Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024810 | Staphylococcus haemolyticus strain 83131A plasmid p83131A-A, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP024809 | Staphylococcus haemolyticus strain 83131A chromosome, complete genome | 1 crisprs | WYL,csa3,DEDDh,cas3,DinG | 0 | 1 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024809_1 | 1985916-1986002 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP024809_1
|
1 spacers
spacers of CP024809_1
>1.1|1985946|27|CP024809|CRISPRCasFinder CCCCAACCCCAGCCTGCTTTGCTTGTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP024809_1
The CRISPR arrays of CP024809_1 >merge|CP024809|1|1985916-1986002|CRISPRCasFinder GAATTTCCATGTGAAATTCTCTCTGCTGGGCCCCAACCCCAGCCTGCTTTGCTTGTGGAATTTCCATGTGAAATTCTCTTTGCTGGG >CP024809|1|1|1985916-1986002|CRISPRCasFinder GAATTTCCATGTGAAATTCTCTCTGCTGGG CCCCAACCCCAGCCTGCTTTGCTTGTG GAATTTCCATGTGAAATTCTCTTTGCTGGG
>CP024809.1|AUV67955.1|1985393_1985795_-|hypothetical-protein MLHMHIASWALTIILYVIAFLHISKSQGPTPMFKPLQMALRVFMLLTLFSGFWLLIQEFMAASHGGGGNHMLLTLKMLCGIAVVALMEVSIAKRKKHEASHGLFWATIILIIITMSLGIILPWGPISSLFGIS >CP024809.1|AUV67954.1|1983997_1985320_+|CoA-disulfide-reductase MRKIIVVGAVAGGATCASQIRRLDKDSEITIFEKDRDMSFANCGLPYFIGNIVNERKDVLPITPDVFKEKKDITVKTYHEVIAINDKDQTVTVVNRQTNEKFKASYDKLILSPGAGANSLGFDSDYIFTLRNMEDTDAIDQFIDQHQAKKALVVGAGYISLEVLENLYARGLDVTLIHRSEKVNKLMDQDMNQVIFDELDSRHIPYRLNEEIVSVKDHLVTFKSGIQEDFDIIIEGVGTHPNSKFIESSNVALDDKGFVKVNYKFETNIPNIYALGDVITSTYRHVNLPAQVPLAWGAHRGASVIAEQLAGNKNIIFKGFLGTNIVKFFDYTLASVGIKVEELTHFDYQMVELNSGTHAGYYPGNTNVHLRVYFDTNNRHLLRAAAVGKTGVDKRIDLLSMAMMSELTIDELTEFEVAYAPPYSHPKDLVNMIGYKARDL >CP024809.1|AUV67953.1|1983091_1983916_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MKPYLICLDLDGTLLNDNKEISDYTKQVLTTLKKQGHRIMIATGRPYRASQIYYHELNMDTPIVNFNGAYVHHPKSDDFKTTHEVLDVDLARNMIETLQKAKVTNIIAEVRDHVFINNHDPRLFEGFSMGNPKIETGNLLEELDEAPTSLLVEAEEIYIPRIKQMLTRFYAENIEHRRWGAPFPVIEIVKRGISKARGIDQVKDYLGIEPSHIIAFGDEDNDIEMIKYAKYGIAMDNGLDELKHIANHITYSNNDDGIGRYLNDFFKLNIPYKG >CP024809.1|AUV67952.1|1982582_1982891_-|DUF59-domain-containing-protein MEEALKDSILGALEMVIDPELGIDIVNLGLVYKVNVDDDGLCTVEMTLTSMGCPLGPQIIEQIKTVLAEIPEIQDTEVNIVWNPPWNKDMMSRYAKIALGVG >CP024809.1|AUV67951.1|1980309_1982136_-|acetyltransferase MKQDFEKGKQRKTKMRYMPGLDGLRAIAVLGIIIYHLNRKWLTGGFIGVDTFFVISGYLITSLLLKEYEERGIISLKQFWIRRVKRLLPAVVALLIVVGIATLIFEPQQIVRVKHDIIAALFYVSNWWYIAKDVNYFEQFSFMPLKHLWSLAIEEQFYLFFPFVLVILLLTIKKYRNVTLILWIISLVSLLAMVIISQPNVGYSRVYFGTDTRLQTLLLGVILAFVWPPFKLKANPPKVLQRSIDGIGILGLIILIYLFFTVKDTSAWIYNGGFYLISGMTLFIIASVVHPSSILAKVLGHRIFVYIGKRSYSLYLWHFPVISFIHIHFVDGQLPIYVYFVDIILTVLFAELSYRYIETPFRREGLKAFSFNYLKRPKFIRTIVSIIAVIPIVLLFLGVFDRFGKDEIDNKANSFNTNDQDKYLVRMMPGENIKIDGSSSNSKSKKQVYTNISPLLIGDSVMVDIGEEFKSQVPKATIDGKVGRHLQEALSIAGNYSNYNKPSDKVVLELGTNGDFTEEELNQLINKFGKAQIYLVNTRVPRDWQDNVNKQLANAAKKHKNVTLVDWYQRSAGHSEYFAPDGVHLENSGVKALSDEIIKTIKKNSKNK >CP024809.1|AUV67950.1|1977405_1980015_-|ATP-dependent-chaperone-ClpB MDINQMTYAIQGALQKAVELSKENELQNIEIEAILKGTLEETDSLFKSILERANIDTDELNQAYTNKLKNYPSVQGDNIQYGQYIGAKANELLNKAESYMKEYEDEYISMEHVLRAAMDIDDTTKQFVGNKEEVVKEIITKVRGGNHVTSQNPEVNYEALEKYGRDLVEEVRQGKMDPVIGRDEEIRNTIRILSRKTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLAQRIVRKDVPESLLDKTIFELDLSALVAGAKFRGEFEERLIAVLKEVKESDGRIILFIDEIHMLVGAGKTDGAMDAGNMLKPMLARGELHCIGATTLNEYREYIEKDSALERRFQKVGVSEPDVEDTISILRGLKERYEVYHGVRIQDRALVAAAELSDRYITDRFLPDKAIDLVDQACATIRTEMGSNPTELDQVNRRVMQLEIEESALKNESDNASKHRLEELQEELSNEKEKQASLQSRVEQEKEKIANVQEKRAELDRSRQALEDAQTEGNLEKAAELQYGTIPQLENELKEFEEAYQDEQGDSERMIREVVSDEEIGDIVSQWTGIPVSKLVETEREKLLNLSDILHERVVGQDKAVDLVSDAVVRARAGIKDPNRPIGSFLFLGPTGVGKTELAKSLAASLFDSEKHMIRIDMSEYMEKHSVSRLIGAPPGYVGHDEGGQLTEAVRRNPYSVILLDEVEKAHSDVFNVLLQILDEGRLTDSKGRSVDFKNTIIIMTSNIGSQVLLENVKDTGDITEETEKAVMDSLHAFFKPEILNRMDDIVLFKPLSINDMSMIVDKILTQLNIRLMDQRISIEVSDDAKKWLGEEVYEPQFGARPLKRFVQRQIETPLARMMIKESMPEGTVVKVDINDDHELTFDVQKPENE >CP024809.1|AUV67949.1|1976917_1977112_+|DUF2929-domain-containing-protein MKYLVTFIWAVILLQMVNFVLNSLNGGGTLNFITPIVLAVIFTIVIAILAAMIKPDDFTRSGNR >CP024809.1|AUV67948.1|1975770_1976712_-|ketoacyl-ACP-synthase-III MNVGIKGFGAYAPEKVVDNAYFESFLETSDEWISKMTGIKERRWASEDQDTSDLAFEASKKAIEDAGITPADIDMIIVATATGDMPFPSVANILQEKLGTRKVPTMDQLAACSGFMYSMITAKQYVQSGDYKNILVVGADKLSKITDLTDRSTAVLFGDGAGAVVIGEVSEGRGIISYEMGSDGNGGKYLYLNKDTGKLVMNGREVFKFAVRIMGEASTRVVDKAGLQSDDIDMFIPHQANIRIMESARERLGIEREKMSVSVNRFGNTSAASIPLSISQELENGRIKDDDTLVLVGFGGGLTWGAMVIKWGK >CP024809.1|AUV67947.1|1974512_1975757_-|beta-ketoacyl-[acyl-carrier-protein]-synthase-II MTENKRVVITGMGALSPIGNDAQTSWENALKGVNGIDTITRIDTEDYNVHLAGELKDFNVEDHIEKKEARRMDRFTQYAVVAARQAVEDAKLEINDETANRIGVWIGSGIGGMETFETAHTTLQNKGPRRVSPFFVPMLIPDMATGQVSIDLGAKGPNGSTVTACATGTNSIGEAFKIIQRGDADAMITGGTEAPITHMALAGFSASRALSTNDDKETACRPFQEGRDGFVMGEGAGILVIESLESAQARGAQIYAEIVGYGSTGDAYHITAPAPEGEGGSRAMQAALDDAGIEAKDVQYLNAHGTSTPVGDMYEIRAIKNTFGDAANQLKVSSTKSMTGHLLGATGGLEAIFSALSIRDSKVAPTIHANTPDPECDLDIVPNEAQDLEITYAMSNSLGFGGHNAVLVFKKFED >CP024809.1|AUV67946.1|1974062_1974440_+|DUF3899-domain-containing-protein MKNLKNWMIWLIITPILSMILWIIFTNHTFVSYINTLFYLSLIIFISIFFILLVQEGIFDATSYGFRRIRYQLSSRSKKRTMADDEFLNPQQVKKEHYFISTWIAPALICNIAYFVMTIIISFLL >CP024809.1|AUV67956.1|1986217_1987123_-|FAA-hydrolase-family-protein MKFLSFNYKDAESYGVKVKREDAVWDLKKVFAEFGEGDFHPQTLLEGLQQNQTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKADEFKIAFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYQDHASELNHEVQRLYVFTKAASSLTGDESTIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYIYGYTIINDITDRNAQNEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPTPENVNIVTKVNNDIRQDGNTSQMINKIDDLIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGLQPPQFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAKD >CP024809.1|AUV67957.1|1987248_1990926_-|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MNNIPIKPKDAQWTDAQWKSIYANGQDILVAAAAGSGKTAVLVERIIQKIIRDEIDVDKLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQQASIENPNNEHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKIIQQHYDVIDLDPNFRTISDVENVLLLEQSIDEVLEKHYDTPDIEFLTLVEQLSSDRNDDNFRDLLKRFYNFSIANPSPFEWLDSLVEIYTDDNKHKLYLDELERLSKIYIKAAYHTLLEAENNFLNCIEAEKHLDVIKLEKFKCEKMIEGNVINFEEIINYTSEKLPTITKKLKDTNEDEGISSQFLTNAKDFYDDYKKLLSEVKNKYLMRSYEDLKVDMKRLAPRIQYLVQIVKDIINGFAEKKRSRNVLDFSDYEHFALQILTDQEGNASPIAKEYRSQFEEILVDEYQDTNQVQEAIISKIKRGDESNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPTLFMDKYHRFTKDGDQSGLRIDLSKNFRSRKEVLATTNYLFDHMMDEEVGEIEYDADARLYFGATKYSDKSMPLELHALIQDKSSDNDLEKSEQEARYIAEQVKYIIEHKQVYDMKSETYRQATFKDIVILERGLKNARNLQQVFKDYNIPFHVNSKEGYFEQTEVRLVLSFLRTVDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFTEDELANIRVQSMNDDYFYQSILHYMKDQEANPLLVEKLEHFMDDINMYQEYSQSHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGKGRRANLYGLFNKAVEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERNKDFGEENVIGPNDNVVRMMTVHSSKGLEFPYVIYSELSKNFNKGDLRKPLILNQKYGLGIDYFDLEQNVTYPSLSSVVIKSITEKELISEEMRLMYVALTRAKEQLILIGTIDKEEALEKLERLPISGNQIALHKRLSADRPFDLIYSILAKYQSTSLLPEYRFEKSIDNLDESLRPTVDIKIAQFEELSIEDSESEQESRNISDLEVEGSHDDTLKQQINDQLSFKYPYLKDTEKPSKQSVSELKRQLETEESGTSYERVRQYRIGVSTYERPKFLRENKKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKETRMTETELNDYINELIEKHIIEEDAKKDIQFEAVMNFIRSDLYMTITQADKVYRELPFVVNQARVDEMPESDEDVSIIQGMIDLIFLKDDQYYFVDYKTDAFNKRRGMTDEEVGIQLRDKYKIQMKYYKNTLETILNSKVYGYLYFFQFGQMSIEEDV >CP024809.1|AUV67958.1|1990918_1994407_-|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MELNAYIGRAGTGKSHHMIDNIKQQMKEDPLGDPIVLIAPTQSTFQLEQAFVNDKELNGSLRTEVLHFERLSYRVFQEVGGLTEERLTQAATEMMIYDLVQQHKSELKLYQSQVNYYGFSEKLSEQIQDFKKYSVTPEHLHTFLQDNDLKTRTRHKLEDISLIYQYFEERINGEFITSEDSLNHFIDILSQSEWIKRAEVYIDGFHNFSTLEYQIIKALVQSAKKVTVLLTTDGNEDPFSLFRKPSEVLTHLKEIAKDLNIELQQQFFKQQYRFNNKDLIQLEQQFDALQINPIAYDGSINILESSSIREEVNEVARQIIKDTRDKQYRYQDIAILYRDEAYAYLFDSVLPQYDIPFNIDTKRSMTHHPIMEMVRSLLEVIQTNWNISPMMRLIKTNILTNHFKDSAYLIDLLENFVVERGVYGKRWLDEKLFSIDNFTKMGRKEHKLTTEEREDFEQVVHLKNDIIDKILTFEKAMNEAENVRGFATAFYETMEAFDLPKYLMTHRDQLDVDGRHEEAEEIDQIWNGLIQILDDLVTVFDNEEMTLKRFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKKHIYMVGMNDGAMPQPVSSSSLITDEEKKVFEQQAQVELSPTSDILQMDEAFVCYIAMTRGSEQVTFSYSLMGAQGEDKEKSPFIDQIQGLFNGLEVMNIHYQHNAQPLSLMEHPHQTKVVLFESLKAWLEAEMVADVWVDAYQVMRDNDKLNNGLEYLLTALTYDNETVKLDEPLAASLYGSTINASVSRFEGYNDCPFKHYANHGLRLNERTKYKLENFDLGNIFHTALKYISDKVDGDFKNLDNKKIHALTVEALENVLPQVQFNLMDSNAYYRYVSKRIGVIVESTLKALRYQNKNTKFKPQRFEAGFRKTPNNSEELIAQPLITKQGIPVNIRGQIDRIDAYTKDDKSYINIIDYKSSNPSAKLDLKKVYYGKQMQMMTYMDIALQNAQRLGLSNEIKPGGLLYFHVHDERLSFKDWGELEDDALTQDKLEQAFLKEYKLRGLVNSDMDVVDALDIRLEEISKSDIVPVSLKKDGSIGSRGSSVADETTIHKFIKHNKDNFIKTATNIMEGHTEVAPLKFDDQLPCQFCNFQSVCHVDTIIDSKHYRHVDETIDPIKAIQDVELESGDHNE >CP024809.1|AUV67959.1|1994569_1995142_-|signal-peptidase-I MKKEIVEWIVAIAVGLLLVWVMVNFVAKSYTIKGDSMDPTLKDGEHVMVNILGYKVGDIKKGNVIVFHANQQDDYVKRVIGVPGDNVIYKNDKLYVNGKKINEPYLDYNEKRKQGEYITGSFETKDLLNANPKSNIIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDRDQIVGKVSFRFWPFSEFKFNFNPDNEK >CP024809.1|AUV67960.1|1995156_1995681_-|signal-peptidase-I MRRVTSWIVAFLFACLFVMFIQMFLVKSAVVQTDDMSPTLNKGDRVIINKIKVTFNMLKDGDIIMYRHNNQLHFGRLVGKPGESIEVRNGKLYRDDRQVNKFYAKNRDINNFAIRDLHDSDGDIILPNSYFILNDNGDKQSDSRTYGLIDKDDIVGDVSLKYYPFKEFTYQFNK >CP024809.1|AUV67961.1|1995685_1996258_-|TVP38/TMEM64-family-protein MFHQIEQWFDLLQGFGYLAGFIILFFRAIVPVLPLTLYVILCVHAYGFIAGTIISWLGVVAGTYTVFFFCRKFVNANFMKRIKSRRSIERLIHFIDRQGLVPIFILMCFPFTPNTLVNFVASFSHIRGKYYFIILLISKLISITFLAIMGKSVTSFFTHPVRAIMVLIVTIALWFVGKKVEGYFMGSDKE >CP024809.1|AUV67962.1|1996487_1997819_-|glucose-6-phosphate-isomerase MTHIQLDYGKALEFFGQHEIDQQQDIVKTIHKTIHEGTGAGSDFLGWVNLPEDYDKKEFSRIVEASKRIKSNSDVLVVIGIGGSYLGARAAIEMLTSSFRNSNEYPEIVFVGNHLSSTYTKELVDYLSDKDFSVNVISKSGTTTEPAVAFRLFKQLVEDKYGKAEAKKRIFATTDKAKGALKQLADNEGYETFVVPDDVGGRYSVLTAVGLLPIATAGINIESIMIGANKARKELSSDKLDENIAYQYATIRNILYSKGYTTEMLINYEPSMQYFNEWWKQLYGESEGKDFKGIYPSSANYTTDLHSLGQYVQEGRRFLFETVVKVNNPKHDITIEEDSDDLDGLNYLAGKTIDEVNTKAFEGTLLAHTDGGVPNVVVNIPRLDEETFGYVVYFFELACAMSGYQLGVNPFNQPGVEAYKQNMFALLGKPGFEDKKKELEERL >CP024809.1|AUV67963.1|1998152_1999355_+|argininosuccinate-synthase MKEKIVLAYSGGLDTSVAVKWLIDKGYDVVAVCLDVGEGKDLDVVYSKALDMGAVECHIIDATKEFSDDFVSYAIKGNLMYENSYPLVSALSRPLIAKKLVEIAEQTNSVGIAHGCTGKGNDQVRFEVAIKALNPNLKAFAPVREWGWSREEEIDYAIKHNIPVGINHDSPYSIDQNLWGRANECGILEDPYAAPPKDAYDLTAELEDTPDTPDEIILSFKNGVPVQLNHQDYDLDQLILTLNELAGKHGIGRIDHVENRLVGIKSREIYETPGAEVILKAHKALETLTLTKDVAHFKPVIEKQFAEQTYNGLWFSPLTDSLKLFIDSTQQYVEGDVRIKLFKGNAIVNGRKSLYTLYDEKLATYTKEDAFNQSAAVGFIDIYGLPTQVNAYLHGGYSNE >CP024809.1|AUV67964.1|1999347_2000730_+|argininosuccinate-lyase MSSKAWGGRFQQQPEDWVDEFNASIDFDQTLLDEDVQGSIAHATMLANQNIISQDDKDAIINGLKEIQQDFHNGKLAFKKSLEDIHLNIEHELIQRVGDAGGKLHTGRSRNDQVATDLHLYVKKEVLEIQDLIRSFQTSILKLAQSHVDTIMPGYTHLQRAQPISFAHHVMTYFWMLERDYSRFVDSMKRIDISPLGAAALSGTTHPIDRHETQQLLEFSSVYENSLDAVSDRDYIIETLHNISLTMIHLSRFAEEIIFWSTDEAKFITLSDAFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKVGRATGHLMSMLVTLKGLPLAYNKDLQEDKEGLFDSVRTIKGSLRIFEGMLDTMTVNTDRLNETVHQDFSNATELADYLVAKDVPFRKAHEIVGKIVFECIQQGIYLLDVPLERYKELNSNIDQDVYDYLKPENCLSRRKSYGSTGQDAVRHQLKVAEKLLNND >CP024809.1|AUV67965.1|2000917_2001880_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MKASNKGIISCLTVASLSLAIIHTPVEASGGESSNTTTTNLTNASKTQNNHTNWSRNLTGERHTTIAHRGASGYAPEHTFAAYDKSYNELGASYIEIDLQRTKDGHLVAMHDETVDRTTNGSGRVEDYTLAELKKLDAGSSFNEQNPQLAKDSYKGATVPTLDEILTRYGTDANYYIETKQPDVYPGMEQQLLDTLNRHNMLTSNSLENGHVLVQSFSEASLLKMHQLNSNVPLIRLLDKGELAQQSEADLQRIRSYAIGVGPEYSDLNAQNTAHLKDLGFLVHPFTVNETADMQRLNQYGVDGVFTNYADQYKAISSQK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP024809_1 | 1.1|1985946|27|CP024809|CRISPRCasFinder | 1985946-1985972 | 27 | MN693238 | Marine virus AFVG_25M402, complete genome | 24675-24701 | 6 | 0.778 |
1. spacer 1.1|1985946|27|CP024809|CRISPRCasFinder matches to MN693238 (Marine virus AFVG_25M402, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
ccccaaccccagcctgctttgcttgtg CRISPR spacer taagaatcccagcctgcgttgcttgtg Protospacer . **.********** *********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1101975 : 1143860
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024809|1101975:1143860|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP024809|1101975:1143860|1106566_1107574_+|AUV67162.1|DBSCAN-SWA MRIKAVNFYLYNHEFRDPIVTPKVKLTYRKALIVEILSEEDQSFFGECNAFETNWYNEETIETVQEILSQWSESIVKKSVHKYEDWKPYLDILDNYPTARSTVVMAIYQMYHDLPKFKVAYGATISGISAQQLDYLKQTQPKRIKLKWTGQLNDDISLLDDILPYDFELALDANESLDVSDFQKLESINDQNILYIEEPFKSLSSTLHIDHTQYPAIALDEKATDINSIISIVNQFPVKVVIVKPFRVGGLDRVQSLIRELKSIDIKVVIGGMYEYGLSRYFTALLAREGDYPGDVTPDGYYFTDDFTQGVGKLKEGMISFSPPQIDKSKLLKLN >CP024809|1101975:1143860|1116833_1117304_+|AUV67174.1|DBSCAN-SWA MKHTEFEEKVKKQLWFLNKKEKKLLQNNLTHYHNEVEGNEGDIQSKKYRKPIQYANQFLKNNIFKQKEVASSTLLFLLIGMVLIYAFLLGLFLTGFITSLTAVNYFINPQVSMPVINVILILIGAVLLAIVSLLLIKSVTAFFTKKLLEYKFNKSA >CP024809|1101975:1143860|1136851_1137163_+|AUV67193.1|DBSCAN-SWA MESITVDQLKEKVLESNPVNIVDVRTDEETAMGVIPGAKTIPMDQIPDNLNQFNKNETYYIICAAGMRSAKVVKYLEDHDIHAINVEGGMNEWGTAGTEINSI >CP024809|1101975:1143860|1117287_1117734_-|AUV67175.1|DBSCAN-SWA 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MNIPRSVWWLVIGMALNITGSSFLWPLNTIYMKEELGKSLTIAAIVLMVNSFGMVVGNLLGGSLFDKLGGYRTIMIGTVTCLISTTLLNFFHGWPWYAIWLVLLGFGGGMIVPAIYAMAGAVWPNGGRTTFNAIYLAQNIGVATGAAMGGFVAELSFNYIFLANLIMYVLFGIVAITQFNLEYHAKIRTPDSLDIHSKENKKRFIALLLLCVMFAICWIAYIQWETTIASFTQELNISMSQYSILWTVNGIMILVAQPLIRPAIILLKGNLKYQMLVGILIFMLSFFVTSFAEQFTVFLIGMIILTFGEMFVWPAVPTIANYLAPEGKQGQYQGVVNSASTVGKAFGPLIGGVLVDTFNMSAMFIGIMFLLIVGIIFLSIFDKGLPKGKQSRQSR >CP024809|1101975:1143860|1124557_1125190_+|AUV67182.1|DBSCAN-SWA MFTGIVEEIGTVKNIRTHQSVRTLDIACQTITEDMHIGDSISVNGACLTVIDFTSNYFSVQLIKGTEDKTYLSQINKNDEVNLERAMSGNGRFGGHFVLGHVDDKGVITQVKETPNSRIVSIRASSTIINQMVKQGSITVDGVSLTIFDLRHDSFDIHLIPETRRSTILSSKQNGDQVHLETDVLFKYVERMVSRNESELTLDKLKAFGF >CP024809|1101975:1143860|1108327_1109098_+|AUV67165.1|DBSCAN-SWA MDIIVTKKMPIASRTHQFDEITYKVDGLKVKALQMCPLTKTVKRIVVYLRGGKGQVGRVRAARLMQFANDNTLVVGPYYRGSNGSEGRDEFANADLKDVTYLIKILKQRFPNAYIHMIGFSRGGIQGLLTYQDYPVDSYIIWGGVSSMHLMYEERTDLRGMLRRMVGHPSKNKESYDQRDAIKLIDSNSPPILIVHGGKDKQVGIHHANYLEEQLKLKGVVHDTFYQLDEGHVPRPQAMKLALDYVHQWMTKCEEI >CP024809|1101975:1143860|1113621_1114458_+|AUV67169.1|DBSCAN-SWA