Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP020018 | Pediococcus pentosaceus strain KCCM 40703 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DinG,cas3,csa3,DEDDh | 0 | 0 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP020018_2 | 1691809-1691914 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP020018_2
|
1 spacers
spacers of CP020018_2
>2.1|1691833|58|CP020018|CRISPRCasFinder CCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCCCCATTATATTTTGAGCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP020018_2
The CRISPR arrays of CP020018_2 >merge|CP020018|2|1691809-1691914|CRISPRCasFinder TTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCCCCATTATATTTTGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTG >CP020018|2|2|1691809-1691914|CRISPRCasFinder TTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTG CCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCCCCATTATATTTTGAGCCG TTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTG
>CP020018.1|AVL02804.1|1685183_1686218_+|hypothetical-protein MSRRNKVVLAVMILAGIIIFGFSLRNVNLNQMARDVVHLNMWWLLVALGCIVLYLGLEAVATKMLIQSNGDRLSWRDAIRIPLIEQLFNGITPFSSGGQPAQLVALMQNGIEGGRASSVLLMKFVVFQSMVVINFIFSLLIGFQYLEEKIRFLSWFVLFGFLIHLAVIIGLLMIMYWHNFTKQLISAIFIPIKHFVSKERYTTWKVTLNEKVDSFYQESVRMKSQWRLLAKVALVTFLQLLFYYLIPYFILLALGKSDVNIVMVTCLHVLIFMVISLFPIPGGAGGAEYGFSVIFAQFVGNNSKLVLAMMIWRILTYYFGMFAGMVATVVKPHKVNRVKVVKNE >CP020018.1|AVL02803.1|1684153_1685170_+|glycosyltransferase MPIKVNMFSSASKVKGQGVGSAYEELIRLLKTHFPKQIDVSINKFTKADISHYHTIDPNFYLSTFSKKRGVKVGYVHFLPETIEGSLNIPQPFRSIFYKYIISFYKRMDHIVVVNPTFIDKLVAYGISRDIITYIPNFVRKNEFYRFTEANRDAVRERLEVNNRFTVLGIGQVQERKGVKDFIKLAENNPDKYFIWAGGFSFGRLTDGYADLKQVVDNPPRNLKFTGIVDRNALVEYYNAADLFLLPSYNELFPMSVLEAFSCGVPVMLRDLELYHSIIKGYYIPTQDYEDMNTQLKLVSEDKERLNKFKQLSDEASEEYSEDHLADIWLDFYSSLTK >CP020018.1|AVL02802.1|1682928_1684104_+|1,2-diacylglycerol-3-glucosyltransferase MNIGLFTDTYFPQVSGVATSIKTLRDQLEKQGHQVYIFTTTDPKVDTNVYERNIFRFTSVPFVSFTDRRIAVSGFIRAAQLAKELNLDIVHTQTEFSLGWMGKFVAKSLKIPLIHTYHTMYEDYLHYVANGKLLKPYHVKQMTRAFCYHIDGIVAPSERVLDTIEGYGINVPIRVIPTGVNLEQYQKPNKRKQWREKLGYDESSPILLSLSRLAYEKNIQEVIDSFPAILKEVPNAQLLIVGDGPARASLENQVHDLHLEDSVQFTGEISNDHVYGFYQLADLFVSASDTESQGLTYIEALASNLKVVAKSGPYTDELLDDISLGKVFNTEDQLVAAIKDYIEHPDAYNDPAPREKKLYEISADYFGKQVVDYYSSAISTHTDLELDEDSE >CP020018.1|AVL02801.1|1682065_1682839_+|alpha/beta-hydrolase MKLKLKSGAQIFFEDEGQGTPILFLTGFGGNTEIWSGQVNFFLQRGYRVIRLDYLNHGQSDRVDGELQIGDLADEVLQLVDYLQLKEPIGIGNSMGAAVLWNIINLRGWDFLSKAIFVDQSPKMLNDQQWHLGFKNLAEDNFDEVMNEPIVRPAYKHIDDFVFKNSKAIDSAYPFSQPQNRALVKGHAKKDWRFVLEQATKPVLFIMGEKSPFFDSTKTAELSALNANITVNVMKNVGHIPMAEDPTEFNRLVLQFV >CP020018.1|AVL02800.1|1680268_1681993_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MAGTLKGIAASDGIAIAKAYLMVDPDLSFEKKNITDVDAEIKRLHDALEKSKEELSLIKAKAAENLGAEEAEVFEAHLTILSDPELIGNIEDKIKNDTINAEEATKEVTDNFISMFEAMTDNAYMQERAADIRDVTKRLMSHLLGVELPNPALIDSEVVIVAHDLTPSDTAQLDRRYVKGFITDIGGRTSHSAIMSRTLEIPAVVGSEKATTSVKQGEMMIVDGLTGDAIIAPTDDEIKAYQQKGEEFKAQKAEWEKLKNEKTVSKDGVHFDLAANIGTPDDLQGVLDNGGEAVGLFRSEFLYMNASELPSEDEQFEAYKKVVEGMNGKQVVVRTMDIGGDKELPYLPLPEEMNPFLGYRAIRISLDRTDLFRTQLRALLRASAFGKLAIMFPMIATVAEFKKARAIYDDERQKMVDAGQEVGEIQVGMMMEIPAAAMIADKLAKYVDFFSIGTNDLIQYSFAADRGNEKVSYLYQPYNPSLLRLIKQTIDASHAEGKWTGMCGEMAGDQIAVPILMGLGLDEFSMSATSILKTRSLMKKLTTDDMKKLAEKAVTEAETNEDVIKLVQETVDNI >CP020018.1|AVL02799.1|1680002_1680269_+|phosphocarrier-protein-HPr MEKRDFHVIAETGIHARPATLLVQSASKFNSDIQLTYKDKSVNLKSIMGVMSLGVGQGADVTISADGDDEADAIAALEDTMKKEGLSD >CP020018.1|AVL02798.1|1679668_1679857_+|hypothetical-protein MRDYLQLLNDLKDGSIKELKITAEEFQDFQPRFMEFPERKQVIGKADRGGVVVYHFERIKDK >CP020018.1|AVL02797.1|1677244_1679464_-|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit MLCQNCQKNEASIHLYTNVNGQRTEVNLCQNCYQLLKNQRNNNINRNGGARMAQDPFGFGNLDDIFRAMQGGNMGQPENLYGQQVPPTQPGGGNGSGGNPNNRGNGGSLLSQYGLNLTDLAKQGKIDPVIGRDSEIERVIEILNRRTKNNPVLIGEAGVGKTAVVEGLAQRIVEGSVPQKLVNKQIVRLDVVSLVQGTGIRGQFEQRMQQLMKEVQANKDMVVFIDEIHEIVGAGNAEGGMDAGNVLKPALARGDFQLVGATTLKEFRDIEKDAALARRLQPVQVDEPSEEEAIKILKGIQKKYEDYHHVHYTDDAIEAAVKLSKRYIQDRFLPDKAIDLLDEAGSKKNLTINIADPETIQKKIDEAEAQKKAALQSEDYEKAAYYRDQVSKLEKNKDGATSSEEQPTVTEEDMEKIIETKTDIPVGDLQKQEQEQLQNLSENLKDHVIGQDEAVDKISRAIRRNRIGLNGTGRPIGSFLFVGPTGVGKTELAKQLAQQLFGSKDSMIRFDMSEYMEPHSISKLIGSPPGYVGYEEAGQLTEQVRRHPYSLVLLDEVEKAHPDVMHMFLQILDDGRLTDSQGRTVSFKDTIIIMTSNAGTGDVQADVGFGAAAQGKTHSVLDKLGNYFKPEFLNRFDDIVEFQALTKENLMQIVDLMIADVNSMLATQGLHVDVTKPVEERLVDLGYNPKMGARPLRRVIQEQIEDRIADFYLDHPAEKQLNAKIKDDQIEITGAPKKD >CP020018.1|AVL02796.1|1676827_1677190_+|hypothetical-protein MNAKKQEMQHVELVIGRVLQVGVYISALVILLGIGLWLFKNGSGYSGALPTRITPIFHGVLAFKPYAVLMFGIFLLILTPVLRVIVSIYAFAKEGDRLYVVITTIVLVILIIGMAIGYRG >CP020018.1|AVL02795.1|1675982_1676828_+|anion-permease MASHLIILLLVGLMAGIFGAILGIGGGMIITPVLTVAMGLDIKYAIGASIIAVIATSSGATIAYLKDEMLNLRVAMFLEIATTVGAIVGAIMTGIFNSTVLFVLFGSFLVFSSWNMYRKLRRGGGEEGSTKNDRLANQLNLNGSYYDKALKKNVDYQVENVPGGSAVMFGAGLASGLLGIGSGAFKVMAMDNIMKMPLKPSSATSNLMMGVTAAASAMVYFFNGSIHADIAGPLAIGILFGAQLGSRIMQHLQPRWIRMIFIPVLLYMGLQMILKGFGVNI >CP020018.1|AVL02805.1|1693866_1695600_+|pyruvate-oxidase MTEKINASDAMIKVLESWGVHNVYGLPGGSFDSTMNALYNRKSTINYVQVRHEEVGALAAVGEAKVTGKLGVTFGSAGPGAVHLLNGLYDAKHDHMPVLALVGQVPTTLMNTDYFQELNENPIFTDVAVYNRTVMTAEQMPHVVDEAIRQAYKYSGVAVVTIPKDLGWQPIEDNYVSSANLYQAPILPEPDVKQVDEALEILSNAKHPVMYIGQGTRGAGSDIIALSEKLHIPIVTSALAKGIVPDSYKANMGSAGRVATKPGVEVLQAADAVMFVGSDFPFQPYFVAPDAKYIQVDIDASKFGRRHVVDLAILADSHKFLKVMLEKAETTAESKWYKAALENKKNWEEWKNSFVGQQDTPLNVENVFAKINALATDDAIFQVDVGNVTIDGMRFLKADQAQRFTTSGWYATMGYALPAAIGAQAEYPDRQVWSISGDGGYAMVMQDVLTQVKYHMPIINVILTNESLGFIEAEQDDSKQPHSGVDLIDADYGTSAQALGAEGFEVRTYDELEQAFEKAKDRKGPVVIDVKITNLRPLPVEQLLLDKETQDPEAVEQFVKKYHAESLIPFRKLLEEA >CP020018.1|AVL02806.1|1695669_1696401_-|hypothetical-protein MNKINLPKFNYPIEKKSYLPAINALLLSVVPWYLSSHFSSEIFSKHLSIQILFFLATFMVNFLTIDRLTNKTNLRLMAPLAIIPILTFIILLFSENTYVALLGLLSFVPFLTTFLPFEQKNGVGLLTFSLSVGTLAPLAFFYIRNGFVTSILLKMGLLLSLMIIVILFAIFIKTSFKFAIFALALTLIITIFAFILLKSWTALIYPILAVFSWFIPKLHLPRNFTLLVLIALIGLASFFITIN >CP020018.1|AVL02807.1|1696573_1697764_+|S-adenosylmethionine-synthase MSERHLFTSESVSEGHPDKIADQISDSILDELLKNDPDARVACETTVTTGLVVVVGEISTTAYIDIQKVVRKTIKDIGYVGGEYGFDGENCAVIVAIDEQSPDIAQGVDDSLETREGHEDRLNQIGAGDQGLMFGYATNETEELMPLPIMLSHHLMQRIAKLRKEQVISYLRPDAKAEVTVEYDDNDHPVRVDTVVLSTQHDPDVTLEQIRQDVIEQVIKAVIPATLLDENTNFYINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGAARHGGGAFSGKDATKVDRSASYAARYIAKNIVAAKLAERVEVQIAYAIGVAEPVSVMVDTFGTGTVSEEKLTQAVRKIFDLRPAGIIEMLDLKRPIYKQTAAYGHFGRTDVELPWEKTDKVEALNDFFKN >CP020018.1|AVL02808.1|1697838_1699305_+|MFS-transporter MEKKQTNVIVVTVAIFVATFMSAIEGTIVSTAMPTIVGDLHGVSLMNWVISIFLLTNAIFTPIYGKLSDIFGRKRVFIFGIIIFLIGSMLSGMAHSMGFLILWRALQGIGAGSIMPVSNTIIADIYPIEKRAKVMGLNGSAWGIASIIAPLLGGFIVDNLSWHWIFFINLPIGIITIFLIQFFLKEEVSVHSKKIDYLGSFWLMVALLGLMYGFQLMGESSFSWITLVISFVIFIVGAGLFIRQEKRAEDPIIFLDLFNNRTFVIQNVATMLVSGLLIGFEVYLPSWTQGILGVPASLAGFAVTPSSILWIFGSFLAGRMIVKLKANQILTISLSILAVGSLLLALVPASTPFLAFFFIAAILGVGFGITITSTLVISQQLVTKDRIGVATSFNTLAKTLGQTIMMSVFGIIMNGTMNAGVKANPKINMDMMNKVINPQTAKTLPETLLPTLRNVLYQALHNIYIGCFILIVVALIINAFDRRSKDNI >CP020018.1|AVL02809.1|1699351_1699915_-|16S-rRNA-(cytosine(1402)-N(4))-methyltransferase MLDNAMQYSHQLLTEIVQPGDVVIDATMGNGHDTLFLSELVQSTGRVFSFDVQKAALEQTRALFEHQHQTLINVELIHASHDQIDHYVTEPITGAIFNLGYLPGGDKSIITHPTSTISAVQQSLNQLKIGGRIILVCYYGHPGGQEELQQLLSFVAELDQHHYSCLRYEFINQINNPPILLCIERKK >CP020018.1|AVL02810.1|1699907_1700540_-|phosphatase-PAP2-family-protein MHSRKYTHLLINILPTLLFILIVSLVIFKPSWVHAYDNSISSLVQSVRTPGFNQVVSIYTQLGNSIPYIIISLLVCSILILKHLKKAALFLACNIILGNGLNHLIKQIIQRQRPEFRLISIGGYSFPSGHSVAAMVLFGSLIFITFQVVHHQLKRNLLALIYLILMLGIGLSRIYLNVHFPTDVTAGFLLGLIVLQFTTYLFYGRKIKNA >CP020018.1|AVL02811.1|1700885_1703303_+|leucine--tRNA-ligase MAYNHKDIEQKWQQFWSDNETFKTVEDADKPKYYALDMFPYPSGQGLHVGHPEGYTATDIMSRMKRMQGYKVLHPMGWDAFGLPAEQYAMKTGNNPRDFTAKNIQNFKRQIQSLGFSYDWSREVNTTDPAYYKWTQWIFEQLYKKGLAYEKETLVNWAPDLMGGTVVANEEVVDGKTERGGFPVYRKPMKQWILKITAYADRLIDDLDLVDWPDSIKEMQKNWIGRSVGASVFFNVEDSEKQIEVFTTRPDTLFGATYLVISPEHDLVDQITTPESKAAVEEYKKAVATKSDLERTDLNKDKTGVFTGAYAVNPVNGKKIPVWISDYVLASYGTGAVMAVPAHDGRDYEFAKKFKIDMVPVYEGGNLEDGVLDSEGGLINSGFLDGMDKQTAIDTMISWLEEHGVGHKKVNYRLRDWVFSRQRYWGEPIPVIHWEDGETTLIPEDELPLRLPAATDIRPSGTGESPLANLDDWVNVVDENGRKGRRETNTMPQWAGSSWYFLRYVDPKNDQKIADEDLLKEWLPVDLYVGGAEHAVLHLLYARFWHKVLYDLGVVPTKEPFQKLVNQGMILGSNHEKMSKSKGNVVNPDDIVERFGADTLRLYEMFMGPLTESVAWSEDGLNGSRKWIDRVWRLMIDDENQLRDHIVTENDGSLDMIYNQTVKKVTDDYENMRFNTAISQMMVFVNEAYKADKLPAVYMEGLVKMLAPIIPHVAEELWSLLGHEGGISYAEWPTYDESKLVEATVQVILQVNGKVRSKITVDKDIAKEELEKLALADAKIQQWTADKTVRKVIVIPNKIVNIVVG >CP020018.1|AVL02812.1|1703506_1705192_+|transporter MDKQSEMDNSESLYMGSQPLRDNSGKSSSKAKMLEGSAWMTAGSIFSRILGAIYIIPWVIWFGVYSDQANALFTKGYNIYSFFLIAAIAGIPSAISKQVSHYNAINEFALGQRLYKRGLLLSVGTGIICAAILYFGAPFLKDGDPNVITVLHALAWAVLVIPTMSLTRGFFQGYQEMGPSAVSQFIEQLARVIYMLTTAYFIMGKSGQGDWVYGVSQSTFAAFIGALGGLLVLGIYFIKYRKRLSYLSQHSANELVVSTSTLYKEIIAQAVPFIIIGSAITIFQLIDQYTFFRIMNAVSDYSTAVLNNMYAIFAFNANKLVMIVISLASAMAVTSVPILSEAKTRGDRVEISRQVTDSILLFAFLMIPAALGMAAVAQPAYTLFYHLSDVGTAILQFNSYVAIVLGLFTVISAIMQGIGENVLAVKYFCVGMIVKFIFQFPMVALFSAVGSLISTAIGFMVVNWLILRHINLEYGLDYRRINTFIGKIITYAFGTFLIAMVVTNGLYIVMDPASKVQSLLVIAAAVVLGGAFYLYFVLKSRLADEIVGARAAGLRRMLKIS >CP020018.1|AVL02813.1|1705200_1705920_+|16S-rRNA-pseudouridine(516)-synthase MRVDKFLHDMNMGTRTQIRKMIKDKLIFVNDTVVKTGRVKVDPVIDEVRLKDQVIEYQQYFYFMMNKPLGVLTATEDRKQKTVMDLFNKVDLRSDLFPVGRLDKDTQGLLLITNNGQLAHDLLAPERHVDKTYEAVVTGKITDQAVEEFQKGITLKDGTTLKPAQLIIEHYSELDDQTVVKVVLKEGKYHQVRRMFGSLGEKVVTLRRTSFGPLELDVGLLPGTYRELTDDEINRLVEG >CP020018.1|AVL02814.1|1705942_1706782_-|NAD(P)H-hydrate-dehydratase MLKINQDGLNYLWPVRSNDSHKGSYGRILIVAGNDQYGGAGILSSSAAVYAGGGLVTLATDKSNFTAVRSTLAEVMLLDFLDFDALKAALKKSTGVVIGPGLGTNATSLKILKFVLDHVQPQTPLVIDGSAIDLIATHQIQVDHPQTIFTPHQMEWQRLSGIKIADQAPTLNQRAVDHLKAIVVLKHYETEIYAPHTDFRQIMAGNPGMATGGSGDALTGVIIALVNQVDSLALGVTLGTFLHSYTADQIYQKEAVVLPHRLIRRLPFTLKQLQKNKLL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1927 : 9593
