Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP025992 | Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain LB1-2 plasmid pLB1-2A, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP025991 | Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain LB1-2 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 0 | 0 | 11 | 0 |
CP025994 | Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain LB1-2 plasmid pLB1-2C, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP025993 | Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain LB1-2 plasmid pLB1-2B, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP025991_1 | 2815886-2815971 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP025991_1
|
1 spacers
spacers of CP025991_1
>1.1|2815909|40|CP025991|CRISPRCasFinder TTGACTTTTTCTTTATATAGCGTATTATACCAGTTATGCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP025991_1
The CRISPR arrays of CP025991_1 >merge|CP025991|1|2815886-2815971|CRISPRCasFinder AATAAGATACTTTAAGTTTCTTATTGACTTTTTCTTTATATAGCGTATTATACCAGTTATGCGAATAAGACACTTTAAGTTTCTTA >CP025991|1|1|2815886-2815971|CRISPRCasFinder AATAAGATACTTTAAGTTTCTTA TTGACTTTTTCTTTATATAGCGTATTATACCAGTTATGCG AATAAGACACTTTAAGTTTCTTA
>CP025991.1|AUV73515.1|2815268_2815868_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MTKTRRRGAELENAIYQAARDILNQDGLEQLTFANVAEQAGTSKPVIYRRWRSPLELAIAAIQDQIITENHGQLDEVSLTGQTLSEDLFQVLKRFTVSINTFNQALVITWFHHLDQQANPEVKDLLNAVKKIDAHAIERVCQRAQQRGELRTGTLSCDLQLMPFDWLRYRAFANEPITDATLHLLVDDLLVPAYQHALG >CP025991.1|AUV73514.1|2814218_2815148_+|ferrichrome-ABC-transporter-substrate-binding-protein MTKRWQIVKLGLVLGLMGSLLLGACGAKQPTSTTVTRTDYLKHKVKVPKHPKRIVASYLEDDLVALGIKPVVQWSVKNGSGTQAYLKEQLKGVPLIDYSLPYEAVTKAKPDLILIGTSSAVANGKYAQYNKIAPTYVVKNGTTVTWRQTFLDVAKVVNRQAKAKKVLAKYDKQVQTTRQALKKSGQHKVAVLWVTNNTAYMVNDNSASGALLYQDLQLGEPSLVKQVSKSATADWSAVSLEKLAKLDADDIFLVNSQKSASLFKDPLWKNIKAVKNNHLYQYGDSSSWQYSGPIAYSQMIDMVKTDLLK >CP025991.1|AUV73513.1|2813187_2813982_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNTIEAQNISIGYGDKVIVDQLSITIPHGQITTLIGPNGSGKSTLIRAIAHLLPPTTGVILLDHQNIQQIKSKTFAKKIAVLPQTNQTANDLTVEELVSFGRLPYRRPLSGLTTTDHQKIEWALTQASLQDLRQRPLSTLSGGQRQRAWIAMAVAQDTDTIILDEPTTYLDLTHQLEVMQLVKKLNEQAHRTIIMALHDLNHAARISDQLIALKDGHVLAHGPVSTVMTAANLKTIFNIDATLVDYHGTPLILTYNGCQEVAPA >CP025991.1|AUV73512.1|2812192_2813191_-|iron-ABC-transporter-permease MKSTSRYWGWLALSTGVLILVMGLSLRFGADQMRTATVWHALTTTHTGNLDQQIIRHIRVPRVLGAALIGAALAGSGALMQAVTRNPLADSGLLGINAGAGLMLTLCLAFFPKLSTLQTTGWAIIGAAASAGLIFSISTARHVQLDPTILVLAGIAISSLLTALSEGLALVLQLKQDLAFWYFGGLGAVSWTQLKFLGPGLVLGLLLTLLLAPQLNLAYLTDDNAQSLGKSLPLLRGLALICAVILSGISVALVGTITFVGLMIPHMARWLVGANYRNSMPLTLILGATLTVGADLIARLVNPPHETPFGIIISLIGVPCFIYLARKEPMKA >CP025991.1|AUV73511.1|2811200_2812196_-|iron-ABC-transporter-permease MSPNRRLIIWSLLLTASMLGLAILNLSTGTMTISWPALLGILTSRGNATDMLVLVNFRLPRIVLAIMVGWALALSGNVLQTVTNNPMADPSLLGINNGAGLAVMLLIIGAGTNASLTLSLPIVALAGAWLSTALIFLLANQRQRGISSKRLLLVGVALSGCFSALMVLMTLKLSPDNYQFVMNWLAGSLWGTDWSYIGWALPWLAVGSGILFIQLPVLDAFTLGTTTAQTLGINLKRQQLGLISVAAMLAGVSVAISGGISFIGLITPNLARRIVGSRQRYQLPLAGLLGSTLLLAADTLGKLITTTTELPAGVLVALIGAPYFIYLLVRG >CP025991.1|AUV73510.1|2810444_2810957_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MANQRNQRMQATILLAYENLLSDKPFRKITVQDISDAALVHRSTFYKHFQDQYDLLEALFEQKRQQSKLTIDQIFTHPFETLNSFGNARFQETLRHQFNDDAFRDAFLNYLIHLCKDTVDDDQRLVRFLAVGRIKGLTLWITVGNAPYNIFTDTATLDNIFSNPLNTVNY >CP025991.1|AUV73509.1|2809570_2810464_+|short-chain-dehydrogenase MKVFITGGTGFVGSAVVQELVANGFEVVGLARSETSAQKLISWGAQPVRGSLTSLSTLATAAAQADAIIHLGFNNDFRHFFQAGAMDRRAIETMGRAISGTNKPLVVTYGTTGIRKHVETEHEVADTGLLKWLTPRKSEIVARQLMAQNINAFVVRLSPAVHGAGDMGFTRTVIERAKKSHRAEYFGLGTHAWSAVHRLDAAHLFYLVTMYGLEHPTTNERVFNAVAEESITIAAIARTISRKLNVPLKAKYNPLSFGDTAMLYLINCPTSSQLTRQILGWVPVQPDLLTDISSSRY >CP025991.1|AUV73508.1|2808530_2809277_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MSIKGKVVVITGASSGIGAATAKLLAAKGAKVVLGARREERLQALSQAIGDNAVYQVTDVTDRQQVRALIDLAVSKFGRVDVLYNNAGTMPQGNLSDREYDKWQMMLNVNIMGVLNGIGEVLPIMQKQHDGLIIATDSVAGHVVYPASAVYNGTKYAVRAIMEGLRQEEKEHGIRSTIVSPGAVRTELVNTIGNTQIQAGISELMNADDRQGLALNPEDIANAVLFAIDQPKHVAISEVLVRPAQQEV >CP025991.1|AUV73507.1|2808007_2808514_+|acetyltransferase MQTIQPIVDANQRRIQALNVTREPSEIRERLAEITGQTIDISVEIRVPLWTDYGRNLKIGKRVFINDNVQITDLGGIKLADDVLIGPGAMLLSVNHPLDPAKRHAVEVQPIHIERNAWIGAGAKVLAGVTVGENAVVGAGAVVTKSVPANTVVAGVPAKVIKTIEQVD >CP025991.1|AUV73506.1|2806912_2807749_-|short-chain-dehydrogenase MQSKLAVIIGGTSGVGKHTAIDLANQNYHVIIVGSRADKGRQAQADISQATGNQAVQLALADLSTKTGVQQFAHQLAAMTDHIDILLNSIGVILPERHLSADGYDLNLVLNYLTHFWTIQALLPLLKHSDQARILLVGALPFVINHAKVSLPDFDAPATSKYNAMTVTAQATAARVLLTLALSERLTATNVTINIFHPGYVPDSNFGAGGSWVSRLAGRILGESFSRKNSPIGAWLATAPELTHTSGHFYDDRLRQVRLSKQYTRSKANDLWRLSSQY >CP025991.1|AUV73516.1|2815985_2817464_+|MFS-transporter MQAKAKISKATMTIAWVVVFGAMAPLLDSTMINIAINNLVTSFHSSVTTVQWAVTGYLLATGVAVPFSSWLLNRFDGKAVFVAGEILFGLGSIFAAVAPNIQLLIIARLVQGFAGGLIMPLLTTLLVQTAGAAVMGQMMATVGLPMILGPLIGPVIGGIIIKFASWHWIFWINVPVVLISIALILWKMPNYPAQNRTAKMDFIGILLLIVSSSAIIYSLVNAAHTDRFNNATSIEMLILGAIALISYVVWAAWQKERAVVPLHLFKFASFDGAGLGLFIAGTVLNGAMLLLPLYFQNVRGMSVINAALALLPQGAGMLVSRTLTGRLTDQIGAKYVVLGSVVITFVGTLPFYWFGQQTSYWILALILFVRGIGAGGILMPLMADAYTGMQPGQVPAATIGTRIIQNIGSAFGSALITTIVTAYSTHQVNVFERHLKAETYHVDAAHLQVFTTSHLQAIRLAAFQQGFLVIAIAAIVIILPTLLLTNKLKAAK >CP025991.1|AUV73517.1|2817580_2818534_+|aldo/keto-reductase MKTIQIGASQLKASAVALGIMRMVRLDTDAAANVLETVHDRGVNFIDSADIYGNGDSERIFGQALKQSSLKREDFFIQSKGGIVLDPEKSSGELVFGQRYDFSKQHLIATVDKILQRMQLDYLDSFLLHRPDPLMDPAEVAAAFDELQATGKVRHFGVSNFNPMQVEMLQAAVSQKLMINQLQFGVMHTGPIQFGLHTNMQDTASLNHDGEIIEYSRLHHMTIQAWSPYQYGMFAGTFIDNPKFPELNAKLQELADQYHVTKNAIATAWILRHPANMQVILGSMNPQHLDESIAGTDVTLTRQEWYDVYFAAGNDLP >CP025991.1|AUV73518.1|2818753_2819320_+|DUF1211-domain-containing-protein MNKARLEAFTDAIIAIVLTLLVLDLPRPQTPSVRALFAEWQSIYVYIITFTLLISIWLNHHDLFVQVKKIDRVVFWANSFWLLCQSFIPFMASWITKFPHSKWPAVFYILTGFVWMLAYQLLVAAVRRLNPHIHRMSSPALSVVFGGFLVVLTVALINPDVGLFLIPVHAFASVILATKRKWHLRKYF >CP025991.1|AUV73519.1|2819468_2820506_-|aldehyde-reductase MQKQLVVVTGGSGFIAIHIIRQLLQQGYAVRTTVRSLAKAPVIKEMLTNGGITDLSALEIVVADLAHDEHWSEAMAGATYAIDVASPTPKLNFKNKAEMIRPAVDGVRRVLTASRDAGVKRVVLTSAYGAIFAGHKNRTTPYTEADWSDLNWKAIHPYQESKTRAELAAWDFINHEGRGLELTTVNPVAVMGPVLSAKYSHSNIQIQQFLEGQVKAVPNVDSGYVDVRDVASLHLLAMTAPQANGERFLATTGETLSMLDVANVLRQAFPAFASQLPTKTIPNAAVKLAAKARPELRMVASLVGTYAETSNHKAQTLLDWHPRPAAESIIATAQSMIDLGIVTKP >CP025991.1|AUV73520.1|2820632_2821199_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAATNHAQAIKKDSQTYLTTALLQLLRTHDLDTITVTQVVKRAGVSRMAFYRNFTTLEDLLTAYFAPAIAARFQDVLQHVPANRKLLAMGQFFSDFAPTLRLAEQRGFENIIQQLFNANMTNYYQATMTNGMLTAVQLKYWTRFMSAGVYAIWREWLLGGQLESLTTIHEILATLQTATMQALTQAQK >CP025991.1|AUV73521.1|2821357_2822086_-|oxidoreductase MKPLVVITGASSGFGAEIAKLFAADNYPLLLLGRRQAKLAALSANFENAMIDTVDVTNYHQFETAVRKAEAKYGKTDLLVNNAGLMLLGNVQNQDPQEWQTMLNTNVMGVLNGTQIVLNDMRDREHGTILNMSSLAGKKTFVNHAAYVASKFGVHGLSETLREENAPKNVRVMLVAPGAAETELLPHVTSKSALSDYEAWKASMGGLTLDPKHVAATVKFMYDMPQNVNIREVDIAATAQDA >CP025991.1|AUV73522.1|2822218_2822584_+|transcriptional-regulator MLKERVTAQPRYRNEFDATMQLIRGKWKIMILFELAEVKVSRFADLQHHIQAVSHKTLASQLKELEQDELIERHDFKTAQPHVEYRLTAKGQSLIPILDAICTWGDQHVDPALIERSLCDE >CP025991.1|AUV73523.1|2822867_2823152_-|DUF1905-domain-containing-protein MKTYQFDAPIQAATIGKGGAYVACPFDIRDLFGKGRVKVHATFDEVPYNGSIVNMGVKNLDGSICYILGIRKDIRAKLHKSIGGVVAVTVTAID >CP025991.1|AUV73524.1|2823437_2826020_+|glycoside-hydrolase-family-25 MNFKSQNPIDASQSERFKLYKSGKLWLVAGLTFFSFLGGSVLNNTNVHADATNATTTSSSAASTASSASVATSSAASDATTKATSVSSSAATQVTSAATTKTTSQAATASSSAATSQSTSTASSSTSQATKTASSAATSTSATATSQATSVASSTATTTQVSHTASSTAASAASSTATVKAVKAASSTVSSAATTATKATAKVAAVAYTAATTSSTDVWTIGDTTRPRVDVVDVASYQSTMTQSDFNKLKAAGVKTVIVKSTEGTDYTNPAALNQAKMANKAGLNVDFYHYATFSTADAAKSEATNMAGFLVKNNVSTKVLLFADMEDSSSYSVNATANLNAFWSTLDSFGYKNHGVYTSNSYLYRDAVVKTVGQSRVWRAQYPYTPSANNLWNTNDGAWQFSDTALLPSGSDYTGYIDVSIDYNGLTEDSAGTNTFVTTTSSNDTTTSEVTTDTSATTNTSTSSTTKKASGWYTFTKNTAIKSAASDSAKTVGTYSKGNRVYYNAEITTNGETWLRYLSYSGSEHFVKIAAAKTTTTKPAASTSKTVTKNETGTYKFTKTTAIKGSVSDSAKTLGTYYKGDTVYYNAKVTKNGETWLRYLSYSGAQHYVKISGAATSTTTTKPATSSSKTVTKAETGTYKFTGTTAIKGSVNDSAKTLGTYYKGDTVYYNAKVTKNGQTWLRYLSYSGAQHYVKISGAATTTTTSSKSTATASAKTVAQSGTYKFAKTTAIKSSASDAASTVGTYYKGNTVNYNAKVTTNGQTWLRYTSYSGAQHYVKVSGGAATTTSSSASKTTAAAGTYTFKTTTNIRTAASLNASVVGQYSAGESVYYIGTVSADGYQWLKYLSNSGAYHYVAKIG >CP025991.1|AUV73525.1|2826290_2827703_-|NAD-dependent-succinate-semialdehyde-dehydrogenase MAYQTINPYTNEVVKTYDNATTDQIEQALTTGDALYHQWRHEPVSSRAASLHKIAALLREHKDELAKIATIDMGKLLSESQGEVELCAMIADYYADHGAELLAPTPISTQATGDAEIEKQATGVLMLVEPWNFPYYQIMRVFAPNYMVGNPMILKHASNTPGSAAAFAKIVEEAGAPAGSLTNLFLNYDQVSDIIADPRIQGVALTGSKRGGQAVAKAAGANLKKSSMELGGSDAFVVLADADIDEAVNLAWRVRLYNAGQVCTSSKRFIVAADVYDDFLAKLKERFAKLVPGDPMDPQTTLAPMNSKRAKEKLQDQVDRAIAGGATVAYGNEPIDLPGQFFQPTILTDIDQDNPLFYEEMFGPVAQVFKVDSEQAAIDLANNSELGLGGIVFAGTAAHGKAVAQQIETGMVFVNTFLSSLPELPFGGVKGSGYGRELSSLGLMAFVNEKLVVTAQKPDYDNGAGGLVVL |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
932 : 25815
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP025991|932:25815|DBSCAN-SWA CATGGCGAAAATGATAAGAAGTAAGTACGGGTATGAACCGCCTGAATGGGTTCAGGCTGATGCCCGGCTAGATAGATGGTACAAGAATAAGCGTCGTGCTAAACAGCATGGCGCTTTTAGTTTGGAGAAAAATAAAAAGGATGGTAATTATTATGAACAAAGTATTGTTGAAAAAGTTAAACACTGAATACGATGAACTGACGGACAAGATTGCTAAAGCTTGGCCGGCTGCCAGTAACTTAGATATTCCTGATGAACAACGGCAACTCATTGGTATTCAAGCAAGAGCTATGGAAACCTATGCATGGGTACTGGCAATTCGGATTTGTTTACTAGAAAAATAATAGGATTATCAATATGAGTCAAGAAGAGTTCGAAACAACGCAAGCCATCAGCACAGTCTGCTTTGATTTGGTTCGGCAAGGTTACTCACTAAATGAAATTAGAAGTGGCCTGGGTAATACGATGAGTGCGGTTGGGAGCGACAATAATTCAGCTCAATATTTACTAGATGAATACAATCGAAAAATGAAGGAACTTAGTGATCAAGTCGATTTCTATTGTGGAAAATAAGGAGGTGCAGCATGGAAATACCTGCAAGTGTCCCAAAGAGTGATGAGCTAACTGAGTGTCTGCGAATGGAAAAGGCTATCGATGATGCTCTACATGAAGCAAATAAACGTCGGGCTGCTTATTATGATCAGAAAATTATGGACGAGCTTTTGAAGTGGTAGATTAGTAGATTAATTCTAAACCCGTCGATTTCGACGGGTTTAAAAACGGAGGTGTGGTGGTATGTAATGACACGAAAGTTAACGCCCAAACAGCGTAAATTTGCTAATGAATTCATTAAAACTAACAACGCTTATCAATCGGCTATAAACGCAGGCTACGCAAAGGGTACAGCTCGGAACGCAACTAAACAATTACTGGAAAATACTGGAATTCATGAATATATCATTAAAAAGACTGGCAACGTTGAAAAACGTGAGTCTGACGAAGCTGACGAAGTGCTAAAAAACATCTATCGTATCAGTGCTGGCAAAGAGATTGAACGTCATTATGTAAAGATTGATAATCTTGCTAAAGAAGTAGCGGGTGGTGATGATTCGATTGAAGCTCGTATGGAGTACATGACTGATGAGACCACTATAACGCCGGCTTCTACCAAGGAGCAGGTGGCCGCTGCTGAATTATGGTTTAAGCTAAGTGGCCGACTTAAAAATGATAGCAAAGATGTTGAAGATCAAAAGATTCGCAAGCTTAAAGCTGATGCAGATATTGCGGAGGCTAAGGCCAAAATGGTATCTGATGAAGGAAATGAAGTGCGGGTTAATATAACTTACCCACCAGGGAGCGATGAAGCACATGGCGATGATTAATTTGGATATCAACCAGCTTGTTAGTTCAGCTTACTATCCGCTGTTTACCAGTCGTATGCGCTACCTTGTTTATAAGGGTTCCCGTGGTTCTGGTAAGTCATATGCTGCGGCAGTAAAGGTTTTAGTCGATATGATGGTATATCCGTACGTAAATTGGATCGTGCTAAGACAATATGCTTATACACAGAAAGATAGCACGTTTGCAACACTAAAAAAGGTTGCTGCAGTGCTGGGTGTATATGACATGTTTAAATGGACTCAAAGCCCACTGGAAGTGACTTACAAGCTGACGGGCCAAAAGATCTACTTTAGAGGGATGGATAGCCCATTAAAGATTACATCAATAACACCTACTATCGGCCAATTATGTCGTGCTTGGTACGAAGAAGCCTATGAGTTAAAGACACTTGATGCTTTTAACACGGTTGAAGAGTCTATGCGTGGCGAGCTTCCGGAAGGCGGCTTTTATCAAACGCTCATTACCTTTAACCCTTGGTCTGAACGGCATTGGCTCAAGCCAGAGTTCTTTGATAAAGACACAGCACGATCAGGTGTGTATGCAACAACAACGACATATCATGACAATGATCATTTGAATGATGATTATGTAGCAGCCTTAGAAGAAATGCTAACACGAAACCCAAATCGTGCACGTGTGGCTGTTTTAGGTGATTGGGGAGTCGCTGAAGGCTTAGTATTTGATGGGCTGTTTGAAACGCGTGATTTTGATATGCAAAGTATTAGTCGTTTACCTAAATCAGTCGGCTTAGACTTTGGGTTTAAGAACGATCCAACCGCTGGAATATTTATTGCAGTGGACCAAATCAACCATGTGATTTATGTGTATGATGAATTTTATAAACACGGCTTGCTCACTGGCCAGATTGCACAACAGCTTATTCAGCATAAGGCGTACGGGTTGCCAATTACGGCAGATAGCGCTGGTGCTAACTTGATTGCTGAACTTACACGGGTGCATGGCGTTCCGGGGATTCAACCTAGCGGTAAAGGTAAAGATAGTGTTGTTCAAGGGATTCAATACATGCAGTCTTACCGTTATGTCATAAGTCCTAGATGCAAAGGACTACTCGAGGAAATGAATCTATATGTCTATGATCGTGACAAGCAAGGGAACTGGCTGAATACGCCCGTCGACGCGAATAACCATGCGATTGACGCGTTGCGTTACGCTATGCAGAAATTTATGTTCGTCAAGAATGGCCAATACATGAGTTATCGTGACCGTGTGGCTGAATTAAAACAATTAGGATTGTGAGGTGAAATATATTGGATTTGGATAACATGGAAAATTTCAAACAGGCAATCATGGTATATCAAGAAGATCTTGAAAAGTTGACGCCTACACGGATTGCAGAGTTTATTAGACATCATTATAGTTATCAACGACCACGTTTACAACGGTTATTAGATTACTATCAGGGACACAATGACGACATTCTTGAACCTGATAACCGACGCAATGAGAAAGGTAAAGCTGACCATCGGGCGGTGCATTCATTTGCTAAATACATCGCTGATTTCCAGACATCCTATAGCGTTGGAAATGCAATTAATCTCAGTGGCGTGTCATCAGACAGCCTGGATAAATTTAATCAAGTGAATGATATTAATACCTTGAATTATGATTTGTTCCTGGACATGTCAACGTTTGGTCGAGCATATGAATACATTTATCACGGGGAAGATGGCATTGATCACAGCGTCAAGCTTGACCCAAAAGAGACGTTTGTTATTTATGATACTTCGGTAGACCCACAGCCGGTTATGGCCGTTCGGTATCATGAAGTACAAGATATTTCAGCAACAGGTGCTCCTGTGATTAAATATGTTCCTGAAACGTGGACTAAGGAAAAGCACGTTACTTATAAACCTGTCGATGTCGCTGGCTCGGTCACGGCGCCGGAACAAGCGGATGAACAAGTACAGTTTGCATTCCCTGTTATCGAATATAAGAATAATGCTTTCCGTCAAGGGGACTATGAAAACGTCTTAACGTTGATTGATCTTTATGACGCAGCACAATCTGACACCGCTAACTATATGACCGACTTTAACGAGGCGTTACTTGTTATTGAAGGGAATATCGATACGTTATTTGATGACTCACTGTTGTTACAATCAATAGACCCGAATGACGAAGAGTCTATGAAGAAATTAGCACAAGACCGACTAGAACAGCTGGAACGCATGCGACAAGCGAACATGTTGTTGATTAAGTCGGGGATTGATTCAACTGGTAAGCAGACCTCAGCCGATGCGAAGTACATTCACAAAGAATACGATAGCACAGGGACCGAGGTATATAAGAAACGACTAGCATCAGACATCCACAAGTTCAGTCATACGCCGGACCTGACAGATGAGAACTTTGCAAGTAATGCTTCAGGGGTAGCGATGAAGTATAAAATTCTTGGTACGGTTGAGTTAGCAAGTACGAAGCGCAAACAGTTTGAACGTGGGTTAACTGCTCGCTATAATACTGTTTCCACTATTGAGAAAGCAGTGTCTGGTGAGTGGGACGTTGATGCGAATAAGATCAACTTTATCTTTAAAGACAATATGCCAACTGATGATATTGCAATCATCACGTCATTGGTTCAGGCGGGGGCGCAGTTACCGCAAGAATATCTCTATCAGTACCTGCCTAACGTATCTGATGCTGACGAAATTATCGACATGATGGATAAGCAACGTCAACGAATGGGTGGTTATGCCACTAAGAACGGGGTGCTAACTAATGGAACAAGCGGTAATGGTGACGGCGATGAGGAAGTTCGCGGACAGCAAGGCGAACCAGAAAACCAACGAACGAGCAATTAAGTCAGCGATTAATGGTGACATGCGAGGATTACTTGATTGGTGGTACAAATTTATTGCCAAGTATCCACAATACAGTCATGCAACTGATAATCAATTGCCAGACCAAGAACTGCTAAATGAGATTCAATCTGTGGCGATGGAGTCGGATATTAGACAGCGCCAAATTGCCACCAATTCTGAGCTTATCGCTTATGCTGCACTAGTATATGCAACCAAGACGGGCATTGAATTAAACAAGCAGTTGAATGCTTATTTTAAAAAAGTCGCTAAGTCAACTGTAAATAAGATTAAATCTTTGTACCCTAAGGCGTCAAAAGGTGACATACAAGCTTTGGTTGATGGTGTAATTGCCGATGTTAATTGGTCAGATCGTATTTGGTCAAACATGGATGAGCTGCAATATGATGTTAGTCGCATCATGAAACAAGCCTTGCTGACTCATACCAATCCTGTTGATGCTGTTGCAGAGATTCGTAAGCGATACAACGTGCTAGATTACCAAGCACGCCGATTATTGCGAACCGAGAGTGCACGCATCATGGCGGAGGAGTCCATCAGAGCCTCTAAGGAAGCAGGATACAGCAAGTTAAGGTGGGTTGCTAACACTGGTGCTTGTCGTATTTGCGCGCCGCTTGACGGCCATGTATTTAGCTATCGTGAAGCAGATGGTATGATTCCCCGGCATCCTAATTGTCTATGCTCGTGGGTTGGTGTTGATGAATAGAGAGGACTGATAAAATTGCCAAAACAAGAAGTTGAACTTAACAACCAAATGAT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27 | Lactobacillus_phage(45.83%) | tail,portal,terminase,capsid,lysis | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
690965 : 706395
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP025991|690965:706395|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP025991|690965:706395|695797_696412_-|AUV71598.1|plate|DBSCAN-SWA MANQELVYDITKQPNLQPAQQAIYARVGDGGLKTVTVKLNANNYPYDLTGKHVNFEGVKADSTRIIDTSGGIVLDPQGGIFRYVFPAQTFTARGRFQQAFFKVMLGDKVDTTIDVVVDVSPNLVEFGINSESYLSEYEQLISELKDKQQTFLTDLGQKVDLSKTQLQNISDRLDNIKTQLATNDVVSKTEFNTKLKNVVFIKEG >CP025991|690965:706395|699284_700022_-|AUV71600.1|tail|DBSCAN-SWA MVMDHDIYFGYQRPRPTEYVQFANFDSRQLNLYLAGRIANNPPTKEVTESIGYMDGIIDFSDILGRRIFDNRTIEYQFKALNINYHDRKLLEQKCKRLLLIPMRQPIYDSHDLPFYWFGKASSVTANDDHVNNVLEITVQFNVSPYALRKGQFDDIWDNFSLETGYAQFTKYSVKGTKKISLYNDSDLKSRLKVICQNDMTINGKYKYTKNYQDNPNFRLEPGINDLTVNGNGDIEFQWESEVML >CP025991|690965:706395|704324_704837_-|AUV71603.1|DBSCAN-SWA MENLMIDGTTCTPKLNYAFANQVKKELSADGRDGFDVLVDGLLDKDPEQIVNAYYYALAYFKRSQPSRDKVVEALEDTIFADDDKTNAAYSDIIQSLHADNFLARKLTSFVKGYNKILDIMQKKLDSEKEGSDQYNKDQLGMEQLQTQLDKLNKVLQPGTPQLVTPEVPA >CP025991|690965:706395|704019_704256_-|AUV71602.1|DBSCAN-SWA MLNQQREQMHARLMPQATYGVELNQPLDEVVERSDEQITNEINKLTDFRTVEERQPDTPQMTMYRKLMEAKADREEAD 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MQIKLDKTKHVVSYALVGGLEDAIDYDESQLPADFLTATDSSAYWLIDGVLTKDPNYAPSIQPVVEDQPSNEQQSLTKLAQQVTEQQEHIASLEESLTQLVKGGTH >CP025991|690965:706395|700015_704020_-|AUV71601.1|DBSCAN-SWA 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>CP025991|690965:706395|691766_691991_+|AUV71590.1|DBSCAN-SWA MTKLTESQEKAFENWEDANEQRKEYINNRTVTHNFIKHWATRDDLDDLFNLILDRHEFLQGNKSSQKRLNNKDS |
18 | Lactobacillus_phage(50.0%) | tail,plate,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
718384 : 730304
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP025991|718384:730304|DBSCAN-SWA ATTATTCATTCTCCGTAATGTAGTACTTATTTTCATCAATCGCATGAATACGCTTATCTAGCCAACTGTTACTCCGTTTTAGTTCCCTAGACGTCTTAGCCTTACCTTGCTTGCCATCCATGACTAATTTAATAGCATTGTACTGGGTATACGTAATCTCTGTGTAATCCCCTAACACGTCTTTAATTCCAGGCATCTTATGCAATTTGGTTAATTTGCTCTTTGGCACGTTATTCATGCTGCCATACCTTGCTTCCAGCTTATGAATTACTTCAAGATCCTTAGACCAATTTTTGTTTACCATAAGTTAATCTCCTTTCTAACTCTTGTTCGTAATGCTTGTGTATCTCGCTCGTGCAATTTGGACATGGCTGCACTACCCATACACCTTTCATAATTTCAACATGCACAATCTTTGTGCCATTACATTCACACATTAGAACGATACCTCCCGTGTATCTGGTGTTGCTGCTGTAAAGCTAATGACGTGCCCGTTTATGCCGCGGTACAATCGCGAAATGATCTTTGGATTATACACGTTTGCTAAGCCGGCACTGCCTAAATTGGTGGTGATGATAGTTCGTTGACGATTATTCACAATCCCAAATAACACATTCTGCACGTAATCACTGGCTTCTTTTCGGTTCTTACTCTGATCACTTTGGAACGTCGCTTCTGAGCCTAAATCATCAAGCACTAGTAAGTCTGCATCGCCTAACAATTGAACCATGTTCTGTTCGGTATAGCGGCTGTCAGGATGGCCGAAACTGCCTTTGATTAATCGGAACAGTTCATTCACACTAACGAATAGGCAGGCCATGGGTTTGTCTGCGTGATCATTTACTGCTTTAGCAATGGATAAGGCCAAATGTGACTTACCGCGCCCCGGCAGACCTGTCAATATCGTGTTGTACGTAGTTTTCGGGTTTAAATACTCGCCAGCAATCTTCCGTGCCAGCTTTAGGTTATTCGCCGACTCCGAACTGTTCGGGCGGAAATTATCAAAGTTGGCATCCATCAGGGTCGGATCATCGAATATCGAGTCCATGGCCAACACGTCAGAGGTTCGGCGCTTATGCCAGTAATCATTAGCATGATCAATAATCTTGTGGTTTTGCTGTTCAATTTTTTCTTTGGTACAAACCATGCAGAATGGCTGGTGTCCCTGCATGTAGACCATATTCACCCCATGTCGTGGGCAAACTTGGTCGCTGGTCTTTAATCGTTGTAGCTCAGGGAAGCTAATCCCTCGCGCACTCTTAGAAGTCGTTTCTGACATACGTTTGTGCCTCCCTTGATGCCTGACCACCGCTAGTCGCAGCTGGTTGAACGGGCGGTGTCATGTCGTAATTGCTTAACCAACCGCCGTTATCCAACCAGTTCGCTAGCTGCTGAACGTATTGTCCCTGTGTCCCCTTAACTTCCAAGTACCGCTTATAATTGCCGATACCCTGAATGATTTGGCTCTTAGTGGCTTTACCAGCGGGGTTGGCGCCAGTCACAGTAGCCCGATAATAAGCATTCCATGCGTCACCAAACTTTTCTTGACGTGGGTAAATAGCCCAGACATCTGTAAAAAATTCTTGACGACGAAGATCGCGCGGATCTTTATTCTTTTTTTTAGTATCGGTAGAGTCAGGTACTGTACTAGTAAGTTCTTTGGAGCTACCAGTTGGGCTACTATCTGGGGTACCAGTTGAGCTACTACTTGGGTTACTAGTTGAGCTATTATTATCGTTTCTAGTAGCCCAACTAGTACTGTAAAGCCTGATAATTTGGTACTGAGGCTTTTGCTTATTTCTTTTGCCGGGGACGTATTTGATTAATCCAAGTTGTACTAGTTCGTTCCTAGCCTTCTTTAGCCCGGCCTCGGATAGTCCAGTAAGATCGAGCAACGCAGAATTCTTTAGGGTAAACAGTTTATCTAGCTGATACTCATCGTTCGCGTAGTCCAATAACTCGCGATACAGGTTATTTTGACCAGTTGAGATATCTATTTGATTCCGTTTCAGATTTCTGTAAGCTCGTCTTTGCTTGAAATAATCCAAATCTACACCTCCTTTACTAATGGGCCTTTCACCCATTCGGTGGATTCAGTCACTGCTGTTCAAGCCAATTCGAAGATTAATTAAAATGGTAGATCGTCATCGCTGATATCAATCTGGTCGCCATTGTTGTCATAGGTTGAAGTATTCGCCGGTTGGGTGTTAGCTGGTGTATTTGTCGTATTACCATTAGGCCGCTTAACACCGTTGGGCTTACTACCTTCAGGGTCGACTTTATGATAACCGTACACTTGTAAGTAAACATTCCCCTTGCTATTGGGGTCACCCCATTCAGCATCAACTGCTAAAGTTCGATTAACAACGCCATTTGCAATTTGATTTAGCGTATCAATTGGGGCGCCGTCTTTGACGCCAACTGCTACTAAGAAGGTATTAAACCGCTTGACAGTCATGTCAAAGTGGTCTTGTTCATCATCCCAAGTCATAACTTGATAACGGATTTGTCCACCTTTATACTTACCATCAACCACTTCATAGTCCAGCGTGAGCTTCTGTTGGCCCCGGCCTGTTGTACCAACCTCGGCTTTAACGATTTTTACATTATATTTGCCAGCCTCTTGTACCCCCACACCAAATACGTTGTTTGAATCTACTGTAAATAAACTCATAATTTTTCATCTTCCTTTTCTGTTTGAATTAACTCTGCTGCATGGATCAATCGACGGTCATCAAGCCGGTTTTTAGCATGGTTACCTTGTTCAGGATCCAAATCAATCAGGCGTTCACCGTCTTTGATATAAATGCGACCGACCAAATCAAACATGCTCGTAAATGCATTAAACGTCTTCTCATTCATATCCGCTGCAAAGCGTCCAGCACCGTTTATACCATTAGTCCCGTTATCCACCTGATGAGCAGTCGCATAAATCGTCTTACCACTCTCTTTCAACGTGGTACCAAGTTGACGGAACCAGAGCTGTAGCTTCTGATAATTTTGACGATTATCCTTAGACGCATTGTCAATATTTTCCAAAACTAAGTTCTGCAAAGCAGTAACGTTAACCAGAACAATCGTACTGTACTTAGCCGTCGAAATGCTCCTAACTAACAAGTTGGAAAACCGCTGTTGGATCTGTGGTGCGTCCTTTTCTTCAAACATGACCACATCCATATCCTTATCACCAATCAAGACATTACTAGATAGATCAAAACTAAATAACAGCTTATGACCTGGCATGTCTTTAGCAATCGTTGTCTTACCAGTACCGCCATCGCCATAGATAAAGTACATGTTGGGTATCTTTGGAATATTCCCTTCTGCATAAAACTTCATAGTCAATCACTCCTTGGCTTTGACGTTCACCTTTGCTGGCTTAAGCGCCCCACTGTACGCTGGCAATACCTCGCCATCAGCGTTAACAATTTCGCCTTTGGGCGTTACAACTAGTGAACCATCGGCTAAGCGTTGCTTAATCTCGGTTTCATTAACCGACTTAGTTGTCTTCAATAAGCTTTGGTCAAATTTTTCATACATTGCTGTGACTTGCTTAGGAGTAGCCATCTTATCCCGGCTCAAATCCCAATTACGACTGCTAGCAGGGTTAACTTGTCCCATCGTGAATTTGTAGTAATCAGTCTCAACTACTTCACAATCACGCATTGCCATTCGCTCAAAGTCGTGCATCTGCTCAATTTTTAACTCATCGTCCTTAAGCAATGATGTTAACTGCTTAACCAATTGTTTTGGTTCTTCAATGACCATTTTTATTGCGCCGATTTCTTGATTGATTTGTTCAATCCACTGCTCGGCTTCGTCTAGTGACAATGGTTTCTGTGTTAGTTTTTCCATATCACTCATCCTCCGGATCAGCAAAAACGCCATTTTCAATCAACTCTTCCTCGGTAGACACATCATCACGCCAGCCTTCCGCAGCTTCTTCTTGGTCAATTAACCAACTATCGTAGCCGTTCATTTCGTCCACCTCCGTATTAACGTGACCAACTATTGTTTTAGCGACTGTTTCGGAGTAAAATGAGACTTGAAATAAAAAAATTTGTTGTGTGTATGAATTTTAGCTGCATGGGTACTGCCAATACTCAAGCAGCTTTTTTTGTACTCAAATTTGTACTTTGGCAATACTTTGCGTACTTCCAACTATCTCAGCCTCCTGACTAAAAATCTTGTACAGTTCATCAATCGTTACCTGTTCAAAATGAAGCCCACCGATATTAAACGTGAATTTTGCCATTACATTTCATCCTCTCCAAACAGTGCTCCCCATCCAGAATTATCAGCAACAATTAAAATAGGTGCTGCTGCAACACAACTAATTGCTAATACCACTTTAACGAATTCCAACATATGTTCTTCCTCCTATGGATTAAGCATCGTGCGTGTGTTTATGGCTGTTTTTAATAATGAAGTTTTGTCTCTTCCGCCAAGCAACTACTTGCGACCATTCATAGCGTCGCGGACCCAATGCAGTATCTGAAGGCAATGGATCATGTTCACGTTTAGCTAACCGAGTGATCTGTGCTGGTGAGACATTCCAAATTTCAGCCAAGTCCTTATTCCTTAACCATTCCGATTTTCGCTTTTTAACTGGCATATTTTTTCGCGTCTGCAGATGAATTACCTGTGGCATAATTAACTTCCCCTCTACTTGATGTACGATTTCATTTTCCAAACCTTCTCACGCTGTCGCATTAAAGCTGGCAGCGAAAAGCCATATTCATTGCATATACCAATAACAGCGTTATATCCGATAAACAGTGCATCCAAGACTTGATATATTGCTTCTTGTGGATCCTTAGTATCACTAACGTGGCCCGCTGGAGTTTCAAATTCATCTTGCGAATTGGTTAATGCATCTATTCCTTGACTAAGCTCACGAATGGTCCGCGGACCGAGCGCTTCAACATCCAATTTCAAGCCATCACCGTTTGCAATCGGTGGTGTAATTCCAACTAATTCATGTGCAATATCCAACGCTA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CATTCTAAATCATTTTCAGAGAAGAAAAATACTTCGCTTATTTCAAATGATAGCAGTGTTTGATGTTATCTCTGATTATGATGCAAACGCTTCTCCTGCACTTCGGTCGCAAGCAAGAAAAGCTAAAGAGTCAGTACTGAAATTACTATACGCAATTCCAACATGTGAAGACCTTTTTATTTCTACATGCTTCAGACAGCTATCAGAAGAAATCATAAAAATAGTTTATGTTCAACTCGTTGATAGTTCTGTCAATGTGACAGAAATTTCTAAGTCGTCATATCGTAATCTTTGGGAATTCGGTATTAAAACAACATCGGACTATAAAATGAATATCGATTTCAAAGTTAGCATTGATAAGATAAACAATATATTTAAACACAAATCTGACGATTTGCATTCAAAATATACTGATACTAAGAATTTAACGGTTTATCTACAACAAATACTTTGTGAAGGTTCTGACTTTTCTGAAAAAGAATTGTATTCATCAATTGATATTCTGTCAATTTTTAGTATTGATTGGTTACCCAGAGTTTGCAAGCTAAATATTAATCTGATGACAATGCCCCAACGACATCAGTTTTTAAAAATGGTTAAAAGTTTGGCATAAGAGTTCTTACTAGTTAAGGGCTTTTATTTTAGCACGTAAAAGAACATACGTTTGCATAATGATCAATACCTATATATGAAAGGATGACTCATCATGGCATCATTCAGTCAATACGAACTAGCAAGCGGCAAAAAACGTTGGCAGTTTGTGGCTTATCAAGGTATGGATACTGGAACCGGTAAGCAAAAACAAGTACACCGGCAAGGATTTAAAACCAAGCGAGCGGCTCAGGATGCTGCTAAGCTAATTGAAGCCGAAGCTGTGGCTAACAACCGATTATCGAATAGCAAGGCCAACATGACACTGGGCGAGTATCTGATGTACTGGATCGATAACTTAAAAGTAAATGTAAAGGTGGATACCATTCAAATCCATCGTCGGAATATCAGATTCTACATCAATCCCCGAATTGGTGATTACCAGCTTAAAGATTATTCGTTTAATGTTCATCAAAAATTTATCAATAACCTTTTCACGGAAGAAGGAGCTGGACGTTCTAAACATGGATATGGTTGGAACACAGTCCAATCCATCAATCAGACGCTCTCAAACGCCCTAGAGAAAGCTGTACGCTTAGATTACATCAAAGTTAACCCTACTCGACATGTAGAATTCAATCGCAAGTATCGTCCCGAGGTTAGAAAAATGCGCTATTTCACTAAGGAACAAACCGATAAATTTTTAAAGGCCGCTCAGTTGGAACATCTATCATTGTGGTACCCCTTTTTCCTACTCATGTTCGACTGTGGCTTACGAGTTGGAGAAGATCTGGCTCTTAGATGGTCACGAGTAGACTTCAAGCATCGCATGATCAGTATCGACACCATTCGCATTTATAACTCTGAGGTTAAGGTAAATGGCATTGGATTAAAAGATATGATGCTAGACACGCCCAAAACGACAAAAAGTATTCGGAAGATTCCTTTAACAGATCGCGCCTATGATGCACTACTGGATCTATTTAAACAAACTCATCCAAATGAAATAATTAAGCTCAATCGGTCTGATATTGACTTGAATGACTTCATCTTTATCAAGCCCACGGGAAAGTTTCACGGTTACCCTCTGGCCATTACTTCCGCACAAGTTGCCATGCCCAGAATTTGTGATCGTGCGGGTATTCCTCGTTTAAACGTTCATGGATGTCGTCACACTTATGGTGTACGATTACGCGAAGCCGGTGTAGATATTAACGACATTCAAGACTTAATGGGACACGTTGATTCGGAGACCACCAAATTGTACGCGGAAATCACACCAAAAATTAAAGAAGACGCAGTTAAAAAACTGAATGCATTTTTAGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP025991|718384:730304|722239_722362_-|AUV71626.1|DBSCAN-SWA