Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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CP027398 | Providencia stuartii strain FDAARGOS_291 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,csa3,cas3,DinG,cas6f,cas7f,cas5f,cas8f,cas3-cas2,cas1,c2c9_V-U4,WYL,TnsE_C | 0 | 0 | 7 | 0 |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
921171 : 967967
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP027398|921171:967967|DBSCAN-SWA 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63 | Cronobacter_phage(26.67%) | holin,tail,tRNA,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1097546 : 1142876
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP027398|1097546:1142876|DBSCAN-SWA 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53 | Proteus_phage(22.22%) | head,transposase,protease,holin,tail,capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1639652 : 1650812
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP027398|1639652:1650812|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP027398|1639652:1650812|1646529_1646892_+|AVL39847.1|DBSCAN-SWA MKVRRLDDNHDWCFGRGRADYNIHSEAIAQSVLTRLLSLKQDWFLNREHGIKWFDYLRKNPNLIAMEAEIKASVLNTQGVEQITEFDIQLNPDTRLMAISVTYIDIYGHKKEVMTDAPNY >CP027398|1639652:1650812|1645052_1645877_+|AVL39845.1|DBSCAN-SWA MKQLGRQLKLVIGNDDESFEITQLRVTFDIKKTLTPEPNPAVIRIYNLNASHRNLLTSKVFNRAALSVGYEELQLIYAGDIIEVKVTESAEDIICELICGDGFKAYTCTLVNKTLSSGNRDRDILTENAQAMDIDIGVIELPNDRQLPRAKVMFGDARELLHKIAKNNQSDWSIQDGQLMLLPKQKVITDNESFVLSQETGLIGKPEKSEDGLTITCLCHPTLKIGALIRLQSITSEFNGDYKITQLSHTGDFMERDWYSRLVCVDGTFDKVKQ >CP027398|1639652:1650812|1641173_1641608_+|AVL39840.1|DBSCAN-SWA MSVYNHKSLMVSINGYEITAFDESADALSIAPVGDDGAWTFGANGRGVYVFSGNQSGILTLKLLQHSADNHFLSNLRNQMLSSQSAPAPLELYIKDTWNGDEIVGHVGFFTTPPTQTRGAGHNAQSWVIQFERVITKLGKGAFN >CP027398|1639652:1650812|1650194_1650812_+|AVL39851.1|tail|DBSCAN-SWA MKNYNLEIEQAEIGQNGLATKAGWIKTYIADPTTREYLNANMEYIYFDVSVSAGAYTDAPELPTKTGFAVVRSEDGSKWEIVTDNRGKTAYSTETRQPIEVDFIGDLPETLTLLEPKTEFDAWNGKKWVTDTEAQKAALIEQAEQEKSQRLDEANNMLTYLQDSIDTGLATDEEAAALQAWKKYRVLLNRIDTSLAPNIEWPEKP >CP027398|1639652:1650812|1639652_1641164_+|AVL39839.1|DBSCAN-SWA MSLSIKEIINAQILPQAAAVQRRDLSMIAIFTSEMGNAFVDASSRYVFVSNEQDVANLFGTKSATYKAAQALFSARPKLKRAMIARFAKEKQTIAATANALKGSTISVGLNVLKAITDGAMTLNLAGSDILLSALDFSKAIDFSDIAKVINQKLPSDANVQAVWDAIGKRMIIQSKTAGVDAKTRFGYVKPSTSGTYVGNLLKLEEGQATLTVGAAAQTVNAELPSEALHKLQNVYQNWYGVYFADSLTDEQLDDAHAWVTAADLKVMAYTATRDEQIEWNNSNILKKLFDKNSGRLMVQFNKTGDNHAGAELLAIAVSTVWQGQNTAKTVKFKQQTSVRSDDRVTQDAAQKCRRLGINFYTDYDGINMLAEGTMLGGTFIDEVMGLDAFIDACQKQAFTTLQASPTKIPQTDKGQAMLIGSLIVIGNEFKRNGFLAGGIWRGSDIGEVTFGDRLDEGFYFYSDSFDVQSQADREARKMMPIMCAIKLAGAGHSADLLIQFNR >CP027398|1639652:1650812|1646875_1648000_+|AVL39848.1|DBSCAN-SWA MLQITETGIVIDKLTDVHQRLTEGFKRIYGDDINLDADSPDGQMIGLFSQEIDNINQAIALIAQMLDPYKAIGSWLEQRAMYAGIVRRGADYSYLNEVVITGKQGVTVHKGSLLSDDNRTKWVTLADVTLGSNGSARVDLRSQELGAFLLPANRPLTMDTVTIGVDSITTTKAAKEGAFEETDGNLLLRFMRSHAINNHDDYQGLEGALLDLPDVKQAKVYENYTNQTDEKGIPPHTLNAVVIGGHDNDIGRTILSKKVGGCGVFGRISNTQTYAGAPRTVYFDRAALVNVKVKLLLERVGGFHDIDTDAIKAALAATEFDIGESVYAMRLTCQVNAVQGFYIKSITVNGRDAVSIGVRQCAQIRPEDVEVLIE >CP027398|1639652:1650812|1647992_1648649_+|AVL39849.1|DBSCAN-SWA MSKPREDFLIWQYRGKPKARQTVGLLLSETKQLFESVITLSTILNIDTATGYGLDLIGKHVGLHRVMKSLVPKDYFGFRGIEGALGFNIGAFYRYGDSLKGSSVLGDDDYRFFIKAKIIKNYQKPDIANITYSLRHLLGEQAFIIDNYDMSMNVVIPANYLTPFRIHAIKDLDILSRPIGVNYQYLVITDAHPFGWVGDQSAFGFNDGKFTRLMNVSH >CP027398|1639652:1650812|1644739_1645078_+|AVL39844.1|DBSCAN-SWA MIYEIPVSNEPIQEQLFTLFGKALKLTLYYNKISKNWQFDLFDINENKVITQMQGLAVNAPSLIEKNLPFILTLSDKSRFGINSISQSELGERLLLYIVDKGFWYETIRQTT >CP027398|1639652:1650812|1642144_1643929_+|AVL39842.1|DBSCAN-SWA MGIEQLLTIIGLNEEQVVKLKGVVTALGAAATSTATVIGQLGEKLSNAGLTIDNLKAVVSGLVTAIDFMSNKFFSFIGGAVAGARELSQEKSVLFTISEKELQQADEYQSVTKKTSLSIESIKTKLVLGLLPNLTEVINRFNEWLDANKALISEGLTQLVVWGSKGIQAIGNAGRAINLLVEKTIGWKAAIIGVIAVLAAFKKAALIAFAANPVMWVAAAVAGLMVLLGDLMAYLDGGESQFSEFWAPAIEWIQSVLAWWNTFYAENKLIFDGIAQAWALTIDSAVMIFRGFFKYIGNALKLLFGLFSGNTAMMGEAWEGMTEGLKEIWAGFEHYFHGFATAFLALWQVLIQGVIQAWDVIKNAAKMAFEWVLSVAKTFIDGLSTVFFAIIDYLLAPFQSAFDLIQSLYEIFTDDSTSWTEKLNLAFAAIQEFLTAPFKAGWEFIRNLFDLSDTDIGKFIHDLANTFNGVTELIKKPFELAFNWVNQKLDELTSGIISILKALGIIDDKYQSEKKLVQISNLAGGLIKQNLADPNLSNVTTSNHKSIVVNQGDVNVKQDIHTMDSRQAGVLAVEGINQYVNEIAYHSLKSANAD >CP027398|1639652:1650812|1644011_1644743_+|AVL39843.1|DBSCAN-SWA MDITSGIFTGRASVITRTIGQFELDCTIRETHTSALRITKNPVESGADIADHAFLEPKSLSITGTVVGYEPAKYFNDFLGFDTEAMGEYPLPLEISSSIRQAEAMLGQYITIGRVLANKVQKVIAPWYPDVLKPFADSSQTLDRAGRAYESLLAIQKMGEPIDVQTGLRLYKNMMLTSIGATQDKPGAVEFSLNLEEVFIVESQTAKGLHPDLKQQPQKSNMGRTQPEAKSAHTFRETLGGRS >CP027398|1639652:1650812|1641607_1642000_+|AVL39841.1|DBSCAN-SWA MEKDNITYEHRHSNFIEAKTHAMKLLGMLKGCIAMNGEQVDIDVGGVLANIGSTEMQGVEKFILKWVIAKDADGNVIQLDKVDVFNTHFNTYRSHYYPLIVNGLVFHFADFLPDGVASKVNMPSLVNLTA >CP027398|1639652:1650812|1645873_1646530_+|AVL39846.1|plate|DBSCAN-SWA MKQPTLLDVMNQYAQNQRYDIHTALPGKLLSCNGHSATVELMISHVTKEGKVIALPPLVDVPVGFYRGGGFCVTVPVREGDEGLVIFAERCIDGWYVSGKQSQPLDHRFHDLSDAFFLPQGSSQPNKIPNYSSDSLSLQTDDGSTFIRMQSGKIMIKGDIEHQGNYQLTGNALIKGNHSVNGNSESSGGTLKHNGKNIGDTHTHSGVQMGGGNTGGPN >CP027398|1639652:1650812|1648635_1650195_+|AVL39850.1|DBSCAN-SWA MSVIKKPDLKIFAQDAKTGEIETFPDVLRGWGITLDRTAGKPPLEWFNAIGKRVDEWLMYLTQRGVAEWDAALSYPKTAIVQWNGVIYVSNKETKGEQPDKSQAAWSTLGVFLGLGNYYTKTDTDTKFQLKGNYALKGESYTKVESDTRFQPKGNYLPSGYSYSKSESDTKYQPKGNYAPAGDYATNTALKNGLNGKFDKTGGNIEGLTRVKNTLDANMVQVTGKDDAYMQLDMSVANVARINSKRAGKQWCNHILPDVSGTIMQVGDYGWGGKGAVINLDEKSYVSFLKGLNTESQIFRNSAATSKYHYQHGVAIYGKSHDTYTVISADYVGKGVIAIGGNSNTFYEYNLYSDRNTAKDHNGNLKVSGSSSELSDYPVGAPIPWPQATAPSGYLICNGQTFNKTTYPLLAKAYPSGVLPDLRGEFIRGLDAGRGIDANRTVLAAQGDAIRNITGSLNYGFLDALSASGVFKRTTNTLRSGGGVNEIKTSADFDASRVVPTANENRPRNIAFLYIVRAA |