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020018|1927:9593|DBSCAN-SWA AATGCCGTTTCAGGAGTTATTAATACCGGAATCAAAGGCGTTAATGGTGTGGTTCATCTTTTTTGGCGGTAAAGAAAATACTATTAGTAAAATTCCAGATGTTAAGTTTGCGACTGGTACTGGTTCACTAGGTGCTTCGAGCTTTAGACGTGCAATCACGCAGATCACACCAGCCATCGTTAATGACGAAGTTGGTGCACGTAATCCAGAATTAATCTTCCGTAAATCAACTGGAAATGTTGAATTTCTTAAAGGACAAAACGCTAAAACAGTGTTGTTCCCAGGTGACGAAGTGGCCAACGCTACCGATTCGGCAATGCTGGCGCCAATGCTTGGTTTGACGCCGTTTGCTAAGGGTGGAATTGGTAGCTTCTTCGGAGGATTGTGGAACGGAGTTACCGGTTTTGTTTCTGATGTTTCGAAGAAACTTTCTAGTCTTTGGAATACTGGAAAGAAAATTATTTCTAATCCGGCTAAAGTGTTAGAAAGTTTGATGCCCTTTTCTAAGGGAGGAGCTAAAGGATTCTTTCCAACAATGGTTAAAGGTGGATTTAATTTTGTGAAGAAGGCTGCTAATAATTGGTGGTCAAATCTTTGGAGCATGGTTAATTTGGATGGCAATGATGGTACAGGATCATATGGTGGAGGTTGGCAATCGCCTGGTAGTGGCTGGGTCAAGACCGATGGATTTGGTTCTTCCCGTGGAAAAGGTGTACACGATGGAAACGACTTTTCAGCATCTATAGGTACACCATTCCATGCGATGCATGGTGGAACAGTTATTCGAGTTGGAAGTGCTCCTTCTGGCTGGGGTCCTGTAGGTTATGACATCGTTACTAAAGATTCAACCGGTAAAGAAATTATTTATCAAGAATTTGGAAATGCAAAAGATGTAAAAGTTCATGAAGGACAGCATGTCAGTACCGGTGATGTGCTTGGTAAATTGGGACGTTCTGGACTTGGGACGGGACCTCATTTACATGTTGGTTTAACTAATGGTGGTAGTGTATGGAGTCGCAATGGTTATAGTACTAAAGGTTGGTTAGATATTACCAAACAACATGGTAAAGACACAGAATCGGATGCTAAAAGTGATGCTGGTTCTAAAACAGATAGTAAGTTACAAGCTACAATTAAGAAACAAGTTGGTAGTGGATTTTGGAAGACTATTTCGAAACTTGCTTCAATGTTTGGAGATAGTGGCGAGGGTGGTAGTGGTAGTTCTCCTTCTGGAAAGATGAGTATGAGTGAATTTATCAAGGTCGCTCATCAAGCTGCTAATATCGGTAAAGTAAAACTTTCGCCAAACGATATTAAGAGATTATATTGGCAAGCACATGTTGAATCTGGAGTAAATCCAGCCGTAGGTGGGGGCTATGATGATCACGATGGTACAGGACTACCAGTTGGATTGTTCCAATATAAAAAGGGCACTTGGAATGCGTGGGCCAAAAGTGGATATAGAAATATTCATTCAGCGCTCGATCAAATAATTACAGTAATCCGTGATAGTAATTGGCGTAGTGATTTAGCTCCATATGGAGTGACTAGAGGTTGGGGACCAACTGGTCACAAGGCATTTGAAAATGGTGGAGTTGTGCAAAATCACCAGTTGATAGAAGTAGCAGAGGGTAATAAACCTGAAATGATTATCCCCTTAGACGTCACTAAACGTTCTAGGGCGCATGAATTAATTCAAGAAGCAGTGGCAAGGACTACTCCTAACGAACCAGTTAAGACGTCCGCTTCAAATAACGATACAAATAACAGAAGCTTGCAGAACCTAGAAGCTAAATTTGACACGTTACTTGCAATGTTTGCTAAATTACTTGGCCTAAATGCTGATCAATTAGAAGCAATCAAAAACAGTGGTCAACTGGATATGAAAGCTTGGTATCGTAAACAGGCACGTGATCAAGCTAACGCAGATTTTCAAGGATTATAAGGTGGTGAAATAATGGAGCCAAAGCTCTACTTAAAAGTTGGTAATCAAGATGAAATTGAGGTAACAGAAGCAATTCCGGAATTAGAGTTCCTAGGCGATAGTGATTCACCTGCTATTCTAAATACTTACCAGCCGAACGTAGGTATTGACGGACAGATATTACAGGCTACCAACTATGATAAGACAACAATTAACGCCAATTTTTTGTTTAATTTTCGAGATTGGTACGATTTCAAGCTGATTAAGCATAAGATTCACCAGCTTTTTCAGCAACGACAAACGATGCGAATTAGAACGGATGCAGAGCCAGCGATTGTTAAATATCTGCGCCCTGGTACTTTTGAAGTGAAGCCTATATCTGATGGTTCGCACGATGCAACATTTACAATTCCGTTTGATAATCCATCCGGATATAAGTATTCATTGCTAAGATCGGATAGCTTGTATACGTTTGGTGAAGAAGGCTGGCAATTAGGTATGAACCTACCTAGTGCAGATTTAAACTATACCCATACTGAATCTAGTTTTAAGATTTTTAACGCTTCTGATATTATGGTTGATCCATATTACCAGAACCACGATTTAATATTAAAAATTAATTTTGAGGGCAAGAATTTAACCGTTACGAATAAAACTACTAATGCCTCGTGGTCTTATACCAAAGCGGCTAAAAAGACGGATAGCATTGTTTTGAGCGGTATTATTACAACTTTAAATGGAGAACCTGCAAGTGTTAATACTGATTACGGTAACTTAACACTCGCTACCGGCTGGAATGACATATCAGTTACTGGTGCAACTGATTTTAAGGTCACATTTAGCTTCCCATTTATTTACATTGCCTAATAATCCAAATGTGATTCTGGTTAAAGGACTACATAGCACCAATGTAGAGCCTTTGATCGCTTTTGTACCAAACTCAGTTCAAATAACATGGGAGAAAAACAACACTTATCAATTAACGTTTACAGCATTTTCAAATTCTAAAAATCTAGTTGCTTTTGAAATGTTAGATGTTGAGAGTAGTGTCTTTTTTGATGATGAGGAATACATTGTTAAACAATCATCAGTGGAGGCGCAAAGTGGTTTCATCACTAAACAGATTACAGCTACTCATGTATATAACGAAGTAATTAGAATTAGACAGCGAAAGGTAAATGATGGAACTAAATCCTATAGTGTCAACGATATTTTGAAATACTATCTTGAAGGCAATAATTTAGGCTTTACTTGGGAGGTTCATGGTAGTTTTGAAAAAAAGCAAATTGAAGGATTGGGTGGAAATAGTGCAAAGGATGGATTAAGTAAGATTACAGAAACATGGTCTAATGCGGTGATCTATCCAACTAATAAAGTGATTCGGGTTTATGAAATTGAAAGCTTTCGAAAGTATTTAGGCGGTCGGATTGACTACTTACATGATACAAGCGATGTTCAATTAGAAAGTGATTCGACCGAGATTGTTAATCAAGTAATGGCCATTGGTAAGGAAAAAGATGGTAGTGATTCAGACAAGCCATCATACTACTTCAATCCGTTTCTGGTTACTAATCAAGATTCGGTTAACAAGTGGGGATTGCATCCAGGAGATGACGTTTCTGATGATCGTTTTACCGATAAGAAAGCAATGGAGCAATATGCATTGTCACAAATGACAGTAGAACCTAGTTTAGCAATCACTATTACAAGTGACCTTAACCAGAAACCAATACCTGGTGAAATGATGCGTTTAGAGGTTCGACCAATGAGCTTTGTAACGGATGTTGAGGTAGTTGGGTACACTTGGTATCCATTGGATAAAACGCAGAAAAATTCAATTACACTGAATAATAGTGCTAGAACAATTCTTGATTATCAGAAGCGAAATAATAACAGTTTAGCGAAAATGATTAAGAATCAGAAAAATAGCATAAAAGGTGTTTCAAATGCTACGAATCTAGCCAATAAGGCTTATGATTCAAGTGTATATGGAGAGGTGGTTGGTGAAAGTGAGTATTAAAATTATACAGTTACGTGCGAGAGGAGATAATGATTTCGGGCTTACAGAAGGTGAACCTTACTATCCAAAGGTTGGAGCGGATAGCGTTGTAGGTCTTGAGATAGAAATTAAAAAGCAGGTTCCTAAGTATGACTTAGCCACTTCAACCGCTGACGGATTAATAAGCAAAGAAGATAAAACTAAATTGGATAAACTACAGGTAGAACCTTTTGAAGGGCTTAAATTTAAGTCTCCAGATGGTTCTATTTTTATTTTATCAGTTGATAACGAGGGTAAACCTATCTTTACGAAGGAGGGTGAACAATGAGTTTTAAATTAAAAACGGATAATTTAAGCCCGGGACTAGGAAACAATTTTAGAAATGATTTAGTTGATAATTTTACTGAAATTGAAAAAGAAATTAGCCAATTAGATTCAGATACCGAATCACCTACGGTAATGCAACTTAAACAAAATGTAAAGGACATTGTCACAATGTTAAATAAATACGATTTTCCAATCGCTTATCGTAATGGAAAAATTATTGATTTAGAGGAGGAGAATTAATGGCAATTACAACAATTGTAATGGATGTATACAAGCCAGGAAGTGAACTAAAAAACAAAGTTGTCGATATTTCAGACAGCTTTAATGCCCGCGTTGGTGATAATCAAGTTCGATTAGTAATTAAGTATATTGAACGTGGCATTGTTGAGCGTATGGAGCAAGAACAACTTACGCCTTTTATGACAGGATTCGTTGGACAGCCAGACGAAGAACTGAAGGTTACGGATGAAACTGGAACTGCCGTTAGTTATCACGGCTCTAGCGACGATATTATCGGCGGTGGCAAAGTTCGAATGGATTTACCGGGAACCATGTTCCCTCAAGAAGGGGCCTTCTATGGCTTCTTTGGTCTTGAAAATAGTGAGGGTAAACGAGTAACTACTAATAATGTGTTTTTTAGAGTTGAAAATGATAATCCCGATATGTATTTTGATACATTGCCATTTAGAACGGAATTACAAAAGTTGCTAGATTGGGCGACGGCTAAATCTAAAACAACTTTTGGAGGTATTAGCGACGCTTGGGAAACATTAAAAAAAGAAATTGAGGACGCATTAGCAAACGGTAATACAAACATAGATACGTATTTAATCCGATTAAAATCAGCAGAGGAACGTCTTGAACAATACGAAAAAGATTTAGCAGCTGGTAAAGCTGTTAGCCAAGCTGATTTAGATAGTACATTAGCTGATTTTAAATCAAATATCCAATCTGGTTTAGATGAAATTAACGAATTTAATGAATCAATCAAAAACCTTAATGTCACTGATGTTGCTGGTGGCATTCCAGATTATATGATGAACACTTTGAATAGCGCTCAAGCTGGAATTGATAAATCAAAATTCAATCTGATTTTTGCGACCGATTATCACTACGATATTGGAACGACCTACAATCCTGACAATATTGACGTACCAGATGCCACGATTCGAGAAGTATGGGAATCTGGACTGCGTAAGGTGTTGAACGCTACCTCATTGAGTAATGCTGACGCAGTTGTATTTAACGGCGATAACGTTGACCAGCCTGCAGTTAAAGATATTCCTTTGGAGAAAAAAATGATGCTTAAAGAACTACATGATTTTCTGTTGACGGCTACTAGCTCGGCTGAAATGCCAGCTTTCATTTTAAAAGGCAATCATGATGGGAACTACAATCATAAAGTTGCTGAAATGAACCTTACTAGTGTTATCACTGATAAGGAATGGTCACAAGTTTATGACAAAGTCGTTCCGGATTATGGTGAAAACCGCAACACTGGAGCTAATTATTTCTACAAAGATTTTGACGATAAAAAAATTCGCTTAATTGGATTAGACACATACGACTTACCTGAAACAACTAATGACGATGGATCAATGAAATACAATCGTTTCAACACTAGTGGACTTCAACAAGCGCAATTGAATTGGTTGGCTAATACGGCTCTACAGGTGCCAGAGGGTACGACAGTTGTCATCAGCATGCACCATCCAATCGATGGAACTCTGGCAACATCTTCTGATGTGACTAAAGTGATTAACCATGATGTTTTGATGCAGATTATCAATGATTTCGTAGCCGGGAAAAGTAACTCCATTTCTGGAAAAGTTAGTGACGTGCCAGTTAACATTGAGTACACATTCAAAGGTGCTGGAACGATAGCTGCGCTATTATCTGGACACTTTCACACAGACGGAAATGTAGTTAAGAATGGAATTAATTTCATTCAAACTCGTTGTTCGCTAGGCTCTGGCGACAATGTTATTGGTGACAAGCGAATTAGAGAATATATTGGCACACCGTTAGAAGATGCCTTTGATATCGTTACGATTGATACAACAGCAAAAACAATTGACTTAAAGCGAGTTGGTGCTGGTTCGGAAGACGCACGATATGCAACCAGACATTTTAATTATTAGGAGGTGTTGATAAATGGCAGAAAATAAGGAATTAAAAACAATGGATCGAACCCTTGAACAGCACGTTGGTGCTGGTGGTAGTGCACATTTGCCGGCCACTAGTCAAACTCCCGGTTTTGAAACGCCCGAACAAGTTCAAGACTTGGAAATGACAACCGGTAAGCGAGTTTACTTGCCGCACGGTACAGACGTCCTAAAACTTCGGCAAGGAAGATATGAGATCGCTAATGCACTTAATAATCCTATCAATCCTAACGACACGTCATTCATTGAATATGACATATCTGTAGCATCAGGAGGAGGAAAAGGCCGACAAATTAAAGCACAAGTTAGCGTTAGTGGCGATATATACTATCGTAATATTCACACCGCCGGCACACCAGAATCTGGTACTGGAGGTTGGCGTAAGCAAGCTTATCTAACCCCAGTTTGGAGTGGTAACGTTAATAGTGGAACGATTACTTTTGCTCAACCACTTTTGCCTTATCGTACTGGCATTGAAGTGTTCTATAACACAATTAGTAATCAGCGTGGTTCAGTTCGCGTCCTACGTTCGTTAGGTGGAGCAATAACCGTTCCAAATCATCCAAACGATACCAGTGACAAGACGTTCCAATCTTACGAACTCGGTTTTACGTTTGACAAAAATAAACTAAACATTGATTACAACGACATGGAAATCCTCTCAGCTAGTGGATTAAATCGCAATAACACTAAAGGTATTTCAATTACCGATGTATTCGTAATTTAGGAGGATAAAAATGTACAACGAATTGAAAAAAATTTTAATTGTAGTAAATGAAAATAACGAGATTGTTCAATATGCCAGTATGGGTGAGTTGCCGGACAGCATAGAATACAGTGGTGCAATTCCAGAAGATTTTAGAGATAAATTCAAGCCGTCTTTTTATTTGCTTGAAAATGATGCAATTGTTGAAAATCCTGATTATGAAGAGATTGAGATTCCAGCAGTTGGACCTTCAACAACGGAGCAACAACTGGCAGCTCTCGGATATCAACAAATGCAGAACAGTCAAGAAAAACAAGCATTGATTAAGCAGAATGCTCAAATGGCATATCAAATTATGCAAATTCAACAACAATTAGGAGGACAAAACGCATGATGGATTTTCCAGATTTTAACTCGATTAAAAGTTGGTACAATGCACAACTATGGACAAAGAGTATGGTTAGTGACGGTGTTGTATGTAACAAGATTACAGCGGGACAATATAAAGAAATCGTTGGAGAAGATTACGTAGCGCCTGTATCATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020018|1927:9593|4646_5870_+|AVL01281.1|DBSCAN-SWA MTYQLLVQLILRSHLASHLFTLPNNPNVILVKGLHSTNVEPLIAFVPNSVQITWEKNNTYQLTFTAFSNSKNLVAFEMLDVESSVFFDDEEYIVKQSSVEAQSGFITKQITATHVYNEVIRIRQRKVNDGTKSYSVNDILKYYLEGNNLGFTWEVHGSFEKKQIEGLGGNSAKDGLSKITETWSNAVIYPTNKVIRVYEIESFRKYLGGRIDYLHDTSDVQLESDSTEIVNQVMAIGKEKDGSDSDKPSYYFNPFLVTNQDSVNKWGLHPGDDVSDDRFTDKKAMEQYALSQMTVEPSLAITITSDLNQKPIPGEMMRLEVRPMSFVTDVEVVGYTWYPLDKTQKNSITLNNSARTILDYQKRNNNSLAKMIKNQKNSIKGVSNATNLANKAYDSSVYGEVVGESEY >CP020018|1927:9593|5853_6177_+|AVL01282.1|DBSCAN-SWA MKVSIKIIQLRARGDNDFGLTEGEPYYPKVGADSVVGLEIEIKKQVPKYDLATSTADGLISKEDKTKLDKLQVEPFEGLKFKSPDGSIFILSVDNEGKPIFTKEGEQ >CP020018|1927:9593|3883_4717_+|AVL01280.1|tail|DBSCAN-SWA MEPKLYLKVGNQDEIEVTEAIPELEFLGDSDSPAILNTYQPNVGIDGQILQATNYDKTTINANFLFNFRDWYDFKLIKHKIHQLFQQRQTMRIRTDAEPAIVKYLRPGTFEVKPISDGSHDATFTIPFDNPSGYKYSLLRSDSLYTFGEEGWQLGMNLPSADLNYTHTESSFKIFNASDIMVDPYYQNHDLILKINFEGKNLTVTNKTTNASWSYTKAAKKTDSIVLSGIITTLNGEPASVNTDYGNLTLATGWNDISVTGATDFKVTFSFPFIYIA >CP020018|1927:9593|6415_8317_+|AVL01284.1|DBSCAN-SWA MAITTIVMDVYKPGSELKNKVVDISDSFNARVGDNQVRLVIKYIERGIVERMEQEQLTPFMTGFVGQPDEELKVTDETGTAVSYHGSSDDIIGGGKVRMDLPGTMFPQEGAFYGFFGLENSEGKRVTTNNVFFRVENDNPDMYFDTLPFRTELQKLLDWATAKSKTTFGGISDAWETLKKEIEDALANGNTNIDTYLIRLKSAEERLEQYEKDLAAGKAVSQADLDSTLADFKSNIQSGLDEINEFNESIKNLNVTDVAGGIPDYMMNTLNSAQAGIDKSKFNLIFATDYHYDIGTTYNPDNIDVPDATIREVWESGLRKVLNATSLSNADAVVFNGDNVDQPAVKDIPLEKKMMLKELHDFLLTATSSAEMPAFILKGNHDGNYNHKVAEMNLTSVITDKEWSQVYDKVVPDYGENRNTGANYFYKDFDDKKIRLIGLDTYDLPETTNDDGSMKYNRFNTSGLQQAQLNWLANTALQVPEGTTVVISMHHPIDGTLATSSDVTKVINHDVLMQIINDFVAGKSNSISGKVSDVPVNIEYTFKGAGTIAALLSGHFHTDGNVVKNGINFIQTRCSLGSGDNVIGDKRIREYIGTPLEDAFDIVTIDTTAKTIDLKRVGAGSEDARYATRHFNY >CP020018|1927:9593|9099_9441_+|AVL02882.1|DBSCAN-SWA MLIVVNENNEIVQYASMGELPDSIEYSGAIPEDFRDKFKPSFYLLENDAIVENPDYEEIEIPAVGPSTTEQQLAALGYQQMQNSQEKQALIKQNAQMAYQIMQIQQQLGGQNA >CP020018|1927:9593|9437_9593_+|AVL01286.1|DBSCAN-SWA MMDFPDFNSIKSWYNAQLWTKSMVSDGVVCNKITAGQYKEIVGEDYVAPVS >CP020018|1927:9593|6173_6416_+|AVL01283.1|DBSCAN-SWA MSFKLKTDNLSPGLGNNFRNDLVDNFTEIEKEISQLDSDTESPTVMQLKQNVKDIVTMLNKYDFPIAYRNGKIIDLEEEN >CP020018|1927:9593|1927_3871_+|AVL01279.1|DBSCAN-SWA MPFQELLIPESKALMVWFIFFGGKENTISKIPDVKFATGTGSLGASSFRRAITQITPAIVNDEVGARNPELIFRKSTGNVEFLKGQNAKTVLFPGDEVANATDSAMLAPMLGLTPFAKGGIGSFFGGLWNGVTGFVSDVSKKLSSLWNTGKKIISNPAKVLESLMPFSKGGAKGFFPTMVKGGFNFVKKAANNWWSNLWSMVNLDGNDGTGSYGGGWQSPGSGWVKTDGFGSSRGKGVHDGNDFSASIGTPFHAMHGGTVIRVGSAPSGWGPVGYDIVTKDSTGKEIIYQEFGNAKDVKVHEGQHVSTGDVLGKLGRSGLGTGPHLHVGLTNGGSVWSRNGYSTKGWLDITKQHGKDTESDAKSDAGSKTDSKLQATIKKQVGSGFWKTISKLASMFGDSGEGGSGSSPSGKMSMSEFIKVAHQAANIGKVKLSPNDIKRLYWQAHVESGVNPAVGGGYDDHDGTGLPVGLFQYKKGTWNAWAKSGYRNIHSALDQIITVIRDSNWRSDLAPYGVTRGWGPTGHKAFENGGVVQNHQLIEVAEGNKPEMIIPLDVTKRSRAHELIQEAVARTTPNEPVKTSASNNDTNNRSLQNLEAKFDTLLAMFAKLLGLNADQLEAIKNSGQLDMKAWYRKQARDQANADFQGL >CP020018|1927:9593|8330_9068_+|AVL01285.1|DBSCAN-SWA MAENKELKTMDRTLEQHVGAGGSAHLPATSQTPGFETPEQVQDLEMTTGKRVYLPHGTDVLKLRQGRYEIANALNNPINPNDTSFIEYDISVASGGGKGRQIKAQVSVSGDIYYRNIHTAGTPESGTGGWRKQAYLTPVWSGNVNSGTITFAQPLLPYRTGIEVFYNTISNQRGSVRVLRSLGGAITVPNHPNDTSDKTFQSYELGFTFDKNKLNIDYNDMEILSASGLNRNNTKGISITDVFVI |
