Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP026515 | Helicobacter pylori strain dRdM2addM2 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas2,cas14j,DEDDh | 1 | 0 | 1 | 0 |
1. CP026515
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP026515_2 | 556231-556518 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP026515_2
|
2 spacers
spacers of CP026515_2
>2.1|556294|54|CP026515|PILER-CR CATTCCTAGCTCTTGATACGCAGTCCAAATAAGCCTTAATGCTTTTCTTAACTT >2.2|556411|68|CP026515|PILER-CR AGCTCTCCTTTCTTCTTCATTTCTAGCTTGAGAGAGGCAGTCTTTATAAGCTTTAAGACTCTCTTTGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP026515_2
The CRISPR arrays of CP026515_2 >merge|CP026515|2|556231-556518|PILER-CR CTAAAAATTTTCTCGCTTCAGGCGTGAGTAATTTCTCGCATTCTTTTTTCTCTTTTTCATTCCTAGCTCTTGATACGCAGTCCAAATAAGCCTTAATGCTTTTCTTAACTTCTTGCTCTAAGAGTTTTCTCGCTTCAGGCGTGAGTAGTTTCTCGCAAGCTCTCCTTTCTTCTTCATTTCTAGCTTGAGAGAGGCAGTCTTTATAAGCTTTAAGACTCTCTTTGGCTTCTTCTAAAAGTTTTTTCGCTTCAGGGGTGAGCAATTTCTCGCATTCTTTTTTCTCTTTTT >CP026515|2|1|556231-556518|PILER-CR CTAAAAATTTTCTCGCTTCAGGCGTGAGTAATTTCTCGCATTCTTTTTTCTCTTTTTCATTCC TAGCTCTTGATACGCAGTCCAAATAAGCCTTAATGCTTTTCTTAACTTCTTGCT CTAAGAGTTTTCTCGCTTCAGGCGTGAGTAGTTTCTCGCAAGCTCTCCTTTCTTCTTCATTTC TAGCTTGAGAGAGGCAGTCTTTATAAGCTTTAAGACTCTCTTTGGCTTCTTCTAAAAGTTTTTTCGCT TCAGGGGTGAGCAATTTCTCGCATTCTTTTTTCTCTTTTT
>CP026515.1|AUZ23741.1|553526_554126_-|sodium:calcium-antiporter MELGFNEAERQKILDSNSSLMGNANEVRDKFIQNYASSLKDSNDPQDFLRRVQELRINMQKNFISFDVYYNYLNNLVLASYNRCKQEKTFAESTIKNELTLGEFVAEISDNFNNFMCDEVARISDLVASYLPREYLPPFIDGNMMGVAFQILGIDDFGRKLNEIVQDIGTKYIILSKNKTYLTSLERAKLITQLKLNLE >CP026515.1|AUZ23740.1|552529_553522_-|P-type-DNA-transfer-ATPase-VirB11 MTEDRLSAEDKKFLEVERALKEAALNPLRHATEELFGDFLKMENITEICYNGNKVVWVLKNNGEWQPFDVRDRKAFSLSRLMHFARCCASFKKKTIDNYENPILSSNLANGERVQIVLSPVTVNDETISISIRIPSKTTYPHSFFEEQGFYNLLDNKEQAISAIKDGIAIGKNVIVCGGTGSGKTTYIKSIMEFIPKEERIISIEDTEEIVFKHHKNYTQLFFGGNITSADCLKSCLRMRPDRIILGELRSSEAYDFYNVLCSGHKGTLTTLHAGSSEEAFIRLANMSSSNSAARNIKFESLIEGFKDLIDMIVHINHHKQCDEFYIKHR >CP026515.1|AUZ23739.1|550274_552521_-|sodium:calcium-antiporter MEDFLYNTLYFIEDYKLVVIFSFIGLIALFFLYKFIKAQKKAFKDKANQPQKKKSFKEIIIDGLKERVKTFGFWLQAILLLSYSFITSGLFFLILLGNFYDDNRSPESDDDLFDIWIYAIQDFPNYYFKALGFSSLKIYGFNISLVVYGSILCSYIFITFFVWFLKYLTRTRDIGANKKVDDLFGSASWETEEKMIKAKLITPNNKKRAFDKREVIVGRRGLGDFIAYAGQAFIGLIAPTRSGKGVGFIMPNMINYPQNIVVFDPKADTMETCGKIREKRFNQKVFIYEPFSLKTHRFNPFAYVDFGNDVVLTEDILSQIDTRLKGHGMVASGGDFSTQIFGLAKLVFPERPNEKDPFFSNQARNLFVINCNIYRDLMWTKKGLEFVKRKKIIMPETPTMFFIGSMASGINLIDEDTNMEKVVSLMEFFGGEEDKSGDNLRVLSPATRNMWNSFKTMGGARETYSSVQGVYTSAFAPYNNAMIRNFTSANDFDFRRLRIDEVSIGVIANPKESTIVGPILELFFNVMIYSNLILPIHDPQCKRSCLMLMDEFTLCGYLETFVKAVGIMAEYNMRPAFVFQSKAQLENDPPLGYGRNGAKTILDNLSLNMYYGINNDNYYEHFEKLSKVLGKYTRQDVSRSIDDNTGKTNTSISNKERFLMTPDELMTMGDELIILENTLKPIKCHKALYYDDPFFTDELIKVSPSLSKKYKLGKVPNQATFYDDLQAAKTRGELSYDKSLVPVGSSEL >CP026515.1|AUZ23738.1|549646_550156_+|sodium:calcium-antiporter MFEKWIGLTLLLNSLAYPCQKVTISFKQYENLLHIHQKGCDNEVMCRTLISIALLESSLGLNNRREKSLKDTSYSMFHITLNTAKKFYPTYSKTLLKFKLLNDVGFAIQLAKQILKENFDYYKQKHPNKSVYQLVEMAIGAYNGGMKHNPNGAYVKKFRCIYSQVRYNE >CP026515.1|AUZ23737.1|548191_549637_+|type-IV-secretion-system-apparatus-protein-Cag3 MFRKLATAVSLIGLLTSNTLYAKEISEADKVIKATKETKETKKEAKRLKKEAKQRQQIPDHKKPQYVSVDDTKTQALFDIYDTLNVNDKSFGDWFGNSALKDKTYLYAMDLLDYNNYLSIENPIIKTRAMGTYADLIIITGSLEQVNGYYNILKALNKRNAKFVLKINENMPYAQATFLRVPKRSDPNAHTLDKGASIDENKLFEQQKKMYFNYANDVICRPDDEVCSPLRDEMVAMPTSDSVTQKPNIIAPYSLYRLKETNNANEAQPSPYATQTAPENSKEKLIEELIANSQLVANEEEREKKLLAEKEKQEAELAKYKLKDLENQKKLKALEAELKKKNAKKPRVVEVPVSPQTSNSDETMRVVKEKENYNGLLVDKETTIKRSYEGTLISENSYSKKTPLNPNDLRSLEEEIKSYYIKSNGLCYTNGINLYVKIKNDPYKEGMLCGYESVQNLLSPLKDKLKYDKQKLQKALLKDSK >CP026515.1|AUZ23736.1|547385_547733_+|cag-pathogenicity-island-protein-Cag1 MADTINTTEATHETKKPNAFVNFFKNNLTDKRYDSLGLIGAGVLCCVLSGAMGIVGIIFVAIGIFLSFSNINLVKLVEKLSKKQSKVPTTVNNETQKSQATSVTNEPTEAKETKD >CP026515.1|AUZ23735.1|546379_547210_-|HP0519-family-Sel1-like-repeat-protein