Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020010 | Haemophilus influenzae strain 67P38H1 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,DinG,cas3,WYL | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1111474 : 1120546
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020010|1111474:1120546|DBSCAN-SWA 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TTGTGTCTCTTTAGCCATTACATTGAAAGGTAAAGTAAGATTTGAAACTGCCAGTGCAGCTCCCGCAGATGACGCCTTGACAAAATCTCGGCGACTTATTTGATTAAAGTTACTCATTATATCGTTCCCCCACAGTCAGATTGAAAAATAACTAAAACAAGTTAATTATAATCTTTGTATAGAAGTTTTACTTGAGCCAAATCAATTAATCATTAATAGGTATATTATTTATAGGGTATTTTAGTAGATTGATGTTTTAATAAATTTTGGAATAACAAATTGACTATGGATTTAAAAACCCGTTAGCATAGTGGCGTATTAGTTTATCTAATATGTTAAGTTTAACTATTATTAACTAGAGGATCTCTTCATGAAGAAACTTATCGCAGTTGCGGTGCTTTCTGCATGTGGCTCGTTAGCTCATGCAAACACTAATATTCCAAACTACAATACAGACGCCCATCTTTACGAATTCACGCAAACCTATGATTTAGTTGTGCCAAAAGGCTCGCAAGGACAAACCAATTTATGGGTTCCATTACCATTTAATGGGGAATACCAACAAGTGAAATCGATTCACTTTGAAGGTAATTACATGAATGCCTATGTAACAGAAAACAATAAATACGGAGCGAAAACCTTATTTGCCACTTGGGATAAAGATGCACAAAAACGTGATTTAAAAGTCACGATGGTCATTGAAACAAAAGACCGTGAACCGATGGTGAAAGGTGCTTTAGAGAATTATACTCCGCCAAAAGATATTCAGTATTCCGTGGATGTACAAGAATACTTAAAAGCTACTCCACATATTAAAACTGATGGCATTGTGAAAGAATTTGCTGACAAAATCCTAGGTAAAGAAACTAATCCATTGAAGAAAGCAGAACTTATTCACCACTGGATCGTAAAAAATATGGAACGTGATAATTCTGTATTAGGTTGTGGTGACGGCGATGTAGAAAAAATTCTTACCACTGGCGTGTTAAAAGGTAAATGTACCGATATTAACTCTGTATTTGTGGCACTTGCTCGTGCTGCAGGCATCCCTGCTCGTGAAATTTTTGGTATTCGCTTAGGTACGGCAGAGAAAATGGGCAAATATTCAAAAGGTGCCTTCGGTAGTGCAAATGAACAAGGCATCGCAAACGTAAGTGGCGGTCAGCACTGCCGCGCTGAATTCTACCTTGCAGGATTTGGATGGGTACCAGTTGATTCCGCAGACGTTGCCAAAATGCGTTTAGCAGAGAAAAAATCTGTTGAAGATAAAGATACACAAGCCGTAGCAAAATATTTGTTTGGTAACTGGGAAGCAAACTGGGTGGGATTTAATCATGCCCGTGACTTCGATTTATATCCACAACCAGAACTGGCTCCAATCAATAACTTCGGCTATCCATATGCAGAAGTAGGTGGCGATCCGTTAAATTCCTTTGACCCAAAAGAATTTAAATATGACTACGTATCTAAAAAACTCTAATAAATCCTTTTGGGTTGCCATAGCCGCCGCACTAAGTGCTGCGGTGGCATCAACCTTGTGCTGCATCGCACCATTAATTTATTTAGTATTTGGTGTGTCGTCCACTTGGTTGATTGGCTTAGGCGAATATGATTATTTGCGTATTCCTATGCTTATCATTTCATTATGCGCCTTTGCCTATGGATTTTGGCTGTTGATGTTTTCCAAAAAAATCATTTGTAGCAAATATATTTCCCGTAAAAAACTTATCGTTTTATATTGGATTGTATTTATCGTGATGATTTTTTTCTTAACCTATCCAACAATTTTACCTTGGATTTTAGAATTAGCTAATTAGGAATAAAAATGAAGAAATTATGTACCGCACTTTTGCTTTCGCTGTTTGCAATTTCTTTCGCTCATGCGAATGAAACCAAACAAATTGTGCTAAAAGTAAAGGAAATGAATTGCCAGCTTTGTGCTTACTTAGTCAATAAAGAACTGCGTAATATCAATGGCGTTATTTTAACAAAAGCATCTATTAAAGATGGTTTAGTGACGGTTGTGGAAGATCCAAAAGTCACAAACCAACAATTATTCGATGCAATTCACAAGCTGAAATATACTGCTGAAGTCGTGAATTAAACGCTAAATATCTAGCAAAAAAGTGCGGTAAAAATTCACCGCACTTTTCTTTAGCTATTAAATTAGACTAATTTTTTAATTAGCTTGATTACAGTACAATTAATTAAATATGATAAACGCAATATCATTCAGCACTTTCGCTTAAAAATCCGCCACTTTGATGATTCCAAAGTTTAGCGTACAGACCATTGAGCTCTAGTAATTCGGCGTGCGTACCTTGTTCGACAATTTGTCCTTTATCAAGCACAATCAGGCGATCCATCGCTGCGATGGTGGATAAACGATGGGCAATGGCAATCACAGTTTTATTTTCCATCATCTTATCTAGACTTTCTTGTATTGCCACTTCCACTTCTGAATCCAATGCACTTGTGGCTTCATCTAACAATAGAATTGGTGCGTCTTTTAACATTACACGAGCAATGGCAATTCTCTGACGCTGACCACCAGAAAGTTTTACCCCGCGTTCTCCCACATGGGCATCATAGCCTTTTCTACCTTGAGAATCACTGAGAAATGGGATGAAATCAGCGGCTTTCGCTCGTTCAGCAGCTAAAACCATTTCTTCATCAGTAGCATTCGGGCGACCATAAATAATATTGTCACGTACAGAACGATGTAGCAACGAAGTGTCTTGAGTGACTAAACCGATTTGGCGACGTAAGCTTTCTTGTTGCACATTGAGTACATTTTGTCCATCAATGGTAATTTCGCCTTGTTGTGCTTCATAAAAGCGAAGTAATAAGTTCACAATCGTAGATTTTCCTGCACCAGAACGACCGATTAACCCAACCTTTTCCCCTGGTTTGATAGTGAGATTGAAATGATTGAGTAATGGTTTTGTCGGATCGTAAGCAAAGGTAATATTGTTAAACTTAATTTCCCCTTGTTTCACTTGTAACGGTGATGCTTGTGGTTTATCCACAATGGTGTGAGGTTTGGTTAAAGTATTCATTCCGTCGTTTACAGTGCCGATATTCTCAAACAAACGGGCAGATTCCCACATAATCCAGCGAGAAAGCCCATTTACGCGTAATGCCATTGCCGTTGCCGTTGCTATTGCACCCACGCCAACTTGACCATTTTTCCATAAAATAATACCAAGTATTGCAGTACTTAACGTAAGTAGAATATTTGTAGCGTAAGTGAGTGTATCTAGTGATGTTGCTAAGCGCATTTGGGCGTGTACTGTTACCATAAAATCTTGCATAGAACGCTTGGCATAAGTAGCTTCGCGTGAGCCGTGAGAAAATAATTTTACTGTAGCAATATTAGAATAAGCATCTGTAATGCGTCCTGTCATTAAAGAACGAGCATCAGCTTGTCGTTGTGCGGTTTTTGATAGTTTAGGAATTAGGGTTCGTAGGATCAAACCGAAGAGTATAATCCAAGTAATAAATGGTAATAAGAACCAAGAATCTAATGCCACTAGCACTACGCCAGAGGTAATAAAATATACCAATACATAAACGAACATATTTGCAAGTGTAAGTACTGTGTCACGTACTGCAAGGGCGGTTTGCATTACTTTTGCGGATACTCTACCTGCAAATTCGTCTTGATAAAAACTTAAACTTTGTCCAAGCATTAAACGATGGAAATTCCAACGTAATCGCATTGGAAATACGCCTTGTAAGGTTTGTAAATGCACGGCCGAAGCTAAAAATCCCCATACAATACTAATGAGTAATAGAGCAGCCATTCCAATTAATAAATGACCTTTTTCTTGCCATAATCTTTCAGGTGTAAATGTGCCTAACCAATCTACAAGCGTTCCCATAAATTGGAATAATACAGCTTCCATTACACCTGTACCTACGGTTAAAATTGCGAGCAAAAAAATCCAGCCTTTCATTCCTGTAATACTAGACCAAATAAAACGGAACAAACCTTTTTTAGGTGTTGTTGGATTGCTTTCTGGATAGGGATTTAAACGATTTTCAAACCACGAAAAAATTTTGTTAAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020010|1111474:1120546|1112697_1113537_-|AVJ03418.1|DBSCAN-SWA MNTGLYELPLVFFTVLAQSAVGAWLVFTFVLLNEKNTKSRTYIHKVMFVILALLGIGFIASIMHLGLPIRAFNSLNRVGSSMMSNEIAAGAIFFTLAGFYWLIAILGKMPVSLGNVWRIVTALIGILFMYVMNQVYHITSIPTWNNALTSWSFYLTVVLGGLTLSYALLIPNKQREYQLQHLPSLFAIGVSLVAIVAIYQGFNLHNIHSAIQNAADLVPNYAIMTVTRLCLLSIVAFLLFRMKNIGLLGISVLLTLVAEGIGRVLFYGLHMTYGMAIGG >CP020010|1111474:1120546|1111974_1112586_-|AVJ03417.1|DBSCAN-SWA MQNTLQQISIYGRLLGAVFYYEPNDARLTDILTFFRQPNWMQEWEISFDVKTHKKITALIEKGLQQNITEQYQYLFIGPNELPTPPWGSVYLDPECVIFGNSLLALRDFLQQHQIAFQTQQDEPEDHIGLMLMLAAYLAENRPHLLIKFLREHFLTWAYHFLEQLSKIENSDFYQALALLTIKTLQQWQVDLHINVPTVRFYR >CP020010|1111474:1120546|1116843_1117953_+|AVJ03421.1|DBSCAN-SWA MKKLIAVAVLSACGSLAHANTNIPNYNTDAHLYEFTQTYDLVVPKGSQGQTNLWVPLPFNGEYQQVKSIHFEGNYMNAYVTENNKYGAKTLFATWDKDAQKRDLKVTMVIETKDREPMVKGALENYTPPKDIQYSVDVQEYLKATPHIKTDGIVKEFADKILGKETNPLKKAELIHHWIVKNMERDNSVLGCGDGDVEKILTTGVLKGKCTDINSVFVALARAAGIPAREIFGIRLGTAEKMGKYSKGAFGSANEQGIANVSGGQHCRAEFYLAGFGWVPVDSADVAKMRLAEKKSVEDKDTQAVAKYLFGNWEANWVGFNHARDFDLYPQPELAPINNFGYPYAEVGGDPLNSFDPKEFKYDYVSKKL >CP020010|1111474:1120546|1114166_1116590_-|AVJ03420.1|DBSCAN-SWA