Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP027777 | Clostridium botulinum strain Mfbjulcb8 chromosome, complete genome | 1 crisprs | csa3,DEDDh,RT,WYL,DinG,cas14i,cas3 | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP027777_1 | 306027-306198 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP027777_1
|
2 spacers
spacers of CP027777_1
>1.1|306061|51|CP027777|PILER-CR AGTTTTTCCCATTTATTATCAATAAACAAAAAAACACCTTATTTAAGGTGC >1.2|306146|49|CP027777|PILER-CR TTTTTTATATTTAATTTGAATTTTGAAATAAATAAACTGTAAAAAGTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP027777_1
The CRISPR arrays of CP027777_1 >merge|CP027777|1|306027-306198|PILER-CR ATATAATTAAGGACTATAGTTTTTCCCATTTATTATCAATAAACAAAAAAACACCTTATTTAAGGTGCTTTTGTACTTTTTGTACATATTTTTTTATATTTAATTTGAATTTTGAAATAAATAAACTGTAAAAAGTATTTTTGTACTTTTTGTATATATAATTAAGTACTAT >CP027777|1|1|306027-306198|PILER-CR ATATAATTAAGGACTATAGTTTTTCCCATTTATT ATCAATAAACAAAAAAACACCTTATTTAAGGTGCTTTTGTACTTTTTGTAC ATATTTTTTTATATTTAATTTGAATTTTGAAATA AATAAACTGTAAAAAGTATTTTTGTACTTTTTGTATATATAATTAAGTA CTAT
>CP027777.1|AVQ37408.1|304250_305672_-|MATE-family-efflux-transporter MGIDYRLFSKEKVEKALLKFAVPAMISLLVMELYNMVDTFFVGLVIGPKAIGALTIAFPVQRLMSSLGMMIAVGASTAVARSLGKKDYDNLKSVILNAINITIVIMVVLTFIISILKKDMITGLLGASQSIYPYAEKYISIVVLGGLFQALTLVICYIMTSLGYTNITLKATSVGAILNVIIDYFLVMHLNFGVAGAAIATVVSQTVALVYAIYKLNKVKKKIGLNLKLNFELKLDILKPILAVGFSTFIIEISDAVVAVILNNILSIYGGDKALIIVGVTTKISMFLFITVIGISSAMQPIAAFNYGAKDLVRVKEVVVKTIVAVTGATLILWAVMLIFANPIIGLFLKDTSLLGETVKAFRIIISLFPTIGIYYVSIYYYQSMGKARTSLILSVYRQMIIFIPLLFILVGKFNIMGAWIAYPISDLISAITGVIYVRVALKEKDKAIEAQEYEKERKEKAFKGRSVKVGGL >CP027777.1|AVQ37407.1|303567_303984_-|flavodoxin MAKVNIIYWSGTGNTEKMAEAIKEGLASAEVKLLSVSDATTKDVEEAEVVVLGCPSMGDEVLEEGEMEPFVDSISNIAKGKKVALFGSYGWGDGQWMRDWEERMESYGAEIKAESLIHQGEPDDSTIEECKAFAQKLV >CP027777.1|AVQ37406.1|300901_302191_-|DUF5050-domain-containing-protein MEDKFVDLNLKFNEEIDEKSIHSNILVVKDTRGNIVTSHIKVEQKNILNIKIKADEEYINNEYMLEFKDCIYSKNGNAFKELDNIKFCLNKGKIENNGTRVVKEDNWIYYSGNEKIYTYMDYNPHGEIRKVNLDGSLNIKLCDDFASNIWINEQWLYYINHRGGNEENCLYRIKKDGSSRERLTNTTVDSLVFSDNYIFYSEYISSSSKDNYKIYRIKKDGSNKIALSNVRGTNLIIQGPFLYYLNIEDNYSIYRIRVDGLDMKKINNYSSRNFMKIKDGWIYYTNEELGNNLYRITLDGNYEEKLNDDNCINAMMDNRRIYYGKDIDNNKTYLYRINIDGLERKKICEEDCSRSIVLTRDNIYFSGNSKKGIYKIRKDGGELCTITKDNALGLDIVEHWIYYYKLNLEELSMKLHRINLYDNKKQEVS >CP027777.1|AVQ37405.1|299565_300459_+|polysaccharide-deacetylase MRNSRKNIYSKKRHHDLRNTVTICLLFFSIISTFITGGRLLKVKVQNNMLAKKITNMSSENKNIKNENIKLMSDIDKENETYKEKMKHIKIAYLTFDDGPSKNTREILKILKENNVRATFFVNGHPGLEDLYKAIAKDGHVIANHTYSHDYRKVYMSPENFEKDIKKLDKYIEETVGQKPSHIIRYPGGSNNTVSHNYGGPGVMRQIIPHMNKLGYIHFDWNVDSTDASAFRQREDKIINSVLTESRGQHKAVILMHDTDPKTTTVQALPEVIKGLKEQGFIFDVITKDTPQISFTK >CP027777.1|AVQ37404.1|299309_299546_+|hypothetical-protein MREKSQSKLILLLTVTVILFIFSFVNINRVNTYKNKNENLNNNLKILQTENQKLSSEKEQLDKKHKEIKNKVSTLKGV >CP027777.1|AVQ37403.1|298694_299045_+|hypothetical-protein MYALVLILNDVKKLHEVNEIFYEENCGATNINSRGLGKILLENNLDVPIFAGLRKLIEGDVPYNKTIISVINSEEKKNIIINRIRKTLDIDNKPGIGFMFILPVIECFGAKTDHYE >CP027777.1|AVQ37402.1|297509_298682_+|potassium-transporter MNPFIGVGIALIVGVLFGKIMNRFKIPAVAGYIIAGLVLGVSGFNLENNIMIEKLSFIGDFALGIIAFNIGSELEVSVIKKLGKPIFIIAFFEATLAFAAVTIITLILGEKIYTALILGAVASATAPAATVMVLKELKAKGPLTTTLLGVVAVDDAICLMIYSVASSLAKVFIANKPINAYSIIVPPLVEIFFSLLAGLVLGIILIYILNKCSRDSEIQTLTLGAIIILTGLCIKFNLSSLLASMCLGITVANLSTHSDDVFATIENFASPVITAFFVLAGARLDIRMIPKIGILGICYLIFRMIGKVSGASLGAAISKAPKPVQKYIGYGLFSQIGVAVGLAIIVSREFKGTGLDTKVLTILLATTIITEIIGPLSTKTAIIKAKEANV >CP027777.1|AVQ37401.1|296946_297324_-|hypothetical-protein MRYIVAQYILIIILIIAIGYFLYLIKNRSDDYLENYYGLSDIIINTDYGEEKSRENIKIILRAISSSVYYVEKNFKKEPNNIKENKALEKVEELLKEYKFKGKINEDTLRYLIRINCALMNELYK >CP027777.1|AVQ37400.1|294378_296334_-|type-IIA-DNA-topoisomerase-subunit-B