Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021325 | Listeria monocytogenes strain NH1 chromosome, complete genome | 2 crisprs | DinG,cas3,WYL,casR,DEDDh,csa3 | 0 | 1 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021325_2 | 536868-537156 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP021325_2
|
4 spacers
spacers of CP021325_2
>2.1|536897|36|CP021325|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGATAAAAAAGATATTAGTAATTTATTTGCAATTTA >2.2|536962|36|CP021325|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTCTCTTTTGTGTAAAGCACATCAAGCATGTAGC >2.3|537027|35|CP021325|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGATTTTTGTCAAAGGGACAGCGATGGGTTACAA >2.4|537091|37|CP021325|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACCACCAAAGTCCCTACACTCAATACCACCAAAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP021325_2
The CRISPR arrays of CP021325_2 >merge|CP021325|2|536868-537156|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATCGATAAAAAAGATATTAGTAATTTATTTGCAATTTAGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATTGCTCTCTTTTGTGTAAAGCACATCAAGCATGTAGCGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATGCGATTTTTGTCAAAGGGACAGCGATGGGTTACAAGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATTTACCACCAAAGTCCCTACACTCAATACCACCAAAGCGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATATAAAT >CP021325|2|1|536868-537156|PILER-CR GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT CGATAAAAAAGATATTAGTAATTTATTTGCAATTTA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TGCTCTCTTTTGTGTAAAGCACATCAAGCATGTAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT GCGATTTTTGTCAAAGGGACAGCGATGGGTTACAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTACCACCAAAGTCCCTACACTCAATACCACCAAAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATATAAAT >CP021325|2|2|536868-537156|CRISPRCasFinder GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT CGATAAAAAAGATATTAGTAATTTATTTGCAATTTA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TGCTCTCTTTTGTGTAAAGCACATCAAGCATGTAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT GCGATTTTTGTCAAAGGGACAGCGATGGGTTACAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTACCACCAAAGTCCCTACACTCAATACCACCAAAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATATAAAT >CP021325|2|1|536868-537156|CRT GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT CGATAAAAAAGATATTAGTAATTTATTTGCAATTTA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TGCTCTCTTTTGTGTAAAGCACATCAAGCATGTAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT GCGATTTTTGTCAAAGGGACAGCGATGGGTTACAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTACCACCAAAGTCCCTACACTCAATACCACCAAAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATATAAAT
>CP021325.1|AVK44063.1|535694_536630_+|ribose-phosphate-pyrophosphokinase-2 MAGKMKLFSVTSERPLATKIADYLDIPLCEVELQKFSDGEVKINIEESIRGTNAYVVQSMNSNVNERLMELLIMVDALKRASVHSINIIMPYYGYARQDRKARSREPITAKLMANLIQRAGANRLITVDLHAAQIQGFFNIPIDHLSAIPLIGDYLIENYGEKDVVVVAPDHSGVVRARRIADRLNAPIAILNRKPRPHEDEIMSVIGDVKGKVAIVVDDIIDTGVRATTSADILLEKGAVEVIACATHSVMAGNATERLQNSNIKEVITSDSIDLPEDKQFDKLTTISIGRILGRAIEGVQENRSLHPLF >CP021325.1|AVK44062.1|534283_535555_+|PTS-galactitol-transporter-subunit-IIC MDIILDFFKYIIGLGVTVMMPIIITILGVIFRKKISVAFKAGLTVGVGFVGLGVITSLMLTTITPVTKALVENYNFKLTATDIGWGVGSSLAWGTEVVPFVFVAIIATNILMIAFKWTKTMDVDIWNYWQPLFIASALYLTTGSMIIAVLSSIINMAIIFKIADWTQKDVEDVLGLEGISLPQIQTTGWALVGYPMNWLLGKIPGVRKINWSTEKVQSRLGIFGEPMLMGLIIGGGLAAIAQMPLSQVLQTGVTIAASLVLIPRMVSLLMDGLTVISEAAHEFMEKRFPGRELFIGLDSAVGIGHPFVLSLGLLMIPITLILAFILPGNKVLPLADLTALPFYMIFAIVPSKGNLFRGIFTGIVIVIITLYLSGAAAPLMTELAGQIGYNIPKDAVEVTSLAVGTQWYTWIVYYGLHWFGGIL >CP021325.1|AVK44061.1|533975_534269_+|PTS-galactitol-transporter-subunit-IIB MKKKRIYVCCGTGIATSTVISKKVRAVLDEKRIPYEISQCTVQEVASKVSTSKPDIIVSSTTVTGDVGDVPVVIGRSFLTGLKKQETIDEILAILQD >CP021325.1|AVK44060.1|532913_533960_+|galactitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKALKLYGKRDLRYEEADMPTIEEPDDVILKVKTVGICGSDISRYSKLGPYVPGMVWGHEFSGEVIEVGSEVTDIEIGDRAAGCPALYCGECEYCKKGEFARCRKLTVIGARHPGAYAEYIKLPAENVVKIPNELDYEAAALVEPSAVVVHGFYHTKLQAGDDVVVVGSGNIGLLAIQWAKVFGARRVIAIDVDDKKLALAKEVGADVVINSLKEDPLEVVAAHTDGLNADLVVEAAGSPITSAQVFAYAKKGGGVVFLGIPYADVTIERFYFEKIVRSELTVWGSWNAISAPFPGKEWQTTIHFLANKQINIEPMITHRLSLAEGPEVFERIYERNEFFGKVLFFPE >CP021325.1|AVK44059.1|532266_532917_+|ribulose-phosphate-3-epimerase MAKIVPSVFGADIGRINEQLQVLEKNDIDLLHVDMMDGSFVPNIAFGPDQIKMMKKGTKLQFDVHMMVYEPDRYIPRLVEAGAHMITVHQEATTHLHRTIQLIKSYGVRAGVVLNPGTPPSTLEYVLDDIDCILLMTVNPGLGGQKFFQSSLEKIRKTKAYIGNRPIQIEVDGGVNDELAKECTLAGADLIVVGSYLFEGDIEANLEKLAKGVLTE >CP021325.1|AVK44058.1|531857_532256_+|hypothetical-protein MGSFFASFVDWLIGSPGRFVVNLIEDNMLIFMVVVMIYATTILYAKWTLAYYLPKKMSQLAEMKTWELDELYAAWQTEKKALPWYILVPSRNEFWVKSARNAPESTKLLHFSQQKLKLSDKEKLQKIIEIQS >CP021325.1|AVK44057.1|531373_531841_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MDVLEYFKEEMVRFSNEQNKEKLLAEMAEQLCEVGAVKPSYKDAVIKREKVFPTGLLTAHAGVAIPHTDSEHVIRPVVAVRILKKPVSFIEMASDNEAIDVRIVFMMALRSADEQLDMLQTLIQLIQDEEVMTTLLKAQETGDVLSAIEHFSKNN >CP021325.1|AVK44056.1|530743_531346_+|phosphosugar-isomerase MDKQAILNNIHQTWQEEANAISRLPEVTSEEALVKTVEKIAECTGKIVVAGCGTSGVAAKKLVHSFNCIERPAVFLTPSDAVHGTLGVLQKEDILILISKGGNTGELLNLIPACKTKGSTLIGVTENPDSVIAKEADIFFPVSVSKEPDPFNMLATASTMAVIASFDAVIVCLMTYMNYTKEQFSVIHPGGAVGNKLLNK >CP021325.1|AVK44055.1|528679_530740_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MYLDNRSKTLFQEVIKNPNITNKQLEVKYKLSRYQISYSFQKVNEWLKWKNYPEVKRSKNGRFILEPELTALFSEKETRDPSVEYLPSENERANLILLMLLTSKEELSLAHFTTKIQVSKNTILRDLKVAQKLLPKETTVTYSRASGYQLAGSEWELRKVLTQVVSSVKEMFRGEHYFLSYSGIEKVQLMEIRRTLEEAEAMMQIKFTYEQIELLPYLLSVMFLRIRDRRLIDTAFHIDEKSLSDTREYHITDILLEKTGPVPEQERLFITLQLLTTNIFSGEILTEKLTEDLEKVVLTCLDLFEKKALVSLKNKHILIEKLLLHLKPAYYRIKYQMNLEDTLYEKFNQEFEALNFIVKEAFDPLAKFIGREIPAGEIFFISLFIGSDMIPQNDIYHKQKRAIVLCPSGVTFSKIMENILVKLFPEIHFYPTISVREYAFFKAEVDIVFSSIPLKDGENVFVVQPFMNDIEKTQLRQHVLQNLFGMGNQLTSIDKIMEVVERNADIKDPNAIRDGIIDILSANIATDENKRVKKVYLHDLITEDNIMICEDVKNYQEAIRLASQPLLLQQAITANYVKTMIDNHKFHDPYIIIGEDIAIPHAMPNAGVNRLAMSLLVVKNGVYFSETEQVHFVIVIAPVDKEQHIEALYQIVHLAENHQILDDLLENVTKEKIMQTINQLVIREDE >CP021325.1|AVK44054.1|527920_528571_+|transaldolase MHLDSANLDDVKKIQASSIFKGITTNPTILVKEKCNRQTAINRILELTDKQVFVQTVGFTYEEILADARMLLTMFGKDKIAIKIPAHEAGTNVIDTLKKEDKTIQILGTAIYSADQAITAALAGADFVAPYVNRMSAANIDPFKEITQMRHFFDKKALKTQIMAASFKHSGQVMQAYESGADTVTIPYEIYSQMTNKVLAVEAIRVFNEDAVLYEK >CP021325.1|AVK44064.1|537415_537994_+|hypothetical-protein MKKILVPILLLATILASCSSPNEKITKDTKISKTITIRADYKVPKDIKELEDDSANIVKVKFLQNKTIGKDGSTISEIEILTSYKGNLEKGSKVDISEPWYLSDGKYVAVENYIALDKEQEYTIFLGEKDKDTYPLSSLGYGKFGGSLKEDQAVLADFNILGEVQKFDFISENTEEVKNYQLIKEQVAGKYK >CP021325.1|AVK44065.1|538101_538782_+|GMP-synthase MIIDVLQHVPHEGPGLIANWARENQHQLKIHSLFEENAHVPNDSDFLIVLGGPMGINDTAEFPWLKDERKLIKRLSEQHKPVFGVCLGAQQIAATFGSEITVNKEKEVGWFPVKRTSDKLLFFPKSLNVFHWHQDTFALPTGSTRLFASEGCLNQAFLYGENIIGLQFHFEMEKAGIETILRIDEAFITPGKYVQSVEVMREKDVPEDNKQMLEAILDYLINPKTI >CP021325.1|AVK44066.1|538806_539166_-|hypothetical-protein MEQILFIQTGFGVDVHGQNITKAAERAVRNAIFTNSMPGIQGLLPDGDLQNMVVNIKLALPCDADQLDEDTIRAIIPYGTVTIEKMAGGMMTTSGIFLEDKEDKNDLMYIVNASVETGY >CP021325.1|AVK44067.1|539172_539631_-|MarR-family-transcriptional-regulator MNNEQNMNQQIALFYFGYKAFTETADLIIAKHSLKRLHHRILFFTARMPGLTINELLTFLEISKQALHQPLAELKERELLTIEQGRRDKRQRCIFLTSAGKELENELGAAQRKQMSEIFTNSADTDGMHFTEVMEGYAKNRPGAAFIKDFKE >CP021325.1|AVK44068.1|540012_541830_+|cell-surface-protein MKKALKLFLATICMFIMIYPSTAAHAEETNIVNIPDANLKTYLNGLLKQASDAPITKTQMNTIQTVTLSGSTYTDLTGLEEAGNLVTLSLNNTNIQTLEPIKNQTSLTYLTVGGDNVKDSLFVDLNGLVNLQSLSINGSEVTHNVFKTFNKLPKLTYLYAQNSMKITDISALASLPALTTLFLQFDGIDDFRPLNDFESFKNGNLKALAAFGQNTGRTNPRITLKSGKLDYNETNQTLYLPFSMMPKPLTSFDGTVAPFSKSTSASNTYLGFNDVALPSSRLSITDDGITVSGVTKEEFDNLDEIEYNARYDFPTGSYPTPPSMTSYTISSGTYDQYFDISHTLDLTADESFDYNQYDTTSEEQFLKDVHAETDDGTAVKSDFDQVVKLDVPGEYTVTLNAENAAGLKATPVTVKVTVHEKPVITSDSQISYKKETTKSVDEFLKEIHGSVTGNAVLTSDFDKVVDLNTPGEYTVTLNAINDRGQKADPVTVVVTVTTSDSGHVDPVPPTPQEETDQTIIPEPQSETTEDSVKEDQAKDGQAKSEEKADKTSLTTKENKVEKSEKTNQPKTKALPQTGDTNKTALPIAGVMLSLAALLIFRKSKS >CP021325.1|AVK44069.1|541930_542362_+|universal-stress-protein MEKYHRILVAVDGSEPAKLAFEKGLELALKLDGVLGIASIVDLRAFSPNVSYDGSLEEKAELELKTSVNEYAEKARTAGVKQVETFVAKGNPKILLSTDIPAEFQADLIICGATGMNRVEKLVLGSVSSYIMAHAICDTLIAR >CP021325.1|AVK44070.1|542408_543839_-|capsule-biosynthesis-protein-CapA MKKLTYVIITGLVLVFIAGAFWITNSTNQSDQKATQTEPIKKISPANVKTISSEAKKTLNSLASSGADKASISDLKQLIKELKSYPTEKNDSGVYLQNLTACLEAVKSYTTGKADEKTLGKVYPAFLASEQKLSAIEKTNQYDWFYAAAATNQQGLKEKGVVTLTMVGDNSFGTYPETPEHLKFDNVFQKNNGNNTYVYKNCLPWFKSDDYTIINAESAFTNATKAENKMWRIKSDPAHVAFLPASGVDAANLANNHTMDYFQVGYDDTLKAFKENNIPVFNADAPLETTIKGMKTVLLGYDCRMSQQSPAYLERIVKDVKKYKKEDTLVIVNMHWGVEYRETPTDYQTQFGHAILDAGADIIMGSHPHRLESVEKYKDKYIVYSMGDFAFGADPTLLSRMTSMFQLRFTKEDNKIVLKDISIVPTYENSDGSTTENNYQPLPVFGDDAKKIVDELNRISKPIEGGVTEYTYFDPF >CP021325.1|AVK44071.1|543959_544775_-|histidine-phosphatase-family-protein MKKNIFKLLMALCAVLLIAGCGNSTSADKKETKETKEDGTVTFYVVRHGKTMLNTTDRVQGWSDAVLTPAGEEVVKSAGKGLKDVDFSAAYSSDSGRAIQTANLILKESDKSADKEVQTDPRFREFNFGSYEGDLNENMWTDIAKSQGKTLEEWQKAGLSPKDFANSVAALDKTRVKEGENWPAEDYATIQARLKEGLTDVAKKESKNGDSNVLLVSHGLSIGALLDTIEPGYKLPAEGIKNASVTKITYKDGKFTIGDVNDLSYVEKGSK >CP021325.1|AVK44072.1|545055_545424_-|hypothetical-protein MAILAFILTFIVMIEHIYIMILEMFFANTKLAAKTFGVEKELLANKKVQTLFANQGLYNGFLAAGLVWGLFFAGAGFAETVQIFFLSCVVVAALFGGATSSKGILVKQGLPAVLALVAVLLV >CP021325.1|AVK44073.1|545570_546986_+|lincomycin-resistance-protein-LmrB MQQEATGGQKIRPIPIIASFLMAGFIGLFSETALNMALSDLIQVFDISSATVQWLTTGYLLTLGILVPISGLLLQWFTTRGLFFTAVSFSIAGTLIAALSPTFAMLMIGRVVQAVGTALLLPLMFNTILLIFPEHKRGSAMGMIGLVIMFAPAVGPTISGLILENLTWNWIFWISLPFLIIALLFGMKFMQNVSVVTKPKIDILSIILSTLGFGGVVFAFSSAGESGWGSATVLVSIIVGGIALGLFVWRQLTMEKPLMDLKVFKYPMFTLGLILVFISFMMILSTMILLPLYLQNSLALAAFSAGLVLLPGGVLNGLMSPFTGRLFDAYGPRALVIPGFIVAVVALFFLTRIEVGTSALTIIVLHSVLMIGISMVMMPAQTNGLNQLPPKLYPDGTAIMNTLQQVSGAIGTAVAITIMSAGQKAYMETAQGVGPEQMVASLTAGIQNAFVFGLIMACIGLLCSLFIRKAK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021325_3 | 2837430-2837540 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP021325_3
|
1 spacers
spacers of CP021325_3
>3.1|2837464|43|CP021325|CRISPRCasFinder TGTACTTTATTTTGATTTAGTTCTTCAATATAAATCTGAGCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP021325_3