MSNFNQISRRDFVKASSAGAALAVSNLTLPFNVMAKETQRLNENNQERIVWSACTVNCGSRCPLRMHVKDNRITYVETDNTGTETYNLDHQVRACLRGRSMRRRVYNPDRLKYPMKRIGKRGEGKFKRISWDEALTEIADALKRNIKKYGNESIYLNYGTGTLGGTMAKSWPPASTMIARFMNCIGGYLNHYGDYSTAQIAVGLDYTYGGGWALGNGMADIENTKLIVLFGNNPAETRMSGGGLTYCIEQAKARSNAKMIIIDPRYNDTGAGREDEWIPIRPGTDAALVAALAYVMIKENLVDQPFLDKYCVGYDEKTLPADAPKNGHYKAYILGYGDDDGIAKTPEWAAKITGIPAERIIKLAREIGSTKPAFISQGWGPQRRSNGELISRAIAMLPILTGNVGIHGGNTGARESAYSIPFVRMPTLKNPVKASIPMFLWTDAIIRGTEMTALTDGIRGVDKLSSPIKVIWNYASNCLINQHAQINRTHDILQDDTQCEMIITIDNHMTSTAKYSDILLPDCTTSEQMDFALDAFVSNMAYVIFADQVIKPSFECRPIYDMLSDLAEKMGVKEKFTEGRTQEEWLRHIYEQSREKLPELPTFEEFRQQGIFKKVDPNGFKVAYKDFRDNPEAHPLKTPSGKIEIYSSRLAEIAKTWKLAEDEVIHPLPIHAQSFEHYGDPLMEKYPLQLSGFHYKARTHSTYGNVDVLKAANPQEVWMNPIDAEPRNIKNGDMIRIFNDRGEVRINVKITPRIIPGVVALSEGAWYAPDKDRIDHSGCINVLTTQRPSPLAKGNPQHSNLVQVERL >CP020010|1111474:1120546|1118298_1118577_+|AVJ03423.1|DBSCAN-SWA MKKLCTALLLSLFAISFAHANETKQIVLKVKEMNCQLCAYLVNKELRNINGVILTKASIKDGLVTVVEDPKVTNQQLFDAIHKLKYTAEVVN >CP020010|1111474:1120546|1117927_1118290_+|AVJ03422.1|DBSCAN-SWA MTTYLKNSNKSFWVAIAAALSAAVASTLCCIAPLIYLVFGVSSTWLIGLGEYDYLRIPMLIISLCAFAYGFWLLMFSKKIICSKYISRKKLIVLYWIVFIVMIFFLTYPTILPWILELAN >CP020010|1111474:1120546|1113538_1114156_-|AVJ03419.1|DBSCAN-SWA MEQYGFYFDSERCTGCKTCELACKDYKDLGTEVNFRRIYEYTGGQWNQQANGCWHQNIFAYYMSISCNHCADPACTKVCPTGAMHKNADGFVIVNEEICIGCRYCHMACPYDAPQYDAQKGHMTKCDGCYYRVKSGQKPICVDACPLRALDFAPIDELRTKYGTQASIAPLPPADITQPNLVVKPNKYARLSGDTSGFLGNLREV >CP020010|1111474:1120546|1111474_1111975_-|AVJ03416.1|DBSCAN-SWA MKNEAYYQAYLSHHHISRRGLLRHVFPATKSTIEKTQSRPPFSAREDLFSAVCNGCGECASACPNGLIQLKQQQATLEIDYAPCDLCGKCAEVCPTNALHPNFPADTLLRPQFSSACLILQNQTCPDCQTACPQQAISSTLEIDNERCNGCGECKITCFVAAITLK >CP020010|1111474:1120546|1118701_1120546_-|AVJ03424.1|DBSCAN-SWA MFNKIFSWFENRLNPYPESNPTTPKKGLFRFIWSSITGMKGWIFLLAILTVGTGVMEAVLFQFMGTLVDWLGTFTPERLWQEKGHLLIGMAALLLISIVWGFLASAVHLQTLQGVFPMRLRWNFHRLMLGQSLSFYQDEFAGRVSAKVMQTALAVRDTVLTLANMFVYVLVYFITSGVVLVALDSWFLLPFITWIILFGLILRTLIPKLSKTAQRQADARSLMTGRITDAYSNIATVKLFSHGSREATYAKRSMQDFMVTVHAQMRLATSLDTLTYATNILLTLSTAILGIILWKNGQVGVGAIATATAMALRVNGLSRWIMWESARLFENIGTVNDGMNTLTKPHTIVDKPQASPLQVKQGEIKFNNITFAYDPTKPLLNHFNLTIKPGEKVGLIGRSGAGKSTIVNLLLRFYEAQQGEITIDGQNVLNVQQESLRRQIGLVTQDTSLLHRSVRDNIIYGRPNATDEEMVLAAERAKAADFIPFLSDSQGRKGYDAHVGERGVKLSGGQRQRIAIARVMLKDAPILLLDEATSALDSEVEVAIQESLDKMMENKTVIAIAHRLSTIAAMDRLIVLDKGQIVEQGTHAELLELNGLYAKLWNHQSGGFLSESAE |
9 | Escherichia_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
1545203 : 1557606