MEERIDNTKDYDVTKLTSLEKLEPVRVRPGMYIGSTGTKGLHHCIWEILDNAIDEISNGYGNTAEVILNEDKSVTVVDNGRGIPTGIHPIKKKSGVEMVFTELHTGGKFNNSIYKTSGGLHGVGASVVNALSEWTEVEVYQNGKIYKQRFEYALDKKLNKKMPGTPVTKLKVIQDTDKTGTKVTFKPDKEVFSTIDFKFDVIDERLQELAFQNKGITLKLIDNRKEEPEIKEYHSERGLLDFIDYLNESKTPIHNPAVLFEGEKEINNLRMEGEICFQFTDSSTENIASYVNNIPTTEAGTHETGFKTGMTRAFKEGAKKLNLIKEKDKEFDGDDLREGITAIVRIKISNPVFEGQTKTKLGNNEAYTMMNDLAYTKFLEWIEDNKEISTLIINNALAAAARREKIKKINEAEKKKIGKGLAPLAGKIAVCTLRDSNVTEFIVVEGDSAGGSAKQARDRRFQSIMPSKGKIMNTEKQKIENVLGSEELKIFNTAIGTGVLDNYKEQDLKYDKIIILSDADVDGYHIRTLWMTYIYRYMKSLVANGHLYIAMPPLYKVYKKDKKGEKSIYCYNDEELEKAKKQIGKGYLIQRYKGLGEMNPEQLWETTLNPETRTLQRITIEDAAKAEKMVSLLMGDVVEPRKNYLYKYAEF >CP027777.1|AVQ37399.1|291432_294303_-|DNA-topoisomerase-IV-subunit-A MAKKIVIPKDNNIVAFPLEEAMPENYLPYAVEVAKERALPDVRDGLKPVQRRIVYGSYMLKAFPDKPYYKSARIVGDILGKYHPHGDSSVYDAMVILAQNFTTRMPIIDGHGNWGSQDGDSAAAMRYTEARLTPIAMEMIRDIDKDVVNMVDNYSNSEKEPEVLPAKFPNILVNGAFGIAVGLATNIPPHNLGEVIDGTLAYIDKNEITTKELLNYIKGPDLPTGGVIIGKNSMLSAYETGEGRVTLRAKTTIEKLENGRLAIVITEFPFRKNKAKLLQFISEMTADKKHSKALENITDIRDESDRNGTRAVIEFKKIVTEDVVEKTLKYLYKKTDLQSNISFNMVALAEGKPKTLGLKAMLKYYVEHQKEVVTRKTKRELEIAEKRFHIVEGFIKAIGIMDEIIKTIRESKSKKNARENLMEKFSFTDIQAEAILELMLYKLTGLEIVAFEKEYKELEKLINKLKKILSSEKELLKVIKKELIEVKETYNDKRRTSIIEDDEKAKIDIEEIIVEEDVVVTLSNEGFTKRIALKSYNRSSANVEDIEYREGDFNRFLIQCNTKDTLCLVTKEGNMYQIKVINIPEFKWKEKGVKLDEIIKTIDLSETIIEAFSIDDFTAQKDMLFITDSGYIKKTTLDKFNTNYTKIMALKLKKEESLLKADLVDRTREEKFFNIKTQKGLSFNIEEPSLEAVDRNIVGYKLFDILPNDSIKQVDFCDNYEYKSFYVNISKDGLITISDLKENKSHVSLFTDSSKIIVLFDSEGKAYYIPAFMLQNIKEEGINISAFIGDKISLLNAISTFRFEEDISIYFISKKGLIKRTVLSELKIEGNSTQVYKFKDKGDELVSILIKEHGEEKNIIIITEKAMVIRFKSEAVNPMGKMASGVTGISLKDLDKVILALIIDENDTGKIKIKTKSKDKGTVEINKIKVQNRAGIGNSLMPLLLNDFVEVVELKK >CP027777.1|AVQ37409.1|306324_308391_-|cupin-domain-containing-protein MPREFVEYTNDLPIKVSMQNIKKSPIHWHNAMEIIYVLEGSIKITIETESHRVNKQEIGIINPEEAHSIKSITNNNKVLIFQIDTSFFNKYYDIENMFFYTDFSAPEAQKHEKYDILRKYLSTMLCEIAQKGDNYEDVVEEILVDLLYHLINNFHYLIYDEEELKENEVQFERYDRIIKYIYSNYNNKISIQDIARLEFLSSHYLSNEMKNKVGYSFNDFVNLTRVEEAIKLLLDTDKTISEISEELGFSHTRYFNKHFKKHYKCTPMQYRKKYKVDEEIYEKLKLYEKLKLKDAYEYLMHYLEDYPRFNYEGKIIKIHVDLSKDTGELDENWHDIINLGSAKEILKGNHVKLIKEFQKYVECEYAIIQNIFSKDMNVFSTEKDRFFNWYEIRQVFEFIYDLDLKPAILIDFHKYEVEFFLTLFKDFIDYFTDFFGDKEIKKWRFYLKNSLDENKKSLESFLKEYEDIEFINWDLDYKEVNNIYDTAYMVPYILNQYLNKKSNVIFLTTFDEIYGGEYINNELFYGGSGIINRQGIKKPSYYAYYLLSKLGNEVIEKGDGYIITKEDDDIQILVYSHSEELESLISLENLYKRRGLKETAEKKFSINIAALPYNYKIVTYKIDEGKGSSYNNWLSMGKPKRIDEYERDLLIKSSVPNIKLGFAKKSPIYNIVSKIEGYGAFLFILQRV >CP027777.1|AVQ37410.1|308798_310295_-|glycerol-kinase MEKYIMSLDQGTTSSRCIIFNKKGEVVSVAQKEFTQIYPKAGWVEHDPLEIWGKQAGVAGEALNIARISPEQIAGIGITNQRETTVVWNKRTGMPVYNAIVWQCRRTAGYCDELREKNIDKTIKEKTGLMLDAYFSATKIKWILDNVEGARELAEKGDLLFGNIDTWLIWNMTKGKVHVTDYTNASRTMLFNIHELKWDEELLEIFDIPKSMLPEVKPSSCVYGETDEILFGVSIPISGDAGDQQAALFGQTCFNAGMAKNTYGTGCFLLMNTGEKAVDSKNGLLTTIAVGIDGKVEYALEGSVFIGGAVIQWLRDELRMVKTAQETEKYATAVEDNNGVYLVPAFVGIGAPYWDSYARGTILGLTRGAKKEHIIRAALESMAYQTHDVLKAMEEDSGIELKALKVDGGACQNNFLMQFQSDILGVQVDRPEVVETTALGAAYLAGLAVGYWKDRNEVSQNWAISKSFDPAMEDEKKEKLIKGWHKAVTKSMDWEEKE >CP027777.1|AVQ37411.1|310586_311291_-|aquaporin-family-protein MSIYMAEFLGTMMLIWLGDGVVASVALNKSKGKDGGWIVVTAAWGLAVAIPAYIFGGISGAHMNPAVTIGNAIAGNFPWANVAGYIIAQMLGGFAGAVLVWLTYLPHWKATEDKATKLGVFCTAPAIRDTKANFITEFLATAFLVFGLMGFGQAKMVDGFGPLTAGAFIFVLGLSLGGPTGYAINPARDLAPRIAHAILPIDGKGDSDWKYAWIPVLGPILGGIAGALLFMLVF >CP027777.1|AVQ37412.1|311777_312098_+|YbjQ-family-protein MLITTTNNIEGKQIKQYKGIVCGEVITGVNFLKDFMAGIRDLVGGRSQGYEEELIRARNEAIDEMMDRAASLGCNAIVGVDIDYEVLGQGGGMLMVTASGTGVITE >CP027777.1|AVQ37413.1|312211_312895_-|VanZ-family-protein MQGIEILLRNVIISIIILILLKINKKQQNKKGHIIGVLFFIFIMNVIFGLTGISPISGFHTDIRIDEISYIPVVSTLGMVKEVFNTAVVENIPRNETILYLGANIFGNILMFGPLGLLLPLLWKYFRKFSKTVLFGFLVSFTIEFSQLFLARGTDIDDLILNTIGTMLGYLTFVVFHKLFPKFTEKFTVEHGVEKLSWNILPVICVIIPYLVTVILGFYDRAILLAR >CP027777.1|AVQ37414.1|313038_314115_-|ABC-transporter-permease