METIEFYNGHTMPKVGIGTFRVENNDECKEAVKHAIVSGYRSIDTAKVYGNEEQVGLGIKEGLEATGLERKDLFITSKLYFEDFGRENVANAYETSINKLGLDYLDLYLVHWPGTNEAIMIDTWKGMEDLYKDDKVKNIGVSNFNAEHFEALLAQVSIKPVINQVEFHPYFTQNKLRKYLEVQNIHMESWSPFMNAQILGDETLNQIGKEVNKSAAQVVIRWNMQHGVIVIPKSVTPQRIEENINVFDFELTDEQMEQIDSLNKDQRIGPDPATFEGH >CP024809|1101975:1143860|1131303_1131864_-|AUV67189.1|DBSCAN-SWA MKLERILPFSKTLIKEHIKQDSIVIDATCGNGNDTLFLAQQVSNGHVFGFDIQDTAIQSTFEKVKAFNNVTLIQDGHENIKKHIDIQFKGQIDAAIFNLGYLPKGDKSIVTRPETTIKAINAIFDYLSVEGIIVLVIYHGHAEGQVERDALLDFLEHFDQEKAHILKYQFMNQVNHAPFICAIEKR >CP024809|1101975:1143860|1114872_1115238_-|AUV67171.1|DBSCAN-SWA MQYLFVFIGGLFGALLRYVLSTLNVDSGLPLGTLIANIVGAFLMGYLSSLSIHFFKNNPLIKKGVTTGLLGALTTFSTFQFELVTMSQNNSIALLFIYGLTSYIGGILFCWFGVKLGGQPT >CP024809|1101975:1143860|1126398_1126857_+|AUV67184.1|DBSCAN-SWA MNFEGKLVGTDLKVAIVVSRFNDFITNRLLDGAKDTLVRHGVEDSNIDVAYVPGAFEIPLVSKKLAQKGEYDAVITLGCVIRGATSHYDYVCNEVAKGVSKANDVSDIPVIFGVLTTESIEQAVERAGTKAGNKGAEAAVSAIEMANLLKQF >CP024809|1101975:1143860|1121582_1123073_+|AUV67180.1|DBSCAN-SWA MRVAIIGVGTAGVSVLRQLVKNEAFKNLEVDVYDHDKNMGQGVPFQNDSSQLLINLPTKQMSLNLDDDEEFWKWYQEQSEFKFDNPKYLPRFVFGHYMKSYLSNYDLLFDNLTIIKHPVREIFTNSEIDETTLKYYVCTSEDMSEWKEYDYIFLTTGTFAYHDPYNLKGNKSYIQTPYPTYNTLDEVSQSDDIAIIGTGLASLDVVRYVATHHPKLPITMTSRSAHLPSVRGNMIDVEFKHLTKQKFNELKSQYYGNVPLELAFELFKLECKDHNIDLEKLVYRRTGNTIQDLQYDLDRPDEIGVFQSLIENIKENLNWIWNSFSREDQKDFDKRFSKIIQLNSNPMPPRTAELIIDLINNQSLIVKSGIEDITYKDNHYLLKFNNDDDYYQYDVIINSTGSKTHLSDLDEEDQLILNLQNRQIVQPHPMGGIQIIPETNQVISPRYGTLNNMIAIGQVTNGVNKLRNGVKMIVDQAVNSVNYLYENQSKFDHFNS >CP024809|1101975:1143860|1130762_1131164_+|AUV67188.1|DBSCAN-SWA MNNQAGENVSMILQLEEVCKEINSIFKVIYETYDLTKEEVLILLTLWDKGSMTLKEMDSYVNIKSYKRTRTYNKLVQSEWIFKERPLDDERTVIIHFNKEKQELKNELLDFITATIKKRYEILENSLNSLMRV >CP024809|1101975:1143860|1115330_1115636_-|AUV67172.1|DBSCAN-SWA 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>CP024809|1101975:1143860|1111144_1112341_+|AUV67167.1|DBSCAN-SWA MTYNKRLFTSESVTEGHPDKIADQVSDAILDEILKDDPNARVACETTVTTGMALISGEISTSTYVDIPKVVRETIKGIGYTRAKYGYDYQTMAVLTAIDEQSPDIAQGVDKALEYRNDISEEEIEATGAGDQGLMFGYATNETETYMPLPIFLSHQLAKRLSDVRKDGILNYLRPDGKVQVTVEYDESDKPKRIDTIVVSSQHADDIELEQIQSDIKEHVIYPTVPEGLIDNETKFFINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGYARHGGGCFSGKDPTKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLADQCEVQLAFAIGVAEPVSISIDTFKTGKVSEAQLVEAVRANFDLRPAGIIKMLDLKHPIYKQTAAYGHFGRTDVLLPWEKLDKVNVLKDAVQA >CP024809|1101975:1143860|1117735_1118212_-|AUV67176.1|DBSCAN-SWA MNFDEIYHKYHRFIHYLLKRYYVKYNYDEFYQLLLIKLWQLSKNYNKNSNICLSSYLYQRLNFYLIDLFRKENLKPELVEVDDLQTPQITSINTETTFFNYNDISKILNTQELAWYNYFIQGYKQFEIADLMHVSLSSIKKYKSSSIKKLTDYYFKGE >CP024809|1101975:1143860|1137389_1143860_+|AUV67194.1|DBSCAN-SWA 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35 | Staphylococcus_phage(90.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1412377 : 1424414
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP024809|1412377:1424414|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP024809|1412377:1424414|1415550_1416072_-|AUV67442.1|DBSCAN-SWA MDRALIDFYYYFHKQQHYFLCHDILEEAWKSNINFSKKDGIVSLILFSTAMYHYRRGNTKGALVTLKKSLSTFEKARDKALLQLNEQDYKILILSQIKSIEDSKSFKPVYIPVNNVFEKQIINTYPDYKFTTLSTQDEYIVNHHKNRDRSDVISARHQAMIKKQNIRSGKDLK >CP024809|1412377:1424414|1422088_1423042_+|AUV67449.1|DBSCAN-SWA MHSIITYASNHSFDYKTNKSIYNILNGKKSHQTFFDACSQQLLSLYHSLPKLKYPSFERFLDTYDNQNTDISIHPRYTYDSMIQTFSCIQLLIQTITHFKNNHLNFIPITQQITVQSRVKQIYSKILEQNLVDDFEKEIEQIFHFIDEKCSNNCLIHYYLQGYEEPMYTRQQVSLIEGIPVTKLFVLELNNLVQMMFALENDKQFPILTQTIILPTLLNKTTITYHQLLKGLSMDEVAVTQNVKINTIEDHVLELFIKGYFSEYQTFVNGPQTSEFIAFYDQNRGQRLKLYKEEFDQLTYFQIKLLIVGIERGELIA >CP024809|1412377:1424414|1414014_1414461_+|AUV67440.1|DBSCAN-SWA MEERLNRVKQQLQQSSYKLTPQREATVRVLIENEKDHLSAEDVYLKVKDKAPEIGLATVYRTLELLAEIKVVDKINFGDGVARFDLRKEGAKHFHHHLVCMECGKVDEIHEDLLPQVEERVETEYNFKILDHRLTFHGVCAECQAKGK >CP024809|1412377:1424414|1416165_1416897_+|AUV67443.1|DBSCAN-SWA MYEVKLDAFNGPLDLLLHLIQKYEIDIYDIPMKSLTEQYMQYVHAMKQLEINVASEYLVMASELLMIKSKLLLPQHDVDDNLEEDPREDLVGRLIEYQNYKEYTQLLTEKKEEREHYFTKHPTDLSHLEKNVTWDECQTLDLTDLIVAYQRVKSRLALNKPKTVEIIKESFTIQQATEKVTTQLRHHTSFNFFSLFTFSEPIEQVVTHFLAILEMSKSGVINIEQVRSFDDIRIIRGVNFNIG >CP024809|1412377:1424414|1423034_1424414_+|AUV67450.1|DBSCAN-SWA MLEEKLKEWFGFSSFNPGQKEIIESIVNKKDTLGILPTGSGKSLCYQMPTYMKGKPTLIISPLISLMDDQVMQLKAQGEKFVTSIHSGMDENEKQQNINSLHKSRFVFLSPEFILQTQNFKLIRNIDFGLIVLDEAHCLSEWGYDFRPHYALIGEITSHYKNASILALTATAPPHLENDLNLILSRKLNVIKTSMNRENISFSHLNFENDAEKIKWLLNFLDQSGPTIIYVSSKKVCLELANMIYHHGYLTGIYHGDLSYQERHTVQNQFMENFIPVIVATSAFGMGVNKKDIRTVIHFHLSTSPSNYLQEIGRAGRDNLQSQAISLYQPDDSYILETLLFSDAITTEDIDAFDIGAFLPPQKQEILTILSQRYSSNVLKTIFDNSLIRKKLGYQRMIGYTSLDQCRRRYLLEFFGDNPTQPQQCCDIDSNLMTIKVTNRKKVKRKLSYTEKLKYLFKV >CP024809|1412377:1424414|1421116_1421659_+|AUV67447.1|DBSCAN-SWA MQQNKRLITISMLSAIAFILTFIKFPLPFLPPYLTLDFSDVPTLLATFLLGPVAGILVALIKNILNFLFNMGDPVGPVANFLAGVSFLLSAYYVTKRQGDTPRSLVVGLAIGTIVMTIVLSILNYFVLLPLYGMIFNLGDVFNNLKIIIISGVIPFNIIKGIVISIIFALLYRRLKRVLS >CP024809|1412377:1424414|1418313_1419039_+|AUV67445.1|DBSCAN-SWA MTNEILIVDDEDRIRRLLKLYLKRESFTIHEASNGKEAYNLAIENDYACILLDLMLPEMDGIEVASKLREHKDTPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTQSSKPEQSEPHARDVIEFNHLIIDNDAHRVLADNQQVNLTPKEYELLIYLAKTPNKVFDREQLLKEVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSEDAAHMIQTVWGVGYKFEVKSNDEPTK >CP024809|1412377:1424414|1414560_1415448_+|AUV67441.1|DBSCAN-SWA METIIEEYLKFIQIEKGLSENTIGAYRRDLKKYQLYMQEQKIAHIDFIDRQTIQECLGSLIDQGASAKSIARFISTIRSFHQFALREKYAAKDPTVLIETPKYEKKLPDVLDVEEVIQLLETPDLTKNNGYRDRTILELLYATGMRVTELIQIEIDDVNLIMGFVKVFGKGNKERIIPLGDTVIEYLDTYINNVRSQLLKKTVTNVLFLNLHGRPLTRQGIWKLIKQYGLRANINKTLTPHTLRHSFATHLLENGADLRAVQEMLGHSDISTTQLYTHVSKTQIRQMYNQFHPRA >CP024809|1412377:1424414|1416889_1417429_+|AUV67444.1|DBSCAN-SWA MDNHGIIESLLYTAGDEGLDEKQLLEILEINQAKLSELISSYTSSGLIIQKFGSTYILTSKKEASPYIEQLIEQKSNMKLSQAAMETLSIIAYNQPLSRSDIELIRGINSDGAVRTLIARGLIEAKDVENSRSHALQTTDLFLNVFGIEKIEDLPTTEEDEEEMDDFFSNLVNQKGDTK >CP024809|1412377:1424414|1419019_1420777_+|AUV67446.1|DBSCAN-SWA MTNRLNSVVIKLWLTILFIVTTVLILLSAALITFIQYYYTQQTENAIREDASRISHLVEQADNKTLAIEHSQQLIDGSGGVIIMANKSSSIKSSNSNTKDKMLEEIHKNSQFQRVFSQGKSTTQNITISNNGNSHSYILLGYPMKAQENANSKYSAVFIYQDLKSIEDTNNAITIIILITAIIFIAVSTVFAFFLSNRITKPLRQLRTQAINISKGDYSKQTSVSTKDEIGELSHTFNNMSSEIQENIEALSTQKNIRDSLINSMIEGVLGLNDKREVILSNKMADDIIKSIDKTVYKEIEKQIEATFVSKDTEFQEYEINNKYYVIIMSYVERIQQDGRSGIVVIIRDMTNEHNLDQMKKDFIANVSHELRTPISLLQGYTESIVDGIVTEPEEIRDSLSIVLDETKRLNRLVNELLNVARMDAEGLTVNKEKQPIKPLLSKMQMKYRQQAEDLELNMSLEPNIDDELWEYDADRIDQVLTNLIDNATRYTQPGDSISITTTTDDSYQTLHIKDTGSGISPEHLELVFDRFYKVEASRTRGKQGTGLGLFICKMIIEEHGGTIKVESKVNKGTTFIIKLPKPKN >CP024809|1412377:1424414|1421730_1421979_-|AUV67448.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAFVILDDNQGTAEVPEELYEDMEDALEGCPTDSIKIEEEPFDGDALKFE >CP024809|1412377:1424414|1412377_1413286_-|AUV67438.1|DBSCAN-SWA MQKNILKSGIEISELGLGCMSLGTEYANAEPIIEKAIESGITYFDTADIYDRGTNEKIVGKALKKYQNRDDIVIGTKVGNRPTEDGGTTWDPSKKYIKESVKGSLKRLGLDHIDLYQLHGGTIDDPLDETISAFNELKQEGIIKAYGISSIRPNVIDYYLKHSEIETIMSQFNLIDNRPEQLLSDIHAKGVKVLARGPVFKGLLTSNSIDALDHKFSEGIFDYTHHDLGETIASVKEIESNLSALSFEYLKSHDALGAIIIGASSPQQLEENVNNYNKKVSLDQVKAARERVKNLEYTQHLK >CP024809|1412377:1424414|1413367_1413910_+|AUV67439.1|DBSCAN-SWA MEFNEKTFDRTVIYNGKIIDLEIHDVELPDGNTSRRELVYHNGAVAVCAITPNDEVLLVKQFRKPVEKALLEIPAGKLEQDEVREEAAKRELEEETGYVANNLEFITGMYGCPGFTNEKLTIYFSNNLSEGQLNLDEDEFVELHKVPISDIKALLDNHEIEDAKTIIGLQYILLNYNHSN |
