRLTHFGNQNAYRIRISFCDIGVHYSQETYVLPSQLEHVVEIDQHGEAWVVLRDVDNHQIFLSVACQHAYASICELFSMPVSDAVIRAFEIEEQLAVKRDAVTESNSEA >CP026316|861558:868262|862726_863872_+|AUW06201.1|DBSCAN-SWA MTTATNILKKFDEQSVHIDYLCFTFAVKDLRHCHNAIQRLHKHEEYKGLAPKSLLQRNCKAPKFPAPPQFNATIAGTAEEIEAYNNAFDICYRNYLEDCLRIFTNQVLGLSLSAPRGLGFQFYSESMKLTSPDGEDFCGFVGIGGNNDTVHFQINGTGCKHVFARRAPWSLHDWLTNVLGVQTLARVDLAYDDYDGIFDCEYARKAWNDDAFRTAERGRNPVLHEDMTIASIKDGKPVYTKEQYSVGSRTSRIYWRIYNKALEQKLANTGLVWYRSEVELKKWNIDVLLNPAGAFAAINDFAASISTAKQFNTKPVPTKRAALDLLASAHWMRRQYGKILNSLIEFHEGDIETVVGSLVRDGTKFTFPDTYGKLVTHILET >CP026316|861558:868262|861558_861927_-|AUW06198.1|DBSCAN-SWA MYTNQLIDAYKEQMKYVQYKQIAHDLGVSPQMITEVRKGRTYLNENQILMLAEAVGEDKEKALIGLALDKAKSCEAQTLWSSIAKKFNGLGLPSISMACAGFAVAFSSPVESSIQCALCILC >CP026316|861558:868262|864481_864712_+|AUW06204.1|DBSCAN-SWA MKYMNQVQSFFTNKYTQAGVAMSLSVPAFAEGNANVEAINGAIDGGKQMVSLTTSGVIGIAALGFGLGMVVAWLRK >CP026316|861558:868262|866861_868262_+|AUW06207.1|DBSCAN-SWA MAVIFRHGSNGSYKSAYATWFEILPALREGRLVVTNIEGLRPKESIEKILGETFPASAKLIRIFTRSSEGVHLWQNWFNWMPTGALVVIDECQDLYCPEAGFKREKFLARPFSEFEDILPKGFGELFHSRWLPIDPDSLDESDLDDCERTQLDENNRLLYPFDFYGAFMRHRKYQWDVIMLTPDYSAIPTWLKGCAGEAYSHRSTDTFFRKRKPRIYNHRPKATKTDPTTKADYASCSSKKIPVDVFALYQSTGTGGFNETKSDISILKSPKFLLAMLIGVLAILKFFWDLYVLSNSDVDSAQTVPAQVETASASSLPTSPTLSIPQADTGLARSDASGLDTSNAHTQASHTTVPNGVNPFFEALPMYNDAKSFYLTGINTVANAHDYLFRIDRGRDTYYLRSQTLAKFGYEFELIDECLVMVKSDTINALLTCPPSINLDANEPEKEIQLTGVQSGVDIFNLNKG |
10 | Vibrio_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
956785 : 1010538
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP026316|956785:1010538|DBSCAN-SWA AATGAGTTCAACACAATACCTAATCTCTGATGCCCTTTGGGCGAAAATTGAGCCTTTGTTGCCTATCCACAAGACTAATCACCCTCTCGGGACACATCGAAAGAGGGTCGATAATCGCGATGCAATGAATGGAATTCTTTTTGTTCTCAGAACGGGTTGTCAGTGGAACGCCCTTAACGCAACGGGTATTTGTACCTCTAGCTCTGCACATCGTCGCTTTCAAGAGTGGCGGGATGCTGGTGTCTTTGAGCGATTTTGGCAAAATGGCCTGATTTACGAAGGTGTTGATTGGCGTTCTATATCAATGGATGGCTGCCAAACGAAAGCGCCTTTAGCAGGCTCAAAAAAACAGGTAAAAACCCAACAGACAGAGCGAAGCAAGGCGTAAAACGCAGTTTGCTTACCGACGCAAATGGATTGCCACTTGCCGTTGTCAGTGATGGTGCGAACGTCCACGATATCAAGCTGGTACTTCAAACATTAAATGCACTGGAGTGTTATCGTCCACCTCTGAAAGTGCCCTTGTATCTAGACAAAGGTTATACAGGTCAGTGGTTACATGATGAACTGGTTGCTTTGAACTACATTCCCCATGTTCAATCACGTGCTGAAGAGGCTGCGAGCTTGAAACAATCGGATGATTTTAAGGCTCATCGTTGGGTTGTGGAGCGAACTCATAGCTGGCTAAACCGTTATCGTAGATTGCTTGTTCGTTGGGAGAAGAAAATCGAAAACTACGAGGCCATGTTGCATTTTGCTTGTGGCCTCATTGTTTGGAATAAATCCCTTTTGGGATAGGCTCTAAGCAAGGTGAGTATTGGCCAATGAGACACGCTCTATTTTCAAATATGCGCAACTTAAATACCGCTTTGTACCAAAAAACCGCAAGTGATTTAAAGCTGGATATCGAAAAGTTCTCCGCGTGCCTTGAAGACCCACAAATGGCAGAGAATGTTGAAAACGACATTGCCCTTGCATCCACTCTTGGTATTCGTGGTACGCCAAGTTTTGTTGTCGGACGTATTGAAAATGGCCAATTAGTGGGCGCACAACTTGTTGTCGGACGTATTGAAAATGGCCAATTAGTGGGCGCACAACTTGTTGTCGGAGCGCAAGATTATCGCGTGTTCTCCGCACTATTTGACGATCTTCTTAAAACACCTAAGTAGCCGTTTAACTTAGTGCTAATATAAACCAAAAGAGGCAATAACTCTCGCTATTGCCTCCTCCATCGCGCAGATCAACAGATTCTATTTACTGTTTCCTTTGCCCTTATTACCACCGCCCCCACTCGTGCTACTTAGCTGAATGGACACCATTGCTGTCGCTGTATTTTGACCATCAGATATGGTGTAGCTAAAGCTATCACTTCCTTTAAAATTCTTCGCAGGTGAATAAACTAAGCGCCCAGAACTGTTTAAACTGACTGATCCCTTAGAGCCTTGAGTAAAGCCAACGACTTGCAGTATGTCTCCTTCTGGATCGCTATCATTCACAAGCACATCAATCTCGGTCACCTCTTTTGCCGTCAATACGACTGAGTCGTCGTTAGCGATGGGAGATAAATTGGCGATCGCTAGGATGCGATATTCGACAACGCCGTTCACCACGGCTTCGCTGGTTTCAGTTAATACCGTGCTCACCTGAATGGGATACTCACCCTCAGGAGCATTGTCTGAAGAAGTAACCATCAACTCAACACTAGCCTTCTGTCCAGACTCAAGCGAAAACTGGTGAGTTGAGCTACTCCATCCGCTTGGTAAATTTGCAGATACAGTGTACGACACAGAGTCGCATTCAGGACCATTTTGGTTCGTCAACGTCGCAGAATACACTAAGGTGTCACCGGCATTACCCTCTTGAATCAAAGAAGAAAGCGTCAACAATGGAGGGCTTAGCTCACAAGTGGGCGTTACTTCAACCACTTTGTACACACTGCTCGCTCGCGCATTATAACTTGCGTCTCGTGAATTGGTTGCTAATGCGTCAATGCTGTAACTTCCTGCTTCGGCCGAAACGTCAGAAGTAACACTCAAATTAATAGATGCCGTTTCACCCGAAGCAAGTGAAGCAACGCTGCTAGTCGTGCTCCACCCTTCAGGCACATTGGCAGTGATCTGAAAAGTAGATAATTTCTCTTTTGATTCATGTAGATCAGAATGTATGTGGTGGTGATGTTGATGAGTACTTTGGTTCGTTACATCATTTATATATACAGCCAAGGTGTTTGACGAAAATATAACGAGGGATATAACAGCAAGTTTTAGAACGATTCTATTATTTAAATTGACACCATTAACTGGTAAGTGATTATTAAAATTAAACATAATTATATTTTAGATTTATATCTTATTATGGATAGAGAACAACAACGTCTTGTGACTTATGATTCAAGTCAAAACGGGTTACTAATTTACTTGCACTCCCACAACAGCATGCTATCCAACCAAGTACGACACTACTAAAATCAATGAGCAATAAAAACCTCACCTATTTAATAAAATGAAAATCTAGGTAGAGTGACGCACATTACTATAACTTCACATGTCGTATCTATGCGCATATAAAGAAATAGAACTGTATTAGGTATTAAATTTAAAGTACAAGTAACCCAAGGTAAATCTGAGTTATATTTAACCTGAACTTTAATTTTGGAGGACGCTGTAAGTAACTAATACAACGATGTGAATATAAAATCCTTATAATTATTAATTCAATTTCATAATTATTACTTCCTTTAAATATTTAGCGAAGGAAATATTACCAAACAGAACGATTAAAAACCAAACAATTCATAATTCAAACTGATCGTTTTTAAAATGCATTTTTAAATCATCATGATAGAAAGCAACACAATACTGAATTATTAATTCGAAAGGCTGGATTCCATGTGATCTACCTCTAAGAACCTATCTCAATAGGTGTTGTCTGAGTTAAATTAGCACCTATTGAAATACTATAAATGAGTTCAACACAATACCTAATCTCTGATGCCCTTTGGGCGAAAATTGAGCCTTTGTTGCCTATCCACAAGACTAATCACCCTCTCGGGACACATCGAAAGAGGGTCGATAATCGCGATGCAATGAATGGAATTCTTTTTGTTCTCAGAACGGGTTGTCAGTGGAACGCCCTTAACGCAACGGGTATTTGTACCTCTAGCTCTGCACATCGTCGCTTTCAAGAGTGGCGGGATGCTGGTGTCTTTGAGCGATTTTGGCAAAATGGCCTGATTTACGAAGGTGTTGATTGGCGTTCTATATCAATGGATGGCTGCCAAACGAAAGCGCCTTTAGCAGGCTCAAAAAAACAGGTAAAAACCCAACAGACAGAGCGAAGCAAGGCGTAAAACGCAGTTTGCTTACCGACGCAAATGGATTGCCACTTGCCGTTGTCAGTGATGGTGCGAACGTCCACGATATCAAGCTGGTACTTCAAACATTAAATGCACTGGAGTGTTATCGTCCACCTCTGAAAGTGCCCTTGTATCTAGACAAAGGTTATACAGGTCAGTGGTTACATGATGAACTGGTTGCTTTGAACTACATTCCCCATGTTCAATCACGTGCTGAAGAGGCTGCGAGCTTGAAACAATCGGATGATTTTAAGGCTCATCGTTGGGTTGTGGAGCGAACTCATAGCTGGCTAAACCGTTATCGTAGATTGCTTGTTCGTTGGGAGAAGAAAATCGAAAACTACGAGGCCATGTTGCATTTTGCTTGTGGCCTCATTGTTTGGAATAAATCCCTTTTGGGATAGGCTCTAAACAGACGTCCTCTGTAGGATTACAAGGTAAAAAACAAAAAGAGCCGCGTATGTCAGCGGCTCCTAGAATCAATACTCTTAACTTCTAAGCACAACAGTTACAGTTGCGCTTGTAGCGGTCCATTTTACCTATGCCTGGGTTAAAGGTGTTGGTCGGGTCAAGTTGATGGTAGAACTTTTGTAGCGAGTTTTCTGCTTCGTATAGGTGCCCTACGTTGTGTTCTGCTGGGTATTTCGCACCGCGACTATTTAGGTGCTCCAGCATCAGTTTCTTCATCAGCTTGGTGTCGGTGCCCTTTTTGAAGACATAGTCTTGGTGGAAAACATAACACATAAAGTGCCCGTAATAGAGGGACTTAACGAGGTTCTTACTTACTTCCTCAGGTAATGTTTCTAACCATTCCTCATCGTTACGTCGTAACGCAATATCAAGAGCAACGATGTCTTCCACTTCCTTGCGATGAATGGTTTCGTAACGAATGGCTGCACCTGCTGCTGCAAAACGGTGTAGATACGCTTTCTTACCCTCTTCTGGCGTACATTCGAAGAAGTCACTGTCGTGCTCAGCCGCCCACACCTCTTTTAGGTATTTCTGCGCTTCGGCAATACCGCCTTCACTCATTTTAAGTACAAGGTGGTGCTCGTACTTATCACGGTATTCCAACATGCGCTTAGGAAGATGCTGCGGGAATAACTTGCTGGCGTAGTAGAGAATAGTATCTGGCAGGTATTTGCTGACCAACGGAACACGCTCTAAGAAGTTTTCAACCTTAGCTTTGAGCGAGAACATCTTAGGCAGATTGTCTGTGCCTAATAGATCGATTGAAAGGAAGACGTCTTTACCGTACTTCTCTGCCATGTTGAAGATGTCACGGTGAAGGTACTCACCCATCTCTGGCAAGTTTTCAAACTGAGTAAGGAAGTCTTTTCTCAGCTTGGTCAGTTTATCTGGATCGTTAGTACCTAAGTAGAACACCTGCTCTGTCTCAGGAATAGGATAACTATCAACTCGAACAGCGAACACGCCAAGCTTACCAGCGCAACCGCTCGCCTCGTACAGACGACGTTCGTCGGCATTAAAGCGCGATGGAATATCAGAAGTCACATCACGGACACGTTCGTCGTATTCTTTATCTGACGCCATACGTTCATCATGAATCACTTTATCTGGGTCGAAGTTACCATCTTGGATGTTCTGTAAGATCTCTTCAGGCGTCGAGCCTAATCCTTCAATA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>CP026316|956785:1010538|989153_989480_-|AUW06310.1|DBSCAN-SWA MQSEILEDKLIEILDSHFGQAVNDFVVKESSDIPALQLVIEMSLYNYFVVRAFVEKRTISLSILQSGFQFKLFSISMIDESIDSIPAKLEEEVRLRIPDKYLIAKGWA |
40 | Sulfolobus_monocaudavirus(16.67%) | plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1219646 : 1259537
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP026316|1219646:1259537|DBSCAN-SWA AATGAGTTCAACACAATACCTAATCTCTGATGCCCTTTGGGCGAAAATTGAGCCTTTGTTGCCTATCCACAAGACTAATCACCCTCTCGGGACACATCGAAAGAGGGTCGATAATCGCGATGCAATGAATGGAATTCTTTTTGTTCTCAGAACGGGTTGTCAGTGGAACGCCCTTAACGCAACGGGTATTTGTACCTCTAGCTCTGCACATCGTCGCTTTCAAGAGTGGCGGGATGCTGGTGTCTTTGAGCGATTTTGGCAAAATGGCCTGATTTACGAAGGTGTTGATTGGCGTTCTATATCAATGGATGGCTGCCAAACGAAAGCGCCTTTAGCAGGCTCAAAAAAACAGGTAAAAACCCAACAGACAGAGCGAAGCAAGGCGTAAAACGCAGTTTGCTTACCGACGCAAATGGATTGCCACTTGCCGTTGTCAGTGATGGTGCGAACGTCCACGATATCAAGCTGGTACTTCAAACATTAAATGCACTGGAGTGTTATCGTCCACCTCTGAAAGTGCCCTTGTATCTAGACAAAGGTTATACAGGTCAGTGGTTACATGATGAACTGGTTGCTTTGAACTACATTCCCCATGTTCAATCACGTGCTGAAGAGGCTGCGAGCTTGAAACAATCGGATGATTTTAAGGCTCATCGTTGGGTTGTGGAGCGAACTCATAGCTGGCTAAACCGTTATCGTAGATTGCTTGTTCGTTGGGAGAAGAAAATCGAAAACTACGAGGCCATGTTGCATTTTGCTTGTGGCCTCATTGTTTGGAATAAATCCCTTTTGGGATAGGCTCTAAGGTGTTAATGGGTAAAGAGAAATCATTGATTACTAATTTCTAGCAAAACATCACATGTGCAACTGTAGTCTATTGACTAAATTAAAAGCCTTACGCTGTTTCTCTCCACCAATGTCGGCTCTAATTGCACGACCTGAGCTTCATCAGACTTCTCGTCCAATTTGCGTAACAGAGTCTCTACTGCGGCTTGTCCTAGACGGTATTTGGGCTGATGAATCGTGGTAAGCGAAGGCGACATAAACTTCGCAATATGAATATCATCGTAACCTATGATAGAAAGCTGTTCTGGAATTTGAATACCGAGTTCATTAGCTGCATTGATAACGCCCATCGCCATCATGTCATTGGAGACAAAGATCGAGCTAGGTAGCGGGCCGCGTTCCACCATTTTCTTGAAGGCTTGATAACCACCCTCACATTCGAAATCAGATTCAACAATCCAGTTTGCATTGAACTCAAGTTCTGCTTCGAGCATCGCGCGTTTGTAGCCTTCATAACGCATTTGCGCTTGGTGCTTAATTAATGGACCAGTGATACAGCCTACCTCTTTGTGGCCGCAGTCGATAAGGTATTTCGCTGCCAGATAACCACCACGAAGTGAGTTGTCTTGAATCTTATCGCTGGTGAACAACATAGGGCCCCAGTCCATCACTACAACCGGGATATCAGGGTAACGTTCGAATACATCAATACGCTCCCCCTCTAACGATGAACACATCAAAATCAGACCATCAACGCGCTTTTGCAACAACGTATTGATAGATTCACGCATGCGCTCGTTATCGCCTTCGGTATTACAAAGGATAAGGCTGTAACCTTTTTGGTAGCAACTGCGCTCAACACCTTTTACGACTTCACCAAAGAATGGGTTGGTTGAGGTAGTAACCAGCATACCAATGGTTTTGGTGCGGTTTACTTTGAGGCTACGCGCCAAAGCAGACGGCGCGTAGTAATTGAGCTCTTTGGCAGCGTTGTTGACTCGTTCCGAGATCTCTTCACTGACAAAGCGAGTTTTGTTAATAACATGGCTCACAGTTGAGGTGGAAACCCCTGCCAGTTTTGCGATGTCTTTCATCGTTGCCATGCTATCTCTCCTTTTGATTATTGTTGTTCAAGGAACTCCTCAACCTCTTTACGGGTTGGAATGGAGGTTTGCGCGCCAAAGCGAGTTACTGAGATCGCAGCTGCTGCGTGGGCAAACTTAATCGCTGATTCTAAAGGTAAGTCTTCCAATAAACCAGTGACTAATGCCCCATTAAACGTATCGCCCGCCGCAGTGGTATCTGTTGCTTCTACGCGGAAGCCAGGAATGATTTCACCACGACCATTTTGACTCAACCACACCCCTTTCGCACCGAGCGTGATCATGACGATTTCAATGCCTTTCGAATGCAGGATGTTTGCCGCTTCTTGTGCGCTATCATCGTCTGTTACCGTCACGCCTGTGAGTACTTCCGCTTCCGTTTCATTTGGTGTGATGACATCAATACAAGACAGTAATTCATCTGACAGTTCGCGAGCTGGTGCTGGGTTTAGAATCACGTTGGTTTTGGCATCTTTCGCGATTCTCGCTGCTTTCTCGATGCCGCACATTGGCGTTTCTAATTGCATCAATAAGTAATCTGCCTGACGAATGCGCTCTAGGTCGGGCTCAATCGCTTCTGCGGTAAGTTTTGCGTTCGCTTCTGCGGAGATACAAATGCTGTTCTCACCACTGTCCGCCACCTGAATCATGGCAATGCCTGTTGGGCAGTTTGGCTGCATCTTCACACCAGTGATGTCGATGCCATCCATTTTGAAGTTCTCACGAATGTTGATGCCGAACGAATCATCACCAACACACGCAATAAAACCGATGTCTGCGTTTAATCTAGCTGCCGCCACAGCTTGGTTGGCACCCTTGCCACCTGGGATAACTTGATAGTTGCGACCATGCAGCGTCTCGCCTGGGCGAGGGAAAGAAGGCACTTGAAGAACATGGTCAGCGTTTACACTACCTAACACCACTAACTTATTCATACGGTTATCCTCGGTTCTGAATGAACCCTTTATATTTGAACAGGAGTAATAGGTTTACACTCTTTGAAAAAGCGTAAGCGTATTACGATTCAGCGAGATTTCATTTTCTAACTTACCGCTTTCGTTGTTTGGAATGACCCAACACACTCATTGGGTCATTCCGTTACTTCAGCAAAAAGAATCACTGAGTCGGGCGTTAAACTTATTTAGTCACGACTTTAAGCGGAACAGGAATGTACTCCTCAACCTTCTCGCCTTTCAATACTTTTGCTGCAGTTTCTACACCCAACGCACCAATAAGATCTGGTTGCTGTGCGATAGTTGCTGCGAGCTTGCCACGGTTAACAGCAGCAATGCCGTCGTCAGTACCGTCAAAGCCAACGATAAGTACGTCTTTACCTGATGCTTGTACTGCACGAAGCGCACCCAATGCCATTTCATCATTTTGAGCAAATACCGCTTGTACGTCTGGGTTCGCTGCAAGCAAGTTTTCCATTACGTTCAGACCTTTAGTACGGTCAAAATCAGCAGGTTGGCTTGCTAGTAGCTCCATGTTGCTGCCCTTCACTGCTGTCATGAAGCCTTCACCACGCTCACGTGCTGCAGACGTACCTGCGATACCTTCTAGTTGGATAACTTTCGCTTTCTCACCTACTTTTTCCATGATGTAGTGACCAGCCATTTCACCACCAACTACGTTGTCAGATGCGATGTGACTAACTACATCACCACGGCTTGCACCACGGTCTAGTGTCAACACAGGGATCTTAGAACGGTTCGCCATACGAATCGCGTTTGACACAGCGTCTGAATCTGTTGGGTTAATCAGAATCGCCTTTACGCCACGAATCGTCAGGTCTTCGATGTTTGATAGTTCTTTACTCGGGTCATTTTGCGAGTCCAGTACAATCAAGTCGTATCCCAGTTCTTTCGCTTTCGCTTCTGCGCCGTCTTTCATCGTTACGAAGAACGGGTTATTTAGCGTAGAAACTACAATCGCCATGGTATCTTGAGCTTGCGCCGCTACCGATACGGTTGAAGAAAGAAGAGCAGCAGAGATAAGAGTTGCGAGTTTTTTCATCGTTCTAGTCCTTTGTGTAGGGTGAGCCAGCACACGTCCTCTGGCTCGGTTTGTATTCAGGATTTAGCTTTAATGTATTAGTTGTTATGGATTACTTGTTTTTGTTGTCTACCAGTACCGCTAGCAAGATAACCACTGCTTTCGCAATCATTTGGTAGTAAGAAGAAACATCGAGTAGGTTCAGCGCATTGTTCAAGAAGCCGATGATTAGAGCACCAATCAAGGTACCCATGATGCGACCTTTACCGCCCATCAAGCTAGTACCGCCAAGAACAACCGCTGCGATAGCGTCTAGCTCGTAGCCCATACCCGCAGTTGGCTGTGCTGAAGACAGACGAGAGGTCACGATAATGCCTGCAAGCGCTGCCAACATACCGCAAATGGCGTATACACCAATTTTCACACGGTCAACGTTGATACCAGAAAGGCGCGTTGCTGATTCGTTGCCACCAAGTGCGTACACATAGCGACCAAAGCGAGTGTGGTTTAGTAGGTACCAAGCTGCCGCAAAGACAATCACCATCAACCAAACTGGAACTGGGATACCAAGAGCGTAACCTGTACCGAACCATGCAAATGCGTCTGCTGTGTCAGTAAAGCCCGTAGAGATAGGACGACCGTCTGTGTAAACCATGGTTACGCCGCGTAGTAACGTCATGGTAACCAGCGTTGCGATAAAGGCTTGAACCTTACCTTTGGCAATAATGATACCGCTGATCGCTCCTAGAGCTGCACCAGCAAACAATGCTGTTGGAACCGCGATAAGCACTGGCACTTCTAGTGCAATCATGCTCGCCGCGAAGGCACCACATAGTGCAAGTACAGAACCTACGCTTAGGTCGATGCCAGCAGTCAAAATAACCAGCGTCATACCAACAGCAATGATCGCGTTAACTGAGGTTTGACGAAGGATGTTAAGAATGTTGTCTACCGTAAAAAAGTTCGGGTTCAAAAATGACACAACAACAATCAAGAAAATCAATGCGATCAGTGACTTTTGCTCAATCAGCCATTCTTTGGTGAACAGCTTCTTGCTGCCCGTTTCGTTTGGTTTGCTCATGGTATTAGTACTCATGCTGCTTCCTCATTGATCTT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37 | Hokovirus(25.0%) | holin,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1947986 : 2008400
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP026316|1947986:2008400|DBSCAN-SWA 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56 | Enterobacteria_phage(15.38%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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