9 | Lactobacillus_phage(83.33%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
177025 : 183381
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020018|177025:183381|DBSCAN-SWA AATGGCAAGTAATAAAATTATTGGTATTGATTTAGGTACTACAAACTCTGCAGTTGCTGTCATGGACGGTGACAAACCAAAAATTATCACAAACCCTGAAGGAGCACGTACAACTCCATCAGTTGTTGCTTTTAAGAATGGTGAAACTCAAGTTGGGGAAGTTGCTAAGCGTCAAGCAATCACTAACCCTGATACAATTGCTTCAATCAAACGTCACATCGGTGAAGCTGGCTATAAAGTAACCGTTGATGGCAAGTCTTATACACCACAAGAAGTTTCAGCAATGATTTTAAGTTATATCAAGAAATTTGCTGAAGATTACCTTGGTGAAGAAGTAGATAAAGCTGTTATCACAGTACCTGCTTACTTTGATGATTCACAACGTCAAGCTACAAAGGACGCTGGTAAGATTGCTGGCTTGGATGTTAAACGTATTATCAACGAACCTACAGCATCTTCATTAGCTTACGGACTAGATCAAAACGGTAAGGATGAAAAGATTCTCGTTTATGATTTAGGTGGTGGTACTTTTGATGTTTCCGTTCTTGAATTAGGGGATGGCGTATTCCAAGTTCTTTCAACAAACGGTGATACACACCTTGGTGGTGACGACTTTGATCAAAAGATCATCGACTGGTTAGTTGATGAATTCAAGAAAGACAATGGCGTAGACTTATCACAAGATAAGATGGCTCTTCAACGTTTGAAGGACGCCGCTGAAAAAGCTAAGAAGGACCTTTCAGGTGTTAGCGAAGCTCAAATCAGTCTACCATTTATTTCAGCTGGCGAAGCCGGACCATTACATCTTGAAAAGACTTTGACACGTGCGCAATTTGATCAATTAACTGCTGACCTAGTGGAACGTACTAAGGCTCCAGTTGAAAATGCGCTTAAAGATGCTGGACTTTCAGCTTCTGAAATTGACGAAGTCATCTTAAATGGTGGTTCAACACGTATTCCTGCCGTTCAAGAAGCCGTTAAGAACTGGACAGGTAAGGAACCTAACCACTCAATCAACCCTGATGAAGCCGTAGCTTTAGGTGCTGCTGTTCAAGGTGGTGTGCTTACTGGTGATGTTAAGGACGTTGTTTTACTTGACGTTACTCCACTCTCACTTGGTATTGAAACAATGGGTGGTGTATTCACTAAGTTAATCGATCGTAATACAACAATCCCAACAAGTAAGTCACAAGTATTCTCAACAGCTGCTGACAACCAACCAGCTGTAGATATCCATGTACTTCAAGGTGAACGTCCAATGGCTGCTGATAACAAGACACTTGGTCGTTTCCAACTTACTGATATTCCAGCTGCTCCTCGTGGAATTCCACAAATCGAAGTTAAGTTTGATATTGATAAGAATGGTATCGTAAACGTTTCTGCAACTGATAAGGGTACTGGTAAGGAACAAAAGATTACAATCAAGAGTTCATCGGGTCTAAGTGATGAAGAAATTGATCGCATGATGAAGGAAGCTAAAGAAAACGAAGAAGCCGACAAGAAACGTAAAGAAGAAGTTGACCTTCGTAACGAAGTTGATCAATTAATCTTTACAACGGATAAGACTTTGAAAGACCTTGAAGGTAAAGTTTCTGAAGATGAAATCAAGAAGGCTAAAGATGCTAAAGAAGCTCTTGAAAAGGCTCAAAAAGATAACAATCTTGACGAAATGAAAGCTAAGAAAGATGACTTGAGCAAGATTGTTCAAGATCTATCTGTAAAGCTTTACCAACAAGCTCAAGAAGCCCAAGGGCAAGCTGCTGATGGAGCTCAAGCCAACGCTGGTGACGCTAAGACTGATGATGACAATACAGTCAATGGTGATTTTGAAGAAGTTGATCCGGACAAGGATAACAAATAAATAACCAGTAATCGTAAAAAGGTCAAAGTCAGTGACTTTGACCTTTTTGCATGATTATCTGTTAAGATAAGCTAATAGAAATCATGGAGGATGAATATGGCTGCAAATAAAGATTATTATGACATTCTAGGCGTTAGTAAGGATGCGTCTGATGATGAAATTAAGAAGGCCTATCGTAAGCTTTCTAAAAAGTATCATCCAGATATCAATAAAGCACCTGATGCCGAACAGAAGTTTAAAGACGTCAATGAGGCGTATGAAGTCTTAGGTGACTCTCAAAAACGTGCTCAATATGATCAATTTGGTTCAGCTGATCCGAATGCTGGCTTTGGTGGCGGTGGATTTGGCGGCCAAGGTGGTTTTAGTGACTTTGGTGGTGGATTCGAAGATATCTTTGGTTCATTCTTTGGTGGTGGACAACGCCAATCACCAAATCAACCACGCCAGGGAGAAGATTTGCAATACCAAATGAGCCTTAAATTTGAGGAAGCTATCTTTGGTAAGAAGACGACCATCAAGTACTCTCGTGAAGCCCTATGTAAAACTTGTGGTGGATCTGGTGCTAAAGAAGGTACTTCTCCCGTAACTTGTCATAAGTGTAATGGTACGGGTACGATTCAAGTAACCCAAAATACGCCACTTGGTAGAATGGTTCGCCAACAAACTTGTGATGTATGTAATGGTACGGGTAAGGAAATTAAAGAAAAATGTCCTACTTGTGGTGGTACAGGTCATACTTCTCAACAACACGAAGTTAAGGTATCGGTTCCTGCTGGGGTTGAAGATGGTCAACAAATGCGTCTTCAAGGCCAAGGAGAAGCTGGATTTAATGGAGGTCCTTATGGGGACTTATACATTATTTTCCAAGTTCAACCAAGCGATATGTATGAACGAGATGGTTCAGAAATTTATTACAACCAAACGATTTCATTTGTTCAGGCAGCTTTGGGTGACGAAATTGAAGTACCAACCGTACATGGTAAGGTTAAATTAAAGGTTCCAGCTGGTACCCAAACGGGAACTAACTTCCGTTTGAAAGGTAAGGGAGCACCACGTTTACGTGGTAATGGAACTGGTGACCAGCATGTTAAAGTTAAGGTCACTGTACCTAAGAAGCTTAACAGCGGACAAAAGGAAGCTTTGAAACAATTTGCTAAAGCTAGTGGTGAAGAACCTTCTGGTCATGGTAAGAGTGGTTTCTTTGATAAGTTTATGAATTAGAAAAAGTGCGTGCAAGAATAAAATCTTGCACGCACTTTTCGAGTCTAAAAAAACGCTATATAAGGGTGAGTATGTAGATTACTCATCCATCTATAGCGTTTTTTTTTAATAGTTATTATCATTCTTCTTTTCTGGTTGAGCACTAATTAAACCAAAAAATTTAAGACAGTAGATGGCACTAATACCAACTAAAACATATACAATCCTAGAAATGATTGCTGCTTGGCCTCCAAAAAGTGTAGCTACTAAATCAAATTGGAAAATACCAACTAATAACCAGTTTAAGCCACCGACAATCAATAGAACAAGTGCTATAACATCTAGTGTTTTCATGGTTGAATCCTCCTTTAGTCTCTTATTTTTGGAACAACTTAATTCTAGCAAAGTTAATTGAATATACCTAAAAATACGCTTACAAGTAAATTGATAATTTTACTACCAAATGATTCAATGACAGAAAGTTAGTTAAGAATGGCTGTTCCTAAGGTTAGGTAAGTAGCAAATAAAATCCAAAGGAAATACGGAATCATTAAGTAGGCTGCCAATTTGCTACTCTTATAAAATTCCTTGATACAAAAGAATACTAGTACGTCTAATACAAGAATGATTAATAGTCCGGTCCAACGACTACTTGCGTTGAAAAATACAATACTCCAAATAAAATTCAAGAAAAGTTGGGCAATAAATAATGTTAGGTTTGTTTTGCGGTAGTTACTCCTAACTGTGAAAATTAGGTAGCCAACGATACCAATCATTAAGTATAAAATTGGCCACACGATACCAAATAAACGATCTGGTGGTGAGAATGGTGGCAAAGTAAAGCTATTATAGATGGCTTTGATGTCGCCAGCTAATAATCCAGATAATGAGCCGATTAGTTCTACTCCAACTACCGCAATAATTAATTGAACCCATTTACTTTTGGTTTGCATAAAAATCCCTCCCTTATATTTTGTGAAACCTATCTCATTAAGGTTAGCTTACCAAAAGTAGAGGAGAGAATATAATATTTTGCTTAGGGTAGTGAAATCAAAAATAAAACTAAAGATGACATTTGCTCAACTAAAAGCTAATATTAAAGGTGTTGGTATTAAATTTTATCTGATACTAACACACACGGTGGTTCGAAATATCCTCCCGCCTCAAACTAAAACTAGGAGAGTTACATATGCACAAGATTAATCGAAATATTTCCGCTACGGCTATCATAGCGGCTCTTTACGTGGCCATTACCCTTGCACTAGCACCTATCAGTTTTGGCGTAGTCCAACTACGACTTTCAGAAATGTTCAACCATTTGGCGGCGTTTAACAAACGCTATATTTTTGCAGTTACGTTAGGGGTCTTGATTGTGAATGTATTTAGTCCATTAGGGCCCATTGATATGCTTTTTGGTACGGCTGGAACCCTAATTGGAACAACGCTAACGTACTTTTGCACACGCAAAGTTACGTCATTGATTGGTAAATTTACCATTGCGACAATTTGCCAGTTACCGGGGATGTTACTGGTAGACTTAGAAATGCACTTATACAGCAATCTTCCCATGTTTCCGACTTATTGGATATTGGCTGCGGGTGAAATTGCCTCAATGGTAATAGGCGCGTTTTTTATCTACTTAATTTCTACTAAAGTTGACTTATATAAATAAAAAAGAGGTTGAATAAATGACTTTTGAAAAAATACTACCTATTTTAAAAAATAATGGTAAAGCAATTCGTGAACAGTGGGATAGCGATGAAGAATTTATCTTAGTAGTCAAAGATCAAAAATTTAATGGTGTTCCCGTAACTCCCTATATGTTAATTAAAACGACTAGCGAAGGCTATTCTAGCTTTGCACCTACCGTTTGTGACGTGTTGGCAGACGATTGGAAGGTCGTGGATTAATTGGTTAATTATCCTGAGTTAAAGAATAAGTATGTTTTACTTACAGGAGCTAATTCTGGCATTGGGCTTGCTCAAGCTCGCGAATTTTTGGGTCAAGGTGCAAAAGTAATCGGACTCGATTGCAATGTAGATCAAATGCAACAACTAAAAGCAATATATACGACCAATTTTGGTTATTACCAAGTGGATTTGACTGATGAAAAACAGTTAGATACGGTAATTGGTAAGATAAGTAAAGTAGACATTTTATTAAATACGGCTGGGGTACTTGACGATTATCAGCCAATTGAAACTACTTCGATCAATTTATGGCAGAAAATTCTGGCTACAAATGTTACAACAATGTTTAATGTAACTAAAAAGATTTTACCGCTGTTAGCTGAAGGTAGCGTTATTGTTAATATGGCTTCAATTGCTGGAATGGTTGCTGGCGGTGGTGGTATAGCTTACACAACGTCAAAACATGCCGTTATTGGATTTACTAAACAATTAGCACTAGATTTGGCTGAGCGAGGAATTCGAGTGAATGGCATTGCTCCAGGATGTATTGATACACCGATGAATGCAAAAGATTTTGCAAATGGTGGGGAGATGGCTAAGTCTGTCGCTAAAGAAGTGCCTATAAAACGCTGGGCTGGAGCTGAAGAAGTTGCCAGAGTTGCTACATTTTTAGCTAGTAATGGGGCAAGTTACTTACAGGGAACAATTATTCCTGTTGATGGTGGCTGGATCACAAAATAATTTAAAGCTTTTCAACTTTAGTTGGAAAGTTTTTTTGTTAAAAAGTATATTTTTAGTTTACATTTTAGCTTTTAAAACGTTACTAACTATGAGTACATCTTTTTAATCATAGGAGGTGCCTTAATGGCCAGACCAACAAAAGCGGGCTTAGATTATTTTCCATTTGACGTTGATTTTAATGTAAATGAAAAAACGGAAGCTATTATGGGAGAATTTGGAGCTAAAGGAGTTTTAACCACGATTTTTATCTTTTCAGCGATTTATAAAAGGGGATATTTTTTGGAGTGGACACCACTTGTTAAAAATAGCCTTGCAAATCGAATTGATGGAGTTAATAGTAAATTGGTAGAGCAGGTAGTTAACCGCTTGGTTGCTTACGGGACCTTTGATGAGGAACTGTTCAACTCGGCTAAGGTTTTGACAAGCTCACGTATTCAGACCACGTATTTAGAGGCGACTAAAAGAAGAAAAGCGCCAAGACCCACTCTATATTGGTTAGTCGATGAAATTGAGACCGATATTAATGTTGTCATTAATCCACAAAGTAAAGGAAACAAAAATAAATTAAATCAAAGTAATAAAGACCTTAATTTAATTAAAGGCGGCTGTGTAAATGATCCAATTCCAATGGTAAAACTTACTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020018|177025:183381|181274_181757_+|AVL01459.1|DBSCAN-SWA MHKINRNISATAIIAALYVAITLALAPISFGVVQLRLSEMFNHLAAFNKRYIFAVTLGVLIVNVFSPLGPIDMLFGTAGTLIGTTLTYFCTRKVTSLIGKFTIATICQLPGMLLVDLEMHLYSNLPMFPTYWILAAGEIASMVIGAFFIYLISTKVDLYK >CP020018|177025:183381|181773_181995_+|AVL01460.1|DBSCAN-SWA MTFEKILPILKNNGKAIREQWDSDEEFILVVKDQKFNGVPVTPYMLIKTTSEGYSSFAPTVCDVLADDWKVVD >CP020018|177025:183381|180567_181038_-|AVL01458.1|DBSCAN-SWA MQTKSKWVQLIIAVVGVELIGSLSGLLAGDIKAIYNSFTLPPFSPPDRLFGIVWPILYLMIGIVGYLIFTVRSNYRKTNLTLFIAQLFLNFIWSIVFFNASSRWTGLLIILVLDVLVFFCIKEFYKSSKLAAYLMIPYFLWILFATYLTLGTAILN >CP020018|177025:183381|180211_180439_-|AVL01457.1|DBSCAN-SWA MKTLDVIALVLLIVGGLNWLLVGIFQFDLVATLFGGQAAIISRIVYVLVGISAIYCLKFFGLISAQPEKKNDNNY >CP020018|177025:183381|177025_178885_+|AVL01455.1|DBSCAN-SWA MASNKIIGIDLGTTNSAVAVMDGDKPKIITNPEGARTTPSVVAFKNGETQVGEVAKRQAITNPDTIASIKRHIGEAGYKVTVDGKSYTPQEVSAMILSYIKKFAEDYLGEEVDKAVITVPAYFDDSQRQATKDAGKIAGLDVKRIINEPTASSLAYGLDQNGKDEKILVYDLGGGTFDVSVLELGDGVFQVLSTNGDTHLGGDDFDQKIIDWLVDEFKKDNGVDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVSEAQISLPFISAGEAGPLHLEKTLTRAQFDQLTADLVERTKAPVENALKDAGLSASEIDEVILNGGSTRIPAVQEAVKNWTGKEPNHSINPDEAVALGAAVQGGVLTGDVKDVVLLDVTPLSLGIETMGGVFTKLIDRNTTIPTSKSQVFSTAADNQPAVDIHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPAAPRGIPQIEVKFDIDKNGIVNVSATDKGTGKEQKITIKSSSGLSDEEIDRMMKEAKENEEADKKRKEEVDLRNEVDQLIFTTDKTLKDLEGKVSEDEIKKAKDAKEALEKAQKDNNLDEMKAKKDDLSKIVQDLSVKLYQQAQEAQGQAADGAQANAGDAKTDDDNTVNGDFEEVDPDKDNK >CP020018|177025:183381|178981_180106_+|AVL01456.1|DBSCAN-SWA MAANKDYYDILGVSKDASDDEIKKAYRKLSKKYHPDINKAPDAEQKFKDVNEAYEVLGDSQKRAQYDQFGSADPNAGFGGGGFGGQGGFSDFGGGFEDIFGSFFGGGQRQSPNQPRQGEDLQYQMSLKFEEAIFGKKTTIKYSREALCKTCGGSGAKEGTSPVTCHKCNGTGTIQVTQNTPLGRMVRQQTCDVCNGTGKEIKEKCPTCGGTGHTSQQHEVKVSVPAGVEDGQQMRLQGQGEAGFNGGPYGDLYIIFQVQPSDMYERDGSEIYYNQTISFVQAALGDEIEVPTVHGKVKLKVPAGTQTGTNFRLKGKGAPRLRGNGTGDQHVKVKVTVPKKLNSGQKEALKQFAKASGEEPSGHGKSGFFDKFMN >CP020018|177025:183381|181995_182736_+|AVL01461.1|DBSCAN-SWA MVNYPELKNKYVLLTGANSGIGLAQAREFLGQGAKVIGLDCNVDQMQQLKAIYTTNFGYYQVDLTDEKQLDTVIGKISKVDILLNTAGVLDDYQPIETTSINLWQKILATNVTTMFNVTKKILPLLAEGSVIVNMASIAGMVAGGGGIAYTTSKHAVIGFTKQLALDLAERGIRVNGIAPGCIDTPMNAKDFANGGEMAKSVAKEVPIKRWAGAEEVARVATFLASNGASYLQGTIIPVDGGWITK >CP020018|177025:183381|182859_183381_+|AVL01462.1|DBSCAN-SWA MARPTKAGLDYFPFDVDFNVNEKTEAIMGEFGAKGVLTTIFIFSAIYKRGYFLEWTPLVKNSLANRIDGVNSKLVEQVVNRLVAYGTFDEELFNSAKVLTSSRIQTTYLEATKRRKAPRPTLYWLVDEIETDINVVINPQSKGNKNKLNQSNKDLNLIKGGCVNDPIPMVKLT |
8 | Megavirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
312698 : 322316