13 | uncultured_Mediterranean_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1607692 : 1678006
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP024809|1607692:1678006|DBSCAN-SWA 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82 | Staphylococcus_phage(67.27%) | portal,head,integrase,terminase,tail,tRNA,capsid,holin,transposase,protease | attL 1645408:1645467|attR 1679975:1681301 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1888139 : 1896609
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP024809|1888139:1896609|DBSCAN-SWA CTTATTTAATAACTTTAGCTATAACACTTGGATAAAGTTCATACTCCAAACGCTTTACACGTTCTTCCAAATTCTCTTTAGTATCGTCCTGTTTTATATCACATTGTCGTTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACAGTTGAACCAGTTACCTTATCGCCACTATTAAACGCTTGTCCAATAGCATCTTTCCCCTTATATTTCGGTAATAGTGATGGATGGATGTTTAAAATTTTACCTTCGTAAGCGTCTAATAAATCAGGTCCAATTAATCGCATATAGCCAGCAAGTATTATCCACTCAACTTCTTCACGTTGTAACAGTTCTATTAAATGTTGTTCGTAATCTGCTTTTGATTCGAAATCTTTAGGTTCATTAATATTGACAGCTACTTTTAATTGTTCAGCACGTTTGACGCAGTAAGCATCGTGATAATCAGTATATAAAGATGTAATTTCTATATTATTGAGTTCCCCTTTATCTGCGTATAATACAATATTTTCGAAATTACTACCTGAACCAGATGCAAATATTGCTACTTTAGCCACTACTCTACCCCCTCAAGATGAATAGGCGTGTCTTTGTCTTCAATAATTTCACCTATTTCGAAAGCAGATATACCCTCTTGTTTTAAAATATCGAGTGTTTGCGCAACATCTTTTTTATCGATTATGACAGTGAAACCAATCCCCATATTAAAGACATTGTACATTTCTTTAGTATCTATATTGGCTTGTTGTTGTAGCCAATTAAATACGTTTGGTGTTGGAAATGCTTGTGTATCAATGTTAGCTGCTAAACCTTCTGGTAACCCACGTGGAATATTCTCATAAAAACCACCACCAGTGATATGATTCATTCCTTTAATTTGAACAGCTTTTTTTAGAGCAAGAATAGGTTTTACATATAGCTGCGTTGGTGCTAGAAACGTTTCTAAGTACGTACGACCATCAAAATCGTCATTTAAATCTATACCAGATTCTTTAATTAATTTACGTACTAAGCTATAACCATTTGAATGTATTCCGTTAGAGGCTAAACCAATGATGGCTTGACCTTCTTGAATTGCTGATCCATCAATATAGTCGTCTTTCTCGACTGCTCCAACAGCAAATCCGGCAAGGTCATATTCACCTTCATGATACATTTCACCCATTTCAGCTGTTTCTCCACCAATAAGTGCAGTGTTAGTCTCTTCGCATCCATCACTCACACCTTTAACAATCTGTTCGATTACTTCTGGAACAACTTTATTCGTTGCAATATAATCTAAGAAATATAATGGCTCAGCACCAGTAGTCAAAATATCGTTTACACACATCGCTACTGCATCAATTCCGATTGTGTCGTGTTTATCATTATCAATAGCCAATTTCAATTTAGTACCAACACCATCTGTACCAGAAACTAGTACGGGTGCCTTCATATTTAATTGAGACAAATCAAAGGTAGCACCAAATCCACCTAAACCACCTAGTACCTCTTTACGCATTGTTCGTTTAACATGACTAGACATTCTCTCAACCGCTTCATAACCTGCATGAATATCAACACCTGATTGTTCATAAGCTTTAGACATGAATATTACCCTCTCTATCAAAGTAGTGTTTATGATTATTAATATAATCCTGTTGACGTTGACTTAAGTTCTTATAATATTTATCTTCATAATCAAATAGTCCTGCTGGATAATCACCTGTAAAGCTCTCTACACATAAACCACTATACGGTGCGTCATAATCTAATCCAATCGATTCAATTAGACCGTCTACGCTTAAATATGATAATGAGTCTGCACCAATATAATCACAAATTTCTTTAGGTGACTTACTTGCAGAAATGAGTTCAGCAGTCGTTGAAACATCTATACCGTAAAAGCTTGGGAACATAAATTCTGGAGAAGCGATTCTTACATGAACCTCTTTAGCTCCGGAGTCCTTTAACATTCTGACAATACGTTTACTCGTTGTTCCACGCACAATTGAATCATCAACTAATACAATTCGTTTACCTTCTACGATATCCTTGACTGCCGACAATTTAACGCGGACACCTTGTTCTCTTAACTCTTGAGTCGGTTGGATAAATGTGCGAGCTACATATTGGTTCTTCACCAACCCCATTTCATAAGGTAGGTGACTTTCTTCAGCATACCCACTTGCAGCTGATAATGATGAGTTGGGTACACCAATAACCATATCTGCATTTGCAGGGCTTTCTTGTGCTAATTTTTTTCCAGATGCTTTACGAACAGCATGAACATTTTTGCCAGCAATAGTAGAATCAGGACGAGCGAAATAAATATATTCCATAGCTGAAATAGCCGTATTTGTATGACTCGTATATGATTTCACTTCAATACCTTCATTATTAATAACAACATATTCTCCAGCATGGATATCTTGCACGTATTCAGCACCTAATACATCAATGGCACATGTTTCACTAGCTAAGATGTACGTGTCATCTTGCATTTTACCTACTACCAGTGGACGGATAGCGTTAGGATCTACTGCTCCATATAATGCATCTTTAGTAAGTATTGCAAATGTGAATCCGCCTTTAATTTGTCGCAAGCTCTCTTTTAACGCTTCTTCAAAAGTTGGTGCTTTACTTCTGCGTATTAAATGCATAATCACTTCAGTGTCAGATGAAGAATGGAAGATTGCACCATGTTTTTCCAAATATTGACGTAACGTCTGGGCATTAATTAAATTACCATTGTGGCAAATCGCAACGCTCATATCGTAAAAGTGATATAAAAATGGTTGTATATTTTCAATCCCTTTATTACCTGATGTGGCATAGCGAACATGGCCAATGGCGTTGTGTCCATCTTTAAGTTGATCCATTTGATCACCTTTAATTGCTTCTGTTAACAATCCAAGACCTCGTTCACCTTTTAAAATTTCTCCATCTGATACAACAATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGTAAACTGTGAAGTCCCATATAGGTTAATTGAGCGGCTTCTGAATGATTCCAAATGCCGAACACACCACATTCTTCGTTTAATCCACTGTAGTTAAACACTGTGCAATTGCTCCTTCCCAACTTTCTTTAATCTCTGAGACTTTTTCAACAATCGAACTTTGAGCATTAGTAACTTTAAATTCATCAACATCTGTCAATTGACCAATTTCTATAGCTTCATCAATATTTAACGTCTGTCCTTCTTTAACAACAATAATATATCGACCTTGCGTTTCACTAAACAATTGTGCATCTGAAAGGTCAATTGAAGCTTCTAATCCTAAACCATAATGGGCACTGATACGCGCTAAAGTAATTAATAAGCCACCTTTACCAACTGTTTGTACGTGAGAAGCCACGCCACTTCTAATCGCATTCTTGACTGCTTCTCCTTTATTAACTTCATCGCTTAAATCAATTGCTTCAAATTCATGATTGACTTTACCGTATAATAATTTTTCAACTTGGCTACCACCAAAATCATCTCTTGTTTCACCAACTAAATATAATTTATGACCAGCTTCAGGATGGAAATCCTTCAGATAATCAATATCCTCTATCAAACCTACCATTCCTACGACAGGCGTTGGAAAAATAGATGTGCCACGTGTTTCGTTATAAAGTGATACGTTACCTGAAACTACCGGTGTTTTTAATACTTCACACGCTTCTGACATACCTTTCGTTGAATCAATTAACTGCTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAGCCATAATTTAAGCAATCCGTCATAGCAAGTGGAGTTGCACCTACTGCTATTAAATTGCGATAGGCTTCAGCTACGACCATTTTTCCACCTTCATAAGGCTGATTAAACACATAACGTGCTTCGCCATCAATTGTAGAGGCCACAGCTTTATTCGTACCTTCAACACGAACAACTGAAGATTGTAAACCTGGTTTAATGATAGTATTAGCACCAACTTGTTGATCATATTGCTCATATAAATAATGTTTTGAGGCAATCGTTGGATGTATTAGAAGTTTCTTAAATGTTTCTTCGACATTTATAGAGCTATAGTCATTTTTAGATGTGTTGTACTCTTTCTCTTCACCTTCTAAAACATAGACCGGCGCTTCATCTGCAAGTGATTGAACCGGTATATCCGCGAATACTTCATCTTCATATTTAAGTACGAAGCGGTCAGTATTTGTTACTTCACCAATTACCGCACTATCAAGTTCATGTTTTTCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAATAACATTCTTTCTTGTGTTTCAGAAAGCATCATTTCATAAGGTGAAATACCTGGTTCACGTGTAGGCACTTGATCTAAATGTAATTCCAGACCACTGCCACCTTTAGCTGCCATTTCTGATGATGAAGACGTTAAACCAGCGGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCGTCGAAAGTAATCGCTTCTAATGTGGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAAAGGGTCACCAATTTGAACAGATGGTCGTTTACTTTCACTTTCTTCAGTTAACTCTTCAGATGCAAAAGTTGCACCATGAATACCATCACGACCTGTTTTTAACCCTACATAAATGACTGAGTTACCTTCACCTTTAGCAGTCCCTTTTTGAATCATGTCATGATCAATAACACCTACACACATGGCATTAACCAACGGATTTCCATCGTAACGATCATCAAATTCAATTTCTCCAGCTGTTGTTGGGATACCGATACAATTTCCATAACCGCCAATACCACGTACTACACCTTTAAGTAAACGTTGGTTCTGTTTAACTGACAATTCACCGAAACGTAGACTGTTTAACAGATTGATTGGTCTAGCTCCAATTGATACGATATCTCTAATAATGCCACCTACACCAGTTGCAGCACCTTGATAAGGTTCGATAGCTGACGGATGGTTATGTGATTCAACTTTAAATACTACTGCTTGATTATCACCAATATCCACAACACCTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP024809|1888139:1896609|1888139_1888706_-|AUV67871.1|DBSCAN-SWA MAKVAIFASGSGSNFENIVLYADKGELNNIEITSLYTDYHDAYCVKRAEQLKVAVNINEPKDFESKADYEQHLIELLQREEVEWIILAGYMRLIGPDLLDAYEGKILNIHPSLLPKYKGKDAIGQAFNSGDKVTGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIKQDDTKENLEERVKRLEYELYPSVIAKVIK >CP024809|1888139:1896609|1889729_1891214_-|AUV67873.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHSEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDGEILKGERGLGLLTEAIKGDQMDQLKDGHNAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVAICHNGNLINAQTLRQYLEKHGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRQIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMQDDTYILASETCAIDVLGAEYVQDIHAGEYVVINNEGIEVKSYTSHTNTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPANADMVIGVPNSSLSAASGYAEESHLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVEGKRIVLVDDSIVRGTTSKRIVRMLKDSGAKEVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPKEICDYIGADSLSYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLFDYEDKYYKNLSQRQQDYINNHKHYFDREGNIHV >CP024809|1888139:1896609|1894047_1894308_-|AUV67876.