MKSLFRNPLFYKEWKSSKWICLLMTLILFWDKPNNVLDQISYQKYSMLIDKNFVLDKMWFNQCLLGWNSGKQILILGVIVLFCILLFKGEKQDSTCDLLHSMPFTRKDIMVSKIKVGILTIILPFLINFIILTFFYFNNKSYISSSYLDIPKFYSINLLFYLFFFMFLVFMQSLVGQYFAATIIAPITLYVPYIVVGYIVDLIRLSQNLQYESPRLMALEKFVRNIYIYGIADTKGLERIEKTPNGEKIRNTYKFIYENFDIKIMVLIVLIVVFSILAVIIYNKVKLERINQLIIFKPVETAFKLGVGICAGMIFSQMFGYPKGPEPVTNMPLIYITLLIGTIIGYFISKLIVKFCSK >CP027777.1|AVQ37415.1|314098_314995_-|ABC-transporter MISISNVSKMLGDKKALNNINLNIEKGSIFGVIGENGAGKTTLIKCMLGIYKQDEGEIKIDGEPIFENTLVKAKIGYVAAEIQYYSSFKVKELVKFYTLTYSTFSYERFKELNKIFKIPENKRIRELSKGMKMRVSLMLNLSIYPEILILDEPTSGLDPIIKRKLINILLEEVSERNTTIFIASHHLDDLERICDSVAIIEKGQIKYTNNIEDMKKYIKKLQVLFKDENKIEEIKTWDEIMTVENVGRINYLITNNYSDELQEKLLKSGAEFVEEINLSLEDMFIYSMEGGKENEKLI >CP027777.1|AVQ37416.1|315000_315381_-|GntR-family-transcriptional-regulator MINIDSRSSKPIYEQIIDGIKENVIRGILKPGDKLPSVRELAVMITTNPNTVSKAYKELEREKIIEVLRGKGTYISDFNPREDEEKMSFLRKELKQLLIEAQYMGIDKKEFLKLIEEIYEDLDGKR >CP027777.1|AVQ37417.1|315549_316065_-|hypothetical-protein MNKKIINILFTIGFVFYILFLLWNISFKYVSPLEVFSTNRYFSRTLNLIPFYDIFNGNYNSLDIWGNIILFIPLGIYMNIINKNNAIYINIFKIFSISLIFEASQYIFGIGASDITDVITNTIGGIIGIGIYMVIERVFKEDKKVKNFITICSIVIMIPVAIILIALFIYN >CP027777.1|AVQ37418.1|316494_318207_+|hydroxylamine-reductase MSMFCYQCQEAAGGRGCTVKGVCGKTEDIAKTQDLIIYVVKGIAIYSSQAKEIGLNTDEADKFIVESLFSTITNANFDGKALNARVQKGLKIRQDLKDAIIKAGGSYNSKENKSWTSKFLSVLGIKNDKDEKEIHDAAVWAANNPEDFKKKAETVGVLATENEDIRSLRELLTYGLKGMAAYLEHANNLGYDEDSIHAFMAKALVATLDDTLSADELTALVLECGKYGVDVMALLDKANTSTYGNPEITKVNIGVRNNPGILISGHDLKDMEELLKQTEGTGVDVYTHSEMLPANYYPAFKKYNHFVGNYGNAWWKQNEEFEAFNGPILMTTNCIVTPKASYKDRMYTTGVTGFEGVKHINPSKDGKKDFSEIIEHAKRCASPKEIEKGEIIGGFAHNQVLALAPQVVDAVKTGAIKRFFVMAGCDGRMKSRNYYTDFAKALPKDTVILTAGCAKYKYNKLDLGDINGIPRVLDAGQCNDSYSLAVIALKLKEVFELEDINELPISYNIAWYEQKAVIVLLALLHLGVKNIHLGPTLPAFLSPNVAKILVENFGIGTISSVDEDIKMFMN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
446182 : 455765
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP027777|446182:455765|DBSCAN-SWA TCTAGTGTTTAAAATGTCTTATTCCTGTAAATACCATAGAAATCCCTTTTTCATTACATACCTTTATAGATTCTTCATCTCTTATAGAACCACCTGGTTGAATTATAGCTTTTATTCCCCATTTTGCAGCTTCTTCTGCTACATCTCCAAATGGGAAAAAAGCATCTGAAGCTAAAACTACGCCATCTCCAGCTCTATCTAATGCTTCCTTTGCTGCCCATATTCTATTTACTTGGCCTCCCCCAATACCTTTTGCCATCCCATCTTTAACTACTACAATAGCGTTGGATTTTACATATTTAACTACTTTCATACCGAATATAAGATCTTTCATTTCTTTCTCTGTTGGAGATTTTTCTGTAACTACTTTTGTATCTTCTAATAATTTATTATCACCCTTTTGTACTAATATTCCTCCATCTACCTTTGCCATATCTTTTGACTCTGTAGATTTTTCTTCACATTTTATAACCCTTAAATTTTTCTTGTTTTTTAATACTTCTAAAGCATCTTCATCAAAATCTGGTGCTACAACTATTTCTAAAAATATTTTTGCAAGATTCTCTGCTGTTTCCTTATCTACTTTTCTATTAAAAGCAACTATGCCACCAAATATAGATATAGGATCACATTCATAGGCCTTAGTATAAACTTCCTGTACAGTATCTCCTATAGCCACACCACAAGGTGTATTATGTTTTAATGCACAACAAGCCACCTCTTCAAATTCACAAACGGTTTTCCAAGCTATATCCATATCCTTTATATTATTGTAGGATAATTCTTTTCCATTTAACTTTTCAAAATTTTTCATAGGATATTTTCCAACAGTAGATGTGTAATAAGCTGCTGTTTGATGAGGGTTTTCTCCATATCTTAAATCCATGTTCTTTTTATAGGATAGAGTTAAGTATTCTGGATATTCCTCTTCTAATAAGAAATTACTTATAGCTGCATCATAGGCTGACATTAGATTAAAAACTTTTCCTGCTAATTTTTTTCTAGTTTTTATATTAACCTGATCATTTTCTTTTATTTCATCTATGACATTTTCATAATCCTTAGTATCTGTTAGTACTACTACATCTTTAAAATTTTTAGCTGCTGCTCTTATCATAGTAGGTCCACCGATGTCTATAAATTCTACTTTTTCATCAAAACTTAAATTTTCTTCTACTTTATTAAAAAAAGGATATAAATTCACTACTACCATATCTATAGGATTTATTCCCTTTTCTTCTATTACCTTCATATGCTCTTCATTATCTCTTATAGCTAATATGCCTCCATGAATTAAAGGATTTAATGTTTTTACTCTTCCATCTAACATTTCTGGGAAACCTGTTACCTCTTCTATGTCTATTACTTTTACTCCATTTTCTTTTAAATGTTTATAAGTTCCACCTGTAGATATTATTTCTACATCTCTACTTTCTAAAAACTTTGCTAAATCTAAAATTCCTGTTTTATCAAATACACTTATTAATGCTCTTTTTATCACTTAAATTCCCCCAGTTTCAATATTTTTTATTATCTTATTTATCTGTCATAAGTAACTGCCACCAATATACCTTCTTTCAAAGAAAACATATAAGTGGCACTATTTCAATTTACAAACTACAATTTTTTATATTTCAATAAATTTAATCTACTCTAAACACATTTTTCTATTAGTTTCATTTATATTAATAGTAATTTTTTCATCATTATAAATTTAGTATGTTTTAATAAAAACTTTTCTTCCTTGTAATTTTACTTTTTCTTCACTTATAAGTTTTATAGCTTCTGGTAATGCCTCATGTTCTTTTTCTAAAACCCTTTTTTGCAATATTTCTGCTGTATCTTCTGCAAAAACTGGTACAGATTTTTGTGTTATTATAGGGCCACTGTCCGTACCCTCATCTACAAAATGCACAGTACACCCAGATACTTTTACTCCGTATTCTAATGCTCTCTGGTGTACTTTTATACCATACATTCCATCTCCGCAAAAGCTTGGTATTAATGAAGGATGTATGTTTATTATCTTATTTTCAAATTTATTTATTAAATCCCCATTTAATATGGAAAGCCATCCTGCTAAAACTATTAAATCTACGTTTCCATATAAACACTCACATATTTTATTAGATAGGTTGCTTTTATATATTTTTCTATCTAGAGTTAAAGTTTTAATTCCCTTTTTTTCTGCTCTTTCTATACCATAAATATTAGATCTATCCCCTATAACCATTTCTATCTTGCAATTTTTTATATATCCCTCTTCTATTTTATCTATTATAGATTGAAGATTGCTTCCTCCCCCTGAAACAAGCACTGCAATTTTAAACATCTTATTCTCCTTTAATTTAAAGAAAATTTTTCATATATACTCTATAAATAATTAATTCCCCAATCAATTATTTTAAAGATCTAACCTATGAACTAATTTTTATTATAAATTTATTTAATACCCTTTTTTAAATTAGTTCAACAGACTTATCTCCTTTTTTAACATATCCTATTTTATAACCCTTTTCTCCCATTTCTATCAAGTCTTTTATTATATCTTCCCCATCTTTTTCATTTACACATAATACAAAACCAATCCCCATATTGAAAGTATTGTACATATGATCTTCTTCTATCCCTAAACTTGTTAAATGGCTAAATATATTTGATAATGGATAAGATTTTTTATTTATAACTGCTGTAAAATCCTCTTTAAACATTCTAGGAATATTTTCATAAAAACCTCCTCCAGTTACATGAGCCATCCCTTTTATATTATATTTTTCTAAAAGTTTCATTACAGGTTTTACATATATTTTTGTAGGGGTTAAAAGAGCATTTCCTATTTTGTCCCCTTCAAAATCTTTATATAAATCTTCTACTAATTTTCTTATAAGAGAATATCCGTTGCTATGAGGTCCTGAAGATGCTATACCTATTAATATATCCCCATCCTCTATTTTACTTCCATCTATTATTTCATCTTTTTCTGCTATACCTACAGCAAAGCCAGCTATATCATATTCTCCATCTCTATAAAACCCTGGCATTTCTGCTGTTTCTCCACCTATTAGAGCACATTCACTTTGGATACAACCATTGCTAACCCCTTCTACAAGCTGAGCTGCAACTTCTGCTTCCAATTTTCCACAAGCTATATAATCTAAGAAAAATAACGGCTTAGCACCATGACATAATATATCATTTACGCACATAGCTACGCAATCTATTCCCACTGTATTATATTTTTTCATTCTAAAGGCTATATCTAATTTAGTTCCAACTCCGTCAGTTCCTGATACTAATACAGGATTTTTATATTTAGGAAGTTCAAACATTCCTGCAAAACTTCCTAAATTATTTAATACTCCTTTTGTAAATGTCTTTGAAGCATGTTTTTTTATAAGATCTACAGATTTGTAACCTTCTTCTATGTTAACCCCAGCTTCTTTGTAAGATACCATGAATAACATTCCCTTCTTTAAATTATTAGTTATTCTACCAATAAAAAAACTATATTAAGTTATTTTAACTTTAGGATCATGAAAAAATAATCCATTAAATATGAATCGTATATTTAGTGTGAAACAAAGAAATAAATCTTTTCTACCTAAAGCTAGAACAACTTAAACCCTCTATTCCAAACTATCTTTAGGCATTTCTATAGGTGCAGATATAGGATATACACCATTAAAACATCCCAAACAAAAACCTTTATCTTTATTAAGTGTTTCTACTAAGCCTTCCATACTTATATAAGCTAGACTATCTGCTCCTATTTTTTCTCTTATTTCTTCTACTTCTGAGTGAGCACCTATTAAATCTTTTCTATAAGGAGTATCTATTCCAAAATAGCAAGGATATTTAACCACTGGAGATGATACTCTAAAATGAACTTCCTTAGCTCCAGCTTTTCTTAATGTTTGTACTAATCTTTTACTAGTAGTTCCTCTTACTATGGAATCATCTATTATTACTACTCTTTTTCCTTCTACATTTATTTTAAGTGGATTTAGTTTTACAGATACAGCTTTTTCTCTTAATTCTTGAGAAGGTGCTATAAAAGTTCTTCCTACATATTTATTTTTTATAAATCCTATACCATAAGGTATTTCTGAAGCTTCAGCATAGCCTACTGCAGCTGGTATACCTGAATCTGGAACTCCTATAACTATATCTGCCTCTACTGGATATTCTTCATAAAGTTTTCTTCCTGCCCTAACCCTTGATTCATAAACATTTATACCATCCATAGTGCTATCTGGCCTTGCAAAATATATATACTCAAAAGCACAGGTATGACATCTTGTTTTTTCTGCGAACTTAATTGAATTTATTCCACTTTCATCTATAATAACTATTTCCCCAGGTTCTATATCTCTTATAAACTCTCCACCTACACAATCAAAAGCACAACTTTCTGAGCTTAGTAAATAGTCATCCCCAATTTTCCCCAGGCACATAGGTCTTATACCATGAGGATCACGTGCTCCTATTAATTTATCTTCTGTAAGTATAACAATAGCATAGGAACCTTTAATTGCTTGTATTGCATCTACTACTGCTTTATCTATACCTTTTTTAGCGCTTCTTGCTATTAAATTTAATAATACTTCTGTATCTATAGAAGTTTGAAAAATACATCCACCATCTTCTAAAAGTTCTCTTATAACTGCTGCATTAACTAAATTACCATTATGGGCTATGGCAATAGAGCCTAATTTATAAGTACCTACTATAGGTTGTGCATTATCTGATTTACTAGCTCCTGTAGTGGAATATCTAACATGCCCTATAGCAGAATTTCCTCTTAATCCTTCTATGGTTTCCTTACTAAAAACATCTGATACAAGACCCATACCTTTATGATATTTAAACTTTTCTCCATCAGATACTACTATTCCTGCACTTTCTTGTCCCCTATGTTGAAGAGCATATAATCCGTAATAAGTTATTTCCGCTGACTTTGATTCATTATCTTTAGAAAATACTCCAAATACCCCACATTCTTCTTTAAACTTATCTCCTTCTAAATCAAAGGGCATATTTTCATTTAAATCATCTAACATATAGCACATACTCATTTTTACTCCCCACTTATTTTCTATTTTTTAAGTTTAATCTCTTCTAGACTATTCCCAGCTACTGCAAAAATAATTTTAAACTATAACAATCTATTTATTGACTCTCTTTAATATTTCCATATAAGCTTCTTTTACATTTCCCATATCTCTTCTAAATCTATCTTTATCTAACTTTTCCCCTGTGCTTTTATCCCATAATCTACAAGTATCTGGGGATATTTCATCTGCTAAAAGGAGTTCACCATTAAATCTTCCTATTTCTATTTTAAAATCAACTAAATTTATTCCTTGCTCATCAAAGAATTCTTTTAATGTATTGTTTACTTTTTCTGCTATAGAATACATTTCTTTTAGTTCCGCAAAGGTTGTAAGTCCTATAGCCACTGCATGATAGTCATTTATAAGAGGGTCATTTAGATCATCATTTTTATAACTTATTTCAAATACGGTAGTATCTAATTTTCTTCCTTCTGAAAGACCTAATCTTTTTGCCATACTTCCTGCTGCTATATTTCTAACTATAACTTCTAGTGGAACTATTTCTACTTTTTTGCAAAGCTGTTCTCTTTCATTTATCTTTTCTATGAAATGTGTTTTTACGCCCTTTTGTTCTAAAAGTTCAAATAACATTGCTGTTATAGAGTTATTCATAACTCCCTTATCTTCAATAGTCCCTTTCTTTTCCCCATTAAAAGCTGTGGCATCATCTTTATAATACACAACAACTGTATCCTTATCATCCGTTCTGAATATTTTTTTAGCCTTTCCTTCATATAACATATCCTTCTTTTCCATTATAACTCCACTCCCTCTTTGTTATCATTTATAAATTTTTCTTTCATATCTTTTCTATATTCTATAAGTTTTTCTTTTACTTCATCATATTTTAAAGATAATATTTGTACCGCAAGCATTCCTGCATTATAACTATTATTTATACCTACTGTAGCTACAGGTATAGATTTGGGCATTTGAACTATAGATAAAAGTGAATCCATTCCTCCAACTGCGGCTTCTATAGGCACTCCTATAACCGGAAGAATCGTATGAGAAGCTATAACCCCAGGTAAATGTGCTGCAAGACCTGCCCCAGCAATTATACATTCATAACCTTCCTTTTCTAAATCTTCAATTGTTTCCATCAACTTTTCTGGTACTCTGTGCGCTGAAAGTATGTAAGCTTTATATTCTATACTAAACTCTTTTAAAGCTTTAGCCGCTCCCTTCATTTTATCAGTGTCAGATTTACTTCCAAAAATAATAGCTACTTTCATGTACTAGACCTCCTTATATTTAAATATATAAAAAATTCCGCTAAGATTTCTATGGAGAATCCTAAAGCGGAACTTAAGCGCATTGCAAAAGCATAGCTAAGATTCATCCATAGACAGGGAATTTATGGTTCCCTCGTAGAGACTCTCAAACCTTATTATTGAGATTATATGGATGATATATTCATTTGTTTTATGTACTCATGGTAACATACAATTCTTAATAAATCAACATACTTTTATAAAAACATTCGTATTTTATTGGTATTTTATTTATTTTTTCATAATTTCATTCGTAATGGAACGAACAATTAGGCAGGTGAGAAGTTTACTCAAATATATATTATATTGTAATAGAAATAATTTATAATATGAAAATAAAATAGATTTAATTTTCAGATATCAAGCAAAATAATATATGGTAATAAACATATGAATAAACTTTAACATTTTCTAATCTTTTTAAATCGAGAGCTTTTGTTATTAATCAAAGAATGAAGGTAAAAAACCGATGGTCAAGCCACGCATGACTTTTCCATCGGGTAAAAATTTTTTAATGGAGAAAATTTGAACTTCTTAGTCAAATAATTGATCTATCTATACATGTATTTTTTATATTTACATGGTTAAAATTAAATCTATTTTAAAATAGTGCTATCTAAGATAATTATTTTTTTCTTCTATAAGCAGTATCTTTGAGAGGAAGTTTTTTTCTAAATTTTCCATCAAATTTATAATAAGCACCTTGAGCTGCTGGCGCTGTCGGTATGGTTGTAATTTCTCCTATTCCTTTTGCACCATAAGCTAAATTATTAGTATTTTTTTCTATTATTGTTATTTTAATTTCTGGTATATCAGTAGCTCTAAACAAACCTAATGTACCAAACTTAGCAGTTGGAATAGATTTATTTAATGGATAATCCTCTGTAAATGCATATCCAAGTCCCATAACTATTCCACCTTCAATTTGTCCTTCTACATTAGTTGAATTTATAGCTTTTCCCACATCATGAGCTGCAACTACTTTTTCTACTTTTCCATCATCATTAAGAATAACAACTTGGGTTGCATAACCATAAGCCACATGACTTACTGGATTCTTTTTATCAGAATTAATAGGATCTGTAATACCTTGATATTCCCCATAAAATTCTTCACCTTCGCACTCTTCTAGTGATGTAGTTAACAATTTATCTTTAAGCTTTAATGATGCCATTCTTGTAGCTTCTCCAGTAAATACTGTTTGTCTTGATGCTGTAGTTGTACCTGAATTTGGTGCAAATTTTGTATCTGGTAAATCTAAAATTATCTGTTCTGGTAATAAATCTGTTGTTTCACATATTATTTGTATAAGAATTGTTCCAAGTCCTTGACCTATACAAGCTGCGCTAGTTCTTATATGAACTTTTCCTTTTATCACCACCAAATTACATCTACCTATATCAGGTAATCCAACACCGACTCCTGAATTTTTCATACAACATGCTATTCCTACATACTTATTATTTTCATATATATCTTTCACAGCCAATATAGTTTCCTTAATTGCAGTACCCTTATCAGCAATTTGTCCATTAGGCAGTGCATCTCCTGGTTCTACTGCATTTTTAAATCTTATTTCCCAAGGAGATATACCAACCTTTTGCGCTAAAAGATTTAAATTACACTCTGATGCAAAAACTGATTGTGTTACTCCAAATCCTCTAAAAGCTCCTCCTGGTGGATTATTAGTATATACAGCCGTACCCTTTATTTTTACATTAGGACATTTATATGGTCCAGCTGCATGAGTGCAAGCTCTTTGAAGTACAGGCCCTCCCAATGATGCATAAGCGCCAGTATCTGCTACAATATCTGCTTTAAAAGCTGTTAAGTTTCCTTTTTCATCACAAGCAGTAGTAATTGTCATCTCCATAGCATGTCTTTTAGGATGAATCTTAATACTTTCTTTACGACTTAATGTTACTTTAACAGGTTTTTTAATAATCCATGCAAGAAGAGCAGCATGATGCTGTACGCTCATATCTTCTTTACCACCAAAGCCTCCGCCTACATATTTGCTAATAGTCCTTACTTTTTCTTTAGGCAGTCCCAAAAGCTCTGAAATCTCTCTTTGCTCATCATATATACCTTGGCTTCCTGTATAAATAATAACTCCATCCCCATCTGGCATAGCTAAAGCACTTTCAGGCTCTAAAAAAGCATGTTCTGTAAAGGGAGTGGAATAGTGATTACTAACCACATATTTAGAATTAGCTATTGCCGCATCCACATCTCCTCTATTAACTTTTTCTACTGTCAACACATTTCCCTTAGGGTGAATTTTAGGGGCATCTTCATCCATTGCCATATCAGGATTAGAAATAGGTTCTAATTCTTCATATTCTACTTTTATTAAATTAAGTATTTCTTTTAAAGCTTTCTTATTTTTTGCTGCTACTAAGGCTACTGAATCTCCAATATACCTTGTTTCTTCACCTACATCTATCATTGCTGGCCAATCTTTTATAATGTGTCCTATATATCTATTTCCTGGAATATCTTTTGCTGTAATAATTGTTTCCACATCTGGATGTTTTAAAGCTTCACTAATATCAATGCTTTTTACTAATGCCCTAGGATATTTTGTTCTTAAAGCAGAGCCATAAATCATCCCTTCTACTTTCATATCATCTACATATTTTCCTATACCTAAAATTTTATCTCTTGCATCTATTCTTGGAATGTTTTCGCCTATCTTTCCTTTATATTCTTCATTAAGTATAAGCTTACCATCTCTAAAAGCTTCTGCTGCCATTTCAATGGCTTTTATTATTTTCACATATCCAGTACATCTACATACATTTCCCCTAATGGCAGTTTTAATTTCTTTTTTATTTGGATTTAGATTTTTATCTAAAAGCGCTTTTGCACTTATTATCATTCCAGGGATACAAAAACCACATTGTACTGCGCCAGCTTTAGAGAAAGCCCATGTAAAAACCTTTTTTTCAAATTCTGTTAATCCTTCTACAGTTTTAATATCCTTACCATGTACTTTTGCAGTTGTATTTATACATGCTCTAACAGCTTTACCATCAAGAAGTATCATACAGGCCCCACAAGCACCTTCTGCACAGCCATTTTTTACTGAAGTTAAATCTTCATGATCTCTTAAATATTCAAGCAAATTCATATCCTCTGAAACAGATACATTTCTTCCATTTAATATAAATTCATACACATTTATTACCCCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP027777|446182:455765|446182_447682_-|AVQ37519.