Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP025536 | Streptococcus pluranimalium strain TH11417 chromosome, complete genome | 1 crisprs | RT,cas3,csm6,csa3,DinG,DEDDh | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP025536_2 | 1858727-1858838 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP025536_2
|
1 spacers
spacers of CP025536_2
>2.1|1858755|56|CP025536|CRISPRCasFinder TTATGTTTCTAATTATACACCTCTCCTAGCGTAAGTCAAGCGAAAAACTCAAAAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP025536_2
The CRISPR arrays of CP025536_2 >merge|CP025536|2|1858727-1858838|CRISPRCasFinder TTAGCACTCTTTATCCATGAATGCTAATTTATGTTTCTAATTATACACCTCTCCTAGCGTAAGTCAAGCGAAAAACTCAAAAAATTAGCACTCTTTATCCATGAGTGCTAAT >CP025536|2|2|1858727-1858838|CRISPRCasFinder TTAGCACTCTTTATCCATGAATGCTAAT TTATGTTTCTAATTATACACCTCTCCTAGCGTAAGTCAAGCGAAAAACTCAAAAAA TTAGCACTCTTTATCCATGAGTGCTAAT
>CP025536.1|AUW97307.1|1857673_1858708_-|heat-inducible-transcriptional-repressor-HrcA MITPRQNDILNLIIDMFTQTHEPIGSKALQTAIDSSSATIRNEMAKLEKLGFLEKAHTSSGRLPSKAGFQYFVQNSLALDSIDEQDVYQVIKAFDYEAFRLEDIFATASQLLADLTGYTSVILDVEPKHQRLTNFELVQLSNHDALAVMMLDDSKPVTVQFAIPKNFLSKDLETLKNLVNERFLGKAVLDIHYKLLTEVPQVIHKYFTITDNILDLFDYIFQGLFRETILISGKVNALTYADLPTYQFLDNEAKVAMEMRSSLSEKEPTTIQVADSREPALANLTVIRHQFLIPYRGFALLSVIGPVEMDYRRMISLINVVSRVLALKLADYYRYLSGNHYEVN >CP025536.1|AUW97306.1|1857103_1857649_-|nucleotide-exchange-factor-GrpE MSEDIKNEEVVDETIDNETVTEEIVDETVESEEAPEKSELDLANERADEFENKYLRAHAEMQNIQRRANEERQSLQRYRSQDLAKKILPSLDNLERALAVEGLTEDVKKGLEMTRDSLIQALKEEGVEEVDVESFDHNLHMAVQTLPADDDHPADTIAEVFQKGYTLHDRLLRPAMVVVYN >CP025536.1|AUW97305.1|1855064_1856888_-|molecular-chaperone-DnaK MSKIIGIDLGTTNSAVAVLEGTESKIIANPEGNRTTPSVVSFKNGEIIVGDAAKRQAVTNPETIISIKSKMGTSEKVAANGKEYTPQEISAMILQYLKGYAEDYLGEKVEKAVITVPAYFNDAQRQATKDAGKIAGLEVERIVNEPTAAALAYGLDKQDKDEKILVFDLGGGTFDVSILELGDGVFDVLATAGDNKLGGDDFDQKIIDFLVEEFKKENGIDLSSDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVTQTQISLPFITAGEAGPLHLEVSLSRAKFDDLTRDLVERTKTPVRQALSDAGLSLSEIDEVILVGGSTRIPAVVEAVKAETGKEPNKSVNPDEVVAMGAAIQGGVITGDVKDVVLLDVTPLSLGIETMGAVFTKLIDRNTTIPTSKSQVFSTAADNQPAVDIHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPAAPRGIPQIEVTFDIDKNGIVSVKAKDLGTQKEQHIVIKSNDGLSEEEIDRMMKDAEANAEADAKRKEEVDLKNEVDQAIFATEKTIKETEGKGFDAERDQAQSALDELKAAQESGNLEDMKAKLEALNEKAQALAVKMYEQAAAAQQAAGGAEGAEAAGNTGDDVVDGEFTEK >CP025536.1|AUW97304.1|1854295_1854928_-|4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole-monophosphate-biosynthesis-protein MKKVACLLYPNYSLYEITTLTSTLVLHYGVKIDYIASKNQVVVSEDGLDTLPTKLIDDVNLDDYSCIILPGMIDFKEALYDDRLITFLKTLKNSSLLIAAISSAPLLLAKAGLLEDVCYTGGIWQNFFNYFDFLKIDNFKAHPVTKDKNIVTAIGFAHQEFARVVLEELHLVSDASGFFREKDSYQKSDIIFTLSEIEFAEFKEDFEKNV >CP025536.1|AUW97303.1|1852848_1853988_-|molecular-chaperone-DnaJ MNNTEFYDRLGVSKDASQDEIKKAYRKMSKKYHPDINKEAGAEQKYKDVQEAYETLSDSQKRAAYDQYGAAGAQGGFGGGAGGFGGFDGGGFGGFEDIFSSFFGGGGASRNPNAPRQGDDLQYRVNLKFEEAIFGAEKEVTYSREATCHTCGGNGAKPGSHPVTCGRCHGQGVINVDTQTPLGMMRRQVTCDVCHGTGQEIKDPCTTCHGTGHEKENHKVDVKIPAGVETGQQIRLQGQGEAGHNGGPYGDLFVIINVMKSDKFEREGATIYYNMNVSFVQAALGDVVDIPTVHGDVELTIPAGTQTGKTFRLKGKGAPRLRGNGQGDQHVTINIVTPTKLNDAQKEALRAFAEAGGEKVHPQKKKGFFDKVKDAIEEF >CP025536.1|AUW97302.1|1851955_1852723_-|phosphorylase MLLEEFDTNSHAIINPEMVNEPIEAFPETVVTCFARGTFGRILKELPHKHLVTTSVANLDIPIYEIDFDGHKIGFFNSYVGAAGCVAVLEDLIVMGMKNLVVFGTCGVLDSSIAETSIIIPRAALRDEGTSFHYASPSDEIAVNQDFHEDFKAFLDRQNVSYTEGKVWTTDGIYRETADKMARRKRQGAICVDMECSAIAALADFRDINHFQFFYSADNLDAEVWDERTLGNDADLETKDRIAYIALGFAIEQFK >CP025536.1|AUW97301.1|1851457_1851910_+|hypothetical-protein MRKSVNVILIVQTILFYSSFFIDFEILFPTHWATLVSLIINPILSLIGLIPAIWFKRWLATLGLILYFLSFPIGMIAGYALQAFSNGWDITSQSLYILLGLWLVTIIIAIMALISFQKNRNKLDLVTFGMIYLPPLLTLVILSIVFARQF >CP025536.1|AUW97300.1|1850555_1851332_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MTRYKAIISYDGTLFSGFQRQPGARTVQEEIEKTLLRLNSGKPVTIHGAGRTDAGVHAYGQVIHFDLPQARDVEKLRFGLDTQCPDDIDIVDIAIVSDDFHARYNKHRKTYEFLVDTGRPKNPMMRHYATAFPYPLDLTSMQEAIKDLVGTHDFTGFTASGTAVENKVRTITQASLEVDAKTGLLVFTFSGNGFLYKQVRNMVGTLLKIGNGRMPVSQIKTVLASKNRDLAGPTAAGNGLYLKEITYEDTLYSDHSGQ >CP025536.1|AUW97299.1|1849825_1850593_-|hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine-kinase MKTPYILTIAGNDILSGGGFQADLATFSAHKLYGFLAQTCMTAITDDGFEIFPTDDNLFQKQLDSLKGIPFSAIKIGLLPTPQIARAVKVFIQKRPQVPVVLDPVLVFKENADQEVAQMSQELQELFPYATIITPNLKEAELLSGQSISNLEEMGNAARVLQQMGAKSVVIKGGARLEGDQAFDVLLREDGQVDFLQSSLLDRNNQGAGCTFASAIASGLAKDRTIRQSSQAAKDFVYQSIAHSNDYGVTQYETD >CP025536.1|AUW97298.1|1849368_1849839_-|ECF-transporter-S-component MKQTNIRQLALLAILTALSVVLAYIHIPTPTGFLTLLDAGIYFTAFYLGSKAGAVVGGLSGFLIDMLLGYPQYMIHSLIAHGTQGFFGGWNGKKRLIGLILASLFMVGWYFLAALLLGYGLGAAWAGIFGNIFQNCFGMGLGYILYKAIIKLNLRK >CP025536.1|AUW97309.1|1859426_1860194_-|D-alanyl-D-alanine-carboxypeptidase MRSKLGKQSLVILGFAFLVLVGVLFWYRSQGVSHRSAGKTVIKPTKQVSEKNHTSKERSQSSDLPKVSPNDWGLILVNREHLTPELNPELEAVDNITVDKRIAENVRDFLKAAQEVDPAFHLISGYRSVAYQKELFQSYIDQEKAANPSLSEEEAEKLVKTYSQPGGASEHQTGLAIDLSTVDALNQADKSTMSEIHQMAPDYGFVLRFPDGKTDFTGVGYEDWHFRYVGKASARYMTDHGLTLEEYTEQLEERE >CP025536.1|AUW97310.1|1860183_1860885_-|histidine-phosphatase-family-protein MTETKLYIARHGKTMFNTIGRAQGWSDTPLTAFGEEGIRELGIGLKEAGIPFKAAFSSDSGRTMQTMEIILRETENESLPYKRDKRIREWCFGSLDGGYDGDLFQGVLPRTVAFADGRSLDEMPYPDIAQSIVEVDTANWAEPWEVLSKRIYDGFEAMAQEIEAQGGGNAIVVSHGMTIGTFMWLIDNNQEKQRIENGSISVVTYKDGKFKIETVADLSYREKGREIIDANEK >CP025536.1|AUW97311.1|1861415_1862159_-|DNA-binding-response-regulator MNIFILEDNLYQKERLLATIKDILKEENLACRHLEAYSKASNLLDNIKERGSHQLFFFDIEIKDEARKGLEVASELRQVDPNAVIVFVTTHSEFAPISFKYKVAAYDFIDKALDPEDFKEQVRDCILYTSSLSGGIQSEVSYFDYKSSKAQIKVPLHDILYFETSQTAHKLILRTKTERLEFYAKISDVEQMSDKFYQCHRSFLINLDNISRVDKSSQLVYFDNGETCLVSRLKMKTLLTKWENNIS >CP025536.1|AUW97312.1|1862155_1863520_-|ATP-binding-protein MSIVAFKDLLVYVIIWYMYWLIFSHTSGITISKRLFVPLSILLLGVVYHYQLLGYSLSVLLFCGIYYFYYPREHLSKYLFYSFFPVVTVDIFSRMMALYVISPLLDLTPEALNNNTMLLSISYGAVFPIYYFLNKILDLDFQRIQNGKTARKRFLARIFNLLLVTYHIMLASTTIIRIISPKLDGSFFEPLLTMADGIWLYRQQLVFVFVVFYFWLLSEINHETKIEMDRKLKKAQADKIKALEDYNQQIEWLYNDIQQFKDEFDRTFEELRVLIDQGDVKAISDAYGRMIAGRQVAIDQSQYELGRLVNLKVSPIKSILSAKMIEAQSQNIEAFLEIPDVITDIYMGALDLVIILSVFLDNAIEAAREAKRPHVSVAFFEREDSQLLIVENSVTKNSVDISKIFHAGYSTKGPNRGIGLSNVQRILENYPQTMLSTKTGQHSFTQILEMRQES >CP025536.1|AUW97313.1|1863516_1864833_-|hypothetical-protein MESVGLYIYCFAFSVIWLIYQDITQKKLKGVYFLVTLLLSIVFALLFPLNPFLPLFLAFFSLSLLANSAKTLCRHFFYSAFPVIFVDLFVRTVTFFIYPKLFQYDIVQKPFSAWEIVFALLLVLPTNRVLKRLFRIDYPAILQMPDKRIQSYIYSMNGFFILYYLVYYGIFFNVKSSVANYHQLTLLAFIMLLIYMLTLLNRQAQLSYQLEVEKEQSQYLENLEHYSQHLEAIYENIRAFKHDYDNILISLKDCMYNGNLGDIKTVYEDVLKKSRDNMEHDDYLLYQLIPLKDNNLKMMLIRDLLDIKNQGIHVSASICEITAHSLNLQKDFVLVIHLLLGLASKLTKASPKPWLKLRITQNESSFEVSVSYATSMERLETSCLCFATQTLNDALDVKEMQTLQAIFQAHPHCQLLFESGFYKSKETLIIEKVREEVV >CP025536.1|AUW97314.1|1864933_1866388_-|glutamate--tRNA-ligase MSNDIRVRYAPSPTGLLHIGNARTALFNYLYARHHGGTFIIRIEDTDRKRHVEDGERSQLENLRWLGMDWDESPETHDNYRQSERLELYQKYIQQLLDEGKAYKSYVTEEELAAERERQEAAGETPRYINEFLGMSEDEKVAYIAEREAAGIIPTVRLAVNETAIYKWTDMVKGDIEFEGGNIGGDWVIQKKDGFPTYNFAVVVDDHDMQISHVIRGDDHIANTPKQLMVYEALGWEAPEFGHMTLIINSETGKKLSKRDTNTLQFIEDYRRKGYLPEAVFNFIALLGWNPGGEDEIFSRDELIKLFDENRLSKSPAAFDQKKLDWMSNDYIKNADFDKVFELCKPFLEEAGRLTDKAEKLVELYKPQMTAADEIVPLTDLFFSDFPELTDAEKEVMAGETVPTVLEAFKAKLEAMSDDDFQPENIFPQIKAVQKETGIKGKNLFMPIRIAVSGEMHGPELPNTIFLLGREKSIEHLNNMLQSL >CP025536.1|AUW97582.1|1866608_1867361_-|TIGR00266-family-protein MTDQRMAYHIDSNMQFPLVEIALEAGESVYLQQGSMVYHTPGVQLNTRLNGRGEGLGRMLGALGRSMTSGESFFITQAISTENDGRLALAPSMPGQVIALDLGQKQYRLNDGAFLALDGSAQYRMERQSVGRAFFGGQGGLFVMTTEGQGTLLANTFGSVKKLELHGDSITIDNAHVVAWSDSLDYDIHLENGFLQSIGTGEGVVNTFRGYGEIYVQSLNIETFSKVIGGHLITGGKGNGGKIDSVLDLF >CP025536.1|AUW97315.1|1867535_1868030_-|carbonate-dehydratase MSYFNNFMLANQAYVALHGEEHLPIRPKTKVAIVTCMDSRLHVAQALGLALGDAHILRNAGGRVTDDMIRSLVISQQQLGTREIVVLHHTDCGAQTFTNPEFHEQLQHDLGVDVSDKDFLPFADIEESVREDMQLLKDSPLIPEDVIINGAVYDVDTGRMTEVK >CP025536.1|AUW97316.1|1868150_1868561_-|Mini-ribonuclease-3 