The CRISPR arrays of CP021325_3 >merge|CP021325|3|2837430-2837540|CRISPRCasFinder AGCGATGATTTAATCCTTCCCAGAACTTTCAAAATGTACTTTATTTTGATTTAGTTCTTCAATATAAATCTGAGCAAAGCGATGATTTAATCCTTCCCAGAACTTTCAAAA >CP021325|3|3|2837430-2837540|CRISPRCasFinder AGCGATGATTTAATCCTTCCCAGAACTTTCAAAA TGTACTTTATTTTGATTTAGTTCTTCAATATAAATCTGAGCAA AGCGATGATTTAATCCTTCCCAGAACTTTCAAAA
>CP021325.1|AVK46378.1|2835576_2837316_-|DNA-polymerase-III-subunit-gamma/tau MAYQALYRVFRPQSFQDVVGQEHVTKTLKNAIVQNKTSHAYLFSGPRGTGKTSAAKIFAKAINCEHGHDGEPCNECEICKGTTDGSIPDVLEIDAASNNGVEEIRDIREKVKYAPTVAKYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPKHVIFILATTEPHKLPLTIISRVQRFDFKRITTQDIIGRLKFILEEEKIPYDEKALMIVARAAEGGMRDALSLLDQVISYGSEEVTVEDALEITGSVAQNLLTKLVSAAFDGDAAEAISTLTALLAEGKDPVRLVEDLLVFFRDVLLYQKAPNLEETMERALIDDDFVALAKRADSLKVYEFVKILNTAQQQMRFSNHPGIYVEVALVQLTQAGQSVAGGGNVPADAASGSDVSDLKRQMEQMHQEIQTLKKQIASGAGAAPADKPTQNRGGSKKAINNGKQFKAPIGKINHVLGEAKKENLQLIRGCWGELLSMLMASQAALLNDAEPVAASQDTFVLKFKHEIHCQMAMDNPNFVETITSSIARLTQVNYTFIGIPEDQWADVRENFLHSHGSDADAEDGANPEAKKPAEDPFVAEAAKLVGEDLLEIKD >CP021325.1|AVK46377.1|2835229_2835547_-|YbaB/EbfC-family-nucleoid-associated-protein MRGMGNMQGMMKQMQKMQKEMAKAQADLEAQEFTGTAGGGMVTVKATGKRVITDVVINEEVVDPEDIEMLQDLVLAATNDVLKQIEDTTSQTMGKFTQGLNIPGM >CP021325.1|AVK46376.1|2834524_2835121_-|recombination-protein-RecR MHYPEPITKLIDSFMKLPGIGPKSAARLAFYVLDMKEDDVLDFAKALVDAKRNLSFCSVCGHITDKDPCYICADTSRDRSVICVVQESKDVIAMEKMRDFHGLYHVLHGTISPMDGIGPEDINIPDLLKRLQDDTIEEVILATNPNVEGEATAMYISRLLKPSGIKVTRIAHGLPVGGDLEYADEVTLSKAMEGRREV >CP021325.1|AVK46375.1|2834264_2834510_-|hypothetical-protein MESRSNKFGRKKNKKIGKLHKSYDAYLMELIEVTQENWHKQKVLMRKSFEYDPNLEYEEKKAEARYFYLFKEARTRQLKNK >CP021325.1|AVK46374.1|2833376_2834219_+|aldo/keto-reductase MTLSFSDTYRLNNGIEMPRHGFGVYKLTDEARMRTALETAVDVGYRLFDTASFYHNEKELGDFFASSGLKRDEFFVTTKMWNTEQGYDETLRAFEKSQKKLQLDQIDLYLVHWPKQDTFFDTWRAVEKLYDEGLVRAIGVSNFEAHHLDRLRTSANVLPVVDQLETHPHFPNHLLHRYLEELHIVHQAWSPLGRGGVLQEQILIDLAEKHGKSPAQIVLRWHLQNNISIIPKSETPSRIRENAAIYDFELSEADMRQVERLNTGERVSHAPDVMYVRSEI >CP021325.1|AVK46373.1|2832416_2833256_+|HAD-family-phosphatase MTTQAIILDIDGTLLNDDKQISPETKKALITAQENGVKLILASGRPTTGMHVYAEQLEMEKHHGLLVSYNGAKVVDCATNEELFNQALTVEEGKAVLEHMKQFEVKVMIDKEDYMYTNDVYDCYVPYRGEEINIIQYESRGGNFKLCEKDDLAAFLDYRLSKILTAGDPAYMQKNYQAMMAPFKDTLNCVFTADFYFEFTAQGIDKAKALDTVLTPMGIHAENVIAFGDGHNDITMVEYAGTGIAMQNAVPELKAAASSVTLSNNEDGIAHVLNSLIPS >CP021325.1|AVK46372.1|2831446_2832298_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MNILIKIRELTNLTNSEKELANYILANPKKTLQFKPKELATAAFVSAATIYRLINKLGLNGIGELKIEIASSLRETSEEKDLNYDYPILESDTPYQIMTNLHQIYKGTIDETLNNADPEELVKIGEKLIQAKTIDVYAASANLFFAQNFKFQMQEIGVLVNVPEEDYIQSLSAANSDENHIAIVVSYGGRSRTLQRVVKILSENNVDIILITSMQDNPLVEFATHKIYMASAENHYNKVSSFSTRQSLLSIFDTLYSIYFNQNYEKNIQYKTTNYQKMNTELE >CP021325.1|AVK46371.1|2830966_2831341_+|PTS-dependent-dihydroxyacetone-kinase-phosphotransferase-subunit-DhaM MAKPYGVVIISHSKDVAKGVHDIIKEIAPDVSITHAGGTEDGRIGTSFDAVNEAIENNEANKVYTFYDLGSAKMNIETVEEISEKEIILFNAPILEGAYATAAQVQMDEKPEVIAANLKTIEIK >CP021325.1|AVK46370.1|2830366_2830963_+|dihydroxyacetone-kinase-subunit-L MTYDKDWALRWLNDFGERVQENKQLLSDLDQAIGDGDHGINMARGLGELKKAFTEKEPADLKDVFKTAGMTMVSKVGGASGPLYGTAFLNMSKAVDADTIDAVGLTKVIEAGLEGIEKRGKSHAGEKTMIDVWEPVVHALHQEDLTDDVVDAALQKTKDLKATKGRASYLGERSIGHLDPGAYSSALLFHAMLQTEVS >CP021325.1|AVK46369.1|2829355_2830345_+|dihydroxyacetone-kinase-subunit-DhaK MKKILNGTDQVVEQMVEGLVKSHADVVHRVEGTRVIARNDKRPGKVGLVSGGGSGHEPAHAGYVGRGMLSAAVCGDVFTSPTPDQIYEGIKAADQGAGVLLIVKNYTGDVMNFEMAADLADADDIKVEQIVVDDDIAVEDSTFTTGRRGVAGTVLVHKIIGAAAEAGASLDELKALGEKVIASVKTLGVALSPCTVPEVGHPGFELGDDEIELGIGIHGEPGFTREKIMPSASLAKQLYERISNESKLLAGDKVVVLVNGMGATPLMEQYVFANDVHELLKNAGVQVEKTLVGDYMTSLEMAGLSLTILKLEDEKWVDMLKLPVDTIAW >CP021325.1|AVK46379.1|2837642_2838107_-|Soluble-KIT-ligand MNVTQKLYISQKECFDTLVSSAIYDVKNATGKTLQVRKLEGYKYQRTMSNGALATTKIVKVQPNELYQFETSSRVNTHTTTYTIKSTSETTCEVTYNELIETEKALNKMNNIIVGFMFGFFRKKRVKNLLKSIELSVINESKQKQEKLAAKSEQ >CP021325.1|AVK46380.1|2838124_2838307_-|DUF3188-domain-containing-protein MKIVNALFLISIGLIIIMFSPSYGKDGMASVPLLVTGLAVVLIGCVFIVLKIRKDKKEKN >CP021325.1|AVK46381.1|2838309_2838531_-|hypothetical-protein MIILNCPMKRDYITELLETYDKDGVTFKKIDEKGMKLTFETNIEDEEKAAKIAKETIKATEIGSVLYFQVSVG >CP021325.1|AVK46382.1|2838665_2840030_-|PTS-cellobiose-transporter-subunit-IIC MNGLTAFLEKYFVPVAAKIGSQKHLVALRDAFISTMPITMAGSIAVLLNAFFRDFPTDWGWTGFVEAMQPLIGINGYVYNGTLAIVSIIFAFSLGYNLSKAYEVDRLAGGLVSLAAFVMNLTVTVSLDAVKAAIAASNANFDVATLPKEFAGIYGFFSLSQVNGTGLFTAMIFGFISTIIYAKLMRRNIIIKMPDSVPPAVSKAFAAIIPALVALYVVGIIDWAFFKITNMDVITWISKTIQEPLLSLSQGYGAVLLVTFLVQLLWFFGIHGPNVLAPVLESLWGTAQLQNISAAQEGAKLPFEWVRGSFDAYVWMGGSGGTLVLIIALLMFSKRADARTVAKLSLAPGIFNINEPIMFGLPIVLNTIYLIPFLIAPMVMVTIAYFATTLGIVGPVKIAVVWVMPPLLNSFLATGGDWMAPVISLINMVVAFLIWVPFVITANRVGVPEEEMKA >CP021325.1|AVK46383.1|2840471_2840627_+|hypothetical-protein MAVKRDMPEESKNSKVVKKEHFSIVFPDDIKEPATVEEKKKQDAEKKTDDN >CP021325.1|AVK46384.1|2841198_2841840_-|hypothetical-protein MQQLKSKKKWLPALIVAVFVGIIVILAIMFGFFQRQEVFDKYEVAYEIDGKLYEVFPISATDIGVDKKSKDKNLYFRVNSYYNIDYLFRLAYKQYEINEPSTNKYYSGLIDYSVADNAYVTQKDVYITNNESYATYDFFDKNGKKIYTYNPEETSNDDYIVRIKPTILQGYEKSDIGSYDDYLNITALFKDKLGMDVNVRIDEDKEMVIFSIK >CP021325.1|AVK46385.1|2842537_2844052_-|gluconate-kinase MTSKPYIMGVDIGTSSTKAVLFNQRGEVIFRQATHYELITDETGKAEESPTEIFDAVLTSIQAVMKNINTEELAGISFSSAMHSLIMVGSNGELLTECITWADGRSSETLEKVKRDNYLFQLYEATGTPIHPMSPFAKICWLKEEKPTLFKRTEKFVDIKSYILYRLFGVWVMDESLASGTGLYNIMEHDWEFEAMEIVKLTPDFLPKVVPETYQLAGVKKEYAELMGIPENLPFIIGGSDGALANIGIQATGQNDVTITVGTSGAVRKLTDQFQIDSRGRTFCYGAGDGYFIAGGAVNNGGKVVEWGLQQFGSEAEISRRDFASFIAKIEEVPPGAAGLLFQPYLLGERAPFWTNDIRGGFVGLTINHTKAHFIRAILEGVAFNLAEVYEAVSAPDDIIYVTGGISAHDAWCKLLADILNREIRVPHTIEGSSLGAAIIGMRSLGILKDLNLKHTLPIKAVYHPSENVLKYAELRLIFKQVTTQLMSSYSQLNSWQKKFDINS >CP021325.1|AVK46386.1|2844167_2845106_-|hypothetical-protein MKKLLSGLIVVLMVSLLGHSFNAEAASYEKIIYDKAVNLKGVVNQSKRNDGINSKMYKTSSSVKYLGSAKKYDKKTLIITREGKTARAKWYYCKLGNTTIGWIDSRAFTNIGKPTIADAVPALWNSKKAIITTKPKSTTATTYFFQKNSAGNWYEVRHFTSHIGKWGFDPKFSEKSSGTPVGVYRTGIAFGQKGNPGTKLTFRAITNRSYWISNSNDKAYNTWQERNSSSSADEKMKIPQYKYGMEVKYNAKRVKGKGSAVFYHVDSPKYNYTLGCVAQSEANTKEVLKFADKNTLIVLGEESRIKTFYGIN >CP021325.1|AVK46387.1|2845148_2846096_-|cell-surface-protein MKKFHGLILTALVTCLIIPFSLAASAETNENGNNSTPTEEKTTDTTENIITEEKTEPAEPTKDTTVTPPQKSKVQTTIDITDSQEVYSYEQNSKIDLKDFTATLTDYTDTKLTNYRLAANSKLSTAQTGIQEVTLLGDNEDGKTTAVKLNYLVKEKTAQLTITDMNFDLETKIFTGKTKPFASVYMSSPADENFGEGTTTADKDGYFYAEWATTPKQITAYAFDESGNYSEEVTYQVPAKKQNEAVVTAPDKVKKIETKNAVKSATTKPTDVTKVTKDDKTDLPSTGDKGTEWIFVVAGVIVILVAVLLLRKRKK >CP021325.1|AVK46388.1|2846236_2847976_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MRKSSWIIPYIKENRGLFLLVIFLGTLTFASAGALMFTSGHLISKSSLMPESIMAVYISTVGVRAFGIMRSVSRYVERLSSHSLVLRILEKMRVRLYRLLEPQALLLKSRYKTGDILGLLAGDIEHLQNFYLTTMLPAIVSLVLYAGVVIALGAFSIPFAALFVLLIGLLVLVLPWVSLLYARGKNAYLKQGRNSLYQKFTDAVFGISDWKFSGREKTFISNYEKDEADMLRTENKQFHFVNWRDFFSQLVVGFMVIVMVYWSTAESRDGAFSGTLIAAFVLAIMALAEAFVPVSSAISDKSLYQDSLARLDKIEDPALPTFEEETKEIERINTENVVLKAENLTFAYNEKSPEILNGFDFTLQQGEKVAIIGRSGTGKSTFLKLVQGALLPTAGKVTMNDVEVEKLRPQIPELTSMLNQKAHLFSTTVLNNIRLGNQDASDEEVYEAAKKVQLHDFIMSMPDGYHTQMSEMGERFSGGERGRIALARILLQNTPIVILDEPTVGLDPITERDLLATIFETLADKSLIWVTHHLVGAEKMDRVLFLEEGKTLMEGPHAELMAEEPRYKRLYQLDRPIEL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP021325_2 | 2.3|537027|35|CP021325|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 537027-537061 | 35 | MH341453 | Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome | 10139-10173 | 1 | 0.971 |
CP021325_2 | 2.3|537027|35|CP021325|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 537027-537061 | 35 | NC_009813 | Listeria phage B054, complete genome | 10139-10173 | 2 | 0.943 |
1. spacer 2.3|537027|35|CP021325|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH341453 (Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcgatttttgtcaaagggacagcgatgggttacaa CRISPR spacer gcgatttttgtcaaaggaacagcgatgggttacaa Protospacer *****************.*****************
2. spacer 2.3|537027|35|CP021325|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009813 (Listeria phage B054, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
gcgatttttgtcaaagggacagcgatgggttacaa CRISPR spacer gcgatttttgtcaaaggaacggcgatgggttacaa Protospacer *****************.**.**************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
120423 : 126948
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP021325|120423:126948|DBSCAN-SWA TTCAAAACTTCTTGTAAACATCAATGGAATTGCCAAAATTAATGAAATATCCACCATAATCATACATTGGACCATATTTTTCCGCGTAATGAGAAACTGTATGGCGCAAAAATTCTTCTGTTACCTCTAAAAACTCCGCTACTTCAAAATATTCTCGTAAGCCTAGATAAAAACAAGCAATGATGTCATCAAGCGGTATTAGTTCCTCATAACCTTTGCGACGAGCGAAAATTTCTTGTTTTTTATCCATGATTGTTTCCTGTTTGGTGATATTACCTACAGTGTATTTGTAATGCATCAATTCTTCTACTAAAACACAGCCTTTTTCAATGGAAGATTGATCCTTACTAATAAAAATCATCCCATTTAAATAAAGTCCCGGAAGTTTGTAAGGCATTTTCTCTTCTCTGATTGTTACCTCATCTTGGTATTTATTTACCAATTTTTCGTACAATAAAATCACATCCCGCGATGGAGTTTTTTCTTCATCTCTATATAAGCTAAAATATCCCGCATTTCTTCCTCGGTTACGTCATCATCAATATGGGCTGCAATTGTTACCAAGCGTTCATCAACAGGGGGTAAATTTCTTTCAGGAAAAAAGTCATCTAATCGTTTGTTGAAGATTTTTGCAAGTTCAAATAAAACATCTTGATTTGCTTTTCGATCGCCATTTTCATAACGGCTAATAGTTTGGCGAGTTGTATGAAGCTTTTCTGCTAATGCTTCTTGATTTAAGCCTCGTTCCTCGCGATATTGTTTTATTTTATTTCCTACAAATTTATTTAGCTCCATAATAATTGTCCTCCATATGTTTATGGCTTCAGTATAGCACTTTTAGCACCAAAACGGAACTTTTTCGAACATATTTGTCGGATAAAGTTTACCAGTAACCAAAATGGTGCTATAATATTTGTAGAGCTAGAAAATAAATGTGGCTGATTTTGTACCGATAGCACCAAATTGGTGACAAAACTACTATATTAATTTATGAGATGGAAGTGGGAATGGATGGATAGAAAACTTTTAAAAGAAAAGCAAATCCAACTAATTTTTCAACTAGAACAAGAAGAAAATCGATTTATTCGAAAGCGTTTGATAGAAGAGTTGGAGTTTTTTGAAGCACTTGGGGATAGGGAAAAAGGACTTCTAACGGCGGAGCAAAAGTTGCTTATTTTAACACCTAGTGAGTACCGAGAATACAAAAGAACCAAATCAGATGTGCAAATTAGTAGGATAATTGGAGTATCGAGATCGTCACTTGCAGAATGGAAACGAAAAAAAGGTTTAAATAGAAAAAAGTCGCAACCGGTTCAGCAGGAAATGATTGATGTATTAGCTTTTCATTTAGATAAAACAAAAGAAGAAATTGGCGCTTTACCTGCTTCGGCGATTGAATGTCAGTATGAGGCTTTTGTGATTAATGAAGCCAATAATTAAGGAGTGATAAAATGCAGGTTTTAGTTTTACCAGAAAATAAGGATATCAATTATATAAAAACGGTCCAAGAAGTAAAACGATTTTTTGCGGATTTTGAGCGGTTTCGGATGATTACGGGGTTATCAAAAAAGCCACATTTACTTAGAAATGGTTTTCTGGAAGAGCCGCAGTTTGAGCCGGTAGCATTTTCTGCTAGACATAATAAAGAAGTCATTTTGGAAGCGCGATGGTTGGTAGAGAAATATACTGAAATGTTGAATCAGATGGATGATTTATATCGAACTATTTTGATGGAATGTTACGTGGAACGAAAACAAGATGTGGCGGTAATGATGGATTTACCGTATGAAATTGCCCAGTTTAAACGGATAAAAAAACGGGCAGTGCTAGAACTTGCAACGCTAATGGGGATTTTAGTAAGGAAATGATGATACTTTCGTGATATTTTGAAACATCATTTTCCTATTAATATAGAAGTAAGCTAATTGTCCAGTAAGCGGATGACAATAAAAGCTGCATCAGAATGAAGGTGCACCGATTTTCTGATAATACATGATGTTTTACAAGGAATTTGTTTTTATGATTGGATTTAAATCCGTTGAGATAAACAAATATTCTATTTTGGAAAGTAAAGTTCGGAGGAATAAATTATTAAATGTGGTCTTGACCGAACTTTGCTTTCTGTTTTAAAGGAGTGAACGTTTGGTGAAGAGTTTGAGCTTCATGAGAGTTTTGGAAGCAGTGAGAACAATGCTCCAGGAAAAAGGCGGACTAGATATTTCTATTGTAATGCGTGACCAAGTGGAAATGCCTACAACGATGATCGAGATGATTGATCAAGAGGAAGAAGAAAGCCAAACTGCCTGGAAAGAAAAATACCGTTTTGCAATCCATCATTATACAAATGAAACGGACTTAGCGGGAGTCGAAAAGATAGATACGCTTATCCAAACAGGATTCACTTTGCCTGAAGGATACAAATTAATCGCTGTTCGACATTACGGAAAACAAAATTTAGTCAAAGAAAATACGTTAATTCACGCAAAAACCAGTTTTGAAGTAAGTATTTGTCGTGAATTAAAAGTAAAAATTTAGGGGGAAATATTAATGGCATTTGAAGAGAATTTATATTGTGATTATACACCGGGAGCTGCTAAAGCGGTCGCGGGGAAAGATGTAATTTTAGCAGTTTTTAACGCAGCGGGGGACAAACTATTAGCGGTTGCGGGCCAACAAGGTCTAACTGTAAACCGTTCTAAAGATAGCATTGAAATTACATCTAAAGATACAGTTGGCGGATGGAAATCCAAAATTGGCGGTATGAAAGAATGGTCAATTGAAAATGACGGATTATATGTCGCTGATGCAGAGTCTCACAAAGAATTGGCGAAATATTTCGAAAGTGATAGCCCGGTTTGTGTGAAAATCATTAATCAAGCATCTAAAAAAGGTCTTTTCGGTGGTTTGGCAATTGTAGCTGACTATAGTTTTGAAGCACCTTTTGACGAAGCGATGACTTACTCTGTAAAACTAGACGGAATGGGCGCGCTTGTTGATTTAACGATTACTGAGGGCGGCGACCAAATGCCCGGCGAAACACCTGTAGCACCAGCAGAATAAAATAGAAAGCCACTGAAATAAGTGGCTTTCCCTTAGGAGGAAAATAAATGTTTGAAGTGAATGATACAACTTATATTTTACGATTTAATAAACAAAAAGTTAAAACGGTGGAATTAACATCAGGGATTAGTTTAGTTGCAGCTTTGACTGCGAATAAAGGGATTTTGAGCTATCAAGTGATTGAAACGCTATTTGTTTCAGGACTTGTGGAAGAAAAAGGCTTAGTACCTGTAAAACAAAAAGAAGCTTTGGAGATTTTCGACAAATTAGTAGAAGAACAAGGCTTAATTTCGCTTAATGTAGCTGTTATTGAGAAATTGCAAGAGGATATGGGTTTTTTGTTCCGTTAAAACAGATTGAATTTGAGTATTTTGGTGCTGAGGACGAAGAAGTGGATAGTGAAATGAACCATGATTTTGATTTGGAAAAACAGTTCGCTTTTTTTGTAGTCAATTTTCGAATGTCCAAGCATGATTTTGAAGAACTTACTGAAGTGGAGAAAAATTTCATCATGAAAGAATGGGAAAACAAGGTGATTTTTGAATCTACTATGCTTCGAAATGCAGTTTTAAATGCGGAACAAAATCTCAATCGAAAACGAAATTCCCGTTTTATCGACTTGCATAAAAAACGTCAGAAGAAAGCCGATGTTAATTATACAGTAAATGCACTTCAAGCAATTTCCGAGAATGAAGCGAAGGAAGGTAAAGCGTGGATTGATCGGATTTATGGTGCAAATGGGTTGCGAAGACCTAAGAATAAAGAAGAAAGGAGGAACGTGAATGGCGGATTCTAAAAGTTTTACATTTGAACTCAACGAGAGCGTTTTAACAGCGCAAGTTGGCAGGCTAGATGAAATGGCGATGGTTGTAGAGCAACGATTTTCAGAGCTCAAAATGACTATTGAAGATGTTGGAAATGCTGATCCAGGTTCGAAAATTTCCGAGTCTTTAGGTGGGCTGCAGTCTGGGCTTGGCACGATTAGTTCGGCGTTTGGACAGCTGGGTTCTAGTAGTGAGGCGATTACATCTGGATTCGGTACTGCGGTTGGTTCTGTTGGTGGAATCACGGATGCGTTTAAAAATCTAGGTTCAAGTGTGCAAAATGGTACGTTATTTTCAAGCTTGGCGACTGGAATTGGTGGCATGAGTACGATGCTTGGTGGAGTATCTGGCGGCGTTCAAGGAATTACAAATCTAGCTAGTGGTTTTATGGAGTTGAAGAACCATTTAGGCGGATTAATGTCTTCTATTGGCGGCGTTGGTGGAATTATGGGTAAACTGACCTCTCCTATGGGGTTAGTTATTATCGGTATTGTAGCGTTAGTAGCTGCATTTGCGTATTTGATGACGACGAATGAATCATTCCGAAATACGGTGATGTCAGTCGTAACACAGGTTGCGCAACTGTTCGGTCAACTTGTCGCCAGTTTAATGCCGATTATCATGCAAATTGTTACTGCGGTTATGCAAATTGGTGCCGCGTTAATGCCAATGGTTATGCAATTTATTAGCTTTTTTGCGCAATTGTTAGCCCAATTAATGCCGTTTATTAATATGCTGATTTCCATGCTTATGCCTGTTATTATGCAGATTGTTCAAGTTGTTATGTCGCTTGTTTCGGCACTATTACCGAGCATCATGACAGTGATTCAAGGCATTATGAGCGTTATTCAATTTTTAATTCCAATAATCATGCAAATTGCGACGGTGGTTGTACAAATTGTTGTAACGATTATTTCTTATATAAGTAAAATTATGCCGATTGTAATGACGATTATTGGCGTTATTGTTTCGATTATCACAACGATTATTAGTTACGTCGTTATTATTGCGACGACGATTGCTAGTGTTATTGGGAAAATTATTAGCTTTATTGCGAGTGTTATTACGGCGGTTATCGGGATTGTGCAACCAATTATTGCCTTTATTACCAATATCTTTACGACTATCGTGACAATTATTGGTGCAGCTTTCCAAATGGTATTTACTGTTGCATCCAAAATTTGGAATTCCATTATGTCGACTATTTCCGGAATTATTGACGGAATCAAAGCAGTCATCACAGGTATTTCTACTACAGTTTCATCAGTGTTTAACGGAGTGAAGCGCATTATTACAGGTGTTTTTGACGGAATCAAAAGTGCTTGGGGTGGTTTAACTGATTTTGTAGGAAATATTTTCGATGGTGTTTCAAGTGCAATTCAAACAGTGGTAGACAATGTCAAAGGTTTTGTAAACGTGGTAATTCGAGGGATTAATGGAGCCATTGGTTTAATTAATAAGATTCCAGGAGTTGAAATCGGCAAAATACCGCAATTAATTTCCGGAACAACAAATTTCCAAGGTGGCTTTGCTCGAATGAATGAAGGCGGCCGAGGCGAAATGGTTGTTTTACCGTCGGGTTCGCAAGTAATTCCGCACGATGCAACGATGAAATACGCAAGAGAAAGTGCGCGCGGAAATAAATCAATGCTTTACACGAGTCAAGGCGCTGATTTGGCTAGAGTTGAAAATCTTCTCGAGCGCTTACTACAAAAAAATCCTGTAATCAAAATGGATGACAAAGTGGTAGCTGAGGTAGTTAGCCGTAATCAAGCTAACTCATTTGATCAGTACAACTACACAATGGGAGGTGCAGCTTATTCATGAGTGACTTGTTTTTAGAATTAAATGGAAAAGTGCATTCGCTTAGTGAGACATTTCCAGGTCTTTCTGTACAAGAAGTTTCGAGACAAAGTCCCCAGTTAAGCATGGAAACTGCTGAAATAGCTGGGACTGATGGGGTTATCCCAGGAATGACCCAATTTAAACCGTTTATCTTTTCAGCAAAATGTAATTTGCAAGCACTTGATATTCCAGATTATCATTTGGCAGTCAGAGAAATTTATGAATTTTTATTCCAGCGCGATAGTTATTATATTTGGAGCGATCAAATGCCAGGAATTCGGTATGAGGTGCATCCTAAACCAGTTGATTTTAGTCGAGAATCGGATCGTGTTGGTTTACTCACTATAGAATTTGATGTATTTAAAGGTTATGCGGAGTCACGTGGCACGAGCCTTGACCCTATGACTTTTGAAGTGGATTTATGGCAAATGGGAATGAATTTATCGAACCGTGATGATTTATTTTATATTTTTAAAGAAAATACATTTCGGGTCTATAATGCGGGGAGCGACCGTGTTAATCCACTGATGCGGCATGAACTAGATATTGCGATGACGGCGAATGGGACACCAACGATTCATAATCTTACAACGGGAGAATCCTTCGAGTATCAGAAAGAGCTCCGAAAAACAGATGTTTTACTGTTGAACAATATTTATCCACTTGTTAATAACCGCCGTGTTGGAAAAGATACCAATCATGGGATTATCACCCTTGAAAAAGGCTGGAACGATTTTGAAATCAAAGGTGTAACGGATGTAACGATTGCTTTTAATTTTCCGTTCATTTATCGGTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP021325|120423:126948|124264_126133_+|AVK43670.1|DBSCAN-SWA MADSKSFTFELNESVLTAQVGRLDEMAMVVEQRFSELKMTIEDVGNADPGSKISESLGGLQSGLGTISSAFGQLGSSSEAITSGFGTAVGSVGGITDAFKNLGSSVQNGTLFSSLATGIGGMSTMLGGVSGGVQGITNLASGFMELKNHLGGLMSSIGGVGGIMGKLTSPMGLVIIGIVALVAAFAYLMTTNESFRNTVMSVVTQVAQLFGQLVASLMPIIMQIVTAVMQIGAALMPMVMQFISFFAQLLAQLMPFINMLISMLMPVIMQIVQVVMSLVSALLPSIMTVIQGIMSVIQFLIPIIMQIATVVVQIVVTIISYISKIMPIVMTIIGVIVSIITTIISYVVIIATTIASVIGKIISFIASVITAVIGIVQPIIAFITNIFTTIVTIIGAAFQMVFTVASKIWNSIMSTISGIIDGIKAVITGISTTVSSVFNGVKRIITGVFDGIKSAWGGLTDFVGNIFDGVSSAIQTVVDNVKGFVNVVIRGINGAIGLINKIPGVEIGKIPQLISGTTNFQGGFARMNEGGRGEMVVLPSGSQVIPHDATMKYARESARGNKSMLYTSQGADLARVENLLERLLQKNPVIKMDDKVVAEVVSRNQANSFDQYNYTMGGAAYS >CP021325|120423:126948|121873_122290_+|AVK43665.1|DBSCAN-SWA MQVLVLPENKDINYIKTVQEVKRFFADFERFRMITGLSKKPHLLRNGFLEEPQFEPVAFSARHNKEVILEARWLVEKYTEMLNQMDDLYRTILMECYVERKQDVAVMMDLPYEIAQFKRIKKRAVLELATLMGILVRK >CP021325|120423:126948|122969_123482_+|AVK43667.1|tail|DBSCAN-SWA MAFEENLYCDYTPGAAKAVAGKDVILAVFNAAGDKLLAVAGQQGLTVNRSKDSIEITSKDTVGGWKSKIGGMKEWSIENDGLYVADAESHKELAKYFESDSPVCVKIINQASKKGLFGGLAIVADYSFEAPFDEAMTYSVKLDGMGALVDLTITEGGDQMPGETPVAPAE >CP021325|120423:126948|123873_124278_+|AVK43669.1|DBSCAN-SWA MDSEMNHDFDLEKQFAFFVVNFRMSKHDFEELTEVEKNFIMKEWENKVIFESTMLRNAVLNAEQNLNRKRNSRFIDLHKKRQKKADVNYTVNALQAISENEAKEGKAWIDRIYGANGLRRPKNKEERRNVNGGF >CP021325|120423:126948|121433_121862_+|AVK43664.1|DBSCAN-SWA MDRKLLKEKQIQLIFQLEQEENRFIRKRLIEELEFFEALGDREKGLLTAEQKLLILTPSEYREYKRTKSDVQISRIIGVSRSSLAEWKRKKGLNRKKSQPVQQEMIDVLAFHLDKTKEEIGALPASAIECQYEAFVINEANN >CP021325|120423:126948|123529_123832_+|AVK43668.1|DBSCAN-SWA MFEVNDTTYILRFNKQKVKTVELTSGISLVAALTANKGILSYQVIETLFVSGLVEEKGLVPVKQKEALEIFDKLVEEQGLISLNVAVIEKLQEDMGFLFR >CP021325|120423:126948|120881_121217_-|AVK43663.1|DBSCAN-SWA MELNKFVGNKIKQYREERGLNQEALAEKLHTTRQTISRYENGDRKANQDVLFELAKIFNKRLDDFFPERNLPPVDERLVTIAAHIDDDVTEEEMRDILAYIEMKKKLHRGM >CP021325|120423:126948|122567_122957_+|AVK43666.1|DBSCAN-SWA MKSLSFMRVLEAVRTMLQEKGGLDISIVMRDQVEMPTTMIEMIDQEEEESQTAWKEKYRFAIHHYTNETDLAGVEKIDTLIQTGFTLPEGYKLIAVRHYGKQNLVKENTLIHAKTSFEVSICRELKVKI >CP021325|120423:126948|120423_120876_-|AVK43662.1|DBSCAN-SWA MYEKLVNKYQDEVTIREEKMPYKLPGLYLNGMIFISKDQSSIEKGCVLVEELMHYKYTVGNITKQETIMDKKQEIFARRKGYEELIPLDDIIACFYLGLREYFEVAEFLEVTEEFLRHTVSHYAEKYGPMYDYGGYFINFGNSIDVYKKF >CP021325|120423:126948|126129_126948_+|AVK43671.1|tail|DBSCAN-SWA MSDLFLELNGKVHSLSETFPGLSVQEVSRQSPQLSMETAEIAGTDGVIPGMTQFKPFIFSAKCNLQALDIPDYHLAVREIYEFLFQRDSYYIWSDQMPGIRYEVHPKPVDFSRESDRVGLLTIEFDVFKGYAESRGTSLDPMTFEVDLWQMGMNLSNRDDLFYIFKENTFRVYNAGSDRVNPLMRHELDIAMTANGTPTIHNLTTGESFEYQKELRKTDVLLLNNIYPLVNNRRVGKDTNHGIITLEKGWNDFEIKGVTDVTIAFNFPFIYR |
10 | Listeria_phage(33.33%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
670048 : 706293
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP021325|670048:706293|DBSCAN-SWA ATTATTTAACTTCTTTTATTCCGTAAACGCTTGATATTATATTATCTACATGTCTAGATTCTTGTTGTTCCATTTCGTCAATTATATGACTGTATGTTTGTAATGTAGTTGTAATTGAATTATGCCCCAAGCGCTTCGAGAGGTATTTAATATTAACGTTCTTAAACAATAATAAAGATGCGTGCGTGTGTCTTAAAGCGTGACTTGTAATCGAAGGAGTAATGCCGCTTTTTTCGCAGAATTTTTTTAAAGTCTTATTAACGGCATTGTTACTAACTACTTGAAAAGAATCGAAACTGCAAAAAACTAGATTGTGTTTGTTTCGAATGTTTTTCTTCAACTCGAATTTAGTTTGCTCTAATTTTATTTCTCGTAGTAGTTCAATTGTCTTTTCATCAATTGTAATAGATCTCTTGCTAGAAAAGTTTTTCGTGTCACTAAAGAACTTAGTATATTTATAATCCCACGTTTTATTTATGATGACACTTTTCTTTTCGAAGTCAACACAATCCCAAGTTAATCCTAACGCTTCGGAAAATCGACACCCGGTAGCTATTTGAAAGAAGATGATATTCCTTGATGTATATTCAACTTTGTGTGTATTCATCAAATTTTTAGTCAGGATAATTAATTGTTTTTCAGTTAAGAATTTCTCGCTTTCTTTTTGAGTTGGGGCGTTTCCTATCGCCCGAACGCGATACGTGGGATCTTTATATATTACCCCTTCTTGAACAGCGTCTTTTATACAAGCGCGCATATAAGTATGTTTCTTTTTAACCGTTGCAGTTGCTCTCTCTTCGCCGTATTTATTTAAAACTTCTTGATACTTTTTTCTTGTTAAATTTTTTAACTTTATTCCATCGAAATTTGCTTTAACAAAGTTTAGCGTGCTATTTATGTCAACGTCGTTTTCGATGCTCAATTTACCTTTTTTATAGATTTTAAACCATTCCTCGAAATAATCAGTGAATAAAGTTTCTCCTTCATCTAAATGAAATCCTTTGCTTAATTTGTTCTTTATTGCGCTTTCGGCAAGTTGAGCTTCCTTTTTAGTTCTATATTTTTTGTCGCTATTTATACGCCCGTATTTTCCGTTTTCTTTTTTAAAACTTATGCGGTATGACCAGTAATTTTCGCGTTTATAAACAGCCATTGAGGCACCTACTTTCAATCTTTATTTAGGATAAATCATTACGCTAGTGATAGTATCACCCATATAGTCCAAGTTTGATACATTGTAGATAATGTTATCCACTGTTTTTTTTGCATCCTCTTTTTCATCTACTGCGTTCTTGATGAAATCTATAGTATCAGTTCCATCAATTGCTTTATTTAATATAACGTTTGTTGCAGCAACTGATAAAATGAAATTTTGATAATCTGTAAAAGATGAAATTGAAGCGTCGGAATTATTTTCTGAATAAGAAAGGCGTATGCTCATAATATTTTTTCCATCTAAAGAAACCGAAAAACCGTCCTGCTGATTTTTTGCTGAATCAATGCTTGGAATTTTGGTGTTTAATCCAGGATATTGTTCGCTTAGTTCATTGAATTGTTTTTCAAAATCATAGTATGCGATTAATTTATTTTTTTTAGGAACTTTTACTTTTGTAGTTGTCTTTTTATCATCTTTTTCAGATGTTACTTGATAAGTGGTGTCCGACAACATGCGAGGAACAACTAGAACAAAGTCACCTTCGCTATTTACGATATCGCTTTTTTCTCCAGATTCGTCTATCAGCGTTACTTTTGCTCCTGGATCAGTCTTACCGTTTACATTAATTACAAATTCGTCTTTTTGTTTTTCTTTGATTGAAAGTTCAGGTTCTCCGCATCCGAAGAGAAATACATTTAAAATAAGCACAAAGCCCAGAATCATCTTTTTCATTTAAGTTCCACCTTTTCCAAGAACGCTAGTTCTGTTTGTTGTTAAAAATAAAAATCATCCATACTGCAACTTCGGCAAAGAAGAACTTTGTAATAAATAATTGCGTATAGATAACATTCGATTGCTAATAATATCGCTTGTTGTCGTAGGGAATAGTTCGAGCAAATCTTGCTCGATGTAATTAGAAGTGAAATCTATAAAATTTAACATGTGATAAGGAATTGATATGTACATTAAACTACGATTTGCATTTTTTTCTTGATTTTCAATAGCTTTTAAATTCATTAATTGTTGATTGCCGCAATGTGTAATAATGTGTACTAGCTCGTGATGCAATTTTTCAATAAATTGTTCCCTTGACAACTGTTGCGCTAAAACAATACCGCCATAATCAGCCAAAGACATAGAGAAATCGCCTTTTACTATAAACAAATTGAGTTTAATTAATAAGCTTTCAATTTCTAGATCGCTAGGCAATAAAACGTTTTGTGCTATTAAATAATCTGATAAATACTTTTCTGCCACGCTAGGTTGGTAAAAATCTAGAATATTCAAATACTCATCCCCTTAAAGTTCTTTTTCAATTTCTTCGAGCTCTTGTCTTTGTTTTTTTATGAGAGCAATGTAATTATTGACCTTCTTTAAATCATCTTCCGTTAATCCTCGTAGATCATCAAAAGCTAAATTTTGAGGGATAGCCTCTTCTCTGCCAAGTAAAAAGTCCGTAGAAACATTAAAAATATCAGCGATGCGTTTTAATGTATCGGTGTCCGGAAACTGATTTCCATTTTCGTATTTTGAGATAGACACTTTACTTATGTTTAGTTTGGAACCTAAGTCAGCTTGTGTCATACCTCTATTTATTCTTAATGTTTTTAAAATTTTTCCAAACAAAATTGCCACTCCTTTGCGTTTCAATAATAAGTTATATTTTAATGATAAGTTAACGGTTAGTTAATTTCAAGGAATTAAAATAAAGTTAACCAAAAAGGGATTTTATATCTTGACAGTTAACTAATGGTTATCTATAATAAGGATAACCAATAGTTAACTAGAGGTGGTGAATGAATGATAACAAAATTAAAAGAATTAAGAATTGAGAACAACTTAACTTACGTAGATGTGGCTACGAAAGTAGGTATATCAAAAGAGTACTACTGGATGATAGAGAACGGAGAACGAGATGGTTATACTTATAACACCGCTAAAAAAATCGCATCGGTTTTTGATAAAAATCCTGATGATATTTTTTTACGCTGATGTTAATTAAAAAGAAACATTTTTACTGCTTATTTTAGAAATAAATAAGTGTAATCAGATCCTCGAAATACGAATAGAATCGAAAGGAGGTTAAGAAATGGTGACACAAGAGTTAAGTGTAACGATACCAATTCCAGAATCGCATGTAATTATTACTAAAACAGAATACGAAGAGTTGCTAAAACAAGAAATTGTTGGAAAGTATTGGGATTTAAAAGCATTGGAAAATAAAATTGGAAGAAAACGGGACTGGATAGAAGAAAAAATCCTCTACAAACCTAGTTTTAGAAGTATGTTAGACGTTGACGAAAATCCAGACGGTTTCGTGAAATATCCGTCGGCTGAAAATCGCAAATGGTCATTTCTTGCTAGCAAGATGAACGATTTTCTTGAAAATAATTTCCCGGAAATTATGAGGGGGTGATGGAATTGATCTTTGAAATAACGCTATTAGTTTTTGCGTTAGGCTCTGCAATAGCAACGTTTGCCGGAGCGCAAAAAAATAGCCCTACGCGTCAACGTAGGACCGATAAATAATAAATTGTAAGTCAATTATAACTTAAAAAAGCACGACGAGCAAGGAGGGCTTATTACGCATGTCTGGAATCAACAACAACAATCTATTGATAAATGATTATCCTCTTCAAGTGTTGCCAACGTTAGCAAGAGAAATCGGCTTAAACGAAGCAATTGTTTTGCAACAAATTCACTATTGGTTAAACAAGAAACAAAATTTGCACGATGGTAGGTATTGGACGTATAGAAGTATTCAAAAGTGGCAAGAAGAAAATTTTTCTTTTTGGAGCTTAAACACAGTAAAGCGCACATTTACTTCTTTGAGAGAAAAAAAGTTGCTTTTAACTGCTAATTATAACAAAAAGAAGTTTGACAAAACCGTCTGGTATTCCATTGATTACGACGCGTTGGAAGCAATGAGCCAACGATTAGCCCAAAATGAGCCAACGATTAGCCCAAAAAGAGCTAATGCATTAGCTCAAAATGAGCCAGACAATACCTTAGACTTACCAGAGACTCCTAAAGAGAATAAAAAGAATACTGTCGAGGAACTCGACGATACATCCATTTTTAAAAATGTTATTGATTTCTTAAATGAAAACGCAGAAACGAATTACAGGCACACTACGCAAGTTACTCAAACATTGATAAGAGCTAGGCTGAAAGATGGATTCACTTTTGAAGACTTTAAAAAAGTAATCATCATCAAATGCAAAGACTGGAAAAACGATAGTGCGATGAGTCGATATTTGAGGCCCGGAACTTTGTTCGGAATTAAATTCGAAGGTTATTTAAATCAAAAAACGGTTTCTGGAAATCAAAAGAAGCCTTGGGAAAAAGAACCGAAAAAAGAAGAGCTTCCGCCGTGGTTTGATAAAGACCAGAACGGAGCTGATGGAAAAGTATATACAGAGGACGAGAAAGCGCAGATCGCGCAAAAACTTGAAGAAGCACAAGCAAAATACGAAGAAGATCGACGGAAAAGAGGTTTGTAAAATGAAAGAATCTGATATGGATAAAGTGCGAAAAATGAACGTTGCAGAAATCAGGCAATTGCAAAACGAAGTGATAGCAAATATCGAAACTAATTACGACAATCTTTCGAGAGATGAACGAAAGGAATTGCAAAATGATTTAAAATTTTTAGAAGGCATTAGAGATTCTAAAAAAGGAATCACGGCGGCAAGTAAACTCCTAGCTTTTACAGTAGAGGAATATAAAGAACTAGCAAAGTCAAATTCGGATAAAAGTATTGCAGACGAACTCGGTGTTTGTCGTTCAACGTTCGCGGACTGGAAAAGAAAAAAGAATTTAGTTCCGTGGAACAATAATGTTA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MAEKFGDLIATASLDINPFQTSARTLERQGKALGKNLKATEAMFKNTGKSIEGLKAKQQVLGKQLQVSSELVRKNTEKYNALKDATGDVNAATDEQKRKLLAAEQAMHKSVAEAESLRGKYNALSKEIALNSSKLVQSGIKMQALGTKMQNVGKGISSVGMGITTKFALPLAAGIGLSVKAASDFESAFAGVKKTVDEVVNQNGEVTYSYDKLAAGIRQMSKEMPASTTEISAVAEAAGQLGIQTPAILDFTKTMVNLGVATNMSSEEAATALARFANIVQMKQSDFDRLGATIVSLGNNFATTEKEITDMGLRLAGQGKQVNMSEADIMGLAAAMSSVGIEAEAGGTAMSMVMKKINNAVYSGKGSLKGFADLAGMSAKQFQKAWKDDAAGALDDVVHGLQKNSKEGKNLTAILNDLGIKGIRESDTMLRLSGNADILTDALGNSKTAWKENSALTDEASKRYETFESQLKIFKNQINDIAIDLGGPFMKALNAGLQASKPFLNSIKEMSKAFADATPETQKLVLKLAATALAFGPVTIGVGKFVSAGGTLIKATGSMVQGLGNFAVKAKLAKTGTDALAIGTVNAGKGAKVASVATRGFGASLGATLVTMGPWVLAIGAIGLAAYGLYKVFGDNNARKWGADIGDAADKSLSKVSQFSAEGTVAMESFSTDMSGNAKIVKTAFQGMADEVKKSVDDSIKALEESYNNLPEEVKTMYKKTLDEAKKDGEEKKKLAQTQADSAMKIVENAAKNERDLTETENKRLISLEKNLLSENVEALKLSSDEEKKVKAALYQDIEKMDRSQRVKSANALSKSMSEQKKAYEEQKENAKALYAEDGNTERYMSTLDILETKNKAVTESIAVRWVELERASGISESAIEDGLKNFGLSLEDIERISNETTKNTADNLGLLADESSDANVAWNDLILDDKTGEVTTNINDVISKAMSSEKEWKNLQFIIKEADLNSNAKATILDAVAQSGKWNQLSFEEKEILIESDSTRQIVLALEDNKKWNNLDYEVKKAILESNTPQKLDEVLKNYELWDEIPWDSSKKEAFLETNVDNTMQDVKKGFAEWDKAIPGQKNLIVDNNDVLNKILQSETVLVQYNNQTVDLKDLFANNSDVLNKVKKGNDVIVEYNGRKINLKELYANNRDLFNKVTSGKKVLYDYNGVPVNLKWLKMETNAGSVASQVQSAINNWQEMLNMRNKKIIEIAYKTNGKAPSGPQGLATGTNFHKGGLAVVNDARGANYQELITLPNGKTFLPYGRNVMLNLARGTKVLRGDKTAKILNKVPKFASGTTRDLVSKSKAVNIASAINSATENASLSKKQTGVSDEQKSNKVLLSQLKELVEQLIVVVQKPVMLGTVECMVSEGVLFKTIARFEKQKNSVQSRGIRGDLNV >CP021325|670048:706293|679184_679727_+|AVK44209.1|integrase|DBSCAN-SWA MNTVEPIRDRDTITEIKRYLIVKSSRDYILFFLGINVGLRIGDLLKLKVKDVRGGHISMREQKTNKNKKILIPRDVKKALELYTLDLEDEDFLFQSRKGVNKPITRETAYRVLKELEPIFKLDRVGTHTLRKTFGYHFYKQFNDVVALQKIFNHKDQKETLLYIGIQQDELDKKMAKFNL >CP021325|670048:706293|693474_695718_+|AVK44226.1|tail|DBSCAN-SWA MYNNSINEFGFSFAGSHSSLYNLKIIDIRRVVIPPSSEIVQNIEGMDGAVYQGNNIGQRPFEIDVKLVSNTHESRLADLHDISDWLWSDKDNEYSLIFDDEPDLEWFAHVSNISEVNRTKANGFFTIAFNCSDVLGYMEKETVQVAVNPFIITPRGTRRSNPIISMIPYANTRKIAVVQDEEDRWAYLGEDVDPETGNIGVDKSPLVYQDECNTLAPWTTLSSSNIPFALENGFIYNDAKMISNHTEFRIGSKNGAQFWGGNGTTTENWHGAAVMKMMDAELDNWSVKFVCHNYTYYPRAKGKVELYLLDKNKSKIGVMTLKKNSVKSSELILEVKLFSGSKNTFVYSGTGPTKKGKTVTKTVRVKLGGKMVKVKVKGTNKTKTEQAWSDVKIAESTTTSMFSNFYGEIILEKRGNKFTLLVNKYNKSRSQDPKFTPIRITKTLNDYKGLSLSGVAYYNAKMDIYEDNPKHAKGYSQQGMSMSFLRVNKLFENTPSGVDYVANSRDEVKFNAEDKHVYINGTIQQKNWAIGGELPTFDGGHETTLAFSHSPYEQIYDGASHNLIRNSTWKEGKKFWTNGDANGNPYRISNPEADKPDSSIFSIMAHTNAAAQNASDLIFVEKGKDYLVSCDVRLTKNDKSSDIFFCVRTFPDEEYTNAAAVATSTFYIRKSDYPNWTINQWYRLTFSFTADDNWVRIIPYNSDVINGTRVDYREVKMTDNLTDIIWSPAPIETECAEIYIEYRPTRG >CP021325|670048:706293|684815_685382_+|AVK44217.1|DBSCAN-SWA MNEMETRSLESVESKEENSIAGYALKYNSLSEDLGGYKEIISPNALNGVDLSDVRALINHDRNQCIGRTKAGTLMLKNDSTGLGFVCTLPGTSFARDLKENIKAGNISQCSFKFRTTENGVSWKRSKDGDYIRTIEQFSEIEEISIVTIPAYEDTNVAVATRELANEKDYQKRLAIVKVQLDLDELTI >CP021325|670048:706293|681622_683374_+|AVK44214.1|terminase|DBSCAN-SWA MMTKKMKTMTNFSEIEDKYKDDAYLYCRLILDKKILASNAVIAACERHLNDLLEIKEQSFKYSYRPKRAQNAIKFMEVLPDPKTGKTFPLAMFQKFIVGNIHGWYKKGKKNVRRFKTALVMMARKNGKSILIAGLMLYEFLFFKNPQMSRQMFCAGNDKKQASLVFKMVAKFLRALSLQDKQVRKATKKVREEIRNLIDDSFIIPLSRDTSSLDGFEPQFTSMDEAHEYTDDEIFELIESGQGQLESPLTFIISTAGFKLNGWLYTTMYPYAKSILAGNVIDDEMFVFIAEQDFADEWQDETTWIKSNPILEIKAKYEDNMEYLRKRIKTGIEQNKIFRRLVKNFNYWMQASEESYMDAKDWKAAGASDADIYGKDVYIGVDLSKGGDISALGFVFPFEDKKFHVDAHSFIGTRGGLDLKIDRDKIDYRLMVKKGVATLTDLESGIINYAQMIDYIERYVQAYNLNVRAICYDSYNISLFLAELEKRGLDYELIEVRQGVKTLSDPTKEFKLGVIDKRITHSNNALLDIAVNNAILKYTNDACQINKERNREKIDPIVAVVDGFTEAMYYEPDSKELYFDVWG >CP021325|670048:706293|703281_704217_+|AVK44234.1|DBSCAN-SWA MTESQKRGIPYVTRTSRNNGLECLVLPDDNFFSCPKNVVTFGAESVCFFSQPYEFITGNKMYYCIRKNSTDLSIEQCLFLQVAFTSSLEGTEYGYGIGLTGTRLSKRKIYLPLSDDKIPNWKYMEQYIINIMAEIRVPKIIPVGNSEINITQKKYKSFAIGNLFKIKRGNSGAKNTLKPGKTLLIAARKIQNGFDSFVEKRNSSTVFSNAIAINNNGDGGAGIAHYHPYEFVATQDVTVLISKNEIGKLSKLYIAQAITNQRKNMSFGFGNKLNSKKLEKLQIMLPVTDEGTPDWQFMEDYIRSIPNSHLI >CP021325|670048:706293|688738_689086_+|AVK44224.1|DBSCAN-SWA MEIRLMKENEKQGVLYKKNKTTMFDAMLGMEYNIRQVERFAGKDEMELTNTHEGIMLQMEGTKDAAKFLVTVFDNQFSVDDVLKGITREDFATVVNGVLFEVMGGNTDETKKEQK >CP021325|670048:706293|677871_678351_+|AVK44206.1|DBSCAN-SWA MMNRVVLVGRLTKDPDLRYTPAGAAVATFTLAVNRPFKNAQGEQEADFINCVVWRKPAENVANFLKKGSMAGVDGRIQTRNYEDNDGKRVFVTEVVAESVQFLEPKNNPGRATTNDYQSKANYSNNTQTSSYESGASQKGGAFVSDSKPIDISDDDLPF >CP021325|670048:706293|688073_688649_+|AVK44223.1|tail|DBSCAN-SWA MVKIGLDKAQYAKLDEKDKASEVKSLPGLTTAKLELEMENENFYADDTIFAILESGITKLGLEYGLADISSDAKKDLLGIAVEKGMELFKKDISAPYIATSFRSRLDSGKYVWFGLVKGKFAPSGLDLTTKEDKATAQTETISASFVAREADGNMLVIAREDNEDFVLGDFYKMVYGIDPTEAVTPPKNGE >CP021325|670048:706293|677276_677504_+|AVK44204.1|DBSCAN-SWA MTKTHELKIAPEFFAAVTEGRKTFEIRKNDRDFQVGDTLILREWDDMDTGLYTVVEVVYMTDYEQKDGFVVLGIV >CP021325|670048:706293|673791_674706_+|AVK44198.1|DBSCAN-SWA MSGINNNNLLINDYPLQVLPTLAREIGLNEAIVLQQIHYWLNKKQNLHDGRYWTYRSIQKWQEENFSFWSLNTVKRTFTSLREKKLLLTANYNKKKFDKTVWYSIDYDALEAMSQRLAQNEPTISPKRANALAQNEPDNTLDLPETPKENKKNTVEELDDTSIFKNVIDFLNENAETNYRHTTQVTQTLIRARLKDGFTFEDFKKVIIIKCKDWKNDSAMSRYLRPGTLFGIKFEGYLNQKTVSGNQKKPWEKEPKKEELPPWFDKDQNGADGKVYTEDEKAQIAQKLEEAQAKYEEDRRKRGL >CP021325|670048:706293|675952_676162_+|AVK44201.1|DBSCAN-SWA MNDKKVRFYVSTGMHGSLETETFLLKADLNIEFDILTTEQLEKEITVAYDDWLGSNIDSGWLIEKEVAE >CP021325|670048:706293|671221_671935_-|AVK44193.1|DBSCAN-SWA MKKMILGFVLILNVFLFGCGEPELSIKEKQKDEFVINVNGKTDPGAKVTLIDESGEKSDIVNSEGDFVLVVPRMLSDTTYQVTSEKDDKKTTTKVKVPKKNKLIAYYDFEKQFNELSEQYPGLNTKIPSIDSAKNQQDGFSVSLDGKNIMSIRLSYSENNSDASISSFTDYQNFILSVAATNVILNKAIDGTDTIDFIKNAVDEKEDAKKTVDNIIYNVSNLDYMGDTITSVMIYPK >CP021325|670048:706293|699485_699764_+|AVK44230.1|holin|DBSCAN-SWA MEFGKELLVYMTFLVVVTPVFVQAIKKTELVPSKWLPTVSILIGAILGALATFLDGSGSLATMIWAGALAGAGGTGLFEQFTNRSKKYGEDE >CP021325|670048:706293|680669_681032_+|AVK44212.1|DBSCAN-SWA MNGSKKRIIENGKSKLVPVGYVSNQRKAFEKERARTESERTKFYKSRTWQKCRYHQLLKEPLCERCLSDGVITQAVIVHHIIDTYTSIGWDKRMDPENLESICFSCHNKETFQKKDPPPE >CP021325|670048:706293|673003_673195_+|AVK44196.1|DBSCAN-SWA MITKLKELRIENNLTYVDVATKVGISKEYYWMIENGERDGYTYNTAKKIASVFDKNPDDIFLR >CP021325|670048:706293|670048_671200_-|AVK44192.1|integrase|DBSCAN-SWA MAVYKRENYWSYRISFKKENGKYGRINSDKKYRTKKEAQLAESAIKNKLSKGFHLDEGETLFTDYFEEWFKIYKKGKLSIENDVDINSTLNFVKANFDGIKLKNLTRKKYQEVLNKYGEERATATVKKKHTYMRACIKDAVQEGVIYKDPTYRVRAIGNAPTQKESEKFLTEKQLIILTKNLMNTHKVEYTSRNIIFFQIATGCRFSEALGLTWDCVDFEKKSVIINKTWDYKYTKFFSDTKNFSSKRSITIDEKTIELLREIKLEQTKFELKKNIRNKHNLVFCSFDSFQVVSNNAVNKTLKKFCEKSGITPSITSHALRHTHASLLLFKNVNIKYLSKRLGHNSITTTLQTYSHIIDEMEQQESRHVDNIISSVYGIKEVK >CP021325|670048:706293|673292_673619_+|AVK44197.1|DBSCAN-SWA 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MKNKTTKKIICGGLATVLLSSSLVLPTTSLASTSKQKVQDYQQEETFSDSPLTELDNLIAEKYITFDSPLKQYKVNPSIGSEMTTEKIEAVNKQVAETNNLLTLATNDSSTNVIAVTPEGKETVVKRGLLKGAGVNKVTYHWNYARIRLSKNTVRTMGVGLSIAGIWLPLKVVSKVCASLGVGTGFVKHGIWFDYNYFSNLLLTGYGWQ >CP021325|670048:706293|698007_699069_+|AVK44228.1|DBSCAN-SWA MSKNVLGTGYLSLQVLSDGITTSAAPPENPSVGTGWLDANYSPAVYKFWNGVVWEVGTIDIAEADPKASEKIEEALEEARKKSKTIYSETPPETPSEGDTWYSLNAAGNVGAVKIWKEGEWVDKKFDLTALSIEELHAISIFGGVISGSEFLHTVNHRDEDGNLYSGAVRMNDDGFTSSTYLPTGLGSTVLESVINTLGGYKIAQKLIDDKGEGVAKDAMLTASSLIFSESGNIKLSIDADSFYKTSWKDLPLNAGYSTAEFNTPQYMILCIFGIRIVFFRGQVQKSTAWASANAFASVPLEIQTTRTAMAYAATSKSTGGRVHASSANAMSFMPVDTSVTYFALNQLFYVLD >CP021325|670048:706293|687654_688053_+|AVK44222.1|DBSCAN-SWA MLPVKRAYDALIQNEALNESINNIRGKALEEQTIYMLVLPETFQNKKNAPVIRIESVNNYSSFYFDDKANAESAEIQISTMTNSIQHLEILIPLIDEAMRLNGFEQYADDTYIEPDFKFNYNARQYKGVFKK >CP021325|670048:706293|687286_687652_+|AVK44221.1|DBSCAN-SWA MVKGLEEMQANIQKMILENKQEAKKAVNQVAVETKELLQSNIPVSDEAGKHLKDDVTLSGFKMLSGGSVEKDILYKKEGWRARFPNNGTAKQSAQNFEEKTLNVMSRKALRIYAEALRRGL >CP021325|670048:706293|695723_698015_+|AVK44227.1|DBSCAN-SWA MYLILDNRLQQVGVLDNDRPASCKFYDDVVVTQLADESGKVWSDNLTISASYGYHETDYIVAGNHILKQKRNGKYYIYRIIEVRETTAGQTFAKTVTCENLLISDLNHTVLDNKNLINATSEQIFEYALQNSGWIISDNEFAGDTKSIDFTGRKEGREAFSEAVSLFNVEIDAYVELSAGQITKCVDIKRKIGDNNGVRIEYEKNVVGMSRIENEESFYTALIVEGGTPSGKGSPITIASVNGGKDYIVNENANDQFNDGKEYRFGKVQNEKIFNASGLLTWGKEQLEKASRPLFNYEIDISLFNEDIQIGDTVRIINLDMSPALTVIARIISVTESEANPSENKVVAGEFVTVKSVKPSDVSALEALIFETQRDIEESKTYKIELAGANVIKSSQLETQIIARVFSGKDNITSSIAPANFVWSLFDKDGNHVESWEREWAGKGNMVTIPASLMAGASISCTVVDDASEVMLVSAKEEDAILLAELGAGTGITNVMQCAGVDYERGHIYWTQASNYAGYTESFILTRTDLRGVYIDSVRCLEGGHGTTIGLEWSELESEMYIWTHWFTDAKHTANAIVRFKYVGTSTPALLTYEKTDYKLNTGTTYYRVTYDTKNNYVVLSDGGANLGISICNVSDVLKGKITPLYRCSGKEMGFNIATMTLQSTCAAFPYAYLSYGTGITGTDRNTVICYDMINKEVIYKLAFTFDKGTIVPTGSVAEMEGAFIYFDGNGVRNLSCNFGFGEPGKRVNRIYRIREKEVLVSE >CP021325|670048:706293|686664_687003_+|AVK44219.1|DBSCAN-SWA MTNEHKTRIDLATAKEHLKLEHDEDDSIIQNIYLPAAEQEIVGAVTLEYESPFFDDNAVFKIATLLLLSSNYENRKATSLQKQNEVPFALISYIQRLRGDYKKWTLKNSQIE >CP021325|670048:706293|674707_675064_+|AVK44199.1|DBSCAN-SWA MKESDMDKVRKMNVAEIRQLQNEVIANIETNYDNLSRDERKELQNDLKFLEGIRDSKKGITAASKLLAFTVEEYKELAKSNSDKSIADELGVCRSTFADWKRKKNLVPWNNNVKGRNI >CP021325|670048:706293|675060_675477_+|AVK44200.1|DBSCAN-SWA MIIANNRLKKVIDKIDFAAKNNRMMLTDKLDAETLATIYAEIEARNSKIKRLEKMAGITESEADLIQIPNKNTDFVHCNVGAFGFDKGQQYEVVKVNKKRGTFILLDNNGKKEEFSFLAIINESFSVSKKRNDKGVSS |