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYKQVNDIRVGKVLYMTVDEATDEAVDNIVTTLSEKLFANNVIEEYSYKIVDEKENA >CP024809|1888139:1896609|1895015_1896140_-|AUV67878.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGDTIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGFKVICLDPNPDSPCKSVAHEFITAAYDDEEALHELGEKSDVITYEFENISAEQLIRLTQKFNIPQGYQAIQLLQDRLTEKQTLQQAESKIVPFLPIKEEKDLNVVINQLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLVKNEESIQEAKDLISQQECVAEQFLDIALEVSLTVTIGNQKQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARSDKEQEARDEVNKIINEVHFVGTFTVEFFIDKSNNLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQNLPKEIEILKPAVMMNLLGRDLDLLEDKFANHPEWHVHIYGKPERKPNRKMGHMTILTNNVDETEKAMLKQFEGRE >CP024809|1888139:1896609|1894307_1895012_-|AUV67877.1|DBSCAN-SWA MALLYEGKAKRIFSTDNEGQLRVEYKDEVTAGNGAKKDKMEGKGRLNNQITSIIFEYLAHHGIASHFIKQLSETEQLVEEVKIIPLEVVVRNIATGSITKRLGFNKGYEFEAPLVEFFYKNDDLNDPLITDDHVKLLKIASDSEIETLKTMAKDINKVLVQLMDEMDLRLVDFKVEFGKTSDGKILLADEISPDTCRIWDKYSDSNFDKDVYRNDTGSLIDTYTTFLNKLEELK >CP024809|1888139:1896609|1888705_1889737_-|AUV67872.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVDIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVLGGLGGFGATFDLSQLNMKAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDNDKHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGVSDGCEETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDLAGFAVGAVEKDDYIDGSAIQEGQAIIGLASNGIHSNGYSLVRKLIKESGIDLNDDFDGRTYLETFLAPTQLYVKPILALKKAVQIKGMNHITGGGFYENIPRGLPEGLAANIDTQAFPTPNVFNWLQQQANIDTKEMYNVFNMGIGFTVIIDKKDVAQTLDILKQEGISAFEIGEIIEDKDTPIHLEGVE >CP024809|1888139:1896609|1893374_1894046_-|AUV67875.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMYNAAIKSGAQADYVDYRETSLEGYDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIINEVKRLANDGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNENLKIANNQTPFTNLYGENEIVVYPVAHGEGHYYCTDDIYNELVENNQIILTYEDNPNGSHENIAGIVNKAGNVCGMMPHPERALEKILGTDSGVKLFEAMVNSWREQNV >CP024809|1888139:1896609|1891192_1893382_-|AUV67874.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSIEEIKFEKLYQDMGLSDAEYNKVCEILGREPNFTEIGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELSVKQNQRLLKGVVRGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDDRYDGNPLVNAMCVGVIDHDMIQKGTAKGEGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLELHLDQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFEKHELDSAVIGEVTNTDRFVLKYEDEVFADIPVQSLADEAPVYVLEGEEKEYNTSKNDYSSINVEETFKKLLIHPTIASKHYLYEQYDQQVGANTIIKPGLQSSVVRVEGTNKAVASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMSEACEVLKTPVVSGNVSLYNETRGTSIFPTPVVGMVGLIEDIDYLKDFHPEAGHKLYLVGETRDDFGGSQVEKLLYGKVNHEFEAIDLSDEVNKGEAVKNAIRSGVASHVQTVGKGGLLITLARISAHYGLGLEASIDLSDAQLFSETQGRYIIVVKEGQTLNIDEAIEIGQLTDVDEFKVTNAQSSIVEKVSEIKESWEGAIAQCLTTVD >CP024809|1888139:1896609|1896126_1896609_-|AUV67879.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKVMQESCAMLDEFEIPYEKKVVSAHRTPKLMYEFASQARTNGYDVIIAGAGGAAHLPGMVASMTTIPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGNAGAKNAGILAARILSISNESVRKHLDEYEQSLVDKVGEMQNELQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2123038 : 2136971
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP024809|2123038:2136971|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP024809|2123038:2136971|2125984_2126953_-|AUV68091.1|DBSCAN-SWA MKAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLTEDEKNTFKRALAGLTGLDTHQADDGMPLIMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDTWVIEEPHLKYKSDKIIENYHKLWGKEASIYDQYIARVSSVFLETFLFYSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQSLRNELSENEKQKADKEMYKLLEDLYANEVSYTHMLYDDIGLSEDVLNYVQYNGNKALSNLGFEPYFEEKEFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYTLALNVEALQDEDFIFDN >CP024809|2123038:2136971|2129148_2129547_-|AUV68093.1|DBSCAN-SWA MKVVYFSFSGNVRRFIKRSEISDVMEITKDNCTDPFEEPYILVTGTIGFGEVPKEVQSFLEINHHNLRAVAASGNRNWGQNFAKAGRTISEEYHVPLLMKFEVQGSNKDVIEFKNKVGHFNENYEREKVQSY >CP024809|2123038:2136971|2130320_2131220_+|AUV68094.1|DBSCAN-SWA MRRLTLNPKVKGIIAILISAVGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNFVAMFIPLFFIFKYKQPMFGKLSSQPLLISRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADTLMKLNPFWTILLSLIFLNEKVRKYQIIAMIVAILGMLFIVKPEFSSTMITSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVVVLIPFSIATYEPMTTIQMVYLLGAGLSAAVGQIGITLAYSFAPAKDISIFTYASIIFTAIFGFILFGETPDFYALIGYVIIIGASYYMFEKARRQTAITKQQSNTKE >CP024809|2123038:2136971|2124766_2125735_-|AUV68090.1|DBSCAN-SWA MKFLFKGYVLLILLVCLTIVSLFVGVSQLSLSDIFHLSEEQQNILFSSRIPRTVSILLSGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILISLIFFPKGHILIKLLFSVGLSLAGTYLFVKLINLIRVKEVIFVPLLGIMIGGIVSSFTTFIALRTNALQSIGNWMNGNFAIITSGRYEVLYLVVPLLIIAFIFANHFTIAGMGKDFSHNLGVSYEKIINIALFITAALTALVVVTVGTLPFLGLIVPNIISMYRGDHLKNALPHTLMLGSIFVLFADIIGRLIVYPYEINIGLTIGVFGTVIFLILLMKGRKHYAN >CP024809|2123038:2136971|2123817_2124777_-|AUV68089.1|DBSCAN-SWA MQISSNKKIIILIIATICMAAFYLLVGLDFEIFQYQFQSRLRKLILILIVGGAIGASVVIFQAITTNRLLTPSIMGLDSVYLFVKVLPVFLVGTQAAVITNVYLNFFVTLIAMVLFSLLLFEGMFKLGHFSVYFILLVGVILGTFFRSITSFIQLIMDPESFLAVQSAMFASFEASNSRLVLVSTCLLLVLIIITVIMRPYLDVLLLGRAQAINLGVSYESMTRLLLILVALLVSISTALVGPVTFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILPATILISWISLFMAQWVVENLFEATTEFSLIIDLIGGSYFIYLLVKRRSAN >CP024809|2123038:2136971|2123038_2123821_-|AUV68088.1|DBSCAN-SWA MIEIKNLDKAIQNKPILKNINVDIQKGRLTSLIGPNGAGKSTLLSAVSRLFEYEKGTIKIEGKAVVDYKNDDLAKKLSILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRMKKEDYEQVEYALDLLQLQSIRHRNIKTLSGGQRQRAYIAMTIAQDTDYILLDEPLNNLDMKHSVQIMQTLRRLCKDLNKTIVIVLHDINFASCYSDDIIALKNGEIVKADTKDNVIQAEILKQLYEMDVHIEEIRGQRICLYYDEDTFDSLL >CP024809|2123038:2136971|2131225_2131726_+|AUV68095.1|DBSCAN-SWA MTQGRQKEELQDITLLGNQNNKYEFDYTPEVLETFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNIKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIDLMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >CP024809|2123038:2136971|2135207_2135741_-|AUV68097.1|DBSCAN-SWA MSRKSIAIDMDEVLADTLGAIIEAVNVKTELGITVESLNGQKLKNVIPEHDGLVRDILRAPGFFRNLTVMPHAQEVVKKLTEQYDVYIATAAMDVPTSFHDKYEWLLEFFPFLDPQQFVFCGRKNVVKTDYLIDDNPRQLQIFEGEPIIFTASHNVSEERFKRVNGWKDVEAFFLGE >CP024809|2123038:2136971|2134208_2135135_+|AUV68536.1|DBSCAN-SWA MGQKFNHGVLFYHEHSGLKDIYEGLGEVTKSLTTMCKHLSIQLSENEGDIIKYCERIKNQEYSSDVDIVFILGGDGTVNELVNGVLANDLNVPIGIIPGGTFNDFTKTLNLNPNFSKASEQLKTSHLESYDVMKVNGTYVLNFVGLGLIVQNAENVQEGRKDIFGKLSYVGSTVKTLMNPEDFDYTLTVDDKELNGNTSMLVVANGPNIGGSRIPLMDLSPQDGKLNSFIFDKQSFTILNDVFKKRDSMDWNEITNGIDHIAGKHITLSTDPVMKVDIDGEISLETPITIEVLPKALQILTFPENAEQ >CP024809|2123038:2136971|2135915_2136971_-|AUV68098.1|DBSCAN-SWA MKQQLNQLAAYQPGLSPQALKEKHGIEGELYKLASNENLYGPSPKAKQAVQAHLDELFYYPETGSPSLRKAISEHLNVDSSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDKIVTSEGTFGQYYHNAIVESAEVVQVPLLNGGFDLENIIKEVDEETALVWLCNPNNPTGTYFNHDELESFLERVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLKLQERFDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVATNEAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAIAALEDQAYLKDVTAKNAKEREKFFEIPQSKHFLPSQTNFVFVVTEKAQELYEALLKVGCITRPFPTGVRITIGFPEQNDRMIEVLKHFDY >CP024809|2123038:2136971|2127080_2129186_-|AUV68092.1|DBSCAN-SWA MKIMNEKKYNHIELNNEVTKRKDNGFFNLEKDQEALAVYLEEIHDKTIYFDSEIERLHYLVDNNFYFNVFDKYSEEDLVEITEFAKSINFEFASYMSASKFYKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLADGNKQQAKQFILAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKALEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKQEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNIVKKKKDAREMLNMIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSVINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMETGKIKDSVHTGMDALTVVSDEANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANTFFMMMNYYSIERSMEIAKERGEVYQDFEQSDYASGKYFEFYTSQEFEPKFEKVKRLFDHIDIPTAKDWKALQEQVQQHGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPETMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHVDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHHKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCAI >CP024809|2123038:2136971|2132026_2133532_+|AUV68096.1|DBSCAN-SWA MATNNSHEQAVQTIPQRGFFGHPSGLGVLFFVEFWERFSYYGMRAMLIFYMYDQIKNGGLGIDQTTAMSIMSVYGALIYMSSIPGAWVADRLFGTRGATLIGAVLIIIGHVCLSLPFAMFGLFASMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDTRMDAGFVIFYMSVNLGALISPIILQHFLDVKNYHGGFLIAAIGMALGLVWYMIFNKKNLGSVGMNPTNPLSSEEKKKYGLIVGIIVAVIAIVLLVTYFTNTLSFNLISNTVLVLGIALPIIYFTTMIRSKDVTDVERSRVKAFIPLFILGMLFWAIQEQGSNVLNIYGLERSDMKMNLFGWTTDFGEAWFQSINPLFILLFAPIVSAIWLKMGKKQPSLPVKFGLGTLLAGASYILMGLIGMSYGDTHFSVNWVILSYVVCVVGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSVWLLTNASAQALNGTLVKLINPLGQTNYFIFLGSVAIVITVIILAFTPKISKAMKGIH |
12 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2151267 : 2159415
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP024809|2151267:2159415|DBSCAN-SWA TTTATAACATCTCCAATATCTTTGTTTTATCTCGAAACTCTTGTACTTCTTTTTCAGGTATAGAATCAATCGTAATCCCTGCACCCACACCGTAATGAACTTTCTCATTTCGATACTCAAGCGTTCGAATTGGAATATTAAATATCATTTTATCATCCGGGCATAATAATCCAATTGTGCCACAATAAATATATCTAGGATTAGCCTCAAGCGCTTTAATGTATGACATCGTATTAAGTTTCGGTGCGCCCGTAATAGAACCACATGGAAACAGCGCTTTTAGAATATCAGTCAAACTCGTTTCGGCTTCTAATCGACCCGAGACCATACTCGTCATTTGATAAACAGTCTTATAACTTTCTATAAAGAATGGCTTATTAACGTGTATAGTTCCTGGCTTAGAAATTCTAGAAATATCATTACGCAATAAATCAACAATCATTACATTTTCAGCACGATCTTTAAGAGAGTTCTTCAATATTTCATAATTCATCAAATCTTCATCTTTATTAATACTACGTGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTACTTACGACTACATTTTCTTGGTTATTAAATGCTCCTTTTTGAAAGAATAATTCAGGAGAAATTGAGGCAACTTTAATCTCTTCTACATCTAATAATGCAGTATAACCACCATTATTTGTCTGAGTTAAATAATAATATAAATCAGAGATTGGGTAATGGATATCACTAACTAAACGTGTTGTATAGTTCACTTGATACGTTTCTCCATCAGTGATTGCGTCTTGAACTTGTTTAATCTTATCTTGCATTTCTGCATCACTTTCCAAAAAGCGAAACTGATGTTTAGGAATGTAGCTTTGTGAAAGATTGTTAGACGGATGTTTAGCCATATTAGGATTGAAACTATATGCAAGAGCTATGACTTGATTATTATCCAATTCGTGCGTAGCCATTTCTTGATTAAAAAATTTTGCCGCTTCATATGTAAGATAAAGTGCTACGTATCGTCCGTTTGATTGTTCATCTTGAGCAAAGCGAACTACTGCACCGATGTCATTCAAAGTGTAAGCCACCTTTTTAGAGACATACGTGTCAAAATTCAATGCTATTGTTTCAAAATGATCAGGTGTCGTATAGTATCGATAATTAAATGCGATGTTCATAGTCTATCCTCACTTTTTCTAAAAATAGTCGAATCTGTTCATGCCCATATTCACTTAAAATAGATTCAGGATGATACTGAACGCCATAAATAGGATATTGATTATGTTCAAAAGCCATTATAATCCCCTCTTCGTTATAAGCTGTCATATTTAAAACGGTAGGGATATGATTTTTATCAGCAATCAGTGAATGATATCTCATTACTTCAAACGATTTAGGTAGTCCTTTAAATAGTCCAGTTCCTCTATGAGTTAACGTCGTGGTATGACCGTGAACCGGCTTTAATCCATGAATAATCGTACCTCCATAATATTCATAAATAAATTGGAAACCTAAACAGACACCTAATATAGGAATTTCACCCTCAAATTGATTCATAATTTCAGTTAAAATTGGATAGTCACTAGGTTTACCTGGACCTGGCGAGATGACAATTGCCTCTACGTTAGATGACCTTAATAGATCAACGGAAACGTCATCTACCTCGTATACAACTATCTCTTTATCAGTTTCTGTCTTAAAATAATCTATTAAATTATATGTAAATGAATCTTTATTATCTATAACTATAATCATTTATGTCGCTCCAACTCTATGTTAAATAAATTCATCTATAACCTTATTATAATTAATAATTTTTTGAAAATGTAAGGGTTTACTATTTATATTGCTTTAAAATATAGCTTGATTTTAAGAAGTGAATATATTACGCTAACTAGCGTACTAAAACTCAAAAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACAATAATCGAAATATTTAGTTTGAAAGTAACATTACTTTTATATAACTAGTTGAAATGTTTCTAAGTCTATCTTTTTTATAGAGATAGACTTTTTTTATGTTCTCATGGCTAGGTTAGAGACGGCATAAAGTATCATTCTAATCTTTTCAAAAAAGGAGAATATTCATGACAAATCAAAATTTAAACAAGGACAAAGCCATTGTAGTATTTAGCGGGGGGCAAGATAGCACAACGTGTTTATTTTACGCTAAAAAACATTTTAAAGATGTTGAATTGGTAACATTTAATTACGGTCAACGACATGATGCAGAAATTGAAGTTGCTACACGCATCGCAAAAGAGCAAAATTTAAAACATCATATTTTAGATATGTCACTATTATCACAATTAACTCCAAACGCCTTAACACAACATGATATGGACATTGAAACTGGTGAAGACGGTATTCCAAACACGTTTGTACCAGCACGTAATTTATTATTCTTATCATTTGCTGGTGCATTAGCTTATCAACGCAATACTAAACATATTATTACCGGGGTTTGTGAAACGGACTTTTCAGGTTATCCAGACTGTCGTGATAGCTTTATTAAATCAATGAATGTAACGCTTAGTTTATCTATGGATAAAGACTTTGTTATTCATACCCCTTTAATGTGGTTAGACAAAGCACAGACATGGGAACTTAGTGACGAATTAGGTGTTCTAGATTATATTCGACACAATACACTTACATGCTATAACGGTGTGATTGGTGATGGTTGTGGTGAATGTCCAGCGTGTCAATTAAGACAACGTGGTCTACAACATTATTTAGAAGCAAAAGGAGCGAATTAAAATGATTCAACAACTCTATCCGTCAGTTGCCCACCCCTATAGTTTTGAACTTAATAAAGATTTTAATTTTTCAGCCGCGCATTACATTCCAAGTGAAGATGCCGGTAAATGTATGAGAACACACGGGCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGCAGGCGATAAACTCGATCATAATGGTTTCTTAATCAATTTTAGTGATTTGAAAAAACTAATCCACGACCAATTCGATCACTACTTATTAAATGATTTACCTCAATTTAAAGATAAGAGTCCCTCAACTGAAGTTGTAGCTCAAACAATATATAAAATGGTCCAAACTCATCTACAAAACTGTGATAATCAACCTGAATGTGTCCAAGTTTATCTACGTGAAACGCCGACTAGTTATGTGGTATATCGCCCAAAGGAGTATAAATAATGGCTGCTAAAATTCCAGTACTCGAAATTTTTGGACCTACGATTCAAGGTGAAGGACGTGTTATAGGTCGCAAAACGATGTTTGTTAGAACTGCAGGTTGTGATTATCGTTGTAGTTGGTGTGACTCTGCTTTCACTTGGGATGGAAGTGCTAAAGAAGACATTAAGTTAATGACAGCTGAAGAAATATATAATCAACTGAAAAAAATCGGCGGTGACCGTTTTGATCACGTTACGATATCTGGAGGTAACCCAGCACTAATTAAAGGTATACAAGATTTAGTGGATTTATTTGAAGAAAAACAGATATACACTGCTTTAGAGACTCAAGGAAGTAAATTCCAACCATGGATGAGACAAATTAACGATTTAACTATAAGTCCTAAACCACCAAGCTCTAACATGAAACCTAACATTGACATATTAGATAGTGTAATCGAACAATGCATTGAATCAACACTTAATTTAAAGGTTGTTATTTTTGATGATGATGATTACGAATTCGCTAAAATGATACATCATCGCTACCCAAACATTCCTTTTTACTTACAAGTCGGTAATCCCTACCTAGATGATGATGTTGACAACCATACAGAGAAACTTTTAAGTCGATATGAAGCATTAGTTGATAGAGTAATGGCTAGTAATGATATGAACCAAGTTTATGTTTTACCACAGTTGCATACGTTACTGTGGAGTAACAAAAAAGGTGTTTAATAATTACTTTATAAATGAAAAATATTTTTTAAGTGTTTTGAAATGATTAAGTTTGTTTTAATTGGTATAATGTTCTAATGAACTATGTGAGATAGGAGTACAGCATGATTATATATGTATTAATTAATATCGCCGTAGTGCTTGGTGTACTCGGCCTTGACTTATATAAGCACCAATTCAAACAGCTTAAATTTAGCTCCGTATTAATAGCAATAACGATTAACGCTTTAATTAATGCTATCGTCATCGACAAATTTAATTTTATAACATTATGCTCAATCGCTTTTTTTATATGTTGGTTGGGACTTCAATTTTACTTGAATCATCAACACTATACACTTGTAATTTACGAGTATAAATCGATTGCCTTGATATTTTCTATCATAATAAGTTGCTCATTATTTATTACCTATGGATCAAGTGATCAATCAATTTACATGTCTGTTCCATACTTAGCGCCAACAATATTCTTAATAGGTGCTAGTGCAATATTTTTAGGTACTTTCTCTAGAGGAGAGCTTGGAATTTTTAAATTTATAAAAAAGCTTAAATTTCCAATTACTATAGGCTATATGCTTATTATAATTTCGATTGTATTATTAACTATTTTGACGCCATTCTGGTATATCTTCTTAATCATCTATATTCTTTTAGGTATCTATCTAGCATGGCAACTTAAAAATACTAATTTAAAACATCATATAGAAAATAAATAAACGCTTGAAGTTTCATCATTTAAAACTTCAAGCGTTTATTTTGATTTTTATTAATGTACTTTTTCTTTCTCTTGCTCTACTACTTTGAGATCGTGCGTTGGTTCTTTTAAATTTGATGCTTGCACAATATATTTAGGTCGTTGCTTAACTTCATAGTAAATCCGTCCAATGTATTCACCTACTACACCAATAGAAATCAATTGAATTCCGCCAATAAGTAATACCGCAGCTATCGTTGTAAAATAACCAGGATTATTAATGCCATTGACCATTATACCTATCAGCAGATACAAGATATAAACGATACTTAAACTGAATATCGTCATTCCGAGATAAATCATCGCACGTAAAGGTTTATTATTAAATGAAATTAGCCCATCAATACCGTAATTTAATAATTTAGTGAATGTCCATTTAGAATGACCCGCTTCTCGTTCTACATTTTGATATGTAAAGATTTTAGTATTATAACCAATCCATTCAAATAAACCTTTTGAAAAGCGGTTATATTCTTTAAGAGAAGACATTGCTTTAACTGCACGTTGACTCAATAATCTAAAGTCACCGACACCATCTATGAATTCAATGTCTTCGACAAAGCTATTTATCAATTTATAATATAACTTAGTCATTGACTTACGGGCTATGTTCTCCCCTGTTCGATCTCGCTTAGCAATAACTTGGTCATACCCCTCTTGGAATCCTTCTATCATTTGTGGAATGAATTCTGGTGGATGTTGTAAATCTCCATCTACCATCACCACAGCATCACATTTCACACTATGCTGAAAACCAGCTATCATTGCTGATTCTTTACCAAAATTTCGGCTGAAAGAAATATATTTAACATGTTGATCTAAGCTTGCTAAATGTTGAACATGGTCGATTGTGTTATCTTTACTACCATCGTCGACAAATAAAAGGTCATAATCATACCCTTTGTCCAAGCTATCTTCCATCAAAATTTCAGTCAATTTGTCGTAAGTTTTTGTTACGACTTCACCTTCGTTAAAACAAGGCACAATGACTCTGATTTTCATTAAATTACATCCTTTTCATCATTCTTAGTACTATTTTATCAATAAAATAAATAACTATTCTACTAAAAACTATGCAATTAACAAATAATTAATAAAAATTAAATAAAAAATATACAATCATTCTATAATTTTCAATGTCTGATTTCATTTAATAGAAACGGCTCTATAATAAATTGGACTGATGACTAAAAATCATCAGTCCAATTTTTATGTTTGAATACAAAAATGGCGCAATTACCTCTATAATTATTAGCTACCAAACAAAATAAAAAGAAAGGTAATGCGCCTATGTGTAAGTCTATATTAAATACATTAAGAATTAAAGATAAAAATCTAAATTTTTCAGATGAAGTGATTGAGAAAAAACATAAAGGACGAATGAGCTTGTTTTACTATGCCGAGCTCACTTATCAACCTACACATTGTGAAAATTGTTCAACTAAAAATGAAAATTTCTCAATAGTAAAAAATGGTAAGAAAACCTCAACGATTACTTTACTTAAAATTATGGAAATGCCCGCTTATTTAGAACTTCAAAAACAAAGATTTTATTGTAAATCATGTGACAGTCATTTTACTGCTAAATCTAATATTGTCGACGCTCATTGCTTTATTTCTAATAAAACAAAACTTGCAGTTTTAGATAAAGCACAAGAATACCGCTCTCAAAAATCTATCGCTAAGTCATGCTTAGTATCATCAATGACTGTGTCTAGAGTGATTAATCAAGCGGCAAGCGACGTAGGTCAGTCTTCTTTTGATGCTTTACCTGAACACTTAATGATGGACGAATTTAAAAGTGTTAAAAATGTAATCGGAAAAATGAGTTTTATTTATGCAGATGCTGTATCGCACCGCATCGTAGATGTGGTAGCGGATCGTAAGTTAAAATCGCTAAAAGATCATTTTTATCGCTATTCTTTGAAACTCAGACAAAAAGTCAAAACAGTCACGATTGATATGTATGAACCATATATGTCACTAATCAAACAATTATTTCCTAACGCGAAGATTATTATTGATCGTTTTCATATTGTTCAATCTTTAAATCGAGCGTTAAATATGTCTAGAGTTCATGTAATGAATTGTTATAGAACCTCTAATAGACCCCTCTATAATAAATATAAAAGTTATTGGAAACTATTTCTTAAACCTTTTGAAACGCTAGAAGCTTTTAATTATCATAAAGTCCATTTATTTAAAGAGTGGAAAACCGAAAAAGGCATTATAAATTACTTATTAGGTGTAGATGTAGAACTATTTAATACATACCACTACGTTCATGAGCTAAGAAGATTATTAAAAGAAAATCAAATAGAGAAATTTAATCATAAACTCTTTTCTATTCATCTTTCAGATGTGTGTCCTAAATTACGCCCAGTCATTAGAACTTTAAGACGATTAGCAGCTTTCATTGAAAATACTATGACATATTCTAACCTGACCAACGGTCCGTTAGAAGGAATTAATAATAAAATCAAACTCATTAAAAGGGTATCTTTTGGTTATAGAAATTATGATAATTTACGTAATCGAATTATTATAACTTCGCGACTATTTGCGTCAACAACAAAAAAAGAGATTAAACAACCTAAGGTTGCTTAATCTCAATATTTGGACTCATCAGTCCGATTTGACGTAGAGCCATAGAAACCAATTTATTTCAAATCACCTATACTCACTTCATCGGGATCTTTACCTTGACGCGCATTGCGATTTAAACTATCTATTTCAGCTATTTCTGTTAGTTCTAGGTTGAAATCAAATATATCATGATTTTCTCTTATACGTGATGGTGTTTTAGATTTTGGAATTACAACACGATTATGTGCCACGTGCCAACGTAATACGATTTGCGCTGGTGTTTTATCATACGCTTTTGCTAGTTTTGTTATAGTAGGATCGTCTAACAATCCTCTGTTTCTCATTAATGGCATCCATGCAGTAACAACTATATCATGCTTATCACAGAAATCTTGGACTTCTTGTTGATTAAAGTAAGGATGTACTTCAATTTGATTAACTTGAGGTACAATATTAGTTTCACGCATTAATTTTTCTAAGTGATGTACTTTGAAGTTACATACTCCAATTGCTTTTATTTTACCTTCTTCATATAATTTTTCTAATGCCTTATATGTTTCAATATAAAGTTCATTTTTTTCGCAAGGCCAGTGAATTAAATATAAATCGATATATTCTAAACCTAAATTGTTTAATGAGCGATTAAAATACTCAAGCGTACTATCATAACCTTGATGGTCGTTCCATAGTTTAGTTGTAATAAACAAGTCTTCTCGAGGCACTCCACTATTTTTTAGTGCTTTACCGAGTGCTTCTTCATTATTATAAAAATATGCTGTATCAAATGCACGATAACCATCATCTAATGCAGCTTGAATCGCTGTTTCCATTTCTTCATCTGTAACCTTATAGACACCTAAGCCAAGTCTCGGCATCGGATAACCATTGTTTAAAATTTGTGTGTCATTTACCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP024809|2151267:2159415|2152396_2152990_-|AUV68111.1|DBSCAN-SWA MIIVIDNKDSFTYNLIDYFKTETDKEIVVYEVDDVSVDLLRSSNVEAIVISPGPGKPSDYPILTEIMNQFEGEIPILGVCLGFQFIYEYYGGTIIHGLKPVHGHTTTLTHRGTGLFKGLPKSFEVMRYHSLIADKNHIPTVLNMTAYNEEGIIMAFEHNQYPIYGVQYHPESILSEYGHEQIRLFLEKVRIDYEHRI >CP024809|2151267:2159415|2157205_2158522_+|AUV68117.1|transposase|DBSCAN-SWA MCKSILNTLRIKDKNLNFSDEVIEKKHKGRMSLFYYAELTYQPTHCENCSTKNENFSIVKNGKKTSTITLLKIMEMPAYLELQKQRFYCKSCDSHFTAKSNIVDAHCFISNKTKLAVLDKAQEYRSQKSIAKSCLVSSMTVSRVINQAASDVGQSSFDALPEHLMMDEFKSVKNVIGKMSFIYADAVSHRIVDVVADRKLKSLKDHFYRYSLKLRQKVKTVTIDMYEPYMSLIKQLFPNAKIIIDRFHIVQSLNRALNMSRVHVMNCYRTSNRPLYNKYKSYWKLFLKPFETLEAFNYHKVHLFKEWKTEKGIINYLLGVDVELFNTYHYVHELRRLLKENQIEKFNHKLFSIHLSDVCPKLRPVIRTLRRLAAFIENTMTYSNLTNGPLEGINNKIKLIKRVSFGYRNYDNLRNRIIITSRLFASTTKKEIKQPKVA >CP024809|2151267:2159415|2154025_2154445_+|AUV68113.1|DBSCAN-SWA MIQQLYPSVAHPYSFELNKDFNFSAAHYIPSEDAGKCMRTHGHTYFVNLTIAGDKLDHNGFLINFSDLKKLIHDQFDHYLLNDLPQFKDKSPSTEVVAQTIYKMVQTHLQNCDNQPECVQVYLRETPTSYVVYRPKEYK >CP024809|2151267:2159415|2158575_2159415_-|AUV68118.1|DBSCAN-SWA MVNDTQILNNGYPMPRLGLGVYKVTDEEMETAIQAALDDGYRAFDTAYFYNNEEALGKALKNSGVPREDLFITTKLWNDHQGYDSTLEYFNRSLNNLGLEYIDLYLIHWPCEKNELYIETYKALEKLYEEGKIKAIGVCNFKVHHLEKLMRETNIVPQVNQIEVHPYFNQQEVQDFCDKHDIVVTAWMPLMRNRGLLDDPTITKLAKAYDKTPAQIVLRWHVAHNRVVIPKSKTPSRIRENHDIFDFNLELTEIAEIDSLNRNARQGKDPDEVSIGDLK >CP024809|2151267:2159415|2155927_2156917_-|AUV68116.1|DBSCAN-SWA MKIRVIVPCFNEGEVVTKTYDKLTEILMEDSLDKGYDYDLLFVDDGSKDNTIDHVQHLASLDQHVKYISFSRNFGKESAMIAGFQHSVKCDAVVMVDGDLQHPPEFIPQMIEGFQEGYDQVIAKRDRTGENIARKSMTKLYYKLINSFVEDIEFIDGVGDFRLLSQRAVKAMSSLKEYNRFSKGLFEWIGYNTKIFTYQNVEREAGHSKWTFTKLLNYGIDGLISFNNKPLRAMIYLGMTIFSLSIVYILYLLIGIMVNGINNPGYFTTIAAVLLIGGIQLISIGVVGEYIGRIYYEVKQRPKYIVQASNLKEPTHDLKVVEQEKEKVH >CP024809|2151267:2159415|2155265_2155877_+|AUV68115.1|DBSCAN-SWA MIIYVLINIAVVLGVLGLDLYKHQFKQLKFSSVLIAITINALINAIVIDKFNFITLCSIAFFICWLGLQFYLNHQHYTLVIYEYKSIALIFSIIISCSLFITYGSSDQSIYMSVPYLAPTIFLIGASAIFLGTFSRGELGIFKFIKKLKFPITIGYMLIIISIVLLTILTPFWYIFLIIYILLGIYLAWQLKNTNLKHHIENK >CP024809|2151267:2159415|2153352_2154024_+|AUV68112.1|DBSCAN-SWA MTNQNLNKDKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKDVELVTFNYGQRHDAEIEVATRIAKEQNLKHHILDMSLLSQLTPNALTQHDMDIETGEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQRNTKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLSMDKDFVIHTPLMWLDKAQTWELSDELGVLDYIRHNTLTCYNGVIGDGCGECPACQLRQRGLQHYLEAKGAN >CP024809|2151267:2159415|2151267_2152413_-|AUV68110.1|DBSCAN-SWA MNIAFNYRYYTTPDHFETIALNFDTYVSKKVAYTLNDIGAVVRFAQDEQSNGRYVALYLTYEAAKFFNQEMATHELDNNQVIALAYSFNPNMAKHPSNNLSQSYIPKHQFRFLESDAEMQDKIKQVQDAITDGETYQVNYTTRLVSDIHYPISDLYYYLTQTNNGGYTALLDVEEIKVASISPELFFQKGAFNNQENVVVSKPMKGTMPRSINKDEDLMNYEILKNSLKDRAENVMIVDLLRNDISRISKPGTIHVNKPFFIESYKTVYQMTSMVSGRLEAETSLTDILKALFPCGSITGAPKLNTMSYIKALEANPRYIYCGTIGLLCPDDKMIFNIPIRTLEYRNEKVHYGVGAGITIDSIPEKEVQEFRDKTKILEML >CP024809|2151267:2159415|2154444_2155161_+|AUV68114.1|DBSCAN-SWA MAAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKEDIKLMTAEEIYNQLKKIGGDRFDHVTISGGNPALIKGIQDLVDLFEEKQIYTALETQGSKFQPWMRQINDLTISPKPPSSNMKPNIDILDSVIEQCIESTLNLKVVIFDDDDYEFAKMIHHRYPNIPFYLQVGNPYLDDDVDNHTEKLLSRYEALVDRVMASNDMNQVYVLPQLHTLLWSNKKGV |
9 | Pandoravirus(12.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2222018 : 2273299
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP024809|2222018:2273299|DBSCAN-SWA CATGACCCAAGTACATTTTACACTGAAAAGCGAAGAGATTCAAAGCATTATTGAATATTCTGTAAAGGATGACGTTTCTAAAAATATTTTAACAACGGTATTTAATCAACTAATGGAAAATCAACGAACAGAATATATTCAAGCAAAAGAATATGAACGAACAGAAAACCGACAAAGTCAACGAAATGGCTATTATGAGCGCAGCTTTACGACACGTGTAGGCACGCTAGAATTAAAAGTACCCAGAACACGTGATGGCCATTTTTCACCCACAGTGTTTGAACGTTATCAACGAAACGAAAAAGCCCTCATGGCTTCAATGTTGGAAATGTATGTATCAGGCGTTTCAACTCGTAAAGTATCAAAAATTGTGGAAGAACTTTGTGGTAAATCCGTCTCTAAGTCCTTCGTTTCTAGCTTAACAGAACAGCTAGAACCTATGGTTAACGAGTGGCAGAATCGTTTATTATCAGAAAAAAATTATCCTTACTTAATGACCGATGTACTCTATATAAAAGTACGAGAAGAAAATCGAGTACTCTCAAAAAGCTGTCATATAGCGATTGGAATAACCAAAGATGGCGACCGTGAAATTATCGGCTTCATGATTCAAAGTGGCGAAAGCGAAGAGACCTGGACAACATTTTTTGAATACCTAAAAGAACGCGGTTTACAAGGTACGGAACTCGTTATTTCTGATGCGCACAAAGGATTAGTCTCTGCCATTAGAAAATCCTTCACCAACGTAAGTTGGCAAAGATGCCAAGTTCACTTCCTAAGAAATATCTTTACCACCATTCCTAAAAAAAATTCAAAATCTTTCAGAGAAGCTGTTAAAGGAATTTTTAAGTTCACAGATATTAACTTAGCGCGTGAGGCTAAAAATCGATTGATTCATGATTATATCGATCAACCAAAATATTCAAAAGCTTGCGCATCATTGGATGATGGATTCGAAGACGCCTTTCAATATACCGTACAAGGAAATTCCCACAATCGACTAAAGAGTACCAATCTAATTGAACGACTGAATCAAGAAGTACGCAGAAGAGAAAAGATTATTCGCATCTTCCCCAATCAAACATCAGCCAATCGCTTAATTGGAGCCGTTCTTATGGACCTACATGATGAATGGATTTATTCTTCAAGAAAATACATCAATTTTGATAAGTAGAAATGGTAAAAACATTGTATAGCATTTTACACAGGAGTCTGGACTTGACTTATCAAATTTATATGATAAAATATTTTAGTTGAAATTTTGAAAAAGGAAAGATAAGAATGAAACGAAGCTTAATAATTACCTTTGCTCTACTTTTAACCATTGTTATTATAGCACCTAACTCCTACGCTTCCGAATATGAACCAACACCTACTGAAATTGCTAGACAATATGGTTACCCGAATGTAACAGATGCCTATCAACCTGAAGGTAGCATAAATGTAAGTCAAACCGGGCAAATTTTGTACGACTATCAATCTAACCAAAAATGGTACCCCGCTTCAATGACGAAGCTAATGACAATGTATCTTACACTTGAAGCCGTGAATAAAGGTGAGCTTTCTTTAAATGACAAAGTACATATTACGGACAAGCATTATCGCATGTCAACTTTACCAGAATTAAGTAATACGAAATTATATGCTGGTGAAACATATACAATTAGCGAGCTACTCCAAATTACAGTTTCTAACTCAAGTAACGCTGCAGCTTTAATTTTAGCTGATGAGGTTTCGGGAAATGTGAATGATTTTACTGATTTAATGAATAAGAAAGCTAAAGCATTAGGCATGTCAAACACCCATTTCGTAAACCCAACAGGTGCTGAAAACAAGCAATTAAAAGAATTTGCGCCATCAAAATATAAAAACCAAGACAATACTACTTCCACTGCGAAAGACTTTGCAATTCTAGATCACCATGTCATCAAAGAGACTCCTAAGATATTACATTTCACTAAACAACTTGCTCCTACACAACACGGTGTCACATATTATACATTCAATCATTCATTAGAAGGAGCCAAAATGAGTTTGCTAGGTACAGATGGTTTAAAGACTGGCTCAAGTGATGTTGCAGATTATAATCACACGATTACAACTAAACGTAACAACTTCCGCATTAACCAAGTTATTATGGGAGCAGGAGATTACGTGAATTTAGGTGGAGAAAAGCAACGTAATATGATGGGAAATGCCATGATGAATCGTTCTTTCGATCAATACAGTTATAAAAAGGTACTTTCAAAAGGCACACATAAAATCAATGGCAAAAAATACTATGTCAAAGATAACTTATATGATGTAGTACCTAAAGGTATGAATAAAAAAGATTATAAATTCATCGTTAAAGATGGTTCAATACATCTTGACTACAATCGCCAATTTCTTACAAAAGATGATGGACCTCCAAAAGTTGAAGTAACGAAACCTCTATTGCACAAAGCAAATACCATTGCTCAAACGACGTGGAAAGAGCATCCAGTGGTTACCTTTGTCGCATTAGCCTTATTAGCAATTGCATTTATACTTATGGTACGTTCAATTATTCATTTATTATTTAAACGTAAATAAAGTGATTGATAACTCTTTAGCTATATAGTAACAATATCTTTTACTTTCAGTATTAATATAAGGAACCTAAGTGCTATGTCACTTAGGTAAGAAATTCTAAAATGTAAAACAATTAAGAATTTCTTTAAAGAACTGCTATAGAGACGTCACCTCAGGAACGCGAAACAACTTAAGTTAAACAAAGAAGCCAGCAAATGAATTCAAAAAGTTCATTTGCTGGCTCTTTTAATAGGATTAAGACCTTATATTTTTAATTATTTAGCGTCTTTGCCATATAATTCTTGTTTAATCTTAGTTGTTGAAATACCTTCAGTACGTTTTAAGTATACGACTTCACATTTATCTTTTAAGAAGTCGAATTCACCTTCCCAGTCATGTCCCATTACAAAGACATCTACCTCAAAGCGATCCACGTCGATTTCTTTTTGACCCCAATCATTCTCAGGAATAACTAAATCAACATAACGAATTGATTCTAACATCATTTTACGTTGTTCATAATCATAATATGACTTTTTATTCTTAATTTGATTGAATTCATCTGAAGATAAAGCAACAATTAAATAATCGCCCATTTCACGCGCTCTTCTTAGTAATTCAATATGACCATAGTGTAATAAGTCATAAGTACCATAAGTAATAACTCTTCTCATAAACGCTATCTCCTTAACATAGTTTTTAACATTTTTTCATAATCTTAATTTAGCATAAATAAAATTTACATACCATTAATTTTATAAGTTATACTACACTATCTCTTTAAAGTACGCTTAACTAACTGTTTACTGCTAAATGCAAATTTTTTGGGCATAACTTGTGCTTGAAAACGAAAGTATCCTGGTCTTCCAATACCAACATCGATAAGCGTTTGACGCCACTTCTCGTAAGTGTCACGTGTCCAATTTGTTGCACCTTGCTCAACTGCTTGAATGATTCTAAACAACGCATCGCCTGAGTAGTTCGTATGTTGCATATCTTTAATGTAATGCGTGACCTTATCAATAAATTTAGGTGTAACTTTACTACATTTTAATAAATAAGCTTGAATAAGATAACTAACAATTAAATCATCCATTCGATAACTATAGTATGCTTTCTCATTTGTTAAAAGTAGCATTTCCATGACGCGCTGACGTACTCGTCGAGCATCTTCAATATAAGATATAAATGTATCAGCTCGTTTATCTGTGATTGAACCTTCTTGCTCATTATAGCCATATATAATGAGTGGTAGTAATTGGATATCGCGTGCTGTTAAATAAGCTCGTGTGACAAAGGTATGCTCTTCACAAAACACAACGTCTTCATCAAAACGTAATGCACTAAATTTAGAATTAAATAATTTTCCACCAGGCCCAATAGATTGTAAAATTTCAGGCGCTTCAGCTAAAGATACTAGTGATTCACGATTTATTTCCTCATGGGTCGGTATAATTTTCCAATCTCCTTGGACACCTCTACCAATTTGACCAATGACGATATCAACCTCTTGATTACGTTCATAGTAATCTATCATCTTATCTAGTCTACCCGGTAAAAATTGATCATCTGCATCTAAAAACATAAATGCTTCAACATCATCAGACATTGCAGCTAATCCAAAATTTCTACTTGCTGCTGCACCTTGATTATCTTGATTGTAAATCATGATATTTTTAACTTCTTTTTGTAATTGAGTGAGCTCATGTCTTGAATGGTCTGTAGAACCATCATTTACGCAAATGATTTCAACCTCATGTGTTGTATCGATAGATTTGATTGCTCTACGTATTGTCTTTTCTGCATTATATACAGGTATTATGATAGCTATTTTCATCTTTTCACCATCTTTTCAATAAATTCTGTAACGCGTCGAACACTATCTTCACGATTATACTTATGCCAATTTTTAAATAAAGGTTTGAACAAGGCAATATCATTTCTTATTTTTAAAATTAATTCTTCTTCTGTTGTTACTTTATATTGTTGTGGAATTGCTTTATAAAATTGGTTTAAGCCACGAATTTTATCATATTTATGCTCGTCGTACACATAAAATAATGTTGGTTTGTCTAATAAACTCGCCTCAATAGGTAATGAACTATAGTCACTAATAATCACATCCGCCATAATCATCAATTCTTGTGTAGTGGCTATAGATTGACTTTTTGAAATAGATGGATGTAATTGATTAATCAATGTGTACTCGGGTAGCGCTTCTTCAAAGCGAGCAACATCTATTTGTCTATTATTTTCAGAACCTTCACGATAAGTGGGAACATAGACCACCAATTTTTTATGAATATTATAATGCTTTTTCAAACGTTCTTGCTCGGCCTTAAGATTGAATTTTAAATATTGTGATAGACGTGGTAAACCGAGTGGCAATAATTGATCTTCAGTAGCTTCAAATGACTCTTTAAAACATGTCCCCATCTCTTTACCAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP024809|2222018:2273299|2245496_2245718_+|AUV68200.1|DBSCAN-SWA MSKTLELAFKTNLNKTAKLQFPQVNVAVSEADAKAAMDNIIKLNILQPTAGTPIKATSAKLIDVTSTTLFETK >CP024809|2222018:2273299|2233747_2235790_-|AUV68187.1|DBSCAN-SWA MEIFETILIFLAVVIVSSFVHTFLPKVPLAFIQIALGMLLFLTPVPVEFNFDSELFMVATIAPLLFVEGVNVSRAHLRRYIKPVMLMALGLVITTVIGVGLFIHWIWPTLPIGAAFAVAAILCPTDAVAVQAITKGKVLPKGAMTILEGESLLNDAAGIISFKIAVGVLITGSFSLFEAVQQFLIASIGGAIIGLLIGIALVRFRLTLTRRGIENINMFTFLQLLTPFVTYLVAEMFHASGIIAAVVAGLVHGFERDRIAQTRTRLQMSYNHTWNILGYALNGFVFSILGFLVPEVIGNIVKTEPHNLLFLVVITALVALAVYLFRFIWVYVLYPLFYLSVSPFQKLMNEEGEDKKKEKPPKRSMYALIMTLCGVHGTISLAIALTLPYFLADHHAFTYRNDLLFISSGMVIISLVIAQVVLPFVTSSAPKAKIGSMNFKEARIYILEHVIDYLNHHSSFETSYRYGNVIKEYHDKLTFLKSVEKDDENSKELERLQSLAFKVETKTLERLADDGEITASVLENYMRYAERTQVYRQASLIRRMIVGARAVLLKRRIRTRTNAASSLSVTDNLMELSKINKIVHYNVVSRLVDEANEDNKLEVGMICDGYLMRIDNLSPSNFFNTRAEDSITKIKLNALREQRRVLSSLTDDGEITESTALKLREAINYDEMVIVDSLTD >CP024809|2222018:2273299|2236169_2237411_+|AUV68188.1|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(42.86%) | tRNA,transposase,integrase | attL 2221918:2221977|attR 2269618:2270941 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2497518 : 2542604
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP024809|2497518:2542604|DBSCAN-SWA 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MWENKFAKESLTFDDVLLIPAASDVLPNDADLSVELSERIKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGIEEQAEEVQKVKRSENGVITNPFYLTPDESVYEAEALMGKYRISGVPIVSDKESRELVGILTNRDLRFIEDFSIKISDVMTKENLITAPVGTTLDEAETILQEHKIEKLPLVENGRLEGLITIKDIEKVLEFPHAAKDAHGRLLAAAAIGTSKDTEIRAQKLVEAGVDALIIDTAHGHSSGVIQEVKKMKEKYPEITIVAGNVATAEATRALFEAGADVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKFGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEVFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKTPRKFVPEGIEGRTAYKGPLQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSPDLKTLRDEAQFTRMGPAGLAESHPHNVQITKESPNYSF |
47 | Staphylococcus_phage(26.32%) | transposase,integrase,terminase | attL 2501587:2501646|attR 2545823:2546612 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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