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020018|312698:322316|DBSCAN-SWA TTTAATCTTCACTGTAATATAAGATACAAAACGCACCCATACCTGTATGAGTTGCAATAATTGGAACAGTCTCTCGTACAACAATATCATTAACTGGGAAAAATTCACCAACATGTTTCTTCATATCTTCTACCATATCAAAGGCTTCTACATGTGAAATTCCTACCCCTTTGATTTTGCCACTACCTTGCATTTCAGTATAAATATCTGACCAAAGTTTCTTCATGGCTTTCATCCCGCGAACCTTGCCGGCTACATCAAGTTTACCATTTTTTACCTCAAGTAATAACTTAATATTTAGTAAACCTCCCAGCATTCCGCCAATCTTACTTAGACGACCGCCTTTAACTAAATTTTCCAAGTTAACAACGCTTAAGTAAAGTTTGGTATGATCTCGGATATATTCTGCTCGCTGGATAATTTCGTCTTTGCTGGCACCTTCTTGAGCCATCTTAGCTGCTTCTAAAACTTGAAAAGCTAAGGCGCGATCCGTGAATTGGCTATCAATCACAGTCACATCTGCTTTACTAAGTTGAGCAGCTTGTTCGGCAGTATGTACCGTTCCACTGATTGCCTCTAACATATTAAAGCTGATGATTTGGCTACCATCTTCACCTAATTTATCAAACATTTCAACAAATTTACCTAATGGTGGTTGGCTAGTCTTTGGTAGTGACTTAGATGATGCCATTTTATGAATAAATTCTTCATTAGTAATGGTTTCACCTTCGACATAAACTGTATCATCAATCATTACACTTAATGGGACAATTGAAATATCATATTTTTTAATTTCTTCATCAGTAACGCCACATGATGAATCTGTGACAATTTTAATTTGACTCATATTTTCACTCTTTCCTTGTTACATAGTTATTCCGAGTTCTATTCACATGAAGCATGTTTCATATACATTTATAGAATCCCCGTACATATTTACAATTTTAATTATAACAATCTATTCTAAATTTTTGTTCTATAAACAAACTTTTCCGCAAAAAATTTTTGTATTTAAAAAGAGCCTTGATAAAAATAATATTTAACCTCATTAAATATTATTTTTACTTCAAGCCCTTTTATTGATTAAACGTTTAAAATTTTGTTTAAAAATTCTTGTGTCCGTTCGTTTTGAGGGTTACCAAAAATTTCTTCCGGCTTTCCTTCTTCCATGATATGACCATCCGCCATAAAAATCACACGATCAGCAACTTCTTTAGCAAAGCCCATTTCATGCGTTACAACAATCATGGTCATCCCTGCCTTAGCTAGTTTTTTCATTACTGCTAACACATCTCCAACCATTTCAGGATCTAGGGCTGAAGTCGGTTCATCAAATAAAATCATATCTGGTTTCATCGCTAGAGTTCTTGCAATGGCCACTCGCTGTTTTTGACCCCCCGAAAGAGATTGGGGTTTAGCATTAAATTTATCTTCTAAACCCACTTCTTTTAGCAATTCACGTGCCTCAAGCTCGGCATCCGCTTTACTCATCTTCCCTAATTCAACCGGCGACAACATCACATTTTCGCCTACGGTCAAATTATTAAATAGATTAAAGTGTTGAAATACCATTCCAATTTTTTCACGAACCTGATTCATATTAACCCGTGGATCGTTCAAATCATGCCCATCGATAATGATTTTTCCAGCGGTCGGTTCTTCTAACTTATTTAGCGTACGTAGAAAAGTACTTTTACCCGAGCCCGACGGACCAATCATAACAACCACTTCATTATCTTTGACGATCAAATCTAATCCTTTCAGAACCTCGTTACTACCGTAAGATTTTTTTAAGTTCTGTACTTCTATTTTTGTACTCATCCCTTCATCCTCCGTTCAACCCATTTTGAAAGCCACGTTAGTAATGTGATGATGACCAAGTAAATTAGTGCTACCATGGTCCAAATTTTAAATCCTTCTAGATTACGTGCAATAATTATCTTACCTGTCTGTGTTAATTCAAGTATTCCAATAATTGAAAGAATCGAAGTATCTTTCAAAGTAATAATAAATTGATTAATAAAGGATGGAACCATAATTTTCAATCCTTGCGGTAAAATAACTCTCCGCATCGCCTTTCCATATGGTAATCCCAGTGAACGTGCTGCTTCCATTTGTCCACCATCTACTGCTTCAATACCACCTTTTACAAAAGCGGCAGTATAAGCTCCTTCATTTAAGGTTAAGGTAATAATTCCGGCAACAAATGCTGGAATTTTTTCACCTACCAAATTAGGCACCCCCGTATAGATAAATAAGGCTAAAACTAACAAAGGAAGTCCACGGAAAATATAAATTACAGTAGTCGAAACTCCATTAGCAAATTTATTTGGGACAACCCCTAACATTCCGAAGAATATCCCAAAAATGGTAGCAAAGAAAATTGATAATACTGTTAAAATAACCGTTTGTTCTAATCCACCAAGTAATGCGCCTTGATTTTGTTTCCATAAACTAATAAATGTATTTTGTGTTTTATGAGCTTTTTGTGAAGCAACAGCAGAAGCTCCTAAATATTTAGCTACAATCTTTTTATACTGTCCATTGCTTTTAATTTTCTTTAAACCCGCATCAAATTTCTTTAATAGTTCTTGGTTATGTCCTTTTTTAACAGAAAATCCATAAGCACCGCCATTGGCTGGTTTAGTAACGATCTTAAGTTTTGCCCCAGTTTTAATAGCGTATTGCATAACCGGCTGATCTTCAAAACATGCCACTGAATTTCCAGTCGTCACGTCGTTATAGACGTTATTAGAATCATCAAAAGTAACCGTTTTGAATCCATACTTTTTCTGAATACTTTTAGCATAGTCTCCAGCAGCTGTACCAGTTTTGATAGCAACTCGCTTGCCCTTTAAATCTTGGAAATTTTTGATGGATGAGTTTTGTCCTACAGCCATCACCACCCCAGTTTTAAAGTATGGGGCCGAAAAATCCATCTTCTGTTTACGTTCATCAGTAATCGTTGTTCCAGCAATAACTCCATCCAATTGCCCGGCATCAAGCGCTTGAACCGCTGCATTGAAACCAACTGGCTTAATCTTTACTTTAAAACCTTCGTTTTTAGCAATCGTCCTAATGATATCCATATCAATCCCTACGTACTGATTTTGATCATTAGCAAATTCAAACGGTGGAAATGTAACATCAGTTCCAATCTCGTACACTTTCTCATCCGCATTGACGTTATTCGAATTAAAAACTGACCACCCAAATAAAATTACAATGCTAAAAACTATGCTCAATAAAGTTTTTTTAATCTTTGCCATGATGCCCTCCTACTTATGTTAGATAACCTAACATTAAAAATTAGATTAAATATATCATATAATTTTAATCTTGAAAAGGAGGATAAATAAAAAACCTCAATAAATGAGGTTTTAACGTTTATTAAATTCTAATCCATGTTTCAAAAGTATATGCAGGATTTCTTTCGGTTGATTCATGTTCAACTGAGCTAGCCAATTTAAATTCATTTTGGGTGATATCAGGTGCTAAAACCTCACATTGATAATCTTTTTGGATTCTAGTTATCAGAAGTTCATCAGCTTGTGATAACAAGGCATTGTATAAATGACTTCCTCCAATAATATAAAATTTTTCATTAGGATGGGTTTCAAAAATCGCCTGAAGTTCACTTAATGAACCCACGCCAACTACAGAATCTGGCAATGAGGTTGGATGATGACTTAAAACAATATTTTTTCGGTTAGGCAACGCTTTTCCAATTGAATCAAAAGTTTTACGACCCATAACTACGGTGTTCCCACTAGTGGTTTTCTTAAAAAAAGCCATATCACCTGGAATATGCCACGGAATAGATTGCTGCTTGCCAATTCCATGACGCAAATCTTCGGCCCAAATCATTGAAATCAAATTTAATTCCTCCTAAATTGACTTAAAATTAAACTGCTACCGGTGCTTTAATGGTTGGATGAGGATCATATCCTTCAACCACAATATCTCCTGGTTCATAGTCAAAGATACTGTCATGCACTTGTTTAAATTTCAATTTAGGAGCCGGACGTGGAGTACGTTCTAATTGTTCTTTAACCTGATCCAGATGATTAGAATAAATGTGAGCATCACCGATGGTATGGATAAATTCTCCCACTTCTAAACCAGTCGCTTTCGCAATTAATTCTGTAAGCAAGGCATAGCTAGCAATATTGAAAGGAATTCCTAAGAAAATATCGCCACTGCGTTGATACAGTTGACAGCTAAGTTTCCCATCAGCCACATAAAATTGAAATAGTGAATGACACGGAGGTAATGCTGAGGTTGGCACATCTTCAGGATTCCAAGCCGAAACGATCATTCTTCTTGAGTTAGGATTATTCTTAATCATATCAATAACATTTGAAATTTGATCGATAGTCTCACCAGTACTAGTCTTCCATGCTCGCCATTGGCTACCGTAAACATTTCCAAGATCACCATATTTAGCAGAAAATGTATCATCTTCCAAAATTTGTTCTGTAAAACGTTGTTTTTCAATTTTATAGAGTTCATTGAATTCAGGATCAGTCAGTGAGCGGTGACCAAAATCGGTCATGTCTGGTCCCTGATATTCATCACTTTCAACCCACTTTTTAAAAGCCCATTCATCCCAAATATGATTATTATGTTGAAGTAAATATCTAATATTGGTATCGCCTTTTAAAAACCAGAGTAACTCACTCTTAATCAAACCAAAAGGGACTCTCTTGGTCGTTAGTAATGGAAAACCTTCACTTAAATCAAAACGCATTTGATATCCAAAAGTACTTAGGGTACCAGTTTGGGTACGGTCTCCTTTGAGATGCCCATTTTCCAAAACATATCTTTCCAAATTAAGGTATTGTTCTTCAAGCATATTAAATTTCCCCTATTCTTCGAAACTTTCTAAGTATTCCCATCTTGCCATTTTTTCTTCTAATTGGTCCGAAATTTCATTTAATTCTTTTTGCAATTCTGCTAATTTTCCGTAATCAGCAGCACATTCGCTCATTTGTTCCTCCACAGATGTGGACTTTTGTTCTAACTTTTCGATTTCAGTTTCAATTGTCTGCCATTCTTTTTCTTCTGAATACGTCCTTTTTTTCTTTTTAGGAGCTTCAACTTGTTCAACTGACTTAGGAGTACTTTTAATTTTACTTGATTGTACTACGTTTTGTTTTAAATAGTCACTGATCGAGCCCGTATATTTTTCAACTTTAGCATTTCCATCAAATATTAGTAATTGGTCACTAACTTTATCTAAGAAATACCGATCATGGGACACGGTAAGGACTGTACCTTTGAAGGTTTTTAAATAACTCTCTAAAACAGTTAAAGTAGCAATATCCAAGTCATTAGTGGGTTCATCTAACAATAGTACATTAGGTTGTTCCATTAAAATCTTAATTAAAAATAGACGCCGTTTTTCACCACCAGATAGCTTTTTAATTAAACTACCATGTAAAAAACTTGGAAATAAGAATTGTTCTAAAAGACTAGTGACACTAATTTTTTCACCATCTTTATTGATTACTTCTTGTCCAACTTCTTTTAGGTAATTAATTACCCGTTTATCTTCTGGTATGGGTTCAATTTTTTGAGTATAATACCCAATTTTAACAGTTTCGCCAATTTCAATTTTCCCACCCTGAATAGGCAATACTCCCGCAATCGCATTCAAAAATGAAGATTTACCTGCGCCGTTGGCTCCTGTTATTCCGATTCGGTCACCCGCCTGAATTAACTTAGAAAAATCCTTCATAATTTGATGGTCGCCAACTTCTAAATCTAAGTCATTGATTTCAATTACTTTTTTGCCCAATCTTTGTTGTGTTAGACCAATCTCAAGGTCTTGATCAACCTCTTTAGGCGCATGTACAGCTTGGTCTAACTTTTCAAAATGGTTAATTCGCGCTTGTTGTTTAGTTCCACGTGCTTTGGGTCCACGTTTCATCCATTCAAGTTCTTGCTTATATAGTTTGTACTCTTTTTGTTTACTAGCTTCGTTTTGCTCATCACGAACCGCTTTTTGTTCAACATATTTTTCATAGTTACCGACGTACTCAAAAAGGTCTCCGTAACTTAATTCCCAAATTCGATTGGTAACTCGATCTAAGAAATATCGATCATGGGTAACCAATAGTAATGCGCCTTTATAATCAGCAAGGTATTTTTCCAGCCACTCAATTGAATCAAAATTTAAATGGTTAGTAGGTTCATCTAAAATCAATAAATCTGCTGGTTCTAACAATGCCTGTGCTAAAGCGATTCGCTTAACTTGTCCACCCGAAAGATGATGGATAGATTCATCTAGCATATCAACATGTAATTGCGTCAAAATGGTTTTAATATTGCTTTCCGTATTCCAAGCATCCAGTTGATTCATTTCATTTTCAAGTTTAGTAAATTTTTCAAATAGCGTTGATGAAGTTGGATTATTAGTATATTGTTCTAAGATTTCTTCGTAGTGTTTAATTACTTGAAATACATGTTGATCCCCGCTGTAAATAAATTCACGTACCGTTTCAAACTGACTAATTTCTTCACTTTGTTTAAGATATGCAATACGGTAATCGTTTGGTGTTTCAATTGTTCCTGAATCAGCGGGATCAAGATTCGAAACGGCATTAAGTAAATTCGTTTTTCCTGATCCATTAGTTCCAATTAGTCCAACTCGATCGTGTTCATTGATTACAAAATTAATCGAGTTAAACAGCTTCTTTTCACCGTAAGTTTTGGTTAGATTCTTACCTTTTAGTATTTTCATATTTAATCATCTTTCTGTAACTTATTTACTGCATTCAAAAGCGCTAAGGACTCGTTTTTCAGTTCATCATTAATAACCATTAATTTTAACCGGTTTAAAACTTGTCCCATCTGAGGTCCAGGCTTAATTATTCCCTTTTGAATTAGCTCTTTACCAGTAATTGCCATTTCATGTGTATCTTTAATTTGAAGGTTTTGGTAAGTATCTAGCCAAGCCTCACGATTCATCCCCAGAATTTGGGCCACCCGAATGGCGTTAACTACATTAGCTTCCCCTGCGTTGAACAGCGCTAAACGTTCGTTTTGATCATTTTTATCCATGCTTAATACTTGTAAAGTCGCACTGACATTTTTGATCAAATCGTTAGATGTCTTCCATTGTTTCAAGAAAGGCATTACTTCTTGAGGAGTTAATTTTAAACTCCAAGCAATCATAGTCCAAACTTGTTCAGGATTTTCTAGAAGTTTCAAGGGATATTTTGTAAGCTGGTCTAGTTCTTTAGAACGGTCCTTAAATCCCGGGCAATATTCATTCAATTTAGTTGTCAGCATGTCTTCTAGTCCACGATTAGGTTTGCTACCCAACATCATTTTTTCAAATTCAACTAAGATTCTTTCGACTGAGATTTTACCTAAAAGCATATTATTTTCTTCGATTGCCTTCAGCGTCTTTGCTTCAATTTTGAAATCTAGTTGGCTTGCAAACCGTACTGCTCGCATCATTCTTAAGGCATCTTCATGAAAACGTTCGTGTGGATCTCCTACCGCACGAATAATTTTATGTTCTAGATCACTTAAACCATCAAAAATGTCAATTACCGTTCGATCTTCTTTTAAAGCAAATGCGTTAATTGTAAAATCACGGCGCATTAAATCTTCTTTTAAAGAGCGTACAAAAGTAACCTGATCTGGACGGCGAAAATCCTGGTAGCCACTTTCGGTTCTAAAAGTCGTGACCTCGTAACCTTCGCCATCATGAATCACCATTACCGTACCATGTTCGATTCCTGTATCAACAGTTTTCTTAAAAATATGTTTAATTTCGGCGGGGTATGCGCTTGATGCAATATCAACATCATGAATTGGCTTATTTAATAATGTATCACGAACACTTCCCCCAACAAAAAAAGCATCAAAACCTGCATCTTCGATTTTTTGTAGGACTGCACGGGCGTCCTCAAATTCTTGGGGCATTTTTTCTATCTGCACCATTTCCACATCCGTTTCAAAGGAATTACTTTCTCGTAACACCTTAAATAATAAATTCTTTAACTTAGTATGCGCATCAATCCGATTTAAGTAAAGGTACTATCTTTTAACTAATTACCGAATTAAGTATAAAAATTTTGCACATACTCTAACATCGTCTTAATAATTCTACCAGCGTATGATTTTTTTGAAAAGCCTGCTCCGCTCTATGGTATGATATTTGCAAGTACTTCAGTTTCTACGTAGGAGGTCTATTATGCAAAAAGATGAATCAATCCGATTTTTAGATTTTGTGATGATTGCCTTAGGTTGTTGTCTGTATGGTTTAGGGTTGGCTGTAGTCAATATCCCTAATAATCTAGCTGAAGGTGGAATTACAGGGGTCACCTTAATTTTACGAGCTTTATTAGGAATTGATCCTGCACTCTCAACAATTTTAATTAATATCCCATTAATTTTCATAGGTTACCGTTTTCTGGGAAAAAGATCTTTAATCTACACAATTTTTGGGACGTTTGCGCTCTCGTTTTGGTTATACGTTTGGCAACGAGTACCCATCAGTCTCGATATTCATCATGATATGTTTATCGCCGGAATCCTGGCCGGAATCGCTGGTGGTTTTGGTAGCGGGATCGTTTACCGTTTCGGTGGTACAACCGGTGGAACCGACGTTGTAGCTCGCATTCTCGAGAAACGGCGTGGAATTGCCATGGGTCATACTCTTTTCGCTTTAGATGCCGTCGTATTAACCATTTCTCTTTGCTACATCGATGTCCTTCATATGATGTATACTCTACTAGCAGCTTATGTATTTTCTCGTCTAGTTTCTCTTACACAGGTGGGAGCCTATGCTGCTCATGGTTTACTAATTGTCAGTAGCAAAAACCAAGAGATTGCTGATGCCTTAATGGACGAGTTAGAGCGCGGGGCAAGCTATATTCATATGTCTGGTGCCTATTCTAAAACAGAGCGTGAAATGGTTTATTGCGTAATTGGACCTAACGAATTAAACGTTGCTAAACGTATCATTGGACGAATTGATCCTCAGGCGTTTACTTCTATTATCGATGTCCATGAAGCCATTGGTGAAGGTTTTACCTACGATTCGCCCAGTGCTAAAAATCGAAATATCCCTAATTAAAAAACATCAGTTATGTATAAACTTAAATACATGACTGATGTTTTTTAATTAGCTTTAGAATACTGTTAAATCAGAATATACCGGCTTTAACAAATTAAAATCATAAGTTGCCAAGTCCTTAATACTTTCACCATTAAAGAAAGCAGTGTGACTTCTAGCAAGCATCAAATTAATTTTGTCAGAATCATCAAATTGAACAAGTGCTACGGGATTACCATGTTCAAAGGCAGTACCGATCTCAAATACTGTTCCAGGATCTGAAATGATTTCTTCACCGTTTTTAGTATAATCTAAGATTGCTACAACAATATCGGCTTTGCGAAGTTGACGCACATCGGTTTCAAAGACTCCCACTTGCCATTCAAATGAACCAAATTCCTTAGTATCATATTGATTATCCATTGGTACAAAAATTCTTTTTGAATCAATTGTAGAATTTTTCTTTAAAAGTTCTTCAACCTTACGTACTCTTTCAATTTGTAAATCACTAAAGAAAGGCCCTGCTAAATATACTGAGTTTCCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020018|312698:322316|320906_321791_+|AVL01575.1|DBSCAN-SWA MQKDESIRFLDFVMIALGCCLYGLGLAVVNIPNNLAEGGITGVTLILRALLGIDPALSTILINIPLIFIGYRFLGKRSLIYTIFGTFALSFWLYVWQRVPISLDIHHDMFIAGILAGIAGGFGSGIVYRFGGTTGGTDVVARILEKRRGIAMGHTLFALDAVVLTISLCYIDVLHMMYTLLAAYVFSRLVSLTQVGAYAAHGLLIVSSKNQEIADALMDELERGASYIHMSGAYSKTEREMVYCVIGPNELNVAKRIIGRIDPQAFTSIIDVHEAIGEGFTYDSPSAKNRNIPN >CP020018|312698:322316|319444_320653_-|AVL01574.1|tRNA|DBSCAN-SWA MVQIEKMPQEFEDARAVLQKIEDAGFDAFFVGGSVRDTLLNKPIHDVDIASSAYPAEIKHIFKKTVDTGIEHGTVMVIHDGEGYEVTTFRTESGYQDFRRPDQVTFVRSLKEDLMRRDFTINAFALKEDRTVIDIFDGLSDLEHKIIRAVGDPHERFHEDALRMMRAVRFASQLDFKIEAKTLKAIEENNMLLGKISVERILVEFEKMMLGSKPNRGLEDMLTTKLNEYCPGFKDRSKELDQLTKYPLKLLENPEQVWTMIAWSLKLTPQEVMPFLKQWKTSNDLIKNVSATLQVLSMDKNDQNERLALFNAGEANVVNAIRVAQILGMNREAWLDTYQNLQIKDTHEMAITGKELIQKGIIKPGPQMGQVLNRLKLMVINDELKNESLALLNAVNKLQKDD >CP020018|312698:322316|321845_322316_-|AVL01576.1|DBSCAN-SWA MGNSVYLAGPFFSDLQIERVRKVEELLKKNSTIDSKRIFVPMDNQYDTKEFGSFEWQVGVFETDVRQLRKADIVVAILDYTKNGEEIISDPGTVFEIGTAFEHGNPVALVQFDDSDKINLMLARSHTAFFNGESIKDLATYDFNLLKPVYSDLTVF >CP020018|312698:322316|312698_313544_-|AVL01568.1|DBSCAN-SWA MSQIKIVTDSSCGVTDEEIKKYDISIVPLSVMIDDTVYVEGETITNEEFIHKMASSKSLPKTSQPPLGKFVEMFDKLGEDGSQIISFNMLEAISGTVHTAEQAAQLSKADVTVIDSQFTDRALAFQVLEAAKMAQEGASKDEIIQRAEYIRDHTKLYLSVVNLENLVKGGRLSKIGGMLGGLLNIKLLLEVKNGKLDVAGKVRGMKAMKKLWSDIYTEMQGSGKIKGVGISHVEAFDMVEDMKKHVGEFFPVNDIVVRETVPIIATHTGMGAFCILYYSED >CP020018|312698:322316|316087_316573_-|AVL01571.1|DBSCAN-SWA MISMIWAEDLRHGIGKQQSIPWHIPGDMAFFKKTTSGNTVVMGRKTFDSIGKALPNRKNIVLSHHPTSLPDSVVGVGSLSELQAIFETHPNEKFYIIGGSHLYNALLSQADELLITRIQKDYQCEVLAPDITQNEFKLASSVEHESTERNPAYTFETWIRI >CP020018|312698:322316|316601_317552_-|AVL01572.1|DBSCAN-SWA MLEEQYLNLERYVLENGHLKGDRTQTGTLSTFGYQMRFDLSEGFPLLTTKRVPFGLIKSELLWFLKGDTNIRYLLQHNNHIWDEWAFKKWVESDEYQGPDMTDFGHRSLTDPEFNELYKIEKQRFTEQILEDDTFSAKYGDLGNVYGSQWRAWKTSTGETIDQISNVIDMIKNNPNSRRMIVSAWNPEDVPTSALPPCHSLFQFYVADGKLSCQLYQRSGDIFLGIPFNIASYALLTELIAKATGLEVGEFIHTIGDAHIYSNHLDQVKEQLERTPRPAPKLKFKQVHDSIFDYEPGDIVVEGYDPHPTIKAPVAV >CP020018|312698:322316|313780_314518_-|AVL01569.1|DBSCAN-SWA MSTKIEVQNLKKSYGSNEVLKGLDLIVKDNEVVVMIGPSGSGKSTFLRTLNKLEEPTAGKIIIDGHDLNDPRVNMNQVREKIGMVFQHFNLFNNLTVGENVMLSPVELGKMSKADAELEARELLKEVGLEDKFNAKPQSLSGGQKQRVAIARTLAMKPDMILFDEPTSALDPEMVGDVLAVMKKLAKAGMTMIVVTHEMGFAKEVADRVIFMADGHIMEEGKPEEIFGNPQNERTQEFLNKILNV >CP020018|312698:322316|317564_319442_-|AVL01573.1|DBSCAN-SWA MKILKGKNLTKTYGEKKLFNSINFVINEHDRVGLIGTNGSGKTNLLNAVSNLDPADSGTIETPNDYRIAYLKQSEEISQFETVREFIYSGDQHVFQVIKHYEEILEQYTNNPTSSTLFEKFTKLENEMNQLDAWNTESNIKTILTQLHVDMLDESIHHLSGGQVKRIALAQALLEPADLLILDEPTNHLNFDSIEWLEKYLADYKGALLLVTHDRYFLDRVTNRIWELSYGDLFEYVGNYEKYVEQKAVRDEQNEASKQKEYKLYKQELEWMKRGPKARGTKQQARINHFEKLDQAVHAPKEVDQDLEIGLTQQRLGKKVIEINDLDLEVGDHQIMKDFSKLIQAGDRIGITGANGAGKSSFLNAIAGVLPIQGGKIEIGETVKIGYYTQKIEPIPEDKRVINYLKEVGQEVINKDGEKISVTSLLEQFLFPSFLHGSLIKKLSGGEKRRLFLIKILMEQPNVLLLDEPTNDLDIATLTVLESYLKTFKGTVLTVSHDRYFLDKVSDQLLIFDGNAKVEKYTGSISDYLKQNVVQSSKIKSTPKSVEQVEAPKKKKRTYSEEKEWQTIETEIEKLEQKSTSVEEQMSECAADYGKLAELQKELNEISDQLEEKMARWEYLESFEE >CP020018|312698:322316|314514_315966_-|AVL01570.1|DBSCAN-SWA MAKIKKTLLSIVFSIVILFGWSVFNSNNVNADEKVYEIGTDVTFPPFEFANDQNQYVGIDMDIIRTIAKNEGFKVKIKPVGFNAAVQALDAGQLDGVIAGTTITDERKQKMDFSAPYFKTGVVMAVGQNSSIKNFQDLKGKRVAIKTGTAAGDYAKSIQKKYGFKTVTFDDSNNVYNDVTTGNSVACFEDQPVMQYAIKTGAKLKIVTKPANGGAYGFSVKKGHNQELLKKFDAGLKKIKSNGQYKKIVAKYLGASAVASQKAHKTQNTFISLWKQNQGALLGGLEQTVILTVLSIFFATIFGIFFGMLGVVPNKFANGVSTTVIYIFRGLPLLVLALFIYTGVPNLVGEKIPAFVAGIITLTLNEGAYTAAFVKGGIEAVDGGQMEAARSLGLPYGKAMRRVILPQGLKIMVPSFINQFIITLKDTSILSIIGILELTQTGKIIIARNLEGFKIWTMVALIYLVIITLLTWLSKWVERRMKG |
9 | Staphylococcus_phage(37.5%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
687597 : 696161
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020018|687597:696161|DBSCAN-SWA CTTAGTTAATCAACTTTCTCTGTTTTAATACTTGGCAGATGCTTCTAAAATATAAATCATGTTCAACTTGATGAATACGTTGAGCTAAATGCTCCGCATCATCCCCTTGTAAAACCGGTACAGGTTGCTGAGCAATAATCGGGCCAGTATCAATCCCTCCGTCAATCCAGTGAATTGTTACTCCCGTAATTTTTACTCCATATTCAAACGCATCCTCAATTCCATGGCGCCCCGGAAACGATGGTAACAGCGCTGGATGGATATTAAGAATGGCATGTGGATAAGCCTCTAACAAAACTTTGGTAACAATCTTCATGTACCCAGCTAAAATGATTAATGCTAAATTATATTTTTTTAGTTCCCGTAAAATCGCCTCTTCATAGCTCGCTTTATCTTCAAATTCTCTCAAATGATGGGTCCAGACTGGAATTCCTAATTTATCAGCTTTAGTAACAACCGGCGCATTGGGTTGGTCACAAATTAAGCATGCAATTTTAATGGGAACTTTTGTTTCTCGAATATGTTGGTATAATGCCATAAAATTAGTCCCTGTTCCTGATGCAAAAACTGCAATATTAATCATCTGCTCCCTCCCGAAAGGTAAACCGCTGATGCATCTTTCTCCCGTTTTTTCACTTTACCAATCTTAAAAAATGTTTCTTTCTGTTGTTCAAGTTCTGCTACCACTCTGGCATAATTGTTGGGGCTAACAGCTAGTACCATTCCAATCCCCATGTTAAAAGTTTCATAACAATCTGTCTGGGATAGCTTTCCAAGTTCCGCTAGGATTTTAAAAATTGCCGGCTTTTCCCAACTATCCAACTTAAATTCAGCCTGTTGCTGATCTTGTAACATTCGCGGAACGTTATCTAATAATCCTCCACCGGTAATATGGGCGATTCCGCTGACCAATTTTTGTTTTAAAAGTGGCCGAATCACGTTGACGTAAAGACGGGTGGGTTGCATCAATTCTTCAATCAAACTACCATTTAATCCTGCCAACTGATCATCGAACTGGAAATCATGGTCTTCAAATAAAATTTTACGAACTAACGAATAACCATTACTATGTAACCCACTGGAGGGAAGACCAATTAAATAATCTCCATTGTGGACATTTTTTGCTTGGAGTAAATCACGTTTAGCAGTTAGTCCCACAGCAAAACCCGCTAAATCAAAATGATGTTTCTGATAAATTCCAGGCATTTCGGCCGTCTCTCCGCCTAACAAGGTGATTGACTGAGCCTGGCAGGCTTTTAAAATTCCGTTTAAAATCTTTTGAACCTGATTTTTCTCTAAATGTGATAGTGCTAAATAATCTAAAAAGAATAATGGCAACGCCCCTTGCGCCAATAAGTCATTTACACACATGGCAACCAAATCTTGCCCAATCGTTTCAACTTGACCTGACTGGGCCGCTAAAAGCACTTTGGTTCCCACTCCATCGCTTCCCGCTACTAAAACCGGCTGATCCAATTGATCTTTTGATAACTGGTAACATCCAGCAAAACTGCCAAGTCCGCCTAGAACATGAGGGTCTGGAGCACCTAATTTTTGCTTTAGATCAGCTACAAGTTCTTCACCAGCTGCAATATTCACACCTGCTTTTTCATAAGCACTTTCTACCATTATTTTTCCTCCACTTGGGCCATTGCTGATAATGTAAAGTCGTTAGCTGTTTTAGGGATCTCAAAATCTTTTTCATAATCATAAAGGGGGGTGGGATATTTACCATCAAAATACGCTACACATAAGCCATCATTGGGCGCATCTTGATGTAAACCGATCGCCTCAATTAAACCTGGCAGGCTCAAAAAATGCAGTGAATCTGCTCCAATTTTCTGACACATCTCACTTACCGTATAATTAGCAGCCATCAATTCACGTGTATGTTCAATATCAATTCCATAAAAGCATGGATATTTAAGTGGTGGAGAACTTATCATCAAATGCACCGACTTAGCTCCTGCATTTTTTAGCATTTTCACAATATACTGACTGGTGGTACCCCGCACGATTGAATCGTCAACTAATGCCACATCTTTCCCCGCAATTACTGCTTTTAATGCAGATAATTTCATCTTCACTCCCTGTTCACGTAGTGCTTGGGTCGGTTGAATAAAAGTCCTACTACTATATTGATTTTTAATTAATCCCATTTCATTGGGAACGCCTAGTTGTTCGGCCACTCCAGATGCTGCTGATAACGAAGAGTTCGGCACCCCCACCACCATATCGACCTTAATGGGGTTTTCTTTTGCCAATCGTTGACCCATCCGTTGACGAGCGAGATGAACATTAACGCCATAAAGATTTGAATCGGGTCGCGCAAAATAAATGTATTCCATCGAACAAATTGATAACTGGGTTTTAGTAGTAAAATTACTAATCTGAAGCCCATGGTGATCAATTTGAACTAACTGTCCCGGTTCAACATTTCGAACCAAGGTTGCTCCGACCGCATCTAAAGCACAGGTTTCACTAGCAACAACATACGAACCGTTAGCTAATTTTCCAATTACTAAGGGCCGAAAACCATTCGGATCAAGGGCCGCGTACAGTGCATCTTTGGTAAGGATTAAGTAAGCAAATCCACCTTGAATTTGTTTTAAACTCGCTTTTAATTTTTCAATAAAAGTTGGACCTTTTTGATGCTGAATTAAATGCATTAGTACTTCCGTATCAGAATTAGATTGAAAAGTAGCACCACTTTTTTCTAATTCGCGTCGTAAACTAACTGCATTGGTTAAATTACCATTATGGGCCATCGCCACATCTCCTTGTAAGTAGTGGAAAAGTAACGGTTGGATATTTTCAATTCCTCGGTTTCCAGCTGTTCCATAGCGCACATGACCAATCGCACTCGGCCCAATTAGCTGTGCCAAATCATCGGGACATCTAAATACATCTGCCAAAAGCCCCTTTCCTTTATGAATTTTCAACTGTCCTTCTTGATTACGAACGACAATACCAGCACCTTCTTGGCCTCGATGTTGTAAGCTGTGAAGTCCGAAGTAGGTCCGTTGGGCAGCTTCTGAATCATTCCAAATACCAAAAACACCGCATTCTTCGTTTAGACCCTTTAATTCAGCTGCCATGCTAGGGCTCCCTTCCAACTCTCCTTAGTATTTTTCAAATCAACATCAATTACATCATCCATCGTTGCAATTTTGATCCGCTTACCGCCAACTTGGCCGATTAAAGTTGCTCTGTTTGCCACTTGTGCTTCAAAAATCTTTTGTTTATCTGGAGCAATCGTCACAATAAAGCGGGCCTGATTTTCGGCAAATAGTTCTGTAGCTGTTAAATTAGTCTTGACGTCACATCCTAACTCACTAGCGAACGCGCATTCAGCTAAACCAACGGCTAAGCCACCTTCGGCTAAGTCATGCGCACTATTCAAAAGTTCCGCGTGAATTAACTGAGTCAACAATTCTTGTTGCTCCTGTTCATAGCGTAAATCGAAATTAAATAATGGACCTTCAACATGTCCGAGTTGCATTTTTTGTAATTCACTACCATTAAGTTCTGCTGTTGTTTCTCCCAAAATATAAATTAAATCACCAGATTTTTTAAAATCTATGGTTGTTATCCAAGCTGGATTTTCAATTAAACCAACCATTCCAACCATCGGTGTTGGATAAATGGGTTGTTGGTTGGATTCATTATAAAGTGAGACATTACCTGAAATGACGGGTGTATCAAATAATTTACAAGCCTCCGTCATCCCTTTAGTAGCCTGTTCTAATTCATAGAAACTTTCTGGGTCTTCGGGGCTACCAAAGTTCAAACAGTCGGTAATTGCCAATGGTATTCCACCTGTAGCAACTATGTTTCGAGCGGCCTCACTGACCGCGATTTGTCCACCATAATAGGGATCTAAATACAAATAACGCGGATTAGCATCGGTCGTCATCGCCAAAGTTTTCTGAGTTCCTCGAATACGAACCACTGCCGCATCACTTTGTGTCGTTGAAATTGTATTAGTTTGAACTTGAGAGTCATACCGTTCAAAAATAGCACCTTTATGCGCAATTGTGGGTTGTTGCAACATCGCTTGGAAGGTTTTAGTTAAATTTTCAATTTTAGGTTGATACTGTTGCTTTTTAGTTTCACTGATATGCTGAGGTTTCTGACTTGGCTGCTGGTAAACTGGGGCTTCATCCACCAAAGCATGCACTGGTACATCAGCAACTTGAACGCCCTTAAAGGTTAATTGATAGCGGTCACCGGCAGTAACTTCACCAATTTTTACTGCTTCGCTCTCGTATTTAGCAAATAGTGCTTCAACTGCGGGTTCAAATCCTTGTTTGACACAGAGCAGCATCCGTTCCTGAGATTCAGATAGCATTAATTCATAAGGGATCATTTTTTCTTCACGTTGTGGAACTAAATCCAAATTCAAATGCATTCCATATCCAGCTTTAGCAGCCATTTCTGCAGATGATGAAATCAACCCCGCTGCTCCCATATCTTGAATTCCCACTAGATATTCGGAATGGTTATGAATCAGTTCTAGACACGCTTCCATTAGTTGTTTTTCAGCAAAAGGATCTCCAACCTGGACGGCTGAACGTTGCGTTTCTTGTTCGTCACTAAATTCGGTTGAAGCAAAAATGGCTCCTTGAATTCCATCACGTCCCGTTTTAGCCCCCACGTAGTAAATGGCATTACCTACACCAGCAGCCGCTCCTTTTTGTTGGTCGTTGATATCCAATAACCCCACACACATTGCGTTCATGACTGGATTGTTTTGATAAATTGTATCGAAGGTCGTTTCCCCTCCTACTGTAGGTATTCCCATACAATTACCGTAATCGCCGATTCCAGCTATTGTCTGGTCAACAAGATACTTAGTATGGGCATCATTCAATTCACCGAAATGTAAACTGTCCATTAATGCAATCGGACGCGCTCCCATGGAAAAAATATCACGAATAATTCCTCCAACTCCAGTAGCCGCTCCTTGATAAGGCTCCACTGCCGTAGGGTGATTATGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020018|687597:696161|693827_694556_-|AVL01930.1|DBSCAN-SWA MKKTTLIKEGKAKRLYNTDEKDLVWVEYMDQATALNGKRKDHIAGKGELNNQIDCILFEQLVAKGIHTDFVQKLSNNEQLNRKVKIIPLEVVVRNAASGSFQRKFDVSYLQAFDQPVVEFFYKSDELDDPFINTNQAIALKIIDLEESQRLEKMALEINQILKERFAKAHLQLVDFKVEFGKTADDEIVLADEISPDSCRLVDLTTKESLDKDVFRKKTGDLVTVYQEVLNRLNNSQEEVHV >CP020018|687597:696161|687597_688179_-|AVL01924.1|DBSCAN-SWA MINIAVFASGTGTNFMALYQHIRETKVPIKIACLICDQPNAPVVTKADKLGIPVWTHHLREFEDKASYEEAILRELKKYNLALIILAGYMKIVTKVLLEAYPHAILNIHPALLPSFPGRHGIEDAFEYGVKITGVTIHWIDGGIDTGPIIAQQPVPVLQGDDAEHLAQRIHQVEHDLYFRSICQVLKQRKLIN >CP020018|687597:696161|689224_690694_-|AVL01926.1|DBSCAN-SWA MAAELKGLNEECGVFGIWNDSEAAQRTYFGLHSLQHRGQEGAGIVVRNQEGQLKIHKGKGLLADVFRCPDDLAQLIGPSAIGHVRYGTAGNRGIENIQPLLFHYLQGDVAMAHNGNLTNAVSLRRELEKSGATFQSNSDTEVLMHLIQHQKGPTFIEKLKASLKQIQGGFAYLILTKDALYAALDPNGFRPLVIGKLANGSYVVASETCALDAVGATLVRNVEPGQLVQIDHHGLQISNFTTKTQLSICSMEYIYFARPDSNLYGVNVHLARQRMGQRLAKENPIKVDMVVGVPNSSLSAASGVAEQLGVPNEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVKMKLSALKAVIAGKDVALVDDSIVRGTTSQYIVKMLKNAGAKSVHLMISSPPLKYPCFYGIDIEHTRELMAANYTVSEMCQKIGADSLHFLSLPGLIEAIGLHQDAPNDGLCVAYFDGKYPTPLYDYEKDFEIPKTANDFTLSAMAQVEEK >CP020018|687597:696161|695678_696161_-|AVL01932.1|DBSCAN-SWA MRKVAVVMGSISDWSTMKLATDILDEFEVDYDRHIISAHRMPKVLQKFGEQAQENGYAVLIAGAGGAAHLPGMLAANTISPVIGVPIESHALHGMDSLLSIVQMPSGVPVATTAIGSAGAKNAALLAAEILALTDKKVAEKLIEFRQKQTQEAIESEKQF >CP020018|687597:696161|693580_693835_-|AVL01929.1|DBSCAN-SWA MYNAKIYVTYKESILDPQGEAIKTALHRLNYENVKAVTVGKYFEIKIEDHGQNIEEQVRKMSDELLANINMETYRFEISRIEED >CP020018|687597:696161|688175_689225_-|AVL01925.1|DBSCAN-SWA MVESAYEKAGVNIAAGEELVADLKQKLGAPDPHVLGGLGSFAGCYQLSKDQLDQPVLVAGSDGVGTKVLLAAQSGQVETIGQDLVAMCVNDLLAQGALPLFFLDYLALSHLEKNQVQKILNGILKACQAQSITLLGGETAEMPGIYQKHHFDLAGFAVGLTAKRDLLQAKNVHNGDYLIGLPSSGLHSNGYSLVRKILFEDHDFQFDDQLAGLNGSLIEELMQPTRLYVNVIRPLLKQKLVSGIAHITGGGLLDNVPRMLQDQQQAEFKLDSWEKPAIFKILAELGKLSQTDCYETFNMGIGMVLAVSPNNYARVVAELEQQKETFFKIGKVKKREKDASAVYLSGGSR >CP020018|687597:696161|694555_695695_-|AVL01931.1|DBSCAN-SWA MKSNSEKGIILPPATIGIIGGGQLGQMMALAAKAMGYKVGVLDPTRDCPTSQVCDFQIVAEYTDHHALMQMAERSDVLTYEFENVDLASLKVAQELVTIPQGTNLLAITGDRIREKNFLSSHGIPVTSYQVVEKPTDLEVAIAKLGYPSILKTSKGGYDGHGQQDINSEADLLAGQRLVAQAPCILEQRQNFTKELSVMVTRSREGIIQCFPVAENEHQHHILHQSIIPARVSQNVQDNARKIAQKIAQRLELRGVLGIEFFMLENGQLLVNEMAPRPHNSGHYSIEACNISQFEAHIRSICGLALPKVTQTTPAVMVNLLGQHLEAARQKLVQRPDWHFHDYGKAESRVNRKMGHITILGDIQKSLDSIKSENIWEIK >CP020018|687597:696161|692903_693578_-|AVL01928.1|DBSCAN-SWA MIYSIIRFPGSNCDWDMYYVLRDVMNVEPQFVDYREKSLPQDTVAVLIPGGFSYGDYLRSGAIARFSPIMDAVKKFAYAGNPVIGICNGFQILTEAGLLPGALRSNDSLNFICKPQKLVVENNQTIFTKRFDLKQTVMFPIAHGEGNYYCDSATLQDLKDHHQIVLRYQNNPNGSTDDIAGIINQKGNVLGMMPHPERASEAVLGGEDGKMLFQSLIESMTQNV >CP020018|687597:696161|690678_692886_-|AVL01927.1|DBSCAN-SWA MMKELTPTEIRDQKLYLQWGISEDEYQKINDALGRLPNFTETGLFAAMWSEHCAYKNSKPLLKQFPTTGSQILQGPGEGAGIVDIGNNQAVVFKAESHNHPTAVEPYQGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALMDSLHFGELNDAHTKYLVDQTIAGIGDYGNCMGIPTVGGETTFDTIYQNNPVMNAMCVGLLDINDQQKGAAAGVGNAIYYVGAKTGRDGIQGAIFASTEFSDEQETQRSAVQVGDPFAEKQLMEACLELIHNHSEYLVGIQDMGAAGLISSSAEMAAKAGYGMHLNLDLVPQREEKMIPYELMLSESQERMLLCVKQGFEPAVEALFAKYESEAVKIGEVTAGDRYQLTFKGVQVADVPVHALVDEAPVYQQPSQKPQHISETKKQQYQPKIENLTKTFQAMLQQPTIAHKGAIFERYDSQVQTNTISTTQSDAAVVRIRGTQKTLAMTTDANPRYLYLDPYYGGQIAVSEAARNIVATGGIPLAITDCLNFGSPEDPESFYELEQATKGMTEACKLFDTPVISGNVSLYNESNQQPIYPTPMVGMVGLIENPAWITTIDFKKSGDLIYILGETTAELNGSELQKMQLGHVEGPLFNFDLRYEQEQQELLTQLIHAELLNSAHDLAEGGLAVGLAECAFASELGCDVKTNLTATELFAENQARFIVTIAPDKQKIFEAQVANRATLIGQVGGKRIKIATMDDVIDVDLKNTKESWKGALAWQLN |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