45 | Listeria_phage(51.61%) | capsid,head,portal,integrase,tail,holin,terminase | attL 677270:677284|attR 681640:681654 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1151062 : 1158485
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP021325|1151062:1158485|DBSCAN-SWA AATGAAAAAGGTTATTACATATGGAACATTTGACTTGCTTCATTGGGGGCATATTCACTTATTAAAGCGCGCTAAGGCTCTTGGTGATTATTTAATAGTAGCAATTTCTTCCGATGAATTTAATCGAATTAAACATAAAGAAGCTTATCATAGTTACGAACACCGTAAATTAATTATTGAAGCAATACGTTATGTGGATGAGGTGATCCCAGAGAATAACTGGGAACAAAAAAGAGATGATATAGAGAAATACGGAATTGATGTTTTTGTAATGGGTGATGACTGGGAAGGCGAATTTGATTTTCTAAAAGATGTGTGTGAAGTTGTTTATCTTCCTCGAACAGAAGGGATTTCTACGTCTCAAATAAAAGATGAACTAAAATAAAAATGTGAGAGGAGCATTCTTTTGGAACCTTTAGTAAGTGTAATTATTCCAGTTTATAATGTAGAAAAGTATGTTAAACGATGCTTGGATTCAGTTCTTGAGCAAACATATCATAACCTCGAAGTTATCGTAGTTAATGATGGAGCGACTGATAATTCAGCTAAAGTCATAAAAAGTATCTCAGATAATCGAATTCGTTATTTTGAAAAAGAAAATGGCGGACAAGCTACTGCCCGAAATTTTGGATTAGATGTGGCTACGGGAGATTACATCGTGATGGTAGATAGTGATGATTACATTAGCAAAAACCTAGTAGAAACTTGTTTGGATACTGTACAAAAAACGAATGCTGATTTAGTCTTGTTTACTTCATATAATGTGAATCAGGAAGGAAAAATGCAGTATATAAAGCGTGATAAAGGCATCAAAGTTTTAGATGCAGGTCCAACTCCATGGAACAAATTTTATCAAGCAGATCTATGGAAGGGTTCGCGTTTTCCAGTAGGTTATTGGTATGAAGATCTAGGAATTATTCCAGTCGTCACGCTAAAAGCAAAAAATCCAGTGAAAATCCAGGACGCACTTTATTACTACATAACTGATAGAGCGGATTCACAATCGAATATTCAACAAGTAGATCACTTTTTAGATGTGGTTATTATGTTGGAAAATGTTGAAACAGAATTAAAAAAACTAGGTATTTACGAAGAATCAAAAGATCAACTTGCGTACCTATATATAGAACATCTAATTTATCGTTTAGTTTTACGAAAAGCGATTTACATTACGAATAAGCAAGAACGAAAAAAACTTATTAAGAAAATTAGTACAATTATTCAAGAGAAGTTCCCTAATTGGGGTAGTTATCCTTATCAAGCGGGTGGCAAACTAACTGCAACATTAAAGAAAAAAGCATTATGGCTTTATTTACATCATTTGTACTTGTTGGGTGATTTAGTATGGAAATATCCATTTTCTATCAGAAGTAAGCAAACAGGGTTTTAAAGGAGGTTATCATTTTGCATAAATTAAGTGTGGTCATTGCCGTATACAATGTTTCTGAGTATATAGAAGCATGCTTAACATCAGTCTTAGAACAAAACTACAAGAATGTGGAATTAATTATTGTCAATGATGGTTCAACTGATGATACCTTTCAAAAAGTAGAAAAACTAGTAGACGGACATACGAATGTTATTTTGATTGATCAAGAAAACCAAGGTGTTTCTGCTGTCCGAAATAATGGTGTAAAAGCCGCTACAGGTGATTATCTAGGCTTTGTCGATGGAGACGATATCATTGCTAAAGATATGTTTCAAAAAATGATGGATTCTTTTGAAATGTCGGATGCAGATATGGTAACAATTGGTGTGGCAAGACTTTCAGGAGATAAAGTATACCCTTCTACATTACACGAAAGATATATGGTAGAAAAAAAAGAAGCCACAACAATTGAAGAAACACCGGCACTTTTATATGATACTACTTCGTGGAATAAAGTATTTAAAAAATCTTTTTGGGATAAACACCATTTGGAATTTCCAGAGGGCCAAATGTATGAAGATATCGCATTAATGATTCCAGCCTTTTTGTATGCAGAAAAGGTAAATATTATTCCTGATGTTGGCTATTATTGGCGCAGTCGCGAGGGTGGAGCAAAATCAATCACTCAAAGACGAAATGACATTGCCATGGTGAATGATCGTTTACTTGCTTTGAAAAAAGTAAATCAAGTACTTAATGAGAAAAATATTCAGGGTGATTTAAGATATCAAAATGAACGTAAAAACTTTGAAATTGATTTGTTTTCCATGATTGAATGGGCATTTTTAGCGCCGAAGGATTACTATTTGGCTCTTCAACCACTTATCAAAAATTATGTTGAGCAAGAAATGAAAACAACTGCTTTGAATGATATTCCAAAAGAAAAGAAACGACTTTTCAAAGCTTTGTTAGCAAATAATCGTCCGGCTTTTCTCCTAAATAGTTACATTTATTTTGGTAAGAAAGCTGTGAAAAAAATAACGAAATAAGAGACAAAGGACAAAATACTTCGGATCTTTAGTACACTTGTAAACAATTGATTCAAGTGTGCCATTGCATCATTAGAAGTACTATGTCTTAGGCTCTTTTTTTGTTAGTAACAGTTAATTTAATAGTGAATCTATCTTTTATATGCTATGATAATTGGTATATAATAAGTCAAATTAATGCTTATAAAAAATGATAGGAGCAGAAGAAATGACAAATTTATTTCAAGATGATAGTCTAACGCTGCATACAGACTTATATCAACTAAATATGATGAAAGCGTATTTTGACGATGGACTTCATGAGCGTAGATCGGTGTTTGAAGTGTTTTTCCGAGATATGCCATTTGATTCGGGTTTTGTTGTGTTTGCGGGGCTAGAACGAATTATTCATTATATGCAAAATTTACGTTTTACAGAAACGGATATTGCTTATTTACACGACGAACTTGGTTTTGATGGACCTTTTCTAGAATATTTACGTAACTTTAAATTTAAAGGAAATATTCTTGCTGCGAAAGAAGGGGAGTTTGTTTTTAAAACAGAGCCAATCCTTCAAGTAGAAGCAAGTCTAGCGGAAGCACAATTAATCGAAACAGCTTTGCTTAATATTGTGAATTTCCAAACGCTGATTGCAACAAAAGCGGCGCGAATCCGTTCTGTTATTGACGACGAAACGTTTGCAGAATTTGGTACAAGACGTGCACAAGAAATGGATGCGGCTATTTGGGGCACACGAGCGGCTTATATTGGTGGTTGTGATTCGACGAGTAATGTTCGCGCTGGAAAGATTTTCGGTATTCCTGTGTCTGGTACGATGGCACATGCGATGGTTCAAGCTTACCGCGACGAACTAGAAGCATTTAGAAGTTACGCAAAAACGCATTTTGATTCAATTTTCTTAGTAGATACATACGATACGCTAAAATCTGGCGTACCAAATGCGATTAAAGTGGCGAAAGAAATGGGCGATAAAATTAACTTTATCGGCATCCGCCTAGATAGTGGCGATATGGCTTTCTTATCTAAAAAAGCACGCCAAATGTTAGACGAAGCTGGCTTTACAGAAGCAAAAATCTTTGCTTCGAGTGACTTAGACGAACATACTATTTTATCGTTAAAAGCGCAAAAAGCAAAAATCGATTCTTGGGGCGTTGGCACAAAACTAATCACCGCTTACGACCAACCAGCATTAGGTGCCGTTTACAAAATGGCGGCGATTGCTGATGAAAATGATATTTTACAGGATTCGATTAAACTTTCAAGTAACACCGAAAAAGTGTCGACACCTGGTAAAAAGAAAGTTTACCGGATTATTACGAATGAAGATGGCTTGAAAGCGGAAGGCGATTATATTGCTTTGGCGGATGAATCACTTGAGAATGTCGACAAACTAACGATGTTCCACCCAGTTCATACGTATATTATGAAGACAGTCGAGAATTTCACCGCGCGTGAGCTACTTGTACCGATTTTCCAAAATGGGGAACTTGTGTATGATATGCCTTCACTCGATGAAATTAAAGCATATAAAGAAGAGAACTTGGCGCTACTTTGGGACGAGTACAAACGAACAGTTCGTCCGGAGCAATACCCAGTTGATTTAAGTGTAAAATGTTGGAAAAATAAGATGCGTAATATCGAAAAAGTACGTAAAAGTGTCCAACTTCATTCACCAGTTGAACTAGATATGCCGTTTTAGGAGGAATTATAATGGAAATCAGAGAAAGAATTTTAGCAGATATGCAAGTGGCAGAAACGATTGATGCACACGAAGAAATCCGAAAAAGTGTCGAGTTTTTAAAAGCATATTTAAAAAAGAATACGTTCTTAAAAAGCTTTGTTCTTGGGATTTCTGGGGGACAAGATTCGACTTTAACAGGAAAACTAGCACAGATGGCGATAAGCGAAATGCGAGCAGAAACGGGCGACGATGAGTACCGATTCTTCGCTGTGAGCTTGCCATACGGAACGCAACTAGATGAATCGGACCGTCAAGATGCACTGAACTTTATGGAACCAGATAATCGTTTAACCGTAAATATTAAAGCCTCAGTGGATGCGAGTGTTGCGGCGCTTGCGGAAGCGGGAGTGGAACTATCTGATTTCGCTAAAGGTAATGAAAAAGCGCGCGAACGGATGAAAGTGCAATACGCAATTGCAGCGATGCATAAAGGCGTAGTGGTTGGAACTGATCACTCCGCGGAAGCAGTTACTGGCTTTTATACGAAATACGGCGATGGTGGAACAGATATTAATCCACTGTTCCGCTTGAATAAAAGACAAGGCAAGGCGCTTCTTAAAGAGCTAGGCTGCCCAGAACATCTATATTTGAAAAAACCGACAGCAGATTTAGAAGATAATAAACCGGCACTTCCTGATGAGGTCGCGCTTGGTGTGACTTATGACCAAATTGACGATTACTTGGAAGGCAAAGAAGTCCCAGCAGATGCTGCGGCAAAAATTGAGAATTGGTTTATTAAAACCGAACATAAACGCCATATGGCAATTACCATATTTGATGATTTCTGGAAATAGGAGGTTGTTTAAATGAAAGTTGGTTACGGGTTATTAACTGCATTTTATACACATCCAGGAGAGCGAGATCATTTAGTGAAGATTTTGCTTGAAGCAGCAGAAAGTTTGGAAGAGTATAATACGTGCATCCAGTATATCGTCAGCGAATCCGAAAACGAAGCAGATACGGTCTTTGTTTCTGAAATTTGGGTCGACAAAGGGCACCACGAAGCTTCTCTTGATAACCCTGCTGTAAAAGCGACGATTGAACGTGCCAAACCATTAATAAAAGAAGTAAAACGAATACAAGAATTAGACATACTCGGCGGAAAAGGCGTATAAGCTTAACAACAAGAATGATTCTGGGACTTTCCTGGAATCATTTTTTTGGAGGGATGACAAATGCAAACGTTGATGATTGTTTGTGCTGGTGGTGCGACTTCCAGCTTAATGGCACAAAACGTAGTGAAAAGTGCTACGTCAGAAGGAATGGACGCGGTTTTACTATTTCCTGATGATGTGAAATATAAAGATAGTTTTCGCGAAAAATATAGCACGCGGGATTTAGTTGTCGTCATGGGACCGGTCGGCGCGATTACGGCCGGTAAGTTTCGCGATTACAAAGAACAAGTCGATGCAGTTTTAGTAGCACCGCAAGTAAAATATATGTATAAAACAGTAGAAGAAGTGCTAGGCGAACTGAATATTCCTTGCGCCAATATTAATTCACTCGATTTCGGTCGGATGCGCGGCGACAAGATTCTTACGCAAGGTCTAGCCTTGATGAACGCGAAAAATTCCAAATAAGGTGTTGCAACTTTAGAGGGGAAACGTTAAAATGAAAGAAGATGAAAAGGACAAGTGATTTGTCCTTTTCTTATATTATTGTGAAGTAACCGCGATTTTGCGGTTTCATTTTATAGATAAGGGTGGTTTTGTTTAAAATTATGAAAGACTTTACCGAGCAAGAGAAAATTATCGTTCTAGATTTTGGTAGTCAGTACAATCAACTAATTACGCGCCGCATTCGTGAATTCGGTGTGTACAGTGAATTACATCCGCATACTATTACAGTTGAAGAAATGAAAGCACTAAATCCAACGGGGATTATTTTTTCAGGAGGACCTAACAGTGTGTATGACGAAGATGCCTTCCGCGCTGACGAAAGAATCTTTGACATGGGAATTCCGATTTTGGGAATTTGTTACGGCATGCAATTAATGACAACGCACTTCGGTGGCAAAGTAGAACGTGCGAAAGACCGCGAATACGGGAAAGCGGACATTCACGTTGAGAAGCCAAACCGTTTATTTGCTGGACTACCAACCGATCAAGTTGTTTGGATGAGTCACGGCGATTTAGTCGTTGAGGAGCCTGCTGGTTTTGAAGTAACAGTTACTAGTAAATCTTGCCCAATTGCAGGTATTGCGGACGAAGAACGTTCACTTTACGGCGTGCAATTCCACCCAGAAGTACGTCACTCCGTTTATGGCAACGAATTACTGAAGAATTTTGCATTAAATGTTTGTGGCTGTAAAGGCGACTGGACAATGGAAAACTTTAGTGAAGTAGAAATCGCAAAAATCCAAGAAATCGTAGGCGACAAAAAAGTCTTGCTTGCCCTTTCTGGCGGTGTAGATTCCTCTGTTGTTGGCGTGTTAATTCATAAAGCAATAGGCGACCAACTAACATGTATTTTCGTTGACCACGGCCTTCTTCGTAAAGGGGAAGCTGACCAAGTAATGGAGACATTACAAGGCGAATTCAACATGAACATCATCAAAGTAGATGCGAAAAAACGCTTCATGGACAAACTTGCTGGCGTTTCTGACCCAGAACAAAAACGTAAAATCATCGGCAACGAATTCATTTACGTATTTGACGATGAAGCCAACAAATTAGATGGCGTAGAATTCCTTGCACAAGGAACACTCTACACAGACATCATCGAAAGTGGTACAGCAACTGCCCAAACAATCAAGTCTCACCACAACGTAGGCGGCTTACCAGAAGATATGCAATTTAAACTAATCGAACCATTAAATACACTTTTCAAAGATGAAGTTCGCGCACTAGGAACCGAACTTGGCATGCCTGACGCAATCGTTTGGCGCCAACCATTCCCAGGCCCAGGCTTAGGAATCCGTGTGCTTGGCGAAATTACGGAAGAGAAATTAGAGATTGTTCGTGATTCTGATTACATCTTGCGTGAAGAAATCAAAAACGCAGGTCTAGAACGCGAAATCTGGCAATACTTTACTGCTCTTCCAAATATCCGTAGCGTTGGTGTTATGGGTGATGGTAGAACGTATGACCATACTGTGGTTGTTCGTGCAGTGACGAGTATTGATGGTATGACAGCCGATTGGGCACGTATTCCGTGGGATGTACTGGAGAAAATTTCGGTACGGATTGTGAATGAAGTGGATCATGTGAATCGTGTTGTTTATGATATTACGAGTAAGCCACCAGCTACGGTTGAGTGGGAATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP021325|1151062:1158485|1151467_1152451_+|AVK44692.1|DBSCAN-SWA MEPLVSVIIPVYNVEKYVKRCLDSVLEQTYHNLEVIVVNDGATDNSAKVIKSISDNRIRYFEKENGGQATARNFGLDVATGDYIVMVDSDDYISKNLVETCLDTVQKTNADLVLFTSYNVNQEGKMQYIKRDKGIKVLDAGPTPWNKFYQADLWKGSRFPVGYWYEDLGIIPVVTLKAKNPVKIQDALYYYITDRADSQSNIQQVDHFLDVVIMLENVETELKKLGIYEESKDQLAYLYIEHLIYRLVLRKAIYITNKQERKKLIKKISTIIQEKFPNWGSYPYQAGGKLTATLKKKALWLYLHHLYLLGDLVWKYPFSIRSKQTGF >CP021325|1151062:1158485|1156026_1156335_+|AVK44696.1|DBSCAN-SWA MKVGYGLLTAFYTHPGERDHLVKILLEAAESLEEYNTCIQYIVSESENEADTVFVSEIWVDKGHHEASLDNPAVKATIERAKPLIKEVKRIQELDILGGKGV >CP021325|1151062:1158485|1153687_1155178_+|AVK44694.1|DBSCAN-SWA MTNLFQDDSLTLHTDLYQLNMMKAYFDDGLHERRSVFEVFFRDMPFDSGFVVFAGLERIIHYMQNLRFTETDIAYLHDELGFDGPFLEYLRNFKFKGNILAAKEGEFVFKTEPILQVEASLAEAQLIETALLNIVNFQTLIATKAARIRSVIDDETFAEFGTRRAQEMDAAIWGTRAAYIGGCDSTSNVRAGKIFGIPVSGTMAHAMVQAYRDELEAFRSYAKTHFDSIFLVDTYDTLKSGVPNAIKVAKEMGDKINFIGIRLDSGDMAFLSKKARQMLDEAGFTEAKIFASSDLDEHTILSLKAQKAKIDSWGVGTKLITAYDQPALGAVYKMAAIADENDILQDSIKLSSNTEKVSTPGKKKVYRIITNEDGLKAEGDYIALADESLENVDKLTMFHPVHTYIMKTVENFTARELLVPIFQNGELVYDMPSLDEIKAYKEENLALLWDEYKRTVRPEQYPVDLSVKCWKNKMRNIEKVRKSVQLHSPVELDMPF >CP021325|1151062:1158485|1155189_1156014_+|AVK44695.1|DBSCAN-SWA MEIRERILADMQVAETIDAHEEIRKSVEFLKAYLKKNTFLKSFVLGISGGQDSTLTGKLAQMAISEMRAETGDDEYRFFAVSLPYGTQLDESDRQDALNFMEPDNRLTVNIKASVDASVAALAEAGVELSDFAKGNEKARERMKVQYAIAAMHKGVVVGTDHSAEAVTGFYTKYGDGGTDINPLFRLNKRQGKALLKELGCPEHLYLKKPTADLEDNKPALPDEVALGVTYDQIDDYLEGKEVPADAAAKIENWFIKTEHKRHMAITIFDDFWK >CP021325|1151062:1158485|1156395_1156800_+|AVK44697.1|DBSCAN-SWA MQTLMIVCAGGATSSLMAQNVVKSATSEGMDAVLLFPDDVKYKDSFREKYSTRDLVVVMGPVGAITAGKFRDYKEQVDAVLVAPQVKYMYKTVEEVLGELNIPCANINSLDFGRMRGDKILTQGLALMNAKNSK >CP021325|1151062:1158485|1152465_1153479_+|AVK44693.1|DBSCAN-SWA MHKLSVVIAVYNVSEYIEACLTSVLEQNYKNVELIIVNDGSTDDTFQKVEKLVDGHTNVILIDQENQGVSAVRNNGVKAATGDYLGFVDGDDIIAKDMFQKMMDSFEMSDADMVTIGVARLSGDKVYPSTLHERYMVEKKEATTIEETPALLYDTTSWNKVFKKSFWDKHHLEFPEGQMYEDIALMIPAFLYAEKVNIIPDVGYYWRSREGGAKSITQRRNDIAMVNDRLLALKKVNQVLNEKNIQGDLRYQNERKNFEIDLFSMIEWAFLAPKDYYLALQPLIKNYVEQEMKTTALNDIPKEKKRLFKALLANNRPAFLLNSYIYFGKKAVKKITK >CP021325|1151062:1158485|1156928_1158485_+|AVK44698.1|DBSCAN-SWA MFKIMKDFTEQEKIIVLDFGSQYNQLITRRIREFGVYSELHPHTITVEEMKALNPTGIIFSGGPNSVYDEDAFRADERIFDMGIPILGICYGMQLMTTHFGGKVERAKDREYGKADIHVEKPNRLFAGLPTDQVVWMSHGDLVVEEPAGFEVTVTSKSCPIAGIADEERSLYGVQFHPEVRHSVYGNELLKNFALNVCGCKGDWTMENFSEVEIAKIQEIVGDKKVLLALSGGVDSSVVGVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEADQVMETLQGEFNMNIIKVDAKKRFMDKLAGVSDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEANKLDGVEFLAQGTLYTDIIESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRALGTELGMPDAIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRDSDYILREEIKNAGLEREIWQYFTALPNIRSVGVMGDGRTYDHTVVVRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPATVEWE >CP021325|1151062:1158485|1151062_1151446_+|AVK44691.1|DBSCAN-SWA MKKVITYGTFDLLHWGHIHLLKRAKALGDYLIVAISSDEFNRIKHKEAYHSYEHRKLIIEAIRYVDEVIPENNWEQKRDDIEKYGIDVFVMGDDWEGEFDFLKDVCEVVYLPRTEGISTSQIKDELK |