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020010|1545203:1557606|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020010|1545203:1557606|1552626_1552944_+|AVJ03824.1|DBSCAN-SWA MKFELIILFNVICLFIPLALIPFVERPFKLQNKADKGLVLFLMYLFILCIQMFLINIQTLQEQYKTILFAIVAGLYGAVIARYLTYPLEIIEQSIGIKNEDKLKK >CP020010|1545203:1557606|1550403_1550985_+|AVJ03821.1|DBSCAN-SWA MANILFLDNFDSFTYNLVDQFRVLGHNVTIYRNDCDLEKLVETALNTADTILALSPGPGTPSEAGILLPLIERLKNQVPIIGICLGHQALIQAFGGKVVHAGEVLHGKVSRICHDNEAMFKDLANPMPVARYHSLMGQNLPQEFIVNAEYNGIIMAIRHRDLPICAFQFHPESILTVQGSQLLQQSIEWLLNR >CP020010|1545203:1557606|1551033_1551420_+|AVJ03822.1|DBSCAN-SWA MITVFGFKSKLEPRREQLAEVIYNSLHLGLDIPKGKHAIRFLCLEKDDFYYPFDRSDDYTVIEINLMAGRMEGTKKRLIKMLFSELEYKLGIRAHDVEITIKEQPAHCWGFRGMTGDEARDLDYDIYV >CP020010|1545203:1557606|1547235_1547733_+|AVJ03817.1|DBSCAN-SWA MLSENVVKLLNDQMNLEFYSSNLYLQMSAWCDQQGFEGTAKFLSVHAAEEMQHMRKLFTYLNETGSLAVISAIEAPAHEYKSLKEIIETTYEHEKLITSKINELVGKTFEEKDYSAFNFLQWYVEEQHEEEKLFSSILDKLNFLGEDGKGLFLIDKDLGNLSTKA >CP020010|1545203:1557606|1551472_1552474_+|AVJ03823.1|DBSCAN-SWA MQHEQLLEQLYNGQTLNKAESAVIFNSIMQGELNNEQIAAMLIALKVRGVSIDELSGAVSASLQNAKAFPYPDYPFADIVGTGGDGQNTINISTASAIVAASMGAKVAKHGNRSVSSKSGASDVLTALGVNVNATPEQARQALDEIGVCFLFAQQYHSGFRHVAPVRAALKTRTIFNILGPLINPARPTYHLLGVYAPELVKTYAETAVALEHQYSFVVHGSGLDEVALHGETQVAEIKNGKIEYFTLTPEDFGLKNQSLESLRGGEPQENAQMLTALLQGKGKAEHANAVAANTALLLKLFGHDDLKQNVQNVLVHLASGKVFETLQKLTIY >CP020010|1545203:1557606|1552921_1554340_+|AVJ03825.1|DBSCAN-SWA MKINLKNKPTILQKIVLDKTQWVKIKETEFPLSQFKQNIQKSDRSFYEALAKGTHQKPAYILECKKASPSKGLIRAEFNLEEIANVYKHYASAVSVLTDEKYFQGNFEFLPLVRDIVSQPVLCKDFMISEYQVYLARYYQADAILLMLSVVNDETYRVLADLAHSLGMGVLTETSNEEEFERALALGAKIIGVNNRNLHDLTVDLNRVVELTEKYADCIPADIRIISESGIYNHKQIRQLQKVAHGFLIGSSLMGNQDLNNAVRSVIFGENKVCGLTRAQDVKIVYENGALYGGLIFAEHSKRCVSLRQAQELVTAAPLRFVGVFQNQEIDFIVKIANQLQLYAVQLHGAETEAFITALRQQLPKNTQIWKAISVNTEAQSAVDFTDNLNVERYIFDSQTSNQQGGTGKTFDWSLIPENLKHKIILAGGISPNNVEQAIQQNCLGLDINSGVESSAGVKDQEKVRLVFNNIY >CP020010|1545203:1557606|1554759_1557606_-|AVJ03827.1|tRNA|DBSCAN-SWA MADRFNPSAVEQALYQHWEESGYFKPSGNENAPSYCIAIPPPNVTGSLHMGHAFQQTLMDTLIRFNRMEGHNTLWQAGTDHAGIATQMVVERKIGAEEGKTRHDYGREAFINKIWDWKAYSGGTISQQMRRLGNSIDWERERFTMDDGLSNAVKEVFVRLHEEGLIYRGKRLVNWDPKLHTAISDLEVENKESKGSLWHFRYPLANGAKTADGKDYLVVATTRPETMLGDTAVAVHPEDERYQSLIGKTVVLPLANREIPIIADEYVDREFGTGVVKITPAHDFNDYEVGKRHGLPMVNVLTLNADIRDEAEIIGTDGKPLAGYEATIPADYRGLERFAARKKIVADFESLGLLDEIKPHDLKVPYGDRGGVPIEPMLTDQWYVSVKPLADVAIKAVEDCEIQFVPKQYENLYFSWMRDIQDWCISRQLWWGHRIPAWYDTEGNVYVARNETEVRSKYNLDFAVELKQDEDVLDTWFSSGLWTFSTLGWPEQTKELKMFHPTDVLITGFDIIFFWVARMIMFTMHFVKDENGKPQVPFKTVYVTGLIRDEQGQKMSKSKGNVLDPIDMIDGISLDDLLEKRTGNMMQPQLAEKIAKATRKEFADGIAAHGTDALRFTLAALASNGRDINWDMKRLEGYRNFCNKLWNASRFVLTNDKLDLSEGEIEFSLADRWIQSEFNRTVETFRNSLSQYRFDLCANAIYEFTWNQFCDWYLELTKPVFANGNAAQIRAASQTLVHVLEKLLRLAHPLIPFITEEIWQKVKGFVGITADSIMLQPFPQVEENGFDPEAEAEIEWLKEVIVAVRNIRAESNIAPSKGLDLLFRNLSTENAKILEKQTALLKAMAKLDNVQVLAVNETAPLAVAKLVGNAELLVPMAGFINKEAELARLTKEIEKYQNEVKRIENKLSNEAFVAKAPEAVIAKEREKQAEYQSGLEKIQEQYKAIEAL >CP020010|1545203:1557606|1548834_1550391_+|AVJ03820.1|DBSCAN-SWA