13 | Haemophilus_phage(44.44%) | plate,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2669323 : 2775111
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP027398|2669323:2775111|DBSCAN-SWA 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MSLYRLLFILLLAGSFPAMAAEWKIGVLALRGANSTQSHWQILADTLNESLPGEHFTLQPLNLDEMRDAIAERKIDFLLTNPAQFIQLDSRYHLRWLLSLRSSVEPDSATRNVIGSLILVRADSDINEVKNLIGKKVGAISPDAFGGYLLGYKVLRDMGYDAEKDFRMQFLGFPADALLYALRDSSLSAAIIPVCLLENMDSEGLIDKNQFRPLIEHASTLPCKTSTELYPNWSFAALNDIPDNLVDKVTKTLLSSDKSGMRWGAPASVNQVETLLRDVNQHPQQRQIWQDIMSWLIQHQLSLGLVLLFFILLGVNHVWIAFLVRRRSRQLEEAHNRLRQQEANLEKAQRLNILGEMASGFAHELNQPLSAIRHYAQGCILRLKKESDDHPLINALTKIDNQAQRGADIIRNLRLWAGKPHQEVALQLSEQHVIPTIQHIWQLLRVSQHYPQVKLMLPDCRDVSLKLPETLLDQLLSNLISNSLQAGATTLCFSFHFAPERFLLVLQDDAGGMQPEQLTQGITPFATTKKEGLGLGLVICQRLIQSQGGDIRIENNVSEAGLNGLRVTLIFPYHHGKSSET >CP027398|2669323:2775111|2761876_2762062_-|AVL40822.1|DBSCAN-SWA MNALETTIKKAGGVPALAKLLNISDQAIRQWEKKGRIPPARYAQINELFGIPFEYLVKDKK >CP027398|2669323:2775111|2773638_2773863_+|AVL40844.1|DBSCAN-SWA MDDVTLENGRRKIARECRDKLKQLKKLSDKQSTAILKDYLPKFQLTLSEKHKKFPPIMWLTYYVNSIDKEINSG >CP027398|2669323:2775111|2757370_2757694_-|AVL40816.1|DBSCAN-SWA MKGTTLTELLAAWDKTAKQAVWKMYCAAGKPDRERFTSINAARYRRKYRNRKDRSYAEKVAYQLADNCSISELVGSNRKHLGLPPYIFTFGNSGTAKSQREASNAGN |
118 | Proteus_phage(20.34%) | head,transposase,integrase,portal,holin,tail,capsid,terminase | attL 2679480:2679495|attR 2777842:2777857 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2804583 : 2815279
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP027398|2804583:2815279|DBSCAN-SWA TATGGATAAAACAAGACAGACTGAATTGGTACGTTGGTTGAAACAGCATAGTACATCCGCAAAACGTTGGCTGCGTATATCTATGCTATTAGGCGTTGTTAGTGGTCTGCTGATTATCGCACAAGCGTGGTTCTTGGCGGTAATATTGCAAGCTCTGATTATGGAACACACTCCACGAGAGCAACTTCTGACCCCTTTTATCCTACTCCTTGCCGTATTTGTGCTACGCGCACTCCTAACGGTTATTAGAGAGCGAGTGGGCTTTCGTTGTGGTCAAGTTGTACGCCAAGAAGTACGCAACATGGTCTTAAATAAGCTACAAGCGCTAGGCCCTGTATGGGTAAAAGGTAAACCAGCCGGTAGCTGGGCGACTATCGTTCTAGAGCAGATAGAAGATATGCAAGAGTACTATTCGCGCTATCTACCACAAATGTATCTTGCTGGCATCATCCCTATTATGATCTTGATTGCCATCTTCCCATTTAACTGGGCCGCCGCCTTAATCTTGTTTGCAACCGCCCCATTGATCCCCATTTTTATGGCCTTAGTGGGACTCGGTGCCGCAGATGCTAACCGACGTAACTTTGTTGCTTTAGGTCGCCTCAGCGGTAGTTTTCTCGACCGGTTACGCGGCTTAGATACATTACGACTGTTTTTCCGTGAAAAAGCAGAAGTGCAACAAATTCGTGAATCTACCGAAGACTTTCGTTCAAGAACCATGGAAGTCCTTAGAATGGCTTTCCTCTCCTCTGGTGTGCTTGAGTTTTTCGCCTCAATTTCAATCGCTATCGTAGCCGTCTATTTCGGTTTTTCCTATCTTGGCGAATTAAATTTTGGAAGCTATGGGTTACCAGTCACCATGTTTGCCGGTTTTCTGGCATTAATTTTATCGCCTGAGTTTTTCCAACCTCTACGTGATTTAGGCACCTATTATCATGCCAAAGCTCAAGCGGTAGGCGCAGCAGAAAGTTTGGTGACATTGTTAGAAAGCGATGGCGAACAAAAAACAGAAACTGGGGATAAGACACCGCAAGATAAACCCATTCAAATTGAAGCAAATAAGTTAGAAATCTATTCCCACGACGGTCAACGTCTTGTCGGTCCTCTCGATTTTACTATCGAGCCACAACAGCGTATCGCTGTTGTCGGGCAAAGTGGTGCTGGGAAAAGCTCTTTACTCAATCTTTTGTTAGGTTTTCTTCCCTATAAAGGCTCGATTAAAATTAATGGGGATGAGCTAAAAGAGCTTTGCCCAGATAAATGGCGTGCATTAATTGGCTGGGTGGGTCAAAACCCTCATTTACCAGAACAAACACTTATCGAGAATATCTGCTTAGGTAAACCGACTGCTTCAGAGGCTGAAATACAACAAGCCATTGATGATGCCTATGTTTCCGAGTTTCTCCCTATGCTACCTGATGGCTTAAATACACGCCTTGGCGACTATGCTGCCAGGCTATCCGTTGGGCAAGCTCAACGTGTTGCTGTCGCGCGTACACTCTTAAAGCCATCGCGTATTTTATTACTGGATGAACCAGCTGCTAGCCTTGATGCGCACAGTGAAAAACGGGTCATGCATACTCTTAATCAACTAGCTCAACAGCAAACGACAATTATGGTCACCCACTTACTCGAAGAAACGGTTAATTACGACCAAATTTGGGTGATGGCAAATGGTCAAATCATTCAGCGTGGTCATTATGCACAATTGAGCCAATCGGAAGGGCCATTTGCCCGCTTGTTGGCTCACCGTAGTGAGGAGCTTTGATAATGCGAGTTCTATTACCTTTTTTGGCTCTCTATCGCCGACACTGGTTTTTGATCCTGCTCGGCATGATCTTAGCCATCGTGACTTTACTTGCCAGTATTGGGCTACTTACTCTATCAGGGTGGTTCCTCGCTGGGGCGGCAATTGCAGGTTTTCCGGGGCTTTATTATTTTAATTATATGCTGCCTGCTGCTGGTGTCCGTGGTGCCGCTATTTTCCGGACCGCAGGTCGCTACGCCGAACGACTGGTTAGCCATGATGCCACATTCCGAGTTTTGGCCCATTTACGTGTGTTCGCCTTTAGTAAAATATTACCGCTCTCACCGGGGGGGATCAGCCGCTTCCGCCAAGGGGAAATTCTTAACCGCCTTGTGGCGGATGTCGAAACCCTCGATCACCTATATTTACGTGTTTTATCGCCGATTTTTGCTGCTTTTGTCGTGATCTTTGTCCTGATTTTTGGGTTGAGCTTCCTTGACCCTCGCCTAGCGTGGACACTCGGTTGTATTATGCTGTTTTTATTATTTACCTTACCGTTTGTCTTTTATCGTGCAGGTAAGCCCATCGGACAAGAGCTGACTTACTTACGTGCCCATTACCGCACTGTCCTGACATCCGCTTTACAAGGGCAAGCGGAACTGACTTTGTTTGGAGCGCTTCCCCGTTTTCGCCAAACATTGGCAAATATTGAAAGCCAATGGCAAGGACGCCAACAACAGCAAGCCAATCTAACAGGGGTATCTCAAGCCATTATTCTATTTGCCTCTGGTTTTACTGCTACTTTGTTGTTGTGGATGGCGGCAGATCATGTGGGGGGGAATACTAACCCAGGAGCACTCATTGCTTTATTTGTCTTCTGTGCACTGGCCGCTTTTGAAGCCTTAGGCCCTGTCGCCGTTGCCTTTCAGCATATGGGGCAAGTGATTGCTTCTGCTGAACGTGTTTCTCAGCTAATTGATGCCAAACCAGAGGTAACATTCCCTGACAACGGTTTATCCCTTCCCCAACTGGAAAGCCTTGTTGTCGACAATATTTCATTTACTTACCCCGAGCAACCTTTCGCAGTTTTAAAACAGGTTTCGCTTTCACTGCTACCGGGGCAACACATCGCCTTATTAGGTAAAACAGGTTGTGGGAAATCAACACTTTTGCAATTACTCACTCGAGCATGGGATGTTGATAGTGGTATGATCAAAATTAATGGTCAAAATATTAGTGACTATAGTGAACAAGCACTGCGTTCGCTCATGTCAGTCGTTCCACAACGGGTACACATTTTTAGTGATACCTTGCGTAATAATCTACTGCTCGCTAACGATAAGGCAACCGACAAACAGCTCATTGAGGTGTTAGACCAAGTTGGTCTTGGTAATTTGTTGGAAAATGAGCAAAAACTTAACGCTTGGATGGGTGAAGGTGGTCGACAATTATCGGGTGGAGAGCAGCGCCGCTTAGGGATCGCTCGAGCGCTATTACATAATACGCCATTAATTTTAATGGATGAGCCAACCGAAGGGCTTGATGCACAAACAGAGCAGCAGATCCTTGCCCTGTTAAAAGAGAAATGTGCCGATAAGGCACTAATTGTGATCACCCATCGCATGCAAGGTATCGAGCAAATGGATACTATTTGCGTGATGGATAACGGTGAAATTGTTGAGCAAGGCTCACATCAGGCGCTTTTAGATTTAAAAGGCCGCTATTTTCAGTTTCGCCAGCGCCATTTACAACAGCAGGCCCTGTGAGGCACATCATGTACCAGCTCGATGATGACTCCTATCTGTTCCCGCCCGTCCATGAAGCGATGCGGGAACCTAATGGCCTGTTAGCTATTGGTGGCGATTTAGCGCCAGATCGGCTGAAGGCTGCCTACTATGATGGCATTTTCCCTTGGTTTAACCCGGGCGAAATGCCATTATGGTGGTCACCCGATCCTAGAGCGGTTTTAATGGTTGGCGAATTGCACATTAGCCGTTCGATGAAAAAGTTATTGAGAAAGCAAAAGTATCGCGTCACTGTCAACCATGCCTTCAAAGATGTCATCGCAGCTTGTGCGATACGTGACGAAGGAACATGGATTTTACCTGAGGTGCGTGAGGGGTATCAGGCACTTCATGAGCAGGGGATCGCTCATTCTATTGAGGCGTGGTATGGTGAAGAACTGGTTGGCGGCCTGTATGGCGTGAACATGGGGCACCTATTTTGTGGGGAATCTATGTTCAGTCGGATGAATGATGCCTCCAAATTTGCTTTTATTACATTTTATTTTCATTTTTTGCGCTATAATGGGCAGCTTTTTGATTGTCAGGTACTTAACCACCATACCGCCTCATTAGGCGCAAAAGAAATATCCCGTCGGGATTTTTTACATATTCTTTATCGGTGGCGTAACAAAGCGATTGATCCCGCCTGCTGGTTACCGCAATCGATTGAAATACCGCCATTATTCGAATAGCGAATTTTGGCTTTACGTTATTTTATGCCCATACTGTTCAAGAAAAATCGCTTTAAAATGCAACATTTCTTTACTTAGTGAGGGTTTTTGGGCATTATCTTGCCCGTTAAAAATCATGGTTATTAGACTTAGAGGATTAGATGGCCAAAGAAGACAATATTGAAATGCAGGGCACAGTACTGGATACCCTGCCAAACACAATGTTTCGTGTTGAACTGGAAAATGGTCACGTTGTGACTGCCCATATTTCTGGAAAAATGCGTAAAAACTATATCCGCATCCTGACAGGCGACAAGGTAACTGTAGAGTTAACTCCGTACGACCTGAGCAAAGGCCGTATCATTTTCCGTAGCCGCTGATTCTATCTCTTCAGGCAAGGCCTGATACAGCCACAGGTGCACAAGACACCTGTGGTCTATTTGTTGTCAGAATACCGCATCCTCCGGAGAGGCCTTGTGCACGCTACTGAAGCTATATGTCAGTGTGTTACTTTTATTATCAAGCCCGATACGTACTGAGCCGCCATTAGTTAACGAACCAAACAGTAGCTCATTTGCTAATGGTTTTTTCAGGTTATCCTGGATCACACGTGCCATAGGTCGGGCTCCCATCGCCTTATCATAGCCTTTTTCACACAACCAGCGGCGAGCCTCTTGGCTAACTTCAATCGAAACACCTTTCTCATCAAGTTGCGCTTGTAGCTCGACAATGAATTTATCCACCACCTGTATGATGATATCCATGGATAATGAATTAAACCAAATAATGCCATCAAGA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CTTCACTTAACACTTGCCCACGAGGCCCTACAATCTTACTACCGCCAAATAAATGAAGATCTTCCTCATTCCCCCAACGGTTAACTGCTAATAAGTGGCTACCATTCTCCAAAGCGCGGCACGCGGTATTGATATCCCACATGTCCTTATCTTGAATACGCCATGCAGAAGGCACGAGCAGCAATTCAGCGCCATTTAAGGTTAAGATACGAGCCACCTCAGGAAACCCCATGTCGTAACAGATCATCACACCAATCTTACCGAATGGAGTATCAAATACCGGATAGCTATTACCACTGCTAAACCATTGTTTTTCAATGCCAAATGCGTGGACCTTACGGTAGACCCCGCTGACACCTTCACAACCTGGATTCCACACCCCAACAGCGTTATAAACCTCGCCTAAGTAGCTTCCTCGCTCAGCAAAGCCACTAACAATAGTGAGATCCAATTGCGTCGCTAGTGCGCTAAACAAGCGATAAGTTTCGCTGCCTTCATCATCGCTGAGATCCCATAGTTGGGTCGCAAGCAAATCGCCTCGATAGCCTGTTGTAGCCAGTTCAGGAAAACAGATTAATTTGGCACCTTGCTCCGCAGCTTGATGGCAGAATGCGGCCATCCGCTCTAAATTATGCTGCTTTTGACCAAGTAAAGAGTTAAATTGCGCAAGAGCAACTTTAACGCTGCTATGATCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP027398|2804583:2815279|2808103_2808805_+|AVL40867.1|tRNA|DBSCAN-SWA MYQLDDDSYLFPPVHEAMREPNGLLAIGGDLAPDRLKAAYYDGIFPWFNPGEMPLWWSPDPRAVLMVGELHISRSMKKLLRKQKYRVTVNHAFKDVIAACAIRDEGTWILPEVREGYQALHEQGIAHSIEAWYGEELVGGLYGVNMGHLFCGESMFSRMNDASKFAFITFYFHFLRYNGQLFDCQVLNHHTASLGAKEISRRDFLHILYRWRNKAIDPACWLPQSIEIPPLFE >CP027398|2804583:2815279|2814433_2815279_-|AVL40874.1|DBSCAN-SWA