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVFDKTGILDLAKFLESRDVEIISTGGTYKHLKENGVKVIDIEEVTGFPEMLDGRVKTLNPLIHGGILAIRDNEEHMKVIEEKGINPIDMVVVNLYPFFNKVEENLSFDEKVEFIDIGGPTMIRAAAKNFKDVVVLTDTKDYENVIDEIKENDQVNIKTRKKLAGKVFNLMSAYDAAISNFLLEEEYPEYLTLSYKKNMDLRYGENPHQTAAYYTSTVGKYPMKNFEKLNGKELSYNNIKDMDIAWKTVCEFEEVACCALKHNTPCGVAIGDTVQEVYTKAYECDPISIFGGIVAFNRKVDKETAENLAKIFLEIVVAPDFDEDALEVLKNKKNLRVIKCEEKSTESKDMAKVDGGILVQKGDNKLLEDTKVVTEKSPTEKEMKDLIFGMKVVKYVKSNAIVVVKDGMAKGIGGGQVNRIWAAKEALDRAGDGVVLASDAFFPFGDVAEEAAKWGIKAIIQPGGSIRDEESIKVCNEKGISMVFTGIRHFKH >CP027777|446182:455765|448640_449636_-|AVQ37521.1|DBSCAN-SWA MVSYKEAGVNIEEGYKSVDLIKKHASKTFTKGVLNNLGSFAGMFELPKYKNPVLVSGTDGVGTKLDIAFRMKKYNTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVAAQLVEGVSNGCIQSECALIGGETAEMPGFYRDGEYDIAGFAVGIAEKDEIIDGSKIEDGDILIGIASSGPHSNGYSLIRKLVEDLYKDFEGDKIGNALLTPTKIYVKPVMKLLEKYNIKGMAHVTGGGFYENIPRMFKEDFTAVINKKSYPLSNIFSHLTSLGIEEDHMYNTFNMGIGFVLCVNEKDGEDIIKDLIEMGEKGYKIGYVKKGDKSVELI >CP027777|446182:455765|451346_452051_-|AVQ37523.1|DBSCAN-SWA MEKKDMLYEGKAKKIFRTDDKDTVVVYYKDDATAFNGEKKGTIEDKGVMNNSITAMLFELLEQKGVKTHFIEKINEREQLCKKVEIVPLEVIVRNIAAGSMAKRLGLSEGRKLDTTVFEISYKNDDLNDPLINDYHAVAIGLTTFAELKEMYSIAEKVNNTLKEFFDEQGINLVDFKIEIGRFNGELLLADEISPDTCRLWDKSTGEKLDKDRFRRDMGNVKEAYMEILKRVNK >CP027777|446182:455765|453194_455765_-|AVQ40612.1|DBSCAN-SWA MGVINVYEFILNGRNVSVSEDMNLLEYLRDHEDLTSVKNGCAEGACGACMILLDGKAVRACINTTAKVHGKDIKTVEGLTEFEKKVFTWAFSKAGAVQCGFCIPGMIISAKALLDKNLNPNKKEIKTAIRGNVCRCTGYVKIIKAIEMAAEAFRDGKLILNEEYKGKIGENIPRIDARDKILGIGKYVDDMKVEGMIYGSALRTKYPRALVKSIDISEALKHPDVETIITAKDIPGNRYIGHIIKDWPAMIDVGEETRYIGDSVALVAAKNKKALKEILNLIKVEYEELEPISNPDMAMDEDAPKIHPKGNVLTVEKVNRGDVDAAIANSKYVVSNHYSTPFTEHAFLEPESALAMPDGDGVIIYTGSQGIYDEQREISELLGLPKEKVRTISKYVGGGFGGKEDMSVQHHAALLAWIIKKPVKVTLSRKESIKIHPKRHAMEMTITTACDEKGNLTAFKADIVADTGAYASLGGPVLQRACTHAAGPYKCPNVKIKGTAVYTNNPPGGAFRGFGVTQSVFASECNLNLLAQKVGISPWEIRFKNAVEPGDALPNGQIADKGTAIKETILAVKDIYENNKYVGIACCMKNSGVGVGLPDIGRCNLVVIKGKVHIRTSAACIGQGLGTILIQIICETTDLLPEQIILDLPDTKFAPNSGTTTASRQTVFTGEATRMASLKLKDKLLTTSLEECEGEEFYGEYQGITDPINSDKKNPVSHVAYGYATQVVILNDDGKVEKVVAAHDVGKAINSTNVEGQIEGGIVMGLGYAFTEDYPLNKSIPTAKFGTLGLFRATDIPEIKITIIEKNTNNLAYGAKGIGEITTIPTAPAAQGAYYKFDGKFRKKLPLKDTAYRRKK >CP027777|446182:455765|449807_451256_-|AVQ37522.1|DBSCAN-SWA MSMCYMLDDLNENMPFDLEGDKFKEECGVFGVFSKDNESKSAEITYYGLYALQHRGQESAGIVVSDGEKFKYHKGMGLVSDVFSKETIEGLRGNSAIGHVRYSTTGASKSDNAQPIVGTYKLGSIAIAHNGNLVNAAVIRELLEDGGCIFQTSIDTEVLLNLIARSAKKGIDKAVVDAIQAIKGSYAIVILTEDKLIGARDPHGIRPMCLGKIGDDYLLSSESCAFDCVGGEFIRDIEPGEIVIIDESGINSIKFAEKTRCHTCAFEYIYFARPDSTMDGINVYESRVRAGRKLYEEYPVEADIVIGVPDSGIPAAVGYAEASEIPYGIGFIKNKYVGRTFIAPSQELREKAVSVKLNPLKINVEGKRVVIIDDSIVRGTTSKRLVQTLRKAGAKEVHFRVSSPVVKYPCYFGIDTPYRKDLIGAHSEVEEIREKIGADSLAYISMEGLVETLNKDKGFCLGCFNGVYPISAPIEMPKDSLE >CP027777|446182:455765|447895_448513_-|AVQ37520.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGSNLQSIIDKIEEGYIKNCKIEMVIGDRSNIYGIERAEKKGIKTLTLDRKIYKSNLSNKICECLYGNVDLIVLAGWLSILNGDLINKFENKIINIHPSLIPSFCGDGMYGIKVHQRALEYGVKVSGCTVHFVDEGTDSGPIITQKSVPVFAEDTAEILQKRVLEKEHEALPEAIKLISEEKVKLQGRKVFIKTY >CP027777|446182:455765|452050_452530_-|AVQ37524.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDTDKMKGAAKALKEFSIEYKAYILSAHRVPEKLMETIEDLEKEGYECIIAGAGLAAHLPGVIASHTILPVIGVPIEAAVGGMDSLLSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQILSLKYDEVKEKLIEYRKDMKEKFINDNKEGVEL |
7 | Synechococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2060031 : 2078859