MNIQAQAFIAVTAQPIPYYADTTAIFNTLCQPNSNSLLLDSAEIGSKNSLQSLILVNSAVKITCLGHNVTFKALNENGKQVLKEIYPKLTALGKISAVNFEDEFSVQFSPLDNQLDEDSKLQSATIFDGLRVISTLYQHSQTPIFLGGLFAYDLVANFIPMDGITLQHDGINCPDYSFYLAEHLITIDHQNQQATLKSFCFAQEEQVNIAKTSLSIAQKLKNIDNVLSIKAASDEVKTNFDDPEFTGIVKALKHHINIGDVFQIVPSRRFSLACPNTLASYAQLKQNNPSPYMFYMNDEDFILFGASPESALKYEPENRQLEIYPIAGSRPRGFDAHGNIDPELDARLELELRLDHKEQAEHLMLVDLARNDIARVCQSGTRKVAELMQVDRYSHIMHLVSRVVGKLRPELDALHAYQACMNMGTLTGAPKIKAMQLIYQFEQQKRHSYGGAVGYLTSDGHFDTCIVIRSAFVQNGIAHVQAGCGEVLDSDPQMEADETRHKAAAVLKAIRQVNTQAK >CP020010|1545203:1557606|1545203_1546223_-|AVJ03815.1|DBSCAN-SWA MFMHKMKKNLIIVLTLGTLPFAQANSITGAGASFPYPIYAKWASLYEKETGNKVNYQSIGSGGGQQQIIAKTVDFGASDDPMKSELLQQHQLVQFPVVIGGIVPVVNLPEIKPGKLKLSGKLLAEIFLGKIKKWNDPDLVALNPTLPLPNKNIIVIHRSDGSGTTFGFTNYLSKVSNDWKNQVGEGKSVKWLTGQGGKGNEGIASYVRQMKYTIGYVEYAYAKQNQLAWISLQNQAGQFVQPSNESFMAAASHAKWHEKAGMGVILTNETGEKSWPITAASFILLNKYSDNPETTKNVLAFFDWAFSRGQDAATELDYVPIPADVVSTIKSQWKTELKQ >CP020010|1545203:1557606|1547935_1548730_+|AVJ03819.1|DBSCAN-SWA MTSTIGRPELTLAIKSVQNQTYLCKHYVFVDGNIFWDKAKSILEQFSDVIPIYLPMNTGKNGILNGAINAAAFLVEEDIICYLDDDNQLREDHVESLVNVIEQGADFAYSLRSFYDSNHQFICHDDFESLGNWNTKSDIFVDVKIKDIQQQLHFTFNEINGHIDTNCYAVPREIAQKTAYSWNTPLIGDRSFLSALKSLGLIGQTSGKYTVKYRADFNKLIAVRRVFPQLSLSDEDNNNISAKILEVINQQNIEYYGGRPWAKE >CP020010|1545203:1557606|1547792_1547915_-|AVJ03818.1|DBSCAN-SWA MVGWLVGWLVGWFISINPFHFYNTLINSKYAIENILENLE >CP020010|1545203:1557606|1554455_1554728_+|AVJ03826.1|DBSCAN-SWA MFRRSGQIVKIDENSLQLATVDVCGVQREVNISLICTRNPADLLGKWVLVHVGFAMSVIDEDEAKKTQEALITMSQLEHEVGDFLGLNQK >CP020010|1545203:1557606|1546805_1547216_+|AVJ03816.1|DBSCAN-SWA MSAWCSKHGYEGAATFLLRHADEELEHMQKLFNYVSETSGMPILGKIDAPKHDYSSLREVFEITLEHEKLVTSKINELVEVTFESKDYSTFNFLQWYVAEQHEEEKLFSGIIDRFNLVGEDGKGLFFIDRELATLE |
13 | Acinetobacter_phage(42.86%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1634142 : 1640821
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020010|1634142:1640821|DBSCAN-SWA ATTATTCAACCGCTTGTTGAGAAGGATTTAGAAGGCGATCAATCGCTTTTAGCGCATCTAACGCTTTCATTTCTAGACTTAAAAAGTGCATTTTCGGCACACCAGCATCTTGTGGGTTAATACGGATAAATCCACCCTTTTTTGCTTTCGCCGTACGTTCAGAAAAGCAACGCACAGTAGGAATAACTTTCCCCGCTCCCAGTTCGATGACGATAAGATTTTGCACTTCTTTTAACCACGATTCTAACCGCACTTTTTTAAAATCCTGATATTGACTTACATAACTCCAATCATTAAACATTAGTACATTTTGACGAGCAAAGCCACCACAATAAGGACAATGTGGTTTTTCACTGGTTAAACATAAATTTTTATTATCCACGACAGGTTGAAAACTTGATGCAGACCAACTTAATCCTCGACAATTATTGACACATTGAAGACGCTCCAAAGTACCGTGTACTTCATAAACATGGCTATCATCAAAACCAGCCTTTTGAAAATGCCCATCCACATTACTGGTAAAAACGAAATATCCATGAGATTTATCTCCCGCCCAGCGTTTTAAAATCTGATACCCTTCGTGAGGAATAGTATTTCGGTATTGAATTAATCGATGTCCATAAAACCAATAGGCAAGTTCCTGATTATGCTTATAAGCTAATGGCGTCGCGATGTCTTCAAAAGATATATTATGTTCTTTAAACATAGGATAAGCATTCCAAAATCCGCCAACGCTGCGAAAATCGGGCAGCCCAGAATCCACGCTCATACCCGCACCAGCTGTAATTAAAATGCCATCCGCTTTGCGGATAAGTTCCACAGCATAATTCAAATCATTTTTCATAATACTTTTCTCTGTCCATTTTTCATTGATGAAATAATACCCGCTTGTTCCAACTGTTCTAAAATTTGCCCAGCTCGATTAAAACCCAACATAAATCTGCGTTGAATCATTGAGCAAGATGCAACTTTTTGTTGTTGCACATATTTTTTTACATCCTCAAAAAGTGGATCTCTTGCCATAATTACTTTCATTGCCATTATTTGCTCCTTTTTATTAATTAAAGGCTTGATAGATATGTAAGAAGTAAAAAATCTCCCTTTATGGAAAAATTATATGAAAGGAAGCGACAACTTGTGTCGTTTGCGAATATTGAAAGCGGTTATTTTTAGAAGATTTTTTGCAAATAAGATGATCTGTATTGCAATATGCATATTTATCTGGTTATATATACATGTAAGTTATTAAGGAAAATAATATGAATAACCAAAACCCGATTGAAATTTACCAAGCTCAAGATGGCACAACGCAAGTGGAAGTGAGATTTGAAAATGGCACCGTTTGGCTTTCCCAGGCACAAATGGCAAATATTTTTGATACTAGCTCAGATAACATAGGCCTACACTTAAAAAATATTTTTAATGAAGAAGAACTTGATGAAAATTTAACTACCGAGGATTTCTCGGTAGTTCGACAAGAAGGAAAAAGGCAAGTTACTCGTAAGGTTAAACATTATAATCTGGATGCTATTATTTCTGTAGGCTATCGAGTGAAGTCTAAGTCTGCAACAAATTTTAGAATTTGGGCAACTGCACGTTTAAAAGAATATCTGACTCAAGGCTATACTATTAACCAAAAACGTTTACAGCAAAATGCTCACGAATTAGAACAAGCACTTGCGCTTATTCAAAAAACGGCAAATTCATCAGAATTAACGCTAGAAAGCGGTCGCGGATTAGTGGATATTGTCAGCCGTTATACGCATACGTTTTTATGGCTACAACAATATGATGAAGGTTTACTTGCCGAACCACAAACACAGCAAGGCGGTACATTACCGACTTATGCAGAAACCTGTTCTGCACTAGCAGAGTTAAAATCACAGCTGATGGCAAAAGGTGAAGCAAGTGATCTATTTGGACGTGAACGAGATAACGGCTTATCTGCGATTCTAGGCAATTTAGATCAAAGTGTATTTGGTGAACCTGCTTATCCAAGCATTGAAGCAAAAGCGGCACATTTACTTTATTTTGTCGTCAAGAATCATCCTTTTTCAGATGGTAATAAACGTAGTGGCGCATTTTTATTTGTAGATTTCTTACATAGAAATGGGCGTTTGTTTGATCATAATGGGCATCCAGTTATCAATGATACTGGGCTTGCAGCACTCACTTTATTAGTTGCTGAATCTGATCCGAAACAAAAAGAAACGCTTATTAGGCTTATTATGCACATGCTTAAGCAAAAACAAGAGAAGTAATGATAAATAGCGACCGAAGTCGCTATTTATCTATCAATGTTAAACTTAATAAAAAATTTATTTACATAATTCTTTTACTGACTCTACTAATGCTTCCATTTTGTCGTAAGAATTAATGCCACTTGGACCACCAAAAAACGGACAAACACAAATTAAAGTATCATTGTACTTGCGATAGAAGATATTAAATTCTTTCAACGCTTTAGTTTCATATACGGCTTCTCCAGTAAAAAACTTAAAGAAGTTATCTTTTTCAGTGACTCCCGTACAAATAATAACTTTAGGATTACATTCATCTATAAGTTGACGATAAAAAGCACCACGATTTTCAACACACCATTCTCTATATTGATCGAATGTTTCAAATCCTGTCATCTTAATGAATTGTTCATTCCATTGAATTGATGCTCTATTTTTGAAATTGATTGGTAGCATATTTAGTTTAAAACCAATACCCTGTGGATAAAGCACATTATAAGTACTAACAAAATACTCATAGCTTTCACCACTTTTCCAATCTAAATTATAGTAGTACCACAAAAACCAACATAATTTTTGATTATATTGCGTAGTCCAACTACCATCAAAATCGTCCTCTAACCAAGAGTGCGGTATTAATTTAGGGCTTAAACTAAATTTCTTATAAAAATCATCAGGAGAAGCTTCATCACCAATCCCCCATTCTAACCCACAAAACCAAACATCTGAGTTAGGATTTCCGCCATCTCCTCCAGCGAAGGATACTGCCACTTTTTTAAACTCTTCTGTTACCATTATTTTATCCTCATTATTTAAGTAGATTTGTCCAAATCCCTATGGTTTCTTCTTGAATTACGCCTTTTTCTTGACCTAATTTTATTGCCAGTTGCTGTAAACTTTTAGCCAACTCAGTATGACCGCAATAATTTAAACTACGAATGATGCGGGAAATCTTCTTACTTTCATGCCCAATATTGCGTAGCCAAACTTTACGTTCAGTTAATTCAGGTTTAGGGAATATTTTATTATCTTCACGATATAAACAGAAGTAATCCAGAATAATATCAATAGAATGTAAATATTTATTTTGAATTGCTTCATCTCCAATAAAAATAGCCAGGTCTTCTTCGTTAAAAACCGGTACTGAACGATTCCATTTGGAACTTTCAGTAACAGGTAAAAGCCAAGGAATATAAAAATAAGCATCGCCAATCATTCTTTTTGGCATTGCCCGCATATCTTGCAAAGATAAATTATGTTGGCTTTTTCTTTGTTCTAAATAAAATTCAATTACTGGATGCATACGTTTCTCGTTAATTCATCAGTCATACAGTATAGTGATATAAAACTCGCTATTTATGTGAAAAGTGCGGTCATTTTTCTATGAGTTTTTGGTGTTCTCTAATAACTCTGCCACCACTTTCGGCACACCCTCGCCTGCTTTTTCTTTTATTGCAATAACTTGCTTACGAACAAAGCCTGTATTTGGGTTAGGATCAATCAGATAAATTGGCGCTTTTCTTGGAGCTTCATTGACTAAGCCGTTGGCTGGATAAACTTGTAATGAAGTACCAATCACTAACACAACATCTGCTTGTTCCACAATATCAACCGCTCGTTCTAACATCGGCACCATTTCACCAAAAAAGACGATGTAAGGGCGCATTGGGTGTCCATTTGGATCTTTATCTTCTAATTTCTGATCACCAAAACAATCCACAATATAACTTTCATCAAAGCTACTGCGAGCTTTATTTAATTCACCGTGTAAATGCAACACCTTCGAGCTGCCGGCACGTTCATGTAAATCATCCACATTTTGCGTGATGATTCTTACATCATAGGCTTTTTCTAGTTCAACTAAGGCGAGATGCGCAGCGTTTGGCTTAGCTGCTGCCGCATTTTTACGGCGTTGGTTATAGAAATCAAGCACTTTCGCACGGTTCTTTTGCAAGGCTTCGGGCGTGCAAACTTCTTCTACTTTATGCCCTGCCCACAATCCATCTTCAGCTCTAAAAGTAGGAATACCACTTTCGGCACTAATTCCAGCTCCCGTTAATACCACGCAAATTGGTTTATTTTTCTCTGTCATTTTTCAGGCTCCTTTTATTAGCAAACTGTTCTGTACCAAAATGAACATGTTCACCTTGAAATTTACCAGCTCCATTTTTAGTGCGATCATCAATTAAATAATTGCCTTGGTTGAGATTTTTATGATGGGATAAAATCAATCGTTTGTATAAGGCTGAACCTTTTTCTTCACCGAAATAATGTTGAATCCATTTTACTTTATCACTCCAAACGGATGGATTATGCCAAGGCGCAGTAGAAAGCACATAAATATGATATTTTTTCATCAATTTATGCACAGCAGAAATCGCATTAGGCATTGGCTCCATTAAGCTAAAAATACCCTCTACTTCATCATATCGACCTTCGTACTCTTGCTTGGTTTTCTCATCTAATTTTGCAATACCAGACGGAAAATCAACCATCACATTATCCATATCAATATAAACAATTTTCTTCATTTTAATGTCCTCTCTGTTGATGGCTTAATGATAAAAGATGAAGCGACAATTTATGTCGTTAGGCATTTTCGTCTAAATAAGTGCGGTCAATTTCTTGGTAATCTTCACCAAAATGGGCTATCCACCATTCCAGCATAGCACTCTTAATCACGGTAGCGGAAATTTCATATTCAGTGCCACAATCTTTTACTGTTTGATCCATTGATAATGGTGTTTCTGTTAAAAAGCCACCAATATCTTTATTAATGCGGAAAGTTAATCGAATTTTTCGACCATAGGTAAAACCAAACTTTTGGCTTTCTACATAAGATTTCAAATTAAAATCAGGGCGTTCAAATATCATTGTACTCACTGTTACCTTAAGCAAGCGATGCAAAGCAAGGTGTAAAATATCGCCATTCTCATATTGTGCGACTAAATAGCTACTTGGTCCTTGTTGAACCAAAGCCAATGGCTTGACCTGTGCCTTATGTTCTTTACCGTGAATACTCCGATAATGCACCTGCAAAAATCGATTTTGATAAAGTGCGGTACTAATTTGAGAAAAAATTTCTGGATTGATTTTGGCAGGTAATAACGGCTGACTAGTTGGGGCAATAGCAACTTTATTAAGCCATTCTGCCCCTGATTTTTTATGGCTGTCATAAACCAAATTATATTCGGCCTGTTGAAAGAACGCCTCCATTGAGTTCATAATGCTAGAAGGCAAAATGCCATTGAGATATTGTTTAGCAAGCATAAGCACAAGTGATTGCTGTTCATTTAAAATCGGTAAATCCAAGCCTTTAGCATTTGATTTCCATCGATATCCATAAGGTTTATCACGCATATCTCGCTCAATTTCAAACTGTTGAGACAAACTTTCTAGCTGGCGTTGGATTGAACGAATATCACGTTGAACGCCAATATCAGCAAGTTTTTGTAAGATTTCTTCTGCGGTAATAAAACGAGTTTTTGGAATAAGGCGTAAAATTTCAAGTTGAATTTGAAGTGCGGTTAAGTTTGAGGGCATTTTTATCTCCCAAATTTGAAAAAAATCATTATAAAAAATGCTGGAAAATTCCAGCATTATATTTTCTAAATCCGTCTGACTTGCCAGAAGGCTTTTGACCAATAAGGGTTATTCATTGAAGAATAGACGATTCCCCCTCTGGTGGAAGCATGAAGGAATTTATCTTCTTTTACATAAATCCCCACATGATAACCATTAGGGCCTCGGCCAGTTTTAAAGAAAATTAAATCGCCAGTTTGAATATCTTCTTTGCGTACATGTTTACCATAATTAGCTTGTTCAACAGTGCTTCTAGGCAAACGAAGATTAAAACGATCGAAGAAAGTTTTCTGCACAAAACCAGAACAATCTACCCCACGGCGTGAAACACCGCCGAGCACATAAGGTGTACCTGCCCATTCATGTTGTTGTTCGCTCAACATGGCTATAGCCATAATAGGATCGCCGATTTGACCTTTATAGTTCATCGCATAATCATCGTTTTGAAAACTGGAACAAGCGAATAAAAACAGCGAGGCAGTAGCGATTAAAAATAATTTATATACTTTCATACCTTTTCATATGAAAAGTGCGGTAGAAATTCACCGCACTTTTTGTTGCTTACTATTTAGTTTTTTCTACACGGGCACGTAACTTTTGCCCAGGTTTAAATGTCACTACTCGGCGAGCAGAAACTGGCACAACATCACCTGTTTTTGGGTTACGCCCTGGGCGAGATGACTTATCACGTAGTTCAAAATTACCAAATCCTGATAATTTCACATCTTGACCAGATTCTAGCGATAAGCGGATCTCTTCCAAAAAGTTCTCCACTACATTTTTCGTATCTTGTTTAGATAAGTGATATTTATCGCTTAAATATTCAATAATATCAAGTTTAGTTATCGTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020010|1634142:1640821|1638459_1638915_-|AVJ03930.1|DBSCAN-SWA