8 | Hokovirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1272534 : 1315276
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP021325|1272534:1315276|DBSCAN-SWA 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>CP021325|1272534:1315276|1292575_1292890_+|AVK44858.1|DBSCAN-SWA MLTQAERHTFYKSKAWVSIRKEVLKRDNYECQECKRQGKVFTDYHDPNKHKRLDVDHIKDLEHHPELALDIDNLTTLCVKCHNKKHNRFQFRRKINKWVNDERW |
56 | Listeria_phage(91.3%) | capsid,head,portal,integrase,tail,holin,terminase | attL 1272418:1272434|attR 1315388:1315404 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1886714 : 1895000
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP021325|1886714:1895000|DBSCAN-SWA ATTAATCGTTCCCTCCATTTTGAATTAATCCTCGAATCACTTTTGGATAAAAAATATGTTCTACTTGATGAATTTTTTCAGCTAAAGTATCTGTGGTTTCTGCTGTTTCAATCGTAACTTTCACTTGGTCAATGATTGGCCCTGTATCCATTCCGGCATCTACAAAATGCGCGGTGACCCCAGTTCCTGAAACATTCGCTTGAATCGCTTGACCAATCGCATCTTTTCCTTTGAATTCAGGTAAAAGAGACGGATGCAAGTTGACAATTTGCTCAGGAAATTCTGCTAATAAAGTTGGTCCAATCAAACGCATATATCCCGCTAGCACCAACAAATCAATTTCCAATCTGCGAAGTTCTAGCAAAATTTCTGTTTCAAAAGCTTCTTTATCCGGATAATTTTTCGCTTCAAAAAGAAAAACTGGAATATCGTGCTTGTTTGCCCGCTCTAAAACATAAGCATTTGGTTTATCACATACCAGTAATTTCACATAAGGCTTAATAAATTCGTCATCCACTAACGCTTGAAAATTCGAACCGCTACCAGAAGCAAAAATGGCTATATTCATCCTTTTTTGCCTCCTGCGAAAATAACCGCGTTGCTTTCACGTGTCGTAACTTCGCCAATAACGTAAGCCGCTTCACCGTTTTGAACAAGAACTTCCAAGGTTTTTTCCACATCCGATTTTGCCACTGCCAACACCATACCAATGCCCATATTGAAAATTTCATACATTTCCATTTCGTTTAATTGGCCGTATTTCTTCACAACATCAAAAATCGGCAACATCGGCCATGAACCTAATTCCACTTTCACAGCTAAATCATTCGTTAACATTCGTGGTAAATTTTCTACAAATCCTCCACCCGTCACATGCGTAATCCCGTGTACAGTTACCTCTTTCAATACTTCTAACACTGGTTTGACATAAATACGTGTTGGTTTAAGTAGCTCTTCCACAAGTGGCACATCTAGTTCACTGATTTCCGCATCGAGCGTAAATTCGTTATCTTTAAAGAAAATTTTCCGAACGAGTGAATAACCATTACTATGAATCCCACTAGATGGAATTCCAATTAACGTATCTCCTGCTTGGACAGCGCCTTCTGTAATTAGTTTTTGTTTCTCTACAGCGCCAACTGTAAAACCAGCTAAATCATAATCATCCGCGCCATACATATCTGGCATTTCCGCTGTTTCGCCACCAATTAACGCTGCTCCCGCTTGTTCACAGCCGTCAGCTACACCTTTAACAATTTGTTCCATTTTAACAGGATCTGTCTTCCCTGTTGCAATATAATCTAAGAAAAATAAGGGCTCGGCACCTTGAGCTAAAATGTCATTCACGCACATTGCCACGCAGTCAATCCCGATAGTATCATGCTTATCTGCTTCAATAGCCAAAAGTAATTTTGTCCCAACACCATCTGTACCAGAAACAAGGACAGGCTCTTTTAAATTCAAGCTACTTAAATCAAACATTCCACCAAAAGAACCAAGTGCCCCCATCGCGCCTATTCGTTCTGTTCTAGCCACATGTTTTTTGATGCGTTCCACTACTTGATAGCCAGCTTCTACGTCCACGCCTGCTTTACTATATGCATTTTCTGCCATTCGATTTGTCACTCCTCATTATTTTTCTGCTTCTAAGCTCGCTAAATATTCCGCTTCATAATCGTATAAAGGGGTTGGGTAATCGCCGTTGAAATAAGCCATACAAAGTCCCCCGTATGGTTCGTTCGGATAAGGTCTACCAATGGAATCTACTAAACCCTCTTCACTCAAATACTCTAAAGAATCAGCCCCAATAATCCGACAAATTTCATCGACAGAATAATTAGATGCGATTAATTCATTTCGCGTTTGAATATCAATACCGTAAAAACAAGGGTAAGCAAGTGGCGGTGAAGCTATTCTCACATGAACTTCCGCTGCTCCCGCTTCCCGCAAAAGTTGCACAATACGTTTACTCGTCGTCCCGCGCACAATCGAATCATCAATCATGACAACACGTTTCCCTTCCACAACCCCACGCACCGCCGAAAGCTTCATTCTAACCCCTTGCTCTCTGAGTTCTTGCGATGGTTGGATAAAGGTTCTTGCCACATATCTATTTTTGATGAGGCCAAGCTCGTATGGAAGTCCAGCCTCTTCCGCATAACCAATCGCCGCAGAAATACTCGAATCTGGCACACCTGTAACAACATCGGCATCAATAAATGCTTCTTTCGCTAGCCTTTTCCCAGAACGTTTTCTAGCTGAGTGGACATTAATCCCAGCGATATTAGAGTCTGGTCGAGCAAAATAAATATACTCCATACTACAAATCGAATGCTTCACATTTTCCGTAAATTTTTCAATCCGAAGTCCGTCATCATTAATAATAATTAGTTCGCCTGGCTCCACGTCTCGAACAAATTCAGCGCCAACCGTTTCAAAAGCACATGTTTCTGAAGCAACTACGTAAGAATCACCAATGCGACCAATCGAAAGCGGTCTAAAACCATTCGGATCAAGTGCAGCATACATCGTATCTTCCGTCAGAAGCATGTACGCAAAGCCACCCTTAACCTTGTTCAAAGCCACTTTTAAATCTTCCACAAAATCCCCTGTATGGCTACGTTTAATTAAATGCGCTAACACTTCTGTATCCGAACTCGTTTGAAAAATAGCGCCTTCTTCTTCTAGTTCACGGCGTAAACTTTTCGCATTAACCAAATTCCCGTTATGCGCAAGTGCTAAAGAAGAACTATGAAAGTGAAATAAAAATGGTTGTACGTTCCCTAAGTTTTTTTGACCAGCTGTCGCGTATCGAACATGGCCAATGGCTGCTTTACCTTTTAAATCATCTAGTTCACCATGTTTAAATACGTCTGCTAAAAGGCCGAGATTTCGGTGACCTTTTAGTATTTCGCCGTCTGTCGAAACAATTCCGGCACCTTCTTGACCGCGATGTTGTAAACTATGCAACCCATAATAGGTGATTTCCGCTGCATTAGGATGATCCCAAATACCAAAAATACCACATTCTTCGTTAAGTCCTTTTACTTCAGCAAGCATGGAATAGCCCCTTCCCAAATGGATCGTAATTCCGTTGTTTTCGCTGTAACTTGATCTTCCTTATGTTTCACACGAATCGTATCATCCTCGGTTACTACACCAAGGCGGTATACTTTTTCCAGTTCCATTAATTGCGCAAAAGCTGCTTCGTTTTCCGGTTTTACCGATACTAAGAAACGTGATTGCGATTCACTGAATAGTTGATTCAACGCAAACGGTACTTCTACTTCCGCACCAAGCCCTGCTTTAAAAGTCGCTTCCGCAAGGGCAACACCAAATCCGCCTTCTGCCAAATCATGACTAGAAGCAACTAGACCTTCCTGAATCGCCGTTAGAAGTAATTGTTGGTATTTTTTCTCTGTCACTAAATCTAATTCCGGCGCACGTCCGCTAATTTTCCCTTGTTGTAATTTCTGCAATTCCGAACCACTATATTCAGCTTTTGTTTCACCAATTAAGAAAATCACATCGCCACTATTTTTAAAATCTTGCGTCGTAATATGTGCCAAATCTTCTACTAAACCAACCATTCCGATAACTGGCGTTGGATAAATTCCGGTACCATCTGTTTCATTATAAAGCGATACATTCCCTGAGATAACTGGCGTATCAAGTTCTAAACAAGCTGCACTAATACCGTCAGCCGCTTTTTCAATTTCCCAAAAAATTTCTGGTTTTTCAGGATTACCAAAATTCAGTCCATCTGTAATCGCTAGTGGTTTCCCGCCAGAACAAACGATATTGCGCGCCGCTTCCGCAACCGCTATCGCTCCGCCTACTTCTGGATCAAGATACAAATAGCGTGAGTTACAATCTGTCGTCATTGCAATTGCCTTCTCTGTTCCACGCACACGAACAATCGCCGCATCTGAACCAGGTACAACAGCTGTATCCGTCCGAACTTGGTAATCATATTGCTCATAAATATGGCGCTTACTAGCAATCGTTGGCTGAGCAAGCAGTTCTTTCCAAACTCCCACCACATCATCCATAGCTGGCACAAACGCTTCCTCTTCTTGGAATGCTTGATAACGAGTTGGTTCTTTTGAAGGCTTATGATAAACTGGCGCGTCTTCCGCAAGTGCATCAACAGGCACATTGGCAACTACTTCACCATGATGAATAATTTTGTACATTTTATCATCCGTTACTTGACCAATCACAACAGCCTCTAAACCATAACGTTCAAATAACGCTTGGATTTCTTCCACATGCCCTTTTTTCACACATAGAAGCATCCGTTCTTGCGATTCAGAAAGCAACATTTCATATGGCGTCATGTGTAGTTCCCGTTGCGGCACATCATCCATAATTAATTCTAGCCCAGCGCCCGCTTTTGAAGCCATTTCAGAACTTGAGCTAACGAGTCCAGCAGCTCCCATATCTTGAATTCCCACTAAAATATCCGAATGATCACGAATCACATCTAAACAAGCTTCAAGCAACAATTTCTCCATAAAAGGATCGCCCACTTGTACAGCAGAACGTTGTTGCTCGCCTTCTTCACTAAACTCTACAGAAGCAAAAGTAGCACCGTGAATACCGTCACGACCAGTTTTAGCACCAACATACATCACCGGGTTGCCAATTCCTTTTGCTTGCCCTTTTTGAATGTCTTTCGCTTCAATTAAGCCTACACACATTGCATTAACTAATGGATTTTTCGTATAACAAGGATCAAATTGGATTTCGCCACCAACCGTTGGAATCCCAATGGAGTTACCGTATCCTGCGATTCCCGCCACGACTTCACTAACTAAGTATTTCGCATGAGGTGTATCTAATTCGCCGAAACGAAGCGAGTTAAGCATTGCAATCGGTCTAGCTCCCATCGAAAACACATCACGGATAATCCCACCGACCCCAGTTGCAGCACCTTGATACGGCTCCACGTAGGATGGATGATTATGACTCTCCACTTTAAAAGCAACACCTAGACCATCGCCAATATCAACAATCCCAGCACCTTCACCCGGTCCTTGCAAAACTTGTTTTCCTTCTGTAGGAAATTTCCGAAGTACTGGTTTAGAATTTTTATAGCTACAATGTTCGGACCACATAACGGAGAAAAGTCCAGTTTCTGTATAATTAGGCTCGCGTCCAAGAATCGAACAAACAAGCTCATATTCACTATCAGTTAAGCCCATTTCTTGATAAATCTTTTGTTCTTTAATTTCTTTTGTCGTTGGCTCCATGTTAGGCATTTACTTGTTCCTCCTTCCAAGCTTTTACAACGGACTCGAAAAGTCTTAAACCATCAGTACCGCCAATAATTTCTTCTACCGCGCGTTCTGGATGTGGCATCATTCCAAGCACATTACCGCGCTCATTTACGATACCCGCAATATCCGCACGACTACCATTCGGATTAACGCTATCATATGTAAAAACAATTTGGTTATTTTCTTTTAGTTTTAAAAGTGTTTCGTCGTCACAGTAATAATTACCTTCTCCGTGAGCAACGGGAACTTGGATAATTTCGCCTTCTTCATAAAGCTCCGTAAACATCGTACTTGCATTTGCCACACGAAGCGGCACTGTTTTACAAATAAAATGCAAATTATTATTTCTAATTAAAGCACCTGGCAGCAAACCAATTTCCGTTAGAATTTGAAATCCGTTACACACACCAAGCACTGGTTTTCCCATTTCAGCAAAGCGCAAAACTTCTGGCATAATACTTGAAAATTTTGCAATCGCACCAGTTCGCAAGTAGTCTCCGTAAGAAAATCCACCTGGAAGTAATACCGCGTCAAAGCCTGCAAGACTTGTTTCCGCATGCCATATATATTCCGCCTCCTCGCCAAGAGAATCGCGAATCGCATGTAGCATATCAAGATCACAATTAGAACCTGGGAACTGAATGACAGCAAATTTCATCGTTTAAGCCTCCTCAATTTCATATCGGTAATCTTCCATCACCGGATTTGTTAGCAGTTTGTCACACATTTCATTTAACACTTCATGAATATCTCTATCCGACTTCGCTACTTTAAGTTCCATAAATTTACCAATACGAACATCTTCTACTTCCTCGTAACCCATGCTTTTCGCTGCATCTTTTACTGCAACCCCTTGCGGATCTAATACGCTTTTCTTTAAAGTGACATAAACTTTGACATTATACATTTTGTGGCCTCCTAGTTTTGAACTTGCTTTAATCTATTCAATACTTCTGTATACACATCTGTTAAATTGCCAATATTCCGACGAAAGACATCCTTATCGAGCTTTTGATTTGTTTCCTTGTCCCAAAGTCTACATGTATCAGGCGAAATCTCATCTGCTAGCAAAATTTCTCCAGCCGCGTCCCGACCAAATTCTAATTTAAAATCGATCAGCGTAATATTCATTTGATTGAATAATTCTTGTAGCACCTTATTAATCGAACGAGCCGCCTGACGAATCGTATCCATCTCACTCGTTGTCGCAACCTCTAAATAAAGCACATGGTCATCATTAATAAACGGGTCATCTAGCGCATCATCTTTATAGTAAAATTCTACTATCGCATTCGGAATTTGCTCGCCTTCTTCTTTTCCAAGCCGTTTCGCAAGACTCCCAGCCATCACATTACGAACAACCACTTCAAGTGGAATAATTGATACCTCTTTCACCAATTGTTCCGTTTCCGAAATCGCCCGAATAAAATGACTCTCTATTCCCGCTTCCGCCAAATGAGAAAAAATAAGCGATGTAATTTGGTTATTAAGCTCACCCTTCCCAGCAAAAGATTCCTTTCGTACTCCATTTAGCGCTGTCGCATCGTCCTTATAAGCAACACGCAAGACACCTGCTTCTTCTGTTTTAAAAAGTCGTTTTGCCTTTCCTTCATAAACCAGTTCATTAGTCACAATAATTTATCTCCTTATAAATTACTTAACCTCTTTGAAAAAATAAATATCAAAGAGGTTAGGTTGTATTCTGCCCGTAATTATAATCCTAAACGATCAAAAATTAAGTCGACATTCTTCAGGTGATAGTTGTAATCAAAGCAATCTGCAATTTCTTCCGCAGATAGGTTTTCAGTAATGGTTGCATCTTGTTCTACTAATTCACGGAAAGGTACTTGTTTTTCCCAAGCTTCCATTGCTCTTGGTTGTACGACATCATAAGCCGCCTCACGAGCCAAACCTTTATCAATGAGCGCAAGTAACACACGCTGTGAATAAATAAGTCCAAGTGTTCTGTCCATATTGCGTTTCATATTTTCTGGGAACACCGTCAAGTTTTTCACGATATTTCCAAAACGATTCAAAATATAATCTAATAAAATAGTAGAATCTGGTAAAATAATTCGTTCCGCTGAACTATGAGAAATATCACGTTCATGCCAAAGTGGTACATTTTCATAAGCAGTAACCATATGACCGCGAATAACGCGCGCTAGTCCAGTAACATTTTCAGAACCAATTGGATTACGTTTATGTGGCATTGCGGACGAACCTTTTTGTCCTTTTGCAAAGAATTCTTCCACTTCGCGCACTTCGCTTTTTTGTAACGCACGTACTTCTACCGCAAATTTTTCTACAGAAGTTGCAATTAATGCAAGTGTTGCCAAATATTCAGCATGTCGATCACGTTGCAATGTTTGCGTAGAAATAGGTGCAGGTGTCGTTCCTAATTTTTCACATACGTAAGTTTCTACAAAAGGATCAATATTTGCATACGTCCCAACCGCCCCAGAGATCTTTCCGAATTCCACACCATCAGCCGCAAAATTAAAACGTTCTAAGTTACGTTTCATTTCCTCGTACCATAGAGCAAGCTTCAACCCAAAAGTAGTAGGTTCCGCGTGAACACCATGTGTACGTCCCATAGTTACAGTATATTTATGTTCTTTTGCTTTTTCGCCAATAATCGCAATGAAATTTTCCAAATCCTTGCGCAAAATCTCATTCGCTTGTTTAAGTAAATAAGAATTCGCTGTATCCACTACGTCTGTTGATGTTAAGCCATAATGAACCCATTTACGTTCCGCACCAAGCGACTCAGAAACCGAACGAGTAAATGCCACAACATCATGTCTAGTTTCTAGCTCAATCTCATGAATACGATCTACATCAAACTTCGCATTAGCACGAATCTTCGCAACGTCTTCTTTCGGAATATCACCAAGCTCTGCCCAAGCTTCACAAGCCAAAATCTCCACTTCTAGCCAAGCCTGATAACGATTTTGTTCTGTCCAAATGTTGCCCATTTCTTTACGAGTATAACGTTCTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP021325|1886714:1895000|1891969_1892653_-|AVK45421.1|DBSCAN-SWA