MFKDFYRTTLSFLKPLLLLLVLLLPFSLCIADEYISISDDWDEIVRNHKTYYFENGLDHFNQGQYQQAFKDFRLAQEYSIGLGSVYLAKMYLEGKGVKVDYKKAQFYAENAIKGYGSGLLGGALILGRMQAEGLGMKKDLKQALKTYRHVVRMFSNKSTNFANNFRLPNLAEFTSMLIGSRFIDLSGLSANPIKFGKKFGILVKKSTQIKDKTLLWEDIAEISSNITLLKQQMGEILYRIGIAYKEGLGTRKKKDRAKKFLQKSAEFGYEKAMEAL >CP026515.1|AUZ23734.1|545298_546291_+|peptidase MKKVLPALLMGFVGLNASDRLLEIMRLYQKQGLEMVGQKLDSYLADKSFWAEELQNKDTDFGYYQNKQFLFVANKSKPSLEFYEIENNMLKKINSSKALVGSKKGDKTLEGDLATPIGVYRITQKLERLDQYYGVLAFVTNYPNLYDTLKKRTGHGIWVHGMPLNGDRNELNTKGCIAIENPLLSSYDKVLKGEKAFLITYEDKFFPSTKEELSMILSSLFQWKEAWARGDFERYMRFYNPNFTRYDGMKFNAFKEYKKRVFAKNEKKNIAFSSINVIPYPNSQNKRLFYVVFDQDYKAYQHNKLSYSSNSQKELYIEIENNQVSIIMEK >CP026515.1|AUZ23733.1|544393_545302_+|GTPase-Era MMKTKAGFVALIGKPNAGKSTLLNTLLNAHLALVSHKANATRKLMKCIVPFKDKEWYESQIIFLDTPGLHHQEKLLNQCMLSQALKAMGDAELCVFLASVHDDLKGYEEFLSLCQKPHILALSKIDTATHKQVLQKLQEYQQYDSQFLALVPLSAKKSQNLNALLECISQHLSPSAWLFEKDLMSDEKMRDIYKEIIRESLFDFLSDEIPYESDVMIDKFIEEERIDKVYARIIVEKESQKKIVIGKNGVNIKRIGTNARLKMQEVGEKKVFLNLQVIAQKSWSKEEKSLQKLGYIHRRNRD >CP026515.1|AUZ23732.1|543065_544397_+|HslU--HslV-peptidase-ATPase-subunit MSKLNMTPREIVAYLDEYIIGQKEAKKSIAIAFRNRYRRLQLEKSLQEEITPKNILMIGSTGVGKTEIARRIAKIMELPFVKVEASKYTEVGFVGRDVESMVRDLVNNSVLLVENEHKEKLKDKIEEAVIEKIAKKLLPPLPNGVSEEKKQEYANSLLKMQQRIAQGELDSREIEIEVRKKSIEIDSNVPPEILRVQENLIKVFHKEQDKVKKTLSVKEAKEALKAEISDTLLDSEAIKMEGLKRAESSGVIFIDEIDKIAVSSKEGSRQDPSKEGVQRDLLPIVEGSVVNTKYGSIKTEHILFIAAGAFHLSKPSDLIPELQGRFPLRVELENLTEEIMYMILTQTKTSIIKQYQALLKVEGVEIAFEDDAIKELAKLSYNANQKSEDIGARRLHTTIEKVLEDISFEAEDYSGQNVTITKELVQSKLEDLVADENLVKYIL >CP026515.1|AUZ23742.1|560060_561629_-|type-IV-secretion-system-apparatus-protein-CagX MGQAFFKKIVGCFCLGYLFLSSAIEAAALDIKNFNRGRVKVVNKKIAYLGDEKPITIWTSLDNVTVIQLEKDETISYITTGFNKGWSIVPNSNHIFIQPKSVKSNLMFEKEAVNFALMTRDYQEFLKTKKLIVDAPDPKELEEQKKALEKEKEAKEQAQKAQKDKREKRKEERAKNRANLENLTNAMSNPQNLSNNKNLSEFIKQQRENELDQMERLEDMQEQAQANALKQIEELNKKQAEETIKQRAKDKINIKTDKPQKSPEDNSIELSPSDSAWRTNLVVRTNKALYQFILRIAQKDNFASAYLTVKLEYPQRHEVSSVIEEELKKREEAKRQKELIKQENLNTTAYINRVMMASNEQIINKEKIREEKQKIILDQAKALETQYVHNALKRNPVPRNYNYYQAPEKRSKHIMPSEIFDDGTFTYFGFKNITLQPAIFVVQPDGKLSMTDAAIDPNMTNSGLRWYRVNEIAEKFKLIKDKALVTVINKGYGKNPLTKNYNIKNYGELERVIKKLPLVRDK >CP026515.1|AUZ23743.1|561681_563289_-|cag-pathogenicity-island-protein MFNIKRNFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILTGYTSIGASGSGKSSGQGVIEALSTPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGFALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSMDSVLDNLSNKIQNFTKGGVEDNVKGNILLQIIGSITAQASTNITADGLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESVVKGADAAVLPAYGVVNLPDIIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISSNIQINIGFEYMRFVGGTLFKMAMVSFIAYAGFGYLYKISYSIYFGLAGAFGLNQVLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGNNAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAGAFSGIVFPIAVSLIVLDWFKDSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIASLITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGRVGGSMFKG >CP026515.1|AUZ23744.1|563293_564052_-|virB8-family-protein MLGKKNEEVLIDENLVGGVIALDRLAKLNKANRTFKRAFYLSMALNVAAVTSIVMMMPLKKTDIFVYGIDRYTGEFKIVKRSDARQIVNSEAVVDSATSKFVSLLFGYSKNSLRDRKDQLMQYCDVSFQTQAMRMFNENIRQFVDKVRAEAIISSNIQREKVKNSPLTRLTFFITIKITPDTMENYEYITKKQVTIYYDFARGNSSQENLIINPFGFKVFDIQITDLQNEQTVSEILRKIREVESKNKALNK >CP026515.1|AUZ23745.1|564437_565094_+|cag-pathogenicity-island-protein MNDTTEHHGPNPLNAPPPSNSQSNDLLNLLDSLYPKGSLGEQRFHEALKNQEELKNILIEIEKLPQEKRYELLMQIGQAKQRIMEAYAHSFLGYIGGLEHLLGLCMGGIFVLFAIYFVFLRTSKNMELVESLKTKLKLQYFYYAFGVGAVLFFGLETIRSIYELYILGIGSTNDKVLFVLKNICFIGMGYLIYKVIKVIGIKNFINGLFTSKKQGGAE >CP026515.1|AUZ23746.1|565129_565972_+|type-IV-secretion-system-apparatus-protein-CagT MKLRASVLIGATILCLILSACSNYAKKVVKQKNHVYTPVYNELIEKYSEIPLNDKLKDTPFMVQVKLPNYKDYLLDNKQVVLTFKLVHHSKKITLIGDANKILQYKNYFQANGARSDIDFYLQPTLNQKGVVMIASNYNDNPNSKEKPQTFDVLQGSQPMLGANTKNLHGYDVSGANNKQVINEVAREKAQLEKINQYYKTLLQDKEQEYTTRKNNQREILETLSNRAGYQMRQNVISSEIFKNGNLNMQAKEEEVREKLQEERENEYLRNQIRSLLSGK >CP026515.1|AUZ23747.1|566182_566773_-|CAG-pathogenicity-island-protein-13 MSNNMRKLFSMIADSKDKKEKLIESLQENELLSTDEKKKIIDQIKTMHDFFKQMHTNKGALDKVLRNYMKDYRAVIKSIGVDKFKKVYRLLESETMELLHAIAENPNFLFSKFDRSILGIFLPFFSKPIMFKMSIREMDSQIELYGTKLPLLKLFVMTDEEMNFYANLKTIEQYNDYVRDLLMKFDLEKYMKEKGV >CP026515.1|AUZ23748.1|567198_567579_-|cag-pathogenicity-island-protein MLPTKTRIRDPNKQELTQPKIKGLIMGKILASLLGGGTNLFTGLSSDLFSMILNFLFFLMLMMGLNEILGKKFNLPMDNIKNFMAEVLKNGFDSIKNMGSALVGNGFGSNKSDKTTNKMSVSQVRL >CP026515.1|AUZ23749.1|567515_567701_-|hypothetical-protein MFGGKIFDLFAIGGYLSLDFMSNLTNRFKNFLSSFRYAIVKCFLLKHALEIRTSKNLHNQK >CP026515.1|AUZ23750.1|568011_568356_-|cag-pathogenicity-island-protein MKRPISKLKQNFLQFKHSFNKHLDKYSLYYRLFNISSIVIGFLVALFSYGAGVILVYPILFLFALIIKPSFFYYTTYLLLLVSLSIISKYYLLSHANFTMKLIILMTQWQNWFL >CP026515.1|AUZ23751.1|568481_568664_+|hypothetical-protein MWYSTNQRFVCLCQKKNRKHLLKNKGVFHLKNTNLLYRNNLKRNLKNTNKPHTSKKNITL |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP026515_2 | 2.1|556294|54|CP026515|PILER-CR | 556294-556347 | 54 | CP026515.1 | 555964-556017 | 1 | 0.981 |
1. spacer 2.1|556294|54|CP026515|PILER-CR matches to position: 555964-556017, mismatch: 1, identity: 0.981
cattcctagctcttgatacgcagtccaaataagccttaatgcttttcttaactt CRISPR spacer cattcctagctcttgatacgcagtccaaataagccttaacgcttttcttaactt Protospacer ***************************************.**************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
1020505 : 1064152
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP026515|1020505:1064152|DBSCAN-SWA CTTAACTAACGCCATTTTCAGCCTTTGTTAAAGCGTTTTTTAAACGCTCTTCCCTCTCTTCTTCTTGTTCTTTATAAAGAAGCGCACACCCTTTGGCTAAATCCCTGATTTGTAAAATATAATTTTGCCTTTCAGCCACCGAAATCGCTTTTCTGGCGTCTAAAATATTGAAAAAATGCGAGCATAACATCACAAAATCATAAGCCGGCAAGGGGAGCTTGTTTTCCAAGCAATGCAAGGCTTCGGCTTGAGCGTTTTTAAACATTTCTAATAGCCGTTTCACGCTCGCTGTTTCAAAATGATACTTGCTGAATTCGTATTCGCTTTCCAAATGCACTTGTGCGTAATTCACGCTGTCATGATTTTTTTTAGCCCATTCAATCTCTAGGATATTTTCCACTTTTTGCACATACATCGCTAATCTTTCTAAGCCGTAAGTGATCTCTACAGGAATAGGGCTACAAGCAATGCCCCCCACTTGCTGGAAATAAGTGAATTGCGTAACTTCCATGCCATCAAGCCACACTTCCCAGCCAAGCCCCCATGCCCCTAAAGTCGGACTCTCCCAATTGTCTTCTACAAATCGTATATCATGCTCATTAAGGTTTATCCCTAACACTTCTAAGCTTTTTAAATAGAGTTCCTGGATATTAGAAGGGCTGGGCTTGATGACTACTTGGAATTGGTAATAACTCCCCAAGCGGTTAGGGTTTTCCCCATAGCGCCCATCAGTAGGCCTTCTAGAGGGCGCGACATACGCCACATTCCACGGCTTTTTATCCAAACTCCTTAAAAGCGTGGCCGGATGGAATGTCCCAGCTCCTGCAGGAATATCATAAGGCTGGATCACCAAACAGCCTTGATTCTTCCAATACTCTTGTAGTTTTAATAATAAACTTGAAAAATCTTGCATGCTCTCTTTCCTTTTAAGCGCGTCTGATCAAATCGTTCATGCTCTCTAGCACACTCTTACCCTTTAAAAGCAAGGCTAATTCGCTCGCAATGGGCGTATAAATGCCGTATTTTCTAGCGATTTCCACAATGGCGTTGGTCGTTTTCACCCCTTCAGCCACTTCGCCCAATTCTTCTAAAACCACCTCTAAAGGCTTGTTTTGGGCTAGCCCTAAACCCACACGATAATTCCTAGATAAAATAGAATTAGCGGTTAAAAACAAATCCCCAGCCCCAGAAAGCCCTAAAAAAGTCTCTGTCTTGCCCCCAAAGAACGCCCCAAAGCGTTGCATTTCCACCAAACCTCTAGACAATAAACTCGCTTTAGCGCTATTGCCTAATTTCAAGCCATCACAAACCCCCCCAGCAATGGCTATCACGTTTTTATACGCCCCGGCGATTTCACCCCCTATGATGTCTTGTTGGGCGTAGGCTCTGATAAAAGAGGGGGTTTTATTGGCAAATTCTAGCGCTAAAGCCTGATTATTGGAATGGATGACGAGCGCGCAAGGCAGGCCTTGAATGATTTCAGCCGCAAAACTTGGGCCCGCTAAAAAACACAAAGAATTAGGATCGATAAAATCCTTTGCGATCTCGCTCACAAACGCCTTATTTAACACCTCTATCCCTTTAGAAGCGATTAAAACCTTAGCGTTTTTGGGTAAAGAAGCGTTTTGAAACCATTCCCTTAAATGCTGCACGCTAATAGCGATGACATAGAGCGTTGCTTTTAAGCCTCTTTGTAAATCCACTTGCTCTATGGGGGCAGAACCTTTAGAAATCAAAGCGTCATTGAGCTTTTTTAACGGCTCGTTTAAATCCCGCCTTGAAATGATTTTGACTTCATTCTTTTCTCCAAAAGCAAAGGCTAAAGCCCTCCCCCACGCCCCGCCACCAAATACTGCAATTTCCATTAAATTCCTAATCTCATTGATTGTAAAACTCACCATTTTACAATAATAAGTTTAAAATAGCCCTTACATTCAAAACGCTGTCTTTGATTGAAACATATACATATTAAATAATATTTTAAAATTAAAAAGCGTTAAATTAGTTGTTTCTCAATATATCTCATTACATCGCCCACATTGACGATTTTTTCCGCTTGCTCATCAGGAATCTCAATGCCAAACTTTTCTTCTAGTGCCATGATTAATTCCACGACATCAGAGTCCGCACCCAAATCCTTCACAAATTCCGCCTCTGGCGTAACTTGCACCGCATCCACATTCAATTGCTCAGCAATAACTGACTGAATAGTTTCAAATGAATTCGTATCATTCGTATTGAAAGTTTTGTTGTTATTTTGTTGATTTTTTGTTCTCCTCCACTCCCGCAATTTTTTTTGGAGCTTTTCATTATTTAAGAGATTTTCATAATCTTTTTCTTCATCATAGCCCGCATCATCATCAGCCCAACTCAAAAATTTTCTTTTAAAGCTTCCCCATACACCGCCTTGATTCACCCTTTCGGTGTAACGCTCTTCTTTGTAGTTTTCTTCAATCATCGTCCTCTTCATCGTCATTTTGTTCTTTGTATTTTTCCCAAGTGAAAGCGCTCACGCGATCAAAAACCTTATCAATACCTTCTTTAAACAAGTCAATCACTTCATTCAATCGCGCTAAACTCTCTCTTTTGGATCGCTCTTGCTCGGAAAATTCTTTTTCTAAATTCTCAATTCTTCTAAAAATTTTATCGCTAAAATCATCAAAGCCTTTTTGCATCAAATCCAATCTAACAGAATGCAATTCGCTTTGGTAGCGTTTGAATTGGTTAGCGTCTTGCTCAATAGCCTTTTCATACATGGAATGCACCTCGTATAAATATCCTAAAATTTCGTTTTGTTTCTCGCTCCTTTGATTTAACTTCATTAGAAATTCCTCAAGCGAGTTAAAAACTTTGCTTTTTTCGCTGAATTCTTTATATTCTTGATACCTTGTAGAACTATAAGCACCAATCCCTAAAAATTCAATGCCATTATCTTTTAAAGTCTCTTTAATTTTAATAACGACTTCTTCTAATTGCCTTTTTGTGCGCCTATCAGCCCTACTCAATACGATAAAAACCTGCTTGCCTTCTTCGTATAATTCTTGCAAATATTCTAAATCATCTTCGTGAATCTCCCCACTCTCGCAACTAATGAGCCACAGAATGTGTTTGGCGTGTTTTAGGGATTCTTTAGAGGCTTCTTTATCCCCACCCGTATAGCCTTGCTTGGCGGAGTTAAAACCAGGCGTGTCTATGAAGCATAAAAATTCAAAAGGCACGCTAGGAGCGCTTAAAAGCATGAAAGGCATGATCTCTTTCAAATTAAAGCCAAGGGAGTTTAAAAACTGATGGTCAAAAGCGAGATGTGGCAATTCCACCATGCCCCCATTTTGAGAAAACCCCATTAAAACTTCTCTTTTACCCTTTAAGCAATAAGTGGGGATAGCTGTGGTGGGATTCATGTCTTCAGGGAGTTTTAATTTCAAGCCCAACAAGTTGTTTAAAAAAGTGGATTTGCCCGCGCTAAACCCTCCCCCCACCGCAACGATGGTTTTTTGGAACAAACTAGGGTAGCTCGCTACCAATTGCAATTCTTTTTGGATTTCTTGGAGCGTCAGTAACGCTATTTCCTTTTCTTTGAGCGAATCCACGCCGCTAGCGAACTCTAAAAACTCGTTATCCAAGACGCTCTGATATTCTTCTAGCCCTTCATTTTCAATTCTGGCGTTTAAAATACGAGCGATCAAATCGTAACGCTCTTTTAAGCCCACTTGATGGTTGTTTTGGTGGTTGTCTTGGTGGTTTTCAGCCCTGCTATTGTCATTAAAAATGCCCTTAAAAAAATTAACGCTCATTGAATCCCCTTTAAAGCTTGGATTTGTGCATCTAATTGAGCGATGGATTGCTCTTTGTTTTGAACTTGATTTTGCAAATTTTGCATGTTTTCTTTAAGTTTTTGAAGCGTATCGCTGGCGAAGTTTTGCCTTTCTAAAGCCTCTCTTAAACCTTGGATATAGCCTTTCACATCTTTTTTAGCCTCAGATTCAAAATTCCTCACATAATTCCCCACGCTTTGTATAAAAGCATCGGCTTCATCGCCTTTTAAAAAGCCCGTTTTCCCCCTTATCTCGCTAGGAAGCTTATCAGTGTAATCAAACTCTTTAAATTCAATGGAATCTAAAACAGCCATCACGCTTTTTTGGAAAGCCACCTCATCAATCAAATCATCAGAGATGATTTCGCGCAATTGAGAAAAGACTTTAGCGTAGAGTTCTTTTCTAAAAACGACTTTAAAAGAATCAGCGCTGTCATTCAAAGCGTTTTCGCAGCGTTCATGCATCTCTGTTAAATAATCAAGCACCGCTCCGGCTTTAATGGTTGCTCTTGTGCGACTCACTTCATCATAGCCCGCATCATCATCAGCCCACCACAAAAAATTCCTTTTAAAGCTTCCAAAAAGACCGCCTTGCTTCACTCTTTCAGTGTAACGCTCTTCTTCCTCTTCTTCTCTAGCGAGCGCACTAGCCTTTTGGATAGCTTTCGTTAAGGTTTCATTCAAGCCATCTCTAGTGTTTTTGATGAAATGAAAGATAAATTCTTCATACGCTTCCCTAAACCCTATTTCAATGTTACCAGAGAGTTTTTCATAAGCCTCTATTTGCTTTTTAATCGCGCCCATATCAGCGTTTTTAACCCTCTTTTTTTCATCTTCTAGGTCTTGAAATAACTGCGCAATCAAATTATGGAGGTTGTTCGCTTGGCTTTGTGCATAATCTTGTAATCTTTGAGAAATGATTTCTTCTTTCCTTGAAGCGGCTTTTTCTAAACGCTCTTTAATCGCGCCCATATTGCTTAAGAATAATAAGCTTTCTTCAGATTTATCAACGCTGTTAAAAGCGTCAGGGGGTAAGCGTTGGTTAAATTCCGCCATGCATTGTAACACTCTTCTTTTTTGCTTTCCCAAGAAGCTTGGTTTTTGAAATCCTTATACATGCTAAAGCAAGCCCCTGAAGTCAAAATGACGCCGTTTTTGATCGCTTTTTCAAAAATCCCTCGTTGGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP026515|1020505:1064152|1022954_1024298_-|AUZ24138.1|DBSCAN-SWA MSVNFFKGIFNDNSRAENHQDNHQNNHQVGLKERYDLIARILNARIENEGLEEYQSVLDNEFLEFASGVDSLKEKEIALLTLQEIQKELQLVASYPSLFQKTIVAVGGGFSAGKSTFLNNLLGLKLKLPEDMNPTTAIPTYCLKGKREVLMGFSQNGGMVELPHLAFDHQFLNSLGFNLKEIMPFMLLSAPSVPFEFLCFIDTPGFNSAKQGYTGGDKEASKESLKHAKHILWLISCESGEIHEDDLEYLQELYEEGKQVFIVLSRADRRTKRQLEEVVIKIKETLKDNGIEFLGIGAYSSTRYQEYKEFSEKSKVFNSLEEFLMKLNQRSEKQNEILGYLYEVHSMYEKAIEQDANQFKRYQSELHSVRLDLMQKGFDDFSDKIFRRIENLEKEFSEQERSKRESLARLNEVIDLFKEGIDKVFDRVSAFTWEKYKEQNDDEEDDD >CP026515|1020505:1064152|1024294_1025386_-|AUZ24139.1|DBSCAN-SWA MLQCMAEFNQRLPPDAFNSVDKSEESLLFLSNMGAIKERLEKAASRKEEIISQRLQDYAQSQANNLHNLIAQLFQDLEDEKKRVKNADMGAIKKQIEAYEKLSGNIEIGFREAYEEFIFHFIKNTRDGLNETLTKAIQKASALAREEEEEERYTERVKQGGLFGSFKRNFLWWADDDAGYDEVSRTRATIKAGAVLDYLTEMHERCENALNDSADSFKVVFRKELYAKVFSQLREIISDDLIDEVAFQKSVMAVLDSIEFKEFDYTDKLPSEIRGKTGFLKGDEADAFIQSVGNYVRNFESEAKKDVKGYIQGLREALERQNFASDTLQKLKENMQNLQNQVQNKEQSIAQLDAQIQALKGIQ 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40 | Helicobacter_phage(50.0%) | protease,tRNA,integrase,transposase | attL 1029159:1029174|attR 1059710:1059725 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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