Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020011 | Haemophilus influenzae strain 67P56H1 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas3,DinG,DEDDh,WYL | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1111389 : 1120461
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020011|1111389:1120461|DBSCAN-SWA 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TTGTGTCTCTTTAGCCATTACATTGAAAGGTAAAGTAAGATTTGAAACTGCCAGTGCAGCTCCCGCAGATGACGCCTTGACAAAATCTCGGCGACTTATTTGATTAAAGTTACTCATTATATCGTTCCCCCACAGTCAGATTGAAAAATAACTAAAACAAGTTAATTATAATCTTTGTATAGAAGTTTTACTTGAGCCAAATCAATTAATCATTAATAGGTATATTATTTATAGGGTATTTTAGTAGATTGATGTTTTAATAAATTTTGGAATAACAAATTGACTATGGATTTAAAAACCCGTTAGCATAGTGGCGTATTAGTTTATCTAATATGTTAAGTTTAACTATTATTAACTAGAGGATCTCTTCATGAAGAAACTTATCGCAGTTGCGGTGCTTTCTGCATGTGGCTCGTTAGCTCATGCAAACACTAATATTCCAAACTACAATACAGACGCCCATCTTTACGAATTCACGCAAACCTATGATTTAGTTGTGCCAAAAGGCTCGCAAGGACAAACCAATTTATGGGTTCCATTACCATTTAATGGGGAATACCAACAAGTGAAATCGATTCACTTTGAAGGTAATTACATGAATGCCTATGTAACAGAAAACAATAAATACGGAGCGAAAACCTTATTTGCCACTTGGGATAAAGATGCACAAAAACGTGATTTAAAAGTCACGATGGTCATTGAAACAAAAGACCGTGAACCGATGGTGAAAGGTGCTTTAGAGAATTATACTCCGCCAAAAGATATTCAGTATTCCGTGGATGTACAAGAATACTTAAAAGCTACTCCACATATTAAAACTGATGGCATTGTGAAAGAATTTGCTGACAAAATCCTAGGTAAAGAAACTAATCCATTGAAGAAAGCAGAACTTATTCACCACTGGATCGTAAAAAATATGGAACGTGATAATTCTGTATTAGGTTGTGGTGACGGCGATGTAGAAAAAATTCTTACCACTGGCGTGTTAAAAGGTAAATGTACCGATATTAACTCTGTATTTGTGGCACTTGCTCGTGCTGCAGGCATCCCTGCTCGTGAAATTTTTGGTATTCGCTTAGGTACGGCAGAGAAAATGGGCAAATATTCAAAAGGTGCCTTCGGTAGTGCAAATGAACAAGGCATCGCAAACGTAAGTGGCGGTCAGCACTGCCGCGCTGAATTCTACCTTGCAGGATTTGGATGGGTACCAGTTGATTCCGCAGACGTTGCCAAAATGCGTTTAGCAGAGAAAAAATCTGTTGAAGATAAAGATACACAAGCCGTAGCAAAATATTTGTTTGGTAACTGGGAAGCAAACTGGGTGGGATTTAATCATGCCCGTGACTTCGATTTATATCCACAACCAGAACTGGCTCCAATCAATAACTTCGGCTATCCATATGCAGAAGTAGGTGGCGATCCGTTAAATTCCTTTGACCCAAAAGAATTTAAATATGACTACGTATCTAAAAAACTCTAATAAATCCTTTTGGGTTGCCATAGCCGCCGCACTAAGTGCTGCGGTGGCATCAACCTTGTGCTGCATCGCACCATTAATTTATTTAGTATTTGGTGTGTCGTCCACTTGGTTGATTGGCTTAGGCGAATATGATTATTTGCGTATTCCTATGCTTATCATTTCATTATGCGCCTTTGCCTATGGATTTTGGCTGTTGATGTTTTCCAAAAAAATCATTTGTAGCAAATATATTTCCCGTAAAAAACTTATCGTTTTATATTGGATTGTATTTATCGTGATGATTTTTTTCTTAACCTATCCAACAATTTTACCTTGGATTTTAGAATTAGCTAATTAGGAATAAAAATGAAGAAATTATGTACCGCACTTTTGCTTTCGCTGTTTGCAATTTCTTTCGCTCATGCGAATGAAACCAAACAAATTGTGCTAAAAGTAAAGGAAATGAATTGCCAGCTTTGTGCTTACTTAGTCAATAAAGAACTGCGTAATATCAATGGCGTTATTTTAACAAAAGCATCTATTAAAGATGGTTTAGTGACGGTTGTGGAAGATCCAAAAGTCACAAACCAACAATTATTCGATGCAATTCACAAGCTGAAATATACTGCTGAAGTCGTGAATTAAACGCTAAATATCTAGCAAAAAAGTGCGGTAAAAATTCACCGCACTTTTCTTTAGCTATTAAATTAGACTAATTTTTTAATTAGCTTGATTACAGTACAATTAATTAAATATGATAAACGCAATATCATTCAGCACTTTCGCTTAAAAATCCGCCACTTTGATGATTCCAAAGTTTAGCGTACAGACCATTGAGCTCTAGTAATTCGGCGTGCGTACCTTGTTCGACAATTTGTCCTTTATCAAGCACAATCAGGCGATCCATCGCTGCGATGGTGGATAAACGATGGGCAATGGCAATCACAGTTTTATTTTCCATCATCTTATCTAGACTTTCTTGTATTGCCACTTCCACTTCTGAATCCAATGCACTTGTGGCTTCATCTAACAATAGAATTGGTGCGTCTTTTAACATTACACGAGCAATGGCAATTCTCTGACGCTGACCACCAGAAAGTTTTACCCCGCGTTCTCCCACATGGGCATCATAGCCTTTTCTACCTTGAGAATCACTGAGAAATGGGATGAAATCAGCGGCTTTCGCTCGTTCAGCAGCTAAAACCATTTCTTCATCAGTAGCATTCGGGCGACCATAAATAATATTGTCACGTACAGAACGATGTAGCAACGAAGTGTCTTGAGTGACTAAACCGATTTGGCGACGTAAGCTTTCTTGTTGCACATTGAGTACATTTTGTCCATCAATGGTAATTTCGCCTTGTTGTGCTTCATAAAAGCGAAGTAATAAGTTCACAATCGTAGATTTTCCTGCACCAGAACGACCGATTAACCCAACCTTTTCCCCTGGTTTGATAGTGAGATTGAAATGATTGAGTAATGGTTTTGTCGGATCGTAAGCAAAGGTAATATTGTTAAACTTAATTTCCCCTTGTTTCACTTGTAACGGTGATGCTTGTGGTTTATCCACAATGGTGTGAGGTTTGGTTAAAGTATTCATTCCGTCGTTTACAGTGCCGATATTCTCAAACAAACGGGCAGATTCCCACATAATCCAGCGAGAAAGCCCATTTACGCGTAATGCCATTGCCGTTGCCGTTGCTATTGCACCCACGCCAACTTGACCATTTTTCCATAAAATAATACCAAGTATTGCAGTACTTAACGTAAGTAGAATATTTGTAGCGTAAGTGAGTGTATCTAGTGATGTTGCTAAGCGCATTTGGGCGTGTACTGTTACCATAAAATCTTGCATAGAACGCTTGGCATAAGTAGCTTCGCGTGAGCCGTGAGAAAATAATTTTACTGTAGCAATATTAGAATAAGCATCTGTAATGCGTCCTGTCATTAAAGAACGAGCATCAGCTTGTCGTTGTGCGGTTTTTGATAGTTTAGGAATTAGGGTTCGTAGGATCAAACCGAAGAGTATAATCCAAGTAATAAATGGTAATAAGAACCAAGAATCTAATGCCACTAGCACTACGCCAGAGGTAATAAAATATACCAATACATAAACGAACATATTTGCAAGTGTAAGTACTGTGTCACGTACTGCAAGGGCGGTTTGCATTACTTTTGCGGATACTCTACCTGCAAATTCGTCTTGATAAAAACTTAAACTTTGTCCAAGCATTAAACGATGGAAATTCCAACGTAATCGCATTGGAAATACGCCTTGTAAGGTTTGTAAATGCACGGCCGAAGCTAAAAATCCCCATACAATACTAATGAGTAATAGAGCAGCCATTCCAATTAATAAATGACCTTTTTCTTGCCATAATCTTTCAGGTGTAAATGTGCCTAACCAATCTACAAGCGTTCCCATAAATTGGAATAATACAGCTTCCATTACACCTGTACCTACGGTTAAAATTGCGAGCAAAAAAATCCAGCCTTTCATTCCTGTAATACTAGACCAAATAAAACGGAACAAACCTTTTTTAGGTGTTGTTGGATTGCTTTCTGGATAGGGATTTAAACGATTTTCAAACCACGAAAAAATTTTGTTAAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020011|1111389:1120461|1111889_1112501_-|AVJ05159.1|DBSCAN-SWA MQNTLQQISIYGRLLGAVFYYEPNDARLTDILTFFRQPNWMQEWEISFDVKTHKKITALIEKGLQQNITEQYQYLFIGPNELPTPPWGSVYLDPECVIFGNSLLALRDFLQQHQIAFQTQQDEPEDHIGLMLMLAAYLAENRPHLLIKFLREHFLTWAYHFLEQLSKIENSDFYQALALLTIKTLQQWQVDLHINVPTVRFYR >CP020011|1111389:1120461|1112612_1113452_-|AVJ05160.1|DBSCAN-SWA MNTGLYELPLVFFTVLAQSAVGAWLVFTFVLLNEKNTKSRTYIHKVMFVILALLGIGFIASIMHLGLPIRAFNSLNRVGSSMMSNEIAAGAIFFTLAGFYWLIAILGKMPVSLGNVWRIVTALIGILFMYVMNQVYHITSIPTWNNALTSWSFYLTVVLGGLTLSYALLIPNKQREYQLQHLPSLFAIGVSLVAIVAIYQGFNLHNIHSAIQNAADLVPNYAIMTVTRLCLLSIVAFLLFRMKNIGLLGISVLLTLVAEGIGRVLFYGLHMTYGMAIGG >CP020011|1111389:1120461|1117842_1118205_+|AVJ05164.1|DBSCAN-SWA MTTYLKNSNKSFWVAIAAALSAAVASTLCCIAPLIYLVFGVSSTWLIGLGEYDYLRIPMLIISLCAFAYGFWLLMFSKKIICSKYISRKKLIVLYWIVFIVMIFFLTYPTILPWILELAN >CP020011|1111389:1120461|1111389_1111890_-|AVJ05158.1|DBSCAN-SWA MKNEAYYQAYLSHHHISRRGLLRHVFPATKSTIEKTQSRPPFSAREDLFSAVCNGCGECASACPNGLIQLKQQQATLEIDYAPCDLCGKCAEVCPTNALHPNFPADTLLRPQFSSACLILQNQTCPDCQTACPQQAISSTLEIDNERCNGCGECKITCFVAAITLK >CP020011|1111389:1120461|1114081_1116505_-|AVJ05162.1|DBSCAN-SWA MSNFNQISRRDFVKASSAGAALAVSNLTLPFNVMAKETQRLNENNQERIVWSACTVNCGSRCPLRMHVKDNRITYVETDNTGTETYNLDHQVRACLRGRSMRRRVYNPDRLKYPMKRIGKRGEGKFKRISWDEALTEIADALKRNIKKYGNESIYLNYGTGTLGGTMAKSWPPASTMIARFMNCIGGYLNHYGDYSTAQIAVGLDYTYGGGWALGNGMADIENTKLIVLFGNNPAETRMSGGGLTYCIEQAKARSNAKMIIIDPRYNDTGAGREDEWIPIRPGTDAALVAALAYVMIKENLVDQPFLDKYCVGYDEKTLPADAPKNGHYKAYILGYGDDDGIAKTPEWAAKITGIPAERIIKLAREIGSTKPAFISQGWGPQRRSNGELISRAIAMLPILTGNVGIHGGNTGARESAYSIPFVRMPTLKNPVKASIPMFLWTDAIIRGTEMTALTDGIRGVDKLSSPIKVIWNYASNCLINQHAQINRTHDILQDDTQCEMIITIDNHMTSTAKYSDILLPDCTTSEQMDFALDAFVSNMAYVIFADQVIKPSFECRPIYDMLSDLAEKMGVKEKFTEGRTQEEWLRHIYEQSREKLPELPTFEEFRQQGIFKKVDPNGFKVAYKDFRDNPEAHPLKTPSGKIEIYSSRLAEIAKTWKLAEDEVIHPLPIHAQSFEHYGDPLMEKYPLQLSGFHYKARTHSTYGNVDVLKAANPQEVWMNPIDAEPRNIKNGDMIRIFNDRGEVRINVKITPRIIPGVVALSEGAWYAPDKDRIDHSGCINVLTTQRPSPLAKGNPQHSNLVQVERL >CP020011|1111389:1120461|1118213_1118492_+|AVJ05165.1|DBSCAN-SWA MKKLCTALLLSLFAISFAHANETKQIVLKVKEMNCQLCAYLVNKELRNINGVILTKASIKDGLVTVVEDPKVTNQQLFDAIHKLKYTAEVVN >CP020011|1111389:1120461|1118616_1120461_-|AVJ05166.1|DBSCAN-SWA MFNKIFSWFENRLNPYPESNPTTPKKGLFRFIWSSITGMKGWIFLLAILTVGTGVMEAVLFQFMGTLVDWLGTFTPERLWQEKGHLLIGMAALLLISIVWGFLASAVHLQTLQGVFPMRLRWNFHRLMLGQSLSFYQDEFAGRVSAKVMQTALAVRDTVLTLANMFVYVLVYFITSGVVLVALDSWFLLPFITWIILFGLILRTLIPKLSKTAQRQADARSLMTGRITDAYSNIATVKLFSHGSREATYAKRSMQDFMVTVHAQMRLATSLDTLTYATNILLTLSTAILGIILWKNGQVGVGAIATATAMALRVNGLSRWIMWESARLFENIGTVNDGMNTLTKPHTIVDKPQASPLQVKQGEIKFNNITFAYDPTKPLLNHFNLTIKPGEKVGLIGRSGAGKSTIVNLLLRFYEAQQGEITIDGQNVLNVQQESLRRQIGLVTQDTSLLHRSVRDNIIYGRPNATDEEMVLAAERAKAADFIPFLSDSQGRKGYDAHVGERGVKLSGGQRQRIAIARVMLKDAPILLLDEATSALDSEVEVAIQESLDKMMENKTVIAIAHRLSTIAAMDRLIVLDKGQIVEQGTHAELLELNGLYAKLWNHQSGGFLSESAE >CP020011|1111389:1120461|1113453_1114071_-|AVJ05161.1|DBSCAN-SWA MEQYGFYFDSERCTGCKTCELACKDYKDLGTEVNFRRIYEYTGGQWNQQANGCWHQNIFAYYMSISCNHCADPACTKVCPTGAMHKNADGFVIVNEEICIGCRYCHMACPYDAPQYDAQKGHMTKCDGCYYRVKSGQKPICVDACPLRALDFAPIDELRTKYGTQASIAPLPPADITQPNLVVKPNKYARLSGDTSGFLGNLREV >CP020011|1111389:1120461|1116758_1117868_+|AVJ05163.1|DBSCAN-SWA MKKLIAVAVLSACGSLAHANTNIPNYNTDAHLYEFTQTYDLVVPKGSQGQTNLWVPLPFNGEYQQVKSIHFEGNYMNAYVTENNKYGAKTLFATWDKDAQKRDLKVTMVIETKDREPMVKGALENYTPPKDIQYSVDVQEYLKATPHIKTDGIVKEFADKILGKETNPLKKAELIHHWIVKNMERDNSVLGCGDGDVEKILTTGVLKGKCTDINSVFVALARAAGIPAREIFGIRLGTAEKMGKYSKGAFGSANEQGIANVSGGQHCRAEFYLAGFGWVPVDSADVAKMRLAEKKSVEDKDTQAVAKYLFGNWEANWVGFNHARDFDLYPQPELAPINNFGYPYAEVGGDPLNSFDPKEFKYDYVSKKL |