MKFAVIQFPGSNCDLDMLHAIRDSLGEEAEYIWHAETSLAGFDAVLLPGGFSYGDYLRTGAIAKFSSIMPEVLRFAEMGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALIRNNNLHFICKTVPLRVANASTMFTELYEEGEIIQVPVAHGEGNYYCDDETLLKLKENNQIVFTYDSVNPNGSRADIAGIVNERGNVLGMMPHPERAVEEIIGGTDGLRLFESVVKAWKEEQVNA >CP021325|1886714:1895000|1887277_1888327_-|AVK45418.1|DBSCAN-SWA MAENAYSKAGVDVEAGYQVVERIKKHVARTERIGAMGALGSFGGMFDLSSLNLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYIATGKTDPVKMEQIVKGVADGCEQAGAALIGGETAEMPDMYGADDYDLAGFTVGAVEKQKLITEGAVQAGDTLIGIPSSGIHSNGYSLVRKIFFKDNEFTLDAEISELDVPLVEELLKPTRIYVKPVLEVLKEVTVHGITHVTGGGFVENLPRMLTNDLAVKVELGSWPMLPIFDVVKKYGQLNEMEMYEIFNMGIGMVLAVAKSDVEKTLEVLVQNGEAAYVIGEVTTRESNAVIFAGGKKG >CP021325|1886714:1895000|1889757_1891977_-|AVK45420.1|DBSCAN-SWA MPNMEPTTKEIKEQKIYQEMGLTDSEYELVCSILGREPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTEGKQVLQGPGEGAGIVDIGDGLGVAFKVESHNHPSYVEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPIAMLNSLRFGELDTPHAKYLVSEVVAGIAGYGNSIGIPTVGGEIQFDPCYTKNPLVNAMCVGLIEAKDIQKGQAKGIGNPVMYVGAKTGRDGIHGATFASVEFSEEGEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLDVIRDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGAGLELIMDDVPQRELHMTPYEMLLSESQERMLLCVKKGHVEEIQALFERYGLEAVVIGQVTDDKMYKIIHHGEVVANVPVDALAEDAPVYHKPSKEPTRYQAFQEEEAFVPAMDDVVGVWKELLAQPTIASKRHIYEQYDYQVRTDTAVVPGSDAAIVRVRGTEKAIAMTTDCNSRYLYLDPEVGGAIAVAEAARNIVCSGGKPLAITDGLNFGNPEKPEIFWEIEKAADGISAACLELDTPVISGNVSLYNETDGTGIYPTPVIGMVGLVEDLAHITTQDFKNSGDVIFLIGETKAEYSGSELQKLQQGKISGRAPELDLVTEKKYQQLLLTAIQEGLVASSHDLAEGGFGVALAEATFKAGLGAEVEVPFALNQLFSESQSRFLVSVKPENEAAFAQLMELEKVYRLGVVTEDDTIRVKHKEDQVTAKTTELRSIWEGAIPCLLK >CP021325|1886714:1895000|1892656_1892902_-|AVK45422.1|DBSCAN-SWA MYNVKVYVTLKKSVLDPQGVAVKDAAKSMGYEEVEDVRIGKFMELKVAKSDRDIHEVLNEMCDKLLTNPVMEDYRYEIEEA >CP021325|1886714:1895000|1893707_1895000_-|AVK45424.1|DBSCAN-SWA MLERYTRKEMGNIWTEQNRYQAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVAKIRANAKFDVDRIHEIELETRHDVVAFTRSVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTANSYLLKQANEILRKDLENFIAIIGEKAKEHKYTVTMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLERFNFAADGVEFGKISGAVGTYANIDPFVETYVCEKLGTTPAPISTQTLQRDRHAEYLATLALIATSVEKFAVEVRALQKSEVREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMVTAYENVPLWHERDISHSSAERIILPDSTILLDYILNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTLGLIYSQRVLLALIDKGLAREAAYDVVQPRAMEAWEKQVPFRELVEQDATITENLSAEEIADCFDYNYHLKNVDLIFDRLGL >CP021325|1886714:1895000|1886714_1887281_-|AVK45417.1|DBSCAN-SWA MNIAIFASGSGSNFQALVDDEFIKPYVKLLVCDKPNAYVLERANKHDIPVFLFEAKNYPDKEAFETEILLELRRLEIDLLVLAGYMRLIGPTLLAEFPEQIVNLHPSLLPEFKGKDAIGQAIQANVSGTGVTAHFVDAGMDTGPIIDQVKVTIETAETTDTLAEKIHQVEHIFYPKVIRGLIQNGGND >CP021325|1886714:1895000|1892913_1893627_-|AVK45423.1|DBSCAN-SWA MTNELVYEGKAKRLFKTEEAGVLRVAYKDDATALNGVRKESFAGKGELNNQITSLIFSHLAEAGIESHFIRAISETEQLVKEVSIIPLEVVVRNVMAGSLAKRLGKEEGEQIPNAIVEFYYKDDALDDPFINDDHVLYLEVATTSEMDTIRQAARSINKVLQELFNQMNITLIDFKLEFGRDAAGEILLADEISPDTCRLWDKETNQKLDKDVFRRNIGNLTDVYTEVLNRLKQVQN >CP021325|1886714:1895000|1888345_1889773_-|AVK45419.1|DBSCAN-SWA MLAEVKGLNEECGIFGIWDHPNAAEITYYGLHSLQHRGQEGAGIVSTDGEILKGHRNLGLLADVFKHGELDDLKGKAAIGHVRYATAGQKNLGNVQPFLFHFHSSSLALAHNGNLVNAKSLRRELEEEGAIFQTSSDTEVLAHLIKRSHTGDFVEDLKVALNKVKGGFAYMLLTEDTMYAALDPNGFRPLSIGRIGDSYVVASETCAFETVGAEFVRDVEPGELIIINDDGLRIEKFTENVKHSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHSARKRSGKRLAKEAFIDADVVTGVPDSSISAAIGYAEEAGLPYELGLIKNRYVARTFIQPSQELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVQLLREAGAAEVHVRIASPPLAYPCFYGIDIQTRNELIASNYSVDEICRIIGADSLEYLSEEGLVDSIGRPYPNEPYGGLCMAYFNGDYPTPLYDYEAEYLASLEAEK |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2394106 : 2450223
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP021325|2394106:2450223|DBSCAN-SWA TTTAATCTTCTAATGCAGAAATGAACGCTGGTAAATATTCTGGTAAATCTGGTGGGCGACGGCTTGAAATAATGTGACCGTCTGTTACAACAGGCTCGTTATGCCAAATAGCTCCCGCATTCGTCATATCGTCTTTAATTCCCGGCGTACTTGTGACATTCACACCTTCTAAAATACCGGCCGAAACAAGTACCCATCCAGCATGGCAAATTTGTCCGATTGGTTTTTTCGCCTTATCAAACGCACGAACCAAATTTAGTACGCTATCAAAACGGCGTAATTTGTCTGGGGACCAGCCACCTGGAACTAAAATCCCATCATAATCTTCTGCGCGAACAGAATCAAAATCATAATCAGAAGTAACAGGGACTCCGTACTTACCGTGATAAACCTTTTTTGCTTCCTCTGCAACTAAATGCACAGAAGCTCCTGCCTCGCGTAATCTAAGCACTGGATACCAAAGTTCTAAATCCTCAAAGTCTTCACTTACAAGGGCAATAACTTTTTTACCTTTTAAAGTCATATAAATCTCCTCCTATCCTCTTCTACAGTATAACAATAACCAGATTGTTATTAAATTATTCCGCCTATAAAAGAAGACAAAAAAAGACGCTCGAAATAAACATTTCCAGCGTTGCCATCATGTTCGGGCGCCTATGCATAACGGGATGAGGCATAGACATGAACTACACGGCCAATGAGATGAATGAAAACAAATAATGATTTTGGTGTCTAAACAGATGTCTGACTAGTTGCCATTCTATTGGAAGATGGATACACCAAAAGTCATTATAACCATGATAGGGTCTTATCCCCATGAAAATCACATTAGTAAAAATGAAACTTTCATCGAGGTAAAACTCTATCCTATAACTTATTTTACTATTGTTCTTGAAAAAAGCAAGTAAATAAATATAGATTTTTTGTGACGAAGATAAGAAAGATGAGAATTGCCTCACTATTATTGTCGTTTTCTGTATAAAAATTACTATATTACAAATAAAAAGGAAACCATTAAAGGTCCCCTTCAACTAAAAATTTCTACAACCATCCAAGAAATAATAGCGACTAATGGAATTAAGACCCATACATTATGACCAAGTAAGCTAGAGCGAACATCTGGTTTATCTTCGAGTAGTTGAATTCTATCGCGCAAGTCATGCACTTCAAGCTCGAGGTCCTGTACTTTATCTTCAAGTTCGTATAAACGTTCTTCCATTTTAATCCCTCCACACCTTTTCTATTGCCTATTATACGCCAAGCACTATGAAATGCATCGTTCCATAGGCTGATTTATTGCTAATTTATTGTCATACCGTTCAGGCATTTGCTACAATGAAAGAAAACTATCAACTGTTGGGGTGGAAAAATGGAAATTCAAGTAGAAGAAGCTGTTGTAAAACTCATTTTGCATGGCGGAAACACACGAAAAGAAGCATACAAAGCAATTGATTTTGCAGAAAAGTATCAATTCGATGAAGCCGATAAACATCTGCAAATCGCACAGGATCAATTCCAAGAAGGTCATATTTGGCAAACGAAATTAGTATCCATTCGCGACTCAGAAACGGTAGCTCATCCTTCCTTTTTACTTATTCATGGGCAGGATCACTTAATGACCGCACAAGCAGAATTGCAACTTGCCAAAAGAATCATTGAACAATATAAACATCAACAACGCTTAGAAGAACGACTTACTAAACTTGAAAATCAAGCATGAGATGTAGCTGGGAATAAGAAATAATTCTCATTCGTAAGTATATTCGGGCGCACAAACAACATATCTTCCGTTTCAATAATATGCGCGGCATCAATGTATTTGCTTTTTTCCGGTGTGAAAAGAAGATGAATTGTTTCGATTTTTTTGATAGGTAGATACCTTAGAACTTCCACCACATCTAGTTTTTTCGTACTAAGTATATCTAGCACATATAAATCAGCATCTTCTTGCTCCATTAATACAATTACATCTAATTCTTCTATATAATAAAGCTCATTTTTCAAGGCAATCAATACATAAAACATCAGTAAATCTTCACTTTCTCGAACATCTAGAATATTAGAAAGTGGCGTTTTTTCGGATACAATACGACTTATTAGCTGAAAATCCGTTTTATTACCGGGATTCAGCTTTTTTAAATTACTAGATTCTCTTTTCAAACTGCAAGCATCTACAGTAAAACTGCTTTCCTCCACACGCTCAAATCCAAATTTCGGGTAAAAATCCAGTACAGTATCATTCGCAAATAGATAAAGAAAATCATACTGGTCTTCGTATTTGGCTATTACATGCTCTAATAATTTCTTAGCAAGCCCCTGCCCCCGATAATCCGGATGCGTCATTACTGTCCCAATTTGCAAGGCGCGGTAATCTTCCCCTTGGTAAATTAGATTCATCTTATTGATAGAGACATTCGCGATTACCTTGTTATCATCAATATATGAATAGCAAATATACTTATCATTCCAAAAGCCGTCCCTGTACCATTCTTCAAAATTAATATCAAATGTACTTTCAGCAAGCCTATTAAAACTATCACGATACATTTTATTATCTTTATAATCACTTATCATTTCATAATTCATCATTCTAATCCTCTATTCCTTCGTATAAAAATAACAGGTACAACGCGAAATACGTCCTACCTGCTCATTTTTATTTAATTTAACGTATTCCAAGCGCTATTTTTGCATAGCGTGACATACGATCTTTAGTCCAAGGTGGATTCCAAACAAGATTTACATTTGTATCCTTCACTTCTGGAATATCACTAAGCGCCATCTGTACTTGCTCAGTCAAAATACCAGCAAGCGGACATCCCATTGTTGTAAGCGTCATTGATACTGTGCAAAGTCCGTCATCATCTAATTCAACATCGTATACAAGCCCAATATTCACAATATCAATTCCAAGTTCTGGATCGATAACTTGTTCTAGTGCGCCCATTAGATTTTCTTTCAGTTGCTCATCCATGAAGCATATGCCTCCTTTTTGCCATTTTGTACATTTATTGTATCATATATGAGAATGATTTTCATTATAAGAATTTCTCAAAAAAGCTGACCCCTTGTAGCATTCCTTCAACGGAAACTTTGTGTTTTGCATTATCATCAATGATAAATTGCACATTATCTGCCAAGCTTTCTTCTACTAATGTTTGGTATAACTTTTCGCTGTACGCAAAAGGTACCACATCGTCTTTTTTGCCATGCCAAAGTAACAATGGTCGGTTATTTATTTTGGTGATATTTTGAGTTAAATCATATTTTTGTAGCGCTAAAATCCGTTCATCCACATCAAACGGAAAAGTTAACCCTTGCGCCAACGCATATTTGGATAGCTCTTTAGCAAAATCAACATAATAGGCACTTCTCATTAAACTAACGGCTACTTTAATATTTTCATATAGCCCAAGAAGGCCAAGCGAAGTAATAGCTCCCATGGAAACTCCGCCAACACCGATACGATTCGCATCTGTTTTCCCAGCTTTAATTAGCTCATCTGTAATCAGCGGGAACTCCGTAATATTCGTTTCAATCACATCCCAAAAGAATGTAGCCTGGTCTTCCGGATTTGCTCCTTGTAGGCGCTCGCCATGTAACTTCGCATCTGGCAAAATCACGCGGAAGCCACGTTGCGCAAGTAAATAGCCATAATGTAAATATAATTCTTTTTGAGATGTAAAGCCATGATAGAAGATAATCGTTGGTAACATTTTATCTGCATTTTCGCTATTACTAATATGTAAAACTGGTATTCCCGCAATTTGTTCATTTTCCACTTGAATCATTGTGAAGCCTCATTTCTATTAGGTTTATTAAGCTATTGTAAAGGTCGGAATCATTTACAAAATGGTGATAAACGTCTATCATTGATGTGTGCCCTTATTTTAGCATGAAGGGGCAGCTTTGAACCAAACATATGAATTAAAGGAGCAAACTATGTCTAAAAAACTAATCGTACTAGACCTTGATGGCACAACACTTAGAGATGATTTAACTATCTCTTCGCATACAAAAAACACTTTAGAAAAGGCGCGCATGGCCGGTCATGAAGTAATGATTGCAACCGGACGCCCATATCGAATCAGTGGTTCTTATTACCATGAGCTAGGATTAACAACACCGATTGTAAATTTCAATGGTGCCGTGTATCATCATCCTAGACTCACTACATTTGCGGAAGGCTATCACCATGCCATTGATCTACAAGTTGTTCACGAGTTACTTGATTTTTCCAATGGCTTTTCATTAGATAATATCGCAGCAGAAGTACAGGATAACGTCTTCTTAAAAGAACGAAACAACAGCGTTCCCGAAACATTCCATTTAGGCACTGAAAATATTGTATTCGGAAACATCCGTGATGCGATTAAATCAGATGCTACTTCATTATTGTTTTTCGGAAAACTGGACCAACTCGATTTAATTAGCAAGCACTTGGATGAATCTCTTTCTGGCGTTATTTCTCATCACACATGGGGTGCATCTGCTTGGCCAGCTGTAGAAATTATTAAATTTGGTATTCATAAAGCCATTGGCGTGCAAGCCGCAGCTAAAACACTTGGTTTTGACCGTAAAGATATCATTGCATTTGGAGATGAAACGAATGATTTACAAATGCTTGATTATGCCGGCGTTGGTGTTGCTATGGGAAATGCCGCTGAGTCCGTGAAAAATGTTGCCAACGTGGTAACAGCATCTAACCAAGATGATGGGATCGCAGTCTATTTAGAAGAAAACTTAAACTTATAATAAAAAGCTGCAAGTAATGTCTTACAAAAGTTAGGAATGCTAATTTTTGATTCAAGAGCCATTACTTTGCAGCTTTTTTACATCATTTTATTTTTATACATCGCCATTGCTAATTTTTGATCTGCTTCTGAACGAAAATCACCAAATACGCTTGAGGTCTCCATAACATTAATAAATGCTTTAGAGTCAAACTCGCCAACAATGTGCGTAATATCATATAGTTCATAACGCGTAATCACCATAAT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79 | Listeria_phage(92.73%) | capsid,protease,tail,holin,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2593512 : 2601356