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP027777|2060031:2078859|DBSCAN-SWA TTTAATAGTTAATTTTAATATCTCCGCTAAACTTACATTCTACTTGCAATAGTGTATTACTAGCATAAATTACTTCATACAAATCTTCTTTGACCTGTCTCCACCTTCCAACACCATCATATTGCAAATCTAGTTTATCTATCTCTTCGATATCTGTTATACTGTCCATGCTAAATAAGTAAGCAAATCTTATTTTTTTAGTAGTAACTAGTTCATTCCAGAATACATCATTAATAGCATTAAAAATAGCAATATTCATACCATTTTTTCTTACGTCATCTACAATTAAATTAACATTTACCCATTTTTCTCCACTAAATGTTTTCCATGTGTTACCGCTATCTACACTACAAACTATTCGTATATTGTTACCATTAGCAGTTAATCTAAAATAATCTATATGATCTACATTACTTAAATTCATATCATCTTTTGGAATAAGTAAACGATCAAATGGAATAGCCTTTATCTTTAATTTTTGAATAACTCCATCTTCAAATGTTTCAAAGCCTTCTATTTTTTTAAATAATGTTTTATCCACATTAACACTATATTCTGTAAAGCTTTCTGCATCTTGAGCAACCTCAAAATCACTTATATGATTTGTTTCTAAATGTGCTTTACCATCAAATGTCATCATTTTGTCATCAATAAAATCATTACTCTCATCATTAGTAAATTCGTTTTTAACTGATATTAAATCCTGTGTATTTTCTGTATCATATCTCAAAACATTCACACGAGGCACTTTAAAATCTACTGTGTTAACAGGGATGTTAACGATTCTAGGTGTTTCGGCACTTCCCACTATGCCCATTTTCGATATTTGTTTCATCCCTGCACCAACTATTTCTCCTGCATCTATACCATCAATAGTTGTAAACTTTCCTGTTTCCTCTGAATAAGCTACTAATTGTTTATTTTTCTTATTAGTAACATCTACATCCTCTAGTTCCTCAAATTTTGTAATTCTTTTATCTATTATTTCCTTTTGTATTTTCTCACTTGACCATCCAGTTTTATTGGAAATTACACTATCATCTAAAATTATATCCTTGTCCAAAGTTACATTAAAAAATTCACTCATTAAGCCATCTCCTATTCACTAATAACTAAATGAAAATCCCTAACTGCAAAATTATGATTCTCTGCATTTTTAGTTATTTTTACATATATACCTTTACTTTCACTCTGTTTTATACTATCTATAGTTAAAGAGTCTGTATAATTTATACCATCGAAGGATAGTTGTATTAAATCACTACTAGGTGTTTCAGTACCTATTTTAATATTGTTATAATCCTTATCCCCTATATTTTTAATTGTTATTAGCTCTTCTAAATACTGAAGCATAGCAGGACTAACATTAGTTACAACATTTCCATGATATATAATTTCAAAATTATATGGACTAAATACCCACATGTCACCATATTGTAGATGAATAGCGTCACTAGTATACATCATTTTTCCATCCCTATCTTTAAATGTAAAATATCCCATCATGTTACCATCTATAAAAACCTTGCATTCCATATCTGAATTAAATAATCTAGTCTTAATTAATTTGTTATCTAAATCATATAACTCACATAAAGTATTTTCTGGGAAATTCTGAATGGTTACGTAAGGGTTAGAATAAACTTTATAGTTGTTTAATATAAAATCTTCATCACTATACTTCATAAATCCTTGCTTTGTAAGTGGCTCTATAAATTCCATACCACCTATATTGGTATAGCTTTTACCATCATTACTTGAATAAGCTTGTATATAATTATCTTTCTTAAGTATTTTCCAATATCTATTTTGTTTATTTGATTTTAAATCCTTAATACCAAAAATATGATCGTTATTCCCTAAATAAAGCATAGAATAATCCATATTTTTCATATGACTGAAATTTTCTTTTTCAACCTCAATAACAAACTCTTTATAATCAAATTTTCTTTCTATTTTATTATTACTTATTAATTTCAATTTACCTGTTTTAATATCTCTAGTTACATTACTTTCTCCTGCAAAATCAGAAAAAGAAGAAGCCAAGAAAAAATTCTCGGCTTCTAATAATCCATTTTTGACTTGTATAAGTTTCATTAAAATCACCCCTAAACTCTAGGCTGCATTATATAATCATATGGTACAAACTCAACTATTTGTATATCTTTAGTTCCTATACCATTTGCCAATAATGTATGTGCTTCTTCTAATGCATCTTCATAACAATTAGTAGCATAAGATGTCAATTCTGCTCCATTTTGATCTGTTTCATGTCCATATGGTAATTGGGCTAAAGTTTTATTTTTTAAAACCCCCCACATCTTTTGTCTAGTTTTTTTAAAATCTATTGTGCTTGTTAACATACTATCTACCTCCCCAATATATTTTTCTTTTCAAAGTTTTGTACTTCTATCATGTAATTTCTTTTACTCTTCAGTTTATCCAAATCTCTCATAATATCACCATTAGTTGATACTTTATTAAATTCTCTTTCAATCTCCATAGCTTTTGGATTATTCCAGACTGGTACTAAATTAAAGTGATGCTGCTTTAAATAATCTATTAAATTAGCTATAAGTAATCCTATAGCTTGTAATCCACTTCCAATATTACAGAAATATACTTTTTCAGCTTCCCATCTAATCCATCTGTATGCCCTAATATAATCTATATTTGGACTTGATGTATCTAAAGTATACCAATCATAAATCAATTCCATTATAAATTGGATAGATTCTTTACCTGTACAACTTAACCAAGATTGTGTATTTTTATGCCATATCATTATTAAAATATTTGTTAAATCTAATATTATTTCAATACTAATTGTCATAGGCGGAATGTTATAATCCACTCCCCAATCTTTACCCCATTCCATAGGATGATTATTAAATCTTAGATATTCATAATCTAAATTATTTAATAGATCATTATTATATATATAATTTTTATTAGGAACAATTATCTTATCTGTTGGATTTGTAGGTTTTAACCACCACCATCTTTTGGTTATTTCAATAAACTTATTTTTATTAGGTGTATATATTTGTCTTATAGCTTCATTATTTAAATATTTATTACCTTGTCTATAAATTTGCCATATACTTAAATTTAATAGATCTATTTCTATCTGCTTATAAATATTAATTACAGGGCTGTTACCTAAATGTTTTTCATTATGTTTAAATATATTAGTTGTATATTCTCTATCTAAATATCTATTATTATATTTAAATATATCTCTTATAGCCTGTCTATCTAAATACCTGTTGATACTTTTATCTATAAATTTAAATACATCTTTATAAAAATATTTTTTATTATGGTCTTTGCAGATTTCTTTATGTGCTATTTTATTTAATGCATTTTTAATTCTATATTTTTCTATATCCTTTAGAGCTATATTATACATTAACATGGTTTTATAATTTCTATCTATATCTTTTAAATCTAATATTTTTAAATTGTTTATACTTGTATCTATATCTATTCCAATTATAATATCTTTGTTTAACATTGTTTTATTACTCATTTTAGCTGCTTCTTTTAAATTACACTTATCTATAAATCTATAATTGTTTTTATTTATATTTTTAGTTCTATATTTTTTAACAAACTTAAACTTATCCATATATATACTCTTACAATAACTCTTATTAAAATAGTATCCAACATTTTTTTCTATATTTATATACTTCTCTAGTTTTAAATTATTTAAAGATTTATCTTTGAATATTTCTTTTTCTACTATCAAATCTGCATATATACTTTTGGATTTATTCAGTTGTAGATTTTCCCTATCTATAGATAAATTTATTAAATTATCAGCTTTATTTAGCTGCAACATTTCTCTTTCCAATAACTTATTGTTATAGCATATAGATATATCTGTATTTCTTCTTATATCAAGTTCCTTACTTGTTTTTCTATTTATATCTATATCCTTTATTTTATCTAAAGATATAGCATTGTTCTTATTTATTTCTTCATTTTTTAATTTTAACTCTTTTTCAAATTCTTTTTTTATATCAGTAATTTCCTTGGATATATATTTATTCTTTTCTTTCTCTATATTATCTTTAGGTTCCTTATAATATAATTTATCTCCTTTAATTTTATCTATTTCACCCATTGTTTCTTTGTAAAATAATTTTTCTGTAGTTTTTGCTACTTTTTCTGTAGTATCATATATAAAAGTTCCACTAGAAAAAGTAGTATCCCCTACATATTTAAAACTACATAGGGGGATTTTATGTAGGGGCATTTATACCACCTCTCTTATTTAGTTGTTTTATAACATCTAATAGCAATGCAATAATTTATATTAGCACTATTATTTAAGAAACAATATGGCGCAGTAATTTTAAATTTCTTATAATATTCTTCCTCTTCTGTATCTTTCTTATATGCTAATCTGTCAGTATCATTTATTGCACTAGCATCACCTACAAGTACATTAATCATTTTACCTCTTTCCATATCAACTGGATGTACAAGTGTTATATCTGAGAATTGATGTTTTTTATGGTTATATCTACTACCTTCTACATTACATTTATCCATAAAAGGATTAGTAGCATAAAAAGCTGGATAATGTGGTTGATATGGCATACCTATTTTATTAGCTATCATACAAACATCTGTTACTCCTGTTGCAGTTCTTTCTCCATAAACCTTTGAATAATTTGGTTCTATATCAGAAGATACAGTTATACCAAAATTATATTTATCATCTGTATAAGCTGAATCCTCTACTGGTTTTAAAGCTCCAATATAAGCATAAGATGTAAGATAGTTTTCATAAGGATGAACATCTGCAGATGGATCTCCACGTAATACTAAATTTATACTATCTTTAGTTACATTTATCCAATATTGAACTGGTAAAAAGTCTTTTATTTCTGGCTGTAATTTTCTATACCATGCTAATCTATAATTATATTCAGCTTGTATATTTTTAGATATAGTTAAATCTGTTCTATCTGCATTTAATTTATCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP027777|2060031:2078859|2078046_2078256_-|AVQ38945.1|DBSCAN-SWA MATAKKLKAYRCLKGAKQEDIARLIGVALNTYNFKENGKKPFTLNEAKIISDFFETTIDELFFKRNSKL >CP027777|2060031:2078859|2069785_2071327_-|AVQ38932.1|DBSCAN-SWA MAVNVGEAVAHLTLDTSKFKTALNGAGKDLEIFVHKVEEEKTKIEKLQEALTKEAETLSKIGKSMEKPSAAAQNLLKTGMKNTLAEESKSKNPKKGPANIAKGNYEKIQKDIQASIKKVQDSFAQLQTSIVKQLIPIFNNQLVPILNNKLIPIFTKLANKAVELMNSFNKLPNPVKNAIAIIIVSIAGVAKTFTVLSKLVGTINNVIGIFNKLKKAGGIFGLLKTIITSKTLLILVAIAAIGLIVYEVIKHWDTLKKYATRFGNFIANIFKGIGRVINSIIQGAIHAFQGFIKILQWVGGMVHNVINGCIAIFRGVGNILYGIVQGWINIFKGLGNLAGALFNIGRNIVEGLINGIRAMFGRVGQVIGNLASEISSRFKKLLGINSPSRVFADYGNFIGEGLIQGIDNQENAINNKFKGIANKIKGLGNVRPNFNGLNNMSLSGAYGGTYASPYVPNNMNKSMGLTQDIKMYVTIPNADKEGANKIANEFKQMTESSMKNVMTGLFMNDVLRD >CP027777|2060031:2078859|2061128_2062127_-|AVQ38923.1|DBSCAN-SWA 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MLDKKLYIKTEERLYRYFRSKKELDKLKNRVKHISNRIEIIMDKIKNNNVTLEEESRSRTYDEIVQTSSNGTSYAERELVRQIEGLEIELGEKIKKKGKVEYKIREIEEEISVIEDNLSSLNEENKKFIEFKYGENKSVDWIAVEMFGRARSTAYRKKNELVERVAQLNNLII >CP027777|2060031:2078859|2074175_2074460_-|AVQ38939.1|DBSCAN-SWA MRTPLEILKFNLQEKQYPYFEDKELEFLLEINNNDVEKSSYKGCILKAIADDGIEVAGVKLQSNRAYWLTLAEYFKEEQKILKDQTPVERVDEH >CP027777|2060031:2078859|2060031_2061117_-|AVQ38922.1|DBSCAN-SWA MSEFFNVTLDKDIILDDSVISNKTGWSSEKIQKEIIDKRITKFEELEDVDVTNKKNKQLVAYSEETGKFTTIDGIDAGEIVGAGMKQISKMGIVGSAETPRIVNIPVNTVDFKVPRVNVLRYDTENTQDLISVKNEFTNDESNDFIDDKMMTFDGKAHLETNHISDFEVAQDAESFTEYSVNVDKTLFKKIEGFETFEDGVIQKLKIKAIPFDRLLIPKDDMNLSNVDHIDYFRLTANGNNIRIVCSVDSGNTWKTFSGEKWVNVNLIVDDVRKNGMNIAIFNAINDVFWNELVTTKKIRFAYLFSMDSITDIEEIDKLDLQYDGVGRWRQVKEDLYEVIYASNTLLQVECKFSGDIKINY >CP027777|2060031:2078859|2073458_2073806_-|AVQ38937.1|DBSCAN-SWA MSELEVNIDDAIDGLSEFELQSKTSIGMYADIAAKNMEEYAKKNAPWKDQSGKDIEIIKGGKEWKGDECNIYISGNKDYCPSLELCNDKKYAILKPTIDKLSSQILKGMSNLFGK |
25 | Clostridium_phage(90.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2088101 : 2102058
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP027777|2088101:2102058|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP027777|2088101:2102058|2091488_2091938_-|AVQ38963.1|tRNA|DBSCAN-SWA MRAVVQRVISSKVEVDGKVIGSIGKGLNVLLGISREDTEEDIKYLKEKIINLRIFEDENEKLNKSLLDIGGDIIIVSQFTLYGDCRKGRRPSFVEALGGEEAYILYNKFVESIKKEVNNVATGEFGADMKVYIENDGPVTILLDSKKTF >CP027777|2088101:2102058|2096875_2098144_-|AVQ38968.1|DBSCAN-SWA MSYNRHKSNKGKSVIIFTLLIVVIAIFAYAGSYGLKVGNYRFKSFGETINKGLDLQGGVSMLEEIQADKVDEKTVDRTIELISMRVNKMGVSETTVTREGKKRIRIEIPGKYNAKEVIDSVGKTGELKFVGPDKSIILTGKDVKDATAYINQEDNSPTVGLDLNEAGAKKFADATKKFIGQPIAIYMDEEELTKPVVQAHITNGKAVITGSKSIEEAKRQANIIKSGALPVAVKPVEVRTVGATLGANALDLSVKAGVVGVGLVFLFMIIYYRVPGLLADIALVLYIVLVLATFSTIKATLTLSGIAGFLLTIGMAVDANVLIFERIREELKTGKSIKSALESGYHRALSSILDSNITTIIAGIVLYNLGSGAVKGFALTLMIGIILSMFTAIVVTRLLLKLGYDIGILNKLACFRVKRGEE >CP027777|2088101:2102058|2096010_2096874_-|AVQ38967.1|DBSCAN-SWA 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14 | uncultured_Mediterranean_phage(37.5%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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