Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP019700 | Helicobacter pylori strain B128_1 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas2,cas3,DEDDh | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. CP019700
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
377556 : 385673
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019700|377556:385673|DBSCAN-SWA TATGGCATTATTATTCACAGGAGCGTGCGGGTATATAGGCTCGCATACCGCAAGGGCGTTTTTAGAAAAAACCAAAGAAAACATCATTATTGTAGATGACTTAAGCACCGGTTTTTTAGAGCATCTCAAAGCGTTAGAGCATTACTACCCTAATAGGGTTGTGTTTGTTCAAGCGAATTTGAATGAAACGTACAAATTAGACGCATTTTTGAATAAGCAGCAGCTAAAAGATCCCATTGAAGCCATCTTGCACTTTGGGGCTAAAATCTCAGTAGAAGAATCCACGCACTTGCCTTTAGAATACTACACCAACAACACGCTCAACACTTTAGAGCTTGTCAAACTTTGCTTAAAACATGCAATCAAGCGTTTTATTTTTTCTTCCACGGCCGTGGTTTATGGCGAATCTAGTTCAAGCTTGAATGAAGAAAGCCCCTTAAACCCCATTAATCCTTATGGAGCGTCTAAAATGATGAGCGAAAGGATTTTGTTGGACACTTCTAAAATAGCGGATTTTAAATGCGTTATTTTGCGCTATTTCAATGTGGCTGGGGCATGCATGCACAATGATTATACCACGCCCTACACGCTAGGCCAGCGCACGCTCAACGCCACGCATTTGATCAAAATCGCATGCGAATGCGCGGTGGGGAAAAGGAAAAAATGGGGATTTTTGGCACTAACTACCCCACAAGAGACGGCACTTGCATTAGGGATTATATCCATGTAGATGATTTGGCTAATGCGCATTTAGCGAGCTATCAAACCCTTTTAGAAAAAAATAAGAGCGAAATTTATAATGTCGGCTACAATCAAGGCCATAGCGTGAAAGAAGTGATAGAAAAGGTTAAAGAAATCTCAAACAACGATTTTTTAGTGGAAATTTTAGACAAACGATTGGGCGATCCAGCAAGCCTTATTGCCAATAACGCTAAAATCTTACAAAACACCCCTTTCAAACCCCTTTATAACAACCTAGACACCATTATCAAAAGCGCTCTAGATTGGGAAGAACACCTTTTGAGGTTTCAATAATACACCCTGTGCAAATACAAGCCATTAGCCATTATGGGCGTTCTTATAGTGGCTTTGAGGTTGTGGATTTGCATTTCAATTTCAGCGAGCGTGATTTTTTCTAAGGAGTATTGAACGCATGCTTGAATGATCAAACGCACGCTGGAGCGTAAAAACGCATCGCCAATGATTTTAAACACCACGCACTCATGCCCCATGATAGAAGTTTTATAAGCAAAAGCGTTAAAAATGATGCGATTAGGATTGGTTGTAGCCCCGCCTTCTTTTTTAAACAAAGAAAAATCATGCTTGCCTGTGAATTGCTTTAAAGCGGTGTTTAACGCATCTAGTGAGCCATAATCCCCACAAGCGATATAGGGCGCTAAAAAAGGCGTTTTTAAATTCTTCGTCAAAAGGTAACGATACGCTCTTTTTTGAGCGTCAAAACGCGCATGGAAATTTTTTTCTTCTAGCTTTTTTAAGACAATATGCGGGGCGAGTTTGGGGGCTAGACAATAAAATAATTTAGCAGCGTTCCAGTGTTTTGGAGCGTGAAAAGACAAAACCTGGTTGTTGGCATGCACGCCTTTATCCGTGCGCCCAGCCGCAACCACAACGCTTTTAATCCCTAGCATGTTTAAAGCGCTTTCTATTTTATCTTGAACGCCGAGTTTGTTAGGCTGTTTGGCATAGCCTAAAAAATACGCCCCATCATAAGCGATAGTAACCTTAAAGCAACGCATTTTAATAACGCTTTAAAATGAATTTTCTAAACAACAAATAAGAGCCAAACGCCCAAATAAAGGGGAAGAAAAAGGTCATCAAAAACAAATCCGTAGAAATCACATGCACCATTAAAAAATAAACCCCAACCGCTCCAAGGACATAAAAATAACTCCAATTCGTTTTGAATCGTGGGTTGGCGATGCCAAATAAGGGGATCAAAAACACGCTCGCTAAAGGGAACAATGAAACTAAAATCGCTTGAGAAAAACGGCGTTTTTGATTTTTATTAGCGTTTTTACCAAAGGCTTTTTTCCAATAACCTAAATAATCCGTGCCTTGCAAATAAGCCGCATCATTAGAATTGAAAGACTTGAGCTTGTTGCGCAAATGCAATTCTTCAAAATCAACTTTACGCATTTTATCGCCTTGAGTGAAATACGCATGCCCTTTGTATAAATTCAATTCAAACACGCCGTTTTGATTGTTGATATTGCCTTTTTGAGCCAAAATAAAGCTTTCTTGAGAGAGGCTTTTATTGGAAAAAAGCACTAAATTATCATAGGAATTGTTTTCAGCCTTATCCACATACACGAGCCAATCGCCTAATTTTTGCCCGAATTCACCGGCTCTGATGTTAATATCAATCTTGTCTTTTTTTTGACGCAAAAACCCGTAATAAGCGCTCTTAGAAGTGGGGATTAAAATAAGCGAAAACACCAATAAAATCGCGCTCACTAACAAACTTAAAGGCACAAACGCTTTAGTCATTGTTTTAGGCGAAACCCCTAAAGAGAAAAACACTAACAATTCATGGTCATAGCTAAGCCTTGAAAGCCCCAAAGCGCAAGCCGCAAAAAAAGTGATTGGCAAAATAAAAAAAATGGTTCCAGGCAAGGAATACAAAAAGAGTTGCACTAGATCTAAAAAGCTCACTTTAATCACGAGCGTTACGCTTGCGATACTGATTAATAGCACGATAGAAGAGATAAAAAATAGCACTAAAAAGAAAGAGAAAAAGACTTGCGAAACCGCCATGAAAAGATAGTGTTTGATCATGTTTTAATCTTTATTGCACCCCATCTACAACAGGCACAAACGAGCATTTTTCTAACACTTTTTGGACGCGCAAGGCGTTATTTTGCTTCACAAAGCGTTTGATCACTTGCTCGTTATTTTCTTGAATGGGTGCGACTAATATCCCGCCTTCTTCAAGCTGATCAATAAGCGCTTGAGGGATATTTTTAGCGCAAGCAGAGAACAAAATCCTATCATAAGGGGCGTATTGCTCCCAGCCCTTATTCCCATCAGCGAATTTGACATGAACATTGTCTAAACCGAGAGTTTTAAGGCGCAAACGCGCTTCTATATACAGGCTTTCAATCCTTTCAATGCTAAAAACACGCCTAAAAATTTGAGACAAAACCGCCGCTTGATAGCCGCTCCCGCAGCCAATTTCTAGCACGCTATCCACATGATCAATTTCTAAATATTGCGTCATTTTGGCCACGGTTAGGGGCGAAGAAATGTATTGTTGTGCTTGCATAGAAAGCGCGTTTAAAGTGTAGGCAAAATGTTTAAAGGGGGCTGGCACAAAAACTTCTCTTTCAATGCTTTCCATAGCCTCTCTCACTTTGGGGTGCAAATTGAAACGCTTATGGATTTCTTCACACATCAAATGGTTTTTAATACTATTCAAACAAGCCCCTTAAAAATCATCAAAACTCACGCTCCCTTTAGCGTAATTGCTCACCCTAGCTTCAAAGAAATTGGAGCGTTGCTCATTGAAACTTGAAAAGCTCTCTACCCATTTAATGGGGTGTTGGACGCCATAAACTTTAGCGATACCCACCTTACTCAAACGGCTATCCGCTAAAAACTGGATGTATTGCTCAATCAGGCTTGAAGTGAGCCCTAAAATCTTGCCTTGCGTGATATAATCCCCCCACAAAGCTTCAATTTCTACCGCTTTTTTAAACATTTCTATGACTTCATTAATCAATTTTGGCGTGAATAGATCCGCTCTTTCATTCCTTAAAGCGTTGATCATGTTTTGGAATAAAATCAAATGCGTTACCTCATCTCTTTGGATAAAACGAATCATTTGCGCTGATCCTAGCATTTTACCGCTCCTAGCCAAAGTGTAAAAATAGCTAAACCCGCTATAAAAATAAATCCCCTCTAAAATCTGGTTCGCAAAAAGCGCTTTGAGAATGTTTTCTTCTGTGGGGTTTTTGGCTAATTCCATATACACTTGCGCGATATAGTCATTCTTGCTTTTTAATTGCATATCGTTACGCCACATGTCATAAATCTCTTCAGTATTCGCGCTAATGCTTTCTACCATCACCGCATACGCATGGCTGTGTAAGGCTTCTTCATAAGCTTGACGCACCAAACACAAATTGATTTCGGGGCTGGTGATGAAGGGATTGATATTGTCAATTAAATTATTCGTTTGCAAGCTGTCCATAAAAATGAGTTGCGCTAAAGCTCTGTCATAGCCGATCTTTTCTTCTGCACTCAATTTCAAATAATCCCTTTTGTCATCATTCATGCTCACTTCTTCAGCAAACCAAGTGTTAGCGAGCATCGTTTTCCACAAATGATCCGCCCATTGATACTTGATCTTATTCAAATCAAACATGCTTGTAGGATTACCCCCAAAAATCTTTCTTTCATTCACACTTTCTGTAGAATCGGGGTTGTAAATTTTCTTGCGTGAAACTTCCATTTTGTTCCTTAATTTCCTTAAAACTATCTAATGATATAGTCTCGTTAGAATACCTTAAAAGAATTTAAAACTCCCTAAAGCCAGAAAAAACTCCAAATTTATAAAAAACTTCAATTTTTCAGTATTTTTAAAGGATTAAACAGCTAAAATACTGCTTCTTTATTTTCTACTCTTATGCGCATGCGATGGCGTGCGGTGCGCGGAAGTGGCGAAATTGGTAGACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGCCGCAAGGCATGAAGGTTCGATTCCTTTCTTCCGCACCATTCTTAATGATTAAGATTTGAAGCCCTAAATGAAACTTATTCTATCTTAAGATCCTCAAAAGTTTTTAAAACGCCATGAGCGATGGTTTGAGCGCTCTCTAAATTCAAATTCGCATGACAAGGCAAGGAAATTTCGGCACGATAAAAATCCTGCGCGCTTTTTAAGGGGGCTGTGTTAAAGAGCTGTTGGTACAATTGGTATTGGTAAATGGGCTTGTAATGCACTTGGGCTAAAATGCCACGCTTGTGCAAATTTTCTAAAATGAGTTTTTTGCATGTAAAAAATTTTTGGCGCATTAAAATAGGATAAAGGTGGTTAGAGCTTTTGTATTTTAACAAGGGGTGTAAAGGGGTGAAATAAGGGTTATCTTTAAAAATCCTATCATAAACTAGAGCGATTTCTTCTCTTTTTTGCATTAAAAAGGGGGCTTTTTTGAGCTGGCTCAAACCCAAAGCGCTTTGGATTTCATTCAAGCGGAAGTTATGCCCTATGCTTTTGACTTCGCCTTCAAAAAAATCTTTTTTGAGCATGCCATGAGAGCGAAACAATTTCATTTTTTCATATAATTCGCTATCGTTAGTAACGACCGCTCCCCCTTCAGCCGTAGTGATGGGCTTAATGGCATGGAAACTAAACACGCTCGCTAACGCAAAGCCTCCTACTTTTTTGTTTTGATATTCGCTTCCTAGAGCATGCGAGCTGTCAGAAAGAAAACTCAAAGAATGCTTTTTGCAAAGCTCTTGAATGCTTTTTATTTCCACGCTTTTACCGGCATAATCCACGCTCACTATGGCTTTGGTTTTTTCGTTAATGAGCTTTTCTAGGGCCAATTCATCTATATTGCCATCGTTTTTAATTCCAGCAAATACGGGTGTATAACCGCTTTCTAAAAGCATGTTAGCCGTCGCTACAAAGCTTATAGGGGTGGTGATTATTTCATTGCAATCAGCGTCAAAATCGCTAAAATTCCTATAGAGCGTTAAAAGGGCTGAAGTCGCGCTGTTAAACACTAACGCATGCTTAACGCCCAAAAACTCGCACAAAGCTTCTTCAAACAAAAGAGAGCGTTTGCCTTGCGTGAGCTGTTTGGAATTTAAAATCTCTAAAACAGCCTTTTTATCTTCTTCATCTAAACAAGGCTCGCTATAAGCAAACTCTTTCAAGCGAGCAAGTCTTGCAAGCGAGATGGGGTGATCTTGCTTGTGTCATGGACATCTTGGAATTTTTGAGCGTTCAGTCTTGTTTTATCTAAGGTGTTGTATTCCTTGTTTAAATGATTCGTTTCAGCGAGCTGTTTTTTCCACTGGTGCAAAGAGTTTTGAATGTTTTCTTTCTCACTTTCTAATGATTTGGAAAATTTTTCCAAAGCCTTCGTGTCGTCAATGTCAATATTATTAGGGAGTTTCAAACTATCATTGCCTGATTTTTGATTGAAAGAATCAATCGCTTTGTCCAAACGGCTTTTAAAATGCTCAAAATCGCTTCGATCTTTTTCATTATTGTGAGCGTAAGCTTTAGAAATCCCTACCAATTCTTTAGCGTCTTTATCCATGCCTTTTAAGCTTTTGAGGCGGCTTTCTAAATCCCCTATGGCTAGGTTATCCTGCTTAGCCTGTTTGGCTAATTTGATCTTTTCATCATTCTCTGAAAGATTTTGAATTTCCTTATTTTCTTCTTTTCTTGCGTGCGGACTAACCCTTTGGGTGTGGTAATCCCTCATCATCAAAGACGGGTTATAATTATTTGAAATCTTAGACATCCTATCCTCCACTTCATTTTATTTCTTAAAGATAAGACAAGCAAACTCTATTCCTAAAAACACTTTATTCCACCCAATTCTATCTAAAAATATTAATCTAATCCTAAAACCCTTTCTAACTCTTTGATGAGGTTTGTAATTTCTTTCAGTTCTTTAAGATTGAGAGTGAGCTTATAATTGACTTGATTATCAGGATTCATTGGCACCAATTGCTTTTTAAACTCATTTTGTTTCATAAAGTATTTTCTTTTTTTATGAATGTAATGGATTTCATCCTTTTTAAAAATTCTATAAAGCAATTGGTCTTCGCACACTCCTAAGCAAATCAAAAAATCATAGTTGTATCGTGGGTTTATACCATTGAACTGAAAAGTGTTGTTGGTTCTGCCTTTCCGCGCTGTTTTAACTTCAAAGGATACACCGCTTTTTGCCATAATATCGTATTCATCATGAATAATGCCATCATTGATCACTTCATCTATAGCGTTAAGCACGCTTTTTAAAAACTCTTCGCCAATCTGCCCTATAGCATTGGCTTCAAAATCTCTAATTTTTGAAAAAATAGCGTTGTAATCTTGTCCTAAATTCAATTCTTTATGTTTTTTTTCAATAATTTTTAAAAAAGTTTGTTCCAAATCCATCAATTATCCCTTAAACTATCCAAATGATCATGTAGGGCTTGAAAAATATGGCTTTTTCCTAAATGATAGCAAGAATTAGTCGCTAAACTTGCATATTTTGTCCAATCAATCTCTTTGAATAGTTTTTTTAATTTAGCGTTTAAAACCTTGTCAGTGCTAGTAAATACCACAGCAATACCAGATTGATACTTAACTTCCTCAAAGTTCTCTACAATTTGTGTGCTTTTATAAAAAGTTGATGAAATGTAAAAAGACGCTTTTTGATTAAAAATCCACTCTTTACCGCATTCTCTGTTTTTAGCTAATGAAACCGTGAAAACCTTGATATATTCGCCAAAGGGTTCTTTATGGCGATTCTTATACCAAGAAAATTCACTTTTTTTATTTTGATACTTTTTGCTCCAAATTTGAAACACGCAATGCACATCCACTTCTTTATTTTTAAAATCTATAAACGCATTTTTTTCTAAGCGTTCGCTATAAAGCAGATTTAAACCTTTCACACGATACTTAATAGAGCCTTTTCCTTGACTTTCAAAGAACATGGGTAGGATAAAACACACAAAATCACAATTTCTAGCATGGTTGATAAATTCTAGTGCCATAACCCCACGATGCCCAAAAGGAGGGTTGCCCAAGCAAATCACTTTTTGATGCGTAGGCAATTTATAATTTAAAAAATCGCATTGAATAAATCCATCTCTTTTAGGTTCAATGTCTATGCCAATGCGTCTATCTTTAGGAAACAAGTCATAAAACACCCCATCGCCTGCACTTGGTTCTAAAAAAATAAATTCATCTAGATTTTCGTATTTTTTAATCACTTCACAAGCTTTTTGGAAGCATTTTAAAGCCACACTAGGCTTAGTGAAATACTGATCTAGAACATTGCTAGAATTTTCTTTCATCTCATTGCCATTGACATAGCGTTTAGGGGTAATTTCTTTAAACAAGGTTTGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019700|377556:385673|378583_379312_-|AVG73347.1|tRNA|DBSCAN-SWA MRCFKVTIAYDGAYFLGYAKQPNKLGVQDKIESALNMLGIKSVVVAAGRTDKGVHANNQVLSFHAPKHWNAAKLFYCLAPKLAPHIVLKKLEEKNFHARFDAQKRAYRYLLTKNLKTPFLAPYIACGDYGSLDALNTALKQFTGKHDFSLFKKEGGATTNPNRIIFNAFAYKTSIMGHECVVFKIIGDAFLRSSVRLIIQACVQYSLEKITLAEIEMQIHNLKATIRTPIMANGLYLHRVYY >CP019700|377556:385673|382346_383474_-|AVG73351.1|DBSCAN-SWA