MTDKSQVDVNLINGIALAFEGDAVYSYYIRRHLIFTGQTKPNQLHRLATKYVSARAQASLITAMLEAQLLTEKEEDIYRRGRNTNSHTKAKNADVVTYRMSTGFEAVMGYLDMTGQTERLEKLVAWCIDWVEQEAK >CP025536.1|AUW97317.1|1868553_1869903_-|cysteine--tRNA-ligase MIKIYDTMTRSLRDFVPLQEGKVKMYVCGPTVYNYIHIGNARSTVAFDTIRRYFEYRGYEVNYISNFTDVDDKIIKAANEAGISTKELSDKFIAAFMEDTAKLGVKPATKNPRVINYMDQIIAFVETLVEKGFAYESQGDVYFRVEKSENYAKLANKTLADLEIGASGRTDEETARKENPVDFALWKSAKDGEVSWDSPWGYGRPGWHIECSVMATEILGDTIDIHGGGADLEFPHHTNEIAQSEAKTGRTFANYWMHNGFVNVDNEKMSKSLGNFVTVHDMLETVDGQVLRFFLATQQYRKPVNFTEKAIHDAEINLKYLKNAYQQPVQETVDSDDFDSFKSQFVAAMDDDFNTANGITVLFDLAKWINSGHYTAIIKEEFAAMLAVFGIVFQDQEEVLDTAIEALIEERQEARANKDFARADAIRDQLAEQGIKLLDTKDGVRWTRD |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
457920 : 466316
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP025536|457920:466316|DBSCAN-SWA AATGGCCTTACTTGAAGTTAAACATTTAACCAAACATTTTGGGGGGTTAACTGCCGTTGGCGATGTTACTATGGAGCTGAATGAAGGGGAACTGGTAGGGCTTATTGGACCTAACGGTGCTGGAAAGACGACTCTTTTTAACCTCTTAACGGGAGTTTATGAACCTTCGGAAGGAACAATCAGCCTTGACGGAACTCTCTTAAACGGTAAGAAACCTTATACTATTGCATCACTTGGATTATCACGTACTTTCCAAAACATTCGTCTCTTTAAAAATATGACTGTTTTGGATAATGTTTTGCTTGGTATGAGCAATACTAACAAGTCACATTTCTTTTCTTCTTTGTTGCGATTGCCGAAATTTTATGCTAGCGAAGAGACGTTACGCCAAAAAGCTATGGATTTGTTAGCTATTTTTGGTCTTGATGATAAGGCAGACCATCTCGCTAAAAATTTACCCTATGGTCAGCAGCGCCGTCTTGAAATTGTGCGTGCCCTAGCTACGGAGCCGAAAATTCTGTTTCTTGATGAACCTGCTGCAGGGATGAACCCACAAGAAACGGCAGAATTAACAGCACTCATTCGCCAAGTTAAGGATCAATTTGGGATTACCATTATTTTGATTGAACATGATATGAGTTTGGTTATGGAAGTGACAGAACGTATCTACGTTCTTGAATATGGTCGTTTAATCGCCCACGGCACACCAGATGAAATAAAAAATGATAAACGTGTTATTGAAGCCTATCTTGGAGGTGACGTCTAATGGCTATGTTAAGTGTAGAAAATCTCTCGGTCAGCTACGGGGCTATTGAGGCGGTAAAAAATGTCTCCTTTGAAGTTAATGAAGGAGAAGTTGTTTCTTTAATTGGAGCGAATGGTGCTGGTAAAACATCTATCCTTCGTACGATTTCTGGTTTGGTACGTCCTAAAGAGGGTAAAATTTCTTTCTTAGGAAATGAAATTCAGCGAGTTCCTGCTCGTAAAATTGTCTCGGATGGCTTGTCGCAAGTTCCAGAAGGTCGTCATGTTTTTGCAGGATTAACCGTTATGGAAAACCTTGAAATGGGTGCCTTCTTAAAGAAAGATAAGGATCAAAACCAAAAAAATCTTAAGAGTATTTTTGAACGTTTTCCACGTTTAGAGGAACGTAAAAACCAAGATGCAGCGACTTTATCAGGTGGTGAGCAGCAGATGCTTGCTATGGGGCGTGCTCTCATGAGCCAACCAAAACTCTTGCTTCTTGATGAACCATCAATGGGGCTAGCGCCAATTTTTATTCAAGAAATCTTTGATATCGTGCAAGATATTCAAAAACAAGGAACAACGGTCCTCCTCATTGAGCAAAATGCCACAAAAGCACTCTCAATCGCAGATCGAGGCTATGTATTAGAAACAGGAAAAATCGTCTTGTCAGGGACAGGACAAGAACTCCTTGAATCAGACGAAGTCCGAAAAGCATATCTGGGTGGTTAAAACTGTCCGGTGGACAGTTTTAATCGGGAAATAGAGATTGCTCTAGCAATCTACATTACAGCCGGTGGACGGTTTTAATCGGAAAATAAAGATTGCGAAGTAATCCATACTCCAGCCAGTGGACCTTTTTAGGTTGCAGATAAGAAACGACGAAAGGTGTTTGACATTACATCTTAGAAATCACAATATTTCTAGTTAATCAGTGTATAATAGAAGTAAACAGTAGGCTTTAAAATGCTGATTACTTAGCGTAAGTGATTCTCTTGTTAACGATTGATTCAAGAATTGAACAAATTGAAGGAGGGCTGGTATGGCCGTTAAAGATTTTATGACGTCAAAAGTCATTTATGTATCGCCTGATACGACTGTTGCACATGCTTCAGATAAAATGAAGGCTCAGGATTTGCGACGATTACCTGTTATTGAAAATGATCGCTTGGTCGGTTTGGTAACAGAAGGGACCATGGCTGATGCAACGCCATCAAAAGCTACAAGTCTCTCCATTTATGAGATGAATTATCTCTTAAACAAAACCAAAATCCGTGATATTATGATTCGAGATGTTATCACCGTATCGCAAGATGCCAGTCTTGAAGATGCTATTTACATTATGATGAAACATAAGGTTGGGGTTTTGCCTGTTGTGGATAATGATCAACTTTATGGCATTATTACAGACCGTGATATTTTTAAAGCCTTTCTTGAAGTATCTGGTTATGGAGAAGAAGGGCTGCGCCTGAACATTCTTCTTAACGATACTATTGGTAGTTTGGAAAAAGTTGTTCGTGTCATCAGTGATGCTAACCTTAATATTCACCGTACGGTAGTCGCCAATCATAAATCTGGAAAAACCTTGGTTGAAATCCAAATTCAAGGGCAAGCAGATACCCAAGCACTACAAAAAGCCTTGGAAGAACAAGGTATCACTGTTACCAGAATTATGCAAACAGAGGCTAAAGCTGGATTCTAAAAGATGAAAAGACGACAAGAATTCTTGTCGTCTTTTTTGATAAATTCTGCTAAAATAGAAGTACTATGACTAATGGATTTTTAATTTCCTTTGAAGGACCTGATGGTGCTGGGAAAACGACTGTTTTAGAACAAGTTATCCCCAGATTACAAGATATATTTGAGCAAGAGATTATTGCGACTCGCGAACCTGGTGGTGTTGACATTGCTGAAAAGATTCGTGATGTCATTTTAGATGTTAATCATACAGCAATGGATGCTAAAACGGAGCTCTTGCTTTACATTGCAGCCCGTCGCCAACACTTGGTTGAGAAAATCCTTCCAAACCTTGAGAAAGATGCTATTGTCTTGGTTGATCGATTTATCGATAGTTCAGTAGCTTATCAGGGCTATGGGCGAGGGTTGGATGTTGCTGATATCACTTGGTTAAATGCTTATGCGACTGACCATCGTCAGCCAGACTTGACAGTCTATCTTGACGTGACTTCAGAACTTGGTTTGGAACGTATCTCCAAAAATGCAGATCGCGAAGTTAATCGTTTGGATTTAGAAAAGTTAGATATGCACCAAAAAGTTCGTCAAGGGTATTTGGCACTTTTAGAGGAAAATCCTGACCGTATTGCCTTAATTGATGCTAGTCAATCTGTGGAAAAGGTTGTGGAGGATACTTTGGCTGTGATTATCAACAAATATAAGGACTTAAAAAATGCCTAAAAATCCTTTGACGAATGTATTGGAGCAACAACAGCCGCAATTACTGCAAGAAATGCAACGAATCCTGAAGAACAATAAACGTAGCCATGCTTATTTGTTTACAGGTGGCTTTGCTTCTTGGGAGATGGCTATCTGGATGACCCAGTATCAATTTTGTGAAGATTTTGACGGTTTGGAACCTTGTGGGAAATGCCGTTCTTGTCGTTTGATTGCTGAGGATGATTTTGCGGACTTGGCTATCTTGGAGCCGACCAATGGCTTTATCAAAACAGATGATGTACGTGCCTTGTTGAGTCGCTTTTCTAGCTCTAGTTATGAAGGTAAGGATCAGGTTGTCATTATCCGTGGAGCTGACAAGATGCATGTCAATGCAGCTAATAGTCTGTTGAAGGTTATGGAAGAGCCGCAGAGTCATATCTATTTGATCCTTTTGGTTGAGGATGAGAATCAGCTTCTAGCAACTATTAAAAGCCGTTGCCAACAATTTCATTTTCGTAAAAATCAAGAGGTTATCAAGCTTGATTTAGAACAAAAAGGCTTATTTCGCAGTCAAGCTGGGCTTCTAGCAGATGTCGCTTCTTCCGTTAGTGAGGCTAGGAGTTTAGCACAAGATGCTAACATTTTAAATGCTTTACAGACACTAGAACGTTTTGTTGGACTGTTACTGACAGATAAAGGAAAAGCTTATTTAGAAATCAGTCGACTAGCCAGTCAATTGACAGATAAGGATTCTCAAGCTTTGGCTTTTCAACTATTGGTGTCTTTGTTGGGGCAAGATTTGAAGAATCCAAAAGCGCTTGACTATTTAGACAGGCTTATTCTTGCTAGAAAGATGTGGCAAGCTAATGTCAGCTTTCAAAACGCTTTAGAATATATGATATTACAAGCATAATGAGTTAAGGTCATGAGGAGGTAGCTGTGATGGCTAAAAAAGATTTATTTGATGCATTTGATGGGTTCTCACAAAATCTCATGGTGACCTTAGCCGAGATTGAAGCCATTAAAAAGCAAGTACAAGATTTGGTAGAGGAAAATACCCAGCTGCGCTTGGAAAATAGCAAGCTACGTGAACGTTTGACGCAAGTCAGTGAGCAACATGCTGAAAAAAATCAACATCAAGCTAAGCAACACTTGGATACCATTTATGAGGATGGTTTTCACATTTGTACGGATTTTTACGGTCAAAGACGTGAAAACGATGAGCAATGTGCCTTCTGTTTAGAGCTACTATATAGGGAGTAATCATGCAGGTTCAAAAAAGTTTTAAGGGACAGTCTTCCCATGGTACGCTATATTTAGTTCCAACACCGATTGGCAATTTATCAGACATGACTTATCGAGCTGTTGAAACGTTGAAATCGGTTGATGCCATCTGTGCAGAAGATACACGAAACACAGGCTTACTGCTTAAGCACTTTGAAATTGAAACACGTCAAATCAGTTTTCATGAACATAACGCTTTTGAAAAAATTCCAGACTTAGTTGCTATGTTAAAAGAAGGACATTCTTTAGCGCAAGTGTCTGATGCGGGTATGCCCTCCATCTCTGATCCTGGACATGATTTAGTTAAAGCAGCAATTGCTGAAGACATTTCAGTAGTTGCTTTGCCAGGTGCTTCAGCCGGGATTACAGCTTTGATCGCTAGTGGTTTAGCGCCTCAACCCCATGTTTTTTATGGTTTTTTACCGCGTAAATCTGGTCAACAAAAAGCCTTTTTTACTGAAAAGTTATCCTACCCAGAAACGCAGATTTTCTATGAATCACCTTATCGTGTCGTTTCAACTTTGGAAAATATGTTGGAAGTTTATGGAGATCGTCAGGTCGTCTTGGTAAGAGAGTTAACCAAACTCTATGAGGAGTACCAACGTGGTTCAATCACAGGATTATTATCTTATTTGTCTGATAATCCTTTAAAGGGAGAGTGTTTAGTGATTGTTGATGGCAATGATGGAAGCATTATGCCAGCTGTACAAGACTTATTATCACCATTAGACGATGTTAAGGCGCGTGTTGCAGCAGGGACTAAACCAAATCAAGCTATTAAGATGGTAGCAAAAGAAAGAGGGCTTAATCGTCAGGACTTATATCAAGAGTATCATGAGCTTGTATAAGGTCTGGTCAAGAAGTTTTAAAAACAGGAAAAGGTTAGAATAACGTGGTCTAGAAACGTTATTTTAGCCTTTTTATCATGATGTGATTTTTAGTTTGCTTCATCCCATAAAGGAAATACCAACAAGATGCTTGCTAACTAATTACTCCGTATTCTTTGAACTTATGGCTGATAATCATAGAGAGTATATGTTTAAAATTGTTATCAAATTGACTTTTTTGTTGAAAACTTGTTAGTCTTATAACTAATTGTTAAGGTAAAATAATTGACTTTTCGCCTTCAAGAAAAATTTATCTGTTTATTGAGATATTTTTGAGGAGGTAAGGATGGAGCTATGTCATCAACTGTTAATATTGTAAAATTGGCTGATGAAGCTAGATTGCCCTAATGATGAGGCTTTGTTATGATTAATATAGTTTAAATAAAGGTGGTTATGATATTGAAAAAGTTTTTAAAAGTGACTTTAGTGACGGCAAGCTTGCTAACAAGCGTTAGCTTGGGACAAGCCAATCATGTTGCAGCAGAAATGTCGCAAGAATTTGTTGGCGATCAAGCTGATAATCAACAAGTTAGCATCAATCCTTGGAAAGAAGGGGATAATACCGTTTCAGGAACAGCTTCAGCCAATCAGATGGTTAGTGTTAGATTCAAGAAGGGGAACGATAAGTGGGATGTCACTTCTGTAACTGTTCAAGCTGACCAAGAAGGACAATGGCAAGTTGCTGTTCCAAGGGATACTTTTGATGGCTGGATGCAGCTGGATATGCAGGTTTTTGCTAGAGCAACCGATGAGACAACTGAAGCTGGTGGTGTTTTTGTTGAATTCGTTGATGCAACTGGTAAAAAATTGACTCAATCTCAAATTTTAGTCACTCCTATGACATTGCCACTAGGGAGTCGCTACGAAGCTATTCCACCAAGACGAATAAAGGACTTTTATGGTCAAGAGTATTGGTTTGTCGGTCGTGATAATTCTTATTCTGCTTATTCGGAGCGTGTCACTAAGCATGATAAGACAGTTCGATTTATCTATGAGCCTGTCCAAGAATCAGAATAATACTCATTGAAAATCAAAATCTGATCTTGTCGAGTTTACCTTGATGACCTTCAGTGCTATCTGTGGCTCTTTTACTAGTCAGATTTTAATTTATAATATGTCATACACAACGACATTCAAAATGATGATTTTTGATAACAGTTAAGAGGCTGGGGAAACCAGCCTCTTTTTTATGATATTAATCGTGTCCCATGAACTTGGGTAGCTCCTGTGAGTTTGACAAGTTCTTGGAAATTATCCTTGGTAATACCTCCACCGATTTGAATGTCAATACGACCTGCGGCATAGTCAACTAAAGCTTTTAAATGAGCAACATTATCAAAGATATCAGACTTGCTATCAGGATTCCCATGGGTTAGAATGCGTGTAAAACCATAGTCAATCAAGTCATCGATAGCCTGAAACTGGTCTTCTTGTGGAATGTGATCAAAAGCCATGTGAAAAACAAGGGGAAGACCTTGAGTTGATGGTAAGAGTTGTTCGATGGCTTCTGTGTCTAGTTGGTTGTCTTCTGTTAATAATCCTAATACAAGAGCATCAGATTCTAATTCGGCGGCATGGAGGATATCCTCTTCTATAGCACGTAGTTCAAGATCGTTATAGACGAAGTTACCACCACGAGGTCGGATCATGATAGCAGTCGAGATGCTTTTTTCATGAAGGTAACGATTTGCTTCCTTGATAACACCATAAGACGGTGTGGTTCCACCTACAGCTAAGTTATCACAAAGTTCAACACGTGAGATGTCTGGGCTATTTAGCCTATGGAGATCGGTTAAGTTTTCAGCGCAAAATTCTTTGGTAATCATTTGTAGTCCTTTCAAGAGGGTTTGGATTTATTATATCATGAATGTTGCTGATTTTCGTTAGTAACTGCTGTCGGTAAAAAACATCAAAAAACAATACTTTGTAGAAAGATTCTGATAATAATACACAATTTTGTGATATAATGAATTAATTTTAAATGGAGGTTGTGGTTATGACAATTTATAACTTTTCTGCAGGTCCTGCAGTATTGCCAAAAGAAGTGCTAAAAAAAGCCCAAGCTGAGTTTTTGGATTATGCCAACTCGGGCATGAGTGTTATGGAATTGTCCCACCGCTCCAAGGAATTTGAAGATATTATTAAGACTGCTGAGCAATTGTTGAGAGATTTGATGCAGATTCCAGACAACTACAAAGTCCTCTTTTTACAAGGAGGTGCTTCAACCCAGTTTTCCATGCTACCTTTAAATATGGCAAAGGGAAAGAAAGCTTATTATCTAGTTGCAGGATCTTGGGGTAAAAAAGCCTATACTGAAGCTGTTAAACTTTCAAAGACAATCCCTTTTGAACCCATTTGCTTGGCTTCATCTGAAGAGACTGGATTTGACCGTATTCCAGAATTTGATAACCGTTTGATTGATCCAGAGGCAGCATATGTGCATCTAACAACCAATAATACTATTGAGGGAACGAGTGTTTATCAGCTCCCTGAAACAAATGGTGTCCCGCTTGTGGCTGACATGTCATCGAATATCTTAGCAGTTGATTACAAAGTTTCTGATTTTGCTATGATTTATGCCGGTGCGCAAAAAAATATTGGGCCTGCTGGTGTGACGATTGTGATTGTTCGTGAGGATTTCTTGAATGATGAGCCTGCTCTTTCTAGCATGTTGGATTATCGTATTCAGGCAGAGAATGCTTCGCTTTATAATACGCCCCCAACTTTTGGTATTTACATGGCTAAATTAGTTTTTGAACATGTGACATCTTTAGGTGGTGTGGCTAAAATGGAGGAACTTAATCGTCAAAAATCAAGTCTTCTTTATGATTTTATTGATAGGTCTGACTTTTATAAGAGCCCGGTTAAGTTTGCTAAGGATCGCTCACTAGCTAATATTCCTTTTGTCACACCGAATGCGGAACTTGATAAAGCCTTTAATCAAGCAGCAGATGAAGCCGGATTTAAAAATATTAAAGGACACCGTAGTGTGGGAGGTATGCGAGCAAGCCTATATAATGCTTTTCCACTGGAAGGTGTGAAAGCCCTGCTTGCATTTATGAAAGCTTTTGAGGAGGAACGTGGTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP025536|457920:466316|458684_459395_+|AUW96042.1|DBSCAN-SWA MAMLSVENLSVSYGAIEAVKNVSFEVNEGEVVSLIGANGAGKTSILRTISGLVRPKEGKISFLGNEIQRVPARKIVSDGLSQVPEGRHVFAGLTVMENLEMGAFLKKDKDQNQKNLKSIFERFPRLEERKNQDAATLSGGEQQMLAMGRALMSQPKLLLLDEPSMGLAPIFIQEIFDIVQDIQKQGTTVLLIEQNATKALSIADRGYVLETGKIVLSGTGQELLESDEVRKAYLGG >CP025536|457920:466316|462322_463189_+|AUW96047.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKGQSSHGTLYLVPTPIGNLSDMTYRAVETLKSVDAICAEDTRNTGLLLKHFEIETRQISFHEHNAFEKIPDLVAMLKEGHSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIAEDISVVALPGASAGITALIASGLAPQPHVFYGFLPRKSGQQKAFFTEKLSYPETQIFYESPYRVVSTLENMLEVYGDRQVVLVRELTKLYEEYQRGSITGLLSYLSDNPLKGECLVIVDGNDGSIMPAVQDLLSPLDDVKARVAAGTKPNQAIKMVAKERGLNRQDLYQEYHELV >CP025536|457920:466316|465224_466316_+|AUW96050.1|DBSCAN-SWA MTIYNFSAGPAVLPKEVLKKAQAEFLDYANSGMSVMELSHRSKEFEDIIKTAEQLLRDLMQIPDNYKVLFLQGGASTQFSMLPLNMAKGKKAYYLVAGSWGKKAYTEAVKLSKTIPFEPICLASSEETGFDRIPEFDNRLIDPEAAYVHLTTNNTIEGTSVYQLPETNGVPLVADMSSNILAVDYKVSDFAMIYAGAQKNIGPAGVTIVIVREDFLNDEPALSSMLDYRIQAENASLYNTPPTFGIYMAKLVFEHVTSLGGVAKMEELNRQKSSLLYDFIDRSDFYKSPVKFAKDRSLANIPFVTPNAELDKAFNQAADEAGFKNIKGHRSVGGMRASLYNAFPLEGVKALLAFMKAFEEERG >CP025536|457920:466316|464415_465054_-|AUW96049.1|DBSCAN-SWA MITKEFCAENLTDLHRLNSPDISRVELCDNLAVGGTTPSYGVIKEANRYLHEKSISTAIMIRPRGGNFVYNDLELRAIEEDILHAAELESDALVLGLLTEDNQLDTEAIEQLLPSTQGLPLVFHMAFDHIPQEDQFQAIDDLIDYGFTRILTHGNPDSKSDIFDNVAHLKALVDYAAGRIDIQIGGGITKDNFQELVKLTGATQVHGTRLIS >CP025536|457920:466316|460430_461078_+|AUW96044.1|DBSCAN-SWA MTNGFLISFEGPDGAGKTTVLEQVIPRLQDIFEQEIIATREPGGVDIAEKIRDVILDVNHTAMDAKTELLLYIAARRQHLVEKILPNLEKDAIVLVDRFIDSSVAYQGYGRGLDVADITWLNAYATDHRQPDLTVYLDVTSELGLERISKNADREVNRLDLEKLDMHQKVRQGYLALLEENPDRIALIDASQSVEKVVEDTLAVIINKYKDLKNA >CP025536|457920:466316|461999_462320_+|AUW96046.1|DBSCAN-SWA MAKKDLFDAFDGFSQNLMVTLAEIEAIKKQVQDLVEENTQLRLENSKLRERLTQVSEQHAEKNQHQAKQHLDTIYEDGFHICTDFYGQRRENDEQCAFCLELLYRE >CP025536|457920:466316|463627_464245_+|AUW96048.1|DBSCAN-SWA MKKFLKVTLVTASLLTSVSLGQANHVAAEMSQEFVGDQADNQQVSINPWKEGDNTVSGTASANQMVSVRFKKGNDKWDVTSVTVQADQEGQWQVAVPRDTFDGWMQLDMQVFARATDETTEAGGVFVEFVDATGKKLTQSQILVTPMTLPLGSRYEAIPPRRIKDFYGQEYWFVGRDNSYSAYSERVTKHDKTVRFIYEPVQESE >CP025536|457920:466316|459705_460365_+|AUW96043.1|DBSCAN-SWA MAVKDFMTSKVIYVSPDTTVAHASDKMKAQDLRRLPVIENDRLVGLVTEGTMADATPSKATSLSIYEMNYLLNKTKIRDIMIRDVITVSQDASLEDAIYIMMKHKVGVLPVVDNDQLYGIITDRDIFKAFLEVSGYGEEGLRLNILLNDTIGSLEKVVRVISDANLNIHRTVVANHKSGKTLVEIQIQGQADTQALQKALEEQGITVTRIMQTEAKAGF >CP025536|457920:466316|461070_461970_+|AUW96045.1|DBSCAN-SWA MPKNPLTNVLEQQQPQLLQEMQRILKNNKRSHAYLFTGGFASWEMAIWMTQYQFCEDFDGLEPCGKCRSCRLIAEDDFADLAILEPTNGFIKTDDVRALLSRFSSSSYEGKDQVVIIRGADKMHVNAANSLLKVMEEPQSHIYLILLVEDENQLLATIKSRCQQFHFRKNQEVIKLDLEQKGLFRSQAGLLADVASSVSEARSLAQDANILNALQTLERFVGLLLTDKGKAYLEISRLASQLTDKDSQALAFQLLVSLLGQDLKNPKALDYLDRLILARKMWQANVSFQNALEYMILQA >CP025536|457920:466316|457920_458685_+|AUW96041.1|DBSCAN-SWA MALLEVKHLTKHFGGLTAVGDVTMELNEGELVGLIGPNGAGKTTLFNLLTGVYEPSEGTISLDGTLLNGKKPYTIASLGLSRTFQNIRLFKNMTVLDNVLLGMSNTNKSHFFSSLLRLPKFYASEETLRQKAMDLLAIFGLDDKADHLAKNLPYGQQRRLEIVRALATEPKILFLDEPAAGMNPQETAELTALIRQVKDQFGITIILIEHDMSLVMEVTERIYVLEYGRLIAHGTPDEIKNDKRVIEAYLGGDV |
10 | Streptococcus_phage(75.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1172345 : 1264275
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP025536|1172345:1264275|DBSCAN-SWA TTTATAAGAGATCATCAATTAAGTCTGTCACATCATCGGATTCTTCGTTAGGTGTTATTTCTGTCACCTTAATTCCTGCAACAGCTCTTTCTACAAGTCCTTCAACATCGAGTCGTTCTTCATACTGTTCTACATTTTTAAGCTTAGGATTCGTCTTAGGACGATCAGGTGCAAAAATAGTACAGCAATCCTCAAACGGTTGAATAGAAATCTCAAAGGTATCAATCTTCTGAGCCAAATCAATAATTTCTAGTTTATCCATCGTTACTACCGGACGAATAACTGGAGTTGTAGTGACTGCATTAATCGCCTGCATAGATTCCAAAGTCTGACTAGCTACTTGACCAAGGCTTTCACCATTGATAATAATACGAGCATCACGTTGTTGACGAATGCGATCTGTGATACGCATCATAAAACGACGTGTTAAGGTCATCAAATAGGCTTCAGGCGCTTTTTCCTTAATCTCTTCCTGAATTTCCGTAAAAGGCACCTCGATAAATTGGATATTTCCACCAAATTTTGTTAATTTACGTGTCAAATCCTGAGCTTTTTTCAGAGCACCTGGACTAGTATATGGAGGGCTGGCAAAGTGAACAGCCTCAATATCAACCCCACGCTTTAGAGCAAGATAGCCCGCAACAGGTGAATCAATTCCACCAGACAACATGAGCATACCCTTACCAGCTGTCCCGACAGGCAGCCCCCCAGCTCCACGAATCTCCTCATGTGAAATATAAGCCGCTTCATCACGGATTTCAACTTTGAGGTTGACATCTGGTTTTTTCATTTGTGCCTTGATATTTGGGAGTACATCAAAGACTGCTCCACCAAGTGTATGGTTCAATTGTGTTGAATCTAGTTCAAACTGGTGGTCGCTGCGCTTACTTGTTACCTTGAAAGTCATGCCTTCATAATACAAATCAGTCATGATTGCTTGCACTGCTTTGGTTAAGACAACCACATCTTTTTCCACGCGATAAACAGGATTAAAGGCTTGAATTCCAAAAATTTGTTGGAGGGATTCCGCAACAGGCGTATAATCTACACCATTTAAAAAGACATGACAACGGTCACGATCTGCTGACACCTTAACCTCAGGGTAAACCGATAAAACATCCTGGATATTACGACGCAACTTGTTAATGAAACGCATGCGGTTTTTCCCTTTGGTTGATAGTTCGCCGTAACGAACCATAATTTCTGAATACTGTAAATTCATTTGACTACTTGCTATCCTTATCTAACTTTTTGAGTTTTTTCATAAACTTGCTTAAAAATGGTTAAAAATTGTTCCACTTGTCCCATATCATTATCATCATCCAGACTAACACGTACAGCTGTCTGAGCAGTCTTAGTTGGAATCCCCATTGCCATCAAGGTTCCTGCTGGTTTACCTGCTTTTGAAGAGCAGGCTGAAGTCGTTGAGATAAAAATATCATGTTCTTCAAAGGCATGGACAACCACTTCTCCACGCACTCCCTTGATACCAAAGGTAATAATGTTTGGCGCAAAGCCATCTTGACCAGAAAAGACAAGAATATCATCATGTTTTTCTAACTCACCAAGGATGATTTCCTTCATTTTGGCAATCTTGGATACAGCAACAGCCTCTTTATCCTTAACCAAACGAAGTGCCTTCGCCATAGCCGCAATTGCTGCAACATTCTCAGTTGTTGAACGTAAATCTTTTTCCTGACCACCACCTGTTAGCAAGGAACTAATTTTCTTACCAGATTTTTTGTAAAGAAATCCGACGCCACGGACAGCGTGAAATTTATGACCAGAAAAAGACGCCAGATCAACTCGGTCAGTTAAATAACTTTCCGTTGGAATTTTTCCGATCGCTTGCACCGCATCAACATGAAAGGTAAGATTAGGACGGTCTGCTAACAAATCTGAGATTTCTTGAATCGGTTGGATTGACCCTATTTCATTATTGACCGCCATAACTGAGACTAAAATCGTATCAGGACGCAATAACTCTTTCAGAGCATCAAGATCTACAAAACCACGAATATCAACTGGAGCTAGTGAAACCTCAAAGCCCTGTTGACTTAACCACTCAGCGGATTCTTTGACCGCAGGATGTTCAATAGCTGAAATGATAATATGTTTGCCAAAAGCTTGCTTTTCAAAGGCAATCCCTTTAAGCGCCCAATTATCAGCTTCTGTACCACCCGATGTAAAGAAAATCTCCTCTGCTTTCTTTCCCAAAAGATCTGCAATTTGTTTGCGGGATGCTTCTAAAATACGACTTGACTGACTTCCTAAACGGTGTAAACTAGACGGATTCCCCCAAATTTTTGTTGTCACTTCTTGATAAGTCCTAAGGACTTCGGGATAAACTTGTGTCGTTGCTGAATTATCAAAATAAATCACAAAATAGCCAACTTTCTCATTCTTTTTTAGTAAGAAGAGCCTTGGGGGACATAGACTTTTCTTCCATTTTCGACTATCTATTATAGCATAAATCCCTATCAAATAGGTTTATGGACTATTCAAAGGAATATCTTCTGGATGTTAAAAATGTATGCAAGCCTTTTCTTGTTGCCTGTACCTTTCTTGTTAAGACATAGAGTCTTTAACATCCTAAAATTCTTGCCTTAAACTATTGCTTTTCTATTGATATTATCATTGATATTATCATTGATACCGTTCTAAAACACCTATCAATTGAGCAAAGAACACTTTTATTTATATACCTCGTAATTATACATATTTTTATACTTCAGTGGCATCAGTCATCCCTTTAAGGAAATAATAAAGAGAGAAGATATAACGAATCTTCTCTCTTTTAAAAAATCAGTTTTATTTTTGACCAAATACATAAGTCAATTGTTTAGCTTCTTGTGCTGAGAATGTTCTAAAGGAAATATTTCCTAATCCAGTTACATTAGACTCTGAGATAAGGATGCTACCATCTTCTCTGACGTCTTCTACAAAGGCAACGTGACCATAAGTGGCATCAGCACCTGCCTGACCTGGCGCAAATGATACTGCTGCACCTTGCTTAGGTTCATGACTTGTTTCATAACCTAATTTCAAACGCCAGTCACCACCATTTCCCATAAATGGACTGAATGCTATACCAAATTCTTGAGCACGGTTGTAAACGTACCAAGTACATTGTCCCCATGGATAAGTAGCGGCTGTATAGCCTGATTTATCTATAGAAGCACTCAAATTGAAGCCTTCTGGAATAGAGCTTGCAATAGAACCACTAGAAATCAAGGTGTTAGCTAAAGCTGGTGCTTTAGGCGTTCCACCATGTTGGTCAATCCAACGGTCCAAATCTTCCATTACTTTGGCACGTCTTTTACCAGTACCAGAAGTATCCGTAAAGTAAACACCACCATCTTTGGCAACATCTAACTGCCCATTTGCTAGTTGACGCGCCTTGTCATCTTGACGTTTAAAAGTGTTATTTTTATTTTTAATGATACTAATCTTAGTCAGAGCTTTGATAGCTTCTTCATCATTAAAACGTTTTGCATTATCTGGATTGTTATCAAAAGCGCCATATCCAAAGGCATTTGCTTGATTATCTTTGGCAACTCCTGCTGTTCCCAAAGAACTTTCAGCAATGGCAATAGCTACAATCGCACGGACATCAAGACCACTTTCTTTTTCCCACTTCAATAAGTTTTCACCATTGAAACGATTGCTATCATAGTCTATACCTGTTGATTGTAAAAAGCCATCTAGTTGTTCAGCTGAGATCCCAAATCGTTTTGAAAGTAAGTTATGGGTGTAAGCATCTTGTCCAGACCAATGGTCAACATACTGATTAGACACGATAATAGCATCATCTAAAACAACATTACTAAAACTTTCAATTGAGGCAGTTGAAGAGGCTACAGTATTTTCAGTTGGAACACTATTAGCGACGCCTTGGTTAGTTGTCACAGCTGGTGCCTTAACTGATGGATTTACTTTAGAAGAAGTCGCGGGTACACTACTATTATTTGCTGCTGGCTTTTGATTAGCAGTATTTGATGTAGAAGATGGTTGACTAGTTTGATCTTTAGTTGAAGACTGATCAACAGCATCTTTCTTTTCATCTGTATTTGTACTTGACGTCTCAGGGGTACTAGATGCTACCGTCTCTGCAGAAGGGGCTGAAGAATCAGCTCCTGTAGAAGCCGGAGTTTCTACAAACTCACTAGCAACCGTTTGAGATCCATTATTCGCCAGTGTGACATTATCTGAAGATTGAACTGTTTCAGTTACCGACTGATCTGCGGACGCAGTTTTTTTATCATTATTTTCTTTTTTTTCTGCAGTTTTATCATTTGTAATAACAGCTGACTGCTCAGTTTGTTGCTCAGAATCCACTGTAGCATAAACTGTGCTAGTTACAGCTGCACTTTCGGAAATAATCATTCCACATAATAAAATTATAGATAAAATTTTATTTTTACTCATCTCTCTATACTAATTCCTATCATTTTATTTTTTTGTATTACTCCACAAATAGTATTATACCATATCATTATCAAATAAGTAGCATTTTTTGTTTGTCAAAATTGCTTTTATCTATAGCTACTATGTTAGGCAATGATAATGATATCATATTCTTTTTAAAAAAAGTTATTCATTTTGACATGATTTTTTTCGAATTAAATCATATAATATAATTCAAAGGAGGACATTATGTCACAACAGTATTCTCGAAAATCAAAACAAACAGGGCAAAAAGAAAAGCGTCGTCCTACTGAACATATCAAGTATGGCTTAACTGCCTTTCAAAAAACCTTAGCCTTAGTTGGTTCTATATTATCCATTATTGTAGCTTCCATTACAATCACCAACTACTTACATAGCAAAGGGACAACCAATGAAGATAAGAGTCCCTCTTCAACTATTGTCATTGAAAACAACGGCGGACAAGGAGCTTCCAATACAAGGTCGGGAAACACTACGGATACTGAAAACTCTTCAAATAGTTCTTCTGACTACCAAAGTGAAGTTATCAATCCGGATAGCTCTTCTGATAC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MSLKDFYRLIKVLGYPLAYHHFEEGRVLSPPYLLYWVSGSENKGADNMAYHKQEEVLLEVYTKIKNLDLEGQVEALLDTHRIYFDKVETYLTTEKLYQVTYHITL |
93 | Streptococcus_phage(81.03%) | holin,portal,terminase,head,tRNA,capsid,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1358527 : 1416046
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP025536|1358527:1416046|DBSCAN-SWA CTTAAAATTGCCATTTCTGACGAACCAATTCTAACTCTTTGAGGCTATCTTCTTCTTTTAGAGAAAGGCTGCGCATAAAATCAAGCATAGCCTCATCTGGTTTTTTAATAATCTCACCCAGTGCCCAAATGGCTGTCGCAGTATGAATGGGATTATTATTCTTATCAATAATCTCCACAAGTTTCACCACCGCACTACGGTCATGAGCATTAGCTAAAGCAATAATAGCATTACGCTGCAAAATATTTTTCCCACGCCAGGAACCTGCAATCATGCCGAATTGTTCTTTGAAGGATTTGTTAGTCAACTCCAAAAATGGAATCAACTCAGGATGAGCTAGTTCTGGATCAATCTCACTAGCCAGAGGATTATCAATCCCACGATTATAAGGACAACAAATCTGACAAATATCACAACCATAAATAACTGTCTTAATTTTCTTACGAAACTCCATGTCCATCATGCCCTTATCTTGAGTTTGGAAAGACAAACAACGACGAGCATTCATAGTCCCATCACCGATGAGACAGGAAGTCGGGCAAGCTTCTAAGCAACGGGTGCAGTCACCACAACCATAGTCCACTTCTTGATCGGGCTCAATCTCTAAGTTGGTAATCAACTCCCCTAAGTACATATAAGAGCCAAATTCCTTAGAAATCACCAGGCCATTTTTACCGATAAAACCAATACCAGCACGTTTAGCTACTGCTGTATCCACCAGAGCACCAGTGTCGACCATGCCTTTGTATTCAAAATTCTCCGTCAACTCTTCAATCCCTTTAGCCAAGCGATTGAGTTTATCTTGAAGAACATAGTGATAATCTAAGCCCCATGAATTAGGTGTAATTTTTCCACGTTTATACTGGGTTTTAGGTGGTTTAACGGGCAGTTTATTAGGATAAGCAACGGCGATTGAGATAATGGTCTTAGCGGATTCTAAAGACAACTTGGGCTTAATGCGCTCCTCAATGACCTTGTGTTCAAAACCAGTCGTCCGGCCCTCCTCAACACCAGCTCTTAAGGTTTTCTCCAAATAACCAAAATCATCGGCAGTCGTAAACCCAATCTTTGAAATGCCAATTTCCTTGGCAAGTTTTTGAATTTCAACCTTAATATCCATACTACTATTTTAAGGAAAAATCATGTTGATAGCAAGTCAGATCAGTAACAAGTTTGTGTCAAATCGCCTTAAAAAAGATACAATAGAGACATGACAACATTAGCTTTCATGAGTGACCTCCACATTGACCTCAACAACTTTACTGACTTTGAAACCAATACCCTTATCGACTTTCTCAAAGAAGAAAGAATTGACCACCTTCATATCGCAGGCGACATCTCCAATCATCACTACCAAGTTTCTCAGCCTTTTCTAGAAACACTCAAACAGCATTTCTCTGTCACCTATAATCTTGGCAATCATGATATGTTAGATCTGACTGAAACTGATATTGAGCATTTAGACTTCAAGATTCATGAGATCAATACCAAAAAATTCCTAGCCTTCCATGGCTGGTATGATTACAGTTTTCATCCAGAGAAAACAGAAGAACAAAACCTAGCCTTCAAAAACCAATTCTGGTTTGACAGACGATTAGATAGACATACTTCTGACAGCAAGCTTACCGAAGAAACATTATCACGACTAGATGATACCCTTACGCATTATCCCGAAATTGATTTAGTGTCTATGCACTTTGTACCACACCAAAACTTTCTCATGACCCATCCAAAGTTCATCCCATTCAATGCCTTTTTGGGAAGCCAAGCCTTCCATGATGTATTCGTCAAACACCACATCAAGGACGTTATTTTCGGACACGCGCACCGTTCCTATGGCAGCCAAATGATTGACGGTATTAACTACCATTCTAGACCTCTTGGCTACAGAAGAGAGTGGGACTTAACCATCGATTATGTCAATCAACACCCTGAACTTAATCCTACAGGCACATGGAACCTATCCAAACGCTATCATTTAGTCAAAAGATTGCCAGACTACCAGAACTACACTAAAAAACAGCTCAAAGAAGAATTTCGCAAATCTGTAACTGTCTTTGATTTCTAACCTTCTGATCGTTTCTTCACCATAAAAGACACATTGGAGAATAGACTTGTGATAATGACTATAATGCCTACCCCCATAAAATCAACTAACTACTATTGTTCTTGTCATCTTCAAAAATCTAGGACCAGACAAAGAAGTTCAAACAGACCCTTATTTTCCAAGAAAATATCACTTTTCAAATGTTAAACCTATACCAAAAACCATTCAAGATAAGCCTCATGAAGTCTCTACAGACATTATCGGGAGACGACAATAGACTATCTCTTTTCCTTGTCACAATTAGCAATAGCGTAACTCTGAAAACCACGACTTTCCTCTTTAAAAGAGTTCCGTCTACTCTTGAAAATTGACTCAGCTCCAGTTATGAATTTGTTATGACTCCAATAAAAAAATCAGATTCGTCATTGAATCTGATTTTTCTATTTCTATTGATTAGATAGCATTTTTATCCATTCCCAAGGCACGTTGAACAGCTTTAACAATTTCAACAAGCACAAGCATAGCAAAACTACCAATTAAAACAACAATCCACTGTGATAATTCCAAATGCGTCACATGGAAAATCTTCTCAAGGAATGGTACTGTCAGAGTCATAACTAAGAGTACCAATGATCCAAGAATAGCCCAGTTAAAGGTTTTGTTTTTAAATGGTCCAACTGTGAAAATAGATTGGTAAACAGACTTAACATTAAAGGCATGTACCAACTGAATCATTCCAAGAGTTGCATAAGCCATAGTGAGGGCGTCTGCGTGAATTTCATGATAAGTATCATGGGCTGGATTAATGATTCCATAACCATAGACACCTAGAACGAGAGCAGCTTGGAAGAGACCTTGATAAACAACTGCTCCCAGAACACCACCTGAGAAGAAGCTTGAATTACGTCCACGAGGTTTGTGACTCATGACACCTGGTTCAGCAGGTTCCATACCAAGCGCAATCGCTGGAAGGGTATCTGTTACCAAGTTAATCCAAAGAAGGTGAACTGGCTCCAAAACATCCCATCCAAATAGAGTAGCTAAGAAGATAGACAATACTTCAGCAATGTTAGCCGATAGAAGGTATTGAACTGTTTTCTGAATATTAGAGAAGACCTTACGCCCTTCTTCAACGGCGACAATGATTGTTGCAAAGTTATCATCCGCAAGAACCATATCAGAAGCACCTTTAGAAACTTCTGTACCAGTAATACCCATACCGATACCAATATCCGCTGTTTTAAGCGATGGTGCATCATTAACACCATCACCAGTCATGGCCACAACCTTACCTTCATTTTGCCAAGCTTTCACGATACGAACCTTATGTTCAGGTGATACACGAGCATAAACAGAATATTGTTGGAAGACTTTTTGGAATTCTTCATCTGACAATTCATTTAGCTCAGCACCTGTAAAGACATGATCTTCTGTATCGTTAGGATCAATAATACCAAGACGTTTAGCGATAGCTTCTGCTGTATCTTGGTGGTCACCAGTAATCATGATGGGACGAATACCAGCTTCTTTAGCCACTTTAACCGCCGCTGCAGCTTCTGGACGTTCAGGGTCAATCATACCAACAAGACCTGAGAATACTAAATTATTTTCAACAACTTCAGTTTCTAAAGTTGGAACATTATCTTCATACTTGTAAGCCATCATAAGGACACGAAGTGCTTGCTTAGCTAACGTTTTGTTAGTAGCCAGAATAGCATCTTTATCAGCTTCAGTAATCGGACGAATCGTTCCATTCTCTTCAATTTGTGTCACACGCTTAAGCAACTGATCGGGAGCACCTTTAACAGCCACCAAATGTTTGCCATCTGCTAGACGGTGAATGGTTGACATCAACTTACGATCTGAATCAAATGGAAGTTCGCCAACACGTGGCTCTTCTTTCAACACATCACGGACATCAAAGTTATGATCCAAACCAAATTGCACAAGCGCTGTCTCTGTTGGATCACCAATCAATTTACCAGATTGATCAACTTTCGTATCATTAGCAAAGTTCATGATACGAAGCGTCATATTTGAATGTTCCAAATCATCTGTCGCATCTTGCAACTGACCATTAGTATAAATTTTTTCAACGGTCATCTGATTCATGGTTAGGGTACCAGTTTTATCAGAAGCAATAATTTCAGTTGAACCAAGAGTCTCAACAGCTGGTAATTGTCTAATGATCGCATTACGTTTTGCAAGGACTTGTGTTCCCATAGAAAGAACAACCGTTACAACCGCAGGGAGACCTTCTGGAATCGCAGCAACCGCCAATGCAACAGCAGTCATCAATGAATTCAACGGAGCTTCTCCACGGACAAAAACAGATACGATAAATGTAATCGCTGCAATAACCAAAATGGCAAATGTCAACACCTTAGAAAGATGATGTAAGTTTTGCTTCAACGGTGTATCTGATTCATCAGCGTTTTGAAGCATGTTGGCAATATGACCAACTTCTGTAAACATCCCTGTATTGGTAACCACGCCAAGTCCACGACCATAAGTAACGTTAGAGTTTTGATAACCCATATTGACACGATCACCAATACCAGCATCTTCTGCCAATTCAACAGATAGATTTTTTTCAACTGGTACTGATTCCCCTGTCAAAGCAGCTTCCTCAATTTTTAAAGAACTTGCTTCTAGTAGGCGCATATCAGCAGGTACAACATCCCCTGCTTCGAGCAAGACGACATCACCAGGAACCAATTCCTTAGAATCAACTTCTTTAACATGACCATCGCGACGAACTCGAGCTAATGGGCTTGACATAGATTTAAGCGCATCAATTGCAGCTTCTGCCTGACCTTCTTGGTAAACACCGAAAGCTGCGTTAAGCACTACGACTAACAAGATAATTAAAGCATCTGTCAAACCATGCATACCTTCTGTCAAAACTGATAGAGCTGCAGCTACTAACAAGATAATAATCATCAAATCTTTG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59 | Bacillus_phage(33.33%) | transposase,bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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