MKKIVYIDMDNVMVDFPSGIAKLDEKTKQEYEGRYDEVEGIFSLMEPMPNAISAVHKLMKKYHIYVLSTAPWHNPSVWSDKVKWIQHYFGEEKGSALYKRLILSHHKNLNQGNYLIDDRTKNGAGKFQGEHVHFGTEQFANKRSLKNDREK >CP020010|1634142:1640821|1634142_1634988_-|AVJ03924.1|DBSCAN-SWA MKNDLNYAVELIRKADGILITAGAGMSVDSGLPDFRSVGGFWNAYPMFKEHNISFEDIATPLAYKHNQELAYWFYGHRLIQYRNTIPHEGYQILKRWAGDKSHGYFVFTSNVDGHFQKAGFDDSHVYEVHGTLERLQCVNNCRGLSWSASSFQPVVDNKNLCLTSEKPHCPYCGGFARQNVLMFNDWSYVSQYQDFKKVRLESWLKEVQNLIVIELGAGKVIPTVRCFSERTAKAKKGGFIRINPQDAGVPKMHFLSLEMKALDALKAIDRLLNPSQQAVE >CP020010|1634142:1640821|1637192_1637687_-|AVJ03928.1|DBSCAN-SWA MHPVIEFYLEQRKSQHNLSLQDMRAMPKRMIGDAYFYIPWLLPVTESSKWNRSVPVFNEEDLAIFIGDEAIQNKYLHSIDIILDYFCLYREDNKIFPKPELTERKVWLRNIGHESKKISRIIRSLNYCGHTELAKSLQQLAIKLGQEKGVIQEETIGIWTNLLK >CP020010|1634142:1640821|1639992_1640478_-|AVJ03932.1|DBSCAN-SWA MKVYKLFLIATASLFLFACSSFQNDDYAMNYKGQIGDPIMAIAMLSEQQHEWAGTPYVLGGVSRRGVDCSGFVQKTFFDRFNLRLPRSTVEQANYGKHVRKEDIQTGDLIFFKTGRGPNGYHVGIYVKEDKFLHASTRGGIVYSSMNNPYWSKAFWQVRRI >CP020010|1634142:1640821|1637765_1638476_-|AVJ03929.1|DBSCAN-SWA MTEKNKPICVVLTGAGISAESGIPTFRAEDGLWAGHKVEEVCTPEALQKNRAKVLDFYNQRRKNAAAAKPNAAHLALVELEKAYDVRIITQNVDDLHERAGSSKVLHLHGELNKARSSFDESYIVDCFGDQKLEDKDPNGHPMRPYIVFFGEMVPMLERAVDIVEQADVVLVIGTSLQVYPANGLVNEAPRKAPIYLIDPNPNTGFVRKQVIAIKEKAGEGVPKVVAELLENTKNS >CP020010|1634142:1640821|1640530_1640821_-|AVJ03933.1|DBSCAN-SWA MATITKLDIIEYLSDKYHLSKQDTKNVVENFLEEIRLSLESGQDVKLSGFGNFELRDKSSRPGRNPKTGDVVPVSARRVVTFKPGQKLRARVEKTK >CP020010|1634142:1640821|1634984_1635185_-|AVJ03925.1|DBSCAN-SWA MAMKVIMARDPLFEDVKKYVQQQKVASCSMIQRRFMLGFNRAGQILEQLEQAGIISSMKNGQRKVL >CP020010|1634142:1640821|1635403_1636405_+|AVJ03926.1|DBSCAN-SWA MNNQNPIEIYQAQDGTTQVEVRFENGTVWLSQAQMANIFDTSSDNIGLHLKNIFNEEELDENLTTEDFSVVRQEGKRQVTRKVKHYNLDAIISVGYRVKSKSATNFRIWATARLKEYLTQGYTINQKRLQQNAHELEQALALIQKTANSSELTLESGRGLVDIVSRYTHTFLWLQQYDEGLLAEPQTQQGGTLPTYAETCSALAELKSQLMAKGEASDLFGRERDNGLSAILGNLDQSVFGEPAYPSIEAKAAHLLYFVVKNHPFSDGNKRSGAFLFVDFLHRNGRLFDHNGHPVINDTGLAALTLLVAESDPKQKETLIRLIMHMLKQKQEK >CP020010|1634142:1640821|1638973_1639927_-|AVJ03931.1|DBSCAN-SWA MPSNLTALQIQLEILRLIPKTRFITAEEILQKLADIGVQRDIRSIQRQLESLSQQFEIERDMRDKPYGYRWKSNAKGLDLPILNEQQSLVLMLAKQYLNGILPSSIMNSMEAFFQQAEYNLVYDSHKKSGAEWLNKVAIAPTSQPLLPAKINPEIFSQISTALYQNRFLQVHYRSIHGKEHKAQVKPLALVQQGPSSYLVAQYENGDILHLALHRLLKVTVSTMIFERPDFNLKSYVESQKFGFTYGRKIRLTFRINKDIGGFLTETPLSMDQTVKDCGTEYEISATVIKSAMLEWWIAHFGEDYQEIDRTYLDENA >CP020010|1634142:1640821|1636462_1637179_-|AVJ03927.1|DBSCAN-SWA MVTEEFKKVAVSFAGGDGGNPNSDVWFCGLEWGIGDEASPDDFYKKFSLSPKLIPHSWLEDDFDGSWTTQYNQKLCWFLWYYYNLDWKSGESYEYFVSTYNVLYPQGIGFKLNMLPINFKNRASIQWNEQFIKMTGFETFDQYREWCVENRGAFYRQLIDECNPKVIICTGVTEKDNFFKFFTGEAVYETKALKEFNIFYRKYNDTLICVCPFFGGPSGINSYDKMEALVESVKELCK |
10 | Escherichia_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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