9 | Escherichia_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
1457495 : 1464174
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020011|1457495:1464174|DBSCAN-SWA TATGGCTACGATAACTAAACTTGATATTATTGAATATTTAAGCGATAAATATCACTTATCTAAACAAGATACGAAAAATGTAGTGGAGAACTTTTTGGAAGAGATCCGCTTATCGCTAGAATCTGGTCAAGATGTGAAATTATCAGGATTTGGTAATTTTGAACTACGTGATAAGTCATCTCGCCCAGGGCGTAACCCAAAAACAGGTGATGTTGTGCCAGTTTCTGCTCGCCGAGTAGTGACATTTAAACCTGGGCAAAAGTTACGTGCCCGTGTAGAAAAAACTAAATAGTAAGCAACAAAAAGTGCGGTGAATTTCTACCGCACTTTTCATATGAAAAGGTATGAAAGTATATAAATTATTTTTAATCGCTACTGCCTCGCTGTTTTTATTCGCTTGTTCCAGTTTTCAAAACGATGATTATGCGATGAACTATAAAGGTCAAATCGGCGATCCTATTATGGCTATAGCCATGTTGAGCGAACAACAACATGAATGGGCAGGTACACCTTATGTGCTCGGCGGTGTTTCACGCCGTGGGGTAGATTGTTCTGGTTTTGTGCAGAAAACTTTCTTCGATCGTTTTAATCTTCGTTTGCCTAGAAGCACTGTTGAACAAGCTAATTATGGTAAACATGTACGCAAAGAAGATATTCAAACTGGCGATTTAATTTTCTTTAAAACTGGCCGAGGCCCTAATGGTTATCATGTGGGGATTTATGTAAAAGAAGATAAATTCCTTCATGCTTCCACCAGAGGGGGAATCGTCTATTCTTCAATGAATAACCCTTATTGGTCAAAAGCCTTCTGGCAAGTCAGACGGATTTAGAAAATATAATGCTGGAATTTTCCAGCATTTTTTATAATGATTTTTTTCAAATTTGGGAGATAAAAATGCCCTCAAACTTAACCGCACTTCAAATTCAACTTGAAATTTTACGCCTTATTCCAAAAACTCGTTTTATTACCGCAGAAGAAATCTTACAAAAACTTGCTGATATTGGCGTTCAACGTGATATTCGTTCAATCCAACGCCAGCTAGAAAGTTTGTCTCAACAGTTTGAAATTGAGCGAGATATGCGTGATAAACCTTATGGATATCGATGGAAATCAAATGCTAAAGGCTTGGATTTACCGATTTTAAATGAACAGCAATCACTTGTGCTTATGCTTGCTAAACAATATCTCAATGGCATTTTGCCTTCTAGCATTATGAACTCAATGGAGGCGTTCTTTCAACAGGCCGAATATAATTTGGTTTATGACAGCCATAAAAAATCAGGGGCAGAATGGCTTAATAAAGTTGCTATTGCCCCAACTAGTCAGCCGTTATTACCTGCCAAAATCAATCCAGAAATTTTTTCTCAAATTAGTACCGCACTTTATCAAAATCGATTTTTGCAGGTGCATTATCGGAGTATTCACGGTAAAGAACATAAGGCACAGGTCAAGCCATTGGCTTTGGTTCAACAAGGACCAAGTAGCTATTTAGTCGCACAATATGAGAATGGCGATATTTTACACCTTGCTTTGCATCGCTTGCTTAAGGTAACAGTGAGTACAATGATATTTGAACGCCCTGATTTTAATTTGAAATCTTATGTAGAAAGCCAAAAGTTTGGTTTTACCTATGGTCGAAAAATTCGATTAACTTTCCGCATTAATAAAGATATTGGTGGCTTTTTAACAGAAACACCATTATCAATGGATCAAACAGTAAAAGATTGTGGCACTGAATATGAAATTTCCGCTACCGTGATTAAGAGTGCTATGCTGGAATGGTGGATAGCCCATTTTGGTGAAGATTACCAAGAAATTGACCGCACTTATTTAGACGAAAATGCCTAACGACATAAATTGTCGCTTCATCTTTTATCATTAAGCCATCAACAGAGAGGACATTAAAATGAAGAAAATTGTTTATATTGATATGGATAATGTGATGGTTGATTTTCCGTCTGGTATTGCAAAATTAGATGAGAAAACCAAGCAAGAGTACGAAGGTCGATATGATGAAGTAGAGGGTATTTTTAGCTTAATGGAGCCAATGCCTAATGCGATTTCTGCTGTGCATAAATTGATGAAAAAATATCATATTTATGTGCTTTCTACTGCGCCTTGGCATAATCCATCCGTTTGGAGTGATAAAGTAAAATGGATTCAACATTATTTCGGTGAAGAAAAAGGTTCAGCCTTATACAAACGATTGATTTTATCCCATCATAAAAATCTCAACCAAGGCAATTATTTAATTGATGATCGCACTAAAAATGGAGCTGGTAAATTTCAAGGTGAACATGTTCATTTTGGTACAGAACAGTTTGCTAATAAAAGGAGCCTGAAAAATGACAGAGAAAAATAAACCAATTTGCGTGGTATTAACGGGAGCTGGAATTAGTGCCGAAAGTGGTATTCCTACTTTTAGAGCTGAAGATGGATTGTGGGCAGGGCATAAAGTAGAAGAAGTTTGCACGCCCGAAGCCTTGCAAAAGAACCGTGCGAAAGTGCTTGATTTCTATAACCAACGCCGTAAAAATGCGGCAGCAGCTAAGCCAAACGCTGCGCATCTCGCCTTAGTTGAACTAGAAAAAGCCTATGATGTAAGAATCATCACGCAAAATGTGGATGATTTACATGAACGTGCCGGCAGCTCGAAGGTGTTGCATTTACACGGTGAATTAAATAAAGCTCGCAGTAGCTTTGATGAAAGTTATATTGTGGATTGTTTTGGTGATCAGAAATTAGAAGATAAAGATCCAAATGGACACCCAATGCGCCCTTACATCGTCTTTTTTGGTGAAATGGTGCCGATGTTAGAACGAGCGGTTGATATTGTGGAACAAGCAGATGTTGTGTTAGTGATTGGTACTTCATTACAAGTTTATCCAGCCAACGGCTTAGTCAATGAAGCTCCAAGAAAAGCGCCAATTTATCTGATTGATCCTAACCCAAATACAGGCTTTGTTCGTAAGCAAGTTATTGCAATAAAAGAAAAAGCAGGCGAGGGTGTGCCGAAAGTGGTGGCAGAGTTATTAGAGAACACCAAAAACTCATAGAAAAATGACCGCACTTTTCACATAAATAGCGAGTTTTATATCACTATACTGTATGACTGATGAATTAACGAGAAACGTATGCATCCAGTAATTGAATTTTATTTAGAACAAAGAAAAAGCCAACATAATTTATCTTTGCAAGATATGCGGGCAATGCCAAAAAGAATGATTGGCGATGCTTATTTTTATATTCCTTGGCTTTTACCTGTTACTGAAAGTTCCAAATGGAATCGTTCAGTACCGGTTTTTAACGAAGAAGACCTGGCTATTTTTATTGGAGATGAAGCAATTCAAAATAAATATTTACATTCTATTGATATTATTCTGGATTACTTCTGTTTATATCGTGAAGATAATAAAATATTCCCTAAACCTGAATTAACTGAACGTAAAGTTTGGCTACGCAATATTGGGCATGAAAGTAAGAAGATTTCCCGCATCATTCGTAGTTTAAATTATTGCGGTCATACTGAGTTGGCTAAAAGTTTACAGCAACTGGCAATAAAATTAGGTCAAGAAAAAGGCGTAATTCAAGAAGAAACCATAGGGATTTGGACAAATCTACTTAAATAATGAGGATAAAATAATGGTAACAGAAGAGTTTAAAAAAGTGGCAGTATCCTTCGCTGGAGGAGATGGCGGAAATCCTAACTCAGATGTTTGGTTTTGTGGGTTAGAATGGGGGATTGGTGATGAAGCTTCTCCTGATGATTTTTATAAGAAATTTAGTTTAAGCCCTAAATTAATACCGCACTCTTGGTTAGAGGACGATTTTGATGGTAGTTGGACTACGCAATATAATCAAAAATTATGTTGGTTTTTGTGGTACTACTATAATTTAGATTGGAAAAGTGGTGAAAGCTATGAGTATTTTGTTAGTACTTATAATGTGCTTTATCCACAGGGTATTGGTTTTAAACTAAATATGCTACCAATCAATTTCAAAAATAGAGCATCAATTCAATGGAATGAACAATTCATTAAGATGACAGGATTTGAAACATTCGATCAATATAGAGAATGGTGTGTTGAAAATCGTGGTGCTTTTTATCGTCAACTTATAGATGAATGTAATCCTAAAGTTATTATTTGTACGGGAGTCACTGAAAAAGATAACTTCTTTAAGTTTTTTACTGGAGAAGCCGTATATGAAACTAAAGCGTTGAAAGAATTTAATATCTTCTATCGCAAGTACAATGATACTTTAATTTGTGTTTGTCCGTTTTTTGGTGGTCCAAGTGGCATTAATTCTTACGACAAAATGGAAGCATTAGTAGAGTCAGTAAAAGAATTATGTAAATAAATTTTTTATTAAGTTTAACATTGATAGATAAATAGCGACTTCGGTCGCTATTTATCATTACTTCTCTTGTTTTTGCTTAAGCATGTGCATAATAAGCCTAATAAGCGTTTCTTTTTGTTTCGGATCAGATTCAGCAACTAATAAAGTGAGTGCTGCAAGCCCAGTATCATTGATAACTGGATGCCCATTATGATCAAACAAACGCCCATTTCTATGTAAGAAATCTACAAATAAAAATGCGCCACTACGTTTATTACCATCTGAAAAAGGATGATTCTTGACGACAAAATAAAGTAAATGTGCCGCTTTTGCTTCAATGCTTGGATAAGCAGGTTCACCAAATACACTTTGATCTAAATTGCCTAGAATCGCAGATAAGCCGTTATCTCGTTCACGTCCAAATAGATCACTTGCTTCACCTTTTGCCATCAGCTGTGATTTTAACTCTGCTAGTGCAGAACAGGTTTCTGCATAAGTCGGTAATGTACCGCCTTGCTGTGTTTGTGGTTCGGCAAGTAAACCTTCATCATATTGTTGTAGCCATAAAAACGTATGCGTATAACGGCTGACAATATCCACTAATCCGCGACCGCTTTCTAGCGTTAATTCTGATGAATTTGCCGTTTTTTGAATAAGCGCAAGTGCTTGTTCTAATTCGTGAGCATTTTGCTGTAAACGTTTTTGGTTAATAGTATAGCCTTGAGTCAGATATTCTTTTAAACGTGCAGTTGCCCAAATTCTAAAATTTGTTGCAGACTTAGACTTCACTCGATAGCCTACAGAAATAATAGCATCCAGATTATAATGTTTAACCTTACGAGTAACTTGCCTTTTTCCTTCTTGTCGAACTACCGAGAAATCCTCGGTAGTTAAATTTTCATCAAGTTCTTCTTCATTAAAAATATTTTTTAAGTGTAGGCCTATGTTATCTGAGCTAGTATCAAAAATATTTGCCATTTGTGCCTGGGAAAGCCAAACGGTGCCATTTTCAAATCTCACTTCCACTTGCGTTGTGCCATCTTGAGCTTGGTAAATTTCAATCGGGTTTTGGTTATTCATATTATTTTCCTTAATAACTTACATGTATATATAACCAGATAAATATGCATATTGCAATACAGATCATCTTATTTGCAAAAAATCTTCTAAAAATAACCGCTTTCAATATTCGCAAACGACACAAGTTGTCGCTTCCTTTCATATAATTTTTCCATAAAGGGAGATTTTTTACTTCTTACATATCTATCAAGCCTTTAATTAATAAAAAGGAGCAAATAATGGCAATGAAAGTAATTATGGCAAGAGATCCACTTTTTGAGGATGTAAAAAAATATGTGCAACAACAAAAAGTTGCATCTTGCTCAATGATTCAACGCAGATTTATGTTGGGTTTTAATCGAGCTGGGCAAATTTTAGAACAGTTGGAACAAGCGGGTATTATTTCATCAATGAAAAATGGACAGAGAAAAGTATTATGAAAAATGATTTGAATTATGCTGTGGAACTTATCCGCAAAGCGGATGGCATTTTAATTACAGCTGGTGCGGGTATGAGCGTGGATTCTGGGCTGCCCGATTTTCGCAGCGTTGGCGGATTTTGGAATGCTTATCCTATGTTTAAAGAACATAATATATCTTTTGAAGACATCGCGACGCCATTAGCTTATAAGCATAATCAGGAACTTGCCTATTGGTTTTATGGACATCGATTAATTCAATACCGAAATACTATTCCTCACGAAGGGTATCAGATTTTAAAACGCTGGGCGGGAGATAAATCTCATGGATATTTCGTTTTTACCAGTAATGTGGATGGGCATTTTCAAAAGGCTGGTTTTGATGATAGCCATGTTTATGAAGTACACGGTACTTTGGAGCGTCTTCAATGTGTCAATAATTGTCGAGGATTAAGTTGGTCTGCATCAAGTTTTCAACCTGTCGTGGATAATAAAAATTTATGTTTAACCAGTGAAAAACCACATTGTCCTTATTGTGGTGGCTTTGCTCGTCAAAATGTACTAATGTTTAATGATTGGAGTTATGTAAGTCAATATCAGGATTTTAAAAAAGTGCGGTTAGAATCGTGGTTAAAAGAAGTGCAAAATCTTATCGTCATCGAACTGGGAGCGGGGAAAGTTATTCCTACTGTGCGTTGCTTTTCTGAACGTACGGCGAAAGCAAAAAAGGGTGGATTTATCCGTATTAACCCACAAGATGCTGGTGTGCCGAAAATGCACTTTTTAAGTCTAGAAATGAAAGCGTTAGATGCGCTAAAAGCGATTGATCGCCTTCTAAATCCTTCTCAACAAGCGGTTGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020011|1457495:1464174|1457495_1457786_+|AVJ05501.1|DBSCAN-SWA MATITKLDIIEYLSDKYHLSKQDTKNVVENFLEEIRLSLESGQDVKLSGFGNFELRDKSSRPGRNPKTGDVVPVSARRVVTFKPGQKLRARVEKTK >CP020011|1457495:1464174|1461911_1462913_-|AVJ05508.1|DBSCAN-SWA MNNQNPIEIYQAQDGTTQVEVRFENGTVWLSQAQMANIFDTSSDNIGLHLKNIFNEEELDENLTTEDFSVVRQEGKRQVTRKVKHYNLDAIISVGYRVKSKSATNFRIWATARLKEYLTQGYTINQKRLQQNAHELEQALALIQKTANSSELTLESGRGLVDIVSRYTHTFLWLQQYDEGLLAEPQTQQGGTLPTYAETCSALAELKSQLMAKGEASDLFGRERDNGLSAILGNLDQSVFGEPAYPSIEAKAAHLLYFVVKNHPFSDGNKRSGAFLFVDFLHRNGRLFDHNGHPVINDTGLAALTLLVAESDPKQKETLIRLIMHMLKQKQEK >CP020011|1457495:1464174|1459401_1459857_+|AVJ05504.1|DBSCAN-SWA MKKIVYIDMDNVMVDFPSGIAKLDEKTKQEYEGRYDEVEGIFSLMEPMPNAISAVHKLMKKYHIYVLSTAPWHNPSVWSDKVKWIQHYFGEEKGSALYKRLILSHHKNLNQGNYLIDDRTKNGAGKFQGEHVHFGTEQFANKRSLKNDREK >CP020011|1457495:1464174|1457838_1458324_+|AVJ05502.1|DBSCAN-SWA MKVYKLFLIATASLFLFACSSFQNDDYAMNYKGQIGDPIMAIAMLSEQQHEWAGTPYVLGGVSRRGVDCSGFVQKTFFDRFNLRLPRSTVEQANYGKHVRKEDIQTGDLIFFKTGRGPNGYHVGIYVKEDKFLHASTRGGIVYSSMNNPYWSKAFWQVRRI >CP020011|1457495:1464174|1463131_1463332_+|AVJ05509.1|DBSCAN-SWA MAMKVIMARDPLFEDVKKYVQQQKVASCSMIQRRFMLGFNRAGQILEQLEQAGIISSMKNGQRKVL >CP020011|1457495:1464174|1459840_1460551_+|AVJ05505.1|DBSCAN-SWA MTEKNKPICVVLTGAGISAESGIPTFRAEDGLWAGHKVEEVCTPEALQKNRAKVLDFYNQRRKNAAAAKPNAAHLALVELEKAYDVRIITQNVDDLHERAGSSKVLHLHGELNKARSSFDESYIVDCFGDQKLEDKDPNGHPMRPYIVFFGEMVPMLERAVDIVEQADVVLVIGTSLQVYPANGLVNEAPRKAPIYLIDPNPNTGFVRKQVIAIKEKAGEGVPKVVAELLENTKNS >CP020011|1457495:1464174|1463328_1464174_+|AVJ05510.1|DBSCAN-SWA MKNDLNYAVELIRKADGILITAGAGMSVDSGLPDFRSVGGFWNAYPMFKEHNISFEDIATPLAYKHNQELAYWFYGHRLIQYRNTIPHEGYQILKRWAGDKSHGYFVFTSNVDGHFQKAGFDDSHVYEVHGTLERLQCVNNCRGLSWSASSFQPVVDNKNLCLTSEKPHCPYCGGFARQNVLMFNDWSYVSQYQDFKKVRLESWLKEVQNLIVIELGAGKVIPTVRCFSERTAKAKKGGFIRINPQDAGVPKMHFLSLEMKALDALKAIDRLLNPSQQAVE >CP020011|1457495:1464174|1458389_1459343_+|AVJ05503.1|DBSCAN-SWA MPSNLTALQIQLEILRLIPKTRFITAEEILQKLADIGVQRDIRSIQRQLESLSQQFEIERDMRDKPYGYRWKSNAKGLDLPILNEQQSLVLMLAKQYLNGILPSSIMNSMEAFFQQAEYNLVYDSHKKSGAEWLNKVAIAPTSQPLLPAKINPEIFSQISTALYQNRFLQVHYRSIHGKEHKAQVKPLALVQQGPSSYLVAQYENGDILHLALHRLLKVTVSTMIFERPDFNLKSYVESQKFGFTYGRKIRLTFRINKDIGGFLTETPLSMDQTVKDCGTEYEISATVIKSAMLEWWIAHFGEDYQEIDRTYLDENA >CP020011|1457495:1464174|1461137_1461854_+|AVJ05507.1|DBSCAN-SWA MVTEEFKKVAVSFAGGDGGNPNSDVWFCGLEWGIGDEASPDDFYKKFSLSPKLIPHSWLEDDFDGSWTTQYNQKLCWFLWYYYNLDWKSGESYEYFVSTYNVLYPQGIGFKLNMLPINFKNRASIQWNEQFIKMTGFETFDQYREWCVENRGAFYRQLIDECNPKVIICTGVTEKDNFFKFFTGEAVYETKALKEFNIFYRKYNDTLICVCPFFGGPSGINSYDKMEALVESVKELCK >CP020011|1457495:1464174|1460629_1461124_+|AVJ05506.1|DBSCAN-SWA MHPVIEFYLEQRKSQHNLSLQDMRAMPKRMIGDAYFYIPWLLPVTESSKWNRSVPVFNEEDLAIFIGDEAIQNKYLHSIDIILDYFCLYREDNKIFPKPELTERKVWLRNIGHESKKISRIIRSLNYCGHTELAKSLQQLAIKLGQEKGVIQEETIGIWTNLLK |
10 | Sodalis_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1540710 : 1553113
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020011|1540710:1553113|DBSCAN-SWA AATGGCAGATCGTTTTAATCCGTCTGCGGTAGAACAAGCCCTTTATCAACATTGGGAAGAGAGCGGTTATTTTAAACCGTCTGGAAATGAAAATGCGCCGAGCTATTGCATTGCGATTCCTCCACCGAATGTAACAGGTTCTCTACACATGGGACATGCTTTCCAACAAACCTTAATGGATACCTTAATCCGTTTTAACCGTATGGAAGGGCATAACACCTTATGGCAAGCGGGGACAGACCACGCCGGTATCGCAACCCAAATGGTGGTGGAGCGTAAAATCGGGGCTGAAGAAGGTAAAACACGCCACGATTATGGACGTGAAGCGTTCATCAACAAAATTTGGGATTGGAAAGCTTATTCAGGCGGCACAATCAGCCAACAAATGCGTCGTTTAGGAAACTCTATCGACTGGGAACGTGAGCGTTTCACTATGGACGATGGTTTATCGAATGCAGTAAAAGAAGTATTTGTTCGTTTGCACGAAGAGGGCTTGATTTACCGTGGTAAACGCTTAGTAAACTGGGATCCAAAACTTCACACCGCGATTTCTGATTTAGAAGTGGAAAATAAAGAGAGCAAAGGTTCTCTTTGGCATTTCCGTTATCCATTAGCAAATGGTGCAAAAACGGCAGATGGTAAAGATTATTTAGTGGTGGCAACTACACGTCCAGAAACTATGTTGGGCGATACAGCGGTGGCGGTGCATCCTGAAGATGAACGTTATCAATCTTTAATCGGTAAAACCGTGGTTCTGCCATTGGCTAATCGCGAAATTCCGATTATTGCCGATGAATATGTGGATCGTGAATTCGGTACTGGTGTAGTGAAAATTACCCCAGCTCATGACTTCAATGACTACGAAGTGGGTAAACGTCACGGCTTGCCAATGGTTAATGTATTAACTTTAAATGCAGATATTCGTGATGAAGCGGAAATTATCGGTACTGACGGCAAACCACTTGCGGGTTATGAGGCGACTATTCCTGCGGATTACCGAGGCTTAGAGCGTTTTGCTGCACGTAAAAAAATCGTGGCAGATTTTGAATCGCTAGGTTTATTAGACGAAATTAAACCACACGATTTGAAAGTGCCTTATGGCGACCGTGGTGGCGTGCCGATTGAGCCGATGCTAACTGACCAATGGTATGTTAGCGTGAAACCGCTTGCCGATGTAGCAATTAAAGCGGTGGAAGACTGCGAAATCCAATTCGTGCCAAAACAATATGAAAACCTTTATTTCTCTTGGATGCGTGATATTCAAGATTGGTGTATTTCTCGCCAACTTTGGTGGGGACACCGTATTCCAGCGTGGTATGACACGGAAGGCAACGTTTATGTTGCGCGTAACGAAACAGAAGTGCGGTCAAAATACAACTTAGATTTTGCGGTTGAACTTAAACAAGATGAAGACGTGCTGGATACGTGGTTCTCCTCAGGCTTGTGGACGTTCTCCACTTTAGGTTGGCCAGAGCAAACTAAAGAGCTCAAAATGTTCCACCCAACGGATGTGTTAATCACTGGTTTTGATATCATCTTCTTCTGGGTTGCGCGTATGATTATGTTTACGATGCACTTTGTGAAAGATGAAAATGGCAAACCACAAGTACCATTCAAAACCGTGTACGTAACGGGATTAATCCGTGATGAGCAAGGTCAAAAAATGTCGAAATCAAAAGGTAACGTACTTGATCCAATCGATATGATTGACGGTATCAGCCTTGACGATTTACTTGAAAAACGCACTGGCAACATGATGCAGCCGCAATTAGCAGAGAAAATCGCCAAAGCAACTCGCAAAGAATTTGCGGACGGAATTGCTGCTCACGGTACAGACGCATTGCGTTTTACATTAGCTGCGTTGGCTTCAAATGGTCGTGATATCAACTGGGATATGAAACGTTTAGAAGGCTACCGCAACTTCTGTAATAAATTATGGAATGCAAGCCGTTTCGTATTAACGAATGACAAATTAGATTTAAGTGAAGGCGAGATCGAGTTTTCATTAGCCGATCGTTGGATTCAATCGGAATTCAATCGCACAGTAGAAACTTTCCGTAACTCATTAAGCCAATATCGTTTCGACCTTTGTGCTAATGCAATTTATGAATTTACCTGGAACCAATTCTGCGACTGGTATTTAGAATTGACTAAACCAGTATTTGCCAACGGCAACGCAGCACAAATCCGTGCAGCAAGCCAAACCTTGGTTCACGTGTTAGAAAAATTATTACGTTTAGCACATCCGCTTATTCCATTTATTACTGAAGAAATTTGGCAAAAAGTGAAAGGATTTGTCGGCATTACGGCTGACAGCATTATGTTGCAACCTTTCCCACAAGTGGAAGAAAACGGCTTTGATCCAGAAGCAGAAGCTGAAATTGAGTGGTTAAAAGAAGTGATCGTTGCGGTGCGTAATATTCGTGCAGAAAGCAACATCGCACCAAGTAAAGGTTTAGATCTGTTATTCCGTAATTTAAGCACAGAAAATGCAAAAATTCTCGAAAAACAGACCGCTCTTTTAAAAGCCATGGCGAAATTAGACAACGTTCAAGTGTTAGCCGTAAACGAAACCGCACCACTTGCCGTAGCGAAACTCGTGGGCAATGCTGAATTGCTCGTGCCAATGGCAGGCTTTATCAATAAAGAAGCTGAGCTTGCCCGTTTAACCAAAGAGATTGAAAAATATCAAAACGAAGTTAAACGTATCGAAAACAAACTTAGCAATGAAGCTTTCGTGGCTAAAGCACCTGAAGCGGTGATTGCGAAAGAACGTGAAAAACAAGCAGAATACCAATCTGGATTAGAAAAAATCCAAGAGCAGTATAAGGCGATTGAAGCGTTGTAAAAACATAAAGAGTAGGCATTATGCCTACTTTTTATTTTTGATTTAGTCCTAAAAAATCCCCAACTTCATGTTCGAGTTGGCTCATTGTGATCAGAGCCTCTTGGGTTTTCTTAGCTTCATCTTCATCAATAACACTCATTGCAAAGCCCACATGAACAAGCACCCATTTGCCAAGTAAATCGGCTGGATTTCTCGTGCAGATTAGTGAAATATTTACTTCACGTTGTACGCCACATACATCTACTGTGGCAAGTTGAAGAGAATTTTCATCAATTTTGACAATTTGACCAGAACGCCTAAACACATAATATTTTTACTCCTATTGGTATTTAAGCTGAAATATAGGTTTATTTTACTATTAGGATCTAGATCAATAGTTGCACATTTCTGGTTATTTAGTGATTTCTATGTTATTAAAATTAATAAATATTATTAAAAACTAACCGCACTTTTTCTTGATCTTTTACGCCCGCAGAACTTTCCACCCCAGAATTAATATCCAAGCCTAAGCAATTTTGTTGAATGGCTTGTTCCACATTATTTGGTGAAATGCCGCCAGCTAAAATAATCTTGTGTTTAAGATTTTCAGGAATTAATGACCAATCAAAAGTTTTCCCCGTGCCACCTTGCTGGTTCGATGTTTGGCTATCAAAAATATAACGTTCTACATTTAAATTATCGGTAAAATCGACCGCACTTTGGGCTTCAGTATTGACCGAAATAGCTTTCCAAATTTGCGTGTTTTTTGGTAGTTGCTGGCGAAGTGCGGTAATAAATGCTTCAGTTTCTGCACCATGTAATTGCACCGCATAAAGCTGTAACTGGTTGGCTATTTTGACGATAAAGTCAATTTCTTGATTCTGAAAAACACCAACAAATCGAAGTGGCGCAGCGGTTACTAATTCTTGCGCTTGGCGTAAACTCACACAGCGTTTTGAATGTTCTGCGAAGATTAATCCGCCGTAGAGTGCGCCGTTTTCGTAAACGATTTTGACATCTTGCGCGCGCGTTAAACCGCATACTTTATTTTCTCCAAAAATTACCGAGCGAACCGCATTATTCAAATCTTGGTTGCCCATTAAGCTGCTCCCAATTAAGAAACCATGCGCCACTTTTTGTAATTGACGAATTTGCTTGTGATTGTAAATGCCTGATTCGCTAATAATACGTATATCAGCAGGAATACAGTCGGCGTATTTTTCAGTGAGTTCAACAACACGATTTAAATCCACAGTTAAATCGTGCAAGTTACGATTATTGACACCAATAATTTTCGCACCAAGTGCAAGAGCACGTTCAAATTCTTCTTCATTACTGGTTTCTGTCAATACGCCCATACCAAGAGAATGTGCAAGATCTGCCAGTACACGATAAGTTTCATCATTTACCACAGAAAGCATTAATAAAATCGCATCCGCTTGATAGTAACGAGCAAGGTAAACCTGATATTCGCTGATCATAAAATCTTTGCAAAGAACAGGTTGGCTCACGATATCTCGAACTAAAGGCAAGAACTCAAAATTCCCTTGGAAGTATTTTTCATCTGTCAGCACAGATACAGCAGAGGCATAATGTTTATACACATTGGCGATTTCTTCCAAATTAAATTCAGCACGAATTAATCCTTTGGAAGGGGAGGCTTTTTTACATTCCAAAATGTAAGCGGGCTTTTGATGTGTACCTTTTGCTAACGCCTCATAAAAAGAGCGGTCAGATTTTTGAATGTTTTGTTTAAACTGAGAAAGGGGAAATTCAGTTTCTTTTATTTTAACCCATTGCGTTTTATCTAAGACGATTTTTTGTAAAATTGTTGGTTTATTTTTTAAGTTTATCTTCATTTTTGATACCGATAGATTGTTCAATTATTTCCAAGGGATACGTTAAGTATCTTGCGATTACAGCTCCATATAAACCTGCAACAATTGCAAATAATATTGTTTTGTATTGTTCTTGTAAGGTTTGAATATTAATCAAGAACATCTGAATACAAAGAATAAATAAATACATTAAAAATAATACCAATCCTTTATCGGCTTTGTTTTGTAGCTTAAATGGTCTTTCTACGAATGGTATTAAGGCTAATGGAATAAATAAACAAATCACATTAAATAATATAATTAATTCAAATTTCATAACATCATCATTATTGTCA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CACATACCATTGTAAGAAATTAAATGCAGAGTAGTCTTTTTCTTCAAAGGTTTTACCTACTAATTCATTGATTTTACTGGTAATTAATTTTTCATGCTCATAGGTAGTTTCAATTATTTCTTTTAATGATTTATATTCATGTGCAGGTGCTTCAATTGCAGAAATTACAGCAAGTGAGCCAGTTTCATTTAAATAAGTAAATAATTTACGCATATGTTGCATTTCTTCAGCAGCATGAACTGATAAAAATTTTGCAGTGCCTTCAAAGCCTTGCTGATCGCACCAAGCACTCATTTGTAAATATAAATTAGAAGAATAAAACTCTAAATTCATTTGATCGTTTAATAGTTTTACTACATTTTCTGATAACATACTATTTTCTCCTATCTATCTATTCCAAAGTTGCGAGTTCACGATCAATAAAGAATAATCCTTTACCATCTTCGCCAACAAGATTAAATCTATCAATAATTCCACTAAATAATTTTTCTTCTTCATGCTGTTCTGCTACATACCACTGCAGGAAGTTAAAAGTAGAGTAGTCTTTGCTTTCAAAAGTAACTTCAACTAATTCATTGATTTTTGACGTGACTAATTTTTCATGTTCTAAAGTTATTTCAAAAACTTCTCTTAATGAAGAATAATCATGTTTAGGAGCATCAATTTTTCCTAAAATAGGCATACCACTAGTTTCACTTACATAATTAAACAGTTTTTGCATATGTTCTAATTCTTCATCAGCATGACGAAGTAAGAAGGTAGCAGCCCCCTCATAACCGTGTTTTGAACACCATGCACTCATTTGTAAATAAACATTAGAAGAGTAGAACTCTAAGTTAATTTGGTCGTTCAGCTTGTTTATGATTATTTGATTAAGCATAACTAATTCCTTTCCATTTTGATTGATAAAATGCAATAAAGCGTAATTTGCGACAATCATTTTAAATTCACAAATGATAATTGCAAGTTTTTTTATCAAAAATTTTGATATAACTAATTAATTTTAAAAAGAAAAATAAAAAACAATTATTATCATTTACATAATTCTATATAAATTAAATATGACGTTGTCACAATAAAACTAACAAATTTTAAATTAGTATTAGATATGTCTTTATTTTCCTCCTTAGATTTGGATGAAAATTTAGATTATCGAGTAAACATGAAAACTTACCAACTTTTATTAAACCTAAAGATCGTTATCAATTAATTGACAAATGTAATATCATTCTGCTAGAAAAACACGGTCAAATTTACCTGTACTTTTCTTATAACTACTTTCTTTTGATTATCCATTTAAAATTTTTCATATTGTCATCAAACTGTCACAATTATTTTCTACACTTCGCTACGCAATCTAAATAACACTCAAGGAGAATTTGTTATGTTTATGCATAAAATGAAAAAAAATCTTATTATCGTTTTAACCTTAGGTACGTTACCTTTTGCTCAAGCTAATAGCATCACTGGTGCTGGAGCGTCTTTCCCTTATCCAATTTATGCGAAGTGGGCATCTTTATATGAGAAAGAAACTGGGAATAAAGTTAATTATCAATCCATCGGTTCGGGCGGCGGACAACAGCAAATTATTGCAAAAACGGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGATCCGATGAAATCCGAATTATTACAACAACACCAACTAGTCCAATTCCCTGTGGTTATCGGTGGTATAGTGCCTGTTGTTAATTTGCCTGAAATTAAACCTGGTAAATTAAAGTTATCAGGTAAGCTGTTAGCAGAAATCTTCCTTGGTAAGATTAAAAAATGGAACGATCCTGACTTAGTTGCATTAAATCCAACGCTTCCTTTACCAAATAAAAACATTATTGTGATTCATCGTTCAGACGGCTCTGGAACAACATTTGGCTTCACTAATTATCTATCTAAAGTTTCGAACGATTGGAAAAATCAAGTTGGTGAAGGTAAATCAGTGAAGTGGTTAACAGGTCAAGGTGGAAAGGGGAATGAGGGAATTGCTTCTTATGTTCGCCAAATGAAATACACCATTGGTTATGTAGAGTATGCCTATGCTAAACAAAATCAGCTTGCTTGGATTTCATTACAAAATCAAGCAGGGCAATTTGTACAGCCTTCTAATGAAAGTTTCATGGCAGCTGCAAGTCACGCAAAATGGCACGAAAAGGCGGGAATGGGTGTTATATTAACCAATGAAACGGGGGAAAAATCTTGGCCAATTACGGCAGCGAGTTTTATTTTATTAAATAAATATTCTGACAATCCTGAAACAACTAAAAATGTATTAGCCTTTTTTGATTGGGCATTCTCAAGAGGGCAAGATGCGGCAACTGAATTAGATTATGTGCCAATTCCAGCTGATGTGGTATCTACCATTAAAAGTCAATGGAAAACAGAGCTAAAACAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020011|1540710:1553113|1545372_1545690_-|AVJ05611.1|DBSCAN-SWA MKFELIILFNVICLFIPLALIPFVERPFKLQNKADKGLVLFLMYLFILCIQMFLINIQTLQEQYKTILFAIVAGLYGAVIARYLTYPLEIIEQSIGIKNEDKLKK >CP020011|1540710:1553113|1550583_1551081_-|AVJ05618.1|DBSCAN-SWA MLSENVVKLLNDQMNLEFYSSNLYLQMSAWCDQQGFEGTAKFLSVHAAEEMQHMRKLFTYLNETGSLAVISAIEAPAHEYKSLKEIIETTYEHEKLITSKINELVGKTFEEKDYSAFNFLQWYVEEQHEEEKLFSSILDKLNFLGEDGKGLFLIDKDLGNLSTKA >CP020011|1540710:1553113|1551100_1551511_-|AVJ05619.1|DBSCAN-SWA MSAWCSKHGYEGAATFLLRHADEELEHMQKLFNYVSETSGMPILGKIDAPKHDYSSLREVFEITLEHEKLVTSKINELVEVTFESKDYSTFNFLQWYVAEQHEEEKLFSGIIDRFNLVGEDGKGLFFIDRELATLE >CP020011|1540710:1553113|1543976_1545395_-|AVJ05610.1|DBSCAN-SWA MKINLKNKPTILQKIVLDKTQWVKIKETEFPLSQFKQNIQKSDRSFYEALAKGTHQKPAYILECKKASPSKGLIRAEFNLEEIANVYKHYASAVSVLTDEKYFQGNFEFLPLVRDIVSQPVLCKDFMISEYQVYLARYYQADAILLMLSVVNDETYRVLADLAHSLGMGVLTETSNEEEFERALALGAKIIGVNNRNLHDLTVDLNRVVELTEKYADCIPADIRIISESGIYNHKQIRQLQKVAHGFLIGSSLMGNQDLNNAVRSVIFGENKVCGLTRAQDVKIVYENGALYGGLIFAEHSKRCVSLRQAQELVTAAPLRFVGVFQNQEIDFIVKIANQLQLYAVQLHGAETEAFITALRQQLPKNTQIWKAISVNTEAQSAVDFTDNLNVERYIFDSQTSNQQGGTGKTFDWSLIPENLKHKIILAGGISPNNVEQAIQQNCLGLDINSGVESSAGVKDQEKVRLVFNNIY >CP020011|1540710:1553113|1547331_1547913_-|AVJ05614.1|DBSCAN-SWA MANILFLDNFDSFTYNLVDQFRVLGHNVTIYRNDCDLEKLVETALNTADTILALSPGPGTPSEAGILLPLIERLKNQVPIIGICLGHQALIQAFGGKVVHAGEVLHGKVSRICHDNEAMFKDLANPMPVARYHSLMGQNLPQEFIVNAEYNGIIMAIRHRDLPICAFQFHPESILTVQGSQLLQQSIEWLLNR >CP020011|1540710:1553113|1540710_1543557_+|AVJ05608.1|tRNA|DBSCAN-SWA MADRFNPSAVEQALYQHWEESGYFKPSGNENAPSYCIAIPPPNVTGSLHMGHAFQQTLMDTLIRFNRMEGHNTLWQAGTDHAGIATQMVVERKIGAEEGKTRHDYGREAFINKIWDWKAYSGGTISQQMRRLGNSIDWERERFTMDDGLSNAVKEVFVRLHEEGLIYRGKRLVNWDPKLHTAISDLEVENKESKGSLWHFRYPLANGAKTADGKDYLVVATTRPETMLGDTAVAVHPEDERYQSLIGKTVVLPLANREIPIIADEYVDREFGTGVVKITPAHDFNDYEVGKRHGLPMVNVLTLNADIRDEAEIIGTDGKPLAGYEATIPADYRGLERFAARKKIVADFESLGLLDEIKPHDLKVPYGDRGGVPIEPMLTDQWYVSVKPLADVAIKAVEDCEIQFVPKQYENLYFSWMRDIQDWCISRQLWWGHRIPAWYDTEGNVYVARNETEVRSKYNLDFAVELKQDEDVLDTWFSSGLWTFSTLGWPEQTKELKMFHPTDVLITGFDIIFFWVARMIMFTMHFVKDENGKPQVPFKTVYVTGLIRDEQGQKMSKSKGNVLDPIDMIDGISLDDLLEKRTGNMMQPQLAEKIAKATRKEFADGIAAHGTDALRFTLAALASNGRDINWDMKRLEGYRNFCNKLWNASRFVLTNDKLDLSEGEIEFSLADRWIQSEFNRTVETFRNSLSQYRFDLCANAIYEFTWNQFCDWYLELTKPVFANGNAAQIRAASQTLVHVLEKLLRLAHPLIPFITEEIWQKVKGFVGITADSIMLQPFPQVEENGFDPEAEAEIEWLKEVIVAVRNIRAESNIAPSKGLDLLFRNLSTENAKILEKQTALLKAMAKLDNVQVLAVNETAPLAVAKLVGNAELLVPMAGFINKEAELARLTKEIEKYQNEVKRIENKLSNEAFVAKAPEAVIAKEREKQAEYQSGLEKIQEQYKAIEAL >CP020011|1540710:1553113|1550401_1550524_+|AVJ05617.1|DBSCAN-SWA MVGWLVGWLVGWFISINPFHFYNTLINSKYAIENILENLE >CP020011|1540710:1553113|1543588_1543861_-|AVJ05609.1|DBSCAN-SWA MFRRSGQIVKIDENSLQLATVDVCGVQREVNISLICTRNPADLLGKWVLVHVGFAMSVIDEDEAKKTQEALITMSQLEHEVGDFLGLNQK >CP020011|1540710:1553113|1552093_1553113_+|AVJ05620.1|DBSCAN-SWA MFMHKMKKNLIIVLTLGTLPFAQANSITGAGASFPYPIYAKWASLYEKETGNKVNYQSIGSGGGQQQIIAKTVDFGASDDPMKSELLQQHQLVQFPVVIGGIVPVVNLPEIKPGKLKLSGKLLAEIFLGKIKKWNDPDLVALNPTLPLPNKNIIVIHRSDGSGTTFGFTNYLSKVSNDWKNQVGEGKSVKWLTGQGGKGNEGIASYVRQMKYTIGYVEYAYAKQNQLAWISLQNQAGQFVQPSNESFMAAASHAKWHEKAGMGVILTNETGEKSWPITAASFILLNKYSDNPETTKNVLAFFDWAFSRGQDAATELDYVPIPADVVSTIKSQWKTELKQ >CP020011|1540710:1553113|1546896_1547283_-|AVJ05613.1|DBSCAN-SWA MITVFGFKSKLEPRREQLAEVIYNSLHLGLDIPKGKHAIRFLCLEKDDFYYPFDRSDDYTVIEINLMAGRMEGTKKRLIKMLFSELEYKLGIRAHDVEITIKEQPAHCWGFRGMTGDEARDLDYDIYV >CP020011|1540710:1553113|1549586_1550381_-|AVJ05616.1|DBSCAN-SWA MTSTIGRPELTLAIKSVQNQTYLCKHYVFVDGNIFWDKAKSILEQFSDVIPIYLPMNTGKNGILNGAINAAAFLVEEDIICYLDDDNQLREDHVESLVNVIEQGADFAYSLRSFYDSNHQFICHDDFESLGNWNTKSDIFVDVKIKDIQQQLHFTFNEINGHIDTNCYAVPREIAQKTAYSWNTPLIGDRSFLSALKSLGLIGQTSGKYTVKYRADFNKLIAVRRVFPQLSLSDEDNNNISAKILEVINQQNIEYYGGRPWAKE >CP020011|1540710:1553113|1547925_1549482_-|AVJ05615.1|DBSCAN-SWA MNIQAQAFIAVTAQPIPYYADTTAIFNTLCQPNSNSLLLDSAEIGSKNSLQSLILVNSAVKITCLGHNVTFKALNENGKQVLKEIYPKLTALGKISAVNFEDEFSVQFSPLDNQLDEDSKLQSATIFDGLRVISTLYQHSQTPIFLGGLFAYDLVANFIPMDGITLQHDGINCPDYSFYLAEHLITIDHQNQQATLKSFCFAQEEQVNIAKTSLSIAQKLKNIDNVLSIKAASDEVKTNFDDPEFTGIVKALKHHINIGDVFQIVPSRRFSLACPNTLASYAQLKQNNPSPYMFYMNDEDFILFGASPESALKYEPENRQLEIYPIAGSRPRGFDAHGNIDPELDARLELELRLDHKEQAEHLMLVDLARNDIARVCQSGTRKVAELMQVDRYSHIMHLVSRVVGKLRPELDALHAYQACMNMGTLTGAPKIKAMQLIYQFEQQKRHSYGGAVGYLTSDGHFDTCIVIRSAFVQNGIAHVQAGCGEVLDSDPQMEADETRHKAAAVLKAIRQVNTQAK >CP020011|1540710:1553113|1545842_1546844_-|AVJ05612.1|DBSCAN-SWA MQHEQLLEQLYNGQTLNKAESAVIFNSIMQGELNNEQIAAMLIALKVRGVSIDELSGAVSASLQNAKAFPYPDYPFADIVGTGGDGQNTINISTASAIVAASMGAKVAKHGNRSVSSKSGASDVLTALGVNVNATPEQARQALDEIGVCFLFAQQYHSGFRHVAPVRAALKTRTIFNILGPLINPARPTYHLLGVYAPELVKTYAETAVALEHQYSFVVHGSGLDEVALHGETQVAEIKNGKIEYFTLTPEDFGLKNQSLESLRGGEPQENAQMLTALLQGKGKAEHANAVAANTALLLKLFGHDDLKQNVQNVLVHLASGKVFETLQKLTIY |
13 | Acinetobacter_phage(42.86%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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