MNGYDSWLIDQEEAAEGWRDDVSTEEELIENGVFADPEDE >CP025991|718384:730304|725469_725901_+|AUV71631.1|DBSCAN-SWA MRNGNVILVAIDNHISAFKITQYAIELANALDKSLYFVHILDDSLPKYKRNPRNPWERSNLDALSEFYLKDCANMALDTNVNHVFHSLIYGRTKNTLVRLSNMKNVALTIVGASGYDNLYNNRIGHIAQYVSCWSKGTVTIVR >CP025991|718384:730304|724692_725124_+|AUV71630.1|DBSCAN-SWA MRYDTYLKVEQLAQSFGTYDPFTIADRLGFEVHFEDIGANMGFCTHILGVTDVVISDKLCDSPGHIPVMAHELCHGIEDTTCVAWYTLGDYQKNSVEYKANAFACQELIKLYEEQYDQLPDNFNALKIAYGLPDEFIEFFTTE >CP025991|718384:730304|721053_721722_-|AUV71624.1|DBSCAN-SWA MKFYAEGNIPKIPNMYFIYGDGGTGKTTIAKDMPGHKLLFSFDLSSNVLIGDKDMDVVMFEEKDAPQIQQRFSNLLVRSISTAKYSTIVLVNVTALQNLVLENIDNASKDNRQNYQKLQLWFRQLGTTLKESGKTIYATAHQVDNGTNGINGAGRFAADMNEKTFNAFTSMFDLVGRIYIKDGERLIDLDPEQGNHAKNRLDDRRLIHAAELIQTEKEDEKL >CP025991|718384:730304|726914_727880_+|AUV71633.1|DBSCAN-SWA MSEPEEATHNAKVISFINMKGGVGKTTLTKEIGFRLSNSLSKEVLLIDVDPQINLTQSVFKHFNYAQSEEIAQKLKKQYNDNNSDTKDNNSDTKDQAVNSNTTKVSTASIKKVFESSVSGPASPEECILTFPNTSLSIIPGELGIEFITRNLNSTQLENGIYNFISAHKLRSKFDYILIDCPPTYSSYTVAALKPSDFYVVPVKPEAYSILGINMLNKVVEAITSDNFIFFEKRPLKNLGIILTDIKSKPSTGIKNIIQDISSSKVLKNQQIGIFNTTFLHNQYLQNDIGYFIDNSNAEKGSKPNLNKLVKEFEKRINGHE >CP025991|718384:730304|724285_724684_+|AUV71629.1|DBSCAN-SWA MADKNLASRIINLRESKNMKQSDLARRLSLDKSSMSKIESGTRKVSSDEILKIANIFDVSTDYLLGNNERTHKSPDWATESDRIDLDKLLQSNTPMGYGGMSMAPEDKEKVRNVIEGIYWDRLKKLREEGKK >CP025991|718384:730304|729089_730304_+|AUV71636.1|integrase|DBSCAN-SWA MASFSQYELASGKKRWQFVAYQGMDTGTGKQKQVHRQGFKTKRAAQDAAKLIEAEAVANNRLSNSKANMTLGEYLMYWIDNLKVNVKVDTIQIHRRNIRFYINPRIGDYQLKDYSFNVHQKFINNLFTEEGAGRSKHGYGWNTVQSINQTLSNALEKAVRLDYIKVNPTRHVEFNRKYRPEVRKMRYFTKEQTDKFLKAAQLEHLSLWYPFFLLMFDCGLRVGEDLALRWSRVDFKHRMISIDTIRIYNSEVKVNGIGLKDMMLDTPKTTKSIRKIPLTDRAYDALLDLFKQTHPNEIIKLNRSDIDLNDFIFIKPTGKFHGYPLAITSAQVAMPRICDRAGIPRLNVHGCRHTYGVRLREAGVDINDIQDLMGHVDSETTKLYAEITPKIKEDAVKKLNAFLD >CP025991|718384:730304|721728_722238_-|AUV71625.1|DBSCAN-SWA MEKLTQKPLSLDEAEQWIEQINQEIGAIKMVIEEPKQLVKQLTSLLKDDELKIEQMHDFERMAMRDCEVVETDYYKFTMGQVNPASSRNWDLSRDKMATPKQVTAMYEKFDQSLLKTTKSVNETEIKQRLADGSLVVTPKGEIVNADGEVLPAYSGALKPAKVNVKAKE >CP025991|718384:730304|719642_720431_-|AUV71622.1|DBSCAN-SWA MDYFKQRRAYRNLKRNQIDISTGQNNLYRELLDYANDEYQLDKLFTLKNSALLDLTGLSEAGLKKARNELVQLGLIKYVPGKRNKQKPQYQIIRLYSTSWATRNDNNSSTSNPSSSSTGTPDSSPTGSSKELTSTVPDSTDTKKKNKDPRDLRRQEFFTDVWAIYPRQEKFGDAWNAYYRATVTGANPAGKATKSQIIQGIGNYKRYLEVKGTQGQYVQQLANWLDNGGWLSNYDMTPPVQPAATSGGQASREAQTYVRNDF >CP025991|718384:730304|723048_723597_-|AUV71628.1|DBSCAN-SWA MSVDIVVHSSVSVKNSLPKVMHLAKQTVTETGKKAGYSQPMISKLSSGVAKLPYENVRTLLNSIPEQYQPLLALDIAHELVGITPPIANGDGLKLDVEALGPRTIRELSQGIDALTNSQDEFETPAGHVSDTKDPQEAIYQVLDALFIGYNAVIGICNEYGFSLPALMRQREKVWKMKSYIK >CP025991|718384:730304|727872_728310_+|AUV71634.1|DBSCAN-SWA MSEIDILKRNIQNISKTKDSEYKRSLLYSGYTTLLLSTHFFKLNINLKEFLTPLLSELEKVYPLHRNQTLIFKDYVYKSRSVVISRMLRVIQKADSASLSKLEFHYSSFISENTTTDNNTVSKDTSKKTNKRNSVDDLFQRFDRG >CP025991|718384:730304|718384_718687_-|AUV71620.1|DBSCAN-SWA MVNKNWSKDLEVIHKLEARYGSMNNVPKSKLTKLHKMPGIKDVLGDYTEITYTQYNAIKLVMDGKQGKAKTSRELKRSNSWLDKRIHAIDENKYYITENE >CP025991|718384:730304|723661_723865_-|AUV74026.1|DBSCAN-SWA MNLSIAYRNNKINYKRELVDSIVELLTLMSPSLIKVKTSWMSETELKELVTMIHNGDRNEFYEMINF >CP025991|718384:730304|726566_726743_+|AUV71632.1|DBSCAN-SWA MNNEISKYELIATMKKNIQTFIDSEAVLYLKKDSYSTAEYDRMLTEIKNDLKTRLLQK >CP025991|718384:730304|722770_723034_-|AUV71627.1|DBSCAN-SWA MPQVIHLQTRKNMPVKKRKSEWLRNKDLAEIWNVSPAQITRLAKREHDPLPSDTALGPRRYEWSQVVAWRKRQNFIIKNSHKHTHDA >CP025991|718384:730304|720511_721057_-|AUV71623.1|DBSCAN-SWA MSLFTVDSNNVFGVGVQEAGKYNVKIVKAEVGTTGRGQQKLTLDYEVVDGKYKGGQIRYQVMTWDDEQDHFDMTVKRFNTFLVAVGVKDGAPIDTLNQIANGVVNRTLAVDAEWGDPNSKGNVYLQVYGYHKVDPEGSKPNGVKRPNGNTTNTPANTQPANTSTYDNNGDQIDISDDDLPF >CP025991|718384:730304|718819_719662_-|AUV71621.1|DBSCAN-SWA MSETTSKSARGISFPELQRLKTSDQVCPRHGVNMVYMQGHQPFCMVCTKEKIEQQNHKIIDHANDYWHKRRTSDVLAMDSIFDDPTLMDANFDNFRPNSSESANNLKLARKIAGEYLNPKTTYNTILTGLPGRGKSHLALSIAKAVNDHADKPMACLFVSVNELFRLIKGSFGHPDSRYTEQNMVQLLGDADLLVLDDLGSEATFQSDQSKNRKEASDYVQNVLFGIVNNRQRTIITTNLGSAGLANVYNPKIISRLYRGINGHVISFTAATPDTREVSF >CP025991|718384:730304|728312_728996_+|AUV71635.1|DBSCAN-SWA MEDFYNHEIKTYIQFCSTFFSESFILNHFQRRKILRLFQMIAVFDVISDYDANASPALRSQARKAKESVLKLLYAIPTCEDLFISTCFRQLSEEIIKIVYVQLVDSSVNVTEISKSSYRNLWEFGIKTTSDYKMNIDFKVSIDKINNIFKHKSDDLHSKYTDTKNLTVYLQQILCEGSDFSEKELYSSIDILSIFSIDWLPRVCKLNINLMTMPQRHQFLKMVKSLA |
18 | Lactobacillus_phage(90.0%) | integrase | attL 717399:717410|attR 730409:730420 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
945456 : 954465
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP025991|945456:954465|DBSCAN-SWA GTCAGTTGATTGCCATCAACTGCCACTTGTGGCACAATCGTCCCGACTGCACAAAATTACCGGCATCGTTGTAGGCGCCCGTTTGCGCAATTACTGAATCGGAGAGGTAACTTTGATTGGAACCCAATGTGTCATTGACAACAACTGTTCCAAGCTTCTTACCGCTTGGATTGAATGCAATATTCCATGTTAAAGTTGCAGGCAGGCCATGCTCATCATAGCTTCCAATCAAAATATACATCAGAATCAGCCGTGCCTTTCACGTAAAACTGGAGGGTACTCGCGCGATTCGTCCCCATTTGTGATAAGGCATCGTTGAAAGTAATCAGTCCAGCGGTTTCACCCGCTTTAATTTTAAAATGACCAGCAACTCGACCATTATCGTCTTTCAATGGAAACCCCAAATCAACGGGTGCAACCGTCCCATTCGGCAATTCTGTATCACCGGCCGCAATTGGTTGACCATTGCGAATAGCCCAGTCATACTCGACTGTAAAATCCTCCCATTTGCTTAATTGACTTGTATCTGTGATGACATTGCCATACCGATCAGTCACTCTGGCCTCATTCCCCGTTAGGCCAGCCGTCGACACATCATCCGCTTGTCCAATCCGTCCTAATACTATGACTGTCACTAAAACTGTTAACAGACCTAGTAGGACTGAAAACAATTTATTTCGCATAAAACTGCCCCCATTCTCTGCCAAACACAACCAACTTTGATACTTAGAATATCCATTGGAATTACCAATAGTTCTACGATCACTTTATAATAAGCCCATCTTTTTCATCAGTGTTATTAATAAGTTGTCATTGGTAGATTTACAAACAAGTTGATGATTAATCAATCGCTACCCACGTTACTTATTTAGCCTTCCAATGGCCAACGTCACCGTATTTTTTACCAACCTGACATGACACGTCTCCACTCAGACCATCCATTAAAAACTGTTTGACGTTAGCGCCTAAAATCTCTAAAATGAACCCATTGGTCTTTATTATCAAATTAATTTTAAGGAGTGTCTTCATGGCGCAAATCTATATTGCTAGTCCGTTTTTCAGTCCCGAACAAGTGACGCGGGTCACACAACTTGAGGAAGCTTTAGCAAAAAATCCAACGGTCACGGATTTTTATTCACCACGTCTACACCAGGACGCTCAAGCCGAACAGTTCACCAAAACTTGGGCGACCGAAATTTTCCACCGTGACATGGCCCAAATTGCGGCCGCGCAAGTCATCGTGACTGTCTTAGACTTTGAAGCCAAAAACTTAGATTCTGGTACCGCCTACGAGCTAGGTGTGGCTACCATGCGCGACTTGCCCATCATCGCCTTGCAGGAAAAAGATGAGGCCGTCAACCTGATGATTACCGAAAGCTTACACTGGTATACCAAACAAGTGAGTGATTTTGAAACTTACGACTTCCAACAATTACCTAAAGGCGACTTTATCGGTGAAATTTTATAATAAAAAACGAAGCCAGACTTTCGACTATTATCGAAAGTCTGGCTTCATATTTTGTAGTTCTTAATTTTACTTACCAGTGGGCCCCAATCGTCTGTTGCCAAGCAAAGTACGGGGTGCCCTTTGTCAATGCTTCAAATTGATCAGCCGTCAAATTGGGCCAGTCGATGTCACTGGTTGCCAATTGTAACGAATCGGTTAAGTGAAGATGAAAGTCGGTGATCCAAGCCAACAGCGGTTTCAACACTGACAAATCGGTATTTAACATCTGATAAGTAGCGGTATCGCTGGTCAACGTCACCGCCAATGTGTAACGGGCCTTCATTCGTACGCCATTACCAAGTTGCCGCACGATTGAGCGATACAATCCCAGCTCGACGTCCGTGATGACTGTGGGTATTGGCGCCAAGGTTTGAAAGACTGTGCCGCGCTCATCGGCCAAACTCAGCCGACTAGGCGTGATCGTCAAACGCCCATGAGCAGCCGCGCCCTCATTCAACGCTTTCAAGATAAACGGCGTCTTTTTGCGCGCGGTCGAATACTTGTGATCATTTAAAACAATCGTCATATAAGCTGGTTGGTGCGTAATATTGTCCGCAATGTTCGTCACCGCGACTGGCATTGGTTTTTGCATGTGATAATCTCCCTTGTCGATCTGCTTCTCTCTACGGTCGATTATACACTAACACGACTCAACCAACGTAGCGACTTAATAATTGCCTTAGGCCGTCACCGGATCAACGTGCTCAGCAACAGCATGAGCCGCCGCGATTCGACCGAACGTAAAGATATCACTAAGCGAGTTACCACCTAGCCGGTTACCCGCGTGAATTCCACCGGCTACTTCTCCCGCCGCGTATAGCCCGTCGATAACCTGGCCGTCCGTATTTAAAACGTGAGCATCCGAATCAATCTTCAAGCCCCCCATCGTGTGGTGGGTTGCTGGTTTACGCGGCGTTGCGTAAAATGGTACCACGGCAACTTTCAAATCAAAGGCCGTCTTATGAAATTCAGGATCCTCGCCAGCATCAACGTAACGATTGTAGTCCGCAATCGTCTTGGTCAGGGCTGCCGGGTCCATGCCAATTTGGTGCGCTAAATCTGTCAAAGTATCAGCACGGAACAAGGTCCCATTCGCCACCTGCTGGTCAATTTTAGCTTGTGTCGTGTTGTAAGCCGTCTTTTTAATTTCATCATCGGCAATTAGATAGAAGAGACTCCCATTATCAATGGCCGCCTGAGTTAACTCATCACGACTGCCGTACTCATTGACGAACCGTTTTCCTTGCTGGTTTACCATCACAAAGTTTGCCGGTGGCACTTGGAGCCCACTGAATAATTCGCCGGTCTCCGGATCAGATACCGGCATCATTTGTGAGAAGCCCATCCCAACTAATGCTGCACCAACACTAGTCCCTAGCCGAATTCCATCACCAGTCATTGCGGGGGAATTAGTCGTCTTGACATCATCGTCGATGGCCGTCCAGTACGTATTGTACTTTTGTAACATTTTAGTATTCGCTGCGAAACCACCAGAAGCTAAAATCACCGCATCAGCATGGACAATAACTTTTTCATGAGCCGCATTAGTCGCAATGACGCCACGAACTTGCCCATCTGTCACCAGTAATTCTTTTACCGGCGTTTCCGTCATAATCGTACCACCCTGTTGTTCAACAAAGGCCCGTAAAGTCTTGATGTAAGCAAAACCTAGATCGCCCATTGGCTTATGCCCGCGCCGCCAGATGGCTCCAACTGGCATTGTCACTTGGCTTTCATCAAATTTCACACCAATCGATTGTAACCACTTGACTGAATCCAGGGCGTTATCCGTCAATTCTTTTACCAAATCATACTGACCGTGAATCTCTTGACCGTTCAAATCAGTCCGTTGACCACCTAAATAAGTTTGAATCCGATGTAACAAGGTTGAATCAAATAAGGTGCCCTTTTGATTGGTATTGGCAGTCAGGTATGCGTCAATCTGCTGTTTCAATTTACGGAAATCAGCCCGATATTCAGGTGCAATTGTACTTTCATCACGCTCACTCAGATCCTTCAACGTTTGCTTTTCACCTGGCAAAGCTGCAAACTGTCGTTGCCAATCCGGATCAGCCGCATTCATGGGCCCCCCAGCGCGAACGGTATTACCACCGACAGCTGGGAATTTTTCTAGGACAACGGCTTGATGACCAGCCTGTAACACTTTGGCCGCTGCCGTCATACCAGCCCCACCAGCACCAACCACTACGACATCAGTCGTCACTTCTTTGACAGCAGGTTGAGCGACCTGCTTAGTCGCACGCCGTTTCTTCAAATCATCAGGATTGGCACCAGCTTCTTTGACCGCACGAGCGACCCCATCGATAACACCATGACTGGTAATTGAAGCCCCGGAAATCGCATCAACAGCGAGCGTTTGACCCGCAATAATCTCCTTGGGAATGCGTTCAAAAGCCACATCGGCAATCCCCTGCGTTTCACTACTGGTATCAATTTCAATATTTTCAATCCGGTCAGCGGAGAGGGTCACTCGCATTGGCAATTCGCCATTATGTCCAGTGGCCGTCACCTGATAAGTACCCGGGGCAAAGCTAAGCGCTTCTGGTGCCCGCATCTCGGCGACGATGGTCGCAAACTTCTGAAACTTTGCAAAACAACTGTCCAGAAAATCAACCGTCCCTTGCACCTTTAAATTACCTTGATCGTCAAAAGCCGTTTGGGCACGACCTAATAAGAATTCTGAACCGGGCATGACACTGGCGTTAACACCGGGAGCGTCTAAAATCTGACGCAGGTGTAGTTGCGCGCGTGACGATCCTTGGACGCTGTATGAAGCCCCAACAATCATTACTGCTTGACCATCTAATGGGTGAATTTTGAATGATAACCATTCAATAATGCTTTTCAACGCGGAAGGCACGGAATGATTGTGTTCCGGTGAGGCAATGATAACCCCGTCAGCCGTCGCAATTTTAGTGGCAAAGTTTTGAATGATGGTACTGTCAGTTTGATCATTCGATTCATCAAACATCGGGACATCAGTCAATTCTAAAATTTCGATTTCGGCTTGTATCGCAAAATGTCGTTGCATAAATTCCAGCAACATCCGATTGTACGAATGCTGAGCATTCGTTCCAACAATTCCAACAAATTTCATGTTTATTCCTCCCCAGTCACTTGCCGCCACGAGAACTGCTTACTCTTTTCGAAAAACTGACTCGACGGCATGATTTTATTCGTTAAATCTACAAAATCAATGAATTCGCCAAACGCATTGTCTAATTCCTGAACTTTATCCGGATAAGTCAGGTCGCCCTGATCATCAAAAGCTTGTAGTGAACGGCCTAGTAAGTATTCAATATTTGGCATCACCAGTGCTTTTAATTCCGGCGCTTCTAAAATCTGGCGTAAGTGCGCTTGAGCGCGTGAGGTTCCCAGTGAGCCGTTCGAGGCCCCAACAATCATAACTGGTTTATTAATTAACGGCCGCGTGGTATATGACAGCCATTCGATTGCACTTTTTAGTACGGCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP025991|945456:954465|946993_947554_-|AUV71844.1|DBSCAN-SWA MQKPMPVAVTNIADNITHQPAYMTIVLNDHKYSTARKKTPFILKALNEGAAAHGRLTITPSRLSLADERGTVFQTLAPIPTVITDVELGLYRSIVRQLGNGVRMKARYTLAVTLTSDTATYQMLNTDLSVLKPLLAWITDFHLHLTDSLQLATSDIDWPNLTADQFEALTKGTPYFAWQQTIGAHW >CP025991|945456:954465|945670_946138_-|AUV71842.1|DBSCAN-SWA MRNKLFSVLLGLLTVLVTVIVLGRIGQADDVSTAGLTGNEARVTDRYGNVITDTSQLSKWEDFTVEYDWAIRNGQPIAAGDTELPNGTVAPVDLGFPLKDDNGRVAGHFKIKAGETAGLITFNDALSQMGTNRASTLQFYVKGTADSDVYFDWKL >CP025991|945456:954465|951040_951988_+|AUV71847.1|DBSCAN-SWA MPKSDSSEMRRFLDVLLKHGNFTRAAKDLYISQPYLTQSIRNVEKELGVTIINREVTPLRLTTAGRTYYQYLTALENEKDYFNKQIRQYTHANQQVIRLGVLSSLGYYLLPLFLPAFLKAHPATKIELTEDIASRNEQRVLHGELDFLIGQNPETIAPGLESYDRGRDGYYAIIPNTVNWYQPHQAFINPGALPLNDLLQAPLVLSPHGSSIRRQVDYLLQKHNVTPNIVIESTNTATITKLATAGLGITFLPDSVHTQPDPERYNILPLPQALMSLNYFIAFPAEHSLNQVEKDLVTIFLTQLEADLAQSSTIS >CP025991|945456:954465|950082_950697_-|AUV71846.