MDHSSVKVALAQFNSLLGQKQHNLERMAAFCHQAAEQGAKLICFPELATTGYRGDLLATQLWDLSDDEGSETYRLFSALATQLDLTIVSGFAERGSYLGEVYNAVGVWNPGCEGVSGVYRKVHAFGIEKQWFSSGNSYPVFDTPFGKIGVMICYDMGFPEVARILTLNGAELLLVPSAWRIQDKDMWDINTACRALENGSHLLAVNRWGNEEDLHLFGGSKIVGPRGQVLSEASCDGETLLIGEVDFRVQAHTRLNIPYLRDRKPQSYEALVQNSQVTGEL >CP027398|2804583:2815279|2806352_2808095_+|AVL40866.1|DBSCAN-SWA MRVLLPFLALYRRHWFLILLGMILAIVTLLASIGLLTLSGWFLAGAAIAGFPGLYYFNYMLPAAGVRGAAIFRTAGRYAERLVSHDATFRVLAHLRVFAFSKILPLSPGGISRFRQGEILNRLVADVETLDHLYLRVLSPIFAAFVVIFVLIFGLSFLDPRLAWTLGCIMLFLLFTLPFVFYRAGKPIGQELTYLRAHYRTVLTSALQGQAELTLFGALPRFRQTLANIESQWQGRQQQQANLTGVSQAIILFASGFTATLLLWMAADHVGGNTNPGALIALFVFCALAAFEALGPVAVAFQHMGQVIASAERVSQLIDAKPEVTFPDNGLSLPQLESLVVDNISFTYPEQPFAVLKQVSLSLLPGQHIALLGKTGCGKSTLLQLLTRAWDVDSGMIKINGQNISDYSEQALRSLMSVVPQRVHIFSDTLRNNLLLANDKATDKQLIEVLDQVGLGNLLENEQKLNAWMGEGGRQLSGGEQRRLGIARALLHNTPLILMDEPTEGLDAQTEQQILALLKEKCADKALIVITHRMQGIEQMDTICVMDNGEIVEQGSHQALLDLKGRYFQFRQRHLQQQAL >CP027398|2804583:2815279|2808945_2809164_+|AVL40868.1|DBSCAN-SWA MAKEDNIEMQGTVLDTLPNTMFRVELENGHVVTAHISGKMRKNYIRILTGDKVTVELTPYDLSKGRIIFRSR >CP027398|2804583:2815279|2813687_2814437_-|AVL40873.1|DBSCAN-SWA MSILSSVVDVYRLFLRSGDELTVTTLVNELGMPKSSASRLLKQMAEHGLLEKKNDAPIYRPGLIIMELAHRARGMNPLIDMALESLDELTKETGFTTYVSLRDKDKVRVVHARIGNSMLQVITQPGTKLPIAGTSTGKALLARYSLSEREVIICQEPQEKQDKLRQELNQIEERGWAFSINESVPGVASVSSTVYDPAQGTLYALCLSLPASQITSELLAQLATKICHKASYLGSMVGDPYWLKRSSES >CP027398|2804583:2815279|2809230_2811516_-|AVL40869.1|protease|DBSCAN-SWA MLNQELELSLNVAFAKAKDNRHEFMTVEHLLLALLSNASAREALDACKVDLVVLRQELEHFIAQTTPLLPENDNRDTQPTLSFQRVLQRAVFHVQSSGRNEVSGANVLVAIFSEQESQAAYLLRKHDVSRLDVVNFISHGTIKGEASASSEQDTPNSNVNHEEQPVSDDHMDNFTTNLNQLAKQGKIDPLVGRQAELERTIQVLCRRRKNNPLLVGESGVGKTAIAEGLAWRIEQGDVPEVMNGCTIYSLDIGSLLAGTKYRGDFEKRFKSLLKMLEKDSKSILFIDEIHTIIGAGAASGGQVDAANLIKPLLSGGRIRVIGSTTYQEFSNIFEKDRALARRFQKIDIVEPTTEETVRIINGLKPKYESHHDVRYTAKAIQAAVDLSVKYITDRHLPDKAIDVIDEAGARTRLVAPSKRRKTIGVPEIESVVARIARIPEKTVSSSDKERLKTLDSRLKMLVFGQDDAITALTEAIKMSRAGLGQDHKPVGSFLFAGPTGVGKTEVTVQLAKALDIKLLRFDMSEYMERHTVSRLIGAPPGYVGFDQGGLLTDAVIKHPHSVVLLDEIEKAHPDVFNILLQVMDHGTLTDNNGRKADFRNVIVVMTTNAGVQETQRRSIGFAEQDNSTDAMSEIKKVFSPEFRNRLDGIIWFNSLSMDIIIQVVDKFIVELQAQLDEKGVSIEVSQEARRWLCEKGYDKAMGARPMARVIQDNLKKPLANELLFGSLTNGGSVRIGLDNKSNTLTYSFSSVHKASPEDAVF >CP027398|2804583:2815279|2812250_2812502_+|AVL40871.1|DBSCAN-SWA METGTVKWFNNAKGFGFICPENGGEDIFAHYSCIQMEGYRTLKAGQKVNFSINTGPKGNHANLIIPIESSTLNHTSAEATPQE >CP027398|2804583:2815279|2812605_2813544_-|AVL40872.1|DBSCAN-SWA MSLKQTLCAYELIDSAVVNGDDIVALFKNFTTIEASSKTVRDGKGQSDFVRIVIPGTHGKRQGNHAPTLGIIGRLGGIGARPSRIGLVSDADGAIAAIATALKLAEMREKGDVLMGDVIITTHICPTAPTRPHSPVDFMDSPLNDETMNENEAIPEADAILSVDTTKGNRLINHKGYALSPTVKDGYILPVSEDLLHLMEWSSGQNAVTFPLAVQDITPYGNGLHHINSIMQPAISTTAPVVGVAICTQTIVPGCSTGASHEVDIAASVKFMIEVAKAFGSGNCQFYDEEQFALLKSLYGDVSFLQTHGRPH >CP027398|2804583:2815279|2804583_2806350_+|AVL40865.1|DBSCAN-SWA MDKTRQTELVRWLKQHSTSAKRWLRISMLLGVVSGLLIIAQAWFLAVILQALIMEHTPREQLLTPFILLLAVFVLRALLTVIRERVGFRCGQVVRQEVRNMVLNKLQALGPVWVKGKPAGSWATIVLEQIEDMQEYYSRYLPQMYLAGIIPIMILIAIFPFNWAAALILFATAPLIPIFMALVGLGAADANRRNFVALGRLSGSFLDRLRGLDTLRLFFREKAEVQQIRESTEDFRSRTMEVLRMAFLSSGVLEFFASISIAIVAVYFGFSYLGELNFGSYGLPVTMFAGFLALILSPEFFQPLRDLGTYYHAKAQAVGAAESLVTLLESDGEQKTETGDKTPQDKPIQIEANKLEIYSHDGQRLVGPLDFTIEPQQRIAVVGQSGAGKSSLLNLLLGFLPYKGSIKINGDELKELCPDKWRALIGWVGQNPHLPEQTLIENICLGKPTASEAEIQQAIDDAYVSEFLPMLPDGLNTRLGDYAARLSVGQAQRVAVARTLLKPSRILLLDEPAASLDAHSEKRVMHTLNQLAQQQTTIMVTHLLEETVNYDQIWVMANGQIIQRGHYAQLSQSEGPFARLLAHRSEEL >CP027398|2804583:2815279|2811546_2811867_-|AVL40870.1|protease|DBSCAN-SWA MSDFLGTFKTDVVFKDEVEQVLQPPSMYKVILNNDDYTPMDFVVEVLQKYFSFDEERATQIMLDVHFQGKGVCGIFTAEVAETKAAQVNSYAREHEYPLLCTIEKV |
10 | Organic_Lake_phycodnavirus(16.67%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3050300 : 3060890
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP027398|3050300:3060890|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP027398|3050300:3060890|3054421_3054892_-|AVL41086.1|DBSCAN-SWA MYCQYLAAPEKFPKPWVQITADDEGVTSIYFVEQKSYPEQKNTHSELCVKQLTEYFNHQRKEFTVKLNPQGTEFQKKVWGHLCSIPFGERWSYKDLALKLGSVNYCRAVGMANSRNPISLIVPCHRVLGHDGKLVGYTGGLDIKDWLLAHEKEYAN >CP027398|3050300:3060890|3054005_3054215_-|AVL41085.1|DBSCAN-SWA MSKVKGNVKWFNESKGFGFITPEDGSKDVFVHFSAIASEGFKTLAEGQKVEFEITEGAKGPSAVNVVSL >CP027398|3050300:3060890|3055182_3055410_+|AVL41087.1|DBSCAN-SWA MAIITIYSKPDCVQCHATYQALERKSIPYQVIDLTQDDEALQFVRKLGYQQVPVVVADQEHWSGFRPDMISRLSA >CP027398|3050300:3060890|3057989_3058961_+|AVL41090.1|DBSCAN-SWA MTTHISSAPVKAINWNRIEDDKDLEVWNRLTTNFWLPEKIPLSNDISSWNTLTAAEQQLTIRVFTGLTLLDTIQNTVGAPSLMSDALTPHEEAVLSNISFMEAVHARSYSSIFSTLCSTSDVDDAYRWSEENSALQNKAKIIMSYYCDSHPLKKKVASVFLESFLFYSGFYLPMYWSSRGKLTNTADLIRLIIRDEAIHGYYIGYKFQKSLLKYDEKTQKEIKDFTFSLLFDLYENEVNYTQELYDTVGWTEDVKKFLHYNANKALMNLGYEALFPDVVTDVSPAILSALSPDANENHDFFSGSGSSYVIGKAVSTEDDDWDF >CP027398|3050300:3060890|3051608_3051872_+|AVL41082.1|DBSCAN-SWA MKTKLNELLEFPCSFTYKVMGLAEPELVDQVVEVVQRHAPGDYSPEVKPSSKGNYHSVSITINATHIEQIEKLYEELGALERVRMVL >CP027398|3050300:3060890|3055843_3057976_+|AVL41089.1|DBSCAN-SWA MENTKNKTTVDYHALNAMLNLYNSAGEIQFEKDKEAAHHYFRQHVNQNTVFFHDLKEKLDFLVNENYYEPQVIEQYDFAFIKKLFKQAYAHKFRFQTFLGAFKYYTSYTLKTFDGKRYLERYEDRVCMVALTLAQGNQALASYLVDEIISGRFQPATPTFLNCGKKQRGELVSCFLLRIEDNMESIGRSVNSALQLSKRGGGVAFLMTNLREQGAPIKLIENQSSGVVPVMKMLEDAFSYANQLGARQGAGAVYLHAHHPDIMRFLDTKRENADEKIRIKTLSLGVVIPDITFQLAKENKEMYLFSPYDIEREYGVPMSEISVTEKYHEMVNNKAIKKYKINAREFFQTLAEIQFESGYPYILFEDTANRANPIAGRINMSNLCSEILQVNRPSFYEDDLSYREVGKDISCNLGSMNIAKMMDAPDFAQSVAIAIRALTAVSDMSHIRSVPSIEQGNHQSHAIGLGQMNLHGYLARERIHYGSEEALDFTNIYFYTITYHALKTSNQLAIERKATFKGFEHSEYANGRYFDKYINQSWLPKTQTVQELFRRSGIEIPTQADWLSLKQSVMEHGIYNQNLQAIPPTGSISYINNSTSSIHPIVARIEIRKEGKIGRVYYPAPFMNNDNLEYYQDAYQIGPEKIIDTYAVATQHVDQGLSLTLFFKDDATTRDINRAQIYAWRKGIKTLYYIRLRQTALEGTEIDGCVSCTL >CP027398|3050300:3060890|3055419_3055833_+|AVL41088.1|DBSCAN-SWA MQTESLIYFSSRSGNCHRFVEKVGLPATRLPIGEQQSSIIATTPFVLLLPTYGGGGSRGAVPKEVIRFLNIESNRRLIRGVIAAGNTNFGEAYAIAGDIIATKCQVPYLYRFELLGTERDVQRVRDGLNAFWQQRHN >CP027398|3050300:3060890|3052130_3052775_+|AVL41083.1|DBSCAN-SWA MDVKTLSARTIIVRQLGLAPYQRVSDAMHQFTENRDKETADELWLVEHPRVFTQGQAGKAEHLLAPGEIPVIQSDRGGQVTYHGPGQQVMYVMLDLKRNKLGVRDLVTALETTVVKTLAHYQIEAYPRPDAPGVYINGDKVCSLGLRIRKGCSFHGLALNINMDLEPFNRINPCGYSQLKMTQMCHFIPNLTLPDVQPVLIEQFCDTLGFHIVQ >CP027398|3050300:3060890|3050300_3051509_+|AVL41081.1|DBSCAN-SWA MKNFAPSRTLRHTLLGASLLFTMTQANANEPFPNSPVPAVPEIDAEAYILIDYNSGKVLAEKNADQRRDPASLTKMMTSYVIGQAIKSGKIGAEDIVTVNEDAWATGNPIFKGSSLMFLKPGDRVSVSQLTRGINLQSGNDACVAMADYVAGDQANFIQLMNGYVSKLGLQNTHFQTVHGLDAEGQYSSARDMALLGQALIRDVPDEYAIYKEKEFTFNNIRQTNRNGLLWDKSLSVDGIKTGHTNAAGYNLVASATEGQMRLISVVMGGKSMKGRDAESKKLLTYGFRFYETVKPLQAGVEFASEPVWFGDENNVKLGVTEDLFLTIPRGRLKDLKASYDISTSELEAPLKKGQAVGTINFQLDGKTIEQRPLVVLKDVEEGGFFSRLIDYIKLLFHRWFG >CP027398|3050300:3060890|3052898_3053864_+|AVL41084.1|DBSCAN-SWA MSKPIQIERGIKYRDADKMALIPVKNVVTEREEILRKPDWMKIRLPADSTRIQGIKAAMRKNGLHSVCEEASCPNLSECFNHGTATFMILGAICTRRCPFCDVAHGRPNAPDANEPVKLAQTIKDMGLRYVVITSVDRDDLRDGGAQHFADCISAIREKSPSIKIETLVPDFRGRMDRALEILTETPPDVFNHNLENVPRLYRQVRPGANYDWSLKLLERFKEAHPDIPTKSGLMVGLGETNEEIIEVMRDLRRHGVTMLTLGQYLQPSRHHLPVKRYVSPAEFDEMKEEAMAMGFTHAACGPFVRSSYHADLQAKGEEVK >CP027398|3050300:3060890|3059687_3060890_+|AVL41091.1|DBSCAN-SWA MPIKLEVKNLYKIFGEHPDQAFKLLESGMSKDDIFEKTGQTVGVQDANLAINEGEIFVVMGLSGSGKSTLVRLLNRLIEPTSGQVLIDGEDISNISEKALRQVRRTKISMVFQSFALMPHMNVLDNTAFGMELSGISKEQRHQKAMDALRQVNLEKWAYSYPDELSGGMRQRIGLARALANDPDILLMDEAFSALDPLIRTEMQDELLSLQGDKQRTIVFISHDLDEAMRIGDRIAIMQGGVVVQIGTPDEILNNPANDYVKTFFRGVDISQVFSAKDIARRRADALLHIAPGFGPRSALKVLNDDDRYYGYLISRGHTFAGVVSVESLEKALQNNQGIESAVISSIEPIQGETPLNEVISTVAQAPCAVPVINEKNRYLGVISKGMLLQALDKETSNEQ |
11 | Mycobacterium_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3207692 : 3340238
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP027398|3207692:3340238|DBSCAN-SWA 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116 | Cronobacter_phage(42.55%) | head,transposase,capsid,integrase,portal,protease,holin,tail,tRNA,terminase | attL 3240682:3240700|attR 3316327:3316345 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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