705520 : 714388
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP020018|705520:714388|DBSCAN-SWA ACTATCGCCCTCTCATTTTGAATATATTACATATTTTAATCGTTGCTTTTTCCACAACGCTTTGAAAATTTAAATTCTGACTTAACTGATGTTTTAAAGGCAGCAATACATCTGCAACAGCCAATAATTGACGGACGTTGGTCTGATCAGCTAACTCTTGTAACTGACGTCGATTAGCTTCATAAGTAATCGTTTCTTGATCAAATTTTAGTTCTAACAGGTCCATTGCATATAACATCATCAAGTCCAATATTTTTTCTTGATAAAATCGATCCTTAGCCAAAGCCATTACTCGAGTTTGAACATCCACAAATGCAGTTATGTCCCCAGTAGTGGCCGTTATAAACCACTTTTCTAACGCCTTATGGGCATCCAAAATCCAGTTGTTATCTACCAGTGTTTGAATTTCACTCATATCGTTGGTTAACCGGGTTAAAATTCTAGCATCCGTTTCAGCTATATTTTGCTCTGTCAATTCCTTAATCAATCGATCTTTAGGTAACGGTTTTAGTTCAATAATTTCGGTTCTCGACACAATAGTTGGTAGCATCAAACTTCTATTTTCAGCAAGTAAAAACGCCGTTACCTCTCCTGAAGGCTCTTCGATGAACTTCAGCAAACTATTGGCCGCACTCGTTGTCATTTTATTAGCTTGTTCAATAATAAAAACTTTCCGTGCGCCCTCTACCCCGCTTTTAGAGAATTCGGATTTTAAAAAACGAACTTGTTCCACCTTGATTGATTGGCCATCTGGTGCAATTTCTACAACATCTGGATGTTGTCCTGACATGATTCGAGTACACTCTTCACATTCTCCACAAGGCATTGATCCCTGTAAGTCAATACAAAAAAGACGCATCGCTACCCATTGAGCGACGTCTTTTTTTCCAATCCCACCTGCTCCGGTTAACAGGTAGGCATGCGACAAATGCTGGCTATCAATCATTTCATTAAAGCGTTTAACAATTTCAGGTTGTTTTTCCACAGCCTGATTAGTTAAATTTTTCAGATCTTCCACTAGAAGCGCTCGAATTGATCTACCGGAAGAACAAGGACGGTTGCACCACCGACTTGAACCTTAATTGGATAGGCCGTAGTACCTTCCATATTAACGTCCATGTTAACAGATGGTGTCATAAATTCTTCTCTGGTATGACTAGCTTTCTTGATAATTTCAAGGACTTCTGGGACACGTTCTTCTTCAATCCCAATCATGAAAGTTGTATTACCTGATTGTAGAAAACCACCAGTTGTGGATAACTTAGTTGCTCGAACATTTTGATCAATAAACTGATCACTCAAATAGTTTGCATCTTTATCTTGTACAATTGCGATAACTAACTTAGTTGCCATAATAATATTCCTCCGCTAATTTAAAATTTGGTCTAACACTTCAATTACATCTCTCTTTACATCATCAAGTTCTTGACTCGCATCAATTACGACAATCCGATCTGGAAATTTCTTAGCTAAATCTAGATATGCCGAACGGACTCGCTGATGAAAATCTAATTGTTCTAAATCTAACCGATCAACATCTTCCGTCCGATGAGTCATAATGCGCTTTAGTCCAAGTTCTGATGGTACATCCAAGTAAATTGTTTTTTCTGGTAATGCTCCTTCAGTAGCAAAGAGATTCATTTGATAGACGGCATCGGTACCAATTTTTCTGCCTGCTCCTTGATATGCAATTGAGCTATCAACAAATCGGTCACAAAAAACCACATGATTTTTTTTCAAAGCTGGTAAAATCGTTTCCACCAAATGTTGTCGTCTAGCAGCCGCATAGAGTAAGGCCTCCGTTCGCTCATCCATCTCGGTGTTGTTTTTATCCAAAATAATAGTTCGAATTGCCTCTGAAATAGGATTTCCGCCGGGCTCCCTCGTTACTGTTAATTGGTCCTTCAAACGCTGTTGGTAATGTTCGACCATCGCTTGCAGAACCGTTGTTTTTCCAGCCCCATCTGGACCTTCAAATGATATAAAATGCCCGTTCACCAGTATTCCCCGCCTTACTTGTTTTAAATTATTTATTGTTTTTATTCTACTTTAGATTTTAAGGACTGTCTATTAACCTTAATTAAAATATCACCATATTAATTTAAAAAAATGAGCTAACGCGCTGGTAAAATCGCATTAACTCATCTTTTAATTATTTTGCTTTACATTTCTGTTCGGCCTTCAACCGCTTTATATAAAGTCATTTGATCCGCATATTCAATATCACTTCCGACCGATAACCCGTGAGCTAAACGAGTAACTTTAATGCCGGACGGTTTAACCAATCTTGAAATATACATCGCTGTCGCTTCCCCTTCTGGAGTTGCATTTGTAGCAATAATAACTTCTTTAATGGCCTCGTTCTTCTGTAAACGGGTAAGTAACGCAGCAATATTGATGTCTTCAGGGCCTTTACCATCCATGGGTGATAACACGCCATGTAACACATGATACAAGCCATGGTATTCTTTCATCTGTTCCATTGACATTACGTCCTTAGAATCTTCGACTACTAAAACCGCTTTTTGATCTCGTGAAGGGTCCTGACAAATATCACATGGATCATCTTCCGTAATATTTCCACAAATACTACAGAAACTTAGGTCCCGTTGTGCTGAAATCAGCGCCTTAGCAAATTCGGTTACATCATCTTTTTCCATATCTAACGTAAAAAATGCTAATCGGGTTGCCGTTTTATAACCAATACCTGGTAATTTCATGAAACTATCGATTAATTTCGCAATCGGTTCTGGATATTGCATAACGGTCTATCACCTACGATTCTTAATTACATTCCGGGGATGCCCTTAGTGTATTTTCCCATTGTTTTATTAGTTTCACTATCCACACGATTCATAGCGTCGTTTACAGCGGCTACAATTAAATCTTGTAACATGTCTGGATCATCTTCATCGATTGCTTCAGGATTAATCACGATGTCTTTCATTCTATGATCACCGGTGAATACAACTTTGACCATGTCATCTGGTGCCACACCCGTAAATTCAGTTTGATTTAATTTTTCTTGTTCTTCTGTTACCTTTTTTTGCATCTTTTGCATTTGACGCATCATGCTTTGCATGTTTCCCATTCCACCACGCATTTGTATTACCATCCTTTAATCATTTTTTATATTTACATTTTCAGAGCCAAATAATTCGACCGCTTTTTTAACAGCTTGATTATCTTCATCCGCTTTGGGTGTAGATTGCTCTGATGCCTCTGGTTCAGATTTTTCTTGATTCTTATCAAAATGATGAGTATTTAAGAAACCTGACCGCACCTCTGGCCACTCTTCAACTGTAACATAAACTACCTTAAAATCGGAACCAGTTAACTTAGCTAAATTTTGTTGAAGTTCAGTACGAAGCACTTCATTATCGACGGCCTTTTCAAACAGAAAGTCGTAATTGAACGCTACGACCACTCCTTCTTTACTAGCTGCAACTGGCTTAGAAACGTGCATTAAAGCCCGTTCTGTAACAGATAGCATATCCATTAGGTCGCGCCAGAGTTCCTGCATTGTATTTAAACTGGCCTTAGTAGCATTTTCCAAGATCGGATAAATCTTGGTTAAATTAGCAGGAGTTTTAACTTGTTTAGCCCCTACCGCTTTTTTCTTAGGTTTAGGCTGAGCTGATTGTGAATTACTTGGCGTATTTTTTACATTTTGTTGTAGCTTTTGAATTGCTTGTTTTAATTGACTGACTTCTGAACGTAACTGCTCCACTTCTTGGTTATCCACGGAACCGGTTGGGGCTTCGGTGGAAACTTTCGCAGTTTTTCGTTGTGATAGCTTAATCGTCAAAACTTCCAAATAGACATCTGGGTGAGTCGTGAAGCGCATTTGTTGTTGAATACTATTCAACGTATCAATCATCTGATATAGCTCCACGCCAGTCACCATAGCTGCTTCTTCAGTAAAAGCTTCCGATAGATCATTCAAGCTTTGTTCTTGCACCAACTGGGGATCTTCTTGGTATAAGAGTAAATTTCTTTGGACAGCAATTAAGTCTTCAATTAATCGTTGTCCATCTTTACCCTCATCTAAAATTTGATGCAAAGTTTCTAATGCCGCTGATGTTTCTTGCTTAAAAATTTGCGTTAAATACTGATCTAATAGTTTTTGGTTAACACTTCCTGTAACTAATAAGGCGTTATCTAAAGTTACTTCTTCGTTACCAAATGAGATCACTTGATCCAAAATACTTAACGCATCTCGCATCCCACCTTCAGCAGCCTTGGCGATAATTGCTAAAGCCTTTTGATCGTACTGGATTCCCTTTTGATCCAAAATATAGACCATGCGATCATAACTTTGAGCTGGTGTAATTCGTTTAAAATCAAAACGTTGTGTTCTTGAAATAATAGTTAATGGAATCTTTTGAGGTTCCGTCGTTGCTAAAATAAAAATTACATTAGCTGGTGGTTCTTCTAAAGTTTTCAACAACGCATTAAATGCTCCGGTTGATAGCATATGGACTTCATCAACAATGTAGACTTTGTAGTCTGCTTCAGTTGGAGCATACTTTGCCTTATCTCGAATATCGCGAATTTCTTCGACACCATTATTCGAGGCCGCATCAATTTCGATTACATCGTTTAAGGTTCCCTCAGTAATCGCTTTACAAGTCACACATTCATTACAAGGCTCACCATCTTTAAGATAGTGACAATTAACCGCCTTAGCAAAAATCTTAGCTGCCGATGTTTTTCCGGTTCCTCGTGGACCAGTAAATAGATACGCATGGCTGGTCTGCTCAGTTATTAATGCATTTTTTAAAGTCCTCGTGACGACGTCTTGACCGACCATATCATCAAACTTTTGAGGCCGCCAAACACGGTATAATGCTTGATAACTCATTTGATTTCCTTCCATATTTGCTTTTTTTAAGAAAAGAACCCTTAGCCCAATGGACTAAGAGTTCGTTAATTTACCCAATAACTTAAGGCACAAGCCAGAGCATACTTAGTGCTGCTTCCTTCCGGACCTGACACAATTCGTAAGTCCAACCTTGCCTCAAGGCCTTACGGCAATAACTATGATACTCGAATTTTAAAAAAATTTCCACTATTTTACTTAGTTTTTTTTCTTCTTTTTCGAATTTCTTTAAAAAACGTCTTCATTAACATCGATGCTCGGTCAGCTTCAATCCCTTCATGAACCGTCACTTGATGGTTTAAACGCGTATCTTCGAGTACGGTATACAGGCTTCGAACCGCTCCTGCTTTAGGATCTCGAGCACCAAAAAATACTTGAGGTAATTGTGAATTGATGATGGTTCCACTACACATTAAGCATGGTTCAATGGTCACAAAAAGCTGACAATCCCACAGCCGCCAGCTTTTTAAATAAGCGCAAGCTTCCGTAATAGCTAAGACTTCCGCATGAGTGGTTGAATCCTGTGAATGTTCTCTTAAGTTATGACCACGACCGATAATTTTACCATCATGAACAACCACTGCTCCAATGGGGACCTCATCAATCATTTTGGCGAATTGGGCCTCTTTAATTGCTTCATTCATATAAAAATTAATTTCATGCTCTGTTAACTTATTCATGTGCACTTCTTAAAATATAATATCCTTTATTCTTTTTTAGGACTTCGACATTCCCAAAGGTTTCTTGCATTAATTTTTTAGCTGAGGGCGCCCCCTGTTTTTTCTGAAGAACAATTACCAGTTGGCCACCTGCTTTTAAATGAGATTTAGCCTCAACGATAATTGTCTCAACTACCGATTTTCCTGCACGGACTGGTGGATTAGAAATAATCGTGGTGAAATCCGTATCATCGATATTCTCATATGCATCTGATTTATAAATTTGAGTCTGTTTTTCGACGCTATTAGCAACTGCATTTCGTTTGGCGAGTCCCAACGCGCGTTCGTTAACATCTGTCATCTGTACTTGTATCTCTGGAAAACTTTTGGCAAGTGATATGCCAATTGGACCGTATCCACATCCCACGTCTAAAATCTTTTCAGCAGAACCTACAATTTGTATTGCTTCAAGCAACGTCCTAGTTCCAAAATCAATTGTGTTTTTTGAAAAAACACCGCGATCCGAAATAAAATTTAATTTATGACCCAAAAGCTCGTAGCTCCAATGCTTCTCGTCATGTTCGGCGTTGGGATTTTCAGTAAAATAATAATCTGTCATTGAAAAGTCCTCCATTCTCTATTAATATAATATCGTATTGTAAATTCAGTTACCAATTTAAAAAGAATAAAATTTAATAAACACCGCCAGCACAATATATAGTGGGATTATAAAAATATATCCTCTACATATTGTGCTTTTTTATTTCAAATTTAGTAATAAATGTTGTATACTTAGTTCCATGATAAATGAGACAAGGGGGATCAGTATTATGAGAAAAATAATTGTGTACACTAAAAATAACTGCATTCAATGCAAAATGACTAAACGCTTCTTATCCGAAAACGGGGTTACTTTTGAAGAACGTAATATCAATGCAAATCCAGAATATATCGACGCTTTAAAAGCTAAAGGCTTCCAAGCCGTACCAGTCGTTCAATTTTCTGAAGAAAAAGCTGTGGCTGGTTTTAGACCTGATTTACTAAAAAAATTAGCAATTTAGTTCTCCACCAACGCTAACTCAGATGTTCAAGACGCCCCATTCGTACATTGTAAATGCGGAGCGTTTTTTTATTTCACTTGATTGAAGAGAGGATTCGAATTATGACTTTAAAAGATCTAAAAGATGTTACTTACTATGATTTAAACAATGAAATTAACATCCCTGTTGATAACCAAATTCCCCTAAGCAAGGATCGTGAAGCTCTAGCTGCATTTCTAAAAGAGAATGTTCAAGCTAACACCATGCAATTTGATTCTCTACGTGAACGTTTCGATTACCTCCTCAAAGAAGACTATATCGAGGCTGCCCTCGTTGAAGAATATTCATTCGATTTTATCGAAAAACTGTACGACTTCTTAAAGCAACAAGACTTCCACTTTCAATCGTTTATGGCAGCTTATAAGTTTTACGCTCAATATGCCTTAAAAACGAATAATAACGAATATTATTTAGAAAACTTCATCGACCGCGTGGCTATGAACGCTCTCTACTTTGCTGATGGTAATGAAGAATTGACCATGAATATTGCCGATGAAATCATTCACCAACGCTATCAACCAGCTACTCCTAGTTTTTTAAATGCCGGTCGTAAGCATCGGGGAGAGTTAGTTTCATGTTTCTTAATTCAAGCTAATGACGATATGAACTCGATTGGTCGTACGATTAATTCTGCTCTTCAACTTTCTAAATTAGGTGGCGGGGTCGGAATCAACCTCACTAACCTTCGTGAGGCGGGAGCACCAATCAAGGGGATTGAAGGCGCTGCTAGCGGTGTGGTTCCGGTTATGAAACTACTAGAAGATAGTTTTTCTTATGCCAATCAATTAGGACAACGTCAGGGAGCTGGTGTTGTATATCTAAACGTTTTCCATCCCGACATTGTATCTTTCCTTTCAGCTAAAAAGGAAAATGCCGACGAAAAGATACGGGTTAAAACCCTCTCACTTGGTGTAGTCGTTCCCGATAAATTTTATGACCTCATCAAACACGACGAAGATATGTATCTATTTAGTCCTTATAGTGTGGAAAAAGTTTACGGTGAACCTTACGCCTACGTCGATATTACTAAAGAATACGACAACATGGTCAAAAACCCTGCTATTAAGAAATTCAAAGTTAAAGCCCGTAACATCGAAAATGAAATTTCTAAACTTCAACAGGAATCTGGCTATCCTTACATTGTTAACGTTGATACGGCTAATCGAGAAAATCCAATTTATGGAAAAATTGTAATGAGTAATCTCTGCTCAGAAATTATGCAAGTACAAACTCCATCCGTAATTGATAACAAGCAAAACTATACGAAACTAGGAACTGATATCAGTTGTAACCTTGGTTCAACAAACATTGTTAATATGATGCAAACGCCCCACTTCGGTAAATCGGTCGAAACTATGGTTAGAGCGCTAACTTTTGTTACGGATCATTCTGATATTGACGTTGTTCCTTCTATCCAAAATGGAAATGCTCTTGCTCATACCATTGGTCTTGGAGCAATGGGACTCCATGGTTACTTAGCTAAGAACCACCTTTACTATGGTGAAGCAGATTCGATTGAATTCACTAGTGTTTACTTTATGCTGTTGAACTATTGGACTCTAAAAGCTTCTAACCAGATTGCCAAAGAAAAGAATCAAGTTTTCCACAACTTTGATAAAAGCAAATATGCTGATGGTTCTTACTTTGATAAATATGTAGAAAATGATTTTGGACCTAAATCCAATCGAGTTAAAGAGTTATTTAATGGGATTGAAATTCCAAGCGTTGAAGATTGGAAGCAACTTAAAGCTGATGTGATGGCTGACGGACTTTATCACCAAAATCGAATGGCAGTTGCTCCTACTGGTTCAATTTCTTATATCAACGATGCGACAGCTAGTCTTCAACCCATTGTTAACAAAATTGAAGAGCGTCAAGAAAAGAAAATTGGGAAAATTTACTTCCCAGCTCCATATCTTTCCAATGATACGTTAAAATATTACCAATCAGCTTACGACATTGATATGCGTAAAGTTATTGATATTTACGCTGCTGCCCAACAACATGTTGACCAAGGGATGAGTATGACCTTCTTCATGCGTTCAACAATTCCAGCTGGAATTTATGATTGGAAGGAAGGCCGCACTGATAAAATGACCACTCGTGATCTTAATATCCTTCGTAACTATGCCCATCATGAAGGTATCAAGTCCATCTACTACGTTCGTACCTTCACAGATAATGATGGTGAAGTTGGCGTAAATCAATGTGAAAGCTGTTCAATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP020018|705520:714388|708307_708622_-|AVL01947.1|DBSCAN-SWA MRGGMGNMQSMMRQMQKMQKKVTEEQEKLNQTEFTGVAPDDMVKVVFTGDHRMKDIVINPEAIDEDDPDMLQDLIVAAVNDAMNRVDSETNKTMGKYTKGIPGM >CP020018|705520:714388|710595_711081_-|AVL01949.