MKEFAYSEPCLDEEDKKAVLEILNSKQLTQGKRSLLFEEALCEFLGVKHALVFNSATSALLTLYRNFSDFDADCNEIITTPISFVATANMLLESGYTPVFAGIKNDGNIDELALEKLINEKTKAIVSVDYAGKSVEIKSIQELCKKHSLSFLSDSSHALGSEYQNKKVGGFALASVFSFHAIKPITTAEGGAVVTNDSELYEKMKLFRSHGMLKKDFFEGEVKSIGHNFRLNEIQSALGLSQLKKAPFLMQKREEIALVYDRIFKDNPYFTPLHPLLKYKSSNHLYPILMRQKFFTCKKLILENLHKRGILAQVHYKPIYQYQLYQQLFNTAPLKSAQDFYRAEISLPCHANLNLESAQTIAHGVLKTFEDLKIE >CP019700|377556:385673|384710_385673_-|AVG73354.1|DBSCAN-SWA MQTLFKEITPKRYVNGNEMKENSSNVLDQYFTKPSVALKCFQKACEVIKKYENLDEFIFLEPSAGDGVFYDLFPKDRRIGIDIEPKRDGFIQCDFLNYKLPTHQKVICLGNPPFGHRGVMALEFINHARNCDFVCFILPMFFESQGKGSIKYRVKGLNLLYSERLEKNAFIDFKNKEVDVHCVFQIWSKKYQNKKSEFSWYKNRHKEPFGEYIKVFTVSLAKNRECGKEWIFNQKASFYISSTFYKSTQIVENFEEVKYQSGIAVVFTSTDKVLNAKLKKLFKEIDWTKYASLATNSCYHLGKSHIFQALHDHLDSLRDN >CP019700|377556:385673|378218_378590_+|AVG73346.1|DBSCAN-SWA MGIFGTNYPTRDGTCIRDYIHVDDLANAHLASYQTLLEKNKSEIYNVGYNQGHSVKEVIEKVKEISNNDFLVEILDKRLGDPASLIANNAKILQNTPFKPLYNNLDTIIKSALDWEEHLLRFQ >CP019700|377556:385673|383470_384070_-|AVG73352.1|DBSCAN-SWA MSKISNNYNPSLMMRDYHTQRVSPHARKEENKEIQNLSENDEKIKLAKQAKQDNLAIGDLESRLKSLKGMDKDAKELVGISKAYAHNNEKDRSDFEHFKSRLDKAIDSFNQKSGNDSLKLPNNIDIDDTKALEKFSKSLESEKENIQNSLHQWKKQLAETNHLNKEYNTLDKTRLNAQKFQDVHDTSKITPSRLQDLLA >CP019700|377556:385673|381000_382026_-|AVG73350.1|DBSCAN-SWA MEVSRKKIYNPDSTESVNERKIFGGNPTSMFDLNKIKYQWADHLWKTMLANTWFAEEVSMNDDKRDYLKLSAEEKIGYDRALAQLIFMDSLQTNNLIDNINPFITSPEINLCLVRQAYEEALHSHAYAVMVESISANTEEIYDMWRNDMQLKSKNDYIAQVYMELAKNPTEENILKALFANQILEGIYFYSGFSYFYTLARSGKMLGSAQMIRFIQRDEVTHLILFQNMINALRNERADLFTPKLINEVIEMFKKAVEIEALWGDYITQGKILGLTSSLIEQYIQFLADSRLSKVGIAKVYGVQHPIKWVESFSSFNEQRSNFFEARVSNYAKGSVSFDDF >CP019700|377556:385673|384162_384711_-|AVG73353.1|DBSCAN-SWA MDLEQTFLKIIEKKHKELNLGQDYNAIFSKIRDFEANAIGQIGEEFLKSVLNAIDEVINDGIIHDEYDIMAKSGVSFEVKTARKGRTNNTFQFNGINPRYNYDFLICLGVCEDQLLYRIFKKDEIHYIHKKRKYFMKQNEFKKQLVPMNPDNQVNYKLTLNLKELKEITNLIKELERVLGLD >CP019700|377556:385673|380361_380991_-|AVG73349.1|DBSCAN-SWA MNSIKNHLMCEEIHKRFNLHPKVREAMESIEREVFVPAPFKHFAYTLNALSMQAQQYISSPLTVAKMTQYLEIDHVDSVLEIGCGSGYQAAVLSQIFRRVFSIERIESLYIEARLRLKTLGLDNVHVKFADGNKGWEQYAPYDRILFSACAKNIPQALIDQLEEGGILVAPIQENNEQVIKRFVKQNNALRVQKVLEKCSFVPVVDGVQ >CP019700|377556:385673|379313_380351_-|AVG73348.1|DBSCAN-SWA MIKHYLFMAVSQVFFSFFLVLFFISSIVLLISIASVTLVIKVSFLDLVQLFLYSLPGTIFFILPITFFAACALGLSRLSYDHELLVFFSLGVSPKTMTKAFVPLSLLVSAILLVFSLILIPTSKSAYYGFLRQKKDKIDINIRAGEFGQKLGDWLVYVDKAENNSYDNLVLFSNKSLSQESFILAQKGNINNQNGVFELNLYKGHAYFTQGDKMRKVDFEELHLRNKLKSFNSNDAAYLQGTDYLGYWKKAFGKNANKNQKRRFSQAILVSLFPLASVFLIPLFGIANPRFKTNWSYFYVLGAVGVYFLMVHVISTDLFLMTFFFPFIWAFGSYLLFRKFILKRY >CP019700|377556:385673|377556_378285_+|AVG73345.1|DBSCAN-SWA MALLFTGACGYIGSHTARAFLEKTKENIIIVDDLSTGFLEHLKALEHYYPNRVVFVQANLNETYKLDAFLNKQQLKDPIEAILHFGAKISVEESTHLPLEYYTNNTLNTLELVKLCLKHAIKRFIFSSTAVVYGESSSSLNEESPLNPINPYGASKMMSERILLDTSKIADFKCVILRYFNVAGACMHNDYTTPYTLGQRTLNATHLIKIACECAVGKRKKWGFLALTTPQETALALGIISM |
10 | Tupanvirus(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_2 |
488979 : 527504
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019700|488979:527504|DBSCAN-SWA ACTAGGTAGGTCTTACAAATTCTACCCCAAGGATTGATGCCCCAACCCTATGAATATTAATAGCCGCATTTAAATCCCTGTCTAGTTCCAATCCACAATATTTGCAGTAGTATTCTCTTTCTTTATCTGTTTTGCCTAATTTTTTAATGTCTTTATTAAAGTTTTCATCAACAGATAAGCAATTAGAACAAGTCTTAGAGCTAGGATAAAATCTATCAATCTTAACGACATGAGCCTTGTTTTCAAGAATTTTCACAAACTCGCTAAAAGCTATATCGCTCACTTTCCTACCCCAAAGTTTTTGCATAGCTTTCATGTTCAAGTCTTCAATGAAAATGCTTTGGTATTTTCTGCTTAATTTCAAAGCCAATTTATAAAAGAAATCGGTTTTTAAGTGTTTGATTTTTTGGTGCAGTTGGGCTAGTTTCTTTTTAGCTTTTTTAAAGTTATTAGAACCCTTAACTTTCTTGCTAAGGTTTTTACTAAGTCGTTTAATCAAAGGCAAGTATTTAGAGAAAAATAAAGGCGATTCTATCTTAGTGTTGTCAGATCCGGTTAAAAAAGTCTTTAACCCAAAGTCAAAGCCCACGCTTTTATCGCATGCGGTTTGCTTGTTAGGGTTATTTTCTAATTTACAGACTAGACACAAGAAATAATCGCCCATATTATCTCTTTTAATGGTTAGAGTTTTTACTTTCCCTATCAAAGCATAAGTTTTAATGAACTTGTAGCTATAACCATTAAAAGAAACAACATTGTCTTTTATCTCAAACCCCACTCCCTTATTCAACCCTGTCTTTTTATCAACTTGGCTTTTGAAAGTGAAAGATTTGTAGTTGGCTACTTTTTTAAATCGTGGCAATTTGGCTTGTTTCTTAAAGAATTTTTTAAACGCTTTATCTATCCTTTCAGTTAAATCTTGCAGGGTTTGTGAGCCTAGCGTTTTTAAAAAAGCATAACGATGGGTCTTTTTCAATTTGGTGGTGTGTTTTTGCAAATCGTTAAGCTTTAAATACTTTTTGAAAAGTCTATAATAGCGTTTGTGCAAGGCAATGCAATGGTTATAAAACACGCCATAATGCCTTAATAGTGTGTCTATACGCCTATTCTTATCGTTCTTATAGAGCTTTTGTTTGTAGGTTATCAACATAACTTTTCCATTTTTCTTTTTGCTTAGGGCGGTTGCTGTTTTGTTGGTTTTCAATGTATTGTTTGACAACATTCAAAGGCGCACCCCCCACTGTTGAAATGAAACAGGAATTGGTCCATAAAGTAGGTAGTTTTGTCTTTAAGTGGTTAAATTCTTGTCTTAATATCCTACTGCTACGACCTTTAGCGGTTTTAATGAACTTCATCACTCCAAAGCTTGGATCAATGTCAGCTAAAATGTGGATATGGTCTTTATCGGTTTGCATCTCTATAATCTCTACTCTTAATTCTTTAGCCACTTCTTGAATGATTTCTTTCAATCTCATTTCTACAGCTCCCACTAAGACCTTACGCCTGTATTTAGGACACCACACGATATGGTATTTGCAAGAATAGACAACATTATGATTGCTTTTGTATAAAACAGCTTTACTCATATTTGTAGTATATATAAAAAAAATAAATAATACAAGATATTCATAACATTACCCTTATTTTTGTGCATGATATTGACTCTAATACCCCTATTCCATATTGGCACGCATAAAGGCGTTTCGCCTTGTATCCCCATAGCTAAAAGCTAGGGGCTTTAAGGCGTTAGTTTTGGGTAAAGAATTTTTTAATGAATTAAGAAGTGAGTTTGCTTATAGGTTGAATGACCACTTATTGAGCGAAGAATACTTGTATGTCAATGAGCCAAAACTTAAAGAGCTAGACAATATCAAACAACAATTACAAGACTTGGAAAAAGAAGAAAAAGCCTTAGAACAAATCAAATCCCCACAAGATGAGTGGGACTTAAACAAGGCTTTACAAAGCGAGTATTTACAAGAACTCAAAGATAAAAACAAAGCAAAAGCCCTAGACATTCAAAATAACCACAGCACCCCTTTAAAACAAAAGATTTCTGAATTTAAAATCGCTCTGTTTAATCACAAAGACACAAGCGATGATGAAAAAGAACAGCTAGATATTGACAGGATAGATAAGAGAAAACCAGTAAGCGAACACTTAAAAAACACTAACAAACACGAGCTATACGAACTCTTAGGCTTTTATCAAAAAGAATTAGATAAAAAACAAAACCATTCAGCCTTTAAGAATTTTGCTATTCTCAATGGTTTAGACAGAGACTTTGAAAGAGAGACTAAGGGTTTTTCTGTGTTAAAGAAAAAAGAAATGCTACTAAGTAAGCTAGAACGCCTAGACAAACGCCTTTTAGATAAAAACTCACACCTACTATTAGCTCAATTAAGGAATGTTGTTAGAACCAAGCAAAACACACAATACAACACTCTAACTAATCCTATCTTTTTAGCCAAAGCCTTAGAACTTCCTAAGGATAAACGCCCCACTCTCAAAACTTTTAAAAACGCTTATTTTAGTGCTAGAAAATATCAATTCATGCTAGAGAGCTTTAAAACTAAGCAAAATGACCCCACTTATAATCTTAATGATAACGCTTATGAGCTAGTGAGTAAGCAACTACAAGACTATCAAAACACCATGCTTTTATTAGCCAAAGAGAGATTACTTTTTTTAGAACAAGATTTAAAACAAAAAGAAGAAGAGTTTGAAAGAGCCAAAGAACATTATGTGAAATCTTTAAAACATTATAGAGAAACTTCATTGTTTCCAAAAGAAAAACAAGGCTTTCTCAAACAAATTAAACAATTTTCTAAAATTTCTAAGGATATTCTCTATACTTGTAATGAAATCATAGGAGCTAATAGGTTTTTAACCCACTATGACAACCTAAACCTTGAAAAAGTCCTAGAACACGCTAAAGATACTAAGCTAGAGCAAAAAGAAATTCAAGCTATCACAAAAGAGCCTAACAGCGATGAGCCTTGGATTGAGTTTGGTAAAAAAGAACAAGCTAGAGCTAAAGCACACTATCAAGCTATGCTAGAAAAAGAAAAAGCTAAAGAATTAGCTAAACAACAAGCTAACACCTTGCACTCTAATGAGCTTGATGATGACCCTAAAGCTCATGCTGGATTAAAACAAAATGACAACACAAACTTTAAAGGGCGTAATAGATAATGCTCTCAAGCGATGATTGCCTTTAATGTTCTTAATAAAGAATATACCCTTTGATTAAAGGGGTTTATTCTTGTTCTTTTCACAAATTAGCTTATTTAAACAGATATACAAATAAAGCACTCTAAAATGCCCCACAATCAAAATAAAGCCATAAGATAAGACAAACTATTAACCTAAAAACAAAAACGCTTTAAAACGCCTTGTAGAGCTTAAATTTTTCTTAAGTAGCACGCAAAAATTTAAAACCTTAAAGTTTTCTTAAACATAATCATAAAGCAAGTTTAAACCTAACCCTTGAACCTACTATCAAATCAAACTTAACTCTTTTAATACTAAGAGCTAGAAACAAACCTTAACCCTACACACTCTAAACAAAAACCTTTCTAATCCTAAATGCTAATGAGACAAACCGCTTACAACCTAACTTAAATAACACAAGCCTTGACTAATCATTCCTTCCACAACTAACATGTCATTGATAGGTAATTCCTATTTTTCTTTTATTTTGATTTTGTTCTTATTTTTACTAATAAAAGAAATTAAAAACTTTCCTTAAACTAAACCTAGCCACAACTAACTTTATGGCTCTTTCAGTCAGTTTGTCTCTTTTAATCAAAAGTTCTTTTTTTTGATTTTTCTTTTTTTCCTTTAGCAAGTTCCTAGTTGTCTAATTTAATCAAGTTTTTTAAAAAAAGAAATCCCCCTCATGACATGATATTTACTAATAACATGTTTACTCAATAGGTTAGGAAAGAAAGGTAAACCTTTCTTTCCCTTAATATTTTTATAACTATACGGAACTTAAGTTCCGCTTTCATATCTAATACCCATAAACACGCACTTCTTAACCTTAAAAAGCGCTTAAAGCTTACTTTCAAAAACTATTTAATCGTTGGTAAATTCAATTTTTGTATTTAGTGAGTAATGCAAATAACTATGTATTTGATTATTTACTTTTAAGGGGGCGAAATTTTGCTTTTATGCCTTAGTTAAAAGCGGAACTTTTTAGAGATTTAGATTTAAAGGCGGAATTTCAAATCTCTAAGGAGCCATGCAAAATTTTTAAAAATACCGCTTTTAGAACCTAACAAACTAAAAAACATAAAACTCTCATTCTTTAAGATTTCTTTTTATATTTTAATAAGGGAGCAATATGCCACATAACAAACTCACTAAATCTCAGAGAGAACTCTTTTGTAATCTCAAAGCCTTTTTATACACTAAGGCTAAAAACTTTACGCCCATTCAAGATGTGAAGGATATGGCTTTAATCCTAGACACACAAGATAAAATCTTAAAATGTCATAATATAGAGCAATTAAAACAACTCTGTCATATTCTTTATAATCAAGGCATTAAACACACTATAATGATGCAAGGCTTGTTTTTATTCTTTAACTATTTTAAAGATAATCTCAAATTAAGAAGTTTTAGAATGCTTAGCGAAGAGCAAGTGATTAACTTTCTCTTTGAACTCGCTCAAAATAGAAAAACCAGCTCTATGGCTAAGTATGTGATGTATTTAAGACAATTCTTTGATTATTTGGATAGAAAAAGGCGTTATAGCTTTGATTTTACGCTTAAAAACCTAGCCTTTGCTAAGACCAAAGAAAGCTTACCCAGACATTTAAACGATAAAGACTTAAAGAGTTTTTTAAAAACACTCTTAGGCTATAAGCCAGCTACAAGCTTTGAAAAACGCAATAAGTGTATTCTACTTATTGTAATACTTGGGGGACTTAGAAAATGCGAAGTGTTAAACATAGAATTAAAACACATTCAAGTAGAAGAGCAAAACTACTCTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019700|488979:527504|522036_524613_-|AVG73456.1|DBSCAN-SWA MLESALKYCKEKAIDLLAGFVPKTYSMAQECNILGLYDDTFIITKQENLVGIISLQGLSYSNLMQKDLEGYFDTRQNVLNTISKDIQLRIVAKRRKEFINQSPNIDNIYAKAIITQFESKEIYKTEYFLVFETITSNVKSFFEKKKLEMTTSINEELEESSKEDKQENENSSNETHSNTSSKKDKKNKFKKKITFSATSKRALLIQTIERVKNALKEFKPTLLNSKEVLNFYAEYINGKYIAFNPKLKRLSDSYIASNVHFKKDYFVIEFQNQNTFCACVGIKAYESEEISSIPISTLLHTKIELDLIFHIRSLGQFESLNFLKTKKKLTLSKIVKADIDNYIELVQANRLSMQECALNLVIRAKSKAKLDKSLKEILSLLNNAGLGSVAETIGLKPSYFSFFPNNANINPRMRHQTSQVIASLILFEKNNTGFRANSWGDMPLSVFKNLDHSPYLFNFHNQEVKHKGVLAHNVARVVGHTMIIGATGAGKTTLISYLMMSALKYSNIDILALDRLNGLYSFTKYFDGIYNQGENFHINPFSLEDSATNRAFLLHFYAQMAKVDSYDDHKDKVEDRTALLNAIDTMYRNYNDEVKQAKFSNQELPLPFDLKEFVNAIVKTNADILDSSFEDYLKSSLFSSRMDSLDFKTRISTINTDSILHNDDDAGLLAYYVFHKMIDRALRINRGFLCFIDEFKSYAQNEIMNKKINEIITQARKANGVIVLALQDINQLSEVRNAQSFIKNMGQLILYPQRNIDTKDLNDKFGIRLSDTEKHFLENTAVNEYKVLLKNMNDGSSNIIDVSLSSLGNYLQIFSSNSSMVEHIDNLIKHYPKTWREVFVSNKHENFDDKKHLEKVLK 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36 | Helicobacter_phage(40.0%) | protease,integrase,transposase | attL 496017:496036|attR 527340:527359 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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