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP021325|2593512:2601356|DBSCAN-SWA ATTAACTATTACTGATTTTCAGCCCTACTTGCGCTGGTGTTTCTCCGCTTCTAAGGCGCTCTGCAATCTGATCTAGTTTCCGGAGACGATGATTAATACCTGATTTACTTACTTGACCCGTTGTCAGCATTTCGCCTAGCTCTTTTAAGGTAACATCCTCATTAGCTATACGAAGCGCTGCAATCTCACGCAATCGTTCTGGTAAAGCTTCTAGTCCAACGGTTGATTGGATATATTTGATATTATCGATTTGCCTAACAGCCGCATTAATTGTCTTGTTGAGATTCGCTGTTTCGCAGTTTACTAGCCTGTTCACCGAATTTCGCATATCTCGCATAATCCGAACATCCTCAAAATGAAGAAGCGCGCTAGTTGCTCCGATAATACTCAAGAATTCCGTGATTTTTTCCGCTTCTTTCAAATAGGTAATAAAACCATTTTTCCGTTCAAGCGTTCGCGCGTTAAGATCAAATTGGTTCATCAAAGCGCAAATTGCCTCGTTGTGCTCCTCATAAACAGAAAAAATTTCTAAATGATAGGAAGAAGTTTCCGGATTATTAACTGATCCACTTGCCAAAAAGGCTCCGCGCAAATAAGCACGTTTGGCGCTTCTCTTCTTAACAAATCCCCTATCAATCGATTTCGTAAACGTCATCGGTGGCTCTAGTATCCGCAAATCTTCCAAAATCCCCCGTGTACCAGACTTCAATCGAACTATATAAACATTATTTTTTTTCAGCTTCATTTTGCGACGTACAAGAAGTTCAATTGGCACTTCATATAAGTCTTTCAGTAATTGATACATTCGTCTAGCTATAGCGGCATTCTCTGTTTGGACATCCATGATGACTAATTGACTCGAAAACGAGATGGCGCCATTCATTCGAATAAAAGCTGCGAGTTCCACTTTTGCATCGCTATCACTTACGTCCATATGGGTTAATTCTTTCTTGGTTTCCGATGCAAATGACATGGCTTACTCACTCCTTTTCATTAGTTTGGTTAGGTAACATCGCTAAAAGCGCGTCCGCCACCTTTTCAGCGGCATGGCGCACAAGACCATCCTCTGTAGAAAGAAAATCTTGATAAATTGCTTCTACACCAAGTTCTTCCATTCCTTTAGCATTATGCTCTACTTGCGCAACGTCTTCTGGGAATAGAAGCTCTTTTGGAACAGTCGTCGTATTAATTAACGTTTTATCTATAAATGATTTCCCCACATGCTCATGGATAACTTTAATGTGATCCGCATCTGAGAAAAAGTCGGTTTCGCCAATTTGCGTTAAAATATTCGTAATATAAACTTTCGGAGCCTTACTTGCTGTGATTTCATCGGCCAACTCCGTAAGTAATAGATTTGGTAAGATACTTGTGTATAAACTTCCTGGACCAATAACAATCAAATCAGCCTCTTTCACTGCTTCGACTGCTGTCGGATAAGGTTTTACATTTTCTGGTTCGATATACACACGATTAATATGCTTTCCTTGTAACGGGATAAGCGATTCACCGTGCACAATAGAACCATCTTCCATTTCGGCATTTAAAATAAGTGGTTGATCCGTTGCTGGAATAACTTTGCCGCGGATTTTCAGCACCGTTGCTAGCACATTAATCGCATCAACATAACTATCATTCAATTGCGATAAAGCCGTTAAAATCAAATTCCCAATAACATGTCCCGATAAATCACCATCTACCGCAAAACGATACTGGAATAAATCAACAACACGTGGATCGACATTGGATAAAGCCAGCATAACATTGCGTATATCACCTGGTGGAAGCACATCCATTTGCTCGCGAATTTTACCAGAACTACCACCATCGTCCGCTACTGTCACGATGGCCGTTAGATGAATGTCCTTCTTTTTAAGCCCTTTTAAAATAACTGGAAGACCAGTCCCCCCACCGATTACTACTACTCTAGGTTTCGTTTCCTTTTTCATATTAACGACCCTTTCTACGTTTCATATCTCGGTGCGAAATCGTTGTCTCATATTTTTGTTGAATTGTCTTACCAACAAACTCTGTCAAGGCTACCGAACGATGCTGTCCTCCAGTACATCCAATGGCAATAACTAATTGTGTTTTTCCTTCTCGTTTGTAAAAAGGGAGTGTAAACATTAATAGATCTACTAACTTATCTAAAAAGGTCTGCGTTTCTGGCCATTTCATCACGTATTCATAAACATCTTCATCAAGCCCTGTCAGCGGACGCATTTTGTCAATGTAATGCGGATTCGGTAAAAAGCGTACATCAAACACTAAGTCAGCATCAATTGGAATGCCGTATTTGAAACCGAACGACATCAATTGCACATTGAATATATCTTTATCTTCGGTTTGGAATTCATTGTTAATTCGTTCTCTGAGTTCGCGCGGTGCCATATTTGACGTATTAATAACTAACTGCGAACGCCCTTTTAAATCGCTAAGCAGTTCGCGCTCTGCATTAATCCCGTCAAGCACAGACCCATTAGGCTCCAGTGGATGGTGGCGGCGCGTTTCTTTATAACGCGAAACAAGTACCTTATCATCAGCCTCTAAAAAGAGGATTTTCGTTGTTATAAAATTGGTATTATCTAGCTCATCTAGTGCTGGTTCAATGGAATCGAAAAACTCACGGCCGCGAAGGTCCATTACGAGCGCGATTTTATCCATTTTATCGCTTTCTTTCATTAACTCCCAGAATTTCGGAAGTAAACTTGGCGGTAAATTATCTACACAAAAATAACCGAGATCTTCTAAAGACTGCATTGCAACTGTTTTTCCTGCCCCAGACATCCCAGTAATGATTACTAATTTTAATTGTTTAGAAGCCATATCTGCCTCATCCTTTCGCACAAATAATATCTACCTTCCATTTTAGCACACTTCCCACTAGAAAATCCCGGAAAAGTCTCTAAAGCGAGTTTCCGGGATTTTTCTTTTTAAGCTTCGATATGTTGCATCAAATCAGCTTTCACTTTTTCTAATTTTGCCGTACTTTCTTCTTTACTTTCACCACGAATACTAAAGTAGAATTTGATTTTCGGTTCTGTGCCCGATGGACGTAAACAGAACCATGAACCATCTTCAAAATAACATTTAATGACATCTGCTGTTGGTAAATGTATCGCTTCAGTTTTTCCAGTAGCAATCCAAGTCGTTTCACTTCTCAAATAATCTTCCGCACGTTCTACTACGAACCCACCCATACTTGTTGGCAGTTGTTCACGGAAGCTACTTGTAATTTCTTTGATGCGCTCAGAACCATCTTTTCCACTTAACGTAAGTGAAACGAGATCCTCATTATAATAACCAAATTCATCATAAATTTGATCTAAATCTTCTAATAAAGTTCTACCTGCTACTTTGCTAACGAGCGCCACTTCAGCAATCGCAAGAACCGCTTGAATCGCATCTTTATCACGCGTAAATGGCTTAACCATATAACCATTGCTTTCTTCATAACCAAATTCAAACGTATGCTTGCCAGTTTCTTCAAAGTGCTTAATTTGTTCTGCAATAAATTTGAAACCAGTTAATACTTCAATCATTTCAGCGCCGTAATGTTTCGCGATTTCTGTTCCAAGATTACTTGTTACGATAGATTTTAATACCGCTGCATTAGCCGGCAACTCACTTTGCGCTTTCTTTTGTTTTAATAAATAATGTAAAATAATCGCACCAATTTGGTTTCCAGATAAAACTTCGTATTCTCCGTCCGCATTACGAACAGCCACGCCTAAACGGTCAGCATCCGGGTCGGTTCCTACTAAAATATCCCCGCCAAACTTCTTACCATATTCAATCGCAAGTAAAAAGGCTTCGCGGTTTTCCGGGTTAGGCGATTTTACCGTTCCAAAATCGGGATCATTCACAAATTGCTCGTCAACCTTAACAATATTCGTAAAGCCAACACTTTCAAGCGCAGGAACGCCAAGAATTCCGCCAGTACCATGAAGGGGCGTGAAAACAATTTTCAAATCCTCCCCTCGTTCTTGAACAAGCTCTTTATTGACAATAACCTCTTTTAATTTTTCCAAATATGGACGGTCTACTTTTTCACTGATTACCTCAAGTAAACCATTTTCAATTAATAGCTCTTGGTTCGCTACTTCTACAGAAAAAATATCCTCTACCGCGTTTATGTATTCAATTACAGCACTTGCGCCTGTTGGAGGCATTTGTCCGCCATCTTCACCATAAATCTTGTAGCCATTGTATTCTGGCGGATTATGGCTAGCTGTGATAACAATTCCACCAAACGCATTTAAATGACGCACTGCAAAAGAAAGTTCCGGTGTTGGTCGAAGCGCATCAAAAACATAACTTTTCACACCATGATGCCCTAATACTGCCGCCGATTCAAAAGCAAATTCACGCGACATATGACGAGGATCATACGCAATAACTATCCCACGTTTTTTAGCCTCTTCCCCGTTCTCCGCCACAAATTGCGCCAAACCTAGAGAAGCCTTACGAATAGTATAGATATTCATACGGTTTGTTCCAGCACCTAGTACGCCACGCATCCCAGCAGTTCCAAATTCCATATTACGATAAAAACTATCTTCAAGTTCTTTTTCATTTGTCTCCATATTCGTTAATTGTTTTCTTAATGTGCTATCTAATTTGTCATTAGCAACCCATTTTTGATATTCTTCTTGCCAATTCATTCTCTACACTCCTTCATTTAGAACTCTTTAATTAAAATTTATCAGCTCTCCACTGTGAAACGAAAAGCTGTTCTAGATGTAAAAGGTTTTTCTGGTCGAAGTACAATATCACCAAATCCCTCATGGTTAATCGCATCCACCAAACCCTGTGTTTCCATTGTTATGCCAGCATATTTTGGCACAGCTCGCTCGTCAATCTCAAAAGAGCCATCCAAACTATTCGCCGTATAAATTAATACCGAGTCAGCTTTGGTTTCCATTTCCAAGCGCCGTCCTGACTTTGGATCAAACAAAACTGCATCTGGACGACCATTTTCATGTTTTAAAATGAACGTATGATCCAGCCCCGCACCAACTAATTTTACTTGCTGGTCCTGACTTTGTGTAATCTCCGCTACTTCACGACCTGCACGCAAATCAAAGATAGTATTTTCCGCTAACCGCTTTTCCCCAATTGGGAGGAACTCTTCATCAATTGGTAGGAAGCTATCACTATTGACCCAAAGCTGATGTTGTAAAACCGTTGAACCAGCTTCTCCGCTCAGATTAAAATAAATATGATTGCTCGGGTTATATATAGTCGGCTGATTGCTTCTCGCTTCATAATCAACCAGCCATTCATTTTTATTATTTAACGTATATGTCATTTTTGCATCAATTTTTCCTGGATAGCCATTTTCTCCATCCGCCCAGCAGTATTCAAAAGTCATCACAATTTGATCAAGACTTTTTTCTACTGAAACATCCCAAAGCTTCTTACTAAAATTGAATTTCCCACCGTGACGATGGTTAGAGCCTTCATTTTGAATCAGTTGAAATTGTTTGCCATCCAAACTAAATTGCCCATTTGTAATACGTCCAGCAACAGGGCCAAGTGTCGCGCCGAAGTAAGGAGAGTGTGCCAAATAATCATCTAAATTTGTAAAACCAAGACTAATATTCGCAAAATCACCAAATTTATCTTTTGTTTCAAGTGAAGTAACAATCGCTCCGTAATTTAAAACACTCATGCGCATATCATGATCATTTATCATCGTCCACTTCCAAACAGTTTCTCCTTCAAACTCCCCAAATCGCTCCTTCATTACTTCGATAAAAATCACATTCCTTCATAAGTTATTAATAGCCATTTGGATGAGATACGTGCCATTTCCAAGCAGTGGCGATAATATCTTTTACATCTGTATAAGTTGGCTCCCAACCAAGAATTTCGCGCGCTTTATCACTAGAAGCAATTAACGTTCCTGGGTCTCCTGCACGACGTGGTACTACTTCAGCAGGGATTTCTTTTCCTGTTACAGTACGAGCTGCTTCAAGCATTTCTTTCACAGAAAAACCGTTACTGCTACCAAGATTGAAAATATTACTTTCTCCCCCATTTTTCAAGTATTCTAGCGCTCTAATATGTGCGTCTATTAAATCTTCTACTTGTACATAGTCACGAATACAAGTACCATCTGGTGTATTATAGTCATCACCGTAGATCGCTAATTTTTCTCGTTGACCAAGCGCAACTTGTAAAATAATTGGCACTAGATGCGATTCTGGTTTGTGATCTTCCCCAATCGAACCATCTGCTTTTGCACCAGCGACATTAAAATAACGGAGTGCAACAAATTTCATGCCGTATGCTTTATCGCACCATTTCATCATTTTTTCCATGATTAGCTTTGTTTCGCCATAAGTACTTTCCGGATTTGTTGGCATATCTTCCGTAATTGGCACGCGTTCTGGTTCACCGTATGTAGCCGCACTGGAAGAAAAGACGATATGCTTCACATCAAATTCCTCCATCACTTCTAAAACGATTTGCGTACCATAGACATTATTATTTAAATAATCCAGCGGTACTTCCATCGATTCTCCTACAAGTGAACTAGCAGCAAAATGAATCACACCATCTACTTTTTCTTTTTCAAAAACTGAACTTAAAAATGCTTTATCACGAATATCTCCTTCATAAAATTTTGCCTTTTTATGAATGGATTCCCTATGCCCTGTTCTTAAATTATCAATAACTACTACTTCATATCCGCGAGTAATTAACTCATCTACTGCATGTGAACCGATATAGCCAGCGCCACCAAGTACAGCAATACCCATTACTTATCTCTCCTAACGCTTGTCTTTGTATTTCATTTTACACTACTCTGGTCTATATAGTCACGCAAAAATGGGTCTAAGATAAATAATCTCAGACCCATTCGAGTTTTCTTTACTATTATTTAGCCGCCTCAGCTTCTAGCGACTCTTTTAATTCTTCTACATATTTTTGAGCATTTTGTCCAGCAAGTCCGCCGTCGCCTGTAGCTGTTACAATTTGGCGTAAGCTTTTCGCACGAACATCACCTGCTGCAAAAATACCAGGAAGATTTGTACGCATTTCTTCGTCCGTTACGATGTATCCTTCATCATCTGTAATACCTAAATTTAAGAATGCTTTCGTAAGTGGAACAAGTCCAACATAGATGAAAACGCCATCTACTGGCATAATCGATTCGGAGCCATCCACAGTAGAAACAAGTTTTGCTCCTGTTACTTTTTTACCATCGCCAACAATTTCTTCTACTGTACTATTCCAAATGAAATCAACTTTTTCATCTTTAAAAGCACGATCTTGTAAAATTTGTTGTGCTCGCAATTTATCACGACGGTGTACAATGGTTACTTTATCTGCATAACGAGTCAAGTAGGTTCCTTCTTCCACTGCAGAGTCTCCGCCGCCAACCACAATTAATTCGCGATTTTTGAAGAATGCTCCGTCACAGACTGCGCAGTAAGAAACACCACGTCCACTAAGTTCTTCTTCACCAGCCGCGCCAAGTTTACGGTGTTCAGCTCCAGTCGCAATAATAATTGCCCGAGCCTTGTAGGTTTTCGACCCAGCTGTTACTGTTTTAAATTCTTTACCGTCAACAACTTCTTTAATATCACCATAAGCATACTCAGCTCCAAATTGTTTCGCACCACTAAGCATCTTGTCGGACAAATCTGGTCCTAAAATGCTATCAAATCCTGGGTAATTTTCTACCTCAGCTGTGTTAACCATTTGTCCACCGGGTACACCGCGTTCAATCATTAACGTATCTAAATCTGCACGGGAAGTATATAAAGCTGCTGTCATTCCAGCAGGCCCCGCCCCAATAATAATCACATCATAAATTTTTTCTTCACTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP021325|2593512:2601356|2595461_2596337_-|AVK46129.1|DBSCAN-SWA MASKQLKLVIITGMSGAGKTVAMQSLEDLGYFCVDNLPPSLLPKFWELMKESDKMDKIALVMDLRGREFFDSIEPALDELDNTNFITTKILFLEADDKVLVSRYKETRRHHPLEPNGSVLDGINAERELLSDLKGRSQLVINTSNMAPRELRERINNEFQTEDKDIFNVQLMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPHYIDKMRPLTGLDEDVYEYVMKWPETQTFLDKLVDLLMFTLPFYKREGKTQLVIAIGCTGGQHRSVALTEFVGKTIQQKYETTISHRDMKRRKGR >CP021325|2593512:2601356|2600396_2601356_-|AVK46133.1|DBSCAN-SWA MASEEKIYDVIIIGAGPAGMTAALYTSRADLDTLMIERGVPGGQMVNTAEVENYPGFDSILGPDLSDKMLSGAKQFGAEYAYGDIKEVVDGKEFKTVTAGSKTYKARAIIIATGAEHRKLGAAGEEELSGRGVSYCAVCDGAFFKNRELIVVGGGDSAVEEGTYLTRYADKVTIVHRRDKLRAQQILQDRAFKDEKVDFIWNSTVEEIVGDGKKVTGAKLVSTVDGSESIMPVDGVFIYVGLVPLTKAFLNLGITDDEGYIVTDEEMRTNLPGIFAAGDVRAKSLRQIVTATGDGGLAGQNAQKYVEELKESLEAEAAK >CP021325|2593512:2601356|2594491_2595460_-|AVK46128.1|DBSCAN-SWA MKKETKPRVVVIGGGTGLPVILKGLKKKDIHLTAIVTVADDGGSSGKIREQMDVLPPGDIRNVMLALSNVDPRVVDLFQYRFAVDGDLSGHVIGNLILTALSQLNDSYVDAINVLATVLKIRGKVIPATDQPLILNAEMEDGSIVHGESLIPLQGKHINRVYIEPENVKPYPTAVEAVKEADLIVIGPGSLYTSILPNLLLTELADEITASKAPKVYITNILTQIGETDFFSDADHIKVIHEHVGKSFIDKTLINTTTVPKELLFPEDVAQVEHNAKGMEELGVEAIYQDFLSTEDGLVRHAAEKVADALLAMLPNQTNEKE >CP021325|2593512:2601356|2596444_2598175_-|AVK46130.1|DBSCAN-SWA MNWQEEYQKWVANDKLDSTLRKQLTNMETNEKELEDSFYRNMEFGTAGMRGVLGAGTNRMNIYTIRKASLGLAQFVAENGEEAKKRGIVIAYDPRHMSREFAFESAAVLGHHGVKSYVFDALRPTPELSFAVRHLNAFGGIVITASHNPPEYNGYKIYGEDGGQMPPTGASAVIEYINAVEDIFSVEVANQELLIENGLLEVISEKVDRPYLEKLKEVIVNKELVQERGEDLKIVFTPLHGTGGILGVPALESVGFTNIVKVDEQFVNDPDFGTVKSPNPENREAFLLAIEYGKKFGGDILVGTDPDADRLGVAVRNADGEYEVLSGNQIGAIILHYLLKQKKAQSELPANAAVLKSIVTSNLGTEIAKHYGAEMIEVLTGFKFIAEQIKHFEETGKHTFEFGYEESNGYMVKPFTRDKDAIQAVLAIAEVALVSKVAGRTLLEDLDQIYDEFGYYNEDLVSLTLSGKDGSERIKEITSSFREQLPTSMGGFVVERAEDYLRSETTWIATGKTEAIHLPTADVIKCYFEDGSWFCLRPSGTEPKIKFYFSIRGESKEESTAKLEKVKADLMQHIEA >CP021325|2593512:2601356|2598216_2599278_-|AVK46131.1|DBSCAN-SWA MIFIEVMKERFGEFEGETVWKWTMINDHDMRMSVLNYGAIVTSLETKDKFGDFANISLGFTNLDDYLAHSPYFGATLGPVAGRITNGQFSLDGKQFQLIQNEGSNHRHGGKFNFSKKLWDVSVEKSLDQIVMTFEYCWADGENGYPGKIDAKMTYTLNNKNEWLVDYEARSNQPTIYNPSNHIYFNLSGEAGSTVLQHQLWVNSDSFLPIDEEFLPIGEKRLAENTIFDLRAGREVAEITQSQDQQVKLVGAGLDHTFILKHENGRPDAVLFDPKSGRRLEMETKADSVLIYTANSLDGSFEIDERAVPKYAGITMETQGLVDAINHEGFGDIVLRPEKPFTSRTAFRFTVES >CP021325|2593512:2601356|2599294_2600278_-|AVK46132.1|DBSCAN-SWA MGIAVLGGAGYIGSHAVDELITRGYEVVVIDNLRTGHRESIHKKAKFYEGDIRDKAFLSSVFEKEKVDGVIHFAASSLVGESMEVPLDYLNNNVYGTQIVLEVMEEFDVKHIVFSSSAATYGEPERVPITEDMPTNPESTYGETKLIMEKMMKWCDKAYGMKFVALRYFNVAGAKADGSIGEDHKPESHLVPIILQVALGQREKLAIYGDDYNTPDGTCIRDYVQVEDLIDAHIRALEYLKNGGESNIFNLGSSNGFSVKEMLEAARTVTGKEIPAEVVPRRAGDPGTLIASSDKAREILGWEPTYTDVKDIIATAWKWHVSHPNGY >CP021325|2593512:2601356|2593512_2594484_-|AVK46127.1|DBSCAN-SWA MSFASETKKELTHMDVSDSDAKVELAAFIRMNGAISFSSQLVIMDVQTENAAIARRMYQLLKDLYEVPIELLVRRKMKLKKNNVYIVRLKSGTRGILEDLRILEPPMTFTKSIDRGFVKKRSAKRAYLRGAFLASGSVNNPETSSYHLEIFSVYEEHNEAICALMNQFDLNARTLERKNGFITYLKEAEKITEFLSIIGATSALLHFEDVRIMRDMRNSVNRLVNCETANLNKTINAAVRQIDNIKYIQSTVGLEALPERLREIAALRIANEDVTLKELGEMLTTGQVSKSGINHRLRKLDQIAERLRSGETPAQVGLKISNS |
7 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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