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNKLTEHEINFYMNEAIKEAQFAKMIDEVPIGAVVVHDGKIIGRGHNLREHSQDSTTHAEVLAITEACAYLKSWRLWDCQLFVTIEPCLMCSGTIINSQLPQVFFGARDPKAGAVRSLYTVLEDTRLNHQVTVHEGIEADRASMLMKTFFKEIRKRRKKTK >CP020018|705520:714388|712222_714388_+|AVL01952.1|DBSCAN-SWA MTLKDLKDVTYYDLNNEINIPVDNQIPLSKDREALAAFLKENVQANTMQFDSLRERFDYLLKEDYIEAALVEEYSFDFIEKLYDFLKQQDFHFQSFMAAYKFYAQYALKTNNNEYYLENFIDRVAMNALYFADGNEELTMNIADEIIHQRYQPATPSFLNAGRKHRGELVSCFLIQANDDMNSIGRTINSALQLSKLGGGVGINLTNLREAGAPIKGIEGAASGVVPVMKLLEDSFSYANQLGQRQGAGVVYLNVFHPDIVSFLSAKKENADEKIRVKTLSLGVVVPDKFYDLIKHDEDMYLFSPYSVEKVYGEPYAYVDITKEYDNMVKNPAIKKFKVKARNIENEISKLQQESGYPYIVNVDTANRENPIYGKIVMSNLCSEIMQVQTPSVIDNKQNYTKLGTDISCNLGSTNIVNMMQTPHFGKSVETMVRALTFVTDHSDIDVVPSIQNGNALAHTIGLGAMGLHGYLAKNHLYYGEADSIEFTSVYFMLLNYWTLKASNQIAKEKNQVFHNFDKSKYADGSYFDKYVENDFGPKSNRVKELFNGIEIPSVEDWKQLKADVMADGLYHQNRMAVAPTGSISYINDATASLQPIVNKIEERQEKKIGKIYFPAPYLSNDTLKYYQSAYDIDMRKVIDIYAAAQQHVDQGMSMTFFMRSTIPAGIYDWKEGRTDKMTTRDLNILRNYAHHEGIKSIYYVRTFTDNDGEVGVNQCESCSI >CP020018|705520:714388|711073_711679_-|AVL01950.1|DBSCAN-SWA MTDYYFTENPNAEHDEKHWSYELLGHKLNFISDRGVFSKNTIDFGTRTLLEAIQIVGSAEKILDVGCGYGPIGISLAKSFPEIQVQMTDVNERALGLAKRNAVANSVEKQTQIYKSDAYENIDDTDFTTIISNPPVRAGKSVVETIIVEAKSHLKAGGQLVIVLQKKQGAPSAKKLMQETFGNVEVLKKNKGYYILRSAHE >CP020018|705520:714388|711890_712121_+|AVL01951.1|DBSCAN-SWA MRKIIVYTKNNCIQCKMTKRFLSENGVTFEERNINANPEYIDALKAKGFQAVPVVQFSEEKAVAGFRPDLLKKLAI >CP020018|705520:714388|705520_706537_-|AVL01943.1|DBSCAN-SWA MEDLKNLTNQAVEKQPEIVKRFNEMIDSQHLSHAYLLTGAGGIGKKDVAQWVAMRLFCIDLQGSMPCGECEECTRIMSGQHPDVVEIAPDGQSIKVEQVRFLKSEFSKSGVEGARKVFIIEQANKMTTSAANSLLKFIEEPSGEVTAFLLAENRSLMLPTIVSRTEIIELKPLPKDRLIKELTEQNIAETDARILTRLTNDMSEIQTLVDNNWILDAHKALEKWFITATTGDITAFVDVQTRVMALAKDRFYQEKILDLMMLYAMDLLELKFDQETITYEANRRQLQELADQTNVRQLLAVADVLLPLKHQLSQNLNFQSVVEKATIKICNIFKMRGR >CP020018|705520:714388|707681_708281_-|AVL01946.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIAKLIDSFMKLPGIGYKTATRLAFFTLDMEKDDVTEFAKALISAQRDLSFCSICGNITEDDPCDICQDPSRDQKAVLVVEDSKDVMSMEQMKEYHGLYHVLHGVLSPMDGKGPEDINIAALLTRLQKNEAIKEVIIATNATPEGEATAMYISRLVKPSGIKVTRLAHGLSVGSDIEYADQMTLYKAVEGRTEM >CP020018|705520:714388|706887_707517_-|AVL01945.1|DBSCAN-SWA MNGHFISFEGPDGAGKTTVLQAMVEHYQQRLKDQLTVTREPGGNPISEAIRTIILDKNNTEMDERTEALLYAAARRQHLVETILPALKKNHVVFCDRFVDSSIAYQGAGRKIGTDAVYQMNLFATEGALPEKTIYLDVPSELGLKRIMTHRTEDVDRLDLEQLDFHQRVRSAYLDLAKKFPDRIVVIDASQELDDVKRDVIEVLDQILN >CP020018|705520:714388|706536_706872_-|AVL01944.1|DBSCAN-SWA MATKLVIAIVQDKDANYLSDQFIDQNVRATKLSTTGGFLQSGNTTFMIGIEEERVPEVLEIIKKASHTREEFMTPSVNMDVNMEGTTAYPIKVQVGGATVLVLPVDQFERF >CP020018|705520:714388|708637_710383_-|AVL01948.1|DBSCAN-SWA MSYQALYRVWRPQKFDDMVGQDVVTRTLKNALITEQTSHAYLFTGPRGTGKTSAAKIFAKAVNCHYLKDGEPCNECVTCKAITEGTLNDVIEIDAASNNGVEEIRDIRDKAKYAPTEADYKVYIVDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPANVIFILATTEPQKIPLTIISRTQRFDFKRITPAQSYDRMVYILDQKGIQYDQKALAIIAKAAEGGMRDALSILDQVISFGNEEVTLDNALLVTGSVNQKLLDQYLTQIFKQETSAALETLHQILDEGKDGQRLIEDLIAVQRNLLLYQEDPQLVQEQSLNDLSEAFTEEAAMVTGVELYQMIDTLNSIQQQMRFTTHPDVYLEVLTIKLSQRKTAKVSTEAPTGSVDNQEVEQLRSEVSQLKQAIQKLQQNVKNTPSNSQSAQPKPKKKAVGAKQVKTPANLTKIYPILENATKASLNTMQELWRDLMDMLSVTERALMHVSKPVAASKEGVVVAFNYDFLFEKAVDNEVLRTELQQNLAKLTGSDFKVVYVTVEEWPEVRSGFLNTHHFDKNQEKSEPEASEQSTPKADEDNQAVKKAVELFGSENVNIKND |
10 | Streptococcus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1506768 : 1514334
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP020018|1506768:1514334|DBSCAN-SWA GCTGACTTCGGGAGGTCTCTTTGACTTAGATGCTTTGAATGAAAGTATCAGCGTCAATGAGGCCAAAATGGCAGAGCCTAACTTTTGGGATAATCAAGAACAGGCTCAAATTGTCATCAATGAAAATAATGAGTTAAAACAAAAATACGATAATTTTAAAAATTTAACCGACCATGTTGAAAACTTAGAGGTAACTGCTGAATTATTGGAAATGGAAGATGATCCTAACGTTCAAAGCGAGTTTGAGAGTGAATTAGCCACCACGGCTAAATTATTGCAGGATTACCGTTTAGGATTATTGCTTAATGGTAAATATGATGCCAATAACGCAATTGTAGAAATTCACCCCGGAGCGGGAGGAACAGAATCTCAAGATTGGGGTTCCATGTTGCTAAGAATGTACACGCGTTGGGCTGAGCAGCATCAGTTTAAGGTTCAAATTGAAGATTACCAAGCAGGTGAAGTGGCAGGAATTAGCAGTGTAACCATGCGAATTGTGGGTCACAACGCATATGGTTATTTACGCTCTGAAAAGGGAGTTCATCGGCTAGTAAGACTATCACCATTTGATTCTGCTGGACGACGGCATACTTCTTTTGCATCAGTCGACGTTATGCCGGAATTGGATGATTCGGTTGAAGTTAACATTAACCAAGATGATTTACGGGTGGATGTATATCGTTCTAGTGGTGCTGGTGGACAGCATATTAACAAGACTTCTTCAGCGGTGCGAATTACGCATTTACCAACTGGAATTGTAGTTGCGAGTCAAGCAGAGCGTTCTCAATTACAAAATCGGGCTACCGCTATGAGTATGTTGAAGGCTAAGCTATTTGAGCTTGAAGAACAAAAGAAAGCAGAAGAAAAGGCTAAAATAGAAGGTATTCAACTTGAAATAGGATGGGGATCGCAGATTCGTTCTTACGTTTTCCATCCCTATTCTATGGTTAAAGATCATCGAAGCAACTTTGAGACGGCTAACGTTCAAGGTGTGATGGATGGGGATCTCGATGGTTTTATCAATGCTTATTTGCAATGGAAATTGAAAGAAGATAATCCAAAATAGGGGGATTCGGATGTCAAAGACGATATTAGTTGTAGATGATGAGCCAGCAATTGTGACTTTAATTACTTATAATTTGGAACAAGCTAATTATCAAGTTGTGAGTGTGGATAACGGTTTAGATGCGGTGGAAATCGTCCAAAAGGGCTTAGTTGATTTTGTAATTATGGATTTAATGCTCCCTCAATTGGATGGAATTGAAGCTACCAAACAAATTCGCAAGTTTGATGAACAAATTCCAATTATTATGTTGACGGCTAAGACTAGTCAAGTTGATAAAATATTGGGATTGGAATTAGGGGCAGATGATTATATTACCAAACCATTTAGTCCTCAGGAGCTTCTTTCACGGATTAAAGTAATCTTACGACGGACTGATCGGGCAATTAATTTGGCTGAAATTGATCCAACTCTACAAGCAGAAAATATCGCCATTGATTTCAAAAGAATGGTGGTTAAGAAGAATAATGAAAAAATTCAATTAACACCCAATGAATTTAAACTATTAAGGTATTTATACAAAAATGCCAACCAAGTTTTATCACGCGATCAAATTTTGGAGAAAGTTTGGGGATATGAATATGGGGGACAGACCCGTATTGTAGATATCCACATCAGTCATTTGAGGGATAAACTGGAAAATGATCCCAAACATCCACAGTTGATCAAAACCATTAGGGGGTTTGGATATGAGTTCGTCTCGAAAAAAGGCGATTAAGCGTACCGTGCAATTCGGTTTTGCTAGTCTAATCGGAAATGCCTTTATGGCTTTTCTGGTGTATAAATTAATTGTAAAAGAAAATCCACGAGTAACTAAGGTAGATATGTCACTGTTAATCGCCGTGATTTTATTAATTACGGTTATTGAAATAATTGTATTTTGGAGTAATCAAAAGAAAATTATTGAGCGTCAAAAGTTATTCAGAAAAAATTTAGAAGAAGTTATTAAAGGTAACCACGTTCCCAAGATTCAATTGGATCCAGAAGATCCATTTTATAAATTATCTAAAGTTGTTAATGAAATTGGTACCCATGAGCGTCACCAAATTCACGTTTTGAGAAATCAACAAAGTGAATTAACCGCCATTATGGATAATTTGCCAGTAGGAGTGCTAGTTATCAATCGGCACCGTGAACTACAAGTGGCTAACACGTACGCTATTAACCACTTAGGGATTACTGGACTCGACGTTCCTCACCCATATACCATGGATATTCGGGATCATGAATTAAGTGAATTGGTGGATAACGTGTTTAGAACACGCCAGAGTACTACCAAAACAATTAAACTAGATGGGGACCAGCCATATATTTATGAAACAACGGTTGTTTACAGTCCCAAAGTGCACCATAAATTTGAAATTATTGTGCTACTTTACGATGCAACGGAAACGGTGCGCTCTAAACAAATTGAACGTGACTTTGTTAACAATGCTTCGCACGAACTTCGTACACCAATTACATCGATTGCGGGCTTCGCAGATACGTTACTAAACGGAGCCAAGGACGATCCAGAAACCTTGGATAATTTCTTACGTATTATTAAGGCTGAAAGTGATAAGTTAGTGCAATTAACGGACGATATTTTAACCATGTCGCGCGTTAAGAGTGGTGAACGAGAACGTAAAGAAATTAATTTACATAAGTATGTGGATCAACAACTTAAGTTAGTAGAAAGTAACATCAGTAGCATGAATCTACATGTGGAAAACAATATTCCAGCAGATGTTAATGAAGAAGTGATTGAAAATGATTTATTCCAAATCGTCAAGAATTTGATTACTAATGCGATTAGTTACAATCGAAAAGGTGGAAAAATCAAGATTGATTACGGATCACATCATGACCGTTGGAAGCTCGTAGTGAGTGATACTGGTATTGGAATTCCTTTAGGTCAGACGGACCGCGTTTTTGAACGTTTTTATCGGGTGAATAATGCTACTAAAGGTGGTACTGGATTAGGTTTAGCCATTGTTAAAGAAGCGGTTGACGATATGAATGGTAGCGTTCGAATCGAATCAGATGAAGATAGCGGAACTACGGTGATCGTAAAATTCAAGCGTGATATTAATTAAACATTGTGGAATAAAGTCGAATTTTAATTCGGCTTTATTTTTTTACACTTTTTACTATTTTAAAATTCTTTACATAATCTTTACATACCTCATATTTAACCTTTACGTTGCCCTTGTATGCTAATAATCGAAGCTAGAGATTAGGGAAAAGAGGCCAGGACATGAAAAAAGTTAATAAGGGGATTATCTTAGCGTCGATGATGGCAATACTCTTGATTTTGACTGGATGTCAGTCTAAGTCATCTCAAAAAAATTCAGTAACGATTGTGGGATCGACGGCGTTACAACCATTAGTAGAAAAAGCTGCTGCTGATTATCAAGTAAAAAATAGCGGTGTGGATATCACTGTTCAGGGGGGCGGATCTGGGACCGGTCTAAGCCAAGTTCAACAAGGCGCCGTAAGTATCGGAAATTCAGATGTTTTTGCAGAACAACAAGATGGAATTGATGCCAAAAAAGTAGTGGATCATAAGGTAGCGGTGGTTGGAATGGCTCCCGTGGTCAACCAAGATGTTCCAATTAAAAATATTTCTATGGCTAATCTACGTAAAGTATTTACAGGTAAAATTACAAACTGGAAACAACTGGGGGGACCCGATCAAAAGATTGTGGTCATCAATCGAGCTCAAGGGAGTGGTATCCGGAAATCATTCGAACGAGTGGTATTAAAAGGACAACCAGCTTTGAATGCTCAAGAACAAGATTCAAATGGGACGGTACAAAAAATTGTACAAGCAACTCCAGGATCGATTAGTTATCTTTCATTCTCATATTTTAATAACCAAATTAAACATTTAGCGATTGATGGAGTTCAACCTAACGCTAAAAATGTGGAAAATAATCGTTGGAAAATTTGGTCATATGAGCACATGTATACGAAACCTAAAGCCAGTGCAGCAACCAATAACTTTATTAAATACATGAAATCTGAAAAAGTACAAAAGAATTTAGTTTCAGACTTAGGTTATATTTCAATCCATGATATGAAGGTAGAACTAACAAGTGATGACCAAGTAATCCCAATTAAAGGAGCTGAGGAATAATGGATGCAGTAAAAAAAGAATTAACGCGTAAATCAAAGGCTTTCAGGCAAGACCAGCGTGGAAAGTTAATTTCCTTAGCTTGTGTAACTTTGATTATGTTGGTAGTCCTTTCAATTTTATACATGATTACCTCTAAAGGTTTAGCAACTTTCTTCGAAAATAAAATGAGTATTGTTGATTTCTTTACTAAGCAAGTTTGGAATCCGAGTGCTAAACCTCAAGCGTTAGTGGGCGCACTACCGATGATTGTAGGATCATTCAGTGTTACCGTTCTTTCAGCCCTTTTGGCAGCGCCATTTGCGATTGCCACCGCCATCTTCATGGTTGATATTGCAGGAAAACGTGGGCGTAAAATTTTACAACCGGTCATCGAATTGTTGGTGGGAATTCCATCAGTAGTTTACGGATTTATCGGGTTGACGGTCGTCGTGCCCTTTACTCGAACAGTATTTGGTGGAACTGGTTTTGGAATTTTGTCGGGAACCTTCGTACTGTTTGTCATGGTCTTACCGACCGTAACTTCCATGTACGTTGATAGTTTAAAAGCTGTTCCACAGTTTTATCGCGAGGCTTCATTGGCTTTGGGAGCCACACGGTGGCAAACAATCTACAAAGTTATCATTCGAGCTTCCATTTCAGGCTTACTAACTGCTATTATTTTTGGAATGGCTAGAGCCTTTGGTGAAGCCTTAGCTGTTCAAATGGTAATTGGTAATGCATCGATTTTACCAAGTGACTTAGTATCACCAGCCTCAACGTTAACTAGTGTGTTAACAACGGGAATTGGAAATACAGTTTTAGGGACCTTACCTAATAATGCCTTATGGTCATTAGCATTGGTGCTCTTACTAATGTCCTTGGTATTTAACCTCCTAACAAGGTTTATTGGAAAGAAGGGAGCATTTTAAATGAACGCTAAGAGAGTTGATAAGATTGCTACAGCCGTTATTTATCTATTAGTTGGAATCGTTATTTTAATTTTAGTGGCTCTACTAGGTTTTATCTTGATTACGGGGTTACCACACGTCACCTGGTCATTTTTAACCTCACCAGCATCGGCATTTAATGCTGGAGGCGGGATTGGTGATCAGCTCTTTAACTCCTTTTATCTACTATTTCTAACCTTGTTGATTTCTTTTCCAATTTCGCTTGGAGCTGGAATTTACTTAGCGGAATATGCGAAGAAAAATCGAGTAACTGAAGCTATTCGAATTACCATTGAAGTTTTAAGTTCCTTACCATCAGTAGTAGTGGGGTTATTTGGATTTTTACTCTTCGTAGTGCAATTTAAATTAGGATTCTCCATTATCTCAGGAGCGATTGCTTTAACCTTCTTCAACCTACCGCTGTTAACTCGAAATATTGAAAATTCTTTAAATGGTGTTTCTAATTTACAACGAGAGGCGGGGCTTTCATTAGGACTTTCCCGTTGGAAAACCGTTACTAAAGTGGTCGTGCCTGCTGCTCTACCAGGAATCATAACTGGAATTATTTTAAGTGCTGGACGCGTTTTTGGAGAAGCCGCCGCTTTGATTTTTACCGCTGGACAGAGTGCTCCAGTATTAAACTACGCAAATTGGAATCCTTTTAGTGGCGACAGTCCCTTGAATATTTTCCGTCCTGCCGAAACCTTGGCAGTGCATATTTGGAAGATTAATACCGAAGGAATCATGCCCGATGCCAGTCAAGTTTCCGCCGGGGCTTCTGCAGTTTTAATCATTGCAGTATTAGTCTTTAATCTTGGGGCCCGTTGGGCAGGAAATTATGTTTATCGTAGAATCACTGCCAGCAAATAGAATTTGGAGGAAAGCATATGTTGGAAACGAAACGTAAAGAAAAATCAATTTTGACCTTCCCCGCCGATCGCGAAATTGCTTTAGAAACGAATAACCTTCAGGTCTATTATGGCGATAACCATGCCATGCAGGATGCATCTTTGCAATTCCCTCGTTATTCCATTACGGCTTTGATCGGCGCTTCTGGATCGGGGAAATCCACTTACTTGAGAAGCTTGAATCGGATGAATGACGGCATTGCTCGCGTAGATGGCGAGATTATGTATCGAGGATTGGATGTTAATGCGGATGAAGTCGATATTTATCAAATGCGGCGTCGGATTGGAATGGTATTTCAACGTCCAAATCCCTTTGCCAAGTCAATTTACAACAATATCAGTTTTCCATTACGCGAAATGGGTATTAAAGACAAATCAAAAATTGATGGCATTGTAGAATCGAGTTTAAAACAGGCGGCCTTATGGGATGAAGTCAAGGATGATTTGAAACGTAGTGCGTTAGCATTGTCAGGGGGGCAACAACAGCGACTATGTATTGCACGTTCACTGGCAATGAGTCCAGATATTCTATTGATGGATGAGCCTGCTAGTGCCTTAGATCCCATTTCAACCCACAAATTAGAAATGACTTTAAATGACTTAAAAGAACAATACACCATTATTATTGTTACACACAGTATGGAACAAGCTTCTCGACTAAGTGATTACACTGCTTTTATGCACATGGGGAAAATTGTTGAATTTGATACGACAGAAAATATTTTTACTAATCCAGCAGTTAAATTAACTGAGGACTATGTCTCTGGAAACTTTGGGTAATTAGGAGAAAAATATGGTAAAAGATATTATTACGGCTGAAAATGTTCATTTATATTACGGACAAAAGGAAGCTCTGCATGGAATTAGTCTCGGCTTCCCTGAAAAAGAAATTACCGCTCTGATCGGACCCTCTGGGAGCGGAAAATCGACGTTCATCAGAACTTTAAATCGAATGAGCGATTTAAATCCCGAAGTTACGGTTACCGGAGCCATCCGACTTGATGGCGAAGACATCTATTCGCCTAAAACAGATACGGTAGAACTACGCAAACGAGTCGGAATGGTATTTCAACAGCCTAATCCTTTTCCTTTTTCGGTTTATGATAACGTAACTTACGGGCTACGACTCAGTGGGATAAAAGATAAGGCACTGTTAGATCAACGTGTGGAAGAAAGTTTAAAGCTGGCGGCCGTTTGGGATGAAACTAAAGATCATTTAAAAGAAAATGCTCTTTCATTTTCTGGAGGACAGCAGCAAAGAATCTGTATTGCAAGGGTTTTGGCAGTTCAACCCGAAATTATTTTACTAGATGAACCAACCAGTGCGTTAGACCCGGTATCTTCAGCAAAGGTAGAAGATAGTTTATTAGCAATTAAGGATCAATTCACCATCGCGGTCGTAACTCACAATATGCAACAAGCATCTCGAATTTCTGATCAAACAGCTTTTTTCTTGGATGGCAACTTGGTGGAATTTAGTAAAACAGTCGATATGTTTACACATCCTGAAAAACAGGAGACGAGCGATTACTTAAACGGTAAATTTGGATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP020018|1506768:1514334|1508519_1509905_+|AVL02644.1|DBSCAN-SWA MSSSRKKAIKRTVQFGFASLIGNAFMAFLVYKLIVKENPRVTKVDMSLLIAVILLITVIEIIVFWSNQKKIIERQKLFRKNLEEVIKGNHVPKIQLDPEDPFYKLSKVVNEIGTHERHQIHVLRNQQSELTAIMDNLPVGVLVINRHRELQVANTYAINHLGITGLDVPHPYTMDIRDHELSELVDNVFRTRQSTTKTIKLDGDQPYIYETTVVYSPKVHHKFEIIVLLYDATETVRSKQIERDFVNNASHELRTPITSIAGFADTLLNGAKDDPETLDNFLRIIKAESDKLVQLTDDILTMSRVKSGERERKEINLHKYVDQQLKLVESNISSMNLHVENNIPADVNEEVIENDLFQIVKNLITNAISYNRKGGKIKIDYGSHHDRWKLVVSDTGIGIPLGQTDRVFERFYRVNNATKGGTGLGLAIVKEAVDDMNGSVRIESDEDSGTTVIVKFKRDIN >CP020018|1506768:1514334|1506768_1507833_+|AVL02642.1|DBSCAN-SWA MTSGGLFDLDALNESISVNEAKMAEPNFWDNQEQAQIVINENNELKQKYDNFKNLTDHVENLEVTAELLEMEDDPNVQSEFESELATTAKLLQDYRLGLLLNGKYDANNAIVEIHPGAGGTESQDWGSMLLRMYTRWAEQHQFKVQIEDYQAGEVAGISSVTMRIVGHNAYGYLRSEKGVHRLVRLSPFDSAGRRHTSFASVDVMPELDDSVEVNINQDDLRVDVYRSSGAGGQHINKTSSAVRITHLPTGIVVASQAERSQLQNRATAMSMLKAKLFELEEQKKAEEKAKIEGIQLEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRSNFETANVQGVMDGDLDGFINAYLQWKLKEDNPK >CP020018|1506768:1514334|1511856_1512744_+|AVL02647.1|DBSCAN-SWA MNAKRVDKIATAVIYLLVGIVILILVALLGFILITGLPHVTWSFLTSPASAFNAGGGIGDQLFNSFYLLFLTLLISFPISLGAGIYLAEYAKKNRVTEAIRITIEVLSSLPSVVVGLFGFLLFVVQFKLGFSIISGAIALTFFNLPLLTRNIENSLNGVSNLQREAGLSLGLSRWKTVTKVVVPAALPGIITGIILSAGRVFGEAAALIFTAGQSAPVLNYANWNPFSGDSPLNIFRPAETLAVHIWKINTEGIMPDASQVSAGASAVLIIAVLVFNLGARWAGNYVYRRITASK >CP020018|1506768:1514334|1512761_1513562_+|AVL02648.1|DBSCAN-SWA MLETKRKEKSILTFPADREIALETNNLQVYYGDNHAMQDASLQFPRYSITALIGASGSGKSTYLRSLNRMNDGIARVDGEIMYRGLDVNADEVDIYQMRRRIGMVFQRPNPFAKSIYNNISFPLREMGIKDKSKIDGIVESSLKQAALWDEVKDDLKRSALALSGGQQQRLCIARSLAMSPDILLMDEPASALDPISTHKLEMTLNDLKEQYTIIIVTHSMEQASRLSDYTAFMHMGKIVEFDTTENIFTNPAVKLTEDYVSGNFG >CP020018|1506768:1514334|1510947_1511856_+|AVL02646.1|DBSCAN-SWA MDAVKKELTRKSKAFRQDQRGKLISLACVTLIMLVVLSILYMITSKGLATFFENKMSIVDFFTKQVWNPSAKPQALVGALPMIVGSFSVTVLSALLAAPFAIATAIFMVDIAGKRGRKILQPVIELLVGIPSVVYGFIGLTVVVPFTRTVFGGTGFGILSGTFVLFVMVLPTVTSMYVDSLKAVPQFYREASLALGATRWQTIYKVIIRASISGLLTAIIFGMARAFGEALAVQMVIGNASILPSDLVSPASTLTSVLTTGIGNTVLGTLPNNALWSLALVLLLMSLVFNLLTRFIGKKGAF >CP020018|1506768:1514334|1507843_1508548_+|AVL02643.1|DBSCAN-SWA MSKTILVVDDEPAIVTLITYNLEQANYQVVSVDNGLDAVEIVQKGLVDFVIMDLMLPQLDGIEATKQIRKFDEQIPIIMLTAKTSQVDKILGLELGADDYITKPFSPQELLSRIKVILRRTDRAINLAEIDPTLQAENIAIDFKRMVVKKNNEKIQLTPNEFKLLRYLYKNANQVLSRDQILEKVWGYEYGGQTRIVDIHISHLRDKLENDPKHPQLIKTIRGFGYEFVSKKGD >CP020018|1506768:1514334|1510066_1510948_+|AVL02645.1|DBSCAN-SWA MKKVNKGIILASMMAILLILTGCQSKSSQKNSVTIVGSTALQPLVEKAAADYQVKNSGVDITVQGGGSGTGLSQVQQGAVSIGNSDVFAEQQDGIDAKKVVDHKVAVVGMAPVVNQDVPIKNISMANLRKVFTGKITNWKQLGGPDQKIVVINRAQGSGIRKSFERVVLKGQPALNAQEQDSNGTVQKIVQATPGSISYLSFSYFNNQIKHLAIDGVQPNAKNVENNRWKIWSYEHMYTKPKASAATNNFIKYMKSEKVQKNLVSDLGYISIHDMKVELTSDDQVIPIKGAEE >CP020018|1506768:1514334|1513575_1514334_+|AVL02649.1|DBSCAN-SWA MVKDIITAENVHLYYGQKEALHGISLGFPEKEITALIGPSGSGKSTFIRTLNRMSDLNPEVTVTGAIRLDGEDIYSPKTDTVELRKRVGMVFQQPNPFPFSVYDNVTYGLRLSGIKDKALLDQRVEESLKLAAVWDETKDHLKENALSFSGGQQQRICIARVLAVQPEIILLDEPTSALDPVSSAKVEDSLLAIKDQFTIAVVTHNMQQASRISDQTAFFLDGNLVEFSKTVDMFTHPEKQETSDYLNGKFG |
8 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1700885 : 1752819
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP020018|1700885:1752819|DBSCAN-SWA TATGGCTTATAATCATAAAGATATCGAACAGAAGTGGCAGCAATTCTGGAGCGACAATGAGACTTTTAAGACGGTCGAAGATGCAGACAAACCCAAATATTATGCATTAGACATGTTCCCTTATCCATCAGGTCAAGGACTCCATGTGGGCCATCCTGAAGGATATACAGCAACAGATATTATGTCACGAATGAAACGGATGCAAGGGTACAAAGTACTTCATCCAATGGGATGGGATGCTTTTGGTCTTCCAGCAGAACAATATGCGATGAAGACAGGTAACAATCCGCGTGATTTTACAGCTAAGAATATTCAAAACTTTAAGCGTCAAATCCAATCACTTGGTTTTTCTTATGACTGGTCGCGAGAAGTTAATACAACTGATCCAGCTTACTACAAGTGGACTCAATGGATTTTTGAGCAACTCTACAAGAAGGGCTTAGCTTATGAAAAAGAAACGTTGGTAAACTGGGCTCCTGATTTAATGGGTGGAACGGTAGTTGCTAACGAAGAAGTTGTGGATGGTAAGACAGAACGTGGCGGGTTCCCCGTTTATCGTAAACCAATGAAACAATGGATTCTTAAAATTACAGCTTACGCCGACCGTTTGATTGACGATTTGGACCTAGTAGATTGGCCCGATAGTATTAAAGAAATGCAAAAAAACTGGATTGGTCGTTCAGTGGGGGCTAGCGTCTTCTTTAATGTTGAAGATAGCGAAAAACAAATTGAAGTATTTACAACGCGTCCAGATACATTATTTGGCGCAACATACTTGGTAATTTCACCAGAACATGACCTCGTTGACCAAATTACAACTCCAGAAAGTAAAGCTGCCGTTGAAGAATACAAGAAAGCTGTTGCAACTAAATCAGATCTTGAACGGACGGATTTGAATAAAGACAAGACGGGAGTCTTCACGGGAGCATACGCGGTTAACCCTGTTAATGGTAAGAAAATTCCAGTTTGGATTAGTGATTACGTATTGGCTTCATACGGAACTGGAGCAGTGATGGCTGTTCCTGCTCATGATGGTCGTGACTACGAATTTGCTAAGAAATTCAAGATAGATATGGTGCCAGTTTATGAAGGTGGCAATCTTGAAGATGGAGTATTGGACAGCGAAGGCGGGCTAATTAACTCTGGATTCCTAGATGGGATGGATAAGCAGACGGCTATTGATACCATGATTAGCTGGTTGGAAGAACATGGAGTTGGTCATAAGAAGGTTAACTATCGTCTTCGTGACTGGGTCTTCTCTCGCCAACGCTACTGGGGTGAACCAATCCCTGTAATTCATTGGGAAGATGGAGAAACAACCTTGATTCCAGAAGATGAATTGCCATTGAGACTCCCAGCTGCAACCGATATTCGTCCTTCCGGTACCGGAGAAAGCCCATTAGCTAACTTAGATGATTGGGTAAACGTAGTTGATGAAAATGGACGTAAGGGTCGCCGGGAAACTAATACAATGCCACAATGGGCGGGTAGTTCATGGTACTTCCTCCGTTACGTTGATCCTAAGAATGATCAAAAGATTGCTGACGAAGATTTACTTAAAGAATGGTTACCAGTCGACTTATATGTTGGTGGAGCTGAACATGCGGTACTTCATTTACTTTATGCACGTTTCTGGCACAAAGTTTTATATGATCTAGGAGTTGTACCAACTAAGGAACCATTCCAAAAATTGGTTAACCAAGGGATGATTCTCGGTAGCAATCATGAGAAGATGTCTAAATCAAAAGGGAACGTAGTTAATCCAGATGATATTGTTGAGCGCTTTGGAGCGGATACTTTACGATTATACGAAATGTTCATGGGACCTCTGACAGAATCAGTCGCCTGGAGTGAAGATGGGCTTAACGGAAGTCGTAAGTGGATTGACCGCGTCTGGCGCTTGATGATTGACGACGAAAACCAATTGCGTGATCATATTGTTACTGAAAATGATGGCAGTTTGGATATGATTTATAACCAAACTGTTAAGAAGGTAACTGATGATTATGAAAACATGCGCTTTAACACGGCTATTTCACAAATGATGGTCTTTGTTAATGAAGCATACAAGGCTGATAAACTTCCAGCAGTATATATGGAAGGATTAGTTAAGATGTTAGCTCCAATTATTCCGCACGTTGCTGAAGAACTTTGGAGTTTGCTAGGTCACGAAGGTGGTATTTCATACGCTGAATGGCCAACATATGATGAAAGTAAGTTAGTAGAAGCTACAGTTCAAGTCATTCTACAAGTTAATGGTAAAGTTCGGAGTAAGATTACCGTTGACAAGGATATCGCCAAAGAAGAACTTGAAAAATTAGCGTTAGCTGATGCTAAGATTCAACAATGGACGGCAGATAAGACTGTTCGTAAGGTAATTGTTATTCCTAACAAGATTGTTAATATCGTAGTAGGCTAACTAAATCAAAAGTAGGGTTCAGATGTTTTAACAGCATCGTGGACCCTTTTTTTGTAGAAAAATAGTTTGGAAAATGAACTAATTTTGGGAGTTTGGTGGATTTTTTAAGTGTTAGCTGAGCTATCAGCGTAAATTTAATTGTATCGGAGGTATGAATTGTATTAAAATAGTGTAGATTGACTAGAGAAAGTAGGTTTTTATAAATGGATAAGCAATCTGAAATGGATAATTCAGAGTCTCTCTATATGGGTTCACAACCCTTAAGAGATAATTCAGGAAAATCTTCATCCAAAGCAAAGATGCTCGAAGGTTCGGCGTGGATGACCGCCGGAAGTATCTTTTCTAGAATATTAGGCGCCATTTATATTATCCCATGGGTAATTTGGTTTGGTGTTTATAGTGACCAAGCGAACGCTCTTTTTACTAAAGGATATAATATTTATAGTTTCTTTCTAATTGCTGCGATTGCAGGAATTCCATCTGCGATTTCCAAGCAGGTATCCCATTACAACGCAATTAATGAGTTTGCGTTGGGGCAACGTTTGTATAAGCGGGGACTTTTGTTATCCGTCGGAACGGGAATTATCTGTGCCGCAATTCTGTATTTTGGCGCTCCATTTTTAAAAGATGGTGACCCGAACGTAATTACGGTTCTCCATGCGTTGGCTTGGGCAGTGTTAGTAATTCCTACGATGAGTTTGACTCGGGGCTTTTTCCAAGGTTACCAAGAAATGGGACCATCAGCCGTTTCTCAATTTATTGAGCAATTAGCCCGAGTGATTTATATGCTAACAACCGCCTACTTTATTATGGGAAAAAGCGGTCAAGGAGATTGGGTTTATGGCGTTTCACAATCAACCTTTGCGGCTTTTATTGGTGCATTAGGTGGATTATTAGTGCTTGGGATTTATTTCATTAAATACCGTAAGCGACTTTCCTATTTGTCACAGCATAGTGCCAATGAACTGGTAGTTTCAACCTCAACGCTATATAAAGAAATTATTGCTCAAGCTGTACCTTTTATTATTATTGGATCAGCTATTACAATTTTCCAATTAATCGACCAATACACCTTTTTCCGGATTATGAATGCGGTGAGTGACTATTCGACTGCCGTCTTAAATAATATGTACGCCATCTTTGCTTTTAATGCTAATAAACTAGTAATGATTGTTATTTCATTAGCGTCAGCGATGGCCGTCACTTCCGTACCGATTTTGTCGGAAGCCAAAACTAGGGGCGATCGAGTAGAAATTAGTCGACAAGTAACGGATTCAATTTTGCTCTTTGCATTTTTGATGATTCCAGCTGCTTTAGGGATGGCTGCGGTAGCTCAACCAGCATACACGCTGTTCTATCATCTAAGTGATGTAGGAACTGCCATTTTACAATTTAATTCTTATGTAGCAATTGTTTTAGGATTATTTACAGTGATTTCGGCTATTATGCAAGGAATTGGTGAAAATGTCTTAGCCGTGAAGTATTTCTGTGTCGGAATGATTGTTAAATTTATTTTCCAATTTCCCATGGTGGCATTATTTTCAGCAGTGGGTTCATTAATTTCAACGGCTATTGGATTTATGGTAGTAAATTGGTTGATTTTACGGCATATCAACTTGGAATATGGCTTAGATTATCGTCGAATTAATACATTTATTGGAAAAATCATCACTTATGCTTTTGGAACATTCTTGATTGCAATGGTCGTAACTAATGGATTATACATAGTGATGGATCCAGCCAGTAAAGTACAATCGTTACTAGTTATAGCTGCGGCCGTAGTTTTAGGTGGAGCATTTTATCTCTACTTTGTATTAAAGAGCCGCCTAGCGGATGAAATTGTTGGGGCACGGGCAGCTGGCTTACGTCGAATGCTAAAGATTAGTTAGGAGGAGACATGCGAGTAGATAAATTTTTACATGACATGAATATGGGAACGCGAACCCAAATTCGAAAAATGATTAAAGACAAGCTAATCTTTGTTAACGATACGGTCGTTAAAACTGGGCGAGTTAAAGTAGATCCAGTGATTGATGAGGTTAGATTAAAAGACCAAGTGATTGAGTATCAACAATATTTTTATTTCATGATGAACAAACCATTGGGAGTCTTAACTGCTACGGAAGATCGTAAGCAAAAAACCGTCATGGATTTATTCAATAAGGTTGATCTCCGAAGTGATTTATTTCCAGTTGGTAGATTGGATAAAGATACCCAAGGCTTACTGTTAATCACTAATAACGGTCAGTTAGCACATGATTTATTAGCACCAGAGCGGCACGTTGATAAAACTTACGAGGCGGTGGTAACTGGAAAAATCACCGATCAAGCTGTCGAAGAATTTCAAAAAGGAATCACCTTAAAGGATGGTACTACGTTAAAACCAGCGCAACTGATCATTGAACACTATTCAGAATTAGATGATCAAACAGTGGTTAAGGTAGTCCTAAAAGAAGGAAAGTATCATCAGGTTCGCCGAATGTTTGGTAGCCTAGGTGAGAAAGTGGTCACTCTTCGAAGGACTTCCTTTGGTCCTTTAGAATTAGATGTGGGATTACTTCCCGGAACTTATCGAGAATTA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72 | Lactobacillus_phage(54.05%) | tail,holin,portal,head,tRNA,capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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