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNATKSTNRQLLQYMQRHFQQQATIEICEIKDLPAFNEPEDRTAPVAIQQLSDKITAADGVIFATPEYDHSIPAVLKSAIEWLSYTTRPLINKPVMIVGASNGSLGTSRAQAHLRQILEAPELKALVMPNIEYLLGRSLQAFDDQGDLTYPDKVQELDNAFGEFIDFVDLTNKIMPSSQFFEKSKQFSWRQVTGEE >CP025991|945456:954465|945456_945696_-|AUV71841.1|DBSCAN-SWA MYILIGSYDEHGLPATLTWNIAFNPSGKKLGTVVVNDTLGSNQSYLSDSVIAQTGAYNDAGNFVQSGRLCHKWQLMAIN >CP025991|945456:954465|947641_950080_-|AUV71845.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNAQHSYNRMLLEFMQRHFAIQAEIEILELTDVPMFDESNDQTDSTIIQNFATKIATADGVIIASPEHNHSVPSALKSIIEWLSFKIHPLDGQAVMIVGASYSVQGSSRAQLHLRQILDAPGVNASVMPGSEFLLGRAQTAFDDQGNLKVQGTVDFLDSCFAKFQKFATIVAEMRAPEALSFAPGTYQVTATGHNGELPMRVTLSADRIENIEIDTSSETQGIADVAFERIPKEIIAGQTLAVDAISGASITSHGVIDGVARAVKEAGANPDDLKKRRATKQVAQPAVKEVTTDVVVVGAGGAGMTAAAKVLQAGHQAVVLEKFPAVGGNTVRAGGPMNAADPDWQRQFAALPGEKQTLKDLSERDESTIAPEYRADFRKLKQQIDAYLTANTNQKGTLFDSTLLHRIQTYLGGQRTDLNGQEIHGQYDLVKELTDNALDSVKWLQSIGVKFDESQVTMPVGAIWRRGHKPMGDLGFAYIKTLRAFVEQQGGTIMTETPVKELLVTDGQVRGVIATNAAHEKVIVHADAVILASGGFAANTKMLQKYNTYWTAIDDDVKTTNSPAMTGDGIRLGTSVGAALVGMGFSQMMPVSDPETGELFSGLQVPPANFVMVNQQGKRFVNEYGSRDELTQAAIDNGSLFYLIADDEIKKTAYNTTQAKIDQQVANGTLFRADTLTDLAHQIGMDPAALTKTIADYNRYVDAGEDPEFHKTAFDLKVAVVPFYATPRKPATHHTMGGLKIDSDAHVLNTDGQVIDGLYAAGEVAGGIHAGNRLGGNSLSDIFTFGRIAAAHAVAEHVDPVTA >CP025991|945456:954465|952173_953145_+|AUV71848.1|DBSCAN-SWA MITNKCRYGLVGLISIVLTFGLSASNRLRASFNAMPAITYMSKYGIINHRTQWQAMLHATDHGRKITSLTQLNQILRAANLHSFAVANLRQVEHATRPTKTMSAGLTIINVPAFYSSQHQLQKQYWTQLQHLIKQTKPTTDLILNFAANTGGSSAPMIAGLAAIIPDGTIYTGITNHHRNRPRMMYHGRITGGLGQDDVNFSQPTAAHFRHIYAIIGNQTASAAEVIIMALKRNPHVTLVGRSSAGYTSLNGGVFLNTAVAVMTIGTLKATVKIHGQQYFNNQPLKPDIPTLYQPLAPLQLGQSPHLDADFLSELRTIMKHYH >CP025991|945456:954465|946482_946923_+|AUV71843.1|DBSCAN-SWA MAQIYIASPFFSPEQVTRVTQLEEALAKNPTVTDFYSPRLHQDAQAEQFTKTWATEIFHRDMAQIAAAQVIVTVLDFEAKNLDSGTAYELGVATMRDLPIIALQEKDEAVNLMITESLHWYTKQVSDFETYDFQQLPKGDFIGEIL >CP025991|945456:954465|953235_954465_-|AUV71849.1|DBSCAN-SWA MARDGTVTETNDLKLHALGEIIGMNEQEAYVTTFYWLADCWLETSYLGLEDEFDDDEIDDAVKSLLNRMQAGAIYEVTADDPMWQAWKRAVRAVLTPNDHAEHEVDETDGEDELVLPAGVRPERQLEEVQAYAAMNAFLQAQDQEYLQEIGKRAATQVSGAGWQVWRAHRQSMHPESAAPLTLTAEQLPAVMWAFFDKYQDTEDSFEIFELVNRLEQWQKSADRDLDAQWSQLVAKSQIDPAAITLMQGLSLAIEFFDQLEWDGDLTAKATLQNKLMQRTLDDTLNDETTANWTDAWQHWDLADPLTTEQWARRFDPADDYEDESEEDGAARPAWQLGASYSTVLIAMRLVAYGVLRPESVPGMATVKMANRALAATVSIGIVLVAWLVTAILITIVIWGWRWLRKLIF |
9 | Lactobacillus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1158303 : 1246527
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP025991|1158303:1246527|DBSCAN-SWA TGTGATTAATATTTACTACAATGTTGAGCCCTTACGTTCCAATGAAGAAATCACTGACTTCGTTAATAAGGCTCGGAACGGTACGCACGGTGAGCGTAACGCGTTGTTAATTCTAATTGGTTTAAATACTGGACTTCGAATGAGTGATATTCTTAACTTAAAGGTCGGACAGATTCGCTATCACGATATTGTCCACATTACTGAAAAAAAGACCAAAAAAAGGCGTGTGATTTTACTCACACGCCTACGTCCACAAATCAATCACTATATTAAAGATTTACCAGATAATGAATACCTTTTTACCAATCGACAACATCAGCCACTAAGTGTTAATGCCGTTTATAAGCTGTTCCAGACCATCGCCCGTAAAATGCACCGGACGGATATTGGTACCCATACGCTCCGTAAAACTTTTGGCTACCATTATTATCAGCAAACCCACGACATTGGAACTTTGATGATGATTTTCAATCATTCTAGTGAAGCAATTACAAAACGGTATATTGGGCTCAATCAAGATATTATTCTGAAACAAATGGCTGGATTTCAATTGGGATTAGAATACGAAAAAAGCCACTAATACTTAGTGGCTTTTTATTATATTCTCTTTGCTACTCAAGGCTCTCTAGAAACTCACTCAATGCTTCCTGCCAGGTCAAAATATGGTAACCAGTGGCTTTGGCTTTATCCAAATTCATCACTGAATGCTGTGGCCGGTAAGCTTTTTGTGGGAATTGTTCAGAAGTAACTGGTGCTACTTCAACATCAGTGTCCTTCAAAATTTCCTTCGCAAAGTCATACCAAGTAGCTGTATTATCGTTACTTAATTGATAGGTCCCTGAAGCGGCTTCAGTTTTCACCAGGTGGGCCATAAATTCTGCTAATGTTCGCGTCCAGGTTGGCCGTCCGAGTTGATCATTGACGACTGTCAACTTGTCATGCGTCTTTGCTAAATTCTGCATTGTGAAGACAAAGTTATGCCCAAATTCACCGAAAACCCAGCTAGTCCGAACAATATAGTAATCAGCACCGCTGTGACGAACGGCTTCTTCACCAGCCCACTTAGCACGCCCATACTCATTCTTGGGGTTGGCTGGATCATCTTCTAAATATTCACCTTTATTAGTGCCATCAAAAATGTAGTCAGTAGAAACATAAACCAATTTAAAACCCTGTTCAGCTGCTACTTGGGCTAAATTTTTTGTTCCATCAACATTGACTAGCCAATTGAGGGCTTTGCCTTCATCTTCGGCCTTATCAACTGCTGTGTAAGCCGCGCAATCATATAAGACCGCTGGTTGTAATTCTGCAATCTTAGCTTTGACTGCGTCTAAGTCTGTAATATCCAATTCTTTTTCAGTCAGCGCGTCAAATGCAATTCCTTGTTCATTTAATAGTCGTTGTAACTCATGACCTAACTGACCATTGGCACCAACAATCATTACTTTAGCCATTTTCATTTCCTCCTAAAAAATAAGCGAACTGTCAATCGACACTCCGCTTATTCAAAATCTTCTGTGTTTTTATTGCCCGTTCTTGGCGTAGTTTGATTCAACCTTGCTCTTATCCGCTTGCCACCAGTCTTGGTGGTCAGTATACCAATCAATCGTTGCTTTCAAACCAGACCGGAAGTCAGTAAACTCTGGCTGCCAACCTAATTCTGTGCGCAACTTAGTGGAATCAATCGCATAACGTAGATCATGGCCGGGACGGTCCTTAACAACATCATAAGCGTCTTTAGGCTGACCCATTAATTCAAGAATCATTTCCAAGACGTCCTTATTGTTCATTTCACCATCGGCACCAATCAGGTAGGTCTCGCCAATCTTACCCTTGGTTAAAATATCCCAAACGGCCGCAGAATGGTCGTTCGTGTGAATCCAGTCACGAACGTTTTTACCACTACCATATAATTTTGGCCGAATACCACTTAAAATATTGGTAATTTGGCGTGGAATAAATTTCTCAATATATTGATAAGGGCCATAGTTATTGGAACAGTTCGAAATGGTGGCTTGTAACCCAAACGAACGCACCCAAGCCCGCACTAAGAGATCACTGCTAGCCTTAGACGAAGAGTATGGACTGGAAGGCTTATACCGACTAGTTGGTGTAAACTTCTCGCCAACACCCTCACCATGGCCCGGTAAGTCTTCCCGTAATGGTAAATCACCGTATACTTCATCAGTGGAAACATGATGGAAGCGCTTGTTGAACTTATGTGCGGACTGAATCAGCGTATAAGTCCCGATAATATTCGTTTCGATGAATGGCCATGGATCCTTCAATGAATTATCATTATGGCTTTCAGCGGCGTAATGGACAACTGCGTCAGTTTGTTGCATTAATTCATCAACTAAGGGCGCATCACAAATGTCACCCACAACTAATTTAACCCGGTCGCCTAGAATTTCTTCTAAGTTAGCACGATTACCGGCATAAGTTAATTTATCTAACACAGTAATCTTAACTTCGGGATGGTGGTTATAAACATAATGAACAAAGTTAGAGCCGATAAAGCCGGCCCCACCAGTAACTAGTAAGTTTTTCATAACGTCTCCTTAAATTTCACCGTAAACGAATGGGTTGTTCTTTTCGAATTCTTTGAACGTCTGTTGCTTTGAATCCTTTTCAGAAGTAATGGCTTGGTCAAAATCAATCGGCCAGTTGATGTTTAGGTCTTTATCCATAAAGGTGATACCACCATCCGCTTCAGCGTCGTAGTAGTTATCGCACTTGTACAAGAAGTTAACGTTATCCGTCAAGGTTACGAAACCATGGGCAAAACCACGTGGCACTAATAATTGACGGTGGTTACTTTCAGAAATGATGTAGCCTTCCCATTCACCATAAGTTGGTGAGCCAGCCCGAACGTCAACGATGACATCAAGCACGGCACCAGTAACGACACGAATCAGCTTGGTTTGAGCTGCTTTTCCACGTTGGAAATGTAAGCCCCGTAGCACACCGGCTTCAGCTGACAATGATTGATTATCCTGAATAAAATCAAAATCAATCCCGGCTTCTTTGAAGTCCCGGTCTGAATAGGTCTCCGTAAAGAAGCCCCGCTTGTCACCAAAAACTGCTGGTTCAATAATCTTAACGTCTTGTAACTTAGTCGTTGTAACCTTTAATTTACCCAAAACTTAAGCCCTCCTACTTTCATTGATCATAATTTATGATGTAATCCTATCTAAGTATACTTTCTTAACCAGCAACTTATCAAGCCCCAGCAATAATTTACACTATCTTCAAATTAAACTATAGACCCGTTAATGCTTCTTTCTGCCTCGATTGCCGAAAATTACTGGAACATGCTTCAAAATAGATGGCTGTAAAATTAACATACAGCCAAAGTAAATTAATAACCCTTCAATTATTTGTAAACTCAAACTAAAAACCGTGATTTTCATTGCTACGTTGAGCATATAAACAACACTAAACATCAAAACACCTGAAAATAAATACTTCCAACAATTCACGAATAGCTTCTTAATGTGTAACTGGCGTCGAACTATTACCAACTGATATACTGTAACCGTCAGTTCGGAAAACACGGTAGCCCACATAGATCCTTGAACACCCCAAACGATTATCAGAGGTATGTTCAAAACTACGTTTACAATAGCACCCAACGTGACTGAGTATGTGTATACTTTTGTCTGCTTAGTTGGTAGTAGATATTGCTGACCAATAACATTACTTAAGCCAATCAACACAATCACTGGAGATTCGATCATAAGTAGTGTGTTAACTGAAGCAAAGTGCTGGCCAAAAAACCACGGTGCAAGTGTAGTAGCCACACCTGCAATTCCAAACGCCATTGGAATTGATATAAAAAGTGCAAAATCAAACGAATTGTAGGTGTACATTCTAACTTTTTTCAAGTCGTGCTTCGCAAACAGATTAGCAATTCTCGGCAACATCACGATACCTGTTGCGGTAACGATTGCTAACACTAGTTTGATTAGTTTATCTGAATAATCGAAAAAACCTGCAGCAGTAACCGAGTCTAACTTCCACAACATCGTCTTATTCAGTGCTAAATATATTTGAATAGCAACCTGTGGAATGAATAAACTAATCGATGGAAGCAAATGGTGAAACGGCCTTAATTTCATAGCAATTGGACTCAAAACTGAATGTCTTAAATACGGCCATAATGTCATATTACCTAAAAGCTGTGACAATGAAATAATTAAGATGTAGGTTCCAATGTCATTCGAATTCCGCACTAATGTAAAAATAGCAATTAATGAAGCCAACTTAACCAGCACATTACGAGTCACAGTCTTACGAAAATCTTCTAGCGCCATGAAATACCACGAAACGTCAAATGCACCTGCAATAACTAAAAACGATTGGTAAAAAAAGTACATGCGAAATTGCTTTTGATAGAATAGGTACACTAGAAACAGCAAGTAGGCAAATGTTATAGTCATAATTTGTAAAAATTCAATTTCCCAAAAGGCTTTTGACCGTTTAACCTTATCTTCTCGAATGAAAGCAATCTCTCTATTTCCATAGATGGTGATACCAACCGTACCCAGAAGTAAAAAATACGTGATAATAGAATTAGTTGTTGCATTTACACCAACACCATATGGGCCTAAAACACGCGATATATAAGGGACGGTTAATAATGGTGTCAATAAGATCAACACATTATAACTCATATTATATATATAATTTCGAATCAGCTTCATTAAAACTCTCCCTTAATATATTGGTGCCTTGAACTAATTATTTAAACGTTCATACTCAAATTGAACCTCTTGAAGGTGAAATTCAAAATTTCGTTTTTCTTGCTTTACTAATGAGTGCAGTATAAAACCACTGTACAATGAAATAATTGCGGCTAGTACTAGAAAACCGCACACGATTAAAGTTGGAAAATTGAATACTTCTCCCGTTGCCAAGTATGGAAGCCACACTGATGGTATGAAGAAAGCTGCCGCTACAAATACAAACAACGCTGCCACTATTGAATAGAATAGTTG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91 | Lactobacillus_phage(62.26%) | tail,head,integrase,portal,terminase,holin,capsid,tRNA | attL 1213638:1213653|attR 1229550:1229565 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1285259 : 1356163
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP025991|1285259:1356163|DBSCAN-SWA TATGAGTCCGTACAACCATCTTACCTTAAAAGACCGAGAATGCATACTGTTGGGCGTCACTTTAAACGATACCTATCAAGTTATTGCGGAGAAAATTGGGTGTTCCAAAGCCACCGTATCGCGCGAAATCAAGTGCAATGGTGGTCTTAAGGCATACTCGGCCGTCAAAGCCCAAGAGAACTATCAGGGACGGCGGCTAAAAAGCCGACGTCCTAGGCTTCTAACTGATTTGAAGTTACGGGATTTTGTTTTTCACTGTATTGTTCAACGTCAGTGGTCCCCGGAACAAATTTCCGGTCGTTTAGTCCACGAAAACAGTGAATGGCATGTCAGTTATAACACCATTTATCGTGGGATTGAACGTGATAATTTAGGCATCAAACGTAAGAATCACGAGGCTCATGGCTTTGCCCGTAAGCTCCGTCACCGTGGTAAAACCCGAAAGGTCAAGGGAACCATTAAGGAACGTCGGGGACGATTTAACGACGTCCCTTCCGTTCATGAACGACCTGTTTCATGTGAGAATCGAAGCTGGTTTGGTCATTGGGAAAGTGATACCGTTCGCGGTAAAACCGGGCGTTCGGCCCTGGTAACCTTGGTGGACCGCAAATCTCGGTATTTATTATCTCAGCGGGTTCCCAAAGTAAACGCCAAGAACGTCACACAAGCGATGATTGACCTCTTGCATACCGTGACGCCCAAACGAGTTCGGACGCTTACGCCGGATCGTGGAACTGAATTCGCAGGATACCGCGAAGTTAGTCAAGAGCTAAGTATCCCAATCTATTTCCCAGATTCTCATGCGCCTCAGCAACGGGGAACCAATGAGAATACCAACGGACTTATCCGTGAGTATTTCCCCAAAGGAACCGACCTAGACCAACTGACTGATCAAGATATCGACAAGTTTGTCAGGGATTTAAATCACCGACCACGTAAGGTCTTAGGCTGGAAGAGTCCATTTGAAGTTTTCTTCGGGACAAAGTTGCGCTTGATTTGACAATTCGTCATACAAAAAATGACCTAGCTAGCAATTTGCCAAGCAAGGTCATTTTTGTCATCAATATACTTTAGTCCTTCACCGCTTTAATCGTATCAATAATCGTGCCATCGCGATATTCAATCAAGGCAACGGTGCGATCTGTAAATTCAAGTGGTTGGGGTTGGCCGACTTTCTTTTCGGCTAATTGTTGTAATTCTTCAATCGTATAGACCGGCACACCTGGGACATGACTGAGTGCTTTAACTAGGTCTTGACGCCGCGGGTTGATTGCAATCCCGTATTCCGTCACAACAACGTCAATGGAGTCCCCCGGCGTTACAACGGTTGTTACTTCTGGCACAATCGTCGCTAACCGACCACGGACAAGTGGTGCAGAGATAATGGTCAGTTTGGCCGTAGCCGCGTCTTGATGTCCACCAATGGCGCCACGAATCACGCCATCCGAACCGGACATGACGTTGACATTGAAGTGCGTATCAATTTCCAACGCACTCAGAATGGCAACATCCAATTGATCAACCATCGCTCCTTTATTATCAGGGTCAGCGTACCATGATGCGTCAATTTCTTGTTGATTAGGATTGGCGTGCATCGATGCTGCCGCCCCTTTGTCAAAGTCTTGAACATCCATGACTTTATCAACTAACCCTTCTTCGAGCAAATCAGTGGTTGGTTTCGTAATACCACCAAGTGCAAACGATGCTTTGATTTGATTATCGAGCATTGCTTGCCGCAAGTACCGAGTGACAGCCAACGCAGCACCGCCGGAACCAGTTTGGAATGAGAAGCCGTTTTTAAAGTATGGTGAGTTCACGATCACATCATTAACGGTCTGGGCAATCTTCAATTCCTTTGGGTCCTTGGTGAAGCGCGTCGCACCTGAACCAATCTTGTCAGGGTCACCAACTTGGTCGACTTGCACGACGTAATCGACTTGTGTCTGTTTAATTGAGGCCGGTGTATTTGGATAAGCCACAATATTATCGGTCAATAAGACAACTTGGTTGGCGTATTGCGCATCCATCAGGGCGTAACCTAAGGAACCAAAGACTGCTTTACCAGCCATCCCGTTCGCATTTCCTAGTCGGTCAGCATTCGGCACACCTAGAAAGGCGACATCAATTTTAATATCACCATGTTCAATGGCCCGGGCCCGATTACCATGAGAACGGAAGATTACGGGGTTCTTTAAACCACCGTGTGAAACGAAGTCCCCAAGAGAGCCCCGCATCCCCGAGCTAGTAATATTCGTAATCGTTCCGGCCTTAATTGCTTCGATCACCATATCGTTCATCACGCCCGTTAAGGAGGATGGCGCCAAGGTCAAATCTTTAATACCGGCATCAATAATGGCCCGCATCACTTGATTGAAGACGAAATCCCCATTACGAAAATGGTGGTGAAATGAAATCGTCATACCATCTTTGACAGTGGCTTTTACCACGTCAGCAACGGAATCAACGACTTTGTTGTCCCCTGTTGAAACGTGAACTTTGGGGGCCACCCGTTGAATTTCAGGATGTCCGATTTCAGTTGACTCAAAACCTTGGTAATTTAACTTCGTCATTAATTCTGCTGGTAATTCGCGGTCTACACTATTTTTCAATGTAATTGCCCTCCTCGTCGAGTAAGTTGGAAACTTTGGCTAAGCTCATCACACGTTGAGCCCGCAAAACAACGGGCCGGTCTACCATTTGGCCATTCATGGAAATAACACCTGAACCCTTGATCCGGGCTTCCTCAATCGCGGCGATGACTTTTTGGGCCTTAATAACTTCATCCTTGGTTGGTTCATAGACTGAATTGACCATTGCAATCTGTCGAGGGTTGACCAATGATTTACCGTCAAATCCTAATTGATGAATATGCCGCGTCTCACGGTAGAAGCCATCAGGATCGGCCATGTTTGTAAAGACCGTATCGAACGCGGCGATTCCAGCGGCACGAGCAGCATGAAGCACCATGTTACGGGCAAATTCCAGTTCCGCGCCATCAGGATAACGGTGGGTCTTCATGTCCGTCGTATAATCTTCTGCTGACAAGGCGATCCCAATCATTCGATCCGAGGCTGCCGCGATTGCCGGGGCATTAAGCACGCCCTTAGCGCTTTCAATTGCAGCCATCAAATGAGTCGTGCCAACTGGTATCTTAAATTCAGCTTCAGCTGCCGCGACATCCTTTTCCAACGTTTGGATCATGGCAGCCGATTCGACTTTGGGCAAACGGATAACATCAATGCCAGCCTTGACCATTGCTTTGACATCATCAGCGTAATACTTGGTATCCAAACCATTGATTCGAACGACCAATTCAGCGTTGCCATAATCTTGCGTTTTTAACGCTTCGTAAACCAGCACCCGGGCCGCATCTTTTTCAGCCATTGAGACGGCATCTTCCAAGTCAAACATGATCGAGTCTGCACCGTAAATCCCGGCATCCTTTACCATGGCTGGATTATTACCAGGTACAAACATCATTGTCCGCCGTAAGCGTTCTTCATTTTCAGCCATTATAATACCTCCCATGCTGGTGTCGTGGTTTCTAACGCCCGTTGTGCTGCCGTAATGGTCCGCGCTTTAATGACGCAGTCCAACGCCCCTTTATCAACAGCGCGCACCTTCACATTATCGATATTCAATTGTTGAAGCGTCGTCGTGATCACGTGCTTGATTTGTGCCCCGAACTGTTTGATAACATCCGATTCAAGGTCGATTTGAATGCCGTTGTCTCCCGCCATTAACATAATTTGAATATCAGATGATTCCAAGGTTCCGGCGACTGCCGTTGTCTTAATTTCCATCAATTTTCATTCCTTTCTGAATTCGCGCTTGTAATGTTGTTAGGTTATTTTTTATAAACTGGGCCGTTGTTGCCGGTACCAGTTGGTTTAACTCAGTTAAGTTGCCGCTTTGAATCCGTTGCCGAACAGTCCGCGCCGAAATTGGTTGATTAGCCACCGTCGTTCGCGATATCACTCGTACAGCAACTGCCGGTGGTAATTCACGCTGCAAAACTCGGTTATAAATCGCAGTCGTCCGCGACGTCGGTTCACTACCAACGAACCGGGTCGTAATGTGCAGTGCTGGTGCAAGTTGCTGCTTAAAGATCCGGGCGTCCAACGTCGTCTGCGCCTCAATTGCGCTCGCCGCTGAATCCAAGAAGTAGGCTGGAAAGGTCGCTGCACTCACGAGATAGTCCTGCCCGCTGACGATCCGAACGTTGGCCAAGTCGGCTGTTCCTTGTTGAACCAGCTTAACGCGCTCGGCCGTACGGAATAGACTCGCATCTGTCGCAACGACGAAGACGTAAACTAAATCACTGACCGCCGCGGCTTGTTCCACTAAATAGCGGTGTCCCCGCGTAAACGGGTTCGCATTCATGACAATCGCGCTGACACGCTGTTGTGCTTGGTTGGGAATCATCGGCAACTGTTTGACAAAATCCGTCATATCCGGTGCGCCGTTTTCTAATACGGCCGCTTCATCCGAATGAGCTAATTCTTTAAAGCCTACGTGTTGAAAACTCGCTGAATACTTGGCCTTGGTAAATACCATCATATGAAAGATCTGTGCTTGAAACAGCCGATTGACCAGTGCACTCACGATTTGATTAAACCGGGCCCCCGGCTGACTATTCTTATTACAGACACCCACATATTTAAGCACGTTGCCAGCTAACGATCCGGTCCCAACAAGTTGGCCATCCTCGATCAATCCTAAGGTCACATCAATATGTTCAACCTCTTGCGGGCTAAAATTAGTAATCCCTAATGACGTTAAGAATTGTTGCCACTGGGCATGCTCGTGCGGATTATTTAATTGCATTTCAACAACTTGCGCTGCCATCAGACAACCTCCTATGATTAATGCTGTGCTTGCGCGTACGCTGCAACGGCCGCCGTCACGTTCGGTACCACTTGTGAATCAAAGACGCTCGGCACAATCGTCGTCGCAGTTGGGTTCGACACGGTCTTAGCCAAAGCCTGAGCCACTTGGAT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87 | Lactobacillus_phage(63.89%) | tail,head,portal,transposase,integrase,terminase,capsid | attL 1287511:1287526|attR 1360406:1360421 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1711941 : 1719861
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP025991|1711941:1719861|DBSCAN-SWA CCTAGTTAATTTGCAATTGGTTCCCTGGATAAATCGCACTGTAGATTGACTTCCCGTTTCGACTGGCCAGCGTGTATACGCCTATGCCGTTCCGTTGAGCAATCGCCCACCATGAATCACCGTACCTGACTGTATAATACGTGTGAGAATAACCAGCTTTAGAATACCACTTGCCAATTACCAGTAATATCAGTTTCACAGTAGTGAGTATTAAAGTTGCACGATTTCTCATGTATTCCTATGATAATAACGGAACCTAGTAATAATCTGGTTTCCTCTTTCGCTAAGATACTTTTTCTTATGTATTAGCCGTCTGTCCTTACAGCAGGCGGTTTTTTACGCAAAAAATCCCCCACGCCGAAACGCAGGGGATTAGCAGATTCAATATTTAATTATACTACTTTTCTCCTGATTATGAGGCGGATCCTGAAGTTGTTTCAGTGTCAGATGCTGCAGAACTATTCACTACAGCGGCTGTGGACGCCGGCCCTTGCACTTCATCAGCAACCTTATTAGCCGTTGCTTCGACTTGGGTTTTCTCATCACTGTCAACCGTTGGTGCCGGCACTGTTTGAACGTCAGTAATAACACCCAGCATACCCAGGATTGTTAATACAGTATTAATAACGGCGACAATGGCTGACCAGTCACCAGTAAATTTAATGCCAAACATGGCTAAGACTTGTTGAATCAAAACGATTAGCAAGGAAATAATCCCAGCAATCAACTTACCATTTAAACTTCCGTCGGCATTCTTAAAACTAATTTTTTTCATTTCCTTTGGCTTCCTTTTCATATAGATGTTTAAATTCAATGTCATGACCATCTAATCGGCCTTCTACCTTAATGACCCGATTTTCAATAGCGTTCATTGTGTCGGCATTTTGCTGTCGTACTTTTAAACTTTCATCGGTAAACCGGCTAAGGCGCTTACCTAAGTCGTTAAGTGGAATACGAACCGTTTTATTTAAAATCCAATTAGCTAATACACAAATACTAGTGACAATGGCAACAATCGATCCCCATTCATCCCAGCCTAATCCTAATAGTGTATGCAATTACCGCACCACCAATCGCTGACCAGGATAGATAGTGGTGTAAATCGTCTTGCCATTCTGATTAGCTAATGCAGTCATACTTAATCCGTTCCGTTGAGCGATTACCCACCAACTGTCACCAGACTTGACTGTGTAATACGTGTGAGCGGCACCACTTTTTACATATTCCAGCGTATTGCTTGCCGGGCCAGTTGCTAGATATCCATAACCATTAAAACGTGGCTGACGAACCCAACGATAACCACCTTGAATAATAGCTTGATCAGTTTTTATCGTAGTGCCTGCTGATAAGCTAGTGATAACACTTGATGAAGTCGAGGCGCCAGTGCGTAGCTTAACCGCAGTCTTGAGCGTGTAAGTCTTTGTTTCCTTGACCCACTTGGCTGACGTAGCTGGCTTGGAAGTGTTTTTGTTGGCTTCCTGGTTGTTGGTCTTAACCGCATCTTTATCGGTCGGTTTGACCGTTGATTTCTGACCAGCTGTGTAATAATCAGTATAAAGTTGACTGACGTCAAAGCCACCGTAACTAATCCGGAAATGGGCTGCCCCGGACCATTGCCAGGCATTGTTATTCGTATACCATTGCTTGCCAGCTGGCACAAACGGATAGCCAGCAATCCAACCTGTTTTGCCCTTGATGGTCATCTTGTTGTTAGCCCACGATCCAGACGTATAAATGTCGGCCCGGTAGCCAAACTTCTGAATCTCTTGCATGAAGGCCGCGTTATTGTGATCATTGGTCGCTTGGGACAAGTTGCCCTGCTCTTCGGCCTCCACGTCCGTTGCCAATACTGCGCCCACCGGTAACCCGGCCGCTTTAGCTGTTTGACCAGCATACTCAGCTTCGGCAATGGCCTGGGCCTTAGTCGTATAATGGGCAAAATGATAGCCGTTGACGTATAAGCCAGCCGCTTGACCATTAGCGATATTGCTAGCAGCATAGCCATCTTTGAAGGTTGTACCTTCACTAATCTTTACGGTAAGGGCCTTAACGCCAAATTCATTACGCATCGAAACGTATTCGGCGGTGCTCATGTAGCTGTTGTTATTCGACACATCGACCATATCCATGCGAGCGGCGTTGGCATTTAGCCCTAAAAAAAGAGCTGCCATGGTGGCCGCTCCTGTCAGTGCTAGTTTACTTTTGAGTTTCACTCTTATCATCTCCCGTTATTCAGTGGCTGGCGCCACGTAGTCCTCACCAGTGATTTCTTTGTACTGCTCAGCTGTCAAACCTGACCCTACAAACACTTTGTAGTAGCTAGCGTCATTTTGACCCCAAGATTTAAATAGTTGGCATTTGTCATAAACAGTCATTATTCAGCACTCCCTTTACTTAAAGTTGCAATCTTTGCTTCTTGATTCATAACCAATTTTTTCAACTGAACAATATCCATTTCCTGTTGCATCAATAATTGTTGTTCAGCCGTTGGTGTTACTGACACTGGCACTGGCTGGTTATTCTCCCACTCTGCTTGAGAAACACCGACCCAATCAGTGCCCGTCCAAGTCAGTGGATCAAGCAGTCCAGCCTGTGGTTGGACAAAGGTTGCGTTAGCTGGCAGATCGGCAGTATCACTGACAATACCAATACGGGTTAACTGCTTAGATGTCTGATCGTAATAGAATACTTGCTTCATTTTATCGCCTCCTTAATTGATAACAATGCCGTCAAAATGAACCGCATTGGTTACAGCACCACTCACACTGACCAGCCAAAAGTCGCCCTTACTAGTGAGCGTTCCAATGGCGTAATTCCCACCAGCTTGTCCGAGAATGAAGACCTTATCATCGCCGCCGAAGTCAGCAATGCTATCAACGGCAATGGTGGCAGCTTTAACTGGCTGGGCGTTTGAGAAATTGTTTGGTACAACAAACCCTTTGAGGTAAATTCCTGATGCCGTTACTTTGTAATACAACCTACCAGTGATAGGGGCATACGTAGTTGCTGTCAACCAACCAGTATCGCTATTCAACGAATCTAAATTCTTATTCATATCGGTTGCCCAAGTGCTTGATAATGGGTCAATTGTAATTAATTTTGAAGCCATAGTTATTTCCTCCTTAATTTTCAGTGAATATCGTGTTCAAACATTGAACGCCAATGGTCGCCGCACTACCACTTGATAAATAAACCCACTTACCTGTTGATGATAGGTTGACGGTTGCCTTAGTCACATCAAAATCGGGTAAAAGCTGTTTTAATTGCGCAAGCGAAAATTCAAACACTACGGTGTGGTTTCCCTTGACATCGGCTGTTAACTTTAATGCGAAGACATCTGGGACGCCATAGCATGGCTGTTCTTGTGGAATACCAGCCCCTCCGTAATACCCATAAGCAACGAAACGTGGCAAGTCATTGCCAGCTAAATGTTCAACACTAAATGGCACCTGCAAACCATTTAAGTCGGTCGTCGCCAAAGTTTCAGTCGTGACAACGTTGTTGTGAGCAAGTTGGTCCTTAAAGGTATCAGTCGTGATCAAATTTTTGGCTTCGATTTGTTTTTGTAGTGAGTTGAAACTTGCTTGTAACGTGTTATACTGCTCAGTTAAAGTGTTCTTAGCCGCTGTTAAGGTCGTGTAATTATCACTCCATTCCTTAACAGCATCACTAAACTTCTGGCGCCATTCATCAAGTAATTTTTGATTGCTTTTTTCAAATTCTTGTGACTGATTATTAATCGCATTAAATTCATCGTTAAACTTCTGCTTCCACTCATCTAACAATGCTTGACAATCAATACCAGTTTGCCTTAATTTGGCCTCTGCCTGATTCATAATGTCTTCAATTGGTGTAATATAATCCGCTGGGATTAAGCCAGATATAACTTTGTCAGCCAGCACTGTCATGTCAAATTCTAGGGTGGCAACGCTGTCGCCATCACGCATGATACGAAAAAACGCCTGCACATAGCTACCAGCTATGGCAAACGCTTGTTTTGGCATATCGAATCTAAACTGTCCCGTTAGCGGGTCTAAAATGACACCATCCCAATTATCATAAATACGAGTTGTTTTATCGGGTAACAAGCCCTCAAAGACAATATTGCAACCCGTCAAATTAAATGGCGTCCGATCGTCATTTAGCATATTAACAAACACTTGCCGCATGGCGTTTTCATACTGACGAGCCTGAACCCAATTTGAGGTACTTTTAGCAAAATCGATTTTAAAATTTTGAATATCTTTAACTAAATCCCGGCGATCCTCGCCGATGATAAAAGTTAATTCCATTTAAATCACTCCTTTTTACGAGTTGCCAACATCGGTGCCGTTAATCTGAATCCAATGCCCCCACACAGCCGGTGCCCCAGATTTCTGTCGAAAATACATCTCACTGGCATTGGTATATAAATGTTGCGTGATGACATCACCAAATTCCTCTTGATCGAGGGTGCCATACCGTTCGAACCCTTGAATTGTCTTGGGACCATTCTTCCAAGCCAGCATGCCACCAAAGCCATAGTGACCAGAAGTATTGAGAATGTTTAAGTCAACATTAGCCACATCCAGTTCTTCGACCACGGTGGCAATATCTTCGTTGGCTAAGCGATATTCGTGTTCAAAGCTCCCCGATTCAAACATCACGTTGCTAATGGTATATGTCGCAGCACTGTTATCAAGGGTGAACCTTAGTCGGTCACCAGCAATCACATCACGTGGTACTAGCAACACGACGGAAACATGTTGTTTCCCATTAATAAACTGCTGGTCAAAAGCATAAGCCGACCAAGCACCACCACCCAAAAAGCCAACAAACAGCTGGCCATTATCAGCCTGTTGCACGTCAAGGTCAAAGGTCAAGCGAGTCACGGTGCCTTGCTTTAAGGCACCTAAAATGCGGTTCGACAAATCGTATTCAGCCACAATTTGACCAGTCTTATTTTGACCAGTAAACGTAAATGGCTGATTACTACCAATGACATAGTTAACGCCGCCTTTAGTGGAGTCTTCGAACGCGCCGACGATGCGATAAGGTGCCGCTGGGTTATTCAGCCAGCTGTCATCAGAGCCATAAGTCATTAAGGTTACTGGTCGATCATAGTCCGCTAATGTCCATGATGGGGCACCGTTAGGCGCATAGAAAGCCTCATTGCGATTGATAACAATCTTAGAACCAGAACTGTCCAAAATAATGAAGTGAATTTTAGAAACCCCTTCGTTATTAGCCATGTGCAAGTTAACGACAGCCTTAAAGCCACTTTTCTGCCCATAGGGCACGTAGTAATAATATTCCAGCCCTTGTCTTGGATAGAGGTCATTAACCCCATCTTTGAGCGGTACCATTGGCAATGACGTCCGAAAGTTAGCGACACCACTGGCTAATGTGGCTGGGCTATAGTAAGCAATAGCCTTTTGCACAATGTCACTGGGCTGTTGATTTTGTTGGTCCAATGGCAGAACTGTGAAGTGTTGTGTTCGGGAACCGTCACTAGCGGTCACTGACTGTTCGTTTTGCCAATGAACACCTTCCGCAGACTCCATGCGCCAACTCGTATATGTTTCGAAGCCATCAGCATAACAGTATAGCCGCCCGTCAGCGACAATCAGCGACGGGCCTTCGCAATGTTGGGTAAAGGGAATATCAGTGACATAGTTAAACGGCCCTTCAAACTGATCTGCTTGATAGAGCTGAATCTTGGGGCTATAATCGGCCAGTCCGTAGTGATAACCATACTTCATCGCTAGCCACCACTTGCCATTGTAATAGGTAGCGGTTGGGTCAATATTATTCTCGTACTCATTATGACTGCGATAGGTCATCTTGTGCCAAGGCGTAAATTTAAGCGTGTCAGTATCAAGACAACATTGATAAATGCAGTAATCAGAACCACTATTCCAGAAGCCGTTAGTGCCACCAGTGCCCATTAAATGGAGCTTATTACCATCGACAACCCACTCTGGGGCCCAATTAACTTGTCCTGGAATAATTTCAGGTAGCTCAAGCTTAGTAAAGTTAATTAGGTCTTCGGAATAGCAAGCCCCCCAAGTATAAGCCAACCAAAACTTACCATTAAACCAAGTAATGCTGGGGTCCCGAATGGTGCCCACGGCTTCAACCTTAGATTTGTTAATCGGATTAAAAGTTAAGTAATCGTTTGTCCAATACAAGTCAAGCGAATTAAAATTATTGCCACCAAAGGCTGAGACAATTGCTTTAAATTGGTAAGGTTGTGCAATCGTATATTGCCCAGTTTGGTAATCCTGTAGAACCGTCCGCAGGGCAACTTTAATGGCTTCAGAATCAGTCCCCATGATAATCCGGTTAATCCGGGCAGTAAGTTCTTGAGCCTGTTGTTTCAAGCGATTCACAGTTACTTGATCTTGTGCTGACAGTTTCCCATCGACGCTTGTATTTATATTTGTTGTCAGCGTGCTCAGTTGCTGGTTAATGTTGCCCTGATATGTTAGCAGCTCATTCAAAACTTCTTGAGTCGTGGCGAAATTCGAAATGAGCAGATTACGGAATGGTGCGTCATTAACTGAAGACAGTTCATTCGTTGCCAGTTGTATTGCCATCTTCTTCCTCCTTTTTTGCTTTTTGCCAGATGACTTTCCCATCATTATCAATGCTAGGTACCCATGCAGTACCATCTGGTGACGTCAACTGCCCAATTAAACTTAGTCGTTGGTCCAAGTCATCACTAGTAACTAACTCTGGTTTATTGGCAATCTTCTCCCAGCTAATTGGAAACTGCATTGAAAGGATATTAATAGCCTGTTGCACCGTCATCTTATCCATTCGCGGCACCACCCAATGCATTAAGTCTTGCTAGTGTACTCGTGTCAGTAATCAAATCATTGCCATCTACAGCATCAAGTCCGGCTTTTAATTGCTCAATCTGTTTACCAGAATCATTATGTGCAGTCTGCAATCCCGCGGTGATTTGCGTAAAGCTTTTGGTCATATTGCCAAAGGTTACGCTTGTCGTCGCTGGGTTAACCAAATCAATCACGGTTTCACTGATTCGAGTTTCAACATCAACACCATTACGATCCCGAATATAGCCGTAATTCCCAACCTCACTGTTATTAATCATTCCAGGTACCGAGTTAGTCTTGAAATCATTCAATGTCGCAGTTCGTTTAATCAACGGCACATCTTGTAATTTTGATTTCAAATATGCCAATAGGGAATCACTATTCGTGAACCGCTCATCAGAAATTGGTTCTGCGTCAATTACACCCCACGTTATTGCGTTAGGACTCGTGTACTCAGCAGTAGCCAATGGCTTTTCCTTGTCGTCTAACTTACCTGTACCTTTAATATGAGTTGCAATCGTCGTGTAATCACTCTCATCTGTCAACGAGCTTAGATTCAATCCATCTAACCAAACGAAAGCATCACGCTTACCAACTTGTTTATAAATATCAATGTGCTTGCCCGTACTAGTCCATTCGAAATTGAAGTCTGACATCAAAGTGTTTAGGAATAAATCAAACGCTAAGCCAGTACCAAAATCTTCAGAGAAATCATAATGATCGAAAACATCATGAATCGTATACGTAAAACCAGTGCCTTCAGTAATTAGCTGCATGCAGCTATCGAGCGACTGAGATCCCTTTATACTCTTTTCAACGTAATGGTCGTTTAAATCGTGCACAGAACCTAGAAACGTTGCTTTGACATTACGACTACCACCAATGTTAGATCCATTCATGGTCTGAATACGATAAGCTTCGCCACTATCAGAATCCAGCAAGAGAGTGCGTGGTTGCAACATGCCCACAGCAGACGCGTTAGTACCCGTGTTAATGAACGTCAATTCCAGTTGCGCCACCTGATTCACAGTTTCAGTCAGTTGTGCTGAAATTGGGATAACTGGTAGTTCGTTACCTGTTACATCACGTAAATAAAACAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP025991|1711941:1719861|1712701_1712998_-|AUV72530.1|DBSCAN-SWA MHTLLGLGWDEWGSIVAIVTSICVLANWILNKTVRIPLNDLGKRLSRFTDESLKVRQQNADTMNAIENRVIKVEGRLDGHDIEFKHLYEKEAKGNEKN >CP025991|1711941:1719861|1711941_1712172_-|AUV72528.1|DBSCAN-SWA MRNRATLILTTVKLILLVIGKWYSKAGYSHTYYTVRYGDSWWAIAQRNGIGVYTLASRNGKSIYSAIYPGNQLQIN >CP025991|1711941:1719861|1712352_1712715_-|AUV72529.1|holin|DBSCAN-SWA MKKISFKNADGSLNGKLIAGIISLLIVLIQQVLAMFGIKFTGDWSAIVAVINTVLTILGMLGVITDVQTVPAPTVDSDEKTQVEATANKVADEVQGPASTAAVVNSSAASDTETTSGSAS >CP025991|1711941:1719861|1714314_1714638_-|AUV72532.1|DBSCAN-SWA MKQVFYYDQTSKQLTRIGIVSDTADLPANATFVQPQAGLLDPLTWTGTDWVGVSQAEWENNQPVPVSVTPTAEQQLLMQQEMDIVQLKKLVMNQEAKIATLSKGSAE >CP025991|1711941:1719861|1715062_1716232_-|AUV72534.1|DBSCAN-SWA MELTFIIGEDRRDLVKDIQNFKIDFAKSTSNWVQARQYENAMRQVFVNMLNDDRTPFNLTGCNIVFEGLLPDKTTRIYDNWDGVILDPLTGQFRFDMPKQAFAIAGSYVQAFFRIMRDGDSVATLEFDMTVLADKVISGLIPADYITPIEDIMNQAEAKLRQTGIDCQALLDEWKQKFNDEFNAINNQSQEFEKSNQKLLDEWRQKFSDAVKEWSDNYTTLTAAKNTLTEQYNTLQASFNSLQKQIEAKNLITTDTFKDQLAHNNVVTTETLATTDLNGLQVPFSVEHLAGNDLPRFVAYGYYGGAGIPQEQPCYGVPDVFALKLTADVKGNHTVVFEFSLAQLKQLLPDFDVTKATVNLSSTGKWVYLSSGSAATIGVQCLNTIFTEN >CP025991|1711941:1719861|1712998_1714159_-|AUV74046.1|DBSCAN-SWA MRVKLKSKLALTGAATMAALFLGLNANAARMDMVDVSNNNSYMSTAEYVSMRNEFGVKALTVKISEGTTFKDGYAASNIANGQAAGLYVNGYHFAHYTTKAQAIAEAEYAGQTAKAAGLPVGAVLATDVEAEEQGNLSQATNDHNNAAFMQEIQKFGYRADIYTSGSWANNKMTIKGKTGWIAGYPFVPAGKQWYTNNNAWQWSGAAHFRISYGGFDVSQLYTDYYTAGQKSTVKPTDKDAVKTNNQEANKNTSKPATSAKWVKETKTYTLKTAVKLRTGASTSSSVITSLSAGTTIKTDQAIIQGGYRWVRQPRFNGYGYLATGPASNTLEYVKSGAAHTYYTVKSGDSWWVIAQRNGLSMTALANQNGKTIYTTIYPGQRLVVR >CP025991|1711941:1719861|1716247_1718518_-|AUV72535.1|DBSCAN-SWA MAIQLATNELSSVNDAPFRNLLISNFATTQEVLNELLTYQGNINQQLSTLTTNINTSVDGKLSAQDQVTVNRLKQQAQELTARINRIIMGTDSEAIKVALRTVLQDYQTGQYTIAQPYQFKAIVSAFGGNNFNSLDLYWTNDYLTFNPINKSKVEAVGTIRDPSITWFNGKFWLAYTWGACYSEDLINFTKLELPEIIPGQVNWAPEWVVDGNKLHLMGTGGTNGFWNSGSDYCIYQCCLDTDTLKFTPWHKMTYRSHNEYENNIDPTATYYNGKWWLAMKYGYHYGLADYSPKIQLYQADQFEGPFNYVTDIPFTQHCEGPSLIVADGRLYCYADGFETYTSWRMESAEGVHWQNEQSVTASDGSRTQHFTVLPLDQQNQQPSDIVQKAIAYYSPATLASGVANFRTSLPMVPLKDGVNDLYPRQGLEYYYYVPYGQKSGFKAVVNLHMANNEGVSKIHFIILDSSGSKIVINRNEAFYAPNGAPSWTLADYDRPVTLMTYGSDDSWLNNPAAPYRIVGAFEDSTKGGVNYVIGSNQPFTFTGQNKTGQIVAEYDLSNRILGALKQGTVTRLTFDLDVQQADNGQLFVGFLGGGAWSAYAFDQQFINGKQHVSVVLLVPRDVIAGDRLRFTLDNSAATYTISNVMFESGSFEHEYRLANEDIATVVEELDVANVDLNILNTSGHYGFGGMLAWKNGPKTIQGFERYGTLDQEEFGDVITQHLYTNASEMYFRQKSGAPAVWGHWIQINGTDVGNS >CP025991|1711941:1719861|1718733_1719861_-|AUV72537.1|DBSCAN-SWA MFYLRDVTGNELPVIPISAQLTETVNQVAQLELTFINTGTNASAVGMLQPRTLLLDSDSGEAYRIQTMNGSNIGGSRNVKATFLGSVHDLNDHYVEKSIKGSQSLDSCMQLITEGTGFTYTIHDVFDHYDFSEDFGTGLAFDLFLNTLMSDFNFEWTSTGKHIDIYKQVGKRDAFVWLDGLNLSSLTDESDYTTIATHIKGTGKLDDKEKPLATAEYTSPNAITWGVIDAEPISDERFTNSDSLLAYLKSKLQDVPLIKRTATLNDFKTNSVPGMINNSEVGNYGYIRDRNGVDVETRISETVIDLVNPATTSVTFGNMTKSFTQITAGLQTAHNDSGKQIEQLKAGLDAVDGNDLITDTSTLARLNALGGAANG >CP025991|1711941:1719861|1714168_1714315_-|AUV72531.1|DBSCAN-SWA MTVYDKCQLFKSWGQNDASYYKVFVGSGLTAEQYKEITGEDYVAPATE >CP025991|1711941:1719861|1718492_1718741_-|AUV72536.1|DBSCAN-SWA MDKMTVQQAINILSMQFPISWEKIANKPELVTSDDLDQRLSLIGQLTSPDGTAWVPSIDNDGKVIWQKAKKEEEDGNTTGNE >CP025991|1711941:1719861|1714650_1715049_-|AUV72533.1|DBSCAN-SWA MASKLITIDPLSSTWATDMNKNLDSLNSDTGWLTATTYAPITGRLYYKVTASGIYLKGFVVPNNFSNAQPVKAATIAVDSIADFGGDDKVFILGQAGGNYAIGTLTSKGDFWLVSVSGAVTNAVHFDGIVIN |
11 | Lactobacillus_phage(100.0%) | holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1729451 : 1750288
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP025991|1729451:1750288|DBSCAN-SWA TTTAATGCACCCCACGATACAATAGGCCAGTTGGTCGTAAGTAGTTGATTGCCGCATTGGAGCGTTGTGCCGTACCACGTGGCAGCGTTGCGGGCGCTGACTTCTCATAACTAAATTTGCCTATCGTTACATGACTAATCCCTTTAGCCGATTGTTTAGCGTTAGCCAGTTCTTCAACCCCACCAGAATCAATAAACCATTCAATCTGAGCGCAGACAGCCTTCTTCACGTTAATTTGGTCAACATCAAGTGGCAAATCATCAAGACTATGCGAATCGAAATAATAATTCGCGTATTGATTGACCATCTCTTCGGCCCGCATTTCCAAACGTTCAAACTTAATATCAGCTGGTACCGTCTCACCAAAATAAACATTATTGTAAAAATCTTGATCTACTATCGGCATCTAATCACCTCTAACCAGCAGTTACACTGGCACCATCAGTGGTCGCTGTAGCTTTAACATCTTGTGGATCAGCGGGCTTAGCAGCAAGAACCGTAAATCCGGGAACATCTACCTTGTCACTCATTTGATTACCGTCCACATAGGCAACCTGATAGTCACCAGTAGCGACAACTGTGCCAGCTGCTAAGCCAGTAATTGCCACACTGGTTGCATCACCAGTTGCAATTGCCGTTTCGTTGCCCTTCTGATAAGCATTCAACACTTTAGCCATTCTACATTCCTCCTAAATTTAATTGCCTACTTTGCTGTGATCTTCGCACCGTCATTCGTAGGCACTGCTTTAACATTAGACGGTGACATTATTTTGACGGCGTATTAGATGCCGCAGCTTTACCTTTATTGGACTTTTTAACCGTTGCATCCTTAGTGCTGGTTACGTTTTGGTTAATAACAGTACCGCCTTCGACATCAAATGGATTAATGACTAACAACTTAGTGTCATCATAGATTGCAACACCATAATGTTCATCAGCATTAAACTTAGTGATCTTATGATCCATATCGCGACCCTTTTCAGAGAGAACATTCCGCTTCATGTAGGTACGCATTGCACCCGGCTTAACTGCCAAGGCGGAGCCTTCTTTGATTTTACGCGACCGCACAATTTGCCATCCGAGTAACTCACCAAATGTGCCATTAATCAAAATGTTGTCACCTAAATCAGTTGCTCGCGTCCAGTTCTCAGCAGCGGCCTTACGTAGTTTATTGACATCTTTAGGGTTCATAAACAATACGCCCGTGGTCGGTGAATCATCTTCTACCGCATATTCACTCGTATCATCATTAAATGCAGCTTCAATTGCATCGACCATATCCAATGACGTAACATCAACGCCAGTACTTAGCGTAAGTCGTGCTTTCATTGCAGTAGCCAAGATATCATTGTCAATCTTAGATGCAATTGCCATCGTAATTTGTCGCTGACCTTCGCCTACTGGATCTCCGTATCCGGATAGAGCGGCTTCGTCAGTAATCTTGACACCTTTACCTGCTTTTTTAATCGTGAACATGTCGGTATCTGTTGAAAGGCTGGCATAATCAATAGCACCACCTTCATCGACATCCGTCGCATCTCCGATATACTTGTATCGAGGTACAGTTACATCAGTACCTGGTCGACCTTCAAGTGTGGTGTCAACAGGTGCAATAGCACTAAACCGAATTGCCTTAGGTAATTTAGCACTAATCATCGCAGTCATAACTTGTGGATCAATCAGGTTATCTAATACAGTTGTTTCATCTGCCATGTGTTATTTCCTCCTAATTATTTGTTAGTTTTGTAACAGCTTGCTTGTATACATCCGGGTGCTCAAGTTTCAGTTTGGCAGCTTCACCGTAGCTAATCTTTGATAAATCTGGCACTGTAACGTTACCTTGACCACCACTAAGGTTCTGACCGGCAATGGCTGTTCCTTGTGCGGCTTCTGCACCCTTAAATGCTGGGTTACGCTCTAAAACCCCAGTTAACGCTTCATCGATTGTTTCCACACCATTAGCTTTACTTGCTAAGTCAGCCTTAGCGAGCGCCAGCGCATCACTCAAATGATCAGCATCAACTCCCTGTTTAAGAGCAGCTACTTGAGCTTCCGCATTGTCAGCGCGACTAGTTTCTTTTGCAAGTTTACTGGTAGCCTTGTCTAACTCACCGGATTTAGCCTCCAGTGCACTCTGATTAGCCGCCACATCTTTATTATGTTGTTCGACGACGCCTTTCAAGTCATCCTCGTTATCGAACCCCAATGACTTTAATAATTCGGTGCGCGCTTCTGTGGCTACCTGCTCAGTATCAATTGGTGCAGTAGTCTGGGCTGGGTCAGTTGCAGACGTTGTCGCTGGTGTCGCTGGATCATTTTCTGCCATCTTTATTGCTCCTCTCTAAATTTAGGTATAAAAAATAAGCCTTTTAACGCCATGCTAAGGGCACTACTGTTTTTCTCGATTGTATTGACGTACTAGTCCATGCTTTTTAACAAACTGACGAGTAACTGACTGACGACGTCTCACTAATTCTTGTGCAGCCGTAACATCACTTTGATCGCCAAGCTTTTTAGCTGCTATCAGTTTACGCTTAGCTTTTCGCACCCCACGTTCAAGGCGACGTTGAGTTTGTTCTAATTGATATCGGGTTGCGTTCTCATCATCTGGCTGCTGTGGCACTGGCATTGAACCGTGGCCTTCAATATATGGAATCGTATAATGTCGGCAATTAATGCCCCCAATGCCAGTAATCGTACCGTATCCCGTTGTTGATTCAAAATCTGGATACTTGTCCGTATCACCATCCAATGAGTAGACATGGTCTTGATACTGCAAGTGGCTTGGCCGACAACCAATATGTGAACTAACTTTAACTAACGAGCCATACTGACGATACCTAAGTAACTCTGTATCATTCGTAGCACTATTAATACTTGAGTTAACCACTGTCCGCACATAGACATCTGGTGACCATTTTCGACCAGCCTTATCAACGAGTGCGGGTACACCTTGTTCTGCCCATTGCTCACTAGCTTTAGCTATTGCTTTGATGGCAGTTGTACCGCTGTCGATTGACCACTTTGCATCACCAACAATTCCCCTAAACATCTGATACGCATTAGCGCTCATATTACGTCTAGCAAGGTTCAGATAATTATCTGTCTCTGTTAACTGGTCATCAACAACTTGCTTAAACTGTTGCGAATCCTTGATCGAATCCACTTGCTTTCCAGTAGCCTTTTTAAGCCACTTTTCAGCTTGTTTAACATTATCTTGGCTAATTGTACTAAGCTTCATGTGCAATTGCTTAGACGCATGCTGTGTAGGTGAGACAGTTATTTTAGCAGCATATTGCCTTACATCATCTGCATGATTAAGTAATTCGTTTATCCATTCATTGTCGGTATCATCATGTTTAGATGCTTCATTTCCTATTAGGTTGATAATGTAAGACCAGATCAAGTCTTCAACATTAGCATAGTTGTTAGCATCTTCATCAGAATAACCCGATAAATCCCATGGTTTAAGCATTATCCTCACCATCTTTACCATTACCACCGACAACATCTTCAATTGCACCTTCAGCATTTGCTGTTTCTGCATTGATTTGGTCAAGAACCTGTTGAGCCTCAACATCAGTAATTCCATTGGCGCGCTTGATTGCTTCTAGTTGTGTCATGACGGGGTGATTGCCATTAGCTTTCATGTAATAATCCAGATTATCATTTCGGTCTTTGGCAATCGAATCATCAAAGTTAACTGAAATATCAATATCTGTTTGACCTGAATATTGTACGCCTGGATCATTTTTAGCCAGCTCCACAATAATCTGGCACATATGTTCAATCGCTTCTCCAATCAACGTTTCATGGCTGTTTTTTGATTGATACGTATCACTATTCTCACTAATTACCGCCGTTGCTGTGATAACACCCTGTTTGCTGTCAAACGTAAACATATCTGCGCTGAAACCAATTTGTGAAGAGTAGAAATGCAACAAATCATTGATGCCAGCCACAATTGCTTCATTTCGCAGTCCTAATGTAATATCAGTCGGTTTCGCTGACTCACCATCACCGCCACTCATTGTCGTGTTGTATGCCATGTAGACATCTTCACTCCAATCAACATAATACCGTGTTTTACCGGTTTGTGGGTCAACTTCACGTTTCAATTGATTTGCTGGTGCGGCAATACGCCGTTTTCCTTTGACAAATTCTTGGAATAACAAGTCATAGGCTTCATCTAACTGGCGCAATGTGTCTATGGCGTTAGCGTAGATAGGAATACCCAATGGACTGTCAATGTGCAAGTTATTAGCTAAATTAGGCTTTAAATAGATAAACGTCGGCCGTGAATAAAGCTTTTTGGAATACCTAGTTGGCTGCGGTGACATGTTTTTGAATGCATCCGGCAAGTTACTCCAATCATCAATTTTCACACCCAAGTCATCATTGCTATTGGTCGTGCTCTTGTAGACTTCATTAGTCACGACATAGTCCGTATCTGTTTCTTCATGCCATTCCAATAACGTATAGTAATGACTGTCGCTCATGAATTTGGAGGCAATGACAGCTTCACTGACACCATTAGCATCTGACGTGATTGGATAGAATGCATCAGCGGTAGCAAATCGAATCTTAACTTTACCACGATCGGTATATAGACGAATCACAATGCCACCAGTTGCGAACATATATTCTAAGTAACGTTCAAAATTGTTATAAAAATGATTGTCCTTCAAGGTTTGCTGTACGAACTGATTCTCAACCGTTTGATAATCATCTGGCGATGAGGGATCATCAGGATTCTTCGCGTTCTTTGGGCTAACAGTAATGACAGCCTTTTGATTGAATACTAAACTTGCCATCTTCTTGGCGGCAACTTGTCCCATGTTTAATGACATCTTTTGGCGATCCAAGTCAGAATCATCGGGTAGCTTTTTATGAATTTTCAACCATTCTGGAGCTGATTGATAAATACTAAACCACTTAGCAATCAATCCGTACTGGTCATCATCCGCCATTATTTTTTTATGATCAGGCACACTTTGCAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP025991|1729451:1750288|1745432_1746095_-|AUV72571.1|DBSCAN-SWA MKFYEDGNIPEIPNMYFIYGDGGTGKTSLLKQLKGHKFVFSFDMSSNVLIGDKDVDVVIFEHNDAPNIQAMVEECIIRAIQNTKYQVIVLDNVTALQNLVLENIDNAAKDNRQNYQKLQLWFRDLGTILKESGKTIYATAHQLDNGSSGISGEGRFQADMNEKTFNAFTSMFDLVGRIYLAAGERMIDLDPEKGNHAKNRLDDRKLIKANELIQSEKGEK >CP025991|1729451:1750288|1732917_1734468_-|AUV72550.1|DBSCAN-SWA MGLAAELQSVPDHKKIMADDDQYGLIAKWFSIYQSAPEWLKIHKKLPDDSDLDRQKMSLNMGQVAAKKMASLVFNQKAVITVSPKNAKNPDDPSSPDDYQTVENQFVQQTLKDNHFYNNFERYLEYMFATGGIVIRLYTDRGKVKIRFATADAFYPITSDANGVSEAVIASKFMSDSHYYTLLEWHEETDTDYVVTNEVYKSTTNSNDDLGVKIDDWSNLPDAFKNMSPQPTRYSKKLYSRPTFIYLKPNLANNLHIDSPLGIPIYANAIDTLRQLDEAYDLLFQEFVKGKRRIAAPANQLKREVDPQTGKTRYYVDWSEDVYMAYNTTMSGGDGESAKPTDITLGLRNEAIVAGINDLLHFYSSQIGFSADMFTFDSKQGVITATAVISENSDTYQSKNSHETLIGEAIEHMCQIIVELAKNDPGVQYSGQTDIDISVNFDDSIAKDRNDNLDYYMKANGNHPVMTQLEAIKRANGITDVEAQQVLDQINAETANAEGAIEDVVGGNGKDGEDNA >CP025991|1729451:1750288|1737248_1737434_-|AUV72556.1|DBSCAN-SWA 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>CP025991|1729451:1750288|1742813_1743101_-|AUV72567.1|DBSCAN-SWA MNWGNQLVKLAANHAYESSALHWTKQRMKRHLKAGGSAQDEVCAHEYKLFALEVLIIEYQRDGLNFDLTQCWGKPAEYFIDLEQARQGLQTEVSA >CP025991|1729451:1750288|1747398_1747953_-|AUV72575.1|DBSCAN-SWA MSTQSSSVFAGRTLTDVMNHNSVAPIELSGKVGYSVTLIYKQRHDQARIRIESVPAFLAALPNQNQFFAIELAHRFVGVTTPVIDGDRIMKEPLAMAVKTMPELSQALAAIQDSLDELTIPKEDLKPNDFDDPKKLVAECFDAVLYLLNLIAYVCRGFDLSMQDQLKQRMKKWFKDGVVKHRKE >CP025991|1729451:1750288|1741587_1741926_-|AUV72564.1|DBSCAN-SWA MRQMNEIERQSVFIRMIQLGADGAAFMYRYENQDYSIIASYGGDWDHVSVSSKNRTPSWNVMANIKDIFFEPEEVAMQLHPAQSDYVNFDEHCLHIWRPQHSSIPLPPVDMV >CP025991|1729451:1750288|1747105_1747393_-|AUV72574.1|DBSCAN-SWA MMISMQNDDAEFINAVAVAVADRIMPQLEVLVKKYYTPDQGLNQQQAASMLGCSVDTLKDFYYYQPGFPHFKKGTKDSFSQKALESWMSDNQIRA >CP025991|1729451:1750288|1746603_1746735_-|AUV72573.1|DBSCAN-SWA MNGYDSWLIDQEEAAEGWRDDEPTEEELIESGVIADEEDDEND >CP025991|1729451:1750288|1749862_1750288_+|AUV72580.1|DBSCAN-SWA MNDKFEFFIEKLLQYAFDNNIGYTLVKKLDPYTPSFVAADQRRMFINMSWHNHDEIPFSIAHEIGHIVNGDTGELYYSPGSFKSKFERGANLKALEILLPIYVDANQGMIPHNYQTVMEQLQIPQILDNDVRVQLFRLDIY >CP025991|1729451:1750288|1739106_1739364_-|AUV72559.1|DBSCAN-SWA MNNYTGFKDHVGNKIYSDSLLEFCNTAPIASVTTLHLVERDTHGGYGIRYPWRENDVVNLEDFGVEDSATNELPFISTVVEHVQK >CP025991|1729451:1750288|1729451_1729856_-|AUV72546.1|DBSCAN-SWA MPIVDQDFYNNVYFGETVPADIKFERLEMRAEEMVNQYANYYFDSHSLDDLPLDVDQINVKKAVCAQIEWFIDSGGVEELANAKQSAKGISHVTIGKFSYEKSAPATLPRGTAQRSNAAINYLRPTGLLYRGVH >CP025991|1729451:1750288|1736862_1737078_-|AUV72554.1|DBSCAN-SWA MSQEEFETTQAISTVCFDLVRQGYSLNEIRSGLGNTMSAVGSDNNSAQYLLDEYNRKMKELSDQVDFYCGK >CP025991|1729451:1750288|1740467_1740659_-|AUV72561.1|DBSCAN-SWA MIKFKDSDCYPMLFDLFGLIAMSDKLTFPMVWRDKYYLKKVIEINIKNVIVLGRDLTREADDD >CP025991|1729451:1750288|1739731_1739977_-|AUV72560.1|DBSCAN-SWA MKAHVLKLYANYFNDVAHGHKRFEIRKNDRDYQVDDLLILREFVPQFGVYTGNMMVYQVTYMTDFKQRPGYVVLGIENFVE >CP025991|1729451:1750288|1735821_1736337_-|AUV72552.1|DBSCAN-SWA MTVYKSLQNGAFQSLDERRKKAIIMLFEDKLTDEEIAKTVNRSRQTLAKWKKNKIFIKAQQEYRHIALDNYVPDAIKQLHHLSLNARSEMVRLQANTTILTMAGFGSIDGTNELQNAQVRKANAEARIAEYQADQLEGKGETNPLLIGIQEAIAKDNEKGDDSDANVVEDS >CP025991|1729451:1750288|1738559_1739021_-|AUV72558.1|DBSCAN-SWA MMGEQQVISDEIFPPIDQEKTIKQVRRFLDKKLPQAVRASGHSVADLKSPSMDGMPKSAPSGNSAEDRITRRLYAEQIVRQTIQAMARCDHECQEILDRLYLQGYSDTMCYMDIGYSKTQYFDRWKPLAMLQFAQSYYLEDLNIYQNRTQTGL >CP025991|1729451:1750288|1746101_1746611_-|AUV72572.1|DBSCAN-SWA MIKEETAGMTLDEMEAKLEQATRDKKAFKKAMLKPQMEVDKYRKAIKTVDDQIDQLQELQRMAMGDQEQVDTEFFRFKMGTVNPSTSRNWNLERDKDATPKELTAVFERFDDTLIKTTRSVNETKIKNRLASGELYVTPDGKIMDSNLQALPGYSGALKKPKISVKAKG >CP025991|1729451:1750288|1741345_1741576_-|AUV72563.1|DBSCAN-SWA MSKLSMTLGHEAVVAYKVVLMFQGEIMKDDPKIYVQYSAAFKKCEQLNHLIKSDDYKWKLMCAKGWYDIDPNDKGE >CP025991|1729451:1750288|1748611_1748821_-|AUV72578.1|DBSCAN-SWA MKIQKAILSATSQGRGIARKSWGTRSRILLPTNTSAGFIRVPFKREGTILREWRPQMKDILATDWIVLG >CP025991|1729451:1750288|1744031_1744724_-|AUV72569.1|DBSCAN-SWA MQQSRAQLIEQDGQYYLVARLDEKPNLDHIETVSGSNSQFYMDWEMADTRKARPQQRRLFFALLSDIYTWSGMPTDFLKNLFYLQYESYTFGKQISLSDTTESSVSDANQLLDLVIDFMFEWHVPFKEGYKLLPREQEYYLFQCCRHRVCMICGNRADIHHVDVIGAGLNRAHVDHTKRHVMALCRIHHSEIEQIGSVAFSAKYHVPVDGIKLDKETLKRIGLKGKYSSD >CP025991|1729451:1750288|1737091_1737283_-|AUV72555.1|DBSCAN-SWA MNKVLLKKLNTEYDELTDKIAKAWPAASNLDIPDEQRQLIGIQARAMETYAWVLAIRICLLEK >CP025991|1729451:1750288|1731839_1733042_-|AUV72549.1|DBSCAN-SWA MELLMLRLNRFLTKSMQKQQMLKVQLKMLSVVMVKMVRIMLKPWDLSGYSDEDANNYANVEDLIWSYIINLIGNEASKHDDTDNEWINELLNHADDVRQYAAKITVSPTQHASKQLHMKLSTISQDNVKQAEKWLKKATGKQVDSIKDSQQFKQVVDDQLTETDNYLNLARRNMSANAYQMFRGIVGDAKWSIDSGTTAIKAIAKASEQWAEQGVPALVDKAGRKWSPDVYVRTVVNSSINSATNDTELLRYRQYGSLVKVSSHIGCRPSHLQYQDHVYSLDGDTDKYPDFESTTGYGTITGIGGINCRHYTIPYIEGHGSMPVPQQPDDENATRYQLEQTQRRLERGVRKAKRKLIAAKKLGDQSDVTAAQELVRRRQSVTRQFVKKHGLVRQYNREKQ >CP025991|1729451:1750288|1748013_1748196_-|AUV72576.1|DBSCAN-SWA MQAIKNRKRELVDSIIELLPAVSPNLINAKTFWMSEDELQELIAMIHDGDRNEFYEMINS >CP025991|1729451:1750288|1748276_1748615_+|AUV72577.1|DBSCAN-SWA MDELTNDAKYFLAVTYKQYLNNIDNGSSKHDARELGDAPDFKQLFPEWEIQDISDTANELKNIGYVKSDQYWCPYPSNVELTSKAIVYCKQRFKRDVKSIMKTIIDLKSLLF >CP025991|1729451:1750288|1730215_1731163_-|AUV72547.1|capsid|DBSCAN-SWA MADETTVLDNLIDPQVMTAMISAKLPKAIRFSAIAPVDTTLEGRPGTDVTVPRYKYIGDATDVDEGGAIDYASLSTDTDMFTIKKAGKGVKITDEAALSGYGDPVGEGQRQITMAIASKIDNDILATAMKARLTLSTGVDVTSLDMVDAIEAAFNDDTSEYAVEDDSPTTGVLFMNPKDVNKLRKAAAENWTRATDLGDNILINGTFGELLGWQIVRSRKIKEGSALAVKPGAMRTYMKRNVLSEKGRDMDHKITKFNADEHYGVAIYDDTKLLVINPFDVEGGTVINQNVTSTKDATVKKSNKGKAAASNTPSK >CP025991|1729451:1750288|1741903_1742302_-|AUV72565.1|DBSCAN-SWA MSKVVIKGELPSLNEYIKAERANRYAAANLKKRYTALCSVYARASRNSGVEFSWPCKLKFTWYTKNNRKDADNIAFAKKFVLDGFMKAGLLGNDNRKHITGFQDEFAIDKQNPRVEIEEVTEGAKYATNERD >CP025991|1729451:1750288|1749494_1749863_+|AUV72579.1|DBSCAN-SWA MGFGTKLKELRQSKNLGVNQLALRSGVSASQISRFENGKKTNPKPITLQKIARGLSVPDSELFKIAGIDFSQNVDPNKPIEVDLKEQIEDKNKIMTYQGRPIPEEDLKYIKRLLDGGKDDDD >CP025991|1729451:1750288|1744770_1745430_-|AUV72570.1|DBSCAN-SWA MALFTVDTNNILGQAVEEAGTYNVVVAPSSQYTTTQQAGNPMAVFDYEVLDGKYKGGRIRFDNEVWDTSTEEKGNLSIKRFNTIAVALGAANGTSFDSIKQFVSQAVGNKLAVTVDWETGQNGKTYLSVKSHKPFMQDGSKPNGVKRPVGSGNTGNSGFGNRKSTSGGFGTTTNNQQGNGFNTPASSNAGNAQAPRYSSQSANSYHGGGFPPIPDGSPF >CP025991|1729451:1750288|1740049_1740388_-|AUV74048.1|DBSCAN-SWA MKYGDGALIVGDTLQADEDRFWPSWWVPIGPKTVGQFTGLKDVNGKDIYEGDILKTKAGLIQIVEEGILAIDREDIISGFYANNINDSKPHTFSYDDEVIGNVHENAELLKG >CP025991|1729451:1750288|1742298_1742817_-|AUV72566.1|DBSCAN-SWA MTETQVLVINADLPDIDHPLAMGPEPEMFKLAQHNYKSGEWPFPVRLVKPGTKPWDDATYLASMRPDPQTEEREQIRAIRRAYHDDCHTIRSLAIKTGFTNQQVSHLVHKYSLRLRNQYWRADKYNDPDDVITGQTIYILGDKLEAPADSIKQASQSNGLVCGYYISRVPRA >CP025991|1729451:1750288|1734515_1735847_-|AUV72551.1|terminase|DBSCAN-SWA MRTWLKTVRYSPKQARFIASPFDHVFDVNEGSIRSGKTAADDARLALAYLQSPEPLHLVSAYNQEMAYNLFIEGDGMGLAYIFDGNSHLRRDRGGDHLELDLPNGKKKVYFKGGGKSNSANAIRGLSLGTVAYSEINLLNEEFIRESFRRTQKSDLRYHLADLNPPAPQDPIIKLFDEYNANWLHWTMKDNPVMTPAKLASAESEMRSSLYRYKRDWLGLRVMPQGAIYEMFEQESMTNLTLIGKPVEMYFSGDAGQNDATTMSCNIVTSVRKADGHHKFVLNRVANYYHSGSDDAEHAPKAMSTYASELKRFINWCVNTYQLHYSYVFVDPAALSLRQELIKIGIQAGKADNNGHDHVSSAKGIEVGIERLQSLMSDGQFVLVETPKSGLLNMSYDHLNFLKELGMYVRDETTGKPVDANNHAMDECRYAANYFTKKYKGGY >CP025991|1729451:1750288|1740671_1741001_-|AUV72562.1|DBSCAN-SWA MIKLDKCVAKPTEFNVIKITSELGNEVQKAFKTADKLDKKLDRPRNTWKAIFQYHGLIWTNIWGFEFIANYGKENQCRRQPVSLNDRIIEDRDSEQFLIPNELFERYFM >CP025991|1729451:1750288|1736376_1736640_-|AUV72553.1|DBSCAN-SWA MNDVEFTSKCKALVLDYANEHLDVTDGKQITVDDIFIVWQVKALQNSKALLSTTLSDGMYYELTYNGDKGEIYLDAYKKFENRCYKI |
37 | Lactobacillus_phage(72.73%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1873971 : 1942601
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP025991|1873971:1942601|DBSCAN-SWA TTTATTTTATCTCTGTCATACCATGCATGTAAGGTTGGAGCACCTTAGGAATCTTAACCGTGCCATCGGCTTGTTGATAATTTTCCAAAATCGCAGCTACCGTCCGGCCAACAGCAAGTCCAGAACCATTCAACGTATGGACGTAATCGACCGTCCCATCAGCTTTCCGGTAACGAATCATCGCCCGCCGTGCTTGGAAGTCCAAGCAGTTAGAGCATGAACTGATTTCCCGATAAACGCCTTGTTCTGGCATCCATACTTCCACATCATAGGTCTTGGCTGATGAGAAACCAGTATCCCCCGTTGAAAGCTTAATAACATGGTATGCAAGCCCTAATTCGCGCAACACTTCTTCGGCATTATCCGTTAATTTTTCGAGCTCATCGTATGAATTCTCAGGTTTACAGTACTTGACCATCTCGACTTTGTGAAATTGGTGCATACGAATCAAGCCCCGGGTATCACGCCCCGCACTCCCAGCTTCGGAGCGATAACAAGGCGTCATCGCCGTGAAGTACGTTGGCAATTGATCTTCAGATAAGATTTCATTCGCATAGTAATTGGTCAGCGGTACTTCAGCCGTCGGGATCAACGTCATTCCTGAAGATTCAACCGTGTAGACGTCTTCTTTGAACTTCGGAAATTGCCCAGTTCCATACATTGTCTGAGCGTTCACCAAGTATGGCGGAATAATTTCATGGTACCCTTGCTTTTGTGTGTGCAGATCTAGCATAAAGCTGTAAACCGCCCGTTCTAAGAGTGCACCCGCATCCTTATAATAAACAAAGCGCGCGCCCGCGACTTTTGCTGCCCGGTCAAAATCCAAGATTCCTAAGCTTTCGCCCAATTCCCAGTGCGCCTTAGGTTTAAAATCAAACGTTGGAATATCGCCGTGCTTACGCATCTCAACATTGCTATCTTCGTCAGGACCGACTGGTACATCATCGGCAGGTAAATTCGGGAAGCGAATCGCTAAGTAATGAAGCCGATCGTTTACTTCCGTTTGGGCCGCTTCCGTACTCTTAATATCACCATTCAGCTGTTTGACTTGTTGAATGAGGGCTTGGCCCGCTTCCGATTGCGGATCACTTTGCCCAATTTGTTCCGTCAACTGGTTTTTCTGTTTCTTCAATCCTTCAACCTTGGTAATTGCATCCCGGTTTTGTTGGTCTAACTGTAAGTATTCATTAACCTCAGCCGGATCAACCTTCCGAGTCTGGAGCTTAGTCTTAACAAATTCTGGGTTATTACGAACAAACTTTGGATTTAACATACGAAAAGCCTCCTTAAAATTAAAACGTCCCATAGTCTTCACCTAAAAGACTATGGGACGTTTTTTATCAACGTGGTACCACCCAATTTACTGCTCTACGAGTATATCGTCTCACCGCGACCTCTTAAAAATGAAGTCAAACGCTAAATGGCGGATTCATCAGTCCAATCAACCAACTTTCAGCAACCGTTGGCTTTCTAAATAATCAGATTAACTACTAGCCCATTATGTTTGCGCTTTCAATTTACACTTATAATCTAGACCTCCTGCCAATTATTGTCAATAGTTTTTTATTATCATTTTATTTTTCTATTATCAAGAGAACCATTTATTGTTACCATGTATTTTCGCAACACCAGTTGTCACTGTGAATATCGGTGACCTAATCAAGCCCGTGGCCGCCCAACAAAAAAAAGCACACCAACAATTCGCTGGCGTGCTTTACTCTTAATTCTACCGTACTAAATTTATGCCTTCACTTTACCAGTCTGGTTAGCGGCATCGATGAATGCCTTGAATAACCCTTCTGGACGGTTAGGCCGTGATAAGAATTCTGGATGGTATTGTGAGGCCACGAAGAAGCGCTTCTTTGGTAATTCAATCACTTCGACGAGCCGGTTGTCAGGCGAAGTTCCGGAGAAGACCATGCCCTTAGCAGCCATTGCTTCACGATACTTATTATTGAATTCATAACGGTGGCGATGACGTTCCATCACAACTTCTTCATTGTGGTAGGCTTTAGCCGCCACAGTTCCCGGCTTCAGCTTGCAAGGGTAAGCGCCTAAACGTTGCGTTCCACCCATGTCTTCAACGTCTTCTTGGTCGGCCATCAAATCAATAATATTGTCCGGCGTCTTCGGATCGATTTCAGCAGAGTTAGCATCCTTCAATCCAAGTACGTTACGTGCAAATTCGACACTGGCCATTTGCATTCCCAAGCAGATACCTAAGAATGGCACGTCGTTTTCACGGGCATACTTGATTGCCGTAATCTTACCTTCAATTCCCCGATCACCAAAGCCACCAGGAACTAAGATTCCGTCAGCATCGCCGAGTAGTTCTTCGACATTTTCTGGCGTAACATCTTCAGCAGAAATCTTCTTCAAATCAATGTCGGCATCATCCGTATAGCCAGCATGCTTCAATGCTTCCGTCACTGAGATATAAGCATCCTGTAAAGCGACGTATTTTCCGACTAGCGCAATCTTGATGGTCCGTGATAAGTTCTGGACATGATGTTCTAAGTCAATCCATTCACTCATGTCGGCCTTAGGTGCCTGTACATCAAAATGGTCAAGGACGATTTGGTCCATGTTTTGTTTCTGAACATTCAACGGAATTGAATAAATCGTCTTAACGTCTAAGGATTCAATGACTGCTTCTGGTTCCACGTCACAGAAGGACGCAATCTTATTCCGCATTTCCCGCGTAATTGGTTGTTCAGTCCGGACAACTAACATGTTCGGCTGAATCCCATAACTCCGCAATTCCTTAACAGAATGTTGCGTTGGCTTCGTCTTCATTTCACCAGCTGCCCGTAAATATGGGATCAACGTGGTATGGATGTAGAAGACATTGTCGGAACCTAAATCGCTCTTCATTTGCCGTAGCGCTTCAATAAATGGCAAGGATTCGATATCACCGACCGTCCCACCGATTTCAGTAATCACGATATCGGAATCCGTCGTCGTACCAGCGCGCATGATTTTTTCCTTGATAGCGTTCGTGATATGCGGAATCACTTGCACCGTGGCGCCTAAATAATCGCCCCGCCGTTCCTTTTGCAGAACTTCTGAATAAATCTTACCGGTGGTAACATTTGAATATTTATTAAGGTTAATGTCGATAAACCGTTCATAATGTCCAAGGTCTAAGTCAGTTTCGGTCCCATCATCGGTCACGAAGACTTCACCGTGTTGATAAGGACTCATCGTACCAGGATCAACGTTGATATAGGGATCAAACTTTTGAATCGTGACCTTTAAGCCCCGGTTCTTCAATAAACGCCCTAGCGAAGCAGCGACGATACCTTTACCAATGGATGACACAACGCCACCAGTTACAAAAATATATTTGGTCATGTGATAACTCCTTAAAGATTTATTTCGTGGGGTGGTATAAATAAAGAAAGCTCCCTATTTCAGCAGAAATAGGGAGCTAATACGATCGTTTGTCTCAGGTATTTCTACCAGAGAGCCCAAATAAGATAATACAAGGAGATTCCCTTTTCGTCAAGGAAAAATCTTGAAAAGCTTATTTCGATTCGTCGTCTTCGTCATCGTAGTCGTCATCATCATCGTCATCATTTAACTCTGATAATTGACCCTCGATACCGTCTGGCAACGTTTCATCAGCAACATCGTCGTCTGTGTCATCAACACCCGCAAGTTCATCGTACTTGCTGCTTGCTGAATCATCAGTATCGTCGTCCTGATCATCATCGTCATCGTAGTTATCGTCATCTTCGGGATCATCGTCATCGTAATCGATCACGTCGTCATCATCCCCGGCATCGGCCAAGAAGGCGTTAACCTTCTTACGCTTCTTGCGCTTTGGCCGATCCTCATCTTCGTCATCGTCCGTATGAATAACGGCTTCGTCAATGGATTCAAATGGGTACCATGCACGCAGGCCCCACATATTGTCACCGAGCGAAATGAAACTACCATCGATATTAAGATCGGTATAAAATTGTGATAAACGCTCCCGAATTTCTTCGTCGCTTTTACCTAAATATGATTGCACAGCGTTGGTCAAGTCGGCAAAAGCCATCACATCACCATGTTGTGATAAGATCGCGTGAGCAACCTCGATTAAAGATAATTCGGACTTTTTTTGTCCATCAAATTGTTTTAGTTCCAAACTGGTGCACGTCCTTTCCACAGTTTATAGTACATAATACCAAATTAGGCCGTGAATTGCAATCGCAACTTGTAGTTACCAAGTAGCTGTTCACCCGCGTATAAATCGTAATCAACGTTCACCTCACCTGAAAATGGCCGTTCACGTAGCCGTACTCGTAACATCGGCGTCACCGTTTCAACAGGTAGCATCCCCATAGGCGTTTGATAATGAGCACGCACCCGTTTACCATTGGAAAAGTGCAACCGAAGTCGGTTCTCCGCACTCCGCGTCAACACGACGTCCCCATTAGCTGCCAGCTTAATCGTCACCGGAATCGGTTCTGGCGCATCATCGTTAACTTCCTTATACCGTAAATAAAACGCGTCACCCATCTGAACCAATTGACCATCGACATCCAGTGCATAGTTCGCCGTATCGTCATCTTGCCGCGCCTGCGTCTCTAAATGAATCGCCACTGGCACACCAGTTGTTAAATCATCCATATTTGGACCTCCTAATATTTCAAAATCACACGCTGAACGCCCGTCTACGATCACCGTGTTACCACTCGCTATATCCTTTTCAGCGTTCACGACCGCGCGACTCCCATCACGCCCGTCGTAAAACTTCCTGTTTAATTATAAGCCATTCATGCCAAAATAACTAAAAATAGGACTAAAAGCGGTCAGCTTAGATCTGCTGGGAAAAGTTCGAACCCGCGTAAACTTTTTGAGTCGGCTGTGTTCCAACAATTGTCCCTCAGCCCCGGAGGTCAAAATAGGCCGCACGTTGCTGACGAATAAAAAGCCAACTAACTTGCACGTTTCATTATCCTATGATGGTATGCTACAGATTAAGTTGATTTGTCTAAGCCAATGCAACG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67 | uncultured_Mediterranean_phage(20.0%) | protease,bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3158519 : 3167033
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP025991|3158519:3167033|DBSCAN-SWA CATGATGGCGAAAGTTGGTTTGATTATGGGGTCAATTTCTGATTGGCCAACCATGCAATTAGCGGCAGAACAGTTAACGGCACTGGGAGTCTCTTATGAGCGTCACGTTATTTCGGCCCACCGAATGCCCCAGACATTACAATCCTATGGTGAAGAAGCAGCGTCACGGGGAATTCAAGTTATTATTGCGGGTGCGGGGGGCGCTGCCCATTTACCCGGGATGCTAGCTGCCAATACACTACTCCCGGTAATTGGGGTGCCCATTAAGACCCATACGTTGAACGGAGTTGATTCGTTATTGTCAATCGTACAGATGCCAGCTGGCGTACCCGTGGCGACGATGGCGATTGGTGATGCGGGGGCTAAGAATGGTGCGCTAATGGCCGCCCAAATTATCGGTTTACGGGAACCACAAGTACAACATGCAATTGGAGAATTTCGTGCTCGTCAACGTCAGGAGGCTGAACAAAGTGAACGCCAATTTTAAGGAAGCACTCTTACCACCCGCAACGATCGGAATCGTTGGTGGCGGTCAACTCGGTCAGATGATGACGCTTAGCGCGAAGGCGATGGGCTATCGGGTAGGTGTCCTTGACCCGACACCCAAAGCACCGGCAGCCCAGGTCGCAGACTTTCAGATTGTTGCGGCTTATGATGATCAGGCGGCTTTACTTGATCTAGCGCGCCGTAGTGATGTCTTGACCTACGAGTTTGAAAACGTTGATGAGAATGCTTTGATTGCTGCGCAAGCCTATGCAAAGTTACCGCAGGGCACTGCACTCCTGCATATTACTGGAGATCGTCTTAATGAGAAGCAATTTCTTCATGATCATGGCATCCCAGTCACATCTTTCGCACCGGTGACGGATTTACAGTCATTAAATTACGCCCTCAACCGTGTTGGTACGCCGGCAATTCTCAAAACGGCGGCAGGTGGCTACGATGGTCACGGACAAACGGATCTAGACACAGCAGTGGTGACAAAAGCCGCTAGTGCCTTATTGACACAGCCGTGCATTCTAGAGGCGCGGCAGAAATTTCGAACAGAAGTTTCCATGATGGTGACGCGTAGTGCTGCTGGTGTTGTTACGACTTTTCCGTTAGTTGAAAATCAGCATCAACATCATATCTTACACACAACGATTGCCCCAGCTAATGTTCAGCCCAGTGTTCATAGTGCGGCCCGCAAAATTGCGGTTTCGATTGCTGAATCTCTGGAACTACGCGGCGTGCTAGGAATCGAATTCTTTGTTTTACCGGATGATACTTTATTAGTCAATGAACTGGCACCACGCCCACATAATTCTGGTCACTATACGATTGAGGCCTGCAACATCTCGCAGTTTGAGGCCCATATTCGAAGTATCTGTGGCTTACCGATTCCGGCCATTACGCAGACCAGTCCGGCAGTGATGCGTAATCTGCTAGGTGATGACTTAACAGTGGCACGTCAACAGTTGGTTGAACACCCAGAATGGCATTTTCACGACTACGGTAAGGCGGCCATTAAGCCCCAGCGCAAGATGGGTCATGTCACCGTATTAAATCACGATATTGACGCAGCATTAGCGTCGTTGGCAAATTTGAAAGGGGAACAATAATAATGACGGCAGCGATTGAGAAACAAGCTTTGCTTTACACGGGTAAAGCGAAAGCGATGTATGCCACTAATGATCCTGAAATTCTATGGGTCGAATACTTAGATCAAGCAACAGCGCTAAATGGTAAGCGGAAGGTTCCCATTGACCAGAAAGGCCGATTGAATAATCGCATCGCGAGTTTGATTTTCAAAGACTTAGCCAATCACGGCATTGCCAACCATTTTATTGAGCAACCTTCAGACTATGTGCAACTTGTCCGTCGCGTGACCATGATTCCCTTGGAGACAGTTGTTCGGAATGCGGCTTCGGGTAGTTTTGAGCGTAAATTTGCCGTGCCACACTTAACCAAATTTGCAGAACCAGTACTGGAATTTTTCTATAAGAGTGATCAGCTGGATGATCCATTTATCAATGATTCACAAATCCACGCGCTAAATGTTGCAACACCGGCAATCGTGGCGGAAATTAAACGGCAGGCCTTACAGGTTAACCAGCGTTTGACGGCAATTTTTGCGGCGATGGGGGTACAGCTCGTTGATTTTAAAATCGAATTTGGGTTGACGACCACCGGTAAAGTCTTGCTGGCTGATGAAATCTCACCAGATAGTTGTCGGTTAGTCGACCTAAAGACCGGTGCATCGCTTGATAAGGATGTCTTCCGCAAGGATCTAGGCGACTTGACTAGTGTTTATCAGGAAGTATTGACGCGGCTAGCAACCGTTGAGGAGGCCTAACATGTACTTAGTTAAAATCTATGTGACTTATAAGCAATCAATTCTAGACCCCAAGGGTGAGGCGATTCATGATGCCTTACACCGACTTGGATATACGAATGTCGATGCCGTTGAATTAGGTAAGTATTTTGAGGTGAAAATTCACGCGGATGATCGGCCAGTTGCCGCTGAAATCGACGAGATGTGTGATCGCTTGTTAGCCAACGTTAATATGGAAACTTATCGTTACGAAATTACTGAGATGGAGGCTTTGTAATGATGAAATTTGCCGTACCAGTCTTTCCTGGTTCTAATTGTGATCATGACATGGTGAATGCCTTGCGCGATATTTTACACGTTACGGCTGATTTGATTCCGGCGACAGCGACCTCATTAGCAGGTTATGACGCGGTGGTGTTACCTGGTGGCTTTTCGTACGGTGATTATTTACGGAGTGGTGCGATTGCCCGCTTTGCGCCCATCATGCCGGCCGTTATTGCATTTGCTAACGCTGGTAAACCAGTCATCGGAATCTGCAATGGCTTTCAAGTCTTGACCGAAGCCGGATTATTACCTGGTGCATTGCAGGCCAATCGCTCAGCGAAGTTTATTTGTCAGGACAGCCCATTACGAATTGCCAATCATGAGACGATTTTTACCACCGCATACGGATCGACAGATCAAATTAGTTTACCGATTGCCCACGGCGAAGGCAATTATTATTGTGATGAGGCCACCTTGGCGCAATTACGTGCTAATCATCAAATCATCTTCGAATACGTCGAGAATCCAAATGGCAGCACGGCTAATATTGCTGGCATTACAAATGAAGCGGGAAATGTGCTTGGGATGATGCCCCATCCGGAACGGGCCGTGGAGATGATCTTAGGTTCCACGGACGGTCTCGGAATTTTTCAATCGGTCATTGCGAGTCAAGAGGAGGTCACCCATGCTTAAAAAGCAACCATTATCACCTACAGATGTTCGCGATTCTAAGGTCTATCGGGATTGGGGCTTAACCGATGCTGAGTATCAATTATTAACGGATAAGGTCCTTCAACGCTTACCTAACGAGACTGAAACCGGGTTGTTTTCCGGCATGTGGAGCGAACATTGCTCCTACAAGAATTCAAAACCAGTCTTGAAAAAATTTTGGACGCAGGGTGAACAGGTACTTGAAGGGCCTGGTGAAGGCGCCGGTATTATCGACATCGGTGATGGTCAGGCCGTGGTCTTTAAAGCTGAAAGTCATAATCATCCGTCTGCAGTTGAACCTTATGAGGGTGCGGCAACGGGTGTGGGTGGTATCATTCGGGACATCTTTTCGATGGGGGCCCGGCCGATTGCGCTGCTGGACAGTCTTCGCTTTGGGGAACCGACTGATGCTCATACGAAATACTTGATTTCGCAAGTAGTCGCCGGCATTGGCGGTTATGGCAACTGTATTGGAATTCCGACAATCGGTGGTGATACGGTATTTGATGCGAGTTATCAGAAGAACCCGTTGGTGAACGCCATGTGTGTTGGAATCTTGGATCAAGCTGATATTCAGAAGGGCCAAGCAACAGGAATTGGCAACGCCGTTATTTATGTCGGCGCAAAAACGGGGCGTGACGGCATTAACGGTGCGTCCTTTGCCTCTGCTGAATTTAATGACGCCAATGAAACCCAGCGTTCCGCGGTTCAAGTTGGTGATCCCTTTATGGAAAAATTATTGATGGAGGCGTGTCTCGAGGTTATTCATGAACATCGTGATGTTTTAATCGGGATTCAAGATATGGGCGCGGCGGGCCTAGTTTCCTCCTCAGCCGAAATGGCGTCCAAAGCAGGCAGTGGGTTGTCACTGAATCTTGACTTGGTACCACAACGTGAAACTGGCATGACGCCGTTCGAACTGATGCTCTCTGAATCACAGGAGCGGATGTTACTATGTGTCAAAGCTGGTGCCGAAGCAGAAATTTATCAAGTCTTTGAAAAGTACGGTCTTGATGCTGTCACAATTGGTAAAGTGACAGCCGGCCACCAGTATCAATTATTCCATCATGGTAAGTTAGTTGCAGATGTTCCCGTCGATGCACTTGCGACCAAAGCGCCGGTCTATGAACGCGAAAAGAAACGACCAACGCGCTTGAACCATCAGAGCCATCATCAATTTATGCCACGACTAGTTGATGCAACTGGCACATTGAAGAAGATGCTCCAACAGCCAACGATTGCTTCCAAAGCGTCGTTATATGGAACGTATGACTCGCAGGTCCAAACGAATACGGTCGTCAAGCCGGGTTCCGATGCGGGGGTCATACGGATTCGACATACGGATAAGGCGTTGGCGGTCACCACCGATGTTAACGGGCGATACTTATACTTAAACCCCCGTGTCGGTGGGGAAATCGCCGTTGCGGAAGCTGCTCGAAACATTGTCGCTTCCGGTGGGCAACCTTTAGGCATCACTGATTGCTTGAACTATGGTAATCCAGAGAAACCTGAACAATTTTACGATTTGGACGAATCGGCGATGGGCATCGCTCGTGCATGCCAATTATTCAATACGCCCGTGATTTCTGGCAATGTCTCGTTGAACAATGAATCGAACGGGGAAGCCATCTATCCCACCCCAATGATTGGGATGGTCGGGTTAATTAAGCATCAGAAAGATATTACGACTAGCGATTTTAAACACGCTGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP025991|3158519:3167033|3165436_3166462_+|AUV73828.1|DBSCAN-SWA MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSPDATAKDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVAGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPAPPIMTLLAELGGLTAMDLRSTFNLGLGMVLIVHSDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTTPVVFEEAEHA >CP025991|3158519:3167033|3160854_3161109_+|AUV73824.1|DBSCAN-SWA MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL >CP025991|3158519:3167033|3166454_3167033_+|AUV73829.1|DBSCAN-SWA MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANVPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIELVLLAGYMRIIGPTLLNAYAHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFAAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI >CP025991|3158519:3167033|3158988_3160119_+|AUV73822.1|DBSCAN-SWA MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASALLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASLANLKGEQ >CP025991|3158519:3167033|3160121_3160853_+|AUV73823.1|DBSCAN-SWA MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNQRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA >CP025991|3158519:3167033|3161108_3161789_+|AUV73825.1|DBSCAN-SWA MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA >CP025991|3158519:3167033|3163985_3165440_+|AUV73827.1|DBSCAN-SWA MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIPEMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK >CP025991|3158519:3167033|3158519_3159005_+|AUV73821.1|DBSCAN-SWA MMAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQHAIGEFRARQRQEAEQSERQF >CP025991|3158519:3167033|3161781_3164001_+|AUV73826.1|DBSCAN-SWA MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHEHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEADFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3344347 : 3358462
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP025991|3344347:3358462|DBSCAN-SWA TTTAATTGCTACTATTCAAATAATCTTCAAGCTTTGACATCGCATCTTCTTTTATCTTGGGAGTAACTTCTGCATACATACGGGTAGTAGTCAAATCAACATGGCCCATCAAGTCTCTGATGTTTTCCATATCGACGCCAGCTTCACGCAAGCGCACTGCGAATGAATGGCGGCATCCATGAACATTGAGATGTTTTAGGCCGGCATTTTTAGCAATGCGCTTCATGGCACCTTCAGCTCCTCGTGAAGATATAGGCTCACCAACATTGCCAGCAGTTAAATAGAAACGTCTAAATACAAAATCGTTTGAGGGATCAGATTGCAGATTTGGGTTAATTGTAACTACTTTTTGCAATGCTGATTGCTTATTACGCAGTTCTAGTAATGCAGTATAAGCACGAGCAGTTAACGGTACATTACGAGAGCTGTGCTCTGTTTTGGGGTCGTCCAGGGTAATTGATAGGTAAGAGTTATCAAGTACTTCACCGGACTCTCTAAGCTGCCTTTTTTGGTCAGCTTCGGCCCGGTAGAGTCTATTTTGGTCTATTGTCAAAGTGCGTTTGTTGAAATCCACCCGAGACCATCTCAATGCTAAATCTTCGCCGAGTCGTAAACCGCAGTCGAACATTAGTAGGAAGAAGGGGTACCATGATGGTTGTTGTTCTTGTTTGGCTGTTTCCAGAAAAATATTAACCTCGTCAAGAGTATAGTAACGAAGTTCACGTTTTTGAGGCTTGAATTTCCTGGAAAACTCAACTCCAATAGTTGGATTAGACTCAATAAACCCGAGCTGTGTTGCTTTTTTTAGAGCGTTAGAAAGTGTTCCATTTATTGATTTTACGGTAGCCCAGCTTAAGCCTTGCTTTTTTCTTCCAACTCCTTTTTCGCTGAAAAGACCATTGATAAAGCGCTGATGTTCTACAAGAGTGTACTCGGTTAATGGATAGCTACCAATTCTTGGCTTGATATAAGTCTCAATGTTTTCACGATGAACAATACGTGTACCTTCTTTTACATTTAACTTAAGGTGAGTTATCCAGTAGTCCAAAAATTCTCCCAAAATCCAAGCTTTTTGAGGTGTAACGTTTCGTTTGTTTGAAATTATTTCTGCTTCTACTAATTTGGCGGCGTCACTGGCTGATTTGTAAGAGGTGAACCCACGACGATGGATCTTCTTCCGCTGACCGGTACCTTTGTCAGTTCCAGCGTAAATATTGTATTGATATCGCGTTTTGCCATTCTTTAACTGATATTTTGAAATGGTTGCCATAATAAGCCTCCTTGATTCGAACTTATGTTCTCTAAAAAATAAAAATATATACCCCGTGATGGGGTATAAGCGAGTGACGAGAATCGGACCCGCGACTACAGCTTGGAAGGCTGTCGTTTTACCACTAAACTACACTCGCGTGAATGGACCTTGTTGGACTCGAACCAACGACAGGACGGTTATGAGCCGCCTGCTCTGACCAACTGAGCTAAAGGTCCAGAAGCTCTCCAATTAAGTGCTATTCTTTTTACTTAATTGAAAAGCACGAGATTAATGATTCATTCTGATGATTTCAGGTTCTGAAGTTAGATAGTCACTGACGTGTGCTAAAAATTTCTGGAAGTGGGGAGTTGTGTTATGAAAATCAACGGCCTCTTGATCTTTCCAATGTTCGATAATCTCGTAATTATTATCACTGTCTAACTTTTTGAAATGTCCATAGAATTCATTTCCCGGTTCCTGAGCTGAGTTAACAACAAGCTCATGAATAAAATCTTCATATTCCTCTTTAAGCTCTGGTTTAACATGTAGTGCGACGTTGATAATCTTCATTTTTTACGCTCCTTATTCGGTGCCCTTGGCGAAATCAATTGTCGGGTGAGTTTTTAGCAATCTTGACACTATTGAAATGTCCCAGATATCAGCAACAATAAAAATCCTATTGCTGCAATGGCGATACCCCATGCTAGCTGGTAAAACATACTTCGATCACCAAAGAATGTGCGTAAAACGAAAAACCATTTTCCAAAACAGAAAATGAATATCCCGATGACAAAGATGATAATACCTATAATTCTAAGCATTTCCATATTAGTAGCTCCTTCATTTTGGTATGATGCGAGCGGCAGGAGTCGAACCTACATCTGTTAGTATCTAGTCAGCAATTCAAAGGAGCACCGTTCTACCGTTGAACTACGCTCGCAAATGACCAATTTGAAATTAAATTGGCACTTGATTAACTGTGCTTATTTTTGCTTTAAGCGAGTAGACAGGTCTTCCTTCATTGCTTGAAACATACGATTGTATTCTTCTTTTGAATAACCATCTTTCATTAAGTACAGAATAGCGTCTGCTTGTAAAAAAGCTGTTAAATCATTGGTAATAAGCTCAATCAGTTCATACTTTGAAATTTCCTGGTTCATTTTATTTCCTTCTTTCTATTTCTTGTTCAATGCGAGCGGCAGGAGTCGAACCTGCATAACGCTTTTTAAGAGTGGGGCTCCTATGATGGAACTTCGTTCTACCGTTGAACTACGCTCGCGTTAAAGCCCAACTAAGGGCCAATTATTTACAGTTAATCTTTTTTGAGATTTGTGTATGATATAACCCAAGAACCCACAGATGAGCTAGCCTTCTTAACTTTTACCGTAACTGTTTCACCTTTATTCACCTTGGGATTTTCAGAACTTACGAAATTCAAGTGCTTGCCAGTTTCAAGGTTATAACCAAATGCGCTATTTGGAACAACTTTATTGACCTTGAATTGAATGGTTTTTCCCTCAATATCTTTATTAGCATTTAATGCTGATTCTGCTGTTGAAGCAGTATAATCAGGCTTTTTATTTCCACAACCAGCCAGTGTGAAAATTATAGCTATAATGGCTACAAAACCAATACTCATCTTTTTCATAACAAATTCTCCAGTCTTTACATGGTTTATTACAGTTAGAATCAAGCCAATATTTTAATTTACAGAATATGTTTTTGTCCCAATAGTTTGGAAATTGGCGTTATTGAATTTGACCGTTACATCATTTTTGTTCTCTAACTTGAACATAACCGCCGCCTGCGTTGTTTTCCCTGGCAACAATTTATCATTTAGGCCATCTTCGTATTTTTGTATTGGATTATTACCGTTATCGTCATATTTGGGTGTGCCGGGCAAAAGTTGTTTGTTTGCTGTATCTGTTTTTTGATAAGCATTTACTACAGTATAGATATTTGAAGGATCCTGTTCCTTTTTAGAGTTGTTAGTAACGTCACAATAGAGAACTAAAATTTTAGTTCCGTCTTCGCTGCCATCACGGATTTCCGATTTCGTAAATTTATAAGTTTCAATTCCGGCTGAGAAAATATTATCTTTAAACGTCCATTTGTCATTTGACGGATCAGTCGATTTTGTTGATGAAACTTTTTCTGCCTTGGAGCTATTAACGGAATTAGTTTTAGAACTATTATTATTTCCGCATGCGGTGAGCGACAATGCGGTTATTCCAGCTAGTAATAAAACACTGTATTTTTTCATTGATGTTTCCTCCAATATAATTTATTCCCCAATTCCAATTTCAATAACATTATTGCTTTGATTCTGTGCTAATAGCCAAACTCTCTCGATACTCTTCGGCCTCAGGAGCTTCTTTGAAATCTACAGTCAAATTGCTGTATTTTTTTAATTCATCTTCAATTTCGTTTATAGAAATGTGAAAATACTCTTTACGGTTGTTCACCATATTGACACGCTTTTGTGAGAAGCGTTGGTGTAGTTCAGATTCTAATTGGTATGCGTTTTCGCTAAATATTAATGCATGTACGTCAAATTTAAATGGAACCGAAGCACTCCCGAGCTCGTTGATACGATCCATTGGATCTAAGCGGCGGGTTACACCAATTTTGAAGACATTTTTACCAAACGACCCAACATTAGAGATGATATAAACATATCCGGCGGTTGCGTTTTCTTCTCGATAATCCACCGCTGCCTTTTTATCTTCATATTGCGTTAGTTTTTGCTTTAATTTTTCAATTTCGGCTATTAATCCATCGTTGTGAGGATCTTCATTTTGTCTTTCTTGAAGTTCTTGAATTGCTTTTGAGTAATGATCGATCTGTTTATTAAGCATTTTTTGTTGAGCTTTAATTTCCCGTTGCAAAGCTTTTTCTTCTTTTTCCCGAGCTCGCTGTTCACGAAGCTTATCTTTTTCTTCTTGAACTTTTTGTCGGTACTCAAAAGCCAGTTCCAATTCAGCAAGTTTAAGTGCTAAGTAGTCCTCGTTAAGACTAACCTGATCGACCTCGTACATCTTGTTATGTTGATCAAATGAGCGTTTTATTCGGGTTTCAATTCGGTCATAATTAGAGTATGTTACTTTATTTATTGCATCTGTGCATTCATTATTAAAACTCCGTAGAATAGCCTTAACGATATTTCTAATCATCTTTTTTCCTTGAGCTACACTGCCATTGACTTGCCAATTTTCATTAAATGTACAGGCCATTTTGTGTTTAATAAAAAACTTTTGTTGATCACGGATTTCTTTCAATTCATCTTTATAACCTAAAGAATCTGAAAAGTCGTATTGTGGGTGATACAGACCATATGAACTCATTTCTAAATCAGGAGAAAGGTCACTAATGTCGGCTTTTATTTCGTTAAGCATGTCAGACTGTTTCTCAATTTCAGATAGTGCATTGATACGCTTTTTGTCAGCGAGATCAATCTGTTTGTCTAATTCATCAAGTGTTTTGTGTTTAGAATTAATGAGTTGGTCAAGTTGTTCAGGCTTCATTTGCTGTAATGATAGCTTGATGTTGTTCTGTTTTTTCAGCTTATCAATGGTTTCCTCTAATTGAACAATTTCCACTTTTGATTTTTGAATAGTATTTTTAAATTCGCTTATTCTGAATAAGTCACCTAGTGACATGAAAATTCCTCCAAATTAATTGATATTAATCTCCGTCGAATGGTACCCCGTATTGATAGGACAGTTCTCTGTATGAATAGGGAATATGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP025991|3344347:3358462|3346910_3347246_-|AUV73991.1|DBSCAN-SWA MKKMSIGFVAIIAIIFTLAGCGNKKPDYTASTAESALNANKDIEGKTIQFKVNKVVPNSAFGYNLETGKHLNFVSSENPKVNKGETVTVKVKKASSSVGSWVISYTNLKKD >CP025991|3344347:3358462|3355159_3355390_+|AUV74003.1|DBSCAN-SWA MTSLSMVLGKEAVVAYMVVLTFQGEIIKSYPKIYAQYSAAFKRCDHLNHVLKSDDYRWKLMCAKGWYDVDPNDKGD >CP025991|3344347:3358462|3349707_3350070_-|AUV73995.1|DBSCAN-SWA MFAERLKELRKREAGLTQERLAMQLGMAKTTLASYEQGKRQPDLETLSKIADRFSVTTDYLLGKNGTPKWATKKDTIDLKDFLEANEGSMTYGGEDLTEEEKQQVRVAMATIFWKRHKHD >CP025991|3344347:3358462|3347910_3349257_-|AUV73993.1|DBSCAN-SWA 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24 | Lactobacillus_phage(73.33%) | integrase | attL 3342406:3342420|attR 3352630:3352644 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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